CC   -------------------------------------------------------------------------
CC        PROSITE protein domains and families database
CC        SIB Swiss Institute of Bioinformatics; Geneva, Switzerland
CC   -------------------------------------------------------------------------
CC
CC   Description: miniprofiles
CC   Name:        evaluator.dat
CC   Release:     2022_01 of 23-Feb-2022
CC   -------------------------------------------------------------------------
CC
CC   This file contains the miniprofiles used by ps_scan.pl to evaluate
CC   PROSITE pattern matches.
//
ID   ASX_HYDROXYL_MP; MATRIX.
AC   MP00010;
DT   01-AUG-2007 CREATED; 01-AUG-2007 DATA UPDATE; 01-AUG-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartic acid and asparagine hydroxylation site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6387091; R2=0.0023904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=7102; N_SCORE=22.613; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=779; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: D=-60; I=-60; B0=-1500; B1=*; E0=-1500; E1=*; MI=-2358; MD=-2462; IM=-89; II=-312; DM=-70; DD=-138;
MA   /I: I=*; I0=*; B1=-846; E0=*; BD=-842;
MA   /M: SY='D'; M=-83,-1504,452,200,-71,-80,50,-78,-73,-70,-97,419,36,-16,-79,14,10,-73,-78,-72;
MA   /M: SY='I'; M=-77,-1560,-47,-78,-70,155,-38,187,-67,147,145,-82,-84,-75,-72,-79,-58,122,-70,-44;
MA   /M: SY='D'; M=-79,-1501,576,101,-72,-74,-34,-70,11,-74,-79,403,56,-13,-5,-40,-70,-74,-70,-75;
MA   /M: SY='E'; M=-74,-1501,76,429,-76,-71,52,-78,-76,-72,-72,-47,173,48,100,0,-71,-75,-70,-74;
MA   /M: SY='C'; M=-560,786,-999,-1030,-990,-749,-398,-974,-972,-1001,-904,-833,-831,-931,-481,-686,-472,-358,-1012,-1008;
MA   /M: SY='S'; M=104,-1543,30,102,-137,-73,-101,-136,-64,-40,-272,4,-92,104,-81,105,23,-71,-273,-653; D=-10;
MA   /I: I=-150,-2050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-539;
MA      MI=-100; MD=-1464; IM=-145; II=-50;
MA   /M: SY='N'; M=-108,-2077,47,-112,-195,34,109,-249,-102,-193,-113,285,-96,63,-53,85,-51,-362,-210,-251;
MA   /M: SY='P'; M=-150,-1593,-100,-75,-124,-257,-106,-116,-193,-68,-105,-158,345,-51,-30,-100,-148,-97,-381,57;
MA   /M: SY='C'; M=-805,588,-1077,-1113,-1071,-870,-1013,-1102,-1094,-572,-1030,-963,-944,-1049,-1047,-442,-852,-981,-1037,-1076;
MA   /M: SY='Q'; M=-20,-1554,-89,-24,-6,-109,188,-136,27,94,27,-122,-189,194,85,-42,-257,-108,-105,-125;
MA   /M: SY='N'; M=-143,-1587,-267,-122,-431,-78,230,-328,-232,-392,-347,381,-73,-183,-145,-120,-280,-259,-705,-91; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-6;
MA      MI=-461; MD=-1448; IM=-206; II=-40; DM=-2; DD=-642;
MA   /M: SY='G'; M=-163,-1582,-3,-180,-174,296,168,-423,-220,-342,-616,150,-156,-32,-38,-153,-287,-472,-725,-155;
MA   /M: SY='G'; M=106,-1568,-352,-398,-703,348,-182,-670,-394,-512,-338,-539,-678,-370,-322,-111,-353,-374,-708,-647;
MA   /M: SY='T'; M=-118,-1505,-281,6,-242,-345,-40,11,9,-99,-138,-61,-250,29,61,18,257,45,-724,-285;
MA   /M: SY='C'; M=-407,586,-860,-481,-933,-761,-873,-977,-899,-468,-905,-806,-453,-416,-892,-701,-724,-856,-966,-467;
MA   /M: SY='I'; M=-203,-1588,-178,-26,-38,-358,120,139,-20,-9,38,-94,-333,75,49,-13,19,130,-81,24;
MA   /M: SY='D'; M=-153,-1560,240,23,-181,-173,18,-213,-287,-207,-57,224,25,51,-212,-53,-123,-36,-316,-33;
MA   /M: SY='T'; M=-106,-1544,-12,-152,-151,83,26,-15,-66,33,-27,4,-233,55,34,7,161,-25,-716,-101;
MA   /M: SY='P'; M=-133,-1507,-25,70,-152,51,-37,81,-53,-42,-103,-56,139,-35,-76,-45,-148,90,81,-104;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-1547,164,48,-143,32,-68,-106,-40,-119,-188,103,-36,83,-23,64,-168,-188,-106,12; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-139;
MA      MI=-158; MD=-183; IM=-191; II=-45; DM=-461; DD=-60;
MA   /M: SY='F'; M=-52,-1509,-89,-6,99,58,-85,31,4,27,-30,-27,-26,-94,-115,49,37,-21,-73,-50;
MA   /M: SY='G'; M=-61,-1541,67,-15,-335,227,9,-153,-152,-239,-278,179,-42,-84,-57,5,-39,-252,-330,-223;
MA   /M: SY='S'; M=-72,-1554,45,-48,-143,161,-13,-283,-100,-299,-11,-1,-178,8,-41,194,45,-220,-184,-272;
MA   /M: SY='Y'; M=-101,-1533,-326,-402,285,-115,19,-167,-232,-278,-313,-171,14,-270,-186,-236,-216,-156,-668,372;
MA   /M: SY='T'; M=-112,-1517,-244,34,2,-324,114,-7,55,-134,-79,-107,-668,99,120,56,139,8,-184,10;
MA   /M: SY='C'; M=-1025,588,-1130,-1168,-1174,-997,-1088,-1251,-1177,-1209,-1179,-1117,-1052,-1156,-1122,-1059,-395,-1171,-1060,-1179;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-1581,60,80,-116,-594,74,43,4,4,-103,-6,-568,106,80,-17,56,28,-232,-182;
MA   /M: SY='C'; M=-994,588,-1126,-1164,-1165,-984,-1081,-1235,-1170,-1200,-1163,-1100,-1041,-1146,-1115,-542,-1035,-1147,-1059,-1170;
MA   /M: SY='P'; M=1,-1044,-30,-90,-216,-273,20,-263,-10,-23,-113,-83,279,69,9,-30,-44,-35,-276,-194; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71;
MA   /M: SY='P'; M=31,-1507,-40,-28,-11,-87,-55,-232,-40,-98,-39,-20,285,-7,-28,-37,-87,-119,-725,-142; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='G'; M=-139,-1506,-91,-139,-285,447,-136,-498,-267,-339,-615,-41,-156,-303,-200,-97,-267,-316,-173,-398;
MA   /I: DD=-199;
MA   /M: SY='Y'; M=-247,-1501,-392,-294,316,-713,-31,-300,-284,-253,-237,-327,-322,-284,-49,-248,-156,-308,280,457;
MA   /M: SY='T'; M=-83,-1503,-29,49,-115,-42,21,-150,-84,-242,-25,-105,-173,38,-57,102,233,-92,-132,34;
MA   /M: SY='G'; M=-268,-1538,-140,-323,-200,471,-564,-604,-424,-214,-281,-392,-250,-438,-452,-384,-570,-399,-673,-410; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-11;
MA      MI=-382; MD=-800; IM=-227; II=-34; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='P'; M=-24,-1542,81,72,-270,-280,-18,-125,102,-81,-219,-101,152,31,116,-7,-18,-58,-163,-306;
MA   /M: SY='H'; M=-260,-1531,-8,-76,24,-241,218,-120,-107,-11,-174,157,-499,51,203,-135,48,-151,-109,67;
MA   /M: SY='C'; M=-463,587,-1006,-1041,-384,-754,-932,-982,-1002,-1008,-910,-839,-439,-944,-960,-469,-713,-848,-1016,-1010;
MA   /M: SY='E'; M=-148,-1507,51,283,-440,-206,4,-207,-187,-132,-210,-47,-339,190,-195,4,-53,-171,-725,-374;
MA   /I: I=*; I0=*; B0=*; E1=-100;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00010;
//
ID   GLA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00011;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Vitamin K-dependent carboxylation domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8620262; R2=0.0165945; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=128; N_SCORE=7.976; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=27,5,-14,-7,-7,-21,4,-11,-15,-8,-19,-14,12,-13,-7,-14,12,1,-11,-27,-21,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-23,3,-1,-19,-2,7,-22,-1,-24,-13,20,-17,5,1,6,-2,-23,-25,-8,1;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-9,-22,-9,-1,-10,-8,-11,-15,-8,-12,-10,-6,-16,-3,-7,3,1,-12,-13,-6,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-12,-22,-14,-14,10,-10,-15,-12,-11,-2,-6,-10,-22,-17,-3,-10,-9,-7,-15,-2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,-19,-28,-20,12,-24,-20,11,-23,21,8,-22,-22,-20,-18,-16,-7,8,-16,0,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-28,8,33,-27,-11,-4,-28,8,-21,-17,-1,0,11,7,0,-9,-26,-27,-19,21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-27,14,37,-26,-15,-5,-23,2,-14,-15,-3,-6,10,-5,-2,-9,-21,-29,-18,24;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-22,-25,-16,3,-25,-19,6,-16,14,6,-20,-13,-16,-9,-15,-5,4,-19,-5,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-22,-11,-7,-5,-18,-8,-15,5,-14,-8,-1,-16,-5,11,-1,4,-10,-16,-2,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-30,-6,6,-27,-20,-9,-19,11,-21,-9,-9,19,8,2,-7,-8,-20,-24,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-26,0,-10,-28,32,-16,-31,-14,-26,-19,1,-6,-13,-17,4,-9,-24,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-25,4,2,-25,-10,4,-20,-4,-26,-15,16,9,4,-7,6,-2,-24,-33,-18,1;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-12,-18,-12,5,-18,-12,14,-17,26,11,-16,-16,-11,-12,-16,-6,7,-11,0,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-17,11,34,-17,-11,0,-17,6,-11,-11,0,0,11,0,0,-6,-17,-17,-11,23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-17,-5,1,-12,-11,-1,-17,18,-12,-6,0,-11,6,38,-6,-6,-11,-11,-6,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-17,11,34,-17,-11,0,-17,6,-11,-11,0,0,11,0,0,-6,-17,-17,-11,23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-11,68,-17,-17,-11,-17,-17,-17,-17,-11,-11,-11,-23,-17,-17,-6,-6,-6,-28,-17,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-10,-14,-13,-10,-1,-15,-7,8,-5,4,8,-7,-13,-6,-5,-9,-5,5,-7,3,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-17,11,34,-17,-11,0,-17,6,-11,-11,0,0,11,0,0,-6,-17,-17,-11,23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-17,11,34,-17,-11,0,-17,6,-11,-11,0,0,11,0,0,-6,-17,-17,-11,23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-11,-13,-14,-9,0,-16,-10,5,-6,5,3,-9,-10,-6,-3,-8,-3,3,-11,-2,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-11,68,-17,-17,-11,-17,-17,-17,-17,-11,-11,-11,-23,-17,-17,-6,-6,-6,-28,-17,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-8,5,0,-12,-2,-4,-11,-4,-15,-11,9,-7,-1,-5,15,8,-6,-22,-11,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-22,-14,17,-27,-3,-3,-8,7,2,-17,-25,-10,-3,-19,-9,-7,2,25,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-27,6,31,-24,-18,-6,-21,2,-16,-15,-2,2,9,-2,2,-6,-21,-29,-18,19;
MA   /M: SY='A'; M=23,-6,-15,-14,-7,-17,-9,-13,-8,-7,-7,-6,-4,-14,-3,-11,3,1,-4,-23,-15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-11,-1,-15,-21,-1,-28,27,-19,-9,-1,-20,7,58,-11,-10,-19,-18,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=7,-24,-16,-29,-23,-5,-26,-25,23,-17,7,7,-22,-23,-20,-20,-9,-3,29,-24,-7,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-15,-26,41,-35,-29,31,-30,-24,-11,-30,0,-7,-21,-34,-34,-24,-17,-10,-3,-19,1,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-30,20,46,-31,-17,-1,-29,9,-21,-18,1,-4,18,1,-1,-10,-28,-30,-19,32;
MA   /M: SY='B'; M=-8,21,-22,21,4,-20,-10,-3,-18,-7,-12,-14,18,-17,-4,-9,1,-3,-18,-34,-16,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,16,-23,12,0,-12,-12,0,-17,-4,-19,-15,19,-14,-5,-6,1,-1,-18,-26,-4,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-4,-29,3,16,-24,-20,-7,-19,2,-17,-12,-7,15,2,-3,-6,-7,-19,-29,-17,7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,4,-24,5,6,-21,-15,-10,-17,4,-11,-10,0,-10,-1,0,-4,-6,-13,-27,-14,2;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-9,46,-19,-19,-14,-24,-24,-19,-19,-14,-14,-9,-23,-19,-19,7,24,-4,-39,-19,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,20,-28,29,24,-28,-17,-4,-24,4,-17,-15,6,-9,5,-4,-4,-8,-21,-32,-16,14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-27,2,21,-20,-19,3,-21,7,-15,-11,-4,-11,11,8,-4,-8,-19,-20,-5,15;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-22,-34,-25,50,-29,-11,6,-25,17,11,-22,-29,-27,-17,-22,-10,1,4,29,-24;
MA   /M: SY='W'; M=5,-25,-31,-29,-21,0,-14,-19,-12,-15,-12,-9,-25,-22,-14,-18,-17,-15,-15,64,15,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-25,10,3,-23,-14,-6,-17,0,-16,-9,4,-4,1,-1,-1,-4,-16,-30,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-23,-8,-1,-20,-18,0,-13,7,-15,-4,-2,-15,5,5,-1,0,-8,-25,-8,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-19,-28,-20,-17,16,-29,13,4,-12,0,2,-17,-26,-8,-12,-16,-9,-4,12,53,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-23,-12,-14,-19,21,-17,-19,-14,-16,-10,-4,-16,-13,-14,1,-4,-12,-24,-19,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-2,-26,0,-9,-1,-14,-9,-7,-13,-5,-6,-6,-20,-13,-15,-10,-10,-7,-15,5,-12;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-5,-4,-2,-12,-10,-4,-5,0,-9,-3,3,-7,4,-2,-2,-3,-6,-15,-7,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-16,-10,-19,-19,8,3,-8,-16,-14,-11,-9,-11,-24,-18,-14,-10,-12,-13,-3,13,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-25,7,-6,-24,18,-10,-26,-8,-19,-13,2,-16,-7,-6,-2,-11,-19,-24,-19,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-29,-5,4,-26,-15,-5,-17,2,-20,-9,-4,18,15,1,-4,-7,-23,-22,-14,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-20,-13,-4,-6,-20,-12,-2,-5,-4,-3,-9,-16,-7,-1,-4,-2,2,-19,-5,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-21,-8,-3,-20,-8,-10,-17,1,-20,-12,-2,-3,0,9,8,3,-11,-27,-16,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-24,2,2,-23,-10,-4,-20,8,-21,-12,10,-8,4,6,2,-2,-19,-29,-15,2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-34,-9,-3,-26,-6,-16,-22,-10,-29,-19,-13,54,-9,-15,-2,-7,-26,-28,-24,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-13,30,-14,-11,-17,-16,-19,-18,-19,-12,-13,-13,-20,-16,-19,-3,-6,-8,-35,-19,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00011;
//
ID   PHOSPHOPANTETHEINE_MP; MATRIX.
AC   MP00012;
DT   01-NOV-1997 CREATED; 01-NOV-1997 DATA UPDATE; 01-JUN-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphopantetheine attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3; R2=.02281121; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=219; N_SCORE=7.282; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=184; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-80; E1=-80; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-20,-17,-12,-10,-22,-18,2,-13,-1,0,-13,-6,-10,-13,-5,4,1,-23,-9,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-22,-6,9,-13,-21,-9,-11,0,-8,-7,-7,-13,1,1,-4,-3,-8,-24,-10,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-24,11,15,-24,-12,-3,-23,3,-20,-15,6,-9,5,1,4,-2,-19,-29,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-26,4,8,-22,-13,-7,-21,7,-17,-12,0,-13,3,7,-2,-6,-16,-22,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-19,-30,-23,4,-30,-23,26,-25,28,17,-25,-27,-21,-20,-19,-5,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-10,-10,-11,2,-16,-19,-11,-13,-1,-8,-7,-8,-17,-1,3,-5,-6,-9,-26,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-23,4,9,-24,-11,-7,-22,8,-19,-13,2,-11,5,6,2,-2,-17,-26,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-20,-27,-19,-4,-29,-20,20,-19,13,10,-18,-21,-14,-17,-15,-6,14,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-33,-27,8,-29,-26,19,-24,15,9,-28,-27,-23,-21,-22,-10,17,9,4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,-8,-12,-5,-19,-11,-14,-14,-1,-14,-9,-6,-15,-4,-4,2,-2,-6,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-26,15,22,-28,-12,-2,-26,6,-21,-16,4,-8,10,0,2,-6,-23,-28,-16,16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-15,-16,-6,-11,-23,-14,4,-11,0,1,-13,-19,-5,-12,-7,-5,6,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-24,-21,-26,-19,5,-24,-20,10,-23,22,7,-23,-24,-18,-19,-18,-7,6,-7,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-4,-25,-5,-4,-27,24,-12,-29,-6,-25,-16,1,-12,-4,-8,5,-9,-23,-24,-22,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-19,-14,-8,-11,-20,-14,4,-12,0,1,-11,-18,-10,-13,-5,-2,7,-25,-9,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0;
MA   /M: M=-2,-6,-13,-6,-5,-9,-11,-10,-2,-8,0,-2,-7,-7,-7,-8,-5,-3,-1,-18,-8,-7; D=-3;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-3,2,-20,5,1,-18,-9,-8,-14,-6,-12,-10,-1,-1,-3,-8,-1,-3,-12,-24,-13,-2; D=-3;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-18,-6,-3,-16,-7,-12,-11,-7,-9,-7,-7,-4,-6,-8,-1,-3,-8,-22,-14,-5; D=-3;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-25,9,9,-25,-7,-7,-23,1,-20,-14,2,-10,2,-2,2,-4,-17,-28,-16,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-25,4,9,-23,-13,-8,-17,1,-15,-11,-1,-9,3,-1,0,-3,-13,-28,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-17,-21,-20,-5,-27,-22,18,-18,7,6,-16,-21,-18,-19,-8,0,21,-27,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-24,3,-2,-23,6,-10,-23,-8,-20,-15,3,-8,-7,-10,2,-4,-18,-28,-18,-5;
MA   /M: M=0,-8,-23,-9,-6,-15,-17,-15,-3,-10,-5,-4,-8,-8,-8,-11,-4,-3,-2,-25,-12,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-23,18,9,-25,-10,0,-25,-1,-20,-16,9,-12,2,-5,5,0,-19,-31,-13,5;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-22,15,5,-24,-12,-4,-21,-1,-19,-15,5,-12,0,-4,6,3,-14,-31,-14,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-23,6,0,-14,-8,-6,-19,-6,-18,-15,10,-8,-6,-8,3,-2,-17,-28,-13,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-35,-26,52,-29,-19,7,-27,16,5,-21,-28,-31,-19,-20,-9,5,-1,19,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-10,-21,-15,-7,15,-20,-13,-9,-10,-5,-5,-7,-18,-13,-8,-5,-4,-7,-13,3,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,-26,33,20,-31,-10,-3,-31,1,-24,-21,9,-9,5,-5,3,-6,-24,-33,-18,12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-27,-19,8,-27,-16,16,-25,34,15,-25,-27,-17,-17,-23,-8,8,-17,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-19,-29,65,-19,-39,-18,-29,-19,0,-20,-19,-19,0,-19,-29,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-20,-23,-23,-21,-4,7,-19,-2,-22,3,2,-15,-22,-19,-20,-11,-12,-1,-16,-8,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-18,38,-29,52,15,-35,-11,13,-36,-1,-28,-24,19,-12,2,-8,0,-9,-29,-38,-14,8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-29,-20,10,-10,0,-10,39,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-22,6,-31,-21,24,-27,38,19,-27,-27,-19,-20,-25,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-1,1,-19,1,-4,-19,-10,-10,-14,-4,-9,-4,-2,-15,-4,-6,0,0,-9,-27,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,-12,-20,-14,-9,-10,-17,-2,-16,2,1,-12,-17,-12,-17,0,3,2,-23,-12,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-17,-27,-22,0,-26,-21,20,-19,16,16,-22,-23,-18,-18,-12,0,22,-24,-6,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-26,7,21,-26,-17,-1,-23,9,-19,-12,1,-9,14,8,0,-5,-20,-27,-14,17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-31,-23,7,-30,-23,23,-26,29,17,-26,-27,-21,-21,-21,-6,19,-18,-1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-18,-23,-17,-9,-20,-19,7,-10,2,2,-16,-21,-14,-3,-7,-2,13,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=3,-3,-21,-9,-6,-14,-3,-6,-13,-7,-14,-4,2,-15,-4,-8,1,-4,-11,-18,-11,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-24,-5,3,-21,-11,-6,-22,9,-17,-10,-2,-15,6,17,-2,-6,-17,-19,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-32,-23,7,-30,-23,24,-27,29,16,-25,-25,-20,-22,-22,-8,16,-16,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-26,4,19,-25,-12,3,-25,7,-21,-14,5,-11,11,9,2,-5,-22,-27,-14,14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,5,17,-26,-17,-1,-25,13,-20,-12,2,-11,14,14,0,-5,-21,-25,-13,15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-24,3,16,-22,-15,-2,-21,6,-17,-12,1,-11,7,5,0,-5,-17,-25,-12,11;
MA   /I: MD=-20;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-16,-25,-19,26,-25,-11,5,-20,14,5,-17,-23,-20,-15,-14,-1,3,-6,15,-19; D=-5;
MA   /I: I=-8; MI=-20; MD=-25; IM=-20; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-27,5,-6,-29,34,-8,-34,-9,-27,-18,7,-16,-8,-12,1,-14,-27,-25,-23,-7; D=-5;
MA   /I: DM=-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-21,-27,-20,0,-27,-20,17,-18,11,8,-19,-22,-16,-16,-14,-6,15,-18,-2,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-23,5,12,-23,-13,-6,-22,7,-19,-13,2,-11,6,8,2,-1,-17,-28,-15,8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-32,-24,4,-31,-23,27,-26,26,16,-25,-24,-21,-22,-20,-7,21,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-4,0,-26,4,6,-25,-11,-11,-22,-5,-25,-18,0,23,-2,-11,7,3,-21,-32,-21,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-9,-21,-7,-7,-9,-20,-16,0,-13,-1,-1,-12,-10,-12,-16,-7,-5,3,-26,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-22,2,7,-22,-10,-7,-21,4,-19,-13,4,-11,2,3,6,4,-15,-29,-15,4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-22,9,6,-18,-17,-9,-12,-5,-7,-7,-3,-15,-2,-9,-4,-3,-9,-28,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-17,-30,-22,4,-26,-23,20,-23,21,11,-23,-24,-21,-21,-15,-5,20,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-18,-24,-22,-13,29,-23,-12,-5,-18,2,-1,-15,-22,-18,-15,-14,-9,-7,2,15,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,13,-24,18,17,-28,-11,-3,-26,4,-22,-16,7,-10,7,-1,3,-4,-21,-30,-16,11;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-10,-21,-14,-12,-5,-19,14,-6,-13,-6,-1,-5,-21,-6,-11,-8,-8,-9,-12,12,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-30,-6,1,-25,-15,-14,-19,-4,-23,-15,-8,37,-4,-8,-1,-3,-21,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,2,-11,-6,-8,-13,-17,-16,-12,-8,-14,-11,4,-12,-8,-8,19,37,-3,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-21,-29,-22,0,-29,-24,21,-23,16,9,-24,-10,-21,-22,-16,-6,18,-23,-6,-23;
MA   /M: SY='E'; M=3,-1,-21,-2,6,-24,-4,-6,-23,2,-19,-12,0,-13,5,3,3,-5,-17,-25,-16,5;
MA   /M: SY='D'; M=2,11,-23,13,11,-27,-6,-4,-24,0,-20,-16,6,-11,4,-5,4,-5,-19,-29,-18,7;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-21,-30,-21,10,-27,-20,16,-25,28,13,-24,-26,-18,-20,-21,-9,10,-11,1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-13,-11,-20,-13,-14,-9,-19,-3,-12,-7,-6,-11,-15,-11,-17,3,1,3,-20,-14,-12;
MA   /M: SY='D'; M=2,7,-23,10,9,-25,-10,-6,-20,0,-17,-13,2,-11,3,-5,2,-4,-15,-28,-16,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-21,-19,-14,7,-24,2,-2,-12,2,1,-14,-24,-11,-9,-13,-7,-3,-5,17,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-33,-26,5,-32,-25,30,-26,26,17,-25,-26,-22,-22,-19,-6,26,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-21,-1,5,-18,-14,-9,-14,-1,-10,-8,-1,-13,1,-3,-2,-4,-12,-26,-12,2;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00012;
//
ID   EF_HAND_1_MP; MATRIX.
AC   MP00018;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   EF-hand calcium-binding domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9731784; R2=0.0278954; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=237; N_SCORE=11.574; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-16; N_SCORE=5.0; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: B0=-100; B1=-150; E1=-150; MM=*; II=*;
MA   /I: B1=-85; E0=*; BD=-85;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-23,-2,3,-15,-17,-9,-13,-8,-10,-7,-5,-10,-2,-6,-4,-5,-11,-21,-9; M0=-3;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-56; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-22,1,4,-20,-14,-6,-16,-2,-16,-10,0,-6,1,-5,2,-1,-14,-27,-13; M0=-3;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-56; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-26,7,15,-19,-16,-19,7,9,0,4,-8,-11,0,-1,-6,-7,-2,-21,-9; M0=-3;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-56; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=7,-71,12,17,-17,-13,-5,-17,9,-12,-10,-2,-7,9,-3,1,-4,-19,-73,-66; M0=-7;
MA   /I: MM=0; MI=-136; MD=-86; IM=-9; II=-11; DM=-22; DD=-3;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-16,10,11,-10,-13,1,-2,6,-14,-1,-8,-24,5,6,-14,-8,0,-21,-4; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-136; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-1; DD=-40;
MA   /M: SY='L'; M=3,6,-40,-42,12,-30,-27,13,-27,17,3,-29,-26,-28,-30,-12,-15,11,14,2; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-27,9,13,-14,-17,-7,-12,17,-11,2,-3,-30,11,14,-15,-11,-15,-6,-16; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=3,-16,4,16,-3,-22,0,-18,15,-24,-29,6,-67,9,5,-3,-4,-16,-4,-5; M0=-8;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='M'; M=14,3,-32,-28,3,-21,-20,17,-20,5,20,-39,-41,-18,-9,-14,-3,9,-5,-8; M0=-9;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-31,-16,-83,-43,39,-75,-27,7,-73,-1,11,-72,-76,-69,-71,-66,-59,-9,20,2; M0=-39;
MA   /I: MM=0; MI=-86; MD=-147; IM=-2; II=-32; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=1,-17,12,5,-29,-35,4,-20,17,-17,-1,6,-41,11,16,-1,-18,-25,-73,-32; M0=-10;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=2,-10,1,10,-10,-34,6,-4,8,7,10,-6,-67,2,0,-3,-4,2,-72,-13; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-10,-42,-44,27,-36,-1,7,-25,10,13,-25,-75,-23,-30,-15,-27,7,-5,19; M0=-16;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-35,-100,41,-30,-103,-29,-86,-103,-77,-49,-95,-22,-32,-25,-87,-18,-41,-35,-103,-92; M0=-47;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-34,-15,-1,-6,-19,-18,-4,19,-5,-9,-10,-7,4,11,-5,9,3,-22,-33; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-23,-23,33,-10,-74,-21,-29,-72,-6,-71,-62,25,-39,-21,-21,-17,-15,-67,-23,-35; M0=-28;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-11,-7,-2,-9,-37,24,8,-72,14,-35,-9,7,-67,2,6,-4,-22,-28,-73,-17; M0=-15;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-25,-26,31,-13,-74,-25,-26,-72,0,-34,-27,19,-67,-15,-30,12,0,-42,-73,-66; M0=-24;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-34,-25,-19,-30,-74,36,-15,-31,-22,-33,-14,-4,-39,-15,-18,-25,-30,-67,-11,-66; M0=-26;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-61; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-4,-25,0,13,-25,3,-8,14,-8,-6,-8,-67,7,6,-3,8,1,-22,14; M0=-6;
MA   /I: MM=0; MI=-56; MD=-147; IM=-4; II=-22; DM=-11; DD=-9;
MA   /M: SY='I'; M=-30,-75,-104,-99,-18,-100,-91,32,-42,12,2,-97,-97,-92,-95,-92,-78,17,-85,-32; M0=-54;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-2; DD=-30;
MA   /M: SY='D'; M=-43,-10,22,0,-38,-8,-2,-32,-26,-30,-30,5,-9,-11,-20,20,17,-65,-60,-62; M0=-17;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=1,-16,-31,-6,22,-10,-15,-1,5,0,-7,-11,-1,-9,7,-10,-8,1,8,10; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-25,16,20,-22,-10,-4,-28,6,-14,-14,7,-14,9,-12,-3,-6,-22,-60,-12; M0=-7;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-26,-71,13,36,-38,-66,-14,-72,-25,-46,-31,-14,-67,-4,-54,-26,-32,-35,-73,-21; M0=-31;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-29,-23,-83,-77,31,-75,-29,2,-73,18,9,-71,-75,-69,-71,-66,-25,2,12,11; M0=-38;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-2,7,-16,0,-19,-3,2,3,13,2,-1,-6,-41,6,11,-4,-4,4,-21,-15; M0=-3;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-13,10,9,-19,-7,-7,-18,4,-11,2,3,-20,14,3,-1,0,-7,-22,2; M0=-3;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='M'; M=13,9,-33,-43,14,-2,-5,9,-17,7,19,-38,-38,-26,-30,-13,-13,7,7,2; M0=-10;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='M'; M=-4,4,-29,-76,13,-35,-13,9,-44,18,26,-30,-18,-37,-32,-44,-20,9,-12,-2; M0=-17;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-25,-9,5,-17,-7,9,-7,14,-11,-7,-3,-17,7,12,2,6,-5,-73,-8; M0=-4;
MA   /I: MM=-88; MI=0; MD=-147; IM=0; II=-114; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-1,-13,-8,9,-13,-5,6,-3,14,12,-6,-40,-4,-12,-3,0,4,-12,-1; M0=-4;
MA   /I: MM=0; MI=-137; MD=-147; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-3,-5,-11,20,-2,-11,1,0,5,-2,-7,-2,-18,-6,-2,-4,-19,0; M0=-3;
MA   /I: MM=-78; MI=0; MD=-147; IM=0; II=-114; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-10,7,8,-5,-3,12,-13,9,-3,-6,8,5,-1,-2,0,-7,-19,-11,-8; M0=-2;
MA   /I: B0=*; E1=-10;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00018;
//
ID   ACTININ_1_MP; MATRIX.
AC   MP00019;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Actinin-type actin-binding domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7108750; R2=0.0162315; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=179; N_SCORE=8.603; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-8,-10,-4,-15,-17,-14,-3,-13,-4,0,-8,-16,-7,-16,0,-3,-2,-29,-14,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-17,7,17,-21,-10,-10,-25,-3,-18,-18,-4,-10,1,-10,-3,-7,-21,-8,-13,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,5,-24,4,1,-16,-16,-8,-13,5,-13,-9,6,-15,-3,2,-6,-4,-12,-17,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-6,-18,-4,5,-24,-13,-11,-20,5,-16,-11,-7,-6,2,3,-5,-9,-15,-26,-17,2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-26,13,7,-19,-17,4,-19,-3,-16,-10,-1,-7,-3,-9,-5,-9,-13,-29,-10,2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-23,-23,-13,-11,-27,-18,14,-9,6,8,-16,-20,-3,-8,-12,-7,11,-22,-7,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-16,7,15,-16,-9,-2,-17,10,-13,-9,1,-5,6,10,-2,-5,-13,-15,-9,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-24,-3,0,-11,-14,-11,-15,-4,-13,-12,-4,2,-5,-5,-3,-5,-16,-12,-9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-11,-18,-8,-11,0,-20,-14,1,-16,10,0,-12,-22,-14,-10,-8,-3,3,-24,-5,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-18,8,3,-29,-8,-6,-23,-1,-22,-13,3,-10,9,-1,1,-7,-19,-30,-18,5;
MA   /M: SY='A'; M=4,-1,-24,0,-5,-19,-16,-7,-9,-4,-12,-8,-5,-9,-7,-11,-4,-7,-5,-23,-8,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-28,2,27,-24,-19,-9,-19,1,-17,-14,-6,9,6,-4,-1,-4,-19,-27,-19,15;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-10,-35,-8,-2,-19,-5,-4,-28,3,-23,-14,-8,-18,4,8,-14,-17,-27,21,-2,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-26,12,31,-23,-17,-2,-18,6,-15,-10,4,-6,10,-2,-3,-8,-20,-27,-15,20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-26,12,13,-25,-19,-7,-19,9,-19,-13,6,-10,6,4,-1,0,-17,-28,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-21,-15,-8,-24,-16,6,-6,3,6,-15,-22,-8,4,-8,1,12,-24,-8,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,5,29,-38,-20,8,-22,10,-20,-5,0,-8,51,8,0,-10,-30,-22,-12,40;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-28,4,24,-29,-18,-6,-28,29,-24,-12,-1,-8,14,18,-5,-9,-22,-23,-14,19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-31,-4,2,-22,-18,-7,-28,32,-26,-12,4,-16,6,33,-10,-11,-22,-6,-7,3;
MA   /M: SY='T'; M=3,-6,-10,-14,-14,-9,-21,-22,-3,-12,-6,-6,-6,-14,-14,-12,14,38,9,-29,-11,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-13,-12,-10,-11,-21,-18,-9,-5,-10,-8,-3,-13,-9,1,13,36,2,-29,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-16,-7,-4,-21,-9,-8,-23,13,-17,-10,4,-19,-1,19,-6,-8,-17,-25,-15,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=1,-23,3,-32,-24,-6,-27,-23,17,-23,10,13,-20,-23,-18,-24,-13,-8,14,-26,-9,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-17,-1,1,-14,-8,2,-18,-6,-20,-13,11,-14,-1,-6,16,5,-14,-32,-11,0;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-13,-25,-13,-8,-7,-25,35,-6,-15,7,7,-9,-24,2,-7,-16,-13,-10,-21,13,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-22,-20,-18,8,-13,-18,4,-26,26,7,-20,-27,-21,-19,-22,-11,-1,-18,-3,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-16,-3,8,-16,-10,-4,-13,10,-12,-3,-2,-7,8,9,0,-4,-11,-16,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-1,-2,8,-18,-15,-7,-20,17,-17,-9,-3,-10,3,11,-5,-7,-14,-19,-11,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-11,-21,-19,-7,-10,-7,-4,-13,-5,-2,-14,-25,-17,-7,-9,-9,7,-25,-9,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-21,0,-5,-21,-1,-10,-18,-4,-20,-13,9,-14,-2,-4,8,8,-14,-29,-16,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-7,-25,-3,6,-24,-14,-13,-20,3,-24,-15,-6,27,-1,-5,4,0,-19,-27,-20,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-24,-8,1,-13,-19,4,-19,10,-17,-7,-2,-17,4,20,-3,-6,-11,-23,-6,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-23,14,16,-24,-12,6,-25,4,-23,-16,16,-11,6,2,5,-1,-23,-32,-14,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,45,12,-32,-8,11,-32,0,-29,-23,31,-14,4,-5,2,-8,-30,-38,-17,8;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-31,-23,20,-32,-16,20,-27,33,15,-26,-28,-21,-20,-26,-10,9,-10,14,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-7,-26,-7,-1,4,-21,1,-14,1,-11,-7,-9,-18,-1,-4,-9,-9,-14,-2,22,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-17,3,7,-18,-11,-7,-11,-5,-19,-13,12,-15,-2,-7,12,3,-6,-35,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-25,10,-6,-18,5,-8,-18,-13,-7,-11,12,-21,-10,-13,-6,-10,-19,-30,-17,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00019;
//
ID   ACTININ_2_MP; MATRIX.
AC   MP00020;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Actinin-type actin-binding domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3637085; R2=0.0152064; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=631; N_SCORE=14.949; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,17,-22,-22,-8,-26,-17,4,-22,1,-1,-13,-28,-20,-20,-8,-3,11,-34,-12,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,25,-19,13,1,-21,1,0,-21,-3,-26,-18,35,-16,-1,-5,12,6,-23,-36,-19,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-25,-15,-9,-3,-25,-1,-4,3,-2,3,-13,-21,-3,4,-13,-5,-4,-10,15,-8;
MA   /M: SY='A'; M=32,-15,1,-22,-16,-17,-5,-23,-6,-14,-8,-8,-14,-17,-16,-21,4,-2,7,-25,-19,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,35,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-25,14,16,-28,-14,-1,-24,10,-23,-15,14,-11,13,5,3,0,-23,-30,-15,14;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-19,-25,-17,23,-25,-12,4,-22,10,2,-16,-24,-20,-17,-10,-4,4,-13,9,-18;
MA   /M: SY='L'; M=3,-21,-23,-24,-20,-9,2,-22,3,-24,11,3,-16,-22,-18,-22,-13,-11,0,-20,-12,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,0,14,-28,-19,-2,-28,33,-25,-10,0,-11,14,30,-7,-10,-22,-22,-11,13;
MA   /M: SY='N'; M=6,6,-21,4,5,-25,-6,1,-22,0,-21,-13,8,-12,7,-2,8,-2,-18,-28,-15,5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-23,-5,3,-18,-17,5,-12,9,-13,-1,0,-9,8,11,-5,-7,-12,-21,-7,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,0,-24,-2,-2,-24,12,-5,-27,12,-25,-12,6,-13,0,7,-2,-10,-21,-20,-15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-28,-4,-33,-28,19,-31,-23,17,-25,11,8,-24,-29,-28,-22,-16,-7,21,-16,6,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-21,2,7,-24,-11,-4,-24,10,-28,-16,5,-3,4,3,13,5,-17,-32,-15,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,24,-28,41,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-14,-25,-22,-4,-29,-27,22,-18,5,6,-24,-20,-24,-19,-7,3,36,-29,-11,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,17,-22,6,-7,-22,21,-3,-25,-9,-26,-18,32,-19,-7,-8,8,-5,-26,-33,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-28,-37,-29,-1,-37,-27,45,-28,18,19,-18,-21,-19,-28,-18,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,3,-26,3,-7,-28,34,-9,-33,-12,-27,-19,7,-16,-10,-13,3,-12,-25,-26,-24,-9;
MA   /M: SY='G'; M=13,-7,-19,-11,-11,-22,18,-18,-21,-13,-21,-15,-2,-7,-12,-17,11,2,-13,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,6,-24,5,13,-28,-10,3,-24,4,-21,-12,5,-10,14,-1,4,-1,-21,-27,-13,13;
MA   /M: SY='D'; M=-15,42,-28,56,21,-36,-10,0,-36,1,-28,-27,21,-10,2,-8,1,-9,-29,-38,-20,12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,26,19,-23,-23,-21,-27,-22,-9,27,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-14,-21,-20,-5,-20,-19,12,-15,2,2,-12,-24,-19,-17,-5,-2,21,-24,-7,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,28,-37,-9,0,-36,2,-27,-25,13,-8,7,-7,0,-10,-30,-35,-20,18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-29,-9,-16,-29,56,-18,-38,-11,-30,-19,0,-19,-15,-12,0,-17,-28,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-12,29,-23,16,2,-22,-5,8,-23,6,-28,-18,44,-19,4,14,5,-3,-28,-35,-18,2;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-29,-9,3,-22,-19,-3,-17,1,-14,-8,-10,17,1,-3,-8,-9,-18,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-22,-6,-1,-17,-18,2,-20,13,-18,-8,0,-14,2,10,2,7,-13,-23,-3,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,23,-28,44,23,-28,-28,-18,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-15,-16,-23,-20,-5,-28,-25,16,-18,3,3,-11,-18,-17,-18,1,20,19,-27,-7,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-26,-11,-17,-28,56,-19,-35,-18,-27,-19,-1,-18,-17,-19,4,-15,-25,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21,8,-30,-19,22,-28,45,23,-29,-29,-19,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,1,-36,-28,40,-27,22,19,-24,-24,-21,-26,-19,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-36,-46,-36,-27,7,-18,-28,-20,-19,-21,-20,-35,-28,-18,-19,-32,-25,-28,130,25,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-21,-5,4,-24,-19,-4,-13,-1,-13,-4,1,-12,24,0,6,11,-14,-25,-10,14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-26,-36,-26,-1,-32,-21,38,-23,19,30,-20,-20,-14,-24,-19,-10,23,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-20,-25,-20,-10,-5,-25,-12,-3,0,17,6,-16,-24,-6,17,-21,-10,-4,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-29,-13,-5,-9,-17,13,-19,6,-13,-5,-3,-20,1,27,-11,-12,-16,-18,1,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-18,-27,-23,-17,31,-20,6,-10,-17,-5,-3,-11,-26,-14,-12,-15,-12,-13,10,29,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-8,-21,-12,-4,-17,-19,-3,-3,-7,-3,6,-6,-16,12,-6,-2,2,-6,-24,-8,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-33,-25,1,-29,-25,31,-28,25,16,-22,-24,-20,-25,-19,-9,19,-21,-3,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,1,-14,2,12,-17,-8,0,-13,6,-12,-5,1,-4,16,3,3,-2,-13,-14,-8,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-5,13,-24,13,4,-24,-6,5,-20,-3,-20,-10,12,-14,2,-7,2,-5,-19,-31,-13,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-24,-17,-16,-7,-28,-21,17,-17,10,6,-13,-17,-15,-18,-13,-5,13,-26,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-18,-20,-13,-3,-21,-14,9,-18,15,14,-14,-21,-9,-15,-8,1,6,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-23,-3,2,-19,-15,-12,-11,2,-15,-9,-1,-14,-1,-4,1,-1,-7,-23,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-22,12,10,-17,-15,-8,-16,-7,-13,-13,5,-12,-2,-10,3,0,-14,-30,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-11,-23,-12,-5,-9,-20,-10,-2,-8,9,2,-11,-19,-8,-8,-13,-4,-3,-24,-7,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-4,-21,-4,4,-19,-6,-2,-16,-7,-14,-5,-2,-10,1,-6,6,1,-13,-29,-14,2;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-3,-20,1,4,-26,-1,-11,-26,-5,-26,-19,-1,9,-2,-6,8,-2,-22,-31,-22,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00019;
//
ID   KRINGLE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00021;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Kringle domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4219713; R2=0.0111636; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; N_SCORE=11.746; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=187; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,-18,-10,-9,-16,-3,-12,-9,-9,-10,-2,-2,-15,-5,-8,6,3,-5,-27,-14,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-6,-18,-6,-5,-7,-9,1,-13,-6,-11,-7,-4,-2,-4,-3,-1,-2,-12,-13,-4,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-26,-16,-7,-5,-21,-11,-11,5,-8,0,-11,-8,-4,8,-12,-9,-10,-14,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-23,-2,7,-16,-14,-6,-18,-4,-17,-14,-5,2,-2,-10,3,2,-15,-22,-8,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,5,-27,8,5,-29,-11,-7,-20,-3,-25,-16,4,13,6,-9,5,-3,-22,-31,-20,4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-17,-16,-11,-3,-11,-17,-9,-11,-8,-9,-11,-15,-12,-13,0,-1,-3,-2,-6,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-6,-20,-11,-6,3,-17,-11,-6,-11,-3,-5,-4,-14,-8,-11,-5,-4,-7,-17,-3,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-23,1,17,-24,-16,-4,-18,4,-15,-10,1,-10,15,4,2,-2,-18,-23,-14,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-20,-21,-14,0,-16,-10,3,-20,19,6,-19,-18,-13,-15,-18,-9,-2,-4,-1,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-25,-10,-15,-22,33,-16,-25,-11,-20,-13,-1,-20,-14,-8,-1,-12,-16,-22,-22,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-19,-19,-13,-3,-13,-16,6,-16,18,7,-17,-15,-12,-13,-16,-9,1,-17,-6,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-25,-8,-9,-22,30,-14,-22,-14,-14,-10,-4,-16,-7,-14,-4,-14,-19,-19,-19,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-26,4,6,-25,0,-8,-24,3,-22,-15,6,-8,-2,1,-1,-9,-19,-28,-19,1;
MA   /M: SY='H'; M=-15,1,-30,3,12,-24,-20,67,-29,-1,-20,-4,6,-15,15,2,-7,-16,-29,-28,8,10;
MA   /M: SY='N'; M=-1,31,-18,14,-1,-20,0,5,-19,-2,-28,-19,48,-18,-1,-3,12,1,-25,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,36,-19,18,0,-20,0,8,-20,-1,-30,-20,55,-19,0,-1,13,2,-28,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,85,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-29,53,12,-37,5,-3,-39,-4,-30,-28,19,-12,-4,-11,1,-11,-30,-36,-22,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-27,-1,-9,-27,37,-11,-33,-10,-28,-19,11,-18,-9,-10,2,-13,-28,-21,-24,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,26,-26,36,15,-33,-12,-3,-29,1,-24,-21,10,-10,6,-4,2,-6,-22,-34,-18,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-24,-2,9,-22,-8,-8,-17,-1,-18,-11,-2,-3,-1,-4,1,-4,-14,-28,-17,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-15,5,13,-14,-8,5,-14,4,-13,-9,6,-1,6,4,1,-4,-15,-17,-8,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-26,-7,-5,-23,11,-4,-29,10,-23,-12,0,-16,-1,20,-3,-11,-20,-19,-15,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-37,-11,-2,-28,-19,-20,-18,-10,-27,-18,-20,79,-11,-20,-8,-9,-25,-29,-29,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-26,-26,-23,46,-30,9,-1,-17,3,0,-19,-30,-20,-13,-20,-10,-7,20,60,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-14,-24,-23,0,-28,-22,17,-17,4,4,-20,-24,-22,-17,-3,12,28,-23,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=2,-11,-22,-13,-8,-16,-9,-15,-8,-5,-8,-3,-9,-15,-4,-7,-3,-4,-5,-19,-12,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,15,5,-26,-4,-6,-23,4,-23,-16,12,-15,0,1,1,-6,-17,-31,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-25,2,8,-27,-5,-6,-24,1,-23,-15,2,2,5,-3,3,-4,-21,-27,-19,6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-25,2,3,-20,-11,-5,-21,1,-18,-13,5,-5,1,7,2,-2,-19,-28,-14,0;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-18,-1,5,-18,0,-6,-19,14,-17,-8,0,-8,4,9,-2,-6,-14,-14,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-14,-22,-18,6,-23,-17,14,-15,10,7,-18,-20,-16,-11,-11,-3,18,-16,-1,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-1,-25,1,-2,-14,-19,-9,-13,0,-11,-8,-4,-7,-3,-1,-4,-1,-11,-22,-5,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-28,-34,-30,-21,14,-22,-23,-9,-14,-10,-10,-25,-25,-19,-14,-22,-16,-11,60,16,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-29,17,29,-31,-7,-2,-31,7,-23,-17,3,-8,15,4,-1,-9,-28,-28,-18,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-28,-17,-13,16,-26,11,-3,-12,0,-2,-17,-16,-10,-12,-16,-9,-11,9,45,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-9,22,-24,30,8,-28,-9,-3,-27,-1,-24,-17,11,-9,0,-2,6,-3,-20,-35,-18,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,4,-34,-26,35,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00020;
//
ID   EGF_1_MP; MATRIX.
AC   MP00022;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   EGF-like domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6387091; R2=0.0023904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=206; N_SCORE=6.131; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: D=-60; I=-60; B0=-1500; B1=*; E0=-1500; E1=*; MI=-2358; MD=-2462; IM=-89; II=-312; DM=-70; DD=-138;
MA   /I: I=*; I0=*; B1=-846; E0=*; BD=-842;
MA   /M: SY='D'; M=-83,-1504,452,200,-71,-80,50,-78,-73,-70,-97,419,36,-16,-79,14,10,-73,-78,-72;
MA   /M: SY='I'; M=-77,-1560,-47,-78,-70,155,-38,187,-67,147,145,-82,-84,-75,-72,-79,-58,122,-70,-44;
MA   /M: SY='D'; M=-79,-1501,576,101,-72,-74,-34,-70,11,-74,-79,403,56,-13,-5,-40,-70,-74,-70,-75;
MA   /M: SY='E'; M=-74,-1501,76,429,-76,-71,52,-78,-76,-72,-72,-47,173,48,100,0,-71,-75,-70,-74;
MA   /M: SY='C'; M=-560,786,-999,-1030,-990,-749,-398,-974,-972,-1001,-904,-833,-831,-931,-481,-686,-472,-358,-1012,-1008;
MA   /M: SY='S'; M=104,-1543,30,102,-137,-73,-101,-136,-64,-40,-272,4,-92,104,-81,105,23,-71,-273,-653; D=-10;
MA   /I: I=-150,-2050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-539;
MA      MI=-100; MD=-1464; IM=-145; II=-50;
MA   /M: SY='N'; M=-108,-2077,47,-112,-195,34,109,-249,-102,-193,-113,285,-96,63,-53,85,-51,-362,-210,-251;
MA   /M: SY='P'; M=-150,-1593,-100,-75,-124,-257,-106,-116,-193,-68,-105,-158,345,-51,-30,-100,-148,-97,-381,57;
MA   /M: SY='C'; M=-805,588,-1077,-1113,-1071,-870,-1013,-1102,-1094,-572,-1030,-963,-944,-1049,-1047,-442,-852,-981,-1037,-1076;
MA   /M: SY='Q'; M=-20,-1554,-89,-24,-6,-109,188,-136,27,94,27,-122,-189,194,85,-42,-257,-108,-105,-125;
MA   /M: SY='N'; M=-143,-1587,-267,-122,-431,-78,230,-328,-232,-392,-347,381,-73,-183,-145,-120,-280,-259,-705,-91; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-6;
MA      MI=-461; MD=-1448; IM=-206; II=-40; DM=-2; DD=-642;
MA   /M: SY='G'; M=-163,-1582,-3,-180,-174,296,168,-423,-220,-342,-616,150,-156,-32,-38,-153,-287,-472,-725,-155;
MA   /M: SY='G'; M=106,-1568,-352,-398,-703,348,-182,-670,-394,-512,-338,-539,-678,-370,-322,-111,-353,-374,-708,-647;
MA   /M: SY='T'; M=-118,-1505,-281,6,-242,-345,-40,11,9,-99,-138,-61,-250,29,61,18,257,45,-724,-285;
MA   /M: SY='C'; M=-407,586,-860,-481,-933,-761,-873,-977,-899,-468,-905,-806,-453,-416,-892,-701,-724,-856,-966,-467;
MA   /M: SY='I'; M=-203,-1588,-178,-26,-38,-358,120,139,-20,-9,38,-94,-333,75,49,-13,19,130,-81,24;
MA   /M: SY='D'; M=-153,-1560,240,23,-181,-173,18,-213,-287,-207,-57,224,25,51,-212,-53,-123,-36,-316,-33;
MA   /M: SY='T'; M=-106,-1544,-12,-152,-151,83,26,-15,-66,33,-27,4,-233,55,34,7,161,-25,-716,-101;
MA   /M: SY='P'; M=-133,-1507,-25,70,-152,51,-37,81,-53,-42,-103,-56,139,-35,-76,-45,-148,90,81,-104;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-1547,164,48,-143,32,-68,-106,-40,-119,-188,103,-36,83,-23,64,-168,-188,-106,12; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-139;
MA      MI=-158; MD=-183; IM=-191; II=-45; DM=-461; DD=-60;
MA   /M: SY='F'; M=-52,-1509,-89,-6,99,58,-85,31,4,27,-30,-27,-26,-94,-115,49,37,-21,-73,-50;
MA   /M: SY='G'; M=-61,-1541,67,-15,-335,227,9,-153,-152,-239,-278,179,-42,-84,-57,5,-39,-252,-330,-223;
MA   /M: SY='S'; M=-72,-1554,45,-48,-143,161,-13,-283,-100,-299,-11,-1,-178,8,-41,194,45,-220,-184,-272;
MA   /M: SY='Y'; M=-101,-1533,-326,-402,285,-115,19,-167,-232,-278,-313,-171,14,-270,-186,-236,-216,-156,-668,372;
MA   /M: SY='T'; M=-112,-1517,-244,34,2,-324,114,-7,55,-134,-79,-107,-668,99,120,56,139,8,-184,10;
MA   /M: SY='C'; M=-1025,588,-1130,-1168,-1174,-997,-1088,-1251,-1177,-1209,-1179,-1117,-1052,-1156,-1122,-1059,-395,-1171,-1060,-1179;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-1581,60,80,-116,-594,74,43,4,4,-103,-6,-568,106,80,-17,56,28,-232,-182;
MA   /M: SY='C'; M=-994,588,-1126,-1164,-1165,-984,-1081,-1235,-1170,-1200,-1163,-1100,-1041,-1146,-1115,-542,-1035,-1147,-1059,-1170;
MA   /M: SY='P'; M=1,-1044,-30,-90,-216,-273,20,-263,-10,-23,-113,-83,279,69,9,-30,-44,-35,-276,-194; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71;
MA   /M: SY='P'; M=31,-1507,-40,-28,-11,-87,-55,-232,-40,-98,-39,-20,285,-7,-28,-37,-87,-119,-725,-142; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='G'; M=-139,-1506,-91,-139,-285,447,-136,-498,-267,-339,-615,-41,-156,-303,-200,-97,-267,-316,-173,-398;
MA   /I: DD=-199;
MA   /M: SY='Y'; M=-247,-1501,-392,-294,316,-713,-31,-300,-284,-253,-237,-327,-322,-284,-49,-248,-156,-308,280,457;
MA   /M: SY='T'; M=-83,-1503,-29,49,-115,-42,21,-150,-84,-242,-25,-105,-173,38,-57,102,233,-92,-132,34;
MA   /M: SY='G'; M=-268,-1538,-140,-323,-200,471,-564,-604,-424,-214,-281,-392,-250,-438,-452,-384,-570,-399,-673,-410; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-11;
MA      MI=-382; MD=-800; IM=-227; II=-34; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='P'; M=-24,-1542,81,72,-270,-280,-18,-125,102,-81,-219,-101,152,31,116,-7,-18,-58,-163,-306;
MA   /M: SY='H'; M=-260,-1531,-8,-76,24,-241,218,-120,-107,-11,-174,157,-499,51,203,-135,48,-151,-109,67;
MA   /M: SY='C'; M=-463,587,-1006,-1041,-384,-754,-932,-982,-1002,-1008,-910,-839,-439,-944,-960,-469,-713,-848,-1016,-1010;
MA   /M: SY='E'; M=-148,-1507,51,283,-440,-206,4,-207,-187,-132,-210,-47,-339,190,-195,4,-53,-171,-725,-374;
MA   /I: I=*; I0=*; B0=*; E1=-100;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00021;
//
ID   FN2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00023;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fibronectin type-II collagen-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=79;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=74;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5929756; R2=0.0121666; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1214; N_SCORE=19.353; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=157; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-25,-13,-7,2,-22,8,-8,0,-8,-2,-11,-21,-3,0,-9,-6,-8,-2,28,-8;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-19,-7,-3,-16,-15,-3,-10,-4,-14,-6,0,-10,-2,-5,4,3,-6,-27,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-24,4,5,-26,9,-13,-25,-6,-19,-16,-1,-9,-5,-12,2,-8,-18,-27,-21,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-7,-23,-7,-4,-14,-20,-11,-2,-7,-2,3,-7,-11,-5,-4,-7,-6,-2,-27,-11,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-15,-30,-17,-12,-1,-17,3,-15,-9,-14,-9,-13,-18,-3,-7,-9,-4,-18,25,22,-9;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-2,-13,-10,-16,-16,-19,-15,-1,-15,-10,-5,-16,-9,-4,7,19,-3,-29,-14,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-26,-21,-14,-1,-27,-10,5,-9,0,3,-17,-12,-7,-2,-13,-6,3,-13,7,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-9,5,-8,-9,-22,-4,-19,-20,-13,-16,-13,-11,-12,-13,-16,-7,-10,-11,-31,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-25,-11,-9,-20,27,-17,-24,-14,-12,-11,-6,-18,-13,-13,-3,-9,-18,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-3,19,-17,6,0,-18,-9,-3,-17,-1,-22,-15,28,-14,0,-3,13,16,-18,-34,-16,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,1,-15,-1,2,-20,-9,-11,-16,-5,-19,-14,3,-12,-3,-5,16,9,-7,-32,-17,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-25,24,8,-22,-13,14,-25,-4,-21,-17,13,-14,0,-7,2,-3,-22,-28,-3,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-11,-30,-10,-17,-20,49,-12,-33,-17,-24,-17,-3,-21,-17,-17,-3,-18,-27,-12,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=11,-4,-21,-5,14,-23,-13,-10,-19,4,-16,-12,-6,-5,4,2,2,-3,-13,-24,-17,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-34,-11,0,-23,-21,-17,-15,-2,-18,-12,-16,47,-7,-8,-11,-8,-20,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=1,-14,-18,-15,-8,-12,-21,5,-1,-9,-5,2,-12,-20,-9,-7,-5,-4,9,-27,-6,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,72,-30,-20,3,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,2,7,27,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-19,-24,-22,-13,-9,-29,-17,12,-9,9,8,-15,-20,-4,-6,-13,-4,8,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-25,-30,-25,47,-31,-1,4,-20,6,2,-20,-29,-23,-16,-20,-10,-1,17,52,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,0,-26,0,0,-16,-3,-1,-19,-4,-9,-9,4,-19,-4,1,-7,-10,-18,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,2,-5,-28,32,-7,-34,-5,-28,-18,11,-17,-6,-3,0,-14,-29,-25,-23,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-27,-1,8,-28,-19,-1,-25,28,-24,-8,5,-12,19,22,-3,-4,-21,-23,-10,13;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-11,-28,-12,-1,-11,-16,-13,-16,-4,-14,-8,-9,-17,-1,-7,-7,-6,-17,17,-2,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-18,24,-29,26,-3,-12,1,1,-17,-29,-9,-10,-19,-11,-11,18,64,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-10,13,-26,18,15,-24,-15,28,-28,-4,-22,-14,7,-12,6,-6,1,-8,-24,-30,-2,9;
MA   /M: SY='D'; M=-4,12,-22,17,15,-27,-9,-7,-27,3,-24,-19,6,-9,3,-1,10,4,-19,-32,-18,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-16,-20,-17,-7,-26,-23,10,-16,0,0,-8,-14,-14,-16,7,30,12,-27,-7,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-7,-20,-8,-3,-17,-14,-3,-13,-1,-16,-8,0,-15,2,5,10,5,-8,-30,-10,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-26,15,23,-26,-17,-8,-20,3,-16,-15,0,-8,4,-4,-1,-6,-16,-29,-17,13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-6,-10,-29,52,-12,-37,-16,-29,-19,1,-17,-13,-16,2,-16,-29,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-24,0,2,-22,-13,-2,-27,15,-24,-14,6,-16,9,37,6,-1,-19,-28,-14,3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-5,-20,-7,1,-13,-12,3,-14,-3,-12,-6,-1,-10,1,2,1,-2,-11,-23,-8,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-22,21,0,-7,-5,-3,-24,-9,-17,-16,5,-14,-9,-11,-1,-7,-18,-21,-4,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-26,-9,-12,-21,24,-14,-25,-11,-22,-14,-1,-7,-11,-12,-1,-12,-22,-10,-19,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-10,-3,-15,-18,2,-16,14,-14,-1,-2,-16,5,23,-10,-10,-14,-9,-3,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-26,-18,-10,-5,-24,-13,-1,-10,10,3,-19,-2,-10,-8,-16,-8,-6,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-14,-14,-8,-22,7,-18,-16,-11,-18,-14,-5,-6,-9,-18,15,2,-7,-25,-22,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-12,-14,-12,-7,-22,-20,-3,-12,-2,-5,-6,-14,-12,-11,11,36,5,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=1,-10,-22,-10,-3,-17,-14,-4,-14,-10,-15,-10,-6,8,0,-12,6,4,-14,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,37,-22,28,4,-24,-3,6,-25,1,-30,-22,46,-17,1,1,9,-1,-28,-39,-20,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,39,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,71,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,53,26,-37,-9,-1,-37,4,-28,-26,14,-8,4,-6,-1,-10,-29,-36,-20,15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-2,4,-20,-18,2,-23,15,-19,-10,-1,-15,9,21,-4,-4,-18,-19,-2,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,67,19,-39,-10,4,-40,0,-30,-29,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-18,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-30,-1,13,-29,-12,9,-29,18,-23,-9,1,-13,19,24,-6,-12,-26,-23,-10,15;
MA   /M: SY='K'; M=3,-6,-24,-7,5,-22,-16,-12,-19,20,-16,-8,-6,-13,2,15,-6,-7,-11,-21,-13,3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,18,-21,-29,-18,-21,-16,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-26,133,30,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-14,-29,47,-17,-36,-5,-28,-17,-1,-18,-13,-7,-2,-17,-26,-20,-25,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-25,-32,-26,51,-31,-5,5,-22,7,2,-20,-29,-26,-17,-20,-10,-1,15,48,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-30,-14,-2,-18,-22,-17,-10,-8,-6,-7,-18,30,-9,-9,-13,-9,-14,-26,-18,-8;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-12,10,-25,15,14,-22,-18,3,-18,0,-10,-10,1,-11,4,-4,-5,-6,-17,-28,-9,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-27,-4,7,-26,-16,-5,-18,2,-22,-11,-7,21,8,-4,0,-4,-19,-26,-16,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-21,-4,3,-11,1,-10,-19,-5,-15,-9,3,-12,-5,-7,3,3,-15,-23,-12,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-6,1,-21,1,4,-11,-13,-1,-16,1,-17,-12,3,-10,0,-3,5,0,-16,-19,2,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,-8,-12,-9,-7,-7,-9,-4,-5,-8,-10,-6,-6,-2,-6,-9,5,3,-1,-16,-2,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-16,-9,-1,-9,-14,-9,-6,3,1,-1,-9,-8,-3,6,-8,-5,-4,-15,-7,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-2,-15,-3,-4,5,-11,-9,-8,-5,-5,-4,-4,-12,-10,-6,-4,-1,-4,-12,-1,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-23,-6,-10,-18,15,0,-21,-13,-11,-8,-2,-19,-9,-8,-3,-10,-17,-23,-13,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-2,-19,-18,-6,-21,-17,1,-14,-3,0,-11,-16,-17,-11,-7,-4,7,-29,-13,-18;
MA   /M: SY='W'; M=9,-18,-28,-24,-16,-9,-13,-20,-7,-14,-13,-10,-15,-19,-8,-17,-9,-11,-11,34,0,-11;
MA   /M: SY='A'; M=9,-3,-22,-8,0,-18,-15,-12,-4,-2,-9,-2,-2,-12,-3,-10,-2,-6,-5,-24,-13,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-28,-9,-3,-8,-16,26,-21,3,-13,-2,-2,-19,2,3,-12,-14,-19,-19,5,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-26,28,27,-29,-12,0,-29,7,-26,-21,18,-8,8,0,4,-4,-27,-34,-19,17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00022;
//
ID   HEMOPEXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00024;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hemopexin domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7226806; R2=0.0136103; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=8.673; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-26,-21,-15,18,-27,-1,-4,-3,5,2,-17,-26,-11,1,-19,-10,-7,3,32,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-18,-26,-21,48,-24,-6,1,-18,5,0,-16,-24,-24,-13,-15,-8,-1,11,34,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-30,-38,-31,-23,6,-18,-22,-10,-17,-12,-9,-29,-24,-15,-17,-26,-20,-18,92,20,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-26,-9,-3,-14,-11,-3,-21,12,-15,-6,-1,-18,3,32,-8,-8,-17,-11,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-21,-12,-4,-11,-18,-4,-7,-1,-1,-1,-10,-18,-5,5,-10,-5,-2,-23,-7,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-22,-1,-3,-17,-13,-1,-14,-4,-12,-9,3,-16,-3,4,2,0,-10,-30,-11,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-27,-4,-4,-23,2,-10,-23,-4,-23,-15,1,9,-6,-5,2,-4,-21,-28,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-10,-6,-9,1,-8,-23,0,-19,-12,0,-18,-2,6,-2,-9,-20,-12,-6,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-10,-21,-13,-7,-12,-18,-6,-7,1,-7,3,-6,-15,2,9,-4,-2,-5,-20,-4,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-29,-4,-2,-15,-21,-13,-10,-9,-7,-5,-12,17,-7,-8,-11,-9,-13,-26,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-26,6,15,-25,-8,-7,-21,0,-17,-13,-4,9,7,-5,-3,-8,-21,-23,-17,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-19,-8,-7,-17,0,-4,-14,-9,-16,-10,-2,4,-8,-9,1,-2,-10,-23,-14,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-12,5,11,-13,0,-3,-13,-1,-11,-9,3,-5,2,-4,4,-2,-12,-16,-10,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-11,-17,-11,-10,3,-3,-6,-8,-9,-8,-6,-9,-4,-9,-9,-7,-4,-10,11,9,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-32,-20,-10,-9,-24,-21,-3,-17,-5,-5,-22,40,-16,-21,-15,-9,-11,-23,-15,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,-2,-20,-8,-6,1,-15,3,-12,-1,-10,-2,4,-17,-2,3,-5,-5,-12,-16,1,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-19,-23,-14,14,-23,-15,4,-18,17,6,-18,-16,-14,-10,-16,-7,1,-14,2,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-27,-37,-28,1,-36,-28,41,-28,16,16,-18,-19,-19,-28,-16,-5,25,-20,-1,-28;
MA   /M: SY='S'; M=16,1,-14,-3,-3,-21,2,-13,-20,-7,-23,-17,5,-11,-4,-11,22,10,-10,-31,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-23,2,2,-20,-16,5,-18,0,-14,-9,0,-16,4,8,1,-5,-13,-27,-8,1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-12,-20,-16,-13,14,-22,-6,-6,-14,-1,-1,-8,-21,-13,-9,-7,-1,-4,-16,4,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-31,-6,1,-24,-17,-5,-18,-3,-23,-14,-6,41,-3,-4,-7,-8,-23,-28,-20,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-22,-6,-6,-25,22,-8,-26,-10,-23,-14,3,-15,-2,-12,8,-5,-20,-25,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-22,-31,-23,6,-23,-23,21,-28,31,15,-25,-27,-22,-22,-23,-10,15,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=3,7,-14,6,-2,-24,6,-10,-24,-8,-26,-19,11,-12,-5,-10,16,3,-17,-34,-21,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-25,1,-2,-26,5,-5,-26,3,-26,-15,8,-6,-2,-1,2,-4,-22,-27,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-33,-26,6,-33,-25,31,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-29,53,20,-38,-11,2,-35,2,-28,-25,19,-10,9,-6,2,-9,-30,-37,-19,14;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-17,-9,-19,-2,-19,-11,-10,-12,-11,-7,-10,-9,-18,14,6,-1,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,-1,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-24,-28,-24,39,-29,0,5,-18,7,7,-21,-29,-20,-14,-20,-9,1,13,47,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-25,13,35,-26,-13,-4,-26,5,-20,-18,1,-5,10,-4,5,-3,-23,-28,-17,23;
MA   /M: M=-8,-7,-26,-5,-7,-14,-12,-10,-10,-9,-9,-8,-7,-19,-9,-5,-8,-9,-6,-12,-8,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-14,-3,2,-20,-9,-10,-19,-6,-19,-14,-3,6,-1,-10,4,0,-17,-26,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-11,11,0,-21,-1,-2,-20,-6,-16,-12,6,-13,-1,-6,2,-5,-16,-25,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-17,-6,0,-14,-10,-5,-14,5,-14,-8,-2,-7,1,13,2,1,-8,-20,-10,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-26,25,9,-26,-8,5,-29,9,-24,-17,13,-12,2,4,-2,-7,-23,-27,-10,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-23,-7,3,-12,-20,-6,-16,5,-12,-7,-2,-14,5,7,0,4,-13,-23,-7,4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-20,-31,-26,10,-32,-17,25,-23,18,13,-24,-27,-22,-20,-18,-7,24,-16,9,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-22,-31,-23,52,-26,-13,-3,-19,6,-1,-18,-26,-27,-8,-19,-10,-4,14,26,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-16,-24,-18,26,-22,-11,11,-19,15,7,-16,-20,-18,-14,-16,-7,5,-1,17,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-21,-39,-30,65,-31,-22,8,-30,12,3,-21,-29,-37,-21,-20,-10,6,4,24,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-26,-2,7,-26,-18,-7,-24,31,-24,-9,0,-12,12,20,-3,-5,-18,-21,-8,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-31,4,-13,-30,51,-17,-39,-16,-30,-22,2,-18,-16,-18,-2,-18,-30,-17,-26,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-20,5,2,-21,-10,-4,-20,1,-20,-13,14,-14,2,6,10,6,-16,-31,-16,2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-1,-24,-2,9,-30,-14,-3,-23,17,-24,-8,1,-11,25,14,5,-3,-20,-24,-13,17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00023;
//
ID   P_TREFOIL_MP; MATRIX.
AC   MP00025;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   P-type 'Trefoil' domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1972480; R2=0.0076568; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=694; N_SCORE=9.509; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-16,-25,-17,-4,-1,-26,-9,3,-11,8,4,-14,-20,1,-7,-13,-8,-3,-16,3,-2;
MA   /M: SY='P'; M=9,-17,-26,-17,-11,-22,-2,-20,-11,-14,-14,-10,-15,19,-12,-20,-4,-8,-10,-24,-22,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-25,-6,0,-23,-9,5,-22,7,-20,-9,0,-10,5,9,-2,-5,-17,-24,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-24,-14,-4,-14,-15,-15,-9,-10,-4,-5,-12,6,-4,-13,-7,-5,-11,-22,-14,-5;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-21,-1,2,-21,-12,-10,-12,-6,-14,-10,0,-10,1,-7,4,0,-8,-29,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=2,-7,-24,-6,5,-24,-14,-11,-17,-2,-19,-12,-6,13,6,-6,5,1,-17,-28,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-23,6,14,-24,-1,-10,-23,-3,-17,-16,1,-10,-1,-9,4,-1,-17,-28,-19,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-26,-6,9,-24,-21,-3,-15,6,-11,-3,-5,-13,25,8,-3,-3,-17,-18,-9,17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-4,4,-24,8,2,-24,-16,-11,-14,-7,-15,-10,-3,3,0,-12,1,-1,-11,-30,-17,0;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-12,-18,-17,-3,-17,-17,10,-13,-1,6,-14,-14,-15,-14,0,1,18,-25,-9,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-26,-3,5,-21,-15,-13,-14,-5,-17,-13,-8,28,-4,-9,-3,-4,-16,-26,-19,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=4,-19,-24,-17,-9,-18,-19,-21,-3,-10,-10,-7,-19,22,-13,-15,-7,-5,0,-27,-19,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-23,1,-2,-19,-7,-3,-21,2,-22,-14,12,-17,1,4,6,-2,-19,-20,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=0,9,-23,15,13,-26,-3,-7,-23,-5,-21,-17,2,-11,-1,-11,5,-5,-15,-31,-19,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,11,-30,26,-20,-9,1,-20,10,60,-10,-11,-21,-21,-6,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-24,-26,-17,7,-31,-21,18,-19,14,9,-18,-22,-16,-16,-16,-6,13,-19,0,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-13,27,-28,27,6,-29,-8,-1,-26,-3,-30,-23,27,13,-3,-8,2,-6,-30,-37,-23,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=12,-15,-23,-21,-19,-19,20,-21,-8,-18,-10,-3,-9,-17,-16,-21,-3,-11,-6,-20,-19,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-20,-28,-17,-13,3,-23,-7,-6,-13,-12,-8,-18,16,-14,-16,-9,-4,-9,-8,14,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-7,5,-29,13,9,-29,-13,-10,-26,-2,-28,-21,0,28,-2,-8,3,-4,-25,-33,-23,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-29,-3,-1,-30,13,-8,-29,0,-26,-14,-1,-2,3,-2,0,-9,-26,-24,-20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-27,-29,-22,-7,-32,-26,28,-23,5,8,-18,-2,-18,-25,-11,-4,19,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-30,-2,10,-30,-17,-6,-22,8,-23,-10,-5,17,16,4,-3,-8,-24,-25,-17,11;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-26,5,22,-29,-2,-5,-25,3,-20,-12,-1,-8,12,-4,2,-9,-23,-26,-19,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-26,9,18,-29,-19,-3,-16,0,-14,-8,0,-10,20,-4,-1,-5,-19,-26,-13,19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-23,2,13,-23,-14,-4,-19,5,-17,-10,2,-11,9,0,1,-3,-16,-24,-12,11;
MA   /M: SY='Q'; M=0,5,-24,3,15,-28,-11,-2,-21,8,-21,-9,5,-10,18,2,4,-5,-21,-26,-15,17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-26,-12,-1,-19,-19,-6,-19,18,-10,-5,-6,-18,7,34,-10,-9,-14,-20,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-7,-17,-29,60,-15,-38,-16,-30,-19,5,-20,-17,-17,0,-18,-30,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-27,-30,-30,-25,42,-28,-1,-5,-19,-1,-4,-23,-30,-22,-15,-24,-14,-11,45,51,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,23,-24,29,6,-27,-11,-4,-23,-1,-23,-17,15,-14,-2,-3,5,-3,-16,-36,-17,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,6,-24,8,4,-25,-8,-8,-22,-6,-29,-21,10,18,-3,-11,13,2,-22,-36,-23,-1;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-14,-10,1,-13,-15,-14,-17,-6,-15,-13,-5,-13,-3,-6,7,9,-11,-14,-11,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: M=-8,-6,-26,-10,-1,-16,-15,-14,0,-4,-8,-3,-1,-15,-5,-6,-7,-8,-2,-25,-12,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-21,-3,4,-12,-13,-2,-16,1,-15,-9,-1,-1,6,5,-2,-4,-16,-13,-7,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-16,9,2,-17,8,-6,-17,-5,-14,-12,4,-4,-4,-8,1,-6,-14,-18,-13,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-15,-22,-13,-1,-24,-22,13,-16,7,4,-19,-21,-18,-17,-7,-1,21,-24,-8,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-33,-6,-1,-24,-20,-14,-12,-5,-21,-11,-7,40,-6,-11,-8,-8,-18,-29,-21,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-25,-40,-23,-17,-5,-10,-23,-22,-16,-23,-20,-24,-10,-14,-18,-20,-19,-27,76,8,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-19,100,-28,-27,-21,-27,-29,-28,-27,-20,-19,-19,-29,-27,-29,-9,-9,-11,-47,-29,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-22,-24,-27,-20,44,-28,-3,-2,-18,2,-1,-17,-27,-17,-13,-15,-8,-5,10,39,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-21,-15,25,-27,9,-3,-8,0,5,-15,-25,-11,-6,-17,-11,-8,7,41,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-30,-11,-9,-28,18,-19,-25,-11,-26,-16,-9,20,-11,-16,-2,-12,-22,-25,-26,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-23,2,0,-20,-14,0,-12,1,-12,-5,16,-18,9,2,-3,-6,-17,-28,-13,5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-13,-10,-9,-12,-20,-20,-11,-10,-12,-11,-2,1,-10,-11,17,43,-3,-30,-12,-10;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-10,-28,-26,-4,-25,-28,23,-18,6,6,-26,-26,-26,-20,-6,0,41,-28,-12,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00024;
//
ID   CHIT_BIND_I_1_MP; MATRIX.
AC   MP00026;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitin recognition or binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6341972; R2=0.0053084; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=901; N_SCORE=8.412; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=540; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-14,-30,-22,15,-21,-23,9,-21,12,4,-22,-24,-25,-20,-10,-4,16,-15,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='C'; M=1,-15,10,-17,-19,-17,3,-22,-12,-19,-16,-11,-10,-24,-19,-19,6,-1,3,-34,-21,-19;
MA   /M: SY='M'; M=7,-15,-15,-20,-13,-7,-13,-11,3,-15,8,15,-12,-18,-7,-14,0,0,3,-26,-9,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-18,-23,-23,-21,17,5,-10,-14,-18,-8,-8,-12,-23,-21,-18,-9,-11,-11,0,15,-21;
MA   /M: SY='P'; M=6,-13,-27,-9,-2,-26,-11,-18,-18,-10,-26,-18,-11,47,-8,-18,6,-1,-19,-31,-26,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-24,0,11,-24,-3,-12,-26,10,-22,-14,0,-9,1,2,3,5,-19,-25,-16,6;
MA   /M: SY='M'; M=0,-11,-3,-17,-10,-14,-15,-14,-5,-10,-7,2,-8,-16,-7,-11,-2,-2,-2,-28,-14,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=7,-16,-1,-19,-16,-11,-10,-20,-3,-15,-4,-5,-13,-21,-16,-13,2,0,8,-28,-15,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-21,9,0,-18,-9,-8,-19,-6,-19,-15,5,-5,-5,-9,7,3,-14,-29,-13,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=19,2,-17,0,-2,-20,-2,-11,-18,-8,-17,-15,-1,-12,-6,-15,10,1,-10,-23,-12,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-28,-3,16,-27,-18,5,-19,5,-17,-3,-5,-2,21,0,-5,-10,-22,-18,-10,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-27,1,9,-29,-8,1,-23,5,-22,-10,8,-8,22,9,0,-6,-25,-25,-16,15;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-20,107,-30,-29,-19,-29,-30,-26,-29,-18,-18,-20,-38,-29,-29,-9,-9,-6,-47,-28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-18,-30,62,-19,-38,-18,-29,-19,-1,-19,-16,-19,1,-19,-28,-20,-29,-17;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-20,-4,5,-18,-12,-8,-16,7,-17,-10,-2,-5,2,11,3,-2,-11,-23,-13,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-8,-2,7,-25,-17,-2,-18,3,-13,-5,-3,-14,21,5,-4,-8,-18,-22,-12,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-5,-18,-12,-12,-6,-18,-6,-8,-8,-6,-11,-14,-12,-13,2,-2,4,-19,-14,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-24,-7,-10,-24,31,-14,-27,-10,-24,-15,-1,-3,-8,-9,3,-9,-22,-20,-22,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-23,-2,-12,-23,44,-11,-29,-13,-24,-16,9,-16,-13,-13,1,-13,-24,-19,-22,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-17,-7,-2,-18,-5,-9,-16,8,-14,-9,-4,-5,-1,9,0,-5,-10,-16,-13,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-19,-15,-9,-8,-21,-14,-2,-1,3,1,-14,-8,-9,3,-11,-2,2,-20,-8,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-7,-31,-4,-2,-27,-8,-15,-21,-7,-26,-18,-6,43,-7,-15,-1,-5,-24,-29,-25,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-2,10,-22,5,-1,-22,1,-6,-20,-7,-21,-15,16,-8,-1,-8,8,1,-21,-32,-19,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-21,4,-11,-26,31,-9,-29,-12,-27,-19,19,-20,-12,-12,2,-12,-26,-29,-24,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-22,-23,-13,5,-24,-9,5,-13,19,12,-18,-24,-10,-5,-19,-9,0,-13,7,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-26,-4,11,-29,-19,-2,-14,9,-17,-4,-1,-11,27,5,0,-7,-17,-23,-12,18;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-30,-31,-25,40,-20,-6,-10,-22,-4,-6,-21,-28,-25,-17,-22,-16,-13,40,33,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-28,-36,-29,-24,24,-24,-7,-9,-16,-9,-9,-27,-29,-17,-15,-25,-17,-17,74,48,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-18,-4,-6,-15,-10,-12,-11,-7,-12,-10,6,-15,-6,-6,10,13,-8,-31,-13,-6;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-17,-9,-13,-17,12,-19,-21,-13,-18,-14,1,-13,-13,-13,14,24,-11,-27,-17,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-4,5,-26,7,6,-24,-11,-7,-20,-1,-22,-16,4,9,-1,-8,1,-3,-19,-28,-16,2;
MA   /M: SY='D'; M=0,18,-25,24,13,-31,-6,-7,-28,2,-24,-20,7,-4,0,-7,2,-7,-22,-30,-20,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,31,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-20,-2,-10,-28,40,-16,-35,-14,-29,-20,3,-17,-13,-15,8,-10,-25,-27,-26,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=3,-5,-23,-4,-1,-23,-10,-13,-18,2,-20,-12,-5,9,-2,-1,1,-2,-14,-25,-18,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-1,-16,-3,-5,-18,22,-9,-20,-5,-18,-12,4,-11,-7,-7,3,-7,-15,-16,-16,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,99,-25,-25,-20,-25,-27,-28,-27,-22,-20,-15,-35,-25,-27,-2,-5,-10,-48,-28,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-26,-3,12,-33,-19,3,-18,7,-18,-3,0,-11,42,10,3,-2,-22,-23,-11,27;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-6,-5,-4,-17,-7,-11,-18,-8,-24,-16,4,-12,-2,-10,27,19,-9,-34,-14,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-17,-6,-4,-18,6,-7,-13,-4,-12,-5,-3,-12,6,-2,0,-4,-10,-15,-11,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-18,-2,3,-18,-2,-2,-13,0,-14,-6,0,7,12,0,-1,-6,-16,-14,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-12,95,-19,-24,-23,-22,-26,-32,-26,-22,-21,-15,-36,-26,-27,-8,-11,-13,-47,-29,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,1,-27,4,1,-21,-12,2,-25,2,-23,-15,0,-6,-1,4,0,-3,-20,-17,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-21,-3,-7,-24,18,-11,-26,-10,-23,-15,1,-9,-5,-12,4,-7,-22,-25,-18,-6;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-13,-11,-12,-22,12,-18,-21,-14,-23,-16,-3,-4,-13,-17,7,-2,-14,-25,-22,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-15,-3,-9,-16,8,-13,-22,-9,-19,-14,-2,-10,-11,-8,2,-2,-14,-23,-14,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: M=-5,-6,-13,-5,-10,-8,-4,-15,-15,-12,-12,-11,-7,-6,-14,-11,-5,-6,-10,-20,-12,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-24,-9,-7,-24,16,-18,-22,-13,-17,-14,-6,-1,-12,-18,1,-7,-17,-23,-23,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00025;
//
ID   HOMEOBOX_1_MP; MATRIX.
AC   MP00027;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   'Homeobox' domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5336208; R2=0.0155793; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=124; N_SCORE=7.455; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-3,-8,-18,-10,-3,-9,-17,-5,-10,-5,-9,-7,-4,-18,-4,-3,-2,-3,-8,-19,-4,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-20,-23,-28,-22,48,-26,5,-6,-22,1,-2,-12,-25,-25,-15,-16,-11,-8,3,31,-22;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-22,-5,6,-18,-17,-7,-12,3,-8,-4,-5,-14,6,2,-5,-6,-10,-22,-9,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-24,-3,4,-17,-19,-7,-11,5,-10,-5,-2,-14,5,5,-5,-6,-11,-23,-9,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-9,15,-12,8,2,-22,-10,0,-23,1,-24,-16,21,-16,3,-2,3,-1,-23,-25,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-28,-8,3,-27,-17,-7,-19,4,-22,-9,-8,26,9,2,-4,-7,-22,-25,-17,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-25,-15,-13,16,-24,13,-8,-3,-7,-3,-9,-24,-8,-1,-13,-7,-12,8,43,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-34,-15,-5,-20,-22,-20,-8,-14,-11,-10,-21,58,-12,-20,-14,-9,-18,-27,-22,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=-2,15,-16,15,2,-22,-6,-8,-22,-6,-24,-19,15,-11,-2,-8,20,16,-15,-35,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-7,-22,-6,3,-18,-17,-7,-12,3,-14,-8,-5,-10,0,2,0,-2,-7,-27,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-17,1,9,-22,-13,-7,-22,2,-19,-13,-2,-7,5,-3,0,-6,-18,-26,-14,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-22,5,15,-21,-18,-6,-17,2,-12,-7,-2,-11,6,0,-1,0,-14,-28,-13,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-14,-4,-16,-24,-9,-11,17,-9,0,-7,-18,4,28,-13,-10,-9,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-25,-2,15,-22,-19,-3,-16,5,-12,-7,-4,-12,10,8,-2,-5,-14,-26,-13,11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-24,0,11,-19,-14,1,-20,4,-14,-7,-2,-14,8,6,-3,-8,-18,-23,-8,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-23,6,-32,-23,29,-29,38,20,-27,-27,-21,-22,-26,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-11,-15,-8,-18,-2,-17,-11,-10,-14,-11,-5,-12,-8,-16,17,6,-1,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-25,0,10,-22,-17,-2,-16,6,-13,-7,0,-13,9,4,-3,-6,-15,-25,-11,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-25,-4,9,-23,-15,-6,-17,10,-15,-6,-4,-12,11,7,-3,-7,-14,-23,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-3,-24,-18,-4,-27,-21,8,-22,14,6,-17,-23,-15,-18,-9,7,8,-27,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-26,5,-3,-26,21,0,-30,-6,-26,-17,15,-17,-3,-6,3,-10,-27,-27,-19,-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-22,6,-29,-18,24,-25,38,26,-27,-27,-18,-19,-25,-9,16,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-17,0,3,-22,-13,-10,-20,-2,-21,-15,1,-1,0,-5,13,15,-14,-31,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-28,1,14,-21,-21,-10,-18,6,-14,-11,-7,4,2,0,-6,-5,-16,-25,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-22,-3,2,-20,-17,-9,-17,9,-15,-10,0,-13,0,15,-2,-3,-12,-27,-13,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-23,-8,3,-25,-20,-3,-11,5,-14,-2,-4,-15,24,10,0,-2,-10,-24,-11,13;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-24,14,14,-27,-27,-26,-23,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-26,-3,6,-24,-17,0,-21,15,-21,-9,5,-14,19,21,2,-2,-20,-23,-8,11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-5,-18,-14,-18,-7,-22,-16,13,-13,-3,0,3,-23,-16,-13,-4,1,14,-30,-11,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-19,-39,-30,74,-30,-19,1,-29,9,0,-20,-30,-39,-20,-19,-10,2,8,29,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-6,-10,-9,2,-27,-17,-3,-15,0,-17,-5,-4,-15,18,-3,-1,-6,-16,-26,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,19,0,-20,-1,11,-20,0,-30,-20,58,-20,0,0,10,0,-30,-40,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-7,1,-21,-18,3,-25,20,-20,-9,0,-16,10,37,-3,-5,-17,-22,-8,3;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-28,-10,-1,-20,-18,-1,-30,28,-20,-10,0,-20,9,66,-10,-10,-20,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-9,-19,-14,-4,-19,-15,-8,-11,3,-12,-1,-7,-15,6,3,-1,-2,-8,-18,-9,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-28,-4,7,-25,-19,-6,-28,35,-24,-10,0,-14,9,41,-7,-8,-19,-21,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-8,-22,-8,4,-12,-17,-6,-13,-8,-10,-7,-8,-16,-1,-10,-7,-9,-14,-5,-3,2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-30,-8,2,-23,-19,-9,-26,33,-24,-10,-3,-15,6,35,-11,-11,-19,-9,-8,3;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-26,-6,-1,-17,-12,-2,-24,17,-21,-9,1,-16,3,23,-5,-7,-17,-21,-8,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-25,-8,1,-19,-16,-2,-12,0,-13,-3,-4,-8,7,0,-3,-6,-13,-22,-10,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-20,-4,1,-20,-11,-2,-15,-1,-15,-5,2,-12,6,-2,2,-1,-14,-26,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-24,-8,-1,-15,-15,-9,-15,4,-14,-7,-3,-7,0,4,-4,-5,-13,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-6,0,-18,-12,-7,-14,-1,-12,-6,-3,-11,0,1,-2,-5,-12,-26,-12,-1;
MA   /M: M=0,-5,-21,-7,-4,-17,-7,-7,-14,-3,-12,-5,-3,-15,-2,-4,0,-3,-10,-24,-11,-4;
MA   /M: M=-5,-4,-25,-5,-1,-17,-9,-7,-15,-3,-13,-5,-3,-12,-1,-4,-4,-6,-14,-17,-11,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,0,-23,1,0,-15,-13,-6,-13,-6,-13,-10,0,-11,-4,-7,0,-1,-11,-24,-7,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-24,-3,4,-20,-11,-6,-17,-1,-15,-10,0,-7,2,0,2,-1,-15,-27,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-19,-7,-4,-14,-11,-5,-12,-8,-9,-5,-4,-14,-3,-7,1,-1,-9,-23,-8,-4;
MA   /M: M=-5,-2,-21,-5,-4,-15,-11,-8,-10,-6,-7,-4,0,-15,-4,-6,-3,-5,-10,-26,-11,-4;
MA   /M: M=-3,-4,-24,-5,-1,-17,-10,-10,-14,-6,-13,-10,-1,-2,-4,-7,0,-4,-14,-26,-15,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-2,-24,-3,1,-21,-5,-6,-20,-1,-19,-11,1,-4,2,-3,2,-4,-18,-25,-14,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-22,-3,1,-19,-10,-5,-17,-3,-16,-9,-1,-8,2,-3,0,-5,-15,-26,-12,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00027;
//
ID   ZINC_FINGER_C2H2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00028;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger C2H2 type domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.6689; R2=0.02078310; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=432; N_SCORE=8.305; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=344; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-24,-25,-21,39,-28,10,-2,-17,2,0,-17,-28,-19,-13,-18,-10,-7,12,48,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-23,-5,6,-20,-18,-9,-14,7,-15,-7,-5,-9,3,2,-2,-2,-9,-25,-12,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,3,6,-22,-11,-6,-20,1,-21,-14,4,-1,1,-3,5,2,-18,-29,-15,3;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-26,1,14,-18,-17,-4,-13,-1,-11,-8,-5,-12,4,-5,-5,-8,-12,-24,-9,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,119,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-28,-1,-7,-28,36,-11,-33,-11,-27,-18,4,-15,-10,-12,1,-13,-27,-24,-23,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-3,8,-25,-19,-7,-26,36,-24,-8,-1,-12,10,27,-9,-9,-18,-19,-8,8;
MA   /M: SY='A'; M=8,-7,-9,-11,-7,-17,-7,-14,-16,-6,-16,-11,-4,-15,-6,-5,8,4,-7,-27,-15,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-19,-37,-28,71,-29,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-19,-9,-1,9,31,-28;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-17,-9,-6,-16,-11,-10,-14,-3,-16,-10,0,-12,-4,0,8,7,-8,-27,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-20,-4,0,-18,-17,2,-19,3,-16,-8,0,-17,8,9,-1,-3,-17,-19,-5,3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-22,-6,0,-19,-13,-5,-18,7,-18,-9,1,-10,2,8,2,-2,-14,-25,-11,0;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-16,-1,-1,-18,-4,-6,-19,-7,-22,-14,4,-12,-2,-7,16,7,-13,-29,-12,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-20,1,0,-18,-10,8,-18,-5,-18,-11,9,-16,1,-4,4,-1,-17,-27,-7,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-30,-20,12,-29,-19,17,-27,43,18,-28,-29,-20,-18,-28,-10,9,-18,2,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-22,-10,-4,-15,-20,-8,-7,2,-9,-3,-2,-16,0,3,-3,0,-6,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-7,0,-19,-17,-7,-14,7,-13,-6,-2,-16,4,12,-3,-3,-10,-24,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,99,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-25,-12,1,-16,-22,-2,-6,1,-3,6,-9,-17,13,3,-9,-8,-9,-19,-4,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-9,0,-19,-19,-4,-21,20,-16,-6,-2,-17,6,35,-8,-7,-14,-21,-9,0;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-21,-17,-6,-25,-20,11,-15,2,3,-12,-18,-14,-14,-2,9,13,-25,-7,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,97,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-13,-8,-6,-14,-15,-15,-12,-7,-13,-9,0,-12,-6,-8,14,25,-5,-29,-12,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-27,-4,-8,-27,34,-14,-32,-9,-25,-16,2,-15,-10,-9,0,-13,-24,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-27,12,33,-26,-17,-3,-24,7,-18,-15,-1,-6,12,0,-2,-8,-22,-28,-16,22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-28,-2,6,-25,-17,-6,-27,32,-25,-10,1,-11,8,28,-7,-8,-19,-22,-11,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-32,-9,-1,-24,-17,-15,-18,-7,-23,-15,-13,51,-7,-13,-6,-6,-23,-28,-22,-7;
MA   /I: E1=0;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00028;
//
ID   NUCLEAR_REC_DBD_1_MP; MATRIX.
AC   MP00031;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nuclear hormones receptors DNA-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8043518; R2=0.0074413; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=836; N_SCORE=10.023; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=363; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-8,-22,-9,-4,-13,-15,-9,-7,-7,-8,4,-7,-6,-3,-8,0,-2,-7,-24,-10,-4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-18,-6,-4,-14,-6,-6,-11,-5,-13,-7,-2,-4,-3,-5,3,0,-9,-21,-10,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-5,-21,-4,0,-15,-10,-10,-10,-4,-13,-7,-3,6,-3,-7,0,-3,-10,-22,-13,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-6,-6,-21,-5,-6,-11,-7,-6,-12,-6,-12,-7,-3,-3,-5,-6,-1,-4,-12,-17,-6,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-21,-6,-1,-15,-4,-11,-14,-5,-11,-8,-5,-3,-4,-9,-1,-3,-12,-19,-12,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-9,-19,-12,-8,-11,-12,-11,-1,-9,-6,1,-6,-10,-4,-10,0,0,-1,-22,-8,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-5,-22,-5,-3,-13,-14,-11,-10,-5,-11,-6,-3,-2,-5,-5,0,1,-10,-23,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-8,-19,-9,-4,-9,-11,-10,-11,-8,-13,-7,-4,-2,-5,-8,2,2,-11,-22,-8,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-4,-19,-2,0,-18,-11,-8,-17,1,-17,-9,-3,-4,0,0,3,-1,-13,-24,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-5,-7,-22,-9,-3,-12,-14,-10,-9,-3,-8,-4,-4,-11,-2,-2,-3,-2,-8,-22,-9,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-5,-8,-23,-8,-6,-10,-15,-10,-8,-8,-7,-5,-7,-5,-7,-10,-3,-1,-8,-22,-5,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-17,-9,-5,-15,-14,-14,-10,-8,-11,-7,-7,2,-8,-11,-1,-1,-8,-27,-15,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,3,-26,4,2,-20,-8,-5,-20,-6,-20,-13,4,2,-1,-8,1,-4,-20,-29,-15,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-24,-6,1,-19,-9,-10,-16,2,-16,-8,-2,-9,1,0,0,-3,-13,-26,-14,0;
MA   /M: M=-8,-12,-25,-13,-7,-12,-23,-15,-1,-7,-3,-1,-11,0,-7,-9,-8,-1,-3,-25,-9,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=2,-12,-22,-13,-2,-16,-16,-9,-9,-1,-4,-1,-10,-10,0,-1,-5,-5,-7,-23,-11,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-30,0,-32,-30,35,-23,12,12,-26,-27,-27,-23,-12,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-22,-1,-2,-24,24,-6,-31,-9,-25,-17,5,-16,-6,-7,4,-10,-24,-26,-20,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-27,33,17,-30,-13,0,-29,1,-24,-20,11,-8,7,-6,1,-7,-24,-32,-16,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-26,-3,4,-21,-17,-6,-19,7,-20,-11,-2,4,0,4,-2,-3,-16,-26,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-10,-14,-9,-20,3,-16,-14,-11,-16,-12,-4,-12,-9,-16,13,3,-5,-26,-19,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-17,-2,-5,-13,-10,-1,-14,-10,-17,-11,7,-15,-6,-10,12,9,-9,-30,-10,-6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-22,-8,-14,-28,45,-15,-34,-14,-28,-18,1,-18,-14,-15,4,-12,-25,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-13,-16,-17,-12,3,-24,-3,-7,-3,-3,-1,-10,-21,-7,-1,-14,-8,-9,-10,14,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,4,-29,2,0,-19,-18,89,-28,-9,-21,-2,15,-20,9,0,-8,-18,-30,-30,17,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-29,-4,-12,-29,53,-15,-37,-15,-29,-20,5,-18,-14,-15,2,-16,-29,-23,-28,-13;
MA   /M: SY='V'; M=16,-20,-11,-25,-21,-10,-12,-25,10,-18,0,1,-18,-21,-20,-21,-3,-2,20,-25,-14,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-23,-23,-14,2,-27,-16,10,-16,12,7,-18,-16,-13,-12,-15,-7,7,-18,0,-15;
MA   /M: SY='T'; M=14,-4,-7,-10,-8,-16,-9,-17,-13,-11,-17,-13,0,-11,-8,-13,23,26,-2,-32,-16,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,5,-26,5,10,-21,-6,-2,-25,7,-20,-14,8,-15,3,13,-1,-8,-22,-26,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=22,-8,-18,-12,-12,-24,27,-18,-24,-14,-22,-16,-2,-14,-12,-18,12,-3,-14,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=15,-3,-20,-8,1,-25,-10,-14,-21,21,-22,-11,-2,-10,1,7,2,-3,-11,-22,-15,1;
MA   /M: SY='A'; M=20,-11,-14,-16,-14,-19,13,-19,-15,-14,-14,-9,-7,-15,-13,-18,7,0,-5,-24,-20,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-30,-8,1,-22,-17,-4,-30,31,-22,-10,-1,-18,8,55,-10,-10,-20,-17,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=14,-2,-10,-10,-8,-14,-10,-16,-13,-9,-16,-12,1,-12,-8,-11,19,23,-3,-29,-15,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-17,-28,-24,-3,-24,-22,20,-20,8,7,-21,-22,-21,-21,-9,-1,26,-23,-6,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-5,-21,-8,0,-17,-15,-9,-10,-1,-12,-6,-1,-16,3,1,2,0,-8,-23,-12,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-7,0,-22,-3,-2,-18,-5,-8,-18,2,-13,-8,4,-17,-2,4,-3,-4,-16,-22,-13,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,10,-24,5,2,-22,-6,1,-23,11,-24,-13,17,-16,3,10,1,-6,-22,-25,-12,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-22,-9,-3,-12,-16,-3,-11,7,-8,-3,-4,-15,4,14,-7,-6,-10,-12,-3,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-23,0,6,-19,-17,-3,-19,10,-18,-10,3,-14,7,8,-1,-2,-16,-25,-10,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-27,-21,-18,24,-28,5,0,-10,1,0,-17,-25,-14,-9,-18,-9,-6,10,45,-19;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-20,-11,-4,-10,-18,-12,-6,-3,-5,-3,-10,-13,-4,-3,-4,1,-2,-22,-7,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,114,-28,-29,-20,-29,-29,-30,-28,-20,-20,-18,-39,-29,-28,-10,-10,-11,-49,-29,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-26,-10,-1,-19,-19,-11,-15,11,-15,-7,-7,-5,2,11,-6,-4,-11,-21,-11,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-3,-21,-7,-6,-6,-7,-5,-19,-1,-17,-11,1,-18,-8,0,-1,-5,-14,-18,-3,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-23,10,3,-26,8,-3,-26,-2,-24,-16,16,-16,0,-2,3,-6,-23,-30,-19,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-25,6,1,-26,7,-4,-27,5,-26,-15,16,-14,2,4,3,-7,-24,-28,-19,1;
MA   /M: SY='N'; M=1,17,-14,9,0,-20,0,-1,-20,-6,-30,-20,32,-14,0,-6,27,11,-19,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00031;
//
ID   ANTENNAPEDIA_MP; MATRIX.
AC   MP00032;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   'Homeobox' antennapedia-type protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7708423; R2=0.0079293; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=752; N_SCORE=6.732; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=723; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-25; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=23,-72,-30,-11,-76,33,-63,-53,18,-36,-65,-1,43,9,-43,34,11,-33,-78,-70;
MA   /M: SY='E'; M=21,-72,0,41,-51,-14,-61,-31,-17,-19,-16,-25,30,28,-32,35,11,-40,-79,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-76,14,33,-53,14,-1,-55,19,-36,-64,5,15,52,-1,12,-22,-28,-79,-66;
MA   /M: SY='P'; M=7,-14,-7,-42,-36,12,23,-69,-31,-71,-34,10,43,31,29,30,10,-16,-79,-40;
MA   /M: SY='P'; M=7,-34,32,11,-75,17,-1,-72,-44,-51,-67,5,50,9,-63,30,26,-43,-80,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-41,3,-48,-9,46,-66,-45,1,-15,22,62,3,-46,37,2,-42,-80,-40;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-71,-2,-25,-68,22,28,-60,-47,13,-31,-16,33,-13,-48,43,23,-9,-81,-65;
MA   /M: SY='N'; M=-14,-72,-12,-1,-70,-5,9,-37,-43,1,-31,42,33,37,-45,30,26,-14,-82,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=33,-72,27,5,-78,-37,17,-72,-41,-51,-35,19,30,60,-58,36,-2,-68,-81,-67;
MA   /M: SY='P'; M=28,-73,9,-15,-77,-13,-60,-53,10,-43,-64,22,52,37,-8,30,-13,-34,-80,-69;
MA   /M: SY='K'; M=19,19,-20,20,-77,12,-62,-74,40,-61,-36,-36,30,-10,-20,36,21,-67,-79,-70;
MA   /M: SY='S'; M=12,0,-44,-42,-68,-24,-61,-15,32,-11,-15,-16,9,40,-40,49,-2,-18,-75,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-35,-18,18,-77,-31,-30,-70,-53,-36,-34,40,64,54,-43,32,23,-54,-81,-69;
MA   /M: SY='P'; M=6,-76,-66,-58,17,-53,-3,-1,25,-39,-32,-61,83,-39,-45,14,17,-31,-73,-39;
MA   /M: SY='Q'; M=-49,-80,-64,-49,-73,-72,-13,-19,-37,-21,-54,-60,57,92,27,-57,-23,31,-77,-64;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-73,-76,14,-16,-86,-77,79,-72,-6,42,-74,-73,-68,-75,-70,-57,51,-76,-57;
MA   /M: SY='Y'; M=-73,-78,-75,-76,76,-79,-44,-54,-69,-49,-50,-73,-84,-68,-66,-69,-66,-59,-31,118;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='R'; M=-34,-79,-58,-44,-78,-71,-55,-78,75,-75,-63,-51,-68,51,77,-56,-10,-74,-74,-64;
MA   /M: SY='K'; M=-49,-78,-51,51,-78,-69,-57,-35,67,-75,-36,-37,36,-42,42,20,-56,-72,-76,-68;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-33,-68,-61,-60,-54,16,13,14,14,66,-60,-70,31,-59,41,-29,23,-78,-59;
MA   /M: SY='H'; M=8,-76,-39,-55,-35,24,106,-81,16,-73,-62,45,-70,-50,34,-53,-61,-77,-85,-53;
MA   /M: SY='Q'; M=27,-70,-66,-34,-67,-41,-66,23,-60,-40,7,-41,29,49,-64,37,-7,36,-79,-65;
MA   /M: SY='S'; M=-2,50,24,-42,-76,-3,34,-75,-25,-76,-69,56,-10,-54,-62,59,15,-69,-88,-67;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-14,-57,-56,-73,-1,66,-43,17,-71,-63,11,-29,-20,46,30,49,-67,-83,-61;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-75,26,5,-73,16,-62,-46,63,-56,-62,-53,-68,-20,31,-19,-42,35,-79,-66;
MA   /M: SY='N'; M=-31,-34,-28,-23,-72,-25,-54,-64,-46,-33,26,63,-30,43,47,21,21,-6,-82,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-75,-22,-44,-35,41,-15,-18,26,-49,-34,-38,52,-36,14,25,-3,-20,-76,-42;
MA   /M: SY='N'; M=-38,-73,-29,-60,-13,45,-55,-72,-10,-25,-63,54,-71,-12,45,9,10,-70,-71,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-47,-15,-61,-56,-60,33,-27,-73,-6,-59,-62,-8,38,58,11,27,-32,-72,-62,65;
MA   /M: SY='T'; M=4,-13,5,-24,-74,-13,-60,-53,-55,-60,-65,32,41,9,-10,39,59,-64,-83,-42;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-35,9,-2,-43,51,9,-56,-26,-72,-65,-15,-3,-23,-17,25,6,-70,-65,58;
MA   /M: SY='G'; M=-13,-72,-61,-45,-70,50,-61,-33,2,-60,-65,-51,-18,-4,31,42,39,-66,-74,9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00032;
//
ID   ENGRAILED_MP; MATRIX.
AC   MP00033;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   'Homeobox' engrailed-type protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6979041; R2=0.0136152; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1008; N_SCORE=18.412; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-26,-35,-26,0,-36,-27,38,-27,20,16,-18,-20,-19,-26,-16,-2,23,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='N'; M=1,1,-19,-7,-3,-12,-14,-8,-7,-7,-13,-7,7,-16,2,-9,5,1,-8,-26,-11,0;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-6,-29,42,-28,-9,0,-11,17,31,-9,-10,-21,-20,-10,13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=0,-12,-6,-12,-10,-24,-2,-20,-23,-14,-24,-18,-10,20,-13,-19,3,1,-18,-32,-25,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,7,-30,-21,24,-27,39,22,-28,-28,-20,-20,-25,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,9,-29,-20,60,-26,-1,-20,0,6,-16,32,4,-6,-16,-30,-26,7,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,3,26,-39,-20,9,-21,10,-20,-3,0,-9,54,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-4,-2,-19,-2,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-11,34,19,-8,-36,-19,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-10,-13,-13,-9,-21,-21,-4,-11,-7,-7,-4,-13,-13,-11,16,43,7,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-15,-15,-20,-17,-7,-26,-22,7,-10,-1,0,-12,-19,-15,-5,1,18,17,-27,-9,-17;
MA   /M: SY='P'; M=3,-11,-19,-12,-8,-17,-16,-20,-9,-11,-17,-12,-9,18,-11,-15,9,16,-4,-31,-19,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-24,-14,-4,-13,-25,-15,-5,9,0,1,-11,-18,-4,10,-13,-5,-1,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-22,16,17,-27,-14,-5,-24,0,-22,-16,6,-8,12,-4,12,10,-19,-32,-16,15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,24,-30,35,14,-35,1,-5,-37,8,-29,-23,10,-11,1,0,-2,-12,-28,-31,-19,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-30,10,21,-27,-22,-8,-20,20,-20,-11,0,-8,8,7,-7,-10,-17,-26,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-23,17,38,-27,-13,-3,-27,3,-24,-21,5,-4,12,-4,13,0,-23,-34,-20,25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='D'; M=-4,17,-21,22,21,-27,-8,-3,-27,-1,-27,-22,13,-8,6,-6,18,3,-22,-37,-20,13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-21,22,35,-22,-12,0,-22,5,-16,-16,3,-2,10,-2,0,-7,-21,-22,-14,23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-17,-24,-17,5,-24,-17,22,-22,28,14,-19,-19,-14,-17,-19,-7,12,-14,0,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,17,48,-30,-18,3,-27,9,-21,-17,7,-4,23,1,1,-9,-30,-30,-19,35;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00033;
//
ID   PAIRED_1_MP; MATRIX.
AC   MP00034;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Paired domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9917912; R2=0.0119526; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1609; N_SCORE=23.214; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=210; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-25,21,9,-19,-15,-4,-16,-7,-5,-11,11,-17,-3,-9,-7,-8,-18,-32,-14,3;
MA   /M: SY='B'; M=-9,16,4,16,-4,-23,-13,-9,-20,-10,-22,-18,14,-21,-10,-13,5,-2,-12,-40,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-15,-24,-21,-4,-28,-26,17,-18,4,4,-14,-19,-19,-18,1,20,23,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-9,-28,-9,7,-25,-22,1,-12,4,-3,3,-7,-16,32,13,-9,-10,-19,-20,-8,19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,10,-30,-20,-1,-27,32,-24,-7,0,-13,25,37,-7,-10,-23,-20,-10,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-15,19,-30,29,32,-33,-17,2,-32,10,-23,-19,7,-8,18,8,-1,-10,-29,-30,-17,25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=3,-17,-21,-20,-15,-9,-22,12,4,-18,5,6,-12,-21,-10,-16,-10,-9,5,-24,0,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,7,2,10,3,-28,-14,-6,-28,-2,-25,-18,4,-17,6,2,8,-2,-19,-36,-19,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=2,-24,-18,-31,-24,-3,-25,-20,26,-18,13,25,-22,-22,-16,-19,-13,-5,26,-23,-6,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-25,46,8,-31,-15,-7,-23,-5,-21,-21,8,-15,-7,-12,-2,-8,-11,-38,-18,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-8,-27,-11,3,-26,-22,-4,0,-4,-10,2,-4,-13,28,-4,1,-5,-10,-23,-9,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-28,-9,2,-21,-22,-5,-20,23,-11,-3,-5,-17,12,34,-12,-10,-16,-20,-8,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-16,18,-26,9,0,-20,-11,60,-26,-6,-24,-9,32,-20,6,0,-1,-11,-30,-34,2,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,4,-24,-3,-14,-24,38,-13,-30,-14,-27,-18,14,-18,-14,-14,6,-3,-25,-26,-24,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,39,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,71,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-30,-15,-11,13,-28,18,-5,-5,-5,0,-15,-25,7,-5,-15,-10,-15,18,59,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-13,4,-30,11,42,-27,-20,0,-30,16,-20,-17,0,-6,17,21,-3,-10,-27,-27,-17,28;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,-10,-9,-9,-14,-9,-16,-5,-13,-18,-11,-2,-16,-9,-13,25,14,8,-37,-17,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-1,18,-23,-20,0,-30,24,-20,-13,0,-14,13,49,-7,-10,-23,-23,-13,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00034;
//
ID   POU_1_MP; MATRIX.
AC   MP00035;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   POU-specific (POUs) domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1214414; R2=0.0149801; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=746; N_SCORE=16.287; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=6,-16,-23,-19,-13,-15,-12,-22,0,-17,-7,-5,-12,7,-13,-20,-1,2,-2,-25,-16,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-24,15,3,-20,-19,-10,-8,-10,-10,-10,8,-14,-5,-13,-1,1,-9,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-24,-17,-7,-13,-22,-12,2,-13,4,7,-14,-2,3,-12,-7,-3,-5,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,10,-29,13,19,-28,-17,-2,-30,24,-25,-16,9,-11,10,25,-4,-9,-25,-27,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-30,25,47,-33,-18,2,-30,8,-22,-18,3,-3,23,0,0,-10,-30,-30,-18,35;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,24,-27,43,25,-28,-28,-17,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-30,15,49,-30,-20,1,-29,12,-20,-17,0,-3,22,9,-1,-10,-29,-28,-18,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,0,-25,-1,15,-30,-18,4,-20,7,-18,-6,-1,-9,29,4,3,0,-21,-23,-11,22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,65,-30,-20,4,-30,19,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,5,-29,4,17,-30,-18,-4,-28,34,-27,-11,5,-10,16,23,-6,-9,-24,-23,-12,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-24,5,19,-21,-18,13,-19,-1,-13,-7,6,-11,10,-3,0,0,-20,-29,-9,14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,56,-30,-20,7,-30,24,7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-28,-7,7,-29,-23,5,-9,6,-14,2,-5,-14,34,4,-5,-10,-15,-21,-7,20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-2,-29,35,-23,-9,0,-15,15,50,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27,2,-35,-24,40,-27,26,25,-22,-22,-17,-25,-22,-10,23,-20,0,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-21,-3,3,-23,-16,-13,-23,22,-25,-12,2,-10,3,11,8,12,-13,-27,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,17,-30,-20,18,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-23,-29,-25,38,-30,-5,7,-20,11,4,-23,-30,-23,-16,-20,-8,5,9,41,-25;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-11,-8,-7,-13,-17,-18,-13,-7,-14,-12,2,-10,-7,-8,22,42,-3,-31,-12,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-13,-16,-12,-20,7,-20,-15,-12,-13,-12,-6,-12,-12,-18,10,7,-5,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,57,18,-38,-10,2,-36,1,-29,-25,21,-11,7,-7,1,-9,-30,-38,-19,13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-24,-19,-7,1,-27,-15,4,-8,11,6,-17,-21,-6,-8,-16,-9,2,-18,-2,-6;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-19,-10,-19,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,4,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-30,-22,7,-29,-21,22,-27,40,20,-29,-29,-21,-19,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-23,-12,-16,-25,42,-20,-29,-16,-23,-16,-2,-16,-16,-19,5,-7,-19,-21,-25,-16;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-17,-11,-6,-19,-11,2,-14,0,-15,-8,-1,-14,-4,-6,3,1,-6,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-19,-25,-18,2,-26,-16,12,-18,28,17,-22,-25,-14,-8,-19,-2,9,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-27,-16,-7,23,-26,9,-11,-4,-6,-4,-12,-22,-10,-4,-15,-11,-13,4,34,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-28,-13,-20,-25,56,-17,-31,-18,-22,-7,-3,-20,-17,-18,-3,-18,-24,-20,-25,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,2,-27,0,2,-25,-15,-10,-22,12,-28,-15,6,16,0,3,1,1,-22,-29,-18,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-7,-19,-5,-9,-16,-6,-18,-3,-12,-7,-4,-11,-19,-15,-16,-4,-6,9,-28,-16,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-34,-27,46,-30,-17,9,-26,17,6,-24,-30,-30,-19,-21,-8,9,0,23,-27;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-13,-2,-3,-22,11,-12,-23,-12,-30,-20,8,-12,-3,-12,34,14,-13,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,0,17,-37,-17,7,-20,7,-22,-3,2,-10,51,7,6,-5,-27,-23,-12,34;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-12,-12,-10,-8,-19,-19,-6,-13,-3,-6,-4,-13,-10,-12,15,37,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00035;
//
ID   BZIP_BASIC_MP; MATRIX.
AC   MP00036;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Basic-leucine zipper (bZIP) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8190863; R2=0.0114923; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; N_SCORE=6.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-24,18,13,-24,-14,-6,-21,-1,-16,-15,3,-11,2,-3,1,-4,-17,-31,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-26,2,12,-19,-18,-9,-11,-5,-7,-8,-7,-6,1,-9,-6,-7,-12,-25,-13,6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-28,-1,10,-26,-19,-5,-26,29,-24,-10,-1,-9,9,25,-5,-7,-18,-23,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-28,-7,-1,-12,-21,-1,-18,14,-13,-6,-5,-18,5,24,-9,-7,-14,-13,7,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-27,-8,5,-18,-20,-8,-13,5,-11,-6,-7,-16,6,10,-7,-8,-11,-13,-8,4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-28,-3,6,-22,-20,-3,-22,21,-18,-8,0,-15,8,33,-7,-8,-16,-23,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-29,-10,0,-17,-21,-4,-26,28,-18,-8,-2,-18,6,53,-11,-10,-17,-19,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-26,-13,-4,-16,-22,-7,-15,18,-8,1,-7,-18,3,31,-11,-6,-10,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-9,-25,-8,8,-17,-17,-9,-9,-2,-3,-2,-9,-14,5,-2,-7,-8,-10,-21,-11,6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-26,-5,4,-25,-14,-5,-26,25,-24,-11,1,-14,11,33,0,-5,-18,-23,-12,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-20,19,0,-21,1,9,-20,0,-30,-20,58,-20,1,0,10,-1,-30,-39,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,2,-24,-3,0,-21,-16,1,-27,23,-23,-12,12,-18,6,43,-5,-5,-21,-25,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-8,-24,-7,7,-17,-18,-13,-3,-8,-3,-2,-9,-12,-1,-11,-6,-7,-3,-26,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-12,-15,-8,-17,-2,-15,-12,-10,-15,-12,-6,-9,-7,-17,16,4,-4,-22,-15,-8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-11,-18,-9,-19,-4,-18,-8,-9,-11,-9,-9,-12,-7,-16,10,1,2,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-22,-9,1,-24,-15,-4,-22,14,-19,-8,-2,-15,13,25,-1,-4,-16,-23,-12,5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-27,-4,6,-24,-17,-5,-26,26,-22,-11,2,-14,9,36,-4,-6,-19,-22,-12,6;
MA   /M: SY='C'; M=0,-10,23,-14,-13,-8,-11,-15,-20,-17,-21,-16,-4,-22,-14,-15,14,5,-10,-32,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10,0,-20,-20,-1,-29,30,-20,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-19,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-26,3,10,-21,-19,-5,-15,6,-11,-6,-1,-14,9,4,-6,-8,-15,-24,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-28,-6,3,-24,-18,-5,-29,34,-23,-10,0,-15,9,47,-8,-9,-19,-20,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-28,-5,5,-26,-19,-7,-26,37,-24,-7,-1,-13,10,34,-8,-9,-18,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-6,6,-23,-21,-7,-19,22,-15,-5,-5,-14,12,21,-8,-6,-14,-21,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=3,-1,-22,1,14,-25,-15,-4,-17,1,-12,-8,-4,-11,11,-2,-2,-7,-15,-25,-14,12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-7,3,-13,-21,5,-19,11,-15,-7,-4,-17,6,14,-10,-10,-18,-8,7,3;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-10,-17,-13,-5,-11,-23,-13,2,-9,1,3,-9,-18,-5,-10,-7,-3,1,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,8,13,-23,-18,-3,-19,6,-14,-9,1,-13,11,3,-3,-7,-17,-27,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-21,8,23,-25,-13,-2,-24,4,-20,-14,1,-10,11,-1,0,-6,-22,-27,-15,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-26,-19,4,-27,-18,17,-24,34,16,-20,-26,-17,-17,-21,-6,9,-22,-3,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-26,6,32,-28,-18,1,-22,6,-17,-10,-2,-6,20,0,1,-6,-22,-27,-15,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,2,-23,1,6,-24,-11,-4,-20,5,-18,-10,3,-13,7,7,1,-3,-16,-26,-14,5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-27,3,18,-27,-19,-4,-27,24,-22,-12,0,-11,15,24,-4,-7,-21,-24,-13,15;
MA   /M: SY='V'; M=3,-22,-9,-25,-21,-3,-24,-23,13,-15,6,4,-20,-24,-20,-15,-8,-1,23,-26,-10,-21;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-23,3,13,-23,-15,-3,-17,3,-13,-9,1,-12,9,-1,0,-5,-16,-26,-14,11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-23,-1,10,-17,-18,-4,-15,1,-11,-8,-4,-14,7,-1,-3,-5,-13,-24,-9,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-19,9,-29,-18,18,-27,42,18,-28,-28,-19,-19,-26,-9,10,-18,2,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-22,-2,15,-21,-17,-8,-16,3,-13,-9,-3,-11,7,-1,2,1,-13,-27,-14,11;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-21,2,10,-24,-11,-6,-21,6,-20,-13,2,-11,6,3,4,-2,-16,-26,-15,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-28,11,35,-28,-19,-2,-24,10,-17,-13,0,-6,19,5,-2,-8,-24,-27,-16,27;
MA   /M: SY='N'; M=-9,24,-21,10,-1,-19,-6,3,-17,3,-24,-15,37,-19,-1,2,4,-2,-21,-34,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-22,4,12,-24,-12,-6,-20,2,-18,-12,2,-10,6,-2,6,1,-15,-28,-15,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-3,-22,-4,4,-23,-15,-4,-18,6,-17,-8,-1,-13,8,8,2,-1,-14,-26,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-28,-20,8,-29,-18,19,-28,44,20,-27,-29,-19,-19,-27,-8,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-7,4,-18,-20,-5,-16,12,-10,-4,-4,-16,7,17,-7,-7,-13,-22,-9,4;
MA   /M: SY='K'; M=0,0,-21,-2,5,-23,-13,-8,-19,8,-18,-10,1,-12,7,6,3,1,-14,-26,-14,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-28,7,31,-27,-18,-1,-25,13,-19,-12,0,-8,18,12,-2,-7,-23,-26,-15,24;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-20,-25,-20,-3,-27,-21,20,-18,14,9,-15,-24,-17,-16,-13,-5,19,-25,-7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-22,8,13,-25,-8,-6,-23,1,-19,-15,3,-11,4,-3,5,-2,-18,-29,-17,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-1,-23,-1,7,-19,-17,-3,-16,1,-12,-7,-2,-14,8,4,-1,-4,-14,-24,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-29,-20,8,-29,-19,19,-27,40,18,-27,-28,-18,-19,-25,-8,11,-19,1,-19;
MA   /I: I=-9; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,0,-23,-2,8,-21,-17,-6,-19,12,-16,-9,1,-13,8,15,1,2,-15,-25,-12,7; D=-6;
MA   /I: DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-22,1,10,-25,-17,-4,-24,17,-20,-10,2,-14,12,20,-3,-6,-19,-25,-13,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-27,12,36,-28,-17,0,-25,8,-18,-15,1,-6,17,2,1,-6,-24,-28,-16,26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-14,-20,-17,-1,-24,-14,7,-15,10,4,-11,-25,-15,-11,-13,-5,6,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-23,5,10,-22,-12,-6,-19,2,-16,-12,3,-12,3,-1,1,-3,-15,-27,-14,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-22,-3,3,-18,-14,-1,-18,2,-16,-9,-1,-15,5,2,0,-2,-15,-19,-6,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-18,-28,-21,11,-28,-15,14,-23,29,16,-24,-27,-18,-17,-22,-6,9,-15,5,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-26,-4,7,-22,-20,-8,-21,23,-18,-8,-1,-13,6,23,-5,-3,-14,-23,-11,5;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-21,-3,1,-18,-7,-6,-17,-2,-17,-10,3,-15,3,-3,5,-1,-13,-25,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-24,-9,5,-12,-23,-11,-4,-2,1,1,-10,-16,2,-4,-10,-6,-6,-22,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-17,-19,-17,6,-23,-13,9,-19,15,6,-7,-26,-16,-15,-14,-6,4,-22,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-21,-7,0,-14,-16,-6,-12,1,-10,-4,-1,-15,0,5,0,1,-9,-26,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-21,-1,7,-22,-15,-7,-16,3,-15,-8,-2,-10,5,-1,1,-3,-12,-27,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-18,-23,-20,-14,0,-26,12,2,-15,14,10,-14,-24,-9,-8,-17,-9,-1,-19,9,-13;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00036;
//
ID   DEAD_ATP_HELICASE_MP; MATRIX.
AC   MP00039;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DEAD-box subfamily ATP-dependent helicases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2214813; R2=0.0155828; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=197; N_SCORE=8.282; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-15,-22,-14,-1,-21,-9,7,-20,16,10,-16,-23,-13,-16,-13,-6,4,-23,-2,-14;
MA   /M: M=-5,-6,-24,-8,-6,-16,-16,-10,-2,-6,-4,0,-4,-17,-3,-6,-7,-7,-4,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-26,5,11,-26,-9,1,-23,8,-23,-12,10,-11,11,6,1,-7,-22,-28,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-20,-4,0,-20,-12,-7,-22,7,-19,-11,-1,-9,1,11,1,2,-16,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-27,-6,-1,-21,-10,-4,-19,8,-16,-7,-2,-8,1,11,-7,-8,-16,-24,-13,-2;
MA   /M: M=-2,-9,-20,-13,-12,-11,-10,-11,-3,-11,-8,-3,-3,-16,-8,-11,-1,-2,-2,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,-14,-30,-23,17,-26,-21,10,-22,13,6,-19,-24,-23,-16,-14,-5,9,-16,2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-22,15,5,-24,-11,-3,-22,1,-22,-16,11,-12,1,-1,3,-4,-17,-32,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-13,-26,-19,7,-26,-20,9,-23,24,10,-23,-19,-19,-18,-17,-1,7,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,2,-23,3,3,-25,-6,-5,-26,9,-25,-15,5,-12,5,12,7,-2,-18,-28,-16,3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-23,4,6,-24,-11,1,-22,8,-23,-11,11,-14,11,9,6,-1,-19,-28,-13,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-3,-30,-24,2,-31,-24,19,-26,21,10,-23,-27,-22,-21,-17,-5,17,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-23,-1,8,-25,-16,-6,-24,18,-22,-11,1,-11,10,19,-2,-5,-18,-25,-13,8;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-23,-14,-29,-23,21,-27,-13,9,-19,9,11,-20,-26,-19,-16,-15,-5,8,-8,15,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-17,-32,-23,20,-30,-21,17,-28,35,16,-28,-30,-24,-20,-25,-9,13,-16,4,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-33,-24,12,-30,-19,25,-25,31,25,-25,-26,-19,-20,-23,-9,16,-18,2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-29,-3,9,-23,-19,-1,-29,30,-23,-12,4,-16,11,50,-8,-9,-22,-22,-12,7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-31,-22,6,-26,-12,22,-20,30,38,-24,-24,-12,-16,-23,-10,13,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23,17,-28,-19,19,-27,32,17,-24,-28,-22,-20,-24,-9,12,-16,4,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,28,-25,37,21,-32,-10,-2,-31,2,-27,-23,15,-9,6,-5,6,-3,-25,-36,-19,13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-13,-23,-15,-5,-11,-19,-6,0,-4,2,14,-11,-13,2,-3,-10,-7,-3,-23,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-27,0,-11,-27,43,-14,-33,-15,-26,-16,3,-18,-13,-16,1,-14,-25,-24,-24,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-22,-33,-24,58,-28,-6,-3,-24,7,3,-16,-28,-29,-13,-19,-11,-4,2,24,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-26,-4,11,-18,-7,-9,-19,2,-16,-10,-4,-12,6,-3,-3,-9,-18,-20,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-27,10,19,-28,-13,-7,-25,5,-23,-17,1,6,6,-2,2,-4,-23,-29,-18,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-29,7,16,-27,-19,-2,-19,0,-18,-9,-2,-10,21,-3,-2,-7,-22,-13,-10,18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-9,-32,-25,0,-31,-24,24,-25,21,15,-24,-26,-21,-23,-17,-6,21,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-26,7,11,-17,-18,-2,-19,2,-16,-12,3,-7,4,1,-2,-3,-18,-24,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-27,4,12,-24,-17,-4,-24,12,-20,-12,0,-10,9,10,-3,-6,-20,-20,-12,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,24,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,30,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-22,-24,-15,5,-28,-15,13,-17,21,11,-21,-24,-15,-15,-19,-8,9,-18,3,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-23,2,5,-23,-8,-4,-24,6,-22,-14,4,-11,5,5,6,-1,-18,-27,-14,4;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-13,-9,-17,-12,-2,-18,2,-8,-13,-2,1,-9,-22,-9,-10,-8,-7,-6,-20,2,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00039;
//
ID   HTH_ARAC_FAMILY_1_MP; MATRIX.
AC   MP00041;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial regulatory proteins, araC family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5162; R2=0.0218; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; N_SCORE=8.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=228; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-25,14,13,-25,-12,2,-25,4,-22,-15,7,-13,8,4,0,-7,-23,-25,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-26,-1,5,-24,-15,-3,-24,15,-19,-11,0,-11,8,20,-3,-6,-18,-22,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-17,-29,-22,-2,-24,-25,21,-21,15,9,-22,-22,-20,-22,-11,-3,22,-23,-8,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-10,-21,-13,-7,-25,-14,4,-11,5,4,-15,-23,-10,-5,-11,-2,6,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-1,-20,-3,2,-23,-10,1,-19,0,-14,-7,0,-15,7,1,-1,-4,-16,-26,-12,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-25,-28,-22,20,-27,-9,3,-16,5,1,-22,-27,-18,-13,-20,-10,-2,19,30,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-20,-35,-26,2,-34,-24,34,-27,24,21,-23,-23,-19,-25,-20,-9,22,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,6,20,-21,-19,2,-19,1,-13,-11,0,-11,7,2,-1,-5,-17,-28,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-24,8,12,-22,-10,-4,-23,3,-18,-14,4,-12,4,1,2,-3,-18,-28,-15,7;
MA   /M: SY='N'; M=-12,21,-22,17,3,-23,-10,20,-24,-1,-23,-14,26,-17,3,0,2,-4,-24,-34,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-24,-26,-17,7,-28,-16,14,-22,20,10,-23,-14,-17,-19,-20,-9,5,-14,6,-18;
MA   /M: SY='E'; M=3,0,-20,0,9,-24,-12,-1,-21,1,-18,-11,0,-10,9,-3,5,-1,-17,-27,-13,9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-24,5,13,-26,-15,4,-26,12,-22,-12,5,-12,14,16,1,-5,-22,-27,-12,12;
MA   /I: MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-1,-25,1,5,-23,-6,-7,-22,4,-23,-15,1,7,0,1,3,-3,-20,-26,-17,1; D=-5;
MA   /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-31,-27,-34,-26,10,-27,-25,8,-24,10,2,-28,-26,-22,-20,-26,-14,2,33,9,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-17,-1,-1,-18,-12,-5,-20,1,-20,-13,7,-13,-2,3,12,15,-13,-30,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-22,-32,-23,4,-31,-24,25,-26,30,16,-27,-24,-20,-21,-23,-8,17,-16,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=0,12,-24,15,17,-27,-9,-5,-26,3,-21,-17,6,-8,3,-2,4,-4,-20,-30,-18,10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-22,14,8,-24,-14,-6,-20,1,-18,-13,5,-12,4,0,3,-3,-16,-30,-15,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-18,-32,-26,9,-32,-24,27,-26,26,16,-27,-28,-24,-21,-20,-6,27,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='A'; M=38,-11,-1,-19,-12,-19,-3,-20,-11,-12,-11,-10,-10,-13,-12,-20,10,2,0,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-25,13,16,-27,-10,-1,-26,6,-21,-15,6,-11,9,5,2,-6,-22,-28,-16,12;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-4,-20,-5,5,-17,-17,9,-16,-2,-11,-6,-3,-15,5,-2,-3,-6,-15,-24,-4,4;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-11,-26,-19,6,-21,-19,8,-20,9,4,-19,-23,-19,-19,-8,-3,11,-19,-2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-15,-9,-13,-15,14,-3,-23,-13,-18,-11,2,-20,-10,-12,-3,-11,-20,-21,-9,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-14,-28,-22,3,-26,-15,17,-18,16,18,-22,-25,-17,-17,-15,-3,17,-18,4,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,1,-12,-1,-2,-19,0,-8,-20,-10,-27,-18,10,-11,-2,-10,33,20,-11,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-29,-5,9,-23,-18,-11,-18,5,-17,-12,-10,15,1,3,-7,-8,-17,-25,-17,3;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-23,-12,-6,-11,-15,-10,-16,1,-17,-11,-2,-17,-2,13,4,1,-11,-11,-6,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-9,-18,-12,-10,-5,-20,10,-10,-9,-7,-4,-5,-20,-5,-5,-1,5,-8,-16,11,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-23,21,-30,-20,18,-29,38,16,-27,-29,-23,-20,-26,-10,11,-14,6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-22,-7,2,-19,-18,8,-20,9,-18,-7,-1,-16,12,15,-1,-5,-17,-20,-1,5;
MA   /I: I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-26,-5,3,-22,-16,0,-22,17,-19,-9,1,-14,5,24,-4,-5,-16,-24,-10,2; D=-6;
MA   /I: DM=-35;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-22,-18,-9,-10,-21,-8,-2,-5,8,6,-12,-21,-3,4,-13,-7,-3,-22,-6,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-12,-35,-26,51,-29,-20,3,-29,17,5,-22,-30,-32,-20,-20,-9,2,-3,17,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-28,-1,12,-25,-16,-4,-26,23,-21,-10,0,-13,12,25,-5,-8,-21,-23,-12,11;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-24,2,11,-26,-14,-5,-24,16,-22,-12,2,-11,13,13,3,-2,-18,-25,-14,11; D=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-6,-22,-6,7,-13,-19,1,-10,-7,-10,-7,-6,-14,2,-9,-1,-3,-8,-21,-3,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-17,-13,-11,-7,-14,-13,-5,-10,-2,-2,-6,-19,-10,-9,-2,7,-2,-23,-5,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-25,-10,-17,-23,40,-16,-28,-16,-21,-15,1,-19,-16,-15,1,-8,-20,-23,-23,-16;
MA   /I: I=-7; MI=-30; MD=-30; IM=-30;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-12,-14,-16,-9,-8,-18,-8,3,-7,2,7,-10,-15,-3,-6,-6,0,3,-18,-4,-7; D=-6;
MA   /I: DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-14,-4,-5,-18,-4,-14,-18,-7,-22,-15,6,-6,-6,-9,19,22,-11,-32,-17,-6; D=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-25,-26,-25,-16,8,-26,-20,1,-19,-2,-3,-22,18,-20,-19,-15,-9,-3,-16,-3,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-3,-19,-8,-5,-17,-8,-6,-15,2,-13,-4,3,-17,-1,2,-1,-3,-13,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,4,-25,4,16,-29,-11,0,-24,7,-21,-12,5,-10,21,7,3,-5,-23,-26,-15,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-31,-27,-21,15,-29,-4,7,-17,5,3,-23,-27,-12,-15,-23,-13,-3,28,37,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-31,-22,4,-32,-21,26,-24,27,16,-23,-25,-17,-17,-21,-8,17,-19,1,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-23,-9,-2,-13,-18,-3,-12,3,-6,-1,1,-18,2,15,-5,-1,-11,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-25,10,10,-25,-14,-1,-22,5,-19,-13,7,-13,9,8,1,-4,-19,-28,-13,8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-18,-17,-20,-12,-8,-22,-12,-6,-5,-5,-2,-14,-22,-6,5,-11,-6,-3,-6,-1,-10; D=-6;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-30,-9,2,-22,-20,-1,-29,32,-21,-9,0,-18,11,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-21,-32,-22,3,-28,-16,25,-22,29,31,-24,-24,-14,-18,-22,-9,16,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-17,-2,6,-20,-14,-5,-16,-3,-13,-9,-1,-13,3,-2,2,-1,-13,-29,-14,3;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-21,-6,2,-16,-18,4,-18,7,-13,-5,-3,-17,6,8,-7,-8,-16,-20,-1,2;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,-13,-21,-13,-17,-4,-21,-3,-13,-6,-6,-11,-13,-12,-20,6,0,4,-22,-17,-13;
MA   /M: SY='R'; M=0,-10,-22,-13,-3,-18,-17,-4,-16,10,-10,-5,-6,-17,2,18,-7,-7,-10,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-23,-7,1,-17,-17,-4,-13,4,-8,-4,-3,-16,5,7,-5,-6,-11,-22,-8,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-18,-13,-7,-3,-23,-12,0,-15,15,5,-16,-22,-9,-12,-16,-9,-3,-19,-2,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-30,-20,8,-29,-20,21,-28,43,19,-28,-28,-19,-20,-26,-9,12,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-12,-18,-14,-5,-10,-21,-12,-5,-5,-1,-1,-8,-19,-3,3,-5,-2,-4,-24,-9,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-9,4,-23,3,3,-14,-16,0,-16,-3,-11,-7,3,-15,0,-2,-1,-1,-14,-26,-7,1;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-20,-1,-2,-21,-3,-7,-21,-6,-22,-15,5,-3,-3,-8,13,12,-16,-30,-16,-3;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-24,15,9,-26,-2,-2,-27,2,-25,-18,16,-12,3,1,5,-4,-23,-29,-18,5; D=-4;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-10,-21,-12,-5,-8,-14,-3,-8,-3,-3,2,-8,-15,-1,-2,-9,-8,-10,-13,1,-4; D=-4;
MA   /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-20,-3,0,-21,-9,-8,-18,-3,-24,-14,5,3,2,-6,15,9,-16,-31,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-35,-29,1,-34,-28,38,-25,17,16,-24,-24,-23,-25,-16,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-17,-11,-8,-9,-12,-14,-8,-9,-8,-7,-2,-16,-9,-10,6,10,-3,-25,-10,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-25,17,21,-29,-14,-2,-25,4,-21,-15,5,-9,15,0,4,-2,-22,-29,-15,17;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-23,-34,-27,-2,-32,-27,36,-25,15,15,-20,-21,-20,-25,-13,-5,28,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-10,-16,-9,-20,3,-18,-12,-11,-14,-12,-6,-11,-9,-18,14,2,-3,-24,-20,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-8,-22,-11,-5,-8,-19,5,-7,-6,-2,5,-5,-20,0,-2,-9,-7,-9,-18,2,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-22,2,6,-21,-15,-3,-18,7,-14,-6,4,-15,7,11,-1,-4,-16,-27,-13,5;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-22,10,-26,-23,-1,-26,-17,2,-20,1,-2,-20,-29,-21,-20,-13,-7,8,-13,2,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-29,-10,-18,-27,62,-18,-38,-18,-28,-19,0,-20,-18,-17,0,-19,-29,-20,-27,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-24,-33,-26,52,-31,-8,6,-23,9,3,-20,-29,-27,-18,-20,-10,1,12,42,-26;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-21,4,1,-20,-2,-8,-21,-7,-20,-15,4,-9,-4,-8,8,0,-16,-28,-16,-2;
MA   /I: I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35;
MA   /M: SY='D'; M=-4,15,-19,20,7,-24,-6,7,-26,-6,-27,-19,13,-11,2,-8,19,5,-19,-37,-14,4; D=-6;
MA   /I: DM=-35;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-21,-8,0,-20,-14,-9,-12,-6,-12,-7,-4,-3,6,-6,5,5,-11,-28,-14,2;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-18,-6,-4,-17,2,-10,-17,-10,-19,-13,5,-11,-1,-11,15,4,-14,-29,-16,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-25,-12,-10,3,-20,15,-12,-4,-9,-5,-7,-22,-3,0,-6,-2,-13,-2,31,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-28,69,-30,-19,2,-29,14,3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,1,7,27,-28;
MA   /M: SY='S'; M=7,-10,-8,-15,-12,-12,-15,-16,-3,-14,-11,-8,-4,-15,-9,-15,13,11,1,-28,-10,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-23,-3,3,-21,-16,-4,-22,14,-19,-10,2,-16,6,23,-1,-2,-15,-25,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=2,-10,-17,-12,-5,-11,-16,-14,-2,-10,-3,-3,-9,-18,-10,-11,-3,-2,4,-26,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-35,-28,62,-30,-13,2,-26,8,1,-20,-29,-32,-19,-19,-10,0,10,35,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-28,-2,5,-25,-17,-6,-28,33,-25,-11,3,-13,8,35,-6,-7,-19,-22,-12,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-27,-1,8,-25,-17,-3,-26,24,-23,-11,2,-13,12,27,-2,-5,-20,-23,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-20,-13,-6,-6,-23,5,-10,-2,-7,-3,-7,-20,-2,2,-8,-3,-9,-13,10,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-21,-27,-20,35,-27,-11,2,-20,8,2,-17,-25,-22,-15,-13,-1,0,-1,25,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-3,-13,-29,51,-14,-36,-14,-29,-20,9,-19,-14,-15,3,-15,-29,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-16,-13,-19,-8,-4,-24,-11,3,-11,1,7,-15,-20,-7,-11,-10,-5,5,-17,-1,-8;
MA   /M: SY='T'; M=5,-3,-12,-9,-7,-13,-13,-16,-11,-11,-12,-11,0,-9,-7,-11,19,28,-4,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-38,-11,-1,-28,-19,-20,-18,-10,-27,-18,-19,80,-10,-19,-9,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-17,-5,-2,-20,-5,-8,-19,1,-22,-12,3,-13,1,2,17,8,-12,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,11,22,-28,-16,1,-24,7,-19,-12,1,-10,19,4,-1,-8,-23,-26,-12,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-23,-23,-20,29,-27,-6,0,-17,3,-1,-17,-25,-19,-15,-13,-1,-3,10,35,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-25,-15,-6,-9,-21,-7,-13,8,-3,-2,-7,-21,0,32,-11,-8,-9,-20,-6,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-24,-6,2,-20,-16,-1,-17,9,-14,-6,-1,-15,7,11,-3,-4,-14,-22,-9,3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-8,-3,-17,-10,-2,-13,0,-12,-4,-2,-17,3,5,-4,-5,-12,-21,-6,-2;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00040;
//
ID   HTH_CRP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00042;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Crp-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7112427; R2=0.0163009; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=239; N_SCORE=9.597; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-27,1,8,-24,-18,7,-24,12,-17,-8,1,-15,14,21,-4,-8,-20,-25,-9,9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-6,-17,-6,-2,1,-12,-3,-6,-5,0,0,-7,-13,-1,-5,-8,-6,-8,-6,6,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-10,-10,-3,-11,-11,-11,-7,-7,-4,-6,-9,7,-6,-8,-3,-2,-7,-17,-12,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-22,-3,3,-10,-15,-3,-15,-1,-10,-9,-1,-11,0,1,-3,-5,-14,-16,-1,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-23,-11,-8,-20,14,-13,-21,-7,-13,-10,-4,-13,-7,-3,-2,-8,-16,-21,-18,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-20,-14,-8,-17,-2,-12,-7,-5,-9,4,-8,-15,-2,-8,-2,-3,-3,-22,-12,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-23,-8,0,-7,-7,-12,-18,-10,-17,-14,-4,2,-6,-12,4,1,-16,-21,-10,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-7,-16,-8,-9,-21,5,7,-23,-10,-21,-11,0,-18,-4,-6,6,-2,-14,-29,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=7,-6,-22,-8,-4,-23,-8,-14,-16,-9,-22,-15,-2,19,-5,-14,9,4,-15,-30,-22,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-25,22,6,-27,-9,-3,-27,4,-22,-15,12,-13,4,5,2,1,-21,-31,-15,4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-26,-4,0,-27,32,-13,-31,-10,-23,-16,0,-13,-5,-12,3,-8,-24,-22,-23,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-22,-34,-26,21,-28,-20,19,-23,12,16,-21,-23,-21,-20,-18,-7,13,-2,8,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-17,1,3,-16,-11,-1,-14,7,-12,-6,0,-6,10,16,-1,-3,-11,-16,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-18,-28,-21,9,-28,-20,23,-25,32,15,-24,-24,-19,-19,-22,-8,16,-17,0,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-25,-9,-3,-21,-18,-14,-17,5,-20,-12,-4,15,-5,5,-1,4,-13,-27,-17,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-22,-32,-23,4,-28,-15,27,-22,31,34,-24,-24,-13,-18,-23,-9,16,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-11,-7,-7,-14,-10,-17,-14,-10,-17,-13,3,-10,-7,-11,25,36,-4,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-6,-30,-8,-3,-17,-19,25,-25,13,-18,-4,3,-20,7,38,-11,-13,-22,-16,0,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-28,0,15,-34,-9,2,-23,9,-22,-6,2,-11,36,6,1,-8,-27,-22,-14,25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-26,21,24,-27,-18,-5,-18,0,-15,-12,0,-9,6,-8,-3,-8,-15,-31,-16,15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-35,-25,37,-29,32,22,-24,-24,-19,-25,-24,-10,21,-20,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-17,-16,-14,-24,25,-20,-21,-14,-17,-14,-6,-14,-14,-20,6,-7,-11,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-28,23,14,-27,-13,5,-26,8,-24,-16,19,-14,13,7,0,-8,-27,-28,-10,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-23,-27,-21,22,-26,-6,9,-19,9,6,-18,-25,-17,-17,-14,-7,2,1,29,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-10,-28,-22,0,-28,-23,19,-26,22,10,-22,-26,-20,-21,-14,-4,16,-26,-6,-22;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-18,6,-22,-17,-6,-22,-20,1,-23,10,0,-15,-24,-16,-19,-4,3,2,-30,-11,-17;
MA   /M: SY='T'; M=9,2,-11,-7,-7,-14,-11,-15,-13,-9,-15,-13,6,-11,-7,-11,21,31,-5,-31,-14,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-18,-27,-19,-11,-12,-26,-5,-2,3,-3,1,-10,-17,-4,23,-14,-10,-1,-22,-6,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-23,6,33,-22,-21,-8,-14,1,-13,-12,-7,-8,6,-6,0,-5,-8,-31,-17,19;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-11,-9,-9,-11,-15,-16,-10,-10,-12,-6,1,-11,-7,-10,21,38,-1,-31,-11,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-13,-30,-28,-2,-29,-29,28,-20,9,9,-26,-26,-26,-21,-9,2,41,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-14,-3,-6,-19,6,-13,-21,-11,-25,-17,9,-12,-6,-11,26,20,-12,-34,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-20,-27,-19,-1,-29,-20,21,-21,20,15,-20,-22,-13,-18,-14,0,17,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-24,18,-31,-22,22,-29,35,18,-27,-28,-23,-21,-25,-9,15,-16,4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-21,-6,-7,-23,15,-16,-26,-1,-25,-15,2,-13,-7,-5,11,6,-16,-26,-19,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-27,4,10,-23,-17,-3,-25,21,-21,-9,3,-13,7,24,-5,-8,-19,-23,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-29,-3,15,-27,-17,-3,-21,14,-16,-7,-3,-12,20,17,-5,-10,-20,-22,-12,16;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-28,6,17,-29,-18,2,-27,19,-22,-11,1,-10,17,17,-3,-6,-23,-24,-12,16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-25,6,15,-27,-16,-1,-20,6,-19,-9,3,-10,15,2,3,-1,-19,-27,-13,15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-28,-4,-9,-29,34,-11,-34,2,-30,-17,6,-17,-8,-3,-1,-14,-26,-23,-22,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-19,-27,-20,4,-28,-20,15,-17,22,14,-23,-26,-17,-11,-19,-6,15,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-16,-6,-2,-18,-10,8,-16,-7,-20,-11,2,-14,-1,-4,16,6,-8,-33,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=0,-23,-22,-28,-21,-2,-26,-18,19,-16,13,11,-19,-22,-15,-12,-14,-7,15,-18,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,5,-28,8,12,-27,-18,9,-24,11,-22,-11,4,-10,14,12,-3,-9,-21,-27,-10,12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-29,5,-1,-30,24,-7,-33,-2,-29,-18,8,-11,-4,-7,0,-13,-28,-26,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-26,3,5,-24,-13,-9,-28,26,-27,-14,3,-12,4,18,0,-5,-18,-24,-12,4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-15,-9,-2,-17,-8,-8,-23,5,-18,-11,-4,-17,0,12,-2,-1,-16,-19,-6,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-22,-26,-20,0,-30,-7,17,-16,7,11,-16,-23,-16,-13,-14,-6,17,-22,1,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-21,-25,-20,-3,-29,-15,16,-15,6,6,-16,-22,-15,-9,-9,1,17,-21,1,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00041;
//
ID   HISTONE_LIKE_MP; MATRIX.
AC   MP00045;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial histone-like DNA-binding proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4501429; R2=0.0135294; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; N_SCORE=10.258; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-23,-1,17,-19,-18,-2,-14,-2,-12,-7,-3,-10,5,-5,1,0,-12,-27,-12,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-33,-26,1,-32,-24,34,-24,21,22,-23,-24,-19,-22,-17,-5,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-13,-14,-8,-16,-15,-16,-6,-5,-12,-5,-6,-16,-5,-5,4,7,0,-28,-13,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-24,14,12,-25,-2,-4,-26,-1,-23,-18,10,-12,3,-3,6,-3,-22,-31,-18,7;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-10,-12,-5,-19,-7,-16,-11,-9,-14,-11,-3,-11,-5,-15,13,7,-4,-27,-18,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-30,-22,6,-29,-22,22,-27,37,17,-28,-28,-21,-21,-23,-7,17,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-13,-4,8,-22,-16,-9,-16,6,-17,-11,-2,-13,0,-2,1,-4,-9,-28,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,6,-24,5,6,-25,-8,3,-25,11,-23,-13,9,-14,5,11,2,-5,-21,-28,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-5,-15,-29,52,-12,-36,-13,-29,-19,8,-19,-14,-14,1,-16,-29,-23,-26,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-29,26,26,-32,-9,6,-31,5,-25,-19,12,-9,13,-1,1,-9,-29,-31,-17,19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-24,2,6,-23,-16,-7,-22,14,-21,-12,2,-12,6,17,1,0,-14,-27,-14,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,5,17,-26,-18,-4,-21,15,-21,-11,6,-10,14,10,0,-2,-20,-26,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-34,-25,10,-34,-24,30,-29,34,18,-26,-26,-22,-24,-24,-9,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-18,-12,-7,-16,-15,-14,-12,-1,-16,-10,-4,-6,-5,7,9,10,-4,-29,-15,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-26,-7,-14,-28,51,-17,-35,-14,-30,-19,2,-17,-14,-15,7,-11,-25,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=2,-11,-27,-12,-19,-25,54,-20,-32,-20,-22,-16,-3,-20,-19,-19,-1,-14,-24,-21,-26,-19;
MA   /M: SY='T'; M=4,3,-13,-5,-8,-14,-11,-13,-8,-10,-17,-12,10,-14,-7,-11,19,21,-3,-34,-15,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-39,-30,71,-30,-21,4,-29,11,2,-21,-30,-38,-20,-20,-9,4,6,26,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-22,5,19,-23,-13,-6,-20,2,-19,-13,1,-9,9,-3,9,2,-16,-29,-15,14;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-18,-26,-20,-4,-28,-22,17,-15,13,9,-23,-21,-17,-11,-14,-5,22,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-26,-6,-1,-20,-16,10,-24,17,-20,-8,3,-18,6,34,-5,-7,-16,-24,-7,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-6,5,-24,5,4,-19,-14,13,-23,4,-19,-11,4,-15,3,3,0,-4,-19,-23,0,2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-30,-7,4,-24,-20,-3,-29,35,-23,-10,0,-16,12,53,-9,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=2,-2,-26,-3,4,-27,-6,-10,-23,5,-24,-14,0,8,3,-1,1,-5,-21,-26,-20,2;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-20,-9,3,-25,-1,-15,-18,-7,-19,-14,-7,6,-2,-15,7,-3,-14,-25,-22,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-29,-10,0,-20,-19,-1,-29,28,-20,-10,0,-19,9,66,-8,-8,-19,-21,-10,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-22,-10,-2,-16,-22,-13,-5,-2,-11,-5,-6,-3,-2,-6,-3,3,-5,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11,-2,-15,-21,3,-26,24,-18,-8,-2,-21,6,58,-10,-10,-17,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,19,0,-20,-1,9,-20,1,-30,-20,58,-20,0,1,9,0,-30,-39,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-28,-4,8,-29,-16,-3,-24,25,-22,-7,-1,-12,22,23,-4,-8,-21,-21,-11,14;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-9,-10,-10,-19,-19,-10,-10,-11,-10,2,-10,-10,-10,20,49,-1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-16,-30,58,-18,-38,-12,-29,-18,0,-19,-14,-13,-1,-19,-29,-20,-27,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-26,13,38,-28,-17,-4,-26,10,-20,-17,1,-4,13,0,1,-7,-23,-28,-18,26;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-25,0,14,-21,-17,-9,-19,4,-19,-14,-5,5,3,-3,2,-2,-16,-25,-13,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-34,-29,1,-33,-27,35,-24,17,17,-26,-26,-24,-23,-16,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-29,2,10,-23,-18,-9,-22,9,-21,-13,-2,9,6,2,-5,-6,-21,-25,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-28,22,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-1,-26,3,6,-25,-13,-12,-21,0,-21,-16,-3,16,-2,-7,2,-1,-19,-30,-19,1;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-20,-6,1,-25,-3,-16,-18,-6,-18,-15,-7,7,-5,-15,5,-4,-13,-25,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-7,0,-19,-15,0,-25,20,-21,-10,0,-15,4,27,-2,-2,-17,-20,-5,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-27,-6,-3,-14,-17,7,-20,10,-20,-10,3,-13,2,17,-5,-7,-18,-12,2,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-15,-21,-18,-7,-23,-22,14,-13,1,4,-21,-24,-17,-14,-6,0,28,-27,-9,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-22,-27,-19,-11,-12,-22,-14,-2,-15,-8,-3,-21,30,-15,-18,-11,-8,-3,-26,-15,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-19,-13,-10,-4,-20,-4,-10,-1,-11,-6,-6,-17,-8,-3,1,8,-2,-19,2,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-19,-38,-29,68,-28,-21,2,-28,9,0,-20,-29,-38,-20,-18,-9,4,5,24,-29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00044;
//
ID   HISTONE_H2A_MP; MATRIX.
AC   MP00046;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histone H2A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6012654; R2=0.0129481; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=457; N_SCORE=10.509; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=147; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-25,24,4,-31,9,-9,-33,1,-30,-22,10,-12,-3,-6,8,-5,-23,-32,-21,1;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-14,-10,-3,-22,-4,-15,-17,2,-20,-13,-2,-10,-3,-7,16,4,-7,-26,-18,-3;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-26,-8,-7,-28,25,-16,-31,7,-26,-15,-2,-15,-7,-2,-2,-13,-21,-20,-21,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-23,0,7,-27,-13,-10,-27,30,-30,-13,3,-10,7,17,6,0,-17,-27,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,14,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=15,-3,-14,-7,0,-19,-6,-12,-16,11,-17,-9,-2,-8,0,1,6,0,-8,-19,-13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-24,-5,1,-21,-20,-11,-24,27,-21,-10,0,-12,4,26,0,9,-14,-23,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-3,5,-25,0,4,-25,-13,-6,-25,30,-26,-12,10,-13,5,23,-3,-7,-19,-24,-13,4;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-24,-13,-10,-24,9,-13,-11,-10,-14,-4,-10,-20,3,-10,-3,-10,-4,-23,-17,-4;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-13,-1,-3,-21,10,-11,-23,-11,-30,-20,9,-11,-3,-11,34,14,-13,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-16,-10,2,-26,-6,-8,-15,-4,-17,-9,-3,-10,14,-8,13,1,-12,-24,-17,8;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,18,-22,-14,-20,-6,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-16,-14,-22,6,-2,-2,-26,-22,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-13,-23,-19,-7,-18,-23,-14,8,-11,-3,4,-9,-14,9,-13,-2,0,1,-21,-8,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-4,-30,-4,-7,-24,12,58,-34,-14,-24,-7,6,-20,-1,-7,-6,-20,-30,-26,2,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-9,-4,-22,2,-6,-31,14,-24,-14,1,-19,2,40,-1,-8,-21,-23,-16,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-18,-23,-20,-14,-2,-25,23,4,-19,21,22,-15,-25,-6,-11,-21,-13,-3,-23,6,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-24,-4,3,-23,-14,-6,-27,24,-26,-13,3,-14,7,31,6,0,-17,-26,-13,3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-10,-30,-10,-14,-27,41,-14,-37,-4,-27,-17,0,-20,-10,9,-3,-17,-27,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-20,3,4,-24,-13,0,-17,0,-20,-10,20,-13,18,0,10,12,-20,-30,-13,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-24,-17,-17,17,-27,7,-3,-10,-3,-3,-14,-24,-10,-10,-7,9,-7,11,51,-17;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-30,-4,7,-27,-20,35,-27,11,-20,-4,3,-17,26,28,-7,-13,-26,-23,0,13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00045;
//
ID   HISTONE_H4_MP; MATRIX.
AC   MP00047;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histone H4 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5984073; R2=0.0091551; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=972; N_SCORE=12.496; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-18,-22,-27,-17,-3,-20,0,11,-3,13,48,-17,-20,2,4,-18,-10,5,-20,-2,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=24,-4,-8,-10,-6,-15,-3,-14,-11,-8,-13,-11,-2,-8,-6,-13,17,12,-3,-23,-15,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-23,-5,3,-19,-15,-3,-23,30,-19,-8,0,-12,8,42,-8,-8,-15,-15,-8,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-18,-31,66,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-27,-13,-21,-26,57,-21,-31,-20,-25,-16,-4,-21,-21,-20,-1,-17,-19,-21,-27,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-19,-22,-17,12,-23,-1,11,-15,21,20,-20,-23,-9,-12,-20,-8,3,-3,22,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-25,-8,-17,-25,58,-17,-33,-17,-25,-17,0,-17,-17,-17,0,-17,-25,-17,-25,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-25,0,8,-25,-17,-8,-25,41,-25,-8,0,-8,8,25,-8,-8,-17,-17,-8,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-15,-18,-22,-10,8,-22,2,-17,-5,-2,-15,-22,-22,-17,-5,-7,15,-22,-15,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-25,-8,-17,-25,58,-17,-33,-17,-25,-17,0,-17,-17,-17,0,-17,-25,-17,-25,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-5,-4,-3,-9,-3,-8,-7,-5,-10,-7,1,-5,-3,-6,13,11,-2,-16,-9,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=10,-16,-12,-19,-16,-10,-16,-21,8,-16,-6,-3,-12,-19,-15,-17,10,6,19,-31,-14,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-20,-19,-15,3,-23,-13,11,-23,32,11,-10,-28,-15,-15,-21,-8,1,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,3,-24,-16,-4,-30,35,-24,-10,0,-16,9,52,-10,-10,-20,-20,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-1,25,-25,36,24,-33,-10,-5,-30,0,-23,-23,8,-7,3,-10,2,-8,-23,-33,-20,14;
MA   /M: SY='N'; M=-3,20,-15,7,-3,-17,-5,-3,-17,-5,-25,-17,32,-15,-3,-5,20,18,-17,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-27,-4,18,-25,-21,2,-11,2,-5,6,-7,-12,32,1,-7,-10,-19,-22,-10,25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00046;
//
ID   PROTAMINE_P1_MP; MATRIX.
AC   MP00048;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protamine P1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2567682; R2=0.0062077; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=717; N_SCORE=8.704; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=362; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=46,-12,-10,-21,-12,-18,-2,-21,-7,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,4,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-28,-20,-20,34,-28,13,-2,-12,-1,-2,-14,-29,-14,-11,-18,-9,-10,21,64,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-28,-9,0,-18,-18,0,-28,28,-18,-9,0,-18,9,64,-9,-9,-18,-18,-9,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-11,20,-13,-9,-16,-19,-5,-23,1,-16,-11,-7,-15,-5,16,-8,-8,-14,-26,-13,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-9,37,-13,-11,-14,-14,-12,-19,-7,-15,-12,-6,-19,-9,0,1,-2,-9,-27,-16,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-22,-7,-2,-13,-16,16,-19,11,-10,-4,-1,-16,5,34,-9,-9,-15,-17,-2,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-11,0,-2,-18,-3,-10,-18,-9,-27,-18,13,-11,-2,-9,34,23,-10,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-31,-8,3,-24,-20,9,-28,20,-21,-9,-1,-9,15,47,-9,-11,-23,-22,-9,5;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-29,-10,0,-21,-16,-1,-27,22,-17,-8,-2,-19,12,54,-9,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13,-3,-15,-22,-3,-22,21,-9,-5,-5,-22,5,56,-13,-10,-15,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-10,26,-13,-13,-10,-15,-10,-19,-16,-21,-16,-5,-23,-11,-16,13,5,-10,-30,-4,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-20,-12,-3,-19,-21,-3,-28,21,-20,-11,-4,-14,5,53,-10,-10,-20,-21,-9,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-23,-13,-6,-9,-23,7,-23,15,-16,-8,-5,-20,3,41,-12,-11,-18,-12,9,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-30,-9,0,-20,-16,-2,-26,18,-21,-11,-2,-9,9,45,-6,-8,-21,-20,-9,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-24,-8,0,-16,-16,0,-24,24,-16,-8,0,-16,8,57,-8,-8,-16,-16,-8,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-24,-7,2,-18,-16,1,-22,21,-16,-7,0,-14,14,48,-7,-8,-17,-16,-8,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-25,-8,0,-20,-15,-2,-28,21,-22,-12,2,-18,8,52,1,-3,-18,-25,-12,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-16,-5,0,-11,-11,0,-16,16,-11,-5,0,-11,5,38,-5,-5,-11,-11,-5,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,4,-14,-9,-21,-13,-10,-30,8,-22,-14,-5,-18,-3,31,-7,-10,-19,-28,-18,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-16,-9,-2,-20,-15,6,-27,16,-19,-9,-1,-19,8,43,-8,-10,-19,-21,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-17,-9,-2,-17,-17,-2,-25,21,-17,-9,-1,-18,6,51,-7,-7,-16,-19,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-9,-4,-22,-1,-5,-30,15,-23,-13,1,-19,3,42,-1,-7,-20,-23,-15,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-23,-10,-8,-20,7,-12,-21,-3,-19,-12,0,-17,-5,10,6,-3,-14,-26,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-18,-6,0,-12,-12,0,-18,18,-12,-6,0,-12,6,43,-6,-6,-12,-12,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-17,-4,-1,-7,-9,7,-12,5,-9,-4,1,-12,6,14,-5,-6,-12,-6,7,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00047;
//
ID   RIBOSOMAL_L14_MP; MATRIX.
AC   MP00049;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L14 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9080102; R2=0.0118940; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=653; N_SCORE=11.665; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=218; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-22,14,19,-27,-10,-6,-25,3,-24,-18,6,-8,8,-3,12,4,-19,-32,-18,13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-5,-12,-8,-11,-4,-14,-6,-7,-6,-6,-6,-8,-8,-12,8,7,2,-16,-12,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-13,-14,-16,-11,-4,-17,-14,9,-8,6,5,-11,-13,-9,-7,-6,0,9,-16,-5,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-25,-6,-1,-20,-12,-13,-13,-6,-19,-13,-10,52,-6,-13,-5,-6,-19,-20,-20,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,13,-15,7,1,-16,2,0,-17,0,-18,-12,21,-11,1,3,5,0,-17,-22,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-8,-8,-9,-11,6,-7,-9,-8,-9,2,1,-13,-6,-9,2,-1,-8,-19,-11,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-18,-9,-5,-11,-13,-10,-9,1,-12,-6,-7,4,-3,0,-3,-1,-7,-9,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-31,-28,1,-31,-28,30,-23,18,13,-29,-29,-27,-21,-14,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,1,14,-29,-20,-9,-29,41,-28,-12,-1,-4,10,25,-8,-9,-21,-22,-12,11;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-27,-1,8,-26,-18,-8,-27,40,-25,-9,0,-10,9,31,-8,-9,-18,-19,-9,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-22,-6,-13,-25,45,-15,-31,-14,-27,-18,2,-15,-13,-15,10,-8,-22,-23,-24,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-28,23,25,-33,-17,-2,-29,14,-24,-16,5,-8,18,5,0,-6,-26,-29,-15,22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-16,-28,-24,-4,-30,-27,25,-13,7,9,-24,-26,-23,-15,-12,-3,36,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-24,-9,-27,-21,4,-28,-16,13,-17,12,10,-22,-26,-19,-16,-16,-6,17,-21,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-5,3,-20,-20,-1,-25,25,-22,-10,-1,-7,6,29,-9,-9,-20,-19,-5,2;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-20,3,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,-1,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,17,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-29,-10,-1,-19,-20,-1,-29,28,-19,-10,0,-19,9,66,-8,-7,-19,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-17,-8,-1,-19,-20,-5,-11,-6,-10,-4,-2,-13,12,-5,9,20,-9,-27,-9,5;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-8,-8,-10,-3,-22,-17,-12,-23,19,-21,-11,-4,-17,0,21,-3,-5,-12,-25,-14,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-4,6,-22,-20,-5,-26,34,-24,-8,0,-13,10,28,-8,-8,-19,-20,-8,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-29,5,17,-28,4,-9,-27,-4,-24,-18,-1,7,1,-10,1,-9,-26,-28,-23,8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-30,-23,13,-29,-16,14,-20,14,9,-24,-27,-18,-15,-20,-10,10,3,14,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-23,-9,0,-21,-20,-5,-25,25,-19,-8,-3,-17,8,41,-10,-9,-17,-21,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-26,-10,0,-21,-19,-2,-30,30,-21,-10,-1,-20,9,63,-10,-10,-20,-21,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-28,-1,4,-25,-16,-11,-19,8,-21,-13,-3,9,1,3,-3,-5,-17,-27,-17,1;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-27,58,15,-35,-8,1,-35,-1,-30,-28,26,-12,0,-8,4,-7,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-14,-14,-11,-10,-15,-15,-1,-13,-7,2,-4,-15,-7,-13,14,18,4,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-23,-23,-18,10,-26,-2,1,-12,-1,2,-14,-23,-12,-6,-11,-3,-1,-1,18,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-34,-27,1,-34,-27,37,-27,21,17,-22,-23,-21,-25,-17,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-25,-8,2,-18,-18,-3,-23,22,-20,-8,-3,-16,8,29,-5,-7,-16,-17,-2,2;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-28,40,28,-34,-10,-1,-35,3,-26,-24,11,-8,6,-3,2,-8,-28,-35,-20,17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-27,47,17,-34,-8,-3,-35,1,-27,-25,15,-10,1,-7,3,-4,-26,-36,-19,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,19,0,-20,-1,9,-20,0,-29,-20,58,-20,0,0,10,2,-29,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-11,-17,-10,-19,-1,-18,-9,-10,-11,-10,-6,-11,-10,-18,11,1,0,-23,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,12,-23,-19,-16,-6,-23,-8,-17,-8,-7,-15,-21,-19,-22,0,-4,5,-28,-20,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,36,-28,29,18,-25,-25,-22,-25,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-27,2,-34,-28,37,-27,23,17,-24,-24,-22,-25,-18,-6,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-12,31,-23,25,5,-25,-8,1,-26,7,-28,-20,34,-15,1,2,5,1,-25,-36,-17,3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-28,8,12,-30,-14,-4,-24,10,-26,-14,7,5,12,2,0,-7,-25,-28,-18,11;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-29,20,22,-31,-16,0,-30,18,-25,-17,11,-10,15,13,-2,-9,-26,-29,-16,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-27,-5,-12,-24,35,-15,-29,-12,-19,-13,1,-19,-13,-12,-3,-13,-23,-23,-22,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,14,-21,10,18,-22,-11,-3,-18,-1,-19,-16,17,-10,4,-5,7,2,-19,-32,-17,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-36,-13,-3,-25,-20,-18,-14,-11,-21,-11,-20,72,-10,-19,-11,-10,-23,-28,-25,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-29,-11,-2,-19,-23,-10,-15,25,-13,-4,-4,-17,3,32,-13,-10,-11,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-8,-19,-30,67,-20,-40,-19,-30,-20,0,-18,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-13,-8,-6,-14,-14,-17,-15,-3,-16,-12,2,-11,-6,-4,19,35,-5,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-28,-3,10,-22,-19,-3,-24,18,-18,-11,-1,-15,9,39,-6,-9,-18,-23,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-27,19,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-21,-26,-17,35,-25,-13,-7,-9,0,2,-13,-23,-20,-4,-12,-4,-4,-6,12,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-27,-10,-20,-30,68,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00048;
//
ID   RIBOSOMAL_L23_MP; MATRIX.
AC   MP00050;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L23 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1884298; R2=0.0195456; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=144; N_SCORE=8.984; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=16; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-25,-8,-1,-21,-21,-11,-15,27,-18,-5,-4,-16,1,19,-9,-7,-6,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-21,-6,0,-17,-12,-12,-18,5,-16,-10,-5,-9,-2,0,0,3,-12,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-10,-24,-10,-3,-20,-21,-13,-17,24,-19,-7,-8,-12,-1,19,-10,-7,-8,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-22,-11,-2,-17,-18,-7,-18,14,-14,-7,-5,-19,2,33,-7,-7,-9,-23,-11,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-11,-23,-13,-8,-8,-20,-11,-6,3,-7,2,-10,-18,-5,0,-8,-4,-1,-19,-5,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-24,-13,-16,-19,19,-18,-17,-9,-17,-10,-3,-21,-14,-8,-3,-9,-8,-23,-19,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,4,-26,-1,-2,-20,-9,-2,-23,10,-23,-13,13,-8,1,17,-1,-4,-21,-27,-14,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-13,-21,-19,-14,5,-18,-9,-4,-10,-3,-2,-9,-19,-12,-5,-4,7,-2,-14,6,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-17,-22,-20,-11,-4,-22,-14,8,-14,9,10,-14,-16,-8,-13,-11,-5,4,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-29,-17,-21,-20,33,-21,-14,-21,-15,-8,-5,-20,-18,-21,-5,-14,-13,-20,-19,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-22,-12,-7,-8,-22,3,-14,5,-11,-3,-5,-18,-2,10,-4,4,-9,-18,3,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-25,-10,-3,-19,-19,-12,-18,6,-19,-10,-6,10,-1,10,0,6,-14,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-21,-3,-3,-19,-14,-10,-12,3,-15,-6,2,-7,-3,0,2,1,-9,-29,-14,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,6,-27,6,-2,-24,5,6,-29,1,-25,-15,9,-17,1,7,0,-9,-24,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-27,-16,-10,4,-23,-4,-8,-7,-7,-6,-16,-23,-7,-6,-14,-7,-10,16,26,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,-12,-22,-12,-15,-5,-15,-3,-10,-3,6,-12,-12,-8,-18,3,-2,2,-20,-15,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-26,-31,-26,14,-34,-14,26,-22,11,10,-20,-24,-19,-21,-17,-6,17,-5,24,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-20,-8,-3,-17,-20,-13,-20,14,-17,-10,0,-12,0,19,6,21,-10,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=9,0,-20,-4,6,-25,-12,-10,-20,12,-21,-11,1,-10,7,3,6,2,-14,-25,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=-2,1,-27,6,16,-28,-14,-10,-24,4,-25,-18,-2,17,3,-5,2,-5,-22,-30,-21,8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-28,11,2,-29,28,-12,-33,-10,-25,-20,5,-15,-8,-13,1,-12,-26,-27,-24,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,3,-26,5,2,-5,-18,13,-16,-5,-15,-10,1,-18,4,-6,-3,-6,-19,-10,19,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-5,10,-20,11,6,-20,-10,-7,-22,-1,-23,-17,10,-10,0,-3,14,8,-16,-33,-15,2;
MA   /M: SY='I'; M=6,-25,-24,-34,-24,-4,-28,-26,31,-25,15,12,-18,-18,-17,-26,-13,-7,20,-20,-5,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,3,-29,10,11,-26,-15,-8,-20,-4,-17,-14,-2,15,2,-9,-4,-7,-22,-30,-19,5;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-20,-29,-23,19,-29,-22,16,-24,18,8,-22,-22,-24,-20,-18,-6,14,-14,5,-23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=2,-21,-15,-27,-20,24,-19,-20,4,-20,8,1,-17,-21,-23,-18,-9,-3,6,-9,4,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-8,-13,-10,-7,-3,-8,-8,4,-7,4,5,-5,-10,-5,-6,-7,-5,0,-11,-3,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-23,-5,-4,-23,20,-14,-24,-9,-21,-14,-1,-5,-8,-12,4,-6,-19,-23,-21,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-1,-7,-19,-9,-3,-14,-10,-13,-7,-9,-9,-6,-5,-14,-6,-10,-3,-7,-5,-25,-12,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-12,-18,-15,-5,-1,-23,-14,1,-12,2,-1,-11,-19,-10,-13,-8,-2,1,-21,-3,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00049;
//
ID   RIBOSOMAL_L39E_MP; MATRIX.
AC   MP00051;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L39e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8864479; R2=0.0133431; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=798; N_SCORE=15.524; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-29,-3,7,-28,-19,-9,-29,44,-27,-10,0,-12,9,35,-9,-10,-19,-20,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-14,-18,-8,-19,-6,-18,-10,-2,-7,-7,-10,-12,-8,-12,3,-3,-2,-20,-16,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-24,-14,-7,-4,-24,-6,3,-11,13,9,-13,-21,-4,-10,-16,-10,-2,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-29,1,7,-27,-18,-6,-29,42,-28,-11,6,-13,9,33,-8,-9,-21,-22,-11,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-27,-2,14,-34,-17,5,-21,9,-21,-4,1,-11,43,14,5,-6,-25,-23,-12,28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-24,-7,0,-20,-14,-3,-27,19,-23,-13,3,-17,7,47,4,-2,-17,-26,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-10,-33,-7,4,-25,-18,-8,-25,9,-24,-15,-6,26,1,22,-7,-9,-24,-26,-20,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-19,-32,-27,-1,-32,-27,32,-23,15,14,-25,-20,-23,-23,-15,-5,33,-25,-7,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-19,-17,-9,-18,-11,-11,-2,-10,-5,2,-11,-14,1,-12,-2,-5,2,-23,-13,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,17,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,136,30,-21;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-17,-29,-25,-1,-29,-26,25,-16,7,8,-23,-24,-23,-18,-11,-4,32,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-24,-25,-17,-8,-27,-13,13,-4,4,16,-14,-21,-6,8,-14,-7,11,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-18,-31,-23,1,-26,-19,24,-21,23,24,-24,-24,-17,-19,-17,-6,23,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-29,-5,5,-25,-20,-6,-26,40,-23,-5,-1,-14,9,39,-11,-10,-18,-20,-9,6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-12,-9,-8,-12,-19,-19,-12,-6,-13,-11,0,-7,-8,-7,17,43,-3,-30,-11,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-25,14,6,-27,3,-2,-28,6,-27,-18,21,-15,3,5,3,-7,-26,-30,-19,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-26,-3,-6,-21,6,5,-28,5,-24,-14,14,-20,-1,20,-1,-9,-24,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-25,1,8,-23,-18,-7,-26,22,-23,-13,2,-12,6,26,1,3,-17,-25,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-18,-32,-29,2,-25,-28,29,-23,10,11,-24,-26,-26,-23,-13,-5,34,-24,-6,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-9,2,-17,-22,-3,-19,15,-14,-6,-3,-17,9,32,-6,-3,-14,-22,-8,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-26,-14,-11,12,-21,5,-11,-4,-8,-5,-10,-23,-2,3,-9,-6,-13,3,32,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-11,28,-21,14,0,-20,-4,28,-22,-3,-28,-16,45,-19,2,-1,8,-3,-28,-38,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=0,-16,-29,-14,-5,-16,-16,-10,-15,-9,-17,-11,-14,34,-9,-11,-6,-7,-18,-23,-15,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-26,-8,2,-22,-19,-6,-20,26,-14,-5,-5,-14,3,16,-11,-9,-13,-21,-8,2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-13,-3,-17,-20,0,-23,25,-15,0,-3,-20,9,59,-11,-10,-16,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-18,11,-28,7,0,-18,-16,70,-27,-7,-22,-6,20,-20,6,-1,-6,-14,-29,-29,12,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-9,0,-20,-19,-1,-29,27,-21,-11,1,-19,9,64,-6,-8,-19,-21,-11,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,7,-17,-1,-4,-18,-6,-10,-18,2,-21,-13,14,-14,-4,-2,12,16,-12,-31,-15,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,15,-27,16,10,-30,-14,-5,-30,29,-30,-16,12,-11,6,15,-2,-6,-23,-28,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-19,7,-28,-19,17,-27,42,19,-26,-27,-18,-18,-24,-4,9,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-29,10,6,-31,-4,-8,-32,29,-30,-15,8,-12,3,15,-6,-11,-24,-24,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-21,-22,-11,-4,-26,-22,14,-14,6,4,-19,-17,-15,-16,-11,-6,16,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-13,-30,-13,-9,8,-26,9,-11,12,-11,-4,-13,-23,-3,5,-16,-10,-14,12,47,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00050;
//
ID   RIBOSOMAL_S7_MP; MATRIX.
AC   MP00052;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S7 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8889818; R2=0.0136860; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=198; N_SCORE=7.589; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-23,-3,-3,-22,-5,-1,-25,12,-22,-12,9,-18,1,25,-3,-7,-20,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-24,-10,-3,-13,-19,1,-13,0,-13,-6,-4,-7,0,4,-2,0,-11,-21,-2,-4;
MA   /M: SY='A'; M=18,-10,-16,-14,-8,-16,-12,-16,-6,-7,-11,-7,-9,-12,-7,-13,4,0,2,-20,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-26,-1,12,-23,-17,-9,-18,10,-20,-12,-3,3,2,1,-3,-6,-15,-26,-16,6;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-28,-4,5,-25,-19,-9,-24,33,-23,-8,-2,-12,7,27,-8,-8,-15,-21,-11,5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-29,-8,0,-21,-15,-2,-27,22,-21,-10,-1,-15,9,46,-7,-7,-20,-20,-9,1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-8,-25,-9,-1,3,-22,-12,-6,-10,-5,-6,-7,-10,-8,-11,-8,-6,-8,-19,-4,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-21,-16,-16,-10,-23,-21,11,-14,2,2,-15,-16,-16,-14,-9,-4,16,-27,-11,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-24,-15,-6,-10,-17,-15,-5,-3,3,2,-13,-11,-7,-5,-12,-7,-6,-23,-9,-7;
MA   /M: SY='P'; M=4,-8,-25,-7,-1,-23,-9,-14,-18,-7,-23,-15,-6,24,-4,-12,4,-1,-17,-28,-22,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,50,21,-37,-13,1,-36,6,-28,-24,15,-10,9,-2,-1,-10,-29,-35,-18,15;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-26,-7,-1,-21,-11,-14,-15,-7,-21,-14,-12,51,-7,-13,-3,-4,-19,-22,-20,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-13,-15,-16,-10,-6,-20,-13,5,1,-1,4,-10,-15,-6,1,-9,-5,7,-16,-4,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-20,-18,-16,29,-21,8,-1,-11,1,-1,-14,-21,-12,-9,-14,-7,-6,18,46,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-18,5,-2,-18,10,6,-20,-1,-20,-12,21,-14,-1,1,2,-6,-21,-23,-13,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,9,-10,6,-2,-20,-8,-7,-17,-5,-24,-15,15,-15,-3,-8,16,6,-12,-37,-18,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-9,-2,-16,-20,-8,-13,6,-13,-7,-7,-4,0,10,-6,-4,-10,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-30,-21,3,-32,-23,26,-26,30,16,-25,-25,-20,-21,-21,-5,20,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-15,-31,-26,0,-29,-27,28,-23,17,12,-26,-26,-24,-22,-14,-4,34,-25,-7,-26;
MA   /M: SY='S'; M=5,4,-17,1,10,-20,-11,-8,-19,-1,-19,-15,5,-9,1,-6,14,13,-13,-31,-16,5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-27,-11,-1,-19,-21,-3,-18,24,-12,3,-5,-17,7,31,-13,-10,-13,-20,-7,2;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-33,-24,31,-29,-20,13,-27,29,13,-24,-28,-25,-20,-22,-8,8,-10,9,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-20,-32,-26,-2,-31,-26,33,-22,13,16,-21,-22,-20,-23,-12,-1,30,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-17,13,-2,-20,-2,7,-19,-2,-27,-17,45,-19,-1,-1,10,1,-25,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-17,-11,-5,-14,-19,1,-17,9,-16,-5,-3,-19,0,16,-5,-7,-11,-23,-5,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-18,-32,-24,2,-31,-20,27,-23,24,20,-24,-25,-18,-19,-20,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-5,20,-15,27,51,-22,-22,-5,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-23,-13,-6,-8,-21,-6,-6,6,-2,3,-9,-19,-2,11,-12,-7,-4,-17,0,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-23,21,9,-25,-9,8,-25,2,-24,-17,16,-8,3,-2,4,-2,-22,-31,-13,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-15,-6,-5,-18,-1,-8,-16,-11,-17,-12,5,-14,-3,-11,17,11,-10,-31,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-21,-23,-15,-4,-28,-20,13,-12,14,10,-18,-21,-13,-9,-13,0,12,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-11,-17,-10,-19,-2,-19,-9,-11,-11,-10,-9,-10,-10,-19,12,3,1,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-25,-4,12,-14,-22,1,-15,3,-11,-6,-7,-15,14,6,-5,-6,-16,-15,4,12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-24,-4,0,-21,-10,-5,-24,16,-22,-12,6,-15,5,22,1,-1,-17,-23,-11,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,47,-30,21,19,-21,-21,-21,-29,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-15,-33,-28,14,-31,-25,25,-24,19,15,-26,-28,-26,-21,-17,-5,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-14,-28,-14,-12,17,-26,14,-7,-3,-6,-4,-13,-25,-6,-4,-14,-8,-12,15,55,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-26,12,8,-27,0,1,-28,2,-24,-16,9,-13,5,1,3,-6,-24,-28,-15,6;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-8,-15,-8,-19,-3,-18,-12,-10,-14,-12,-5,-10,-8,-17,17,11,-2,-25,-19,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-21,-35,-25,38,-29,-17,13,-27,26,18,-23,-28,-25,-19,-23,-10,7,-7,13,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-28,25,22,-29,-13,4,-30,9,-24,-18,8,-9,8,1,-1,-8,-25,-30,-13,14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-13,-25,-18,-9,-11,-23,-13,6,-6,2,4,-7,-19,-5,-1,-11,-7,2,-23,-7,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-23,-35,-27,0,-34,-28,37,-27,19,16,-22,-21,-21,-26,-18,-7,27,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-24,0,13,-23,-12,2,-22,8,-19,-11,1,-11,10,4,0,-7,-19,-22,-9,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-21,4,18,-22,-17,-6,-18,10,-15,-9,-1,-10,9,3,-3,-7,-16,-24,-13,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-28,-6,4,-23,-20,-7,-22,27,-18,-6,-2,-12,8,30,-9,-8,-16,-21,-10,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-13,-11,-10,-8,-19,-15,-7,-9,-4,-6,-3,-14,-10,-8,9,32,0,-27,-7,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-28,5,5,-29,17,-5,-32,2,-27,-17,10,-14,2,-2,1,-11,-27,-26,-20,3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,4,19,-28,-9,-4,-25,12,-22,-12,2,-10,16,8,0,-8,-22,-25,-16,17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-26,40,17,-31,-7,2,-31,2,-28,-24,27,-10,2,-5,4,-6,-29,-37,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-34,-9,-1,-27,-16,-17,-17,-9,-25,-17,-16,60,-10,-18,-6,-8,-22,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-22,-31,-23,4,-28,-22,25,-25,28,17,-24,-26,-20,-21,-21,-8,17,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-27,3,16,-25,-20,-6,-14,3,-13,-6,-3,-6,15,-2,-3,-7,-16,-26,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00051;
//
ID   RIBOSOMAL_S8_MP; MATRIX.
AC   MP00053;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S8 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2529759; R2=0.0151300; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=674; N_SCORE=15.441; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-11,-19,-10,-5,-13,-22,-18,5,-8,-4,-2,-13,-19,-11,-10,-4,-2,14,-29,-13,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-28,-26,-22,28,-31,6,8,-16,8,5,-21,-29,-15,-14,-21,-10,-2,16,54,-22;
MA   /M: SY='E'; M=2,-5,-18,-3,11,-22,-15,-13,-14,1,-16,-11,-6,-6,-1,-6,3,-3,-8,-29,-18,5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-25,1,3,-27,2,-8,-27,13,-27,-14,5,-12,4,7,3,-6,-21,-25,-16,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-17,-27,-19,-14,2,-18,-5,-11,-6,-12,-8,-14,-21,-9,-6,-10,-9,-11,22,17,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-24,6,13,-24,-16,-8,-19,8,-18,-12,2,-11,4,1,0,-1,-14,-28,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-26,16,19,-28,-14,-2,-27,14,-24,-16,12,-10,9,9,0,-6,-23,-29,-16,14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-19,-25,-23,-14,-5,-28,-14,11,-8,13,10,-14,-23,-7,1,-18,-9,5,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-32,-15,-7,-7,-23,-9,-12,-7,-11,-8,-17,27,-9,-10,-13,-8,-17,-15,0,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-25,-15,-5,-10,-22,-9,-8,3,6,2,-13,-18,-1,11,-15,-8,-8,-20,-4,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-25,-24,-23,-18,-5,-26,-22,8,-16,-5,-2,-23,15,-21,-20,-11,-4,11,-23,-9,-21;
MA   /M: SY='A'; M=6,-12,-19,-16,-8,-8,-15,-12,-6,-4,-1,0,-9,-17,-6,-6,-3,-1,-4,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-26,2,-2,-23,8,-3,-28,9,-27,-16,20,-18,0,17,0,-8,-25,-27,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-29,5,-4,-31,36,-9,-34,-10,-28,-18,9,-16,-2,-11,1,-15,-30,-25,-24,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-23,-32,-24,24,-30,-15,16,-25,24,15,-25,-28,-21,-19,-23,-10,8,-2,16,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-9,-18,-30,68,-20,-40,-19,-30,-20,0,-20,-19,-20,0,-20,-30,-20,-30,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-22,-30,-24,3,-32,-20,27,-23,15,11,-20,-23,-19,-22,-14,-2,22,-18,4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=7,-21,-15,-26,-19,-1,-21,-20,12,-21,11,5,-18,-21,-17,-20,-7,-2,12,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,28,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-2,-2,-17,-5,-12,-18,-10,-25,-18,7,-10,-2,-10,35,27,-8,-37,-17,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-18,-2,0,-22,-6,-12,-20,-10,-29,-20,4,15,-3,-12,25,13,-16,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-27,1,10,-28,-16,1,-25,22,-23,-9,0,-11,17,16,-2,-7,-21,-23,-10,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,35,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-21,-31,-22,2,-25,-10,25,-17,26,44,-22,-22,-8,-15,-22,-10,15,-20,0,-16;
MA   /M: SY='T'; M=1,6,-15,5,-1,-19,-12,-13,-17,-9,-18,-15,4,-7,-6,-11,18,24,-8,-33,-15,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,24,-28,31,7,-31,-4,31,-34,-5,-26,-17,17,-15,3,-6,-3,-13,-30,-34,-8,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-27,1,8,-18,-19,1,-22,15,-19,-11,1,-14,6,18,-5,-7,-18,-19,-2,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-26,13,34,-27,-17,-3,-24,8,-18,-16,2,-6,14,1,1,-6,-22,-29,-17,24;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-20,-10,-20,2,-20,-11,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-11,-3,-17,-22,2,-21,22,-16,-6,-3,-19,6,45,-11,-10,-15,-18,-3,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-25,5,14,-25,-16,-6,-24,16,-19,-12,2,-11,7,13,-2,-6,-18,-26,-14,10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-5,-24,-7,4,-23,-16,-8,-19,15,-14,-7,-3,-14,9,14,-4,-6,-15,-22,-12,6;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-27,2,-5,-26,21,2,-31,1,-28,-16,16,-18,-3,0,0,-12,-28,-27,-18,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-18,-33,-28,0,-33,-28,34,-24,18,14,-25,-25,-24,-23,-15,-3,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-20,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-29,9,38,-28,-21,-3,-24,14,-19,-13,-2,-6,18,8,-3,-9,-22,-27,-16,27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-17,-31,-25,2,-30,-26,28,-24,22,13,-26,-26,-23,-22,-16,-4,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23,7,-33,-23,29,-29,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='C'; M=9,-15,34,-23,-21,-13,0,-23,-23,-22,-16,-15,-12,-25,-22,-23,-2,-8,-10,-30,-21,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-24,-18,-15,22,-24,2,-6,-9,-3,-4,-13,-25,-12,-6,-10,-3,-8,6,39,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-33,-29,9,-32,-28,30,-23,13,12,-26,-27,-28,-22,-14,-4,38,-22,-3,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-27,-30,-29,-23,22,-23,-7,-10,-17,-9,-9,-25,-28,-17,-16,-22,-16,-16,62,41,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00052;
//
ID   RIBOSOMAL_S11_MP; MATRIX.
AC   MP00054;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S11 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4106469; R2=0.0125333; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=732; N_SCORE=13.575; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=27,-17,-10,-23,-18,-11,-13,-24,6,-14,-2,-2,-17,-18,-18,-19,3,3,20,-25,-15,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-17,-22,-22,-7,-4,-22,12,-19,3,4,-16,-20,-20,-19,-9,-7,17,-20,-11,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-26,8,9,-28,9,-6,-29,-1,-25,-17,3,-12,0,-5,5,-8,-22,-28,-20,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-17,-25,-23,-4,-27,-22,24,-18,7,10,-15,-24,-18,-18,-8,0,27,-28,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-25,-16,-9,-5,-20,-6,-8,7,-5,3,-9,-20,-4,12,-13,-9,-7,-15,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-16,-27,-24,-2,-28,-26,24,-21,10,8,-20,-23,-21,-20,-6,5,29,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-27,-1,6,-29,-10,-9,-29,33,-29,-11,2,-11,9,21,-2,-7,-20,-23,-13,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-27,-11,-18,-25,49,-19,-30,-19,-25,-17,1,-19,-18,-19,2,-9,-23,-22,-25,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-33,-13,-5,-23,-21,-20,-11,-12,-18,-12,-18,57,-10,-18,-7,-3,-18,-29,-23,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=0,-12,-27,-10,-3,-22,-14,-13,-17,-5,-22,-14,-8,29,-4,-6,2,-2,-18,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-31,62,-17,-38,-17,-29,-18,0,-19,-13,-17,0,-19,-30,-20,-28,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-26,-10,-1,-22,-12,-6,-27,23,-20,-10,-2,-17,5,44,-6,-9,-17,-20,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-29,24,35,-33,-17,1,-28,7,-21,-17,4,-6,22,0,0,-9,-28,-28,-16,29;
MA   /M: SY='S'; M=14,-3,-11,-8,-5,-17,-7,-15,-14,-10,-19,-14,2,-8,-4,-12,25,24,-5,-32,-17,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-18,-10,-19,-1,-19,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-19,12,4,0,-21,-19,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-33,-24,1,-33,-22,31,-23,24,21,-23,-24,-17,-17,-21,-9,21,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,1,-21,-20,0,-30,32,-21,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=28,-7,-12,-13,-8,-22,4,-16,-16,-10,-17,-12,-4,-12,-5,-16,14,4,-7,-25,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,13,-33,-23,26,-29,37,18,-27,-27,-22,-23,-25,-9,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-21,-9,1,-14,-10,-7,-15,-4,-14,-8,-1,-14,4,-2,3,-3,-13,-22,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=0,-5,-22,-9,-7,-19,-2,-10,-19,3,-16,-9,2,-17,-3,12,1,-2,-12,-25,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-15,-10,-3,-20,-2,-13,-14,-9,-16,-11,-3,-12,-1,-12,16,5,-7,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-6,-17,-29,61,-16,-37,-18,-30,-20,7,-20,-17,-18,2,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-34,-25,20,-31,-20,24,-26,27,21,-24,-26,-22,-21,-23,-9,15,-14,6,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-23,-4,7,-20,-19,-11,-15,11,-15,-8,-4,-14,2,11,-2,0,-8,-26,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-35,-29,1,-35,-29,40,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,35,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-20,-11,-11,-16,-1,-14,-12,-8,-12,-8,-2,-16,-10,-9,6,8,-6,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-20,-6,1,-9,-15,-6,-18,-1,-15,-10,0,-17,1,9,3,-2,-14,-21,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-2,12,-20,-20,-6,-16,10,-12,-7,0,-14,7,14,-4,-4,-14,-26,-12,8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,62,26,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,17,-8,3,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-14,-23,-21,-6,-27,-24,19,-13,3,5,-19,-24,-20,-14,-9,-1,29,-28,-10,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,75,-9,-19,-3,-6,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-22,-32,-24,-1,-33,-24,32,-23,19,17,-22,-23,-17,-22,-16,-4,25,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,71,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-1,-27,-2,-2,-15,-19,78,-27,-11,-19,-2,8,-19,6,-2,-4,-12,-25,-29,15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,31,5,-25,-2,8,-25,0,-30,-22,51,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-25,-9,-18,-29,60,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-27,-23,-29,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-15,68,-24,-24,-15,-27,-27,-18,-23,-14,-14,-15,-30,-24,-23,-1,9,-1,-42,-22,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-29,-8,1,-21,-20,-2,-29,32,-21,-10,0,-18,9,61,-9,-8,-19,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-35,-11,-1,-26,-19,-17,-20,-1,-24,-16,-16,57,-6,-5,-9,-9,-24,-27,-24,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-14,-35,-8,2,-27,-20,-15,-22,10,-25,-14,-12,44,-3,3,-10,-10,-24,-26,-21,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-29,-2,3,-29,-1,-12,-31,32,-30,-13,1,-12,3,19,-5,-10,-21,-21,-15,3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-28,-8,-2,-24,-3,-9,-28,22,-23,-11,-2,-16,2,30,-6,-9,-17,-21,-14,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-11,-2,-17,-21,-3,-24,23,-18,-9,-1,-16,6,55,-10,-9,-16,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-2,-18,-20,-3,-25,24,-14,-8,-3,-20,7,58,-11,-10,-17,-20,-10,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-14,-27,-24,-1,-27,-25,23,-20,15,9,-23,-27,-24,-19,-12,-2,32,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00053;
//
ID   RIBOSOMAL_S12_MP; MATRIX.
AC   MP00055;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S12 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4748116; R2=0.0157505; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=480; N_SCORE=13.025; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,76,-9,-19,-3,-6,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-28,-6,10,-30,-20,20,-14,3,-12,11,-2,-13,42,5,-5,-11,-22,-21,-4,25;
MA   /M: SY='K'; M=11,-7,-22,-11,-1,-22,-13,-13,-19,19,-15,-8,-6,-13,0,12,-4,-6,-10,-20,-13,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-30,-2,11,-26,-20,-3,-29,35,-24,-10,0,-13,14,43,-8,-10,-22,-21,-11,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-31,-26,-1,-31,-27,32,-23,13,12,-23,-25,-23,-23,-10,-2,34,-27,-7,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-25,42,-30,-29,-9,-29,-30,4,-24,-3,-3,-25,-33,-29,-24,-9,-4,23,-38,-19,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-17,-22,-16,0,-26,-20,9,-20,21,10,-19,-15,-16,-16,-11,9,8,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-29,4,25,-26,-19,-3,-29,25,-23,-14,1,-9,13,29,-3,-8,-23,-25,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-15,-21,-15,-10,-14,-25,-20,-1,7,-7,-1,-15,-10,-11,0,-9,-2,9,-25,-11,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-25,-22,-17,4,-23,-11,4,-8,0,2,-14,-23,-12,0,-12,-7,4,-11,11,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-22,-18,-18,-14,5,-23,-4,-18,-9,-6,-6,-16,-16,-19,3,9,-2,-24,-14,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-22,-20,-28,-22,-4,-30,-23,22,-14,7,10,-18,-22,-17,-8,-10,2,25,-25,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-21,5,21,-22,-18,-9,-22,8,-19,-15,4,-7,6,1,8,13,-17,-29,-15,13;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-29,-10,-2,-26,-12,-18,-18,-10,-26,-18,-12,52,-8,-18,4,-2,-21,-30,-26,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-2,-26,35,-26,-6,0,-10,29,22,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-14,-24,-18,-9,-10,-25,-13,8,-10,5,8,-11,-13,-4,-6,-11,-5,4,-25,-9,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-31,-1,9,-30,-20,-11,-29,44,-30,-11,-2,-1,8,25,-10,-10,-21,-21,-12,8;
MA   /M: SY='C'; M=5,-24,23,-29,-26,-5,-25,-28,6,-22,-1,-2,-22,-28,-26,-23,-7,-4,21,-31,-15,-26;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,5,-25,-20,-12,-15,-25,3,-16,-4,-4,-19,-21,-20,-21,0,-1,18,-27,-17,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-11,-29,-27,-1,-27,-28,25,-20,12,9,-28,-28,-27,-20,-10,-1,42,-28,-10,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-29,-6,5,-25,-19,1,-23,19,-16,-5,2,-17,22,37,-7,-9,-21,-21,-10,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-15,-15,-12,-11,-19,-19,1,-12,-9,-5,-4,-15,-10,-9,13,20,7,-30,-11,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,13,-21,5,2,-22,-11,-5,-22,16,-27,-15,21,-13,2,8,8,7,-19,-31,-15,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-26,1,-7,-23,16,-5,-27,1,-24,-16,21,-20,-5,6,0,-9,-26,-28,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-28,-13,-9,-12,0,-5,-19,3,-18,-8,-3,-18,-6,7,-6,-11,-15,-18,-5,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-27,3,18,-16,-19,-5,-23,15,-17,-8,-2,-11,6,13,-5,-8,-19,-23,-10,12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-21,-26,-20,-8,-29,-24,22,-11,4,8,-19,-21,-13,-14,-11,-5,24,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-17,-28,-24,2,-29,-26,24,-21,6,7,-18,-22,-22,-21,-5,5,28,-25,-5,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00054;
//
ID   RIBOSOMAL_S17_MP; MATRIX.
AC   MP00056;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S17 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4048958; R2=0.0156797; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=423; N_SCORE=12.027; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-15,-8,-6,-8,-13,-12,-16,-3,-18,-12,1,-13,-6,-2,17,21,-7,-27,-7,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-18,-4,2,-17,-15,-10,-15,21,-17,-6,-1,-9,2,11,-1,3,-8,-19,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,5,-28,2,7,-27,-16,-6,-28,37,-28,-12,9,-13,8,29,-5,-7,-21,-24,-12,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-28,-23,23,-31,-3,14,-19,14,11,-22,-28,-17,-16,-21,-9,6,5,38,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-7,-25,-9,-3,-17,-20,13,-15,3,-13,-3,-4,-8,1,1,-6,-3,-13,-23,-1,-3;
MA   /M: SY='A'; M=32,-17,-11,-24,-17,-13,-11,-23,4,-14,-3,-3,-16,-16,-16,-20,3,0,16,-23,-16,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,0,-19,-20,95,-29,-9,-20,0,9,-20,10,2,-10,-19,-29,-29,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-26,46,9,-30,-12,-4,-26,-4,-21,-21,16,-15,-5,-11,-2,-7,-18,-38,-18,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-29,8,32,-26,-18,-5,-25,2,-23,-18,-3,16,9,-5,3,-5,-25,-30,-20,19;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-26,6,10,-25,-8,-5,-22,3,-24,-16,12,5,2,-2,3,-4,-24,-31,-20,5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,18,9,4,-5,-22,-4,-1,-23,-8,-26,-18,30,-23,-5,-8,5,-4,-24,-39,-22,-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-22,5,16,-21,-15,-3,-15,1,-15,-10,2,-9,8,-2,3,-2,-13,-26,-13,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=9,-19,19,-26,-21,-4,-19,-21,-4,-20,-5,-6,-17,-25,-21,-21,-4,-3,6,-25,-9,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-28,0,6,-27,-11,-3,-26,27,-26,-10,7,-13,10,21,-5,-8,-21,-23,-12,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-21,-18,-9,-9,-27,-21,15,-16,5,4,-18,-14,-14,-18,-10,-4,18,-27,-11,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-22,-17,-9,-8,-26,-11,2,-2,1,5,-12,-19,-5,0,-10,-1,4,-22,-3,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-24,-10,2,-12,-22,-12,-8,1,-6,-4,-7,-15,-1,3,-4,0,-6,-21,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-23,-36,-28,-1,-34,-29,39,-26,17,15,-22,-22,-21,-27,-16,-7,31,-22,-4,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-12,-23,-16,-8,-17,-7,-13,-2,-8,-7,3,-8,-17,-2,-9,-4,-6,-1,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,54,-31,-20,1,-29,11,-20,-17,0,-1,24,2,0,-10,-30,-29,-19,39;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-10,43,-18,-17,-14,-20,-18,-20,-19,-17,-15,-8,-24,-17,-19,8,13,-6,-39,-18,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-24,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-28,-3,7,-28,-18,-10,-28,41,-27,-10,-1,-11,8,29,-8,-8,-18,-20,-11,7;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-15,-3,-6,-13,-17,-14,-14,-7,-10,-10,2,-13,-7,-4,11,30,-6,-30,-11,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-28,-5,4,-25,-22,-13,-20,38,-23,-6,-4,-13,4,22,-10,-9,-10,-21,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-19,-8,-2,-19,-13,-1,-24,11,-21,-12,2,-16,3,28,6,1,-15,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-36,-38,-29,32,-24,-22,-13,-23,-10,-12,-31,-30,-26,-19,-31,-22,-19,92,30,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-20,-13,-11,-12,-20,-10,-3,1,-9,-2,-2,-21,-7,12,-4,0,4,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-26,6,-30,-25,26,-25,25,14,-28,-28,-25,-21,-18,-5,29,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-17,-21,-17,-5,-25,-19,12,-13,8,5,-18,-23,-16,-13,-9,0,19,-26,-7,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-27,5,19,-27,-12,-4,-28,18,-24,-15,4,-8,10,18,0,-7,-23,-26,-16,14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-20,-26,-22,-5,-28,-26,25,-17,9,9,-20,-23,-20,-18,-12,-5,27,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-20,-22,-15,-4,-27,-21,17,-18,14,7,-17,-22,-16,-17,-11,-2,16,-26,-7,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-26,5,24,-26,-16,-5,-22,7,-19,-14,-2,-2,11,1,1,-4,-19,-28,-17,17;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-24,-4,2,-24,-13,-7,-22,21,-21,-9,0,-11,4,15,-3,-6,-14,-23,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-9,-16,-15,-11,-18,4,-18,-12,-10,-12,-10,-7,-14,-11,-15,6,1,-4,-23,-17,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00055;
//
ID   RIBOSOMAL_S18_MP; MATRIX.
AC   MP00057;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S18 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3362789; R2=0.0138879; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=603; N_SCORE=12.701; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-27,-8,0,-24,-18,-11,-21,14,-21,-11,-6,6,3,17,-3,-2,-15,-24,-15,0;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-14,-19,-14,-11,3,-15,-9,-5,-12,-11,-8,-9,-1,-11,-13,3,1,-4,-13,5,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-24,-13,-7,-2,-20,-6,-13,10,-11,-2,-7,-16,-3,18,-10,-7,-9,-12,3,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-25,-3,3,-21,-13,-4,-25,18,-21,-12,4,-15,6,34,0,-4,-17,-24,-13,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-24,-6,2,-24,-17,-7,-26,24,-23,-11,-1,-4,7,33,-5,-7,-19,-22,-13,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-27,-4,3,-22,-19,-5,-24,32,-20,-8,0,-14,6,31,-9,-8,-16,-21,-9,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-22,-22,-16,10,-22,-14,3,-9,3,2,-15,-18,-16,-10,-13,-6,3,-10,8,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-6,47,-12,-13,-12,-12,-13,-15,-13,-12,-11,-4,-19,-13,-14,-2,-4,-7,-26,-16,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-17,-5,-1,-11,-11,-5,-13,10,-12,-6,-1,1,0,16,-5,-5,-11,-14,-8,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-16,-13,-19,-12,27,-17,-9,2,-15,9,2,-13,-13,-16,-11,-12,-6,-1,0,12,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,6,-6,-8,-13,-12,-14,-12,-7,-12,-9,-2,-13,-9,-9,5,12,-5,-25,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=10,-6,-14,-7,3,-15,-7,-10,-10,-1,-9,-6,-6,-4,-1,-5,1,-3,-6,-18,-13,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=1,0,-14,0,0,-12,-7,-8,-6,-2,-7,-5,-1,-5,-3,-6,-1,-3,-4,-16,-9,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-1,-13,-1,-2,-21,2,-11,-21,1,-22,-14,2,-5,-5,-3,3,-4,-15,-25,-17,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-11,-21,-15,-15,-12,-6,-17,1,-15,-7,-3,-5,-19,-12,-15,-2,-4,4,-25,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-27,11,16,-26,-16,-6,-23,10,-20,-13,3,-5,8,2,-2,-4,-20,-27,-14,11;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-23,-7,2,-11,-16,-1,-15,1,-12,-7,-4,-16,1,5,-2,-5,-11,-21,-3,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-36,-28,0,-36,-28,40,-26,18,16,-22,-21,-21,-24,-18,-8,30,-22,-3,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,62,17,-36,-9,2,-37,0,-30,-28,25,-12,0,-9,1,-9,-30,-39,-18,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,17,0,-12,2,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-30,2,9,-29,-19,-8,-30,44,-29,-11,1,-11,10,33,-9,-10,-21,-21,-11,9;
MA   /M: SY='D'; M=-16,44,-26,49,12,-32,-7,2,-32,0,-29,-25,31,-13,0,-7,4,-4,-29,-39,-19,6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-18,-27,-21,0,-28,-22,19,-20,14,13,-19,-18,-18,-19,-10,6,19,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-23,20,19,-28,-11,-3,-25,2,-23,-19,11,-9,8,-4,9,0,-21,-33,-18,13;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-18,-25,-18,3,-25,-19,12,-21,27,14,-21,-23,-16,-17,-15,2,9,-22,-3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-5,3,-22,-16,-7,-22,22,-23,-10,2,-14,7,28,1,-3,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-27,3,9,-25,-18,3,-26,20,-21,-10,6,-14,12,27,-5,-7,-21,-25,-11,8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-21,-35,-27,67,-29,-13,-1,-26,7,-1,-19,-29,-33,-18,-17,-8,-2,11,36,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-34,-27,2,-35,-27,36,-27,24,17,-25,-25,-22,-25,-19,-6,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,1,-11,-2,-2,-18,-3,-11,-18,-10,-26,-18,10,-11,-2,-10,33,24,-9,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-31,31,39,-33,-17,-2,-31,4,-24,-23,5,8,10,-5,-1,-10,-30,-33,-21,24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-26,-5,2,-21,-15,1,-22,13,-19,-8,4,-16,16,27,-1,-2,-20,-20,-6,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-11,-19,-26,59,-15,-36,-19,-27,-18,-1,-20,-18,-19,-1,-18,-27,-18,-23,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-22,-3,7,-28,-21,-10,-30,44,-28,-11,-1,-13,8,31,-10,-10,-19,-22,-11,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-39,-29,49,-29,20,21,-20,-20,-19,-29,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-22,-23,-17,0,-27,-13,11,-13,17,11,-15,-25,-12,-1,-18,-7,7,-20,0,-16;
MA   /M: SY='P'; M=2,-14,-29,-9,-2,-27,-8,-18,-20,-11,-28,-19,-11,49,-8,-18,5,-2,-22,-31,-27,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-25,-8,0,-21,-13,-4,-26,19,-20,-11,0,-17,8,42,0,-5,-17,-23,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,-1,-20,-18,5,-30,27,-20,-10,1,-20,9,64,-10,-11,-21,-21,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-32,-26,0,-32,-26,32,-24,19,15,-23,-24,-21,-21,-16,-6,29,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-1,5,-11,-6,-9,-11,-17,-16,-11,-9,-13,-11,7,-11,-9,-9,19,44,-4,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-29,-8,-14,-28,47,-15,-36,-8,-28,-18,3,-19,-13,-3,-1,-16,-27,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-7,-15,-14,-14,-4,-19,-15,4,-16,9,1,-3,-22,-14,-13,-3,8,4,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-5,20,-11,-10,-18,-17,-17,-21,-6,-20,-15,-2,-18,-9,-6,12,17,-9,-36,-18,-10;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-16,-14,-9,-17,-5,-16,-9,-8,-11,-8,-6,-12,-8,-10,6,1,-2,-26,-16,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,8,-27,-21,-2,-23,33,-23,-3,-2,-12,18,24,-9,-10,-20,-19,-7,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-6,-31,-6,6,-17,-22,19,-20,7,-17,-4,-5,-16,21,5,-10,-13,-24,-1,13,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,19,-39,-20,14,-20,9,-20,0,0,-10,58,10,0,-10,-30,-20,-9,38;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-7,5,-22,-20,-1,-30,32,-21,-11,0,-18,11,61,-9,-10,-21,-21,-11,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-27,-5,7,-21,-22,0,-11,4,-4,1,-7,-16,14,6,-10,-10,-14,-23,-7,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-25,4,-33,-25,31,-27,30,19,-27,-27,-22,-23,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=21,0,-14,-7,-1,-19,-9,-15,-15,-5,-14,-12,-1,-10,-5,-11,11,12,-7,-26,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-23,-11,-7,-15,-22,-13,-6,10,-9,-3,-2,-18,-3,10,-6,0,-2,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-11,-18,-7,-19,-3,-19,-10,-10,-8,-9,-10,-10,-9,-19,8,1,-1,-21,-19,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00056;
//
ID   DNA_MISMATCH_REPAIR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00058;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA mismatch repair proteins mutL / hexB / PMS1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2625971; R2=0.0152697; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=352; N_SCORE=10.628; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-12,-2,-1,-18,-3,-11,-17,-11,-25,-17,6,-8,-2,-11,33,17,-9,-38,-19,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,2,9,-29,-20,-10,-29,44,-29,-11,1,-10,8,26,-8,-6,-19,-21,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-19,-35,-26,0,-32,-25,33,-27,20,17,-21,-22,-18,-26,-18,-9,20,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-23,7,4,-25,-3,-1,-25,3,-24,-15,8,-13,4,1,7,-1,-19,-28,-14,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-3,7,-20,9,9,-24,-7,-4,-23,-1,-24,-17,7,-3,3,-4,13,5,-18,-31,-17,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-13,-19,-13,-3,10,-21,-10,-3,-14,7,0,-13,-19,-10,-11,-11,-6,-3,-15,2,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-21,6,11,-24,-7,-8,-23,-1,-21,-16,3,-10,5,-7,7,1,-19,-22,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,43,-30,60,16,-38,-3,-2,-39,-2,-30,-29,18,-11,-2,-11,1,-10,-29,-38,-21,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-30,-21,9,-29,-22,22,-28,35,16,-25,-27,-20,-21,-22,-7,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-7,-23,-7,3,4,-20,-6,-12,-11,-2,-6,-7,-17,-7,-10,-7,-6,-12,-15,-1,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,5,-22,1,0,-22,-9,3,-19,3,-22,-11,12,-15,4,7,6,-2,-17,-30,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-33,-26,1,-34,-27,34,-26,22,15,-25,-20,-22,-24,-19,-7,29,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-22,-6,1,-19,-14,6,-19,2,-15,-7,3,-15,6,10,2,3,-15,-26,-9,1;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-10,-9,-9,-8,-15,-18,-12,-11,-14,-12,1,-11,-9,-11,23,39,-2,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-27,-22,-30,-22,27,-29,-11,12,-25,31,15,-25,-29,-21,-17,-25,-10,4,-5,20,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-11,-20,-10,-20,2,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,-1,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=10,-16,-25,-16,-9,-13,-11,-13,-15,-12,-18,-14,-13,19,-11,-18,-1,-6,-15,-10,-11,-11;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-11,-3,-3,-18,-2,-11,-16,-11,-23,-16,8,-12,-3,-11,31,16,-8,-36,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-26,-37,-27,0,-35,-27,40,-28,23,18,-21,-21,-19,-27,-20,-9,25,-20,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-9,1,-15,-11,-21,4,-18,-18,-13,-18,-14,-5,-15,-11,-16,13,2,-7,-29,-22,-11;
MA   /M: SY='S'; M=9,2,-13,-1,-1,-23,-3,-4,-19,-8,-24,-15,8,-12,3,-10,22,8,-13,-33,-17,1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-13,-31,-27,-1,-30,-27,29,-22,15,14,-26,-26,-24,-22,-13,-4,35,-26,-7,-27;
MA   /M: SY='A'; M=22,-6,-4,-10,-7,-21,5,-16,-19,-12,-22,-16,0,-13,-7,-16,22,7,-8,-31,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-28,6,12,-26,-17,4,-29,23,-24,-13,7,-13,11,28,-4,-8,-23,-26,-11,10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-18,-28,-20,4,-26,-18,18,-21,25,19,-24,-26,-15,-17,-18,-6,17,-21,-3,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-19,-5,5,-16,-20,-12,-10,-1,-10,-8,-4,-11,0,-4,5,15,-5,-28,-11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-31,-21,2,-27,-23,27,-26,25,16,-22,-24,-19,-23,-21,-10,17,-21,-3,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-18,-10,-5,-14,-19,-11,-7,-4,-11,-6,-2,-13,-4,-4,8,16,-2,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-11,-6,-6,-14,-10,-14,-13,-10,-18,-11,4,-11,-5,-10,27,32,-4,-34,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-8,-10,-3,-22,-15,-9,-26,13,-22,-12,-2,-18,4,26,1,-3,-16,-27,-15,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00057;
//
ID   ADH_ZINC_MP; MATRIX.
AC   MP00059;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc-containing alcohol dehydrogenases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9512706; R2=0.0159430; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=129; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=35; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-5,-13,-10,-11,-17,-9,32,-17,-14,-14,0,2,-20,-4,-10,-5,-7,-16,-29,-1,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-19,-26,-22,-15,-1,-19,-3,-5,-16,-4,-1,-16,-20,-10,-15,-13,-9,-6,13,5,-13;
MA   /M: M=-8,-6,-22,-5,-9,-14,-15,-11,-9,-4,-10,-6,-9,-19,-10,-7,-10,-8,-3,-14,-4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-26,-4,-2,-20,2,-7,-20,0,-15,-10,1,-17,-3,2,-4,-9,-16,-24,-14,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-29,-5,-8,-17,2,-12,-18,-10,-19,-13,-1,-16,-8,-13,-6,-11,-17,-1,-10,-8;
MA   /M: M=-3,-4,-28,-3,0,-20,-3,-12,-24,-1,-21,-15,-5,-12,-4,-3,-5,-11,-20,-2,-11,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-29,-7,-2,-15,-12,-9,-17,-6,-18,-11,-5,6,-1,-9,-5,-8,-20,-10,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-8,-11,-24,-12,-9,-8,-9,-7,-9,-3,-8,-3,-8,-11,-7,-5,-9,-9,-8,-15,-2,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: M=-2,-10,-21,-12,-9,-12,-8,-15,-10,-6,-9,-4,-8,-7,-9,-8,-3,0,-6,-23,-12,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-13,-22,-13,-11,-11,-19,-16,0,-12,-7,-3,-12,-1,-12,-13,-3,-1,3,-27,-12,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-26,-7,0,-16,-20,-8,-15,7,-16,-8,-5,1,-2,5,-6,-4,-12,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-10,-20,-14,5,-25,-8,-4,-11,-1,-1,-15,-16,-13,-11,-12,-4,-3,-15,7,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-35,-7,-3,-28,-3,-18,-23,-11,-28,-19,-12,61,-10,-18,-7,-10,-28,-27,-28,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-20,-25,-17,2,-26,-11,12,-15,16,19,-20,-24,-8,-10,-17,-8,9,-18,3,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-19,-26,-21,-5,-29,-24,23,-20,6,7,-20,-16,-20,-21,-9,1,27,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-22,-23,-17,-4,-15,-20,4,-19,9,3,-18,-7,-17,-18,-12,-5,2,-22,-10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=1,-19,-20,-24,-19,1,-2,-19,-5,-19,-6,-3,-13,-17,-17,-19,-7,-10,-4,-11,-5,-18;
MA   /M: SY='V'; M=12,-18,-7,-23,-19,-10,-12,-23,5,-17,-4,-1,-15,-20,-18,-20,1,0,15,-27,-14,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-11,-21,-12,1,-13,-26,-14,0,-3,-6,-3,-10,-15,-3,-2,-4,1,3,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-17,-28,-27,-1,-31,-28,31,-22,13,11,-25,-26,-25,-22,-13,-4,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='V'; M=3,-11,-18,-11,-2,-14,-22,-18,4,-9,-3,-2,-14,-17,-8,-13,-3,0,12,-28,-13,-5;
MA   /M: SY='E'; M=5,0,-23,2,17,-24,-9,-7,-23,6,-20,-14,-2,-9,6,-2,4,-4,-18,-23,-12,11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-18,-27,-20,0,-28,-23,21,-18,16,12,-23,-24,-19,-17,-14,-3,25,-24,-6,-20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-24,8,14,-27,-9,-7,-24,4,-25,-17,5,2,6,-2,8,-1,-21,-31,-19,9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-25,4,0,-25,14,-9,-26,-2,-22,-15,9,-15,-4,-6,2,-7,-22,-27,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-6,-28,-26,-4,-25,-28,21,-19,5,6,-26,-27,-26,-20,-6,0,39,-29,-12,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-21,1,5,-22,-17,-8,-20,8,-20,-12,2,-6,2,4,6,11,-13,-28,-13,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-24,6,2,-27,11,-3,-30,0,-26,-17,8,-14,-2,-2,5,-5,-23,-28,-18,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-22,-29,-23,22,-28,-18,9,-21,17,6,-24,-27,-24,-17,-21,-9,9,-1,13,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,0,10,-27,-18,-4,-25,31,-25,-10,1,-11,12,20,-5,-7,-19,-22,-9,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-23,-20,-12,-12,-24,-22,9,-8,-3,1,-17,-4,-14,-11,-10,-5,12,-26,-12,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-27,-10,-17,-28,60,-18,-36,-18,-27,-18,0,-18,-17,-18,1,-17,-27,-19,-27,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-18,33,-29,47,19,-36,-13,1,-34,5,-26,-23,14,-11,10,1,-1,-10,-28,-35,-18,14;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-28,-6,-1,-18,-20,4,-23,18,-16,-7,-2,-16,6,36,-10,-10,-17,-21,-5,-1;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-12,-28,-26,-4,-25,-28,22,-18,5,6,-27,-21,-26,-20,-7,-1,39,-29,-12,-26;
MA   /M: SY='G'; M=4,-13,-15,-15,-14,-19,6,-19,-11,-16,-13,-9,-7,-12,-11,-17,3,-4,-7,-27,-19,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-19,-24,-21,-9,-15,-23,12,-20,3,4,-19,-13,-19,-21,-9,-6,15,-25,-13,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-27,0,9,-21,-4,-12,-20,-3,-15,-13,-5,0,-3,-9,-3,-8,-18,-26,-17,2;
MA   /M: M=-5,-16,-20,-16,-12,-5,-8,-16,-17,-15,-16,-13,-13,0,-15,-17,-7,-8,-16,0,-6,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-17,-23,-20,-15,-4,-17,-1,4,-18,4,7,-13,-22,-12,-15,-12,-7,4,-17,0,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00058;
//
ID   ADH_IRON_2_MP; MATRIX.
AC   MP00060;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Iron-containing alcohol dehydrogenases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5366473; R2=0.0158001; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=10.124; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-18,-17,-15,-1,-23,-11,6,-14,0,0,-11,-21,-10,-13,-1,7,8,-18,7,-14;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-14,-6,-3,-8,-13,-8,1,-7,0,-1,-7,5,-1,-8,-5,-1,-3,-13,-6,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-6,-11,-6,-8,-2,-10,-3,-7,-1,-3,-7,-7,-6,-10,2,-1,1,-10,-9,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-1,-16,-12,2,-16,-12,9,-15,18,7,-14,-15,-11,-12,-13,-5,6,-12,-2,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-13,8,9,-13,2,1,-13,0,-14,-10,16,-7,2,-1,3,-3,-15,-17,-11,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=18,2,-10,-6,-6,-14,7,-8,-11,-6,-12,-9,6,-9,-6,-10,6,-2,-8,-16,-14,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-11,-4,3,-15,-7,-6,-11,-3,-11,-7,0,-6,7,-5,11,9,-7,-18,-10,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-9,-2,-13,-13,9,-16,-2,-2,-10,1,2,-7,-18,-10,-9,-8,-1,-4,-5,15,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-14,-20,-14,6,-20,-10,15,-16,23,16,-17,-18,-11,-12,-17,-6,8,-10,5,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=25,-8,-17,-13,-12,-24,26,-18,-23,-14,-21,-15,-3,-14,-12,-18,11,-4,-13,-23,-24,-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-13,-25,-15,-19,-20,39,-19,-23,-20,-11,-8,-7,-21,-18,-19,-4,-13,-18,-20,-22,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-22,-30,-22,2,-29,-9,24,-22,25,28,-22,-24,-14,-18,-21,-9,17,-22,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-16,-12,-10,-23,17,-17,-20,-12,-19,-14,-3,-13,-8,-16,12,0,-11,-24,-22,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-20,-34,-26,50,-27,-14,4,-24,10,7,-20,-28,-29,-18,-18,-9,4,3,24,-25;
MA   /M: SY='G'; M=2,3,-24,0,0,-26,30,-11,-30,-10,-27,-19,10,-15,-7,-12,7,-9,-25,-27,-25,-4;
MA   /M: SY='N'; M=1,8,-16,0,-5,-16,-8,-5,-12,-2,-22,-13,17,-17,-4,-5,13,5,-8,-32,-13,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-4,-21,-6,-4,-19,4,-16,-20,-9,-17,-14,-5,-6,-9,-12,4,-3,-12,-24,-19,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-24,-11,-13,-14,23,-14,-23,-15,-16,-12,-2,-19,-10,-11,2,-7,-18,-22,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-9,-10,-8,-12,-7,-23,-16,1,-17,15,2,-14,-24,-15,-16,-16,-8,2,-28,-9,-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-18,-32,-20,-21,-18,34,-23,-30,-18,-24,-18,-12,-21,-18,-20,-9,-19,-25,26,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-15,-17,-20,-14,-9,-3,-15,-4,-15,-2,-2,-12,-18,-12,-18,0,-3,0,-17,-5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=13,-14,13,-19,-18,-13,-17,-24,-3,-16,-7,-7,-14,-21,-19,-20,3,5,12,-31,-17,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-14,-15,-9,-17,-3,-15,-10,-11,-11,-6,-5,-7,-8,-16,10,3,-4,-25,-18,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-20,-32,-23,2,-27,-13,27,-18,23,38,-23,-23,-12,-17,-20,-8,20,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-20,-4,6,-23,3,6,-23,-8,-20,-14,0,-11,-1,-11,9,-5,-17,-27,-15,2;
MA   /M: SY='H'; M=-18,5,-28,2,0,-18,-17,74,-26,-7,-20,-3,16,-20,10,0,-7,-15,-29,-27,15,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-28,0,15,-30,-3,-8,-25,4,-22,-13,-3,1,13,-2,0,-7,-24,-24,-19,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-22,11,-30,-23,19,-26,31,13,-27,-22,-23,-20,-22,-6,15,-20,-1,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-20,-7,-12,-22,35,-16,-27,-14,-23,-16,2,-14,-12,-14,11,0,-18,-23,-22,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-4,-19,-6,-2,-25,18,-16,-24,-10,-20,-16,-2,-12,-8,-16,9,-5,-15,-24,-23,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-17,-15,-24,-20,7,-24,-11,8,-16,3,5,-14,-24,-14,-16,-10,-4,8,-12,10,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-19,-17,21,-28,29,-3,-15,0,2,-13,-27,-10,-11,-18,-12,-10,7,50,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-15,10,-30,14,1,-27,0,37,-33,-6,-26,-13,11,-10,0,-6,-5,-15,-30,-31,-5,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-33,-25,8,-33,-23,29,-27,28,17,-24,-26,-21,-23,-21,-7,21,-18,3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-29,-6,-3,-20,-18,-12,-16,-8,-20,-15,-12,35,-6,-15,-3,0,-19,-22,-11,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-10,-19,-8,8,-19,-15,-11,-8,-6,-7,-4,-11,-16,4,-6,-6,-9,-4,-26,-15,6;
MA   /M: SY='C'; M=9,-9,14,-16,-13,-22,0,-21,-24,-7,-20,-14,-7,-19,-13,-13,1,-1,-12,-29,-21,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-2,-18,-10,-14,-5,-18,-10,6,-15,8,1,6,-26,-14,-12,-9,-4,3,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-12,-19,-10,-16,-2,-16,-10,-10,-10,-10,-10,-12,-9,-19,9,0,-1,-17,-12,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-22,-34,-26,0,-32,-26,35,-25,19,18,-23,-23,-20,-24,-17,-7,29,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-19,-26,-20,11,-27,-16,14,-23,29,15,-20,-27,-18,-17,-20,-3,9,-18,3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-18,-28,-20,18,-27,-18,12,-23,24,16,-20,-24,-19,-17,-16,2,7,-16,4,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-28,-11,-4,-28,-12,-21,-21,-12,-27,-19,-16,63,-12,-20,-6,-6,-25,-30,-28,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-6,8,-25,2,1,-20,-5,25,-23,-6,-22,-12,16,-8,0,-6,1,-6,-25,-29,-6,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-32,-22,-33,-29,3,-28,-29,19,-22,7,5,-32,-29,-26,-21,-20,-9,26,14,1,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-17,-30,-20,2,-24,-10,12,-15,10,30,-20,-22,-5,-14,-19,-12,4,-4,2,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-27,1,15,-24,-14,-3,-27,20,-21,-13,4,-13,9,28,-4,-8,-21,-25,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-25,-20,-14,32,-27,7,-6,-14,-1,-3,-15,-25,-15,-12,-14,-6,-9,9,42,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,19,-22,5,-5,-13,-11,1,-10,-1,-20,-12,32,-19,-3,-3,4,3,-17,-29,-8,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-24,-19,-12,-5,-16,-12,-7,-6,4,0,-15,-22,-8,0,-12,-8,-7,-4,1,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-26,14,13,-25,-15,-2,-19,6,-20,-10,11,-12,8,2,0,-6,-19,-30,-14,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00059;
//
ID   ADH_SHORT_MP; MATRIX.
AC   MP00061;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Short-chain dehydrogenases/reductases family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.9346718; R2=0.0073407; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1053; N_SCORE=6.792; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1013; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-26; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=34,-65,-74,-68,-59,-69,-64,-39,-65,-42,107,-64,-69,-62,-67,-54,49,39,-79,-59;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-78,-8,-11,-64,-12,1,-25,-13,32,-53,-34,73,20,7,-39,-60,-42,-75,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-25,-3,0,13,-25,43,-4,-27,-16,35,-19,65,15,-14,-28,-24,-62,-72,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-27,-71,-29,-6,-11,-40,-26,15,4,27,94,-24,-42,-57,-2,7,-39,-19,-74,-55;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-76,-68,5,-60,-42,47,21,17,27,37,-24,-74,-6,-8,-46,-62,9,-78,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=20,-74,-13,16,-72,-19,-24,-49,26,-17,4,23,-23,24,48,0,-26,-49,-77,-35;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-77,-13,-24,-48,23,48,-54,41,-74,-64,19,-23,44,53,-19,-27,-54,-78,-62;
MA   /M: SY='K'; M=1,-73,-6,-3,-16,14,-25,-9,27,-34,-27,0,-11,24,11,27,-1,-12,-75,-17;
MA   /M: SY='K'; M=1,-74,-15,-39,-16,35,-25,-71,38,-72,-65,0,6,18,27,24,-38,-14,-9,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-22,8,-65,-75,-80,97,-71,-88,-70,-84,-74,-52,-70,-67,-77,-17,-45,-81,-74,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=12,-73,-26,-40,-44,-65,32,-16,7,-27,-60,13,-24,-15,55,36,5,-12,-80,-34; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-75,-86,-83,-9,-89,-84,91,-79,6,-15,-78,-77,-76,-81,-73,-58,40,-75,-56; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-26,-71,-3,-35,-53,-83,-79,65,-73,8,-41,-44,-76,-72,-76,-67,-37,70,-81,-60;
MA   /M: SY='N'; M=-48,-26,-19,-62,37,-60,-21,-14,-56,-15,5,101,-74,-58,-62,-50,23,-35,-80,-57;
MA   /M: SY='I'; M=-27,-27,-31,-24,-34,-80,-74,67,-70,-10,61,-68,-72,-68,-73,-62,35,44,-79,-58;
MA   /M: SY='S'; M=20,20,7,-59,-75,30,-62,-50,-30,-74,-68,8,-66,-55,-64,75,2,-27,-82,-69;
MA   /M: SY='S'; M=-18,-65,-13,-56,-72,-51,-59,-70,-41,-30,-67,-28,-38,-50,-61,102,-38,-48,-82,-66;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-27,-18,-46,-12,-14,6,28,-46,-18,76,17,-25,2,-67,-22,-25,40,-77,-31;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=53,-25,-65,-64,-15,-5,24,-21,-63,-14,30,12,-70,-18,-67,30,5,-10,15,-61; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=31,-27,-62,-22,-78,75,-8,-77,-63,-77,-69,-52,-39,-6,-69,33,-8,-39,-77,-72;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-52,-31,-29,-13,8,-57,37,-24,-21,-11,14,-13,-80,32,26,2,-19,-8,-11,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-74,-44,-20,-12,-40,-25,24,6,1,54,-3,-73,11,38,-44,-27,17,-9,20;
MA   /M: SY='P'; M=15,-6,-65,-30,-76,46,-29,-35,-14,-73,-66,-60,78,-36,-69,0,-2,-2,-78,-39;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-36,-74,-8,-45,16,2,-25,-28,-60,6,24,30,-26,-18,14,4,-17,11,43,43; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=17,-29,-1,-29,-28,-20,-67,-3,-62,-16,-28,-3,72,10,-20,-1,-9,-26,15,-37; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,19,-7,-12,-68,28,-7,-62,-6,4,5,18,28,-6,-9,-6,-1,-7,15,-35;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-76,-43,-43,-12,6,48,-20,-6,16,16,5,-73,28,15,-22,-28,-6,80,15;
MA   /M: SY='A'; M=46,20,-65,-64,-27,4,-9,8,-64,-50,-59,-21,18,-61,-69,41,27,9,-79,-66;
MA   /M: SY='A'; M=47,-69,-8,-63,-15,15,16,-6,-64,-39,5,-2,28,-35,-69,6,-7,27,-79,-64;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-70,-74,-19,-78,-37,-56,-65,-53,-50,-72,-83,-61,-62,-66,-65,-62,-27,135;
MA   /M: SY='C'; M=33,70,-61,-64,-74,36,-65,-71,-62,-73,-67,23,-40,-60,-68,55,20,-26,-83,-72;
MA   /M: SY='A'; M=66,-4,-66,-62,-71,9,-66,-2,-62,-62,30,-35,-67,11,-66,33,11,-15,-78,-67;
MA   /M: SY='S'; M=33,-62,-58,-58,-72,-54,-63,-67,-58,-71,-65,-48,-63,-54,-64,81,66,-58,-83,-67;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='A'; M=56,-69,-65,-44,8,43,52,-48,-7,-11,-59,-57,-69,-59,-64,-4,-27,-61,-70,13;
MA   /M: SY='A'; M=73,-67,-68,-66,13,58,-68,-70,-65,-69,-64,-59,-69,-63,-46,-33,-58,-61,-68,4;
MA   /M: SY='V'; M=-35,-69,-34,-75,-49,-83,-75,40,-74,45,43,-76,-78,-72,-75,-49,-38,65,-79,-57;
MA   /M: SY='D'; M=-3,-27,29,29,-68,-50,7,12,6,-31,-8,23,-67,-4,-1,-5,23,15,-82,-35;
MA   /M: SY='M'; M=25,-71,-66,-66,-26,49,25,-43,-64,2,60,12,-70,3,-67,0,-9,-34,42,-60;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-71,-86,-79,85,-83,-67,-12,-77,56,58,-79,-83,-76,-74,-75,-64,-34,18,-35;
MA   /M: SY='T'; M=10,-4,-61,-62,-26,-35,6,-56,-60,-61,23,-51,-64,-59,-66,47,82,5,-82,-34;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-76,13,13,-73,-28,-5,-70,52,-22,4,-8,-68,20,56,-20,-9,-38,-77,-35;
MA   /M: SY='C'; M=10,67,-40,-13,-71,26,-28,-3,-62,-52,-28,0,-69,-6,-67,47,30,0,-83,-68;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-15,-70,-82,-76,0,-58,-67,10,-74,67,70,-77,-79,-69,-73,-70,-10,-9,-70,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=71,-5,-64,-56,-77,-4,-7,-72,-49,-71,-63,-57,-68,28,50,22,-54,-62,-77,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-21,8,-16,-11,-4,-40,17,-1,11,16,6,-2,-73,18,48,-14,-17,-24,-71,14;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-79,35,93,-80,-53,-23,-54,-14,-47,-69,-33,-60,9,1,-40,-59,-40,-82,-70;
MA   /M: SY='W'; M=-50,-6,-77,-25,14,-23,-26,-22,-71,59,19,-45,-80,-67,-71,-70,-29,-20,66,65;
MA   /M: SY='A'; M=60,-70,-7,-19,-72,29,6,-36,-19,-44,-62,-35,-23,11,10,2,-38,-35,15,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-30,22,13,-77,-2,25,-39,28,-76,-67,-20,67,33,0,-13,-59,-74,-78,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-22,-78,7,-9,-5,-71,71,-70,40,-16,-26,-19,-70,33,12,-21,-3,-70,52,31; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-32,-78,-39,-45,-83,81,-65,-87,20,-84,-73,23,-11,10,-17,-18,-64,-82,-77,-75; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-28,-52,-78,-53,-61,-83,85,-52,-30,-40,-74,-44,-74,-51,-49,-16,59,-79,-60;
MA   /M: SY='R'; M=-37,-76,-25,-26,-45,-40,17,-4,27,-53,-8,-9,-41,-13,82,-55,40,-63,-78,-61;
MA   /M: SY='V'; M=9,47,-33,-73,-22,-77,-81,9,-73,-44,-46,-44,-77,-74,-75,-44,-35,88,-85,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-69,-45,-40,-44,-42,-50,-24,-36,-56,-28,100,-71,24,-16,11,-5,-7,-12,-36;
MA   /M: SY='A'; M=53,42,-28,-65,-68,4,-69,9,-45,-38,5,-2,-70,-62,-45,18,19,19,-81,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-27,-80,-78,-32,-84,-79,72,-74,14,-39,-15,-76,-74,-77,-67,5,63,-78,-32;
MA   /M: SY='C'; M=48,52,-59,15,-70,-11,6,-45,-41,-7,-26,27,-41,-5,-9,6,5,-17,-81,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00060;
//
ID   ALDOKETO_REDUCTASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00062;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldo/keto reductase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9410803; R2=0.0081083; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1858; N_SCORE=17.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=563; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-36; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-34,-74,-20,-8,-67,-65,20,-32,47,-43,-63,65,-21,-51,-3,-9,17,-5,84,-59;
MA   /M: SY='P'; M=-36,-76,-30,-13,29,-41,-73,36,-15,5,-49,-71,56,-67,-31,-34,-58,43,43,-55;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-5,17,11,-58,-75,17,51,-31,21,-3,-22,-72,-60,-9,16,-25,22,15,-59;
MA   /M: SY='Y'; M=-22,-78,-8,0,21,-39,-57,-30,-32,2,-55,-24,70,-62,-67,-32,-9,-18,-57,74;
MA   /M: SY='D'; M=1,-74,60,38,-76,-6,18,-72,1,-18,-67,24,-22,-14,-58,34,-53,-39,-85,-67;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-74,60,21,-76,-19,17,-4,30,-71,-66,2,-22,5,-54,17,29,-36,-85,-66;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-19,-70,-71,-34,9,-41,-76,-22,-16,-36,-55,-24,-74,-69,-70,9,53,61,14,-62; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-60,-75,69,-47,-77,-63,66,-75,-28,-48,-68,24,51,-54,-27,29,29,-73,-91,-64;
MA   /M: SY='Y'; M=-68,-73,-81,-76,60,-83,-62,26,-36,44,19,-77,-81,-71,-31,-72,-63,8,18,64;
MA   /M: SY='C'; M=-36,80,-66,31,-58,-79,-68,2,16,43,-47,-68,-75,17,-62,-65,-59,25,-79,-63;
MA   /M: SY='D'; M=8,-77,79,65,-84,-7,-56,-82,-9,-78,-74,-46,-63,6,-25,-27,-26,-75,-86,-71;
MA   /M: SY='T'; M=21,-62,-61,-62,8,-66,-69,-55,-60,-60,-58,-51,-62,-63,-67,-19,101,-3,-81,-61;
MA   /M: SY='W'; M=-74,-98,-100,-79,-40,-74,-93,-69,-71,-66,28,-93,-79,-70,-74,-81,-85,-82,174,14;
MA   /M: SY='E'; M=-36,-78,-46,69,-79,-39,-55,-80,58,-75,-67,-53,-62,9,51,-28,4,-73,-77,-68;
MA   /M: SY='A'; M=84,-65,-27,1,-76,19,-66,-69,-59,-44,-63,-59,-66,4,-29,-22,-55,-58,-76,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-63,-69,-84,-75,-17,-80,-60,-34,-71,58,120,-76,-76,-63,-69,-73,-61,-22,-72,-50;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-80,-37,102,-75,-77,-56,-4,-45,-16,-63,-59,-59,9,-54,-58,-60,-19,-79,-70;
MA   /M: SY='E'; M=20,-75,-2,62,-79,-37,-57,-74,60,-46,-65,-19,-62,30,-18,-27,-26,-38,-77,-68;
MA   /M: SY='C'; M=8,86,-81,-74,-49,-78,-71,-21,-73,73,-38,-76,-82,-71,-32,-68,-28,-45,-77,-60;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-72,-70,-60,-56,-78,-7,-36,51,-20,-49,-65,-25,18,-23,-62,-55,75,-73,31;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=7,-77,88,29,-32,-36,-56,-80,44,-78,-74,-14,-65,-49,-22,-28,-57,-75,-86,-68;
MA   /M: SY='E'; M=44,-72,9,56,-75,-64,-59,-69,31,-8,-61,-55,-63,44,-51,-26,5,-63,-77,-67;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-63,-35,-82,100,-9,-90,-15,-85,-74,-50,-68,-64,-72,-50,-67,-84,-74,-76;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-71,-76,-66,-47,-82,-8,-39,42,80,-34,-72,-79,-61,-26,-72,-62,-46,-72,-55;
MA   /M: SY='V'; M=26,-66,-77,-72,-57,-75,-80,38,-71,-44,-45,-70,-73,-72,-74,-57,30,80,-83,-63;
MA   /M: SY='K'; M=-64,-79,-58,-44,-78,-72,-56,-80,92,-77,-65,-51,-67,-9,73,-58,-60,-75,-73,-64;
MA   /M: SY='S'; M=53,-64,-24,-10,-75,-51,-6,-71,-57,-73,-67,1,-65,-14,-62,81,-19,-62,-81,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-76,-86,-82,-47,-89,-81,96,-79,37,-34,-78,-76,-74,-81,-74,-59,-10,-73,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-68,-84,-78,-51,-86,-83,47,-76,14,-39,-79,-79,-76,-77,-69,-53,88,-83,-60;
MA   /M: SY='S'; M=-42,47,-57,-58,-74,-51,-60,-74,-58,-77,-71,-46,-65,-50,-63,105,-37,-66,-84,-67;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='F'; M=-75,-72,-86,-82,118,-82,-63,-50,-77,-41,-51,-76,-86,-86,-74,-73,-67,-55,-39,45;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-69,-18,-26,-76,-31,19,-74,-52,-77,-67,87,-1,29,-58,51,30,-71,-88,-67;
MA   /M: SY='H'; M=8,-75,-27,-30,-66,17,76,42,-29,-37,-6,-57,-2,-56,29,9,-58,-3,-81,-58;
MA   /M: SY='R'; M=7,-76,-25,12,18,-70,32,-67,20,1,-58,-21,23,19,57,-29,-9,-65,-73,-57;
MA   /M: SY='Q'; M=-62,-77,-6,-46,-65,-71,53,-59,2,33,17,-1,-71,96,-49,-29,-61,-63,-74,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-71,-84,-78,-45,-86,-74,65,-77,63,34,-79,-78,-72,-77,-73,-27,18,-74,-55;
MA   /M: SY='E'; M=-62,-80,40,81,-73,-72,-52,-75,4,-29,-10,-19,-62,56,-22,-56,-60,-73,-74,19;
MA   /M: SY='R'; M=-38,-79,69,6,-76,-70,-54,-73,27,-45,29,-17,-69,6,69,-57,-27,-40,-83,-65;
MA   /M: SY='I'; M=0,-5,-83,-78,-47,-83,-76,67,-77,61,-34,-78,-78,-72,-77,-71,-59,12,-74,-57;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-71,-85,-78,-42,-87,-72,49,-78,82,-30,-82,-82,-72,-77,-77,-62,-34,-72,-54;
MA   /M: SY='N'; M=8,-71,27,3,-77,-58,-51,-39,4,-77,-68,82,-69,-47,46,24,-51,-71,-85,-69;
MA   /M: SY='K'; M=1,-73,-59,19,-5,17,-62,-60,67,-65,-9,-56,-67,-51,-46,-1,-57,23,16,19;
MA   /M: SY='P'; M=54,47,-68,-60,-76,-61,-71,-64,-64,-70,-64,-65,89,-65,-72,-26,23,-6,-81,-75;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-73,-59,-13,-78,76,-65,-79,10,-78,-70,-17,-66,-56,23,18,29,-40,-77,-72;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-70,-82,-77,-48,-82,-76,58,-76,53,-36,-28,-78,-72,-76,-69,-57,50,-76,-57;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00061;
//
ID   ALDOKETO_REDUCTASE_3_MP; MATRIX.
AC   MP00063;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldo/keto reductase family putative active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4783015; R2=0.0071579; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=688; N_SCORE=7.400; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=562; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-77,-61,-61,-82,86,-66,-87,64,-83,-72,-49,-66,-56,-51,-52,-64,-81,-73,-73;
MA   /M: SY='P'; M=-60,-86,-66,-61,-85,57,-70,-79,-65,-85,-72,-64,110,-67,-76,-58,-62,-81,-77,-81;
MA   /M: SY='D'; M=-57,-74,102,-38,-83,-59,-55,-82,-55,-82,-79,-38,-66,-52,-63,63,-49,-77,-95,-69;
MA   /M: SY='A'; M=91,-63,-66,-60,-76,2,-68,-67,-62,-69,-63,-26,-6,-59,-68,-10,-27,-55,-76,-72;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-80,-28,-8,-73,-70,-8,-63,-46,27,-50,-54,-69,115,-47,-15,-61,-66,-73,-59;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-71,-85,-80,-50,-87,-84,76,-77,5,-38,-78,-77,-76,-79,-70,-55,73,-79,-59;
MA   /M: SY='L'; M=38,41,-37,-71,-52,-73,-72,1,-73,57,-40,-73,-78,-69,-74,-35,-57,37,-77,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-72,-84,-79,-42,-87,-71,61,-78,73,-1,-80,-80,-72,-76,-75,-61,-18,-69,2;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-82,-62,-51,-76,-74,-52,-82,-11,-75,-64,-23,-74,-40,113,-6,-63,-76,-76,-63;
MA   /M: SY='W'; M=-74,-86,-86,-41,67,-77,-67,-62,-71,-57,-60,-82,-9,-71,-72,-75,-74,-70,144,76;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-77,3,-25,-76,-38,78,-40,-52,-32,-12,18,26,82,-54,12,-57,-70,-82,-59;
MA   /M: SY='I'; M=-39,-70,-80,-76,-20,-82,-72,57,-74,43,15,-74,-76,-71,-75,-37,17,42,-71,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-84,33,19,-89,-68,-48,-78,-41,-73,-61,-48,-66,121,-21,-50,-61,-78,-76,-63;
MA   /M: SY='R'; M=-41,-13,-62,-50,-76,-73,-8,-79,-3,-49,-63,-23,-8,33,103,-17,-63,-74,-76,-63;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-56,-77,-27,-36,-83,82,-63,-88,11,-87,-75,63,-71,-61,-65,-51,-63,-84,-81,-77; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-72,-16,-76,-22,-85,-76,43,-76,30,-42,-75,-79,-74,-77,-39,0,64,-76,14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=24,-70,-81,-75,-59,-78,-83,40,-74,-31,-47,-75,-30,-74,-77,-35,-11,77,-85,-65; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-21,41,-77,-20,-26,-80,-80,-14,-71,-12,-46,-74,6,-73,-75,-63,1,87,-85,-63;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-74,-85,-81,-46,-88,-78,89,-78,46,16,-78,-77,-73,-79,-74,-60,-4,-73,-55;
MA   /M: SY='P'; M=40,-80,-68,-58,-79,-64,-71,-36,-64,-73,-65,-71,111,-65,-73,-57,-57,-3,-79,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-42,-79,-70,-58,-79,108,-78,-66,-48,-63,-39,12,-57,-58,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-50,-59,-73,-57,-77,-70,-44,-63,-49,-61,106,6,-65,-83,-66;
MA   /M: SY='V'; M=-38,-70,-69,-70,50,-73,-62,0,-7,-34,-50,31,-77,-66,-66,3,-11,57,-61,57;
MA   /M: SY='N'; M=-58,-66,15,-55,-72,-36,13,-68,-3,-49,-65,86,-66,-54,-58,-11,75,-65,-91,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-25,-13,-27,44,-80,-69,-65,-40,12,-51,-67,-64,101,-55,-31,-18,-58,-26,-79,-76;
MA   /M: SY='E'; M=10,-74,22,59,-13,-39,-57,-73,26,-72,-66,-22,-25,45,-25,33,-54,-25,-78,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-76,-38,-78,-49,-85,-75,93,-75,23,46,-10,-75,-26,-77,-72,-59,-26,-74,-56;
MA   /M: SY='K'; M=28,-74,-61,-13,-67,-68,-10,-63,62,2,-57,-24,-7,1,45,-32,-58,-11,-72,0;
MA   /M: SY='E'; M=-36,-78,-39,91,-83,-25,-54,-80,-24,-75,-68,-53,-59,66,-50,5,-1,-74,-78,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-61,-67,-37,-57,-75,-51,-44,-73,-49,-37,-68,121,-73,-50,-57,-1,-46,-76,-94,-71;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-72,-81,-76,63,-28,-70,48,-39,39,46,-73,-78,-71,-16,-69,-14,-12,-63,-44;
MA   /M: SY='Q'; M=-23,-80,38,18,-85,-39,-8,-78,35,-75,-64,-20,-6,97,-44,-3,-58,-76,-78,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-35,-68,-84,-78,-6,-84,-84,48,-76,-16,-41,-78,-78,-77,-77,-68,-53,89,-81,-58;
MA   /M: SY='F'; M=-45,-72,-80,-41,109,-79,-66,-28,-74,2,-50,4,-83,-80,-73,-70,-33,-33,39,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-82,101,38,-85,-12,-56,-87,-31,-84,-81,-1,-67,-52,-63,-32,-60,-83,-94,-25; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-77,-76,-89,-83,112,-84,-72,-31,-41,-46,-55,-79,-86,-85,-17,-76,-71,-58,75,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-75,5,61,-79,-67,-55,-71,-1,-71,-64,-21,-62,72,-9,13,34,-24,-80,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-69,-85,-77,38,-86,-69,-18,-78,85,-31,-83,-84,-73,-75,-77,-63,-24,-66,-47;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-66,20,-30,-73,-21,-63,-68,-32,-71,-66,-47,8,-20,-63,61,79,-61,-85,-68;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-74,34,48,-80,-62,-58,-76,30,-77,-70,-21,45,2,-53,47,1,-71,-81,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-39,-81,45,95,-77,-73,-52,-82,-24,-75,-71,-52,-59,34,-52,-56,-60,-76,-77,13;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-81,95,70,-37,-69,-53,-84,-13,-80,-77,-43,-62,2,-56,-56,-59,-79,-89,-69;
MA   /M: SY='M'; M=-63,-70,-81,-73,31,-78,-10,-20,-66,26,124,-30,-75,-62,-15,-71,-61,-14,-70,-47;
MA   /M: SY='K'; M=19,-74,3,16,-76,-23,-10,-71,76,-47,34,-4,-64,24,-39,-53,-12,-67,-76,-65;
MA   /M: SY='T'; M=32,-69,27,21,-32,-65,11,-18,-15,-43,-60,-22,-65,31,-30,-2,50,7,-82,-64;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-74,-84,-80,-20,-88,-77,84,-78,55,-33,-77,-77,-73,-79,-73,-13,-27,-72,-54;
MA   /M: SY='D'; M=4,-10,75,9,-67,-64,13,-65,-58,24,-60,19,-69,-55,-64,29,-27,-64,-85,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-64,-71,74,-46,-80,-54,-46,-79,-50,-84,-74,108,-71,-51,-59,-48,-50,-80,-99,-71;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-73,-86,-81,77,-86,-73,64,-79,49,-37,-79,-81,-78,-78,-75,-63,-35,-59,-39;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00061;
//
ID   L_LDH_MP; MATRIX.
AC   MP00064;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   L-lactate dehydrogenase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8688028; R2=0.0100713; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1900; N_SCORE=21.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=460; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-43; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=51,-68,-63,-66,-78,71,-67,-77,-64,-77,-69,-52,-67,-60,-56,49,-54,-68,-76,-73;
MA   /M: SY='E'; M=-31,-80,26,93,-83,-61,-35,-82,15,-76,-70,-52,-59,42,-21,-55,-33,-76,-80,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-78,-58,11,-61,-72,39,-58,71,-42,26,-55,-68,-18,46,-59,-61,-50,-27,49;
MA   /M: SY='L'; M=-30,-26,-82,-44,53,-83,-67,-2,-76,72,-23,-79,-82,-72,-74,-72,-29,-13,-62,9;
MA   /M: SY='H'; M=-39,-76,47,-22,-79,63,70,-85,-5,-71,-70,45,-68,-31,-22,-31,-61,-81,-85,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-44,-69,-84,-78,-51,-85,-82,54,-76,19,-15,-78,-78,-76,-77,-69,-54,82,-81,-59;
MA   /M: SY='H'; M=33,-74,68,-39,-76,-29,103,-79,-41,-74,-65,9,-52,-52,-59,-2,-39,-74,-93,-56;
MA   /M: SY='P'; M=32,-80,-53,-57,-81,-53,-69,-69,-62,-77,-67,-67,110,-47,-72,13,-31,-29,-79,-78;
MA   /M: SY='R'; M=-29,-73,-38,-13,-71,-65,8,-70,-12,-4,-60,-13,-69,34,70,54,11,-66,-79,-62;
MA   /M: SY='S'; M=-35,-65,-21,-56,-75,-43,-5,-74,-46,-78,-70,56,-65,-37,-60,96,-39,-59,-85,-66;
MA   /M: SY='C'; M=-44,108,-83,-79,-23,-82,-83,28,-76,-34,-49,-74,-82,-79,-79,-66,-55,73,-88,-65;
MA   /M: SY='H'; M=-68,-80,33,-41,-71,-59,137,-85,-56,-71,-57,10,-69,16,-53,-48,-65,-84,-99,-31;
MA   /M: SY='A'; M=77,-66,-66,-65,-78,63,-70,-73,-65,-73,-66,-57,-67,-62,-70,-22,-32,-53,-75,-73;
MA   /M: SY='W'; M=-60,-86,-61,-71,6,-74,-13,-63,-65,-54,-39,-74,-59,6,-53,-9,-56,-70,133,103;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-75,-84,-82,-50,-87,-83,98,-77,-34,11,-57,-74,-74,-80,-31,-56,36,-76,-57;
MA   /M: SY='M'; M=-41,-71,-84,-78,-48,-84,-73,61,-75,45,70,-77,-77,-71,-75,-72,-58,44,-76,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-27,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='S'; M=-44,-63,-56,-58,-72,-54,-61,-69,-57,-73,-67,-45,-62,-52,-62,93,67,-61,-84,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-44,-73,-42,80,-79,-61,-55,-79,-47,-76,-70,-50,-60,28,-54,75,-47,-72,-81,-69;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-68,-85,-78,62,-84,-75,-9,-76,34,10,-79,-81,-77,-76,-71,-57,73,-68,-45;
MA   /M: SY='P'; M=52,-77,-67,-41,-78,-62,-70,-54,-63,-41,-63,-69,103,-64,-72,-33,-38,-9,-78,-76;
MA   /M: SY='V'; M=18,-66,-79,-74,-56,-77,-81,-4,-72,-16,-44,-27,-77,-73,-74,-61,-29,92,-85,-63;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-98,-100,-80,-9,-74,-95,-50,-72,-43,-70,-94,-80,-72,-75,-81,-85,-82,174,15;
MA   /M: SY='S'; M=-42,-64,-18,-39,-75,-50,-59,-74,-57,-78,-71,-44,-64,-48,-61,107,-36,-67,-83,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-43,-76,-57,-24,-73,61,97,-66,-42,-42,-42,-11,-68,33,-40,10,-14,-77,-81,-22;
MA   /M: SY='A'; M=65,-64,-72,-67,-64,-54,-74,-12,-67,-46,7,-32,-71,-65,-70,-26,11,63,-81,-66;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-67,-11,-55,-74,-54,-48,-60,-9,-77,-19,107,-69,-4,-46,12,37,-71,-90,-50;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-70,-84,-79,-52,-86,-86,69,-76,-33,-39,-78,-77,-77,-79,-69,-53,84,-82,-60;
MA   /M: SY='A'; M=82,-65,-43,-63,-75,48,-68,-70,-64,-70,-9,-46,-67,-46,-69,-27,-56,-59,-74,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-44,-76,-65,-75,-79,98,-46,-35,-69,-79,-32,-32,-68,-67,-76,-42,-24,-31,-75,-75;
MA   /M: SY='V'; M=-43,-70,-73,-26,-59,-80,-72,19,11,-20,3,-68,-74,43,-22,-62,-30,80,-81,-61;
MA   /M: SY='P'; M=-36,-6,-31,-54,-48,-24,-61,-74,16,-79,-69,7,81,-16,-40,69,-33,-72,-80,-51;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00062;
//
ID   D_2_HYDROXYACID_DH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00065;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases NAD-binding signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1785336; R2=0.0145320; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=329; N_SCORE=9.950; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-32,-29,-35,-26,16,-26,-25,0,-22,1,-2,-30,-25,-23,-20,-27,-17,-4,53,15,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-19,-4,3,-18,-14,0,-19,3,-15,-8,3,-15,1,9,-1,-3,-15,-23,-10,1;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-27,-14,-5,-10,-18,-13,-15,-3,-7,-7,-16,-9,-5,0,-16,-13,-16,5,-3,-5;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-15,-9,-4,-16,-11,-14,-9,-5,-11,-7,-3,-16,-5,-9,0,-3,-5,-26,-14,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=4,-10,-19,-9,0,-19,-11,-14,-15,-5,-13,-10,-10,-1,-4,-9,-2,-5,-12,-18,-14,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-23,-17,-12,7,-21,-9,-6,-8,-3,-3,-9,-18,-12,-1,-7,-3,-5,-14,6,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-7,-25,-7,-9,-11,-14,-9,-5,-9,-3,1,-8,-15,-9,-5,-10,-8,-4,-25,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-16,-10,-14,-25,35,-18,-29,-15,-25,-17,0,-17,-14,-17,7,-7,-20,-25,-25,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-25,-18,-14,16,-24,-5,-6,-7,-4,-3,-11,-22,-14,-3,-12,-6,-6,-2,17,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-26,23,24,-27,-15,-5,-26,2,-21,-19,4,-5,6,-4,2,-5,-21,-32,-18,15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-30,-21,3,-30,-22,22,-25,30,17,-27,-19,-20,-21,-22,-8,17,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-3,5,-12,-15,3,-21,10,-16,-10,-1,-17,3,18,-7,-9,-18,-16,2,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,7,-25,8,-6,-30,32,-10,-34,-9,-27,-19,8,-17,-9,-12,0,-14,-27,-27,-24,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-27,-5,7,-25,-19,-6,-20,31,-20,2,-3,-12,13,20,-8,-9,-16,-21,-9,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-12,-12,-11,-10,-21,-16,-8,-7,-9,-7,-3,-13,-10,-5,13,36,3,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-16,-31,-26,3,-30,-26,27,-24,24,15,-28,-28,-24,-21,-17,-5,32,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-22,-34,-28,-1,-35,-29,37,-25,14,14,-20,-21,-21,-25,-12,0,32,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,2,-35,-27,38,-26,20,18,-24,-24,-22,-25,-18,-7,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,68,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=0,-19,-16,-24,-19,9,-23,-16,6,-18,10,6,-17,-22,-18,-16,-7,7,9,-16,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-27,-4,0,-21,-14,17,-28,16,-22,-10,8,-18,8,36,-5,-10,-22,-25,-7,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-5,-23,-6,3,-19,-14,-5,-17,6,-16,-7,-1,-14,11,9,3,-1,-14,-23,-9,6;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-12,-12,0,-19,-14,-10,-13,-3,-9,-7,-8,-15,2,-1,1,-3,-7,-25,-15,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-16,-29,-23,7,-27,-23,19,-22,19,11,-24,-25,-22,-20,-14,-1,22,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-16,-19,-12,-13,-9,-17,-1,-13,1,0,-10,-16,-10,-17,-1,-3,1,-22,-12,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-27,-4,7,-23,-19,-5,-19,17,-16,-7,-2,-14,10,20,-6,-7,-15,-23,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-17,-28,-19,-9,-12,-26,-10,-5,9,-2,2,-9,-21,-1,32,-15,-10,-4,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=8,-21,-15,-27,-18,4,-18,-17,6,-20,16,9,-19,-22,-16,-18,-13,-6,5,-16,-2,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-1,-26,-1,13,-26,-16,-6,-23,22,-21,-10,-1,-11,9,14,-3,-7,-17,-24,-13,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=17,-11,-22,-13,-12,-25,22,-19,-23,-14,-22,-16,-7,2,-13,-19,5,-7,-16,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-21,-36,-27,54,-30,-19,7,-28,19,8,-23,-29,-32,-19,-22,-10,4,2,21,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-29,3,-11,-30,51,-14,-38,-14,-30,-21,8,-18,-14,-16,1,-17,-30,-24,-27,-13;
MA   /M: SY='M'; M=1,-21,3,-29,-21,-2,-21,-15,7,-17,6,21,-20,-20,-14,-18,-12,-7,8,-24,-8,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-13,7,-27,6,9,-23,-17,7,-26,20,-24,-12,10,-14,8,20,-3,-5,-22,-25,-8,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-16,-28,-25,2,-30,-26,24,-22,15,10,-21,-25,-23,-20,-11,3,29,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-29,-22,6,-31,-16,24,-25,26,16,-23,-26,-19,-21,-21,-8,17,-19,3,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-18,-22,-22,-18,8,-10,-7,-3,-16,2,-2,-16,-23,-15,-17,-9,-8,-4,-2,19,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-9,-20,-19,21,-28,20,-9,-15,-5,-3,-15,-29,-13,-12,-16,-9,-12,6,48,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,44,-27,58,16,-36,-8,0,-36,0,-30,-28,23,-11,0,-8,4,-7,-28,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-32,-16,-7,-18,-23,-14,-9,-2,-15,-8,-14,26,-7,3,-11,-8,-12,-23,-13,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-26,-16,-11,9,-24,9,-5,-13,-5,-3,-10,-11,-8,-11,-10,-5,-10,-6,24,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-29,-12,-3,-20,-21,-8,-14,6,-14,-7,-6,4,2,17,-8,-7,-14,-24,-13,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-20,-1,0,-20,-10,-9,-15,-1,-18,-11,7,-6,-1,-5,8,2,-13,-30,-16,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,1,-29,6,10,-26,-17,-8,-20,2,-20,-13,-5,14,2,-6,-4,-7,-20,-28,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-22,4,20,-26,-7,-8,-25,2,-20,-16,-2,-4,5,-1,3,-6,-20,-28,-20,11;
MA   /M: SY='L'; M=1,-14,-20,-15,-8,-10,-14,-16,-1,-12,6,0,-13,-20,-11,-8,-9,-6,3,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,9,-25,14,24,-28,-8,-4,-25,1,-19,-17,3,-8,7,-6,2,-7,-21,-29,-18,15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-26,6,14,-21,-14,-6,-23,11,-20,-14,3,-9,3,5,-2,-7,-19,-24,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-24,-4,9,-19,-12,-8,-16,2,-12,-9,-4,-13,3,-3,-2,-7,-13,-21,-12,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-21,-16,-10,-4,-14,-16,3,-15,7,4,-13,-17,-12,-13,-10,-5,2,-21,-7,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-7,-26,-10,-12,-8,16,-11,-22,-12,-16,-10,-2,-20,-11,-10,-3,-9,-18,-15,-7,-11;
MA   /M: SY='V'; M=1,-18,-15,-20,-15,-2,-22,-15,2,-13,3,0,-18,-23,-13,-13,-11,-7,5,-8,3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-24,-1,9,-19,-16,-8,-14,1,-13,-9,-5,-9,3,-2,-1,-3,-11,-25,-9,5;
MA   /M: SY='Y'; M=9,-19,-19,-25,-19,23,-18,-8,-4,-15,-1,-4,-16,-22,-18,-17,-8,-6,-3,4,25,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00063;
//
ID   HMG_COA_REDUCTASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00066;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0756469; R2=0.0176137; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=305; N_SCORE=11.438; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-26,-15,5,-29,-20,18,-25,36,15,-27,-27,-18,-19,-24,-8,14,-22,-3,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-26,-5,7,-27,-18,9,-19,10,-15,-3,-2,-14,25,10,-3,-9,-20,-22,-7,15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-23,1,0,-21,-10,4,-20,2,-20,-11,5,-14,0,4,5,1,-14,-29,-10,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-17,-28,-23,6,-32,-24,25,-24,15,11,-21,-24,-22,-23,-16,-7,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-26,-11,-2,-16,-21,5,-13,3,-15,-4,-5,-6,6,-1,-5,-4,-14,-19,-1,0;
MA   /M: M=-8,-6,-1,-6,-11,-19,-24,-20,-6,-16,-11,-8,-10,0,-14,-21,-6,-2,-5,-33,-17,-15;
MA   /M: SY='T'; M=8,-12,-6,-19,-15,-2,-16,-16,-7,-14,-6,-7,-10,-18,-14,-14,3,11,-2,-18,-1,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-31,-23,-3,-31,-24,27,-23,16,15,-24,-7,-19,-23,-18,-8,20,-24,-7,-23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-12,-16,-17,-12,-15,-12,-17,-2,-8,-3,0,-12,-16,-10,-10,-1,-3,5,-22,-14,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,4,-27,2,2,-24,-14,-5,-25,17,-26,-15,10,-1,3,22,-1,-4,-22,-28,-16,1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,-21,-6,-9,-6,-14,5,-5,-8,-4,5,12,-21,-2,-5,-4,-3,-12,-23,1,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-18,-30,-23,6,-30,-22,23,-26,36,18,-29,-29,-22,-20,-23,-7,21,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-28,-27,-24,28,-29,3,4,-17,2,1,-22,-29,-18,-15,-20,-11,-1,25,48,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-23,-30,-21,-3,-27,-22,22,-22,18,16,-23,-11,-17,-22,-17,-8,15,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,19,-30,22,-20,-8,2,-20,10,56,-10,-12,-22,-22,-4,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,59,-30,-19,6,-29,21,6,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,2,23,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-13,-13,-17,-9,-15,-21,-16,0,-5,-9,-3,-8,-18,-4,-3,0,-2,3,-28,-12,-8;
MA   /M: SY='C'; M=2,-18,9,-24,-21,7,-22,-19,-4,-19,-5,-6,-16,-25,-22,-19,-2,3,6,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-20,14,5,-22,-15,-10,-20,0,-19,-16,5,-12,-2,-1,8,7,-13,-32,-15,1;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-10,-14,-14,-8,-21,-22,-3,-12,-7,-6,-6,-14,-14,-12,15,40,9,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-30,-9,-14,-29,48,-16,-38,-5,-29,-18,0,-19,-13,-4,-2,-18,-28,-20,-25,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=2,-18,-18,-28,-18,-4,-16,-4,14,-10,14,46,-18,-18,-2,-12,-14,-8,8,-20,-4,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-18,-27,-18,-3,-18,-4,14,-10,14,46,-17,-18,-2,-11,-13,-3,8,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-15,-32,-29,-1,-31,-29,33,-22,13,12,-26,-26,-26,-22,-12,-3,41,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,8,-12,1,-3,-17,-5,-9,-17,-8,-25,-17,17,-12,-3,-8,29,24,-11,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-26,-13,-5,-18,-25,-17,-4,17,-12,-2,-5,-13,-2,6,-7,2,-2,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='G'; M=12,-11,-22,-16,-16,-21,30,-16,-19,-15,-15,-2,-6,-17,-12,-17,1,-11,-13,-21,-21,-14;
MA   /M: SY='T'; M=8,-13,5,-19,-18,-11,-19,-23,-1,-15,-7,-6,-12,-20,-18,-17,8,17,13,-32,-15,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,22,50,-32,-19,1,-30,9,-21,-18,2,-2,24,0,0,-10,-30,-30,-19,37;
MA   /M: SY='K'; M=0,2,-23,-3,1,-20,-13,0,-19,13,-20,-9,7,-15,3,10,-1,-5,-15,-23,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-12,-26,-21,-9,-18,-25,14,-17,1,2,-20,-20,-20,-21,-1,0,26,-25,-13,-21;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,7,-28,-20,-2,-24,-21,5,-25,25,8,-24,-28,-19,-21,-18,-8,4,-25,-9,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-28,6,9,-26,-11,-2,-25,3,-23,-15,0,7,1,1,-1,-8,-22,-29,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-22,-16,-26,-19,19,-28,-10,3,-15,8,3,-19,-27,-17,-11,-17,-9,3,-8,16,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-33,-24,4,-31,-20,31,-25,30,27,-25,-25,-17,-21,-23,-9,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,6,28,-28,-19,1,-23,10,-19,-11,-1,-7,21,3,2,-2,-22,-27,-13,25;
MA   /M: SY='E'; M=-1,6,-24,6,15,-24,-11,-5,-22,5,-18,-14,5,-11,5,5,1,-4,-19,-27,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-27,1,7,-11,-23,-3,-3,-8,-7,-4,-1,-15,-1,-11,-8,-9,-8,-22,0,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00064;
//
ID   3HCDH_MP; MATRIX.
AC   MP00067;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1570826; R2=0.0151376; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=689; N_SCORE=15.577; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-10,-27,-22,-4,-24,-22,15,-14,6,10,-21,-24,-19,-14,-9,-2,24,-25,-9,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=11,6,-16,6,12,-21,-8,-9,-18,0,-16,-14,1,-7,1,-7,7,0,-12,-24,-16,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-29,-22,18,-29,-16,14,-24,27,11,-26,-29,-22,-18,-22,-6,11,-7,14,-22;
MA   /M: SY='A'; M=20,-11,-13,-17,-13,-18,9,-16,-12,-13,-12,-3,-7,-15,-10,-17,7,-1,-4,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-24,-7,3,-20,-19,-11,-18,20,-13,-6,-5,-14,3,14,-6,-4,-12,-23,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-26,-3,5,-26,-17,-9,-25,34,-25,-8,1,-11,8,23,-4,-5,-17,-22,-11,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-25,-27,-17,-6,-29,-15,21,-16,13,21,-19,-21,-1,-15,-17,-10,11,-15,-2,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-30,-6,-14,-29,52,-17,-38,-9,-29,-19,2,-19,-14,-9,-1,-18,-28,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,11,-31,-20,-7,-29,44,-29,-9,0,-10,17,27,-9,-10,-21,-20,-10,14;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-9,-12,-11,-13,-21,-13,-4,-12,-9,-6,-4,-16,-7,-12,10,23,4,-31,-10,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-34,-13,-6,-25,-13,-21,-14,-12,-23,-15,-17,58,-12,-20,-7,-7,-19,-28,-26,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-19,-34,-28,-1,-32,-28,36,-24,15,16,-25,-25,-24,-24,-14,-5,37,-25,-6,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-16,-18,-14,-9,-24,-20,8,-7,-2,0,-17,-23,-16,-1,-5,-1,23,-29,-12,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,8,-28,-26,-4,-29,-27,16,-21,7,5,-26,-30,-24,-20,-10,-2,31,-32,-12,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-26,2,1,-26,5,-3,-28,14,-28,-15,15,-15,1,9,0,-9,-24,-26,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-27,47,24,-33,-10,2,-33,2,-28,-26,23,-10,4,-6,3,-7,-29,-38,-20,14;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-16,33,-23,-20,-9,-18,-23,-14,-18,-13,-10,-13,-26,-20,-18,-4,-2,-4,-31,-15,-20;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-30,-5,-2,-21,-16,-16,-18,-10,-22,-17,-12,43,-10,-18,-3,-2,-20,-25,-18,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-19,-29,-24,13,-27,-16,17,-20,10,6,-22,-26,-22,-19,-14,-6,19,-9,15,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-13,-26,-25,-3,-20,-26,18,-20,9,6,-24,-27,-25,-19,-7,1,32,-28,-11,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-19,18,-1,-19,-1,8,-19,-1,-29,-19,56,-19,-1,-1,11,3,-28,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-11,-32,-26,1,-31,-23,26,-24,20,19,-24,-26,-20,-22,-17,-5,24,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-26,-15,9,-27,-16,11,-24,34,14,-24,-26,-10,-16,-23,-10,3,-17,1,-12;
MA   /M: SY='F'; M=0,-21,-20,-28,-21,21,-22,-14,5,-18,6,3,-16,-23,-20,-15,-12,-7,5,-6,13,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,76,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-24,-21,19,-28,8,10,-12,7,16,-21,-27,-10,-12,-19,-9,2,11,49,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-24,-24,-32,-24,17,-30,-16,22,-23,16,17,-19,-23,-18,-20,-17,-5,12,-10,13,-22;
MA   /M: SY='N'; M=4,10,-18,0,-4,-17,-1,-4,-16,-7,-21,-13,20,-16,0,-8,12,1,-17,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-28,9,35,-30,-1,-5,-29,2,-21,-17,-1,-6,12,-5,1,-11,-27,-26,-21,24;
MA   /M: SY='A'; M=29,-15,-13,-23,-15,0,-4,-20,-7,-15,-7,-8,-12,-16,-17,-19,4,-2,1,-16,-10,-15;
MA   /M: SY='W'; M=0,-20,-26,-24,-19,-3,-18,-15,4,-18,-2,-1,-17,-21,-14,-19,-11,-9,1,10,4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-27,-16,-9,-3,-14,-1,-16,2,-5,-2,-8,-22,-1,20,-13,-11,-14,-13,2,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-7,-31,-22,2,-29,-22,18,-27,30,16,-25,-27,-19,-22,-22,-7,12,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-18,-28,-23,7,-29,-17,20,-24,28,14,-27,-29,-21,-19,-21,-7,21,-19,4,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,0,20,-18,-19,-3,-17,3,-10,-7,-5,-11,9,3,-3,-6,-16,-23,-8,14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,15,30,-27,-18,2,-24,5,-18,-16,1,-8,10,1,-1,-9,-21,-29,-15,19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-8,-16,-29,59,-18,-36,-17,-28,-18,1,-19,-16,-18,0,-18,-28,-21,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-19,-11,-8,-13,-18,-20,6,-14,-2,-2,-13,-18,-13,-17,-3,-2,13,-28,-13,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-24,20,8,-29,-7,-7,-28,1,-28,-21,9,1,-1,-5,10,0,-21,-34,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-30,-19,-12,-2,-25,-20,-1,-13,-10,-4,-19,25,-17,-17,-13,-9,-5,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-25,5,22,-18,-15,-3,-22,6,-18,-14,0,-10,7,1,1,-4,-19,-24,-10,14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-25,15,9,-28,-10,2,-26,5,-21,-14,4,-12,6,1,0,-8,-19,-28,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,40,-29,26,19,-24,-24,-21,-26,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-5,-23,-7,1,-19,-7,-11,-18,5,-12,-8,-3,-15,-1,4,-2,-4,-13,-23,-13,0;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-12,-26,-20,-8,-17,-25,12,-17,4,2,-20,-21,-20,-20,-2,0,24,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-29,-20,2,-24,-9,20,-17,25,41,-21,-22,-8,-14,-20,-6,12,-21,-1,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-12,1,12,-10,-11,-6,-7,-2,-5,-6,-3,-6,1,-4,3,2,-4,-17,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-25,6,11,-27,-14,-7,-28,26,-29,-15,5,-10,7,17,4,-2,-19,-28,-14,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-13,-20,-14,-13,30,-23,-14,-2,-20,12,0,-13,-22,-20,-15,-16,-9,-3,-8,9,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-29,-14,-21,-15,57,-20,-35,-21,-25,-17,-3,-21,-23,-20,-3,-19,-26,-16,-22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=6,-22,-17,-30,-20,24,-18,-17,3,-20,10,9,-18,-22,-21,-18,-11,-7,3,-9,4,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00065;
//
ID   MDH_MP; MATRIX.
AC   MP00068;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Malate dehydrogenase active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.4333811; R2=0.0191196; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=164; N_SCORE=9.559; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=4; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=16,-19,-7,-24,-19,-9,-18,-17,8,-16,2,2,-18,-21,-18,-19,-3,0,18,-26,-12,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-20,-24,-13,4,-24,-12,5,-15,18,15,-20,-17,-7,-12,-18,-9,-1,-18,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-26,1,9,-27,-16,-6,-26,31,-26,-11,7,-11,10,22,-3,-5,-20,-24,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-24,3,2,-18,-12,3,-23,17,-26,-13,19,-15,3,10,1,-4,-21,-26,-9,2;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-13,-18,-9,-19,-4,-14,-11,-5,-10,-6,-9,-11,-7,-11,6,-1,-3,-21,-16,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-33,-8,-9,-29,22,-18,-28,-11,-29,-19,-5,24,-13,-16,-4,-14,-27,-25,-28,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-4,3,-15,7,-6,-19,-11,-15,-10,-8,-16,-12,-1,-18,-11,-12,7,4,3,-34,-16,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-25,-27,-28,-24,16,-27,-7,17,-21,11,8,-21,-26,-18,-19,-19,-10,8,1,32,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,13,-31,20,6,-30,-14,-9,-23,-1,-26,-20,5,22,-4,-10,-3,-8,-24,-33,-21,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-5,-30,-2,12,-28,-17,-10,-24,15,-25,-15,-5,18,5,7,-4,-8,-23,-25,-19,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,8,-28,10,13,-27,-8,-3,-31,20,-26,-16,9,-13,7,22,-3,-9,-25,-26,-16,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,8,-21,2,2,-23,-14,1,-27,24,-26,-13,17,-18,5,31,-4,-7,-23,-27,-13,2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-27,36,-31,-23,16,-29,24,10,-25,-29,-29,-21,-23,-10,11,-3,12,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-17,-18,-24,-18,28,-22,-8,-3,-19,2,3,-12,-22,-19,-14,-5,5,-2,-9,14,-17;
MA   /M: SY='G'; M=18,-11,-7,-16,-17,-25,33,-21,-27,-17,-21,-16,-6,-18,-17,-21,3,-11,-16,-23,-26,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-17,-31,-25,2,-29,-20,27,-21,23,26,-26,-26,-19,-19,-18,-6,28,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-21,-8,-4,-16,-19,-9,-20,13,-17,-10,3,-15,1,28,4,16,-12,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-12,-23,-13,-6,-13,-25,20,0,-13,-4,3,-8,-19,-3,-10,-8,-7,1,-28,1,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-6,2,-19,-9,-15,-9,-18,-11,10,-13,-4,-1,14,-23,-13,-13,-4,-3,6,-32,-12,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-24,-3,9,-19,-19,-8,-12,7,-11,-6,2,-13,4,3,-3,-2,-13,-26,-12,6;
MA   /M: SY='T'; M=7,-5,-9,-12,-10,-12,-7,-17,-16,-9,-15,-12,-2,-14,-10,-9,13,22,-6,-26,-12,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-18,-24,-23,-9,28,-26,-8,-7,-14,-1,1,-12,-22,2,-8,-12,-10,-12,-4,12,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,6,-32,-23,28,-26,29,16,-27,-28,-23,-22,-21,-7,25,-21,1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-11,-16,-9,-18,-3,-18,-10,-9,-14,-11,-7,-12,-9,-13,14,4,1,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-27,6,24,-25,-13,-5,-23,7,-14,-12,-2,-9,11,3,-3,-8,-21,-26,-16,17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-13,-26,-13,-5,-13,-24,-9,-7,13,-2,1,-11,-18,-3,7,-15,-9,-5,-19,-2,-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,-14,-12,-4,-15,-17,-15,-12,3,-6,-6,-8,-15,-5,-2,-1,4,-6,-25,-12,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,0,-11,-27,40,-9,-32,-12,-27,-15,11,-19,-10,-13,1,-14,-27,-25,-24,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-11,-23,-18,-5,-26,-19,11,-14,10,6,-20,-24,-17,-14,-10,-1,18,-27,-8,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-24,12,5,-22,-12,-8,-23,0,-22,-17,8,1,-1,-6,5,4,-20,-30,-16,2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-19,-18,-16,-9,-21,-19,8,-15,-4,-2,-15,1,-17,-17,-5,-1,12,-26,-11,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-19,3,2,-21,-10,-10,-18,-1,-19,-14,6,-4,-1,-5,9,8,-13,-28,-16,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-24,27,19,-30,-14,-2,-30,11,-24,-19,8,-10,8,8,-1,-8,-24,-29,-16,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-18,-27,-23,-4,-30,-26,26,-20,7,8,-21,-18,-22,-21,-10,-1,32,-28,-9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-8,5,-23,4,5,-24,-10,-5,-25,14,-24,-14,8,-13,3,15,4,1,-17,-28,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-8,-15,-13,-13,-13,-22,-7,2,-4,-8,-1,-2,-23,-7,-1,-6,-5,8,-29,-10,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-24,-15,-9,-13,-20,-15,1,-12,-5,3,-12,12,-11,-15,-8,-5,0,-29,-16,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00066;
//
ID   G6P_DEHYDROGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP00069;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucose-6-phosphate dehydrogenase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8996563; R2=0.0143457; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=583; N_SCORE=13.253; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='B'; M=4,11,-20,11,5,-27,-13,-8,-20,-3,-18,-13,3,-10,9,-8,8,8,-15,-28,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-20,0,13,-20,-15,-8,-22,5,-20,-15,2,-10,5,12,12,13,-15,-30,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-5,-25,-5,0,-28,9,-5,-28,2,-25,-12,2,-15,13,12,7,-6,-23,-25,-18,5;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-15,-9,-2,-23,-5,-15,-18,6,-21,-13,-2,-10,-2,-4,13,3,-8,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-20,-32,-27,48,-30,-12,7,-22,7,2,-22,-30,-30,-17,-18,-8,9,6,34,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,63,-30,-20,5,-30,20,5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-30,-2,8,-35,2,-2,-27,12,-25,-7,0,-12,29,7,-2,-12,-28,-20,-15,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,31,-37,-20,7,-23,10,-20,-5,0,-7,49,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-35,-22,42,-25,20,31,-20,-20,-15,-25,-20,-10,25,-20,0,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-32,-25,50,-30,-9,5,-25,17,5,-22,-30,-27,-17,-22,-10,0,8,36,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,28,-35,-20,3,-25,19,-22,-8,0,-7,38,12,-2,-10,-28,-23,-13,33;
MA   /M: SY='P'; M=11,-10,-22,-13,-10,-22,6,-20,-19,-12,-19,-15,-7,12,-12,-17,6,6,-14,-25,-22,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-10,-20,-13,0,-25,-17,-8,-5,-3,-10,0,-10,-15,20,-5,0,-5,-3,-22,-13,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-25,15,20,-28,-10,8,-22,5,-25,-15,30,-13,21,3,5,-5,-30,-32,-17,20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-22,-18,-1,0,-28,-15,8,-20,33,10,-23,-23,-10,-15,-23,-10,0,-22,-5,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-27,-11,1,-8,-25,-8,-4,-8,-10,-7,-18,9,-8,-13,-10,-7,-4,-16,4,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,47,-30,-20,9,-30,29,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-9,-23,-8,-14,32,-25,-15,-6,-22,8,-3,-12,-25,-25,-17,-17,-10,-6,-10,10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=20,4,-18,-5,0,-25,-5,-5,-15,-2,-17,-10,9,-12,11,-7,7,-3,-15,-25,-17,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-30,-16,-3,-1,-23,-7,-17,0,-14,-7,-10,5,4,11,-10,-10,-19,-14,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=2,-20,-25,-27,-17,-10,-25,-20,14,-9,2,5,-12,-18,-10,-1,-10,-8,9,-20,-7,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00067;
//
ID   ALDEHYDE_DEHYDR_CYS_MP; MATRIX.
AC   MP00070;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldehyde dehydrogenases cysteine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2849367; R2=0.0083857; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=988; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=810; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-63,-78,82,74,-84,-65,-51,-83,-48,-81,-76,59,-63,-44,-57,-53,-56,-79,-91,-72;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-75,101,-28,-76,-64,-56,-47,-57,-72,-71,10,-68,-32,-64,5,-15,17,-93,-18;
MA   /M: SY='A'; M=81,52,-27,-19,-74,-30,-28,-47,-31,-68,-62,-37,-23,-18,-65,-2,-24,-31,-78,-38;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-78,106,8,-18,-64,-52,-80,-27,-49,-76,37,-68,-53,-61,-55,-57,-78,-92,-18;
MA   /I: I=-3; MD=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-38,-72,-81,-74,-9,-83,-71,43,-25,60,33,-76,-14,-39,-32,-50,-17,13,-73,-56; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-49,-80,91,56,-85,-50,-54,-83,-9,-80,-34,-15,-38,6,-7,-20,-40,-79,-91,-71; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='W'; M=29,-72,-6,-18,-67,-36,7,-62,30,10,-57,31,-70,18,0,-5,-1,-12,42,-34; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=86,-24,-70,-63,-71,-55,-72,-55,-65,-50,-58,-64,-68,-63,-69,-32,15,25,-79,-70; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=45,-4,-79,-73,-58,-72,-80,25,-72,-4,-46,-74,-76,-72,-75,-43,-53,75,-82,-64; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-20,-77,15,58,-74,-20,56,-53,19,-37,-65,7,-39,6,1,13,-16,-53,-11,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='W'; M=1,-28,0,-62,-6,41,-7,-16,-42,-7,-27,34,-72,22,4,0,-27,-19,59,-60; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=55,-5,-74,-70,-4,-50,-75,57,-69,-20,-49,-66,-42,-68,-74,-28,29,9,-76,-62; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='M'; M=11,-71,-48,-71,-21,-76,42,44,-70,17,61,-13,-75,-20,-71,-63,-16,41,-79,-56; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-75,-44,-41,31,-29,-7,-41,-28,3,46,-38,-72,66,15,-30,13,-25,59,-28; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=33,-69,-41,-65,0,67,-66,-76,-63,-75,-69,-51,-67,-59,-46,60,-36,-68,-74,-67;
MA   /M: SY='A'; M=58,10,-63,-61,-42,-25,-65,9,17,-19,-56,37,-70,-58,-17,-10,-7,13,-79,-66;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-74,-88,-84,112,-85,-66,-50,-79,-17,-52,-79,-88,-87,-77,-76,-69,-31,0,41; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-74,-29,-14,49,6,-7,13,-63,4,-5,-64,-75,-7,3,-8,-9,-3,17,53;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-25,-25,-49,-59,-5,-57,33,-49,-55,-45,-63,85,-70,-53,-40,50,30,-66,-78,25;
MA   /M: SY='Q'; M=41,-5,-58,-51,-77,-16,17,-71,-27,-71,-28,-8,-66,71,-56,54,23,-64,-79,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-84,-50,37,-89,-68,-48,-77,-40,-71,-59,-51,-65,124,-41,-49,-62,-77,-73,-62;
MA   /M: SY='R'; M=-13,52,-67,-61,-66,-74,-66,10,22,-58,-55,-11,-73,-56,63,-41,22,46,-82,-64;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-23,52,-66,-66,-63,-50,-69,27,-64,-35,30,-34,-67,-63,-69,43,70,17,-84,-64;
MA   /M: SY='C'; M=75,93,-63,-64,-75,-9,-66,-71,-63,-70,-65,46,-72,-63,-69,-46,-54,-60,-83,-74;
MA   /M: SY='G'; M=48,9,-66,-64,-73,49,-69,-24,-64,-28,-62,-58,36,-7,-70,6,19,-17,-78,-71;
MA   /M: SY='S'; M=-40,-69,13,-3,-75,-33,-58,-74,3,-75,-68,2,-65,-48,46,72,41,-67,-83,-66;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-81,-64,-53,-68,-55,-22,-51,-6,-70,-61,-57,-75,-24,106,-31,-29,-14,-71,19;
MA   /M: SY='V'; M=11,-68,-80,-75,-1,-78,-31,37,-74,49,-15,-75,-77,-71,-74,-34,-26,52,-74,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-68,-27,-81,-78,75,-82,-62,22,-74,39,-17,-75,-81,-74,-73,-50,-10,-1,-51,64;
MA   /M: SY='V'; M=-56,9,-81,-37,-52,-85,-82,43,-75,11,-17,-77,-78,-75,-76,-68,-37,85,-83,-60;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-80,-11,48,-78,-70,85,-73,2,-69,4,-52,36,73,-50,-20,-41,-22,-82,-58;
MA   /M: SY='E'; M=-20,-78,27,69,-31,-28,-23,-79,20,-59,-68,-18,-21,34,37,-12,-27,-74,-79,-66;
MA   /M: SY='S'; M=-11,-27,36,16,-80,46,-61,-80,-12,-80,-73,2,13,-53,-62,61,-35,-73,-82,-72;
MA   /M: SY='I'; M=17,-72,-31,-15,-35,-77,-76,76,-49,-3,-2,-43,-72,-38,-73,-45,-16,37,-10,-59;
MA   /M: SY='Y'; M=24,-76,-66,-42,13,-69,44,-62,14,-31,-24,-62,-74,36,0,-30,-62,-47,34,90;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-5,-78,99,35,-85,-64,-55,-81,-37,-80,-77,-4,-1,-14,-41,-19,-16,-77,-93,-71;
MA   /M: SY='E'; M=35,-76,-12,55,-77,-66,-24,-38,26,-72,-64,-34,-10,45,31,-27,-27,-50,31,-66;
MA   /M: SY='F'; M=-70,-72,-85,-80,99,-60,-9,22,-77,26,-44,-77,-47,-81,-76,-73,-64,7,-52,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-20,-71,-77,-24,-34,-81,-74,32,-35,39,26,-45,-13,-69,-32,-67,-8,58,-79,-59; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=29,-76,26,75,-81,-22,-57,-51,-4,-74,-68,-30,-16,31,-1,-6,-36,-70,-80,-70;
MA   /I: I=-6; E1=0; MI=-32; IE=-32; DE=-32;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00068;
//
ID   GAPDH_MP; MATRIX.
AC   MP00071;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0502567; R2=0.0171329; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=130; N_SCORE=8.275; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=27; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-22,-26,-22,-20,8,-6,-5,-2,-20,13,3,-19,-28,-16,-16,-19,-12,-7,-2,22,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-18,28,-22,-22,-11,-23,-25,-1,-20,-9,-7,-16,-27,-22,-20,3,6,16,-38,-18,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-5,-27,-5,-1,-4,-21,29,-16,-7,-12,-4,-4,-19,6,-5,-7,-9,-19,-10,22,1;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-27,30,20,-23,-14,6,-28,0,-23,-19,16,-11,6,-5,0,-7,-27,-32,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-15,15,18,-28,-18,-6,-25,2,-18,-15,1,-11,9,-4,0,-3,-20,-31,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-19,-21,-22,-17,9,-20,-2,1,-14,7,1,-19,-23,-12,-15,-12,-7,-2,3,30,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-13,4,-29,7,4,-26,-20,-8,-18,17,-19,-9,1,-13,6,14,-6,-8,-14,-25,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=6,-1,-23,-5,-8,-25,21,-7,-26,-12,-26,-17,8,-4,-9,-14,8,-6,-22,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-29,23,22,-34,-16,-3,-31,19,-27,-16,6,-8,16,8,0,-8,-25,-29,-15,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-6,3,-23,0,1,-15,-16,20,-17,-4,-17,-8,6,-15,-1,-5,0,-4,-16,-27,-3,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-13,8,6,-13,-10,5,-14,0,-11,-8,3,-6,1,2,2,5,-10,-17,-5,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-27,-24,-31,-27,16,-34,-13,25,-21,10,9,-22,-26,-21,-20,-18,-8,19,-4,26,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-17,-3,0,-20,-7,-7,-23,3,-27,-17,7,-13,3,17,23,10,-13,-33,-17,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,2,-6,-16,-14,-9,-11,-6,-12,-15,-10,15,-26,-16,-12,0,-3,-1,-37,-19,-16;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-10,-22,-16,-13,-10,-23,3,-13,-5,-4,-15,-17,-16,-19,6,2,16,-25,-17,-16;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,13,-13,0,-7,-13,-13,-10,-13,-7,-17,-13,20,-13,-7,-7,17,33,-10,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,21,-18,5,-6,-15,-10,-3,-11,-6,-19,-13,33,-17,-5,-6,11,16,-15,-35,-15,-6;
MA   /M: SY='C'; M=9,-12,26,-17,-18,-23,13,-22,-28,-20,-23,-18,-7,-23,-18,-22,4,-7,-14,-33,-27,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-32,-20,29,-27,37,26,-26,-26,-17,-22,-26,-10,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-13,-23,-13,-13,-8,-21,0,-15,3,-3,-14,-14,-12,-21,1,-2,4,-20,-15,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-34,-11,-1,-26,-18,-13,-22,3,-25,-16,-12,45,-3,10,-8,-9,-24,-26,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-18,-30,-24,12,-31,-25,22,-24,19,10,-21,-24,-24,-21,-14,2,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=11,-22,-7,-28,-21,-6,-21,-23,13,-21,13,8,-21,-22,-18,-22,-11,-5,14,-24,-10,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-3,-9,-2,-21,-21,-2,-26,20,-23,-10,-5,-18,0,14,-9,-10,-17,-22,-5,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-8,-24,-21,-7,-27,-26,11,-19,2,1,-22,-7,-22,-20,-7,5,20,-30,-13,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-32,-21,30,-28,38,24,-26,-26,-18,-22,-26,-10,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-16,26,-27,24,7,-27,-10,28,-28,1,-26,-16,28,-17,8,4,0,-9,-29,-34,-9,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-29,36,23,-35,-14,1,-32,11,-27,-19,14,-9,14,2,-1,-9,-28,-32,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=1,-8,-24,-11,-4,-11,-20,-15,-7,4,-8,-4,-8,-15,-6,0,-8,-8,-5,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-19,-23,-23,-20,43,-23,-12,-7,-21,-2,-6,-15,-25,-25,-17,-13,-8,-7,13,27,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-28,-8,-12,-28,40,-18,-35,-2,-28,-17,0,-17,-12,-7,-1,-12,-25,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-25,-32,-22,-2,-35,-27,37,-24,17,14,-21,-21,-19,-24,-17,-8,28,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-9,-24,-6,12,-17,-25,-13,-5,5,-9,-5,-11,-14,-1,2,-7,-7,2,-27,-13,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00069;
//
ID   ACYL_COA_DH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00072;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acyl-CoA dehydrogenases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2507997; R2=0.0160612; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=144; N_SCORE=7.554; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-27,-3,7,-27,-18,2,-26,29,-24,-8,0,-11,11,20,-5,-7,-19,-22,-8,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-27,-28,-23,33,-29,-1,4,-18,5,1,-22,-28,-19,-15,-20,-10,-2,22,48,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-16,-29,-18,5,-30,-20,19,-26,37,18,-27,-27,-18,-20,-25,-9,12,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-30,-12,-7,-24,-8,-19,-17,-10,-23,-15,-14,41,-11,-14,-3,-3,-17,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-28,-8,-1,-20,-12,-11,-22,8,-23,-12,-5,11,2,7,-3,-5,-20,-23,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-26,-19,7,-20,-16,10,-22,29,17,-22,-26,-16,-13,-20,-9,5,-20,-2,-17;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-11,-18,-11,-15,-12,-20,-2,-13,-6,-4,-10,-15,-9,-17,3,6,3,-25,-14,-11;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-17,-2,6,-21,-11,-10,-18,2,-19,-13,4,-10,3,-3,14,12,-12,-30,-16,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-29,-6,-3,-27,38,-13,-32,-11,-22,-14,-2,-17,-7,-9,-3,-16,-26,-22,-24,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,17,20,-29,-7,-6,-29,6,-24,-19,4,4,5,-3,-1,-7,-26,-28,-19,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-12,-14,-14,-6,-15,-22,-2,-10,1,-4,1,-10,-14,-2,-2,-11,-6,-9,-23,-4,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-33,-25,5,-30,-22,29,-24,24,23,-24,-24,-19,-22,-19,-8,22,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=11,-14,-15,-17,-18,-19,24,-19,-21,-17,-19,-14,-8,-19,-16,-20,0,-11,-15,-10,-16,-17;
MA   /M: SY='A'; M=26,-6,6,-14,-11,-21,0,-17,-17,-13,-18,-15,-2,-15,-11,-18,13,2,-7,-30,-22,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-24,-31,-24,35,-28,-10,8,-22,11,7,-20,-27,-22,-18,-19,-9,1,9,30,-23;
MA   /M: SY='C'; M=23,-13,25,-21,-18,-22,4,-23,-22,-18,-17,-15,-11,-21,-18,-23,2,-7,-9,-29,-25,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-31,-22,6,-28,-18,24,-24,35,27,-27,-27,-18,-18,-24,-8,18,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-36,-11,-1,-27,-19,-18,-19,-5,-25,-17,-17,67,-8,-13,-9,-9,-25,-28,-26,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-25,3,-4,-27,25,1,-30,-10,-28,-17,15,-17,-3,-10,6,-10,-27,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='A'; M=32,-3,-12,-11,-7,-21,4,-15,-15,-10,-18,-14,2,-12,-7,-16,16,3,-7,-26,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=17,-17,-12,-21,-17,-10,-15,-22,7,-15,-1,-1,-15,-17,-17,-18,1,1,18,-27,-15,-17;
MA   /M: SY='A'; M=11,-6,-18,-11,-10,-16,9,-13,-15,-12,-16,-8,0,-16,-7,-14,8,-2,-9,-25,-17,-8;
MA   /M: SY='G'; M=17,-5,-16,-8,-8,-23,21,-15,-24,-13,-25,-18,2,-13,-8,-15,21,3,-14,-29,-23,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-19,-22,-26,-17,-5,-25,-15,19,-18,16,19,-15,-21,-7,-17,-15,-8,11,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-26,-4,5,-25,-15,-7,-25,23,-21,-9,-1,-13,11,25,-3,-2,-18,-23,-11,7;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-5,-11,-11,-10,-20,-20,-10,-12,-10,-10,-1,-12,-11,-11,18,43,-1,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-21,-7,-4,-17,-18,-5,-16,9,-18,-9,4,-15,0,16,4,10,-9,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-8,-20,-12,-15,-4,-16,-10,-11,-9,-9,-11,-13,-11,-19,6,-1,-1,-16,-10,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-26,0,14,-21,-22,-8,-18,14,-16,-10,-3,-12,5,17,-4,-2,-12,-26,-13,8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-28,-8,2,-22,-19,-9,-23,27,-19,-8,-5,-8,4,26,-10,-9,-16,-19,-9,1;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-22,5,5,-18,-15,-5,-15,4,-17,-11,9,-15,1,-1,3,-2,-13,-28,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-30,2,-3,-30,41,-14,-36,-13,-29,-21,3,-9,-11,-16,1,-15,-29,-25,-27,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-12,32,6,-27,0,-4,-29,-5,-25,-22,15,-12,-4,-10,7,-4,-21,-33,-19,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,1,-27,6,4,-11,-16,13,-20,2,-17,-11,-2,-17,0,-3,-5,-8,-17,-14,14,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-25,-22,-19,15,-22,-5,2,-14,2,-1,-21,-23,-13,-13,-20,-11,-4,36,34,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-17,-24,-20,4,-25,-15,25,-17,10,10,-16,-18,-15,-17,-12,-5,21,-11,7,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-24,-31,-22,4,-33,-21,26,-24,29,16,-22,-24,-17,-17,-22,-7,15,-19,2,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00070;
//
ID   ACYL_COA_DH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00073;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acyl-CoA dehydrogenases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8344378; R2=0.0173228; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=420; N_SCORE=13.100; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-21,-15,-24,-17,8,-25,-10,1,-12,10,3,-19,-26,-14,-5,-17,-8,0,-9,14,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-17,-22,-23,-20,23,-23,-6,-5,-14,-4,-4,-12,-26,-19,-12,-16,-10,-6,15,22,-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-11,1,-20,-15,-17,-9,-20,-4,-16,-10,-8,-6,-17,-13,-21,5,-1,0,-28,-18,-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-8,12,-13,-11,-21,2,-18,-21,-15,-22,-17,-3,-17,-11,-18,17,4,-9,-34,-23,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-28,20,24,-29,-4,-3,-31,7,-25,-20,11,-10,7,4,2,-8,-27,-31,-20,15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-15,-12,-20,-12,-13,-20,-18,-3,-1,-3,-1,-13,-18,-9,-2,-7,-3,2,-23,-11,-12;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-13,-18,-9,-22,4,-18,-13,-9,-12,-10,-9,-11,-6,-18,9,-2,-4,-20,-20,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-11,-23,-18,-15,1,-14,-10,-5,-10,-1,6,-5,-22,-10,-3,-10,-2,-7,-7,-2,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-28,9,24,-31,-17,-3,-25,11,-21,-13,0,-1,20,4,0,-8,-24,-26,-16,22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-8,-29,-26,4,-29,-27,21,-21,9,7,-23,-26,-26,-20,-9,3,31,-25,-6,-26; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-11,-19,-14,-13,-13,-22,0,-13,-6,-5,-11,-15,-14,-17,9,13,11,-26,-15,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-20,6,-2,-16,-14,-3,-17,-6,-12,-11,1,-16,-4,-2,5,5,-12,-27,-6,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-28,23,22,-31,-16,-2,-26,8,-20,-15,5,-9,16,1,0,-6,-24,-29,-15,19;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,16,-21,-16,-21,2,-22,-18,-16,-15,-13,-11,-18,-16,-22,4,-5,-6,-27,-23,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-22,-29,-22,-3,-29,-19,22,-13,13,19,-20,-24,-14,-5,-17,-7,21,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,8,-30,12,28,-38,-19,7,-24,9,-21,-7,2,-8,45,6,0,-10,-30,-24,-13,37;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-9,-34,-27,0,-32,-26,25,-26,17,15,-25,-26,-21,-24,-20,-9,20,-14,-3,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-22,-30,-21,21,-27,-9,10,-25,29,18,-24,-28,-19,-17,-26,-12,3,-5,11,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-2,-21,-11,-15,-5,-16,-6,2,-11,-5,0,6,-23,-11,-12,-6,-5,-2,-13,0,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-29,-28,-24,28,-33,2,14,-18,7,5,-20,-27,-16,-17,-20,-10,2,14,52,-24;
MA   /M: SY='M'; M=0,-12,-6,-20,-17,-7,-20,-17,5,-16,3,7,-8,-20,-13,-16,-1,7,7,-28,-10,-15;
MA   /M: SY='B'; M=-6,10,-25,9,5,-24,-5,-8,-26,6,-24,-18,10,-13,-1,0,1,-2,-22,-18,-14,2;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-29,39,41,-33,-15,1,-33,6,-24,-24,11,-5,11,-4,1,-9,-30,-34,-20,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-26,-18,-16,21,-23,14,-6,-13,-5,-1,-10,-21,-11,-11,-12,-8,-11,6,42,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-34,-8,1,-25,-12,-2,-22,-6,-21,-14,-11,36,-5,-5,-9,-12,-26,-27,-19,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-31,-26,1,-30,-24,29,-21,14,14,-24,-25,-22,-21,-13,-2,32,-23,-2,-26;
MA   /M: SY='E'; M=5,-4,-24,-2,15,-23,-6,-11,-17,-5,-16,-11,-4,-1,1,-11,4,-4,-15,-27,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-21,-20,-26,-18,18,-23,2,1,-20,10,6,-16,-24,-17,-16,-15,-9,0,-10,14,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-26,-25,-31,-22,22,-25,-9,6,-19,14,15,-24,-26,-17,-16,-23,-12,-1,16,23,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-17,-15,-7,-16,-22,-5,-20,18,-14,-4,-6,-22,2,48,-11,-9,-9,-23,-11,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,61,21,-37,-10,1,-37,1,-29,-28,23,-10,1,-8,1,-9,-30,-39,-20,11;
MA   /M: SY='A'; M=20,-19,-14,-25,-16,-3,-14,-19,4,-18,13,6,-18,-19,-15,-19,-7,-3,6,-19,-9,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-31,-1,14,-26,-20,-5,-29,31,-24,-13,-1,-5,10,36,-8,-10,-23,-23,-13,10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-17,-31,-25,-4,-31,-27,28,-23,12,11,-22,-16,-21,-24,-13,-4,24,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-6,-22,-9,-11,1,-18,-8,-4,-12,-5,-5,-5,-20,-10,-12,-5,1,-4,-14,8,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-25,0,11,-21,-16,-1,-20,4,-18,-11,4,-7,13,9,2,-1,-21,-25,-9,11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-25,-34,-26,-2,-35,-28,37,-25,14,14,-17,-19,-19,-25,-12,2,26,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-28,-20,-20,17,-9,2,-10,-14,-9,-7,-15,-26,-14,-14,-12,-10,-14,21,42,-19;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-27,8,34,-28,0,-7,-29,1,-20,-18,-2,-5,8,-7,2,-10,-25,-26,-22,21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-3,-10,-9,-13,-16,-19,-13,-11,-14,-12,0,-12,-9,-11,21,40,-2,-32,-13,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,16,-21,15,1,-22,-1,10,-25,-6,-26,-18,20,-15,0,-7,12,-1,-22,-32,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,22,-29,29,39,-32,-15,2,-30,6,-24,-20,13,-6,17,-1,1,-9,-30,-32,-19,28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-37,-29,0,-36,-27,43,-26,18,22,-22,-22,-20,-26,-18,-8,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-6,-26,-9,2,-21,-20,14,-10,1,-5,13,-2,-17,25,7,-9,-11,-16,-22,-4,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00070;
//
ID   GLFV_DEHYDROGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP00074;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glu / Leu / Phe / Val dehydrogenases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1830883; R2=0.0181831; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=269; N_SCORE=11.064; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=18; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-26,-5,8,-18,-22,-10,-12,14,-5,-3,-6,-15,3,7,-12,-9,-11,-23,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-2,-19,-12,-11,1,-6,-10,-15,-6,-13,-11,7,-19,-11,-1,1,-4,-12,-19,-8,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20,13,-30,-14,17,-27,43,17,-29,-30,-19,-19,-29,-10,7,-13,12,-20;
MA   /M: SY='G'; M=18,-6,-18,-10,-8,-25,20,-15,-23,-12,-23,-15,0,-13,-5,-15,15,-1,-14,-26,-22,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-18,-22,-22,-12,11,-23,-12,-3,-6,5,7,-13,-21,-9,-1,-13,-7,-3,-13,2,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-16,-30,-15,-4,-13,3,-18,-19,-14,-11,-12,-15,-18,-10,-16,-12,-16,-19,18,-8,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-13,-21,-19,-8,-12,-17,1,6,-6,4,35,-11,-16,13,-6,-7,-6,-2,-23,-5,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-13,-14,-13,-9,-21,-20,-1,-13,-7,-5,-3,-12,-11,-13,15,37,5,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-25,-31,-28,-19,29,-26,-6,-6,-16,-1,-3,-22,-27,-11,-13,-22,-14,-13,39,36,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,11,-31,-20,-7,-29,44,-29,-9,0,-10,17,27,-9,-10,-21,-20,-10,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,8,22,-4,-11,-19,-13,-8,-23,-7,-23,-17,18,-25,-10,-1,1,0,-18,-39,-21,-11;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-14,-13,-6,-22,1,-17,-17,-2,-18,-12,-4,-11,-6,-11,12,1,-7,-24,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-12,-22,-19,-3,-21,-18,11,-20,16,8,-13,-25,-17,-17,-12,-5,12,-26,-9,-18;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-15,-17,-11,-13,-16,-18,-3,-4,-4,1,-11,-15,-9,-9,2,9,5,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-27,28,1,-31,17,-8,-34,-8,-26,-23,13,-15,-8,-12,2,-8,-26,-31,-22,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-1,-34,7,4,-30,-15,-13,-23,-7,-29,-21,-4,55,-6,-16,-4,-8,-28,-33,-27,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-25,-21,-9,22,-26,7,-1,-14,5,10,-15,-23,-11,-11,-17,-11,-6,-3,25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-21,-11,-14,-26,40,-19,-29,-16,-24,-17,-1,-16,-14,-19,9,-9,-19,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-24,-12,-17,-26,46,-19,-30,-17,-23,-15,-2,-17,-16,-19,3,-11,-20,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-18,-22,-18,-24,-18,31,-24,-13,-20,-14,-8,-12,-24,-24,-20,-4,-12,1,-24,-22,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-20,-32,-25,-3,-31,-27,33,-25,13,12,-19,-21,-19,-25,-11,-5,25,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-10,-17,-10,-13,-13,-22,-19,5,-13,2,0,-10,-20,-13,-13,-13,-8,3,-26,-10,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,-5,-28,-26,6,-6,-24,0,-25,4,0,-19,-28,-27,-22,-13,-10,6,-20,-8,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-14,41,-25,47,12,-32,-6,1,-32,-1,-30,-26,30,-13,0,-7,7,-3,-27,-40,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-28,-20,-20,-18,-11,-27,-18,-20,85,-10,-20,-11,-10,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-28,-3,8,-27,-11,-9,-28,30,-25,-11,-1,-12,7,23,-6,-9,-19,-21,-13,7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-26,0,7,-24,1,-10,-22,4,-17,-11,-1,-8,2,-2,-4,-8,-20,-23,-16,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-8,-22,-6,-8,-7,-23,-10,0,-3,6,4,-12,-20,-8,-3,-15,-8,1,-19,-1,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=2,1,-17,1,7,-24,-8,-8,-22,5,-27,-16,6,-9,7,0,23,11,-14,-33,-17,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-25,12,13,-24,-14,4,-22,-1,-19,-13,6,-7,8,-2,3,-4,-21,-31,-13,9;
MA   /M: SY='D'; M=-5,9,-27,11,9,-27,-2,3,-28,-2,-24,-17,8,-3,0,-2,1,-8,-24,-30,-18,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-28,12,44,-29,-15,-2,-28,9,-20,-17,-1,-4,18,3,0,-10,-27,-27,-19,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-25,-17,-1,-29,-9,15,-18,22,15,-19,-23,-12,-14,-19,-6,8,-22,0,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-8,-26,-8,14,2,-23,-6,-16,3,-6,-3,-8,-14,0,8,-10,-10,-15,-17,-3,7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-27,-9,2,-19,-21,-4,-21,19,-14,-7,-4,-18,7,43,-8,-8,-13,-22,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-18,-28,-17,10,-21,-21,9,-22,16,5,-20,-21,-19,-20,-13,-7,7,-16,-2,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-15,14,-23,-19,9,-21,-19,-10,-20,-7,-9,-11,-23,-20,-19,2,7,-3,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-8,-1,-20,-2,-6,-24,6,-18,-10,-3,-18,5,21,-3,-8,-18,-21,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=1,-9,-24,-11,-3,-23,-4,-9,-20,8,-17,-8,-4,-16,5,15,-2,-7,-13,-22,-15,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00071;
//
ID   DHFR_MP; MATRIX.
AC   MP00075;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydrofolate reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4928184; R2=0.0141951; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; N_SCORE=9.110; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-23,-8,-3,-13,-13,-7,-12,-4,-15,-1,1,3,-1,-5,3,0,-13,-27,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-8,-19,-9,-4,-9,-20,-8,-3,-8,-1,6,-9,-14,1,-6,-6,-3,-3,-24,-7,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-10,-24,-13,-9,-12,-15,-7,-7,3,-4,9,-7,-14,-2,8,-11,-7,-7,-21,-6,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-21,-5,3,-18,-15,-8,-13,6,-13,-1,-2,-6,1,1,1,2,-10,-26,-12,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-24,-30,-22,11,-31,-21,20,-20,19,12,-22,-21,-20,-18,-20,-8,13,-15,4,-22;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-13,-6,-7,-16,-9,-10,-9,-9,-18,-11,8,-16,-5,-10,15,10,-5,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-13,-24,-15,-3,-19,-19,7,-19,15,8,-18,-23,-15,-16,-13,-7,5,-23,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-17,-34,-28,-1,-34,-27,35,-25,15,16,-22,-21,-21,-25,-16,-6,29,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-18,-30,-26,8,-23,-26,10,-20,2,0,-26,-26,-25,-20,-12,-6,21,4,-1,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=43,-7,-10,-15,-8,-19,0,-18,-10,-9,-10,-10,-8,-9,-9,-18,9,0,-1,-19,-18,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-11,-16,-16,-12,-10,-18,-6,4,-12,3,10,-7,-18,-5,-11,-8,-5,4,-26,-8,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-1,12,-12,14,4,-25,-11,-9,-25,-2,-22,-18,5,-12,-2,-7,9,6,-16,-32,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-23,-4,9,-21,-18,-8,-15,5,-11,-7,-5,-6,7,0,-1,0,-13,-25,-13,8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-21,10,7,-14,-10,2,-20,1,-22,-15,25,-15,3,-2,5,-1,-22,-29,-12,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-10,-26,-13,-12,-15,9,-5,-19,-3,-11,0,-2,-20,-6,7,-9,-13,-16,-18,-11,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-19,-16,-20,-23,-15,19,-23,-9,-21,-6,-5,-14,-24,-23,-20,-7,-11,2,-24,-20,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-29,-39,-29,5,-39,-29,45,-30,21,19,-21,-21,-21,-29,-21,-10,27,-18,2,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-23,-2,-2,-12,-18,-4,-14,9,-13,-6,6,-18,-2,7,-7,-7,-14,-21,-4,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-27,19,9,-31,7,-5,-32,4,-27,-19,12,-13,3,-2,1,-10,-27,-29,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,10,-27,5,-7,-26,31,-8,-31,-10,-28,-20,20,-13,-10,-11,2,-11,-29,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,4,-23,6,1,-25,-2,-6,-23,-1,-20,-13,3,-14,1,-4,4,-2,-15,-28,-15,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-23,6,-31,-20,27,-27,37,26,-26,-26,-17,-21,-26,-10,16,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-2,-28,-3,2,-23,-14,19,-26,11,-23,-9,5,-7,7,19,-4,-9,-23,-26,-6,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-9,-31,-23,3,-31,-23,21,-27,27,13,-25,-27,-21,-23,-21,-9,15,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-33,-5,2,-27,-18,-12,-22,10,-28,-15,-4,37,-1,3,-6,-7,-25,-27,-21,-2;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-23,4,12,-25,0,-7,-24,2,-22,-15,8,-11,4,-4,6,-3,-21,-28,-19,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-23,-22,-28,-17,8,-26,-11,13,-17,24,25,-22,-24,-7,-13,-22,-10,5,-13,3,-12;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-25,-6,6,-26,-17,-6,-21,21,-19,-7,-3,-12,13,14,-3,-5,-16,-21,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-29,-18,-14,17,-25,24,-9,-13,-4,-1,-11,-26,-7,-6,-17,-13,-15,11,37,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-38,-30,72,-30,-19,2,-28,10,1,-21,-30,-38,-20,-19,-9,3,8,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-26,-3,6,-27,-17,-7,-27,31,-26,-10,1,-12,12,28,-2,-5,-18,-22,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-1,5,-23,4,8,-25,-12,-4,-24,12,-22,-14,6,-12,8,15,3,-3,-18,-27,-15,7;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-19,-21,-16,-5,-25,-12,11,-12,8,11,-14,-22,-9,-7,-9,1,12,-24,-4,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-11,-11,-10,-20,-20,-7,-11,-9,-9,-1,-10,-10,-11,19,46,1,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-17,-14,-7,-8,-19,-13,-2,-8,0,2,-9,-16,-7,-9,2,11,0,-24,-5,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,2,-24,-2,-9,-14,9,-2,-22,-7,-19,-13,9,-19,-8,-6,1,-3,-19,-22,-7,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-20,-4,-1,-18,-17,4,-12,3,-15,-5,0,-13,4,0,2,4,-7,-26,-7,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-14,-9,-8,-7,-12,-13,-1,-8,-6,-5,-8,5,-8,-11,-3,1,-1,-6,-7,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-17,-11,-18,-14,1,-18,-14,17,-14,13,10,-15,-13,-12,-12,-11,-4,16,-14,-3,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-13,-21,-17,1,-21,-17,21,-17,15,10,-16,-16,-14,-15,-11,-4,18,-15,-2,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-10,-19,-14,-10,-10,-16,-5,1,-7,0,19,-7,-15,-2,-5,-4,-2,0,-27,-8,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-27,4,-3,-28,33,-14,-32,-11,-26,-19,3,-16,-11,-14,1,-13,-23,-26,-25,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-27,-5,4,-20,-16,-5,-24,16,-22,-12,-1,0,5,31,-2,-4,-19,-23,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-14,-5,2,-9,-11,-4,-6,5,-5,-1,-4,-4,5,5,-5,-5,-7,-10,-5,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,8,-25,2,4,-22,-15,-3,-22,19,-22,-12,14,-12,3,17,-3,-4,-20,-27,-13,3;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-13,-11,-8,-11,-16,-18,-7,-12,-3,-7,-4,-13,-10,-13,10,26,-1,-28,-12,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-26,-29,-22,24,-23,-19,-1,-14,-1,-1,-22,-23,-23,-13,-19,-11,1,15,15,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-29,-2,13,-16,-22,-10,-10,-2,-10,-9,-6,-13,2,-6,-8,-10,-12,-11,-7,7;
MA   /M: SY='S'; M=1,-6,-16,-9,-5,-16,-5,-9,-12,-2,-16,1,0,-14,0,-3,15,6,-6,-31,-14,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00072;
//
ID   PYRIDINE_REDOX_1_MP; MATRIX.
AC   MP00076;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases class-I active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9957442; R2=0.0135942; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=11.579; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-16,-16,-5,-17,-6,-19,-4,-11,-7,-7,-12,-14,-10,-17,2,-4,4,-24,-18,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,7,-28,12,16,-30,-18,0,-21,6,-14,-8,1,-12,24,4,-3,-9,-22,-26,-12,20;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-18,-19,-13,-7,-19,-5,-4,-16,6,1,-17,-10,-10,-12,-14,-9,-5,-19,-1,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-25,-15,-19,-13,36,-18,-24,-18,-19,-13,-4,-21,-18,-17,-3,-14,-16,-18,-18,-18;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-21,-18,-6,-7,-19,-10,-2,-14,10,3,-15,-19,-8,-11,-9,-4,-3,-15,-6,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-27,6,5,-26,-16,-9,-25,16,-25,-15,2,8,1,10,-2,-2,-20,-26,-15,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-12,-21,-20,-5,-24,-24,14,-16,1,2,-14,-19,-18,-16,3,17,24,-28,-9,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-9,-17,-12,-14,-14,-20,-5,-14,-7,-7,-11,-5,-13,-17,7,11,2,-28,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-12,-23,-16,-2,-25,-6,7,-21,19,8,-18,-26,-14,-13,-15,-7,4,-26,-3,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-24,-21,-20,-9,-15,-25,18,-21,3,5,-16,-21,-19,-22,-11,-9,18,-25,-11,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-28,16,43,-27,-20,1,-27,5,-20,-18,0,3,13,-3,1,-3,-26,-30,-17,27;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-21,-6,1,-21,-3,-8,-20,11,-18,-9,-3,0,3,10,-3,-7,-15,-17,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=1,-8,-19,-10,-4,-11,-9,-10,-13,5,-15,-8,-3,-13,-3,5,2,-2,-7,-18,-7,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-19,1,-6,-15,13,-8,-19,-7,-17,-13,2,-12,-6,-9,-2,-9,-17,1,-10,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=9,-5,-21,-7,-5,-21,7,-10,-21,-5,-18,-13,-3,-14,-7,-8,4,-2,-12,-22,-14,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-30,-23,9,-29,-15,20,-23,26,17,-26,-27,-18,-19,-23,-9,13,-7,11,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-6,-15,-14,-9,-22,-22,-4,-13,-7,-7,-5,-14,-13,-14,13,37,5,-30,-11,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-15,-30,-25,3,-29,-26,25,-24,25,13,-29,-29,-25,-20,-17,-4,31,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,30,-21,13,-3,-17,-5,8,-14,-4,-21,-14,48,-21,-2,-3,5,-2,-24,-37,-16,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-20,-25,-21,-14,-6,-27,-13,3,-2,-4,0,-17,-23,-11,6,-14,-8,9,-7,1,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-29,42,-26,16,18,-24,-24,-23,-26,-16,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-18,-2,2,-22,-11,-12,-22,13,-27,-14,4,-10,2,5,18,14,-12,-31,-14,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-19,-16,-25,-17,-7,-18,-22,11,-19,10,4,-16,-18,-15,-21,-4,0,11,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-13,20,-23,40,33,-27,-27,-13,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-30,-23,2,-30,-12,20,-25,20,12,-24,-27,-19,-20,-22,-10,16,-9,2,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-4,-26,-6,0,-13,-19,26,-20,1,-16,-6,1,-18,8,10,-4,-5,-19,-17,11,1;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-15,-10,-10,-20,7,-17,-13,-12,-16,-12,-2,-14,-10,-17,12,0,-5,-26,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-28,8,16,-27,-12,3,-22,5,-17,-10,3,-11,12,0,-3,-8,-22,-27,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-26,-20,5,-29,-13,16,-17,17,12,-24,-27,-13,-12,-18,-7,15,-14,11,-18;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-19,-19,-17,-5,-3,-7,-5,-15,-5,-1,-12,-20,-13,-16,-3,-6,-1,-14,2,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-8,6,-26,8,4,-25,-6,25,-29,-1,-22,-12,6,-14,4,1,0,-7,-23,-28,-6,3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-27,6,25,-25,-20,-3,-18,7,-11,-6,-3,-9,16,2,-5,-8,-19,-26,-13,20;
MA   /M: SY='L'; M=5,-21,-20,-28,-18,6,-21,-17,9,-17,11,11,-17,-20,-13,-15,-12,-7,6,-15,-2,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00073;
//
ID   COX1_CUB_MP; MATRIX.
AC   MP00077;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=88;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=83;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0942984; R2=0.0071467; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=662; N_SCORE=7.823; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=477; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-25,10,3,-10,-11,-8,-22,1,-18,-15,4,-14,-5,-4,-2,-1,-17,-22,-5,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-22,-6,-6,-15,-14,-14,-11,-11,-13,-11,-5,10,-10,-15,2,-1,-10,-28,-15,-9;
MA   /M: SY='A'; M=6,-4,-17,-7,-6,-6,-14,-10,-8,-10,-11,-9,-4,-14,-10,-14,1,-1,-3,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-23,-15,-11,-9,4,-12,-11,-14,-10,-6,-9,-16,-12,-15,-4,-8,-8,-16,-5,-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-25,-8,-15,-25,39,-16,-28,-16,-24,-17,4,-14,-15,-17,2,-12,-22,-24,-25,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-29,-16,-20,-19,39,-21,-26,-19,-22,-13,-9,-13,-20,-19,-6,-17,-19,-10,-21,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,26,-25,31,9,-29,3,-3,-29,-4,-26,-20,20,-13,-2,-9,6,-6,-25,-35,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-30,-9,-6,-23,-5,-16,-15,-11,-21,-13,-6,34,-10,-17,-5,-7,-19,-28,-24,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-26,4,-31,-23,31,-25,26,22,-26,-26,-21,-21,-20,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-20,-24,-15,1,-26,-15,13,-21,26,16,-21,-25,-8,-15,-18,-7,7,-21,-2,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-18,-31,-18,-17,16,-21,-7,-12,-12,-9,-10,-18,-25,-15,-9,-18,-13,-14,38,30,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=2,0,-25,0,9,-31,-15,-1,-17,3,-15,-5,-2,-12,28,3,0,-7,-18,-23,-13,18;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,-4,-3,-17,-19,48,-16,-5,-13,4,8,-18,7,-1,-7,-10,-19,-28,6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-19,-31,-22,19,-30,-21,17,-28,37,15,-26,-28,-23,-20,-24,-6,10,-16,4,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-23,-33,-22,53,-29,-14,1,-23,7,2,-18,-27,-23,-16,-18,-10,-2,5,26,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-32,-28,-39,-29,48,-26,-24,-2,-26,2,-4,-25,-28,-31,-21,-23,-15,-5,43,24,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-25,-33,-26,54,-28,-12,-3,-23,3,-3,-21,-29,-28,-17,-20,-9,-6,29,40,-25;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-27,-11,-20,-27,58,-20,-33,-19,-27,-18,-2,-20,-20,-19,2,-16,-23,-22,-28,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-8,-2,-26,-18,-16,-17,-10,-24,-17,-10,67,-9,-17,-9,-9,-27,-31,-26,-9;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-27,2,29,-21,-19,-10,-17,0,-14,-14,-8,-7,6,-8,-3,-8,-16,-14,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-30,-24,-22,35,-29,11,-2,-13,0,-2,-22,-30,-15,-12,-22,-12,-10,37,70,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-26,-33,-22,15,-35,-23,29,-25,14,11,-20,-22,-21,-24,-18,-9,19,-13,7,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-32,-23,7,-29,-21,21,-26,35,20,-29,-28,-19,-20,-26,-10,14,-10,1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-23,-31,-23,-3,-31,-26,27,-24,14,11,-19,-15,-18,-24,-12,0,20,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-19,-30,-21,10,-26,-19,17,-25,33,18,-25,-26,-19,-20,-22,-8,11,-18,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,-1,-20,-24,-12,-30,-20,-16,67,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12;
MA   /M: SY='A'; M=14,-17,-17,-23,-18,5,-2,-20,-7,-18,-4,-6,-13,-17,-20,-19,-2,-4,-1,-14,-6,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-21,-36,-26,54,-29,-15,6,-26,18,11,-22,-29,-30,-18,-22,-10,2,2,24,-25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-12,-27,-13,-19,-26,53,-20,-32,-19,-21,-16,-4,-19,-19,-20,-1,-17,-23,-20,-26,-19;
MA   /M: SY='I'; M=1,-25,-22,-33,-24,0,-28,-23,30,-23,16,20,-20,-21,-17,-23,-15,-7,22,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-22,-35,-27,17,-31,-20,26,-24,18,21,-22,-24,-21,-21,-18,-8,20,-15,5,-25;
MA   /M: SY='S'; M=3,-6,-15,-8,-8,-6,-10,-4,-10,-10,-18,-12,1,-17,-6,-11,18,10,-5,-21,5,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-26,-1,12,-11,-23,12,-13,-5,-6,-4,-6,-15,5,-6,-7,-5,-16,-17,8,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-35,-28,12,-34,-25,32,-26,16,13,-23,-25,-25,-24,-17,-6,29,-17,5,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-23,-32,-24,0,-32,-26,30,-20,16,13,-21,-22,-20,-21,-16,-6,24,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='P'; M=1,-14,-26,-9,-2,-23,-14,-16,-15,-11,-23,-15,-11,39,-8,-17,4,0,-15,-31,-23,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-18,-11,-6,-12,-20,-11,-10,4,-13,-6,-5,-15,-4,-1,3,14,-1,-24,-6,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-15,-24,-20,-14,22,-17,-1,-10,-12,-4,-2,-8,-24,-10,-6,-12,-10,-12,-3,18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-11,-12,-8,-17,-4,-16,-10,-11,-15,-11,-3,-13,-9,-15,17,9,1,-28,-17,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-26,2,0,-23,7,-6,-30,5,-23,-14,4,-16,-2,14,-2,-9,-22,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-30,-4,4,-26,-14,-7,-30,38,-26,-10,0,-14,8,41,-9,-11,-20,-20,-11,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-28,-2,11,-27,-18,-10,-24,5,-26,-17,-6,30,2,2,-3,-7,-25,-29,-22,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-31,-25,2,-31,-23,28,-25,24,17,-26,-23,-21,-22,-19,-6,26,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-34,-27,53,-29,-13,5,-24,7,1,-20,-28,-30,-18,-17,-8,3,7,33,-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-23,-5,-7,-27,39,-15,-32,-14,-29,-20,3,-15,-10,-15,13,-6,-23,-27,-26,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-6,-28,-5,-4,5,-23,11,-12,2,-10,-6,-7,-21,-3,-2,-11,-8,-15,3,38,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-23,-12,-4,-15,-21,-4,-9,3,-6,-1,-7,-10,2,10,-7,-2,-7,-22,-7,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=2,-12,-20,-15,-12,-10,2,-8,-11,-14,-7,-3,-8,-15,-8,-13,0,-3,-10,-12,-7,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-20,-21,-27,-18,-3,-18,-12,11,-15,10,26,-18,-20,-7,-15,-11,-6,6,-10,-3,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-21,-31,-24,-3,-30,-25,26,-18,13,11,-21,-24,-19,-13,-15,-6,26,-23,-6,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-27,-30,-28,-24,16,-23,-9,1,-19,3,-1,-25,-28,-18,-17,-23,-13,-6,38,34,-22;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-13,-14,-9,-18,-5,-3,-11,-10,-13,-9,-3,-13,-7,-15,10,0,-3,-26,-14,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-19,-19,-27,-20,13,-25,-16,12,-18,7,16,-14,-20,-14,-16,-7,4,8,-17,3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-23,-30,-24,4,-22,-18,13,-22,14,10,-24,-25,-18,-20,-21,-12,6,6,7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-10,-19,-13,-14,-4,-20,-4,-16,-3,-5,-11,-16,-13,-19,5,0,2,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-36,-26,6,-34,-24,36,-27,24,23,-21,-22,-19,-25,-21,-10,21,-18,1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-13,-20,-16,-16,3,-21,-6,-17,-7,-5,-9,-16,-14,-19,2,-1,-1,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-27,-18,-33,-26,22,-26,-22,16,-26,17,9,-23,-27,-26,-21,-18,-8,14,-12,7,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-30,-22,5,-25,-20,21,-28,38,21,-26,-27,-19,-21,-26,-10,12,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-21,-8,-12,-16,23,-12,-24,-14,-24,-16,1,-17,-11,-14,13,3,-17,-21,-10,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-14,-28,-21,30,-24,-16,6,-21,8,7,-17,-16,-22,-17,-14,-6,3,-7,10,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-22,-17,-26,-21,1,-16,-20,17,-20,12,12,-18,-21,-18,-18,-13,-6,17,-18,-5,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-15,-29,-29,-4,-17,-29,22,-21,6,7,-24,-27,-27,-21,-10,-4,36,-27,-11,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-36,-45,-38,-28,13,-21,-29,-18,-20,-17,-18,-36,-28,-21,-19,-34,-23,-26,127,27,-20;
MA   /M: SY='A'; M=22,-13,-15,-19,-14,-15,1,-12,-7,-14,-6,-3,-11,-17,-12,-17,2,-3,1,-23,-15,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,1,-21,-20,94,-29,-9,-20,0,9,-19,13,1,-9,-19,-30,-29,18,3;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-25,-20,-33,-23,23,-25,-9,15,-19,23,37,-22,-25,-14,-15,-22,-10,7,-12,8,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-23,-27,-20,44,-26,6,-6,-20,1,-1,-14,-26,-20,-14,-16,-11,-8,6,35,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-18,-13,-14,-4,-22,-16,-4,-13,-5,-6,-10,-17,-13,-13,2,20,0,-8,4,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-17,-22,-19,-6,-22,-21,9,-15,-1,5,-16,-13,-15,-16,-1,11,14,-19,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=6,-11,-28,-12,-18,-28,54,-20,-33,-18,-26,-18,-3,-13,-18,-20,0,-17,-25,-21,-28,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=4,-16,-18,-21,-14,-4,-19,-16,8,-18,18,12,-15,-20,-12,-17,-12,-3,5,-22,-7,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,9,-29,17,3,-29,-4,-11,-25,-7,-26,-21,3,16,-7,-14,1,-7,-22,-33,-23,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-22,-9,-10,-14,-20,-13,-1,-15,-4,-3,-11,-1,-13,-17,-5,1,1,-28,-11,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-3,-26,0,-9,-10,-19,-13,-10,-11,-6,-9,-8,-21,-11,-9,-11,-5,-7,1,-1,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,-17,-21,-21,-15,-6,-18,-21,-3,-15,-7,-6,-15,-9,-13,-16,-1,8,0,-2,-6,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-26,-7,0,-14,-18,0,-19,12,-14,-6,5,-19,11,27,-6,-7,-18,-21,-6,4;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,-18,-19,-12,-4,-13,-17,-5,-13,-5,-2,-10,-15,-11,-16,1,4,-3,-8,-6,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-24,-23,-28,-23,21,-26,-11,9,-20,8,4,-20,-26,-20,-18,-15,-7,5,4,23,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-22,-30,-26,43,-7,-17,-7,-25,0,-4,-15,-27,-31,-19,-14,-11,-5,1,17,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00074;
//
ID   COX2_MP; MATRIX.
AC   MP00078;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CO II and nitrous oxide reductase dinuclear copper centers signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=79;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=74;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2889609; R2=0.0123606; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=753; N_SCORE=13.586; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-11,-23,-21,-2,-27,-22,17,-23,19,8,-19,-26,-20,-20,-15,-5,17,-27,-8,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-35,-10,-1,-25,-18,-18,-16,-10,-23,-16,-18,75,-9,-18,-10,-9,-25,-26,-25,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-13,-12,-16,-10,-7,-19,-13,5,-10,-2,6,-11,-16,-7,-11,-1,4,8,-23,-6,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-9,15,-24,15,3,-23,7,-3,-23,-4,-18,-15,15,-15,-4,-7,-1,-9,-22,-28,-17,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-15,-9,-4,-14,-17,-13,-8,2,-10,-5,-4,-12,-3,-1,5,13,-1,-24,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-29,1,9,-23,-19,9,-19,1,-19,-10,0,6,6,0,-5,-7,-21,-28,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-34,-28,2,-34,-26,36,-24,16,16,-24,-25,-22,-23,-16,-5,34,-22,0,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-26,-7,4,-17,-21,-5,-19,15,-15,-8,-3,-16,6,30,-4,-1,-13,-21,-7,3;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-18,-35,-27,35,-29,-21,15,-25,18,12,-24,-28,-29,-20,-19,-7,16,-10,10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-11,-19,-17,-13,-6,-24,-15,5,-13,6,4,-8,-22,-9,-11,-12,-4,1,-17,-5,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-32,-25,1,-32,-25,31,-25,22,16,-24,-24,-21,-23,-16,-4,27,-24,-4,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-13,-7,-5,-14,-14,-13,-13,-7,-15,-12,3,-11,-5,-7,19,30,-5,-30,-13,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=23,0,-12,-6,-4,-20,2,-12,-17,-9,-22,-16,7,-11,-4,-13,24,9,-9,-32,-20,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-6,-20,-7,3,-21,-5,-12,-16,-4,-16,-12,-5,-8,-2,-6,5,-1,-9,-25,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-24,-30,-22,0,-31,-24,27,-23,18,13,-18,-21,-17,-21,-14,-5,17,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=11,3,-15,4,-2,-24,9,-12,-24,-10,-26,-19,6,-11,-5,-13,24,8,-14,-34,-21,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-30,-40,-30,55,-27,-23,-7,-26,0,-7,-27,-30,-33,-20,-27,-17,-10,59,31,-26;
MA   /M: SY='W'; M=11,-18,-20,-23,-17,-6,-12,-17,-10,-14,-11,-10,-17,-19,-15,-17,-5,0,-4,19,0,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-15,-33,-28,1,-32,-26,32,-23,17,19,-26,-26,-23,-22,-16,-5,34,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-34,-10,-1,-26,-20,-19,-15,-10,-25,-17,-17,64,-10,-18,-6,-6,-20,-30,-26,-9;
MA   /M: SY='S'; M=8,3,-17,1,7,-23,-2,-8,-21,-4,-25,-17,9,-8,4,-7,20,7,-16,-33,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-20,-28,-20,21,-28,-7,9,-25,25,13,-21,-27,-20,-17,-21,-8,5,-15,8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-27,-11,-16,-22,38,-16,-28,-14,-17,-13,-2,-21,-15,-10,-3,-14,-21,-22,-22,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-20,-31,-26,6,-23,-24,22,-24,13,10,-19,-24,-23,-22,-14,-6,21,-20,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-24,0,8,-29,-18,-10,-29,41,-30,-11,3,-11,8,24,-6,-7,-19,-23,-12,8;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-20,-12,-25,-17,-8,-26,-15,12,-12,6,16,-17,-22,-6,-8,-12,-4,12,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,62,25,-38,-12,0,-38,1,-28,-28,17,-9,3,-9,0,-10,-29,-38,-20,14;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-3,-23,-17,-13,-12,-23,1,-16,-4,-3,-14,-17,-16,-21,2,2,9,-25,-16,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-17,-18,-22,-20,-3,-25,-18,17,-18,4,7,-12,-21,-15,-18,-4,2,17,-24,-2,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,-1,-28,-18,-19,-19,-10,-28,-19,-17,78,-10,-19,-6,-6,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-30,-3,-12,-31,49,-9,-36,-14,-28,-17,4,-18,-8,-14,0,-17,-30,-22,-25,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-29,-9,2,-21,-20,0,-20,15,-17,-6,-1,-9,11,36,-8,-9,-18,-22,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-12,-22,-13,-3,-25,-20,8,-19,18,6,-19,-23,-16,-16,-14,0,8,-25,-8,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,24,-18,11,0,-20,-3,3,-20,-1,-28,-19,39,-14,0,-2,15,6,-23,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-22,-1,11,-27,-15,3,-19,2,-20,-8,2,-11,27,2,10,4,-20,-26,-10,18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-21,-18,-28,-22,13,-24,-19,12,-21,10,8,-17,-22,-21,-19,-9,2,13,-17,1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-9,-22,-13,-8,-11,-14,-13,-12,-8,-15,-9,-5,-15,-2,-6,4,6,-9,-5,-7,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-26,-20,-33,-25,28,-29,-19,14,-25,18,9,-22,-26,-25,-20,-18,-6,11,-8,13,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-11,-20,-14,-7,-1,-23,-11,-2,-8,-1,0,-8,-18,-9,-6,-4,4,-1,-20,0,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=8,-20,-17,-27,-18,0,-20,-22,10,-19,2,2,-15,-11,-17,-21,-5,-3,9,-20,-7,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-23,16,7,-24,-12,-4,-22,1,-23,-15,14,-9,5,-4,7,3,-20,-32,-15,6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-27,-4,6,-23,-17,-3,-24,22,-20,-8,3,-15,11,34,-4,-6,-19,-24,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-27,-2,12,-25,-19,-13,-18,-2,-22,-16,-8,31,-2,-10,-3,-4,-19,-30,-22,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-8,-18,-29,62,-19,-38,-19,-29,-20,0,-19,-18,-19,2,-17,-28,-21,-29,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-16,-25,-18,-3,-26,-22,16,-18,11,8,-19,-21,-16,-18,-8,3,20,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-24,-24,-29,-23,47,-29,5,0,-21,5,1,-17,-29,-24,-15,-19,-11,-4,10,43,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-29,-22,-20,23,-27,-2,-3,-12,-3,-4,-19,-22,-16,-10,-19,-11,-7,22,40,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-13,-28,-14,-21,-20,45,-17,-26,-19,-21,-14,-6,-22,-20,-19,-3,-16,-18,-16,-16,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-7,-29,-8,5,-22,-23,7,-11,6,-12,2,-6,-15,30,7,-7,-10,-18,-14,4,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-11,-5,-3,-19,-1,-11,-17,-10,-24,-17,6,-11,-3,-12,29,13,-8,-33,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-32,13,49,-26,-20,-3,-29,7,-20,-19,-4,-4,18,-2,-4,-12,-30,-11,-14,34;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-24,-34,-25,14,-33,-20,27,-27,29,20,-24,-25,-20,-22,-23,-9,15,-15,7,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-18,-29,61,-8,-39,-19,-29,-18,1,-20,-17,-18,-1,-20,-30,-21,-25,-18;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-16,-21,-15,-12,-14,-21,4,-14,-3,-1,-14,-10,-14,-17,2,4,9,-25,-14,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-22,-4,-10,-6,-6,0,-9,-11,-6,-6,11,-22,-7,-10,-3,-5,-14,-21,1,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=11,-6,-14,-9,-6,-19,5,-9,-16,-11,-20,-8,1,-13,-2,-12,19,5,-10,-29,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-15,-21,-20,-10,22,-18,-9,-6,-15,1,1,-10,-21,-14,-11,-9,-7,-7,-10,7,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-27,-5,-4,-20,-19,-15,-16,-7,-22,-15,-8,40,-11,-12,-8,-8,-19,-30,-21,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-26,-32,-26,8,-16,-25,19,-26,6,8,-15,-21,-22,-24,-13,-9,12,-16,-1,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-11,-19,-12,-4,-16,-21,-15,-5,6,-10,-3,-10,-17,-5,4,-4,-1,6,-26,-12,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-27,4,-32,-24,33,-24,21,21,-25,-25,-21,-22,-18,-7,29,-22,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-20,-3,19,-18,-23,-6,-13,4,-9,-6,-7,-13,6,4,-8,-9,-13,-25,-10,11;
MA   /M: SY='V'; M=10,-19,-12,-23,-19,-2,-17,-22,8,-17,-1,0,-16,-19,-19,-18,2,4,19,-25,-10,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-18,-20,-12,-7,-27,-15,13,-13,5,6,-18,-21,-14,-14,-8,0,20,-27,-8,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-22,1,3,-23,-11,-12,-20,-4,-23,-17,0,13,-3,-9,12,7,-17,-32,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-17,-24,-17,-6,-8,-21,-16,-4,-9,2,-1,-15,2,-9,-8,-11,-6,-6,-22,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-27,16,22,-28,-13,-4,-27,14,-26,-18,9,-4,7,4,2,-6,-24,-31,-18,15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-27,17,12,-20,-16,5,-23,4,-19,-14,8,-14,4,0,-2,-6,-22,-24,-3,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-25,-3,4,-14,-21,-7,-6,-5,1,-2,-9,-16,-1,-8,-10,-8,-7,-23,-5,1;
MA   /M: SY='N'; M=4,4,-20,0,1,-20,-8,-8,-15,-1,-16,-10,7,-13,1,-5,6,2,-13,-27,-15,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00075;
//
ID   MULTICOPPER_OXIDASE1_MP; MATRIX.
AC   MP00079;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Multicopper oxidases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3821859; R2=0.0177224; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=91; N_SCORE=7.985; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=7; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-26,-14,-8,1,-12,-12,-11,-13,-10,-9,-7,3,-13,-13,-6,-5,-14,-17,-3,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-32,-7,-4,-28,-4,-18,-22,-11,-26,-19,-11,49,-11,-18,-3,-5,-24,-28,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-28,-6,-10,-26,37,-11,-32,-9,-27,-16,6,-18,-4,-8,0,-14,-28,-21,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-21,-2,0,-23,10,-11,-23,-8,-23,-16,3,-10,-6,-11,11,1,-15,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-23,-17,-14,15,-18,-2,-12,-14,-11,-9,-5,-22,-13,-10,-4,-3,-13,7,14,-13;
MA   /M: M=-6,-14,-24,-15,-5,-4,-16,-11,-7,-5,-3,-2,-12,-15,-6,-3,-9,-5,-7,-15,0,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-16,-12,-20,-17,-1,-21,-19,6,-16,6,1,-14,-20,-17,-15,0,14,13,-23,-5,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-22,-27,-21,9,-29,-9,19,-21,19,13,-21,-25,-16,-18,-18,-7,12,-10,16,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-25,4,16,-23,-13,-6,-25,8,-17,-14,1,-11,5,14,0,-3,-19,-26,-16,9;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-21,-33,-24,37,-22,-12,6,-20,9,16,-18,-25,-23,-15,-18,-10,4,-6,13,-22;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-21,-17,-12,-5,-16,-15,-4,-1,-3,-1,-10,-20,-9,1,-9,-4,2,-20,-7,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-20,-8,-6,-19,-11,-14,-14,-11,-15,-12,-6,9,-9,-15,6,12,-10,-27,-17,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,23,-27,34,13,-32,-8,-6,-28,-4,-26,-22,10,-3,1,-10,6,-3,-23,-36,-19,6;
MA   /M: SY='N'; M=-1,14,-21,4,2,-23,-8,0,-18,5,-22,-10,23,-15,10,2,7,2,-20,-30,-15,6;
MA   /M: SY='P'; M=4,-18,-28,-15,-7,-20,-17,-19,-11,-12,-17,-13,-18,44,-12,-19,-5,-3,-14,-25,-19,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-20,-14,-11,-12,-19,-19,-6,-8,-11,-8,-9,-10,-11,-7,2,11,1,-15,-10,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-42,-36,-28,22,-23,-18,-13,-19,-12,-13,-33,-30,-20,-18,-33,-23,-22,109,41,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-25,-30,-21,15,-24,-16,3,-19,16,8,-25,-27,-18,-12,-23,-12,-1,15,11,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-23,-29,-23,26,-29,-6,12,-21,20,14,-23,-28,-18,-16,-23,-10,4,1,31,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-28,1,1,-19,-21,70,-22,-9,-17,-2,6,-19,5,-3,-9,-16,-21,-30,11,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-15,89,-24,-24,-19,-24,-26,-27,-25,-21,-19,-14,-33,-24,-25,0,-1,-9,-47,-27,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-2,-29,-1,2,-20,-16,71,-26,-10,-15,-1,5,-18,8,-2,-9,-16,-26,-28,11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-35,-27,4,-34,-27,35,-27,22,17,-23,-24,-22,-24,-18,-6,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-22,0,4,-21,1,-13,-20,-10,-13,-13,-4,-6,-6,-13,3,-1,-16,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-11,-34,-8,-2,-10,-4,-15,-25,-11,-21,-19,-13,-13,-9,-14,-11,-12,-25,31,1,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,1,-30,0,2,-23,-20,78,-26,-7,-19,0,10,-18,17,1,-8,-17,-28,-29,13,6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-21,-23,-14,2,-24,-9,9,-15,14,12,-21,-23,-8,-14,-15,-7,6,-12,10,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-5,-14,-5,2,-21,-14,7,-17,-5,-13,-6,-3,-17,4,-2,-1,-7,-13,-29,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=11,1,-20,0,0,-23,-6,-10,-14,-5,-13,-4,-3,-12,1,-11,3,-3,-10,-26,-16,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,34,41,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-23,-14,-5,-12,-3,-12,-18,-3,-14,-8,-6,-16,-2,1,0,-6,-13,-12,-10,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-20,-16,-16,-13,0,-18,-7,-13,-7,-4,-6,-19,-14,-9,0,5,-1,-25,-14,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-23,-15,-8,-14,-25,-19,2,-11,-4,-2,-17,7,-9,-14,-7,1,4,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-36,-27,52,-30,-18,9,-27,18,8,-22,-29,-31,-20,-21,-10,6,1,23,-27;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-17,-25,-18,-3,-26,-23,16,-18,13,7,-20,-22,-18,-15,-9,2,20,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-21,-13,4,-12,-27,-19,10,-10,0,0,-16,-16,-9,-14,-7,-5,15,-28,-12,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-6,-24,-6,-3,-8,-14,-5,-11,-5,-8,-4,-8,-14,-4,-6,-4,-4,-10,-15,5,-5;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,7,-26,13,7,-26,-13,-10,-20,-5,-23,-18,1,18,-3,-12,3,-2,-18,-32,-21,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,0,-25,0,5,-20,-16,-2,-18,1,-20,-12,3,6,2,1,1,-2,-18,-28,-14,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-23,13,14,-24,-13,-3,-20,2,-16,-12,2,-11,4,-4,2,-2,-15,-29,-14,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-11,7,-15,-8,-4,-19,-13,3,-13,3,1,-10,-16,-9,-13,-8,-4,3,-19,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-24,7,7,-21,-14,0,-20,5,-17,-10,1,-10,9,5,-2,-5,-17,-23,-10,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=2,-3,-14,-7,-5,-8,-11,-8,-4,-6,-5,-1,0,-9,-4,-6,1,1,-4,-19,-8,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-28,-12,-6,-22,-11,-18,-13,-8,-20,-13,-11,33,-9,-12,-2,-1,-15,-26,-21,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-11,-24,-12,-6,-5,-20,4,-4,-9,-4,3,-7,-5,-5,-10,-8,-6,-9,-17,5,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-20,-5,-5,-21,12,-4,-21,-6,-20,-10,2,-9,-1,-8,7,-3,-17,-24,-16,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-10,-23,-11,-2,-16,-15,-12,-5,-8,-2,2,-10,-9,1,-10,-4,-1,-6,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='A'; M=8,3,-20,1,1,-23,-5,-8,-19,-6,-19,-14,2,-8,0,-11,7,2,-15,-23,-16,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00076;
//
ID   MULTICOPPER_OXIDASE2_MP; MATRIX.
AC   MP00080;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Multicopper oxidases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8660383; R2=0.0138147; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=370; N_SCORE=9.967; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-23,-21,-11,-8,-25,-16,6,-9,4,5,-15,-15,-6,-2,-10,-3,6,-23,-8,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-11,-21,-20,0,-21,-22,12,-17,5,3,-18,-22,-20,-16,-1,8,24,-25,-8,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-24,-23,-29,-22,8,-30,-11,24,-23,22,17,-20,-23,-16,-19,-20,-9,13,-13,10,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-24,-8,4,-19,-10,-5,-23,14,-14,-10,-3,-15,4,34,-6,-9,-16,-20,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-21,-34,-26,48,-29,-10,7,-24,9,10,-20,-28,-28,-17,-18,-9,6,0,24,-25;
MA   /M: M=-11,-3,-23,-4,-7,-2,-17,-12,-11,-3,-11,-7,-2,-19,-8,-2,-5,-2,-6,-21,-5,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,-14,-15,-10,-14,-13,-10,-6,-11,-9,-6,-8,-5,-10,-15,6,11,1,-24,-12,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-28,42,16,-35,-7,-2,-34,1,-27,-23,13,-11,5,-2,2,-6,-27,-34,-19,10;
MA   /M: SY='N'; M=5,22,-18,9,-3,-20,-4,-1,-16,-4,-21,-13,30,-16,-3,-7,8,2,-18,-33,-18,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-36,-12,-3,-22,-22,-16,-15,-7,-20,-14,-19,61,-9,-15,-13,-10,-24,-24,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-28,-13,-20,-18,49,-10,-33,-20,-24,-15,-2,-21,-20,-18,-3,-18,-24,-19,-20,-20;
MA   /M: SY='A'; M=6,-16,-21,-18,-10,-17,-18,-18,-5,-3,-11,-6,-13,1,-10,-2,-3,-2,2,-25,-16,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-43,-35,-27,14,-20,-23,-17,-19,-17,-17,-33,-28,-19,-18,-30,-23,-25,114,30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-19,-31,-22,19,-25,-17,13,-23,21,16,-22,-25,-20,-19,-18,-8,9,-12,6,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-21,-30,-22,25,-27,-11,11,-22,22,15,-23,-27,-19,-17,-21,-9,4,-5,19,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-27,2,-34,-26,37,-26,23,19,-25,-25,-22,-24,-19,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-21,5,8,-17,-16,-12,-13,-9,-1,-9,-6,-13,-4,-13,-3,0,-10,-27,-14,2;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-14,-37,-10,-5,-1,-19,-14,-21,-11,-19,-18,-18,-15,-9,-14,-18,-16,-25,55,14,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-21,-20,-6,-6,-25,-13,12,-14,17,18,-19,-20,-4,-13,-16,-8,7,-23,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-26,10,17,-24,-16,16,-21,0,-15,-3,2,-11,12,-3,-1,-8,-20,-30,-8,13;
MA   /M: SY='A'; M=8,-9,-20,-15,-6,-19,-3,-10,-9,-5,-9,6,-7,-14,3,-9,0,-3,-7,-22,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,35,41,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-19,-16,-7,-9,3,-14,-12,-12,-7,-1,-9,-15,-10,-16,-1,-7,-8,-19,-13,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-19,-22,-16,-4,-25,-18,9,-13,10,5,-13,-22,-13,-4,-9,1,10,-25,-7,-16;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-19,-13,-9,-14,-15,-20,1,-13,-5,-4,-13,-11,-12,-15,-2,3,9,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-27,55,-30,-18,7,-27,17,5,-23,-30,-33,-19,-21,-9,6,2,24,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=4,-13,-16,-18,-11,-8,-20,-18,5,-10,2,0,-11,-16,-10,-7,-2,6,8,-22,-9,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-19,-3,16,-14,-23,-13,-1,-4,-5,-5,-13,-13,-3,-9,-4,-5,7,-27,-14,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-24,1,3,-18,-12,-10,-12,-8,-3,-4,-7,-9,-2,-9,-6,-8,-12,-26,-14,0;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-29,1,8,-27,-18,-13,-17,-5,-22,-15,-9,30,0,-12,-1,-3,-18,-30,-22,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-23,-1,7,-20,-6,-2,-20,-5,-20,-13,3,-4,4,-8,5,0,-18,-28,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-21,7,12,-22,-13,-10,-16,-2,-13,-10,-3,-11,-1,-8,2,-1,-10,-29,-16,6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-2,-24,-2,-3,-9,-22,-14,2,-13,0,-1,-6,-16,-10,-16,-8,-5,0,-26,-8,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-24,3,0,-22,-14,-3,-15,-3,-11,-7,-3,-11,4,-3,-3,-3,-12,-28,-11,1;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-21,-3,3,-17,-13,-9,-19,6,-19,-12,1,-9,2,3,6,0,-14,-26,-13,2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-20,-15,-13,-7,-8,-16,-7,-11,-12,-8,-3,-12,-12,-7,5,6,-4,-25,-11,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00076;
//
ID   LIPOXYGENASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00081;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipoxygenases iron-binding region signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7980857; R2=0.0136603; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=634; N_SCORE=13.449; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-1,-27,-24,-4,-26,-24,15,-19,7,10,-21,-24,-20,-19,-7,4,24,-29,-10,-23;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-6,-20,-16,-12,-11,-18,-1,-15,-6,2,-11,-15,-12,-17,4,5,5,-28,-14,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=7,-19,-22,-17,-11,-18,-17,-22,-3,-13,-14,-9,-18,22,-15,-19,-1,-2,3,-29,-21,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-23,-38,-29,63,-31,-17,7,-28,10,3,-20,-29,-34,-20,-20,-10,3,8,31,-29;
MA   /M: SY='V'; M=11,-19,3,-25,-21,-12,-14,-25,5,-19,-4,-3,-16,-21,-19,-22,-1,-2,13,-28,-16,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-26,3,-33,-25,34,-26,27,21,-25,-25,-21,-23,-21,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='T'; M=8,-5,-11,-15,-11,-10,-17,-19,-6,-11,-4,-3,-5,-12,-10,-12,12,33,1,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-26,-11,-10,-6,-16,8,-5,-10,-2,8,4,-23,0,-7,-12,-10,-14,-6,4,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,1,-3,2,-27,-18,14,-23,-4,-21,-8,8,-19,19,-2,1,-5,-24,-32,-11,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='P'; M=8,-11,-23,-8,-2,-24,-9,-16,-18,-10,-26,-18,-7,34,-6,-16,13,3,-17,-32,-24,-6;
MA   /M: SY='A'; M=6,-12,-15,-13,-7,-16,-10,-13,-6,-12,-9,-3,-9,-9,-6,-14,5,0,0,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='M'; M=0,-21,5,-27,-21,-6,-23,-20,9,-20,9,12,-19,-24,-17,-20,-9,-2,12,-28,-10,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-34,-27,37,-26,23,18,-25,-25,-23,-24,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-25,-25,-21,44,-28,15,-5,-19,1,0,-14,-28,-20,-13,-18,-12,-9,10,45,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-3,7,-28,-21,-10,-25,42,-26,-8,-2,-12,9,28,-10,-9,-15,-21,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,12,-30,-20,19,-30,49,19,-30,-30,-21,-20,-30,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-16,-22,-19,-11,-10,-24,1,5,-12,1,4,-12,-19,-3,-10,-8,-6,4,-22,-1,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-21,-29,-23,26,-29,-14,12,-21,12,9,-19,-25,-21,-18,-14,0,9,-6,19,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-9,2,-15,-21,2,-26,23,-16,-9,-3,-20,8,54,-11,-10,-19,-16,-1,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-5,-28,-4,-14,13,-8,4,-15,-12,-10,-9,-7,-24,-14,-13,-12,-11,-16,4,33,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-11,-9,-11,-10,-19,-18,-7,-10,-10,-9,2,-13,-11,-10,16,41,3,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-20,-31,-21,4,-26,-12,23,-20,32,38,-25,-25,-12,-16,-23,-9,14,-21,-1,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-23,2,17,-18,-14,-1,-20,3,-17,-12,6,-11,10,0,2,-4,-20,-25,-13,13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,25,2,-22,-1,9,-22,0,-30,-21,56,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='T'; M=17,-7,-12,-13,-7,-15,-12,-19,-7,-10,-10,-9,-6,-12,-9,-14,13,18,3,-27,-15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-26,-22,-13,-8,-21,-15,5,-8,11,7,-15,-22,-6,2,-17,-10,0,-20,-6,-12;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-13,-18,-12,-21,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,9,-2,-5,-20,-21,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-29,-11,-1,-20,-19,-1,-29,27,-19,-10,-1,-19,9,63,-9,-9,-19,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=2,2,-22,-1,8,-25,-11,-6,-20,6,-19,-11,4,-11,12,4,5,1,-18,-26,-15,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-22,-9,-2,-17,-10,-11,-6,-10,-6,-1,-4,-15,1,-10,0,2,-7,-26,-12,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00077;
//
ID   EXTRADIOL_DIOXYGENAS_MP; MATRIX.
AC   MP00082;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Extradiol ring-cleavage dioxygenases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.6705647; R2=0.0190795; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=237; N_SCORE=11.182; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-8; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=36,-14,-12,-24,-14,-1,-6,-20,-8,-14,-6,-8,-12,-14,-16,-20,4,-2,0,-14,-10,-14;
MA   /M: SY='D'; M=1,26,-21,35,9,-31,-6,-6,-29,-4,-26,-24,12,-10,-2,-12,12,-1,-19,-36,-20,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-10,-9,-3,-12,-5,-9,-10,3,-9,-6,-3,-7,-2,2,3,2,-4,-13,-10,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-17,-14,-12,14,-19,15,-1,-11,2,2,-10,-19,-9,-8,-12,-7,-3,1,27,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-19,24,13,-21,-11,-2,-19,3,-12,-11,5,-7,6,-2,-3,-7,-16,-21,-10,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-26,-13,-1,-17,-22,-6,-9,5,-3,1,-7,-18,13,18,-8,-7,-11,-22,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-5,-33,-25,12,-30,-22,17,-27,25,16,-25,-29,-23,-21,-22,-9,14,-20,0,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-22,1,-3,-17,-8,-12,-20,5,-19,-12,-1,-16,-6,5,1,-4,-9,-25,-13,-5;
MA   /M: SY='A'; M=3,2,-22,2,1,-19,-13,1,-17,3,-15,-4,-2,-13,0,-4,-1,-6,-12,-22,-5,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=0,5,-21,3,3,-22,-7,1,-22,6,-19,-12,6,-12,0,3,2,0,-16,-25,-12,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-28,11,6,-29,23,-9,-34,-2,-25,-19,4,-12,-4,-4,-1,-14,-26,-24,-21,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-22,-24,-19,2,-26,-13,16,-15,6,5,-14,-18,-12,-14,-10,0,9,-10,11,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-16,15,11,-11,-10,-5,-18,-3,-14,-14,4,-7,-1,-7,6,3,-13,-22,-9,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-27,-26,-18,-11,-31,-24,22,-19,2,6,-21,3,-12,-21,-13,-7,15,-25,-10,-18;
MA   /M: SY='A'; M=3,-2,-22,-2,-1,-20,-7,-14,-15,-3,-11,-10,-4,-14,-6,-5,-1,-2,-8,-25,-15,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-20,-28,-22,0,-25,-21,16,-20,12,13,-22,-24,-17,-18,-13,-3,16,-8,-2,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-20,-6,-5,-20,7,-10,-17,-8,-15,-10,1,-4,0,-9,4,2,-16,-22,-16,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-28,-21,-12,-9,-26,-21,4,-20,10,1,-22,20,-15,-20,-16,-4,-5,-25,-13,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-25,-11,-18,-21,34,-19,-21,-18,-20,-13,1,-19,-18,-18,1,-6,-14,-24,-22,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-30,-8,4,-25,-22,-2,-21,24,-19,-5,-2,-16,20,41,-8,-10,-19,-20,-9,9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=8,-9,-13,-12,-13,-14,7,-18,-9,-12,-11,-8,-6,-14,-13,-14,7,8,1,-22,-15,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,10,-18,-1,-8,-8,-11,-2,-1,-10,-1,-3,21,-19,-7,-8,-4,-3,-10,-27,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,-25,31,3,-31,11,-9,-34,-8,-27,-24,11,-13,-7,-13,6,-2,-24,-33,-21,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-25,-6,1,-20,-20,21,-15,3,-16,-2,-3,-17,15,2,-3,-8,-12,-23,2,6;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,-15,-15,-13,-15,0,-15,-7,-11,-9,0,-2,-16,-10,-14,5,7,-2,-25,-15,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-21,-22,-17,9,-28,-13,6,-10,8,4,-18,-23,-16,-10,-13,1,7,-11,13,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,1,-10,-9,-7,-12,-16,-16,-14,-19,-15,1,-15,-10,-13,24,23,-6,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-37,-27,50,-30,-20,12,-28,19,11,-22,-28,-30,-20,-22,-10,7,-2,18,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-21,-11,-26,-24,7,-8,-15,0,-19,-2,2,-17,-25,-21,-19,-11,-9,5,-12,5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-19,-15,-10,1,-17,-9,-7,-9,-1,0,-10,-18,-6,-7,-4,-2,-5,-14,2,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-6,23,-21,26,9,-25,-13,-8,-25,-3,-20,-20,12,-10,-3,-9,9,13,-17,-34,-16,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-19,5,-2,-21,3,-12,-24,-10,-27,-21,4,-13,-5,-13,19,5,-16,-17,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-19,-30,65,-20,-39,-19,-30,-20,-1,-13,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,0,-23,-11,-15,12,-13,-8,-10,-13,-14,-9,11,-23,-14,-11,-5,-6,-14,3,2,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-19,-20,-25,-15,8,-20,-12,0,-8,7,9,-14,-21,-11,2,-13,-8,0,-13,0,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,1,-29,-27,-4,-29,-27,17,-22,2,3,-20,-28,-24,-22,-11,-5,24,-18,-9,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-23,-28,-22,24,-29,-11,9,-22,18,7,-25,-21,-22,-17,-21,-9,5,-3,23,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-26,-14,-14,-5,25,-14,-26,-16,-19,-12,-4,-20,-9,-14,0,-12,-21,-15,-12,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-29,-15,-34,-27,3,-15,-27,-9,-23,-11,-11,-26,-27,-22,-23,-22,-18,-12,50,6,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-8,12,-29,19,-3,-32,31,-11,-38,-9,-29,-23,8,-16,-10,-9,1,-14,-28,-28,-24,-7;
MA   /M: SY='G'; M=11,-5,-21,-12,-14,-20,13,-16,-13,-14,-17,-11,2,-11,-13,-17,3,-7,-10,-25,-21,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-26,0,-3,-9,-9,-5,-24,4,-18,-12,4,-18,-1,17,-5,-9,-19,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-10,-21,-11,-5,-1,-21,-4,-6,-4,-8,-6,-10,-18,-7,-8,-1,6,-3,-9,17,-8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-14,-16,-21,-19,-6,-22,-21,13,-17,4,2,-10,-20,-17,-18,-2,6,17,-27,-10,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-31,-8,-7,-15,-17,-14,-6,-13,-13,-9,-13,18,-11,-18,-9,-7,-10,-20,-6,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-24,13,9,-27,-12,-8,-25,-1,-24,-18,3,3,3,-2,8,2,-19,-32,-19,5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,13,-27,21,17,-29,-2,1,-29,-4,-20,-17,5,-11,5,-8,1,-9,-25,-31,-17,11;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-12,-30,-12,-1,-16,-16,5,-19,-7,-19,-11,-11,-7,6,-9,-7,-12,-22,14,3,2;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-18,-4,6,-20,-14,-14,-17,1,-19,-13,-2,-3,-1,-5,12,14,-9,-29,-16,2;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-21,-31,-19,-18,-2,-21,-17,-6,-14,-11,-10,-24,-9,-17,-18,-18,-13,-6,32,11,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00078;
//
ID   INTRADIOL_DIOXYGENAS_MP; MATRIX.
AC   MP00083;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Intradiol ring-cleavage dioxygenases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7365985; R2=0.0163243; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; N_SCORE=12.746; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-4,-21,-5,-8,-18,0,-16,-18,-10,-14,-13,-5,-15,-9,-14,3,-1,-12,-12,-14,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-24,-2,-4,-20,-8,-5,-20,7,-22,-13,13,-9,-2,17,0,-1,-17,-28,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-21,-22,-17,2,-18,-11,6,-15,15,14,-13,-23,-12,-9,-14,-4,1,-18,0,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-27,14,1,-23,-18,-11,-14,0,-11,-10,0,-6,-6,-7,-8,-9,-12,-29,-14,-3;
MA   /M: SY='B'; M=0,5,-20,3,-5,-18,-16,-13,-7,-4,-10,-4,0,-14,-7,-10,0,4,-3,-28,-12,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-26,0,-5,-17,4,-3,-23,0,-20,-13,4,-18,-2,-1,-3,-10,-20,-15,-2,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-1,1,-27,7,2,-29,4,-14,-27,-9,-27,-20,-2,17,-7,-15,4,-4,-23,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,24,-26,32,12,-27,-10,4,-27,-5,-18,-18,11,-13,-1,-9,-1,-4,-23,-34,-14,5;
MA   /M: SY='P'; M=4,3,-25,8,9,-27,-12,-13,-22,-5,-22,-18,-3,18,-3,-13,4,1,-18,-30,-21,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,10,-25,14,3,-25,-13,-9,-16,-7,-17,-14,3,5,-2,-13,-1,-6,-16,-30,-17,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-28,-10,-16,-26,43,1,-32,-18,-25,-14,-1,-20,-14,-16,-2,-18,-23,-22,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-30,18,31,-31,-13,12,-31,9,-23,-15,4,-8,17,2,-2,-12,-29,-29,-13,23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-28,-9,-2,-21,-19,6,-22,2,-21,-11,-5,15,-1,12,-4,-1,-20,-26,-12,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-13,-32,-24,3,-31,-21,26,-26,29,22,-26,-27,-19,-22,-22,-9,19,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-31,-23,0,-30,-23,18,-17,14,9,-24,-26,-18,-9,-21,-10,16,-3,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-21,-34,-26,11,-33,-24,29,-27,28,18,-26,-26,-23,-23,-21,-8,23,-19,1,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-5,-24,-5,6,-18,-21,16,-17,-1,-10,-5,-3,-16,5,7,-4,-3,-13,-26,-5,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-20,-6,1,-20,-16,-4,-17,2,-17,-8,3,-13,15,8,8,12,-15,-24,-8,7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-16,-22,-20,-13,14,-24,-10,-11,0,-4,-4,-10,-22,-12,14,-9,1,-6,-10,8,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-26,46,11,-35,0,-5,-35,-4,-27,-26,14,-11,-4,-12,4,-5,-25,-36,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-23,2,1,-24,3,-13,-22,-8,-19,-14,-1,-7,-3,-11,5,5,-15,-27,-19,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,20,-23,25,2,-20,-7,-6,-24,-8,-18,-18,10,-15,-6,-12,3,-2,-18,-29,-12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-24,-1,5,-22,-15,2,-21,14,-19,-9,7,-13,7,10,0,-2,-18,-26,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-32,-18,-9,-18,-24,-22,-3,-15,-10,-8,-23,49,-15,-21,-13,-9,-9,-28,-21,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-17,-31,-26,1,-30,-27,29,-24,20,13,-27,-27,-24,-22,-16,-4,33,-25,-6,-26;
MA   /M: SY='P'; M=5,-9,-25,-9,1,-23,-14,-13,-20,2,-21,-14,-7,17,-2,3,2,0,-16,-26,-20,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-27,28,0,-30,19,-3,-34,-7,-30,-24,26,-16,-7,-10,3,-10,-30,-33,-23,-3;
MA   /M: SY='A'; M=36,-11,-10,-19,-12,-16,-6,-20,-6,-11,-9,-8,-10,-13,-12,-18,11,6,6,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-19,-23,-16,2,-26,-18,7,-6,11,10,-19,-24,-15,-4,-15,-4,12,-21,-3,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-17,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,5,-3,15,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-8,-33,-30,6,-32,-28,28,-23,11,12,-26,-28,-27,-23,-14,-4,35,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-37,-47,-37,-28,8,-20,-29,-19,-19,-19,-19,-37,-28,-19,-19,-35,-23,-27,135,27,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-16,1,-30,1,11,-28,-20,60,-26,-1,-20,-1,6,-15,29,4,-6,-16,-30,-26,6,17;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-3,-16,-10,-18,-4,-19,-10,-12,-14,-12,-7,-13,-10,-18,15,5,1,-28,-20,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-10,32,-20,26,3,-23,-8,-1,-23,-3,-25,-20,32,-14,-3,-6,10,11,-22,-37,-17,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-20,-3,-4,-23,-2,-8,-20,-9,-22,-16,3,6,-7,-14,10,5,-16,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-4,17,-24,19,4,-25,-7,-7,-23,3,-18,-16,11,-14,-3,-4,0,-6,-19,-30,-16,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-24,-8,-4,-2,-14,-7,-16,5,-13,-9,5,-20,-6,13,-8,-8,-14,-20,-6,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-19,0,1,-23,-9,-9,-20,-5,-26,-16,2,3,3,-3,20,8,-14,-34,-19,1;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-8,-24,-9,-12,1,-3,16,-19,-16,-13,-8,-3,-21,-12,-13,-5,-11,-14,-17,5,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-22,-27,-22,35,-26,-12,2,-17,2,0,-11,-26,-23,-10,-14,-8,0,-2,20,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-27,47,13,-33,-10,18,-35,-3,-28,-23,20,-13,2,-7,3,-8,-28,-38,-13,6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,9,-30,17,8,-29,-18,-8,-25,6,-21,-15,0,9,4,0,-5,-6,-23,-29,-17,5;
MA   /M: SY='S'; M=-2,4,-20,4,3,-18,-14,0,-15,-5,-17,-11,3,-14,4,-7,7,4,-11,-26,-5,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-14,-2,-6,-12,8,-7,-10,-6,-8,-6,3,-10,-6,-4,-1,-6,-9,-14,-11,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=10,-2,-11,-5,1,-13,-2,-8,-11,4,-10,-7,-2,-5,-1,-2,2,0,-6,-12,-10,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-14,-25,-16,-4,-14,-22,-10,-1,-10,-5,1,-10,-6,11,-10,-4,-6,-8,-20,-8,3;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-25,-11,-6,-20,-9,-14,-12,-11,-14,-8,-7,17,-6,-14,0,-2,-13,-28,-19,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-21,14,0,-17,-13,-11,-20,-6,-18,-17,2,-8,-8,-9,4,2,-12,-29,-14,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-10,1,-15,2,-3,10,-12,-3,-9,-7,-5,-6,-2,-12,-5,-6,-6,-6,-9,-5,7,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-13,-1,-6,4,-8,5,-5,-4,-7,-2,12,-13,-4,-3,-3,-3,-10,-8,8,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-13,-15,-11,9,-16,-3,8,-12,17,10,-15,-16,-8,-9,-15,-6,2,-2,15,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-15,-27,-15,-6,-9,-21,-12,-17,2,-11,-8,-10,6,-6,17,-9,-3,-14,-21,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-10,3,-28,-2,-8,-24,21,1,-32,0,-26,-16,15,-20,-4,13,-1,-12,-27,-25,-18,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00079;
//
ID   CU2_MONOOXYGENASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00084;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper type II, ascorbate-dependent monooxygenases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5216284; R2=0.0130617; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=789; N_SCORE=14.817; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,19,-26,25,5,-25,-15,-1,-17,3,-12,4,3,-14,1,-5,-8,-10,-15,-30,-12,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,49,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,61,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-12,2,-30,7,32,-28,-20,-3,-30,26,-23,-15,0,-8,15,25,-5,-10,-25,-25,-15,22;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,70,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-15,1,-30,4,23,-25,-20,23,-30,16,-21,-11,2,-12,14,23,-6,-12,-26,-26,-6,15;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-20,-15,-15,-25,34,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-5,29,-17,15,0,-20,0,5,-20,-3,-30,-20,47,-17,0,-3,18,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-5,-25,-6,19,-15,-20,0,-4,0,0,21,-10,-10,10,-5,-10,-10,-10,-25,-10,14;
MA   /M: SY='D'; M=14,21,-20,26,5,-30,-5,-10,-25,-5,-20,-20,5,-10,-5,-15,5,-5,-15,-30,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-15,-20,-15,0,-25,-20,5,-20,19,5,-15,-20,-15,-15,-4,21,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=12,-25,-10,-28,-25,-5,-23,-28,20,-18,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,38,-28,-12,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-25,-6,19,-10,-25,-10,-4,-10,16,0,-15,-15,0,-10,-15,-10,-10,-25,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,30,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,0,-35,26,-5,-30,-5,-25,-10,0,-15,19,-5,0,-15,-30,-20,-20,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=14,17,-15,2,-5,-19,-2,-5,-15,-5,-20,-15,27,-15,-5,-9,11,6,-15,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='M'; M=6,-13,-20,-20,-15,-11,-17,-14,8,-13,-1,12,-10,-4,-10,-16,-7,-5,5,-25,-12,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-5,-35,5,29,-30,-20,-10,-25,0,-25,-20,-10,46,5,-10,-5,-10,-30,-30,-25,14;
MA   /M: SY='S'; M=8,-8,-13,-12,-8,-2,-7,-11,-10,-13,-15,-5,-1,-14,-7,-13,19,9,-5,-28,-10,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-3,7,-20,12,15,-25,-8,-5,-26,1,-26,-20,8,-9,6,4,19,5,-18,-35,-19,10;
MA   /M: SY='T'; M=2,11,-15,9,-1,-20,-13,-14,-19,-8,-17,-16,5,-10,-6,-11,17,26,-9,-33,-15,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-1,-25,2,-11,-4,3,1,-21,-16,-15,-11,-2,-21,-16,-15,-7,-13,-13,-22,-5,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,7,-31,15,5,-30,-12,-10,-25,-6,-30,-22,4,38,-5,-14,2,-4,-27,-35,-25,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-13,-29,-14,-11,6,-25,39,-8,-8,-5,7,-10,-24,3,-5,-15,-13,-15,3,46,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-35,-40,-30,44,-25,-25,-10,-25,-5,-10,-30,-30,-30,-20,-30,-20,-15,82,30,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-20,10,-3,2,-10,-6,-20,-11,-19,-17,15,-17,-11,-11,8,1,-16,-27,-7,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-6,26,-20,37,10,-30,-5,-5,-30,-5,-30,-25,15,-10,0,-10,19,4,-20,-40,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=19,0,-20,1,27,-25,-10,-10,-20,0,-15,-15,-5,-5,6,-10,5,-5,-16,-25,-20,16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00080;
//
ID   CU2_MONOOXYGENASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00085;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper type II, ascorbate-dependent monooxygenases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4420905; R2=0.0151104; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=556; N_SCORE=13.833; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,13,-16,-1,-3,-27,-19,-7,-14,-7,-8,-17,-23,-16,-16,-8,-7,3,-29,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-19,4,0,-20,-11,14,-19,-4,-22,-12,21,-15,8,-3,13,11,-20,-33,-10,3;
MA   /M: SY='B'; M=-2,6,-19,5,-5,-4,-12,-10,-14,-13,-8,-11,5,-18,-11,-13,1,-3,-11,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-29,30,28,-32,-14,-1,-32,15,-27,-21,15,-8,9,4,-1,-9,-28,-32,-18,18;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-18,12,-28,-24,-8,-31,-27,12,-24,1,1,-14,-22,-19,-24,-5,9,11,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-10,-13,-8,-16,-8,-18,-12,-10,-13,-12,-3,-10,-8,-15,18,22,-2,-27,-16,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-15,84,-23,-18,-25,-28,-20,-28,-20,-20,-15,-15,-33,-9,-20,-8,-10,-15,-43,-25,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-23,-18,-1,-9,-21,-1,6,-7,12,32,-15,-17,9,-7,-15,-10,-2,-22,-5,4;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-22,-21,-28,-22,16,-24,-11,10,-18,4,2,-19,-24,-19,-19,-11,-6,10,-2,22,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-25,5,15,-17,-16,-3,-15,4,-8,-9,11,-15,3,0,-6,-7,-19,-29,-14,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-26,0,21,-25,-17,1,-18,7,-15,-1,-2,-10,22,10,1,-6,-19,-26,-13,21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-29,23,8,-25,-15,0,-25,-3,-24,-18,3,2,6,-8,1,-6,-24,-25,-4,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-10,-6,-5,-11,-11,-12,-6,1,-12,-6,-2,-10,-5,-2,9,10,3,-22,-9,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-24,-16,-16,-17,-2,-23,-7,-16,-14,-9,-15,11,-19,-19,-3,0,0,-28,-21,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-35,-25,2,-32,-19,36,-24,25,33,-22,-22,-14,-22,-22,-10,21,-20,0,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-24,-33,-20,-12,-18,-26,-24,4,-16,-12,-6,-22,45,-15,-22,-12,-8,-3,-28,-20,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-24,-18,-17,25,-23,7,-5,-13,-6,-5,-13,-25,-12,-11,-6,-3,-9,11,49,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,5,-25,-20,2,-28,25,-20,-8,0,-18,22,56,-8,-10,-22,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-12,-24,-22,-1,-27,-25,16,-19,13,6,-21,-24,-22,-17,-6,13,25,-28,-8,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-12,-25,-13,-6,-17,-5,6,-15,-7,-4,-1,-7,-19,3,2,-9,-12,-15,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-19,-20,-14,-1,-25,2,5,-19,20,15,-15,-22,-10,-13,-14,3,1,-24,1,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,-3,-29,36,-25,-9,0,-14,17,42,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-19,-15,-5,-11,-26,-19,5,0,1,2,-18,-20,-11,-5,-11,-5,15,-26,-10,-8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=8,-7,-10,-7,-7,-15,-7,-15,-8,-12,-20,-13,0,-15,-7,-12,28,15,4,-38,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-22,-11,-16,-24,39,-20,-29,-16,-22,-16,-1,-16,-16,-18,6,-1,-19,-22,-24,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-28,-26,-31,-27,34,-28,-12,4,-20,2,-1,-26,-30,-25,-17,-21,-11,4,29,36,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-21,-25,-22,-12,6,-25,-11,-6,-2,12,3,-15,-25,-9,22,-19,-10,-5,-16,0,-12;
MA   /M: SY='V'; M=10,-21,-13,-23,-20,-9,-21,-25,12,-8,0,2,-21,-22,-20,-13,-5,-1,28,-26,-12,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,2,-22,-20,12,-30,28,-22,-9,1,-18,10,54,-10,-11,-21,-21,-6,2;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-25,31,16,-28,-13,13,-29,-1,-24,-19,18,-11,3,-5,3,-1,-25,-35,-12,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-28,8,-10,-30,46,-12,-37,-14,-30,-22,13,-18,-14,-15,2,-15,-30,-26,-27,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-27,0,13,-33,-17,16,-23,10,-23,-5,3,-11,36,8,3,-7,-25,-25,-7,24;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-8,-39,-2,6,-14,-18,-15,-27,2,-23,-20,-15,-17,-3,-6,-19,-19,-28,50,4,4;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-4,-21,-8,-8,-17,-6,4,-23,-2,-17,-10,2,-16,-4,9,5,14,-14,-26,-8,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00080;
//
ID   CYTOCHROME_P450_MP; MATRIX.
AC   MP00086;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome P450 cysteine heme-iron ligand signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.9743571; R2=0.0207695; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=112; N_SCORE=9.297; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-22; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-23,2,5,-20,-13,-9,-16,-7,-10,-9,-3,3,-3,-10,-6,-8,-17,-28,-16,0;
MA   /M: SY='D'; M=-4,14,-21,18,7,-26,-6,-5,-25,-4,-20,-17,7,-10,-2,-8,5,-1,-19,-33,-18,2;
MA   /M: M=-7,-4,-22,-4,-1,-15,-12,-5,-20,-2,-17,-12,-2,-10,-4,0,-5,-9,-17,-17,-10,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-22,-17,-11,11,-23,-15,-2,-14,0,-2,-11,-18,-14,-10,-9,-4,-2,-12,1,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,13,-22,18,12,-29,-2,-5,-30,1,-24,-19,6,-12,3,-2,0,-8,-24,-29,-17,7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-6,-10,-22,-13,-8,-8,-18,-5,-3,-8,-4,0,-6,-12,-6,-7,-6,-4,-4,-21,-4,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-7,3,-22,-1,-2,-11,-11,-6,-18,0,-17,-12,6,-10,-4,-1,1,2,-16,-23,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-27,-6,1,-21,-7,-5,-24,11,-20,-10,-3,-8,1,19,-5,-9,-17,-22,-13,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-22,7,4,-24,-11,-2,-21,2,-19,-13,9,-7,4,0,1,-3,-19,-28,-14,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-27,0,0,-20,-13,-7,-19,0,-20,-12,0,2,-1,2,0,-3,-17,-25,-12,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-8,-4,-23,-5,-5,-8,-14,-5,-15,-5,-13,-10,-2,-7,-8,-5,-6,-7,-14,-20,-5,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-24,-4,4,-20,-9,2,-21,0,-20,-12,0,-2,3,0,2,-5,-19,-23,-8,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-25,-22,-18,22,-25,11,-3,-17,1,2,-13,-24,-15,-10,-16,-11,-5,-2,23,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-20,-29,-22,4,-29,-18,23,-22,26,19,-22,-25,-17,-19,-19,-5,17,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=2,-11,-28,-9,-2,-25,-8,-17,-18,-10,-24,-17,-9,39,-8,-17,1,-3,-20,-29,-25,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-23,-40,-30,73,-29,-21,-2,-29,7,-2,-22,-30,-38,-20,-22,-12,-3,23,30,-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-4,-22,-5,-12,-26,41,-13,-32,-15,-30,-20,6,-16,-12,-15,14,-5,-23,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-8,-22,-10,-8,-10,-5,0,-15,-9,-13,-7,-4,-17,-6,-9,1,-2,-11,-18,-2,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-8,-19,-30,68,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-21,-14,-7,-18,-21,-12,-10,1,-13,-6,-11,3,-5,3,-7,-5,-7,-25,-13,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-5,-30,-5,1,-21,-20,35,-30,17,-21,-6,4,-19,10,39,-10,-13,-23,-24,1,1;
MA   /M: M=-6,-10,-23,-14,-8,-6,-14,-6,-5,-8,-6,0,-4,-19,-5,-3,-5,-5,-5,-21,-4,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-26,-28,-19,-4,-29,-23,19,-22,14,11,-23,1,-17,-22,-18,-8,11,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=11,-9,-26,-11,-17,-28,53,-20,-33,-17,-26,-18,-2,-18,-17,-20,2,-15,-23,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='E'; M=0,-6,-18,-8,5,-19,-17,-8,-14,3,-13,-6,-5,-13,4,3,-3,-6,-11,-22,-11,3;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-1,-23,-2,-1,-22,-7,-3,-20,1,-18,-11,1,-10,2,2,0,-5,-16,-24,-12,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-33,-23,25,-29,-17,16,-27,32,18,-25,-28,-22,-19,-25,-10,9,-11,10,-22;
MA   /M: SY='A'; M=34,-9,-15,-16,-11,-22,12,-19,-17,-10,-15,-12,-7,-13,-11,-16,9,-3,-7,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-26,-11,0,-11,-22,-7,-12,8,-7,-2,-7,-17,2,18,-9,-4,-9,-18,-4,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-14,-20,-19,-12,-5,-19,-9,4,-10,9,15,-11,-20,-4,-8,-10,-3,1,-21,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-24,5,30,-23,-17,-2,-18,1,-12,-8,-1,-8,13,-4,-2,-7,-20,-28,-15,21;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-17,-28,-21,0,-22,-18,15,-20,18,18,-21,-24,-16,-18,-15,-5,13,-17,-4,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-26,-7,5,-10,-22,-4,-18,13,-15,-8,-4,-15,2,13,-6,-4,-14,-18,-2,3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-21,-18,-25,-18,0,-26,-20,17,-19,14,11,-20,-22,-15,-18,-11,0,17,-22,-3,-17;
MA   /M: SY='F'; M=3,-21,-18,-27,-22,12,-14,-20,5,-21,6,2,-17,-23,-22,-19,-9,-4,8,-14,1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-17,-30,-21,13,-29,-20,16,-25,27,13,-23,-26,-19,-20,-20,-6,10,-17,2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-14,-12,-6,-16,-8,-11,-11,-9,-12,-8,-4,-13,-7,-11,7,5,-4,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-20,-6,1,-17,-16,-4,-15,4,-15,-9,2,-15,1,7,2,3,-11,-25,-9,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00081;
//
ID   SOD_CU_ZN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00087;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper/Zinc superoxide dismutase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9466081; R2=0.0135527; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=455; N_SCORE=11.103; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-12,-28,-23,12,-28,-24,15,-23,20,8,-24,-27,-25,-19,-14,2,20,-22,-2,-23;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-16,-15,-12,-6,-20,-8,0,-7,0,0,-11,-18,-11,-8,-3,9,6,-22,-2,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-18,-32,-25,20,-29,-23,22,-23,16,11,-22,-24,-25,-20,-17,-6,21,-13,5,-25; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-14,-2,-2,-15,-11,-8,-16,1,-18,-12,9,-11,-3,-2,14,22,-10,-28,-11,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-19,-28,-17,-15,-14,6,-19,-13,-16,-13,-10,-16,6,-16,-18,-11,-13,-12,-2,-12,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-25,17,18,-24,-13,9,-25,3,-23,-17,15,-12,7,1,5,-4,-24,-31,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-33,-24,6,-32,-23,29,-27,33,20,-27,-27,-21,-22,-23,-8,22,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-21,-3,8,-18,-15,-2,-18,3,-16,-10,-2,-11,5,-2,7,5,-14,-24,-7,6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-29,0,-13,-29,50,-14,-37,-12,-30,-20,9,-19,-14,-14,1,-16,-29,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-21,-25,-18,13,-27,-10,12,-27,36,14,-20,-29,-19,-17,-25,-10,4,-19,3,-18;
MA   /M: SY='P'; M=0,-1,-22,0,-1,-22,-16,-16,-18,-3,-20,-15,-3,14,-5,-9,6,13,-13,-29,-18,-5;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-29,-9,3,-26,-16,-13,-17,-6,-21,-15,-13,39,-5,-13,-4,-7,-18,-27,-22,-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-20,-7,-13,-21,42,-15,-27,-14,-22,-15,1,-14,-13,-14,5,-7,-19,-18,-21,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-24,-15,-5,-4,-22,-12,-3,-8,9,2,-13,-21,-6,-8,-14,-6,-7,-8,1,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,-1,-19,-20,76,-28,-3,-17,-1,6,-20,9,12,-11,-18,-26,-28,13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-20,-36,-26,51,-27,-19,6,-25,10,8,-18,-25,-30,-19,-16,-6,4,-1,18,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-30,7,-34,-29,36,-25,15,14,-25,-26,-26,-24,-16,-5,36,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-28,5,31,-29,-19,-2,-20,6,-16,-10,-2,-7,24,2,-1,-7,-22,-25,-15,27;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-4,-23,-13,-13,22,-19,-4,-9,-6,-7,-6,5,-24,-15,-5,-10,-7,-12,-7,15,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-15,-30,46,-20,-35,-17,-30,-20,-5,10,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,32,-24,45,12,-33,-3,-4,-34,-4,-30,-26,16,-10,-1,-10,12,-1,-24,-39,-20,6;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-7,36,-16,-18,-12,-22,-18,-13,-20,-5,-9,-3,-28,-17,-18,-5,2,-8,-37,-18,-17;
MA   /M: SY='T'; M=3,2,-18,0,2,-20,0,-14,-21,-8,-19,-16,2,-10,-5,-11,14,17,-13,-29,-18,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-13,32,-26,30,11,-30,-8,4,-26,1,-28,-21,32,-7,7,-3,4,-5,-30,-36,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-3,-16,-29,55,-16,-36,-17,-28,-17,4,-19,-16,-17,0,-17,-28,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-15,63,-22,-20,-15,-21,-24,-28,-10,-21,-16,-14,-31,-20,-14,-10,-11,-13,-36,-20,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-21,-17,-12,-6,-27,-20,10,-14,10,6,-13,-18,-12,-14,-8,7,8,-25,-6,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,-6,-11,-7,-4,-16,-8,-15,-10,-11,-19,-13,0,-13,-6,-12,25,15,1,-35,-18,-5;
MA   /M: SY='A'; M=34,-9,-12,-17,-9,-18,-6,-20,-10,-11,-10,-10,-9,-5,-10,-18,11,8,-2,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-24,-11,-20,-29,63,-20,-38,-20,-29,-19,-1,-20,-20,-20,0,-19,-28,-21,-29,-20;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-28,-14,-6,-20,-5,-19,-13,-15,-9,-10,-16,24,-12,-19,-8,-9,-16,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-27,-4,-3,-21,-9,71,-28,-11,-19,-3,6,-18,4,-5,-6,-17,-25,-28,9,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-24,-20,-31,-23,37,-22,-15,-1,-20,2,-3,-20,-25,-26,-18,-13,-8,0,12,23,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-12,37,-22,22,2,-22,-3,18,-23,-1,-29,-19,51,-19,1,-1,7,-3,-30,-39,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,-1,-28,-20,-20,-19,-10,-28,-19,-18,80,-10,-19,-7,-4,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-8,-21,-12,-12,12,-19,2,-9,-17,-1,-4,-5,-20,-14,-14,-8,-5,-9,-16,5,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,7,-24,1,-5,-25,16,-9,-28,3,-28,-17,16,-16,-5,-1,5,-6,-23,-27,-21,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00082;
//
ID   SOD_MN_MP; MATRIX.
AC   MP00088;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Manganese and iron superoxide dismutases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1036763; R2=0.0129632; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=610; N_SCORE=12.001; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=185; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-7,-26,-8,-9,-23,10,28,-24,-12,-19,-6,0,-19,-1,-9,-4,-15,-19,-25,-6,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-22,12,12,-14,-13,0,-19,5,-16,-10,7,-10,11,1,-2,-7,-19,-19,-7,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,2,-14,0,2,-17,0,0,-13,0,-12,-5,5,-8,14,0,3,0,-14,-14,-9,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-5,26,2,-23,-6,2,-24,-3,-26,-21,35,-18,-3,-6,4,-4,-25,-37,-19,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-30,-12,-5,-19,-20,-6,-10,-12,-15,-9,-17,46,-10,-16,-11,-9,-15,-26,-17,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-22,-25,-19,-2,-17,-21,15,-24,20,9,-21,-13,-18,-20,-18,-9,9,-20,-7,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=7,-14,-14,-19,-13,-9,-19,-18,7,-13,3,2,-13,-16,-8,-14,-1,7,12,-22,-9,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-27,-4,-8,-23,38,-10,-32,-13,-26,-18,4,-18,-11,-14,3,-13,-26,-20,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-18,-16,-13,-7,-8,-4,-5,-16,-2,-3,-10,-20,-11,-15,0,-3,-1,-21,-2,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-15,-18,-16,1,-22,-12,6,-12,-1,-1,-12,-17,-13,-13,0,14,10,-13,9,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,4,-35,-26,37,-29,31,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,24,-21,-1,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24,13,-33,-23,27,-30,39,18,-26,-27,-22,-23,-26,-10,15,-18,2,-24;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-22,-16,-16,-19,13,-20,-11,-15,-13,-7,-6,-17,-11,-16,2,1,-5,-23,-18,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-18,-33,-27,12,-32,-26,28,-26,24,14,-27,-28,-26,-22,-19,-6,29,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=4,-20,-19,-24,-13,-6,-23,-19,16,-16,11,14,-19,-19,-13,-18,-11,-6,16,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,18,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,135,30,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,17,-30,23,19,-39,-17,5,-28,10,-24,-11,7,-10,35,5,-1,-10,-29,-27,-13,27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,6,-24,-22,-4,-19,20,-11,-2,-5,-16,20,25,-10,-10,-18,-20,-8,11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-21,-10,-6,-16,-21,-13,-6,3,-5,-2,-11,-20,-2,8,-8,-6,3,-24,-11,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=14,-17,-23,-18,-11,-19,-7,-21,-9,-14,-11,-9,-17,19,-14,-20,-4,-6,-6,-24,-21,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-13,35,-26,48,15,-35,-9,-3,-35,4,-30,-26,16,-10,1,-5,6,-4,-25,-38,-19,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,36,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,74,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-20,-33,-25,8,-30,-23,27,-24,21,18,-23,-24,-21,-22,-18,-7,22,-19,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-25,18,14,-29,-12,-5,-28,17,-27,-18,11,-10,5,6,3,-5,-22,-30,-16,10;
MA   /M: SY='A'; M=16,0,-16,-8,-10,-20,10,-13,-15,-11,-19,-14,7,-16,-10,-14,11,0,-8,-29,-21,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-31,-28,-38,-28,37,-29,-21,9,-26,11,8,-25,-27,-26,-21,-25,-14,1,26,19,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00083;
//
ID   RIBORED_LARGE_MP; MATRIX.
AC   MP00089;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonucleotide reductase large subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9566312; R2=0.0173546; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=284; N_SCORE=10.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=32; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-25,19,-34,-27,20,-29,-25,1,-28,5,-1,-20,-29,-28,-25,-15,-9,3,-18,0,-27;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-25,3,7,-20,-14,0,-19,2,-13,-10,2,-6,2,1,-5,-8,-19,-26,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-9,-18,-9,-2,-9,-9,2,-6,-6,2,3,-8,-11,4,-2,-9,-8,-9,-13,-2,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-14,-17,-15,-10,16,-15,-6,-5,-5,-1,-2,-12,-14,-9,-5,-12,-8,-7,16,17,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-14,10,-25,16,4,-4,-19,-4,-18,-7,-12,-13,1,-17,-9,-10,-7,-9,-13,-22,-1,-2;
MA   /M: M=0,-1,-21,-5,-2,-17,-11,-6,-10,-5,-8,-1,0,-15,-1,-3,-1,-2,-9,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-7,-31,-6,-7,-6,-15,-11,-16,-5,-14,-12,-9,-21,-7,-7,-15,-13,-16,20,5,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,2,6,-16,-11,-7,-17,-3,-16,-13,3,-3,-1,-6,3,0,-15,-25,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: M=-2,-9,-16,-12,-10,-16,-3,-12,-10,-8,-11,-5,-6,-18,-3,-7,-3,-4,-6,-21,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-13,-21,-16,-8,-23,-14,7,-11,3,8,-14,-20,-9,-10,-5,5,10,-24,-6,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,3,-19,3,0,-17,-8,-2,-15,-3,-13,-9,4,-9,-1,-2,3,0,-12,-25,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-25,-13,-5,-10,-22,-13,-1,-13,-3,-3,-13,11,-9,-15,-9,-4,-6,-22,-9,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-18,-9,-5,-15,-11,-12,-12,-6,-15,-11,-4,11,-6,-5,4,3,-11,-25,-15,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-18,-5,-8,-10,-11,-8,-8,-9,-6,-6,-1,-16,-9,-10,1,6,-4,-23,-6,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-18,-3,0,-15,-11,2,-14,3,-14,-7,-1,6,3,8,-2,-3,-13,-17,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-17,-8,5,-14,-17,-12,-18,0,-13,-11,-10,-18,-3,-5,-12,-12,-17,1,-6,1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-27,27,8,-27,-14,-4,-23,-1,-17,-15,8,-9,0,-2,-4,-8,-20,-32,-16,3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-21,3,14,-23,-17,-8,-22,6,-19,-14,-1,-11,6,2,0,-1,-18,-19,-13,10;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-24,-7,2,-22,-13,-6,-18,5,-16,-8,-2,-4,5,6,-1,-2,-15,-25,-14,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-27,-8,2,-23,-18,-4,-26,27,-21,-10,-1,-17,10,47,-5,-7,-17,-21,-11,3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-23,10,17,-24,-14,-7,-21,4,-16,-14,1,-10,5,-2,3,-3,-16,-29,-16,11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,18,8,-21,-14,-6,-25,6,-19,-15,7,-13,0,4,0,-5,-19,-29,-13,4;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-22,-35,-28,-1,-33,-27,38,-25,16,19,-23,-23,-21,-25,-16,-7,32,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='K'; M=1,-11,-18,-14,-4,-19,-18,-11,-9,8,-8,3,-10,-16,4,5,-7,-7,-5,-22,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-24,-2,12,-22,-17,-7,-20,20,-17,-6,-2,-10,8,15,-4,-3,-15,-22,-11,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-28,-4,-7,2,-22,46,-18,-10,-12,-3,2,-22,0,-5,-11,-13,-20,-12,28,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-32,-24,4,-30,-20,28,-24,30,26,-26,-26,-18,-20,-22,-8,23,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-28,-14,-7,-3,-22,2,-21,16,-13,-7,-6,-22,2,43,-12,-10,-16,-7,11,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-11,37,-21,18,0,-20,-2,17,-21,-1,-29,-18,56,-20,1,0,8,-2,-30,-39,-17,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,-7,-2,-9,-7,-20,0,-14,-17,-14,-20,-14,0,-16,-4,-14,20,7,-10,-34,-19,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-25,-9,-2,-11,-22,13,-9,-7,-3,1,-4,-19,13,-4,-7,-2,-15,-15,10,4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-20,-32,-23,31,-30,-20,12,-27,31,11,-24,-29,-25,-16,-24,-9,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-18,-24,-18,-3,-25,-17,16,-18,14,16,-18,-21,-10,-16,-9,3,15,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-4,-19,-10,-20,-1,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-10,-20,11,1,-1,-23,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-25,-27,-20,-3,-22,-22,15,-24,16,8,-23,-7,-19,-22,-19,-9,9,-21,-6,-22;
MA   /M: SY='M'; M=7,-15,-18,-23,-15,-10,-10,-9,4,-10,3,27,-14,-9,-5,-14,-6,-4,2,-22,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,81,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-9,-7,-9,-12,-18,-16,-10,-10,-10,-6,1,-12,-8,-10,16,37,-2,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='A'; M=17,-5,-17,-7,-3,-22,6,-16,-17,-10,-17,-13,-4,-13,-6,-15,9,-1,-7,-26,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-14,-2,0,-20,-1,-13,-21,-4,-25,-17,5,-10,-2,-7,26,18,-11,-34,-18,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-13,-14,-7,-12,-20,-19,2,-15,-9,-6,-4,-14,-8,-15,12,15,4,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='S'; M=15,-5,-11,-8,-5,-11,-3,-13,-16,-12,-22,-16,3,-12,-6,-13,29,13,-7,-31,-16,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,3,-28,2,5,-20,-20,11,-13,-1,-13,-3,4,-17,25,-1,-5,-9,-21,-17,5,14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-34,-27,1,-34,-27,36,-27,21,16,-23,-24,-21,-25,-17,-6,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-19,-16,-12,-7,-20,-16,2,-16,2,0,-7,-18,-7,-14,1,8,0,-19,-7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-26,3,-4,-27,32,-3,-33,-11,-28,-19,13,-17,-8,-12,5,-11,-28,-28,-22,-6;
MA   /M: SY='C'; M=3,-5,10,-12,-13,-14,-12,-14,-12,-11,-17,-12,1,-21,-13,-13,7,4,-3,-32,-14,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,9,-12,0,-5,-15,-10,-10,-15,-8,-20,-15,17,-12,-5,-8,23,31,-10,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-27,11,28,-29,-14,-3,-24,3,-22,-17,4,5,15,-4,4,-6,-26,-30,-20,21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-5,0,-7,-9,-22,14,-16,-26,-15,-27,-19,3,-16,-9,-15,22,6,-14,-35,-23,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-22,-38,-29,37,-33,-24,22,-28,15,9,-22,-27,-30,-23,-19,-9,17,-7,14,-29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00084;
//
ID   NITROGENASE_1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00090;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitrogenases component 1 alpha and beta subunits signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4822841; R2=0.0155040; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=222; N_SCORE=8.914; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-23,-8,-4,-18,-16,-8,-12,5,-8,-4,-7,-18,0,9,-8,-6,-6,-24,-10,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-24,13,32,-24,-14,5,-22,5,-19,-14,11,-4,15,0,1,-7,-25,-27,-15,23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=6,-23,-19,-28,-21,-3,-24,-23,20,-21,16,10,-20,-21,-17,-20,-11,-4,18,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-20,-16,-9,3,-22,-10,2,-11,-1,0,-11,-21,-12,-11,-7,-5,5,-16,4,-11;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-23,5,18,-25,-15,-8,-24,12,-20,-14,0,-8,7,6,3,-1,-17,-27,-15,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-24,-15,-1,-10,-22,-11,-5,-2,7,2,-12,-19,-3,9,-12,-8,-5,-22,-9,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-22,-27,-21,46,-29,1,-2,-18,3,0,-18,-29,-22,-14,-19,-10,-6,14,47,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-33,-8,0,-25,-17,-6,-18,-9,-24,-15,-13,60,-5,-15,-7,-9,-25,-27,-21,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-14,9,8,-9,-10,-2,-9,-3,-2,-4,1,-8,1,-5,-5,-5,-9,-16,-6,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-21,-14,-10,-12,-18,-14,1,-13,-4,-3,-11,14,-12,-15,-7,-4,-2,-23,-13,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-2,4,-23,2,5,-24,-8,-7,-23,16,-24,-14,6,-3,2,9,1,-5,-19,-25,-16,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-14,-17,-19,-15,-14,3,-16,-5,-11,-4,1,-11,-16,-12,-11,-3,-7,1,-19,-14,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-35,-28,0,-34,-26,38,-24,16,20,-22,-23,-20,-24,-16,-5,33,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='F'; M=0,-16,-20,-21,-16,11,-10,-17,-10,-17,-9,-9,-11,-6,-19,-17,0,2,-8,-13,0,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-18,-33,-29,0,-34,-30,36,-24,13,13,-25,-25,-25,-24,-13,-2,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-17,-19,-15,4,-27,4,2,-12,-3,1,-15,-25,-2,-11,-11,-8,-3,-2,31,-11;
MA   /M: SY='T'; M=10,0,-12,-7,-5,-17,-10,-13,-14,-8,-17,-12,4,-11,-1,-10,21,26,-7,-31,-15,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-13,-5,1,-13,-20,-17,-13,-7,-12,-12,0,-8,-5,-8,17,40,-5,-30,-12,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-21,-17,-12,-13,-18,-18,1,-14,-9,0,-14,11,-11,-16,1,4,3,-30,-16,-13;
MA   /M: SY='T'; M=6,-10,-14,-15,-13,-12,-18,-21,-1,-13,-9,-7,-8,-6,-13,-15,11,22,7,-30,-14,-13;
MA   /M: SY='G'; M=11,-3,-24,-2,12,-27,17,-13,-28,-6,-21,-17,-3,-10,-2,-13,3,-11,-21,-24,-23,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-30,-23,5,-30,-22,25,-25,32,18,-26,-27,-20,-20,-21,-4,21,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-29,-35,-25,-1,-37,-27,43,-27,18,17,-17,-19,-18,-27,-18,-8,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,68,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-34,-27,3,-34,-27,36,-27,25,17,-25,-25,-22,-24,-19,-6,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-27,25,24,-30,-8,-2,-29,2,-23,-20,9,-5,6,-5,2,-7,-26,-32,-19,15;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-16,-15,-12,-23,20,-19,-20,-13,-18,-14,-5,-13,-12,-19,10,-2,-10,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-16,-31,-28,17,-30,-25,22,-23,10,8,-24,-27,-28,-20,-12,-1,30,-18,3,-28;
MA   /M: SY='C'; M=7,-18,18,-26,-20,-12,-22,-24,3,-22,-3,-2,-14,-22,-17,-24,-3,-4,5,-31,-15,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-26,-1,6,-25,-12,-5,-27,25,-25,-12,6,-14,8,28,-2,-6,-20,-24,-13,6;
MA   /M: SY='A'; M=5,1,-19,-4,4,-20,-14,-10,-13,4,-16,-10,3,-13,1,-1,3,2,-8,-27,-15,2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-8,-20,-13,-15,-12,-19,-2,-7,-5,-2,-13,-16,-11,-14,1,-2,6,-24,-15,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,4,-22,3,16,-24,-11,-4,-20,7,-20,-9,5,-10,11,1,6,-1,-18,-28,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-24,6,17,-25,-15,-7,-24,15,-21,-14,3,-10,6,8,0,-4,-17,-26,-14,11;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-25,6,24,-24,-14,-8,-24,10,-19,-15,-2,-7,6,1,0,-7,-19,-25,-16,15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-20,-22,-17,3,-14,-14,0,-19,9,3,-15,-23,-16,-13,-12,-2,-2,-13,1,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-23,-7,-9,-21,25,-15,-26,-10,-21,-15,-2,-10,-11,-10,4,-8,-19,-22,-20,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-21,-8,0,-19,-20,-16,-7,8,-11,-5,-8,-14,-4,-1,-6,-3,-2,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-32,0,7,-26,-19,-15,-20,2,-24,-16,-11,32,-4,-6,-7,-7,-20,-23,-20,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-13,-18,-17,0,-24,-20,9,-16,3,2,-18,-21,-19,-17,-8,-3,17,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-25,-18,-18,-10,-17,-21,12,-20,-2,1,-15,-8,-18,-21,-10,-8,12,-26,-11,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-28,-11,-2,-6,-18,-16,-14,-9,-16,-13,-12,24,-11,-15,-7,-8,-16,-21,-13,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00085;
//
ID   THYMIDYLATE_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP00091;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thymidylate synthase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4999919; R2=0.0129778; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; N_SCORE=13.016; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-30,-7,11,-32,-24,3,-7,2,-11,4,-4,-12,44,3,-4,-10,-19,-20,-8,27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-34,-25,3,-34,-24,33,-27,30,20,-24,-25,-19,-22,-23,-9,22,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-6,9,-25,9,8,-27,-12,-2,-25,13,-23,-14,9,-13,9,12,1,-5,-20,-28,-14,8;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-28,-1,3,-17,-18,-3,-19,13,-19,-10,3,-16,8,11,-6,-6,-19,-12,-1,5;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-9,-32,-25,-1,-30,-26,25,-25,18,11,-24,-25,-22,-24,-16,-6,24,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-22,-34,-27,2,-34,-27,35,-27,26,17,-25,-25,-22,-24,-20,-7,28,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-27,28,22,-31,-12,5,-30,7,-25,-19,14,-10,8,0,0,-8,-26,-32,-16,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,5,-24,4,9,-26,-14,-4,-20,4,-18,-9,4,-9,14,2,3,3,-19,-27,-14,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-32,-22,5,-34,-23,30,-29,37,19,-25,-25,-19,-23,-25,-10,17,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-26,-1,10,-26,-17,-4,-26,28,-25,-11,2,-11,9,21,-2,-4,-19,-24,-11,9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-23,4,7,-23,-13,1,-21,8,-22,-13,16,-11,7,7,4,3,-20,-29,-14,6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,25,-17,13,-1,-23,6,4,-24,-5,-27,-19,37,-19,-1,-5,7,-4,-28,-36,-20,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-36,-13,-4,-25,-22,-20,-11,-8,-23,-13,-18,64,-10,-17,-11,-9,-19,-28,-24,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-27,19,3,-19,-8,-1,-26,-6,-24,-20,12,-16,-3,-9,-1,-5,-24,-7,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-3,23,-17,26,6,-27,-4,-4,-27,-5,-30,-23,21,-12,0,-8,21,6,-20,-40,-20,3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-21,-7,-3,-31,23,-21,-11,0,-20,6,57,-9,-11,-21,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-9,-24,-15,-5,-9,-23,-4,9,-14,6,9,-4,-18,-5,-14,-11,-8,0,-25,-6,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-34,-26,2,-34,-26,36,-26,23,19,-23,-24,-20,-24,-19,-6,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-18,-31,-25,7,-29,-21,24,-22,17,16,-23,-25,-20,-20,-15,-3,23,-20,1,-23;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-7,-4,-5,-16,-10,-5,-13,-10,-20,-11,9,-15,-4,-10,19,15,-8,-36,-14,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-16,-23,-15,2,-10,-20,-3,-19,4,-3,-14,-16,-17,-19,-3,-1,0,-18,-8,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-46,-38,-29,16,-22,-24,-17,-19,-16,-17,-37,-30,-20,-19,-37,-27,-26,130,35,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-12,37,-22,25,3,-23,-4,11,-22,-1,-28,-19,49,-18,1,-2,7,-3,-29,-39,-18,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-27,-18,-12,-13,-24,-18,-5,-14,-15,-10,-23,36,-16,-19,-13,-9,-8,-15,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=6,-1,-19,-2,2,-26,9,-13,-25,-2,-22,-16,0,-10,-4,-8,4,-6,-19,-26,-21,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-1,18,-25,26,24,-30,-13,-5,-25,0,-20,-19,5,-7,7,-9,2,-7,-21,-31,-19,15;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-30,-23,26,-30,-21,15,-26,26,10,-23,-27,-25,-18,-22,-9,10,-12,7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-29,22,20,-30,-14,6,-30,4,-25,-19,5,3,5,-4,-1,-8,-26,-32,-16,12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-26,3,17,-21,-17,-5,-17,7,-10,-4,-2,-11,9,2,-5,-7,-17,-25,-12,13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-20,-22,-17,-7,-6,-6,4,-10,5,32,-12,-18,-4,-9,-8,-2,1,-22,-7,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-9,4,-15,-13,-22,5,-18,-19,-13,-16,-13,-7,-17,-13,-18,4,-5,-8,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-27,-17,7,-29,-19,18,-28,44,17,-28,-28,-18,-19,-26,-9,9,-21,-2,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-29,-14,-6,-19,-20,-16,-11,-6,-13,-9,-16,30,-7,-3,-8,-3,-13,-26,-19,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-9,-21,-12,-8,-14,-19,50,-13,-12,-6,9,-3,-20,0,-7,-10,-14,-12,-27,7,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-20,-15,-25,-20,13,-23,-3,4,-19,5,6,-16,-25,-15,-16,-13,-6,3,-11,14,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-16,-20,-8,3,-24,-14,1,-18,14,6,-16,-19,-6,-13,-12,-4,-3,-21,-3,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-7,-23,-19,15,-23,0,-6,-19,-4,-2,-11,-24,-18,-15,-7,1,-2,-14,12,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-27,-4,9,-29,-20,14,-14,3,-12,9,-2,-13,38,3,-4,-7,-21,-22,-6,23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-23,-39,-30,71,-29,-20,-1,-29,9,-1,-22,-30,-37,-20,-22,-12,-2,21,30,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-4,-25,-2,-8,4,-17,8,-13,-9,-9,-8,-5,-22,-8,-10,-5,-5,-13,-6,25,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-29,-27,0,-30,-28,27,-21,14,11,-29,-25,-27,-20,-13,-2,40,-28,-9,-28;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=4,1,-7,-4,-4,-7,-5,-4,-6,-3,-8,-5,5,-9,-2,-4,3,1,-4,-15,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,20,-25,22,6,-26,6,-3,-29,-4,-24,-19,16,-14,-3,-8,2,-7,-25,-30,-18,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-26,5,-5,-26,34,-10,-32,-8,-25,-18,6,-15,-9,-9,0,-13,-25,-22,-21,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-26,6,16,-25,-19,-7,-26,20,-22,-14,1,-7,8,15,-2,1,-19,-26,-12,11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-30,-21,7,-30,-21,22,-29,42,18,-27,-28,-20,-21,-26,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-4,-20,-5,-7,-1,-13,12,-14,-10,-18,-11,2,-19,-4,-9,10,3,-13,-14,19,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-22,30,-25,-18,-7,-28,-22,-4,-25,13,0,-22,-28,-18,-21,-16,-6,-1,-33,-14,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,6,-18,5,6,-25,-17,-3,-15,-2,-15,-5,3,-11,14,-5,0,-1,-16,-29,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=4,-21,-18,-22,-16,-5,-15,-19,5,-20,12,6,-19,-16,-15,-18,-8,-3,7,-21,-10,-16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-16,-27,-18,-17,13,-23,6,-3,-9,-3,-2,-14,-25,-9,-5,-13,-4,-8,12,44,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-28,-4,12,-29,-18,4,-18,8,-18,-3,-1,-11,42,7,-2,-10,-25,-11,-7,27; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-9,0,-20,-19,-1,-28,27,-20,-10,-1,-13,8,60,-10,-10,-20,-20,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-11,0,0,-20,2,-10,-20,-7,-28,-18,9,-10,0,-8,34,16,-11,-36,-19,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=8,-11,20,-19,-17,-19,-6,-14,-17,-16,-14,-11,-8,-23,-14,-16,-3,-8,-8,-30,-19,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00086;
//
ID   N6_MTASE_MP; MATRIX.
AC   MP00092;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   N-6 Adenine-specific DNA methylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4909820; R2=0.0097756; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=659; N_SCORE=6.926; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=615; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-16; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-26,40,27,14,9,-28,0,-25,-14,-3,-35,20,-71,22,-2,0,-2,13,-26,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,23,0,-19,16,-21,7,-11,-21,6,-20,-15,-26,-20,-30,44,-4,-1,-2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-32,-9,48,7,13,-65,9,-44,-9,-15,5,33,-50,19,-21,26,-5,-66,23,25;
MA   /M: SY='W'; M=7,-40,22,11,29,-13,29,-41,-6,7,-35,5,-51,15,-22,-3,-29,-20,60,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-40,-21,6,-15,61,-50,-65,-17,6,27,19,-6,23,-64,-39,-23,-29,-22,56,-21;
MA   /M: SY='S'; M=4,-39,11,11,22,-54,0,-32,-6,17,-34,10,-17,-18,-16,34,18,-34,-25,-27;
MA   /M: SY='W'; M=3,-21,17,6,-3,-13,0,-1,10,1,12,28,1,11,-36,-3,-10,-35,45,-40;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-73,-20,28,-12,-34,-20,-2,5,25,1,9,-18,7,15,-20,-6,0,-25,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-41,14,9,-27,-33,-35,-7,19,1,18,16,46,-4,3,-20,-21,-8,-2,12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-74,25,21,-40,30,-36,-24,29,-10,-62,23,1,-26,-14,-18,-6,-26,-3,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,-76,18,36,-54,22,1,-19,28,-35,-2,17,6,37,-25,-36,8,-33,-26,-31;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-75,-13,-5,-74,-26,-34,-56,55,-47,-38,-28,21,51,18,23,9,-27,-75,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-72,-33,-37,76,7,-21,-1,-45,-33,-8,-27,-77,-49,-70,-17,-47,27,-54,53;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-77,102,-24,-84,-16,2,-65,-23,-81,-76,17,-67,2,-37,-2,-44,-63,-95,-69;
MA   /M: SY='L'; M=0,-69,-79,-74,31,-44,-41,31,-38,42,37,-53,-77,-70,-55,-43,-6,40,-70,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-18,-21,-84,-80,-51,-85,-82,86,-76,-3,11,-76,-75,-74,-79,-70,-56,53,-77,-58;
MA   /M: SY='V'; M=-32,-72,-81,-78,38,-83,-69,44,-74,7,-42,-77,-80,-74,-74,-69,-58,64,-20,61;
MA   /M: SY='C'; M=17,56,-67,-66,2,11,-68,8,-42,-13,-1,-56,-69,-44,-69,47,45,-12,-78,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-64,-72,82,-44,-81,-55,-47,-80,-50,-84,-75,103,-71,-51,-59,-48,-51,-80,-99,-71;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='Y'; M=-72,-81,-74,-75,52,-78,-43,-56,-68,-52,-51,-74,-84,-65,-65,-68,-67,-61,59,124;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-72,-29,-34,-2,36,13,30,-27,-6,-33,38,-51,-21,-41,-6,-27,28,-77,-42;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-75,27,-1,-28,0,-63,21,-10,1,-35,6,31,-5,8,3,14,-18,-79,-44;
MA   /M: SY='R'; M=8,-73,-4,-4,-14,12,8,-34,5,3,-35,-41,-26,28,29,-2,24,-25,-3,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-40,-25,32,-21,-17,1,-22,15,5,-10,23,-17,31,-26,18,-1,-16,12,-42;
MA   /M: SY='D'; M=8,-22,48,36,-40,13,1,-30,-18,-30,-64,7,-25,2,-47,14,-21,-17,-26,2;
MA   /M: SY='T'; M=-31,-74,20,-5,-8,18,-21,-4,12,-5,31,-22,24,-19,-29,-19,38,-28,-25,-10;
MA   /M: SY='H'; M=12,-22,15,17,-14,-3,25,-30,5,-15,-37,2,-10,11,-5,19,-10,-45,-2,21;
MA   /M: SY='N'; M=3,-40,32,0,-14,-21,-35,-13,13,2,-58,39,-18,2,3,4,2,-20,-78,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-27,-73,17,-14,23,-28,20,-7,-3,18,23,16,-37,-5,-11,-11,22,-33,-70,25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-40,4,-23,-9,-6,0,-22,-2,-2,-21,6,38,25,18,4,17,-20,-78,-63;
MA   /M: SY='W'; M=8,-73,0,2,-8,10,-37,19,3,-8,-35,22,10,-11,-62,14,-1,-22,23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-76,37,39,6,-18,1,-43,11,4,-36,-30,-36,16,3,0,-29,-45,-2,28;
MA   /M: SY='H'; M=-22,-40,-14,23,-1,-29,29,9,17,4,-32,-16,-37,11,-5,-32,5,16,-24,21;
MA   /M: SY='H'; M=-32,-41,8,6,-12,-23,33,-12,18,17,0,13,-26,-17,29,-7,-6,-42,-24,21;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00087;
//
ID   N4_MTASE_MP; MATRIX.
AC   MP00093;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   N-4 cytosine-specific DNA methylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9925480; R2=0.0151384; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=149; N_SCORE=7.238; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-22,-20,-26,-16,12,-22,-16,1,-15,18,5,-19,-24,-17,-4,-16,-8,1,-14,0,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-26,12,38,-28,-16,-4,-28,14,-24,-18,2,-4,14,4,6,-4,-24,-30,-18,26;
MA   /M: SY='A'; M=14,-16,-16,-24,-16,-7,-19,-22,9,-18,9,3,-14,-16,-14,-20,-3,6,8,-22,-9,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-4,-32,0,19,-30,-20,-4,-26,18,-24,-12,-4,11,17,17,-6,-10,-26,-24,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,3,-3,5,-26,-2,-14,-30,1,-26,-18,-2,-15,-3,-5,5,-5,-20,-32,-22,1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,40,-30,-20,12,-30,33,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-7,13,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-12,4,-34,16,27,-32,-18,-9,-27,0,-26,-22,-5,37,4,-10,-4,-10,-30,-32,-24,13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,31,-26,43,16,-36,-10,0,-32,0,-28,-22,14,-10,12,-6,7,-5,-26,-36,-18,14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,24,-28,30,40,-30,-14,2,-30,6,-24,-22,16,-6,12,-2,2,-8,-30,-34,-20,26;
MA   /M: SY='S'; M=0,-11,-16,-15,-11,4,-13,-16,-4,-18,-13,-9,-1,-16,-12,-16,17,9,-1,-26,-6,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-24,-34,-28,20,-34,-18,27,-24,12,10,-22,-26,-24,-22,-18,-8,21,-7,20,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,27,-20,31,8,-28,-4,-2,-28,-4,-30,-24,24,-12,0,-8,19,4,-22,-40,-20,4;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-26,35,-30,-26,-3,-30,-26,3,-28,16,3,-26,-34,-26,-24,-19,-8,10,-33,-13,-26;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-14,-30,-26,-4,-26,-28,26,-20,8,8,-24,-24,-24,-22,-8,-2,36,-26,-10,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-20,-34,-26,19,-30,-19,24,-24,22,23,-24,-26,-22,-20,-20,-8,19,-16,4,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-23,-7,-25,-17,-3,-24,-11,-18,-13,-16,-11,-23,-28,-2,-13,-21,-17,-22,47,19,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-12,11,-26,2,-4,-22,4,1,-28,9,-26,-16,25,-20,1,25,0,-8,-26,-28,-18,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,5,-23,-22,-6,-19,24,-12,-3,-5,-16,14,26,-12,-10,-17,-20,-8,8;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-32,-10,-2,-14,-22,-2,-22,18,-20,-10,-8,3,2,26,-12,-10,-20,-12,4,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-22,-8,-14,-24,37,-18,-30,-16,-26,-18,2,-16,-14,-16,12,3,-20,-26,-24,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-14,10,-24,2,7,-3,-14,0,-20,2,-18,-14,20,-18,-2,10,-2,-6,-22,-24,-8,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-24,-15,-12,-5,-9,-10,-10,-5,-2,-3,-11,-20,-10,-6,-9,1,-9,-12,7,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-30,-3,2,-16,11,18,-28,-9,-20,-12,-2,-18,-3,-9,-6,-16,-26,-14,5,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-2,-22,-6,8,-30,-16,-2,-16,2,-16,-4,-2,-10,31,0,6,5,-18,-22,-12,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-28,-25,-19,4,-31,11,16,-21,13,11,-15,-24,-11,-17,-20,-12,4,-12,21,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-8,11,-30,19,12,-33,25,-9,-37,-7,-27,-23,5,-12,-4,-12,0,-15,-30,-28,-25,4;
MA   /M: SY='R'; M=5,-17,-20,-20,-10,-9,-17,-13,-6,-4,8,1,-14,-21,-7,10,-11,-7,-3,-20,-9,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00088;
//
ID   C5_MTASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00094;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   C-5 cytosine-specific DNA methylases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2451196; R2=0.0151605; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=154; N_SCORE=7.570; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-13,-21,-16,-9,-5,-24,-7,-5,-1,-5,0,-10,-20,-4,1,-10,-5,-1,-20,-1,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-16,-5,-1,-10,-14,2,-8,-3,-5,-3,2,-12,2,4,-1,3,-8,-20,-5,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-17,-2,8,-13,-14,-7,-7,1,-7,-5,-4,-3,2,-3,-3,-3,-6,-18,-10,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-22,-8,-11,-13,14,-13,-15,-8,-14,-9,0,-16,-11,-8,-3,-10,-12,-19,-14,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-24,38,10,-27,-9,-3,-25,-1,-18,-18,11,-11,0,-7,-1,-6,-20,-30,-14,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-20,-22,-16,-4,-21,-19,22,-16,8,8,-13,-12,-13,-17,-12,-7,14,-16,-4,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-2,-18,-3,3,-16,-11,-7,-18,8,-14,-10,1,-11,2,15,3,4,-12,-21,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-2,3,-18,1,6,-19,-11,-5,-14,7,-14,-8,4,-11,7,3,1,-3,-12,-21,-11,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-19,-17,-22,-17,2,-23,-19,18,-18,15,9,-17,-18,-16,-17,-13,-4,15,-17,-3,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-18,8,7,-18,-7,-3,-17,4,-15,-10,6,-10,5,0,1,-3,-15,-20,-9,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: M=-4,-6,-21,-7,-2,-11,-10,-7,-11,0,-10,-6,-5,-4,-5,-5,-5,-5,-9,-18,-7,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-18,-1,7,-13,-14,-7,-9,0,-4,-4,-3,-11,1,0,-2,-2,-8,-21,-9,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-24,2,3,-19,-13,-11,-11,-4,-14,-10,-2,1,-3,-9,-2,-4,-11,-24,-14,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-25,-23,-16,8,-24,-11,4,-16,7,5,-15,-18,-11,-12,-15,-8,-2,-9,5,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-32,-3,-1,-26,-11,-13,-20,-3,-23,-14,-6,32,-4,-9,-5,-6,-22,-28,-21,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-16,2,1,-13,6,2,-16,-2,-15,-10,9,-8,-2,-2,1,-5,-16,-17,-9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-16,12,10,-16,-5,-2,-16,0,-14,-11,3,0,2,-4,0,-4,-15,-16,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-22,-13,-27,-23,7,-28,-5,14,-21,4,6,-17,-24,-20,-19,-13,-8,16,-20,3,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-29,56,21,-37,-11,-1,-37,5,-29,-27,18,-10,2,-6,1,-9,-29,-38,-19,11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-32,-25,12,-26,-22,21,-25,23,15,-24,-26,-23,-21,-19,-8,18,-18,0,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-33,-25,10,-32,-24,28,-28,32,17,-27,-28,-23,-22,-23,-8,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-2,-25,-21,-5,-26,-22,12,-21,9,6,-16,-23,-18,-20,-7,5,13,-28,-9,-20;
MA   /M: SY='G'; M=9,-11,-25,-13,-17,-20,43,-17,-29,-17,-23,-16,-4,-18,-17,-19,2,-13,-21,-17,-19,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-21,-10,-18,-28,56,-20,-37,-19,-29,-20,0,-19,-18,-19,4,-13,-26,-23,-28,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-25,-26,-17,26,-23,-20,-6,-20,-7,-7,-19,12,-25,-19,-11,-7,-7,-10,3,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-29,-1,14,-35,-19,5,-19,6,-21,-4,2,0,43,4,0,-6,-27,-23,-13,28;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-28,13,-2,-31,16,-14,-31,-10,-27,-22,2,5,-10,-16,3,-8,-25,-29,-25,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-23,-37,-28,57,-30,-18,6,-28,13,5,-22,-29,-32,-20,-22,-11,2,12,27,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-23,-15,-9,-9,-14,-11,1,-11,-3,2,-9,-19,-4,-11,-5,-5,0,-21,-5,-7;
MA   /M: SY='A'; M=25,-14,-15,-21,-14,-11,-9,-14,-1,-12,-5,-1,-12,-16,-10,-17,2,-2,5,-19,-8,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-28,-6,-16,-26,51,-15,-35,-15,-29,-19,8,-20,-16,-14,1,-14,-29,-19,-26,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-28,-6,3,-22,-17,-7,-21,22,-21,-9,-3,-5,4,17,-7,-8,-16,-21,-8,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-27,-7,0,-13,-18,3,-21,14,-16,-7,3,-19,11,29,-7,-9,-20,-19,-4,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-24,1,2,-19,-15,-3,-18,11,-13,-7,5,-13,3,11,-5,-5,-16,-25,-11,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-25,-2,-10,-24,35,-8,-31,-10,-25,-16,4,-16,-10,-10,1,-13,-24,-21,-20,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-18,-20,-23,-13,15,-23,-12,4,-13,9,9,-14,-21,-11,-8,-13,-8,1,-13,3,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-25,21,17,-25,-12,-5,-24,0,-19,-17,4,-10,2,-7,3,-3,-19,-30,-14,10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-29,27,8,-25,-4,4,-29,-5,-20,-18,7,-15,-2,-8,-4,-11,-25,-24,-9,2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-24,-4,0,-18,-6,-11,-18,-7,-17,-10,-2,3,-6,-11,3,3,-16,-27,-16,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-23,-10,-1,-18,-20,-6,-21,18,-15,-8,-3,-18,5,35,-6,-5,-14,-21,-7,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-27,8,-4,-27,24,-10,-32,-8,-26,-18,5,-16,-3,-11,3,-11,-26,-25,-20,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-21,-12,-9,-11,-14,-7,-7,-12,3,0,-5,-14,-5,-10,-5,6,-8,-25,-8,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00089;
//
ID   C5_MTASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00095;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   C-5 cytosine-specific DNA methylases C-terminal signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.9387984; R2=0.0198918; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=61; N_SCORE=8.142; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-22; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-25,-25,-19,35,-19,-15,-9,-19,-4,-6,-14,-8,-25,-15,-13,-8,-10,-4,13,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-2,-34,5,11,-27,-17,-11,-23,-3,-25,-19,-5,41,-2,-9,-6,-9,-28,-30,-23,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-25,21,7,-17,-12,-7,-24,-1,-18,-16,4,-14,-4,-5,-1,-6,-16,-27,-11,1;
MA   /M: SY='B'; M=-4,5,-23,4,0,-13,-6,-10,-22,-5,-20,-16,4,-13,-6,-9,4,1,-18,-17,-9,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-25,-29,-20,34,-25,-17,-4,-18,-2,-5,-18,-22,-23,-15,-15,-8,-6,18,20,-19;
MA   /M: M=-5,-12,-23,-14,-3,-11,-21,-13,-5,-1,-8,-3,-9,-9,-2,0,-4,-3,-4,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-18,-23,-23,-12,17,-25,-15,5,-17,2,0,-13,-19,-18,-16,-11,-7,3,-13,5,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-28,-6,-3,-10,-12,6,-19,-4,-17,-10,-1,-3,-4,-4,-6,-10,-20,-16,-2,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-13,-19,-15,-14,-15,-1,-19,-4,-14,-7,-3,-9,-16,-14,-15,-3,-3,1,-26,-16,-14;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-18,-2,-2,-20,-9,-10,-19,1,-24,-15,10,-6,-2,0,16,14,-13,-33,-17,-3;
MA   /M: M=-9,-2,-24,-2,-2,-14,-21,-7,-6,-2,-6,-2,-4,-15,-2,-4,-8,-5,-5,-25,-8,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-16,-4,-4,-15,-10,-12,-15,-2,-15,-10,4,-15,-5,-5,8,9,-11,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,3,-20,4,7,-26,-15,3,-20,0,-18,-8,0,-11,17,-2,2,-4,-19,-26,-11,11;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-8,-23,-12,-4,-19,-9,-8,-12,3,-8,0,-5,-16,5,4,-5,-7,-10,-22,-12,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-29,-20,-16,27,-28,14,-3,-12,-2,-1,-16,-27,-10,-9,-17,-10,-10,18,57,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-29,-8,2,-19,-18,-5,-27,29,-22,-9,-1,-16,10,41,-9,-9,-19,-18,-8,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-22,-11,5,-24,-23,0,-6,-2,-3,10,-9,-16,31,-1,-8,-9,-13,-22,-8,18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-17,-34,-26,11,-31,-24,25,-26,17,13,-21,-24,-22,-24,-16,-7,19,-18,0,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-32,-29,4,-31,-29,30,-23,15,12,-28,-29,-28,-21,-14,-3,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-24,-11,-6,-22,-16,-18,-11,-11,-21,-14,-9,37,-12,-17,-1,0,-12,-31,-23,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-20,-24,-21,-9,-27,-27,16,-17,-2,1,-27,7,-23,-20,-10,-3,25,-30,-16,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-29,-6,-2,-18,-16,-6,-15,-8,-13,-10,-4,20,-7,-11,-7,-7,-19,-28,-15,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-29,-15,-30,-25,4,-29,-24,24,-24,29,16,-29,-29,-24,-19,-19,-4,29,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=15,-20,-17,-26,-20,-7,-11,-23,9,-20,5,2,-16,-19,-18,-22,-5,-4,12,-21,-11,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-24,-6,10,-11,-19,-4,-18,7,-13,-8,-5,-14,5,9,-4,-5,-14,-19,-5,6;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-16,-15,-6,-13,-9,-14,-12,-2,-12,-9,-8,-13,-7,-8,4,-2,-4,-18,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-27,3,-34,-27,36,-27,25,18,-25,-25,-22,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,-19,-21,-17,-12,12,-21,-9,-18,-8,-7,-10,-16,-17,-21,-1,-8,-4,-18,-16,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-26,3,13,-24,-12,-7,-25,19,-22,-12,1,-11,7,12,-2,-4,-19,-24,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-22,-2,5,-22,-14,-6,-16,4,-15,-9,1,-11,5,2,2,-2,-12,-27,-14,4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-35,-25,4,-34,-23,34,-27,30,24,-24,-24,-18,-24,-23,-9,22,-21,-1,-24;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: M=-6,-12,-19,-14,-4,-9,-19,-12,-5,0,-5,-1,-9,-14,-3,-2,-7,-6,-4,-19,-6,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-19,1,10,-22,-15,1,-21,8,-20,-11,2,-9,7,4,-2,-7,-18,-21,-11,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-13,-12,-11,-3,-13,-7,-6,-10,-7,-4,-6,-16,-8,-10,-2,0,-3,-12,1,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-19,-18,-13,5,-21,-11,7,-16,18,7,-15,-21,-13,-13,-17,-8,2,-11,3,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,2,-12,1,3,-10,-4,-1,-9,0,-7,-5,4,-8,1,-1,0,-2,-9,-15,-7,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='B'; M=-3,1,-13,0,-2,-9,-5,-4,-5,-4,-2,-1,1,-9,-1,-5,-3,-3,-6,-14,-6,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-19,3,7,-17,-14,-5,-10,2,-10,-5,0,-6,5,0,-3,-4,-9,-21,-10,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-19,-2,5,-16,-8,-6,-10,1,-11,-6,0,-7,3,0,-1,-5,-10,-19,-10,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: M=-7,-4,-14,-5,-2,-11,-14,-8,-9,-2,-8,-5,-3,-8,0,-1,-4,-5,-9,-20,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: M=-7,-2,-13,-2,0,-12,-13,0,-15,-3,-12,-7,-2,-11,-1,-3,0,-4,-12,-23,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-16,-3,7,-19,-13,-8,-19,2,-19,-10,-1,-8,4,-2,-1,-6,-18,-26,-13,5;
MA   /M: M=-6,-4,-23,-7,0,-12,-14,-6,-10,-2,-8,-4,0,-15,-3,-1,-5,-6,-10,-24,-9,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00089;
//
ID   SHMT_MP; MATRIX.
AC   MP00096;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine hydroxymethyltransferase pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3349710; R2=0.0129663; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=670; N_SCORE=13.012; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-19,-30,64,-20,-39,-19,-30,-20,-1,-13,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-13,-11,-21,-12,-17,-6,-21,-3,-11,-6,-5,-12,-13,-12,-19,6,0,6,-22,-17,-12;
MA   /M: SY='G'; M=22,-9,-17,-14,-14,-24,30,-20,-24,-15,-20,-15,-4,-15,-14,-19,7,-5,-14,-22,-24,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-5,-11,-30,44,-16,-37,-3,-30,-18,3,-18,-12,-7,-2,-17,-28,-21,-25,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-17,-17,-7,-8,-23,-14,5,-12,4,2,-16,-21,-8,-12,-9,-6,9,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-22,-17,21,-25,28,-9,-17,-4,3,-12,-25,-12,-11,-18,-14,-12,8,31,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-32,-7,2,-28,-17,-8,-18,-6,-24,-13,-7,43,4,-11,-3,-5,-25,-28,-21,0;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-3,22,-16,18,2,-23,-1,0,-24,-5,-30,-21,30,-14,-1,-7,21,6,-21,-40,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-19,85,-10,-20,-9,-9,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-18,-32,-26,16,-30,-24,23,-25,21,12,-25,-27,-26,-21,-17,-5,24,-19,1,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-32,0,13,-28,-12,-10,-26,7,-25,-16,-6,21,3,5,-5,-9,-25,-26,-21,6;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-7,-28,-6,3,-4,-24,30,-14,-7,-10,-4,-6,-19,0,-5,-11,-13,-15,-8,21,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=40,-11,6,-20,-12,-20,-4,-21,-13,-13,-12,-12,-10,-14,-12,-21,9,0,-1,-25,-21,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-19,30,-30,42,16,-33,-14,31,-35,-2,-26,-19,15,-13,6,-6,-3,-13,-30,-35,-7,10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-33,-28,8,-32,-25,31,-23,13,12,-24,-26,-25,-23,-15,-5,32,-19,2,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-15,-30,-27,-1,-30,-26,29,-20,12,15,-24,-25,-23,-20,-11,1,36,-27,-7,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-12,-11,-10,-19,-18,-7,-10,-8,-4,-2,-11,-9,-10,17,41,1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-14,-8,-9,-18,5,-17,-18,-12,-20,-15,2,-12,-9,-13,22,22,-8,-31,-18,-9;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-9,-10,-10,-9,-1,-11,-10,-10,20,46,1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,1,-21,-20,95,-29,-9,-20,0,9,-19,13,1,-9,-19,-30,-29,18,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-11,-9,-9,-12,-14,-19,-13,-10,-13,-12,1,-10,-9,-10,22,43,-3,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-21,-33,-23,27,-30,-20,17,-29,37,16,-26,-29,-24,-20,-26,-10,9,-12,8,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-13,-31,-12,-3,-18,-16,-7,-26,14,-21,-12,-6,4,1,38,-9,-10,-21,-21,-14,-5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,2,-18,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-34,-11,-2,-29,-14,-20,-20,-11,-28,-19,-18,74,-11,-20,-8,-10,-27,-29,-29,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,5,-25,-20,3,-27,25,-20,-7,0,-17,23,54,-7,-10,-23,-20,-10,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-17,-28,56,-14,-37,-17,-29,-19,1,-19,-16,-16,3,-15,-27,-22,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-32,-24,7,-28,-20,25,-23,25,23,-24,-24,-18,-20,-20,-8,19,-19,-1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-32,-22,20,-28,-18,17,-26,32,20,-25,-27,-21,-19,-24,-9,10,-14,5,-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,7,-16,-14,-6,-13,-14,-14,-15,-14,-11,-7,-19,-13,-16,9,13,-6,-23,-3,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-11,13,-25,8,3,-24,-11,-2,-25,16,-25,-14,19,-16,5,19,1,-2,-21,-29,-15,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-19,15,8,-21,-8,-3,-21,9,-18,-13,8,-8,2,4,1,-3,-16,-22,-12,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-15,4,12,-15,-7,-3,-14,6,-12,-8,1,-2,6,4,0,-4,-12,-15,-10,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-21,11,21,-24,-5,-5,-22,1,-17,-14,1,-6,7,-5,3,-6,-18,-23,-16,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-21,-22,-24,-20,12,-29,-13,14,-22,17,8,-19,-26,-19,-18,-17,-5,11,-13,11,-21;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,-21,-12,-5,-9,-10,-8,-14,-6,-11,-9,-7,-15,-6,-7,-2,-5,-10,-11,-3,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-28,8,12,-28,-17,-7,-28,31,-26,-13,2,-10,7,18,-5,-7,-20,-23,-10,9;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-24,1,2,-24,-18,-11,-18,19,-19,-8,0,-13,3,9,-4,-4,-10,-25,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-22,-20,-26,-24,-2,-25,-25,25,-23,12,10,-19,-23,-21,-22,-13,-6,24,-24,-7,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-25,30,11,-29,-9,-1,-27,1,-26,-21,22,-8,2,-4,5,-3,-25,-36,-19,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-22,-3,4,-17,-14,-7,-22,13,-23,-13,3,-13,4,14,8,5,-15,-25,-9,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00090;
//
ID   CARBAMOYLTRANSFERASE_MP; MATRIX.
AC   MP00097;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartate and ornithine carbamoyltransferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6175270; R2=0.0166713; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=100; N_SCORE=7.275; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-5,-5,-24,-5,-3,-17,-2,-10,-15,-3,-17,-8,-1,-17,-4,-3,0,-7,-10,-25,-14,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-25,-1,1,-23,-8,-9,-15,3,-18,-10,3,-14,-1,0,-1,-7,-13,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-25,-12,-2,-4,-21,-7,-13,5,-10,-5,-8,-12,-2,2,-9,-6,-11,-14,2,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-8,-4,-18,-7,-5,-12,-15,-1,-9,-7,-6,-5,0,-18,-5,-1,-4,-1,-6,-26,-8,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-29,-3,1,-22,-16,-7,-16,-3,-15,-10,-5,11,-2,-3,-6,-6,-17,-27,-15,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-14,-23,-15,-12,-7,-18,-14,-4,-10,-5,-4,-12,0,-13,-13,-6,1,-4,-21,-5,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-27,-17,7,-28,-14,14,-23,36,16,-25,-27,-16,-15,-26,-10,6,-18,2,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-16,-5,3,-24,-14,-5,-24,14,-22,-12,2,-12,6,16,0,-5,-17,-27,-14,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-4,-13,-28,45,-7,-34,-14,-28,-18,8,-16,-12,-14,1,-16,-29,-24,-24,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-27,-7,3,-22,-20,-8,-22,32,-18,-5,-4,-15,7,33,-11,-9,-14,-20,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-16,-9,-12,-13,-9,-15,-3,-12,-12,-8,6,-17,-10,-13,10,13,1,-31,-14,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-20,-32,-24,1,-31,-24,29,-24,24,17,-25,-25,-19,-22,-18,-7,25,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-7,-22,-20,-10,-2,-21,-3,-18,-7,-5,-14,-21,-19,-21,-1,-5,6,-22,-12,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-20,-21,-17,-1,-18,-13,11,-20,20,16,-11,-24,-13,-15,-14,-4,5,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-20,-34,-25,9,-32,-20,28,-26,28,20,-24,-26,-20,-22,-23,-9,17,-17,4,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-23,-2,6,-4,-20,-5,-12,-7,-7,-8,-6,-16,0,-9,-3,-3,-11,-18,1,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,7,28,-30,-20,-6,-30,35,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-25,-2,-1,-23,-13,-7,-18,-5,-21,-14,0,17,-4,-5,2,0,-18,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-10,-11,-11,-15,-20,-12,-11,-11,-11,0,-11,-11,-11,19,46,-2,-29,-11,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-8,2,-22,-18,-1,-29,28,-22,-10,1,-18,11,58,-5,-8,-20,-22,-11,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-1,-23,-17,-3,-26,-20,7,-20,6,1,-17,-23,-18,-18,-6,3,13,-28,-9,-18;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-3,-1,-20,-1,-11,-19,-10,-27,-19,7,-10,-1,-11,36,18,-9,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-19,-37,-27,68,-29,-20,0,-28,10,0,-18,-28,-36,-19,-16,-5,0,5,25,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,11,33,-25,-20,-3,-20,3,-16,-14,-1,-6,10,-3,1,-2,-18,-30,-16,21;
MA   /M: SY='V'; M=5,-17,-10,-21,-19,-8,-15,-22,7,-16,1,0,-14,-22,-19,-17,-3,2,17,-28,-13,-19;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,14,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-18,-22,-16,-11,-4,-16,3,-15,-2,8,-12,-16,-11,-18,-1,-5,4,-22,-12,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-11,-23,-14,-7,-6,-19,-3,-11,7,-11,-4,-8,-17,-3,5,-7,-5,-7,-12,7,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-15,4,-29,8,11,-20,-19,0,-24,7,-17,-11,0,-15,17,16,-6,-10,-23,-18,-7,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-22,-10,3,-26,-8,9,-21,30,16,-21,-24,-9,-14,-22,-10,1,-21,-1,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,57,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,7,-13,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=20,-11,-22,-16,-17,-23,32,-20,-21,-16,-18,-12,-6,-16,-15,-20,2,-11,-13,-20,-23,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-14,12,-25,16,9,-28,-14,26,-28,-3,-24,-13,10,-9,12,-3,0,-9,-27,-31,-7,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00091;
//
ID   THIOLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00098;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thiolases acyl-enzyme intermediate signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2416587; R2=0.0157820; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; N_SCORE=12.017; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=32,-15,-13,-23,-15,-14,-10,-22,4,-14,-4,-3,-13,-14,-13,-21,4,0,10,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-7,-20,-15,-15,-8,-18,-3,-15,-6,-5,-12,-18,-13,-18,2,-1,6,-26,-15,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-30,-21,15,-30,-16,19,-26,36,17,-26,-29,-19,-18,-26,-10,10,-13,10,-21;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-24,-18,-13,-10,-3,-13,-9,-6,3,2,-13,-21,-10,-4,-13,-11,-7,-19,-8,-12;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-11,-17,-12,-17,-2,-20,-9,-12,-11,-9,-8,-13,-12,-17,12,10,2,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-5,-15,-31,61,-18,-39,-17,-29,-20,1,-19,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-26,11,-33,-23,31,-27,27,21,-24,-25,-21,-23,-22,-9,21,-18,2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-34,-7,0,-28,-14,-17,-21,-9,-29,-20,-11,66,-8,-17,-2,-6,-27,-31,-28,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-24,1,5,-16,-19,1,-12,2,-13,-8,-3,-15,0,-1,-7,-7,-8,-15,-4,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-1,3,-17,3,10,-19,-12,2,-20,0,-19,-13,4,-8,3,-3,13,11,-14,-29,-11,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-16,-13,-21,-18,-6,-22,-23,13,-15,1,2,-14,-18,-17,-16,2,13,21,-26,-9,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-26,-2,-1,-25,-9,-16,-18,-9,-22,-16,-10,38,-9,-17,-3,-7,-19,-27,-23,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,-10,-22,-15,-11,-1,-21,-6,-16,-7,-7,-11,-16,-15,-21,3,-3,0,-21,-15,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-18,-23,-21,-15,1,-25,-5,6,-15,3,5,-15,-22,-9,-11,-9,-2,4,-10,8,-13;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-11,-8,-9,-13,-13,-17,-11,-10,-14,-12,5,-12,-9,-10,19,36,-3,-31,-13,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-33,-29,1,-32,-28,34,-23,17,15,-27,-27,-26,-22,-15,-4,40,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-7,32,-18,15,-1,-19,-2,5,-19,-2,-28,-19,49,-18,-1,-2,15,6,-25,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-28,-6,1,-21,-19,-3,-23,26,-18,-6,3,-17,9,41,-9,-9,-18,-22,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-17,-16,-21,-15,-5,-21,-16,9,-16,11,7,-15,-23,-10,-15,-10,-4,12,-24,-9,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-21,-13,-14,-22,27,-19,-20,-16,-19,-13,-3,-16,-13,-19,9,-5,-13,-24,-22,-14;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-23,-7,-13,-26,44,-17,-32,-16,-29,-20,3,-16,-13,-17,13,-6,-22,-26,-26,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-19,-26,-19,15,-23,-12,11,-21,22,20,-15,-25,-15,-15,-17,-7,4,-18,2,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-26,1,10,-29,-19,-1,-20,15,-19,-4,0,-12,25,15,-1,-3,-19,-24,-11,17;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-17,-9,-19,-1,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-18,15,6,-1,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-33,-27,2,-32,-25,32,-24,23,19,-26,-26,-23,-22,-18,-6,32,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-17,-15,-11,-8,-11,6,-9,-12,-9,-2,-4,-16,-7,-13,2,-1,-5,-23,-5,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,2,-20,-1,-7,-10,-17,-8,-3,-12,3,4,1,-19,-6,-11,-5,2,-6,-29,-9,-7;
MA   /M: SY='A'; M=24,-15,-14,-21,-18,-18,8,-23,-6,-16,-9,-7,-12,-17,-17,-21,2,-6,3,-22,-19,-18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-6,-15,-10,-15,-10,-14,-10,-10,-10,-5,-9,-16,-8,-13,4,0,-1,-24,-13,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-28,0,14,-32,-7,2,-24,7,-21,-8,4,-12,31,10,0,-9,-26,-23,-15,22;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-18,-11,-2,-16,-9,-11,-9,-7,-6,-2,-6,-14,0,-10,5,0,-7,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-13,-13,-19,-9,-16,-19,-9,-4,2,-3,12,-11,-18,4,3,-9,-8,-3,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=15,-8,-1,-15,-13,-16,-4,-19,-12,-14,-11,-10,-5,-17,-13,-17,9,9,-2,-29,-18,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-9,-17,-30,59,-18,-38,-14,-29,-19,1,-19,-15,-13,-1,-19,-29,-20,-28,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-25,21,13,-24,-15,1,-21,-2,-17,-13,8,-12,8,-6,2,-2,-20,-30,-12,10;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-12,-20,-15,-12,-4,-16,-5,-14,-8,-5,-9,-17,-12,-17,1,-5,-1,-19,-9,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-28,42,23,-33,-12,2,-33,5,-27,-23,19,-10,7,1,1,-8,-29,-36,-18,14;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-26,-5,-33,-27,-4,-31,-28,27,-25,10,9,-22,-24,-23,-25,-12,-5,27,-27,-9,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-13,-27,-26,-1,-8,-24,9,-22,2,4,-19,-25,-24,-21,-10,-7,17,-22,-10,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-33,-26,34,-26,26,19,-26,-26,-22,-23,-20,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=32,-15,-5,-23,-16,-17,-5,-23,-3,-15,-7,-6,-13,-15,-15,-22,3,-3,5,-23,-18,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-20,-14,-20,-25,51,-21,-32,-21,-20,-15,-5,-22,-20,-21,-3,-18,-24,-22,-26,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-20,-13,-25,-18,-1,-22,-17,10,-14,4,12,-19,-22,-11,-15,-7,-1,17,-22,-7,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,25,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00092;
//
ID   THIOLASE_3_MP; MATRIX.
AC   MP00099;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thiolases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2745848; R2=0.0145064; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=272; N_SCORE=9.210; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-21,-15,-9,-13,-23,-11,-11,10,-11,-5,-8,-21,-4,33,-4,4,1,-24,-10,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-9,-17,-11,-3,-11,-17,-6,9,-6,0,6,-6,-9,11,-6,-6,-6,0,-11,-3,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-16,-25,-20,2,-24,-21,14,-21,16,7,-19,-23,-18,-19,-9,3,15,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-15,-23,-21,-6,-16,-22,10,-17,6,7,-17,-21,-18,-17,-4,6,18,-26,-10,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-15,-8,-5,-15,-18,5,-15,-8,-13,-8,1,-12,0,-7,12,27,-8,-29,-6,-4;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-17,-26,-18,2,-23,-20,13,-24,30,11,-23,-24,-17,-19,-16,-4,9,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-14,-27,-19,1,-25,-22,15,-25,29,11,-24,-25,-19,-20,-17,-4,13,-23,-6,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-13,6,-25,1,-3,-17,-9,43,-23,-8,-20,-8,17,-16,2,-3,-1,-9,-25,-29,3,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-24,-4,15,-21,-20,-7,-11,1,-9,-7,-5,-12,9,1,-3,-5,-10,-26,-14,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,30,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-27,0,13,-26,-18,-2,-25,24,-23,-10,2,-11,14,23,-4,-6,-20,-23,-11,12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-29,1,12,-28,-19,1,-27,21,-22,-10,0,-10,19,32,-6,-10,-23,-23,-12,13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-23,1,9,-19,-14,-2,-23,16,-19,-11,3,-12,7,30,-1,-4,-17,-23,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-27,5,-6,-29,38,-13,-34,-8,-27,-19,6,-15,-11,-11,0,-14,-26,-23,-24,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-26,-10,-14,-26,38,-18,-30,-7,-25,-16,-2,-17,-14,-10,1,-12,-20,-22,-24,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-2,8,-28,-4,-7,-28,18,-24,-11,0,-10,12,17,-2,-7,-23,-22,-15,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-24,-24,-19,20,-29,-7,5,-11,7,3,-18,-25,-16,-9,-16,-5,2,-1,28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-29,-15,-30,-25,4,-29,-25,24,-25,29,14,-29,-29,-25,-20,-19,-5,29,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,-6,-20,-15,-16,-5,-22,-5,-14,-9,-7,-10,-15,-14,-20,6,5,4,-25,-17,-15;
MA   /M: SY='S'; M=16,-3,-11,-9,-8,-17,-2,-17,-15,-11,-18,-14,1,-11,-8,-13,22,22,-5,-30,-17,-8;
MA   /M: SY='M'; M=5,-22,-18,-29,-20,-2,-21,-16,17,-18,19,24,-21,-21,-12,-18,-14,-7,13,-21,-6,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=3,-12,-23,-23,-19,-9,-19,-20,19,-20,1,4,-3,-18,-14,-22,-6,-5,10,-24,-10,-19;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-13,-24,-14,-19,-21,39,-20,-24,-20,-16,-12,-6,-20,-19,-19,0,-10,-15,-22,-23,-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-8,-27,-10,1,-25,-6,5,-13,-3,-8,10,-6,-16,26,-2,-7,-12,-19,-21,-9,13;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=3,-11,-19,-15,-14,-12,-20,-14,9,-17,-3,0,-8,-17,-12,-19,2,1,10,-28,-9,-15;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-11,-17,-9,-21,4,-19,-13,-11,-14,-12,-7,-11,-9,-19,13,2,-3,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-19,-17,-25,-18,-2,-21,-14,13,-17,16,23,-18,-20,-11,-15,-9,2,12,-24,-5,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-14,-33,-27,0,-31,-27,30,-25,18,13,-25,-26,-23,-24,-15,-5,30,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-28,14,-33,-26,29,-27,23,14,-26,-27,-26,-23,-19,-7,27,-19,1,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-28,11,42,-29,-20,-1,-24,8,-19,-14,-1,-5,22,3,1,-8,-24,-28,-17,32;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-10,-23,-13,-5,-15,-17,-10,-16,15,-14,-7,-5,-18,-1,25,-6,-6,-7,-20,-9,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-21,-15,-6,-6,-17,-7,-2,-12,0,0,-15,-15,-10,-13,-11,-7,-1,-17,3,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,5,-27,9,2,-29,10,-12,-29,-4,-27,-20,3,3,-6,-11,3,-8,-23,-28,-23,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-21,-3,6,-23,-9,-11,-20,16,-22,-11,-2,-11,2,6,3,-3,-11,-24,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-20,15,0,-20,-17,-11,-11,5,-14,-10,-2,-15,-7,-3,-5,-6,0,-27,-12,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=11,11,-15,12,0,-21,-7,-11,-18,-6,-15,-15,3,-9,-6,-12,8,8,-9,-25,-15,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-24,-3,5,-18,-18,-8,-7,12,-14,-5,6,-11,2,4,-6,-7,-9,-22,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-11,-12,-11,-10,-4,6,-10,-3,-13,8,2,-9,-13,-10,-10,-9,-7,-4,-10,-7,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-7,7,-8,-8,1,-10,-1,-7,-8,-8,-6,-5,-13,-6,-8,1,0,-5,-7,10,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,8,-19,5,-4,-12,-12,-6,-9,-13,-2,-7,13,-20,-7,-10,1,0,-12,-33,-13,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00092;
//
ID   CAT_MP; MATRIX.
AC   MP00100;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chloramphenicol acetyltransferase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7665529; R2=0.0141467; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=901; N_SCORE=17.503; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-24,-24,-21,25,-29,-3,6,-16,3,1,-16,-24,-16,-15,-11,3,0,6,40,-21;
MA   /M: SY='S'; M=-2,8,-19,6,13,-22,-11,-6,-22,5,-24,-17,12,-9,4,0,15,11,-17,-33,-17,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,2,20,-31,-20,1,-27,25,-23,-9,0,-10,28,27,-5,-10,-25,-22,-12,23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-28,27,10,-31,16,-5,-35,-5,-28,-23,18,-14,-3,-10,2,-11,-30,-32,-23,3;
MA   /M: SY='N'; M=-11,34,-21,27,3,-23,-7,1,-23,-2,-26,-21,36,-15,-2,-5,9,8,-23,-38,-18,1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-27,-2,6,-26,-17,-8,-28,36,-28,-12,2,-12,8,32,-2,-5,-18,-23,-12,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-27,-22,30,-30,-2,8,-21,21,8,-24,-30,-19,-15,-24,-10,-1,7,41,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,5,-32,-20,30,-27,35,27,-25,-25,-17,-22,-25,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-33,-25,14,-32,-23,24,-28,33,16,-27,-28,-24,-22,-24,-8,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=22,-6,-13,-8,-4,-21,-2,-15,-16,-10,-23,-16,0,1,-5,-15,24,10,-9,-32,-21,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,32,-28,31,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=40,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-13,-29,-26,-4,-25,-28,24,-19,7,7,-24,-24,-24,-22,-7,-2,36,-26,-11,-26;
MA   /M: SY='C'; M=3,-18,92,-28,-26,-20,-23,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-33,-26,-28,-6,-8,-8,-43,-28,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,49,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,61,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-10,-21,-16,-12,-13,-23,1,-13,-4,-4,-13,-16,-16,-18,7,11,14,-25,-15,-16;
MA   /M: SY='G'; M=15,-5,-17,-8,-9,-23,23,-15,-24,-13,-26,-18,2,-13,-9,-15,20,3,-14,-29,-23,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-19,-25,-19,-9,-6,-25,-9,-7,3,12,4,-14,-25,-4,29,-19,-10,-6,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26,51,-28,-17,8,-27,20,15,-22,-28,-29,-18,-22,-10,4,-2,18,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-19,-27,-19,0,-25,-13,18,-17,19,32,-17,-20,-9,-15,-13,3,11,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-27,17,51,-28,-17,-2,-28,7,-22,-20,2,-2,17,-2,6,-5,-27,-32,-20,34;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-22,-35,-25,28,-30,-18,19,-27,29,20,-24,-27,-23,-20,-24,-10,10,-11,9,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,17,-25,19,24,-28,-16,-2,-25,3,-21,-16,10,-8,14,-2,5,4,-23,-31,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-25,-31,-23,10,-33,-16,26,-27,33,17,-25,-27,-18,-21,-25,-10,13,-12,14,-23;
MA   /M: SY='I'; M=3,-20,4,-27,-20,-8,-24,-23,9,-24,7,2,-16,-22,-17,-23,-6,-4,8,-28,-11,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-21,12,0,-8,-12,11,-21,-9,-14,-12,3,-14,-7,-11,-3,-9,-15,-21,-2,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,9,-27,15,15,-27,-15,-2,-31,15,-25,-18,6,-12,8,25,2,-5,-22,-29,-15,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00093;
//
ID   HEXAPEP_TRANSFERASES_MP; MATRIX.
AC   MP00101;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hexapeptide-repeat containing-transferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=9.2702427; R2=0.0281232; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-64; N_SCORE=9.230; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,13,2,-23,-4,-2,-24,-1,-21,-14,9,-12,1,-4,1,-6,-21,-27,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-11,-14,-13,-15,2,-17,-12,-13,-13,-8,-6,-16,-13,-15,1,-4,-4,-25,-17,-13;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-15,-9,-7,-15,-6,-12,-14,-6,-14,-9,-3,-15,-7,-8,3,1,-7,-26,-13,-8;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-11,-23,-16,-14,-10,-21,-13,8,-13,-1,1,-5,-12,-10,-13,-8,-4,4,-25,-8,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-22,-7,-4,-20,-5,-6,-16,1,-14,-6,-4,-13,-4,-4,-3,-7,-12,-23,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: M=-3,-8,-26,-10,-6,-14,-3,-3,-17,-6,-16,-7,-4,-3,-6,-5,-5,-9,-16,-21,-11,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-24,6,1,-22,-9,5,-23,-2,-21,-13,4,-5,0,-3,2,-4,-20,-27,-11,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=7,-10,-8,-15,-11,-14,-17,-14,-6,-11,-10,-7,-8,-11,-10,-11,6,11,2,-28,-13,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-19,-12,-9,-11,-13,-12,-4,-8,-9,-4,-6,-17,-9,-8,0,2,1,-23,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-24,-33,-25,0,-32,-26,31,-24,16,13,-22,-20,-20,-23,-17,-7,24,-17,-2,-25; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-26,-1,-2,-24,21,-7,-26,-10,-20,-14,0,-16,-8,-11,-2,-13,-20,-24,-19,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-27,19,9,-29,-7,-3,-26,0,-25,-19,8,2,0,-6,1,-7,-23,-31,-18,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-21,5,-4,-20,10,-3,-26,-7,-24,-16,13,-16,-5,-7,5,-5,-22,-27,-15,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=17,-16,-3,-21,-17,-12,-16,-22,3,-14,-5,-4,-15,-19,-17,-18,4,6,16,-28,-15,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-18,-22,-23,-15,6,-22,-17,5,-14,1,3,-14,-21,-13,-13,-10,-4,5,-10,2,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,39,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='G'; M=8,-2,-26,-1,-10,-29,42,-17,-33,-14,-25,-19,0,-16,-14,-18,2,-14,-24,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-21,-1,0,-24,1,-11,-24,-7,-24,-17,0,1,-6,-11,5,-4,-19,-22,-20,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-23,9,-2,-22,7,0,-24,-5,-22,-14,17,-17,-1,-5,4,-6,-23,-29,-15,-2;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-10,-18,-15,-12,-12,-21,1,-13,-7,-5,-12,-17,-15,-17,10,10,15,-28,-15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-11,-21,-15,-10,-14,-13,-14,-3,-5,-8,0,-7,-18,-4,-6,-2,0,1,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,36,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-22,-4,-11,-19,6,-8,-14,-13,-12,-8,-4,-18,-12,-14,-4,-10,-8,-26,-15,-12;
MA   /M: SY='P'; M=7,-4,-25,-5,-1,-26,-3,-12,-20,-5,-22,-15,-3,12,-3,-10,2,-5,-18,-26,-21,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-5,-29,-6,-7,-15,-2,4,-23,-11,-21,-13,1,-1,-6,-10,-5,-10,-24,-12,-8,-7;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,10,-29,-25,-8,-25,-27,12,-21,3,2,-22,-26,-23,-23,-8,-4,23,-29,-14,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-21,-10,-3,-12,-19,-9,-10,0,-11,-5,-3,-16,-2,3,0,5,-5,-24,-7,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-27,-6,-8,-29,47,-17,-34,-14,-26,-19,-1,-16,-13,-17,2,-16,-25,-22,-27,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-2,10,-25,14,6,-28,-3,-1,-28,1,-25,-18,7,-5,1,-3,3,-6,-22,-30,-17,3;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-19,2,-6,-19,10,3,-25,-8,-23,-15,15,-20,-6,-6,0,-9,-23,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-10,-20,-17,-11,-15,-23,4,-14,-5,-3,-14,-18,-17,-17,7,9,18,-28,-15,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-13,-20,-16,-9,-9,-21,-8,0,-5,-4,3,-11,-19,-4,-3,-5,0,4,-23,-4,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=8,-6,-26,-6,-9,-28,46,-17,-33,-15,-25,-18,-1,-16,-14,-18,2,-15,-24,-22,-27,-12;
MA   /M: SY='A'; M=18,0,-19,-2,0,-24,0,-13,-20,-5,-20,-15,0,-2,-5,-11,7,-2,-14,-27,-21,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-25,0,-8,-21,19,-2,-27,-10,-21,-13,9,-19,-7,-8,-2,-12,-24,-23,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=13,-10,-10,-13,-12,-13,-12,-19,-3,-13,-12,-8,-6,-15,-12,-14,18,17,10,-32,-15,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-13,-18,-16,-12,-12,-13,-14,-3,-10,-6,-2,-11,-17,-11,-8,-1,4,5,-26,-11,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,36,-27,25,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-22,-11,-9,-15,3,-9,-17,-8,-14,-8,-4,-15,-9,-10,1,0,-12,-17,-10,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-2,5,-25,8,5,-27,-3,-7,-26,3,-24,-16,3,-2,1,-1,2,-6,-21,-27,-18,2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-23,21,4,-25,4,0,-29,-4,-25,-19,17,-15,-2,-6,2,-8,-26,-31,-17,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,32,-22,13,12,-29,-29,-28,-21,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-26,-12,-6,-17,-12,-14,-10,-8,-14,-9,-10,9,-8,-9,-4,-4,-10,-24,-13,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-16,-24,-17,-12,-11,-22,-20,11,-17,3,3,-15,-8,-13,-19,-10,-7,8,-25,-11,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-25,-2,-9,-16,15,-4,-24,-9,-21,-14,5,-18,-9,-10,-1,-10,-21,-18,-7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,0,-22,0,0,-24,6,-6,-24,-6,-20,-14,1,-12,-3,-6,4,-5,-16,-27,-18,-2;
MA   /M: M=-6,-8,-19,-10,-12,-12,-7,-6,-7,-13,-4,-2,-4,-20,-11,-10,-5,-5,-4,-26,-10,-12;
MA   /M: SY='V'; M=7,-17,3,-22,-18,-10,-18,-22,-2,-14,-4,-4,-16,-22,-17,-17,-1,2,8,-23,-12,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-21,-20,-13,-4,-18,-16,5,-12,1,2,-13,-20,-12,-11,-7,-4,8,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-19,-24,-23,-20,-11,-4,-23,9,-22,2,2,-13,-16,-18,-22,-8,-8,6,-23,-13,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-26,-8,-9,-21,17,-9,-24,-7,-20,-12,1,-14,-9,-2,-1,-10,-18,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='P'; M=1,-5,-25,-5,0,-24,-7,-4,-20,-2,-20,-12,-3,6,-1,-5,-1,-6,-18,-26,-16,-3;
MA   /M: SY='A'; M=4,-1,-21,-3,-3,-22,0,-4,-23,1,-20,-13,2,-12,-2,2,2,-5,-17,-24,-14,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-8,-1,-12,-6,-18,-17,-10,-14,-4,-14,-7,-5,-19,2,-3,1,0,-8,-27,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-23,-19,-12,-8,-25,-17,7,-12,1,3,-14,-7,-12,-12,-8,0,6,-25,-8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-15,-23,-21,-16,-7,-21,-14,11,-14,2,4,-9,-19,-12,-13,-9,-4,8,-23,-5,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00094;
//
ID   PHOSPHORYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00102;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphorylase pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5205855; R2=0.0158565; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=823; N_SCORE=18.560; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-24,-33,-27,11,-34,-18,30,-23,13,14,-22,-25,-21,-22,-18,-8,24,-10,16,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-22,-40,-15,-5,-22,-20,-18,-22,-5,-27,-18,-20,51,-8,-5,-15,-13,-28,2,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-20,-15,-15,-25,33,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='S'; M=12,-10,12,-15,-13,-16,-11,-19,-11,-15,-17,-12,-6,-19,-13,-17,16,9,3,-36,-19,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,23,-38,-6,-2,-38,0,-28,-28,15,-9,2,-9,0,-11,-30,-37,-21,13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-31,-25,5,-31,-25,28,-26,30,16,-29,-29,-24,-21,-21,-6,29,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-11,-24,-12,-10,-10,-7,-15,-20,-13,-27,-20,-4,-17,-7,-13,11,2,-18,25,-3,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-27,-4,19,-20,-23,-3,-10,-4,4,0,-10,-14,20,-3,-10,-10,-16,-23,-10,20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,14,-27,7,7,-27,-13,36,-23,1,-23,-7,23,-16,25,4,1,-9,-30,-30,-5,15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-6,-27,-20,-20,-7,-26,-16,26,-20,3,6,7,-20,-13,-20,-10,-7,10,-27,-7,-20;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-20,-3,0,-23,-7,-13,-20,-10,-30,-20,0,24,-3,-13,23,10,-17,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-13,-17,-13,-3,-23,-20,0,-17,10,0,-10,-17,-13,-13,3,30,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-19,-17,-7,-22,-7,-17,-15,-3,-15,-12,-10,5,-7,-5,3,-3,-9,-22,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-32,-9,-12,-29,35,-19,-32,-16,-30,-20,-6,18,-15,-19,-1,-14,-29,-25,-29,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-20,-21,-13,-4,-23,-13,5,-6,16,20,-16,-20,-7,-6,-14,2,3,-22,-4,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=3,-7,34,-10,-10,-20,-10,-17,-23,-17,-27,-20,0,-20,-10,-17,23,10,-10,-43,-23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-12,-9,-8,-12,-20,-18,-11,-8,-11,-9,0,-10,-5,-8,18,45,-2,-29,-10,-6;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,21,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,28,8,-16,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-23,10,-7,-23,24,0,-27,-7,-30,-20,40,-20,-7,-7,7,-7,-30,-33,-23,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-21,-17,-29,-21,41,-20,-18,-4,-23,3,-4,-14,-23,-27,-18,-5,-3,-1,-6,11,-21;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-12,-14,-7,-17,-6,-14,-9,-10,-13,-5,-5,-12,-4,-14,16,8,-1,-27,-16,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,41,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=13,-15,16,-21,-20,-19,3,-23,-15,-19,-15,-12,-12,-23,-20,-22,2,-5,-1,-30,-23,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-21,9,-31,-21,23,-29,45,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-3,-21,-12,-11,-10,-22,4,1,-14,-2,0,4,-18,-6,-11,-2,8,-3,-28,-3,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,38,-29,30,19,-24,-24,-21,-26,-23,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-17,-20,-17,-7,-27,-23,10,-17,0,0,-7,-13,-13,-17,6,30,10,-27,-7,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-25,-16,2,-27,-8,9,-16,29,17,-22,-27,-12,-3,-24,-10,5,-21,-1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=26,-20,-24,-27,-17,-10,-7,-23,-13,-13,-13,-13,-20,-17,-13,-20,-7,-10,-10,38,-3,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-13,13,-30,0,-10,-10,-7,-4,-20,-7,-27,-20,26,-23,-7,-7,-7,-10,-30,25,-3,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-16,-20,-16,-22,-7,-30,-25,25,-20,6,6,-18,-23,-22,-22,-12,-5,30,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00095;
//
ID   EPSP_SYNTHASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00104;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   EPSP synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2751223; R2=0.0096235; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684; N_SCORE=6.848; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=647; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-30; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-46,-72,-52,-8,-26,-17,-38,62,-22,-29,-44,-71,-74,-43,-51,-49,-40,71,-17,-59;
MA   /M: SY='H'; M=-48,-74,2,38,-45,-20,58,10,-16,-35,-29,31,-68,17,-13,-42,16,24,7,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-42,-75,-63,-50,-49,81,9,7,-27,-49,-65,-23,-68,-4,-49,15,-8,-52,-16,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-47,-33,-64,-18,2,18,-13,-5,14,2,-54,19,28,4,-1,-58,8,34,-76,-37;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-33,-63,-69,-24,87,-68,-80,-13,-80,-71,1,25,-64,-36,-4,-23,-37,-75,-73;
MA   /M: SY='G'; M=-30,-74,-65,-37,25,52,-62,-18,-27,-4,-12,30,16,-24,-16,-33,-60,8,-13,32;
MA   /M: SY='P'; M=14,-76,29,6,-78,42,-30,-74,0,-43,-67,-35,44,30,-14,8,-13,-43,-78,-42;
MA   /M: SY='G'; M=-1,28,-32,-19,24,47,-64,-14,2,11,-13,-7,-9,-38,-2,-17,-15,-60,-70,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-33,-72,-34,-12,48,-36,40,-8,-28,54,-43,-29,-19,-24,-16,-14,-22,-24,-68,-48;
MA   /M: SY='Q'; M=23,-72,-61,-9,-46,-40,-30,-19,35,6,-29,6,25,42,-39,4,4,-11,24,-63;
MA   /M: SY='Q'; M=19,-33,-36,49,-76,-24,-29,-30,9,-48,-62,-14,7,57,-27,5,31,-39,-78,-40;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-35,-29,10,-81,5,0,-76,-5,-80,-69,-16,98,-2,-33,19,-56,-75,-79,-44;
MA   /M: SY='H'; M=16,12,23,35,-51,1,49,-42,12,-73,-66,17,21,22,-56,0,-7,-54,-81,-39;
MA   /M: SY='Q'; M=38,-32,10,-15,-66,4,-30,6,-6,18,-27,0,-70,47,-21,-31,-13,-26,-76,-38;
MA   /M: SY='P'; M=3,-32,-11,42,-45,-70,-32,-5,-58,-29,-57,-41,48,-2,-33,10,9,39,-79,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-85,-77,-10,-86,-70,19,-78,84,-30,-83,-83,-72,-76,-76,-62,-2,-71,-53;
MA   /M: SY='D'; M=-70,-76,80,-38,73,-70,-9,-66,-46,-61,-63,28,-75,-62,-65,-46,-60,-68,-59,58;
MA   /M: SY='C'; M=-15,68,-80,-75,29,-78,-69,-10,-73,51,62,-73,-49,-71,-73,-66,15,12,-73,-53;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-76,-63,-73,-82,100,-70,-89,-38,-85,-74,-22,-68,-41,-74,-49,-67,-82,-74,-77;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-37,-58,-74,-32,-44,-73,-49,-26,-67,122,-74,-51,-57,-45,-48,-76,-94,-71;
MA   /M: SY='S'; M=74,-62,-62,-58,-75,-49,-64,-69,-60,-71,-65,-53,-65,-54,-64,76,-44,-58,-79,-69;
MA   /M: SY='G'; M=-25,-76,-64,-76,-83,102,-71,-90,-69,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-83,-74,-78;
MA   /M: SY='T'; M=-34,-62,-58,-61,-67,-68,-68,-25,-58,-62,-59,-47,-59,-62,-66,-36,113,-49,-87,-65;
MA   /M: SY='T'; M=60,-63,-63,-62,-72,20,-69,-60,-62,-66,-61,-54,-65,-61,-68,22,65,3,-80,-69;
MA   /M: SY='M'; M=5,3,-77,-72,-1,-73,-63,31,-67,8,110,-66,-71,-63,-69,-19,30,-32,-74,-53;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='P'; M=-67,-76,-78,-69,40,-79,-69,-12,-72,62,-21,-78,79,-71,-75,-53,-45,-50,-68,-53;
MA   /M: SY='L'; M=-41,-69,-81,-75,-31,-82,-67,24,-74,70,68,-76,-78,-68,-73,-69,11,-3,-72,-18;
MA   /M: SY='M'; M=57,-10,-67,-63,-66,-60,-65,-33,-62,-10,64,-58,6,-59,-67,26,54,-51,-79,-65;
MA   /M: SY='G'; M=59,-70,-65,-67,-80,75,-70,-77,-66,-77,-69,-55,17,-63,-72,-8,-43,-68,-75,-75;
MA   /M: SY='A'; M=52,-67,-78,-72,-37,-71,-74,41,-72,47,-40,-74,-75,-68,-74,-60,-56,32,-75,-60;
MA   /M: SY='L'; M=22,-30,-81,-73,-32,-77,-70,-34,-74,76,-16,-78,-80,-69,-74,-39,-59,25,-74,-56;
MA   /M: SY='C'; M=64,85,-66,-65,-74,12,-70,-69,-64,-70,-65,-57,-69,-62,-70,38,17,-36,-82,-72;
MA   /M: SY='L'; M=3,-69,-70,-71,-26,49,-33,-48,-52,54,-46,-2,-74,-41,-72,-44,11,3,-75,-62;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-32,-65,-60,-18,35,-29,-26,-17,9,-12,-39,-71,56,-7,-5,8,-22,-67,35;
MA   /M: SY='P'; M=-23,-78,49,-2,-81,39,-60,-79,-5,-65,-71,2,62,21,-22,20,-41,-76,-80,-43;
MA   /M: SY='F'; M=-48,-72,-32,-38,70,43,-63,10,-28,-54,42,41,-30,-66,-48,-7,-43,-28,-64,-47;
MA   /M: SY='E'; M=-40,-13,55,60,6,-53,11,-42,5,-40,-67,21,12,-49,-41,-6,-1,-54,-80,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-16,-68,-46,-36,4,-67,-65,30,-47,-37,-53,-57,-69,-61,-48,53,52,28,-71,32;
MA   /M: SY='V'; M=-17,22,-67,-12,-29,-56,-1,-23,-18,-20,-26,-41,-71,-62,12,14,38,65,-83,-62;
MA   /M: SY='L'; M=-52,-71,-54,-21,43,-62,-66,8,-54,63,41,-76,-79,-26,-71,-71,-44,12,-64,10;
MA   /M: SY='T'; M=-45,-31,18,-60,-3,-42,-1,28,-26,-26,-54,-24,-68,4,-65,28,60,26,-78,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-41,-76,-45,-54,-77,96,-34,-34,-69,-30,-69,-35,-69,-66,-76,-39,-34,-45,-74,-44;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-79,101,44,-79,-41,-56,-54,-54,-29,-72,-28,-66,-51,-62,-33,-57,-5,-92,-41;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00097;
//
ID   AA_TRANSFER_CLASS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00105;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminotransferases class-I pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9392017; R2=0.0100158; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1421; N_SCORE=16.171; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=456; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-28; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=17,-71,7,-64,30,-19,-6,27,-32,-1,-51,-1,14,-18,-68,-12,-24,32,-70,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-74,-25,-9,-23,-19,-59,-11,-47,16,-53,-20,-23,20,63,1,6,-3,-72,7;
MA   /M: SY='M'; M=17,-72,9,21,-62,-18,19,1,-30,21,44,-20,15,-56,-64,19,-6,-29,-77,-15;
MA   /M: SY='F'; M=17,-71,-6,-30,61,-5,-6,2,-13,-10,-5,0,0,-65,-67,1,-6,7,-66,-10;
MA   /M: SY='P'; M=27,-3,27,4,-25,-67,19,-28,-11,15,-5,-20,42,-58,-7,-11,-6,-3,-80,-63;
MA   /M: SY='E'; M=11,38,41,44,-5,13,-60,-35,-9,-70,-66,-17,-67,7,-6,19,-56,-18,-77,-16;
MA   /M: SY='W'; M=17,-71,34,-27,-24,-17,-61,-11,-29,10,18,40,-70,5,-27,2,7,-3,45,-60;
MA   /M: SY='K'; M=-60,-76,-25,-58,10,35,19,-66,42,-14,-60,-18,15,6,18,-11,6,-18,18,8;
MA   /M: SY='D'; M=-60,-76,59,44,-75,-5,-4,-33,-9,-26,16,16,26,7,-59,-10,-6,-5,-85,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-63,-78,-3,39,-26,-38,35,-63,-7,9,-58,25,34,7,48,-29,-59,-5,-79,-62;
MA   /M: SY='T'; M=-17,50,-75,-73,-1,-21,-75,38,-69,7,-2,-66,-73,-71,-31,-58,51,48,-79,-59;
MA   /M: SY='H'; M=-37,-73,-77,-73,31,-42,73,50,-73,38,-40,-70,-77,-69,-72,-69,-61,34,18,-47;
MA   /M: SY='I'; M=-58,-71,-72,0,-52,-81,-74,62,-69,9,-42,-69,-72,-67,-73,-13,32,55,-76,8;
MA   /M: SY='V'; M=23,50,-75,-71,-1,-70,-75,33,-70,7,-47,-67,-75,-68,-73,31,-22,54,-79,-60;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-74,-51,-55,-60,6,-1,-71,-23,-71,-62,74,-72,58,18,20,-23,-38,-67,60;
MA   /M: SY='S'; M=-44,-68,-59,-63,-77,61,-63,-79,-61,-80,-72,-46,-65,-54,-66,90,-45,-72,-79,-70;
MA   /M: SY='F'; M=-21,22,-82,-77,80,-80,-64,-42,-75,44,-1,-76,-83,-75,-73,-69,-27,8,-52,51;
MA   /M: SY='S'; M=47,-63,-59,-58,-75,-12,-62,-71,-59,-74,-67,-49,-64,-52,-63,90,-1,-62,-80,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='N'; M=11,-68,46,-53,-5,-59,-56,-33,-54,-27,-64,68,-68,-55,-7,32,43,-63,-84,-64;
MA   /M: SY='F'; M=-39,-74,-80,-75,78,-78,35,-48,-71,14,76,-73,-80,-69,-68,-71,-66,-53,63,67;
MA   /M: SY='G'; M=33,-69,-62,-66,-75,70,-66,-73,-64,-29,-67,2,-68,-60,-69,53,-53,-36,-77,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-36,-69,-84,-75,2,-80,-63,-2,-72,58,108,-76,-77,-66,-70,-72,-61,3,-71,-50;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-74,-64,-62,-50,-69,-57,-62,-61,-65,-59,-61,73,-62,-67,-50,70,-60,-58,83;
MA   /M: SY='G'; M=-29,-76,-62,-73,-82,98,-68,-89,-65,-85,-74,16,-69,-64,-10,-49,-66,-82,-75,-77;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-85,-26,54,49,-77,-73,-64,-62,4,-61,-75,-73,-16,-67,-71,-72,-70,142,-37;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-69,-83,-77,-51,-82,-78,55,-75,29,35,-77,-77,-73,-76,-68,-55,69,-79,-58;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-76,-64,-75,-83,101,-71,-89,-69,-85,-75,-51,-68,-67,-77,-49,-67,-82,-74,-78;
MA   /M: SY='W'; M=35,22,-75,-72,45,-36,-60,18,-68,-54,-54,-24,-77,-67,-70,-12,-61,-29,84,81;
MA   /M: SY='I'; M=27,-3,-81,-75,13,-40,-75,47,-74,46,-39,-75,-77,-72,-76,-65,-58,38,-73,-55;
MA   /M: SY='Y'; M=11,-3,-70,-70,1,-37,-5,21,-67,6,-49,-22,-74,-65,-69,19,25,32,-64,60;
MA   /M: SY='S'; M=24,-68,-67,-68,-64,40,-69,19,-66,-12,-55,-20,-70,-62,-70,52,-51,32,-77,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-18,-3,-61,-11,12,-67,19,-9,-29,-22,-5,40,41,-59,-27,25,-23,31,-73,22;
MA   /M: SY='C'; M=-7,66,41,29,-75,-65,-4,-71,3,-28,-66,46,0,-13,7,-10,7,-37,-87,-69;
MA   /M: SY='D'; M=10,-77,55,52,-79,-66,-57,-76,5,-46,-69,2,26,8,18,-10,-6,-72,17,-68;
MA   /M: SY='D'; M=10,-72,40,-9,-63,-68,-5,36,-29,5,-4,14,-71,-58,6,18,-54,22,-82,-62;
MA   /M: SY='I'; M=36,-71,-7,-31,-60,-37,-72,59,-66,-8,-48,-22,0,-18,-30,-28,-6,34,-79,-63;
MA   /M: SY='K'; M=22,-73,28,35,-71,-69,-62,-11,46,-39,-58,-19,-67,21,-21,-55,-24,35,-80,-66;
MA   /M: SY='A'; M=49,-68,-57,13,-5,-32,19,-31,3,-41,-60,33,-68,7,-6,26,-22,-4,-77,-62;
MA   /M: SY='M'; M=43,50,-73,-69,-2,-18,-66,20,-66,7,66,-1,-23,-65,-30,-28,-24,0,-74,-14;
MA   /M: SY='A'; M=49,-66,9,-57,-72,7,-63,-63,2,-26,-7,25,-66,-15,-61,21,43,-15,-81,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-74,-4,5,-27,-37,-59,-33,43,-42,-61,2,-68,-48,69,-27,31,-5,-78,-63;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00098;
//
ID   GALACTOKINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00106;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Galactokinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2072020; R2=0.0152960; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=672; N_SCORE=15.476; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-1,-21,-8,-7,0,-5,-11,-8,-13,-13,-10,9,-19,-12,-12,1,-4,-9,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='K'; M=1,3,-21,1,8,-25,-10,-5,-23,12,-25,-14,8,-11,10,10,10,0,-18,-29,-16,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-5,-6,-11,-9,-10,-23,-6,-11,-2,-13,-7,-2,-20,-1,-5,-3,4,-11,-18,6,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-15,-22,-18,-14,19,-21,0,-11,-17,-9,-8,-9,-7,-16,-14,-2,2,-10,-12,12,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,-1,-10,-27,34,1,-33,-6,-29,-17,15,-19,-9,-7,0,-14,-29,-26,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-24,12,16,-24,-14,-5,-22,8,-22,-16,8,-12,4,7,4,-3,-16,-32,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-22,-2,11,-19,-19,-12,-16,9,-13,-9,-4,-11,2,2,1,4,-10,-27,-13,7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-33,-13,-2,-24,-13,-17,-13,-7,-19,-12,-13,35,-7,-9,-8,-10,-18,-26,-22,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,10,-27,12,19,-26,-17,-3,-28,21,-24,-16,9,-11,9,20,-2,-4,-23,-28,-15,13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-20,-17,-17,18,-10,-15,-4,-19,-2,1,-9,-20,-19,-17,-7,-7,-3,-12,2,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,6,-24,-19,7,-27,-16,0,-14,1,-1,-16,-25,-18,-14,-12,-2,3,-16,6,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=4,-23,-16,-27,-24,15,-12,-21,4,-20,0,-1,-19,-25,-26,-19,-8,-6,13,-12,2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-16,-27,-20,-11,17,-24,-6,-17,9,-9,-6,-9,-23,-8,28,-14,-10,-12,-5,12,-11;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-12,-9,-4,-20,-2,-13,-17,-6,-21,-15,1,-11,-3,-5,22,8,-7,-29,-19,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,79,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-20,-28,-20,-3,-33,-27,31,-20,10,10,-23,-23,-21,-21,-13,-5,34,-26,-7,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,36,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-13,-19,-23,-19,-6,-29,-24,17,-19,3,3,-9,-14,-14,-19,2,23,13,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,12,8,-7,-20,-7,1,-22,-7,-28,-20,41,-25,-7,-7,5,-2,-25,-42,-22,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-11,14,-30,22,-3,-27,25,-7,-35,-10,-26,-22,6,-17,-10,-15,-2,-15,-28,-22,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-16,-28,-18,-22,2,35,-15,-26,-21,-17,-13,-7,-24,-23,-19,-7,-16,-21,-7,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-16,-23,-18,-13,22,-20,6,-12,-18,-10,-7,-8,-9,-16,-13,-3,-5,-12,-11,15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-20,-33,-23,31,-28,-16,13,-26,31,22,-25,-28,-22,-18,-25,-10,7,-10,10,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=1,-18,20,-26,-20,-1,-19,-16,-5,-19,1,8,-16,-25,-16,-19,-7,-5,0,-27,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-16,-18,-8,-22,-4,-20,-12,-10,-14,-12,-12,9,-10,-20,6,-2,-6,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,23,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-24,18,17,-25,-12,-4,-24,-1,-24,-20,14,2,2,-6,8,5,-23,-35,-19,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-20,-21,-22,-14,6,-26,-2,2,-14,10,6,-16,-25,-8,-4,-16,-9,4,-18,3,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-10,11,-30,18,-1,-28,21,-5,-33,-9,-26,-19,5,-16,-3,-12,-2,-14,-28,-22,-12,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-12,-23,-21,-3,-24,-20,14,-14,6,15,-18,-21,-16,-14,-2,14,24,-28,-8,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00099;
//
ID   PROTEIN_KINASE_ATP_MP; MATRIX.
AC   MP00107;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein kinases ATP-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=259;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=254;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2664; R2=0.014134; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=265; N_SCORE=6.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=229; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-29,-23,32,-29,-7,5,-19,8,3,-21,-29,-21,-15,-21,-10,1,15,35,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-21,-2,11,-23,-18,-2,-17,8,-16,-8,0,-13,9,6,-1,-4,-14,-27,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-23,-16,-8,-2,-23,-15,1,-9,7,2,-11,-17,-10,-6,-12,-6,-1,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-22,-17,-15,-6,-14,-17,5,-16,7,3,-14,-22,-15,-15,-11,-6,7,-23,-7,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,6,12,-25,-16,-3,-23,10,-20,-12,1,-10,8,11,0,-4,-17,-28,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-11,-21,-13,-5,-8,-24,-15,-5,2,-5,-3,-10,-16,-7,1,-8,-1,0,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-33,-24,7,-33,-24,29,-27,29,17,-24,-25,-21,-23,-22,-9,19,-19,0,-24;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-29,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-17,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-1,-20,-2,9,-24,-11,-5,-22,8,-22,-13,2,-12,10,9,8,-1,-17,-27,-14,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-16,-6,-2,-21,6,-13,-21,-6,-21,-15,2,-14,-5,-8,11,1,-13,-28,-19,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-20,-30,-23,52,-21,-13,-4,-23,1,-2,-13,-26,-28,-17,-10,-6,-4,2,24,-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-26,-9,-16,-27,51,-14,-34,-17,-28,-19,1,-18,-15,-18,6,-13,-25,-23,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-17,-4,4,-20,-18,-10,-14,4,-16,-8,-4,-14,1,1,2,1,-7,-27,-12,2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-7,-29,-29,-2,-29,-29,27,-20,8,8,-27,-29,-28,-20,-8,0,44,-30,-11,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-22,-21,-25,-19,22,-28,-5,0,-10,1,1,-19,-27,-16,-7,-18,-10,-1,8,32,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-26,-11,1,-15,-21,-11,-10,10,-3,0,-9,-16,3,9,-11,-7,-9,-21,-8,2;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-1,-20,-15,-17,0,-21,-9,-15,-10,-8,-13,-19,-15,-20,1,-5,2,-25,-18,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-25,-10,-2,-14,-22,-8,-7,6,-8,-2,-7,-16,2,5,-7,-2,-6,-20,-2,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-28,5,1,-17,-16,8,-21,2,-15,-10,5,-18,0,3,-8,-10,-21,-12,-3,0;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-10,-24,-12,-6,-13,-22,-6,-3,3,-7,0,-6,-15,-5,2,-8,-6,-1,-23,-6,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-1,-19,0,1,-15,-9,-6,-13,-5,-12,-9,-2,-5,-2,-7,2,2,-11,-23,-9,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='B'; M=-5,13,-18,13,2,-20,-9,-6,-18,-2,-17,-13,9,-11,-2,-6,6,9,-13,-28,-13,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-22,0,-6,-23,21,-12,-28,-5,-24,-16,6,-14,-8,-7,3,-6,-22,-24,-20,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-22,-3,10,-20,-19,-5,-16,8,-12,-6,-3,-14,9,8,-5,-6,-14,-25,-11,9;
MA   /M: M=-11,-11,-26,-11,-6,-12,-25,-7,-2,-3,-5,-1,-10,-11,-5,0,-10,-5,-2,-23,-4,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-26,-15,-27,-26,14,-29,-14,17,-18,10,9,-24,-29,-23,-17,-15,-5,24,-12,16,-25;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-8,-21,-12,-18,-4,-21,-7,-11,-9,-8,-12,-11,-12,-20,7,0,4,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-17,-31,-25,-3,-27,-24,26,-19,12,15,-22,-24,-19,-18,-14,-6,27,-24,-7,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-23,-20,-9,-10,-29,-15,11,-6,2,6,-13,-18,-6,-6,-12,-6,7,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-22,-29,-19,5,-31,-21,24,-23,22,16,-22,-24,-17,-20,-18,-7,19,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-24,3,4,-22,-15,1,-23,13,-23,-13,8,-6,2,10,-3,-6,-21,-27,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-25,-12,-5,-12,-22,-8,-7,6,-9,-3,-8,-12,-2,2,-8,-5,-6,-18,1,-5;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-21,3,5,-21,-16,-9,-16,4,-16,-11,-3,-8,0,-1,-3,-4,-11,-23,-12,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-19,-1,0,-14,-11,-8,-14,-2,-11,-8,-1,-11,-2,-2,1,1,-10,-22,-10,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-8,-21,-9,-1,-10,-16,-7,-5,-2,-5,1,-7,-7,-1,-3,-6,-5,-6,-16,-6,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-1,0,-15,-3,-3,-13,-4,-7,-8,-2,-11,-6,4,-5,-3,-5,2,-1,-7,-20,-11,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-14,-1,2,-11,-10,-6,-10,1,-11,-6,-1,-4,0,-1,3,2,-7,-16,-7,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-14,-1,1,-10,-8,-4,-11,4,-9,-5,-1,-7,1,3,-3,-3,-9,-11,-6,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-25,4,8,-20,-11,-5,-18,0,-14,-9,0,-13,6,-2,-1,-4,-16,-24,-9,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-18,-9,-2,-15,-20,-4,-13,1,-11,-6,-6,-11,-3,4,-7,-7,-10,-26,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-27,4,15,-25,-15,-2,-22,8,-20,-12,4,-9,13,4,-1,-6,-22,-20,-12,14;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-19,-9,0,-16,-18,-3,-16,5,-13,-4,-3,-14,6,7,-4,-5,-13,-23,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=1,-18,-18,-24,-18,6,-22,-19,8,-19,8,3,-14,-20,-16,-17,-5,3,7,-19,-1,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-10,-25,-11,-1,-11,-21,-7,-5,-5,1,2,-10,-16,0,-2,-10,-6,-7,-18,-5,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-22,-6,-3,-16,-14,-2,-14,5,-14,-6,5,-18,3,14,-1,-4,-12,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=1,-22,-18,-26,-18,-4,-25,-21,15,-15,10,7,-19,-22,-15,-13,-12,-6,15,-21,-5,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-21,-2,1,-17,-14,-3,-17,5,-17,-8,2,-16,7,4,0,-4,-15,-21,-4,3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-21,-29,-23,1,-29,-22,24,-20,15,11,-21,-23,-19,-19,-14,-6,21,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-17,-22,-16,-1,-22,-2,6,-20,23,16,-19,-26,-11,-14,-21,-11,2,-22,0,-14;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-23,-8,0,-18,-14,-7,-14,6,-15,-7,0,-12,2,6,0,-2,-11,-23,-10,0;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-23,-5,-1,-15,-12,-4,-12,1,-11,-7,3,-16,-1,1,-2,-4,-11,-25,-8,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-16,-26,-19,3,-25,-19,16,-20,25,15,-23,-25,-17,-15,-18,-6,13,-22,-4,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,11,-27,10,2,-26,-1,0,-29,9,-27,-16,15,-12,3,11,-1,-8,-25,-28,-15,1;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-26,-1,-2,-17,-14,72,-29,-10,-21,-4,9,-18,5,-2,-6,-16,-27,-29,11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-29,-1,7,-26,-18,-14,-18,-6,-22,-16,-10,38,-4,-12,-4,-7,-20,-31,-23,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-13,18,-21,6,-5,-8,-6,17,-20,-5,-23,-14,32,-22,-4,-3,0,-7,-25,-25,-3,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-27,1,-36,-28,39,-26,21,17,-22,-23,-21,-25,-18,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-12,-29,-25,-3,-29,-27,24,-22,10,8,-24,-20,-23,-22,-11,-1,30,-27,-9,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-24,-2,7,-23,-15,0,-22,11,-19,-9,3,-12,12,16,-2,-5,-20,-24,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-22,-30,-22,22,-30,-15,14,-23,26,13,-24,-28,-21,-15,-22,-8,9,-9,15,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-21,-20,-15,6,-26,9,0,-13,4,4,-12,-25,-10,-9,-16,-11,-5,-7,21,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-24,6,-2,-19,11,-6,-28,-9,-22,-17,1,-17,-9,-11,-2,-10,-21,-18,-10,-6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-8,-21,-15,-6,-16,-16,-1,-14,-5,-1,-12,-19,-12,-16,0,0,3,-17,-4,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-11,-23,-17,15,-22,-16,-2,-18,-2,-3,-16,-24,-19,-17,-13,-9,-2,-1,8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-22,-2,8,-17,-20,-1,-15,2,-12,-7,-3,-14,6,1,-2,-1,-13,-23,-5,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-23,3,8,-19,-16,-9,-17,0,-14,-12,-1,-11,-1,-1,2,4,-12,-26,-13,3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-26,2,3,-23,-1,-11,-23,-1,-24,-16,1,4,-3,-5,1,-5,-21,-23,-18,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-26,14,4,-26,2,-5,-27,-2,-22,-17,8,-11,-1,-4,2,-6,-22,-29,-17,1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,1,-23,1,3,-13,-18,10,-19,0,-16,-8,2,-10,2,0,-3,-4,-19,-22,0,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-25,-20,2,-27,-16,16,-23,19,10,-19,-18,-18,-19,-19,-9,9,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-19,-20,-16,11,-25,-2,-3,-15,-2,-3,-16,-26,-13,-14,-15,-8,-6,12,30,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-33,-24,7,-31,-21,29,-25,28,22,-24,-25,-18,-22,-22,-9,19,-19,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-17,-27,-23,1,-30,-23,23,-21,11,9,-22,-25,-19,-20,-13,-5,27,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-19,-24,-18,6,-20,-10,8,-16,14,23,-15,-21,-10,-13,-12,1,4,-19,1,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-30,21,42,-30,-17,-2,-29,6,-22,-19,2,-2,16,-3,0,-10,-28,-24,-18,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-24,-25,-20,24,-28,2,0,-16,9,2,-21,-28,-16,-10,-21,-11,-6,13,38,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-21,30,-26,-24,-9,-21,-16,-4,-22,0,4,-19,-28,-19,-21,-12,-9,3,-31,-12,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,6,11,-25,-4,-7,-24,-1,-23,-17,4,4,0,-6,2,-5,-22,-30,-20,4;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-24,-4,-9,-19,19,-8,-24,-7,-20,-12,6,-17,-9,-9,-3,-11,-21,-22,-15,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-24,-8,-12,-24,41,-15,-29,-12,-23,-15,-1,-13,-12,-10,0,-13,-22,-18,-22,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-17,23,13,-27,-10,-6,-26,-4,-26,-21,11,-8,2,-8,16,8,-19,-37,-19,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-30,-21,11,-29,-20,18,-28,43,19,-28,-29,-20,-19,-26,-8,11,-19,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-11,-22,-13,-7,7,-20,-3,-8,-9,-2,-1,-9,-20,-7,-6,-8,-6,-8,-12,7,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-25,19,12,-26,-14,-3,-25,5,-21,-15,5,-11,7,1,2,-2,-20,-25,-12,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-24,-23,-17,12,-25,-4,2,-14,5,4,-17,-25,-14,-8,-16,-9,0,-1,16,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-23,-32,-24,7,-31,-20,24,-25,27,15,-25,-27,-20,-20,-23,-9,17,-12,4,-23;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-23,-1,3,-18,-15,-1,-18,9,-18,-8,3,-14,3,8,1,0,-13,-25,-9,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-23,3,7,-22,-11,-3,-22,6,-20,-12,2,-13,6,6,3,-2,-16,-26,-12,6;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-17,-3,3,-17,-13,6,-20,1,-16,-9,2,-15,3,5,-5,-9,-18,-24,-7,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-23,-2,-3,-20,5,-10,-21,4,-20,-12,3,-15,-5,-1,0,-6,-14,-24,-15,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: M=-4,-7,-17,-8,-7,-11,-8,-8,-10,-3,-11,-6,-4,-12,-5,-1,-2,-3,-7,-19,-6,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-13,-5,-3,-6,-9,0,-7,-1,-4,-3,2,-10,-1,3,-3,-1,-7,-13,-3,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-31,-21,18,-26,-17,15,-24,21,15,-21,-25,-18,-19,-19,-9,8,-13,6,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-5,2,-22,1,3,-21,-11,-7,-20,1,-21,-13,4,-4,3,1,9,7,-16,-28,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-29,0,20,-17,-19,-7,-17,-2,-13,-10,-8,-7,4,-7,-7,-10,-19,-6,-7,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-27,-1,4,-15,-10,-3,-19,-4,-16,-11,-3,-6,-1,-8,-5,-8,-18,-16,-7,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-26,4,10,-17,-17,2,-16,-4,-10,-7,-2,-12,6,-5,-4,-4,-17,-24,-6,7;
MA   /M: SY='I'; M=2,-22,-15,-27,-20,-5,-25,-22,15,-18,10,7,-18,-19,-16,-15,-10,-3,14,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-16,-18,-10,-10,-20,-14,-11,4,-7,-3,-12,-22,-6,11,-12,-9,-6,-13,-7,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-21,-7,-6,0,-17,-6,-17,2,-14,-8,-2,-19,-8,2,-5,-5,-12,-15,1,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-27,-20,-32,-26,19,-32,-13,18,-23,14,10,-23,-27,-21,-20,-21,-10,11,1,23,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-19,-12,-25,-18,5,-17,-20,3,-20,7,3,-16,-21,-18,-19,-5,0,5,-16,-5,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-12,-23,-13,-6,-6,-18,-5,-10,-3,-6,-5,-10,-19,-4,2,-7,-5,-7,-10,3,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-26,6,21,-34,-12,5,-25,5,-21,-9,2,-10,32,4,1,-9,-27,-25,-14,26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-32,-26,1,-32,-25,32,-24,21,18,-22,-23,-20,-22,-16,-2,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-1,-27,-20,-4,-20,-23,8,-22,12,3,-20,-24,-19,-22,-10,-4,10,-25,-11,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-24,0,6,-20,-16,-6,-17,8,-13,-7,1,-14,5,10,-1,-3,-15,-27,-12,5;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-21,-14,-16,-24,34,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-16,-15,-17,4,-9,-14,-21,-24,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-31,-23,7,-29,-22,24,-25,30,19,-26,-27,-20,-20,-20,-6,20,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-22,5,7,-20,-14,-4,-18,2,-15,-11,4,-14,3,-2,-2,-6,-16,-24,-9,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-16,-27,-19,-15,24,-26,25,-7,-13,-3,-1,-12,-26,-11,-9,-15,-11,-12,7,47,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-3,-31,-23,3,-30,-22,18,-28,31,16,-27,-29,-21,-22,-23,-9,14,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-29,0,1,-20,-19,84,-28,-8,-19,-2,9,-19,9,0,-8,-18,-28,-28,16,1;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-19,4,5,-23,-7,-3,-23,2,-25,-16,7,-12,5,3,16,5,-16,-31,-14,4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-23,-5,0,-20,-16,-1,-15,9,-12,-1,1,-17,6,8,-8,-9,-14,-21,-9,2;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-27,-2,-6,-24,16,-8,-29,0,-27,-17,9,-11,-6,1,0,-9,-25,-23,-19,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-18,-35,-28,5,-35,-26,34,-26,19,14,-24,-26,-23,-25,-18,-7,28,-20,2,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-18,-32,-26,1,-32,-25,31,-24,19,15,-24,-25,-22,-23,-16,-5,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,-2,-15,-21,92,-27,-10,-18,0,7,-21,8,-1,-11,-19,-28,-24,26,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-25,-11,-3,-18,-18,0,-25,20,-15,-7,0,-21,6,52,-9,-8,-18,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,37,20,-26,-26,-20,-23,-25,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-29,-1,9,-29,-19,-10,-29,46,-29,-10,0,-10,9,29,-8,-9,-19,-20,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-32,-11,-4,-24,-14,-19,-15,-13,-19,-15,-16,52,-10,-19,-5,-6,-21,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,8,-24,12,17,-28,-6,-3,-26,2,-23,-17,4,-9,8,-1,7,-4,-21,-29,-18,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-37,-29,6,-36,-28,38,-28,20,16,-23,-24,-23,-26,-19,-8,28,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-32,-23,19,-29,-19,18,-27,36,20,-27,-29,-22,-19,-25,-9,13,-16,4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-34,-25,13,-32,-24,26,-28,30,17,-26,-27,-23,-23,-23,-9,19,-19,1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-18,22,1,-26,-5,-6,-24,-3,-23,-17,12,-15,-5,-8,4,-2,-16,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-24,4,10,-19,-17,2,-19,2,-17,-10,5,-11,5,3,2,-1,-17,-27,-9,6;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-5,9,-18,8,8,-24,-7,-2,-24,1,-22,-16,9,-9,3,-1,4,-1,-21,-30,-17,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-23,-10,-13,-17,14,-12,-18,-12,-12,-8,-2,-16,-11,-10,-5,-10,-16,-23,-16,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-21,-4,1,-13,-20,6,-14,0,-11,-4,-1,-16,1,1,-4,-1,-11,-24,-3,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-9,-30,-24,-3,-27,-26,19,-23,11,7,-24,-18,-23,-23,-14,-6,21,-26,-9,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-22,-6,3,-22,-22,-11,-22,32,-22,-7,-5,-15,4,21,-10,-9,-13,-21,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,1,-21,-19,-15,-4,-23,-5,-19,-9,-7,-10,-20,-17,-21,2,1,2,-28,-17,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-39,-29,73,-30,-20,1,-30,12,1,-21,-30,-38,-20,-21,-10,0,11,28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-17,-28,-20,8,-27,-17,15,-26,30,14,-23,-27,-18,-19,-19,-7,10,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,4,-16,-11,-19,-5,-15,-13,-13,-15,-12,-7,-16,-11,-18,12,3,-1,-29,-19,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-19,-7,0,-19,-17,-11,-18,14,-16,-9,-1,-15,0,14,-2,0,-11,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-7,1,-14,-22,-9,-10,6,-7,-3,-6,-17,3,9,-9,-7,-7,-22,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-22,-24,-17,5,-24,-13,10,-18,14,10,-19,-23,-14,-16,-15,-7,6,-13,5,-16;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,5,-25,6,5,-23,-10,-1,-18,0,-19,-10,5,-5,2,-3,1,-4,-17,-29,-14,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-24,5,3,-19,-10,-5,-19,-1,-19,-13,2,-1,-1,-2,1,-4,-16,-25,-11,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-22,7,2,-20,1,-2,-22,-6,-18,-14,6,-7,-3,-7,2,-3,-19,-22,-12,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-18,-4,2,-13,-6,-6,-11,-2,-7,-4,-2,-12,0,-2,-3,-4,-9,-19,-10,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-3,1,-11,1,2,-12,-6,-4,-13,-1,-12,-9,1,-5,-1,-3,4,2,-9,-17,-7,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-24,-5,3,-15,-15,-2,-17,6,-16,-7,-1,-11,2,6,-3,-5,-13,-24,-9,1;
MA   /M: M=0,-10,-19,-12,-7,-12,-16,-10,-9,-5,-4,-4,-9,-12,-7,-3,-6,-2,-6,-20,-7,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-23,-2,-1,-16,-11,2,-19,-1,-17,-9,4,-16,2,-1,2,1,-16,-19,-5,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-19,-4,-4,-18,-6,-10,-16,-7,-18,-12,2,-8,-5,-8,8,10,-10,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-17,-17,-20,-12,3,-20,-14,-2,-12,0,0,-13,-18,-11,-8,-9,-6,-2,-18,-1,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,8,-21,-17,-8,-21,-23,-2,-13,-6,-4,-16,-25,-18,-14,-7,-4,10,-29,-13,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-25,-13,-20,-22,53,-20,-32,-20,-24,-17,-3,-21,-21,-20,-1,-17,-23,-20,-25,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-5,-7,-15,-16,-17,-14,-10,-16,-13,1,-5,-8,-11,21,37,-5,-33,-14,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-25,-12,-3,-17,-21,-13,-9,-6,-9,-7,-13,12,-7,-4,-8,-7,-10,-26,-14,-8;
MA   /M: M=-10,-4,-23,-4,0,-11,-11,-5,-17,-2,-15,-10,-1,-13,-4,-1,-4,-6,-16,-16,-4,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-32,-26,-23,34,-28,7,-4,-15,-2,-3,-23,-30,-16,-13,-23,-13,-12,45,63,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-19,-19,-25,-16,-5,-23,-11,11,-8,13,26,-17,-21,-6,-3,-16,-7,7,-22,-5,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-12,-15,-7,-21,1,-18,-13,-10,-16,-13,-5,-6,-8,-18,16,4,-4,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-38,-11,-1,-28,-20,-20,-17,-11,-27,-18,-18,80,-10,-20,-10,-9,-27,-30,-28,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,20,58,-30,-19,0,-30,10,-20,-20,2,-1,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-23,-1,-28,-24,21,-20,12,8,-23,-25,-19,-18,-13,-5,23,-18,-5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-12,-29,-22,0,-26,-20,17,-25,20,11,-21,-26,-18,-20,-18,-9,13,-23,-5,-22;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-6,-12,-6,-1,-4,-12,-2,-2,-2,1,3,-6,-9,2,1,-5,-4,-2,-11,-3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: M=-3,-3,-23,-5,-4,-13,-1,-11,-16,-5,-11,-8,-1,-16,-6,-6,-1,-5,-14,-22,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-15,-6,-6,-14,-4,1,-19,-4,-19,-11,6,-19,-3,-2,1,-5,-16,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-25,0,5,-21,-12,-4,-21,7,-17,-10,2,-12,4,10,-2,-4,-17,-25,-12,3;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-27,-9,-8,-17,5,-8,-18,-9,-16,-9,-7,-3,-6,-10,-4,-8,-17,-19,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-9,-26,-8,-11,5,-23,15,-7,-11,-6,-3,-9,-23,-7,-11,-11,-9,-9,-1,31,-11;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-18,4,-4,-21,2,-12,-21,-9,-21,-17,7,-11,-7,-10,16,12,-14,-32,-18,-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: M=-7,-8,-24,-9,-3,-9,-15,-5,-15,-2,-14,-8,-4,-5,-5,-2,-3,-1,-12,-21,-6,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-26,-3,9,-25,-15,-7,-23,16,-22,-11,-2,-2,8,13,0,-5,-19,-25,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-7,-17,-15,-12,-14,-21,2,-16,-6,-4,-10,-19,-15,-18,6,4,11,-30,-15,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-30,68,19,-40,-10,0,-39,0,-30,-30,19,-10,0,-10,0,-10,-29,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-34,-27,2,-31,-24,28,-22,14,17,-26,-25,-21,-21,-18,-7,26,-6,1,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-42,-34,-25,21,-23,-18,-14,-18,-12,-14,-32,-29,-19,-17,-32,-23,-22,104,39,-20;
MA   /M: SY='S'; M=19,-3,-10,-6,-3,-19,-1,-13,-16,-11,-22,-16,4,-11,-3,-13,30,14,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-16,-29,-22,14,-28,-16,14,-24,28,15,-25,-28,-20,-18,-21,-7,10,-14,8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-28,-12,-19,-28,60,-20,-35,-19,-27,-18,-2,-19,-19,-20,1,-18,-25,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,12,-31,-26,-4,-30,-26,16,-25,8,6,-23,-28,-23,-24,-12,-6,20,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-19,-29,-23,0,-30,-24,25,-22,15,14,-19,-22,-19,-20,-10,5,23,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-18,-30,-21,10,-27,-20,18,-25,33,18,-25,-26,-19,-19,-21,-5,13,-19,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-24,-26,-28,-22,18,-26,-6,7,-18,6,3,-22,-26,-17,-17,-18,-9,1,17,32,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-18,7,27,-22,-20,2,-21,1,-17,-13,-2,-10,9,-5,-1,-6,-20,-27,-10,17;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-15,-30,-20,5,-25,-13,17,-21,29,30,-24,-25,-13,-17,-22,-9,9,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-11,-27,-20,6,-25,-19,11,-22,19,10,-19,-24,-18,-19,-14,-3,9,-20,-2,-19;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-8,-11,-7,-9,-15,-12,-11,-10,-8,-8,-6,-16,-8,-9,4,12,-4,-23,-6,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-25,-5,-11,-24,38,-14,-31,-6,-24,-15,2,-16,-11,-6,-1,-12,-23,-19,-21,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-23,-2,6,-15,-15,-2,-20,9,-17,-9,1,-13,7,13,-1,-4,-16,-20,-7,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-26,-12,-3,-10,-21,-10,-8,-11,-7,-6,-12,15,-8,-12,-7,-3,-11,-24,-10,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-35,-14,-5,-23,-22,-21,-12,-10,-22,-14,-20,65,-12,-19,-11,-9,-18,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-21,-32,-25,49,-27,-14,-1,-24,5,-1,-18,-28,-27,-17,-19,-10,-4,16,28,-24;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-26,1,3,-18,-12,-5,-21,-5,-20,-14,-4,7,0,-8,-4,-8,-21,-20,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,4,-24,6,1,-25,9,-5,-25,-6,-20,-15,3,-9,-3,-7,1,-7,-20,-25,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-2,-16,-1,0,-9,-11,1,-5,-5,-5,-1,-1,-4,-3,-6,-5,-5,-6,-17,-5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-27,10,8,-24,-4,-6,-24,3,-21,-14,5,-10,2,4,-2,-8,-21,-28,-17,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-24,7,5,-25,-12,-1,-20,0,-19,-11,5,-7,8,-3,3,0,-18,-28,-13,6;
MA   /M: M=-6,-7,-21,-8,-4,-15,-15,-7,-10,-5,-8,-3,-6,-8,-1,-3,-4,-3,-10,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-24,-3,1,-13,-17,-2,-14,-1,-12,-6,-4,-14,-1,-2,-4,-7,-12,-17,-5,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-26,0,10,-24,-16,8,-21,8,-18,-7,4,-11,13,9,-2,-6,-19,-26,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-23,-29,-19,3,-30,-22,22,-22,17,12,-19,-18,-17,-21,-15,-3,14,-20,-2,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-20,-20,-24,-19,10,-27,-6,11,-21,10,6,-16,-24,-16,-18,-14,-8,6,-13,12,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-22,2,8,-20,-13,-6,-22,6,-18,-13,2,-12,4,9,-1,-3,-18,-25,-12,5;
MA   /M: M=-3,-7,-22,-10,-6,-14,-15,-9,-5,-2,-8,-1,-3,-17,-3,-4,-3,-3,-4,-24,-8,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-22,-23,-16,-6,-19,-19,13,-19,10,8,-17,-19,-13,-19,-13,-9,8,-21,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-25,-10,-5,-15,-11,-11,-13,1,-9,-2,-8,-12,-3,3,-8,-6,-10,-20,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-22,-3,1,-18,-15,-5,-18,2,-16,-11,-1,-7,0,3,1,-2,-15,-25,-10,-1;
MA   /M: M=-6,-10,-18,-11,-10,-13,-1,-9,-16,-13,-14,-10,-7,-10,-11,-12,-4,-6,-13,-19,-9,-12;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6;
MA   /M: M=-9,-4,-25,-2,-4,-13,-18,-8,-10,-2,-12,-7,-7,-11,-7,-5,-7,-5,-6,-16,-3,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-24,-14,-7,-5,-22,-4,-3,-5,-3,1,-9,-16,-5,1,-10,-8,-4,-14,2,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-24,-4,3,-13,-18,-3,-10,-1,-8,-1,-5,-5,0,-2,-7,-7,-10,-22,-7,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-23,-5,2,-12,-15,-8,-11,-4,-12,-9,-7,14,-3,-5,-5,-6,-13,-17,-10,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-3,-17,-2,-1,-16,-14,-10,-13,-6,-12,-9,-2,-8,-2,-6,1,-1,-10,-27,-12,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-19,-15,-9,-6,-16,-14,-5,-12,-4,-3,-11,2,-11,-11,-7,-4,-8,-19,-8,-11; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-26,-2,2,-19,-14,-8,-17,0,-18,-12,-7,18,-2,-3,-4,-6,-17,-20,-13,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-7,-17,-7,-2,-11,-14,-7,-10,-3,-6,-5,-6,-6,-3,-3,-5,-2,-9,-19,-6,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-8,-16,-8,-5,-2,-15,-6,-7,-7,-6,-6,-8,-6,-7,-7,-6,-5,-6,-6,0,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,3,-13,4,2,-11,-7,-1,-9,-2,-8,-6,2,-5,-1,-3,0,-2,-8,-15,-6,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-3,-3,-13,-5,-2,-7,-7,-7,-4,-2,-5,-3,-2,-5,-3,-1,-3,-3,-4,-12,-6,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-11,-23,-19,3,-19,-17,2,-19,6,2,-19,-23,-18,-17,-13,-6,4,-14,2,-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-16,-2,0,-20,-9,-7,-16,-8,-20,-12,2,-3,-1,-9,16,8,-12,-33,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,1,6,-23,-15,-8,-19,4,-19,-11,-1,-1,4,-1,2,-1,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,7,20,-22,-12,-6,-23,1,-18,-13,0,-7,5,-4,-1,-7,-20,-23,-14,12;
MA   /M: SY='L'; M=6,-20,-7,-25,-18,-2,-17,-18,3,-19,9,4,-18,-23,-16,-19,-11,-6,5,-18,-6,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-19,-8,-3,-15,-18,-6,-16,7,-14,-7,-2,-17,1,9,-6,-4,-12,-21,-6,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-26,22,13,-28,-9,2,-28,3,-23,-17,10,-12,4,0,4,-5,-22,-32,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-32,-23,21,-30,-22,18,-26,27,13,-24,-27,-23,-20,-20,-6,14,-15,4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-17,-32,-25,1,-30,-24,27,-25,25,17,-24,-26,-20,-21,-20,-8,21,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-20,-1,3,-19,-12,-9,-18,4,-17,-11,2,-14,2,5,3,0,-13,-28,-14,2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-25,2,8,-25,-13,-5,-26,13,-22,-13,0,-14,8,13,-4,-9,-21,-16,-12,8;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-21,26,-27,-21,-5,-26,-19,1,-23,10,9,-19,-28,-17,-21,-15,-8,2,-31,-12,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-23,13,-28,-23,12,-27,26,10,-27,-28,-21,-21,-25,-10,5,5,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-20,3,8,-23,-16,-5,-17,1,-15,-10,-3,-11,3,0,-2,-5,-12,-28,-14,4;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-25,-9,-4,-12,-23,-3,-9,5,-8,-3,-9,-10,-4,5,-10,-7,-6,-20,-1,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,28,-25,30,11,-27,-10,2,-27,3,-26,-21,23,-12,2,-1,4,-4,-25,-34,-15,6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-32,-13,-3,-22,-18,-15,-14,-8,-20,-11,-17,48,-8,-15,-8,-8,-18,-26,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-24,6,13,-23,-11,-3,-21,2,-18,-13,4,-12,7,-1,3,-4,-18,-26,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-21,7,9,-23,-15,-3,-22,7,-19,-13,5,-13,4,4,2,-3,-17,-29,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-29,-20,-11,-13,-22,-19,0,-17,-3,-3,-20,26,-12,-20,-13,-9,-9,-21,-13,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-17,0,-4,-19,0,-12,-19,-9,-19,-14,5,-11,-6,-9,17,14,-12,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-13,-24,-17,2,-17,-19,3,-18,1,1,-12,-17,-16,-18,-4,-2,4,-18,-6,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,-3,3,-21,-8,-5,-18,2,-14,-8,1,-9,1,2,-3,-6,-16,-26,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-22,5,23,-28,-15,-3,-23,3,-20,-13,-2,-2,16,-3,-1,-7,-23,-27,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=4,-20,-17,-25,-18,-4,-21,-20,13,-21,18,8,-18,-22,-16,-19,-14,-7,11,-23,-8,-18;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-17,-22,-17,2,-12,-15,5,-19,18,11,-18,-23,-15,-13,-16,-9,4,-18,-4,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-18,-1,8,-20,-14,-5,-17,7,-14,-9,0,-12,3,4,-1,-4,-11,-24,-12,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,1,0,-17,-20,47,-19,-9,-14,-2,3,-18,4,-5,-6,-10,-17,-28,7,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-29,-9,0,-20,-18,-14,-10,-9,-14,-10,-14,23,-6,-14,-6,-7,-12,-26,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-23,-29,-21,28,-24,-14,-7,-20,-1,-5,-20,-26,-22,-15,-17,-8,-7,27,19,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-32,-24,26,-29,-20,15,-26,21,11,-22,-25,-25,-19,-21,-9,10,-9,8,-24;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=P_Bucher, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00100;
//
ID   PROTEIN_KINASE_ST_MP; MATRIX.
AC   MP00108;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine/Threonine protein kinases active-site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=259;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=254;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2664; R2=0.014134; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=447; N_SCORE=8.583; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=299; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-29,-23,32,-29,-7,5,-19,8,3,-21,-29,-21,-15,-21,-10,1,15,35,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-21,-2,11,-23,-18,-2,-17,8,-16,-8,0,-13,9,6,-1,-4,-14,-27,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-23,-16,-8,-2,-23,-15,1,-9,7,2,-11,-17,-10,-6,-12,-6,-1,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-22,-17,-15,-6,-14,-17,5,-16,7,3,-14,-22,-15,-15,-11,-6,7,-23,-7,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,6,12,-25,-16,-3,-23,10,-20,-12,1,-10,8,11,0,-4,-17,-28,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-11,-21,-13,-5,-8,-24,-15,-5,2,-5,-3,-10,-16,-7,1,-8,-1,0,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-33,-24,7,-33,-24,29,-27,29,17,-24,-25,-21,-23,-22,-9,19,-19,0,-24;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-29,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-17,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-1,-20,-2,9,-24,-11,-5,-22,8,-22,-13,2,-12,10,9,8,-1,-17,-27,-14,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-16,-6,-2,-21,6,-13,-21,-6,-21,-15,2,-14,-5,-8,11,1,-13,-28,-19,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-20,-30,-23,52,-21,-13,-4,-23,1,-2,-13,-26,-28,-17,-10,-6,-4,2,24,-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-26,-9,-16,-27,51,-14,-34,-17,-28,-19,1,-18,-15,-18,6,-13,-25,-23,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-17,-4,4,-20,-18,-10,-14,4,-16,-8,-4,-14,1,1,2,1,-7,-27,-12,2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-7,-29,-29,-2,-29,-29,27,-20,8,8,-27,-29,-28,-20,-8,0,44,-30,-11,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-22,-21,-25,-19,22,-28,-5,0,-10,1,1,-19,-27,-16,-7,-18,-10,-1,8,32,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-26,-11,1,-15,-21,-11,-10,10,-3,0,-9,-16,3,9,-11,-7,-9,-21,-8,2;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-1,-20,-15,-17,0,-21,-9,-15,-10,-8,-13,-19,-15,-20,1,-5,2,-25,-18,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-25,-10,-2,-14,-22,-8,-7,6,-8,-2,-7,-16,2,5,-7,-2,-6,-20,-2,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-28,5,1,-17,-16,8,-21,2,-15,-10,5,-18,0,3,-8,-10,-21,-12,-3,0;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-10,-24,-12,-6,-13,-22,-6,-3,3,-7,0,-6,-15,-5,2,-8,-6,-1,-23,-6,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-1,-19,0,1,-15,-9,-6,-13,-5,-12,-9,-2,-5,-2,-7,2,2,-11,-23,-9,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='B'; M=-5,13,-18,13,2,-20,-9,-6,-18,-2,-17,-13,9,-11,-2,-6,6,9,-13,-28,-13,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; MD=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-22,0,-6,-23,21,-12,-28,-5,-24,-16,6,-14,-8,-7,3,-6,-22,-24,-20,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-22,-3,10,-20,-19,-5,-16,8,-12,-6,-3,-14,9,8,-5,-6,-14,-25,-11,9;
MA   /M: M=-11,-11,-26,-11,-6,-12,-25,-7,-2,-3,-5,-1,-10,-11,-5,0,-10,-5,-2,-23,-4,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-26,-15,-27,-26,14,-29,-14,17,-18,10,9,-24,-29,-23,-17,-15,-5,24,-12,16,-25;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-8,-21,-12,-18,-4,-21,-7,-11,-9,-8,-12,-11,-12,-20,7,0,4,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-17,-31,-25,-3,-27,-24,26,-19,12,15,-22,-24,-19,-18,-14,-6,27,-24,-7,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-23,-20,-9,-10,-29,-15,11,-6,2,6,-13,-18,-6,-6,-12,-6,7,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-22,-29,-19,5,-31,-21,24,-23,22,16,-22,-24,-17,-20,-18,-7,19,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-24,3,4,-22,-15,1,-23,13,-23,-13,8,-6,2,10,-3,-6,-21,-27,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-25,-12,-5,-12,-22,-8,-7,6,-9,-3,-8,-12,-2,2,-8,-5,-6,-18,1,-5;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-21,3,5,-21,-16,-9,-16,4,-16,-11,-3,-8,0,-1,-3,-4,-11,-23,-12,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-19,-1,0,-14,-11,-8,-14,-2,-11,-8,-1,-11,-2,-2,1,1,-10,-22,-10,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-8,-21,-9,-1,-10,-16,-7,-5,-2,-5,1,-7,-7,-1,-3,-6,-5,-6,-16,-6,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-1,0,-15,-3,-3,-13,-4,-7,-8,-2,-11,-6,4,-5,-3,-5,2,-1,-7,-20,-11,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-14,-1,2,-11,-10,-6,-10,1,-11,-6,-1,-4,0,-1,3,2,-7,-16,-7,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-14,-1,1,-10,-8,-4,-11,4,-9,-5,-1,-7,1,3,-3,-3,-9,-11,-6,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-25,4,8,-20,-11,-5,-18,0,-14,-9,0,-13,6,-2,-1,-4,-16,-24,-9,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-18,-9,-2,-15,-20,-4,-13,1,-11,-6,-6,-11,-3,4,-7,-7,-10,-26,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-27,4,15,-25,-15,-2,-22,8,-20,-12,4,-9,13,4,-1,-6,-22,-20,-12,14;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-19,-9,0,-16,-18,-3,-16,5,-13,-4,-3,-14,6,7,-4,-5,-13,-23,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=1,-18,-18,-24,-18,6,-22,-19,8,-19,8,3,-14,-20,-16,-17,-5,3,7,-19,-1,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-10,-25,-11,-1,-11,-21,-7,-5,-5,1,2,-10,-16,0,-2,-10,-6,-7,-18,-5,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-22,-6,-3,-16,-14,-2,-14,5,-14,-6,5,-18,3,14,-1,-4,-12,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=1,-22,-18,-26,-18,-4,-25,-21,15,-15,10,7,-19,-22,-15,-13,-12,-6,15,-21,-5,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-21,-2,1,-17,-14,-3,-17,5,-17,-8,2,-16,7,4,0,-4,-15,-21,-4,3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-21,-29,-23,1,-29,-22,24,-20,15,11,-21,-23,-19,-19,-14,-6,21,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-17,-22,-16,-1,-22,-2,6,-20,23,16,-19,-26,-11,-14,-21,-11,2,-22,0,-14;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-23,-8,0,-18,-14,-7,-14,6,-15,-7,0,-12,2,6,0,-2,-11,-23,-10,0;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-23,-5,-1,-15,-12,-4,-12,1,-11,-7,3,-16,-1,1,-2,-4,-11,-25,-8,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-16,-26,-19,3,-25,-19,16,-20,25,15,-23,-25,-17,-15,-18,-6,13,-22,-4,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,11,-27,10,2,-26,-1,0,-29,9,-27,-16,15,-12,3,11,-1,-8,-25,-28,-15,1;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-26,-1,-2,-17,-14,72,-29,-10,-21,-4,9,-18,5,-2,-6,-16,-27,-29,11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-29,-1,7,-26,-18,-14,-18,-6,-22,-16,-10,38,-4,-12,-4,-7,-20,-31,-23,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-13,18,-21,6,-5,-8,-6,17,-20,-5,-23,-14,32,-22,-4,-3,0,-7,-25,-25,-3,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-27,1,-36,-28,39,-26,21,17,-22,-23,-21,-25,-18,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-12,-29,-25,-3,-29,-27,24,-22,10,8,-24,-20,-23,-22,-11,-1,30,-27,-9,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-24,-2,7,-23,-15,0,-22,11,-19,-9,3,-12,12,16,-2,-5,-20,-24,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-22,-30,-22,22,-30,-15,14,-23,26,13,-24,-28,-21,-15,-22,-8,9,-9,15,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-21,-20,-15,6,-26,9,0,-13,4,4,-12,-25,-10,-9,-16,-11,-5,-7,21,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-24,6,-2,-19,11,-6,-28,-9,-22,-17,1,-17,-9,-11,-2,-10,-21,-18,-10,-6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-8,-21,-15,-6,-16,-16,-1,-14,-5,-1,-12,-19,-12,-16,0,0,3,-17,-4,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-11,-23,-17,15,-22,-16,-2,-18,-2,-3,-16,-24,-19,-17,-13,-9,-2,-1,8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-22,-2,8,-17,-20,-1,-15,2,-12,-7,-3,-14,6,1,-2,-1,-13,-23,-5,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-23,3,8,-19,-16,-9,-17,0,-14,-12,-1,-11,-1,-1,2,4,-12,-26,-13,3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-26,2,3,-23,-1,-11,-23,-1,-24,-16,1,4,-3,-5,1,-5,-21,-23,-18,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-26,14,4,-26,2,-5,-27,-2,-22,-17,8,-11,-1,-4,2,-6,-22,-29,-17,1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,1,-23,1,3,-13,-18,10,-19,0,-16,-8,2,-10,2,0,-3,-4,-19,-22,0,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-25,-20,2,-27,-16,16,-23,19,10,-19,-18,-18,-19,-19,-9,9,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-19,-20,-16,11,-25,-2,-3,-15,-2,-3,-16,-26,-13,-14,-15,-8,-6,12,30,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-33,-24,7,-31,-21,29,-25,28,22,-24,-25,-18,-22,-22,-9,19,-19,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-17,-27,-23,1,-30,-23,23,-21,11,9,-22,-25,-19,-20,-13,-5,27,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-19,-24,-18,6,-20,-10,8,-16,14,23,-15,-21,-10,-13,-12,1,4,-19,1,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-30,21,42,-30,-17,-2,-29,6,-22,-19,2,-2,16,-3,0,-10,-28,-24,-18,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-24,-25,-20,24,-28,2,0,-16,9,2,-21,-28,-16,-10,-21,-11,-6,13,38,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-21,30,-26,-24,-9,-21,-16,-4,-22,0,4,-19,-28,-19,-21,-12,-9,3,-31,-12,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,6,11,-25,-4,-7,-24,-1,-23,-17,4,4,0,-6,2,-5,-22,-30,-20,4;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-24,-4,-9,-19,19,-8,-24,-7,-20,-12,6,-17,-9,-9,-3,-11,-21,-22,-15,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-24,-8,-12,-24,41,-15,-29,-12,-23,-15,-1,-13,-12,-10,0,-13,-22,-18,-22,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-17,23,13,-27,-10,-6,-26,-4,-26,-21,11,-8,2,-8,16,8,-19,-37,-19,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-30,-21,11,-29,-20,18,-28,43,19,-28,-29,-20,-19,-26,-8,11,-19,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-11,-22,-13,-7,7,-20,-3,-8,-9,-2,-1,-9,-20,-7,-6,-8,-6,-8,-12,7,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-25,19,12,-26,-14,-3,-25,5,-21,-15,5,-11,7,1,2,-2,-20,-25,-12,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-24,-23,-17,12,-25,-4,2,-14,5,4,-17,-25,-14,-8,-16,-9,0,-1,16,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-23,-32,-24,7,-31,-20,24,-25,27,15,-25,-27,-20,-20,-23,-9,17,-12,4,-23;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-23,-1,3,-18,-15,-1,-18,9,-18,-8,3,-14,3,8,1,0,-13,-25,-9,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-23,3,7,-22,-11,-3,-22,6,-20,-12,2,-13,6,6,3,-2,-16,-26,-12,6;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-17,-3,3,-17,-13,6,-20,1,-16,-9,2,-15,3,5,-5,-9,-18,-24,-7,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-23,-2,-3,-20,5,-10,-21,4,-20,-12,3,-15,-5,-1,0,-6,-14,-24,-15,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: M=-4,-7,-17,-8,-7,-11,-8,-8,-10,-3,-11,-6,-4,-12,-5,-1,-2,-3,-7,-19,-6,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-8; MD=-8; IM=-8; DM=-8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-13,-5,-3,-6,-9,0,-7,-1,-4,-3,2,-10,-1,3,-3,-1,-7,-13,-3,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-31,-21,18,-26,-17,15,-24,21,15,-21,-25,-18,-19,-19,-9,8,-13,6,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-5,2,-22,1,3,-21,-11,-7,-20,1,-21,-13,4,-4,3,1,9,7,-16,-28,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-29,0,20,-17,-19,-7,-17,-2,-13,-10,-8,-7,4,-7,-7,-10,-19,-6,-7,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-27,-1,4,-15,-10,-3,-19,-4,-16,-11,-3,-6,-1,-8,-5,-8,-18,-16,-7,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-26,4,10,-17,-17,2,-16,-4,-10,-7,-2,-12,6,-5,-4,-4,-17,-24,-6,7;
MA   /M: SY='I'; M=2,-22,-15,-27,-20,-5,-25,-22,15,-18,10,7,-18,-19,-16,-15,-10,-3,14,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-16,-18,-10,-10,-20,-14,-11,4,-7,-3,-12,-22,-6,11,-12,-9,-6,-13,-7,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-21,-7,-6,0,-17,-6,-17,2,-14,-8,-2,-19,-8,2,-5,-5,-12,-15,1,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-27,-20,-32,-26,19,-32,-13,18,-23,14,10,-23,-27,-21,-20,-21,-10,11,1,23,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-19,-12,-25,-18,5,-17,-20,3,-20,7,3,-16,-21,-18,-19,-5,0,5,-16,-5,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-12,-23,-13,-6,-6,-18,-5,-10,-3,-6,-5,-10,-19,-4,2,-7,-5,-7,-10,3,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-26,6,21,-34,-12,5,-25,5,-21,-9,2,-10,32,4,1,-9,-27,-25,-14,26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-32,-26,1,-32,-25,32,-24,21,18,-22,-23,-20,-22,-16,-2,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-1,-27,-20,-4,-20,-23,8,-22,12,3,-20,-24,-19,-22,-10,-4,10,-25,-11,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-24,0,6,-20,-16,-6,-17,8,-13,-7,1,-14,5,10,-1,-3,-15,-27,-12,5;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-21,-14,-16,-24,34,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-16,-15,-17,4,-9,-14,-21,-24,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-31,-23,7,-29,-22,24,-25,30,19,-26,-27,-20,-20,-20,-6,20,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-22,5,7,-20,-14,-4,-18,2,-15,-11,4,-14,3,-2,-2,-6,-16,-24,-9,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-16,-27,-19,-15,24,-26,25,-7,-13,-3,-1,-12,-26,-11,-9,-15,-11,-12,7,47,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-3,-31,-23,3,-30,-22,18,-28,31,16,-27,-29,-21,-22,-23,-9,14,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-29,0,1,-20,-19,84,-28,-8,-19,-2,9,-19,9,0,-8,-18,-28,-28,16,1;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-19,4,5,-23,-7,-3,-23,2,-25,-16,7,-12,5,3,16,5,-16,-31,-14,4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-23,-5,0,-20,-16,-1,-15,9,-12,-1,1,-17,6,8,-8,-9,-14,-21,-9,2;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-27,-2,-6,-24,16,-8,-29,0,-27,-17,9,-11,-6,1,0,-9,-25,-23,-19,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-18,-35,-28,5,-35,-26,34,-26,19,14,-24,-26,-23,-25,-18,-7,28,-20,2,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-18,-32,-26,1,-32,-25,31,-24,19,15,-24,-25,-22,-23,-16,-5,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,-2,-15,-21,92,-27,-10,-18,0,7,-21,8,-1,-11,-19,-28,-24,26,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-25,-11,-3,-18,-18,0,-25,20,-15,-7,0,-21,6,52,-9,-8,-18,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,37,20,-26,-26,-20,-23,-25,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-29,-1,9,-29,-19,-10,-29,46,-29,-10,0,-10,9,29,-8,-9,-19,-20,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-32,-11,-4,-24,-14,-19,-15,-13,-19,-15,-16,52,-10,-19,-5,-6,-21,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,8,-24,12,17,-28,-6,-3,-26,2,-23,-17,4,-9,8,-1,7,-4,-21,-29,-18,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-37,-29,6,-36,-28,38,-28,20,16,-23,-24,-23,-26,-19,-8,28,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-32,-23,19,-29,-19,18,-27,36,20,-27,-29,-22,-19,-25,-9,13,-16,4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-34,-25,13,-32,-24,26,-28,30,17,-26,-27,-23,-23,-23,-9,19,-19,1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-18,22,1,-26,-5,-6,-24,-3,-23,-17,12,-15,-5,-8,4,-2,-16,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-24,4,10,-19,-17,2,-19,2,-17,-10,5,-11,5,3,2,-1,-17,-27,-9,6;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-5,9,-18,8,8,-24,-7,-2,-24,1,-22,-16,9,-9,3,-1,4,-1,-21,-30,-17,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-23,-10,-13,-17,14,-12,-18,-12,-12,-8,-2,-16,-11,-10,-5,-10,-16,-23,-16,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-21,-4,1,-13,-20,6,-14,0,-11,-4,-1,-16,1,1,-4,-1,-11,-24,-3,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-9,-30,-24,-3,-27,-26,19,-23,11,7,-24,-18,-23,-23,-14,-6,21,-26,-9,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-22,-6,3,-22,-22,-11,-22,32,-22,-7,-5,-15,4,21,-10,-9,-13,-21,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,1,-21,-19,-15,-4,-23,-5,-19,-9,-7,-10,-20,-17,-21,2,1,2,-28,-17,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-39,-29,73,-30,-20,1,-30,12,1,-21,-30,-38,-20,-21,-10,0,11,28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-17,-28,-20,8,-27,-17,15,-26,30,14,-23,-27,-18,-19,-19,-7,10,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,4,-16,-11,-19,-5,-15,-13,-13,-15,-12,-7,-16,-11,-18,12,3,-1,-29,-19,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-19,-7,0,-19,-17,-11,-18,14,-16,-9,-1,-15,0,14,-2,0,-11,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-7,1,-14,-22,-9,-10,6,-7,-3,-6,-17,3,9,-9,-7,-7,-22,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-22,-24,-17,5,-24,-13,10,-18,14,10,-19,-23,-14,-16,-15,-7,6,-13,5,-16;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,5,-25,6,5,-23,-10,-1,-18,0,-19,-10,5,-5,2,-3,1,-4,-17,-29,-14,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-24,5,3,-19,-10,-5,-19,-1,-19,-13,2,-1,-1,-2,1,-4,-16,-25,-11,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-22,7,2,-20,1,-2,-22,-6,-18,-14,6,-7,-3,-7,2,-3,-19,-22,-12,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-18,-4,2,-13,-6,-6,-11,-2,-7,-4,-2,-12,0,-2,-3,-4,-9,-19,-10,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-11; MD=-11; IM=-11; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-3,1,-11,1,2,-12,-6,-4,-13,-1,-12,-9,1,-5,-1,-3,4,2,-9,-17,-7,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-24,-5,3,-15,-15,-2,-17,6,-16,-7,-1,-11,2,6,-3,-5,-13,-24,-9,1;
MA   /M: M=0,-10,-19,-12,-7,-12,-16,-10,-9,-5,-4,-4,-9,-12,-7,-3,-6,-2,-6,-20,-7,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-23,-2,-1,-16,-11,2,-19,-1,-17,-9,4,-16,2,-1,2,1,-16,-19,-5,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-19,-4,-4,-18,-6,-10,-16,-7,-18,-12,2,-8,-5,-8,8,10,-10,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-17,-17,-20,-12,3,-20,-14,-2,-12,0,0,-13,-18,-11,-8,-9,-6,-2,-18,-1,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,8,-21,-17,-8,-21,-23,-2,-13,-6,-4,-16,-25,-18,-14,-7,-4,10,-29,-13,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-25,-13,-20,-22,53,-20,-32,-20,-24,-17,-3,-21,-21,-20,-1,-17,-23,-20,-25,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-5,-7,-15,-16,-17,-14,-10,-16,-13,1,-5,-8,-11,21,37,-5,-33,-14,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-25,-12,-3,-17,-21,-13,-9,-6,-9,-7,-13,12,-7,-4,-8,-7,-10,-26,-14,-8;
MA   /M: M=-10,-4,-23,-4,0,-11,-11,-5,-17,-2,-15,-10,-1,-13,-4,-1,-4,-6,-16,-16,-4,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-32,-26,-23,34,-28,7,-4,-15,-2,-3,-23,-30,-16,-13,-23,-13,-12,45,63,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-19,-19,-25,-16,-5,-23,-11,11,-8,13,26,-17,-21,-6,-3,-16,-7,7,-22,-5,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-12,-15,-7,-21,1,-18,-13,-10,-16,-13,-5,-6,-8,-18,16,4,-4,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-38,-11,-1,-28,-20,-20,-17,-11,-27,-18,-18,80,-10,-20,-10,-9,-27,-30,-28,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,20,58,-30,-19,0,-30,10,-20,-20,2,-1,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-23,-1,-28,-24,21,-20,12,8,-23,-25,-19,-18,-13,-5,23,-18,-5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-12,-29,-22,0,-26,-20,17,-25,20,11,-21,-26,-18,-20,-18,-9,13,-23,-5,-22;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-6,-12,-6,-1,-4,-12,-2,-2,-2,1,3,-6,-9,2,1,-5,-4,-2,-11,-3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: M=-3,-3,-23,-5,-4,-13,-1,-11,-16,-5,-11,-8,-1,-16,-6,-6,-1,-5,-14,-22,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-15,-6,-6,-14,-4,1,-19,-4,-19,-11,6,-19,-3,-2,1,-5,-16,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-25,0,5,-21,-12,-4,-21,7,-17,-10,2,-12,4,10,-2,-4,-17,-25,-12,3;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-27,-9,-8,-17,5,-8,-18,-9,-16,-9,-7,-3,-6,-10,-4,-8,-17,-19,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-9,-26,-8,-11,5,-23,15,-7,-11,-6,-3,-9,-23,-7,-11,-11,-9,-9,-1,31,-11;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-18,4,-4,-21,2,-12,-21,-9,-21,-17,7,-11,-7,-10,16,12,-14,-32,-18,-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: M=-7,-8,-24,-9,-3,-9,-15,-5,-15,-2,-14,-8,-4,-5,-5,-2,-3,-1,-12,-21,-6,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-26,-3,9,-25,-15,-7,-23,16,-22,-11,-2,-2,8,13,0,-5,-19,-25,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-7,-17,-15,-12,-14,-21,2,-16,-6,-4,-10,-19,-15,-18,6,4,11,-30,-15,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-30,68,19,-40,-10,0,-39,0,-30,-30,19,-10,0,-10,0,-10,-29,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-34,-27,2,-31,-24,28,-22,14,17,-26,-25,-21,-21,-18,-7,26,-6,1,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-42,-34,-25,21,-23,-18,-14,-18,-12,-14,-32,-29,-19,-17,-32,-23,-22,104,39,-20;
MA   /M: SY='S'; M=19,-3,-10,-6,-3,-19,-1,-13,-16,-11,-22,-16,4,-11,-3,-13,30,14,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-16,-29,-22,14,-28,-16,14,-24,28,15,-25,-28,-20,-18,-21,-7,10,-14,8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-28,-12,-19,-28,60,-20,-35,-19,-27,-18,-2,-19,-19,-20,1,-18,-25,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,12,-31,-26,-4,-30,-26,16,-25,8,6,-23,-28,-23,-24,-12,-6,20,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-19,-29,-23,0,-30,-24,25,-22,15,14,-19,-22,-19,-20,-10,5,23,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-18,-30,-21,10,-27,-20,18,-25,33,18,-25,-26,-19,-19,-21,-5,13,-19,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-24,-26,-28,-22,18,-26,-6,7,-18,6,3,-22,-26,-17,-17,-18,-9,1,17,32,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-18,7,27,-22,-20,2,-21,1,-17,-13,-2,-10,9,-5,-1,-6,-20,-27,-10,17;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-15,-30,-20,5,-25,-13,17,-21,29,30,-24,-25,-13,-17,-22,-9,9,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-11,-27,-20,6,-25,-19,11,-22,19,10,-19,-24,-18,-19,-14,-3,9,-20,-2,-19;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-8,-11,-7,-9,-15,-12,-11,-10,-8,-8,-6,-16,-8,-9,4,12,-4,-23,-6,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-25,-5,-11,-24,38,-14,-31,-6,-24,-15,2,-16,-11,-6,-1,-12,-23,-19,-21,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-23,-2,6,-15,-15,-2,-20,9,-17,-9,1,-13,7,13,-1,-4,-16,-20,-7,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-26,-12,-3,-10,-21,-10,-8,-11,-7,-6,-12,15,-8,-12,-7,-3,-11,-24,-10,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-35,-14,-5,-23,-22,-21,-12,-10,-22,-14,-20,65,-12,-19,-11,-9,-18,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-21,-32,-25,49,-27,-14,-1,-24,5,-1,-18,-28,-27,-17,-19,-10,-4,16,28,-24;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-26,1,3,-18,-12,-5,-21,-5,-20,-14,-4,7,0,-8,-4,-8,-21,-20,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,4,-24,6,1,-25,9,-5,-25,-6,-20,-15,3,-9,-3,-7,1,-7,-20,-25,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-2,-16,-1,0,-9,-11,1,-5,-5,-5,-1,-1,-4,-3,-6,-5,-5,-6,-17,-5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-27,10,8,-24,-4,-6,-24,3,-21,-14,5,-10,2,4,-2,-8,-21,-28,-17,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-24,7,5,-25,-12,-1,-20,0,-19,-11,5,-7,8,-3,3,0,-18,-28,-13,6;
MA   /M: M=-6,-7,-21,-8,-4,-15,-15,-7,-10,-5,-8,-3,-6,-8,-1,-3,-4,-3,-10,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-24,-3,1,-13,-17,-2,-14,-1,-12,-6,-4,-14,-1,-2,-4,-7,-12,-17,-5,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-26,0,10,-24,-16,8,-21,8,-18,-7,4,-11,13,9,-2,-6,-19,-26,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-23,-29,-19,3,-30,-22,22,-22,17,12,-19,-18,-17,-21,-15,-3,14,-20,-2,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-20,-20,-24,-19,10,-27,-6,11,-21,10,6,-16,-24,-16,-18,-14,-8,6,-13,12,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-22,2,8,-20,-13,-6,-22,6,-18,-13,2,-12,4,9,-1,-3,-18,-25,-12,5;
MA   /M: M=-3,-7,-22,-10,-6,-14,-15,-9,-5,-2,-8,-1,-3,-17,-3,-4,-3,-3,-4,-24,-8,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-22,-23,-16,-6,-19,-19,13,-19,10,8,-17,-19,-13,-19,-13,-9,8,-21,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-25,-10,-5,-15,-11,-11,-13,1,-9,-2,-8,-12,-3,3,-8,-6,-10,-20,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-22,-3,1,-18,-15,-5,-18,2,-16,-11,-1,-7,0,3,1,-2,-15,-25,-10,-1;
MA   /M: M=-6,-10,-18,-11,-10,-13,-1,-9,-16,-13,-14,-10,-7,-10,-11,-12,-4,-6,-13,-19,-9,-12;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6;
MA   /M: M=-9,-4,-25,-2,-4,-13,-18,-8,-10,-2,-12,-7,-7,-11,-7,-5,-7,-5,-6,-16,-3,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-24,-14,-7,-5,-22,-4,-3,-5,-3,1,-9,-16,-5,1,-10,-8,-4,-14,2,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-24,-4,3,-13,-18,-3,-10,-1,-8,-1,-5,-5,0,-2,-7,-7,-10,-22,-7,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-23,-5,2,-12,-15,-8,-11,-4,-12,-9,-7,14,-3,-5,-5,-6,-13,-17,-10,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-3,-17,-2,-1,-16,-14,-10,-13,-6,-12,-9,-2,-8,-2,-6,1,-1,-10,-27,-12,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-19,-15,-9,-6,-16,-14,-5,-12,-4,-3,-11,2,-11,-11,-7,-4,-8,-19,-8,-11; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-26,-2,2,-19,-14,-8,-17,0,-18,-12,-7,18,-2,-3,-4,-6,-17,-20,-13,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-7,-17,-7,-2,-11,-14,-7,-10,-3,-6,-5,-6,-6,-3,-3,-5,-2,-9,-19,-6,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-8,-16,-8,-5,-2,-15,-6,-7,-7,-6,-6,-8,-6,-7,-7,-6,-5,-6,-6,0,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,3,-13,4,2,-11,-7,-1,-9,-2,-8,-6,2,-5,-1,-3,0,-2,-8,-15,-6,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=-6; MD=-6; IM=-6; DM=-6;
MA   /M: M=-3,-3,-13,-5,-2,-7,-7,-7,-4,-2,-5,-3,-2,-5,-3,-1,-3,-3,-4,-12,-6,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-11,-23,-19,3,-19,-17,2,-19,6,2,-19,-23,-18,-17,-13,-6,4,-14,2,-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-16,-2,0,-20,-9,-7,-16,-8,-20,-12,2,-3,-1,-9,16,8,-12,-33,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,1,6,-23,-15,-8,-19,4,-19,-11,-1,-1,4,-1,2,-1,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,7,20,-22,-12,-6,-23,1,-18,-13,0,-7,5,-4,-1,-7,-20,-23,-14,12;
MA   /M: SY='L'; M=6,-20,-7,-25,-18,-2,-17,-18,3,-19,9,4,-18,-23,-16,-19,-11,-6,5,-18,-6,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-19,-8,-3,-15,-18,-6,-16,7,-14,-7,-2,-17,1,9,-6,-4,-12,-21,-6,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-26,22,13,-28,-9,2,-28,3,-23,-17,10,-12,4,0,4,-5,-22,-32,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-32,-23,21,-30,-22,18,-26,27,13,-24,-27,-23,-20,-20,-6,14,-15,4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-17,-32,-25,1,-30,-24,27,-25,25,17,-24,-26,-20,-21,-20,-8,21,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-20,-1,3,-19,-12,-9,-18,4,-17,-11,2,-14,2,5,3,0,-13,-28,-14,2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-25,2,8,-25,-13,-5,-26,13,-22,-13,0,-14,8,13,-4,-9,-21,-16,-12,8;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-21,26,-27,-21,-5,-26,-19,1,-23,10,9,-19,-28,-17,-21,-15,-8,2,-31,-12,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-23,13,-28,-23,12,-27,26,10,-27,-28,-21,-21,-25,-10,5,5,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-20,3,8,-23,-16,-5,-17,1,-15,-10,-3,-11,3,0,-2,-5,-12,-28,-14,4;
MA   /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-25,-9,-4,-12,-23,-3,-9,5,-8,-3,-9,-10,-4,5,-10,-7,-6,-20,-1,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,28,-25,30,11,-27,-10,2,-27,3,-26,-21,23,-12,2,-1,4,-4,-25,-34,-15,6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-32,-13,-3,-22,-18,-15,-14,-8,-20,-11,-17,48,-8,-15,-8,-8,-18,-26,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-24,6,13,-23,-11,-3,-21,2,-18,-13,4,-12,7,-1,3,-4,-18,-26,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-21,7,9,-23,-15,-3,-22,7,-19,-13,5,-13,4,4,2,-3,-17,-29,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-29,-20,-11,-13,-22,-19,0,-17,-3,-3,-20,26,-12,-20,-13,-9,-9,-21,-13,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-17,0,-4,-19,0,-12,-19,-9,-19,-14,5,-11,-6,-9,17,14,-12,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-13,-24,-17,2,-17,-19,3,-18,1,1,-12,-17,-16,-18,-4,-2,4,-18,-6,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,-3,3,-21,-8,-5,-18,2,-14,-8,1,-9,1,2,-3,-6,-16,-26,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-22,5,23,-28,-15,-3,-23,3,-20,-13,-2,-2,16,-3,-1,-7,-23,-27,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=4,-20,-17,-25,-18,-4,-21,-20,13,-21,18,8,-18,-22,-16,-19,-14,-7,11,-23,-8,-18;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-17,-22,-17,2,-12,-15,5,-19,18,11,-18,-23,-15,-13,-16,-9,4,-18,-4,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-18,-1,8,-20,-14,-5,-17,7,-14,-9,0,-12,3,4,-1,-4,-11,-24,-12,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,1,0,-17,-20,47,-19,-9,-14,-2,3,-18,4,-5,-6,-10,-17,-28,7,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-29,-9,0,-20,-18,-14,-10,-9,-14,-10,-14,23,-6,-14,-6,-7,-12,-26,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-23,-29,-21,28,-24,-14,-7,-20,-1,-5,-20,-26,-22,-15,-17,-8,-7,27,19,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-32,-24,26,-29,-20,15,-26,21,11,-22,-25,-25,-19,-21,-9,10,-9,8,-24;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=P_Bucher, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00100;
//
ID   PROTEIN_KINASE_TYR_MP; MATRIX.
AC   MP00109;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Tyrosine protein kinases specific active-site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2106190; R2=0.0174730; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=439; N_SCORE=13.865; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=17; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=7,-17,9,-24,-18,-11,-15,-20,-2,-18,2,2,-16,-22,-14,-19,-6,-4,2,-28,-14,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-17,-16,-9,-8,-18,-9,-5,-1,-3,-1,-10,-19,-4,6,-8,-6,-4,-14,-2,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,6,-28,8,18,-33,-15,3,-24,11,-22,-9,5,-11,32,10,0,-8,-26,-25,-13,24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-33,-26,2,-33,-26,33,-26,25,18,-25,-25,-21,-23,-19,-6,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-5,-21,-17,-17,5,-22,-10,-17,-7,-7,-11,-18,-16,-20,-1,-7,-3,-24,-19,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-18,5,9,-24,-14,-6,-22,4,-18,-12,3,-13,6,3,2,-4,-17,-26,-15,7;
MA   /M: SY='G'; M=17,-11,-22,-14,-13,-24,28,-18,-21,-14,-17,-11,-6,-16,-12,-18,2,-11,-14,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-25,-15,-31,-23,1,-27,-17,23,-21,24,28,-24,-24,-15,-18,-19,-7,19,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-24,-2,6,-22,-1,-8,-20,0,-17,-12,0,-13,1,-3,1,-7,-16,-24,-15,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-16,-27,-18,-14,20,-23,14,-9,-7,-4,-2,-13,-25,-11,-5,-16,-11,-12,7,40,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-17,-31,-21,7,-29,-18,21,-27,42,24,-28,-28,-18,-20,-27,-10,11,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-8,5,-26,3,9,-22,-13,47,-26,-4,-21,-9,11,-15,8,-2,-1,-11,-26,-27,1,6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,1,-24,1,3,-19,-9,-5,-23,4,-20,-13,4,-13,1,6,3,-3,-18,-21,-12,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-13,-6,-2,-19,-17,3,-17,6,-16,-5,5,-17,3,6,-5,-6,-15,-27,-9,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,6,-27,6,-1,-26,7,11,-31,0,-26,-14,11,-13,-1,3,-3,-12,-27,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-13,-34,-27,15,-33,-20,23,-24,14,12,-23,-27,-24,-22,-18,-8,19,-14,10,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-10,-32,-27,4,-32,-26,26,-25,14,11,-21,-26,-24,-23,-15,-5,26,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-22,-10,-7,-18,3,-8,-29,9,-21,-13,0,-20,-3,28,-4,-10,-20,-22,-15,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,8,-32,-23,27,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-5,-10,-12,-7,-17,-9,-16,-14,-6,-15,-12,-2,-12,-6,-5,16,18,-4,-27,-16,-7;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-12,-16,-10,-15,-10,-19,-9,-14,-8,-9,-10,-1,-12,-17,6,9,-4,-27,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-22,-4,2,-20,-10,-2,-23,10,-21,-10,3,-15,4,24,6,-1,-16,-27,-14,1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,8,-34,-28,-2,-33,-26,22,-27,13,12,-23,-28,-23,-25,-17,-8,21,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-23,13,-30,-19,22,-26,36,22,-27,-28,-20,-20,-25,-9,15,-18,2,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-20,-33,-25,7,-32,-24,29,-26,29,18,-27,-27,-22,-22,-21,-7,25,-21,0,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-20,4,-1,-22,-6,-9,-21,2,-20,-14,4,-14,-2,2,5,3,-13,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-23,10,7,-23,-10,9,-26,0,-22,-15,7,-11,2,1,3,-6,-20,-30,-11,3;
MA   /M: SY='B'; M=-7,10,-23,10,3,-24,-5,-2,-25,1,-23,-16,10,-10,1,-2,3,-3,-21,-28,-13,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: M=-9,0,-25,0,-2,-16,-8,-9,-16,-2,-9,-7,0,-13,-4,-1,-7,-7,-16,-25,-12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-18,-7,-6,-14,-16,-9,-9,-7,-9,-6,-3,-11,-7,-6,-1,3,-5,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-16,-18,-15,-10,-18,-18,5,-10,-4,1,-13,-17,-13,-12,-7,-5,11,-25,-10,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-9,-27,-11,-4,-15,-18,-15,-13,14,-16,-7,-7,-10,-3,6,-9,-8,-11,-12,-7,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-18,-23,-19,-6,-20,-18,12,-20,4,4,-14,-18,-16,-19,-8,-3,11,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-13,-1,-5,-20,-4,-14,-17,-11,-16,-13,-3,-8,-9,-14,4,1,-11,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-24,18,-1,-11,-11,-7,-22,-7,-17,-16,2,-17,-10,-11,-6,-10,-15,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-22,-25,-21,20,-14,-19,0,-20,6,0,-16,-23,-23,-16,-13,-8,2,-11,4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-21,-14,-17,-14,20,-19,-16,-20,-8,-8,-8,-19,-18,-18,-6,-12,-13,-22,-17,-18;
MA   /M: SY='L'; M=0,-12,-21,-13,-12,-9,-9,-14,-2,-16,8,4,-12,-19,-12,-15,-10,-7,-2,-24,-10,-12;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-18,-9,-8,-5,-10,-12,-12,-11,-10,-10,-4,-14,-10,-10,4,0,-7,-22,-8,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00100;
//
ID   PYRUVATE_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00110;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyruvate kinase active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5642719; R2=0.0131943; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=445; N_SCORE=10.426; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=147; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-16,1,-28,-3,5,-25,-17,4,-26,20,-22,-9,10,-18,21,44,-4,-8,-24,-23,-12,10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-15,-13,-5,-17,-5,-15,-10,-8,-12,-10,-10,17,-8,-15,3,-2,-7,-17,-17,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,7,-23,13,18,-21,-13,0,-24,13,-17,-13,3,-8,8,22,-3,-8,-19,-21,-12,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,57,16,-35,-11,-2,-33,-1,-26,-25,15,-11,0,-10,0,-9,-24,-36,-18,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-17,-32,-27,2,-31,-26,31,-24,22,17,-28,-28,-24,-21,-17,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-25,-4,-1,-17,-19,-3,-8,3,-8,-2,1,-17,-1,1,-8,-7,-8,-26,-9,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-27,8,24,-21,-19,7,-21,2,-14,-11,0,-10,13,-2,-2,-5,-22,-23,-4,18;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-18,-31,-24,-2,-27,-26,26,-23,18,11,-23,-23,-21,-23,-14,-5,27,-23,-7,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,4,-30,32,-23,-9,1,-17,11,54,-10,-11,-21,-21,-8,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,15,24,-30,-10,-5,-30,12,-25,-17,4,-8,11,6,3,-6,-24,-29,-17,17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-20,-29,-23,8,-29,-16,20,-22,21,11,-24,-27,-20,-20,-18,-7,18,-15,8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-15,-30,-21,4,-27,-21,19,-25,30,16,-25,-25,-19,-21,-20,-8,13,-21,-3,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,0,-23,0,1,-26,12,-11,-26,1,-22,-14,0,-12,0,-3,2,-8,-19,-22,-19,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-21,2,16,-23,-12,-7,-20,4,-17,-13,-1,1,6,0,3,-3,-17,-25,-16,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-2,-20,-3,1,-14,-14,7,-16,4,-14,-7,0,-13,1,4,-1,-5,-11,-20,-3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-3,-24,-6,-14,-26,46,-15,-32,-13,-26,-17,5,-17,-14,-15,3,-13,-24,-21,-25,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-21,-3,1,-25,-8,-12,-24,11,-22,-13,-2,-5,0,7,0,-6,-18,-26,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-25,28,7,-28,-7,7,-30,3,-27,-20,23,-15,2,6,4,-4,-26,-34,-15,3;
MA   /M: SY='I'; M=5,-25,-15,-32,-25,-5,-28,-27,28,-23,11,10,-21,-21,-21,-25,-11,-5,26,-23,-8,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-29,-5,6,-27,-15,-4,-20,13,-18,-6,-6,3,11,5,-7,-10,-20,-23,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-38,-29,0,-37,-27,44,-27,20,23,-21,-21,-19,-27,-19,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-7,-16,-9,-19,-5,-19,-10,-12,-14,-11,-8,-7,-10,-18,14,4,0,-27,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,20,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,32,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-8,16,-22,7,2,-22,-8,0,-23,14,-28,-16,28,-16,3,14,8,1,-22,-32,-16,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-28,-7,4,-26,-17,5,-15,-1,-18,-6,-3,5,15,-4,-3,-9,-19,-23,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,17,38,-33,-18,7,-27,7,-21,-14,3,-5,29,2,1,-9,-29,-28,-15,33;
MA   /M: SY='G'; M=20,-9,-20,-13,-14,-24,33,-19,-26,-15,-22,-16,-3,-15,-14,-19,8,-6,-16,-22,-24,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-32,-27,3,-32,-26,32,-25,24,16,-27,-27,-24,-22,-18,-6,33,-24,-4,-27;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-26,23,10,-27,-12,-1,-25,6,-23,-17,17,-9,3,-1,0,-5,-23,-32,-16,6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,32,-20,19,1,-22,-3,4,-21,1,-27,-19,44,-17,-1,-1,8,0,-25,-37,-19,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-23,-36,-26,22,-32,-21,25,-27,26,20,-23,-25,-22,-22,-23,-10,14,-13,7,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,44,30,-36,-14,3,-35,5,-26,-23,11,-8,10,-4,-1,-10,-29,-34,-17,20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,14,-25,21,31,-29,-11,-4,-28,3,-22,-20,5,-6,8,-5,5,-4,-23,-31,-20,19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-22,-34,-25,2,-32,-26,33,-27,27,17,-24,-24,-21,-24,-20,-8,24,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-26,-2,14,-19,-20,-7,-15,7,-7,-6,-5,-13,6,8,-7,-8,-14,-25,-12,9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-16,-13,-2,-17,-12,-17,-5,-6,-7,-6,-10,-14,-8,-13,2,-2,3,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-4,-8,-7,-12,-5,-15,-17,-13,-22,-16,2,-13,-7,-13,26,18,-7,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,47,-30,64,18,-37,-10,2,-38,0,-29,-28,21,-11,0,-9,0,-10,-29,-38,-17,9;
MA   /M: SY='G'; M=9,-9,-25,-11,-17,-28,54,-19,-34,-18,-27,-18,-1,-18,-17,-19,4,-14,-24,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-19,-34,-27,5,-31,-28,31,-24,14,12,-23,-24,-24,-24,-14,-5,30,-21,-3,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00101;
//
ID   PGLYCERATE_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00111;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoglycerate kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1705470; R2=0.0134109; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=556; N_SCORE=11.617; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-10,-22,-15,-13,-6,-19,-9,6,-10,10,18,-10,-20,-8,-11,-13,-7,2,-22,-3,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-8,-19,-12,-9,-4,-15,-7,-3,-3,-2,9,-6,-14,-5,-4,-6,-2,-3,-18,-2,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-16,1,-1,-15,-5,-5,-12,-3,-13,-5,12,-13,-2,-4,4,2,-11,-26,-13,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-21,-19,-11,5,-23,-14,2,1,2,6,-12,-17,-10,-2,-13,-7,2,-14,1,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-13,-24,-14,-4,-9,-20,-12,-8,6,-4,-2,-11,-4,-3,6,-12,-8,-8,-17,-7,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-15,-9,-7,-12,-17,-15,-11,-3,-13,-9,0,-13,-6,0,13,24,-3,-29,-11,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-18,-33,-24,3,-31,-23,28,-26,30,21,-25,-26,-19,-22,-22,-9,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-24,17,10,-26,-11,-7,-26,9,-23,-17,8,-11,3,3,4,4,-19,-30,-15,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,40,-27,53,18,-35,-9,0,-35,2,-29,-26,20,-10,2,-7,3,-7,-28,-38,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-13,-32,-24,13,-28,-23,18,-27,25,12,-25,-28,-23,-21,-21,-8,15,-19,0,-24;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-27,41,15,-32,-4,-2,-32,-2,-27,-24,20,-9,0,-9,3,-5,-27,-36,-20,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-18,-29,-23,12,-29,-18,20,-24,27,14,-27,-26,-22,-19,-21,-7,18,-16,6,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-23,1,7,-24,-16,1,-22,13,-20,-10,3,-13,10,9,1,-3,-18,-25,-9,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-28,3,-12,-29,47,-12,-36,-13,-30,-21,14,-19,-14,-14,2,-14,-30,-26,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,11,-29,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-11,12,33,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-23,-8,-2,-20,-19,-3,-24,21,-19,-9,0,-16,3,34,-4,1,-14,-24,-9,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-10,-30,-30,0,-30,-30,29,-20,10,10,-29,-30,-30,-20,-9,1,49,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-33,-24,23,-31,-22,20,-28,33,16,-27,-29,-25,-21,-24,-9,14,-15,5,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-15,-32,-26,3,-32,-25,29,-25,25,18,-27,-27,-23,-22,-19,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-2,-23,-18,-7,-23,-24,11,-18,2,1,-20,-24,-19,-19,-5,-2,22,-29,-13,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-35,-25,39,-31,-20,14,-29,28,12,-24,-29,-28,-21,-24,-10,8,-7,14,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-7,-24,-24,-5,-23,-26,18,-18,1,3,-21,-26,-24,-18,0,4,35,-32,-13,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-32,-24,6,-29,-19,26,-22,25,26,-25,-25,-17,-19,-20,-8,22,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-28,22,14,-31,-13,-5,-29,18,-26,-17,8,-11,6,8,-3,-9,-22,-29,-15,10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-16,15,8,-17,-2,-2,-18,3,-15,-12,7,-2,1,1,-1,-5,-15,-17,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,22,-16,23,5,-20,-2,-1,-20,-1,-18,-15,17,-9,-2,-5,4,0,-17,-25,-13,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-27,-5,-14,-25,46,-14,-34,-13,-28,-18,5,-19,-14,-13,2,-14,-27,-22,-24,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-23,-3,7,-21,-19,-10,-17,17,-18,-7,-1,-13,4,12,-2,1,-10,-25,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,44,-28,19,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,34,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-14,-13,-9,-10,-20,-17,-4,-12,-3,-4,-5,-14,-6,-10,10,29,0,-28,-9,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,38,-25,48,14,-33,-7,0,-33,-2,-30,-26,24,-11,1,-8,9,-3,-26,-40,-20,7;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-27,37,13,-28,-13,-3,-27,-1,-21,-21,14,-9,-1,-8,0,-5,-23,-33,-15,6;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-19,-5,-1,-19,-6,-9,-19,-1,-18,-12,4,-13,1,-2,10,12,-13,-25,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-39,-29,10,-37,-28,41,-29,20,18,-21,-22,-23,-27,-20,-9,26,-17,3,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-24,-8,-1,-14,-22,-7,-10,6,-7,-4,-5,-18,-1,19,-7,-2,-5,-24,-9,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-16,-13,-3,-22,-2,-14,-17,-1,-16,-11,-5,-12,-1,-3,8,-2,-9,-22,-18,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00102;
//
ID   GUANIDO_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00112;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP:guanido phosphotransferases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0298743; R2=0.0145838; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=828; N_SCORE=17.095; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-26,-2,-1,-27,17,-9,-30,3,-27,-16,6,-15,0,4,3,-7,-24,-25,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-23,-24,-18,1,-26,-4,8,-15,13,10,-20,-25,-13,-12,-18,-9,5,-7,9,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-31,17,21,-32,-10,-7,-29,3,-26,-20,0,16,5,-6,-1,-9,-28,-31,-22,12;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-36,-28,62,-31,-14,5,-26,11,2,-21,-29,-33,-19,-20,-10,2,9,34,-28;
MA   /M: SY='A'; M=18,-11,-14,-18,-10,-14,-8,-10,-3,-9,-5,12,-8,-13,-1,-13,7,1,0,-25,-13,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-20,-34,-21,-14,10,-23,10,-19,-5,-14,-8,-14,-24,-9,4,-21,-18,-20,34,23,-12;
MA   /M: SY='B'; M=-12,31,-23,30,6,-26,-8,8,-26,-2,-26,-20,30,-15,0,-2,6,-1,-25,-37,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-31,32,40,-33,-17,-2,-32,5,-24,-23,4,6,11,-5,-1,-10,-30,-33,-21,25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-27,-4,1,-23,-13,23,-27,12,-22,-8,6,-17,10,25,-4,-8,-22,-25,-4,2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-28,-19,9,-30,-12,15,-24,38,16,-25,-28,-17,-15,-27,-10,6,-17,6,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-30,-24,-22,37,-29,11,-1,-14,0,-1,-21,-30,-15,-12,-21,-11,-10,34,69,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-24,30,-28,34,19,-27,-27,-21,-23,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-4,-17,-14,-5,-23,-20,-3,-17,6,-2,-10,-18,-14,-14,4,27,2,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-5,-19,-16,10,-16,-19,-11,-17,-9,-10,-6,-18,-18,-15,8,21,-3,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,41,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,18,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-23,-11,-17,-23,38,-20,-28,-17,-23,-16,-1,-17,-17,-17,7,0,-17,-24,-24,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-31,-23,5,-28,-18,25,-23,32,28,-27,-27,-17,-18,-23,-8,20,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-6,-19,-12,-21,6,-20,-14,-12,-13,-12,-9,-12,-12,-20,8,-3,-4,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-15,-2,-5,-22,17,-12,-25,-12,-30,-20,8,-12,-5,-12,30,10,-15,-35,-22,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-7,-27,-11,-7,-13,-21,65,-11,-11,-7,17,0,-20,5,-5,-13,-17,-15,-27,13,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-34,-26,1,-32,-25,34,-24,21,21,-24,-24,-20,-23,-18,-7,28,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-30,-1,7,-27,-20,22,-29,29,-26,-7,3,-14,13,25,-9,-13,-23,-23,-2,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-20,4,-30,-21,22,-27,37,16,-25,-27,-19,-21,-25,-9,13,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-35,-11,-2,-27,-18,-17,-19,-10,-26,-18,-17,70,-10,-19,-6,-5,-25,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-25,-2,-1,-24,-4,6,-25,14,-22,-10,8,-15,1,7,-3,-8,-20,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-19,-29,-20,6,-28,-20,20,-27,39,18,-26,-27,-18,-20,-23,-5,12,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='S'; M=14,-8,-9,-11,-7,-16,-4,-17,-11,-13,-14,-11,-4,-15,-9,-15,16,9,-2,-31,-18,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00103;
//
ID   ADENYLATE_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00113;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenylate kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2459478; R2=0.0147532; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=155; N_SCORE=7.523; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,16,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,44,-29,-9,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-6,-29,-26,-1,-29,-26,25,-21,11,9,-23,-25,-23,-21,-11,-1,32,-25,-7,-26; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,0,-7,-5,-7,-4,-11,-6,3,-8,1,2,3,-11,-6,-8,-3,0,-1,-16,-5,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-25,4,7,-25,-2,-6,-27,6,-23,-15,4,-10,4,5,1,-5,-21,-25,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-29,-19,3,-29,-18,22,-22,25,23,-21,-22,-14,-18,-19,-5,12,-18,-1,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-18,-31,-25,0,-30,-23,28,-21,19,16,-25,-26,-21,-18,-17,-6,29,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-25,-2,7,-20,-17,-8,-16,12,-14,-6,-2,-14,5,9,-6,-8,-13,-23,-11,5;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-25,21,18,-28,-10,-1,-27,6,-25,-19,13,-10,7,0,5,-4,-23,-32,-16,12;
MA   /M: SY='R'; M=1,-10,-18,-14,-4,-9,-17,-9,-16,4,-11,-8,-7,-17,-3,14,-4,-3,-10,-19,-7,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-32,-23,6,-30,-20,25,-26,30,22,-24,-25,-18,-21,-22,-8,15,-20,1,-22;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-21,1,5,-21,-10,-2,-18,1,-16,-10,1,-11,5,-2,2,-4,-14,-25,-12,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,7,-21,6,12,-23,-12,0,-20,12,-18,-9,7,-9,14,8,1,-4,-19,-22,-11,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: M=-1,-2,-17,-3,-2,-12,-11,-9,-8,-2,-9,-5,-2,0,-4,-5,-2,-2,-7,-20,-11,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-21,22,8,-24,-9,-5,-22,4,-19,-15,6,-6,1,-2,0,-5,-16,-25,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=1,-3,4,-5,-6,-19,-8,-13,-17,-9,-16,-12,-3,-11,-6,-12,2,-1,-11,-27,-16,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=1,2,-22,-2,3,-23,-7,-4,-19,6,-21,-11,6,-11,3,1,4,-2,-15,-26,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-9,15,-26,13,7,-25,-8,2,-26,11,-26,-16,17,-12,5,4,1,-6,-24,-28,-12,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-27,-5,-11,-26,33,-13,-30,-5,-26,-15,5,-18,-10,-7,0,-12,-23,-24,-22,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-36,-28,41,-29,-19,3,-25,4,-1,-24,-29,-29,-20,-21,-12,1,25,25,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,21,-32,-22,23,-29,34,17,-26,-28,-24,-22,-25,-10,13,-14,6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-25,-31,-26,55,-30,-3,2,-21,6,1,-20,-30,-26,-16,-20,-10,-3,18,51,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,11,-15,1,-1,-16,-12,-9,-16,-5,-19,-15,17,-12,-3,-6,18,26,-12,-34,-15,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-21,-22,-11,-5,-27,-17,14,-16,13,11,-20,-18,-10,-15,-14,-5,12,-24,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-22,6,10,-25,-8,-7,-20,-1,-21,-15,4,-3,2,-7,5,-3,-17,-30,-19,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-29,2,18,-38,-18,10,-20,9,-21,-2,6,-11,54,9,1,-9,-30,-22,-11,36;
MA   /M: SY='A'; M=25,-14,-9,-21,-14,-14,-6,-19,-4,-13,-2,-2,-12,-17,-12,-16,0,-3,2,-22,-16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,10,27,-26,-18,0,-22,9,-18,-12,2,-8,12,2,-1,-8,-21,-28,-14,19;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-17,-18,-8,-5,-8,-15,-8,-11,-6,-6,-10,-15,-10,-15,2,-3,-3,-17,-8,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-33,-23,21,-29,-20,16,-28,35,16,-28,-29,-23,-20,-27,-11,8,-6,7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-28,27,27,-28,-15,1,-28,4,-21,-18,9,-9,9,-2,-1,-9,-25,-30,-16,17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-25,6,16,-27,-12,-6,-24,12,-22,-14,4,-9,9,7,2,-4,-20,-27,-16,12;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-21,-19,-12,1,-22,-12,5,-12,6,9,-11,-20,-10,-11,-10,-3,3,-19,-1,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-19,-25,-18,1,-19,-19,12,-23,25,13,-20,-22,-17,-18,-18,-7,7,-21,-5,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=0,-3,-17,-5,0,-19,-13,-13,-13,-1,-15,-9,-4,-11,-2,-7,0,-2,-9,-25,-13,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-25,6,13,-22,-13,-5,-20,3,-15,-12,1,-9,4,0,-1,-6,-17,-26,-14,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-8,-10,-25,-11,-2,-10,-23,-6,-3,-6,-2,0,-9,-12,-2,-4,-9,-7,-6,-22,-4,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-5,5,-25,5,-3,-22,5,-5,-23,-6,-20,-14,5,-11,-7,-9,-1,-7,-18,-26,-15,-6;
MA   /M: M=-7,-8,-22,-9,-5,-11,-22,-7,-4,-7,-2,0,-9,-16,-1,-8,-8,-4,-5,-20,-3,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-13,-23,-14,-11,-7,-21,-16,-2,-6,-6,-3,-11,-7,-11,-8,-7,-4,1,-23,-8,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00104;
//
ID   PRPP_SYNTHETASE_MP; MATRIX.
AC   MP00114;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoribosyl pyrophosphate synthetase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9448419; R2=0.0144542; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=855; N_SCORE=17.293; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=48,-11,-10,-21,-11,-17,-1,-20,-10,-11,-9,-10,-10,-11,-11,-20,9,0,0,-19,-18,-11;
MA   /M: SY='B'; M=-14,39,-25,36,8,-28,-6,7,-28,4,-30,-22,39,-15,1,-1,4,-5,-29,-38,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,8,-27,-13,20,-23,38,33,-26,-26,-14,-17,-26,-10,10,-19,1,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,5,-33,-22,32,-28,36,23,-25,-25,-18,-23,-25,-10,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-15,-3,8,-20,-20,-10,-14,-1,-15,-10,-3,-11,7,-4,9,15,-8,-29,-13,7;
MA   /M: SY='T'; M=5,-6,-17,-8,2,-18,-16,-14,-11,1,-13,-7,-5,-12,-1,-3,6,9,-3,-27,-14,0;
MA   /M: SY='A'; M=39,-13,-11,-21,-13,-16,-5,-20,-3,-12,-7,-5,-12,-13,-12,-19,7,0,7,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-18,-30,67,-19,-40,-19,-30,-20,0,-19,-19,-19,0,-20,-30,-20,-30,-18;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,-9,-25,-18,-9,-13,-23,5,-16,-2,-2,-16,-17,-17,-21,1,-1,13,-22,-14,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-23,40,11,-30,-9,2,-30,-3,-27,-23,22,-12,0,-8,9,2,-24,-38,-17,5;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-29,-8,0,-20,-19,12,-30,23,-20,-9,2,-20,10,57,-8,-10,-21,-22,-7,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,1,-32,-27,33,-23,18,16,-27,-27,-25,-22,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-21,-33,-24,4,-31,-24,29,-27,31,18,-26,-26,-20,-23,-22,-8,21,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='T'; M=8,-7,-11,-15,-12,-10,-17,-20,-4,-12,-5,-6,-6,-13,-12,-13,13,31,5,-28,-12,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-7,-30,-23,1,-26,-17,15,-19,16,24,-24,-26,-16,-17,-17,-5,16,-18,-4,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-31,-21,25,-30,44,21,-28,-28,-20,-21,-28,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=32,-3,-11,-10,-6,-20,-1,-15,-14,-9,-17,-14,0,-10,-7,-16,18,7,-5,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='D'; M=2,3,-23,8,1,-25,-6,-14,-20,-9,-19,-17,-2,6,-7,-15,4,-1,-14,-31,-21,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-29,0,19,-39,-19,9,-20,9,-20,-1,0,-10,57,9,2,-9,-29,-21,-10,38;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-24,-32,-24,-1,-31,-25,32,-24,11,14,-16,-19,-17,-24,-10,-1,22,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-29,-3,16,-36,-20,8,-17,7,-16,3,-3,-8,52,7,-2,-10,-27,-20,-10,34;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-20,-30,68,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-27,52,13,-32,-10,3,-34,0,-27,-25,23,-13,-1,-7,1,-6,-27,-36,-15,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-27,-35,-27,-3,-31,-27,37,-23,14,17,-19,-21,-19,-23,-17,-9,26,-21,-4,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-11,-32,-29,7,-31,-28,27,-23,13,10,-28,-29,-29,-21,-13,-2,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,19,-24,11,1,-21,-10,45,-25,-5,-25,-11,30,-18,5,-1,4,-6,-27,-35,-3,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,6,-31,-23,26,-28,38,19,-28,-28,-21,-21,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-26,-17,-11,14,-25,10,-5,-6,-2,3,-12,-24,-6,-3,-15,-9,-9,3,35,-11;
MA   /M: SY='G'; M=18,-10,-11,-15,-15,-21,24,-20,-23,-16,-19,-15,-5,-16,-16,-19,6,-3,-13,-22,-22,-15;
MA   /M: SY='S'; M=2,-10,-18,-11,-4,-14,-12,-9,-6,-8,-10,-2,-7,-16,1,-9,6,0,-1,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-38,-14,-6,-21,-23,-11,-13,-12,-22,-13,-19,57,-10,-17,-13,-11,-22,-18,-15,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-18,-29,-24,0,-29,-25,26,-23,17,11,-21,-25,-22,-21,-12,-2,27,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-33,-23,18,-29,-22,20,-28,31,15,-25,-27,-23,-22,-23,-9,13,-15,3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=10,-17,-17,-21,-14,-8,-13,-17,3,-16,11,5,-14,-20,-11,-14,-6,-4,4,-23,-11,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-27,25,16,-28,-13,-2,-30,11,-25,-18,10,-11,6,4,-1,-7,-24,-29,-15,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-9,-31,-6,-6,9,-25,18,-13,-5,-9,-7,-11,-24,-4,-4,-16,-12,-18,16,45,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-23,-33,-26,25,-32,-18,21,-25,18,11,-22,-26,-24,-21,-19,-7,14,-7,17,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-22,-14,-6,-12,-18,-13,-13,5,-12,-6,-7,-18,-3,10,-6,-5,-8,-12,-7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-23,7,15,-23,-15,-3,-20,2,-18,-13,4,-11,7,2,6,0,-17,-30,-14,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00105;
//
ID   RNA_POL_II_REPEAT_MP; MATRIX.
AC   MP00115;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic RNA polymerase II heptapeptide repeat.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6686196; R2=0.0069539; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1086; N_SCORE=11.218; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=408; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-16,-5,-2,-18,-15,-15,-18,7,-21,-13,3,-10,-2,1,17,25,-8,-30,-13,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-20,-5,-4,-23,6,-15,-25,4,-25,-15,3,-12,-4,-1,12,9,-15,-28,-17,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=11,-2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,39,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-16,-2,1,-21,-10,-12,-21,7,-25,-15,5,-10,1,1,21,18,-11,-32,-15,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-35,-15,-5,-21,-22,-20,-11,-15,-12,-11,-22,63,-12,-20,-15,-10,-21,-28,-23,-12;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-16,-7,-2,-21,-10,-15,-18,7,-21,-13,0,-10,-2,-1,15,14,-8,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-30,-26,-23,21,-33,4,16,-16,6,6,-20,-27,-13,-16,-20,-10,2,14,55,-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,15,-16,22,6,-26,-3,-7,-26,-7,-30,-23,13,-10,0,-10,28,11,-16,-40,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,4,-30,7,1,-25,-25,-8,0,-8,-8,-2,-1,-14,11,-11,-8,-10,-7,-26,-9,4;
MA   /M: SY='B'; M=10,24,-19,20,2,-26,-3,-5,-22,-4,-22,-19,21,-13,-4,-11,7,-3,-19,-32,-20,-1;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-14,11,-36,26,9,-34,-16,-11,-29,-6,-30,-24,-2,45,-6,-16,-6,-10,-30,-34,-26,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00106;
//
ID   DNA_POLYMERASE_B_MP; MATRIX.
AC   MP00116;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA polymerase family B signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1609220; R2=0.0073990; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1060; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=857; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-29; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=14,-72,-22,-25,-19,-15,-1,14,24,1,48,18,-19,-12,-2,-25,10,-54,22,12;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-74,-2,16,14,-36,-3,-9,-26,13,-56,3,-20,-14,9,-27,34,-12,21,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-16,-71,-65,-9,-21,-4,-66,28,-27,-19,35,2,-69,-60,8,4,54,1,20,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-36,-80,-70,-9,-23,-78,-4,3,28,-11,19,-66,-22,7,19,11,-25,16,-78,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-35,-76,-59,41,-2,-76,21,2,4,6,-4,16,-21,-57,-5,-28,33,-14,-82,-63; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-19,24,-3,-9,13,-17,-3,12,-29,12,-3,35,16,-16,-6,-61,8,-58,-77,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='L'; M=24,-74,-3,15,-65,15,-3,-28,-10,27,-3,-19,17,7,-65,-57,-5,-31,-77,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-77,14,64,-22,-35,-54,-13,-6,-12,-61,17,-19,34,-21,4,-4,-65,-70,35;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=4,-78,12,7,-26,-69,-60,-34,56,-43,-6,27,2,9,21,-9,-59,-36,-80,-67; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,24,-71,-10,47,-76,-3,-8,-30,8,21,0,-23,-16,-6,-31,-25,-1,22,52; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-15,-74,-57,-9,-70,53,-60,-14,-27,-26,-65,59,-72,-57,8,22,-57,-35,-77,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=12,-71,29,-29,68,-37,-3,-6,-69,20,-1,-21,-22,-68,-71,-63,-60,17,-63,13;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-76,13,9,-4,-35,-55,-77,63,-74,-66,28,-67,24,56,-8,-4,-73,-76,-62;
MA   /M: SY='V'; M=-55,0,-78,-74,2,-78,-78,42,-73,4,-44,-71,-22,-72,-75,27,-51,75,-79,-58;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-17,-73,-79,-76,-44,-82,-70,67,-33,26,-39,-24,-77,-70,-73,-68,-58,45,-66,51;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-80,-70,-72,-22,-74,-39,-57,-65,-54,-51,-71,-82,-61,-63,-63,-64,-61,-30,130;
MA   /M: SY='G'; M=7,24,-66,-73,-76,86,-72,-1,-68,-73,-67,-53,-68,-66,-75,-6,8,-34,-76,-74;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='S'; M=-42,-66,-57,-60,-76,35,-61,-76,-59,-79,-71,-45,-64,-51,-64,100,-40,-69,-81,-68;
MA   /M: SY='I'; M=-62,25,-83,-79,26,-85,-77,62,-76,31,23,-76,-78,-75,-77,-69,-5,49,-73,-53;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-73,-28,-72,89,-78,37,-23,-12,-43,69,-68,-79,-68,-65,-32,-63,-12,-49,60;
MA   /M: SY='V'; M=25,25,-78,-73,-55,-75,-77,41,-72,21,1,-71,-75,-70,-74,-28,9,60,-80,-61;
MA   /M: SY='T'; M=-33,-1,12,24,-22,-70,22,2,5,-2,-56,4,-67,23,10,-8,50,-58,-76,10;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-35,52,-70,4,24,-78,20,34,-30,-8,-2,-21,-22,6,-27,-62,26,10,47,-55; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-82,37,16,-79,28,-63,-77,14,-47,-71,3,56,-56,19,-27,-6,-39,-82,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-32,-75,-71,-73,-1,55,-5,12,-12,12,-57,-19,-74,-67,-71,13,-6,-1,-75,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-22,-4,47,-65,-84,-82,-75,-37,11,-83,-9,-21,0,-18,-73,0,-8,-20,-94,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-76,44,37,-72,-33,-2,0,35,-42,-65,18,-19,-50,-54,28,-55,-34,19,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-41,23,8,2,-24,-90,-79,12,-14,17,-61,-25,-88,-74,-31,-36,-71,15,-89,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-79,0,67,-2,-37,-59,-32,-8,-65,45,-19,3,9,-59,-10,-61,-35,-73,24; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-73,12,31,-24,-36,-3,-28,29,-23,-59,-56,-19,23,-21,4,27,22,-80,-64; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=13,-74,21,15,-72,7,20,-28,-29,-12,-61,-59,-72,-15,-68,28,-4,28,-86,-68; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-78,-25,5,-23,-77,-67,-10,34,12,20,-65,-22,-14,20,2,-25,8,-78,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-35,-81,-3,5,-27,21,-65,-83,52,-81,-73,3,-72,-55,20,-10,18,-78,19,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-3,30,-25,-79,-4,32,34,-11,-4,1,-22,-14,-24,-66,-64,-30,-83,-68; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=36,4,-20,10,3,49,27,-72,-25,-38,0,-60,-73,-10,-22,-56,-65,-31,-76,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-71,-85,-78,-42,-87,-72,53,-78,80,-30,-82,-81,-72,-77,-76,-62,-33,-72,-54;
MA   /M: SY='I'; M=-67,-76,-87,-84,65,-89,-81,96,-79,-34,-39,-76,-77,-79,-81,-74,-61,-25,-63,-44;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-60,-73,61,-49,63,-65,-59,-70,52,-66,-66,-48,-69,-54,-51,51,-53,-68,-68,-49;
MA   /M: SY='K'; M=-64,-78,-68,-58,-61,-79,-70,79,80,-49,-48,-60,-68,-54,-44,-64,-58,-38,-73,-61;
MA   /M: SY='C'; M=-56,124,-82,-79,-62,-80,-83,-39,-76,-52,-54,-72,-85,-81,-80,-65,-55,74,-94,-71;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00107;
//
ID   GAL_P_UDP_TRANSF_I_MP; MATRIX.
AC   MP00117;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Galactose-1-phosphate uridyl transferase family 1 active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1386428; R2=0.0140264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=816; N_SCORE=16.574; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-1,-21,-4,4,-22,-8,-10,-22,3,-20,-12,1,-11,5,4,9,13,-15,-27,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-22,-3,11,-23,-19,-7,-14,7,-16,-8,-5,-13,11,7,2,-3,-7,-28,-14,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-22,3,11,-16,-18,-8,-12,-5,-13,-12,-2,-10,0,-10,4,5,-11,-24,-5,4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-24,-20,-7,-5,-23,-14,3,-14,19,11,-20,-10,-9,-8,-18,-9,-2,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-22,7,30,-27,-12,-4,-24,2,-22,-17,2,-5,15,-4,13,0,-21,-31,-19,23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-26,-5,3,-17,-12,10,-15,-4,-4,-2,-1,-18,4,-3,-10,-12,-18,-25,-6,3;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-9,-29,-7,-1,-21,4,10,-23,-7,-13,-8,-5,-7,-4,-8,-9,-15,-22,-24,-11,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-4,-28,-1,2,-27,-17,-12,-16,2,-22,-12,-5,17,3,-6,-1,-6,-17,-27,-18,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-23,-7,1,-14,-15,-8,-19,2,-21,-11,-1,-3,8,4,8,3,-16,-24,-10,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-22,-16,-19,16,-28,-5,6,-16,6,2,-19,-28,-19,-15,-16,-7,8,-3,28,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-32,1,17,-29,-10,-9,-29,18,-26,-16,-4,8,6,12,-6,-11,-26,-25,-19,10;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-22,-18,-23,-17,7,-25,-2,-13,-12,-11,-8,-22,-28,-3,-12,-21,-16,-19,46,38,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,1,-30,-26,30,-21,16,18,-28,-28,-24,-20,-14,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-9,-27,-11,6,-6,-23,1,-14,-1,-11,0,-6,-16,32,1,-6,-10,-21,-11,1,20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-3,-38,-30,-3,-38,-30,35,-29,12,12,-21,-24,-22,-29,-18,-9,25,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-12,-15,-7,-20,-4,-18,-13,-3,-14,-11,-6,-10,-7,-12,12,6,-3,-23,-18,-7;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-18,-12,6,-16,-13,-11,-5,-5,-4,4,-11,-11,-1,-12,-1,-5,-1,-24,-15,2;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-24,-20,-32,-24,0,-26,-12,27,-16,18,42,-22,-22,-10,-16,-18,-8,22,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-21,83,-29,-28,-17,-27,-29,-18,-26,-14,-14,-21,-35,-28,-27,-8,-7,1,-43,-25,-28;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-3,-12,-18,-10,-27,-18,8,-10,-2,-10,37,25,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,14,-19,1,-7,-11,-9,-2,-7,-10,-5,-7,26,-22,-7,-8,-1,-3,-15,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-34,-14,-8,-23,-6,-18,-15,-14,-16,-7,-18,47,-12,-19,-11,-12,-22,-26,-24,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,2,-14,-22,-28,49,-22,-38,-22,-28,-20,-4,-24,-22,-22,-2,-18,-26,-26,-30,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=5,-26,-19,-32,-25,-3,-28,-27,29,-23,14,11,-22,-22,-21,-24,-12,-5,28,-23,-7,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-44,-34,-27,16,-23,-16,-14,-17,-14,-14,-34,-30,-17,-17,-34,-24,-24,116,44,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,17,-20,-14,-18,-11,-22,-14,-14,-12,-12,-10,-16,-14,-20,8,9,-2,-28,-20,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-17,-15,-13,8,-19,-9,-4,-16,1,-4,-5,-21,-13,-12,2,11,-4,-16,9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,5,-24,8,8,-26,-9,-9,-23,-6,-29,-21,7,18,-1,-11,14,3,-22,-36,-23,2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-18,-29,-24,46,-26,-16,0,-23,2,-2,-16,-26,-28,-17,-8,1,3,-2,21,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-19,-29,-21,3,-30,-23,22,-25,29,14,-23,-25,-19,-20,-17,1,17,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-35,-10,-2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17,73,-10,-18,-5,0,-25,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-25,16,11,-27,-12,-8,-26,2,-27,-20,8,7,1,-5,8,3,-22,-34,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-8,-27,-5,17,-17,-24,-8,-11,5,-6,-6,-8,-14,4,13,-9,-9,-9,-25,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=4,-18,-22,-19,-13,-15,-21,-23,2,-14,-9,-6,-17,18,-15,-19,-3,4,4,-27,-17,-16;
MA   /M: SY='A'; M=16,-5,-19,-8,5,-23,0,-10,-16,-5,-14,-6,-5,-10,4,-11,6,-4,-12,-24,-18,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-24,-11,-2,-18,-23,-9,-10,10,-6,-1,-9,-17,8,14,-8,-2,-7,-22,-8,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-28,7,35,-25,-20,-2,-21,15,-15,-4,-3,-6,14,5,-6,-10,-21,-26,-14,25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00108;
//
ID   PA2_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00118;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phospholipase A2 histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2995665; R2=0.0056608; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1008; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=743; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-35; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='C'; M=-9,147,-77,-45,-71,-73,-21,-76,-74,-49,-67,-66,-88,-79,-80,-23,-60,-65,-98,-79;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-16,-34,-73,-40,97,-70,-51,-68,-82,-73,-50,-68,-66,-75,8,-36,-79,-74,-74;
MA   /M: SY='W'; M=3,-76,-19,-61,-58,-18,-67,-20,13,19,5,-32,27,6,12,-11,-34,7,97,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-34,-76,-65,-43,-77,94,-69,-47,-67,-55,-21,-53,-12,-65,-41,-18,-65,-32,-73,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-76,-32,-40,-80,90,-17,-85,-22,-82,-73,13,-68,-61,-8,-7,-36,-51,3,-73;
MA   /M: SY='S'; M=-37,-16,-56,3,-74,-41,32,-75,33,-38,-64,-24,-67,19,54,62,-3,-70,-79,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-17,-64,-43,-77,96,-18,-82,-68,-13,-69,-25,-32,-66,-41,-51,-67,-78,-75,-74;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-56,-69,-58,-8,-71,6,-17,-25,28,-68,-62,-50,-29,17,-31,-27,89,-59,29,-65; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-44,-19,-67,-57,-80,-44,-69,-70,-62,-40,-67,-71,120,-66,-22,-62,-17,-47,-78,-31;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-72,-71,-37,-1,-49,-70,-11,38,5,-48,-67,-34,16,13,-39,-56,69,3,-58;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-80,113,-33,-86,-65,-54,-80,-8,-81,-79,-37,-31,-23,-61,-34,-32,-33,-99,-70;
MA   /M: SY='E'; M=50,-73,48,63,-81,1,21,-77,-32,-75,-69,-25,-10,-20,-59,-31,-57,-69,-82,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-58,-67,-37,-68,-53,-48,-69,3,-67,57,-42,-63,-12,-66,-71,-9,72,-1,-79,-60;
MA   /M: SY='D'; M=-45,-80,117,-32,-87,-64,-54,-85,-55,-83,-82,-16,-67,-54,-63,-54,-17,-81,-102,-70;
MA   /M: SY='W'; M=-44,-83,-67,-55,-67,-73,-58,-77,-8,-51,-19,-60,-74,-19,100,-3,-37,-75,101,-54;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='Q'; M=-43,-79,-61,-5,34,-46,8,-65,33,-23,-56,-28,-71,80,26,-36,-62,-29,31,41;
MA   /M: SY='T'; M=19,-68,-4,-21,-63,-44,5,14,-37,-39,19,-28,-68,6,-36,-18,55,44,-81,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='D'; M=-44,-79,111,-19,-86,-63,-13,-84,-8,-83,-80,-3,-67,-52,-33,-9,-56,-81,-99,-69;
MA   /M: SY='C'; M=-42,109,21,14,-71,-44,40,-45,-9,-49,17,42,-75,-6,4,-57,-33,-68,-88,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-37,-72,-8,-77,-40,-58,-66,-40,-51,-72,10,-62,-64,-41,-65,-63,-31,128; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=10,-74,54,22,-80,38,-15,-79,28,-78,-71,21,-65,-22,-15,-7,11,-73,-82,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-41,-77,9,53,-77,-70,8,-44,37,-51,-64,13,-65,53,39,-19,4,-30,-80,-65;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='A'; M=70,-14,-75,-67,-60,-63,-70,-6,-68,38,21,-70,-33,-28,-71,-54,-56,10,-76,-64; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-16,-73,-48,63,-76,0,-60,-71,24,-51,-19,3,-10,-3,-14,13,40,-28,-81,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-21,-86,-3,20,-86,-49,5,-51,71,-85,-75,1,-34,-5,-26,-39,-38,-82,-86,-30; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-22,-87,-20,-23,-4,-11,-74,9,30,1,-19,-71,-37,23,-19,-14,-71,-43,-83,-28; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-37,-77,21,8,-82,80,-17,-84,-1,-82,-73,13,-31,-6,-65,-8,-62,-51,-79,-74; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-69,146,-89,-89,-79,-84,-89,-86,-85,-77,-77,-75,-100,-92,-91,-71,-69,-74,-109,-90; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-17,23,36,-57,1,-27,-56,-26,7,-67,-64,20,-33,-24,-17,38,-16,-67,75,62;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-83,-34,-56,-18,-68,-67,-4,6,-52,-65,-13,109,-62,-67,5,-5,-68,-76,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-42,8,-61,-32,-56,-46,21,-24,74,-9,-56,-27,-69,-49,9,-21,4,-27,-64,58;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-63,-16,-6,-40,24,-2,-68,-8,5,36,45,-64,-73,-65,-66,-38,43,-34,58,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-36,-71,58,25,-67,-39,-58,-34,-55,11,-10,12,-66,16,-29,-12,60,-60,-83,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-74,-5,-8,-68,-74,-59,-63,15,9,-57,-55,-70,-49,80,-11,50,-17,-79,-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-69,-79,-67,-72,21,-75,-40,-57,-64,-54,-51,12,-81,-61,-63,-62,4,-61,-32,126;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00109;
//
ID   PA2_ASP_MP; MATRIX.
AC   MP00119;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phospholipase A2 aspartic acid active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3227072; R2=0.0089846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=498; N_SCORE=8.796; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-9,25,-24,21,5,-27,-1,-2,-26,-1,-26,-20,26,-10,0,-5,5,-1,-26,-34,-20,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-26,-2,-6,-25,21,-1,-29,-4,-24,-14,4,-13,-5,-5,1,-10,-23,-24,-17,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-22,0,-1,-21,-4,-9,-17,-3,-16,-9,2,-14,-1,-5,3,3,-12,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-22,-29,-21,-5,-31,-25,20,-24,10,7,-22,3,-19,-24,-17,-9,11,-24,-9,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-13,-19,-17,-13,-5,-22,-14,3,-10,-1,0,-12,-19,-10,-10,-3,10,6,-20,1,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-23,0,-4,-23,15,-10,-26,-3,-25,-15,9,-16,-6,-4,7,-3,-20,-27,-19,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-21,14,6,-22,-1,-4,-21,0,-19,-13,6,-4,-2,-5,1,-5,-17,-24,-15,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-24,10,3,-26,3,-6,-27,7,-26,-17,16,-11,-1,2,2,-6,-23,-28,-19,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='B'; M=-4,9,-13,9,6,-15,-2,0,-13,0,-12,-8,8,-6,5,-2,3,0,-13,-16,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-3,10,-9,8,0,-18,-4,-6,-18,-2,-19,-14,11,-8,-3,-5,9,6,-13,-26,-14,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-28,-4,5,-20,-13,-13,-19,1,-17,-12,-7,6,-1,-3,-4,-6,-18,-21,-15,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-29,-20,-30,-29,-30,-29,-20,-20,-20,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-50,-30,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-27,-2,15,-26,-10,-6,-21,8,-15,-8,-4,-9,15,5,-4,-9,-21,-23,-15,14;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-25,-4,6,-24,-15,-6,-22,20,-20,-8,0,-13,9,24,-3,-7,-16,-23,-13,6;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-14,-23,-18,-5,11,-22,-10,-7,-8,0,0,-11,-19,-4,-6,-10,-8,-8,-12,3,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-18,-32,-26,1,-31,-26,30,-24,22,16,-26,-26,-23,-22,-17,-5,31,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=0,16,-24,18,22,-28,-9,-3,-26,4,-22,-19,11,-9,6,-2,3,-7,-23,-30,-19,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-11,1,-17,-21,-8,-17,17,-12,-5,-6,-17,5,27,-9,-9,-11,-20,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=12,-8,-17,-12,-2,-17,-16,-16,-6,-2,-8,-4,-9,-13,-4,-8,1,2,1,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='A'; M=36,-14,-11,-22,-13,-14,-7,-21,-2,-13,-4,-5,-13,-14,-13,-20,5,0,6,-21,-16,-13;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-10,-21,-12,-18,-4,-21,-6,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-19,8,0,5,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-10,-26,-14,-8,-4,-27,-11,6,-6,1,2,-7,-19,-8,-9,-12,-6,1,-18,3,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-27,59,-29,-19,6,-29,20,8,-22,-29,-33,-19,-22,-10,3,1,21,-26;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,-17,-14,-6,-20,-4,-13,-17,2,-15,-9,-5,-13,-3,4,5,-1,-8,-22,-16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-27,7,10,-28,-3,-5,-30,12,-25,-16,4,-12,6,13,0,-8,-23,-26,-17,7;
MA   /M: SY='N'; M=12,12,-16,0,-3,-17,-3,-5,-15,-5,-20,-15,21,-15,-4,-8,12,4,-14,-30,-16,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-23,-5,0,-17,-18,-15,-16,-8,-19,-15,-6,24,-7,-11,6,16,-15,-29,-17,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-11,32,-22,19,4,-22,-5,9,-20,1,-27,-18,45,-18,3,-1,7,-2,-27,-37,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-26,8,6,-25,-13,-5,-22,14,-21,-12,10,-10,5,7,-3,-6,-20,-28,-14,5;
MA   /M: SY='K'; M=0,3,-23,1,7,-23,-12,-7,-23,17,-22,-13,6,-12,4,11,1,-3,-17,-25,-13,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,1,-25,-7,-11,9,-19,13,-8,-8,-6,-5,9,-25,-7,-6,-9,-7,-16,-7,25,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-13,-30,-14,-7,-2,-23,-4,-14,8,-11,-4,-11,-20,1,8,-15,-11,-15,11,16,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-12,5,-1,-5,-3,1,-10,-3,-13,-8,18,-10,-3,-3,4,-1,-13,-18,-7,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-17,-20,-15,3,-21,-13,19,-15,9,7,-12,-7,-11,-15,-12,-6,10,-8,4,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,11,-26,13,-2,-11,-11,-5,-19,-7,-19,-15,8,-11,-6,-10,-3,-7,-19,-19,-4,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00109;
//
ID   COLIPASE_MP; MATRIX.
AC   MP00121;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Colipase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1650562; R2=0.0116226; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1610; N_SCORE=22.867; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=201; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-10,-15,-10,-15,-9,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,23,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,4,-27,10,1,-18,-20,14,-20,-2,-5,-6,0,-20,0,11,-12,-12,-17,-28,-4,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-23,-11,-4,-16,-15,-3,-18,12,-15,1,-1,-17,5,33,1,-2,-11,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-30,11,37,-30,6,-6,-33,1,-23,-20,0,-6,9,-6,0,-13,-30,-27,-23,23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=5,-17,-32,-13,-3,-27,-15,-20,-17,-10,-25,-17,-17,65,-10,-20,-5,-7,-22,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-8,-27,-10,3,-5,-23,-7,-20,18,-17,-5,-5,-15,12,12,-10,-10,-18,-12,0,8;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-11,-1,-17,-23,-11,-16,23,-5,-1,-9,-18,1,24,-16,-10,-11,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-25,-7,-15,-27,51,-17,-35,-17,-30,-20,3,-17,-15,-17,11,-9,-25,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00111;
//
ID   CARBOXYLESTERASE_B_1_MP; MATRIX.
AC   MP00122;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Carboxylesterases type-B serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0674171; R2=0.0146735; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=847; N_SCORE=17.486; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-29,-1,19,-39,-20,9,-19,9,-19,0,-1,-11,58,9,0,-10,-28,-20,-10,38;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-15,-22,-17,-11,-9,-21,-6,-5,1,-5,-2,-10,-22,-4,13,-8,-5,2,-18,-1,-10;
MA   /M: SY='L'; M=4,-18,-17,-21,-12,-3,-21,-17,5,-16,20,9,-18,-20,-12,-15,-11,1,3,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='A'; M=40,-11,-13,-19,-12,-20,9,-20,-13,-12,-10,-10,-9,-12,-12,-20,7,-3,-4,-20,-21,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-14,-31,-22,6,-30,-20,21,-28,39,22,-27,-28,-19,-21,-27,-10,12,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-29,-2,12,-28,-20,5,-24,20,-19,-6,-1,-14,23,26,-7,-10,-22,-22,-9,16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30,13,-20,-30,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-29,144,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,15,14,-27,-27,-26,-23,-14,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-26,-3,7,-27,-16,4,-22,16,-21,-7,3,-13,21,15,-1,-7,-21,-22,-8,13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-28,20,19,-31,-13,0,-30,14,-25,-16,11,-11,15,13,-1,-8,-27,-29,-16,16;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-21,17,0,-20,-3,22,-21,-1,-29,-17,54,-20,1,0,7,-3,-30,-39,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-27,-37,-28,-2,-35,-29,43,-27,16,16,-19,-19,-19,-28,-16,-8,28,-21,-3,-28;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-17,-10,-3,-22,-6,-8,-12,-5,-14,-8,-6,-13,-2,-11,4,-4,-5,-24,-15,-3;
MA   /M: SY='A'; M=9,2,-19,-2,-2,-17,-5,-3,-17,-7,-18,-13,7,-10,-5,-8,8,-1,-13,-29,-15,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,68,-20,-40,-19,-30,-20,0,-20,-19,-18,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-28,52,18,-34,-9,2,-34,2,-28,-25,25,-11,2,-6,1,-8,-29,-38,-19,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-38,-10,0,-29,-20,-19,-20,-8,-28,-19,-18,78,-9,-17,-8,-8,-28,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-23,16,10,-25,-6,0,-25,2,-23,-16,15,-13,3,-2,6,-2,-22,-33,-16,6;
MA   /M: SY='N'; M=-9,10,-16,6,1,-23,-12,-3,-23,6,-23,-13,14,-17,6,8,2,-3,-21,-25,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-34,-29,39,-24,15,16,-25,-25,-24,-24,-15,-5,40,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-12,-14,-12,-8,-21,-20,-3,-13,-4,-4,-4,-13,-11,-12,13,39,3,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,36,-29,30,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-22,-32,-26,39,-23,-19,2,-24,5,-1,-20,-26,-28,-19,-15,-6,2,9,19,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-29,8,34,-23,-20,14,-24,4,-17,-10,1,-8,21,0,-3,-11,-26,-24,-6,27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-11,-19,-10,-20,2,-20,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-10,-19,10,1,-1,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=22,-8,-18,-12,-12,-24,27,-18,-24,-13,-22,-16,-2,-14,-12,-17,12,-4,-14,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='A'; M=15,-15,-16,-21,-15,-6,-12,-16,2,-14,-4,2,-11,-16,-12,-18,3,1,6,-21,-7,-14;
MA   /M: SY='S'; M=13,-2,-11,-4,-3,-20,2,-12,-18,-11,-27,-18,7,-11,-2,-12,34,15,-9,-37,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-12,-29,-27,-1,-28,-28,27,-20,10,9,-26,-27,-26,-20,-9,1,40,-28,-9,-27;
MA   /M: SY='H'; M=0,-2,-15,-4,-5,-18,-5,22,-21,-11,-20,-9,5,-17,-1,-9,9,-3,-15,-31,-6,-5;
MA   /M: SY='L'; M=7,-15,-13,-20,-14,-7,-17,-12,3,-17,11,6,-12,-21,-10,-16,-8,-5,2,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-26,-12,-3,-14,-23,30,-8,-12,6,10,-8,-21,12,-5,-15,-13,-14,-23,4,3;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-17,-27,-19,1,-25,-19,16,-21,25,18,-22,-23,-16,-18,-15,0,13,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-29,-20,2,-28,-19,22,-23,30,20,-24,-25,-14,-19,-20,-6,15,-22,-3,-18;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-17,-7,-4,-16,-9,5,-21,-5,-23,-12,2,-15,0,-1,15,5,-14,-21,-8,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-33,3,12,-28,-18,-11,-23,0,-26,-18,-6,41,0,-9,-5,-7,-27,-29,-21,3;
MA   /M: M=-4,-4,-23,-1,-5,-14,-9,-6,-11,-7,-8,-4,-6,-16,-6,-10,-4,-6,-7,-22,-5,-6;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-15,-12,-11,-5,-3,-11,-12,-13,-14,-6,1,-15,-9,-13,13,10,-7,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-27,5,7,-26,-9,-2,-29,18,-24,-14,5,-14,6,22,-3,-9,-22,-24,-13,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00112;
//
ID   ALKALINE_PHOSPHATASE_MP; MATRIX.
AC   MP00123;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alkaline phosphatase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2819023; R2=0.0152027; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=433; N_SCORE=11.855; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-19,-25,-23,-9,40,-27,-8,-10,-11,-1,-5,-14,-24,-18,-1,-15,-10,-9,1,22,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-27,-5,0,-20,-14,5,-16,-7,-20,-11,-9,46,-4,-11,-7,-9,-21,-21,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-16,-18,-18,-14,11,-22,3,4,-16,16,6,-15,-21,-11,-11,-15,-4,-1,-6,19,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-13,-22,-18,0,-22,-17,18,-16,13,15,-17,-18,-14,-14,-9,2,20,-19,-4,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=17,-8,-17,-11,-12,-20,31,-16,-21,-12,-17,-12,-3,-12,-12,-16,3,-9,-13,-16,-20,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-15,-16,-9,-3,-17,-9,6,-14,17,13,-14,-17,-2,-10,-10,-4,1,-18,-4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,-15,-6,-1,-18,-7,-5,-14,-2,-17,-4,1,-11,7,2,16,6,-9,-27,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-22,-8,-2,-18,-20,-11,-17,20,-16,-2,-2,-12,2,17,-1,10,-10,-23,-9,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-12,-9,-9,-11,-20,-8,-12,-10,-11,-9,1,-11,-8,-9,17,43,-3,-30,-7,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-26,-15,-15,20,-25,27,-4,-9,-2,0,-14,-25,-6,-8,-16,-10,-11,19,63,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=3,1,-7,-3,-4,-20,-7,-10,-17,-8,-23,-16,8,9,-6,-12,9,1,-16,-31,-21,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-4,-18,-1,-10,-12,-22,-17,-1,-8,-2,-4,-10,-21,-14,-5,-5,4,10,-30,-11,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-18,37,9,-22,-5,2,-22,0,-19,-18,20,-8,0,-5,2,-5,-19,-26,-13,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=2,-2,-16,-3,7,-16,-9,-5,-16,13,-13,-8,-2,-7,4,15,-2,-5,-11,-14,-9,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-17,-4,1,-15,-9,-7,-14,5,-16,-9,-3,16,0,6,0,-2,-13,-16,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-4,3,-17,8,9,-17,-8,-6,-15,-2,-16,-13,-1,18,0,-7,3,-2,-15,-20,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-1,-12,1,-2,-7,-10,-1,-5,-4,-8,-4,-3,-11,2,-5,1,-1,-3,-11,3,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,1,-26,-4,0,-12,-19,15,-11,-3,-9,-2,6,-20,17,-1,-7,-8,-20,-14,11,7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-8,-21,-11,-6,-18,-19,-20,-14,-10,-17,-14,-8,27,-10,-14,8,25,-11,-29,-18,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-18,-10,-21,5,-19,-13,-11,-13,-12,-8,-11,-10,-19,12,0,-3,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-3,-18,-13,-22,10,-20,-17,-13,-15,-13,-8,-14,-13,-20,8,-3,-6,-23,-23,-13;
MA   /M: SY='T'; M=12,-5,-15,-11,-11,-18,9,-19,-18,-12,-17,-14,-1,-12,-11,-15,15,18,-8,-26,-18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,14,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-28,-30,-31,-24,30,-27,-7,0,-19,6,4,-26,-29,-19,-16,-26,-14,-8,41,40,-21;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-14,-20,-12,-7,-13,-18,0,-18,11,0,-14,-18,-12,-18,0,0,2,-25,-12,-12;
MA   /M: SY='C'; M=0,-12,61,-22,-21,-17,-23,-25,-21,-21,-15,-15,-12,-26,-21,-22,3,12,-5,-40,-22,-21;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-16,-22,-23,-5,-26,-21,19,-12,2,5,-14,-26,-20,-8,-9,-2,29,-29,-10,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='T'; M=11,-3,-11,-12,-11,-14,-9,-20,-12,-11,-11,-11,-2,-11,-11,-13,16,34,-2,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,4,-23,-4,-13,5,-17,10,-5,-7,-11,-7,12,-26,-8,-7,-6,-5,-11,-7,27,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-12,18,-22,5,1,-7,-10,5,-14,-3,-18,-8,30,-19,2,-3,1,-4,-22,-26,-7,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-28,-1,-7,-29,32,-8,-32,-3,-29,-16,14,-18,-2,-5,1,-13,-29,-25,-23,-4;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,-12,-16,-10,-15,-12,-18,-9,-6,-10,-8,-7,-13,-9,-6,9,16,2,-24,-15,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-33,-26,-1,-34,-28,34,-25,16,13,-24,-15,-23,-25,-17,-7,30,-24,-6,-27;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-25,-10,-16,-28,54,-19,-34,-18,-28,-19,0,-18,-16,-19,6,-13,-24,-22,-28,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00113;
//
ID   FBPASE_MP; MATRIX.
AC   MP00124;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fructose-1-6-bisphosphatase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9967654; R2=0.0124877; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=12.503; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=201; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-10,-30,-10,-3,-3,-25,7,-14,16,-14,-4,-10,-20,7,8,-13,-10,-17,4,33,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-12,-30,45,-17,-37,-1,-30,-17,0,-17,-12,-6,-3,-17,-27,-20,-24,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,19,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-18,-25,-18,1,-20,-19,10,-23,26,13,-20,-23,-16,-18,-15,1,6,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-9,-28,-13,-16,21,-25,18,-4,-8,-5,-4,-6,-28,-8,-8,-15,-8,-14,17,62,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-33,-8,0,-25,-16,-16,-16,-8,-25,-16,-16,74,-8,-16,-8,-8,-25,-25,-25,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-8,-16,-13,-18,6,-18,-16,-11,-11,-10,-9,-20,-13,-8,0,-7,-7,-25,-19,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-9,30,-22,36,8,-28,-11,-6,-28,-4,-23,-22,15,-11,-3,-10,9,10,-19,-36,-17,2;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-19,-5,2,-23,-4,-13,-19,3,-21,-13,0,-11,0,-3,11,4,-11,-27,-17,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-31,-5,3,-26,-15,-7,-28,24,-26,-13,-1,4,6,29,-7,-9,-23,-23,-15,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-20,8,2,-21,-12,-3,-22,8,-25,-15,14,-13,1,2,11,9,-17,-30,-10,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=3,-8,-25,-6,5,-23,-14,-15,-18,-2,-22,-15,-8,28,-3,-10,4,4,-17,-27,-20,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-26,10,11,-26,-13,10,-26,12,-26,-14,17,-10,10,9,2,-5,-25,-30,-12,10;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-28,-9,0,-19,-19,0,-28,28,-19,-9,0,-19,9,65,-9,-9,-19,-19,-9,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-21,7,-30,-13,20,-27,36,17,-26,-28,-19,-19,-25,-9,14,-20,3,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,13,0,-14,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=13,-18,33,-24,-22,-15,-15,-25,-9,-20,-10,-9,-17,-25,-22,-23,-1,-2,7,-34,-21,-22;
MA   /M: SY='A'; M=12,3,-17,-8,-9,-2,-8,-2,-14,-11,-13,-11,10,-17,-11,-13,2,-4,-12,-21,-8,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-22,-33,-24,2,-29,-17,30,-22,26,34,-23,-23,-14,-19,-22,-9,20,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-12,-17,-10,-21,6,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,12,0,-4,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-36,-27,62,-30,-16,4,-28,16,4,-22,-30,-33,-19,-22,-10,1,7,30,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-21,-33,-26,-2,-29,-23,33,-21,15,23,-22,-22,-17,-22,-15,-6,28,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-28,16,52,-28,-20,-2,-28,8,-19,-18,0,-1,18,-1,2,-4,-27,-30,-19,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,8,-28,4,15,-35,-16,7,-22,15,-24,-5,11,-12,40,12,0,-8,-28,-24,-12,27;
MA   /M: SY='A'; M=47,-11,-10,-21,-11,-19,-2,-21,-8,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,3,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=1,-12,-22,-15,-10,-11,-3,-14,-13,-2,-11,-4,-7,-18,-6,-1,-3,-7,-8,-20,-11,-8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-8,-11,-15,-8,-21,4,-18,-14,-11,-15,-13,-5,-11,-8,-18,16,3,-4,-24,-21,-8;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-11,-9,-9,-8,-13,-17,-10,-12,-16,-12,1,-13,-9,-11,24,30,0,-32,-12,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-21,33,6,-26,-13,-7,-26,-4,-22,-21,15,-11,-4,-9,9,15,-18,-36,-16,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-2,-15,-30,56,-17,-38,-17,-30,-21,3,-18,-16,-18,4,-15,-28,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-17,-9,-2,-17,-22,9,-17,9,-14,-5,-2,-19,3,15,-9,-8,-13,-23,-2,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00114;
//
ID   SER_THR_PHOSPHATASE_MP; MATRIX.
AC   MP00125;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine/threonine specific protein phosphatases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1325245; R2=0.0150006; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=244; N_SCORE=8.788; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-8,-20,-14,-13,-6,-19,-13,8,-19,7,2,1,-21,-11,-15,-3,-1,1,-29,-9,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-1,8,4,3,-19,-23,-15,-14,-12,-7,-11,-10,-21,-11,-15,-8,-8,-5,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,19,-27,-23,-11,-20,-27,3,-19,-3,-3,-21,-26,-23,-22,-3,-2,20,-31,-18,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-24,-16,4,-24,-18,11,-26,33,11,-21,-26,-16,-18,-15,-4,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-7,10,-4,-22,-8,-24,19,-17,-10,-4,-14,1,22,-10,-10,-18,-16,-4,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-8,2,-19,-3,0,-15,-18,-9,-10,1,-14,-9,7,-17,-4,7,3,8,-4,-30,-14,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-20,-13,25,-28,9,-5,-10,-2,0,-15,-25,0,-8,-15,-10,-12,14,48,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,18,-12,11,8,-12,-3,4,-12,1,-15,-11,24,-8,3,0,4,-1,-16,-21,-11,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-4,-38,-2,-9,-11,-15,-12,-26,-3,-24,-20,-5,-22,-7,2,-19,-18,-28,50,5,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-21,-36,-28,38,-32,-23,18,-29,21,10,-24,-28,-30,-22,-21,-9,15,-8,12,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-2,-22,-6,-4,-16,-20,27,-22,-1,-16,-6,4,-16,2,11,3,12,-15,-28,1,-4;
MA   /M: SY='L'; M=8,-19,-17,-23,-15,-5,-18,-20,10,-21,13,4,-14,-19,-13,-20,-3,-1,7,-25,-9,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-17,-21,-22,-2,-25,-19,20,-19,10,7,-9,-26,-20,-17,-11,-3,22,-29,-9,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=14,7,-19,8,5,-29,-7,-7,-21,-3,-20,-14,3,-10,10,-9,11,-1,-15,-28,-18,7;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-21,-27,-17,11,-19,-7,2,-7,6,24,-15,-21,-8,2,-14,-9,1,-14,2,-12;
MA   /M: SY='M'; M=2,-4,-21,-8,-4,-18,-14,-3,-3,-5,-2,20,-8,-14,9,-8,-6,-8,-6,-23,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-36,-26,2,-33,-21,37,-26,27,29,-22,-22,-16,-23,-22,-10,21,-20,0,-23;
MA   /M: SY='B'; M=-10,28,-23,25,16,-25,-11,0,-25,0,-24,-20,26,-11,3,-4,7,5,-24,-36,-18,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-20,-16,-9,-20,5,-14,-12,-13,-3,-4,-10,-17,-1,-14,-3,-8,-10,-20,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-28,-20,18,-28,-18,7,-15,18,7,-21,-28,-20,-1,-20,-8,9,-15,3,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-29,-5,15,10,-25,5,-14,-4,-8,-9,-11,-16,-1,-7,-11,-10,-18,0,28,6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-25,-10,-13,-23,29,-16,-31,-7,-23,-15,0,-18,-11,2,2,-2,-21,-22,-21,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-18,-24,-21,37,0,-16,-9,-21,-1,-5,-11,-21,-27,-16,-11,-10,-7,1,10,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,6,-19,9,-1,-8,-15,0,-16,0,-12,-10,1,-13,-3,3,-1,5,-12,-13,7,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-7,1,-29,5,-6,-26,21,-14,-29,-2,-19,-14,0,-17,-10,-7,-6,-15,-22,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,24,-25,20,33,-25,-11,5,-25,5,-25,-20,27,-9,11,0,5,-5,-30,-35,-20,22;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-24,27,-32,-28,-7,-30,-23,12,-23,4,14,-22,-29,-21,-23,-14,-8,16,-32,-12,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00115;
//
ID   PDEASE_I_MP; MATRIX.
AC   MP00126;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4253583; R2=0.0157151; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=471; N_SCORE=12.817; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-23,-20,-24,-20,25,-28,-19,10,-26,27,9,-23,-28,-25,-19,-22,-9,8,-14,6,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,8,-14,1,-3,-16,-8,-12,-17,-8,-19,-15,11,-12,-5,-9,20,28,-10,-33,-15,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-32,28,17,-33,-16,-1,-30,1,-27,-21,3,17,3,-8,-3,-8,-28,-33,-19,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-20,-29,-21,4,-27,-20,18,-24,28,17,-25,-26,-18,-19,-20,-5,13,-14,-1,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-13,18,-30,29,43,-33,-18,6,-32,7,-22,-20,5,-4,18,-2,-1,-11,-30,-32,-17,31;
MA   /M: SY='I'; M=1,-19,-21,-25,-16,-7,-26,-22,15,-15,7,5,-15,-18,-13,-12,-8,1,14,-23,-8,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-29,-21,14,-25,-19,14,-23,32,18,-25,-28,-20,-17,-24,-9,10,-17,2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-14,-14,-21,-13,-14,-2,-20,-4,-16,0,-4,-12,-15,-13,-20,2,-3,0,-21,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=3,-23,-18,-26,-18,-1,-18,-20,12,-23,25,12,-22,-23,-16,-20,-15,-7,9,-22,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-9,-32,-24,12,-31,-20,18,-27,29,15,-26,-29,-22,-21,-24,-9,12,-18,4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-21,-32,-25,17,-31,-23,22,-24,15,14,-19,-23,-22,-21,-14,0,17,-16,4,-24;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-12,-15,-9,-21,7,-18,-15,-11,-16,-13,-5,-11,-9,-18,15,2,-5,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,29,-23,-17,-20,-6,-23,-17,-17,-14,-13,-13,-20,-17,-23,3,-4,-4,-29,-23,-17;
MA   /M: SY='L'; M=10,-21,-12,-28,-19,-1,-20,-20,11,-20,14,10,-19,-21,-16,-20,-10,-4,10,-20,-7,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-20,37,-28,-25,-13,-19,-26,-3,-24,-7,-4,-16,-28,-22,-25,-7,-5,4,-35,-18,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-24,10,-31,-17,23,-24,27,14,-27,-29,-21,-19,-22,-7,20,-14,11,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-29,54,20,-37,-3,-1,-38,-1,-29,-27,18,-10,1,-9,1,-10,-30,-37,-21,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-14,-33,-10,-1,-24,-20,-13,-22,4,-24,-15,-11,39,-3,13,-6,-3,-23,-26,-21,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-12,-18,-17,-14,4,-24,-10,-6,-6,-5,-3,-9,-20,-13,1,-1,13,2,-19,2,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-5,21,-16,7,-5,-17,-3,-3,-18,-5,-23,-17,33,-16,-5,-5,15,17,-18,-35,-17,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,36,-21,18,2,-22,-2,10,-20,1,-29,-18,54,-19,6,1,9,-1,-30,-38,-19,4;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-18,-6,-1,-22,-9,-9,-15,-7,-17,-11,2,-2,6,-9,13,7,-13,-29,-17,2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-32,-26,57,-30,-6,2,-23,10,2,-21,-30,-28,-17,-21,-10,-2,14,44,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-16,-25,-17,-5,-10,-26,5,3,-14,17,13,-15,-22,10,-8,-17,-11,-7,-21,-1,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-5,-29,-21,-9,-30,-21,19,-17,5,13,-19,-23,-12,-19,-13,-8,17,-26,-8,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-7,14,-24,6,6,-27,-12,2,-22,15,-25,-11,22,-14,16,11,2,-3,-24,-28,-14,11;
MA   /M: SY='T'; M=8,-7,1,-13,-11,-11,-12,-17,-11,-13,-14,-9,-3,-15,-10,-14,17,19,-1,-31,-14,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-27,8,15,-28,-7,-1,-27,12,-25,-14,11,-12,14,12,2,-7,-25,-28,-16,14;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-17,3,0,-20,-10,11,-21,-7,-23,-14,13,-13,3,-6,19,14,-15,-35,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-30,4,21,-25,-19,-2,-22,1,-21,-15,-6,17,6,-6,-2,-8,-22,-26,-14,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-16,-28,-20,8,-29,-21,14,-24,35,14,-27,-25,-20,-18,-25,-9,10,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-16,-21,-21,-13,-10,-24,-16,12,-13,6,8,-12,-19,-5,-13,-8,-3,8,-24,-7,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-22,-22,-13,2,-26,-14,13,-20,31,17,-17,-25,-13,-12,-22,-9,4,-22,-3,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-21,-20,32,-29,21,-2,-12,0,0,-18,-29,-12,-10,-19,-11,-10,25,72,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,18,-16,7,-1,-24,3,-1,-24,3,-29,-17,30,-17,1,0,9,-2,-25,-34,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-23,37,8,-28,-9,2,-29,-3,-26,-22,23,-12,-1,-8,9,4,-23,-38,-17,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00116;
//
ID   RNASE_PANCREATIC_MP; MATRIX.
AC   MP00127;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pancreatic ribonuclease family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2897406; R2=0.0121888; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=388; N_SCORE=9.009; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-5,9,-23,-20,-1,-30,30,-21,-11,0,-16,11,56,-9,-10,-21,-21,-11,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-29,-14,-9,4,-24,17,-10,-2,-9,-3,-12,-19,5,2,-13,-10,-16,7,41,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,27,-21,17,8,-20,-7,2,-21,-1,-24,-19,35,-15,0,-4,8,3,-24,-35,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-17,-9,-6,-14,-18,-11,-6,-4,-10,-5,-1,-18,-1,-2,5,8,0,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='M'; M=6,-17,-20,-26,-15,-7,-18,-10,13,-10,9,29,-16,-16,-5,-14,-11,-7,8,-20,-6,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-22,-3,21,-12,22,55,-21,-21,-2,-12,-21,-10,11,-20,0,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-3,3,-22,-17,-8,-18,12,-16,-8,-1,-15,7,15,-1,-5,-12,-25,-12,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-23,-7,-5,-19,-5,-6,-21,7,-18,-11,6,-19,0,21,0,-5,-15,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-19,-28,-22,-13,-10,-27,-13,2,4,0,3,-11,-22,-4,26,-15,-9,2,-21,-6,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-24,4,-6,-16,9,0,-24,-4,-25,-16,24,-20,-2,0,3,-6,-25,-25,-12,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-11,-21,-18,-14,-5,-20,-8,9,-8,10,19,-6,-21,-6,-4,-14,-7,3,-23,-5,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-16,-13,-14,5,-22,-7,-3,-11,-6,-5,-4,-18,-12,-10,3,21,-1,-12,15,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-18,-7,-2,-21,-7,-7,-17,-2,-19,-10,0,-8,6,2,12,8,-12,-26,-15,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-18,-4,-3,-15,-1,-3,-14,-7,-15,-9,-3,21,-5,-9,-1,-2,-15,-17,-12,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-23,-6,1,-18,-15,12,-19,8,-16,-6,-1,-7,9,20,-4,-6,-17,-17,-4,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-27,12,8,-26,-8,-6,-26,-3,-25,-19,5,10,0,-5,3,-4,-24,-31,-19,2;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-22,-20,-10,-4,-25,-15,4,-7,3,5,-14,-20,-5,-1,-9,-3,5,-22,-5,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,21,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,59,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-4,-30,-5,-4,-15,-22,81,-22,-11,-14,2,5,-21,6,-1,-12,-18,-24,-26,20,-4;
MA   /M: SY='S'; M=4,3,-20,2,9,-23,4,-12,-24,-6,-20,-17,3,-10,-1,-10,11,6,-17,-28,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,6,-21,6,0,-22,-10,-10,-20,-6,-25,-18,9,8,-4,-7,14,10,-16,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-19,-23,-22,-13,12,-20,-18,-6,-11,-3,-4,-14,-3,-17,-11,-9,-6,-6,-14,-2,-15;
MA   /M: SY='A'; M=7,-1,-21,-3,6,-22,-11,-8,-19,1,-18,-13,1,-12,6,2,7,1,-14,-20,-15,5;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-22,26,7,-25,-9,2,-25,-3,-26,-20,24,-9,-1,-7,9,3,-22,-37,-17,3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-17,-33,-28,1,-32,-28,33,-24,18,14,-26,-26,-25,-23,-15,-4,36,-25,-6,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-21,-7,-2,-22,-18,-11,-12,13,-16,-5,-3,-16,4,8,-3,-2,-4,-25,-12,1;
MA   /M: SY='A'; M=28,-4,-14,-13,-8,-19,-2,-12,-11,-9,-13,-10,0,-12,-6,-15,9,3,-6,-24,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-18,-31,-26,-1,-32,-28,31,-23,14,12,-22,-23,-22,-22,-11,3,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-24,4,-2,-22,8,-9,-24,-7,-22,-15,5,-14,-4,-8,6,-2,-18,-28,-17,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-24,8,1,-23,-3,-3,-21,-3,-18,-11,15,-14,3,-2,3,-2,-21,-30,-17,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00118;
//
ID   LACTALBUMIN_LYSOZYME_MP; MATRIX.
AC   MP00128;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-lactalbumin / lysozyme C signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2291403; R2=0.0109256; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=979; N_SCORE=14.915; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-3,-28,-2,1,-13,-21,7,-11,5,-10,5,-6,-17,18,1,-10,-10,-17,-9,15,8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,16,-14,7,0,-12,-4,4,-14,5,-17,-11,27,-12,2,12,3,-2,-17,-21,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-2,16,-15,20,4,-22,1,-4,-22,-5,-24,-18,14,-9,-1,-8,16,4,-16,-30,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-26,-4,2,-17,-17,2,-24,25,-20,-8,3,-15,5,32,-7,-8,-18,-20,-6,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-32,-19,-17,12,-21,-1,-8,-11,-6,-6,-18,-26,-12,-9,-20,-13,-14,36,38,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30,12,-20,-30,-20,-20,-19,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-29,147,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-23,11,4,-25,-5,-1,-24,7,-26,-16,21,-15,4,6,6,-3,-21,-32,-17,4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-26,32,11,-31,-7,-1,-30,1,-28,-23,17,-4,0,-5,5,-4,-25,-36,-19,5;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-23,-5,-9,-20,22,-11,-24,-9,-20,-14,3,-15,-9,-11,3,-6,-19,-22,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-23,1,8,-25,-15,-5,-23,19,-23,-11,3,-11,13,15,4,0,-18,-24,-11,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-16,-7,-6,-12,-8,-12,-14,-7,-14,-11,2,-9,-7,-7,11,20,-8,-27,-12,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-26,-4,2,-21,-13,-12,-16,-3,-19,-13,-10,36,-4,-5,-4,-6,-18,-23,-19,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-3,-23,-5,-3,-10,-1,5,-18,-3,-16,-8,2,-10,-1,-1,-5,-10,-17,-17,-5,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-11,-6,-2,-18,2,-12,-15,-9,-19,-14,1,-10,-3,-12,21,8,-7,-28,-18,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-10,-24,-10,-4,-16,-12,-8,-13,5,-15,-8,-6,-13,-5,7,-6,-7,-5,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,21,3,-23,-3,6,-23,5,-30,-20,49,-18,1,2,8,-1,-28,-38,-19,2;
MA   /M: SY='A'; M=4,-9,-22,-10,-7,-14,-9,-13,-3,-14,-3,-4,-9,-17,-11,-16,-6,-8,-1,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-12,12,-27,10,0,-26,4,27,-30,-2,-26,-13,18,-18,3,1,-1,-12,-28,-30,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,1,-35,-27,38,-26,19,18,-23,-24,-22,-25,-17,-6,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-18,-3,-2,-17,-10,-9,-16,-7,-19,-12,1,-2,-2,-8,16,10,-11,-30,-12,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,14,-17,14,5,-24,-5,-5,-24,-3,-27,-19,16,-11,3,-5,22,9,-17,-37,-19,4;
MA   /M: SY='K'; M=8,5,-23,4,11,-27,-12,-9,-22,12,-20,-13,0,-10,5,1,0,-6,-15,-25,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-19,17,-29,43,18,-28,-30,-22,-20,-28,-10,8,-15,5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-18,6,-29,-17,18,-24,41,21,-27,-28,-15,-15,-27,-10,9,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-22,23,9,-25,-12,-5,-24,-1,-21,-17,14,-12,2,-4,7,8,-19,-33,-16,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,34,-28,46,13,-35,-9,-3,-33,-2,-29,-26,17,1,-2,-11,2,-7,-27,-38,-21,5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-27,54,16,-34,-8,3,-34,0,-30,-27,31,-12,1,-7,3,-7,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-16,-3,-1,-16,-17,-16,-13,-3,-12,-11,-1,-10,-5,-7,11,24,-5,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,24,-26,32,11,-32,-12,-3,-28,6,-25,-19,11,-10,3,-3,1,-7,-20,-33,-17,7;
MA   /M: SY='D'; M=12,14,-18,16,2,-26,-4,-11,-23,-7,-21,-19,5,-10,-5,-14,12,5,-13,-31,-19,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-20,-32,-26,-2,-31,-27,33,-23,11,12,-21,-23,-22,-23,-11,-4,33,-25,-6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-5,-22,-10,-2,-18,-18,-5,-10,7,-12,-1,-2,-15,2,5,-3,-2,-7,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=47,-11,-10,-21,-11,-19,-2,-21,-7,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,3,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,7,-27,-20,-8,-25,41,-23,-3,-2,-12,10,27,-11,-10,-17,-20,-9,8;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,6,-26,-20,-4,-28,39,-25,-9,0,-13,10,36,-9,-8,-19,-21,-9,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-16,-27,-23,3,-28,-19,18,-19,16,9,-25,-28,-21,-17,-14,-3,26,-21,1,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-24,7,6,-27,-10,-6,-27,15,-25,-14,4,-12,9,16,5,-3,-19,-28,-15,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-19,20,16,-20,-2,-2,-20,0,-13,-13,4,-6,3,-4,-1,-7,-17,-20,-13,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-27,-9,-1,-23,-13,-12,-15,2,-19,-10,-8,19,1,1,-3,-5,-16,-23,-17,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,4,-28,4,15,-29,-16,17,-23,9,-20,-7,7,-13,26,8,-3,-10,-25,-26,-8,19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-17,-29,60,-18,-38,-14,-30,-19,2,-20,-17,-14,0,-18,-29,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-27,-36,-26,11,-30,-20,26,-24,19,24,-23,-24,-17,-21,-23,-12,13,-1,6,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,13,-22,12,-1,-24,1,-7,-26,-1,-24,-16,14,-15,-2,1,7,5,-20,-31,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-18,-17,-11,-8,-9,-3,-9,-10,-10,-8,-9,-11,-9,-16,1,-4,-7,-10,6,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-19,-19,-20,-16,3,-22,-10,5,-13,7,2,-17,-24,-13,-12,-7,-2,7,-14,11,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00119;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F31_1_MP; MATRIX.
AC   MP00129;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 31 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5390115; R2=0.0155774; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=274; N_SCORE=9.797; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-22,-38,-24,-16,6,-17,-19,-17,-15,-17,-14,-19,-24,-13,-15,-22,-18,-24,77,15,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,-21,-18,-11,-4,-11,-16,-4,-14,2,3,-15,-19,-10,-16,-9,-8,-2,-8,-6,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,9,-26,7,-1,-8,-2,-5,-22,-4,-17,-11,10,-18,-7,-3,-5,-10,-20,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-22,-2,15,-16,-17,-6,-11,-2,-5,-4,-3,-13,3,-2,-2,-5,-11,-28,-14,8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-23,-32,-24,17,-32,-22,20,-22,17,10,-20,-24,-22,-19,-18,-5,14,-13,8,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-21,-4,-5,-16,-16,-4,-12,0,-15,-5,-5,-8,-5,-6,1,1,-6,-25,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-24,6,10,-23,-16,-7,-17,5,-17,-12,4,-12,4,3,0,-4,-13,-28,-15,6;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-25,-30,-31,-25,39,-25,-13,-5,-21,0,-5,-20,-29,-25,-17,-24,-14,-11,44,32,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-29,-8,0,-9,-20,14,-16,-3,-12,-7,-5,-11,3,3,-9,-10,-20,-6,11,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,5,-24,6,-2,-27,16,-11,-29,-3,-25,-18,6,-14,-6,-5,5,-5,-21,-27,-21,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-20,0,-2,-17,-17,-11,-7,-4,-8,-6,-1,-13,0,-6,3,4,-6,-26,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=1,-19,-15,-22,-16,-4,-24,-20,10,-18,14,6,-19,-22,-12,-15,-8,6,14,-25,-8,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-33,-5,-3,-28,-4,-12,-24,-11,-27,-18,-10,45,-10,-17,-4,-7,-26,-29,-24,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-14,-20,-23,-21,19,-24,-15,13,-19,4,3,-5,-23,-21,-17,-11,-6,9,-13,7,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-24,31,9,-24,-14,-7,-21,-9,-9,-15,4,-14,-4,-12,-2,-6,-17,-34,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-15,-28,-17,-22,-5,44,-18,-30,-21,-20,-15,-5,-23,-23,-19,-5,-17,-23,-11,-12,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-35,-27,8,-33,-25,33,-26,23,20,-24,-25,-22,-23,-20,-8,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-3,-22,-13,-15,-3,-20,-9,9,-15,1,0,5,-22,-12,-14,-7,-2,1,-22,1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,35,-19,17,-1,-20,0,7,-19,-1,-29,-19,53,-19,-1,-2,12,1,-27,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-23,-29,-20,-12,-12,-23,-23,-2,-15,-13,-8,-22,40,-18,-21,-10,-7,-4,-25,-18,-18;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-17,3,-8,-15,-11,-9,-4,-10,-16,-10,16,-19,-9,-11,9,3,-1,-36,-16,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-5,19,-11,-16,-16,-22,-17,-7,-15,-13,-9,0,-25,-15,-13,-3,-4,-1,-37,-17,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-22,-4,-8,-19,4,-13,-17,-5,-17,-11,0,-19,-10,1,0,-4,-6,-28,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-12,-29,-10,-11,-27,24,-19,-28,-15,-27,-18,-7,18,-14,-19,1,-8,-24,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-23,0,17,-21,-15,-10,-15,-2,-17,-13,-2,-1,3,-8,9,0,-14,-31,-17,9;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-15,18,-17,-8,-16,-26,-21,-9,-16,-9,-8,-15,-9,-12,-18,-6,0,-4,-34,-18,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-20,-11,-12,-15,1,-17,-10,-14,-9,-4,-4,-15,-9,-14,5,12,-6,-26,-14,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-22,-5,-3,-17,-8,-9,-12,-5,-12,-1,0,-8,-3,-5,2,3,-10,-27,-14,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-13,-2,-9,-23,3,-10,-21,-15,-15,-13,-7,-6,-13,-18,-5,-11,-15,-29,-19,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-26,-5,2,-22,-19,-9,-12,14,-18,-4,0,-5,5,5,-5,-6,-11,-26,-13,3;
MA   /M: SY='B'; M=-10,8,-22,8,-6,-14,-13,-8,-8,-12,-5,-8,5,-19,-10,-13,-4,-3,-8,-28,-8,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00120;
//
ID   U_DNA_GLYCOSYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00130;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uracil-DNA glycosylase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6478949; R2=0.0166239; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=330; N_SCORE=11.124; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-30,-5,2,-23,-18,11,-19,-9,-23,-12,-8,31,-3,-12,-2,-7,-20,-31,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-25,10,18,-25,-11,-1,-25,2,-22,-16,4,-5,7,0,5,-2,-21,-29,-15,12;
MA   /M: SY='B'; M=-13,24,-26,24,13,-26,-12,1,-24,4,-19,-16,21,-14,6,1,-1,-7,-25,-33,-16,9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-29,8,-35,-27,35,-26,18,15,-24,-25,-25,-25,-18,-7,31,-20,1,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-21,-36,-27,64,-29,-12,1,-28,13,2,-20,-29,-34,-18,-21,-11,-1,5,28,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-2,-10,-8,-5,-19,-14,-1,-17,3,-19,-10,6,-18,0,11,2,-4,-13,-29,-13,-5;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-23,-21,-10,-16,-10,-18,-12,-10,-14,-10,-16,-10,-2,-15,-4,-8,-10,14,-8,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-18,-30,-22,41,-25,-19,2,-26,15,2,-17,-26,-27,-18,-12,-2,2,-8,12,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,3,-24,0,0,-15,-14,7,-23,8,-22,-12,9,-16,1,10,1,-3,-19,-19,-3,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-23,-24,-14,12,-26,-7,4,-19,16,7,-19,-24,-8,-14,-18,-8,-3,-7,11,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,16,-14,-13,0,-17,-16,-10,-13,-8,-8,-5,-15,-14,-12,5,18,-2,-22,-7,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-14,-33,-8,1,-28,-12,-18,-21,-7,-28,-19,-13,58,-7,-16,-2,-6,-25,-30,-27,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-27,-25,-16,13,-27,-18,1,-21,7,0,-24,11,-21,-19,-19,-9,-5,-14,2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-28,16,15,-23,-17,3,-23,6,-20,-14,6,-12,7,4,-2,-7,-21,-25,-6,10;
MA   /M: SY='E'; M=1,11,-23,11,13,-27,-10,-4,-24,7,-23,-16,10,-11,8,4,6,-3,-20,-30,-17,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-17,-24,-21,-6,-29,-25,18,-9,2,5,-19,-22,-19,-12,-7,5,27,-27,-8,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-13,-31,-29,0,-30,-29,31,-21,13,11,-28,-28,-28,-21,-12,-2,44,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,0,-34,-28,-1,-34,-28,28,-27,16,11,-24,-27,-24,-26,-18,-7,26,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-29,25,19,-24,-24,-21,-26,-21,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-7,-31,-25,8,-31,-22,19,-26,27,13,-27,-30,-23,-21,-22,-8,18,-21,1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-30,-6,12,-34,-23,4,-9,4,-14,3,-3,-12,48,4,-3,-10,-21,-20,-8,29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-10,-35,-5,0,-25,-20,42,-25,-10,-25,-10,-4,33,0,-10,-10,-15,-30,-30,-4,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,3,-21,0,-5,-24,11,-12,-25,-5,-24,-16,8,-14,-3,-7,11,7,-18,-28,-19,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-22,-6,1,-18,-15,-12,-11,-5,-15,-10,-8,25,-2,-8,-1,2,-13,-21,-15,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-25,-4,-12,-20,37,-9,-28,-12,-22,-15,4,-17,-10,-13,-1,-14,-24,-15,-14,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-14,7,-28,10,9,-28,-19,23,-23,0,-15,-6,4,-15,22,3,-4,-8,-24,-27,-4,14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-18,-14,-6,-22,7,-19,-15,-11,-15,-12,-9,-4,-10,-18,5,-5,-7,-23,-22,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-9,-4,-8,-16,-20,32,-16,-12,-13,-1,5,-20,-3,-8,-3,-2,-14,-32,0,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-13,-30,62,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-26,-17,2,-28,-18,15,-21,33,15,-25,-28,-12,-11,-23,-8,11,-22,-3,-15;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,9,-10,0,-23,-12,-17,-21,-11,-21,-17,-8,0,-7,-17,8,-1,-13,-34,-24,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-38,-29,68,-30,-21,4,-29,14,2,-22,-30,-38,-20,-20,-9,4,5,25,-29;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-13,-2,7,-23,-7,-12,-21,-8,-25,-19,0,6,-1,-12,20,7,-15,-35,-22,2;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-11,-18,-17,-9,-21,-21,10,-14,-4,0,-15,-22,-14,-14,6,10,24,-32,-13,-16;
MA   /M: SY='P'; M=1,-2,-24,-4,-2,-22,-13,-9,-17,3,-18,-12,2,4,-1,4,-2,-5,-15,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-15,26,-26,25,7,-27,-10,2,-29,13,-28,-19,27,-16,4,17,0,-6,-26,-33,-16,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00121;
//
ID   CARBOXYPEPT_SER_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00131;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine carboxypeptidases, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5329866; R2=0.0154105; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=232; N_SCORE=9.098; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=6,0,-21,-2,7,-27,-12,-6,-20,7,-20,-10,0,-11,15,6,7,1,-16,-25,-14,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-33,-28,-39,-29,55,-27,-23,-3,-27,6,-3,-26,-30,-33,-20,-26,-15,-7,45,27,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-22,-35,-27,61,-30,-12,3,-26,13,5,-21,-30,-31,-18,-21,-10,0,9,34,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-19,-2,5,-22,-13,-5,-15,1,-18,-10,7,-13,9,1,8,4,-12,-29,-15,7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-16,-7,7,-22,-21,-9,-19,17,-14,-5,-6,-15,6,14,-9,-9,-14,-24,-12,6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-15,-24,-22,-16,37,-24,10,-11,-16,-3,-2,-5,-25,-17,-6,-14,-11,-12,-5,21,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-36,-8,3,-30,-19,-16,-21,-3,-29,-17,-15,67,-1,-13,-6,-8,-28,-29,-26,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,6,23,-28,-18,15,-25,8,-21,-10,5,-9,22,4,2,-4,-25,-28,-9,22;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-24,-29,-23,39,-30,-5,7,-23,19,7,-23,-30,-23,-16,-23,-10,0,8,38,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-24,-8,1,-19,-20,-7,-8,7,-8,3,-2,-15,8,5,-6,-4,-9,-24,-10,4;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-22,-1,-1,-19,-6,2,-21,4,-23,-12,10,-15,4,1,7,3,-19,-24,-5,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-25,-2,-1,-19,-15,14,-22,12,-22,-10,13,-19,4,26,-1,-6,-17,-28,-8,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-31,23,14,-32,-16,-7,-28,3,-27,-21,4,20,3,-6,-2,-6,-27,-32,-21,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-19,-34,-25,51,-29,-20,5,-28,19,5,-21,-28,-31,-19,-19,-4,3,-3,17,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-25,-27,-23,43,-28,4,-1,-17,3,-1,-19,-29,-20,-14,-18,-9,-6,20,57,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,38,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-12,-21,-17,2,-16,-20,1,-15,-3,-1,-12,-18,-17,-16,5,9,11,-23,-8,-16;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-24,-11,-16,-26,48,-19,-32,-17,-26,-18,-1,-17,-16,-19,6,-9,-22,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-13,-26,-16,-11,-14,-27,14,2,-2,-7,4,-8,-20,-6,-4,-12,-11,4,-25,1,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-31,-26,-22,25,-29,7,4,-14,2,4,-22,-28,-13,-13,-22,-12,-6,33,59,-21;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,-15,-24,-22,-9,-11,-25,12,-19,-1,1,-17,-22,-21,-20,-2,-2,22,-27,-14,-22;
MA   /M: SY='P'; M=2,-19,-32,-14,-5,-25,-17,-21,-14,-11,-23,-15,-19,61,-12,-20,-6,-7,-17,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=1,1,-21,-5,3,-21,-8,-7,-15,1,-14,-3,3,-12,6,-3,3,5,-14,-25,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-33,-23,26,-31,-21,17,-29,33,13,-25,-28,-25,-21,-24,-7,9,-13,7,-23;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-14,-14,-11,-20,12,-19,-16,-13,-16,-13,-5,-13,-11,-17,13,4,-6,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-23,2,5,-17,-16,3,-15,-5,-8,-7,-4,-15,3,-8,-2,-6,-14,-22,-3,3;
MA   /M: M=0,-9,-20,-10,0,-10,-18,-10,-7,-5,-1,-4,-8,-17,-5,-2,-3,-2,-4,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-22,-20,-14,-2,-28,8,10,-18,11,8,-17,-25,-13,-14,-16,-9,11,-22,6,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,18,14,-29,-13,-3,-27,11,-23,-16,8,-11,11,5,4,-4,-22,-31,-15,12;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-23,-9,-3,-17,10,-8,-21,-9,-17,-12,-4,-16,-3,-9,4,-7,-17,-17,-7,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,2,-25,-6,-8,-17,-13,-7,-1,-10,-12,-5,12,-8,-1,-10,-3,-6,-9,-29,-14,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00122;
//
ID   CARBOXYPEPT_ZN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00132;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc carboxypeptidases, zinc-binding region 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9998269; R2=0.0166200; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=138; N_SCORE=8.283; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=31; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,3,-27,-2,0,-20,-15,3,-27,22,-23,-13,15,-20,7,52,-5,-7,-23,-25,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-25,-6,-3,-22,-14,-15,-17,-9,-24,-17,-2,35,-7,-14,8,11,-18,-32,-22,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-24,-34,-24,1,-30,-15,33,-21,24,38,-21,-21,-11,-20,-21,-10,19,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-31,-21,-17,12,-26,0,-2,-7,0,-1,-17,-26,-10,-8,-21,-12,-10,26,41,-16;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-14,-27,-24,-3,-18,-23,16,-19,9,8,-24,-26,-23,-19,-9,-3,28,-24,-8,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-23,7,-30,-21,24,-27,38,21,-29,-29,-21,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-29,4,21,-28,-20,-3,-27,32,-25,-11,-1,-9,11,18,-7,-10,-20,-24,-11,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-21,-36,-28,21,-33,-24,27,-27,20,15,-24,-26,-26,-23,-19,-8,23,-15,5,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-16,-6,-8,-17,13,-14,-21,-14,-23,-16,4,-14,-8,-13,23,9,-13,-32,-19,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-24,16,6,-26,-11,-8,-26,8,-22,-16,4,-11,1,2,2,3,-18,-26,-12,3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-24,-2,-5,-18,6,3,-23,-3,-22,-12,12,-9,-2,-5,0,-6,-23,-23,-11,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-19,-6,-2,-14,-11,-11,-8,-3,-13,-8,-10,35,-6,-8,-5,-5,-10,-15,-14,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-15,-8,-9,-14,18,-11,-13,-7,-12,-7,-3,-5,-8,-9,-1,-8,-10,-11,-13,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-13,-3,6,-10,-12,-4,-4,-4,-6,-4,-4,0,-1,-6,0,1,-3,-16,-7,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-8,6,-15,9,6,-13,-8,30,-16,-3,-12,-5,6,-8,4,-2,-1,-7,-15,-17,2,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-28,4,11,-27,21,-9,-31,-4,-24,-18,4,-13,-2,-5,0,-13,-26,-25,-23,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-24,-7,-2,-18,-13,-12,-10,-5,-14,-9,-5,19,-5,-10,-3,-4,-13,-25,-17,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-26,3,-1,-24,14,-8,-26,-5,-20,-15,11,-14,-6,-4,-1,-10,-24,-27,-21,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-28,1,19,-25,-20,-4,-24,23,-21,-11,-1,-10,10,22,-4,-8,-18,-25,-13,13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-8,2,-30,-20,-18,-22,2,-30,-18,-16,70,-6,-10,-10,-10,-28,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='E'; M=9,-3,-23,-3,17,-23,-7,-11,-18,-1,-14,-13,-5,-8,2,-6,2,-5,-14,-25,-18,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-37,-30,18,-35,-28,34,-27,15,13,-23,-25,-27,-25,-17,-7,29,-16,4,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-21,-29,-24,-15,16,-24,-8,-11,-4,-5,-4,-17,-24,-15,-3,-21,-14,-11,20,13,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-26,-29,-23,20,-30,-3,17,-19,16,17,-22,-26,-14,-16,-22,-10,5,2,34,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-23,15,2,-21,-20,-13,-9,-5,-12,-11,2,-14,-7,-11,-2,1,-3,-32,-13,-3;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,14,-19,-17,-21,10,-22,-22,-18,-16,-14,-9,-20,-17,-22,3,-4,-10,-28,-24,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-26,-1,-12,-25,39,-7,-31,-14,-27,-18,17,-20,-12,-13,4,-11,-27,-27,-24,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-25,-34,-24,10,-30,-13,26,-21,15,27,-18,-21,-13,-19,-18,-10,14,-16,4,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-16,-15,-12,-23,21,-19,-20,-13,-18,-14,-5,-13,-12,-19,10,-4,-10,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,9,-27,3,1,-21,-13,3,-27,19,-24,-14,20,-20,6,44,-3,-7,-24,-27,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-29,-36,-31,-24,1,-19,-14,-12,-17,-14,-12,-28,-26,-17,-17,-24,-17,-13,77,16,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-16,-9,-10,-20,16,-17,-22,-13,-22,-16,1,-13,-10,-14,18,14,-12,-28,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-29,-11,-2,-22,-22,-5,-15,4,-18,-8,-10,13,2,10,-7,-5,-13,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='E'; M=18,-2,-20,-1,20,-25,-10,-11,-20,-2,-17,-16,-5,1,3,-11,7,-3,-15,-27,-21,12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-17,-26,-19,14,-25,-18,8,-21,17,10,-17,-22,-18,-17,-10,7,6,-17,1,-18;
MA   /M: SY='C'; M=3,-22,11,-27,-22,-8,-15,-24,1,-23,8,1,-21,-27,-21,-22,-12,-8,6,-25,-14,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-15,-23,-14,-5,-28,-14,10,-17,16,12,-18,-22,-3,-14,-14,-2,4,-21,-2,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-23,-34,-26,-19,9,-23,-8,-10,-14,-8,-8,-21,-25,-11,-11,-22,-12,-17,56,27,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-20,-32,-23,25,-29,-22,15,-27,22,9,-21,-25,-24,-21,-17,-2,9,-12,7,-23;
MA   /M: SY='V'; M=5,-22,-17,-26,-20,-4,-23,-22,16,-19,12,8,-19,-22,-17,-17,-8,-1,19,-24,-8,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,11,-27,8,8,-21,-15,4,-23,13,-23,-13,14,-15,12,15,-1,-6,-24,-23,-5,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-29,-2,11,-9,-23,0,-16,5,-12,-6,-6,-14,12,1,-9,-10,-18,-12,6,11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-16,-30,-22,11,-27,-17,15,-24,22,11,-23,-26,-20,-21,-19,-8,9,-13,7,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,11,-26,-23,-4,-24,-25,6,-23,10,2,-21,-27,-23,-20,-9,4,15,-30,-12,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-23,3,9,-23,-16,0,-19,4,-16,-9,7,-13,12,5,4,3,-18,-28,-12,10;
MA   /M: SY='B'; M=-1,11,-21,10,8,-24,-4,-6,-25,1,-23,-18,11,-12,2,-1,10,4,-19,-31,-18,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-27,-14,-11,22,-27,12,-5,-11,-1,-3,-15,-25,-10,-11,-15,-9,-11,11,50,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-24,-8,-11,-22,21,-14,-22,-10,-16,-11,-1,-19,-9,-9,-2,-9,-16,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,4,-22,0,4,-21,-15,-5,-19,8,-17,-10,7,-14,7,9,3,3,-16,-26,-11,5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-27,25,10,-28,-1,-1,-30,2,-26,-20,16,-13,4,0,2,-8,-26,-30,-15,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,3,-25,2,-3,-21,-15,-9,-13,-3,-20,-12,5,6,-5,-7,2,0,-13,-31,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-24,-4,5,-22,-18,-2,-16,4,-17,-9,-3,-5,4,4,0,-1,-12,-26,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-25,-26,-14,-3,-28,-16,16,-12,8,14,-15,-19,-8,-6,-14,-6,10,-20,-3,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00123;
//
ID   CARBOXYPEPT_ZN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00133;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc carboxypeptidases, zinc-binding region 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8990211; R2=0.0163409; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=171; N_SCORE=8.683; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=37; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,30,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-17,-23,-25,-16,39,-24,-10,-10,-11,-3,-4,-7,-25,-17,3,-13,-9,-10,-3,14,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-23,-31,-21,-2,-34,-27,34,-23,16,13,-22,-22,-20,-23,-16,-7,29,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-16,-22,-20,-12,-8,-25,-13,7,-4,4,14,-13,-19,-5,3,-10,0,7,-23,-6,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,4,-24,1,4,-27,1,-1,-27,12,-28,-14,9,-13,4,5,5,-5,-22,-27,-15,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-18,-32,-18,-16,-4,0,-2,-19,-13,-15,-11,-14,-21,-11,-12,-18,-18,-22,46,12,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-13,-24,-15,-11,-10,-24,3,1,-8,4,7,-10,-20,-6,-3,-13,-7,0,-24,-2,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-26,-7,-3,-22,2,-6,-21,6,-18,-6,-1,-16,6,5,-2,-9,-19,-20,-10,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-21,4,7,-24,-11,-3,-22,8,-24,-14,13,-12,10,8,11,5,-19,-30,-15,8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-27,-35,-25,13,-36,-23,33,-27,18,14,-20,-23,-21,-25,-20,-10,20,-14,8,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-30,-5,1,-24,-16,-11,-24,18,-26,-13,-4,14,0,9,-6,-4,-21,-22,-12,-1;
MA   /M: SY='F'; M=12,-18,-11,-27,-20,18,-12,-21,-5,-19,-3,-6,-14,-20,-24,-20,-3,-1,2,-12,-1,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-24,-20,-26,-23,17,-28,-4,11,-17,7,6,-22,-28,-20,-15,-15,-6,14,-4,26,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,19,-20,0,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,20,-17,15,1,-21,-7,-5,-21,-5,-24,-19,23,-13,-3,-8,17,16,-16,-36,-17,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-35,-25,29,-31,-21,17,-28,28,15,-25,-28,-25,-21,-25,-11,9,-4,10,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=7,-4,-17,-6,-9,-22,23,-15,-25,-14,-26,-18,4,-14,-9,-14,21,8,-15,-30,-22,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-30,-16,-20,8,6,6,-14,-14,-11,-7,-13,-26,-14,-14,-13,-14,-17,12,40,-20;
MA   /M: SY='S'; M=12,4,-13,5,5,-23,-2,-10,-21,-8,-26,-19,7,-9,0,-11,29,12,-12,-36,-20,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-26,-8,10,-21,-24,-3,-6,-4,2,4,-11,-16,25,-2,-9,-9,-12,-22,-9,18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-17,-27,-19,2,-27,-17,21,-19,24,24,-26,-26,-16,-16,-19,-6,22,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='I'; M=4,-26,-19,-30,-23,-1,-25,-24,19,-22,18,11,-25,-24,-19,-21,-16,-7,19,-12,-5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-9,-19,-16,-13,-3,-18,-9,7,-17,15,14,-3,-23,-9,-13,-9,-2,0,-27,-7,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-31,-25,-22,33,-29,9,-1,-14,0,-1,-22,-30,-15,-13,-22,-12,-10,38,68,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-29,-26,-23,41,-29,7,-1,-16,1,-1,-21,-30,-18,-13,-21,-11,-9,32,65,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,13,-26,20,-2,-32,28,-11,-36,-11,-29,-23,8,-15,-10,-15,6,-10,-26,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-6,-28,-6,-8,12,-24,15,-11,-5,-8,-4,-7,-23,-6,-4,-14,-10,-15,4,39,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,5,-16,0,-4,-17,-10,-13,-17,-4,-18,-14,7,-12,-5,-6,15,23,-10,-31,-14,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-10,-15,-8,-1,-20,-5,-10,-7,-5,-6,-13,-23,-8,-2,-8,-7,-8,-13,11,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-6,12,-24,11,11,-26,-10,2,-25,6,-23,-14,11,-11,8,1,4,1,-22,-29,-14,9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-1,-26,3,-2,-22,-6,-4,-20,-7,-14,-11,-4,5,-7,-11,-5,-7,-18,-26,-14,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-12,-13,-15,-11,1,-16,-9,3,-11,4,3,-9,-14,-9,-7,-5,3,4,-9,-1,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=7,-10,-21,-9,-3,-19,-6,-16,-12,-9,-16,-12,-8,18,-9,-15,1,-3,-9,-25,-20,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,0,-27,6,6,-25,-13,-4,-22,-1,-23,-16,-3,23,-1,-3,-1,-6,-21,-27,-18,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-9,20,-26,20,7,-26,1,-4,-25,-5,-22,-19,19,-10,-3,-9,1,-7,-25,-33,-20,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-26,-19,-13,12,-22,7,-7,-9,-2,3,-9,-24,-7,-5,-15,-11,-11,1,19,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-18,0,12,-20,-11,-3,-15,2,-15,-6,2,-9,11,2,7,-1,-13,-25,-13,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-17,11,14,-18,-17,-6,-25,3,-18,-16,4,-13,1,4,-1,-3,-19,-29,-14,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=2,-16,-15,-18,-12,-4,-18,-16,4,-18,14,3,-14,-20,-10,-15,-2,4,4,-25,-8,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,13,-29,19,7,-21,-15,-4,-21,-5,-18,-16,7,6,-1,-10,-5,-8,-23,-28,-13,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00123;
//
ID   TRYPSIN_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00134;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, trypsin family, histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=234;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=229;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0169; R2=0.00836256; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1134; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=775; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-26,-37,-28,0,-35,-29,41,-28,20,17,-22,-22,-21,-27,-19,-9,29,-21,-2,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-30,-25,0,-31,-26,26,-20,10,9,-24,-25,-23,-20,-13,-3,32,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-27,-5,-15,-28,54,-15,-35,-16,-29,-20,8,-19,-16,-17,3,-15,-28,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-29,-7,-16,-29,60,-18,-37,-18,-28,-18,1,-19,-17,-18,0,-18,-29,-21,-28,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-19,-4,4,-13,-16,0,-15,-1,-14,-7,0,-14,5,0,4,2,-12,-23,-5,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-24,7,13,-22,-14,-7,-18,0,-17,-13,0,-3,1,-5,0,-4,-15,-29,-16,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,10,-17,-13,-18,-13,-20,-10,-14,-12,-10,-8,-15,-11,-19,6,5,-1,-29,-18,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-3,2,-22,1,2,-19,-15,-5,-15,-1,-14,-10,2,-10,0,-3,2,2,-12,-27,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-28,-15,-3,-16,-21,-14,-3,-6,-9,-4,-12,8,-4,-7,-8,-8,-7,-21,-12,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-26,-4,-8,-23,21,5,-28,-11,-22,-13,6,-18,-6,-9,1,-10,-24,-24,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-21,5,12,-24,-9,-1,-22,1,-21,-13,7,-11,9,-2,10,0,-18,-30,-15,10;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-17,-25,-20,-14,8,-22,-3,-14,-12,-10,-7,-14,-23,-8,-5,-15,-12,-14,20,11,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-30,-19,-19,-21,-8,-30,-19,-19,83,-9,-16,-10,-10,-29,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-38,-32,-25,19,-23,-13,-12,-18,-12,-12,-29,-29,-18,-17,-27,-19,-18,86,36,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-25,-15,-1,-18,-24,-2,2,-6,4,15,-12,-17,23,-4,-11,-8,-7,-20,-5,10;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-11,-26,-21,-9,-16,-26,13,-16,2,2,-21,-21,-21,-20,-2,0,26,-25,-14,-21;
MA   /M: SY='S'; M=8,-8,-16,-11,-8,-8,-5,-14,-12,-11,-11,-8,-4,-16,-9,-12,10,3,-6,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-23,8,-31,-22,24,-28,35,17,-27,-24,-21,-22,-24,-8,16,-20,-1,-23;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-25,-10,-4,-6,-17,1,-11,-2,-8,-3,-5,-19,6,2,-6,-6,-12,-13,8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-23,-15,-13,0,-21,-6,0,-8,-3,3,-9,-19,-9,-3,-8,-4,0,-13,6,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-22,0,3,-19,-8,-3,-20,3,-19,-12,6,-10,1,5,4,0,-17,-25,-12,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-1,-15,-3,-3,-11,-5,-4,-10,-5,-11,-7,4,-12,-2,-3,4,1,-9,-19,-8,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-20,-5,-9,-13,19,-10,-20,-8,-15,-11,-3,-14,-8,-7,-3,-10,-16,-5,-9,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-23,-1,0,-16,-8,-2,-21,5,-19,-11,5,-15,2,10,0,-4,-17,-22,-8,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-25,-11,-5,-4,-22,29,-11,-14,-1,1,-7,-17,-2,-8,-11,-10,-13,-18,9,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-22,-24,-17,15,-23,-12,-2,-16,2,0,-15,-22,-15,-10,-11,-2,-2,-1,6,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-19,103,-28,-29,-20,-23,-29,-29,-28,-20,-20,-18,-37,-28,-29,-9,-9,-11,-44,-28,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-27,-11,-18,-27,52,-19,-31,-18,-25,-16,-1,-18,-16,-19,2,-13,-23,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-26,-12,-19,-28,59,-20,-35,-20,-26,-18,-2,-20,-19,-20,0,-18,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='S'; M=9,-9,-10,-13,-11,-11,-9,-18,-6,-14,-14,-10,-4,-15,-11,-15,18,16,4,-31,-15,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-31,-20,23,-28,42,19,-28,-28,-20,-21,-27,-10,13,-18,3,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-34,-26,3,-34,-24,34,-26,19,15,-24,-21,-21,-24,-19,-8,25,-19,3,-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,14,-19,10,1,-22,-1,6,-23,-4,-26,-17,20,-14,-1,-6,13,2,-20,-34,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,7,14,-26,-13,-7,-23,3,-22,-16,2,7,3,-3,2,-2,-21,-30,-18,8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-17,5,7,-23,-17,3,-24,8,-20,-12,7,-16,10,12,-2,-6,-21,-27,-9,7;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-33,-41,-35,-27,13,-22,-24,-11,-18,-13,-13,-31,-27,-20,-18,-30,-21,-18,97,25,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-14,-31,-28,-1,-30,-29,31,-22,13,11,-27,-27,-26,-22,-12,-2,41,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,9,-30,-21,23,-27,37,20,-28,-28,-21,-20,-25,-8,17,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-10,-10,-13,-11,1,-11,-9,-10,23,43,0,-32,-12,-9;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-11,-19,-10,-20,-2,-15,-11,-10,-11,-10,-9,-11,-9,-19,10,1,-1,-21,-18,-10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-13,-17,-8,-21,5,-18,-14,-9,-13,-12,-8,-11,-9,-16,9,-2,-5,-21,-21,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-29,0,1,-21,-19,89,-29,-8,-21,-1,9,-19,11,0,-7,-17,-29,-30,16,1;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,112,-28,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-20,-19,-18,-39,-29,-29,-9,-9,-9,-49,-29,-29;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-17,-25,-20,17,-24,-17,11,-19,14,7,-20,-23,-21,-14,-15,-5,12,-11,5,-20; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-17,-3,-3,-10,-12,2,-11,-6,-11,-6,-2,-12,-1,-6,-1,-4,-9,-18,0,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-19,4,-2,-18,14,-6,-21,-6,-18,-13,9,-11,-4,-7,3,-6,-18,-21,-15,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: M=-6,-5,-15,-6,-5,-8,-10,-6,-7,-3,-8,-5,-2,-9,-3,0,-1,-2,-7,-16,-4,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='A'; M=2,0,-12,-1,-1,-10,-4,0,-9,-3,-7,-5,0,-3,-2,-4,-1,-3,-8,-13,-6,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-18,10,7,-19,-9,-4,-17,1,-16,-12,6,0,1,-2,3,2,-15,-23,-12,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-20,-8,-5,-18,-4,-11,-13,-6,-14,-9,-5,2,-5,-9,0,-2,-11,-20,-15,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-20,1,4,-18,-8,3,-21,3,-21,-13,5,-12,2,4,7,1,-16,-26,-9,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-22,5,3,-17,-9,-5,-17,-2,-16,-12,3,-12,-1,-3,2,-2,-14,-25,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-25,-27,-22,12,-27,-10,12,-19,10,9,-22,-21,-17,-17,-19,-9,6,6,19,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-23,-6,2,-19,-17,-9,-16,9,-15,-7,-2,-14,5,8,0,2,-11,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-16,-31,-27,-2,-30,-28,30,-21,11,11,-26,-23,-25,-22,-11,-2,37,-26,-8,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-17,-22,-20,-16,0,-23,-13,1,-7,-1,0,-13,-24,-12,2,-12,-5,3,-10,2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-19,-24,-19,4,-20,-18,10,-23,22,9,-22,-26,-19,-18,-16,-6,9,-19,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-17,-29,58,-15,-37,-18,-28,-18,1,-19,-16,-17,1,-16,-28,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-5,-20,-6,2,-16,-12,-10,-13,-3,-9,-6,-5,-14,-2,-4,1,-1,-9,-26,-13,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-6,-24,-7,-7,-11,-17,29,-14,-10,-9,-3,-2,-18,-3,-5,-6,-6,-13,-22,7,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-21,5,-2,-13,-13,-2,-17,-3,-18,-12,10,-17,-4,-2,5,1,-13,-26,-8,-4;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-18,-19,-12,0,-22,-12,8,-11,13,8,-15,-18,-8,-5,-13,-3,5,-13,-1,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-14,-2,-1,-11,-8,-3,-11,3,-11,-6,4,-11,1,7,1,0,-8,-16,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-17,-1,1,-14,-10,-3,-14,5,-13,-8,0,-9,3,9,0,-2,-10,-14,-6,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-18,0,0,-14,-8,-1,-14,-4,-12,-8,2,-11,0,-3,0,-3,-12,-20,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-20,11,15,-21,-8,-5,-21,-2,-17,-15,4,-8,3,-6,5,-2,-17,-27,-15,8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-27,0,8,-24,-6,0,-23,-1,-21,-12,-1,4,4,-4,0,-8,-22,-24,-14,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-2,-23,-3,-3,-21,-1,-2,-23,-3,-21,-12,1,-10,-1,-1,1,-3,-19,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-24,-1,7,-23,1,-9,-22,-2,-19,-13,-2,-11,1,-6,2,-5,-18,-23,-15,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-25,-8,2,-23,-19,-1,-9,1,-10,0,-2,-13,19,1,-4,-5,-12,-24,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-9,-22,-10,-7,-11,-23,-5,-2,-8,-2,0,-9,-17,-6,-8,-6,-1,1,-23,-5,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-22,-20,-12,2,-24,-7,2,-12,2,2,-14,-18,-11,-5,-9,-5,3,-19,1,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-25,-1,6,-20,-11,-4,-20,3,-18,-11,2,-5,4,2,0,-4,-19,-24,-12,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-17,-22,-22,-6,-23,-25,18,-19,4,4,-19,-19,-21,-20,-6,0,26,-28,-11,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-22,3,11,-24,-12,-7,-22,7,-20,-14,2,-11,5,5,6,1,-16,-28,-15,7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-26,3,10,-26,-13,-2,-26,16,-22,-12,3,-12,10,16,0,-4,-20,-25,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-17,-29,-23,2,-29,-23,23,-20,11,9,-21,-24,-20,-20,-11,-2,24,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-22,-25,-20,7,-28,-19,14,-15,6,6,-17,-23,-18,-12,-13,-6,14,-15,3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-15,-22,-17,-4,-26,-18,8,-17,2,2,-16,-12,-15,-16,-10,-2,8,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-25,-4,-3,-15,-15,66,-25,-10,-18,-4,8,-18,3,-4,-7,-16,-25,-26,11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-33,-1,15,-29,-18,-10,-23,-1,-27,-18,-8,45,1,-9,-3,-7,-27,-30,-23,5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-24,3,0,-22,4,-3,-24,1,-20,-13,10,-17,-3,-1,-1,-8,-21,-27,-15,-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-23,-21,32,-26,5,0,-14,1,-1,-19,-27,-16,-12,-18,-10,-5,21,54,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-20,8,0,-14,-10,-1,-16,0,-18,-12,19,-11,-1,0,3,-1,-17,-27,-11,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-19,-3,-1,-14,-11,-8,-14,-2,-14,-9,-3,1,-2,-2,2,0,-11,-21,-10,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-19,-1,2,-14,-7,-7,-15,-2,-13,-10,0,-8,-1,-2,3,-1,-12,-19,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-15,-7,-7,-8,-8,-11,-10,-8,-9,-8,2,-13,-7,-6,6,9,-6,-23,-10,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-20,-16,-13,7,-18,-1,1,-12,4,5,-8,-20,-10,-9,-11,-5,-3,-9,14,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,17,7,-24,-5,-1,-23,-2,-18,-14,8,-12,0,-6,-2,-8,-20,-28,-14,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-22,6,-4,-12,-7,10,-18,-2,-22,-14,25,-19,-3,-3,3,-4,-21,-26,-3,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-30,67,19,-39,-10,1,-39,0,-30,-29,21,-10,1,-9,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-28,4,-36,-25,38,-28,23,17,-23,-24,-21,-26,-21,-9,26,-16,3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-15,-19,-11,-15,-4,-15,-5,-11,-3,4,-12,-14,-8,-16,1,-3,0,-22,-15,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-30,-21,7,-29,-21,21,-27,41,18,-28,-28,-20,-20,-26,-8,13,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-24,5,-33,-23,30,-27,32,20,-26,-26,-20,-21,-23,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,9,-24,-21,0,-23,25,-21,-7,-2,-13,11,25,-8,-9,-17,-21,-8,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-20,9,-30,-20,21,-29,46,19,-29,-29,-20,-20,-27,-8,12,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-22,4,10,-24,-12,-8,-22,6,-21,-14,2,-4,5,0,6,1,-17,-28,-16,7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-24,4,8,-24,-11,-1,-24,6,-22,-14,6,-8,8,9,5,-1,-21,-28,-14,7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-28,0,5,-27,-16,-12,-21,3,-26,-15,-6,33,-1,-6,-1,-5,-22,-29,-21,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=9,-24,-14,-28,-23,-4,-22,-25,19,-20,11,8,-24,-22,-22,-21,-9,-3,27,-25,-10,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-5,2,-21,0,3,-21,-16,-8,-17,6,-18,-11,4,-10,3,7,4,5,-11,-28,-14,2;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-21,-28,-19,23,-27,-14,8,-21,18,9,-21,-23,-20,-16,-19,-8,3,-8,13,-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,10,-16,3,-4,-20,2,-8,-20,-7,-25,-17,18,-14,-4,-8,19,14,-16,-32,-18,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-24,12,11,-26,-12,0,-24,1,-23,-16,7,-3,7,-2,6,0,-21,-31,-15,8;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-21,-10,-9,-3,-14,8,-14,-6,-11,-6,1,-19,-5,0,-1,1,-12,-16,5,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-17,-31,-27,0,-30,-27,30,-22,12,11,-24,-25,-24,-22,-11,-2,36,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-23,-9,-1,-20,-15,-5,-15,5,-10,-3,-4,-16,8,13,-3,-4,-12,-23,-11,2;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-29,-12,-4,-22,-17,-19,-13,-10,-20,-14,-15,50,-10,-17,-4,-1,-17,-27,-22,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-20,-30,-24,-1,-28,-25,30,-23,17,12,-20,-20,-19,-23,-14,-4,24,-21,-4,-24; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-10,41,-14,-11,-16,-19,-15,-23,-14,-19,-15,-8,-17,-13,-14,-2,-5,-13,-34,-19,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,9,-28,-18,20,-27,43,18,-27,-27,-18,-19,-26,-9,10,-18,1,-19; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-30,-9,-1,-22,-15,-16,-15,-8,-22,-15,-16,61,-8,-15,-8,-8,-22,-18,-21,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-15,2,6,-11,-7,-4,-13,0,-12,-9,2,-2,2,-1,1,-2,-12,-13,-8,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=7,-2,-14,-4,2,-15,-8,-6,-12,-1,-12,-8,-1,-7,2,-4,5,0,-9,-16,-9,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-19,2,1,-17,-4,-7,-18,-2,-17,-12,5,-9,-1,-2,6,2,-15,-22,-12,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-18,4,6,-15,-13,-1,-16,-2,-15,-11,3,-12,4,-2,3,0,-15,-19,-4,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: M=-5,-5,-9,-6,-4,-10,-15,-10,-11,-9,-11,-9,-4,-7,-7,-11,-2,-1,-9,-21,-9,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-19,-18,-14,0,-20,-16,5,-15,3,1,-17,-4,-15,-16,-10,-4,6,-18,-4,-15; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-23,-8,-1,-16,-15,-11,-11,-1,-13,-7,-9,11,-2,-5,-3,-2,-11,-21,-12,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='P'; M=3,-3,-20,-2,-1,-16,-13,-12,-10,-8,-11,-10,-5,4,-8,-13,-1,-2,-7,-24,-15,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-5,-13,-22,38,-11,-29,-13,-23,-15,2,-16,-13,-14,-1,-13,-22,-17,-20,-13; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-3,-3,-14,-14,-9,-13,-1,-12,-7,-1,-12,-2,0,5,13,-8,-21,-8,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: M=-4,-8,-18,-11,-4,-12,-15,-10,-6,-4,-6,0,-6,-12,-2,-4,-2,0,-5,-17,-9,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='C'; M=1,-17,46,-23,-22,-15,-11,-24,-15,-21,-12,-11,-15,-26,-22,-22,-5,-6,-1,-34,-22,-22; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-22,-12,-8,-3,-21,-10,-4,-9,-4,-3,-10,-18,-6,-6,-5,1,-3,-9,2,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-15,-28,-24,-4,-27,-27,24,-20,7,7,-23,-19,-23,-21,-7,1,32,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-12,-10,-8,-14,-7,-15,-10,-11,-15,-10,0,-13,-7,-13,20,18,-2,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-17,-29,62,-15,-38,-19,-28,-18,0,-19,-17,-19,-1,-19,-29,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-33,-45,-34,-25,9,-20,-23,-19,-16,-18,-17,-32,-28,-14,-14,-34,-26,-28,119,28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-28,-8,-18,-29,60,-18,-36,-18,-28,-18,2,-19,-18,-19,1,-17,-28,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-23,-7,-3,-13,-17,0,-15,3,-11,-6,-1,-17,2,9,-3,-2,-12,-21,-4,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-16,-8,-5,-13,-20,-13,-5,-10,-5,-4,-3,-14,-4,-9,5,16,-2,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-3,1,-21,-1,3,-17,-9,-4,-20,2,-18,-11,4,-14,1,3,4,0,-16,-25,-11,2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-23,4,7,-19,-11,-3,-20,0,-18,-14,5,-7,1,0,2,-2,-17,-27,-12,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,3,-21,1,-4,-18,4,-6,-20,-1,-19,-13,8,-8,-4,0,1,-4,-17,-23,-14,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-21,-8,-10,-14,13,-14,-16,-12,-13,-9,-4,-15,-12,-12,-1,-8,-10,-17,-14,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-23,-6,-2,-17,-12,-11,-17,-2,-17,-12,-2,1,-3,-2,3,4,-13,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-23,-13,-10,0,-20,-8,-5,-11,-2,-3,-8,-13,-8,-8,-6,0,-7,-16,3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=7,-7,-23,-6,-3,-24,-4,-11,-20,-10,-24,-16,-4,18,-5,-15,10,2,-17,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-24,12,4,-22,-9,-5,-23,0,-21,-16,8,-9,0,0,4,-1,-17,-31,-16,1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-20,-15,-13,-10,-17,-13,1,-12,-4,0,-8,-17,-10,-11,-5,-1,4,-23,-8,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-19,-26,-16,4,-28,-18,12,-23,35,14,-26,-21,-15,-16,-26,-10,4,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-26,-5,7,-26,-19,1,-17,13,-14,-1,-2,-14,24,16,-5,-6,-18,-21,-9,15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-9,-7,4,-15,-22,-7,-14,1,-14,-8,-9,-17,2,-2,-5,-7,-8,-22,-6,3;
MA   /M: SY='V'; M=12,-21,-9,-25,-21,-8,-16,-22,9,-18,4,2,-20,-22,-20,-20,-5,-1,20,-26,-13,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-24,6,5,-20,-16,2,-16,3,-16,-9,11,-15,4,2,-1,-3,-16,-28,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-16,-27,-24,2,-28,-24,22,-22,18,11,-23,-26,-23,-20,-13,-1,27,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-30,-5,2,-24,-14,-13,-20,-3,-23,-15,-7,31,-3,-5,-2,-2,-22,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-32,-26,2,-32,-26,30,-24,20,14,-23,-25,-22,-22,-16,-5,27,-23,-3,-26;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-18,-26,-21,0,-25,-16,19,-19,11,12,-19,-23,-16,-17,-11,-4,20,-21,-3,-20; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,14,-20,15,7,-24,-4,-6,-23,-5,-25,-19,13,-4,-1,-8,15,6,-19,-34,-19,3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,10,-24,7,6,-23,-9,4,-22,3,-21,-12,14,-10,10,6,1,-5,-23,-26,-13,7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='E'; M=0,6,-22,8,16,-26,-12,-4,-22,5,-19,-13,2,-7,11,0,4,-3,-18,-26,-15,13; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-20,2,7,-19,-17,-8,-15,3,-13,-9,0,-11,3,1,2,5,-10,-26,-12,5; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-20,113,-29,-29,-19,-29,-29,-28,-29,-19,-19,-20,-38,-29,-29,-10,-9,-8,-48,-29,-29; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-13,-4,-1,-11,-8,-3,-10,2,-10,-5,-1,-10,3,4,2,-1,-7,-13,-6,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-20,-5,1,-12,-13,-2,-13,2,-12,-6,-3,-4,1,-1,-2,-4,-12,-17,-4,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-2,-3,-21,-3,0,-15,-8,-4,-15,0,-15,-9,-3,-7,-1,-3,-2,-4,-12,-17,-6,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-6,-20,-8,-8,-4,-10,-2,-10,-6,-11,-7,-3,-16,-7,-5,-1,-2,-8,-12,5,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-24,-8,-5,-3,-13,1,-11,-7,-9,-6,-8,-12,-6,-6,-8,-7,-11,-8,8,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-1,-25,-1,-1,-21,-4,-6,-19,-1,-19,-11,2,1,-2,-1,-2,-5,-19,-23,-14,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-4,-26,-2,0,-16,-2,-6,-20,-7,-16,-12,-3,-5,-5,-7,-3,-8,-18,-18,-10,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-1,-12,-20,-15,-10,-4,-16,-13,-3,-9,-3,-2,-9,-17,-9,-7,-5,-2,0,-17,-4,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-20,-29,-24,1,-28,-24,24,-22,11,10,-20,-22,-20,-21,-13,-4,23,-22,-3,-23; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-6,-5,-12,-13,-8,-15,-6,-15,-11,3,-10,-5,-4,11,20,-9,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-27,14,12,-27,-12,-6,-23,2,-24,-17,7,3,2,-5,2,-4,-21,-31,-18,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-22,4,2,-17,-4,0,-21,-1,-21,-14,17,-16,0,3,6,-1,-20,-29,-14,0;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-11,-21,-17,-9,-4,-19,-1,3,-8,4,27,-10,-15,1,-8,-9,-1,-1,-22,-2,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-33,-25,14,-32,-23,25,-26,23,16,-24,-26,-23,-21,-19,-6,20,-18,2,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,115,-28,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-17,-39,-29,-29,-9,-10,-11,-50,-30,-29;
MA   /M: SY='A'; M=32,-7,-12,-17,-11,-16,-4,-18,-7,-11,-10,-9,-5,-13,-11,-18,9,4,1,-23,-17,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-28,-8,-14,-24,50,-17,-34,-17,-25,-17,0,-18,-15,-17,-1,-16,-26,-19,-24,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-21,-12,-13,5,-12,-7,-5,-13,-4,-2,-10,-20,-13,-12,-8,-4,-4,-3,10,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-21,-9,-1,-9,-12,-10,-8,-7,-5,-4,-10,4,-5,-8,-6,-6,-9,-17,-9,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-21,9,13,-24,-13,-8,-23,6,-20,-15,3,-11,4,1,4,-1,-16,-29,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-26,-3,-5,-24,23,-9,-29,-9,-24,-16,3,-14,-8,-10,0,-11,-24,-21,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-28,-6,-9,-27,37,-14,-32,-10,-26,-16,-1,-16,-10,-10,0,-14,-24,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-24,-8,0,-20,-20,-9,-12,14,-15,-5,-5,-15,3,11,-4,-5,-5,-24,-10,1;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-26,47,12,-32,-4,-1,-33,-3,-25,-24,18,-12,-2,-9,3,-7,-25,-36,-18,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-13,-11,-6,-16,-6,-15,-13,-10,-17,-12,-3,-2,-6,-14,17,12,-6,-27,-17,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,98,-26,-25,-18,-28,-22,-28,-27,-19,-18,-18,-37,-26,-27,-10,-10,-11,-44,-23,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-27,1,10,-26,-14,2,-22,12,-22,-8,7,-11,24,9,0,-6,-24,-23,-10,17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-10,-19,-29,65,-20,-39,-20,-30,-20,-1,-16,-20,-20,0,-19,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,64,19,-38,-10,-1,-37,-1,-29,-28,18,-10,0,-10,1,-9,-28,-39,-20,9;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-12,1,0,-19,0,-9,-20,-10,-29,-20,9,-11,-1,-10,35,17,-11,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-18,-30,66,-19,-39,-19,-30,-19,0,-20,-17,-19,0,-20,-30,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-19,-29,63,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-19,3,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-36,-12,-3,-28,-17,-21,-17,-11,-26,-18,-19,74,-11,-20,-8,-9,-24,-29,-28,-11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-30,-21,14,-29,-15,18,-28,41,20,-27,-29,-20,-19,-27,-10,10,-18,3,-20;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-14,-28,-24,3,-24,-23,20,-19,9,8,-22,-24,-22,-19,-9,-2,29,-23,-6,-23; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-18,49,-24,-22,-11,-22,-23,-11,-21,-8,-8,-17,-23,-22,-21,-7,-4,1,-33,-18,-22; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-14,-3,4,-9,-9,3,-11,4,-8,-3,-2,-6,4,7,-3,-5,-10,-11,-4,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-14,2,4,-11,-10,-2,-11,2,-11,-7,1,-5,1,2,0,-1,-9,-15,-5,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-15,5,3,-15,-5,6,-16,2,-15,-9,10,-10,2,4,2,-2,-14,-19,-8,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-6,6,-16,6,-2,-16,5,-2,-18,-4,-15,-11,6,-11,-4,-5,1,-3,-15,-19,-9,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-23,1,1,-22,-6,-4,-22,3,-20,-12,6,-12,1,8,-1,-4,-18,-27,-15,0;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-13,-31,-17,-17,-2,4,-16,-20,-14,-18,-13,-7,-22,-15,-12,-11,-14,-21,27,1,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-22,-21,-13,8,-26,-10,3,-9,0,4,-15,-19,-8,-8,-10,-2,3,-11,11,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-20,-26,-17,1,-26,-19,14,-22,25,11,-24,-21,-13,-18,-18,-7,10,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-18,-18,-12,-9,-21,-11,3,-11,-2,1,-14,-19,-6,-10,-4,3,8,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-33,-27,0,-34,-27,35,-25,18,15,-22,-24,-22,-23,-16,-5,30,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-14,-27,-25,3,-28,-26,20,-20,8,6,-22,-24,-25,-19,-7,5,31,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-11,1,-1,-19,-1,-9,-18,-10,-28,-19,14,-11,-1,-10,35,18,-10,-39,-19,-1;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-37,-33,-25,22,-20,-17,-14,-19,-11,-12,-28,-24,-21,-17,-29,-21,-20,86,29,-20; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-26,-6,-16,-26,53,-16,-32,-17,-26,-17,3,-18,-17,-17,1,-15,-24,-21,-26,-17; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-22,-1,2,-10,-14,-2,-13,-2,-11,-8,-1,-13,-1,-2,-2,-4,-12,-16,0,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-25,-4,-8,-22,21,-14,-24,-9,-23,-15,-2,-1,-11,-12,-1,-10,-19,-22,-20,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,105,-27,-27,-19,-28,-26,-27,-27,-18,-18,-18,-36,-27,-27,-9,-9,-9,-46,-27,-27; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-16,-10,-7,-22,13,-12,-20,-9,-17,-12,-3,-11,-7,-13,6,-4,-12,-20,-18,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-23,-3,2,-18,-16,-4,-14,3,-9,-5,-2,-15,6,10,-3,-4,-12,-23,-9,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-24,-8,-4,-19,-6,-15,-18,-3,-20,-13,-7,13,-6,-6,0,-4,-15,-23,-18,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-23,6,2,-21,5,-3,-24,3,-23,-15,16,-15,0,4,2,-6,-22,-26,-16,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-25,-11,-5,-4,-19,-2,-13,5,-10,-5,-7,-13,0,6,-10,-7,-13,-6,9,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-35,-9,-2,-18,-20,-13,-16,-8,-23,-15,-17,58,-8,-16,-10,-9,-24,-20,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-26,-6,-14,-25,45,-17,-33,-16,-26,-18,2,-17,-15,-18,3,-14,-25,-22,-25,-14;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-13,-29,-27,3,-24,-27,24,-21,10,9,-25,-27,-27,-20,-11,-3,37,-24,-7,-27; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-27,-24,-21,34,-29,10,-1,-15,2,-1,-19,-30,-16,-12,-20,-11,-9,25,62,-21;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-13,-13,-9,-13,-13,-20,-7,-11,-10,-9,-4,-12,-10,-13,14,28,1,-28,-13,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-27,-3,2,-21,-15,-4,-24,19,-18,-10,1,-17,5,31,-6,-8,-18,-22,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-14,-29,-27,3,-30,-28,27,-22,14,10,-27,-28,-27,-20,-13,-2,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='S'; M=7,-10,-8,-14,-11,-8,-9,-14,-13,-13,-15,-12,-5,-10,-11,-15,9,7,-8,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-23,-3,-1,-16,-14,-2,-17,6,-16,-10,2,-14,0,6,0,-3,-13,-23,-5,-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-24,-28,-23,37,-28,-1,4,-20,10,4,-20,-29,-21,-15,-20,-9,-1,9,41,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-20,-21,-14,-5,-25,-13,7,-10,11,8,-16,-23,-7,-4,-13,-4,8,-21,-4,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-27,31,11,-29,-10,-6,-29,-1,-27,-23,11,4,-1,-8,4,-3,-25,-35,-20,4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-39,-47,-40,-30,11,-21,-30,-16,-21,-17,-17,-38,-29,-21,-20,-38,-28,-25,134,28,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-28,0,-37,-28,43,-27,20,18,-21,-22,-20,-25,-19,-9,29,-21,-2,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-26,4,10,-25,-17,6,-21,9,-18,-7,3,-14,16,12,-2,-7,-20,-25,-9,12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,6,-23,5,10,-25,-13,-5,-23,13,-23,-12,6,-11,8,7,6,2,-18,-28,-13,9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,-21,-12,-9,-10,-21,-6,-2,-7,-9,-3,-1,-13,-6,-8,-1,3,-1,-25,-5,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-18,-19,-24,-16,-5,-24,-17,15,-17,11,15,-15,-19,-11,-15,-8,2,12,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-18,-5,0,-22,-6,-8,-21,2,-18,-11,0,-15,3,6,0,-5,-16,-25,-15,1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00124;
//
ID   TRYPSIN_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00135;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, trypsin family, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=234;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=229;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0169; R2=0.00836256; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=776; N_SCORE=6.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=775; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-26,-37,-28,0,-35,-29,41,-28,20,17,-22,-22,-21,-27,-19,-9,29,-21,-2,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-30,-25,0,-31,-26,26,-20,10,9,-24,-25,-23,-20,-13,-3,32,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-27,-5,-15,-28,54,-15,-35,-16,-29,-20,8,-19,-16,-17,3,-15,-28,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-29,-7,-16,-29,60,-18,-37,-18,-28,-18,1,-19,-17,-18,0,-18,-29,-21,-28,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-19,-4,4,-13,-16,0,-15,-1,-14,-7,0,-14,5,0,4,2,-12,-23,-5,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-24,7,13,-22,-14,-7,-18,0,-17,-13,0,-3,1,-5,0,-4,-15,-29,-16,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,10,-17,-13,-18,-13,-20,-10,-14,-12,-10,-8,-15,-11,-19,6,5,-1,-29,-18,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-3,2,-22,1,2,-19,-15,-5,-15,-1,-14,-10,2,-10,0,-3,2,2,-12,-27,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-28,-15,-3,-16,-21,-14,-3,-6,-9,-4,-12,8,-4,-7,-8,-8,-7,-21,-12,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-26,-4,-8,-23,21,5,-28,-11,-22,-13,6,-18,-6,-9,1,-10,-24,-24,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-21,5,12,-24,-9,-1,-22,1,-21,-13,7,-11,9,-2,10,0,-18,-30,-15,10;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-17,-25,-20,-14,8,-22,-3,-14,-12,-10,-7,-14,-23,-8,-5,-15,-12,-14,20,11,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-30,-19,-19,-21,-8,-30,-19,-19,83,-9,-16,-10,-10,-29,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-38,-32,-25,19,-23,-13,-12,-18,-12,-12,-29,-29,-18,-17,-27,-19,-18,86,36,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-25,-15,-1,-18,-24,-2,2,-6,4,15,-12,-17,23,-4,-11,-8,-7,-20,-5,10;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-11,-26,-21,-9,-16,-26,13,-16,2,2,-21,-21,-21,-20,-2,0,26,-25,-14,-21;
MA   /M: SY='S'; M=8,-8,-16,-11,-8,-8,-5,-14,-12,-11,-11,-8,-4,-16,-9,-12,10,3,-6,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-23,8,-31,-22,24,-28,35,17,-27,-24,-21,-22,-24,-8,16,-20,-1,-23;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-25,-10,-4,-6,-17,1,-11,-2,-8,-3,-5,-19,6,2,-6,-6,-12,-13,8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-23,-15,-13,0,-21,-6,0,-8,-3,3,-9,-19,-9,-3,-8,-4,0,-13,6,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-22,0,3,-19,-8,-3,-20,3,-19,-12,6,-10,1,5,4,0,-17,-25,-12,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-1,-15,-3,-3,-11,-5,-4,-10,-5,-11,-7,4,-12,-2,-3,4,1,-9,-19,-8,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-20,-5,-9,-13,19,-10,-20,-8,-15,-11,-3,-14,-8,-7,-3,-10,-16,-5,-9,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-23,-1,0,-16,-8,-2,-21,5,-19,-11,5,-15,2,10,0,-4,-17,-22,-8,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-25,-11,-5,-4,-22,29,-11,-14,-1,1,-7,-17,-2,-8,-11,-10,-13,-18,9,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-22,-24,-17,15,-23,-12,-2,-16,2,0,-15,-22,-15,-10,-11,-2,-2,-1,6,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-19,103,-28,-29,-20,-23,-29,-29,-28,-20,-20,-18,-37,-28,-29,-9,-9,-11,-44,-28,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-27,-11,-18,-27,52,-19,-31,-18,-25,-16,-1,-18,-16,-19,2,-13,-23,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-26,-12,-19,-28,59,-20,-35,-20,-26,-18,-2,-20,-19,-20,0,-18,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='S'; M=9,-9,-10,-13,-11,-11,-9,-18,-6,-14,-14,-10,-4,-15,-11,-15,18,16,4,-31,-15,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-31,-20,23,-28,42,19,-28,-28,-20,-21,-27,-10,13,-18,3,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-34,-26,3,-34,-24,34,-26,19,15,-24,-21,-21,-24,-19,-8,25,-19,3,-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,14,-19,10,1,-22,-1,6,-23,-4,-26,-17,20,-14,-1,-6,13,2,-20,-34,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,7,14,-26,-13,-7,-23,3,-22,-16,2,7,3,-3,2,-2,-21,-30,-18,8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-17,5,7,-23,-17,3,-24,8,-20,-12,7,-16,10,12,-2,-6,-21,-27,-9,7;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-33,-41,-35,-27,13,-22,-24,-11,-18,-13,-13,-31,-27,-20,-18,-30,-21,-18,97,25,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-14,-31,-28,-1,-30,-29,31,-22,13,11,-27,-27,-26,-22,-12,-2,41,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,9,-30,-21,23,-27,37,20,-28,-28,-21,-20,-25,-8,17,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-10,-10,-13,-11,1,-11,-9,-10,23,43,0,-32,-12,-9;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-11,-19,-10,-20,-2,-15,-11,-10,-11,-10,-9,-11,-9,-19,10,1,-1,-21,-18,-10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-13,-17,-8,-21,5,-18,-14,-9,-13,-12,-8,-11,-9,-16,9,-2,-5,-21,-21,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-29,0,1,-21,-19,89,-29,-8,-21,-1,9,-19,11,0,-7,-17,-29,-30,16,1;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,112,-28,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-20,-19,-18,-39,-29,-29,-9,-9,-9,-49,-29,-29;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-17,-25,-20,17,-24,-17,11,-19,14,7,-20,-23,-21,-14,-15,-5,12,-11,5,-20; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-17,-3,-3,-10,-12,2,-11,-6,-11,-6,-2,-12,-1,-6,-1,-4,-9,-18,0,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-19,4,-2,-18,14,-6,-21,-6,-18,-13,9,-11,-4,-7,3,-6,-18,-21,-15,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: M=-6,-5,-15,-6,-5,-8,-10,-6,-7,-3,-8,-5,-2,-9,-3,0,-1,-2,-7,-16,-4,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='A'; M=2,0,-12,-1,-1,-10,-4,0,-9,-3,-7,-5,0,-3,-2,-4,-1,-3,-8,-13,-6,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-18,10,7,-19,-9,-4,-17,1,-16,-12,6,0,1,-2,3,2,-15,-23,-12,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-20,-8,-5,-18,-4,-11,-13,-6,-14,-9,-5,2,-5,-9,0,-2,-11,-20,-15,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-20,1,4,-18,-8,3,-21,3,-21,-13,5,-12,2,4,7,1,-16,-26,-9,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-22,5,3,-17,-9,-5,-17,-2,-16,-12,3,-12,-1,-3,2,-2,-14,-25,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-25,-27,-22,12,-27,-10,12,-19,10,9,-22,-21,-17,-17,-19,-9,6,6,19,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-23,-6,2,-19,-17,-9,-16,9,-15,-7,-2,-14,5,8,0,2,-11,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-16,-31,-27,-2,-30,-28,30,-21,11,11,-26,-23,-25,-22,-11,-2,37,-26,-8,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-17,-22,-20,-16,0,-23,-13,1,-7,-1,0,-13,-24,-12,2,-12,-5,3,-10,2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-19,-24,-19,4,-20,-18,10,-23,22,9,-22,-26,-19,-18,-16,-6,9,-19,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-17,-29,58,-15,-37,-18,-28,-18,1,-19,-16,-17,1,-16,-28,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-5,-20,-6,2,-16,-12,-10,-13,-3,-9,-6,-5,-14,-2,-4,1,-1,-9,-26,-13,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-6,-24,-7,-7,-11,-17,29,-14,-10,-9,-3,-2,-18,-3,-5,-6,-6,-13,-22,7,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-21,5,-2,-13,-13,-2,-17,-3,-18,-12,10,-17,-4,-2,5,1,-13,-26,-8,-4;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-18,-19,-12,0,-22,-12,8,-11,13,8,-15,-18,-8,-5,-13,-3,5,-13,-1,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-14,-2,-1,-11,-8,-3,-11,3,-11,-6,4,-11,1,7,1,0,-8,-16,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-17,-1,1,-14,-10,-3,-14,5,-13,-8,0,-9,3,9,0,-2,-10,-14,-6,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-18,0,0,-14,-8,-1,-14,-4,-12,-8,2,-11,0,-3,0,-3,-12,-20,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-20,11,15,-21,-8,-5,-21,-2,-17,-15,4,-8,3,-6,5,-2,-17,-27,-15,8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-27,0,8,-24,-6,0,-23,-1,-21,-12,-1,4,4,-4,0,-8,-22,-24,-14,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-2,-23,-3,-3,-21,-1,-2,-23,-3,-21,-12,1,-10,-1,-1,1,-3,-19,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-24,-1,7,-23,1,-9,-22,-2,-19,-13,-2,-11,1,-6,2,-5,-18,-23,-15,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-25,-8,2,-23,-19,-1,-9,1,-10,0,-2,-13,19,1,-4,-5,-12,-24,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-9,-22,-10,-7,-11,-23,-5,-2,-8,-2,0,-9,-17,-6,-8,-6,-1,1,-23,-5,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-22,-20,-12,2,-24,-7,2,-12,2,2,-14,-18,-11,-5,-9,-5,3,-19,1,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-25,-1,6,-20,-11,-4,-20,3,-18,-11,2,-5,4,2,0,-4,-19,-24,-12,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-17,-22,-22,-6,-23,-25,18,-19,4,4,-19,-19,-21,-20,-6,0,26,-28,-11,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-22,3,11,-24,-12,-7,-22,7,-20,-14,2,-11,5,5,6,1,-16,-28,-15,7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-26,3,10,-26,-13,-2,-26,16,-22,-12,3,-12,10,16,0,-4,-20,-25,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-17,-29,-23,2,-29,-23,23,-20,11,9,-21,-24,-20,-20,-11,-2,24,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-22,-25,-20,7,-28,-19,14,-15,6,6,-17,-23,-18,-12,-13,-6,14,-15,3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-15,-22,-17,-4,-26,-18,8,-17,2,2,-16,-12,-15,-16,-10,-2,8,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-25,-4,-3,-15,-15,66,-25,-10,-18,-4,8,-18,3,-4,-7,-16,-25,-26,11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-33,-1,15,-29,-18,-10,-23,-1,-27,-18,-8,45,1,-9,-3,-7,-27,-30,-23,5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-24,3,0,-22,4,-3,-24,1,-20,-13,10,-17,-3,-1,-1,-8,-21,-27,-15,-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-23,-21,32,-26,5,0,-14,1,-1,-19,-27,-16,-12,-18,-10,-5,21,54,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-20,8,0,-14,-10,-1,-16,0,-18,-12,19,-11,-1,0,3,-1,-17,-27,-11,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-19,-3,-1,-14,-11,-8,-14,-2,-14,-9,-3,1,-2,-2,2,0,-11,-21,-10,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-19,-1,2,-14,-7,-7,-15,-2,-13,-10,0,-8,-1,-2,3,-1,-12,-19,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-15,-7,-7,-8,-8,-11,-10,-8,-9,-8,2,-13,-7,-6,6,9,-6,-23,-10,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-20,-16,-13,7,-18,-1,1,-12,4,5,-8,-20,-10,-9,-11,-5,-3,-9,14,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,17,7,-24,-5,-1,-23,-2,-18,-14,8,-12,0,-6,-2,-8,-20,-28,-14,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-22,6,-4,-12,-7,10,-18,-2,-22,-14,25,-19,-3,-3,3,-4,-21,-26,-3,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-30,67,19,-39,-10,1,-39,0,-30,-29,21,-10,1,-9,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-28,4,-36,-25,38,-28,23,17,-23,-24,-21,-26,-21,-9,26,-16,3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-15,-19,-11,-15,-4,-15,-5,-11,-3,4,-12,-14,-8,-16,1,-3,0,-22,-15,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-30,-21,7,-29,-21,21,-27,41,18,-28,-28,-20,-20,-26,-8,13,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-24,5,-33,-23,30,-27,32,20,-26,-26,-20,-21,-23,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,9,-24,-21,0,-23,25,-21,-7,-2,-13,11,25,-8,-9,-17,-21,-8,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-20,9,-30,-20,21,-29,46,19,-29,-29,-20,-20,-27,-8,12,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-22,4,10,-24,-12,-8,-22,6,-21,-14,2,-4,5,0,6,1,-17,-28,-16,7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-24,4,8,-24,-11,-1,-24,6,-22,-14,6,-8,8,9,5,-1,-21,-28,-14,7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-28,0,5,-27,-16,-12,-21,3,-26,-15,-6,33,-1,-6,-1,-5,-22,-29,-21,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=9,-24,-14,-28,-23,-4,-22,-25,19,-20,11,8,-24,-22,-22,-21,-9,-3,27,-25,-10,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-5,2,-21,0,3,-21,-16,-8,-17,6,-18,-11,4,-10,3,7,4,5,-11,-28,-14,2;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-21,-28,-19,23,-27,-14,8,-21,18,9,-21,-23,-20,-16,-19,-8,3,-8,13,-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,10,-16,3,-4,-20,2,-8,-20,-7,-25,-17,18,-14,-4,-8,19,14,-16,-32,-18,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-24,12,11,-26,-12,0,-24,1,-23,-16,7,-3,7,-2,6,0,-21,-31,-15,8;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-21,-10,-9,-3,-14,8,-14,-6,-11,-6,1,-19,-5,0,-1,1,-12,-16,5,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-17,-31,-27,0,-30,-27,30,-22,12,11,-24,-25,-24,-22,-11,-2,36,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-23,-9,-1,-20,-15,-5,-15,5,-10,-3,-4,-16,8,13,-3,-4,-12,-23,-11,2;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-29,-12,-4,-22,-17,-19,-13,-10,-20,-14,-15,50,-10,-17,-4,-1,-17,-27,-22,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-20,-30,-24,-1,-28,-25,30,-23,17,12,-20,-20,-19,-23,-14,-4,24,-21,-4,-24; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-10,41,-14,-11,-16,-19,-15,-23,-14,-19,-15,-8,-17,-13,-14,-2,-5,-13,-34,-19,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,9,-28,-18,20,-27,43,18,-27,-27,-18,-19,-26,-9,10,-18,1,-19; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-30,-9,-1,-22,-15,-16,-15,-8,-22,-15,-16,61,-8,-15,-8,-8,-22,-18,-21,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-15,2,6,-11,-7,-4,-13,0,-12,-9,2,-2,2,-1,1,-2,-12,-13,-8,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=7,-2,-14,-4,2,-15,-8,-6,-12,-1,-12,-8,-1,-7,2,-4,5,0,-9,-16,-9,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-19,2,1,-17,-4,-7,-18,-2,-17,-12,5,-9,-1,-2,6,2,-15,-22,-12,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-18,4,6,-15,-13,-1,-16,-2,-15,-11,3,-12,4,-2,3,0,-15,-19,-4,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: M=-5,-5,-9,-6,-4,-10,-15,-10,-11,-9,-11,-9,-4,-7,-7,-11,-2,-1,-9,-21,-9,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-19,-18,-14,0,-20,-16,5,-15,3,1,-17,-4,-15,-16,-10,-4,6,-18,-4,-15; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-23,-8,-1,-16,-15,-11,-11,-1,-13,-7,-9,11,-2,-5,-3,-2,-11,-21,-12,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='P'; M=3,-3,-20,-2,-1,-16,-13,-12,-10,-8,-11,-10,-5,4,-8,-13,-1,-2,-7,-24,-15,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-5,-13,-22,38,-11,-29,-13,-23,-15,2,-16,-13,-14,-1,-13,-22,-17,-20,-13; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-3,-3,-14,-14,-9,-13,-1,-12,-7,-1,-12,-2,0,5,13,-8,-21,-8,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: M=-4,-8,-18,-11,-4,-12,-15,-10,-6,-4,-6,0,-6,-12,-2,-4,-2,0,-5,-17,-9,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='C'; M=1,-17,46,-23,-22,-15,-11,-24,-15,-21,-12,-11,-15,-26,-22,-22,-5,-6,-1,-34,-22,-22; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-22,-12,-8,-3,-21,-10,-4,-9,-4,-3,-10,-18,-6,-6,-5,1,-3,-9,2,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-15,-28,-24,-4,-27,-27,24,-20,7,7,-23,-19,-23,-21,-7,1,32,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-12,-10,-8,-14,-7,-15,-10,-11,-15,-10,0,-13,-7,-13,20,18,-2,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-17,-29,62,-15,-38,-19,-28,-18,0,-19,-17,-19,-1,-19,-29,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-33,-45,-34,-25,9,-20,-23,-19,-16,-18,-17,-32,-28,-14,-14,-34,-26,-28,119,28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-28,-8,-18,-29,60,-18,-36,-18,-28,-18,2,-19,-18,-19,1,-17,-28,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-23,-7,-3,-13,-17,0,-15,3,-11,-6,-1,-17,2,9,-3,-2,-12,-21,-4,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-16,-8,-5,-13,-20,-13,-5,-10,-5,-4,-3,-14,-4,-9,5,16,-2,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-3,1,-21,-1,3,-17,-9,-4,-20,2,-18,-11,4,-14,1,3,4,0,-16,-25,-11,2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-23,4,7,-19,-11,-3,-20,0,-18,-14,5,-7,1,0,2,-2,-17,-27,-12,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,3,-21,1,-4,-18,4,-6,-20,-1,-19,-13,8,-8,-4,0,1,-4,-17,-23,-14,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-21,-8,-10,-14,13,-14,-16,-12,-13,-9,-4,-15,-12,-12,-1,-8,-10,-17,-14,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-23,-6,-2,-17,-12,-11,-17,-2,-17,-12,-2,1,-3,-2,3,4,-13,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-23,-13,-10,0,-20,-8,-5,-11,-2,-3,-8,-13,-8,-8,-6,0,-7,-16,3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=7,-7,-23,-6,-3,-24,-4,-11,-20,-10,-24,-16,-4,18,-5,-15,10,2,-17,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-24,12,4,-22,-9,-5,-23,0,-21,-16,8,-9,0,0,4,-1,-17,-31,-16,1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-20,-15,-13,-10,-17,-13,1,-12,-4,0,-8,-17,-10,-11,-5,-1,4,-23,-8,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-19,-26,-16,4,-28,-18,12,-23,35,14,-26,-21,-15,-16,-26,-10,4,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-26,-5,7,-26,-19,1,-17,13,-14,-1,-2,-14,24,16,-5,-6,-18,-21,-9,15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-9,-7,4,-15,-22,-7,-14,1,-14,-8,-9,-17,2,-2,-5,-7,-8,-22,-6,3;
MA   /M: SY='V'; M=12,-21,-9,-25,-21,-8,-16,-22,9,-18,4,2,-20,-22,-20,-20,-5,-1,20,-26,-13,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-24,6,5,-20,-16,2,-16,3,-16,-9,11,-15,4,2,-1,-3,-16,-28,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-16,-27,-24,2,-28,-24,22,-22,18,11,-23,-26,-23,-20,-13,-1,27,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-30,-5,2,-24,-14,-13,-20,-3,-23,-15,-7,31,-3,-5,-2,-2,-22,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-32,-26,2,-32,-26,30,-24,20,14,-23,-25,-22,-22,-16,-5,27,-23,-3,-26;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-18,-26,-21,0,-25,-16,19,-19,11,12,-19,-23,-16,-17,-11,-4,20,-21,-3,-20; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,14,-20,15,7,-24,-4,-6,-23,-5,-25,-19,13,-4,-1,-8,15,6,-19,-34,-19,3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,10,-24,7,6,-23,-9,4,-22,3,-21,-12,14,-10,10,6,1,-5,-23,-26,-13,7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='E'; M=0,6,-22,8,16,-26,-12,-4,-22,5,-19,-13,2,-7,11,0,4,-3,-18,-26,-15,13; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-20,2,7,-19,-17,-8,-15,3,-13,-9,0,-11,3,1,2,5,-10,-26,-12,5; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-20,113,-29,-29,-19,-29,-29,-28,-29,-19,-19,-20,-38,-29,-29,-10,-9,-8,-48,-29,-29; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-13,-4,-1,-11,-8,-3,-10,2,-10,-5,-1,-10,3,4,2,-1,-7,-13,-6,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-20,-5,1,-12,-13,-2,-13,2,-12,-6,-3,-4,1,-1,-2,-4,-12,-17,-4,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-2,-3,-21,-3,0,-15,-8,-4,-15,0,-15,-9,-3,-7,-1,-3,-2,-4,-12,-17,-6,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-6,-20,-8,-8,-4,-10,-2,-10,-6,-11,-7,-3,-16,-7,-5,-1,-2,-8,-12,5,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-24,-8,-5,-3,-13,1,-11,-7,-9,-6,-8,-12,-6,-6,-8,-7,-11,-8,8,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-1,-25,-1,-1,-21,-4,-6,-19,-1,-19,-11,2,1,-2,-1,-2,-5,-19,-23,-14,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-6,-4,-26,-2,0,-16,-2,-6,-20,-7,-16,-12,-3,-5,-5,-7,-3,-8,-18,-18,-10,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-1,-12,-20,-15,-10,-4,-16,-13,-3,-9,-3,-2,-9,-17,-9,-7,-5,-2,0,-17,-4,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-20,-29,-24,1,-28,-24,24,-22,11,10,-20,-22,-20,-21,-13,-4,23,-22,-3,-23; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-6,-5,-12,-13,-8,-15,-6,-15,-11,3,-10,-5,-4,11,20,-9,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-27,14,12,-27,-12,-6,-23,2,-24,-17,7,3,2,-5,2,-4,-21,-31,-18,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-22,4,2,-17,-4,0,-21,-1,-21,-14,17,-16,0,3,6,-1,-20,-29,-14,0;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-11,-21,-17,-9,-4,-19,-1,3,-8,4,27,-10,-15,1,-8,-9,-1,-1,-22,-2,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-33,-25,14,-32,-23,25,-26,23,16,-24,-26,-23,-21,-19,-6,20,-18,2,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,115,-28,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-17,-39,-29,-29,-9,-10,-11,-50,-30,-29;
MA   /M: SY='A'; M=32,-7,-12,-17,-11,-16,-4,-18,-7,-11,-10,-9,-5,-13,-11,-18,9,4,1,-23,-17,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-28,-8,-14,-24,50,-17,-34,-17,-25,-17,0,-18,-15,-17,-1,-16,-26,-19,-24,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-21,-12,-13,5,-12,-7,-5,-13,-4,-2,-10,-20,-13,-12,-8,-4,-4,-3,10,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-21,-9,-1,-9,-12,-10,-8,-7,-5,-4,-10,4,-5,-8,-6,-6,-9,-17,-9,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-21,9,13,-24,-13,-8,-23,6,-20,-15,3,-11,4,1,4,-1,-16,-29,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-26,-3,-5,-24,23,-9,-29,-9,-24,-16,3,-14,-8,-10,0,-11,-24,-21,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-28,-6,-9,-27,37,-14,-32,-10,-26,-16,-1,-16,-10,-10,0,-14,-24,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-24,-8,0,-20,-20,-9,-12,14,-15,-5,-5,-15,3,11,-4,-5,-5,-24,-10,1;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-26,47,12,-32,-4,-1,-33,-3,-25,-24,18,-12,-2,-9,3,-7,-25,-36,-18,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-13,-11,-6,-16,-6,-15,-13,-10,-17,-12,-3,-2,-6,-14,17,12,-6,-27,-17,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,98,-26,-25,-18,-28,-22,-28,-27,-19,-18,-18,-37,-26,-27,-10,-10,-11,-44,-23,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-27,1,10,-26,-14,2,-22,12,-22,-8,7,-11,24,9,0,-6,-24,-23,-10,17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-10,-19,-29,65,-20,-39,-20,-30,-20,-1,-16,-20,-20,0,-19,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,64,19,-38,-10,-1,-37,-1,-29,-28,18,-10,0,-10,1,-9,-28,-39,-20,9;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-12,1,0,-19,0,-9,-20,-10,-29,-20,9,-11,-1,-10,35,17,-11,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-18,-30,66,-19,-39,-19,-30,-19,0,-20,-17,-19,0,-20,-30,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-19,-29,63,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-19,3,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-36,-12,-3,-28,-17,-21,-17,-11,-26,-18,-19,74,-11,-20,-8,-9,-24,-29,-28,-11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-30,-21,14,-29,-15,18,-28,41,20,-27,-29,-20,-19,-27,-10,10,-18,3,-20;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-14,-28,-24,3,-24,-23,20,-19,9,8,-22,-24,-22,-19,-9,-2,29,-23,-6,-23; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-18,49,-24,-22,-11,-22,-23,-11,-21,-8,-8,-17,-23,-22,-21,-7,-4,1,-33,-18,-22; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-14,-3,4,-9,-9,3,-11,4,-8,-3,-2,-6,4,7,-3,-5,-10,-11,-4,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-14,2,4,-11,-10,-2,-11,2,-11,-7,1,-5,1,2,0,-1,-9,-15,-5,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-15,5,3,-15,-5,6,-16,2,-15,-9,10,-10,2,4,2,-2,-14,-19,-8,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-6,6,-16,6,-2,-16,5,-2,-18,-4,-15,-11,6,-11,-4,-5,1,-3,-15,-19,-9,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-23,1,1,-22,-6,-4,-22,3,-20,-12,6,-12,1,8,-1,-4,-18,-27,-15,0;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-13,-31,-17,-17,-2,4,-16,-20,-14,-18,-13,-7,-22,-15,-12,-11,-14,-21,27,1,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-22,-21,-13,8,-26,-10,3,-9,0,4,-15,-19,-8,-8,-10,-2,3,-11,11,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-20,-26,-17,1,-26,-19,14,-22,25,11,-24,-21,-13,-18,-18,-7,10,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-18,-18,-12,-9,-21,-11,3,-11,-2,1,-14,-19,-6,-10,-4,3,8,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-33,-27,0,-34,-27,35,-25,18,15,-22,-24,-22,-23,-16,-5,30,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-14,-27,-25,3,-28,-26,20,-20,8,6,-22,-24,-25,-19,-7,5,31,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-11,1,-1,-19,-1,-9,-18,-10,-28,-19,14,-11,-1,-10,35,18,-10,-39,-19,-1;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-37,-33,-25,22,-20,-17,-14,-19,-11,-12,-28,-24,-21,-17,-29,-21,-20,86,29,-20; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-26,-6,-16,-26,53,-16,-32,-17,-26,-17,3,-18,-17,-17,1,-15,-24,-21,-26,-17; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-22,-1,2,-10,-14,-2,-13,-2,-11,-8,-1,-13,-1,-2,-2,-4,-12,-16,0,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-25,-4,-8,-22,21,-14,-24,-9,-23,-15,-2,-1,-11,-12,-1,-10,-19,-22,-20,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,105,-27,-27,-19,-28,-26,-27,-27,-18,-18,-18,-36,-27,-27,-9,-9,-9,-46,-27,-27; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-16,-10,-7,-22,13,-12,-20,-9,-17,-12,-3,-11,-7,-13,6,-4,-12,-20,-18,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-23,-3,2,-18,-16,-4,-14,3,-9,-5,-2,-15,6,10,-3,-4,-12,-23,-9,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-24,-8,-4,-19,-6,-15,-18,-3,-20,-13,-7,13,-6,-6,0,-4,-15,-23,-18,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-23,6,2,-21,5,-3,-24,3,-23,-15,16,-15,0,4,2,-6,-22,-26,-16,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-25,-11,-5,-4,-19,-2,-13,5,-10,-5,-7,-13,0,6,-10,-7,-13,-6,9,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-35,-9,-2,-18,-20,-13,-16,-8,-23,-15,-17,58,-8,-16,-10,-9,-24,-20,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-26,-6,-14,-25,45,-17,-33,-16,-26,-18,2,-17,-15,-18,3,-14,-25,-22,-25,-14;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-13,-29,-27,3,-24,-27,24,-21,10,9,-25,-27,-27,-20,-11,-3,37,-24,-7,-27; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-27,-24,-21,34,-29,10,-1,-15,2,-1,-19,-30,-16,-12,-20,-11,-9,25,62,-21;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-13,-13,-9,-13,-13,-20,-7,-11,-10,-9,-4,-12,-10,-13,14,28,1,-28,-13,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-27,-3,2,-21,-15,-4,-24,19,-18,-10,1,-17,5,31,-6,-8,-18,-22,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-14,-29,-27,3,-30,-28,27,-22,14,10,-27,-28,-27,-20,-13,-2,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='S'; M=7,-10,-8,-14,-11,-8,-9,-14,-13,-13,-15,-12,-5,-10,-11,-15,9,7,-8,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-23,-3,-1,-16,-14,-2,-17,6,-16,-10,2,-14,0,6,0,-3,-13,-23,-5,-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-24,-28,-23,37,-28,-1,4,-20,10,4,-20,-29,-21,-15,-20,-9,-1,9,41,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-20,-21,-14,-5,-25,-13,7,-10,11,8,-16,-23,-7,-4,-13,-4,8,-21,-4,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-27,31,11,-29,-10,-6,-29,-1,-27,-23,11,4,-1,-8,4,-3,-25,-35,-20,4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-39,-47,-40,-30,11,-21,-30,-16,-21,-17,-17,-38,-29,-21,-20,-38,-28,-25,134,28,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-28,0,-37,-28,43,-27,20,18,-21,-22,-20,-25,-19,-9,29,-21,-2,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-26,4,10,-25,-17,6,-21,9,-18,-7,3,-14,16,12,-2,-7,-20,-25,-9,12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,6,-23,5,10,-25,-13,-5,-23,13,-23,-12,6,-11,8,7,6,2,-18,-28,-13,9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,-21,-12,-9,-10,-21,-6,-2,-7,-9,-3,-1,-13,-6,-8,-1,3,-1,-25,-5,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-18,-19,-24,-16,-5,-24,-17,15,-17,11,15,-15,-19,-11,-15,-8,2,12,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-18,-5,0,-22,-6,-8,-21,2,-18,-11,0,-15,3,6,0,-5,-16,-25,-15,1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00124;
//
ID   SUBTILASE_ASP_MP; MATRIX.
AC   MP00136;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4173824; R2=0.0079711; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=826; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=638; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-31; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=34,-67,-43,-44,-23,-68,-69,6,-64,-9,-21,13,-23,18,-68,2,2,61,-80,-62;
MA   /M: SY='P'; M=16,-73,14,-26,-69,-18,-64,9,23,-14,-58,8,47,5,-25,-10,24,-15,-9,-35;
MA   /M: SY='P'; M=29,-74,-3,39,-44,-5,-62,-47,16,-70,-64,-19,41,6,-24,-17,20,-11,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=59,-68,-73,-67,-51,-64,-64,-33,-66,16,-21,-41,-42,-35,-44,-11,-56,32,54,54;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-85,-76,-64,-49,-71,64,-8,-43,-40,-60,-69,-75,38,-27,-7,-69,-27,143,35;
MA   /M: SY='W'; M=2,-75,11,41,-61,-65,-53,-50,27,-44,-64,40,-67,7,-12,15,-14,-68,54,51;
MA   /M: SY='Q'; M=-20,-78,34,-13,-41,-70,-3,-67,38,-1,-6,-7,-40,62,42,-56,-26,-49,-72,21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-73,14,-19,-76,76,-64,-53,-5,-38,-68,21,-67,-33,-66,-8,16,-72,-77,-37;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-73,-45,-70,20,-1,-57,28,-33,2,-49,-65,-42,-35,-67,24,-25,-6,-52,84;
MA   /M: SY='T'; M=23,-66,3,-38,-26,-25,-65,-64,29,-42,-61,-50,-36,-31,-37,-20,88,-56,-81,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-76,-64,-50,-82,101,-70,-88,-47,-85,-74,-50,-68,-65,-48,-24,-67,-59,-74,-77;
MA   /M: SY='K'; M=22,-73,-36,10,-75,-46,9,-75,57,-74,-65,-30,-65,27,34,39,-5,-69,-8,-34;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-75,-12,-68,-81,91,-64,-85,-31,-85,-74,54,-39,-62,-70,-49,-63,-58,-78,-76;
MA   /M: SY='V'; M=-16,-67,-75,-71,-57,-78,-31,43,-69,-44,-45,-67,-72,-20,-73,-41,49,77,-84,-61;
MA   /M: SY='V'; M=-56,22,-66,-43,-37,-75,-27,-5,43,-53,-52,-1,-71,-33,-24,-28,37,65,-78,7;
MA   /M: SY='V'; M=17,-68,-80,-75,-56,-77,-82,51,-73,-41,-43,-74,-75,-73,-76,-21,-35,82,-83,-62;
MA   /M: SY='Y'; M=61,-66,-64,-63,-57,14,-59,-65,-62,-66,-61,-57,-68,-58,-66,39,28,-43,-63,64;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-70,-84,-79,-32,-86,-85,64,-76,-23,-40,-78,-77,-77,-78,-69,-53,85,-82,-59;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-71,-85,-79,-46,-86,-75,66,-77,56,41,-79,-78,-72,-77,-73,-59,37,-75,-55;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='D'; M=-11,-68,80,-46,-76,-62,-60,-70,-56,-73,-70,-42,-63,-56,-64,37,76,-63,-91,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='I'; M=-63,10,-85,-82,8,-88,-82,87,-78,21,-37,-77,-77,-76,-80,-73,-58,36,-73,-54;
MA   /M: SY='D'; M=-26,-76,79,57,-48,-65,-54,-76,-50,-37,-30,26,-64,15,-25,11,-24,-53,-87,-68;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-80,-44,-30,-38,-73,-66,-8,28,-53,-28,-39,14,-61,0,18,20,-18,68,44; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-69,44,5,-73,-59,-3,-69,-38,-16,-65,73,-38,-52,-60,41,45,-66,-89,-67;
MA   /M: SY='H'; M=-51,-80,-53,-53,-68,-70,146,-85,-57,-69,-54,-13,-70,-47,-34,-41,-67,-85,-102,-38;
MA   /M: SY='P'; M=-36,-83,-37,31,-81,-69,-65,-69,-4,-76,-67,-38,104,5,-41,-41,11,-13,-80,-76;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-79,108,39,-50,-65,-54,-84,-53,-81,-79,-39,-65,-28,-61,-39,-57,-79,-95,-70;
MA   /M: SY='L'; M=-69,-72,-86,-79,60,-85,-70,19,-77,70,22,-81,-83,-74,-75,-76,-64,-41,54,-41;
MA   /M: SY='N'; M=33,-73,-34,31,-69,-16,-55,-73,18,-56,-8,46,-68,15,38,-9,-38,-68,33,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=32,-72,8,-43,-67,43,-67,14,-32,0,-57,-9,-10,-5,-68,11,-57,6,-76,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-71,-31,-55,-75,-60,-50,-51,-18,-75,-65,89,-72,-26,70,8,7,-38,-85,-67;
MA   /M: SY='Y'; M=22,-75,22,-66,-6,37,-22,0,-66,-47,-24,-36,-42,-63,-68,-40,-61,-4,-53,88;
MA   /M: SY='D'; M=-44,-4,68,-23,-45,39,-61,8,15,-44,-66,16,-68,-15,-26,-4,-7,-26,-83,-68;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=44,-73,-66,-58,-43,-10,-67,-22,6,-26,-7,-37,64,19,-62,7,1,-33,61,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-16,-4,9,33,-68,49,-62,-47,6,-6,-63,-53,-67,-54,-40,34,-24,-11,-75,6;
MA   /M: SY='A'; M=63,-68,-70,-64,46,-10,-63,-41,10,-58,-24,-38,-41,-62,-27,-26,-57,2,-5,45;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-52,-70,24,-38,-73,-33,-61,-43,7,-69,-65,30,-10,-54,1,68,3,27,-86,-68; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-5,-72,-70,47,-72,-56,6,-66,-10,-52,-24,44,-66,-29,-13,-27,-41,36,86;
MA   /M: SY='D'; M=-7,-74,76,-49,-69,5,-61,-7,-60,-33,-64,-49,8,12,-66,7,24,0,-9,6;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00125;
//
ID   SUBTILASE_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00137;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, subtilase family, histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8101435; R2=0.0162550; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=130; N_SCORE=7.913; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-9,-25,-10,-11,-9,-5,2,-14,-9,-14,-8,-5,-18,-6,-8,-6,-8,-12,-7,8,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-25,10,-2,-21,-2,-6,-22,-7,-20,-14,4,-7,-7,-11,1,-3,-17,-28,-14,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='B'; M=-8,4,-22,3,-1,-3,-18,-5,-12,-6,-11,-11,2,-17,-7,-8,-2,1,-10,-17,4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: M=-5,-8,-23,-12,-15,-13,-2,-16,-5,-11,-12,-7,-3,-17,-14,-13,-3,-3,-2,-18,-9,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-22,14,3,-22,-3,-7,-23,-4,-23,-18,9,-1,-4,-9,6,2,-19,-28,-15,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-4,-21,-9,-10,-10,-12,-6,-9,-8,-11,-8,2,-9,-10,-8,-1,2,-8,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-25,14,5,-18,-10,-2,-21,-3,-16,-14,8,-13,-3,-6,-2,-5,-19,-27,-9,1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-25,9,4,-24,-3,-8,-24,-4,-24,-18,6,3,-4,-7,4,-2,-21,-30,-18,-1;
MA   /M: SY='B'; M=-8,4,-22,3,1,-13,-15,-7,-13,-3,-15,-8,4,-15,0,-6,2,0,-11,-26,-8,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-21,-6,-4,-13,-17,-12,-10,-11,-14,-10,-8,7,-11,-14,-3,-3,-8,-27,-13,-9;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-4,0,-23,2,-2,-19,-8,-11,-14,-6,-13,-8,-3,-15,-5,-9,-1,-2,-9,-21,-11,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-26,28,4,-23,-13,-5,-23,-3,-21,-17,9,-8,-5,-10,-2,-7,-18,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-24,6,-3,-22,9,-11,-24,-6,-20,-15,3,-16,-7,-6,3,-5,-16,-28,-18,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-23,6,1,-19,-8,1,-13,-7,-13,-9,20,-18,2,-7,0,-4,-18,-31,-14,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-3,-25,-5,-7,-26,30,-11,-31,-10,-26,-18,4,-13,-8,-12,1,-13,-26,-20,-23,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-10,-10,-10,-19,-19,-10,-10,-10,-8,0,-10,-9,-10,20,46,0,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-3,-28,-4,-1,-16,-19,70,-26,-6,-16,-2,5,-19,7,5,-9,-17,-25,-26,12,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,22,-30,-30,-5,-30,-30,16,-23,3,3,-27,-32,-30,-23,-10,-3,34,-35,-15,-30;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,0,-17,-10,-20,-1,-19,-14,-12,-14,-13,-7,-13,-10,-19,13,3,-3,-26,-21,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-20,-16,-8,-11,-25,-19,8,-14,-2,0,-8,-14,-7,-15,3,14,7,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='I'; M=11,-23,-19,-31,-23,-6,-24,-25,25,-21,10,11,-19,-19,-17,-24,-9,-5,22,-22,-8,-22;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-6,-13,-9,-15,3,-15,-10,-10,-10,-9,-6,-11,-9,-15,8,1,-2,-19,-16,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='G'; M=21,-8,-15,-12,-11,-18,22,-15,-17,-11,-14,-10,-4,-11,-11,-15,5,-6,-10,-16,-18,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-2,5,-15,-1,-4,-12,-8,-1,-7,-5,-10,-5,10,-14,-2,-6,2,1,-7,-22,-7,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-17,-6,-4,-12,1,-4,-15,-7,-13,-10,-3,-1,-6,-8,1,-2,-12,-16,-9,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-18,7,8,-17,-5,-2,-16,0,-19,-13,13,5,1,-3,4,-1,-18,-24,-15,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-6,19,-14,15,3,-14,-1,0,-16,-3,-18,-14,22,-11,-2,-4,7,1,-17,-24,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=8,-1,-19,-4,-4,-23,24,-9,-25,-10,-23,-16,6,-13,-7,-13,10,-5,-19,-25,-21,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-19,-7,-7,-14,-6,-11,-12,-6,-15,-9,-1,-7,-5,-6,6,5,-8,-22,-9,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-9,-4,-5,-23,4,-12,-25,1,-23,-14,1,-17,-5,-1,-1,-8,-17,-21,-17,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-17,-16,-12,-13,-14,-11,-3,-9,-7,-2,-8,-19,-9,-10,-4,-1,1,-21,-10,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-10,-22,-11,-13,-3,-22,-9,2,-11,-3,-2,-10,-16,-11,-14,-7,-3,3,-15,8,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-19,-25,57,-18,-36,-19,-28,-19,-1,-20,-18,-19,1,-17,-27,-14,-22,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-14,-27,-24,0,-27,-25,21,-18,9,8,-23,-26,-23,-15,-8,0,33,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='A'; M=34,-8,-12,-17,-10,-11,-4,-17,-9,-12,-8,-9,-6,-13,-12,-18,7,0,-2,-20,-15,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-31,-7,1,-19,-18,-9,-18,3,-23,-12,-10,30,-3,-6,-6,-7,-21,-20,-8,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,9,-23,6,-4,-26,18,-7,-31,1,-28,-18,15,-18,-5,-2,0,-11,-27,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-11,-19,-13,-14,-10,-21,-2,-12,-7,-6,-10,-14,-13,-18,10,9,8,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-24,9,18,-26,-13,-1,-24,12,-25,-15,15,-10,14,5,7,0,-23,-30,-16,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-33,-24,5,-32,-22,29,-26,33,23,-26,-26,-20,-22,-23,-8,22,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-13,-20,-19,-20,6,-25,-2,10,-17,2,3,-6,-26,-17,-14,-11,-6,11,-20,7,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-15,-9,0,-23,7,-15,-19,-9,-18,-15,-3,-10,-5,-15,14,0,-10,-26,-21,-3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00125;
//
ID   SUBTILASE_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00138;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, subtilase family, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2779502; R2=0.0084846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=997; N_SCORE=8.736; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=734; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-33; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=18,-71,10,-19,-70,36,-63,33,-61,-63,-59,63,-9,-60,-68,-16,-13,11,-82,-69;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-26,-73,6,-69,-60,7,32,52,-23,3,-48,-11,-75,-67,-71,-1,-57,47,-82,-61; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-29,-72,-20,-23,-56,2,-64,-51,-23,42,-49,-62,8,13,0,-23,46,-7,27,16;
MA   /M: SY='S'; M=-23,-67,-57,-22,-75,14,2,-72,-57,-75,-68,-47,9,-8,-63,84,47,-65,-82,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=1,-70,59,-52,-71,-29,2,-27,-24,2,-62,10,-67,-10,-64,28,56,-61,-87,-66; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-82,-1,-68,-50,-34,-68,8,-67,11,-55,-71,6,11,-24,6,-22,3,112,50; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=0,4,-65,-24,-17,-32,2,39,-4,-5,-53,21,43,-10,24,-24,-20,-7,-75,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-82,-100,-2,-85,-99,37,-86,-98,-10,-51,-93,31,-96,-83,-29,-32,-84,-42,23,-93; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-77,0,-26,-81,-106,19,-85,-105,-80,-105,-95,-19,5,25,-29,37,-77,-100,-106,-96; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-65,-81,3,-62,-23,33,2,-84,-23,-83,-74,60,-77,27,24,-5,-1,-82,-85,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-35,-84,-22,-72,-68,-34,1,-79,-27,-81,-75,32,-84,-66,12,32,12,-36,-78,56; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='C'; M=29,81,-24,-7,-86,-35,-79,-88,-9,-46,-81,20,-89,-75,-79,-28,-72,-80,-97,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-74,2,-81,-82,20,-86,1,-66,-78,-20,-1,-74,-86,-77,-79,-8,50,-31,-66,73; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=24,-72,36,-55,-75,-10,-58,-28,-56,-21,0,65,-72,27,0,-51,24,-30,-86,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=-27,-69,-61,-24,-60,-11,-62,26,-5,-16,25,22,-68,-57,-21,40,51,-6,-75,14;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-75,-72,-26,7,-36,77,54,-7,31,62,-65,-74,-11,-64,-68,-63,-43,26,-48;
MA   /M: SY='S'; M=-23,-66,4,-56,-76,15,-58,-74,-56,-77,-70,34,-65,-7,-62,88,17,-68,-83,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='M'; M=25,-68,-78,-69,6,-69,-58,-40,-65,-19,126,-67,-71,-10,-65,-6,-57,-5,-72,-52;
MA   /M: SY='A'; M=85,-62,-64,-59,-75,-49,-66,-67,-61,-70,-64,-56,-65,-56,-65,58,-47,-56,-77,-70;
MA   /M: SY='T'; M=55,59,-63,-62,-73,-8,-68,-67,-61,-69,-64,-53,-66,-60,-67,46,64,-57,-83,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='H'; M=-33,-75,-59,-23,-15,-33,114,-24,-25,18,26,22,-73,-54,-58,-61,-62,-10,-80,18;
MA   /M: SY='V'; M=55,-66,-76,-70,-60,-69,-78,36,-70,-47,-47,-70,-72,-69,-73,-55,2,70,-81,-64;
MA   /M: SY='A'; M=72,6,-64,-60,-72,-54,-68,-61,-61,-66,-62,-55,-65,-58,-66,46,46,-8,-80,-69;
MA   /M: SY='G'; M=26,-74,-65,-73,-82,96,-71,-86,-68,-83,-73,-52,-68,-66,-75,-48,-65,-77,-74,-77;
MA   /M: SY='V'; M=31,-68,-76,-72,-55,-33,-74,36,-71,31,5,-18,-75,-68,-73,-6,-54,57,-78,-61;
MA   /M: SY='A'; M=63,-67,-73,-67,6,-64,-66,10,-67,13,26,-67,-72,-12,-69,-22,-19,16,-67,30;
MA   /M: SY='A'; M=80,-63,-67,-63,-69,5,-69,-59,-64,3,-56,-60,-67,-61,-68,-17,33,-24,-77,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-66,4,-80,-75,-6,-83,-60,2,-29,68,-36,-78,-83,-68,-70,-72,-62,8,-56,74;
MA   /M: SY='L'; M=9,-69,-79,-28,8,-79,-71,30,-73,59,29,-76,-77,-69,-73,-67,-20,31,-72,-54;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-73,-71,-60,-15,-75,-65,11,50,51,5,-65,-74,27,-17,-27,-59,-6,26,-56;
MA   /M: SY='S'; M=19,-70,-15,30,-79,-26,-57,-74,-20,-75,-67,-11,-14,61,-55,70,-15,-68,-79,-67;
MA   /M: SY='A'; M=44,-71,-68,-60,-16,-11,-61,-23,9,29,-50,-63,-72,27,25,-23,-20,-25,-67,30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-14,-74,-15,21,4,-30,43,-65,-21,2,-58,73,-73,28,-19,-55,-58,-31,-74,30; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-31,-82,-18,-20,-80,13,-63,-29,9,-42,-65,32,96,27,-62,-57,-58,-33,-79,-74;
MA   /M: SY='N'; M=-12,-72,43,-1,4,-10,-55,-66,9,2,-61,49,-69,13,-57,27,1,-66,-74,15;
MA   /M: SY='W'; M=0,-72,-21,-24,-55,-32,-66,-21,-5,50,4,6,-17,-10,-22,-6,13,-53,82,-56;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-68,28,-2,-19,-10,-58,-67,-22,-70,-65,24,-65,-54,-20,54,64,-29,-78,14;
MA   /M: SY='W'; M=0,-78,-66,-61,-17,-65,-66,-63,-4,-20,0,40,62,-10,0,8,-59,-12,112,-54;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00125;
//
ID   THIOL_PROTEASE_CYS_MP; MATRIX.
AC   MP00139;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic thiol (cysteine) proteases cysteine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6073484; R2=0.0142549; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=65; N_SCORE=6.524; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,12,4,-23,-15,-7,-15,-4,-17,-11,7,-1,-2,-9,-1,-3,-14,-32,-17,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-32,-16,-5,-5,-22,-18,-14,-10,-18,-13,-16,42,-13,-12,-10,-7,-19,-21,-14,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-23,-5,0,-18,-12,-1,-19,3,-18,-10,2,-16,4,12,2,-1,-14,-20,-9,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-18,-17,-21,-14,19,-23,-16,5,-14,7,2,-15,-20,-19,-12,-12,-5,7,-10,4,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-23,22,4,-16,-16,-6,-14,-4,-13,-12,4,-12,-2,-8,-5,-8,-11,-24,-8,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-31,-33,-33,-25,15,-22,-20,-10,-20,-9,-10,-29,-25,-20,-19,-26,-18,-14,73,21,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-27,0,4,-23,-12,-3,-27,12,-23,-14,2,-6,3,28,-1,-7,-20,-26,-16,1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-24,6,0,-24,1,-5,-21,-3,-20,-13,6,-15,-2,-6,3,-2,-15,-29,-16,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-6,-8,-1,-20,-18,-12,-15,2,-15,-8,-7,-8,-3,-5,-4,-6,-10,-26,-14,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-22,-5,-7,-18,8,-2,-19,-9,-16,-9,5,-16,-4,-7,3,-4,-16,-26,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-21,-4,-1,-19,-10,-9,-16,0,-18,-12,0,-6,-3,-1,3,0,-11,-26,-14,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-12,-20,-18,-1,-19,-19,16,-14,6,7,-17,-19,-17,-14,-7,1,23,-20,-6,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-15,-1,-4,-10,-11,-10,-13,-4,-12,-10,2,-9,-6,-6,6,13,-8,-16,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-3,-27,-1,4,-20,-13,-7,-20,-6,-22,-16,-2,21,-3,-10,3,0,-21,-29,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-11,-20,-10,-17,-10,-27,-22,15,-17,1,2,-15,-19,-18,-19,-8,-3,23,-29,-11,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-24,-13,-6,-16,-23,-15,-8,14,-12,-3,-7,-15,-3,16,-7,-1,-1,-23,-9,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-12,26,-10,22,2,-24,-11,4,-24,-4,-24,-18,26,-19,-3,-6,2,-5,-22,-38,-17,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-27,-7,-9,-29,39,-15,-33,-6,-27,-16,1,-16,-8,-10,2,-13,-25,-22,-24,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-2,-23,-5,1,-20,-12,-4,-10,-5,-12,-4,1,-12,6,-5,2,-3,-11,-27,-12,2;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-18,64,-25,-22,-14,-24,-25,-17,-26,-8,-12,-17,-32,-22,-24,-5,-5,-4,-41,-22,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-19;
MA   /M: SY='S'; M=0,9,-18,10,2,-24,-1,-6,-25,-2,-27,-20,13,-13,0,2,19,5,-17,-35,-19,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-24,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,136,36,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-15,-23,-15,1,-13,-17,0,-16,4,3,-13,-17,-14,-17,-1,1,2,-18,-7,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-19,-37,-27,57,-30,-19,6,-29,19,5,-23,-30,-34,-20,-21,-9,6,0,20,-27;
MA   /M: SY='A'; M=26,-6,-6,-11,-7,-21,5,-16,-18,-12,-21,-15,-1,-12,-7,-16,21,6,-7,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-6,-16,-11,-17,-6,-20,-10,-11,-12,-11,-6,-12,-11,-17,14,14,1,-27,-18,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-7,-28,-22,-2,-27,-24,16,-22,16,9,-21,-24,-20,-20,-11,1,18,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=18,0,-19,-6,-5,-24,19,-13,-23,-10,-22,-16,6,-14,-8,-15,9,-5,-16,-26,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=19,-5,-8,-13,-10,-16,-8,-16,-7,-10,-12,-8,-2,-14,-8,-14,13,10,1,-29,-17,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-32,-24,9,-30,-21,25,-25,30,21,-25,-26,-20,-20,-21,-7,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-23,4,25,-24,-14,-6,-24,6,-19,-16,0,-7,10,6,7,2,-19,-28,-17,17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-24,0,-4,-20,5,1,-23,-11,-16,-12,-1,-16,-5,-12,2,-6,-18,-21,-11,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-23,-9,-4,-16,-19,-5,-11,4,-12,-5,0,-15,4,13,-5,-6,-11,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-28,-19,-12,9,-25,-5,-1,-13,-2,-2,-12,-13,-11,-10,-14,-10,-6,-2,13,-13;
MA   /M: M=-3,-8,-6,-12,-8,-15,-15,-7,-15,-3,-12,-5,-6,-16,-3,-3,-6,-7,-11,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-21,-25,-17,-5,-26,-19,15,-15,11,9,-15,-20,-12,-15,-14,-8,8,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-9,-23,-11,-2,-13,-19,-10,-9,2,-2,-2,-10,-17,-2,-1,-9,-5,-7,-18,-7,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-21,-8,-5,-5,-14,-2,-14,-6,-9,-7,-2,-17,-4,-4,1,5,-12,-20,0,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,7,-27,4,-1,-27,10,-1,-29,7,-26,-15,15,-17,1,7,-2,-11,-26,-26,-17,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-9,-21,-11,-9,-14,-11,-14,-3,-5,-7,-2,-6,-18,-9,-6,-5,-5,2,-25,-12,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00126;
//
ID   UCH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00140;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family 1 cysteine active-site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8922024; R2=0.0142118; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=753; N_SCORE=15.584; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-23,-1,6,-25,1,-12,-27,9,-25,-15,2,-10,0,2,8,4,-18,-27,-17,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-22,1,19,-19,-15,-6,-20,1,-13,-12,-1,-11,6,6,6,-1,-16,-30,-15,12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-14,-21,-16,-10,-4,-23,-7,7,-2,-2,4,-13,-17,-2,-5,-11,-6,5,-8,11,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-23,-4,5,-20,7,-7,-17,-7,-7,-6,-5,-13,6,-7,-5,-11,-18,-18,-14,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-28,2,20,-33,-16,-1,-22,3,-24,-11,-1,9,29,-1,6,-4,-26,-27,-17,24;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-25,26,22,-32,-13,4,-24,5,-20,-13,6,-7,24,0,0,-8,-25,-24,-13,23; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-18,-19,-20,-18,2,-25,8,12,-15,3,6,-14,-21,-12,-13,-12,-7,12,-11,16,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-21,-5,-1,-22,-10,-15,-19,-10,-27,-19,-2,27,-5,-14,19,13,-16,-35,-22,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-29,24,14,-21,-16,-1,-25,-3,-23,-20,2,3,0,-10,0,-6,-24,-24,-3,5;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-24,25,10,-30,-10,-6,-30,13,-30,-20,10,-10,3,3,10,0,-20,-34,-17,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-29,-24,30,-32,-3,13,-21,14,7,-22,-28,-19,-17,-22,-10,3,9,43,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-34,-33,-26,37,-26,-9,-7,-19,-4,-7,-27,-30,-22,-16,-27,-17,-14,67,48,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-18,-20,-26,-20,18,-24,-4,7,-14,9,25,-16,-22,-11,-12,-12,2,3,-8,17,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-32,-3,7,-28,-20,-10,-28,36,-28,-12,-3,5,7,28,-10,-10,-22,-22,-13,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-12,-13,-12,4,-18,-18,-10,-13,-10,-10,-2,-13,-13,-12,17,34,-2,-25,-5,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-23,-33,-27,-2,-35,-28,36,-25,13,13,-18,-20,-20,-25,-11,2,28,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-29,-5,-5,-27,13,4,-30,-2,-28,-15,0,2,-5,-6,0,-11,-26,-26,-16,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-12,-14,-12,-6,-22,-20,-4,-14,1,-4,-6,-14,-12,-12,11,39,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-33,-28,6,-34,-21,33,-23,13,13,-24,-26,-22,-23,-16,-6,30,-14,11,-28;
MA   /M: SY='G'; M=28,-10,-19,-16,-14,-24,31,-20,-23,-14,-19,-14,-6,-14,-14,-20,6,-9,-13,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-34,-26,4,-34,-26,35,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,4,-31,-26,29,-25,26,15,-29,-29,-25,-21,-19,-5,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,31,-22,15,-3,-22,12,5,-23,-3,-30,-20,50,-20,-3,-3,8,-3,-30,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-30,7,32,-33,-20,0,-27,22,-23,-10,0,-6,30,12,-3,-10,-27,-24,-14,31;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-23,21,12,-22,-11,-3,-20,-5,-14,-16,14,-14,0,-8,4,-3,-19,-35,-17,6;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-18,-21,-18,-12,-10,-26,-18,1,6,1,3,-17,-23,-10,9,-14,-6,11,-24,-8,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-25,-30,-20,0,-31,-18,22,-17,23,20,-20,-23,-12,-7,-22,-10,12,-20,-2,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-26,13,14,-25,-15,7,-24,7,-22,-14,1,12,4,0,-5,-9,-23,-24,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-16,-26,-19,34,-23,-15,0,-12,3,0,-15,-23,-22,-1,-13,-6,5,-4,11,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,20,-28,25,28,-30,1,-2,-32,1,-25,-22,14,-9,6,-5,2,-10,-30,-32,-22,17;
MA   /M: SY='P'; M=5,-2,-22,3,6,-23,-14,-14,-14,-7,-17,-14,-7,7,-6,-14,3,-3,-8,-31,-20,-1;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-23,-10,-15,-19,27,-15,-20,-16,-12,-11,3,-20,-15,-17,-2,-11,-17,-23,-21,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-3,9,-21,12,7,-27,-9,-8,-27,14,-30,-18,8,-10,4,5,15,4,-17,-33,-16,5;
MA   /M: SY='D'; M=-15,8,-23,13,-4,-6,-20,9,-17,-11,-13,-11,1,-18,-11,-11,-4,-3,-9,-27,-1,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,25,-32,-22,22,-30,34,15,-26,-28,-25,-22,-26,-10,12,-13,7,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00127;
//
ID   ASP_PROTEASE_MP; MATRIX.
AC   MP00141;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2275907; R2=0.0099151; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=909; N_SCORE=9.231; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=633; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-21; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-41,-10,-54,-63,5,-20,-6,30,-38,-8,26,14,1,-11,-13,42,-1,-75,33;
MA   /M: SY='R'; M=-46,-77,-51,8,-11,-26,-62,-4,-18,-35,-55,-62,13,2,48,23,5,36,-72,39;
MA   /M: SY='P'; M=-26,-43,3,-12,-71,6,-64,-29,-45,-31,-61,44,82,-37,-65,17,-23,17,-28,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-27,-42,-37,5,-36,2,66,-28,6,-28,-8,17,-44,2,16,2,-3,27,-28,0;
MA   /M: SY='T'; M=-12,35,-71,-30,-18,17,13,26,-25,-5,16,-17,-30,-61,-67,2,45,13,-82,-41;
MA   /M: SY='T'; M=-16,-73,5,9,-29,-23,-20,-31,32,-40,-21,48,-9,-21,-23,18,51,-20,-28,-64;
MA   /M: SY='H'; M=21,-75,-32,-21,-48,29,66,10,-31,12,-52,-61,-66,-26,-65,-33,20,19,-84,-59;
MA   /M: SY='S'; M=-25,-23,-39,-44,-18,15,-21,8,25,-15,-58,2,-18,-6,-12,43,9,-11,31,11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-23,42,-57,7,-47,-69,39,-50,0,-31,-4,-31,-8,-39,22,-12,20,-81,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-47,61,43,21,-9,15,-62,-50,-27,-56,-39,26,25,34,-35,6,-7,-28,-85,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-42,20,49,-56,41,-36,-78,6,-50,-67,11,26,-31,-57,24,2,-41,-81,-45;
MA   /M: SY='Q'; M=-17,-10,-15,13,-51,-4,-19,-53,23,11,-55,-3,-63,64,23,-1,5,-12,-78,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-31,-80,-47,-23,-54,33,-63,-49,-5,-65,-22,20,83,39,-45,9,5,-49,38,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-14,69,-36,-70,52,27,-43,13,-27,-12,-32,-69,-73,-19,-54,-60,-21,26,-72,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-77,-7,41,-74,-7,65,-75,4,-27,-9,21,14,38,-16,7,27,-57,-85,-61;
MA   /M: SY='V'; M=38,16,-80,-70,24,31,-76,-2,-70,22,-15,-71,-71,-68,-73,-56,-58,42,-76,-58;
MA   /M: SY='L'; M=-37,-76,-90,-77,-48,-87,-78,47,-78,71,-8,-84,-78,-71,-77,-73,-28,6,-79,-57;
MA   /M: SY='V'; M=0,-74,-88,-74,-3,-83,-80,23,-75,54,-39,-82,-76,-71,-76,-53,-58,58,-80,-57;
MA   /M: SY='D'; M=-69,-88,116,-31,-92,-67,-59,-94,-56,-91,-87,-40,-65,-54,-65,-56,-60,-88,-110,-73;
MA   /M: SY='T'; M=-44,-64,-59,-54,-69,-58,-65,-66,-54,-69,-62,-46,-54,-52,-61,69,98,-56,-88,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-80,-67,-72,-84,104,-73,-94,-67,-89,-75,-52,-63,-63,-75,-46,-67,-85,-76,-77;
MA   /M: SY='A'; M=76,-63,-64,-54,-72,-52,-68,-65,-56,-68,-60,-54,-56,-53,-62,32,70,-44,-81,-66;
MA   /M: SY='S'; M=-40,-71,60,-25,-77,-57,-59,-76,-52,-77,-69,-16,-39,32,-58,74,51,-68,-89,-66;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-78,12,-35,-5,-75,29,15,-2,23,3,9,-70,-55,40,-38,-27,13,-27,6;
MA   /M: SY='T'; M=-50,-38,-67,-61,-1,-65,-68,19,-61,17,-31,-3,-62,-57,-66,60,67,-24,-82,-59;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-42,-82,-72,-48,-78,-24,48,-70,26,-3,-54,-72,-66,-54,-14,-8,31,45,48;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-77,-86,-76,13,13,-80,58,-75,30,12,-77,-73,-71,-77,-66,-46,35,-77,-57;
MA   /M: SY='P'; M=21,-23,-5,-48,-55,-23,-21,-59,-3,-74,-63,-31,81,-5,40,7,37,-46,-81,-67;
MA   /M: SY='S'; M=5,-22,7,-1,-71,-2,-61,-56,-19,-11,-60,-20,-2,42,-33,58,36,-36,-28,-43;
MA   /M: SY='N'; M=45,-71,1,25,-74,-38,15,-2,-19,-71,-62,48,-27,-11,-25,41,-10,-42,-84,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-43,21,9,-7,-56,75,15,-45,-24,-33,-15,28,31,-60,-6,-3,-15,-4,7;
MA   /M: SY='W'; M=9,0,-59,-68,-15,-5,73,8,-69,14,3,-51,-72,-63,-69,-63,-64,18,96,13;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-43,3,2,-54,-10,-63,24,-5,-52,-60,17,70,21,6,23,-6,-35,-81,-67;
MA   /M: SY='H'; M=17,-23,-5,2,-3,-19,65,-57,35,-5,-8,-14,-28,13,0,19,-18,-45,-80,-56;
MA   /M: SY='N'; M=-39,-41,-30,-61,-17,-45,14,39,-49,9,-16,46,-20,-7,-65,45,-31,-4,-79,11;
MA   /M: SY='W'; M=37,-78,-7,-56,-31,-36,14,-14,1,-28,20,9,3,16,-45,-27,-27,-24,92,44;
MA   /M: SY='S'; M=-15,-23,-9,13,-70,-34,-19,-33,29,-42,-62,-40,49,32,20,51,-10,-46,-76,10;
MA   /M: SY='S'; M=30,-73,-47,-17,-50,-2,-61,-16,24,-52,-60,-8,29,25,-5,48,-1,-24,-74,15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-42,-29,-34,-6,-31,-37,22,2,-5,-17,51,-11,27,-13,-27,9,11,-77,11;
MA   /M: SY='P'; M=-32,-24,-10,-12,-73,43,-22,9,11,-41,-37,-9,54,24,2,-5,-8,-55,44,-65;
MA   /M: SY='A'; M=51,-40,37,-41,-73,20,-23,-23,-11,-68,-36,-22,-3,-37,-8,-12,-2,21,-28,-44;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00128;
//
ID   INSULINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00143;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Insulinase family, zinc-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8673382; R2=0.0164544; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=229; N_SCORE=9.625; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,10,-30,-20,5,-25,20,-20,-5,0,-15,36,39,-5,-10,-25,-20,-10,21;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-25,25,10,-27,-12,0,-23,-2,-19,-14,11,-9,2,-8,1,-4,-20,-33,-15,5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-29,-5,-1,-23,-13,-7,-19,-6,-22,-15,-3,31,-5,-9,-1,-2,-22,-30,-20,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-28,-8,-2,-15,-16,-3,-17,-1,-18,-11,-6,8,1,-1,-3,-2,-18,-18,-2,-3;
MA   /M: SY='A'; M=10,-3,-16,-6,-7,-18,-3,-16,-12,-8,-12,-10,-2,-15,-10,-12,7,5,-4,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,4,-28,8,6,-27,-16,1,-24,5,-24,-14,1,7,4,2,-2,-6,-21,-29,-15,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-20,-15,-8,-4,-19,-14,-6,-3,-9,-5,-5,-17,-6,1,1,3,-2,-22,-6,-7;
MA   /M: SY='S'; M=18,-9,0,-13,-10,-17,-7,-17,-10,-13,-17,-13,-4,-15,-10,-16,20,9,2,-34,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-3,-15,-8,-8,-16,-3,-14,-16,-8,-14,-12,-1,-13,-7,-8,12,12,-8,-26,-14,-8;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-12,-28,-21,-2,-24,-24,17,-21,11,6,-20,-22,-18,-21,-9,-4,18,-23,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=10,-9,-22,-13,-14,-21,27,-17,-24,-14,-19,-13,-3,-17,-13,-15,4,-8,-17,-15,-20,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-29,-18,-31,-24,5,-30,-24,26,-26,33,17,-28,-28,-22,-21,-22,-7,24,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-16,-26,-16,-15,4,-22,-12,-9,-9,-9,-8,-16,-24,-12,-5,-15,-10,-8,19,14,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-18,-32,-28,0,-31,-27,32,-23,13,12,-25,-25,-24,-23,-13,-4,36,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-22,14,5,-28,-8,9,-29,6,-25,-16,10,-11,2,1,-3,-10,-24,-30,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-6,-22,-17,-14,-9,-23,-1,-16,-6,-5,-13,-17,-17,-20,4,5,10,-26,-16,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=11,1,-11,-1,-1,-20,-1,-6,-20,-10,-28,-19,10,-11,0,-10,35,16,-11,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-27,-16,-7,-9,-22,9,-14,6,-4,1,-6,-21,2,29,-13,-11,-12,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-2,-26,-1,-4,3,-19,12,-14,-8,-11,-8,-4,-20,-4,-9,-7,-8,-16,-3,26,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,16,-27,25,40,-30,-15,-3,-28,5,-21,-20,4,-4,11,-5,1,-8,-25,-31,-20,26;
MA   /M: SY='P'; M=-4,2,-26,1,-1,-24,-10,-13,-20,-8,-24,-18,3,26,-7,-13,4,7,-21,-31,-22,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-27,5,7,-21,-17,-10,-20,4,-19,-14,-5,3,-1,-1,-3,-6,-17,-23,-13,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='B'; M=-2,11,-22,9,9,-20,-8,-2,-21,6,-20,-14,10,-12,2,1,1,-4,-19,-23,-9,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-11,-22,-15,-10,3,-21,-7,1,-13,3,0,-6,-21,-10,-11,-11,-5,-3,-9,3,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-1,-27,-1,0,-21,-14,-6,-16,-3,-17,-12,2,12,-2,-5,-2,-5,-20,-29,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-12,-27,-21,-2,-26,-24,16,-22,19,8,-21,-23,-19,-20,-11,2,17,-24,-7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-14,-8,-19,-3,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-16,18,12,-2,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-22,-36,-27,50,-31,-19,10,-29,21,7,-23,-29,-31,-20,-23,-10,5,0,22,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,2,-30,-22,4,-29,-21,13,-28,35,16,-28,-31,-21,-21,-25,-9,9,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-30,23,50,-30,-18,0,-31,10,-21,-20,4,-3,17,4,0,-10,-29,-31,-19,33;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-4,-29,-4,-1,-18,-21,62,-26,1,-15,-1,4,-20,8,15,-11,-16,-24,-26,10,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-24,-19,-30,-20,9,-24,-11,16,-20,30,33,-23,-24,-12,-15,-22,-8,9,-18,1,-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-13,-22,-15,-4,-15,-17,3,-18,6,3,-11,-19,-13,-18,-3,-2,4,-22,-9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-35,-26,65,-28,-16,-1,-28,10,0,-18,-28,-34,-19,-16,-7,-1,3,24,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-25,-10,-2,-15,-20,-7,-9,11,-3,5,-6,-17,5,6,-11,-7,-10,-21,-5,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-4,-24,-6,-14,-26,44,-16,-32,-16,-28,-19,6,-17,-14,-16,9,-6,-23,-26,-26,-14;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-11,-8,-9,-13,-12,-18,-13,-11,-14,-12,2,-11,-9,-11,22,42,-3,-31,-13,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-25,0,11,-23,-12,-10,-21,14,-18,-11,-1,-10,4,6,-2,-5,-16,-26,-15,7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-3,0,-23,-11,-6,-26,21,-24,-12,4,-10,2,20,-2,1,-18,-24,-12,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-26,-18,-12,8,-23,1,-13,4,-9,-5,-11,-23,-6,17,-12,-8,-11,2,21,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-7,-25,-4,2,-25,-13,-14,-19,-8,-26,-18,-5,32,-2,-13,11,8,-19,-32,-22,-2;
MA   /M: SY='A'; M=7,2,-20,3,2,-25,-4,-2,-20,-5,-19,-12,0,-13,2,-8,7,-3,-13,-28,-15,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-26,0,6,-11,-11,-7,-18,-4,-10,-9,-2,-10,-1,-4,-7,-10,-18,-22,-11,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-26,14,18,-28,-12,-2,-26,12,-23,-15,9,-10,12,9,0,-8,-23,-27,-16,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-18,-25,-22,-13,-2,-16,-17,10,-18,8,9,-13,-20,-13,-14,-12,-9,4,-21,-6,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-16,-20,-18,-8,0,-23,-13,4,-13,8,1,-16,-20,-11,-14,-9,-1,4,-17,3,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-22,-6,4,-10,-17,-6,-14,0,-7,-3,-4,-15,1,8,-3,-5,-12,-23,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-23,0,14,-24,-5,-7,-24,2,-20,-15,-1,-7,4,-3,6,1,-18,-27,-17,9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-25,-32,-24,22,-31,-16,17,-24,15,8,-21,-26,-21,-20,-19,-7,9,1,19,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-25,7,23,-17,-21,-8,-12,-5,0,-8,-7,-12,2,-9,-8,-9,-12,-28,-14,13;
MA   /M: SY='A'; M=7,-2,-20,-6,1,-20,-12,-10,-13,2,-12,-8,1,-14,3,-1,3,-1,-11,-26,-14,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00130;
//
ID   ASN_GLN_ASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00144;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Asparaginase / glutaminase active site signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0876527; R2=0.0152310; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=215; N_SCORE=8.356; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-16,-21,-21,-11,-2,-18,-4,2,-12,3,22,-14,-5,-5,-13,-9,-6,-2,-22,-5,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-17,-3,5,-14,-5,-8,-10,2,-11,-7,-4,7,-1,-4,-3,-6,-10,-14,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='A'; M=2,-6,-12,-6,0,-9,-6,-9,-3,-3,-4,-3,-5,-8,-3,-6,-1,-2,-1,-14,-8,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-13,2,13,-9,-9,-3,-12,2,-9,-8,2,-5,3,2,1,0,-11,-14,-8,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='V'; M=4,-11,-10,-13,-7,-3,-13,-12,8,-10,7,3,-11,-11,-8,-11,-6,-3,9,-13,-5,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-16,7,27,-16,-11,-3,-14,3,-10,-10,-2,-2,8,-2,0,-5,-13,-17,-11,18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-17,-4,2,-6,-9,-6,-13,7,-12,-7,-4,0,-2,2,-4,-3,-11,-10,-2,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-22,11,4,-25,-1,-3,-22,2,-21,-13,9,-5,6,1,0,-7,-21,-23,-15,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-12,0,6,-25,-14,-7,-19,1,-20,-11,-4,11,9,-4,0,-6,-19,-24,-16,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-23,9,14,-26,-4,0,-26,9,-24,-14,8,-9,9,3,4,-6,-22,-26,-15,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-21,-14,-7,-3,-23,-12,5,-12,23,13,-16,-22,-9,-10,-20,-9,0,-22,-4,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=1,-10,-30,-8,0,-27,-15,-15,-21,5,-26,-16,-8,37,-4,-4,-3,-6,-21,-27,-22,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-22,9,3,-23,-13,2,-25,10,-24,-15,16,-14,2,12,6,5,-19,-31,-12,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-14,-15,-10,-10,-14,-16,-6,-8,-6,-6,-8,-16,-9,-11,7,10,2,-23,-8,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,2,-33,-26,35,-26,23,19,-26,-26,-22,-23,-19,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-23,-34,-24,7,-31,-23,29,-27,29,18,-24,-25,-20,-23,-22,-9,18,-19,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=13,-7,-16,-11,-9,-13,1,-6,-16,-11,-17,-12,-2,-14,-7,-14,13,7,-9,-21,-5,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-13,-17,-10,-21,9,-19,-15,-11,-15,-12,-7,-11,-10,-19,12,-1,-5,-22,-21,-10;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-9,-8,-8,-17,6,-12,-16,-12,-19,-7,2,-14,-6,-12,19,10,-9,-31,-17,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-22,-9,-1,-19,-16,-9,-16,14,-17,-7,-2,-14,5,21,0,-1,-9,-22,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-17,-7,-5,-12,7,-8,-14,-3,-12,-8,-5,-6,-6,-3,-2,-4,-10,-12,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=9,-2,-10,-3,-5,-12,3,-10,-8,-8,-11,-8,0,-8,-5,-10,8,2,-4,-17,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-13,2,9,-13,-7,1,-12,-2,-13,-9,0,6,2,-4,6,3,-11,-18,-9,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='D'; M=2,12,-12,14,5,-18,-4,-3,-15,-2,-15,-12,8,-7,3,-6,7,0,-12,-20,-11,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-14,-6,-9,-17,26,-12,-19,-10,-17,-12,0,-10,-9,-12,7,-3,-13,-16,-17,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-5,-11,-9,-9,-2,-13,-6,0,-4,-1,-1,-2,-14,-7,0,-3,3,4,-14,-1,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-20,-22,-19,-4,-14,-18,10,-17,5,3,-14,-21,-16,-14,-7,-3,10,-20,-3,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-14,-17,-7,-18,-5,-14,-10,-5,-8,-7,-9,-12,-3,-7,4,-2,-4,-19,-16,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-19,-17,-17,-14,-11,-20,-21,6,-13,-6,-3,-19,14,-17,-16,-6,0,12,-24,-15,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-21,-8,-6,-15,-5,-2,-17,-8,-16,-10,-4,-9,-7,-10,5,8,-11,-23,-6,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=2,-14,-24,-13,-8,-9,-15,-3,-10,-10,-15,-10,-12,13,-8,-14,-1,-3,-11,-14,4,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=9,-3,-11,-7,-1,-24,-4,-8,-16,-3,-19,-9,1,-14,9,-6,8,-2,-12,-26,-17,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-19,-18,-26,-20,28,-22,-8,-2,-20,0,-2,-13,-22,-22,-17,-7,-2,1,-7,14,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00132;
//
ID   UREASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00145;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Urease active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3982096; R2=0.0130729; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1497; N_SCORE=23.958; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-13,-24,-19,-13,-6,-23,-9,3,-5,10,11,-6,-23,-6,10,-16,-9,-2,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-13,-25,-22,34,-30,9,-4,-17,1,-1,-19,-30,-18,-14,-19,-10,-8,14,53,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-6,-12,-13,-15,-2,-21,-17,-13,-14,-13,-2,-14,-13,-14,14,31,-6,-29,-15,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-20,-18,-14,-12,-26,-15,6,2,-5,2,-14,-20,-11,-1,-8,-2,15,-25,-8,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,22,1,-21,0,10,-21,0,-30,-20,59,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-11,-9,-9,-12,-16,-18,-10,-11,-13,-11,1,-10,-8,-11,22,40,-1,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-22,-26,-15,-3,-30,-20,22,-20,20,14,-22,-23,-11,-18,-17,-8,17,-23,-5,-14;
MA   /M: SY='D'; M=2,23,-25,32,12,-32,-5,-6,-30,-3,-23,-22,7,-7,-2,-13,2,-8,-21,-32,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-9,-27,-8,-5,-11,-23,62,-15,-15,1,5,-2,-23,1,-6,-16,-17,-18,-27,13,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-33,-23,27,-29,-19,15,-29,37,17,-27,-29,-24,-19,-27,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,46,-30,65,18,-36,-11,1,-38,-1,-28,-28,18,-11,-1,-10,-1,-10,-29,-36,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-31,-22,5,-30,-21,25,-25,33,22,-25,-26,-18,-20,-22,-5,18,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-12,-30,-29,0,-30,-29,31,-21,11,11,-28,-28,-28,-21,-11,-1,46,-28,-8,-29; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,114,-29,-29,-20,-30,-30,-29,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29,-9,-7,-10,-49,-29,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-16,13,-27,6,-1,-20,-10,67,-27,-7,-24,-7,26,-20,6,-1,-3,-13,-30,-33,5,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-12,38,-23,38,9,-29,-5,4,-29,0,-30,-24,36,-14,0,-5,9,-2,-28,-40,-19,4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-29,-10,0,-28,-17,-17,-21,2,-26,-16,-12,47,-5,-6,-7,-8,-23,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-2,10,-22,5,4,-24,-9,-4,-24,17,-27,-15,17,-13,4,12,7,-1,-19,-30,-16,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,43,-27,20,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-37,-10,0,-29,-18,-19,-20,-4,-28,-18,-17,72,-8,-15,-8,-9,-27,-28,-27,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-26,17,45,-29,-16,-3,-28,6,-21,-20,1,-3,14,-3,5,-6,-25,-31,-20,30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-28,1,-31,-27,32,-23,17,16,-28,-28,-25,-21,-15,-4,40,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='A'; M=38,-8,-13,-15,-4,-21,-3,-15,-13,-7,-13,-10,-7,-10,-5,-14,11,0,-4,-22,-19,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-14,21,-30,34,44,-32,-17,6,-33,6,-23,-22,7,-4,13,-3,-1,-11,-30,-33,-17,28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-28,-8,1,-26,-16,-13,-23,14,-25,-14,-7,20,0,9,-3,-6,-19,-24,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-28,12,44,-31,-18,1,-26,9,-20,-15,0,-4,27,2,2,-8,-28,-27,-17,35;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-28,-36,-25,-2,-38,-28,43,-27,17,17,-20,-20,-18,-27,-18,-9,28,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=45,-12,-10,-21,-12,-18,-3,-21,-6,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,5,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-16,44,-27,58,16,-36,-8,0,-36,-1,-30,-28,23,-11,0,-9,5,-6,-28,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-30,-26,-3,-32,-27,31,-19,11,12,-24,-25,-22,-19,-13,-4,36,-26,-7,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00133;
//
ID   BETA_LACTAMASE_A_MP; MATRIX.
AC   MP00146;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-lactamase class-A active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2365985; R2=0.0180748; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=148; N_SCORE=8.902; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=15; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-13,44,-26,49,12,-33,-6,2,-32,-1,-29,-26,31,-13,-1,-7,4,-6,-28,-39,-20,6;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-2,-20,-4,-5,-12,-18,-17,-8,-12,-4,-8,-5,-14,-9,-13,3,18,-5,-21,-9,-7;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-21,-7,-6,-21,6,-15,-19,-8,-17,-12,-3,-10,-8,-10,4,0,-11,-26,-19,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-5,17,-20,17,4,-25,-3,-6,-25,-4,-25,-19,15,-12,0,-6,14,10,-19,-34,-18,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-24,3,-9,-20,20,-9,-27,-8,-25,-18,17,-15,-10,-8,4,-2,-24,-27,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-25,-8,-3,-23,4,-7,-26,6,-20,-11,-1,-16,3,17,0,-6,-19,-23,-16,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-25,6,13,-24,-12,-8,-23,2,-20,-14,0,-10,7,0,4,4,-19,-21,-14,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-21,-24,-17,-3,-28,-20,17,-17,8,8,-18,-16,-15,-14,-10,1,16,-23,-3,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-19,-7,-2,-16,-12,-14,-13,-4,-7,-8,-4,-10,-5,-6,2,3,-9,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-20,-18,16,-27,27,-3,-14,-3,3,-15,-27,-9,-10,-18,-13,-8,12,46,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,4,-27,-1,0,-20,-15,5,-27,22,-23,-12,16,-20,7,48,-5,-8,-23,-26,-12,0;
MA   /M: SY='A'; M=12,-1,-21,-2,-4,-24,5,-14,-19,-10,-19,-15,-1,-3,-7,-15,5,-4,-14,-27,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-27,35,12,-27,-8,5,-32,2,-26,-21,19,-13,0,-3,-1,-9,-27,-33,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-26,14,42,-28,-17,-3,-25,7,-20,-17,0,-4,17,-1,4,-6,-23,-30,-18,29;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-27,-13,-4,-16,-22,0,-20,19,-11,-3,-5,-21,4,49,-12,-10,-12,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-17,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='P'; M=13,-16,-27,-15,-5,-24,-13,-19,-15,-9,-18,-14,-16,41,-10,-16,-3,-6,-16,-25,-24,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-23,-22,-29,-22,20,-25,-2,13,-16,19,32,-22,-25,-11,-13,-22,-10,4,-5,21,-17;
MA   /M: SY='C'; M=6,-9,21,-18,-15,-17,-13,-13,-13,-15,-10,-3,-6,-22,-10,-17,-1,-3,-7,-32,-18,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-10,-16,-16,-7,-23,-23,1,-13,-4,-4,-9,-16,-16,-13,11,36,14,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-19,-29,-23,47,-23,-13,-3,-24,1,-3,-13,-25,-28,-17,-8,-3,-1,-3,18,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=12,-16,-12,-22,-18,-3,-16,-23,4,-16,-1,-2,-15,-19,-19,-17,3,10,16,-24,-10,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-24,-25,-17,2,-27,1,11,-21,21,18,-20,-17,-13,-16,-21,-11,4,-20,4,-17;
MA   /M: SY='A'; M=15,-12,-16,-16,-8,-14,-14,-15,-2,-12,2,-1,-10,-17,-4,-14,0,1,1,-24,-13,-6;
MA   /M: SY='C'; M=23,-15,24,-22,-17,-17,-12,-23,-10,-17,-12,-11,-14,-21,-17,-22,5,-1,4,-31,-21,-17;
MA   /M: SY='A'; M=27,-13,-17,-19,-14,-18,15,-19,-13,-15,-7,-6,-10,-15,-13,-20,1,-7,-6,-20,-20,-14;
MA   /M: SY='A'; M=31,-11,-14,-19,-11,-15,-8,-19,-4,-9,-4,-5,-10,-14,-11,-14,3,-1,3,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-15,-30,-27,2,-28,-27,28,-24,20,13,-28,-29,-26,-21,-16,-4,36,-26,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-10,-30,-21,8,-30,-21,17,-30,45,17,-29,-31,-21,-21,-29,-10,9,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-3,5,-25,5,6,-24,-13,10,-24,8,-21,-11,6,-14,10,8,0,-7,-20,-24,-7,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,8,-28,12,13,-32,-16,0,-25,14,-22,-9,3,-11,23,14,-1,-7,-23,-25,-13,17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-17,-19,-17,-1,-18,-14,5,-15,-1,1,-9,-22,-15,-14,-3,-1,9,-18,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-27,33,21,-31,-13,-4,-29,-1,-24,-22,10,0,4,-8,4,-3,-25,-35,-19,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-24,-7,-1,-18,-14,-3,-12,-1,-11,-6,-1,-14,3,1,-2,-5,-12,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,8,-29,10,8,-32,7,-4,-30,5,-26,-15,8,-13,11,2,0,-10,-27,-26,-18,9;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-27,1,3,-28,1,-6,-28,8,-25,-14,0,-4,1,3,-1,-8,-22,-25,-17,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-7,-18,-7,2,-9,-15,-9,1,-8,3,0,-6,-12,-4,-8,-7,-6,-2,-19,-8,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-3,-1,-7,-11,-6,-8,-7,-6,-5,0,-12,1,-4,5,1,-7,-21,-7,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-29,-20,7,-30,-20,20,-28,42,19,-29,-23,-20,-20,-27,-9,11,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,32,-24,35,9,-30,-3,0,-30,-1,-28,-23,27,-14,0,-5,6,-4,-26,-36,-20,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-25,1,9,-26,-16,-4,-25,17,-23,-11,4,-12,15,21,4,1,-20,-26,-13,11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-11,-22,-14,-9,-14,-18,-10,-9,5,-8,-4,-6,-18,-5,14,-5,-1,-2,-24,-10,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-19,-34,-28,0,-33,-28,35,-24,17,15,-25,-25,-24,-24,-15,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-18,-6,-4,-16,-18,10,-19,0,-17,-9,3,-13,-1,3,9,21,-11,-29,-4,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-29,-25,-22,30,-31,9,7,-15,4,3,-20,-29,-14,-14,-20,-10,-3,21,64,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00134;
//
ID   ARGINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00147;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arginase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8480144; R2=0.0161263; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=269; N_SCORE=10.176; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-2,10,-24,13,15,-28,-6,-5,-26,5,-24,-17,7,-10,7,0,6,-4,-21,-30,-18,11;
MA   /M: M=0,-8,-22,-10,-6,-15,-13,-1,-9,-2,-10,-4,-6,-18,-4,-2,-4,-6,-4,-23,-5,-6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-15,-27,-23,-2,-26,-23,21,-18,8,8,-22,-24,-21,-19,-8,-2,29,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=6,-4,-17,-6,-1,-17,-11,-5,-14,-6,-12,-9,-2,-14,-1,-7,5,1,-10,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-25,-1,8,-21,-12,-8,-20,9,-17,-10,-1,-10,6,6,-2,-6,-16,-24,-12,6;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-11,-22,-15,-3,-25,-15,10,-19,12,9,-18,-23,-13,-17,-13,-6,9,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-18,-23,-14,-4,-23,-17,10,-18,20,9,-20,-23,-13,-15,-16,-7,8,-23,-6,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=1,0,-20,1,12,-25,-13,-7,-23,10,-19,-13,-1,-11,6,7,2,-4,-17,-26,-15,9;
MA   /M: SY='A'; M=5,1,-20,-1,4,-22,-9,-8,-19,1,-18,-12,3,-9,4,-2,3,-4,-16,-26,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,0,-23,-2,-9,-27,30,-4,-32,-11,-26,-16,8,-17,-8,-10,-1,-14,-28,-26,-22,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-22,-10,-5,-17,-14,5,-18,6,-14,-3,-6,-15,-1,7,-8,-9,-14,-18,-3,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-16,-24,-20,-10,5,-24,-12,-6,-2,-3,0,-11,-17,-6,5,-11,-7,-5,-15,0,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-20,-14,-19,-13,-15,-23,-22,-3,-16,-12,-7,-19,24,-16,-20,-6,-1,-2,-29,-19,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-18,-33,-25,6,-33,-25,30,-27,26,17,-25,-26,-21,-23,-21,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-11,-21,-21,-4,-13,-23,4,-17,0,0,-15,-22,-21,-17,-1,8,16,-27,-11,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-23,16,-31,-20,22,-28,38,20,-27,-28,-21,-21,-26,-10,12,-16,4,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-30,30,9,-35,22,-8,-39,-7,-29,-25,9,-13,-6,-13,0,-14,-30,-30,-24,1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-20,6,16,-16,-13,-7,-19,-5,-16,-15,1,-10,2,-8,12,4,-15,-29,-12,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-23,-34,-26,1,-34,-26,35,-25,20,18,-22,-22,-20,-24,-16,-3,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-10,-16,-9,-17,-5,-19,-10,-10,-12,-11,-6,-11,-9,-17,15,13,0,-25,-18,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-28,-30,-31,-25,19,-27,-13,5,-20,5,0,-25,-27,-19,-18,-23,-12,-2,36,31,-22;
MA   /M: SY='G'; M=8,-13,-29,-12,-12,-28,30,-20,-28,-15,-26,-18,-8,13,-15,-20,-1,-13,-24,-23,-28,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-16,-14,-11,-11,-19,-6,-1,-14,-6,-3,-5,-16,-7,-13,8,14,4,-30,-8,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-24,-32,-26,21,-27,-18,16,-24,15,8,-24,-28,-24,-20,-20,-10,12,-1,17,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-23,-9,0,-19,-15,-8,-14,5,-11,-6,-3,-14,7,10,1,-2,-11,-25,-12,2;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-13,-16,-26,40,-20,-28,-16,-22,-16,-3,-16,-16,-20,5,-10,-18,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-19,-26,-21,4,-27,-4,15,-21,15,14,-19,-25,-16,-17,-15,-5,15,-22,3,-20;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-18,-13,-6,-17,-7,-10,-14,-4,-11,-8,-7,-15,-3,-4,4,-2,-8,-18,-10,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,3,-26,6,14,-26,-15,-5,-26,17,-21,-13,1,-11,11,18,-1,-7,-19,-25,-14,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-11,-23,-14,-9,-10,-16,12,-10,-3,-10,-3,-7,-19,-3,-1,-7,-9,-7,-16,5,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-19,-22,-17,15,-25,4,-1,-17,7,2,-15,-25,-14,-13,-14,-6,-4,-6,23,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-5,-27,-2,-2,-26,6,-13,-24,-5,-23,-15,-3,8,-5,-8,0,-8,-21,-26,-21,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-20,10,12,-21,-9,-1,-21,6,-17,-12,5,-8,8,6,2,-2,-17,-22,-12,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,1,-19,4,3,-18,-11,-2,-15,0,-15,-10,-1,10,1,-1,0,-1,-14,-20,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-15,-23,-17,6,-22,-17,16,-16,19,12,-18,-19,-15,-14,-15,-6,14,-15,-1,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-4,-7,-11,-19,19,-15,-20,-13,-17,-13,-2,-14,-12,-15,3,-5,-12,-20,-18,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-22,-22,-17,-6,-28,-20,17,-15,7,7,-19,-13,-16,-13,-13,-6,18,-25,-8,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-23,-22,-13,-7,-30,-20,18,-16,12,8,-16,-18,-13,-16,-15,-8,12,-24,-7,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-7,-28,-8,-3,-17,-16,21,-19,-5,-19,-7,-3,-9,6,-5,-9,-12,-22,2,3,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,-20,-24,-18,20,-23,-17,5,-16,4,1,-16,-18,-21,-12,-12,-7,7,-11,5,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-27,32,5,-27,-16,-8,-19,-6,-18,-17,9,-8,-6,-10,-2,-5,-14,-35,-16,-1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00135;
//
ID   ARGINASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00148;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arginase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6879735; R2=0.0156108; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=217; N_SCORE=9.066; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-25,-27,-20,6,-24,-10,10,-20,13,6,-21,-25,-16,-15,-19,-10,4,0,11,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=3,-12,-28,-11,-9,-23,12,-16,-21,-13,-21,-15,-8,20,-13,-18,-3,-10,-21,-23,-21,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-15,-19,-15,-4,-21,-16,9,-15,4,3,-11,-17,-11,-13,-1,7,11,-23,-6,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-19,-23,-16,5,-25,-9,13,-18,16,8,-19,-22,-14,-16,-15,-6,10,-13,8,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-10,-24,-12,-2,-17,-19,-8,-14,9,-10,-4,-7,-17,6,19,-5,-5,-9,-21,-8,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-17,-14,-11,-22,16,-14,-20,-9,-18,-13,-5,-13,-10,-13,7,-6,-11,-21,-20,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-20,-20,-23,-19,-4,-26,-3,11,-17,5,10,-17,-19,-14,-14,-11,-2,13,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-20,-14,-6,-17,-9,-7,-13,-4,-9,-6,-7,-13,-1,0,1,-4,-8,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-27,12,21,-28,-18,0,-27,17,-22,-14,2,-9,11,12,-2,-6,-21,-27,-13,15;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-12,-22,-15,-9,-10,-17,-7,-10,1,-10,-4,-9,-13,-7,1,-5,-4,-4,-20,-6,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-18,-15,-13,15,-19,6,-3,-12,3,0,-11,-19,-11,-9,-11,-6,-5,-1,23,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-20,-3,-5,-14,11,1,-19,-6,-15,-9,1,-12,-5,-5,-2,-9,-16,-15,-5,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-26,3,5,-26,3,-10,-25,-1,-23,-16,-3,15,-2,-6,-1,-8,-22,-24,-20,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-28,15,8,-28,-14,-8,-27,6,-27,-19,5,13,0,2,0,-4,-24,-31,-20,2;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-18,-30,-24,5,-29,-23,24,-22,19,15,-24,-25,-20,-20,-15,-4,24,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=11,-8,-10,-12,-14,-20,21,-19,-23,-17,-19,-15,-4,-17,-15,-19,6,-4,-14,-25,-22,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-33,-28,36,-25,20,16,-26,-26,-24,-23,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-22,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-27,-2,-4,-16,-14,36,-24,-8,-23,-10,13,-21,5,-4,-6,-13,-28,-1,5,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-20,-36,-28,38,-31,-22,17,-27,18,10,-23,-28,-30,-21,-20,-8,16,-8,13,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=1,-18,-11,-24,-18,11,-14,-16,-5,-20,3,-1,-14,-18,-20,-18,-7,0,-3,-17,-2,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-13,-25,-19,1,-27,-19,14,-22,20,12,-18,-22,-15,-18,-11,6,10,-23,-2,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-29,-9,-7,-10,-16,2,-22,9,-19,-12,4,-22,1,28,-9,-9,-21,3,4,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-23,13,5,-25,-14,-7,-22,-1,-22,-17,7,3,-2,-5,5,6,-18,-32,-17,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-4,-25,-3,-1,-13,-14,-10,-14,-6,-13,-10,-4,3,-7,-9,-3,-2,-13,-23,-8,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-17,5,7,-16,-6,-3,-14,3,-13,-9,1,0,1,0,-1,-5,-12,-17,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=-2,2,-12,3,1,-13,-7,-6,-12,0,-12,-8,1,-5,-1,1,4,4,-6,-18,-9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-10,-15,-10,-7,9,-13,-3,-4,-7,-4,-4,-9,-1,-9,-8,-7,-5,-6,-1,12,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-11,-3,2,-5,-5,-4,-8,-5,-6,-6,-2,-8,-2,-6,5,2,-7,-13,-2,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-21,-6,-11,-20,36,-12,-25,-10,-20,-13,0,-5,-11,-12,-1,-12,-20,-15,-19,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-2,12,-13,7,5,-17,0,-2,-17,-1,-19,-14,18,-7,0,-4,7,-1,-17,-25,-15,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-14,-5,1,-11,-7,-3,-14,4,-12,-6,-4,-4,2,2,-5,-6,-13,-10,-1,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-11,-15,-11,-8,5,-12,-2,-2,-10,1,-1,-10,0,-8,-9,-8,-5,-5,-5,8,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-19,-3,-6,-12,-14,-7,-9,-11,-10,-9,5,-17,-5,-11,7,9,-10,-22,-7,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-22,0,0,-20,-12,57,-26,-10,-23,-7,11,-16,6,-4,8,-6,-22,-33,4,0;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-25,-9,-16,-27,48,-19,-32,-17,-26,-18,-1,-18,-17,-19,5,-13,-21,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,0,-13,-12,-12,-19,-21,-10,-13,-11,-10,-3,-13,-12,-13,16,37,0,-31,-12,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-30,-15,-8,-19,-14,-14,-8,-7,-14,4,-16,33,-7,-13,-9,-8,-12,-26,-18,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-23,-37,-27,62,-30,-21,2,-28,7,0,-20,-17,-35,-21,-19,-10,0,3,21,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-27,1,2,-22,-16,-2,-30,20,-23,-14,4,-17,7,48,-1,-5,-20,-26,-13,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00135;
//
ID   SULFATASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00149;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sulfatases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4286089; R2=0.0155522; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=122; N_SCORE=7.316; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-22,-24,-17,1,-24,-12,12,-24,23,10,-20,-20,-16,-19,-17,-7,5,-21,1,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-33,-15,-9,-17,-10,-19,-13,-14,-18,-12,-14,34,-11,-18,-9,-9,-19,-16,-18,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-1,-25,1,0,-18,-17,-10,-8,-8,-2,-4,-4,-12,0,-9,-7,-5,-10,-27,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-10,17,-24,18,10,-23,-9,0,-25,3,-25,-18,17,-11,3,1,5,-1,-23,-29,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-27,-1,23,-17,-23,-9,-10,-1,-11,-9,-8,-2,5,-7,-6,-9,-11,-26,-14,13;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-17,-9,-8,-13,-17,-7,-7,-7,-12,-7,0,-12,-6,-6,7,12,-2,-29,-9,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-13,-14,-12,-2,-21,-16,-6,-13,-4,-6,-5,-15,-12,-12,11,33,1,-23,-1,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-33,-23,21,-30,-17,20,-27,32,19,-25,-27,-21,-20,-25,-10,11,-12,9,-22;
MA   /M: SY='P'; M=17,-15,-26,-14,-5,-26,-7,-20,-16,-10,-21,-16,-15,41,-10,-20,-1,-6,-17,-25,-26,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-25,0,20,-23,-18,0,-18,5,-12,-8,-4,-11,13,4,-3,-8,-17,-25,-12,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-25,-25,-16,2,-27,-11,9,-17,15,7,-22,-24,-14,-13,-20,-11,5,-3,7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22,25,-29,-19,16,-29,40,18,-27,-29,-23,-19,-27,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-27,-3,8,-28,-17,-2,-26,29,-26,-9,1,-12,16,25,-2,-7,-20,-22,-11,11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,13,-26,16,18,-30,-5,-3,-29,6,-25,-17,9,-10,12,2,3,-7,-25,-29,-18,15;
MA   /M: SY='A'; M=18,-7,-18,-13,-4,-20,-11,-3,-10,-4,-9,-2,-5,-14,4,-6,1,-5,-6,-22,-12,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-21,28,-30,17,2,-11,1,1,-21,-30,-11,-11,-19,-9,-7,27,75,-21;
MA   /M: SY='H'; M=0,-6,-19,-10,-8,-12,-16,2,-6,-7,-9,-4,-1,-19,-1,-5,1,0,-3,-23,-2,-6;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-13,-18,-16,-13,-9,6,-5,-18,-11,-11,-5,-8,-20,-8,-12,-7,-12,-14,-15,-4,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-15,-29,-21,9,-25,-11,14,-20,16,21,-20,-24,-14,-18,-16,-8,7,-13,9,-19;
MA   /M: SY='V'; M=7,-24,-17,-30,-24,-5,-26,-27,26,-21,7,8,-20,-21,-21,-23,-7,-2,30,-25,-9,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-33,-40,-35,-26,14,-22,-21,-11,-15,-11,-7,-32,-28,-18,-15,-32,-22,-18,93,27,-19;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-3,-27,-3,-2,-16,-19,81,-23,-11,-12,2,6,-19,7,-2,-11,-17,-24,-27,17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-17,-24,-16,6,-24,-16,14,-21,28,13,-23,-19,-15,-15,-20,-7,9,-17,-2,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-24,-1,-13,-22,35,-15,-26,-15,-22,-15,-1,-18,-15,-16,0,-13,-17,-20,-18,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-12,-18,-12,-9,-4,-17,9,2,-11,1,4,-9,-3,-6,-9,-10,-7,-1,-13,5,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-23,9,5,-22,-7,2,-21,1,-23,-15,17,-15,1,5,7,-2,-19,-33,-15,2;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-5,-8,2,-20,-20,-12,-17,-2,-19,-12,-9,4,-2,-5,-2,-3,-13,-28,-15,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-22,2,7,-13,-11,1,-15,-3,-14,-10,7,-15,4,-4,0,-5,-16,-22,-5,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,0,-11,-2,-6,-12,14,-7,-13,-7,-14,-9,5,-9,-6,-7,8,-1,-9,-17,-13,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=8,-5,-10,-7,-4,-7,-5,-5,-7,-2,-8,-6,-4,-2,-3,-3,3,0,-5,-9,-2,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-7,-5,-10,-7,0,-10,-8,-10,-9,-10,-7,-4,-5,-6,-9,1,1,-9,-13,-2,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-18,11,-1,-15,-15,6,-10,-7,-6,-4,0,-14,-3,-8,-5,-4,-6,-24,-5,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-24,-8,-3,-13,-9,-7,-14,-8,-17,-11,-10,39,-7,-12,-7,-8,-18,-17,-13,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-5,7,-7,-3,-11,-12,-6,-10,-6,-7,-6,-4,-7,-4,-7,-2,-1,-7,-19,-10,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-24,-2,-2,-11,-12,30,-20,-3,-13,-5,2,-17,0,0,-7,-12,-18,-19,6,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-9,-20,-10,-6,-20,-8,13,-23,-1,-16,-7,-3,-13,-1,9,-6,-8,-18,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-27,-9,-16,-15,42,-17,-31,-18,-23,-16,-2,-20,-16,-18,-2,-16,-24,-17,-19,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-8,-24,-8,-4,28,-25,-13,-9,-18,4,-6,-11,-21,-19,-15,-14,-10,-9,-11,8,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-6,-6,7,-7,-10,3,-25,-11,-17,-14,-3,-17,-5,-11,0,-8,-19,-26,-8,1;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-3,-28,-5,-2,-23,-14,19,-22,-2,-22,-12,4,12,0,2,-4,-10,-23,-28,-11,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-21,-23,-22,-18,5,-26,-8,14,-15,2,4,-19,-7,-14,-16,-14,-7,8,-4,19,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-15,-17,-13,-5,-18,-13,2,-15,8,11,-10,-17,-8,-13,3,14,3,-27,-7,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00117;
//
ID   ACYLPHOSPHATASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00150;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acylphosphatase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5661697; R2=0.0164363; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=516; N_SCORE=14.037; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=57; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-20,-20,-28,-18,-2,-19,-4,16,-11,17,48,-20,-15,-3,-12,-18,-9,7,-20,-3,-11;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-11,-10,-7,-11,-1,-11,-5,-8,-5,-4,-7,-6,-5,-10,1,-2,-1,-15,-11,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-12,-8,-3,-2,-9,-8,-1,-5,-2,0,-6,-9,-5,-4,-2,2,1,-12,-4,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-16,-7,-2,-11,-3,-9,-9,-4,-11,-6,0,-10,-1,-6,3,-1,-8,-17,-9,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-23,-2,5,-19,-9,-2,-14,0,-17,-10,3,2,0,-2,-1,-6,-16,-24,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='M'; M=0,-9,-21,-13,-5,-15,-12,-10,-6,-7,-7,4,-7,1,-1,-8,-2,0,-7,-24,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-23,-15,-9,-9,-24,-17,7,-11,6,6,-15,-6,-10,-13,-11,-5,4,-24,-9,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-13,-21,-15,-5,-24,-12,3,-7,-1,5,-13,-20,-10,-7,-8,0,7,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-13,-9,-5,-21,-2,-13,-22,-1,-21,-14,0,-14,-2,3,13,9,-12,-28,-17,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-12,-29,-25,6,-29,-18,17,-21,14,7,-26,-29,-22,-19,-17,-6,21,-10,10,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-13,11,-28,18,19,-27,-17,2,-27,9,-20,-16,4,-11,9,14,-2,-7,-22,-29,-14,12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-24,-31,-23,17,-30,-15,19,-24,23,11,-23,-26,-19,-20,-21,-9,9,-7,18,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-8,-31,-6,13,-16,-23,-8,-15,9,-12,-8,-9,-14,6,10,-12,-12,-16,-6,-4,8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-13,-26,-15,-11,17,-23,3,-14,-2,-9,-6,-8,-23,-7,9,-10,-8,-13,-4,21,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-28,-10,-2,-19,-19,-7,-21,22,-19,-9,-2,-18,5,37,-9,-7,-15,-13,-8,-1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-30,-9,-17,-29,57,-3,-39,-19,-29,-17,1,-20,-16,-17,-1,-20,-30,-21,-23,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-16,-16,-22,-9,40,-19,-31,-22,-22,-16,-2,-23,-23,-20,-4,-16,-23,-18,-19,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,75,-29,-19,1,-29,11,4,-20,-29,-37,-19,-20,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-8,-34,-2,-2,-17,-20,-9,-19,3,-21,-10,-11,17,-4,-3,-13,-12,-22,-4,-2,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-18,-16,-23,-17,25,-25,7,-13,-13,-6,-5,-11,-26,-16,-2,-13,-9,-12,2,23,-17;
MA   /M: SY='V'; M=3,-16,-13,-23,-20,-6,-24,-24,13,-16,2,4,-14,-18,-17,-17,2,18,21,-27,-9,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-7,-30,-5,11,-14,-21,8,-18,1,-14,-8,-7,-16,16,4,-8,-11,-22,0,8,13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-18,-5,-3,-20,-13,11,-23,5,-18,-7,4,-18,6,18,-3,-6,-19,-24,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-12,-26,-10,11,-11,-27,-13,2,-7,8,1,-13,-15,-2,-7,-14,-10,-3,-24,-9,3;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-14,-18,-12,-22,16,-20,-17,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-28,-1,5,-25,-19,-5,-25,28,-21,-9,2,-15,11,33,-7,-6,-19,-22,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-26,-2,10,-26,-4,-8,-28,15,-23,-13,0,-12,7,15,0,-6,-20,-24,-16,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-22,-26,-17,4,-27,-15,13,-20,34,18,-21,-27,-14,-8,-24,-10,5,-21,-2,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-7,-16,-29,55,-16,-37,-13,-30,-19,6,-20,-15,-12,0,-17,-29,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-17,-8,-7,-16,-14,-6,-11,1,-15,-8,4,-18,-5,4,5,3,-2,-29,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00136;
//
ID   ACYLPHOSPHATASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00151;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acylphosphatase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6595273; R2=0.0161806; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=665; N_SCORE=16.410; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-19,-33,-21,-14,3,-23,-3,-12,5,-11,0,-18,-23,-4,5,-21,-15,-15,35,28,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-21,-18,24,-23,8,-9,-16,-7,-5,-13,-25,-14,-12,-10,-5,-11,18,37,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-11,-16,-14,-9,-19,-19,-1,-11,-4,1,-7,-14,-11,-12,10,31,7,-28,-10,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-27,-3,15,-27,-20,2,-19,8,-13,-4,-3,-13,30,17,-3,-8,-22,-23,-11,21;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-9,-14,-5,-15,-12,-7,-19,3,-13,-4,-7,-19,-2,15,-5,-7,-12,-21,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-28,9,37,-25,-21,-5,-23,13,-18,-14,-3,-7,12,9,-3,-9,-19,-28,-17,24;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-12,-22,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,8,-3,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-14,3,-28,3,4,-23,-18,-5,-25,25,-18,-10,4,-16,5,30,-9,-9,-19,-24,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-28,1,17,-26,-20,-7,-28,30,-23,-12,0,-10,10,27,-4,-3,-20,-23,-12,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-28,-18,6,-29,-18,16,-23,40,17,-26,-28,-17,-10,-27,-10,8,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,60,-19,-39,-12,-30,-19,0,-19,-17,-14,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,26,-27,36,17,-29,-29,-23,-21,-24,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-10,-17,-14,-12,-12,-20,-10,-3,-1,-8,-3,-7,-19,-10,1,-1,5,9,-27,-10,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-44,-34,-27,16,-23,-15,-14,-17,-14,-14,-34,-30,-17,-17,-34,-24,-24,115,45,-20;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,5,-28,-26,-6,-25,-28,16,-19,3,3,-25,-28,-26,-21,-6,-1,34,-31,-14,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-27,-8,3,-24,-18,-6,-21,28,-19,-1,-3,-14,11,29,-8,-9,-15,-20,-10,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-18,-14,-10,-7,-21,-4,-6,-12,5,-1,-7,-19,-8,-3,0,13,-3,-27,-5,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-2,11,-25,20,6,-29,-9,-10,-26,-5,-27,-22,4,14,-3,-10,9,-1,-21,-35,-22,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-28,35,13,-33,-14,4,-33,7,-25,-19,11,-12,9,7,-1,-7,-25,-32,-14,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-17,-9,-5,-15,-17,-12,-18,3,-16,-11,1,-13,-2,17,13,26,-8,-28,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-25,-1,16,-16,-22,-4,-16,4,-9,-8,-5,-11,10,-1,-2,3,-16,-20,-2,13;
MA   /M: SY='G'; M=4,-18,-24,-22,-23,-16,18,-24,-3,-21,-9,-4,-11,-20,-20,-22,-5,-12,2,-22,-18,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-23,-17,-9,-6,-27,-3,5,-9,2,5,-17,-23,7,-7,-11,-7,4,-11,12,-2;
MA   /M: SY='A'; M=19,-21,-16,-27,-19,-7,-18,-23,13,-19,11,5,-19,-19,-17,-22,-7,-4,14,-21,-11,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-17,2,25,-30,-22,-1,-19,4,-17,-8,-5,-11,29,0,-2,-9,-19,-27,-15,27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-4,-36,6,14,-30,-19,-11,-26,0,-27,-20,-9,47,-1,-4,-7,-10,-29,-30,-25,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-28,4,28,-26,-17,-8,-23,4,-21,-17,-5,12,7,0,1,-6,-22,-29,-20,16;
MA   /M: SY='E'; M=8,4,-21,3,11,-21,-4,-9,-18,-6,-13,-13,3,-12,-1,-11,4,-4,-16,-28,-18,5;
MA   /M: SY='K'; M=3,-3,-23,-5,8,-24,-16,-9,-23,19,-20,-10,-2,-11,8,17,0,-1,-15,-22,-13,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,0,-30,-27,0,-29,-24,20,-22,17,15,-28,-30,-24,-20,-16,-5,30,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,17,-29,21,21,-31,-15,4,-29,11,-24,-16,13,-11,19,15,-1,-9,-28,-29,-16,19;
MA   /M: SY='K'; M=6,-5,-20,-6,4,-18,-14,-9,-16,8,-18,-10,-4,-12,-1,0,4,-2,-7,-25,-12,2;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-26,-20,-32,-22,22,-26,-12,15,-22,28,32,-24,-26,-16,-16,-24,-10,8,-13,7,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-25,-17,-7,-14,-26,-12,4,1,5,10,-14,-19,5,-2,-14,-9,1,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-24,2,19,-27,-5,-5,-21,-2,-21,-13,0,-9,15,-5,9,-3,-19,-29,-18,17;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-32,-38,-34,-24,3,-16,-27,-13,-19,-10,-13,-32,-25,-18,-20,-27,-21,-19,93,15,-18;
MA   /M: SY='L'; M=0,-27,-16,-29,-21,4,-26,-22,18,-25,33,14,-27,-27,-21,-20,-20,-6,18,-22,-5,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,0,11,-27,-18,10,-26,20,-24,-9,2,-12,18,21,-1,-6,-22,-24,-8,13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-21,-1,1,-24,-4,-8,-23,9,-25,-13,9,-12,6,3,10,8,-18,-28,-15,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00136;
//
ID   ATPASE_ALPHA_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00152;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP synthase alpha and beta subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.6598396; R2=0.0202834; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=70; N_SCORE=8.078; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-7; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=13,-12,-21,-15,-18,-23,35,-21,-22,-17,-19,-13,-6,-18,-18,-20,2,-10,-10,-22,-24,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-8,-24,-12,-1,-2,-22,12,-15,-5,-11,-1,-3,-17,14,-2,-4,-2,-17,-16,5,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-33,-26,-1,-31,-24,20,-24,6,5,-20,-22,-18,-23,-17,-4,11,8,3,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-18,-19,-23,-21,12,-11,-16,1,-18,-2,-1,-13,-24,-22,-16,-9,-7,7,-13,3,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-29,-20,9,-29,-19,19,-28,44,21,-28,-29,-19,-19,-27,-8,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-22,30,16,-29,-9,-4,-28,-1,-26,-22,12,-9,4,-7,13,2,-21,-37,-19,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-24,-7,1,-21,-15,-7,-25,17,-21,-12,0,-10,4,33,2,0,-16,-25,-14,0;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-23,15,13,-28,-8,-4,-26,7,-25,-17,9,-10,7,0,8,-2,-21,-31,-17,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-29,-20,6,-30,-19,20,-24,38,17,-26,-28,-17,-14,-26,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-15,-22,-15,10,-11,-11,-9,-16,-6,-7,-8,-17,-17,-17,2,-1,-3,-14,-2,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-23,8,13,-19,-13,0,-20,1,-19,-13,10,-13,10,-1,3,-4,-20,-25,-9,11;
MA   /M: SY='R'; M=0,-9,-22,-11,-1,-18,-15,-8,-16,10,-12,-5,-5,-15,4,15,-1,-4,-11,-22,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-29,-9,-13,-28,43,-15,-36,-5,-28,-17,1,-19,-10,0,-2,-16,-27,-21,-24,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-16,-27,-19,-12,-9,-28,12,6,-13,1,7,-9,-20,0,-5,-13,-11,1,-23,2,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-26,-23,-18,30,-27,1,-6,-6,0,-2,-15,-27,-14,4,-17,-9,-8,9,39,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-14,-15,-7,-21,-3,-18,-13,-10,-16,-13,-8,5,-8,-18,12,2,-6,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-26,16,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-15,42,-25,42,9,-29,-6,11,-30,-1,-29,-23,38,-15,1,-5,4,-6,-30,-39,-18,5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-25,-29,-24,-17,-11,-23,-25,3,-17,-10,-6,-23,13,-18,-21,-12,-7,1,1,-10,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-22,-19,-16,-5,-1,-18,-1,-23,17,5,-16,-24,-17,-18,-14,-9,-3,-22,-11,-16;
MA   /M: M=-5,-3,-25,-4,-1,-17,-17,-12,-9,-4,-8,-6,-3,-5,-3,-6,-6,-4,-9,-26,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-21,-20,-25,-21,6,-25,-16,11,-18,6,3,-19,-25,-19,-16,-10,-1,13,-7,9,-21;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-28,-10,-1,-19,-20,-4,-24,24,-14,-7,-3,-19,8,50,-10,-8,-16,-21,-9,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-19,-27,-22,7,-28,-14,17,-19,14,10,-24,-27,-18,-17,-15,-5,19,-12,13,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-23,-21,-18,-9,3,-15,-3,-17,6,11,-15,-19,-13,-16,-12,-9,-3,-21,-12,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-25,15,4,-28,5,-8,-30,-1,-28,-20,10,-7,-1,-3,7,-3,-23,-31,-20,1;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-17,4,3,-18,-5,-4,-17,3,-16,-10,7,-10,2,-1,4,-2,-14,-20,-12,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-11,-19,-15,-9,-7,-18,6,-14,0,0,-11,-14,-13,-17,-2,-3,9,-16,-10,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-22,-21,-12,-11,-27,-15,13,-13,7,9,-18,-21,2,-12,-11,-6,12,-19,-6,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-23,-4,-9,-22,14,-6,-20,-13,-17,-11,1,-17,-8,-12,1,-5,-16,-26,-16,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-29,8,21,-29,-17,-4,-25,14,-23,-14,0,7,12,5,-3,-8,-24,-26,-16,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-23,-1,9,-24,-3,-9,-19,-2,-17,-12,-2,-11,2,-7,3,-6,-14,-26,-17,5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-11,-26,-14,-7,-12,-23,32,-5,-8,-3,13,-6,-19,4,-4,-12,-13,-8,-22,8,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-8,-27,-10,-4,-3,-23,1,-16,13,-14,-6,-6,-19,0,13,-9,-2,-14,-5,20,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-26,1,8,-25,-13,-5,-23,14,-20,-10,2,-13,11,14,-1,-6,-19,-23,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-14,-18,-10,-7,-22,-19,3,-10,2,1,-17,-20,-12,-10,-8,-4,10,-21,-9,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00137;
//
ID   ATPASE_GAMMA_MP; MATRIX.
AC   MP00153;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP synthase gamma subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4748259; R2=0.0128236; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=464; N_SCORE=10.415; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-24,-32,-24,-1,-33,-25,32,-22,16,13,-21,-22,-19,-23,-16,-7,25,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-7,16,-24,15,5,-27,-3,-4,-28,13,-29,-18,18,-13,2,5,5,-4,-23,-30,-16,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,11,-24,11,10,-26,-13,-6,-25,12,-23,-15,9,-12,6,8,3,0,-19,-29,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-30,-21,17,-30,-17,17,-28,43,17,-28,-30,-21,-19,-28,-10,8,-14,9,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-17,-1,1,-20,-14,-9,-17,0,-20,-12,7,-11,7,0,16,20,-11,-31,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-23,-30,-21,2,-31,-21,22,-23,29,16,-22,-24,-16,-15,-21,-6,13,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-7,-19,-8,-2,-16,-18,-13,-4,-4,-6,-3,-7,-17,-2,-6,-1,0,1,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-27,-22,-20,28,-28,12,1,-13,4,1,-20,-29,-13,-12,-19,-9,-7,21,64,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-29,-5,5,-25,-19,-4,-29,35,-24,-10,0,-15,12,46,-8,-9,-20,-20,-11,6;
MA   /M: SY='A'; M=25,-11,-14,-17,-8,-16,-10,-18,-5,-10,-6,-5,-10,-13,-6,-15,6,4,2,-23,-15,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=41,-7,-11,-15,-6,-20,-1,-18,-12,-9,-13,-12,-7,-10,-8,-18,13,2,-3,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,-16,-13,-5,-20,-9,-15,-8,-3,-13,-7,-5,-13,-2,-10,7,0,-1,-25,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,6,-25,1,9,-30,-13,3,-21,8,-21,-7,10,-13,31,8,3,0,-25,-25,-13,20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-13,-16,-19,-15,-6,-19,-18,8,-17,5,4,-9,-19,-13,-16,2,10,8,-28,-9,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-14,-31,-28,-2,-31,-28,31,-22,10,10,-23,-26,-25,-22,-11,-2,39,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-15,-10,-10,-22,17,-17,-21,-13,-22,-16,0,-13,-10,-16,17,5,-11,-27,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=8,11,-19,8,15,-25,-5,-5,-22,-2,-22,-18,12,-9,4,-8,12,0,-19,-31,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-11,-16,-8,-20,-1,-18,-13,-7,-14,-11,-7,-10,-7,-15,13,2,-3,-23,-19,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-16,-29,-22,6,-30,-22,21,-26,33,15,-27,-28,-20,-19,-22,-6,19,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-1,4,-23,4,7,-25,-3,-9,-24,8,-23,-14,4,-12,1,2,3,-4,-17,-27,-17,4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,2,-27,7,-1,-24,14,-13,-23,-12,-13,-13,-2,-17,-7,-14,-5,-11,-19,-26,-19,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=4,3,3,-1,-7,-13,-4,-6,-16,-9,-16,-13,5,-16,-8,-12,3,-3,-12,-21,-8,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=14,-2,-6,-4,-2,-12,0,-8,-10,-6,-14,-10,2,-6,-2,-8,18,8,-4,-20,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=12,-8,-20,-11,-14,-23,42,-17,-26,-14,-20,-14,-2,-14,-14,-17,2,-12,-18,-17,-23,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-21,8,29,-26,-13,0,-21,4,-19,-12,2,-5,23,0,8,-2,-21,-25,-14,26; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-5,10,-18,14,4,-21,-7,21,-23,-6,-23,-14,10,-11,2,-6,13,1,-18,-31,-7,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,9,-28,14,0,-3,-19,-5,-26,3,-16,-15,3,-19,-6,16,-9,-10,-19,-20,-4,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00138;
//
ID   ATPASE_E1_E2_MP; MATRIX.
AC   MP00154;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   E1-E2 ATPases phosphorylation site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6011639; R2=0.0163861; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=104; N_SCORE=7.295; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-20,-23,-24,-20,-6,3,-12,2,-19,15,23,-17,-23,-12,-16,-17,-13,-2,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-11,-33,-5,10,-7,-24,1,-15,-4,-16,-12,-14,18,-1,-10,-11,-10,-22,-7,15,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-16,0,0,-20,-6,23,-23,-10,-27,-14,10,-13,3,-7,25,8,-16,-37,-8,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-4,-16,-20,-17,-16,8,-16,-10,0,-10,-4,2,11,32,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-24,-17,4,-27,-20,11,-24,32,11,-21,-24,-17,-17,-15,8,7,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='G'; M=13,-7,-22,-11,-10,-23,17,16,-26,-13,-19,-10,-1,-16,-7,-14,1,-12,-19,-23,-11,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-27,29,-30,-27,-4,-30,-27,8,-26,12,3,-27,-33,-27,-23,-16,-6,19,-34,-14,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-24,44,10,-30,-13,-6,-30,-3,-24,-24,14,-10,-3,-10,6,9,-20,-37,-17,4;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-14,-24,-20,-3,-23,-16,14,-13,8,23,-17,-20,-13,-13,-5,11,20,-26,-6,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-23,81,-30,-30,-14,-30,-30,-12,-27,-11,-11,-23,-37,-30,-27,-10,-7,8,-44,-24,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-17,-20,-14,0,-20,-17,7,-24,24,7,-17,-24,-14,-17,-7,0,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,34,-27,27,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,12,-21,3,4,-24,-14,0,-17,1,-20,-9,18,-13,19,1,9,12,-20,-29,-13,12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-27,0,-14,-27,47,-10,-34,-14,-30,-20,19,-20,-14,-14,3,-14,-30,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-27,-10,0,-20,-20,-7,-14,31,-14,13,-6,-13,7,17,-13,-10,-10,-20,-7,4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-26,-24,-14,-9,-20,-6,8,-10,5,36,-20,13,-3,-13,-17,-10,-2,-23,-9,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-24,-3,8,-28,-14,1,-23,9,-23,-9,3,-13,26,21,10,0,-21,-26,-13,15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-21,-5,13,-11,-23,-12,-8,-9,6,-4,-10,-13,-2,-9,-4,8,-8,-27,-11,6;
MA   /M: SY='H'; M=7,11,-22,13,2,-26,-9,25,-25,-7,-19,-13,5,-13,-1,-11,1,-9,-19,-29,-7,-1;
MA   /M: SY='A'; M=31,-18,-10,-24,-18,-12,-11,-24,5,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,19,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-36,-26,30,-33,-23,22,-30,28,14,-24,-27,-26,-23,-24,-10,13,-10,10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-30,-10,-3,-24,-20,-20,-17,-10,-24,-17,-14,58,-10,-17,0,9,-20,-30,-24,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,31,-30,-20,14,-30,38,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-22,-7,-6,-22,7,-17,-25,7,-22,-13,0,-13,-6,0,4,10,-15,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-30,1,16,-27,9,-6,-33,6,-23,-17,0,-12,4,14,-3,-13,-27,-24,-20,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00139;
//
ID   CUTINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00155;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cutinase, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1232181; R2=0.0145380; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=537; N_SCORE=12.920; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=95; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=7,-15,-19,-21,-15,-11,-18,-20,12,-19,-5,-1,-6,-14,-10,-20,9,4,9,-28,-11,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,21,-25,16,7,-28,-10,3,-25,8,-25,-15,24,-15,12,11,2,-6,-25,-31,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,18,-25,23,28,-27,-14,-4,-25,2,-20,-19,8,-8,5,-6,3,-3,-21,-33,-19,17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-16,-24,-15,-7,-11,-8,3,-10,3,19,-15,-16,-6,-15,-5,-5,3,-15,-2,-11;
MA   /M: SY='A'; M=9,-13,-18,-17,-8,-14,-15,-15,-3,-6,-1,0,-10,-16,-4,-7,0,-2,0,-24,-11,-7;
MA   /M: SY='R'; M=3,-4,-21,-8,-5,-21,5,-11,-24,0,-20,-14,2,-15,-4,9,6,3,-15,-25,-18,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-21,-24,-25,-17,-1,-28,11,13,-21,22,23,-17,-24,-9,-15,-21,-12,4,-22,5,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-35,-28,34,-31,-25,18,-26,10,6,-20,-26,-30,-21,-14,-2,18,-10,10,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,9,-22,4,9,-25,-15,-2,-20,8,-22,-11,13,-11,17,4,8,8,-20,-29,-14,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-9,-22,-9,0,-18,-9,-8,-12,-7,-5,-4,-5,-16,9,-2,3,-2,-13,-26,-12,4;
MA   /M: SY='A'; M=28,-9,-12,-19,-12,-14,-8,-17,-5,-10,-5,1,-9,-12,-8,-16,8,11,2,-22,-14,-10;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-14,-12,-14,-11,-12,-14,2,-12,-3,-4,3,-21,-14,-14,-1,-1,6,-29,-15,-14;
MA   /M: SY='T'; M=6,3,-13,-4,-3,-18,-10,-11,-15,-7,-20,-13,8,-11,0,-8,23,26,-9,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-3,3,-22,2,6,-26,-11,-6,-24,19,-29,-14,9,-11,10,11,11,2,-18,-29,-15,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,41,-22,31,5,-25,-2,7,-25,0,-30,-22,48,-17,0,-3,9,-2,-29,-40,-20,2;
MA   /M: SY='T'; M=16,-3,-10,-11,-8,-14,-11,-18,-12,-10,-13,-12,-1,-10,-8,-13,20,31,-2,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-6,-26,-7,2,-25,-17,-11,-23,23,-23,-11,-4,-1,5,19,-4,-3,-16,-22,-14,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,4,-35,-26,36,-29,30,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-12,-30,-29,-1,-30,-29,29,-20,10,10,-27,-28,-28,-20,-9,2,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,-20,-25,-16,-10,-17,-20,10,-18,6,6,-16,-7,-13,-21,-6,-5,6,-22,-12,-16;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,55,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-29,-3,16,-35,-21,7,-16,6,-14,2,-3,-12,53,7,-3,-10,-26,-20,-9,34;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-14,-15,-12,-20,10,-20,-17,-12,-14,-12,-5,-12,-12,-18,10,8,-7,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-16,-12,0,-25,-9,-10,-13,-4,-13,-7,-5,-10,12,-9,8,4,-10,-21,-15,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-27,3,-31,-27,29,-24,23,14,-29,-29,-26,-21,-17,-4,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-16,-27,-21,-4,-23,-17,18,-15,9,23,-17,-19,-12,-16,-7,5,19,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-1,10,-23,12,1,-20,-12,29,-26,-8,-19,-12,6,-15,-1,-9,0,-9,-20,-29,-3,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-20,-3,-11,-16,4,-8,-10,-11,-15,-10,19,-20,-10,-11,3,-4,-12,-31,-18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-10,-15,-10,-17,-5,-18,-7,-12,-13,-10,-7,-13,-10,-17,16,6,5,-28,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=12,-16,-16,-24,-17,-7,-19,-21,17,-17,4,4,-13,-13,-13,-20,-3,0,14,-18,-8,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=3,-6,-22,-5,6,-23,-13,-10,-18,4,-17,-11,-4,0,5,0,5,-1,-15,-27,-16,5;
MA   /M: SY='A'; M=1,-4,-24,-4,0,-19,-1,-10,-15,-6,-6,-3,-4,-16,-2,-8,-6,-10,-14,-24,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-29,-22,9,-29,-15,20,-24,34,22,-28,-29,-18,-18,-24,-8,14,-17,6,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-5,-31,4,3,-29,-13,-15,-23,-9,-30,-21,-7,50,-6,-16,5,-2,-25,-34,-26,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-19,-10,-1,-24,-3,-15,-17,-8,-20,-14,-6,8,-1,-14,10,2,-13,-26,-21,-2;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-15,-14,-4,-14,-11,-14,-6,-10,-4,-2,-8,-13,-7,-14,4,3,-1,-25,-15,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00140;
//
ID   OMPDECASE_MP; MATRIX.
AC   MP00156;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Orotidine 5'-phosphate decarboxylase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.1712632; R2=0.0200869; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-12; N_SCORE=6.900; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-20,-8,-6,-13,1,-11,-14,-11,-11,-10,-4,-16,-10,-14,1,-1,-8,-23,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-17,-21,-18,-18,-11,12,-18,-10,-21,-2,-3,-12,-21,-17,-19,-9,-11,-9,-19,-11,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-26,-9,1,-13,-12,-14,-15,-5,-13,-10,-9,4,-5,-8,-5,-6,-14,-20,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-25,2,8,-21,-9,-5,-19,-2,-17,-12,0,-9,3,-4,1,-6,-16,-25,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-20,-27,-21,6,-26,-22,18,-23,19,9,-20,-23,-20,-19,-14,-1,15,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-18,-22,-17,-7,-25,-21,14,-15,6,6,-15,-20,-13,-17,-10,-4,15,-24,-8,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-24,4,12,-26,-8,-3,-26,9,-22,-15,3,-11,6,9,3,-4,-20,-27,-16,8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-8,-25,-8,3,-10,-20,-8,-6,-6,-1,-3,-9,-16,-1,-6,-8,-6,-9,-17,-3,0;
MA   /M: SY='L'; M=4,-21,-19,-24,-16,-3,-21,-20,9,-15,18,8,-20,-22,-15,-14,-14,-7,8,-21,-7,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-22,-4,5,-21,-14,-1,-19,16,-17,-6,0,-11,10,17,-2,-5,-14,-20,-9,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-23,3,11,-24,-10,-8,-22,8,-18,-12,-1,-11,4,1,1,-5,-16,-25,-14,7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-21,-7,1,-19,-17,9,-20,6,-16,-6,-3,-12,5,11,-5,-7,-16,-24,-6,1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,3,-9,-23,30,-9,-32,-9,-26,-18,9,-19,-11,-9,-1,-14,-26,-20,-19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-17,-15,-21,-15,14,-21,-13,-6,-9,-1,-2,-14,-21,-18,-9,-12,-7,-2,-13,5,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-9,-29,-6,5,-19,-22,-11,-14,7,-7,-5,-9,-1,1,7,-12,-9,-14,-24,-12,2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-20,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,18,14,-24,-25,-24,-24,-16,-4,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-22,-39,-29,48,-32,-23,16,-29,16,8,-21,-27,-32,-22,-20,-10,11,-3,17,-29;
MA   /M: SY='L'; M=0,-20,-10,-21,-9,-1,-23,-18,4,-20,20,6,-20,-23,-14,-17,-15,-6,3,-23,-8,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-22,-27,-18,9,-20,-17,5,-18,20,11,-20,-25,-16,-8,-19,-10,3,-14,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-29,-20,24,-28,-16,5,-16,16,7,-20,-28,-21,-1,-20,-9,5,-11,7,-20;
MA   /M: SY='H'; M=3,-9,-20,-13,-12,-10,1,18,-18,-15,-12,-6,-3,-20,-9,-13,-5,-12,-14,-19,1,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-34,-4,-6,-30,14,-18,-28,-13,-29,-20,-9,39,-13,-19,-5,-13,-29,-27,-29,-12;
MA   /M: SY='N'; M=2,17,-18,6,0,-19,-5,5,-19,-3,-24,-16,28,-15,0,-4,13,4,-20,-33,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-13,-22,-21,-6,-20,-18,16,-14,3,12,-12,-23,-17,-16,-6,-2,23,-28,-11,-19;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-21,-5,8,-22,-5,-10,-20,2,-17,-12,-3,-11,3,-2,4,-4,-14,-23,-15,5;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-24,-7,-3,-21,-6,-5,-18,6,-13,-5,-1,-16,0,5,-5,-8,-14,-23,-12,-2;
MA   /M: SY='A'; M=9,-13,-22,-18,-12,-10,-9,-9,-3,-12,-7,-3,-10,-17,-3,-15,-2,-4,-5,-11,5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=13,-19,3,-25,-20,-5,-19,-18,3,-16,-1,2,-18,-22,-17,-20,-5,-3,10,-20,-4,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-25,1,14,-23,-17,-3,-25,16,-20,-12,0,-11,8,16,-2,-3,-19,-24,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=12,-5,-19,-10,-4,-19,-1,-12,-16,-4,-16,-11,-1,-14,-4,-6,7,-1,-9,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-20,-25,-21,-1,-11,-17,2,-20,4,0,-18,-23,-19,-19,-11,-6,3,-6,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-16,-21,-15,0,-15,-19,1,-15,2,-2,-14,-17,-16,-15,-2,0,5,-20,-7,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,4,7,-21,-7,-1,-24,4,-19,-13,3,-11,2,2,-2,-8,-20,-25,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-24,-16,-10,-4,-17,-8,-5,-9,5,2,-14,-18,-7,-4,-13,-8,-7,-14,1,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-27,-4,-14,-22,27,-17,-22,-16,-20,-14,0,-16,-15,-18,-1,-12,-17,-23,-20,-15;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-16,-17,-14,-10,-18,-18,4,-15,-4,-2,-14,-11,-14,-18,-2,-2,11,-26,-12,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-28,9,5,-22,-9,-12,-23,-6,-20,-18,-2,-8,-3,-10,-1,-6,-20,-7,-12,1;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-20,-25,-24,-20,6,-14,-14,1,-18,5,10,-19,-23,-15,-17,-16,-10,-3,7,6,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00141;
//
ID   RUBISCO_LARGE_MP; MATRIX.
AC   MP00157;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribulose bisphosphate carboxylase large chain active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5574875; R2=0.0164159; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=656; N_SCORE=16.316; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=58; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=8,-6,-17,-8,-2,-20,-7,-9,-21,4,-22,-14,2,-14,1,16,16,5,-11,-29,-16,-2;
MA   /M: SY='P'; M=0,-15,-32,-10,-6,-28,7,-19,-24,-13,-28,-19,-11,44,-12,-19,-1,-9,-25,-27,-28,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,7,28,-30,-20,-6,-30,35,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,10,-29,5,4,-28,-11,-1,-20,-1,-28,-16,19,21,9,-5,1,-6,-30,-32,-21,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-22,-25,-21,39,-28,-3,-2,-17,1,-2,-16,-26,-21,-14,-11,3,-4,10,43,-21;
MA   /M: SY='G'; M=28,-10,-19,-16,-14,-24,31,-20,-23,-14,-19,-14,-6,-14,-14,-20,6,-9,-13,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='R'; M=6,2,-23,2,0,-24,-11,-7,-25,9,-18,-14,0,-14,1,21,-1,-6,-15,-24,-16,-2;
MA   /M: SY='A'; M=20,-19,-12,-25,-19,-9,-14,-19,10,-13,3,12,-19,-19,-15,-18,-3,-2,19,-23,-12,-17;
MA   /M: SY='V'; M=16,-21,16,-26,-23,-11,-19,-26,4,-18,-3,-3,-21,-25,-23,-22,-3,-2,20,-30,-18,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-12,9,-26,32,-12,-1,-8,-2,-10,-26,-2,9,-16,-12,-16,8,49,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-8,-27,-24,19,0,-21,-11,-26,3,-4,-16,-27,-28,-21,-14,-12,-7,-13,-2,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-29,-28,-31,-21,4,-20,-24,0,-22,13,0,-29,-26,-18,-20,-25,-15,-6,40,6,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-26,-8,8,-14,-24,-9,-12,9,2,-2,-11,-17,2,14,-15,-10,-12,-22,-9,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-11,-20,-16,4,-20,-16,17,-17,22,11,-19,-19,-15,-14,-15,-4,16,-15,-2,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-24,-34,-25,1,-34,-24,34,-25,22,20,-20,-21,-18,-24,-17,-3,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,52,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,34,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,4,-27,-1,-4,-17,-13,-7,-11,-10,-13,-11,13,16,-8,-11,-6,-6,-21,-32,-19,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-19,-26,-23,-10,-12,-30,-14,17,-15,11,12,-16,-20,7,-13,-14,-9,7,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='G'; M=6,12,-21,1,-9,-24,25,-7,-25,-9,-26,-18,24,-18,-9,-11,6,-7,-24,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-1,23,-16,11,0,-20,0,1,-20,-4,-30,-20,38,-16,0,-4,23,9,-21,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-32,-2,16,-38,-20,4,-20,6,-22,-4,-4,11,45,4,-2,-10,-30,-22,-14,29;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-29,-13,-7,-21,-22,-22,-10,-12,-20,-13,-18,52,-13,-18,-4,3,-12,-30,-23,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,69,-30,-11,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,41,-28;
MA   /M: SY='M'; M=6,-14,5,-22,-15,-11,-13,-11,-2,-13,-3,17,-12,-19,-7,-15,0,-2,1,-29,-13,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-15,-36,-9,0,-26,-20,-1,-24,4,-26,-15,-10,42,-1,12,-10,-11,-27,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-34,-31,-34,-26,8,-26,-26,5,-24,11,0,-34,-30,-22,-20,-30,-17,1,52,11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-6,-26,-8,2,-24,-16,-8,-26,30,-22,-10,-2,-14,6,35,-6,-8,-16,-20,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-14,12,-30,21,32,-30,-18,-2,-32,18,-24,-18,4,-8,12,17,-4,-10,-26,-28,-16,21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-23,-13,-7,-15,-22,-9,-17,14,-13,-7,-5,-20,0,40,-4,3,-5,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-21,-31,-23,25,-26,-16,11,-23,12,5,-19,-24,-22,-20,-15,-8,6,-4,16,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00142;
//
ID   ALDOLASE_CLASS_I_MP; MATRIX.
AC   MP00158;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fructose-bisphosphate aldolase class-I active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5835381; R2=0.0164816; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=528; N_SCORE=14.276; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,41,-35,-20,5,-25,10,-20,-10,0,-5,39,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-25,-5,4,-25,-17,1,-25,24,-22,-8,0,-12,10,20,-4,-4,-17,-22,-8,6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-10,-27,-27,-1,-29,-29,25,-19,7,7,-26,-27,-27,-19,-6,7,43,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-33,-30,-33,-23,10,-27,-23,7,-27,26,7,-33,-30,-20,-20,-33,-17,-3,37,10,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-13,-13,-6,-20,-3,-15,-15,-5,-17,-13,-3,-11,-5,-5,15,4,-5,-25,-19,-6;
MA   /M: SY='E'; M=11,-3,-10,-3,13,-19,-12,-8,-19,-5,-17,-15,-4,-11,1,-11,9,-1,-14,-25,-11,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-2,-26,-24,-2,-28,-27,16,-20,9,5,-23,-27,-24,-19,-6,8,30,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-31,-26,53,-30,-6,3,-21,6,1,-21,-30,-27,-16,-19,-9,1,14,46,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-25,-6,-2,-3,-18,3,-20,14,-20,-9,5,-17,-3,8,-5,-7,-17,-17,3,-2;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-14,-16,-11,-12,-5,-11,-9,-9,-10,-9,-5,-14,-9,-17,5,-2,-4,-14,-5,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='H'; M=6,2,-19,-4,-4,-15,-9,15,-17,-7,-19,-10,9,-16,2,-8,8,-1,-16,-23,1,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-15,23,-30,35,40,-33,-16,0,-34,8,-24,-23,7,-6,12,3,-1,-10,-29,-33,-19,25;
MA   /M: SY='H'; M=-15,15,-26,8,3,-23,-12,53,-25,-3,-24,-8,28,-19,13,1,-1,-11,-30,-33,1,5;
MA   /M: SY='H'; M=-11,13,-26,5,-5,-22,9,38,-29,-9,-26,-12,26,-20,-1,-5,0,-12,-30,-31,-7,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-28,-21,13,-29,-13,16,-20,21,16,-25,-28,-16,-16,-20,-8,14,-12,13,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-31,-23,-32,-22,21,-29,-21,13,-29,37,13,-29,-30,-23,-20,-29,-12,5,1,7,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-8,-1,-16,-14,-12,-18,-21,-4,-15,-9,-8,-5,-14,-12,-16,12,24,2,-30,-13,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-19,-24,-17,2,-24,-19,15,-25,27,11,-19,-24,-15,-19,-12,-3,8,-25,-5,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,77,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-2,25,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,41,-16,0,-4,21,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-21,-31,-21,0,-22,-2,22,-12,20,57,-20,-20,-2,-12,-20,-10,12,-20,0,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-14,-16,-15,-9,-16,-22,-1,-15,-6,-5,-6,-14,-14,-15,10,31,6,-28,-10,-15;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-31,-11,-2,-27,-14,-19,-18,-10,-26,-18,-15,61,-9,-19,-1,-5,-22,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=12,-6,-18,-11,-5,-14,-12,4,-13,-7,-14,-7,-4,-14,4,-9,8,4,-10,-18,1,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-1,13,-24,21,26,-27,-13,-6,-24,-1,-16,-18,2,-8,5,-9,3,-6,-20,-31,-18,15;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-13,51,-19,-18,-10,-17,-21,-23,-22,-21,-18,-8,-26,-19,-21,9,2,-9,-39,-20,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-23,-4,5,-23,-10,-15,-22,9,-21,-13,-3,0,-1,0,3,8,-15,-25,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-28,5,11,-24,-11,-9,-18,4,-13,-10,-2,-13,4,1,-6,-10,-16,-25,-14,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-4,9,-26,-21,-8,-21,28,-21,-7,-4,-13,12,24,-8,-9,-13,-22,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-10,-16,-13,-12,2,-18,-17,-8,-14,-11,-7,-16,-13,-13,4,5,-8,-20,-12,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-23,-5,-1,-22,-14,-5,-20,-6,-25,-15,-2,21,-4,-9,12,11,-17,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-27,-9,2,-21,-19,-10,-10,-10,-17,-11,-9,22,-5,-15,1,2,-13,-29,-17,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00143;
//
ID   ALDOLASE_KDPG_KHG_1_MP; MATRIX.
AC   MP00159;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   KDPG and KHG aldolases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0006876; R2=0.0144532; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=818; N_SCORE=16.813; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-16,15,-28,14,6,-26,-14,0,-30,22,-26,-16,17,-16,6,30,-4,-8,-24,-28,-14,4;
MA   /M: SY='I'; M=5,-18,-20,-21,-8,-8,-23,-20,12,-17,11,4,-18,-18,-13,-18,-10,-6,12,-24,-10,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-1,15,-26,24,38,-30,-14,-4,-28,4,-20,-20,3,-4,10,-6,2,-8,-24,-30,-20,24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,39,-30,55,16,-36,-12,22,-38,-2,-28,-23,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=26,-18,-18,-28,-18,-12,-16,-24,14,-18,2,2,-14,-14,-14,-24,-2,-4,12,-20,-12,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-18,-24,-18,-2,-28,-22,14,-11,18,10,-24,-26,-18,-10,-18,-6,21,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,6,-30,-18,26,-26,38,29,-26,-26,-16,-20,-26,-10,14,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,20,-30,30,22,-32,-16,-2,-34,19,-26,-20,8,-10,8,16,-4,-10,-26,-30,-16,14;
MA   /M: SY='A'; M=39,-8,-10,-18,-10,-18,-5,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,11,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=18,-22,-14,-28,-22,-8,-20,-26,18,-18,4,4,-20,-20,-20,-22,-4,-2,26,-24,-12,-22;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-15,-14,-5,-20,-8,-18,-15,4,-15,-10,-6,-10,-5,-7,7,7,-5,-22,-16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-15,-28,54,-13,-35,-15,-30,-20,14,-20,-15,-15,2,-15,-30,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,30,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-24,-2,0,-20,-12,0,-26,15,-24,-14,14,-18,6,39,5,-1,-20,-28,-14,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,14,-26,-26,-5,-28,-28,12,-20,1,1,-23,-28,-26,-20,-5,7,30,-34,-14,-26;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-18,-28,-18,1,-21,-16,13,-22,31,21,-24,-24,-14,-18,-19,-8,8,-20,-5,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,17,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,39,-30,-20,12,-30,34,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-8,12,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-30,1,26,-24,-22,-6,-17,-1,-9,-9,-9,10,14,-6,-8,-10,-23,-26,-16,19;
MA   /M: SY='C'; M=4,-16,40,-22,-20,-16,-21,-5,-14,-20,-12,-9,-14,-28,-18,-21,-5,-8,0,-36,-15,-20;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,12,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=17,-22,-14,-26,-18,-5,-18,-22,10,-20,16,5,-22,-22,-18,-20,-9,-4,15,-22,-10,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,33,38,-33,-17,-2,-33,14,-25,-22,7,-5,12,2,-2,-10,-28,-32,-18,25;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-26,-8,4,-25,-16,-4,-25,23,-20,-8,-2,-14,15,35,-5,-8,-18,-20,-12,7;
MA   /M: SY='I'; M=10,-24,-17,-29,-21,-3,-23,-24,19,-22,19,9,-22,-22,-19,-22,-13,-5,18,-22,-8,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-34,-24,4,-32,-20,32,-26,32,28,-24,-24,-16,-22,-24,-10,18,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-26,-10,0,-22,-16,-6,-26,25,-20,-10,-2,-16,6,42,-6,-8,-16,-20,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-25,3,27,-31,-15,-3,-23,10,-19,-11,-2,-6,24,2,1,-8,-22,-24,-16,25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-24,7,22,-24,-17,-2,-14,2,-16,-11,8,-12,13,-2,0,-6,-15,-30,-16,18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00144;
//
ID   ALDOLASE_KDPG_KHG_2_MP; MATRIX.
AC   MP00160;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   KDPG and KHG aldolases Schiff-base forming residue.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1036577; R2=0.0146045; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=973; N_SCORE=19.304; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='A'; M=16,-3,-13,-9,-7,-14,-6,-12,-9,-12,-8,-9,3,-15,-7,-14,12,5,-6,-30,-16,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,12,-13,1,-5,-15,-11,-9,-15,-7,-19,-15,20,-13,-5,-7,20,30,-11,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=11,-19,-25,-17,-9,-21,-15,-22,-7,-12,-16,-11,-19,35,-14,-20,-4,-5,-5,-27,-23,-14;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-11,-9,-6,-15,-6,-12,-11,-10,-16,-5,1,-11,-3,-12,23,17,-4,-32,-15,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,14,-27,22,43,-30,-15,-3,-29,5,-20,-20,2,-3,12,-5,1,-9,-26,-30,-20,28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,41,-28,24,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-11,-23,-15,5,-9,-20,0,5,-4,8,35,-14,-14,6,-7,-14,-10,-2,-23,-6,5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-25,-18,-3,-6,-26,-11,7,-10,16,13,-16,-20,-4,-2,-18,-10,0,-22,-6,-5;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-20,-15,-15,-25,35,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-29,-20,11,-28,-10,17,-23,37,24,-27,-28,-15,-17,-27,-10,7,-13,12,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-3,19,-23,26,22,-28,-14,-7,-27,0,-20,-20,6,-7,3,-8,5,3,-20,-32,-18,12;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-22,-32,-24,37,-29,-10,9,-23,22,15,-23,-29,-22,-17,-23,-10,3,0,26,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-25,-34,-25,24,-33,-17,22,-27,26,13,-23,-27,-22,-22,-23,-10,11,-7,18,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,6,-20,7,2,-22,-12,-8,-25,7,-24,-16,6,-12,1,13,13,11,-15,-31,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-8,-20,-9,3,-17,-19,-12,-14,5,-12,-9,-6,-14,-1,14,1,5,-4,-25,-13,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-17,-35,-28,42,-30,-23,13,-27,18,7,-25,-30,-33,-20,-19,-7,17,-8,12,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,56,-30,-20,7,-30,24,7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-30,14,44,-30,-2,-4,-32,4,-22,-20,0,-4,12,-4,0,-12,-30,-28,-22,28;
MA   /M: SY='A'; M=12,-12,-16,-20,-17,-8,-17,-19,10,-16,5,2,-7,-20,-15,-18,-5,-3,11,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-8,-19,-15,-14,8,-17,-13,2,-19,-1,-3,2,-21,-14,-15,2,1,-2,-24,-4,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-24,-8,-16,-24,56,-16,-32,-16,-24,-16,0,-16,-16,-16,0,-16,-24,-16,-24,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-16,-29,-25,0,-30,-27,26,-22,15,10,-23,-25,-23,-20,-10,4,32,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='P'; M=8,-10,-27,-10,0,-27,-14,-17,-20,10,-24,-14,-10,26,-3,-3,-4,-7,-17,-24,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=18,-17,-15,-27,-17,6,-12,-14,1,-14,3,13,-15,-17,-13,-17,-5,-5,3,-14,-4,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-23,-33,-23,3,-29,-16,29,-23,30,34,-23,-23,-13,-19,-23,-10,16,-20,0,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,0,10,-30,-17,-6,-27,33,-28,-10,2,-10,18,20,0,-5,-20,-23,-12,14;
MA   /M: SY='A'; M=32,1,-12,-9,-6,-20,0,-12,-14,-8,-17,-14,7,-12,-6,-14,15,3,-8,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-33,-23,17,-30,-19,23,-27,34,24,-25,-27,-20,-20,-25,-10,12,-16,4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=34,-13,-14,-20,-13,-17,6,-20,-10,-14,-4,-7,-11,-14,-13,-20,3,-4,-3,-20,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-27,-8,-14,-27,44,-15,-35,-10,-28,-18,2,-18,-12,-4,5,-12,-25,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-22,-35,-13,-5,-25,-22,-22,-12,-12,-23,-15,-22,70,-13,-20,-10,-8,-17,-30,-27,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,65,-30,-8,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,45,-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-24,-11,-8,-23,7,-16,-24,-6,-22,-15,-5,6,-8,-3,5,1,-17,-25,-21,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,6,-27,7,14,-36,-15,2,-22,9,-21,-7,1,-10,35,4,1,-8,-24,-23,-13,25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00144;
//
ID   ISOCITRATE_LYASE_MP; MATRIX.
AC   MP00161;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Isocitrate lyase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0840425; R2=0.0147984; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=12.251; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-30,34,15,-35,-15,-5,-35,26,-30,-20,10,-10,5,10,-5,-10,-25,-30,-15,10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-14,-18,-22,-12,-16,-12,-18,-1,-7,-6,-4,-10,-14,-8,-5,0,-4,2,-20,-14,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,6,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,20,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-16,-18,-8,-22,-4,-20,-12,-10,-14,-12,-12,10,-10,-20,6,-2,-6,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-20,8,-26,-24,0,-30,-18,8,-20,0,0,-18,-26,-20,-20,-8,4,12,-20,6,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-30,-36,-26,4,-30,-22,24,-24,18,21,-26,-24,-16,-22,-26,-14,10,13,6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=3,-22,-16,-24,-18,-6,-22,-20,8,-10,8,4,-20,-24,-16,-2,-10,-4,19,-24,-10,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=6,-10,-18,-8,-2,-16,-8,-12,-10,-6,-14,-10,-10,33,-6,-12,-2,-4,-12,-16,-16,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=10,2,-20,-4,-10,-24,28,-12,-26,-12,-26,-18,12,-16,-10,-14,12,-4,-20,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-2,-24,-2,12,-24,-20,-10,-18,-2,-18,-12,-4,12,11,-6,6,14,-18,-28,-16,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-18,-24,-20,-8,-8,-24,-6,1,-5,15,17,-16,-22,6,7,-18,-10,-5,-20,-4,-2;
MA   /M: SY='G'; M=3,0,-28,4,-6,-30,22,-16,-30,-12,-26,-20,-2,7,-12,-18,0,-12,-24,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-4,-16,-28,55,-14,-36,-16,-30,-20,13,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=9,-18,-14,-18,-8,-10,-22,-22,9,-12,0,0,-20,-20,-16,-16,-4,-2,23,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-32,-8,-4,-28,2,-18,-24,-12,-30,-20,-10,47,-10,-18,3,-6,-26,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-14,-10,-5,-16,-18,-14,-7,-8,-12,-6,-4,-14,3,-8,14,22,1,-30,-12,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,20,-30,28,20,-40,-16,6,-28,6,-24,-12,8,-10,36,2,0,-10,-30,-28,-14,28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-30,4,34,-26,-24,-4,-12,2,-12,-8,-4,-6,20,-4,-4,-10,-18,-26,-14,26;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-26,-12,-4,-16,-20,40,-7,-6,-3,25,-4,-18,16,-2,-12,-14,-13,-24,6,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,14,-28,15,6,-26,-14,0,-30,22,-26,-16,16,-16,6,32,-4,-8,-24,-28,-14,4;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-26,-10,-2,-18,-20,-4,-26,22,-18,-10,0,-18,6,55,-4,2,-16,-22,-10,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00145;
//
ID   ALPHA_CA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00162;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-carbonic anhydrases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8863788; R2=0.0135742; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=629; N_SCORE=13.415; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,39,-24,42,9,-31,-5,1,-29,-1,-27,-24,30,-13,-1,-8,5,-5,-26,-37,-20,4;
MA   /M: SY='N'; M=-12,11,-28,13,6,-27,8,7,-33,0,-26,-18,14,-16,0,6,-1,-12,-28,-29,-17,1;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-18,-11,-1,-14,-23,-14,-4,-2,-7,-4,-10,-17,-2,3,0,8,6,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-18,-8,-3,-18,-20,-15,-15,-1,-16,-10,-2,1,1,-4,11,29,-9,-28,-12,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,-21,-31,-24,48,-25,-9,-2,-21,4,-2,-18,-26,-26,-17,-15,-8,-3,10,35,-24;
MA   /M: SY='T'; M=1,-11,-20,-14,-3,-16,-21,-14,-3,-3,-7,-3,-9,-15,1,1,-1,3,2,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=1,-24,-20,-25,-15,-1,-23,-20,8,-23,27,9,-24,-11,-16,-19,-19,-6,3,-22,-8,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-22,-16,-8,-7,-23,-12,-3,3,-2,1,-11,-18,-2,4,-10,-3,-1,-17,-1,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,1,22,-39,-20,9,-21,10,-20,-1,0,-9,58,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-19,-35,-26,44,-29,-18,10,-27,21,11,-24,-29,-30,-19,-21,-9,9,-4,16,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,0,-20,-20,95,-30,-8,-20,-1,9,-20,10,4,-10,-19,-29,-29,18,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-31,-23,-37,-27,52,-29,-21,5,-29,19,4,-25,-30,-32,-20,-25,-12,1,14,21,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-31,-38,-33,-25,8,-18,-26,-15,-18,-16,-16,-30,-25,-18,-18,-25,-18,-19,97,19,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-18,-6,-12,-20,41,-13,-25,-13,-21,-14,1,-13,-12,-13,4,-9,-18,-16,-20,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-14,2,2,-16,1,-5,-16,-1,-16,-11,7,-9,1,-2,8,1,-12,-21,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-11,2,-1,-13,-8,-3,-11,-4,-13,-9,5,-10,0,-4,8,5,-8,-20,-7,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-18,-7,-2,-9,-13,10,-15,0,-14,-6,-2,-10,1,1,-4,-7,-14,-9,1,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-30,-12,-16,-23,41,-20,-31,-19,-23,-17,-6,-1,-18,-19,-3,-13,-25,-21,-25,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-19,5,-29,3,0,-20,-17,88,-29,-9,-21,-3,17,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,15,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-14,-10,-5,-13,-18,-16,-9,-9,-8,-8,-2,-12,-4,-8,14,30,-3,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-28,1,-32,-28,33,-23,18,16,-27,-27,-25,-22,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-27,41,11,-33,-2,1,-34,0,-28,-24,19,-12,-1,-8,2,-8,-27,-35,-19,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-28,-11,-18,-23,57,-19,-36,-18,-28,-19,0,-20,-19,-17,1,-16,-27,-20,-26,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-9,-25,-10,0,-18,-23,-4,-10,14,-10,-1,-8,-16,0,10,-10,-7,-4,-23,-7,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-20,-9,-2,-20,-20,19,-20,6,-16,-5,-1,-17,6,15,-6,-7,-16,-25,-3,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,54,-30,2,-1,-20,5,0,-19,-30,-25,-15,-20,-10,-5,18,53,-25;
MA   /M: SY='P'; M=8,-11,-26,-9,-4,-24,-13,-18,-14,-10,-21,-15,-10,36,-10,-18,1,-4,-14,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='M'; M=15,-18,-14,-25,-16,-7,-13,-15,7,-16,11,17,-17,-18,-10,-18,-8,-5,6,-21,-10,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-25,-20,-29,-20,1,-21,-18,17,-24,30,20,-23,-24,-16,-20,-20,-9,9,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-34,-26,12,-33,-25,29,-28,30,16,-26,-27,-24,-23,-23,-8,22,-19,1,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-11,-30,-29,-1,-30,-30,30,-20,10,10,-29,-29,-29,-21,-10,-1,47,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-2,-29,-2,-2,-17,-20,91,-26,-10,-17,3,7,-20,9,-1,-11,-19,-27,-27,22,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-20,-35,-19,-8,-4,-23,-12,-15,2,-12,-9,-20,-22,-3,-1,-22,-16,-18,43,15,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,24,-21,15,1,-22,-4,3,-21,4,-27,-17,33,-17,-1,2,8,-1,-22,-36,-17,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-15,-4,2,-17,-10,-11,-13,-6,-16,-11,4,-11,-2,-9,16,12,-8,-32,-16,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='B'; M=0,11,-19,11,4,-22,-8,-8,-20,4,-19,-14,7,-11,-2,-3,4,3,-13,-27,-15,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-23,-5,-4,-16,0,-12,-20,9,-15,-9,0,-15,-5,4,-5,-7,-15,-20,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-14,-24,-15,-13,9,-19,-2,-6,-10,-3,-4,-13,-19,-9,-11,-8,-3,-9,-1,26,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-26,-4,1,-18,0,-13,-20,-6,-15,-12,-5,0,-6,-8,-2,-8,-17,-26,-18,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-18,4,1,-20,-11,-10,-16,-1,-17,-13,5,-14,-3,-4,10,5,-9,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-12,-19,-17,12,-25,-12,4,-18,2,-1,-15,-25,-20,-17,-10,-6,8,-15,8,-19;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-21,-4,0,-20,-8,-14,-10,-5,-11,-6,-6,-14,-4,-11,0,-5,-5,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='E'; M=3,0,-24,1,9,-24,0,-13,-21,-1,-16,-13,-3,-11,-2,-8,0,-6,-15,-25,-18,3;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-16,-16,-9,-16,-7,-18,-3,-13,-4,-5,-11,-15,-9,-17,2,-2,2,-24,-16,-9;
MA   /M: SY='A'; M=4,-14,-11,-17,-12,-11,-12,-15,-4,-11,-2,2,-12,-20,-8,-11,-5,-5,1,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,14,-26,13,9,-29,-13,11,-27,14,-27,-13,16,-13,14,8,2,-6,-25,-30,-11,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00146;
//
ID   FUMARATE_LYASES_MP; MATRIX.
AC   MP00163;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fumarate lyases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1918511; R2=0.0089964; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1031; N_SCORE=9.082; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=744; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-68,-59,-58,-74,-62,-66,-66,-59,-72,-65,-52,73,-59,-67,56,82,-61,-84,-70;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=27,21,-64,-59,-69,-17,-66,35,-12,-60,-57,-56,0,45,-62,45,31,-13,-79,-66;
MA   /M: SY='E'; M=2,-74,-43,81,-78,37,-58,-78,-51,-31,-69,23,-62,-45,-59,24,-56,-72,-79,-72;
MA   /M: SY='F'; M=-22,-71,-82,-74,69,-82,-69,13,-71,55,-39,-76,-81,0,-11,-70,-62,21,-62,-42;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-25,-86,-70,-73,-83,16,-69,-78,8,-10,39,57,-85,1,13,-68,-71,-80,-93,-79; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-79,-98,-5,80,-79,-92,16,-95,-63,-88,-84,-73,-77,-56,-70,-75,-78,-91,-83,45; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-21,-71,-84,-79,47,-84,-79,63,-77,23,-39,-77,-78,-76,-78,-70,-57,58,-69,-49;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-74,34,53,-73,-20,-56,-69,25,-8,14,24,-64,6,-6,10,29,-67,-82,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-63,-75,-56,64,-4,-78,-59,-11,-55,50,42,-66,-69,55,-59,-64,-62,-53,-72,-57;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-80,17,-52,-8,-66,-64,-71,24,-31,-66,-58,96,-57,-8,34,-7,-71,-78,-69;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-96,-98,-105,-102,73,-106,-96,-79,-100,-31,-80,-96,-7,-106,-101,-89,26,-82,-81,-60; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-29,-106,-12,23,-100,-2,-91,18,-19,-90,-87,-84,-94,-1,-14,-85,-89,-83,-105,-95; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=14,-76,19,60,-78,-69,-57,-75,58,-30,-65,-52,-63,30,18,-54,-9,-69,-77,-67;
MA   /M: SY='Y'; M=-61,-75,32,-11,46,28,-55,-64,9,-26,-60,23,-72,3,-60,9,-58,-20,-60,58;
MA   /M: SY='Q'; M=1,47,-51,53,-79,-67,18,-18,-48,-69,-62,-53,-64,88,-52,10,14,-66,-79,-65;
MA   /M: SY='T'; M=1,-70,-68,-66,-63,-21,-72,56,-14,-53,-52,-59,24,-64,-10,-11,68,8,-80,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='S'; M=-42,-64,-56,-57,-73,-50,-59,-71,-57,-74,13,-45,-64,-49,-61,107,-36,-65,-82,-65;
MA   /M: SY='I'; M=33,-69,-76,-72,-56,-73,-75,74,-70,0,18,-67,-71,-68,-74,-13,29,12,-77,-60;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-89,-68,-56,-82,-68,-70,-71,-63,-32,-67,-73,124,-66,-75,-63,-59,-75,-79,-81;
MA   /M: SY='H'; M=0,-78,-56,-52,-64,17,105,-77,-54,-69,-58,24,-70,71,-53,-53,-63,-76,-72,47;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-60,-75,-66,-56,-66,-22,-64,23,63,-57,16,-58,-70,-51,58,-60,-8,38,-77,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-69,-74,-60,-84,-70,-72,126,-65,-12,-63,-59,-79,-79,-82;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-77,71,-58,-63,-78,-69,66,-68,-48,57,-57,-72,-66,-73,-64,14,9,-86,-63; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=15,-73,43,-54,-72,-20,-63,-59,-11,-26,14,-54,-70,28,30,-11,40,18,-84,-66; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=25,76,-72,-68,46,-67,-70,-12,-68,9,-55,-64,23,-68,-72,34,15,-15,-72,-55;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-32,110,-84,-76,-53,-84,-41,-76,-72,-56,-56,10,-51,-56,-61,-77,-80,-73;
MA   /M: SY='N'; M=14,-71,-60,-60,-61,-67,-57,-54,-9,45,-49,65,-75,4,50,-57,-57,-16,-78,-62;
MA   /M: SY='I'; M=-56,47,-76,-73,-55,-75,-73,51,-70,12,42,-66,-74,-68,-73,33,15,46,-81,-60;
MA   /M: SY='C'; M=-61,85,-56,37,-73,-73,-60,-72,-43,-28,-63,-1,-70,5,69,-54,48,-66,-83,-68;
MA   /M: SY='G'; M=16,-73,-7,-64,-77,79,-65,-76,-63,-30,13,-51,-68,27,-68,24,-59,-71,-76,-71;
MA   /M: SY='K'; M=-21,-70,-62,-60,-4,-71,-63,11,57,34,-48,49,-72,-57,-51,-59,-8,19,-75,-59;
MA   /M: SY='C'; M=47,85,-67,-65,-66,-61,16,-61,-65,18,-56,-58,-71,-62,-69,43,30,-55,-83,-66;
MA   /M: SY='R'; M=25,-75,-65,-63,-8,65,16,-75,-48,-73,-65,-55,-71,-55,68,-53,-64,-21,-74,-64;
MA   /M: SY='R'; M=-62,-76,-66,-55,-63,-75,43,-53,26,27,17,-59,-73,44,64,-14,-60,18,-77,-57;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-76,-72,-53,-76,15,16,-71,29,18,-69,-76,-68,-72,33,-51,73,-82,-58;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00147;
//
ID   ENOLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00164;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Enolase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7987094; R2=0.0172887; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=430; N_SCORE=13.223; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-30,-15,-6,-20,-20,-20,-6,-11,-16,-9,-16,38,-11,-17,-5,-3,-11,-27,-20,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-25,4,18,-25,-17,-8,-21,15,-18,-12,0,-10,7,7,-1,-4,-16,-26,-14,12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-18,-28,-20,-11,-3,-26,-8,-5,5,-1,1,-10,-22,-4,28,-16,-10,-5,-14,3,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,34,19,-25,-26,-21,-24,-24,-9,20,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-25,-3,10,-27,-16,-7,-23,22,-22,-10,-2,-11,13,17,-1,-5,-17,-22,-13,11;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-29,3,15,-26,-20,-6,-26,29,-23,-10,0,-10,11,22,-6,-7,-20,-23,-11,12;
MA   /M: SY='G'; M=13,-11,-25,-13,-17,-26,47,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-15,-17,-20,2,-14,-21,-20,-26,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-35,-28,-1,-32,-28,39,-27,15,15,-19,-21,-20,-26,-16,-8,27,-22,-3,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-27,17,32,-29,-16,-3,-27,12,-22,-17,4,-6,13,4,0,-7,-24,-29,-17,22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-4,9,-20,-20,-6,-14,11,-10,-1,-4,-13,7,9,-7,-6,-12,-24,-10,7;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-28,-2,-4,-27,18,-8,-32,10,-28,-14,7,-16,-4,5,-3,-12,-25,-23,-19,-4;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-8,-20,-14,-13,-12,-20,2,-15,-6,-4,-11,-16,-13,-19,8,4,9,-28,-15,-14;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,8,-18,-14,-20,0,-21,-16,-15,-14,-12,-9,-17,-14,-20,6,1,-5,-27,-21,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-20,18,0,-20,-3,7,-20,3,-29,-19,52,-19,0,1,9,2,-27,-38,-19,0;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-3,-12,-10,-21,8,-17,-20,-13,-21,-16,-2,-14,-10,-17,17,4,-9,-29,-22,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-32,-25,3,-32,-25,31,-26,26,16,-25,-25,-21,-23,-18,-4,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-31,-21,8,-31,-21,23,-30,45,19,-29,-27,-20,-21,-28,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,37,-27,25,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,11,30,-10,-10,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-21,-25,-19,-3,-27,-24,13,-20,9,5,-26,4,-21,-20,-16,-6,14,-26,-11,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,22,1,-21,0,10,-21,0,-30,-20,58,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-29,-38,-30,0,-39,-29,48,-29,19,19,-19,-21,-20,-29,-19,-9,30,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,35,18,-28,-28,-22,-22,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-13,-11,-16,-13,3,-11,-6,-10,27,35,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,52,-30,-18,0,-30,10,-21,-20,1,-2,18,2,0,-10,-29,-30,-19,35;
MA   /M: SY='T'; M=14,-2,-10,-11,-8,-14,-12,-18,-12,-10,-14,-12,-1,-10,-8,-12,21,32,-2,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-32,-23,11,-31,-15,22,-25,25,17,-22,-25,-18,-20,-22,-10,13,-16,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,16,-28,22,29,-32,-15,0,-28,8,-22,-17,6,-8,17,1,0,-8,-26,-29,-16,23;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-11,-18,-11,-13,-7,-18,-9,-11,-9,-9,-8,-12,-11,-17,11,11,1,-21,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=2,-25,-3,-32,-26,-6,-29,-28,24,-24,7,7,-20,-23,-22,-25,-11,-4,24,-26,-10,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,6,-26,6,14,-24,-15,-2,-25,15,-21,-13,7,-12,9,15,0,-5,-21,-27,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-20,-22,-17,5,-24,-15,12,-21,25,19,-20,-24,-14,-17,-18,-6,7,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-8,-18,-9,-20,0,-19,-12,-10,-12,-11,-8,-11,-9,-19,13,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-26,-7,2,-17,-20,6,-21,14,-18,-6,-1,-16,14,20,-5,-5,-18,-19,-1,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-27,5,11,-24,-15,-3,-27,19,-22,-13,4,-13,7,23,-2,-6,-20,-25,-13,8;
MA   /M: SY='N'; M=10,10,-17,-1,-5,-15,-5,4,-15,-6,-19,-13,20,-16,-4,-7,7,-2,-15,-29,-13,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-26,-4,-12,-26,39,-11,-32,-10,-28,-18,10,-18,-11,-10,5,-11,-26,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-27,-33,-30,-24,23,-26,-4,-1,-16,-1,2,-26,-29,-15,-15,-26,-16,-10,53,46,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-22,-6,-6,-22,6,-13,-24,3,-21,-13,1,-15,-5,3,5,3,-15,-25,-17,-6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-3,-19,-17,-10,-21,-18,3,-16,-4,-3,-12,-17,-16,-16,1,7,13,-30,-12,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00148;
//
ID   DEHYDRATASE_SER_THR_MP; MATRIX.
AC   MP00165;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine/threonine dehydratases pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7776338; R2=0.0075844; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1226; N_SCORE=10.070; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=755; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-29; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-75,16,1,-13,-48,60,-47,34,-25,18,27,-8,32,20,-17,-6,-35,-8,-58;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-76,-58,10,-8,-50,12,-12,22,-38,-5,34,16,-13,27,-40,-14,-15,-62,64;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-72,-75,-47,34,-40,-59,-31,-33,59,-41,-42,-11,-35,-43,-67,-26,-36,-55,69;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-28,-71,-34,0,-76,-7,-3,-73,-8,-36,-67,22,36,22,-38,78,-30,-69,-81,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-77,-20,37,-75,-36,-57,1,26,-31,-57,-32,-66,87,-31,-9,-14,2,-76,-64;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-26,-59,6,-26,-18,-60,-13,48,-25,-25,-7,46,22,46,-18,-25,-25,-75,-65;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,32,-29,-72,-27,-54,-65,47,-48,37,-43,-69,-42,-68,-72,-62,25,-7,-4,59;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-32,-75,45,11,-46,50,-23,-76,8,-22,-68,35,2,-2,-39,-2,-6,-74,-81,-70; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=5,82,-12,-3,-75,56,-67,-49,-11,-72,-27,21,-71,-62,-27,-24,13,-10,-83,-73;
MA   /M: SY='N'; M=-45,-75,13,41,-78,-47,-53,-74,26,-75,-67,62,-20,37,31,-15,18,-38,-8,-67;
MA   /M: SY='V'; M=-34,-71,-83,-51,-6,-84,-77,52,-76,49,14,-79,-79,-73,-76,-71,-58,55,19,-54;
MA   /M: SY='Y'; M=-51,-77,-75,-73,52,-54,42,-36,-69,31,-18,-41,-81,-66,-67,-22,-65,-56,71,92;
MA   /M: SY='L'; M=-48,32,-84,-77,-4,-58,-72,5,-77,77,-33,-80,-83,-73,-76,-73,-61,28,-73,-54;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-76,-58,-44,-14,-51,-59,-71,103,-5,-60,-51,-65,-9,-28,-58,-58,-69,-71,-62;
MA   /M: SY='R'; M=-35,64,-59,32,5,-38,21,-69,23,-31,8,-34,-72,-49,67,-42,-40,-25,-73,9;
MA   /M: SY='E'; M=-63,-4,71,84,-74,-73,-56,-71,-50,15,-65,-52,-63,-44,-58,-59,-60,-70,-85,-69;
MA   /M: SY='D'; M=-56,-24,68,-51,30,15,11,-50,-59,-43,-68,28,-69,-56,-65,58,-51,-70,-78,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-73,-65,-28,-9,-73,104,-26,-42,42,35,-19,-74,-30,-5,-30,-62,-30,-79,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-33,-82,-57,-46,-85,27,-55,-76,-50,-58,-63,26,66,99,-54,-24,-60,-77,-76,-69;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-85,-45,-63,-64,-75,-7,51,-19,-60,-57,-71,89,-64,17,-66,-15,-28,92,-60;
MA   /M: SY='T'; M=-48,-64,-63,-64,-65,-46,-69,-45,-62,-58,-56,-53,-66,-61,-67,64,69,56,-86,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-43,-77,-66,-69,11,77,9,-73,-56,3,-61,-33,-73,-60,51,-56,-66,-72,-70,-14;
MA   /M: SY='S'; M=29,-63,-57,-57,-74,-49,-60,-72,-58,-76,-69,-47,-64,-50,-62,101,-38,-63,-81,-67;
MA   /M: SY='F'; M=-73,-73,-87,-83,107,-85,-70,52,-78,-38,-46,-76,-82,-84,-77,-74,-65,-42,-46,18;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='D'; M=40,-71,63,-56,-36,-68,-66,33,-66,42,-48,-59,-72,-63,-70,-19,-57,-47,-79,-62;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-81,-67,-55,17,-78,-54,-70,-29,-40,18,-59,-76,-44,108,-63,-65,-26,-72,-56;
MA   /M: SY='G'; M=6,-75,-65,-74,-82,99,-71,-88,-69,-84,-74,-51,-68,-66,-76,-48,-66,-80,-74,-77;
MA   /M: SY='A'; M=65,-68,-71,-68,-67,52,-68,7,-67,-10,61,-61,-69,-63,-71,-50,-58,-52,-74,-67;
MA   /M: SY='Y'; M=-64,-77,-72,-68,16,-1,-57,52,-62,-23,-19,-65,-75,31,7,-61,17,-16,-53,82;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-73,-56,-65,29,-65,48,-58,-59,-28,40,79,-23,-58,-62,-57,-57,-24,-58,78;
MA   /M: SY='M'; M=42,-70,-58,54,-23,-48,-61,-54,8,23,67,-63,-67,-27,-58,-27,-58,-29,-74,-62;
MA   /M: SY='V'; M=4,32,-80,-77,-55,-1,-78,52,-74,3,41,-73,-76,-72,-76,-64,-56,63,-80,-61;
MA   /M: SY='S'; M=12,-68,-63,-40,-62,-63,-61,-38,-3,37,-20,2,-70,27,-5,57,-3,-13,-77,-62;
MA   /M: SY='K'; M=4,-71,-13,-37,-67,-17,-4,-38,49,-2,40,-33,-68,32,-20,12,2,22,-78,-62;
MA   /M: SY='H'; M=2,-72,-73,-68,25,-76,86,-6,-33,58,-15,-66,-77,-63,-66,-32,-62,-26,19,-23;
MA   /M: SY='A'; M=55,-66,-11,-1,-72,-56,-63,-45,-10,-19,-62,3,2,-54,-62,51,30,-42,-80,-68;
MA   /M: SY='E'; M=3,-26,53,71,-26,-68,-2,-52,0,-56,-68,3,-7,1,-12,-26,-58,-72,-77,7;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-76,13,64,-14,-70,-2,-46,29,-4,-60,-32,-65,45,-2,-18,-58,-17,-77,-63;
MA   /M: SY='L'; M=26,-72,-23,29,-63,24,-62,-39,-40,43,-50,-8,-39,36,-15,-56,-25,-41,-75,-64;
MA   /M: SY='K'; M=46,32,-63,-37,-71,-24,-24,-44,55,0,-58,-34,-38,15,20,-25,-24,-22,-76,-66;
MA   /M: SY='R'; M=15,-72,10,15,-65,-35,-60,-19,5,26,9,2,-70,-12,42,23,-56,-42,-7,-63;
MA   /M: SY='K'; M=23,-75,-19,24,-78,-47,47,-75,64,-73,-63,11,-65,45,7,-36,-14,-50,-78,-63;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00149;
//
ID   ENOYL_COA_HYDRATASE_MP; MATRIX.
AC   MP00166;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Enoyl-CoA hydratase/isomerase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8292317; R2=0.0165940; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=235; N_SCORE=9.719; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=0,-19,-20,-21,-16,1,-14,-16,4,-18,9,5,-18,-23,-17,-16,-12,-7,7,-18,-2,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-27,-2,2,-13,-17,2,-12,-5,-8,-5,0,-16,10,-2,-7,-9,-17,-18,0,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,11,-25,14,15,-27,-11,-4,-23,4,-22,-15,7,-7,6,0,5,-4,-20,-31,-17,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-20,-27,-21,2,-22,-20,16,-24,21,11,-20,-24,-19,-20,-15,-2,13,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-27,-27,-20,22,-25,-12,-3,-20,1,-2,-18,-25,-17,-15,-17,-9,-6,22,16,-17;
MA   /M: SY='B'; M=-9,6,-22,4,1,-15,-14,-5,-17,-1,-11,-7,6,-16,0,4,-1,0,-15,-27,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-24,-8,2,-19,-19,-4,-12,7,-8,-1,-6,-16,5,12,-7,-8,-9,-23,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-22,-34,-25,13,-31,-22,27,-27,28,19,-24,-25,-21,-23,-22,-9,17,-17,2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,1,16,-17,-18,-1,-18,2,-12,-7,-4,-12,12,3,-2,-6,-18,-20,-4,13;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-22,9,2,-24,-12,-8,-22,5,-19,-14,4,-13,1,5,4,3,-14,-28,-15,1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,3,-25,-20,3,-19,-18,1,-23,8,0,-17,-27,-20,-20,-10,-5,3,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-2,-32,1,6,-26,-17,-7,-21,-1,-24,-16,0,34,-1,-5,-5,-7,-26,-30,-21,0;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-14,-24,-16,-8,-10,-25,-13,-2,10,-1,6,-13,-19,-4,3,-14,-7,1,-18,-1,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-37,-14,-4,-25,-22,-21,-11,-12,-23,-15,-20,71,-12,-21,-10,-8,-19,-29,-26,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-14,-24,-21,-4,-26,-24,17,-18,6,6,-18,-22,-19,-17,-2,10,25,-28,-9,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-11,-15,-9,-20,4,-18,-14,-11,-15,-13,-5,-11,-9,-17,16,5,-4,-25,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=34,-12,-13,-21,-12,-13,-6,-13,-6,-11,-4,-1,-11,-13,-10,-17,3,-3,0,-19,-13,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-35,-29,0,-34,-28,39,-24,16,19,-24,-24,-23,-24,-16,-6,37,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-23,14,6,-25,-8,11,-23,2,-25,-15,30,-15,10,3,7,-2,-26,-33,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-17,-25,-20,-14,1,-17,-5,-4,-12,-5,-2,-14,-10,-11,-13,-9,-7,-6,-5,11,-15;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,10,-20,-15,-18,-6,-22,-12,-14,-12,-11,-11,-17,-15,-21,7,1,1,-27,-21,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-24,-29,-21,5,-28,-21,19,-25,25,14,-22,-18,-18,-21,-22,-10,9,-14,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-22,17,-27,-22,4,-26,-17,-1,-25,13,2,-20,-30,-22,-21,-16,-8,3,-26,-7,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-22,8,28,-24,-13,-6,-19,-1,-13,-13,-2,-10,7,-6,-3,-9,-18,-29,-18,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-9,-31,-22,9,-28,-19,16,-26,34,21,-27,-29,-19,-19,-24,-9,11,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=23,-11,-8,-18,-14,-15,-8,-16,-4,-14,-8,-7,-8,-16,-13,-18,6,3,4,-26,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-19,-28,-19,3,-26,-15,18,-22,29,26,-22,-24,-13,-17,-18,-4,11,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-12,-18,-11,-14,-5,-11,-8,-12,-8,-1,-9,-15,-7,-16,4,0,-2,-23,-13,-9;
MA   /M: SY='C'; M=3,-14,72,-24,-22,-18,-22,-26,-23,-23,-17,-17,-14,-29,-22,-24,0,2,-7,-41,-25,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-19,39,-30,56,17,-37,-12,11,-37,-1,-28,-25,16,-7,3,-8,-2,-11,-30,-38,-15,9;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-23,-31,-24,24,-30,-13,16,-23,16,9,-23,-27,-22,-19,-19,-8,11,-3,24,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-26,-16,-8,-15,-23,-9,-12,13,-10,-4,-6,-20,0,39,-9,-4,-5,-22,-9,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-28,3,-35,-25,37,-26,19,16,-24,-25,-22,-25,-18,-7,31,-19,3,-28;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,4,-23,-15,-14,-10,-18,-5,-14,-3,1,-14,-17,-12,-19,1,-2,3,-25,-17,-14;
MA   /M: SY='A'; M=17,1,-14,-4,-6,-20,0,-13,-18,-10,-18,-15,2,-11,-7,-14,17,13,-8,-29,-18,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-28,14,15,-29,-15,-7,-24,1,-23,-17,0,10,7,-4,2,-3,-22,-30,-19,10;
MA   /M: SY='B'; M=-7,21,-21,19,10,-24,-9,-4,-24,1,-24,-19,20,-12,1,-3,9,7,-21,-34,-17,5;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-14,-14,-6,-20,-5,-17,-12,-8,-14,-11,-6,-6,-7,-14,12,4,-4,-25,-19,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-12,-15,-15,-9,-6,-19,-11,-7,1,-8,-3,-8,-17,-5,6,-3,1,-1,-18,-2,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-23,-37,-28,42,-31,-21,14,-28,17,8,-23,-28,-30,-22,-22,-10,9,3,18,-27;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-8,-12,-26,35,-15,-28,-13,-23,-13,-2,-17,-9,-13,3,-10,-19,-23,-23,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-21,-22,-12,-1,-24,-7,6,-17,18,13,-18,-22,-3,-13,-16,-8,1,-19,-2,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-27,-8,-2,-22,-15,-15,-16,-5,-22,-15,-9,45,-7,-11,-1,0,-19,-26,-21,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-24,5,27,-13,-8,-6,-22,-1,-15,-15,-3,-2,3,-6,-1,-7,-21,-21,-13,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-14,-20,-19,-15,-9,-23,-17,9,-12,1,6,-10,-11,-11,-13,-5,2,9,-27,-10,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00150;
//
ID   TRP_SYNTHASE_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00167;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tryptophan synthase alpha chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1275845; R2=0.0147864; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=420; N_SCORE=11.328; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=18,-4,-16,-7,0,-23,-6,-14,-20,9,-23,-13,0,-10,0,-1,13,3,-10,-26,-17,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-11,-12,-11,0,-13,-16,-12,-14,-11,-10,0,-16,-12,-11,15,22,-5,-27,-8,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-22,-25,-16,7,-27,-17,10,-13,10,5,-19,-22,-16,-11,-15,-7,9,-14,4,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-27,10,23,-28,-14,-1,-25,8,-20,-14,1,-5,12,0,-1,-8,-23,-28,-16,17;
MA   /M: SY='F'; M=1,-20,-20,-26,-16,10,-24,-18,9,-19,6,2,-16,-20,-18,-18,-9,-3,8,-13,2,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-19,-33,-25,2,-30,-23,29,-25,22,19,-23,-24,-19,-23,-19,-8,21,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-25,1,8,-21,-20,-1,-17,9,-12,-6,-3,-14,6,7,-7,-8,-14,-24,-8,6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-18,-11,-6,-16,-1,-15,-15,-6,-13,-10,-2,-14,-6,-9,6,4,-9,-23,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-19,-25,-18,4,-25,-18,15,-24,33,17,-23,-25,-16,-18,-20,-6,9,-21,-3,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-10,-22,-9,-3,-14,-23,-16,3,-11,0,-1,-14,-12,-7,-14,-8,-5,6,-27,-12,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,14,20,-29,-14,-4,-26,13,-21,-14,5,-9,11,7,-2,-8,-22,-27,-15,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,0,-18,-5,-6,-18,8,-6,-21,-10,-19,-14,7,-14,-6,-11,8,-3,-16,-27,-17,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-25,-11,-19,-26,57,-18,-37,-19,-28,-19,-2,-18,-19,-18,-2,-19,-28,-19,-24,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-16,-5,-23,-17,-13,-12,-23,2,-14,-4,-4,-15,-17,-17,-20,4,3,14,-25,-16,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,40,-28,55,14,-37,-3,-3,-37,-3,-30,-28,18,-11,-2,-11,4,-7,-28,-38,-21,6;
MA   /M: SY='I'; M=4,-25,-16,-31,-24,-3,-26,-24,24,-23,13,11,-20,-22,-19,-24,-13,-6,21,-21,-5,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-26,4,-34,-25,34,-28,31,20,-25,-25,-21,-24,-23,-9,24,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-23,29,-28,36,20,-27,-27,-21,-22,-24,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,67,-19,-39,-19,-30,-19,0,-20,-18,-19,0,-20,-30,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-35,-27,10,-33,-25,33,-26,22,18,-24,-25,-23,-23,-19,-8,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-38,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,82,-10,-20,-8,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-24,-30,-23,48,-28,-8,-4,-21,1,-3,-19,-16,-27,-17,-18,-9,-7,12,34,-24;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-13,-1,1,-21,-4,-11,-21,-3,-29,-18,7,-7,0,-6,32,17,-11,-37,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,38,-30,54,18,-31,-13,2,-34,1,-26,-25,13,-11,1,-8,-3,-10,-27,-31,-9,9;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18,73,-10,-20,-7,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-24,-20,-27,-21,-1,-26,-20,20,-14,17,19,-23,-25,-17,-14,-17,-7,21,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-15,-20,-13,-11,-3,-13,-7,-11,-6,-4,-12,-15,-10,-18,3,-3,-2,-13,-4,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,67,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-20,-30,69,-19,-40,-20,-30,-20,1,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-35,-10,0,-27,-20,-18,-17,-6,-25,-15,-16,64,-8,-15,-7,-7,-23,-29,-25,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-13,-22,-20,-5,-26,-25,15,-17,2,2,-16,-20,-19,-17,2,17,25,-29,-9,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,20,19,-21,-21,-21,-29,-20,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-25,-4,14,-33,-20,4,-19,9,-16,-2,-3,-13,41,14,-3,-9,-24,-21,-11,27;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-24,-5,2,-20,-15,-9,-18,13,-13,-8,-1,-15,1,11,-5,-6,-12,-23,-12,1;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-10,-15,-8,-20,0,-18,-13,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-17,17,8,-3,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='H'; M=2,0,-20,-4,-8,-13,-3,6,-15,-11,-16,-9,5,-17,-6,-11,5,-2,-12,-22,-2,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-25,-1,9,-19,-21,-6,-13,3,-5,-4,-6,-14,7,0,-7,-5,-12,-24,-8,7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-28,-12,-1,-20,-21,-6,-15,15,-13,-5,-4,-17,8,34,-9,-9,-12,-21,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=38,-11,-10,-18,-11,-18,-2,-20,-7,-11,-11,-9,-9,-12,-11,-19,12,2,4,-24,-19,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-28,-19,9,-29,-20,16,-25,38,15,-25,-27,-19,-18,-23,-6,10,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=4,4,-22,3,5,-25,-8,-5,-22,8,-21,-12,5,-12,4,6,3,-4,-16,-27,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=0,4,-23,-2,-1,-22,0,3,-22,-2,-22,-13,12,-16,2,-2,4,-5,-21,-22,-13,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-5,-14,-26,42,-16,-30,-14,-24,-16,4,-18,-15,-14,-1,-15,-24,-23,-24,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00151;
//
ID   TRP_SYNTHASE_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00168;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tryptophan synthase beta chain pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4795394; R2=0.0161145; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=581; N_SCORE=14.832; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-21,-6,8,-16,-16,-12,-13,-2,-5,-7,-6,-13,-1,-2,1,5,-10,-27,-13,3;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-22,-5,4,-9,-14,-5,-16,-1,-15,-10,-4,-13,0,-4,2,-1,-13,-17,0,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-23,-12,-4,-8,-20,-3,-6,-6,6,1,-11,-20,-6,-5,-13,-8,-6,-21,-1,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-18,-9,-9,-20,3,-15,-18,-3,-12,-8,-5,-19,-8,-5,-8,-12,-14,-21,-15,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-22,-8,-12,-17,18,-13,-22,-14,-16,-13,0,-15,-12,-13,4,6,-16,-21,-13,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-28,-7,-10,-25,22,-14,-29,-8,-27,-18,-2,7,-11,-11,-3,-12,-27,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=27,-13,-12,-21,-13,-16,-11,-20,-1,-13,-7,-6,-11,-9,-13,-19,4,1,5,-24,-17,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-29,0,10,-28,-19,-3,-29,34,-24,-10,0,-13,13,34,-8,-10,-21,-21,-11,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,46,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-29,-24,-22,36,-29,10,-1,-14,1,-1,-21,-30,-15,-12,-21,-11,-9,33,68,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-22,-30,-22,24,-30,-12,13,-25,33,15,-26,-30,-20,-18,-26,-10,5,-6,20,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-27,-14,-7,-3,-21,2,-17,13,-11,-1,-4,-22,2,38,-11,-9,-14,-11,8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-27,36,9,-34,10,-7,-36,-6,-29,-25,12,-12,-4,-12,6,-8,-26,-34,-22,3;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-19,-26,-19,5,-26,-12,14,-23,28,13,-25,-27,-17,-18,-20,-8,12,-18,4,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-15,-7,-10,-9,-14,-11,-4,-13,-2,-5,9,-19,-10,-11,5,10,-4,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-8,-32,-5,-3,-16,-21,52,-22,-10,-20,-6,-1,9,1,-7,-11,-15,-26,-23,11,-6;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-16,-11,-12,-15,-2,-20,-15,-12,-14,-12,-3,-6,-12,-13,13,28,-6,-28,-16,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-25,-31,-23,-3,-31,-26,28,-25,15,11,-19,-12,-18,-24,-14,-1,18,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,18,-17,7,0,-19,-9,3,-18,-3,-23,-15,29,-15,3,-3,14,15,-19,-35,-15,1;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,5,-21,-15,-16,-10,-22,-7,-14,-9,-9,-12,-16,-15,-20,7,6,5,-27,-19,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-24,31,-28,33,20,-26,-26,-21,-23,-24,-9,22,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=21,-11,-22,-15,-15,-25,34,-20,-25,-15,-21,-15,-6,-9,-15,-20,3,-11,-16,-21,-25,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,1,20,-37,-20,19,-21,8,-20,-1,1,-11,53,9,-1,-11,-30,-21,-7,36;
MA   /M: SY='A'; M=29,-16,-5,-24,-17,-15,-8,-23,0,-15,-5,-5,-15,-17,-17,-21,2,-1,11,-24,-17,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-24,-27,-21,20,-30,-5,12,-22,29,13,-26,-30,-17,-16,-26,-10,3,-1,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-27,-23,-29,-22,24,-30,-10,13,-24,29,12,-26,-30,-20,-18,-25,-10,5,-3,25,-22;
MA   /M: SY='A'; M=40,-3,-12,-14,-9,-20,2,-16,-12,-9,-13,-12,0,-12,-9,-17,10,0,-5,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-28,-2,7,-28,-17,-9,-27,40,-26,-8,-1,-11,9,27,-9,-10,-18,-20,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-27,-12,-1,-10,-23,0,-15,11,-7,-3,-7,-19,3,24,-12,-10,-13,-17,-1,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-2,-23,-1,2,-13,-19,-3,-2,-7,4,19,-9,-15,3,-9,-11,-9,-6,-26,-8,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-29,-6,-17,-29,59,-14,-37,-16,-30,-19,7,-20,-17,-16,1,-18,-30,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='K'; M=3,-7,-24,-10,-2,-22,-19,-16,-13,23,-18,-6,-6,-13,-1,9,-6,-5,-4,-21,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-24,2,13,-25,-17,-10,-24,22,-23,-12,1,-9,6,12,1,3,-16,-26,-13,9;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-9,3,-11,-20,2,-26,20,-18,-9,-1,-18,5,42,-9,-10,-19,-19,-5,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,26,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-21,-30,-24,-4,-31,-27,30,-23,9,10,-16,-19,-19,-23,-6,4,25,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-10,-16,-10,-16,-8,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,20,0,-24,-16,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00152;
//
ID   D_ALA_DEHYDRATASE_MP; MATRIX.
AC   MP00169;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Delta-aminolevulinic acid dehydratase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2971249; R2=0.0154909; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=581; N_SCORE=14.287; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=1,28,-19,11,-3,-21,5,3,-20,-3,-27,-18,43,-18,-3,-5,9,-1,-25,-35,-21,-3;
MA   /M: SY='R'; M=0,-11,-21,-13,-6,-13,-16,-6,-15,7,-14,-8,-6,-18,1,21,0,-1,-8,-18,-3,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-28,-10,-8,-19,1,-10,-19,2,-10,-4,-5,-20,-2,15,-10,-12,-15,-21,-13,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-28,8,40,-20,-22,-5,-18,0,-3,-10,-7,-7,10,-5,-7,-10,-20,-28,-15,25;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-22,-27,-17,4,-29,-18,15,-20,36,18,-25,-27,-15,-11,-26,-10,7,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-2,-16,-22,-5,-21,22,-10,-5,-5,-20,5,47,-12,-8,-15,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-25,10,43,-28,-15,-5,-25,5,-18,-18,-2,-2,13,-5,2,-8,-23,-28,-20,28;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-11,-28,-23,-4,-25,-24,20,-22,11,9,-20,-23,-19,-21,-8,-3,23,-27,-9,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-25,3,20,-23,-18,-3,-19,4,-9,-9,-4,-11,10,2,-4,-8,-18,-26,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-21,-16,-5,-7,-20,-12,-4,-7,11,3,-13,-21,-6,6,-10,-5,-4,-23,-8,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-22,-18,-3,-6,-28,-17,14,-15,14,10,-20,-20,-10,-16,-15,-7,13,-25,-8,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-24,6,19,-25,-15,-6,-22,8,-19,-14,1,-9,10,6,4,-4,-18,-28,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,55,-31,-20,1,-29,10,-20,-17,0,-1,25,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-2,-21,-11,-20,-2,-21,-11,-11,-11,-11,-11,-12,-11,-21,9,-1,-1,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-20,-32,-26,5,-18,-20,20,-23,11,20,-18,-23,-18,-22,-17,-11,12,-18,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-32,-25,4,-31,-23,30,-25,28,21,-27,-27,-21,-21,-21,-7,27,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-22,-32,-22,1,-25,-8,26,-15,22,49,-21,-21,-5,-15,-21,-10,14,-20,0,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-16,-14,-11,-23,21,-18,-21,-13,-19,-15,-4,-13,-11,-18,12,-3,-11,-23,-23,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-20,-23,-18,-2,-11,-15,6,-21,21,17,-18,-23,-13,-16,-14,-2,2,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='P'; M=4,-15,-25,-14,-7,-12,-8,-18,-16,-14,-19,-14,-11,27,-13,-18,2,-3,-16,-24,-18,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,19,-39,-10,4,-40,0,-30,-29,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-19,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-36,-29,0,-36,-28,42,-26,17,20,-23,-23,-22,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-27,1,-32,-25,35,-24,21,21,-25,-25,-21,-22,-18,-6,32,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-13,-21,-15,-6,-17,-16,-8,-21,12,-16,-9,-7,-19,1,30,-7,-8,-12,-9,-7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,6,11,-20,-18,-6,-18,5,-8,-4,-3,-13,3,6,-7,-7,-14,-26,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=13,-23,-14,-28,-21,-5,-21,-25,17,-19,10,6,-21,-21,-20,-21,-7,-1,24,-24,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-25,-5,3,-24,-15,-8,-27,30,-25,-11,0,-13,7,34,-1,-5,-17,-23,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-28,31,28,-32,-9,-1,-31,6,-25,-21,14,-8,8,-3,1,-9,-28,-33,-19,18;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-2,-23,-8,-4,-14,-20,-3,-6,0,-9,-3,4,-17,-3,3,-4,1,-6,-27,-9,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-4,-14,-12,0,-16,-5,-14,-15,-13,-10,-2,-17,-12,-13,11,16,-6,-27,-5,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,8,-23,10,3,-26,-11,-5,-23,-4,-22,-17,5,11,-5,-10,-3,-6,-23,-32,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-19,-8,-11,-5,-25,-18,9,-18,18,6,-19,-24,-16,-17,-16,-7,12,-27,-8,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-35,-15,-5,-20,-22,-20,-10,-15,-10,-10,-22,60,-12,-20,-15,-10,-20,-28,-23,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00153;
//
ID   CSA_PPIASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00170;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6283164; R2=0.0128951; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=724; N_SCORE=13.954; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-36,-7,1,-29,-16,-19,-20,-9,-27,-19,-16,69,-9,-19,-6,-7,-27,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-11,-28,-12,-5,-17,-11,-13,-12,10,-11,-4,-8,-18,-3,4,-12,-11,-9,-14,-7,-5;
MA   /M: SY='T'; M=11,0,-12,-5,-4,-16,-13,-17,-13,-9,-13,-12,-1,-10,-8,-12,16,26,-3,-29,-15,-6;
MA   /M: SY='C'; M=14,-17,20,-23,-19,-13,-18,-24,-2,-17,-7,-6,-16,-24,-20,-21,-1,0,12,-32,-19,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-27,2,18,-24,-10,-6,-26,12,-22,-15,-1,-8,7,7,-2,-6,-22,-19,-13,12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,35,-20,17,1,-19,-2,8,-19,-1,-28,-17,52,-19,0,-1,10,1,-27,-39,-19,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-20,-36,-26,64,-28,-20,-2,-27,7,-2,-18,-22,-35,-19,-16,-5,-1,4,22,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-22,-22,-14,-4,-23,-16,6,-11,11,5,-17,-20,-12,-1,-13,-6,6,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=4,3,-21,1,8,-26,-12,-2,-21,5,-19,-11,2,-11,10,0,2,-2,-17,-26,-14,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-21,-20,-22,-17,9,-26,-10,9,-23,28,11,-20,-28,-17,-17,-23,-10,2,-16,8,-18;
MA   /M: SY='C'; M=4,-16,58,-23,-19,-20,-21,-24,-20,-18,-17,-14,-15,-26,-18,-21,-2,-5,-5,-39,-24,-19;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-15,-3,1,-14,-5,-7,-11,3,-7,-4,-2,-10,1,0,-2,-3,-9,-16,-9,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-17,4,6,-15,-8,-3,-16,4,-15,-10,2,-7,3,6,2,-2,-12,-18,-8,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-20,-4,-10,-17,27,-10,-20,-11,-14,-10,2,-11,-11,-10,-2,-11,-17,-17,-17,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-17,-14,-12,15,-13,1,-3,-10,-2,-2,-9,-17,-10,-9,-7,-5,-5,2,22,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,14,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,16,-27,16,8,-28,-14,-4,-25,20,-26,-15,14,-13,5,10,-3,-7,-20,-29,-14,6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,8,-27,4,-9,-28,37,-8,-33,-9,-29,-19,17,-18,-9,-11,3,-12,-28,-27,-24,-9;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,1,-9,-9,-13,-12,-16,-11,-14,-13,-12,1,-17,-9,-13,18,18,-3,-35,-16,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-22,-19,-12,-10,-22,-19,7,-13,-2,0,-11,-7,-12,-14,-4,3,5,-25,-9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,79,-30,-20,1,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,1,9,29,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-15,-29,-27,-1,-29,-26,29,-21,12,12,-22,-27,-24,-20,-12,-3,37,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-33,-1,5,-30,-18,-13,-24,10,-28,-16,-7,37,0,-1,-6,-7,-25,-27,-21,0;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-27,17,2,-30,16,-6,-33,0,-29,-20,15,-15,-2,-3,2,-10,-28,-29,-21,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-31,-21,1,-23,-6,23,-13,21,51,-21,-21,-5,-13,-20,-9,14,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-2,-33,-27,-4,-32,-28,26,-26,10,9,-21,-24,-22,-26,-13,-6,24,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-26,-11,-19,-23,52,-20,-34,-19,-25,-18,-1,-19,-19,-19,2,-10,-24,-20,-25,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-14,39,-22,54,13,-37,-4,-4,-38,-4,-29,-28,15,-12,-4,-12,0,-10,-28,-38,-21,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-24,-27,-19,28,-25,-19,3,-21,0,-1,-18,6,-24,-19,-15,-8,-3,-7,6,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-14,-11,-8,-12,-18,-19,-7,-12,-11,-9,-5,-2,-11,-13,11,23,0,-30,-14,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-18,0,2,-12,-11,0,-14,3,-13,-8,9,-11,1,5,0,-2,-14,-21,-8,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-29,-10,-16,-24,46,-11,-34,-17,-26,-17,-1,-13,-15,-17,-2,-17,-27,-20,-22,-16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-9,23,-19,19,1,-20,-10,-4,-19,-4,-18,-13,21,-14,-3,-7,8,11,-16,-34,-15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-31,-9,-14,-31,53,-17,-37,-15,-29,-18,-1,-11,-12,-15,-1,-18,-30,-21,-28,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-18,-8,-2,-16,-19,-12,-16,2,-14,-9,-1,-7,-1,6,8,22,-9,-27,-11,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-5,-12,-30,54,-17,-38,-12,-29,-19,1,-18,-15,-15,-1,-18,-29,-21,-27,-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-25,-7,-14,-27,47,-16,-33,-14,-28,-19,5,-18,-14,-15,6,-12,-25,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-26,-1,15,-19,-19,-9,-18,3,-18,-12,-5,7,5,-3,1,1,-18,-26,-13,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-8,-3,-3,-20,3,-11,-20,-8,-26,-16,5,-12,-2,-9,26,12,-10,-33,-18,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-29,-28,-23,-4,-26,-19,26,-20,7,9,-13,-20,-15,-20,-14,-9,14,-17,3,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-31,-22,-19,21,-26,2,-4,-14,-6,-5,-19,-17,-14,-14,-17,-10,-12,30,47,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-30,4,-3,-31,44,-14,-38,-11,-29,-21,4,-16,-11,-14,0,-17,-30,-24,-27,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00154;
//
ID   TIM_MP; MATRIX.
AC   MP00171;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Triosephosphate isomerase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3873706; R2=0.0181328; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=59; N_SCORE=7.447; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=7; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-24,-17,-7,-10,-24,-18,3,-10,4,1,-16,-4,-10,-8,-11,-6,1,-25,-11,-10;
MA   /M: M=0,-7,-22,-8,-1,-9,-14,-11,-11,-4,-8,-4,-7,-15,-1,-5,-4,-7,-8,-20,-8,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-21,-5,-1,-15,-13,-9,-13,-2,-12,-7,2,-15,2,-3,2,3,-11,-25,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-11,-21,-11,-6,-12,-15,-10,-4,-9,1,-1,-10,-18,-9,-10,-5,-2,-1,-26,-9,-8;
MA   /M: SY='A'; M=4,-9,-22,-13,-6,-6,-17,-16,-2,-14,-4,-5,-6,-6,-11,-17,-3,-4,-4,-23,-11,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-2,-21,-6,-6,-20,11,-14,-17,-12,-15,-12,2,-15,-9,-15,5,-2,-13,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='A'; M=2,-4,-23,-3,1,-17,-15,-14,-8,-8,-8,-8,-7,-7,-6,-13,-3,-4,-6,-24,-11,-4;
MA   /M: SY='A'; M=15,-6,-17,-9,0,-19,-12,-13,-11,-2,-8,-5,-7,-13,-2,-9,3,-1,-5,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='A'; M=9,1,-20,-2,-3,-23,3,-12,-19,-4,-16,-12,2,-14,-2,-9,4,-3,-14,-26,-18,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-21,-25,-24,-13,9,-21,-13,-1,-17,9,3,-19,-23,-9,-14,-17,-9,-6,6,8,-11;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-24,-1,4,-23,0,-10,-22,1,-17,-13,2,-14,-2,1,-1,-8,-17,-25,-18,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-28,8,5,-25,-11,3,-23,6,-28,-17,20,9,1,1,-1,-6,-27,-32,-18,1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-20,-15,-16,-3,-22,-19,10,-18,5,5,-13,-20,-16,-19,-7,-3,11,-24,-6,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-19,-31,-25,5,-29,-22,26,-23,18,14,-24,-25,-21,-21,-15,-5,25,-21,0,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-29,9,-34,-28,35,-26,18,14,-25,-26,-26,-24,-17,-6,32,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-11,-20,-11,-20,2,-20,-10,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,-1,0,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-27,-22,-21,25,-30,11,5,-12,4,2,-22,-30,-13,-12,-19,-9,-1,19,64,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-22,-22,-15,-9,-27,-24,14,-16,2,2,-20,-1,-17,-18,-9,-2,16,-28,-12,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-28,-42,-27,-14,2,-18,-22,-20,-14,-19,-19,-29,-24,-12,-16,-26,-22,-27,100,19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-13,-12,-20,-11,-14,-6,-19,-5,-14,-1,-5,-12,-14,-11,-19,6,0,1,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-8,-19,-29,66,-18,-39,-19,-30,-20,4,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-14,-3,-3,-15,-17,-16,-14,-4,-15,-12,1,-10,-6,-7,17,32,-4,-31,-12,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-28,-2,-12,-29,44,-14,-35,-8,-29,-19,8,-18,-13,-11,1,-15,-27,-23,-25,-12;
MA   /M: M=-7,-5,-24,-9,-9,-18,-8,-14,-8,0,-13,-6,0,-18,-6,-1,-3,-3,-5,-26,-13,-8;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-12,-15,-9,-16,-19,-20,-3,-15,-13,-9,-9,4,-11,-17,7,9,-1,-31,-17,-12;
MA   /M: SY='A'; M=25,-17,-11,-21,-13,-17,-12,-22,-4,-14,-8,-7,-17,2,-15,-20,0,-3,4,-25,-19,-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,6,-15,4,4,-21,-8,-10,-19,-6,-21,-16,8,-10,0,-9,21,16,-12,-33,-17,2;
MA   /M: SY='P'; M=0,-11,-23,-11,-3,-18,-16,-14,-13,-6,-18,-11,-7,13,-1,-8,6,4,-12,-27,-16,-4;
MA   /M: SY='A'; M=16,4,-19,-1,8,-24,-3,-10,-20,2,-19,-15,4,-10,-1,-7,5,-3,-15,-26,-19,4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,20,-29,27,13,-24,-16,5,-25,4,-21,-15,10,-13,9,-2,-4,-10,-24,-26,-5,10;
MA   /M: SY='I'; M=5,-22,-25,-26,-18,-6,-24,-18,13,-17,-1,1,-18,1,-15,-22,-10,-7,7,-16,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=3,2,-23,2,16,-25,-15,-3,-16,1,-15,-10,0,-11,15,-5,1,-6,-15,-24,-13,15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-24,1,11,-18,-21,-8,-12,3,-11,-8,-5,-14,3,2,-4,-6,-8,-26,-9,6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-18,-27,-20,-5,-27,-22,22,-15,8,14,-20,-21,-16,-17,-10,-3,26,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-8,-13,-11,-6,-17,-19,23,-17,-9,-12,-5,-2,-14,0,-2,-3,-3,-14,-28,-3,-6;
MA   /M: SY='A'; M=8,-1,-22,-3,5,-25,-6,-3,-20,3,-17,-8,0,-12,7,-1,1,-7,-15,-24,-15,6;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-17,-22,-16,7,-3,-13,-11,-15,-7,-5,-10,-18,-17,-14,-1,-4,-5,-14,-5,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00155;
//
ID   XYLOSE_ISOMERASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00172;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Xylose isomerase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2204995; R2=0.0154250; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=526; N_SCORE=13.324; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,-14,-26,-19,-5,-17,-19,12,-16,13,15,-21,-21,-15,-18,-9,-4,17,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='V'; M=6,-16,-19,-18,-15,-16,-2,-20,-7,-2,-11,-5,-12,-20,-14,-2,-4,-6,7,-24,-16,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,22,-26,32,30,-32,-12,-4,-30,2,-22,-22,6,-6,6,-8,2,-8,-24,-32,-20,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15,17,-27,41,-8,-10,-5,0,-12,-27,-5,-7,-17,-13,-15,14,64,-15;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,-18,-16,-10,-20,-2,-19,-11,2,-14,-7,-10,-15,-10,-7,0,-5,1,-22,-17,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,6,-25,4,11,-21,-17,23,-25,6,-20,-11,11,-13,7,9,1,0,-22,-29,-6,7;
MA   /M: SY='E'; M=1,9,-24,13,17,-28,-12,-6,-27,9,-22,-17,3,-9,5,6,4,-4,-19,-29,-17,11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-18,-30,-24,-11,-16,-32,-14,23,-14,4,12,-12,-16,11,-14,-12,-10,7,-20,-4,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-28,22,10,-31,1,-9,-33,9,-27,-20,7,-11,-1,-1,0,-5,-24,-29,-18,4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-16,-25,-17,-19,-9,21,-12,-16,-19,-6,-7,-11,-22,-17,-18,-8,-13,-14,-10,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-24,-4,2,-22,-18,-2,-21,11,-19,-9,7,-15,15,27,2,7,-18,-25,-11,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-36,-26,43,-30,-19,14,-27,21,15,-22,-27,-27,-20,-22,-10,8,-5,15,-25;
MA   /M: SY='L'; M=13,-22,-16,-26,-16,-2,-18,-20,8,-22,27,8,-22,-22,-16,-20,-14,-6,6,-20,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,13,-25,4,2,-22,-12,16,-19,10,-21,-3,22,-16,11,7,-2,-7,-23,-29,-9,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-19,-11,-6,-14,-17,-8,-16,6,-13,-3,-1,-15,0,21,6,15,-8,-26,-10,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-27,-5,-4,-27,15,-15,-31,14,-27,-14,0,-14,-4,5,-2,-5,-21,-21,-18,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,19,-30,27,8,-28,-16,61,-34,-6,-24,-12,14,-16,6,-4,-6,-16,-30,-34,4,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-12,-30,-16,1,-24,-28,-6,7,-6,-4,8,-8,-14,29,-6,-8,-10,-7,-20,-6,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,26,-30,12,4,-14,10,4,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-6,20,65,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,19,-26,29,2,-7,-18,-8,-21,-12,-7,-15,3,-18,-12,-14,-10,-10,-16,-26,-6,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-23,-23,-28,-19,33,-22,-15,-6,-20,-3,-6,-18,-3,-25,-19,-12,-8,-7,-1,15,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-22,39,8,-28,-14,-8,-28,-4,-22,-22,12,-10,-4,-10,8,13,-18,-36,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-10,-20,-17,-11,-14,-23,4,-14,-5,-3,-14,-18,-17,-17,7,9,18,-28,-15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=17,-7,-21,-11,-9,-27,25,-15,-24,-11,-22,-14,-2,-14,-3,-15,8,-7,-17,-22,-23,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-16,-5,-5,-15,-16,16,-18,-10,-17,-9,5,-13,-2,-7,15,24,-10,-32,-4,-5;
MA   /M: SY='V'; M=8,-20,-12,-25,-21,-5,-21,-21,15,-15,5,13,-20,-21,-17,-17,-4,5,26,-26,-10,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-28,-25,-32,-24,21,-33,-14,21,-26,26,13,-24,-27,-21,-20,-24,-10,10,-5,21,-24;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-18,-16,-14,-24,27,-20,-21,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-11,-20,-24,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00156;
//
ID   XYLOSE_ISOMERASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00173;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Xylose isomerase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8698955; R2=0.0173646; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=381; N_SCORE=12.476; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=37; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=19,-10,-17,-12,3,-14,-14,-13,-6,-7,-8,-8,-12,-13,-6,-14,1,-3,1,-20,-9,-2;
MA   /M: SY='A'; M=30,-14,-13,-23,-15,-5,-10,-17,-3,-14,-5,-5,-12,-15,-15,-19,3,0,5,-18,-11,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-17,-37,-30,52,-30,-23,10,-27,10,3,-23,-30,-37,-20,-17,-7,17,-4,16,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-29,13,36,-28,-19,25,-28,4,-20,-13,3,-7,19,0,-2,-12,-28,-29,-9,26;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-20,-25,-26,-16,29,-27,-16,-3,-3,0,2,-13,-22,-18,0,-17,-10,-3,-6,11,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-20,-33,-24,38,-28,-17,10,-27,27,13,-24,-28,-26,-19,-23,-10,5,-5,15,-23;
MA   /M: SY='E'; M=10,1,-21,1,18,-23,-13,0,-20,-1,-16,-12,-3,-8,8,-8,4,-3,-17,-24,-12,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-30,4,24,-27,-21,-8,-24,29,-21,-11,-2,-8,11,15,-8,-10,-20,-23,-13,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,8,-30,-21,21,-29,45,19,-28,-28,-20,-20,-27,-7,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-29,0,-13,-29,48,-10,-36,-13,-29,-20,10,-19,-14,-12,1,-16,-30,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='V'; M=20,-20,-12,-26,-20,-9,-18,-25,13,-16,1,1,-19,-20,-20,-20,-1,2,24,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-10,-34,-2,2,-10,-23,-2,-16,-5,-19,-14,-13,26,-5,-12,-11,-10,-23,-10,11,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-19,-27,-21,-22,20,5,-5,-15,-17,-8,-7,-12,-26,-20,-13,-13,-13,-15,6,26,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-31,-27,33,-30,-13,12,-22,9,4,-24,-29,-26,-18,-18,-8,12,6,29,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-8,67,-19,-21,-17,-24,-23,-23,-21,-18,-17,-7,-29,-21,-21,1,9,-9,-43,-23,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,0,-21,0,-4,-16,-20,-14,-3,-6,-8,-7,-3,-17,-9,-5,-3,-1,4,-29,-13,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-17,-20,-14,-13,-14,-19,4,-11,-5,-3,-8,-16,-11,-12,3,-1,8,-25,-14,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-40,-6,1,-30,-20,-19,-21,-10,-30,-20,-18,85,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-2,-27,1,24,-1,-22,-6,-22,2,-13,-13,-4,-11,3,2,-6,-8,-20,-18,-5,15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-4,-17,-31,64,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=16,4,-10,0,0,-22,-8,-12,-19,-4,-18,-15,3,-12,-5,-8,10,5,-10,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='S'; M=0,8,-16,5,-1,-20,-9,-10,-19,-8,-24,-18,12,-2,-4,-10,22,21,-13,-36,-18,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-23,-15,-8,2,-24,-17,3,-21,21,4,-19,-13,-15,-17,-19,-9,-2,-21,-5,-12;
MA   /M: SY='K'; M=11,-5,-21,-9,1,-24,-12,-5,-21,14,-19,-9,-3,-12,6,10,1,-3,-13,-22,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,19,53,-29,-20,-2,-29,8,-20,-20,1,-1,17,-1,2,-5,-27,-30,-19,35;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-22,-13,-9,3,-20,-3,-15,2,-12,-8,-2,-20,-5,17,-1,6,-11,-12,10,-9;
MA   /M: SY='B'; M=-12,6,-25,6,4,-8,-20,-5,-11,-3,-11,-10,4,-17,-5,-7,-5,-5,-11,-22,-2,-1;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-22,-1,7,-23,-5,-6,-22,6,-22,-13,4,-12,6,2,6,-1,-18,-24,-13,6;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-24,1,-8,-13,-13,9,-2,-9,-15,-7,31,-20,-5,-8,-1,-5,-14,-31,-7,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-33,-25,17,-31,-23,23,-28,32,15,-27,-29,-25,-21,-23,-8,20,-18,2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=1,15,-25,19,5,-30,3,-8,-30,3,-24,-19,8,-12,-3,-2,1,-9,-21,-28,-20,1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-27,1,11,-25,-13,-6,-20,7,-17,-10,-2,-13,9,12,-3,-8,-15,-25,-15,9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-23,-37,-27,28,-31,-18,24,-24,16,24,-20,-24,-22,-21,-20,-10,15,-10,10,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-14,-14,-14,-11,-19,-18,2,-5,-9,-3,-7,-21,-13,-3,4,7,15,-31,-13,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00156;
//
ID   P_GLUCOSE_ISOMERASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00174;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoglucose isomerase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9002509; R2=0.0162949; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=332; N_SCORE=11.300; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=37; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-32,-23,18,-29,-20,19,-27,33,18,-26,-28,-23,-20,-23,-9,14,-16,3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-20,-14,-5,-9,-12,-4,-10,-4,-10,-5,-10,-16,-3,-8,-2,-5,-8,-9,5,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,11,-30,-20,20,-29,45,20,-28,-29,-20,-20,-28,-9,11,-19,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-34,-26,9,-33,-21,31,-25,22,18,-23,-25,-20,-23,-20,-8,22,-15,7,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-17,-21,-13,2,-12,-8,-6,-12,-5,-3,-12,-17,-10,-16,0,-3,-3,-7,9,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-22,-28,-21,21,-23,-10,3,-23,18,10,-22,-27,-20,-17,-22,-12,-1,2,11,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-25,-28,-23,44,-30,3,2,-19,9,3,-21,-30,-21,-14,-21,-10,-4,16,52,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-25,17,53,-29,-19,-1,-29,8,-20,-19,0,-2,18,-1,1,-9,-28,-31,-20,35;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-25,-9,-5,-15,-19,30,-15,0,-10,2,0,-20,2,9,-9,-11,-13,-25,1,-4;
MA   /M: SY='A'; M=16,-6,-20,-11,0,-23,-11,-13,-17,13,-18,-9,-5,-11,4,4,1,-4,-10,-20,-14,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,4,-29,-27,-4,-31,-28,19,-22,5,5,-21,-26,-24,-22,-8,4,28,-31,-11,-27;
MA   /M: SY='F'; M=5,-18,-18,-24,-19,12,-5,-16,-5,-19,-4,-2,-12,-21,-20,-18,-3,-4,-1,-13,-1,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-25,-16,-31,-25,14,-28,-21,19,-22,16,16,-22,-25,-23,-19,-14,-1,22,-19,1,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-19,-5,5,-18,-15,2,-14,-3,-16,-5,-2,-14,18,-4,7,-1,-16,-19,1,10;
MA   /M: SY='G'; M=14,-9,-23,-12,-16,-26,45,-19,-30,-16,-25,-17,-2,-16,-16,-19,6,-11,-20,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-15,-20,-16,-6,4,-23,-10,1,-13,0,-2,-14,-20,-12,-13,-5,-2,4,-16,6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-31,-23,5,-31,-21,25,-26,32,19,-25,-26,-18,-21,-23,-9,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-28,-30,-30,-24,12,-26,-19,5,-22,13,2,-27,-29,-20,-18,-27,-15,-2,36,17,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,11,-26,7,-6,-28,32,-6,-32,-8,-29,-20,20,-18,-7,-10,3,-12,-29,-28,-24,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-34,-27,-1,-35,-21,37,-26,17,16,-21,-23,-21,-24,-17,-7,29,-23,-1,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-20,21,3,-19,-3,7,-22,-1,-28,-20,47,-19,-1,-2,6,-2,-28,-36,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=13,-11,-21,-11,-5,-22,-10,-18,-15,-10,-21,-15,-9,25,-8,-17,10,6,-11,-30,-22,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-27,48,12,-32,-10,12,-33,-2,-28,-24,26,-13,1,-7,2,-6,-29,-38,-15,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-23,-41,-16,-4,-15,-20,-19,-20,-12,-25,-19,-23,44,-11,-18,-17,-15,-29,19,-10,-9;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-29,18,55,-30,-20,0,-29,9,-20,-18,0,-1,22,0,1,-8,-29,-29,-19,38;
MA   /M: SY='L'; M=4,-19,-19,-22,-13,-3,-19,-17,5,-17,13,5,-18,-22,-14,-16,-11,-6,5,-13,-5,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-30,-12,-17,-14,39,-9,-28,-16,-21,-14,-6,-22,-16,-17,-5,-17,-24,-7,0,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-25,-3,7,-24,-17,-5,-18,15,-19,-7,0,-13,12,11,-2,-4,-15,-23,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=3,-11,-20,-19,-12,-8,-19,-14,7,-14,10,5,-7,-20,-9,-12,-10,-6,1,-23,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-10,-22,-14,-14,-6,-13,-4,-12,-1,8,-12,-15,-9,-17,0,-2,1,-22,-14,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-8,-24,-13,-9,6,-12,-8,-16,-1,-13,-8,-2,-20,-10,0,-6,-6,-13,-9,2,-9;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-23,-2,8,-24,-8,-6,-22,7,-19,-12,0,-12,7,6,2,-4,-16,-24,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-19,-30,-23,1,-31,-24,25,-22,23,14,-22,-25,-19,-19,-20,-8,19,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-26,-16,5,-28,-17,17,-25,34,15,-24,-26,-16,-19,-23,-8,8,-19,1,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-28,0,3,-27,4,-10,-26,2,-24,-15,3,2,0,-1,0,-8,-24,-26,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-25,-6,3,-19,-9,-9,-16,3,-12,-8,-4,-14,0,2,-4,-7,-14,-21,-12,1;
MA   /M: M=-9,-12,-27,-10,-1,-15,-17,-13,-6,-10,0,-1,-13,-1,-1,-11,-10,-8,-11,-24,-12,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-24,3,4,-25,4,-5,-24,1,-22,-13,4,-14,1,-1,2,-6,-19,-25,-17,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: M=-7,-4,-23,-5,-3,-7,-5,-9,-18,-7,-15,-11,-3,-11,-6,-8,-3,-7,-16,-18,-5,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-26,2,12,-21,-12,-10,-15,-1,-12,-10,-4,-9,0,-5,-5,-9,-13,-26,-15,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-22,5,8,-20,-11,-10,-17,-3,-16,-12,1,-9,-1,-6,4,1,-12,-29,-16,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00157;
//
ID   PG_MUTASE_MP; MATRIX.
AC   MP00175;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoglycerate mutase family phosphohistidine signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9593320; R2=0.0153011; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; N_SCORE=9.937; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-20,-27,-20,-5,-16,-10,14,-13,9,35,-21,-12,-9,-14,-15,-8,13,-23,-7,-15;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-7,4,-14,5,1,-12,-9,16,-11,-2,-10,-5,5,-6,1,0,-3,-6,-10,-16,-2,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-3,-9,-6,-5,-7,-8,-7,-1,-5,-4,-3,-1,-7,-5,-5,0,1,2,-15,-8,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=0,3,-18,0,2,-18,-10,-2,-16,3,-15,-9,6,-7,3,2,4,1,-14,-23,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-23,-15,-8,-12,-19,-11,0,-4,-5,8,-13,12,-5,-5,-9,-4,-4,-20,-10,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-24,-18,-12,-1,-20,-3,-5,-4,-4,3,-8,-17,-7,5,-9,-5,-5,-16,3,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-23,-8,0,-18,-18,-8,-18,15,-15,-7,-2,-15,5,18,-2,1,-13,-21,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,40,20,-27,-27,-20,-22,-26,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-27,-22,-31,-27,15,-30,-19,17,-20,6,5,-24,-27,-24,-19,-16,-4,19,4,17,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-22,7,-31,-21,26,-28,40,22,-27,-27,-19,-21,-26,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-5,-30,-24,-1,-30,-25,22,-24,16,11,-22,-26,-21,-22,-13,-3,23,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,46,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,34,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-12,-2,-4,-18,0,-12,-19,-10,-25,-18,9,-11,-4,-10,31,24,-10,-36,-18,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-26,0,21,-23,-20,-7,-13,1,-11,-8,-6,-10,12,-1,-3,-6,-13,-26,-14,16;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-26,-34,-28,-21,6,-17,-11,-13,-18,-8,-10,-24,-25,-15,-17,-22,-17,-17,61,19,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=0,-13,-21,-15,-6,-15,-20,-12,-4,3,-2,0,-12,-18,-2,1,-8,-6,1,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-26,11,23,-25,-17,-4,-21,8,-13,-10,1,-10,9,1,-4,-9,-20,-27,-15,16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,14,-26,5,-3,-25,12,-3,-28,8,-29,-17,26,-18,-2,7,1,-8,-27,-29,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-25,-16,-5,-12,-25,-9,-6,5,-1,0,-9,-20,-2,21,-13,-8,-5,-22,-7,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-23,-36,-28,44,-32,-18,16,-27,15,7,-21,-28,-29,-21,-20,-9,10,0,24,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,1,-9,-8,-22,-3,-14,-21,-11,-19,-13,1,-17,-1,-11,9,14,-14,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,65,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,3,-17,-29,-21,-29,-19;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-22,-35,-22,-15,-1,-17,-1,-17,-11,-16,-11,-20,-21,-3,-10,-23,-19,-23,72,21,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=1,-10,-17,-14,-11,-9,-8,-12,-3,-8,-8,-4,-6,-15,-10,-9,1,1,2,-19,-8,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,42,-31,61,18,-39,-11,-2,-38,-1,-30,-29,15,2,-1,-11,-1,-10,-30,-39,-21,8;
MA   /M: SY='V'; M=6,-11,-15,-14,-10,-13,-17,-18,2,-12,-8,-4,-7,-13,-9,-14,7,8,9,-29,-14,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-30,6,3,-29,-5,-7,-26,-3,-27,-18,-2,23,-3,-10,-1,-8,-24,-30,-21,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='T'; M=2,4,-12,-4,-6,-15,-11,-13,-12,-10,-19,-14,11,-12,-5,-10,24,28,-6,-35,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-21,0,16,-20,-17,-12,-14,-4,-17,-14,-5,0,0,-9,10,5,-8,-33,-18,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,3,-30,7,4,-24,-18,0,-32,24,-22,-14,4,-18,8,53,-8,-10,-22,-24,-12,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00158;
//
ID   TOPOISOMERASE_I_EUK_MP; MATRIX.
AC   MP00176;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic DNA topoisomerase I active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2009139; R2=0.0148644; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=176; N_SCORE=7.807; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-26,4,17,-16,-17,5,-20,4,-19,-13,6,-13,13,5,2,-5,-23,-19,2,14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-31,9,25,-30,-16,-7,-24,1,-24,-18,-1,24,8,-8,-1,-8,-27,-30,-22,15;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-27,-8,3,-24,-17,-3,-18,10,-19,-2,-4,3,15,16,-2,-6,-18,-25,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-33,-23,-2,-35,-26,33,-27,19,14,-22,-6,-19,-26,-21,-10,17,-21,-4,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-26,-2,8,-24,-17,-7,-20,23,-17,-4,1,-12,9,12,-7,-8,-17,-23,-11,9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,5,-26,-19,-9,-21,31,-24,-8,2,-13,8,18,-5,-4,-14,-23,-11,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-13,-23,-14,-1,-17,-21,-3,0,-6,4,15,-12,-18,20,-4,-8,-7,-6,-22,-7,9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-19,3,18,-20,-15,-9,-21,1,-19,-16,2,-7,5,1,15,16,-15,-31,-16,11;
MA   /M: SY='A'; M=18,-16,-16,-23,-16,-11,-16,-21,5,-12,1,0,-14,-17,-13,-12,-1,2,11,-22,-12,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,15,-30,23,31,-37,-17,5,-28,7,-23,-13,5,-7,33,2,0,-10,-30,-28,-15,32;
MA   /M: SY='L'; M=1,-23,-19,-27,-16,-2,-25,-18,19,-19,20,19,-22,-22,-14,-18,-16,-7,15,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-17,-19,-17,-9,-26,-13,9,-7,-2,3,-14,-21,-15,-9,-4,7,19,-28,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-27,31,2,-32,15,-7,-35,-7,-28,-24,17,-14,-7,-12,3,-6,-27,-33,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-30,-1,6,-26,-20,26,-30,29,-26,-7,3,-14,10,26,-10,-13,-23,-23,-1,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,17,-22,19,24,-24,-16,-5,-24,1,-20,-18,11,-7,5,-5,8,10,-21,-33,-17,14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-32,19,27,-30,-16,-5,-27,1,-26,-22,5,24,5,-8,-2,-9,-30,-33,-23,14;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-12,5,-3,-10,-5,0,-9,-4,-11,-9,25,-13,-3,-3,5,6,-13,-24,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-15,0,4,-18,-8,-7,-18,17,-21,-10,3,-7,4,9,7,2,-11,-19,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,7,-16,8,9,-19,-12,-3,-15,1,-13,-8,3,-6,13,-2,5,8,-13,-20,-9,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-9,-20,-19,-1,-21,-20,19,-14,6,6,-16,-17,-17,-14,-5,3,27,-19,-6,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-7,-11,-5,-14,0,-12,-8,-7,-10,-8,-4,-7,-5,-12,11,3,-2,-17,-14,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-14,-21,-14,7,-21,-14,14,-21,34,14,-21,-21,-14,-14,-21,-7,7,-14,0,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-21,-6,-11,-26,39,-16,-31,-16,-30,-20,4,-16,-11,-16,18,-2,-21,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-19,-16,-7,-26,-23,9,-16,-1,-1,-6,-13,-13,-16,7,31,9,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-23,-26,-26,-16,-3,-29,-15,12,-10,18,14,-17,-23,-9,6,-20,-10,6,-20,-3,-16;
MA   /M: SY='N'; M=9,24,-17,7,-3,-20,0,1,-17,-3,-24,-17,38,-17,-3,-6,10,0,-21,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-35,-25,3,-34,-22,36,-27,29,26,-23,-23,-17,-24,-23,-10,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=2,31,-24,42,11,-34,-7,-6,-31,-3,-24,-24,11,-10,-3,-13,3,-7,-21,-34,-20,4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-32,-5,-1,-25,-17,-15,-19,-8,-27,-19,-4,57,-8,-15,-2,1,-26,-32,-25,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-24,-10,-3,-17,-20,-6,-24,17,-17,-10,0,-17,4,45,-1,9,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,28,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-15,-16,-12,-5,-20,-18,2,-18,6,-1,-9,-17,-12,-15,6,20,3,-28,-8,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-28,-18,-30,-25,6,-29,-18,24,-21,23,20,-27,-28,-20,-18,-19,-6,25,-19,4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=22,-13,-11,-19,-14,-12,-12,-20,0,-12,-5,-1,-12,-15,-13,-17,8,9,11,-26,-15,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-25,-36,-27,-19,16,-22,-3,-18,-10,-14,-10,-21,-25,-16,-9,-26,-20,-21,61,22,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,4,32,6,-8,-22,-19,-16,-25,-17,-16,-18,-4,-24,-14,-19,-1,-5,-14,-41,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,0,8,-28,-17,-10,-28,40,-30,-12,2,-10,8,23,-2,-5,-18,-23,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,6,-29,6,21,-26,-17,-1,-29,25,-24,-14,9,-11,11,28,-4,-9,-24,-26,-14,15;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-29,-25,-14,25,-26,2,-8,-20,2,-3,-19,-26,-17,-14,-22,-15,-13,24,23,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-15,12,-29,21,5,-23,-15,-9,-15,-7,-8,-11,1,-15,-5,-7,-9,-11,-13,-30,-13,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,4,-17,6,-11,-15,-19,-15,2,-11,-8,-6,-1,-23,-17,-14,-4,-3,14,-34,-14,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-29,-13,-6,-21,-21,-19,-12,-6,-19,-13,-16,41,-10,-6,-5,1,-12,-29,-21,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,41,-28,22,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-21,13,40,-23,-13,-2,-23,5,-18,-16,2,-2,13,-2,6,-3,-21,-26,-16,26; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,8,-26,11,10,-30,-15,-8,-30,31,-30,-15,5,-10,7,16,1,-5,-20,-27,-13,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00159;
//
ID   TOPOISOMERASE_II_MP; MATRIX.
AC   MP00177;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA topoisomerase II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9871759; R2=0.0167371; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=176; N_SCORE=8.923; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=31; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=7,-15,-20,-18,-9,-10,-17,-4,-6,-7,8,2,-13,-19,-7,-3,-11,-8,-4,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='A'; M=25,2,-14,-10,-8,-11,-3,-11,-12,-9,-15,-12,9,-15,-9,-14,9,0,-9,-24,-15,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,29,-25,30,8,-26,-11,-3,-28,3,-26,-21,22,-13,-1,-3,3,1,-25,-26,-15,4;
MA   /M: SY='C'; M=13,-8,28,-14,-14,-18,-14,-21,-17,-17,-11,-13,-10,-21,-15,-21,2,0,-6,-33,-21,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-10,-8,-9,-25,16,-14,-27,-10,-25,-16,1,-17,-3,-8,10,1,-19,-29,-21,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-23,-3,2,-25,13,-10,-28,-4,-25,-16,3,-13,1,1,11,1,-20,-27,-20,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-27,-3,3,-24,-19,-10,-23,28,-22,-10,1,-6,4,21,-6,-2,-17,-23,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-27,34,18,-33,-12,4,-31,8,-28,-20,18,-11,9,0,2,-7,-27,-34,-16,13;
MA   /M: SY='A'; M=15,-10,-21,-10,-7,-24,7,-17,-20,-12,-24,-17,-6,14,-9,-17,11,-1,-16,-28,-24,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-26,-2,15,-20,-19,3,-19,12,-14,-7,-3,-11,12,16,-6,-9,-18,-19,-6,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,2,-25,6,2,-16,-15,-5,-13,-5,-12,-8,-3,-16,-2,-8,-5,-8,-8,-27,-9,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-9,33,-15,-13,-18,-20,-18,-23,-9,-19,-15,-5,-23,-11,0,6,10,-10,-37,-19,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-1,-18,-4,10,-14,-20,-10,-11,-4,-7,0,-4,-9,1,-7,6,20,-7,-28,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-25,-35,-27,31,-34,-17,22,-26,16,10,-21,-26,-25,-22,-21,-10,12,-2,23,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-20,-32,-23,3,-30,-24,26,-27,31,16,-26,-26,-20,-22,-21,-8,20,-21,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=5,-10,-10,-17,-16,-8,-21,-23,2,-13,-4,-4,-10,-16,-16,-14,10,30,15,-29,-11,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-10,-27,-12,-9,-20,5,-17,-17,5,-13,-6,-6,-17,-8,-1,-8,-8,-13,-21,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=12,-7,-21,-10,-13,-25,37,-18,-29,-15,-25,-18,0,-15,-13,-17,12,-4,-19,-25,-25,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-17,-17,-12,0,-18,-13,2,-20,14,2,-13,-22,-11,-15,-1,2,0,-24,-1,-12;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-12,-23,-14,-14,-7,-19,-1,-13,0,1,-15,-15,-12,-19,2,-2,7,-21,-15,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-23,-19,-10,-11,-25,-13,4,5,2,12,-15,-20,-2,4,-14,-8,7,-22,-6,-7;
MA   /M: SY='S'; M=11,6,-17,1,1,-24,-6,-5,-16,-4,-19,-9,9,-12,8,-8,12,1,-14,-29,-17,5;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-10,-13,-18,-24,37,-20,-28,-19,-24,-17,-4,-21,-18,-19,5,-10,-16,-27,-26,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-19,-25,-19,-9,-6,-25,-9,-7,3,12,4,-14,-25,-4,29,-19,-10,-6,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-1,21,-20,24,4,-27,0,-7,-27,-6,-26,-22,16,-12,-4,-10,14,4,-19,-35,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-18,-16,-12,-11,-20,-16,-2,0,-6,-2,-12,-22,-9,9,-1,0,10,-28,-11,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-7,-23,-5,2,-15,-13,-11,-8,-2,-9,-4,-10,-16,-6,-8,-7,-8,-2,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-23,-11,-9,-10,4,-13,-18,-7,-13,-8,-1,-17,-4,-7,-1,1,-16,-20,-11,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-3,-29,-3,9,-30,-18,9,-24,15,-23,-7,1,-7,28,21,-1,-8,-25,-23,-9,17;
MA   /M: SY='A'; M=12,11,-21,8,-1,-26,1,-9,-24,0,-21,-17,9,-13,-4,-4,4,-5,-16,-27,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-28,-23,-18,-3,-21,-10,10,-15,1,3,-15,-12,-13,-15,-13,-9,3,-13,8,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-21,-11,-24,-20,20,-26,-8,1,-21,12,2,-19,-27,-18,-16,-14,-3,-2,-5,23,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00160;
//
ID   AA_TRNA_LIGASE_I_MP; MATRIX.
AC   MP00178;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-I signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1261874; R2=0.0087841; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=897; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=726; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-26; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-24,-47,-36,28,-14,-59,-16,-19,29,2,93,-13,-34,-5,-1,11,-37,-32,-77,-30;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-81,-71,-10,-53,-11,-46,-22,15,20,-57,-2,23,-15,-8,-5,22,-10,-82,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=10,-83,-25,14,-50,-11,-31,-55,22,-30,-31,6,20,-22,0,8,-5,-16,-89,-53; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-54,-25,33,-65,15,-21,-83,20,-15,-48,-15,-14,-32,-35,-16,11,-44,-93,-78; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-47,-97,4,6,-98,19,-22,-81,40,-85,-86,-2,25,-34,-64,-23,-33,-93,-99,-86; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-55,-84,-34,16,-81,-30,-42,-82,75,-64,-31,20,-48,-16,26,-40,-5,-38,-84,-27; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-83,-78,-36,31,-78,-75,11,12,-25,-58,-29,60,-66,-36,-22,1,25,-77,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-55,-80,-49,-11,12,-80,-45,22,2,21,-22,10,-3,-17,-66,-46,-22,29,-72,43; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-21,-75,-77,-66,6,-65,-73,40,-24,10,-47,-34,-70,-62,27,-12,31,43,-78,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-75,0,37,6,-65,3,23,-61,24,-48,-66,-65,-8,-66,-48,34,27,-79,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-36,-78,38,8,72,-72,-7,-56,9,-39,-8,-60,-69,-56,-11,1,-12,-64,-57,64;
MA   /M: SY='S'; M=13,25,-69,-61,-41,8,-67,-13,-61,-12,41,-58,-11,-56,-66,65,21,9,-80,-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-76,-69,-65,17,72,-70,-25,-64,-15,-42,-57,29,-60,-70,40,-56,-67,-12,-46;
MA   /M: SY='P'; M=30,-80,-74,-59,11,-67,-69,28,-62,-32,-14,-72,93,-62,-24,-57,-55,6,-70,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-60,-80,42,-26,-12,-1,-49,-75,-30,-72,-62,58,-66,66,-54,-12,-25,-74,-64,76;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-84,-69,-52,-75,-65,-70,-11,-59,-41,-40,-71,121,-60,-70,-56,-29,13,-79,-73;
MA   /M: SY='S'; M=14,-65,-56,-53,-72,-46,-61,-70,-53,-73,-64,41,-57,-49,-60,76,72,-60,-87,-65;
MA   /M: SY='G'; M=24,-75,-51,-61,-81,84,-67,-86,27,-83,-70,19,-61,-55,-60,-10,-59,-76,-78,-73;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-23,-49,18,25,-35,5,-2,-1,-1,-11,-40,-3,51,-7,-48,23,-19,-3,-80,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-80,-83,-68,22,-80,-72,37,-70,43,61,-79,72,-67,-74,-69,-60,-10,-74,-55;
MA   /M: SY='H'; M=-64,-80,-59,-53,-70,-71,136,-84,-57,-71,-56,-47,-64,-48,-55,-51,53,-78,-104,-43;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-76,-89,-76,-51,-84,-79,58,-75,41,36,-82,-75,-70,-77,-69,-59,45,-80,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-80,-67,-72,-84,104,-73,-94,-67,-89,-75,-52,-63,-63,-75,-46,-67,-85,-76,-77;
MA   /M: SY='H'; M=-61,-78,-52,-55,-75,13,113,-85,-55,-78,-63,77,-66,-49,-57,-49,25,-81,-100,-54;
MA   /M: SY='Y'; M=18,-18,-76,-66,19,-53,-63,4,-66,26,2,-70,20,-63,-68,-28,33,-12,-61,69;
MA   /M: SY='R'; M=-47,-81,-77,-11,-12,-28,-69,48,-37,16,25,-72,-71,-57,57,-66,-62,16,21,11;
MA   /M: SY='G'; M=-28,-78,-60,16,-74,61,-66,-35,-57,-68,-66,21,34,15,-64,25,6,-16,55,-66;
MA   /M: SY='A'; M=55,6,-71,-60,14,-34,-43,-16,-2,0,-14,-19,-65,-42,-62,-5,29,-7,-69,38;
MA   /M: SY='M'; M=18,-73,-77,-68,-23,-74,-47,44,-67,29,55,11,-69,-46,-37,-41,21,16,-81,-58;
MA   /M: SY='K'; M=14,-76,-73,-57,8,-72,-66,26,43,11,37,-51,-49,-28,42,-19,-26,1,-75,-56;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-47,-63,-44,-69,38,-17,-66,12,5,38,14,-62,54,-36,6,36,-41,-79,-46;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-83,73,-32,22,-51,-28,-47,3,-52,-68,-16,-68,-54,22,-24,-50,-36,89,15;
MA   /M: SY='W'; M=20,-9,7,-60,-6,-24,-72,26,-51,-30,20,-51,-68,10,2,7,-7,40,48,-58;
MA   /M: SY='F'; M=-41,-76,1,-19,46,-79,-69,18,-18,34,13,-11,-73,-17,-68,-32,-48,32,-32,8;
MA   /M: SY='Q'; M=39,-46,-69,-43,13,1,-41,-42,-46,-3,41,-61,-48,71,-25,3,-37,12,-73,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-51,14,-2,-77,-58,12,-78,22,-29,-60,-2,-63,75,74,-43,-59,-63,-79,-61;
MA   /M: SY='Y'; M=25,-48,23,-26,21,-69,10,-2,-28,5,6,12,-69,-15,5,-47,-12,1,-12,40;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-19,31,5,27,31,19,-50,24,16,-25,-23,-67,-21,-47,-34,-61,-66,-70,31;
MA   /M: SY='H'; M=-30,4,-33,27,-30,-28,76,-65,-16,-63,-60,-2,-48,-9,56,-10,-8,-72,-69,63;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00161;
//
ID   GLNA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00180;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamine synthetase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3060184; R2=0.0150703; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=271; N_SCORE=9.380; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-21,-21,-9,6,-27,-17,9,-18,24,8,-20,-23,-14,-14,-18,-8,4,-20,-2,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-23,10,0,-15,-15,-12,-18,-7,-19,-16,3,1,-8,-12,5,6,-14,-29,-13,-5;
MA   /M: M=-3,-9,-21,-11,-10,-17,-2,-15,-10,-5,-13,-5,-7,-15,-9,-9,-6,-9,-7,-23,-14,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-19,-7,1,-14,-15,-12,-5,-4,-8,-6,-8,13,-3,-8,-3,-2,-7,-19,-12,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-18,-15,-11,-4,-12,-17,2,-13,-4,-3,-15,10,-15,-14,-8,-6,3,-17,-10,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-27,-3,-1,-20,-14,-9,-18,-1,-21,-14,-5,16,-4,-7,0,1,-18,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='D'; M=1,3,-15,4,-2,-21,-12,-9,-15,-5,-16,-11,-1,-13,-5,-10,4,1,-7,-30,-14,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-24,-6,-3,-17,-15,-12,-7,-11,-10,-8,-6,5,-7,-13,-1,-3,-8,-30,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-21,4,17,-25,-15,-5,-20,2,-17,-11,0,-10,13,0,7,0,-17,-29,-15,15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-25,-4,5,-9,-22,-10,-7,-5,-2,-3,-9,-16,0,-6,-10,-9,-7,-21,-6,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-3,-20,1,-6,-6,-19,-10,0,-15,14,1,-10,-15,-10,-14,-15,-8,-3,-20,-3,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-34,2,18,-28,-20,-11,-23,-1,-23,-17,-11,44,2,-9,-7,-10,-27,-28,-22,7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,11,13,-24,-17,-8,-18,7,-16,-12,0,-12,1,0,-3,-7,-13,-29,-14,7;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-30,-33,-32,-24,7,-18,-25,-8,-19,-10,-9,-28,-25,-18,-19,-22,-16,-11,72,14,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-22,-2,-7,-15,-1,-2,-14,-4,-17,-4,17,-14,-3,-5,1,-5,-18,-26,-13,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-27,65,-30,-10,1,-25,9,1,-20,-30,-32,-18,-20,-10,-2,14,41,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-15,-23,-20,-5,-29,-25,16,-19,3,3,-11,-16,-16,-19,2,22,16,-27,-7,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-26,0,1,-19,6,-6,-25,-3,-20,-14,5,-11,-3,-1,-2,-10,-22,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-5,-30,-5,2,-35,21,-4,-29,-4,-24,-9,0,-14,23,-4,0,-14,-29,-20,-19,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-20,-19,-28,-18,14,-11,-21,-9,-17,-7,-9,-16,-19,-20,-19,-5,-7,-6,15,3,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-28,-2,13,-25,-20,-9,-17,6,-20,-11,-7,13,5,-2,-4,-5,-15,-28,-17,8;
MA   /M: SY='G'; M=6,-7,-25,-9,-13,-26,40,-17,-32,-12,-26,-18,0,-17,-13,-10,5,-11,-22,-23,-25,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-25,13,17,-23,-11,17,-25,1,-23,-15,16,-12,9,0,5,-5,-25,-30,-8,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,25,-25,29,25,-29,-11,0,-29,4,-26,-22,18,-9,7,-4,6,-4,-26,-35,-19,16;
MA   /M: SY='S'; M=11,0,-10,-1,0,-20,0,-10,-20,-10,-29,-20,9,-10,0,-10,39,19,-10,-39,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-3,-29,-23,-2,-24,-14,15,-16,14,29,-22,-25,-13,-15,-15,-5,17,-26,-7,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-20,-28,-23,8,-30,-15,19,-19,10,8,-20,-25,-18,-17,-14,-4,17,-12,13,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,13,-29,-18,19,-28,43,20,-28,-29,-20,-19,-28,-10,10,-17,3,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-27,-14,-7,-5,-24,0,-6,8,-5,4,-11,-21,-1,10,-14,-9,-6,-9,13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-36,-12,-2,-27,-19,-20,-17,-11,-24,-17,-19,73,-11,-20,-9,-8,-25,-29,-27,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-21,15,0,-24,-18,-6,-12,-4,-14,-8,-1,-17,0,-4,-4,-6,-4,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='A'; M=14,-13,-21,-16,-8,-14,-13,-17,-9,-11,-7,-8,-12,9,-10,-15,-3,-4,-8,-22,-16,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=4,-22,-21,-29,-20,2,-23,-19,14,-18,6,10,-19,-18,-16,-20,-11,-6,10,-8,1,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-13,-27,-22,26,-26,-13,0,-18,1,-2,-17,-26,-23,-14,-11,-3,3,-1,19,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-26,-15,-6,-15,-24,-16,-3,3,-7,-1,-13,-2,-6,4,-10,-5,1,-25,-12,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,29,-23,42,8,-26,-16,-7,-24,-8,-16,-19,8,-15,-7,-14,-6,-10,-18,-35,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,85,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-32,-27,-39,-29,53,-27,-23,-1,-27,3,-3,-24,-29,-33,-21,-23,-14,-4,39,25,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-22,-10,-3,-13,-18,-4,-23,15,-15,-7,-3,-19,2,40,-7,-6,-15,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-27,-4,0,-25,-2,-9,-26,7,-22,-13,-1,-4,2,13,-2,-5,-21,-24,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-27,3,-10,-29,44,-12,-35,-13,-29,-21,12,-18,-13,-15,3,-14,-28,-26,-27,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-27,16,2,-27,0,-6,-24,-3,-27,-19,16,3,-5,-8,1,-7,-24,-33,-22,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00162;
//
ID   GLNA_ATP_MP; MATRIX.
AC   MP00181;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamine synthetase putative ATP-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2807088; R2=0.0133019; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=442; N_SCORE=10.150; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-2,8,-24,-20,17,-24,21,-21,-6,0,-14,11,17,-9,-12,-19,-22,-2,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,2,-22,-4,0,-18,-14,-4,-20,10,-17,-11,10,-17,4,24,1,1,-16,-27,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-19,-33,-28,1,-33,-27,35,-24,17,17,-24,-25,-23,-23,-15,-3,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-4,-19,-12,-19,-2,-21,-12,-12,-11,-11,-9,-12,-12,-19,10,6,-1,-23,-19,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-28,9,29,-24,-17,4,-25,7,-17,-14,0,-9,10,6,-4,-10,-23,-24,-12,18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,3,13,-24,-20,-7,-17,15,-16,-5,-2,-11,10,7,-6,-9,-15,-24,-11,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-11,-24,-14,-10,10,-22,32,-15,-14,-10,-4,-5,-23,-8,-8,-12,-13,-16,-4,23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-3,-14,-29,51,-11,-38,-13,-29,-19,5,-19,-14,-14,0,-18,-29,-23,-25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-20,-24,-18,0,-27,-18,12,-10,11,10,-20,-23,-15,-11,-16,-7,14,-18,1,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-7,-21,-10,-9,-12,-21,5,-8,-2,-9,-3,-5,-17,-5,-1,-3,4,-3,-23,0,-9;
MA   /M: SY='A'; M=27,-17,-7,-24,-17,-13,-12,-23,4,-15,-3,-3,-16,-16,-17,-20,2,-1,14,-25,-16,-17;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-10,-7,-5,-13,-15,-16,-12,-11,-12,-11,1,-11,-7,-10,21,34,-4,-32,-13,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-37,-28,66,-30,-19,3,-29,15,3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,2,5,26,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-14,0,-24,-1,-7,-13,-17,19,-3,-8,0,27,-4,-18,2,-8,-13,-12,-7,-27,-1,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-29,-10,1,-28,-18,-19,-20,-10,-27,-19,-17,67,-9,-19,-7,-9,-26,-30,-28,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-22,-34,-26,20,-31,-20,23,-26,23,16,-24,-26,-23,-21,-21,-9,17,-12,10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-11,-27,-11,-3,1,-13,-7,-16,-2,-14,-9,-8,-6,-7,-5,-9,-9,-16,-12,3,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-7,-11,-28,51,-16,-35,-15,-26,-18,0,-18,-12,-15,0,-15,-28,-22,-26,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,19,-26,27,4,-22,-17,3,-16,-8,-13,-10,6,-16,-5,-11,-6,-9,-12,-33,-10,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,30,-21,14,-1,-20,-2,4,-19,-2,-28,-19,46,-10,-2,-3,9,1,-27,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=19,2,-11,-4,-3,-20,-1,-11,-17,-9,-23,-17,10,-11,-3,-12,27,12,-9,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='M'; M=0,-18,4,-27,-18,-8,-19,-9,4,-10,7,30,-18,-21,-7,-13,-13,-8,3,-25,-9,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,13,-17,-17,-9,-21,-21,-5,-17,-7,-7,-7,-21,-17,-17,5,17,4,-33,-14,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-15,22,-25,11,0,-20,-9,51,-25,-5,-25,-11,37,-20,5,0,1,-9,-30,-35,-2,0;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-25,-28,-18,15,-27,-10,9,-16,6,13,-19,-23,-7,-14,-17,-10,3,1,14,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-17,-24,-18,0,-27,-21,14,-21,20,10,-17,-21,-16,-17,-9,12,11,-24,-4,-18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-21,-23,-24,-15,3,-20,-14,-20,-2,-14,-11,-15,-25,-8,14,-17,-14,-18,27,5,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,9,-28,13,15,-26,-16,-7,-26,16,-23,-15,4,-4,4,6,-4,-8,-20,-28,-15,9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,8,-20,9,-3,-19,16,-7,-22,-8,-18,-14,7,-13,-7,-10,1,-6,-18,-20,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-27,0,-11,-28,48,-15,-35,-12,-27,-19,3,-17,-14,-13,0,-16,-27,-21,-25,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-10,-25,-11,5,-13,-24,-10,-2,1,-3,3,-12,-13,2,-4,-10,-8,-3,-21,-6,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-25,10,6,-24,-10,-2,-20,6,-26,-16,26,-2,1,1,1,-5,-24,-32,-19,2;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-16,-23,-18,-2,-21,-14,10,-19,10,4,-18,-22,-16,-18,-8,-3,13,-20,-1,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-17,-11,-22,-16,40,-17,-11,2,-17,8,3,-12,-17,-21,-11,-12,-6,1,3,15,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-19,-22,-25,-18,5,-22,-9,9,-18,2,3,-13,-20,-14,-18,-8,-4,4,-10,10,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-17,22,3,-22,11,-5,-24,-5,-19,-16,7,-8,-4,-9,3,-6,-17,-21,-15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-2,5,-19,8,10,-19,-7,-6,-16,1,-16,-12,1,12,0,-6,-1,-5,-16,-19,-14,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-16,12,9,-17,-1,-3,-18,3,-15,-11,7,-7,1,-1,1,-3,-15,-19,-11,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-28,6,11,-18,-6,-3,-25,6,-20,-14,-1,-13,1,-2,-4,-8,-21,-16,-1,5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00162;
//
ID   GLNA_ADENYLATION_MP; MATRIX.
AC   MP00182;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamine synthetase class-I adenylation site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8279357; R2=0.0143141; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=905; N_SCORE=17.772; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=40,-13,-7,-21,-13,-18,-1,-22,-7,-12,-9,-8,-12,-14,-13,-20,7,-1,4,-22,-20,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-27,60,-29,-18,5,-28,17,10,-21,-29,-32,-19,-21,-10,3,2,22,-26;
MA   /M: SY='A'; M=33,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,23,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-10,-20,-13,-16,-7,-21,-4,-11,-7,-7,-12,-13,-13,-19,8,6,7,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-29,-19,4,-25,-10,19,-19,34,38,-24,-25,-8,-14,-24,-10,9,-20,0,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,16,-30,-20,18,-30,47,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='M'; M=6,-18,0,-27,-19,-7,-17,-10,6,-14,9,29,-18,-21,-8,-16,-11,-7,5,-24,-9,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-20,24,-28,44,23,-28,-28,-18,-20,-28,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-3,8,-27,-21,-8,-24,35,-21,-6,-2,-12,14,24,-9,-8,-18,-20,-9,11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-15,12,-28,17,19,-25,-18,40,-29,-3,-21,-12,8,-11,9,-3,-2,-7,-26,-32,-2,12;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,76,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-31,-11,-10,-29,27,-18,-28,-14,-27,-17,-8,17,-10,-18,-2,-14,-26,-23,-27,-12;
MA   /M: SY='E'; M=10,7,-21,9,15,-26,-10,-10,-23,0,-20,-17,0,-3,1,-9,7,-1,-16,-29,-19,8;
MA   /M: SY='P'; M=20,-15,-25,-15,-5,-25,-10,-20,-15,-10,-20,-15,-15,40,-10,-20,0,-5,-15,-25,-25,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-25,-20,-32,-24,0,-27,-17,28,-20,20,30,-22,-22,-14,-19,-17,-7,22,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,43,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-25,28,19,-26,-18,-8,-18,-2,-16,-16,1,-12,-2,-10,-3,-7,-9,-34,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,31,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='P'; M=1,-11,-26,-8,-2,-24,-13,-17,-18,-10,-26,-18,-9,44,-7,-16,8,6,-19,-32,-24,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-34,-8,2,-29,-18,-17,-22,9,-28,-16,-13,49,-4,-4,-8,-9,-24,-26,-23,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,10,-28,18,50,-30,-18,-2,-29,10,-20,-19,0,-2,16,0,0,-9,-27,-29,-19,33;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-13,-23,-14,-6,-12,-19,-3,-8,-4,6,1,-11,-20,-2,8,-12,-9,-8,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=17,-6,-20,-11,3,-21,-11,-12,-14,10,-13,-1,-7,-10,1,-2,-1,-6,-8,-21,-14,2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-26,8,26,-27,-15,-2,-23,11,-20,-13,6,-8,16,4,2,-6,-23,-28,-16,21;
MA   /M: SY='I'; M=0,-18,-20,-26,-23,-5,-27,-23,27,-20,6,8,-10,-22,-19,-22,-9,-4,23,-26,-8,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-35,-11,-6,-29,5,-20,-25,-13,-29,-19,-14,54,-13,-20,-6,-12,-28,-27,-29,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-22,-14,-6,-18,-17,-13,0,-9,-9,-1,-4,-13,7,-10,5,9,-3,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,22,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,10,40,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-3,0,10,4,-4,-28,-17,-17,-26,-13,-24,-21,-8,13,-13,-20,-4,-8,-20,-36,-26,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00162;
//
ID   UBIQUITIN_CONJUGAT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00183;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin-conjugating enzymes active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7935452; R2=0.0124510; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=774; N_SCORE=13.421; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=218; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-25,19,14,-24,-12,-4,-23,1,-20,-15,9,-11,6,-5,1,-5,-20,-29,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-29,-20,-17,30,-29,14,-3,-9,-1,-1,-18,-28,-11,-6,-19,-10,-10,23,66,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-37,-8,-1,-29,-15,-17,-21,-8,-29,-19,-12,71,-9,-17,-8,-9,-29,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-13,-21,-21,-17,18,-21,1,0,-16,3,7,-7,-23,-13,-13,-10,-6,-4,-9,16,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-22,4,13,-24,-12,-7,-22,12,-22,-12,3,-10,5,4,6,-1,-15,-29,-15,9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-33,-10,-1,-26,-16,-17,-19,-8,-27,-18,-15,63,-8,-17,-3,-6,-24,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,80,-9,-20,-10,-10,-28,-29,-29,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-22,-7,1,-22,-17,-11,-16,18,-19,-6,-3,-13,6,9,1,2,-8,-24,-11,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-12,-31,-26,2,-26,-25,22,-21,12,12,-24,-27,-23,-18,-14,-5,28,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-7,-1,-21,-14,-10,-22,23,-20,-9,-3,-15,2,23,-6,-4,-14,-20,-8,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,4,-36,-29,57,-30,-17,-5,-29,4,-3,-19,-31,-36,-21,-18,-10,-1,-3,18,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-9,-19,-12,-7,-26,-18,5,-13,8,6,-15,-21,-12,-11,-9,3,7,-27,-8,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-12,-5,-6,-13,-15,-9,-15,-8,-18,-13,6,-6,-6,-9,15,24,-10,-29,-9,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-30,-1,12,-26,-19,-8,-24,24,-24,-11,-2,2,7,18,-6,-8,-20,-24,-14,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-21,-34,-26,0,-32,-22,33,-23,17,25,-21,-19,-16,-23,-18,-9,22,-22,-3,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-27,-32,-29,-23,32,-26,-9,-6,-19,-3,-6,-24,-21,-21,-16,-23,-14,-13,45,40,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-31,-11,-2,-29,-21,-21,-21,-11,-29,-20,-20,83,-11,-21,-10,-10,-29,-31,-30,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,19,0,-20,-1,13,-20,0,-30,-19,58,-20,0,0,9,-1,-30,-40,-19,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-13,17,-27,23,1,-14,-12,5,-23,-3,-20,-17,8,-17,-4,-7,-2,-6,-21,-17,9,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-8,-24,-7,7,-13,-16,-11,-14,-3,-14,-10,-7,5,-2,-6,0,-3,-14,-24,-12,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='B'; M=-5,15,-19,13,6,-22,-11,-5,-21,-2,-21,-16,14,-12,1,-5,12,12,-17,-34,-15,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-23,7,16,-23,-14,0,-22,5,-20,-14,10,-12,8,7,4,0,-20,-30,-15,11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,0,-34,-29,37,-25,18,15,-25,-22,-24,-25,-17,-6,34,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-23,7,-32,-23,27,-30,42,20,-28,-28,-20,-22,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,28,-23,34,9,-30,-6,-3,-29,-4,-30,-24,22,-5,-1,-9,13,1,-24,-39,-21,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,3,-37,-29,42,-28,20,17,-22,-23,-22,-27,-19,-8,31,-21,-1,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,8,-31,-21,24,-30,45,20,-28,-28,-20,-21,-28,-10,13,-20,0,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-28,3,7,-25,-17,19,-27,16,-24,-9,8,-15,14,20,-3,-9,-24,-25,-4,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-27,17,24,-30,-12,-2,-26,3,-22,-17,8,-2,13,-1,2,-7,-26,-30,-19,18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,13,-27,15,7,-27,-13,-2,-26,8,-26,-17,11,3,2,3,1,-2,-23,-31,-17,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-33,-44,-33,-25,6,-21,-27,-15,-18,-14,-15,-34,-28,-18,-18,-34,-25,-24,113,22,-18;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-16,-4,-1,-20,-9,-12,-19,2,-24,-15,4,-5,-2,-2,19,14,-11,-31,-17,-2;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-31,-8,3,-27,-14,-17,-19,-8,-25,-17,-13,53,-5,-16,-1,-5,-23,-29,-26,-4;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-11,-17,-11,-11,-14,-17,-1,-12,-3,-2,-10,-16,-12,-15,4,8,7,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-24,-26,-26,-20,13,-27,-10,4,-17,15,7,-23,-27,-14,-10,-22,-7,-3,14,22,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-22,22,4,-26,-10,-7,-26,0,-23,-18,13,-12,0,-4,8,11,-18,-33,-16,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-31,-23,3,-32,-24,26,-26,28,15,-25,-23,-21,-22,-19,-4,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,0,-19,-3,1,-20,-14,-4,-15,1,-17,-10,6,-16,7,8,5,0,-13,-27,-12,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-14,-3,-1,-21,-10,1,-19,-4,-22,-12,9,-13,4,-5,16,13,-14,-32,-13,1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-11,-32,-28,-3,-30,-29,29,-23,10,10,-24,-25,-24,-24,-11,-4,35,-26,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-13,-32,-23,13,-31,-22,19,-29,35,16,-27,-29,-23,-21,-25,-9,13,-19,1,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00163;
//
ID   GARS_MP; MATRIX.
AC   MP00184;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoribosylglycinamide synthetase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8698373; R2=0.0142574; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=12.402; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=0,-24,-21,-29,-21,12,-13,-21,6,-25,19,6,-20,-24,-22,-21,-16,-10,3,-14,-1,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-23,-28,-15,-3,-25,-7,23,-13,16,43,-18,-18,-3,-14,-18,-10,11,-21,-2,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-22,-29,-20,3,-31,-22,23,-22,32,16,-25,-26,-18,-18,-24,-9,16,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-14,-8,-7,-14,-17,-5,-12,-6,-15,-9,0,-13,-6,-6,15,26,-2,-31,-9,-7;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-25,2,1,-27,-3,-12,-26,3,-27,-17,0,6,-2,0,7,-2,-19,-29,-20,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-24,4,12,-24,1,-6,-25,0,-21,-16,9,-12,4,0,5,3,-23,-28,-18,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-29,-2,-13,-28,43,-17,-34,-12,-23,-17,0,-19,-15,-14,-4,-17,-25,-22,-24,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-36,-15,-7,-23,-23,-22,-7,-13,-20,-12,-21,65,-13,-21,-11,-9,-15,-29,-25,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-28,-7,1,-16,-23,-3,-17,26,-19,-5,-7,-16,8,15,-11,-9,-13,-10,9,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-26,4,-34,-26,34,-29,31,19,-26,-26,-21,-24,-23,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=16,-21,3,-26,-21,-8,-19,-25,8,-18,4,0,-21,-24,-21,-21,-5,-2,20,-27,-15,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,51,-30,-20,8,-30,26,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-2,18,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=17,-9,25,-19,-15,-17,-15,-23,-15,-15,-13,-13,-9,-18,-15,-19,8,14,-3,-31,-19,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-29,-1,23,-30,-22,3,-13,5,-13,1,-3,-9,37,2,-3,-10,-21,-23,-11,29;
MA   /M: SY='V'; M=5,-13,-17,-19,-18,-10,-20,-20,11,-15,-4,-1,-9,-11,-18,-18,-4,-2,17,-29,-14,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-32,-26,4,-32,-26,30,-27,30,17,-28,-28,-23,-22,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-31,-22,5,-28,-17,24,-24,35,30,-27,-27,-16,-18,-24,-9,16,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-27,-14,-7,-18,-17,-13,-8,-10,-14,3,-13,34,-6,-15,-2,1,-13,-29,-18,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-20,-25,-21,-10,-6,-27,-11,2,-6,16,8,-16,-24,-1,12,-19,-10,-2,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-21,-26,-21,3,-28,-19,22,-25,30,17,-18,-27,-18,-19,-21,-8,13,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-29,8,36,-30,-18,-4,-26,10,-21,-16,-3,7,17,0,-1,-9,-26,-27,-19,26;
MA   /M: SY='S'; M=-2,15,-17,16,9,-23,-8,-7,-23,-5,-25,-20,14,-10,0,-8,21,14,-16,-37,-18,4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-31,40,10,-35,-2,-5,-34,-4,-30,-26,13,9,-4,-12,-1,-10,-30,-36,-23,2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-35,-25,38,-31,-21,14,-30,31,12,-25,-29,-28,-21,-25,-10,7,-8,12,-25;
MA   /M: SY='V'; M=1,-17,-19,-17,-5,-4,-23,-13,5,-12,7,4,-19,-20,-11,-14,-10,-6,9,-19,-1,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-29,4,21,-27,-19,-2,-21,11,-17,-9,2,-2,19,5,-5,-9,-24,-26,-14,20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-19,-26,-21,-5,-27,-11,19,-20,8,8,-17,-22,-17,-19,-9,-1,21,-25,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-19,-30,-21,2,-26,-21,21,-24,29,17,-24,-24,-18,-21,-19,-7,16,-21,-4,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00164;
//
ID   IPNS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00185;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Isopenicillin N synthetase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6009307; R2=0.0144433; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=320; N_SCORE=9.213; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=0,16,-19,11,1,-22,-5,17,-23,-6,-26,-16,24,-15,1,-6,14,1,-21,-36,-12,0;
MA   /M: SY='N'; M=7,18,-19,5,1,-24,-4,2,-17,-1,-22,-13,29,-15,9,-4,8,-2,-22,-31,-18,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-27,1,-2,-19,-17,-14,-13,-14,-8,-11,-10,19,-9,-16,-4,-4,-15,-31,-18,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,3,21,-27,-20,31,-28,9,-20,-8,3,-12,22,19,-5,-13,-28,-26,-4,19;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-21,-26,-26,-24,-1,-24,-24,9,-18,-4,-2,-17,-25,-19,-18,-14,-4,8,21,2,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-2,17,-23,-20,0,-30,24,-20,-13,0,-14,13,50,-7,-10,-23,-23,-13,11;
MA   /M: SY='N'; M=7,19,-15,7,-2,-20,0,-1,-18,-5,-26,-18,33,-15,-2,-7,18,6,-19,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-24,-10,-17,-24,45,-20,-32,-17,-24,-17,0,-17,-17,-17,6,0,-22,-23,-24,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-17,-24,-20,-17,16,-22,9,-3,-10,-3,-3,-17,-24,-10,-13,-12,-7,-7,16,52,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-24,-23,-23,22,-30,6,8,-13,3,3,-23,-30,-16,-13,-17,-7,7,13,55,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-18,-27,-20,-1,-25,-13,17,-10,18,31,-23,-24,-11,-10,-18,-7,18,-23,-4,-15;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-13,-8,-17,-6,-18,-12,-10,-14,-12,-3,-10,-8,-15,19,18,-2,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-15,-23,-14,1,-12,-27,-16,6,-4,-2,0,-14,-18,-7,0,-9,-7,11,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-29,-5,6,-24,-20,-16,-20,-1,-23,-16,-10,39,-4,-9,0,7,-20,-29,-21,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-4,-5,-30,53,-16,-38,-14,-28,-20,0,-16,-12,-16,0,-18,-30,-22,-28,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-30,-3,8,-13,-23,0,-22,28,-20,-8,-6,-14,6,15,-12,-10,-18,-7,14,5;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-13,-7,-18,-4,-17,-13,-10,-16,-13,-3,-10,-7,-15,20,15,-3,-27,-18,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-7,1,-17,4,-12,-14,-21,-17,4,-12,-6,-5,-5,-23,-18,-15,-5,-3,18,-34,-14,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-13,2,-30,9,38,-13,-23,6,-22,4,-14,-14,-6,-8,12,-3,-6,-10,-24,-13,8,23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-25,-26,-32,-24,34,-24,-23,-9,-21,-5,-9,-20,-24,-26,-17,-15,1,-9,41,19,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-13,20,-20,3,-8,8,-8,2,-14,-8,-19,-14,38,-23,-11,-6,2,-3,-22,-26,-6,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,24,-17,17,2,-22,-1,0,-22,-4,-30,-21,35,-15,0,-5,22,7,-22,-40,-20,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-23,-32,-22,52,-27,-14,-8,-13,2,-3,-14,-27,-26,5,-17,-10,-6,2,19,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-28,3,-7,-30,35,-15,-36,-3,-30,-19,4,-16,-10,-8,3,-12,-26,-25,-24,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-21,4,23,-20,-12,-6,-17,1,-15,-13,-5,16,5,-6,-1,-6,-18,-20,-16,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-22,50,14,-29,-7,0,-29,0,-22,-22,14,-7,0,-7,0,-7,-22,-29,-14,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-22,0,0,-14,-14,72,-22,-7,-14,0,7,-14,7,0,-7,-14,-22,-22,14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=0,-13,-25,-8,-1,-20,-12,-14,-13,-7,-19,-13,-13,53,-7,-14,-5,-6,-18,-20,-20,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-12,-14,-16,-8,-4,-16,-5,6,-9,12,20,-12,-14,2,-7,-9,0,1,-16,-2,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-20,-28,-20,0,-26,-18,32,-19,14,19,-14,-14,-12,-19,-14,-7,19,-14,0,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-2,-19,-3,6,-21,-12,-3,-18,20,-16,-5,-1,-8,15,17,-3,-6,-14,-14,-8,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-13,-19,-13,8,-8,-17,-10,-16,-11,-10,-7,-16,-15,-17,11,3,-3,-18,-6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-30,0,8,-30,28,-12,-35,2,-27,-18,0,-12,-3,-5,-2,-15,-28,-23,-23,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00165;
//
ID   IPNS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00186;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Isopenicillin N synthetase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5182710; R2=0.0160033; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=753; N_SCORE=17.559; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-11,-19,-18,-5,-24,-21,7,-14,0,5,-13,-18,-16,-14,5,26,19,-29,-9,-17;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-23,-3,-9,-22,-1,-19,-13,-12,-16,-12,-10,4,-15,-18,-2,-7,-5,-28,-21,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-28,17,7,-34,16,-6,-33,-5,-26,-18,5,-13,6,-9,1,-13,-28,-27,-21,6;
MA   /M: SY='G'; M=7,-7,-26,-7,-4,-28,42,-17,-33,-13,-25,-18,-2,-15,-11,-17,2,-15,-25,-22,-26,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-31,-34,-35,-27,40,-26,-14,-8,-21,-4,-8,-28,-30,-24,-17,-28,-18,-14,70,43,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-11,-21,-13,-3,-17,-24,-8,-3,-5,0,3,-11,-18,14,0,-4,2,-3,-24,-8,5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,45,-28,63,18,-38,-9,-1,-38,-1,-30,-29,19,-10,0,-10,4,-7,-28,-40,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-37,-3,13,-31,-20,-13,-22,-4,-27,-18,-14,64,2,-13,-7,-10,-30,-29,-26,4;
MA   /M: SY='T'; M=9,-9,-15,-16,-12,-6,-17,-12,-7,-8,-8,-7,-8,-16,-10,-8,6,18,0,-16,3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-21,13,2,-20,-12,-7,-20,-4,-14,-14,4,-15,-2,2,8,1,-14,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-34,26,9,-34,-1,-10,-32,-6,-29,-24,1,24,-5,-15,-4,-12,-30,-33,-25,0;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-25,19,17,-27,1,-5,-28,-2,-24,-20,14,-10,1,-7,5,0,-25,-32,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=17,7,-19,2,-5,-24,9,-4,-22,-9,-20,-15,9,-14,-7,-14,6,-6,-16,-27,-19,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-20,-33,-26,43,-28,-11,9,-21,10,12,-22,-28,-26,-16,-18,-8,9,1,27,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-14,15,-20,-1,-11,15,-11,-1,-13,-11,-16,-13,32,-24,-14,-7,-1,-4,-19,-22,-2,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=20,-4,-10,-11,-7,-16,-7,-17,-13,-10,-16,-13,-1,-10,-7,-14,22,24,-3,-29,-16,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-27,-25,-24,19,-32,2,14,-15,5,5,-22,-28,-15,-15,-18,-8,8,11,50,-24;
MA   /M: SY='M'; M=2,-18,-20,-25,-18,-8,-2,-9,4,-14,9,29,-16,-19,-7,-15,-12,-10,1,-20,-9,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-6,-15,-14,-12,-19,9,-20,-17,-12,-15,-12,-4,-12,-12,-16,11,13,-7,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-14,-26,-14,-10,-1,-25,45,-8,-17,8,7,-9,-25,-4,-9,-19,-15,-13,-17,23,-10;
MA   /M: SY='I'; M=3,-27,-19,-32,-24,-1,-28,-26,28,-24,20,12,-23,-23,-21,-23,-15,-6,25,-22,-6,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-25,13,-5,-25,22,5,-30,-8,-29,-19,32,-19,-6,-8,4,-9,-30,-32,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-28,27,-1,-32,26,-7,-36,-8,-30,-24,19,-16,-8,-12,2,-12,-30,-32,-24,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-13,-30,-13,-8,7,-26,13,-9,4,-9,-2,-13,-23,6,1,-15,-10,-15,12,48,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-29,-26,34,-30,-9,11,-19,6,4,-24,-30,-26,-16,-16,-6,14,3,33,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-36,-6,4,-30,-20,-16,-24,16,-30,-16,-11,47,-1,1,-10,-10,-26,-26,-21,-1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,0,-26,-9,-9,-15,-20,-9,0,4,-11,-3,10,-19,-4,8,-7,-6,-4,-27,-10,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,18,-30,23,-20,-8,2,-20,10,58,-10,-12,-22,-22,-5,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-26,-4,6,-28,-16,-12,-26,39,-26,-10,-2,-10,6,21,-6,-8,-16,-20,-12,6;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-22,-27,-26,-19,16,-17,-14,-11,-17,-11,-11,-19,-23,-17,-16,-10,-9,-12,39,21,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-25,-25,-19,-11,-28,-26,16,-18,-2,1,-25,14,-21,-22,-12,-5,18,-28,-15,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-24,9,-3,-22,9,3,-25,2,-28,-18,39,-20,-2,9,5,-5,-28,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=13,-6,-21,-8,8,-22,-11,-9,-21,8,-16,-12,-4,-11,3,16,1,-6,-13,-22,-16,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00165;
//
ID   TPP_ENZYMES_MP; MATRIX.
AC   MP00187;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thiamine pyrophosphate enzymes signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3213840; R2=0.0150034; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=495; N_SCORE=12.738; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-18,-5,-10,-12,-11,-13,-5,-12,-10,-8,2,-16,-10,-14,6,9,-3,-26,-8,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-16,-1,9,-19,-6,-10,-20,-7,-25,-18,3,-4,2,-10,24,9,-14,-33,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-20,-14,-16,-14,20,-13,-20,-16,-15,-6,-3,-12,-15,-16,-4,-12,-18,-21,-15,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-25,-11,-12,-22,22,-13,-21,-14,-13,-7,-3,-14,-6,-14,-2,-8,-19,-22,-19,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-24,-27,-28,-20,19,-24,-11,-1,-21,10,3,-21,-27,-17,-16,-23,-14,-8,24,15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-27,-10,-16,-29,53,-18,-34,-17,-27,-18,-1,-18,-14,-18,3,-15,-25,-21,-27,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-5,-8,-8,-16,-13,-4,-17,-12,-18,-12,2,-9,-8,-11,14,23,-10,-33,-12,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-15,-31,-22,0,-26,-11,23,-17,20,41,-20,-22,-8,-16,-19,-8,13,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-24,-25,-30,-25,37,-27,-12,3,-21,2,-1,-18,-28,-25,-17,-18,-10,0,20,30,-24;
MA   /M: SY='G'; M=15,-7,-20,-10,-11,-24,30,-18,-26,-14,-22,-16,-2,-14,-12,-17,9,-2,-16,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-30,-23,11,-30,-20,20,-24,26,16,-25,-23,-21,-20,-21,-6,16,-18,3,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-36,-10,-3,-30,-5,-18,-23,-11,-29,-19,-15,62,-8,-18,-5,-10,-28,-28,-29,-9;
MA   /M: SY='A'; M=26,-11,-17,-16,-10,-17,4,-14,-15,-11,-15,-12,-8,-14,-7,-16,7,-3,-9,-10,-10,-9;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-10,-20,-13,-18,1,-21,-9,-13,-9,-9,-10,-13,-12,-20,7,0,-1,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-23,-35,-25,13,-33,-22,29,-27,29,21,-24,-25,-21,-23,-23,-9,19,-17,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-6,-22,-15,-11,-9,-17,-4,-13,-5,-6,-15,-17,-14,-19,2,-2,4,-17,-7,-15;
MA   /M: SY='K'; M=3,-3,-25,-5,6,-28,-15,-8,-22,21,-23,-8,-3,-11,17,11,-1,-5,-18,-17,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-18,-29,-21,2,-26,-21,19,-19,20,15,-22,-24,-18,-18,-16,-5,18,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-15,-11,-10,-21,6,-17,-15,-10,-15,-12,-4,-13,-10,-15,8,0,-5,-24,-20,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-9,4,-11,2,5,-17,-15,11,-20,1,-14,-9,6,-16,2,2,-5,-8,-18,-25,-6,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-29,29,26,-31,-10,0,-31,9,-26,-20,14,-9,10,0,0,-9,-29,-31,-17,18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-4,4,-21,-17,-6,-23,17,-17,-10,-2,-16,4,31,-4,-6,-14,-24,-13,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-1,-28,-1,8,-25,-20,0,-18,7,-16,-7,0,-5,15,11,-4,-6,-19,-25,-11,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-11,-28,-28,-1,-29,-28,26,-19,8,8,-26,-28,-28,-19,-8,3,44,-30,-10,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-31,-23,-35,-29,6,-33,-27,30,-24,12,10,-26,-26,-24,-24,-18,-8,29,-4,3,-28;
MA   /M: SY='C'; M=4,-8,7,-11,-14,-14,-12,-18,-8,-17,-5,-8,-7,-23,-16,-18,-2,-3,-1,-32,-17,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-36,-27,16,-33,-23,31,-26,21,19,-23,-25,-23,-23,-20,-9,22,-16,4,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-6,-10,-8,-10,-16,-19,-16,-1,-12,-8,-3,-8,-17,-7,-15,3,5,6,-30,-13,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-27,-10,-18,-28,58,-19,-36,-18,-28,-19,0,-18,-18,-19,4,-15,-26,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='S'; M=17,-5,-7,-9,-8,-22,12,-15,-22,-13,-24,-17,1,-13,-8,-15,22,6,-11,-32,-22,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-21,-37,-27,54,-27,-21,4,-27,11,1,-21,-27,-33,-21,-18,-10,2,7,20,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-25,-6,0,-24,-2,-3,-14,-6,-12,-2,2,-16,17,-5,0,-7,-19,-24,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-21,-21,-28,-17,8,-24,-6,15,-15,19,35,-20,-22,-5,-12,-19,-10,7,-15,5,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-1,5,-7,-3,-7,-14,-12,-11,-13,-11,-15,-13,12,-15,-7,-10,17,23,-9,-35,-15,-7;
MA   /M: SY='M'; M=1,-16,-19,-22,-19,-7,-14,-11,10,-17,4,11,-11,-21,-13,-17,-8,-7,8,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-26,-5,6,-29,-13,7,-15,1,-15,5,0,-8,32,1,0,-7,-21,-24,-10,19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-29,25,52,-31,-18,-1,-31,8,-21,-21,2,-2,16,-2,0,-10,-29,-31,-20,34;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,10,-31,-22,24,-27,32,19,-27,-27,-21,-21,-25,-9,17,-13,1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=10,-6,-19,-8,-4,-18,0,-16,-13,-12,-14,-12,-4,-13,-7,-15,10,2,-9,-21,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-12,-8,-5,-15,-17,-15,-12,-8,-13,-10,1,-10,-1,-8,20,37,-5,-30,-11,-3;
MA   /M: SY='M'; M=11,-16,-13,-25,-17,-9,-17,-16,10,-15,6,13,-14,-19,-10,-18,-7,-5,9,-23,-10,-14;
MA   /M: SY='V'; M=5,-20,-16,-24,-20,-8,-18,-23,13,-15,2,4,-17,-22,-18,-14,-5,-2,21,-26,-11,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,7,-27,-19,1,-20,15,-17,-5,-3,-16,26,31,-5,-9,-18,-21,-11,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-22,-13,-7,8,-25,8,-8,-11,-2,-2,-14,-24,-7,-11,-17,-12,-13,8,30,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00166;
//
ID   BIOTIN_MP; MATRIX.
AC   MP00188;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Biotin-requiring enzymes attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2906160; R2=0.0177919; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=281; N_SCORE=11.280; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-24,-12,-6,-18,-21,-17,-9,2,-13,-6,-11,11,-8,-4,-4,3,-5,-27,-15,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-22,-20,-17,-4,-19,-23,15,-21,9,5,-18,-23,-19,-20,-13,-7,16,-24,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-20,-21,-11,-8,-23,-22,10,-13,0,0,-18,-19,-14,-16,-7,-3,15,-14,-8,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-28,2,14,-29,-14,-9,-26,20,-26,-14,-1,3,8,10,-3,-8,-22,-25,-17,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-19,-26,-22,3,-26,-21,16,-19,1,3,-20,-13,-22,-20,-8,-3,21,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-23,-24,-15,17,-25,-14,1,-10,8,3,-13,-24,-15,-3,-16,-8,-1,-12,6,-15;
MA   /M: SY='V'; M=3,-29,-12,-30,-28,-1,-28,-29,28,-20,10,9,-28,-28,-28,-21,-10,-1,44,-28,-10,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-26,2,17,-25,-17,7,-25,16,-22,-11,1,-10,9,8,-1,-5,-19,-26,-10,12;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-22,1,4,-21,-16,-13,-11,-4,-16,-12,-3,1,-6,-10,1,-2,-5,-31,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-17,-30,64,-18,-39,-17,-30,-20,2,-19,-18,-18,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-4,18,-24,26,11,-31,-4,-6,-27,-4,-23,-19,7,-11,4,-9,6,-4,-21,-32,-19,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-24,-8,1,-17,-22,6,-13,7,-11,-1,-4,-15,3,7,-5,-1,-9,-25,-5,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-1,-23,-3,5,-16,-15,-10,-19,14,-20,-9,1,-12,2,6,1,-4,-14,-23,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=8,-2,-20,-3,13,-26,-15,-11,-21,17,-20,-11,-4,-9,6,4,-1,-5,-14,-23,-16,9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-3,-16,-30,60,-17,-39,-17,-30,-21,6,-19,-17,-18,1,-18,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,17,-28,24,21,-37,-17,3,-26,5,-22,-12,7,-9,31,1,2,-5,-27,-28,-14,26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-16,-16,-16,-10,-16,-19,-21,-3,-14,-11,-7,-15,10,-12,-17,-2,2,1,-30,-18,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-20,-31,-25,10,-32,-19,25,-24,25,14,-27,-28,-22,-20,-21,-7,22,-15,9,-25;
MA   /M: SY='C'; M=9,-20,29,-27,-22,-11,-20,-23,-4,-21,1,1,-20,-26,-20,-22,-8,-6,6,-31,-17,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-21,-26,-15,-5,-32,-25,28,-19,9,9,-21,-21,-18,-21,-12,-5,29,-26,-8,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-33,-25,4,-32,-23,31,-26,29,22,-26,-26,-20,-22,-22,-8,25,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-26,13,44,-27,-17,-3,-24,4,-20,-18,1,-3,14,-3,7,-4,-23,-31,-19,29;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-11,-22,-13,-17,-5,-22,-3,-12,-6,-6,-13,-13,-13,-20,6,0,7,-21,-18,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-21,-19,-29,-20,0,-21,-6,19,-13,21,47,-21,-21,-5,-12,-18,-7,12,-21,-2,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-26,-1,25,-18,-22,-2,-10,1,-7,5,-8,-9,15,-4,-7,-10,-14,-25,-11,20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,8,-21,-4,-8,-12,-13,18,-6,-7,-9,12,17,-19,0,-5,-3,-2,-13,-30,-5,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-9,-24,-6,10,-18,-22,-13,-7,-6,-12,-9,-10,4,-3,-10,0,0,-3,-30,-16,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-28,2,-35,-27,38,-27,24,19,-24,-24,-22,-25,-20,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-21,-1,11,-20,-17,-8,-16,6,-18,-10,-2,-9,2,1,6,5,-9,-30,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-5,-33,2,4,-30,-4,-12,-26,-6,-27,-19,-7,35,-4,-14,-4,-9,-27,-28,-24,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-15,-8,2,-18,-20,-3,-10,2,-12,0,-7,-15,2,-2,-2,-4,-4,-28,-10,1;
MA   /M: SY='D'; M=3,13,-19,16,7,-25,-7,-8,-22,-4,-23,-17,9,-10,-1,-9,15,5,-15,-34,-18,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-15,-14,-7,-14,-24,-13,-8,3,-11,-4,-7,-17,-2,8,-2,6,-1,-24,-7,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-24,14,14,-27,-27,-26,-23,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-26,-5,7,-23,-16,1,-16,8,-16,-6,-3,-14,9,6,-3,-6,-13,-25,-9,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-25,2,11,-20,-7,-7,-20,2,-12,-10,-4,-12,3,-2,-4,-8,-18,-22,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-13,-20,-12,-1,-23,-8,-5,-7,5,2,-13,-23,-11,-5,-14,-9,-3,-20,-3,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-14,-25,-20,-6,-26,-17,15,-15,3,6,-20,-24,-13,-13,-9,-4,23,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-26,0,8,-24,-14,-8,-22,9,-24,-13,0,5,3,4,2,1,-18,-28,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=1,11,-22,9,7,-25,3,-7,-22,-3,-22,-17,13,-14,-2,-8,5,-5,-18,-30,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-4,-26,-5,-13,-28,48,-16,-34,-15,-28,-19,3,-17,-14,-16,4,-13,-25,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00167;
//
ID   LIPOYL_MP; MATRIX.
AC   MP00189;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase component lipoyl binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.4851155; R2=0.0223821; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=24; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-44; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-5,-25,-6,10,-32,-18,1,-14,4,-15,-1,-4,-12,38,4,1,-6,-17,-21,-12,24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-28,8,20,-23,-15,-7,-20,-1,-18,-15,-2,6,3,-8,-1,-6,-21,-27,-15,10;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-20,-6,-2,-20,-1,-4,-18,-6,-15,-6,-1,-14,1,-6,8,5,-13,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-25,-19,-29,-21,1,-23,-18,18,-22,26,21,-23,-24,-16,-19,-18,-7,14,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-25,-2,-4,-25,24,-10,-30,-9,-23,-16,2,-14,-9,-10,4,-2,-22,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-29,30,31,-32,-16,-1,-30,10,-22,-19,7,-7,11,1,-2,-9,-26,-31,-17,21;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-22,-25,-24,-11,4,-24,7,-22,0,2,-15,-22,-21,-22,-9,-10,10,-22,-14,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-9,-16,-12,-10,-6,-21,-18,2,-10,-4,-4,-7,-18,-14,-10,0,9,11,-28,-11,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-22,-29,-23,19,-27,-15,14,-21,10,7,-19,-25,-20,-17,-16,-8,13,-12,9,-22;
MA   /M: SY='V'; M=3,-20,-14,-24,-21,-7,-22,-24,15,-16,2,3,-17,-22,-19,-17,-5,0,23,-26,-10,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-26,11,26,-27,-16,-4,-26,13,-21,-15,2,-7,13,9,2,-3,-22,-27,-16,19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-32,-32,-34,-25,7,-26,-25,7,-24,12,2,-31,-26,-20,-21,-29,-15,-1,45,11,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-13,-11,-5,3,-14,0,0,-9,8,4,-9,-11,-5,-6,-10,-5,-3,-7,4,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-29,-11,-3,-21,-22,-17,-13,12,-20,-9,-14,20,-6,2,-10,-8,-8,-25,-15,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-27,6,20,-29,-17,-6,-27,23,-25,-14,3,-4,12,12,-1,-7,-22,-26,-15,16;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-22,-15,-4,-13,-25,-20,5,-8,-2,-1,-17,-4,-11,-13,-8,-4,9,-27,-13,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-29,-4,-17,-30,62,-17,-39,-18,-30,-20,4,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,22,-25,31,18,-30,-13,-6,-28,2,-22,-20,8,-9,2,-5,3,-2,-20,-32,-18,9;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-23,-4,8,-19,-17,-7,-18,9,-17,-10,-2,-9,4,3,2,1,-14,-23,-9,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-33,-28,6,-33,-28,32,-25,19,14,-27,-27,-26,-23,-16,-5,36,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='K'; M=2,6,-21,3,9,-24,-11,-8,-21,10,-23,-14,8,-11,4,2,8,3,-16,-29,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=5,-5,-24,-6,8,-24,-14,-11,-17,8,-17,-10,-5,-2,5,1,-1,-6,-13,-24,-16,6;
MA   /M: SY='G'; M=-8,8,-29,14,0,-28,27,-9,-36,-8,-27,-21,5,-16,-8,-10,-1,-15,-28,-25,-21,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-28,29,29,-32,-14,-2,-31,7,-23,-19,7,-7,12,0,1,-7,-26,-31,-18,21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-18,-12,-6,-15,-16,-18,-4,-12,-9,-7,-11,-2,-10,-14,2,3,1,-29,-15,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-14,-33,-25,15,-30,-24,20,-27,25,12,-25,-28,-25,-22,-20,-8,18,-18,1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=11,-18,-4,-23,-20,-9,3,-22,-8,-20,-6,-6,-14,-22,-20,-22,-4,-8,0,-22,-15,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-19,3,15,-18,-18,-12,-14,-4,-14,-13,-3,-10,-1,-9,8,9,-7,-31,-15,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,20,16,-26,-26,-24,-23,-17,-5,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-29,17,55,-29,-20,0,-28,9,-19,-17,-1,-1,21,0,0,-10,-29,-29,-19,38;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-12,-5,-6,-16,-4,-14,-16,-10,-21,-16,6,-11,-6,-11,28,28,-7,-34,-17,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-22,24,0,-25,-10,-12,-16,-8,-16,-15,1,-16,-10,-14,0,-4,-4,-34,-17,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,-16,-22,-15,-12,-11,-22,-3,-14,-8,-7,-14,-16,-14,-19,4,3,5,-5,-11,-14;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-14,-14,-12,-13,-15,-19,1,-12,-7,-5,-7,-16,-11,-15,8,10,9,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='M'; M=3,-13,-17,-16,-12,-12,-6,-15,0,-14,-5,4,-8,-17,-9,-15,4,1,3,-28,-13,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-29,28,33,-32,-14,-4,-31,5,-24,-22,5,3,9,-4,0,-7,-28,-32,-20,20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-34,-28,11,-33,-27,30,-26,21,14,-26,-27,-26,-23,-18,-6,30,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-10,-31,-7,3,-7,-22,-4,-13,-6,-13,-11,-10,16,-5,-8,-10,-7,-19,-13,6,-4;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-8,-13,-8,-16,-5,-16,-11,-12,-14,-11,-4,-13,-7,-16,18,8,-3,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-35,-9,1,-27,-20,-16,-16,-9,-23,-15,-16,61,-5,-15,-7,-8,-23,-29,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-14,-19,-14,-12,-3,-25,-17,9,-17,4,1,-15,-21,-16,-18,-9,-6,13,-24,-5,-15;
MA   /M: SY='S'; M=6,8,-18,9,9,-24,-3,-9,-23,-4,-23,-18,7,-10,0,-9,15,6,-16,-32,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-22,-7,9,-13,-24,-13,-5,1,-9,-6,-9,-13,-2,-4,-3,3,-1,-24,-7,2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,33,-25,22,15,-27,-27,-25,-23,-18,-5,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-19,-18,-11,-10,-21,-20,6,-7,0,1,-13,-18,-11,-10,-5,-1,10,-24,-10,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-26,11,28,-27,-16,-4,-26,12,-21,-16,1,-7,9,4,0,-8,-21,-27,-16,18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-30,-24,-3,-32,-25,29,-20,14,12,-22,-24,-18,-18,-14,-5,28,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-19,-2,-10,-9,-12,-5,-3,-9,-6,-5,20,-22,-9,-8,-3,-2,-8,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-22,-8,1,-16,-18,-14,-5,-3,-10,-6,-8,-12,-3,-8,-2,-2,0,-25,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-27,11,15,-29,-12,-5,-25,9,-23,-16,3,0,6,0,-1,-7,-22,-28,-17,10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-21,-12,-1,-9,-24,-17,4,-14,10,2,-17,-15,-10,-14,-12,-6,5,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-25,-3,-3,-23,21,-15,-23,-11,-20,-14,-2,-15,-9,-14,0,-10,-16,-25,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,19,-24,25,17,-30,-8,-6,-29,4,-25,-20,9,-9,4,-4,6,-1,-22,-32,-18,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-20,5,4,-21,-13,-8,-16,6,-20,-12,10,-12,1,0,7,5,-12,-30,-14,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-27,-10,-8,-19,-19,-19,-4,-13,-14,-9,-13,28,-14,-18,-7,-5,-5,-30,-20,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-8,-21,-8,1,-16,-11,-12,-7,-8,-9,-6,-7,-14,-4,-11,1,0,-3,-26,-12,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-21,-19,-14,-6,-23,-19,6,-15,6,2,-18,-8,-14,-15,-10,0,6,-24,-8,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-21,-21,-23,-10,-4,-24,10,-20,1,2,-15,-24,-22,-20,-9,-8,15,-25,-13,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-9,-30,37,-16,-36,6,-30,-16,0,-16,-9,-1,-4,-16,-26,-20,-23,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00168;
//
ID   CYTOCHROME_B5_1_MP; MATRIX.
AC   MP00191;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome b5 family, heme-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1266389; R2=0.0153640; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=482; N_SCORE=12.522; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-27,23,19,-30,-8,-4,-31,10,-27,-20,9,-10,6,7,4,-6,-24,-32,-18,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,0,-25,-20,-6,-19,-23,2,-23,5,1,-19,-11,-20,-22,-13,-5,1,-27,-13,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-43,-37,-28,14,-23,-24,-10,-21,-9,-12,-36,-29,-20,-20,-36,-25,-21,111,31,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-28,-13,-34,-27,12,-32,-26,24,-24,15,11,-24,-27,-25,-19,-17,-7,25,-20,-1,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=7,-19,-15,-25,-20,-6,-23,-24,18,-18,5,4,-16,-18,-17,-20,-2,5,21,-24,-9,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-33,-27,5,-34,-18,32,-25,17,14,-21,-24,-21,-23,-18,-8,26,-20,4,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,8,-26,4,-1,-24,1,14,-29,5,-26,-14,16,-17,1,9,0,-9,-25,-28,-11,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,3,-11,-28,39,-10,-34,-15,-25,-19,5,-18,-13,-16,2,-12,-26,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-29,4,7,-26,-10,2,-24,16,-22,-11,2,-14,5,10,-7,-11,-19,-24,-9,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-14,-30,-28,-2,-31,-29,30,-18,9,10,-27,-28,-27,-19,-11,-2,44,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-21,-20,33,-29,21,-3,-13,0,0,-17,-29,-13,-11,-19,-11,-10,22,67,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-13,-30,-27,-2,-18,-27,20,-24,7,7,-22,-25,-25,-23,-12,-7,25,-24,-9,-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-3,8,-26,11,9,-28,-7,-7,-27,7,-25,-18,5,-1,3,3,2,-6,-22,-29,-19,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-23,5,-31,-23,26,-25,34,18,-27,-27,-20,-20,-24,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-28,28,20,-31,-14,-4,-29,7,-26,-20,7,-1,5,0,1,-6,-24,-33,-18,12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-27,14,15,-17,-13,-4,-22,2,-14,-14,5,-13,1,-2,-5,-9,-21,-24,-9,8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-23,4,15,-25,-15,-9,-20,3,-18,-13,-3,2,6,-5,3,0,-16,-26,-17,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,16,-25,21,22,-25,-14,-4,-27,4,-22,-18,7,-9,8,-3,3,-2,-22,-30,-15,15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-20,-20,-15,-9,-22,-19,7,-6,-4,2,-13,-20,-12,-7,-3,0,12,-20,-8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-23,-26,-18,0,-28,-17,16,-14,21,15,-17,-24,-13,-8,-20,-9,9,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-24,7,5,-17,-16,-8,-13,-2,-9,-5,0,-14,-2,-5,-3,-3,-12,-29,-12,1;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-14,-10,-7,-15,-7,-4,-11,-10,-11,-6,-1,-17,-3,-12,2,-2,-8,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-15,-16,-9,-18,-3,-17,-10,-7,-10,-9,-5,-13,-8,-11,6,0,-4,-22,-17,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-29,-9,-19,-29,63,-18,-38,-19,-29,-20,3,-20,-19,-19,1,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-25,-5,2,-25,-5,-10,-24,13,-22,-11,0,-13,6,13,2,-1,-17,-24,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,41,-29,58,16,-38,-10,-3,-36,-1,-28,-28,15,-5,-1,-11,0,-9,-27,-38,-21,7;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-9,-20,-15,-14,-13,-21,2,-16,0,-3,-14,-16,-14,-21,-1,-3,7,-24,-15,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-14,-3,2,-14,-19,-16,-13,-8,-10,-11,0,-10,-5,-9,15,33,-6,-31,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-29,8,24,-27,-16,-9,-20,2,-19,-16,-4,9,3,-7,-3,-9,-19,-29,-20,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00170;
//
ID   THIOREDOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00194;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thioredoxin family active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1956113; R2=0.0082981; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=877; N_SCORE=7.080; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=807; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-27; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-56,-77,-74,-80,-63,74,-78,79,-74,-51,-51,-61,-71,-71,-80,-60,-63,-40,-74,-66;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=0,-76,51,33,-77,9,-60,-41,-6,-25,-66,23,36,10,-32,-17,-3,-27,-83,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=7,-77,13,26,-69,-13,-59,-71,5,-9,-65,34,-42,18,-41,13,-9,-52,-77,29; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-76,-88,11,9,-84,-58,-70,-56,-23,-3,-33,50,-15,-8,-12,-9,2,-80,-97,-43; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-50,-101,-36,-10,42,-66,-12,-60,-28,-51,-82,-31,-53,7,-24,-59,-38,-89,71,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-29,-99,-14,-42,25,-68,-95,-12,-44,-25,-13,-90,-17,-49,-94,-31,-7,-16,-14,-78; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-37,-76,38,26,-28,-71,-7,-3,-5,-3,-8,-20,-2,37,-16,9,26,-35,-81,-35; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=1,-74,8,48,-69,-38,-60,-42,14,15,-25,-2,19,33,-25,-29,-8,8,-79,-66;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=20,-74,12,37,-26,-51,-27,8,0,2,15,-60,13,-5,-27,-1,-8,-4,-77,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=27,-69,-1,-31,-38,-28,-68,3,13,29,-48,-23,-72,-35,-28,-7,-15,44,-78,-62;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=1,-72,-40,-28,14,-50,-26,-7,27,25,-23,31,6,23,-15,17,-15,-43,-74,-59; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=25,-96,9,-26,-102,-17,-84,-98,-19,-75,-92,28,-16,-44,-85,-52,-36,-92,-106,-48; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,-74,14,27,-79,15,-60,-52,30,-59,-67,-18,36,33,-36,39,-7,-52,-79,-70;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-56,-77,30,15,-83,67,-7,-85,9,-83,-74,28,-40,4,-41,-5,-9,-80,-82,-73; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-36,-78,-38,-8,-78,2,-60,-53,75,-38,-65,-9,-68,33,19,-6,-17,-40,-77,-37; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-65,-79,-9,-31,-62,-41,-29,20,-15,32,-51,-26,78,-66,-71,-47,4,-9,15,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-12,-70,-67,0,-23,-75,15,17,-22,-25,-21,-39,-71,16,-43,-13,29,64,15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-69,-84,-77,22,-84,-74,29,-75,47,52,-78,-79,-73,-49,-71,-58,62,-73,-52;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-70,-84,-78,-48,-86,-79,56,-76,45,0,-79,-79,-74,-77,-71,-38,68,-78,-57;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-77,80,57,-75,-66,9,-54,-3,-59,-11,42,-65,-47,-56,-54,-26,-54,-85,4;
MA   /M: SY='F'; M=-68,-71,-85,-80,99,-83,-67,-12,-76,5,18,-77,-83,-80,-74,-72,-63,36,-49,35;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-81,-94,-87,-39,22,-86,15,-75,-78,-71,-71,-83,-88,-76,-79,-53,19,-79,119,78; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=72,-66,-7,-57,-74,9,-66,-69,-43,-70,-29,-55,-66,17,-64,35,11,-60,42,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-74,38,-3,18,-36,-60,-25,-29,-68,-64,-19,56,-6,-43,37,35,-48,-72,19;
MA   /M: SY='W'; M=-71,-92,-89,-78,-6,2,-85,-71,-70,-69,-70,-30,-77,-70,-74,-72,-6,-81,166,35;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='P'; M=-18,-78,-66,-47,-78,73,-72,-66,-67,-59,-67,-60,77,-67,-75,-54,-18,16,-77,-76;
MA   /M: SY='P'; M=0,-81,-62,-57,-66,-66,90,-73,-61,-73,-62,-59,92,-58,-65,16,-16,-73,-10,39;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-78,-59,-34,-63,-71,9,-73,75,-55,-27,-54,-69,30,57,-57,-61,-71,-64,52;
MA   /M: SY='Q'; M=35,-72,-25,23,-15,-49,-25,-31,22,-39,41,-10,-23,47,1,-28,-26,4,-73,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-72,-69,36,52,-82,-66,36,-67,30,65,-72,-73,-63,-69,-68,-17,13,-66,-11;
MA   /M: SY='H'; M=44,-72,-23,47,-16,-18,69,-48,-28,-26,23,-55,-65,19,-39,1,-26,-35,-79,-59;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-83,-60,3,-82,-49,-27,-74,10,-79,-31,-62,106,11,-17,20,-38,-75,-79,-75;
MA   /M: SY='T'; M=1,-71,-7,11,-22,-72,17,1,13,6,-6,-36,-41,4,-26,-29,37,22,-72,30;
MA   /M: SY='W'; M=-68,-74,-82,-78,59,-82,-65,28,-74,34,18,-76,-80,-73,-73,-70,3,4,72,59;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=11,-6,26,46,18,-70,-61,-25,10,-67,3,6,-24,18,-1,-20,-9,-27,-78,-34; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=18,-74,10,61,-78,-36,-24,-75,34,-37,-66,-8,-21,14,17,10,-1,-69,-79,-68;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-72,4,-69,17,-78,-68,20,-25,58,33,-71,-77,-38,-70,-48,-9,0,59,-12;
MA   /M: SY='A'; M=68,-68,-26,-39,-69,-32,-26,-65,27,-68,-62,-21,6,-16,-15,18,-36,-11,-9,12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-75,14,38,-47,-12,-5,-52,61,-46,-29,32,-65,30,-10,-18,-26,-52,-78,-66;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-90,20,28,-90,-60,-31,-55,38,-84,-79,-25,-80,2,-42,-25,-21,4,-14,-81; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-52,-79,-75,-71,30,-16,38,-19,-34,27,17,-42,-81,9,-19,-48,-30,-24,-57,76; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-78,-6,12,-71,10,-7,19,21,-21,-58,-2,60,23,-26,-13,-58,-6,-77,-36;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-75,56,30,-45,14,-24,-69,-4,-29,-66,19,-67,12,-1,-11,4,-14,-80,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-13,-72,38,-4,-15,2,-27,-5,5,-9,-56,6,-41,-6,5,-20,5,39,-81,-63;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-70,-66,0,-24,-21,-28,16,-44,10,-21,5,-2,2,-10,-6,15,48,-78,-33;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-72,24,-61,56,5,-4,2,11,-6,-55,37,-41,-17,-62,-19,-24,11,-68,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-26,-24,-45,-12,49,-40,-25,12,-32,38,-16,-23,-77,-67,-44,-31,-24,34,-63,31;
MA   /M: SY='K'; M=20,-71,-39,-15,8,-70,12,1,46,-8,-52,3,-20,-56,6,-40,-56,42,-75,-28;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00172;
//
ID   GLUTAREDOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00195;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutaredoxin active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8364873; R2=0.0135767; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; N_SCORE=10.014; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=11,-15,-16,-21,-12,-10,-15,-15,3,-11,3,12,-15,-12,-9,-14,-4,1,6,-23,-11,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-5,-16,-5,2,-11,-14,-6,-2,-1,0,3,-7,-10,3,-3,-6,-5,-3,-16,-6,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=7,0,-12,0,4,-13,-7,-6,-11,-2,-12,-9,0,-7,0,-6,7,2,-7,-17,-7,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-18,-17,-11,19,-15,-2,-6,-7,-1,-1,-8,-16,-13,-5,-11,-8,-5,-5,9,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=8,-16,-8,-18,-16,-5,-15,-18,11,-10,2,2,-16,-17,-16,-10,-3,1,23,-19,-9,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-21,6,10,-23,-12,-1,-19,16,-19,-8,6,-3,15,9,-2,-6,-18,-18,-10,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-11,8,12,-21,-10,-4,-20,5,-18,-12,4,-8,8,0,5,-2,-16,-24,-13,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-8,-17,-10,-6,-9,-17,-7,-1,-1,0,2,-7,-13,-4,-2,-7,-2,-1,-17,-5,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-18,-15,-21,-17,-4,-18,-18,17,-16,8,7,-14,-17,-12,-15,-7,-2,17,-18,-6,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=9,-7,-14,-10,-6,-16,-1,-11,-8,-6,-12,-6,-3,-11,-2,-7,6,-1,-3,-20,-13,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-1,5,-20,-2,-3,-16,0,2,-17,-5,-18,-11,12,-14,-4,-6,2,-6,-15,-26,-13,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-26,0,7,-21,-17,-10,-21,13,-21,-9,-2,3,2,3,-1,-1,-17,-25,-13,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-32,-28,3,-31,-27,31,-22,12,15,-25,-26,-25,-21,-12,-1,38,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-17,-16,-9,-3,-25,-19,4,-6,-4,-2,-15,-19,-14,-10,-4,4,14,-23,-5,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-33,-27,1,-29,-27,32,-25,20,16,-25,-26,-23,-23,-17,-7,31,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-22,-32,-25,56,-28,-7,-1,-22,5,-1,-19,-28,-28,-17,-18,-9,-3,14,42,-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-15,-11,-11,-13,-10,-17,-5,-14,-12,-9,-3,-14,-10,-15,14,16,1,-28,-11,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-27,-7,0,-19,-16,-11,-22,23,-22,-10,-4,-15,1,15,-5,-4,-14,-10,-4,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-24,-4,-1,-21,-12,-10,-19,-9,-23,-16,-5,23,-5,-13,8,7,-18,-29,-17,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-22,-14,-12,5,-13,0,-12,-10,-10,-6,-8,-19,-10,-10,-2,7,-11,-4,19,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-29,-20,-20,-18,-10,-28,-19,-20,85,-11,-20,-10,-10,-27,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-28,-26,-22,41,-29,10,-2,-16,1,-1,-20,-30,-18,-13,-20,-11,-9,27,63,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-10,-25,-11,-6,-17,-22,-4,-8,3,-9,-2,-8,-9,-2,5,-8,-5,-4,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-2,-23,-6,0,-22,-13,-6,-22,20,-20,-8,4,-15,4,25,-1,-5,-15,-24,-13,0;
MA   /M: SY='A'; M=35,-11,-10,-20,-13,-16,-8,-21,-5,-11,-7,-7,-11,-13,-13,-18,9,9,7,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-28,-7,6,-21,-23,-10,-15,24,-10,-3,-7,-14,7,16,-13,-10,-13,-21,-8,6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,5,11,-24,-14,-4,-20,8,-18,-9,4,-12,8,7,1,-5,-16,-28,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-18,-28,-22,5,-30,-22,21,-24,28,13,-24,-26,-20,-19,-17,1,18,-22,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-31,-22,16,-29,-21,18,-28,36,15,-27,-28,-23,-20,-24,-9,12,-17,2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-24,1,5,-16,-10,-1,-23,2,-21,-14,4,-14,1,1,3,-2,-19,-20,-9,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-28,5,18,-26,-18,-5,-23,14,-19,-11,-2,-11,14,8,-4,-8,-20,-20,-12,16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-23,-19,-10,-1,-24,-15,-2,2,10,4,-16,-22,-10,1,-18,-9,-1,-17,-1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,6,-24,2,-3,-26,14,-9,-27,0,-28,-18,13,-7,-5,-5,6,-6,-24,-29,-22,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-17,-22,-16,2,-19,-18,7,-12,3,3,-13,-21,-14,-13,-9,-5,10,-18,-5,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-27,2,11,-24,-15,-11,-20,9,-20,-13,-4,10,2,0,-2,-4,-18,-26,-16,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-18,-24,-22,-11,22,-25,-6,-6,-7,-3,-1,-12,-18,-11,-1,-13,-9,-7,-5,15,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-21,-2,-1,-21,4,-11,-18,3,-19,-10,-2,-2,-2,-2,-1,-7,-14,-19,-15,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-10,4,5,-13,-11,-6,-8,-4,-5,-5,-4,-3,1,-7,-4,-5,-7,-16,-9,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-18,0,9,-15,-10,-10,-12,1,-11,-9,-5,-10,-2,-6,-1,-5,-6,-20,-12,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-18,-26,-21,10,-26,-14,20,-18,11,8,-19,-21,-17,-17,-14,-6,17,-7,13,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-23,9,24,-24,-18,3,-21,2,-15,-12,7,-9,10,-1,-3,-9,-23,-30,-15,17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-17,-33,-27,10,-32,-23,27,-25,22,13,-26,-28,-24,-22,-19,-7,25,-18,4,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-23,18,2,-21,-13,-9,-14,-7,-8,-9,1,-17,-6,-9,-5,-7,-8,-31,-15,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-25,13,-2,-22,-2,-4,-21,-8,-15,-14,6,-11,-7,-10,-2,-5,-18,-31,-15,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00173;
//
ID   COPPER_BLUE_MP; MATRIX.
AC   MP00196;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Type-1 copper (blue) proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3682981; R2=0.0148791; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=111; N_SCORE=7.010; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-11,-25,-11,2,-7,-17,-4,-11,-7,-10,-9,-13,1,-4,-13,-6,-7,-13,-9,9,-3;
MA   /M: SY='L'; M=1,-11,-20,-12,-8,-11,-18,-14,-3,-4,5,4,-12,-18,-7,-7,-8,-4,-1,-24,-9,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-18,2,-6,-13,-11,2,-11,-9,-16,-8,14,-18,-6,-9,8,4,-9,-33,-11,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-18,-4,0,-21,-6,-11,-20,3,-20,-14,5,-12,-2,1,11,10,-13,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-23,-10,-5,-17,-16,-18,-10,-5,-16,-10,-8,10,-8,-11,2,5,-7,-27,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-2,-11,-28,46,-14,-35,-14,-30,-20,7,-11,-14,-16,2,-14,-29,-25,-28,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-29,8,34,-26,-19,-3,-25,5,-20,-15,-3,8,16,-2,-2,-9,-26,-26,-16,24;
MA   /M: SY='T'; M=1,3,-16,0,-1,-17,-14,-13,-13,-2,-17,-12,3,-13,-5,-7,12,16,-4,-31,-14,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-5,-24,-4,-8,4,-21,-3,-9,-6,-9,-7,-7,-20,-8,-7,-6,-3,-8,-9,17,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-11,-3,3,-12,-8,-10,-11,-4,-15,-10,0,-9,-2,-6,15,8,-3,-25,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-10,-20,-17,-1,-19,-18,15,-13,9,6,-18,-19,-16,-11,-8,-1,22,-19,-6,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-11,-5,-3,-12,-14,-12,-11,5,-11,-7,0,-7,-3,1,8,22,-4,-19,-8,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-14,-26,-19,33,-22,-15,8,-21,16,6,-18,-21,-23,-15,-16,-6,7,-4,11,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-14,17,3,-18,-7,-6,-18,-1,-16,-14,8,-5,-2,-5,8,9,-12,-24,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-10,-8,-3,-7,-9,-9,3,-7,-4,-1,-3,-7,-2,-8,4,2,2,-14,-6,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-15,-4,0,-11,-10,-5,-10,11,-11,-2,-1,-2,1,8,-4,-2,-9,-9,-6,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-15,-11,-16,-10,6,-15,-8,9,-15,22,9,-14,-15,-10,-10,-14,-5,4,-10,1,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=1,4,-13,3,1,-14,-6,-5,-12,5,-14,-9,4,3,-1,-1,1,-1,-10,-16,-10,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=5,3,-20,3,13,-23,-14,-11,-20,4,-17,-14,-1,-7,3,-2,6,7,-14,-27,-16,8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-26,-4,-2,-23,0,-16,-20,-5,-19,-14,-8,15,-8,-12,-3,-6,-17,-24,-20,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-1,-5,-30,51,-16,-38,-14,-28,-20,1,-16,-12,-16,0,-17,-30,-23,-28,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-18,-4,-1,-18,-16,-13,-11,-3,-12,-7,-4,-5,-1,-7,6,13,-5,-27,-13,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-16,-28,-17,-14,19,-27,20,-5,-7,-5,-1,-15,-26,-4,-7,-15,-9,-12,17,59,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-8,-23,-9,-10,-6,-5,-6,-14,-8,-9,-7,-7,-19,-9,-9,-3,0,-11,-12,8,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-32,-27,54,-30,-7,3,-22,7,1,-21,-30,-28,-17,-19,-9,2,13,43,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-23,-25,-28,-22,24,-30,-9,10,-15,6,4,-19,-25,-19,-14,-17,-9,6,0,27,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-16,-2,3,-19,-5,-13,-19,-7,-19,-15,4,-10,-2,-10,18,20,-11,-31,-17,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-15,-9,-18,-15,20,-16,-12,8,-13,5,3,-12,-15,-17,-11,-8,-3,11,-3,8,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-2,-30,-10,-20,-22,-11,-30,-20,-18,78,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-28,0,-6,-24,15,37,-33,-11,-24,-10,6,-18,-3,-7,-4,-15,-28,-26,-4,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-24,-2,3,-20,-16,54,-23,-1,-17,-2,5,-15,14,6,-5,-13,-23,-23,7,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-23,-10,-11,-17,19,-14,-21,-11,-18,-11,-3,-16,-8,-9,1,-9,-17,-14,-15,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,-16,-17,-10,-13,-7,-15,-6,-12,-7,-3,-8,-6,-8,-16,4,1,-3,-24,-15,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-27,-16,-20,-15,38,-17,-22,-20,-12,-4,-6,-22,-18,-18,-7,-16,-18,-19,-19,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-22,-25,-13,-7,-20,2,13,-6,13,49,-16,-18,11,-6,-16,-10,3,-20,-2,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-9,-24,-10,-4,-17,-23,-13,-10,21,-16,-4,-7,-18,-2,15,-9,-7,-1,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-15,-26,-16,-21,-20,39,-20,-20,-21,-12,-8,-8,-22,-19,-20,-6,-16,-14,-21,-22,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-19,-7,0,-18,-17,-11,-15,8,-14,-8,-3,-12,-1,1,5,10,-7,-27,-11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-17,-9,-8,-14,-20,-15,-4,-2,-11,-6,3,-15,-6,-5,5,18,0,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-12,-30,-27,1,-29,-28,27,-22,18,11,-29,-29,-27,-20,-13,-2,40,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,-1,4,-22,-8,-10,-15,3,-16,-9,1,-15,1,-2,-1,-4,-9,-27,-16,2;
MA   /M: SY='D'; M=2,11,-24,17,4,-28,0,-11,-24,-7,-22,-19,3,-3,-7,-14,4,-6,-17,-31,-21,-2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-16,-13,-7,-22,4,-15,-19,-2,-18,-13,-3,-12,-5,-4,11,-1,-9,-24,-19,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-25,-2,-4,-25,9,-11,-25,-8,-29,-19,8,10,-6,-8,11,-1,-23,-32,-24,-7;
MA   /M: SY='A'; M=22,-2,-18,-4,-2,-25,13,-15,-22,-10,-20,-16,-2,-11,-7,-16,10,-4,-13,-25,-22,-4;
MA   /M: SY='N'; M=5,13,-14,1,-4,-17,-6,-7,-16,-6,-21,-16,22,-14,-4,-8,19,19,-13,-34,-17,-4;
MA   /M: SY='L'; M=4,-20,-19,-21,-19,-8,2,-21,-1,-21,8,1,-16,-23,-19,-19,-7,-7,4,-24,-14,-19;
MA   /M: SY='D'; M=1,10,-24,15,8,-29,15,-10,-31,-7,-26,-21,6,-11,-4,-12,9,-6,-23,-31,-23,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00174;
//
ID   2FE2S_FER_1_MP; MATRIX.
AC   MP00197;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   2Fe-2S ferredoxins, iron-sulfur binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8041449; R2=0.0109195; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=431; N_SCORE=6.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=339; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-40; I=-40; B1=-200; E1=-200; MI=-35; MD=-35; IM=-35; DM=-35;
MA   /I: B1=0; BI=-35; BD=-35;
MA   /M: M=-6,-10,-23,-11,-7,-8,-16,-2,-10,-7,-10,-2,-8,-4,-5,-8,-6,-5,-10,-18,0,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-1,6,-22,-16,-6,-19,11,-18,-9,1,-8,6,7,-1,-1,-15,-26,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-19,-33,-27,3,-32,-27,31,-24,17,13,-24,-24,-24,-23,-16,-5,31,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-18,-7,-2,-14,-19,-10,-12,1,-13,-8,-1,-14,-3,2,4,12,-6,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-28,-20,-33,-25,21,-31,-22,20,-25,20,11,-23,-26,-25,-19,-19,-8,17,-13,7,-25;
MA   /M: M=-7,-8,-22,-11,-5,-8,-21,-9,-4,-6,-5,-3,-6,-16,-5,-6,-5,-1,-4,-18,-3,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-13,-24,-15,-12,-7,-20,-14,1,-13,-4,-2,-10,-8,-12,-11,-8,-4,1,-22,-8,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,11,-24,9,6,-19,-10,3,-20,2,-21,-14,13,-4,3,1,-1,-6,-22,-22,-10,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-20,15,3,-22,7,-5,-23,-2,-19,-14,7,-8,-2,-4,1,-7,-18,-22,-15,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-17,-1,5,-14,-10,-4,-12,3,-11,-6,-1,-8,4,3,0,-1,-10,-17,-8,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-21,-2,-2,-18,7,-11,-19,-6,-16,-11,-1,-11,-5,-6,0,-4,-14,-21,-15,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-25,-9,-2,-11,-20,-2,-10,3,-10,-4,-7,-17,0,5,-8,-6,-8,-18,1,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-20,-4,5,-16,-18,-11,-13,-3,-13,-10,-4,-8,0,-4,4,8,-8,-27,-12,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-19,-29,-23,14,-28,-19,16,-21,12,8,-21,-25,-22,-18,-15,-5,16,-14,7,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-25,12,18,-23,-15,-4,-22,2,-19,-15,2,-5,5,-2,2,-2,-19,-29,-14,11;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,1,-25,-22,-7,-18,-24,7,-19,1,0,-20,-23,-21,-20,-5,-2,18,-27,-13,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,9,10,-26,-12,-7,-22,0,-22,-16,1,8,2,-4,0,-5,-21,-29,-18,4;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-2,-26,2,8,-24,-13,-11,-19,-3,-19,-14,-4,11,-2,-8,-1,-5,-17,-28,-19,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-26,8,-4,-28,25,-9,-33,-8,-27,-19,7,-15,-8,-9,2,-11,-25,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,6,13,-23,-14,-6,-19,1,-15,-10,0,-9,6,-2,1,0,-16,-28,-14,9;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-17,-7,-6,-10,-15,-9,-10,-7,-11,-6,1,-11,-5,-7,10,17,-7,-26,-6,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-32,-25,5,-32,-24,29,-26,29,18,-27,-27,-22,-22,-22,-7,24,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-18,-29,-20,6,-28,-19,18,-26,38,19,-26,-28,-18,-18,-25,-9,10,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-27,27,19,-29,-13,1,-28,2,-23,-18,8,-10,8,-1,1,-6,-24,-28,-13,13;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-13,-21,-15,-7,-10,-18,-2,-14,-3,-4,-13,-17,-14,-17,0,-1,5,-18,-8,-14;
MA   /M: SY='L'; M=12,-21,-11,-26,-17,-4,-16,-20,6,-21,16,7,-19,-21,-16,-20,-11,-6,6,-21,-9,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-25,-10,1,-13,-21,-4,-8,-1,-2,-1,-6,-18,0,8,-10,-8,-8,-23,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-26,5,13,-23,-14,-3,-24,11,-19,-13,2,-12,8,13,-1,-7,-20,-24,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=1,-1,-22,-6,-1,-18,-15,0,-8,-5,-9,-5,4,-16,3,-6,-2,-5,-10,-26,-10,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-26,0,-8,-27,35,-10,-33,-10,-28,-19,7,-16,-9,-10,4,-11,-26,-26,-23,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-21,-30,-22,4,-31,-21,24,-23,23,14,-23,-25,-19,-19,-19,-7,19,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-23,9,7,-20,-14,-7,-21,-2,-19,-15,2,-4,-2,-5,2,1,-17,-26,-12,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-21,-29,-22,9,-28,-19,16,-22,15,9,-19,-21,-19,-18,-15,-2,12,-17,3,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-31,-4,5,-23,-18,-9,-21,6,-21,-12,-9,23,-1,5,-7,-9,-21,-26,-17,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-12,-23,-14,-10,-2,-14,4,-12,-7,-9,-5,-8,-19,-7,-2,-6,-6,-10,-12,8,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-20,-4,-5,-16,7,-13,-18,-12,-17,-13,1,-14,-8,-13,9,-2,-13,-27,-17,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-27,-4,0,-20,2,-3,-27,5,-19,-12,-1,-18,0,15,-5,-11,-21,-19,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='E'; M=1,0,-19,-1,6,-17,-7,-3,-14,-3,-12,-7,0,-11,1,-5,1,-4,-12,-23,-11,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-28,-10,-18,-29,61,-19,-37,-19,-29,-19,0,-18,-18,-19,3,-16,-27,-21,-29,-18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-17,-12,-9,-17,-5,-15,-6,-11,-11,-6,-4,-16,-7,-13,4,0,-2,-26,-15,-9;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-24,-8,-12,-24,33,-14,-30,-11,-25,-16,1,-17,-12,-9,6,-7,-20,-24,-22,-13;
MA   /M: SY='T'; M=11,-5,-12,-11,-7,-15,-12,-16,-9,-10,-11,-7,-3,-12,-5,-11,15,20,-1,-29,-14,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,114,-26,-28,-21,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-18,-39,-29,-29,-10,-10,-11,-50,-30,-28;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=3,-9,-20,-13,-8,-15,-10,-1,-12,-4,-9,-4,-6,-16,-5,-2,-1,0,-7,-23,-8,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-7,-27,-25,-3,-23,-23,17,-18,7,11,-23,-26,-22,-18,-11,-4,28,-27,-10,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-24,-8,0,-11,-22,-4,-6,0,-4,0,-5,-18,-1,2,-9,-7,-7,-22,-3,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-33,-28,1,-32,-27,32,-24,16,14,-25,-26,-24,-23,-15,-5,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-22,12,6,-21,-12,-6,-17,-3,-15,-13,9,-14,-1,-4,1,-2,-14,-31,-15,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-27,3,1,-28,23,-10,-32,-5,-26,-18,3,-11,-5,-8,3,-10,-25,-26,-22,-2;
MA   /I: I=-3; MD=-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-17,-4,-5,-13,16,-8,-16,-8,-12,-9,-1,-9,-7,-8,-1,-7,-13,-12,-10,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-2;
MA   /M: M=-4,-1,-15,0,0,-7,-8,-4,-9,-4,-8,-6,-2,-9,-2,-5,-2,-3,-8,-9,-4,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-2;
MA   /M: M=-4,-5,-13,-4,-4,-5,-10,-6,-2,-6,-4,-3,-6,-7,-6,-7,-5,-4,-1,-11,-1,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-2;
MA   /M: SY='D'; M=-4,6,-12,8,7,-13,-7,0,-12,0,-10,-7,3,-5,3,-1,1,-2,-10,-16,-7,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-11,-5,-1,-8,-9,-3,-4,-2,-2,-1,-4,-7,1,-2,-3,-3,-5,-12,-4,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
MA   /M: M=-1,-5,-10,-5,-2,-4,-7,-5,-3,-5,-1,0,-4,-7,-3,-5,-1,-1,-3,-12,-4,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: M=-2,-3,-11,-4,-4,-1,-6,-3,-6,-7,-2,-3,-4,-9,-6,-7,-3,-3,-4,-10,-2,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-8,-11,-7,-6,-2,-9,-8,1,-8,7,2,-8,-11,-7,-6,-8,-5,0,-11,-4,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-11,-2,-1,-8,-6,-7,-8,-4,-8,-5,-1,-5,-3,-5,4,2,-5,-15,-8,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='D'; M=-1,0,-14,1,0,-9,-8,-5,-10,-3,-8,-7,-3,-6,-4,-5,-2,-3,-8,-11,-6,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='D'; M=-3,3,-17,4,3,-15,2,-5,-17,0,-14,-10,1,-6,-1,-2,-1,-6,-14,-15,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-15,5,12,-15,-8,0,-13,3,-9,-7,0,-4,7,1,-1,-5,-12,-15,-8,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-10,-14,-11,-6,-4,-13,-8,2,-5,4,3,-9,-12,-5,-1,-8,-4,2,-13,-4,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-15,1,7,-16,-9,-5,-14,2,-12,-9,-1,-2,3,0,2,-1,-11,-17,-11,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-19,3,9,-18,-10,-1,-16,2,-14,-9,-1,1,6,1,-1,-5,-15,-18,-10,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-24,-5,-4,-21,9,-9,-26,1,-22,-13,2,-16,-4,2,-1,-7,-20,-22,-15,-5;
MA   /M: M=-4,-8,-22,-10,-8,-6,-14,-8,-10,-9,-12,-9,-3,-9,-8,-9,-1,-2,-11,-14,-1,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-16,-18,-18,-12,-12,-19,-15,-3,0,-6,-1,-12,-20,-8,10,-6,-2,6,-24,-10,-12;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-19,-18,-22,-15,0,-24,-15,7,-18,26,10,-17,-22,-13,-10,-19,-7,1,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-12,-13,-9,-17,0,-17,-13,-12,-13,-11,-4,-11,-9,-16,15,8,-5,-27,-18,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-12,-19,-15,-4,-17,-22,-9,-2,-5,-2,3,-10,-18,10,-3,-6,-3,-3,-24,-9,2;
MA   /M: SY='T'; M=5,-12,-9,-19,-14,-9,-19,-18,1,-13,-2,0,-10,-17,-11,-14,3,12,6,-26,-10,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-14,-25,-15,-8,-5,-22,-8,-7,-3,-5,-3,-11,-6,-7,0,-11,-6,-8,-16,1,-9;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-20,-24,-18,-9,-23,-23,10,-18,4,4,-22,2,-18,-20,-10,-4,12,-25,-13,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-5,-16,-7,-3,-17,-14,-10,-15,0,-14,-8,-3,-14,-2,2,1,2,-9,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-21,9,8,-26,-4,-6,-24,-2,-24,-16,6,-7,3,-6,11,3,-19,-31,-18,5;
MA   /I: I=-7; MD=-6;
MA   /M: M=-1,-5,-6,-5,-2,-4,-9,-6,-3,-6,0,-2,-6,-9,-5,-7,-4,-3,-1,-12,-4,-4; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-28,21,1,-31,20,-8,-35,-7,-28,-22,10,-10,-7,-12,1,-12,-28,-30,-23,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-5,-23,-17,-6,-22,-16,6,-16,9,11,-17,-23,-13,-14,-12,-5,7,-25,-9,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-18,-7,0,-15,-19,-11,-8,0,-11,-7,-5,-15,-4,-1,1,4,-1,-27,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-28,3,-34,-28,35,-25,19,15,-25,-25,-24,-24,-17,-6,34,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-24,1,12,-18,-20,-3,-17,3,-13,-9,-3,-12,4,3,-1,1,-13,-25,-8,7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-17,-19,-15,-5,-24,-21,4,-15,1,-1,-13,-9,-15,-15,0,15,7,-24,-8,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-26,-10,-5,-14,-20,-6,-5,-10,-6,-3,-9,1,-6,-10,-8,-6,-7,-26,-10,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-26,3,14,-22,-14,-7,-21,1,-19,-14,-2,4,3,-4,0,-4,-19,-26,-14,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-27,-1,4,-19,-1,-4,-21,-5,-17,-11,-2,-8,-2,-7,-3,-7,-19,-20,-10,0;
MA   /M: M=-7,-9,-23,-9,-3,-12,-19,-11,-6,-8,-3,-1,-9,-8,-5,-6,-6,-3,-6,-24,-9,-5;
MA   /I: E1=0; IE=-35; DE=-35;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo,B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00175;
//
ID   4FE4S_FERREDOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00198;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   4Fe-4S ferredoxins, iron-sulfur binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6865614; R2=0.0079734; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1146; N_SCORE=9.820; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=730; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-20; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=10,-73,-24,-27,10,-2,-1,26,-26,2,30,-35,4,-30,29,-40,10,-9,-69,20;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-27,-61,12,-25,-2,-6,13,28,3,-6,6,-1,38,-14,-29,-16,-15,-8,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='I'; M=-35,-75,13,-4,-24,-2,-63,34,24,-13,-6,-1,-41,12,-26,9,10,-14,-9,13; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-75,26,-3,-16,3,-26,3,19,-26,-27,13,29,-4,11,-18,26,-25,-79,-65; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='D'; M=1,-27,45,38,-28,-12,-60,-23,22,-43,-28,19,-10,-52,-25,1,6,-1,-81,-36; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-29,53,30,-69,-20,-61,-3,-20,1,-63,7,-42,-16,-2,-7,-27,-26,-81,12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-86,6,5,0,-9,16,-11,9,-30,-70,-3,-81,-65,19,-34,-11,-29,-11,-37; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-29,-15,26,-14,-74,-7,12,10,-31,30,-2,-24,23,-1,-22,-17,0,-10,13; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-76,-10,-22,28,-42,15,10,3,-8,-7,-68,11,-38,-68,-9,-28,36,-73,13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='K'; M=-21,-10,-13,-40,-94,-50,-37,-21,13,-69,-37,-85,-53,-46,-84,-21,-15,-11,-15,-25; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='I'; M=-23,-81,27,-1,2,-59,-74,44,-17,-23,-57,-26,4,-70,-74,-49,-43,27,-11,12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-22,-79,67,-26,-72,-2,17,-17,-21,-17,-30,41,-74,-34,-29,-43,-18,-14,30,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-79,-27,38,-5,-41,-67,-13,-45,13,5,-13,31,-7,-30,-8,-28,8,-10,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='D'; M=0,-80,61,44,-70,-20,-6,-54,-29,-59,-32,7,-70,-31,-63,8,-41,-54,51,30; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-12; IM=-12; DM=-12;
MA   /M: SY='K'; M=-36,-75,8,32,-14,2,-58,-44,38,16,15,-10,-69,12,24,-30,-27,-18,-72,5;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='I'; M=-19,-70,-28,-14,-37,-40,-8,47,-32,2,31,5,-70,-63,-30,-20,47,31,-79,-33;
MA   /M: SY='G'; M=1,-27,8,11,14,41,-61,-64,0,4,-27,35,-69,-33,-42,-18,18,-36,-73,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=15,-74,7,-4,-69,52,-25,-70,18,-28,29,13,-69,-5,10,-18,-40,-50,-9,12;
MA   /M: SY='C'; M=23,47,-16,-12,-12,-68,-62,5,-20,9,-6,22,-72,-6,4,0,10,1,-73,19;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='Y'; M=9,-72,-40,34,-36,-29,-7,21,-42,-3,24,-23,-70,4,-28,13,-25,27,-70,35;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-74,13,32,-26,-50,-6,-7,-11,-10,-26,-1,28,23,-16,0,26,0,-10,-17;
MA   /M: SY='V'; M=30,-71,-65,10,3,-50,-8,10,-29,-17,-6,-23,-2,3,14,4,-15,34,-74,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='P'; M=-65,-90,-64,2,-86,-13,-69,-75,-61,-84,-71,-71,123,-64,-74,-62,-59,-79,-79,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-70,-24,15,3,-67,-25,-13,-18,-48,5,18,-40,-5,19,21,45,15,-10,13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-26,-75,30,20,-44,43,-5,-75,15,-59,-67,52,-40,5,-7,-18,-26,-41,-74,24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=57,19,-80,-74,-44,-13,-33,7,-74,-15,-62,-73,-45,-40,-78,-7,-42,4,65,-68; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-50,-78,24,-45,-21,-78,-69,66,12,11,-4,-13,18,-63,-18,-67,-41,-16,65,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-34,-72,-24,25,-24,-69,-61,38,10,-18,-24,12,-11,-16,-16,34,19,-3,-74,13;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-74,-17,10,-4,-14,16,18,-44,4,42,-39,42,-18,-19,-31,-2,25,-75,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,-76,47,46,-47,3,17,-18,22,-72,-67,8,-38,6,-24,5,5,-38,30,-64;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-76,8,30,-5,-2,-62,-2,28,-20,-8,-35,13,5,1,0,-16,-11,16,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-35,-75,14,24,12,-13,-5,15,-20,-6,8,-21,-41,-16,-16,5,-39,21,18,37; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-25,-76,-3,35,-39,5,9,5,24,1,8,-19,22,-2,-37,-18,7,-44,34,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-80,-3,15,-1,14,-64,-5,18,-31,-63,-36,-21,7,9,-29,-26,-16,20,35; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-43,-29,-49,-12,-14,-44,36,-74,-13,-28,-76,-45,28,-80,-31,-81,-31,14,-96,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=47,-22,-2,0,-20,-7,-66,22,5,4,-1,-18,-19,-59,-13,-25,-36,-10,-4,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-24,18,7,-25,8,-65,-12,20,-32,-65,4,18,-29,36,-40,9,-15,-5,-68; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-61,20,8,20,9,-7,18,8,-9,-24,-7,23,-71,5,36,-12,-8,-5,-74,6;
MA   /I: I=-6; E1=0; MI=-32; IE=-32; DE=-32;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00176;
//
ID   FLAVODOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00201;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Flavodoxin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0482135; R2=0.0144330; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=343; N_SCORE=8.998; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=7,-7,-20,-10,-1,-22,-10,-7,-21,9,-19,-11,-1,-14,8,22,6,-2,-13,-24,-15,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,7,-26,12,13,-22,-16,5,-21,1,-20,-11,2,-13,20,-2,3,-5,-23,-19,2,15;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-27,-39,-29,-21,1,-20,-23,-20,-9,-18,-16,-25,-24,-13,-2,-23,-11,-23,86,15,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-17,26,-20,-19,-13,-5,-21,-16,-24,-4,-9,-13,-27,-19,-21,-4,-6,-8,-34,-19,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-9,-28,-11,2,-24,-14,-7,-19,3,-20,-9,-8,-14,21,-1,-3,-9,-21,10,-5,12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-6,-19,-11,1,-26,5,-13,-18,-6,-16,-11,-6,-10,4,-13,6,-6,-13,-21,-20,2;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-22,-21,-9,-9,-20,1,9,-6,10,42,-15,-17,11,-6,-14,-7,1,-21,-3,1;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-19,-9,-4,-23,3,-15,-19,-3,-20,-14,-1,-5,-5,-10,9,2,-13,-25,-20,-5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-24,-1,3,-23,-16,-8,-21,28,-23,-8,6,-12,5,18,-3,-2,-15,-23,-11,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-18,-31,-25,-2,-29,-26,29,-22,12,14,-21,-22,-20,-22,-10,-1,30,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-15,-22,-17,-14,-14,15,-19,-13,-18,0,-5,-11,-20,-15,-17,-6,-8,-10,-21,-17,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,35,-29,30,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-19,-36,-29,36,-32,-24,19,-28,18,9,-24,-28,-31,-22,-19,-8,19,-9,11,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,49,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,61,-24;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-25,-7,-14,-23,30,-19,-28,-15,-24,-18,-4,-18,-15,-18,3,-9,-19,-9,-20,-14;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='S'; M=3,5,-21,4,-1,-24,-4,-8,-20,-1,-18,-9,3,-13,2,-2,6,2,-14,-27,-16,0;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-1,-16,-7,-9,-5,-21,-6,-11,-9,-10,-9,-2,-14,-8,-10,11,32,-5,-20,7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-23,-11,-20,-30,66,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-21,-20,-20,0,-20,-29,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,22,-21,9,0,-20,-7,8,-19,4,-25,-14,34,-18,4,2,6,-1,-23,-31,-12,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-26,4,27,-26,-13,-5,-26,10,-19,-15,-1,-7,11,11,1,-6,-21,-26,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-23,-6,3,-18,-16,-11,-15,8,-16,-7,0,-12,2,3,1,6,-12,-19,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-19,-31,-24,0,-28,-21,27,-21,19,23,-23,-23,-17,-20,-16,-6,24,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-28,12,25,-29,-17,4,-28,17,-24,-14,7,-9,18,12,0,-8,-26,-28,-14,21;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,-13,-19,-11,-5,-18,-14,-2,-11,4,2,-14,-19,-8,-13,-6,-2,0,-19,-3,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-21,-8,4,-24,-6,3,-19,0,-16,-9,-4,-12,6,-3,1,-8,-14,-23,-13,4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-28,10,19,-30,-17,-4,-27,20,-23,-13,2,-9,15,14,-2,-8,-22,-26,-14,16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-26,-6,-3,-22,15,-12,-22,-8,-17,-10,-4,-15,-5,-10,-2,-10,-17,-21,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-20,-32,-23,14,-28,-22,20,-27,28,14,-24,-26,-22,-22,-20,-8,14,-16,2,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-24,-3,-4,-24,10,-13,-22,-2,-19,-11,1,-15,-5,-6,0,-5,-15,-25,-18,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-18,6,13,-20,-4,-5,-19,4,-17,-12,2,-7,4,0,3,-4,-14,-21,-14,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=5,1,-22,0,3,-22,-2,-12,-18,-5,-15,-13,2,-9,-5,-10,4,-3,-14,-28,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-25,-11,-15,-19,21,-18,-14,-18,-10,-6,-5,-20,-16,-18,-5,-13,-10,-23,-19,-16;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-17,-15,-16,-10,-21,-13,9,-14,-2,3,-13,-20,-15,-16,-3,-1,17,-27,-8,-16;
MA   /M: SY='D'; M=1,12,-20,15,15,-28,-12,-6,-24,3,-21,-16,5,-10,6,-3,4,-2,-19,-30,-17,10;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-16,-27,-22,-4,-25,-25,18,-19,9,7,-25,-13,-22,-20,-11,-2,26,-27,-11,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,5,-25,8,7,-18,-19,5,-18,1,-14,-9,3,-15,2,2,-4,-5,-15,-27,-6,4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-20,7,-5,-15,-15,-11,-8,-11,-5,-8,3,-18,-9,-10,0,1,-5,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-22,-29,-22,5,-30,-21,19,-15,10,8,-20,-23,-19,-13,-15,-7,19,-17,2,-22;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00178;
//
ID   RUBREDOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00202;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rubredoxin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6851888; R2=0.0124323; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=10.705; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,83,-18,-8,-22,-28,-23,-30,-20,-20,-20,-15,-30,-18,-23,-8,-10,-15,-45,-28,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-30,-11,-18,-25,55,-16,-37,-15,-27,-18,-1,-21,-17,-11,-2,-18,-28,-17,-21,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-30,39,16,-30,-14,-6,-27,-3,-22,-22,7,-11,-1,-12,-4,-11,-23,-21,-14,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-21,-5,5,-25,-20,-13,-21,-6,-24,-17,-14,44,-4,-14,-8,-9,-25,-26,-19,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-25,13,2,-21,-10,-3,-20,-1,-17,-13,0,-17,-4,-1,-4,-8,-10,-29,-13,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-10,0,-30,-1,2,-15,-9,-4,-23,-4,-21,-16,1,-10,-2,-5,-6,-8,-24,3,-2,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-27,-2,-3,-29,19,-7,-26,-6,-21,-11,3,-16,8,-7,1,-12,-25,-23,-19,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-33,-24,10,-34,-26,31,-24,13,11,-21,-23,-23,-24,-15,-6,26,-19,0,-25;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-27,-8,-1,-22,-9,-2,-18,-8,-18,-12,-6,19,-5,-12,-2,-6,-19,-27,-17,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=2,-12,-30,-6,-1,-26,-14,-17,-18,-9,-23,-17,-14,56,-9,-18,-5,-7,-21,-26,-25,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-29,1,-8,-29,49,-14,-37,-14,-29,-21,8,-18,-13,-15,1,-16,-30,-24,-27,-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-12,-11,-12,-11,-13,-21,-10,-11,-10,-10,-2,-12,-12,-11,17,41,1,-29,-12,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-29,-5,5,-27,-15,-14,-22,3,-27,-17,-8,33,-1,-3,2,-4,-21,-29,-22,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-32,-25,-40,-30,67,-28,-22,-4,-28,5,-4,-24,-30,-36,-20,-24,-14,-5,35,30,-28;
MA   /M: SY='E'; M=0,16,-23,19,26,-27,-11,-3,-25,1,-22,-19,11,-7,7,-6,7,-3,-23,-32,-19,16;
MA   /M: SY='D'; M=2,20,-23,26,9,-28,-9,-6,-23,-4,-17,-17,8,-12,0,-11,2,-6,-18,-31,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-36,-7,5,-29,-19,-18,-20,-8,-28,-20,-16,72,-7,-17,-5,-6,-28,-31,-28,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-3,20,-26,29,26,-30,-13,-5,-28,3,-20,-20,5,-7,5,-7,0,-8,-22,-31,-19,15;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-28,43,12,-33,-4,12,-35,-3,-28,-23,20,-13,0,-8,1,-9,-29,-36,-15,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,2,-18,-14,-13,-23,-11,-6,-5,-9,-3,-13,-24,-12,2,-5,-3,7,-30,-12,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,4,-22,5,-5,-16,-19,-9,-6,-7,-5,-6,2,-20,-6,-3,-6,-4,-3,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,3,-29,7,-11,-32,49,-16,-38,-15,-29,-22,4,-17,-15,-18,1,-17,-28,-24,-27,-13;
MA   /M: SY='A'; M=24,-18,-12,-23,-19,-13,-5,-24,3,-15,-4,-3,-17,-19,-19,-20,1,-2,17,-24,-17,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-27,3,-1,-26,9,-13,-28,-5,-24,-18,-1,2,-6,-5,2,-6,-22,-28,-22,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-29,-2,8,-29,-19,-9,-29,44,-28,-10,0,-11,11,31,-9,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-22,15,18,-23,-15,-8,-19,0,-16,-15,2,-11,1,-6,4,-2,-12,-32,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-27,20,21,-29,-15,1,-25,6,-21,-13,4,-9,18,-1,0,-8,-24,-26,-11,19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-38,-29,72,-30,-19,2,-29,13,2,-21,-30,-37,-20,-21,-10,0,8,29,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-7,-24,-7,13,-17,-22,-7,-3,-2,-6,5,-8,-12,7,-5,-4,-5,-5,-26,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-25,-9,-6,-13,-20,-15,-8,-2,-11,-4,-13,5,-8,-4,-8,-6,-3,-25,-13,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-19,-19,-22,-15,-2,-23,-14,11,-17,10,9,-17,-21,-10,-16,-8,-2,10,-19,1,-14;
MA   /M: SY='E'; M=5,6,-24,10,16,-28,2,-10,-27,-4,-22,-19,1,-2,0,-11,6,-6,-21,-29,-22,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-26,28,19,-30,-11,-7,-26,-2,-22,-20,3,-4,0,-10,1,-7,-18,-33,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-1,-26,2,4,-26,-9,-12,-23,-2,-24,-16,-2,16,1,-8,6,5,-21,-30,-20,1;
MA   /M: SY='A'; M=5,-10,-24,-9,-7,-18,-8,-14,-14,-6,-6,-8,-10,-3,-8,-2,-6,-8,-11,-23,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,37,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00179;
//
ID   METALLOTHIONEIN_VRT_MP; MATRIX.
AC   MP00203;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Vertebrate metallothioneins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5598006; R2=0.0032960; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2356; N_SCORE=11.325; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=893; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-28,66,19,-38,-9,0,-38,0,-28,-28,19,-9,0,-9,0,-9,-28,-38,-19,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-36,-9,0,-28,-18,-18,-19,-9,-28,-19,-17,80,-9,-18,-7,-8,-27,-29,-28,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-8,24,-16,23,9,-19,-6,1,-19,0,-19,-16,23,-9,1,-3,5,1,-19,-27,-13,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-21,4,12,-23,-12,-11,-20,-3,-23,-17,0,5,1,-8,13,8,-15,-33,-19,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-16,-12,-4,-19,-7,-15,-11,-9,-15,-8,-7,3,-5,-15,11,4,-6,-27,-19,-5;
MA   /M: SY='T'; M=7,-2,-16,-8,-3,-19,-14,-16,-17,7,-18,-11,-1,-9,-3,0,12,20,-7,-27,-13,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-24,-6,-15,-25,39,-19,-31,-15,-24,-17,1,-17,-16,-15,6,0,-21,-24,-24,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-28,-2,-13,-30,52,-17,-36,-16,-28,-20,1,-18,-16,-18,1,-16,-26,-23,-28,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-13,-6,-5,-16,-9,-14,-11,-10,-20,-14,5,-11,-4,-11,27,23,-5,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=2,7,-14,-3,-6,-15,-9,-9,-11,-8,-18,-11,16,-13,-5,-9,18,20,-9,-33,-15,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=19,-9,-20,-13,-13,-24,31,-19,-25,-15,-22,-16,-3,-14,-14,-18,9,-5,-15,-23,-24,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-25,8,-8,-28,32,-14,-33,-13,-27,-21,6,-15,-12,-15,6,-5,-24,-27,-24,-10;
MA   /M: SY='S'; M=5,6,-13,2,0,-20,-3,-8,-19,-7,-28,-19,15,-8,-1,-8,30,18,-13,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-24,-3,4,-25,-15,-13,-25,29,-25,-11,1,-10,4,16,1,5,-15,-24,-12,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-22,-1,10,-23,-18,-12,-23,22,-23,-12,0,-9,4,10,4,9,-14,-26,-12,7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,22,-22,13,7,-23,0,0,-23,0,-25,-18,30,-15,2,-3,7,0,-25,-33,-19,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-24,-1,5,-25,-14,-7,-25,24,-26,-12,5,-12,9,21,4,-1,-18,-26,-13,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-16,-8,-5,-16,-18,-16,-15,3,-15,-10,0,-9,-3,-1,12,29,-6,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-6,-3,-3,-18,-6,-13,-18,-9,-25,-18,7,-11,-3,-10,32,24,-8,-38,-18,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,1,-12,10,35,-9,-9,-20,-21,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-11,0,-1,-20,3,-10,-21,-10,-30,-20,10,-10,-1,-10,38,18,-11,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-18,0,2,-23,-6,-12,-21,-9,-29,-20,3,12,-2,-12,26,12,-15,-37,-22,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-14,-15,-10,-17,-8,-18,-6,-12,-14,-9,-9,-4,-11,-17,13,5,3,-29,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-4,-5,-29,50,-16,-37,-14,-28,-20,1,-16,-12,-16,2,-16,-29,-23,-28,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=20,-2,-15,-5,5,-21,-5,-13,-17,-7,-19,-16,0,-5,-2,-12,18,8,-10,-30,-20,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,1,9,-29,-19,-8,-29,46,-30,-11,4,-11,9,29,-9,-9,-21,-21,-11,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-18,-10,-21,4,-19,-13,-11,-13,-12,-8,-11,-10,-19,12,1,-3,-22,-21,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00180;
//
ID   FERRITIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00204;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ferritin iron-binding regions signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1911502; R2=0.0156519; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=853; N_SCORE=18.532; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-20,18,0,-19,0,9,-20,-1,-30,-20,56,-20,0,-1,11,1,-29,-39,-18,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-29,4,28,-35,-19,4,-22,11,-20,-6,-1,-7,42,6,0,-9,-27,-23,-13,35;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,-17,-5,2,-24,-7,-11,-20,8,-24,-13,1,-10,5,1,15,4,-12,-28,-16,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-21,9,-30,-21,21,-30,48,20,-30,-30,-20,-20,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-19,8,-29,-15,18,-27,45,22,-28,-29,-17,-17,-28,-10,8,-20,0,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-27,39,22,-30,-11,6,-31,3,-27,-23,24,-11,5,-4,2,-7,-29,-36,-16,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,8,-30,-21,23,-28,42,21,-29,-29,-20,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-29,-3,-2,-17,-21,86,-25,-10,-17,1,6,-21,8,-1,-10,-18,-24,-28,19,-2;
MA   /M: SY='K'; M=9,-2,-21,-4,7,-25,-7,-11,-23,12,-23,-13,-1,-10,4,3,7,-1,-15,-25,-17,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-28,-24,1,-30,-25,23,-19,21,12,-27,-28,-23,-17,-17,-5,30,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-8,-18,-13,-22,13,-20,-17,-13,-15,-13,-8,-13,-13,-20,8,-4,-7,-22,-22,-13;
MA   /M: SY='S'; M=1,5,-16,5,6,-20,-12,-12,-18,-3,-21,-16,4,-10,-2,-7,18,17,-9,-34,-16,2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-27,21,16,-29,-14,-4,-31,15,-24,-18,5,-11,6,15,-2,-8,-22,-28,-16,10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,11,-22,6,7,-24,-14,20,-27,14,-26,-12,19,-16,7,12,-2,-9,-25,-30,-8,6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-21,4,-6,-21,6,-6,-21,-1,-24,-15,20,-18,-6,0,5,0,-18,-31,-19,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=0,-19,-29,-15,-7,-22,-19,-21,-10,-12,-18,-13,-19,50,-13,-19,-6,-3,-12,-28,-24,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-29,0,8,-26,-19,63,-26,-3,-19,-1,6,-16,24,2,-6,-16,-28,-26,7,13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,13,-29,-17,19,-27,42,25,-27,-28,-18,-19,-27,-10,10,-18,2,-19;
MA   /M: SY='C'; M=8,-13,53,-23,-19,-19,-20,-24,-19,-19,-15,-14,-13,-25,-18,-22,1,4,-5,-37,-22,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,40,-30,55,16,-36,-12,21,-38,-2,-28,-24,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-12,8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-39,-30,72,-31,-19,4,-29,10,1,-20,-29,-37,-20,-20,-10,2,9,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,31,-29,35,19,-27,-27,-21,-23,-24,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,20,56,-29,-19,1,-29,9,-21,-20,4,-1,19,0,1,-9,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='S'; M=1,4,-15,0,-1,-20,-5,4,-20,-8,-25,-15,13,-13,2,-7,23,15,-15,-35,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,6,-29,11,33,-25,-19,28,-27,3,-20,-13,5,-5,13,-1,-3,-12,-28,-29,-7,21;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-16,-30,-26,52,-30,-3,-2,-21,4,-1,-20,-31,-26,-16,-19,-10,-5,15,49,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-26,21,19,-27,-6,10,-29,-1,-24,-18,11,-11,4,-5,2,-8,-25,-31,-14,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,14,50,-29,-21,-2,-24,9,-18,-16,-1,-2,19,0,-2,-10,-26,-28,-18,34;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,2,-29,3,26,-38,-19,8,-22,9,-20,-4,0,-8,52,8,1,-9,-29,-22,-12,39;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-12,-27,-25,-3,-27,-28,25,-19,7,8,-27,-28,-27,-19,-9,-1,43,-29,-11,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,15,27,-31,-17,-4,-30,24,-26,-16,3,-7,14,11,-1,-8,-24,-27,-15,20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-13,-14,-9,-14,-9,-17,-5,-14,-6,-7,-6,-14,-9,-16,13,8,0,-28,-15,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-38,-28,1,-37,-26,44,-28,23,25,-21,-21,-18,-27,-21,-10,26,-20,0,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-29,2,9,-29,-18,-8,-29,45,-30,-11,6,-11,9,27,-8,-9,-21,-22,-11,9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,4,23,-29,-20,-5,-28,33,-24,-10,-1,-8,17,21,-7,-10,-23,-23,-12,19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-24,-34,-24,8,-32,-20,30,-26,31,26,-24,-24,-18,-22,-24,-10,17,-18,2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=12,-6,-19,-8,-10,-24,31,-16,-27,-14,-27,-18,2,-14,-10,-16,17,-1,-17,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,42,23,-34,-5,5,-36,1,-27,-24,13,-10,4,-6,-1,-11,-30,-34,-18,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-28,-15,-13,12,-24,41,-11,-11,-7,-1,-10,-25,-5,-8,-15,-13,-16,8,50,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,34,-26,24,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=11,-2,-11,-11,-9,-13,-14,-16,-11,-10,-12,-10,-1,-10,-9,-12,18,35,-2,-28,-12,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-24,11,9,-26,-8,8,-21,5,-26,-14,34,-16,19,8,6,-3,-29,-32,-16,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-20,8,-30,-20,20,-29,45,18,-28,-28,-19,-20,-27,-7,10,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11,-1,-20,-22,-1,-21,23,-17,-6,-2,-18,10,48,-9,-9,-15,-21,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-27,-9,1,-21,-19,-3,-24,25,-18,-6,-1,-17,10,46,-6,-7,-17,-22,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-16,-31,-25,7,-28,-20,24,-21,19,22,-25,-27,-21,-18,-16,-5,27,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-24,-9,-12,-26,41,-19,-33,-14,-26,-19,-4,-19,-15,-16,-2,-16,-25,-12,-23,-13;
MA   /M: SY='K'; M=8,-3,-22,-7,-1,-25,-3,-11,-20,9,-20,-10,0,-10,4,0,2,-4,-14,-23,-16,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00181;
//
ID   TRANSFERRIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00205;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transferrins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1719122; R2=0.0139423; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=359; N_SCORE=10.167; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,0,5,-25,-20,47,-30,19,-25,-5,5,-15,10,14,-10,-15,-25,-25,6,5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,2,-30,8,12,-28,-15,-5,-24,1,-26,-17,-1,20,8,-3,2,-5,-25,-29,-17,8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-10,-19,-13,-7,-7,-19,-8,-2,-4,-5,-3,-8,-18,-5,-7,-4,-2,0,-16,3,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=6,-4,-13,-7,-7,-6,-9,-5,-8,-6,-9,-7,-2,-13,-7,-4,4,1,-3,-16,-3,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-15,13,8,-15,-7,-4,-17,-1,-16,-13,6,-2,0,-5,7,3,-13,-22,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=7,-3,-23,-2,0,-27,17,-7,-27,-10,-24,-17,0,-6,-3,-13,8,-7,-21,-27,-21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-14,4,17,-22,-13,-10,-20,-6,-14,-15,-4,-6,0,-10,4,-1,-16,-32,-19,8;
MA   /M: SY='B'; M=-11,6,-24,6,1,-14,-17,0,-15,-4,-9,-7,4,-18,5,-3,-6,-8,-15,-25,-7,3;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-19,58,-25,-24,-4,-29,-8,-21,-19,-14,-12,-18,-35,-20,-16,-13,-10,-11,-22,8,-24;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='V'; M=9,-11,-10,-12,-8,-11,-11,-15,0,-7,-8,-4,-9,-14,-10,-10,8,4,11,-24,-12,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='B'; M=0,6,-10,6,3,-20,-10,1,-18,0,-16,-12,5,-7,-2,-5,-1,-6,-15,-24,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,6,-17,5,0,-16,-12,2,-19,5,-14,-10,5,-11,1,14,2,4,-13,-21,-8,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-33,-10,-1,-27,-17,-11,-21,-2,-26,-16,-13,49,-5,-6,-5,-8,-24,-27,-22,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-13,-2,6,-14,-8,-8,-8,-4,-11,-7,-3,-9,3,-5,6,4,-4,-21,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-21,4,15,-23,-6,-5,-22,3,-21,-15,9,-9,6,1,8,2,-19,-28,-17,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-21,-10,-13,-17,21,-7,-20,-16,-16,-11,-2,-18,-12,-14,6,-5,-13,-25,-15,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-29,-18,-19,27,-28,19,-1,-9,-2,-1,-16,-29,-9,-9,-18,-9,-11,26,75,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-24,-28,-22,36,-30,1,4,-21,16,6,-21,-30,-20,-15,-22,-10,-2,7,40,-22;
MA   /M: SY='A'; M=39,-13,-10,-21,-13,-16,-5,-21,-3,-12,-8,-7,-12,-14,-13,-19,8,1,8,-23,-18,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-29,-11,-30,-29,-1,-29,-30,29,-20,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,46,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-11,-29,-26,-4,-25,-28,24,-19,7,7,-26,-26,-26,-21,-7,-1,40,-28,-11,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,7,-27,-19,-7,-30,41,-27,-10,0,-13,10,40,-8,-9,-20,-21,-10,7;
MA   /M: SY='G'; M=2,10,-23,15,1,-29,18,-11,-31,-9,-27,-22,7,-13,-6,-14,11,-4,-22,-31,-23,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-8,-2,-2,-13,-4,-9,-13,-7,-18,-13,8,-8,-2,-7,23,20,-6,-28,-13,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-14,18,3,-19,-1,-4,-18,-3,-17,-14,12,-8,-2,-7,7,1,-13,-23,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-5,-15,-4,-2,-8,-5,0,-10,-5,-10,-7,-4,5,-4,-7,-1,-2,-10,-10,0,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-23,8,-3,-21,12,-5,-25,-7,-22,-16,5,-14,-3,-10,3,-7,-20,-20,-9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-20,-30,-23,23,-29,-20,16,-25,20,9,-19,-27,-22,-19,-19,-8,12,-14,5,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-14,-3,-4,-16,-15,-12,-15,-2,-17,-12,10,-11,-1,-4,17,30,-9,-31,-13,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-37,-40,-38,-28,9,-25,-28,-2,-23,-1,-7,-35,-29,-20,-21,-35,-23,-12,90,19,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,32,-22,28,11,-26,-6,2,-26,1,-28,-22,34,-14,2,-3,10,1,-26,-38,-19,6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,19,-20,16,13,-24,-7,-1,-23,-1,-26,-19,22,-11,7,-4,16,6,-22,-36,-19,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-4,9,-25,-20,-3,-30,34,-23,-10,0,-15,13,49,-9,-10,-21,-21,-11,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-6,-18,-30,64,-18,-39,-18,-30,-20,4,-20,-18,-19,1,-19,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-27,-3,5,-27,-20,-12,-24,39,-25,-9,-2,-11,5,22,-7,-6,-13,-21,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,41,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00182;
//
ID   TRANSFERRIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00206;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transferrins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2964067; R2=0.0117465; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=568; N_SCORE=10.958; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-27,1,-5,-26,14,-4,-30,-5,-26,-16,1,-3,-6,-6,2,-8,-24,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-29,-11,3,-18,-14,-15,-10,-10,-5,-7,-15,14,-6,-11,-10,-10,-13,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-24,3,12,-18,-13,-6,-17,1,-17,-13,4,-14,0,-2,-1,-6,-15,-19,-12,6;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-4,7,-25,-21,-9,-22,28,-21,-8,-2,-12,10,22,-5,-2,-15,-22,-10,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-11,-7,-4,-11,-10,-12,-3,0,-7,-4,-7,-11,-6,-5,1,0,5,-19,-10,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=9,-9,-13,-8,3,-21,-7,-14,-17,-5,-17,-13,-9,18,-5,-12,-1,-6,-15,-22,-20,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-19,22,4,-24,-3,0,-25,-2,-29,-22,31,-14,1,-1,17,4,-23,-39,-19,2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,5,-21,0,-2,-14,-10,2,-16,-5,-22,-13,13,-10,5,-6,11,2,-19,-23,-1,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,4,13,-28,-18,12,-24,5,-22,-11,0,7,14,2,-3,-9,-26,-28,-11,11;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-30,24,42,-24,-19,3,-28,6,-19,-19,1,-6,12,-3,-3,-10,-27,-24,-7,27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-27,-2,5,-26,-11,-4,-27,24,-25,-11,5,-14,11,30,-3,-8,-21,-23,-13,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-22,-14,-13,16,-19,4,-8,-12,-10,-7,-6,-22,-8,-10,1,0,-10,0,33,-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-29,-7,-18,-30,65,-19,-39,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,0,-19,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-30,-23,-21,26,-31,14,6,-13,3,3,-20,-29,-11,-13,-20,-10,-5,24,70,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,6,-17,4,4,-21,-13,-11,-20,2,-21,-15,5,-10,-1,-2,15,18,-12,-31,-15,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27,50,-31,-21,11,-30,24,8,-23,-29,-32,-21,-23,-10,6,-3,17,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-27,-8,1,-21,-17,-2,-29,26,-22,-11,1,-18,10,56,-3,-6,-19,-23,-11,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=14,-8,-16,-8,-4,-17,-16,-17,-2,-9,-7,-5,-12,-16,-8,-15,0,-3,10,-27,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-26,13,39,-27,-16,6,-28,9,-23,-17,3,-5,15,1,5,-6,-25,-31,-15,26;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-23,8,4,-24,8,-4,-26,9,-24,-14,11,-12,1,3,-1,-9,-22,-22,-15,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-13,-6,-3,-14,-9,-10,-9,8,-12,-6,0,-10,-3,1,0,-3,-2,-17,-10,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,43,27,-37,-14,3,-33,4,-26,-21,13,-9,17,-3,0,-10,-30,-34,-18,22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-11,-18,-10,-19,1,-20,-11,-10,-11,-10,-8,-10,-10,-19,11,5,-1,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-14,-27,-25,-2,-28,-27,23,-20,9,7,-22,-24,-23,-20,-6,7,33,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-12,5,-30,8,11,-31,-19,-7,-31,41,-29,-12,3,-11,10,28,-8,-10,-22,-23,-11,10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,2,-26,3,-1,-21,-20,47,-18,-8,-16,-3,4,-19,7,-4,-6,-12,-15,-30,4,1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-20,-6,-1,-21,-19,-11,-9,0,-15,-6,-2,-13,9,-3,8,11,-5,-28,-11,3;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-15,-23,-19,10,-26,-23,6,-18,1,-1,-11,-18,-20,-16,3,23,11,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-30,-28,-1,-31,-29,31,-21,10,10,-25,-26,-26,-21,-10,2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-15,-29,-15,-5,-4,-18,-14,-14,3,-7,-5,-13,-5,-7,3,-15,-11,-14,-12,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,14,35,-32,-19,-2,-29,22,-24,-15,1,-5,21,10,-3,-10,-27,-26,-15,28;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-22,1,-9,-3,-11,2,-6,-8,-15,-8,31,-22,-7,-7,0,-3,-16,-25,-2,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-14,-20,-16,10,-23,-18,-1,-15,2,3,-9,-17,-16,-13,4,26,3,-21,-1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,20,-26,27,4,-31,13,-7,-33,-7,-30,-24,15,-8,-5,-12,7,-7,-27,-34,-23,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-28,1,-13,-25,37,-14,-29,-16,-18,-10,-1,-19,-14,-17,-5,-16,-22,-24,-22,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-28,-3,3,-24,-18,1,-20,11,-24,-11,0,7,2,7,-4,-7,-17,-28,-13,0;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-21,5,-6,-20,4,-4,-17,-7,-25,-16,28,-9,-7,-8,6,-1,-19,-34,-21,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00182;
//
ID   TRANSFERRIN_3_MP; MATRIX.
AC   MP00207;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transferrins signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4782333; R2=0.0132380; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=655; N_SCORE=13.139; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-21,19,-3,-22,-8,-9,-13,-8,-17,-14,10,-19,-11,-12,-1,-6,-4,-35,-18,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-23,-12,-16,-25,47,-19,-30,-16,-23,-16,-2,-16,-16,-19,2,-14,-20,-19,-25,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-24,-8,-1,3,-19,8,-19,6,-14,-7,1,-17,-3,9,-8,-9,-16,-15,4,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-4,11,-16,1,-10,-14,-2,-6,-7,-8,-17,-11,23,-20,-10,-8,6,2,-5,-32,-16,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-22,-4,2,-21,-14,-11,-18,8,-21,-11,-1,8,2,1,5,5,-15,-26,-15,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=3,2,-24,4,12,-25,-12,18,-24,-5,-21,-13,1,1,3,-9,3,-7,-21,-30,-11,6;
MA   /M: SY='A'; M=5,0,-21,3,1,-21,-11,-13,-15,-9,-12,-12,-5,0,-6,-14,2,-1,-11,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-20,-38,-20,-19,-1,-19,-24,-20,-15,-19,-19,-23,-23,-15,-16,-20,-7,-22,83,14,-14;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,-12,-23,-17,-11,-9,-23,2,-15,1,-2,-16,-18,-17,-19,1,1,13,-23,-15,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-6,-26,-6,3,-21,-16,-6,-22,15,-24,-11,-3,1,6,8,0,-5,-18,-23,-11,4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-28,31,17,-29,-7,16,-30,-1,-25,-17,21,-13,4,-5,0,-10,-28,-35,-14,10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-23,-20,-3,7,-27,-14,6,-20,28,9,-21,-23,-9,-14,-21,-10,-1,-19,-1,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-13,11,-28,14,17,-27,-17,-2,-27,20,-22,-11,7,-11,11,17,-5,-9,-23,-27,-14,13;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-22,-8,2,-20,-13,-9,-18,8,-17,-8,-3,-13,7,8,5,-1,-14,-18,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-25,16,21,-27,-10,-1,-26,8,-24,-16,13,-10,10,3,6,-4,-24,-32,-18,15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-29,50,20,-37,-12,1,-35,5,-28,-24,19,-10,9,-4,0,-9,-29,-36,-18,14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-30,16,52,-30,-20,0,-29,12,-20,-18,0,-2,20,5,-1,-10,-28,-28,-19,36;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-27,-16,-7,-14,-17,-14,-7,-8,3,-1,-16,2,-4,-4,-13,-8,-11,-23,-12,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,30,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-2,-15,-28,55,-14,-36,-16,-30,-20,12,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-14,-10,-9,-17,0,-18,-17,-9,-17,-13,0,-12,-9,-9,17,25,-7,-28,-16,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-28,-10,-1,-19,-20,-2,-28,26,-19,-10,0,-19,8,61,-7,-4,-18,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='K'; M=8,3,-24,2,7,-29,-13,-10,-24,20,-22,-11,-1,-10,9,7,-1,-7,-16,-22,-14,8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-30,-7,2,-25,-17,-16,-15,-9,-25,-17,-11,47,-7,-16,1,-3,-18,-32,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,18,-19,20,4,-23,-12,-9,-22,-4,-21,-16,11,-11,-3,-8,13,17,-14,-35,-15,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-26,23,29,-31,-14,3,-29,5,-25,-18,8,-7,17,-1,7,-5,-26,-32,-17,23;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-23,-22,-29,-22,40,-23,-7,-3,-19,1,-3,-19,-26,-23,-17,-15,-9,-5,16,37,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-2,-24,-3,11,-28,-14,-4,-22,14,-21,-9,-1,-10,18,10,3,-5,-18,-23,-14,14;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-19,2,8,-20,-11,-3,-21,2,-21,-15,12,-11,2,2,12,10,-16,-31,-15,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,17,-26,10,-1,-16,-13,49,-23,-5,-22,-10,27,-21,3,-2,-3,-10,-28,-28,8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-31,-21,-31,-22,9,-29,-22,18,-28,41,16,-31,-30,-21,-20,-29,-10,12,-9,1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-10,4,-19,-21,-4,-11,13,-10,6,-7,-15,11,19,-9,-9,-8,-22,-9,6;
MA   /M: SY='V'; M=19,-21,-11,-26,-21,-8,-18,-25,14,-16,3,5,-21,-21,-20,-20,-3,-1,27,-25,-13,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='S'; M=13,6,-16,-1,-3,-21,-3,-9,-17,-7,-24,-17,15,-3,-4,-11,18,7,-14,-33,-21,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,0,-20,-20,89,-30,-6,-20,-1,9,-20,10,8,-10,-19,-29,-29,17,0;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-11,-20,-12,-17,-5,-19,-6,-11,-7,-5,-11,-12,-11,-18,8,5,3,-22,-17,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-31,-16,-32,-30,1,-30,-30,26,-21,7,7,-30,-29,-28,-21,-14,-4,40,-10,-5,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-31,-29,0,-30,-27,31,-20,12,15,-28,-28,-27,-20,-12,-2,45,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='T'; M=16,-8,-10,-13,-11,-14,-11,-19,-6,-12,-12,-9,-5,-13,-11,-14,18,21,6,-30,-15,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-26,-11,-2,-18,-17,3,-25,18,-16,-8,-1,-19,6,47,-6,-8,-16,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-28,3,4,-27,-16,-12,-22,15,-25,-13,0,12,0,3,-2,-2,-19,-27,-17,1;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-29,52,27,-35,-14,-2,-33,1,-25,-25,12,-9,3,-8,-1,-9,-25,-37,-19,15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-24,-7,-2,-13,-12,-12,-22,13,-22,-12,1,-7,-4,8,1,3,-15,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-20,-7,-1,-19,-10,-11,-13,-1,-9,-7,-2,-16,-2,-1,-2,-3,-8,-25,-15,-2;
MA   /M: SY='A'; M=8,-4,-21,-6,0,-19,-8,-15,-8,-8,-10,-8,-3,-13,-6,-13,2,-3,-7,-26,-15,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,2,-11,4,1,-15,-15,-3,-21,-5,-16,-12,-2,-17,-4,-6,-5,-10,-15,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-11,-18,-9,-9,-12,-25,-18,8,-13,2,1,-15,-21,-9,-13,-7,0,16,-29,-11,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-14,-15,-7,-6,-20,-13,-1,-8,-2,-1,-12,-19,-9,-6,-4,-3,5,-24,-8,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-9,-28,-10,-4,-7,-16,-7,-17,-3,-17,-11,-8,-17,5,-4,-9,-9,-20,27,8,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-21,-14,-3,-15,-14,-16,-1,-9,-5,-2,-11,-16,-5,-10,-1,-2,3,-26,-13,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-26,-18,9,-27,-6,12,-26,30,13,-21,-27,-17,-18,-21,-9,6,-21,3,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-19,-21,-12,1,-26,-13,5,-17,23,8,-18,-23,-13,-8,-15,2,3,-22,-3,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00182;
//
ID   PLANT_GLOBIN_MP; MATRIX.
AC   MP00208;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Plant hemoglobins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0587330; R2=0.0146610; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=858; N_SCORE=17.628; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,11,-31,-20,-8,-29,46,-29,-9,0,-10,15,28,-9,-10,-21,-20,-10,13;
MA   /M: SY='B'; M=-5,16,-26,16,1,-25,4,1,-27,-2,-24,-17,13,-15,1,-7,0,-9,-24,-25,-11,0;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-19,-30,-21,5,-25,-12,21,-20,33,37,-25,-25,-12,-15,-24,-9,13,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-13,-1,0,-21,-2,-11,-20,-10,-30,-20,7,0,-1,-11,35,17,-12,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-17,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-26,-6,4,-25,-16,-9,-27,34,-24,-10,-1,-13,7,33,-5,-7,-17,-21,-12,4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-27,46,14,-33,-1,1,-34,-1,-29,-26,27,-13,0,-8,3,-8,-30,-37,-21,7;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-14,-3,-5,-21,10,-13,-22,-12,-27,-19,7,-12,-5,-12,30,17,-12,-35,-21,-5;
MA   /M: SY='D'; M=1,6,-20,7,-5,-22,-6,-13,-15,-9,-18,-15,3,-5,-10,-14,5,2,-7,-32,-19,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-24,4,5,-20,-7,-13,-8,-9,-10,-9,-5,-14,-7,-13,-5,-9,-4,-26,-15,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-23,-27,-18,-12,-15,-23,-22,4,-14,-9,-5,-22,35,-16,-19,-11,-6,3,-27,-18,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-20,-14,-7,-2,-16,-14,-3,-13,1,-3,-15,22,-12,-14,-11,-7,-8,-15,-9,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-23,8,31,-24,-17,3,-19,8,-15,-10,-1,-5,18,3,-2,-8,-19,-22,-12,25; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-23,15,9,-25,-12,7,-23,4,-23,-15,22,-13,8,2,5,4,-23,-32,-13,8;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,49,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-29,4,13,-31,-18,-7,-29,40,-29,-11,3,-10,13,23,-6,-9,-22,-23,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-28,-4,8,-29,-18,-6,-21,26,-22,-6,-1,-11,21,17,-5,-5,-19,-21,-10,14;
MA   /M: SY='A'; M=25,-6,-17,-12,-8,-21,2,-17,-15,-9,-17,-13,-2,-2,-9,-16,8,1,-9,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-24,-4,15,-19,-11,-8,-13,0,-10,-1,-8,-12,3,-2,-4,-7,-10,-26,-15,9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-23,-6,0,-19,-17,-9,-18,20,-21,-9,-3,-13,3,10,1,0,-10,-20,-4,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-29,1,-31,-29,30,-22,17,12,-29,-29,-28,-21,-14,-2,43,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=2,-13,-22,-15,-12,-19,3,-18,-11,2,-12,-1,-10,-18,-11,-5,-6,-9,-1,-22,-15,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-19,-28,-19,3,-24,-9,17,-18,29,39,-22,-23,-8,-14,-20,-5,9,-21,-1,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-14,-7,-20,-20,-6,-26,-25,9,-16,-1,-1,-13,-19,-19,-16,5,25,20,-30,-10,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-15,31,-19,-17,-16,-17,-4,-26,-7,-18,-12,-10,-29,-12,5,-10,-11,-14,-29,-9,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-8,-4,-20,-1,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,14,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=12,-19,-14,-25,-21,-9,-17,-25,12,-17,1,1,-16,-19,-19,-20,-1,5,21,-25,-12,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,2,23,-39,-20,9,-21,10,-20,-2,0,-9,57,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-29,-10,-2,-22,-13,-4,-26,21,-19,-8,-2,-19,9,48,-8,-10,-17,-21,-12,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,-20,-8,6,-23,-14,-13,-14,8,-15,-8,-7,-11,3,-2,1,-3,-6,-23,-15,5;
MA   /M: SY='K'; M=4,2,-20,-3,3,-22,-14,-12,-21,16,-22,-12,4,-10,1,6,6,9,-13,-26,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00183;
//
ID   HEMOCYANIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00209;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arthropod hemocyanins / insect LSPs signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5011215; R2=0.0161309; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=836; N_SCORE=18.977; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-20,-20,-16,-4,-24,-12,3,-6,-3,1,-13,-21,-10,3,-4,4,9,-18,3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-25,7,13,-24,-16,13,-24,8,-23,-11,5,-12,13,3,3,-5,-21,-26,-4,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,1,-26,0,-1,-4,-7,-5,-16,-7,-13,-11,2,-18,-9,-9,-6,-9,-15,-16,1,-5;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-13,-13,-11,-6,-18,-16,-7,-9,-10,-8,-5,-14,-12,-10,12,25,3,-27,-9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-25,-11,-11,-21,12,-11,-21,-7,-14,-10,-4,-18,-8,0,-3,-8,-14,-22,-17,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-18,4,-4,-17,-11,-6,-15,-2,-18,-13,18,-17,-4,3,10,10,-11,-34,-15,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-7,-25,-7,-8,-8,-24,2,-3,-6,-6,-2,-6,-18,-5,-8,-7,-3,-5,-17,10,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-23,-18,-12,-2,-24,-12,2,-10,18,8,-14,-20,-10,-3,-18,-7,-2,-21,-2,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-12,36,-24,39,13,-29,-7,1,-29,-1,-28,-24,30,-12,1,-6,8,0,-27,-38,-19,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-34,0,19,-29,-20,-11,-22,3,-25,-17,-11,41,6,-5,-6,-10,-26,-28,-23,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-28,19,41,-27,-15,9,-28,6,-22,-19,15,-6,14,0,2,-8,-30,-32,-17,28;
MA   /M: SY='H'; M=-14,6,-28,10,8,-19,-18,20,-21,-1,-19,-9,2,-15,18,-2,-2,-8,-23,-16,11,11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-28,-4,5,-22,-19,1,-25,25,-21,-10,3,-17,7,39,-8,-9,-17,-24,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-23,6,-30,-21,25,-27,37,21,-28,-28,-20,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-16,-13,-5,-17,-6,-8,-15,-8,-14,-11,-5,-13,-5,-10,10,2,-8,-17,-13,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-23,-38,-29,72,-29,-17,-1,-28,7,-1,-21,-30,-36,-19,-21,-11,-3,20,34,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-23,-15,-10,-11,-11,-10,-13,0,-4,-1,-7,-19,-5,14,-6,3,-9,-21,-7,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,22,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-30,6,-12,-32,54,-16,-40,-16,-30,-22,4,-18,-16,-18,0,-18,-30,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-31,-22,3,-28,-18,25,-23,30,27,-24,-24,-15,-19,-21,-7,17,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=14,-8,-12,-14,-10,-12,-12,-18,-6,-14,-6,-7,-5,-13,-9,-15,14,18,0,-28,-14,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-30,-7,-7,-3,-23,72,-20,-10,-13,0,0,-23,3,-3,-13,-17,-23,-9,41,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-7,-29,-8,-7,-7,-22,69,-17,-10,-10,8,0,-22,4,-3,-13,-17,-20,-16,30,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-27,-33,-28,-24,21,-26,-1,-5,-17,-6,-5,-26,-29,-17,-15,-25,-16,-9,55,42,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-9,-27,-10,-9,3,-24,54,-15,-12,-8,0,-4,-23,-2,-6,-12,-10,-18,-9,36,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-37,-40,-39,-29,24,-23,-27,-10,-23,-4,-10,-34,-30,-24,-20,-34,-23,-18,97,26,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-25,-17,-29,-23,1,-26,-18,24,-20,21,25,-24,-25,-16,-18,-15,-5,23,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-7,-20,-7,-9,-12,-23,-1,5,-13,-5,-1,-6,-20,-11,-14,-5,-5,11,-31,-8,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-27,-21,-18,25,-28,23,-2,-15,5,3,-16,-28,-12,-11,-20,-12,-9,10,52,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=4,-18,-16,-27,-19,34,-17,-18,-6,-20,-2,-6,-11,-19,-25,-18,-4,-2,-2,-7,7,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-23,-32,-26,-21,2,-21,-25,-8,-17,-12,-12,-22,-23,-17,-17,-16,-5,-9,57,10,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-31,-37,-34,-24,5,-18,-20,-10,-16,-10,-2,-30,-25,-14,-17,-27,-20,-17,86,19,-16;
MA   /M: SY='B'; M=-7,11,-22,10,4,-22,-15,-7,-18,-1,-16,-12,8,-10,3,-3,4,7,-15,-31,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-5,19,-26,30,12,-32,-10,-8,-29,-4,-27,-24,6,10,-2,-12,6,-4,-23,-35,-22,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-23,12,16,-25,-14,-7,-24,8,-21,-16,2,-10,4,3,5,-2,-16,-30,-16,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-10,-15,-13,-9,4,-15,-4,-3,-1,-4,2,-8,-14,-7,-1,-6,-5,-1,-8,5,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-21,-18,-15,12,-21,7,1,-11,4,9,-13,-22,-8,-9,-11,-5,-3,-3,27,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-28,-3,-10,-25,28,-11,-24,-16,-21,-14,0,-17,-13,-17,-1,-12,-19,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-24,-11,-5,-15,-17,-8,-7,4,-12,-3,-6,-12,-5,2,-8,-7,-2,-23,-8,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-22,-10,-7,-8,-19,4,-3,-9,0,4,0,-20,-6,-5,-9,-7,-5,-26,-5,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-28,-5,4,-24,-22,-12,-21,36,-20,-6,-3,-12,5,21,-10,-6,-14,-21,-9,4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-29,42,27,-33,-14,6,-32,1,-23,-19,11,-8,6,-6,-1,-10,-27,-35,-16,16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,1,-29,29,-20,-9,0,-19,13,66,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,-3,5,-25,-20,12,-30,33,-25,-8,2,-15,10,39,-10,-12,-22,-22,-5,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00184;
//
ID   HEMOCYANIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00210;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arthropod hemocyanins / insect LSPs signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7500720; R2=0.0169731; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; N_SCORE=13.140; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=45; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-2,-24,-2,-6,7,-15,9,-17,-12,-11,-9,-3,-19,-10,-11,-5,-2,-15,-12,15,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-14,11,-29,12,-2,-20,2,25,-28,-7,-23,-13,12,-19,0,-7,-4,-13,-27,-22,3,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-2,4,-27,-14,-8,-25,27,-23,-9,0,-13,9,26,-7,-8,-18,-22,-11,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-27,-16,-15,17,-25,15,-3,-13,2,9,-14,-19,-10,-11,-17,-11,-9,-1,32,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-22,-2,2,-12,-11,-11,-13,-10,-3,-7,-3,-16,-4,-8,-3,1,-12,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-17,-20,-16,-2,6,-25,-15,3,-14,5,0,-17,-21,-13,-13,-9,-5,7,-20,0,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-15,-23,-18,-14,7,-23,-10,1,-14,-3,2,-13,-9,-11,-14,-9,-6,0,-13,7,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-35,-13,-4,-15,-19,-19,-17,-12,-24,-17,-16,64,-13,-19,-9,-9,-25,-25,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-22,-2,-10,-24,29,-7,-29,-13,-28,-18,12,-16,-9,-13,14,-1,-22,-30,-22,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,-12,-28,-24,-3,-23,-26,22,-19,9,7,-24,-24,-23,-20,-8,-2,33,-25,-10,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-26,-21,-32,-22,18,-27,-13,18,-22,30,32,-24,-26,-16,-17,-24,-10,9,-15,5,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,6,-26,12,10,-21,-6,-3,-19,-8,-7,-8,-2,-14,-2,-11,-6,-10,-17,-28,-14,4;
MA   /M: SY='H'; M=-17,15,-26,15,1,-10,-16,28,-23,-9,-16,-11,15,-19,-1,-6,-6,-11,-23,-28,1,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-19,-24,-21,-15,28,-25,-1,-4,-15,-3,-4,-16,-20,-16,-14,-10,-5,-6,6,36,-17;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-24,8,26,-30,-13,-3,-23,3,-20,-14,1,-6,20,-3,8,-4,-22,-28,-18,23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-3,-14,-10,-16,-7,-14,-9,-12,-13,-4,-5,-14,-7,-15,15,8,-1,-30,-17,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-18,-27,-18,2,-23,-12,15,-19,28,31,-21,-23,-10,-15,-18,-2,8,-21,-2,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-17,-29,-22,7,-23,-20,16,-19,9,14,-19,-22,-18,-19,-8,-2,18,-20,-3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-18,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-30,-24,-22,35,-29,12,-1,-13,0,-1,-21,-30,-14,-12,-21,-11,-10,35,71,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-27,-10,3,-20,-20,0,-15,14,-10,9,-5,-16,17,28,-8,-7,-14,-21,-8,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-31,-25,-34,-25,22,-29,-22,11,-26,22,7,-29,-29,-25,-20,-26,-12,6,16,13,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-13,-31,-14,-11,4,-24,44,-13,-10,-9,2,-10,-25,1,-6,-17,-16,-19,14,43,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-2,4,-26,1,6,-27,-15,-8,-27,33,-26,-12,5,-12,6,21,-5,-8,-19,-23,-13,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-26,-16,-10,6,-21,-5,-17,6,-13,-8,-8,-21,-6,20,-8,-4,-13,0,12,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-36,-29,4,-35,-26,39,-25,17,21,-23,-23,-21,-25,-17,-7,31,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-22,16,-2,-20,-17,-14,-9,-11,-7,-10,-1,-15,-10,-16,-3,-1,-3,-31,-14,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-10,26,-25,26,8,-29,-1,5,-29,0,-28,-20,25,-14,5,-4,7,-5,-27,-35,-18,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-22,-28,-23,4,-31,-10,23,-21,15,14,-21,-25,-17,-19,-16,-5,19,-16,10,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-35,-28,56,-31,-13,7,-25,9,3,-20,-29,-31,-19,-20,-10,4,9,35,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-9,-27,-14,-6,4,-22,5,-13,-4,-9,-4,-3,-21,4,1,-11,-11,-16,-1,11,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-26,-1,18,-23,-21,2,-16,5,-10,-5,-4,-11,17,1,-4,-6,-18,-25,-9,17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-23,-26,-28,-22,42,-28,10,-5,-21,3,0,-17,-28,-22,-14,-20,-13,-9,14,38,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-7,3,-19,-21,-8,-19,31,-18,2,-4,-13,8,18,-10,-7,-14,-19,-6,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00184;
//
ID   ABC_TRANSPORTER_1_MP; MATRIX.
AC   MP00211;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   ABC transporters family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=240;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=235;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7291522; R2=0.0066693; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=431; N_SCORE=8.6; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,29,-26,29,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-30,-4,6,-26,-20,19,-28,22,-22,-6,2,-16,21,38,-8,-12,-24,-22,-5,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-10,-18,-11,-14,8,-25,-18,2,-19,11,0,-13,-22,-20,-16,-9,4,5,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-27,5,12,-24,-23,-9,-8,3,-12,-6,-4,-12,9,-3,-6,-8,-7,-27,-12,10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,38,-23,41,10,-30,-5,2,-30,-2,-30,-25,32,-13,0,-7,10,-2,-27,-40,-20,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,31,-25,25,15,-28,-28,-25,-22,-19,-5,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-18,-21,-21,-17,7,-20,-4,-6,-17,-9,-6,-13,-22,-16,-14,-3,1,0,3,6,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-10,-27,-14,-4,8,-23,-13,-20,22,-16,-7,-7,-17,-7,13,-13,-10,-13,-10,4,-4;
MA   /M: SY='T'; M=3,-12,-17,-15,-12,-5,-17,-8,-6,-5,-10,-6,-9,-19,-8,-1,4,6,1,-15,6,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-20,-25,-22,-9,28,-27,-8,-6,-11,6,-1,-15,-24,-15,0,-17,-10,-7,-3,19,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-30,-9,-6,-23,25,-17,-25,-16,-15,-13,-9,1,-13,-17,-7,-15,-23,-23,-24,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-30,11,15,-28,8,-10,-24,-7,-20,-16,1,-11,-2,-12,-3,-13,-22,-27,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-20,-18,-26,-22,12,-28,-6,10,-20,3,4,-15,-24,-21,-17,-8,2,16,-20,4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-27,-8,3,-12,-23,-9,-12,2,-7,-6,-11,2,-3,-3,-9,-1,-13,-18,-1,-1;
MA   /M: SY='A'; M=25,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25,10,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,25,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,44,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,16,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-14,9,-30,13,12,-32,-18,-3,-30,29,-27,-13,4,-12,17,24,-6,-10,-24,-24,-12,14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,10,-29,12,2,-30,33,-10,-36,-9,-28,-22,11,-15,-8,-13,1,-14,-30,-28,-25,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-17,-32,-27,2,-30,-24,30,-22,20,21,-27,-27,-22,-20,-17,-5,33,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='S'; M=2,12,-13,4,-2,-18,-4,-6,-18,-7,-26,-18,23,-13,-2,-7,27,19,-14,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-22,-36,-26,32,-32,-22,20,-30,30,13,-24,-28,-27,-22,-24,-10,11,-10,10,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-21,4,12,-24,-13,-5,-21,7,-23,-14,10,-10,12,3,12,9,-19,-30,-15,12;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-18,-31,-25,-1,-28,-27,28,-23,17,12,-24,-24,-22,-23,-14,-5,29,-24,-7,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,7,-28,4,13,-25,-16,-1,-28,26,-25,-14,13,-14,10,32,-4,-8,-24,-26,-14,10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-29,7,12,-28,-15,-9,-27,14,-24,-16,-2,8,3,10,-4,-8,-22,-26,-18,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-14,23,-30,35,39,-35,-16,2,-32,6,-24,-20,7,-5,19,-2,0,-10,-30,-32,-18,29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-15,-33,-28,25,-30,-25,20,-25,17,9,-27,-30,-31,-20,-16,-5,29,-17,3,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-17,-16,-24,-19,-2,-26,-20,14,-18,12,13,-15,-19,-14,-16,-5,15,14,-25,-5,-17;
MA   /M: SY='A'; M=16,-15,-15,-20,-12,-10,-13,-19,3,-17,2,-2,-10,-16,-11,-19,5,2,4,-26,-13,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-22,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=3,-23,-18,-28,-21,-2,-25,-23,25,-21,15,11,-19,-19,-17,-21,-12,-5,21,-19,-5,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-30,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-10,58,-7,-17,6,0,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='N'; M=0,16,-14,6,-2,-18,-3,-4,-18,-6,-27,-18,28,-14,-2,-6,25,17,-16,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=14,-5,10,-8,-6,-20,-5,-15,-20,-13,-25,-18,2,-15,-6,-15,27,12,-8,-38,-22,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-14,-24,-19,14,-24,-19,11,-21,21,8,-20,-23,-21,-16,-13,2,13,-16,1,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-20,-30,-20,2,-27,-22,21,-26,33,15,-24,-24,-18,-22,-21,-8,13,-20,-4,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-21,-5,-5,-17,-9,0,-15,6,-15,-2,16,-18,1,16,-1,-5,-15,-27,-14,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,2,-31,-25,-1,-28,-19,19,-21,17,25,-24,-27,-17,-20,-18,-8,18,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,45,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-19,-9,-6,-19,-2,-7,-12,-6,-13,1,4,-15,4,-8,4,5,-12,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-7,-12,-19,-10,29,-16,-29,-19,-23,-17,5,-24,-21,-18,-3,-14,-23,-23,-19,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-22,-24,-9,18,-28,-17,7,-23,30,9,-23,-25,-18,-17,-23,-10,1,-15,3,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-5,-26,1,10,-5,-24,-4,-7,-10,9,-3,-12,-18,-3,-11,-15,-10,-11,-17,5,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,28,-32,-20,-3,-28,30,-25,-11,0,-7,22,17,-5,-10,-25,-23,-13,25;
MA   /M: SY='P'; M=3,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,69,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,11,-14,12,1,-21,-8,-11,-21,-8,-24,-19,9,-10,-3,-10,25,23,-11,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-30,10,36,-28,-4,-4,-32,8,-22,-18,0,-7,11,7,-2,-12,-28,-27,-20,23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-27,-2,15,-30,-17,-1,-24,18,-20,-8,-2,-11,25,20,-2,-8,-22,-21,-13,19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-23,-21,-18,17,-27,2,11,-15,12,7,-18,-23,-12,-13,-18,-8,1,8,40,-18; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-18,-30,-23,19,-28,-21,23,-23,18,11,-20,-22,-22,-20,-17,-7,18,-12,5,-23; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-23,28,16,-27,3,-2,-28,-1,-23,-20,15,-9,1,-6,2,-8,-25,-28,-18,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-22,14,-4,-23,22,-3,-26,-7,-25,-18,24,-15,-7,-8,3,-8,-25,-27,-20,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-20,-5,3,-17,-16,-6,-7,16,-11,-1,-3,-8,10,9,-6,-7,-8,-13,-5,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-17,13,3,-14,-9,-3,-13,2,-7,-8,9,-11,-2,-1,-4,-5,-12,-20,-9,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-19,20,9,-21,-9,-3,-21,17,-19,-12,6,-6,3,7,-3,-6,-15,-18,-9,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-24,-21,-14,-9,-24,-20,11,-17,3,2,-20,17,-15,-19,-13,-7,5,-22,-11,-17; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-16,2,5,-13,-14,-11,-10,-7,-2,-7,-4,-10,-4,-10,0,6,-7,-23,-11,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-25,23,7,-26,-10,-3,-24,6,-25,-18,15,7,0,-2,-1,-6,-23,-28,-17,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-25,8,7,-28,-1,-5,-26,17,-23,-11,3,-10,11,8,-4,-10,-21,-19,-13,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-23,0,13,-8,-19,0,-6,-3,-8,-7,2,-11,2,-6,-5,-7,-12,-14,4,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-24,-9,6,-4,-20,-9,-10,-7,-5,-5,-11,9,2,-9,-9,-8,-15,-16,-7,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='A'; M=6,-11,-13,-15,-11,-8,-15,3,-1,-13,2,1,-10,-16,-9,-12,-3,2,4,-21,-4,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-1,14,-22,-17,-4,-23,17,-20,-12,-3,6,7,24,-6,-8,-20,-20,-14,8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-21,-15,4,-25,-11,11,-18,16,7,-20,-5,-13,-16,-19,-8,1,-9,10,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-27,-16,-8,-3,-25,-6,-7,8,4,2,-14,-22,-4,10,-19,-10,-8,-9,13,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,5,-30,8,3,-23,-18,56,-32,3,-22,-7,9,-18,8,18,-8,-16,-27,-29,5,2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-24,0,-3,-10,-17,0,-20,5,-17,-12,0,-18,0,17,2,4,-14,-17,6,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-9,2,-30,5,0,-32,16,-7,-34,5,-27,-15,3,-15,6,7,-3,-14,-27,-23,-19,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-32,-23,-2,-33,-23,29,-18,16,13,-20,-23,-17,-10,-18,-8,22,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-16,-23,-19,-12,-7,-24,5,-17,-3,-2,-13,-17,-17,-20,1,3,12,-24,-14,-19;
MA   /M: SY='M'; M=1,-14,-19,-20,-12,0,-14,-8,-5,-4,-4,11,-9,-18,-5,4,-3,-3,-3,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-12,-27,-26,11,-28,-26,16,-20,6,4,-22,-26,-27,-18,-5,9,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,2,-33,-28,44,-12,-22,-12,-28,-2,-7,-16,-30,-35,-22,-15,-12,-7,-5,9,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,0,17,-37,-17,7,-20,7,-22,-3,2,-10,50,7,7,-5,-27,-23,-12,33;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-17,-2,4,-20,-13,12,-16,-2,-16,-5,3,-10,17,-1,9,8,-15,-23,-5,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-19,-28,-20,-6,29,-26,-10,-10,-15,-5,-8,-16,1,-18,-15,-14,-10,-13,-3,16,-12;
MA   /M: SY='N'; M=3,6,-23,1,3,-26,-8,-3,-18,-3,-25,-14,14,5,10,-6,9,-1,-22,-31,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-31,-22,-10,-8,-24,-16,-2,-17,9,1,-24,-1,-4,-15,-22,-13,-12,6,-3,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-33,-26,8,-31,-20,22,-24,16,9,-27,-27,-20,-21,-23,-11,14,12,15,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-26,-15,-7,-4,-19,-13,-12,-1,-15,-1,-11,14,-8,-6,-6,-5,-13,-21,-8,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-7,-30,-3,7,-22,-5,21,-23,-10,-14,-9,-4,1,-1,-10,-9,-15,-25,-27,-9,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-23,-23,-16,-7,-6,-6,1,-7,9,29,-14,-21,-4,1,-16,-12,-2,-20,-7,-11;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-15,-30,-26,-1,-28,-27,26,-22,16,11,-26,-26,-24,-22,-13,-3,33,-25,-8,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-18,-25,-18,-8,-3,-27,-7,1,-6,16,8,-18,-23,1,-5,-20,-10,-5,-12,9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='L'; M=10,-16,-20,-22,-8,-9,-19,-16,8,-15,11,11,-16,-16,-8,-17,-9,-7,5,-21,-9,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-25,-26,-13,28,-31,-12,9,-20,11,4,-18,-23,-19,-17,-18,-10,1,-3,21,-16;
MA   /M: SY='G'; M=5,-13,-30,-12,-13,-28,33,-20,-30,-16,-27,-18,-7,13,-16,-20,-1,-14,-25,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-24,-16,-1,-6,-26,-17,5,-17,16,4,-22,-5,-12,-16,-17,-8,2,-25,-11,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-23,-22,-15,-10,-27,-22,15,-11,-1,3,-8,-15,-10,-14,-1,6,10,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-10,-10,-14,-7,0,-23,-1,-9,-10,-3,-1,-6,-23,6,-7,-11,-9,-14,-13,9,0;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-29,3,2,-26,-20,-12,-20,15,-22,-12,-6,7,-2,11,-8,-8,-13,-27,-16,-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-25,-11,-8,-11,0,-10,-14,-4,-9,-6,-11,2,-9,-8,-11,-10,-15,-12,-3,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-18,-5,3,-15,-5,-11,-14,-2,-12,-9,-5,-12,-4,2,1,2,-6,-22,-14,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-19,-13,-9,-11,-2,-11,-6,-13,-4,4,-9,1,-7,-13,-1,-3,-7,-23,-13,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-16,-6,-1,-15,-7,-9,-13,0,-15,-10,-4,13,-2,2,4,-1,-11,-18,-14,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-6,-10,-6,-3,-5,-9,-7,-3,0,2,0,-5,-9,-3,-1,-3,-1,-2,-13,-4,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='H'; M=-5,7,-13,3,-3,-11,6,15,-14,-4,-14,-7,14,-10,-1,-3,1,-6,-15,-16,-5,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-15,7,24,-17,-10,2,-14,5,-10,-7,0,-2,16,2,0,-5,-15,-14,-9,20; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-20,21,33,-21,-12,0,-21,5,-15,-15,3,-2,10,-2,0,-7,-20,-21,-13,22; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='M'; M=1,-12,-14,-17,-10,-6,-13,-8,6,-4,3,13,-9,-12,-3,0,-7,-5,4,-13,-4,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-20,5,7,-17,-17,-6,-13,6,-12,-9,-3,-14,0,14,-5,-6,-5,-23,-11,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,2,-30,8,34,-22,-22,4,-23,12,-18,-12,-3,-8,20,4,-5,-10,-25,-17,0,26;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-30,-2,13,-24,-20,-2,-30,31,-22,-12,0,-14,12,49,-8,-10,-22,-22,-12,9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-18,-17,-25,-18,-5,-17,-17,9,-15,0,0,-17,-18,-15,-20,-3,-3,11,-13,2,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-18,-21,-22,-14,12,-25,-14,-6,-7,8,1,-13,-23,-13,11,-13,1,-4,-15,1,-14;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-23,2,19,-27,-13,-9,-25,18,-24,-15,0,-7,8,6,5,-3,-18,-26,-16,13;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,0,-29,-25,-2,-27,-21,15,-20,3,3,-21,-26,-21,-22,-10,-5,20,-20,1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=10,-23,-18,-28,-18,-2,-22,-22,15,-23,25,10,-22,-22,-17,-22,-15,-7,10,-20,-7,-18;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='E'; M=2,-3,-19,-1,17,-19,-16,-10,-12,7,-12,-9,-7,-9,2,-2,-2,-5,-5,-23,-14,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-13,-19,-17,-8,5,-18,-14,-8,4,-2,-2,-11,-16,-10,-1,-11,-7,-5,-11,0,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,9,-21,-17,-3,-21,-19,3,-21,11,2,-17,-24,-17,-17,-7,-2,8,-27,-10,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-21,-3,-1,-23,16,-7,-23,6,-20,-9,0,-10,5,1,-2,-10,-19,-14,-14,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='L'; M=4,-18,-12,-20,-12,2,-16,-14,9,-18,25,9,-18,-18,-12,-14,-14,-5,5,-14,-4,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-19,4,19,-21,1,-1,-19,2,-14,-9,0,-5,14,-1,0,-8,-19,-16,-12,16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: M=-5,-10,-18,-12,-9,-9,-1,-12,-2,-4,-1,0,-7,-12,-8,-6,-9,-8,-3,-13,-7,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-19,21,11,-11,-11,4,-17,0,-12,-12,3,-9,1,-5,-4,-6,-15,-11,5,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-6,18,-21,20,19,-25,-11,-4,-25,-1,-24,-20,16,-9,4,-5,13,7,-21,-36,-18,12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-26,-8,2,-16,-23,13,-13,1,-12,-4,-1,-15,3,13,-5,-1,-12,-25,-3,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-19,-21,-7,6,-24,-18,5,-18,16,4,-20,-22,-16,-16,-14,-7,7,-19,-4,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-21,-21,-22,-14,1,-24,-9,7,-15,13,7,-21,-24,-6,-13,-14,-7,5,-11,11,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,28,-27,30,2,-31,18,-3,-34,-6,-30,-24,25,-16,-6,-10,3,-10,-30,-34,-23,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,0,-30,3,22,-25,-20,12,-30,21,-22,-12,1,-12,13,30,-7,-11,-25,-25,-9,15;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-26,-8,-3,-19,-3,-9,-24,19,-22,-10,-5,-15,-2,7,-6,-10,-17,-12,-1,-3;
MA   /M: SY='P'; M=6,-14,-30,-12,-9,-28,15,-20,-25,-13,-26,-18,-11,31,-13,-20,-2,-11,-24,-24,-28,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-8,-22,-12,-14,-16,1,-14,-7,-9,-14,-7,2,-20,-11,-3,2,-4,-3,-28,-16,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-27,6,27,-28,-20,15,-24,4,-18,-9,2,-8,26,1,2,-2,-25,-27,-9,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-28,-11,1,-21,-20,3,-16,16,-11,8,-4,-17,22,36,-9,-10,-16,-20,-8,9;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-2,-27,-3,13,-35,-17,1,-20,15,-20,-4,-2,-10,38,9,0,-8,-23,-20,-12,25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-14,-24,-16,-6,-14,-19,-8,-16,10,-3,-4,-8,-20,0,35,-11,-8,-10,-20,-10,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='A'; M=24,-3,-14,-5,8,-22,-4,-13,-17,-6,-19,-15,-1,-8,0,-13,17,4,-10,-29,-20,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-17,-16,-14,-24,26,-20,-21,-14,-17,-14,-6,-14,-14,-20,6,-7,-11,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,26,-28,39,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=7,-20,-19,-27,-20,-1,-21,-12,15,-15,7,15,-19,-20,-13,-18,-10,-6,14,-13,6,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-23,-7,-4,-16,-17,-5,-17,15,-15,-1,5,-16,3,25,-2,4,-12,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='B'; M=-12,24,-27,22,16,-28,-11,0,-28,18,-28,-18,24,-12,6,8,0,-7,-27,-32,-17,11;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18,73,-10,-20,-7,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,10,-5,16,6,-33,-19,-9,-30,6,-27,-18,0,-2,5,-3,-5,-10,-24,-33,-19,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-31,-26,2,-29,-22,29,-21,20,24,-27,-27,-21,-19,-17,-5,32,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-25,-33,-25,21,-33,-17,24,-27,25,14,-23,-27,-21,-22,-23,-10,12,-7,18,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-24,-19,-30,-20,13,-22,-13,13,-20,25,28,-22,-24,-14,-16,-19,-9,7,-15,2,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-27,23,39,-31,-15,-1,-29,5,-23,-20,5,-5,17,-2,7,-5,-27,-32,-19,28;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-35,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,72,-10,-20,-6,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-16,-17,-25,-19,10,-28,-22,9,-21,9,3,-12,-19,-19,-17,-3,18,8,-20,0,-19;
MA   /M: SY='S'; M=16,-5,-16,-7,-8,-23,21,-15,-24,-13,-26,-18,3,-13,-8,-15,22,4,-14,-30,-23,-8;
MA   /M: SY='A'; M=18,-4,-19,-12,-12,-14,10,-9,-16,-11,-16,-12,1,-17,-11,-15,3,-6,-13,-15,-6,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,37,-26,51,14,-36,-8,-4,-34,-2,-26,-26,14,-10,-2,-12,2,-8,-24,-36,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=14,-16,-21,-15,-8,-20,-12,-20,-8,-12,-17,-12,-14,23,-12,-19,3,-1,-4,-28,-22,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-27,-1,4,-22,1,-9,-22,7,-15,-10,6,-16,-2,1,-6,-10,-20,-25,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-15,-19,-13,-1,-22,-18,4,-20,18,4,-14,-20,-13,-15,-2,13,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-8,-23,-8,4,-24,-5,-10,-16,0,-15,-8,-7,-14,6,3,-1,-8,-10,-23,-16,4;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-10,-25,-9,-2,-16,-10,9,-13,-4,-6,-2,-8,-19,-5,-5,-11,-12,-9,-25,-6,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-14,12,-30,20,28,-32,-18,0,-30,16,-23,-16,4,-8,20,14,-3,-10,-27,-27,-15,23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-18,-30,-24,0,-28,-21,32,-20,14,20,-21,-21,-18,-20,-14,-5,29,-21,-3,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-20,-25,-23,-8,24,-28,-15,0,-14,7,1,-15,-22,-16,-4,-16,-10,-3,-10,6,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,7,-25,3,15,-28,-13,2,-22,8,-21,-11,11,-12,22,11,2,-6,-24,-26,-15,18;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-12,-24,-12,-2,-9,-23,9,-1,-16,6,3,-9,-18,-4,-12,-8,-7,-5,-27,-2,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,5,-30,-24,1,-28,-21,14,-25,25,17,-27,-30,-21,-20,-21,-8,15,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-25,-15,-7,-7,-26,-7,-2,4,1,3,-15,-21,1,1,-15,-8,-2,-13,8,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-25,8,30,-27,-17,-1,-23,20,-20,-11,0,-4,20,10,-3,-8,-22,-21,-12,25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,5,-25,-18,0,-25,-20,5,-26,24,6,-21,-28,-18,-20,-14,-5,3,-29,-9,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-26,1,7,-26,-14,-4,-21,19,-24,-10,4,8,11,9,-4,-7,-22,-21,-13,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=10,-7,-21,-8,12,-18,-14,-11,-14,-1,-5,-8,-9,-12,1,0,-3,-6,-11,-23,-15,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-22,-1,17,-18,-16,2,-14,8,-9,2,-3,-8,17,12,-5,-8,-15,-19,-9,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-25,1,6,-13,-19,-5,-15,4,-7,-8,-7,-15,-1,-3,-9,-8,-13,-15,3,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-25,-3,-13,-27,46,-13,-33,-15,-30,-20,12,-18,-13,-15,9,-10,-26,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-13,-27,-15,-7,-17,-26,-16,-4,18,-11,0,-9,-17,-3,17,-12,-8,2,-22,-8,-7;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-21,-17,-26,-20,12,-25,-17,6,-11,3,9,-17,-24,-18,-2,-9,2,14,-18,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-31,-25,8,-32,-19,26,-24,24,14,-26,-28,-21,-21,-21,-7,23,-15,9,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-14,-4,5,-14,-20,-16,-14,-6,-12,-12,0,-8,-4,-8,16,37,-6,-30,-12,1;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-27,0,4,-24,-17,66,-27,-6,-22,-3,8,-17,17,0,0,-12,-27,-30,8,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,7,-16,12,12,-15,-9,0,-17,8,-12,-10,3,-6,5,13,-2,-5,-13,-15,-8,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-26,-2,0,-18,-21,13,-11,0,-2,8,-5,-18,8,-1,-13,-12,-14,-24,-2,3;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-8,-23,-7,-14,-11,-10,-15,4,-17,5,8,-12,-21,-14,-18,-13,-10,4,-26,-10,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-24,-6,8,-4,-20,-10,-5,-10,-10,-8,3,-13,-4,-11,1,-3,-9,-25,-8,2;
MA   /M: SY='V'; M=10,-19,-15,-22,-17,-8,-19,-4,6,-17,6,4,-17,-22,-15,-17,-7,-5,14,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-18,-26,-17,-2,-23,-16,10,-13,20,16,-21,-24,-13,-5,-16,-7,11,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-25,5,11,-22,-16,13,-25,11,-22,-12,14,-13,7,13,1,0,-22,-29,-9,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-24,-19,-11,5,-25,-3,-1,-1,-3,9,-15,-22,0,-3,-13,-8,-2,-7,16,-6;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-20,-18,-16,-19,12,-21,-7,-17,-12,-8,-6,-15,-14,-21,5,-5,-4,-23,-19,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-14,37,-27,53,22,-36,-10,-2,-36,0,-29,-27,16,-9,3,-9,6,-5,-27,-39,-20,13;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-30,-3,2,-22,-20,53,-30,12,-22,-5,5,-18,10,25,-10,-15,-25,-25,6,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-23,-29,-21,7,-28,-14,20,-23,21,11,-22,-24,-16,-21,-19,-8,10,-9,14,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-19,-34,-29,30,-32,-20,19,-24,10,7,-24,-28,-29,-20,-16,-6,22,-7,17,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,35,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-15,2,-26,-2,6,-2,-19,28,-22,-1,-16,-8,8,-17,0,0,-7,-12,-22,-22,5,2;
MA   /M: SY='N'; M=-11,14,-28,14,12,-29,2,0,-29,4,-25,-17,16,-14,10,7,1,-10,-28,-29,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-5,-20,-6,7,-24,-15,-9,-13,5,-17,-8,-5,-12,11,-2,5,-2,-7,-26,-15,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-22,-30,-23,-2,-30,-25,31,-25,15,12,-18,-21,-18,-24,-10,-4,23,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-9,-30,-8,10,-13,-26,-2,-6,2,-8,-3,-8,-14,11,6,-9,-10,-12,-15,4,8;
MA   /M: SY='E'; M=0,-5,-24,-6,16,-10,-17,-6,-19,2,-13,-10,-5,-11,8,3,-3,-8,-17,-18,-9,12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-27,0,19,-15,-7,-5,-18,-3,-14,-12,-8,-13,0,-8,-5,-10,-14,-18,-4,9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-9,-30,58,-17,-39,-16,-29,-20,0,-17,-15,-17,0,-19,-30,-21,-29,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-7,5,-20,5,1,-21,-15,-10,-23,8,-21,-15,5,-12,0,13,10,15,-13,-30,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-30,-16,-12,-5,-4,1,-17,-18,-11,-8,-12,11,-15,-16,-12,-14,-20,-20,-7,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-27,17,29,-30,-15,0,-28,8,-23,-17,5,-8,19,8,5,-5,-25,-30,-17,23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-30,9,36,-33,-8,1,-28,6,-21,-13,0,-6,28,1,0,-11,-30,-25,-18,32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-19,-21,-7,8,-28,-19,10,-18,17,6,-22,-24,-17,-16,-16,-7,12,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-26,-27,-17,12,-28,-5,13,-15,7,17,-16,-22,-2,-13,-16,-10,2,-6,18,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,17,-28,19,15,-30,1,-4,-32,11,-28,-19,15,-12,3,2,-1,-10,-28,-29,-19,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-24,3,0,-18,-13,-3,-16,13,-15,-8,20,-18,0,8,-5,-6,-18,-28,-12,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-29,-11,-2,-24,-22,-15,-10,4,-18,-7,-15,20,3,-4,-8,-8,-8,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='A'; M=3,-15,-26,-15,-7,-20,0,-15,-12,-14,-5,-5,-13,2,-2,-15,-8,-10,-15,-22,-17,-6;
MA   /M: SY='C'; M=0,4,21,-3,-8,-20,-8,-11,-23,-13,-27,-20,13,-20,-8,-13,21,8,-14,-43,-23,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,6,-28,12,-1,-13,-19,-4,-19,-7,-18,-16,-3,7,-7,-12,-3,3,-18,-18,6,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-25,-36,-24,-14,7,-22,-18,-18,-8,-16,-13,-21,9,-15,0,-20,-15,-21,27,3,-15;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-18,-18,-10,-12,-19,-19,-1,2,1,1,-16,-19,-10,-5,-9,-5,7,-22,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=6,-17,-17,-21,-12,-13,-19,-11,8,-9,2,16,-17,-19,2,-11,-6,-5,11,-23,-10,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-19,-19,-17,-15,-6,-19,4,-13,-5,1,-17,-23,-8,-13,-6,-7,15,-26,-14,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-10,-26,-11,10,16,-24,-6,-14,-7,-7,-6,-9,-16,4,-6,-9,-10,-17,-10,4,9;
MA   /M: SY='I'; M=5,-25,-23,-33,-23,-3,-28,-25,28,-25,19,12,-20,-20,-17,-25,-15,-7,18,-20,-5,-23;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
DO   PDOC00185;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=V_Lesaux, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00185;
//
ID   ALBUMIN_MP; MATRIX.
AC   MP00212;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serum albumin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2972088; R2=0.0132879; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=388; N_SCORE=10.443; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-28,-6,0,-14,-21,9,-20,21,-17,-5,-4,-16,3,12,-10,-9,-17,-14,10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-34,-9,-5,-27,-4,-13,-23,-12,-27,-17,-12,51,-11,-17,-4,-5,-26,-28,-24,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,3,-28,5,19,-29,-20,5,-22,13,-17,-7,0,-10,24,8,-4,-7,-23,-24,-10,21;
MA   /M: SY='L'; M=16,-21,-17,-27,-17,-5,-18,-20,11,-20,18,10,-19,-19,-14,-21,-11,-6,8,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-18,-4,3,-18,-17,-16,-16,-7,-18,-15,-2,9,-4,-10,14,26,-11,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,7,18,-20,-18,-9,-18,1,-9,-11,-1,-11,2,-4,0,1,-15,-29,-14,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-29,15,28,-28,-15,-6,-26,0,-25,-21,3,18,6,-7,3,-4,-27,-33,-22,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-4,14,-24,-23,10,-11,-2,-6,0,-6,-14,25,-1,-7,-10,-16,-24,-6,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-21,8,-31,-18,22,-29,44,19,-28,-29,-19,-21,-28,-10,11,-20,1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-5,2,-19,-21,-12,-12,12,-9,-4,-8,-17,1,10,-10,-8,-5,-24,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-18,-8,-2,-18,-7,-13,-20,0,-17,-13,0,-12,-3,6,11,15,-10,-27,-15,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-29,-25,4,-31,-19,21,-16,8,8,-24,-26,-20,-17,-17,-8,21,-3,12,-24;
MA   /M: SY='T'; M=2,-13,-15,-21,-16,-1,-20,-17,4,-15,5,8,-12,-17,-13,-15,1,15,7,-23,-6,-14;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-24,-2,-1,-22,-4,-14,-20,6,-13,-10,-4,-14,-5,-1,-4,-3,-14,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-21,18,6,-25,-7,-7,-20,-2,-22,-17,13,-14,-3,-8,7,-2,-13,-34,-19,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-2,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='A'; M=6,-12,-16,-16,-11,-10,-13,-10,-4,-11,2,1,-10,-17,-9,-12,1,5,-1,-25,-9,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,5,-20,4,-1,-26,9,-11,-25,-4,-24,-17,6,-12,-2,-9,11,0,-18,-28,-20,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-19,-34,-24,31,-27,-14,13,-22,23,26,-23,-27,-21,-17,-22,-9,9,-10,10,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-15,-27,-23,1,-29,-25,20,-19,20,11,-26,-27,-23,-17,-15,0,28,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,20,-30,30,26,-35,0,-3,-34,1,-25,-21,7,-8,9,-7,0,-12,-29,-31,-21,17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,11,-26,14,9,-29,-15,-9,-29,27,-28,-16,6,-10,5,13,1,-1,-19,-28,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=3,1,-19,-5,0,-22,-12,-10,-20,11,-20,-11,4,-12,4,7,8,10,-13,-26,-14,1;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-16,-10,-4,-23,-1,-12,-18,-3,-18,-13,-2,-12,0,-2,12,0,-10,-25,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-24,8,18,-28,-15,-8,-20,3,-19,-14,-3,-1,9,-5,1,-6,-16,-28,-18,13;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-25,39,17,-31,-6,0,-31,1,-29,-24,24,-11,3,-5,7,-4,-27,-38,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-34,-6,5,-29,-21,0,-21,10,-25,-10,-7,26,10,2,-9,-11,-24,-25,-14,5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-21,5,20,-22,-17,-8,-18,-1,-12,-12,0,-8,7,-6,4,7,-16,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=15,-14,-14,-18,-16,-14,-6,-22,-2,-14,-9,-6,-12,-11,-17,-18,4,4,10,-27,-17,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-15,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-17,-7,-7,-15,-10,-13,-12,-7,-7,-8,-2,-16,-7,-3,4,6,-5,-27,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-25,4,23,-23,-21,6,-21,10,-17,-11,-2,-9,7,3,-2,-2,-16,-28,-10,14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,12,46,-27,-19,-4,-25,10,-18,-17,-3,-3,14,0,-1,-9,-22,-28,-19,30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-27,-7,-2,-24,20,-12,-29,-2,-20,-14,-2,-16,-5,3,-2,-12,-22,-23,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-33,0,4,-24,-20,-15,-16,-9,-14,-13,-14,40,-6,-15,-10,-10,-21,-29,-21,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-26,-2,6,-28,-17,-6,-21,26,-23,-8,3,-12,14,14,-4,-7,-16,-23,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-33,-23,19,-31,-20,22,-29,36,19,-26,-28,-22,-21,-26,-10,12,-15,5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-12,-23,-17,-15,-12,-20,-19,9,-2,-6,1,-6,-20,-13,-7,-9,-6,12,-26,-10,-15;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-20,0,10,-21,-12,7,-17,-5,-18,-12,4,-11,4,-8,10,1,-13,-31,-12,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-17,-1,7,-18,-12,1,-18,6,-17,-10,2,-8,6,5,8,5,-13,-23,-9,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,7,-9,-9,-12,-12,-15,-11,-11,-13,-11,-1,-12,-8,-11,15,21,-3,-28,-13,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-27,-9,7,-18,-21,-3,-16,9,-8,-3,-6,-16,17,18,-9,-9,-17,-19,-8,11;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-20,-3,5,-22,-8,-10,-21,4,-17,-13,-2,-12,0,4,5,-2,-13,-26,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=16,-15,-14,-20,-13,-8,-14,-19,1,-18,9,0,-13,-17,-12,-18,0,4,3,-24,-11,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-28,-19,7,-29,-11,17,-28,42,18,-27,-29,-18,-18,-27,-10,9,-21,1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-19,-13,-11,-22,11,-20,-19,-9,-18,-13,-6,-5,-12,-15,6,4,-10,-23,-21,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-16,-27,-22,-2,-27,-20,21,-17,11,19,-19,-21,-16,-17,-8,8,24,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-24,-17,-28,-24,-2,-15,-18,16,-19,16,23,-23,-26,-18,-17,-16,-7,20,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-1,-18,-4,5,-26,-10,-5,-18,-2,-21,-10,3,-10,20,-4,19,10,-15,-29,-15,13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,23,-24,11,9,-29,-9,10,-20,4,-26,-11,34,-16,26,4,6,-4,-30,-31,-16,17;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-1,-30,3,26,-24,-20,0,-30,21,-20,-14,0,-11,14,40,-6,-10,-24,-24,-14,17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00186;
//
ID   LIPOCALIN_MP; MATRIX.
AC   MP00213;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipocalin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4507987; R2=0.0076347; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=989; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=793; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-24,-77,-11,-51,-68,-24,-58,-63,20,20,10,-6,33,72,11,18,-58,-65,36,-61;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='A'; M=57,-71,-69,-5,-20,-67,-72,25,-64,-35,-60,-16,-72,-64,-2,-21,39,-24,-82,-69; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-85,-34,16,35,-48,-78,-28,-82,52,-53,-87,-91,-78,-84,-83,-76,-34,-78,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='H'; M=-43,-85,-13,-75,-72,-89,49,-30,-36,-1,-62,-74,-87,-24,19,-38,0,42,-95,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='C'; M=-1,124,-5,-81,-37,-17,-84,-82,-82,-26,-75,-32,-93,-84,-87,-23,-69,-74,-101,-84; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='V'; M=-33,-94,-46,-96,-17,16,-98,-38,-96,-3,-73,-90,-40,-95,-99,-48,-42,37,-101,-84; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='P'; M=16,-76,-17,-67,-69,-43,-73,8,-70,17,-57,-68,64,-67,-75,36,-31,4,-83,-71; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='H'; M=7,-74,-30,-31,9,-40,67,-68,-55,-14,-59,15,23,55,-15,26,21,-67,6,-56; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='P'; M=47,-14,-71,-21,24,-26,-71,0,-39,-6,-14,-67,50,-27,-71,-8,-4,-3,-74,-62; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-63,35,-4,-17,-68,-74,-8,-77,-70,-68,66,45,-4,-38,-66,-8,-81,-73; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='E'; M=13,-98,-44,25,-94,-38,-90,-33,-86,-24,-26,-87,-93,-80,-92,0,-26,-53,-104,-37; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='V'; M=-85,-100,-50,-95,-44,-61,-27,-15,-91,-42,-79,-93,-20,-39,-14,-2,-46,35,-107,-36; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='P'; M=-35,-21,-23,-46,-81,-54,-85,19,-80,-20,-70,-18,61,-80,-87,-7,7,-2,-96,-83; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-91,-79,-41,-91,-83,-22,-75,-5,-42,-75,-74,-3,59,-22,8,-41,8,-95,-82; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='V'; M=-18,-72,-71,-3,-63,-78,17,2,-42,-13,18,-34,18,-67,-72,-38,39,62,-87,-65; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='M'; M=-19,-77,-65,-8,-71,-31,-16,-35,22,-56,80,-30,-71,78,-4,-37,-35,15,-78,-62; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-29,-82,21,60,-84,-46,-15,-79,8,-78,-69,-27,26,64,5,-2,-19,-50,-82,-70; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-46,-77,47,-34,-83,0,-53,-84,-35,-88,-77,99,-76,-26,-64,-33,-33,-84,-96,-32; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='F'; M=-78,-77,-91,-86,98,-55,-73,-31,-49,35,-49,-83,-90,-87,-80,-80,-71,-37,-54,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=-9; IM=-9; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-77,97,-2,-84,-40,-50,-82,-51,-83,-76,66,-68,24,-34,-19,-54,-81,-96,-70;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-74,-38,6,-14,-76,-68,30,5,27,6,-68,18,-8,10,-40,-34,26,45,-58;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-72,21,21,-80,-58,-14,-76,19,-76,-67,45,-31,58,-14,50,-50,-71,-81,-67;
MA   /M: SY='K'; M=-43,-79,-2,37,-80,-70,-54,-80,73,-77,-66,2,-65,43,56,-56,-59,-76,-76,-66;
MA   /M: SY='F'; M=-66,-73,-82,-80,70,-84,-65,49,-75,11,-42,-77,-81,-75,-74,-71,-61,36,-52,67;
MA   /M: SY='A'; M=49,-67,-63,-37,-14,-60,-16,-56,-60,23,-15,24,-71,5,-36,39,-16,-24,-70,25;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-29,-73,-16,8,-4,-71,-60,-64,56,-26,-18,-27,1,-49,47,-53,51,-17,-75,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-79,-70,-70,48,-78,74,-58,-64,-7,-49,-66,-81,-61,-7,-67,-66,-62,10,109;
MA   /M: SY='S'; M=9,-68,-54,38,-69,-8,-62,10,-57,-25,-60,18,-65,-23,-63,58,23,1,-81,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-70,-81,-76,-51,-80,-75,65,-73,22,65,-73,-74,-70,-75,-66,3,47,-77,-57;
MA   /M: SY='A'; M=77,-66,-65,6,-17,7,-18,-38,-61,-17,-58,-62,-68,-26,-37,-17,-55,-14,-71,6;
MA   /M: SY='M'; M=-42,-72,-72,-39,-29,-21,-66,19,48,33,68,-66,-73,-58,-5,-65,-34,29,-74,-58;
MA   /M: SY='A'; M=71,-67,-70,-64,-34,20,-69,10,16,6,-54,-63,-69,-61,-63,-50,-56,-12,-73,-27;
MA   /M: SY='S'; M=28,-69,35,-32,-77,-6,-61,-72,-58,-76,-69,3,37,-24,-64,71,-3,-44,-83,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-27,-71,46,-53,-73,-61,5,-64,-35,-52,-65,58,46,-56,-19,33,32,4,-87,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-2,66,39,39,-75,-64,-60,-70,6,-71,-21,19,-66,-23,-33,33,27,-18,-86,-70;
MA   /M: SY='F'; M=-29,-75,-37,-38,45,14,-18,29,17,-22,-55,-13,25,-8,22,-4,-59,1,-68,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-76,7,63,14,-18,-62,-68,-34,5,-62,-29,-66,17,-60,32,-34,-68,90,-55;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-72,-70,-61,60,-75,-63,-51,55,46,-47,-1,-15,-59,5,-65,-61,-55,-63,-47;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-31,-18,-73,-40,-2,-34,-68,42,-13,40,-12,-15,-77,49,-8,-26,-36,-31,-75,-59; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-33,-87,49,50,-89,-76,-63,-86,6,-84,-24,10,-14,-6,32,-25,-38,-53,-92,-77; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=3,74,31,59,-39,-68,-61,-7,6,-68,-20,-54,-31,7,-58,16,-6,-42,-83,-69;
MA   /M: SY='N'; M=-61,-76,-27,19,-74,20,30,7,46,-51,-19,65,-67,31,-13,-53,-33,-67,1,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-25,-74,26,1,-69,41,20,4,-21,-9,-59,-9,-31,32,-62,23,-5,-7,-79,-26;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00187;
//
ID   FABP_MP; MATRIX.
AC   MP00214;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytosolic fatty-acid binding proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2679157; R2=0.0149744; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=189; N_SCORE=8.088; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=18,-22,-13,-26,-19,-5,-17,-23,10,-19,13,5,-22,-22,-19,-20,-7,-3,17,-23,-11,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-18,-19,-17,-8,-27,5,8,-17,-1,4,-10,-20,-13,-14,-3,7,13,-28,-1,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,6,-18,-17,-22,4,-19,-21,-18,-19,-6,-14,6,-16,-21,-9,-13,-18,-30,-25,-18;
MA   /M: SY='A'; M=33,-4,-16,-9,9,-23,-6,-14,-16,-4,-13,-13,-7,-7,-2,-14,7,-3,-8,-23,-20,4;
MA   /M: SY='A'; M=11,-17,-16,-18,-5,-9,-19,-19,5,-14,8,1,-19,-19,-13,-16,-7,-4,11,-25,-12,-9;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-20,0,15,-23,-10,-7,-23,5,-21,-16,1,-10,6,11,11,1,-16,-29,-18,9;
MA   /M: SY='A'; M=35,2,-12,-10,-8,-20,0,-13,-12,-8,-15,-12,7,-12,-8,-15,10,0,-7,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='M'; M=0,-15,-19,-22,-13,-8,-16,-5,6,-2,6,35,-14,-17,0,-6,-10,-6,3,-22,-6,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-14,-13,-4,-17,-10,-18,-8,-9,-12,-10,-9,0,-9,-15,8,6,0,-25,-17,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-21,-24,-16,-6,-19,-6,11,-11,7,36,-16,-4,-3,-12,-11,-4,4,-24,-7,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-13,-12,-8,-9,-14,-13,1,-9,-4,-2,-11,8,-7,-11,-3,1,2,-18,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-2,-20,-4,1,-15,-15,-3,-5,0,-4,14,-5,-13,4,-2,-5,-5,-6,-23,-9,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,8,-20,6,3,-25,-7,-9,-20,0,-21,-15,7,-6,-1,-8,6,-2,-14,-29,-19,1;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-22,-36,-27,61,-30,-18,3,-27,12,2,-21,-29,-31,-19,-21,-10,0,9,27,-26;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-14,-5,-4,-10,-15,-12,-7,-12,-5,-8,-1,-17,-9,-13,4,4,-4,-29,-11,-6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-20,-30,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-2,-20,-7,-3,-17,-19,-11,-16,13,-17,-9,0,-13,-1,9,4,15,-8,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-42,-34,-27,21,-24,-14,-13,-18,-12,-13,-33,-30,-19,-17,-33,-23,-22,103,45,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-29,6,17,-30,-18,-3,-28,30,-26,-11,5,-10,18,20,-4,-8,-23,-24,-13,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-31,-24,10,-29,-19,23,-25,32,23,-27,-28,-20,-19,-23,-8,19,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-23,6,7,-16,-22,-6,-10,-4,-9,-7,-6,-16,1,-8,-5,-6,-6,-23,-4,3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-21,2,8,-24,-11,-3,-24,8,-24,-15,4,-11,6,10,12,2,-16,-30,-15,6;
MA   /M: SY='S'; M=0,6,-18,6,11,-26,-8,-2,-21,-2,-26,-15,12,-10,16,-3,22,8,-19,-34,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-29,17,42,-30,-19,7,-30,12,-22,-17,2,-4,17,3,-2,-9,-28,-29,-15,29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,35,-21,17,-2,-21,7,8,-22,-2,-30,-20,53,-20,-2,-2,9,-2,-30,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-30,47,38,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-28,14,28,-30,-6,-6,-29,6,-23,-18,2,-4,8,-3,0,-10,-25,-28,-20,18;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-31,-25,51,-30,-3,3,-21,8,3,-21,-30,-25,-16,-20,-10,-2,15,47,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-9,20,-19,33,42,-24,-24,-9,-14,-24,-10,11,-20,0,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-28,2,12,-27,-19,-8,-28,35,-25,-11,0,-11,9,26,-6,-7,-19,-23,-12,9;
MA   /M: SY='A'; M=19,-5,-17,-9,5,-21,-10,-13,-15,2,-14,-11,-5,-11,-2,-4,5,-1,-7,-25,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-29,-20,2,-29,-20,21,-20,29,19,-25,-26,-17,-16,-22,-8,16,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-29,-4,-16,-30,59,-18,-38,-18,-29,-20,1,-18,-18,-19,1,-17,-28,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-30,-27,4,-31,-24,28,-23,21,14,-28,-29,-25,-20,-17,-4,34,-23,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-28,3,-4,-27,17,-11,-28,-10,-29,-21,10,9,-9,-14,4,-8,-27,-30,-26,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-14,-23,-15,-8,7,-20,-17,-5,-16,-1,-4,-15,-21,-15,-16,-13,-9,-5,2,1,-10;
MA   /M: SY='A'; M=4,0,-21,1,-3,-12,-15,-13,-6,-10,-6,-3,-7,-13,-9,-16,-4,-6,-2,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-17,-20,-21,-14,-6,-26,-19,11,-12,10,8,-16,-18,-11,-12,-10,3,10,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-16,-29,-18,-9,-14,-26,-10,-6,13,-8,-1,-7,-20,0,38,-13,-9,-3,-21,-7,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,2,14,-32,-19,-4,-26,30,-26,-9,1,-8,22,18,-4,-6,-23,-22,-11,18;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-20,-24,-17,-7,-24,-17,12,-8,9,13,-18,-20,-12,-10,-13,-7,14,-22,-6,-15;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-18,-18,-15,-20,19,-20,-15,-15,-13,-10,-8,-15,-14,-20,4,-7,-7,-20,-19,-15;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-16,-8,-5,-18,-14,-12,-14,10,-15,-8,2,-17,-4,7,-2,-1,-6,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-3,2,-20,1,-4,-13,-15,0,-11,-9,-5,-2,1,-17,-4,-9,-3,-1,-9,-28,-8,-4;
MA   /M: SY='I'; M=5,-14,-19,-18,-16,-5,-22,-20,11,-19,8,3,-15,-19,-16,-20,-7,-1,11,-22,-7,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-25,-1,4,-26,-12,-10,-26,29,-27,-12,6,-11,4,16,-1,-2,-18,-24,-13,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00188;
//
ID   SUGAR_TRANSPORT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00216;
DT   01-AUG-2007 CREATED; 01-AUG-2007 DATA UPDATE; 01-AUG-2007 INFO UPDATE.
DE   Sugar transport proteins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=393;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=388;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5937655; R2=0.0212681; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1986; N_SCORE=44.821; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=184; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=1,-17,-16,-23,-17,-6,-21,-20,9,-17,5,4,-13,-17,-14,-15,-6,1,9,-24,-9,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-14,-28,-21,6,-23,-21,11,-23,15,8,-20,-23,-20,-19,-13,-3,9,-16,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-22,-27,-21,7,-19,-20,9,-21,11,6,-19,-20,-19,-18,-14,-6,7,-12,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-17,-26,-20,2,-18,-20,8,-18,5,5,-17,-21,-17,-17,-8,-4,10,-16,-4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=10,-20,-12,-25,-18,-6,-17,-21,9,-20,11,5,-17,-20,-16,-20,-6,-2,10,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=7,-17,-15,-22,-17,3,-9,-18,-6,-18,-3,-5,-13,-20,-17,-18,-3,-1,-2,-7,-2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-17,-29,-22,11,-22,-21,13,-24,18,10,-20,-25,-21,-20,-14,-5,11,-19,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=9,-11,-21,-15,-17,-19,24,-19,-16,-18,-14,-10,-5,-18,-16,-19,2,-8,-9,-23,-20,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-21,-17,-17,-3,1,-12,-9,-17,-7,-6,-8,-21,-15,-16,-5,-5,-7,-12,-1,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-28,-17,-34,-25,36,-27,-21,10,-26,18,8,-23,-28,-29,-20,-19,-8,9,-7,10,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-29,-20,7,-26,-19,19,-23,25,18,-22,-23,-17,-19,-18,-6,13,-19,-1,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-2,-21,-3,-6,1,-13,-9,-12,-12,-9,-8,-4,-15,-11,-13,-4,-5,-9,-19,-4,-8;
MA   /M: SY='G'; M=2,-14,-23,-16,-18,-9,20,-15,-19,-17,-16,-11,-8,-17,-17,-18,-2,-10,-14,-11,-8,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-22,-28,-21,23,-27,-10,8,-21,17,10,-22,-26,-18,-16,-19,-7,3,0,22,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,28,-25,37,8,-30,-3,-6,-29,-5,-24,-22,13,-12,-4,-11,4,-3,-21,-35,-19,2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-15,-20,-20,-13,-1,-21,-16,4,-13,2,2,-11,-19,-12,-8,-5,3,4,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-21,-13,-15,-7,7,-15,-14,-14,-12,-7,-5,-18,-14,-14,1,0,-9,-19,-8,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-16,-26,-21,0,-25,-21,18,-21,12,9,-18,-23,-18,-19,-9,0,19,-23,-5,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-22,-30,-23,4,-28,-20,23,-22,16,13,-21,-21,-18,-21,-16,-6,18,-18,3,-22;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-18,-8,-9,-14,-1,-10,-10,-11,-15,-7,7,-15,-7,-12,8,2,-8,-29,-15,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-22,-20,-17,-2,-15,-18,2,-18,-2,-1,-15,-5,-17,-18,-8,-3,3,-21,-7,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-14,-21,-15,-8,-13,-19,3,-15,-1,-2,-12,-16,-14,-18,0,-1,7,-22,-10,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-20,-24,-17,0,-21,-14,11,-19,18,15,-16,-22,-12,-16,-14,-6,6,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-29,-7,-1,-21,-17,-14,-14,-8,-17,-13,-9,31,-6,-12,-3,-3,-18,-28,-19,-6;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-19,-5,-3,-13,-15,-8,-10,-9,-11,-7,-5,-11,-5,-11,4,4,-5,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-23,-34,-26,17,-32,-21,27,-26,25,18,-24,-26,-22,-22,-22,-9,19,-14,8,-25;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-21,-12,-3,-17,-13,-9,-8,-2,-8,-1,-5,-15,3,-3,-1,-3,-6,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-23,3,10,-23,-14,-3,-21,7,-18,-11,3,-11,7,7,1,-3,-18,-26,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-25,15,17,-24,-14,0,-22,1,-19,-15,5,-9,8,-3,2,-4,-20,-29,-13,12;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-23,-32,-24,34,-25,-16,4,-25,17,6,-23,-28,-25,-18,-22,-10,0,7,19,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-26,-2,-8,-16,15,-3,-25,-11,-22,-14,5,-16,-9,-12,-1,-11,-21,-19,-12,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-22,-20,-13,-3,-21,-14,5,-16,8,5,-16,-13,-13,-15,-11,-4,4,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-19,3,-1,-21,-5,-9,-20,-6,-24,-16,5,-4,-2,-9,17,11,-14,-32,-16,-2;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-18,-8,-6,-16,-9,-12,-13,-8,-13,-10,-3,-4,-8,-10,1,0,-11,-25,-15,-8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='A'; M=5,-10,-17,-13,-8,-9,-10,-15,-7,-12,-4,-4,-8,-14,-9,-12,2,4,-3,-19,-10,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-4,-24,-4,5,-20,-15,-4,-14,-2,-10,-5,-4,-14,10,-3,-2,-3,-14,-20,-9,7;
MA   /M: SY='M'; M=1,-17,-21,-21,-13,-6,-19,-13,4,-13,3,5,-14,-19,-7,-13,-7,-2,3,-13,-2,-11;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-23,-7,-6,-24,22,-12,-26,-11,-21,-14,0,-14,-4,-12,6,-4,-20,-24,-20,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-26,-26,-29,-21,6,-22,-17,5,-21,11,6,-23,-25,-17,-17,-20,-11,0,17,9,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-24,-17,-29,-23,3,-26,-24,21,-23,16,11,-21,-23,-21,-21,-12,-1,20,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-17,-24,-22,3,-18,-22,10,-20,6,4,-16,-23,-21,-18,-8,1,14,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-13,-6,-7,-17,-1,-15,-15,-11,-19,-14,3,-12,-7,-14,21,14,-6,-31,-18,-7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-16,-15,-20,-16,-10,-6,-20,1,-18,-3,-1,-11,-18,-14,-19,2,-1,5,-24,-13,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-19,-19,-24,-20,22,-20,-10,-1,-18,4,0,-16,-23,-19,-16,-10,-2,0,-3,20,-20;
MA   /M: SY='A'; M=3,-13,-17,-18,-13,0,-13,-15,-3,-16,-1,-2,-8,-16,-12,-15,1,3,-1,-21,-5,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-21,-31,-23,7,-26,-22,20,-25,23,12,-24,-26,-21,-21,-19,-7,15,-13,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=8,-12,-20,-16,-17,-18,21,-19,-17,-16,-14,-8,-7,-16,-16,-18,3,-3,-8,-23,-20,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-12,-15,-18,-14,-1,-13,-8,-6,-10,-3,2,-8,-22,-8,-7,-6,-5,-5,-16,2,-12;
MA   /M: SY='A'; M=12,-18,-18,-23,-16,-4,-8,-20,-1,-18,2,0,-15,-13,-16,-19,-5,-3,2,-18,-10,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-32,-25,9,-25,-24,23,-26,17,11,-21,-23,-23,-23,-16,-7,19,-19,-1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-14,-22,-17,-18,-10,24,-18,-18,-20,-11,-7,-7,-21,-18,-18,-1,-9,-12,-19,-16,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-14,-13,-7,-19,-3,-14,-11,-10,-11,-6,-6,-14,-2,-12,5,-1,-8,-26,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-24,-27,-18,7,-26,-21,9,-23,15,6,-23,-3,-20,-20,-18,-7,3,-16,-4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-22,-30,-22,13,-25,-23,14,-24,13,6,-22,-14,-23,-21,-16,-6,11,-16,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=3,-17,-18,-21,-18,2,-2,-18,-9,-18,-6,-5,-12,-21,-17,-18,-3,-4,-5,-6,-4,-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-26,-10,-17,-27,52,-18,-34,-17,-27,-17,0,-17,-16,-18,3,-14,-25,-22,-26,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-18,-27,-20,-13,-5,-19,-11,-8,-6,-7,-4,-15,-9,-9,-2,-12,-8,-8,2,2,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-19,-32,-23,12,-28,-20,19,-26,28,16,-25,-26,-20,-21,-22,-9,12,-13,3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-13,-14,-12,-17,5,-17,-12,-14,-13,-10,-4,-15,-11,-17,11,3,-4,-27,-19,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-28,52,15,-35,-9,-1,-35,1,-28,-26,18,-11,0,-5,2,-7,-27,-37,-18,7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-12,-4,-15,-20,-6,-17,15,-15,-6,-5,-17,2,26,-9,-8,-12,-16,-6,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-23,-31,-24,31,-28,-11,6,-21,9,4,-20,-27,-23,-16,-19,-10,3,5,21,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-29,-8,-16,-29,60,-17,-38,-18,-29,-20,2,-18,-17,-18,2,-17,-29,-22,-28,-17;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-11,-2,-17,-19,-2,-25,19,-18,-9,-2,-16,5,46,-6,-6,-16,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-29,-7,3,-24,-21,-7,-24,34,-22,-8,-2,-14,8,40,-10,-10,-16,-20,-9,4;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-26,-11,-4,-16,-17,-10,-13,4,-12,-6,-7,-5,-3,6,-7,-5,-11,-19,-8,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-15,-24,-19,-5,-17,-20,8,-19,4,6,-15,-19,-15,-18,-4,1,10,-21,-8,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-33,-24,17,-30,-17,22,-25,27,21,-24,-26,-19,-20,-23,-9,13,-13,9,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-19,-26,-20,2,-20,-18,11,-20,17,12,-19,-24,-17,-16,-14,-5,10,-19,-4,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-18,-27,-21,7,-20,-20,9,-20,9,6,-18,-24,-19,-16,-12,-4,9,-13,-1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-8,-14,-12,-12,-17,12,-17,-18,-15,-16,-12,-2,-16,-12,-16,10,1,-10,-26,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,-15,-23,-19,-3,-17,-18,10,-20,9,8,-13,-22,-15,-19,-9,-3,8,-23,-8,-18;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,-16,-30,-23,5,-24,-24,17,-25,18,8,-22,-24,-21,-22,-15,-6,15,-19,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-17,-29,-23,3,-21,-22,15,-23,15,11,-21,-22,-20,-21,-15,-6,13,-20,-5,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-22,-31,-24,35,-23,-16,1,-21,4,3,-18,-26,-24,-17,-15,-8,0,10,17,-22;
MA   /M: SY='S'; M=2,-13,-11,-18,-16,-10,-2,-20,-6,-18,-8,-6,-8,-19,-15,-18,4,3,-1,-26,-14,-16;
MA   /M: SY='I'; M=1,-25,-18,-30,-23,3,-25,-24,20,-24,20,11,-22,-23,-20,-22,-15,-5,18,-21,-5,-22;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-17,-14,-16,-10,17,-19,-18,-18,-14,-11,-6,-18,-18,-18,2,-5,-10,-22,-16,-17;
MA   /M: SY='S'; M=7,-5,-12,-10,-8,-12,-7,-10,-13,-11,-16,-10,0,-14,-7,-13,14,12,-7,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-17,-29,-22,6,-19,-23,13,-24,16,7,-21,-25,-22,-21,-14,-6,13,-18,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-18,-28,-21,0,-15,-22,11,-23,17,9,-21,-23,-19,-21,-15,-8,9,-19,-7,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-13,1,-19,-14,-10,-15,-15,-5,-15,-5,2,-9,-20,-6,-15,-3,-2,-4,-27,-12,-10;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-16,-18,-16,-15,14,-20,-15,-16,-13,-10,-8,-15,-16,-19,4,-4,-6,-20,-18,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-24,-13,-30,-22,18,-22,-20,6,-24,13,6,-20,-25,-22,-20,-15,-7,5,-10,3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-12,-15,-10,-16,-5,-18,-8,-13,-12,-9,-7,-9,-10,-17,13,6,0,-28,-18,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-27,-5,-2,-19,-13,-3,-18,-5,-20,-12,-2,5,0,-6,0,-1,-18,-20,-11,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,10,-19,6,-2,-19,2,-2,-21,-8,-23,-16,16,-13,-4,-9,14,6,-18,-33,-17,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-22,-27,-20,13,-23,-18,8,-19,9,5,-20,-20,-20,-16,-15,-7,8,-9,6,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-11,-27,-12,-5,-10,-13,-11,-14,-10,-15,-10,-10,-5,-7,-13,-5,-5,-15,3,-3,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-12,-20,-16,-10,-9,-14,-9,-2,-10,-3,6,-10,-18,-4,-10,-3,0,-1,-17,-5,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21,18,-28,-17,16,-26,30,17,-24,-26,-19,-19,-23,-9,8,-14,5,-20;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-18,-30,-24,10,-29,-20,20,-23,16,11,-21,-25,-21,-21,-15,-5,16,-15,6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-18,-29,-23,4,-19,-23,16,-22,13,8,-20,-23,-21,-21,-12,-6,17,-19,-5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,-18,-16,-22,-19,0,4,-18,-9,-20,-1,-2,-13,-22,-19,-19,-6,-8,-5,-15,-8,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-30,-11,-2,-18,-18,-1,-28,26,-19,-10,-1,-20,7,60,-11,-10,-20,-14,-7,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-18,-31,-24,16,-23,-23,14,-23,11,8,-20,-24,-24,-20,-12,-3,15,-14,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-32,-25,6,-27,-24,24,-27,27,15,-24,-26,-22,-23,-21,-9,17,-19,-2,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-10,-19,-15,-8,-15,-15,-10,-2,-10,-2,2,-7,-17,3,-9,-2,0,-2,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-27,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-19,1,-18,-27,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-34,-25,13,-29,-22,23,-25,20,15,-23,-25,-22,-22,-19,-8,17,-12,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=8,-11,-20,-15,-17,-13,29,-19,-23,-18,-18,-14,-5,-19,-18,-19,2,-8,-15,-19,-17,-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-14,-18,-17,-11,-13,-6,-14,-1,-15,-2,0,-11,-19,-10,-16,-6,-7,1,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-19,-12,-15,-26,38,-19,-28,-16,-24,-17,-3,-16,-15,-19,6,-9,-18,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='A'; M=3,-18,-21,-22,-19,-5,2,-20,-5,-19,-3,-2,-13,-14,-18,-19,-6,-7,-3,-17,-11,-19;
MA   /M: SY='L'; M=0,-14,-19,-16,-10,-4,-11,-16,-1,-16,1,1,-12,-18,-14,-17,-6,-4,1,-22,-9,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-14,-21,-17,-14,0,-16,-11,-4,-14,-6,-1,-11,-14,-9,-14,-3,-3,-6,-4,4,-12;
MA   /M: SY='P'; M=1,-14,-25,-14,-9,-19,-9,-17,-9,-12,-15,-8,-11,20,-10,-17,-1,-3,-9,-27,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=3,-18,-12,-22,-18,-8,-13,-21,5,-20,5,2,-15,-17,-17,-19,-6,-1,8,-26,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,-3,-18,-17,-14,-5,-21,-5,-16,-9,-6,-9,-19,-16,-18,5,3,5,-29,-17,-16;
MA   /M: SY='P'; M=1,-14,-22,-16,-10,-11,-15,-13,-6,-13,-8,-3,-11,7,-10,-14,-3,-1,-7,-23,-10,-12;
MA   /M: SY='T'; M=2,-13,-17,-18,-13,-9,-15,-16,0,-11,0,3,-10,-16,-10,-10,-1,5,4,-25,-10,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-22,-22,-25,-20,13,-27,-8,12,-19,14,9,-20,-25,-15,-17,-15,-4,6,-5,24,-20;
MA   /M: SY='I'; M=1,-22,-18,-27,-20,-2,-23,-21,17,-21,16,10,-19,-22,-16,-20,-11,-3,15,-23,-7,-19;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-12,-10,-7,-15,-5,-13,-11,-9,-13,-8,0,-13,-6,-9,14,10,-4,-28,-15,-7; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-26,16,32,-25,-17,-1,-25,5,-19,-16,3,-7,11,1,1,-6,-22,-30,-16,21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-24,-27,-19,6,-25,-18,9,-18,3,5,-18,-23,-15,-17,-15,-8,5,6,7,-17;
MA   /M: SY='F'; M=8,-18,-13,-24,-18,9,-18,-19,0,-18,-2,-3,-14,-20,-19,-18,-1,1,6,-12,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-33,-6,2,-27,-14,-15,-20,-9,-26,-18,-12,53,-7,-16,-3,-4,-25,-30,-24,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-26,-6,4,-21,-16,-13,-18,5,-19,-12,-6,11,-1,0,-1,-1,-16,-25,-16,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-25,2,6,-24,-7,1,-27,11,-24,-14,6,-11,4,12,2,-4,-21,-26,-14,4;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-25,-7,4,-15,-20,0,-11,5,-10,-3,-4,-15,6,4,-7,-8,-11,-20,-5,4; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-28,-11,-1,-17,-20,-3,-25,23,-16,-8,-2,-19,7,53,-8,-8,-17,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-23,-11,-15,-24,37,-18,-27,-16,-23,-16,-1,-15,-15,-17,6,-8,-19,-23,-25,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-21,-15,-8,-9,-16,-13,-10,1,-9,-4,-6,-15,-5,2,-1,3,-6,-18,-7,-7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-20,-17,-25,-18,-1,-18,-17,5,-17,7,5,-19,-20,-15,-18,-10,-5,5,-7,0,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-20,-20,-24,-20,1,-14,-18,9,-20,8,10,-15,-23,-17,-17,-10,-5,9,-16,-5,-18;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-18,-11,-13,-20,18,-18,-18,-15,-20,-13,-1,-16,-12,-16,12,2,-9,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-17,-28,-22,13,-24,-19,10,-22,14,7,-20,-25,-20,-18,-14,-3,9,-11,6,-21;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-20,-22,-18,11,-22,-10,5,-16,6,5,-15,-21,-14,-14,-14,-6,2,3,12,-16; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-18,-6,-3,-13,-6,-6,-11,-6,-13,-6,3,-13,3,-7,5,0,-10,-21,-9,0; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=8,-15,-9,-19,-14,-5,-13,-17,1,-16,4,2,-12,-16,-12,-16,-1,2,4,-21,-9,-13; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,-14,-17,-18,-16,-6,6,-16,-7,-16,-8,-3,-9,-15,-16,-17,-1,-5,-2,-18,-12,-16; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-23,-24,-19,3,-19,-14,6,-18,1,2,-14,-19,-15,-17,-10,-5,5,-8,2,-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,-6,-17,-11,-8,-16,-4,-13,-11,-10,-12,-6,-2,-11,-4,-12,5,5,-7,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-20,-28,-23,6,-19,-23,15,-23,13,8,-20,-24,-21,-21,-13,-4,14,-17,-3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-23,-12,-17,-25,50,-19,-32,-18,-25,-17,-1,-18,-17,-19,3,-14,-23,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='A'; M=1,-15,-22,-19,-12,-10,-10,-16,-3,-15,-5,-2,-12,-8,-8,-16,-5,-4,-4,-17,-9,-11;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-19,-28,-21,2,-22,-22,15,-22,15,9,-20,-20,-19,-21,-12,-3,15,-20,-5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-15,-30,-23,7,-25,-23,17,-25,18,10,-22,-24,-22,-21,-15,-5,16,-21,-3,-23;
MA   /M: SY='G'; M=14,-11,-22,-14,-16,-21,35,-19,-25,-17,-20,-14,-4,-17,-16,-19,4,-10,-16,-20,-22,-16;
MA   /M: SY='P'; M=0,-14,-26,-14,-8,-13,-14,-14,-9,-12,-13,-9,-11,16,-10,-14,-4,-4,-12,-21,-10,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-21,-26,-19,-1,-20,-21,10,-22,8,6,-19,-7,-17,-21,-13,-6,6,-21,-7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-19,-31,-24,5,-29,-24,25,-25,23,13,-24,-25,-22,-22,-17,-5,21,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-21,-9,-14,-18,20,-15,-18,-15,-16,-11,2,-17,-14,-16,4,-5,-13,-25,-19,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-24,-15,-16,-10,14,-12,-17,-16,-13,-9,-7,-17,-14,-15,-2,-8,-13,-14,-6,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-22,-28,-22,8,-17,-19,5,-21,8,3,-20,-23,-19,-19,-15,-10,3,0,3,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-18,-30,-22,12,-26,-21,17,-24,22,13,-22,-25,-21,-20,-17,-5,14,-18,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-14,-17,-19,-14,-10,-9,-16,1,-15,-1,0,-11,-19,-12,-16,-2,-1,4,-23,-10,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-22,-4,3,-14,-14,-7,-13,-3,-10,-7,-4,-8,0,-6,-4,-5,-12,-19,-9,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-6,-23,-8,-3,-7,-15,1,-12,-9,-9,-6,-4,-15,-5,-8,-4,-4,-11,-16,-1,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-16,-24,-20,-15,7,-19,-14,-1,-17,0,-2,-13,-20,-15,-15,-12,-8,-3,1,5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-24,-5,-10,-23,24,-9,-25,-13,-22,-14,2,-16,-9,-13,6,-6,-19,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-37,-46,-37,-28,8,-19,-27,-17,-20,-17,-17,-37,-28,-19,-20,-36,-27,-26,127,26,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-7,1,-20,-17,10,-27,16,-20,-9,0,-16,10,39,-8,-11,-21,-22,-6,2;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-21,-26,-25,-20,-3,-15,-17,3,-18,-3,0,-18,-21,-15,-18,-11,-7,1,13,3,-18;
MA   /I: I=-11; MD=-23;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-16,-21,-15,-9,-19,-16,6,-15,2,7,-16,-3,-11,-17,-7,-3,5,-23,-10,-14; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-37,-27,53,-30,-20,9,-28,20,9,-23,-28,-32,-20,-22,-10,6,-1,18,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-22,-24,-26,-21,7,-7,-16,-1,-21,7,3,-18,-24,-19,-17,-15,-11,-2,-5,2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-31,-24,8,-28,-24,23,-25,17,11,-21,-23,-22,-22,-15,-5,19,-17,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=7,-4,-18,-10,-8,-18,-1,-14,-10,-12,-14,-9,2,-10,-7,-14,5,0,-9,-27,-18,-8;
MA   /I: I=-11; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=7,-13,-14,-16,-15,-11,9,-16,-6,-15,-5,-4,-9,-16,-13,-15,-3,-6,-2,-14,-11,-14; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=1,-21,-16,-24,-17,-6,-19,-22,6,-19,3,2,-19,-4,-17,-20,-10,-5,6,-23,-11,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-32,-24,4,-29,-24,23,-25,18,12,-24,-19,-21,-23,-19,-8,17,-13,-2,-24;
MA   /M: SY='P'; M=5,-13,-22,-13,-11,-22,9,-18,-20,-15,-20,-14,-8,12,-14,-19,-1,-8,-17,-23,-22,-14;
MA   /M: SY='I'; M=5,-23,-17,-28,-21,-1,-19,-23,14,-22,12,6,-19,-20,-19,-22,-10,-6,13,-21,-7,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-21,-30,-23,1,-26,-24,24,-25,22,12,-23,-22,-21,-23,-17,-7,19,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=4,-20,-16,-25,-19,-3,-15,-21,7,-20,7,4,-17,-20,-16,-19,-9,-4,7,-17,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-17,-24,-17,2,-15,-18,5,-19,8,6,-16,-21,-14,-17,-8,-3,4,-18,-5,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-31,-23,12,-26,-21,16,-25,18,10,-23,-23,-22,-21,-18,-7,11,-11,4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-19,-29,-22,10,-19,-20,10,-24,16,10,-21,-23,-21,-20,-16,-8,7,-13,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-17,-23,-18,0,-12,-19,-2,-18,4,0,-15,-20,-17,-13,-9,-4,0,-13,-5,-18;
MA   /I: I=-7; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-17,-22,-15,6,-19,-12,5,-14,10,7,-16,-20,-13,-9,-13,-6,3,-6,4,-14; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-20,-23,-15,9,-24,-15,-2,-11,5,1,-16,-21,-14,-7,-15,-7,-3,-7,4,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-18,-23,-23,-16,13,-22,-12,-1,-14,3,-1,-12,-23,-16,-9,-12,-5,-2,-6,7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-18,-28,-21,7,-25,-19,16,-23,24,14,-23,-26,-19,-19,-19,-7,13,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-35,-7,2,-27,-20,-10,-21,-1,-26,-16,-12,51,-3,-5,-7,-8,-25,-28,-21,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-29,17,36,-29,-15,0,-28,7,-21,-18,4,-3,12,2,-1,-9,-26,-30,-18,23;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-17,-1,-1,-19,-7,-9,-18,-5,-21,-14,5,-9,-1,-6,18,14,-11,-32,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-31,-10,0,-21,-19,-10,-17,-3,-19,-12,-13,33,-4,-6,-8,-7,-20,-24,-16,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-25,-2,3,-22,-13,-1,-22,11,-19,-10,3,-14,6,20,-2,-5,-17,-25,-12,3;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-15,-18,-16,-12,11,-14,-7,-5,-10,-5,-5,-13,-13,-10,-9,-11,-8,-8,24,16,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: M=-1,-6,-12,-7,-1,-6,-10,-8,0,-4,0,-1,-6,-7,-4,-5,-4,-2,0,-12,-5,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: M=-2,-5,-13,-6,-2,-6,-11,-5,-2,-4,0,-1,-4,-7,-3,-3,-4,-3,-3,-13,-4,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-17,-2,-1,-13,-10,-3,-9,1,-9,-3,-2,-10,3,2,-3,-4,-7,-14,-6,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-19,3,6,-16,-11,-2,-15,4,-12,-8,3,-8,5,5,-1,-4,-13,-20,-10,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: M=-3,-11,-21,-13,-7,-9,-19,-12,-3,-7,-1,-1,-10,-15,-6,-5,-5,-2,-2,-22,-7,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-24,2,6,-20,-12,-6,-18,2,-15,-10,1,-9,1,2,-1,-5,-15,-27,-14,2;
MA   /M: M=-3,-8,-22,-10,-4,-13,-12,-11,-11,-3,-10,-6,-6,-13,-6,-3,-3,-2,-7,-22,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-23,3,8,-24,-12,-4,-21,5,-20,-12,3,-6,4,-1,2,-1,-17,-28,-14,5;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-22,-8,-1,-17,-9,-9,-13,-2,-11,-7,-4,-13,-2,-4,0,-3,-10,-25,-13,-2;
MA   /M: M=-4,-3,-21,-3,0,-20,-9,-8,-17,0,-16,-10,-2,-10,-1,-1,0,-4,-12,-27,-14,-1;
MA   /M: M=-2,-10,-23,-12,-4,-12,-13,-14,-8,-6,-8,-5,-8,-9,-5,-7,-4,-3,-7,-22,-11,-5;
MA   /M: M=-4,-9,-23,-11,-4,-11,-16,-11,-9,-3,-7,-3,-7,-12,-2,-4,-5,-2,-8,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-23,-3,3,-19,-14,-8,-14,-1,-12,-8,-3,-7,0,-4,-1,-2,-11,-26,-13,1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-19,-20,-12,-5,-20,-17,3,-13,5,3,-14,-15,-12,-13,-9,-3,2,-19,-6,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-23,-19,-12,-1,-19,-15,2,-13,4,1,-12,-20,-12,-9,-10,-6,1,-17,-4,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-23,-4,2,-16,-7,-7,-18,-1,-15,-10,1,-12,-1,-1,2,-3,-15,-25,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-21,-5,1,-14,-16,-8,-11,-4,-10,-6,-1,-11,-2,-4,0,0,-10,-26,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-23,-25,-18,5,-23,-19,7,-15,7,4,-17,-18,-17,-10,-13,-6,6,-15,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-7,-22,-9,-1,-17,-12,-9,-15,2,-12,-7,-5,-12,1,1,-3,-5,-12,-19,-10,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-21,-14,-7,-6,-18,-12,-3,-12,1,-2,-10,-15,-9,-11,-5,-1,-2,-22,-5,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-17,-20,-20,-15,-2,-19,-12,5,-16,6,5,-13,-19,-13,-14,-9,-3,5,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-23,-28,-20,12,-26,-17,10,-20,16,8,-20,-25,-18,-16,-18,-7,6,-5,6,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-23,-3,1,-18,-12,-8,-19,3,-16,-10,0,-10,0,5,0,0,-15,-24,-12,-1;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-20,1,1,-15,-10,-3,-15,2,-13,-7,2,-9,0,2,-2,-3,-12,-22,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-2,-19,-1,2,-18,-5,-5,-16,3,-16,-9,-1,1,2,1,1,-3,-13,-18,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-13,-2,2,-10,-6,-2,-9,3,-7,-3,-2,-7,1,3,-3,-4,-7,-11,-4,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-8,-13,-10,-6,1,-10,-7,-3,-5,-1,-2,-6,-11,-6,-3,-6,-3,-2,-1,1,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-5;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-14,-13,-16,-11,-1,-17,-13,8,-11,7,5,-12,-12,-9,-11,-8,-2,7,-14,-2,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-23,-26,-18,4,-25,-17,5,-15,9,5,-19,-20,-14,-9,-14,-5,3,-5,2,-16;
MA   /M: M=-7,-14,-23,-15,-11,-7,-17,-13,-6,-8,-6,-4,-11,-13,-9,-5,-7,-4,-5,-12,-2,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-21,-22,-16,-1,-20,-16,6,-15,8,5,-17,-19,-14,-12,-11,-3,6,-17,-2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-18,-27,-20,9,-24,-19,11,-21,14,9,-19,-21,-18,-17,-13,-2,10,-17,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-18,-28,-21,9,-24,-20,12,-21,13,8,-19,-22,-19,-19,-12,-2,11,-15,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-19,-16,-25,-18,1,-22,-19,11,-20,11,6,-16,-21,-17,-18,-9,0,10,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-22,-9,-13,-24,33,-17,-27,-15,-24,-16,0,-14,-12,-16,6,-7,-20,-23,-24,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-19,-26,-20,8,-26,-20,14,-20,12,8,-19,-23,-18,-18,-12,-3,15,-18,1,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-18,-28,-21,15,-23,-20,8,-20,10,6,-19,-24,-20,-16,-13,-4,8,-12,2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-17,-24,-17,-2,-21,-19,9,-18,9,5,-18,-21,-14,-16,-10,-4,9,-18,-5,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-17,-14,-21,-16,6,-19,-14,5,-15,6,6,-15,-19,-13,-13,-10,-4,5,-13,2,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='F'; M=0,-14,-12,-18,-13,4,-13,-13,0,-12,1,1,-11,-18,-12,-11,-6,-4,3,-14,-2,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='V'; M=1,-11,-13,-15,-12,0,-11,-13,1,-12,0,0,-9,-15,-11,-12,-2,1,4,-12,-3,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-10,-12,-13,-9,4,-12,-7,0,-8,0,1,-7,-14,-5,-7,-5,-3,-1,-9,2,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-21,-17,-10,-4,-20,-8,-3,-8,-2,2,-8,-18,-3,-4,-8,-3,-5,-17,0,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-15,-22,-19,-15,7,-12,-9,-5,-16,-2,-3,-10,-21,-13,-14,-8,-5,-7,-5,10,-14;
MA   /M: SY='T'; M=4,-10,-12,-16,-14,-10,-5,-18,-8,-15,-7,-6,-6,-16,-13,-15,4,6,-2,-26,-14,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-21,-19,-25,-21,2,-9,-20,5,-21,3,4,-15,-19,-19,-20,-9,-6,5,-17,-5,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-21,-23,-17,3,-21,-17,11,-19,11,8,-16,-21,-16,-18,-12,-5,9,-18,-1,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-18,-9,-10,-6,-16,-9,-5,-11,-7,-5,0,-16,-7,-11,1,7,-4,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-24,-27,-27,-21,11,-23,-15,2,-19,2,0,-22,-22,-17,-18,-18,-10,-2,23,17,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-30,-22,11,-25,-21,17,-24,20,14,-22,-24,-20,-20,-18,-7,13,-14,1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-26,-12,-5,-15,-15,-14,-12,-10,-16,-9,-10,17,-5,-13,-2,-1,-13,-22,-15,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-15,-23,-18,-11,0,-21,-8,-2,-10,1,2,-12,-16,-5,-9,-8,-2,-5,-12,6,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-24,-28,-23,35,-28,-4,6,-20,9,4,-20,-28,-21,-16,-18,-9,1,8,38,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-17,-23,-17,1,-15,-17,3,-18,11,6,-16,-22,-14,-14,-9,-3,4,-20,-5,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-5,-23,-6,-1,-18,-9,-9,-12,-4,-12,-6,-3,-9,4,-5,0,-1,-11,-24,-12,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-18,3,6,-17,-9,-2,-16,-2,-14,-10,4,-10,4,-3,3,-1,-14,-24,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-11,-18,-13,-7,-7,-16,-13,1,-9,-1,-1,-10,-10,-7,-10,-4,0,1,-17,-6,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-11;
MA   /M: M=-1,-8,-14,-11,-9,-1,-2,-8,-6,-8,-3,-3,-4,-11,-9,-7,-4,-4,-5,-10,-4,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-16,-21,-19,-15,4,-20,-12,2,-13,2,2,-13,-19,-13,-12,-8,-3,2,-15,4,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-24,-2,-7,-23,20,-7,-25,-10,-23,-15,8,-13,-8,-10,4,-6,-21,-27,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-22,-21,-14,4,-19,-15,2,-15,5,2,-14,-18,-14,-14,-11,-7,1,-12,1,-14;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-20,-5,-8,-15,-8,-14,-9,-11,-13,-8,1,-11,-9,-13,5,4,-6,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='M'; M=0,-12,-19,-16,-10,-6,-15,-14,-3,-12,0,2,-10,-12,-9,-13,-5,-1,-2,-22,-9,-10;
MA   /M: M=0,-10,-19,-13,-9,-4,-11,-11,-7,-10,-5,-3,-8,-19,-10,-10,-2,-2,-4,-18,-2,-10;
MA   /M: M=-6,-10,-24,-11,-9,-4,-14,-10,-6,-12,-4,-4,-9,-17,-11,-12,-7,-6,-5,-13,-1,-10;
MA   /M: SY='A'; M=4,-15,-18,-18,-14,-10,-10,-18,-3,-14,-8,-5,-11,-13,-12,-16,0,-2,0,-15,-9,-13;
MA   /M: M=0,-11,-20,-15,-13,-9,-1,-13,-10,-14,-7,-5,-6,-16,-11,-14,-1,0,-8,-19,-7,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-18,-19,-23,-17,10,-23,-14,8,-19,9,6,-14,-21,-17,-16,-9,-1,6,-17,2,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-20,-18,-25,-20,2,-22,-21,14,-21,11,8,-16,-21,-17,-20,-9,-2,12,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-19,-23,-15,4,-21,-16,4,-18,8,4,-15,-16,-12,-15,-9,-2,2,-18,-2,-14;
MA   /M: SY='M'; M=0,-13,-20,-17,-9,-5,-16,-12,-1,-12,0,1,-10,-17,-8,-12,-4,-1,-1,-17,-4,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-16,-21,-17,-4,-19,-18,8,-17,4,4,-14,-17,-15,-16,-7,-2,9,-24,-7,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-19,-26,-20,3,-20,-20,10,-20,7,5,-18,-16,-19,-19,-10,-3,11,-20,-4,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-27,-10,-17,-24,50,-18,-33,-18,-25,-18,0,-19,-17,-18,2,-14,-24,-20,-25,-17;
MA   /I: I=-3; MD=-6;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-11,-10,-14,-11,9,-10,-9,4,-11,6,4,-9,-12,-11,-9,-6,-2,3,-7,3,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='I'; M=1,-15,-12,-18,-14,2,-15,-15,11,-14,10,6,-14,-13,-13,-13,-8,-3,10,-11,-3,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-11,-11,-15,-13,-4,-6,-12,1,-13,-2,-1,-8,-14,-12,-13,0,1,6,-17,-7,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-6;
MA   /M: SY='N'; M=3,2,-15,-4,-5,-11,-2,-7,-10,-7,-12,-7,8,-13,-5,-8,5,0,-9,-23,-12,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-18,-29,-23,10,-23,-22,15,-22,13,11,-21,-22,-22,-20,-13,-5,16,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-20,-29,-23,7,-22,-23,14,-23,11,6,-21,-17,-22,-21,-13,-6,14,-17,-3,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-13,-16,-16,-16,-10,19,-17,-19,-17,-15,-8,-6,-19,-14,-17,2,-7,-13,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-10,-15,-12,-10,-13,-16,-6,-11,-9,-5,-5,-17,-9,-11,7,12,0,-26,-10,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-23,-28,-20,4,-26,-22,12,-22,11,5,-21,-8,-18,-20,-16,-8,6,-13,-2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-15,-29,-23,5,-27,-24,17,-22,15,9,-22,-21,-22,-20,-15,-5,17,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-15,-18,-15,-10,2,-18,-10,-16,-11,-8,-8,-16,-14,-18,2,-2,-5,-17,-13,-14;
MA   /M: SY='G'; M=4,-15,-23,-18,-19,-16,23,-20,-14,-18,-12,-6,-9,-17,-18,-19,-3,-11,-8,-20,-18,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-21,-26,-24,-17,11,-21,-12,-5,-9,0,0,-17,-23,-13,-2,-17,-10,-5,9,12,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-30,-23,10,-28,-20,20,-25,27,14,-24,-27,-21,-20,-20,-5,15,-16,3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-16,-23,-19,-4,-15,-20,9,-18,2,4,-15,-19,-16,-18,-1,1,14,-25,-9,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-28,42,19,-33,-11,0,-33,5,-27,-23,16,-9,4,-1,1,-7,-27,-35,-18,11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-29,-9,0,-17,-21,-1,-23,25,-18,-7,-3,-18,5,34,-11,-9,-17,-13,-2,0;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-25,-22,-30,-22,22,-27,-19,10,-22,13,5,-20,-24,-22,-18,-16,-5,7,-2,11,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-28,-8,-14,-24,37,-16,-29,-13,-24,-15,-1,-14,-14,-13,-1,-14,-22,-22,-23,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-27,-9,1,-18,-18,-3,-21,14,-17,-9,-3,-9,4,32,-6,-7,-16,-21,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-27,-6,1,-19,-17,-2,-24,24,-18,-8,1,-16,6,36,-8,-7,-17,-20,-8,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-12;
MA   /M: M=-8,-11,-26,-13,-8,-10,-17,-11,-11,-1,-11,-7,-7,-3,-6,0,-7,-2,-11,-14,-6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-14,-27,-21,1,-24,-21,14,-22,18,11,-21,-21,-18,-19,-14,-3,13,-22,-6,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-21,-28,-20,9,-29,-18,17,-24,25,13,-23,-23,-18,-19,-20,-7,11,-18,2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-22,-19,-27,-20,0,-25,-19,16,-19,14,11,-18,-22,-16,-17,-13,-5,14,-19,-4,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-19,-25,-20,1,-13,-22,6,-21,2,1,-15,-21,-19,-20,-8,-4,7,-15,-5,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-16,-13,-15,-18,26,-17,-24,-17,-20,-13,-3,-18,-15,-17,6,-5,-16,-24,-19,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-17,-24,-18,3,-11,-17,3,-20,8,7,-15,-21,-15,-18,-8,-3,2,-19,-4,-17;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-18,-28,-21,4,-21,-22,13,-22,13,6,-19,-20,-19,-21,-11,-4,11,-18,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-21,-21,-25,-20,0,-8,-20,5,-22,8,5,-17,-22,-18,-19,-12,-8,4,-16,-5,-19;
MA   /M: SY='M'; M=1,-14,-14,-19,-15,-8,-11,-13,1,-16,3,10,-12,-19,-9,-15,-4,-1,1,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='A'; M=8,-17,-15,-23,-18,-3,-9,-20,2,-18,2,1,-13,-19,-16,-18,-2,1,6,-21,-9,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-16,-30,-23,4,-22,-24,16,-23,12,8,-20,-22,-21,-22,-12,-5,15,-19,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=7,-14,-6,-19,-16,-9,1,-19,-11,-18,-9,-7,-9,-20,-16,-18,2,-2,-4,-23,-14,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-16,-26,-19,5,-22,-16,9,-21,17,10,-19,-23,-16,-18,-14,-4,6,-17,0,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-19,-29,-22,9,-18,-20,7,-22,10,5,-21,-22,-21,-20,-16,-9,4,-6,2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-22,-21,-24,-19,-1,-19,-20,8,-20,9,5,-19,-15,-17,-19,-11,-3,7,-16,-4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-15,-29,-22,12,-26,-17,12,-22,17,13,-21,-24,-19,-18,-16,-5,9,-16,5,-20;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-17,-15,-13,-12,1,-15,-11,-14,-11,-8,-6,-12,-12,-15,4,1,-6,-23,-13,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-19,-18,-23,-18,9,-20,-15,2,-18,5,2,-15,-20,-15,-16,-11,-4,1,-10,4,-17;
MA   /M: SY='L'; M=2,-18,-15,-23,-17,-2,-18,-16,5,-18,6,3,-14,-21,-14,-17,-7,-1,6,-19,-5,-16;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-19,-13,-10,-4,-11,-12,-6,-15,-4,-4,-7,-12,-11,-14,-2,1,-7,-20,-6,-11; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-20,-2,-1,-15,-7,-5,-14,-6,-15,-10,2,-8,-4,-8,3,0,-11,-24,-11,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-18,-5,-6,-7,-10,-11,-11,-8,-10,-8,-3,-5,-7,-8,1,2,-8,-19,-9,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: M=-2,-5,-14,-7,-4,-8,-6,-7,-7,-7,-5,-4,-3,-10,-3,-7,0,0,-7,-14,-6,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-3,-15,-3,-2,-11,-1,-7,-11,-5,-10,-6,-2,-1,-4,-7,1,-1,-9,-14,-9,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-20,-17,-13,6,-16,-8,2,-11,1,0,-12,-14,-11,-11,-11,-7,-1,1,10,-13; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-22,-23,-25,-22,3,-16,-21,3,-20,1,-1,-19,-23,-20,-19,-12,-5,4,7,2,-20;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-19,-22,-16,-6,-17,-15,5,-17,4,6,-16,-17,-12,-15,-8,-4,5,-18,-7,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-21,-27,-21,2,-27,-18,21,-22,20,14,-20,-24,-17,-19,-17,-6,16,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-19,-25,-21,1,-16,-21,10,-21,9,5,-17,-21,-19,-20,-9,-2,10,-19,-5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-13,-27,-21,5,-19,-21,8,-22,11,6,-19,-22,-20,-20,-11,-4,9,-19,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-12,-25,-19,0,-16,-20,4,-21,7,3,-17,-17,-18,-20,-10,-5,4,-20,-6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-10,-26,-20,4,-20,-17,6,-21,12,7,-18,-25,-17,-17,-13,-6,5,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-13,-30,-23,14,-24,-22,13,-23,12,8,-20,-24,-23,-21,-12,-5,13,-16,0,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-12,-30,-24,14,-28,-19,13,-23,12,7,-21,-25,-21,-20,-16,-7,10,-11,7,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-22,-21,-27,-21,3,-18,-20,11,-20,8,6,-17,-22,-17,-19,-13,-7,9,-14,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-12,-19,-17,-16,-6,12,-16,-15,-16,-11,-7,-5,-19,-16,-15,0,-7,-9,-20,-13,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-23,-15,-30,-23,21,-16,-21,3,-24,7,2,-17,-24,-25,-21,-11,-7,3,-11,2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=0,-17,-17,-22,-19,11,3,-16,-12,-20,-7,-7,-10,-22,-20,-18,-4,-6,-8,-12,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=3,-13,-18,-19,-15,-1,-11,-13,-1,-16,-1,1,-9,-20,-13,-16,-4,-3,1,-17,-3,-14;
MA   /M: SY='A'; M=2,-10,-22,-14,-13,-8,1,-15,-12,-14,-12,-7,-6,-13,-11,-15,0,-3,-9,-17,-9,-12;
MA   /M: SY='G'; M=5,-13,-14,-18,-16,-13,10,-18,-13,-17,-10,-5,-8,-17,-15,-18,2,-2,-8,-22,-15,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-22,-23,-25,-19,-2,-16,-21,0,-18,-2,-1,-19,-9,-17,-18,-12,-7,-2,1,-4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-22,-16,-13,-9,4,-11,-12,-13,-9,-4,-6,-20,-9,-12,-3,-7,-9,-17,-9,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-23,-11,-8,-21,-1,-15,-15,-12,-17,-9,-7,14,-8,-15,1,-2,-15,-27,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-18,-22,-17,-9,-17,-21,8,-18,4,4,-15,-11,-16,-19,-5,-1,9,-26,-12,-18;
MA   /M: SY='I'; M=0,-18,-18,-22,-17,-4,-17,-18,6,-18,5,6,-15,-13,-14,-18,-7,0,6,-23,-8,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-17,-30,-20,-15,-3,-10,-13,-12,-14,-12,-7,-14,-14,-8,-14,-11,-8,-15,23,5,-11;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-17,-19,-16,-6,-19,-17,4,-15,2,1,-14,-17,-15,-14,-2,4,9,-23,-9,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-22,-20,-25,-19,2,-26,-14,12,-17,12,9,-20,-24,-13,-14,-14,-5,10,-11,6,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,-17,-22,-16,-6,-21,-18,9,-17,6,7,-14,-12,-13,-17,-7,1,8,-25,-9,-16;
MA   /M: SY='S'; M=8,-9,-16,-12,-9,-15,-4,-15,-9,-13,-12,-8,-4,-9,-8,-14,11,7,-4,-28,-15,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,13,31,-26,-14,-4,-25,7,-20,-16,3,-6,11,0,1,-7,-23,-28,-17,21;
MA   /I: I=-8; MD=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-17,-20,-15,-1,-21,-15,7,-17,8,7,-14,-20,-11,-14,-10,-5,5,-21,-4,-14; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-22,-18,-27,-20,28,-22,-14,2,-20,7,2,-18,-23,-22,-16,-11,-5,3,-3,15,-20; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-31,-4,0,-27,-8,-14,-21,-8,-25,-17,-9,43,-7,-15,-3,-6,-24,-28,-24,-6; D=-8;
MA   /I: I=-8; MD=-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-18,-6,-2,-14,-13,-10,-10,-1,-9,-5,-4,-4,-1,-3,0,5,-8,-20,-10,-2; D=-8;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,4,11,-23,-12,4,-22,7,-19,-11,6,-10,9,7,0,-5,-20,-25,-11,9; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-13,-18,-16,-10,-7,-20,-13,4,-12,1,2,-12,-17,-9,-12,-7,-5,5,-21,-6,-10; D=-8;
MA   /I: I=-8; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-10,-23,-13,-3,-18,-17,-8,-17,14,-14,-6,-4,-17,5,28,-4,-5,-11,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=11,-7,-22,-9,-11,-22,22,-16,-23,-14,-22,-16,-1,-8,-12,-17,8,-5,-16,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-17,-13,-8,-10,-16,-15,-7,-5,-6,-5,-7,-16,-7,-5,3,8,0,-25,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-12,-18,-16,-18,16,-20,-16,-16,-13,-10,-8,-17,-16,-20,3,-6,-6,-22,-21,-16;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-17,-15,-12,-7,-10,-10,-5,-13,-6,0,-5,-17,-8,-13,2,4,-2,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='G'; M=14,-7,-20,-10,-12,-24,31,-17,-26,-15,-24,-16,0,-14,-12,-17,12,-4,-16,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-17,-31,-25,13,-29,-22,20,-25,19,11,-23,-26,-23,-21,-17,-5,17,-15,3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=5,-11,-8,-17,-13,-6,-14,-13,-4,-14,-5,-3,-7,-19,-10,-15,2,2,-1,-23,-5,-12;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-17,-10,-10,-9,-5,-8,-10,-11,-13,-8,2,-18,-8,-11,5,4,-7,-21,-5,-10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-11,-15,-18,-15,2,-9,-16,-6,-15,-5,-3,-6,-18,-14,-15,3,4,-2,-19,-7,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-14,-26,-21,9,-21,-20,9,-20,7,6,-16,-23,-20,-18,-7,0,11,-18,-2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=0,1,-21,-5,-7,-18,5,-6,-20,-4,-20,-12,9,-17,-2,-2,4,-3,-18,-24,-13,-5;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-8,-27,-12,-9,-7,-12,-8,-14,-5,-13,-9,-3,-20,-2,-2,-7,-8,-15,4,0,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-18,-31,-23,10,-28,-23,21,-26,25,13,-23,-25,-22,-21,-18,-5,17,-19,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-21,-13,-17,-21,36,-20,-24,-18,-21,-14,-2,-18,-17,-19,4,-8,-16,-23,-23,-17;
MA   /M: SY='G'; M=9,1,-19,-7,-10,-16,13,-12,-18,-12,-19,-13,9,-16,-10,-14,9,-2,-15,-26,-18,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-19,-26,-21,6,-14,-21,7,-20,3,3,-15,-21,-19,-19,-5,-3,9,-18,-4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-19,-32,-24,16,-29,-23,20,-25,18,10,-21,-25,-24,-21,-15,-3,18,-17,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=9,-13,-19,-17,-18,-16,21,-21,-15,-18,-14,-10,-7,-18,-18,-19,2,-5,-7,-21,-18,-18;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-26,-12,-7,-21,-7,-18,-12,-11,-18,-11,-10,21,-9,-16,0,-1,-12,-27,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=4,-19,-18,-23,-16,1,-18,-18,3,-18,9,3,-17,-19,-15,-18,-8,-2,3,-13,-2,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-17,-29,-23,3,-27,-23,19,-23,16,10,-22,-21,-20,-21,-15,-4,17,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='F'; M=0,-18,-17,-23,-19,9,-11,-19,-1,-20,3,0,-14,-20,-19,-17,-4,1,2,-17,-3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-23,-11,-11,-20,16,-16,-20,-14,-16,-12,-4,-7,-11,-16,3,-4,-15,-24,-20,-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,-15,-19,-20,-14,1,-18,-13,-2,-11,-3,0,-12,-17,-12,-12,-3,4,0,-11,2,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-21,-30,-23,6,-29,-20,24,-25,25,17,-22,-25,-20,-20,-19,-6,18,-21,-1,-22;
MA   /I: I=-2; MD=-4;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-13,-9,-16,-12,1,-16,-12,5,-12,6,4,-13,-14,-11,-11,-8,-3,5,-11,-1,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-4;
MA   /M: SY='D'; M=-4,10,-14,12,6,-16,-4,1,-16,0,-14,-11,7,-7,2,-3,3,-1,-13,-19,-9,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: SY='N'; M=-1,4,-16,2,-3,-17,5,-1,-17,-5,-18,-11,8,-10,-2,-6,7,0,-14,-22,-11,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-4;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-26,-30,-23,32,-26,-12,4,-21,9,2,-23,-26,-22,-17,-22,-12,-2,28,30,-22; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-21,-1,-8,-22,19,-8,-26,-9,-24,-16,6,-16,-8,-11,8,-3,-19,-27,-18,-8;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='A'; M=1,-9,-16,-12,-10,-9,-4,-10,-7,-12,-7,-4,-6,-11,-10,-12,1,1,-5,-19,-8,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-14,-6,-4,-11,-3,-1,-11,-5,-11,-5,-1,-9,-1,-6,3,1,-9,-16,-5,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-8,-14,-11,-9,-2,-7,-5,-5,-8,-4,-2,-6,-11,-7,-7,-4,-3,-5,-5,1,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='A'; M=6,-16,-17,-20,-16,-7,-13,-20,1,-16,-2,-2,-13,-12,-15,-18,-1,4,6,-22,-9,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-22,-31,-24,37,-20,-17,1,-24,9,3,-19,-25,-27,-19,-17,-9,0,2,15,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-25,-29,-22,11,-22,-17,9,-22,12,6,-22,-24,-19,-19,-18,-10,4,5,11,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-20,-27,-22,8,-24,-20,15,-21,12,9,-20,-23,-20,-19,-12,-3,14,-15,2,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-20,-15,-26,-21,15,-19,-17,4,-21,7,5,-17,-24,-21,-19,-12,-5,4,-10,6,-20;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-14,-17,-14,-17,11,-19,-14,-15,-12,-9,-7,-15,-14,-18,5,-2,-6,-23,-19,-14;
MA   /M: SY='A'; M=10,-17,-13,-22,-18,-10,-2,-21,-2,-19,-3,-4,-13,-19,-17,-19,-2,-4,3,-23,-14,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-8,-30,-23,6,-23,-23,11,-24,11,7,-20,-22,-21,-21,-15,-6,9,-18,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=5,-16,-1,-22,-18,-5,-15,-17,-2,-18,-1,0,-13,-21,-16,-19,-5,-3,1,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='L'; M=3,-24,-15,-28,-22,3,-22,-22,15,-22,16,8,-21,-24,-21,-21,-12,-5,16,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-19,-30,-23,3,-27,-24,22,-24,20,11,-22,-23,-20,-22,-15,-5,19,-19,-4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=10,-12,-13,-16,-15,-15,12,-18,-14,-17,-12,-7,-6,-17,-14,-18,4,-3,-8,-25,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=5,-20,-16,-26,-19,3,-17,-20,7,-21,10,3,-17,-21,-18,-20,-8,-3,7,-16,-4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-21,-31,-24,5,-24,-23,20,-25,22,12,-23,-25,-21,-22,-18,-8,16,-17,-2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-24,-14,-30,-23,18,-24,-20,9,-23,11,4,-20,-25,-23,-20,-13,-5,9,-10,6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-13,-22,-19,-2,-17,-20,4,-17,0,0,-14,-20,-17,-17,-1,5,10,-20,-5,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-23,-29,-22,17,-25,-16,7,-21,11,5,-22,-24,-20,-17,-17,-8,4,4,12,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-20,-28,-21,24,-26,-17,5,-20,11,5,-17,-22,-21,-13,-16,-7,3,-10,8,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-15,-28,-21,14,-26,-19,8,-20,14,9,-20,-25,-19,-16,-16,-5,7,-11,3,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-23,-19,-13,-6,-20,-10,1,-9,-1,1,-14,-14,-11,-7,-10,-6,3,-18,-3,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-29,-6,1,-20,-15,-10,-18,0,-20,-13,-6,21,-3,-3,-4,-6,-19,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-25,5,20,-24,-17,-2,-24,9,-19,-14,0,-6,8,8,-1,-5,-20,-27,-15,13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-20,-10,-6,-13,-18,-11,-12,0,-11,-7,-4,-12,-5,1,3,13,-6,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-6,1,-20,-16,-5,-19,15,-17,-6,-2,-12,4,15,-6,-6,-15,-22,-9,1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
//
ID   SUGAR_TRANSPORT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00217;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sugar transport proteins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1370914; R2=0.0097133; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1447; N_SCORE=14.185; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=656; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-29; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,36,-63,-43,-64,-49,17,36,-61,-27,57,22,-41,32,-64,36,26,-13,-81,-61;
MA   /M: SY='A'; M=56,-5,-67,-63,-15,11,-68,8,20,-9,-56,-22,-41,-60,-27,-10,15,-3,-75,-35;
MA   /M: SY='F'; M=20,9,-72,-70,62,26,-67,-1,-48,-4,-7,-63,-13,-38,-47,26,-26,-22,-7,-1;
MA   /M: SY='A'; M=70,-25,-44,-64,-66,1,-68,4,-64,-10,-57,-37,-69,-60,-68,35,-23,-8,-10,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-27,-29,1,-10,-71,-2,25,-49,14,-45,-64,18,55,32,0,-20,9,-14,71,-34;
MA   /M: SY='N'; M=21,-69,23,-9,-47,-4,8,-74,25,-76,-68,64,-66,-50,-37,47,-5,-51,-84,-67;
MA   /M: SY='W'; M=-49,-76,-78,-70,33,-78,5,3,-35,22,17,-74,39,-21,-46,-68,-28,34,85,40;
MA   /M: SY='W'; M=11,-76,-7,38,-55,-28,-62,3,-59,-24,23,-39,6,-17,-43,-1,-9,-11,91,46;
MA   /M: SY='M'; M=-46,-27,-47,-64,10,-41,-26,-21,-63,29,91,-40,-74,54,-63,-15,-17,17,42,-51;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-71,-83,-77,-5,-85,-66,30,-76,74,28,-80,-82,-70,-74,-75,-62,2,-65,31;
MA   /M: SY='I'; M=-38,-27,-11,-75,36,-58,-71,65,-74,38,33,-26,-76,-71,-75,-49,-9,-1,-68,-12;
MA   /M: SY='I'; M=11,9,-80,-76,25,-16,-75,57,-74,33,-41,-73,-77,-72,-76,-34,-39,36,-71,-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-28,-67,-73,1,88,-69,-77,-69,-24,-68,-54,-70,-66,-74,6,-63,-73,31,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-74,-77,-52,-81,-3,-58,-63,-56,-75,-22,114,-61,-65,-75,-75,-34;
MA   /M: SY='F'; M=-21,-27,-82,-78,60,-58,-74,52,-75,37,-17,-75,-78,-74,-76,-35,-2,19,32,-45;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-72,-85,-80,37,-87,-75,64,-78,57,1,-79,-80,-75,-77,-74,-60,21,-68,-49;
MA   /M: SY='Q'; M=12,-26,-45,-63,-36,-51,-65,22,-45,30,17,-62,-72,36,-66,26,23,20,-74,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='I'; M=-49,-71,-85,-79,52,-85,-73,55,-76,45,48,-78,-79,-74,-76,-73,-60,32,-66,-46;
MA   /M: SY='G'; M=13,9,-42,-70,-6,79,-66,-53,-67,-37,-67,-19,-41,-64,-72,21,-41,-70,-69,18;
MA   /M: SY='C'; M=1,60,-79,-75,-21,-31,-77,51,-73,0,-3,-71,-76,-22,-75,-33,-16,58,-11,-33;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='G'; M=12,-5,-76,-75,38,42,-71,22,-72,26,8,-41,-75,-71,-75,-44,-41,23,-68,-14;
MA   /M: SY='A'; M=41,20,12,18,-27,21,-28,22,-62,-32,-59,-35,-40,-59,-68,10,10,-9,-77,-18;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-5,-62,-63,-3,-61,-58,-30,-61,-9,36,27,-41,-32,-64,66,20,-24,16,43;
MA   /M: SY='P'; M=9,-27,-66,-62,-63,26,-7,-38,-62,-31,36,-2,39,36,-66,5,-16,33,-73,25;
MA   /M: SY='L'; M=12,-5,-73,-72,4,-3,-70,16,-70,39,18,-4,-74,-68,-72,-21,22,35,-75,-58;
MA   /M: SY='V'; M=38,10,-70,-67,-63,-12,-73,-13,-67,-21,-52,-39,-72,-37,-70,36,1,64,-82,-65;
MA   /M: SY='P'; M=8,-83,-67,-58,-78,-66,-29,-24,-63,-73,14,-69,113,-64,-73,-13,-8,-38,-11,-75;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-67,-75,-71,-54,-40,-68,6,-68,29,82,-67,-72,-65,-70,-13,42,43,-79,-58;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-78,-75,-75,27,-80,-45,1,-69,26,-44,-75,-83,-65,-67,-69,-65,-52,-36,118;
MA   /M: SY='I'; M=-28,-27,-77,-72,-33,-58,-73,68,-71,39,19,-43,-74,16,-73,-33,14,18,-75,-57;
MA   /M: SY='S'; M=48,-64,-39,-59,-46,14,-63,-70,-60,-73,-67,-17,-65,-54,-65,81,-3,-35,-80,-68;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,110,-84,-76,-53,-84,-41,-76,-72,-56,-56,3,-51,-56,-61,-77,-80,-73;
MA   /M: SY='I'; M=5,-70,-75,-72,-2,-75,-71,62,-34,-11,47,-13,-73,-66,-20,-8,-1,40,-73,-3;
MA   /M: SY='A'; M=71,10,-64,-60,-45,-53,-67,-33,-61,-67,-63,-56,-39,-57,-66,62,7,-23,-11,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-86,-42,-55,-79,-50,-8,-70,-31,-49,-67,-41,116,-19,-46,-22,-8,-41,-78,-21;
MA   /M: SY='P'; M=23,-72,-15,-3,-71,-65,-63,-47,47,-22,-62,-56,53,-53,1,10,38,-35,-77,-19;
MA   /M: SY='K'; M=15,-28,-12,24,-75,-12,38,-75,42,-74,-29,31,-39,13,31,10,-25,-52,-11,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-49,-74,-73,-33,-9,-79,24,52,8,38,-2,-25,-75,-62,9,-24,-40,12,31,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-50,-76,-77,-52,-83,15,-75,-64,-56,-74,-40,114,-61,-65,-76,-75,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-75,-63,-73,-81,97,-68,-87,-47,-84,-74,-8,-68,-65,-48,-17,-65,-81,-74,-40;
MA   /M: SY='T'; M=49,-67,-66,-62,34,4,-65,-44,-20,-14,-58,-57,-68,-18,14,7,53,-56,-71,-31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-5,-81,-75,30,-80,-28,10,-74,65,39,-75,-79,-70,-73,-68,-2,0,-66,15;
MA   /M: SY='V'; M=-24,-26,-65,-70,-62,44,-68,21,-66,-17,-6,34,-71,-65,-71,9,19,45,-79,-18;
MA   /M: SY='S'; M=-9,-4,-62,-62,-15,4,-65,4,-61,-63,-8,-51,-66,-17,-66,74,48,5,-80,-63;
MA   /M: SY='C'; M=-26,47,-74,-49,29,10,-68,-3,-69,35,31,-65,-75,-21,-71,8,22,6,16,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-29,-73,-62,-65,44,-69,26,-11,-31,-22,24,55,17,2,-63,-21,-26,12,-6,58;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,-79,-53,34,17,-20,-51,-51,-46,-67,-59,-19,-66,108,-48,-4,-41,-52,-68,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,20,-80,-75,12,-42,-71,20,-75,67,0,-45,-80,-70,-74,-10,-59,9,16,-53;
MA   /M: SY='M'; M=23,9,-73,-72,59,33,-66,-38,-69,-10,74,-23,-73,-67,-71,4,-17,-15,-8,-49;
MA   /M: SY='I'; M=-36,-28,-76,-69,-21,-42,-73,71,-67,-12,-3,-68,-73,39,-70,-14,18,25,59,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,20,-62,-63,-66,-2,-67,-18,-60,-31,-25,23,-40,16,-44,-9,75,32,-84,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-20,9,-78,-76,32,9,-74,44,-73,32,-18,-70,-76,-72,-75,-15,4,33,16,-53;
MA   /M: SY='G'; M=-15,-76,-65,-75,-82,101,-71,-60,-69,-84,-74,-51,-68,-67,-77,-35,-67,-81,-74,-77;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00190;
//
ID   AMINO_ACID_PERMEASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00218;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Amino acid permeases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3302350; R2=0.0145225; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=341; N_SCORE=10.272; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-27,-36,-27,-2,-36,-28,41,-28,17,16,-20,-16,-20,-27,-17,-8,27,-22,-3,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-30,-13,-21,-23,56,-18,-34,-19,-26,-18,-4,-21,-20,-19,-3,-19,-25,-10,-20,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-13,-13,-12,-8,-14,-20,-9,-13,-8,-9,-4,-10,-13,-13,13,34,-1,-27,-11,-12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-19,-28,61,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-15,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-17,-31,-21,10,-30,-20,20,-29,44,20,-29,-29,-20,-20,-28,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-10,-34,-26,44,-28,-18,3,-27,14,5,-22,-29,-29,-20,-19,-9,2,-1,17,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-18,-26,-22,0,-27,-23,19,-20,12,9,-23,-16,-21,-19,-10,0,23,-25,-6,-22;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-22,-8,-14,-25,40,-17,-30,-15,-26,-18,3,-16,-14,-17,10,-5,-21,-25,-25,-14;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-17,-14,-11,-10,-14,-14,-2,-13,-9,-2,-1,-15,-7,-14,9,11,-2,-20,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=11,-11,-23,-13,-16,-24,35,-20,-23,-16,-21,-14,-3,-17,-15,-18,5,-10,-15,-23,-24,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-22,-7,-6,-13,-8,-9,-15,0,-18,-11,0,-11,-5,-5,4,2,-11,-20,-4,-6;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-17,-15,-13,-17,3,-19,-11,-12,-13,-10,-7,-12,-13,-13,8,5,-2,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,8,-32,-22,28,-29,40,21,-27,-27,-19,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=3,-6,-20,-10,-4,-17,-12,4,-12,-4,-11,-4,-1,-16,3,-2,3,-2,-10,-24,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-22,-1,1,-16,-10,-4,-17,-1,-16,-9,6,-15,1,-3,3,2,-16,-21,-9,1;
MA   /M: SY='G'; M=19,-9,-12,-15,-15,-24,28,-20,-25,-16,-20,-15,-5,-16,-15,-19,6,-4,-14,-23,-24,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-29,68,-19,-39,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,0,-19,-29,-19,-29,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-37,-11,-2,-29,-15,-20,-20,-10,-28,-19,-18,76,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='A'; M=23,-13,-16,-18,-14,-17,9,-19,-10,-15,-8,-6,-10,-16,-13,-19,4,-4,-2,-23,-19,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=9,-5,-14,-8,-8,-16,13,-12,-16,-10,-16,-8,-1,-9,-7,-12,11,3,-10,-21,-16,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-19,-30,-22,2,-28,-22,23,-24,26,16,-23,-24,-19,-21,-17,-4,19,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-32,-24,10,-29,-21,23,-25,29,20,-26,-27,-21,-20,-21,-7,20,-20,0,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-31,-28,-35,-26,10,-32,-24,24,-27,23,13,-26,-26,-20,-23,-25,-12,12,6,8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=15,-5,-15,-8,-11,-23,19,-16,-22,-13,-22,-16,1,-15,-12,-17,12,-2,-12,-28,-23,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-32,-29,-24,36,-28,0,-2,-17,-1,-3,-24,-30,-19,-15,-24,-14,-10,46,57,-23;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-21,-28,-21,-1,-19,-22,17,-23,15,10,-18,-21,-17,-22,-12,-7,12,-21,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-36,-28,9,-35,-26,35,-27,22,18,-23,-24,-22,-25,-19,-8,26,-19,1,-27;
MA   /M: SY='V'; M=6,-19,-12,-24,-21,-11,-5,-22,3,-19,-2,2,-15,-21,-17,-20,-5,-4,7,-19,-13,-20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-14,-11,-17,-26,44,-19,-32,-18,-26,-19,-1,-19,-17,-19,6,-10,-22,-25,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-17,-27,-20,7,-24,-22,13,-22,10,4,-16,-21,-20,-20,-5,4,14,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-7,-27,-21,4,-21,-18,8,-21,5,10,-16,-20,-17,-19,-13,-8,6,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-11,-28,-23,-5,-21,-23,17,-21,10,11,-19,-23,-19,-21,-10,-3,18,-26,-9,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-28,-33,-26,35,-30,-13,7,-23,10,3,-25,-29,-24,-19,-24,-12,0,26,34,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-21,3,-27,-21,15,-22,-19,-4,-23,4,-1,-17,-20,-23,-20,-11,-5,-1,-19,-2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-18,-30,-25,-1,-31,-26,29,-22,14,14,-22,-23,-21,-21,-11,1,30,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-18,-19,-25,-20,-6,-15,-15,13,-16,8,21,-15,-19,-11,-16,-7,0,12,-24,-7,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-10,-23,-13,-3,-13,-23,-1,-7,0,-5,0,-6,-19,10,8,-8,-6,-10,-17,2,1;
MA   /M: SY='S'; M=18,-6,-2,-11,-7,-19,-4,-15,-15,-11,-19,-11,-2,-13,-5,-14,20,9,-5,-32,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-16,-29,-20,4,-27,-19,17,-26,35,19,-25,-26,-17,-20,-22,-7,10,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-22,-30,-20,3,-27,-8,21,-21,31,36,-23,-24,-10,-16,-24,-10,11,-20,1,-16;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-9,-19,-14,-13,-7,-20,-3,-15,-6,-6,-11,-17,-14,-18,8,4,7,-27,-16,-14;
MA   /M: SY='V'; M=4,-17,1,-20,-17,-7,-19,-21,2,-18,-1,-3,-14,-22,-17,-18,3,7,12,-30,-12,-17;
MA   /M: SY='A'; M=6,-13,-16,-18,-11,1,-17,-6,-6,-11,-6,-4,-10,-18,-10,-12,0,-1,-3,-16,3,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-25,-20,-15,18,-25,-3,3,-13,3,5,-9,-24,-12,-8,-14,-7,-4,-4,23,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-36,-11,-1,-27,-18,-19,-18,-11,-26,-18,-18,75,-10,-19,-7,-8,-26,-30,-28,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-17,-14,-13,-9,-18,-14,6,-15,0,1,-10,-20,-14,-15,0,3,12,-29,-10,-14;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-16,-3,-3,-17,-8,-11,-15,-8,-19,-14,1,-8,-4,-10,17,12,-8,-29,-13,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-26,-8,-15,-27,51,-14,-35,-15,-28,-18,1,-17,-15,-15,4,-14,-26,-22,-25,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-16,-4,-6,-21,15,-12,-21,-11,-26,-17,6,-9,-7,-13,21,5,-14,-31,-21,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-21,-33,-24,53,-28,-15,3,-25,12,6,-19,-28,-28,-18,-19,-9,0,2,23,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-6,-16,-11,-11,-4,-16,2,-8,-11,-10,-6,-1,-19,-7,-11,4,5,-5,-19,6,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-19,-12,-11,-4,-17,-11,-9,-8,-10,-6,-7,-16,-9,-5,1,7,-3,-16,-3,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-29,-25,-22,28,-22,3,-5,-16,0,-3,-20,-28,-17,-14,-19,-10,-10,29,48,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-15,-16,-12,-13,-4,-19,-7,-14,-9,-8,-8,-10,-12,-17,8,4,0,-26,-16,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-20,-9,-4,-12,-13,-5,-14,-3,-13,-7,-3,-15,0,0,5,7,-10,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-27,-5,1,-11,-19,-6,-19,13,-15,-7,-2,-17,1,22,-8,-7,-14,-19,-4,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-18,-29,-22,35,-27,-10,2,-22,13,3,-19,-29,-23,-15,-20,-10,-2,4,26,-22;
MA   /M: SY='I'; M=3,-25,-20,-30,-23,2,-26,-21,20,-23,16,10,-22,-23,-20,-22,-15,-7,17,-15,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-28,12,1,-29,10,-8,-30,-10,-28,-21,4,6,-7,-14,5,-6,-24,-31,-23,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-33,12,43,-30,-20,-6,-27,4,-23,-20,-6,25,12,-6,-3,-10,-30,-30,-23,26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00191;
//
ID   ANION_EXCHANGER_1_MP; MATRIX.
AC   MP00219;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Anion exchangers family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4098830; R2=0.0127840; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1300; N_SCORE=21.019; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=164; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-28,24,18,-34,2,-4,-31,-1,-24,-19,6,-10,9,-8,1,-11,-27,-29,-20,13;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-22,-7,8,-25,-1,-15,-20,-6,-18,-15,-8,9,-4,-15,3,-6,-16,-24,-23,1;
MA   /M: SY='E'; M=6,-5,-23,-5,7,-24,0,-15,-22,-7,-19,-16,-5,7,-5,-13,5,3,-18,-26,-21,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-30,6,6,-31,-14,-10,-23,-5,-26,-17,-5,34,4,-12,1,-6,-25,-30,-23,3;
MA   /M: SY='E'; M=-14,12,-30,21,39,-29,-18,0,-32,13,-22,-19,3,-7,14,15,-2,-10,-28,-29,-18,25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=2,-16,-22,-19,-7,-11,-19,-11,-6,-3,8,2,-13,-20,0,9,-11,-8,-5,-20,-9,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-28,55,-17,-38,-12,-28,-18,0,-20,-15,-5,-2,-18,-28,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-24,-14,-7,-15,-19,-10,-7,3,-13,-6,-2,-17,0,21,3,-1,-5,-26,-11,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-25,-29,-22,-15,-15,-27,-25,8,-17,-9,-4,-23,33,-18,-22,-12,-7,5,-28,-18,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,30,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-19,-33,-28,0,-31,-23,34,-21,16,26,-24,-24,-19,-21,-16,-6,33,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-38,-10,0,-28,-20,-15,-22,0,-28,-18,-15,63,-5,2,-10,-10,-28,-28,-25,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-30,-4,-2,-13,-22,68,-25,0,-18,-2,3,-20,6,3,-12,-17,-25,-18,26,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-29,-26,-16,-5,-29,-22,15,-24,18,8,-25,9,-17,-22,-21,-10,3,-23,-9,-19;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,31,-33,-23,23,-30,26,13,-23,-27,-27,-23,-23,-10,13,-9,11,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-22,-10,-4,-16,-20,-8,-22,13,-16,-10,0,-16,2,36,3,15,-12,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,24,-25,28,7,-27,-10,30,-30,-5,-27,-17,22,-15,3,-5,6,-6,-26,-37,-8,4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11,59,-7,-17,5,-1,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00192;
//
ID   ANION_EXCHANGER_2_MP; MATRIX.
AC   MP00220;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Anion exchangers family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1952167; R2=0.0119360; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1564; N_SCORE=22.853; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-18,-38,-30,62,-30,-22,7,-28,10,2,-22,-30,-38,-20,-18,-8,11,1,21,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,6,-26,-20,0,-28,30,-22,-8,0,-16,20,51,-8,-10,-22,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-27,-24,48,-30,6,0,-17,4,0,-20,-30,-21,-14,-20,-10,-6,23,62,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-28,-32,-26,-3,-18,-26,27,-28,18,13,-19,-22,-20,-26,-19,-12,15,-20,-5,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,0,-22,-20,-5,-28,21,-22,-12,-5,5,5,50,-10,-10,-22,-22,-15,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,59,-30,-3,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,51,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,66,-32,-22,9,-30,12,4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,5,5,25,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=7,-6,-18,-8,-6,-11,-10,18,-16,-10,-18,-10,0,-16,-2,-10,11,1,-12,-21,7,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-22,-26,-26,1,-14,-17,15,-20,3,4,-20,-26,-22,-20,-12,-8,18,-13,9,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,6,-26,-20,-12,-26,37,-26,-10,0,-10,6,21,-3,3,-16,-22,-10,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-25,2,20,-29,-20,-3,-22,13,-20,-8,0,-8,26,7,3,4,-21,-24,-12,23;
MA   /M: SY='E'; M=12,10,-22,14,24,-28,-10,-8,-24,0,-18,-18,0,-6,4,-10,4,-6,-18,-28,-20,14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-4,-30,-4,-4,-10,-22,84,-24,-10,-16,0,4,-22,6,-2,-12,-18,-26,-18,32,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-12,-24,-12,-2,-18,-24,12,-4,-8,1,6,-10,-20,17,-4,-10,-10,-7,-24,-2,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-12,-30,-9,1,-27,-6,-8,-16,-7,-12,-5,-10,7,16,-8,-8,-12,-23,-22,-16,7;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-3,9,-13,-14,5,-16,-14,-15,-16,-15,-14,5,-22,-16,-14,8,10,-9,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,26,-30,13,4,-14,9,4,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-6,21,66,-20;
MA   /M: SY='P'; M=10,5,-25,9,11,-28,-10,-12,-22,-4,-21,-18,-4,15,-2,-14,1,-6,-19,-28,-22,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00192;
//
ID   MIP_MP; MATRIX.
AC   MP00221;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   MIP family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.4045057; R2=0.0185867; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=6; N_SCORE=6.506; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-47; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-15,-20,-16,-7,-7,-20,-1,-17,-1,-3,-12,-17,-15,-18,2,4,4,-23,-12,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-8,-30,-27,2,-25,-26,20,-23,14,11,-26,-28,-25,-21,-14,-4,29,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='A'; M=6,-17,-18,-22,-19,-1,0,-19,-4,-18,-1,2,-13,-20,-18,-18,-4,-3,1,-19,-9,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-15,-25,-21,0,-25,-19,15,-16,8,13,-18,-21,-17,-16,-5,10,20,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='M'; M=5,-20,-17,-25,-18,-2,-15,-16,9,-18,14,16,-18,-21,-14,-17,-10,-5,9,-22,-7,-16;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-14,-29,-23,-6,-26,-26,21,-21,7,6,-20,-16,-20,-23,-8,-2,23,-25,-10,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-15,-19,-17,-12,4,-19,-1,-7,-10,-6,-4,-13,-21,-3,-11,-5,-4,-8,2,23,-9;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-2,-20,-17,-7,-14,-19,-1,-17,-5,-5,-9,-21,-17,-18,1,1,6,-26,-11,-17;
MA   /M: SY='A'; M=5,-16,-10,-21,-17,-7,-11,-21,1,-18,-3,-3,-12,-19,-14,-18,0,2,5,-25,-11,-16;
MA   /M: SY='G'; M=3,-16,-23,-19,-19,-10,22,-20,-16,-20,-11,-8,-10,-21,-19,-19,-3,-11,-10,-14,-15,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-27,-6,-8,-14,6,26,-25,-12,-19,-9,6,-16,-5,-8,-4,-13,-24,-24,-3,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-24,-28,-21,-5,-32,-21,29,-17,8,11,-15,-21,-17,-19,-13,-6,24,-24,-5,-22;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-14,-4,-4,-19,5,-12,-18,-13,-25,-17,6,-12,-4,-12,30,13,-10,-36,-20,-4;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-27,-8,-17,-28,56,-18,-35,-18,-28,-19,3,-19,-17,-18,4,-13,-26,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-8,-16,-16,-24,29,-20,-25,-16,-21,-16,-6,-17,-16,-20,5,-9,-15,-23,-25,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-17,3,-29,1,1,-21,-18,85,-28,-8,-21,-2,13,-19,11,0,-7,-17,-29,-30,14,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-34,-25,17,-32,-23,25,-28,29,17,-25,-27,-23,-22,-23,-9,17,-16,4,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-32,-30,5,-32,-29,31,-23,13,11,-28,-28,-29,-22,-13,-3,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-35,-26,22,-33,-24,25,-29,28,14,-25,-27,-26,-23,-22,-9,19,-15,5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-18,-18,-15,-9,17,-17,-18,-15,-15,-12,-7,-16,-16,-19,4,-6,-10,-16,-12,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-20,-29,-21,24,-26,-13,10,-23,25,15,-21,-27,-20,-17,-21,-9,4,-9,12,-20;
MA   /M: SY='A'; M=11,-21,-4,-27,-19,-2,-17,-21,-4,-19,3,-1,-20,-22,-17,-20,-10,-6,0,-1,-6,-17;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-14,-28,-22,0,-24,-24,19,-22,13,8,-21,-23,-20,-21,-9,-3,22,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-18,-15,-15,-4,7,-15,-13,-16,-13,-10,-2,-20,-16,-15,4,-3,-8,-21,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-27,-7,-8,-27,28,-11,-32,-2,-26,-15,2,-17,-3,4,2,-11,-24,-23,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-25,-5,1,-23,-10,5,-26,12,-19,-9,1,-17,8,24,-4,-8,-20,-24,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-23,-36,-26,35,-27,-21,16,-27,16,12,-20,-25,-27,-22,-20,-10,10,-7,11,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-5,-26,-3,3,-26,-12,-13,-20,-5,-27,-18,-2,31,-2,-11,8,3,-21,-32,-23,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-22,-28,-24,-17,-3,-17,-21,-3,-14,2,-3,-19,-18,-15,-15,-18,-12,-7,17,-1,-15;
MA   /M: M=0,-13,-23,-18,-11,-6,-18,-17,-3,-4,-7,-4,-8,-8,-11,-6,-6,-4,-3,-20,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-28,-2,7,-25,-16,4,-25,18,-19,-7,1,-14,15,24,-6,-7,-21,-23,-9,9;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-10,-25,-20,-3,-18,-22,10,-20,10,4,-21,-24,-20,-20,-7,-3,17,-23,-8,-20;
MA   /M: SY='P'; M=0,-23,-25,-23,-14,-8,-23,-22,5,-18,3,0,-22,15,-17,-21,-13,-7,2,-24,-14,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-23,-22,-25,-17,10,-22,-18,1,-20,3,0,-20,-1,-18,-19,-14,-9,-3,-14,0,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00193;
//
ID   IGF_BINDING_MP; MATRIX.
AC   MP00222;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Insulin-like growth factor binding proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4896889; R2=0.0082929; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=611; N_SCORE=9.555; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: M=-1,-14,0,-18,-12,-18,-10,-13,-16,-7,-14,-1,-11,-4,-8,-3,-4,-7,-11,-28,-18,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-18,47,-21,-18,-24,-15,-25,-27,-22,-24,-19,-17,6,-22,-25,-8,-11,-18,-39,-29,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-35,-8,-2,-27,-15,-16,-20,-5,-25,-14,-15,57,-7,-9,-9,-10,-25,-28,-25,-8;
MA   /M: SY='P'; M=3,-14,-28,-13,-2,-21,-11,-15,-17,-6,-16,-12,-13,16,-3,-7,-5,-8,-18,-12,-16,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-8,-17,-9,-3,-13,-7,-13,-4,-7,-9,-5,-6,-6,-5,-10,2,2,-2,-20,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-11,-29,-8,-4,-27,2,-16,-24,-6,-26,-17,-8,28,-8,-8,0,-6,-22,-27,-24,-9;
MA   /M: SY='P'; M=0,-20,-13,-17,-9,-19,-20,-20,-9,-14,-11,-9,-20,27,-14,-18,-9,-7,-9,-29,-21,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-24,-11,-6,-21,-7,-14,-17,-2,-20,-12,-7,5,-4,2,2,0,-11,-27,-18,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,105,-25,-21,-21,-29,-27,-30,-26,-20,-20,-18,-36,-25,-27,-9,-10,-12,-48,-29,-23;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=8,-8,-24,-6,7,-24,-9,-14,-19,-1,-20,-15,-8,23,-3,-10,1,-4,-17,-24,-21,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-29,2,25,-25,-18,-9,-19,-1,-16,-14,-9,24,6,-9,-5,-9,-23,-26,-20,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-17,0,-8,-17,21,-11,-17,-11,-16,-11,1,-12,-10,-12,4,-6,-11,-19,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='V'; M=6,-13,-6,-15,-13,-4,-13,-15,9,-10,1,1,-13,-14,-13,-11,0,3,19,-17,-8,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-17,-1,5,-16,3,-7,-16,-3,-14,-11,-1,2,-1,-3,4,-3,-14,-19,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-17,-22,-15,5,-22,-14,10,-22,26,9,-20,-23,-14,-16,-14,-4,5,-16,3,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-20,-23,-20,-14,-12,-26,-17,2,2,-6,0,-16,-12,-11,14,-11,-6,11,-25,-11,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-9,-24,-7,10,-11,-20,-8,-10,-6,1,-5,-11,-10,-1,-5,-7,-4,-11,-21,-5,3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-29,29,8,-32,-13,-10,-28,-5,-26,-23,3,21,-5,-14,0,-4,-24,-34,-22,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,62,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-10,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-27,-8,-13,-27,52,-18,-35,-17,-27,-19,1,-17,-16,-17,4,-10,-26,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,105,-25,-21,-21,-29,-27,-30,-26,-20,-20,-18,-36,-25,-27,-9,-10,-12,-48,-29,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-19,107,-29,-28,-20,-27,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-37,-28,-29,-8,-9,-9,-47,-29,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-29,-12,-5,-21,-9,-14,-17,1,-15,-7,-11,16,-5,0,-7,-8,-17,-24,-18,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-16,-21,-19,-9,-16,-21,9,-15,1,6,-16,-21,-13,-15,-3,7,18,-26,-10,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=39,-13,-14,-20,-10,-18,-5,-20,-8,-12,-6,-8,-13,-3,-11,-20,4,-2,-2,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-26,-15,-5,-11,-24,-8,-11,10,5,2,-11,-22,2,27,-17,-10,-9,-20,-6,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-29,-5,10,-28,-14,-2,-21,7,-16,-7,-4,-3,23,14,-4,-9,-23,-22,-14,15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-11,-26,-7,15,-11,-24,-10,-6,-6,11,1,-14,-12,0,-3,-15,-10,-10,-24,-10,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-28,-6,-17,-29,60,-18,-38,-18,-29,-20,3,-19,-18,-18,2,-16,-29,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-27,11,33,-30,-17,4,-23,5,-18,-9,0,-6,25,-1,0,-9,-25,-27,-15,29;
MA   /M: SY='P'; M=5,-8,-24,-7,-3,-22,-12,-14,-14,-8,-17,-13,-5,17,-5,-11,4,-1,-14,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-24,-3,-11,-26,38,-16,-32,-15,-27,-19,5,-16,-13,-15,9,-3,-23,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-19,-10,-2,-13,-23,-8,2,-8,-6,-2,-13,-17,-9,-11,-3,-3,13,-30,-11,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-19,-23,-23,-17,15,-23,-1,-1,-12,6,2,-17,-24,-12,-9,-13,-6,-4,3,31,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-17,1,-2,-17,-16,-5,-15,-7,-15,-11,4,-12,-2,-7,12,22,-9,-31,-11,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-19,-9,-3,-13,-14,-10,-3,-7,-8,-4,-11,25,-2,-10,-6,-5,-7,-16,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-11,36,-13,-5,-19,-18,-18,-21,-13,-17,-15,-13,-1,-12,-18,-5,-7,-13,-31,-22,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-18,12,-30,19,10,-29,-17,3,-33,19,-24,-16,7,-15,9,33,-6,-10,-24,-27,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-16,58,-19,-12,-24,-26,-18,-27,-20,-22,-18,-16,-6,-16,-22,-8,-10,-17,-41,-26,-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-3,-19,-6,-4,-24,5,5,-22,-10,-20,-12,1,-13,0,-11,10,-2,-16,-27,-14,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-25,-7,3,-19,-14,-7,-21,10,-22,-10,-2,-3,11,9,2,-3,-19,-22,-11,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-3,-16,-30,61,-18,-39,-18,-29,-21,2,-19,-18,-19,1,-17,-29,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,21,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-28,-15,-7,-1,-22,-2,-14,2,-12,-7,-10,-22,1,15,-9,-8,-13,4,14,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-28,-15,-5,-3,-26,4,-6,-3,3,3,-13,-23,11,6,-15,-10,-12,-5,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00194;
//
ID   ANNEXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00223;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Annexins repeated domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=77;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0619669; R2=0.0178525; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=920; N_SCORE=22.476; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=2,-12,-22,-9,4,-21,-18,-11,-14,-7,-17,-12,-13,22,-5,-14,-4,-7,-13,-27,-19,-2;
MA   /M: SY='A'; M=4,-1,-20,-1,-1,-18,-10,-6,-16,-3,-8,-7,-5,-15,-3,-8,-5,-8,-12,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-27,-21,-17,31,-28,12,-7,-7,-3,-1,-15,-26,-14,-6,-18,-11,-10,13,49,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-7,-23,-7,-15,40,-24,-14,-10,-21,1,-7,-9,-24,-27,-17,-15,-10,-8,-7,13,-18;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-12,-17,-6,-18,-7,-19,-6,-9,-8,-8,-12,-13,-10,-16,6,-1,5,-23,-18,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-29,18,32,-32,-18,4,-30,16,-24,-15,5,-7,19,7,-2,-10,-27,-28,-14,25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-25,-11,0,-19,-21,-7,-16,16,-14,-5,-6,-18,6,33,-7,-6,-7,-23,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-21,9,-31,-21,22,-29,46,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-14,-26,-15,-11,0,-24,24,-14,-3,-5,-2,-9,-25,-3,10,-17,-13,-16,0,25,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-27,4,6,-19,-18,5,-23,15,-19,-9,3,-15,7,13,-5,-8,-19,-21,-1,5;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-15,-33,-24,-1,-28,-13,27,-19,19,39,-21,-22,-10,-18,-19,-10,17,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='K'; M=2,3,-24,0,9,-26,-14,-9,-24,25,-24,-12,5,-10,5,13,-1,-4,-17,-24,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-17,-30,59,-18,-39,-13,-30,-19,0,-19,-16,-12,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-12,-18,-17,-9,-8,-16,-13,-2,-9,0,3,-11,-17,-3,-11,-4,-3,0,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-10,-13,-13,-9,-21,-21,-5,-11,-7,-7,-4,-13,-13,-11,16,43,7,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,34,-29,46,14,-34,-12,-1,-34,6,-26,-23,17,-12,2,3,-1,-9,-26,-35,-17,8;
MA   /M: SY='D'; M=-16,21,-30,33,31,-29,-17,9,-32,6,-23,-20,7,-8,9,2,-3,-11,-28,-30,-12,19;
MA   /M: SY='N'; M=-8,5,-25,4,0,-18,-8,-7,-22,3,-23,-15,7,-15,-2,0,2,-3,-18,-16,-11,-1;
MA   /M: SY='T'; M=10,-4,-6,-11,-11,-15,-11,-19,-11,-12,-12,-10,-3,-13,-10,-14,13,24,-2,-29,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-22,-30,-25,-2,-33,-26,31,-23,12,11,-15,-20,-19,-23,-10,3,24,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,1,-30,6,12,-24,-19,2,-31,22,-21,-14,3,-16,10,47,-7,-10,-23,-24,-12,8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-22,-32,-27,-2,-32,-27,36,-24,12,13,-19,-23,-22,-25,-13,-5,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-27,-21,-33,-24,3,-29,-18,29,-22,27,30,-24,-24,-16,-19,-21,-8,22,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-10,-25,-23,-4,-25,-27,17,-17,4,4,-21,-23,-23,-18,-1,11,33,-29,-11,-23;
MA   /M: SY='T'; M=3,5,-11,-1,-4,-16,-8,-11,-16,-9,-22,-16,13,-11,-4,-9,28,30,-9,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=16,-1,-10,-5,-3,-19,-3,-9,-17,-9,-23,-16,6,-11,-3,-10,27,15,-9,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-28,16,42,-27,-17,2,-28,11,-22,-19,10,-6,15,10,0,-8,-29,-30,-19,28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-25,-25,-14,-6,-27,-22,22,-18,7,8,-17,-20,-13,-18,-13,-8,18,-23,-7,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,52,24,-39,-13,2,-35,3,-27,-23,14,-9,13,-5,0,-10,-30,-35,-18,19;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-24,-22,-28,-18,1,-26,-12,16,-15,27,28,-21,-24,-9,-5,-22,-10,8,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-23,-7,3,-12,-16,-5,-9,-5,-3,0,-2,-17,6,-4,-6,-7,-11,-22,-8,5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,4,-25,6,2,-16,-16,-5,-16,0,-8,-7,0,-17,2,0,-8,-8,-15,-23,-6,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-28,-39,-29,0,-38,-28,47,-28,19,22,-21,-21,-19,-28,-19,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-27,-4,3,-24,-15,-7,-26,29,-25,-11,3,-13,6,31,-2,-6,-18,-24,-12,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-22,-1,14,-26,-9,-4,-23,5,-19,-12,-2,-12,11,7,1,-6,-19,-26,-16,12;
MA   /M: SY='E'; M=6,-2,-19,-4,14,-17,-16,-6,-14,-2,-12,-9,-3,-11,2,-8,0,-5,-12,-23,-11,8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-2,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-20,-7,6,-21,-22,1,-19,13,-17,-4,-4,-15,19,12,-7,-9,-18,-20,-5,11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,4,-28,2,15,-25,-17,-2,-25,22,-21,-11,7,-13,13,23,-5,-8,-22,-25,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-26,-13,-4,-16,-20,-1,-11,14,-7,9,-6,-18,6,21,-12,-10,-10,-21,-6,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-9,-26,-13,-15,17,-24,16,-6,-9,-6,-4,-6,-25,-9,-9,-10,-1,-12,9,50,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-25,-2,-4,-29,24,-4,-30,-5,-27,-15,7,-15,3,-7,7,-9,-25,-26,-20,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-26,-8,0,-21,-23,-10,-11,19,-16,-3,-3,-14,7,10,-7,-4,-8,-21,-6,3;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-17,8,1,-23,-7,-10,-21,-8,-27,-20,9,3,-3,-11,24,15,-15,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-2,-13,0,2,-12,-19,5,-17,-4,-11,-7,-5,-18,1,-7,-5,-7,-16,-20,5,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,9,-24,10,10,-25,-12,0,-24,9,-24,-14,10,-12,11,6,7,-1,-21,-28,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,-18,-10,-9,-9,-9,-12,-11,-9,-10,-3,-7,-15,-8,-11,2,-3,-6,-13,-9,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,41,-29,26,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,27,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-6,-22,-9,2,-19,-14,-1,-14,2,-11,-1,-5,-14,10,-1,0,-1,-12,-21,-6,5;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-20,4,3,-27,7,-10,-26,-2,-26,-17,5,-11,0,-7,13,-1,-18,-29,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-8,34,-27,48,24,-35,-11,-3,-34,1,-25,-25,12,-8,3,-9,1,-9,-26,-35,-20,13;
MA   /M: SY='T'; M=2,-8,-10,-16,-13,-7,-21,-21,-2,-15,2,-3,-7,-15,-13,-14,8,31,3,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-14,0,3,-21,-5,-7,-22,0,-29,-18,8,-10,2,-2,29,14,-12,-36,-17,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-28,-11,-19,-28,60,-20,-35,-19,-28,-18,-1,-20,-19,-19,2,-15,-25,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-28,46,11,-32,-9,16,-34,-3,-27,-22,22,-14,1,-8,0,-10,-29,-36,-12,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-27,-26,-22,36,-30,5,4,-17,9,3,-21,-30,-18,-14,-21,-10,-4,18,57,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-30,4,23,-28,-17,-4,-29,27,-23,-12,0,-9,15,25,-6,-10,-24,-23,-14,18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,7,-27,9,4,-24,-18,-3,-26,20,-23,-13,5,-14,4,21,-4,-3,-18,-24,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-19,-30,-22,6,-25,-22,18,-22,14,12,-19,-19,-18,-21,-12,-3,14,-18,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,23,-29,43,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-18,-27,-20,4,-29,-20,21,-22,25,17,-26,-26,-19,-18,-19,-6,22,-23,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=20,-2,-15,-10,-6,-18,-7,-13,-12,-3,-14,-10,2,-13,-5,-9,9,6,-6,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-22,21,-26,-21,-4,-27,-24,2,-24,13,2,-22,-29,-22,-21,-12,-1,8,-31,-12,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-29,-7,-7,-29,38,-10,-32,-13,-23,-13,-1,-17,-1,-13,-1,-16,-27,-21,-22,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-30,-6,-2,-26,12,-2,-28,-9,-27,-17,-3,9,-5,-12,1,-10,-26,-22,-18,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-5,20,-24,22,9,-27,-9,-5,-26,3,-23,-18,14,-12,1,-1,4,-1,-21,-31,-17,5;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-25,19,2,-25,-14,-3,-20,-2,-17,-14,5,-12,-3,-1,-3,-8,-14,-30,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=1,9,-25,13,21,-30,-13,8,-25,1,-20,-13,3,-8,17,-4,3,-7,-23,-28,-14,18;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-10,-21,-10,7,10,-20,-11,-11,-12,-3,-8,-8,-16,-8,-11,0,-3,-11,-19,-3,1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-32,28,3,-35,16,-11,-36,-9,-30,-25,6,5,-9,-15,-2,-13,-30,-31,-25,-4;
MA   /M: SY='A'; M=18,-17,-18,-20,-14,-9,-14,-15,-2,-12,-8,-6,-17,-2,-14,-18,-2,-3,3,-14,-1,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-26,-8,8,-22,-24,-6,-8,2,-11,-3,-4,-12,18,7,-2,1,-12,-23,-10,11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,28,-27,29,32,-28,-11,3,-28,5,-25,-22,24,-9,9,-2,3,-7,-30,-35,-20,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-27,-23,-13,-5,-26,-20,5,-23,20,5,-26,14,-16,-20,-23,-10,-5,-24,-11,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-10,-21,-16,-7,-15,-16,-7,-14,9,-9,3,-6,-17,1,26,-3,1,-8,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-19,-10,-2,-18,-20,-6,-8,-3,-8,6,-4,-12,16,-3,6,18,-8,-25,-8,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00195;
//
ID   CLATHRIN_LIGHT_CHN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00224;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clathrin light chain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2375398; R2=0.0123131; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1254; N_SCORE=19.668; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=184; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=6,-2,-26,0,15,-28,19,-12,-30,-6,-22,-18,-2,-10,-2,-12,2,-12,-24,-24,-24,7;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-16,2,-4,-14,-6,-4,-12,-10,-14,-12,21,-18,-4,-8,14,6,-14,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=18,-7,-12,-16,-16,-12,-12,-18,3,-12,-6,-4,-3,-20,-16,-16,2,0,13,-28,-16,-16;
MA   /M: SY='P'; M=15,-14,-26,-14,-8,-26,6,-20,-20,-12,-22,-16,-12,29,-12,-20,0,-8,-18,-24,-26,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-2,11,-24,13,-14,-22,-8,-18,-14,-6,-14,-6,-12,-2,-12,-14,-26,-22,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,0,16,-36,-20,28,-22,6,-20,0,2,-12,50,8,-2,-12,-30,-22,-4,32;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,4,28,-38,-20,8,-22,10,-20,-4,0,-8,52,8,0,-10,-30,-22,-12,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-29,13,42,-29,-17,-4,-27,4,-23,-20,-2,12,13,-4,4,-6,-27,-31,-22,27;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-18,-16,-14,-24,29,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-18,-16,-14,-24,29,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='I'; M=15,-22,-22,-32,-22,-8,-24,-26,25,-22,8,8,-16,-16,-16,-26,-8,-6,18,-20,-8,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-26,-28,-22,-12,-6,-26,-20,4,-22,17,4,-26,19,-16,-20,-22,-10,-6,-24,-12,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00196;
//
ID   IF_MP; MATRIX.
AC   MP00226;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Intermediate filaments signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4928441; R2=0.0159306; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; N_SCORE=12.078; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-29,28,42,-32,-13,-1,-32,6,-23,-21,5,-4,14,-3,1,-9,-29,-31,-20,28;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-20,-18,20,-24,14,-2,-11,4,1,-18,-29,-10,-8,-20,-11,-9,16,58,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-28,2,18,-36,-18,7,-21,12,-22,-4,4,-10,47,10,2,-8,-28,-23,-11,32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-23,-4,2,-19,-21,-8,-4,-4,-4,3,-8,-15,7,-4,-6,-5,-4,-25,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,21,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-29,-20,8,-27,-18,18,-25,37,22,-25,-26,-17,-19,-23,-6,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-27,40,10,-33,-2,7,-34,-3,-27,-22,18,-13,1,-9,2,-9,-27,-35,-17,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-16,-29,-25,-1,-30,-27,26,-21,12,9,-22,-24,-23,-21,-9,5,31,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,49,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='M'; M=2,-13,-17,-20,-13,-8,-20,-13,5,-13,7,13,-12,-16,-4,-13,-3,10,3,-23,-7,-9;
MA   /M: SY='R'; M=2,-7,-20,-10,-4,-19,-8,-7,-21,7,-19,-10,0,-15,1,20,6,3,-12,-25,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,23,-27,35,37,-32,-14,-1,-32,4,-25,-24,9,-5,10,-5,6,-6,-27,-35,-20,24;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-13,-7,-19,-12,-12,-20,-13,2,-10,4,8,-10,-22,-4,-11,-10,-7,1,-26,-10,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='A'; M=22,-1,-16,-7,0,-20,-7,-11,-13,-5,-14,-11,0,-12,-3,-10,7,0,-6,-26,-18,-1;
MA   /M: SY='T'; M=5,-5,-5,-15,-13,-11,-20,-21,-6,-13,-8,-8,-4,-12,-12,-14,14,35,2,-29,-12,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,1,-21,-20,6,-30,29,-21,-9,1,-19,10,61,-10,-11,-21,-21,-8,1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-24,-4,0,-23,-9,-7,-23,17,-24,-11,5,-14,4,17,2,-1,-16,-25,-13,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-25,-9,-16,-28,53,-19,-34,-18,-28,-19,1,-18,-16,-19,7,-12,-24,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,21,47,-32,-15,0,-30,8,-22,-19,2,-3,21,-1,0,-10,-30,-29,-19,34;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-26,22,32,-28,-12,-2,-27,2,-21,-19,8,-7,11,-4,5,-5,-25,-33,-19,21;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-6,-3,0,-20,-8,-11,-17,-9,-18,-14,5,-14,-1,-11,13,7,-12,-33,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-29,-3,1,-24,-13,3,-28,22,-23,-9,2,-12,7,38,-8,-10,-21,-23,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-21,-23,-17,5,-24,-17,12,-20,14,11,-19,-19,-17,-18,-14,-6,10,-19,-1,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-6,-22,-6,-1,-23,1,-10,-21,-2,-22,-13,-1,-4,0,-3,3,-5,-19,-24,-15,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-8,-13,-11,-9,-9,-11,-10,-17,-4,-6,-7,-18,-12,-15,2,6,-6,-28,-11,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-25,-1,0,-22,-3,-9,-17,-5,-19,-12,4,-9,-1,-1,3,-5,-15,-29,-17,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-13,-26,-12,-8,-19,4,-9,-19,-12,-19,-9,-10,4,-5,-14,-4,-10,-20,-14,-11,-8;
MA   /M: SY='A'; M=4,-11,-5,-15,-10,-18,-4,-10,-15,-10,-10,-6,-6,-19,-6,-6,0,-4,-9,-27,-15,-9;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-21,-8,-8,-20,1,-13,-13,-12,-18,-11,-4,-5,-10,-13,6,0,-7,-29,-18,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-21,1,8,-20,-9,-2,-20,-2,-21,-13,3,-7,1,-6,11,7,-15,-31,-14,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-11,-21,-14,-7,-13,-19,-10,-2,-9,-7,0,-7,-15,5,-8,2,2,-2,-23,-6,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00198;
//
ID   TUBULIN_MP; MATRIX.
AC   MP00227;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tubulin subunits alpha, beta, and gamma signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9757614; R2=0.0133487; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=463; N_SCORE=11.146; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-26,28,24,-27,-18,-7,-20,-1,-17,-17,1,-11,1,-8,-2,-8,-12,-34,-18,13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,12,-22,4,-8,-24,30,-6,-28,-10,-30,-20,26,-18,-8,-10,11,-5,-26,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-15,41,-25,-23,6,-26,-24,-16,-23,-10,-12,-13,-27,-25,-20,-1,12,-4,-29,-9,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-24,33,19,-28,-12,-2,-28,0,-24,-22,19,-10,2,-6,6,4,-24,-36,-18,11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,4,15,-6,-27,6,-6,-31,-10,-28,-22,23,-22,-10,-12,2,-8,-26,-38,-24,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-18,-32,-24,20,-30,-22,19,-28,34,14,-28,-30,-26,-20,-24,-8,17,-17,3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-30,33,27,-38,-16,4,-30,6,-24,-16,8,-8,28,0,0,-10,-30,-30,-16,28;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-30,-17,-22,-23,45,-22,-20,-22,-19,-11,-4,-20,-20,-22,-4,-18,-17,-20,-23,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,65,-32,-22,10,-30,12,4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,6,4,24,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-19,-24,-21,-7,7,-26,-9,0,-15,15,8,-16,-22,6,-9,-16,-10,-7,-13,3,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-18,-32,-24,21,-30,-22,18,-28,34,14,-28,-30,-26,-20,-24,-8,16,-16,4,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-12,-14,-20,-16,12,-24,-20,-3,-18,5,-3,-9,-18,-18,-14,3,27,2,-20,0,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-28,-9,-7,2,-22,73,-23,-14,-13,0,3,-22,-1,-4,-12,-18,-23,-21,22,-7;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-14,-6,-7,-22,16,-14,-22,-12,-26,-18,4,-12,-7,-14,25,7,-12,-31,-22,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-14,-32,-28,20,-30,-26,21,-24,18,10,-28,-30,-30,-20,-16,-4,31,-19,1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=11,-8,-23,-10,-14,-26,44,-18,-31,-16,-26,-18,0,-16,-14,-18,9,-9,-21,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,33,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-20,-22,-18,-5,-4,-16,1,-20,15,13,-16,-22,-14,-16,-12,-1,-1,-22,-9,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-26,-10,-18,-26,50,-20,-33,-18,-26,-18,0,-18,-18,-18,4,-4,-23,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,-17,-4,-2,-20,-8,-14,-18,-10,-26,-18,1,12,-4,-12,25,19,-13,-36,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-18,-21,-19,2,-25,-17,15,-22,27,11,-14,-28,-19,-16,-18,-6,12,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=3,-26,-20,-30,-20,1,-25,-22,19,-26,31,13,-24,-24,-18,-22,-19,-8,12,-20,-4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-26,16,48,-28,-16,-2,-28,6,-22,-20,2,-2,16,-2,8,-4,-26,-32,-20,32;
MA   /M: SY='R'; M=10,-8,-22,-12,-2,-22,-12,-10,-22,18,-18,-10,-4,-14,2,26,-2,-6,-12,-20,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,1,-9,-3,-22,-18,-10,-28,16,-24,-14,-1,-19,1,27,0,-4,-16,-29,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-26,18,34,-25,-20,-6,-19,2,-15,-15,-3,-8,6,-6,-2,-8,-13,-32,-18,20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,11,-26,18,28,-28,-14,-4,-28,8,-20,-18,2,-8,8,6,0,-8,-23,-28,-18,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,-1,-20,-24,-12,-30,-20,-16,67,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00199;
//
ID   TUBULIN_B_AUTOREG_MP; MATRIX.
AC   MP00228;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tubulin-beta mRNA autoregulation signal.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=18;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=2; N2=17;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8510072; R2=0.0088171; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1038; N_SCORE=10.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=641; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-50; D=-20; I=-20; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-86,-84,-49,-91,-86,108,-79,-22,-35,-76,-74,-75,-83,-74,-59,-19,-73,-56;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-67,-83,-77,-50,-85,-81,3,-76,36,-38,-80,-80,-76,-76,-69,-53,90,-83,-59;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-30,-54,-54,-66,-71,146,-84,-58,-48,-54,-34,-70,-36,-53,-36,-54,-83,-100,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-45,-85,-81,-47,-88,-79,84,-78,46,-13,-78,-77,-74,-79,-73,-33,23,-74,-56;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-84,-54,-34,-89,-67,-47,-75,-40,-71,-57,-50,-66,131,-40,-29,-61,-77,-72,-61;
MA   /M: SY='A'; M=62,-41,-64,-65,-74,55,-70,-35,-64,-69,-63,-54,-65,-63,-70,-43,57,-38,-78,-71;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-85,-54,-34,-89,-58,-47,-76,-39,-71,-57,-50,-66,131,-33,-48,-62,-78,-72,-61;
MA   /M: SY='C'; M=-47,153,-81,-81,-71,-76,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-84,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-90,-69,-75,-75,-50,-68,-67,-61,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-28,-57,-76,-50,-43,-63,-48,-83,-46,124,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='Q'; M=-52,-84,-54,-34,-89,-67,-47,-75,-40,-71,-57,-39,-66,131,-40,-48,-62,-77,-72,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-77,-86,-84,-49,-75,-86,106,-78,-33,-36,-76,-74,-55,-82,-73,-58,8,-74,-57;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-90,-70,-86,-75,-39,-68,-67,-77,-49,-68,-70,-74,-78;
MA   /M: SY='A'; M=86,-12,-52,-59,-75,-24,-67,-67,-61,-69,-63,-57,-66,-43,-66,39,-5,-55,-78,-70;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00200;
//
ID   TAU_MAP_MP; MATRIX.
AC   MP00229;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tau and MAP proteins tubulin-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6007733; R2=0.0137830; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1213; N_SCORE=21.310; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,43,-30,-20,-3,-30,23,-23,-17,0,-3,17,10,-3,-10,-27,-27,-17,30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-24,-2,19,-25,-23,-5,-9,1,-11,-4,-9,-12,21,-2,-3,-7,-7,-26,-13,20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,37,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-13,-7,-20,0,-17,-13,-10,-17,-13,-3,-10,-7,-17,20,7,-3,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=11,-24,-17,-30,-24,-6,-25,-27,25,-20,8,8,-21,-21,-21,-23,-8,-3,29,-24,-10,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-23,-7,-11,-20,14,14,-27,-14,-20,-11,3,-17,-8,-11,4,3,-20,-26,-9,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-14,-16,-26,43,-20,-29,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=13,21,-16,5,-4,-20,0,-1,-16,-4,-22,-16,33,-16,-4,-8,10,0,-19,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-17,-20,-17,-10,-27,-23,10,3,-3,3,-20,-23,-17,-3,-10,-3,27,-27,-10,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-22,-29,-22,-4,-32,-26,27,-22,9,9,-12,-16,-16,-22,-5,13,19,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='G'; M=3,-4,-18,-7,-11,-20,20,-17,-24,-14,-23,-17,3,-14,-11,-14,18,15,-14,-29,-20,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-4,-30,-4,-2,-30,14,28,-31,-8,-24,-8,3,-17,13,-5,-3,-17,-30,-23,-8,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-30,-4,-1,-30,14,-14,-34,23,-30,-14,0,-14,-1,11,-6,-14,-24,-20,-18,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-16,-19,-12,-1,-19,-16,5,-22,19,5,-15,-22,-12,-16,-3,1,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-20,10,20,-20,-14,-4,-20,0,-20,-17,17,-9,4,-3,10,13,-20,-33,-17,12;
MA   /M: SY='F'; M=7,-22,-16,-32,-22,42,-19,-20,-4,-22,2,-4,-16,-22,-29,-20,-9,-6,0,-1,11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-18,-26,-18,-8,-9,-24,-8,-11,7,7,1,-11,-24,-1,36,-18,-10,-9,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-34,9,37,-30,-20,-8,-26,2,-24,-20,-8,34,9,-8,-4,-10,-30,-30,-24,21;
MA   /M: SY='C'; M=-13,6,31,-5,-11,-20,-17,20,-27,-14,-23,-14,15,-28,-9,-11,-3,-10,-22,-41,-12,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00201;
//
ID   MAP1B_NEURAXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00230;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neuraxin and MAP1B proteins repeated region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5105004; R2=0.0128928; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1717; N_SCORE=26.637; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=9,2,-17,2,-4,-19,4,-9,-21,-10,-22,-17,3,-13,-6,-13,17,5,-13,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-18,-21,-21,26,-30,16,-2,-12,-2,-2,-20,-31,-12,-12,-19,-10,-10,24,72,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,28,43,-34,-18,2,-30,8,-22,-18,5,-4,23,0,0,-10,-30,-30,-18,33;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-24,-3,-4,-18,-21,-16,-5,3,-13,-6,-1,-13,-4,-4,1,5,-3,-27,-10,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-20,-9,-6,-15,-16,-6,-12,-11,-18,-12,-3,7,-6,-13,13,16,-10,-29,-9,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-28,15,47,-28,-14,-3,-29,6,-20,-19,0,-2,14,-2,2,-4,-27,-29,-20,31;
MA   /M: SY='K'; M=-11,9,-28,10,11,-29,-16,-6,-30,32,-29,-15,7,-11,8,22,-3,-7,-22,-26,-13,9;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-13,-11,-11,-13,-7,-20,-14,-11,-13,-11,-1,-11,-11,-12,17,37,-4,-28,-13,-11;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-16,-16,-15,-12,-10,-22,-4,-15,-7,-6,-4,-13,-13,-15,10,27,1,-26,-12,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-28,-3,6,-25,-12,10,-29,17,-23,-10,2,-15,11,30,-3,-9,-22,-24,-9,6;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-13,-7,-5,-16,-12,-17,-15,-10,-19,-15,1,0,-7,-12,23,30,-7,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-35,-11,-3,-23,-20,-10,-16,-13,-19,-13,-17,60,-9,-18,-10,-9,-24,-29,-22,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-15,33,23,-33,-5,-5,-36,-2,-26,-24,7,-11,1,-10,-1,-11,-28,-35,-22,12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-21,15,11,-21,-20,-12,-11,-5,-12,-12,-4,-14,-6,-11,-1,0,-1,-33,-16,3;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-10,-2,4,-25,12,-13,-28,-11,-27,-20,1,-8,-5,-13,15,-1,-20,-33,-24,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,7,-25,12,-6,-30,31,-13,-34,-12,-28,-22,6,-15,-11,-16,7,-8,-24,-28,-25,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-4,2,12,2,-6,-17,-13,-10,-22,-13,-23,-19,1,-19,-8,-14,14,7,-13,-33,-9,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-18,-9,-5,-16,-19,-17,-10,5,-15,-8,-1,-11,-4,-1,10,20,-4,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-19,-18,-13,-8,-22,-6,5,-13,-1,9,-7,-15,-4,-13,1,13,3,-23,-2,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-17,-18,-15,-8,-23,-22,8,-17,-4,-2,-5,-13,-12,-17,10,25,8,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-17,-16,-12,-10,-24,-19,-2,-7,-6,-4,-4,-14,-9,0,7,28,2,-26,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-28,-4,5,-25,-18,-4,-28,32,-25,-10,1,-14,12,42,-4,-7,-20,-22,-11,6;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-13,-16,-13,2,-19,-19,-5,-16,0,-5,-7,-16,-14,-14,9,26,0,-24,-6,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-34,-12,-3,-22,-21,-4,-15,-13,-15,-11,-17,51,-9,-17,-11,-10,-22,-29,-18,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-19,28,29,-34,-16,0,-31,3,-24,-19,6,-9,17,-4,2,-8,-28,-33,-19,23;
MA   /M: SY='D'; M=4,10,-19,16,2,-23,-12,-13,-14,-7,-16,-14,-1,-14,-8,-14,4,-2,-2,-33,-18,-3;
MA   /M: SY='S'; M=1,-8,-21,-9,-5,-19,7,-16,-11,-14,-18,-11,-1,-14,-8,-15,12,0,-7,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-21,-8,-12,-23,29,-16,-28,-12,-25,-17,2,-15,-11,-10,13,5,-18,-27,-22,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-10,-28,-13,-17,22,-25,18,-3,-8,-5,-3,-6,-28,-8,-8,-15,-8,-13,18,63,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-17,-6,-8,-12,4,-8,-19,-12,-23,-15,2,-15,-6,-12,21,12,-12,-23,-3,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-17,-21,-21,26,-30,16,-3,-12,-2,-2,-20,-31,-12,-12,-19,-10,-10,23,71,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,5,-2,15,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='T'; M=-7,4,-21,2,-3,-18,-21,-16,-11,3,-14,-9,0,-11,-5,-3,4,17,-6,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-13,-11,-9,-13,-15,-17,-5,-13,-14,-9,1,-12,-7,-13,22,27,1,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-25,-10,-5,-20,-20,-20,-15,-10,-20,-15,-10,40,-10,-15,5,20,-15,-30,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00202;
//
ID   F_ACTIN_CAPPING_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00231;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   F-actin capping protein beta subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4217477; R2=0.0128396; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=990; N_SCORE=17.123; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-17,-20,-13,0,-20,-17,6,-23,22,6,-16,-23,-13,-17,-6,0,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-23,-3,7,-27,-20,-7,-20,15,-20,-7,0,-10,20,9,4,11,-17,-23,-10,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-17,-20,-13,-14,-27,-16,13,-10,0,7,-20,-23,1,-10,-7,-3,22,-27,-10,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,2,-23,-4,-3,-13,-17,-7,-10,7,-2,-3,8,-20,-3,3,-11,-7,-13,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,14,-24,18,4,-24,-17,-6,-27,7,-20,-17,7,-13,0,18,3,8,-17,-30,-13,0;
MA   /M: SY='C'; M=-7,11,23,15,-2,-27,-13,-13,-30,-13,-27,-23,4,-19,-9,-16,11,0,-17,-43,-23,-6;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,-17,-21,-14,-13,-14,-20,8,-17,-6,-3,-7,-13,-10,-20,9,3,7,-26,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-27,0,-13,-27,46,-10,-33,-13,-30,-20,21,-20,-13,-13,3,-13,-30,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,9,-27,3,3,-23,-14,0,-27,28,-27,-13,18,-17,7,35,-4,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,31,34,-37,-17,3,-30,7,-23,-17,7,-7,25,0,0,-10,-30,-30,-17,30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-27,29,-30,-23,0,-30,-23,3,-30,26,6,-27,-33,-23,-23,-23,-10,3,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-17,-23,-24,-20,-16,7,-23,2,-20,-6,-3,-10,-17,-17,-23,-3,-10,1,-20,-16,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-23,-3,3,-23,-20,-13,-23,29,-23,-10,0,-10,3,16,0,11,-13,-23,-10,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-2,-27,4,-8,2,-24,0,-5,-14,8,-2,-11,-24,-10,-13,-17,-10,-9,-9,22,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00203;
//
ID   CADHERIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00232;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cadherin domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1352053; R2=0.0183484; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=82; N_SCORE=7.630; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=20; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-17,-12,-6,-13,-19,-14,-3,-7,-4,0,-8,-16,-5,-5,0,6,1,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,26,-23,35,14,-32,-9,-5,-29,-2,-23,-21,11,-11,1,-10,3,-6,-22,-34,-19,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-23,-3,-8,-19,9,-9,-19,-8,-18,-11,2,-16,-7,-8,2,-6,-15,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,3,-7,-28,28,-9,-31,-11,-25,-18,3,-13,-9,-12,1,-11,-24,-26,-22,-9;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-21,-4,-2,-17,-2,-7,-16,-8,-17,-11,3,-12,-2,-9,6,-1,-13,-26,-13,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-30,0,0,-27,-8,-14,-22,-9,-25,-18,-8,37,-7,-15,-2,-5,-22,-30,-24,-6;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-27,-7,-6,-25,7,-15,-21,-9,-22,-14,-6,14,-7,-13,1,-6,-19,-26,-23,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-22,-19,-10,-5,-22,-10,-1,-6,13,6,-14,-22,-6,1,-15,-7,-3,-20,-3,-9;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,-9,-10,-7,-13,-12,-14,-11,-12,-16,-11,-1,-14,-7,-11,20,18,-2,-31,-14,-7;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-4,-7,-8,-21,9,-15,-21,-13,-23,-17,4,-16,-9,-15,16,4,-13,-33,-22,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-18,-4,0,-15,-18,-9,-13,-4,-12,-10,4,-11,-1,-1,9,20,-9,-30,-12,-2;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-5,-18,-17,-18,8,-20,-13,-16,-12,-9,-10,-19,-15,-18,1,-3,-3,-26,-19,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-1,-19,-3,3,-16,-18,-12,-14,-4,-13,-10,-2,-4,-2,-6,10,20,-10,-29,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-8,-31,-26,5,-30,-26,22,-25,22,11,-27,-29,-25,-21,-18,-5,27,-25,-5,-26;
MA   /M: M=-5,-8,-21,-13,-8,-8,-17,0,-7,-8,-4,-2,-3,-19,-4,-2,-4,-1,-6,-21,-2,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-7,-22,-11,-4,-3,-22,-3,-8,-5,-5,-4,-4,-18,-5,-2,-5,1,-6,-20,0,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,31,-26,27,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,31,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-22,-10,0,-12,-21,-10,-1,-10,6,3,-11,-16,-2,-10,-8,-3,-3,-26,-9,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-20,-19,-10,-7,-28,-19,14,-11,3,5,-18,-20,-10,-11,-9,-5,18,-24,-7,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-22,16,0,-20,-4,28,-22,-2,-28,-16,50,-20,2,0,6,-4,-30,-38,-12,0;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-15,-16,-10,-18,-1,-19,-15,-11,-16,-13,-11,6,-12,-17,2,-4,-10,-23,-20,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-11,-21,-12,1,-8,-23,-11,-4,-3,-6,-2,-11,-16,-3,-3,-5,-1,1,-22,-6,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-33,-25,28,-30,-23,15,-27,16,7,-23,-18,-27,-22,-19,-9,11,-12,6,-26;
MA   /M: M=-2,-11,-23,-11,-3,-11,-20,-14,-4,-9,-1,-4,-11,-7,-7,-10,-5,-2,-3,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-28,-5,1,-16,-17,-5,-16,2,-15,-7,-6,1,3,-1,-6,-6,-18,-19,-4,1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-25,1,7,-20,-16,-7,-21,-2,-22,-15,-3,16,-1,-4,0,-3,-21,-28,-16,1;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: M=-2,-5,-18,-6,0,-10,-12,-7,-7,-6,-6,-5,-4,-7,0,-6,-2,-2,-8,-17,-5,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-18,-13,-9,4,-18,-2,0,-7,1,1,-10,-11,-4,-5,-9,-4,-4,-3,16,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-6,-16,-6,-2,-12,-9,-11,-10,-8,-13,-9,-2,-3,-4,-9,8,7,-7,-24,-11,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,-15,-23,-17,1,-18,-17,7,-17,5,4,-16,-18,-16,-17,-8,-2,9,-18,-3,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-15,-7,-3,-5,-12,-9,-6,-7,-9,-6,-1,-8,-6,-7,2,4,-4,-19,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-15,-23,-19,6,-21,-18,19,-17,10,8,-14,-18,-16,-16,-11,-4,17,-13,-1,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-12,31,-14,-9,-16,-19,-12,-16,-12,-14,-11,-11,-13,-8,-13,-4,-6,-10,-28,-14,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-22,8,27,-20,-16,2,-17,4,-12,-10,0,-5,11,0,-2,-7,-17,-23,-12,18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-4,11,-15,7,1,-15,-5,2,-13,0,-16,-10,15,-5,2,0,4,-1,-14,-21,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='A'; M=5,2,-7,0,5,-17,-9,-8,-15,-3,-14,-12,2,-5,-1,-6,5,1,-12,-23,-15,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-23,-11,-4,-13,-12,-13,-8,-6,-10,-3,-9,13,-7,-9,-5,-2,-9,-22,-14,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-26,27,11,-24,-13,-1,-23,-1,-15,-16,17,-16,0,1,-3,-8,-22,-34,-16,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00205;
//
ID   CHIT_BIND_RR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00233;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitin-binding type R&R domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0876603; R2=0.0154216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=325; N_SCORE=10.090; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=0,3,-21,4,2,-21,-11,-9,-17,0,-15,-11,0,-14,0,-3,2,0,-11,-26,-12,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-11,-16,-13,-9,-8,-8,-12,-1,-6,0,0,-8,-14,-6,-5,-7,-6,1,-17,-8,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-3,-17,-6,-4,-10,-5,-9,-9,0,-13,-7,2,-11,-4,-2,2,-2,-7,-18,-9,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-21,0,0,-19,-13,-1,-18,4,-18,-11,8,-15,2,4,4,3,-13,-27,-11,0;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-24,-9,-3,-22,5,-10,-18,-8,-19,-11,-3,-8,-1,-9,4,-5,-14,-25,-17,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-25,-1,4,-25,1,-2,-23,-2,-20,-11,0,-12,7,-2,2,-5,-19,-24,-14,5;
MA   /M: SY='P'; M=1,-8,-22,-9,-4,-15,-16,-12,-10,-9,-15,-10,-5,5,-5,-12,4,4,-8,-26,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-27,5,21,-27,4,-9,-28,2,-23,-18,0,-5,3,-5,2,-8,-23,-27,-21,11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,7,-21,6,0,-23,4,-9,-22,-8,-22,-15,9,-7,-3,-11,11,2,-17,-31,-20,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-3,2,-20,3,4,-17,-6,3,-18,2,-12,-9,2,-12,3,7,-3,-7,-15,-19,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=0,3,-23,5,4,-22,2,-12,-20,-7,-17,-14,1,-12,-6,-12,2,-5,-14,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=11,-5,-22,-10,-10,-23,18,-6,-22,-11,-20,-12,1,-15,-5,-13,2,-10,-17,-23,-18,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-5,-1,-22,0,-8,-17,-3,-14,-8,-13,-12,-8,-1,-18,-9,-14,0,-5,-4,-24,-14,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=0,2,-16,-4,-4,-12,-13,-9,-4,-7,-12,-8,9,-17,-7,-8,4,1,0,-30,-14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=4,-20,-16,-23,-18,-8,-23,-20,12,-6,0,7,-18,-21,-15,-11,-7,-2,22,-24,-8,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-3,-24,-4,4,-25,-17,1,-17,8,-18,-6,-1,-14,17,11,0,-2,-14,-25,-10,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-16,-1,2,-20,-3,-9,-19,-7,-23,-15,5,-11,4,-7,23,11,-12,-32,-17,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-26,-26,-23,41,-29,4,1,-17,2,0,-19,-29,-19,-14,-17,-8,-4,18,56,-23;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-15,-1,3,-21,-4,-9,-21,-3,-25,-17,7,-11,1,-1,24,14,-13,-33,-18,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-26,-28,-29,-24,31,-29,-3,4,-19,7,2,-24,-30,-19,-16,-23,-12,-3,29,46,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-19,-20,-16,-8,-25,-21,8,-12,1,1,-13,-10,-14,-13,-5,8,12,-27,-10,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-2,4,-22,8,3,-21,2,-12,-20,-11,-11,-13,0,-15,-6,-13,3,-3,-15,-29,-18,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-30,-3,1,-27,-16,-17,-18,-8,-24,-17,-12,45,-8,-16,-2,-5,-19,-30,-24,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-29,55,25,-36,-11,1,-36,2,-28,-27,21,-9,4,-7,1,-9,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-20,-1,3,-19,-18,-9,-14,5,-17,-10,1,-13,3,4,6,8,-8,-28,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-24,-8,-6,-17,-21,-4,-10,-4,-12,-6,-7,-3,-4,1,-3,1,-7,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-17,-24,-20,-12,-4,-24,-8,0,-1,-4,0,-13,-22,-5,10,-10,-7,3,-12,7,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-19,-3,5,-19,-17,-11,-14,0,-16,-11,-1,-12,3,1,11,13,-7,-30,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,5,-31,-28,28,-22,15,11,-28,-28,-28,-21,-13,-1,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-21,7,5,-22,-14,-5,-18,3,-20,-13,11,-13,3,1,7,8,-14,-31,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-15,-18,-13,-5,-24,-21,6,-11,-3,-1,-13,-19,-14,-12,1,12,16,-26,-7,-14;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,43,-30,60,15,-38,-1,-2,-39,-2,-30,-29,20,-11,-2,-11,0,-11,-30,-38,-21,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-27,11,36,-29,-16,-5,-25,5,-20,-18,-3,6,12,-4,1,-8,-24,-28,-20,23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,20,-20,10,3,-16,-7,1,-19,-3,-21,-16,28,-16,0,-3,7,4,-21,-30,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-1,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-27,0,5,-25,-17,24,-21,7,-19,-5,12,-17,20,14,-4,-10,-23,-27,-5,11;
MA   /M: SY='P'; M=15,-17,-25,-16,-7,-23,-13,-21,-11,-11,-18,-13,-17,37,-12,-20,-2,-5,-9,-26,-24,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-19,-2,3,-20,-18,-10,-8,-3,-13,-7,-4,-15,5,-5,4,1,-1,-30,-14,4;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-14,-20,-15,-18,-16,17,-19,-10,-17,-15,-9,-7,-20,-17,-18,5,-4,-1,-25,-16,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,11,-24,14,5,-27,-11,5,-25,-1,-23,-16,7,0,1,-3,2,-5,-21,-30,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-12,-21,-15,-10,-4,-21,10,-8,-8,-3,0,-8,-20,-5,-1,-6,-3,-5,-19,3,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-23,-17,-10,-3,-20,-16,10,-19,13,5,-9,-21,-13,-17,-14,-8,3,-23,-7,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-33,-11,-3,-25,-18,-17,-15,-10,-24,-16,-18,67,-10,-18,-8,-8,-21,-27,-25,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-18,-6,-10,-17,-3,-18,-12,-8,-12,-9,-5,-14,-12,-11,4,10,-1,-27,-15,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=6,-12,-23,-12,-8,-20,-8,-18,-12,-9,-15,-11,-11,16,-11,-12,0,1,-9,-26,-19,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-27,-7,-2,-20,-15,6,-15,-6,-19,-10,-6,32,-3,-8,-6,-9,-19,-24,-12,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-29,-1,3,-26,-16,-15,-21,-3,-25,-18,-9,42,-5,-11,-1,-1,-22,-29,-23,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=5,-17,-19,-22,-17,-7,-18,-18,9,-15,3,2,-13,-17,-13,-15,-5,-2,9,-20,-6,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-24,-13,-6,-20,-16,-19,-7,-11,-17,-11,-15,33,-11,-18,0,-3,-6,-28,-21,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-21,-7,6,-21,-10,-14,-13,-5,-13,-11,-8,7,-3,-12,0,-5,-10,-25,-19,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-23,-10,-3,-20,-13,5,-16,-4,-15,-9,-7,1,-3,-7,-2,-7,-12,-22,-7,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00206;
//
ID   GAS_VESICLE_A_1_MP; MATRIX.
AC   MP00234;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gas vesicles protein GVPa signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4619193; R2=0.0162463; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=484; N_SCORE=13.315; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-17,-23,-24,-17,-4,-22,-11,10,-13,3,17,-16,-6,-9,-16,-9,1,4,-16,3,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-11,-12,-11,-9,-7,-14,-14,1,-11,-1,-3,-10,0,-10,-11,2,9,4,-21,-9,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-18,-12,-11,-3,-6,-4,-7,0,-7,-3,-8,-17,-7,9,-7,-7,-2,-7,6,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-22,8,9,-18,-13,-8,-14,-5,-10,-11,-6,20,-3,-10,-6,-7,-16,-21,-14,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-6,-21,-8,-3,-15,-14,-4,-4,-6,-4,17,-8,-8,4,-9,-2,-4,-6,-27,-11,0;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=10,3,-17,2,3,-21,-9,-8,-13,-5,-12,-4,-2,-10,2,-10,6,1,-9,-25,-14,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-23,-12,1,-14,-24,-16,2,-10,-2,-2,-17,4,-6,-13,-9,-6,3,-25,-13,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-27,-2,11,-21,-20,-10,-18,13,-19,-11,-7,10,1,3,-6,-4,-15,-21,-10,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: M=-7,-9,-14,-11,-7,-20,-11,-5,-19,-4,-19,-10,-7,-3,-2,-7,-2,0,-14,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-20,-6,-4,-22,-3,-12,-16,-1,-20,-10,3,-13,2,-5,10,7,-11,-27,-16,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,1,-28,1,-4,-22,-5,-7,-18,-3,-18,-4,2,6,-4,-1,-5,-7,-19,-28,-18,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-24,7,17,-27,-7,-6,-25,1,-23,-16,2,-3,11,0,9,0,-22,-30,-19,13;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-15,-1,0,-22,-2,-7,-19,-6,-24,-15,11,-12,5,-7,23,14,-14,-33,-18,2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-21,-4,-5,-24,15,2,-28,-6,-28,-16,5,-14,-4,-7,14,-2,-19,-29,-16,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=12,6,-15,4,-3,-22,1,-12,-20,-9,-22,-17,7,-11,-6,-13,19,11,-11,-32,-19,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=21,-18,-15,-25,-18,-6,-16,-17,7,-15,-1,-1,-17,-19,-15,-20,-3,-3,13,-14,0,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,46,39,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-28,-17,-33,-27,11,-31,-25,27,-23,15,15,-24,-26,-25,-21,-14,-3,30,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,24,-28,40,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-19,-22,-20,-13,-8,-25,-13,0,3,5,8,-16,-24,-7,18,-15,-7,7,-23,-7,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,25,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,42,-30,59,17,-37,-11,0,-39,4,-29,-27,17,-11,1,1,-1,-10,-29,-37,-19,9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,5,-30,8,10,-30,-19,-7,-31,40,-28,-13,3,-12,9,31,-9,-10,-21,-23,-11,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-15,-31,-26,-2,-27,-25,27,-20,13,14,-25,-25,-22,-21,-11,-3,33,-25,-8,-25;
MA   /M: SY='V'; M=6,-28,-10,-29,-28,-2,-26,-29,25,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,44,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=1,21,-24,23,8,-31,-9,-3,-26,5,-24,-17,13,-11,7,-4,3,-6,-21,-30,-17,8;
MA   /M: SY='A'; M=24,-13,-17,-18,-17,-21,21,-22,-15,-15,-14,-11,-9,-17,-17,-20,3,-7,-3,-22,-22,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,20,-32,31,2,-12,-15,-9,-30,-9,-22,-23,2,-17,-10,-14,-11,-14,-25,5,-2,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-29,-19,-33,-27,0,-32,-28,34,-24,17,14,-25,-25,-23,-24,-15,-5,34,-24,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-13,-24,-18,-9,-15,-22,-14,-4,6,-8,-2,-7,-16,-3,16,-6,-1,-2,-21,-9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='S'; M=5,4,-13,3,-2,-21,2,-10,-21,-10,-27,-19,11,-11,-3,-10,30,18,-12,-37,-19,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,5,-32,-25,30,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=16,-19,-15,-23,-20,-12,0,-24,1,-18,0,-2,-17,-21,-20,-20,-4,-5,13,-24,-16,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-29,29,0,-34,28,-10,-39,-10,-30,-25,10,-15,-9,-15,2,-13,-29,-31,-25,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-22,-33,-27,-1,-35,-29,36,-25,13,13,-20,-21,-21,-25,-12,1,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-31,22,47,-31,-19,-3,-30,6,-23,-21,0,11,14,-4,-1,-10,-30,-31,-21,30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00207;
//
ID   GAS_VESICLE_C_MP; MATRIX.
AC   MP00235;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gas vesicles protein GVPc repeated domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1787939; R2=0.0117859; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1672; N_SCORE=23.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=197; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-5,-27,-5,19,0,-23,-3,-18,-2,-11,-7,-6,-12,15,-3,-6,-10,-21,-15,-1,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-14,-26,-14,-7,-9,-24,23,-12,-4,6,4,-8,-24,-1,16,-17,-13,-12,-23,3,-7;
MA   /M: SY='E'; M=12,0,-23,-1,19,-26,-13,-10,-23,15,-19,-13,-4,-7,6,2,1,-6,-16,-23,-17,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,3,-24,25,-24,-4,0,-10,42,17,-4,-10,-26,-20,-10,29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-24,20,22,-24,-7,6,-24,4,-26,-20,38,-13,7,0,6,-4,-30,-36,-20,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,7,35,-36,-20,6,-24,10,-20,-7,0,-6,45,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,13,-27,7,13,-33,-13,10,-20,7,-23,-7,20,-13,40,7,3,-7,-30,-27,-13,27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='D'; M=9,16,-23,22,21,-30,-9,-7,-26,-1,-20,-20,3,-7,2,-11,4,-6,-19,-30,-20,12;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-14,18,-30,26,14,-34,-16,-6,-34,32,-30,-17,7,-10,6,15,-6,-10,-24,-27,-14,10;
MA   /M: SY='E'; M=12,12,-20,5,16,-23,-7,-4,-20,0,-19,-16,15,-10,3,-7,7,-3,-19,-29,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-13,-17,-13,-7,-20,-13,0,-10,0,13,-7,-13,-7,-10,7,30,3,-27,-7,-10;
MA   /M: SY='A'; M=32,-4,-16,-8,11,-23,-6,-14,-16,-4,-13,-13,-7,-7,-1,-14,7,-3,-9,-23,-20,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-3,-27,37,-27,-7,0,-10,27,23,-7,-10,-23,-20,-10,20;
MA   /M: SY='E'; M=8,4,-24,8,39,-27,-14,-6,-24,4,-17,-17,-3,-3,11,-6,3,-7,-21,-27,-20,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,7,-27,-14,-10,-27,32,-30,-13,3,-10,7,18,5,-1,-17,-26,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,7,35,-36,-20,6,-24,10,-20,-7,0,-6,45,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-23,-6,1,-11,-16,6,-14,-3,-18,-7,-2,-16,17,-3,9,1,-17,-12,14,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-26,-11,-1,-15,-24,29,-9,-11,6,7,-8,-21,14,-4,-14,-13,-15,-23,4,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,3,-24,25,-24,-4,0,-10,42,17,-4,-10,-26,-20,-10,29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,17,-37,-20,4,-23,22,-23,-3,0,-10,45,16,-3,-10,-27,-20,-10,31;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=32,-17,-10,-24,-17,-13,-11,-24,5,-14,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,18,-24,-16,-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00208;
//
ID   NEUROTR_ION_CHANNEL_MP; MATRIX.
AC   MP00236;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neurotransmitter-gated ion-channels signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8504725; R2=0.0166328; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=270; N_SCORE=10.331; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=40; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-24,31,7,-28,-6,-1,-29,-1,-26,-21,23,-13,0,-2,7,2,-24,-36,-18,3;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-20,-2,3,-17,-17,-3,-17,6,-16,-9,1,-14,0,2,2,4,-12,-26,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-13,-32,-29,1,-32,-28,32,-23,16,15,-27,-28,-25,-22,-15,-4,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-22,-17,-8,-3,-23,-11,-1,-13,10,2,-14,-21,-6,-8,-10,1,-3,-12,1,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-35,-28,-23,19,-24,-5,-8,-14,-8,-5,-25,-28,-14,-13,-25,-16,-16,67,45,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-18,-7,-9,-9,-11,-12,-7,-13,-4,-6,-5,-18,-9,-12,3,7,-4,-24,-5,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-26,-21,-12,-9,-23,-16,0,-14,-4,3,-18,22,-12,-18,-12,-8,-7,-22,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-13,-33,-10,-1,-24,-19,-10,-24,9,-24,-15,-8,29,0,23,-7,-5,-23,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=13,-21,-18,-28,-19,1,-13,-21,8,-21,11,5,-17,-20,-18,-21,-9,-7,7,-17,-7,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-19,-19,-15,-8,-24,-20,12,-18,-1,1,-5,-15,-11,-17,5,16,9,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-23,-21,-29,-23,21,-30,-15,14,-22,9,5,-18,-24,-21,-19,-12,0,11,-7,18,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-22,-2,1,-21,-19,-9,-21,18,-20,-10,2,-12,3,17,2,10,-13,-26,-11,1;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-12,-15,-11,-12,-11,-18,-2,-15,-7,-6,-7,-15,-10,-16,14,10,5,-30,-15,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,-5,-17,-6,-1,-17,-1,-11,-17,-9,-18,-11,-1,-9,-4,-11,16,7,-10,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-25,-6,1,-19,-15,-8,-15,-3,-18,-8,-4,11,-1,-5,1,-2,-15,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-33,-24,6,-29,-16,27,-21,22,32,-22,-23,-13,-18,-20,-9,18,-19,1,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-27,36,12,-31,-12,7,-28,1,-25,-19,20,-13,6,-1,0,-8,-25,-35,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-32,-26,12,-31,-24,25,-26,28,16,-28,-29,-25,-21,-20,-6,25,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-21,-6,3,-18,-18,-1,-16,2,-13,-7,-1,-13,5,5,4,8,-12,-26,-8,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-3,-27,-5,-10,6,-20,4,-12,-5,-7,-6,-1,-23,-8,-2,-13,-10,-15,-1,19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-10,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,43,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-21,-33,-25,41,-28,-11,9,-23,19,19,-22,-28,-23,-16,-22,-10,3,-1,22,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: M=-5,-10,-25,-10,-1,-13,-15,-9,-13,-5,-10,-8,-9,-17,-2,-3,-4,-3,-11,-4,-5,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-29,0,15,-35,-19,21,-20,6,-19,-1,4,-13,47,7,-2,-11,-29,-23,-6,31;
MA   /M: SY='N'; M=-3,10,-19,1,0,-18,-10,-3,-15,0,-20,-12,19,-15,2,-1,7,3,-16,-30,-14,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-20,-4,-2,-16,-10,-10,-17,-6,-20,-13,2,2,-5,-9,10,9,-13,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-32,-22,10,-29,-18,23,-25,36,27,-26,-27,-17,-19,-25,-10,14,-19,1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-24,2,9,-23,-19,-9,-18,15,-19,-10,1,-12,5,8,-1,1,-11,-27,-13,6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-21,-37,-27,45,-31,-21,14,-29,23,10,-23,-28,-30,-21,-23,-10,9,-4,16,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-24,-4,5,-19,13,-12,-25,-8,-20,-15,-2,-14,-4,-9,4,-6,-19,-24,-18,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,-1,-1,-19,-1,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-10,38,20,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-27,-35,-28,-22,21,-25,-7,-9,-15,-6,-7,-26,-28,-14,-14,-24,-14,-16,65,43,-17;
MA   /M: SY='T'; M=10,-4,-15,-10,-11,-18,9,-18,-19,-12,-18,-14,0,-13,-11,-14,15,17,-9,-27,-18,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-28,-17,-17,23,-27,22,-5,-11,-4,-2,-13,-27,-10,-9,-16,-7,-12,19,61,-17;
MA   /M: SY='B'; M=-7,14,-21,13,0,-22,-8,-7,-21,-6,-21,-14,12,-4,-4,-9,9,11,-17,-34,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-22,-10,-5,-20,3,-13,-15,-3,-14,-5,-4,-14,-6,-7,1,-1,-9,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-6,16,-22,15,10,-22,-10,1,-24,-1,-23,-17,15,-13,3,-4,7,1,-21,-28,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-27,23,26,-29,-17,-3,-24,4,-18,-15,2,-9,11,-4,-1,-8,-20,-31,-17,18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-24,0,-32,-23,31,-23,22,18,-24,-25,-17,-21,-18,-7,26,-23,-4,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00209;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00237;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=259;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=254;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9359; R2=0.02006056; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=287; N_SCORE=7.693; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=227; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-10;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-24,-13,-15,-19,30,-19,-20,-18,-15,-11,-5,-19,-16,-18,-2,-11,-15,-22,-20,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-9,33,-19,15,-2,-18,-2,8,-18,-2,-26,-18,51,-20,-1,-2,9,1,-26,-38,-17,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-21,-16,-26,-21,0,-16,-22,10,-22,8,4,-17,-22,-19,-20,-8,-3,10,-21,-7,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-17,-28,-21,8,-25,-20,14,-24,23,12,-21,-25,-20,-19,-17,-5,11,-17,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-16,-23,-21,-2,-24,-14,15,-18,6,7,-16,-24,-18,-17,-7,-1,21,-26,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-16,-33,-25,6,-31,-24,26,-26,24,15,-24,-26,-21,-23,-20,-8,20,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-19,-27,-21,5,-24,-16,8,-19,8,5,-20,-23,-17,-17,-15,-6,5,-2,7,-19;
MA   /M: SY='V'; M=4,-22,-14,-26,-21,-5,-23,-23,16,-18,7,6,-19,-22,-18,-19,-7,-1,20,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-19,-30,-24,14,-29,-20,19,-24,19,11,-21,-25,-21,-20,-17,-4,16,-16,5,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-18,-12,-23,-18,4,-20,-16,2,-17,3,1,-14,-22,-16,-14,-7,0,3,-16,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-22,-12,-6,-10,-18,-7,-15,7,-11,-5,-5,-17,-1,14,-6,-4,-11,-18,-5,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-21,-1,0,-14,-16,-1,-18,4,-17,-10,3,-12,-1,3,-1,-1,-15,-23,-5,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-25,-7,0,-19,-16,-6,-19,11,-18,-7,-3,-5,2,13,-3,-4,-15,-23,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-21,-9,-3,-16,-16,-4,-14,7,-12,-1,-3,-14,3,11,-4,-4,-11,-23,-8,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-20,-19,-11,-2,-20,-11,1,-8,11,8,-14,-19,-8,-1,-14,-7,0,-18,-3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-24,-7,-1,-18,-17,7,-20,8,-16,-6,1,-15,6,17,-5,-6,-17,-22,-6,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-16,-3,-3,-17,-11,-7,-17,-1,-20,-13,9,-13,-1,0,15,16,-11,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-13,-21,-13,-8,-17,-15,-16,-8,-8,-13,-7,-10,8,-10,-10,1,2,-4,-29,-17,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-14,-20,-15,-2,-20,-15,2,-14,-1,3,-11,-14,-13,-13,-1,7,4,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-9,11,-22,4,-4,-10,-9,5,-15,-5,-16,-11,19,-20,-4,-4,1,-2,-18,-23,-1,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-20,-29,-23,12,-29,-16,17,-21,14,10,-20,-24,-19,-18,-16,-6,12,-11,11,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-22,-31,-23,34,-30,-11,9,-24,18,7,-22,-27,-23,-18,-21,-9,3,1,26,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-31,-23,4,-30,-20,25,-24,26,21,-23,-24,-17,-20,-21,-8,17,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-8,-24,-19,-2,-18,-20,5,-19,7,4,-17,-22,-17,-18,-7,-1,8,-23,-8,-18;
MA   /M: SY='N'; M=1,8,-16,-1,-6,-15,-2,0,-15,-9,-19,-13,19,-18,-5,-8,10,2,-15,-30,-14,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-29,-19,7,-29,-18,18,-25,36,18,-25,-27,-17,-17,-24,-8,10,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,0,-16,-11,-17,-5,-18,-12,-12,-14,-12,-6,-14,-11,-18,13,5,-2,-26,-18,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-13,-31,-25,10,-28,-24,20,-24,17,10,-22,-26,-23,-21,-15,-5,20,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=17,-11,-3,-17,-12,-10,-7,-18,-10,-15,-11,-10,-6,-16,-12,-17,10,5,-2,-25,-14,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-28,57,17,-37,-9,2,-36,-1,-28,-26,20,-11,2,-9,1,-9,-29,-38,-18,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-31,-22,13,-28,-21,19,-26,27,14,-23,-26,-21,-21,-20,-7,13,-17,1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-10,-30,-23,9,-24,-21,11,-25,20,10,-22,-27,-22,-20,-18,-8,9,-17,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-21,-13,-25,-20,9,-22,-14,7,-19,8,7,-17,-24,-18,-16,-11,-3,9,-17,4,-19;
MA   /M: SY='A'; M=2,-16,-7,-20,-17,-8,-10,-18,-1,-19,2,1,-12,-21,-15,-18,-3,-1,2,-26,-12,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-10,-27,-21,4,-25,-22,13,-24,16,7,-19,-24,-20,-20,-11,0,13,-23,-5,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-15,-13,-20,-16,2,-17,-18,1,-18,2,-1,-11,-20,-16,-16,-2,5,4,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-14,-11,-18,-15,-4,-17,-14,1,-17,2,1,-11,-20,-13,-15,-6,-1,2,-23,-5,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-19,-24,-18,2,-21,-18,12,-19,10,9,-18,-8,-16,-18,-13,-5,8,-18,-4,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-24,-14,-8,-8,-19,-14,-4,-13,-7,-5,-15,22,-11,-15,-8,-4,-8,-19,-11,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-17,-21,-20,-14,9,-21,-13,1,-11,3,2,-13,-18,-13,-9,-12,-6,0,-6,4,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-20;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-15,-18,-20,-15,1,-19,-13,2,-14,2,4,-12,-18,-12,-13,-6,-1,3,-19,-2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-20,-19,-24,-18,2,-23,-18,9,-19,9,5,-17,-19,-17,-17,-12,-4,8,-14,-1,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-13,-20,-17,-12,-1,-20,-10,1,-13,-1,1,-11,-18,-11,-12,-5,-1,2,-16,2,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-6,-22,-9,-8,-5,-16,-4,-7,-9,-9,-6,-2,-17,-7,-9,-3,-2,-8,-16,3,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-13,-18,-18,-14,5,-20,-12,1,-16,2,1,-10,-20,-13,-15,-7,-2,0,-15,2,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-19,-21,-15,1,-20,-13,3,-16,5,3,-13,-21,-13,-13,-10,-4,2,-14,0,-15;
MA   /M: M=-5,-6,-21,-9,-6,-8,-13,-4,-11,-8,-7,-4,-4,-15,-6,-7,-3,-2,-9,-22,-4,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-1,-24,-2,-3,-16,1,-5,-20,-6,-17,-11,2,-13,-4,-7,-2,-8,-18,-23,-11,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,0,-22,-1,0,-15,-13,0,-17,-3,-16,-10,2,-12,0,-1,0,-2,-15,-24,-5,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-26,-36,-27,-20,7,-18,-17,-13,-14,-12,-11,-24,-25,-14,-13,-23,-17,-18,65,20,-15;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-4,-11,-20,-12,-9,-10,-17,-11,-4,-9,-8,-4,-9,0,-8,-10,-3,0,-4,-22,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-18,-24,-18,23,-22,-13,5,-19,9,4,-15,-22,-19,-14,-15,-7,2,-5,11,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-20,-6,-9,-18,16,-9,-21,-11,-20,-13,1,-9,-9,-11,4,-4,-17,-20,-15,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-6,-4,-21,-4,-2,-9,-14,-6,-12,-4,-11,-8,-3,-11,-3,-3,-3,-4,-11,-18,-3,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-14,-21,-17,-13,1,-18,-11,-1,-14,1,0,-11,-19,-12,-12,-7,-3,-1,-14,2,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-20,-21,-16,1,-12,-14,2,-18,6,5,-14,-22,-15,-16,-10,-5,1,-15,-1,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,74,-22,-22,-17,-25,-24,-23,-22,-16,-15,-14,-32,-22,-22,-7,-7,-9,-40,-23,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-25,-9,-4,-10,-20,-6,-11,4,-9,-3,-6,-15,-2,4,-9,-7,-9,-18,-3,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-19,-28,-21,9,-25,-19,12,-21,12,7,-20,-21,-20,-18,-13,-4,11,-13,2,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-18,-20,-22,-14,3,-22,-11,2,-15,3,3,-15,-21,-10,-13,-10,-5,2,-8,4,-12;
MA   /M: M=-3,-12,-22,-15,-11,-7,-12,-9,-4,-13,-3,-1,-8,-16,-9,-11,-5,-4,-4,-20,-5,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-18,-17,-22,-18,13,-16,-13,-3,-18,-2,-3,-13,-18,-18,-17,-6,-3,-1,-10,8,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-16,-31,-23,17,-27,-21,15,-25,19,10,-21,-25,-23,-20,-17,-6,12,-16,2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-7,-20,-8,-8,-3,-15,-7,-9,-10,-7,-4,-6,-17,-7,-10,-6,-5,-8,-18,1,-8;
MA   /M: M=-7,-9,-17,-11,-11,-7,-17,-7,-4,-11,-4,-2,-7,-20,-9,-10,-6,-3,-2,-20,-1,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-22,-18,-27,-22,11,-23,-17,11,-21,10,7,-18,-23,-19,-19,-11,-2,10,-13,4,-21;
MA   /M: SY='S'; M=1,-9,-7,-15,-14,1,-8,-15,-11,-17,-8,-9,-2,-20,-16,-15,4,3,-6,-24,-9,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-13,-18,-14,-5,-13,-11,-5,-11,-3,2,-11,-21,-9,-8,-7,-6,-3,-21,-6,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-15,-17,-13,3,-18,-8,-6,-12,-3,-2,-9,-20,-11,-9,-5,2,-5,-14,6,-13;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-1,-21,-17,-7,-14,-19,-3,-17,-3,-3,-13,-20,-15,-18,1,2,4,-25,-12,-16;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-14,-2,0,-20,-1,-11,-18,-10,-23,-16,5,-11,-1,-11,24,11,-11,-34,-18,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-19,-13,-24,-19,-6,-22,-21,13,-20,4,5,-14,-17,-16,-20,-5,2,12,-26,-8,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-18,-29,-23,20,-23,-16,-1,-22,5,0,-22,-25,-22,-18,-19,-11,-4,17,15,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-16,-20,-16,5,-21,-13,4,-20,9,4,-9,-21,-14,-15,-5,3,2,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-19,-28,-20,4,-25,-17,16,-24,26,15,-21,-25,-17,-19,-19,-7,10,-19,-1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,1,-25,-20,-2,-22,-23,5,-20,5,2,-17,-22,-20,-19,-5,5,11,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='A'; M=9,-19,-5,-25,-19,-3,-16,-20,4,-19,5,3,-17,-22,-18,-20,-6,-4,8,-22,-8,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-23,-33,-24,2,-30,-20,31,-23,22,25,-21,-22,-16,-22,-18,-7,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-6,-9,-12,-8,-16,-3,-16,-13,-11,-17,-13,-2,-12,-8,-15,19,12,-4,-28,-17,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-19,-31,-25,12,-29,-21,21,-24,18,11,-23,-26,-22,-21,-17,-6,19,-14,5,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-27,36,17,-28,-15,0,-26,-2,-19,-19,10,-12,2,-9,-3,-9,-22,-33,-14,9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-26,-11,-1,-19,-20,-1,-27,25,-18,-9,-2,-20,8,59,-10,-9,-18,-20,-10,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-19,-24,-21,25,-28,4,-1,-16,3,0,-20,-28,-16,-14,-17,-8,-6,15,47,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-17,-28,-21,4,-29,-18,15,-20,16,10,-20,-26,-17,-15,-18,-7,12,-15,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-12,-20,-14,-13,-8,-18,-3,-14,-6,-5,-10,-16,-12,-17,4,1,4,-22,-13,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-34,-28,2,-34,-27,35,-25,17,15,-23,-24,-23,-24,-16,-5,31,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-16,15,-21,-18,-6,-23,-18,-9,-12,-8,-6,-13,-25,-16,-9,-5,-1,1,-27,-10,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-24,-7,-5,-6,-18,17,-17,-1,-13,-6,3,-19,-1,5,-6,-7,-16,-17,7,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-34,-10,-2,-26,-16,-17,-19,-8,-26,-17,-14,59,-8,-15,-5,-6,-24,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-20,-27,-19,8,-26,-16,14,-21,23,15,-20,-24,-17,-16,-18,-5,9,-19,1,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-24,-7,-1,-15,-15,2,-19,5,-15,-8,-1,-17,3,11,-5,-6,-16,-17,-4,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-22,-15,-13,5,-19,4,-7,-9,-7,-4,-10,-20,-8,-8,-6,-4,-8,-3,25,-13;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-23,-7,-1,-16,-15,-3,-16,6,-14,-6,-1,-11,3,10,-3,-4,-13,-22,-8,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-18,-8,-5,-11,-15,-7,-9,0,-10,-5,-2,-13,-2,4,-1,1,-6,-19,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-14,-19,-16,-10,-2,-19,-9,3,-8,2,2,-11,-15,-7,-6,-10,-6,1,-6,1,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-16,-19,-13,-4,-19,-10,-3,-7,-1,6,-11,-19,-7,0,-10,-6,-2,-18,-4,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-16,-4,-4,-16,-10,-9,-17,-3,-19,-13,7,-11,-2,-2,14,15,-12,-30,-13,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-24,-11,-5,-16,-17,-10,-12,-1,-13,-7,-7,1,-3,1,-5,-4,-11,-21,-10,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-23,-8,-2,-17,-14,-6,-20,11,-17,-8,0,-15,2,17,-3,-3,-15,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-20,-14,-10,-7,-18,-3,-9,-3,-6,-2,-6,-19,-5,4,-7,-4,-6,-19,-1,-9;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,0,-19,-15,-13,-10,-19,-8,-14,-10,-7,-10,-17,-13,-15,3,2,0,-26,-15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-22,-16,-1,-20,-14,0,-9,0,0,-14,-21,-13,-7,-11,-5,1,-11,0,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-18,-24,-17,-2,-21,-16,7,-15,8,7,-16,-22,-13,-11,-12,-6,6,-17,-3,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-22,-16,-26,-20,1,-24,-19,14,-19,14,11,-19,-22,-16,-18,-12,-3,13,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-7,-29,-24,-1,-27,-24,19,-23,11,8,-19,-24,-20,-22,-11,-4,18,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='V'; M=5,-20,-15,-24,-19,-3,-13,-21,5,-20,4,2,-16,-19,-18,-19,-6,-3,8,-21,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-15,-24,-20,-1,-9,-21,3,-21,4,1,-16,-20,-19,-20,-7,-4,5,-21,-9,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-12,-24,-20,-6,-22,-22,13,-20,3,4,-16,-18,-17,-20,-4,1,15,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-33,-36,-35,-27,13,-22,-24,-10,-20,-10,-12,-32,-28,-20,-20,-29,-20,-17,91,24,-21;
MA   /M: SY='I'; M=0,-23,-17,-28,-22,2,-23,-23,17,-22,14,8,-20,-22,-20,-21,-11,-3,16,-21,-5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-17,-28,-22,9,-23,-20,13,-23,15,9,-20,-24,-20,-19,-14,-5,11,-15,1,-21;
MA   /M: SY='S'; M=13,-7,-9,-11,-9,-18,1,-16,-15,-13,-19,-13,-2,-11,-10,-15,15,6,-7,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-22,-15,-27,-21,11,-22,-20,10,-23,12,6,-17,-23,-21,-19,-10,-2,10,-19,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-17,-26,-20,1,-20,-21,11,-22,13,7,-20,-19,-19,-20,-12,-4,10,-21,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-14,-25,-19,4,-23,-15,8,-20,8,5,-16,-24,-17,-18,-12,-6,7,-14,1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=9,-7,-9,-12,-10,-14,-5,-14,-12,-12,-15,-10,-2,-14,-9,-13,12,7,-5,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-17,-26,-20,4,-23,-20,13,-22,14,8,-18,-22,-18,-19,-10,-1,12,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-28,-19,-11,-10,-22,-18,-1,-16,-5,-3,-19,24,-14,-19,-11,-7,-7,-22,-12,-15;
MA   /M: M=-8,-11,-23,-12,-7,-10,-19,-4,-7,-9,-8,-3,-8,-2,-5,-10,-7,-5,-9,-21,-5,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-21,-19,-26,-20,11,-22,-17,7,-21,10,5,-18,-20,-19,-18,-12,-3,6,-12,3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-20,-27,-21,15,-24,-17,10,-21,12,7,-19,-23,-20,-17,-14,-5,9,-13,6,-20;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-17,-15,-12,4,-7,-10,-4,-12,0,0,-9,-17,-12,-10,-8,-6,-4,-9,2,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-7,-13,-8,-4,-5,-11,-6,-3,-6,1,0,-5,-11,-4,-4,-5,-3,-3,-12,-3,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: M=-5,-7,-16,-8,-4,-6,-12,-8,-8,-6,-8,-6,-6,-8,-5,-6,-3,-3,-7,-7,-2,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-9,-18,-11,-9,2,-12,-7,-6,-9,-6,-4,-6,-15,-9,-7,-4,-2,-5,-12,2,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: M=-6,-4,-2,-6,-4,-13,-14,-9,-14,-5,-13,-9,-4,-13,-4,-5,-2,-2,-10,-22,-10,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: M=-5,-7,-20,-9,-6,-8,-11,-9,-10,-8,-10,-7,-5,-13,-7,-8,-3,-3,-8,-15,-3,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: M=-5,-4,-23,-5,-3,-12,-14,-7,-10,-7,-12,-7,-2,-10,-4,-7,-1,-2,-9,-23,-7,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-1,-21,-3,-2,-14,-14,-6,-14,-4,-14,-9,1,-9,-4,-4,-3,-5,-13,-24,-9,-4;
MA   /M: M=-8,-4,-25,-4,0,-13,-14,-7,-11,-5,-11,-7,-3,-14,-3,-6,-4,-4,-9,-19,-6,-3;
MA   /M: M=-6,-7,-21,-9,-6,-11,-14,-10,-7,-9,-9,-5,-4,-13,-7,-10,-3,-3,-6,-22,-7,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-6,2,-22,0,-1,-18,-8,-6,-17,-4,-17,-12,4,-8,-4,-6,0,-3,-15,-26,-12,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-8,-24,-10,-6,-11,-14,1,-10,-8,-9,-4,-4,-12,-5,-6,-5,-5,-9,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-9,-19,-12,-8,-2,-19,-9,-8,-10,-7,-6,-7,-12,-9,-9,-2,2,-6,-19,0,-9;
MA   /M: M=-6,-10,-21,-13,-8,-2,-18,-11,-6,-9,-7,-4,-8,-16,-7,-9,-4,-2,-4,-15,-2,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,110,-29,-29,-19,-29,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-38,-28,-28,-9,-9,-9,-48,-28,-29;
MA   /M: M=-6,-3,-22,-3,-4,-10,-12,-8,-11,-10,-8,-7,-4,-15,-7,-10,-3,-2,-9,-20,-6,-6;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-21,-14,-9,-1,-19,-12,2,-14,2,1,-12,-9,-11,-13,-9,-5,0,-18,-4,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: M=-6,-1,-19,-2,-2,-10,-13,-3,-9,-5,-9,-5,0,-8,-4,-6,-2,-2,-8,-21,-6,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-20,-14,-10,2,-13,-9,-5,-10,-5,-3,-11,-5,-9,-10,-9,-6,-7,2,4,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: M=-3,-9,-16,-9,-6,-8,-10,-9,-4,-8,-3,-2,-8,0,-7,-8,-4,-2,-4,-17,-7,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: M=-4,-7,-14,-8,-4,-3,-11,-7,-3,-8,-1,-1,-6,-8,-5,-7,-3,0,-4,-14,-3,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-15,1,2,-10,-8,-3,-11,2,-11,-7,0,-3,0,1,-2,-4,-10,-12,-5,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,4,-14,6,3,-12,-6,-4,-13,-2,-11,-9,2,-8,-1,-4,1,-2,-10,-16,-8,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-15,-9,-6,-3,-12,-7,-5,-6,-5,-3,-5,-9,-6,-6,-1,3,-4,-9,-1,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-7,-17,-9,-8,-4,-10,-4,-6,-9,-6,-3,-5,-14,-6,-8,-4,-3,-5,-8,1,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-19,-2,-1,-13,-9,-3,-12,-3,-11,-7,3,-12,0,-2,0,-2,-11,-19,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-20,-5,-1,-15,-13,-6,-12,1,-11,-6,1,-10,0,1,-1,-2,-11,-22,-10,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: M=-1,-9,-22,-12,-6,-10,-13,-11,-8,-9,-9,-6,-7,-12,-7,-9,-2,-2,-7,-19,-7,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-26,-25,-21,27,-27,-1,3,-17,6,3,-20,-27,-17,-14,-19,-10,-3,15,39,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-18,-13,-10,-9,-15,-11,-3,-9,-6,-2,-5,-17,-8,-10,-1,1,0,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-20,-27,-21,3,-28,-20,19,-20,16,12,-19,-23,-18,-18,-14,-3,16,-19,-1,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-18,-26,-20,17,-23,-13,4,-19,6,2,-17,-23,-19,-16,-12,-5,2,-4,12,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-18,-18,-15,-1,-18,-13,2,-16,2,1,-11,-20,-13,-14,-6,-2,3,-19,-2,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-16,-17,-13,2,-17,-14,-1,-14,-1,-1,-8,-18,-13,-12,-1,4,1,-20,-3,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=1,-5,-7,-8,-7,-4,-3,-7,-5,-7,-4,-3,-2,-9,-6,-7,0,0,-3,-12,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-22,-16,-28,-22,4,-21,-22,14,-22,12,9,-18,-23,-19,-20,-11,-4,13,-21,-4,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-15,-27,-22,7,-21,-21,10,-21,10,6,-19,-23,-21,-19,-11,-3,12,-18,-2,-21;
MA   /M: M=0,-11,-14,-15,-13,-7,-7,-12,-8,-15,-7,-4,-7,-20,-11,-14,0,-1,-4,-21,-8,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-19,-26,-21,29,-23,-14,1,-20,5,1,-14,-25,-23,-16,-14,-6,0,-5,15,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-18,-30,-23,12,-25,-20,15,-24,16,9,-22,-26,-22,-20,-16,-6,13,-12,5,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-19,-31,-24,5,-26,-24,22,-25,19,12,-22,-24,-21,-22,-16,-6,18,-20,-3,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-33,-10,-2,-25,-18,-18,-17,-11,-25,-17,-15,62,-10,-18,-5,-5,-23,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-8,-29,-22,14,-25,-20,9,-24,18,9,-21,-26,-22,-19,-16,-5,9,-19,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=0,-21,-15,-26,-20,3,-20,-21,11,-22,11,6,-17,-22,-19,-20,-9,-1,11,-21,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-16,-30,-23,4,-27,-24,21,-24,17,11,-21,-23,-21,-22,-14,-3,19,-22,-4,-23;
MA   /I: I=-5; MD=-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-20,-31,-23,4,-29,-19,25,-22,20,21,-20,-22,-16,-20,-16,-5,17,-20,-1,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-13,-26,-20,0,-23,-22,11,-22,10,5,-18,-18,-19,-20,-9,0,12,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-19,-30,-24,13,-26,-20,15,-23,11,6,-20,-24,-22,-20,-14,-5,14,-11,7,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-17,14,-22,-19,-2,-21,-20,-4,-21,-2,-4,-13,-25,-18,-19,-1,3,3,-29,-10,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-25,-15,-16,16,-24,11,-3,-10,-4,-3,-9,-26,-9,-9,-11,-4,-10,8,47,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-14,-24,-20,-2,-15,-18,4,-19,2,1,-15,-22,-17,-18,-6,-1,6,-16,-3,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-14,-19,-16,-9,-5,-19,-6,-8,-2,-3,0,-9,-20,-5,4,-9,-7,-6,-19,-2,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-34,-26,1,-33,-25,34,-25,20,18,-21,-23,-19,-24,-17,-6,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-18,-28,-22,8,-24,-18,13,-21,10,6,-20,-24,-19,-19,-14,-6,10,-9,6,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-18,-15,-9,-10,-19,-7,-10,0,-8,-3,-7,-20,-3,6,-7,-6,-6,-18,-5,-7;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-18,-11,-4,-14,-16,-11,-10,-1,-10,-5,-6,-15,-4,-1,1,2,-4,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-19,-29,-21,3,-28,-21,21,-23,24,14,-23,-24,-19,-19,-18,-6,18,-21,-3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-23,-14,-7,-10,-20,-6,-14,4,-8,-4,-7,-20,-1,15,-10,-8,-11,-11,-3,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-23,-4,4,-22,-14,-4,-22,15,-20,-9,2,-13,8,17,0,-4,-16,-25,-12,5;
MA   /M: M=-3,-8,-21,-12,-7,-15,-15,-1,-7,-5,-10,-2,-2,-15,-1,-2,-1,-3,-6,-24,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-22,-6,0,-18,-14,-7,-16,2,-14,-8,-3,-10,1,4,0,-2,-12,-24,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-22,-4,0,-19,-13,-4,-17,5,-16,-8,1,-14,3,8,3,-1,-13,-25,-11,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-22,-7,-2,-18,-12,-7,-14,0,-14,-7,-1,-12,1,1,1,-1,-11,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-7,0,-16,-14,-6,-14,2,-11,-5,-4,-15,2,6,-3,-4,-11,-23,-10,0;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-17,-4,-1,-16,-2,-6,-16,2,-14,-8,-1,-9,0,3,0,-4,-12,-17,-11,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: M=-2,-2,-12,-4,-1,-10,-7,-3,-9,0,-9,-4,0,-7,0,0,0,-1,-7,-15,-7,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-3;
MA   /M: M=-3,-4,-12,-5,-2,-8,-7,-3,-5,-2,-3,-2,-3,-8,0,-1,-2,-2,-5,-12,-4,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-1,-13,-2,1,-12,-7,-4,-10,0,-10,-6,1,-6,1,0,3,0,-8,-17,-8,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-4,-13,-5,-2,-9,-9,-5,-8,-3,-7,-4,-1,-8,-1,-2,2,1,-6,-16,-7,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-15,-3,0,-13,-8,-6,-12,2,-12,-7,1,-6,0,2,3,1,-8,-18,-10,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-16,-4,0,-12,-8,-5,-11,1,-10,-6,0,-8,0,2,1,-1,-8,-17,-8,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-15,-4,-2,-11,-11,-4,-9,0,-9,-4,0,-11,0,2,0,0,-7,-17,-6,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: M=-2,-5,-15,-7,-3,-10,-11,-6,-6,-2,-7,-3,-2,-9,-1,-1,0,-1,-5,-17,-7,-3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-17,-3,2,-16,-9,-6,-14,5,-13,-7,0,-8,3,5,2,-2,-11,-20,-10,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-1,-19,-2,2,-17,-11,-5,-16,5,-15,-9,2,-8,2,7,1,-2,-12,-22,-11,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-25,2,12,-21,-16,-4,-22,11,-18,-11,1,-12,6,14,-1,-5,-17,-25,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-24,-7,-3,-16,-17,-3,-15,6,-12,-4,-3,-17,3,12,-5,-5,-11,-21,-7,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,-1,7,-24,-17,-3,-26,26,-23,-11,3,-13,9,29,-4,-6,-19,-23,-10,6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-14,-15,-20,-15,-8,-15,-18,3,-14,0,0,-12,-16,-14,-16,0,6,9,-24,-10,-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,-16,-16,-22,-17,6,-20,-18,3,-17,4,1,-12,-19,-17,-16,-3,7,6,-20,-3,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-24,-11,-4,-15,-16,-9,-15,12,-15,-6,-5,-17,0,15,-5,-5,-9,-19,-7,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-13,-17,-19,-14,-5,-22,-15,4,-12,5,9,-11,-18,-9,-10,-2,11,6,-24,-6,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-2,-29,-23,0,-27,-23,16,-24,18,11,-22,-26,-20,-21,-15,-3,16,-26,-7,-22;
MA   /M: SY='L'; M=0,-20,-16,-25,-19,4,-16,-20,5,-20,7,3,-16,-22,-18,-18,-8,-2,7,-19,-4,-19;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-13,-24,-19,-2,-19,-20,8,-19,5,3,-15,-20,-17,-18,-4,2,11,-23,-6,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-20,-25,-20,-2,-28,-10,18,-20,11,13,-16,-23,-14,-17,-12,-4,17,-24,-2,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-14,-27,-22,1,-25,-22,17,-20,14,12,-21,-24,-20,-18,-10,1,22,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-13,-24,-20,-2,-13,-22,6,-21,4,2,-15,-21,-19,-20,-5,0,9,-23,-9,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-20,-12,-25,-20,0,-23,-22,11,-19,7,5,-18,-21,-19,-18,-6,3,16,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-19,-31,-25,47,-28,-14,3,-24,6,1,-19,-26,-29,-18,-16,-8,4,2,23,-25;
MA   /M: SY='L'; M=0,-23,-14,-28,-21,9,-22,-22,10,-23,13,5,-19,-23,-21,-20,-11,-3,11,-19,-3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-14,-32,-25,8,-29,-24,23,-26,21,12,-24,-26,-23,-22,-18,-7,21,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-17,43,-25,-22,-4,-20,-22,-16,-23,-10,-10,-15,-28,-22,-22,-4,-3,-5,-31,-13,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-22,-35,-24,-16,9,-20,-13,-14,-15,-13,-12,-20,-25,-12,-14,-22,-17,-21,65,22,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-20,-15,-24,-19,4,-15,-20,5,-22,10,4,-16,-22,-19,-19,-8,1,6,-20,-5,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-34,-12,-4,-23,-20,-20,-15,-12,-22,-15,-18,64,-11,-19,-7,-4,-22,-28,-24,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-21,-22,-17,17,-22,-6,1,-17,5,2,-15,-23,-15,-14,-12,-6,-2,-5,20,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-11,-20,-16,-14,2,-12,0,-7,-15,-5,-3,-4,-21,-11,-12,-6,-5,-8,-14,3,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-16,-30,-24,6,-27,-24,20,-24,13,9,-21,-24,-22,-22,-13,-4,19,-20,-2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-17,-26,-20,7,-24,-17,12,-20,10,8,-17,-23,-18,-16,-10,-2,12,-19,0,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-7,-19,-12,-11,-3,-15,-2,-7,-9,-8,-3,-1,-19,-6,-7,-4,-3,-9,-16,4,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-17,-29,-22,7,-25,-20,15,-23,18,11,-21,-24,-20,-20,-15,-5,12,-18,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-19,-26,-19,5,-25,-17,10,-19,12,7,-20,-23,-15,-15,-14,-6,8,-10,2,-18;
MA   /M: M=-3,-4,-23,-4,-1,-16,-11,-7,-14,-5,-14,-9,-3,-8,-3,-5,0,-2,-11,-24,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=1,-11,-19,-13,-10,-8,-14,-13,-6,-12,-6,-4,-9,-15,-9,-12,-2,0,-3,-16,-5,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-20,-25,-19,15,-23,-14,7,-20,9,4,-16,-23,-19,-16,-12,-5,5,-10,8,-19;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-8,-9,-11,-10,1,-16,-8,-4,-11,-3,-3,-6,-17,-10,-10,-7,-4,-4,-12,0,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: M=-4,-2,-13,-3,-2,-6,-7,-3,-7,-4,-6,-4,-1,-4,-2,-4,-2,-3,-7,-10,-3,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-13,0,0,-10,-7,-4,-8,-3,-9,-6,1,-4,-2,-4,2,1,-7,-16,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-5,-6,0,-8,-7,-11,-10,-10,-10,-9,-10,-7,-4,-11,-7,-10,-2,-3,-8,-22,-10,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-5,-2,-18,-2,0,-13,-9,-6,-13,-4,-12,-7,-2,-7,-2,-5,-1,-4,-11,-20,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-4,-6,-19,-7,-6,-10,-10,-8,-8,-9,-7,-5,-4,-9,-6,-10,-2,-2,-7,-19,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-3,-16,-5,-2,-13,-13,-5,-14,-5,-12,-8,-1,-12,-2,-4,1,0,-12,-23,-7,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-7,-4,-18,-5,-3,-15,-16,-5,-14,-2,-13,-8,-1,-12,-2,-2,-2,-3,-12,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-13,-19,-17,-13,-2,-20,-13,2,-14,0,0,-10,-18,-12,-13,-6,-3,2,-20,-3,-13;
MA   /M: M=-6,-15,-21,-17,-12,-2,-19,-11,0,-15,0,0,-12,-11,-12,-14,-7,-3,-1,-19,-2,-13;
MA   /M: M=-7,-2,-22,-2,0,-14,-15,-6,-13,-6,-13,-8,-1,-7,-2,-7,-2,-3,-12,-25,-9,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-22,-19,-13,1,-22,-9,1,-12,2,2,-12,-19,-11,-10,-10,-4,0,-11,5,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-16,-23,-18,4,-21,-17,6,-19,8,5,-17,-21,-17,-17,-11,-4,6,-16,-1,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-11,-22,-14,-10,-1,-15,-7,-7,-9,-6,-3,-7,-19,-8,-7,-5,-3,-6,-14,4,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-8,-21,-10,-8,-5,-20,-4,-4,-10,-4,-2,-6,-16,-6,-11,-5,-2,-5,-18,1,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-17,-30,-24,9,-27,-21,18,-23,14,9,-21,-24,-21,-21,-15,-5,16,-14,2,-23;
MA   /M: SY='T'; M=2,-14,-8,-19,-15,-1,-16,-18,-4,-17,-5,-5,-10,-14,-15,-17,2,5,1,-24,-8,-15;
MA   /M: M=-5,-9,-20,-13,-10,-7,-16,-6,-3,-12,-3,-2,-4,-17,-9,-10,-3,0,-2,-24,-4,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-17,-29,-22,8,-25,-20,6,-21,7,4,-21,-22,-19,-17,-17,-8,4,3,3,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-17,-30,-22,15,-28,-18,15,-26,28,14,-24,-27,-21,-19,-22,-7,9,-15,5,-22;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-15,-18,-14,-11,-4,-17,-6,-15,-7,-6,-10,-14,-13,-17,2,0,-2,-21,-11,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-20,-18,-15,4,-22,-6,2,-11,-1,3,-11,-19,-11,-11,-6,0,1,-13,11,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-12,-26,-20,4,-22,-21,11,-22,10,5,-18,-22,-19,-20,-8,-1,12,-20,-5,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-18,3,-5,-16,-6,7,-16,-6,-21,-12,26,-16,-2,-5,8,2,-18,-32,-11,-4;
MA   /M: SY='S'; M=6,-7,2,-10,-8,-17,-10,-14,-16,-13,-20,-14,-3,-6,-8,-14,16,10,-9,-34,-18,-8;
MA   /M: SY='C'; M=3,-17,19,-24,-20,-9,-19,-21,-4,-20,-3,-2,-15,-23,-18,-21,-3,0,4,-30,-14,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-14,-27,-21,5,-26,-18,14,-23,16,9,-20,-24,-18,-19,-13,-3,11,-18,1,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,30,-21,20,2,-21,-5,9,-22,-1,-26,-18,39,-17,0,-1,7,-1,-25,-37,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-32,-16,-7,-13,-21,-20,-14,-14,-20,-14,-20,57,-14,-20,-11,-8,-20,-22,-19,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-34,-27,18,-31,-24,23,-26,18,11,-24,-25,-25,-22,-20,-9,17,-7,7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-34,-27,4,-33,-26,32,-27,22,15,-23,-24,-22,-24,-19,-7,25,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-21,-22,-21,27,-29,10,-1,-13,1,0,-18,-29,-14,-12,-18,-8,-7,18,59,-20;
MA   /I: E1=0;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00210;
//
ID   OPSIN_MP; MATRIX.
AC   MP00238;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Visual pigments (opsins) retinal binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5265846; R2=0.0184000; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3; N_SCORE=6.572; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-1; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-13,-22,-16,1,-14,-18,0,-14,-3,3,-12,-17,-15,-16,4,5,8,-21,-8,-15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-20,-22,-19,-13,5,-22,0,-18,-7,-3,-11,-18,-17,-21,-1,-7,4,-21,-15,-19;
MA   /M: SY='F'; M=1,-22,-11,-28,-21,10,-23,-22,6,-20,6,2,-19,-23,-19,-19,-9,-2,10,-11,-1,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-14,-17,-23,-19,24,-21,-16,-1,-19,-1,-3,-7,-21,-21,-16,-3,5,0,-11,8,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,2,-18,-2,-9,-22,17,11,-25,-12,-22,-13,11,-18,-7,-11,1,-11,-22,-26,-14,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-29,8,9,-26,-9,2,-27,6,-24,-14,4,-1,9,7,-3,-9,-26,-25,-12,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-25,-8,-11,-23,21,-15,-24,-8,-22,-14,0,-12,-10,-9,2,-7,-18,-22,-20,-11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-19,-6,0,-15,-13,1,-13,-7,-14,-7,-1,-13,0,-8,6,3,-10,-25,-6,-1;
MA   /M: M=-2,-6,-24,-8,-4,-14,-9,-5,-12,-8,-10,-7,-2,-15,-2,-8,-2,-5,-13,-15,-6,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-34,-25,23,-32,-23,21,-26,25,12,-24,-27,-25,-21,-23,-9,15,-11,7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-19,6,0,-21,-3,-7,-22,-8,-22,-17,6,-7,-4,-10,16,16,-15,-33,-16,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-34,-12,-4,-22,-20,-11,-14,-12,-19,-13,-16,56,-10,-18,-10,-10,-21,-27,-19,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-23,-19,-13,-2,-19,-12,0,-8,7,3,-15,-23,-8,-2,-12,-5,0,-16,2,-12;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-17,-25,-18,10,-21,-17,5,-18,12,6,-16,-23,-17,-13,-9,-3,7,-18,-1,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-16,-15,-10,-16,-6,-13,-8,-8,-9,2,-6,-14,-4,-11,7,9,-2,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='M'; M=4,-11,-17,-19,-12,-10,-19,-9,4,-12,-1,9,-8,-14,-6,-14,2,9,4,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-34,-27,3,-32,-27,27,-25,18,12,-27,-26,-23,-23,-20,-8,25,-8,-1,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-36,-10,-3,-29,-10,-20,-22,-11,-29,-20,-17,73,-11,-20,-7,-10,-29,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-10,-15,-9,-17,-6,-16,-11,-11,-14,-11,-8,-4,-9,-17,12,5,-3,-24,-15,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-3,-32,-26,23,-30,-20,11,-26,17,8,-24,-30,-26,-21,-19,-8,11,-14,8,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-35,-26,47,-29,-20,9,-26,14,7,-19,-26,-30,-20,-17,-5,6,-3,16,-26;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,3,-15,-9,-20,-3,-18,-15,-12,-17,-14,-5,-13,-9,-18,16,5,-4,-29,-21,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=19,-6,-11,-11,-7,-16,-6,-15,-10,-11,-14,-9,-2,-11,-6,-14,20,16,-3,-30,-16,-7;
MA   /M: SY='S'; M=13,-5,-10,-9,-9,-17,-2,-15,-10,-12,-18,-12,3,-16,-9,-14,18,7,0,-33,-19,-9;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,8,-15,-11,-19,-10,-20,-16,-13,-17,-14,-6,-8,-11,-18,13,12,-5,-31,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,7,-30,-26,-4,-29,-26,16,-23,7,7,-22,-26,-23,-23,-11,-2,22,-28,-10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-25,-24,-21,22,-30,11,6,-16,7,4,-19,-28,-14,-14,-20,-10,-2,10,49,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-12,36,-21,22,1,-16,-3,7,-21,-2,-27,-20,50,-19,-2,-2,7,-2,-28,-37,-17,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-19,-35,-28,11,-32,-25,26,-26,17,14,-25,-26,-23,-23,-20,-9,20,-8,4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-23,-33,-27,-1,-34,-27,38,-25,16,15,-18,-23,-21,-25,-16,-7,30,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-30,-21,-21,28,-31,17,3,-11,1,1,-20,-29,-11,-11,-20,-10,-7,27,75,-21;
MA   /M: SY='A'; M=14,-19,-12,-25,-20,-8,-9,-23,5,-18,-3,-2,-15,-19,-17,-21,-2,-4,11,-22,-13,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-15,-34,-26,20,-31,-23,20,-28,22,13,-23,-27,-25,-23,-20,-8,14,-15,4,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-13,-18,-18,-14,-8,-10,-10,4,-15,4,17,-8,-18,-6,-13,0,1,1,-27,-9,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,20,-23,10,-1,-20,-10,42,-23,-5,-24,-11,33,-19,3,-2,3,-4,-26,-35,-3,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-31,-5,6,-27,-18,-12,-24,16,-26,-14,-8,23,2,8,-7,-9,-22,-23,-16,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-29,-3,10,-30,-20,1,-22,25,-21,-2,0,-13,29,26,-6,-10,-22,-20,-10,18;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-25,-21,-30,-25,51,-28,-8,1,-22,4,-1,-19,-29,-27,-16,-15,-7,1,9,38,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-24,-10,-2,-19,-19,1,-26,20,-16,-8,0,-20,7,50,-9,-9,-18,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='N'; M=0,0,-18,-2,0,-20,-12,-5,-16,-2,-13,-8,3,-9,-1,-1,0,-3,-14,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='C'; M=2,-10,35,-15,-8,-21,-14,-19,-23,-12,-18,-15,-11,-22,-12,-15,-1,-4,-11,-34,-21,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-22,-30,-21,2,-27,-16,24,-22,24,26,-21,-23,-12,-19,-18,-7,14,-21,-2,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-12,-25,-14,-7,-9,-21,-10,1,-10,4,6,-13,-19,-2,-10,-13,-9,-3,-10,-2,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-25,0,13,-26,-16,-6,-22,11,-20,-11,0,-8,16,6,2,4,-20,-22,-12,14;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-11,-14,-9,-14,-18,-7,-13,2,-8,1,-6,-19,-4,7,-6,2,-8,-26,-9,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00211;
//
ID   RECEPTOR_TYR_KIN_II_MP; MATRIX.
AC   MP00239;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Receptor tyrosine kinase class II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6487865; R2=0.0133787; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=696; N_SCORE=13.950; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=5,0,-24,-2,-12,-27,40,-14,-31,-14,-27,-19,7,-17,-13,-16,8,-9,-23,-26,-26,-12;
MA   /M: SY='E'; M=4,-2,4,-3,7,-25,-14,-11,-24,0,-21,-15,-3,-14,3,-3,5,-3,-16,-31,-19,5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-24,22,1,-27,11,-3,-30,-4,-29,-22,25,-16,-4,-4,9,-5,-26,-34,-22,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-24,-26,-17,23,-27,-10,-2,-11,13,4,-17,-27,-16,7,-20,-10,-4,-7,13,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-14,-21,-19,-5,-26,-23,9,-13,2,1,-14,-20,-17,-8,0,18,20,-28,-9,-19;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-29,30,-21,10,10,-25,-25,-25,-23,-10,-3,38,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,47,-30,23,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-23,-10,-14,-26,45,-18,-31,-16,-27,-18,0,-16,-14,-18,9,-9,-21,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-5,20,-15,27,50,-22,-22,-5,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-8,-5,-19,-2,-15,-15,-10,-21,-15,2,-10,-5,-14,27,16,-5,-32,-19,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,57,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,30,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,38,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,1,-21,2,17,-25,-13,-7,-23,9,-23,-15,2,-8,10,6,11,4,-17,-29,-16,13;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-7,-8,-19,3,-12,-21,-4,-20,-14,6,-14,-6,1,12,12,-13,-28,-17,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,35,-25,47,11,-32,-10,-3,-29,-3,-26,-24,17,-13,-3,-10,5,-4,-20,-39,-19,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-17,-11,-14,-26,-21,4,12,-8,2,-15,-20,-10,2,-11,-6,15,-24,-9,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-30,3,9,-32,10,-4,-31,3,-24,-14,1,-14,14,8,-2,-13,-28,-23,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-27,-9,-18,-28,58,-19,-36,-18,-29,-19,1,-18,-18,-18,5,-12,-26,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-16,-4,8,-23,-21,-2,-28,22,-22,-12,-1,-15,7,30,-6,-5,-19,-25,-12,5;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-15,-13,-11,-21,15,-18,-19,-13,-18,-14,-3,-13,-11,-17,14,6,-9,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-30,-22,5,-27,-15,22,-21,33,32,-27,-27,-15,-17,-23,-8,17,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-38,-7,0,-29,-18,-17,-20,-9,-30,-20,-13,80,-9,-18,-8,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='P'; M=16,-13,-24,-12,-4,-25,-9,-18,-16,-10,-22,-16,-12,37,-8,-18,5,-2,-16,-28,-25,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-36,-14,-6,-20,-18,-21,-19,-12,-26,-19,-19,51,-11,-18,-7,-5,-25,-1,-17,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00212;
//
ID   RECEPTOR_TYR_KIN_III_MP; MATRIX.
AC   MP00240;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Receptor tyrosine kinase class III signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9636483; R2=0.0122851; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1535; N_SCORE=22.811; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=207; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-32,-10,-2,-15,-21,7,-26,22,-21,-9,-5,-19,5,34,-14,-13,-21,1,6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-30,8,35,-30,-20,1,-28,18,-21,-13,0,-7,24,20,-3,-10,-27,-25,-15,29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-37,-28,0,-35,-25,42,-25,19,25,-21,-21,-18,-25,-19,-9,29,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,36,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-16,-15,-12,-11,-18,-19,4,-16,-9,-5,-2,-13,-9,-16,16,19,5,-31,-11,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-3,-30,-3,-1,-15,-21,80,-25,-8,-17,0,5,-20,12,0,-10,-18,-27,-21,25,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-9,3,-26,0,0,-20,-14,37,-22,-6,-22,-9,12,-4,7,-4,0,-8,-25,-28,1,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-9,-25,-5,1,-10,-24,-12,-1,-10,15,5,-14,-19,-4,-9,-17,-10,-5,-24,-7,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-27,-11,-2,-16,-24,-2,-9,15,-7,1,-9,-17,2,8,-14,-10,-8,-19,0,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-24,-4,-13,-26,44,-14,-33,-15,-30,-20,9,-17,-13,-15,12,-7,-25,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-19,-30,-24,2,-31,-24,26,-24,23,16,-23,-24,-20,-21,-16,0,23,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-23,-23,-27,-20,14,-27,0,13,-17,23,25,-23,-27,-10,-13,-23,-10,3,-3,28,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-33,-28,2,-32,-26,33,-24,20,18,-27,-27,-24,-22,-17,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-12,-21,-20,8,-25,-23,4,-16,0,-2,-13,-20,-21,-15,4,24,15,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-12,32,-16,-11,-14,-22,-18,-26,2,-21,-14,-9,-24,-12,0,-5,-6,-13,-31,-15,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-20,-19,25,-29,22,0,-12,3,2,-19,-29,-10,-10,-20,-11,-10,22,70,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00213;
//
ID   INTEGRIN_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00242;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Integrins alpha chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9610977; R2=0.0133488; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=369; N_SCORE=9.877; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=5,-23,-17,-26,-21,-5,-18,-24,16,-21,11,6,-19,-22,-19,-21,-7,-3,19,-25,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-11,-31,-25,5,-27,-23,21,-27,26,15,-26,-28,-22,-22,-21,-8,18,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='A'; M=9,-20,-20,-24,-20,-7,2,-22,1,-21,4,0,-16,-21,-19,-21,-8,-9,4,-20,-13,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-21,-31,-22,6,-30,-23,24,-28,38,17,-27,-27,-20,-22,-24,-9,16,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-20,-30,-21,7,-29,-21,21,-28,42,18,-28,-28,-20,-21,-26,-9,13,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,30,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,28,-30,-20,15,-30,40,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-17,-20,-14,-6,-7,-18,0,-18,1,0,-10,-18,-13,-18,2,-1,1,-23,-11,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-28,-18,-29,-21,4,-27,-22,20,-26,35,15,-27,-27,-21,-20,-21,-7,17,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-23,-33,-24,4,-32,-24,30,-28,33,18,-25,-25,-20,-24,-23,-9,19,-20,-2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-16,-23,-19,-1,-24,-23,13,-19,3,2,-13,-18,-17,-18,2,12,16,-25,-7,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-26,-13,-29,-23,15,-29,-12,9,-22,15,5,-25,-29,-20,-19,-21,-10,5,3,21,-23;
MA   /M: SY='I'; M=5,-25,-10,-30,-22,-2,-26,-25,19,-24,19,9,-23,-24,-20,-23,-14,-6,18,-24,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,26,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-29,-38,-30,-24,20,-23,-8,-11,-16,-11,-11,-28,-29,-16,-15,-26,-18,-19,84,47,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-21,28,-29,-23,-5,-25,-21,-1,-19,1,5,-20,-28,-20,-17,-12,-7,7,-30,-13,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,6,-29,5,8,-28,-17,-6,-29,39,-29,-12,8,-12,8,29,-7,-9,-22,-23,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=4,3,-20,-5,-2,-21,-12,-7,-13,3,-18,-10,9,-11,3,1,4,0,-12,-27,-15,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-29,-17,-10,0,-26,0,-9,8,-3,-1,-12,-23,-2,23,-16,-10,-10,-5,19,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-32,-6,5,-28,-21,-6,-22,15,-23,-10,-8,22,7,5,-9,-8,-23,-24,-14,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,3,-29,10,13,-26,-17,-8,-24,0,-24,-18,-3,21,3,-6,0,-2,-24,-28,-16,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-27,1,5,-22,-18,-9,-7,-2,-9,-2,-4,-13,7,-7,-6,-6,-10,-25,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-9,-25,-9,-3,-12,-15,-6,-4,-14,4,3,-9,-8,-7,-14,-11,-8,-8,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-23,8,17,-22,-16,1,-21,1,-17,-13,1,-10,8,-4,5,3,-18,-28,-10,12;
MA   /M: SY='E'; M=1,-6,-23,-6,13,-21,-18,-6,-11,2,-6,0,-8,-12,13,-1,-5,-8,-11,-23,-13,13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-20,2,15,-15,-14,-6,-14,-4,-8,-10,-5,-3,1,-9,0,-4,-14,-21,-9,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-19,5,7,-18,-3,-4,-15,3,-15,-10,8,-8,3,-1,1,-3,-15,-20,-12,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-25,-3,6,-22,-5,-2,-24,7,-21,-12,5,-15,9,17,1,-7,-21,-22,-11,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-28,-3,6,-28,-19,4,-19,9,-17,-5,-3,-8,22,15,-5,-9,-19,-23,-11,13;
MA   /M: M=-5,-4,-23,-3,-2,-11,-18,-12,-11,-5,0,-5,-6,-12,-7,-4,-8,-6,-10,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-25,-5,7,-17,-18,-7,-17,9,-18,-9,-2,-8,7,9,-2,-5,-13,-24,-12,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00215;
//
ID   INTEGRIN_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00243;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Integrins beta chain cysteine-rich domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8099208; R2=0.0053846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=880; N_SCORE=8.544; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=500; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,94,-26,-24,-22,-28,-27,-29,-21,-22,-19,-18,-28,-25,-24,-10,-10,-12,-46,-28,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-6,-9,-6,4,-22,-16,-11,-18,-6,-18,-12,-4,0,5,-6,9,7,-15,-32,-17,3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-12,-6,-16,-7,-13,-20,-15,-10,-3,-2,-2,-11,-20,-7,2,-8,-1,-6,-26,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=0,14,-19,18,6,-27,-7,-6,-25,-3,-26,-20,11,-11,5,-5,19,7,-17,-36,-18,5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,4,-16,-5,-7,-15,-14,-12,-12,-6,-15,-10,10,-5,-7,-6,11,23,-8,-31,-15,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-23,19,6,-16,-13,-7,-23,-6,-19,-16,4,-13,1,-9,3,-1,-17,-27,-11,4;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-18,-5,-6,-21,5,-8,-22,-11,-24,-16,3,-5,-5,-12,19,14,-15,-32,-18,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-14,107,-21,-26,-22,-28,-27,-31,-27,-21,-21,-17,-37,-27,-28,-9,-10,-12,-49,-29,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-20,-26,-17,-2,-26,-18,17,-15,20,19,-21,-23,-14,-14,-17,-6,15,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='N'; M=7,11,-17,6,0,-22,-3,-6,-20,-4,-26,-18,18,-8,-2,-6,18,5,-16,-34,-20,-2;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-20,-6,0,-18,-12,-14,-13,-8,-16,-12,-1,4,-6,-11,8,7,-10,-31,-18,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,21,-24,17,8,-25,-4,1,-27,9,-28,-19,27,-15,4,9,5,-4,-26,-33,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-29,-9,-12,-27,51,-16,-34,-15,-24,-15,-2,-19,-14,-14,-2,-18,-26,-21,-26,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-22,-15,-8,-16,-11,-15,-2,-6,-3,1,-14,-20,-2,-8,-9,-8,3,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-23,-24,-10,-3,-31,-21,22,-20,19,10,-21,-21,-14,-19,-17,-8,17,-24,-6,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=5,11,-13,5,0,-20,0,-5,-20,-7,-30,-20,23,-13,0,-7,32,15,-15,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-7,-18,-29,64,-17,-38,-18,-30,-20,5,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-4,-29,-5,0,-19,-19,30,-27,14,-18,-6,5,-20,8,38,-10,-12,-22,-24,-1,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-25,3,1,-14,-21,-1,-14,0,-13,-9,0,-16,-3,5,-4,-2,-9,-25,-5,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-27,9,15,-21,-21,0,-17,5,-15,-10,-3,-13,4,4,-6,-9,-11,-26,-9,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-27,-2,-15,-27,51,-12,-35,-15,-30,-20,16,-20,-15,-15,3,-15,-30,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-12,-21,-13,-5,-15,-21,-13,-10,9,-12,-6,-8,-19,-4,21,-3,1,2,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-26,-8,4,-19,-24,-1,-9,9,-8,-1,-6,-16,8,6,-10,-10,-9,-23,-7,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-10,-8,-7,-1,-13,-5,-3,-7,-2,-2,-1,-11,-7,-4,2,12,-1,-16,-3,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-28,40,16,-33,-13,11,-30,0,-25,-19,16,-12,9,-5,-1,-10,-26,-35,-14,12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-31,-8,-1,-24,-9,-13,-19,-7,-24,-13,-9,40,-4,-12,-2,-7,-23,-28,-23,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-26,-3,-8,-27,32,-14,-32,-4,-27,-17,1,-11,-9,-5,1,-12,-24,-22,-22,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-25,-23,-19,27,-23,2,-4,-14,-4,-4,-17,-26,-15,-13,-11,-7,-8,21,46,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-5,-23,-8,2,-17,-20,-3,-8,-5,-13,-5,-3,-13,15,-5,6,6,-11,-20,0,8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-7,-31,-4,-12,-28,40,-17,-34,-14,-26,-18,-3,-4,-15,-14,-3,-17,-28,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-4,-30,2,1,-27,-16,-14,-22,-4,-23,-17,-8,35,-4,-6,-3,-4,-22,-29,-22,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-8,-19,-14,-13,5,-23,-10,-2,-14,5,1,-7,-19,-14,-12,-6,9,-2,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-26,15,37,-25,-17,-1,-23,8,-17,-15,1,-4,15,5,-1,-7,-22,-26,-15,25; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-24,1,9,-19,-19,3,-12,5,-10,-1,-2,-11,8,6,-7,-7,-13,-22,-7,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-14,88,-23,-23,-20,-24,-24,-28,-23,-22,-19,-11,-34,-22,-21,-2,-5,-11,-47,-27,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-32,-9,1,-26,-21,-14,-16,-7,-21,-13,-14,49,2,-13,-4,0,-23,-28,-22,-1;
MA   /M: SY='G'; M=7,0,-24,1,-10,-28,38,-16,-32,-14,-27,-20,3,-16,-13,-17,7,-10,-22,-26,-26,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00216;
//
ID   REACTION_CENTER_MP; MATRIX.
AC   MP00244;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Photosynthetic reaction center proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0450382; R2=0.0172498; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=678; N_SCORE=17.730; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=27; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-24,-34,-25,22,-29,-22,13,-20,11,9,-24,-26,-23,-18,-21,-11,11,7,9,-23;
MA   /M: SY='S'; M=13,-7,-17,-8,-4,-21,-7,-16,-16,-10,-23,-16,-3,13,-6,-15,19,12,-11,-32,-21,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-5,-26,-7,-7,-20,-1,50,-25,-13,-15,-4,2,-19,-1,-8,-6,-16,-22,-26,3,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-20,-29,-20,4,-30,-22,21,-26,33,15,-22,-24,-18,-20,-19,1,13,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,21,-27,30,4,2,-17,-7,-26,-10,-16,-19,5,-17,-13,-13,-7,-10,-20,-22,-3,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-21,-41,-24,-20,0,-16,-18,-22,-8,-22,-18,-15,-27,-11,-1,-26,-21,-28,88,14,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-14,-29,-25,26,-28,-24,10,-22,8,3,-20,-25,-28,-18,-8,7,19,-16,4,-25;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-16,-9,-9,-11,-11,-8,-3,-11,-7,2,7,-16,-5,-11,9,7,-4,-31,-12,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-19,-5,-10,-9,-11,-6,-2,-12,-4,-5,18,-21,-9,-11,-1,-3,-9,-30,-12,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-15,-32,-27,39,-29,-24,9,-24,7,2,-21,-27,-32,-19,-11,2,18,-10,10,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-21,-17,-17,4,15,-18,-17,-21,-14,-11,-4,-20,-19,-18,4,-5,-12,-18,-9,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-28,-17,-8,-2,-28,4,3,-8,1,5,-15,-22,11,-7,-13,-9,-6,-2,26,-1;
MA   /M: SY='R'; M=4,-6,-22,-10,-4,-24,1,-8,-21,2,-18,-10,-1,-15,6,11,2,-4,-15,-23,-16,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-28,-16,-7,28,-28,11,-6,-11,-2,-4,-15,-24,-10,-10,-16,-10,-12,13,50,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-27,-9,-12,-18,15,23,-24,-17,-12,-6,1,-21,-8,-12,-8,-16,-22,-25,-6,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-11,34,-22,17,1,-21,-3,20,-21,-1,-28,-17,52,-20,3,0,7,-3,-30,-38,-15,2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-32,-27,-39,-29,45,-30,-24,8,-28,11,2,-25,-28,-30,-22,-25,-14,1,26,21,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-14,-23,-17,-14,12,-25,25,-8,-17,2,2,-9,-23,-10,-10,-12,-3,-10,-11,24,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-27,-23,-20,22,-28,9,7,-14,13,13,-22,-28,-10,-12,-22,-10,-3,13,52,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-12,27,-15,13,-1,-20,-6,20,-23,0,-28,-16,44,-21,1,2,4,-4,-28,-38,-14,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-25,-20,-34,-25,48,-16,-21,-6,-25,1,-5,-18,-25,-31,-20,-13,-10,-4,9,15,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-15,-26,-18,-7,-10,-4,8,-11,10,41,-16,-19,-1,-12,-14,-10,3,-21,-6,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-20,-29,-20,7,-25,-17,18,-24,29,21,-22,-24,-15,-19,-19,-7,10,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=13,-7,-19,-8,-11,-25,33,-17,-28,-15,-26,-18,2,-15,-11,-17,16,-2,-18,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-12,-16,-11,-11,-4,-19,-11,-12,-12,-10,-6,-13,-12,-16,13,13,-1,-23,-14,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-24,-27,-25,28,10,-20,-14,-26,-2,-6,-13,-26,-30,-20,-13,-14,-11,-5,3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-33,-25,23,-29,-23,18,-26,24,12,-25,-28,-26,-21,-20,-7,18,-15,4,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-26,53,-30,-11,5,-26,17,5,-22,-30,-29,-18,-22,-10,0,7,34,-26;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-23,-12,-18,-22,37,-21,-26,-17,-21,-15,-3,-18,-18,-17,5,0,-16,-23,-23,-18;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-8,-6,-9,-20,9,-14,-21,-12,-23,-17,8,-15,-9,-13,17,10,-13,-31,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,3,-17,-13,-17,-7,-21,-12,-14,-13,-11,-8,-16,-13,-18,11,11,0,-29,-19,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-31,-21,9,-28,-20,16,-28,41,19,-30,-29,-19,-19,-30,-12,6,-4,3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=7,-24,-17,-29,-19,13,-20,-20,7,-24,24,7,-22,-24,-20,-20,-15,-7,5,-15,-1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,9,-26,-20,11,-24,-20,-1,-26,14,3,-19,-28,-21,-20,-11,-5,1,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-6,-18,-11,-21,4,-20,-13,-11,-13,-12,-8,-12,-11,-20,11,0,-3,-23,-21,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-13,-31,-22,0,-25,-12,21,-19,22,37,-22,-23,-10,-17,-20,-9,12,-22,-3,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-16,-11,-10,-23,20,-17,-22,-13,-22,-16,-1,-13,-10,-17,16,0,-12,-26,-23,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-16,-21,-16,1,-26,-20,7,-21,23,7,-17,-21,-16,-16,-8,17,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-22,-20,-8,-1,-26,-17,4,-19,23,6,-20,-22,-9,-14,-17,-1,-1,-11,-3,-8;
MA   /M: SY='S'; M=18,4,-12,-2,-3,-20,0,-9,-17,-8,-24,-17,13,-12,-3,-11,27,11,-11,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=14,-14,-11,-19,-15,-10,-15,-21,3,-15,-3,-3,-13,-18,-15,-17,8,11,15,-28,-14,-15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-15,-11,-19,-9,-9,-16,-18,0,-17,8,-1,-14,-18,-11,-18,-2,1,1,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-14,0,-25,-9,-9,-1,-19,-6,-7,0,-12,-6,12,-21,-4,9,-6,-7,-11,-22,-5,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-15,-31,-12,2,-2,-23,-7,-16,-3,-13,-11,-13,15,-6,1,-12,-10,-19,-13,2,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-28,13,12,-30,11,-9,-31,-2,-24,-19,2,-12,0,-5,-1,-12,-24,-27,-21,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-25,-3,-8,-26,21,-16,-30,1,-25,-16,1,-15,-9,-3,2,-3,-20,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-27,18,2,-29,12,-4,-32,-9,-26,-20,6,-8,-6,-12,3,-4,-25,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-28,10,29,-28,-11,-4,-30,12,-21,-17,0,-8,10,13,-2,-10,-24,-26,-18,18;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-23,1,18,-23,-11,-10,-20,1,-18,-15,-1,-1,2,-6,3,0,-16,-28,-19,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-9,-23,-13,-6,-9,-16,-13,2,-12,-1,2,-6,-20,-9,-13,-9,-8,1,-16,-9,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00217;
//
ID   PHYTOCHROME_1_MP; MATRIX.
AC   MP00245;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phytochrome chromophore attachment site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8380013; R2=0.0137974; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1141; N_SCORE=20.571; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-10,51,12,-36,-11,-5,-37,-5,-29,-28,14,-14,-4,-12,3,-7,-26,-41,-21,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,17,40,-29,-16,-3,-29,9,-24,-20,2,1,13,-1,5,-5,-26,-31,-20,26;
MA   /M: SY='R'; M=3,-2,-23,-3,12,-23,-14,-9,-23,14,-19,-13,-2,-10,5,16,2,-1,-15,-24,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-23,-9,-2,-20,-16,-11,-12,-1,-18,-2,-7,12,2,-6,5,5,-11,-29,-16,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-9,-28,-12,5,-14,-25,-1,-7,-2,-9,3,-6,-15,32,-1,-6,-10,-16,-15,-2,18;
MA   /M: SY='P'; M=-12,8,-33,21,16,-32,-15,-10,-28,-4,-28,-23,-2,37,-1,-13,-2,-8,-29,-34,-25,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21,5,-28,-15,24,-23,36,33,-25,-25,-13,-18,-25,-10,13,-20,0,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-11,44,-17,-16,-17,-18,-21,-17,-20,-20,-16,-6,-24,-15,-20,12,7,-6,-42,-22,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=5,-21,30,-27,-25,-10,-24,-27,1,-21,-4,-4,-21,-28,-25,-22,-4,1,19,-35,-18,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-6,-18,-29,61,-16,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-12,-9,-8,-12,-20,-19,-12,-5,-12,-10,0,-10,-8,-6,17,45,-2,-29,-10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-28,-18,4,-27,-17,16,-25,37,23,-27,-16,-16,-18,-26,-10,6,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-28,-9,-1,-20,-14,-2,-29,24,-21,-11,1,-19,8,58,-5,-7,-19,-22,-12,-1;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-13,-15,-10,-22,12,-18,-17,-12,-17,-13,-5,-12,-10,-18,13,0,-7,-23,-22,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-22,-35,-13,-5,-25,-22,-22,-12,-12,-23,-15,-22,70,-13,-20,-10,-8,-17,-30,-27,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-25,-8,-15,-23,46,-15,-32,-17,-28,-18,1,-18,-15,-17,8,-10,-24,-21,-19,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=15,-10,-12,-17,-12,-10,-14,-19,-4,-14,2,-4,-9,-14,-12,-15,7,18,2,-25,-12,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,18,-38,-20,6,-22,18,-22,-2,0,-10,50,14,-2,-10,-28,-20,-10,34;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-16,-13,4,-19,-8,-12,-9,-6,-7,-1,-9,-9,-2,-14,3,-4,-5,-22,-17,1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,11,-27,6,-10,-28,41,-9,-34,-12,-30,-21,21,-19,-12,-13,3,-13,-30,-28,-26,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-27,-35,-27,-2,-37,-28,40,-27,15,15,-17,-18,-18,-27,-13,0,25,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-12,-17,-8,-20,-2,-17,-13,-6,-13,-11,-7,-11,-7,-10,11,1,-3,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-11,-28,-26,-1,-27,-28,24,-20,11,8,-27,-27,-26,-19,-9,2,40,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-3,20,-13,24,54,-21,-21,-3,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00218;
//
ID   WNT1_MP; MATRIX.
AC   MP00246;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Wnt-1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4592919; R2=0.0108385; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=981; N_SCORE=15.082; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=189; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,4,-30,12,43,-27,-20,0,-30,16,-20,-17,0,-6,17,20,-3,-10,-27,-27,-17,29;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-4,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,7,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-8,-27,-10,4,-23,-21,0,-12,11,-6,8,-7,-16,26,15,-10,-10,-16,-20,-7,14;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-13,-22,-16,-11,-17,-23,5,-15,-2,-2,-12,-15,-15,-19,5,13,12,-24,-12,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,17,13,-29,-29,-27,-21,-14,-3,41,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-16,-20,-20,-13,3,-19,-12,-7,1,-7,-4,-13,-20,-11,1,-7,-6,0,-10,6,-13;
MA   /M: SY='N'; M=0,10,-21,9,3,-25,-8,-5,-25,9,-26,-17,13,-13,2,9,10,0,-18,-31,-17,2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-24,-7,1,-11,-23,33,-12,-13,2,2,-5,-19,0,-7,-11,-6,-14,-27,4,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-17,-20,-25,-15,-6,-17,-3,8,-4,9,39,-15,-19,0,1,-14,-9,4,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,6,-27,8,7,-27,-15,5,-30,24,-27,-13,6,-13,7,20,-1,-6,-21,-27,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-18,-24,-17,-8,-15,-24,-13,-3,-1,-5,-1,-16,-5,-1,10,-11,-7,1,-25,-12,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-2,8,-25,10,13,-28,-16,-10,-26,20,-23,-15,2,-9,4,7,0,-1,-18,-26,-14,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-15,-28,-24,0,-28,-23,24,-20,14,17,-23,-24,-20,-18,-11,3,30,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-13,-2,0,-20,-3,-8,-22,-4,-28,-18,8,-12,2,3,32,15,-12,-37,-18,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=14,4,-17,-1,7,-24,-5,-6,-18,-3,-21,-14,9,-10,8,-7,16,3,-15,-30,-19,7;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-17,-31,-26,3,-30,-22,28,-23,24,22,-27,-27,-21,-20,-19,-6,29,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-6,-29,42,-27,-9,0,-11,17,33,-9,-10,-21,-20,-10,13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-28,-23,-12,-7,-26,-14,6,-7,10,14,-19,-21,0,-8,-20,-12,-2,-1,0,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-22,-4,9,-23,-19,-6,-14,3,-15,-7,-3,-13,15,7,5,4,-10,-27,-13,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-20,-24,-14,0,-26,-13,11,-19,28,20,-21,-23,-6,-14,-18,-1,4,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=10,-14,-27,-11,-3,-26,-11,-18,-17,-10,-25,-17,-12,46,-8,-18,4,-2,-19,-29,-26,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-21,22,20,-26,-11,-6,-26,-2,-24,-21,8,-7,4,-7,16,8,-19,-36,-19,12;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28,67,-28,-17,3,-27,12,10,-20,-28,-34,-18,-20,-10,2,5,25,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,0,19,-23,-20,0,-30,24,-20,-13,0,-14,13,48,-7,-10,-23,-23,-13,13;
MA   /M: SY='K'; M=7,-1,-22,-4,10,-26,-15,-10,-20,14,-19,-10,-3,-9,11,4,3,1,-15,-23,-14,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00219;
//
ID   HBGF_FGF_MP; MATRIX.
AC   MP00247;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HBGF/FGF family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5339069; R2=0.0161461; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=527; N_SCORE=14.033; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-28,-10,1,-13,-22,-7,-19,23,-16,-5,-4,-16,8,24,-10,-8,-15,-16,-3,4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-26,-4,-14,-28,50,-16,-35,-16,-29,-20,7,-18,-15,-17,4,-12,-27,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,-13,-26,-21,-7,-21,-25,14,-16,5,3,-20,-21,-20,-19,-4,2,26,-25,-12,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-20,-5,5,-12,-19,-5,-13,3,-13,-5,-4,-15,-1,-1,-4,-6,-9,-23,-7,2;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-10,-6,-5,-16,-7,-14,-15,-11,-19,-15,3,-11,-5,-12,28,25,-5,-34,-17,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-9,-7,-7,-23,13,-13,-26,-7,-22,-16,3,-20,-10,-4,1,-9,-17,-28,-22,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-17,-22,-19,-11,1,-24,-3,-8,1,2,5,-13,-24,-3,17,-16,-10,-7,-14,6,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,6,-31,-23,26,-27,37,19,-28,-28,-21,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='C'; M=22,-14,44,-24,-19,-20,-9,-24,-20,-19,-15,-15,-14,-23,-19,-24,1,-5,-6,-33,-25,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-29,-18,-1,-21,-1,18,-11,20,55,-20,-20,1,-10,-20,-10,8,-20,0,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-23,26,6,-27,-2,3,-26,2,-30,-21,36,-15,2,-2,9,-2,-27,-37,-19,4;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-23,-5,5,-22,-10,-10,-21,10,-18,-11,-3,-8,2,10,2,-2,-15,-25,-15,3;
MA   /M: SY='K'; M=-14,8,-14,12,11,-28,-18,-2,-31,17,-25,-16,4,-15,5,17,-5,-9,-23,-30,-15,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-26,-5,5,-20,-18,-4,-21,21,-17,-8,0,-15,7,21,-7,-8,-17,-19,-6,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,23,-28,43,24,-28,-28,-18,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-27,-23,-20,26,-30,8,5,-14,4,3,-19,-28,-12,-13,-18,-8,-3,14,53,-19;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-22,-12,-15,-25,39,-19,-28,-16,-23,-17,-3,-14,-15,-19,7,-8,-19,-22,-25,-15;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-15,-6,-3,-16,-9,-12,-15,-3,-17,-12,1,-13,-2,-4,20,12,-7,-33,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-29,-6,6,-21,-19,-11,-16,5,-14,-10,-9,11,1,1,-7,-8,-17,-23,-13,1;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-3,-14,-6,-2,-13,-18,11,-17,-3,-14,-7,0,-18,-1,-2,-2,-2,-13,-26,-3,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-19,-28,-20,32,-28,-13,0,-17,7,0,-19,-20,-23,-12,-18,-8,-2,-3,19,-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,8,-15,3,-4,-19,-1,-7,-20,-8,-24,-17,16,-13,-3,-8,22,19,-14,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-28,11,19,-29,-15,-7,-26,8,-25,-18,0,10,5,1,0,-6,-23,-30,-19,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-28,38,37,-33,-14,0,-32,5,-24,-24,12,-6,9,-5,1,-9,-29,-34,-20,23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-12,-23,-15,-6,-5,-23,-15,-4,4,-6,-2,-8,-18,-8,3,-8,-4,0,-21,-6,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-19,3,-29,14,4,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-25,-10,-2,-11,-21,-9,-16,15,-12,-6,-2,-18,-1,25,-8,-3,-11,-21,-7,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,19,57,-31,-20,1,-29,10,-20,-19,0,-1,23,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-16,-21,-18,-8,-8,-24,-14,-4,-4,-5,-3,-11,-19,-4,6,-9,-4,-3,-11,-5,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-31,-24,9,-30,-22,24,-24,25,18,-24,-26,-21,-20,-18,-3,21,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-13,-24,-10,5,0,-25,-5,-4,-14,15,3,-15,-20,-5,-9,-17,-11,-8,-21,-3,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-24,11,40,-29,-19,-6,-27,5,-22,-19,-4,12,11,-4,0,-8,-27,-31,-22,25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,34,-21,19,0,-19,-4,6,-17,-3,-22,-17,48,-20,-2,-3,5,-2,-26,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-9,10,-26,2,-9,-17,15,9,-25,-9,-26,-16,23,-21,-7,-8,0,-10,-28,-17,-7,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-9,29,-19,18,-1,-20,-7,1,-17,-3,-24,-17,38,-18,-4,-5,8,5,-18,-38,-18,-3;
MA   /M: SY='T'; M=12,-11,-12,-18,-14,-11,-18,-21,2,-13,-3,-3,-11,-15,-12,-15,7,20,11,-26,-12,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-28,-22,-20,26,-29,13,3,-13,6,6,-20,-29,-11,-11,-20,-9,-6,20,63,-19;
MA   /M: SY='E'; M=3,-9,-22,-11,4,-12,-16,-8,-13,-1,-9,-5,-7,-14,4,2,-1,-4,-11,-20,-7,3;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-11,1,0,-21,-3,-9,-21,-3,-29,-19,13,-12,0,-5,30,14,-13,-38,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=1,-6,-23,-9,-2,-15,-17,-9,-11,2,-10,-3,-6,-11,-1,4,-4,-5,-8,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-27,-12,-4,-12,-23,-8,-10,14,-5,-1,-8,-18,-2,10,-14,-9,-9,-16,1,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-8,-31,-9,-11,5,-23,42,-15,-10,-12,-4,-5,-25,-3,-7,-16,-14,-21,12,45,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-27,-5,3,-24,-7,4,-26,7,-22,-12,-1,-6,5,16,0,-6,-21,-25,-13,1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-4,-26,-4,-4,-19,2,5,-22,-6,-14,-8,-2,-17,0,-6,-4,-7,-19,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-29,-17,-9,-11,-17,-9,-11,-4,-9,-1,-13,-11,-3,-4,-13,-9,-13,9,-2,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-23,-11,-11,3,-16,-6,-6,-10,-6,-5,-7,-19,-10,-9,-7,-2,-5,-11,11,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-22,-19,-15,-6,-16,-13,1,-12,-7,1,-11,-18,-9,-8,0,1,2,-11,0,-14;
MA   /M: SY='A'; M=10,-16,-20,-19,-12,-6,1,-19,-8,-16,-2,-5,-13,-15,-15,-18,-5,-7,-3,-19,-13,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00220;
//
ID   NGF_1_MP; MATRIX.
AC   MP00248;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nerve growth factor family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8264666; R2=0.0132472; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1070; N_SCORE=18.991; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-31,-15,-13,13,-27,10,-7,0,-8,-4,-17,-13,-7,-4,-17,-10,-14,15,52,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-19,-32,-22,51,-24,-19,-5,-18,2,-3,-16,-24,-29,-15,-14,-8,-2,2,17,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-17,-26,-19,-13,39,-26,-8,-8,-18,-2,-6,-15,-13,-22,-15,-16,-10,-10,3,26,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-28,15,42,-28,-7,-2,-29,4,-23,-20,6,-5,13,-3,4,-8,-28,-31,-21,27;
MA   /M: SY='T'; M=7,-2,-12,-11,-7,-15,-17,-17,-11,-8,-11,-9,-2,-10,-3,-10,16,36,-3,-27,-12,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-27,-2,5,-27,-3,-12,-29,25,-26,-13,0,-12,3,16,-4,-4,-20,-22,-15,4;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,78,-20,-13,-20,-25,-23,-27,-21,-18,-18,-16,-30,-19,-23,-7,-9,-12,-41,-24,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,5,-25,1,-2,-23,3,3,-28,8,-27,-15,16,-17,1,16,4,-5,-23,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,6,-27,6,0,-27,12,-9,-27,-8,-29,-21,13,8,-6,-12,5,-6,-27,-32,-25,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-29,-15,-8,-21,-14,-18,-9,-12,-16,-6,-17,40,-11,-18,-6,-6,-12,-28,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-8,4,-28,-1,-7,-26,21,-8,-30,1,-28,-17,15,-11,-6,5,-1,-11,-27,-26,-22,-8;
MA   /M: SY='P'; M=4,-15,-24,-13,-8,-14,-15,-13,-11,-11,-18,-12,-13,23,-10,-16,2,1,-10,-21,-8,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-20,-12,-14,-17,14,-20,-13,-15,-14,-10,-5,-19,-17,-15,2,3,-2,-27,-19,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-28,-6,-5,-26,7,-17,-27,0,-26,-16,-4,12,-8,-7,1,0,-21,-26,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,4,-19,4,3,-23,7,-8,-26,-5,-28,-19,10,-12,-1,-3,21,6,-18,-34,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-28,-7,-13,-28,52,-17,-37,-14,-29,-19,1,-18,-14,-11,3,-15,-27,-23,-27,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-13,-29,-13,-3,-16,-21,-3,-24,22,-11,-6,-4,-21,6,59,-13,-10,-16,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-25,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-22,-22,-22,-27,-17,-6,34,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-19,-1,2,-24,-9,-10,-23,11,-24,-15,3,-12,2,10,12,2,-13,-28,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-29,-6,3,-23,-16,-4,-30,32,-24,-11,1,-16,9,50,-7,-8,-20,-21,-11,3;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-29,-3,0,-19,-21,81,-24,-10,-13,2,5,-20,11,-1,-11,-18,-26,-28,16,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-25,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,138,35,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-9,20,-19,6,-7,-14,-10,-2,-6,-7,-14,-10,33,-21,-7,-7,3,2,-13,-35,-15,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-7,-30,-4,10,-3,-25,19,-14,-1,-11,-5,-9,-18,14,-3,-10,-11,-21,0,32,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-19,-7,-2,-18,-20,-14,-19,15,-18,-10,0,-11,-1,14,6,22,-9,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='T'; M=9,7,-14,-3,-3,-17,-10,-12,-14,-5,-16,-13,11,-12,-5,-9,13,21,-9,-30,-15,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-15,-6,-3,-17,-16,-16,-17,5,-19,-12,2,-10,-3,0,16,29,-7,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,4,-30,5,13,-33,-19,37,-24,3,-21,-3,6,-13,39,5,-3,-13,-30,-25,-2,25;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=6,-13,-16,-20,-13,-9,-12,-9,6,-12,0,21,-9,-15,-3,-13,3,1,4,-26,-9,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-28,32,26,-21,-16,0,-29,0,-21,-21,6,-10,4,-7,0,-8,-25,-27,-7,15;
MA   /M: SY='G'; M=8,-1,-21,-4,-2,-25,17,-13,-27,-1,-26,-17,5,-13,-5,-7,10,-4,-19,-27,-21,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00221;
//
ID   PDGF_1_MP; MATRIX.
AC   MP00249;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Platelet-derived growth factor (PDGF) family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5488644; R2=0.0100773; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=769; N_SCORE=12.298; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-11,9,-29,18,8,-23,-14,-4,-24,-5,-25,-20,0,14,-3,-12,3,-4,-23,-27,-8,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-31,-23,-2,-32,-23,26,-17,16,12,-21,-24,-17,-8,-17,-8,22,-22,-4,-23;
MA   /M: M=-2,-14,-20,-18,-16,-1,-5,-16,-5,-15,-1,-3,-7,-22,-15,-9,-4,-5,-3,-22,-9,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-25,2,17,-26,-17,-2,-17,6,-14,-3,-2,-11,22,2,1,-5,-19,-26,-12,19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-27,11,38,-24,-22,-6,-17,2,-14,-14,-4,-5,9,-6,-2,-6,-16,-30,-17,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-6,-28,-3,-10,10,-25,21,-9,-13,0,-2,-9,-25,-8,-11,-16,-12,-13,-1,37,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-36,-12,-4,-27,-7,-17,-21,-8,-25,-13,-15,56,-9,-11,-9,-11,-26,-27,-26,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,17,-23,24,12,-27,-8,-9,-26,0,-22,-19,6,-11,-2,-7,6,3,-17,-33,-18,5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,6,-21,6,24,-21,-14,-6,-20,-1,-17,-16,5,-7,6,-6,10,6,-18,-31,-17,15;
MA   /M: SY='V'; M=7,-17,-13,-24,-20,-6,-23,-24,14,-16,3,4,-16,-19,-18,-18,0,13,22,-26,-10,-20;
MA   /M: SY='N'; M=0,18,-19,12,14,-23,-5,0,-22,-1,-26,-19,27,-12,4,-4,15,3,-23,-36,-20,9;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-8,-24,-10,-8,5,-23,22,-14,-9,-6,-2,-5,-21,-5,-6,-9,-4,-14,-14,17,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-25,-27,-16,6,-30,-16,15,-18,16,12,-17,-22,-6,-12,-17,-7,5,-16,2,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-35,-27,50,-31,-16,10,-26,14,5,-22,-29,-31,-19,-20,-9,7,3,27,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-28,-10,-6,-15,-16,-12,-17,11,-22,-12,0,-18,-3,9,-6,-7,-14,4,-5,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-25,-5,0,-24,-10,-13,-21,-6,-29,-19,-4,31,-3,-7,14,5,-19,-34,-23,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-18,-4,4,-18,-14,-13,-13,-7,-14,-13,0,-1,-4,-11,11,14,-9,-31,-17,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-29,-25,2,-28,-26,24,-23,23,12,-29,-29,-25,-20,-16,-4,33,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-18,-8,-3,-22,-5,-1,-1,6,17,-14,-19,4,-2,-14,-9,-5,-15,3,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-19,-8,-12,-23,29,-17,-27,-15,-25,-18,2,-15,-12,-15,16,5,-17,-27,-23,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,23,-21,10,-3,-21,3,0,-21,-5,-28,-19,37,-10,-4,-5,11,5,-25,-36,-21,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,33,-26,43,14,-33,-3,-3,-33,-3,-28,-25,18,-11,-1,-9,5,-3,-26,-37,-20,6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-28,24,43,-30,-17,-1,-31,8,-23,-21,4,-4,14,4,3,-7,-27,-32,-19,28;
MA   /M: SY='G'; M=10,1,-18,-3,-8,-23,22,-12,-25,-12,-27,-19,11,-14,-8,-13,19,2,-17,-31,-23,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-18,-27,-19,2,-28,-18,19,-22,31,19,-26,-27,-13,-16,-21,-7,16,-23,-3,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-28,0,18,-24,-22,9,-16,9,-15,-2,-2,-10,16,3,-6,-9,-18,-25,-7,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-15,-21,-17,-8,-24,-17,9,-9,1,9,-16,-21,-9,-5,-3,9,19,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=2,-10,-31,-8,-2,-27,-13,-16,-18,-9,-26,-18,-7,55,-9,-17,-3,-7,-24,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-11,-15,-14,-8,-22,-22,1,-14,-4,-4,-7,-15,-14,-13,12,33,10,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-27,4,20,-28,4,-6,-30,3,-25,-17,2,-9,10,2,5,-7,-25,-27,-20,14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-17,-9,-1,-15,-22,-15,-7,0,-8,-4,-7,-14,-2,-3,3,17,1,-27,-10,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-7,-23,-9,-3,-15,-15,22,-19,-1,-17,-6,0,-17,6,8,1,-6,-14,-23,2,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-22,3,-4,-11,-11,13,-14,-6,-16,-10,23,-20,2,-4,3,0,-20,-25,1,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00222;
//
ID   TGF_BETA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00250;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TGF-beta family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0886612; R2=0.0126915; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=566; N_SCORE=11.262; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=190; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-26,-16,3,-28,-16,9,-17,34,13,-23,-28,-13,0,-26,-10,3,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-25,-10,-3,-16,-18,13,-18,8,-13,-5,-4,-19,5,20,-7,-8,-13,-20,0,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,9,16,-27,-14,-3,-24,2,-23,-17,2,7,8,-2,3,-5,-23,-28,-16,11;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-31,-22,22,-28,-15,15,-27,36,21,-26,-28,-21,-18,-26,-10,7,-13,8,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-8,-25,-12,-10,9,-22,9,-9,-5,-9,-5,-3,-22,-5,-3,-7,-4,-12,-3,28,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,31,-23,40,14,-31,-6,-2,-31,-2,-29,-25,20,-11,1,-8,13,0,-24,-39,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,67,-30,-20,4,-30,17,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,-1,14,-28,-16,0,-26,19,-23,-10,1,-9,20,25,-2,-8,-23,-23,-13,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-27,26,21,-32,-7,-5,-29,2,-21,-19,5,-9,7,-6,0,-9,-24,-30,-19,14;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-30,-22,7,-29,-20,26,-25,31,20,-24,-25,-18,-20,-22,-8,18,-19,0,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-28,-6,-11,-28,48,-13,-35,-9,-27,-17,1,-17,-13,-11,-2,-17,-27,-19,-23,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-36,-45,-37,-27,9,-19,-27,-17,-18,-17,-16,-36,-27,-18,-18,-36,-27,-26,133,27,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-25,26,15,-27,-7,11,-28,1,-22,-16,13,-11,7,-2,-1,-9,-25,-29,-12,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,21,-25,22,10,-26,-11,5,-28,12,-26,-17,20,-13,5,14,1,-6,-24,-31,-14,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-35,-46,-35,-26,6,-18,-27,-20,-18,-21,-20,-34,-28,-17,-16,-32,-25,-28,128,24,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-32,-25,0,-34,-15,31,-25,18,15,-21,-24,-19,-23,-18,-9,25,-24,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-19,-11,3,-17,-12,-2,-11,-7,-11,-8,-7,-11,0,-13,2,-5,-8,-19,-7,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-30,-2,11,-25,-19,-4,-23,14,-21,-11,-5,10,6,9,-5,-7,-21,-26,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-25,-6,-8,-24,27,-14,-30,-6,-24,-16,1,-16,-8,-4,4,-6,-22,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: M=-8,-2,-23,-5,0,-9,-19,-2,-6,-7,-5,-1,0,-17,0,-8,-6,-5,-9,-23,-4,-1;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-14,-21,-12,-9,-5,-19,-9,-13,-8,-7,-12,-5,-13,-19,4,-1,-3,-18,-14,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,8,-25,-2,-9,5,-15,19,-13,-6,-15,-9,19,-24,-5,-2,-5,-6,-20,-10,22,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-12,-28,-14,-9,21,-25,12,-7,-7,-4,-3,-10,-25,-8,-5,-15,-10,-13,9,44,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-24,-3,6,-21,-14,10,-18,2,-16,-7,-1,-14,8,1,0,-6,-14,-26,-6,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-23,3,8,-24,-4,-10,-20,-5,-18,-14,0,-5,1,-10,5,-1,-15,-29,-19,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-29,-7,-1,-22,-7,-11,-19,-9,-19,-14,-7,23,-5,-12,-3,-7,-21,-26,-20,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-27,-24,-16,22,-24,-8,-3,-14,3,0,-17,-23,-12,-8,-17,-11,-8,10,22,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-30,-13,-7,-19,-17,-9,-10,-13,-15,-9,-14,36,-10,-17,-7,-8,-15,-28,-16,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-24,-24,-14,-1,-25,-14,6,-18,14,8,-21,-14,-10,-13,-18,-9,1,-10,-2,-13;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-21,-4,-1,-21,-2,-7,-20,-6,-20,-14,4,-2,-4,-5,8,2,-17,-29,-18,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-2,3,-23,6,5,-22,-6,-2,-20,-5,-16,-12,0,-7,0,-9,3,-3,-17,-27,-12,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-11,3,-20,3,-1,-17,-13,5,-18,-1,-14,-7,4,-17,-1,4,-2,-4,-14,-28,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-20,-18,-15,2,-19,-9,1,-17,9,6,-10,-15,-13,-14,-10,0,-2,-20,0,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-26,-3,-2,-20,-4,-7,-20,-1,-23,-14,9,4,-3,-3,0,-3,-21,-27,-17,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-9,-25,-9,-6,-17,-6,-3,-15,-10,-14,-10,-4,0,-6,-8,1,-4,-15,-25,-11,-8;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-20,-11,-9,-12,-10,-16,-15,-11,-19,-14,-6,1,-9,-13,11,17,-11,-13,-7,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,6,-22,-1,-7,-19,-4,-5,-14,-4,-20,-12,15,-8,-6,-6,2,-1,-13,-31,-18,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-7,-25,-8,-7,-8,-19,38,-16,-12,-14,-4,1,-10,-3,-8,-6,-10,-15,-26,6,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,-16,-20,-12,-5,-8,-8,-6,-16,2,-2,-12,-17,-13,-17,-3,-4,-2,-19,-7,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,37,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00223;
//
ID   TNF_1_MP; MATRIX.
AC   MP00251;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   TNF family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.8965473; R2=0.0194214; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=125; N_SCORE=9.308; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-20; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=3,-4,-21,-5,-4,-13,-14,-7,-12,-7,-14,-11,-4,-2,-5,-11,3,2,-11,-20,-2,-6;
MA   /M: SY='N'; M=0,-3,-20,-8,-8,-10,0,-8,-16,-7,-15,-11,4,-18,-9,-6,3,1,-12,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=0,-12,-21,-15,-9,-6,-20,-8,-2,-10,5,3,-11,-19,-6,-8,-9,-3,-3,-21,-5,-8;
MA   /M: M=-2,-9,-20,-12,-7,-9,-11,-13,-12,-4,-6,-6,-4,-14,-8,-1,0,0,-9,-24,-10,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-13,-13,-5,7,-17,-10,2,-11,12,4,-11,-14,-9,-6,-10,-2,0,-11,0,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-21,-8,-7,-13,-13,-9,-9,-6,-6,-4,-4,-18,-3,1,-1,-1,-7,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-23,5,0,-23,12,12,-27,-8,-27,-16,20,-16,-1,-7,9,-5,-26,-31,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-24,-14,-16,-16,18,-14,-17,-16,-7,-7,-5,-21,-14,-10,-5,-6,-14,-23,-16,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-20,-19,-24,-19,-3,-15,-16,8,-15,4,13,-18,-18,-13,-13,-9,-5,11,-22,-8,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-24,-3,8,-12,-20,-3,-13,0,-9,-7,-5,-14,4,-2,-2,-3,-12,-21,-2,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-23,-13,11,-28,-12,8,-17,21,8,-22,-26,-14,-13,-20,-9,5,-11,12,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,10,-26,12,9,-29,-15,3,-22,6,-22,-11,8,-9,17,5,1,-4,-21,-29,-13,12;
MA   /M: SY='B'; M=-8,20,-25,19,6,-28,5,-5,-29,3,-27,-20,20,-14,-2,-3,3,-4,-25,-31,-20,2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-26,6,-3,-23,15,1,-29,2,-28,-17,22,-18,-4,0,1,-10,-27,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-25,-1,9,-27,-2,-4,-20,-2,-20,-10,4,-12,16,-3,7,-4,-21,-27,-16,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=4,-22,-16,-25,-19,-7,-24,-22,13,-10,4,4,-19,-23,-17,-7,-8,-2,22,-25,-10,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-1,-32,0,7,-28,-16,0,-23,3,-26,-14,0,21,8,-3,-5,-10,-27,-21,-15,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-4,0,2,-19,-17,-9,-24,1,-20,-14,-1,-16,4,4,2,-2,-17,-29,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,17,-24,24,11,-30,-12,-7,-26,-1,-23,-19,6,1,3,-9,5,1,-20,-32,-19,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-33,-24,16,-32,-23,24,-28,34,17,-27,-28,-23,-22,-24,-9,17,-17,3,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-24,-29,-23,33,-30,-6,9,-22,21,10,-23,-29,-20,-16,-23,-10,1,4,34,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,35,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-20,-18,25,-27,17,-1,-12,-2,-1,-16,-27,-11,-11,-14,-8,-7,15,59,-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,-12,9,-15,-12,-9,-14,-17,-10,-19,-9,-9,-6,-20,-12,-17,11,7,-3,-34,-15,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,17,-35,-20,12,-22,15,-20,-2,0,-11,42,12,-4,-11,-27,-21,-8,29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-16,-27,-25,-3,-16,-26,17,-22,12,7,-24,-27,-25,-20,-11,-2,27,-26,-10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-21,-14,-10,-4,-13,-9,-5,-12,2,-2,-11,-21,-7,-11,-5,1,-5,-16,5,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-27,65,-30,-15,2,-27,14,2,-21,-30,-34,-19,-21,-10,0,9,33,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-3,-12,-6,-14,-18,-6,-21,4,-16,-10,-4,-20,-1,14,0,-2,-13,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-26,-5,-9,-20,16,-13,-22,-11,-20,-13,-2,-14,-5,-10,1,-8,-17,-23,-18,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-19,-1,11,-25,-19,-3,-17,7,-17,-8,1,-15,17,9,-1,-5,-15,-27,-14,14;
MA   /M: SY='S'; M=1,-10,-10,-13,-10,-13,-5,-17,-13,-9,-13,-10,-7,-18,-11,-7,4,4,-2,-26,-14,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-9,15,-12,-6,-13,-18,-17,-21,-11,-19,-16,-8,-6,-12,-15,0,-3,-14,-30,-17,-9;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-22,-10,-8,-16,-10,-15,-7,-12,-15,-10,2,4,-9,-15,5,4,-9,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-20,1,-1,-20,-5,-5,-18,-5,-19,-9,6,-5,-3,-8,9,3,-15,-31,-16,-2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-22,-9,-5,-19,10,-13,-19,-10,-13,-10,-4,-16,-5,-10,3,-4,-15,-23,-15,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-5,-25,-5,2,-23,-14,14,-18,-5,-19,-8,-1,-2,10,-3,1,-6,-17,-28,-9,4;
MA   /M: M=-5,-11,-21,-12,-11,-2,-18,-13,-5,-9,-1,-2,-11,-19,-11,-7,-7,-3,-1,-18,-1,-11;
MA   /M: M=-9,-16,-23,-16,-10,-7,-21,-10,-5,-8,-3,-1,-12,-2,-8,-2,-8,-4,-4,-25,-9,-10;
MA   /M: M=-6,-9,-20,-12,-5,-5,-20,-1,-10,-4,-5,-3,-5,-18,-4,-2,-3,0,-7,-23,-3,-5;
MA   /M: M=-8,-4,-25,-2,-5,-18,-10,-9,-16,-4,-15,-10,-3,-5,-6,-2,-1,0,-13,-26,-11,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-24,-8,5,-17,-20,5,-12,-3,-8,-4,-7,-15,4,-2,-5,-5,-10,-19,-5,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00224;
//
ID   INTERFERON_A_B_D_MP; MATRIX.
AC   MP00252;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interferon alpha, beta and delta family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4838133; R2=0.0158881; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=575; N_SCORE=14.609; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,24,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-26,15,21,-28,-10,-3,-27,2,-22,-17,5,-5,11,1,5,-5,-24,-31,-18,15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-20,-3,0,-14,-12,2,-16,-5,-15,-10,9,-13,1,-1,8,4,-15,-30,-11,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-4,-21,-3,0,-17,-12,-14,-19,-6,-20,-16,-3,9,-6,-6,9,9,-14,-28,-17,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-24,-20,-11,-4,-22,-15,-4,-8,8,2,-15,-21,-8,4,-13,1,-5,-8,-3,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-14,-26,-16,-15,-11,4,-14,-13,-15,-7,-1,-12,-20,-13,-14,-10,-7,-10,1,-8,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-4,-29,-4,2,-20,-12,-5,-20,2,-20,-10,-1,9,2,3,-5,-6,-21,-25,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-24,5,11,-20,-16,2,-17,2,-12,-4,2,-14,6,7,-1,-5,-15,-29,-12,7;
MA   /M: SY='B'; M=-9,22,-21,22,1,-24,-3,-6,-24,-6,-22,-18,17,-14,-5,-9,8,8,-19,-34,-17,-2;
MA   /M: SY='P'; M=2,-12,-20,-14,-9,-15,-17,-19,-5,-14,-12,-9,-9,11,-10,-17,8,10,-4,-30,-16,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-20,-19,-15,-7,-23,1,6,-18,1,3,-9,-19,-11,-15,-2,3,6,-25,0,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-27,-18,6,-28,-19,16,-26,39,16,-27,-21,-18,-17,-26,-9,9,-20,-2,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=7,-1,-17,-6,-2,-18,-8,12,-18,-7,-16,-9,2,-12,-2,-7,8,7,-12,-26,-8,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-32,-25,4,-32,-25,30,-27,30,17,-28,-28,-23,-22,-21,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,2,-29,-1,3,-26,-8,-5,-30,30,-27,-12,9,-15,6,33,-6,-10,-22,-23,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-1,6,-25,-17,-9,-27,32,-27,-12,3,-11,7,26,0,-1,-18,-24,-12,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-18,-30,-18,-18,26,-29,27,-3,-10,-2,0,-17,-29,-8,-9,-19,-11,-12,25,75,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-10,-28,-12,-3,-8,-12,8,-21,-4,-16,-7,-5,-18,8,2,-7,-11,-21,-4,1,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-9,-7,-7,-22,-3,-7,-30,8,-23,-15,5,-22,-2,29,-3,-9,-21,-27,-18,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-35,-26,39,-28,27,21,-24,-24,-20,-25,-22,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-5,-22,-8,-4,-15,-19,20,-12,-5,-10,2,-2,-17,6,-1,-1,1,-10,-25,2,-1;
MA   /M: M=-7,-6,-22,-7,-6,-13,-21,-3,-6,-5,-2,-1,-5,-21,0,0,-8,-5,-3,-25,-7,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,9,0,-16,4,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-29,-2,13,-29,-21,2,-22,23,-21,-5,-1,-11,24,19,-6,-8,-21,-22,-9,17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,13,-25,17,24,-27,-9,1,-27,1,-21,-18,7,-9,6,-5,4,-6,-23,-31,-17,15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,5,-28,1,6,-26,-17,-1,-26,35,-27,-8,9,-13,8,26,-7,-9,-21,-24,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-28,12,17,-28,-9,-5,-29,21,-27,-16,10,-10,7,11,-2,-7,-24,-27,-16,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-30,-17,-17,23,-29,31,-4,-10,-3,0,-16,-29,-7,-9,-19,-11,-13,22,72,-17;
MA   /M: SY='S'; M=5,9,-13,7,1,-21,-1,-6,-21,-8,-30,-21,19,-12,0,-8,33,15,-14,-40,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,1,-26,6,0,-21,-13,-6,-21,-5,-21,-16,-2,10,-5,-5,1,-5,-17,-29,-16,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-20,107,-29,-29,-16,-30,-26,-27,-28,-18,-18,-20,-39,-28,-28,-11,-10,-10,-43,-20,-29;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-10,-19,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,3,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-25,16,32,-25,-19,-4,-23,5,-16,-12,1,-5,9,-3,2,1,-20,-30,-16,21;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-19,-27,-24,-4,-30,-5,23,-20,7,12,-19,-25,-19,-19,-12,-5,28,-27,-2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-29,-9,2,-22,-20,3,-28,26,-20,-9,0,-18,14,58,-8,-8,-20,-21,-9,4;
MA   /M: SY='V'; M=16,-22,-13,-26,-20,-5,-18,-22,12,-18,12,9,-22,-22,-18,-19,-7,-3,20,-23,-11,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,15,48,-32,-20,2,-28,11,-20,-16,0,-3,27,5,-1,-10,-29,-28,-17,37;
MA   /M: SY='I'; M=3,-24,-21,-32,-24,-4,-27,-23,29,-21,12,17,-19,-19,-17,-23,-11,-4,24,-22,-6,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-20,-25,-24,-15,2,-20,-5,-1,-6,8,19,-17,-23,-6,5,-20,-12,-4,-5,2,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-26,-7,-1,-20,-17,-4,-26,20,-19,-11,0,-17,5,47,-4,-4,-16,-22,-12,-1;
MA   /M: SY='N'; M=8,2,4,-7,-10,-17,-6,-12,-19,-11,-23,-18,10,-19,-9,-13,10,1,-15,-20,-17,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-13,-35,-26,44,-30,-21,8,-29,24,7,-24,-30,-31,-20,-23,-9,6,-6,14,-26;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-11,-17,-13,-9,-2,-15,-10,-7,-13,-6,-6,-5,-18,-6,-9,10,7,-5,-23,-2,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-15,-20,-19,-15,9,-20,1,-2,-17,-5,-2,-7,-21,-13,-12,0,-2,0,-19,6,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-18,-18,-22,-16,-1,-21,-20,12,-21,4,2,-10,-19,-14,-19,3,3,10,-27,-7,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00225;
//
ID   INTERLEUKIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00253;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukin-1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9876728; R2=0.0170203; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=498; N_SCORE=14.454; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=31; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-23,-3,4,-24,-19,-13,-24,30,-24,-10,0,-10,4,17,1,9,-14,-24,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,8,-25,6,2,-23,-12,-1,-27,14,-24,-16,13,-17,4,32,2,-4,-20,-28,-15,1;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,58,-30,-20,7,-30,21,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,4,1,21,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-15,-26,-21,-1,-27,-24,17,-21,18,8,-21,-23,-20,-19,-9,7,20,-25,-7,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-11,-24,-21,-21,29,-25,-6,5,-18,0,-1,-1,-26,-20,-15,-13,-7,-2,-4,22,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-17,-36,-17,-7,-12,-20,-7,-26,15,-21,-12,-13,-21,-1,21,-21,-17,-23,36,6,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-23,-4,10,-17,-13,-11,-13,-3,-14,-10,-2,-11,0,-3,5,3,-10,-28,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-26,17,22,-26,-18,-6,-23,8,-20,-16,6,-9,6,3,1,-1,-20,-30,-16,13;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-11,-24,-15,-8,-12,-23,7,6,-13,-4,6,-5,-17,-2,-12,-4,-5,1,-27,-2,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-28,-3,-10,-28,38,-13,-35,-1,-30,-18,9,-18,-10,-5,-1,-15,-28,-23,-24,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,5,-22,3,-2,-20,-7,-9,-18,-8,-22,-16,11,7,-5,-10,11,6,-18,-34,-20,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-1,-19,-7,-3,-17,-19,-13,-15,13,-16,-5,0,-11,-1,7,5,18,-8,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-15,-1,-8,-12,-14,-8,-6,-11,-10,-8,9,-18,-10,-10,8,13,-1,-34,-13,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-6,-23,-3,9,-5,-19,1,-13,-5,-14,-11,-6,-15,0,-8,4,0,-12,-13,15,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-15,-40,-30,77,-30,-20,-1,-30,9,-1,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,8,28,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-28,9,37,-27,-21,-5,-24,14,-19,-14,-1,-4,16,4,0,-3,-23,-27,-16,26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=33,-16,-10,-22,-15,-14,-9,-22,1,-13,-4,-4,-15,-16,-15,-20,5,1,13,-24,-17,-15;
MA   /M: SY='A'; M=27,-11,-16,-16,-4,-18,-9,-14,-7,-9,-3,-3,-11,-13,1,-14,2,-3,-4,-21,-15,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,4,-20,-19,17,-27,14,-13,-17,-8,-5,-10,-29,-14,-14,-14,-11,-13,-6,28,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-26,5,0,-27,20,-4,-29,1,-29,-18,22,-16,-1,-3,2,-10,-29,-28,-22,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-37,-40,-37,-27,10,-23,-27,-7,-23,3,-7,-37,-30,-20,-20,-37,-23,-17,93,20,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-26,61,-30,-8,1,-24,9,1,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,15,44,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='C'; M=20,-10,28,-17,-13,-20,-9,-20,-19,-16,-19,-16,-7,-19,-13,-20,13,3,-6,-35,-23,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-17,-5,0,-22,-9,-11,-19,7,-24,-13,2,-11,3,2,17,8,-10,-30,-16,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-28,-4,12,-25,-20,1,-14,-2,-9,-2,-7,0,22,-3,-5,-7,-20,-25,-11,16;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-25,4,23,-25,-16,-7,-16,0,-14,-11,-4,-6,9,-6,0,-7,-16,-26,-17,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=10,2,-14,3,18,-17,-8,-6,-14,1,-11,-11,-2,-3,4,-6,3,-2,-11,-17,-13,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-19,22,12,-20,-8,5,-21,3,-16,-13,8,-8,4,1,-1,-6,-18,-21,-8,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-26,-5,5,-25,-18,9,-19,14,-18,1,1,-14,23,15,-3,-7,-19,-22,-5,13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-34,-15,-5,-19,-22,-18,-12,-12,-12,-11,-20,45,-8,-15,-13,-7,-20,-16,-18,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-14,-14,-18,-14,11,-16,14,-15,-16,-10,-5,-4,-23,-13,-7,-6,-9,-12,-19,7,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,27,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=17,-6,-16,-13,-13,-19,14,-20,-19,-13,-16,-13,-3,-13,-13,-16,11,12,-9,-24,-19,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-16,7,1,-16,-1,14,-16,0,-18,-9,24,-12,6,2,3,-4,-20,-22,-8,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-12,-8,-6,-5,-13,-8,-2,-6,-4,0,0,-10,-2,-4,3,10,-2,-17,-5,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-32,-7,0,-25,-15,-9,-26,14,-26,-15,-4,18,1,25,-6,-8,-23,-25,-18,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-1,-4,-30,43,-15,-36,-9,-28,-19,1,-16,-9,-13,0,-15,-28,-23,-26,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-3,-26,0,1,-20,2,-11,-19,-6,-8,-9,-4,-10,-4,-8,-8,-11,-18,-24,-16,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-31,-9,1,-28,-12,-9,-19,-5,-20,-11,-11,30,6,-8,-4,-9,-23,-26,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-2,7,-14,11,-3,-20,-9,-12,-15,-11,-17,-14,2,-16,-8,-14,9,1,-6,-34,-17,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-26,-29,-22,-3,-28,-19,24,-17,9,18,-16,-21,-12,-18,-17,-8,15,-9,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-13,-13,-15,-8,-23,-21,4,-14,-4,-3,-6,-16,-15,-14,8,28,12,-30,-10,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,34,-23,42,10,-31,-11,-5,-30,-3,-24,-23,16,-11,-3,-10,6,4,-21,-36,-18,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-24,-29,-19,47,-27,-18,-8,-11,-2,-4,-16,-16,-27,-9,-17,-10,-7,0,16,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-28,-2,15,-35,-20,6,-20,12,-20,-2,0,-11,47,14,1,-5,-26,-21,-10,31;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,47,-30,23,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-16,-18,-12,-2,-18,-16,4,-22,18,4,-14,-22,-12,-16,-2,2,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00226;
//
ID   INTERLEUKIN_6_MP; MATRIX.
AC   MP00254;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukin-6 / G-CSF / MGF signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7854285; R2=0.0168830; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=616; N_SCORE=16.175; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-17,-13,-21,-14,-8,-13,-20,3,-17,7,0,-16,-19,-14,-18,0,0,9,-25,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-30,8,31,-31,6,-4,-31,1,-23,-17,0,-7,14,-4,0,-13,-30,-26,-21,23;
MA   /M: SY='H'; M=-12,14,-25,6,-2,-20,-11,28,-19,-6,-24,-12,26,-4,-1,-5,0,-7,-24,-35,-9,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-4,27,-19,20,3,-24,-3,1,-23,0,-29,-20,35,-15,0,-3,15,3,-23,-38,-19,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-27,-17,4,-29,-20,14,-27,38,14,-29,-12,-19,-20,-27,-10,4,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-10,10,-27,3,-5,-24,12,23,-30,-2,-27,-13,22,-19,-2,-2,-1,-12,-29,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-36,-13,-4,-26,-21,-21,-13,-11,-24,-16,-21,72,-13,-20,-10,-9,-18,-30,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-31,-1,16,-30,-20,-3,-26,27,-24,-9,-2,-11,25,20,-7,-11,-25,-11,-9,21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-12,-18,-12,2,-15,-7,15,-11,16,23,-13,-13,-6,-10,-13,-6,8,-11,0,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-17,-14,-1,-21,-10,-15,-9,-7,-11,-8,-8,-5,0,-14,5,1,-6,-22,-17,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-4,-31,3,23,-28,-14,-8,-26,2,-25,-19,-5,24,5,0,0,-7,-26,-30,-22,12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-24,-9,0,-11,-22,-11,-7,6,6,1,-6,-19,-4,2,-16,-9,-9,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,36,-24,50,14,-34,-7,-3,-34,-3,-30,-27,17,-10,0,-10,12,-1,-24,-40,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-25,-6,-9,-29,40,-13,-32,-13,-29,-17,2,-16,-3,-13,9,-9,-25,-25,-25,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-17,-21,-22,-16,32,-21,3,-10,-20,-7,-6,-9,-17,-20,-14,-4,-5,-9,-8,17,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-25,-1,11,-32,-14,-1,-21,9,-25,-9,1,-2,30,5,9,-1,-23,-27,-14,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-21,-4,4,-25,-14,-5,-20,2,-22,-11,1,-4,16,7,13,10,-17,-29,-15,9;
MA   /M: SY='G'; M=16,-9,-23,-13,-16,-26,44,-19,-30,-16,-24,-17,-3,-16,-16,-19,5,-11,-20,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-21,-33,-25,44,-30,-13,8,-25,20,7,-24,-30,-28,-18,-22,-9,5,2,27,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-24,11,9,-29,-9,10,-20,4,-26,-11,34,-16,26,4,6,-4,-30,-31,-16,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-24,-8,6,-22,-18,-3,-10,-2,-3,0,-4,-15,20,1,-5,-8,-16,-22,-11,13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-24,13,31,-25,-17,-6,-23,2,-16,-14,0,-5,8,-6,4,2,-19,-29,-17,20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-19,-12,-14,-15,-7,-20,-2,-15,-8,-5,-6,-16,-11,-16,4,11,3,-27,-13,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-9,-17,-13,-12,-7,-20,-14,3,-13,5,5,-7,-19,-10,-10,-2,9,4,-28,-9,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,11,-31,-20,2,-26,25,-22,-6,0,-13,32,35,-6,-10,-24,-20,-10,20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-36,-26,2,-36,-27,38,-29,27,18,-22,-22,-19,-26,-21,-7,23,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-12,-9,-7,-15,-20,17,-18,-6,-15,-7,2,-16,-2,3,5,13,-12,-30,-3,-7;
MA   /M: SY='S'; M=14,-4,-13,-9,-8,-18,3,-16,-16,-12,-20,-15,2,-12,-7,-14,23,17,-7,-31,-18,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-12,-25,-19,11,-27,-1,5,-22,17,12,-19,-27,-16,-16,-18,-9,4,-20,4,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-5,-24,0,26,-17,-20,-9,-13,-5,2,-7,-10,-10,4,-9,-7,-9,-14,-26,-14,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,51,-30,3,0,-18,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,22,59,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-1,-30,0,16,-32,-20,27,-24,8,-20,-3,2,-13,40,15,-3,-12,-29,-23,-4,26;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-24,-10,-16,-11,3,-18,-3,-18,-6,-1,-8,-20,-17,-19,-6,-10,0,-24,-13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-19,-24,-19,-16,15,-25,7,2,-16,9,3,-17,-27,-11,-12,-14,-6,-5,3,39,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,13,23,-33,-4,0,-29,6,-24,-15,5,-10,21,4,-1,-11,-29,-26,-18,22;
MA   /M: SY='Y'; M=11,-15,-20,-21,-15,7,-16,3,-5,-13,-4,-4,-13,-20,-11,-15,-6,-6,-5,-1,24,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-23,7,-30,-21,24,-27,38,21,-29,-29,-21,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-6,-24,-7,8,-25,-17,-4,-15,6,-10,-3,-6,-13,21,5,-2,-7,-16,-22,-11,14;
MA   /M: SY='N'; M=-4,14,-24,5,-6,-24,17,-3,-27,-1,-27,-18,26,-19,-5,3,3,-8,-26,-29,-21,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-7,-27,-12,-3,-11,-24,-11,3,-1,-1,1,-1,-18,-4,-2,-12,-8,-4,-23,-6,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-19,-22,-17,22,-21,-9,0,-20,7,0,-14,-24,-17,-15,-5,-1,-2,-8,18,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-34,0,19,-30,-20,-8,-24,7,-25,-16,-9,36,10,1,-6,-10,-28,-27,-21,12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-24,14,15,-28,8,-6,-29,-3,-26,-21,12,-11,1,-8,9,-5,-25,-32,-22,8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,9,-24,10,-1,-17,-10,9,-16,-12,-5,-8,9,-20,-5,-10,-6,-8,-17,-31,-9,-4;
MA   /M: SY='K'; M=6,1,-22,-2,8,-25,-9,-11,-22,12,-20,-12,2,-10,4,2,3,1,-16,-24,-16,6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-29,2,16,-26,-12,-11,-24,3,-24,-17,-2,21,1,-5,0,-1,-24,-29,-21,7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-19,5,-2,-17,-13,-6,-14,-5,-11,-10,15,-16,-1,-3,4,8,-14,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-18,-17,-15,-6,-24,-21,8,-12,11,4,-17,-22,-16,-13,-10,0,13,-25,-8,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00227;
//
ID   INTERLEUKIN_7_9_MP; MATRIX.
AC   MP00255;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukin-7 and -9 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6742892; R2=0.0168831; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=620; N_SCORE=16.132; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,1,-32,0,3,-28,-15,-10,-23,10,-30,-17,5,33,-2,0,-5,-8,-27,-29,-22,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,2,-16,-4,-7,-6,-12,-3,-13,-8,-18,-13,8,-16,-5,-8,17,17,-11,-22,5,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-23,-18,-27,-20,35,-23,-18,1,-25,12,1,-16,-25,-24,-18,-8,-3,1,-11,9,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-21,6,20,-25,-11,-7,-25,11,-27,-18,5,-7,8,3,16,4,-18,-32,-18,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-4,39,-3,19,-25,-25,-14,-30,-8,-20,-20,-9,-18,-3,-14,-5,-10,-21,-39,-25,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-27,20,42,-27,-14,3,-27,7,-23,-20,18,-6,14,0,3,-7,-30,-33,-20,28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-5,-28,41,-28,-8,0,-10,21,25,-8,-10,-22,-20,-10,17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-4,-25,-3,-1,-23,-12,-13,-19,-9,-28,-19,1,35,-6,-13,11,7,-20,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-25,44,-31,-27,-6,-31,-27,2,-29,9,0,-24,-33,-26,-26,-17,-9,8,-35,-15,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,18,-25,9,5,-25,-11,-1,-25,27,-30,-15,27,-15,5,16,-1,-5,-25,-29,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,11,42,-35,-20,5,-25,10,-20,-11,0,-5,38,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-21,-5,6,-26,-20,-4,-15,1,-15,-5,0,-10,28,1,9,17,-16,-25,-10,17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-23,-11,-3,-17,-20,-8,-14,19,-12,6,-5,-14,3,18,-6,4,-9,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='K'; M=17,-5,-21,-9,1,-25,-11,-15,-21,23,-21,-10,-5,-10,1,7,-1,-5,-11,-20,-15,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-21,-9,-9,-18,25,-11,-19,-12,-10,-6,-4,-15,-3,-11,-4,-12,-17,-15,-15,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=0,25,-21,31,6,-29,-10,-9,-26,-5,-21,-21,9,-10,-5,-12,7,6,-16,-33,-18,1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-21,-26,-16,2,-25,-20,12,-25,33,12,-26,-13,-18,-20,-23,-9,4,-21,-6,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-11,60,-19,-19,-18,-21,-23,-23,-21,-20,-18,-9,-26,-19,-21,8,11,-8,-43,-23,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-21,-10,-5,-17,-14,-9,-13,2,-18,-10,1,-15,1,18,11,4,-8,-29,-13,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-30,0,15,-31,1,-2,-29,8,-22,-12,0,-12,20,15,-2,-12,-28,-22,-17,16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-25,-4,16,-19,-25,-13,-7,2,-10,-7,-5,-8,2,-4,-1,4,-8,-26,-12,8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-25,-40,-30,37,-35,-25,27,-30,15,11,-20,-25,-29,-25,-20,-10,16,-6,14,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,15,-35,-20,-1,-25,32,-25,-5,0,-10,33,21,-5,-10,-25,-20,-10,24;
MA   /M: SY='T'; M=-5,0,-19,-5,-1,-19,-20,-15,-19,17,-19,-10,0,-10,-1,8,6,23,-9,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-9,56,-14,-5,-20,-25,-21,-25,-16,-18,-18,-11,-24,-14,-19,-1,4,-12,-41,-23,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-19,-41,-17,0,-8,-20,-19,-25,3,-22,-18,-22,-19,-4,-4,-24,-21,-28,70,9,1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-20,-3,-9,-11,-9,5,-2,-5,-7,17,23,-20,0,-5,-4,-5,-12,-31,-11,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,10,-30,-20,-3,-28,36,-25,-8,0,-12,22,34,-8,-10,-22,-20,-10,15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-30,-26,-21,-11,-10,-21,11,-14,-1,4,-11,-20,-13,-5,-13,-12,5,-20,-9,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-23,-11,-4,-25,-9,11,-16,27,24,-21,-23,3,-11,-21,-10,1,-20,-2,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-29,-8,2,-22,-20,-5,-23,34,-19,0,-3,-15,9,39,-11,-10,-16,-20,-9,3;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-8,-15,-28,54,-18,-35,-18,-30,-20,2,-18,-15,-18,9,-11,-25,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-22,-10,-4,-18,-18,-12,-12,10,-17,-8,-1,-14,0,14,5,6,-7,-26,-11,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00228;
//
ID   AKH_MP; MATRIX.
AC   MP00256;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adipokinetic hormone family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9530720; R2=0.0070956; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=718; N_SCORE=7.045; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=641; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-50; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-65,-73,-71,-55,-78,-76,-31,-68,22,-44,-66,-72,-71,-72,-55,69,75,-85,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-69,-84,-78,-46,-86,-76,40,-77,64,-34,-81,-81,-74,-77,-73,-58,59,-76,-56;
MA   /M: SY='M'; M=70,-64,-75,-67,-60,-62,-68,-43,-67,22,71,-69,-72,-63,-69,-53,-55,32,-76,-62;
MA   /M: SY='L'; M=26,-67,-81,-73,-47,-77,-71,-33,-75,75,-34,-79,-80,-69,-74,-67,-59,33,-74,-57;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-67,-83,-77,-49,-85,-79,-23,-76,48,-37,-80,-81,-75,-76,-70,-54,87,-82,-59;
MA   /M: SY='V'; M=27,-66,-80,-73,-54,-76,-79,-26,-73,23,-42,-76,-77,-73,-74,-62,-53,86,-83,-62;
MA   /M: SY='V'; M=54,-66,-78,-71,48,-69,-74,-37,-71,22,-46,-73,-76,-71,-73,-58,-55,58,-70,-52;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-66,-78,-73,-55,-80,-75,-26,-70,-40,71,-70,-74,-71,-72,-60,42,86,-86,-60;
MA   /M: SY='C'; M=53,77,-78,-71,-54,-69,-71,-47,-72,63,-42,-73,-78,-68,-73,-60,-59,-47,-76,-63;
MA   /M: SY='M'; M=70,-64,-75,-67,-60,-62,-68,-43,-67,22,71,-69,-72,-63,-69,-53,-55,32,-76,-62;
MA   /M: SY='A'; M=91,-62,-65,-59,-75,-49,-67,-66,-62,-69,-62,-59,-66,-57,-66,37,-49,-54,-77,-70;
MA   /M: SY='C'; M=-58,77,-73,-70,-53,-73,-68,-47,-70,63,-43,-65,-76,-66,-72,35,42,-49,-79,-61;
MA   /M: SY='C'; M=28,77,-69,-67,-66,-62,-72,-47,-66,-58,-57,-60,-73,-63,-70,63,-46,58,-86,-68;
MA   /M: SY='S'; M=28,-69,-59,-52,-76,-59,-58,-71,-47,-71,-64,-50,-65,57,43,63,42,-63,-79,-65;
MA   /M: SY='A'; M=91,78,-70,-63,-75,-53,-71,-67,-65,-67,-62,-63,-70,-62,-69,-44,-53,-54,-79,-73;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-85,-54,-34,-90,-67,-47,-76,-39,-71,-57,-50,-66,131,-40,-48,-62,-77,-72,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-68,-84,-77,-44,-85,-73,-27,-77,75,-32,-82,-82,-73,-75,-73,-58,59,-76,-56;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-65,-41,-58,-73,-55,-49,-69,-51,-76,-66,108,-68,-53,-59,-41,70,-67,-93,-70;
MA   /M: SY='F'; M=-75,-72,-87,-83,120,-83,-65,-49,-78,-41,-51,-77,-86,-87,-75,-74,-67,-54,-40,27;
MA   /M: SY='S'; M=-45,-63,-56,-58,-71,-56,-62,-67,-57,-71,-66,-45,-62,-53,-63,88,76,-59,-85,-66;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-81,-64,-56,-81,-65,-67,-72,-58,-79,-68,-64,110,-61,0,20,26,-71,-80,-77;
MA   /M: SY='N'; M=-55,-74,46,-58,-77,64,-58,-82,-59,-83,-74,72,-69,-57,-66,22,-56,-80,55,-69;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-48,-75,-63,-74,-82,100,-70,-89,-68,-85,-75,-50,-68,-65,-76,12,-64,-82,-74,-77;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='T'; M=-67,-78,-63,-62,-81,-76,-67,-78,40,-79,-72,27,-73,-58,46,-54,72,-71,-91,-74; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-74,-90,-70,-58,-83,-84,-59,-89,-30,-82,-71,-63,-82,-47,110,-68,-72,-83,-82,-69; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=47,-77,38,-63,-55,-66,-59,-73,-68,-72,-68,-62,-78,-63,-71,29,-60,-68,-62,81; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=75,-70,-79,-71,-70,-65,-78,-54,-73,14,-57,-74,-77,-70,-76,-56,-60,25,-83,-73; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=20,-82,66,-60,-90,68,-71,-91,-70,-88,-82,-53,-74,-68,-77,-56,-68,-83,-89,-81; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=46,-90,37,-65,-97,-73,-80,-87,-76,-91,-83,-73,74,-75,-84,-66,-70,-81,-96,-90; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-74,-86,-66,-75,40,-73,-69,-83,-72,-85,-80,72,45,-73,-79,28,-64,-85,-88,-70; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=75,-78,-82,-77,-92,24,-84,-84,-78,-85,-78,-74,-81,-75,-83,-57,-69,-71,-90,-87; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-75,-92,95,-50,-99,-75,-69,-98,-70,-98,-95,-51,-81,-68,-77,28,-66,-94,-113,-84; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-65,70,-62,-58,-82,-66,-66,-75,-62,-82,-70,43,113,-66,-73,-60,-57,-77,-84,-81;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-72,-90,-90,-92,-81,56,-79,-72,-85,-66,99,-76,-87,-80,-88,-76,-81,-76,-91,-79; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=52,-91,-94,-90,-103,-84,-99,-93,-91,-96,-91,-86,-94,-90,-97,-69,39,-81,-109,-99; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-85,-90,-98,-99,92,27,-86,-74,-94,-66,-73,-86,-98,-100,-94,-84,-85,-77,-64,-45; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-61,-71,-81,-77,65,-82,-64,-32,-73,-43,-46,-76,-82,-75,-72,-68,-58,74,-52,77;
MA   /I: I=-5; E1=0; IE=-105; DE=-27;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00229;
//
ID   BOMBESIN_MP; MATRIX.
AC   MP00257;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bombesin-like peptides family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2329721; R2=0.0150591; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=90; N_SCORE=6.578; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-26,1,9,-28,28,-12,-33,-9,-27,-20,2,-12,-3,-12,8,-9,-26,-27,-25,3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,9,31,-29,-14,-1,-24,4,-23,-15,3,-6,23,-1,13,-1,-24,-31,-18,27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-28,26,0,-25,5,-10,-25,-12,-10,-15,3,-17,-10,-15,-7,-12,-20,-30,-18,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-2,26,-21,33,7,-29,-10,-9,-27,-4,-21,-21,9,-10,-4,-12,7,7,-17,-34,-18,1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-19,-22,-19,-11,-8,-26,-16,0,4,7,4,-17,-23,-9,10,-16,-8,7,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-14,-3,-5,-13,-7,-9,-10,-13,-10,-10,10,-17,-5,-10,17,9,-9,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-12,16,-28,14,2,-24,-17,-7,-14,10,-20,-11,16,-14,-1,1,-5,-8,-15,-30,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=2,-4,-25,-4,12,-24,-15,-7,-25,21,-20,-12,-2,-11,7,25,-3,-8,-17,-22,-14,8;
MA   /M: SY='N'; M=-12,0,-22,-11,-10,7,-16,-4,-7,0,-8,6,9,-21,-8,-2,-9,-7,-11,-19,-1,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-21,-15,-3,-28,-8,8,-5,-1,4,-16,-24,-4,3,-13,-7,9,-12,11,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-16,-27,-14,-6,-14,-20,-11,-13,0,-4,-5,-11,2,-4,16,-9,-6,-13,-25,-13,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-29,-9,6,-17,-21,2,-21,13,-16,-4,-3,-16,28,29,-6,-10,-22,-16,-5,16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-14,-26,-14,-17,-21,24,-17,-22,-6,-19,-11,-6,-22,-14,5,-5,-13,-10,-22,-20,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,14,-27,7,7,-29,-11,4,-20,2,-26,-13,23,4,20,0,3,-6,-30,-31,-18,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-11,-26,-11,2,-18,-24,16,-7,-8,6,7,-9,-19,21,-3,-13,-12,-15,-22,-1,11;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-15,-27,-24,-3,-29,-25,21,-15,6,7,-21,-25,-22,-10,-8,4,33,-27,-9,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-25,0,0,-20,-15,73,-28,-10,-22,-5,10,-18,8,-2,2,-10,-25,-32,10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,57,-30,-20,7,-30,23,7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,8,30,-29,-14,-1,-24,4,-23,-15,3,-6,24,-1,13,0,-24,-31,-17,27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,49,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,37,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='T'; M=-6,16,-16,16,0,-20,-17,-14,-20,-7,-16,-16,6,-10,-7,-10,14,31,-10,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-19,0,-8,-4,-14,3,-12,-6,-16,-12,20,-19,-6,-6,6,14,-15,-19,9,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,7,19,-23,-15,3,-27,16,-23,-16,15,-14,11,29,-2,-7,-26,-28,-16,13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-33,-7,6,-29,-20,-2,-24,13,-23,-9,-5,12,21,27,-7,-10,-26,-23,-15,10;
MA   /M: SY='S'; M=23,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,30,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-24,31,21,-28,-16,-6,-28,-1,-21,-21,8,-7,2,-7,6,9,-20,-34,-17,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-27,-1,24,-23,-20,3,-11,4,-7,11,-6,-9,24,-1,-6,-10,-17,-24,-11,24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00230;
//
ID   CALCITONIN_MP; MATRIX.
AC   MP00258;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calcitonin / CGRP / IAPP family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4250708; R2=0.0142380; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=356; N_SCORE=9.484; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-26,6,35,-19,-21,-6,-16,-2,-3,-10,-7,-8,8,-6,-4,-7,-18,-28,-15,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,5,-30,7,17,-37,-19,5,-24,16,-23,-5,2,-11,44,14,-2,-10,-28,-22,-11,30;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=7,-2,-13,-3,10,-12,-8,-5,-8,2,-6,-1,-4,-5,3,-4,-1,-4,-7,-14,-9,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,1,-11,-1,8,-12,-10,-9,-11,-2,-8,-8,-1,-4,0,-6,7,13,-6,-18,-10,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-4,-16,-4,-1,-14,-9,-8,-12,-3,-16,-11,-1,18,-3,-2,4,4,-12,-20,-14,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-17,-6,8,-10,-14,-10,3,-6,-2,-2,-7,-8,-2,-9,-5,-6,1,-17,-8,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-25,-6,0,-25,20,-13,-28,-4,-22,-15,-1,-14,-5,-3,3,-6,-20,-24,-21,-3;
MA   /M: SY='S'; M=8,5,-16,3,9,-23,-5,-6,-21,-3,-26,-18,11,-10,5,-6,23,8,-16,-34,-19,7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-17,3,-5,-23,22,-11,-26,-11,-26,-18,6,-12,-6,-12,19,2,-17,-29,-21,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-13,-11,-8,-6,-13,-13,-3,-15,4,-3,-4,-16,-8,-12,7,11,-1,-27,-9,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-20,27,7,-26,-2,-3,-27,-1,-25,-20,16,-11,0,-2,11,0,-20,-32,-17,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-9,-22,-10,-9,-16,-10,11,-12,-9,-16,-6,-1,-14,-5,-2,3,-4,-7,-30,-8,-9;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,-26,-11,0,-25,-18,-12,-11,-5,-17,-8,-8,17,9,-7,1,2,-15,-25,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=10,-16,-17,-22,-14,-11,-16,-15,2,-5,-2,7,-13,-18,-8,0,-4,-4,9,-23,-11,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,6,-23,9,14,-30,-8,6,-25,-1,-23,-13,5,-10,18,-4,10,-3,-22,-30,-14,15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=7,-2,-13,-3,1,-17,-6,-9,-16,11,-18,-10,1,-7,1,4,8,2,-9,-19,-11,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,24,2,-22,-1,8,-22,0,-30,-21,54,-19,0,-1,11,0,-29,-40,-20,1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-14,-18,-14,-2,-24,-20,2,-18,15,2,-12,-18,-14,-14,0,25,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=14,-22,-11,-27,-22,-6,-19,-23,16,-16,5,10,-22,-22,-20,-19,-5,-1,29,-26,-12,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-14,-18,-14,-2,-24,-20,2,-18,15,2,-12,-18,-14,-14,0,25,4,-26,-6,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,13,-33,-20,32,-24,9,-21,-1,3,-13,39,12,-4,-13,-29,-23,-2,24;
MA   /M: SY='R'; M=-19,11,-30,16,11,-26,-16,0,-32,19,-23,-17,8,-15,8,39,-5,-10,-24,-27,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,14,-30,-20,19,-30,48,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,5,-16,-6,-6,-19,-5,7,-16,-8,-17,-11,11,-14,-4,-11,7,0,-12,-27,-13,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-26,17,2,-28,6,-2,-29,10,-30,-19,27,-16,-1,3,1,-8,-27,-31,-19,1;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-35,-26,52,-30,-18,7,-29,24,7,-24,-30,-31,-19,-24,-10,3,0,21,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-18,-9,-6,-26,14,1,-19,21,12,-15,-24,0,-10,-20,-12,-6,-22,3,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-13,-12,-11,-12,-17,-17,-5,-8,-12,-8,-4,-16,-9,-3,14,20,7,-32,-13,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-16,-27,-20,-11,17,-24,5,-18,3,-9,-5,-7,-24,-8,27,-14,-11,-14,-7,14,-11;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-18,-3,0,-22,-6,-13,-20,-10,-29,-20,1,17,-3,-13,26,13,-15,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-26,-5,-7,-27,28,-10,-31,-5,-27,-16,6,-17,-1,1,7,-8,-25,-25,-22,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-22,-7,-13,-18,13,-5,-18,-12,-17,-7,9,-17,-10,-12,4,4,-16,-27,-15,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-19,-3,-12,-16,-1,-8,-6,-10,-13,-5,14,-20,-10,-12,1,-4,-5,-31,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-18,-28,-24,11,-19,-23,12,-24,14,6,-20,-25,-24,-20,-13,-1,14,-18,-2,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-7,-11,-29,41,-17,-36,0,-30,-17,1,-17,-11,-6,0,-15,-26,-21,-24,-11;
MA   /M: SY='P'; M=12,-3,-20,-5,-5,-22,-9,-15,-13,-9,-19,-14,-2,13,-9,-16,6,-1,-9,-30,-22,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,-12,2,-5,-9,-7,-4,-1,-5,-8,-5,12,-12,-5,-7,1,-1,-2,-20,-9,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-18,-12,-21,-15,29,-18,-12,5,-18,16,5,-14,-18,-19,-12,-14,-6,3,-2,10,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-8,-12,-11,-5,-12,-14,6,-10,-2,0,-11,-7,-11,-10,1,2,14,-19,-8,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-23,-6,0,-17,-11,-12,-12,-6,-18,-12,-11,50,-6,-12,-4,-5,-17,-18,-17,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-18,-6,-3,-18,5,-17,-21,-10,-17,-14,0,-11,-9,-11,12,23,-12,-27,-17,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00231;
//
ID   GASTRIN_MP; MATRIX.
AC   MP00259;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gastrin / cholecystokinin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1418517; R2=0.0066163; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=756; N_SCORE=7.140; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=659; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-44; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-78,73,-47,19,4,-56,-72,13,-7,-65,25,-72,-52,59,-58,-60,-72,-79,-60;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-79,-82,-9,-82,25,-94,-78,-48,-87,70,-45,-89,-1,-82,-85,-86,-74,-55,-79,-60; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-10,-66,-59,-61,-71,10,-63,-65,-60,-72,-67,5,-66,-53,-64,92,-42,7,47,-64;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-77,-52,-1,-79,-69,22,-79,99,-77,-65,5,-63,35,-28,-55,-58,-76,-74,-64;
MA   /M: SY='K'; M=-16,-75,-54,-3,-78,-15,-57,-79,91,-78,-67,5,-64,-42,25,14,-55,-73,-75,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-81,-2,18,-82,5,-51,-15,-5,-68,18,3,-66,110,-46,-51,-61,-71,-75,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-77,20,-66,-82,93,-67,-88,-61,-84,-74,-49,-69,-62,16,-50,-66,-81,-76,-75;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=0,-91,-69,-61,-88,-71,44,-80,-67,-86,-73,-3,110,-68,-77,-65,-64,-82,-87,-80; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-93,-91,-79,-52,-79,-88,-66,-72,-6,15,-6,-3,-73,-11,-78,-13,-22,152,-43; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=0,-79,-77,-14,-64,-82,61,-51,-69,21,80,-72,-81,3,-10,-71,-67,19,-87,-61; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-22,-82,-2,90,-83,-72,-54,-81,-41,-76,-69,-56,22,53,28,-55,-61,-76,-79,-70;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-68,-84,-7,86,-76,-84,-63,1,-15,2,34,-66,-67,-48,-62,-67,-67,-66,-85,-73; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-86,-46,81,-88,-77,38,-88,-13,-81,-73,-7,-67,59,-11,-60,-67,-83,-86,-72; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-62,-77,59,80,54,-71,-56,-74,-51,-68,-69,-52,-64,-47,-59,16,-58,-71,-72,-55;
MA   /M: SY='D'; M=52,-74,63,45,-80,-62,35,-77,-48,-74,-68,-50,-65,0,33,-51,-58,-69,-84,-67;
MA   /M: SY='D'; M=68,-70,83,-11,-16,-56,-60,-73,-58,-73,-69,-5,-67,-56,-65,-48,-55,-64,-84,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-70,-74,-19,-78,-37,-56,-65,-53,-50,-72,-83,-61,-62,-66,-65,-62,-27,135;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-14,-74,-83,102,-70,-91,-69,-86,-76,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='W'; M=-74,-94,-82,-71,-47,-73,96,-77,-68,-70,-67,-73,-76,-63,-67,-74,-81,-87,164,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-82,105,-36,-84,-68,-53,-85,-43,-82,-77,-40,-69,-50,65,-57,-60,-81,-93,-68;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-71,-88,-84,122,-83,-68,-49,-79,-40,-51,-77,-86,-90,-76,-74,-67,-54,-40,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,12,-75,-64,-56,-75,-40,114,-61,-65,-76,-76,-63;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-82,-63,-52,-76,-75,-52,-82,-25,-75,-64,-55,-75,-40,114,2,-63,-75,-76,-63;
MA   /M: SY='S'; M=0,-64,-58,-58,-72,-51,-61,0,-58,-72,-66,-47,-64,-50,-63,103,-38,-60,-81,-66;
MA   /M: SY='A'; M=89,-62,-67,-61,-72,-52,-69,3,-63,-64,-59,-60,-66,-59,-67,9,12,-49,-77,-69;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='E'; M=-61,-80,68,93,-82,-73,-55,-75,-46,-74,-72,-50,-60,-41,-56,-57,-59,-3,-86,-72;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-78,-62,31,-65,68,-65,-71,-65,-73,-68,-59,-71,-62,-71,-55,9,-3,-68,52; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-78,101,50,-85,-64,-53,-83,-51,-81,-78,22,-64,-49,-60,-54,-57,-78,-94,-71;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-66,-87,16,-44,-62,-73,-48,-74,-49,-70,-60,-56,-74,111,-50,-56,-66,-77,-60,72; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=2,-78,-59,12,-68,-67,90,-80,-52,-74,-65,-54,-72,-50,42,51,-58,-75,-79,32; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=3,-77,-61,-57,-70,-60,-60,-71,-60,-77,-67,23,98,-59,-68,51,-51,-71,-73,31;
MA   /I: I=-6; E1=0; MI=-29; IE=-29; DE=-29;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00232;
//
ID   GLUCAGON_MP; MATRIX.
AC   MP00260;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucagon / GIP / secretin / VIP family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2141290; R2=0.0182086; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=199; N_SCORE=9.828; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=16; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-25,-15,-8,-15,-23,-8,-14,16,-12,-5,-8,-23,-1,46,-10,-7,-1,-23,-10,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-22,12,11,-22,-8,-6,-20,-3,-15,-14,4,-12,2,-3,4,-4,-16,-29,-16,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-11,-28,-11,-9,7,-14,4,-20,-13,-16,-12,-7,-21,-11,-9,-7,-10,-19,12,8,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,2,-14,-11,-15,-10,-11,-14,-18,-9,-9,-10,-4,-12,-17,0,-3,-11,-32,-17,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=9,-5,-17,-7,4,-19,-7,-11,-11,-6,-15,-6,-3,-11,-1,-10,12,2,-6,-29,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,3,13,-17,-16,-8,-17,1,-12,-11,3,-5,0,-4,-2,-5,-18,-28,-15,6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,-18,-12,-7,-18,-6,-18,-7,-12,-14,-10,-9,-2,-12,-16,6,0,2,-29,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-26,0,6,-24,-14,-6,-21,4,-18,-12,-3,5,2,-1,-1,-3,-18,-27,-15,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-22,-6,-3,-19,-10,-12,-9,-8,-18,-8,1,2,-4,-12,9,2,-9,-31,-17,-5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-14,-21,-17,-14,-11,0,-19,-10,-13,-10,-8,-10,-4,-16,-16,-3,-7,-5,-22,-16,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=0,-5,-27,-2,13,-25,-9,-12,-18,-5,-19,-14,-7,14,1,-11,0,-5,-18,-26,-20,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-26,-2,10,-10,-17,-9,-17,-5,-15,-13,-5,17,-3,-7,-3,-6,-19,-22,-13,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-17,-23,-18,-9,-6,-21,-9,-3,1,8,9,-12,-21,-4,16,-15,-8,-3,-19,-5,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: M=-2,-9,-23,-11,-7,-13,-4,-11,-9,-9,-10,-2,-6,-16,-6,-8,0,-3,-7,-22,-9,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-30,-6,4,-25,-19,-5,-28,28,-24,-11,-2,-3,10,41,-7,-9,-21,-22,-13,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,-3,-13,-21,89,-26,-10,-17,0,6,-21,7,-1,-11,-19,-27,-22,28,-3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-11,-13,-8,-18,-1,-17,-11,-11,-16,-12,-4,-12,-8,-16,19,7,-1,-28,-19,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-30,57,28,-38,-13,0,-37,3,-27,-27,15,-8,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,54,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-11,-16,-18,-15,-8,-22,-21,8,-16,-2,1,-7,-15,-12,-16,9,22,10,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-16,0,-28,10,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,11,34,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-10,-10,-11,-18,-19,-8,-11,-11,-10,2,-11,-9,-11,20,41,0,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,19,-17,19,5,-24,-4,-4,-24,-4,-29,-21,21,-12,0,-7,22,9,-18,-39,-19,3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,30,-25,40,23,-32,-9,-1,-32,0,-27,-25,16,-9,4,-7,8,-4,-26,-37,-20,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-25,-26,-22,17,-29,2,13,-15,13,15,-23,-28,-13,-14,-20,-9,6,5,40,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,6,-15,1,-1,-19,-5,-6,-20,-2,-26,-17,16,-13,0,4,24,14,-14,-35,-17,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-6,1,-22,-18,-9,-20,23,-22,-9,1,-14,4,24,-1,0,-12,-24,-11,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-23,-22,-26,-20,10,-27,-9,14,-19,15,10,-22,-26,-14,-16,-17,-8,9,-7,19,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-24,-14,0,-26,-13,8,-15,29,17,-21,-25,-8,-1,-22,-8,2,-20,-3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-29,31,16,-34,-2,-5,-34,7,-27,-22,9,-10,4,-1,0,-10,-26,-31,-19,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,8,-25,9,12,-28,-13,1,-23,6,-23,-12,8,-12,18,4,5,-3,-22,-27,-12,15;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-18,-23,-21,-9,-7,-23,-12,7,-9,15,16,-17,-20,-2,-5,-16,-9,1,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='A'; M=21,-8,-17,-14,-6,-18,-8,-7,-16,0,-15,-10,-5,-13,-2,2,7,-1,-8,-20,-10,-5;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,-13,-21,-13,-12,-14,-19,2,-13,1,0,-14,-16,-10,-17,2,4,9,-23,-13,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,10,-30,-20,0,-26,30,-23,-6,0,-13,28,36,-6,-10,-24,-20,-10,17;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-29,22,17,-29,-16,-4,-30,20,-24,-16,8,-11,6,14,-5,-9,-24,-28,-14,11;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-33,-26,53,-30,-11,5,-25,15,4,-22,-30,-29,-18,-21,-10,1,8,34,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,9,-24,7,12,-28,-10,5,-21,2,-20,-11,12,-12,18,0,3,-6,-23,-28,-14,15;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-17,-36,-15,-15,-7,-7,-21,-23,-14,-23,-20,-17,-22,-13,-15,-15,-15,-25,64,6,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-21,-22,-25,-16,-3,-25,-15,14,-9,17,23,-19,-21,-9,-10,-18,-8,10,-21,-3,-13;
MA   /M: SY='N'; M=3,11,-20,2,-3,-23,8,-3,-22,-5,-24,-15,21,-16,1,-6,11,1,-21,-30,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-23,-5,-2,-22,-1,-9,-24,7,-22,-12,3,-14,4,8,5,4,-18,-23,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-29,-1,6,-29,-10,-2,-28,23,-25,-10,3,-14,19,29,-4,-10,-24,-22,-13,11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-7,-12,-25,-12,-5,-16,-12,-11,-9,-4,-13,-6,-8,-2,-1,-4,-3,-2,-8,-20,-7,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-22,-3,0,-23,5,-12,-27,6,-25,-15,3,-13,-2,5,8,4,-18,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-29,9,19,-32,-8,-2,-29,9,-24,-14,2,-5,19,8,0,-9,-27,-26,-17,18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-27,3,6,-25,-6,-4,-29,15,-24,-15,6,-13,4,26,-1,-7,-22,-26,-16,3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,13,-22,14,0,-23,-12,-9,-16,-2,-19,-14,9,-9,-5,-9,3,-1,-12,-32,-16,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-9,-30,-9,5,-19,-17,-8,-16,1,-11,-5,-9,-4,10,1,-11,-10,-20,-6,-9,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-26,1,10,-20,-14,-7,-16,4,-13,-10,6,-6,1,1,-5,-7,-19,-28,-15,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00233;
//
ID   GLYCO_HORMONE_BETA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00261;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycoprotein hormones beta chain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8578191; R2=0.0122203; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=497; N_SCORE=10.921; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-27,-1,6,-26,-16,-6,-28,34,-27,-12,6,-13,8,34,-3,-6,-20,-24,-12,6;
MA   /M: SY='E'; M=-14,13,-30,22,40,-30,-18,0,-32,13,-22,-20,4,-6,14,14,-2,-10,-28,-30,-18,26;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-28,8,22,-24,9,-4,-31,-4,-22,-18,0,-10,1,-9,-1,-13,-27,-25,-19,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-31,-1,2,-28,-3,-7,-25,-8,-26,-18,-7,33,-6,-12,-2,-9,-26,-29,-23,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-17,-21,-19,-16,3,-9,-15,-5,-11,-6,-3,-12,-22,-15,-10,-5,-4,1,-16,1,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,111,-28,-28,-20,-28,-29,-29,-29,-21,-20,-18,-38,-28,-29,-7,-8,-10,-49,-29,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-34,-25,1,-34,-19,34,-27,24,19,-22,-24,-19,-24,-21,-9,23,-22,0,-25;
MA   /M: SY='T'; M=9,-7,-13,-14,-11,-13,-16,-19,-7,-9,-10,-9,-6,-9,-11,-9,13,25,3,-28,-14,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-22,-38,-30,29,-34,-26,27,-28,14,10,-22,-26,-30,-24,-18,-8,24,-11,9,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-8,21,-20,11,4,-22,-10,1,-19,0,-22,-15,29,-14,7,0,10,11,-22,-33,-16,6;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,48,0,-30,-10,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-11,-7,-7,-12,-14,-16,-12,-9,-15,-12,1,-5,-7,-10,22,37,-4,-30,-12,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-27,-34,-24,-2,-27,-26,27,-23,8,8,-19,-18,-17,-25,-16,-10,15,3,0,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-12,-13,-8,-18,-1,-15,-12,-10,-15,-8,-3,-11,-7,-15,18,10,-4,-27,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-21,-17,22,-28,22,-1,-17,8,4,-16,-28,-12,-11,-20,-12,-8,6,46,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-25,-17,-7,0,-22,-5,-6,-5,-5,1,-13,-9,-5,-1,-10,-8,-8,-13,5,-7;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-11,0,-20,-20,-2,-15,19,-12,8,-5,-16,13,28,-9,-6,-13,-21,-8,5;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-27,39,23,-31,-16,-5,-27,2,-22,-21,7,-10,2,-7,-1,-7,-19,-35,-18,13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-27,-11,-3,-19,-17,-13,-17,-3,-16,-12,-9,20,-4,5,-1,-3,-17,-28,-18,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-8,-13,-14,-19,-8,-18,-17,11,-13,-4,-1,-1,-25,-19,-14,-1,1,22,-33,-14,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-27,-23,-20,20,-20,7,2,-14,7,10,-19,-28,-12,-12,-19,-11,-6,11,47,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-31,-3,9,-30,-20,-7,-27,34,-27,-10,-2,0,15,27,-9,-10,-23,-21,-12,11;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-15,-1,2,-17,-10,-11,-16,-6,-18,-14,1,-12,-2,-9,19,14,-8,-31,-12,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-25,-15,-8,-13,-18,-19,-7,-14,-10,-9,-15,30,-12,-18,-4,-1,-10,-25,-17,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-22,-29,-21,13,-25,-19,9,-24,23,7,-26,-22,-21,-20,-21,-10,4,-3,6,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-24,-11,-7,-19,-5,-14,-14,-8,-15,-9,-6,8,-8,-7,1,-3,-13,-28,-19,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-29,-8,-1,-24,-18,-17,-17,-3,-23,-15,-11,40,-7,-10,0,1,-18,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-21,-15,-11,-4,-20,-10,-1,-8,-4,-1,-8,-17,-9,-3,-4,-3,2,-21,-2,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-27,-20,-14,3,-23,-12,-1,-13,-9,-5,-14,8,-14,-16,-9,-6,-6,-12,6,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-28,-5,14,-32,-22,5,-14,4,-9,3,-5,-13,47,5,-5,-10,-24,-20,-8,30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00234;
//
ID   INSULIN_MP; MATRIX.
AC   MP00262;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Insulin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5821892; R2=0.0063646; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1009; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=773; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-76,-62,-65,-81,86,-65,-86,21,-83,-72,-50,-68,-57,27,21,-62,-80,-75,-73;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-8,15,8,35,-42,24,-1,-72,1,-24,-4,12,12,18,-11,0,-3,-49,37,-65; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=1,-81,5,-62,-41,16,-23,-48,0,-25,-25,-35,24,-31,44,9,-40,-25,-77,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-43,-74,-26,-43,-26,41,25,-34,-59,10,15,7,6,11,4,46,-38,-65,-76,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-73,-41,15,54,-38,-6,-64,-36,-39,5,-36,-12,4,51,26,4,-26,-8,-51;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-49,-78,7,16,43,-8,32,-25,35,-64,4,-1,-71,-4,36,-22,-42,-28,-69,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-75,-61,-11,-54,-38,-22,-33,31,-26,-7,6,-24,-29,50,4,-1,-18,-62,67;
MA   /M: SY='R'; M=-37,-77,-39,-10,-71,-39,-56,-17,6,-12,-8,12,-42,6,86,4,-2,-65,-78,-64;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-84,-29,-30,-81,9,16,-53,-5,-59,21,-23,5,43,38,3,-66,-22,-85,-38; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-83,-43,-42,-19,-41,5,-55,61,-25,-70,17,12,-33,16,-23,-3,-76,-84,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=2,-87,-47,-45,-80,-58,-67,-85,2,-64,-33,-41,-47,-17,73,-9,2,-79,-83,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-31,-75,7,-66,-79,87,-64,-84,-44,-64,-72,32,-40,-35,-11,-17,-28,-79,-77,-40;
MA   /M: SY='I'; M=-49,-75,-84,-79,0,-86,-78,85,-76,25,11,-77,-3,-74,-79,-72,-40,22,-71,-14;
MA   /M: SY='V'; M=34,-66,-47,-68,-13,-68,-31,-23,-68,-49,-50,-67,-43,-21,-70,26,-50,80,-81,-33;
MA   /M: SY='E'; M=-47,28,70,73,-81,-69,33,-82,-24,-77,-73,-16,-37,-25,-15,-5,-8,-76,-89,-68;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-80,-9,69,-47,-71,-21,-52,32,-45,-63,-33,-63,83,-10,-28,-60,-40,-73,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-72,-62,-5,41,-52,76,-30,-6,12,-23,12,-72,-32,-1,-30,22,-24,-67,32;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-28,-36,-10,-70,-7,-24,-4,38,-69,-62,47,-69,24,42,17,-1,-7,31,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-41,-75,-41,-30,-73,49,-67,2,-44,-68,-28,-56,62,3,-45,36,15,3,-78,-38;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-50,-66,42,-37,-73,-59,-60,-49,-40,-72,-67,10,-37,-54,-62,69,75,-61,-88,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-74,-18,-31,-11,-79,-63,30,14,41,37,-40,-25,-6,38,-47,-17,-1,-71,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-21,-76,46,17,28,-50,-21,-69,7,-53,-62,13,-70,24,27,4,-26,-51,-63,58;
MA   /M: SY='Q'; M=-46,-77,57,47,-43,-70,-56,-44,-36,-20,-61,-18,-67,60,-7,-6,-26,20,-78,5;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-84,-77,-6,-85,-70,27,-77,82,22,-81,-82,-71,-75,-53,-62,-20,-70,-52;
MA   /M: SY='E'; M=18,-74,-53,58,-67,-69,-58,-44,-9,25,-6,-59,-66,48,16,5,-26,-44,-75,-34;
MA   /M: SY='N'; M=-12,-69,-22,-18,-71,-5,-24,-24,7,-53,30,59,-67,-4,0,42,41,-34,-83,-66;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-78,-72,-71,-6,-76,-44,-37,-46,15,-47,-72,-81,-19,-42,-46,-63,-32,-36,119;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=26,49,-2,-59,-69,-25,-53,-69,-56,-20,-64,92,24,-57,-64,-31,-16,-67,-83,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-87,-21,-63,-77,-75,44,-68,-26,-21,-66,-16,90,-67,-23,-26,-64,2,-85,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-84,-74,-15,34,-81,-70,-15,8,-27,-64,-5,22,1,-11,-17,-11,2,-73,30; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-57,-73,-3,-52,-70,-69,-64,13,68,-63,-59,-53,3,-51,22,28,20,23,-79,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-76,43,-51,2,-64,-61,-71,-55,-74,-67,9,79,13,-1,19,40,-69,-80,-67;
MA   /M: SY='A'; M=54,-68,-63,-2,47,-8,-65,-5,-59,-62,-60,9,10,-60,1,-1,26,-56,-70,-56;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-78,-55,11,13,-71,-59,-76,100,-74,-65,-51,20,-43,-30,-58,-58,-73,-70,-61;
MA   /M: SY='S'; M=25,-65,-54,-57,-74,-52,-57,-72,-52,-75,-67,48,-66,-50,13,83,16,-64,-83,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=50,-77,-54,71,-80,-71,-68,-74,-59,-10,-68,-67,-69,-54,-67,-57,12,-67,-85,-77; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-74,-91,-70,-58,-84,-84,-60,-90,17,-83,-72,-63,-82,-48,104,-69,-73,-84,-83,-71; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-54,-72,83,16,-80,6,-57,-79,-55,-79,-75,-41,-64,-52,-63,63,17,-73,-89,-69;
MA   /M: SY='V'; M=3,-68,-77,-69,-58,-78,-77,17,10,-45,-46,-71,-76,-67,15,-63,-53,86,-83,-62;
MA   /M: SY='R'; M=-54,-73,-56,16,-75,-64,-56,-77,-37,-75,-67,-51,-67,-44,83,66,20,-69,-80,-65;
MA   /M: SY='A'; M=66,-65,-59,16,-75,-57,-66,-66,-58,-69,-63,-56,29,-56,-65,16,61,-56,-80,-70;
MA   /M: SY='Q'; M=54,-66,-63,-56,-71,-59,-65,-54,-58,-62,-58,-56,-66,56,-61,37,42,31,-80,-66;
MA   /M: SY='P'; M=-58,-76,-61,-53,-78,-66,-62,-73,37,-76,-67,-55,81,-52,43,36,42,-70,-79,-70;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00235;
//
ID   NATRIURETIC_PEPTIDE_MP; MATRIX.
AC   MP00263;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Natriuretic peptides signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7088351; R2=0.0134741; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=522; N_SCORE=11.732; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-19,-8,-5,-19,-14,-15,-10,1,-18,-10,0,-6,-5,-5,8,6,-5,-29,-15,-6;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-26,-8,-1,-20,-14,-3,-21,15,-14,-5,0,-17,10,34,-7,-6,-17,-20,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-24,4,7,-19,-13,0,-23,9,-15,-11,0,-13,5,19,-5,-8,-18,-21,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-22,-17,-8,-3,-21,-10,-3,-4,10,3,-13,-21,-6,6,-13,-7,-4,-17,-1,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-26,-19,-11,-9,-20,-16,-5,-5,3,-1,-16,-10,-10,1,-15,-7,-5,-11,-8,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-26,-5,-3,-25,9,-6,-24,-1,-21,-8,3,-14,5,5,2,-7,-21,-25,-18,0;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=1,-7,-21,-13,-10,-14,-9,-11,-7,-5,-7,-3,0,-14,-6,1,-1,-3,-6,-24,-13,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=3,-5,-22,-4,-2,-18,-11,-10,-15,-6,-19,-14,-3,17,-5,-11,4,-1,-15,-24,-13,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-27,3,6,-26,-17,-7,-28,31,-25,-12,3,-9,7,29,-5,-5,-19,-23,-12,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-20,-7,0,-17,-14,-8,-12,7,-15,1,-1,-7,2,2,4,2,-9,-27,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-20,-13,-12,-17,6,-15,-11,-4,-11,-1,-6,-17,-9,-8,-3,-6,-4,-23,-15,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-10,-25,-12,-7,-18,-4,-4,-17,0,-15,-7,-4,-15,0,8,-2,-7,-14,-18,-9,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-19,-7,-9,-11,5,-9,-14,-13,-15,-8,-1,-13,-8,-14,8,-1,-11,-22,-8,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,9,-20,9,3,-24,-5,-5,-26,4,-28,-19,14,-13,2,9,17,5,-18,-34,-18,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-25,-3,-10,-28,37,-16,-32,-15,-30,-21,2,-7,-12,-16,11,-7,-24,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-11,-21,-14,-10,-10,-13,5,-9,-8,-3,2,-5,-21,-5,2,-6,-5,-5,-25,-5,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-31,-5,5,-26,-20,-6,-29,37,-26,-11,-2,-7,8,44,-10,-10,-21,-21,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-34,-24,4,-31,-19,31,-25,31,29,-24,-24,-15,-21,-23,-10,18,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,45,-29,63,22,-39,-10,-1,-38,0,-29,-29,18,-9,1,-10,0,-10,-29,-39,-20,12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,5,-30,28,-20,-9,1,-20,10,66,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-29,-8,-18,-29,63,-18,-38,-18,-30,-20,4,-20,-18,-18,2,-17,-29,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='S'; M=14,0,-11,-4,-3,-19,-3,-6,-18,-10,-24,-16,7,-11,-2,-11,29,16,-9,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-22,-26,-19,2,-24,-11,11,-15,7,17,-20,-23,-8,-14,-14,-7,9,-6,3,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-26,-7,-15,-27,49,-16,-35,-14,-29,-19,4,-18,-14,-12,5,-13,-26,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,27,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-9,26,-24,14,-1,-24,6,2,-24,0,-30,-20,39,-10,-3,-3,5,-5,-29,-35,-22,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-20,-6,-8,-20,6,-10,-21,-2,-22,-14,7,-17,-6,5,9,1,-12,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-22,-20,-14,0,-13,-17,-3,-16,5,-1,-14,-15,-15,-8,-8,-5,-2,-22,-8,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-26,-12,-5,-12,-16,-7,-21,19,-17,-6,-4,-19,0,37,-8,-8,-12,-19,-8,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-28,-3,-1,-12,-15,-5,-19,7,-13,-7,-2,-14,3,10,-10,-10,-18,-17,-3,0;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-1,-25,-4,-8,-15,9,4,-20,-7,-17,-11,7,-8,-7,-4,-4,-10,-21,-18,-6,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-18,-3,-1,-15,-10,-4,-18,7,-18,-11,6,-6,2,21,6,4,-14,-23,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-27,-6,0,-18,-16,-9,-16,6,-20,-11,-11,36,-3,-3,-8,-8,-19,-15,-9,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-21,3,6,-21,-12,-5,-21,30,-23,-9,9,-9,6,18,-5,-6,-17,-18,-9,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=0,-4,-19,-6,2,-18,-11,-7,-19,22,-16,-7,-2,-10,4,23,-4,-6,-11,-15,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-19,-17,-11,-1,-18,-15,8,-14,-3,0,-10,8,-11,-15,-5,-3,2,-15,-5,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-10,-10,-13,-10,19,-10,-10,-6,-13,-6,-6,-3,-13,-13,-10,6,3,-3,-10,3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-11,-6,-8,-11,15,-11,-14,-8,-11,-8,0,-8,-8,-8,5,8,-9,-14,-11,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-2,-20,-5,-1,0,-15,5,-13,-12,-8,-8,6,-18,-6,-9,3,-1,-13,-26,-4,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00236;
//
ID   NEUROHYPOPHYS_HORM_MP; MATRIX.
AC   MP00264;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neurohypophysial hormones signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0409431; R2=0.0091929; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=777; N_SCORE=7.101; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=712; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-48; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=54,-64,-62,-61,-57,-59,-60,-63,-60,-65,-60,-54,-66,-58,-65,37,70,-55,-66,59;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-70,-85,-78,-42,-87,-71,39,-78,84,-29,-82,-82,-71,-76,-77,-62,-35,-71,-54;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=54,-66,-61,-58,-75,-55,-65,-68,-60,-72,-65,-54,53,-57,-66,63,43,-60,-80,-70;
MA   /M: SY='C'; M=70,77,-74,-68,-67,-62,-76,-45,-68,-56,-55,-68,-74,-68,-72,-51,-53,58,-83,-69;
MA   /M: SY='C'; M=27,136,-74,-73,-71,-69,-76,-72,-70,-68,-66,-62,-80,-75,-77,-53,41,-60,-94,-77;
MA   /M: SY='F'; M=-68,-70,-86,-80,93,-84,-70,-37,-78,48,-41,-79,-84,-80,-76,-74,-63,32,-55,-33;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-69,-85,-78,50,-86,-68,-34,-78,84,-31,-83,-85,-73,-75,-77,-64,-42,-64,-45;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-71,-64,-70,47,74,-66,-75,-66,-72,-69,-51,-69,-63,-71,63,-54,-71,-68,-58;
MA   /M: SY='W'; M=-68,-73,-87,-77,-40,-84,-73,-37,-77,84,-33,-86,-83,-71,-75,-78,-66,-45,102,-48;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-75,-77,-92,-84,-48,-94,-76,-40,-86,84,-36,-92,-92,-79,-83,-85,-71,-47,-79,-61; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=82,-62,-63,-59,-75,-49,-66,-68,-61,-70,-64,-55,-65,-55,-65,64,-46,-56,-78,-70;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-68,-84,-77,-42,-86,-71,-29,-77,84,-30,-83,-83,-72,-75,-75,-61,33,-73,-55;
MA   /M: SY='T'; M=-51,77,-60,-63,-69,-66,-68,-64,-60,-66,-63,-49,-64,-62,-67,38,98,-55,-89,-68;
MA   /M: SY='S'; M=-44,-66,45,-51,-76,-51,-58,-76,-56,-79,-73,-42,-64,-49,-62,101,-38,-68,-85,-67;
MA   /M: SY='A'; M=99,-61,-68,-60,-76,-49,-69,-65,-63,-67,-61,-62,-66,-59,-67,-41,-52,-52,-76,-71;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-79,-74,-75,42,-80,-43,2,-68,-9,-47,-73,-83,-65,-66,-68,-65,-55,-32,122;
MA   /M: SY='I'; M=-66,-76,-86,-84,65,-88,-81,93,-79,-34,-39,-76,-77,-79,-81,-73,-60,8,-63,-44;
MA   /M: SY='Q'; M=-58,-76,-52,-46,-80,-63,-50,-76,-39,-74,-63,56,-69,90,59,26,6,-74,-79,-64;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-75,-70,-60,-60,-79,-66,41,27,11,-47,-63,-73,19,59,-62,5,36,-77,-60;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='S'; M=71,-62,-61,-58,-75,-49,-64,-69,-60,-72,-66,-52,-65,-53,-64,80,-43,-58,-79,-69;
MA   /M: SY='M'; M=27,-67,-76,-71,-55,-73,-70,38,-69,23,71,-68,-71,-66,-71,-57,42,33,-78,-59;
MA   /M: SY='M'; M=-55,-74,45,-56,-67,-64,-62,35,-62,-57,70,-54,52,-57,-67,63,-49,-53,-81,-64;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-77,112,-35,-84,-65,-55,-80,-55,-80,-79,-37,-65,-55,-64,-51,42,-76,-100,-70;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=27,-69,-77,-72,-54,29,-63,-44,-70,48,99,-68,-73,-63,-70,-62,-61,-48,-73,-58;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-80,74,66,-78,-70,-56,-70,-52,-67,70,-52,53,-48,-61,-59,-59,-71,-85,-69;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-70,-77,-66,-53,-81,-71,-29,-67,48,-39,-74,-78,56,-67,-66,-56,75,-79,-59;
MA   /M: SY='R'; M=-64,-79,-62,-53,-74,-75,-54,-78,-28,-73,-63,-55,-72,-43,109,-56,41,-71,-78,-63;
MA   /M: SY='Q'; M=-57,-77,-55,-41,-81,-65,-54,-77,81,-75,-64,-48,-64,85,-33,36,-54,-74,-74,-64;
MA   /M: SY='C'; M=-62,146,-78,-75,-72,-77,-75,-79,-62,-70,-68,-65,-89,-73,41,-63,-62,-67,-96,-78;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-71,-67,44,-48,-82,-62,-39,-66,71,79,-74,-74,-58,-67,-71,-62,-45,-73,-56;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00237;
//
ID   PANCREATIC_HORMONE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00265;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pancreatic hormone family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8380566; R2=0.0134358; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=377; N_SCORE=9.893; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-26,-21,-20,-16,-12,-23,-16,-21,79,-11,-20,-12,-10,-26,-29,-27,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-22,6,12,-20,-18,0,-15,0,-14,-8,-3,-3,3,-5,-1,1,-11,-27,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,0,-25,-6,-7,-4,-16,14,-16,1,-16,-9,8,-22,-1,10,-3,-5,-17,-11,18,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-7,-9,-27,41,-14,-35,-9,-28,-18,1,-17,-10,-4,4,-12,-26,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-27,41,27,-33,-11,-1,-33,1,-27,-25,14,-4,5,-7,5,-6,-28,-37,-20,16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,12,-26,17,0,-4,-14,-2,-21,-11,-11,-13,3,-18,-7,-12,-8,-10,-18,-21,-2,-3;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-11,-18,-10,-17,-6,-19,-8,-8,-10,-9,-9,-13,-10,-12,10,4,3,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-8,-19,-7,-4,-17,-13,-8,-15,-12,-17,-13,-3,11,-6,-13,14,14,-12,-33,-16,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-29,-4,1,-24,-19,-13,-13,-8,-19,-13,-13,33,-7,-15,-6,-8,-12,-30,-21,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,22,-28,28,38,-31,-15,3,-29,6,-24,-20,14,-6,17,-1,2,-8,-30,-33,-19,28;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-30,25,33,-36,-17,2,-30,11,-24,-15,5,-7,26,3,-1,-10,-29,-29,-16,29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-29,-19,8,-28,-13,15,-22,34,21,-26,-27,-14,-14,-26,-11,6,-9,7,-17;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-20,-15,-6,-19,-13,-11,-11,1,-12,-7,-4,-15,1,9,2,-2,-6,-23,-14,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-1,-29,-1,8,-24,-21,-1,-19,14,-17,-5,-1,-14,23,18,-6,-10,-20,-20,-8,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,36,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,74,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-21,-24,-22,-15,12,-26,0,5,-16,17,8,-21,-26,-12,-13,-20,-9,-1,-2,27,-15;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-19,1,-1,-21,-10,-10,-20,2,-17,-14,3,-13,-2,5,8,4,-12,-28,-16,-2;
MA   /M: SY='B'; M=7,16,-21,14,12,-28,-7,-3,-22,-1,-21,-16,13,-10,8,-7,7,-3,-20,-30,-19,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,6,-31,-22,25,-27,37,19,-29,-29,-21,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-26,-1,2,-20,-14,5,-23,13,-22,-11,13,-18,15,30,0,-5,-23,-23,-7,6;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-30,4,20,-28,-19,27,-27,11,-21,-8,5,-12,25,15,-4,-12,-28,-26,-5,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-27,-26,-33,-25,12,-34,-19,27,-23,19,13,-21,-25,-19,-18,-21,-10,16,-11,13,-25;
MA   /M: SY='N'; M=2,19,-18,5,-2,-19,-5,0,-15,-4,-20,-14,31,-17,1,-5,9,3,-19,-33,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-21,-29,-22,8,-29,-20,22,-23,24,17,-19,-25,-19,-18,-19,-6,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-32,-26,4,-32,-20,31,-22,19,20,-25,-26,-20,-21,-18,-7,28,-19,3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-17,-12,-14,-11,8,-20,-19,-14,-15,-13,-1,-14,-15,-14,11,25,-9,-25,-14,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-10,-34,-6,5,-30,-20,6,-21,-4,-24,-11,-9,39,13,-8,-5,-7,-28,-27,-16,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,1,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-27,-9,0,-20,-17,-1,-29,25,-21,-11,1,-19,9,59,-3,-6,-19,-23,-11,0;
MA   /M: SY='D'; M=5,11,-22,13,-2,-27,10,-7,-28,-9,-22,-19,5,-13,-8,-14,7,-2,-18,-29,-19,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,2,-21,7,5,-4,-17,-8,-13,-6,-2,-7,-4,-15,-6,-6,-8,-7,-11,-21,-5,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-19,3,16,-22,-9,-10,-22,-4,-23,-18,2,-1,3,-8,18,14,-16,-33,-19,9;
MA   /M: SY='E'; M=-15,10,-29,19,21,-8,-19,-7,-25,-4,-17,-19,0,-1,-3,-10,-6,-10,-23,-24,-9,9;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-22,-11,-1,-20,-9,-13,-18,1,-16,-10,-6,-1,-3,5,2,3,-13,-24,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-22,-15,-10,-6,-20,-10,-3,-1,5,1,-9,-21,-8,-2,-13,-7,-3,-17,1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-16,-27,-17,-16,-13,3,-16,-14,-8,-7,-4,-13,-23,-12,2,-12,-13,-9,-5,-10,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-11,-19,-11,3,-4,-20,-12,1,-13,6,0,-10,-14,-5,-12,-4,-3,-2,-22,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-20,-7,-3,-9,-12,-7,-8,-6,-11,-8,-10,30,-6,-10,-5,-4,-13,-11,-5,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-11,-18,-12,-3,9,-7,-11,-4,-12,-2,-3,-7,-12,-11,-11,-7,-8,-5,-8,-1,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-22,-24,-13,23,-27,-15,-1,-11,8,1,-17,-25,-18,2,-17,-9,2,-12,5,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-16,-32,-15,-10,-10,-23,-13,-8,-6,-2,-3,-15,-22,-1,5,-20,-14,-13,16,1,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00238;
//
ID   SOMATOTROPIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00266;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Somatotropin, prolactin and related hormones signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0638642; R2=0.0174466; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=450; N_SCORE=13.905; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,9,30,-29,-13,-1,-24,3,-23,-16,3,-6,22,-1,14,0,-23,-31,-18,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-27,-3,1,-23,-19,3,-16,2,-17,-7,-2,1,6,1,-4,-5,-15,-27,-11,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-29,-4,5,6,-23,-2,-14,-9,-10,-11,-11,0,-8,-11,-11,-10,-18,-9,12,-2;
MA   /M: SY='A'; M=3,0,-23,0,3,-17,-3,-9,-19,-9,-15,-13,-1,-6,-5,-13,1,-6,-16,-25,-15,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-28,-4,7,-27,-19,1,-17,12,-17,-3,-1,-9,24,14,-4,-8,-19,-23,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-26,-8,-8,-17,2,-2,-22,1,-16,-9,-2,-20,-4,13,-5,-9,-16,-21,-8,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-5,0,-19,-17,5,-18,4,-17,-7,-2,-12,10,12,-1,-4,-16,-22,-5,3;
MA   /M: M=-5,-15,-21,-16,-9,-4,-8,-17,-9,-15,-2,-6,-12,-19,-12,-14,-7,-6,-8,-9,-7,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-7,-22,-14,-11,6,-19,-1,-3,-13,-1,2,1,-20,-6,-8,-6,-4,-8,-19,3,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-26,-12,-3,-17,-23,-5,-6,12,-10,3,-7,-15,6,10,-9,-6,-6,-19,-3,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-19,-2,-7,-14,-15,-10,0,-9,-10,-6,7,-14,-8,-11,2,3,-1,-28,-11,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-2,-9,-17,-7,-17,5,-16,-8,0,-6,-1,7,-3,-4,-15,-22,-8,-2;
MA   /M: SY='A'; M=4,-13,-22,-15,-8,-17,-10,-12,-8,-7,-7,-2,-10,-7,-1,-4,-2,-4,-6,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-23,-19,-12,-7,-16,-17,1,-16,4,1,-14,-7,-10,-15,-8,-1,-1,-23,-10,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-1,10,-20,6,-1,-18,-9,-4,-17,-3,-21,-13,14,-7,-3,-7,8,2,-15,-29,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-12,-19,-16,-12,7,-12,-12,-9,-13,-6,-3,-6,-16,-12,-9,2,1,-6,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-2,-27,-7,-7,-6,-21,50,-15,-12,-13,-1,8,-19,0,-6,-9,-12,-19,-21,17,-7;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='D'; M=1,10,-20,13,12,-23,-9,-7,-23,1,-22,-18,8,-10,1,-6,11,1,-16,-32,-17,7;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-15,-6,-6,-10,-7,-10,-14,-11,-19,-14,2,-9,-7,-12,20,12,-8,-28,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-25,11,-34,-24,31,-29,30,18,-24,-25,-21,-24,-23,-9,19,-18,2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-9,-29,-7,1,-23,-19,-1,-15,-5,-18,-9,-7,21,1,-6,-4,-5,-18,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='T'; M=9,-9,-12,-16,-13,-11,-17,-20,-1,-14,-6,-6,-6,-14,-12,-15,13,24,7,-29,-12,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-23,-1,14,-20,-17,-9,-12,-1,-15,-10,2,-9,3,-6,5,4,-11,-29,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,25,-23,27,6,-28,3,-4,-29,-5,-28,-23,21,-11,-3,-9,10,1,-24,-36,-21,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-28,-3,8,-26,-18,-10,-25,37,-23,-8,-2,-12,7,27,-9,-9,-17,-21,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-27,22,30,-28,-15,8,-28,4,-21,-17,6,-8,10,-2,2,-7,-25,-32,-14,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,16,38,-33,-18,2,-26,9,-21,-14,3,-5,28,2,0,-10,-28,-27,-16,33;
MA   /M: SY='A'; M=24,-13,-12,-21,-15,-12,-13,-22,2,-14,-4,-4,-12,-14,-14,-19,6,11,10,-24,-14,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-5,-28,-6,9,-27,-21,16,-16,5,-11,2,-3,-15,33,10,-7,-11,-22,-21,-5,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-29,-1,14,-31,-18,2,-22,17,-19,-5,1,-13,33,21,-4,-9,-24,-22,-11,22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-14,-19,-19,-14,-9,-23,-18,7,-7,-3,3,-9,-17,-10,-7,1,7,9,-26,-8,-13;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-17,1,3,-22,-7,4,-22,-4,-28,-16,10,-6,3,-5,23,9,-16,-36,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-24,12,3,-16,-18,-1,-13,-8,-10,-9,2,-12,-5,-11,-3,-4,-10,-30,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-25,-3,13,-18,-18,-10,-11,1,-5,-3,-8,-8,2,-3,-6,-7,-11,-26,-13,7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-30,19,14,-25,-17,-9,-25,5,-22,-18,-1,-12,0,-4,-7,-10,-20,-9,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,19,-30,-20,17,-30,45,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-29,-20,9,-28,-19,19,-28,43,20,-27,-28,-19,-19,-26,-8,10,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-25,0,2,-22,-12,11,-26,14,-24,-11,9,-16,6,20,2,-5,-20,-28,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-21,-28,-20,7,-25,-19,15,-22,13,10,-18,-23,-17,-19,-10,-4,10,-14,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=7,-14,-15,-18,-15,-11,-14,-20,7,-17,-7,-2,-8,-17,-13,-18,11,7,12,-30,-13,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-26,-18,7,-27,-13,12,-19,22,10,-20,-25,-15,-10,-19,-8,7,-16,5,-18;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-8,-19,-12,-8,-13,-11,-6,-8,-5,-9,0,-1,-17,-3,2,4,3,-5,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-31,-22,26,-28,40,20,-28,-28,-21,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-30,-23,3,-30,-24,27,-27,28,15,-24,-26,-20,-22,-18,-6,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-28,0,15,-25,-21,7,-17,6,-13,-3,-2,-13,26,10,-6,-10,-20,-22,-6,19;
MA   /M: SY='S'; M=21,-4,-8,-7,-4,-20,-1,-14,-16,-11,-23,-16,3,-11,-4,-13,29,13,-6,-34,-20,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-25,3,8,-17,-19,-5,-8,-3,-8,-6,5,-14,2,-6,-5,-7,-12,-28,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-25,14,17,-14,-13,-4,-22,-1,-18,-16,7,-12,0,-5,0,-6,-20,-26,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-38,-10,-1,-27,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-19,82,-10,-20,-8,-9,-28,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-18,-25,-18,5,-25,-20,15,-26,31,12,-23,-26,-18,-19,-16,-4,12,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-26,-7,-1,-14,-21,6,-12,5,-11,-3,-6,-18,9,6,-8,-9,-11,-17,4,2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-7,-25,-9,-9,1,-22,28,-11,-14,-6,-1,-3,-21,-5,-9,-9,-8,-12,-17,15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-30,-20,9,-28,-19,19,-27,43,21,-28,-28,-19,-19,-27,-9,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-18,-13,-6,-15,-17,-13,-1,-9,-10,-4,-10,-17,-4,-8,4,1,6,-26,-12,-5;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-17,-6,-6,-17,-7,-13,-16,-4,-18,-12,3,-14,-5,-1,12,13,-9,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-17,-1,13,-20,-9,-12,-17,-6,-16,-13,-3,-8,-2,-10,6,2,-11,-29,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-17,-27,-20,14,-24,-19,10,-22,19,9,-19,-26,-21,-17,-14,-4,11,-18,1,-20;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-17,1,-2,-21,-8,-7,-21,-4,-19,-14,2,-8,-2,-5,7,3,-14,-29,-15,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-14,-2,-3,-19,-7,-4,-17,-5,-19,-12,11,-13,-3,-3,8,4,-14,-32,-16,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-22,-17,-12,-3,-20,-6,2,-10,6,10,-11,-20,-6,-3,-8,-4,-2,-19,3,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00239;
//
ID   TACHYKININ_MP; MATRIX.
AC   MP00267;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tachykinin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4728897; R2=0.0096242; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=523; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-41; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-78,8,-59,-51,-64,-51,-68,-60,-70,-63,39,78,-59,-65,25,-55,-69,-57,85;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-75,8,-58,-73,62,-63,-72,52,7,-63,14,14,-56,-54,-54,-61,-70,-76,-70;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-84,-53,54,-75,-76,107,21,-60,-70,-63,14,-71,-52,-62,-1,-65,-70,-95,-57; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-80,-69,-71,-87,62,-75,-87,24,-87,-78,-58,-74,-66,-68,25,30,-79,-86,-80; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-66,-88,-66,-51,-91,-74,-61,-84,-50,-82,-70,-60,13,96,32,24,4,-82,-85,-73; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-77,-78,-78,-58,-79,-76,67,-76,36,-46,11,-80,-71,-79,39,-58,-40,-82,-64; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-52,-75,-57,27,-80,-61,-64,-77,-59,-81,-73,-55,69,-54,-66,79,8,-72,-84,-74; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-66,-82,-58,5,-75,-75,107,-69,26,-68,-59,-53,-71,62,9,-60,-65,17,-88,-53; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-13,58,43,-43,-79,-68,-60,-79,94,-77,-68,-48,-66,-46,-34,-56,-57,-73,-78,-68;
MA   /M: SY='Q'; M=-62,-83,-59,-16,-80,-71,-54,-75,31,-74,-63,-55,43,79,75,-23,-61,-34,-75,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-83,52,-49,-78,-66,88,-78,-59,-77,-66,-19,91,-17,-64,-58,-60,-78,-86,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-60,-74,26,-49,-73,-19,18,-71,65,-68,56,39,-67,-47,26,17,-7,-69,-80,-63;
MA   /M: SY='P'; M=-36,-79,-63,-58,-29,-20,59,-4,-13,-45,-62,-59,95,-61,-66,9,35,-65,-80,-65;
MA   /M: SY='D'; M=-37,-77,96,-17,-84,-34,-4,-82,-10,-82,-75,55,-67,29,-57,-11,-55,-80,-94,-69;
MA   /M: SY='Q'; M=2,20,-56,32,33,-64,-58,-72,19,-68,-64,-53,-67,55,16,53,-24,-67,-72,-57;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-71,-88,-84,122,-83,-68,-49,-79,-40,-51,-77,-86,-90,-76,-74,-67,-54,-40,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-61,-72,-81,-78,43,-83,-66,33,-73,-41,-44,-76,-80,-74,-73,-68,-57,73,-56,75;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-76,-41,-86,-68,-32,-78,91,4,-83,-84,-70,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-78,-56,-43,-78,-71,-57,-80,102,-78,-65,-49,-65,-40,47,-58,-58,-75,-73,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-79,-62,-52,-76,-71,-53,-81,-28,-75,-65,-54,-73,-41,109,35,-59,-74,-77,-63;
MA   /M: SY='A'; M=70,-66,-49,38,-77,-53,-58,-71,-54,-73,-66,67,-66,-51,-61,13,-50,-62,-81,-71;
MA   /M: SY='L'; M=-59,-70,-65,37,-51,-76,-65,-41,-65,69,-40,-69,-74,-58,-68,34,-56,8,-75,-59;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-73,-46,-50,-71,-60,-48,-65,-48,18,-56,96,-72,85,-52,-50,-54,-69,-82,-64;
MA   /M: SY='P'; M=-50,-71,-59,-57,-76,-58,-64,-71,-59,-77,-69,-52,81,-56,-66,80,43,-67,-82,-71;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-73,73,-52,-66,-75,-66,-40,-55,-55,-56,-56,-74,-61,42,-61,-55,74,-90,-65;
MA   /M: SY='A'; M=70,-64,-63,-58,-73,-57,-65,-66,-52,-68,-62,-55,-65,-55,42,14,58,-56,-79,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-69,-81,-72,-68,25,-76,-53,-55,-67,20,-51,-75,81,-66,-69,-68,-63,-61,-46,97;
MA   /M: SY='E'; M=2,-73,-46,82,-70,-74,-63,35,-52,-59,-58,-59,-61,-47,-61,-54,41,7,-80,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-83,73,-40,-82,-71,-52,-83,-34,-77,-68,-47,-71,57,87,-57,-62,-79,-82,-65;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-68,-63,-62,-65,-62,73,11,-62,-59,-56,-52,-69,-56,-64,79,-45,46,-86,-58;
MA   /M: SY='A'; M=63,-67,-63,-62,-71,-59,-67,-50,-62,-62,-58,50,52,-62,-68,-50,-52,46,-82,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-74,-62,38,-65,29,-55,-53,-56,-46,116,-60,-66,57,-58,-60,-62,-57,-75,-59;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00240;
//
ID   CECROPIN_MP; MATRIX.
AC   MP00268;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cecropin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6922543; R2=0.0067242; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=7.075; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=715; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-47; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-60,104,-83,-79,37,-81,-76,-38,-76,26,33,-75,-84,-78,-77,-68,-58,55,-77,-55;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-69,-84,-78,65,-82,-77,29,-76,14,-42,-77,-80,-78,-76,-68,-57,69,-67,-45;
MA   /M: SY='V'; M=-58,37,-79,-75,13,-80,-75,8,-74,45,-41,-73,-79,-73,-75,-2,6,63,-77,-56;
MA   /M: SY='A'; M=90,-63,-69,-63,-71,-2,-70,-58,-64,-14,-57,-63,-68,-61,-69,-44,-53,-2,-76,-70;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-70,-85,-79,38,-86,-72,43,-77,64,35,-80,-81,-73,-76,-74,-61,24,-68,-48;
MA   /M: SY='A'; M=65,-66,-65,-59,35,-3,-64,-67,-58,-66,-62,-56,-68,19,5,52,-51,-60,-70,-58;
MA   /M: SY='M'; M=17,-66,-66,-63,-63,-63,-63,-53,-62,11,75,-56,14,-58,-66,52,58,-52,-79,-62;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=17,-67,-70,-64,-62,-72,-72,-32,-64,-49,-48,12,-74,44,-67,-56,7,83,-85,-63;
MA   /M: SY='S'; M=-45,-64,10,-55,-74,-53,-59,-71,-56,-75,-69,16,-63,-51,-62,93,48,-64,-85,-67;
MA   /M: SY='A'; M=79,-67,-58,42,-78,36,-66,-72,-59,-72,-65,-59,-64,-54,-65,-45,-56,-61,-76,-73;
MA   /M: SY='A'; M=90,-63,-68,-60,-72,-53,-70,-56,0,-63,-58,-63,-67,-59,-64,-44,-52,21,-77,-70;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-91,-117,-92,-80,-111,-93,-95,-99,-88,-109,-95,-98,103,-91,-100,-88,-84,-104,-104,-108; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-85,-106,-56,87,-108,-101,-78,-110,-66,-101,-98,-82,-80,-59,-76,-82,-85,-102,-105,-98; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-87,-112,-87,-76,-106,-88,-90,-94,-83,-105,-91,-94,107,-87,-96,-84,-79,-99,-100,-104; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-60,-81,-62,-55,-79,42,-59,-82,32,-79,-68,-55,44,-48,83,-9,-62,-77,-75,-69;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-74,-4,-44,-79,-63,-53,-79,94,-80,-67,70,-66,-42,-31,-53,-54,-76,-78,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-75,-79,-73,45,-81,-75,55,-73,20,-44,-75,65,-74,-77,-68,-10,30,-69,-53;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-72,-80,-81,109,42,-68,-56,-76,-48,-56,-68,-80,-82,-76,-65,-67,-59,-47,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-79,-48,58,-80,-72,-56,-81,90,-77,-67,-51,-62,-38,33,-57,-59,-75,-75,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-66,-75,-86,-82,-46,-89,-80,93,-79,46,-33,-78,-77,-74,-80,-75,-60,-24,-73,-55;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-80,-58,-46,-77,-72,-54,-81,78,-77,-65,-1,-69,-40,88,-58,-61,-76,-75,-64;
MA   /M: SY='V'; M=39,-66,-78,-72,-57,-71,-76,15,-70,-17,41,-72,-74,-69,-73,-15,-52,78,-82,-62;
MA   /M: SY='G'; M=-16,-76,-65,-75,-81,100,-71,-83,-70,-82,-73,-51,-68,-67,-77,-49,-67,-25,-74,-77;
MA   /M: SY='Q'; M=-21,-83,-57,-40,-84,-69,-50,-77,-4,-72,-60,-52,-69,111,68,-52,-62,-76,-73,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-65,-74,-46,-54,-74,-61,87,-80,-7,-77,-64,92,-73,-46,62,-52,-56,-79,-90,-59;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-57,-69,-77,-75,-55,-82,-81,70,-71,-40,-43,-68,-72,-73,-76,-59,55,65,-82,-60;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-82,-64,-52,-9,-76,-53,-80,-26,-73,-64,-56,-75,-41,113,-15,-64,-75,-74,-60;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-80,112,-2,-86,-64,-52,-85,-52,-84,-81,25,-67,-52,-10,-55,-57,-82,-100,-70;
MA   /M: SY='G'; M=70,-68,-66,-67,-79,75,-70,-76,-66,-76,-68,-56,-67,-63,-72,-45,-59,-65,-75,-74;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-70,-77,-75,-53,-80,-79,73,-72,0,-41,-69,-72,-71,-76,-15,39,52,-79,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-22,-76,-83,-80,-51,-86,-84,100,-19,-35,-38,-74,-74,-73,-77,-70,-57,25,-75,-58;
MA   /M: SY='K'; M=-55,-74,-56,-44,-78,-63,-57,-20,81,-73,-64,-48,-64,63,-36,54,-51,-69,-75,-64;
MA   /M: SY='A'; M=90,-62,-68,-62,-73,-15,-70,-59,-63,-64,-60,-61,-67,-61,-68,-42,14,4,-77,-70;
MA   /M: SY='G'; M=24,-73,-70,-74,-68,80,-72,20,-71,16,-57,-58,-71,-67,-76,-53,-63,-57,-74,-69;
MA   /M: SY='P'; M=14,-85,-67,-58,-84,18,-70,-74,-64,-82,-70,-68,116,-66,-75,-58,-59,-75,-78,-81;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00241;
//
ID   DEFENSIN_MP; MATRIX.
AC   MP00269;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mammalian defensins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2565804; R2=0.0092783; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=563; N_SCORE=9.480; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=242; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-34,-2,17,-34,-20,-3,-22,4,-24,-11,-8,29,25,1,-4,-10,-29,-25,-19,18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-29,7,29,-29,0,-7,-31,9,-23,-18,-1,-7,8,0,-1,-11,-26,-25,-20,18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-3,-19,-2,-8,-20,16,-14,-22,-15,-18,-15,2,-16,-9,-14,14,4,-14,-31,-20,-9;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-14,-8,-5,-14,-11,-15,-12,-13,-14,-12,0,-5,-6,-12,21,22,-6,-34,-16,-6;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-12,-13,-7,-19,-3,-17,-12,-10,-17,-13,-5,-4,-8,-16,18,8,-3,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-28,-18,10,-29,-20,13,-27,37,13,-28,-15,-20,-20,-27,-10,4,-19,-2,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,1,21,-32,-20,9,-25,18,-21,-7,1,-11,35,22,-4,-11,-27,-22,-10,27;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-22,19,11,-25,-15,-4,-18,-4,-16,-15,1,-12,-3,-11,1,-3,-9,-32,-15,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-21,-9,5,-18,-13,-14,-12,-10,-8,-10,-10,5,-4,-14,3,-2,-11,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-24,-6,-15,-24,36,-18,-26,-17,-21,-15,-2,-19,-17,-18,3,-10,-16,-25,-24,-16;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-13,-17,-12,-8,-14,-18,1,-17,2,-2,-11,-19,-12,-16,7,7,6,-29,-13,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-6,2,-25,-11,-7,-27,23,-23,-10,0,-14,10,31,-4,-3,-20,-21,-12,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-12,-10,-3,-15,-5,-10,-12,6,-11,-7,-4,-8,-2,4,2,-3,-5,-14,-11,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-26,10,-3,-27,19,-8,-32,-1,-26,-18,11,-16,-6,2,0,-11,-25,-26,-21,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-21,-23,-17,-3,-14,-15,2,-10,8,10,-17,-24,-12,0,-14,-8,6,-20,-7,-15;
MA   /M: SY='T'; M=3,-14,-17,-20,-15,-9,-21,-20,3,-7,-4,-2,-11,-17,-12,-4,1,10,10,-24,-9,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-23,-21,-17,15,-24,3,-2,-11,-3,-2,-13,-23,-12,-6,-9,-4,-4,0,30,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-28,-10,0,-20,-20,-2,-28,28,-20,-10,0,-19,8,62,-8,-5,-18,-21,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-23,-19,-12,-7,-22,-15,0,-1,-2,0,-8,-17,-7,9,-7,0,0,-20,-6,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-28,-12,-6,-18,-4,-11,-24,6,-21,-12,-6,-1,-3,18,-6,-9,-18,-21,-15,-7;
MA   /M: SY='A'; M=2,-12,-19,-16,-12,-6,0,-12,-15,-10,-10,-8,-6,-19,-12,-3,2,-1,-8,-21,-10,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-24,-11,-8,-9,-13,-11,-12,-1,-5,-5,-5,-16,-7,4,-8,-6,-9,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-23,-15,-11,-1,-9,-11,-16,-5,-15,-11,-3,-16,-9,3,0,-3,-12,-9,-3,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-27,-12,-10,-18,8,-13,-25,-1,-16,-11,-4,-11,-8,13,-4,-6,-18,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,17,54,-25,-21,2,-28,8,-18,-18,-2,-2,18,-1,-2,-10,-28,-25,-12,35;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-10,-4,-16,-14,1,-22,11,-16,-8,-2,-20,4,35,-4,-5,-15,-21,-6,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-17,-24,-20,-12,-1,-23,-5,-3,-2,2,5,-12,-22,-4,13,-12,-8,-3,-15,4,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-10,-19,-16,-14,4,-18,-8,2,-15,-3,0,-4,-20,-11,-14,2,2,0,-17,7,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-15,-11,-12,-4,-18,-13,-4,-12,-9,-7,-3,-16,-11,-13,8,20,1,-21,1,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-25,-13,-6,-5,-18,-10,-13,5,-8,-5,-3,-19,-5,18,-8,-4,-10,-19,-6,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-21,-24,-26,-20,9,-30,-15,14,-12,8,7,-16,-24,-17,-12,-17,-8,10,-11,12,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-9,1,-25,-4,-5,-21,5,1,-21,-2,-17,-6,11,-19,4,7,-2,-9,-21,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-28,-6,-14,-19,37,0,-32,-14,-25,-16,8,-21,-13,-11,-2,-16,-27,-20,-14,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-16,-23,-18,-11,-12,-18,-13,-8,3,-3,-2,-10,-22,-6,22,-9,-4,-1,-22,-10,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-21,-23,-17,-2,-25,-17,12,-14,8,8,-12,-22,-13,-5,-9,-2,11,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-30,-22,-18,22,-25,15,-9,-14,-7,-4,-17,-20,-13,-12,-18,-13,-15,26,46,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-20,-15,-10,-15,-17,-15,-9,-1,-11,-5,-7,-8,-6,8,2,9,-2,-26,-13,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-31,-21,32,-29,-16,7,-23,27,9,-23,-29,-23,-11,-24,-10,3,-7,13,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-11,-2,-18,-20,-4,-24,19,-16,-9,-3,-14,5,50,-7,-5,-17,-22,-11,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,16,63,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00242;
//
ID   ENDOTHELIN_MP; MATRIX.
AC   MP00270;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endothelin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4353046; R2=0.0103510; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=8.586; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=200; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-26,-22,-11,-5,-26,-17,6,-21,22,8,-24,4,-10,-17,-22,-10,-4,-23,-9,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=1,-8,-14,-9,-3,-11,-14,-12,-4,8,-4,-1,-9,-12,-4,1,-6,-4,3,-16,-7,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,9,-23,11,-5,-26,29,-10,-29,-10,-23,-18,8,-14,-10,-13,2,-11,-22,-23,-21,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-9,3,-17,-4,-7,-3,-12,-4,-5,-8,1,-3,13,-20,-7,-1,-5,-3,-10,-23,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-15,-23,-14,-11,14,-21,-15,-6,-17,0,-5,-15,11,-18,-16,-14,-8,-10,-12,-1,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-17,-2,10,-14,-13,0,-13,8,-7,-4,-2,-9,11,17,-5,-6,-13,-14,-7,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-12,-3,0,-12,-6,-3,-15,5,-15,-9,3,-9,3,17,10,4,-9,-19,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-16,-3,1,-14,-9,5,-15,4,-15,-7,1,-1,5,13,2,-2,-13,-17,-7,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-18,-4,5,-17,-12,2,-16,13,-12,-4,0,-10,18,28,-4,-6,-15,-12,-6,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-16,-34,-10,-1,-25,-19,-14,-20,1,-25,-16,-12,47,-4,6,-6,-8,-23,-28,-22,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-12,-3,-3,-17,-7,-4,-18,-10,-23,-15,7,-11,-2,-10,30,24,-9,-36,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-29,-14,-4,-15,-24,-16,-9,5,-1,-2,-16,7,-6,1,-17,-10,-12,-23,-11,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=5,-15,-28,-15,-4,-19,-13,-15,-15,-7,-18,-12,-15,16,1,-13,-6,-7,-19,6,-11,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-17,-9,-5,-16,-12,-13,-17,6,-15,-10,-1,-12,-3,10,6,17,-8,-23,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-17,-1,7,-13,-7,-1,-17,13,-12,-7,0,-8,6,25,-4,-6,-13,-12,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-17,1,0,-12,-11,-3,-8,0,-5,-4,4,-2,2,-2,-5,-5,-12,-18,-9,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-29,-12,-2,-17,-21,-2,-26,25,-14,-7,-3,-21,7,62,-12,-10,-17,-20,-9,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=7,0,-20,-2,15,-26,-13,-6,-19,1,-18,-11,-1,-8,17,-2,9,4,-17,-26,-16,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-15,-14,-9,-13,-11,-13,-7,-3,-12,-4,-7,-15,-7,-9,8,4,2,-24,-9,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-20,10,1,-27,10,-5,-28,-9,-28,-19,9,-13,0,-10,18,3,-20,-33,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-10,-20,-14,-5,-20,-11,-8,-8,-4,-9,5,-8,-11,9,-3,1,-2,-6,-23,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-25,4,1,-21,-11,-3,-25,9,-20,-12,2,-14,3,11,-1,3,-18,-22,-6,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-28,-1,7,-28,-16,-11,-27,30,-30,-13,-1,4,5,15,-1,-4,-20,-25,-15,5;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-19,-7,8,-25,-9,-14,-19,10,-17,-12,-5,-8,1,-3,3,-5,-11,-22,-17,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=9,-24,-23,-28,-18,-3,-17,-22,-1,-19,8,-1,-24,-22,-14,-19,-16,-11,-3,20,-1,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-10,8,-21,-1,-6,-8,-15,22,-16,-7,-17,-9,16,-19,-2,-5,4,9,-17,-23,9,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-2,-24,-5,2,-23,-17,37,-20,-5,-15,-2,2,-15,17,-2,-1,-4,-20,-26,1,7;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-6,-25,-8,4,-27,-15,6,-21,9,-17,-6,-2,-14,22,19,-1,-8,-19,-21,-10,12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-23,9,-2,-24,5,-9,-28,2,-21,-16,4,-14,-4,7,2,1,-19,-25,-16,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-14,-24,-13,-6,-14,-22,-12,-5,2,-6,-2,-12,2,-7,0,-10,-5,-3,-23,-10,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-19,5,10,-15,-11,-8,-6,-5,-7,-7,-2,-7,-1,-9,-3,-6,-7,-19,-10,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-32,-29,-33,-26,5,-26,-26,6,-19,6,0,-32,-29,-21,-16,-26,-15,6,41,8,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-23,4,12,-23,-16,-7,-26,15,-22,-15,3,-11,6,20,5,5,-17,-28,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=17,3,-16,-1,-1,-21,-5,-10,-17,-5,-17,-14,4,-12,-3,-6,12,2,-10,-29,-18,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-22,-6,0,-15,-14,0,-9,-4,-13,-6,1,-18,9,-5,0,-5,-10,-19,0,4;
MA   /M: SY='D'; M=3,10,-18,16,3,-24,-5,-11,-20,-8,-22,-18,5,-13,-5,-12,14,3,-9,-35,-19,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-11,-17,-15,-12,-13,-13,-17,-8,-4,-11,-6,-7,-18,-9,6,5,12,3,-27,-13,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-8,-13,-12,-8,-7,-13,-4,-2,-1,-2,13,-5,-12,0,6,-1,5,-1,-18,-5,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=18,-2,-13,-3,12,-18,-6,-8,-13,-1,-10,-9,-4,-5,3,-8,4,-3,-9,-17,-14,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-18,6,17,-18,-12,-4,-18,15,-17,-10,6,-5,7,7,0,-1,-16,-19,-10,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-35,-7,2,-29,-18,-17,-22,4,-30,-18,-13,59,-5,-8,-6,-7,-26,-29,-25,-5;
MA   /M: SY='G'; M=14,-7,-19,-9,-12,-25,33,-17,-27,-15,-25,-18,1,-15,-12,-17,14,-3,-17,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=13,-2,-15,-3,6,-21,-5,-10,-20,-3,-23,-17,3,-10,2,-3,23,8,-12,-32,-19,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00243;
//
ID   THIONIN_MP; MATRIX.
AC   MP00271;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Plant thionins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2699485; R2=0.0115411; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=692; N_SCORE=12.246; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-26,-34,-26,-1,-36,-27,37,-27,18,15,-18,-19,-18,-26,-15,0,23,-22,-2,-26;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-17,-26,-17,3,-21,-7,17,-16,28,38,-21,-21,-7,-12,-21,-9,9,-17,0,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-17,-6,-9,-21,28,-13,-24,-13,-24,-16,3,-13,-9,-13,16,0,-16,-25,-21,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-17,-26,-17,9,-26,-17,17,-26,43,17,-26,-26,-17,-17,-26,-9,9,-17,0,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-11,-27,-25,11,-26,-24,21,-19,12,8,-25,-26,-26,-17,-12,-2,34,-20,-3,-25; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-18,-27,-20,4,-24,-14,22,-19,27,27,-22,-22,-13,-16,-20,-8,15,-18,-1,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=19,-1,-14,-2,12,-20,-5,-10,-16,-3,-16,-13,-2,-6,1,-10,13,2,-10,-24,-17,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-23,0,15,-31,-15,8,-15,8,-15,0,0,-8,46,8,0,-8,-23,-15,-8,31; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-10,-14,-16,-18,-4,-20,-16,18,-14,3,4,-4,-19,-15,-14,-6,-2,19,-23,-7,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,0,17,-35,-17,9,-17,9,-17,0,0,-9,52,9,0,-9,-26,-17,-9,35; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-9,-26,-26,0,-26,-26,26,-17,9,9,-26,-26,-26,-17,-9,0,43,-26,-9,-26; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-26,23,47,-27,-16,0,-27,7,-18,-18,2,-1,15,-1,0,-9,-26,-27,-17,31; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-13,-13,-10,-19,15,-16,-16,-11,-15,-12,-5,-11,-10,-16,9,-2,-7,-19,-19,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-26,2,8,-26,-16,-7,-26,40,-27,-10,5,-10,8,24,-7,-8,-19,-20,-10,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-16,-13,-10,-12,-15,-18,2,-16,-12,-7,0,-13,-8,-16,19,18,3,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-16,-37,-9,1,-28,-20,-15,-23,4,-28,-17,-14,59,-4,2,-10,-10,-27,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='S'; M=0,13,-15,8,0,-20,-6,-6,-20,-5,-26,-18,21,-13,-1,-4,23,17,-15,-37,-18,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-18,-12,-9,-13,-23,-16,-2,-7,-8,-4,0,-13,-3,-8,7,25,-1,-27,-9,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-20,-11,-8,-12,-21,-15,-2,-13,1,-2,-10,-18,-3,-12,-1,7,-1,-19,-8,-5;
MA   /M: SY='A'; M=22,-1,-18,-5,-9,-24,17,-18,-23,-12,-18,-15,-2,-13,-12,-18,7,-2,-13,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-18,13,1,-21,-4,1,-21,2,-28,-18,39,-16,0,0,14,7,-23,-37,-18,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-14,17,-21,-15,-7,-22,-20,-3,-20,-7,-6,-9,-25,-17,-20,-9,-9,-1,-30,-13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,29,-20,16,4,-14,-5,5,-20,-2,-26,-19,44,-18,-1,-3,8,0,-26,-35,-16,3;
MA   /M: SY='V'; M=11,-11,-14,-14,-15,-10,-18,-21,4,-15,2,-2,-14,-18,-16,-18,-1,6,14,-27,-12,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-14,-28,-16,-6,-14,-23,0,-14,14,-7,1,-6,-21,4,43,-14,-10,-10,-20,-6,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-19,-29,-21,26,-25,-20,9,-26,20,6,-20,-26,-23,-19,-14,-5,6,-14,6,-21;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-23,-8,0,-22,-6,-14,-21,-2,-20,-15,-5,7,-4,1,5,5,-16,-26,-19,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-26,-15,-22,-18,47,-22,-26,-21,-21,-14,-6,-22,-23,-20,-3,-16,-15,-20,-23,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=7,-1,-16,-6,-10,-18,19,-13,-20,-10,-18,-13,5,-12,-10,-12,9,4,-13,-22,-18,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=8,-8,-17,-7,-3,-19,-7,-14,-15,-12,-20,-15,-2,8,-5,-14,19,9,-11,-34,-20,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-4,12,-28,-20,1,-23,17,-20,-5,-3,-4,26,28,-6,-10,-24,-22,-12,17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-26,-11,0,-16,-13,-16,-14,-5,-18,-11,-8,13,-6,-11,0,-3,-14,-24,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-17,-21,-18,0,-24,-16,10,-17,12,5,-15,-24,-16,-11,-9,3,12,-23,-1,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-14,-20,-12,-15,-4,-18,-3,-14,-5,-3,-10,-14,-10,-19,6,0,1,-23,-16,-12;
MA   /M: SY='R'; M=0,-4,-21,-9,-5,-18,-9,-11,-15,3,-13,-8,1,-15,-1,5,2,4,-11,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-13,-21,-16,-8,-4,-23,-12,4,-8,8,3,-12,-22,-10,-10,-13,-7,4,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,23,-9,-9,-19,-10,-16,-21,-15,-25,-19,1,-18,-9,-15,25,16,-9,-41,-21,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-30,-10,-7,-24,13,-7,-34,12,-24,-14,0,-20,-1,37,-6,-14,-24,-20,-17,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00244;
//
ID   SNAKE_TOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00272;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Snake toxins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1038147; R2=0.0052534; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1085; N_SCORE=6.799; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1028; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-42; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-15,-70,-72,14,-78,-39,-57,-38,-53,-50,-71,-82,-25,-62,-65,-35,-62,-30,130;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-89,-102,-76,-23,-103,-92,5,-103,57,-66,-91,33,-38,-70,-16,-46,-82,-101,-105,-91; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-35,-44,-76,-71,-58,-15,103,-74,-64,-15,-65,-42,7,-58,-37,-70,-73,-33; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-33,-2,-38,-22,-41,-70,-56,-62,49,-58,83,-32,-67,52,42,-17,22,-62,-6,-59;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-52,-85,-82,-73,34,-73,-73,-65,-66,-26,-28,-45,-45,-8,-20,2,7,-71,147,45; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-79,59,-35,-38,-77,-92,36,-18,-27,-22,59,-46,-50,-10,-22,-55,-6,-30,-14,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-28,-76,-67,-41,15,-71,-6,-22,26,-40,-8,-60,-42,5,61,22,-27,7,59,26;
MA   /M: SY='D'; M=-4,60,67,-52,-71,-28,7,7,9,-41,35,-8,-71,-57,-1,-1,-8,-25,-87,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-73,-40,-60,2,17,88,-23,-13,-33,-26,7,6,-17,-27,17,18,-2,-80,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-80,-100,-52,-73,-91,-86,-12,-13,-26,-27,-78,-82,88,-77,1,-12,-49,-82,-95,-88; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-78,-94,-77,-68,-87,-11,-70,-90,16,-21,-76,-26,-49,-34,82,-38,-77,-87,-90,-78; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-42,-75,-16,-32,-68,74,-27,-25,23,-3,35,-54,-69,-34,-42,-28,-10,-49,-73,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-45,-71,-67,-45,-10,-72,-61,-4,16,-36,16,-61,18,-61,-61,13,53,29,-7,62;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-80,31,-11,-65,-56,-67,55,-5,-36,-53,-38,53,-33,43,-64,-59,17,-11,-64;
MA   /M: SY='I'; M=-45,-72,-78,-75,-19,-81,-75,70,-50,-2,-42,-71,-25,-70,-49,-3,10,54,-73,14;
MA   /M: SY='E'; M=-34,-76,-18,77,-77,-14,-25,-11,48,-72,-67,-53,-60,-43,-32,0,22,-50,-79,-69;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-82,-65,-52,-28,-77,-53,-76,-11,-36,4,-58,-75,14,109,-62,-65,-73,15,-59;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=41,-72,-71,-73,-73,59,-76,25,-71,-65,-62,-61,-71,-69,-76,-38,25,9,-80,-72; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-91,46,-49,-36,-79,-85,-91,-56,-70,-88,-15,-90,-80,-87,-70,-77,-60,-104,-90; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-41,-82,-79,-82,-85,-5,-87,-68,-79,-78,-75,-26,-82,-45,-86,-31,75,19,-104,-84; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='K'; M=-58,-74,-37,9,-74,-69,-60,-9,72,-54,-61,-51,-10,38,-2,6,45,-18,-77,-65;
MA   /M: SY='V'; M=25,-69,-28,-64,19,-12,-67,-34,-22,-23,-24,22,32,-63,-10,13,-36,51,-77,-60;
MA   /M: SY='K'; M=-57,-74,23,27,-74,-48,-56,-74,67,-57,22,-7,-64,-11,14,41,-15,-70,-10,-35;
MA   /M: SY='P'; M=4,-76,-6,-4,-43,-65,-61,-35,21,-8,-28,22,67,-31,-8,26,-38,-66,42,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-74,-95,-21,-83,-46,59,-73,-95,-51,-90,-83,-26,-50,-76,20,-72,-82,-93,-76,54; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-75,16,14,-57,-4,-68,53,-7,8,-47,-39,-72,-61,9,-64,-27,39,-75,5;
MA   /M: SY='K'; M=-45,35,-14,3,-43,-20,7,-16,66,-67,-9,-8,-67,13,-19,23,-25,-7,-74,13;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-72,-81,-78,-26,-85,-69,59,-74,44,-37,-76,-79,-71,-75,-70,-9,42,-64,55;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-75,-23,39,-24,-73,52,-42,25,-5,30,-1,-69,13,12,-13,-9,11,-74,20;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-71,-21,16,-75,-35,33,-73,31,-57,-10,50,-66,19,24,30,33,-69,-82,-64;
MA   /M: SY='T'; M=-39,-65,-58,-59,-70,-18,-64,-23,-11,-67,-62,-48,-62,-56,10,51,92,-56,-84,-66;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-79,104,35,-86,-63,-52,-84,-52,-83,-80,48,-39,-50,-60,-54,-56,-81,-98,-71;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,27,5,-78,-50,-55,-76,83,-77,-67,39,-66,-43,41,-56,-57,-31,-78,-67;
MA   /M: SY='C'; M=-61,153,-79,-80,-71,-76,-80,-78,-76,-69,-69,-24,-91,-84,-83,-63,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='N'; M=-21,-74,-48,17,-70,-29,50,-72,32,-30,-62,77,-15,6,22,-52,-8,-48,-79,4;
MA   /M: SY='F'; M=-67,-76,-78,-73,84,-79,-62,-45,-72,-49,-52,-75,59,-75,-73,-69,-61,37,-49,68;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-78,-84,-85,-74,-62,-92,-77,-55,51,62,-50,-81,-88,-70,-63,-82,-74,-61,-84,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-80,-96,-76,-64,-88,-90,-64,-95,-36,-87,-76,-69,-88,-52,104,-74,-78,-89,-88,-75; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-77,-99,-75,-62,-96,-81,-78,-88,51,-95,-81,-75,98,-68,-63,-74,-71,-90,-89,-89; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-82,-98,-76,-63,-95,-91,-72,-98,64,-94,-82,-69,-86,-57,71,-76,-79,-93,-91,-81; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-75,-97,-81,-79,-97,56,-78,-104,-58,-98,-87,-71,-89,-69,70,-72,-84,-98,-92,-87; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-85,-101,-81,-69,-93,-95,-70,-100,-41,-92,-81,-74,-93,-57,99,-79,-83,-94,-93,-80; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-52,-70,-60,-57,-75,-61,-65,-68,-59,-74,-67,-53,81,-58,-67,63,70,-64,-83,-71;
MA   /I: I=-4; E1=0; MI=0; IE=0; DE=-21;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00245;
//
ID   ENTEROTOXIN_H_STABLE_MP; MATRIX.
AC   MP00273;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heat-stable enterotoxins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0134168; R2=0.0083472; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=716; N_SCORE=9.988; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=298; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-23,-5,-10,-20,7,-13,-16,2,-21,-10,8,-20,-10,-3,-2,-8,-9,-27,-18,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,29,-17,12,-3,-17,-6,2,-17,-3,-24,-17,43,-17,-3,-3,13,14,-22,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,10,-23,5,8,-28,-10,0,-22,12,-27,-12,17,-12,19,7,10,0,-23,-30,-15,13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-24,10,32,-27,-14,-5,-27,14,-25,-18,3,-5,12,4,9,-2,-22,-30,-18,22;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-15,-10,-3,-22,-5,-15,-17,5,-20,-12,-3,-10,-3,-5,12,2,-7,-25,-18,-3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-26,-6,0,-24,-16,-16,-20,1,-26,-16,-7,32,-4,-7,5,8,-18,-30,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-28,-8,-2,-24,-16,-18,-18,-10,-26,-18,-10,50,-8,-16,6,8,-20,-32,-24,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-20,3,24,-24,-12,-3,-18,3,-14,-10,-2,-4,18,-3,2,-6,-17,-20,-14,21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,-19,6,10,-21,10,-4,-23,-4,-22,-16,13,-10,1,-6,9,-3,-21,-26,-18,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-12,-16,-14,-2,-6,-19,-7,8,-6,6,20,-15,-15,-3,-8,-10,-6,9,-21,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-3,23,-14,12,0,-16,0,3,-16,-2,-25,-16,37,-14,0,-2,15,5,-20,-33,-16,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,22,-17,19,4,-24,-2,-2,-24,-5,-30,-22,28,-13,0,-7,23,8,-20,-40,-20,2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-24,14,-2,-18,-13,-13,-24,-8,-22,-20,1,-14,-7,-12,6,10,-17,-3,-8,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-12,-32,-16,-19,16,-22,-18,-7,-19,-9,-10,-10,-24,-20,-17,-19,-15,-13,33,12,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,2,-29,8,-6,1,-18,4,-16,-7,-13,-13,-8,-20,-7,-10,-14,-12,-18,22,30,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,28,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-24,6,-32,-24,28,-27,34,17,-28,-28,-23,-22,-23,-7,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,32,-21,14,-3,-13,-4,11,-17,-1,-26,-17,49,-21,-1,-1,6,-1,-27,-30,-6,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,-13,-25,-16,11,-12,-20,-7,-16,-4,-7,-12,-16,-19,-19,2,3,0,-12,-4,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-25,-13,-15,12,-22,7,0,-13,6,0,-3,-27,-10,-10,-15,-7,-10,-1,33,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00246;
//
ID   AEROLYSIN_MP; MATRIX.
AC   MP00274;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aerolysin type toxins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0380507; R2=0.0124969; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=621; N_SCORE=11.789; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=198; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-3,17,-17,22,4,-24,-9,-9,-24,-7,-24,-21,11,-10,-3,-10,20,18,-14,-37,-17,1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,11,-23,21,-4,-15,-20,-7,-9,-9,-11,-11,-4,-20,-12,-13,-7,-7,1,-26,-1,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-20,-26,-20,-1,-30,-23,20,-23,18,9,-16,-19,-16,-20,-8,12,13,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-20,-37,-13,-7,-9,-23,-6,-13,-10,-20,-13,-20,48,-10,-17,-13,-10,-23,-9,8,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,7,34,-37,-20,7,-23,10,-20,-7,0,-7,46,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-23,-3,6,-26,-13,-1,-23,10,-24,-11,4,-13,21,24,11,1,-19,-27,-14,12;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,-14,-24,-25,-9,-5,-26,9,-18,-1,1,-21,-25,-25,-20,-5,-4,26,-26,-16,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-24,-19,-16,4,-27,-1,-2,1,-4,-1,-16,-27,-9,15,-14,-7,4,-5,22,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-21,50,14,-28,-7,0,-28,0,-21,-21,14,-7,0,-7,0,-7,-21,-28,-14,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-17,-27,-27,10,-30,-13,20,-17,7,7,-27,-30,-23,-17,-13,-3,29,-9,21,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-7,0,-20,-20,-10,-13,-3,-13,-7,0,-10,14,-3,13,29,-10,-27,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,7,-28,3,3,-23,-16,34,-28,16,-25,-9,16,-17,8,20,-6,-11,-26,-28,-2,3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-27,-37,-27,-23,23,-27,3,-7,-13,-7,-7,-27,-30,-13,-13,-27,-17,-17,72,63,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,22,-15,29,7,-20,-9,-4,-20,-2,-15,-15,9,-7,-2,-7,4,6,-13,-24,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-4,-16,-20,-17,-16,7,-16,-10,0,-10,-4,2,11,33,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=24,-9,-12,-15,-9,-16,-4,-12,-7,-10,-11,1,-5,-12,-4,-14,14,5,-1,-27,-16,-7;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-17,0,3,-23,-7,-10,-23,11,-30,-17,7,-10,3,4,23,10,-13,-33,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,0,-30,11,-13,-33,26,-30,-13,0,-13,0,13,-7,-13,-23,-20,-17,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,34,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,48,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,4,-30,11,-6,6,-23,13,-14,-7,-10,-10,-6,-23,-7,-10,-13,-10,-17,6,45,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-24,-7,-7,-24,18,-10,-31,0,-27,-17,3,-17,-4,14,8,-5,-21,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-17,-20,-13,0,-20,-17,6,-23,22,6,-16,-23,-13,-17,-6,0,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-7,-20,-20,0,-20,-20,20,-13,7,7,-20,-20,-20,-13,-7,0,33,-20,-7,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-7,-4,-4,-9,-9,-11,-9,-7,-11,-9,2,-7,-4,-7,17,26,-2,-22,-9,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-7,-7,-7,-7,-13,-13,-7,-7,-7,-7,0,-7,-7,-7,13,33,0,-20,-7,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-20,0,7,-20,-13,-7,-20,33,-20,-7,0,-7,7,20,-7,-7,-13,-13,-7,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-13,19,-23,6,-7,-3,-10,13,-13,-3,-20,-13,32,-23,-3,-3,0,-3,-23,-16,15,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,52,-33,-23,17,-30,13,7,-20,-27,-33,-23,-20,-10,10,0,20,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-1,-26,32,-26,-6,0,-10,32,21,-6,-10,-24,-20,-10,23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00247;
//
ID   SHIGA_RICIN_MP; MATRIX.
AC   MP00275;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4422183; R2=0.0160347; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=100; N_SCORE=7.036; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-3,-10,-17,-13,-11,-5,0,-11,-18,-6,-14,-6,-6,-19,-9,-7,-2,-7,-13,-17,-5,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=6,-3,-17,-8,-7,-11,-3,5,-14,-5,-12,-8,1,-15,-5,-6,1,-2,-11,-15,0,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-5,-22,-10,-10,-4,-5,-2,-15,-7,-15,-10,1,-19,-6,-3,2,2,-14,-12,9,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-26,24,4,-24,-15,-2,-20,-4,-17,-13,7,-5,-2,-9,-3,-4,-17,-31,-12,0;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-23,0,-2,-23,-10,-14,-15,-6,-19,-13,-2,4,-5,-11,5,3,-10,-30,-18,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-24,1,11,-26,-17,-4,-21,14,-20,-9,2,-6,18,12,2,2,-19,-24,-12,14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-17,5,9,-23,-8,-7,-20,0,-21,-15,7,-9,5,-4,14,6,-15,-30,-17,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-20,-6,2,-15,-17,-13,-5,-5,-5,-4,-9,-13,-1,-10,-4,-6,-2,-22,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-13,-17,-9,-19,-6,-19,-10,-9,-12,-10,-10,-2,-10,-16,9,4,-1,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-6,5,-22,-15,-6,-25,22,-21,-11,0,-15,7,37,-2,-6,-17,-23,-13,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=9,-7,-13,-12,-4,0,-10,-12,-11,-10,-11,-10,-4,-12,-6,-11,11,7,-6,-19,-7,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-18,-32,-24,24,-29,-21,17,-27,32,16,-27,-29,-25,-19,-24,-8,15,-15,5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-20,-30,-21,4,-29,-21,23,-25,32,18,-24,-25,-18,-20,-20,-5,16,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-16,-24,-20,-6,-28,-23,15,-9,3,5,-19,-24,-18,-6,-8,3,27,-27,-9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-14,-32,-23,8,-27,-24,18,-26,22,10,-22,-24,-22,-23,-17,-7,14,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-23,-36,-28,0,-34,-28,39,-27,19,16,-23,-23,-22,-26,-17,-7,31,-22,-3,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-24,-7,7,-28,-22,-1,-9,1,-10,2,-6,-14,34,2,-1,-2,-13,-23,-9,21;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-16,-24,-18,-4,-19,-8,12,-11,9,34,-15,-18,-6,-12,-7,4,11,-24,-5,-12;
MA   /M: SY='V'; M=3,-18,-11,-22,-21,-5,-25,-26,13,-16,2,2,-17,-21,-21,-17,2,18,27,-29,-10,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,8,-11,-9,-20,-5,-16,-17,-12,-20,-16,1,-15,-9,-16,19,8,-7,-33,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-12,-19,-11,-20,5,-20,-11,-11,-12,-10,-9,-12,-11,-20,9,-1,-1,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,-12,-19,-11,-13,-8,-19,-5,-14,0,-5,-11,-14,-11,-18,6,5,1,-23,-15,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-13,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-27,-2,6,-26,-17,-3,-27,30,-25,-10,6,-14,13,35,-3,-6,-21,-23,-11,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-16,-23,-19,-15,17,-27,3,-4,-11,-4,-2,-15,-18,-7,-11,-11,-1,-9,6,39,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,9,31,-28,-13,-2,-24,3,-24,-16,4,-6,21,-2,14,1,-23,-32,-18,26;
MA   /M: SY='R'; M=-9,6,-27,2,0,-24,-1,-1,-25,9,-23,-12,13,-17,8,15,-2,-9,-24,-24,-13,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-26,-7,6,-17,-17,-4,-17,6,-11,-5,-5,-15,12,10,-6,-5,-15,-21,-8,8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-30,9,-33,-28,32,-24,13,14,-25,-27,-27,-23,-15,-5,37,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-25,-5,-5,-22,-5,-11,-17,3,-18,-10,0,-12,-2,7,-2,-6,-13,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='A'; M=6,-2,-20,-5,2,-22,-10,-13,-15,4,-16,-10,-2,-12,0,-3,3,2,-8,-25,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-22,-3,-3,-18,0,-6,-22,1,-19,-13,11,-17,-2,8,5,-1,-18,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-23,-34,-25,22,-31,-24,18,-25,19,9,-24,-26,-25,-20,-21,-10,13,-4,7,-25;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-25,9,3,-20,-13,6,-22,2,-23,-14,9,-6,4,4,2,-3,-21,-25,-5,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,9,-24,11,8,-23,-12,-5,-23,5,-22,-15,7,-6,3,2,3,0,-19,-27,-12,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,3,-22,-1,3,-23,-6,-8,-21,6,-18,-11,7,-13,4,3,2,0,-17,-26,-15,3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,-3,-11,-7,-6,-10,-10,-1,-6,-5,-9,-5,1,-11,-5,-4,4,5,-1,-20,-7,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-15,-8,-6,-15,6,-12,-14,-4,-14,-9,-3,-5,-6,-4,4,0,-7,-18,-14,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-18,-18,-21,-11,28,-23,-14,-1,-14,0,-2,-15,-18,-19,-12,-10,-6,3,-7,9,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-18,-3,-2,-17,-17,-9,-10,2,-10,-5,-3,-13,3,-2,0,5,-5,-22,-8,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-33,-9,0,-23,-20,-16,-15,-5,-20,-14,-14,48,-7,-10,-8,-7,-20,-29,-23,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-17,27,7,-20,-6,0,-21,-2,-21,-18,15,-10,0,-6,8,0,-18,-26,-10,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-19,-11,-6,-9,-14,-10,-4,-10,-2,-4,-9,10,-6,-11,-6,-1,-8,-17,-7,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-17,-8,-7,-16,-12,-13,-10,-1,-12,-5,-6,-14,-6,-8,5,4,-2,-23,-9,-7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,-16,-24,-21,-3,-14,-21,9,-17,2,9,-16,-20,-18,-17,-4,6,16,-24,-9,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00248;
//
ID   CHANNEL_COLICIN_MP; MATRIX.
AC   MP00276;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Channel forming colicins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5089293; R2=0.0160087; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=577; N_SCORE=14.736; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-15,-20,-22,-17,-8,-24,-22,17,-20,-1,2,-7,-15,-12,-20,6,9,12,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-8,-24,-10,3,8,-20,-12,-18,7,-15,-10,-5,-15,-7,2,-4,-5,-13,-15,0,0;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-20,-21,-17,-11,-1,-18,-5,-13,4,-1,-15,-23,-15,-5,-10,-9,1,-22,-13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-3,-25,-6,-1,3,-18,9,-10,-5,-10,-9,-1,-20,-3,-8,-7,-7,-15,0,30,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-28,49,15,-35,-10,0,-35,9,-30,-25,24,-12,2,-1,0,-8,-28,-37,-18,8;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-32,-23,-35,-30,2,-32,-30,29,-23,9,9,-28,-27,-25,-23,-18,-8,31,1,0,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-18,-26,-22,-15,-13,-11,-17,-7,-2,-10,-5,-12,-21,-9,10,-10,-10,-3,-5,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-19,7,16,-21,-16,-10,-16,-4,-17,-15,-1,-10,1,-8,11,8,-8,-33,-17,8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,22,25,-32,-9,-5,-33,19,-27,-19,5,-8,8,6,-3,-11,-27,-28,-17,17;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-17,-17,-22,-16,15,-20,-18,2,-21,2,-2,-9,-20,-17,-17,3,6,2,-20,0,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-28,-22,-14,-12,-15,-17,9,-13,7,7,-14,-19,-4,-13,-15,-12,1,-20,-7,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,8,-29,9,26,-29,-18,-4,-29,30,-27,-15,7,-8,12,16,-4,-9,-25,-26,-15,19;
MA   /M: SY='G'; M=20,-12,-21,-18,-17,-22,26,-21,-16,-17,-15,-11,-7,-16,-16,-21,2,-10,-10,-20,-22,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-23,-23,-24,-21,8,-30,-9,13,-10,7,6,-22,-26,-16,-11,-17,-7,14,-6,23,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-13,13,-28,13,16,-30,-15,1,-28,20,-26,-14,13,-12,17,19,-2,-8,-26,-27,-14,16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-30,8,-1,-32,43,-14,-38,-12,-28,-22,3,-15,-11,-15,0,-17,-30,-25,-27,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,31,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,51,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-30,-8,-5,-26,11,-9,-33,17,-26,-13,0,-18,0,30,-7,-13,-23,-20,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-20,17,-30,43,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-37,-27,54,-28,-16,7,-26,19,14,-22,-28,-29,-18,-22,-10,3,0,20,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-19,-5,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-23,4,21,-23,-20,-10,-23,16,-20,-13,0,-7,7,6,4,10,-17,-27,-13,14;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-15,-27,-22,3,-28,-23,19,-23,27,12,-25,-27,-22,-18,-15,3,22,-25,-5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-17,-2,2,-22,-10,-12,-22,10,-27,-15,5,-10,2,3,20,15,-12,-32,-15,2;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-23,-31,-25,-17,-3,-20,-22,-4,-12,-6,-6,-20,-22,-12,-13,-15,-11,-9,35,5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=22,-20,-16,-28,-20,-10,-18,-25,17,-18,3,3,-17,-17,-17,-23,-3,-3,19,-22,-12,-20;
MA   /M: SY='V'; M=18,-21,-17,-29,-21,-9,-20,-26,19,-19,5,5,-18,-18,-18,-23,-5,-3,21,-22,-11,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,12,-26,19,-3,-32,31,-12,-36,-12,-30,-23,8,-15,-10,-15,7,-10,-26,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-23,-12,-15,-12,15,-13,-20,-9,-17,-12,3,-21,-14,-2,-2,-10,-13,-21,-16,-15;
MA   /M: SY='G'; M=14,-15,-18,-20,-19,-16,15,-18,-8,-15,-8,2,-12,-19,-15,-18,-2,-8,0,-22,-18,-17;
MA   /M: SY='A'; M=25,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25,10,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,25,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-9,-5,-18,-3,-15,-15,-10,-19,-15,1,-10,-5,-14,25,17,-5,-31,-18,-5;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-20,-14,-9,-18,4,-13,-18,1,-16,-10,-7,-14,-7,-8,0,-7,-11,-14,-7,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,18,14,-28,-28,-26,-22,-15,-4,40,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='V'; M=17,-18,-10,-23,-20,-9,-18,-25,10,-15,0,0,-18,-20,-20,-18,2,8,24,-27,-13,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-17,-15,-25,-15,-11,-12,-22,6,-17,6,0,-15,-15,-13,-22,-2,-3,7,-20,-13,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-21,-21,-15,0,-18,-18,0,-21,11,0,-18,-23,-13,-17,-7,-3,-3,1,-2,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00249;
//
ID   STAPH_STREP_TOXIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00277;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Staphylococcal enterotoxin/Streptococcal pyrogenic exotoxin signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9509168; R2=0.0140598; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=542; N_SCORE=12.561; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-6,0,-23,-3,-8,-11,3,16,-21,-10,-22,-12,10,-19,-4,-9,7,-4,-20,-20,6,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-11,-28,-12,-13,-3,-29,-12,10,-10,6,4,-13,-21,-11,-13,-17,-10,3,-14,10,-14;
MA   /M: M=-11,-2,-1,-5,-7,-17,-23,-11,-5,-14,-2,-3,-2,-22,-1,-14,-10,-9,-9,-31,-12,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-12,11,23,-3,-13,-12,-15,-1,-20,-11,-22,-17,21,-28,-11,-11,-1,-5,-20,-31,-6,-13;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-14,-16,-12,-5,-13,-12,-2,-15,-3,-4,-10,-19,-11,-15,8,4,4,-22,-2,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-8,-5,-10,-14,-25,20,23,-35,-18,-25,-13,0,-23,-11,-14,-5,-18,-27,-29,-11,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-26,-2,6,-27,9,-11,-27,2,-22,-13,0,-12,6,-3,3,0,-22,-24,-18,6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-19,-4,-4,-17,1,-14,-15,-9,-16,-12,6,-15,-9,-11,7,11,-8,-30,-17,-7;
MA   /M: SY='E'; M=0,1,-26,3,9,-23,-18,-14,-13,-7,-15,-13,-5,9,-3,-14,0,0,-13,-29,-18,1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-22,15,11,-23,2,-3,-25,7,-22,-15,14,-9,2,0,0,-7,-22,-24,-16,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-24,-6,-1,-19,-3,-5,-25,20,-19,-9,0,-14,4,35,-6,-9,-17,-16,-11,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-14,-3,0,-16,-12,-11,-16,10,-17,-10,2,-8,0,4,10,16,-8,-22,-10,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-8,-13,-8,-13,-6,-16,-8,-8,-8,-8,-5,-8,-8,-13,11,15,0,-19,-13,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-20,88,-28,-28,-9,-30,-19,-24,-26,-16,-16,-20,-38,-26,-26,-12,-10,-10,-33,-6,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-22,-31,-22,-1,-28,-14,27,-18,16,35,-17,-19,-9,-18,-15,-2,16,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-30,-3,7,-21,-19,-10,-16,0,-14,-11,-2,21,-3,-6,-9,-8,-21,-28,-18,1;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-2,-26,-4,-2,-20,-16,74,-26,-10,-18,-2,6,-18,6,-4,-6,-16,-24,-28,11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-28,25,35,-32,-15,4,-28,7,-23,-18,13,-7,22,0,2,-8,-30,-31,-18,28;
MA   /M: SY='G'; M=-4,10,-26,2,-12,-26,42,-8,-32,-12,-30,-20,24,-20,-12,-12,4,-12,-30,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-2,-30,-2,7,-27,-20,29,-28,21,-23,-5,3,-15,18,25,-8,-13,-25,-23,-1,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-31,-24,18,-30,-22,19,-28,36,15,-29,-30,-25,-20,-24,-8,17,-18,2,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-24,27,16,-27,-13,-3,-27,7,-25,-20,19,-10,3,-1,4,3,-23,-34,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-29,3,16,-21,-20,16,-15,4,-16,-7,7,-12,7,0,-6,-11,-18,-28,-7,9;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-23,1,13,-20,-14,-5,-19,15,-18,-11,-3,10,6,12,-5,-7,-18,-18,-12,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-12,-14,-10,8,-15,-4,7,-12,18,7,-14,-15,-9,-9,-14,-5,2,-2,12,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-24,-2,8,-23,-16,-3,-22,30,-21,-6,0,-9,15,27,-6,-8,-17,-16,-8,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,6,-19,3,5,-21,-10,-5,-21,23,-24,-11,10,-9,5,13,3,-2,-16,-22,-11,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-17,-28,-24,0,-28,-24,33,-20,12,12,-19,-19,-19,-20,-12,-5,30,-19,-3,-24; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-19,-14,-9,-10,-19,-17,0,-12,-2,-3,-16,18,-13,-14,-6,3,0,-22,-13,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-14,-27,-24,0,-27,-24,30,-19,11,11,-20,-20,-20,-19,-11,-3,33,-20,-5,-24; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,10,-20,3,2,-17,-9,2,-20,17,-21,-11,19,-14,5,26,-1,-5,-19,-22,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-11,-24,-20,3,-24,-20,20,-19,21,11,-24,-24,-20,-16,-14,-3,27,-20,-5,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-28,-29,-32,-24,34,-20,-22,-11,-22,-9,-11,-22,-26,-25,-18,-16,-12,-13,52,20,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-28,-27,-11,-3,-34,-22,29,-23,19,13,-19,-19,-13,-22,-19,-10,15,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00250;
//
ID   STAPH_STREP_TOXIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00278;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Staphyloccocal enterotoxin/Streptococcal pyrogenic exotoxin signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2844529; R2=0.0144460; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=542; N_SCORE=13.104; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-25,-26,-27,-23,11,-23,-19,-2,-17,-7,-7,-23,-26,-20,-16,-13,-3,1,35,17,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,1,-28,5,7,-19,-24,14,-7,-9,-9,-4,-2,-15,-1,-11,-8,-11,-7,-30,-5,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-22,38,11,-28,-7,0,-28,4,-26,-21,20,-10,1,-3,4,-4,-23,-32,-16,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-27,-6,-14,-28,50,-16,-36,-12,-30,-19,6,-18,-14,-13,4,-13,-27,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-28,-7,5,-22,-23,-12,-15,28,-18,-6,-5,-13,4,22,-10,-9,-9,-22,-10,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,14,-27,15,20,-34,-14,6,-24,5,-24,-11,12,-10,33,3,5,-6,-28,-28,-15,27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-18,-3,2,-21,-14,-8,-17,3,-18,-10,5,-12,10,0,14,15,-13,-29,-13,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-18,-2,7,-11,-14,-2,-11,-1,-11,-7,-5,7,5,-4,-1,2,-13,-11,-1,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-19,-22,-18,-1,-25,-19,15,-21,19,8,-18,-13,-18,-18,-17,-6,12,-24,-7,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-26,-8,-3,-22,-9,-16,-18,-4,-21,-14,-7,22,-6,-10,4,1,-17,-30,-20,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-13,-18,-19,-16,23,-19,-8,3,-17,5,0,-7,-21,-16,-13,-9,-4,-2,-6,15,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,12,-16,14,15,-15,-8,1,-13,1,-10,-5,7,-6,5,-3,-1,-5,-14,-19,-10,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-23,-3,-2,-12,-8,-14,-19,2,-13,-10,-4,-15,-8,-3,-4,-2,-11,-22,-10,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-22,-31,-26,-4,-33,-29,31,-23,8,10,-25,-9,-23,-24,-14,-5,31,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-26,-6,6,-24,-22,-7,-17,17,-17,-6,-2,-12,15,18,-3,1,-14,-22,-10,9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-15,-22,-18,7,-26,-22,5,-18,4,0,-11,-18,-18,-16,2,24,10,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-11,33,-24,31,13,-28,-7,2,-28,6,-29,-22,32,-13,3,-1,6,-4,-27,-37,-19,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,6,-30,7,9,-30,-18,-9,-29,35,-30,-14,4,0,6,19,-8,-9,-23,-24,-14,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-25,-2,6,-23,-16,-1,-11,6,-16,1,9,-14,16,2,-1,-6,-16,-27,-11,11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-13,-31,-29,10,-30,-27,25,-23,16,10,-29,-30,-30,-20,-14,-3,39,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-10,-11,-10,-11,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,43,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='V'; M=9,-24,-17,-30,-22,3,-23,-24,18,-22,13,7,-21,-22,-21,-22,-11,-5,19,-19,-5,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,0,17,-37,-17,7,-20,7,-21,-3,1,-10,51,7,6,-6,-27,-23,-11,34;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-27,16,50,-27,-20,-3,-27,7,-19,-19,0,-1,16,-1,3,-1,-26,-30,-19,33;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,16,-31,-22,22,-29,39,17,-28,-29,-23,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-27,-24,-33,-25,29,-30,-15,16,-25,17,8,-21,-26,-23,-21,-20,-9,8,-2,22,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,1,18,-30,-21,-5,-25,31,-22,-8,-2,-10,21,19,-7,-10,-22,-21,-11,19;
MA   /M: SY='I'; M=15,-21,-18,-29,-21,-8,-22,-26,21,-20,6,6,-17,-17,-17,-24,-5,-1,20,-22,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-15,2,-29,0,4,-24,-18,31,-29,22,-25,-7,8,-16,9,23,-8,-13,-24,-25,0,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-29,-25,-18,24,-28,0,1,-15,4,2,-20,-26,-8,-12,-20,-12,-8,20,40,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-11,-20,-18,-11,-11,-23,-4,6,-11,-1,12,-8,-16,1,-11,-1,8,3,-25,-4,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-29,19,19,-33,-9,-3,-31,17,-27,-16,9,-10,14,7,-2,-10,-27,-28,-16,16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,9,-28,6,7,-25,-18,-7,-17,21,-22,-10,11,-13,4,10,-6,-8,-16,-26,-12,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-13,-28,-14,-10,9,-26,17,-11,3,-6,-1,-11,-23,-5,0,-17,-11,-13,3,38,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-28,10,3,-29,6,-5,-30,15,-29,-16,17,-15,3,6,-1,-10,-26,-27,-18,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-14,22,-26,22,15,-22,-12,4,-26,5,-23,-19,22,-14,4,7,2,-4,-26,-30,-11,9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=0,2,-14,-5,-7,3,-8,-7,-13,-6,-15,-11,12,-15,-9,-6,8,2,-11,-21,-6,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-23,28,12,-25,-6,-2,-27,2,-22,-19,15,-10,1,2,2,-2,-22,-29,-16,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-13,-1,2,-15,-1,-8,-13,-6,-17,-12,3,-3,-3,-8,13,7,-9,-25,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-16,-2,-2,-24,13,-10,-24,-10,-29,-18,7,-12,2,-10,27,8,-16,-34,-21,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-31,6,10,-30,-17,-10,-28,20,-27,-16,-2,12,3,11,-6,-9,-23,-26,-17,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-27,-23,-19,17,-30,-2,7,-7,1,3,-19,-26,-14,-9,-17,-9,3,6,39,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-20,0,15,-23,-17,-7,-15,-1,-16,-10,-1,-9,13,-4,11,11,-11,-30,-14,14;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-21,-5,-3,-21,-2,-11,-25,8,-24,-14,3,-14,-1,13,11,8,-15,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-15,-24,-16,-12,7,-24,0,-4,-5,2,-1,-13,-23,-7,-1,-10,0,-7,-3,27,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-31,-30,-38,-29,3,-35,-29,35,-28,16,13,-25,-24,-21,-26,-23,-12,21,3,3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,-3,12,-12,-21,-11,-23,22,-20,-11,-3,-11,2,11,-5,-2,-17,-19,-7,8;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,37,-33,-23,21,-30,24,12,-23,-27,-28,-23,-23,-10,12,-7,13,-27;
MA   /M: SY='T'; M=10,3,-18,1,-7,-22,7,-17,-22,-11,-18,-16,1,-12,-11,-15,9,11,-12,-27,-19,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00250;
//
ID   MAC_PERFORIN_MP; MATRIX.
AC   MP00279;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Membrane attack complex components / perforin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8976841; R2=0.0143324; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=650; N_SCORE=14.204; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-31,-21,-32,-24,15,-29,-23,15,-27,30,12,-30,-30,-24,-20,-26,-10,12,0,4,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,6,-26,8,10,-30,-16,-3,-21,11,-16,-8,0,-12,20,4,-4,-9,-20,-24,-12,15;
MA   /M: SY='R'; M=-2,6,-24,9,9,-25,-12,8,-27,5,-21,-15,4,-13,4,12,2,-6,-19,-28,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,26,-27,36,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-25,-5,-1,-23,-9,-8,-22,22,-22,-6,3,-15,2,19,-4,-7,-14,-24,-13,0;
MA   /M: SY='H'; M=8,5,-20,4,7,-23,-8,11,-23,-3,-20,-14,7,-12,2,-5,8,-3,-17,-30,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-11,-22,-10,1,-11,-22,6,-7,-10,4,1,-9,-18,1,-4,-7,-3,-8,-26,-4,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-23,5,19,-23,-15,7,-20,-1,-16,-11,7,-11,13,-3,4,-2,-21,-30,-13,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,28,-22,22,17,-24,-6,4,-24,1,-27,-21,35,-13,5,-2,10,-1,-27,-37,-20,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-9,-24,-10,-7,-1,-18,2,-13,5,-15,-8,-7,-19,-3,-1,-1,-2,-12,-3,25,-7;
MA   /M: SY='G'; M=8,-7,-22,-8,-13,-26,41,-17,-31,-16,-28,-19,2,-16,-13,-17,14,-5,-21,-26,-26,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-21,-6,12,-12,-21,-9,-3,-6,0,2,-7,-10,1,-8,-3,5,-5,-24,-9,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-24,-16,-9,-1,-19,1,-12,-1,-7,-5,-6,-21,-4,16,-5,-5,-9,-16,4,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-26,0,2,-26,-10,-6,-27,17,-21,-12,1,-15,7,27,-3,-9,-19,-23,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26,35,-32,-22,17,-30,30,12,-24,-28,-28,-22,-24,-10,9,-8,12,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-25,-35,-26,17,-35,-22,29,-28,27,16,-23,-25,-22,-24,-23,-10,16,-12,10,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-24,18,19,-26,-11,-1,-28,6,-25,-20,14,-11,7,10,9,-2,-23,-33,-18,12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,30,-23,37,11,-31,-10,-3,-29,-2,-26,-22,18,-11,4,-7,10,4,-23,-37,-18,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-23,-30,-23,4,-30,-24,26,-25,11,9,-14,-19,-18,-23,-8,1,16,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-16,-7,-3,-17,-17,-13,-16,1,-17,-11,2,-11,1,3,16,29,-8,-29,-12,-1;
MA   /M: SY='S'; M=13,4,-15,1,10,-22,-4,-8,-20,-5,-23,-18,8,-9,2,-9,22,7,-14,-33,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=10,-15,-21,-17,-20,-21,33,-22,-18,-18,-17,-11,-9,-20,-20,-20,0,-11,-5,-22,-23,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-17,6,4,-21,-12,-12,-17,-2,-21,-15,3,-12,-2,-6,16,12,-6,-34,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-19,-27,-18,6,-26,-16,16,-25,38,21,-25,-27,-15,-18,-22,-7,8,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-25,-9,0,-12,-26,-13,0,-4,1,-1,-10,-17,-4,4,-11,-5,0,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-29,-24,-22,23,-32,8,10,-14,4,4,-21,-28,-13,-14,-19,-9,1,18,61,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-25,17,37,-28,-14,-2,-29,6,-23,-20,4,-5,13,3,8,-3,-24,-32,-19,25;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-25,-20,-26,-21,12,-27,-9,13,-19,18,8,-25,-28,-18,-17,-18,-7,11,-5,23,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-28,-22,2,-30,-24,22,-24,24,12,-22,-24,-20,-20,-14,4,19,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-19,-20,-23,-19,17,-27,-6,5,-16,10,7,-18,-25,-15,-14,-12,5,3,-3,27,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00251;
//
ID   BPTI_KUNITZ_1_MP; MATRIX.
AC   MP00280;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pancreatic trypsin inhibitor (Kunitz) family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9362583; R2=0.0129250; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=740; N_SCORE=14.491; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-21,-28,-19,15,-28,-18,15,-19,10,12,-18,-22,-19,-17,-14,-7,13,-16,3,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-27,-12,-2,-18,-22,-13,-9,-3,-11,-7,-10,11,-2,-1,-5,-1,-11,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-11,-25,-13,-4,-16,-17,-4,-19,14,-12,-6,-3,-18,3,36,-6,-7,-12,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-34,-32,-26,35,-26,-10,-7,-19,-5,-7,-27,-28,-22,-17,-27,-17,-14,65,46,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-27,-23,-20,28,-24,6,-5,-14,-3,-4,-17,-27,-15,-12,-16,-10,-10,25,48,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-22,43,-30,11,-1,-16,2,0,-19,-30,-19,-13,-20,-10,-8,21,62,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-12,38,-24,32,7,-27,-5,5,-27,3,-29,-22,40,-16,2,0,6,-4,-28,-38,-19,4;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-22,-11,-6,-16,-14,-16,-12,-8,-15,-11,-9,6,-7,-11,3,2,-9,-20,-14,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-22,-4,3,-17,-17,-8,-16,7,-16,-9,-3,-14,0,6,1,1,-8,-25,-10,1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-6,-3,-17,-12,-11,-12,-3,-15,-10,3,-13,-2,-5,11,11,-8,-28,-13,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-27,0,-2,-26,14,-4,-30,7,-27,-15,10,-16,-1,5,1,-10,-25,-24,-16,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-22,-8,1,-18,-16,-10,-17,10,-15,-7,-2,-13,6,9,1,3,-12,-23,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-24,-2,14,-20,-20,-1,-12,1,-10,-7,-4,-13,8,-1,-3,-5,-11,-26,-11,10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-25,-5,5,-22,-15,-9,-18,2,-18,-10,-3,5,4,3,3,1,-16,-28,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-16,-23,-21,-16,-7,-27,-17,11,-12,1,3,-11,-17,-11,-12,-8,0,10,-20,-5,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-30,-22,-21,33,-30,17,-1,-12,0,0,-20,-30,-12,-11,-20,-11,-10,30,74,-21;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-25,-8,-15,-26,47,-18,-34,-15,-27,-19,1,-18,-15,-14,6,-8,-24,-24,-26,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-2,-29,-1,2,-28,16,-5,-31,4,-26,-14,4,-15,4,7,-2,-13,-27,-22,-17,2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,64,-20,-38,-18,-29,-19,-1,-19,-19,-19,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,37,-21,19,1,-21,-1,9,-21,3,-30,-19,56,-19,1,2,9,-1,-29,-39,-19,1;
MA   /M: SY='A'; M=10,4,-22,2,1,-26,6,-10,-25,-1,-22,-16,5,-13,-1,-4,5,-6,-18,-26,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,21,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-12,19,-24,8,1,-21,-8,10,-24,11,-27,-15,34,-19,4,20,3,-4,-26,-32,-14,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-26,-1,6,-19,-16,-3,-18,10,-14,-6,-2,-14,6,8,-6,-6,-16,-21,-5,5;
MA   /M: SY='T'; M=2,3,-12,-2,-4,-15,-11,-13,-16,-8,-19,-15,8,-11,-5,-8,25,31,-7,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-28,-7,10,-17,-24,-10,-7,2,-5,-3,-8,-11,5,0,-9,-8,-10,-21,-10,6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,15,26,-30,-15,0,-28,11,-21,-15,3,-8,13,5,-1,-8,-24,-28,-16,20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-24,12,23,-24,-16,-3,-21,1,-14,-13,1,-10,8,-5,-2,-8,-20,-26,-12,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-26,-7,7,-14,-21,-1,-11,4,-2,5,-6,-16,6,10,-11,-9,-12,-23,-8,5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-18,-3,5,-23,-16,2,-25,14,-20,-11,4,-16,7,20,-4,-7,-20,-25,-11,4;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-18,-13,-7,-9,-19,-8,-9,-4,-9,-6,-7,-15,-6,-3,3,11,-2,-21,-2,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: M=-2,-12,-23,-12,-8,-14,-6,-12,-10,-5,-8,-3,-9,-16,-8,-5,-4,-7,-5,-23,-12,-9;
MA   /M: M=-2,-8,-24,-9,-3,-20,-1,-14,-17,-2,-17,-9,-5,-5,-6,-4,-1,-5,-11,-25,-17,-5;
MA   /M: M=0,-8,-21,-10,-4,-17,-10,-12,-14,-1,-16,-9,-5,-3,-5,-5,-3,-6,-12,-22,-11,-5;
MA   /M: M=-2,-12,-24,-13,-8,-13,-10,-13,-9,-8,-8,-4,-9,-11,-4,-7,-4,-6,-8,-19,-11,-7;
MA   /M: M=-5,-6,-20,-7,-4,-16,-10,-12,-13,0,-15,-7,-4,-12,-5,-3,-4,-7,-10,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-27,-3,1,-26,-6,-7,-23,4,-23,-13,-1,6,2,0,0,-3,-21,-26,-17,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-26,-1,-1,-20,-9,-10,-20,-3,-19,-14,-3,1,-2,-5,-3,-5,-18,-14,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-21,0,6,-22,-6,-11,-22,0,-21,-14,-1,-4,0,-5,-1,-8,-18,-27,-17,3;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-2,-13,-6,-2,-14,-13,-10,-11,-6,-11,-9,4,-16,-7,-5,0,-3,-9,-30,-15,-5;
MA   /M: M=-8,-11,-25,-12,-7,-13,-18,-15,-7,-4,-5,-4,-8,-3,-8,-5,-8,-2,-7,-20,-11,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00252;
//
ID   BOWMAN_BIRK_MP; MATRIX.
AC   MP00281;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bowman-Birk serine protease inhibitors family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6822393; R2=0.0046644; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=903; N_SCORE=7.894; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=605; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-25,49,12,-32,-11,-3,-33,-1,-26,-25,19,-12,-1,-6,4,2,-24,-38,-18,7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-5,-23,-11,-7,-10,-14,-9,-6,-5,-5,-3,1,-18,-3,-4,-4,-2,-8,-24,-9,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=3,-14,67,-22,-18,-19,-19,-21,-21,-19,-15,-14,-14,-26,-15,-21,-4,-7,-8,-35,-22,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-15,-16,-19,-14,0,-19,-14,7,-14,8,9,-13,-12,-11,-12,-8,0,5,-18,-4,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,14,-14,5,-5,-15,-15,-12,-15,-7,-16,-14,15,-12,-7,-8,16,33,-10,-33,-13,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-11,-1,-10,-20,-8,-24,27,-19,-9,-4,-17,1,34,-10,-9,-16,-16,-5,-1;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-13,-3,-1,-19,-4,-8,-19,-5,-26,-14,7,-12,1,-1,31,15,-10,-36,-18,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-12,-24,-21,-14,2,-24,-15,14,-16,3,6,-5,-19,-11,-16,-10,-8,5,-19,-3,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,76,-9,-19,-3,-6,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-36,-11,-4,-29,-6,-20,-22,-11,-28,-19,-16,67,-11,-20,-7,-11,-28,-28,-29,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-24,-9,7,-13,-24,-7,-8,-5,-3,-1,-7,-14,14,-5,-4,2,-12,-21,-7,11;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-20,99,-29,-29,-13,-30,-23,-26,-27,-17,-17,-20,-39,-27,-27,-11,-10,-10,-39,-14,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-23,-10,-3,-18,-21,3,-19,10,-15,-6,-2,-18,6,31,-2,3,-10,-24,-7,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-18,-4,-8,-16,-12,-14,-7,-7,-10,-5,-5,-17,-8,-7,3,5,3,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,66,20,-39,-10,0,-39,0,-30,-29,21,-11,2,-9,0,-9,-30,-39,-20,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-19,-22,-13,-6,-29,-22,17,-13,8,8,-19,-20,-15,-15,-10,0,21,-26,-8,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-24,-17,-11,-5,-15,-13,-13,7,-8,-4,-10,-22,-8,22,-12,-9,-3,-18,-7,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-27,28,20,-30,-12,0,-30,15,-28,-20,22,-11,7,5,0,-7,-27,-33,-17,14;
MA   /M: SY='S'; M=-6,7,-22,10,8,-25,-11,7,-26,3,-25,-15,8,-12,8,5,13,3,-19,-33,-12,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-6,4,-26,7,2,-24,-13,42,-27,-9,-23,-11,6,-3,3,-7,1,-9,-24,-32,-2,-1;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-20,11,3,-26,-6,-11,-23,-8,-28,-21,4,9,-3,-13,18,6,-17,-36,-22,-1;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-10,-18,-12,-17,-5,-20,-6,-11,-9,-8,-11,-13,-12,-19,9,3,6,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,10,-28,9,12,-29,-16,-6,-29,35,-29,-14,11,-11,8,20,-5,-8,-23,-25,-13,10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-20,9,8,-25,-10,-6,-25,7,-26,-17,7,-10,3,2,15,7,-16,-33,-16,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-18,-23,-15,-8,-18,-19,13,-16,7,10,-19,-22,-13,-17,-10,-6,17,-24,-10,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-17,62,-22,-17,-19,-27,-24,-21,-15,-17,-14,-17,-26,-20,-15,-9,-9,-5,-41,-24,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-13,-10,-6,-13,-18,-17,-9,-6,-11,-9,-3,-13,-8,-4,12,26,2,-29,-12,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-24,-7,-1,-8,-18,0,-18,3,-10,-8,-4,-18,-2,15,-6,-7,-14,-18,-1,-3;
MA   /M: SY='S'; M=8,4,-11,5,1,-21,-1,-9,-21,-9,-30,-21,11,-10,0,-10,37,18,-11,-40,-20,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-3,-25,-6,-6,-4,-21,-1,2,-7,-2,5,-2,-18,-3,-7,-10,-8,-5,-14,8,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-33,-8,0,-26,-16,-17,-19,-9,-28,-19,-14,69,-8,-17,-2,-5,-25,-29,-26,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-29,-9,-8,-27,16,-17,-25,-13,-27,-18,-4,24,-12,-18,0,-10,-24,-26,-27,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,2,-28,-1,9,-28,-17,4,-22,16,-19,-5,7,-15,28,25,-4,-9,-24,-23,-11,17;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-9,61,-18,-21,-13,-24,-6,-24,-18,-19,-15,-5,-33,-18,-16,-9,-9,-15,-35,-9,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-19,-17,-10,-3,-21,-8,-2,-1,-5,0,-9,-19,-4,12,-7,-5,4,-18,-4,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-17,103,-26,-26,-17,-26,-26,-26,-26,-17,-17,-17,-34,-26,-26,-9,-9,-9,-43,-26,-26; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-14,-18,-18,-13,7,-18,-13,1,-12,6,2,-12,-19,-10,-10,-9,0,0,-13,2,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,40,-24,56,15,-32,-8,0,-32,0,-25,-24,19,-10,0,-8,0,-7,-25,-33,-17,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-23,-3,3,-23,-20,-13,-23,30,-23,-10,0,-10,3,16,0,10,-13,-23,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00253;
//
ID   KAZAL_MP; MATRIX.
AC   MP00282;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Kazal serine protease inhibitors family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5143876; R2=0.0110541; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=514; N_SCORE=10.186; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,2,-24,3,6,-21,-15,-1,-17,-2,-16,-10,3,-3,7,-5,3,-1,-19,-28,-10,6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-15,18,1,-16,-10,-6,-10,-5,-11,-7,3,-10,-5,-9,1,-2,-4,-24,-11,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-8,-19,-13,-11,3,-16,-13,-4,-11,-1,-3,-3,-18,-10,-10,-6,-1,-4,-19,-4,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-23,-11,-9,-13,10,-11,-18,-7,-14,-9,-5,-13,-7,-6,-3,-9,-15,-16,-9,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-7,-18,-11,-9,-22,-14,-14,6,-13,-7,-8,-21,-8,17,-9,-5,-6,-23,-9,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-26,7,17,-27,-18,-4,-20,5,-18,-7,-1,-1,15,1,1,0,-20,-28,-15,16;
MA   /M: SY='P'; M=3,-17,-26,-15,-6,-19,-19,-20,-3,-13,-14,-9,-15,25,-11,-19,-2,-4,-3,-28,-20,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-23,19,8,-21,-12,-2,-20,-1,-21,-15,13,-13,-1,-6,4,-3,-17,-32,-14,3;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-15,104,-22,-23,-22,-28,-27,-31,-26,-21,-21,-17,-36,-26,-27,-9,-10,-12,-48,-29,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-24,11,5,-24,-5,-3,-26,1,-24,-17,9,-7,-1,-3,5,1,-21,-29,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,9,-26,11,13,-23,-18,5,-18,3,-17,-11,7,-14,6,0,-4,-8,-16,-29,-10,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-16,-27,-18,-12,19,-25,7,-5,-5,-2,4,-14,-24,-6,-1,-15,-9,-10,7,39,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-17,-1,1,-16,-12,-5,-16,9,-14,-8,-1,-4,5,15,-1,-1,-11,-17,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-14,5,11,-14,-11,-5,-12,3,-10,-8,0,-6,2,0,2,2,-8,-18,-9,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-16,-19,-18,-12,5,-15,-7,-1,-14,3,1,-14,-12,-13,-13,-10,-6,-1,-13,3,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-5,-19,-5,-3,-15,-6,-8,-12,-3,-14,-7,-3,17,-5,-6,-2,0,-12,-18,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=1,-6,-13,-5,-2,-11,-5,-9,-8,0,-10,-6,-5,6,-3,-4,1,-1,-6,-15,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-8,11,-9,-10,-4,-14,-11,-5,-11,-6,-6,-9,-6,-11,-12,-5,-4,-2,-15,-6,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-22,-10,-12,-10,4,-12,-12,-11,-11,-6,-1,-13,-12,-13,-4,-8,-11,-19,-10,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-24,-10,-5,-21,-16,-19,-15,-10,-21,-15,-8,34,-9,-15,7,14,-15,-30,-21,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-28,-5,0,-21,-20,-1,-17,15,-13,1,-4,-11,6,24,-11,-10,-14,-23,-9,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-27,8,13,-23,-21,-4,-9,-5,-11,-7,1,-11,7,-9,-4,-6,-11,-28,-12,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-24,-21,-18,23,-25,-1,3,-17,6,4,-15,-24,-15,-14,-14,-7,-4,2,33,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-22,9,-2,-16,-14,-2,-13,-2,-14,-11,13,-19,-6,-2,-2,-5,-11,-31,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-38,-12,-2,-27,-21,-19,-17,-10,-23,-17,-20,76,-10,-16,-12,-10,-27,-29,-27,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-29,-26,0,-31,-20,27,-22,15,12,-26,-28,-24,-20,-14,-4,36,-27,-5,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-29,-7,-18,-30,63,-19,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,1,-18,-28,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,2,-13,-2,-2,-18,-11,-12,-16,-8,-20,-14,5,-10,2,-8,26,29,-8,-34,-15,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-27,55,14,-35,-7,1,-34,0,-29,-27,28,-12,0,-8,3,-7,-29,-39,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-10,-18,-24,49,-14,-31,-16,-24,-13,2,-20,-16,-16,-1,-16,-25,-19,-21,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-8,0,-19,-22,-8,-8,11,-12,-3,1,-16,4,13,-8,-8,-8,-24,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,2,-12,-7,-6,-11,-18,-17,-11,-9,-11,-10,3,-11,-8,-9,18,40,-3,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,-6,-22,-7,-3,-22,5,-13,-21,-10,-24,-17,-1,8,-7,-15,11,0,-17,-27,-19,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,34,-19,17,0,-20,0,7,-20,-1,-30,-20,53,-19,0,-1,14,3,-27,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-29,6,30,-28,-17,-7,-26,15,-23,-16,-3,7,10,4,-1,-8,-24,-27,-19,19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=0,-14,-19,-20,-14,-6,-22,-13,8,-14,4,5,-9,-18,-10,-14,-4,3,6,-24,-6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-27,-19,-32,-22,29,-26,-20,9,-27,29,9,-24,-27,-25,-20,-21,-9,5,-10,7,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-5,-18,-12,-13,0,-17,-7,0,-10,-2,2,3,-22,-12,-9,-4,-1,1,-26,-6,-12;
MA   /M: SY='E'; M=6,-2,-24,-1,17,-22,-3,-10,-24,2,-18,-14,-3,-9,5,-5,2,-7,-19,-23,-17,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-8,-22,-15,-14,-5,-22,-13,6,-6,-1,1,0,-23,-12,-3,-9,-5,5,-24,-6,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-16,-6,-1,-11,-12,3,-8,5,-6,0,0,-11,6,12,-4,-5,-8,-15,-4,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-25,-4,2,-18,-16,-6,-8,2,-7,1,-7,-16,0,-3,-10,-10,-6,-25,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-26,-1,4,-19,-13,4,-25,13,-20,-11,5,-15,4,18,-2,-4,-20,-25,-9,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-23,-2,2,-26,-4,-5,-22,3,-24,-11,5,-9,11,5,10,1,-19,-28,-16,6;
MA   /M: SY='N'; M=-9,4,-22,-1,2,-11,-13,-4,-18,0,-16,-10,8,-15,1,3,3,4,-16,-26,-10,1;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-15,10,8,-15,-7,1,-14,0,-13,-10,7,0,1,-3,1,-3,-14,-20,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-17,-5,-6,-17,24,-5,-20,-5,-16,-9,0,-10,-5,-5,-1,-10,-16,-12,-13,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-12,-2,-2,-12,-10,-9,-8,3,-11,-6,-2,-2,-2,0,3,5,-4,-16,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-2,-32,-25,2,-31,-25,23,-26,14,9,-21,-24,-22,-24,-16,-8,19,-22,-5,-25; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-23,-3,-3,-9,-18,2,-10,-5,-6,-2,2,-13,2,-1,-7,-5,-13,-22,-4,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-25,-25,-31,-22,11,-32,-17,21,-21,19,12,-19,-23,-19,-16,-19,-8,12,-16,4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=2,-5,-22,-8,-4,-18,-8,-10,-9,-4,-9,-3,-3,-16,1,-7,-1,-5,-8,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-2,-29,-3,2,-23,-20,26,-24,20,-22,-6,4,-16,8,20,-8,-12,-20,-24,0,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00254;
//
ID   SOYBEAN_KUNITZ_MP; MATRIX.
AC   MP00283;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Soybean trypsin inhibitor (Kunitz) protease inhibitors family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0592318; R2=0.0146664; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=232; N_SCORE=8.452; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=8,-19,8,-26,-20,0,-19,-23,0,-21,-2,-4,-15,-23,-20,-22,-2,-2,7,-25,-10,-20;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='T'; M=8,-7,-13,-13,-8,-8,-13,-14,-10,-4,-8,-7,-5,-13,-7,-1,7,14,-3,-21,-9,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='F'; M=1,-10,-15,-14,-11,5,-11,-13,-7,-16,-4,-7,-4,-18,-12,-13,5,2,-5,-12,-4,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-8,-20,-9,-1,-15,-16,-7,-7,-3,-10,-4,-6,6,7,-3,-1,2,-10,-16,-6,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-4,-17,-12,-11,-3,-16,-11,6,-12,-1,-1,3,-8,-10,-12,-4,0,0,-19,-6,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='P'; M=2,-9,-15,-9,-5,-9,-10,-12,-9,-11,-10,-9,-6,10,-7,-12,6,4,-8,-22,-12,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-13,-22,-15,15,-19,-14,10,-20,26,10,-18,-20,-16,-14,-17,-6,5,-10,3,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-29,-10,-2,-17,-15,-16,-14,-9,-21,-14,-15,59,-10,-16,-7,-7,-21,-21,-20,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=1,9,-12,13,3,-19,-3,-7,-19,-6,-22,-17,9,-8,-1,-8,23,12,-11,-31,-15,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-8,-5,-5,-10,7,-9,-10,-7,-10,-8,0,-7,-5,-8,9,7,-5,-14,-10,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='C'; M=1,-9,12,-12,-11,-5,-13,-13,0,-10,-3,-3,-8,-12,-11,-11,0,6,7,-17,-8,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='H'; M=2,-2,-14,-4,-3,-12,-4,31,-14,-6,-10,-3,2,-10,1,-5,-2,-8,-12,-15,2,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-12,24,12,-22,-10,-4,-22,0,-17,-16,5,-4,0,-4,0,-4,-17,-24,-14,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,5,-7,-1,-2,-11,0,-4,-9,-4,-12,-9,10,-7,-2,-6,11,3,-7,-18,-11,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-8,-6,-7,-8,-7,-11,-1,-8,-2,-3,-7,-10,-8,-11,2,0,5,-16,-9,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-4,-26,2,4,-21,-14,-12,-15,-7,-14,-13,-8,32,-6,-13,-7,-7,-19,-25,-19,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-26,9,9,-29,-14,-8,-24,5,-24,-15,2,7,7,-2,3,0,-21,-29,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-31,-7,6,-17,-20,-16,-15,-9,-19,-15,-14,39,-8,-16,-7,-9,-18,-26,-19,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-30,-27,3,-30,-27,28,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-27,-21,10,-29,-9,16,-24,30,14,-26,-29,-19,-17,-23,-8,13,-14,12,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-12,-17,-19,-15,-5,-17,-19,3,-15,-2,-1,-9,-18,-11,-15,1,9,7,-23,-8,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,28,-27,34,23,-26,-13,2,-28,2,-24,-22,18,-11,5,-5,2,-5,-27,-31,-12,13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-18,-30,66,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-28,22,15,-28,-13,9,-30,14,-27,-17,20,-13,7,10,-2,-8,-27,-31,-13,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-31,0,17,-22,-22,-12,-17,0,-15,-13,-10,22,0,-8,-7,-8,-19,-27,-18,7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,34,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,26,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-25,-2,4,-20,-19,-2,-16,7,-14,-7,1,-18,11,19,-3,-6,-12,-25,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=3,9,-21,-1,-6,-17,-9,-5,-11,-7,-19,-13,19,-1,-6,-11,4,0,-16,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-30,0,-13,-30,49,-14,-38,-12,-29,-20,5,-19,-14,-8,-1,-17,-29,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-23,-11,-11,-23,29,-17,-23,-15,-17,-11,-5,-17,-11,-16,2,-9,-15,-23,-22,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,7,-17,2,0,-20,-11,-7,-19,0,-22,-14,11,-12,4,1,17,18,-14,-32,-15,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-28,-21,-18,20,-29,8,1,-10,3,2,-17,-27,-10,-4,-17,-7,-6,12,50,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-27,2,-34,-25,38,-26,23,23,-24,-24,-20,-24,-20,-8,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-20,-20,-19,0,-28,-20,19,-23,24,11,-18,-26,-19,-19,-18,-7,16,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-27,-4,1,-25,-12,-11,-20,-8,-29,-18,-2,36,0,-12,9,1,-23,-32,-22,-2;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-22,-8,-3,-15,-13,-4,-10,-10,-12,-7,-7,-7,-4,-13,-1,-4,-6,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-23,-19,-18,2,-19,-18,11,-20,7,6,-10,-21,-16,-17,-11,-7,6,-21,-4,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-18,-33,-18,-11,-2,-21,-15,-17,-3,-12,-11,-16,-19,-8,9,-18,-12,-17,31,4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-26,-10,-13,-27,38,-18,-31,-13,-25,-17,-3,-9,-14,-13,1,-14,-23,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-20,-11,-7,-16,-6,1,-14,-5,-12,-6,-5,-16,-6,-9,-2,-8,-8,-22,-9,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-25,-6,-15,-25,53,-15,-33,-16,-26,-18,5,-17,-15,-16,3,-14,-25,-20,-25,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-27,-12,-19,-26,55,-20,-31,-19,-24,-16,-2,-18,-18,-20,0,-17,-23,-19,-26,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-27,4,-11,-29,43,-16,-35,-15,-27,-20,3,-17,-15,-17,2,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-26,4,-32,-24,31,-26,28,20,-27,-27,-21,-22,-21,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-23,-1,11,-11,-20,-1,-15,1,-14,-11,-1,-14,3,1,1,3,-14,-18,4,5;
MA   /M: SY='L'; M=3,-22,-19,-25,-17,-1,-14,-19,5,-21,16,8,-21,-15,-17,-19,-14,-6,4,-21,-8,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=27,2,-13,-8,-3,-19,-4,-13,-14,-7,-15,-13,6,-11,-6,-13,12,6,-8,-26,-19,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00255;
//
ID   SERPIN_MP; MATRIX.
AC   MP00284;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serpins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2892551; R2=0.0154787; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=218; N_SCORE=8.655; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-17,-6,-9,-18,1,-16,-16,-10,-16,-12,-2,-10,-10,-13,10,6,-7,-27,-17,-10;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-14,-11,-8,-12,-3,-14,-8,-8,-8,-6,-7,-10,-9,-10,3,3,-1,-20,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-13,-9,-6,-6,-14,-13,-6,-9,-7,-5,-4,-7,-9,-10,4,12,-2,-19,-8,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-11,-13,-13,-8,4,-11,-10,1,-9,0,0,-8,-13,-10,-7,-4,-1,3,-12,-1,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-14,-15,-13,-4,-16,-14,5,-11,1,2,-11,-14,-11,-11,-3,1,8,-18,-6,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: M=-3,-8,-23,-8,-1,-17,-5,-12,-15,-8,-15,-9,-6,0,-1,-10,-1,-5,-14,-24,-15,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-13,-16,-15,-10,-8,-19,-15,-1,-8,-1,1,-11,-13,-8,-7,-6,-3,2,-22,-9,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-5,-12,-7,-3,-14,-14,-7,-9,-7,-13,-5,-2,-15,-3,-6,5,0,-5,-26,-11,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='A'; M=2,-11,-21,-12,-6,-13,-14,-13,-8,-7,-8,-4,-9,-4,-7,-7,-4,-4,-6,-20,-11,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-10,-20,-13,-8,-13,-13,-13,-8,-2,-5,2,-8,-11,-6,1,-4,2,-4,-22,-11,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-11,-20,-11,-5,-13,-13,-13,-8,-7,-10,-5,-7,-3,-5,-5,3,3,-6,-26,-13,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-17,-4,1,-8,-12,-8,-6,-4,-1,-3,-4,-9,-3,-5,-5,-3,-6,-17,-6,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-21,-10,-5,-10,-13,-6,-10,-7,-12,-8,-10,20,-6,-7,-4,-3,-12,-16,-7,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-16,-4,0,-10,-13,-7,-5,-4,-6,-5,-5,3,-3,-5,-4,-2,-6,-17,-8,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-19,-3,4,-13,-18,-9,-4,-4,-6,-5,-4,-10,-2,-5,-1,2,-3,-23,-9,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-19,-34,-27,29,-31,-22,19,-26,19,12,-25,-28,-28,-20,-19,-7,19,-11,10,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-21,-8,-2,-14,-20,0,-13,7,-14,-6,0,-18,1,7,-6,-5,-11,-19,-1,-2;
MA   /M: SY='F'; M=1,-25,-14,-32,-24,26,-25,-22,10,-23,11,4,-21,-25,-27,-21,-13,-6,13,-11,5,-24;
MA   /M: SY='B'; M=-14,43,-25,40,9,-29,-5,6,-28,0,-30,-24,41,-15,2,-4,5,-5,-30,-39,-20,6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-29,-5,3,-23,-19,27,-29,19,-22,-7,3,-18,13,38,-8,-12,-23,-23,-2,4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,0,-29,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-18,81,-10,-19,-6,-6,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-23,10,-31,-20,26,-27,35,21,-26,-27,-19,-21,-25,-9,15,-17,4,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-35,-27,41,-30,-16,12,-25,16,13,-22,-28,-27,-19,-20,-9,9,-3,20,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-14,-31,-23,10,-27,-21,19,-23,18,16,-23,-25,-21,-20,-16,-6,18,-19,-1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-24,-35,-27,1,-35,-25,38,-27,22,18,-23,-23,-21,-25,-19,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-14,-5,-1,-22,-8,-11,4,-9,-5,-10,-19,-4,10,-8,-4,-8,-8,7,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,23,-28,32,19,-29,-13,21,-31,-1,-23,-18,12,-11,5,-5,-2,-11,-26,-33,-9,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-23,4,2,-20,-15,4,-18,6,-19,-10,12,-15,4,8,1,1,-15,-28,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-24,0,2,-12,-15,-5,-15,-1,-15,-10,1,-5,-1,-2,-2,-4,-14,-21,-6,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-11,-7,-8,-11,-15,-12,-8,-10,-9,-7,-1,-11,-8,-10,14,29,-1,-27,-9,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-8,0,-28,-2,0,-22,4,-6,-26,2,-23,-14,4,-13,3,3,-3,-8,-24,-10,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-12,-10,-9,-12,-11,-13,-9,-9,-16,-11,3,-15,-8,-9,16,12,-3,-31,-13,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-25,-23,-17,-9,-27,-23,17,-20,4,5,-17,0,-15,-22,-9,-4,10,-25,-10,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-20,8,-30,-16,19,-27,38,18,-27,-26,-19,-19,-26,-10,11,-19,3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-39,-29,71,-29,-19,2,-29,13,3,-21,-29,-37,-20,-20,-10,1,6,26,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-17,-28,-22,6,-27,-15,21,-21,23,25,-20,-25,-16,-17,-19,-8,16,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-26,-11,-18,-28,57,-20,-35,-18,-27,-19,-1,-18,-18,-20,3,-15,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-29,-5,5,-26,-21,-2,-26,34,-23,-8,-1,-14,13,38,-9,-9,-19,-21,-9,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-12,-32,-29,9,-31,-26,26,-23,12,10,-26,-28,-28,-21,-13,-3,35,-22,-1,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-10,9,-15,-9,-15,-27,8,-6,-17,-9,-4,-5,-22,-9,-16,-9,-8,-7,-33,-7,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-16,-2,4,-10,-12,-4,-1,-2,-6,-4,7,-9,0,-1,-3,-4,-6,-17,-8,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,7,-30,3,3,-26,-13,-7,-23,11,-30,-17,14,22,-1,2,-3,-6,-27,-31,-21,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00256;
//
ID   POTATO_INHIBITOR_MP; MATRIX.
AC   MP00285;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Potato inhibitor I family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2351165; R2=0.0154332; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=171; N_SCORE=7.864; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-7,4,-25,2,6,-19,8,-7,-20,-9,-12,-12,10,-17,-4,-9,-3,-10,-22,-28,-19,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-11,-32,-9,-5,-17,-2,-8,-24,9,-24,-12,-8,5,-5,0,-10,-12,-22,-12,0,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-26,6,16,-24,-17,6,-24,7,-23,-14,9,2,5,1,1,0,-24,-30,-13,10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-4,-23,-4,3,5,-23,-10,-12,-10,-3,-6,-7,-16,-2,-9,-6,0,-12,-18,-1,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=3,3,-18,5,1,-20,1,-12,-16,-7,-14,-12,-2,-11,-7,-12,3,0,-8,-24,-16,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=6,-8,-11,-11,-8,-9,-10,-11,-4,-12,-4,1,-4,-13,-5,-11,11,12,-1,-26,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-20,-2,2,-21,-6,-11,-13,-7,-14,-9,-1,-10,3,-10,6,3,-10,-24,-14,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,4,-18,6,8,-22,-2,-7,-24,-1,-23,-17,6,-10,1,1,16,7,-16,-30,-17,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,-7,4,-3,-16,4,-19,-3,-15,-9,2,-16,4,4,0,-6,-17,-20,-3,4;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,56,-18,-20,-21,-10,-14,-28,-22,-22,-17,-8,-28,-19,-21,2,-3,-14,-41,-23,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-2,-29,1,1,-28,-7,-12,-23,-4,-28,-18,-1,32,-3,-11,3,-2,-24,-31,-23,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-15,-7,-12,-14,31,-12,-17,-11,-13,-9,-2,-12,-12,-11,-1,-9,-11,-12,-15,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-13,-1,8,-14,-10,-4,-12,5,-10,-6,-1,-5,7,5,2,4,-9,-14,-8,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-29,-4,6,-25,-21,-11,-23,39,-19,-6,-4,-13,6,23,-13,-10,-16,-20,-9,6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-22,-1,7,-20,-17,-6,-19,8,-16,-10,6,-13,8,10,3,7,-16,-27,-12,7;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-15,-2,7,-16,-7,-9,-19,-7,-23,-16,4,-10,4,-8,25,12,-12,-32,-16,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,19,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,131,30,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,55,-30,-20,5,-29,9,-20,-18,0,-1,22,1,0,-10,-30,-29,-18,38;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,14,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,44,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-18,-15,-9,-12,-23,-18,1,4,-7,3,-13,-18,-9,-2,-4,3,13,-27,-10,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-20,-6,-5,-17,-10,-13,-17,-10,-22,-16,0,13,-7,-12,13,18,-14,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-16,-19,-17,-18,12,-22,-10,-15,-11,-8,-11,-17,-17,-19,3,-2,2,-23,-20,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,13,-27,18,23,-25,-16,-3,-25,10,-19,-16,5,-10,6,1,-2,-7,-22,-27,-12,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-11,-25,-12,4,-6,-23,-6,-6,0,-4,2,-11,-16,7,-3,-10,-9,-9,-15,0,5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-26,-3,12,-26,-16,-8,-26,29,-23,-12,-2,-10,8,24,-5,-8,-18,-22,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=5,0,-24,1,18,-27,-4,-10,-25,6,-20,-14,-2,-8,7,-2,2,-4,-20,-24,-18,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-24,-28,-22,1,-31,-19,27,-16,9,10,-17,-20,-16,-18,-14,-4,19,-14,8,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-39,-30,11,-38,-29,42,-29,18,17,-21,-22,-23,-28,-19,-9,27,-17,3,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-26,1,22,-22,-22,-6,-17,7,-8,-7,-5,-10,15,2,-4,-2,-18,-25,-12,19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-5,10,-21,-21,-6,-21,19,-12,-7,-4,-14,10,26,-8,-6,-17,-22,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-30,23,40,-32,-18,15,-30,6,-22,-17,5,-6,20,0,-1,-11,-30,-30,-13,30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-23,4,-4,-12,-11,6,-13,6,-18,-3,27,-20,0,2,-2,-5,-19,-24,-2,-3;
MA   /M: SY='P'; M=0,-14,-26,-9,-3,-23,-14,-17,-16,-8,-25,-16,-10,37,-7,-11,6,0,-15,-32,-23,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-26,14,9,-27,-7,-1,-24,5,-21,-14,16,-14,9,3,1,-7,-24,-30,-16,9;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-17,-28,-24,2,-26,-20,21,-20,11,8,-24,-25,-21,-20,-12,-4,26,-18,3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,6,-25,8,11,-28,-17,3,-24,9,-21,-11,4,-11,17,9,4,3,-21,-27,-11,14;
MA   /M: SY='I'; M=6,-6,-19,-16,-16,-11,-17,-16,12,-15,-4,-1,3,-18,-13,-18,-1,-2,8,-28,-12,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00257;
//
ID   SQUASH_INHIBITOR_MP; MATRIX.
AC   MP00286;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Squash family of serine protease inhibitors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9399564; R2=0.0084494; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=973; N_SCORE=12.160; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=303; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,30,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,23,3,-18,-32,-24,-8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,22,-11,11,0,-11,0,6,-11,0,-17,-11,33,-11,0,0,6,0,-17,-22,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-17,23,24,-19,-9,0,-19,3,-13,-13,5,-2,7,-2,0,-6,-17,-19,-11,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-14,-13,-11,12,-17,2,5,-10,11,5,-13,-17,-8,-8,-13,-6,-1,5,26,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=1,-5,-12,-2,0,-13,-5,-8,-11,-6,-17,-11,-1,17,-2,-8,11,4,-10,-20,-13,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-17,4,20,-14,-11,0,-17,10,-11,-9,0,-5,9,16,-2,-6,-14,-14,-9,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-17,0,6,-17,-11,-6,-17,28,-17,-6,0,-6,6,17,-6,-6,-11,-11,-6,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-13,-19,-13,0,-16,-7,18,-10,11,24,-11,-11,-5,-10,-11,-6,10,-11,0,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-11,-11,-17,-11,0,-11,0,11,-6,11,33,-11,-11,0,-6,-11,-6,6,-11,0,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-12,7,20,-14,-7,-2,-14,1,-13,-11,2,-2,7,-2,9,1,-12,-19,-11,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-20,-3,8,-18,-16,1,-14,-1,-17,-10,-2,-14,1,3,7,0,-6,-31,-12,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-24,27,27,-25,-13,15,-27,2,-19,-16,7,-6,8,-3,-1,-9,-24,-27,-10,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-26,5,13,-28,14,-6,-28,-3,-21,-14,1,-10,9,-6,0,-12,-25,-21,-19,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-27,-14,-9,-18,-2,-7,-22,11,-16,-4,-5,-21,-1,35,-9,-11,-13,-21,-13,-8;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-21,-24,-19,-10,-16,-19,11,-11,0,7,-14,-20,-13,-8,-7,-6,13,-23,-10,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,1,-21,-21,-4,-27,32,-19,-8,-2,-18,8,55,-11,-10,-18,-20,-9,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-31,-25,-31,-21,12,-29,-18,13,-27,36,13,-31,-30,-19,-19,-31,-13,3,8,11,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-22,-24,-13,-7,-20,-1,10,1,10,46,-16,-18,5,-3,-17,-10,3,-20,-2,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-32,3,23,-29,-20,-6,-28,22,-25,-14,-3,8,13,17,-6,-10,-25,-25,-16,17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-2,7,-27,-19,-9,-28,41,-27,-11,1,-11,8,32,-6,-5,-18,-22,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-25,-10,-2,-18,-20,6,-19,12,-13,-5,-3,-19,8,30,-6,-5,-13,-23,-7,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='S'; M=7,6,-13,8,1,-22,-3,-10,-21,-9,-28,-20,10,-10,-1,-10,32,17,-11,-38,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-24,-26,-16,5,-26,-17,10,-23,26,16,-26,-3,-16,-19,-24,-10,1,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-21,-17,-12,-19,7,-18,-15,-12,-9,-9,-11,-4,-12,-13,-1,-8,-10,-21,-20,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-26,15,16,-31,-1,-7,-29,3,-23,-17,3,-9,8,-4,2,-6,-24,-27,-19,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-22,-29,-23,-5,-32,-26,27,-15,8,10,-18,-21,-18,-15,-11,-1,26,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-22,-21,-11,-5,-23,-13,4,-7,16,11,-19,-24,-6,2,-18,-9,4,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-26,8,19,-29,-5,-8,-27,2,-24,-18,0,2,6,-5,5,-6,-23,-29,-21,12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-9,17,-20,12,4,-19,-7,28,-21,-3,-23,-12,26,-14,5,-2,6,-4,-23,-31,-7,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-16,-30,66,-19,-40,-19,-30,-20,0,-19,-18,-19,0,-20,-30,-20,-30,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-27,-25,-21,35,-29,15,0,-18,2,2,-16,-28,-17,-13,-19,-11,-7,12,50,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=4,-17,-10,-17,-17,-9,-17,-21,8,-16,-7,-3,-13,-21,-17,-16,12,9,24,-34,-14,-17;
MA   /M: SY='P'; M=1,-9,-23,-4,0,-24,-9,-14,-20,-10,-30,-20,-3,34,-4,-14,18,7,-19,-36,-24,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00258;
//
ID   CYSTATIN_MP; MATRIX.
AC   MP00287;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cysteine proteases inhibitors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.2208452; R2=0.0204706; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-8; N_SCORE=7.027; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-35; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,9,-25,5,4,-25,-5,-5,-24,16,-25,-14,15,-14,3,9,1,-5,-21,-28,-16,4;
MA   /M: SY='D'; M=-3,15,-23,20,11,-27,-9,-5,-25,-4,-21,-18,6,-7,1,-9,7,3,-19,-32,-17,6;
MA   /M: SY='N'; M=-1,14,-20,5,0,-19,-3,-4,-16,-4,-18,-12,23,-16,-3,-7,6,0,-18,-32,-17,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-6,-26,-6,-2,0,-16,-3,-15,-3,-12,-9,-8,-11,-6,-7,-8,-9,-15,-7,14,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-24,-10,-7,-7,-18,4,-10,-2,-8,-3,-8,-17,-4,-3,-6,-1,-8,-16,9,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-22,-23,-17,20,-25,-5,1,-17,13,3,-17,-26,-16,-7,-14,-6,-3,-7,19,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-29,3,19,-27,-17,-4,-27,20,-22,-12,-1,-5,13,21,-5,-7,-23,-24,-14,15;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-22,-23,-16,12,-26,-19,5,-13,4,1,-19,-14,-20,-14,-14,-7,7,-15,2,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-14,-21,-15,-11,7,-21,-14,0,-14,2,-1,-13,-21,-16,-11,-9,-5,4,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-28,0,12,-26,-19,-1,-27,27,-23,-10,3,-13,15,32,-5,-6,-22,-23,-11,12;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-13,-28,-24,-4,-24,-26,22,-19,9,7,-22,-24,-23,-21,-8,-2,33,-26,-10,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-19,-24,-20,-4,-28,-20,19,-14,10,9,-17,-23,-18,-15,-11,0,22,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-2,4,-24,4,12,-26,-8,-7,-25,13,-25,-15,5,-10,6,9,6,-3,-19,-28,-17,8;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-15,-22,-17,-2,-6,-16,-3,-14,-5,-5,-15,-19,-17,-18,-1,-3,5,-12,-1,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,-2,12,-25,-20,-4,-25,23,-22,-10,0,-11,15,25,-2,-1,-20,-22,-9,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-21,-1,10,-24,-14,-7,-19,6,-20,-11,0,-10,13,4,10,7,-14,-28,-14,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-13,-30,-28,1,-30,-28,29,-22,15,11,-28,-29,-27,-20,-12,0,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-10,-30,-29,2,-29,-29,28,-20,9,9,-29,-29,-30,-20,-10,0,47,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=32,-7,-13,-13,-8,-22,8,-16,-16,-10,-17,-13,-4,-11,-6,-16,15,2,-7,-24,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-17,-21,-15,-5,-24,-17,9,-11,3,10,-13,-18,-10,-11,-3,8,12,-25,-7,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-24,2,-2,-18,-13,-2,-12,10,-16,-4,22,-18,0,5,-4,-5,-16,-29,-12,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-16,-29,-16,-17,23,-28,19,-2,-12,1,0,-15,-28,-10,-10,-18,-10,-10,17,62,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-20,-24,-24,-18,27,-28,-2,0,-14,2,1,-15,-25,-17,-7,-14,-6,-1,-1,27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-23,-35,-26,17,-33,-22,28,-28,27,18,-24,-26,-22,-23,-23,-9,17,-14,7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-9,8,-22,8,7,-20,-18,-10,-19,9,-18,-12,4,-12,0,3,1,7,-12,-28,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-32,-27,6,-30,-25,28,-23,17,16,-26,-26,-24,-21,-15,-5,32,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-29,16,31,-28,-20,0,-21,5,-18,-14,2,-8,14,-1,-2,-9,-21,-29,-15,22;
MA   /M: SY='V'; M=12,-22,-13,-27,-21,-3,-20,-22,14,-17,9,10,-21,-22,-19,-19,-7,-1,22,-23,-9,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-26,-4,-7,-25,21,-15,-27,-4,-21,-14,-1,-16,-9,-5,0,-8,-19,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-26,15,15,-26,-10,-2,-28,8,-23,-17,9,-12,6,12,3,-4,-22,-30,-16,9;
MA   /M: SY='T'; M=1,2,-20,-1,-4,-22,5,-15,-22,-8,-21,-16,3,-5,-8,-12,10,12,-16,-29,-19,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-15,0,-5,-22,-1,-13,-20,-5,-20,-14,5,-14,-6,-5,4,3,-15,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-12,36,-17,-18,-8,-13,-18,-23,-17,-16,-14,-12,-28,-19,-17,-8,-10,-12,-27,-10,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-6,-21,-8,-4,-17,-19,-15,-11,9,-13,-5,-5,-11,-4,3,-1,4,-4,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-27,-1,4,-24,-20,14,-25,24,-23,-6,3,-13,6,15,-6,-5,-18,-25,-4,4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-10,-21,-13,-8,-14,-11,-15,-4,-8,-7,-2,-5,-16,-5,-7,2,2,-2,-26,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-20,-8,-1,-15,-12,-4,-18,4,-16,-7,-3,-17,6,7,0,-3,-14,-19,-2,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-15,-13,-7,-7,-17,-15,-3,-11,-8,-6,-11,-11,-14,-14,-5,-3,3,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='B'; M=-4,2,-22,0,0,0,-16,-8,-14,-7,-10,-11,0,-14,-10,-9,-4,-4,-11,-19,-3,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-8,-24,-9,3,-18,-15,-13,-12,5,-6,-4,-8,-13,0,1,-7,-6,-10,-23,-12,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-6,-20,-5,-6,-16,-13,-16,-4,-10,-7,-5,-8,-14,-9,-13,-1,0,2,-29,-14,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00259;
//
ID   TIMP_MP; MATRIX.
AC   MP00288;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tissue inhibitors of metalloproteinases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1681647; R2=0.0104995; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=961; N_SCORE=14.248; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,2,-21,-16,-3,-21,-18,1,-24,17,3,-17,-26,-16,-18,-7,-1,1,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-24,-14,-11,-9,10,-12,-25,-3,-19,-13,-3,-19,-9,10,0,-8,-16,-18,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-31,-24,5,-30,-22,26,-26,33,21,-28,-28,-21,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-29,-20,17,-28,-19,17,-28,43,17,-27,-28,-21,-19,-27,-9,8,-16,3,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=9,-23,-17,-28,-18,7,-20,-20,8,-23,26,8,-22,-23,-19,-20,-16,-7,6,-17,-3,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-6,-30,-21,7,-30,-21,15,-30,43,16,-29,-31,-21,-21,-28,-10,8,-23,-3,-21;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=0,-17,-16,-19,-14,-2,-9,-14,4,-18,18,9,-15,-19,-12,-15,-11,-5,2,-19,-7,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-11,-20,-12,-6,-8,-13,-9,-12,-2,-8,-6,-8,-14,1,6,-4,-1,-11,8,-1,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-30,-23,-13,-7,-26,-18,1,-13,9,2,-21,2,-12,-3,-21,-11,-6,-11,-7,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=3,-14,-21,-13,-8,-17,-14,-18,-4,-12,-15,-9,-10,21,-10,-17,4,0,-4,-27,-18,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-22,-9,-2,-20,8,-12,-22,3,-15,-10,-4,-14,-4,5,-3,-9,-15,-19,-16,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-25,-13,-7,-15,-12,-16,-9,-12,-9,-8,-14,22,-11,-11,-5,-5,-10,-25,-17,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-15,-12,-9,-22,17,-17,-20,-12,-21,-15,-2,-12,-9,-17,17,1,-10,-26,-22,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-30,24,41,-31,-18,-1,-32,15,-23,-20,4,-5,14,8,-2,-10,-28,-30,-18,27;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-12,-19,-11,-21,7,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,-11,-18,-12,-14,-7,-18,-2,-12,-9,-3,-10,-15,-11,-17,11,4,8,-27,-16,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-19,-16,-12,-15,-15,-19,1,-14,-10,-6,-5,1,-11,-18,5,3,2,-28,-16,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,14,-26,19,17,-33,-17,0,-24,3,-21,-12,5,-9,25,-1,4,3,-23,-28,-14,21;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-15,-15,-8,-20,-5,9,-15,-10,-12,-8,-5,-12,-5,-15,5,-5,-7,-22,-10,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-39,-30,66,-31,-22,7,-29,11,2,-21,-29,-38,-21,-19,-9,8,4,24,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-12,30,-22,15,0,-20,-5,32,-22,-2,-28,-15,48,-20,2,0,5,-5,-30,-38,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,35,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-3,35,-25,48,13,-35,-8,-5,-33,-2,-25,-25,13,-10,-2,-12,2,-8,-23,-35,-20,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-25,5,-34,-25,33,-28,32,18,-26,-26,-22,-24,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,26,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,45,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-19,-32,-25,14,-29,-24,19,-19,8,7,-21,-25,-24,-14,-13,-6,23,-17,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-11,-23,-21,-5,-21,-21,17,-16,2,9,-19,-24,-19,-16,1,4,30,-31,-11,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,40,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,17,-3,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='K'; M=5,-2,-22,-2,14,-24,-15,-11,-20,15,-20,-12,-3,-9,4,4,3,-3,-11,-26,-16,9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-32,-2,8,-30,-20,-12,-28,37,-30,-12,-4,12,6,19,-10,-10,-22,-22,-14,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00260;
//
ID   PENTAXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00289;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pentaxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4554181; R2=0.0153785; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=429; N_SCORE=12.043; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-25,9,7,-24,-14,-3,-22,6,-20,-14,8,-4,1,-1,1,-3,-19,-30,-15,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-25,1,10,-24,-14,-13,-18,17,-19,-10,-6,-13,0,6,-6,-9,-8,-26,-14,5;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-16,-26,-22,-5,-23,-23,19,-19,10,6,-17,-23,-20,-20,-9,-3,23,-25,-10,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-13,-20,-17,-9,-14,-24,-16,5,-7,-1,3,-12,-17,2,-8,-4,4,6,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-25,-5,-31,-24,29,-24,-21,3,-25,12,2,-20,-27,-28,-20,-13,-6,6,-13,5,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-4,-33,2,9,-29,-18,-12,-26,15,-28,-17,-6,29,1,7,-6,-9,-25,-27,-20,2;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-18,-19,-16,-4,-11,-18,-2,-14,-1,-3,-10,-16,-17,-10,-6,-2,3,-23,-11,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-10,-19,-12,-11,-7,-18,-6,-1,-7,-4,7,-8,-19,-7,-6,-2,-2,3,-26,-6,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-10,-26,-7,7,-17,-26,-15,1,-5,-3,-2,-13,-7,-2,-10,-9,-8,1,-27,-12,1;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-4,-21,-7,-1,-10,-17,-3,-9,-4,-15,-8,3,-15,-4,-6,6,3,-7,-27,-7,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-9,-4,-25,-1,-6,-4,-20,-12,-8,-9,-4,-7,-9,-3,-12,-13,-11,-9,-9,-18,-3,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-24,-9,-7,-22,16,-17,-20,-14,-20,-14,-6,-3,-12,-16,5,-6,-13,-28,-23,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-24,4,13,-24,-16,-6,-22,16,-21,-13,4,-12,5,16,0,-5,-15,-28,-15,8;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-32,-46,-28,-18,-5,-20,-26,-20,-16,-24,-20,-32,16,-16,-20,-28,-22,-30,81,7,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-20,-8,-8,-14,-19,21,-9,-7,-12,0,3,-18,-3,-5,1,4,-5,-30,-1,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-34,-25,11,-33,-25,29,-28,26,15,-23,-24,-22,-23,-19,-5,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-19,-22,-19,-9,-10,-12,5,-18,1,4,-13,-20,-16,-18,-5,0,9,-24,-9,-18;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,11,-22,14,27,-24,-15,-6,-24,1,-21,-18,7,-6,7,-5,12,9,-20,-33,-18,17;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-5,-12,-18,-10,-25,-18,8,-10,-2,-10,35,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-8,-22,-8,3,-18,-14,-11,-19,5,-19,-13,-4,-14,0,10,4,0,-12,-13,-11,1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-21,15,12,-22,-13,-4,-23,-3,-22,-17,6,-10,5,-7,13,9,-17,-29,-9,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-23,-26,-15,-4,-29,-20,22,-17,12,12,-17,-21,-13,-13,-13,-6,17,-24,-6,-16;
MA   /M: SY='W'; M=10,-19,-20,-25,-19,-6,-16,-23,-3,-14,-6,-3,-19,-19,-15,-17,-5,2,3,15,-3,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-24,13,40,-26,-16,-4,-26,4,-21,-19,2,-3,13,-3,11,2,-23,-32,-19,27;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-19,-31,-21,21,-24,-21,10,-25,23,8,-22,-25,-23,-21,-17,-8,7,-12,4,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-33,-41,-35,-27,15,-21,-20,-15,-18,-14,-15,-33,-28,-19,-18,-31,-23,-22,107,34,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-19,-24,-16,-9,-27,-19,17,-15,8,9,-20,-22,-5,-15,-10,-5,19,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,49,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-27,1,20,-17,-21,-8,-25,21,-20,-12,-2,-9,6,14,-4,-2,-19,-22,-10,13;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-31,-14,-4,-17,-23,-5,-10,-7,-3,-3,-16,21,-3,-5,-15,-11,-16,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-12,-22,-16,-6,-14,-14,-8,-9,-3,1,-16,-24,-11,-4,-12,-9,-5,-4,-1,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00261;
//
ID   IG_MHC_MP; MATRIX.
AC   MP00290;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5480793; R2=0.0084494; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=764; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=587; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-26; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-26,-75,-61,-56,-7,-27,62,-45,-31,-44,-58,-31,-20,54,-16,55,-54,-28,-22,68;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-72,-66,-58,-26,-51,-63,2,60,38,-30,-45,-71,-12,10,-9,12,-10,-71,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-67,-73,-83,-75,12,-82,-72,-2,-74,74,-22,-80,-31,-36,-57,-33,-14,-32,93,-47;
MA   /M: SY='Y'; M=19,-70,-60,11,-56,-46,23,-39,-15,-15,-56,-24,-50,-12,-3,38,25,9,-67,57;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-72,-72,-70,-39,-74,35,0,-68,22,8,-68,-55,-63,-67,11,-29,37,-55,87;
MA   /M: SY='T'; M=0,-68,-2,-26,-47,-58,-40,-40,-34,24,-32,-33,15,-2,-52,3,65,25,-81,-63;
MA   /M: SY='E'; M=16,-71,-17,63,-74,-56,-61,-61,11,-67,-63,0,5,-35,-21,-6,41,21,-82,-69;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-70,-8,15,82,-76,-67,-30,-30,-10,-9,-67,-75,-67,-26,5,-23,41,-61,-41;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-72,9,1,-70,-29,-38,-14,-3,-6,-58,-31,40,23,15,-28,64,-35,-81,-66;
MA   /M: SY='W'; M=-65,-87,-72,-41,-62,-48,-4,-55,-42,-13,-40,-72,96,-45,-21,10,-62,-51,116,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-25,-71,-16,27,-77,31,-20,-75,1,-58,-42,64,-48,14,-11,37,8,-50,-82,-69;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-75,51,54,-79,-65,13,-75,21,-56,-68,-20,-34,22,2,26,-3,-42,-83,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-49,-77,30,49,-59,43,27,-81,44,-77,-43,-27,-64,-16,-9,2,-8,-63,-80,-67;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-76,79,19,-81,15,13,-76,-23,-66,-71,28,-66,36,-37,-3,-29,-27,-88,-68;
MA   /M: SY='E'; M=-57,-73,-34,46,-15,-50,12,29,-19,-34,-55,-1,-36,5,0,20,22,24,-77,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-72,-79,-74,-76,68,-79,-43,-54,-68,-50,-50,-73,-84,-66,-65,-68,-66,-60,-30,122;
MA   /M: SY='T'; M=37,-9,33,-18,-73,-60,-63,-37,-55,-68,-64,-49,-64,-12,-4,43,67,-35,-84,-67;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='R'; M=-60,-77,-57,18,-54,-71,60,-37,30,-39,-3,-30,-69,43,62,12,-30,3,-79,-59;
MA   /M: SY='V'; M=3,-65,-82,-75,-55,-80,-84,-21,-74,-41,-44,-77,-78,-76,-75,-63,-51,100,-87,-62;
MA   /M: SY='Q'; M=-31,-73,-8,38,-67,-8,-9,-43,4,-64,35,15,-66,39,-6,21,28,-5,-75,18;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='W'; M=-32,-77,-8,68,-67,-17,-65,-47,-24,-56,3,-47,15,-11,-38,-13,-23,35,89,-61;
MA   /M: SY='G'; M=23,-39,-63,-53,-71,59,-13,-5,-43,-31,-39,-39,-66,-44,-69,22,57,-49,-79,-68;
MA   /M: SY='L'; M=-47,-71,-4,-18,27,-18,5,-23,-57,71,-24,-21,-78,-34,-70,-25,-24,-34,-25,-51;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-76,38,8,-44,-32,41,-59,3,-39,-66,-39,67,-27,-23,41,10,-70,-83,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-18,-73,-30,47,-72,-27,-20,-37,20,-20,-38,40,-11,39,-53,15,24,-15,-79,-32;
MA   /M: SY='P'; M=-29,-46,-37,7,-78,-68,46,-40,-32,-50,-25,-35,103,13,-25,-6,-29,-73,-79,-34;
MA   /M: SY='K'; M=-24,-72,-25,-26,-7,-44,17,-8,46,35,-7,-63,-73,-21,-6,-62,-8,30,-71,11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-26,-67,-65,-52,-48,-59,-69,5,-33,11,-54,-56,-49,-62,2,18,84,-1,-83,-64; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-28,-73,-68,-8,-46,-78,-41,-29,31,28,-30,-20,-40,31,-22,-43,-17,54,-78,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-23,-76,-33,16,-54,-67,62,-62,64,-74,-64,-38,-11,-32,39,26,-7,-72,10,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-48,-83,-48,-46,-15,-72,-82,-59,-54,-6,-39,-31,-8,-47,-27,-1,18,3,151,-39;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-75,57,59,-32,-49,-59,3,-6,-22,-24,-9,-65,-36,-12,-2,-17,11,-83,-66;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-28,-77,27,-9,-12,-57,-61,-24,-40,-31,-62,-6,64,-54,55,20,-22,8,-79,-65;
MA   /M: SY='N'; M=-52,25,30,27,-74,-47,-9,-58,17,-18,-5,42,27,10,27,10,-16,-58,-29,-46;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00262;
//
ID   PRION_1_MP; MATRIX.
AC   MP00291;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prion protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5796273; R2=0.0103135; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1632; N_SCORE=20.401; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=284; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,11,-27,5,14,-34,-15,8,-21,11,-24,-6,16,-13,39,9,2,-7,-29,-25,-13,26;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-29,-45,-29,-17,-3,-20,-19,-20,-12,-20,-15,-29,-25,1,-12,-29,-25,-30,104,19,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-14,9,-1,-13,2,14,-15,-2,-18,-11,29,-13,0,-1,4,-3,-19,-23,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-23,-2,-6,-14,-6,-13,-22,-11,-27,-21,2,-16,-5,-12,12,2,-19,11,-7,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,28,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,45,-17,0,-3,19,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-24,-20,-33,-23,23,-24,-8,15,-18,22,38,-22,-24,-14,-14,-22,-10,7,-12,8,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-14,-30,-26,0,-26,-19,26,-16,14,28,-26,-26,-19,-16,-14,-4,36,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=6,-18,-17,-27,-17,-5,-15,-6,12,-11,13,40,-18,-18,-3,-13,-12,-7,7,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,31,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-15,-3,0,-20,-5,-7,-23,1,-27,-17,7,-13,3,11,27,12,-13,-35,-17,0;
MA   /M: SY='A'; M=37,-15,-10,-23,-15,-15,-8,-23,1,-13,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,13,-23,-17,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=9,2,-11,1,0,-20,0,-9,-20,-9,-30,-20,13,-11,0,-9,38,19,-11,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10,-5,-23,4,-5,-33,17,-23,-13,0,-20,2,46,-7,-13,-23,-20,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-35,-15,-5,-22,-20,-15,-9,-10,-17,1,-20,61,-7,-17,-13,-10,-19,-27,-22,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-9,-20,-17,-16,-2,-20,-9,12,-17,17,17,-3,-25,-11,-13,-15,-6,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-27,-28,-33,-26,9,-35,-14,31,-24,19,16,-21,-24,-16,-22,-21,-10,16,-7,21,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-30,11,-9,-33,49,-15,-40,-15,-30,-23,5,-17,-15,-17,0,-17,-30,-25,-27,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00263;
//
ID   CYCLINS_MP; MATRIX.
AC   MP00292;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9891462; R2=0.0172563; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=10.155; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=30; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-22,-29,-24,-5,-31,-27,26,-22,9,8,-26,-6,-23,-23,-14,-5,27,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='B'; M=-11,12,-20,12,5,-20,-15,-2,-23,3,-20,-15,10,-10,-2,1,0,-3,-19,-29,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-28,-11,-2,-17,-20,-8,-12,-2,-13,-8,-11,13,0,-5,-5,-3,-15,-21,-6,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-1,-22,-1,-3,-14,-12,1,-18,-1,-14,-9,1,-14,-3,-2,-3,-5,-15,-22,-3,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-24,-14,-15,17,-25,3,-2,-14,5,2,-11,-26,-13,-11,-15,-8,-6,-3,29,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-24,-25,-15,2,-25,-13,9,-10,13,19,-17,-21,-8,-6,-17,-8,3,-13,0,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,6,-9,8,7,-19,-15,-6,-23,-3,-17,-14,2,-16,0,-4,-2,-7,-18,-29,-12,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-18,-10,-6,-19,-6,-10,-13,-2,-11,-5,-3,-19,1,-1,-3,-7,-10,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-28,0,11,-32,-18,16,-19,4,-19,-2,1,-11,36,6,-1,-8,-25,-23,-6,22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-27,-4,0,-20,-13,-11,-18,3,-21,-13,-7,26,-4,-3,-4,-3,-18,-21,-14,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,13,-27,21,26,-26,-14,1,-24,0,-18,-16,4,-10,8,-6,0,-8,-22,-29,-13,16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-32,-24,4,-31,-20,29,-24,23,19,-23,-23,-18,-22,-19,-7,21,-19,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-20,7,2,-21,-14,-4,-16,1,-18,-11,14,-15,3,-1,6,6,-14,-31,-14,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-29,-7,-1,-18,-9,-13,-17,-10,-16,-14,-10,13,-8,-13,-6,-7,-18,-11,-14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-21,2,8,-20,-14,-4,-24,9,-22,-13,4,-12,7,10,3,-1,-19,-26,-12,6;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-11,-19,-20,-16,-3,-18,-4,10,-8,9,37,-11,-19,-3,-9,-12,-4,5,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-4,-19,-7,0,-17,-10,-11,-18,-1,-17,-13,-3,-5,-4,-4,5,1,-12,-24,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-25,-23,-14,-5,-29,-19,23,-20,11,12,-13,-18,-11,-20,-13,-6,13,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-19,-29,-21,4,-27,-22,21,-26,34,16,-26,-26,-19,-21,-21,-7,15,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-18,-32,-26,3,-31,-27,29,-24,18,13,-24,-25,-24,-23,-15,-5,30,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-13,33,-26,43,11,-31,-8,-4,-32,-2,-25,-24,15,-12,-2,-7,3,-1,-24,-35,-17,4;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-37,-44,-39,-29,20,-21,-28,-17,-21,-16,-17,-35,-29,-22,-20,-34,-25,-25,122,28,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,6,-31,-19,27,-27,38,26,-26,-26,-17,-21,-26,-10,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-17,-30,-25,5,-29,-16,24,-22,19,19,-23,-26,-20,-19,-17,-7,24,-22,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-29,7,31,-28,-18,0,-25,13,-19,-11,-2,-8,24,8,-3,-10,-26,-23,-11,27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-8,-31,-28,1,-31,-28,28,-22,15,12,-29,-29,-27,-21,-14,-3,40,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-3,8,-7,-6,-22,-17,33,-25,-12,-21,-8,4,-22,4,-8,-2,-10,-22,-34,-5,-3;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-19,-5,9,-15,-17,-10,-9,-5,-9,-7,-5,-12,-2,-9,3,3,-5,-27,-12,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-21,-6,4,-18,-20,3,-16,10,-16,-4,-3,-16,4,13,-4,-6,-11,-25,-6,2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-21,-23,-27,-19,39,-28,-8,0,-18,7,1,-17,-26,-19,-14,-16,-6,-4,4,30,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-26,4,8,-26,-10,9,-28,15,-25,-12,11,-15,10,19,-3,-9,-25,-26,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-6,-32,-23,17,-30,-21,13,-29,34,13,-27,-31,-24,-21,-25,-9,10,-19,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-8,-20,-8,-3,-11,-16,1,-8,-14,3,0,-6,-19,-3,-10,-3,-1,-9,-26,-5,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-4,-29,-3,6,-26,-17,0,-21,2,-23,-13,0,17,8,3,-1,-2,-23,-28,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-26,9,34,-24,-13,-5,-22,0,-12,-14,-3,-7,10,-5,0,-7,-22,-29,-17,22;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-4,-15,-14,-10,-21,-22,-3,-14,-7,-7,-6,-14,-13,-14,13,34,6,-30,-11,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-28,-20,-33,-23,30,-27,-19,12,-27,29,13,-24,-28,-25,-20,-23,-9,7,-10,8,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-22,-24,-19,30,-28,3,-4,-18,-1,-2,-18,-16,-18,-15,-17,-10,-8,5,36,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-28,-19,7,-28,-9,16,-26,41,23,-26,-28,-15,-17,-27,-11,7,-21,1,-17;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-2,-14,-10,-18,-4,-19,-14,-12,-15,-13,-4,-12,-10,-16,17,15,-4,-28,-19,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-17,-31,-25,1,-30,-24,29,-20,12,17,-24,-25,-19,-19,-13,-5,33,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,21,-21,12,1,-20,-4,0,-22,1,-24,-17,29,-16,-1,1,8,2,-22,-32,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-27,-23,-32,-26,17,-34,-14,23,-24,17,11,-22,-27,-20,-21,-21,-9,13,-5,23,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-24,11,-31,-18,25,-25,28,22,-25,-26,-19,-20,-23,-9,17,-16,7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,3,-30,30,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-9,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,59,-30,-4,0,-22,7,1,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,17,49,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,1,-29,-21,3,-28,-20,12,-27,32,16,-25,-29,-19,-21,-23,-9,7,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-6,3,-10,-4,-20,-11,-10,-17,-9,-18,-11,-3,-16,2,-10,12,4,-11,-30,-15,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-16,-5,1,-20,-16,-13,-16,9,-16,-9,-4,-15,-1,5,1,0,-7,-27,-14,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-13,-2,4,-13,-10,4,-7,3,-8,-1,0,-8,8,2,-1,-4,-7,-14,-5,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-15,-6,-1,-4,-13,0,-9,8,-8,-3,-4,-10,3,13,-6,-5,-7,-6,4,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-22,-6,-6,-17,-19,-14,-3,-9,-11,-6,-3,1,-7,-11,-2,-2,-3,-30,-15,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-10,-28,-26,1,-26,-27,21,-22,11,8,-24,-27,-25,-20,-10,1,30,-27,-8,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-25,-11,-2,-17,-20,-13,-10,-3,-10,-5,-10,9,-1,-5,-5,-2,-12,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-23,-9,1,-20,-17,-9,-21,22,-15,-6,-5,-17,3,28,-9,-9,-13,-22,-11,0;
MA   /M: SY='B'; M=-7,13,-20,13,2,-23,-8,-4,-24,3,-23,-16,11,-14,2,0,5,2,-19,-28,-11,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-26,-2,6,-23,-19,3,-21,20,-20,-6,1,-14,12,17,-4,-5,-17,-23,-7,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-22,-21,-17,6,-22,-14,7,-23,26,9,-22,-21,-17,-18,-21,-10,1,-15,5,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-5,-32,-5,11,-30,-20,4,-20,9,-20,-4,-4,-13,42,7,-6,-12,-28,1,-2,27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-27,-17,6,-27,-18,14,-23,37,17,-26,-23,-17,-15,-26,-10,6,-20,-2,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-12,-29,-24,1,-29,-24,23,-22,20,13,-27,-28,-22,-20,-16,-4,29,-26,-7,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00264;
//
ID   PCNA_2_MP; MATRIX.
AC   MP00293;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Proliferating cell nuclear antigen signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2441134; R2=0.0152634; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=707; N_SCORE=16.025; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-11,-11,-6,-17,-3,-15,-12,-12,-14,-12,-2,-12,-6,-15,21,9,-4,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-11,-28,-27,-4,-22,-28,22,-19,6,6,-26,-27,-27,-20,-7,-1,40,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-18,7,5,-26,-7,5,-23,-5,-25,-15,8,-11,10,-7,20,5,-17,-34,-14,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-28,47,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-22,-8,2,-15,-22,0,-14,2,-5,-4,-5,-15,4,7,-3,7,-11,-25,-6,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-29,-2,-1,-21,-11,3,-27,15,-16,-9,0,-19,3,34,-10,-12,-20,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-15,-1,-3,-20,-7,-11,-17,-5,-21,-15,2,-13,-3,-2,19,7,-6,-33,-18,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,20,-25,30,31,-31,-12,-4,-30,2,-23,-22,6,-6,7,-7,5,-6,-24,-33,-20,19;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-26,-10,-17,-28,56,-19,-35,-18,-28,-19,0,-18,-17,-19,5,-14,-25,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-2,14,-25,21,27,-31,-13,-4,-28,6,-23,-18,5,-7,12,-3,4,-6,-23,-30,-18,20;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-28,2,14,-24,-18,16,-27,13,-23,-12,4,-5,8,13,-3,-6,-24,-27,-8,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-27,-10,0,-21,-17,-4,-27,27,-20,-10,-1,-18,7,54,-7,-9,-17,-20,-11,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,21,-30,22,-20,-8,2,-20,10,56,-10,-12,-22,-22,-4,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,21,-23,11,6,-22,-9,0,-21,6,-27,-18,32,-5,1,1,5,2,-25,-34,-19,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-23,-27,-20,2,-30,-16,18,-17,18,11,-21,-24,-14,-10,-18,-6,14,-17,5,-19;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-15,-6,1,-19,-9,-15,-13,-9,-19,-14,-2,-3,-5,-13,19,11,-5,-32,-19,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-32,-22,15,-27,-14,19,-23,33,31,-25,-26,-16,-17,-25,-10,10,-16,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-27,-6,-16,-28,55,-16,-36,-17,-30,-20,6,-19,-16,-17,6,-13,-27,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-16,-31,-27,0,-28,-20,29,-18,15,28,-25,-25,-19,-18,-15,-5,34,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,27,-23,18,2,-24,-5,2,-22,0,-30,-21,37,-3,-1,-3,9,-1,-27,-38,-21,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-32,-24,5,-31,-22,28,-26,32,22,-27,-27,-20,-21,-22,-8,23,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='N'; M=0,1,-20,-6,-9,-17,5,-10,-18,-7,-14,-12,9,-18,-8,-1,5,3,-15,-27,-17,-9;
MA   /M: SY='S'; M=7,7,-15,2,-3,-21,9,-8,-22,-9,-29,-19,18,-14,-3,-10,26,9,-16,-36,-21,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,35,41,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='S'; M=12,-5,-12,-10,-9,-7,-7,-14,-9,-12,-16,-12,2,-16,-10,-13,18,8,-1,-29,-13,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-36,-28,1,-34,-25,39,-26,22,24,-23,-23,-19,-24,-19,-8,29,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-18,-31,-23,14,-29,-21,20,-27,36,18,-28,-29,-23,-19,-24,-8,18,-19,1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-30,-6,4,-24,-21,-7,-26,38,-23,-9,-1,-15,9,43,-10,-10,-18,-20,-10,4;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,68,-25,-23,-11,-25,-25,-20,-25,-11,-14,-15,-31,-24,-24,-3,1,-6,-40,-20,-23;
MA   /M: SY='A'; M=35,-13,1,-21,-15,-19,1,-22,-12,-14,-11,-10,-12,-16,-15,-21,5,-3,0,-24,-21,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,12,-26,9,-6,-29,31,-7,-32,-10,-28,-19,18,-17,-6,-11,3,-12,-29,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-1,19,-21,11,5,-23,-5,-1,-21,-3,-27,-19,28,-1,-1,-7,11,0,-24,-36,-21,1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-24,22,15,-26,-13,8,-28,3,-24,-18,14,-11,5,2,6,0,-23,-34,-13,9;
MA   /M: SY='D'; M=-7,34,-26,47,18,-35,-9,-3,-33,-1,-26,-26,13,-9,1,-10,5,-6,-24,-36,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-21,-16,-12,-12,-20,-19,4,-17,-7,-4,-5,-1,-10,-17,7,11,1,-30,-12,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-20,-33,-27,1,-32,-27,33,-26,22,15,-25,-25,-23,-24,-18,-6,31,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-12,-16,-14,-5,-23,-21,0,-15,3,-2,-9,-16,-14,-13,7,34,7,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-33,-24,12,-30,-18,25,-25,29,27,-24,-25,-18,-20,-23,-10,15,-17,3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-8,1,-22,-20,-8,-21,28,-21,-8,-1,-15,6,36,-6,-7,-14,-22,-10,1;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-13,-19,-13,-12,-5,-16,-5,-12,-9,-8,-11,-15,-12,-18,7,0,4,-18,-8,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-26,15,23,-28,-16,-5,-23,5,-14,-13,0,-9,12,-3,-3,-9,-21,-27,-16,18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00265;
//
ID   ARRESTINS_MP; MATRIX.
AC   MP00295;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arrestins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8955026; R2=0.0147917; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=919; N_SCORE=18.479; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-13,17,-30,28,44,-27,-18,2,-30,6,-21,-21,3,-5,13,-3,-2,-10,-28,-27,-11,28;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-23,-26,-23,-21,23,-30,7,7,-15,12,5,-23,-30,-14,-13,-21,-9,0,14,54,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-20,-24,-15,-2,-28,-16,12,-17,26,13,-23,-26,-9,-8,-20,-8,11,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-7,-29,44,-28,-9,0,-11,14,34,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-22,8,-1,-29,32,-10,-35,-10,-28,-21,13,-17,-9,-13,1,-13,-29,-29,-26,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-13,-31,-29,0,-30,-27,31,-20,13,15,-28,-28,-26,-20,-12,-2,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-16,-24,-27,-10,2,-27,8,-20,-3,0,-20,-27,-27,-20,-7,-6,24,-27,-16,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-20,-8,2,-22,-19,-6,-10,-3,-12,0,-2,-11,20,-3,9,16,-11,-26,-10,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-21,8,-29,-18,21,-27,43,25,-29,-29,-18,-19,-27,-9,13,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=8,-6,-10,-15,-13,-10,-18,-21,-4,-11,-7,-7,-6,-13,-13,-13,14,34,7,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-15,86,-25,-25,-17,-27,-27,-25,-25,-17,-17,-15,-32,-25,-25,-2,6,-7,-45,-25,-25;
MA   /M: SY='A'; M=26,-2,-11,-13,-9,-16,-8,-17,-11,-9,-12,-11,0,-11,-9,-14,14,19,-3,-26,-16,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-30,-7,4,-24,-19,7,-28,23,-20,-8,2,-18,19,53,-7,-10,-23,-21,-9,8;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,33,50,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,5,-3,15,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,54,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,5,-27,10,-5,-15,-23,-5,-1,-15,4,1,-4,-18,-9,-16,-14,-11,-4,-29,-7,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-30,-28,1,-29,-26,28,-20,16,16,-29,-29,-26,-19,-14,-2,41,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-25,-35,-25,1,-31,-17,35,-22,23,36,-21,-21,-12,-21,-21,-10,20,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-18,-3,-1,-19,-13,-3,-20,5,-22,-13,7,-12,0,6,15,17,-12,-31,-11,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-25,-7,0,-18,-17,-2,-24,17,-20,-10,1,-17,10,37,2,0,-17,-21,-6,2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,36,-36,-15,1,-35,5,-25,-24,11,-6,12,-5,0,-10,-30,-35,-19,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,22,-28,45,23,-28,-28,-18,-20,-28,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-15,-27,-24,28,-30,-4,5,-18,3,1,-19,-28,-20,-16,-15,-4,2,6,39,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-18,-33,-26,25,-31,-22,18,-27,26,12,-27,-29,-27,-20,-22,-7,18,-13,8,-26;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-14,-14,-5,-18,-9,-14,-8,-10,-9,-6,-7,-14,1,-13,11,3,-2,-26,-16,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-21,-6,-2,-18,-16,-1,-17,5,-16,-8,3,-16,5,14,5,5,-12,-28,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-4,-2,5,-19,-23,-10,-11,-7,-10,-8,-9,-18,2,-10,-4,-4,-5,-29,-11,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,2,24,-39,-20,9,-21,10,-20,-2,0,-9,56,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-16,-31,-27,-2,-29,-28,31,-22,9,10,-24,-25,-24,-22,-9,-2,38,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-24,-8,-27,-24,21,-29,-5,6,-20,6,3,-22,-30,-23,-17,-16,-8,10,-7,23,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-16,-31,-12,-2,-25,-18,-15,-14,-8,-20,-8,-16,51,-3,-16,-6,-4,-20,-27,-23,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-19,-14,-3,-13,-22,-15,-1,-6,-1,1,-14,-10,-4,-9,-4,4,4,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-1,-29,1,7,-28,-1,-11,-27,7,-29,-18,2,13,-1,-2,1,-7,-25,-28,-22,2;
MA   /M: SY='E'; M=1,8,-25,7,13,-28,-5,-6,-24,1,-24,-17,8,0,6,-5,5,-5,-23,-29,-20,9;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-24,15,11,-26,-11,-6,-23,3,-23,-16,8,-2,2,-1,5,-3,-19,-32,-18,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00267;
//
ID   CHAPERONINS_CPN60_MP; MATRIX.
AC   MP00296;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins cpn60 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5457020; R2=0.0133052; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=707; N_SCORE=13.942; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=147; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,6,-29,3,9,-29,-17,-7,-29,43,-30,-11,9,-11,9,26,-7,-9,-21,-23,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-29,18,45,-28,-18,0,-29,11,-20,-19,2,-4,15,3,-1,-9,-27,-28,-16,30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-29,-6,4,-23,-20,-5,-27,33,-21,-9,-1,-16,10,45,-9,-7,-18,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-30,-2,8,-28,-21,-10,-26,45,-27,-9,-1,-11,9,29,-10,-10,-18,-20,-10,8;
MA   /M: SY='H'; M=-8,3,-25,7,1,-15,-18,9,-13,-11,0,-2,-4,-18,-2,-11,-10,-10,-13,-25,-2,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-28,-11,-2,-17,-20,-2,-25,23,-14,-8,-2,-20,7,58,-9,-8,-17,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-34,-29,0,-34,-29,37,-24,16,14,-25,-25,-25,-24,-14,-3,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-29,34,45,-32,-17,-1,-32,6,-23,-23,6,-3,13,-3,1,-8,-29,-33,-20,29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-19,11,2,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-22,5,-31,-22,25,-27,36,19,-28,-28,-20,-20,-24,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,16,-20,6,-1,-20,-6,15,-21,-1,-25,-15,30,-18,2,5,10,0,-22,-34,-13,-1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-4,-11,-14,-8,-20,0,-16,-12,-9,-14,-12,-1,-11,-8,-17,13,2,-4,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-13,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,35,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-30,-7,3,-23,-20,-4,-29,36,-22,-9,-1,-17,9,54,-10,-10,-19,-20,-10,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-16,-30,-26,-5,-24,-28,26,-21,8,8,-23,-24,-24,-23,-9,-4,33,-25,-10,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,48,-33,-19,2,-29,9,-21,-18,2,-3,24,1,0,-10,-30,-29,-18,36;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-28,3,-35,-26,38,-26,18,16,-23,-24,-22,-25,-17,-6,31,-20,1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-29,1,-31,-29,33,-24,17,13,-27,-27,-26,-23,-15,-4,38,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='P'; M=12,-16,-24,-16,-8,-21,-14,-20,-8,-13,-15,-11,-15,30,-11,-20,-1,-3,-8,-27,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-29,68,-19,-39,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,0,-19,-29,-19,-29,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-13,-4,-17,-15,-11,-18,-21,1,-14,-8,-5,-10,-18,-13,-15,10,15,13,-31,-14,-14;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-10,-18,-11,-18,-3,-20,-9,-11,-10,-10,-9,-11,-11,-18,11,7,2,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20,12,-30,-16,18,-28,45,18,-29,-30,-19,-19,-29,-10,8,-15,7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-18,-32,-26,5,-31,-25,28,-25,23,15,-26,-26,-23,-22,-18,-5,27,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-15,3,-29,0,9,-26,-17,19,-25,12,-21,-7,10,-16,25,25,-4,-10,-26,-24,-6,15;
MA   /M: SY='A'; M=19,-18,7,-27,-20,-10,-17,-24,3,-19,-1,-3,-17,-20,-19,-23,-3,-3,10,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-13,-18,-19,-12,-14,-6,-17,-1,-15,-4,-4,-9,-15,-11,-18,2,-2,1,-23,-13,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-26,6,12,-28,-12,-7,-24,9,-24,-16,1,4,4,-1,2,-4,-20,-28,-18,7;
MA   /M: SY='A'; M=11,-6,-16,-9,-3,-19,-12,-16,-11,1,-14,-9,-6,-13,-6,-5,4,2,-2,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-29,-19,-31,-23,5,-30,-24,25,-27,33,16,-27,-27,-22,-21,-22,-7,22,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,13,-25,17,17,-26,-14,-6,-24,8,-20,-16,7,-11,3,1,0,-6,-18,-30,-17,10;
MA   /M: SY='B'; M=2,6,-23,6,5,-25,-1,-8,-21,-3,-19,-15,5,-13,0,-6,4,-5,-16,-28,-18,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-21,-15,-13,-1,-22,-15,6,-17,15,5,-15,-24,-15,-15,-16,-8,4,-16,-2,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-8,-22,-9,2,-14,-16,-13,-12,4,-8,-6,-6,-15,-2,2,-2,-1,-8,-24,-11,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00268;
//
ID   HSP70_1_MP; MATRIX.
AC   MP00297;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heat shock hsp70 proteins family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6551495; R2=0.0167988; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=315; N_SCORE=10.937; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-23,-23,-14,-6,-20,-10,7,-15,12,24,-19,2,-7,-15,-14,-7,-1,-24,-8,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=12,0,-11,-5,-7,-14,15,-8,-13,-7,-12,-9,4,-9,-7,-9,4,-4,-10,-14,-14,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-6,-14,-7,2,-13,-11,-2,-7,1,-2,0,-5,-9,12,5,-4,-5,-8,-12,-6,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-11,-1,2,-13,-7,8,-11,-3,-12,-5,3,-7,9,-2,9,6,-10,-18,-5,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=3,-4,-13,-4,0,-6,1,-2,-10,-5,-9,-7,-3,-9,-3,-7,2,-3,-9,-7,3,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-5,-11,-11,-8,-12,-5,-12,-6,-10,-3,-6,-2,-12,-8,-13,5,1,-3,-20,-13,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-28,-3,8,-25,-6,-10,-21,3,-22,-13,-7,28,4,-5,-5,-9,-23,-21,-19,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-23,-5,1,-16,-18,14,-17,16,-10,-1,-2,-13,4,10,-11,-10,-14,-18,0,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-18,-7,-1,-15,-6,-10,-6,-6,-10,-5,-9,4,-1,-8,-4,-6,-4,-18,-13,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-17,-1,8,-16,-14,6,-16,9,-13,-6,1,-8,10,11,0,1,-14,-17,-5,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-32,-6,-3,-28,26,-13,-34,-4,-27,-18,-3,-1,-7,2,-4,-15,-28,-23,-25,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-31,-2,2,-24,-22,-14,-15,15,-16,-8,-8,8,-2,3,-12,-10,-15,-24,-13,-2;
MA   /M: SY='V'; M=14,-24,-15,-29,-24,-6,-23,-27,22,-19,6,6,-21,-21,-21,-22,-6,-2,29,-24,-11,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-26,-36,-26,-1,-34,-28,39,-28,20,16,-20,-20,-19,-28,-18,-9,24,-20,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,5,-24,-4,-11,7,-17,17,-11,-8,-13,-8,14,-23,-7,-6,-4,-1,-17,-9,25,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,10,-5,-5,-20,-5,-13,-22,-13,-28,-20,5,-15,-5,-13,32,15,-10,-42,-22,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-17,38,-22,-18,-14,-21,-20,-15,-18,-5,-9,-14,-27,-16,-13,-4,-4,-6,-35,-19,-18;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-11,-29,-26,-1,-26,-28,24,-20,12,9,-27,-27,-26,-20,-10,-1,39,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-14,-26,-24,-3,-29,-27,22,-19,6,6,-18,-21,-21,-19,-3,14,30,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-28,-22,-34,-26,15,-27,-19,18,-21,16,22,-26,-26,-19,-18,-21,-10,15,1,6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-4,-28,-2,12,-7,-24,-8,-11,-4,-5,-6,-6,-14,3,0,-10,-10,-13,-20,-6,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-6,-8,-26,23,-4,-29,-14,-29,-18,1,0,-9,-15,10,-5,-23,-29,-21,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,10,-29,12,-5,-32,35,-9,-36,-10,-29,-20,11,-17,-5,-12,1,-14,-30,-27,-25,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-25,-4,5,-25,-20,-8,-23,25,-22,-8,0,-11,13,21,-1,6,-16,-23,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=8,-15,-26,-13,-9,-24,-1,-20,-15,-13,-21,-15,-13,29,-13,-19,1,-5,-13,-27,-25,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-26,-3,9,-24,-21,-7,-22,24,-20,-8,-2,-13,12,24,-4,-2,-15,-23,-11,9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-15,-30,-28,-1,-31,-29,30,-21,10,10,-24,-25,-25,-21,-9,4,39,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-26,-30,-20,0,-33,-23,25,-18,25,15,-21,-23,-15,-17,-23,-10,14,-20,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-22,-9,7,-23,-15,-14,-11,-5,-14,-10,-12,9,0,-13,0,-5,-8,-26,-20,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00269;
//
ID   HSP90_MP; MATRIX.
AC   MP00298;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heat shock hsp90 proteins family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7053947; R2=0.0141788; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=640; N_SCORE=13.770; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,8,-28,11,16,-33,-6,-2,-28,12,-26,-13,6,-10,21,5,1,-9,-27,-26,-16,19;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,-10,-20,-13,-16,-7,-22,-4,-12,-7,-7,-12,-13,-13,-19,8,6,8,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-28,23,46,-29,-19,-2,-29,6,-20,-20,3,-3,14,-3,2,-3,-27,-31,-19,30;
MA   /M: SY='V'; M=7,-18,-14,-22,-19,-8,-21,-24,14,-17,-1,1,-14,-19,-17,-19,4,9,22,-28,-11,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-26,2,8,-27,-2,-4,-28,14,-27,-15,10,-13,8,13,4,-5,-23,-27,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-29,0,11,-29,-18,3,-25,22,-23,-8,7,-14,27,31,-4,-9,-25,-23,-12,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,7,-31,-22,25,-28,40,21,-28,-28,-20,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,17,-29,-17,18,-27,41,23,-27,-29,-19,-19,-27,-10,9,-17,3,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-27,29,11,-31,-11,9,-29,0,-28,-20,17,-1,5,-5,3,-6,-28,-35,-16,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,5,-31,-19,29,-26,36,27,-25,-25,-16,-21,-25,-10,16,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-19,-33,-26,0,-29,-19,31,-19,16,31,-24,-24,-16,-19,-16,-6,30,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-33,-25,-3,-36,-28,37,-19,12,15,-20,-21,-19,-21,-17,-8,28,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-15,15,-26,7,1,-21,-13,54,-26,1,-25,-8,27,-19,6,3,-3,-12,-29,-33,2,1;
MA   /M: SY='S'; M=8,-4,-11,-7,-5,-8,-5,-13,-16,-12,-22,-16,4,-12,-6,-12,29,18,-7,-32,-13,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24,13,-32,-23,26,-29,34,17,-27,-28,-23,-22,-24,-9,19,-18,2,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-12,-3,-2,-19,-5,-11,-19,-5,-25,-17,7,-11,-1,-3,30,22,-9,-36,-17,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-14,33,-26,31,9,-29,-8,16,-27,0,-28,-18,34,-15,9,-2,3,-7,-30,-36,-15,9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-2,7,-27,-20,5,-30,39,-27,-9,1,-13,10,35,-10,-11,-21,-21,-7,7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-24,-37,-29,-1,-36,-30,43,-27,16,16,-22,-22,-22,-27,-16,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,21,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,18,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-10,-1,-1,-20,0,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-11,38,19,-9,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=17,-4,-10,-7,-6,-18,-3,-14,-12,-11,-21,-14,3,-13,-6,-13,26,12,-2,-34,-19,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-20,11,-27,-22,-6,-28,-24,8,-24,8,2,-16,-24,-19,-23,-8,3,8,-30,-11,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-29,52,24,-37,-12,2,-35,2,-28,-25,18,-9,9,-6,1,-9,-30,-36,-19,17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-31,-23,4,-32,-23,26,-25,32,17,-25,-26,-19,-16,-23,-9,18,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-28,-8,-3,-11,-20,3,-22,19,-16,-8,2,-21,4,42,-10,-9,-18,-14,4,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-24,-24,-17,34,-28,-3,0,-17,5,0,-17,-25,-19,-14,-15,-3,-4,7,38,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00270;
//
ID   UBIQUITIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00299;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6718879; R2=0.0158751; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=355; N_SCORE=11.298; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-23,-4,12,-11,-22,-10,-16,4,-9,-8,-5,-12,3,4,-2,6,-13,-23,-8,7;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-22,-6,-27,-22,-6,-23,-8,5,-21,1,2,-16,-25,-16,-16,-17,-13,0,-12,2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,5,-20,6,6,-16,-8,-10,-20,-7,-17,-16,2,-11,-4,-10,10,10,-14,-28,-12,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-32,-24,13,-30,-23,22,-27,32,15,-27,-28,-24,-21,-22,-8,19,-19,0,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-29,20,37,-30,-19,-1,-24,7,-20,-16,5,-6,17,-1,-1,-9,-25,-30,-17,27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-17,-32,-28,1,-32,-28,32,-24,17,13,-26,-27,-25,-22,-14,-2,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-22,5,18,-25,-7,-9,-23,1,-21,-17,4,-4,3,-6,7,1,-19,-29,-19,10;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-26,-8,3,-23,-1,-16,-19,-9,-18,-13,-9,18,-6,-15,0,-4,-18,-26,-22,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,18,-22,15,10,-27,-10,0,-22,0,-24,-15,19,-12,13,-3,11,4,-22,-33,-16,12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-28,32,38,-31,-15,-1,-29,4,-21,-18,6,-5,11,-5,1,-8,-26,-33,-19,24;
MA   /M: SY='T'; M=-6,1,-19,-3,-5,-15,-18,-14,-13,-4,-10,-9,0,-6,-7,-5,6,19,-9,-29,-12,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-17,-28,-27,-5,-23,-28,24,-21,5,7,-26,-18,-26,-21,-11,-4,35,-28,-12,-28;
MA   /M: SY='A'; M=4,-6,-20,-7,3,-11,-14,-9,-10,-5,-6,-3,-7,-14,-1,-9,1,-3,-9,-22,-7,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-22,-3,3,-20,-17,2,-15,3,-15,-3,3,-15,10,10,2,2,-12,-27,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-36,-27,20,-34,-25,30,-29,25,15,-24,-26,-25,-24,-22,-9,20,-14,6,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-26,6,25,-29,-15,8,-24,6,-19,-12,0,-8,18,1,0,-9,-23,-26,-13,21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-27,-9,0,-19,-21,11,-16,9,-6,0,-6,-18,10,14,-12,-11,-15,-22,-3,3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,35,-26,22,16,-27,-27,-24,-23,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='E'; M=5,0,-21,-1,15,-13,-13,-5,-18,-3,-16,-13,0,-10,5,-8,6,-2,-16,-22,-8,10;
MA   /M: SY='E'; M=6,9,-22,13,22,-27,-10,-7,-25,4,-22,-18,3,-7,6,-5,9,-2,-19,-30,-19,14;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-10,-23,-12,-2,-17,-18,-13,-13,13,-5,-2,-9,-16,0,9,-9,-7,-9,-21,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-23,4,26,-18,-21,-8,-14,-2,-6,-10,-3,-10,4,-6,-2,0,-14,-29,-15,15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-5,-13,-28,46,-4,-35,-15,-28,-17,6,-19,-9,-14,3,-15,-29,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-36,-10,1,-30,-18,-18,-19,-8,-27,-17,-17,71,-4,-18,-7,-9,-27,-28,-27,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-29,-10,-1,-23,-19,-19,-12,-10,-21,-14,-17,47,-10,-17,-3,-5,-13,-31,-24,-8;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-23,8,19,-25,-14,-8,-20,3,-18,-15,-2,-6,5,-1,3,-5,-14,-29,-18,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,7,-29,9,17,-33,-18,10,-26,13,-22,-8,6,-12,33,16,-2,-10,-28,-25,-11,24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-28,-11,-3,-18,-21,1,-23,24,-17,-7,-3,-20,6,53,-10,-9,-13,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-23,7,-30,-23,24,-28,39,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-18,-35,-26,2,-34,-25,34,-28,26,21,-24,-24,-20,-25,-21,-9,23,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-31,-26,44,-30,-8,7,-22,11,4,-23,-30,-26,-17,-20,-8,5,7,37,-26;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,-19,-9,0,-25,-8,-11,-19,10,-19,-10,-3,-11,6,4,5,-1,-12,-22,-15,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-28,-4,3,-28,-5,-9,-29,26,-26,-11,0,-13,8,22,-4,-8,-21,-21,-14,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-9,-25,-11,3,-26,-21,-6,-7,-3,-10,0,-9,-3,23,-4,-3,-3,-11,-23,-12,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,22,-28,45,24,-28,-28,-18,-20,-28,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=7,6,-24,6,20,-28,-12,-7,-23,12,-21,-14,2,-8,9,1,1,-6,-19,-26,-17,15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,22,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-27,38,19,-33,-1,-4,-35,1,-28,-24,13,-10,2,-7,4,-7,-27,-35,-21,10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-23,-3,2,-21,-17,-10,-16,18,-13,-6,-5,-14,3,12,-8,-7,-9,-21,-10,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-18,-11,-8,-9,-18,-14,-13,-1,-9,-8,-3,-14,-6,5,3,20,-7,-10,-6,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=4,-21,-14,-23,-16,1,-19,-17,12,-19,25,11,-21,-21,-15,-16,-15,-5,11,-18,-5,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=8,-3,-20,-5,0,-23,12,-9,-23,-5,-21,-14,0,-11,-1,-8,9,-2,-17,-24,-18,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-13,33,-26,43,14,-34,-9,5,-32,-1,-28,-23,19,-11,7,-6,7,-5,-27,-37,-17,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-21,1,-24,-23,13,-29,1,0,-16,-2,-2,-20,-30,-16,-17,-16,-9,-2,4,40,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,8,-21,2,-5,-24,10,10,-29,2,-28,-15,18,-19,-2,2,0,-10,-26,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,23,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-28,4,13,-28,0,-7,-25,4,-18,-11,-2,-12,9,-1,-4,-12,-21,-25,-17,11;
MA   /M: SY='P'; M=2,-2,-27,-1,1,-27,3,-13,-25,0,-25,-17,0,11,-5,-6,0,-8,-22,-27,-23,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-27,1,2,-23,19,-8,-26,-6,-19,-15,11,-17,-6,-8,-2,-12,-25,-27,-21,-2;
MA   /M: SY='S'; M=12,-7,-13,-11,-8,-15,-8,-6,-9,-11,-14,-3,-2,-13,-4,-12,17,10,-2,-31,-13,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-14,-13,-11,-12,-21,-19,-2,-7,-9,-5,-6,-14,-8,-9,10,25,7,-29,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00271;
//
ID   SRP54_MP; MATRIX.
AC   MP00300;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SRP54-type proteins GTP-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8278089; R2=0.0172641; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=457; N_SCORE=13.708; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=32,-2,-12,-8,-3,-21,-3,-16,-15,-8,-15,-13,-4,-10,-6,-16,14,6,-5,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,5,-26,-19,-7,-27,40,-25,-7,0,-13,9,36,-10,-10,-18,-20,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-26,-13,-19,-25,50,-20,-29,-19,-21,-15,-4,-20,-19,-20,0,-15,-19,-21,-26,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-18,-18,-24,-20,-13,-2,-24,4,-18,-3,-2,-14,-18,-18,-21,-2,-3,10,-22,-15,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-17,-15,-25,-17,-11,-13,-22,8,-16,3,3,-15,-16,-14,-21,-1,-2,11,-21,-13,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,17,-31,-22,21,-28,35,15,-27,-28,-24,-21,-24,-9,15,-17,3,-23;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-13,-3,-2,-21,3,-11,-20,-9,-27,-18,8,-10,-2,-10,30,13,-11,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='I'; M=6,-24,-18,-30,-22,-3,-24,-22,23,-21,15,16,-21,-21,-17,-22,-12,-6,21,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='V'; M=6,-13,-14,-17,-11,-15,-16,-18,-5,0,-8,-4,-11,-18,-9,2,-1,2,7,-25,-13,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-1,-24,-2,0,-10,-16,8,-15,-2,-14,-9,-2,-17,6,-3,-2,-6,-16,-10,15,1;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-22,-12,2,-15,-21,-14,0,-7,-1,0,-11,-14,1,-10,-6,-6,0,-23,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-14,-16,-21,-16,12,-24,-19,1,-18,8,1,-11,-19,-17,-13,-1,19,3,-20,0,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-1,-28,-3,-3,-26,14,-5,-28,4,-23,-13,5,-14,-1,1,-3,-12,-24,-24,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-22,-19,-12,-11,-25,-19,7,-4,3,4,-14,-19,-7,-7,-9,-2,8,-24,-7,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,44,-28,18,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-14,-26,-15,-7,-12,-25,-12,-6,15,-6,0,-11,-19,-3,15,-14,-9,-2,-17,-1,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-26,56,-30,-10,3,-25,14,3,-22,-30,-29,-18,-22,-10,-1,10,37,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-22,-34,-27,0,-33,-27,35,-25,19,17,-23,-23,-21,-24,-16,-6,30,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-14,-21,-18,1,-24,-22,9,-16,3,2,-14,-20,-18,-14,1,15,16,-25,-6,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,3,-17,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,17,53,-32,-20,2,-28,10,-20,-17,0,-2,27,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-26,0,1,-25,-7,2,-28,19,-25,-11,5,-14,2,14,-3,-3,-20,-25,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-23,-25,-27,-20,7,-30,-14,18,-20,13,11,-21,-15,-16,-19,-17,-5,10,-12,12,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-20,21,18,-27,-15,-4,-24,-2,-20,-16,6,-8,4,-8,2,-1,-20,-32,-17,11;
MA   /M: SY='D'; M=-13,38,-28,54,18,-37,-5,-3,-37,-1,-28,-27,15,-10,0,-10,1,-10,-28,-37,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,14,-31,-20,21,-30,43,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,11,-18,2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-28,4,23,-26,-18,-5,-20,9,-17,-11,-2,-9,14,9,-3,-9,-19,-25,-15,17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-26,-12,0,-20,-20,-15,-7,-8,-13,-8,-13,18,-5,-12,-4,-3,-7,-27,-17,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,4,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,2,6,26,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-25,23,7,-21,-11,17,-25,-1,-24,-16,20,-15,2,-4,2,-6,-24,-30,-3,3;
MA   /M: SY='P'; M=5,-16,-25,-13,-5,-21,-15,-19,-11,-10,-17,-12,-15,33,-10,-15,-1,-3,-10,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-28,22,25,-29,-15,2,-29,14,-24,-18,10,-8,10,6,-2,-8,-26,-29,-14,17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-28,-8,-1,-20,-15,-10,-21,7,-19,-13,-6,-11,1,17,-5,-8,-17,-6,-10,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-35,-26,40,-29,-16,12,-24,14,12,-21,-27,-26,-19,-19,-9,8,-2,19,-25;
MA   /M: SY='V'; M=12,-23,-14,-28,-23,-6,-22,-26,20,-19,5,5,-21,-22,-21,-21,-4,-1,29,-26,-11,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-21,9,9,-23,-5,-4,-23,-1,-22,-17,11,-13,3,-1,11,0,-20,-31,-16,6;
MA   /M: SY='R'; M=1,-6,-23,-8,-2,-22,-8,-8,-24,13,-20,-12,0,-15,3,26,2,-2,-15,-23,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-19,-31,-22,18,-28,-17,17,-26,35,22,-26,-28,-20,-18,-25,-8,11,-16,4,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-25,1,-7,-27,31,-14,-31,-8,-27,-18,5,-16,-10,-11,5,-9,-22,-27,-24,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00272;
//
ID   EFACTOR_GTP_MP; MATRIX.
AC   MP00301;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GTP-binding elongation factors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1505446; R2=0.0174587; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=58; N_SCORE=7.153; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=21; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-23,-27,-20,16,-30,-7,14,-24,34,14,-27,-30,-17,-17,-27,-10,4,-4,25,-20;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-12,-13,-7,-18,-8,-11,-12,-8,-10,-9,-6,-13,-7,-11,7,4,-5,-25,-15,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-25,-8,-9,-23,25,-13,-24,-8,-21,-12,0,-16,-9,-10,1,-9,-18,-21,-18,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-20,-7,-1,-14,-15,-6,-7,-6,-7,-3,-4,-12,-3,-9,1,5,-5,-24,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-21,-20,-11,-6,-24,-16,10,-8,1,5,-13,-17,-10,-9,-10,-5,10,-21,-6,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-20,-6,-6,-22,9,-13,-23,0,-22,-12,0,-15,-5,-2,4,-5,-15,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='K'; M=1,-3,-24,-4,1,-25,5,-11,-27,7,-22,-14,-1,-13,-1,3,-1,-9,-19,-22,-17,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-15,-2,4,-15,-9,-2,-16,8,-12,-7,-1,-10,2,14,-3,-5,-11,-17,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-20,-3,4,-18,-15,-8,-13,15,-12,-5,-4,-11,3,10,-6,-5,-7,-19,-9,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=11,0,-14,-3,-2,-11,-7,-5,-11,-5,-10,-7,-1,-10,-4,-9,4,-1,-7,-18,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-23,-1,-5,-17,6,-9,-19,-4,-15,-11,0,-15,-7,-7,-3,-6,-14,-19,-9,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-6,-2,-10,-12,-9,-17,1,-12,-9,-4,-13,-5,3,-5,-4,-12,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='A'; M=3,-4,-21,-7,-4,-8,-7,2,-17,-8,-14,-10,-2,-16,-5,-10,1,-3,-14,-17,1,-5;
MA   /M: SY='A'; M=2,-10,-23,-12,-6,-11,-16,-13,-11,-6,-7,-7,-11,-17,-3,-3,-6,-4,-9,-2,-5,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-20,-16,-12,0,-23,-17,2,-9,0,1,-10,-19,-13,-9,-6,1,6,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-15,-22,-16,-4,-21,-15,10,-18,11,14,-13,-19,-10,-16,-3,7,7,-26,-7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-11,-27,-15,-11,-3,-11,-13,-19,-2,-18,-13,-5,-19,-8,1,-4,-1,-17,13,2,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-11,-20,-17,-13,-4,-19,-9,4,-11,13,18,-10,-21,-7,-7,-13,-4,0,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-28,9,16,-29,-14,-8,-25,8,-23,-16,1,8,6,-1,-1,-6,-23,-28,-19,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-25,-3,12,-15,-22,-10,-3,-7,1,1,-11,-14,1,-11,-9,-9,-5,-23,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-29,-5,7,-28,-19,-2,-27,31,-23,-8,0,-14,20,40,-7,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-27,11,34,-30,-17,-2,-26,11,-20,-15,1,-5,19,4,0,-8,-24,-27,-17,26;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-6,3,-23,-20,-1,-30,30,-21,-10,1,-18,13,60,-9,-10,-21,-21,-10,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-19,-11,-21,-29,63,-21,-39,-21,-29,-20,-1,-21,-21,-21,-1,-19,-29,-22,-30,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-28,-36,-27,-2,-37,-28,43,-24,16,18,-20,-20,-19,-25,-18,-9,29,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-6,10,-23,9,9,-22,-15,-6,-22,8,-20,-14,8,-12,5,2,4,4,-18,-28,-13,7;
MA   /M: SY='T'; M=9,-12,-13,-17,-13,-10,-15,-19,1,-15,-3,-3,-8,-16,-12,-16,10,12,7,-29,-12,-13;
MA   /M: SY='A'; M=17,-4,-13,-10,-6,-21,2,-15,-18,-7,-19,-13,0,-12,-4,-10,15,9,-10,-27,-18,-5;
MA   /M: SY='H'; M=0,-9,-19,-14,-13,-6,-16,6,-5,-10,-8,-3,-4,-19,-11,-9,-3,-3,0,-21,1,-13;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-15,-25,-19,-7,-22,-18,12,-12,4,13,-16,-20,-12,-11,-6,2,15,-22,-8,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-24,-3,9,-17,-15,3,-20,4,-20,-10,-1,-11,13,3,6,-1,-19,-20,0,10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-16,-34,-26,40,-29,-14,7,-25,15,10,-22,-28,-26,-19,-21,-10,3,1,22,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-26,-2,9,-10,-20,-6,-14,-4,-14,-10,-5,-1,1,-8,-2,-3,-14,-21,-5,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-25,-18,-15,7,-23,3,-9,-12,-7,-6,-13,-22,-9,-11,-8,6,-11,18,29,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-27,9,16,-26,-13,-1,-26,11,-22,-15,6,-5,7,7,-1,-6,-23,-27,-14,11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,4,-25,5,0,-19,-7,-5,-21,6,-18,-11,3,-15,-3,2,-5,-7,-17,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-22,-6,0,-12,-17,3,-19,6,-15,-9,-3,-18,0,13,-5,-3,-15,-16,4,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-15,-2,0,-13,2,-7,-12,-1,-9,-6,-2,-8,-3,-1,-2,-4,-9,-15,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-16,-21,-20,-15,11,-27,-12,5,-11,0,2,-12,-23,-13,-11,-14,-9,3,-11,11,-15;
MA   /M: SY='N'; M=0,12,-20,4,1,-20,-9,-6,-14,-6,-17,-13,17,-11,-1,-8,7,6,-15,-31,-17,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-22,-27,-26,-21,3,-26,-2,17,-23,16,12,-18,-24,-14,-19,-20,-12,7,-14,13,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-21,-29,-21,2,-30,-23,24,-24,24,13,-23,-24,-19,-21,-18,-7,20,-22,-4,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00273;
//
ID   IF5A_HYPUSINE_MP; MATRIX.
AC   MP00302;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic initiation factor 5A hypusine signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8807325; R2=0.0141456; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684; N_SCORE=14.546; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,56,18,-38,-12,-2,-38,10,-30,-26,16,-10,2,-2,-2,-10,-28,-36,-18,10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,8,-30,14,-8,-33,46,-14,-40,-14,-30,-23,6,-17,-14,-17,0,-17,-30,-26,-27,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-24,4,26,-22,-18,-6,-20,7,-18,-14,-2,-10,8,10,3,-4,-14,-30,-17,16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,0,18,-25,-20,-2,-30,29,-22,-13,0,-13,13,43,-7,-10,-23,-23,-13,13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,15,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-25,32,27,-29,-10,1,-29,2,-26,-23,20,-8,7,-4,8,-4,-27,-36,-20,17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-36,-28,0,-34,-24,40,-24,18,26,-22,-22,-18,-24,-18,-8,30,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-15,-21,-18,-7,-25,-20,11,-5,1,11,-18,-21,-15,-8,-6,7,22,-27,-8,-16;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-3,-2,-20,0,-12,-18,-10,-27,-18,7,-10,-2,-12,35,17,-8,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-26,0,8,-28,-16,-10,-28,37,-30,-12,2,-10,8,22,0,-4,-18,-24,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-29,-10,-4,-23,-20,-20,-16,-10,-23,-16,-13,54,-10,-16,1,12,-19,-30,-23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-20,-1,6,-23,2,11,-25,-8,-24,-15,4,-12,1,-9,14,-1,-19,-31,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=32,-14,-13,-20,-16,-18,5,-22,-7,-14,-9,-8,-12,-16,-16,-20,4,-3,5,-22,-20,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-18,0,-28,-3,0,-20,-17,21,-28,17,-22,-10,12,-20,8,45,-7,-10,-24,-25,-6,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,41,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-11,-17,-6,-4,-12,-25,-20,8,-11,-2,-2,-17,-21,-15,-14,-7,-3,22,-31,-13,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,23,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-30,6,-12,-32,54,-16,-40,-16,-30,-22,4,-18,-16,-18,0,-18,-30,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,42,-28,23,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-23,35,15,-28,-15,-7,-28,-2,-21,-21,10,-9,-1,-9,7,12,-19,-35,-16,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-26,-2,-10,-27,37,-12,-33,-6,-30,-19,11,-17,-10,-9,6,-10,-26,-26,-24,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-27,-4,9,-31,-21,-3,-17,22,-20,-3,-4,-13,28,14,-5,-9,-15,-21,-10,19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-26,-6,2,-24,-22,-14,-17,35,-22,-6,-6,-14,2,20,-10,-8,-5,-22,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,-3,-11,-22,19,-24,18,-17,-6,-2,-21,6,37,-12,-12,-20,-12,13,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00274;
//
ID   S100_CABP_MP; MATRIX.
AC   MP00303;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-100/ICaBP type calcium binding protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0746078; R2=0.0172826; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=388; N_SCORE=12.770; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=0,-2,-24,-4,2,-18,-2,-7,-22,-7,-21,-16,2,6,-5,-10,4,-2,-20,-27,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-21,-4,1,-13,-8,-4,-16,-9,-8,-8,-1,-15,-2,-9,1,0,-14,-25,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-22,-26,-16,22,-24,-18,4,-20,5,1,-15,-22,-20,-17,-10,-1,2,-5,8,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-10,-25,-17,-2,-27,-21,7,-20,19,6,-21,-16,-17,-18,-17,-3,4,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-19,-3,4,-28,-3,-11,-28,7,-26,-15,-2,-1,3,4,0,-8,-22,-27,-20,2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-21,7,9,-22,-13,0,-20,4,-18,-12,13,-15,6,5,2,-4,-20,-30,-15,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-25,-10,1,-16,-21,-11,-13,3,-13,-6,-9,3,3,0,-8,-5,-15,-22,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-25,-4,-2,-16,-17,-3,-16,15,-14,-4,-1,-17,-1,11,-8,-7,-11,-23,-7,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-28,35,14,-34,-3,-1,-33,3,-27,-21,16,-12,6,-1,1,-9,-28,-33,-19,9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-1,-31,4,14,-29,-18,-8,-22,3,-24,-15,-3,23,7,-2,-2,-7,-24,-29,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-17,5,7,-24,-9,-7,-21,1,-19,-12,0,-10,0,-5,2,-5,-15,-29,-16,3;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-16,-7,-6,-12,-12,-14,-8,-10,-8,-7,-4,-15,-9,-13,6,11,-1,-25,-9,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-19,-31,-25,5,-30,-24,26,-24,20,12,-25,-26,-23,-22,-16,-5,26,-20,0,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,32,-27,43,19,-34,-11,-2,-32,2,-26,-23,14,-10,4,-5,2,-8,-25,-35,-19,11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-25,0,3,-21,-19,-7,-17,17,-17,-8,4,-15,2,12,-4,-2,-12,-26,-11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-35,-26,9,-33,-24,29,-27,26,19,-25,-25,-21,-23,-23,-10,20,-12,2,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-25,-20,-34,-24,27,-26,-11,15,-21,22,32,-22,-25,-17,-16,-22,-10,8,-11,9,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,12,24,-31,-15,-3,-28,20,-26,-14,4,-8,18,11,0,-7,-25,-27,-15,21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,17,-26,23,15,-25,-13,1,-24,2,-18,-16,10,-13,2,-3,-1,-6,-20,-33,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-28,-17,6,-29,-18,16,-25,44,18,-28,-28,-15,-17,-28,-10,7,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-21,-10,0,-19,-19,-11,-12,8,-13,-6,-3,-14,4,10,-1,1,-9,-24,-11,0;
MA   /M: SY='N'; M=-13,40,-16,30,4,-25,-4,6,-26,-1,-30,-23,46,-18,-1,-4,7,-3,-29,-40,-20,1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-4,2,-25,-2,3,-27,9,-24,-11,2,-14,6,11,3,-5,-20,-26,-13,3;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-22,-3,-5,-29,25,-7,-32,-3,-27,-15,7,-17,0,-4,-1,-14,-27,-24,-21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-27,0,20,-26,-18,-2,-20,12,-16,-8,-4,-10,17,7,-4,-9,-19,-23,-11,18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-12,-32,-29,1,-32,-29,32,-24,17,13,-27,-28,-26,-23,-15,-4,38,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-24,40,9,-31,-1,-2,-32,-4,-30,-25,23,-12,-1,-9,11,-2,-25,-39,-21,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30,78,-30,-18,0,-29,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,11,32,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-26,7,20,-30,-13,6,-23,4,-21,-10,4,-10,24,1,4,-3,-24,-27,-13,22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-29,19,57,-30,-19,0,-30,9,-20,-20,0,0,19,0,2,-9,-29,-30,-20,38;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-20,-32,-26,57,-30,-6,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-17,-19,-10,-3,15,45,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-11,-27,-18,1,-27,-20,13,-22,20,12,-24,-26,-16,-18,-18,-8,12,-18,-4,-17;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-14,-20,-17,-6,-19,-18,8,-15,5,4,-12,-21,-15,-13,-2,5,14,-28,-10,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-20,-32,-22,26,-28,-17,14,-27,31,18,-24,-28,-22,-18,-23,-9,7,-13,7,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-33,-27,6,-32,-26,30,-25,23,17,-27,-27,-24,-22,-18,-6,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=11,-14,-20,-20,-16,-4,3,-20,-10,-13,-9,-7,-9,-17,-16,-16,-1,-5,-5,-17,-10,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-13,-5,-3,-25,-5,-12,-24,11,-20,-10,-3,-16,-1,6,-4,-8,-16,-25,-16,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-20,-32,-24,5,-31,-24,28,-27,32,18,-27,-27,-21,-22,-22,-7,22,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-5,-17,-14,-14,-7,-21,-9,-14,-9,-9,-8,-15,-13,-17,9,13,1,-27,-16,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-19,-20,-13,-7,-19,-14,8,-9,4,11,-15,-18,-3,-10,-9,-4,7,-17,-5,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-15,-14,-8,-14,-8,-15,-4,-10,-5,-3,-9,-9,-8,-17,2,-1,-1,-18,-11,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-15,47,-22,-20,-8,-22,-15,-16,-18,-12,-12,-14,-27,-18,-19,-5,-5,-7,-24,-3,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-13,10,-24,4,-3,-13,-12,50,-20,-6,-19,-7,21,-19,3,-2,-3,-10,-24,-24,11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-27,18,23,-23,-17,4,-25,12,-20,-15,5,-9,8,3,-4,-9,-23,-23,-6,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-7,-21,-9,-6,2,-17,-1,-9,-5,-8,-5,-6,-17,-7,-7,-4,-5,-7,-13,7,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-17,-26,-19,25,-23,-17,9,-22,13,6,-15,-21,-20,-17,-10,-2,5,-11,7,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-25,-4,-1,-17,-9,23,-17,-6,-11,-4,-2,-17,0,-3,-8,-13,-15,-20,-1,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-25,1,11,-22,-6,-4,-22,11,-19,-10,0,-11,6,5,-3,-9,-18,-22,-13,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-7,1,9,-25,-10,-5,-24,-1,-20,-14,1,-13,6,-6,2,-5,-20,-29,-17,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00275;
//
ID   SASP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00304;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Small, acid-soluble spore proteins, alpha/beta type, signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7157969; R2=0.0155086; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=169; N_SCORE=7.327; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-4,26,-16,12,-1,-19,-2,2,-19,-4,-28,-19,41,-16,-1,-4,19,10,-22,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,2,-28,3,15,-33,-20,-1,-24,21,-23,-7,1,-9,30,13,-1,-3,-23,-22,-11,23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-23,-16,-8,-6,-23,1,-3,-7,14,6,-13,-22,-7,-5,-16,-9,-5,-24,-1,-8;
MA   /M: SY='L'; M=3,-23,-17,-28,-18,1,-21,-16,14,-20,28,22,-23,-23,-14,-18,-18,-7,10,-21,-5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-13,-24,-26,-6,-14,-27,16,-19,1,3,-22,-27,-26,-19,-4,-1,33,-30,-14,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-36,-11,-1,-25,-20,-14,-21,-1,-26,-16,-15,55,-5,2,-10,-10,-26,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-30,1,14,-28,16,-8,-34,3,-24,-18,0,-13,2,8,-2,-14,-28,-24,-22,6;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-15,-19,-11,-17,-10,-17,-8,-2,-9,-7,-11,-16,-9,1,2,-2,4,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-27,-2,9,-30,4,-10,-28,15,-25,-13,-1,-11,7,4,-2,-11,-22,-22,-18,8;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-1,-19,-7,-2,-22,-14,-5,-7,-3,-14,-4,3,-17,13,-5,3,-3,-5,-27,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-16,-21,-16,-16,7,-16,-6,-13,-5,6,-12,-16,-11,-18,0,-6,0,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-20,-25,-18,1,-25,-20,18,-25,24,11,-18,-23,-15,-20,-11,-3,10,-25,-5,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-23,36,9,-29,-6,0,-29,2,-30,-23,28,-13,1,-4,10,-1,-25,-38,-19,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,3,23,-37,-20,5,-23,18,-22,-5,0,-9,45,13,-2,-10,-28,-21,-11,34;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-20,-35,-25,39,-25,-10,10,-20,15,31,-20,-25,-20,-15,-20,-10,5,-5,15,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-6,-24,-9,0,8,-22,-1,-5,-11,4,-3,-3,-22,-8,-10,-13,-8,-12,-12,13,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,25,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,30,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,10,-22,4,5,-25,-9,-1,-23,13,-27,-13,18,-14,12,11,8,-1,-21,-30,-15,8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,27,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-34,-24,37,-29,-18,12,-28,30,17,-25,-29,-26,-19,-25,-10,6,-8,12,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-15,-33,-29,20,-31,-27,24,-24,14,9,-27,-29,-31,-21,-15,-4,33,-19,1,-29;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,7,-18,3,2,-19,-7,-3,-15,-3,-21,-13,13,9,4,-5,8,3,-18,-26,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-11,-15,-16,-14,16,-18,-10,5,-18,17,5,-6,-21,-16,-12,-14,-6,-1,-13,2,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-13,-21,-14,-10,-1,-14,-1,-10,-10,-13,-10,-10,-7,-7,-13,3,0,-10,-6,19,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,62,26,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,17,-8,3,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-8,-10,-9,-9,-12,-16,-5,-9,-9,-7,-3,-10,-9,-10,15,26,4,-25,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=5,-12,-8,-16,-15,-6,-17,-19,7,-12,-2,-1,-12,-16,-15,-13,5,15,19,-24,-9,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-22,5,1,-17,-12,-2,-19,2,-20,-13,1,-14,4,-4,6,-1,-15,-19,2,2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,2,3,-23,-13,1,-27,26,-26,-13,20,-17,7,36,-3,-7,-23,-27,-13,3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,16,-15,9,4,-15,7,1,-16,-2,-18,-13,24,-11,-1,-3,4,-4,-19,-22,-14,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-19,-6,-13,-19,45,-13,-26,-13,-19,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-19,-13,-19,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-18,-6,-12,-18,42,-12,-24,-12,-18,-12,0,-12,-12,-12,0,-12,-18,-12,-18,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-16,18,10,-18,3,0,-19,-1,-17,-14,14,-7,1,-4,2,-5,-18,-21,-13,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-14,-20,-14,3,-19,-13,19,-16,20,15,-15,-15,-10,-13,-15,-6,11,-12,0,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-2,-11,-4,-2,-10,-8,-5,-13,3,-12,-8,2,-8,1,13,9,10,-7,-17,-8,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-6,-8,-4,-12,0,-10,-8,-6,-10,-8,-2,-6,-4,-10,12,4,-2,-16,-12,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-16,0,6,-26,-6,-4,-20,-4,-27,-14,7,-10,19,-4,27,10,-16,-34,-17,13;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-27,32,-30,-30,-6,-30,-30,11,-23,0,0,-27,-33,-30,-23,-10,-3,31,-36,-16,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00276;
//
ID   11S_SEED_STORAGE_MP; MATRIX.
AC   MP00305;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   11-S plant seed storage proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1636939; R2=0.0152799; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=902; N_SCORE=18.936; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-30,5,18,-26,-18,-4,-21,4,-19,-12,-5,4,13,4,-4,-9,-20,-25,-14,14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-29,5,25,-28,-20,-1,-20,5,-16,-10,-3,-2,22,5,-3,-9,-23,-26,-15,22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-6,-17,-5,9,-20,-10,-11,-21,-1,-18,-13,-6,-14,1,2,-1,-2,-15,-18,-15,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,5,-30,9,18,-33,-11,2,-28,9,-23,-11,2,-7,27,14,-2,-11,-28,-25,-15,21;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-6,-24,-4,3,-9,0,6,-18,-4,-13,-9,-5,-10,0,-4,-6,-10,-18,-7,8,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-26,5,27,-25,-17,-1,-21,5,-18,-12,-2,-1,20,0,3,-5,-23,-24,-12,23; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-3,-31,1,19,-31,-9,-2,-27,10,-23,-12,-2,1,21,13,-4,-11,-28,-24,-17,18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-20,1,8,-25,-4,-1,-29,7,-24,-14,0,-15,6,9,-1,-9,-23,-24,-12,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-30,-4,5,-31,0,4,-22,0,-21,-6,-1,-7,22,-2,-2,-11,-25,-22,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-29,-7,5,-21,-20,6,-24,16,-18,-8,-2,-11,15,35,-7,-9,-21,-19,-5,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-29,-7,1,-25,-2,-5,-26,2,-24,-13,-3,0,6,10,-1,-6,-24,-18,-15,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-11,-1,1,-23,2,-5,-26,-2,-24,-15,3,-14,2,1,10,-2,-18,-29,-17,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-27,1,16,-29,-7,-3,-26,5,-23,-12,0,-5,20,8,4,-5,-25,-26,-17,17;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-9,-9,-10,-3,-18,-10,-8,-18,-7,-16,-11,-4,-18,0,-2,4,0,-14,-21,-13,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,3,-21,7,0,-20,-5,-10,-27,-1,-22,-18,0,-14,-5,4,-1,-8,-19,-19,-14,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-30,32,50,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,5,-2,15,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,8,-12,-4,-8,-12,-16,-14,-12,-8,-14,-12,12,-12,-8,-8,18,40,-6,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-39,-29,34,-35,-25,26,-29,17,11,-21,-25,-29,-25,-20,-9,17,-8,12,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-21,-19,-29,-19,-1,-21,-10,18,-16,21,38,-20,-20,-7,-15,-17,-8,10,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,7,-25,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,1,-30,-23,9,-27,-24,9,-25,17,5,-22,-27,-24,-22,-15,-4,11,-22,-4,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-7,1,-21,-20,8,-27,23,-21,-9,1,-17,7,42,-6,-3,-18,-23,-6,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-25,4,18,-23,-21,7,-16,-2,-10,-6,-3,-12,15,-3,-3,-5,-15,-27,-9,16;
MA   /M: SY='N'; M=-11,37,-21,18,0,-20,-1,9,-21,2,-29,-19,56,-20,1,4,9,-1,-29,-39,-19,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-36,-27,1,-36,-28,39,-28,23,17,-21,-22,-20,-26,-19,-6,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-1,14,-27,22,14,-32,6,-9,-32,-4,-24,-22,4,-4,-2,-12,1,-10,-25,-30,-23,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-12,22,-24,22,8,-27,-9,2,-25,4,-26,-18,22,-8,9,5,4,-4,-25,-32,-17,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-31,-8,-1,-26,-15,-16,-19,-6,-26,-18,-9,51,-7,-10,0,-2,-23,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='S'; M=8,1,-14,-2,0,-20,-5,-9,-18,-3,-24,-16,9,-12,-1,-2,23,10,-10,-34,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-24,-1,6,-22,-14,2,-25,12,-21,-13,5,-15,9,30,4,-3,-19,-28,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-15,-18,-8,-22,-3,-20,-12,-10,-13,-12,-12,6,-10,-20,7,-2,-5,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,-17,-29,-24,7,-29,-25,22,-22,9,7,-18,-23,-23,-21,-7,5,24,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-26,-26,-23,43,-30,6,2,-16,3,1,-21,-30,-20,-13,-19,-9,-4,21,61,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-21,14,2,-22,-4,4,-22,9,-30,-18,44,-17,2,5,9,0,-26,-36,-18,2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-39,-10,0,-29,-20,-18,-21,-7,-29,-19,-18,81,-8,-12,-10,-10,-29,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-28,-2,11,-28,-18,3,-25,19,-22,-8,4,-14,27,33,-2,-8,-24,-23,-12,17;
MA   /M: SY='A'; M=33,-14,-14,-21,-13,-15,2,-20,-7,-15,0,-5,-13,-15,-13,-20,1,-4,-1,-20,-17,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-26,-10,-3,-13,-18,1,-24,17,-19,-10,-1,-20,5,44,-2,-4,-17,-17,1,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-13,-5,-4,-16,-11,-6,-17,-7,-20,-13,4,-11,-3,-8,23,27,-7,-33,-12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-13,-7,-9,-11,-17,-9,-10,-8,-13,-10,5,-14,-8,-6,15,29,-3,-30,-8,-9;
MA   /M: SY='L'; M=6,-26,-15,-28,-21,1,-24,-23,17,-23,25,11,-26,-26,-21,-20,-15,-5,20,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-9,34,-19,19,0,-20,-4,4,-20,-2,-27,-19,47,-18,-2,-2,11,7,-25,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-14,-3,-2,-17,-2,-8,-21,-5,-27,-17,7,-13,0,0,29,14,-12,-33,-14,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00284;
//
ID   CASEIN_ALPHA_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00306;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Caseins alpha/beta signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8722196; R2=0.0134172; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=286; N_SCORE=8.702; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-18,-32,-24,25,-30,-22,17,-28,34,14,-28,-30,-26,-20,-25,-8,14,-14,6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-10,-12,-10,-12,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,42,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,20,12,-30,-30,-28,-20,-15,-2,40,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=11,-18,-12,-21,-17,-7,-18,-22,7,-17,3,0,-16,-20,-17,-17,2,7,18,-28,-12,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-19,-32,-24,25,-30,-21,17,-29,35,14,-28,-30,-26,-20,-25,-9,13,-14,6,-24;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-11,-15,-14,-7,-4,-13,-2,0,1,6,15,-9,-13,0,12,-11,-6,-1,-12,-2,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-23,-5,0,-17,-12,2,-13,-6,-17,-10,-9,42,-4,-10,-6,-7,-18,-18,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-12,-12,-16,-9,15,-14,-9,-1,-11,5,1,-10,-14,-7,-9,-8,-5,-3,-4,4,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-4,-33,0,9,-24,-20,53,-27,-7,-23,-8,0,12,6,-5,-8,-16,-30,-30,1,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-16,1,10,-16,-10,-4,-17,17,-16,-8,1,-6,6,15,1,-3,-12,-16,-8,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-19,-20,-24,-15,8,-22,-9,7,-7,10,17,-14,-20,-8,4,-16,-8,3,-13,2,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-28,10,22,-26,-5,-1,-29,12,-25,-17,13,-11,8,11,0,-9,-27,-28,-19,14;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-2,-26,-4,1,-23,-16,60,-24,-7,-18,-2,4,-16,13,-3,-4,-14,-23,-26,7,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-15,-23,-18,-4,-27,-21,15,-18,14,9,-22,-25,-13,-15,-10,3,22,-26,-7,-16;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-18,2,8,-24,3,-10,-25,-1,-29,-19,6,-10,2,-5,23,7,-17,-34,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-14,-16,-12,-5,-16,-17,3,-19,7,0,-12,-21,-12,-15,5,5,7,-31,-11,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-17,-10,-6,-2,-12,-13,-11,-11,-15,-11,-6,17,-10,-12,6,7,-11,-20,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-27,3,25,-33,-20,3,-21,7,-18,-6,0,-8,40,5,3,-1,-25,-24,-12,32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-23,5,24,-23,-9,-10,-24,-1,-18,-16,0,-6,4,-6,7,11,-19,-29,-18,14;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-19,-11,-4,-23,-6,-17,-16,-10,-22,-16,-7,19,-7,-17,14,3,-12,-29,-23,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00277;
//
ID   LECTIN_LEGUME_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00307;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Legume lectins beta-chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.3289256; R2=0.0214218; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-32; N_SCORE=6.612; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-38; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-24,-7,-13,-9,11,-16,-14,-21,1,-6,-8,-22,-17,-18,-9,-11,-12,-22,-13,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-17,-25,-20,-22,5,23,-17,-20,-22,-9,-9,-9,-23,-23,-18,-8,-11,-15,-10,-3,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-16,-28,-21,9,-27,-23,15,-23,22,9,-22,-24,-21,-19,-13,3,16,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-9,-32,-26,29,-14,-22,-1,-28,11,1,-19,-29,-29,-22,-18,-12,-1,-10,5,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-22,0,-9,-16,-7,0,-6,-11,-15,-8,16,-20,-9,-11,2,-4,-7,-33,-13,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-8,-18,-12,-11,6,-15,-14,-10,-15,-15,-12,0,-4,-15,-14,9,7,-6,-25,-8,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,8,-17,6,2,-20,-10,-8,-15,-3,-22,-15,12,-14,-3,-6,16,9,-8,-35,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-6,17,-26,21,6,-32,2,-5,-30,2,-25,-18,11,-13,5,-4,2,-6,-24,-29,-18,5;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-22,-9,-5,-11,-14,-3,-13,-7,-17,-10,-4,-1,1,-10,5,3,-14,-15,5,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-13,20,-27,20,14,-25,-14,1,-27,17,-26,-17,18,-13,5,7,-2,-7,-25,-27,-9,9;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-19,1,-3,-23,10,-7,-25,-2,-29,-18,16,-15,-2,0,19,4,-19,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='S'; M=11,2,-16,-1,-2,-15,-6,-11,-19,-2,-22,-15,6,-12,-4,-7,16,5,-11,-28,-15,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-26,7,-4,-15,4,-2,-19,-8,-19,-14,11,-18,-7,-11,-2,-9,-20,-19,-2,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,3,-25,2,9,-29,-19,23,-21,0,-18,-4,4,-12,29,2,2,1,-23,-26,-4,18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-19,-28,-22,10,-30,-25,17,-22,6,5,-13,-19,-20,-20,-4,14,15,-19,1,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,-13,-17,-11,-20,8,-20,-14,-11,-13,-11,-7,-11,-11,-19,10,3,-4,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-28,19,47,-29,-20,-2,-26,7,-19,-17,-1,-4,17,-2,-1,-9,-24,-30,-19,32;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-21,-38,-28,63,-31,-21,7,-30,17,5,-22,-29,-35,-21,-22,-10,4,3,23,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-25,-27,-23,43,-29,7,0,-18,3,1,-18,-29,-21,-14,-18,-10,-3,13,50,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-7,-12,-23,-13,-8,-3,-17,2,-11,-13,-13,-8,-5,-1,-8,-8,3,-1,-11,-25,-5,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,27,-20,13,-3,-21,10,3,-23,-4,-30,-20,45,-19,-3,-4,12,0,-27,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-23,-11,-4,-19,-18,-13,-15,8,-17,-9,-4,-3,-2,14,2,7,-10,-25,-13,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-14,-35,-13,-12,-6,-23,-21,-8,-15,-12,-12,-17,-19,-12,-17,-17,-9,-13,43,6,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-14,12,-27,19,3,-14,-19,-1,-13,-8,-14,-13,2,-15,-4,-12,-3,-6,-13,-20,6,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-32,-9,-9,-22,-5,-15,-9,-13,-20,-12,2,24,-11,-17,-6,-9,-18,-29,-22,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-30,29,10,-33,-13,-7,-30,4,-29,-22,8,15,-2,-6,-3,-9,-26,-33,-21,3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-27,-17,-11,-14,-20,-18,-4,-12,-14,-8,-13,6,-7,-15,-6,-3,-5,-3,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-21,9,-2,-19,-10,-6,-15,-5,-18,-14,14,-9,-5,-4,7,1,-13,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-5,-28,-5,-4,-14,-17,12,-19,-3,-21,-12,2,8,-2,2,-3,-3,-21,-21,1,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-12,7,-29,8,-2,-22,-18,8,-11,-11,-17,-10,7,0,-4,-13,-3,-8,-15,-32,-10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-5,-27,-6,-10,-6,-9,12,-13,-14,-12,-6,-1,-19,-9,-8,-6,-11,-13,-22,0,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-29,-22,-18,-14,-14,-14,9,-12,-4,3,-12,-11,-13,-15,-13,-12,4,-22,-8,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00278;
//
ID   LECTIN_LEGUME_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00308;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Legume lectins alpha-chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9137731; R2=0.0140529; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=464; N_SCORE=11.424; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-28,-1,2,-29,17,-9,-30,-1,-24,-14,0,-15,5,2,0,-12,-24,-23,-20,3;
MA   /M: SY='D'; M=-4,9,-21,11,5,-24,-15,-10,-23,6,-20,-15,4,-11,1,4,6,9,-14,-29,-14,3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-6,-21,-8,-6,-15,-15,-6,-5,-8,-15,-7,-1,-14,-1,-8,10,3,-4,-27,-6,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-5,-10,-14,-16,12,-20,-3,-9,-13,-8,-8,0,-23,-14,-12,-3,7,-9,-9,19,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-19,-13,-8,-12,-22,-12,2,-13,-7,-3,0,-13,-5,-13,8,17,1,-29,-9,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-18,-25,-23,0,-30,-24,25,-23,19,11,-23,-26,-22,-21,-15,-5,27,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-14,-4,-2,-18,-6,-6,-19,-4,-24,-15,6,-12,-1,-4,24,13,-10,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='A'; M=10,0,-21,1,9,-22,-9,0,-18,-5,-16,-12,-3,-11,2,-10,3,-4,-13,-25,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-10,-16,-14,-14,-10,-21,-18,4,-10,-7,-3,-6,-19,-12,-6,5,10,12,-30,-11,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-30,-29,0,-30,-28,30,-20,11,13,-29,-29,-28,-20,-11,-1,47,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-29,47,20,-35,-12,11,-35,-1,-27,-24,14,-6,3,-8,0,-10,-29,-37,-15,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-31,-23,11,-30,-21,22,-27,38,19,-28,-29,-22,-20,-25,-8,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-28,3,18,-27,-18,-8,-27,29,-25,-13,1,-4,9,17,-4,-6,-21,-24,-14,13;
MA   /M: SY='K'; M=-1,9,-24,8,7,-29,-13,-6,-24,17,-24,-13,7,-11,10,7,2,-2,-19,-26,-14,8;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-13,-19,-14,-4,-11,-24,-19,9,-9,-2,0,-12,-18,-11,-13,-5,-4,16,-28,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-8,-37,2,4,-29,-18,-14,-22,-8,-29,-20,-11,66,-7,-17,-8,-10,-29,-30,-24,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-30,31,46,-34,-17,1,-32,7,-23,-20,5,-4,19,-2,0,-10,-30,-32,-19,32;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-32,-45,-32,-23,5,-21,-23,-21,-8,-20,-17,-31,-27,-14,-6,-33,-25,-27,112,25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-23,0,1,-22,-13,-5,-25,12,-24,-14,5,-15,5,29,9,1,-16,-29,-14,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-33,-30,7,-32,-29,32,-23,12,11,-27,-28,-29,-22,-13,-3,41,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,64,-30,-20,5,-30,19,5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-15,-12,-12,-16,1,-19,-13,-13,-14,-11,-2,-12,-11,-15,15,22,-5,-27,-16,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-11,-8,-9,-13,-10,-17,-12,-11,-15,-12,1,-11,-9,-11,22,34,-2,-31,-13,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-28,-10,-18,-29,62,-19,-37,-19,-29,-19,0,-19,-18,-19,3,-17,-27,-21,-29,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=4,-16,-16,-20,-16,0,-13,-16,4,-18,11,3,-13,-20,-15,-17,-8,-2,4,-17,-3,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-10,2,-23,4,2,-14,-10,6,-19,0,-17,-11,2,-10,4,0,0,-3,-18,-16,4,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-26,5,20,-17,-14,-2,-21,9,-17,-12,0,-10,8,7,-4,-8,-20,-19,-6,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-3,4,-22,8,1,-19,-3,-10,-20,-7,-18,-15,-1,-5,-6,-12,2,-1,-14,-17,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-9,-7,-6,-3,-9,-3,-5,-7,-4,-4,-2,-10,-5,-7,4,7,-3,-10,4,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-9,-13,-13,-11,-1,-12,-10,-2,-5,-5,-3,-6,-15,-10,-2,-1,3,4,-14,-1,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-21,9,34,-19,-15,0,-19,5,-13,-11,-1,-3,16,0,0,-5,-20,-20,-12,25; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-15,-11,-8,-15,-18,-16,-7,-7,-10,-7,-1,-11,-3,-9,12,28,-2,-27,-11,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-29,-2,-3,-14,-19,74,-24,-8,-16,-2,10,-21,6,2,-10,-16,-26,-24,19,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-18,23,15,-18,-9,-1,-18,2,-12,-13,7,-7,3,0,-2,-6,-16,-21,-11,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-14,-23,-18,1,-23,-18,25,-17,13,11,-16,-16,-15,-16,-11,-4,22,-15,-2,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-14,-15,-14,-10,8,-17,-2,4,-9,13,5,-13,-17,-7,-3,-14,-6,-1,-1,17,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-3,22,-19,30,9,-29,-4,-6,-29,-6,-30,-24,14,-10,0,-10,23,7,-19,-40,-20,4;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-30,-40,-30,-23,3,-15,-25,-20,-18,-22,-20,-28,-25,-15,-18,-20,-18,-25,103,18,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00278;
//
ID   LAMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00310;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lysosome-associated membrane glycoproteins duplicated domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6759233; R2=0.0161243; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=561; N_SCORE=14.712; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=7,-11,-13,-14,-12,-13,-17,-20,-2,-5,-10,-6,-9,-16,-12,-9,9,13,11,-29,-13,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,5,-22,2,8,-28,-10,2,-21,4,-25,-11,13,-13,26,8,14,1,-22,-30,-15,16;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,-24,-5,0,-25,-10,-15,-20,-10,-30,-20,-4,38,-5,-15,16,6,-20,-35,-25,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-6,-19,-12,-12,2,-15,1,-8,-9,-10,-8,-3,-19,-8,-11,2,6,-8,-5,23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25,9,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,24,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-17,-21,-18,-19,9,-13,-20,3,-22,7,1,-15,-24,-23,-19,-11,-8,6,-19,-3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-30,3,25,-26,-22,-7,-21,23,-20,-11,-2,-8,11,15,-7,-10,-19,-24,-13,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-22,-25,-23,17,-30,-4,13,-17,14,7,-25,-30,-18,-15,-19,-7,12,1,36,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,29,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,53,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,23,13,-30,-30,-27,-20,-17,-3,37,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-17,-6,-3,-18,-16,-16,-17,1,-20,-13,-1,2,-5,-4,15,26,-9,-30,-14,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-30,31,1,-35,29,-10,-40,-10,-30,-25,10,-15,-10,-15,0,-15,-30,-30,-25,-4;
MA   /M: SY='S'; M=19,0,-12,-4,1,-20,-4,-12,-17,-8,-21,-16,5,-10,-2,-12,23,13,-9,-32,-19,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-2,1,-12,2,9,-14,-7,-4,-14,11,-14,-8,2,-4,4,5,5,0,-10,-15,-8,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,31,-15,15,0,-15,0,8,-15,0,-23,-15,46,-15,0,0,8,0,-23,-31,-15,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=8,-14,-24,-18,-19,-8,36,-20,-26,-19,-18,-14,-6,-19,-21,-20,-1,-14,-18,-15,-17,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-24,-27,-21,27,-30,-4,10,-22,25,10,-25,-30,-19,-16,-25,-10,1,3,35,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-20,2,12,-27,-10,-5,-23,10,-27,-14,5,-9,15,4,17,4,-18,-31,-16,14;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-30,-36,-35,-25,5,-20,-16,-1,-15,-1,19,-30,-25,-10,-15,-30,-20,-11,68,16,-15;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-25,-10,-2,-24,13,-10,-20,-2,-16,-1,-5,-14,2,-7,-3,-12,-17,-21,-17,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,34,41,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,13,-27,7,11,-31,-13,6,-22,14,-25,-9,20,-13,31,10,2,-7,-28,-27,-13,21;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-25,45,-29,-18,10,-28,27,13,-24,-29,-29,-19,-24,-10,5,-4,16,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-7,14,-17,1,-7,-11,-12,-6,-9,-9,-9,-9,24,-18,-7,-7,6,15,-13,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-16,-7,-4,-16,-18,-15,-17,5,-17,-11,1,-11,-3,6,14,29,-7,-28,-11,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-26,3,30,-20,-22,-6,-14,3,-7,-5,-8,-10,8,1,-6,-9,-11,-28,-15,18;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-20,-7,-2,-18,-20,-13,-20,15,-18,-10,0,-12,0,17,6,21,-10,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-20,-2,-2,-19,-17,-11,-16,15,-20,-10,8,-13,-2,7,4,13,-9,-28,-12,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-16,33,8,-21,-7,-2,-21,-1,-16,-16,10,-6,-1,-6,2,1,-14,-23,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-9,7,0,-10,0,2,-10,-2,-16,-10,22,-9,0,-2,11,4,-12,-21,-10,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-12,0,4,-15,-7,-3,-13,11,-14,-6,2,-5,9,6,5,0,-10,-14,-7,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,9,-9,9,0,-11,-9,-7,-11,-3,-9,-9,4,-5,-3,-5,7,15,-5,-17,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-13,10,-24,2,0,-3,-15,8,-11,-5,-10,-9,17,-21,-2,-5,-5,-6,-19,-16,11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-27,-4,5,-25,-20,-10,-24,39,-24,-4,-2,-11,7,23,-8,-4,-15,-21,-9,6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,4,-13,-7,-10,-10,-16,-12,-8,-8,-9,-2,8,-13,-7,-8,12,32,-4,-30,-10,-8;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-15,-26,-25,-8,-11,-27,15,-19,2,3,-21,-24,-24,-21,-6,-4,27,-26,-14,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-11,-11,-10,-9,-18,-18,-8,-13,-5,-8,-2,-13,-10,-11,16,36,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-28,-12,-11,-11,-27,-14,5,-5,5,3,-9,-20,-7,9,-16,-10,1,-23,-6,-12;
MA   /M: SY='A'; M=9,0,-18,2,1,-17,-11,-12,-12,-11,-4,-9,-4,-14,-6,-14,5,0,-8,-29,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-20,-20,-20,-18,15,-28,-19,11,-25,28,9,-22,-28,-22,-19,-22,-9,8,-18,2,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-38,-30,24,-35,-27,32,-28,15,12,-22,-25,-28,-25,-18,-8,25,-13,7,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00280;
//
ID   LAMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00311;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LAMP glycoproteins transmembrane and cytoplasmic domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6277828; R2=0.0133100; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1348; N_SCORE=22.560; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-3,-23,-7,10,-33,-13,0,-17,3,-17,-3,-3,-10,36,0,3,-7,-20,-20,-13,23;
MA   /M: SY='A'; M=33,-13,-18,-17,-7,-23,-6,-20,-13,-10,-16,-13,-13,18,-10,-20,4,-3,-8,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-20,-23,-26,-13,39,-27,-10,-7,-16,0,0,-13,-23,-6,-10,-13,-10,-10,0,16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-24,-6,-4,-13,-18,-7,-10,7,-2,-3,7,-21,-3,8,-11,-7,-13,-26,-9,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-20,-23,-20,-10,-27,-27,13,-17,-4,0,-27,11,-23,-20,-10,-3,23,-30,-17,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-24,31,13,-27,-15,10,-29,-3,-22,-19,11,-11,1,-7,4,5,-22,-35,-11,6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-25,-4,-2,-27,8,-12,-28,10,-26,-13,1,-13,3,3,3,-1,-20,-23,-17,1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-30,12,-9,-33,48,-15,-40,-15,-30,-23,5,-17,-15,-17,0,-17,-30,-25,-27,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-27,-4,6,-24,-22,11,-19,19,-19,-5,-3,-15,10,16,-8,-10,-13,-24,-5,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-24,-9,-15,-27,50,-18,-33,-17,-28,-19,1,-17,-15,-18,9,-10,-23,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='P'; M=2,-6,-21,-7,-1,-23,-14,-13,-16,-7,-21,-13,-5,18,3,-10,11,14,-15,-29,-18,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,13,-22,-19,-12,-16,-21,-1,-17,-7,-1,-15,-22,-17,-19,3,0,12,-32,-17,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-6,-27,-6,18,5,-23,-4,-17,-4,-10,-8,-7,-13,11,-4,-7,-10,-20,-14,0,16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,18,-23,27,28,-29,-10,-3,-29,0,-26,-23,9,-6,8,-6,14,0,-23,-36,-20,18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-21,-4,-1,-20,-13,-7,-11,-7,-16,-9,5,0,5,-8,7,1,-13,-32,-17,1;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-18,-16,-7,-13,-14,-12,-7,-7,2,-2,-10,-18,-2,1,-1,-2,-5,-23,-12,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-30,15,32,-31,-11,0,-30,9,-22,-16,2,-8,20,10,-2,-11,-28,-27,-17,25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-9,29,-16,27,6,-19,-3,4,-19,0,-20,-16,28,-10,0,-3,4,-3,-20,-26,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=1,18,-15,9,0,-20,0,-1,-20,-5,-30,-20,33,-15,0,-5,26,11,-19,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-21,-32,-23,23,-28,-16,16,-22,19,22,-20,-24,-19,-18,-18,-4,9,-13,7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,34,-27,27,17,-26,-26,-23,-24,-21,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,-19,-29,-19,-11,-17,-24,16,-19,3,3,-14,-14,-14,-24,-3,-4,13,-20,-11,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=15,-17,-19,-21,-16,-13,10,-20,-8,-20,5,-3,-14,-20,-16,-20,-7,-9,-5,-20,-16,-16;
MA   /M: SY='A'; M=31,-17,-13,-25,-17,-13,-12,-23,7,-15,-2,-2,-15,-15,-15,-22,2,-2,14,-22,-15,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,-15,-23,-14,-11,-5,-20,-2,-18,9,-1,-16,-18,-14,-20,-4,-5,1,-20,-14,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,35,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,25,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=7,-20,-18,-26,-18,-3,-23,-22,13,-21,18,7,-18,-19,-16,-20,-9,3,10,-22,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-27,28,-33,-26,20,-30,-23,-3,-30,15,1,-24,-33,-29,-23,-20,-10,0,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-26,-15,-20,-22,36,-22,-20,-20,-18,-12,-3,-18,-18,-20,0,-6,-15,-22,-22,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16,-6,-12,-23,-6,-16,13,0,-2,-8,-23,2,45,-16,-10,-12,-20,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,12,-30,25,-20,-9,1,-20,10,62,-10,-11,-21,-21,-6,0;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-3,-24,-2,4,-25,-12,23,-23,-6,-25,-11,3,3,12,-5,11,-2,-22,-32,-8,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-20,0,0,-13,-13,66,-20,-7,-13,0,7,-13,7,0,-7,-13,-20,-20,13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-12,-7,-18,-3,-17,-13,-10,-17,-13,-2,-10,-7,-15,22,15,-3,-28,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-23,-12,-17,-25,42,-20,-30,-17,-23,-17,-2,-17,-17,-18,5,-4,-20,-22,-25,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,31,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,49,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-21,-9,0,-24,-17,-12,-15,-4,-16,-9,-5,8,10,-8,7,14,-14,-26,-15,4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-24,-37,-27,26,-34,-24,26,-30,27,14,-23,-26,-26,-24,-23,-10,15,-12,8,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00280;
//
ID   GLYCOPHORIN_A_MP; MATRIX.
AC   MP00312;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycophorin A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4794774; R2=0.0121378; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=780; N_SCORE=13.937; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-38,-10,0,-28,-20,-15,-22,0,-28,-18,-15,63,-5,2,-10,-10,-28,-28,-25,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-15,-1,12,-15,-14,-10,-7,-4,-11,-9,-5,-10,-1,-7,7,1,0,-27,-14,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-5,-20,-2,5,-23,-10,-5,-16,-3,-22,-11,-1,15,12,-5,11,2,-18,-25,-16,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-22,-22,-24,-19,12,-27,-7,17,-19,21,11,-20,-23,-14,-16,-20,-8,7,-2,23,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-15,-20,-15,-11,-14,-25,15,3,-11,-5,5,-13,-23,0,-8,-8,-8,11,-28,-1,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,6,-26,-20,74,-27,-4,-20,0,7,-17,24,3,-7,-17,-30,-27,11,11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,22,-32,35,23,-34,-15,-3,-33,5,-27,-24,6,7,4,1,-3,-10,-29,-34,-20,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-16,-3,-1,-21,-7,-13,-19,-10,-27,-19,3,10,-3,-12,27,18,-13,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-6,-23,-5,7,-19,-17,21,-18,0,-14,-7,-3,-15,3,5,-4,-10,-12,-26,-6,3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=10,-24,-14,-27,-20,-2,-21,-23,14,-21,21,8,-24,-24,-20,-20,-13,-4,19,-23,-9,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-16,-16,-4,-9,-27,-21,13,-11,1,1,-21,-21,-16,-14,-7,-3,27,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-36,-24,44,-26,20,28,-20,-20,-16,-26,-20,-10,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='I'; M=6,-17,-20,-27,-20,-7,-26,-25,20,-20,5,5,-12,-15,-15,-22,-2,9,15,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-23,-24,-20,-1,-1,-20,3,-27,27,9,-21,-27,-20,-20,-21,-13,-1,-20,-9,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,45,-30,-20,10,-30,30,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='C'; M=11,-13,21,-19,-20,-24,20,-23,-28,-20,-21,-17,-9,-23,-20,-23,0,-11,-15,-29,-27,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,34,-26,25,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-27,-16,-20,-19,41,-20,-23,-23,-7,-9,-9,-23,-20,-20,-9,-17,-19,-20,-21,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-19,-16,-7,-26,-23,7,-16,-1,-1,-6,-13,-13,-16,9,33,9,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,25,-30,-20,16,-30,41,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-16,6,-20,-21,-14,9,-22,-17,-24,-2,-7,-13,-26,-21,-21,-8,-6,-10,-27,-19,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-26,-31,-24,-4,-31,-26,35,-26,9,11,-14,-18,-16,-26,-7,-4,21,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-8,0,-20,-16,-2,-28,22,-22,-12,2,-18,8,54,0,-4,-18,-24,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13,-3,-15,-22,-3,-22,20,-8,-5,-5,-22,5,55,-13,-10,-15,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,35,39,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-26,-34,-26,-2,-36,-28,38,-26,14,14,-16,-18,-18,-26,-12,2,24,-22,-2,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00281;
//
ID   SVP_I_MP; MATRIX.
AC   MP00313;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Seminal vesicle protein I repeats signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8278832; R2=0.0136625; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1041; N_SCORE=19.041; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-1,19,-23,-20,0,-30,24,-20,-13,0,-14,13,48,-7,-10,-23,-23,-13,12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,27,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,30,-24,-4,-27;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-9,-16,-9,0,-10,-16,-3,0,-6,9,6,-9,-13,14,-3,-9,-6,-7,-13,-3,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-16,12,0,-12,-10,0,-6,-3,-3,11,0,-10,0,-6,-7,-6,-6,-19,-6,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-9,-19,-12,-6,-10,-19,-13,6,7,-4,3,-6,-10,-3,1,-10,-6,3,-13,-3,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-19,-6,-13,-19,45,-13,-26,-13,-19,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-19,-13,-19,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-19,0,6,-19,-13,37,-16,0,-13,0,3,-10,22,3,-3,-10,-19,-16,4,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,32,-19,45,13,-26,-6,0,-26,0,-19,-19,13,-6,0,-6,0,-6,-19,-26,-13,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-19,-13,-7,-6,-16,-13,0,-13,7,0,-16,18,-10,-13,-13,-6,-6,-16,-9,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-10,-19,-16,3,-19,-16,16,-16,20,10,-19,-19,-16,-13,-13,-3,19,-16,-3,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-19,7,23,-19,-13,-3,-19,19,-16,-10,0,-3,10,9,-3,-6,-16,-16,-10,17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-19,4,14,-19,15,-6,-23,-3,-16,-13,0,-6,0,-6,0,-10,-19,-16,-16,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-19,-3,6,-19,-13,3,-16,13,-13,-3,0,-10,22,27,-3,-6,-16,-13,-6,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,6,-16,8,-4,14,-13,-7,-12,-10,-6,-9,0,-13,-13,-10,-7,-6,-9,-9,4,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,56,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-14,-34,-30,28,-30,-26,19,-24,10,6,-26,-30,-34,-20,-14,-4,32,-16,4,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-3,14,-20,7,3,-23,-6,-3,-23,12,-30,-17,24,-14,3,6,14,4,-20,-34,-17,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,56,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-27,-10,7,-23,-23,0,-7,-3,3,7,-10,-17,33,0,-10,-10,-17,-20,-7,20;
MA   /M: SY='A'; M=11,2,-16,5,-8,-19,-14,-17,-5,-10,-9,-9,-8,-17,-14,-17,0,-3,8,-30,-16,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-26,-6,0,-23,-13,-10,-23,3,-27,-17,-3,18,0,14,8,1,-20,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,53,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-9,-20,-9,-3,-14,-16,-13,-11,5,-5,-4,-6,-16,-3,1,1,0,-7,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-3,-27,37,-27,-7,0,-10,27,23,-7,-10,-23,-20,-10,20;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-30,-3,7,-37,10,0,-27,0,-23,-7,0,-13,33,0,0,-13,-30,-20,-17,20;
MA   /M: SY='E'; M=-16,9,-27,15,17,4,-20,-7,-23,-7,-13,-16,0,-13,-6,-10,-7,-10,-20,-20,-3,7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,56,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-24,-13,-17,-27,48,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-34,3,25,-33,-20,-4,-23,3,-24,-13,-7,28,23,-4,-4,-10,-30,-27,-20,22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-20,-23,-24,-7,4,-24,3,-23,9,3,-20,-27,-24,-20,-13,-10,11,-24,-14,-24;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-7,0,0,-14,0,-7,-14,-7,-21,-14,7,-7,0,-7,28,14,-7,-28,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-10,-14,-10,0,-17,-14,3,-14,13,3,-10,-14,-10,-10,-3,14,3,-17,-4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-21,0,7,-21,-14,-7,-21,34,-21,-7,0,-7,7,21,-7,-7,-14,-14,-7,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-24,-7,-7,-21,16,-14,-20,-10,-21,-14,-7,25,-10,-14,-4,-10,-21,-17,-21,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-16,-5,-11,-16,37,-11,-21,-11,-16,-11,0,-11,-11,-11,0,-11,-16,-11,-16,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-5,0,0,-11,0,-5,-11,-5,-16,-11,5,-5,0,-5,21,11,-5,-21,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-11,64,-16,-16,-11,-16,-16,-16,-16,-11,-11,-11,-21,-16,-16,-5,-5,-5,-26,-16,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-21,-5,0,-16,-11,-11,-11,-5,-16,-11,-11,48,-5,-11,-5,-5,-16,-16,-16,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-16,-21,-16,0,-21,-16,26,-16,11,11,-11,-11,-11,-16,-11,-5,16,-11,0,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-25,-35,-26,-16,-14,-31,-25,17,-21,-4,1,-20,32,-15,-25,-15,-10,2,-25,-14,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,8,-25,17,-1,-14,-21,-11,-8,-16,12,-4,-6,-21,-11,-15,-16,-10,-9,-29,-9,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-30,-10,-9,-25,22,-9,-35,6,-25,-15,0,-20,-4,28,-5,-15,-25,-20,-19,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00282;
//
ID   ICE_NUCLEATION_MP; MATRIX.
AC   MP00314;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial ice-nucleation proteins octamer repeat.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4653611; R2=0.0112451; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1214; N_SCORE=18.107; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-3,-19,-6,6,-29,-9,-4,-17,-1,-19,-7,-1,-10,25,-4,12,0,-16,-24,-15,16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-12,-14,-12,-8,-20,-16,-4,-10,-4,5,-4,-12,-8,-10,11,37,2,-28,-8,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-30,4,17,-30,28,-11,-35,-6,-25,-20,0,-11,-1,-11,0,-15,-30,-25,-25,8;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-6,-30,-6,2,-16,-22,33,-20,5,-16,-2,-2,-19,22,16,-9,-13,-24,-12,17,8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,37,-25,52,15,-35,-7,-3,-35,-3,-30,-27,17,-10,0,-10,10,-2,-25,-40,-20,7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-16,-20,-16,-7,-26,-23,9,-16,0,0,-6,-13,-13,-16,7,31,10,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=7,-14,-22,-17,-9,-17,1,-14,-9,-14,3,0,-12,-18,0,-14,-7,-10,-10,-20,-14,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-16,-25,-22,-12,-7,-23,-8,9,-12,0,4,-13,-17,2,-15,-8,-7,1,-9,10,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,20,-30,30,12,-32,-15,-2,-35,20,-27,-19,9,-13,5,24,-5,-10,-25,-29,-15,7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-10,-13,-15,-12,14,-14,-15,-12,-16,-13,-12,-2,-16,-15,-13,17,17,-5,-22,-2,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-19,-24,-19,-5,-29,-25,18,-19,4,4,-9,-15,-15,-19,1,22,14,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=3,9,-12,1,-3,-17,-6,-9,-17,-8,-24,-17,17,-12,-3,-8,27,25,-11,-37,-17,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00283;
//
ID   DEHYDRIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00315;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dehydrins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0079372; R2=0.0105879; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=746; N_SCORE=10.897; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=330; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-10,13,-27,12,12,-26,-2,18,-29,2,-26,-16,17,-14,5,0,1,-9,-28,-31,-12,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-7,0,-26,1,7,-24,-7,17,-27,16,-22,-9,2,-12,5,9,-6,-12,-21,-21,-5,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-31,-3,3,-26,4,16,-29,-9,-24,-14,-2,8,-2,-10,-4,-12,-28,-27,-13,-2;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-19,-3,2,-24,4,-11,-23,-1,-24,-15,3,-11,2,-6,16,7,-15,-29,-19,2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-20,-21,-17,-3,-12,-20,4,-20,21,7,-19,-24,-18,-16,-16,-4,4,-22,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-12,-25,-13,-11,-9,3,-6,-12,-17,-3,-4,-7,-20,-9,-13,-8,-10,-12,-21,-8,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-28,10,19,-29,7,2,-31,-3,-25,-18,3,-10,7,-7,4,-10,-27,-26,-18,12;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-27,-9,0,-24,-15,0,-14,14,-16,1,-4,-15,12,7,-8,-10,-12,-22,-8,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-19,9,-30,-14,18,-29,47,19,-28,-30,-19,-19,-29,-10,8,-20,1,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-3,-29,-4,1,-21,-19,63,-28,2,-20,-3,6,-19,12,18,-8,-16,-26,-26,9,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-9,-1,-1,-18,-2,-10,-18,-9,-26,-18,8,-9,-1,-9,36,21,-8,-36,-18,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-21,3,-9,-23,35,-9,-28,-11,-25,-17,12,-15,-10,-12,5,-9,-23,-23,-22,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=6,4,-10,2,0,-17,0,-6,-17,-7,-25,-17,14,-10,0,-7,31,15,-11,-34,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=8,4,-11,5,1,-21,-1,-9,-21,-9,-30,-21,11,-10,0,-10,37,18,-11,-40,-20,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-8,0,-1,-14,3,-7,-14,-7,-20,-13,6,-7,-1,-7,25,12,-8,-26,-14,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-9,0,0,-19,0,-9,-19,-9,-28,-19,9,-9,0,-9,38,19,-9,-38,-19,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-11,6,2,-20,-1,-8,-20,-8,-28,-19,10,-9,0,-9,34,16,-11,-37,-19,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-28,29,46,-31,-16,-1,-31,6,-23,-22,5,-3,14,-3,3,-8,-28,-33,-20,30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-29,44,37,-35,-14,0,-35,4,-25,-25,10,-5,9,-5,2,-9,-29,-35,-20,23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,52,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-29,-6,-7,-28,49,-17,-34,-15,-26,-18,-2,-17,-14,-17,-1,-17,-26,-22,-27,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-24,3,26,-23,-18,0,-15,3,-11,-2,-4,-7,22,-1,-1,-7,-18,-24,-13,24; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-28,-7,-15,-28,49,-17,-35,-12,-28,-18,5,-18,-15,-13,2,-12,-27,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-5,-6,-30,49,-16,-38,-10,-29,-19,0,-16,-12,-13,-1,-18,-29,-21,-27,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-28,-1,15,-22,-18,-1,-28,26,-20,-11,0,-12,11,43,-7,-9,-21,-21,-11,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-26,-9,0,-19,-19,-5,-22,28,-18,-7,-3,-17,6,48,-9,-8,-12,-19,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-4,5,-23,-19,-10,-20,36,-22,-6,-2,-10,6,23,-10,-9,-13,-18,-8,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-25,1,12,-25,-17,-7,-25,37,-24,-9,0,-9,9,26,-8,-8,-18,-18,-9,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-16,2,9,-16,-11,-4,-16,23,-15,-6,0,-4,6,13,-4,-5,-11,-11,-6,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-24,-7,-12,-24,41,-16,-29,-15,-25,-17,-1,-3,-14,-16,3,-12,-23,-20,-24,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-24,-29,-17,5,-31,-20,24,-23,24,17,-20,-21,-15,-20,-19,-6,13,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-24,-3,7,-24,-21,-13,-21,29,-22,-9,-2,-11,4,16,-3,3,-11,-24,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-29,27,46,-31,-18,-1,-30,7,-21,-21,4,-3,16,-2,1,-7,-28,-32,-19,31;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-29,-4,4,-27,-13,-11,-27,38,-27,-9,-2,-13,5,26,-9,-10,-16,-21,-12,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,2,-35,-26,37,-27,25,20,-24,-24,-21,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-3,8,-26,-21,-9,-21,34,-22,-3,-4,-12,11,20,-9,-9,-14,-21,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-28,17,46,-29,-12,-3,-30,5,-20,-20,1,-3,13,-3,2,-6,-28,-30,-20,30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-30,1,14,-30,-20,-9,-30,47,-29,-11,0,-9,11,28,-9,-10,-21,-21,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,11,-31,-20,24,-28,40,23,-27,-27,-19,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-38,-9,-3,-29,-4,-11,-24,-12,-29,-19,-14,63,-10,-19,-8,-12,-30,-28,-26,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-28,-3,-10,-28,38,2,-33,-13,-28,-15,9,-19,-4,-11,1,-15,-29,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-7,2,-27,-1,2,-23,-16,40,-27,11,-23,-6,8,-15,7,8,-6,-12,-23,-26,1,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00285;
//
ID   THAUMATIN_MP; MATRIX.
AC   MP00316;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thaumatin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7241964; R2=0.0090174; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1456; N_SCORE=16.853; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=308; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-17,-36,-19,-12,-8,-15,-14,-20,-10,-23,-16,-13,-22,1,-10,-14,-15,-27,65,8,-3;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-16,-7,-5,-20,3,-10,-17,-6,-20,-7,2,-13,-1,-9,17,4,-11,-30,-17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,50,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-39,-30,34,-35,-26,27,-29,15,11,-21,-25,-29,-25,-19,-9,19,-8,12,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30,13,-20,-30,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-29,144,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-20,-15,-15,-25,35,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-11,-9,-9,-11,-19,-15,-11,-10,-12,-10,1,-10,-9,-10,20,45,-2,-31,-9,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-9,3,-29,2,-8,-27,28,-2,-34,-4,-27,-17,11,-19,-7,4,-1,-14,-28,-25,-20,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-1,11,-16,3,-2,-15,-7,-2,-17,-5,-24,-16,21,-15,0,-5,20,14,-16,-32,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-19,-31,-24,49,-28,-18,1,-24,5,-1,-15,-24,-29,-17,-10,5,1,0,22,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-17,44,-27,51,15,-35,-8,3,-33,1,-29,-25,29,-13,5,-6,3,-7,-30,-38,-19,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=16,0,-16,-3,-7,-21,15,-12,-20,-8,-18,-14,2,-12,-8,-11,7,-4,-13,-21,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-10,-3,-1,-17,-2,-2,-17,-9,-22,-14,6,-9,-1,-9,27,12,-9,-31,-14,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-3,4,-24,-17,-5,-28,32,-26,-12,4,-14,8,40,-3,-6,-19,-23,-12,4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-18,-26,-22,-24,12,31,-20,-25,-24,-15,-12,-8,-24,-28,-20,-8,-16,-18,-8,-7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-19,-11,-10,-11,-14,-8,-9,-6,-15,-8,-1,-16,-7,-5,9,11,-4,-21,-4,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-3,-23,-3,15,-27,-14,-5,-19,6,-17,-9,-3,-10,19,4,4,-5,-16,-24,-15,16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-25,-5,-14,-28,46,-17,-33,-16,-27,-19,3,-17,-15,-18,6,-12,-24,-24,-27,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-11,-21,-13,-2,-20,-17,-6,-5,-2,-6,3,-10,-16,16,0,-3,-6,-4,-22,-10,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,26,-28,37,18,-29,-29,-22,-21,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-1,-20,0,10,-24,-10,-4,-18,0,-19,-8,1,-10,14,1,13,2,-15,-29,-16,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,19,-19,10,1,-21,-10,-4,-20,4,-24,-16,25,-14,1,1,10,13,-19,-33,-15,1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-27,-14,-18,-21,40,-19,-26,-17,-14,-11,-6,-22,-17,-12,-6,-16,-19,-20,-22,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-8,-23,-13,-12,0,-10,-9,-13,-10,-13,-11,-2,-20,-10,-11,-1,-4,-13,3,5,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,1,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=2,-10,-23,-13,-2,-20,-19,-11,-7,5,-11,-3,-7,-14,6,7,-3,-5,-4,-22,-11,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-31,-11,-2,-25,-16,-19,-15,-8,-23,-16,-17,61,-9,-17,-6,-7,-20,-26,-25,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=27,2,-13,-10,-8,-18,-4,-13,-10,-8,-13,-11,7,-14,-8,-14,9,4,-6,-26,-18,-8;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-7,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,57,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,23,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-25,-33,-26,44,-32,-9,11,-24,11,5,-21,-28,-25,-19,-21,-10,3,8,38,-26;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-11,-12,-9,-17,-3,-18,-14,-11,-15,-13,-2,-11,-9,-14,19,21,-4,-28,-17,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00286;
//
ID   4_DISULFIDE_CORE_MP; MATRIX.
AC   MP00317;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   WAP-type 'four-disulfide core' domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2165251; R2=0.0072376; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=593; N_SCORE=8.506; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=316; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,0,-20,-24,-12,-30,-20,-16,65,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,-23,-6,-2,-18,-18,-17,-7,-11,-10,-9,-13,12,-11,-16,-2,-3,-3,-30,-19,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-17,59,-22,-20,-20,-25,-25,-19,-22,-15,-14,-18,-18,-20,-24,-8,-8,-7,-40,-25,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-33,-11,-2,-25,-20,-17,-13,-9,-22,-12,-18,63,-6,-16,-9,-8,-19,-27,-24,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=1,-4,-22,-5,4,-21,-15,-11,-17,7,-18,-11,-3,0,2,5,2,1,-12,-25,-15,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-25,-7,-7,-14,-20,-15,-4,-7,-8,-4,-8,-4,-8,-9,-5,1,-3,-24,-9,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: M=-7,-7,-25,-8,-4,-14,-16,-6,-8,-6,-3,-1,-6,-7,-1,-4,-8,-6,-11,-22,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-12,-18,-13,-2,-16,-15,3,-14,0,0,-15,-3,-13,-15,-7,-3,4,-17,-6,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-22,-2,3,-19,-7,-8,-17,-1,-18,-12,-3,17,-2,1,-1,-5,-17,-21,-16,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-5,5,-5,0,-14,-12,-8,-14,-4,-13,-9,-5,-1,0,-7,-1,-4,-12,-19,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=0,-11,-11,-13,-8,2,-12,-8,3,-9,8,3,-10,-8,-8,-9,-8,-3,1,-10,-1,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-10,-12,-10,-16,11,-15,-21,-7,-17,-11,-5,-17,-11,-5,-3,-10,-14,-21,-16,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: M=-1,-13,-22,-13,-3,-13,-14,-13,-5,-9,-3,-4,-11,-3,-4,-8,-5,-5,-6,-21,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,68,-18,-15,-18,-26,-22,-25,-22,-15,-15,-16,-31,-19,-23,-9,-10,-12,-36,-23,-17;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-16,-5,2,-11,-14,-7,-3,-3,-3,-1,-7,2,1,-5,-5,-4,-4,-15,-8,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-4,-18,-3,-3,-11,-13,-11,-9,-2,-9,-7,-5,2,-6,-4,-3,-2,-7,-20,-10,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,7,-26,7,2,-23,-15,2,-17,-5,-22,-14,9,7,-3,-7,1,-3,-19,-33,-15,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-26,-1,5,-19,-14,-5,-18,2,-14,-8,-4,-9,7,3,-2,-5,-16,-24,-10,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-23,-4,3,-18,-17,4,-15,-2,-14,-7,-1,-15,9,0,3,0,-14,-20,-4,5;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-20,-10,-7,-15,-11,-10,-11,0,-12,-4,1,-17,-3,6,4,2,-6,-28,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-21,4,0,-18,-7,-8,-17,-5,-20,-14,7,-14,-2,-4,11,3,-13,-29,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,21,-29,30,24,-35,-9,4,-31,3,-25,-18,10,-9,18,-3,2,-9,-29,-32,-17,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-29,-4,5,-26,-14,-12,-21,3,-25,-15,-6,24,1,0,1,-4,-21,-29,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-29,1,-7,-29,37,-13,-35,-8,-26,-19,3,-17,-10,-6,-1,-16,-27,-23,-24,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,5,-23,2,-1,-20,-12,1,-13,-3,-12,-7,7,-16,1,-5,-4,-6,-12,-29,-12,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-27,-4,11,-21,-21,-3,-16,18,-11,1,-4,-13,14,14,-10,-10,-16,-21,-8,12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-30,-3,7,-27,-21,-10,-26,43,-26,-8,-1,-12,8,31,-11,-10,-17,-20,-9,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-23,-11,-6,4,-16,-2,-13,-4,-12,-7,-5,-12,-8,-4,-4,-5,-11,-13,8,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-22,-3,-9,-7,0,-8,-18,-11,-20,-16,10,-19,-10,-11,4,-3,-18,-5,-7,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-25,-9,-11,-18,18,-4,-23,-12,-20,-11,-1,-14,-8,-10,2,-9,-19,-22,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,109,-29,-29,-21,-23,-29,-31,-29,-21,-20,-19,-39,-29,-29,-9,-11,-11,-48,-30,-29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-12,-27,-13,-17,-26,43,-20,-27,-16,-23,-14,-4,-15,-15,-18,-1,-15,-20,-21,-25,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-25,-15,-9,-3,-22,2,-8,7,-5,11,-10,-20,-1,13,-14,-10,-6,-14,7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-5,-22,-7,-2,-16,-14,-6,-17,6,-15,-9,-3,-15,-1,9,1,0,-10,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,113,-30,-30,-18,-30,-28,-29,-29,-19,-19,-20,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-46,-25,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-18,-23,-16,-1,-26,-17,12,-14,15,12,-21,-24,-13,-9,-13,0,15,-23,-4,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-24,13,8,-23,-16,-6,-18,-4,-18,-15,3,-2,0,-9,3,2,-15,-31,-15,3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-36,-11,-2,-28,-19,-20,-17,-11,-26,-18,-19,76,-10,-20,-8,-8,-25,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-15,-19,-13,-8,-23,-20,5,-7,-4,0,-15,-21,-12,-9,-7,-3,13,-20,-9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-14,-29,-13,-3,-5,-22,-13,-15,0,-13,-8,-11,13,-4,0,-10,-6,-17,-19,-8,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-26,9,12,-26,-12,-11,-20,-3,-19,-15,-4,7,0,-10,0,-4,-17,-30,-19,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00026;
//
ID   HMG_COA_REDUCTASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00318;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3858061; R2=0.0127586; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=605; N_SCORE=12.095; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,34,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,26,-24,-4,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-24,51,14,-31,-10,-2,-31,-1,-24,-24,15,-9,-1,-9,2,-1,-22,-33,-16,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-26,3,-7,-24,22,-3,-29,-2,-28,-18,26,-20,-5,6,2,-9,-28,-29,-22,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-26,5,9,-26,-3,-6,-27,22,-26,-14,11,-11,5,12,-3,-9,-23,-23,-15,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,31,-25,36,8,-30,-9,17,-30,-3,-26,-20,22,-14,0,-8,1,-9,-26,-36,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-22,-17,-13,-4,-26,13,1,-8,-4,3,-14,-25,-3,-2,-11,-8,5,-14,16,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-28,-28,-26,-11,2,-26,14,-25,0,4,-13,-21,-21,-25,-11,-13,9,-21,-12,-26;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,13,-32,-28,-3,-32,-28,19,-26,12,7,-26,-30,-26,-24,-16,-6,25,-31,-11,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-18,5,20,-21,-14,-9,-21,-2,-20,-17,3,-6,5,-6,19,18,-15,-33,-17,12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-32,-22,0,-24,-6,26,-14,20,52,-20,-20,-4,-14,-20,-10,14,-20,0,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-6,0,0,-12,0,-6,-12,-6,-19,-12,6,-6,0,-6,25,12,-6,-25,-12,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-25,-35,-25,1,-31,-17,35,-22,24,35,-21,-21,-12,-21,-21,-10,20,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-28,7,36,-28,-16,-8,-24,2,-20,-18,-6,14,9,-8,0,-8,-24,-28,-22,21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-11,-12,-18,-16,-4,-24,-22,3,-16,5,-1,-11,-18,-16,-14,5,29,12,-28,-8,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-8,-2,-21,-22,-10,-5,13,-14,-2,-1,-16,6,5,-7,-7,-3,-24,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-16,-26,-20,4,-28,-22,16,-24,31,13,-25,-26,-20,-18,-17,3,16,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-1,2,-24,0,9,-20,-14,12,-17,-6,-13,-10,6,-4,1,-8,-3,-8,-20,-29,-11,4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-35,-8,0,-28,-16,-18,-20,-10,-30,-20,-15,72,-8,-18,-1,-5,-26,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-11,-26,-11,5,-21,-24,-1,-5,-5,6,8,-11,-18,30,-1,-11,-10,-15,-20,-6,17;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-17,-12,-7,-25,13,-14,-20,-10,-19,-13,-3,-12,-2,-14,12,-2,-12,-24,-21,-4;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-18,-12,-1,-26,-8,-13,-16,5,-16,-8,-6,-10,7,-5,4,-4,-9,-20,-16,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-24,35,-32,-26,-6,-30,-22,6,-26,9,13,-22,-30,-20,-24,-18,-10,6,-32,-12,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,21,-28,24,11,-31,-13,1,-30,16,-27,-17,17,-14,11,17,-2,-8,-26,-30,-15,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-35,-25,3,-33,-21,35,-26,28,29,-23,-23,-16,-23,-23,-10,20,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00064;
//
ID   A4_EXTRA_MP; MATRIX.
AC   MP00319;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Amyloidogenic glycoprotein extracellular domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4944935; R2=0.0122255; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=644; N_SCORE=12.358; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=165; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-30,-6,-6,-5,-23,76,-21,-10,-14,0,1,-23,4,-3,-13,-17,-24,-12,38,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,21,-24,30,4,-32,12,-8,-34,-8,-30,-25,12,-12,-5,-12,12,-3,-24,-35,-22,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-25,-15,-15,18,-23,13,-5,-10,-7,-5,-13,-25,-8,-10,-6,-3,-10,13,56,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-23,-19,-27,-23,-5,-27,-25,27,-22,5,7,-16,-21,-18,-22,-3,0,26,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,8,-28,-20,1,-27,28,-22,-7,0,-15,25,43,-7,-10,-23,-20,-10,14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,30,-30,18,-20,-7,3,-20,10,49,-10,-13,-23,-23,-1,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,15,48,-30,-20,-2,-30,20,-22,-18,0,-2,18,7,-2,-10,-28,-28,-18,33;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-25,-14,-1,-22,-17,-11,-9,-8,-5,-3,-14,10,9,-11,-6,-8,-14,-22,-15,3;
MA   /M: SY='P'; M=6,-4,-22,-5,10,-22,-16,-15,-17,-5,-17,-15,-7,16,-3,-12,6,10,-15,-28,-19,2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-25,-1,9,-25,2,-13,-27,10,-23,-15,0,-10,0,2,2,2,-20,-25,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-19,-2,16,-16,-23,-14,-7,-4,-9,-9,-9,-11,-2,-8,2,7,1,-30,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-14,-22,-11,-4,-21,-19,-14,-5,-8,-15,-6,-12,8,3,-11,3,-1,-2,-30,-17,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-19,-1,-2,-20,-10,-11,-18,-8,-25,-18,11,12,-5,-10,17,16,-17,-35,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-21,32,5,-27,-12,-9,-20,-7,-21,-19,7,-14,-6,-12,7,-1,-8,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-19,12,-1,-27,15,-10,-29,-10,-30,-22,10,-12,-5,-12,22,4,-19,-35,-22,-3;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='A'; M=17,-8,-18,-13,4,-16,-11,-9,-6,-5,-3,9,-11,-11,0,-12,-2,-5,-4,-22,-14,2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-4,-14,0,-10,-15,-17,-18,0,-13,-11,-8,-7,-20,-15,-15,7,4,15,-35,-15,-12;
MA   /M: SY='E'; M=5,-2,-26,-2,11,-28,6,-12,-28,11,-23,-15,-2,-10,1,0,-1,-10,-21,-22,-19,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-30,25,31,-32,5,-5,-35,0,-25,-22,5,-7,5,-7,0,-12,-30,-30,-22,18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00204;
//
ID   A4_INTRA_MP; MATRIX.
AC   MP00320;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Amyloidogenic glycoprotein intracellular domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=30;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8610945; R2=0.0139570; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=708; N_SCORE=14.733; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=7,-17,-22,-22,-12,-13,-14,-11,1,-10,-1,20,-17,10,-5,-15,-9,-7,-3,-22,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,30,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-10,-15,-15,-8,-22,-22,0,-12,-5,-5,-7,-15,-15,-12,13,38,12,-30,-10,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-32,-15,-5,-17,-23,-15,-12,-5,-7,-7,-18,31,-8,2,-15,-10,-17,-25,-17,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,8,-28,-20,0,-27,30,-22,-7,0,-15,23,44,-7,-10,-23,-20,-10,13;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-7,-30,-10,-2,-20,-25,44,-7,-10,-10,5,0,-17,16,-5,-10,-15,-15,-25,7,3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,40,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-25,-3,-1,-22,-10,-7,-22,2,-25,-16,8,10,-1,9,5,-1,-21,-30,-20,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,12,-28,9,20,-26,-15,-1,-28,25,-26,-15,15,-11,10,19,-2,-8,-25,-28,-15,14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-5,20,-15,28,49,-23,-23,-5,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-2,-28,-9,-2,-21,-21,-3,-5,3,-12,-2,7,-17,15,14,-6,-8,-12,-24,-9,4;
MA   /M: SY='H'; M=-15,22,-25,11,0,-20,-9,52,-25,-5,-25,-11,37,-20,5,0,1,-9,-30,-35,-2,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,41,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-2,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,48,-30,-20,9,-30,28,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-25,-2,18,-27,-22,-3,-10,3,-13,-3,-7,-12,27,0,-2,-8,-10,-25,-13,23;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-12,-25,-17,-7,-13,-20,-2,-6,15,-3,24,-10,-18,5,21,-15,-10,-5,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-33,2,25,-35,-20,0,-22,5,-23,-10,-5,19,32,0,-3,-10,-30,-25,-18,27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-24,-4,-12,-12,-16,-6,8,-12,-10,-4,27,-20,-8,-12,-2,-4,-6,-32,-12,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00204;
//
ID   RECA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00321;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   recA signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8589158; R2=0.0143828; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=694; N_SCORE=14.831; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-36,-27,5,-36,-28,36,-27,13,13,-21,-13,-22,-27,-18,-9,25,-19,-1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-8,-18,-29,64,-18,-38,-18,-30,-20,5,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-14,-27,-27,-4,-21,-28,22,-20,5,6,-24,-27,-27,-20,-7,1,37,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-23,-21,-31,-22,16,-24,-6,17,-16,16,37,-19,-23,-11,-14,-19,-9,8,-11,11,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-34,-27,60,-21,-15,-3,-26,7,-1,-19,-29,-33,-19,-19,-11,-4,8,29,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-21,14,-1,-20,-3,4,-19,-2,-29,-19,46,-8,-1,-3,11,3,-27,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-34,-6,-1,-27,-17,-16,-19,-9,-28,-19,-7,65,-9,-16,-4,-3,-27,-31,-27,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-13,-13,-20,-19,-5,-25,-22,10,-15,1,5,-13,-18,-16,-15,4,24,19,-28,-8,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-3,-11,-9,-15,-19,-20,-15,-12,-16,-14,-5,6,-11,-14,13,31,-7,-33,-16,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-26,-4,-1,-19,-17,-4,-14,14,-17,-7,11,-17,5,21,-4,-6,-15,-26,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,9,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,67,-23;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-10,-5,-19,-2,-15,-15,-10,-19,-15,0,-10,-5,-14,25,14,-5,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-11,1,-1,-19,-5,-12,-19,-9,-26,-18,8,-10,-2,-10,34,25,-9,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-32,-24,2,-30,-21,29,-22,24,24,-25,-25,-17,-20,-19,-7,25,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-31,-19,26,-27,40,25,-27,-27,-17,-21,-27,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-29,34,43,-32,-15,1,-32,6,-24,-23,11,-5,12,-3,1,-9,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-19,-32,-27,-3,-31,-28,32,-23,11,11,-22,-22,-22,-23,-10,0,33,-25,-7,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-28,-6,3,-23,-18,-4,-29,33,-24,-11,1,-16,9,51,-6,-8,-19,-22,-11,3;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-16,-25,-19,-10,-14,-24,12,-18,2,2,-16,-18,-17,-21,-1,-2,17,-24,-13,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-28,15,25,-30,10,-7,-33,-2,-24,-21,3,-8,3,-8,3,-9,-28,-29,-23,14;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-8,-22,-9,-3,-16,-19,-11,-7,-7,2,-1,-8,-9,2,-8,-6,-2,-10,-24,-11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-28,-2,7,-27,-20,-11,-26,40,-25,-9,-1,-11,7,24,-7,-6,-17,-21,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-26,17,19,-30,-6,-2,-29,7,-26,-17,10,-10,13,3,6,-5,-25,-30,-18,16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-27,-6,-12,-28,46,-16,-35,-8,-30,-19,4,-17,-12,-11,4,-13,-26,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-25,5,7,-13,-15,-8,-17,0,-16,-12,1,-13,0,-5,1,0,-15,-23,-7,3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,24,-26,26,26,-29,-5,0,-29,2,-25,-22,20,-10,6,-5,3,-8,-29,-34,-21,16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00131;
//
ID   HISTONE_H3_1_MP; MATRIX.
AC   MP00322;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histone H3 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3332434; R2=0.0118698; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=783; N_SCORE=13.617; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=183; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-8,-16,-8,-16,0,-16,-8,-8,-8,-8,-8,-8,-8,-16,8,0,0,-16,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-24,-8,0,-16,-16,6,-24,22,-16,-8,1,-16,8,53,-8,-9,-17,-17,-6,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-10,-11,-10,-7,-16,-13,-3,-8,-3,3,-3,-10,-7,-8,10,31,2,-23,-7,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-24,0,8,-24,-16,-8,-24,41,-24,-8,0,-8,8,24,-8,-8,-16,-16,-8,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-24,-2,12,-27,-17,13,-14,4,-11,1,-1,-10,39,5,-3,-9,-21,-17,-5,25; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,3,-9,-5,-6,-10,-13,-13,-10,-7,-12,-10,5,-9,-6,-7,17,34,-3,-26,-10,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-8,-16,-8,-16,0,-16,-8,-8,-8,-8,-8,-8,-8,-16,8,0,0,-16,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-18,-9,-1,-16,-17,-1,-24,22,-16,-9,-1,-17,6,52,-8,-8,-16,-18,-9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-23,-6,2,-19,-17,-7,-14,28,-15,4,-4,-10,5,16,-10,-8,-10,-16,-6,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,13,-4,-7,-19,-8,-12,-21,-12,-26,-19,10,-17,-7,-12,25,15,-12,-41,-21,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-16,-13,-11,-12,-21,-21,-7,-11,-11,-9,-8,6,-13,-13,10,32,1,-30,-14,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-21,-11,-21,-29,64,-21,-39,-21,-29,-20,-1,-21,-21,-21,-1,-19,-29,-22,-30,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-11,-19,-29,63,-19,-37,-18,-28,-19,-1,-20,-19,-16,-1,-19,-27,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,17,-37,-20,22,-21,7,-20,0,1,-11,53,9,-1,-11,-30,-21,-6,35;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-13,-17,-11,-21,8,-19,-14,-12,-14,-12,-7,-12,-11,-19,11,-1,-4,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-15,-9,-5,-14,-16,-12,-12,-7,-14,-10,-2,-8,1,-9,15,27,-7,-25,-6,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='A'; M=37,-15,-13,-23,-13,-14,-6,-21,-5,-13,-4,-7,-15,-14,-13,-20,2,-3,3,-11,-15,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-6,-29,-8,0,-20,-19,5,-29,27,-21,-10,4,-20,9,61,-9,-10,-21,-22,-9,0;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-29,-1,9,-29,-20,-10,-29,45,-29,-10,0,-10,11,27,-8,-7,-19,-21,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=9,3,-12,-5,-6,-18,1,-11,-17,-10,-19,-14,10,-15,-5,-11,16,10,-12,-32,-18,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,-13,-20,-11,-18,-6,-21,-5,-11,-9,-8,-13,-4,-12,-20,6,0,3,-22,-19,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-30,-13,-6,-21,-19,-20,-6,-14,-19,-12,-12,41,-10,-19,1,0,-12,-30,-21,-12;
MA   /M: SY='P'; M=10,-14,-18,-15,-11,-16,-15,-21,-5,-12,-13,-9,-13,11,-13,-17,6,8,2,-29,-19,-13;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-14,-15,-12,-12,-17,-20,-3,-12,-8,-4,-9,-6,-11,-13,9,24,6,-28,-13,-12;
MA   /M: SY='G'; M=6,-11,-21,-14,-17,-22,33,-20,-22,-18,-20,-12,-3,-17,-16,-19,4,-6,-14,-23,-23,-17;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-24,-10,-13,-27,41,-18,-31,-11,-26,-17,-1,-16,-13,-15,6,-11,-21,-22,-25,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00287;
//
ID   RIBOSOMAL_S19_MP; MATRIX.
AC   MP00323;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S19 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5916848; R2=0.0166570; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=611; N_SCORE=15.759; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=3,-8,-12,-12,-8,-10,-8,-9,-6,-12,-11,5,-2,-15,-3,-11,18,9,-2,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-14,-14,-21,-18,-7,-25,-22,10,-16,0,4,-12,-12,-14,-17,2,18,13,-28,-9,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-30,-23,11,-30,-21,21,-25,27,15,-24,-26,-21,-20,-18,-3,17,-19,1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-39,-8,0,-29,-19,-18,-20,-9,-30,-20,-15,84,-9,-19,-9,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-26,11,27,-26,-18,-3,-22,4,-18,-13,3,-7,16,0,3,-1,-22,-29,-15,21;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-23,-20,-33,-23,23,-23,-6,14,-16,18,41,-20,-23,-12,-13,-20,-10,7,-11,10,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,40,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-7,-16,-30,61,-19,-39,-15,-30,-20,1,-19,-17,-17,0,-19,-29,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-12,-17,-14,-9,-7,-20,12,-10,-7,0,1,-7,-22,-6,-4,-11,-9,-9,-23,2,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-15,-11,-9,-9,-21,-17,-6,-5,-9,-7,-2,-14,-9,-7,9,28,1,-27,-8,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-22,-37,-29,28,-33,-25,25,-27,15,11,-22,-26,-28,-23,-18,-8,21,-11,9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-20,-8,-1,-23,12,-11,-22,-8,-19,-13,0,-13,-4,-11,7,-3,-16,-24,-19,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-29,1,-33,-29,35,-23,16,13,-27,-27,-27,-23,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-10,-30,-10,-10,6,-25,59,-14,-10,-10,0,-6,-25,0,-5,-15,-15,-20,1,51,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,40,-21,27,3,-23,-2,8,-23,0,-30,-21,52,-18,0,-2,9,0,-29,-40,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-1,-29,-2,7,-27,-19,1,-27,34,-25,-8,3,-13,14,32,-8,-10,-21,-22,-9,9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-23,2,16,-24,-13,-7,-21,10,-21,-13,3,-9,8,3,5,1,-17,-28,-15,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-20,-26,-24,-19,38,-26,23,-10,-20,-2,-1,-12,-27,-19,-12,-18,-14,-12,7,35,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-20,-22,-17,-3,-27,-20,18,-13,6,6,-12,-23,-17,-15,-11,-5,19,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-32,-2,9,-28,-16,-11,-23,1,-26,-17,-7,36,4,-3,-2,-5,-26,-29,-22,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-11,-33,-29,6,-33,-29,29,-24,12,10,-25,-27,-28,-23,-14,-4,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-10,-25,-10,2,4,-24,-5,-10,0,-4,-4,-10,-18,-4,-3,-11,-7,-11,-10,12,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,0,-36,-29,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-19,0,1,-19,-16,-11,-16,4,-17,-10,3,-12,1,0,9,16,-9,-29,-12,1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,7,-33,17,25,-31,-17,-7,-28,2,-26,-21,0,28,4,-5,-4,-9,-29,-32,-23,12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-27,21,30,-29,-12,-1,-28,5,-23,-19,9,-6,13,1,3,-6,-27,-30,-18,21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-20,-27,-18,-1,-20,3,15,-9,17,52,-18,-20,-1,-9,-19,-9,7,-20,1,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-25,15,14,-26,-26,-25,-24,-15,-5,40,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-19,-30,67,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-5,-25,-5,-3,-15,-21,71,-24,-9,-14,1,4,-21,7,1,-10,-17,-24,-26,16,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-7,-30,-8,-1,-9,-23,-1,-21,29,-19,-7,-6,-17,3,21,-13,-10,-17,-5,17,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23,25,-31,-21,17,-30,39,16,-27,-29,-24,-21,-27,-10,9,-13,7,-23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-17,0,-28,10,1,-20,-30,-37,-19,-20,-10,0,11,33,-29;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-11,-14,-9,-17,-7,-17,-7,-11,-14,-9,-6,-14,-7,-15,16,7,4,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-30,-21,-12,-4,-24,-19,-1,-16,-5,-3,-19,26,-14,-17,-13,-8,-8,-22,-11,-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-26,-12,-3,-14,-21,0,-25,22,-16,-9,-3,-21,5,54,-10,-7,-17,-17,-2,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-21,-4,-2,-19,-14,-10,-19,13,-20,-10,6,-13,-1,7,4,11,-12,-27,-11,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-18,-24,-22,-13,21,-23,-10,-7,-8,-5,-2,-14,-12,-16,-4,-11,-6,-7,-6,13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-15,-22,-15,-12,-11,-17,-11,-6,2,-10,-4,-11,-17,-9,9,-7,-3,4,-22,-6,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-6,-3,-25,17,-12,-24,-3,-23,-13,0,-13,-4,-6,1,-10,-19,-25,-20,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-29,-3,-2,-16,-21,85,-25,-12,-14,1,6,-21,7,-2,-11,-18,-26,-27,19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-24,-10,-10,-24,20,-8,-25,-6,-22,-13,-2,-14,-9,-8,1,-10,-17,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-1,-25,-3,2,-26,-2,-9,-25,13,-23,-12,2,-13,4,11,1,-5,-18,-24,-16,2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,4,-26,7,2,-27,-12,-11,-21,1,-24,-17,1,14,-3,-6,1,-3,-19,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,5,-28,8,-1,-28,13,-12,-30,5,-26,-16,4,-15,-5,-1,-2,-11,-21,-25,-19,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-12,-25,-15,-8,-16,-19,-14,-3,9,-7,3,-9,-18,-4,3,-11,-8,1,-22,-9,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-23,-8,-7,-24,9,-16,-24,6,-20,-12,-5,-11,-7,-1,-4,-9,-16,-23,-18,-8;
MA   /M: SY='A'; M=18,-7,-17,-12,-6,-21,-2,-17,-17,3,-17,-11,-4,-12,-5,-5,6,1,-7,-23,-17,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-19,-9,-4,-18,-18,-12,-19,12,-17,-9,-1,-14,0,18,3,12,-10,-25,-11,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00288;
//
ID   ASPARTOKINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00324;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartokinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6946783; R2=0.0175200; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=197; N_SCORE=9.136; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-7,-19,-14,-9,-11,-13,0,2,-7,-2,26,-2,-16,7,-7,0,-2,-3,-27,-8,-1;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-20,4,6,-19,-12,-9,-12,-1,-17,-11,1,-2,0,-6,7,0,-10,-26,-14,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=3,-8,-12,-8,0,-7,-15,-10,-1,-6,-4,-4,-9,-11,-6,-9,0,3,5,-16,-4,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-17,-16,-6,3,-21,-14,7,-6,4,3,-11,-14,-10,-8,-11,-6,6,-13,-1,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='N'; M=2,12,-11,4,0,-13,-2,0,-11,4,-15,-9,19,-9,0,1,4,-1,-12,-18,-10,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-8,-14,-11,-7,-8,-6,-9,1,-9,2,2,-6,-10,-1,-8,-4,0,-2,-13,-5,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='H'; M=0,2,-14,0,5,-7,-8,11,-10,-2,-9,-6,4,-9,1,-4,-1,-4,-11,-11,3,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: M=-6,-5,-16,-8,-8,-1,-2,-8,-7,-6,0,-2,0,-15,-9,-5,-8,-7,-8,-13,-5,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=1,1,-17,4,1,-18,-9,-10,-14,0,-15,-11,-3,14,-4,-7,1,1,-12,-19,-13,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-21,3,15,-20,-13,-6,-19,17,-18,-10,-3,9,6,7,-5,-7,-17,-17,-11,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-17,-3,-5,-19,19,-10,-22,2,-20,-11,1,-10,-5,-2,3,-6,-15,-16,-15,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-20,1,0,-15,-14,-2,-10,12,-8,9,-3,-11,3,9,-9,-8,-8,-18,-6,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-11,-12,-8,-10,2,-10,-5,-9,-3,2,-6,-11,-6,-11,3,-1,-2,-16,-11,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-19,-22,-21,-14,0,-18,-14,0,-11,6,7,-19,-13,-10,-11,-17,-6,-5,16,3,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-9,-19,-13,-11,-22,-18,5,-8,-3,1,-13,-19,-8,-7,-4,-1,10,-26,-10,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-29,1,-31,-29,31,-22,15,12,-29,-29,-28,-21,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-11,-17,-13,-4,-16,-22,16,-7,-9,-2,8,-9,-20,13,-6,-9,-10,-10,-22,1,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,6,-4,-4,-20,-4,-12,-21,-12,-29,-20,6,-14,-4,-12,34,16,-10,-41,-21,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-15,-30,-25,4,-29,-23,25,-23,26,19,-29,-29,-23,-19,-18,-5,31,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,-18,-13,-10,-24,25,-18,-23,-13,-19,-15,-5,-13,-12,-18,7,-7,-13,-22,-24,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-5,22,-18,18,3,-23,-7,-4,-23,0,-27,-20,24,-13,-1,-4,16,11,-19,-37,-18,1;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-18,-19,-14,-6,-6,-15,-7,-16,-9,-7,-11,-7,-15,-18,2,-3,-1,-22,-12,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-28,15,36,-30,-17,-5,-28,12,-23,-18,0,3,11,1,0,-8,-25,-29,-19,23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-13,-10,-2,-18,-16,-4,-22,13,-15,-9,0,-18,5,33,-5,-6,-15,-23,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-26,-36,-27,15,-34,-20,32,-26,19,21,-21,-23,-19,-23,-21,-10,18,-12,10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-19,-6,-3,-14,-21,0,-15,4,-10,-4,-2,-18,3,7,-8,-7,-13,-24,-6,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-14,-4,-2,-22,-20,3,-19,8,-16,-7,3,-19,5,14,-7,-10,-16,-27,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-5,-28,-26,-3,-25,-28,20,-19,7,6,-26,-27,-26,-20,-7,0,37,-30,-12,-26;
MA   /M: SY='A'; M=33,-15,2,-24,-16,-11,-9,-22,-6,-15,-7,-8,-14,-17,-17,-21,3,-2,5,-22,-16,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-28,17,14,-30,-9,2,-29,8,-25,-16,7,-6,8,0,-1,-7,-25,-29,-15,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-32,-24,-3,-34,-24,30,-18,15,13,-19,-22,-16,-10,-18,-9,22,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-20,-34,-27,-2,-31,-26,35,-23,14,18,-23,-23,-21,-24,-14,-6,33,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-13,-13,-15,-3,-11,-23,-17,-3,-5,2,-1,-14,-18,-9,-6,-8,-1,2,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00289;
//
ID   TROPOMYOSIN_MP; MATRIX.
AC   MP00326;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tropomyosins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3842659; R2=0.0118809; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=916; N_SCORE=15.257; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-24,4,32,-21,-23,-9,-11,1,-11,-11,-9,-9,4,-6,-3,-7,-5,-30,-17,18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,28,-30,42,42,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,9,-4,11,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-20,4,20,-25,-10,-8,-24,9,-25,-17,3,-7,7,0,14,2,-17,-31,-18,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,7,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,39,-30,-20,-4,-30,27,-24,-16,0,-4,16,13,-4,-10,-26,-26,-16,27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,5,-30,12,42,-28,-20,-1,-30,19,-21,-17,0,-5,17,17,-3,-10,-27,-27,-17,29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-22,4,24,-25,-20,-5,-20,2,-16,-11,0,-6,18,-1,8,13,-19,-28,-14,21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-37,-27,1,-35,-23,41,-26,24,27,-21,-21,-16,-25,-21,-10,24,-20,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='T'; M=-8,13,-18,16,-3,-19,-18,-14,-13,-8,-13,-13,1,-14,-10,-12,6,17,-1,-34,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=8,-1,-10,-8,-7,-14,-12,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-11,25,35,-3,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-11,13,-28,13,5,-25,-5,-7,-17,0,-20,-14,13,-14,-2,-6,-3,-9,-18,-29,-16,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-29,0,6,-26,-17,-5,-29,38,-28,-11,9,-14,9,35,-7,-9,-21,-23,-11,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=2,15,-25,23,34,-30,-13,-5,-28,3,-20,-20,3,-5,8,-7,2,-8,-23,-30,-20,21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=8,2,-17,-6,0,-23,-13,-8,-14,-3,-15,-8,4,-11,13,-5,10,14,-12,-26,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,9,33,-22,-20,-8,-22,2,-16,-16,0,-4,9,-4,8,13,-19,-30,-16,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-8,-27,-7,11,14,-24,14,-17,-9,-8,-8,-7,-17,-4,-8,-11,-12,-18,-9,16,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-19,-2,7,-27,-14,-3,-18,-1,-21,-9,3,-10,25,-1,17,14,-17,-29,-13,16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,16,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,44,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-18,-3,2,-22,-15,-11,-20,11,-22,-11,2,-10,6,5,13,18,-12,-28,-12,4;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,4,28,-38,-20,8,-22,10,-20,-4,0,-8,52,8,0,-10,-30,-22,-12,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-29,3,9,-29,-17,-7,-29,43,-30,-11,8,-11,9,26,-7,-9,-21,-23,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-26,16,48,-28,-16,-2,-28,6,-22,-20,2,-2,16,-2,8,-4,-26,-32,-20,32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00290;
//
ID   BACTERIAL_OPSIN_RET_MP; MATRIX.
AC   MP00327;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial rhodopsins retinal binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5302277; R2=0.0160447; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=219; N_SCORE=9.034; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=10,-13,-22,-13,-6,-21,-13,-20,-12,-11,-19,-14,-12,29,-10,-17,5,6,-9,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='E'; M=8,0,-25,4,28,-27,-6,-9,-24,0,-19,-17,-4,2,6,-9,2,-8,-21,-26,-22,17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=2,-26,-20,-32,-24,3,-28,-25,26,-25,19,12,-22,-23,-21,-24,-15,-6,22,-20,-4,-24;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-24,-13,-15,-26,40,-18,-30,-12,-23,-16,-3,-17,-14,-12,2,-13,-20,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-27,-17,6,-30,-20,18,-20,23,11,-23,-25,-18,-12,-20,-8,15,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-15,-25,-19,0,-24,-21,13,-20,21,11,-22,-23,-18,-18,-11,3,16,-24,-7,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-21,8,1,-23,2,-7,-21,-5,-22,-15,6,6,0,-8,4,-1,-20,-25,-17,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-18,-25,-22,-3,-20,-22,13,-20,9,5,-22,-17,-21,-19,-10,-1,19,-22,-5,-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-23,-1,-2,-20,7,-13,-19,-10,-17,-14,-3,-12,-9,-14,1,-5,-12,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-21,-22,-26,-24,-7,-9,-24,11,-20,1,6,-16,-21,-19,-20,-8,-1,13,-15,-8,-23;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-20,1,12,-16,-19,-10,-13,-4,-11,-11,-6,-11,-2,-9,3,7,-6,-24,-8,5;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-12,-13,-10,-13,-14,-19,-5,-13,-12,-9,-2,-12,-9,-14,19,25,3,-31,-13,-10;
MA   /M: SY='W'; M=2,-28,-26,-32,-22,2,-22,-24,8,-23,15,4,-26,-24,-18,-22,-22,-12,1,20,2,-19;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-17,-21,-18,-11,-3,-22,0,-18,-1,-2,-12,-18,-17,-19,0,5,6,-24,-14,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-28,-25,36,-31,-1,8,-18,5,3,-22,-29,-21,-15,-18,-8,4,12,48,-25;
MA   /M: SY='V'; M=7,-15,-12,-20,-16,-8,-16,-16,7,-13,-1,11,-13,-18,-11,-14,5,7,15,-29,-11,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-25,-20,-28,-27,25,-18,-15,6,-20,3,1,-21,-29,-27,-18,-14,-7,13,-4,19,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-30,-19,22,-29,46,23,-29,-29,-19,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-33,-26,11,-32,-25,27,-27,28,15,-27,-28,-25,-22,-21,-7,26,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-16,-26,-21,4,-27,-23,17,-23,18,9,-21,-25,-21,-19,-10,3,21,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-17,-9,-19,-3,-19,-11,-10,-12,-11,-7,-10,-9,-18,14,9,-1,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-18,-26,-25,4,-29,-17,19,-17,4,5,-26,-19,-23,-18,-13,-4,28,-16,10,-26;
MA   /M: SY='G'; M=1,-19,-26,-18,-18,-19,13,-23,-10,-19,-12,-8,-14,1,-19,-21,-7,-11,-6,-24,-21,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='G'; M=12,-16,-20,-18,-21,-19,25,-23,-13,-18,-14,-9,-11,-21,-21,-20,-1,-10,0,-23,-22,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-21,-33,-26,40,-29,-14,9,-23,9,3,-21,-27,-27,-19,-17,-8,8,2,27,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-31,-26,-38,-28,26,-33,-25,23,-29,19,10,-24,-26,-26,-24,-23,-11,13,4,11,-27;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-18,-30,-20,18,-23,-20,9,-26,28,9,-23,-26,-22,-20,-19,-8,6,-14,2,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-28,-21,13,-30,-13,17,-25,36,15,-28,-30,-19,-18,-26,-9,9,-11,16,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=6,-6,-9,-6,-5,-5,-8,-9,0,-9,8,1,-8,-10,-7,-10,-5,-3,0,-12,-6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=4,-4,-11,-6,-3,-11,2,-5,-13,2,-11,-7,0,-8,-1,9,3,-2,-8,-12,-9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-20,-4,2,-16,-12,2,-19,17,-14,-7,4,-13,11,38,-5,-6,-15,-15,-7,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-9,-19,-9,-4,-8,-9,-5,-13,-3,-15,-9,-6,-12,5,0,1,-3,-14,13,3,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=3,-16,-18,-19,-14,-11,-19,5,-1,-9,-1,5,-13,-21,-9,-3,-8,-7,8,-25,-5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,-18,-15,-14,2,-10,-17,-8,-12,-7,-7,-8,-18,-16,-10,-1,-1,-1,-18,-7,-14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-15,-11,-12,-14,-13,-16,0,-11,-7,-3,-2,-16,-11,-15,5,6,5,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-3,-20,-9,-12,-2,-19,-2,1,-16,9,6,1,-23,-11,-12,-11,-3,-3,-27,-5,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-27,8,15,-27,-3,-9,-26,2,-24,-18,0,-2,1,-2,3,-6,-20,-30,-20,7;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-25,-1,13,-24,-2,-6,-28,7,-22,-16,1,-12,5,16,4,-6,-21,-26,-18,7;
MA   /M: SY='T'; M=9,-10,-14,-15,-8,-11,-14,-20,-4,-12,-3,-5,-10,-15,-12,-14,5,16,4,-26,-13,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00291;
//
ID   HCP_MP; MATRIX.
AC   MP00328;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HCP repeats signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5423841; R2=0.0055057; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2141; N_SCORE=15.326; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=538; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-30,40,13,-36,13,-6,-39,-5,-29,-26,11,-12,-3,-12,0,-13,-30,-33,-23,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-30,9,9,-31,33,-11,-37,-8,-27,-21,3,-13,-5,-13,0,-16,-30,-26,-26,2;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='S'; M=4,3,-16,6,18,-23,-6,-7,-23,-4,-27,-20,7,-7,6,-7,28,11,-16,-37,-20,12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-16,-1,11,-16,-20,-14,-16,-4,-13,-13,0,-7,-1,-7,14,32,-9,-30,-13,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=4,3,-16,6,18,-23,-6,-7,-23,-4,-27,-20,7,-7,6,-7,28,11,-16,-37,-20,12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-24,-15,-9,-14,-23,5,-12,9,-11,-3,-8,-23,-2,33,-10,-8,0,-24,-6,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-24,0,0,-20,-14,67,-27,-10,-23,-6,10,-17,7,-3,5,-8,-24,-33,8,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-33,-3,14,-37,-20,1,-20,4,-23,-6,-6,20,39,1,-3,-10,-30,-23,-16,25;
MA   /M: SY='A'; M=32,-4,-16,-8,11,-23,-6,-14,-16,-4,-13,-13,-7,-7,-1,-14,7,-3,-9,-23,-20,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-9,-30,-8,-6,-26,26,-10,-35,3,-25,-16,0,-19,-5,19,-4,-15,-26,-21,-21,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,45,-30,-20,-3,-30,22,-23,-17,0,-3,17,9,-3,-10,-27,-27,-17,31;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,35,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-27,64,18,-37,-9,0,-37,0,-27,-27,18,-9,0,-9,0,-9,-27,-37,-18,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-18,42,12,-24,-6,0,-24,0,-18,-18,12,-6,0,-6,0,-6,-18,-24,-12,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-21,14,42,-21,-14,0,-21,7,-14,-14,0,0,14,0,0,-7,-21,-21,-14,28; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-21,-7,-14,-21,49,-14,-28,-14,-21,-14,0,-14,-14,-14,0,-14,-21,-14,-21,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-21,38,23,-26,-9,0,-26,2,-19,-19,10,-5,4,-5,0,-7,-21,-26,-14,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-14,0,0,-20,-4,14,-22,-10,-28,-16,10,-12,2,-8,29,11,-14,-38,-11,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-14,-8,-8,-12,-20,6,-14,-10,-12,-8,2,-12,-6,-8,14,35,-6,-30,-4,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-30,16,47,-28,-20,21,-30,6,-20,-16,2,-4,18,0,-2,-12,-30,-30,-11,31;
MA   /M: SY='S'; M=8,-6,-10,-6,-6,-16,-6,-14,-9,-12,-21,-14,1,-14,-6,-12,29,16,3,-38,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,35,-32,53,16,-38,-12,-4,-36,-2,-30,-28,11,11,-2,-12,-2,-10,-30,-38,-22,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-24,-6,0,-16,-16,17,-24,17,-16,-6,2,-16,8,43,-8,-10,-17,-17,-3,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,16,-36,-20,8,-22,14,-20,-2,0,-12,49,23,-2,-10,-28,-20,-10,31;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-14,-18,-12,-22,15,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00292;
//
ID   HSP70_2_MP; MATRIX.
AC   MP00329;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heat shock hsp70 proteins family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0125918; R2=0.0171953; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=140; N_SCORE=8.417; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-30,-23,9,-30,-17,23,-24,31,19,-27,-28,-19,-19,-23,-8,17,-16,8,-22;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-17,-16,-8,-12,-5,-17,-13,-2,-10,-8,-8,-14,-9,-9,2,-3,-6,-19,-13,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-26,-15,-11,9,-25,6,-6,-4,-2,-1,-12,-24,-1,0,-13,-5,-11,4,36,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-28,11,-5,-31,31,-11,-36,-8,-28,-20,5,-16,-7,-8,2,-13,-27,-26,-24,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-18,-25,-16,4,-28,-15,7,-14,25,12,-22,-26,-13,-4,-23,-10,4,-18,1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-30,36,16,-35,-11,-1,-32,-2,-28,-23,8,10,3,-10,1,-8,-28,-35,-20,8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-26,-8,2,-11,-16,-11,-18,15,-18,-9,-1,-14,-1,10,-6,-8,-13,-19,-8,0;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-3,-23,-5,0,-20,-6,-11,-16,-1,-15,-10,1,-5,-2,-5,1,-2,-14,-28,-16,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-19,6,10,-20,1,-4,-20,-2,-17,-13,4,-9,1,-6,5,0,-16,-23,-15,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-2,7,-25,9,11,-28,-5,-9,-28,13,-25,-16,3,-10,4,3,2,-3,-20,-27,-17,8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-26,8,15,-27,-13,-8,-22,-2,-23,-18,3,13,4,-8,5,-1,-21,-31,-21,8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-6,5,-21,-14,-1,-22,11,-17,-6,-1,-15,12,24,-3,-5,-18,-23,-10,7;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-24,-3,-5,-14,-17,4,-11,4,-16,-7,13,-16,-1,5,-3,-2,-13,-24,-2,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-19,-29,-27,3,-31,-22,30,-21,10,10,-20,-26,-23,-21,-13,-4,31,-21,2,-27;
MA   /M: SY='L'; M=4,-25,-18,-29,-22,-1,-21,-22,19,-22,21,15,-23,-23,-18,-21,-15,-7,18,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-17,-35,-30,19,-32,-27,27,-25,14,10,-25,-28,-30,-22,-15,-5,32,-18,2,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-28,-24,34,-31,-2,9,-19,8,4,-22,-29,-21,-16,-19,-9,4,11,45,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-21,-30,-21,9,-28,-17,21,-24,30,25,-23,-25,-16,-19,-21,-8,12,-19,1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-26,-6,-12,-26,38,6,-34,-16,-28,-16,4,-18,-10,-14,6,-12,-26,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,55,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-10,-8,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-11,25,39,-3,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-20,-28,-22,37,-28,-12,2,-22,9,1,-16,-25,-24,-16,-12,3,1,-2,23,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-25,39,11,-32,-13,-4,-28,1,-24,-20,10,-12,4,-6,3,-2,-19,-35,-17,8;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,15,-29,-26,-7,-26,-28,12,-22,3,2,-24,-28,-25,-23,-8,-3,26,-31,-14,-26;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-35,-27,2,-34,-26,37,-26,24,20,-25,-25,-21,-24,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-13,-33,-24,7,-31,-21,23,-26,28,21,-25,-27,-20,-21,-22,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-19,0,11,-21,-12,-7,-19,0,-17,-13,1,-10,4,-2,11,6,-14,-29,-16,7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-24,-34,-26,27,-30,-19,19,-24,16,11,-20,-25,-24,-21,-19,-9,11,-7,14,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-24,7,2,-25,4,-7,-24,-3,-19,-14,7,-14,2,-5,4,-5,-20,-28,-18,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-27,11,8,-27,-9,-4,-26,10,-23,-12,8,-9,7,8,-1,-4,-22,-28,-15,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-25,-12,-17,-23,32,-19,-21,-16,-20,-12,-4,-15,-16,-15,-2,-13,-12,-24,-23,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-9,-24,-7,2,-15,-24,-16,-3,0,-7,-3,-13,-14,-5,-6,-9,-6,3,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-17,-22,-22,-20,26,-13,-16,-5,-21,5,0,-12,-25,-24,-14,-13,-6,-4,-10,6,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-25,8,25,-26,-18,-6,-23,12,-20,-13,0,-8,12,4,2,-2,-18,-28,-15,18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-15,-19,-13,-9,-25,-18,10,-10,-1,4,-18,-22,-13,-10,-4,2,24,-29,-10,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-23,-17,-7,-11,-23,-13,-2,0,9,5,-15,-20,-1,3,-15,-7,-2,-21,-7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=17,-7,-19,-11,-11,-18,11,-16,-18,-13,-17,-13,-3,-9,-12,-17,7,-4,-11,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-15,-10,-5,-12,-19,-15,-9,-4,-9,-3,-3,-12,-5,-4,11,28,-1,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='S'; M=10,-2,-14,-7,-4,-21,-1,-13,-16,-5,-19,-12,3,-14,-2,-9,11,5,-9,-28,-18,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-16,-25,-17,-17,-13,20,-16,-19,-18,-15,-10,-10,-13,-14,-18,-7,-14,-18,-11,-10,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00269;
//
ID   HEMOLYSIN_CALCIUM_MP; MATRIX.
AC   MP00330;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hemolysin-type calcium-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9438300; R2=0.0111400; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=686; N_SCORE=12.576; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-23,13,40,-27,-13,-3,-27,3,-23,-20,3,-3,13,-3,13,0,-23,-33,-20,27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-7,-30,9,-20,-27,-13,-30,-20,-13,54,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-23,-3,-3,-17,-20,61,-23,-10,-17,-3,7,-17,3,-3,0,3,-20,-30,10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-23,3,19,-23,-20,-10,-23,16,-20,-13,0,-7,6,6,4,11,-16,-27,-13,13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-17,-27,-17,-20,-17,37,-20,-20,-23,-4,-7,-10,-23,-20,-20,-10,-17,-17,-20,-20,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-17,0,13,-17,-20,-13,-17,-3,-13,-13,0,-7,0,-7,13,30,-10,-30,-13,6;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-17,-23,-20,-1,44,-27,-13,-10,-17,0,-7,-13,-20,-20,-13,-13,-10,-10,-3,14,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-18,-25,-23,-17,4,-28,-6,10,-13,4,5,-11,-22,-12,-8,-13,-8,6,-17,5,-16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,7,-23,1,-10,-25,36,-9,-30,-12,-30,-20,20,-18,-10,-12,10,-7,-26,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-2,11,-24,15,11,-28,-8,-7,-25,6,-21,-15,5,-11,4,-2,1,-6,-19,-29,-17,8;
MA   /M: SY='G'; M=9,-12,-24,-14,-18,-19,44,-20,-29,-18,-22,-16,-4,-19,-19,-20,2,-13,-19,-19,-23,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,30,-24,32,7,-25,-8,4,-28,-1,-25,-21,25,-15,-2,-4,2,-6,-25,-34,-16,3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,57,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,31,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-20,-22,-23,-17,-7,-29,-17,15,-9,6,7,-16,-21,-12,-6,-12,-3,16,-24,-5,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,12,-32,-22,26,-30,40,19,-27,-28,-21,-22,-27,-10,14,-18,2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,6,-28,8,2,-12,-19,12,-19,4,-16,-9,3,-18,8,3,-8,-10,-21,-13,13,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-2,-12,-28,51,-15,-37,-16,-29,-20,3,-18,-15,-17,3,-15,-28,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,7,-20,3,4,-25,-6,-9,-19,-1,-20,-16,6,-2,-1,-10,6,-3,-16,-28,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='B'; M=0,24,-20,24,3,-26,-6,-4,-22,-5,-24,-20,20,-14,-4,-10,10,0,-16,-36,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-20,-33,-26,19,-32,-25,23,-26,18,11,-22,-25,-25,-22,-16,-2,20,-16,4,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,13,-27,22,6,-11,-19,3,-18,-6,-15,-14,1,-17,-5,-11,-6,-8,-14,-20,7,-1;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-29,-1,-15,-30,57,-16,-38,-17,-30,-21,6,-19,-16,-18,2,-17,-29,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='D'; M=2,6,-23,9,8,-25,-5,-10,-23,2,-17,-14,0,-12,1,-5,1,-5,-17,-27,-17,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-8,-16,-30,65,-19,-39,-18,-29,-20,0,-19,-18,-19,0,-19,-30,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='N'; M=8,17,-20,11,0,-24,-5,-4,-22,1,-22,-17,19,-15,-2,1,5,-3,-18,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-10,-6,-22,-8,-6,-10,-23,2,-5,-7,-5,-2,-4,-18,-2,-3,-4,5,-4,-22,2,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-12,-23,-15,-8,0,-20,-4,-15,-5,-13,-9,-8,-18,-8,-1,-3,4,-11,1,6,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,-1,-16,-31,61,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='S'; M=8,5,-19,5,9,-23,-8,-7,-21,0,-21,-16,4,-10,3,-6,12,2,-15,-28,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-3,-16,-31,63,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-2,12,-23,10,1,-25,-2,6,-26,3,-25,-16,16,-15,0,3,4,-6,-22,-30,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='T'; M=0,-15,-17,-24,-19,-2,-26,-23,12,-16,2,2,-11,-17,-16,-15,1,17,14,-24,-6,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-23,-35,-27,59,-31,-13,5,-26,12,3,-21,-29,-31,-19,-21,-10,1,9,35,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-21,-11,-21,-21,-5,-28,-22,13,-13,8,5,-21,-27,-20,-7,-13,-4,25,-28,-10,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-22,-25,-26,-23,42,-18,0,-6,-20,0,-3,-16,-28,-23,-15,-16,-9,-8,10,39,-23;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-7,-17,-10,-8,-13,3,-10,-14,-3,-8,-7,-2,-15,-6,6,-1,-3,-9,-19,-12,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-15,-7,-3,-7,-6,-11,-13,-3,-13,-10,-3,-11,-4,-7,5,-1,-9,-10,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-22,-9,-7,-21,19,-4,-22,-9,-17,-11,-2,-14,-8,-8,0,-9,-16,-20,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-20,7,4,-12,-12,-2,-17,4,-16,-11,4,-12,2,-1,2,-2,-15,-18,-1,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-7,9,-27,16,3,-29,22,-10,-33,-8,-26,-20,4,-3,-7,-13,-1,-13,-27,-25,-23,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-15,2,-1,-17,-5,11,-15,-6,-20,-7,19,-14,3,-4,15,4,-15,-32,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-9,6,-21,6,-2,-14,-15,10,-14,-5,-13,-9,5,-9,-5,-7,-3,-4,-12,-25,-3,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-18,-16,-13,-3,-10,-16,-6,-11,-9,-6,-8,-6,-13,-7,1,5,-1,-20,-9,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=2,-15,-17,-20,-16,-5,-18,-19,12,-18,7,4,-10,-16,-13,-17,-3,4,9,-22,-7,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-18,-3,-3,-12,-13,-8,-12,-8,-15,-12,-2,-12,-6,-12,9,8,-7,-22,-2,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-22,-7,-14,-22,50,-14,-29,-14,-22,-14,0,-14,-14,-14,0,-14,-22,-14,-22,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-30,12,-9,-33,48,-14,-40,-14,-30,-23,6,-17,-14,-17,0,-17,-30,-26,-27,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00293;
//
ID   MALIC_ENZYMES_MP; MATRIX.
AC   MP00331;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Malic enzymes signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3949795; R2=0.0161250; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=629; N_SCORE=15.528; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-11,30,-24,12,-4,-16,-3,5,-20,-3,-29,-20,47,-21,-3,-3,4,-4,-30,-15,-14,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-20,-29,-20,36,-25,-14,-3,-15,6,5,-15,-25,-21,-5,-14,-6,-2,-6,12,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-28,4,8,-19,-19,-7,-17,2,-17,-13,-1,4,0,2,-4,-4,-18,-25,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-25,7,-35,-25,33,-29,31,18,-24,-25,-21,-25,-23,-8,21,-19,1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-23,-15,5,-3,-27,-13,5,-17,27,9,-20,-20,-7,-13,-20,-10,-2,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-27,13,19,-28,-16,1,-25,11,-20,-13,9,-11,16,9,-2,-7,-24,-28,-14,17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-29,-4,4,-24,-19,-2,-29,34,-25,-10,3,-15,9,44,-7,-7,-20,-22,-10,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,24,-30,8,6,-16,15,6,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-4,15,55,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-29,-5,3,-25,-13,-4,-30,31,-25,-11,3,-16,9,44,-7,-10,-21,-21,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-25,21,19,-26,-15,6,-27,2,-23,-18,11,-7,6,-3,4,0,-24,-32,-12,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-27,19,20,-29,-14,-2,-28,16,-26,-17,14,-10,11,7,1,-4,-25,-30,-16,15;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-26,-28,-32,-25,8,-35,-9,29,-24,15,13,-19,-24,-17,-22,-20,-10,16,-11,17,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-20,26,-21,-15,-20,-24,-22,-19,-17,-14,-14,-19,12,-18,-18,-11,-9,-15,-35,-24,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,10,-23,-22,-7,-24,-23,6,-17,-2,4,-17,-24,-20,-17,0,10,19,-33,-13,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,76,-30,-19,1,-29,10,3,-20,-30,-38,-20,-20,-10,0,9,29,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-13,28,-23,14,0,-20,-6,38,-23,-3,-27,-14,45,-20,3,0,4,-6,-30,-37,-8,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-29,65,18,-38,-11,-1,-37,-1,-28,-28,18,-11,-1,-10,0,-10,-26,-40,-20,8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-29,-27,-14,-12,-33,-17,26,-17,7,15,-14,-17,5,-17,-13,-10,12,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-34,-20,38,-23,4,-20,0,3,-13,45,7,-3,-13,-30,-23,-1,28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-15,-16,-12,-23,19,-20,-19,-13,-16,-13,-6,-13,-12,-20,9,-4,-9,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=19,-16,-17,-23,-17,-14,-8,-22,6,-17,-4,-2,-11,-15,-14,-21,3,-2,9,-24,-14,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=15,-11,-10,-17,-14,-11,-14,-21,0,-13,-6,-5,-10,-16,-14,-16,11,17,11,-28,-14,-14;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-17,-28,-21,1,-26,-22,19,-24,27,13,-25,-25,-20,-20,-17,-4,18,-23,-6,-21;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-14,-17,-12,-22,16,-20,-17,-12,-15,-13,-7,-12,-12,-20,9,-4,-7,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=14,-8,-18,-11,-14,-24,32,-19,-27,-15,-23,-17,-1,-15,-14,-18,10,-3,-16,-24,-24,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-29,-19,-31,-23,5,-30,-24,26,-27,33,16,-27,-27,-22,-22,-22,-7,22,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-24,9,-33,-22,29,-28,33,18,-26,-27,-21,-23,-24,-9,19,-18,3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=19,5,-16,-5,-8,-22,13,-11,-20,-9,-22,-16,13,-14,-8,-13,13,0,-15,-28,-22,-8;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-8,-16,-11,-20,6,-19,-15,-12,-15,-13,-6,-12,-11,-19,12,3,-5,-24,-21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,2,-26,-18,-3,-24,-19,7,-23,20,11,-22,-27,-15,-19,-15,-6,7,-27,-9,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-29,-3,6,-22,-20,1,-27,29,-21,-10,0,-15,9,38,-9,-8,-20,-20,-5,5;
MA   /M: SY='A'; M=11,-19,-17,-24,-16,-7,-20,-18,10,-16,9,5,-16,-20,-14,-18,-7,-4,11,-23,-9,-16;
MA   /M: SY='T'; M=6,-9,-16,-14,-9,-15,-17,-16,-5,-5,-8,-5,-6,-15,-4,-6,6,13,3,-26,-12,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,-1,-10,-29,45,-13,-36,-9,-30,-19,9,-18,-12,-12,1,-15,-29,-24,-26,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-26,-6,0,-23,-4,-10,-22,13,-21,-10,-1,-15,2,14,-2,-7,-14,-24,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,4,-27,7,5,-27,-16,-10,-24,8,-26,-16,2,12,2,1,3,3,-21,-30,-18,2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-23,13,-31,-20,24,-28,38,22,-26,-27,-20,-21,-26,-10,14,-18,2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-20,-7,1,-21,-11,-13,-17,7,-19,-11,-1,-11,0,5,9,5,-9,-26,-15,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-28,50,27,-36,-13,0,-35,2,-27,-25,14,-8,7,-7,2,-7,-28,-37,-19,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-11,-24,-14,-4,-13,-22,9,-5,-8,-6,2,-7,-17,12,-7,-6,-8,-8,-20,-1,3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-7,1,-22,-20,-11,-22,26,-22,-10,-3,-7,3,26,-5,1,-13,-23,-12,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00294;
//
ID   SOD_CU_ZN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00332;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper/Zinc superoxide dismutase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8474579; R2=0.0139237; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=287; N_SCORE=8.834; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-26,-6,10,-20,-21,-10,-12,1,-9,-5,-8,-1,8,-1,-4,-1,-14,-25,-13,8;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-24,38,5,-27,-16,-7,-18,-6,-16,-13,5,-16,-7,-12,-4,-8,-7,-36,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-14,37,-22,49,14,-29,-7,1,-29,0,-23,-22,18,-8,0,-7,1,-7,-23,-30,-15,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-31,-23,5,-26,-22,24,-28,34,16,-26,-27,-21,-22,-24,-10,15,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-6,-29,-7,-13,-25,34,21,-35,-16,-25,-13,3,-19,-9,-13,-2,-16,-28,-24,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=1,-10,-24,-11,-2,-21,-13,-12,-19,15,-16,-8,-6,-9,-1,18,-5,-7,-12,-22,-14,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-27,-5,-16,-27,53,-15,-35,-16,-29,-19,9,-19,-16,-16,3,-12,-28,-24,-27,-16;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-30,-6,-13,-29,40,-18,-34,-14,-28,-19,-3,2,-15,-15,-2,-14,-28,-23,-27,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-17,34,-27,42,11,-29,-10,20,-32,-3,-26,-21,23,-14,1,-6,1,-9,-28,-36,-11,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,19,-26,23,26,-29,-13,-2,-27,2,-23,-20,12,0,7,-5,3,-4,-26,-33,-20,16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-25,-1,11,-20,-15,-6,-16,4,-7,-5,-3,-13,5,-1,-6,-6,-15,-25,-12,8;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-17,-3,-1,-21,-7,-13,-19,-10,-28,-19,2,12,-3,-12,27,17,-13,-37,-21,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-23,-5,-1,-17,-20,-11,-11,11,-5,-2,-8,-16,2,7,-10,-6,-7,-21,-8,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-26,-7,2,-22,-19,-16,-17,3,-21,-13,-7,22,-4,-5,1,8,-15,-28,-17,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-14,-13,-10,-9,-20,-17,-3,-12,-1,-4,-2,-14,-7,-12,7,27,-1,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,26,-24,14,-4,-24,17,5,-27,-6,-30,-20,40,-19,-5,-6,6,-7,-30,-34,-21,-5;
MA   /M: SY='A'; M=34,-9,-14,-15,-11,-22,15,-19,-18,-12,-17,-13,-5,-12,-11,-19,12,-2,-8,-23,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,68,-20,-40,-19,-30,-20,0,-20,-19,-18,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=9,-3,-23,-4,-1,-26,2,-14,-23,2,-22,-14,-2,0,-4,-5,3,-5,-17,-25,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-21,-30,-23,5,-30,-20,24,-24,23,15,-24,-21,-20,-21,-20,-7,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=40,-11,-14,-20,-12,-19,4,-20,-12,-10,-12,-11,-10,-12,-11,-17,7,-3,-3,-15,-18,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-18,-12,-19,-28,56,-20,-37,-20,-28,-19,-2,-20,-19,-20,1,-17,-26,-23,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-14,-31,-29,0,-31,-29,31,-21,11,10,-26,-27,-27,-21,-10,2,42,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-26,-8,-7,-28,30,-16,-31,0,-26,-15,-2,-15,-7,-5,-1,-13,-22,-20,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-23,-23,-18,1,-27,-20,16,-18,10,6,-15,-21,-16,-15,-11,-4,12,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,2,-13,-9,-21,-4,-15,-18,-9,-18,-12,-3,-17,-5,-9,9,2,-9,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-24,-8,0,-27,2,-10,-22,3,-21,-12,-4,-4,1,-5,0,-9,-17,-23,-18,0;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=0,-13,-26,-9,0,-20,-9,-17,-12,-11,-15,-12,-12,21,-8,-16,-1,-5,-13,-28,-21,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-18,-12,-10,-14,-2,-13,-10,-9,-7,-6,-3,-18,-7,-5,2,2,-5,-25,-14,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-24,-29,-20,23,-28,-20,8,-24,12,4,-21,-2,-23,-20,-19,-9,1,-10,4,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-25,-16,-26,-16,-5,-22,-18,-14,-15,-7,-8,-25,-25,-3,-14,-23,-18,-19,51,7,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=5,12,-21,9,24,-23,-9,-2,-21,2,-19,-16,12,-7,7,-5,5,-4,-21,-28,-18,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-26,-9,-2,-19,-18,-9,-22,11,-19,-12,-5,10,1,28,-4,2,-17,-23,-14,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-2,10,-29,-18,-1,-19,15,-19,-4,0,-9,30,10,1,2,-20,-20,-9,20; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-14,-12,-2,-22,-9,-11,-12,-4,-12,-7,-5,-9,8,-9,9,7,-7,-20,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-12,-24,-16,-4,-18,-20,-9,-2,1,-7,0,-7,-14,10,10,-6,-7,-5,-18,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-1,22,0,20,-25,-20,-11,-28,-7,-22,-20,-5,-15,0,-11,4,-4,-20,-38,-23,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00082;
//
ID   DNA_LIGASE_A2_MP; MATRIX.
AC   MP00333;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-dependent DNA ligase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6694221; R2=0.0138975; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=285; N_SCORE=8.620; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-7,19,-24,23,16,-28,-11,-4,-26,4,-23,-18,12,-11,4,-3,3,-3,-21,-32,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-27,23,32,-26,-17,3,-28,3,-20,-18,4,-7,12,-3,1,-7,-25,-30,-14,22;
MA   /M: SY='I'; M=7,-24,-19,-29,-21,-3,-24,-23,19,-21,18,10,-21,-22,-18,-19,-13,-6,18,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-24,-10,2,-11,-21,-7,-11,3,-7,-4,-7,-16,2,5,-7,-3,-10,-16,-3,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-27,9,18,-26,-17,-5,-25,13,-22,-14,0,-11,11,12,-2,-7,-20,-21,-13,14;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-22,-20,-28,-21,31,-25,-16,5,-21,12,7,-18,-25,-23,-15,-16,-8,4,-7,13,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-24,-29,-21,30,-30,-9,8,-19,18,9,-22,-28,-20,-14,-22,-10,2,1,27,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,13,-24,13,15,-23,-13,1,-24,7,-21,-16,12,-12,4,3,1,-3,-21,-28,-11,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,4,20,-27,-20,-2,-22,11,-19,-10,-2,-11,21,12,-4,-10,-22,-16,-11,20;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-8,-18,-13,-7,-12,-18,-5,-10,-9,-7,-11,-17,-14,-15,6,3,6,-22,-9,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-30,-21,0,-33,-22,29,-21,17,15,-21,-23,-17,-17,-18,-8,22,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-23,12,17,-26,-12,-5,-24,7,-23,-17,7,-10,7,2,8,0,-18,-31,-17,12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-25,6,13,-19,-18,-3,-13,-1,-8,-6,3,-14,4,-3,-4,-6,-14,-29,-12,8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-29,-8,-10,-28,34,-13,-35,-1,-27,-16,1,-18,-5,5,0,-14,-26,-21,-22,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-8,1,-9,-7,-15,-9,13,-21,-16,-11,-8,-6,-23,-8,-14,-8,-11,-17,-27,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-29,-19,-32,-24,3,-31,-25,28,-26,29,16,-26,-26,-22,-23,-20,-7,24,-22,-4,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-19,-33,-26,0,-29,-18,31,-19,17,33,-23,-23,-15,-19,-17,-7,29,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-17,-31,-25,1,-29,-26,28,-24,21,13,-26,-26,-23,-22,-16,-5,30,-24,-6,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='B'; M=-9,22,-23,21,4,-23,-10,5,-23,0,-22,-15,20,-15,1,-2,5,0,-21,-33,-12,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-22,-23,-16,-5,-24,-19,10,-19,11,5,-20,1,-15,-19,-13,-2,6,-21,-7,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-27,31,17,-29,-12,0,-26,5,-22,-16,17,-12,7,-2,0,-7,-25,-33,-17,12;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-10,-11,-10,-22,14,-17,-20,-13,-22,-16,-1,-14,-10,-17,17,2,-9,-29,-22,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-26,-18,-11,-11,-25,-15,3,-8,-6,-2,-13,7,-11,-12,-8,-1,0,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-33,-23,-21,27,-29,14,-3,-11,-3,-3,-23,-30,-11,-11,-23,-13,-13,45,74,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-28,6,31,-26,-21,-5,-19,11,-17,-12,0,-6,15,2,-2,-4,-20,-27,-15,22;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-28,-11,-4,-21,-17,-17,-11,-8,-16,-11,-14,41,-9,-12,-6,-5,-14,-24,-20,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-25,-3,-12,-26,42,-14,-32,-12,-26,-18,5,-17,-13,-11,3,-12,-24,-23,-24,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-22,-2,-1,-16,-12,-9,-17,13,-20,-10,1,-14,-1,5,0,-4,-11,-20,-6,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-28,-9,0,-19,-19,7,-28,26,-19,-9,1,-19,9,61,-9,-10,-19,-19,-7,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=3,-1,-17,-3,-9,-20,23,-11,-22,-12,-24,-16,8,-14,-9,-12,15,0,-14,-27,-20,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-26,-7,-1,-14,-9,-4,-22,6,-21,-13,-2,-8,-2,3,-3,-6,-19,-5,-5,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-25,5,-1,-22,-5,7,-22,2,-17,-10,10,-17,1,2,-4,-7,-21,-28,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-36,-42,-38,-28,8,-22,-25,-7,-21,-5,-4,-35,-28,-18,-19,-35,-24,-17,101,21,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-24,-31,-22,7,-29,-18,21,-25,27,15,-25,-26,-18,-21,-24,-10,10,-4,9,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-33,-25,15,-31,-23,24,-26,28,17,-27,-28,-24,-21,-21,-7,22,-18,2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-33,-7,4,-27,-19,-14,-23,7,-26,-16,-11,40,-2,4,-7,-6,-23,-26,-21,-2;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-22,26,21,-23,-13,-4,-20,-1,-13,-15,3,-8,2,-7,-2,-7,-16,-27,-14,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-18,-16,-15,17,-22,8,3,-10,3,1,-13,-22,-9,-10,-15,-7,-5,12,45,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-5,-18,-3,-1,-10,-18,-8,1,-8,5,4,-8,-14,0,-8,-8,-6,-1,-20,-6,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-2,10,-13,11,8,-15,-5,2,-15,0,-15,-11,10,-7,2,-1,7,0,-13,-20,-10,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-14,-18,-12,2,-19,-10,8,-10,10,16,-13,-16,-8,-6,-9,0,8,-16,-2,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-19,-15,-13,-12,14,-12,-10,-12,-6,1,-9,-10,-10,-13,-6,-10,-9,-8,-12,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-23,32,29,-28,-11,-1,-27,3,-19,-19,7,-4,7,-5,1,-7,-22,-28,-16,18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,11,-14,8,6,-16,-9,-6,-16,-3,-17,-14,13,-9,-1,-5,14,16,-12,-28,-13,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=4,-25,-8,-28,-21,0,-24,-23,14,-24,25,10,-25,-26,-20,-21,-16,-6,15,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,61,22,-37,-12,-1,-37,0,-28,-28,17,-9,1,-9,1,-7,-28,-38,-19,12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-15,-30,-24,9,-24,-23,17,-27,28,12,-27,-29,-25,-21,-21,-8,18,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-17,-31,-25,-1,-32,-27,28,-21,16,12,-23,-25,-21,-20,-15,-4,28,-25,-5,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-32,-25,1,-32,-25,36,-24,20,16,-21,-21,-20,-23,-17,-7,28,-20,-2,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-15,-21,-16,-7,-25,-19,17,-13,4,6,-16,-19,-9,-13,-5,3,23,-23,-7,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,0,-27,2,-9,-30,37,-15,-35,-8,-27,-19,2,-16,-12,-10,0,-15,-25,-23,-25,-11;
MA   /M: SY='A'; M=4,-16,-23,-20,-17,-8,-3,0,-4,-17,-4,-1,-11,-21,-13,-17,-8,-10,-3,-14,4,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-23,-5,2,-11,-22,6,-12,0,-13,-7,-1,-15,-1,-3,-1,5,-10,-21,4,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-15,-37,-12,0,-23,-20,-12,-22,7,-25,-12,-15,8,12,0,-15,-15,-28,21,-5,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00295;
//
ID   PARATHYROID_MP; MATRIX.
AC   MP00335;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Parathyroid hormone family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4674430; R2=0.0130335; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=676; N_SCORE=13.268; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-23,-31,-27,46,1,-20,-12,-27,-2,-6,-14,-27,-34,-20,-14,-13,-9,1,11,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-24,-23,-27,-17,23,-27,-14,-2,-11,15,4,-17,-27,-17,8,-21,-10,-3,-10,7,-17;
MA   /M: SY='S'; M=21,-4,-10,-11,-7,-17,-6,-17,-13,-10,-16,-13,-1,-10,-7,-14,23,22,-3,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-21,-7,-9,-14,-17,-6,-8,5,-14,-7,10,-23,-6,19,-4,-4,-1,-30,-13,-9;
MA   /M: SY='S'; M=4,3,-16,6,19,-23,-6,-7,-23,-4,-27,-20,7,-7,6,-7,28,11,-16,-37,-20,12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,54,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-31,-8,0,-25,-16,-12,-23,2,-27,-17,-8,35,-2,10,0,-4,-23,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-27,-20,-32,-24,3,-28,-17,27,-21,27,31,-25,-25,-16,-18,-21,-8,21,-22,-2,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-6,-17,-10,-3,-11,-14,-4,-4,15,-4,16,-6,-10,4,8,-10,-7,-4,-14,-4,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-17,-27,-24,-17,-6,-27,20,15,-17,8,27,-11,-20,-4,-14,-17,-13,5,-23,6,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,24,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-16,29,48,-23,-23,-6,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,36,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,48,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-21,-11,-2,-27,-17,4,-5,25,11,-21,-24,-11,-4,-24,-10,1,-20,-3,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,26,-30,-20,-7,-30,37,-27,-13,0,-7,13,20,-7,-10,-23,-23,-13,20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-24,0,0,-20,-14,66,-27,-10,-23,-6,10,-17,7,-3,6,-8,-24,-33,8,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-26,-27,-17,-3,-30,-17,13,-11,18,10,-17,-24,-10,6,-20,-10,7,-20,-3,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-6,0,-23,0,6,-26,-13,32,-23,-4,-24,-7,7,-13,22,-1,11,-2,-23,-31,-4,12;
MA   /M: SY='S'; M=-3,16,-16,19,3,-23,-10,-10,-23,-7,-24,-20,10,-10,-3,-10,21,20,-13,-37,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-17,-30,-23,5,-28,-19,23,-23,31,25,-28,-28,-19,-18,-21,-7,23,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,4,-30,11,41,-27,-20,0,-30,16,-20,-17,0,-6,17,22,-3,-10,-27,-27,-17,28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-23,-14,-4,-19,-24,-8,-5,5,-9,1,-11,-20,12,18,-7,-6,2,-24,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-16,10,-27,17,19,1,-20,-6,-24,-6,-14,-17,0,-13,-5,-9,-6,-10,-21,-21,-4,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-41,-40,-30,32,-23,-27,-14,-23,-11,-14,-34,-30,-26,-20,-34,-24,-21,106,30,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-30,-4,6,-26,-20,34,-27,11,-20,-4,3,-17,26,29,-7,-13,-26,-23,-1,13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-27,-10,-3,-17,-20,28,-14,12,-11,16,-3,-16,7,8,-13,-13,-13,-23,3,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00296;
//
ID   BETA_LACTAMASE_C_MP; MATRIX.
AC   MP00336;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-lactamase class-C active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6332016; R2=0.0158148; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=487; N_SCORE=13.325; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-15,-19,-16,-7,-21,-18,9,-9,3,8,-16,-22,-13,-10,-2,1,18,-29,-10,-15;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-20,-12,-2,-25,-8,-14,-15,-7,-19,-12,-8,13,2,-14,8,-1,-13,-25,-21,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-4,10,-19,14,5,-25,-7,-5,-27,2,-28,-20,10,-12,2,8,19,6,-17,-35,-18,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-15,-30,-20,-10,-15,-29,-18,7,10,-5,4,-9,-16,-4,7,-15,-10,3,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-2,-23,-4,12,-29,-13,-7,-20,13,-19,-9,-4,-9,17,3,1,-6,-17,-21,-15,15;
MA   /M: SY='T'; M=7,14,-15,5,-4,-19,-9,-10,-16,-6,-17,-15,14,-12,-6,-10,13,19,-11,-31,-16,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-26,3,-1,-29,19,-1,-27,-4,-27,-14,21,-17,10,-4,4,-10,-30,-27,-21,5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-27,-11,-4,-19,-20,13,-15,11,-15,-3,-2,-16,3,17,-9,-11,-12,-22,-3,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-16,-37,-9,1,-29,-20,-16,-23,4,-29,-17,-15,61,-5,-1,-10,-10,-27,-27,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-12,-29,-25,-5,-24,-28,23,-19,6,6,-24,-24,-24,-21,-6,-1,36,-27,-11,-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-13,-8,-10,-14,-5,-18,-16,-11,-16,-13,2,-11,-10,-11,20,36,-6,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-30,10,20,-32,-16,-6,-24,1,-23,-16,-3,18,14,-7,-1,-9,-26,-28,-20,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,10,-27,6,17,-30,-15,7,-23,11,-23,-9,15,-13,32,15,1,-7,-28,-26,-14,24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,32,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-20,-27,-25,-4,-8,-25,14,-24,12,7,-22,-26,-24,-21,-14,-8,19,-24,-11,-25;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-15,-3,6,-15,-20,-15,-15,-5,-12,-12,0,-8,-3,-8,15,36,-7,-30,-12,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-22,-33,-23,57,-28,-15,-7,-16,3,-2,-15,-28,-29,1,-18,-10,-5,3,21,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,9,-12,-3,-8,-12,-15,-13,-12,-8,-15,-12,14,-12,-8,-8,18,39,-7,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-15,-18,-12,-22,17,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-14,-15,-22,-19,-5,-27,-25,13,-17,2,2,-12,-17,-17,-17,4,24,19,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-19,-17,-14,0,-20,-13,7,-21,25,7,-7,-25,-14,-15,-16,-7,0,-25,-7,-14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-15,-15,-20,-17,-18,10,-22,-8,-15,-10,-8,-12,-17,-17,-20,3,-5,4,-22,-20,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-17,-5,-3,-20,9,-15,-19,-11,-22,-15,0,-13,-7,-12,17,9,-10,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-12,-30,-9,-15,22,-28,18,-5,-9,-4,-4,-15,-28,-9,-10,-18,-10,-12,22,68,-16;
MA   /M: SY='A'; M=36,-15,-12,-22,-12,-13,-7,-20,-3,-15,4,-3,-15,-15,-12,-20,1,-2,2,-20,-15,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-10,-23,-15,-3,-17,-24,-7,1,-7,1,10,-9,-15,16,-6,-4,4,-6,-22,-6,6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-18,-19,-9,-17,-17,-16,3,-10,-5,0,-11,-14,1,-13,2,3,5,-23,-12,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-24,-7,2,-20,-20,-2,-11,0,-4,-1,1,-17,19,7,-4,-2,-16,-24,-9,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,3,-7,-32,40,-12,-35,-12,-29,-19,4,-16,-4,-13,4,-13,-28,-25,-25,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00134;
//
ID   BETA_LACTAMASE_D_MP; MATRIX.
AC   MP00337;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-lactamase class-D active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2827492; R2=0.0183372; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=439; N_SCORE=14.323; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=4,-2,-24,-2,8,-29,12,-8,-26,-5,-24,-14,1,-11,11,-8,9,-6,-23,-25,-20,9;
MA   /M: SY='C'; M=-12,1,3,-5,-11,-16,-21,-11,-9,-9,-11,-3,2,-21,-9,-5,-5,-2,-7,-33,-14,-11;
MA   /M: SY='L'; M=7,-18,-15,-24,-16,6,-20,-20,3,-20,16,3,-17,-20,-17,-18,-7,6,4,-19,-4,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-16,-21,-15,-5,-27,-19,12,-16,13,8,-20,-23,-9,-13,-9,5,16,-26,-7,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-6,-25,-13,-14,21,-22,29,-12,-14,-8,-4,3,-25,-11,-8,-12,-11,-16,-5,31,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-14,31,-25,27,13,-26,-8,5,-27,6,-27,-21,34,-15,4,8,3,-5,-29,-36,-19,8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-26,3,9,-22,-18,-11,-20,6,-14,-12,-4,0,0,4,-4,-1,-16,-27,-15,3;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-22,-15,-12,-23,12,-20,-17,-7,-18,-12,-10,-2,-13,-14,0,-8,-9,-22,-22,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-27,-3,10,-23,-17,-3,-29,25,-23,-13,1,-14,10,42,-1,-6,-20,-24,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=18,-13,48,-22,-18,-20,-13,-23,-20,-19,-17,-16,-12,-23,-18,-23,5,-2,-6,-36,-24,-18;
MA   /M: SY='A'; M=10,9,-19,7,4,-27,-6,-7,-21,2,-23,-15,9,-11,6,-5,10,0,-16,-29,-18,5;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-25,-4,6,-26,-20,-6,-23,23,-21,-8,0,-11,18,21,0,4,-18,-22,-10,11;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-26,-7,8,-24,-16,-3,-24,16,-18,-9,-2,-14,15,33,-3,-8,-18,-21,-13,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-24,-24,-18,20,-27,3,5,-12,4,11,-19,-26,-7,-11,-16,-9,1,5,37,-14;
MA   /M: SY='A'; M=15,-11,-17,-15,-9,-15,-11,-18,-6,-14,-9,-8,-8,0,-9,-17,10,8,-3,-28,-16,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,77,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,1,-6,-6,-23,-11,-12,-14,-9,-11,-3,-7,-16,-2,-15,0,-6,-8,-27,-17,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,36,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='P'; M=1,-21,-29,-17,-8,-20,-19,-21,-7,-14,-12,-10,-21,44,-14,-20,-9,-7,-11,-27,-22,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-21,-5,-9,-7,-16,7,-3,-15,7,0,14,-24,-8,-9,-10,-7,-12,-30,-6,-9;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-14,-8,-18,-5,-18,-12,-10,-13,-12,-4,-10,-8,-16,17,16,-2,-26,-18,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-26,-24,-36,-26,9,-30,-15,31,-21,19,36,-20,-21,-13,-20,-20,-10,17,-16,4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-32,-23,34,-30,-14,11,-27,31,11,-26,-30,-25,-19,-26,-10,4,-4,21,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-30,46,33,-37,-14,1,-35,4,-26,-23,11,-7,13,-5,0,-10,-30,-35,-19,23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-6,-13,-11,-2,-17,-10,-17,-9,-9,-12,-10,-6,-11,-7,-14,12,11,0,-27,-17,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-30,8,2,-31,33,-13,-37,-4,-28,-20,3,-14,-7,-10,-1,-16,-29,-25,-25,-2;
MA   /M: SY='I'; M=18,-21,-19,-30,-21,-9,-21,-26,21,-20,6,6,-17,-17,-17,-24,-6,-4,19,-21,-10,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-26,5,5,-24,-17,-5,-22,12,-15,-9,0,-15,10,18,-3,-6,-17,-26,-11,6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-26,33,10,-34,1,-1,-32,-2,-28,-21,17,-12,7,-7,7,-6,-27,-34,-20,8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-28,7,33,-29,-17,-7,-26,11,-22,-17,-4,10,10,-1,-2,-9,-24,-27,-20,21;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-1,-21,-8,-8,-1,-20,5,-16,0,-14,-8,4,-18,-6,3,-1,9,-13,-17,7,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-24,0,5,-26,-19,-5,-10,-3,-15,-5,1,-12,21,-4,5,3,-13,-27,-11,12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-25,-28,-21,4,-30,-26,16,-21,1,2,-23,7,-23,-22,-14,-7,14,-21,-7,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00134;
//
ID   SOMATOTROPIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00338;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Somatotropin, prolactin and related hormones signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8136387; R2=0.0127548; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=220; N_SCORE=7.610; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-20,-4,-3,-19,-12,-10,-13,-10,-17,-11,-1,6,-4,-12,10,5,-11,-32,-17,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-27,32,12,-28,-8,5,-29,0,-23,-19,18,-14,2,-1,-1,-9,-26,-34,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,3,19,-22,-15,-6,-18,9,-17,-8,2,-10,6,2,0,-4,-15,-28,-15,12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,18,-25,24,18,-23,-14,-3,-22,-3,-16,-17,9,-12,1,-8,0,-5,-19,-32,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-21,7,10,-18,-15,-2,-19,-3,-15,-13,1,-12,-1,-3,5,5,-12,-30,-12,4;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-23,-6,0,-21,-11,1,-24,12,-22,-11,2,-15,7,21,4,-2,-16,-24,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-20,-21,-24,-18,13,-27,-9,9,-21,17,8,-16,-26,-17,-14,-17,-8,6,-17,5,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-20,-26,-19,16,-23,-13,6,-19,16,10,-17,-24,-17,-10,-15,-6,3,-16,3,-18;
MA   /M: SY='A'; M=15,-3,-19,-8,-1,-22,-9,-12,-18,8,-17,-11,-1,-13,-1,6,3,-2,-10,-24,-16,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-2,-22,-5,-12,12,-21,-12,-2,-18,5,-3,0,-23,-18,-15,-11,-7,-5,-20,0,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-14,-21,-20,24,-28,13,-6,-12,-4,-3,-17,-30,-13,-10,-17,-10,-10,14,56,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,3,-22,-3,-5,-16,1,-7,-20,2,-20,-10,12,-17,-4,4,3,-1,-17,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-30,-21,14,-29,-19,18,-26,38,19,-26,-28,-20,-19,-25,-8,12,-18,1,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-13,-28,-20,16,-25,-19,8,-26,20,7,-20,-26,-20,-19,-14,-6,4,-16,3,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-8,-18,-11,-8,-4,-15,10,-16,-6,-15,-8,-1,-19,-3,0,5,1,-12,-17,9,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-35,-25,41,-30,-20,12,-29,29,11,-25,-30,-29,-20,-24,-10,7,-7,13,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-1,-30,0,5,-24,-20,5,-30,30,-24,-10,2,-16,9,42,-10,-11,-21,-21,-6,4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-8,-1,-19,-21,-8,-19,28,-19,-7,-3,-17,3,33,-10,-8,-10,-20,-6,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=7,-13,-15,-19,-13,-7,-15,-15,3,-15,1,7,-9,-16,-9,-15,5,8,3,-26,-9,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-16,1,-28,2,4,-19,-18,58,-27,-3,-21,-5,8,-17,10,5,-4,-13,-26,-28,7,4;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-26,-3,4,-25,-20,-10,-23,36,-24,-7,-1,-12,5,22,-6,-2,-14,-22,-9,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-18,-31,-26,-2,-30,-20,29,-21,13,17,-23,-24,-20,-21,-13,-4,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-29,35,35,-29,-16,2,-31,4,-23,-22,8,-7,10,-5,0,-9,-28,-30,-12,22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-15,-13,-13,-3,-19,-12,-2,-13,-4,-1,1,-16,-11,-12,7,22,0,-27,-6,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-27,-23,39,-30,3,4,-18,10,3,-21,-30,-19,-14,-21,-10,-4,17,55,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-29,-20,8,-29,-20,18,-27,39,17,-26,-27,-19,-19,-23,-5,11,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-28,0,9,-27,-18,-5,-27,36,-27,-10,6,-12,12,29,-6,-8,-21,-23,-11,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-18,-32,-26,12,-31,-23,25,-25,25,14,-27,-28,-25,-21,-19,-5,25,-19,2,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-29,-20,6,-27,-19,19,-26,39,20,-27,-28,-18,-19,-24,-8,13,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-28,-2,7,-26,-17,-5,-26,32,-24,-9,4,-13,11,29,-6,-8,-20,-22,-11,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-13,-27,-13,-4,-15,-21,-3,-20,19,-11,-4,-5,-21,6,49,-11,-9,-12,-19,-7,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-14,-23,-16,-9,-10,-23,-9,2,-9,4,4,-12,-20,-1,-2,-9,-6,1,-22,-6,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-17,-21,-18,6,-23,-16,8,-18,3,1,-10,-21,-17,-16,-2,8,9,-20,1,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-8,-2,-22,1,-5,-10,-11,0,-13,-5,-12,-8,-5,-10,-8,-8,-5,-7,-9,-18,0,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-16,11,14,-24,-15,-3,-21,8,-20,-12,8,-8,7,3,-2,-7,-20,-27,-15,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-19,2,2,-16,-3,-2,-18,-2,-19,-12,10,-12,-1,-4,8,0,-16,-25,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-17,3,-2,-16,-8,-5,-12,-2,-20,-12,21,-15,-3,-3,11,7,-11,-33,-16,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-13,-11,-10,-6,0,-11,-11,-9,-10,-8,-4,-11,-9,-9,6,8,-5,-15,-5,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23,22,-31,-19,17,-27,29,12,-24,-28,-23,-20,-22,-6,11,-12,11,-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-15,-8,-7,1,-9,-4,-15,-13,-20,-14,2,-16,-7,-11,22,10,-9,-23,2,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-7,-21,-8,4,-16,-22,-15,-3,-1,-11,-6,-6,-13,-3,-6,3,4,1,-29,-12,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-16,6,3,-16,-7,0,-16,16,-19,-9,19,-9,3,10,0,-3,-16,-19,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-18,-29,-22,37,-25,-20,3,-24,2,-2,-12,-22,-26,-18,-4,5,3,-9,11,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00239;
//
ID   SURFACT_PALMYTOYL_MP; MATRIX.
AC   MP00341;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Surfactant associated polypeptide SP-C palmitoylation sites.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1834478; R2=0.0116287; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=879; N_SCORE=14.395; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=200; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=38,-8,-10,-18,-10,-18,-5,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,12,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=14,-17,-18,-19,-21,-17,18,-23,-9,-17,-11,-7,-13,-21,-21,-20,-1,-8,5,-23,-21,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-30,-10,-7,-23,10,-7,-33,14,-23,-13,0,-20,0,40,-7,-13,-23,-20,-17,-7;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,42,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,16,-4,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,8,-28,-20,4,-26,22,-20,-6,0,-16,30,46,-6,-10,-24,-20,-10,16;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,39,-30,-20,12,-30,33,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-7,13,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-28,-14,-8,-16,-6,-8,-21,9,-7,-6,-6,-22,-1,36,-12,-12,-16,-20,-11,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,23,-24,12,0,-20,-8,48,-24,-4,-26,-12,39,-20,4,0,2,-8,-30,-36,-3,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00298;
//
ID   GATA_ZN_FINGER_1_MP; MATRIX.
AC   MP00344;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GATA-type zinc finger domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8198481; R2=0.0093843; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=358; N_SCORE=7.179; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=286; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-21,-4,1,-21,-5,-9,-19,2,-20,-11,3,-10,0,1,7,2,-14,-27,-15,0;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-25,-4,-1,-22,-7,-8,-21,2,-21,-13,-1,-7,0,6,0,-5,-16,-20,-14,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-4,-20,-5,0,-18,-10,-8,-15,1,-13,-3,-4,-13,4,-2,0,-3,-12,-24,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-23,-1,1,-22,-8,-8,-19,5,-19,-9,1,-11,2,2,4,-1,-13,-28,-14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-23,-5,0,-20,-4,-9,-20,2,-17,-11,1,-11,0,4,1,-5,-15,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='A'; M=3,-2,-21,-4,-4,-19,-3,-10,-16,-5,-13,-9,0,-13,-4,-6,3,-2,-12,-26,-14,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-16,-3,-1,-16,-8,-9,-13,-2,-14,-9,0,-8,-2,-4,5,4,-9,-23,-11,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-2,-20,-3,-1,-19,-10,-11,-13,-4,-15,-9,0,-6,-3,-6,2,-1,-10,-29,-16,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-20,-3,1,-18,-10,-7,-16,-3,-14,-11,1,-8,-1,-3,5,2,-12,-27,-14,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-23,-2,0,-22,-4,-6,-21,5,-19,-9,4,-15,3,8,2,-2,-16,-27,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-24,-4,-5,-22,1,0,-24,2,-20,-11,4,-16,-2,8,-2,-8,-18,-25,-13,-5;
MA   /M: M=-3,-8,-24,-10,0,-18,-14,-14,-8,-7,-10,-5,-7,-1,-1,-10,-1,0,-9,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-27,-8,-1,-22,-5,-13,-15,-7,-15,-9,-8,4,-4,-10,-3,-5,-13,-25,-18,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-26,-15,-8,-10,-21,-10,-9,4,-7,-4,-10,-10,-5,15,-10,-3,-7,-18,-2,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-11,-14,-8,-8,-21,-13,-8,-4,-9,-2,-9,-15,-7,-1,-2,2,-2,-24,-8,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=10,-8,-16,-13,-8,-13,-11,-14,-10,-7,-12,-7,-6,-12,-3,-8,9,11,-4,-23,-10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-12,21,-24,14,4,-23,-10,31,-23,-3,-25,-12,29,-17,8,-1,4,-5,-27,-34,-7,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-27,-5,-5,-20,17,0,-28,-6,-20,-12,1,-17,-4,-7,-3,-13,-23,-21,-14,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-13,-8,-8,-12,-19,-19,-7,-11,-10,-9,-2,-12,-10,-12,15,34,3,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-4,-3,-16,-16,-13,-10,-8,-12,-9,1,-13,-2,-6,11,17,-6,-29,-12,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-19,0,-1,-15,-16,-11,-21,9,-21,-13,4,-14,-3,3,3,7,-14,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-23,-11,-4,-25,-19,-20,-18,-12,-25,-18,-15,56,-11,-19,-2,0,-22,-32,-26,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-15,-18,-16,-3,-9,-25,-8,1,-12,17,11,-15,-22,5,-5,-17,-10,-6,-23,-6,0;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-39,-48,-39,-29,9,-20,-28,-17,-19,-17,-15,-39,-29,-19,-19,-39,-29,-27,139,28,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-26,-2,7,-22,-11,-4,-26,14,-21,-13,5,-10,5,26,-1,-4,-20,-26,-15,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,8,-26,7,-5,-28,35,-10,-33,-11,-29,-21,14,-17,-10,-13,5,-11,-28,-28,-25,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-34,-7,4,-28,-17,-17,-20,-5,-26,-18,-14,57,-6,-14,-5,-6,-24,-29,-26,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-22,3,4,-18,-12,-1,-17,-1,-16,-9,5,-11,2,0,4,-1,-15,-27,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-29,60,-18,-37,-16,-28,-17,-1,-19,-17,-17,-1,-19,-28,-20,-28,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-2,0,-28,1,6,-27,-12,-6,-21,-2,-23,-15,1,21,3,-8,-1,-6,-24,-29,-20,3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-17,-2,1,-15,-11,-7,-12,15,-13,-5,-2,-5,1,13,-5,-5,-7,-14,-7,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-18,-10,-6,-16,-19,-15,-8,-10,-14,-8,-7,9,-6,-13,6,14,-6,-29,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,7,-30,-21,23,-27,40,21,-29,-29,-20,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-20,19,4,-21,-1,9,-21,0,-29,-20,54,-18,1,0,10,0,-29,-39,-20,3;
MA   /M: SY='A'; M=41,-6,-11,-16,-8,-20,-1,-17,-12,-8,-13,-11,-4,-11,-8,-15,11,1,-3,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-20,-28,64,-19,-36,-19,-27,-15,-1,-20,-19,-19,-1,-19,-27,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-30,-22,4,-30,-23,24,-26,32,16,-25,-26,-20,-21,-20,-4,18,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-16,-26,-19,-13,13,-24,-1,-13,3,-7,-3,-10,-23,-7,20,-12,-6,-10,-2,20,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-30,-23,-18,20,-24,0,-5,-15,-2,-1,-15,-27,-12,-12,-20,-13,-13,30,33,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-27,-5,5,-26,-17,-8,-26,33,-24,-9,-1,-12,10,31,-6,-7,-17,-20,-11,6;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-22,-9,-4,-14,-19,-13,-9,7,-3,-2,-4,-17,-3,2,-5,-1,-7,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-3,-28,-4,0,-23,-6,24,-26,7,-21,-7,2,-16,4,6,-6,-12,-21,-24,-4,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-26,-8,-4,-21,10,-3,-26,0,-20,-11,2,-17,-3,10,-2,-9,-20,-23,-15,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-17,-17,-10,-8,-22,-17,1,-8,5,1,-14,-21,-10,-3,-7,3,6,-25,-9,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-22,-14,-8,-11,-20,-9,-8,0,-7,-2,-9,-8,-8,2,-9,-6,-4,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-15,-20,-15,-7,-13,-20,-12,-17,8,-14,-8,-10,-5,-5,23,-9,-8,-10,-22,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-4,-31,1,10,-24,-14,-12,-17,-7,-17,-13,-5,25,-3,-13,-5,-7,-21,-30,-21,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-16,-23,-18,-13,0,-22,-2,1,-12,7,2,-12,-21,-9,-7,-12,-5,-3,-14,10,-13;
MA   /M: SY='S'; M=0,4,-18,1,-2,-20,-7,-8,-21,0,-21,-14,9,-14,-2,6,14,12,-13,-31,-16,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00300;
//
ID   ETS_DOMAIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00345;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ets-domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0869322; R2=0.0141440; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=290; N_SCORE=9.179; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-13,-26,-14,-4,-15,-7,-10,-13,-7,-14,1,-10,0,-3,-6,-3,-6,-14,-10,-12,-4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-23,-10,-6,-7,8,-11,-19,-12,-16,-13,-3,-2,-12,-14,-3,-9,-17,-15,-10,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-13,-20,-17,-15,4,-12,-8,-1,-11,-2,-2,-7,-20,-12,-6,-7,-6,-2,-10,7,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-21,-7,4,-15,-17,-9,-13,9,-7,-6,-7,-3,0,10,-7,-3,-11,-19,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-2,-25,0,1,-22,6,-3,-25,-1,-18,-12,-1,-5,-4,-2,-3,-7,-20,-22,-15,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=1,-5,-22,-7,-2,-18,-1,-12,-13,-4,-13,-9,-1,-3,-5,-8,0,-6,-12,-23,-16,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-22,5,9,-24,1,-9,-24,-3,-24,-18,1,6,0,-4,9,-2,-20,-28,-20,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-17,-6,0,-10,-13,-5,-15,1,-15,-10,-2,-12,-1,2,8,8,-10,-17,1,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-27,0,2,-27,18,-11,-27,-8,-23,-16,-2,5,-2,-11,-1,-9,-25,-22,-22,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-18,-2,-8,-17,25,-6,-21,-5,-18,-12,10,-13,-7,-1,1,-9,-18,-16,-16,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=5,2,-11,-1,-1,-15,3,-6,-15,1,-17,-11,7,-8,-1,-3,12,3,-10,-20,-12,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-20,0,1,-18,3,-6,-23,8,-17,-11,1,-11,0,16,-2,-4,-16,-17,-12,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-4,0,-24,-2,-3,-25,9,-9,-28,5,-28,-17,10,-9,-2,8,7,-4,-22,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-3,-23,-5,1,-25,-8,-3,-22,7,-22,-10,0,-6,8,1,5,3,-17,-25,-13,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-22,-30,-23,0,-32,-24,26,-21,20,13,-20,-23,-18,-15,-16,-2,20,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-8,-27,-9,0,-14,-23,10,-15,4,-10,-2,-5,-18,18,15,-7,-4,-17,-13,8,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-35,-28,15,-22,-18,-15,-18,-15,-15,-35,-30,-18,-18,-35,-25,-25,121,42,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,6,-30,9,25,-37,-19,15,-24,8,-21,-6,3,-9,44,6,-1,-11,-30,-24,-10,34;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-25,-15,2,-28,-18,14,-20,34,15,-25,-27,-12,-14,-24,-9,8,-21,-3,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-27,13,26,-30,-10,2,-27,4,-21,-15,2,-7,15,-2,1,-7,-25,-27,-16,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-24,-1,2,-21,-17,-4,-16,3,-10,-6,2,-16,12,11,-2,0,-16,-25,-11,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-27,38,16,-32,-12,-2,-34,8,-28,-23,12,-11,4,7,3,-6,-25,-34,-18,9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-20,-7,1,-28,1,-11,-30,5,-25,-15,-5,1,3,8,-6,-12,-25,-25,-21,0;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-25,23,18,-29,-6,-2,-28,3,-25,-19,17,-10,7,-3,5,-3,-25,-33,-19,12;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-14,-12,-11,-7,-19,12,-5,-9,-6,9,0,-21,0,-7,-6,-2,-7,-21,6,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-26,-6,4,-28,-4,-9,-23,2,-23,-12,-4,5,9,1,3,-3,-21,-25,-18,5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,12,-27,17,13,-27,-9,17,-31,3,-24,-16,7,-12,5,4,0,-7,-25,-30,-10,7;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-24,4,-29,-24,16,-26,-19,4,-23,6,0,-20,-28,-24,-20,-12,-5,8,-16,6,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='W'; M=5,-13,-19,-16,-5,-15,-13,-17,-21,1,-20,-15,-12,-16,-5,-3,-5,-8,-16,16,-6,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-15,-17,-14,-10,-25,-21,5,-8,-4,-1,-11,-17,-10,-10,3,20,14,-28,-9,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-27,12,10,-31,17,-6,-32,-5,-27,-19,8,-12,4,-9,6,-9,-27,-29,-22,7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,8,-28,11,4,-25,-16,6,-28,9,-24,-15,7,-1,2,14,-3,-3,-23,-29,-12,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00374;
//
ID   ETS_DOMAIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00346;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ets-domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4503770; R2=0.0134077; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=920; N_SCORE=16.775; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-7,-17,-12,-9,-25,-20,7,-12,1,0,-13,-23,-16,-14,-6,0,16,-30,-12,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-29,38,16,-34,-13,14,-33,6,-27,-19,17,-12,9,0,-2,-10,-29,-34,-12,12;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-28,-6,2,-27,-13,-15,-22,4,-29,-17,-7,33,-3,-6,4,-2,-20,-29,-22,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,12,-26,17,31,-27,-17,-4,-24,10,-21,-17,5,-8,8,0,-1,-8,-20,-30,-18,20;
MA   /M: SY='E'; M=6,-6,-23,-6,8,-21,-3,-12,-20,0,-11,-11,-6,-12,-1,0,-1,-6,-15,-23,-17,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-19,-5,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-30,-3,10,-25,-20,6,-29,29,-23,-10,1,-15,14,44,-8,-11,-22,-22,-9,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-25,-15,2,-27,-14,9,-14,31,17,-22,-26,-11,-1,-25,-10,3,-20,-2,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-9,3,-20,-23,-5,-3,2,-7,4,-2,-15,15,3,-8,-9,-9,-23,-9,8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-30,-4,7,-25,-20,19,-28,19,-20,-7,2,-17,20,41,-8,-12,-24,-22,-5,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-11,31,-15,14,-1,-21,-4,6,-22,5,-29,-19,48,-20,0,5,6,-2,-28,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-29,-3,4,-24,-18,2,-29,33,-25,-10,6,-16,9,45,-8,-10,-21,-22,-9,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-32,-3,1,-26,-20,-16,-19,4,-22,-14,-11,38,-6,-7,-8,-5,-19,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='N'; M=3,6,-21,2,-1,-24,-5,-8,-22,4,-22,-15,9,-8,0,4,5,1,-17,-28,-17,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,23,-16,8,-4,-16,-8,-2,-16,-4,-22,-16,35,-16,-4,-4,14,21,-18,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,31,38,-35,-17,2,-31,7,-23,-18,6,-5,23,-1,0,-10,-30,-31,-18,31;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-28,-1,8,-28,-20,-11,-28,45,-28,-10,0,-10,8,27,-7,-5,-18,-21,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,37,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='S'; M=19,-3,-12,-6,-4,-21,6,-13,-19,-11,-25,-18,4,-11,-4,-13,29,12,-9,-34,-21,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-12,-16,-10,-21,7,-19,-14,-11,-15,-12,-6,-11,-10,-19,13,1,-4,-23,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-2,-28,-7,-10,8,-21,24,-9,-6,-11,-5,3,-25,0,-5,-10,-9,-18,4,43,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-28,-19,-19,17,-14,11,-6,-11,-5,-4,-16,-27,-11,-12,-14,-10,-12,18,55,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-13,8,-29,11,11,-29,-18,-4,-28,27,-25,-13,5,-13,11,25,-6,-9,-21,-25,-13,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-22,-9,-5,-17,-12,-14,-17,10,-14,-8,-4,-15,-4,11,0,7,-9,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-7,12,-27,10,-8,-29,36,-8,-34,-9,-30,-21,18,-18,-10,-9,2,-13,-30,-28,-25,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-29,-25,-8,-7,-33,-20,28,-19,11,14,-15,-15,-9,-21,-15,-10,14,-22,-5,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-35,-26,3,-34,-23,36,-26,27,24,-24,-24,-18,-24,-22,-9,24,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-18,-8,3,-21,-20,-1,-19,12,-16,-7,-3,-15,5,14,-5,-6,-14,-25,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-14,-21,-17,-6,-27,-24,17,-16,3,3,-19,-22,-19,-17,-2,8,29,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-28,9,9,-29,-11,-7,-25,10,-23,-14,3,-2,7,6,-1,-8,-21,-27,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-30,-9,-11,-27,33,-13,-36,2,-27,-16,0,-19,-8,13,-4,-16,-26,-20,-22,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-28,1,15,-30,-18,-3,-27,28,-25,-9,1,-10,23,24,-2,-7,-23,-23,-12,18;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-27,-14,-3,-14,-23,-7,-13,13,1,1,-10,-21,5,29,-16,-10,-11,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-18,-20,-23,-18,19,-26,-8,0,-15,7,1,-15,-24,-17,-8,-10,5,1,-10,15,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00374;
//
ID   PARP_ZN_FINGER_1_MP; MATRIX.
AC   MP00347;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Poly(ADP-ribose) polymerase zinc finger domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7316923; R2=0.0133573; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1484; N_SCORE=24.544; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-3,-28,5,17,-18,-22,-10,-13,-9,0,-8,-11,5,-2,-12,-12,-10,-17,-28,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-19,-23,-20,-13,-8,-12,-15,3,-19,16,7,-16,-22,-4,-15,-14,-6,-3,-21,-7,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-15,5,-35,17,7,-32,-17,-10,-29,1,-28,-22,-3,36,-3,0,-7,-10,-28,-32,-23,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,8,-20,-13,-18,-7,-20,-14,-10,-7,-8,-13,-20,-13,-15,-4,-7,-6,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='A'; M=23,-20,-14,-27,-20,-10,-17,-25,14,-17,2,2,-18,-18,-18,-22,-2,-2,22,-23,-13,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-30,26,45,-32,-10,-2,-33,5,-23,-22,4,-4,13,-4,0,-11,-30,-31,-21,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-14,-3,-2,-18,-7,-10,-20,-3,-25,-17,7,-12,0,5,28,19,-10,-35,-17,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,8,-24,1,-11,-25,37,-9,-31,-12,-30,-20,22,-19,-11,-12,9,-8,-27,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-26,-10,-2,-18,-20,-4,-26,23,-18,-10,0,-18,6,55,-4,1,-16,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,26,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-15,-7,-10,-16,1,-14,-16,-11,-17,-10,6,-13,-9,-11,16,24,-9,-30,-16,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-25,-7,-11,-25,31,-17,-31,-4,-26,-16,1,-15,-11,-8,5,-2,-21,-24,-22,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-6,7,-22,-21,-8,-18,30,-15,4,-6,-12,7,17,-12,-10,-13,-21,-8,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-25,11,30,-28,-14,-1,-26,13,-25,-16,10,-7,16,5,6,-4,-25,-30,-17,23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-25,2,5,-25,-16,-8,-25,31,-27,-12,11,-12,5,18,-2,1,-19,-25,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=5,1,-19,5,17,-22,-14,-11,-15,-3,-15,-14,-4,-10,0,-10,6,-2,-7,-31,-18,9;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-7,-25,-8,2,-21,-19,-13,-18,27,-13,-5,-7,-14,2,14,-11,-9,-12,-20,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-30,17,-6,-33,43,-13,-40,-13,-30,-23,7,-17,-13,-17,0,-17,-30,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-10,-23,-13,-1,-22,-25,-8,0,-4,-7,3,-8,-15,21,-4,-1,1,-2,-23,-9,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,7,-31,-25,1,-30,-24,15,-27,25,13,-27,-30,-23,-22,-21,-8,16,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-36,-26,2,-34,-22,37,-26,27,27,-22,-22,-16,-24,-22,-10,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='S'; M=20,-5,-14,-8,-7,-22,13,-15,-21,-12,-24,-17,2,-12,-7,-15,24,7,-11,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='K'; M=0,-10,-22,-13,-5,-18,-19,-13,-9,20,-12,6,-10,-15,-1,8,-9,-7,-1,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-4,-22,-11,-8,-14,-18,-7,-2,10,-8,13,-1,-18,-2,3,-9,-6,0,-25,-9,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-10,-20,-7,-13,-9,-24,-4,0,-6,-5,-2,-12,-24,-13,1,-9,-6,12,-24,-1,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,6,-33,-20,-11,-20,-4,-27,-14,-14,60,11,-11,-7,-10,-30,-27,-24,5;
MA   /M: SY='S'; M=-1,14,-19,15,17,-24,-6,-3,-24,-2,-28,-21,18,-9,5,-6,21,6,-20,-38,-20,11;
MA   /M: SY='A'; M=10,-7,-22,-10,-1,-23,-14,-17,-19,10,-20,-12,-7,8,-3,-1,1,4,-12,-24,-17,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-27,-30,-20,43,-27,-20,-7,-23,-3,-7,-20,10,-30,-20,-17,-10,-10,-3,10,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-24,-7,1,-9,-18,28,-19,-7,-16,-4,1,-17,16,-2,1,-7,-21,-21,4,8;
MA   /M: SY='D'; M=-15,16,-27,27,14,-21,-19,-7,-18,-8,-1,-11,-1,-15,-3,-12,-10,-10,-17,-31,-13,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-12,10,-25,6,0,-20,-15,-1,-13,11,-13,8,8,-15,3,4,-8,-8,-14,-27,-10,1;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-21,-28,-19,-5,-27,-14,24,-15,12,29,-20,-21,-4,-15,-15,-7,20,-23,-4,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-15,20,-33,33,12,-35,-15,-8,-32,6,-30,-23,4,20,-1,-6,-5,-10,-28,-33,-21,4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,14,-9,7,8,-22,-10,-1,-24,2,-26,-18,23,-16,2,6,9,-1,-23,-36,-19,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25,54,-30,1,0,-20,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,20,56,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-15,-33,-12,1,-14,-26,-10,-6,-1,-14,-7,-14,20,-5,-9,-12,-10,-14,-16,0,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-23,7,4,-25,-12,-6,-23,12,-23,-13,13,-12,7,5,5,8,-19,-28,-14,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28,65,-28,-16,4,-26,12,11,-20,-28,-33,-18,-20,-10,2,4,24,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-32,-22,-37,-30,40,-28,-25,6,-25,5,0,-27,-30,-33,-20,-20,-10,11,22,17,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-27,1,16,-28,-19,-4,-18,16,-21,-8,4,-10,19,8,-1,-7,-19,-25,-12,17;
MA   /M: SY='K'; M=-11,10,-27,4,7,-27,-15,-4,-27,35,-29,-13,16,-13,7,26,-5,-7,-23,-25,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-26,-14,-1,-17,-22,-1,-9,6,0,11,-9,-19,17,21,-13,-10,-12,-20,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-28,0,17,-21,-21,-7,-14,6,-12,-9,-3,-11,6,13,-6,-9,-14,-25,-13,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-28,2,20,-23,-16,-6,-22,6,-19,-15,-6,23,6,7,-5,-8,-23,-23,-17,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=4,-14,-17,-17,-10,-9,-16,-15,-5,-9,5,-1,-10,-19,-8,-1,-1,5,-2,-25,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-24,-7,-10,-25,33,-13,-32,-8,-28,-18,3,-17,-9,0,10,-6,-22,-26,-23,-10;
MA   /M: SY='F'; M=6,-20,-17,-27,-18,17,-19,-18,-4,-11,-2,-3,-15,-22,-20,-4,-7,-5,4,-11,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-10,1,-25,3,-6,-22,8,-11,-27,-3,-17,-14,1,-17,-7,6,-1,-2,-18,-25,-17,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,17,-30,28,8,-31,-15,-10,-28,-5,-26,-23,3,24,-5,-13,0,1,-24,-35,-22,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-13,-28,-16,2,-15,-28,-18,10,-4,-2,2,-10,-12,-4,-11,-11,-9,3,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,1,-27,-2,6,-5,-20,5,-16,7,-16,-8,4,-17,8,3,-7,-8,-20,-10,13,6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00360;
//
ID   P53_MP; MATRIX.
AC   MP00348;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   p53 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3928285; R2=0.0132998; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1536; N_SCORE=24.811; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=159; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-33,-11,-3,-26,-14,-19,-18,-9,-26,-17,-15,59,-9,-15,-4,-6,-22,-30,-26,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,8,36,-36,-20,6,-24,10,-20,-8,0,-6,44,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-17,-29,-24,0,-29,-26,24,-23,18,11,-27,-20,-24,-21,-16,-4,29,-26,-8,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-4,-14,-31,62,-18,-40,-18,-30,-21,1,-19,-17,-19,0,-19,-30,-22,-29,-16;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-10,-3,-3,-18,-4,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-11,34,25,-7,-37,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,49,-33,-18,0,-32,8,-22,-22,5,-3,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-21,30,-29,-25,14,-26,-18,-11,-23,-6,-3,-18,-30,-24,-20,-12,-5,-5,-11,4,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,46,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-20,-23,-20,-13,0,-27,21,3,-23,26,13,-16,-27,-10,-13,-23,-13,-4,-23,7,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,24,-30,8,6,-16,15,6,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-4,15,57,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,28,-18,14,1,-21,-1,4,-21,1,-30,-19,44,-17,1,0,16,4,-25,-39,-19,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,61,-30,-5,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,49,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-18,-30,-22,0,-22,-5,22,-12,18,52,-22,-22,-5,-12,-18,-8,17,-22,-2,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,2,-31,-20,-17,-20,-8,-29,-18,-18,81,-4,-17,-9,-10,-30,-29,-28,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-13,-15,-13,-8,-23,-22,0,-13,-5,-5,-3,-12,-12,-13,13,40,5,-28,-8,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-7,14,-18,14,-2,-21,-10,-13,-20,-8,-16,-14,5,-11,-7,-11,10,22,-11,-32,-14,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-25,-3,6,-25,-14,-2,-22,1,-24,-14,-1,9,9,5,9,2,-20,-30,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-18,25,12,-30,-1,-5,-32,-3,-27,-22,11,-12,1,-6,7,-5,-25,-35,-21,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-20,-27,63,-20,-36,-21,-24,-17,-2,-21,-20,-20,-2,-19,-27,-20,-28,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-25,-1,5,-22,-17,4,-11,1,-11,-3,10,-17,18,1,-3,-7,-17,-27,-11,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00301;
//
ID   CTF_NFI_1_MP; MATRIX.
AC   MP00349;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CTF/NF-I DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6169295; R2=0.0107070; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2133; N_SCORE=26.445; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=270; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,60,-32,-22,12,-30,12,5,-20,-28,-35,-22,-20,-10,7,3,23,-30;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00361;
//
ID   MADS_BOX_1_MP; MATRIX.
AC   MP00350;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MADS-box domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2536778; R2=0.0124350; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1181; N_SCORE=18.929; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-21,-22,-12,-6,-16,-2,7,-6,9,39,-14,-18,1,-2,-12,-6,3,-22,-4,-6;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-22,-10,-13,-23,35,-18,-26,-14,-22,-15,-2,-16,-14,-16,5,-5,-17,-22,-23,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,-1,-21,-13,-2,-30,24,-21,-11,1,-19,7,59,-7,-9,-20,-21,-12,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-28,-7,-7,-27,27,-14,-31,-1,-26,-16,-2,-11,-8,1,-1,-13,-23,-23,-23,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-2,7,-27,-19,-8,-29,42,-28,-11,1,-12,9,36,-7,-8,-19,-21,-11,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-25,-29,-21,-6,-32,-22,28,-18,9,12,-17,-21,-10,-14,-13,-6,21,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-27,6,30,-29,-12,-3,-24,5,-21,-14,-2,-3,19,-1,3,-7,-23,-27,-18,24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-26,-33,-26,0,-34,-23,38,-26,21,20,-16,-22,-17,-24,-19,-9,22,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-27,-1,11,-28,-17,-6,-27,30,-25,-10,1,-11,15,25,-2,-5,-20,-23,-12,12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-30,-13,-4,-9,-22,-2,-23,20,-17,-8,-5,-13,3,44,-12,-10,-18,-13,1,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-27,20,41,-28,-17,-3,-27,6,-20,-18,3,-4,13,-2,3,-4,-25,-31,-18,27;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-23,34,6,-26,-3,6,-26,0,-30,-23,46,-17,0,-3,8,-3,-29,-40,-20,3;
MA   /M: SY='K'; M=-1,2,-25,3,6,-27,-14,-9,-24,13,-24,-14,0,1,5,6,1,-3,-18,-26,-16,5;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-18,-13,-8,-14,-20,-14,-6,-2,-9,-4,-3,-15,-2,3,5,15,-2,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-19,6,0,-21,-5,5,-21,3,-26,-16,28,-16,3,6,12,2,-21,-34,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-27,-3,12,-32,-18,12,-18,4,-18,-2,-1,-12,42,4,1,-7,-23,-20,-6,26;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-11,-25,-26,-2,-27,-26,23,-18,8,7,-21,-28,-26,-18,-7,2,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-1,-7,-8,-16,-9,-13,-13,-13,-21,-14,4,-15,-7,-13,23,15,-5,-35,-15,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,49,-29,-10,0,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-19,-2,-5,-14,-7,1,-16,-5,-16,-10,14,-17,-3,-3,5,1,-15,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-19,-30,-20,0,-20,-20,-19,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-34,-24,26,-30,-16,19,-25,26,22,-23,-26,-21,-19,-23,-10,10,-10,11,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,1,12,-30,-20,-10,-30,48,-30,-10,0,-10,10,29,-10,-10,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-20,-10,-20,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,2,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-28,-6,-2,-3,-21,25,-19,5,-15,-6,2,-21,2,11,-10,-11,-20,-9,21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,58,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,22,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-6,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-12,31,18,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-31,-29,31,-22,14,12,-27,-27,-27,-21,-12,0,42,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,92,-26,-26,-18,-27,-28,-26,-26,-18,-18,-16,-33,-26,-26,-4,1,-8,-45,-26,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-30,49,15,-38,3,-3,-38,-2,-29,-26,14,-11,1,-10,0,-12,-30,-35,-21,8;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,3,-19,-12,-18,-6,-21,-11,-13,-12,-11,-9,-14,-12,-19,11,4,1,-26,-20,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,21,33,-31,-17,1,-30,13,-24,-17,6,-7,17,6,0,-8,-27,-30,-17,25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,14,13,-27,-27,-27,-23,-14,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-14,-18,-14,-15,6,-18,-9,-16,-5,-3,-10,-17,-13,-18,3,-4,-3,-24,-18,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-31,-24,6,-31,-24,25,-26,34,16,-29,-29,-24,-21,-22,-6,25,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-34,-26,2,-34,-25,35,-27,26,20,-23,-24,-20,-24,-20,-6,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-35,-29,0,-34,-28,39,-25,17,18,-25,-25,-23,-24,-16,-6,36,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-19,-37,-28,51,-30,-22,10,-28,14,5,-22,-28,-34,-21,-18,-8,11,-3,17,-28;
MA   /M: SY='S'; M=8,5,-14,5,0,-23,4,-10,-23,-9,-29,-20,11,-11,-2,-11,30,12,-14,-37,-21,-1;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-17,1,6,-22,-3,-5,-22,-5,-25,-17,8,-7,0,-6,19,7,-16,-33,-19,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,2,-17,-4,-2,-19,-12,-8,-19,5,-21,-13,7,-12,1,5,14,18,-12,-30,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-3,-15,-28,52,-11,-36,-15,-30,-20,12,-20,-14,-15,2,-15,-30,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-26,-7,2,-21,-20,-7,-21,27,-15,-6,-4,-15,4,23,-10,-6,-14,-21,-8,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-11,-31,-23,10,-29,-21,18,-27,34,18,-28,-30,-22,-20,-24,-8,15,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-27,-17,-15,21,-26,33,-8,-14,-5,-1,-10,-26,-9,-9,-14,-11,-13,6,49,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-24,11,25,-25,-20,0,-21,2,-17,-13,0,-8,11,-3,2,1,-16,-30,-14,18;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-31,-25,54,-29,-4,0,-22,7,0,-20,-29,-26,-16,-19,-9,-4,15,46,-25;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,11,-15,-11,-17,-8,-18,-14,-15,-16,-13,-5,-17,-10,-18,16,7,-4,-33,-20,-11;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-8,-2,-3,-17,-6,-12,-17,-10,-24,-17,10,-11,-3,-10,32,26,-9,-37,-17,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-24,-3,1,-22,-11,-14,-17,-6,-22,-15,-4,19,-6,-9,6,4,-14,-31,-21,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-5,12,-14,12,5,-25,-9,-7,-26,5,-26,-18,12,-12,0,0,10,5,-18,-33,-17,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-27,-20,4,-25,-11,16,-17,21,30,-22,-17,-11,-15,-18,-4,10,-19,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-27,7,19,-27,-14,-4,-24,9,-21,-13,2,-4,11,3,0,-7,-21,-28,-16,14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,7,13,-28,-12,-4,-26,12,-26,-16,8,0,9,9,2,-5,-24,-29,-17,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-19,-27,-21,-3,-29,-21,22,-19,15,15,-19,-21,-14,-18,-10,4,20,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-32,-24,6,-33,-23,27,-23,24,15,-23,-26,-20,-16,-21,-8,21,-19,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-27,28,23,-28,-16,-2,-28,5,-19,-18,7,-10,7,-1,-1,-5,-24,-30,-14,15;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-7,4,-20,-16,-1,-23,15,-18,-9,-1,-16,10,28,-2,-6,-17,-23,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-16,-29,-14,-12,14,-27,13,-3,-10,0,-1,-17,-19,-7,-10,-17,-10,-11,10,48,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-25,4,16,-23,-14,-1,-20,4,-15,-9,6,-11,12,1,0,0,-21,-27,-12,14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-25,-1,2,-24,8,-8,-26,1,-22,-14,7,-14,2,2,2,-2,-22,-26,-18,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00302;
//
ID   TFIID_MP; MATRIX.
AC   MP00351;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transcription factor TFIID repeat signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=83;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=78;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5912061; R2=0.0133453; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1132; N_SCORE=19.688; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=144; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-34,-22,42,-24,20,31,-20,-20,-14,-24,-20,-10,24,-20,0,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-24,14,25,-24,-19,-5,-20,6,-18,-14,1,-4,6,-3,-4,-9,-20,-26,-13,15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-23,-31,-23,6,-30,-24,26,-25,19,12,-22,-14,-20,-23,-18,-8,17,-18,-2,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-7,25,-22,18,3,-23,-6,3,-24,6,-25,-18,31,-16,2,9,4,-4,-24,-32,-17,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-29,-19,9,-29,-19,19,-28,47,20,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-19,0,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-28,24,26,-29,-15,0,-30,11,-24,-19,13,-9,11,10,0,-6,-27,-31,-17,18;
MA   /M: SY='A'; M=1,-2,-22,-3,-4,-21,-4,-12,-15,-4,-11,-8,-2,-14,-2,-7,-1,-3,-11,-25,-15,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-19,-32,-25,2,-30,-26,28,-25,25,14,-25,-25,-22,-23,-18,-6,25,-23,-5,-25;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-6,-14,-10,-10,-7,-11,-2,-9,-4,-4,-7,-12,-9,-13,3,0,5,-18,-11,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-5,-13,-7,-8,-1,-9,-3,2,-9,1,2,-3,-11,-6,-8,-4,-2,-1,-10,3,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-7,-5,-4,-12,4,-9,-9,-5,-9,-7,-2,-6,-5,-9,6,0,-4,-12,-11,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-13,-18,-12,10,-19,-13,8,-16,17,7,-15,-18,-14,-12,-11,-1,7,-14,0,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-21,0,-5,-18,3,-6,-18,-9,-15,-9,0,-15,-6,-9,4,0,-12,-25,-11,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-24,-17,1,-27,3,11,-23,22,12,-19,-25,-14,-17,-19,-10,7,-23,2,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-28,7,28,-28,-17,-2,-26,8,-21,-15,-1,3,14,9,0,-7,-25,-27,-18,20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,12,-19,-2,-12,3,5,-3,-19,-12,-20,-15,27,-23,-14,-9,0,-6,-22,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,6,-18,-15,-14,-14,-21,-4,-16,-11,-8,-7,-18,-14,-19,9,7,5,-31,-17,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-25,12,36,-25,-16,-2,-23,3,-18,-13,2,-5,14,-3,5,-4,-22,-31,-17,25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-28,22,44,-28,-15,2,-28,7,-23,-20,15,-5,15,0,2,-8,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-28,17,50,-29,-18,-2,-29,11,-22,-19,1,-2,17,1,3,-7,-27,-30,-19,34;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-8,-26,-7,3,-23,-23,-4,-7,3,-5,3,-8,-17,20,5,-9,-9,-9,-22,-8,11;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,72,-31,-21,5,-30,11,2,-20,-29,-38,-21,-20,-10,3,7,27,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-36,-8,-1,-28,-17,-17,-19,-9,-28,-19,-11,72,-9,-18,-7,-8,-28,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-10,-18,-28,55,-20,-35,-18,-27,-19,-1,-14,-18,-19,2,-12,-26,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-29,-23,-21,24,-30,13,7,-13,5,7,-20,-28,-11,-12,-20,-10,-4,18,61,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-19,-30,-22,3,-27,-15,23,-21,29,31,-25,-25,-14,-17,-21,-6,17,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-24,7,6,-24,-15,-6,-17,5,-17,-10,5,-14,5,5,-1,-5,-12,-29,-14,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-27,22,28,-31,-15,-3,-29,13,-24,-17,5,-7,13,3,1,-7,-24,-30,-17,20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,8,-28,-20,-5,-29,39,-26,-9,0,-13,15,42,-9,-10,-21,-20,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,0,-26,-24,-6,-26,-26,16,-20,1,3,-19,-25,-22,-21,-2,4,28,-31,-12,-24;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,-10,-24,-23,-5,-24,-26,16,-17,4,3,-21,-23,-23,-18,-1,10,31,-28,-11,-23;
MA   /M: SY='L'; M=5,-23,-16,-28,-20,-1,-23,-22,17,-21,21,12,-22,-23,-18,-20,-13,-2,18,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,24,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-11,-19,-11,-10,-16,-1,-14,-14,-2,-18,-10,-4,-18,-8,1,7,0,-3,-26,-13,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,5,-11,2,-1,-19,-2,-8,-19,-9,-28,-19,15,-11,-1,-9,35,20,-12,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-20,-33,-26,0,-30,-23,32,-22,19,22,-24,-24,-19,-22,-17,-6,29,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-30,-29,0,-29,-27,29,-19,11,15,-29,-29,-27,-19,-11,-1,46,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-26,29,-33,-27,-2,-33,-27,10,-29,13,4,-23,-31,-25,-26,-19,-9,10,-31,-11,-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-10,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-11,-11,0,-10,-9,-10,21,47,-1,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-14,-18,-12,-18,6,-20,-12,-13,-9,-9,-9,-13,-12,-19,7,1,-4,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-5,-4,-7,-6,-16,-12,-15,-13,-8,-16,-10,-3,-16,-8,-8,13,13,-2,-34,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-29,1,23,-25,-21,-7,-22,13,-19,-13,-5,3,7,12,-5,-7,-19,-26,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,16,-28,23,33,-31,-16,-2,-30,12,-23,-19,6,-6,12,2,1,-7,-26,-30,-18,22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-29,48,29,-34,-13,0,-34,2,-26,-25,12,-8,5,-7,1,-9,-28,-34,-17,17;
MA   /M: SY='V'; M=7,-19,0,-24,-19,-11,-21,-24,7,-20,-3,-2,-15,-17,-17,-21,0,1,12,-30,-14,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-6,-29,-7,1,-6,-22,12,-11,-3,-12,-5,-3,-19,0,-2,-11,-11,-16,-1,16,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-26,4,16,-21,-18,-5,-17,5,-9,-4,-4,-12,7,5,-6,-7,-16,-26,-12,11;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-11,-17,-12,-22,15,-20,-18,-13,-16,-13,-7,-13,-12,-20,9,-3,-8,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-27,-3,-31,-26,17,-28,-23,11,-24,15,6,-25,-29,-27,-21,-16,-6,17,-18,2,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-13,3,-30,6,20,-27,-15,-5,-28,23,-23,-13,2,-11,11,23,-6,-10,-23,-24,-14,14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-27,-7,-1,-21,-20,-11,-10,19,-17,-5,4,-15,2,11,-8,-7,-9,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-28,3,-36,-25,37,-26,18,15,-23,-24,-21,-25,-18,-6,29,-19,3,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-16,-21,-20,-13,9,-19,-7,-7,-6,-2,-3,-13,-21,-11,-5,-8,-6,-6,-4,17,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,1,-30,6,9,-28,-15,-9,-27,12,-26,-16,-1,14,3,8,-4,-6,-24,-27,-18,4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-8,-26,-8,1,-17,-26,-15,3,-1,-6,0,-8,-14,1,-6,-8,-5,2,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,10,-33,-23,27,-30,40,19,-27,-27,-21,-23,-27,-10,15,-19,1,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-26,7,10,-26,-17,-6,-23,16,-19,-11,1,-12,10,13,-2,-4,-18,-26,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,4,19,-25,-14,-7,-19,11,-20,-12,4,-9,7,2,0,-6,-18,-27,-16,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-20,-29,-23,22,-28,-15,14,-23,23,11,-22,-28,-22,-18,-20,-8,11,-10,13,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-27,-1,-4,-27,22,-12,-33,0,-26,-17,2,-16,-5,5,1,-7,-24,-24,-21,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-19,-17,-6,-5,-26,-17,-2,2,6,2,-15,-20,-8,-2,-17,-9,-2,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-6,-25,-4,-3,-14,-24,-13,-1,-7,1,0,-9,-14,-7,-7,-11,-6,-1,-27,-9,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-17,-12,-8,-7,-23,-11,1,-8,-2,-1,-13,-22,-9,-9,-8,-5,7,-20,1,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-25,-2,8,-19,-17,-9,-15,7,-16,-9,-5,-2,3,-1,-3,-2,-13,-20,-8,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-10,-17,-12,-5,12,-14,-14,-8,-16,-7,-8,-7,-17,-14,-15,-2,-5,-6,-16,-1,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,5,3,8,-19,-17,-9,-20,-4,-14,-14,3,-15,-3,-8,-1,-1,-16,-32,-17,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-26,14,13,-28,-9,-1,-22,1,-23,-15,10,8,12,-4,0,-7,-26,-27,-17,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-16,-19,-17,-8,19,-14,-13,-6,-15,0,-4,-13,0,-16,-13,-11,-8,-8,-7,2,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-29,-3,16,-23,-24,-12,-12,18,-15,-7,-6,-10,5,6,-9,-9,-10,-24,-11,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-29,-8,14,-16,-26,-15,-2,-2,-7,-5,-12,-12,0,-9,-10,-10,-4,-12,-9,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-20,-4,2,-28,-16,10,-22,36,12,-24,-24,-12,-16,-24,-10,2,-22,-4,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00303;
//
ID   COLD_SHOCK_MP; MATRIX.
AC   MP00352;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   'Cold-shock' domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0415206; R2=0.0146301; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=603; N_SCORE=13.853; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-5,0,-21,-18,-10,-21,10,-20,-9,-2,2,2,15,1,6,-15,-26,-14,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-4,-23,-9,-5,-16,-17,-3,-7,9,-8,12,0,-18,5,10,-8,-7,-6,-24,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-16,-21,-21,-11,-2,-22,-11,7,-10,6,14,-14,-18,-6,-10,-11,-7,5,-18,-2,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-18,-10,-5,-15,-20,-13,-9,1,-8,-4,-3,-15,0,0,3,14,-4,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-19,-18,-14,-6,-26,-17,4,-7,-2,0,-10,-17,-10,-9,0,16,7,-21,0,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,2,-30,-30,-2,-30,-30,25,-21,7,7,-29,-31,-30,-21,-10,-1,45,-32,-12,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-28,-2,8,-29,-18,-11,-28,45,-28,-10,-1,-10,8,26,-8,-9,-18,-20,-11,8;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-28,-32,-31,-23,2,-20,-26,-18,-17,-18,-17,-28,-25,-15,-17,-23,-9,-22,91,16,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-38,-29,72,-30,-18,2,-29,13,2,-21,-30,-37,-20,-21,-10,0,8,29,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,33,-13,24,3,-22,-3,4,-23,-2,-27,-20,39,-16,-1,-4,9,-1,-25,-37,-19,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=4,-1,-12,-3,-3,-19,-6,-10,-16,-2,-17,-12,2,-12,-5,0,4,-1,-9,-27,-17,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-24,6,17,-27,-15,-7,-26,16,-23,-15,2,-8,9,9,4,0,-19,-27,-15,12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,7,-26,8,9,-29,-14,-7,-28,30,-30,-14,7,-11,9,16,2,-4,-20,-27,-13,9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,60,-16,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-21,-24,-27,-20,45,-28,0,-7,-13,0,-1,-14,-26,-23,-9,-18,-11,-8,6,33,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,21,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,4,-13,-1,8,-18,-17,-11,-15,-5,-15,-13,5,-10,0,-8,11,19,-11,-31,-15,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-31,-10,-1,-25,-19,-14,-16,-2,-21,-12,-13,37,1,-2,-5,-3,-19,-27,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=1,15,-23,20,23,-28,-10,-5,-26,0,-23,-20,8,-6,6,-7,9,-2,-21,-33,-20,14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,34,-26,39,7,-32,6,-2,-33,-4,-29,-25,26,-14,-3,-9,4,-8,-29,-36,-22,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-27,-7,-12,-26,43,-7,-33,-16,-26,-17,2,-18,-13,-15,3,-11,-25,-24,-22,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-22,6,-2,-24,13,-8,-28,2,-24,-16,6,-13,-3,5,4,-6,-20,-23,-17,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-27,6,14,-27,-13,-9,-22,14,-22,-13,2,-2,5,3,-3,-7,-19,-25,-16,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,63,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-34,-23,62,-29,-16,-3,-24,6,0,-17,-27,-25,-16,-17,-10,-4,6,24,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-11,-30,-27,6,-27,-27,22,-21,12,8,-27,-28,-28,-20,-11,-2,36,-25,-7,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-25,-27,-18,23,-29,-9,5,-14,2,3,-17,-24,-12,-11,-15,-9,2,1,22,-15;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-12,-2,-1,-19,-5,-11,-19,-6,-26,-18,8,-10,-1,-5,33,22,-9,-37,-18,-1;
MA   /M: SY='A'; M=27,1,-15,-3,3,-23,-4,-14,-16,-6,-15,-14,-3,-9,-5,-15,9,0,-8,-26,-20,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-19,-38,-29,10,-36,-28,36,-29,17,14,-22,-24,-24,-27,-19,-9,26,-19,1,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,7,-25,7,16,-28,-16,-1,-21,8,-21,-11,7,-11,20,7,4,-2,-20,-28,-15,17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-23,-11,-8,-22,11,-13,-19,-5,-17,-6,-3,-11,-4,-7,2,-4,-15,-24,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-25,24,18,-28,-10,4,-28,3,-23,-19,16,-11,5,2,2,-5,-25,-32,-17,11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-24,6,-5,-25,35,-10,-30,-10,-24,-18,9,-14,-9,-12,1,-12,-25,-21,-22,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-21,-19,-25,-19,27,-23,-13,1,-19,4,0,-18,-12,-22,-16,-12,-5,1,-3,15,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,1,-30,4,12,-22,-20,3,-28,25,-22,-12,0,-14,8,28,-8,-10,-22,-19,-3,8;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,-14,-6,0,-17,-12,-15,-13,-3,-18,-12,-1,-12,-4,-7,17,17,-2,-32,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-28,-19,10,-30,-18,16,-27,36,14,-28,-19,-19,-20,-27,-10,6,-17,4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-24,-1,11,-18,-21,-11,-8,-1,-7,-6,-5,-13,2,-6,-5,-4,-7,-26,-12,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-27,6,30,-24,-19,-7,-22,4,-14,-14,-5,2,8,2,-3,-6,-21,-27,-17,18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-27,-6,-14,-28,55,-16,-36,-16,-30,-20,6,-18,-15,-17,5,-14,-28,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-27,6,10,-28,-21,-2,-12,-1,-10,-3,-3,-14,25,-3,-5,-9,-15,-25,-11,17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-2,7,-23,-9,-6,-23,14,-19,-7,-1,-13,6,16,-3,-7,-17,-23,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-12,-20,-25,-4,-28,-27,23,-18,6,6,-25,-28,-27,-19,-9,-1,42,-31,-11,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-20,5,25,-20,-20,-10,-20,0,-15,-15,0,-5,5,-5,10,20,-15,-30,-15,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00304;
//
ID   HMG_BOX_1_MP; MATRIX.
AC   MP00353;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HMG box A DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1048760; R2=0.0120682; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1434; N_SCORE=21.401; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=199; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=17,0,-17,0,18,-24,-7,-10,-20,-3,-19,-16,-1,-6,4,-10,15,2,-14,-29,-20,11;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-24,-2,-11,-13,-14,-4,5,-11,-12,-6,31,-20,-7,-11,-1,-4,-8,-33,-13,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,-11,-10,-11,-11,-13,-11,-17,-2,-14,-16,-9,-4,-17,-11,-14,22,13,12,-36,-16,-11;
MA   /M: SY='D'; M=13,14,-17,18,4,-27,-4,-10,-24,-6,-23,-20,7,-10,-4,-14,15,2,-14,-33,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-9,-30,38,-16,-36,5,-30,-16,0,-16,-9,-2,-4,-16,-26,-20,-23,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,6,-30,13,38,-26,-20,36,-30,3,-20,-13,4,-7,16,0,-4,-14,-30,-30,-6,26;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,7,28,-30,-20,-6,-30,36,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-23,-10,-6,-26,13,-16,-26,9,-23,-13,-4,-13,-6,-2,0,-9,-16,-20,-19,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00305;
//
ID   HMGI_Y_MP; MATRIX.
AC   MP00354;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain (A+T-hook).
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6310115; R2=0.0112382; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=399; N_SCORE=9.105; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-25,3,16,-26,-13,-10,-24,4,-28,-18,-1,15,4,-3,11,1,-21,-32,-21,9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-29,-5,1,-21,-19,-11,-17,17,-15,-7,-2,3,-1,7,-11,-9,-17,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-26,8,-2,-21,-16,-9,-13,-2,-19,-13,13,2,-5,-7,0,2,-15,-32,-16,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-26,9,3,-29,0,-11,-29,6,-30,-19,3,4,-2,-3,7,-3,-22,-30,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-33,-4,4,-31,18,-12,-30,-8,-27,-17,-5,15,1,-12,-3,-14,-30,-24,-26,1;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-21,-4,12,-7,-17,-11,-19,3,-15,-13,-3,-10,-1,-3,3,2,-14,-22,-9,6;
MA   /M: SY='P'; M=7,-2,-23,-7,-3,-23,-12,-14,-17,-2,-22,-15,1,20,-6,-10,3,3,-17,-28,-21,-6;
MA   /M: SY='K'; M=1,1,-22,3,-3,-25,0,-14,-21,4,-22,-14,-1,-14,-6,-4,4,-4,-9,-28,-18,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-7,-15,-11,-10,-8,-16,-1,-9,-4,-4,-9,-11,-11,-13,6,8,8,-18,-12,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,3,-23,4,3,-26,-15,-12,-21,3,-20,-14,-1,6,2,-5,4,7,-16,-27,-16,2;
MA   /M: SY='R'; M=3,2,-19,-2,0,-21,-7,-6,-22,9,-24,-15,11,-14,2,15,12,2,-15,-29,-16,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-31,-5,4,-28,-17,-15,-24,12,-30,-16,-8,37,-1,0,-2,-5,-23,-28,-21,-1;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-13,-10,-1,-17,-11,-16,-6,-9,-13,-10,-7,-13,-7,-14,12,4,5,-30,-17,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-28,0,17,-26,-20,-10,-20,-2,-21,-14,-6,25,9,-7,2,5,-22,-29,-19,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=12,-15,-15,-19,-15,-13,-18,-23,1,-13,-7,-5,-15,0,-16,-17,3,11,11,-27,-16,-16;
MA   /M: SY='T'; M=10,0,-15,-4,-7,-14,-14,-17,-10,-12,-3,-8,-5,-13,-10,-14,6,17,-3,-27,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-20,-15,-9,-22,-1,-20,-16,-11,-17,-14,-10,15,-11,-18,5,3,-11,-24,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-2,-28,1,-6,-13,31,-15,-32,-15,-22,-18,0,-18,-16,-16,-3,-16,-25,-19,-17,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-35,-10,-9,-30,23,-20,-29,-15,-30,-20,-11,38,-15,-20,-5,-15,-30,-25,-30,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-7,3,-25,-23,-13,-17,37,-22,-5,-3,-12,5,20,-12,-10,-12,-20,-8,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-19,-17,-11,-4,-18,-16,-1,-6,2,0,-15,-19,-10,-7,-9,-4,2,-2,-3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-29,1,18,-27,-17,-7,-19,0,-21,-14,-9,38,10,-7,-4,-8,-25,-24,-20,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=1,-11,-19,-16,-8,-4,-20,-16,-8,3,-10,-4,-10,-16,-5,-2,-3,2,0,-18,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-25,7,18,-29,0,0,-26,1,-25,-15,11,-11,18,-2,8,-5,-27,-29,-19,18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-21,-11,4,-9,-24,-13,-5,-6,7,-1,-13,-17,-4,1,-9,1,-2,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-23,0,26,-19,-20,-10,-12,-3,-4,-9,-10,-10,3,-9,-4,-7,-10,-27,-16,15;
MA   /M: SY='D'; M=-15,17,-30,27,27,-34,-17,3,-31,10,-23,-17,7,-9,22,10,-2,-10,-28,-29,-16,24;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-25,-7,-2,-24,5,-11,-22,4,-17,-8,-3,-16,5,0,-1,-8,-18,-23,-15,1;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-22,-21,-14,-10,-27,-18,11,-1,0,12,-13,-17,-9,-6,-9,1,11,-23,-6,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-24,-12,-7,-6,-16,-17,-15,-13,-20,-15,-9,28,-12,-16,6,8,-15,-26,-14,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-1,-18,-5,-4,-21,2,-6,-12,-5,-15,-6,4,-15,7,-6,1,-6,-10,-22,-14,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-19,5,21,-25,-10,-1,-19,2,-20,-12,3,-6,21,-1,13,1,-19,-26,-14,21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-22,7,25,-23,-12,-6,-21,0,-21,-17,-1,12,7,-6,9,-1,-20,-28,-18,15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,5,-20,1,2,-21,3,-7,-24,-1,-24,-17,12,-14,-1,4,13,7,-19,-31,-19,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00306;
//
ID   HMG14_17_MP; MATRIX.
AC   MP00355;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HMG14 and HMG17 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6352358; R2=0.0089225; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=904; N_SCORE=11.700; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=322; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-16,-24,-22,-20,-11,14,-8,-3,-14,1,30,-12,-20,-8,-14,-12,-14,-5,-20,-11,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=13,-16,-29,-14,-4,-26,-12,-20,-16,-10,-22,-16,-16,52,-10,-20,-2,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10,-5,-23,4,-5,-33,16,-23,-13,0,-20,2,46,-7,-13,-23,-20,-15,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-13,14,-30,19,13,-33,-17,-7,-33,36,-30,-15,5,-10,7,19,-7,-10,-23,-25,-13,10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-15,-10,-2,-23,-5,-15,-18,6,-20,-12,-2,-10,-2,-4,12,2,-8,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-10,-17,-10,-17,-5,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,14,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-25,-7,-9,-25,23,-17,-30,1,-25,-15,0,-15,-9,-4,2,0,-20,-22,-20,-9;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-18,-23,-17,-7,-25,-17,12,0,3,19,-20,-22,-12,-5,-13,-5,22,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-26,-5,-2,-25,6,-10,-30,15,-27,-15,2,-15,1,21,3,-6,-20,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-30,36,20,-40,-15,5,-30,5,-25,-16,10,-10,29,0,0,-10,-30,-30,-15,24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=5,-2,-25,-5,8,-30,-15,-7,-22,24,-22,-7,-2,-10,19,12,-2,-8,-18,-20,-12,13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-12,-25,-17,-7,-13,-20,-3,-6,16,-3,24,-10,-17,5,21,-15,-10,-6,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-34,-16,-6,-19,-23,-20,-9,-16,-8,-9,-23,57,-13,-20,-16,-10,-19,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='V'; M=14,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,19,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,36,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-18,-19,-14,8,-20,-18,3,-14,-3,-3,-18,10,-19,-15,-10,-5,6,-14,-5,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-20,-5,0,-20,-20,-15,-20,21,-20,-10,0,-10,0,11,4,19,-10,-25,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-25,10,43,-28,-15,-5,-25,5,-18,-18,-2,-2,13,-5,2,-8,-23,-28,-20,28;
MA   /M: SY='A'; M=8,-22,-20,-22,-15,-11,-20,-23,5,-17,2,-1,-22,7,-18,-20,-9,-5,8,-25,-16,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-10,-17,-10,-17,-6,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,14,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='S'; M=14,-8,-18,-8,-2,-23,-5,-15,-18,-10,-25,-18,-3,17,-5,-15,19,7,-13,-32,-23,-5;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-12,-7,-18,-4,-17,-13,-10,-16,-13,-2,-10,-7,-15,20,16,-3,-28,-18,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00307;
//
ID   HTH_LACI_1_MP; MATRIX.
AC   MP00356;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   LacI-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0363259; R2=0.0126423; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; N_SCORE=7.360; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-21,-28,-20,-1,-20,-2,20,-11,17,53,-16,-20,-1,-11,-18,-9,9,-21,-1,-11;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='A'; M=9,-3,-18,-6,-2,-20,-13,-13,-14,8,-16,-9,-3,-10,-2,1,2,2,-6,-23,-13,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='I'; M=3,-10,-10,-12,-9,-5,-12,-12,6,-9,0,0,-8,0,-8,-10,-2,2,6,-13,-6,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-15,-7,-7,-14,-17,-16,-13,-3,-16,-11,3,-7,-7,-3,14,31,-5,-30,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-35,-25,4,-34,-23,35,-28,31,25,-24,-24,-18,-24,-24,-10,20,-20,0,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-26,-3,2,-18,-20,-3,-19,20,-18,-7,-4,-15,5,12,-7,-6,-14,-16,1,3;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-28,2,16,-24,-18,-5,-25,21,-19,-12,0,-12,9,27,-6,-8,-20,-24,-13,11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-15,-21,-16,-4,-11,-21,-10,-4,-3,7,3,-14,-19,-2,0,-13,-9,-5,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-10,-18,-10,-19,-1,-19,-9,-10,-11,-10,-9,-11,-10,-19,12,2,1,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-29,-2,-12,-30,49,-14,-36,-11,-29,-19,6,-18,-12,-12,0,-16,-29,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-11,-1,-2,-20,2,-11,-20,-10,-29,-19,9,-10,-2,-10,37,20,-10,-38,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-9,-23,-12,-3,-17,-22,-13,-7,11,-11,0,-9,-12,0,5,-6,0,-2,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-13,-12,-7,-17,-7,-14,-11,-10,-14,-6,-3,-6,-5,-14,17,13,-4,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-10,-11,-10,-11,-19,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,47,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-11,-29,-27,-1,-27,-28,25,-20,11,9,-28,-28,-27,-20,-9,-1,42,-28,-10,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-13,-2,-2,-19,-4,-3,-17,-11,-26,-16,8,-11,0,-10,33,16,-9,-38,-16,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-11,-2,-17,-20,9,-25,18,-15,-7,-2,-20,8,48,-10,-10,-18,-19,-3,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-15,-31,-29,18,-30,-24,22,-22,9,7,-25,-29,-29,-20,-13,-3,32,-17,5,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-5,-33,-25,2,-33,-25,25,-29,28,15,-25,-28,-21,-24,-23,-9,17,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-22,10,-1,-21,1,7,-22,2,-27,-16,39,-19,3,7,7,-3,-27,-34,-18,1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-24,4,-4,-24,14,-2,-28,0,-27,-16,16,-17,-4,-2,5,-4,-24,-28,-16,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,3,-26,1,2,-22,-13,0,-22,7,-20,-12,7,-4,1,10,-1,-3,-19,-28,-13,0;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-4,-29,0,0,-22,1,-11,-25,-4,-23,-17,-4,1,-5,-4,-2,-8,-22,-15,-13,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,0,-15,-5,-7,-6,-14,-4,-17,2,-16,-10,5,-19,-5,1,-3,-2,-14,-19,1,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-18,-23,-16,-5,-27,-19,15,-14,9,7,-22,-24,-13,-14,-11,-4,22,-24,-5,-15;
MA   /M: SY='S'; M=5,-7,-17,-10,-7,-15,-7,-10,-12,-5,-15,-8,-1,-16,-5,-4,11,4,-5,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,2,12,-24,-18,-6,-18,7,-15,-9,-4,-8,10,8,-2,-6,-14,-26,-14,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-21,-3,10,-20,-16,-10,-11,-1,-13,-6,-3,-9,1,-6,4,1,-7,-28,-15,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-16,-6,-4,-13,-18,-15,-9,-9,-7,-8,-1,-11,-6,-10,9,21,-5,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-27,-2,8,-20,-15,-6,-24,15,-19,-11,-1,-14,7,24,-5,-7,-19,-22,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-27,13,18,-28,-14,-6,-27,17,-23,-15,4,-9,9,6,-1,-4,-21,-27,-15,14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-25,-10,-2,-17,-20,-3,-18,17,-10,-4,-5,-17,1,22,-9,-4,-12,-22,-7,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-17,-21,-20,-9,-19,-19,11,-10,-1,3,-18,-24,-18,-11,-8,-5,24,-27,-11,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00366;
//
ID   HISTONE_H2B_MP; MATRIX.
AC   MP00357;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histone H2B signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5246129; R2=0.0133149; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1235; N_SCORE=20.959; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=149; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-22,-4,2,-22,-14,-8,-25,20,-25,-13,3,-13,5,25,8,6,-15,-27,-13,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-10,-20,-16,-12,-13,-23,2,-13,-5,-4,-13,-16,-16,-18,7,10,15,-26,-15,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-26,-9,-2,-19,-17,11,-25,14,-17,-8,1,-19,6,40,-3,-7,-17,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-23,-15,-17,16,-21,5,-1,-11,-5,-4,-5,-26,-13,-11,-10,-6,-5,3,36,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-12,23,-23,9,-4,-11,-8,21,-17,-3,-23,-14,37,-21,-1,-2,4,-3,-25,-26,3,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,11,-31,-20,-1,-28,39,-27,-8,0,-11,19,26,-8,-10,-22,-20,-9,15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-18,-7,-3,-18,-9,-11,-17,-4,-18,-13,0,-5,-2,3,16,7,-11,-32,-17,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-15,-6,-9,-18,8,-16,-20,-12,-22,-16,4,-12,-9,-12,23,23,-10,-31,-18,-9;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-6,-4,-18,-4,-14,-16,-10,-22,-16,4,-10,-4,-12,30,21,-6,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,21,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,4,27,-38,-20,8,-22,10,-20,-4,0,-8,53,8,0,-10,-30,-22,-12,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-10,-17,-9,-19,-1,-19,-10,-10,-13,-11,-7,-11,-9,-18,15,4,0,-24,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-11,-27,-26,-2,-29,-28,24,-19,7,7,-24,-26,-26,-19,-5,9,40,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-29,-19,9,-29,-20,19,-29,47,19,-29,-29,-19,-20,-28,-9,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-26,35,-26,25,18,-26,-26,-22,-24,-19,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-8,2,-30,-20,-18,-22,1,-30,-18,-16,72,-6,-11,-10,-10,-28,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-29,-11,-17,-29,52,-20,-34,-18,-28,-19,-3,-6,-18,-20,0,-17,-27,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,35,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,0,-12,-10,-7,-20,0,-13,-13,-8,-16,-13,5,-12,-7,-15,14,2,-7,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-32,-28,0,-30,-23,32,-20,14,23,-26,-26,-21,-20,-14,-4,37,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-5,-3,-20,-1,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-12,32,17,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-14,-8,-4,-16,-20,-14,-12,-6,-12,-8,0,-10,3,-6,16,39,-6,-28,-10,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-26,0,8,-28,-16,-10,-28,39,-30,-12,2,-10,8,23,-1,-4,-18,-24,-12,8;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-14,-6,-4,-16,-15,-16,-16,1,-18,-12,2,-10,-4,-3,19,32,-6,-30,-12,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-13,3,-29,0,6,-26,-18,6,-29,34,-27,-10,8,-14,9,31,-8,-10,-22,-23,-8,6;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-18,-19,-24,-18,24,-18,-7,-5,-16,-3,-5,-14,-22,-18,-16,-4,-4,-4,1,25,-18;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,1,-7,-3,-21,-13,-12,-18,-9,-21,-13,2,-13,4,-9,21,21,-11,-34,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-16,-4,-4,-21,9,-11,-24,-7,-28,-18,6,-13,-3,-3,26,11,-14,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-16,0,3,-25,-1,-5,-21,-5,-27,-15,9,-11,13,-6,26,9,-17,-33,-18,8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-28,-6,1,-26,-12,-16,-23,15,-26,-14,-6,18,-2,3,-3,-1,-19,-24,-18,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,9,-18,0,-1,-19,-16,-8,-17,5,-19,-11,13,-12,4,1,10,22,-14,-29,-12,2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00308;
//
ID   RIBOSOMAL_L5_MP; MATRIX.
AC   MP00358;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L5 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4610052; R2=0.0153181; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=130; N_SCORE=7.442; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-15,14,20,-28,-1,-9,-29,-4,-22,-20,1,-11,0,-10,0,-10,-22,-32,-22,10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-13,-20,-14,-15,-11,-18,0,-13,-7,-5,-14,-10,-14,-19,4,0,10,-24,-15,-14;
MA   /M: SY='A'; M=7,-13,-14,-17,-16,-17,7,-21,-10,-13,-13,-8,-9,-19,-15,-15,2,-3,0,-26,-18,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-25,3,19,-27,-10,-2,-23,7,-21,-12,3,-9,16,3,3,-4,-22,-26,-15,17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,26,-22,28,6,-28,-2,-3,-28,-4,-29,-23,23,-7,-2,-9,12,0,-24,-38,-21,2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-23,-6,-6,-24,13,-13,-24,-1,-25,-14,1,-10,-5,-3,7,-3,-17,-26,-20,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,11,-29,13,15,-30,-16,-5,-30,32,-28,-14,8,-10,10,18,-5,-9,-23,-26,-13,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-16,-24,-19,-12,-6,-22,-12,-1,-1,-3,0,-11,-20,-9,4,-11,-8,2,-20,-5,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-21,-30,-20,6,-28,-17,20,-26,35,19,-25,-24,-18,-20,-24,-9,11,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-25,15,25,-28,-17,-4,-24,8,-20,-15,3,-8,13,0,2,-1,-20,-29,-16,19;
MA   /M: SY='N'; M=-1,4,-21,-2,-2,-20,-8,-3,-17,3,-20,-12,11,-15,-1,5,6,1,-14,-29,-14,-3;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-11,-19,-13,-16,-4,-18,-6,-13,-8,-7,-10,-13,-12,-19,7,0,3,-24,-17,-13;
MA   /M: SY='L'; M=5,-16,-19,-19,-9,-7,-20,-14,4,-10,6,3,-16,-19,-9,-13,-7,-4,6,-20,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-23,5,9,-24,-12,-7,-20,8,-18,-12,3,-12,5,1,1,-4,-16,-27,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-24,14,15,-21,-19,-10,-13,-6,-9,-11,-3,-12,-2,-11,-3,-5,-8,-31,-15,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-22,6,-29,-18,24,-26,38,28,-27,-27,-16,-19,-26,-10,14,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-22,0,16,-23,-12,-5,-20,3,-18,-12,0,-9,8,-2,7,3,-16,-27,-14,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-8,-23,-10,2,-15,-21,-11,-3,-4,1,2,-8,-15,3,-6,-7,-4,-5,-24,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-27,3,-36,-27,40,-29,27,20,-23,-23,-20,-26,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='T'; M=15,-5,1,-12,-9,-16,-10,-18,-14,-12,-16,-13,-2,-13,-9,-14,20,22,-3,-32,-17,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-8,-16,-30,65,-19,-39,-18,-29,-20,0,-19,-18,-19,0,-19,-30,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-29,-1,18,-38,-20,8,-18,9,-19,0,-1,-11,56,9,0,-10,-27,-20,-10,37;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-28,-1,10,-27,-19,-5,-27,36,-26,-9,0,-11,10,25,-6,-6,-19,-21,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=2,-19,-31,-15,-7,-20,-12,-21,-16,-12,-22,-15,-17,51,-14,-20,-6,-8,-18,-25,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-16,-32,-28,0,-31,-29,32,-23,15,13,-27,-27,-26,-22,-14,-3,40,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-23,-25,-17,-2,-28,-17,13,-10,5,6,-17,-22,-11,-6,-12,-5,13,-19,0,-16;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-2,-10,-10,-12,-18,-19,-12,-11,-13,-12,0,-12,-10,-11,21,43,-2,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-11,-2,-12,-23,-4,-19,23,-14,-5,-5,-18,2,31,-12,-9,-13,-15,1,-2;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-15,-8,-20,1,-17,-13,-10,-16,-13,-5,-10,-8,-17,18,5,-3,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-5,-30,41,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-27,-6,-1,-20,-14,-6,-18,21,-19,-5,0,-16,4,16,-8,-8,-14,-19,-5,1;
MA   /M: SY='S'; M=17,-3,-10,-8,-5,-17,-5,-15,-15,-10,-20,-15,2,-10,-5,-13,27,23,-5,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-23,-29,-24,-2,-32,-25,33,-23,13,12,-15,-22,-19,-23,-13,-3,26,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-18,-14,-7,-22,0,-16,-18,-3,-18,-13,-6,-2,-6,-4,7,-2,-10,-23,-20,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=5,2,-19,-3,-5,-22,17,-12,-24,-10,-23,-17,9,-14,-8,-12,13,5,-17,-29,-21,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,79,-30,-19,0,-30,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,10,31,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-29,-2,2,-29,2,-11,-32,28,-29,-13,1,-13,2,20,-6,-11,-22,-21,-15,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-27,8,-35,-26,35,-28,27,18,-24,-25,-22,-25,-22,-9,24,-19,1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-29,-7,1,-21,-19,0,-29,30,-22,-11,4,-19,9,62,-9,-9,-21,-21,-11,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-28,9,28,-29,-18,-3,-28,22,-23,-14,1,-7,16,16,-3,-9,-24,-25,-15,21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-26,4,-6,-27,31,-9,-31,-4,-28,-18,15,-17,-7,-7,1,-12,-27,-25,-22,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-11,-25,-14,1,-7,-20,-2,-3,-6,0,14,-12,-16,7,-7,-11,-9,-9,-11,0,4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-32,-11,-2,-25,-17,-19,-15,-5,-22,-14,-16,50,-9,-14,-7,-6,-18,-27,-24,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-37,-28,1,-36,-27,42,-27,22,21,-23,-23,-20,-26,-19,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-27,-9,-17,-28,57,-18,-35,-17,-28,-19,3,-19,-17,-19,2,-16,-26,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='C'; M=1,-21,30,-27,-23,-12,-25,-24,1,-21,-2,-1,-20,-28,-19,-22,-8,-5,11,-33,-16,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00309;
//
ID   RIBOSOMAL_L11_MP; MATRIX.
AC   MP00359;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L11 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1218791; R2=0.0140304; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=241; N_SCORE=8.493; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-12,-21,-17,-8,-11,-24,-11,3,-5,-1,7,-10,-16,1,-6,-5,5,0,-20,-2,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-4,6,-26,-20,-9,-24,43,-24,-2,-2,-11,9,27,-11,-10,-17,-20,-9,7;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-22,-21,-11,-2,-22,-8,3,-6,10,17,-14,-21,-5,0,-14,-7,0,-21,-3,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-29,-1,3,-24,-18,-12,-16,-3,-21,-14,-8,27,-4,-11,-4,-7,-16,-29,-19,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-29,51,16,-37,-10,-1,-37,5,-28,-25,15,-11,3,0,-1,-10,-27,-35,-18,9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-18,-25,-17,3,-23,-14,13,-22,28,23,-20,-24,-12,-16,-15,-4,7,-23,-3,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-9,11,-19,0,-8,-8,-12,-4,-8,-10,-7,-7,21,-20,-8,-8,1,6,-13,-30,-9,-8;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,0,-15,-12,-18,0,-20,-15,-13,-15,-13,-6,-15,-12,-18,13,9,-4,-28,-20,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-23,1,-2,-15,-12,-2,-17,7,-19,-11,10,-17,-1,4,1,-1,-15,-21,-1,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-22,29,10,-26,-10,-4,-26,-2,-23,-21,17,-11,0,-6,10,6,-20,-36,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-27,-17,2,-31,-20,22,-22,26,14,-22,-24,-16,-18,-19,-6,15,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-26,18,30,-27,-15,-5,-28,10,-24,-19,5,-5,9,1,5,-4,-23,-31,-17,19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-1,-16,-7,-5,-22,9,-11,-20,-7,-21,-15,6,-13,-5,-11,14,1,-13,-27,-20,-5;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-12,-21,-13,-16,-7,-20,-3,-11,-6,-5,-11,-12,-11,-18,7,5,5,-22,-16,-12;
MA   /M: SY='M'; M=1,-19,-16,-24,-17,-4,-21,-16,13,-14,7,17,-17,-20,-12,-14,-6,0,16,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-30,-3,6,-26,-19,-6,-30,41,-26,-10,2,-14,10,44,-9,-10,-20,-21,-10,6;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-23,-12,4,-13,-23,-12,5,-10,-2,7,-8,-12,-1,-12,-2,1,1,-27,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-29,40,-25,17,16,-24,-24,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='A'; M=7,-13,-17,-15,1,-12,-18,-16,-1,-12,6,1,-15,-16,-7,-15,-8,-7,0,-24,-12,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,18,-22,-14,-20,-7,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-17,-14,-22,6,-2,-2,-27,-22,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-24,-9,-1,-20,-18,-5,-21,20,-18,-7,-2,-17,5,31,-7,-6,-12,-22,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=5,8,-13,4,1,-21,-1,-5,-20,-7,-29,-19,19,-12,4,-7,32,14,-15,-39,-19,3;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-20,-31,-23,1,-25,-10,26,-16,21,45,-22,-22,-8,-15,-19,-9,18,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-1,-34,-28,0,-34,-28,26,-27,19,12,-25,-28,-24,-25,-18,-7,25,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-5,3,-20,1,8,-19,-17,-11,-15,1,-15,-12,3,-11,0,-2,7,12,-10,-30,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-22,21,24,-24,-14,-4,-21,2,-17,-16,4,-7,5,-5,2,-4,-16,-28,-16,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-29,11,-6,-28,34,-13,-36,-12,-27,-21,6,-15,-13,-15,0,-14,-27,-26,-24,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-25,-5,3,-21,-19,-9,-15,18,-17,-5,-2,-12,3,12,-7,-6,-9,-22,-11,2;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-16,26,6,-27,-12,4,-26,-3,-24,-19,17,-13,-2,-8,3,-4,-22,-37,-16,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-34,-8,0,-27,-15,-15,-18,-10,-24,-17,-16,62,-9,-18,-8,-9,-25,-27,-25,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-6,1,-19,-19,9,-21,20,-19,-6,-2,-15,4,21,-7,-8,-13,-22,-4,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-27,28,28,-27,-17,-3,-26,3,-20,-19,4,-6,5,-5,0,-4,-21,-30,-14,16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-19,-27,-21,8,-27,-22,17,-15,11,9,-19,-22,-19,-15,-14,-5,18,-17,-1,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-25,-11,-1,-20,-24,-4,-3,0,-9,0,-4,-14,11,-3,-3,0,-6,-24,-7,4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,5,19,-30,-19,-4,-29,30,-25,-12,1,-10,16,25,-5,-9,-23,-24,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-27,13,24,-28,-10,-4,-28,9,-21,-15,2,-9,9,7,0,-8,-23,-28,-18,16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-22,-32,-25,0,-32,-24,38,-23,17,17,-19,-19,-18,-23,-16,-7,28,-19,-2,-25; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,29,-23,36,16,-28,-9,0,-25,0,-21,-19,17,-10,4,-6,1,-7,-23,-31,-16,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=7,9,-17,6,8,-19,-4,-5,-17,-3,-17,-13,9,-10,2,-7,7,-2,-16,-25,-16,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-25,11,22,-27,-17,-6,-20,9,-19,-13,1,-10,9,1,0,-6,-15,-29,-16,16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00310;
//
ID   RIBOSOMAL_S9_MP; MATRIX.
AC   MP00360;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S9 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6957345; R2=0.0162782; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=12.197; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=50; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=3,-15,-20,-17,-14,-8,0,-20,-5,-15,-1,-2,-13,-20,-17,-16,-6,-6,1,-22,-13,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-13,-16,-16,-9,-6,-20,-18,0,-11,6,0,-13,-20,-12,-10,-7,4,3,-25,-9,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-27,22,14,-29,1,-2,-30,2,-25,-19,13,-12,2,-4,2,-8,-26,-31,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-21,-12,-7,-12,-21,-9,-5,-1,-1,0,-6,-19,-3,5,-6,0,-3,-25,-7,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-12,-21,-14,1,-4,-20,-14,-4,-10,-1,-3,-11,-16,-6,-9,-5,-3,-2,-20,-7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-22,3,-1,-24,9,-8,-24,-1,-24,-16,12,-15,-2,-5,7,-2,-20,-29,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-26,4,9,-28,-6,-5,-26,14,-24,-13,6,-12,11,10,1,-6,-22,-26,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-25,-20,-28,-24,27,-30,-3,10,-19,8,6,-21,-29,-21,-16,-18,-8,8,2,34,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-28,57,15,-35,-7,1,-36,1,-30,-27,27,-12,0,-8,2,-8,-30,-39,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-20,-33,-26,0,-32,-26,33,-24,17,16,-22,-23,-21,-23,-15,-3,30,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-11,-24,-14,-12,2,-25,-5,-3,-6,-3,-2,-8,-21,-10,-1,-12,-7,-4,-11,7,-12;
MA   /M: SY='V'; M=9,-24,-9,-30,-25,-6,-25,-27,22,-21,7,6,-21,-23,-22,-23,-8,-4,27,-25,-11,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,3,-21,-3,-3,-15,-18,-7,-15,8,-14,-8,7,-16,-1,10,1,9,-11,-25,-8,-3;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-10,-28,-27,-2,-28,-29,25,-19,8,8,-26,-27,-27,-20,-7,3,42,-29,-10,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-24,-5,4,-18,-17,2,-19,9,-18,-8,0,-15,7,11,0,-3,-15,-22,-6,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,1,-19,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-24,-20,-14,1,-26,-5,6,-16,9,5,-13,-17,-13,-12,-15,-7,3,-18,3,-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-14,-11,-9,-12,-15,-14,-4,-10,-10,-2,-3,-14,-6,-10,15,21,2,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=9,-9,-25,-11,-16,-27,51,-19,-33,-17,-27,-18,-1,-17,-16,-19,6,-12,-23,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,11,-20,0,0,-10,59,10,0,-10,-30,-20,-10,39;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-12,-20,-13,-15,-8,-20,-1,-12,-7,-5,-11,-13,-12,-18,8,4,7,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-29,14,10,-24,8,-4,-28,-5,-22,-17,3,-14,-1,-10,-3,-13,-25,-22,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-26,-20,-33,-26,-2,-32,-28,33,-25,14,12,-20,-21,-21,-25,-12,-3,28,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-28,-10,0,-20,-19,-1,-23,25,-17,-3,-2,-18,9,46,-8,-8,-16,-21,-9,1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-14,-23,-16,-8,-7,-24,16,-1,-15,11,10,-11,-22,2,-9,-14,-6,-7,-21,5,-5;
MA   /M: SY='G'; M=24,-9,-20,-14,-14,-25,34,-19,-25,-15,-21,-15,-4,-15,-14,-19,7,-9,-15,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-24,-36,-28,1,-35,-26,39,-27,22,20,-23,-23,-20,-25,-19,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-11,-14,-8,-20,1,-18,-13,-10,-15,-13,-4,-10,-8,-17,17,8,-3,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-13,-17,-11,-20,6,-19,-13,-12,-11,-11,-9,-12,-11,-19,8,-2,-3,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,10,-31,-22,24,-30,44,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,13,-19,1,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,15,-27,-25,-5,-28,-26,11,-22,6,3,-21,-29,-24,-22,-11,-4,20,-32,-13,-25;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-22,-2,10,-23,-14,-9,-16,4,-15,-9,-4,-11,7,-1,1,-3,-11,-25,-13,8;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,-25,-27,-20,30,-27,-1,2,-18,6,5,-18,-26,-18,-14,-18,-10,-2,7,29,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-10,12,-22,10,1,-10,-15,-1,-16,-5,-16,-13,12,-17,-5,-7,2,1,-15,-25,-2,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-8,-28,-6,3,-25,-10,-9,-18,-5,-20,-12,-6,19,2,-9,-2,-5,-20,-27,-19,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-21,16,12,-24,-12,-7,-22,4,-17,-15,4,-11,2,-3,2,-2,-17,-30,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-4,-23,-4,-8,1,-19,-5,-4,-15,8,0,-4,-22,-12,-13,-13,-8,-8,-21,1,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-30,2,16,-25,-18,0,-30,27,-23,-13,2,-13,12,38,-7,-10,-23,-23,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-24,1,5,-25,-12,-7,-19,1,-20,-12,-1,3,3,-6,2,-3,-16,-28,-17,3;
MA   /M: SY='S'; M=2,-9,-20,-9,0,-17,-15,-14,-8,-3,-12,-8,-6,-8,-4,-3,3,0,-4,-28,-15,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-26,-17,11,-27,-17,7,-15,24,10,-23,-26,-17,-12,-23,-10,2,-8,6,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-25,-5,2,-21,-18,-1,-22,24,-18,-4,0,-15,5,23,-7,-8,-16,-23,-8,2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-28,-3,4,-24,-17,-10,-24,18,-23,-12,-4,4,4,14,-3,-5,-19,-22,-14,3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-2,-22,-4,2,-18,-7,-6,-18,-3,-16,-11,-1,-10,0,-7,3,-3,-14,-24,-13,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00311;
//
ID   RIBOSOMAL_S10_MP; MATRIX.
AC   MP00361;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S10 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5144386; R2=0.0161682; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=420; N_SCORE=12.295; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-27,45,16,-33,-9,0,-33,2,-29,-25,21,-11,2,-6,3,-7,-28,-33,-18,9;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-11,-24,-11,-9,-13,-21,33,-9,-13,-11,-1,-5,-10,-5,-9,-6,-9,-7,-27,5,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-27,3,12,-24,-16,-4,-25,16,-21,-13,2,-10,7,20,-2,-4,-19,-25,-13,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-21,-11,-8,-9,-22,-14,5,-14,9,3,-9,-21,-8,-13,-9,-4,3,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,28,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-29,50,26,-35,-11,2,-34,2,-26,-26,18,-9,4,-7,1,-9,-29,-37,-19,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,3,-25,2,8,-21,-14,-4,-21,9,-18,-10,3,-14,11,8,-2,-5,-19,-23,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=8,-14,-12,-16,-14,-11,-14,-20,3,-15,-10,-6,-9,-18,-13,-16,14,10,15,-30,-14,-14;
MA   /M: SY='C'; M=12,-15,34,-23,-20,-16,-18,-24,-10,-19,-11,-10,-14,-23,-19,-22,3,2,4,-34,-20,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-25,6,13,-25,-10,-6,-25,12,-22,-14,6,-11,6,9,2,-2,-20,-27,-16,9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,8,-28,11,19,-32,-17,-3,-28,23,-25,-13,4,-9,19,15,-2,-8,-24,-25,-14,18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-29,3,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-19,-24,-20,-7,-28,-23,17,-6,3,7,-20,-23,-17,-7,-11,-4,26,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-27,17,26,-28,-13,-2,-27,9,-21,-16,6,-8,10,4,-1,-8,-24,-29,-17,18;
MA   /M: SY='T'; M=3,-13,-18,-21,-17,-7,-14,-22,6,-17,-1,0,-8,-16,-15,-18,2,12,7,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-10,-23,-16,-14,-10,-23,3,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,16,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-27,6,17,-27,-18,-6,-27,27,-25,-13,3,-10,11,21,-3,-4,-21,-25,-13,14;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-27,0,7,-25,-13,-4,-27,21,-23,-12,5,-14,10,31,-2,-5,-21,-24,-13,6;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-14,-10,-8,-13,-17,-14,-11,-5,-11,-8,-1,-12,-6,-7,13,31,-3,-28,-10,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-28,1,-13,-28,48,-12,-35,-14,-30,-20,13,-19,-14,-13,3,-14,-29,-26,-27,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-19,-13,-24,-18,-10,-14,-23,9,-17,4,1,-17,-19,-17,-20,-1,-1,16,-24,-13,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-25,1,7,-22,-19,-8,-15,11,-16,-8,0,-13,7,7,-2,-3,-11,-26,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-17,-30,-25,-1,-28,-24,26,-18,12,16,-23,-23,-20,-19,-12,-2,30,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-8,-14,-10,-4,-16,-13,-10,-15,4,-18,-9,-3,-15,-2,7,7,1,-6,-28,-13,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-29,41,-26,17,17,-24,-24,-23,-26,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-39,-10,0,-28,-20,-18,-21,-5,-28,-18,-18,75,-8,-9,-10,-10,-28,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-28,2,14,-27,-18,-4,-29,32,-26,-12,2,-11,10,27,-4,-7,-21,-24,-12,11;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-25,-14,-6,-17,-24,-14,-6,15,-12,-2,-6,-16,-2,18,-8,-3,-1,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-8,-23,-9,2,-11,-20,-4,-8,-3,4,1,-6,-18,-1,3,-9,-6,-9,-25,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-24,-17,-7,-13,-26,-13,2,5,-4,1,-13,-20,-6,10,-12,-8,7,-24,-8,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-27,-23,-31,-27,24,-32,-13,19,-21,9,7,-23,-28,-23,-19,-18,-8,17,1,28,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,7,-13,-12,-16,-21,-21,-15,-14,-16,-14,-7,5,-14,-16,8,24,-8,-34,-18,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-14,-27,-25,-3,-29,-27,24,-19,7,7,-21,-23,-23,-20,-4,9,34,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-17,-25,-21,-14,-4,-25,-12,6,-8,15,9,-11,-24,-8,9,-18,-9,1,-22,-5,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-30,-7,3,-23,-20,-5,-28,35,-23,-9,-1,-16,9,52,-10,-9,-18,-20,-10,3;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-12,-6,-5,-18,0,-13,-15,-12,-21,-15,4,-12,-4,-13,28,16,-7,-34,-18,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-33,-12,-5,-24,-21,-21,-13,-11,-23,-15,-19,65,-12,-19,-7,-3,-17,-30,-25,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-17,5,-15,6,-2,-17,-16,54,-29,-11,-20,-8,9,-20,0,-6,-6,-14,-25,-31,5,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-23,-17,-18,-17,7,-19,-6,-8,-12,-4,-12,-22,-17,-11,-7,-10,4,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,20,-28,23,21,-20,-15,10,-26,2,-22,-18,16,-13,6,-2,-1,-8,-27,-26,-4,13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00312;
//
ID   RIBOSOMAL_S15_MP; MATRIX.
AC   MP00362;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S15 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2313962; R2=0.0181975; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=475; N_SCORE=14.865; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=15; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-18,7,10,-22,-8,-8,-22,0,-25,-18,8,-9,3,-4,19,7,-16,-34,-17,7;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-21,-23,-17,-7,-23,-22,11,-18,3,1,-17,-3,-16,-20,-5,2,10,-25,-9,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-32,7,31,-27,-19,-8,-25,1,-23,-19,-7,29,7,-8,-3,-9,-27,-29,-22,17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-14,-18,-12,2,-7,-23,-14,2,-9,-4,-3,-15,-18,-11,-12,-4,-4,12,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,17,-30,24,20,-40,-17,7,-27,7,-23,-10,7,-10,39,3,0,-10,-30,-27,-13,30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-19,-33,-26,4,-32,-26,31,-26,25,15,-26,-26,-23,-23,-19,-6,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-17,-20,-11,-1,-12,-13,-9,-9,-5,-6,-12,-16,-11,-10,-1,-2,-4,-10,-1,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-10,-16,-16,-15,-1,-21,-3,5,-17,8,6,-3,-24,-12,-13,-11,-6,0,-25,-2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-30,-20,16,-29,-19,17,-29,43,19,-28,-29,-21,-19,-27,-9,8,-17,3,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-16,-17,-14,-8,-22,-20,5,-15,-3,1,-6,-13,-11,-15,9,24,7,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-24,-3,9,-18,-16,0,-20,8,-17,-11,-1,-13,3,7,-2,-6,-15,-19,-7,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,2,-30,5,10,-26,-18,-2,-30,29,-24,-13,3,-14,11,39,-7,-9,-22,-24,-12,8;
MA   /M: SY='I'; M=11,-23,-22,-32,-23,-7,-26,-27,28,-22,9,9,-17,-17,-17,-26,-9,-6,21,-21,-8,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-2,-19,-6,-3,-14,-16,-10,-4,-6,-8,-6,3,-18,-5,-6,0,0,-1,-30,-13,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,6,-25,4,4,-24,-10,7,-25,9,-23,-12,12,-15,8,13,1,-5,-22,-27,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-22,7,-30,-20,24,-28,41,22,-28,-28,-19,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-20,-6,-1,-19,-16,-6,-21,9,-19,-11,4,-14,5,21,7,12,-13,-27,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-25,9,15,-25,-11,-6,-25,10,-23,-15,5,-8,7,6,3,-3,-21,-28,-15,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-33,-23,21,-30,-19,19,-28,36,20,-26,-28,-22,-20,-26,-10,11,-15,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,7,21,-26,-18,-4,-23,17,-21,-12,3,-10,14,9,-3,-8,-21,-25,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-23,-4,9,-19,-17,-9,-14,3,-9,-7,-3,-13,4,3,-3,-3,-11,-26,-13,6;
MA   /M: SY='H'; M=-14,16,-25,7,-2,-15,-11,50,-23,-6,-23,-9,30,-20,3,-1,-1,-9,-28,-30,5,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-9,-32,-7,1,-26,-16,-12,-23,20,-24,-12,-6,11,1,19,-9,-9,-20,-23,-16,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-30,-1,7,-28,-16,8,-29,33,-27,-9,3,-13,12,25,-8,-11,-23,-22,-7,8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-12,-25,-16,-11,10,-24,12,-8,-4,-5,0,-7,-22,-8,-3,-13,-9,-9,-8,20,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-2,2,-22,2,0,-22,-12,31,-21,-8,-18,-8,6,-13,5,-6,5,-5,-18,-30,-3,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,4,-12,-1,-3,-19,1,-10,-19,-9,-26,-18,14,-12,-3,-10,28,17,-12,-36,-19,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-29,-4,8,-24,-20,-2,-26,30,-22,-8,-1,-14,16,36,-7,-7,-20,-19,-7,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-12,-28,-13,-4,-10,-22,-2,-20,17,-13,-6,-4,-20,5,44,-11,-9,-14,-16,-2,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-26,-10,-14,-27,44,-16,-33,-11,-26,-17,1,-18,-12,-8,2,-13,-24,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,14,-30,-20,19,-30,48,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-18,-26,-22,-10,-5,-27,-11,7,-10,10,11,-15,-21,-1,-5,-17,-9,-1,-12,-1,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-24,-10,-2,-14,-20,-10,-8,8,-2,2,-6,-17,-1,7,-12,-7,-8,-22,-8,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-21,-24,-17,-4,-27,-18,15,-9,13,17,-18,-21,-12,-10,-15,-2,13,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-15,-22,-14,0,-10,-27,-17,11,-13,5,3,-15,-18,-8,-14,-9,-6,12,-27,-10,-5;
MA   /M: SY='G'; M=8,-1,-18,-4,-7,-24,23,-13,-26,-12,-27,-18,8,-14,-6,-13,19,3,-18,-30,-23,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-29,-3,8,-28,-20,3,-27,30,-24,-7,1,-13,19,32,-6,-8,-22,-21,-8,12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-17,-29,-20,-10,-13,-26,-9,-4,10,-6,1,-7,-20,0,36,-13,-10,-3,-20,-7,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,3,-22,-20,9,-28,27,-22,-8,0,-17,13,44,-10,-11,-22,-17,-4,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-28,-5,2,-22,-18,0,-28,27,-22,-11,4,-17,9,48,-7,-8,-20,-22,-11,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,9,-30,-20,22,-29,46,21,-29,-29,-20,-20,-29,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=2,-25,-17,-27,-19,2,-23,-21,15,-24,30,12,-24,-25,-19,-20,-17,-5,13,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-2,9,-23,9,4,-25,-9,-6,-25,11,-24,-16,9,-13,1,12,4,-2,-17,-29,-16,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,31,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-26,-23,-27,-21,17,-30,-6,14,-22,29,13,-26,-29,-16,-17,-25,-9,4,-3,27,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-24,-7,2,-20,-19,-8,-22,26,-21,-9,-2,-15,4,24,-6,-7,-14,-21,-9,2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-26,0,3,-25,-4,-7,-27,15,-24,-13,5,-14,3,18,0,-4,-20,-25,-15,2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-25,4,6,-24,-18,-9,-20,21,-22,-11,5,-12,4,12,-2,0,-14,-27,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-26,27,8,-29,0,-2,-30,4,-28,-19,20,-13,1,-2,3,-7,-26,-33,-19,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-21,-18,-10,-6,-23,-16,2,-3,-3,0,-14,-10,-10,-3,-9,-4,7,-20,-6,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-9,-22,-9,-1,-12,-20,-13,-1,-12,7,1,-10,-17,-3,-12,-9,-5,-2,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-30,-4,1,-24,-15,-9,-25,10,-22,-14,-5,13,0,22,-5,-7,-21,-26,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-30,-14,-8,10,-23,9,-8,-5,-8,-5,-16,-12,-5,-8,-14,-10,-15,10,44,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,8,-26,7,8,-21,-15,-3,-21,9,-19,-12,9,-15,6,12,-2,-4,-19,-26,-11,6;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-7,-31,-7,1,-7,-16,-14,-22,-3,-19,-16,-9,-16,-5,-7,-10,-11,-21,26,0,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-18,-23,-15,-2,-27,-19,7,-11,18,8,-19,-23,-14,-8,-16,-2,7,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-25,-28,-30,-24,9,-34,-12,26,-21,12,11,-20,-21,-16,-20,-18,-8,13,-5,24,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-24,11,15,-28,-10,-5,-24,9,-24,-15,8,-10,9,1,5,-2,-20,-29,-17,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00313;
//
ID   BACTERIAL_PQQ_1_MP; MATRIX.
AC   MP00363;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial quinoprotein dehydrogenases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3058338; R2=0.0155960; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=892; N_SCORE=19.207; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=8,-1,-25,0,2,-25,1,-15,-16,-10,-16,-14,-4,-2,-7,-17,0,-9,-13,-25,-20,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-2,-18,-5,1,-8,-17,-3,-6,-4,-9,-6,-2,-15,0,-6,0,2,-5,-16,3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='T'; M=11,-9,-13,-14,-9,-10,-14,-18,-6,-12,-2,-6,-9,-3,-10,-14,6,18,-1,-23,-12,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-8,1,-28,-2,-4,-18,11,-9,-24,-8,-24,-18,8,-2,-8,-11,-4,-11,-27,-2,-15,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,12,-22,19,19,-20,-16,-6,-19,-3,-9,-13,1,-9,1,-7,-1,2,-16,-28,-13,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=22,1,-9,-1,-2,-15,-1,-10,-10,-5,-9,-9,-2,-6,-5,-11,5,-1,-4,-15,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-17,-15,-22,-18,-3,-22,-20,22,-17,6,7,-13,-15,-14,-17,-4,2,20,-20,-5,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=13,-20,-15,-25,-21,-9,-14,-25,12,-18,1,1,-17,-20,-20,-21,-2,2,21,-25,-13,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,20,-25,25,24,-26,-12,15,-28,1,-23,-18,15,-9,8,-3,3,-7,-26,-32,-12,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=4,-8,-21,-5,-5,-16,-14,-15,-9,-13,-3,-8,-11,9,-10,-16,-4,-4,-9,-25,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=3,19,-20,26,5,-27,-7,-8,-21,-6,-20,-18,7,-10,-4,-13,7,-3,-14,-31,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-8,-17,-8,-5,-14,-9,-13,-8,12,-12,-3,-7,-13,-5,5,-6,-6,2,-17,-9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-1,2,-23,3,1,-23,-13,14,-23,-1,-22,-12,3,-2,0,-5,5,1,-18,-30,-9,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,3,-29,9,9,-30,-16,-10,-23,-4,-23,-17,-4,26,3,-11,0,-1,-23,-30,-21,4;
MA   /M: SY='G'; M=3,0,-22,3,-1,-25,11,-13,-22,-9,-21,-15,0,-14,-5,-13,7,-5,-13,-29,-21,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-14,40,-25,38,14,-28,-6,5,-28,1,-29,-24,39,-14,2,-4,5,-5,-30,-39,-20,8;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-39,-45,-39,-30,9,-21,-30,-14,-20,-16,-16,-39,-30,-21,-20,-36,-26,-20,127,25,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-23,-11,-12,-8,-24,-6,4,-18,9,5,-17,-9,-14,-16,-16,-9,5,-28,-7,-15;
MA   /M: SY='A'; M=8,-8,-18,-13,-6,-17,-11,6,-8,-7,-9,8,-4,-14,6,-9,5,0,-7,-26,-8,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-29,-17,-16,17,-27,10,-4,-10,-5,-4,-18,-11,-10,-11,-14,-3,-12,15,55,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-27,-7,-1,-19,-17,0,-22,24,-18,-2,5,-19,7,45,-9,-9,-17,-23,-10,0;
MA   /M: SY='B'; M=-6,19,-19,16,-1,-23,0,-8,-24,-7,-23,-19,18,-13,-6,-9,12,14,-18,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-11,-25,-14,-8,1,-22,7,-8,-5,-8,-3,-11,-20,7,-6,-6,-1,-12,3,33,-3;
MA   /M: SY='N'; M=4,9,-20,8,2,-25,4,5,-26,-7,-24,-17,11,-13,-2,-10,11,-2,-20,-32,-16,0;
MA   /M: SY='G'; M=11,-4,-22,-4,5,-26,22,-14,-28,-9,-23,-18,-1,-11,-5,-14,8,-7,-20,-25,-24,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,9,-24,8,11,-31,-14,3,-18,3,-21,-8,10,-13,30,2,6,-4,-21,-28,-14,21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,3,-27,-2,0,-20,-15,3,-27,22,-23,-13,15,-20,7,52,-5,-7,-23,-25,-13,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-27,-32,-30,-25,38,-28,-2,-5,-18,-2,-5,-25,-30,-20,-15,-25,-15,-12,53,55,-23;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-10,-4,-4,-17,-4,-13,-13,-11,-25,-16,5,-13,-4,-11,33,17,-2,-39,-19,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-34,-1,11,-29,-17,-15,-22,-6,-26,-19,-12,54,-4,-16,-5,-9,-26,-29,-26,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-27,27,10,-30,-14,-5,-30,19,-28,-19,14,-11,3,7,-1,-2,-23,-31,-15,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,6,-30,8,20,-40,-19,9,-22,9,-21,-3,2,-10,53,8,0,-10,-30,-22,-11,37;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=5,-2,-22,-4,0,-23,-13,-10,-23,17,-19,-12,-1,-13,1,20,0,-1,-13,-22,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-22,20,16,-28,-3,-3,-27,-2,-27,-20,15,-10,7,-6,15,1,-23,-35,-20,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-24,-8,-5,-13,5,-7,-26,5,-24,-13,0,-16,-6,0,3,-6,-18,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,18,-28,17,12,-32,-14,1,-27,20,-27,-13,17,-12,19,11,-1,-8,-26,-28,-14,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-27,-4,5,-25,-20,-9,-27,37,-25,-10,0,-13,7,35,-6,-2,-17,-21,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-28,-13,1,-15,-24,-18,-3,-13,-1,-5,-20,21,-10,-16,-13,-8,-6,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='A'; M=44,-12,-11,-21,-11,-17,-3,-20,-7,-12,-4,-7,-12,-12,-11,-20,6,-1,1,-20,-18,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-37,-48,-37,-29,6,-11,-29,-22,-20,-21,-20,-36,-29,-20,-20,-36,-29,-30,134,24,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-6,-20,-8,-7,-9,-17,14,-15,-5,-15,-8,-1,-18,-2,2,7,9,-9,-22,7,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-24,-32,-26,47,-31,-8,8,-24,13,5,-21,-29,-26,-18,-21,-10,1,9,39,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-7,5,-20,7,2,-22,-11,5,-26,2,-24,-16,8,-14,3,13,13,6,-17,-33,-12,1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-11,-14,-19,-15,6,-24,-20,-1,-17,7,-1,-10,-17,-16,-14,3,28,2,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-30,10,-7,-32,41,-14,-39,-8,-30,-21,5,-17,-12,-12,-1,-17,-29,-25,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-22,25,2,-21,-17,-11,-16,-9,-9,-14,3,-15,-9,-13,0,6,-8,-34,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-7,-21,-13,-7,5,-20,-9,2,-15,11,6,-2,-23,-11,-12,-13,-7,-4,-23,-4,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-25,-4,-1,-19,-17,7,-21,17,-19,-3,7,-16,5,23,-4,-2,-17,-25,-7,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-25,-5,-8,-27,27,-11,-28,-10,-24,-14,6,-16,0,-10,5,-1,-24,-24,-21,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-29,2,4,-28,-5,23,-28,-1,-24,-10,4,-9,15,6,0,-11,-27,-27,-8,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-25,12,26,-25,-4,-3,-26,1,-22,-19,15,-9,6,-4,5,-1,-26,-31,-20,16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00375;
//
ID   BACTERIAL_PQQ_2_MP; MATRIX.
AC   MP00364;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial quinoprotein dehydrogenases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2890029; R2=0.0124766; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=658; N_SCORE=12.489; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-22,-4,-7,-19,3,-14,-10,-9,-13,-5,-1,-17,-9,-13,-1,-7,-6,-27,-17,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-23,-8,-2,-15,-14,-13,-8,-8,-11,-8,-14,44,-7,-13,-8,-6,-15,-18,-16,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=0,-8,-25,-8,-10,-16,12,-15,-23,-6,-21,-15,-7,-15,-10,-10,-5,-12,-19,15,-8,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-27,11,20,-28,-15,-8,-25,8,-22,-17,-2,15,4,-3,-3,-8,-22,-26,-19,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-22,-6,-9,-22,27,-15,-24,-9,-21,-14,1,-16,-11,-11,3,-7,-15,-23,-21,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,11,-26,16,13,-28,-1,8,-31,0,-25,-18,7,-11,2,-5,4,-5,-25,-31,-14,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-17,-17,-11,-14,-12,-19,-5,-12,-11,-8,-9,-14,-7,-15,8,7,0,-12,-11,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-39,-36,-28,30,-24,-17,-11,-20,-9,-11,-31,-30,-22,-18,-31,-21,-19,94,41,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-20,-7,1,-19,-20,-6,-11,8,-15,-6,-6,-15,1,2,0,2,-1,-27,-10,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-24,-15,-7,-7,-21,-1,-4,1,-7,-1,-6,-8,0,14,-10,-9,-6,-15,-2,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,4,-20,0,-9,-22,32,-9,-27,-11,-27,-18,15,-16,-9,-11,11,-5,-23,-26,-22,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-21,-7,-12,-25,38,-17,-30,-16,-28,-19,3,-16,-12,-16,15,1,-20,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-31,-10,-12,-28,31,-20,-30,-16,-28,-19,-7,17,-16,-19,-1,-10,-27,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='N'; M=1,16,-14,2,-6,-15,-9,-7,-14,-6,-19,-14,25,-14,-6,-7,15,23,-13,-33,-15,-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-9,-17,-13,-13,-12,-15,-15,3,-13,-10,-1,-3,-8,-11,-14,5,2,7,-32,-15,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=11,5,-23,6,-3,-28,7,-12,-20,-9,-18,-14,0,-13,-3,-15,2,-8,-15,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='P'; M=2,-17,-26,-15,-9,-15,-11,-19,-15,-13,-23,-17,-13,10,-10,-16,4,-1,-14,4,-12,-10;
MA   /M: SY='M'; M=0,-20,-19,-26,-18,6,-20,-8,9,-16,13,19,-18,-21,-11,-15,-12,-6,4,-13,8,-15;
MA   /M: SY='S'; M=19,-8,-10,-12,-9,-16,-7,-17,-8,-12,-16,-11,-3,-13,-9,-15,21,14,4,-32,-17,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=16,-15,-26,-14,-4,-25,-11,-18,-16,-7,-20,-15,-14,37,-8,-13,-1,-6,-16,-25,-24,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-24,3,13,-25,-13,-8,-17,7,-18,-11,0,-12,6,-1,-2,-7,-11,-27,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-18,-16,-23,-17,0,-22,-16,10,-19,20,17,-18,-21,-12,-15,-9,6,8,-24,-5,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-14,44,-24,38,7,-27,-4,6,-27,0,-30,-24,45,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-17,-23,-17,1,-27,-21,10,-22,23,8,-17,-21,-16,-17,-9,14,7,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-33,-29,7,-31,-27,31,-22,13,16,-26,-27,-26,-21,-14,-4,38,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-28,-26,-23,37,-31,6,5,-16,4,2,-20,-29,-17,-14,-20,-10,-4,20,61,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-30,-24,13,-31,-17,21,-24,27,13,-27,-29,-22,-19,-22,-7,19,-13,11,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=7,-14,-12,-17,-17,-11,-8,-22,0,-15,-8,-5,-11,-19,-17,-16,9,12,14,-30,-15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-9,-15,-28,47,-19,-34,-17,-29,-19,-1,-6,-16,-18,4,-10,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-4,23,-16,9,-2,-18,-4,-1,-18,-4,-26,-18,36,-16,-2,-4,19,15,-19,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-31,-12,-9,-25,2,-21,-19,-14,-24,-16,-14,39,-15,-19,-4,-5,-19,-27,-26,-15;
MA   /M: SY='D'; M=2,19,-21,26,5,-30,3,-8,-29,-7,-27,-23,10,-11,-4,-12,14,0,-19,-35,-21,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-31,-18,-9,-18,-25,-20,0,-15,-8,-5,-19,35,-9,-19,-11,-5,-7,-27,-18,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-25,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,137,35,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,15,-23,5,-9,-24,30,-5,-29,-10,-30,-20,30,-19,-9,-10,8,-7,-28,-31,-24,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-26,-8,-4,-16,9,0,-23,-10,-18,-13,-5,-10,-7,-13,-2,-7,-20,-16,-2,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-10,11,-26,10,7,-22,-14,-8,-25,10,-25,-18,10,-13,1,2,0,0,-22,-12,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-24,-18,-9,-6,-20,-3,-10,7,-7,4,-10,-21,1,23,-10,-8,-6,-14,3,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-21,-10,-4,-16,-20,-9,-21,13,-16,-10,0,-16,1,35,3,16,-11,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='P'; M=9,-7,-21,-7,2,-23,-11,-15,-18,-4,-23,-16,-5,18,-4,-11,11,6,-15,-30,-21,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-26,-7,-10,-22,32,-17,-25,-17,-13,-12,-5,-19,-15,-18,-4,-15,-20,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,34,-26,44,14,-34,-9,0,-33,3,-29,-24,20,-11,5,-5,6,-5,-26,-37,-19,10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,18,-26,13,13,-23,-11,24,-24,-1,-26,-16,28,-4,5,-2,1,-8,-30,-35,-13,8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-19,-3,3,-16,-13,-3,-19,25,-16,-6,0,-10,6,32,-6,-6,-13,-13,-6,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-18,-22,-18,-16,19,-17,-1,-4,-10,-3,-4,-17,-19,-11,-9,-17,-10,-10,42,37,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-21,-22,-24,-16,1,-25,10,11,-19,26,31,-19,-25,-7,-13,-23,-12,2,-22,4,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00375;
//
ID   NIR_SIR_MP; MATRIX.
AC   MP00365;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitrite and sulfite reductases iron-sulfur/siroheme-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5977449; R2=0.0147207; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=287; N_SCORE=9.813; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-8,-23,-9,7,-13,-20,-7,-6,-2,1,4,-8,-16,1,3,-9,-6,-6,-25,-11,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,0,-24,0,4,-3,-19,-1,-16,-2,-11,-10,-2,-16,0,-4,-4,-3,-15,-13,9,1;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-24,-7,5,-21,-20,-12,-14,18,-14,-6,-7,-13,2,11,-6,-7,-7,-23,-12,3;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-3,-27,-2,-1,-17,0,7,-19,-9,-15,-9,0,-12,-1,-9,-4,-11,-19,-21,-4,-3;
MA   /M: M=-6,-10,-24,-10,-10,-13,-2,-6,-9,-12,-6,-5,-7,-20,-11,-9,-7,-10,-5,-22,-8,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-27,-12,-7,-13,-22,-13,-4,-9,1,-2,-13,-9,-3,-2,-13,-9,-7,-15,-8,-7;
MA   /M: SY='A'; M=6,-16,-18,-18,-11,-7,-12,-18,-3,-15,1,-3,-14,-11,-13,-14,-3,-2,1,-23,-12,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-14,9,-33,19,8,-32,-16,-6,-27,-3,-28,-21,0,35,-3,-10,-4,-7,-28,-33,-22,0;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-27,2,8,-19,-13,13,-22,2,-16,-10,-2,-16,5,7,-5,-11,-18,-21,-1,4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-29,-4,3,-23,-17,5,-22,9,-25,-11,-3,11,1,1,-2,-7,-20,-25,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-36,-28,12,-35,-26,35,-27,20,17,-23,-24,-24,-25,-19,-8,27,-18,2,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-11,-22,-14,-7,-16,-24,-17,-5,13,-12,-3,-8,-17,-5,11,-5,1,4,-24,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-19,-29,-24,7,-21,-20,17,-21,12,15,-19,-23,-20,-19,-12,-1,16,-20,-2,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-25,-6,-6,-20,-4,18,-24,3,-20,-9,7,-19,0,17,-4,-11,-18,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-33,-27,2,-29,-24,24,-22,15,17,-26,-25,-20,-21,-20,-8,22,-2,0,-24;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-11,-4,-6,-15,-10,-13,-13,-9,-19,-14,9,-12,-6,-9,25,30,-5,-35,-15,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-33,-12,-3,-26,-19,-20,-16,-10,-24,-17,-17,66,-11,-19,-5,-2,-21,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-12,26,-22,11,-1,-15,-6,6,-21,6,-26,-17,43,-20,0,12,4,-3,-26,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-16,1,0,-26,23,-13,-31,-11,-27,-20,4,-14,-7,-13,11,-4,-23,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,-16,-15,-13,-21,19,-20,-18,-14,-17,-13,-6,-14,-13,-19,9,-2,-7,-23,-22,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-29,-4,14,-19,-21,0,-27,21,-19,-10,-1,-15,16,41,-7,-10,-22,-20,-10,12;
MA   /M: SY='P'; M=12,-15,-23,-16,-9,-19,-14,-14,-6,-13,-14,-9,-12,18,-10,-19,1,-3,-5,-27,-18,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-10,-28,-11,0,-14,-18,2,-12,2,-9,4,-8,-17,21,4,-8,-9,-17,-7,6,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-20,-24,-21,1,-18,-18,12,-20,14,12,-18,-19,-19,-18,-15,-7,12,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,-9,-14,-7,-22,-4,-11,-18,0,-17,-11,-6,-13,-6,-6,5,-3,-8,-23,-17,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,36,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-28,8,-36,-27,37,-29,24,17,-24,-24,-23,-26,-21,-9,26,-19,1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-27,-11,-18,-28,57,-20,-35,-18,-27,-18,-1,-18,-18,-19,2,-14,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-25,24,-32,-22,22,-30,33,15,-26,-28,-25,-22,-25,-10,13,-13,7,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-11,-28,-23,-6,-28,-23,20,-13,6,13,-21,-23,-18,-16,-12,-4,25,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=7,-11,-27,-12,-18,-25,54,-18,-33,-18,-25,-17,-3,-19,-18,-19,0,-16,-24,-17,-22,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-7,-11,-5,-20,-18,-14,-15,6,-16,-8,-5,-16,1,5,3,7,-6,-27,-13,-3;
MA   /M: SY='A'; M=8,-9,-23,-11,1,-17,-10,-11,-14,0,-11,-4,-10,-7,-2,-7,-4,-8,-12,-13,-9,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-14,-26,-14,-7,-16,-23,-16,-5,5,-12,-4,-12,3,-7,-4,-8,-4,-3,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-1,-29,0,-10,-26,24,-8,-27,-9,-23,-13,4,-13,-9,-5,-4,-14,-23,-25,-20,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-18,4,1,-17,-8,-4,-20,11,-17,-11,5,-11,2,19,1,2,-14,-20,-10,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-29,-22,-16,18,-16,-4,-5,-15,-5,-5,-18,-24,-15,-14,-17,-13,-9,25,34,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,27,-22,17,5,-23,-2,7,-23,-1,-26,-18,36,-16,4,-2,7,1,-27,-35,-17,4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-23,-21,-15,-7,-4,-20,1,-19,15,4,-18,-23,-16,-17,-16,-11,0,-21,-10,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-10,-28,-10,-5,-4,-18,3,-10,-6,-8,-2,-10,-19,-4,-8,-12,-10,-11,-2,12,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-21,-24,-17,-5,-26,-20,14,-15,11,8,-20,-14,-15,-12,-12,-4,13,-25,-8,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,23,-18,-24,-20,14,-23,-22,-22,-19,-14,-9,-28,-24,-22,-5,-12,-8,-33,-26,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-3,0,-26,32,-14,-29,-12,-23,-17,2,-14,-9,-14,1,-12,-24,-24,-24,-4;
MA   /M: SY='N'; M=3,23,-19,8,-5,-21,10,0,-21,-5,-26,-18,38,-18,-5,-7,9,-3,-24,-33,-21,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00314;
//
ID   URICASE_MP; MATRIX.
AC   MP00366;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uricase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2206893; R2=0.0153432; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1069; N_SCORE=21.613; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-18,-24,-19,8,-27,-15,7,-11,1,2,-19,-25,-15,-5,-9,0,16,-15,7,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-23,-6,5,-21,-18,-5,-16,11,-16,-3,-3,-14,12,16,1,1,-11,-25,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-28,3,22,-26,-20,-4,-27,22,-21,-12,0,-9,15,22,-2,-3,-22,-24,-13,18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,10,-23,16,-2,-29,22,-11,-33,-11,-30,-23,9,-14,-7,-14,15,-2,-23,-33,-24,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-28,-3,-8,-26,17,-13,-25,-2,-27,-16,7,0,-9,-7,-2,-11,-22,-27,-23,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,0,-22,0,-5,-25,8,-15,-26,-1,-24,-16,1,-7,-7,-7,7,4,-17,-27,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-26,-26,-16,6,-30,-13,14,-20,17,10,-20,-17,-7,-16,-19,-10,3,-12,8,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-9,18,-22,17,4,-25,-15,-5,-20,3,-21,-14,14,-13,5,-2,6,9,-16,-32,-14,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-17,-14,-11,-12,-22,-13,-1,-6,-8,-3,-5,-14,-9,-8,6,18,5,-28,-8,-11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-23,-5,-6,-26,36,-15,-31,-13,-27,-19,2,-14,-10,-15,11,-7,-22,-26,-25,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-25,-2,8,-24,-9,-8,-22,19,-21,-6,2,-11,5,8,-2,-7,-17,-24,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=-8,13,-30,20,-3,-34,34,-12,-39,-7,-30,-23,7,-16,-10,-13,-1,-16,-29,-27,-25,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-6,-20,-9,-1,-19,-17,-8,-15,2,-11,-6,-3,-14,10,8,6,10,-11,-25,-11,4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,23,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,37,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,43,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-10,-11,-11,-11,-15,-19,-5,-12,-13,-9,-3,-14,-11,-12,21,29,7,-34,-14,-11;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-29,-4,-2,-33,26,-6,-30,-4,-26,-12,4,-16,14,-5,0,-14,-30,-21,-21,6;
MA   /M: SY='S'; M=6,8,-12,4,0,-20,0,-6,-20,-8,-30,-20,20,-12,0,-8,34,16,-14,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-21,-7,-7,-25,21,-10,-23,-11,-23,-9,2,-15,1,-11,13,-2,-18,-28,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-22,-17,-7,-3,-25,-17,2,-11,-4,-4,-21,-21,-13,-13,-10,-2,9,2,3,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-26,1,-11,-26,38,-8,-32,-9,-29,-19,22,-20,-11,-7,3,-12,-29,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-22,-26,-23,-3,-30,-11,26,-22,10,11,-12,-24,-18,-20,-13,-7,22,-26,-3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,2,-29,2,4,-24,-17,-2,-30,30,-24,-12,7,-17,8,47,-7,-9,-22,-23,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,2,47,9,-35,-14,-6,-37,-6,-28,-27,13,-17,-6,-14,-2,-10,-26,-42,-22,1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-30,20,43,-32,-19,-1,-30,17,-23,-18,2,-4,18,6,-2,-10,-28,-28,-17,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,52,-30,2,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,58,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-13,-10,-8,-12,-20,-17,-13,-3,-12,-10,0,-12,-7,4,15,40,-3,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='T'; M=7,-3,-11,-12,-10,-12,-17,-20,-7,-11,-10,-9,-2,-11,-10,-13,18,36,1,-29,-12,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-9,2,-30,-19,-16,-20,-4,-27,-16,-16,65,-1,-13,-7,-9,-27,-28,-26,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-13,17,-31,30,43,-33,-17,-2,-32,5,-24,-23,3,7,12,-5,-1,-10,-30,-33,-21,27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,3,-18,4,-3,-19,-20,-13,-8,-7,-11,-8,-3,-15,-1,-9,5,15,1,-30,-12,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-27,-14,-11,-7,-10,-4,-19,-3,-17,-11,-8,-19,-6,3,-3,1,-16,8,9,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-28,49,24,-34,-10,2,-34,2,-28,-26,24,-10,4,-6,2,-8,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-22,-32,-22,-7,-32,-23,26,-23,7,16,-20,2,-15,-25,-17,-10,12,-24,-8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-24,33,-30,-20,14,-30,35,13,-27,-30,-27,-20,-26,-10,8,-10,10,-24;
MA   /M: SY='S'; M=14,-9,-12,-14,-9,1,-6,-15,-13,-14,-16,-13,-2,-14,-11,-15,19,8,-5,-24,-10,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-10,-14,-14,-8,-22,-22,-2,-12,-6,-6,-6,-14,-14,-12,14,40,10,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,5,-24,12,9,-14,-19,-3,-15,-2,-15,-13,-3,-16,-2,-7,-2,-5,-9,-20,3,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-31,-28,2,-31,-28,30,-23,19,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-13,30,-24,32,14,-25,-11,1,-26,-1,-24,-21,23,-12,1,-6,4,1,-25,-33,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=17,-18,30,-28,-21,-16,-18,-25,-4,-21,-7,-7,-15,-22,-19,-25,-3,-5,3,-30,-19,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-16,-4,-4,-15,-12,-12,-14,-2,-14,-10,6,-14,-4,-4,14,16,-9,-31,-13,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-25,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,137,35,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-24,-5,10,-23,-20,-6,-18,13,-16,-8,-4,-13,13,19,-2,-2,-13,-24,-12,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-34,-27,-24,30,-28,3,-5,-15,-4,-5,-25,-30,-16,-14,-25,-15,-14,58,62,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,6,-22,9,12,-27,-11,-1,-27,15,-28,-16,6,-10,6,6,11,1,-19,-31,-14,9;
MA   /M: SY='N'; M=-16,19,-26,15,0,-14,-13,19,-21,0,-21,-13,23,-20,3,2,-2,-7,-25,-22,6,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00315;
//
ID   BIOPTERIN_HYDROXYL_MP; MATRIX.
AC   MP00367;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Biopterin-dependent aromatic amino acid hydroxylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1647100; R2=0.0147651; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=749; N_SCORE=16.214; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=15,-4,-11,-12,-10,-15,-6,-19,-13,-11,-13,-11,-2,-11,-10,-14,17,28,-3,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-24,-6,1,-21,-16,-6,-17,-3,-20,-9,1,-14,19,-3,6,7,-20,-3,-7,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-28,-30,-30,-26,33,-28,-7,-1,-18,-1,-3,-26,-30,-22,-16,-23,-13,-4,44,46,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-25,3,-32,-21,32,-25,29,27,-24,-24,-17,-22,-22,-9,21,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-25,-3,2,-19,-20,36,-25,2,-18,-6,4,-15,5,11,-1,2,-19,-28,2,1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-29,-11,-5,-18,-19,9,-16,-6,-13,-7,-10,14,-4,1,-9,-10,-16,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-24,18,16,-28,-11,11,-28,3,-26,-17,11,-10,10,-1,10,-2,-23,-34,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-25,8,24,-29,-14,-3,-26,13,-24,-15,3,-8,16,8,6,-3,-22,-28,-16,20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-16,-30,-10,-7,-6,-23,-17,-7,-18,2,-5,-18,23,-15,-19,-17,-10,-13,-24,-12,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-16,22,-26,26,3,-19,-14,10,-21,-2,-16,-5,12,-16,-1,-6,-6,-10,-20,-29,-5,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-16,-29,-17,-16,23,-27,37,-8,-13,-4,0,-12,-27,-8,-9,-17,-13,-14,11,57,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-14,-15,-17,-12,-5,-20,-18,3,-19,9,1,-10,-18,-12,-15,4,14,3,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-31,-11,2,-26,-22,-10,-11,-6,-13,-5,-15,28,13,-9,-9,-9,-18,-25,-17,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-27,16,51,-27,-20,-3,-27,7,-19,-19,0,-1,16,-1,3,-2,-26,-30,-19,34;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-1,-29,-24,4,-22,-22,10,-25,11,8,-19,-26,-21,-21,-14,-5,10,-24,-6,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,1,-38,-30,33,-33,-25,13,-30,8,4,-20,-28,-31,-25,-18,-10,10,-12,8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-24,13,-31,-23,24,-28,36,17,-28,-29,-23,-21,-24,-8,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-22,-33,-24,35,-30,-16,13,-27,27,13,-24,-29,-25,-19,-24,-10,6,-4,19,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,10,-30,-29,-3,-29,-26,19,-20,6,11,-27,-30,-26,-20,-11,-3,36,-32,-12,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,80,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-23,-31,-22,5,-25,-14,16,-20,26,30,-27,-26,-13,-16,-26,-12,8,1,3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,43,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,-14,-19,-14,-10,-16,-20,3,-16,0,-2,-10,-15,-12,-17,7,12,7,-27,-12,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-27,32,12,-29,-11,26,-30,-1,-26,-17,26,-15,8,-3,0,-10,-30,-36,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-37,-11,-1,-27,-20,-18,-19,-5,-27,-17,-18,69,-8,-7,-10,-10,-25,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-9,-18,-8,-7,-13,-17,-16,-3,-12,-7,-6,-10,-18,-7,-13,3,3,5,-20,-11,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-8,19,-28,27,25,-36,-14,1,-28,4,-23,-16,6,-8,24,-2,1,-9,-27,-29,-17,24;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-22,-35,-27,62,-29,-10,2,-24,9,5,-20,-29,-30,-17,-20,-10,-1,11,38,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-14,-15,-11,1,-14,-11,-4,-14,-5,5,-5,-16,-8,-12,11,12,-1,-26,-6,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-30,-4,13,-31,-23,19,-13,2,-15,1,-1,-12,39,3,-4,-12,-22,-22,-5,25;
MA   /M: SY='E'; M=3,9,-20,7,11,-21,-12,-7,-14,-3,-14,-9,6,-12,0,-9,2,-2,-11,-30,-17,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-28,-29,-23,14,-32,-3,21,-18,13,16,-21,-25,-13,-18,-21,-10,8,3,36,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00316;
//
ID   RIBORED_SMALL_MP; MATRIX.
AC   MP00368;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonucleotide reductase small subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3167725; R2=0.0149430; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=152; N_SCORE=7.578; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-19,-31,-26,14,-29,-25,23,-24,11,8,-22,-25,-26,-22,-13,-6,25,-18,0,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-21,-2,6,-22,-18,-5,-14,1,-15,-7,-1,-12,13,-1,6,7,-11,-28,-11,9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-8,-19,-12,-10,-15,-21,-16,6,-13,-4,-1,-6,-17,-4,-15,1,2,7,-28,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-32,-6,0,-26,-14,-8,-22,2,-27,-15,-7,39,-4,-6,-5,-5,-24,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-29,26,41,-30,-17,14,-32,4,-22,-19,6,-5,14,-2,0,-10,-29,-32,-14,27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=9,-19,-21,-24,-13,-10,-19,-21,12,-16,6,3,-16,-17,-13,-17,-8,-7,10,-22,-10,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-27,5,15,-21,-18,-1,-22,11,-13,-11,3,-14,6,16,-6,-8,-20,-27,-12,9;
MA   /M: SY='H'; M=3,-11,4,-17,-13,-10,-18,6,-13,-14,-7,-4,-8,-21,-10,-14,-2,0,-8,-26,-4,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-10,-32,-26,31,-26,-16,-2,-22,0,-4,-23,-29,-27,-19,-18,-10,1,18,24,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-27,-25,-22,21,-31,3,12,-17,13,7,-23,-29,-15,-15,-21,-9,3,10,48,-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-21,-11,-9,-18,10,-18,-13,-14,-15,-11,-2,-16,-12,-15,5,3,-7,-26,-18,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-9,-21,-15,-3,20,-22,-11,-9,-11,-4,-5,-4,-18,-14,-7,-6,-1,-9,-13,3,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-9,-32,-10,7,-28,-21,1,-13,2,-14,3,-8,-14,39,3,-8,-13,-23,2,-3,23;
MA   /M: SY='A'; M=8,-11,-20,-16,-3,-13,-18,-15,3,-10,-3,1,-10,-13,-6,-15,0,-1,2,-23,-9,-5;
MA   /M: SY='F'; M=8,-19,-5,-28,-20,17,-17,-15,-4,-18,0,3,-15,-22,-19,-18,-6,-5,0,-11,3,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-23,-22,-11,-9,-23,-10,16,-12,6,25,-13,-16,2,-13,-8,-6,7,-23,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=6,10,-9,-2,-8,-16,-8,-8,-11,-8,-18,-13,19,-18,-8,-10,11,8,-7,-34,-18,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-20,-33,-28,-1,-33,-29,35,-24,15,14,-24,-24,-23,-24,-14,-4,34,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-1,-18,-20,97,-29,-10,-19,0,9,-20,9,0,-10,-20,-29,-28,22,-1;
MA   /M: SY='S'; M=18,-3,-12,-6,-4,-21,7,-13,-20,-11,-25,-18,4,-11,-4,-13,29,11,-10,-33,-21,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-14,0,-30,5,27,-24,-20,6,-28,19,-20,-13,0,-10,15,25,-6,-11,-25,-23,-9,19;
MA   /M: SY='T'; M=7,-11,-12,-16,-13,-10,-13,-14,1,-12,-7,5,-8,-16,-9,-13,11,12,9,-30,-12,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=12,1,-11,-3,-2,-19,-4,-11,-17,-9,-24,-16,8,-10,0,-10,30,20,-9,-35,-18,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-11,-21,-16,-12,-4,-20,2,3,-15,4,5,-5,-22,-7,-12,-8,-6,0,-23,0,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-26,-34,-23,1,-33,-20,34,-25,26,26,-22,-22,-13,-22,-22,-10,19,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-30,-21,8,-31,-20,22,-23,19,15,-21,-24,-13,-19,-18,-9,15,-17,1,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-25,15,10,-21,-16,-5,-19,1,-12,-10,5,-14,1,3,-2,-5,-16,-30,-14,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-13,-9,-10,-11,-14,-12,-6,-9,-9,-2,5,-14,-7,-10,13,25,-2,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-24,-30,-23,18,-32,-13,20,-25,28,13,-25,-28,-20,-20,-24,-10,10,-6,21,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-26,-2,-33,-27,16,-30,-24,15,-25,5,3,-20,-26,-26,-23,-12,-6,16,-18,2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-25,2,2,-25,-11,-3,-24,12,-24,-13,5,-5,3,10,1,-3,-19,-27,-14,1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-23,30,7,-29,-6,-5,-29,-2,-26,-22,19,-5,-3,-8,4,1,-25,-35,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,8,-27,12,13,-27,-15,-8,-23,1,-25,-19,4,16,0,-7,2,-2,-22,-32,-21,5;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-22,8,13,-24,-13,-5,-20,9,-20,-13,5,-9,6,3,4,-1,-16,-27,-14,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-14,-12,-7,-11,-14,-11,1,-3,-3,0,-5,-12,-2,-4,-2,-1,2,-17,-7,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=2,-7,-15,-6,9,-11,-14,-10,-4,-5,0,-3,-9,-10,-1,-8,-4,-4,-2,-18,-10,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-18,-13,-6,5,-17,-6,-11,8,-7,-2,-6,-15,-3,18,-9,-7,-7,-9,1,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-18,23,10,-20,-8,0,-18,2,-15,-12,13,-8,5,-2,0,-4,-17,-23,-11,7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-20,11,15,-13,-13,1,-19,4,-13,-12,2,-8,3,4,-3,-6,-17,-17,-5,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-20,-17,-24,-17,0,-23,-17,22,-19,17,11,-16,-16,-14,-18,-14,-6,15,-15,-2,-17; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-16,-12,-19,-15,23,-17,-9,6,-14,7,3,-13,-16,-16,-11,-11,-5,5,0,14,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,1,-14,-2,-5,3,-11,-2,-7,-5,-6,-6,2,-13,-7,-3,-2,-1,-7,-9,5,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='B'; M=-2,4,-15,3,4,-13,-7,-1,-12,2,-11,-5,4,-9,4,2,0,-4,-11,-15,-6,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-21,-16,-13,9,-13,-5,-5,-9,-4,-5,-16,-15,-8,-8,-16,-11,-10,47,24,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=2,-8,-9,-9,-7,-6,-9,-9,0,-1,-4,-1,-6,-10,-5,1,1,0,6,-14,-6,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-14,10,11,-20,-8,4,-21,2,-20,-15,16,-11,3,0,4,-3,-19,-28,-14,7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=14,0,-16,0,2,-21,1,-10,-16,-4,-15,-11,-2,-9,0,-9,6,-3,-10,-21,-16,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-17,-23,-23,-12,-8,-27,-20,20,-13,6,10,-13,-15,-10,-17,-10,-3,13,-21,-6,-14; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-29,16,36,-27,-18,3,-27,11,-19,-16,7,-7,15,6,-2,-9,-27,-29,-16,25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00317;
//
ID   PTS_HPR_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00369;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTS HPR component histidine phosphorylation site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7968287; R2=0.0174419; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=144; N_SCORE=8.298; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-22,-10,-6,-18,-20,-20,-14,-10,-18,-14,-8,30,-10,-14,8,26,-12,-30,-18,-10;
MA   /M: SY='D'; M=8,26,-22,34,8,-32,-6,-8,-28,-4,-22,-22,8,-10,-4,-14,4,-6,-18,-32,-20,2;
MA   /M: SY='B'; M=-13,18,-23,15,-2,-15,-13,-3,-11,-11,-2,-9,18,-21,-7,-10,-7,-6,-16,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='M'; M=1,-19,-18,-28,-19,-3,-17,-5,16,-11,14,45,-19,-19,-3,-12,-14,-8,11,-21,-4,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-22,-22,-12,-3,-26,-18,11,-16,16,7,-22,-15,-15,-16,-17,-7,9,-21,-3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-23,-3,12,-22,-18,-10,-16,11,-18,-10,-3,-10,6,6,2,-1,-11,-26,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-11,-24,-13,-2,-11,-20,-4,-13,7,-10,-2,-8,-17,6,7,-8,-8,-10,-18,-4,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,8,27,-25,-18,-5,-19,2,-17,-13,-1,-7,14,-3,6,3,-16,-30,-16,20;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-27,-19,-33,-26,24,-26,-25,12,-23,8,3,-22,-25,-27,-21,-14,-5,15,0,7,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-20,-14,-4,-10,-26,-14,4,-11,-1,-1,-9,-15,-8,-9,0,12,6,-27,-8,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-14,-37,-30,-2,-37,-30,39,-28,15,15,-22,-24,-23,-28,-17,-8,31,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-17,-16,-6,-14,-25,-18,0,-3,-4,-1,-9,-15,-5,-5,-5,4,1,-24,-9,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-2,23,-20,11,-3,-16,-6,2,-16,-5,-18,-15,31,-19,-4,-7,4,-3,-20,-30,-11,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-31,-1,16,-27,-21,-10,-23,20,-24,-13,-7,11,5,12,-8,-9,-19,-25,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-7,-19,-12,-9,-8,-18,-4,0,-15,10,2,-1,-22,-5,-11,-7,-3,-5,-27,-7,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-21,24,-28,40,21,-28,-28,-20,-20,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-10,-20,-11,-18,-3,-21,-7,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-19,9,3,4,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=9,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,59,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-11,-15,-9,-20,3,-18,-14,-11,-15,-13,-5,-11,-9,-18,16,5,-4,-24,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-4,-11,-12,-8,-16,-7,-15,-10,-10,-14,-8,0,-12,-7,-14,17,15,-2,-29,-16,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-26,-11,-2,-19,-23,-2,-10,14,-9,2,-6,-16,6,11,-10,-6,-8,-22,-5,1;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-31,-22,-34,-25,27,-30,-22,14,-28,29,11,-28,-29,-26,-21,-26,-11,8,0,9,-24;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-12,-23,-18,-2,-23,-24,13,-16,2,2,-21,-22,-21,-17,-3,4,28,-26,-10,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,5,-26,1,12,-28,-10,-3,-20,9,-21,-9,7,-11,19,4,1,-4,-22,-25,-15,15;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-19,-10,2,-11,-22,-16,-5,-4,3,-2,-11,-15,-6,-7,-4,8,-2,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-2,-24,-16,-15,-9,-20,-1,-14,-4,0,-14,-16,-13,-20,2,-2,7,-23,-17,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-22,-1,2,-25,-2,-8,-25,11,-27,-14,7,-13,6,9,10,2,-19,-28,-16,4;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-27,-2,7,-27,-5,-8,-26,12,-24,-13,2,-6,8,11,0,-4,-22,-24,-17,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-11,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-3,15,-21,17,4,-26,-8,-6,-22,-2,-25,-18,13,-5,0,-7,12,3,-17,-35,-19,2;
MA   /M: SY='S'; M=23,-5,0,-9,-6,-20,-2,-15,-17,-11,-22,-16,1,-12,-6,-15,25,11,-6,-33,-21,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-25,9,23,-28,-15,-1,-23,8,-21,-13,6,-9,18,6,3,-5,-22,-28,-16,20;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-20,-33,-27,-2,-32,-28,34,-24,14,13,-22,-22,-22,-24,-13,-3,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-20,-9,1,-15,-19,-12,-13,-1,-9,-6,-6,-12,2,-1,3,14,-10,-16,-9,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00318;
//
ID   PEP_ENZYMES_PHOS_SITE_MP; MATRIX.
AC   MP00370;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PEP-utilizing enzymes phosphorylation site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9318919; R2=0.0169711; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=281; N_SCORE=10.691; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=34; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=11,-2,-23,-2,-7,-16,-10,-14,-13,-11,-8,-6,-10,-16,-9,-16,-6,-9,-10,-1,-9,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-22,-8,6,-18,-23,-10,-2,-4,-7,-2,-8,-16,7,-5,-3,-4,0,-27,-12,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-26,-21,-13,-4,-18,-14,-2,-16,9,2,-19,0,-15,-15,-17,-11,-6,-20,-8,-15;
MA   /M: SY='B'; M=-2,12,-19,11,-4,-24,2,-9,-22,-8,-21,-17,11,-10,-8,-11,0,-8,-19,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-16,-24,-20,-11,-7,-22,-6,3,-5,4,19,-13,-10,-1,-6,-12,-6,-2,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-6,10,-25,10,10,-22,-15,1,-26,15,-23,-14,7,-11,3,5,-2,-4,-20,-26,-10,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-16,-16,-18,-12,-3,-24,-3,-7,1,-5,0,-13,-23,-7,6,-12,-8,-1,-14,8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=20,-21,-13,-27,-20,-5,-17,-24,11,-18,6,3,-20,-20,-19,-21,-4,-2,19,-22,-11,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-11,-20,-13,-5,-13,-19,-11,-6,0,-5,-3,-8,-17,-4,1,-1,1,-1,-26,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-37,-29,28,-33,-25,25,-28,19,11,-23,-27,-29,-23,-19,-8,21,-12,8,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-17,-30,-24,2,-29,-25,25,-24,25,13,-26,-26,-22,-21,-17,-4,26,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-11,-11,-10,-10,-18,-19,-7,-12,-8,-9,-2,-12,-10,-11,18,39,2,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='B'; M=1,16,-15,14,4,-24,-9,-5,-22,0,-19,-16,14,-15,-3,-4,1,-5,-18,-31,-18,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-25,-2,11,-20,-20,-6,-13,4,-11,-6,-5,-14,8,10,-3,-6,-9,-26,-13,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-26,-13,-3,-16,-19,-6,-13,6,-13,0,-10,-1,3,10,-7,-5,-12,-18,-5,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,3,-11,-7,-8,-12,-17,-17,-12,-9,-13,-12,5,-11,-8,-9,21,44,-3,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,8,-6,-5,-20,-4,-14,-20,-13,-26,-19,4,-14,-5,-14,30,14,-9,-39,-21,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-15,-9,-17,-6,-19,-11,-10,-12,-11,-5,-10,-9,-16,16,17,-1,-25,-17,-9;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-10,-17,-9,-19,-2,-19,-10,-11,-13,-11,-7,-11,-9,-18,15,4,1,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-31,-26,2,-29,-22,28,-21,20,23,-27,-27,-21,-19,-17,-5,32,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-10,-16,-9,-19,-2,-18,-10,-11,-13,-11,-7,-11,-9,-18,15,4,1,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10,-1,-21,-15,-1,-31,27,-21,-11,0,-20,8,65,-9,-11,-21,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='S'; M=10,-2,-19,-2,8,-25,3,-11,-22,-6,-21,-15,0,-9,4,-10,14,3,-16,-28,-20,6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-24,-29,-20,11,-27,-13,12,-19,26,20,-25,-26,-14,-14,-26,-12,3,-1,11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,3,-2,-30,41,-13,-36,-12,-28,-21,5,-15,-10,-14,3,-14,-29,-25,-26,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-27,-28,-19,-6,-33,-24,24,-9,11,11,-17,-20,-14,-13,-18,-9,17,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-21,-15,-6,-26,-23,-22,-15,-14,-24,-16,-20,65,-13,-22,-11,-10,-22,-31,-27,-14;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,12,-19,-13,-16,-10,-18,-14,-14,-13,-12,-9,-17,-13,-19,8,5,-3,-25,-15,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-32,-26,2,-31,-27,30,-25,23,14,-27,-27,-24,-22,-17,-5,33,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=7,-23,-11,-25,-23,-5,-22,-24,18,-17,4,7,-22,-24,-21,-18,-2,2,32,-29,-12,-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-27,-10,-16,-26,48,-16,-33,-13,-25,-15,2,-19,-14,-10,0,-16,-25,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=6,-16,2,-21,-17,-11,-21,-24,-1,-17,-3,-5,-15,-10,-17,-19,0,10,7,-29,-15,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-26,13,3,-29,7,-10,-29,0,-25,-18,4,-9,-2,-6,3,-7,-21,-29,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-19,1,-1,-20,-1,-10,-13,-10,-16,-8,5,-12,-6,-13,2,-5,-13,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=6,-7,-18,-10,-4,-20,-19,-15,-2,-5,-8,-4,-8,-14,-1,-9,-4,-7,-1,-24,-13,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-20,-17,-11,-11,-19,-17,-2,-9,-1,-1,-9,-9,-8,-7,-1,12,-1,-25,-10,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00527;
//
ID   PTS_EIIA_TYPE_1_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00371;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTS EIIA domains phosphorylation site signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3360329; R2=0.0152926; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=517; N_SCORE=13.232; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-10,-21,-14,-6,-5,-20,-11,-5,-6,-1,0,-7,-18,1,-5,-5,-2,-6,-21,-5,-2;
MA   /M: SY='I'; M=6,-21,-17,-27,-21,-4,-25,-25,19,-21,12,7,-18,-20,-18,-21,-7,4,19,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-21,-34,-24,59,-28,-14,-2,-24,7,0,-18,-27,-27,-17,-17,-9,-3,7,27,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-31,2,5,-28,-12,-6,-25,6,-28,-17,-3,27,-1,-4,-3,-7,-25,-29,-19,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-12,-9,-10,-13,-11,-19,-14,-11,-14,-12,1,-11,-10,-11,21,41,-4,-31,-13,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-29,-2,-2,-25,5,4,-30,15,-26,-12,8,-17,1,14,-5,-12,-24,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-10,-20,-11,-19,-2,-20,-8,-11,-10,-9,-10,-11,-11,-19,10,1,3,-22,-19,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-21,-34,-27,29,-32,-18,20,-25,15,9,-23,-28,-27,-21,-19,-8,17,-6,19,-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-20,-15,-16,-22,30,-20,-19,-19,-19,-12,-5,-19,-17,-20,1,-12,-13,-24,-23,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-36,-27,17,-34,-25,30,-29,28,16,-24,-26,-24,-24,-23,-9,20,-16,4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-25,6,13,-24,-20,-8,-18,10,-16,-9,-3,-12,5,7,-3,-4,-10,-27,-14,9;
MA   /M: SY='T'; M=5,-5,-13,-11,-10,-12,-11,-16,-6,-14,-10,-8,0,-14,-9,-13,16,19,0,-32,-14,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-28,31,20,-32,-13,-2,-31,9,-26,-21,13,-7,7,3,0,-6,-26,-32,-18,13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-1,12,-18,7,1,-20,4,3,-21,-4,-23,-15,19,-13,0,-3,10,-1,-20,-29,-16,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,-15,-28,-22,-4,-24,-25,18,-19,12,7,-21,-22,-20,-19,-8,-1,24,-24,-9,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-29,9,38,-26,-21,-4,-23,14,-16,-13,-3,-6,15,4,-5,-10,-22,-27,-16,26;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-29,-20,-33,-26,1,-32,-27,32,-25,22,15,-25,-25,-23,-24,-17,-6,30,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-22,13,-29,-19,21,-26,37,23,-27,-28,-20,-19,-25,-9,14,-18,2,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,39,-27,23,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-35,-29,10,-34,-27,34,-26,19,16,-24,-25,-25,-24,-18,-7,30,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-30,45,14,-36,8,-4,-38,-4,-29,-26,15,-12,-3,-11,0,-12,-30,-35,-22,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-29,-12,-30,-29,-1,-29,-29,29,-21,11,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,44,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,10,-24,5,10,-28,-12,0,-23,16,-26,-12,16,-12,17,11,5,-3,-23,-28,-15,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,7,-30,-18,24,-26,40,27,-27,-27,-16,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-12,22,-26,20,11,-27,-4,1,-29,9,-27,-19,26,-14,4,10,1,-7,-28,-32,-18,7;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,10,26,-28,-17,-5,-27,19,-23,-15,3,-7,11,9,-1,-4,-22,-27,-16,19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-30,-11,-15,-20,40,-12,-34,-10,-26,-16,-3,-17,-15,-12,-5,-18,-26,-13,-16,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-34,-24,64,-29,-17,-3,-22,5,-1,-17,-27,-29,-15,-18,-10,-4,6,24,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,-22,-6,5,-18,-22,-16,-10,-1,-14,-10,-7,3,-4,-7,3,12,-5,-28,-14,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,-9,-17,-12,-9,-19,0,-15,-14,-7,-17,-11,-4,-12,-7,-4,11,5,-4,-27,-18,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-7,-27,-8,-1,-1,-23,36,-13,-10,-7,-1,-2,-20,-2,-6,-12,-13,-15,-18,16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-17,-24,-21,-4,-26,-20,16,-16,2,4,-23,-17,-18,-17,-8,-1,25,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-24,2,18,-20,-20,-8,-14,2,-8,-8,-4,-11,7,-2,-3,-3,-12,-27,-13,12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-27,15,33,-29,-18,-2,-25,9,-20,-16,1,-7,16,4,1,-7,-22,-29,-17,24;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-27,-7,-17,-26,43,-19,-30,-14,-24,-16,-3,-20,-18,-14,-2,-16,-18,-23,-25,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00528;
//
ID   PTS_EIIA_TYPE_2_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00372;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTS EIIA domains phosphorylation site signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1485076; R2=0.0150884; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=253; N_SCORE=8.956; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-19,-12,-6,-11,-6,-13,-14,-3,-11,-8,-3,-15,-3,-7,2,-1,-10,-21,-11,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-30,-16,-22,-24,50,-22,-23,-22,-21,-13,-4,-20,-20,-22,-4,-18,-19,-20,-24,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-13,-10,-17,-13,0,-21,-5,-5,-10,-3,-3,-11,-23,-8,-11,-6,-1,-4,-11,15,-12;
MA   /M: SY='V'; M=2,-16,-14,-17,-20,-8,-22,-23,16,-17,0,2,-14,-23,-20,-18,-2,0,27,-31,-12,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,4,-22,6,20,-26,-15,-3,-22,4,-20,-13,2,-8,13,-2,8,4,-19,-29,-15,17;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-6,-34,2,15,-27,-19,-3,-24,0,-25,-17,-7,39,3,-5,-7,-10,-28,-29,-20,6;
MA   /M: SY='Q'; M=3,2,-13,0,2,-26,-5,-8,-22,-2,-19,-13,3,-15,4,-1,2,-7,-18,-28,-18,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-27,-24,-22,34,-30,10,3,-14,2,1,-21,-30,-16,-12,-19,-9,-3,21,64,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-23,-28,-25,14,-26,-21,19,-24,14,8,-21,-26,-24,-22,-17,-9,17,-14,6,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,18,-27,23,25,-34,-14,3,-27,5,-23,-15,11,-9,25,0,3,-8,-28,-30,-17,25;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-17,-5,-3,-22,2,-16,-18,-5,-18,-13,-3,-12,-7,-12,9,1,-8,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-22,-33,-24,1,-28,-14,30,-19,23,39,-22,-22,-11,-18,-21,-9,19,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-24,-28,-19,13,-29,-16,13,-17,25,14,-22,-26,-16,-11,-23,-10,6,-13,7,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,18,19,-28,-12,-4,-27,6,-18,-15,3,-11,9,5,-3,-8,-23,-28,-16,14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-26,-7,-1,-20,-12,-2,-28,20,-22,-12,5,-18,6,48,-1,-5,-19,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-25,12,36,-24,-21,-7,-19,3,-15,-15,-3,-6,8,-5,1,-1,-15,-31,-17,22;
MA   /M: SY='K'; M=2,-6,-24,-7,4,-22,-13,-12,-16,11,-14,-7,-5,-12,4,2,-3,-5,-12,-23,-13,4;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-11,-21,-16,-9,-9,-22,-8,7,-12,11,15,-9,-21,2,-9,-12,-6,1,-24,-7,-4;
MA   /M: SY='A'; M=1,-11,-22,-16,-15,-7,-3,-3,-12,-15,-9,-6,-7,-20,-12,-14,-3,-2,-8,-7,-1,-14;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-19,-2,-6,-23,16,-12,-25,-12,-29,-19,9,-5,-7,-13,20,6,-19,-33,-23,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-18,-11,-9,-15,-21,-21,-10,-11,-14,-11,-7,16,-11,-13,10,31,-5,-30,-15,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-22,-27,-25,-22,27,-15,-2,-7,-16,-4,-5,-18,-26,-19,-15,-16,-11,-10,23,40,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-33,-24,10,-31,-20,26,-26,33,24,-26,-26,-19,-21,-24,-9,16,-19,1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-27,9,16,-22,-13,5,-22,-1,-25,-18,16,8,4,-5,2,-5,-27,-30,-14,8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-26,-10,-17,-14,41,-15,-30,-18,-25,-17,3,-20,-18,-17,3,-12,-23,-19,-18,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,36,-27,25,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-34,-26,2,-32,-23,35,-24,23,26,-24,-24,-18,-22,-20,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-21,-9,-3,-17,-21,-12,-16,12,-13,-7,-3,-14,2,16,1,14,-8,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-27,-4,-1,-18,-16,-15,-8,-12,-10,-9,-6,11,-8,-15,-4,-2,-11,-29,-17,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,11,-27,17,33,-30,-15,-3,-26,5,-22,-18,4,0,13,-3,1,-8,-26,-29,-19,23;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-3,-2,2,-26,-6,-13,-23,-5,-19,-15,-3,-13,-2,-12,5,-3,-14,-29,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-25,-7,-6,-21,-4,-14,-20,12,-17,-8,-5,-17,-5,12,-7,-6,-10,-23,-14,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-19,17,12,-21,-12,1,-21,9,-17,-12,5,-7,5,2,0,-3,-16,-22,-9,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=5,-22,-11,-24,-21,-2,-21,-22,21,-16,8,7,-20,-20,-20,-17,-7,-2,30,-21,-8,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-8,-26,-10,1,-15,-23,-3,-7,4,0,2,-5,-18,6,6,-13,-10,-11,-23,-6,2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-28,-3,2,-22,-19,5,-19,15,-20,-7,-1,-7,7,8,-7,-10,-18,-20,-3,3;
MA   /M: SY='T'; M=0,3,-14,-5,-9,-3,-13,-13,-12,-11,-14,-12,7,-15,-11,-11,14,21,-6,-28,-9,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-16,-15,-18,-20,39,-19,-29,-19,-22,-15,-5,-21,-16,-18,-2,-15,-19,-21,-23,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-20,-34,-26,12,-30,-24,26,-25,19,16,-24,-25,-23,-22,-17,-7,23,-18,1,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=1,-7,-7,-10,-7,8,-7,-8,-3,-9,-5,-4,-3,-10,-9,-8,6,3,1,-10,-1,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-13,-11,-18,-14,-12,-21,-19,0,-9,-6,-3,-10,-18,-10,-4,4,12,10,-28,-12,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00528;
//
ID   GART_MP; MATRIX.
AC   MP00373;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoribosylglycinamide formyltransferase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0574026; R2=0.0174322; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=179; N_SCORE=9.168; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=26; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-14,-19,-12,-17,5,-19,-9,-14,-6,-4,-10,-15,-12,-19,1,-6,-4,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=30,-3,-14,-11,-6,-21,-4,-9,-15,-5,-16,-12,-1,-11,-5,-10,11,2,-7,-25,-17,-6;
MA   /M: SY='P'; M=0,-19,-32,-14,-5,-24,-18,-21,-15,-11,-23,-16,-19,57,-12,-19,-7,-6,-19,-20,-23,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-24,-28,-31,-23,0,-34,-11,29,-23,13,14,-16,-21,-14,-19,-18,-10,17,-19,4,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,5,-29,3,13,-31,-15,21,-24,11,-23,-6,9,-13,31,11,-2,-11,-28,-25,-7,21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-14,-23,-15,-7,-11,-19,-2,-20,3,-16,-9,-10,-21,3,16,-11,-11,-19,11,7,-4;
MA   /M: SY='A'; M=34,-11,-3,-19,-11,-19,-6,-19,-8,-11,-11,-9,-10,-14,-9,-18,9,2,2,-25,-19,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-26,-30,-23,2,-34,-24,32,-27,25,16,-21,-23,-17,-24,-21,-9,19,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-28,-15,4,-10,-25,-11,3,-8,3,8,-14,-15,1,-10,-14,-11,-4,-10,-3,1;
MA   /M: SY='N'; M=10,12,-18,4,-1,-21,-2,2,-19,-5,-21,-15,18,-14,-2,-8,9,-1,-18,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-16,-30,59,-19,-39,-12,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,23,-28,35,20,-31,-14,-6,-26,0,-22,-20,6,-5,1,-9,-2,-9,-20,-34,-19,10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-1,-22,-2,6,-21,-17,-11,-18,11,-16,-10,-1,-11,1,7,1,4,-12,-26,-13,3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-26,4,27,-20,-22,-2,-20,8,-15,-11,-4,-9,9,2,-3,-5,-16,-25,-10,18;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-12,-8,-7,-15,-10,-11,-15,-10,-16,-12,2,-11,-7,-11,21,31,-5,-31,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-2,-27,-24,-4,-28,-24,16,-21,2,5,-16,-20,-22,-21,-9,-2,20,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,2,-13,-12,-11,-18,-17,-9,-12,-10,-3,-3,-14,-9,-12,14,32,-1,-32,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-33,-27,0,-34,-28,34,-25,17,14,-23,-24,-22,-24,-14,-1,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-15,-24,-22,-15,-3,-23,26,7,-13,7,34,-11,-20,0,-9,-17,-13,-1,-21,8,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-29,-16,-4,6,-24,-3,-12,1,-6,-3,-13,-21,3,4,-15,-12,-15,7,17,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-22,-16,-29,-22,-1,-22,-11,21,-13,15,40,-22,-22,-10,-13,-15,-5,22,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-23,20,5,-23,-17,-10,-12,-7,-14,-13,6,-14,-6,-13,-1,-2,-6,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-24,6,22,-26,-16,-10,-20,10,-17,-13,-3,-8,5,-1,-2,-7,-14,-26,-16,13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-29,1,7,-30,23,-9,-33,2,-26,-17,1,-13,0,-4,-1,-14,-27,-23,-22,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-30,-22,6,-28,-15,22,-22,32,28,-27,-27,-16,-17,-23,-8,17,-20,2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=14,-3,-13,-11,-7,-16,-9,-16,-13,-7,-12,-11,-3,-10,-8,-11,13,24,-4,-26,-14,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-4,15,-28,23,10,-31,-11,-8,-27,0,-25,-21,4,11,-1,-8,0,-6,-23,-32,-21,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-24,-32,-24,-1,-31,-20,30,-21,15,25,-22,-13,-16,-21,-18,-8,22,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-21,-31,-22,4,-29,-21,23,-26,30,15,-25,-25,-19,-22,-21,-8,15,-18,1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=1,-15,-14,-19,-13,-5,-18,-12,2,-15,7,3,-11,-22,-13,-14,-7,-3,3,-24,-6,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-25,-7,6,-27,-20,-5,-11,9,-16,-2,-5,-13,23,5,0,-5,-11,-23,-11,14;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-22,-5,7,-21,-16,-7,-16,7,-14,-8,-4,-13,5,6,-1,-4,-11,-24,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=4,-4,-21,-5,9,-20,-15,-8,-18,9,-18,-11,-3,-11,2,5,3,-1,-11,-24,-12,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,3,-30,-27,-2,-31,-27,20,-24,10,7,-23,-27,-25,-23,-11,0,27,-29,-8,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-4,-31,2,10,-29,-15,-12,-23,1,-26,-18,-6,36,-2,-7,-3,-8,-25,-29,-23,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,-5,1,-11,-11,-12,-12,-8,-5,-7,-4,-15,-5,-9,-3,-1,-11,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,2,-27,8,13,-27,-12,-11,-22,-4,-20,-17,-5,17,-1,-11,-1,-7,-21,-30,-21,4;
MA   /M: SY='B'; M=-7,14,-23,14,9,-24,-3,-3,-25,-2,-22,-16,12,-12,1,-5,5,0,-21,-30,-16,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-28,45,19,-32,-13,-1,-29,0,-22,-17,12,-10,3,-8,-2,-9,-24,-34,-17,11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,10,-14,3,-5,-15,-14,-11,-16,-7,-17,-14,12,-12,-6,-8,18,32,-9,-33,-13,-5;
MA   /M: SY='A'; M=10,-14,-15,-18,-12,-8,-13,-20,0,-15,-4,-4,-12,-14,-14,-17,4,6,8,-26,-13,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,3,-24,6,9,-26,13,-11,-27,-6,-21,-17,1,-11,-2,-10,3,-7,-21,-26,-21,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,6,-19,5,11,-23,-14,-9,-19,-3,-18,-14,2,-8,6,-7,13,16,-14,-30,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-21,8,-30,-18,22,-26,39,23,-28,-28,-18,-19,-26,-9,14,-19,3,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-8,-23,-10,-2,4,-18,20,-15,-11,-9,-6,-5,-18,-5,-9,-4,-5,-14,-15,13,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-7,20,-27,26,21,-30,-13,0,-27,5,-22,-17,9,-9,10,-3,0,-8,-24,-30,-16,15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-28,-7,4,-24,-19,-6,-25,31,-21,-8,-2,-15,10,39,-8,-9,-17,-20,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-31,-23,10,-30,-21,23,-27,36,19,-27,-28,-21,-20,-24,-7,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-14,-12,-6,-17,-9,-2,-11,-8,-10,-4,-3,-15,-3,-9,6,-1,-7,-27,-12,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00319;
//
ID   MGMT_MP; MATRIX.
AC   MP00374;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8559589; R2=0.0144100; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=670; N_SCORE=14.501; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13,-3,-15,-22,-3,-22,20,-9,-5,-5,-22,5,55,-13,-10,-15,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-13,-15,-7,-20,-3,-4,-14,-10,-14,-10,-5,-11,-6,-16,12,0,-5,-24,-15,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-25,-15,-13,-16,10,-15,-21,-8,-18,-8,-7,-18,-9,-3,1,-4,-16,-3,-12,-11;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-11,-21,-11,-16,-4,-20,-6,-13,-2,-6,-13,-13,-11,-20,5,-1,1,-20,-17,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-24,24,-30,-25,-4,-27,-19,7,-22,12,17,-24,-30,-19,-20,-17,-8,13,-31,-11,-22;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-24,-7,-7,-27,24,-15,-30,2,-27,-16,1,-14,-7,-5,6,-7,-20,-24,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=1,-5,-22,-7,0,-22,-12,-8,-24,17,-23,-13,1,-14,4,27,6,-1,-14,-25,-14,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-34,-1,2,-28,-15,-11,-22,2,-30,-18,2,48,-5,-7,-5,-8,-28,-31,-25,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-29,-23,12,-31,-13,20,-23,26,13,-26,-29,-19,-19,-22,-8,15,-9,19,-23;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-24,-16,-7,-18,-14,-19,-9,-14,-8,-9,-15,25,-11,-19,-2,-4,-11,-26,-20,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-25,3,-32,-22,33,-26,29,25,-25,-25,-18,-22,-22,-9,23,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-29,1,-35,-29,39,-27,21,17,-25,-25,-23,-25,-18,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,18,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-10,-12,-27,38,-16,-34,-2,-26,-16,-1,-18,-11,0,-2,-15,-24,-20,-23,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-17,-3,3,-16,-11,-4,-19,20,-18,-8,1,-9,5,25,0,-2,-12,-16,-8,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-28,48,23,-33,-10,2,-33,2,-28,-26,26,-10,4,-6,2,-8,-30,-38,-20,13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-29,-12,-6,-13,-5,-13,-24,2,-22,-14,-7,10,-7,9,-5,-8,-21,-21,-14,-9;
MA   /M: SY='W'; M=3,-11,-24,-14,-10,-11,-4,-14,-19,-4,-20,-14,-8,-16,-8,-8,3,1,-14,7,0,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-14,-6,-9,-15,17,-13,-19,-11,-17,-12,2,-11,-9,-11,11,10,-11,-20,-15,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-22,-7,-15,-22,52,-15,-29,-15,-22,-15,0,-15,-15,-15,0,-15,-22,-15,-22,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-18,-7,-5,-19,-6,-13,-21,4,-21,-13,2,-13,-3,7,13,18,-11,-28,-14,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-39,-19,-14,-16,2,-19,-27,-8,-25,-18,-17,6,-11,-2,-17,-18,-28,28,-8,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-27,-6,-9,-29,36,-16,-34,0,-30,-17,1,-16,-9,-5,3,-12,-24,-23,-23,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-2,-26,-21,-10,-28,-26,9,-21,1,0,-25,1,-23,-22,-13,-6,14,-31,-16,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-12,5,-30,12,43,-28,-20,-1,-30,19,-21,-17,0,-5,17,15,-3,-10,-27,-27,-17,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20,21,-30,3,9,-19,21,9,-24,-30,-14,-14,-24,-10,-1,9,46,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00320;
//
ID   UDPGT_MP; MATRIX.
AC   MP00375;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   UDP-glycosyltransferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4032879; R2=0.0162621; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=600; N_SCORE=15.151; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-25,-3,-1,-20,2,-13,-18,-8,-16,-11,-5,-8,-3,-9,-1,-7,-14,-25,-17,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=3,-9,-11,-13,-8,-11,-12,-12,-12,-3,-13,-8,-7,-3,-9,-7,-1,0,-6,-21,-11,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-26,11,20,-24,-17,-5,-22,10,-18,-13,2,-9,7,4,-2,-4,-19,-26,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-28,-7,4,-18,-14,-7,-21,4,-17,-10,-5,3,3,12,-3,-6,-19,-24,-13,2;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-18,-10,-8,-12,-14,-15,-4,-10,-5,-5,-7,-16,-11,-12,1,4,2,-27,-11,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-22,3,8,-21,-12,-5,-20,7,-21,-13,10,-11,4,3,5,4,-17,-27,-12,5;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-9,-23,-9,-9,-12,-8,-15,-5,-11,5,0,-9,-20,-11,-10,-11,-8,-5,-24,-11,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-20,-14,-10,-16,-8,-16,-14,-5,-16,-9,-10,5,-10,-5,-4,-3,-11,-24,-14,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-21,-3,-4,-25,18,-12,-27,-7,-24,-16,3,-11,-6,-7,7,-5,-20,-27,-22,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-3,22,-13,10,-1,-14,-1,8,-14,-1,-19,-12,34,-13,0,-1,7,0,-18,-26,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-9,-15,-14,-4,-14,-17,7,-12,3,1,-11,-14,-14,-12,0,11,14,-19,-7,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-25,-18,-7,-1,-27,-8,3,-7,9,7,-14,-21,-6,-3,-17,-10,-1,-19,-1,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-14,-24,-20,5,-24,-17,18,-19,13,8,-19,-21,-19,-16,-11,-1,21,-19,-2,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-14,-22,-14,-8,-11,-23,-9,-2,0,-9,-1,-12,-13,0,0,-5,-2,3,-20,-2,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-27,10,6,-28,-4,-9,-29,11,-28,-17,4,-2,2,3,2,-5,-23,-28,-17,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,20,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,130,30,-21;
MA   /M: SY='L'; M=6,-22,-11,-28,-20,8,-21,-22,8,-22,12,3,-19,-23,-21,-20,-9,-4,11,-19,-4,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-37,0,4,-31,-18,-15,-22,-7,-29,-20,-11,67,-5,-17,-6,-9,-29,-31,-27,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,-1,18,-38,-20,9,-18,8,-17,1,-1,-11,57,9,-1,-10,-28,-20,-10,38;
MA   /M: M=-8,-5,-22,-10,-6,-11,-19,-8,-5,-4,-5,-1,0,-13,-3,-1,-5,-1,-6,-25,-9,-5;
MA   /M: SY='D'; M=1,16,-24,20,12,-28,-9,-2,-25,1,-19,-17,7,-11,1,-4,1,-7,-19,-30,-17,6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-19,-32,-26,3,-32,-25,30,-25,24,15,-26,-26,-23,-22,-18,-6,28,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,9,-30,-20,21,-29,47,22,-29,-29,-19,-20,-29,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=9,-4,-21,-7,-3,-24,9,-4,-24,-3,-22,-14,2,-14,-1,0,7,-4,-17,-25,-17,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-29,1,4,-22,-18,80,-28,-8,-20,-2,9,-18,13,0,-5,-16,-28,-30,13,5;
MA   /M: SY='P'; M=2,-10,-29,-7,0,-27,-10,-15,-22,0,-26,-16,-8,31,-3,-5,1,-5,-21,-27,-22,-4;
MA   /M: SY='K'; M=2,7,-21,3,3,-25,-9,-4,-23,14,-26,-13,12,-12,5,7,8,-1,-18,-29,-15,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-10,-26,-22,-2,-28,-24,18,-20,13,9,-20,-23,-20,-19,-7,9,22,-27,-7,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-24,-5,-5,-23,10,-12,-25,11,-21,-11,-2,-14,-4,10,-4,-11,-16,-19,-16,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,1,-19,-16,-13,1,-20,-8,-16,-3,-6,-13,-18,-16,-19,-2,-6,0,-22,-17,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-20,-36,-27,64,-28,-14,1,-27,9,2,-19,-29,-34,-19,-18,-10,1,5,26,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-19,-33,-28,1,-33,-27,35,-24,20,18,-26,-26,-23,-23,-17,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-6,-9,-9,-13,-15,-18,-12,-11,-14,-11,1,-11,-8,-11,22,39,-2,-32,-13,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,3,-23,-20,85,-28,-7,-20,0,8,-18,18,2,-8,-18,-30,-28,15,6;
MA   /M: SY='G'; M=8,-12,19,-17,-19,-24,22,-22,-30,-20,-23,-18,-7,-23,-19,-22,2,-10,-17,-30,-27,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-26,-28,-28,-20,4,-20,-18,-2,-17,1,-1,-25,-24,-12,-16,-19,-12,-6,37,11,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-22,13,2,-24,-1,10,-21,0,-27,-16,42,-18,9,0,8,-3,-28,-35,-17,5;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-14,-3,-4,-21,11,-13,-23,-12,-28,-19,7,-12,-4,-12,31,15,-13,-35,-21,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-12,-25,-21,-2,-27,-24,17,-21,6,4,-16,-21,-19,-19,-2,9,21,-27,-7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-14,-24,-13,-13,4,-27,-10,8,-19,20,10,-17,-24,-12,-16,-20,-10,1,-15,8,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-13,-12,-9,-21,9,-17,-17,-12,-19,-14,-2,-12,-9,-16,18,7,-7,-26,-21,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-33,-25,7,-31,-24,28,-26,25,17,-24,-25,-21,-23,-19,-8,23,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-4,-14,-7,-4,-8,-17,3,-13,-8,-14,-10,-2,-19,-3,-8,1,0,-11,-15,6,-5;
MA   /M: SY='H'; M=5,-2,-14,-8,-7,-10,-10,13,-17,-10,-17,-9,6,-17,-5,-9,7,0,-13,-25,-1,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-8,-15,-26,45,-16,-32,-13,-24,-17,1,-19,-15,-10,-1,-16,-24,-21,-25,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-10,-27,-25,-3,-30,-28,23,-18,7,7,-22,-25,-24,-19,-7,5,34,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-39,-10,1,-30,-20,-18,-21,-7,-29,-19,-18,80,-6,-13,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-24,-17,-29,-23,1,-25,-14,22,-17,20,34,-23,-24,-13,-15,-16,-5,22,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-17,-32,-26,2,-29,-27,28,-24,19,12,-26,-26,-24,-22,-15,-5,31,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,0,-19,-18,-18,9,-20,-15,-17,-11,-6,-8,-19,-16,-20,0,-3,-8,-26,-20,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-29,-26,-32,-24,4,-27,-22,14,-19,11,11,-26,-26,-18,-14,-22,-10,11,15,4,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,86,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-29,-18,11,-28,-14,16,-22,29,24,-23,-25,-11,-16,-23,-10,7,-17,2,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-22,-28,-20,31,-23,-4,-2,-16,3,9,-15,-24,-18,-13,-14,-7,-3,2,19,-18;
MA   /M: SY='G'; M=11,-12,-21,-16,-17,-12,28,-19,-23,-17,-19,-14,-5,-18,-18,-19,5,-7,-14,-18,-18,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-19,42,-30,60,25,-38,-12,0,-38,3,-28,-28,16,-9,3,-6,0,-10,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,18,-39,-17,12,-21,8,-20,-1,0,-11,55,9,0,-11,-30,-20,-10,36;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-15,-28,-17,-9,2,-22,-2,-11,-6,-11,-4,-11,5,-9,-6,-11,-9,-13,-14,3,-10;
MA   /M: M=-12,-3,-22,-2,-8,-9,-13,-2,-14,-8,-7,-3,-6,-20,-8,-3,-11,-9,-12,-15,0,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,30,-20,16,-2,-19,-4,11,-18,-3,-26,-16,44,-20,-2,-3,7,-1,-23,-38,-16,-2;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-12,-20,-11,-15,-7,-19,-3,-13,-5,-3,-11,-14,-10,-18,4,-2,3,-23,-16,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-22,-7,-2,-16,-17,-5,-16,9,-14,-6,-3,-16,0,12,-3,-3,-9,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-15,-7,-8,-21,4,-8,2,0,6,-6,-21,0,13,-12,-9,-9,-21,-1,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-16,-29,-23,2,-26,-18,21,-21,21,19,-24,-25,-18,-19,-17,-6,20,-20,0,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-9,-10,2,-15,-22,-14,-7,-5,-9,-5,-10,-17,0,-8,0,3,0,-28,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-24,1,11,-21,-10,-4,-20,1,-16,-12,-2,-12,6,-2,0,-4,-17,-21,-9,7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-24,-6,-3,-8,-20,-4,-9,2,-6,-4,-3,-20,-5,3,-10,-8,-7,-20,-1,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-30,-3,-9,-30,45,-16,-38,-5,-29,-19,1,-17,-11,-9,-2,-17,-28,-22,-25,-10;
MA   /M: SY='V'; M=10,-22,-17,-28,-20,-2,-20,-22,13,-19,9,7,-20,-21,-18,-20,-8,-3,16,-15,-7,-19;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-14,-16,-25,40,-20,-26,-16,-22,-15,-4,-16,-16,-19,4,-12,-17,-21,-25,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-14,-24,-15,-6,-14,-25,-8,-3,6,-7,-1,-10,-19,-4,14,-9,-5,4,-24,-8,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00359;
//
ID   ADOMET_SYNTHETASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00376;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-adenosylmethionine synthetase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6526051; R2=0.0134037; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=693; N_SCORE=13.931; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-3,-1,-20,0,-11,-19,-10,-27,-19,7,-10,-1,-11,36,17,-9,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-28,-9,1,-15,-21,-12,-10,-5,-7,-7,-13,11,-5,-5,-9,-8,-14,-22,-9,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-28,38,31,-33,-12,1,-31,4,-25,-23,15,-7,9,-5,2,-8,-28,-34,-20,20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-27,-30,-19,-5,-33,-20,29,-19,9,11,-17,-19,-10,-18,-14,-9,18,-18,1,-18;
MA   /M: SY='R'; M=5,3,-16,-2,2,-23,-11,-5,-21,5,-19,-12,8,-15,6,10,3,-3,-17,-26,-16,3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-6,-22,-6,-1,-17,-11,-2,-7,-2,-4,7,-7,-14,14,-2,-7,-9,-10,-16,-4,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-24,-3,-9,-27,40,-16,-31,-13,-24,-18,0,-15,-12,-16,3,-12,-23,-22,-25,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-17,-22,-16,-4,-21,-18,15,-18,10,7,-21,-23,-18,-17,-12,-5,22,-25,-8,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-22,6,-3,-20,2,8,-20,-10,-15,-10,9,-17,-2,-9,1,-7,-18,-29,-11,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,3,-16,1,5,-14,-7,3,-14,5,-11,-7,7,-9,5,8,-1,-3,-14,-17,-8,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-4,-10,-6,-4,-5,-9,-7,-4,1,-7,-4,0,-9,-4,3,1,0,-1,-13,-5,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,7,-19,7,7,-19,12,-4,-21,-3,-18,-13,8,-9,1,-6,2,-6,-19,-19,-15,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-17,13,14,-19,-8,-2,-19,7,-16,-13,7,-6,4,4,2,-4,-15,-21,-12,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-18,20,16,-21,-9,-3,-22,2,-18,-16,7,-6,4,1,6,1,-17,-25,-13,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-11,-18,-11,-9,1,-17,-11,3,-12,3,0,-9,-5,-10,-10,-8,-5,-1,-14,-1,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-17,13,17,-17,-10,-2,-18,2,-14,-13,2,-5,4,-3,3,-1,-14,-19,-8,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-22,13,20,-25,-13,-2,-19,1,-13,-9,0,-7,14,-4,-1,-7,-18,-24,-14,17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-16,-24,-19,-6,-10,-26,-12,12,-13,11,9,-13,-16,6,-11,-12,-6,2,-19,-4,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-8,-19,-29,65,-18,-39,-19,-30,-20,4,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-22,-27,-20,0,-27,-7,20,-21,12,16,-16,-22,-14,-19,-12,-6,14,-24,0,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-18,-29,-21,3,-23,-10,18,-14,16,38,-19,-21,-9,-13,-14,-1,14,-21,-1,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-29,62,-30,-18,6,-27,10,2,-21,-30,-35,-20,-19,-9,7,5,28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-21,-20,32,-25,17,-4,-14,-1,-1,-17,-29,-14,-11,-18,-11,-11,20,62,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-12,37,-20,-20,-12,-25,-25,-11,-19,-10,-10,-12,-24,-20,-19,4,21,4,-37,-17,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-25,37,9,-29,-7,3,-30,3,-29,-23,32,-15,1,4,5,-5,-28,-37,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-4,-31,3,19,-29,-17,-12,-24,4,-25,-18,-8,33,2,-7,-3,-8,-25,-29,-23,9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-23,12,24,-26,-17,-4,-22,2,-19,-15,5,-8,14,-3,7,5,-19,-31,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-21,-30,-21,20,-29,-13,15,-26,36,18,-27,-29,-19,-18,-27,-10,6,-9,15,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-1,20,-11,22,58,-21,-21,-1,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-18,-28,-18,1,-22,-18,15,-23,31,18,-24,-24,-15,-19,-19,-8,9,-20,-5,-17;
MA   /M: SY='P'; M=0,-13,-29,-11,-6,-26,-2,-20,-21,-12,-25,-17,-11,42,-11,-18,0,0,-21,-28,-26,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-27,-31,-24,-1,-34,-12,31,-25,14,14,-17,-21,-16,-23,-16,-9,19,-21,4,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-18,-17,-13,-1,-23,-7,3,-13,0,1,-12,-19,-11,-13,-1,10,6,-17,8,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00369;
//
ID   ADOMET_SYNTHETASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00377;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-adenosylmethionine synthetase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2601218; R2=0.0117397; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1265; N_SCORE=19.101; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=191; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,-17,-31,-25,-5,-26,-28,27,-21,9,9,-22,-22,-22,-23,-9,-3,31,-24,-9,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-28,-29,-34,-24,20,-20,-18,-2,-18,0,9,-25,-24,-18,-17,-23,-15,-7,45,15,-18;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='R'; M=4,-10,-23,-13,-3,-20,-13,-7,-23,16,-17,-10,-3,-17,3,39,-3,-7,-13,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,8,-18,-11,-20,-4,-20,-14,-13,-14,-13,-8,-14,-11,-20,12,2,-3,-27,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-10,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-30,-10,-16,-28,51,-16,-38,-10,-28,-18,0,-20,-14,-1,-2,-18,-28,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,63,26,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='P'; M=4,-18,-33,-12,-2,-28,-15,-20,-18,-10,-25,-18,-18,66,-10,-20,-5,-8,-23,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,37,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-20,-15,-15,-25,33,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=15,-19,-19,-29,-19,-8,-18,-19,17,-17,7,17,-16,-16,-11,-21,-7,-6,13,-20,-8,-17;
MA   /M: SY='A'; M=41,-13,-11,-21,-11,-16,-4,-20,-6,-13,-1,-6,-13,-13,-11,-20,4,-1,1,-20,-17,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-10,-30,-10,-4,-1,-25,28,-11,-3,-10,0,-9,-22,17,-2,-12,-11,-20,5,41,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00369;
//
ID   HEXOKINASES_MP; MATRIX.
AC   MP00378;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hexokinases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6014524; R2=0.0139953; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=977; N_SCORE=18.265; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=136; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-21,-6,2,-20,-16,0,-15,0,-18,-10,-1,-7,0,-2,7,4,-10,-29,-11,0;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-27,20,22,-20,-10,-3,-27,3,-21,-19,7,-5,3,-2,-2,-9,-25,-26,-15,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-16,-21,-19,-19,32,-13,-17,-12,-22,-4,-8,-11,-12,-27,-19,-14,-11,-11,-8,6,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-15,-9,-2,-10,-19,-14,0,-15,6,-1,-10,-20,-8,-14,-9,-6,-1,-28,-12,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-30,25,24,-31,-17,1,-31,18,-24,-17,5,-9,8,9,-5,-10,-25,-29,-14,16;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-8,-23,-12,-2,11,-17,-8,-14,-4,-8,-8,-3,-19,-9,-2,-6,-6,-13,-13,5,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-4,-24,-6,0,-18,-7,14,-15,-5,-12,-1,-1,-16,4,-5,-5,-9,-15,-19,-5,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-8,-14,-9,-9,-13,10,-6,-20,-15,-10,-9,-5,-19,-9,-14,-7,-13,-18,-20,-11,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-8,-26,-3,4,-22,-18,-13,-13,-6,-12,-5,-12,22,-4,-11,-11,-10,-17,-28,-18,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-26,12,22,-27,-15,-2,-24,11,-23,-15,9,0,12,3,1,-3,-24,-28,-16,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,2,-3,-27,24,-8,-28,-8,-24,-16,6,-16,-8,-11,-1,-13,-23,-26,-21,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-28,4,20,-27,-16,-5,-26,17,-22,-13,-1,-4,12,15,-2,-6,-22,-26,-15,15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-27,-6,0,-21,-15,-7,-17,6,-21,-10,-3,6,4,3,-3,-6,-17,-23,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-22,-23,-25,-15,4,-26,-13,5,-8,18,14,-19,-25,-11,5,-20,-9,3,-18,-1,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-2,-30,5,17,-29,-15,-12,-24,1,-25,-19,-7,31,1,-9,-1,-7,-24,-30,-23,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-31,-22,7,-29,-19,23,-26,40,24,-28,-28,-19,-19,-26,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=4,-23,35,-28,-26,-10,-25,-28,2,-22,-2,-3,-23,-30,-26,-24,-8,-4,18,-35,-18,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-5,2,-21,0,-1,-21,-15,-4,-16,7,-18,-7,5,-16,4,9,2,0,-10,-28,-13,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-29,0,18,-38,-19,12,-20,8,-21,-1,1,-10,54,8,2,-8,-29,-22,-9,36;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-19,-11,-6,-15,-18,-15,-8,-4,-8,-6,-4,-8,-5,-4,2,12,-4,-27,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=8,1,-16,0,-2,-23,10,-11,-24,-7,-29,-19,8,-12,-3,-9,26,8,-15,-34,-21,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26,4,-35,-26,37,-30,32,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-6,28,-19,23,3,-23,-5,-1,-23,-4,-27,-21,31,-14,-1,-6,16,9,-21,-39,-19,1;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-5,4,10,-25,-11,-3,-26,0,-26,-17,4,-12,4,-4,15,3,-17,-35,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-23,-9,-14,-27,46,-18,-32,-17,-28,-19,1,-17,-14,-18,10,-9,-22,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-20,-22,-18,2,-26,-18,12,-18,1,1,-10,-17,-15,-18,1,15,9,-19,4,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-24,-31,-22,-3,-32,-23,31,-23,18,16,-20,-22,-12,-21,-16,-7,22,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-26,1,5,-23,-15,-3,-27,20,-22,-13,7,-15,6,34,-2,-5,-19,-25,-14,3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-8,-16,-30,64,-19,-39,-18,-30,-20,0,-19,-18,-19,2,-18,-29,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,75,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,14,-22,15,12,-26,-9,-4,-26,10,-28,-19,14,-11,5,4,11,1,-21,-33,-17,8;
MA   /M: SY='I'; M=5,-22,-15,-31,-23,-6,-28,-27,24,-23,7,7,-16,-18,-18,-25,-7,0,19,-23,-8,-23;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-26,23,18,-29,-12,-6,-28,-1,-26,-22,6,6,2,-7,7,-1,-23,-34,-21,9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,12,-30,20,7,-32,19,-9,-36,-5,-28,-22,7,-7,-5,-8,-1,-14,-29,-29,-24,0;
MA   /M: SY='V'; M=11,-17,4,-24,-20,-10,-20,-24,5,-17,-2,0,-17,-21,-19,-19,0,8,17,-29,-14,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-9,-22,-6,16,-16,-25,-15,0,-5,-5,-5,-14,-14,-4,-11,-5,-6,7,-29,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-4,-17,-29,60,-16,-38,-17,-30,-20,7,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-13,2,-30,2,13,-27,-19,17,-29,26,-25,-8,5,-12,15,22,-7,-12,-24,-24,-5,12;
MA   /M: SY='D'; M=-16,45,-27,57,15,-35,-8,1,-35,-1,-30,-28,27,-12,0,-8,4,-6,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-11,-31,-30,7,-30,-29,27,-21,10,9,-29,-30,-31,-20,-11,-1,46,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=14,-23,-6,-26,-24,-8,-15,-27,12,-18,1,1,-22,-24,-24,-20,-4,-2,28,-27,-15,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-7,-26,-7,2,-25,-2,-9,-21,-4,-21,-12,-5,5,7,-5,4,-3,-20,-23,-16,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,3,-25,-14,5,-27,-17,4,-23,22,11,-23,-27,-17,-18,-20,-10,1,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20,12,-30,-16,18,-28,45,18,-29,-30,-19,-19,-29,-10,8,-15,8,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00370;
//
ID   CDP_ALCOHOL_P_TRANSF_MP; MATRIX.
AC   MP00379;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CDP-alcohol phosphatidyltransferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5481725; R2=0.0196030; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=308; N_SCORE=12.576; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-2; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=6,-16,-19,-21,-14,-5,-17,-16,3,-15,2,0,-13,-16,-12,-15,-3,-2,3,-15,-5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-3,-17,-14,-9,0,-15,-15,-15,-14,-12,-6,-18,-14,-18,6,-1,-6,-21,-10,-14;
MA   /M: SY='A'; M=6,-15,-12,-20,-17,-4,-5,-16,-6,-18,-2,-3,-11,-20,-17,-18,-1,1,1,-22,-10,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-22,-30,-23,5,-24,-24,17,-24,16,8,-21,-24,-20,-22,-15,-6,12,-10,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-31,-24,10,-24,-23,20,-28,30,15,-24,-27,-22,-22,-23,-10,13,-18,0,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-32,-26,33,-30,-16,15,-24,15,9,-19,-27,-25,-19,-19,-8,10,-5,19,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-26,-16,-32,-24,23,-26,-22,13,-25,17,7,-22,-26,-25,-21,-15,-6,12,-13,5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-17,-29,-22,17,-27,-21,13,-24,20,8,-22,-25,-24,-19,-14,-1,14,-15,4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-17,-13,-11,-14,4,-12,-13,-12,-14,-11,-3,-15,-9,-16,10,0,-8,-20,-8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-13,-18,-11,-9,-6,-13,-9,-11,-8,-3,-9,-17,-7,-12,3,-3,-4,-20,-9,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-4,-29,-23,3,-29,-25,15,-24,15,7,-20,-24,-21,-22,-12,2,14,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-16,-5,-22,-17,7,-22,-19,-1,-21,10,1,-14,-22,-17,-16,-3,11,2,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=0,-19,-26,-24,-21,12,2,-18,-16,-19,-13,-12,-13,-22,-21,-18,-9,-12,-14,21,5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-7,-32,-24,21,-28,-22,11,-27,24,10,-25,-29,-26,-21,-21,-8,11,-16,3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-18,-25,-22,-16,13,-22,-3,-7,-5,-5,-1,-15,-23,-11,-1,-13,-8,-6,8,22,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-18,-25,-18,1,-26,-8,11,-20,16,10,-21,-25,-12,-16,-17,-9,9,-16,3,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-27,-11,-1,-19,-21,-10,-17,25,-11,-4,-6,-16,3,28,-12,-9,-12,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-23,-26,-26,-19,7,-25,-17,-1,-17,8,-1,-21,-24,-15,-11,-16,-1,-5,19,11,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,19,-23,9,-2,-23,11,3,-25,0,-26,-16,31,-18,-2,-1,3,-7,-27,-31,-18,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-23,-8,6,-24,-18,-4,-12,2,-8,-2,-6,-14,23,2,0,-3,-14,-23,-11,14;
MA   /M: SY='T'; M=1,-11,-16,-12,-8,-13,-13,-16,-4,-8,-10,-5,-9,-17,-7,-10,7,8,6,-28,-11,-8;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-12,-5,-6,-16,-3,-15,-17,-11,-21,-16,5,-11,-6,-11,28,30,-7,-34,-16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-23,3,2,-22,-15,-7,-22,6,-22,-15,7,-1,0,12,2,-2,-19,-30,-17,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-34,-24,40,-26,-16,9,-25,20,16,-22,-26,-25,-18,-20,-9,5,-5,13,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-22,-8,5,-25,-5,-12,-19,7,-18,-11,-4,-10,3,-1,1,-5,-13,-22,-17,4;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-22,-22,-25,-11,21,-28,-17,9,-20,16,9,-20,-23,-18,-17,-18,-9,6,-14,5,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-22,-33,-23,27,-30,-21,15,-30,35,13,-27,-29,-25,-21,-27,-11,7,-5,9,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-28,-10,-4,-21,-16,4,-14,-11,-20,-5,-8,30,-3,-13,1,-4,-18,-31,-15,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-13,-26,-22,2,-19,-23,12,-23,13,5,-19,-25,-21,-20,-10,-2,14,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-13,-22,-15,-12,-13,-22,3,-15,0,-2,-13,-15,-14,-20,3,5,10,-23,-14,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-23,-10,-3,-16,-18,-11,-17,18,-15,-7,-3,-17,-1,20,-5,-5,-9,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-5,-31,-26,3,-30,-26,20,-25,16,8,-26,-28,-24,-22,-16,-6,23,-19,-5,-26;
MA   /M: SY='M'; M=1,-8,-12,-15,-13,-3,-14,-11,-2,-15,-2,2,-2,-19,-10,-14,2,2,-3,-25,-6,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-17,-18,-18,9,-23,-16,5,-16,0,2,-11,-21,-18,-16,-4,6,9,-18,4,-18;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,-17,-19,-17,-11,2,-20,-4,-16,-7,-4,-9,-19,-17,-18,2,-1,4,-24,-15,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,0,-24,-21,-3,-18,-22,4,-21,3,0,-17,-24,-20,-20,-5,2,10,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-14,-21,-15,-8,-13,-21,1,-16,0,-3,-14,-14,-15,-18,3,5,9,-24,-13,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-25,-24,-15,-2,-26,-18,9,-21,16,11,-23,4,-15,-19,-18,-7,1,-23,-8,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-10,-30,-24,5,-27,-25,18,-23,9,6,-19,-23,-22,-22,-9,-2,20,-22,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-15,-25,-19,-2,-15,-19,7,-20,8,5,-16,-18,-17,-20,-9,-4,7,-21,-7,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-33,-25,15,-32,-22,25,-27,30,16,-26,-28,-23,-21,-23,-8,19,-17,4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-2,-20,-17,-10,-11,-20,-3,-17,-4,-5,-12,-20,-16,-19,3,4,5,-26,-12,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-12,-21,-13,-3,-4,-18,-8,-5,-9,-3,-3,-11,-18,-2,-10,-3,-4,-4,-16,3,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-8,-23,-11,-6,-6,-16,4,-8,-11,-7,-2,-5,-15,-6,-11,-4,-5,-8,-20,1,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00321;
//
ID   RHODANESE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00380;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rhodanese signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4417224; R2=0.0158449; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=235; N_SCORE=9.154; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-5,-20,-15,-14,-3,-17,-3,8,-13,14,23,1,-23,-6,-10,-14,-7,-2,-26,-6,-10;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-17,41,12,-23,-6,0,-23,0,-17,-17,12,-6,0,-6,0,-6,-17,-23,-12,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-6,-14,-10,-9,-5,-14,0,-8,-3,-3,-10,-10,-10,-13,3,0,8,-14,-11,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-12,-3,0,-14,-5,-4,-16,4,-18,-11,4,-9,3,14,14,6,-9,-22,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-24,-31,-25,-19,4,-13,-18,-12,-13,-13,-8,-23,-20,-11,-13,-20,-16,-17,79,15,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-9,-19,-11,-5,-3,-14,4,-8,0,-7,-3,-8,-15,5,2,-5,-6,-10,0,18,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-11,-7,-4,-8,-9,-10,-5,-7,-4,-5,-4,-2,-5,-7,5,7,-4,-19,-9,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-6,-33,2,12,-28,-11,-13,-24,-1,-26,-18,-9,44,-2,-10,-6,-10,-27,-27,-24,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-28,10,5,-30,26,-9,-33,-4,-25,-18,3,-13,-1,-9,-1,-14,-27,-23,-22,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-20,-20,-12,-4,-15,-18,3,-17,11,3,-19,-22,-12,-14,-13,-5,4,-9,-5,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-9,-13,-11,-7,-10,-13,-12,-1,5,-6,-1,-8,-11,-5,1,-4,-3,5,-15,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-13,-23,-19,10,-22,-18,20,-17,12,9,-16,-17,-17,-15,-11,-4,19,-12,1,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-16,-15,-13,-5,-22,-18,16,-15,7,5,-15,-17,-14,-16,-9,-4,18,-21,-7,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-25,35,30,-29,-7,-1,-30,3,-22,-21,8,-5,7,-5,0,-9,-25,-29,-18,18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-18,-9,-20,-14,-13,-22,-17,-4,-6,-7,-4,-13,-14,-11,4,-5,-4,3,-28,-14,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-12,9,-29,15,17,-25,-17,-6,-26,2,-22,-19,3,-1,5,1,-2,-2,-25,-17,-14,11;
MA   /M: SY='B'; M=4,17,-21,17,-1,-26,6,-8,-24,-7,-23,-19,15,-15,-7,-12,7,-5,-17,-32,-21,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-26,-16,-8,-18,-20,-8,-7,-5,-13,-6,-10,10,-7,0,-5,-4,-7,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-10,-23,-12,-1,-18,-19,1,-11,2,-2,1,-8,-17,10,3,-8,-6,-12,-21,-6,4;
MA   /M: SY='E'; M=3,-3,-21,-1,11,-17,-15,-10,-13,-6,-2,-8,-7,-13,-1,-6,-2,-5,-11,-27,-14,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-4,-24,-3,0,-16,-21,-14,-2,-9,3,-2,-9,-16,-4,-13,-10,-8,-4,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-24,-5,13,-18,-16,-11,-7,-6,-6,-6,-5,-12,3,-10,-3,-5,-8,-26,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-26,-7,-6,-26,30,-13,-32,-5,-25,-17,0,-16,-7,2,2,-12,-23,-22,-23,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,39,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-13,-14,-14,-16,-10,-21,-21,7,-12,-4,-2,-13,-21,-16,-11,2,6,20,-30,-12,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-14,-25,-19,-14,29,-24,4,-11,-5,-7,-4,-6,-24,-15,-1,-14,-10,-12,-1,24,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-20,-35,-27,25,-32,-24,24,-28,24,13,-25,-28,-27,-22,-21,-8,20,-14,6,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,35,-23,42,10,-31,-8,-3,-30,-3,-26,-24,21,-12,-2,-9,7,1,-23,-37,-19,4;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-13,-32,-15,-10,-8,-23,-19,1,-16,-5,-6,-11,-12,-11,-17,-15,-9,-8,13,-1,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-27,10,24,-28,-7,3,-28,7,-22,-16,5,-9,10,0,0,-10,-25,-27,-16,17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,8,14,-21,-17,-9,-18,0,-11,-12,-3,-12,1,1,-2,-2,-12,-28,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,9,-25,-16,7,-28,-18,0,-24,18,3,-22,-28,-19,-19,-18,-6,-1,-21,0,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-4,1,-22,-12,-4,-23,6,-25,-14,6,-5,9,18,6,-2,-21,-20,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-29,44,20,-33,-8,2,-33,-3,-22,-22,11,-11,1,-9,-3,-11,-27,-35,-17,10;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-12,-32,-10,-5,-15,-14,11,-22,-9,-22,-11,-8,27,-7,-11,-8,-8,-24,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-17,-13,-10,-11,-20,-14,-3,-5,-4,-3,-5,-19,-6,0,1,10,3,-27,-11,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-6,-16,-6,-6,-15,5,-10,-13,-6,-16,-10,0,-3,-5,-3,8,0,-10,-20,-14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-30,-14,-6,-14,-11,-18,-18,-5,-20,-14,-15,19,-11,-9,-9,-8,-17,-10,-14,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-11,-23,-15,-11,-6,-10,-4,-12,-3,-5,-5,-6,-21,-7,5,-7,-7,-10,-11,6,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-31,31,15,-32,-14,-7,-29,2,-27,-22,3,21,-1,-8,-4,-9,-27,-32,-21,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,-21,-25,-20,20,-17,-1,-3,-16,-1,3,-14,-25,-19,-9,-12,-9,0,-9,12,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00322;
//
ID   CLP_PROTEASE_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00381;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endopeptidase Clp serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0587683; R2=0.0144694; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=594; N_SCORE=13.644; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-30,-22,8,-28,-17,21,-23,31,26,-24,-25,-16,-18,-22,-6,13,-19,1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-13,-14,-10,-21,10,-18,-17,-12,-17,-13,-4,-12,-10,-18,14,3,-7,-24,-21,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,0,-37,-29,44,-27,19,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,33,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-27,-22,-21,32,-29,16,0,-14,2,2,-19,-29,-14,-11,-19,-10,-7,19,63,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,19,-39,-10,0,-40,1,-30,-29,19,-10,0,-8,0,-10,-30,-39,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-12,-15,-12,-9,-19,-20,-4,-12,-6,-4,-4,-11,-10,-13,13,36,3,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-20,-30,-20,0,-21,-3,21,-12,21,53,-20,-20,-3,-12,-20,-10,11,-20,-1,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,8,-27,4,15,-35,-16,9,-20,8,-22,-5,12,-12,44,8,2,-6,-29,-24,-12,29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-22,-23,-27,-22,41,-27,6,-2,-19,3,1,-16,-27,-21,-14,-16,-8,-5,7,39,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,0,-35,-29,40,-25,16,17,-24,-24,-23,-25,-16,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-25,-4,4,-24,-17,-5,-24,27,-22,-8,1,-13,7,25,-5,-6,-17,-23,-11,5;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-20,-12,-4,-26,-14,-18,-17,-10,-24,-17,-13,42,-8,-18,1,-4,-18,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-29,38,14,-35,-7,-5,-33,0,-28,-24,11,3,1,-9,1,-8,-28,-35,-21,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-15,-31,-28,-1,-31,-29,32,-22,10,11,-25,-26,-26,-22,-9,-1,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-15,-6,-2,-17,-12,-2,-14,-7,-16,-9,3,-15,5,-5,13,8,-10,-29,-10,1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-34,-26,4,-34,-24,33,-26,20,15,-23,-24,-20,-24,-19,-6,23,-14,4,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-20,83,-28,-28,-18,-23,-29,-20,-26,-15,-15,-20,-35,-28,-27,-8,-8,-1,-43,-26,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-33,-25,4,-30,-19,29,-22,25,29,-25,-25,-17,-20,-20,-8,23,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-23,-18,-6,-12,-24,-6,5,-8,5,16,-14,-19,14,-6,-10,-7,0,-21,-5,4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,1,-20,-11,-20,-2,-20,-12,-12,-12,-11,-10,-12,-11,-20,9,0,-1,-23,-21,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=3,-18,-18,-28,-18,-4,-16,-4,14,-10,14,45,-18,-18,-2,-12,-14,-8,8,-20,-4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,37,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-9,-5,-19,-1,-15,-15,-10,-20,-15,1,-10,-5,-14,26,13,-5,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-18,-35,-27,38,-30,-23,15,-28,22,9,-25,-30,-31,-20,-21,-8,15,-9,11,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-21,-32,-22,5,-30,-23,26,-28,37,17,-26,-26,-20,-22,-24,-9,17,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-29,-19,8,-28,-20,18,-28,45,18,-28,-28,-19,-20,-27,-8,9,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-3,-18,-12,-16,-8,-19,-7,-13,-10,-7,-8,-14,-11,-18,11,7,1,-26,-17,-11;
MA   /M: SY='G'; M=21,-9,-18,-13,-13,-25,31,-19,-25,-15,-22,-16,-3,-15,-13,-19,10,-6,-15,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=12,0,-15,-5,8,-19,-13,-12,-16,-4,-14,-13,-2,-8,-1,-9,12,16,-9,-27,-16,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-28,-6,2,-23,-20,-13,-15,16,-18,-6,-6,6,1,6,-8,-6,-13,-23,-13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-28,-9,-18,-28,58,-20,-36,-18,-28,-19,0,-16,-18,-19,2,-13,-27,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-2,10,-27,-20,-4,-23,33,-22,-3,-2,-11,14,21,-8,-9,-18,-22,-9,12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-23,-23,-28,-22,27,-27,-6,8,-22,11,6,-18,-25,-20,-17,-16,-7,3,-3,24,-21;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,8,-20,-14,-17,-8,-20,-9,-14,-10,-6,-11,-17,-13,-19,7,0,2,-28,-19,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-29,-20,16,-29,-20,15,-28,41,15,-26,-28,-21,-19,-25,-5,8,-18,2,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00358;
//
ID   CLP_PROTEASE_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00382;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endopeptidase Clp histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2785358; R2=0.0139995; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=417; N_SCORE=10.106; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=159; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-6,-20,-11,-20,-1,-20,-12,-10,-11,-11,-10,-12,-10,-19,9,-1,-1,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=8,-17,-17,-27,-17,-6,-13,-7,10,-11,10,37,-17,-17,-4,-14,-11,-7,7,-20,-6,-11;
MA   /M: SY='G'; M=22,-10,-21,-14,-16,-26,39,-20,-27,-16,-21,-16,-4,-16,-16,-20,4,-11,-17,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='A'; M=24,-4,-12,-8,-2,-21,-3,-13,-16,-8,-20,-14,1,-10,0,-12,24,11,-7,-30,-19,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-18,-34,-27,27,-31,-24,19,-27,23,11,-26,-29,-29,-21,-20,-6,20,-14,6,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-22,-33,-23,5,-32,-24,29,-29,36,18,-26,-26,-20,-23,-24,-9,18,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-29,-19,12,-27,-18,15,-27,39,15,-27,-28,-19,-19,-24,-9,7,-16,4,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-5,-21,-15,-12,-12,-21,-1,-15,-2,-3,-13,-17,-14,-18,5,5,8,-26,-15,-14;
MA   /M: SY='A'; M=24,-9,-14,-14,-12,-24,24,-19,-23,-14,-20,-15,-4,-14,-12,-19,10,-5,-13,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-28,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,2,-16,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='T'; M=8,1,-16,-2,7,-19,-14,-13,-16,-4,-14,-13,-2,-7,-2,-8,10,15,-8,-28,-15,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-29,-8,2,-24,-21,-11,-16,18,-19,-8,-7,5,2,8,-9,-7,-14,-23,-12,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-27,-3,-7,-28,44,-15,-34,-14,-27,-19,3,-16,-12,-15,3,-11,-27,-24,-26,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-28,1,12,-27,-18,-1,-26,32,-24,-7,3,-12,13,24,-7,-9,-21,-23,-10,12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-19,-28,-21,29,-28,-6,5,-22,11,5,-18,-26,-21,-17,-17,-8,1,-3,24,-21;
MA   /M: SY='A'; M=23,-13,4,-21,-15,-16,-8,-19,-6,-14,-9,-3,-11,-17,-12,-19,6,0,3,-28,-18,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-29,-21,16,-26,-19,12,-27,34,14,-25,-27,-21,-19,-23,-4,6,-14,3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-36,-9,4,-29,-18,-18,-20,-8,-27,-19,-17,73,-8,-18,-7,-9,-27,-29,-28,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-12,20,-23,9,-2,-17,-3,35,-24,-6,-25,-13,35,-20,1,-2,3,-7,-28,-33,-6,-2;
MA   /M: SY='A'; M=25,-6,-3,-12,-8,-19,-1,-17,-16,-12,-19,-15,-2,-12,-8,-16,20,11,-5,-30,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-29,-5,7,-21,-20,6,-29,23,-20,-11,1,-17,10,49,-7,-8,-21,-21,-9,5;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-20,-32,-28,10,-33,-23,29,-23,12,12,-23,-25,-24,-22,-14,-3,30,-17,6,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-8,20,-18,33,43,-24,-24,-8,-14,-24,-10,10,-20,0,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-36,-27,2,-35,-25,39,-27,25,23,-23,-23,-19,-25,-21,-9,26,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=5,-7,-13,-8,0,-11,-9,-6,-7,-8,-4,-2,-5,-11,-1,-8,6,1,-5,-21,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-18,-9,-13,-24,38,-16,-28,-15,-24,-16,0,-16,-11,-16,7,-9,-19,-23,-24,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-27,-7,-14,-28,52,-17,-35,-15,-27,-18,0,-16,-13,-16,2,-15,-26,-20,-26,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-20,-19,-26,-21,15,-21,-17,10,-20,7,4,-15,-22,-20,-18,-9,-1,9,-12,6,-21; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-26,-3,3,-21,-4,-2,-21,3,-19,-9,1,-15,13,5,0,-5,-20,-18,-5,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-7,-13,-28,54,-15,-37,-16,-27,-19,0,-18,-15,-16,0,-18,-28,-21,-26,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-6,-24,-7,4,-27,-15,-5,-15,2,-15,-4,-5,-5,22,0,1,1,-16,-23,-13,13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-13,-16,-9,-17,-8,-18,-9,-9,-11,-9,-9,-10,-7,-15,7,3,-2,-19,-16,-8;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-12,-6,-4,-17,-10,-14,-14,-8,-20,-13,3,-11,-1,-9,26,28,-6,-33,-15,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,49,20,-36,-7,1,-36,0,-28,-25,14,-8,3,-8,0,-10,-29,-35,-18,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-26,-30,-18,-2,-33,-19,30,-23,18,18,-19,-20,-14,-22,-17,-8,18,-22,-2,-19;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-23,5,16,-14,-17,-6,-16,-2,-11,-9,-3,-11,3,-5,-4,-6,-14,-21,-10,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-25,-32,-23,0,-33,-23,34,-23,18,17,-19,-20,-17,-21,-17,-7,23,-20,-1,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-27,-1,8,-23,-16,18,-18,-2,-12,-3,-1,-15,19,-1,-5,-11,-21,-21,-1,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00358;
//
ID   TYR_PHOSPHATASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00383;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Tyrosine specific protein phosphatases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.7969; R2=.01657001; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=477; N_SCORE=8.685; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=344; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-21,0,5,-18,-20,-6,-15,1,-6,-7,-6,-13,1,2,-8,-7,-13,-25,-10,2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-25,13,10,-22,-12,0,-24,5,-20,-15,8,-12,3,2,2,-4,-20,-28,-11,6;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-24,-34,-26,39,-27,-18,6,-25,9,2,-21,-25,-28,-20,-19,-10,2,10,19,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-21,-24,-16,2,-26,-18,13,-19,14,8,-19,-20,-15,-16,-14,-6,11,-20,-3,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-26,7,10,-24,-10,-2,-24,7,-22,-13,5,-8,8,6,1,-5,-21,-27,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-13,-21,-15,-5,-2,-19,-12,-4,-7,1,3,-12,-17,-6,-6,-9,-6,-3,-19,-4,-5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-12,-27,-23,-2,-27,-24,19,-19,11,8,-22,-24,-21,-19,-10,-1,24,-25,-7,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,5,-25,4,7,-23,-17,2,-22,13,-20,-9,6,-14,9,14,-2,-6,-19,-26,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-22,-2,3,-12,-17,-3,-14,-2,-13,-7,2,-13,2,-4,2,3,-12,-23,-6,2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-13,-23,-17,4,-24,-14,7,-15,5,4,-16,-21,-15,-13,-10,-4,7,-16,1,-16; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-7,-22,-9,-6,-4,-19,-5,-5,-5,-3,-2,-5,-17,-5,-2,-8,-4,-5,-18,1,-7; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-19,4,9,-22,-12,-5,-20,6,-19,-12,2,-1,5,4,0,-4,-18,-24,-15,6; D=-2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-19,-3,5,-16,-14,-3,-13,4,-12,-6,-4,-7,4,0,-2,-5,-10,-19,-9,4; D=-2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-14,-2,2,-11,-6,-4,-12,3,-9,-5,-2,-5,1,2,-1,-2,-9,-13,-7,1; D=-2;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-4,2,-19,1,3,-21,-9,-1,-21,-1,-19,-11,3,-12,4,-2,5,-1,-17,-28,-11,3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-25,0,5,-24,-14,-3,-20,5,-21,-12,1,4,4,2,0,-4,-19,-27,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-27,0,-10,-27,40,-11,-34,-13,-28,-19,7,-18,-11,-13,4,-12,-27,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-14,-10,-5,-24,0,-13,-24,-4,-22,-14,-6,4,-7,-5,-3,-8,-19,-28,-21,-8;
MA   /I: MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-17,-6,0,-17,-10,-9,-14,2,-14,-8,-6,8,-2,1,-5,-6,-13,-20,-13,-3; D=-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-18,-32,-26,-1,-32,-27,30,-24,15,13,-22,-21,-22,-23,-14,-3,28,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-13,-28,-23,0,-24,-22,18,-23,17,9,-23,-26,-22,-21,-14,-3,21,-24,-6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-31,-29,1,-31,-29,32,-22,12,11,-28,-28,-28,-22,-11,-1,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,-29,-1,-1,-19,-20,94,-28,-10,-20,0,9,-20,9,-1,-9,-18,-28,-29,19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-30,-30,-20,-28,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,-6,-15,-8,-4,-15,-9,-11,-12,-7,-15,-9,0,-15,-1,-4,16,8,-6,-31,-13,-3;
MA   /M: SY='A'; M=30,-4,-11,-11,-8,-20,-1,-13,-13,-10,-12,-9,-4,-13,-9,-17,6,-2,-5,-24,-18,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-14,-28,-22,-4,-27,-21,19,-20,10,8,-20,-24,-18,-18,-12,-4,21,-25,-6,-22;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-25,-5,-13,-27,46,-15,-34,-15,-29,-19,6,-17,-12,-15,9,-10,-25,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-10,1,-20,-20,-1,-28,28,-19,-10,0,-19,10,64,-9,-9,-19,-20,-10,1;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-8,-7,-6,-15,-11,-16,-14,-10,-18,-14,3,-10,-6,-11,27,35,-4,-34,-15,-6;
MA   /M: SY='G'; M=8,-11,-23,-12,-16,-26,42,-20,-30,-16,-25,-17,-4,-12,-17,-19,3,-12,-20,-22,-26,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-3,-18,-16,-7,-22,-20,0,-15,-3,-3,-10,-18,-14,-15,6,22,8,-28,-8,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-20,-34,-26,35,-30,-19,15,-26,20,11,-24,-28,-28,-20,-20,-8,13,-7,15,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,0,-31,-26,-5,-30,-27,22,-24,8,7,-20,-24,-21,-24,-11,-3,22,-27,-9,-26;
MA   /M: SY='A'; M=16,-18,-8,-24,-19,-10,-12,-22,4,-18,3,1,-16,-20,-17,-20,-3,-1,11,-24,-14,-18;
MA   /M: SY='I'; M=8,-21,-12,-27,-19,-5,-22,-21,13,-19,11,8,-18,-21,-16,-19,-9,-4,12,-23,-9,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,1,-25,5,0,-4,-18,3,-17,-8,-11,-10,-5,-19,-6,-10,-8,-9,-16,-4,14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-17,-25,-19,1,-27,-17,15,-21,17,11,-17,-23,-16,-17,-14,-4,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-23,-15,-29,-22,-1,-22,-16,19,-20,18,27,-20,-23,-14,-18,-17,-7,14,-23,-5,-19;
MA   /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-25,4,14,-21,-12,-4,-20,2,-18,-13,3,-8,4,-2,1,-2,-19,-25,-11,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-20,-3,1,-15,-10,-4,-18,-2,-11,-7,-3,-15,-1,-2,-6,-8,-16,-23,-8,-1;
MA   /M: M=-6,-3,-18,-5,-5,-19,-3,-10,-15,-6,-16,-9,0,-14,-5,-6,-1,-4,-10,-27,-15,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-16,-29,-22,6,-29,-21,19,-20,16,14,-23,-25,-20,-17,-17,-7,19,-17,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-24,25,8,-27,-8,-4,-27,2,-26,-20,13,-10,1,-2,8,1,-21,-33,-15,4;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-24,-22,-26,-19,-1,-27,-21,16,-20,9,6,-21,-11,-18,-20,-12,-5,15,-19,-2,-20;
MA   /M: M=-9,-4,-23,-6,-1,0,-16,-6,-15,-5,-10,-9,-3,-13,-7,-4,-7,-8,-15,-17,-1,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-27,20,16,-29,-8,1,-28,3,-23,-16,8,-9,10,-1,1,-8,-25,-29,-16,13;
MA   /M: SY='A'; M=17,-16,-9,-23,-17,-7,-16,-20,3,-16,1,0,-14,-17,-15,-19,0,4,9,-23,-11,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-19,-31,-26,8,-31,-21,24,-21,15,12,-24,-27,-22,-18,-16,-5,26,-15,6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-21,5,8,-23,-16,-3,-22,9,-16,-11,-1,-14,6,8,-3,-7,-18,-26,-11,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-11,-22,-14,-5,-1,-20,-6,-7,-6,-3,0,-8,-18,-4,-4,-7,-4,-7,-15,3,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-31,-23,7,-29,-20,24,-24,29,23,-26,-27,-18,-19,-21,-8,20,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-29,-7,4,-22,-20,0,-28,29,-21,-9,0,-17,12,53,-9,-10,-20,-20,-9,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-23,1,5,-21,-16,-1,-17,4,-15,-7,1,-14,8,3,1,-1,-14,-26,-10,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-22,-6,3,-21,-19,2,-18,8,-15,-4,-3,-16,17,11,-4,-8,-17,-20,-5,9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,1,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-27,-11,-6,-20,-12,-9,-15,-8,-17,-8,-7,26,-7,-8,-6,-7,-18,-28,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-8,-13,-18,27,-6,-23,-14,-19,-9,5,-20,-10,-13,0,-11,-21,-22,-15,-12;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-19,-25,-17,-4,-16,-11,11,-14,14,27,-17,-20,-8,-13,-11,-6,7,-22,-6,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-16,-31,-28,2,-28,-28,28,-22,10,11,-24,-26,-26,-22,-11,-3,36,-25,-7,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-25,-5,9,-28,-19,1,-11,1,-12,-1,0,-14,32,2,-2,-7,-18,-24,-11,20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-14,-5,-4,-17,-13,-12,-14,-7,-15,-9,1,-11,0,-7,17,29,-7,-30,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-26,4,11,-16,-19,-9,-20,1,-16,-13,-4,6,0,-5,-5,-6,-20,-24,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-23,13,23,-27,-13,-1,-23,1,-19,-14,4,-9,11,-5,3,-5,-21,-30,-16,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-29,-2,16,-34,-21,11,-18,8,-15,1,-2,-12,47,8,-4,-11,-26,-21,-8,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-29,-13,-12,14,-27,11,-6,-5,-2,-2,-15,-23,-5,-5,-16,-9,-12,11,48,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-25,-17,-6,-2,-25,-7,0,-6,-1,0,-13,-20,-4,-3,-11,-6,-1,-12,6,-7;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00323;
//
ID   PROKAR_ZN_DEPEND_PLPC_MP; MATRIX.
AC   MP00384;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic zinc-dependent phospholipase C signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5074539; R2=0.0125384; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1198; N_SCORE=19.518; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=159; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-12,9,-28,7,18,-26,-16,-2,-28,28,-26,-14,12,-11,10,24,-4,-8,-24,-26,-14,13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-14,-30,52,-18,-38,-6,-30,-18,0,-18,-14,-10,-2,-18,-28,-20,-26,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-12,33,-24,25,6,-26,-7,3,-26,11,-30,-20,38,-16,2,5,3,-4,-28,-35,-18,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-25,-28,-23,40,-28,3,4,-16,7,12,-20,-28,-18,-13,-20,-10,-3,14,48,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-12,14,-30,21,25,-32,-18,-5,-32,29,-27,-17,5,-7,10,13,-5,-10,-25,-27,-15,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-25,1,18,-30,-20,-1,-21,11,-19,-7,0,-8,31,7,3,4,-22,-24,-12,24;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-13,-14,-23,-19,28,-24,-20,-6,-19,-1,-6,-9,-19,-23,-14,3,24,0,-13,7,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-35,-28,51,-27,-13,-5,-23,0,-5,-25,-30,-28,-18,-25,-15,-10,50,41,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-27,-18,-13,11,-28,2,-1,-2,7,3,-18,-25,-8,-4,-20,-10,-7,5,38,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-11,-26,-9,10,-17,-24,-4,-5,-7,10,5,-13,-17,19,-4,-13,-10,-13,-22,-7,14;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-15,-13,-11,-23,19,-18,-20,-13,-19,-15,-3,-13,-11,-18,13,-1,-10,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22,4,-29,-15,27,-23,32,35,-24,-24,-13,-19,-24,-10,15,-20,0,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-32,-24,44,-30,-11,7,-25,22,7,-24,-30,-26,-18,-24,-10,1,4,31,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-25,-10,-18,-25,50,-20,-33,-18,-25,-18,0,-18,-18,-18,5,-4,-23,-22,-25,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-34,-26,11,-31,-25,27,-27,24,14,-24,-25,-24,-23,-19,-7,23,-19,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,28,-21,22,3,-23,-4,14,-24,-3,-29,-19,36,-16,1,-4,13,1,-25,-39,-16,2;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-19,-6,3,-23,-20,-7,-14,-1,-14,-6,0,-10,20,-1,11,24,-13,-26,-10,11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-24,-20,17,-26,11,9,-10,9,26,-20,-26,-6,-10,-20,-10,-1,9,46,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-16,-18,-8,-22,-4,-20,-12,-10,-14,-12,-12,11,-10,-20,6,-2,-6,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,3,-12,-7,-6,-20,0,-11,-14,-8,-19,-14,10,-12,-6,-13,16,4,-9,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-30,-14,-34,-30,34,-30,-26,17,-24,10,6,-26,-30,-34,-20,-14,-4,29,-13,7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=38,0,-12,-12,-8,-20,0,-14,-12,-8,-14,-12,4,-12,-8,-16,10,0,-6,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-7,29,-21,40,11,-31,-6,-4,-31,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,17,3,-21,-40,-20,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-9,-19,-9,-9,1,-13,3,-11,-10,-17,-11,-3,-19,-4,-10,14,7,-10,-10,23,-9;
MA   /M: SY='P'; M=2,-19,-32,-16,-6,-24,-19,-21,-8,-13,-19,-12,-18,54,-11,-21,-7,-8,-15,-27,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-32,-8,-7,-32,32,-14,-31,-12,-28,-16,-5,7,-2,-14,-2,-16,-30,-22,-26,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=0,-14,20,-19,-19,-11,-22,-24,-4,-18,-10,-8,-12,-23,-19,-18,7,14,12,-37,-17,-19;
MA   /M: SY='K'; M=4,-2,-25,-5,5,-28,-15,-12,-25,36,-25,-10,-2,-10,5,19,-5,-8,-15,-20,-12,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-15,-10,-12,-15,2,-20,-17,-12,-15,-12,0,-12,-12,-12,15,33,-7,-28,-15,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00357;
//
ID   ALPHA_L_FUCOSIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00385;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-L-fucosidase putative active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7062125; R2=0.0133375; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1145; N_SCORE=19.968; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-12,-21,-16,-10,-12,-17,-10,0,-4,-8,6,-4,-16,-2,5,4,1,0,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-1,54,-2,-16,-27,-6,-21,-34,-21,-24,-22,-6,-29,-21,-23,-6,-12,-19,-42,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-30,-1,6,-26,-20,17,-30,33,-26,-8,2,-14,10,28,-10,-12,-22,-22,-3,6;
MA   /M: SY='H'; M=-18,10,-28,5,0,-20,-15,78,-28,-8,-22,-5,22,-20,8,0,-5,-15,-30,-32,10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-2,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-22,-20,24,-28,16,4,-10,4,12,-20,-28,-8,-10,-20,-10,-6,20,64,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,14,-14,1,-6,-14,-13,-9,-14,-6,-17,-14,22,-14,-6,-6,16,32,-11,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,54,-23,-26,-13,-6,-18,-27,-24,-18,-16,-15,-33,-24,-24,-10,-12,-15,-27,-8,-26;
MA   /M: SY='S'; M=12,0,-17,0,14,-25,-7,-7,-20,-3,-22,-15,2,-8,10,-7,18,4,-15,-30,-19,12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-2,-30,-2,4,-24,-20,40,-30,20,-24,-6,4,-16,10,25,-10,-14,-24,-24,3,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-13,26,-26,21,6,-26,-9,2,-28,16,-29,-18,31,-16,4,14,1,-6,-26,-33,-16,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-7,-30,-6,-3,-15,14,10,-26,-9,-19,-11,-4,-19,0,-9,-6,-15,-25,-10,6,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-23,-2,3,-20,-14,5,-24,16,-26,-12,3,-13,5,9,7,0,-17,-24,-2,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-30,-16,-3,-16,-24,-13,-4,-13,4,1,-19,18,3,-13,-16,-10,-14,-24,-13,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-27,27,19,-31,-12,-6,-29,-2,-28,-24,6,12,2,-10,8,-3,-25,-36,-22,9;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-29,-4,-1,-18,-21,63,-23,-1,-13,1,3,-19,6,3,-13,-17,-23,-27,11,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,18,-20,2,-7,-13,-7,6,-6,-4,-12,9,31,-20,0,-4,-1,-4,-16,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=8,-10,-14,-20,-14,-8,-15,-12,2,-10,2,18,-10,-14,-6,-12,2,14,4,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-30,51,10,-38,9,-5,-40,-5,-30,-28,15,-12,-5,-12,0,-12,-30,-35,-22,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-23,0,8,-23,-15,-8,-23,38,-23,-8,0,-8,8,23,-8,-8,-15,-15,-8,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-19,-22,-22,-18,18,-24,12,-1,-18,4,2,-15,-26,-16,-14,-14,-9,-1,-5,25,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-35,-28,15,-22,-18,-15,-18,-15,-15,-35,-30,-18,-18,-35,-25,-25,121,42,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-8,-28,-12,-16,20,-24,18,-4,-8,-6,-4,-4,-28,-8,-8,-14,-8,-14,16,60,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,4,-30,9,5,-25,-18,0,-32,23,-22,-15,5,-18,8,51,-8,-10,-22,-25,-12,2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-5,-30,-3,14,-22,-20,0,-30,25,-20,-12,0,-15,12,53,-8,-10,-22,-22,-12,10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,24,-29,32,16,-18,-16,6,-26,0,-21,-19,12,-14,2,-7,-4,-9,-25,-21,4,8;
MA   /M: SY='M'; M=2,-11,-20,-16,1,-11,-16,-4,2,-5,4,26,-13,-13,3,-10,-9,-8,-2,-22,-9,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00324;
//
ID   PPASE_MP; MATRIX.
AC   MP00387;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Inorganic pyrophosphatase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3826528; R2=0.0162404; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=9.299; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-17,-22,-21,-17,3,-12,-14,-7,-15,-9,-6,-13,-22,-14,-15,-6,-3,-2,5,3,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-2,-30,2,-3,5,-24,11,-13,0,-11,-8,-9,-22,-4,-5,-14,-10,-16,7,43,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-35,-8,0,-28,-17,-10,-21,-10,-29,-19,-13,66,-7,-17,-2,-6,-27,-32,-25,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=1,-6,-8,-8,-6,-8,-7,2,-6,-8,-3,-2,-5,-11,-2,-7,-1,0,-3,-14,-3,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=-9,24,-18,21,8,-20,-6,2,-20,8,-21,-15,24,-10,2,2,2,-4,-20,-26,-13,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-21,-14,-12,16,-21,9,-1,-4,1,1,-14,-20,-6,-5,-14,-7,-7,15,46,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-5,-17,-28,58,-15,-37,-17,-30,-20,10,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-20,-21,-24,-15,29,-26,-5,1,-15,3,2,-14,-22,-18,-12,-15,-9,1,-6,14,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-12,-27,-20,-5,-29,-22,22,-20,6,8,-15,-19,-12,-20,-8,-1,17,-23,-5,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,4,-31,11,8,-30,-15,0,-27,3,-28,-18,0,24,0,-5,-2,-8,-26,-31,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,4,-26,1,6,-22,-15,6,-18,3,-18,-10,10,-6,8,5,-2,-7,-20,-29,-13,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-14,-6,-1,-14,-16,-10,-14,-3,-13,-10,0,-9,-4,-4,12,26,-6,-26,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-21,-19,-13,4,-25,-15,7,-20,24,7,-20,-23,-14,-15,-18,-2,1,-7,4,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-16,1,-8,-16,3,-8,-21,-7,-17,-13,1,-19,-9,-10,-2,-8,-17,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-20,-1,4,-11,-18,-14,-13,-11,-9,-12,-8,-15,-7,-15,-6,-9,-12,-9,-8,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,11,-25,7,-9,-27,35,-8,-32,-11,-30,-21,21,-18,-10,-12,7,-9,-28,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-39,-6,9,-30,-20,-17,-21,-7,-29,-20,-17,77,-6,-17,-9,-10,-30,-30,-29,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-24,13,-30,-20,23,-26,34,21,-27,-28,-21,-20,-24,-9,17,-19,1,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,1,-31,-27,-6,-26,-28,20,-22,5,5,-22,-25,-24,-24,-9,-4,27,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-26,22,-31,-24,4,-29,-21,5,-28,22,10,-25,-32,-23,-22,-22,-9,6,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-18,-10,-2,-10,-27,-20,10,-12,2,0,-18,-20,-14,-15,-8,-4,20,-30,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-19,-36,-26,8,-35,-26,31,-29,24,16,-23,-22,-22,-26,-22,-10,18,-19,1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-20,-14,-16,-15,13,-14,-12,-14,-8,2,-3,-18,-12,-15,0,-1,-8,-24,-16,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-24,15,20,-28,-13,-5,-27,3,-24,-19,4,-2,8,1,9,0,-21,-32,-18,13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-26,4,16,-25,-16,-3,-21,10,-18,-11,-2,-11,14,6,-2,-8,-18,-21,-8,14;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-15,-10,-5,-23,-15,-15,-15,-9,-22,-14,-7,23,-7,-11,1,-3,-14,-32,-23,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-11,-26,-21,8,-21,-22,10,-23,14,5,-18,-23,-21,-19,-11,2,11,-20,-3,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-24,-18,-8,7,-24,-8,-3,-6,0,-1,-13,-20,-6,-8,-11,-4,-5,-8,14,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-29,-13,-5,-21,-20,-11,-11,-7,-17,-7,-12,32,-5,-8,-5,0,-15,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-11,-19,-26,57,-19,-34,-19,-24,-17,0,-20,-19,-19,-1,-17,-26,-21,-27,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-5,3,-10,-7,-20,-13,-13,-12,-11,-16,-9,-1,-19,-1,-11,7,4,-6,-33,-17,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-19,-35,-30,8,-32,-29,33,-25,14,13,-25,-26,-27,-24,-15,-6,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-22,-27,-21,-1,-31,-22,22,-13,15,11,-22,-24,-17,-14,-18,-7,21,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00325;
//
ID   PROTEASOME_A_MP; MATRIX.
AC   MP00388;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Proteasome A-type subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3667197; R2=0.0135353; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=849; N_SCORE=15.848; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=0,-10,-16,-13,-11,0,-10,-11,-2,-13,-7,-5,-6,-11,-10,-13,3,2,-1,-17,-3,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=0,-7,-22,-9,-5,-20,2,-9,-19,1,-15,-3,-3,-14,0,5,1,-4,-13,-23,-15,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-17,1,0,-20,-7,-7,-18,-2,-20,-13,11,-10,1,-1,13,9,-14,-30,-16,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-27,-6,-1,-26,17,-7,-29,-1,-23,-13,0,-16,3,5,-1,-12,-23,-22,-19,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-27,-21,-20,33,-28,12,-1,-13,0,-1,-17,-29,-14,-11,-17,-9,-9,23,66,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-14,40,-27,56,15,-37,-4,-2,-37,-2,-30,-28,18,-11,-1,-11,5,-7,-27,-39,-21,7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-24,-14,-6,-2,-17,-6,-16,2,-7,-6,-6,-20,-4,20,-7,-5,-12,-18,-3,-6;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-20,2,-4,-21,4,0,-24,-7,-22,-15,3,-14,-5,-8,9,-2,-16,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-23,-18,-28,-23,-1,-28,-25,23,-23,17,10,-21,-23,-20,-21,-12,1,23,-24,-6,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,4,-11,-5,-7,-13,-14,-15,-12,-9,-15,-12,8,-11,-7,-9,22,37,-4,-32,-13,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-17,-24,-20,-3,-29,-25,18,-19,5,5,-14,-18,-17,-18,-1,17,19,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-24,-38,-29,67,-29,-18,-2,-27,6,-2,-22,-30,-35,-19,-22,-12,-4,28,34,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-19,-10,-29,-19,-19,84,-9,-19,-9,-9,-28,-29,-29,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,-25,32,27,-32,-12,-2,-30,2,-25,-22,10,-7,10,-5,8,-2,-25,-35,-19,18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-29,-5,2,-22,-19,10,-30,27,-22,-9,2,-18,9,50,-8,-10,-21,-22,-7,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-22,7,-31,-22,25,-29,40,18,-27,-28,-21,-21,-26,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-24,-23,-28,-23,37,-27,1,2,-21,8,4,-19,-29,-23,-15,-19,-10,1,2,33,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-15,-32,-29,0,-32,-30,34,-22,13,12,-27,-27,-27,-22,-12,-3,43,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,0,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-19,29,-30,22,-1,-10,-1,0,-19,-30,-9,-10,-20,-10,-11,28,78,-19;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-19,-10,-20,2,-20,-11,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,10,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-22,-21,-13,5,-22,-9,3,-13,9,12,-12,-22,-4,-6,-13,-5,-2,-17,1,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-27,10,35,-27,-18,-5,-27,18,-22,-16,2,-5,13,7,0,-4,-24,-27,-16,24;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-20,-10,-20,1,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-14,-30,-28,0,-30,-26,29,-21,10,12,-26,-27,-26,-21,-11,-1,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-26,5,10,-26,-11,-5,-28,23,-26,-14,9,-12,6,20,0,-5,-21,-26,-15,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,2,-26,-2,3,-23,-13,4,-20,11,-18,-7,9,-16,14,14,-2,-7,-21,-24,-9,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-27,-7,-16,-28,56,-17,-35,-17,-29,-20,5,-19,-16,-18,5,-14,-27,-23,-28,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=4,-8,-17,-11,-10,-14,-2,-15,-9,-13,-13,-9,-3,-14,-6,-13,12,8,-5,-20,-13,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=7,-5,-11,-13,-10,-13,-17,-20,-9,-11,-10,-10,-4,-3,-11,-13,12,30,-2,-29,-14,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-3,-15,-11,-14,-10,-18,-7,-12,-10,-8,-7,-14,-11,-15,13,12,3,-28,-16,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-28,2,-32,-27,33,-24,21,15,-27,-27,-25,-22,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-34,-27,2,-34,-27,36,-27,25,17,-25,-25,-23,-24,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,3,-23,-21,-7,-23,31,-19,-6,-3,-15,9,36,-10,-9,-15,-20,-9,4;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,0,-13,-14,-19,9,-19,-21,-15,-19,-15,-3,-17,-14,-17,11,6,-11,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-1,3,-24,-1,5,-25,-11,-9,-24,23,-26,-13,6,-9,4,13,1,-1,-17,-25,-14,4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,32,-25,37,18,-30,-10,0,-29,0,-25,-23,22,-11,3,-6,5,-1,-26,-36,-19,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00326;
//
ID   ATPASE_DELTA_MP; MATRIX.
AC   MP00389;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP synthase delta (OSCP) subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4010653; R2=0.0147337; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=197; N_SCORE=8.294; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-26,-4,13,-17,-22,-10,-11,4,0,-4,-9,-14,3,1,-11,-9,-12,-24,-11,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=3,-1,-18,-4,2,-16,-13,-6,-12,0,-8,-6,0,-12,3,-3,0,-2,-11,-22,-10,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=6,-5,-23,-8,4,-24,-15,-9,-18,14,-16,-7,-4,-10,10,9,-2,-5,-14,-21,-12,6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-22,-32,-24,3,-32,-25,29,-27,28,16,-24,-24,-20,-23,-19,-4,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,-16,-16,-10,-15,-12,-19,1,-11,-8,-4,-9,-16,-9,-15,5,4,7,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-22,-2,9,-22,-14,-9,-16,5,-12,-7,-3,-12,5,-2,-1,-5,-12,-25,-14,7;
MA   /M: SY='K'; M=3,-6,-22,-10,-3,-20,-13,-11,-12,8,-14,-6,-3,-14,1,2,0,-3,-7,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-19,-26,-18,8,-25,-18,14,-20,17,13,-21,-22,-17,-17,-13,-5,13,-21,-2,-18;
MA   /M: SY='E'; M=1,-5,-23,-6,8,-15,-17,-5,-16,6,-11,-6,-5,-12,5,0,-3,-6,-14,-20,-7,7;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-8,-24,-8,3,-20,-21,-12,-13,18,-13,-4,-8,-15,3,10,-7,-6,-5,-24,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-24,-15,-8,-13,-11,-12,-10,3,-5,2,-9,-18,-2,5,-8,-7,-7,-21,-9,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-17,-17,-12,-1,-23,-16,-2,-11,0,0,-11,-16,-9,-10,0,16,2,-21,-2,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-21,-2,-7,-22,32,-10,-27,-6,-22,-14,5,-13,-8,-8,1,-11,-21,-18,-20,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-13,-8,-3,-14,-3,-10,-11,2,-11,-7,-2,-10,-4,-4,2,-2,-6,-16,-10,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-24,-3,5,-26,-14,0,-24,20,-24,-10,4,-12,12,18,2,-3,-18,-24,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-23,0,6,-22,-15,-9,-19,12,-21,-11,5,-8,4,4,3,4,-15,-27,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-31,-27,3,-31,-26,30,-24,23,16,-28,-28,-25,-21,-17,-4,35,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-27,-3,7,-22,-21,-3,-18,22,-18,-7,0,-14,6,19,-8,-8,-13,-24,-9,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-31,-23,10,-32,-20,25,-27,33,16,-26,-27,-20,-21,-24,-8,16,-16,6,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-24,6,14,-22,-16,-6,-18,9,-17,-12,7,-12,3,4,-1,-4,-16,-29,-15,8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-10,-9,-10,-10,-18,-12,-4,-12,-8,-6,6,-17,-8,-12,2,10,-4,-29,-10,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-6,-22,-7,1,-19,-20,-13,-7,6,-11,-5,-5,-14,0,0,-2,-1,-3,-26,-11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-18,-32,-28,0,-33,-29,34,-23,14,12,-24,-25,-24,-23,-12,0,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,57,19,-37,-10,0,-37,4,-29,-27,21,-10,3,-6,0,-9,-29,-38,-19,11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-31,-5,5,-28,-15,-13,-22,5,-27,-16,-7,34,1,-3,-2,-5,-23,-27,-22,1;
MA   /M: SY='S'; M=2,11,-18,15,14,-25,-8,-7,-24,-3,-25,-20,8,-8,2,-8,19,9,-17,-35,-19,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-34,-25,0,-35,-24,36,-24,22,21,-21,-22,-16,-23,-21,-9,22,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=10,-9,-24,-11,-16,-27,49,-19,-32,-17,-26,-18,-1,-17,-16,-19,6,-12,-22,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-28,-21,-33,-26,22,-28,-20,20,-25,20,15,-23,-26,-24,-20,-19,-8,16,-12,8,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-24,-21,-13,-10,-29,-19,11,-3,0,4,-12,-19,-10,1,-10,-2,11,-23,-7,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,16,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-30,2,21,-28,-20,2,-28,24,-22,-11,1,-11,20,31,-5,-10,-25,-23,-12,19;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-22,-19,-27,-23,3,-27,-21,21,-21,7,6,-18,-22,-19,-20,-7,1,21,-20,2,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-27,-6,-15,-28,55,-16,-36,-17,-30,-20,6,-19,-16,-17,5,-14,-28,-24,-28,-15;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-3,19,-20,24,12,-27,-7,-2,-26,-4,-27,-21,15,-10,3,-8,17,5,-20,-37,-18,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-26,-7,5,-17,-20,-2,-21,17,-15,-5,-2,-15,10,22,-6,-6,-17,-21,-7,6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-18,-27,-22,3,-29,-20,20,-18,15,12,-22,-25,-18,-17,-13,0,22,-20,1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-34,-26,14,-34,-20,28,-24,15,13,-22,-25,-20,-22,-18,-8,20,-11,12,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,61,22,-38,-11,0,-38,2,-29,-28,19,-10,2,-6,0,-10,-30,-38,-20,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-21,-13,-13,-13,8,-13,-13,-10,-7,2,-4,-18,-10,-11,-3,-4,-10,-23,-14,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,5,-11,2,0,-20,-1,-8,-20,-9,-29,-20,15,-11,0,-9,36,19,-12,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-18,-32,-27,-1,-31,-28,32,-24,16,13,-24,-25,-23,-23,-13,-4,34,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-5,2,-23,-14,-6,-26,22,-22,-12,1,-15,6,33,1,-4,-16,-24,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-22,4,-6,-25,21,-12,-29,-7,-27,-19,8,-15,-8,-8,11,1,-21,-29,-22,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-31,1,14,-32,-20,0,-26,23,-24,-7,-1,-12,31,21,-6,-11,-26,-15,-9,22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-22,-32,-22,6,-31,-23,26,-29,40,19,-27,-27,-20,-22,-26,-9,15,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,5,-26,7,15,-28,-17,-3,-23,13,-20,-11,2,-11,16,11,-1,-6,-19,-26,-14,15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-27,-3,5,-25,-19,-3,-24,23,-20,-8,1,-15,17,33,-5,-5,-19,-22,-11,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00327;
//
ID   ATPASE_NA_K_BETA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00390;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium and potassium ATPases beta subunits signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2486539; R2=0.0138121; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=660; N_SCORE=14.355; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-20,-12,-3,-19,-7,1,-9,-6,-8,6,-4,-14,4,-9,-2,-7,-8,-23,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-20,-12,-7,-21,-4,-7,-14,-2,-15,-7,-5,-14,-2,-7,2,-1,-7,-23,-13,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-26,-8,2,-14,-13,-7,-14,3,-6,-2,-4,-17,9,1,-10,-10,-17,-20,-8,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-22,-2,7,-20,-19,-6,-10,-1,-9,1,-5,-8,8,-5,0,1,-10,-27,-12,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-20,-3,12,-13,-11,-11,-17,-5,-12,-9,-4,-9,0,-9,4,6,-13,-23,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-28,-1,4,-25,-2,-7,-28,19,-26,-12,6,-12,3,19,-2,-9,-22,-25,-16,3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-26,-2,1,-20,-1,-12,-27,12,-26,-15,2,-8,-2,4,1,-6,-20,-23,-14,0;
MA   /M: SY='S'; M=12,-6,-20,-6,1,-24,-4,-15,-20,-2,-24,-16,-3,7,-3,-9,13,3,-14,-29,-21,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-14,6,-20,-15,-8,-16,-17,-20,-10,-16,-13,-11,-24,-10,-9,-8,-8,-15,2,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-29,-1,4,-20,-10,-8,-25,3,-26,-18,0,-6,-1,-2,-1,-5,-23,0,-9,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,8,-26,10,16,-33,-16,1,-23,5,-20,-10,2,-10,29,4,2,-5,-23,-25,-14,22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-22,0,3,-22,-13,-8,-20,16,-22,-10,2,-14,2,15,3,-2,-11,-27,-14,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-26,-12,-10,-10,-15,-14,-3,-11,4,7,-16,-9,-10,-13,-16,-11,-5,-13,-8,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-1,-25,-1,16,-31,1,-5,-24,-1,-20,-12,-2,-9,18,-5,4,-8,-23,-24,-19,17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-24,0,13,-20,-11,-12,-12,-7,-14,-11,0,-10,1,-10,6,4,-12,-29,-15,6;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-31,-38,-30,37,-25,-25,-4,-24,-2,-4,-30,-30,-29,-20,-27,-17,-6,62,24,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-25,-1,5,-25,-14,-5,-26,28,-27,-12,8,-13,8,26,0,-5,-19,-25,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-29,4,24,-27,-15,4,-24,10,-16,-9,-2,-10,18,7,-5,-10,-24,-25,-12,20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-23,-33,-26,58,-29,-5,2,-22,8,5,-20,-29,-27,-16,-20,-10,-2,14,44,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,0,-33,-26,1,-32,-25,22,-28,25,14,-25,-29,-22,-24,-21,-9,18,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26,17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,107,48,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,33,5,-25,-3,7,-25,0,-30,-23,50,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-32,-7,1,-28,-16,-16,-21,-3,-30,-19,-11,56,-5,-11,1,-4,-24,-31,-25,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-27,22,31,-30,-17,-1,-29,9,-23,-18,6,-7,15,4,2,-4,-26,-30,-17,23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-21,-1,5,-21,-17,-11,-22,17,-22,-12,4,-10,2,10,7,14,-14,-27,-12,4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-29,-7,-8,-27,25,-8,-34,5,-27,-15,1,-18,-5,11,-2,-13,-25,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-25,0,21,-24,-20,-1,-15,3,-11,2,-3,-8,23,0,0,1,-18,-25,-12,22;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-17,-31,-24,37,-25,-17,7,-23,9,10,-18,-26,-26,-17,-11,-5,9,-10,10,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-31,-21,13,-27,-15,18,-25,39,29,-27,-27,-16,-17,-27,-10,9,-18,2,-18;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-12,-25,-13,-16,-25,38,-20,-27,-17,-20,-15,-6,-9,-16,-20,0,-13,-20,-21,-25,-16;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-17,-5,0,-26,-3,-11,-23,7,-23,-12,0,-12,7,1,8,3,-16,-26,-16,4;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-13,-2,0,-20,-3,-8,-22,-4,-28,-18,8,-12,2,2,32,15,-12,-37,-18,0;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-38,-47,-38,-28,8,-21,-28,-18,-18,-15,-17,-37,-29,-18,-14,-38,-27,-27,128,26,-19;
MA   /M: SY='A'; M=8,-15,-7,-20,-17,3,-4,-20,-9,-18,-11,-9,-10,-20,-19,-18,6,0,1,-22,-10,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-19,-29,-19,-7,-6,-24,-14,-7,-1,5,2,-18,-21,1,-2,-21,-13,-11,8,2,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-18,-24,-17,6,-25,-19,11,-24,27,9,-19,-24,-17,-18,-12,2,6,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-23,7,-31,-23,25,-27,37,17,-29,-29,-23,-21,-24,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-37,-28,59,-32,-15,9,-27,10,3,-20,-28,-32,-20,-20,-10,4,8,33,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-17,-30,-24,14,-28,-24,18,-24,20,9,-23,-26,-24,-20,-15,-2,19,-18,0,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-21,-34,-27,10,-26,-27,25,-25,10,9,-21,-23,-25,-24,-13,-7,24,-18,-1,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-15,-20,-20,-20,-18,16,-23,-8,-18,-11,-7,-10,-18,-18,-21,0,-6,0,-22,-19,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,9,-28,-24,22,-25,-22,0,-24,0,-3,-18,-28,-28,-20,-6,-3,9,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00328;
//
ID   ATPASE_NA_K_BETA_2_MP; MATRIX.
AC   MP00391;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium and potassium ATPases beta subunits signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0478158; R2=0.0113971; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=882; N_SCORE=14.090; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=216; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-14,12,-20,-4,-12,20,-12,-2,-12,-12,-14,-12,28,-24,-16,-8,-2,-4,-18,-20,0,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-28,-10,-4,-22,-20,-20,-16,-10,-22,-16,-12,49,-10,-16,2,15,-18,-30,-22,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-21,-5,-2,-24,13,-15,-24,-3,-24,-15,0,-13,-6,-7,10,-1,-14,-27,-20,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-23,5,10,-25,-6,-7,-23,6,-18,-12,1,-11,7,4,1,-5,-18,-24,-15,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-30,-19,-16,15,-28,9,-3,-7,-3,-2,-19,-15,-9,-4,-17,-9,-9,12,49,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-13,-26,-20,-13,15,-26,-12,-4,3,-6,-2,-7,-20,-13,-1,-14,-9,-5,-7,12,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-23,6,12,-8,-17,-7,-15,-5,-12,-9,3,-12,-3,-10,-2,-4,-15,-24,-9,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-30,-9,6,-27,-22,1,-17,14,-16,-2,-2,-15,30,31,-6,-10,-19,-20,-9,16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-28,8,4,-29,21,-12,-32,-9,-26,-20,5,-3,-7,-13,2,-7,-27,-28,-24,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-6,15,-22,23,12,-26,-12,-8,-23,-3,-21,-19,4,3,-2,-10,5,1,-17,-31,-18,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-20,-19,-11,15,-24,-12,6,-16,6,1,-8,-20,-16,-14,-11,-3,2,-12,8,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-24,5,4,-27,15,-5,-27,-3,-25,-16,13,-14,3,-4,4,-9,-25,-26,-21,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-18,2,5,-18,-11,-1,-12,-5,-15,-10,5,-8,-3,-8,3,-3,-8,-28,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-26,6,12,-23,-6,-8,-22,-3,-16,-15,-1,4,-1,-5,-1,-7,-21,-27,-19,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-23,4,2,-20,-14,5,-13,2,-17,-8,16,-17,9,8,-1,-6,-15,-28,-11,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-3,-27,-3,-2,-19,19,8,-26,-10,-20,-12,2,-17,-6,-10,-3,-14,-23,-19,-7,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-25,-1,13,-23,-22,-11,-12,-3,-15,-10,-7,6,7,-8,0,3,-12,-28,-16,9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-7,-28,-8,2,-11,-22,-9,-25,34,-22,-8,-3,-15,2,31,-12,-10,-17,-15,-4,2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-12,-10,-16,-12,-14,-9,-20,-2,-13,-11,-8,-9,-15,-12,-16,14,8,10,-29,-17,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-31,-8,5,-26,-21,-2,-22,21,-20,-6,-4,-15,24,30,-9,-11,-22,-8,-7,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-23,-2,-2,-12,-15,-5,-17,13,-16,-7,14,-17,-1,11,-3,-1,-16,-25,-9,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-16,-24,-17,-7,-11,-20,-9,-13,7,1,-1,-10,-21,-2,31,-13,-8,-8,-20,-9,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-20,21,15,-27,-10,-5,-25,-2,-25,-20,11,-9,6,-7,16,9,-19,-36,-18,10;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-23,-32,-24,-13,-1,-18,-16,-10,-13,-12,-3,-21,-22,-5,-13,-15,-13,-14,49,8,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-30,0,-1,-32,33,-12,-35,-1,-28,-17,1,-15,-2,-6,-2,-16,-28,-22,-23,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-12,26,-26,20,7,-26,-9,2,-21,1,-27,-18,31,-4,3,-3,3,-5,-27,-35,-19,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=14,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,37,18,-9,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-23,-31,-21,4,-32,-23,25,-24,34,17,-26,-26,-19,-19,-25,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,14,-24,15,22,-27,-4,-4,-26,0,-23,-19,12,-9,7,-5,7,-1,-24,-31,-20,14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,65,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-32,2,13,-27,-19,-12,-23,1,-25,-18,-5,37,0,-5,-3,-2,-25,-30,-22,4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-14,-7,-9,-8,-16,-10,-10,-9,-13,-9,5,-14,-7,-9,16,31,-5,-26,-3,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-1,5,-21,2,6,-25,-5,-5,-24,11,-27,-15,12,-12,7,6,12,2,-19,-30,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,22,-27,32,32,-31,-16,-4,-31,6,-23,-21,7,-6,8,-3,2,-1,-25,-33,-18,20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,-1,9,-29,-18,-8,-26,34,-27,-10,1,-10,15,20,-1,-3,-19,-23,-11,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00328;
//
ID   DDC_GAD_HDC_YDC_MP; MATRIX.
AC   MP00392;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DDC / GAD / HDC / TyrDC pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7342553; R2=0.0165468; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=137; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-17,27,-23,-21,4,-9,-21,-19,-24,-12,-13,-11,-27,-23,-21,-1,-5,-9,-27,-12,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-28,-13,-6,-13,-22,-10,-6,-3,-13,-5,-12,10,-7,0,-9,-7,-7,-21,-5,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-27,18,29,-29,-16,-4,-28,13,-22,-18,5,-7,9,5,0,-4,-23,-29,-17,19;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-11,-18,-15,-12,11,-23,24,-12,-15,-6,-2,-4,-18,-9,-10,-13,-12,-15,-13,18,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-15,7,-26,10,4,-24,-15,-2,-30,16,-23,-16,8,-16,5,34,0,-3,-20,-28,-14,2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-12,-24,-16,-13,20,-19,13,-14,-16,-8,-5,-7,-22,-12,-11,-9,-8,-14,-4,17,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-15,-23,-16,-9,4,-20,-6,-8,1,-1,1,-11,-19,-4,8,-13,-8,-8,-1,9,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-21,-24,-14,3,-26,-16,10,-17,27,12,-19,-25,-14,-11,-21,-9,4,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-28,26,12,-30,-14,-4,-31,15,-28,-20,13,-6,4,9,-1,-5,-24,-31,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-31,-10,-18,-29,59,-19,-38,-16,-29,-19,-1,-13,-18,-15,-1,-19,-29,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,19,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-19,14,33,-20,-12,0,-19,6,-13,-12,1,-1,13,0,0,-6,-19,-19,-12,23; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-16,-5,-3,-6,-12,3,-12,5,-6,-4,0,-13,0,18,-5,-4,-9,-12,-1,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-6,-12,-8,-10,-4,-13,-3,-7,-5,-5,-7,-8,-8,-12,6,3,4,-15,-11,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-28,43,13,-34,-5,3,-35,2,-29,-24,18,-12,2,-5,3,-8,-27,-36,-18,8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-37,-29,16,-36,-27,34,-28,19,15,-23,-24,-25,-26,-19,-8,26,-16,4,-29;
MA   /M: SY='T'; M=6,4,-9,-5,-7,-16,-7,-13,-16,-9,-19,-15,10,-13,-7,-10,21,26,-8,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-30,-26,-35,-26,19,-29,-24,15,-26,16,8,-26,-26,-24,-22,-23,-12,9,13,9,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-8,33,-20,29,6,-26,-3,2,-26,-3,-30,-23,36,-15,0,-5,15,2,-25,-40,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-31,-16,-10,-13,-1,-20,-19,-16,-19,-14,-15,35,-16,-20,-8,-11,-21,-21,-20,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-28,0,0,-20,-18,90,-29,-10,-21,-2,10,-19,9,-1,-6,-16,-28,-31,16,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-27,-29,-32,-23,16,-23,-6,1,-18,7,19,-24,-25,-14,-15,-26,-16,-6,32,15,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-24,-27,-22,8,-6,-15,6,-22,15,17,-18,-24,-18,-18,-18,-12,1,-14,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-22,-26,-21,7,1,-16,-1,-22,13,13,-17,-24,-18,-18,-16,-12,-3,-15,-4,-19;
MA   /M: SY='A'; M=15,-14,-5,-18,-13,-15,-15,-19,-1,-12,-8,-4,-13,-18,-8,-15,5,5,10,-28,-15,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-6,-28,-6,-5,-19,-14,-3,-16,-11,-18,-13,-2,26,-8,-13,-2,0,-21,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-24,-36,-26,22,-33,-23,27,-29,27,18,-23,-26,-23,-23,-23,-10,15,-13,7,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-28,21,9,-33,-7,-6,-28,-4,-28,-20,5,11,6,-10,7,-4,-25,-33,-21,6;
MA   /M: SY='C'; M=3,-18,92,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28,-6,-8,-8,-44,-28,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-11,-8,-13,-24,31,-18,-29,-16,-27,-19,2,-17,-13,-16,14,2,-19,-29,-24,-13;
MA   /M: SY='A'; M=15,-17,-5,-23,-20,-15,1,-24,-8,-18,-9,-8,-14,-20,-18,-22,-3,-6,0,-15,-16,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-22,-32,-23,10,-31,-20,24,-24,24,20,-23,-25,-17,-20,-20,-8,18,-18,1,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-32,-32,-34,-26,6,-28,-21,12,-25,13,5,-30,-27,-20,-21,-29,-16,3,36,10,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-27,-17,-31,-24,17,-26,-24,13,-23,16,6,-25,-27,-26,-20,-15,-4,17,-7,2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,28,-29,38,20,-33,-13,1,-34,10,-26,-22,15,-11,8,9,-2,-9,-28,-33,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-26,4,13,-26,-14,-4,-25,10,-25,-16,3,4,6,5,4,-2,-21,-29,-17,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-18,2,2,-18,0,-3,-19,-2,-18,-10,4,-11,-1,-5,6,1,-14,-23,-11,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-2,-22,-7,-9,-2,-16,-5,-8,-7,-7,-5,1,-20,-9,-9,-6,-5,-10,-11,5,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-28,-22,10,-29,-19,18,-22,28,15,-27,-29,-21,-17,-22,-7,18,-18,4,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-24,-6,-4,-19,-20,-7,-9,-1,-9,-4,-6,-11,1,1,-4,-3,-5,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-24,-5,0,-15,-13,-7,-20,4,-17,-10,-1,-10,4,7,0,-2,-16,-21,-8,1;
MA   /M: SY='L'; M=2,-17,-3,-22,-13,-9,-22,-20,4,-17,5,2,-14,-20,-12,-16,-6,0,4,-27,-11,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-4,-13,-7,-7,4,-16,-7,-11,-16,-4,-8,0,-20,-12,-13,0,-2,-9,-25,-5,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-16,-8,-9,-11,-16,-3,-1,-9,-11,-4,1,-19,-3,-8,4,3,4,-26,-5,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-21,-10,-1,-9,-19,-13,-5,-2,-3,4,-11,-16,-6,-6,-7,-1,0,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='A'; M=6,4,-13,-1,-4,-18,-12,-7,-10,-10,-15,-11,6,-16,-7,-13,6,1,-7,-29,-13,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-31,5,8,-29,-16,-13,-21,-4,-23,-17,-8,34,-2,-10,-4,-8,-21,-30,-23,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-11,-27,-10,-4,4,-22,2,-3,-10,-2,-3,-13,-21,-6,-12,-12,-9,-8,-2,28,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00329;
//
ID   PEPCASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00393;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoenolpyruvate carboxylase active site 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0212893; R2=0.0142196; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=459; N_SCORE=11.538; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,44,-30,-20,10,-30,31,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,36,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,19,-1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-20,-9,-14,-7,-18,-10,8,-14,1,0,13,-24,-13,-12,-6,-4,3,-31,-11,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-4,-33,4,1,-29,-10,-15,-21,-5,-26,-18,-7,37,-7,-13,-4,-9,-23,-30,-23,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-26,-27,-26,-21,1,-18,-20,1,-20,2,-2,-25,-19,-19,-18,-17,-10,1,18,5,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-25,-23,-19,24,-26,5,2,-14,6,5,-19,-26,-13,-13,-16,-5,-4,12,48,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-28,-8,-1,-20,-18,-4,-24,21,-20,-7,2,-8,5,40,-7,-5,-18,-23,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-13,-5,-1,-20,-12,-8,-19,2,-13,-7,-1,-17,1,7,-2,-3,-14,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-15,-26,-16,-9,-8,-22,20,-10,-7,-2,1,-10,-23,-1,4,-14,-13,-10,-8,8,-7;
MA   /M: SY='I'; M=3,-25,-20,-29,-22,-3,-18,-24,18,-24,18,9,-21,-23,-20,-22,-15,-8,16,-22,-8,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=16,-1,-11,-4,1,-13,-6,-10,-9,-6,-5,-7,-4,-7,-4,-10,3,1,-4,-16,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-4,-9,-8,-13,-2,-12,-11,-6,-9,-7,-2,-14,-8,-8,3,-1,-5,-22,-13,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-22,-5,0,-16,-13,10,-21,11,-17,-8,1,-7,5,31,-3,-6,-16,-19,-6,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-22,3,-4,-25,27,-7,-26,-7,-21,-13,6,-13,1,-8,1,-11,-23,-18,-18,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-9,13,-29,14,-3,-29,21,-8,-33,-6,-29,-21,15,-8,-8,-6,0,-12,-29,-30,-24,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-17,-22,-17,2,-25,-19,6,-15,8,3,-19,-16,-18,-14,-9,5,11,-20,-1,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-27,0,17,-35,-18,17,-19,7,-18,0,1,-10,50,8,-1,-10,-27,-19,-7,33; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-29,15,52,-29,-20,1,-26,9,-17,-13,-1,-2,21,0,-1,-10,-27,-29,-18,36;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-7,-32,-29,0,-32,-29,30,-24,14,11,-27,-29,-27,-23,-14,-4,39,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-1,15,-21,5,-7,-22,20,-5,-25,-8,-28,-19,29,-18,-7,-9,11,-1,-24,-32,-22,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,42,-29,59,15,-28,-12,-2,-36,-3,-26,-27,16,-12,-4,-11,-2,-10,-27,-35,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=21,-8,-18,-12,-12,-24,27,-18,-24,-14,-22,-16,-2,-14,-12,-18,13,-3,-14,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-22,-25,-29,-21,31,-29,-12,1,-12,2,0,-14,-25,-19,1,-15,-6,-1,-2,20,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-20,-27,-18,5,-26,-21,11,-25,32,11,-24,-25,-18,-18,-20,-1,5,-11,-1,-18;
MA   /M: SY='S'; M=15,-6,-12,-11,-7,-15,-7,-13,-10,-10,-14,-4,-1,-12,-4,-12,20,16,-3,-30,-15,-6;
MA   /M: SY='A'; M=28,-4,-10,-9,-4,-20,0,-14,-16,-10,-21,-16,1,-10,-4,-14,27,11,-6,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='N'; M=6,10,-10,-1,-4,-23,0,-4,-21,-4,-23,-15,19,-17,1,-3,7,-3,-19,-31,-20,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-39,-47,-39,-29,10,-21,-29,-16,-21,-14,-16,-39,-30,-20,-20,-39,-28,-26,135,27,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-2,-20,-3,16,-26,-5,-10,-20,-2,-16,-13,-4,-7,7,-9,6,-2,-16,-24,-19,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-31,-21,4,-33,-21,27,-27,36,19,-25,-25,-15,-21,-25,-10,14,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-13,-29,-13,-11,12,-26,43,-11,-10,-7,0,-9,-25,-1,-6,-15,-13,-17,6,51,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-29,-4,9,-25,-21,-3,-25,28,-18,-7,-2,-14,18,35,-9,-10,-20,-21,-10,12;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-3,-20,-12,-18,-4,-21,-9,-12,-10,-10,-11,-13,-12,-20,8,2,2,-23,-19,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,2,23,-39,-20,9,-21,10,-20,-2,0,-9,57,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-4,-29,-1,23,-23,-24,-7,-10,6,-12,-6,-6,-10,13,4,-6,-9,-12,-25,-13,17;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-3,-25,-3,9,-27,-7,1,-25,9,-21,-10,0,-12,14,10,1,-8,-20,-23,-13,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00330;
//
ID   DNA_PHOTOLYASES_1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00394;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA photolyases class 1 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9906726; R2=0.0146977; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=867; N_SCORE=17.724; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=103; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-35,-45,-35,-26,6,-18,-28,-20,-19,-21,-20,-34,-28,-18,-19,-30,-24,-28,127,24,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-13,9,-29,15,14,-27,-17,-5,-26,13,-23,-15,3,-12,9,11,-4,-9,-21,-19,-12,11;
MA   /M: SY='N'; M=1,13,-21,9,10,-20,-8,-1,-21,0,-22,-17,16,-13,2,-2,8,-1,-20,-28,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-28,42,10,-32,-8,1,-30,-1,-30,-25,29,-1,-1,-8,2,-6,-30,-39,-21,4;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-25,-14,-2,-16,-18,-15,-6,-7,-9,-7,-12,1,-5,-9,-7,-8,-7,-14,-13,-4;
MA   /M: SY='D'; M=4,8,-23,12,10,-23,-14,-8,-19,3,-17,-14,-2,-11,-1,-7,-1,-6,-12,-24,-10,4;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-9,-25,-11,0,-15,-20,13,-11,-1,-5,-1,-7,-17,6,0,-9,-10,-12,-19,2,1;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-26,51,-29,-19,8,-29,24,11,-23,-29,-31,-19,-23,-10,4,-2,18,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,5,-26,3,14,-28,-15,15,-24,9,-21,-9,8,-12,21,8,-1,-9,-24,-26,-10,16;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-15,-19,-9,-15,-9,-18,-7,-6,-1,-4,-12,-15,-9,-9,-1,-3,-1,-20,-15,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,1,-9,-1,-23,-23,-7,-24,15,-21,-9,-5,-19,9,13,-7,-5,-18,-23,-7,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-22,12,18,-26,-17,-5,-22,0,-19,-14,4,-8,14,-3,9,12,-19,-30,-15,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-25,1,5,-20,-16,10,-21,9,-17,-9,13,-16,7,15,-2,-1,-20,-28,-9,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-26,-29,-25,31,-32,-2,13,-19,7,5,-21,-28,-20,-17,-19,-9,5,11,46,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-3,-13,-15,-21,11,-16,-17,-15,-18,-13,4,-19,-14,-18,2,-7,-12,-28,-22,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11,-1,-20,-19,-1,-29,28,-19,-10,-1,-19,9,65,-9,-9,-19,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-11,3,26,-33,-21,0,-25,9,-21,-10,-2,-10,31,4,-2,-10,-27,-27,-16,29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-7,-24,-14,-10,-12,-17,-4,-6,-4,-4,-3,-1,-20,-6,1,-9,-8,-8,-15,-6,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-4,-20,-8,4,-22,-13,3,-15,-3,-15,-7,-4,-12,15,-6,5,-1,-15,-19,-5,9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-14,-8,-1,-10,-21,-17,-9,-10,-3,-7,-4,-11,-7,-10,10,33,-3,-29,-10,-4;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-35,-31,-26,33,-26,-6,-7,-18,-5,-7,-27,-30,-20,-16,-27,-17,-15,70,52,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-32,-22,2,-25,-9,25,-17,26,45,-22,-22,-7,-15,-22,-10,13,-20,0,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-7,8,-21,4,0,-20,-9,43,-24,-8,-26,-11,21,-17,4,-3,12,-2,-23,-36,-2,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,31,-20,13,-4,-8,-4,6,-18,-4,-25,-18,50,-21,-5,-2,6,-1,-26,-34,-14,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-12,-23,-19,-9,-3,-19,0,-20,6,6,-15,-22,-16,-19,-8,-7,2,-24,-13,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-15,-20,-23,-12,-10,-18,-2,9,-7,8,37,-15,-17,9,-8,-12,-8,3,-21,-5,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-10,-25,-22,-20,-5,-26,-15,25,-19,8,14,1,-21,-12,-19,-13,-7,10,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-11,-24,-21,-4,-23,-25,14,-18,8,4,-20,-23,-21,-18,-3,10,27,-27,-10,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00331;
//
ID   ALANINE_RACEMASE_MP; MATRIX.
AC   MP00395;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alanine racemase pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6984348; R2=0.0157268; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=174; N_SCORE=8.425; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,28,-20,10,-4,-13,-4,4,-14,-4,-23,-16,45,-20,-4,-4,7,-1,-23,-34,-16,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-21,-22,-25,-19,15,-27,-10,9,-16,12,6,-18,-26,-16,-12,-17,-6,6,-4,18,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-27,2,10,-25,-15,-3,-22,12,-16,-9,3,-14,14,17,-4,-8,-20,-24,-13,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-21,-8,1,-16,-20,-6,-7,0,-7,-2,-1,-16,2,-2,-5,-3,-8,-25,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-33,-24,16,-29,-21,22,-25,23,17,-23,-26,-22,-21,-19,-7,17,-16,3,-23;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-25,-5,2,-22,-17,-4,-18,16,-15,-5,0,-15,9,20,-5,-6,-15,-22,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-21,1,5,-22,-8,-6,-21,12,-18,-10,3,-11,6,12,1,-2,-16,-22,-12,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-5,-16,-7,-1,-6,-14,7,-3,-4,-3,0,-2,-11,0,-2,-5,-6,-5,-14,-1,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-20,-24,-16,-2,-26,-10,11,-12,12,12,-16,-21,-10,-8,-16,-9,8,-20,-1,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=2,1,-16,-1,-5,-17,7,-7,-16,-5,-17,-11,5,-6,-5,-6,5,0,-13,-21,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-3,-22,-1,2,-21,-8,-10,-17,2,-20,-13,-2,23,-3,-5,-1,-4,-17,-21,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-25,9,5,-23,-3,-2,-25,5,-24,-15,15,-11,3,2,2,-5,-23,-28,-16,4;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-9,-11,-7,-20,-8,-17,-13,-3,-17,-11,-4,-14,-6,-9,11,7,-3,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-22,-2,11,-22,-20,1,-24,16,-17,-9,0,-13,9,20,-4,-2,-19,-25,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-12,-32,-26,2,-30,-27,26,-25,18,11,-24,-26,-24,-23,-15,-5,27,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-22,-6,-29,-23,-3,-16,-19,4,-20,5,13,-20,-24,-15,-20,-16,-10,2,-6,-5,-19;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-7,-18,-12,-21,3,-20,-15,-13,-14,-12,-10,-6,-12,-20,6,-3,-6,-24,-22,-12;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-14,-30,-27,-3,-28,-28,27,-20,8,8,-25,-23,-25,-21,-9,0,38,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-29,-26,4,-30,-25,27,-23,20,15,-27,-28,-24,-21,-17,-5,33,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=38,-6,-14,-13,-9,-22,8,-18,-16,-11,-15,-13,-6,-11,-10,-19,10,-2,-6,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-15,44,-25,43,11,-29,-5,5,-29,0,-30,-25,40,-15,1,-5,5,-5,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-21,-10,-8,-12,-22,50,-12,-16,-1,4,0,-23,-2,-8,-14,-15,-15,-28,9,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-18,-30,66,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-15,-21,-14,-11,-13,-20,6,-16,2,2,-13,-16,-12,-20,1,-1,8,-24,-13,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-16,-17,-10,-10,-25,-17,5,-6,-3,1,-14,-20,-11,-4,-6,-1,12,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-29,4,14,-25,-14,1,-22,5,-17,-11,-2,-2,10,5,-6,-10,-22,-25,-13,11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-13,-32,-27,-1,-30,-27,30,-23,15,14,-25,-25,-23,-23,-14,-5,33,-26,-7,-27;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-13,-18,-11,-12,-6,-17,-10,-11,-10,-7,-9,-13,-10,-17,9,6,-2,-14,-12,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-30,-2,9,-27,-18,-7,-24,15,-23,-12,-5,9,10,13,-4,-7,-22,-24,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=8,-14,-18,-20,-12,-3,-16,-11,-2,-13,-2,-3,-11,-17,-12,-13,-2,2,2,-19,-4,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-15,-29,-20,7,-26,-20,16,-26,32,15,-25,-26,-19,-20,-21,-8,10,-20,-2,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-25,-18,-5,-5,-23,-15,5,-10,7,5,-14,-18,-8,-11,-12,-7,0,-16,-2,-8;
MA   /M: SY='E'; M=4,4,-24,4,13,-27,-8,-7,-24,8,-22,-15,3,-5,7,1,3,-6,-20,-26,-18,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=6,-5,-17,-9,3,-15,-16,-5,-8,-7,-5,-5,-4,-14,-1,-10,-3,-5,-8,-23,-9,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-20,4,-4,-28,29,-11,-32,-10,-27,-19,9,-18,-9,-12,0,-13,-26,-28,-25,-6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-18,8,-23,-18,-14,-11,-24,-1,-19,-7,-5,-15,-22,-19,-22,-2,-5,8,-29,-18,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-24,3,0,-13,-10,-5,-21,-1,-19,-13,4,-11,-2,2,1,-3,-16,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00332;
//
ID   TOPOISOMERASE_I_PROK_MP; MATRIX.
AC   MP00396;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic DNA topoisomerase I active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2606292; R2=0.0161819; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=409; N_SCORE=11.869; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=11,-2,-18,-8,-6,-14,-8,-3,-10,-10,-16,-11,4,-11,-5,-13,10,1,-9,-24,-6,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-1,-21,-5,-1,-20,-12,-7,-20,13,-22,-12,7,-15,2,20,6,1,-13,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-7,0,-20,-17,-3,-21,21,-19,-8,-3,-15,6,24,-6,-6,-14,-19,-5,1;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-21,-31,-21,23,-30,-18,14,-26,36,14,-26,-29,-22,-18,-26,-10,6,-11,10,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-29,-7,-11,-24,34,-12,-34,-3,-27,-16,4,-19,-8,1,-3,-15,-26,-20,-21,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-24,-36,-27,32,-30,-20,17,-26,18,15,-23,-26,-25,-21,-23,-11,9,2,13,-25;
MA   /M: SY='S'; M=2,3,-18,1,-3,-22,6,-9,-22,-7,-27,-17,11,-8,-3,-6,21,7,-16,-34,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=18,-14,-20,-16,-8,-20,-11,-20,-9,-11,-16,-12,-13,19,-11,-19,5,1,-5,-27,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-27,-1,11,-25,-19,-2,-23,24,-20,-7,-1,-12,14,17,-5,-6,-19,-22,-9,12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-27,1,13,-28,-17,0,-26,25,-24,-10,2,-10,15,18,-3,-6,-21,-24,-11,13;
MA   /M: SY='T'; M=10,-8,-11,-16,-14,-10,-18,-22,-1,-13,-6,-6,-8,-14,-13,-15,12,28,9,-28,-12,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-21,-24,-13,-4,-22,-5,11,-9,18,36,-18,-20,2,-8,-17,-6,3,-21,-2,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-24,11,8,-23,-15,-2,-20,5,-17,-5,4,-13,11,4,1,-3,-18,-28,-12,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-23,-31,-23,-2,-31,-17,28,-24,17,14,-19,-22,-17,-22,-15,-5,21,-23,-2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,4,-22,-13,-19,-5,-22,-10,-13,-10,-10,-12,-14,-13,-22,6,-2,0,-24,-20,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,32,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,48,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-26,3,11,-25,-15,-1,-26,23,-25,-13,9,-12,11,23,1,-4,-21,-26,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-25,9,38,-23,-20,-4,-21,3,-13,-11,-2,-5,13,-3,2,1,-20,-29,-16,25;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-20,-1,6,-17,-15,8,-11,5,-12,-3,4,-11,8,4,-3,-4,-12,-21,-5,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-27,-11,-15,-28,48,-18,-34,-11,-26,-17,-2,-18,-15,-12,0,-16,-24,-20,-26,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-23,-28,-22,32,-30,-4,7,-23,21,8,-23,-30,-21,-16,-23,-10,1,3,33,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-28,-38,-29,-1,-38,-29,45,-28,17,18,-19,-20,-19,-28,-17,-6,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-33,-16,-7,-20,-20,-10,-7,-10,-13,6,-19,51,-6,-16,-13,-10,-17,-27,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-28,50,26,-35,-11,-1,-35,1,-28,-26,16,-8,5,-7,4,-7,-28,-38,-20,16;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,4,-4,-6,-18,-5,-13,-20,-12,-25,-18,9,-15,-6,-12,26,19,-11,-39,-20,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-9,0,-21,-4,-4,-16,-19,-5,-12,-1,-12,-7,2,-13,2,5,1,9,-8,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-26,-5,-2,-13,-20,10,-16,8,-16,-6,4,-18,6,13,-5,-4,-15,-19,4,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-31,-23,20,-31,-16,19,-26,30,16,-26,-28,-21,-20,-24,-9,12,-11,13,-23;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-26,-2,0,-26,-10,-15,-20,-9,-29,-20,-4,39,-5,-15,11,2,-21,-34,-25,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-27,8,16,-27,-16,-3,-25,9,-23,-15,3,2,7,4,0,-4,-22,-28,-16,11;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-23,12,19,-24,-12,-4,-21,0,-20,-16,7,-10,7,-5,7,0,-18,-30,-14,12;
MA   /M: SY='A'; M=6,-15,-21,-22,-13,-2,-16,-2,-1,-13,0,4,-11,-18,-8,-13,-6,-7,-2,-17,0,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,0,-22,-5,-9,-8,-14,-9,-4,-8,-6,-4,4,-20,-9,-9,-7,-7,-5,-25,-9,-9;
MA   /M: M=-2,-6,-23,-6,-2,-8,-12,-9,-11,-7,-1,-5,-7,-18,-6,-8,-7,-7,-10,-19,-3,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-25,1,10,-23,-14,-5,-20,7,-16,-9,-1,-9,5,6,-2,-5,-16,-26,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-13,-19,-11,-13,-14,-19,-2,-10,-6,-4,-13,-13,-11,-10,-2,-3,4,-24,-14,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-26,-14,-7,-12,-24,-6,-3,0,-2,1,-9,-15,-3,7,-11,-6,-3,-22,-4,-7;
MA   /M: M=-1,-6,-22,-8,-8,-15,-12,-16,-4,-5,-5,-4,-4,-18,-10,-9,-6,-5,-1,-26,-13,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00333;
//
ID   RECOMBINASES_1_MP; MATRIX.
AC   MP00397;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Site-specific recombinases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8781757; R2=0.0162604; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=199; N_SCORE=8.104; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-12,-21,-17,-14,-6,-19,-3,8,-7,12,38,-14,-19,-1,-4,-16,-10,3,-22,-4,-8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-13,-1,4,-12,-11,6,-12,1,-9,-4,1,-7,7,5,3,6,-10,-15,-4,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-16,-4,0,-15,-2,-7,-15,8,-14,-7,-2,0,1,7,-1,-1,-12,-13,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-11,-18,-11,-5,-11,-17,-4,-6,7,-5,0,-8,-16,-1,13,-8,-6,0,-18,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=4,-11,-20,-16,-11,-13,-11,-16,-4,-7,-3,-3,-5,-18,-9,-5,-3,-2,-1,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-26,-33,-25,7,-34,-23,26,-18,10,10,-18,-23,-19,-9,-17,-9,20,-17,1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=1,-15,-2,-18,-23,-22,30,-23,-22,-22,-19,-13,-9,-24,-22,-23,-4,-14,-12,-26,-25,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,3,-29,-23,-6,-24,-26,13,-22,9,4,-22,-25,-22,-23,-10,-5,19,-27,-12,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,27,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,46,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-25,7,12,-12,-14,-7,-17,-3,-12,-12,6,-14,-2,-6,-2,-4,-17,-27,-11,5;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-28,33,25,-31,-11,-1,-30,5,-24,-21,12,-9,8,-3,1,-8,-27,-33,-18,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-4,18,-20,9,-2,-19,-8,-3,-14,-1,-20,-14,26,-16,-3,-5,7,2,-17,-34,-16,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-18,-2,-2,-11,-15,-10,-8,-1,-2,-4,-8,4,-5,-4,-8,-3,-8,-17,-8,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-12,-12,-15,-11,2,-17,-11,12,-15,18,8,-10,-14,-10,-11,-11,-1,6,-13,-2,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,19,-24,22,27,-29,-11,1,-27,3,-25,-19,15,-8,13,-3,8,-3,-26,-34,-19,20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-25,-14,-6,-14,-19,-7,-14,10,-5,-4,-4,-21,0,34,-10,-8,-10,-21,-10,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-15,-26,-16,-1,-7,-28,-15,4,-4,3,2,-13,-18,-6,1,-13,-9,3,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,14,-25,17,21,-28,-12,-2,-27,9,-24,-18,10,-9,10,6,3,-5,-23,-30,-18,15;
MA   /M: SY='M'; M=0,-11,-24,-15,-4,-6,-16,-9,-5,-5,-3,1,-9,-17,-1,-6,-8,-8,-7,-15,-1,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-30,-23,4,-29,-20,25,-24,30,23,-25,-26,-18,-19,-20,-5,19,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-24,-2,8,-24,-8,-9,-20,10,-20,-11,2,-13,3,4,0,-3,-14,-26,-16,5;
MA   /M: SY='B'; M=4,5,-15,3,2,-23,-12,-7,-18,3,-19,-12,4,-14,-1,-4,4,-1,-10,-29,-15,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-18,-10,-8,-9,-12,-10,-10,-5,-12,-9,-2,-15,-8,-11,3,2,-6,-17,-1,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-6,-29,-7,-11,-26,32,-11,-35,1,-27,-16,4,-19,-8,11,-3,-15,-26,-21,-22,-11;
MA   /M: SY='C'; M=4,-17,18,-23,-13,-6,-22,-21,-4,-18,-3,-3,-18,-23,-17,-20,-7,-6,4,-28,-14,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00334;
//
ID   RECOMBINASES_2_MP; MATRIX.
AC   MP00398;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Site-specific recombinases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2012463; R2=0.0148131; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=521; N_SCORE=12.909; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-17,-3,5,-18,-12,-10,-15,-1,-15,-12,3,-13,-1,-2,12,8,-9,-31,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-27,23,13,-31,0,-3,-31,4,-26,-20,13,-12,4,1,0,-10,-27,-30,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-29,-11,-1,-20,-19,-1,-29,27,-19,-10,-1,-19,9,63,-9,-9,-19,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-11,-38,-1,6,-31,-19,-16,-23,-3,-29,-20,-14,68,-6,-14,-9,-10,-29,-30,-27,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-29,-4,7,-29,10,-8,-21,-6,-19,-9,-3,-14,11,-8,-2,-13,-20,-23,-19,9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,18,-30,-20,18,-30,45,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-26,12,12,-22,-17,-5,-15,-1,-8,-6,1,-13,5,-3,-6,-9,-16,-28,-13,8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-6,3,-19,-18,-6,-20,19,-14,-5,0,-15,4,26,-7,-4,-15,-23,-11,2;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-24,-9,-29,-20,0,-24,-16,15,-21,26,25,-23,-24,-13,-19,-19,-9,9,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-25,-31,-21,2,-32,-21,24,-22,30,16,-22,-25,-16,-11,-24,-10,13,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-23,9,12,-23,-12,-4,-19,6,-16,-9,7,-12,4,1,0,-5,-17,-29,-15,8;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-1,-24,0,0,3,-20,-11,-18,0,-9,-10,-4,-17,-9,2,-9,-7,-13,-17,-2,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-17,-30,-23,4,-28,-22,23,-25,32,17,-28,-28,-21,-20,-21,-7,22,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,-1,16,-27,-18,7,-26,16,-20,-9,1,-12,21,26,-2,-9,-23,-23,-11,16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-16,0,20,-23,-16,-7,-18,-2,-16,-8,-4,4,4,-9,-1,-6,-18,-30,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,59,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-13,-16,-14,-10,-22,-20,3,-10,-5,-2,-11,-19,-11,-7,6,20,15,-29,-11,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-16,-32,-26,14,-31,-25,23,-25,22,12,-26,-28,-27,-21,-17,-3,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,35,-25,19,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-29,29,-21,10,10,-25,-25,-25,-22,-10,-2,38,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-8,-27,-9,2,-10,-21,-7,-16,0,-15,-11,-10,-15,-3,-4,-6,3,-14,8,3,0;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,3,6,-27,-15,-8,-28,29,-26,-13,2,-12,6,26,-1,-5,-18,-24,-13,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,7,-32,-22,29,-29,40,22,-27,-27,-19,-22,-27,-10,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-28,63,17,-37,-11,-2,-37,-1,-28,-28,18,-10,-1,-10,2,-5,-27,-39,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=13,-7,-20,-9,-12,-25,35,-17,-28,-15,-26,-18,1,-15,-12,-17,14,-4,-18,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-20,-11,-3,-21,-14,-3,-31,22,-21,-11,-1,-21,5,57,-9,-11,-20,-22,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-20,15,3,-24,-4,-4,-23,-6,-30,-21,23,1,-1,-8,18,6,-22,-39,-21,0;
MA   /M: SY='L'; M=0,-17,-16,-22,-17,0,-23,-16,7,-18,16,10,-17,-21,-14,-15,-7,10,7,-20,0,-15;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-19,-7,-4,-19,-10,-10,-13,5,-15,-4,0,-14,-2,3,3,-2,-7,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,29,-30,42,25,-34,-15,19,-35,1,-25,-20,13,-10,10,-5,-2,-12,-30,-35,-12,17;
MA   /M: SY='L'; M=0,-26,-18,-30,-21,2,-26,-20,21,-23,28,20,-25,-25,-17,-20,-19,-7,17,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-19,-28,-22,-7,-9,-30,-16,15,-11,9,7,-14,-18,-4,-4,-15,-10,6,-22,-6,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-24,2,5,-23,-19,1,-19,11,-18,-8,4,-14,9,11,-1,-1,-13,-27,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-19,-28,-20,4,-30,-22,20,-26,31,14,-23,-25,-19,-20,-18,2,14,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-26,-1,-30,-27,29,-22,12,10,-23,-25,-24,-21,-9,1,35,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,-27,28,26,-32,-13,-1,-30,10,-25,-20,13,-8,10,0,1,-8,-26,-32,-18,18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,8,17,-22,-17,-1,-22,7,-15,-12,-1,-12,11,9,-2,-7,-20,-23,-8,13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,23,-32,-22,22,-30,35,16,-26,-28,-24,-22,-26,-10,12,-14,6,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-7,11,-25,13,15,-27,-16,-7,-27,19,-24,-16,7,-10,5,10,0,0,-20,-28,-15,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00334;
//
ID   SUCCINYL_COA_LIG_2_MP; MATRIX.
AC   MP00399;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-citrate lyase / succinyl-CoA ligases family active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6406546; R2=0.0133263; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=542; N_SCORE=11.854; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-18,-28,-22,-17,6,-24,-11,1,-14,-2,-2,-14,-24,-15,-13,-17,-11,-3,15,11,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-12,-24,-20,-14,2,-26,-17,5,-3,-4,1,-6,-19,-12,-6,-10,-3,3,-17,1,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-26,0,13,-27,-18,-6,-18,14,-21,-9,0,-10,16,6,2,-3,-16,-26,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-26,3,8,-25,5,-9,-28,5,-22,-16,3,-13,0,5,1,-6,-22,-26,-19,4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-25,0,1,-22,-12,1,-17,6,-22,-11,14,-9,3,7,2,-3,-18,-29,-13,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-21,-25,-18,1,-24,-17,13,-10,6,15,-16,-21,-12,-11,-12,-3,13,-20,-3,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-19,0,1,-21,-12,-13,-20,0,-22,-15,2,0,-2,-4,14,17,-13,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-29,-3,7,-27,-20,-9,-26,45,-26,-4,-2,-11,9,27,-11,-10,-17,-20,-9,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-29,1,-31,-29,31,-22,14,12,-29,-29,-28,-21,-13,-2,45,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-14,-31,-28,2,-29,-29,29,-21,10,10,-26,-27,-27,-22,-10,-2,40,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='G'; M=17,-8,-3,-12,-12,-23,19,-18,-24,-15,-23,-17,-2,-16,-12,-18,13,-2,-13,-29,-24,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-29,-36,-28,51,-27,-15,-5,-23,0,-5,-25,-30,-29,-18,-24,-15,-10,49,38,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,2,-35,-29,-5,-34,-29,28,-27,9,9,-21,-25,-23,-28,-14,-8,24,-27,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=29,-15,-17,-24,-16,-16,-4,-22,2,-16,-5,-4,-11,-14,-13,-22,2,-4,5,-21,-16,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-14,-18,-20,-14,-4,-24,-18,4,-13,6,2,-12,-18,-9,-9,-3,12,5,-23,-6,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,23,-15,-15,-13,-21,-22,-13,-16,-14,-12,-6,-19,-15,-16,13,26,0,-37,-17,-15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-33,-3,-1,-29,-9,-18,-22,-10,-28,-20,-11,55,-9,-18,-2,-5,-25,-30,-27,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-31,-8,4,-24,-19,-1,-16,5,-18,0,-10,23,6,-3,-9,-10,-20,-25,-14,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-13,-28,-15,-21,-9,41,-20,-26,-22,-19,-14,-4,-21,-23,-20,-5,-17,-20,-15,-17,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-6,1,-22,-19,-10,-22,28,-22,-9,-2,-14,4,29,-2,-1,-11,-24,-11,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-29,-7,5,-25,-20,2,-27,23,-20,-7,0,-17,22,51,-6,-7,-22,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-23,-20,-33,-23,20,-23,-5,15,-15,17,45,-20,-23,-10,-13,-20,-10,7,-12,8,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-18,-29,61,-8,-39,-19,-29,-18,1,-20,-17,-18,-1,-20,-30,-21,-25,-18;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-12,-18,-9,-20,-2,-8,-12,-10,-11,-9,-8,-11,-8,-18,8,-2,-3,-21,-16,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-12,-33,-27,-1,-24,-27,24,-27,6,7,-16,-22,-21,-27,-12,-9,15,-22,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-18,-32,-25,3,-26,-26,24,-22,9,8,-20,-21,-22,-24,-10,-5,25,-20,-5,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=4,10,-16,5,9,-19,-5,-3,-16,-3,-20,-12,16,-10,2,-6,14,3,-15,-31,-17,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-27,-9,-13,-29,47,-16,-34,-13,-27,-17,0,-17,-9,-14,3,-14,-26,-21,-26,-11;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-22,-8,-10,-24,28,-14,-25,-14,-21,-14,2,-17,-7,-14,9,-6,-19,-26,-22,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-24,-7,-5,-23,5,-15,-23,10,-21,-11,-3,-15,-5,2,0,-5,-14,-24,-16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-2,1,-28,39,-15,-35,-11,-26,-19,0,-14,-9,-14,2,-12,-27,-23,-26,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-14,0,-7,-16,-10,-17,-16,-10,-15,-14,3,-11,-9,-11,17,36,-6,-31,-13,-8;
MA   /M: SY='A'; M=47,-10,-11,-20,-10,-20,-1,-20,-10,-10,-11,-10,-10,-5,-10,-20,9,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=8,2,-20,3,15,-24,-13,-10,-16,1,-16,-13,-2,-10,3,-7,4,-4,-10,-28,-18,9;
MA   /M: SY='S'; M=9,4,-5,4,5,-24,-6,-12,-23,-8,-22,-18,2,-12,-4,-13,14,5,-13,-33,-20,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-4,-25,-13,-12,-5,-22,-7,7,-7,-3,5,5,-21,-6,-7,-9,-7,-2,-21,-1,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00335;
//
ID   LBP_BPI_CETP_MP; MATRIX.
AC   MP00400;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LBP / BPI / CETP family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7754445; R2=0.0168785; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=715; N_SCORE=17.834; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-24,-31,-23,21,-19,-19,6,-26,24,13,-25,-28,-22,-19,-25,-13,0,4,7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=8,-20,-18,-22,-18,-8,-2,-21,1,-21,10,1,-17,-22,-18,-19,-8,-6,5,-23,-13,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-28,-20,8,-29,-21,18,-28,42,17,-28,-28,-20,-19,-25,-4,12,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-28,-26,-30,-24,13,-10,-23,0,-25,13,1,-25,-28,-24,-20,-23,-15,-2,15,4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=1,-5,-18,-12,-12,-2,-14,-11,0,-17,9,0,2,-22,-12,-14,-6,-3,-5,-26,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=15,-18,-15,-24,-17,-6,-18,-22,8,-19,13,4,-17,-19,-16,-20,-5,3,10,-22,-10,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-14,-22,-16,-13,3,-12,11,-9,-17,0,-2,-9,-22,-10,-13,-6,-7,-10,-14,13,-13;
MA   /M: SY='V'; M=10,-16,-15,-23,-17,-7,-20,-22,10,-18,6,2,-13,-17,-15,-19,0,9,12,-25,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,7,-14,-8,-22,-12,-18,-18,-12,-20,-15,-9,3,-8,-18,8,3,-11,-32,-22,-9;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-20,-7,-7,-22,20,-15,-23,-11,-24,-16,0,-16,-9,-10,14,-1,-13,-29,-22,-9;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-14,-11,-6,-18,-10,-17,-13,0,-16,-11,-4,-11,-6,-7,13,12,-2,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-10,-25,-11,-6,-20,1,6,-16,-12,-6,-2,-6,-18,6,-9,-5,-9,-17,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='T'; M=12,-6,-8,-14,-14,-18,8,-21,-19,-14,-16,-13,-4,-14,-14,-16,11,16,-9,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='V'; M=6,-12,-15,-14,-5,-12,-19,-19,3,-12,-6,-4,-10,-15,-10,-15,6,8,11,-29,-14,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-13,12,-24,2,-1,-3,-14,5,-13,-1,-14,-11,21,-21,-4,-2,-4,-5,-20,-19,5,-3;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-35,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,72,-10,-20,-6,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-1,-34,-27,-1,-34,-26,27,-27,19,15,-24,-27,-22,-25,-19,-9,21,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-17,-21,-18,-9,-27,-24,13,-2,-1,4,-19,-23,-17,-7,-8,1,27,-27,-9,-18;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,10,-27,-21,-12,-20,-26,5,-19,-2,-2,-17,-22,-20,-23,-2,0,15,-28,-16,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-27,23,15,-35,-14,0,-28,11,-27,-15,8,-10,22,4,4,-5,-25,-30,-15,19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-30,-5,6,-28,-18,-9,-26,27,-26,-11,-4,6,9,23,-8,-9,-21,-22,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-20,-15,-15,-25,34,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-27,29,23,-27,-16,-4,-24,-3,-11,-15,3,-11,5,-8,-5,-9,-21,-31,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-25,-23,-22,22,-30,5,8,-15,9,5,-23,-30,-15,-13,-20,-8,4,12,52,-22;
MA   /M: SY='A'; M=18,-18,-15,-22,-18,-12,0,-22,-1,-18,2,-2,-16,-20,-18,-20,-4,-5,8,-22,-16,-18;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-7,-10,-8,-17,-11,-14,-11,-3,-12,-9,2,-17,-8,-8,3,-1,-4,-28,-16,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-1,-30,-1,16,-36,-20,15,-23,14,-21,-2,1,-12,46,16,-3,-11,-28,-21,-7,30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-26,9,39,-28,-19,-3,-21,6,-17,-13,-3,-5,19,-2,0,-8,-20,-27,-18,29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-26,-8,-12,-26,47,-18,-34,-16,-26,-18,0,-17,-15,-17,4,-7,-25,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-17,-26,-18,0,-22,-17,12,-20,25,19,-22,-23,-14,-17,-15,-2,10,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-14,-24,-15,-6,-13,-22,-14,-8,11,2,1,-13,-19,-4,12,-15,-9,-4,-21,-8,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-18,-13,-25,-19,3,-16,-20,4,-16,0,3,-16,-19,-18,-18,0,2,13,-20,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,7,33,-36,-20,6,-24,12,-21,-7,0,-7,44,8,-1,-10,-29,-23,-13,38;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-24,-3,7,-27,-15,-2,-23,14,-23,-9,2,-12,23,18,7,2,-19,-25,-12,14;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-25,1,25,-22,-17,-7,-17,7,-10,-5,-6,-8,8,-2,-4,-8,-16,-25,-15,16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-31,-21,20,-28,-20,14,-28,38,14,-27,-28,-23,-20,-25,-9,7,-15,4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-4,-29,-2,15,-19,-22,7,-18,12,-12,-5,-5,-13,15,6,-10,-11,-20,-17,2,14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-27,0,16,-24,-20,-6,-27,24,-21,-13,0,-11,9,29,-3,-1,-19,-24,-13,11;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-23,-31,-22,-7,-29,-26,28,-17,8,10,-18,-19,-17,-21,-12,-7,23,-22,-6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-15,-6,-6,-15,-17,-15,-12,2,-16,-10,4,-13,-6,-2,13,27,-3,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-26,-32,-24,10,-34,-17,28,-26,29,16,-24,-26,-18,-22,-24,-10,14,-11,14,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-32,-24,29,-30,-18,15,-26,18,8,-21,-27,-25,-20,-17,-7,10,-8,15,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-2,8,-16,4,-3,-15,-9,-5,-18,-5,-22,-16,13,-14,-2,-3,19,17,-13,-31,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-2,-16,-31,62,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,20,-22,26,17,-29,-8,-4,-28,2,-27,-22,12,-9,3,-5,12,0,-21,-35,-19,10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-12,-24,-13,4,13,-25,-13,-12,2,-6,-6,-11,-17,-10,-2,-12,-9,-8,-13,2,-1;
MA   /M: SY='R'; M=4,-5,-23,-7,-2,-24,1,-11,-26,13,-24,-13,0,-14,0,14,4,-4,-16,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-24,-26,-30,-22,-1,-31,-3,27,-23,19,24,-17,-22,-12,-20,-20,-12,13,-22,3,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-8,-27,-10,3,-8,-22,-9,-16,20,-14,3,-8,-8,0,9,-12,-10,-13,-17,-4,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-16,-24,-19,-15,15,-24,25,-7,-17,4,2,-12,-25,-11,-12,-15,-12,-9,-6,27,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-30,-23,22,-30,-16,16,-25,29,12,-27,-30,-23,-18,-24,-8,12,-9,15,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-28,-4,-11,-28,43,-14,-35,-4,-30,-18,9,-18,-11,-8,0,-15,-28,-23,-25,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-26,-15,-5,-18,-24,-11,-2,7,-10,0,-7,-17,7,14,-7,-7,-2,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-3,-20,0,-11,-22,13,-17,-17,-14,-18,-13,-3,-19,-15,-17,4,-5,-4,-29,-21,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00367;
//
ID   PROK_SULFATE_BIND_1_MP; MATRIX.
AC   MP00401;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic sulfate-binding proteins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4384766; R2=0.0136216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1101; N_SCORE=19.426; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,6,-26,-20,3,-27,24,-20,-7,0,-17,25,53,-7,-10,-23,-20,-10,12;
MA   /M: SY='E'; M=1,15,-26,23,36,-30,-14,-4,-28,4,-20,-20,2,-4,9,-6,2,-8,-24,-30,-20,23;
MA   /M: SY='L'; M=16,-21,-16,-26,-16,-3,-17,-20,7,-21,24,7,-21,-21,-16,-20,-13,-6,6,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25,54,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,56,-25;
MA   /M: SY='E'; M=6,5,-25,9,41,-27,-15,-5,-25,5,-17,-17,-3,-3,12,-5,3,-7,-22,-27,-20,27;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-3,-25,-5,10,-32,-15,-2,-20,14,-20,-5,-3,-10,30,6,0,-7,-20,-20,-13,20;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-27,-27,-31,-24,12,-34,-12,27,-24,22,14,-23,-26,-17,-21,-23,-10,13,-5,24,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,10,-24,-6,-13,-11,-17,-7,10,-13,-8,-3,25,-20,-9,-13,-3,-4,-4,-31,-11,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,3,-30,-20,-17,-23,8,-30,-17,-14,60,-4,-5,-10,-10,-27,-27,-24,-4;
MA   /M: SY='P'; M=8,-8,-27,-9,1,-27,-14,-16,-21,16,-24,-13,-8,17,-1,2,-4,-7,-17,-23,-18,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=11,1,-15,-1,12,-20,-10,-12,-18,-5,-19,-16,1,-7,1,-9,19,14,-11,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=21,-3,-20,-6,13,-28,-10,-8,-17,0,-15,-10,-5,-8,15,-8,5,-5,-15,-22,-17,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,2,-30,4,23,-32,-20,35,-25,4,-20,-4,3,-11,36,5,-3,-13,-30,-25,-3,28;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-26,23,24,-33,-13,1,-27,3,-25,-17,8,-8,22,-2,9,-3,-26,-32,-17,23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,8,17,-29,-15,0,-26,25,-27,-13,16,-11,16,14,-2,-7,-26,-27,-14,16;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-15,-10,-13,-15,4,-20,-18,-13,-15,-13,0,-13,-13,-13,15,31,-8,-27,-15,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,28,-30,40,20,-40,-14,4,-31,4,-26,-17,11,-10,26,-1,0,-10,-30,-31,-16,23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-27,26,20,-29,-12,0,-29,15,-28,-20,22,-11,7,6,0,-7,-27,-33,-17,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-15,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-14,-16,-14,-9,-23,-19,-2,-4,-6,-4,-9,-18,-12,4,5,22,11,-28,-10,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-26,-40,-30,35,-36,-26,28,-30,16,11,-20,-24,-29,-26,-20,-10,17,-7,13,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,8,-28,6,16,-25,-16,-1,-28,24,-25,-14,13,-13,10,29,-4,-8,-24,-26,-14,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-30,-9,-9,2,-24,65,-17,-10,-11,0,-3,-24,1,-4,-14,-16,-21,-4,46,-9;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-25,-7,-15,-27,51,-17,-35,-17,-30,-20,3,-17,-15,-17,11,-9,-25,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-21,0,6,-26,-11,-10,-26,24,-30,-14,4,-10,6,13,12,3,-16,-29,-14,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-10,-16,-10,-16,-9,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,22,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-21,-15,-8,-9,-23,-11,-11,2,2,-2,-8,-20,-4,22,-6,8,-6,-23,-7,-8;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,38,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-27,36,14,-34,-10,6,-29,3,-27,-19,27,-13,16,-2,3,-7,-30,-35,-17,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00337;
//
ID   43_KD_POSTSYNAPTIC_MP; MATRIX.
AC   MP00405;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   43 Kd postsynaptic protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=24;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=22;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5373507; R2=0.0132634; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1090; N_SCORE=18.984; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,13,-33,-20,40,-23,3,-20,0,3,-13,43,7,-3,-13,-30,-23,0,27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,8,36,-36,-20,6,-24,10,-20,-8,0,-6,44,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-30,8,29,-30,15,-8,-34,-2,-24,-20,0,-8,4,-8,0,-14,-30,-26,-24,17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00339;
//
ID   ACTINS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00406;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Actins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8532486; R2=0.0136039; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=601; N_SCORE=13.019; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='H'; M=-14,10,-24,1,-4,-13,-14,38,-19,-4,-18,-5,20,-20,3,1,-2,-4,-22,-26,7,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-23,-8,2,-19,-22,-7,-10,2,-12,-5,-9,-5,3,-1,-3,2,-5,-26,-11,1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-24,1,-1,-29,22,-9,-29,-8,-27,-16,5,-14,4,-9,10,-4,-24,-27,-22,1;
MA   /M: SY='V'; M=13,-18,-15,-22,-20,-9,-21,-25,16,-17,3,3,-18,-20,-20,-21,-5,-2,25,-26,-12,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-21,-31,-21,3,-25,-9,24,-18,27,44,-23,-23,-8,-15,-22,-10,13,-20,0,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-19,-18,-22,-6,-28,-22,24,-18,8,13,-19,-24,-20,-20,-12,-5,29,-28,-8,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-28,-6,-15,-28,54,-19,-34,-18,-27,-18,-1,-19,-18,-19,-1,-17,-24,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='M'; M=1,-19,-16,-25,-19,-5,-18,-11,15,-13,9,30,-17,-20,-8,-14,-7,-3,15,-25,-7,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,9,-27,14,-2,-31,29,-12,-35,-11,-27,-21,6,-14,-10,-15,3,-10,-26,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,8,-24,5,12,-28,-12,10,-23,6,-25,-11,14,-12,23,4,9,-2,-25,-30,-12,17;
MA   /M: SY='K'; M=2,-2,-26,-4,6,-28,-16,-11,-26,36,-26,-10,-2,-10,8,19,-6,-8,-16,-20,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-26,37,17,-32,-5,-1,-33,-1,-28,-24,13,-10,2,-7,8,-4,-25,-36,-19,9;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,4,-7,5,-17,-15,-11,-17,-9,-15,-12,-6,-15,-4,-13,7,1,-11,-30,-13,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-28,-12,-21,-27,60,-21,-33,-20,-26,-17,-3,-21,-21,-20,-1,-18,-22,-21,-28,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,68,21,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-12,-19,-10,-19,-3,-18,-11,-6,-10,-9,-10,-12,-9,-11,7,-1,0,-20,-19,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,17,-36,-20,16,-19,7,-17,1,-1,-12,52,8,-2,-11,-28,-21,-7,34;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-16,-5,3,-25,-8,-6,-16,-4,-21,-10,3,-11,15,-6,18,7,-13,-29,-16,9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-11,11,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-5,-17,-31,65,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,6,-34,-29,35,-25,14,13,-25,-26,-27,-24,-15,-5,38,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-6,-30,-21,7,-30,-21,15,-30,43,16,-29,-31,-21,-21,-28,-10,8,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-16,-6,-3,-18,-15,-13,-17,5,-19,-12,2,-10,-3,0,14,23,-8,-28,-12,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-29,-9,0,-14,-18,-11,-25,24,-25,-12,-5,-15,1,16,-7,-8,-18,0,-3,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-11,-29,-14,-16,21,-26,24,-4,-9,-5,-2,-8,-28,-7,-8,-16,-9,-14,18,64,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-18,-39,-9,0,-29,-20,-5,-21,-10,-29,-18,-16,76,-8,-18,-10,-11,-30,-30,-24,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-27,-35,-27,-2,-37,-28,41,-27,15,16,-16,-19,-18,-27,-14,-2,25,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-29,10,44,-16,-21,-4,-26,9,-17,-16,-2,-5,12,1,-4,-10,-25,-24,-13,28;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-28,-4,-2,-14,-19,62,-25,-4,-19,-3,5,-20,8,8,-6,-13,-24,-22,18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-28,-12,-21,-26,58,-21,-31,-20,-25,-16,-4,-21,-21,-20,-1,-18,-20,-21,-28,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-27,-29,-15,-6,-34,-21,32,-20,12,17,-17,-17,-10,-21,-15,-8,18,-22,-4,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,34,-24,18,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,3,-18,-4,-2,-18,-17,-11,-19,10,-19,-12,7,-12,-1,10,10,22,-11,-28,-12,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00340;
//
ID   CONNEXINS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00407;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Connexins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5504413; R2=0.0123488; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1387; N_SCORE=21.668; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=11,-18,-12,-22,-19,-8,-19,-23,10,-16,0,0,-16,-20,-18,-18,4,7,22,-28,-13,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-14,-13,-11,-20,9,-18,-15,-12,-17,-13,-4,-13,-11,-17,15,6,-5,-26,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=27,-10,-19,-15,-15,-25,32,-20,-24,-15,-19,-15,-5,-15,-15,-20,5,-9,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-32,10,40,-30,-16,-6,-28,5,-23,-19,-5,20,12,-4,-3,-10,-30,-29,-22,25;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-23,4,2,-24,10,-9,-28,-4,-26,-19,8,-9,-3,-1,12,1,-21,-31,-21,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-12,-29,-28,-1,-29,-28,28,-21,10,9,-27,-28,-27,-20,-9,0,43,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-40,-35,-28,26,-24,-16,-12,-19,-10,-12,-32,-30,-21,-18,-32,-22,-20,99,42,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-27,2,-12,-27,43,-14,-35,-15,-28,-20,5,-18,-14,-16,4,-12,-26,-23,-22,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,1,-30,2,23,-35,-20,12,-24,13,-21,-5,1,-10,43,14,-2,-11,-29,-22,-10,32;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-15,1,2,-21,-5,-8,-20,1,-27,-17,13,-11,1,-3,22,11,-14,-34,-18,1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,-27,31,21,-30,-10,-2,-29,5,-23,-17,11,-9,5,-4,1,-8,-24,-33,-18,13;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-20,-16,-16,-9,-27,-21,16,-15,3,6,-15,-20,-15,-16,-7,0,20,-27,-9,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-13,31,-23,20,2,-22,-6,31,-24,-2,-28,-16,44,-19,2,-1,4,-6,-30,-38,-10,1;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-12,-13,-12,-7,-22,-20,-5,-13,-1,-5,-5,-13,-12,-12,12,41,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-27,-7,3,-21,-6,-5,-16,1,-9,-3,-1,-17,10,5,-7,-10,-18,-23,-13,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-28,-1,17,-37,-20,7,-19,8,-19,-1,0,-10,54,8,2,-5,-27,-21,-10,36;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-9,12,-25,12,10,-26,-11,-5,-26,14,-26,-16,12,-8,5,8,3,0,-22,-30,-16,7;
MA   /M: SY='N'; M=-2,24,-18,9,-1,-20,-4,2,-18,-2,-25,-16,38,-16,2,-3,13,8,-22,-35,-18,0;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-15,-30,-26,-2,-27,-28,27,-21,12,10,-25,-25,-24,-22,-11,-3,35,-26,-9,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-7,-25,-7,5,-20,-18,2,-15,2,-15,-7,-8,-15,6,-3,-6,-10,-11,-10,-6,5;
MA   /M: SY='F'; M=2,-21,-18,-30,-19,38,-20,-16,-5,-20,1,-3,-15,-22,-21,-17,-9,-7,-3,-1,13,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-21,-30,-21,47,-25,-7,-8,-17,1,-2,-13,-26,-25,-4,-15,-10,-6,-1,18,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-22,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-6,-32,-4,-1,-21,-20,61,-24,-11,-18,-4,2,6,3,-6,-11,-16,-28,-30,6,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,36,-27,24,17,-26,-26,-23,-24,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-33,-25,50,-30,-11,5,-26,19,5,-23,-30,-28,-18,-23,-10,1,6,33,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=20,-21,-10,-25,-21,-9,-17,-25,12,-16,1,1,-21,-21,-21,-20,0,1,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-34,-24,37,-29,-18,12,-28,31,15,-25,-29,-26,-19,-25,-10,6,-8,12,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00341;
//
ID   CONNEXINS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00408;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Connexins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1116109; R2=0.0109462; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=973; N_SCORE=14.752; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=219; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-16,-27,-17,-22,-21,40,-22,-18,-22,-14,-9,-7,-22,-21,-21,-6,-16,-13,-21,-22,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-12,-26,-15,0,3,-24,-1,-10,-7,-4,2,-9,-18,20,-2,-9,-10,-17,-11,4,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-18,-33,-18,-16,14,-26,34,-11,-11,-8,-3,-15,-27,-6,-9,-20,-15,-18,31,58,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-14,-22,-17,15,-24,-6,-3,-15,2,-1,-11,-24,-16,-10,-10,-3,-3,-11,13,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-22,15,-31,-20,22,-29,40,20,-27,-28,-21,-21,-27,-10,12,-17,3,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-31,-22,-21,30,-29,14,-2,-12,-1,-2,-22,-30,-12,-11,-22,-12,-11,40,74,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-30,-4,-15,-30,55,-17,-39,-13,-29,-20,1,-19,-16,-12,-1,-18,-29,-21,-27,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-24,-35,-28,60,-30,-11,2,-25,7,1,-21,-29,-31,-18,-21,-11,-2,18,40,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-2,-21,-4,-1,-13,-15,-6,-13,-4,-15,-8,0,-14,1,-4,5,5,-10,-26,-9,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-19,-31,-22,3,-26,-13,23,-20,29,36,-25,-25,-13,-16,-22,-8,18,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-29,0,4,-26,-17,-9,-19,-6,-23,-16,-7,33,-2,-12,0,-4,-20,-31,-20,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-26,-10,-4,-20,-13,-8,-21,-1,-23,-15,-6,14,-3,6,2,0,-18,-21,-14,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-27,-20,5,-27,-19,16,-19,21,15,-22,-25,-18,-14,-15,-3,16,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-29,-25,29,-30,-6,11,-20,8,5,-22,-29,-24,-16,-17,-7,13,-2,28,-25;
MA   /M: SY='K'; M=0,-11,-23,-14,-4,-19,-22,-16,-4,7,-10,-2,-10,-12,-1,1,-6,-4,2,-23,-11,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-23,6,8,-24,-9,7,-25,2,-23,-14,8,-13,6,6,7,-1,-20,-30,-13,6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-23,-10,-2,-19,-15,-7,-17,10,-14,-8,-1,-17,3,26,-3,-5,-10,-24,-13,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-24,-1,1,-13,-15,-7,-16,-5,-14,-12,-6,-14,-2,-9,-1,-4,-13,-8,-2,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-14,-4,-24,-22,-20,-10,-12,-20,-11,-20,67,-11,-19,-12,-10,-20,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,14,-26,6,-2,-19,-3,37,-26,-2,-25,-11,28,-20,2,2,-1,-10,-28,-31,-3,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-18,-12,-6,-13,-20,-16,-5,-4,-9,-5,-6,-7,-5,-5,6,17,-1,-27,-11,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-12,-30,-28,-1,-30,-29,29,-20,9,9,-27,-27,-27,-21,-9,2,44,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,53,21,-35,-12,-1,-35,0,-27,-26,18,-9,1,-8,3,-3,-27,-38,-19,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-23,-31,-26,60,-29,-6,-1,-22,5,-1,-16,-30,-29,-16,-19,-10,-4,14,43,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-32,-26,-1,-33,-26,34,-24,18,16,-24,-25,-19,-22,-17,-6,31,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,1,-21,-20,4,-30,31,-21,-9,1,-19,10,61,-10,-11,-21,-21,-8,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-10,-9,-8,-12,-16,-17,-11,-10,-13,-10,1,-10,-8,-10,23,42,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,7,-15,-3,-5,-15,-15,-13,-15,1,-18,-12,10,-12,-5,-2,15,30,-9,-31,-12,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,17,16,-24,-24,-24,-26,-17,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,78,-30,-20,1,-30,10,1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,1,9,29,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-21,-28,-21,-1,-31,-24,23,-23,18,11,-16,-19,-17,-21,-10,9,16,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-23,-27,-23,5,-30,-17,19,-18,14,9,-21,-26,-18,-17,-19,-8,16,-8,10,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-38,-29,65,-31,-21,6,-29,10,2,-19,-28,-36,-21,-18,-7,5,4,24,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,-1,20,-11,21,59,-20,-20,-1,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-30,-24,18,-30,-17,18,-24,24,13,-25,-29,-23,-19,-21,-8,17,-14,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-15,-20,-20,-14,2,-23,0,-17,-8,-4,-14,-20,-19,-19,2,-2,12,-26,-17,-20;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-12,-25,-22,-6,-23,-26,16,-17,3,3,-19,-21,-21,-19,-1,9,29,-27,-11,-22;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-11,-9,-5,-20,2,-15,-16,-10,-21,-16,1,-10,-5,-14,26,12,-6,-31,-20,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00341;
//
ID   PROKAR_NTER_METHYL_MP; MATRIX.
AC   MP00409;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic N-terminal methylation site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7960486; R2=0.0158423; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=234; N_SCORE=8.493; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-20,-27,-18,-2,-19,-1,16,-8,16,53,-18,-19,0,-9,-16,-8,8,-21,-1,-9;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-18,-8,-3,-10,-11,-6,-8,6,-7,-1,-5,-8,2,10,-8,-6,-8,-6,-4,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,3,-22,0,3,-21,-14,-1,-20,15,-20,-10,7,-9,5,17,-1,-2,-16,-23,-11,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-4,1,-20,-10,0,-22,12,-18,-8,3,-15,4,16,-4,-6,-18,-22,-8,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-26,1,17,-29,-17,3,-19,7,-18,-4,3,-10,33,4,2,-6,-23,-23,-12,25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-25,-5,5,-26,-12,-3,-26,19,-23,-10,0,-13,12,26,0,-5,-19,-23,-13,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-21,-37,-27,58,-28,-14,5,-25,13,13,-20,-28,-30,-18,-20,-10,2,4,25,-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-20,9,-30,-20,19,-29,47,19,-29,-29,-20,-20,-28,-7,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-34,-25,3,-34,-25,33,-28,30,18,-25,-22,-21,-24,-23,-9,21,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-16,-28,-23,0,-27,-21,23,-20,17,18,-23,-25,-19,-18,-12,0,26,-26,-6,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-20,-30,-20,3,-25,-12,21,-20,29,36,-23,-23,-11,-17,-21,-8,12,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-18,-31,-25,1,-30,-25,29,-24,22,16,-25,-26,-22,-22,-16,-5,28,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='V'; M=23,-20,-10,-25,-20,-9,-16,-25,11,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,1,25,-25,-14,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-19,-30,-22,4,-28,-20,25,-24,31,22,-25,-25,-17,-19,-21,-7,18,-21,-2,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-12,-21,-15,-10,-8,-19,1,-14,-1,1,-14,-17,-14,-18,2,-1,9,-23,-14,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-34,-25,4,-34,-25,36,-28,29,18,-24,-24,-20,-25,-22,-9,24,-20,-1,-25; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-26,-22,-33,-24,19,-26,-20,16,-23,13,13,-20,-23,-21,-21,-15,-8,11,-6,5,-22;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,-16,-15,-14,-19,14,-19,-14,-15,-14,-11,-6,-16,-13,-18,9,-1,-5,-25,-20,-14;
MA   /M: SY='I'; M=1,-23,-20,-30,-22,0,-24,-23,21,-22,14,13,-19,-21,-18,-21,-11,-3,18,-21,-5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-17,-27,-21,0,-22,-22,16,-24,24,10,-24,-25,-20,-20,-15,-4,17,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,-15,-18,-13,-10,-5,-19,-5,-17,0,-4,-11,-17,-13,-18,4,2,0,-24,-14,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=8,-17,-15,-21,-16,-6,-13,-19,5,-18,10,4,-15,-19,-14,-17,-4,2,7,-23,-10,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-18,-22,-17,-8,-6,-21,2,-19,3,1,-13,-19,-16,-19,-2,1,4,-23,-12,-17;
MA   /M: SY='V'; M=15,-21,-13,-25,-21,-7,-16,-25,12,-18,5,3,-20,-21,-21,-20,-4,0,24,-25,-13,-21;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-29,-23,9,-24,-18,18,-22,19,16,-22,-25,-19,-19,-17,-6,15,-16,4,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-26,-14,-5,-13,-16,-11,-11,-7,-13,-4,-11,12,-2,-7,-3,-3,-14,-21,-9,-5;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-16,-11,-10,-10,-9,-12,-7,-11,-9,-6,0,-17,-7,-9,7,7,-3,-26,-9,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-25,-22,-29,-23,23,-26,-14,7,-21,13,7,-22,-26,-21,-17,-17,-5,5,5,19,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-25,-2,2,-25,-11,-5,-17,-3,-16,-7,0,-1,13,-2,2,-2,-19,-27,-15,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-2,-25,-4,-3,-19,2,-7,-23,1,-22,-13,3,-13,0,2,2,-5,-18,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-11,-20,-14,-8,-9,-13,-2,-7,-11,-6,-4,-8,-17,-5,-11,-2,-5,-4,-17,-3,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-8,-21,-13,-8,-14,-15,-9,-5,-3,-6,4,-5,-15,0,-2,-1,0,-4,-24,-9,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-5,8,-24,8,6,-23,-12,-5,-21,4,-20,-13,6,-14,6,6,2,-4,-17,-27,-14,5;
MA   /M: SY='S'; M=-2,4,-21,2,1,-18,-11,-7,-19,1,-20,-13,6,-14,3,3,8,2,-14,-28,-13,2;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-20,-2,-1,-16,-11,-10,-11,-9,-9,-8,-1,-15,-4,-9,3,0,-8,-27,-13,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-24,-1,9,-23,-11,-7,-20,8,-19,-11,1,-11,9,4,2,-4,-17,-24,-14,9;
MA   /M: SY='R'; M=0,-13,-21,-15,-10,-13,-11,-12,-7,-3,-5,0,-10,-18,-4,1,-4,-4,-2,-21,-8,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00342;
//
ID   DYNAMIN_MP; MATRIX.
AC   MP00410;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dynamin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9340405; R2=0.0141492; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=697; N_SCORE=14.786; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=2,16,-14,8,0,-20,0,-2,-20,-6,-30,-20,30,-14,0,-6,28,12,-18,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,3,-7,-5,-20,-3,-14,-19,-12,-25,-18,3,-13,-5,-14,29,13,-8,-37,-21,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-28,20,48,-28,-16,2,-28,8,-22,-20,12,-4,16,0,2,-8,-30,-32,-20,32;
MA   /M: SY='A'; M=29,-1,-11,-9,-5,-20,0,-13,-15,-9,-19,-15,4,-11,-5,-14,21,7,-7,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-14,-23,-21,-6,-23,-24,19,-19,0,3,-16,-22,-19,-19,3,4,28,-31,-11,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-11,-24,-11,-7,-16,-23,20,-12,6,-13,-1,-6,-21,-2,13,-10,-10,-2,-26,-1,-7;
MA   /M: SY='D'; M=0,15,-26,24,13,-31,-10,-9,-27,-4,-25,-22,3,10,-2,-13,4,-5,-22,-33,-22,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-12,-25,-20,34,-21,-16,8,-19,11,4,-17,-21,-24,-14,-13,-5,11,-3,11,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-26,-9,-1,-19,-20,-5,-26,25,-19,-10,0,-17,6,50,-4,2,-16,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,0,-15,-31,60,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-16;
MA   /M: SY='N'; M=1,10,-18,4,10,-21,-10,-7,-20,3,-22,-16,14,-10,2,-2,13,10,-17,-32,-17,6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,12,-27,8,-10,-28,40,-9,-34,-12,-30,-21,21,-19,-12,-13,3,-13,-30,-28,-26,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-25,-31,-27,-6,-14,-25,25,-24,8,15,-18,-22,-20,-24,-14,-10,20,-22,-8,-26;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,1,-29,-26,-6,-25,-28,18,-20,4,4,-24,-26,-25,-22,-7,-2,32,-29,-13,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-13,19,-18,-11,-20,-19,-13,-26,4,-18,-13,-8,-24,-6,22,-6,-8,-13,-29,-18,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-14,-27,-14,5,-13,-29,-16,10,-8,0,1,-13,-15,-5,-7,-10,-8,7,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,9,-28,12,13,-33,-18,-1,-26,16,-23,-10,4,-11,25,13,-1,-3,-23,-25,-12,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-20,-13,-9,-15,-21,-8,-1,3,-12,-2,-8,-18,-7,-2,-1,-2,8,-28,-8,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,1,-29,-1,5,-25,-18,20,-28,23,-24,-8,8,-16,14,30,-7,-11,-24,-24,-5,7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-14,-21,-17,-4,-8,-24,-15,9,-14,7,8,-13,-16,-7,-15,-6,1,6,-26,-8,-7;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-25,5,12,-26,-8,-11,-25,6,-23,-16,-1,2,1,-3,4,0,-19,-28,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=0,4,-23,5,6,-24,-11,-10,-22,-2,-23,-18,4,9,-1,-4,9,4,-18,-32,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-8,-23,-6,4,-18,-9,-14,-16,-6,-11,-10,-6,-1,-4,-9,3,3,-13,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='S'; M=2,7,-20,8,7,-28,-10,-6,-22,2,-23,-14,5,-10,13,-3,14,6,-17,-30,-16,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00362;
//
ID   KINESIN_MOTOR_DOMAIN1_MP; MATRIX.
AC   MP00411;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Kinesin motor domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3813825; R2=0.0184960; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=23; N_SCORE=6.797; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=7; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-15,-20,-18,-10,-9,-23,-8,4,-11,5,5,-12,-20,-5,-8,-9,-5,3,-24,-6,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-8,-22,-11,-1,-12,-22,3,-8,-4,-7,-2,-5,-16,2,-1,-5,-3,-8,-24,-4,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-17,-15,-10,-12,-22,-16,5,-12,4,3,-13,-20,-5,-11,-8,-3,6,-26,-9,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-25,-8,1,-10,-21,-5,-5,-8,-9,-4,-3,-11,0,-8,-2,-3,-8,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-23,-7,-3,-21,-5,-9,-14,-3,-15,-6,-5,-14,2,-3,-2,-7,-10,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-20,-7,0,-15,-16,-11,-12,0,-12,-8,-1,-13,-1,1,0,1,-9,-26,-12,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-9,3,-25,-1,-4,-16,-15,-2,-7,-5,-11,-7,8,-14,-3,-4,-3,-5,-10,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-1,-22,-2,0,-18,-14,-4,-14,-4,-12,-8,1,-6,-2,-3,1,-1,-12,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-24,0,6,-24,-8,-10,-19,3,-18,-11,-1,-8,3,0,-1,-5,-16,-27,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=-7,4,-23,4,3,-20,-9,-1,-22,1,-19,-13,7,-10,0,2,4,2,-17,-29,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-2,4,-25,7,5,-25,6,-6,-27,-4,-24,-16,4,-9,2,-7,4,-7,-23,-27,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-23,-7,2,-19,-11,-3,-14,-4,-12,-7,-3,-12,2,-5,-1,-1,-13,-25,-10,1;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-9,-22,-12,-4,-14,-20,-9,-5,-3,-7,-3,-6,-14,-1,-2,-2,2,-3,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-13,-17,-16,-10,-12,-24,-11,-5,2,-5,0,-9,-19,-5,9,-7,1,0,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-9,-22,-13,-9,-10,-17,7,-6,-9,-9,-2,-3,-19,-2,-4,-2,-2,-3,-25,-3,-7;
MA   /M: SY='G'; M=11,-6,-19,-7,-10,-24,30,-16,-27,-14,-27,-19,3,-14,-10,-16,19,0,-17,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-24,-4,3,-23,-17,-8,-23,23,-23,-10,0,-10,6,21,1,2,-14,-25,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-33,-23,18,-31,-19,22,-28,35,20,-26,-28,-21,-21,-26,-10,12,-14,6,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-16,0,-3,-12,-7,13,-20,-7,-23,-13,16,-17,0,-6,13,2,-19,-29,-3,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-32,-22,20,-30,-19,18,-29,40,19,-27,-29,-22,-20,-27,-10,9,-15,5,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-5,-33,-30,-2,-33,-30,31,-24,10,10,-26,-28,-27,-24,-13,-4,39,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-29,-19,9,-29,-20,19,-29,47,19,-29,-29,-19,-20,-27,-9,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-11,-19,-9,-20,-1,-14,-11,-10,-11,-9,-9,-11,-9,-19,9,-1,-2,-21,-18,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,3,-11,1,-1,-20,0,-9,-19,-9,-29,-19,14,-11,-1,-10,36,17,-11,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-23,-6,0,-22,-15,-3,-29,24,-23,-12,4,-19,6,50,-6,-8,-20,-24,-13,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-18,-14,-22,-18,-8,-9,-21,2,-17,-1,-1,-15,-17,-16,-19,-4,-4,8,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='S'; M=5,5,-20,4,-3,-22,0,-10,-21,-2,-22,-15,7,-14,-4,-5,10,1,-14,-26,-17,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-24,4,3,-25,-12,-9,-24,15,-22,-13,2,-11,3,13,0,-2,-15,-26,-14,2;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-13,-8,-6,-16,-11,-13,-15,-8,-17,-12,2,-11,-4,-6,21,29,-6,-31,-13,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-7,-8,-25,24,-8,-29,-6,-22,-13,1,-17,-3,-4,2,-6,-22,-23,-19,-6;
MA   /M: SY='A'; M=13,0,-16,-4,1,-20,-9,-8,-13,-4,-16,-11,2,-13,-3,-8,9,3,-6,-29,-16,-1;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-19,-6,3,-18,-13,-8,-16,1,-14,-9,-2,-13,0,5,6,6,-9,-27,-13,1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-26,1,-11,-27,39,-14,-34,-12,-27,-19,7,-18,-13,-11,4,-8,-25,-25,-25,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-27,1,9,-22,-20,-5,-15,5,-10,-5,-4,-10,8,6,-7,-7,-14,-26,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-25,-9,2,-20,-17,-5,-20,13,-15,-8,-3,-16,9,30,-3,-3,-14,-23,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-21,-20,-11,-4,-18,-14,1,-13,17,8,-17,-22,-7,-7,-14,-4,-2,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-27,1,6,-25,-18,-3,-25,25,-22,-10,2,-14,9,27,-6,-7,-17,-24,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,7,36,-18,-21,-5,-18,1,-10,-9,-5,-6,9,-5,-4,-8,-19,-26,-14,22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00343;
//
ID   NEUROMODULIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00412;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neuromodulin (GAP-43) signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3532395; R2=0.0122606; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=973; N_SCORE=16.273; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=176; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-33,-23,0,-26,-9,29,-16,20,48,-20,-20,-6,-16,-20,-10,16,-20,0,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-33,-3,14,-37,-20,1,-20,4,-23,-6,-6,21,38,1,-3,-10,-30,-23,-16,25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,-10,-8,-7,-13,15,-11,-12,-7,-10,-7,-3,-7,-7,-11,3,-4,-7,-11,-13,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,25,-30,-20,-7,-30,38,-27,-13,0,-7,13,21,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00344;
//
ID   NEUROMODULIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00413;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neuromodulin (GAP-43) signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2217455; R2=0.0120885; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1384; N_SCORE=20.942; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=189; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,15,-26,8,6,-26,-12,-2,-26,31,-30,-14,23,-14,6,18,-2,-6,-24,-28,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-17,-20,-17,-7,-27,-23,10,-17,0,0,-7,-13,-13,-17,7,30,10,-27,-7,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-16,29,49,-23,-23,-6,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-30,47,9,-37,13,-6,-40,-6,-30,-27,14,-13,-6,-13,0,-13,-30,-34,-23,1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,37,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='K'; M=-14,19,-30,27,14,-34,-16,-6,-34,31,-30,-18,8,-10,6,15,-6,-10,-24,-28,-14,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-30,47,9,-37,13,-6,-40,-6,-30,-27,14,-13,-6,-13,0,-13,-30,-34,-23,1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-30,39,5,-36,21,-8,-40,-8,-30,-26,12,-14,-8,-14,0,-14,-30,-32,-24,-2;
MA   /M: SY='E'; M=7,14,-21,9,20,-24,-8,-2,-21,1,-20,-17,17,-9,5,-6,6,-4,-21,-30,-20,13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,10,-22,5,0,-23,-6,-5,-20,-6,-30,-20,21,15,-3,-9,14,4,-23,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='D'; M=3,20,-24,28,25,-31,-10,-6,-28,0,-21,-21,5,-7,4,-10,3,-7,-21,-31,-20,14;
MA   /M: SY='T'; M=11,0,-17,-3,13,-19,-14,-13,-17,-3,-13,-13,-3,-7,0,-10,11,16,-10,-27,-16,7;
MA   /M: SY='A'; M=33,-4,-16,-9,10,-23,-6,-14,-16,-4,-13,-13,-7,-7,-1,-14,7,-3,-9,-23,-20,4;
MA   /M: SY='P'; M=10,-20,-22,-19,-13,-17,-18,-23,-1,-13,-11,-7,-20,22,-17,-20,-4,-4,5,-27,-21,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00344;
//
ID   PROFILIN_MP; MATRIX.
AC   MP00414;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Profilin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5085158; R2=0.0143960; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=180; N_SCORE=7.099; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-3,-2,-20,-1,-12,-18,-10,-26,-18,7,-10,-2,-12,35,18,-8,-37,-20,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,10,-29,11,17,-37,-17,16,-24,6,-22,-6,8,-12,43,6,0,-10,-30,-25,-10,29;
MA   /M: SY='A'; M=16,-2,-14,-8,-3,-20,-10,-15,-15,-3,-16,-11,-1,-10,-1,-8,15,16,-6,-27,-15,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-30,-22,-21,27,-31,16,4,-12,2,2,-20,-29,-11,-12,-20,-10,-7,26,73,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-15,-32,-29,0,-32,-30,34,-23,13,12,-27,-27,-27,-22,-13,-2,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,63,23,-39,-11,0,-38,1,-29,-28,17,-9,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-25,34,18,-27,-11,1,-28,1,-25,-22,20,-11,3,-5,5,-1,-25,-34,-14,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-26,-10,-7,-11,-22,42,-8,-13,0,6,0,-21,2,-6,-13,-13,-13,-25,8,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-26,-18,4,-26,-19,16,-25,33,16,-23,-26,-17,-18,-18,-2,10,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='M'; M=4,-18,-13,-26,-17,-7,-19,-13,9,-10,10,24,-18,-20,-8,-13,-12,-6,8,-22,-7,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=1,6,-14,4,-1,-16,10,-3,-15,-4,-14,-9,8,-9,1,-5,2,-5,-14,-15,-12,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-2,15,-22,17,18,-27,-6,-5,-26,-1,-23,-19,10,-9,5,-7,9,2,-21,-32,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-6,-11,-29,38,-14,-34,-8,-28,-17,4,-14,-9,-10,0,-13,-27,-23,-25,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: M=-7,-2,0,-4,-5,-3,-14,-6,-12,-6,-9,-7,-2,-15,-4,-6,-3,-4,-8,-17,-5,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-12,0,6,-12,-9,-4,-6,-2,-6,-4,-2,-5,4,-5,1,-1,-6,-13,-7,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-2,4,-16,6,1,-16,3,-5,-17,1,-16,-10,3,-9,-1,-3,4,-3,-13,-16,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=11,1,-20,-4,-4,-24,8,4,-21,-6,-19,-11,7,-14,1,-7,3,-8,-18,-24,-15,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=4,-8,-12,-12,-7,-17,-16,22,-15,-10,-10,-3,-4,-16,-1,-7,-2,-4,-10,-26,-3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=9,-16,-20,-23,-16,-11,-17,-16,10,-18,0,2,-10,-16,-11,-19,0,-1,7,-24,-9,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-22,-20,-23,-20,0,-29,6,13,-20,12,10,-19,-27,-16,-15,-16,-9,16,-22,8,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00372;
//
ID   SYNAPSIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00415;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Synapsins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=26;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=24;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3073740; R2=0.0126871; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1033; N_SCORE=17.403; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,61,-30,-5,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,49,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=3,15,-14,7,0,-20,0,-3,-20,-6,-30,-20,29,-14,0,-6,29,13,-17,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-20,-33,-25,0,-28,-16,31,-18,17,36,-23,-23,-13,-18,-17,-7,26,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-18,-10,-7,-15,-20,-20,-13,-10,-15,-13,-5,17,-10,-13,12,34,-8,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00345;
//
ID   SYNAPSIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00416;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Synapsins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2537203; R2=0.0126352; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1633; N_SCORE=24.877; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-34,8,36,-30,-20,-8,-26,2,-24,-20,-8,36,8,-8,-4,-10,-30,-30,-24,20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-13,-17,-10,-11,-9,-17,-4,-16,3,-4,-10,-16,-10,-17,6,3,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-31,-10,-3,-24,-20,-20,-17,-10,-24,-17,-14,61,-10,-17,-1,7,-21,-30,-24,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,9,-16,-1,-6,-14,-15,8,-16,-8,-16,-10,15,-14,-4,-6,12,26,-12,-32,-7,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-8,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-30,-17,29,-24,32,32,-24,-24,-14,-20,-24,-10,16,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,34,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-34,-20,38,-23,4,-20,0,3,-13,45,7,-3,-13,-30,-23,-1,28;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-11,-28,-11,-10,1,-25,54,-12,-14,-1,4,-6,-25,-1,-7,-17,-15,-17,-10,35,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,69,-30,-11,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,41,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-10,-16,-10,-16,-8,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,20,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00345;
//
ID   SYNAPTOBREVIN_MP; MATRIX.
AC   MP00417;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Synaptobrevin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4663525; R2=0.0154639; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=680; N_SCORE=15.972; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-27,-3,7,-26,-16,3,-25,21,-22,-9,4,-15,18,31,-4,-9,-22,-22,-11,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,1,-28,-25,-3,-30,-27,17,-23,10,5,-21,-25,-23,-21,-9,6,23,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,15,-35,-20,4,-24,21,-22,-4,0,-12,42,24,-4,-10,-26,-20,-10,27;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-1,-23,-4,1,-29,3,-6,-23,0,-20,-10,2,-13,13,1,4,-7,-20,-23,-18,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,39,-35,-20,4,-25,12,-20,-10,0,-5,38,6,0,-10,-30,-25,-15,39;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-15,-30,-24,-1,-26,-24,24,-21,17,15,-25,-25,-22,-20,-13,-4,30,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,35,-25,44,18,-32,-8,0,-32,-1,-29,-26,22,-10,2,-7,9,-3,-26,-39,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,20,44,-32,-12,0,-30,7,-22,-18,2,-4,20,-1,0,-11,-30,-29,-20,32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-12,-25,-24,-2,-28,-27,20,-18,6,5,-21,-24,-23,-18,-3,13,33,-29,-9,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-11,-22,-12,-6,-17,-23,-16,-9,18,-13,-4,-9,-17,-4,16,-6,0,3,-24,-10,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-26,14,3,-26,6,-9,-20,-9,-21,-16,10,-14,-5,-13,3,-8,-19,-31,-19,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-23,-36,-29,0,-36,-30,41,-26,16,16,-23,-23,-23,-26,-15,-5,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,26,52,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-24,-17,-10,-11,-25,9,-4,-3,0,4,-8,-21,-2,12,-12,-6,-3,-24,-1,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-25,8,20,-25,-19,-5,-18,11,-19,-12,4,-12,9,5,-3,-7,-14,-29,-15,14;
MA   /M: SY='N'; M=-8,32,-18,14,-2,-18,-4,4,-18,-2,-26,-18,49,-18,-2,-2,12,9,-24,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-37,-30,10,-36,-29,39,-27,16,15,-23,-24,-25,-26,-17,-7,31,-19,1,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-28,39,31,-33,-10,-1,-33,2,-25,-24,13,-7,7,-6,3,-6,-28,-35,-20,19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-26,-1,5,-26,-13,-8,-26,32,-26,-11,5,-13,6,22,-2,-6,-19,-24,-12,5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-14,-31,-29,-1,-30,-29,32,-21,11,11,-27,-27,-27,-22,-11,-2,43,-27,-9,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-20,-29,-19,4,-26,-19,19,-26,37,18,-25,-26,-17,-20,-22,-8,10,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=0,14,-26,21,32,-31,-14,-3,-27,4,-20,-18,3,-5,13,-5,2,-8,-24,-29,-19,23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-30,8,-10,-32,49,-11,-40,-15,-30,-21,5,-18,-14,-17,0,-18,-30,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,15,39,-30,-11,-3,-28,6,-21,-17,0,-5,15,-2,1,-9,-26,-29,-19,27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,3,-28,0,5,-25,-17,-3,-28,34,-26,-12,10,-15,8,39,-7,-8,-22,-23,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-2,17,-22,24,21,-28,-11,-6,-27,-1,-23,-21,7,-7,3,-8,11,4,-20,-34,-19,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-22,0,13,-16,-18,0,-12,-8,-4,-6,-3,-14,2,-8,-1,-3,-11,-30,-11,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-7,-22,-4,-2,-18,-20,-14,-2,-6,-7,-3,-10,-18,-2,-5,-5,-3,5,-28,-13,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-29,47,21,-37,-9,2,-34,2,-27,-23,17,-10,12,-5,1,-9,-30,-35,-19,16;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='T'; M=15,-2,-10,-9,-6,-16,-8,-16,-14,-10,-17,-14,1,-10,-6,-12,25,28,-4,-31,-16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,23,-26,33,31,-32,-12,-3,-31,2,-23,-23,7,-6,7,-7,4,-7,-25,-33,-20,19;
MA   /M: SY='N'; M=2,19,-20,12,5,-25,-6,0,-20,-1,-23,-15,23,-13,9,-4,10,2,-21,-32,-18,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,27,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-6,-22,-5,9,-22,-15,-5,-14,-1,-11,-6,-4,-13,16,2,5,-2,-14,-26,-13,12;
MA   /M: SY='A'; M=7,6,-21,7,-2,-24,-3,-12,-16,-9,-15,-12,0,-13,-3,-14,5,-2,-10,-28,-17,-3;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-19,-5,-5,-21,5,-7,-16,-8,-19,-5,7,-14,3,-8,12,3,-15,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-10,-9,-5,-19,-2,-15,-15,-10,-20,-15,1,-10,-5,-14,26,15,-5,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-21,-7,3,-8,-16,-7,-17,0,-17,-9,-1,-14,8,4,7,2,-13,-23,-7,6;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-5,-24,-8,0,-21,-9,10,-15,-3,-12,3,-3,-15,9,1,-4,-7,-15,-24,-8,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-18,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-27,-3,8,-13,-19,-1,-23,17,-20,-11,0,-15,5,20,-3,-6,-19,-16,2,5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,-4,4,-24,-17,-10,-24,28,-23,-10,1,-11,6,20,-1,3,-15,-23,-11,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-21,-4,4,-26,-8,-5,-19,-1,-20,-8,2,-11,21,0,12,11,-18,-26,-14,12;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-12,-13,-9,-19,3,-18,-15,-11,-16,-13,-3,-11,-9,-16,17,11,-5,-26,-19,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-26,-2,2,-27,-5,-7,-27,21,-25,-11,5,-14,8,18,-2,-4,-21,-23,-14,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00368;
//
ID   POTEX_CARLAVIRUS_COAT_MP; MATRIX.
AC   MP00418;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Potexviruses and carlaviruses coat protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8689752; R2=0.0150624; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=740; N_SCORE=16.005; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-5,-22,-6,1,-19,-18,-8,-11,1,-8,-2,-5,-15,9,4,-1,0,-8,-26,-11,4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,86,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=38,-8,-12,-15,-6,-21,4,-18,-14,-10,-15,-13,-6,-10,-8,-18,13,1,-5,-23,-21,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-12,28,-25,25,5,-27,3,2,-29,1,-29,-21,32,-16,-1,2,5,-6,-28,-35,-20,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30,15,-21,-29,-19,-21,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-28,140,30,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-14,-9,1,-23,-7,-11,-15,-6,-17,-11,-2,-10,6,-10,16,8,-9,-26,-17,4;
MA   /M: SY='K'; M=8,5,-20,-1,0,-23,-7,-7,-21,10,-23,-14,10,-13,1,9,7,-1,-15,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-22,-13,1,-16,-18,-7,-4,-1,-1,11,-10,-14,8,-4,-6,-6,-6,-23,-9,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-28,-2,-11,-29,43,-9,-33,-12,-29,-18,14,-19,-6,-12,2,-14,-30,-25,-25,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-22,-33,-27,49,-31,-12,8,-24,10,4,-22,-29,-29,-18,-19,-9,6,7,35,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-29,-5,5,-29,-19,-5,-22,13,-24,-10,-5,17,11,4,-4,-3,-22,-24,-14,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-32,0,15,-15,-20,-8,-22,2,-20,-16,-10,16,0,-7,-9,-10,-24,-13,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,18,-24,20,29,-28,-11,-2,-26,2,-22,-20,13,-7,7,-5,5,-5,-24,-32,-20,18;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-10,-2,-7,-16,-14,1,-14,-10,-14,-10,3,-17,-8,-12,5,7,-7,-29,-8,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-27,-38,-29,62,-28,-18,-4,-26,3,-4,-24,-30,-33,-19,-24,-14,-7,38,35,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-16,-17,-12,-23,16,-20,-18,-12,-15,-13,-8,-9,-12,-20,7,-5,-8,-20,-23,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-3,-32,-25,48,-28,-21,-5,-25,2,-4,-15,-26,-32,-19,-9,4,-1,-6,14,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,60,22,-37,-10,1,-37,1,-29,-28,22,-10,2,-8,1,-9,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='G'; M=9,-13,-24,-17,-18,-8,21,-10,-20,-15,-15,-11,-9,-20,-16,-18,-3,-11,-15,-7,2,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,17,12,-30,-30,-28,-20,-14,-2,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-3,-21,-2,4,-10,-21,-11,-5,-12,8,-1,-7,-16,-5,-11,-6,2,-7,-28,-10,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,28,-19,19,2,-22,-2,7,-23,-3,-30,-20,39,-16,0,-4,17,4,-24,-40,-18,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-32,-6,2,-27,-9,-16,-22,-9,-27,-18,-11,48,-5,-15,0,-1,-25,-30,-25,-4;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-13,-18,-11,-15,1,-15,-11,-11,-12,-10,-9,-13,-10,-18,8,-1,-4,-16,-9,-11;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-10,-18,-11,-18,-3,-20,-7,-11,-11,-9,-9,-12,-11,-19,12,3,4,-24,-19,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-23,-28,-19,-3,-30,-21,22,-22,19,14,-24,-12,-14,-20,-19,-8,16,-23,-6,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-27,3,20,-29,-17,-2,-20,4,-18,-7,-3,2,22,1,0,-6,-23,-26,-16,20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-35,-10,-2,-27,-18,-20,-16,-11,-27,-18,-17,70,-10,-19,-4,-6,-22,-31,-27,-10;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-23,-13,-6,-18,-15,-18,-9,-11,-12,-10,-13,21,-10,-15,1,-1,-8,-29,-19,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-24,12,15,-26,13,-6,-28,-3,-21,-17,3,-8,2,-7,2,-10,-24,-23,-19,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-18,-14,-21,-22,44,-21,-28,-19,-22,-15,-6,-21,-20,-19,-4,-16,-18,-13,-23,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-22,-27,-19,1,-27,-20,17,-24,28,15,-25,-14,-17,-20,-20,-7,10,-23,-5,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-26,-28,-21,1,-28,-18,22,-17,6,7,-16,-20,-14,-14,-14,-8,12,-2,8,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-4,-1,-16,-18,-5,-27,16,-19,-13,-2,-8,2,40,-8,-9,-19,-21,-11,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-27,-2,10,-25,-13,-3,-25,9,-23,-13,-2,3,8,11,1,-3,-21,-26,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-11,-10,-9,-8,-17,-18,-10,-12,-9,-10,0,-12,-10,-11,20,40,-1,-30,-10,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-32,-2,10,-30,-18,-9,-23,5,-25,-15,-8,31,9,1,-4,-8,-26,-27,-20,7;
MA   /M: SY='E'; M=7,6,-22,6,14,-25,-12,-7,-21,1,-15,-14,1,-10,6,-1,3,-3,-16,-27,-17,9;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,36,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00346;
//
ID   PHOTOSYSTEM_I_PSAAB_MP; MATRIX.
AC   MP00419;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Photosystem I psaA and psaB proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9466622; R2=0.0117560; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1619; N_SCORE=22.970; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=218; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-3,-12,-18,-10,-27,-18,8,-10,-2,-10,37,25,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,4,-22,-21,-4,-28,38,-24,-9,-1,-15,9,43,-11,-10,-19,-17,-4,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,11,-30,-20,20,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-21,-33,-26,5,-28,-16,29,-19,17,34,-22,-23,-15,-18,-18,-8,23,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-37,-7,0,-29,-17,-17,-20,-9,-30,-20,-11,75,-9,-18,-5,-7,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=3,-7,-25,-9,0,-20,-15,-10,-17,19,-16,-6,-6,-13,4,8,-6,-7,-12,-16,-4,1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-26,36,18,-31,-10,3,-31,5,-28,-22,21,-11,6,-2,5,-5,-27,-36,-18,12;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,47,-30,-20,10,-30,29,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-3,-17,-31,63,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,59,-30,-3,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,51,-26;
MA   /M: SY='R'; M=3,-7,-20,-10,-5,-20,-2,-10,-24,5,-20,-13,0,-15,-1,20,8,3,-14,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-14,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-35,-11,-1,-28,-16,-20,-19,-10,-27,-19,-17,72,-10,-20,-5,-7,-25,-29,-28,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-18,-30,67,-19,-40,-19,-30,-20,0,-19,-19,-19,0,-20,-30,-20,-30,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-30,34,20,-40,-15,5,-30,5,-25,-15,10,-10,31,0,0,-10,-30,-30,-15,25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-21,-29,-24,-4,-30,-26,30,-23,8,9,-16,-20,-18,-23,-5,2,25,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-16,-12,-7,-22,1,-18,-16,-11,-19,-15,-5,4,-8,-17,14,5,-9,-27,-22,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-25,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,138,35,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='H'; M=9,-3,-20,-6,-1,-22,-10,32,-21,-8,-19,-7,3,-14,7,-7,7,-5,-17,-28,-3,1;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,-15,-29,-25,26,-26,-22,11,-22,5,5,-20,-26,-27,-18,-7,1,20,-16,4,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-19,9,-29,-19,19,-29,46,20,-29,-27,-19,-19,-28,-10,9,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=26,-9,-18,-14,-13,-24,29,-19,-23,-14,-20,-15,-4,-14,-13,-19,8,-7,-13,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-31,-24,10,-29,-20,23,-25,31,22,-27,-28,-21,-19,-22,-7,20,-20,0,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00347;
//
ID   SRCR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00420;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SRCR domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1647677; R2=0.0147634; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=216; N_SCORE=8.344; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-23,13,38,-26,-13,-4,-26,3,-24,-20,4,-4,13,-4,15,1,-23,-34,-20,25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-23,13,13,-26,-14,-6,-25,9,-21,-15,5,-10,7,5,5,2,-18,-29,-15,9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-6,-25,-6,2,-23,2,-10,-21,6,-18,-10,-3,-13,0,3,-3,-9,-15,-21,-15,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-2,6,-20,9,8,-19,-10,-4,-17,-6,-11,-11,1,-11,0,-9,3,1,-13,-27,-13,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-16,-29,-17,-13,-13,4,-15,-16,-7,-11,-7,-12,-20,-9,-4,-12,-13,-15,6,-5,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-25,-8,-1,-19,-7,-14,-11,-8,-13,-7,-7,1,-6,-10,-1,-4,-10,-27,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-22,11,12,-25,-15,-9,-19,-3,-18,-14,0,-1,3,-7,5,3,-15,-30,-17,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,2,-4,7,-20,-16,-12,-20,-8,-14,-14,-5,-10,-4,-11,-3,-6,-17,-31,-19,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-23,-7,-2,-7,-10,-4,-15,-9,-15,-11,-5,6,-6,-10,-1,-5,-16,-18,-5,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-21,-11,-5,-7,-16,-3,-13,3,-10,-3,-5,-12,-3,4,-4,-2,-9,-19,-5,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-6,4,-8,-4,-19,-19,-14,-20,0,-15,-10,-6,-14,-6,1,-1,3,-10,-30,-16,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,18,14,-28,-28,-26,-21,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-8,0,-20,-18,-2,-29,26,-22,-11,1,-18,9,59,-4,-6,-19,-22,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-34,-24,21,-32,-22,22,-29,34,15,-26,-28,-25,-22,-25,-9,15,-15,5,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-17,-21,-16,-4,-24,-16,7,-4,3,6,-17,-23,-10,5,-11,-5,16,-22,-7,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-26,3,-7,-23,23,-10,-21,-12,-22,-15,14,-17,-10,-13,1,-11,-21,-27,-21,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-6,-17,-28,59,-16,-37,-17,-30,-20,8,-20,-17,-17,3,-16,-29,-23,-28,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-17,1,-2,-20,3,-10,-20,-8,-19,-12,3,-10,-5,-10,13,9,-12,-29,-17,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-19,1,2,-19,7,-4,-21,-4,-18,-13,6,-11,-1,-4,4,0,-17,-22,-14,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-22,8,5,-22,-12,-7,-16,0,-17,-12,1,6,1,-3,0,-4,-15,-25,-15,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-2,11,-9,-12,-15,-6,3,-23,-13,-18,-12,6,-25,-8,-11,-4,-10,-20,-32,-13,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-22,2,15,-21,-14,-3,-19,2,-15,-11,5,-12,11,5,6,-2,-18,-29,-15,12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-12,-27,-13,-19,-25,53,-20,-31,-21,-19,-15,-4,-21,-19,-20,-3,-17,-23,-20,-26,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-28,-11,1,-17,-22,-4,-20,17,-10,-5,-5,-20,8,46,-11,-9,-13,-21,-9,1;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-11,-28,-25,-2,-25,-27,22,-20,12,8,-27,-27,-25,-20,-9,-1,36,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,48,-33,-20,3,-27,10,-20,-14,0,-3,32,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-33,-30,9,-32,-28,31,-23,13,13,-26,-27,-28,-22,-14,-4,38,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-25,-25,-18,19,-24,-12,-4,-13,9,0,-16,-27,-16,0,-19,-10,-7,6,14,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-8,-26,-9,-8,-6,-24,24,-7,-9,-6,1,-6,-20,-3,-8,-11,-8,-9,-15,17,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-24,4,4,-27,-4,5,-25,5,-24,-12,13,-14,11,7,3,-7,-23,-27,-14,6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-26,-6,-11,-25,29,-14,-29,-11,-26,-18,5,-5,-11,-11,5,-9,-24,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-22,-3,3,-21,-12,-9,-14,-3,-16,-9,0,-13,7,1,7,2,-11,-27,-13,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-11,-29,-11,-16,-24,42,-6,-31,-15,-19,-12,-2,-21,-15,-14,-5,-18,-25,-21,-19,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-13,-13,-11,-8,-21,-19,-4,-12,-3,-5,-5,-14,-10,-8,12,32,2,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-15,-31,-27,-2,-28,-27,29,-20,11,13,-25,-25,-24,-21,-11,-3,37,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-10,34,-26,47,13,-34,-9,9,-34,-3,-27,-23,15,-11,0,-10,3,-8,-25,-37,-15,6;
MA   /M: SY='D'; M=-17,34,-30,49,27,-35,-13,2,-36,3,-27,-26,13,-3,5,-5,-1,-10,-30,-36,-19,15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-24,11,0,-25,9,-5,-27,-2,-25,-18,16,-16,-4,-2,6,-4,-22,-31,-19,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-8,20,-23,27,9,-29,-5,-7,-29,-1,-26,-21,11,-11,1,-7,10,4,-21,-34,-18,5;
MA   /M: M=-9,-5,-24,-5,-5,-13,-15,-14,-6,-12,0,-5,-4,-6,-10,-13,-8,-1,-8,-27,-13,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,2,-23,-2,4,-24,-14,8,-19,7,-20,-9,7,-14,9,6,1,-5,-17,-26,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-25,18,8,-20,-16,-5,-15,-8,-10,-12,0,-14,-3,-12,-3,-6,-13,-27,-8,2;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-16,-9,-10,-24,17,-18,-21,-12,-19,-15,-3,-13,-11,-18,10,-4,-11,-24,-23,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-23,6,4,-22,-14,-1,-14,-2,-14,-6,9,-14,8,-4,3,-1,-16,-30,-12,5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-15,-16,-17,-8,-26,-16,14,-14,1,4,-19,-24,-17,-15,-7,0,29,-30,-9,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-32,-29,7,-30,-28,27,-22,10,9,-26,-27,-28,-22,-11,-3,38,-23,-5,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-30,-10,0,-20,-19,2,-25,20,-20,-9,-4,-16,12,37,-10,-11,-21,-8,-3,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-23,-8,6,-21,-17,4,-9,-3,-7,7,-5,-14,22,-3,1,-4,-14,-25,-9,13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-30,-19,9,-28,-20,19,-29,47,19,-29,-29,-19,-20,-28,-9,9,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,11,-26,-22,22,-29,3,-9,-22,1,-3,-18,-31,-21,-17,-17,-11,-8,-8,24,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-28,-10,-9,-24,21,-13,-25,-7,-21,-13,-3,-8,-9,-8,-1,-11,-20,-24,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-25,-8,-5,-19,-1,-12,-25,1,-25,-16,-1,-13,-2,5,4,0,-19,-7,-12,-3;
MA   /M: SY='A'; M=16,-15,-18,-18,-15,-13,6,-18,-9,-16,-6,-7,-12,-14,-15,-19,0,-6,-2,-20,-13,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-20,-12,-6,-12,-19,-12,-6,-1,-2,-2,-4,-19,-4,3,-5,2,-2,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-20,0,12,-25,-7,4,-23,-1,-23,-14,3,-10,10,-2,14,0,-18,-30,-15,11;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-17,-16,-10,-12,-12,-4,-7,-12,-8,-6,-9,-10,-9,-12,4,-1,-1,-26,-11,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-10,-23,-10,-8,-9,-19,0,-7,-5,-3,1,-9,-14,-6,-5,-8,-5,-5,-21,0,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-25,-11,-8,-13,-5,-14,-19,0,-19,-12,-4,2,-9,-2,-2,-4,-15,-21,-12,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-23,-12,-10,-14,4,-16,-13,-8,-11,-6,-5,-19,-11,-6,-3,-4,-7,-24,-15,-11;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-16,-10,-9,-13,1,-13,-16,-9,-15,-12,2,-15,-9,-10,8,1,-9,-24,-16,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-12,-22,-13,-8,-13,-7,-2,-14,-4,-9,-6,-7,-19,-4,5,-3,-6,-10,-18,-5,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-13,-17,-19,-12,22,-20,-15,-8,-14,-4,-5,-8,-19,-17,-11,2,8,-4,-15,4,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-22,-2,-14,-27,39,-18,-30,-17,-25,-18,0,-19,-16,-18,2,-12,-20,-26,-25,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00348;
//
ID   TM4_1_MP; MATRIX.
AC   MP00421;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transmembrane 4 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7305450; R2=0.0163291; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=287; N_SCORE=10.407; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=3,-9,-19,-13,-9,-13,-6,-13,-6,-14,-5,-6,-3,-14,-10,-13,3,3,-4,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-1,6,-22,4,-3,-16,-3,4,-21,-9,-19,-14,10,-11,-6,-8,4,-4,-18,-29,-12,-5;
MA   /M: M=-5,-11,-22,-11,-4,-11,-10,-15,-10,-9,-9,-5,-9,-1,-9,-12,-1,0,-7,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-24,-13,-9,-10,-17,-8,-7,-11,-8,-5,-11,3,-9,-12,-5,-1,-7,-22,-4,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-19,-23,-21,-16,8,-8,-15,-10,-17,-2,-6,-13,-16,-17,-11,-7,-5,-9,-7,1,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-15,-23,-16,-8,-7,-24,-11,-2,-10,1,0,-13,-7,-2,-9,-7,2,-5,-18,1,-7;
MA   /M: SY='T'; M=3,1,-16,-2,-9,-15,-14,-14,-4,-12,-8,-7,2,-17,-11,-14,6,7,2,-31,-14,-10;
MA   /M: SY='A'; M=5,-19,-24,-20,-16,-14,-4,-22,-5,-17,-8,-7,-16,-1,-16,-20,-5,-5,-3,-14,-15,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-21,-19,-13,-10,-8,-14,-6,-15,-9,-4,-14,3,-14,-18,-2,-5,-2,-23,-14,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-26,-14,-14,6,-23,-3,-2,-8,-8,-5,-11,-11,-12,-10,-13,-8,-6,3,23,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-32,-27,4,-31,-27,30,-24,19,13,-26,-26,-25,-23,-16,-5,33,-23,-5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-30,-23,9,-24,-22,19,-26,26,14,-24,-27,-21,-21,-19,-8,15,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-13,-34,-27,-1,-33,-27,31,-27,20,14,-23,-24,-22,-26,-18,-8,24,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='A'; M=18,-19,-16,-25,-20,-7,-4,-23,3,-17,-3,-1,-15,-19,-19,-21,-2,-5,11,-20,-13,-20;
MA   /M: SY='V'; M=7,-18,-5,-23,-20,-7,-21,-23,10,-17,2,3,-18,-22,-19,-18,0,9,22,-29,-12,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-23,-11,-20,-30,65,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-21,-20,-20,0,-20,-29,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-1,-18,-16,-16,-2,-22,-8,-16,-12,-9,-10,-18,-16,-19,7,5,3,-28,-19,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-17,-32,-27,20,-30,-25,20,-25,16,9,-24,-27,-28,-21,-15,-3,24,-17,2,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-19,-29,-22,-1,-29,-20,24,-20,19,20,-22,-23,-14,-18,-14,-1,22,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-21,-32,-23,18,-26,-14,18,-21,16,26,-19,-23,-16,-17,-16,-7,11,-15,5,-19;
MA   /M: SY='I'; M=3,-24,-19,-29,-23,-1,-24,-25,21,-23,16,9,-21,-23,-20,-22,-12,-3,20,-22,-6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-24,4,-28,-24,22,-22,19,13,-25,-26,-23,-20,-14,-1,26,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='G'; M=13,-9,-23,-11,-15,-27,46,-19,-31,-17,-25,-18,-1,-17,-15,-19,7,-11,-21,-22,-27,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-9,-35,-27,46,-29,-20,4,-28,16,6,-22,-29,-31,-20,-19,-7,5,-6,14,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-17,-30,-22,12,-26,-22,16,-26,29,12,-26,-27,-23,-20,-20,-7,15,-18,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-21,95,-30,-29,-15,-31,-27,-21,-29,-13,-14,-20,-38,-28,-29,-12,-10,-6,-43,-21,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-25,39,-32,-28,1,-31,-24,2,-27,2,1,-22,-32,-26,-25,-16,-9,7,-28,-6,-28;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-11,-17,-10,-15,-7,-20,-8,-11,-7,-8,-8,-11,-10,-17,11,13,0,-23,-16,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,0,-32,-25,2,-31,-23,19,-24,16,14,-24,-27,-21,-21,-18,-8,18,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-20,-3,4,-25,-19,-6,-28,31,-25,-11,4,-15,9,33,-6,-7,-20,-24,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-29,12,42,-29,-9,-3,-30,8,-21,-19,0,-5,13,4,-1,-11,-28,-27,-20,27;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-18,4,-4,-18,1,-3,-17,-6,-23,-16,26,-18,-3,-3,15,4,-17,-36,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-11,-2,-17,-21,-8,-15,15,-14,-6,-7,-10,4,21,-7,-3,-11,-19,-6,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-20,77,-29,-28,-7,-27,-26,-23,-27,-14,-16,-18,-37,-28,-26,-13,-11,-11,-25,-17,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-29,-20,5,-23,-16,17,-25,37,25,-26,-27,-16,-18,-25,-10,9,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-12,-24,-16,-12,-12,-4,-12,-10,-3,-3,1,-8,-20,-8,-1,-9,-6,-8,-19,-7,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-19,-23,-17,7,-16,-17,1,-20,11,7,-16,-22,-16,-16,-8,3,0,-12,-1,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-24,-30,-24,55,-29,3,-2,-22,4,0,-18,-29,-26,-15,-19,-11,-6,14,47,-24;
MA   /M: SY='F'; M=0,-23,-12,-31,-23,34,-22,-21,1,-23,2,-2,-16,-24,-27,-20,-7,-4,5,-9,7,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-23,-28,-24,0,-7,-21,12,-22,6,11,-16,-22,-20,-21,-12,-8,10,-19,-7,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-13,-30,-24,27,-17,-20,1,-25,7,3,-17,-25,-26,-20,-12,-6,2,-11,5,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-27,-20,2,-24,-21,17,-26,28,12,-22,-25,-18,-20,-16,-4,11,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-21,-31,-24,2,-27,-24,25,-27,29,15,-25,-26,-21,-23,-21,-9,19,-21,-4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-23,-34,-26,4,-33,-27,33,-26,18,14,-21,-22,-22,-25,-16,-5,25,-20,-2,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-19,-35,-25,51,-29,-19,6,-27,19,8,-21,-28,-30,-19,-20,-6,3,-2,18,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-13,-31,-23,7,-28,-24,19,-26,25,11,-24,-26,-22,-23,-18,-8,15,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=13,-20,-12,-26,-19,-6,-20,-23,10,-19,12,4,-19,-20,-18,-20,-6,1,14,-23,-10,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,50,-33,-19,1,-30,9,-21,-18,2,-3,23,0,0,-10,-30,-30,-19,36;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00371;
//
ID   GRANINS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00422;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Granins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9583201; R2=0.0141412; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=306; N_SCORE=9.276; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-13,0,-30,4,23,-27,-20,-4,-30,32,-24,-13,0,-10,13,31,-7,-10,-23,-23,-13,17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-16,-10,7,-18,-13,-16,-6,-6,-8,-8,-12,-12,-6,-14,2,-3,3,-25,-18,0;
MA   /M: SY='A'; M=18,-4,-21,-5,9,-26,12,-14,-24,-6,-18,-16,-4,-10,-3,-14,4,-8,-17,-23,-23,3;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-20,-39,-20,-14,-15,8,-16,-26,-12,-23,-15,-17,-22,1,-12,-17,-22,-30,53,1,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-16,-24,-20,-18,-14,1,-21,5,-21,-9,-3,-6,-17,-14,-21,4,-3,2,-26,-14,-18;
MA   /M: SY='P'; M=11,-20,-23,-18,-11,-19,-16,-23,-4,-13,-13,-9,-20,28,-15,-20,-4,-4,0,-27,-22,-15;
MA   /M: SY='B'; M=-14,17,-24,15,0,-17,-14,17,-16,-10,-7,-8,17,-20,-3,-8,-7,-9,-19,-33,-7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-16,-19,-16,-9,-24,-18,1,-2,-4,-1,-13,-22,-12,10,-2,10,15,-27,-10,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-13,4,-30,11,42,-27,-20,0,-30,16,-20,-17,0,-6,17,21,-3,-10,-27,-27,-17,28;
MA   /M: SY='S'; M=13,7,-17,3,13,-23,-5,-7,-20,-3,-21,-17,11,-9,2,-9,15,2,-16,-31,-20,7;
MA   /M: SY='E'; M=-14,1,-30,7,34,-26,-20,0,-30,19,-20,-16,0,-9,16,30,-4,-10,-26,-26,-16,23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,18,-30,27,31,-37,-17,4,-29,7,-23,-14,6,-7,31,1,0,-10,-30,-29,-16,31;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-6,-23,-10,3,-25,-15,-4,-13,12,-13,6,-6,-12,19,4,-4,-8,-13,-20,-11,11;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-29,5,32,-28,-16,-9,-24,1,-21,-18,-7,20,7,-9,-1,-8,-24,-28,-22,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-24,-26,-20,19,-30,-3,11,-21,29,11,-26,-30,-16,-16,-26,-10,1,1,34,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-30,32,50,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,5,-2,15,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='N'; M=-4,28,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,45,-17,0,-3,19,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=12,15,-14,3,-3,-20,0,-4,-17,-6,-25,-17,26,-14,-3,-8,19,6,-16,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=20,16,-19,19,3,-29,-4,-11,-23,-6,-19,-19,3,-10,-6,-16,6,-4,-13,-29,-20,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-27,-20,-10,-13,-26,-14,8,10,-1,18,-11,-16,-2,1,-16,-10,3,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-11,-21,-14,0,-21,-16,-7,-6,-7,1,2,-11,-15,17,-7,-5,-7,-10,-20,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,49,-33,-20,3,-27,10,-20,-15,0,-3,31,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-9,-30,-9,-3,-4,-24,3,-17,24,-17,-6,-9,-19,1,13,-14,-10,-16,1,29,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,31,-27,30,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-2,-30,1,16,-23,-20,31,-30,12,-20,-10,3,-15,13,30,-7,-13,-26,-26,-3,11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-9,-26,-13,0,-20,-20,0,-5,12,-5,23,-9,-14,21,7,-11,-10,-10,-20,-6,11;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,28,-30,-20,15,-30,39,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=0,0,-12,0,6,-18,-6,0,-11,0,-14,-5,3,-6,18,0,11,2,-12,-17,-8,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,-15,-22,-21,-14,6,-24,-1,-17,-7,-4,-16,-21,-21,-20,-1,-5,14,-24,-18,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-24,-4,-2,-15,-18,-8,-12,12,-5,-3,7,-19,-2,7,-11,-7,-13,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-14,-30,-14,-9,1,-24,9,-17,13,-11,-6,-9,-24,1,36,-14,-10,-16,1,29,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-34,-10,0,-24,-20,-9,-26,13,-24,-14,-9,27,1,31,-10,-10,-24,-24,-19,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-30,3,14,-30,31,-11,-36,-7,-26,-20,0,-11,-3,-11,0,-16,-30,-24,-26,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,19,-20,0,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00365;
//
ID   GRANINS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00423;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Granins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5166335; R2=0.0131266; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1390; N_SCORE=22.753; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=9,-17,-17,-27,-17,-6,-14,-6,11,-10,11,38,-17,-17,-3,-13,-11,-7,7,-20,-6,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,47,11,-31,-5,5,-31,0,-30,-25,38,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='N'; M=-1,13,-17,4,-4,-18,-5,-4,-11,-8,-24,-15,27,-15,-2,-8,20,8,-14,-38,-18,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-25,-19,-9,-11,-20,0,-7,12,-2,22,-9,-20,5,34,-15,-10,-6,-20,-5,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-12,37,-22,31,5,-25,-6,2,-25,-2,-27,-22,38,-15,-2,-5,8,5,-25,-38,-18,2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-27,-1,2,-22,-20,49,-27,9,-22,-5,5,-15,7,8,-6,-7,-23,-27,6,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,17,-25,6,-9,-25,32,-4,-29,-9,-30,-20,33,-20,-9,-9,5,-9,-30,-31,-25,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-21,3,18,-21,-8,-12,-22,-3,-17,-15,0,-7,1,-7,9,16,-16,-29,-17,10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-9,-23,-11,7,-14,-21,-5,-1,4,-1,19,-12,-14,4,-2,-11,-9,-2,-24,-9,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='M'; M=2,-10,-15,-20,-15,-7,-18,-11,4,-10,4,22,-10,-15,-5,-11,1,17,5,-24,-7,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,-3,5,-25,-20,20,-30,29,-25,-8,2,-15,10,35,-10,-12,-22,-22,-3,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,39,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,43,9,-29,-5,5,-29,0,-30,-25,42,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-14,-8,-17,-6,-18,-12,-10,-13,-12,-4,-10,-8,-15,18,18,-2,-26,-17,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,-4,-11,-4,-2,-16,-4,-11,-15,-12,-20,-15,5,-12,-2,-11,31,16,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=1,-9,-24,-5,0,-25,-9,-15,-20,-10,-30,-20,-4,35,-5,-15,17,6,-19,-35,-25,-5;
MA   /M: SY='S'; M=8,5,-11,2,0,-20,0,-8,-20,-9,-30,-20,16,-11,0,-9,36,18,-12,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=19,-16,-24,-16,-7,-23,-12,-21,-11,-11,-17,-13,-16,34,-12,-20,-1,-5,-9,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-30,-19,-10,-16,-21,-15,-1,-11,-9,9,-21,39,-10,-17,-13,-9,-6,-27,-18,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-35,-10,-2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17,73,-10,-18,-5,0,-25,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,5,-32,-20,-13,-21,0,-28,-15,-14,60,6,-9,-8,-10,-29,-27,-24,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-19,-25,-22,-12,14,-25,-9,-13,3,0,-2,-11,-25,-9,29,-16,-10,-9,-11,3,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-30,9,38,-35,-20,5,-25,10,-20,-9,0,-5,42,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-10,-21,-21,-5,-25,-25,12,-15,1,1,-16,-21,-21,-15,4,23,27,-30,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,-3,-28,36,-25,-8,0,-14,18,42,-8,-10,-22,-20,-10,11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-27,-6,-6,-27,21,-16,-32,11,-27,-15,0,-15,-6,2,-2,-7,-22,-21,-19,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,26,-23,33,7,-30,4,-4,-31,-5,-30,-25,19,-12,-2,-10,13,-1,-24,-38,-21,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-30,4,19,-29,18,-8,-34,0,-24,-19,0,-11,2,1,-1,-14,-29,-25,-23,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-27,1,14,-18,-26,-14,2,-8,-5,-5,-8,-12,-2,-13,-7,-8,0,-28,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,33,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,27,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-21,0,5,-25,-11,-10,-25,23,-30,-15,5,-10,5,12,13,4,-15,-29,-15,5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,2,-29,0,-12,-18,-9,-16,3,-17,-7,-4,3,-17,-12,-20,-8,-10,-3,-28,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-9,-25,-5,17,-12,-25,-10,-7,-3,10,-1,-14,-15,1,-5,-15,-10,-11,-24,-10,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00365;
//
ID   INTERLEUKIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00424;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukin-2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9636443; R2=0.0123111; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1107; N_SCORE=17.582; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=207; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=1,-8,-18,-8,-4,-10,-9,-14,-17,-12,-24,-17,-1,9,-8,-13,21,13,-12,-31,-16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-11,-1,-19,-20,-2,-25,29,-17,-2,-2,-18,9,55,-11,-10,-17,-20,-9,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-23,-21,-14,1,-27,16,5,-24,29,14,-18,-27,-11,-14,-24,-13,-2,-23,6,-14;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,44,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,7,-27,-14,-4,-27,35,-30,-13,18,-13,7,21,-4,-7,-23,-26,-13,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-18,-26,-19,0,-23,-9,15,-15,21,37,-19,-21,-7,-13,-15,1,10,-22,-2,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,10,-30,-14,1,-24,25,-27,-10,18,-13,20,16,-1,-7,-26,-26,-13,15;
MA   /M: SY='A'; M=41,-2,-13,-8,-6,-23,-1,-17,-14,-9,-13,-13,-6,-10,-9,-19,9,-1,-4,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,19,-30,47,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-26,-3,5,-25,-20,-12,-26,35,-25,-10,0,-11,6,24,-3,3,-16,-22,-10,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,5,-30,7,2,-22,-19,90,-31,-9,-21,-3,11,-19,9,-1,-9,-19,-30,-31,16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,7,-28,3,15,-35,-17,7,-21,14,-23,-5,10,-12,43,11,0,-8,-29,-23,-12,29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,-13,-22,-11,7,-13,-20,-15,-3,-11,6,-2,-16,-7,-6,-14,-9,-7,-3,-25,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-29,25,49,-30,-17,1,-30,8,-22,-21,9,-3,16,-1,1,-9,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-30,-2,4,-30,-1,-12,-32,35,-30,-12,0,-12,4,19,-8,-12,-22,-20,-14,4;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-26,-17,-9,-13,-19,-18,-3,-17,3,-3,-16,21,-13,-19,-13,-8,-10,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,29,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-28,34,27,-32,-9,-2,-34,4,-26,-23,9,-8,7,1,3,-7,-27,-34,-19,16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-24,26,2,-20,-3,2,-25,-5,-26,-20,22,-16,-3,-8,6,-3,-24,-28,-6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-13,-13,-8,-19,-2,-18,-14,-10,-16,-13,-5,-3,-9,-16,15,12,-5,-26,-19,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-8,-34,-4,12,-36,-20,-1,-20,2,-24,-8,-8,28,34,-1,-4,-10,-30,-24,-18,21;
MA   /M: SY='S'; M=8,3,-11,2,0,-20,0,-8,-20,-9,-30,-20,14,-11,0,-9,38,18,-12,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,24,-16,11,-1,-19,-2,1,-19,-4,-28,-19,39,-16,-1,-4,19,11,-21,-39,-19,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00349;
//
ID   ARTHROPOD_DEFENSINS_MP; MATRIX.
AC   MP00425;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arthropod defensins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5035597; R2=0.0072172; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1531; N_SCORE=11.550; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=831; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-46; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=95,-62,-69,-62,-72,-51,-71,12,-64,-62,-58,-63,-67,-60,-68,-43,-53,-48,-75,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='L'; M=-22,-69,-84,-76,-42,-84,-70,15,-77,85,-30,-82,-82,-71,-75,-74,-62,-8,-72,-54;
MA   /M: SY='L'; M=-22,-69,-79,-73,-42,-81,-64,-36,-71,85,-32,-6,-82,-67,-11,-72,-62,-43,-69,7;
MA   /M: SY='S'; M=-12,-65,-57,-58,-74,-14,-60,-70,-56,-75,-69,-46,-65,-50,-9,101,-38,-19,-82,-66;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-88,-91,-101,-95,74,-101,14,-15,-88,-5,40,-91,-100,-92,-15,-91,-83,-20,-74,-52; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='W'; M=-79,-99,-67,50,-92,-90,-76,-97,22,-93,-86,-74,-81,26,13,-19,-15,-93,69,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='G'; M=24,-85,-78,-80,-90,51,-82,-5,-24,-85,-79,-11,-82,-75,-21,0,-19,-76,-91,-86; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-36,-96,-92,-81,59,-98,-87,-80,46,-37,-78,-85,-97,-9,-69,-86,-84,-31,-81,-64; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-24,-83,-70,-23,-83,87,-77,-92,-23,-88,-79,-59,-74,-70,-77,-56,-19,-86,62,-76; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='C'; M=-70,96,-86,-85,70,-31,-81,1,-80,-28,-60,-75,-87,-86,-83,-70,19,-3,34,-50; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=25,-79,-66,-19,-84,47,-71,-76,1,-80,-71,-9,65,-5,-68,-55,6,-28,-82,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='W'; M=25,-73,-85,-77,-9,-78,-82,29,-76,21,-47,-80,-11,-75,-78,-67,-60,57,79,-57; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-72,27,-15,-80,37,-48,-80,-51,-83,-71,104,-70,21,-59,-47,-52,-80,-89,-72;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-80,63,-44,-15,-68,115,-82,-52,-72,-62,-43,-69,47,9,2,-61,-80,-91,-48;
MA   /M: SY='S'; M=27,-67,-62,-61,-65,12,-60,-68,-60,-68,32,-51,-66,-54,-64,83,-9,-63,34,22;
MA   /M: SY='A'; M=78,-66,-68,-60,-68,-21,-67,1,-62,10,-54,-63,-9,35,-66,-14,-55,-50,-75,-67;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='H'; M=83,-66,-63,-59,-72,-20,85,-68,-62,-33,-58,-8,-68,-56,-63,-46,-56,-59,-81,-60;
MA   /M: SY='A'; M=76,-66,-65,-61,-70,-21,-64,-21,-55,0,-57,14,-69,-56,32,4,-53,-54,-76,-67;
MA   /M: SY='H'; M=-68,-79,-52,-54,-68,-68,144,-85,-57,-69,-55,18,-70,-47,-53,-19,-65,-84,-102,-39;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-74,-77,-68,-50,-83,-68,48,2,59,-38,-72,-78,-5,41,-70,-61,3,-73,-57;
MA   /M: SY='S'; M=53,-65,-67,-64,11,-22,-67,-18,-64,11,-55,-58,-69,-60,-68,58,9,-1,-75,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-72,-63,-58,-81,9,65,28,13,34,-64,-74,-55,65,-67,-61,-41,-74,-57;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-78,-64,-70,-81,94,-67,-89,-56,-84,-73,-51,-69,-60,48,-51,-68,-82,-74,-74;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-78,-12,-55,-9,-70,-47,-73,20,-69,-61,56,-75,-47,80,-58,-60,-72,-60,72;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-76,-62,-51,-72,-70,-57,-70,57,-14,-60,-55,-70,-44,85,16,-58,-25,-75,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-64,-73,-83,100,-69,-90,-66,-85,-74,-50,-68,-5,-19,-49,-68,-84,-74,-77;
MA   /M: SY='G'; M=-20,-76,-64,-75,-83,102,-71,-90,-69,-85,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-83,-74,-78;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-78,-67,-66,-30,-71,14,-62,-57,-59,-54,-64,-78,-3,22,15,-61,-64,-38,118;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=18,-70,-47,19,-75,-21,-54,-71,4,-74,-66,81,-67,36,-54,17,8,-27,33,-67;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-88,7,-73,-96,60,-78,-98,-1,-96,-87,-62,-81,-7,-76,33,-70,-91,-92,-87; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-77,-10,-12,-74,-25,-53,-26,80,-75,-64,50,-67,37,26,-54,-57,-72,-74,-3;
MA   /M: SY='G'; M=26,-72,-64,-59,-14,52,-64,-66,35,-1,-59,-55,-68,35,-13,-16,6,-25,-73,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-67,-76,-73,-54,-30,-77,22,-68,-21,-45,-69,-74,-71,-19,-60,41,83,-81,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-67,-70,-67,-59,-77,7,9,-20,-23,-47,-10,-72,-6,-17,-56,54,76,-85,-61;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-82,-65,-55,-55,-77,-49,-71,-6,-67,-59,-59,-76,1,100,-62,-65,-27,-59,72;
MA   /M: SY='N'; M=-64,-75,-46,-11,-77,-62,-48,-79,25,-79,-67,91,-72,5,75,-52,-55,-77,-83,-67;
MA   /M: SY='N'; M=-53,-64,-47,-58,-72,-56,-54,-68,-53,-73,-66,87,-65,-54,-61,44,77,-63,-90,-68;
MA   /M: SY='T'; M=-46,-62,-56,-59,-71,-58,-63,-65,-57,-70,-65,-45,-61,-55,-63,80,87,-58,-85,-66;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-71,-88,-84,122,-83,-68,-49,-79,-40,-51,-77,-86,-90,-76,-74,-67,-54,-40,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-81,91,83,-86,-70,-53,-85,-47,-80,-78,-44,-61,-43,-57,-56,-59,-80,-90,-72;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-71,-88,-84,122,-83,-68,-49,-79,-40,-51,-77,-86,-90,-76,-74,-67,-54,-40,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00356;
//
ID   CEREAL_TRYP_AMYL_INH_MP; MATRIX.
AC   MP00426;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cereal trypsin/alpha-amylase inhibitors family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4850984; R2=0.0148252; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=435; N_SCORE=11.924; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-16,-18,-11,-12,-21,-23,5,-13,-4,-3,-18,-6,-16,-17,-2,3,16,-28,-16,-14;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-11,-18,-12,-7,0,-20,-7,5,-13,17,13,-14,-18,-7,-11,-14,-4,0,-16,3,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-15,-18,-15,-1,-21,2,7,-15,9,9,-15,-21,-12,-12,-10,-2,10,-18,4,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-14,-5,-5,-18,8,4,-20,-10,-21,-12,4,-11,-3,-10,16,2,-13,-26,-13,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=3,-12,-16,-14,-12,-11,-20,-17,10,-8,-1,2,-12,-16,-9,-12,-6,-4,14,-21,-9,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-11,-22,-11,-11,15,-23,-4,-7,-13,8,0,-10,-23,-14,-2,-16,-10,-7,-14,6,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-14,-12,-4,-20,-7,-5,-11,-7,-13,-7,-5,-12,2,-11,9,0,-4,-23,-13,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-7,-13,-9,-8,-16,-11,-8,-4,-9,-7,-4,-9,-14,-6,-13,1,-3,5,-22,-12,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-10,-14,-14,-10,-11,-16,3,-10,-5,-4,-4,-17,-14,-14,3,4,12,-24,-13,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=18,-4,-5,-8,-4,-9,-2,-9,-6,-5,-6,-6,-3,-5,-4,-9,8,6,-1,-12,-9,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=15,-7,-15,-10,-4,-9,-9,-7,-11,-8,-13,-10,-5,-13,-5,-12,10,5,-7,-15,2,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=6,-7,-15,-10,-11,-17,4,-18,-13,-14,-18,-12,-1,-14,-11,-14,18,15,-3,-31,-18,-11;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-26,-11,-10,-16,-1,-19,-15,-15,-16,-12,-12,16,-15,-19,-3,-7,-12,-25,-20,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=3,-13,-25,-16,-15,-13,8,-18,-15,-11,-17,-12,-8,-18,-13,-14,-5,-10,-12,11,-9,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-25,5,8,-19,-13,-5,-17,-4,-15,-7,0,1,1,-9,1,2,-17,-26,-10,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-5,-25,-3,-2,-11,-14,-8,-17,-6,-15,-13,-7,-16,-1,-6,-2,-3,-16,8,2,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-4,-23,-5,-2,-11,-19,-1,-9,-3,-11,-6,-4,-17,5,-3,-2,-1,-9,-14,8,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-36,-10,2,-27,-19,-19,-17,-10,-23,-17,-19,69,-9,-19,-9,-9,-25,-29,-27,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-31,-11,-15,-26,53,-19,-36,-17,-27,-19,-4,-19,-17,-19,-3,-19,-28,-7,-24,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-17,-20,-21,-17,-5,-24,-13,13,-14,11,23,-19,-22,-7,-13,-14,-4,12,-17,-4,-12;
MA   /M: SY='G'; M=19,-6,-19,-8,-12,-24,25,-18,-23,-14,-20,-15,-3,-15,-13,-18,8,-6,-12,-24,-23,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,-24,-28,-22,25,-30,-5,11,-23,15,7,-19,-26,-19,-17,-18,-6,3,-4,25,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-37,-9,2,-28,-20,-16,-20,-1,-25,-15,-16,61,-2,-8,-10,-10,-26,-27,-24,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-18,-20,-17,-7,-23,3,8,-16,2,10,-12,-21,-11,-14,-5,1,12,-27,-2,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-9,15,-23,8,-3,-13,-10,2,-17,-5,-23,-16,23,-5,-4,-7,6,3,-22,-26,-3,-5;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-31,-12,-3,-24,-16,-19,-15,-12,-21,-15,-16,56,-10,-19,-4,-5,-21,-29,-25,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-31,-5,5,-27,-14,-14,-21,-4,-24,-17,-10,42,-2,-9,-3,-3,-24,-28,-23,-1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-21,-7,-6,-22,8,-2,-25,-4,-22,-13,2,-15,-1,3,9,1,-17,-26,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,13,-30,25,-20,-9,1,-20,10,61,-10,-11,-21,-21,-6,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,1,-22,1,0,-17,-14,-13,-18,-7,-16,-15,-5,-5,-6,-13,3,9,-13,-12,-8,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-25,-25,-21,25,-29,4,8,-17,15,9,-23,-29,-15,-14,-22,-9,0,10,48,-21;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-11,-29,-28,0,-28,-27,26,-20,12,12,-28,-28,-27,-19,-11,-1,42,-28,-9,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-10,-22,-12,-2,-16,-21,-14,-9,9,-9,-4,-8,-15,-3,9,-5,-1,-3,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-25,-9,2,-21,-19,-5,-15,4,-9,-4,-5,-10,14,13,-2,-3,-15,-24,-11,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-2,-30,-1,18,-34,-20,7,-23,15,-20,-4,0,-12,45,24,-3,-10,-27,-21,-11,30;
MA   /M: SY='C'; M=2,-12,36,-22,-20,-14,-23,-25,-11,-19,-10,-10,-12,-23,-19,-20,3,15,2,-35,-18,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-19,73,-27,-28,-14,-28,-27,-12,-25,-12,-11,-17,-36,-28,-25,-9,-6,6,-44,-24,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-29,-10,-17,-28,54,-11,-37,-15,-28,-18,0,-20,-15,-11,-1,-18,-28,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-13,-21,-17,-13,-6,-23,-8,2,-8,-3,0,-6,-21,-7,1,-4,-2,4,-25,-5,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-25,-9,-7,-18,21,-13,-25,-10,-21,-13,-3,-17,-5,-7,1,-9,-19,-21,-17,-6;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=5,-10,-10,-15,-13,-6,-10,-16,5,-11,-1,-1,-9,-12,-12,-12,2,9,11,-18,-8,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=3,-12,-21,-8,-2,-18,-10,-13,-11,-7,-17,-12,-11,40,-7,-13,-2,-4,-13,-19,-18,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-23,-6,0,-19,-12,-12,-13,-1,-18,-11,-11,45,-5,-8,-6,-6,-17,-18,-17,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-12,-14,-11,0,-16,-8,4,-6,5,2,-12,-17,-9,1,-7,-2,7,-12,2,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-10,-14,-8,-6,-5,-14,-10,-1,-9,6,0,-10,-5,-7,-5,-7,-3,-1,-17,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-6,-16,-7,3,-11,-8,-10,-7,-7,-6,-3,-5,-9,-2,-9,1,1,-7,-13,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=8,-4,-17,-3,1,-17,-4,-10,-13,-7,-11,-10,-5,6,-3,-11,1,-4,-11,-19,-15,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=7,-11,-10,-10,-9,-8,-15,-16,6,-10,-1,-1,-13,-15,-13,-13,-3,-1,17,-21,-10,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-16,-10,-6,-3,-17,-8,5,-8,14,13,-13,-15,-6,-7,-14,-7,3,-17,-4,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,2,-22,5,13,-21,-14,-2,-22,21,-18,-9,1,-8,11,22,-5,-7,-17,-17,-9,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-24,16,13,-27,-15,-6,-24,4,-19,-16,3,-12,5,6,1,-3,-16,-29,-16,8;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-13,12,-15,-5,-19,-24,-14,-25,3,-19,-13,-12,-24,-3,12,-11,-11,-15,-14,-13,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-19,14,-22,-14,-16,-24,-15,-15,-12,-10,-2,-18,-10,-5,-9,-15,-12,-14,-15,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-23,-7,-4,-27,12,-11,-24,-7,-20,-10,0,-14,8,-7,7,6,-20,-23,-17,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00350;
//
ID   DISINTEGRIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00427;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Disintegrins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8139443; R2=0.0054678; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=955; N_SCORE=9.031; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=492; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-6,23,-26,29,11,-31,2,6,-32,-4,-25,-21,14,-12,-1,-10,1,-10,-26,-32,-17,5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-33,-8,3,-26,-19,-15,-19,-1,-24,-15,-11,46,-3,-4,-6,-5,-23,-28,-22,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-27,39,11,-26,-12,-1,-28,1,-23,-20,17,-14,-1,-6,-1,-8,-23,-33,-14,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,-16,-14,-8,-13,-6,-15,-9,-10,-12,-9,-10,10,-9,-16,2,-2,-7,-16,-12,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,-5,-14,-9,-8,-15,-10,-7,-8,-7,-10,-7,-3,-12,-8,-9,5,4,-1,-25,-12,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,5,-15,-4,-6,-14,-17,-15,-14,-1,-16,-11,7,-11,-6,-4,14,33,-7,-30,-11,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-23,-4,5,-23,-20,-11,-20,23,-20,-9,-2,-12,6,17,-1,5,-11,-24,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-27,-16,5,-28,-18,12,-25,32,13,-26,-13,-15,-18,-25,-10,3,-20,-3,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-26,-6,3,-23,-19,-4,-24,26,-21,-9,0,-14,8,31,-3,-1,-16,-23,-10,4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-30,-1,9,-28,-12,-8,-22,-1,-24,-16,-6,26,4,-6,0,-7,-23,-28,-21,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-2,-10,-27,45,-17,-36,-14,-28,-20,1,-17,-14,-16,1,-15,-27,-18,-24,-12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-14,-10,1,-13,-8,-15,-13,-7,-14,-12,-5,-11,-6,-13,12,2,-4,-25,-15,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-27,0,14,-29,-18,11,-20,7,-19,-5,1,-6,25,4,-1,-6,-23,-25,-10,18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-17,-11,-5,-19,0,-16,-11,-11,-14,-11,-5,-13,-8,-17,8,-1,-4,-24,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-21,8,10,-16,-14,4,-21,-5,-19,-14,6,-12,1,-7,10,4,-17,-30,-8,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-28,-10,0,-14,-23,-16,-5,-14,3,-4,-17,16,-8,-15,-13,-7,-12,-27,-15,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,9,-28,14,18,-25,-17,4,-28,13,-22,-15,6,-12,9,16,-3,-7,-23,-27,-10,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-26,14,11,-29,-12,3,-25,12,-26,-14,19,-13,18,12,4,-5,-26,-30,-15,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-28,-4,8,-23,-20,-4,-22,25,-19,-7,-2,-14,14,23,-7,-7,-19,-19,-5,10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-28,54,-31,-20,10,-29,17,7,-22,-29,-33,-21,-21,-10,7,0,21,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-12,-24,-14,-4,-13,-23,-11,-4,8,1,7,-10,-18,0,6,-13,-8,-4,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-28,-5,2,-25,-15,-12,-20,12,-23,-12,-2,12,1,7,-3,-3,-19,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-20,-8,3,-22,-10,-14,-17,5,-17,-11,-6,-3,-1,-2,4,-2,-10,-25,-17,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-8,-15,-30,63,-19,-39,-17,-29,-20,0,-19,-17,-17,0,-19,-30,-21,-29,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-16,-8,-2,-14,-20,-12,-11,-1,-11,-6,-3,-12,-4,-3,9,24,-3,-27,-9,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-21,-26,-18,-4,-29,-23,23,-20,13,10,-22,-17,-17,-20,-13,-5,23,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,1,-21,-19,-1,-30,32,-22,-10,2,-19,10,62,-9,-10,-20,-21,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-28,-9,3,-22,-16,-13,-15,3,-15,-9,-10,9,-1,4,-7,-8,-13,-25,-17,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-15,-12,-2,-22,-3,-15,-16,-2,-17,-12,-5,-8,-3,-10,11,1,-7,-24,-19,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-23,-13,-5,-13,-19,-10,-11,10,-11,-2,-7,-18,-1,22,-6,-4,-3,-23,-10,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,14,-26,15,-3,-28,22,-8,-31,-9,-27,-20,15,-14,-7,-10,3,-9,-26,-30,-23,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-29,40,35,-34,-15,-1,-32,5,-24,-22,9,-6,10,-5,0,-9,-27,-34,-19,22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,74,-18,-18,-12,-18,-18,-18,-18,-12,-12,-12,-25,-18,-18,-6,-6,-6,-31,-18,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,34,-31,48,10,-30,-8,-4,-35,-3,-27,-26,13,-14,-4,-10,-5,-12,-29,-17,-14,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-23,-19,3,-25,-16,15,-21,19,12,-13,-17,-17,-18,-18,-7,8,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,9,-28,14,5,-27,-13,-7,-24,-5,-25,-19,5,21,-3,-10,1,-3,-24,-32,-21,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,38,44,-33,-16,0,-33,6,-23,-23,7,-4,12,-4,0,-10,-30,-33,-19,28;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-16,-26,-19,-17,18,-25,7,-5,-10,-5,-2,-12,-26,-11,-6,-13,-5,-9,15,40,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-5,20,-16,9,-3,-17,-11,-6,-17,-5,-20,-16,25,-14,-5,-6,15,24,-15,-35,-15,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-13,-28,-16,-5,-19,-27,-13,3,7,-6,4,-10,-16,8,2,-11,-9,0,-21,-7,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00351;
//
ID   FTSW_RODA_SPOVE_MP; MATRIX.
AC   MP00428;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cell cycle proteins ftsW / rodA / spoVE signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2203197; R2=0.0150519; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=796; N_SCORE=17.192; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-35,-26,19,-32,-23,25,-27,27,17,-25,-27,-24,-22,-22,-9,19,-15,5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-12,2,-21,-14,-18,-1,-20,-12,-14,-9,-6,-11,-16,-13,-20,4,-1,-3,-24,-19,-14;
MA   /M: SY='V'; M=2,-22,1,-27,-23,0,-15,-24,4,-23,5,0,-18,-25,-22,-22,-9,-6,8,-24,-10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-25,-11,-17,-25,46,-19,-29,-18,-25,-17,0,-18,-17,-19,5,-9,-21,-23,-25,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-13,-28,-23,-1,-28,-23,20,-22,11,7,-19,-23,-19,-21,-9,1,21,-23,-2,-23;
MA   /M: SY='S'; M=2,-12,-18,-16,-15,-13,0,-19,-4,-17,-9,-3,-6,-17,-13,-17,8,7,1,-28,-15,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-20,-21,-24,-18,-1,-13,-20,9,-23,13,7,-15,-21,-16,-20,-8,-3,5,-22,-7,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-28,-27,-32,-23,7,-25,-22,8,-22,13,9,-26,-25,-17,-19,-22,-9,1,25,7,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-35,-26,17,-34,-24,29,-29,30,16,-25,-26,-24,-24,-23,-9,18,-16,4,-26;
MA   /M: SY='F'; M=1,-22,-16,-27,-20,17,-21,-19,7,-22,11,6,-18,-23,-21,-18,-8,-3,9,-17,0,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-27,-22,-33,-28,18,-19,-25,17,-26,10,6,-20,-26,-28,-23,-15,-9,18,-14,1,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-3,-29,-3,10,-26,-20,20,-18,4,-18,-1,-1,-14,40,5,-2,-9,-26,-15,7,24;
MA   /M: SY='T'; M=4,-13,-13,-17,-15,-4,-14,-20,0,-16,-1,-4,-10,-18,-15,-15,7,14,8,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-18,-31,-23,36,-26,-18,7,-25,16,9,-20,-27,-26,-18,-14,-5,8,-10,10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-33,-25,-1,-33,-25,34,-23,17,18,-23,-24,-17,-22,-16,-7,30,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,34,-19,16,-3,-18,-3,6,-16,-2,-26,-17,52,-21,-3,-2,8,0,-23,-39,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-22,-33,-26,-1,-31,-26,34,-24,16,16,-21,-22,-20,-24,-14,-6,29,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-27,-14,-20,-20,51,-20,-31,-20,-21,-15,-4,-20,-20,-20,-2,-17,-23,-18,-24,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-17,-20,-22,-20,-8,1,-13,2,-15,-1,14,-14,-21,-13,-16,-6,-6,5,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='V'; M=14,-15,-11,-21,-18,-9,-17,-22,9,-14,-2,-1,-13,-20,-18,-17,3,7,20,-28,-14,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-16,-19,-21,-17,-7,-18,-20,10,-19,4,4,-10,-17,-13,-18,1,9,9,-26,-9,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-29,-10,-19,-29,62,-19,-38,-17,-29,-19,0,-20,-18,-15,0,-17,-28,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-34,-24,3,-33,-23,33,-28,31,22,-24,-24,-18,-24,-23,-10,19,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-22,-33,-23,9,-30,-20,25,-27,34,22,-25,-25,-18,-21,-24,-9,14,-18,1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-16,-21,-15,-6,-26,-22,12,-16,5,4,-17,-14,-17,-16,-3,12,18,-28,-10,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-14,-11,-9,-13,-22,-19,-8,2,-11,-7,-5,-13,-9,-3,9,29,3,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,30,-28,33,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-25,-8,-3,-22,-18,-16,-16,-8,-21,-14,-6,34,-5,-13,4,14,-17,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-19,-29,-21,15,-29,-21,16,-28,38,15,-26,-28,-22,-19,-23,-4,10,-18,2,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-26,-21,-20,-16,-12,-21,-16,-21,77,-11,-20,-12,-10,-26,-29,-27,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-31,-23,-36,-26,46,-29,-21,6,-29,23,6,-26,-30,-30,-20,-26,-12,1,10,18,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-35,-27,26,-31,-22,22,-26,21,16,-24,-27,-26,-21,-20,-8,19,-13,7,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-28,-18,-16,20,-26,15,-3,-9,-4,-2,-16,-26,-5,-9,-13,-8,-11,20,62,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-11,0,-2,-18,-3,-10,-18,-9,-27,-18,13,-11,-2,-9,34,23,-10,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='S'; M=14,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,37,18,-9,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-16,-29,-22,15,-30,-18,15,-26,27,11,-23,-27,-21,-20,-20,-3,8,-14,8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-23,-32,-23,4,-30,-24,25,-27,29,14,-25,-25,-20,-23,-22,-8,16,-12,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-15,-22,-17,-11,-11,-22,5,-17,-1,-2,-12,-16,-15,-20,3,3,10,-24,-13,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-17,-12,-13,-3,-17,-11,1,-14,2,3,4,-20,-11,-12,-1,8,-2,-27,-8,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-10,-22,-16,3,-20,-9,5,-18,13,16,-16,-23,-10,-15,-8,-3,2,-21,2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=4,-22,-20,-30,-22,1,-22,-23,19,-22,9,9,-16,-19,-18,-22,-8,-4,15,-20,-5,-21;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,-17,-17,-14,-12,1,-18,-6,-18,2,-3,-9,-19,-14,-18,-2,-3,-3,-24,-15,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-14,-32,-24,14,-29,-23,18,-25,10,8,-17,-23,-22,-23,-11,-3,13,-18,1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=11,-11,-20,-15,-17,-22,37,-19,-25,-18,-20,-13,-4,-18,-17,-20,3,-12,-17,-21,-23,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-36,-27,15,-35,-25,32,-29,27,18,-23,-25,-23,-25,-23,-10,20,-16,4,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-18,-30,-22,4,-28,-23,22,-26,33,15,-27,-27,-21,-21,-21,-7,18,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=2,-20,-20,-25,-15,-1,-22,-15,13,-18,18,15,-19,-21,-12,-18,-13,-6,8,-19,-1,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-11,13,-22,4,0,-20,-8,3,-24,11,-26,-16,27,-18,4,27,7,-1,-23,-32,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-23,-34,-26,-1,-32,-27,34,-26,20,15,-22,-22,-21,-25,-16,-7,26,-22,-4,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00352;
//
ID   STAPHYLOCOAGULASE_MP; MATRIX.
AC   MP00429;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Staphylocoagulase repeat signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2598996; R2=0.0123915; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2394; N_SCORE=33.915; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-25,-17,-17,20,-27,10,-3,-10,-3,-3,-15,-25,-10,-10,-10,6,-7,14,57,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-23,12,-5,-23,18,2,-25,-5,-30,-20,44,-20,-5,-5,7,-5,-30,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-15,-10,-7,-13,-20,-15,-15,0,-13,-10,0,-13,-5,11,12,34,-5,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-15,-2,8,-15,-20,-15,-15,-5,-13,-13,0,-7,-2,-7,15,34,-8,-30,-13,3;
MA   /M: SY='H'; M=-18,1,-28,-2,-5,-7,-20,66,-21,-8,-16,-3,10,-23,3,-3,-10,-14,-25,-16,29,-5;
MA   /M: SY='A'; M=16,4,-19,-5,-5,-25,10,-8,-20,-6,-20,-13,11,-14,1,-10,7,-5,-18,-25,-20,-2;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,44,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-22,-4,8,-28,-20,-2,-16,2,-16,-4,0,-10,31,2,8,15,-18,-24,-10,19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-13,-33,-30,21,-30,-27,22,-23,10,7,-27,-30,-33,-20,-13,-3,37,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-15,-3,-5,-23,18,-13,-25,-13,-30,-20,7,-13,-5,-13,30,10,-15,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-30,-2,1,-30,47,-15,-37,-12,-27,-20,0,-15,-10,-15,0,-17,-30,-23,-27,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-15,-10,-7,-13,-20,-15,-15,0,-13,-10,0,-13,-5,11,12,34,-5,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-27,-16,-4,11,-25,5,-9,-6,-7,0,-11,-21,15,-3,-11,-10,-17,2,25,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-23,14,3,-23,-6,4,-23,15,-30,-17,42,-17,3,9,4,-3,-27,-34,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,80,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,46,-30,-20,-3,-30,21,-23,-17,0,-3,17,8,-3,-10,-27,-27,-17,32;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,10,-27,5,0,-20,-15,77,-27,-7,-23,-5,23,-20,7,0,-5,-15,-30,-33,10,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-17,-14,-3,-26,1,-12,-15,-6,-14,-8,-7,-11,7,-12,7,-4,-10,-20,-18,2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,47,11,-31,-5,5,-31,0,-30,-25,39,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-19,-5,4,-24,-20,-6,-15,-1,-15,-5,0,-10,23,-1,11,22,-14,-25,-10,13;
MA   /M: SY='V'; M=14,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,19,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,36,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-13,-18,-17,-7,-23,-5,-20,-13,-10,-15,-13,-13,17,-10,-20,5,-3,-8,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-32,-15,-8,-22,-23,-23,-6,-13,-19,-12,-23,57,-15,-20,-10,-7,-8,-30,-25,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-30,-3,10,-25,-22,6,-19,17,-19,-3,-3,-13,34,12,-6,-10,-24,-11,6,21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-24,12,4,-24,-8,2,-24,19,-30,-16,37,-16,4,12,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,71,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,47,-30,-20,-3,-30,20,-23,-17,0,-3,17,8,-3,-10,-27,-27,-17,32;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00353;
//
ID   TONB_DEPENDENT_REC_1_MP; MATRIX.
AC   MP00430;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TonB-dependent receptor proteins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3101912; R2=0.0176274; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=135; N_SCORE=7.684; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-21,-11,-4,-9,-18,-7,-5,-9,-7,-2,-1,-13,0,-9,3,5,-7,-25,-7,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-26,1,4,-25,-15,1,-23,16,-24,-11,6,-9,9,15,0,-5,-19,-26,-12,5;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-19,-4,0,-18,-13,-9,-17,3,-18,-10,5,-10,4,-1,10,7,-14,-28,-13,2;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-24,-12,-4,-12,-20,-5,-10,2,-9,-4,-4,-13,-2,7,-6,-5,-8,-22,-6,-5;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: M=-3,-7,-16,-10,-8,-1,-13,-5,-5,-7,-6,-4,-2,-7,-8,-6,-2,-1,-5,-15,-2,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-4,-12,-8,-8,9,-11,-8,-3,-8,-3,-1,-2,-11,-9,-7,-1,1,-2,-10,1,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,0,-11,-3,-2,-7,-8,-3,-8,2,-5,-4,4,-9,0,8,1,2,-6,-14,-6,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-10,-15,-13,-9,2,-13,-9,1,-7,1,0,-8,-8,-8,-5,-9,-6,-2,1,3,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-13,-3,-1,-13,1,-6,-14,5,-14,-8,0,-1,-1,5,2,-2,-10,-13,-10,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-12,-13,-9,-2,-13,-10,6,-11,9,5,-11,-3,-8,-10,-8,-3,3,-13,-5,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='A'; M=3,-15,-20,-18,-14,-10,-5,-16,-5,-16,-2,-2,-10,-15,-11,-13,0,0,-4,-19,-9,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-22,-11,-26,-18,6,-23,-20,6,-24,20,5,-20,-20,-19,-20,-13,-3,4,-21,-4,-18;
MA   /I: I=-1; MD=-7;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-8,-26,-18,3,-22,-20,11,-22,20,7,-20,-22,-18,-19,-14,-6,9,-20,-5,-18; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-15,-22,-16,2,-22,-16,18,-18,21,13,-19,-15,-14,-15,-16,-6,14,-16,-3,-16; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=16,-7,-2,-13,-9,-10,-7,-12,-5,-10,-2,-2,-6,-11,-8,-12,3,3,0,-18,-11,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-15,-8,-19,-14,-5,-18,-18,3,-18,6,1,-12,-18,-12,-16,-1,6,4,-19,-7,-14; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-16,-13,-11,-16,8,-16,-13,-12,-9,-8,-6,-14,-8,-14,5,4,-7,-21,-16,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-10,-29,-21,5,-28,-21,17,-25,28,12,-24,-26,-20,-20,-20,-6,12,-20,-2,-21; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='S'; M=1,-8,-5,-11,-9,-10,-14,-13,-10,-13,-11,-10,-4,-8,-9,-14,10,9,-6,-28,-9,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='P'; M=1,-19,-22,-19,-13,-8,-13,-19,-2,-16,-6,-4,-16,12,-15,-18,-5,-5,-2,-23,-14,-15; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-12,-16,-10,-9,-16,-9,-2,-8,-5,3,-9,-17,-2,-10,2,3,0,-20,-2,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='A'; M=26,-12,-10,-18,-12,-10,-8,-19,-4,-13,-7,-7,-10,-14,-13,-17,9,4,6,-23,-14,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-27,-20,-13,10,-27,-5,0,-15,4,2,-16,-23,-3,-12,-17,-11,-6,4,16,-8;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,-15,-15,-8,-17,-8,-18,-9,-12,-9,-9,-10,3,-9,-17,7,4,-5,-24,-18,-9; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-8,-21,-11,-1,-23,-10,-2,-11,-6,-12,-4,-6,-8,11,-9,1,-4,-10,-22,-12,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-20,-7,2,-16,-13,-5,-13,-5,-11,-8,-5,-13,2,-8,1,-2,-11,-11,-8,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-14,-13,-8,-15,1,-12,-10,-10,-8,-7,-5,-13,-5,-13,5,1,-6,-18,-11,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=6,-1,-23,0,15,-27,-10,-7,-18,2,-16,-10,-4,-6,13,-4,1,-7,-16,-23,-16,14; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-22,4,7,-23,-17,-11,-12,-1,-15,-10,-3,-7,2,-7,2,1,-8,-29,-15,4;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,3,-24,1,3,-23,-17,0,-17,4,-19,-9,4,-9,7,3,3,3,-15,-28,-11,4;
MA   /M: SY='S'; M=2,3,-20,4,1,-21,-10,-7,-18,-5,-18,-13,0,-7,-1,-9,8,5,-12,-27,-11,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-27,16,4,-27,4,-8,-25,-8,-17,-16,6,-9,-3,-12,-2,-9,-22,-29,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-29,46,28,-30,-13,0,-34,2,-25,-25,16,-9,4,-6,0,-9,-29,-35,-18,17;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-21,-34,-26,5,-31,-21,31,-24,24,26,-24,-25,-19,-21,-20,-8,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-14,-20,-16,-7,-25,-23,13,-15,0,2,-16,-21,-15,-15,1,11,24,-30,-11,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-18,-7,-3,-10,-20,-15,-12,-6,-10,-10,-4,-13,-7,-8,8,23,-6,-17,-4,-5;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-15,-18,-11,-22,13,-20,-16,-12,-15,-12,-9,-7,-12,-20,7,-4,-7,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='N'; M=5,8,-18,2,3,-23,-6,-6,-20,1,-25,-16,16,-7,3,-4,15,6,-17,-33,-18,3;
MA   /M: SY='R'; M=6,-8,-22,-11,-3,-21,-6,-12,-20,6,-16,-10,-4,-11,0,11,1,-1,-13,-22,-15,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-8,-21,-13,-10,2,-7,-12,-12,-13,-12,-9,-2,-13,-11,-12,0,0,-10,-18,-5,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-25,2,16,-26,-11,0,-25,10,-22,-14,4,-7,9,9,2,-5,-22,-26,-15,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-5,-25,-5,5,-20,-15,-6,-15,0,-12,-6,-4,-10,13,2,-1,-4,-16,-23,-11,8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-26,-5,-3,-17,-18,-9,-14,1,-17,-11,-6,3,-3,1,-4,-4,-11,-21,-6,-5;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-21,-6,-5,-19,-7,-13,-11,-5,-9,-5,-5,-15,-4,-4,-1,-4,-7,-25,-14,-6;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-22,-2,-1,-20,3,-12,-21,-8,-19,-14,-2,-5,-3,-12,7,-3,-16,-26,-18,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-4,5,-25,4,5,-23,-2,-8,-20,-7,-20,-15,7,-5,-1,-10,2,-5,-21,-25,-18,2;
MA   /M: SY='A'; M=4,-8,-19,-11,-4,-16,-12,-14,-4,-6,-7,-3,-6,-16,-6,-10,-2,-1,2,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-24,-11,-9,-13,-21,-18,-1,-12,1,-2,-14,2,-12,-14,-8,-5,-2,-27,-13,-12;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,-17,-14,-9,-16,-4,-10,-12,-11,-11,-6,-7,-8,-6,-14,7,6,-7,-23,-11,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-4,-25,-5,-7,-20,1,-12,-14,-9,-18,-9,-1,-3,-7,-13,2,-4,-13,-25,-14,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-19,-18,-17,-8,-20,-21,6,-17,1,-1,-15,-10,-17,-18,-4,8,11,-25,-8,-18;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-18,-8,-7,-15,-4,-14,-15,-8,-18,-13,2,-14,-7,-10,12,13,-9,-20,-11,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00354;
//
ID   SMALL_HYDR_PLANT_SEED_MP; MATRIX.
AC   MP00431;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Small hydrophilic plant seed proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3322253; R2=0.0124996; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1194; N_SCORE=19.247; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-18,-10,-4,-21,2,-15,-12,-11,-17,-11,-2,-12,-3,-15,14,2,-7,-28,-18,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-29,-5,1,-31,7,-10,-26,-2,-27,-14,-3,11,9,-6,3,-8,-26,-25,-21,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,30,-37,-20,7,-23,10,-20,-5,0,-7,50,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-29,0,21,-32,-21,3,-19,11,-15,-2,-3,-10,40,8,-4,-10,-25,-22,-11,30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,15,34,-29,0,-5,-31,1,-24,-21,3,-6,8,-6,6,-8,-27,-30,-22,21;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-22,3,15,-25,-12,-7,-26,16,-27,-16,4,-9,8,11,12,2,-18,-30,-16,11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,22,46,-34,-19,2,-29,9,-21,-17,3,-4,27,1,0,-10,-30,-29,-18,36;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=3,-4,-23,-4,12,-24,-13,-5,-23,9,-19,-12,-1,-11,12,17,4,-4,-17,-25,-16,11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-27,-12,-2,-17,-21,-6,-16,23,-9,4,-7,-18,5,33,-14,-10,-12,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-27,-8,2,-23,-17,-6,-27,31,-22,-10,-1,-16,7,47,-7,-9,-17,-20,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,39,-33,-20,0,-27,19,-22,-13,0,-5,28,9,-2,-10,-28,-25,-15,33;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,53,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,27,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-30,-10,-15,-28,49,-15,-38,-8,-28,-18,0,-20,-13,1,-2,-18,-28,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,9,-29,-20,0,-30,44,-29,-9,1,-11,10,27,-10,-11,-21,-21,-7,9;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-1,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-10,39,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-30,-21,19,-30,-15,16,-27,38,15,-28,-30,-21,-19,-27,-10,8,-11,13,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-38,-20,18,-21,8,-20,0,1,-11,55,9,-1,-11,-30,-21,-7,36;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-30,13,41,-29,-22,-1,-20,5,-16,-13,-1,-5,22,-2,-2,-10,-24,-28,-16,31;
MA   /M: SY='H'; M=-16,10,-27,4,1,-21,-14,40,-27,9,-24,-9,21,-19,7,18,-4,-11,-27,-30,-1,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-30,22,58,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00355;
//
ID   ACTINS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00432;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Actins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3320909; R2=0.0126455; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=496; N_SCORE=10.594; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=172; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-35,-26,-1,-36,-25,38,-23,18,19,-20,-22,-17,-19,-19,-9,25,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-22,-27,-28,-20,-7,-32,-20,21,-10,5,8,-14,-20,-11,2,-14,-6,15,-22,-5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-6,-23,0,-8,-5,-24,-14,2,-21,26,5,-15,-24,-14,-17,-21,-10,-2,-26,-6,-11;
MA   /M: SY='W'; M=21,-17,-22,-23,-15,-10,-7,-22,-14,-13,-16,-14,-16,-16,-12,-18,0,-3,-10,28,-4,-12;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-22,13,5,-27,13,-9,-29,-8,-27,-21,11,-12,-3,-11,13,0,-22,-32,-22,1;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-16,-7,-7,-13,-19,16,-16,-10,-14,-7,3,-13,-4,-7,12,28,-9,-30,-1,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-27,58,-29,-17,6,-27,18,11,-22,-29,-31,-19,-22,-10,3,1,21,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-6,4,-26,3,14,-28,-15,26,-24,4,-22,-8,7,-12,23,3,2,-8,-25,-27,-6,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-27,4,21,-32,-9,3,-25,7,-22,-10,3,-9,28,3,3,-6,-26,-25,-15,24;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-19,-19,-27,-20,-5,-8,-9,10,-14,12,36,-18,-21,-8,-14,-15,-9,7,-21,-7,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-37,-30,-1,-37,-30,42,-27,16,16,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-11,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-7,-20,-14,4,-10,-5,-8,27,34,-5,-34,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,41,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-27,3,18,-29,-17,-6,-26,24,-24,-11,0,-8,17,14,0,-4,-21,-24,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,35,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,25,-29,36,42,-32,-15,1,-32,6,-24,-23,12,-5,12,-3,1,-9,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,22,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='K'; M=-1,3,-21,1,2,-23,-10,1,-20,9,-23,-11,7,-13,1,3,5,-2,-14,-29,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-27,-11,-8,-26,11,-18,-22,-11,-24,-16,-9,20,-10,-17,1,-8,-19,-26,-25,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-24,14,21,-27,-3,-5,-28,2,-25,-19,7,-8,7,-2,10,-2,-23,-32,-20,14;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-17,-14,-22,-16,-3,-22,-17,18,-13,8,7,-12,-15,-11,-9,-11,-6,13,-15,-4,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-11,-23,-21,0,-23,-21,25,-16,9,9,-19,-19,-19,-16,-9,-2,31,-19,-5,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-1,-29,0,11,-22,-21,39,-25,9,-16,-4,1,-15,9,7,-10,-14,-23,-26,3,8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,4,-28,5,20,-25,-17,0,-29,22,-23,-14,8,-12,12,33,-4,-8,-24,-26,-14,14;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-1,-30,-1,7,-27,-20,26,-29,25,-25,-6,3,-14,15,24,-9,-13,-24,-23,-1,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,91,-26,-25,-19,-27,-26,-28,-22,-20,-18,-16,-35,-24,-18,-6,-4,-10,-45,-26,-25;
MA   /M: SY='F'; M=5,-19,-19,-26,-17,23,-19,-19,-5,-12,-3,-4,-13,-17,-21,-13,-7,-6,-1,-8,4,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,1,-15,-1,0,-20,-5,-6,-22,0,-28,-18,11,-13,2,9,26,12,-14,-35,-18,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,34,-21,16,-2,-15,-3,11,-18,-1,-27,-18,52,-21,-1,-1,7,-1,-28,-33,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-16,-27,-23,-2,-30,-26,22,-20,10,8,-19,-22,-21,-20,-6,11,27,-27,-7,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00340;
//
ID   PHOSPHOFRUCTOKINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00433;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphofructokinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8802614; R2=0.0146529; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=609; N_SCORE=13.794; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-26,4,-36,-26,38,-29,30,19,-24,-24,-21,-26,-23,-9,24,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-18,-19,-13,-1,-8,-9,-10,-8,-8,-7,-12,-17,-11,-14,-1,-3,-6,-5,10,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-25,15,13,-25,-12,5,-23,2,-21,-14,12,-13,12,1,3,-4,-23,-29,-11,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-12,-23,-12,-1,-9,-22,-11,3,-10,2,2,-12,-16,-1,-11,-10,-7,-1,-15,-2,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-19,-32,-24,21,-31,-20,19,-26,21,10,-23,-27,-24,-21,-20,-8,14,-11,10,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-4,-16,-9,-4,-20,-5,-14,-14,0,-15,-10,-2,-12,-4,-8,8,2,-6,-24,-16,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-28,14,25,-27,-17,-3,-25,12,-21,-15,2,-8,12,6,-2,-8,-22,-27,-15,18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-27,6,27,-24,-19,-2,-20,7,-15,-11,-2,-6,13,1,-3,-7,-19,-26,-13,19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-16,-22,-16,1,-22,-16,21,-16,17,12,-15,-16,-12,-15,-14,-6,14,-14,-1,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-16,3,15,-15,-9,-1,-16,5,-13,-9,0,-5,7,1,2,-3,-13,-17,-9,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=4,-2,-16,-2,8,-25,0,-10,-25,1,-21,-15,-2,-12,1,-3,2,-6,-18,-26,-18,4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-22,-3,2,-15,-17,4,-20,10,-14,-8,0,-17,2,15,-8,-9,-16,-20,-2,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-22,-13,-13,-14,11,-14,-13,-14,-8,-6,-6,-14,-13,-13,-3,-2,-10,-21,-14,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-2,-20,-2,-5,-16,-1,-6,-14,-2,-13,-8,1,-15,-4,1,-4,-8,-12,-20,-10,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-22,-27,-19,28,-25,-10,3,-17,7,2,-15,-24,-20,-12,-14,-8,1,-7,14,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-28,37,31,-32,-12,-2,-32,2,-24,-23,9,-7,6,-7,2,-6,-26,-34,-19,18;
MA   /M: SY='T'; M=6,-12,-5,-19,-16,-9,-20,-22,1,-16,-2,-4,-10,-16,-15,-17,6,18,8,-29,-12,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=9,-14,-12,-19,-14,-12,-16,-21,2,-12,-6,-3,-13,-12,-14,-16,3,6,10,-27,-14,-15;
MA   /M: SY='T'; M=11,0,-11,-9,-10,-14,-12,-16,-8,-10,-13,-10,4,-14,-10,-12,15,22,1,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-18,-29,-26,-2,-31,-26,30,-21,9,10,-20,-24,-22,-20,-10,0,33,-26,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-26,-16,2,-28,-20,13,-26,33,12,-28,-5,-18,-20,-26,-10,2,-22,-6,-18;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-10,-19,-29,63,-20,-37,-19,-29,-19,0,-19,-19,-20,2,-18,-27,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-33,-26,4,-32,-25,32,-24,20,19,-24,-24,-21,-22,-17,-5,28,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,-1,18,-38,-20,9,-18,8,-17,1,-1,-11,57,9,-1,-10,-28,-20,-10,37;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,7,-27,-20,3,-27,23,-20,-7,0,-17,27,50,-7,-10,-23,-20,-10,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-11,-20,-26,67,-20,-39,-20,-29,-19,-1,-20,-21,-20,-1,-20,-29,-19,-28,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-15,-10,-9,-12,-12,-12,-7,-10,-11,-8,2,-15,-7,-11,12,13,-3,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,0,-29,-20,-20,-20,-10,-29,-20,-19,86,-10,-20,-9,-8,-29,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,-3,-4,-8,-8,-14,-12,-16,-13,-12,-17,-12,1,-13,-7,-12,24,28,-3,-35,-15,-8;
MA   /M: SY='P'; M=19,-14,-22,-16,-8,-20,-7,-18,-12,-12,-17,-12,-12,20,-11,-19,3,-2,-10,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-17,-24,-23,-17,19,-24,-7,0,-9,2,5,-10,-23,-13,-2,-13,-8,-3,-7,14,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,22,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-20,-25,-23,-1,-27,-22,22,-20,9,8,-14,-24,-19,-19,-11,-2,21,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-21,-22,-25,-17,6,-26,-13,9,-15,23,16,-18,-25,-12,-3,-20,-7,4,-18,1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,-15,-16,-12,-22,16,-19,-18,-12,-16,-13,-6,-12,-12,-19,10,-3,-8,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-12,-8,-7,-11,-13,-16,-10,-12,-11,-10,0,-13,-7,-12,19,26,-2,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-28,-12,-3,-19,-20,-7,-20,22,-16,-6,-5,-19,5,40,-11,-10,-12,-16,-9,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-25,-21,-32,-22,25,-26,-11,13,-21,24,27,-22,-26,-15,-15,-22,-10,6,-10,11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-24,-12,-17,-26,47,-19,-30,-17,-24,-15,-2,-17,-16,-19,4,-13,-21,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='A'; M=8,-14,-19,-18,-13,-11,-17,-18,5,-10,-2,0,-11,-18,-11,-14,-5,-5,8,-19,-9,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-27,-5,1,-13,-20,13,-22,14,-18,-8,-1,-17,3,18,-8,-9,-17,-16,6,0;
MA   /M: SY='A'; M=42,-11,0,-20,-12,-19,-3,-19,-12,-12,-11,-11,-11,-13,-11,-20,8,-1,-1,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-14,-30,-27,1,-29,-23,27,-19,12,16,-26,-27,-24,-19,-12,-2,38,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-13,11,-29,18,24,-28,-14,1,-26,5,-17,-14,4,-11,14,2,-4,-10,-25,-28,-14,18;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-23,-21,-27,-17,13,-22,-14,1,-20,13,3,-20,-24,-17,-14,-17,-9,-1,-1,5,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-20,-33,-24,5,-31,-24,28,-27,30,18,-25,-25,-20,-23,-21,-8,20,-21,-2,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00336;
//
ID   HSF_DOMAIN_MP; MATRIX.
AC   MP00434;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HSF-type DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5829954; R2=0.0131884; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=990; N_SCORE=17.630; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-22,8,4,-24,-7,-6,-19,2,-21,-13,12,-14,4,-2,4,1,-16,-30,-16,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-12,-3,-4,-10,-1,-10,-18,-12,-25,-18,10,-13,-5,-11,30,15,-11,-34,-15,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-12,-34,-27,1,-33,-25,30,-26,22,18,-25,-26,-22,-24,-19,-8,26,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-30,-26,-3,-32,-28,30,-16,9,11,-24,-25,-23,-18,-13,-4,37,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-24,-33,-24,-14,-5,-22,-20,-8,-12,-5,-6,-23,-12,-8,-13,-20,-12,-14,36,4,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-29,31,9,-26,-9,2,-28,1,-26,-21,18,-6,1,-6,-1,-8,-27,-29,-10,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-26,3,8,-25,-18,-1,-19,-2,-20,-12,-3,9,6,-3,2,1,-17,-30,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-24,-2,12,-22,-15,-2,-17,-3,-16,-11,-2,2,8,-8,2,-2,-18,-25,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-27,11,22,-26,-17,-1,-26,13,-21,-15,7,-11,13,17,-1,-6,-23,-28,-15,16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-7,-10,-12,-7,-18,-3,-17,-11,-11,-16,-13,-3,-11,-7,-16,21,11,-1,-29,-19,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-26,-5,4,-22,-21,-4,-22,25,-19,-7,-2,-13,5,21,-6,-1,-13,-23,-8,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-24,8,15,-20,-18,5,-15,-3,-11,-8,2,-11,7,-4,-2,-2,-16,-27,-9,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-13,-31,-24,2,-30,-25,24,-26,28,14,-26,-27,-22,-23,-20,-7,21,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-37,-10,0,-29,-18,-19,-20,-4,-28,-18,-17,72,-8,-15,-8,-9,-27,-28,-27,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-8,1,-20,-20,-8,-22,24,-15,-7,-3,-15,6,31,-6,-1,-14,-22,-9,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-10,-21,-14,-16,17,-25,21,-6,-11,-5,-3,-6,-28,-9,-9,-15,-10,-14,8,50,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-3,18,-13,7,-4,-21,4,-3,-22,-4,-28,-19,31,-17,-4,-5,16,6,-21,-37,-20,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-37,-28,45,-30,-19,14,-25,13,15,-21,-27,-29,-20,-19,-9,11,-4,16,-26;
MA   /M: SY='S'; M=20,1,-11,-5,-4,-19,-2,-12,-16,-9,-22,-16,8,-11,-4,-12,26,14,-8,-33,-19,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,36,-21,18,0,-20,-2,19,-21,-1,-29,-18,55,-20,1,0,8,-2,-30,-39,-16,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-12,-18,-21,-15,-6,-21,-11,9,-8,5,25,-11,-16,-5,-10,-4,11,6,-24,-5,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-5,-17,-31,65,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-22,-40,-30,76,-29,-21,-1,-29,8,-1,-21,-30,-39,-20,-21,-11,-2,18,30,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-4,-30,-4,1,-21,-20,43,-30,15,-21,-6,4,-19,10,34,-10,-14,-24,-24,3,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-33,-29,1,-33,-29,34,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-19,10,-2,-21,-16,-11,-13,-6,-17,-13,1,-11,-4,-6,7,6,-3,-33,-16,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-2,-24,-1,-1,-22,-14,23,-22,-9,-22,-12,1,8,-1,-10,5,0,-20,-31,-8,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,6,-29,13,5,-21,-23,-13,-4,-11,-7,-8,-4,-4,-7,-16,-9,-9,-7,-30,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-28,10,16,-27,-17,6,-30,17,-24,-14,5,-12,12,25,-1,-8,-23,-27,-12,12;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-12,-34,-14,-11,-12,-7,-15,-21,-11,-25,-18,-7,-10,-5,-12,-8,-11,-26,39,-1,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-27,10,18,-30,16,-9,-32,-5,-25,-20,2,-10,0,-10,4,-10,-26,-28,-24,9;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-15,-23,-21,-17,19,-10,-13,-7,-18,-6,-1,-7,-15,-15,-14,-8,-8,-8,-12,1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-16,-13,-11,-12,-14,-18,1,-17,1,-3,-9,-16,-11,-18,3,1,3,-27,-13,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,11,-20,2,-1,-17,-10,-1,-12,1,-17,-10,22,-16,4,4,5,2,-16,-29,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-24,10,16,-14,-13,-1,-22,0,-19,-16,10,-12,4,-2,3,-4,-21,-25,-8,10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,9,-25,10,3,-23,8,-1,-27,-8,-24,-16,11,-9,-4,-10,5,-7,-24,-30,-18,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-14,-24,-17,-8,16,-5,-13,-19,-8,-12,-10,-7,-20,-15,-1,-6,-9,-14,-11,0,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,7,-24,11,0,-19,-11,-7,-15,-2,-8,-9,2,-12,-3,-1,-8,-9,-14,-26,-12,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-25,13,7,-27,-2,-4,-29,9,-25,-18,12,-14,2,10,2,-7,-23,-29,-18,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00381;
//
ID   PEROXIDASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00435;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Peroxidases proximal heme-ligand signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=302;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=297;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4070; R2=0.00965486; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=580; N_SCORE=6.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=528; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-40; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-27,-3,4,-26,-5,0,-20,2,-18,-7,3,-11,19,3,-2,-9,-23,-22,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-19,8,-29,-20,18,-29,46,18,-29,-26,-19,-20,-28,-9,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-21,-1,2,-17,-14,-3,-20,5,-20,-11,4,-14,4,11,8,6,-14,-28,-10,2;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-18,-24,-20,-14,-2,-21,-13,-2,-12,-3,2,-16,-3,-12,-12,-9,-2,-3,-9,-1,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-25,17,-1,-27,12,2,-30,-6,-27,-19,20,-16,-3,-6,5,-5,-26,-32,-18,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-24,-33,-26,61,-30,-6,1,-23,7,0,-20,-30,-29,-17,-20,-10,-3,16,46,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-22,7,6,-24,-7,-6,-24,4,-23,-14,4,-12,4,2,9,0,-17,-29,-15,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-25,5,9,-25,-7,-2,-25,12,-25,-13,11,-12,9,9,3,-3,-22,-28,-14,9;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-12,-6,-5,-16,-11,-15,-14,-7,-19,-14,5,-11,-5,-8,25,29,-5,-33,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-39,-8,2,-30,-19,-17,-21,-8,-29,-19,-17,76,-6,-16,-9,-10,-29,-27,-27,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-24,7,5,-22,-10,-1,-22,8,-23,-13,17,-12,8,6,3,-2,-22,-28,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,-12,-26,-18,-2,-14,-23,5,-17,3,-1,-18,-19,-19,-20,-2,-2,15,-20,-10,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-27,10,39,-18,-21,-2,-22,2,-12,-14,-2,-7,11,-4,-3,-8,-23,-27,-14,25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-22,8,10,-22,-12,-5,-21,2,-19,-14,7,-10,5,-3,7,4,-17,-30,-14,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-37,-28,2,-38,-28,42,-27,18,17,-19,-20,-20,-27,-18,-6,26,-19,1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-14,-32,-29,0,-32,-30,33,-22,13,12,-27,-27,-27,-22,-12,-2,44,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-9,0,-21,-14,-5,-24,21,-19,-8,-2,-17,7,40,-6,-7,-16,-21,-11,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,11,-23,9,8,-24,-9,1,-25,7,-25,-16,14,-13,7,6,9,1,-21,-30,-13,7;
MA   /M: SY='T'; M=4,-12,-16,-15,-8,-12,-18,-16,0,-10,-5,-3,-10,-17,-6,-12,3,7,7,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,0,-31,-28,31,-22,14,13,-27,-27,-26,-21,-12,-1,41,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-23,-5,7,-18,-15,-8,-19,6,-17,-10,-2,-14,6,9,1,-1,-14,-19,-11,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-20,4,6,-24,-13,-5,-20,6,-21,-12,10,-12,8,3,5,1,-18,-30,-15,6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-21,-14,-5,-13,-14,-4,-12,1,-10,-4,-7,-15,-4,-3,-4,-7,-8,-16,-6,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-23,-21,-28,-21,19,-28,-14,10,-19,8,7,-20,-25,-17,-16,-13,-4,9,-6,14,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-25,-7,-1,-18,-15,-8,-11,6,-12,-5,-1,-15,3,4,-3,-5,-10,-23,-9,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-2,2,-21,-1,3,-21,-12,-4,-19,7,-21,-12,8,-14,7,10,7,1,-15,-28,-13,4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-25,34,14,-30,-12,1,-28,-2,-23,-20,13,-11,3,-8,3,-1,-22,-34,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-31,-12,-4,-19,-17,-17,-17,-4,-22,-14,-13,39,-8,-7,-5,-5,-19,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-18,-7,-5,-17,-12,-10,-17,3,-18,-12,4,-15,-2,13,11,14,-9,-29,-14,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-19,-23,-19,-3,-25,-19,17,-18,11,13,-12,-20,-14,-17,-7,6,14,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-16,-18,-11,-19,-1,-20,-10,-12,-12,-10,-10,-1,-12,-19,6,1,-3,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,-20,-18,-9,-20,-4,-20,-12,-11,-15,-12,-14,17,-12,-20,2,-4,-8,-23,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=16,-8,-18,-11,-6,-22,4,-16,-18,-5,-21,-13,-3,-6,-6,-10,12,1,-10,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-21,-29,-21,5,-29,-22,18,-25,29,13,-24,-25,-19,-20,-20,-2,11,-13,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-32,-21,26,-29,42,21,-27,-27,-19,-22,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-28,-19,6,-26,-13,18,-23,36,28,-22,-27,-14,-16,-25,-9,9,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-14,-26,-17,-11,11,-25,36,-9,-17,-1,5,-7,-23,-5,-9,-15,-14,-12,-15,19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-29,9,0,-19,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,32,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-29,0,0,-20,-19,95,-30,-10,-20,-1,10,-20,10,0,-8,-18,-29,-30,18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-37,-27,65,-26,-19,1,-27,8,2,-19,-28,-34,-19,-18,-10,1,5,23,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-12,-29,-28,-1,-29,-29,28,-20,9,10,-28,-25,-28,-20,-10,-1,44,-29,-10,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-12,12,-26,8,14,-26,-14,6,-24,11,-23,-13,18,-14,17,16,1,-5,-26,-29,-14,15;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,68,21,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,22,15,-27,-27,-25,-23,-18,-5,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,10,-29,-19,20,-29,47,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,18,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-4,25,-25,33,16,-32,-10,-3,-29,2,-24,-21,12,-10,5,-6,4,-6,-23,-33,-19,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,4,-20,4,-3,-22,9,-9,-24,-9,-25,-18,7,-5,-6,-12,13,4,-18,-29,-18,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-17,-5,-4,-17,-12,-13,-14,-5,-16,-12,3,-5,-6,-7,12,19,-9,-30,-14,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-23,-2,0,-23,-1,-10,-23,-1,-24,-16,6,2,-3,-1,7,1,-19,-29,-20,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-15,1,-2,-11,1,-8,-17,-3,-17,-12,6,-11,-4,-2,8,3,-12,-21,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,2,-18,-4,-5,-4,-12,-2,-5,-4,-7,-2,8,-15,-3,-3,-4,-5,-8,-19,-5,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-18,-4,3,-15,-14,-7,-10,5,-7,-4,-5,-4,5,4,-3,-1,-9,-17,-8,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=15,-3,-14,-6,-7,-20,8,-16,-19,-11,-21,-16,2,-12,-8,-14,21,12,-9,-30,-20,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-30,-4,7,-27,-20,-6,-28,39,-24,-8,-1,-14,13,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-23,26,10,-25,-12,-4,-25,1,-21,-18,14,-12,1,-3,5,2,-20,-34,-16,5;
MA   /M: SY='A'; M=26,-3,-14,-8,-6,-21,-1,-5,-16,-10,-17,-13,-1,-12,-6,-15,14,2,-7,-27,-16,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-8,-26,-6,-6,-16,-6,-15,-13,-11,-15,-12,-6,8,-10,-14,-2,-5,-13,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-33,-6,0,-27,-10,-15,-19,-6,-22,-15,-11,36,-4,-10,-6,-10,-22,-27,-23,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-20,19,0,-20,-1,10,-21,-1,-30,-20,54,-19,0,-1,12,1,-28,-40,-19,0;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-22,-21,-12,2,-21,-16,2,-10,9,3,-14,-21,-12,-5,-13,-8,1,-18,-4,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=7,-4,-17,-5,-5,-22,9,-14,-22,-10,-26,-18,4,-4,-6,-10,22,10,-14,-32,-21,-6;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-19,-24,-19,-5,-10,-21,8,-21,16,7,-21,-24,-18,-19,-13,-7,10,-23,-10,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,2,-29,6,4,-26,-11,1,-32,19,-23,-14,4,-17,7,40,-6,-10,-23,-24,-13,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-27,-8,-16,-28,55,-18,-35,-15,-28,-19,3,-18,-16,-17,2,-16,-27,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-21,-37,-28,71,-30,-15,-1,-26,9,0,-20,-30,-35,-16,-20,-10,-2,11,34,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-28,26,26,-28,-13,-3,-27,4,-22,-19,7,-7,6,-3,-1,-9,-23,-30,-16,16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-16,-30,-27,5,-31,-25,27,-22,14,10,-25,-27,-25,-21,-12,-1,33,-23,-1,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,28,-28,40,16,-31,-13,-5,-26,-2,-22,-21,10,-10,-1,-10,-1,-7,-20,-35,-17,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-26,11,14,-26,-14,-4,-25,13,-22,-15,7,-11,7,12,1,-5,-20,-27,-14,9;
MA   /M: SY='I'; M=12,-22,-20,-31,-22,-7,-23,-25,24,-21,9,10,-17,-17,-16,-24,-8,-5,19,-21,-8,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-17,-5,0,-17,-11,-10,-15,-2,-17,-12,2,-11,-1,-5,12,11,-9,-27,-12,0;
MA   /M: SY='A'; M=21,-8,-18,-12,0,-20,-11,-15,-9,-4,-8,-7,-9,-12,-2,-9,2,-4,-4,-23,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,25,-27,38,19,-29,-29,-22,-21,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,23,57,-31,-19,0,-30,9,-21,-20,1,-1,19,0,0,-10,-30,-30,-20,38;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-22,-6,0,-19,-14,-9,-15,9,-14,-8,3,-15,2,8,1,-2,-12,-26,-13,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-19,-8,4,-17,-14,-9,-12,0,-12,-8,-5,-13,0,-3,2,-3,-6,-25,-14,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-39,-8,0,-30,-18,-18,-22,-7,-29,-20,-17,78,-9,-14,-10,-10,-29,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-26,-4,-7,-25,25,-10,-29,-3,-25,-16,9,-18,-6,0,2,-10,-24,-25,-22,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-15,-20,-17,-7,-26,-23,10,-10,1,2,-14,-19,-15,-12,-1,16,19,-27,-8,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,60,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,100,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=60,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,80,10,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-29,0,-38,-29,45,-28,20,19,-21,-21,-20,-28,-19,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,27,-28,38,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-11,-17,-12,-15,-9,-20,-5,-11,-8,-8,-6,-13,-11,-17,10,13,4,-25,-16,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-30,-21,4,-28,-20,23,-26,35,20,-25,-26,-17,-20,-24,-9,13,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=52,-10,-10,-19,-11,-19,-1,-20,-9,-11,-10,-10,-9,-11,-11,-19,11,2,1,-22,-19,-11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-10,-16,-10,-17,-6,-19,-10,-10,-11,-10,-6,-10,-10,-17,14,15,0,-24,-17,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-8,3,-21,-20,0,-30,29,-20,-10,0,-19,13,65,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-29,55,20,-37,-11,-2,-34,-1,-27,-26,15,-10,2,-10,1,-9,-27,-37,-19,11;
MA   /M: SY='A'; M=22,-12,-12,-16,-11,-12,-4,-18,-7,-14,-8,-8,-8,-15,-12,-17,11,4,1,-26,-16,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-14,-29,-27,-1,-29,-27,28,-21,10,11,-24,-26,-25,-20,-9,2,39,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='V'; M=4,-14,-16,-16,-11,-7,-20,-11,4,-14,-1,-1,-12,-19,-14,-15,-1,2,12,-27,-8,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-19,-27,-17,3,-24,-17,13,-22,28,15,-24,-25,-14,-18,-19,-6,8,-16,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=16,-13,-12,-19,-13,-11,-13,-20,0,-14,-2,-3,-12,-16,-13,-16,5,9,8,-26,-14,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-6,-14,-30,78,-17,-38,-14,-30,-19,3,-19,-15,-16,0,-18,-29,-21,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-19,-29,74,-19,-38,-17,-29,-19,0,-19,-18,-18,0,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-29,-20,-19,-20,-9,-29,-19,-19,82,-8,-18,-9,-8,-29,-30,-29,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-8,-23,-9,-8,-4,-12,-6,-15,-5,-15,-11,-4,-19,-6,-1,2,-1,-12,-7,6,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-37,-33,-27,20,-26,-13,-3,-18,-6,-7,-30,-29,-18,-18,-29,-19,-12,77,42,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,8,16,-27,-14,-7,-23,1,-23,-17,1,12,5,-4,3,-3,-22,-31,-20,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-13,-30,-29,0,-31,-29,31,-21,13,11,-27,-29,-28,-21,-12,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-32,-8,6,-18,-21,-15,-18,2,-19,-13,-13,34,-5,-6,-10,-9,-21,-24,-17,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-16,-20,-15,0,-25,-19,5,-16,16,5,-15,-21,-15,-12,-7,14,6,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,100,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,80,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-29,-11,-1,-15,-21,-5,-24,26,-16,-8,-4,-19,5,49,-12,-10,-16,-16,-7,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,80,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-22,-6,-12,-26,41,-16,-32,-16,-29,-20,4,-16,-12,-16,16,-4,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-17,-24,-18,-9,-6,-22,-12,-8,3,6,1,-12,-22,-6,19,-15,-6,-6,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-19,-16,-10,-12,-20,-16,3,-9,-5,-2,-9,-17,-9,-7,0,7,7,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='S'; M=20,-4,-11,-8,-5,-17,-1,-14,-16,-11,-21,-15,2,-11,-5,-14,27,14,-6,-32,-18,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,3,-21,-2,-5,-8,-14,-5,-14,-1,-15,-9,10,-14,-4,-1,3,2,-14,-24,-5,-5;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-19,-18,-9,-8,-15,-14,-5,-8,-3,-1,-11,-11,-7,-9,-2,-2,-3,-20,-8,-9;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-19,3,3,-23,-7,-5,-18,-3,-19,-13,7,-12,3,-6,10,2,-14,-30,-16,2;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-23,8,6,-18,-10,-3,-18,-5,-10,-10,3,-15,-2,-7,-2,-5,-16,-29,-13,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=20,-19,-10,-23,-18,-9,-15,-23,9,-15,1,0,-18,-18,-18,-18,1,1,22,-25,-14,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-19,8,5,-18,-11,-4,-16,-1,-15,-11,14,-11,0,-2,4,4,-15,-28,-14,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-19,4,1,-19,-2,-4,-19,-2,-17,-12,6,-7,-2,-1,4,1,-16,-25,-14,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-6,15,-19,8,0,-15,-4,0,-15,-1,-17,-12,22,-15,-1,-3,3,-3,-17,-26,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,7,-32,-22,26,-29,42,21,-28,-28,-20,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-39,-12,-2,-28,-20,-20,-17,-11,-27,-18,-20,82,-11,-20,-10,-10,-27,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-22,-1,-1,-23,1,-11,-21,-8,-21,-15,1,1,-4,-10,9,0,-17,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-34,-11,-3,-24,-16,-14,-18,-11,-26,-17,-16,62,-10,-18,-6,-7,-23,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-19,-3,-5,-1,-13,-9,-15,-7,-15,-12,9,-15,-8,-4,6,7,-13,-25,-7,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-4,1,-21,0,-1,-6,-15,-10,-10,-10,-9,-7,0,-15,-7,-11,0,-3,-9,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-1,11,-17,7,-1,-21,-6,-8,-20,-6,-24,-17,15,-8,-3,-8,19,17,-15,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-18,-32,-26,8,-30,-25,25,-25,23,14,-27,-27,-24,-22,-19,-6,25,-18,-2,-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,12,-20,13,6,-25,-9,-8,-21,-3,-23,-18,10,-6,0,-8,14,7,-16,-34,-18,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,0,-22,-2,2,-21,-14,-6,-13,0,-16,-8,2,-13,9,-3,4,4,-11,-27,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-21,-27,-18,0,-27,-19,18,-23,26,16,-21,-23,-12,-18,-17,-4,11,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-16,-25,-22,-14,-8,-27,-16,14,-10,8,8,-11,-19,-7,-11,-12,-5,7,-22,-5,-13;
MA   /M: SY='S'; M=5,2,-19,0,4,-23,-8,-8,-19,0,-19,-12,3,-11,7,-3,11,4,-14,-28,-16,6;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-23,-10,-6,-11,-21,-10,-6,2,-1,1,-6,-18,-2,2,-9,-3,-6,-21,-4,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,90,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-20,-5,1,-22,-6,-10,-18,5,-19,-10,0,-13,2,0,6,-1,-12,-25,-14,1;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-19,2,3,-20,-8,-5,-20,2,-23,-15,12,-13,5,1,13,3,-16,-30,-16,4;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-26,-8,-1,-18,-21,-3,-13,14,-15,-4,0,-17,6,15,-7,-7,-10,-22,-6,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-6,-16,-29,57,-17,-37,-14,-30,-19,5,-19,-16,-15,0,-17,-29,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-22,17,-30,-19,19,-29,42,21,-28,-29,-21,-20,-28,-10,10,-16,4,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-6,26,-18,22,3,-23,-5,-2,-23,-3,-27,-21,28,-14,-1,-6,17,10,-20,-38,-19,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-18,-19,-13,-8,-25,-19,8,-13,5,4,-16,-16,-11,-11,-6,5,13,-26,-9,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-25,-3,7,-19,-19,-2,-18,8,-15,-8,0,-8,8,9,-2,0,-16,-25,-10,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-29,57,24,-37,-9,-1,-37,1,-28,-27,15,-9,2,-9,1,-9,-29,-37,-20,13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-28,-19,3,-24,-13,17,-20,30,30,-23,-24,-12,-16,-19,-5,11,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-12,-30,-29,-1,-30,-30,30,-21,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,0,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-11,-20,-14,-13,-10,-21,-1,-14,-2,-5,-13,-15,-13,-18,6,6,8,-24,-15,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-10,-13,-11,-8,-10,-10,-14,-5,-15,-9,-6,-2,-16,-7,-14,19,10,0,-33,-13,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-16,-15,-12,-23,20,-19,-20,-13,-18,-14,-5,-13,-12,-19,11,-3,-10,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,110,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,40,65,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-37,-29,9,-36,-27,39,-28,21,19,-22,-23,-22,-26,-20,-9,27,-18,2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-15,-22,-20,-12,6,-24,-14,-3,-3,-5,-1,-9,-20,-8,2,-8,-2,1,-16,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-12,-12,-9,-18,0,-17,-13,-11,-16,-13,-1,-12,-9,-15,18,13,-3,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-28,-2,2,-24,-14,53,-28,-1,-21,-4,6,-17,14,9,-4,-14,-26,-27,4,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-20,-10,-9,-12,-1,-14,-14,-6,-16,-10,-1,-12,-8,-7,5,2,-8,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-19,-10,-5,1,-17,-11,-8,-7,-7,-7,-1,-18,-9,-7,1,3,-6,-22,-3,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-37,-29,46,-31,-22,15,-27,14,9,-22,-28,-32,-21,-19,-8,14,-5,15,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-20,-11,-6,-11,-16,-10,-9,1,-10,-2,-1,-18,-2,6,0,2,-4,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-24,17,3,-25,-2,4,-26,-1,-27,-18,20,-12,2,-4,7,-3,-24,-32,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23,14,-32,-22,25,-30,38,18,-27,-28,-22,-22,-26,-10,15,-18,2,-23;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-25,-16,-15,22,-26,12,-4,-9,-2,-1,-14,-25,-9,-8,-14,-8,-9,11,48,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-8,25,-17,14,1,-17,0,4,-17,1,-22,-15,35,-13,0,0,5,-1,-22,-29,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-12,-20,-17,-14,30,-20,-8,-7,-16,-2,-5,-8,-12,-17,-12,-10,-7,-8,-3,14,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-16,2,2,-16,-8,-5,-17,0,-20,-13,13,-10,2,-1,13,10,-14,-28,-13,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-20,-7,-9,-20,13,-13,-18,-6,-18,-11,2,-10,-8,-9,3,-2,-13,-23,-18,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-14,-5,-6,-11,-6,-12,-12,-3,-12,-8,1,-9,-6,-4,6,13,-6,-21,-10,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-20,-2,-6,-20,20,-5,-22,-6,-19,-11,6,-11,-3,-6,2,-6,-19,-19,-16,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-19,4,2,-17,-7,-5,-16,4,-15,-10,7,-8,1,2,1,-2,-14,-23,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-23,-8,-1,-18,-12,-12,-9,-7,-16,-10,-8,26,-3,-12,-1,-3,-12,-23,-17,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-27,53,14,-33,-10,-2,-33,-3,-26,-25,17,-10,-2,-10,2,-7,-25,-37,-18,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-34,-11,-2,-24,-21,-17,-12,-9,-22,-13,-15,55,-8,-16,-8,-7,-19,-29,-23,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,4,-15,0,0,-18,-7,-12,-17,-6,-19,-15,6,-6,-4,-9,18,21,-10,-31,-16,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-20,-27,-19,3,-25,-14,20,-20,28,25,-22,-23,-12,-17,-20,-8,11,-18,1,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-12,38,-24,37,13,-29,-6,4,-29,1,-29,-24,35,-14,2,-4,7,-4,-28,-39,-20,7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-28,-7,1,-25,-16,-12,-18,-2,-23,-14,-7,32,0,-8,0,-1,-20,-28,-19,-2;
MA   /M: SY='S'; M=0,0,-19,-1,2,-18,-8,-10,-21,1,-21,-14,2,-12,-1,2,12,9,-13,-27,-13,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-24,-29,-23,44,-30,-1,3,-21,12,3,-21,-29,-23,-15,-21,-10,-3,11,44,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-18,-14,-23,-15,-7,-15,-20,3,-14,8,1,-18,-20,-14,-15,-5,-3,9,-21,-10,-14;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-20,-7,-1,-20,-12,-12,-12,-5,-14,-9,-3,-4,1,-7,6,3,-9,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-22,-3,8,-14,-17,-4,-16,0,-14,-9,1,-13,5,-1,4,4,-14,-24,-7,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-19,7,-29,-18,18,-25,43,20,-27,-29,-17,-15,-28,-10,9,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-6,5,-24,-20,-5,-22,24,-18,-6,-2,-15,13,31,-7,-7,-17,-22,-10,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,0,-24,-2,2,-23,-12,-3,-22,13,-20,-9,3,-15,7,16,-1,-3,-16,-24,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-22,-11,-2,-18,-18,-10,-11,6,-7,-2,-6,-16,5,7,-4,-1,-8,-23,-10,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-32,-8,0,-25,-16,-16,-18,-4,-25,-16,-14,59,-6,-12,-5,-7,-23,-26,-24,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-1,-22,-2,2,-16,-13,-6,-15,1,-15,-9,1,-1,5,1,0,-3,-15,-19,-11,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-11,-7,-4,-5,-7,-5,-9,-4,-10,-7,-1,-7,-3,-2,7,4,-5,-15,-4,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-4,-5,-11,-6,-8,-8,-7,-10,-7,3,-9,-5,-7,9,10,-3,-22,-10,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-4,1,-19,0,-2,-17,-1,-8,-13,-5,-16,-11,5,2,-4,-7,2,-2,-13,-23,-16,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-17,-1,-7,-18,25,-11,-21,-10,-18,-13,1,-6,-9,-11,4,-7,-16,-18,-17,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-26,26,6,-30,1,-4,-30,-1,-27,-20,15,-6,1,-6,4,-6,-25,-32,-20,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-22,3,0,-19,-9,-11,-16,-7,-18,-13,3,1,-4,-11,4,2,-14,-28,-16,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-16,-4,-6,-18,-8,-11,-12,-5,-16,-10,4,-14,-3,-3,10,9,-6,-28,-15,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-19,-14,-10,-9,-14,-15,0,-10,-5,-2,-4,-12,-10,-12,-1,3,2,-25,-11,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='L'; M=2,-16,-18,-19,-13,-5,-19,-14,3,-10,7,3,-14,-19,-9,-5,-6,-1,4,-19,-4,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='V'; M=5,-13,-14,-15,-16,-7,-18,-20,8,-16,2,0,-14,-19,-17,-17,-2,2,16,-25,-10,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,4,-26,3,3,-12,-14,-5,-17,-4,-18,-13,5,-1,-1,-5,-3,-7,-19,-23,-9,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-20,-19,-16,4,-21,-11,10,-17,18,15,-7,-22,-13,-13,-15,-7,2,-23,-4,-14; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,45,-28,63,18,-37,-9,0,-37,0,-27,-27,18,-10,0,-10,0,-9,-27,-37,-19,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-24,-15,-8,-12,-20,-15,-2,-10,-5,-4,-12,10,-7,-8,-7,-3,-4,-20,-11,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-19,-11,-10,-13,6,-15,-13,-9,-13,-7,-4,-16,-11,-7,2,0,-5,-23,-14,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-11,-6,-7,-15,-9,-16,-15,-10,-18,-14,4,-10,-7,-10,27,36,-5,-33,-15,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-30,-7,-1,-23,-12,-15,-19,-8,-26,-17,-8,43,-7,-12,0,-4,-21,-29,-23,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,4,-21,1,-3,-12,-9,-6,-15,-4,-13,-8,6,-17,-5,-3,0,-2,-12,-26,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-18,-11,-8,-14,-19,-15,-6,0,-9,-5,-6,-17,-5,1,3,10,2,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-39,-30,71,-30,-20,3,-29,11,2,-21,-30,-38,-20,-20,-10,3,8,26,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-29,65,18,-39,-9,-1,-39,-1,-29,-29,19,-10,-1,-10,1,-8,-29,-39,-20,8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,24,-19,10,-1,-17,-5,3,-17,-3,-22,-16,38,-18,-2,-2,10,6,-21,-36,-17,-2;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-20,-6,-2,-20,-8,-2,-13,-3,-16,-3,4,-14,6,-4,8,1,-11,-28,-12,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-29,-24,-22,33,-31,11,5,-14,3,2,-20,-29,-14,-13,-20,-10,-5,23,67,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-25,-29,-24,49,-30,2,1,-19,7,1,-21,-30,-23,-15,-21,-10,-5,19,56,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-25,-5,1,-23,-17,-7,-18,19,-20,-7,0,-15,6,17,-4,-4,-11,-24,-11,2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-22,12,3,-21,-7,3,-18,0,-20,-13,32,-18,4,2,3,-3,-23,-33,-16,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-21,-32,-23,6,-31,-23,26,-28,37,19,-27,-27,-21,-22,-24,-9,19,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-24,-17,-7,-13,-22,-11,0,-1,4,9,-13,-17,2,0,-12,-7,-2,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,5,-23,3,9,-25,-13,-1,-21,8,-21,-11,7,-12,12,7,5,-1,-18,-26,-14,10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,2,-27,-2,-6,-24,19,5,-30,-2,-26,-14,13,-19,-2,3,0,-12,-27,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-28,-6,3,-19,-20,-5,-21,26,-16,-4,-1,-16,6,30,-10,-9,-16,-20,-7,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-28,61,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,2,-17,-26,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-29,-22,7,-30,-22,23,-27,37,17,-27,-29,-22,-20,-24,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-21,-33,-23,27,-31,-20,17,-30,37,16,-26,-29,-25,-21,-26,-10,9,-12,8,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-22,-3,7,-21,-15,-2,-16,-1,-14,-8,1,-12,13,2,4,3,-15,-26,-12,9;
MA   /M: SY='S'; M=6,-6,-13,-8,-7,-15,-9,-15,-6,-13,-19,-12,2,-13,-6,-13,27,17,1,-36,-16,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,2,-26,2,14,-32,-16,15,-21,3,-20,-5,3,-11,35,2,4,-7,-25,-25,-9,24;
MA   /M: SY='A'; M=5,-8,-20,-10,0,-17,-14,-15,-3,-7,-8,-5,-8,-15,-4,-10,-1,-2,2,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-30,-20,22,-30,47,21,-29,-29,-20,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-24,-22,-31,-23,29,-20,-16,2,-22,9,4,-20,-25,-23,-18,-16,-8,0,6,15,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-18,-3,-3,-15,-9,-8,-15,-5,-16,-11,4,-14,-4,-6,10,11,-10,-29,-12,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-24,41,11,-31,-6,-2,-31,-2,-28,-24,21,-12,0,-8,8,-1,-24,-38,-19,5;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-29,3,1,-25,-7,-11,-20,-5,-21,-15,-1,20,-5,-10,-3,-8,-21,-29,-21,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-22,-2,3,-17,-13,-6,-19,6,-16,-11,0,-12,1,17,1,-2,-13,-25,-12,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='T'; M=7,-2,-11,-10,-8,-13,-11,-18,-12,-10,-12,-10,-1,-10,-9,-11,18,34,-3,-28,-13,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-24,-3,3,-21,-11,-6,-23,18,-18,-10,0,-14,6,27,-3,-6,-16,-21,-12,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='P'; M=2,-6,-23,-7,-1,-22,-7,-12,-17,-4,-22,-13,-3,12,-2,-9,6,1,-16,-24,-17,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-24,-24,-30,-22,12,-30,-18,20,-23,18,13,-20,-23,-17,-19,-18,-5,10,-9,9,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-10,-27,-26,-1,-26,-27,24,-19,10,8,-26,-27,-26,-19,-8,1,40,-28,-10,-26; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-23,5,9,-21,-10,-6,-19,6,-18,-12,6,-12,4,3,1,-3,-16,-24,-14,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-19,-3,4,-14,-11,-9,-12,-1,-6,-6,-5,-12,0,-3,-1,-3,-10,-21,-10,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-24,-25,-21,29,-25,-1,3,-16,7,5,-17,-26,-16,-13,-19,-10,-4,14,38,-19; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-14,-14,-6,-19,-2,-15,-13,-8,-14,-10,-5,-7,-6,-13,11,1,-6,-23,-18,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,1,7,-18,-10,-5,-19,1,-19,-13,6,-11,3,1,6,0,-16,-27,-13,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-24,26,3,-25,1,-1,-27,-5,-27,-22,24,-10,-4,-9,7,-3,-24,-36,-20,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-26,-2,8,-21,-10,-3,-20,0,-20,-10,3,-3,14,-1,0,-6,-22,-24,-14,11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-22,3,7,-21,-8,-8,-19,-3,-17,-12,2,-10,4,-6,5,1,-16,-27,-14,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-20,-10,-3,-10,-17,-11,-7,-5,-1,-3,-8,-16,-6,-4,-4,-1,-5,-21,-6,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-14,-23,-21,-15,31,-20,-9,-10,-12,-2,-5,-6,-24,-19,-3,-12,-9,-9,-7,11,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,3,-25,3,11,-23,-16,-5,-21,12,-20,-11,3,-13,9,13,-1,-5,-17,-25,-12,9;
MA   /M: SY='D'; M=3,11,-23,15,14,-29,-11,-4,-24,2,-20,-16,4,-10,11,-2,4,-5,-20,-27,-16,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-21,-40,-30,78,-30,-20,-1,-30,9,-1,-21,-30,-39,-20,-21,-11,-1,14,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=22,-11,-14,-17,-13,-17,-1,-20,-7,-13,-11,-8,-8,-14,-12,-17,10,5,3,-25,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-23,-2,6,-22,-17,-8,-17,11,-16,-8,-2,-14,5,12,-3,-5,-12,-26,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-11,-11,-6,-20,3,-16,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-6,-16,22,8,-5,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-31,-22,5,-23,-5,21,-13,20,51,-20,-21,-5,-13,-20,-10,12,-18,2,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-17,-20,-20,-12,-9,-27,-19,15,-13,3,5,-14,-20,-9,-12,-7,-1,17,-26,-9,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-29,-2,7,-27,-20,-9,-26,41,-26,-9,2,-12,8,29,-10,-9,-18,-21,-10,7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-8,20,-17,30,45,-24,-24,-8,-14,-23,-10,11,-20,0,-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-14,-26,46,-17,-32,-17,-29,-19,3,-17,-14,-17,12,-7,-22,-27,-26,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-21,5,4,-19,-9,-3,-20,2,-19,-13,15,-15,3,6,6,0,-18,-30,-15,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-23,-31,-26,3,-33,-22,31,-22,14,14,-19,-23,-20,-22,-16,-5,25,-20,2,-25;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,6,-23,4,-2,-26,20,-8,-29,-3,-27,-17,12,-15,-3,-3,7,-6,-24,-27,-21,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-18,-24,-21,-7,-27,-26,18,-18,1,3,-25,-1,-23,-20,-10,-2,26,-28,-14,-24; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-22,-17,-8,-6,-24,-14,2,-2,17,8,-15,-21,-6,-1,-19,-8,-1,-20,-4,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-10,-10,-10,-16,-18,-8,-10,-9,-9,-1,-11,-10,-9,16,38,1,-28,-10,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-6,-13,-30,56,-18,-38,-13,-30,-20,1,-18,-15,-15,1,-17,-29,-22,-28,-14;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-20,2,2,-18,-12,-9,-19,3,-20,-14,6,-11,0,3,9,6,-14,-29,-14,0;
MA   /M: SY='B'; M=-3,11,-23,11,10,-26,-10,-3,-22,3,-20,-14,10,-11,9,1,4,-3,-20,-30,-16,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-19,-30,68,-19,-39,-20,-30,-20,1,-20,-19,-20,1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,15,48,-29,-20,-1,-25,8,-18,-16,1,-4,20,0,0,-9,-25,-30,-18,34;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-26,-8,1,-19,-19,-6,-23,22,-17,-8,-2,-16,7,36,-5,-3,-15,-22,-10,2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,14,-22,12,-1,-21,-13,-4,-14,0,-19,-13,17,-18,-2,2,3,-1,-11,-34,-15,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-9,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-24,2,1,-23,-6,-4,-28,10,-25,-16,6,-16,3,27,7,-2,-19,-28,-16,0;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-18,-18,-11,-4,-17,-10,-6,-3,-6,-2,-11,-19,-9,-1,-4,-4,2,-19,-5,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-17,-29,-24,11,-27,-24,16,-20,5,4,-21,-18,-25,-19,-9,0,22,-19,-2,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-17,17,-1,-20,-1,7,-20,-2,-26,-18,51,-21,-2,-1,7,-2,-28,-39,-20,-2;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00394;
//
ID   PEROXIDASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00436;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Peroxidases active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4515027; R2=0.0084769; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=714; N_SCORE=7.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=596; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-41; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='V'; M=-19,-70,-81,-74,-53,-81,-76,52,-7,-3,58,-74,-75,-69,-41,-67,-55,72,-80,-59;
MA   /M: SY='R'; M=9,3,-36,-34,-71,-32,-60,-43,35,-28,-1,-54,-68,-7,69,-12,44,-29,-78,-64;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-73,39,17,-78,-11,-18,-76,37,-76,-68,17,-33,14,21,36,32,-71,-82,-67;
MA   /M: SY='S'; M=0,-68,-37,-14,-36,-31,-22,-11,-38,-7,-54,-15,-69,11,6,47,28,42,-81,-63;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-72,34,0,-58,-78,-71,40,-30,14,13,-37,11,-65,-70,-44,-22,59,-82,-62;
MA   /M: SY='W'; M=-33,-79,6,13,-10,-49,-62,-31,21,-67,-24,-17,-69,50,43,-26,14,-8,98,-54;
MA   /M: SY='W'; M=-23,-24,23,8,-71,-14,-59,-75,1,-75,-68,44,-6,53,-2,15,3,-52,98,-59;
MA   /M: SY='P'; M=39,-73,-10,7,-41,-14,38,-31,10,-24,-61,28,48,-55,-3,-36,-22,-22,-5,-32;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-87,-97,-104,-96,28,-106,-95,13,-95,-7,-26,-98,-103,11,-95,-59,-51,25,-7,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-23,-98,-16,-50,-97,-43,-6,-17,7,-52,-85,15,-94,-5,7,-7,-31,-59,-105,-89; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-14,-95,-79,-33,-99,-84,-81,-94,2,-70,-89,21,-92,-5,7,33,-29,-44,-106,-91; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-99,53,19,-106,-60,-81,-100,-77,-101,-96,1,-89,-5,-85,-50,5,-63,-114,-95; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-33,-107,-91,-81,-32,-93,-92,-59,-23,-98,-90,-91,78,-85,5,-38,-32,-44,-101,-95; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-57,-96,-87,-83,-97,-31,-85,-59,-66,-94,-88,-77,-93,-75,54,11,36,-42,-105,-90; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-44,-94,-98,-96,-77,-100,-91,16,-58,12,59,-13,-98,-89,-94,-56,5,-23,-102,-82; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=75,-66,-66,-65,-76,57,-70,-68,-65,-71,-64,-57,-67,-62,-70,-30,10,-21,-76,-72;
MA   /M: SY='P'; M=62,-74,-66,-59,-79,17,37,-70,-63,-74,-65,-63,86,-62,-43,-51,-57,-33,-78,-72;
MA   /M: SY='S'; M=24,-70,-65,5,-37,4,-67,0,4,24,-52,-62,11,-59,-64,40,-53,21,-77,-64;
MA   /M: SY='L'; M=-25,-70,-47,-75,48,-80,-70,37,-74,54,38,-73,-77,-71,-74,-20,9,5,-67,-48;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-72,-85,-79,-45,-87,-76,70,-78,63,6,-80,-79,-73,-78,-75,-60,20,-74,-55;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='M'; M=-65,-69,-84,-76,-44,-83,-64,-6,-74,75,97,-79,-79,-66,-71,-75,-62,-39,-72,-52;
MA   /M: SY='H'; M=51,-70,-66,-61,49,-64,94,-41,-63,-27,-54,-57,-71,8,-62,-15,-13,-6,-72,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-80,-93,-82,104,-79,-77,-56,-76,-49,-57,-83,-84,-83,-76,-77,-74,-63,134,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='D'; M=6,14,102,-39,-83,-21,-57,-81,-57,-81,-78,-40,-67,-55,-64,35,-34,-75,-95,-70;
MA   /M: SY='C'; M=50,130,-73,-70,-73,-63,-74,-73,-69,-69,-67,-62,-79,-70,-75,22,-55,-61,-90,-77;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-73,-78,-80,94,57,-70,14,-75,-51,-21,-65,-77,-78,-76,-63,-66,-40,-54,-37;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-65,-70,-68,-61,-36,-76,-14,-66,-39,-50,-62,-19,-68,-71,-14,70,73,-86,-64;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-79,-10,7,17,-71,-17,2,-23,-47,-57,46,-74,46,25,-59,-39,-64,39,79; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-76,41,-39,-81,78,-62,-86,-55,-83,-74,-2,-68,-57,38,19,-60,-80,-79,-72;
MA   /M: SY='C'; M=-16,129,-75,-70,-68,-74,-76,16,13,-37,-60,-65,17,-37,-70,-18,-37,-12,-89,-74;
MA   /M: SY='D'; M=5,-76,93,6,-12,-45,13,-35,-7,-56,-70,-24,-67,-12,-60,-7,-12,-70,-84,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=51,-92,-91,-90,-104,40,-95,-99,-57,-99,-91,-82,-92,-87,-94,-70,-83,-88,-100,-99; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-67,-90,-81,-83,-100,-26,-85,-100,-83,-103,-96,-70,-89,-75,-87,81,-62,-92,-107,-92; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-85,-97,-111,-106,-75,-113,-108,42,-103,3,-63,-105,-104,-102,-104,-97,-82,45,-105,-84; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-93,-95,-111,-103,-39,-112,-94,-58,-104,64,-21,-109,-110,-97,-101,-103,-89,-66,-96,-78; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-63,-72,58,-60,-54,-76,-66,36,-68,55,14,-60,-40,-65,-71,-11,15,-22,-80,-59;
MA   /M: SY='D'; M=-3,-75,69,14,-82,37,-20,-81,11,-80,-73,34,-66,-11,-11,11,-36,-76,-85,-70;
MA   /M: SY='T'; M=11,-70,18,-24,-73,13,-21,-72,-22,-55,-66,13,-18,-53,38,36,55,-65,-81,-33;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-72,-21,-26,-44,62,-24,-49,-16,-73,-26,-29,4,16,-25,-5,58,-67,-78,-69;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-75,-83,102,-71,-90,-28,-86,-75,-50,-68,-66,-74,-49,-68,-84,-74,-77;
MA   /M: SY='S'; M=51,-70,-62,-56,-76,-9,-64,-9,18,-71,-64,-55,49,12,-59,56,-49,-61,-77,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-72,-17,-67,66,39,-55,-66,-60,-36,-62,76,-75,-62,-22,-4,-57,-68,-62,31;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-76,-19,-26,1,87,-66,-82,-61,-78,-70,-11,-68,12,-2,-50,-2,-77,-73,-69;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00394;
//
ID   CATALASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00437;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Catalase proximal heme-ligand signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1169605; R2=0.0124484; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=758; N_SCORE=13.543; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=192; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-16,-31,-24,3,-31,-23,25,-23,18,17,-21,-24,-20,-21,-15,0,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-13,-29,-28,-2,-30,-29,28,-20,9,9,-29,-22,-28,-21,-11,-1,43,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-15,-38,-6,1,-29,-19,-17,-21,-7,-29,-20,-15,76,-8,-13,-9,-10,-29,-30,-28,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-30,-11,-20,-25,61,-17,-37,-19,-27,-18,-2,-21,-19,-19,-2,-19,-28,-16,-21,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-35,-26,0,-35,-25,38,-25,20,20,-22,-23,-18,-24,-19,-8,28,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-29,20,14,-23,2,-2,-30,-3,-22,-19,3,-13,-1,-9,-3,-12,-26,-22,-8,6;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-24,-27,-19,26,-25,-15,-3,-20,-1,-4,-20,2,-24,-19,-15,-9,-6,-5,13,-21;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,10,-30,16,12,-30,-13,-8,-25,-3,-26,-21,5,27,-2,-12,-1,-7,-27,-33,-24,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-8,-33,-5,5,-28,-19,-11,-26,25,-28,-14,-6,21,3,20,-9,-9,-23,-24,-17,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-18,-30,-22,4,-26,-13,22,-20,30,36,-26,-26,-13,-16,-22,-8,17,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,12,-30,-20,19,-30,49,19,-30,-30,-21,-20,-30,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,-1,18,-38,-20,10,-18,8,-17,1,-1,-11,56,9,-1,-10,-28,-20,-9,37;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-22,-12,-17,-24,41,-20,-28,-17,-22,-16,-3,-18,-17,-19,4,-7,-18,-23,-25,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-19,-25,-20,2,-27,-20,18,-24,27,13,-18,-25,-18,-19,-17,-4,13,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=19,-4,-13,-6,-4,-21,1,-13,-18,-10,-24,-17,3,-5,-4,-14,27,11,-9,-33,-21,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-19,-14,-8,-16,-4,-8,-14,-12,-12,-9,-7,-3,-8,-15,5,1,-10,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=16,-3,-10,-13,-10,-13,-13,-20,-10,-10,-11,-10,-3,-10,-10,-13,18,33,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-33,-20,41,-24,3,-20,0,3,-13,42,6,-3,-13,-30,-24,0,26;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-17,-28,-18,-8,-9,-24,-7,-10,10,-1,1,-9,-22,0,38,-15,-10,-8,-19,-6,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-8,-28,-9,-9,2,-22,43,-13,-8,-12,-2,-2,-23,-1,-5,-9,-10,-17,-5,38,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-29,-21,7,-30,-16,20,-27,39,17,-28,-29,-20,-19,-25,-9,15,-22,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=8,-15,-23,-15,-8,-19,-16,-20,-8,-11,-15,-11,-15,31,-12,-18,0,3,-7,-26,-20,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-21,17,-1,-19,-3,15,-19,-2,-28,-17,54,-20,0,-1,8,-2,-28,-39,-16,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-27,-23,-21,31,-25,14,-4,-16,0,0,-17,-28,-17,-13,-18,-11,-8,14,48,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-7,-25,-8,2,-11,-22,8,-9,-10,1,0,-6,-17,3,-6,-10,-5,-13,-19,-2,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-28,0,19,-32,-20,13,-19,4,-14,-1,-2,-11,40,4,-2,-10,-25,-23,-8,29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,88,-10,-20,-10,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-16,-33,-29,-1,-32,-30,34,-23,12,12,-26,-26,-26,-23,-12,-3,42,-26,-7,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00395;
//
ID   CATALASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00438;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Catalase proximal active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0607061; R2=0.0146532; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=590; N_SCORE=13.696; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-33,-11,-2,-27,-16,-19,-18,-10,-27,-18,-16,67,-9,-19,-3,-4,-24,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-16,-24,-19,-2,-26,-22,15,-20,14,8,-16,-21,-17,-18,-5,11,16,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-29,-20,9,-30,-20,19,-29,46,18,-29,-29,-20,-20,-27,-7,11,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-21,7,-30,-20,22,-28,42,21,-28,-28,-19,-20,-27,-9,13,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,5,-30,10,36,-35,-20,10,-25,9,-20,-9,1,-6,40,5,0,-10,-30,-25,-13,38;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,0,-39,0,-30,-29,21,-10,0,-10,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-28,-22,25,-30,-9,10,-20,7,4,-19,-24,-20,-17,-15,-5,7,-3,24,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-7,-27,-10,-8,-11,-20,23,-8,-13,-10,-2,0,-20,0,-9,-8,-11,-12,-12,5,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-28,-15,24,-27,-18,7,-24,27,9,-23,-26,-21,-18,-21,-9,3,-12,6,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-22,-27,-26,-17,-2,-27,-18,8,-12,13,6,-17,-24,-12,1,-19,-8,3,-6,-1,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,28,47,-33,-18,1,-31,8,-22,-20,4,-3,20,-1,0,-10,-30,-31,-19,34;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-27,0,11,-25,-19,-9,-23,30,-22,-10,1,-11,7,19,-5,-5,-17,-24,-11,9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-32,-24,3,-33,-18,30,-27,29,21,-24,-25,-18,-22,-22,-9,20,-22,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-16,-17,-7,-7,-12,-9,-11,-9,-10,-5,-7,-14,1,-12,5,2,-7,-18,-8,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-27,-1,0,-20,-17,49,-28,2,-20,-6,7,-18,7,17,-4,-10,-23,-28,4,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,77,-30,-20,2,-30,10,1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,1,9,29,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-25,47,11,-32,-9,-2,-30,-2,-26,-24,22,-12,-2,-9,3,-2,-23,-38,-19,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,31,-30,18,-20,-7,3,-20,10,49,-10,-13,-23,-23,-1,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-29,13,49,-25,-21,-2,-23,5,-12,-13,-4,-4,15,-2,-4,-10,-24,-29,-17,32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-28,-5,4,-20,-18,-1,-25,22,-19,-11,5,-19,7,49,-7,-8,-17,-24,-12,2;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-24,-36,-28,-2,-34,-29,41,-26,15,15,-21,-21,-21,-27,-15,-7,31,-22,-4,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-37,-12,-3,-27,-21,-21,-15,-11,-26,-17,-21,77,-12,-20,-10,-9,-22,-30,-28,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,58,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,22,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-14,-24,-21,-7,-23,-22,14,-11,1,3,-18,-24,-19,-7,-6,-2,28,-27,-12,-21;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-13,-27,-25,-5,-26,-26,21,-17,5,9,-27,-16,-24,-19,-9,-2,35,-28,-12,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-9,-10,-10,-10,-10,-10,-18,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-28,-8,2,-23,-18,0,-28,30,-22,-10,0,-16,8,47,-8,-10,-19,-20,-9,2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-12,-13,-9,-14,-1,-16,-14,-11,-15,-13,-3,-12,-9,-15,17,13,-5,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=8,-8,-24,-10,-16,-27,49,-19,-33,-17,-27,-18,0,-17,-16,-18,7,-10,-23,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-4,-21,-13,-18,-4,-21,-8,-12,-9,-9,-12,-13,-13,-20,7,0,4,-22,-20,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-12,-27,-15,-10,13,-22,31,-17,-5,-10,-2,-6,-23,-7,0,-14,-14,-17,-6,27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-30,-11,-20,-28,66,-20,-37,-20,-26,-18,-1,-20,-20,-20,-1,-20,-28,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-10,-21,-14,-6,12,-22,-4,-9,-8,-6,-6,-9,-19,-11,-9,-5,3,-7,-6,18,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-22,1,22,-21,-22,-9,-14,2,-11,-10,-6,-9,7,-3,1,4,-10,-28,-14,15;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-10,-22,-19,-7,-20,-24,11,-17,2,1,-19,-18,-20,-18,0,4,23,-29,-13,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-7,-19,-12,-10,-1,-22,-6,-11,-3,-10,-8,-5,-17,-7,0,5,22,-6,-12,15,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-28,13,11,-29,3,13,-32,0,-24,-16,6,-13,2,-2,-2,-13,-27,-28,-13,6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,37,-26,51,15,-35,-8,-3,-35,-2,-30,-27,18,-7,0,-10,8,-3,-26,-40,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-35,-27,9,-30,-22,21,-23,11,11,-24,-25,-21,-21,-21,-12,14,8,6,-24;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-12,-5,-3,-17,-7,-15,-16,-8,-20,-15,3,-10,-5,-10,25,26,-7,-33,-16,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,20,-26,23,8,-30,-7,2,-29,7,-26,-18,13,-10,1,-1,0,-8,-23,-31,-16,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-22,-24,-24,-17,10,-28,-7,12,-19,13,6,-20,-25,-13,-16,-16,-7,5,-3,24,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00395;
//
ID   ACYLTRANSF_C_1_MP; MATRIX.
AC   MP00439;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acyltransferases ChoActase / COT / CPT family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1037760; R2=0.0147270; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=481; N_SCORE=12.177; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=95; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-20,-20,-14,-3,-23,-16,7,-10,9,4,-16,-21,-12,-11,-9,-4,7,-20,0,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-16,-22,-15,6,-21,-18,3,-18,11,2,-15,-22,-16,-11,-5,3,5,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-21,1,1,-24,-7,-9,-20,-2,-23,-10,1,2,3,-6,13,6,-15,-31,-17,1;
MA   /M: SY='N'; M=-2,5,-24,5,5,-26,2,1,-29,6,-26,-16,7,-13,1,1,5,-6,-22,-28,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-22,-16,-6,-7,-22,-13,-4,0,-3,2,-11,-19,-6,8,-7,-4,1,-22,-7,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-27,-4,6,-24,-16,2,-18,1,-23,-12,-2,10,5,-1,4,-3,-18,-29,-14,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-23,-7,-2,-20,6,-14,-16,-9,-18,-12,-9,19,-9,-13,-3,-9,-15,-20,-20,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-25,-1,-3,-17,-15,-3,-14,6,-13,0,2,-8,2,17,-5,-6,-13,-25,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-16,-8,-6,2,-20,-15,-5,-15,5,-3,-8,-16,-12,-12,-2,11,-3,-22,-4,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-15,-12,-23,-18,32,-23,-8,-5,-13,-1,1,-9,-24,-17,-10,-14,-8,-7,-2,19,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-6,-22,-7,1,-19,-5,-3,-20,-1,-18,-11,-3,-13,4,-4,3,-5,-16,-10,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-25,-16,-10,23,-24,22,-10,-10,-5,-2,-10,-23,-10,-7,-15,-11,-13,4,37,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-27,1,20,-32,-19,3,-17,6,-17,-4,-4,-1,37,3,-1,-9,-23,-22,-12,28; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-25,20,12,-26,-16,-7,-24,-1,-18,-17,4,-3,2,-3,3,5,-19,-32,-16,6;
MA   /M: SY='S'; M=11,7,-16,6,5,-23,-5,-9,-20,-5,-22,-17,8,-10,1,-10,19,8,-13,-32,-19,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-5,-30,-19,-18,82,-8,-16,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-28,-4,4,-25,-18,-2,-28,31,-26,-11,1,-11,8,37,-4,-7,-20,-23,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-22,-26,-16,2,-28,-18,14,-24,35,14,-27,-18,-14,-18,-24,-9,7,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-29,1,-32,-29,32,-22,15,12,-28,-28,-28,-22,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=6,-7,-23,-6,3,-24,-11,-14,-20,2,-25,-16,-4,17,-2,-5,9,3,-16,-29,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-18,-30,-21,7,-29,-22,20,-27,41,17,-29,-29,-21,-20,-25,-8,16,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-18,9,25,-33,-19,-2,-27,9,-23,-13,-1,-4,25,2,-1,-9,-27,-28,-17,25;
MA   /M: SY='D'; M=-2,17,-26,24,24,-33,-12,-2,-27,2,-22,-18,5,-7,15,-5,4,-7,-24,-30,-18,20;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-30,-22,5,-28,-20,23,-25,34,21,-27,-27,-19,-20,-23,-8,18,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,15,-25,17,7,-29,-11,3,-27,8,-24,-15,11,-13,8,7,2,-6,-22,-29,-14,7;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-2,-29,-1,3,-22,-20,0,-28,27,-22,-11,1,-16,7,41,-8,-6,-19,-20,-6,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,17,2,-12,4,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,26,73,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-28,-18,6,-30,-20,18,-23,41,18,-27,-28,-18,-17,-28,-10,9,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-27,7,28,-28,-17,-2,-24,12,-19,-13,1,-8,18,8,-1,-8,-23,-26,-16,23;
MA   /M: SY='S'; M=14,-7,-5,-11,-7,-15,-8,-12,-16,-8,-18,-14,-2,-14,-6,-8,17,11,-7,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-16,-27,-21,-2,-27,-21,20,-20,19,14,-25,-26,-16,-18,-14,-5,25,-24,-7,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-28,2,24,-29,-18,-2,-26,20,-21,-11,-1,-9,21,22,-3,-9,-23,-23,-14,21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-36,-11,-3,-26,-21,-10,-17,-11,-26,-16,-18,69,-10,-18,-10,-10,-23,-30,-24,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-34,-26,20,-32,-24,24,-29,30,15,-26,-28,-25,-22,-23,-9,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=2,-20,-10,-24,-17,-3,-23,-16,8,-18,12,7,-19,-23,-12,-17,-11,-2,8,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='B'; M=-8,14,-22,14,-1,-20,-8,-5,-19,-4,-23,-17,13,-9,-5,-8,6,2,-15,-30,-11,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-29,25,28,-33,-8,-4,-31,1,-24,-20,3,1,9,-7,0,-10,-28,-30,-21,18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-26,18,29,-29,-16,-3,-25,5,-20,-17,2,-7,12,1,2,-6,-21,-30,-18,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-29,10,26,-34,-10,0,-27,9,-22,-12,1,-8,27,2,0,-10,-27,-25,-16,27;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-24,-25,-21,28,-24,-8,-1,-19,6,-1,-15,-26,-20,-15,-16,-7,-6,13,28,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-25,-1,5,-9,-17,-2,-21,9,-17,-12,0,-16,2,13,-3,-6,-17,-16,2,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00402;
//
ID   ACYLTRANSF_C_2_MP; MATRIX.
AC   MP00440;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acyltransferases ChoActase / COT / CPT family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7165074; R2=0.0163488; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=396; N_SCORE=12.181; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-25,-22,-15,2,-26,-10,8,-18,11,8,-19,-10,-9,-16,-15,-7,-1,-13,9,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-6,0,-22,4,4,-17,-17,-5,-8,-11,-8,-8,-2,-15,-4,-12,3,-2,-5,-32,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-26,-3,14,-24,-19,8,-12,-3,-10,-3,-3,-12,20,-4,-1,-7,-17,-26,-8,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-15,-25,-17,-14,2,-25,-7,4,-7,5,2,-13,-17,-12,-8,-16,-8,0,-11,14,-15;
MA   /M: SY='S'; M=9,-11,-17,-14,-10,-10,-3,-16,-10,-16,-11,-10,-5,-9,-11,-16,12,3,-6,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-27,-7,1,-18,-15,10,-21,13,-14,-6,-4,-16,3,14,-9,-11,-17,-19,0,0;
MA   /M: SY='N'; M=4,9,-19,1,1,-23,-1,-4,-18,-2,-22,-11,16,-14,5,-5,11,2,-18,-30,-18,3;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-3,-24,-18,-3,-24,-9,8,-20,14,16,-17,-24,-13,-17,-12,-3,6,-27,-5,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-24,-26,-16,1,-27,-18,9,-22,26,10,-24,-25,-9,-16,-22,-7,0,-1,1,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-27,-9,-9,-14,-15,43,-18,-13,-16,-4,1,-20,-2,-8,-8,-9,-17,-12,8,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-28,61,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-13,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,15,-28,21,3,-29,1,1,-32,-2,-27,-20,11,-5,-3,-1,2,-6,-26,-32,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,14,-13,-18,-26,21,-20,-32,-20,-27,-20,-3,-10,-20,-21,-3,-14,-24,-32,-29,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-5,-12,-9,0,-13,-11,-1,-11,-3,-3,-6,-13,-7,-9,4,5,2,-17,-4,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-7,-12,-9,-8,-1,0,-3,-7,-9,-4,-4,-4,-12,-7,-8,0,1,-6,-8,3,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-19,18,-2,-20,-5,2,-16,-4,-24,-17,39,-19,-4,-5,8,0,-17,-39,-19,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,18,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,134,30,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-21,-25,-26,-23,41,-15,3,-8,-21,-1,-3,-14,-28,-24,-15,-16,-12,-10,8,35,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,44,-28,61,17,-38,-9,-2,-37,-1,-28,-28,17,-10,-1,-11,1,-9,-27,-38,-20,8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-29,-1,9,-29,-19,-11,-29,46,-29,-10,-1,-10,9,27,-9,-9,-19,-20,-11,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-12,-4,-4,-17,2,-12,-17,-10,-22,-16,4,-4,-4,-10,24,18,-10,-31,-17,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-23,-33,-25,28,-32,-16,18,-26,25,14,-24,-27,-23,-20,-24,-10,9,-6,19,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,10,-24,4,12,-29,-15,3,-19,4,-20,-8,14,-12,30,3,6,4,-24,-27,-13,21;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,33,-30,-20,13,-30,37,13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,7,-10,10,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-29,5,-35,-29,38,-27,18,15,-24,-25,-25,-25,-17,-7,34,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-14,-27,-24,-4,-26,-26,25,-20,5,7,-21,-24,-22,-21,-4,1,33,-29,-10,-24;
MA   /M: SY='F'; M=3,-13,-4,-21,-17,14,-14,-19,-11,-18,-8,-9,-8,-19,-20,-17,5,12,-3,-18,-3,-17;
MA   /M: SY='K'; M=6,-2,-22,-3,7,-25,-7,-11,-24,16,-24,-14,0,-10,3,7,6,0,-15,-25,-16,5;
MA   /M: SY='N'; M=-12,40,-23,35,6,-26,-3,5,-26,-1,-30,-23,44,-16,0,-4,9,-2,-29,-40,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-11,-17,-28,55,-20,-34,-18,-27,-18,-1,-18,-17,-20,3,-15,-24,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-20,-8,-3,-19,-19,-12,-8,6,-14,-5,-1,-15,3,1,4,6,-3,-27,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=3,-16,-2,-23,-18,3,-17,-18,-3,-20,3,-1,-12,-23,-17,-19,-6,-5,-2,-15,-6,-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-25,-13,-19,-25,48,-21,-28,-18,-23,-16,-4,-19,-19,-19,1,-11,-17,-22,-26,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-7,-32,-25,9,-30,-23,19,-26,20,13,-23,-27,-23,-22,-17,-7,17,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,-3,3,-12,-15,-10,-20,-4,-3,-17,-2,-3,5,-26,-13,-14,-7,-6,-4,-34,-11,-15;
MA   /M: SY='A'; M=4,-20,4,-27,-22,4,-15,-19,-8,-19,-7,-8,-17,-24,-20,-21,-8,-6,-3,-3,3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,35,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-29,0,0,-20,-19,92,-29,-10,-21,-1,10,-19,9,-1,-6,-17,-29,-31,17,0;
MA   /M: SY='S'; M=18,-5,-11,-11,-7,-11,-5,-15,-14,-11,-18,-14,0,-11,-7,-14,24,16,-5,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-18,-26,-19,-12,-13,-13,-21,-21,-9,-22,-17,-16,3,-11,-10,-8,-4,-20,23,-6,-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,-17,-7,-25,-19,7,-8,-16,-6,-17,-4,0,-14,-21,-18,-19,-4,-5,-1,-14,-2,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='G'; M=18,-10,-17,-14,-17,-26,41,-20,-29,-17,-22,-16,-4,-17,-17,-20,3,-12,-18,-21,-26,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-24,-17,-11,-14,-21,-12,1,-14,-9,2,-12,13,-9,-16,-1,2,-1,-29,-13,-13;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-19,-23,-18,-11,-23,-24,12,-17,-4,-1,-18,1,-18,-20,-3,1,16,-28,-14,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-16,-29,-25,-1,-29,-24,26,-21,13,14,-22,-24,-21,-20,-10,3,31,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-18,-26,-23,-5,-9,-24,11,-22,12,6,-22,-25,-22,-21,-12,-7,18,-24,-11,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-9,2,-24,-4,0,-17,-16,18,-22,5,-19,-8,10,-17,9,14,-1,-4,-21,-25,-4,3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-15,-33,-23,18,-30,-20,18,-28,34,18,-26,-29,-23,-21,-25,-10,11,-17,3,-23;
MA   /M: SY='W'; M=6,-13,-15,-21,-17,-1,-14,-19,-10,-16,-8,-10,-10,-21,-16,-17,-5,-2,-8,11,-3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,18,-24,16,21,-20,-13,8,-23,1,-22,-17,19,-12,6,-3,5,-2,-25,-29,-9,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-8,-26,-8,-2,5,-25,9,-8,-8,-7,-5,-8,-18,-6,-8,-9,-3,-11,-7,23,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-17,-32,-28,6,-30,-28,28,-23,12,10,-24,-25,-26,-22,-12,-2,33,-22,-4,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-15,-15,-18,9,-27,-8,6,-17,8,9,-17,-26,-16,-16,-17,-9,5,-12,15,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-23,0,13,-25,-9,-8,-25,11,-22,-14,1,-10,7,8,6,2,-18,-26,-16,9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,5,-26,6,6,-18,-20,2,-20,8,-18,-10,2,-14,7,5,-2,1,-18,-19,2,5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-20,-5,-7,-13,-19,-15,1,-15,-1,-2,-6,-16,-9,-16,1,2,2,-29,-11,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00402;
//
ID   CHALCONE_SYNTH_MP; MATRIX.
AC   MP00441;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chalcone and stilbene synthases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1969252; R2=0.0149266; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=766; N_SCORE=16.621; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-21,-21,-25,-20,23,-22,-1,-5,-14,-3,-4,-19,-26,-16,-15,-14,-9,-8,22,41,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-28,-2,16,-32,-18,3,-23,17,-20,-6,-1,-11,35,23,-2,-9,-24,-21,-12,24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-12,-30,-21,8,-30,-21,18,-29,44,17,-29,-31,-21,-21,-28,-9,11,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=7,-11,-14,-20,-15,-8,-17,-15,4,-11,2,14,-11,-15,-8,-13,2,16,7,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-26,5,6,-26,-14,-2,-24,27,-27,-12,19,-15,9,19,-3,-6,-22,-27,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-24,-19,-2,-1,-28,-15,11,-20,29,11,-21,-21,-9,-16,-21,-10,2,-22,-5,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-15,-30,49,-20,-35,-18,-30,-20,-5,6,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-21,6,6,-22,-6,4,-25,3,-26,-17,17,-14,5,11,14,2,-21,-33,-16,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-35,-9,-1,-28,-18,-19,-19,-10,-29,-19,-16,75,-9,-18,-3,-4,-26,-31,-28,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-16,-5,-7,-5,-10,-2,-13,-9,-20,-13,4,-16,-4,-9,19,14,-10,-20,8,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-10,-25,-25,-2,-28,-28,20,-18,5,5,-23,-25,-25,-18,-3,12,38,-30,-10,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,2,12,-29,-18,-6,-29,40,-28,-11,5,-11,11,29,-7,-9,-22,-22,-12,11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-20,-32,-26,9,-32,-21,27,-23,19,15,-25,-27,-23,-21,-18,-6,26,-17,5,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-19,-25,-24,-15,-9,-15,-6,7,-11,5,36,-19,6,-4,-13,-16,-11,-2,-22,-9,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-27,-21,-33,-24,2,-29,-18,30,-22,26,31,-24,-24,-15,-19,-21,-8,22,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-34,-22,-21,24,-26,5,-7,-13,-6,-6,-21,-29,-13,-13,-23,-14,-16,53,59,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-30,-2,9,-36,1,11,-26,1,-22,-5,1,-13,37,2,-1,-13,-30,-21,-12,22;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-10,-27,-10,5,-22,-23,5,-7,-5,4,7,-10,-17,29,-1,-11,-11,-16,-21,-5,17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-18,-20,-26,-21,36,-20,-9,-4,-18,0,-4,-12,-24,-23,-16,-10,-7,-4,3,25,-21;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,21,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-12,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=16,-11,-12,-15,-17,-26,38,-21,-29,-17,-22,-17,-5,-18,-17,-21,3,-12,-18,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-11,-8,-7,-14,-14,-17,-13,-7,-16,-12,2,-10,-7,-9,23,36,-3,-31,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-16,-24,-25,-8,-4,-24,9,-18,0,6,-19,-25,-23,-18,-6,-2,23,-27,-14,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,12,-30,-20,20,-30,48,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-10,-25,-12,-2,-20,-15,-5,-25,20,-18,-10,-2,-18,5,49,-5,-8,-15,-20,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-23,-25,-16,0,-28,-16,9,-14,24,11,-19,-24,-12,1,-19,-5,5,-21,-3,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=4,-2,-25,-5,5,-28,-15,-12,-25,36,-25,-10,-2,-10,5,18,-5,-8,-15,-20,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-19,51,26,-36,-14,-2,-37,0,-27,-27,12,-10,3,-9,-1,-10,-28,-38,-21,14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-23,-29,-21,14,-31,-11,18,-25,35,15,-27,-29,-18,-19,-27,-10,7,-8,19,-21;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,21,-22,-15,-20,-7,-22,-15,-15,-12,-12,-12,-17,-15,-22,5,-2,-2,-27,-22,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,15,48,-30,-20,-2,-30,20,-22,-18,0,-2,18,7,-2,-10,-28,-28,-18,33;
MA   /M: SY='N'; M=7,22,-16,8,-2,-20,0,0,-18,-4,-25,-18,36,-16,-2,-6,14,3,-20,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-13,22,-23,8,-5,-8,-9,12,-16,0,-22,-14,36,-22,-2,3,1,-3,-24,-22,5,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-30,-6,4,-28,-18,-12,-26,27,-27,-12,-6,13,3,18,-8,-9,-20,-22,-16,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,1,1,-30,44,-14,-37,-12,-28,-20,2,-15,-9,-14,0,-17,-30,-24,-27,-4;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-11,-16,-9,-21,5,-18,-14,-11,-14,-12,-6,-11,-9,-18,14,2,-4,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-15,-28,-17,-7,4,-22,-5,-23,16,-13,-8,-5,-22,-2,49,-12,-10,-15,-13,0,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-12,-31,-30,0,-30,-30,31,-21,10,10,-29,-29,-29,-21,-10,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00403;
//
ID   POLYPRENYL_SYNTHET_2_MP; MATRIX.
AC   MP00444;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Polyprenyl synthetases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9649005; R2=0.0166491; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=195; N_SCORE=9.201; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-11,-13,-9,-13,-2,-18,-15,-11,-12,-11,-9,-9,-13,-17,2,-2,-8,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-3,11,-21,11,3,-22,-6,-5,-23,-3,-25,-18,12,-4,-3,-5,11,3,-19,-33,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-25,6,10,-26,-7,-9,-24,0,-22,-17,0,5,1,-3,4,-4,-21,-30,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-25,5,16,-24,-13,-2,-24,5,-21,-15,0,-4,5,1,2,-4,-20,-26,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-22,-1,4,-16,-19,-6,-7,-6,-8,-6,-4,-11,-1,-9,-2,-3,-5,-28,-10,0;
MA   /M: M=-6,-12,-25,-13,-9,-11,-16,0,-5,-9,-3,0,-9,-14,-8,-5,-10,-9,-5,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-19,5,13,-21,-16,-5,-21,7,-19,-13,2,-12,3,1,-1,-5,-16,-28,-13,7;
MA   /M: SY='D'; M=1,4,-16,5,4,-24,-13,-9,-19,-2,-18,-13,1,-8,1,-5,2,-1,-14,-29,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,-9,-28,-20,5,-23,-19,7,-24,23,10,-24,-26,-18,-20,-19,-8,5,-13,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-4,-24,-2,0,-10,-20,1,-12,0,-11,-7,-5,-18,-2,-2,-5,-3,-8,-18,5,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,5,-29,9,8,-26,-15,-4,-23,2,-22,-16,2,7,2,-3,-3,-7,-22,-24,-15,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-27,-24,-31,-25,33,-32,-9,13,-23,16,8,-23,-28,-22,-18,-21,-9,6,4,34,-25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-14,-21,-16,-17,-16,19,-20,-13,-19,-8,-8,-8,-20,-16,-19,1,-7,-6,-24,-19,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-23,-8,-5,-14,-18,-6,-9,4,-8,-2,2,-19,-2,10,-7,-5,-7,-24,-9,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,1,-9,-2,-4,-15,-19,1,-14,-7,-12,-9,4,-15,-6,-6,-5,-6,-14,-28,-7,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,10,-32,-22,29,-27,29,21,-25,-26,-21,-22,-22,-9,21,-19,1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-22,-21,-9,-3,-28,-17,14,-19,22,11,-19,-21,-8,-16,-16,-4,6,-23,-5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-11,-23,-16,-3,-14,-12,-1,-16,0,-1,-13,-18,-13,-18,-3,-3,1,-15,0,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,72,-30,-16,1,-28,11,1,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,11,34,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-34,-27,37,-26,23,19,-25,-25,-22,-24,-19,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-16,-22,-19,-9,-15,-24,-10,3,-3,-1,6,-13,-20,4,5,-9,-6,5,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-26,-25,-29,-24,14,-32,-8,22,-20,15,13,-23,-27,-17,-19,-20,-9,13,-2,29,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-26,-17,5,-27,-14,13,-22,37,18,-24,-27,-15,-13,-25,-8,6,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-17,44,-28,55,14,-36,-3,1,-36,-1,-30,-27,26,-13,-1,-9,2,-9,-30,-39,-21,6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-6,-26,-19,8,-27,-17,9,-20,15,6,-20,-25,-19,-18,-17,-8,7,-16,4,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-20,-10,-5,-1,-20,-10,-9,-7,-8,-7,-6,-15,-7,-8,0,9,-7,-11,0,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,1,-17,-1,-6,-23,19,-12,-25,-9,-23,-15,5,-15,-8,-11,9,-4,-17,-27,-21,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-19,17,2,-19,-8,-9,-26,-1,-23,-19,8,-14,-5,-4,8,2,-17,-31,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-26,-2,12,-20,-15,-5,-18,-4,-18,-12,-4,7,3,-6,2,0,-18,-26,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-26,3,20,-19,-18,-3,-19,7,-16,-9,-4,-6,7,-1,-1,-4,-18,-21,-5,13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-21,3,9,-21,-15,-6,-18,2,-17,-11,1,-11,4,-3,7,4,-13,-28,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-20,-21,-12,-1,-26,-15,11,-21,22,10,-16,-21,-13,-17,-13,0,5,-24,-4,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-3,-11,-28,53,-14,-36,-15,-29,-20,9,-19,-14,-15,2,-16,-30,-24,-28,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-29,1,12,-30,-19,-10,-30,46,-30,-11,0,-10,10,27,-8,-9,-20,-21,-11,11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-23,-8,-8,-22,-6,-17,-14,-11,-19,-11,-7,14,-10,-15,-2,-3,-14,-28,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=3,-18,-19,-22,-18,-1,-7,-19,-3,-15,-4,-1,-13,-16,-18,-13,-3,-3,4,-20,-9,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-4,-11,-16,-19,19,-16,-26,-14,-22,-16,1,-20,-15,-15,3,-2,-18,-25,-18,-16;
MA   /M: SY='E'; M=0,11,-23,16,17,-30,-9,-6,-27,7,-25,-18,5,-8,8,-2,8,-3,-20,-30,-18,13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00407;
//
ID   FGGY_KINASES_2_MP; MATRIX.
AC   MP00445;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FGGY family of carbohydrate kinases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1388092; R2=0.0069473; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1420; N_SCORE=12.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=628; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-73,-74,-80,-73,110,-81,-63,-55,-57,-47,-54,-71,-83,-71,58,-71,-67,-59,-47,-26;
MA   /M: SY='A'; M=70,-64,-75,-67,-59,-63,-73,-40,-69,36,-46,-71,-73,-66,-71,-54,-54,47,-77,-64;
MA   /M: SY='P'; M=53,-77,-68,-58,-79,-62,-71,-63,-64,-72,-64,-70,105,-65,-73,-55,-56,4,-79,-77;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=86,-66,-70,-64,9,-55,-65,-65,-65,-65,-61,-40,-71,-62,-68,-9,-55,-56,-66,42; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-73,-89,-84,111,-85,-70,-16,-81,22,-47,-80,-87,-87,-78,-76,-68,-51,-47,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-65,-6,-20,-64,-47,-66,-50,-60,-48,-58,-33,-66,-59,-66,50,71,41,-82,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-38,-77,-64,-76,-83,103,-71,-90,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-70,-71,30,-46,-83,-66,-26,-70,81,-13,-77,-78,-63,-70,-26,-61,-10,-73,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-43,-77,-65,-70,34,82,-63,-78,-29,-57,-67,-9,-72,-62,40,-54,-66,-75,-65,13;
MA   /M: SY='A'; M=90,-62,-67,-60,-73,-52,-68,-62,-62,-64,15,-60,-66,-59,-67,-13,27,-39,-77,-69;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-67,-93,-67,-55,-88,-69,-70,-75,-63,-85,-71,-73,124,9,-74,-64,-60,-80,-80,-83; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-81,-67,-68,-29,-41,77,-61,-45,-13,-51,-24,-46,-58,-27,-65,-66,-65,1,117;
MA   /M: SY='W'; M=-33,-93,-94,-78,-27,-40,-92,-67,-72,0,-66,-18,-79,-71,-75,-77,-81,-78,169,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-72,-85,99,1,-89,-70,-24,-88,-53,-87,-82,25,-73,-55,29,-60,-62,-61,-101,-74; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=30,-74,-63,-40,-79,-16,-64,-71,-60,-75,13,-58,81,17,-66,61,-50,-68,-79,-72; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-63,19,53,16,-12,-49,-21,-73,-39,-56,-66,38,-72,12,-8,26,-26,-72,-66,69; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=83,-64,-69,-62,-70,-41,-70,9,-63,-59,6,-63,-68,3,-67,-8,-24,10,-77,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-30,-61,-50,-77,-74,-53,-81,10,-75,-64,-1,-25,8,107,-30,-43,-76,-77,-63;
MA   /M: SY='G'; M=7,-75,-65,-74,-82,99,-71,-88,-69,-84,-74,-51,-68,-66,-76,-35,-66,-80,-74,-77;
MA   /M: SY='A'; M=55,-24,-67,-64,-65,-5,-69,9,-64,-1,-54,-36,-68,-61,-69,41,33,10,-79,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-73,-86,-81,45,-86,-79,74,-77,23,-1,-78,-78,-76,-78,-73,-60,41,43,-47;
MA   /M: SY='F'; M=-38,28,-80,-75,83,-81,-9,36,-73,-16,-20,-72,-79,0,-73,-48,-9,35,-58,11;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-70,-85,-77,-43,-85,-70,39,-76,75,56,-80,-80,-70,-75,-75,-61,3,-73,-54;
MA   /M: SY='T'; M=-31,-64,2,-4,-71,-65,-64,-63,-54,-67,-63,-47,-60,4,-28,29,100,-56,-86,-66;
MA   /M: SY='R'; M=0,-79,-63,-53,-73,-8,18,-74,-33,-22,5,-35,-73,20,98,-30,-63,-70,-76,-61;
MA   /M: SY='G'; M=-32,-74,-26,-67,31,76,7,-54,-45,-72,-67,31,-71,2,-45,1,-42,-74,-67,20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-65,-60,-61,-41,-67,68,-54,-60,-60,-25,-8,-64,-60,-64,-7,90,24,-88,-59;
MA   /M: SY='T'; M=-54,-68,-21,-3,-74,15,-59,-71,25,-73,-66,50,-64,-4,-6,19,74,-65,-83,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-28,-78,-58,-48,-77,-51,-57,-38,71,-74,-64,7,18,7,70,-13,-58,-29,-76,-66;
MA   /M: SY='E'; M=45,28,-2,68,-77,18,-59,-53,-18,-58,-68,27,-64,-27,-59,-36,-57,-67,-79,-39;
MA   /M: SY='H'; M=-68,-81,51,9,-73,-69,132,-85,-55,-72,-60,-26,-68,19,-53,-57,-65,-84,-99,-45;
MA   /M: SY='F'; M=-68,-73,-86,-82,75,-86,-74,72,-78,34,11,-78,-80,-78,-78,-74,-62,-17,-60,-40;
MA   /M: SY='A'; M=57,-5,-76,-70,-56,-68,-74,49,-49,-9,-46,-70,-73,-67,-72,-41,-37,48,-74,13;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-81,-62,-50,0,-75,-22,-78,43,-72,-63,-55,-73,15,102,-60,-64,-54,-73,-59;
MA   /M: SY='A'; M=98,-61,-68,-60,-76,-49,-69,-65,-62,-67,-61,-62,-66,-59,-67,-20,-52,-52,-76,-71;
MA   /M: SY='T'; M=52,-63,-66,-64,-65,-64,-72,2,-63,-45,-24,-58,-66,-64,-69,-32,78,35,-82,-66;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-84,-77,-40,-86,-67,7,-77,85,3,-82,-83,-70,-74,-76,-62,-14,-68,14;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-82,-12,104,-84,-74,-52,-83,-41,-76,-70,-55,-57,54,-50,-55,-61,-77,-79,-71;
MA   /M: SY='S'; M=52,-66,-61,-62,-77,47,-27,-74,-62,-76,-68,-51,-66,-56,-66,74,-47,-65,-78,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-27,-72,-82,-79,-50,-84,-79,84,-75,12,27,-45,-75,-73,-78,-68,-1,42,-77,-58;
MA   /M: SY='A'; M=80,67,-69,-64,-71,-31,-72,-8,-65,-50,-59,-62,-69,-63,-70,-33,23,-14,-80,-70;
MA   /M: SY='Y'; M=-24,-78,-75,-75,68,-77,-19,-54,-69,-20,-50,-44,-83,-67,-66,-67,-66,-59,36,114;
MA   /M: SY='Q'; M=-33,-80,-55,-38,-84,-64,-49,-73,-30,-36,-58,-17,-67,121,-29,24,-39,-73,-74,-62;
MA   /M: SY='T'; M=-24,-64,-65,-65,-23,-69,-29,-24,-63,25,-50,-56,-67,-63,-68,35,81,23,-81,-61;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-78,-62,-38,-15,-72,-22,-72,-8,-35,15,18,-74,7,96,-58,-42,-69,-71,13;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-79,101,49,-83,-49,-22,-83,-50,-80,-77,-25,-64,-49,-8,-39,-16,-78,-92,-38;
MA   /M: SY='V'; M=-33,-69,-76,-74,-53,-23,4,35,-72,26,-42,-5,-77,-71,-74,-9,-54,74,-82,-59;
MA   /M: SY='L'; M=-29,-71,-83,-77,0,-84,-74,52,-53,62,12,-78,-79,-72,-75,-71,-27,28,-9,-53;
MA   /M: SY='D'; M=-36,-78,84,49,-77,-37,-22,-78,11,-48,-72,-5,-65,6,-24,0,-26,-55,-84,-6;
MA   /M: SY='A'; M=72,10,-66,-5,-68,-60,-69,4,-61,-18,-7,-61,-67,-60,-19,-33,40,-7,-78,-67;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-74,-18,-77,-56,-9,-68,5,136,-72,-72,-60,-66,-71,-60,-4,-72,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-76,-48,46,-77,-66,18,-52,17,-45,-62,35,-65,77,25,-18,-1,-52,-78,-35;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00408;
//
ID   RNA_POL_D_30KD_MP; MATRIX.
AC   MP00446;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases D / 30 to 40 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2101884; R2=0.0154765; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1264; N_SCORE=24.762; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,6,-25,8,7,-8,-19,-4,-20,0,-10,-12,3,-16,-2,6,-5,-4,-17,-23,-5,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-23,0,12,-15,-16,-4,-22,9,-20,-14,3,-12,4,12,5,2,-18,-24,-7,7;
MA   /M: SY='V'; M=10,-22,-9,-29,-21,-2,-21,-22,14,-20,11,10,-20,-22,-18,-21,-10,-5,16,-22,-8,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-26,3,6,-23,-20,-9,-19,19,-19,-10,1,-14,2,18,-5,-4,-11,-26,-12,3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-37,-27,59,-29,-21,6,-29,17,4,-21,-29,-34,-21,-20,-10,3,2,21,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-21,-14,-10,-9,-27,-20,13,-13,3,2,-14,-19,-13,-12,-8,-2,15,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-32,-25,8,-32,-24,28,-27,30,18,-27,-28,-23,-22,-22,-7,24,-21,-1,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,-1,13,-21,-13,-7,-20,7,-19,-13,0,-11,5,12,6,0,-14,-27,-15,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,11,-26,5,-1,-26,26,-5,-31,-4,-28,-19,22,-17,-5,-4,3,-11,-29,-29,-23,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-11,-26,-22,0,-27,-18,15,-18,3,3,-18,-22,-18,-19,-6,5,17,-17,6,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-26,23,6,-29,-12,-10,-26,-6,-27,-22,4,17,-4,-13,8,5,-22,-36,-21,0;
MA   /M: SY='I'; M=1,-23,-20,-25,-18,-7,-24,-23,12,-19,8,6,-22,-1,-18,-20,-11,-3,12,-25,-12,-19;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-16,-7,3,-21,-7,-14,-14,-8,-18,-14,-5,-1,-4,-14,15,4,-7,-29,-20,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-36,-27,41,-30,-20,15,-27,20,13,-23,-28,-29,-20,-21,-9,11,-6,14,-26;
MA   /M: SY='A'; M=32,-16,-11,-23,-16,-14,-10,-23,4,-14,-4,-3,-15,-16,-15,-20,4,0,15,-24,-16,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-13,-12,-8,-21,9,-17,-18,-11,-19,-15,-2,-11,-8,-16,19,6,-8,-27,-21,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-24,-36,-27,19,-34,-25,30,-30,27,16,-24,-26,-24,-24,-23,-10,19,-14,6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-16,-27,-20,-8,-21,-25,16,-18,3,3,-16,-17,-17,-22,-2,4,20,-24,-11,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-12,-29,-21,1,-25,-15,18,-20,17,26,-20,-23,-13,-17,-14,-6,14,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-32,-23,3,-33,-21,30,-22,25,21,-23,-24,-16,-20,-22,-9,18,-18,3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-12,-15,-10,-15,-5,-16,-7,-13,-8,-6,-6,-14,-8,-16,13,7,0,-27,-16,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-14,13,-30,23,37,-23,-19,1,-27,5,-17,-18,1,-8,10,-1,-4,-10,-26,-25,-8,23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,14,12,-28,-28,-28,-22,-13,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-8,3,-30,-20,-19,-21,-9,-29,-20,-19,85,-8,-19,-9,-10,-30,-30,-29,-7;
MA   /M: SY='T'; M=2,-6,-13,-14,-12,-10,-20,-21,-3,-9,-8,-6,-5,-13,-11,-11,13,32,6,-29,-10,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-20,-32,-24,16,-27,-15,21,-22,25,30,-24,-26,-17,-17,-21,-9,15,-16,4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-18,-9,-20,-1,-18,-12,-8,-12,-11,-8,-10,-8,-15,12,1,-2,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-22,-36,-29,3,-34,-29,37,-26,15,14,-23,-23,-24,-26,-15,-6,34,-22,-3,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-17,32,-30,47,32,-35,-14,9,-36,2,-26,-24,12,-8,8,-6,-1,-11,-30,-36,-16,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-2,-25,-2,1,1,-21,0,-12,-6,-7,-8,-3,-19,-5,-8,-8,-3,-14,-6,16,-3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-29,-10,-29,-29,-1,-28,-29,27,-19,9,9,-29,-29,-29,-20,-9,0,46,-29,-11,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-3,-28,-2,3,-5,-22,3,-11,3,-10,-7,-3,-19,1,3,-10,-9,-14,-9,17,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-37,-29,21,-34,-25,29,-27,17,15,-23,-25,-26,-24,-18,-8,25,-14,6,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-17,-26,-20,-14,16,-29,-5,9,-16,4,2,-14,-24,-14,-15,-16,-9,2,-2,28,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-25,14,22,-22,-14,-4,-19,1,-16,-15,9,-12,3,-2,-1,-6,-17,-32,-17,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,12,-14,9,-2,-18,-11,-11,-18,-7,-20,-17,12,-11,-5,-9,20,28,-11,-35,-15,-3;
MA   /M: SY='S'; M=11,-1,-10,-3,-2,-19,-3,-12,-18,-10,-26,-18,7,-10,-2,-11,36,23,-8,-37,-19,-2;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-19,-21,-17,-9,-22,-21,9,-13,-5,-1,-19,-5,-17,-17,-4,-2,16,-25,-9,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-27,-20,-32,-23,9,-28,-16,23,-22,30,31,-25,-26,-16,-18,-23,-9,16,-19,1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-11,-28,-13,-10,15,-24,6,-9,-10,-8,-5,-9,-13,-5,-10,-12,-9,-15,2,30,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,22,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-22,-29,-21,10,-30,-15,20,-18,9,17,-19,-23,-10,-16,-15,-8,15,-14,6,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-24,6,-34,-24,31,-29,36,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-12,-18,-10,-21,7,-19,-13,-11,-13,-12,-8,-11,-10,-19,11,-1,-3,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-29,-4,-2,-16,-21,80,-23,-12,-10,3,4,-21,8,-2,-12,-18,-24,-28,16,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-24,-11,-16,-27,48,-19,-31,-17,-25,-18,-1,-17,-16,-19,6,-12,-21,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,41,-26,18,16,-24,-24,-24,-26,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-16,-11,-27,-18,-21,82,-11,-20,-10,-9,-24,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,16,-32,-22,24,-30,40,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-19,0,-3,-18,-16,-12,-14,3,-14,-8,2,-14,-2,0,5,11,-7,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='S'; M=11,-5,-11,-9,-8,-15,-6,-17,-12,-11,-17,-13,0,-12,-8,-13,23,23,-1,-32,-16,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-29,30,14,-28,-13,-3,-28,0,-25,-20,8,4,0,-8,-1,-7,-25,-31,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-30,2,11,-21,-21,-6,-15,-3,-11,-10,-6,11,-1,-5,-9,-10,-18,-28,-15,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=3,7,-22,10,7,-23,-14,-10,-12,-5,-11,-11,-2,-12,-1,-10,-2,-7,-9,-27,-15,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-9,-22,-9,-10,-3,-22,-10,1,-10,6,8,-12,-21,-9,-4,-11,-5,1,-22,-2,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-17,12,12,-10,-11,-4,-16,-3,-10,-11,1,-8,0,-6,0,-4,-13,-18,-8,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-16,-1,6,-14,-11,3,-12,7,-11,-2,1,-2,5,3,-2,-1,-11,-16,-6,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-15,-18,-15,26,-18,-2,2,-13,7,2,-14,-19,-14,-10,-13,-6,-2,8,28,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-21,0,8,-17,-11,-2,-17,7,-15,-8,4,-1,6,14,-1,-5,-16,-21,-12,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-32,-21,-13,1,-20,-12,-7,-13,-6,-4,-19,-1,-12,-11,-16,-12,-13,11,9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-21,-10,-6,-13,-17,-14,-9,-11,-12,-8,-12,5,-6,-11,-5,-6,-8,-24,-11,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=0,3,-20,4,3,-20,-6,-7,-17,0,-16,-11,1,-10,3,-2,0,-6,-14,-12,-11,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-14,0,6,-10,-12,1,-6,-4,-1,0,-4,-8,2,-5,-2,-2,-6,-17,-5,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-4,2,7,-19,-16,-11,-21,-7,-17,-16,-1,-6,-6,-10,-4,-6,-17,-32,-19,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00411;
//
ID   DNA_POLYMERASE_A_MP; MATRIX.
AC   MP00447;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA polymerase family A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4296660; R2=0.0162914; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=109; N_SCORE=7.195; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-6,-11,-3,-17,-6,-14,-13,-11,-13,-10,-3,-13,-5,-15,16,6,-5,-31,-18,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,14,-29,23,15,-23,-16,-3,-27,4,-22,-18,3,-13,6,2,-4,-10,-23,-18,-9,10;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-24,-14,-29,-22,-2,-22,-19,14,-19,16,17,-22,-24,-15,-18,-18,-9,11,-15,-5,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-14,-24,-18,-12,29,-24,16,-13,-16,-3,-2,-8,-23,-17,-11,-14,-12,-12,-9,17,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-24,-6,-7,-24,16,-8,-24,-6,-22,-11,2,-10,-4,-8,4,-4,-20,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-22,-21,-25,-18,-4,-29,-21,14,-5,5,9,-19,-23,-15,-4,-14,-6,19,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,5,-23,6,8,-24,-11,-11,-22,-3,-22,-17,3,7,-1,-9,8,9,-18,-31,-19,3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-14,-23,-15,-2,-17,-20,-17,0,-6,-6,-3,-14,-1,-5,-11,-6,-6,1,-24,-14,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-26,16,20,-26,-16,-2,-23,5,-20,-15,2,-9,6,-3,1,-5,-19,-27,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=3,2,-21,2,10,-21,-9,-11,-16,-4,-13,-12,0,-11,-1,-9,5,1,-12,-28,-16,4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-14,-29,-24,-1,-26,-25,24,-20,14,11,-24,-24,-22,-20,-11,-3,31,-24,-8,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-20,-1,-3,-16,3,-13,-21,-9,-17,-13,1,-8,-5,-10,8,10,-15,-24,-14,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-23,-11,-7,-20,-14,-18,-9,-6,-15,-9,-10,11,-9,-12,-4,-6,-9,-28,-17,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-20,11,16,-20,-10,-4,-18,1,-16,-14,5,6,3,-5,0,-5,-18,-23,-15,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-10,-21,-10,-1,-13,-20,-6,-4,-8,2,5,-10,-12,3,-8,-4,0,-6,-26,-9,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-27,5,11,-27,-16,0,-26,16,-23,-12,6,-13,18,27,0,-4,-23,-26,-13,13;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-3,-23,-7,-3,-17,-17,4,-9,-1,-11,-4,0,-17,2,-1,-4,-7,-8,-23,-5,-2;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-12,-18,-11,-20,7,-20,-13,-12,-13,-11,-8,-12,-11,-19,10,-1,-2,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-11,-13,-17,-12,-14,-15,-20,-1,-9,-7,-5,-9,-14,-9,-13,8,13,8,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-22,-35,-27,13,-31,-26,29,-25,13,12,-21,-23,-24,-24,-15,-7,24,-16,2,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-14,9,1,-20,-8,2,-15,-3,-23,-15,36,-18,1,-4,7,1,-21,-37,-18,1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-33,-26,59,-30,-7,1,-24,10,1,-21,-30,-29,-17,-21,-10,-2,14,44,-26;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-17,-29,58,-19,-36,-17,-27,-18,-1,-18,-15,-19,1,-17,-27,-20,-28,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-24,-25,-28,-19,1,-31,-20,17,-12,14,10,-18,-24,-14,-1,-18,-9,13,-19,-2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-22,-33,-27,-1,-26,-27,31,-26,18,13,-23,-24,-22,-24,-16,-7,27,-23,-6,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-14,-31,55,-15,-37,-14,-28,-17,0,-19,-9,-13,0,-18,-30,-20,-27,-12;
MA   /M: SY='M'; M=7,-16,-21,-22,-14,-12,-5,-15,5,-15,1,12,-12,-16,-9,-18,-6,-8,2,-22,-12,-13;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,37,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,19,-1,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='A'; M=20,1,-19,0,1,-26,-8,-12,-18,-2,-16,-12,-3,-5,1,-11,4,-4,-12,-25,-18,1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-10,-25,-13,-6,5,-15,-3,-17,2,-12,-8,-5,-15,-9,1,-9,-9,-15,-12,5,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-24,-15,-12,-7,13,-16,-25,-3,-19,-12,-4,-18,-13,-1,-2,-8,-16,-16,-12,-12;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-18,-29,-20,3,-25,-22,17,-26,34,14,-26,-26,-19,-21,-20,-7,13,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=21,-6,-16,-9,-1,-21,2,-15,-14,-10,-18,-13,-2,-11,-5,-15,16,3,-8,-28,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,5,-29,6,23,-30,-16,7,-26,12,-21,-10,5,-10,26,14,-1,-8,-27,-25,-13,23;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-15,6,10,-16,-9,0,-14,2,-13,-8,4,-7,10,0,3,-1,-14,-16,-7,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-18,-29,-21,6,-28,-21,20,-26,37,18,-27,-28,-20,-19,-23,-6,16,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-26,-2,-7,-23,17,-7,-27,3,-25,-11,14,-18,-4,6,1,-9,-23,-26,-19,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-25,-25,-13,-9,-29,-17,23,-16,9,14,-14,-16,-2,-15,-13,-9,11,-20,-4,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=3,-7,-19,-8,-5,-6,2,-14,-20,-11,-19,-15,-2,-10,-11,-12,10,1,-13,-23,-12,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-26,-6,-1,-11,-20,-3,-9,3,-6,-4,4,-19,0,9,-9,-6,-12,-21,-2,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-28,2,10,-25,-5,-2,-24,2,-21,-14,1,3,0,-4,-2,-9,-23,-27,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-25,7,25,-22,-20,-7,-17,3,-14,-13,-3,-9,6,3,0,-2,-14,-29,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-16,-18,-9,-14,1,-18,-11,-13,-4,-7,-10,-14,-9,-17,2,-2,-5,-20,-15,-9;
MA   /M: SY='K'; M=2,-3,-21,-6,3,-22,-12,-10,-16,9,-17,-6,-1,-12,4,2,3,2,-11,-25,-14,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-16,4,17,-27,-10,-6,-24,4,-20,-14,-1,-10,10,1,3,-6,-19,-26,-18,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-23,-14,-9,12,-24,-5,-3,-10,1,-1,-14,-23,-8,-10,-12,-7,-4,-6,18,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00412;
//
ID   CLOS_CELLULOSOME_RPT_MP; MATRIX.
AC   MP00448;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clostridium cellulosome enzymes repeated domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5666118; R2=0.0159265; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=232; N_SCORE=9.252; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=59; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-9,-9,-2,-19,-20,-12,-18,9,-14,-9,-4,-11,-2,10,-7,-7,-14,-28,-14,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-20,-24,-22,-13,9,-26,-9,3,-10,8,3,-17,-23,-12,-6,-15,-8,1,-8,14,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-6,-13,-9,-11,4,-3,-5,-1,-10,-1,-1,-2,-14,-10,-8,-6,-5,-3,-6,5,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-19,-22,-18,-7,-10,-20,7,-17,7,3,-14,-20,-16,-14,-8,-1,8,-21,-9,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-8,-21,-9,-8,-8,-16,-13,-2,-14,8,2,-11,-19,-10,-14,-8,0,-3,-22,-5,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,1,-19,-2,-1,-17,-1,-7,-15,-1,-18,-12,9,-5,-2,2,5,0,-14,-24,-15,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-22,-7,4,-10,-16,-13,-15,-4,-13,-12,-6,2,-5,-8,5,5,-13,-26,-12,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-25,-5,1,-21,-2,-11,-15,-9,-14,-10,-2,2,-2,-12,-2,-7,-16,-28,-19,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-20,-3,3,-18,-17,-7,-13,-9,-16,-12,-2,1,-4,-11,10,13,-9,-31,-14,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-1,9,-23,8,4,-27,-1,-1,-24,-2,-25,-16,11,-8,5,-6,8,-1,-22,-30,-17,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-3,-5,-25,-8,-5,-17,-20,-15,0,-3,-10,-5,-3,-2,-7,-10,-5,-6,-2,-26,-13,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-23,7,-3,-7,-4,-2,-19,-8,-17,-15,11,-18,-8,-11,-1,-7,-19,-18,-1,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-14,-21,-17,-10,-10,-20,-17,5,-5,2,4,-12,-17,-7,-6,-8,-1,6,-22,-8,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-22,-1,8,-20,-15,-12,-13,1,-8,-8,-5,-12,-1,-5,-1,-5,-10,-26,-14,3;
MA   /M: SY='A'; M=6,0,-20,-7,-2,-15,-13,-8,-9,0,-13,-9,5,-16,-4,0,0,-4,-7,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,-15,-19,-13,-17,7,-19,-11,-15,-6,-8,-10,-15,-13,-19,4,-4,-4,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,1,-30,-25,30,-20,15,18,-28,-28,-24,-20,-14,-3,40,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,26,3,-23,-1,9,-23,0,-30,-21,55,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-23,-6,2,-20,-9,-8,-21,11,-18,-11,1,-16,2,20,0,-5,-14,-25,-15,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,43,-26,52,13,-33,-7,1,-33,-1,-30,-27,28,-12,0,-8,6,-5,-28,-40,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-28,-6,-15,-26,49,-15,-33,-13,-26,-17,8,-20,-15,-14,0,-16,-27,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='R'; M=5,0,-22,-5,2,-22,-11,-8,-22,16,-21,-12,5,-13,3,17,2,-2,-15,-24,-15,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-14,44,-24,39,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,45,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=22,-6,-11,-10,-6,-18,-2,-13,-12,-10,-18,-8,0,-11,-4,-14,23,10,-4,-31,-18,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-17,-17,-11,-5,-23,-17,1,-15,3,0,-8,-16,-7,-13,4,20,2,-25,-6,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-31,-24,18,-31,-16,20,-25,28,15,-25,-28,-21,-20,-23,-9,13,-10,15,-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,-14,-19,-13,-10,-9,-15,-4,-12,-3,0,-10,-15,-10,-16,5,8,2,-20,-8,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-20,-33,-25,0,-30,-25,30,-24,21,16,-23,-23,-20,-23,-17,-7,25,-22,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-21,8,-29,-19,21,-27,43,23,-29,-29,-19,-19,-27,-9,14,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-27,1,7,-27,-17,2,-28,34,-29,-11,6,-12,8,21,-3,-7,-21,-25,-9,7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-27,-19,-17,17,-25,22,-3,-10,-2,3,-16,-26,-7,-10,-15,-10,-9,15,56,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-24,14,-32,-23,26,-30,37,18,-27,-28,-22,-22,-26,-10,16,-17,3,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-29,-21,5,-21,-21,18,-29,38,16,-26,-28,-20,-21,-26,-11,9,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-24,-3,-1,-24,-5,-9,-27,15,-23,-13,1,-15,2,24,2,-3,-17,-24,-15,-1;
MA   /M: SY='S'; M=3,-12,-18,-15,-8,-13,-12,-16,0,-13,-5,-1,-8,-16,-6,-14,5,5,3,-27,-13,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-23,-26,-19,-7,-29,-23,25,-21,5,8,-12,-17,-10,-21,-3,3,16,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-4,9,-22,15,9,-25,-12,-10,-21,-6,-23,-19,5,1,-1,-11,14,8,-16,-35,-19,3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,6,-23,10,14,-26,-14,-4,-26,15,-26,-15,4,-9,6,6,7,0,-18,-30,-14,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-24,-34,-25,29,-32,-18,20,-28,26,12,-24,-28,-24,-21,-24,-10,10,-6,17,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-1,-35,8,4,-31,-15,-13,-24,-7,-30,-22,-5,56,-7,-16,-3,-7,-29,-33,-27,-5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-16,-20,-20,-15,-7,-13,-7,0,-12,-3,-1,-13,-20,-12,-14,-5,-5,4,-16,2,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-23,-1,12,-26,-18,-6,-18,12,-19,-9,1,-11,15,5,1,0,-15,-25,-13,14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-1,13,-21,11,9,-24,2,-1,-21,-1,-20,-14,15,-11,8,-4,4,-6,-22,-25,-17,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=18,9,-12,4,-1,-19,-1,-8,-15,-5,-16,-14,9,-10,-4,-11,11,1,-10,-25,-17,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-24,24,7,-26,-14,-6,-18,-3,-18,-14,1,4,2,-9,-3,-7,-14,-28,-16,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-17,-8,-5,-16,-17,-12,-5,-9,-13,-7,5,-13,2,-9,13,21,-5,-30,-11,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00416;
//
ID   ATPASE_A_MP; MATRIX.
AC   MP00449;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP synthase a subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1856275; R2=0.0140291; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=238; N_SCORE=8.515; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-32,-24,29,-27,-19,11,-23,19,11,-22,-27,-24,-16,-19,-8,9,-8,8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-21,-26,-18,3,-24,-12,16,-20,28,28,-19,-20,-12,-16,-21,-9,6,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-16,-27,-24,11,-27,-22,18,-22,14,9,-18,-26,-24,-19,-13,-2,21,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-26,-26,-24,-16,-7,-28,-23,10,-21,9,3,-24,13,-17,-21,-17,-7,3,-22,-12,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-37,-27,7,-35,-25,38,-28,24,21,-22,-23,-20,-25,-21,-9,24,-19,1,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,13,-28,17,43,-28,-16,0,-28,13,-23,-19,9,-4,15,3,2,-7,-28,-31,-19,29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-18,-28,-22,12,-28,-23,16,-23,16,7,-18,-23,-21,-19,-10,5,14,-19,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-34,-27,5,-33,-26,33,-26,22,16,-24,-25,-22,-24,-18,-6,27,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-17,2,10,-23,1,-9,-24,-5,-27,-19,6,-9,2,-6,25,10,-16,-35,-20,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-6,-27,-4,6,-3,-25,4,-5,-9,1,-3,-8,-18,-2,-10,-13,-10,-11,-12,15,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-15,-35,-27,36,-30,-22,13,-27,17,8,-22,-27,-29,-21,-18,-8,11,-9,10,-26;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-15,-22,-16,-8,-15,-21,6,-16,-3,-2,-10,-15,-14,-20,5,6,9,-23,-11,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-30,-4,3,-24,-18,-2,-28,27,-24,-11,6,-9,10,43,-7,-9,-22,-23,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-30,-14,-6,-21,-18,-20,-11,-13,-15,-12,-17,48,-12,-19,-7,-4,-16,-27,-23,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-32,-24,14,-29,-23,22,-27,26,15,-23,-25,-22,-21,-20,-6,14,-14,3,-24;
MA   /M: SY='S'; M=14,-1,-10,-6,-5,-17,-6,-14,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-11,28,25,-6,-34,-17,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-29,-20,7,-30,-15,19,-28,41,17,-26,-28,-18,-20,-27,-10,9,-18,1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=13,-5,-16,-8,-9,-22,20,-16,-24,-13,-24,-17,2,-13,-9,-15,20,6,-14,-29,-22,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-33,-26,13,-31,-24,26,-26,27,17,-27,-28,-24,-21,-21,-7,24,-20,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-18,-19,-25,-20,26,-17,-17,-7,-19,-4,-7,-13,-21,-22,-16,-4,5,-4,4,12,-19;
MA   /M: SY='G'; M=25,-11,-18,-16,-15,-22,26,-21,-19,-15,-17,-13,-7,-15,-15,-20,5,-7,-8,-21,-23,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-22,-33,-25,1,-30,-18,32,-21,21,32,-22,-23,-15,-20,-19,-8,24,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-20,-24,-18,12,-26,-12,8,-18,13,9,-16,-22,-15,-15,-10,4,4,-13,12,-17;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-11,-18,-11,-19,1,-20,-9,-11,-12,-10,-9,-12,-11,-19,12,2,1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-4,-16,-31,62,-18,-40,-17,-30,-20,1,-19,-18,-18,0,-19,-30,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-13,2,-28,3,14,-22,-17,58,-27,-5,-19,-5,6,-14,10,-2,-4,-13,-26,-30,5,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-16,-29,-22,3,-29,-22,21,-25,28,15,-24,-26,-20,-20,-17,-2,18,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-24,7,-31,-24,26,-27,32,16,-26,-27,-22,-22,-22,-6,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-22,10,-27,-17,19,-21,25,23,-23,-26,-17,-15,-20,-8,14,-19,1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=1,-10,-21,-15,-10,-14,-8,-3,-7,-8,-7,1,-6,-16,-7,-10,-2,-2,-5,-24,-8,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-23,6,-31,-22,26,-27,35,21,-27,-27,-20,-21,-23,-7,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-19,-33,-23,14,-31,-22,22,-28,31,16,-24,-26,-21,-22,-22,-7,13,-18,2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-18,-15,-14,-10,4,-12,-11,-13,-13,-9,-8,-18,-13,-16,5,0,-4,-16,-3,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-21,-10,-8,-17,4,-13,-12,-11,-12,-7,0,-17,-4,-12,4,-1,-11,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-22,-18,-28,-20,18,-19,-17,5,-22,16,8,-18,-24,-20,-18,-14,-6,4,-13,3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=5,-19,-17,-24,-18,-4,-12,-20,4,-19,4,1,-16,-19,-17,-19,-6,-3,5,-15,-7,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00420;
//
ID   ACONITASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00450;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aconitase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0002904; R2=0.0087415; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=826; N_SCORE=7.220; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=744; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-35; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=18,-73,33,-1,-44,-65,17,7,51,-42,-60,-8,-67,6,-4,14,-7,-11,-79,-34;
MA   /M: SY='Y'; M=-48,-75,-27,-22,14,-74,-4,11,-7,-53,-51,21,12,-35,-42,-32,-58,40,-54,88;
MA   /M: SY='M'; M=27,-69,20,-30,32,-65,-25,-36,-62,-31,93,-11,-41,-59,-29,23,-37,-3,-71,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-77,29,-63,-7,37,-62,-71,-1,-59,-31,60,-13,-63,-67,-29,18,-9,-81,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-77,31,-13,-66,-30,5,-55,-68,38,-24,11,22,-20,-72,-15,-10,7,-86,-68; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-75,-58,22,-69,54,17,-64,18,7,-59,12,-69,-31,15,-55,-9,2,-77,-36;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-29,-13,24,-79,-19,-6,-73,14,-59,-66,-56,77,37,-25,32,-7,-53,-78,-38;
MA   /M: SY='G'; M=-44,-75,30,32,-73,47,-26,-44,27,-54,-29,18,-23,-31,-58,-54,-17,30,-80,-37;
MA   /M: SY='Q'; M=39,-71,-42,-11,-11,-27,-58,-41,-20,21,-52,-60,-70,59,-59,-11,14,-31,-64,49;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-74,-2,66,-77,-50,-59,-71,48,-46,-66,-52,14,-1,-48,10,35,-28,-80,-69;
MA   /M: SY='M'; M=37,-26,-47,-64,-58,-70,-67,28,26,27,61,-66,-72,-7,-40,-43,-39,18,-10,-60;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-37,-101,-2,30,-106,-6,-83,-106,25,-104,-96,-6,-50,-40,-32,-28,-37,-100,-105,-96; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-59,-96,67,-20,-101,12,-74,-99,-36,-100,-93,22,38,-72,-52,-50,-74,-97,-105,-90; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-45,-75,-74,-76,-58,54,-31,71,-50,5,-47,-63,-72,-21,-75,-60,13,-22,-73,-17;
MA   /M: SY='D'; M=14,-75,70,1,-78,-63,8,-74,51,-58,13,-6,-22,-3,-21,10,-37,-52,-84,-66;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-71,-84,-79,-49,-87,-82,68,-77,27,-37,-79,-78,-75,-78,-71,-55,72,-79,-58;
MA   /M: SY='D'; M=20,-72,63,-25,-75,24,-25,-61,-19,-69,-65,41,-69,-57,4,-37,-15,30,-87,-69;
MA   /M: SY='I'; M=-15,-76,-67,-29,-53,-76,7,60,39,-50,-48,-62,-71,40,-14,-61,-17,15,-65,52;
MA   /M: SY='A'; M=69,-24,-73,-68,-66,8,-75,-7,-68,-54,-23,-66,-71,-66,-72,-37,-53,61,-80,-67;
MA   /M: SY='F'; M=45,-69,-76,-72,84,-69,-60,-52,-70,5,-51,-70,-78,-70,-70,-14,-60,-40,-48,64;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-74,-85,-81,-47,-88,-80,86,-78,43,-34,-78,-77,-74,-80,-74,-58,30,-75,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-70,-65,-71,-71,76,-72,-21,-67,-66,-62,-53,-67,-67,-74,-47,62,28,-79,-71;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-50,-59,-73,-57,-76,-70,-44,-63,-49,-61,106,11,-65,-83,-66;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-58,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-62,-8,-47,-59,-62,-66,-36,114,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-83,-70,124,-73,-50,-56,-44,-21,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='T'; M=27,-65,-58,-62,-74,42,-64,-70,-60,-73,-67,8,-64,-57,-66,58,63,-62,-81,-69;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-56,8,-61,-55,-76,-65,-56,-80,-36,-77,-67,-52,-72,-45,93,68,-52,-73,-80,-65; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-70,-61,-69,-1,-68,-56,32,-64,40,8,75,-77,-62,-67,-59,-56,-47,-68,43;
MA   /M: SY='P'; M=-54,-77,-33,57,-80,-26,-61,-76,-53,-79,-71,-55,78,-14,-41,60,-6,-73,-81,-73;
MA   /M: SY='D'; M=-61,-77,100,-27,-71,-62,9,-79,-56,-78,-74,-40,-68,-4,-61,43,-53,-76,-82,38;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-70,-84,-77,-30,-85,-73,40,-75,52,62,-79,-79,-71,-75,-72,-58,58,-75,-30;
MA   /M: SY='M'; M=8,-73,-65,15,-64,-14,-6,9,-10,-20,90,-61,-69,18,46,-13,-40,-30,-76,-59;
MA   /M: SY='A'; M=33,-71,-16,25,-60,-71,-65,24,-40,31,-21,-65,-71,-17,32,-13,-57,14,-77,-62;
MA   /M: SY='A'; M=77,-65,-67,-64,-29,47,-70,-65,-65,-69,-63,-58,-68,-61,-70,12,-54,-5,-75,-70;
MA   /M: SY='A'; M=93,-62,-67,-60,-75,-37,-68,-65,-62,-53,-61,-60,-66,-58,-67,20,-34,-40,-76,-70;
MA   /M: SY='H'; M=28,-74,22,35,-79,41,48,-79,18,-76,-68,-8,-66,-28,16,-4,-59,-53,-80,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-71,-84,-79,-47,-86,-78,64,-77,47,1,-79,-78,-74,-77,-72,-39,57,-76,-31;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=62,-25,-77,-70,15,-67,-73,16,-71,32,-45,-72,-74,-68,-73,-57,-56,39,-73,-58;
MA   /M: SY='K'; M=-37,8,-36,0,-78,-52,-57,-80,95,-77,-66,-50,-65,-23,47,-57,-59,-74,-74,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-56,-78,13,-2,-83,67,-61,-84,58,-81,-70,1,-10,37,-48,-52,-62,-80,-76,-71;
MA   /M: SY='A'; M=69,-68,-59,-10,-76,-58,25,-71,22,-56,-62,23,-67,-3,41,-34,-25,-62,-78,-66;
MA   /M: SY='K'; M=15,9,-42,-27,-66,-14,-8,-27,59,5,-54,-59,-41,12,-12,-29,-26,35,-77,-64;
MA   /M: SY='V'; M=12,-71,13,59,-66,-54,-68,3,-20,-55,-55,-38,-40,-55,-63,-42,-25,64,-83,-67;
MA   /M: SY='H'; M=49,-71,-25,-38,-70,-46,86,-35,43,-7,-57,-8,-40,-29,-22,-18,-26,-46,-81,-58;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-78,40,2,-79,28,-16,-69,-21,-76,-68,32,75,-7,-65,-10,-32,4,-83,-73;
MA   /M: SY='G'; M=70,-68,-66,-67,-79,75,-70,-76,-66,-76,-68,-56,-67,-63,-72,-45,-59,-65,-75,-74;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00423;
//
ID   PATHOGENESIS_BETVI_MP; MATRIX.
AC   MP00451;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pathogenesis-related proteins Bet v I family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5968294; R2=0.0171193; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=610; N_SCORE=16.030; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-17,-12,1,-10,-7,-15,-11,-11,-9,-9,-9,-14,-8,-14,4,-2,-4,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-27,15,22,-27,-16,11,-28,12,-23,-15,6,-10,9,5,-1,-9,-23,-30,-11,14;
MA   /M: SY='A'; M=18,4,-18,2,4,-23,-8,-9,-17,-2,-16,-13,0,-11,-3,-11,5,0,-9,-27,-17,0;
MA   /M: SY='N'; M=2,20,-19,7,-2,-21,0,-1,-20,2,-26,-17,32,-16,-2,-2,10,1,-21,-33,-19,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-22,-34,-25,46,-30,-16,7,-28,24,7,-24,-30,-29,-19,-24,-10,2,3,23,-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-19,-4,4,-21,-4,-14,-19,1,-20,-13,-1,-11,-3,-5,11,8,-10,-28,-17,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-27,-21,-21,24,-29,9,4,-13,1,1,-18,-28,-13,-12,-16,-5,-2,16,58,-21;
MA   /M: SY='N'; M=1,14,-17,8,1,-22,-5,-5,-21,2,-27,-18,21,-13,0,-2,18,10,-17,-35,-18,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-29,-18,-16,24,-28,17,-2,-9,-2,-1,-17,-28,-5,-9,-16,-9,-11,23,68,-15;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-33,-26,2,-33,-25,33,-25,24,20,-24,-24,-20,-23,-19,-5,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,5,-36,-29,40,-27,16,15,-23,-24,-25,-26,-17,-7,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-30,14,25,-31,15,-8,-35,-2,-25,-21,2,-9,3,-9,0,-14,-30,-27,-24,14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-27,31,4,-31,3,-10,-29,-7,-24,-21,6,-10,-8,-14,0,-8,-19,-33,-21,-2;
MA   /M: SY='A'; M=10,-19,-22,-23,-20,-15,6,-24,0,-19,-5,-3,-14,-14,-19,-22,-5,-9,4,-22,-17,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,11,-30,-21,22,-29,45,19,-29,-30,-21,-20,-28,-9,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-25,-10,-12,-17,7,-12,-15,-17,-8,-5,-9,-5,-13,-16,-5,-6,-12,-26,-16,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,28,-30,41,16,-36,4,-5,-38,1,-29,-25,11,-11,-1,-7,-1,-12,-29,-33,-21,8;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-18,-20,-15,0,-23,-19,5,-10,-3,3,-9,-16,-12,-12,1,13,7,-23,-4,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-22,-34,-25,9,-31,-25,28,-27,27,15,-24,-25,-22,-24,-20,-8,20,-18,0,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-10,-2,3,-25,-13,-11,-26,20,-29,-15,4,-13,3,10,9,1,-16,-30,-16,3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-25,-35,-28,-3,-28,-29,36,-26,13,13,-20,-21,-21,-27,-14,-8,28,-22,-5,-28;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-4,-5,-1,-17,-11,-14,-15,-10,-19,-15,2,-13,-5,-11,21,20,-5,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-2,-22,-11,-13,16,-19,9,-9,-13,-9,-7,8,-23,-12,-9,-4,0,-13,-10,19,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-15,13,-30,22,33,-29,-18,30,-32,4,-22,-15,6,-8,13,0,-3,-13,-30,-31,-8,22;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-19,-17,-26,-19,16,-22,-20,6,-22,8,1,-14,-21,-20,-18,-4,3,6,-17,1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-26,-6,2,-23,-22,-14,-18,33,-21,-6,-4,-13,2,18,-8,-3,-8,-22,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-34,-25,19,-32,-24,24,-28,27,14,-25,-27,-25,-23,-22,-8,18,-15,4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-15,-19,-12,-2,-25,-21,12,-16,7,3,-20,-23,-18,-16,-6,-1,23,-28,-10,-15;
MA   /M: SY='P'; M=18,-10,-24,-9,-1,-26,-10,-18,-17,-9,-20,-16,-11,32,-8,-18,2,-4,-15,-26,-24,-7;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-14,-7,-10,-20,13,-10,-23,-13,-22,-15,4,-15,-9,-13,16,11,-14,-30,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=5,-12,-25,-9,-4,-24,1,-16,-19,-10,-23,-16,-9,35,-9,-16,2,-5,-19,-25,-24,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-25,43,10,-31,-2,1,-32,-2,-30,-25,31,-14,-1,-7,7,-4,-28,-39,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-9,-18,-28,64,-18,-37,-18,-28,-18,0,-18,-18,-18,0,-18,-28,-18,-28,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=4,-6,27,-9,-9,-20,-9,-16,-23,-16,-27,-20,1,-19,-9,-16,26,11,-10,-43,-23,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-22,-32,-26,-1,-33,-27,33,-25,17,13,-20,-22,-20,-24,-13,0,27,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-5,-27,-25,-4,-17,-24,12,-22,6,4,-21,-26,-23,-22,-11,-5,18,-24,-7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,0,9,-29,-20,-10,-29,48,-29,-10,0,-10,9,29,-9,-8,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-11,-20,-17,-14,-8,-21,-9,9,-17,2,4,-4,-19,-9,-15,-1,3,6,-28,-7,-13;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-15,-10,-9,-13,-16,-17,-4,-11,-13,-8,3,-12,-7,-12,18,25,0,-32,-12,-9;
MA   /M: SY='T'; M=8,-9,-13,-16,-14,-11,-15,-17,4,-13,-6,-1,-4,-17,-12,-15,8,10,10,-29,-13,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-27,-10,-2,-18,-24,-1,-6,10,-13,-2,-4,-14,0,2,-7,-6,-4,-24,-5,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,4,-28,1,1,-17,-18,59,-26,0,-21,-5,12,-18,6,3,-7,-12,-26,-26,11,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-5,-14,-12,-12,-20,-21,-7,-13,-10,-9,-4,-9,-11,-14,14,35,0,-30,-12,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-29,-6,4,-24,-23,-13,-19,36,-19,-5,-4,-13,5,20,-13,-10,-13,-20,-8,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,62,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-11,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-29,57,14,-36,-3,0,-38,-2,-29,-28,20,-12,-2,-10,0,-10,-29,-36,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,-15,-21,-15,-11,-14,-4,0,-13,-5,-2,-13,-18,-12,-17,-1,-4,8,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='E'; M=3,-12,-20,-10,6,-16,-21,-16,-3,-3,-5,-5,-14,-9,-6,-10,-5,-5,4,-26,-15,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-23,-19,-16,-6,-27,-21,16,-20,10,6,-19,-5,-17,-20,-15,-7,12,-24,-9,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,5,-29,6,9,-27,-16,-9,-22,9,-26,-16,5,16,1,0,-2,-4,-23,-30,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=4,9,-23,14,30,-27,-13,-6,-25,2,-19,-18,1,-5,9,-7,7,-2,-20,-30,-19,19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-26,17,38,-27,-18,-5,-23,5,-17,-17,-2,-6,9,-4,-1,-8,-18,-30,-19,24;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-26,11,18,-26,-14,14,-25,12,-24,-13,17,-12,14,10,-1,-8,-27,-28,-11,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-21,-24,-18,-6,-27,-14,19,-17,9,11,-18,-22,-14,-15,-12,-7,20,-25,-5,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-28,5,12,-29,-17,-7,-28,35,-27,-12,4,-10,10,20,-5,-8,-21,-24,-12,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00437;
//
ID   GUANYLATE_CYCLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00452;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Guanylate cyclase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6644392; R2=0.0133993; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=926; N_SCORE=17.062; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=137; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-8,2,-28,2,3,-28,-8,-3,-24,1,-27,-15,7,14,7,-1,3,-5,-26,-30,-19,3;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-30,-18,-35,-29,24,-32,-26,24,-26,17,10,-25,-28,-30,-22,-17,-6,27,-16,4,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-29,-5,7,-25,-20,-1,-19,12,-14,-4,-5,-10,19,17,-8,-10,-19,-18,-9,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-34,-24,13,-31,-21,27,-27,32,23,-25,-26,-20,-21,-24,-10,16,-17,3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-9,0,-20,-20,-2,-29,30,-20,-10,0,-19,9,63,-9,-8,-19,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-2,-35,-29,-4,-34,-29,30,-27,11,10,-22,-25,-23,-27,-15,-7,27,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,7,-34,-26,35,-27,25,17,-25,-25,-23,-24,-20,-8,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-7,8,-24,1,-3,-16,-12,52,-23,-8,-20,-7,19,-19,2,-4,-1,-11,-24,-30,3,-3;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,4,-10,-9,-17,-14,0,-17,-12,-18,-10,-1,-16,-7,-12,14,13,-8,-34,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-29,-7,1,-26,-13,-17,-20,-9,-27,-19,-10,51,-7,-16,5,2,-22,-32,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-2,-31,-29,-1,-31,-29,26,-22,10,9,-29,-30,-29,-21,-12,-2,42,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-14,-28,-25,5,-29,-22,22,-21,12,8,-24,-26,-23,-20,-12,0,28,-20,2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-13,-17,-11,-21,9,-20,-15,-11,-14,-12,-7,-11,-11,-19,10,0,-5,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-19,-30,68,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=6,-10,-18,-13,-8,-13,-17,-12,-3,-10,-3,-2,-9,-16,-1,-10,3,4,0,-24,-8,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-26,-5,5,-26,-18,-5,-23,22,-21,-8,-1,-13,17,26,-1,-2,-17,-22,-11,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-10,-25,-14,-5,-15,-21,-3,-7,18,-7,19,-9,-16,4,12,-13,-7,-5,-21,-5,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-37,-13,-4,-17,-22,-16,-15,-12,-21,-15,-21,66,-12,-19,-12,-10,-25,-22,-15,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-9,3,-20,-21,7,-24,17,-15,-5,-2,-18,19,40,-9,-11,-21,-19,-6,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-14,9,58,11,-9,-28,-22,-18,-34,-18,-24,-24,-3,-28,-18,-22,-6,-10,-18,-46,-26,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-34,-32,-39,-29,46,-26,-24,-7,-26,1,-7,-29,-30,-30,-20,-29,-18,-12,66,28,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,46,16,-32,-8,6,-32,2,-29,-24,30,-13,2,-5,3,-7,-30,-38,-19,9;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-11,-8,-9,-11,-17,-18,-11,-9,-12,-11,3,-11,-9,-10,20,44,-2,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-3,27,-18,10,-3,-17,-4,3,-17,-3,-24,-17,42,-18,-3,-4,10,7,-22,-34,-15,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-16,-24,-20,-3,-27,-22,13,-15,10,6,-18,-23,-18,-9,-7,9,20,-26,-7,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-16,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-13,-12,-6,-10,-8,-17,16,9,-2,-24,-19,-8;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-15,2,1,-21,-4,4,-22,-4,-29,-17,15,-12,2,-5,28,11,-15,-37,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-26,-7,1,-21,-18,-4,-26,24,-21,-10,1,-16,10,46,-2,-1,-17,-23,-11,2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-21,7,-23,-7,19,-15,20,44,-20,-21,-7,-13,-19,-8,10,-18,2,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-19,26,46,-31,-19,-2,-32,5,-22,-22,2,-5,12,-4,-1,-10,-28,-33,-21,29;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-13,-1,2,-22,-5,-8,-19,-7,-27,-16,8,-10,7,-7,33,19,-12,-36,-18,5;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-7,-10,-10,-12,-13,-1,-13,-14,-7,-7,2,-18,-9,-11,6,16,-9,-31,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-24,-2,-12,-27,43,-15,-33,-15,-30,-20,6,-17,-12,-16,12,-7,-24,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-20,-11,-4,-15,-22,-11,2,-10,-3,2,-11,-16,0,-10,-3,-3,5,-28,-10,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=2,-15,-29,-12,-1,-23,-17,-17,-12,-7,-17,-9,-15,39,-6,-15,-5,-7,-15,-27,-22,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-10,-17,-11,-16,-19,25,-14,-24,-15,-15,-7,-5,-22,-14,-13,-6,-14,-19,-18,-17,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-29,-4,6,-25,-20,-5,-26,34,-23,-7,0,-14,12,36,-8,-7,-19,-21,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,44,-28,19,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,2,-28,-1,6,-25,-19,39,-19,-3,-14,0,8,-17,25,2,-6,-12,-26,-26,1,14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-3,-30,-27,-2,-29,-28,22,-21,11,8,-26,-28,-26,-21,-11,-1,35,-29,-10,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-15,-4,-5,-20,5,-14,-20,-11,-26,-18,5,-5,-6,-12,26,16,-12,-35,-20,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-28,15,29,-28,-15,-3,-26,5,-24,-18,7,5,11,-2,2,-5,-27,-31,-20,19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-21,0,5,-15,-15,-8,-19,-2,-17,-15,1,-12,-1,-2,7,11,-14,-16,-6,2;
MA   /M: SY='T'; M=5,-11,-13,-19,-16,-8,-19,-22,4,-15,-2,-2,-10,-16,-15,-16,8,23,12,-28,-11,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00425;
//
ID   AMP_BINDING_MP; MATRIX.
AC   MP00455;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Putative AMP-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4086332; R2=0.0089176; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=852; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=684; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-26; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-76,18,12,-2,-6,29,-49,-35,-48,10,25,58,-36,-11,14,35,-40,-83,-62;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-78,-8,34,4,-11,11,-10,-11,-3,-56,-19,-6,31,23,5,-16,-18,-72,30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,57,11,-36,-9,-71,-13,5,1,-3,-10,5,9,8,12,-6,-11,-1,-76,26;
MA   /M: SY='P'; M=15,-26,-14,-2,-21,-54,-13,-25,-2,-6,-56,-47,71,-26,-48,13,17,-4,8,26;
MA   /M: SY='P'; M=9,22,-18,19,-42,-18,10,-33,3,-16,-3,-26,67,17,-1,-22,21,-28,-31,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-44,-31,27,-70,-28,-4,-39,-5,-23,-35,-46,56,30,-28,11,12,42,-83,-65;
MA   /M: SY='P'; M=2,-78,-8,28,-24,-39,-40,-26,24,-11,-58,-36,77,-35,-14,-9,-2,5,-8,-45;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-28,-45,-49,-49,-68,20,-20,3,30,-15,48,48,-62,1,-43,35,18,-61;
MA   /M: SY='Q'; M=-23,-77,34,-7,-76,10,33,-43,-3,-44,-63,4,-5,51,13,36,14,-25,-84,-44;
MA   /M: SY='P'; M=12,-78,-41,-26,3,-37,-24,-33,-19,-22,-12,-36,92,-55,-49,31,6,-45,8,7;
MA   /M: SY='E'; M=-41,-80,67,68,-60,-22,-2,-82,-6,-68,-15,-28,11,-19,-19,8,11,-74,-88,-67;
MA   /M: SY='D'; M=-21,-81,88,15,-84,-31,30,-86,-50,-84,-75,35,-63,5,-6,11,-15,-80,-97,-68;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-75,-72,-24,-46,-60,-70,-12,-21,35,7,-16,64,-60,-24,-37,31,25,-80,-44;
MA   /M: SY='A'; M=74,18,-74,-48,-37,-59,-71,-27,-63,22,-32,-51,-1,-28,-67,-7,-41,12,-78,-31;
MA   /M: SY='Y'; M=12,-13,-74,-2,55,-74,25,9,-65,9,-31,-69,-70,-62,-52,-11,4,3,-61,60;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-78,-89,-78,-4,-88,-76,62,-76,42,36,-83,-76,-71,-77,-72,-61,34,-73,27;
MA   /M: SY='M'; M=-50,35,-77,-63,-45,-9,-42,34,-52,38,55,-52,32,37,-52,-8,-22,-35,-79,-60;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-80,-79,-73,85,-38,-9,-58,-68,-15,-50,-17,-79,-46,-52,-66,-65,-60,-40,101;
MA   /M: SY='T'; M=-46,-64,-59,-55,-68,-63,-67,-64,-54,-67,-60,-47,-54,-55,-62,42,108,-53,-89,-64;
MA   /M: SY='S'; M=-18,-66,-58,-52,-74,13,-60,-77,-54,-78,-68,-45,-57,-44,-59,106,-35,-66,-82,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-80,-67,-72,-84,104,-73,-94,-67,-89,-75,-52,-63,-63,-75,-46,-67,-85,-76,-77;
MA   /M: SY='T'; M=-43,-64,-58,-54,-70,-57,-64,-67,-53,-70,-63,-46,-54,-50,-61,77,92,-57,-87,-64;
MA   /M: SY='T'; M=-49,-65,-56,23,-69,-67,-67,-38,-52,-66,-60,-49,-53,-53,-61,-5,109,-53,-89,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-45,-78,-66,-70,-83,101,-72,-93,-66,-88,-74,-51,-62,-62,-74,10,-63,-84,-77,-76;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-75,-33,-16,-47,-71,16,-11,16,37,-18,26,-67,3,23,-14,19,0,-82,-60;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-88,-66,-48,-80,-62,-67,-59,-56,-60,-40,-70,130,-58,-69,-37,-53,-61,-77,-76;
MA   /M: SY='K'; M=-58,-78,-56,-36,-78,-68,-58,-81,111,-79,-64,-48,-56,-34,3,-52,-55,-74,-73,-63;
MA   /M: SY='G'; M=26,-44,-68,-67,-59,90,-72,-83,-65,-48,-42,-55,0,-61,-56,-37,-18,-62,-77,-73;
MA   /M: SY='V'; M=40,-41,-82,-70,-34,-73,-80,8,-70,-38,-29,-76,-71,-69,-73,-57,-41,82,-82,7;
MA   /M: SY='M'; M=-29,-76,-76,-13,-55,-76,-63,8,-48,0,93,-40,13,32,-17,-50,-36,42,-75,20;
MA   /M: SY='H'; M=-45,-80,-77,-64,-44,-27,80,34,-50,37,2,-68,-72,2,14,-65,-63,19,-83,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-35,-69,-7,14,-70,-37,-12,-67,-41,-48,-62,0,-4,-50,-6,49,82,-22,-86,-31;
MA   /M: SY='H'; M=-54,-47,-36,6,-31,-71,128,-82,-55,-62,-36,-38,-13,22,-54,-44,22,-65,-34,-5;
MA   /M: SY='K'; M=7,-45,18,10,-16,16,11,-75,40,-44,-62,-16,-30,25,26,3,-21,-50,-72,32;
MA   /M: SY='N'; M=24,-25,-21,-55,-77,40,-58,-80,-21,-61,-68,72,-63,-35,9,46,-39,-72,-84,-48;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-78,-82,-44,-45,-66,20,34,-70,37,19,-77,-74,-45,-71,-66,-24,25,51,63;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-85,-71,-50,-80,-73,18,-68,48,24,-78,-74,-45,0,-43,-23,44,34,12;
MA   /M: SY='A'; M=43,-71,-33,-57,11,-52,-38,-51,-55,8,-54,26,-66,12,12,14,24,-21,8,33;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-25,-4,-35,-38,25,-36,-58,-36,-17,10,46,-64,-8,-2,52,-18,-40,-29,29;
MA   /M: SY='F'; M=35,12,-60,-41,40,-11,-44,-5,-34,7,7,-69,-69,-31,-25,-14,-11,39,-74,-25;
MA   /M: SY='A'; M=43,-72,-7,42,-29,-20,-22,-68,-3,-22,-37,-18,-29,-13,3,26,3,-27,-73,29;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00427;
//
ID   NA_SOLUT_SYMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00456;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:solute symporter family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8622160; R2=0.0166798; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=461; N_SCORE=13.542; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=6,-11,-18,-15,-13,-14,-2,-19,-4,-17,-9,-7,-4,-15,-11,-17,11,9,-1,-28,-15,-13;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-12,-16,-14,-13,-11,-18,2,-13,-9,-6,-5,-17,-13,-16,10,5,11,-30,-16,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,5,-24,10,1,-29,-2,-8,-19,-5,-19,-11,0,-15,8,-8,2,-7,-12,-29,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-34,-24,12,-30,-19,26,-25,29,27,-24,-25,-18,-20,-23,-9,17,-18,2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-20,-31,-27,31,-31,-14,15,-21,8,5,-23,-29,-26,-18,-17,-7,18,-1,27,-27;
MA   /M: SY='G'; M=15,-8,-18,-11,-10,-21,16,-7,-21,-14,-18,-13,-1,-15,-9,-16,11,-3,-13,-26,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=7,-13,-26,-14,-16,-26,35,-21,-26,-17,-23,-16,-7,-2,-18,-20,-1,-13,-18,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='A'; M=27,-9,-18,-15,-13,-24,27,-19,-23,-14,-19,-15,-5,-14,-13,-19,8,-6,-13,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-16,-25,-17,-5,-11,-25,-14,-1,2,5,3,-13,-19,-5,8,-15,-9,-1,-21,-7,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-18,-29,-20,20,-24,-20,9,-25,22,7,-20,-25,-22,-20,-15,-6,6,-14,3,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-24,-36,-26,17,-34,-24,30,-30,31,17,-24,-26,-23,-24,-24,-10,17,-15,5,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,11,29,-31,-16,4,-25,13,-23,-12,12,-8,28,7,1,-8,-29,-27,-15,28;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-10,-19,-14,-6,-10,-20,-13,1,-14,7,1,-8,-17,-2,-12,-3,5,-2,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-14,-22,-16,-8,-17,-21,8,-18,5,1,-14,-18,-15,-19,1,6,12,-26,-11,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-22,-19,-27,-19,22,-26,-10,5,-24,18,6,-17,-24,-21,-17,-15,-1,2,-14,8,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-23,-32,-23,8,-26,-22,16,-25,22,11,-25,-25,-20,-21,-21,-10,9,-1,2,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-7,27,-25,31,11,-30,-8,-3,-28,-2,-28,-23,20,0,-1,-9,6,-4,-26,-36,-21,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-27,-28,-23,16,-33,-5,19,-21,20,11,-23,-27,-16,-18,-23,-10,6,2,36,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-15,-31,-16,-8,0,-21,7,-14,-7,-13,-6,-14,-21,-4,-8,-13,-8,-18,29,25,-7;
MA   /M: SY='L'; M=3,-20,-16,-23,-17,-2,-23,-18,10,-18,15,6,-19,-22,-14,-17,-9,3,11,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-13,-13,-9,-19,6,-17,-14,-13,-14,-12,-4,-13,-9,-17,15,3,-6,-26,-19,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-32,-27,3,-32,-27,31,-26,26,16,-28,-28,-24,-22,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-31,-24,-35,-26,19,-31,-24,20,-28,24,11,-27,-28,-25,-22,-25,-11,13,2,7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=2,-21,-21,-25,-18,-2,-18,-18,11,-23,17,7,-17,-22,-15,-20,-11,-5,6,-19,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-26,-21,9,-18,-22,9,-24,22,8,-22,-26,-23,-19,-16,-1,11,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='G'; M=8,-14,-23,-18,-18,-17,24,-21,-15,-20,-6,-7,-9,-19,-17,-20,-4,-9,-11,-21,-19,-18;
MA   /M: SY='I'; M=9,-22,-20,-28,-21,-7,-14,-24,16,-22,11,6,-18,-20,-19,-23,-10,-7,14,-21,-10,-21;
MA   /M: SY='I'; M=4,-22,-18,-28,-21,2,-23,-21,18,-21,13,12,-19,-21,-17,-20,-9,-2,16,-21,-5,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,5,-21,-19,-10,-15,-20,-3,-16,-4,4,-12,-20,-15,-17,0,12,5,-29,-13,-17;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-17,-23,-19,-9,-14,-21,9,-17,3,6,-12,-18,-15,-19,-3,4,11,-24,-11,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-32,-23,6,-30,-22,26,-26,30,19,-25,-26,-20,-22,-21,-8,19,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,29,-30,18,1,-11,3,1,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-9,27,76,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-6,-10,-14,-13,-10,-19,-21,-4,-12,-8,-7,-6,-14,-13,-13,15,35,8,-30,-12,-13;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-17,-30,-23,9,-25,-23,17,-22,13,9,-21,-23,-22,-21,-11,-1,19,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-20,-30,-24,24,-30,-21,13,-23,10,5,-17,-23,-24,-19,-10,6,11,-11,11,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-20,-33,-23,26,-27,-15,15,-25,32,25,-25,-27,-20,-17,-25,-10,7,-12,8,-20;
MA   /M: SY='R'; M=2,-16,-21,-18,-9,-11,-19,-15,-3,-1,4,1,-13,-19,-7,5,-9,-6,0,-22,-9,-9;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-11,-25,-23,-2,-26,-24,19,-17,7,9,-21,-24,-22,-17,-4,9,32,-29,-9,-23;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-16,-23,-19,-7,-22,-22,16,-18,0,4,-12,-18,-15,-19,3,7,19,-28,-10,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-33,-37,-33,-26,14,-25,-16,-4,-19,-1,-6,-33,-30,-18,-18,-31,-19,-12,77,34,-21;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-11,-13,-13,-10,-19,-20,-3,-11,-8,-7,-3,-14,-13,-12,13,34,7,-30,-11,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,57,20,-40,-12,2,-36,2,-28,-25,16,-10,11,-6,0,-10,-30,-36,-18,15;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-14,-14,-21,-18,-1,-25,-23,9,-17,-1,-1,-10,-17,-17,-16,6,22,15,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-36,-27,14,-34,-25,32,-27,23,18,-24,-25,-23,-24,-20,-8,23,-17,3,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-29,2,16,-36,-18,6,-22,16,-23,-4,5,-11,46,13,-1,-9,-28,-22,-11,31;
MA   /M: SY='A'; M=17,-10,-15,-16,-15,-17,8,-21,-12,-14,-12,-10,-8,-15,-15,-17,7,9,-1,-24,-18,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-16,-28,-22,7,-26,-24,17,-22,13,7,-20,-23,-22,-20,-9,2,20,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-31,-26,6,-23,-24,23,-26,21,14,-24,-26,-23,-22,-18,-8,22,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,3,-24,-8,21,-18,30,45,-23,-23,-8,-14,-23,-10,11,-20,0,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-33,-25,15,-31,-22,25,-27,30,19,-26,-27,-23,-21,-23,-8,19,-17,3,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-19,-30,-23,14,-21,-23,14,-24,10,5,-19,-23,-23,-21,-10,-5,14,-16,0,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00429;
//
ID   NA_SOLUT_SYMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00457;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:solute symporter family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2020488; R2=0.0176667; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=14.760; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=17; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=29,-18,-14,-26,-18,-12,-13,-24,9,-16,-1,-1,-16,-16,-16,-22,1,-2,15,-22,-14,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-22,-23,-28,-21,28,-18,-20,-10,-20,-8,-10,-16,-22,-23,-17,-7,-2,-8,25,12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=20,0,-15,-2,-5,-24,10,-14,-21,-11,-23,-17,2,-12,-7,-15,19,3,-11,-30,-22,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-28,-20,-22,0,6,-7,-4,-18,-7,-3,-13,-25,-17,-18,-12,-13,-6,-2,18,-22;
MA   /M: SY='L'; M=3,-25,-18,-30,-20,18,-23,-20,8,-25,26,8,-23,-25,-22,-20,-18,-8,5,-13,2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=15,-6,-21,-9,-3,-25,23,-17,-25,-11,-20,-16,-3,-12,-9,-16,5,-5,-17,-23,-23,-6;
MA   /M: SY='P'; M=12,-10,-21,-9,-2,-24,-8,-16,-18,-10,-25,-18,-6,28,-6,-16,14,4,-15,-31,-24,-6;
MA   /M: SY='P'; M=13,-17,1,-19,-11,-22,-15,-23,-14,-14,-18,-14,-17,21,-15,-22,-3,-5,-9,-30,-25,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-13,-20,-23,-23,25,-24,-16,10,-21,2,1,-2,-26,-24,-17,-11,-6,8,-16,4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-18,-22,-17,2,3,-19,-9,-20,1,-4,-12,-20,-19,-19,-4,-7,-5,-17,-9,-17;
MA   /M: SY='P'; M=11,-19,-30,-18,-8,-20,-12,-22,-16,-12,-21,-16,-19,34,-12,-20,-7,-9,-19,2,-17,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-18,-29,-24,-2,-29,-27,25,-22,14,10,-26,-17,-23,-22,-14,-4,29,-26,-9,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-22,-38,-29,31,-34,-25,26,-29,17,11,-22,-26,-29,-24,-19,-9,20,-10,10,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-31,-24,6,-31,-24,25,-26,34,16,-29,-29,-24,-21,-22,-6,25,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-33,-23,25,-31,-21,18,-30,38,15,-27,-29,-25,-21,-26,-10,10,-14,6,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-13,-10,-8,-21,9,-16,-19,-12,-21,-15,0,-12,-8,-15,21,9,-9,-29,-21,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-21,-33,-25,3,-32,-22,32,-25,27,25,-25,-25,-19,-22,-21,-8,25,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-31,-25,53,-29,-2,2,-20,7,5,-20,-29,-25,-15,-20,-10,-3,15,47,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-36,-21,-38,-30,5,-22,-30,-17,-21,-17,-17,-36,-31,-22,-21,-33,-24,-20,105,18,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-27,6,11,-28,-15,-4,-28,22,-29,-15,2,-1,6,10,2,-4,-21,-28,-14,8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='M'; M=3,-23,-1,-29,-22,2,-22,-19,10,-19,12,15,-22,-25,-19,-19,-13,-6,15,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-17,10,-3,-17,-6,0,-17,-3,-24,-17,41,-17,-3,-3,13,16,-20,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-21,2,23,-23,-14,-9,-21,2,-17,-15,-2,-6,6,-1,7,4,-16,-27,-17,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-28,-5,3,-21,-16,-2,-22,10,-23,-11,1,-8,15,13,-2,-6,-23,-10,-4,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-20,-34,-24,34,-28,-16,12,-26,29,20,-24,-28,-24,-18,-24,-10,6,-9,11,-22;
MA   /M: SY='W'; M=2,-23,-28,-26,-19,0,-16,-18,-7,-16,-10,-8,-21,-22,-14,-18,-11,-10,-8,42,11,-16;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-25,-11,-17,-28,54,-19,-34,-18,-27,-18,-1,-18,-17,-19,4,-14,-24,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-18,-22,-22,-18,-7,3,-12,0,-18,11,21,-15,-22,-11,-15,-13,-10,-2,-22,-10,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-29,-36,-27,3,-31,-23,28,-24,17,19,-25,-24,-17,-23,-24,-13,15,9,5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-18,-27,-22,-5,-17,-25,16,-21,11,6,-20,-22,-20,-21,-9,-2,19,-24,-10,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-19,-28,-20,14,-15,-20,5,-25,22,6,-21,-25,-22,-20,-17,-9,3,-14,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-19,-30,-24,-1,-22,-25,22,-24,20,11,-24,-25,-22,-22,-16,-7,22,-23,-7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-16,-19,-14,-5,-21,-16,5,-16,6,9,-9,-16,-9,-14,3,18,5,-27,-7,-12;
MA   /M: SY='G'; M=9,-17,-20,-19,-20,-10,10,-16,-7,-16,-10,-6,-14,-22,-19,-18,-3,-8,2,-15,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-19,-32,-24,6,-28,-25,24,-25,23,12,-24,-25,-22,-22,-17,-6,23,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-15,-28,-23,-4,-25,-26,23,-20,8,7,-21,-23,-21,-21,-6,-1,29,-26,-10,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-25,-30,-25,-15,-1,-24,-15,-8,-5,8,0,-21,-26,-9,14,-25,-14,-10,17,3,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-18,-20,-24,-15,-5,-22,-13,11,-7,13,24,-17,-20,-8,-9,-14,-4,9,-22,-5,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-14,-23,-20,-10,-12,-28,-18,15,-15,0,4,-10,-15,-2,-15,-2,5,9,-25,-7,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-19,-24,-17,3,-25,-18,8,-20,19,10,-20,-13,-16,-17,-13,3,5,-20,-2,-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-1,-24,-1,6,-25,21,-12,-27,-8,-23,-17,3,-13,-5,-12,4,-9,-20,-27,-23,0;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-30,-30,-20,22,-28,-22,1,-23,-1,-3,-22,9,-24,-22,-19,-12,-7,3,4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-15,-14,-7,-11,-12,-16,-10,-7,-9,-7,-6,-13,-4,-10,9,11,-4,-24,-11,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-27,-16,-17,11,-24,-5,4,-13,2,1,-15,-24,-15,-14,-16,-10,0,-2,27,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-21,-30,-22,-19,-2,4,-20,-18,-16,-9,-10,-16,-24,-16,-9,-13,-12,-17,23,-2,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-17,-1,-9,-13,-9,-13,-10,-10,-13,-11,0,-17,-11,-13,7,11,-2,-26,-8,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00429;
//
ID   ANF_RECEPTORS_MP; MATRIX.
AC   MP00458;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Natriuretic peptides receptors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3174481; R2=0.0124769; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1642; N_SCORE=24.795; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=5,11,-23,14,3,-27,-9,-7,-26,5,-20,-17,3,-13,-1,10,1,-6,-16,-27,-17,0;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,-17,-17,-7,-20,-7,-13,-17,4,-13,-10,-7,-13,-3,11,3,-3,-7,-20,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=4,29,-23,39,10,-33,-7,-7,-30,-3,-23,-23,10,-10,-3,-13,3,-7,-20,-33,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=11,-23,-17,-27,-17,0,-20,-20,10,-23,29,10,-23,-23,-17,-20,-16,-7,7,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='K'; M=11,-3,-23,-7,3,-27,-13,-13,-23,29,-23,-10,-3,-10,3,13,-3,-7,-13,-20,-13,3;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-27,-34,-27,-17,0,-23,-17,-12,-5,0,-5,-23,-27,-10,11,-27,-17,-15,41,7,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-30,-2,9,-13,8,-1,-25,-6,-18,-14,-6,-16,-3,-10,-6,-13,-24,-9,6,2;
MA   /M: SY='H'; M=4,-3,-23,-7,-3,-20,-13,58,-23,-10,-17,-3,3,-17,3,-7,-3,-13,-20,-27,6,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-24,23,9,-29,-10,-4,-29,15,-30,-19,17,-12,3,5,6,-2,-22,-33,-17,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=5,28,-23,38,9,-33,-6,-7,-29,-4,-23,-23,9,-10,-4,-14,4,-6,-19,-33,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,36,16,-30,-30,-24,-20,-23,-6,24,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,32,-33,-23,23,-30,25,13,-23,-27,-27,-23,-23,-10,13,-9,11,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-17,-23,-17,-23,-20,35,-23,-16,-20,-16,-10,-10,-23,-23,-20,-3,-13,-2,-23,-23,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-13,1,-10,-27,-20,9,-10,0,0,-20,-20,-13,-13,-7,-3,22,-30,-13,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,-19,-13,-5,-23,-6,-18,-15,-10,-20,-15,-9,19,-8,-18,10,1,-11,-27,-23,-8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11,61,-7,-17,5,-1,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-17,-16,-14,-24,25,-20,-21,-14,-17,-14,-6,-14,-14,-20,6,-7,-11,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,56,-30,-20,7,-30,24,7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-10,-16,-10,-16,-7,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,18,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,11,-30,18,7,-27,-17,0,-33,20,-23,-17,7,-17,7,42,-7,-10,-23,-27,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,36,16,-30,-30,-24,-20,-23,-6,24,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-13,20,-23,40,34,-27,-27,-13,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-26,-24,-23,-16,-7,-26,-23,8,-20,10,3,-26,13,-19,-20,-17,-7,7,-27,-14,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,-14,-18,-11,-9,-11,-17,-2,-17,6,-2,-11,-17,-11,-17,4,2,1,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,63,-32,-22,10,-30,12,4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,6,4,24,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00430;
//
ID   MYOTOXINS_MP; MATRIX.
AC   MP00459;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myotoxins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7985632; R2=0.0106216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2444; N_SCORE=29.748; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=255; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,7,-27,-20,3,-27,23,-20,-7,0,-17,27,50,-7,-10,-23,-20,-10,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-30,-10,0,-23,-25,-15,-10,30,-18,-3,-5,-12,3,15,-12,-10,-8,-20,-8,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-5,-6,-30,54,-16,-38,-15,-28,-20,0,-16,-13,-16,0,-18,-30,-22,-28,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-24,3,19,-24,2,-11,-26,-3,-19,-17,0,-8,1,-8,6,6,-21,-28,-19,10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-9,-24,-9,-2,-21,-23,-16,-12,29,-18,-4,-9,-16,-2,15,-10,-7,1,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-32,-23,3,-33,-24,29,-28,30,17,-22,-23,-19,-23,-20,-3,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,67,-30,-20,4,-30,17,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,0,-22,-20,-5,-28,20,-22,-12,-5,7,5,48,-10,-10,-22,-22,-15,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-45,-33,-23,3,-20,-23,-22,-8,-20,-18,-30,-28,-13,2,-33,-25,-28,108,20,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-18,-22,-18,-24,-17,28,-24,-11,-20,-13,-7,-13,-24,-24,-20,-4,-12,3,-24,-22,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-24,13,4,-24,-7,3,-24,19,-30,-16,38,-16,4,11,3,-4,-26,-33,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00435;
//
ID   GLUTATHIONE_PEROXID_1_MP; MATRIX.
AC   MP00460;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutathione peroxidases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4808254; R2=0.0160320; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=500; N_SCORE=13.487; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=12,-19,-17,-22,-16,-12,-18,-22,6,-9,-3,0,-18,-10,-15,-11,-4,-3,15,-25,-14,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-11,-27,-12,-1,-13,-24,-12,-7,9,-6,-2,-8,-10,0,5,-13,-9,-8,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,19,-22,24,4,-24,-14,-8,-22,-3,-15,-14,7,-13,-4,-7,3,5,-15,-32,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=1,-22,-22,-28,-17,-4,-26,-21,20,-20,18,12,-19,-20,-14,-20,-14,-6,12,-21,-5,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-12,28,-26,30,10,-30,-4,-1,-30,6,-28,-21,23,-13,3,0,3,-5,-27,-34,-18,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,61,-19,-39,-13,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-24,9,25,-24,-15,4,-23,14,-21,-13,8,-8,12,7,-1,-7,-21,-26,-13,18; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,5,-28,9,4,-17,-17,-1,-17,-2,-16,-9,1,2,-1,-7,-6,-6,-18,-22,-3,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-16,-28,-24,3,-29,-25,21,-14,8,9,-23,-25,-23,-15,-11,0,30,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-19,13,7,-27,-9,-8,-23,-5,-26,-19,8,2,2,-10,13,4,-19,-35,-20,4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-20,-33,-23,30,-29,-19,14,-29,36,17,-26,-29,-25,-19,-26,-10,7,-11,9,-22;
MA   /M: SY='S'; M=0,7,-16,7,7,-26,-4,-7,-26,4,-26,-17,9,-12,4,-1,11,0,-19,-32,-19,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,3,-26,5,11,-29,-15,-5,-20,10,-22,-10,2,-7,16,3,3,-3,-18,-27,-14,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-25,-27,-23,40,-30,2,4,-19,12,4,-22,-30,-20,-15,-22,-10,-4,15,52,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-25,-8,2,-23,-16,-7,-23,22,-20,-10,-1,-13,6,31,-4,-6,-15,-22,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-24,-4,-16,-29,54,-16,-37,-16,-29,-20,7,-20,-17,-16,1,-17,-29,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-26,-2,6,-26,-19,-3,-28,38,-27,-10,1,-13,9,27,-8,-9,-20,-21,-7,7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-15,-24,-23,-5,-24,-13,16,-18,3,5,-22,-22,-22,-18,-9,-3,30,-27,-6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-4,-30,-24,2,-30,-24,20,-26,26,13,-27,-29,-23,-22,-19,-6,21,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,8,-31,-21,24,-29,44,21,-28,-28,-20,-21,-28,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-29,12,-35,-28,36,-27,18,15,-23,-25,-25,-25,-18,-7,30,-19,1,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-12,-23,-19,-4,-28,-26,21,-16,5,5,-25,-25,-23,-17,-7,2,38,-30,-11,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,21,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,11,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-6,-4,-3,-18,-5,-13,-18,-11,-25,-18,6,-11,-3,-11,34,25,-8,-38,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-10,-28,-11,-1,-4,-24,1,-14,12,-9,-2,-9,-19,5,10,-13,-10,-15,-8,13,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-23,-20,-27,-19,26,-27,-14,4,-19,18,6,-20,-26,-21,-14,-18,-3,1,-7,15,-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,48,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=0,-1,-24,0,1,-20,-13,-10,-16,-8,-19,-12,-2,13,-5,-13,1,-2,-14,-29,-18,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-22,-5,7,-27,-14,-1,-16,6,-17,-5,-1,-12,27,9,4,-2,-16,-22,-11,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,19,-12,14,4,-14,-3,4,-13,1,-15,-10,22,-9,5,0,4,-2,-16,-20,-10,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-21,35,-30,14,1,-13,3,1,-20,-30,-14,-12,-20,-10,-8,26,71,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-24,-2,6,-22,-19,-11,-20,10,-20,-12,0,2,2,7,3,10,-16,-27,-14,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-29,15,28,-34,-6,-1,-29,4,-22,-15,2,-7,23,-2,1,-11,-28,-27,-18,26;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22,20,-29,-18,17,-28,41,21,-27,-29,-21,-19,-27,-10,8,-15,5,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-5,16,-21,8,11,-23,-10,1,-17,0,-22,-13,23,-14,10,-2,7,1,-20,-33,-17,11;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-25,2,13,-24,-16,-5,-18,0,-18,-13,-2,2,4,-7,1,-2,-17,-26,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-20,7,-29,-19,21,-27,42,23,-28,-24,-18,-20,-27,-10,10,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-28,-14,-6,1,-26,19,-6,-7,0,3,-13,-23,11,-5,-15,-11,-15,1,34,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-20,6,24,-27,-13,-5,-26,8,-20,-15,1,-10,11,6,-1,-7,-23,-27,-18,17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-26,2,11,-25,-16,-4,-27,23,-24,-13,7,-13,9,28,-2,-4,-21,-25,-13,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-26,-22,-20,25,-27,4,3,-17,11,3,-17,-29,-15,-13,-21,-10,-6,13,46,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-25,-3,4,-27,-11,-9,-24,23,-25,-10,0,-12,10,14,1,-3,-16,-24,-13,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00396;
//
ID   6PGD_MP; MATRIX.
AC   MP00461;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   6-phosphogluconate dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8489342; R2=0.0137175; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=349; N_SCORE=9.626; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=1,-24,-23,-30,-26,-8,-13,-27,22,-24,5,7,-17,-21,-21,-25,-11,-9,20,-22,-10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-32,-22,26,-27,-20,12,-28,34,12,-25,-28,-24,-20,-24,-9,6,-12,6,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-21,-15,-9,-15,-16,-14,-9,4,-8,-2,-6,-15,-4,8,-1,8,-4,-23,-10,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-7,-25,-8,6,-9,-19,-7,-18,13,-13,-8,-7,-14,0,6,-8,-8,-14,-13,2,3;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-29,0,8,-27,-20,-8,-27,38,-23,-9,-1,-13,10,30,-10,-10,-19,-21,-10,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,37,-26,51,16,-36,-9,-4,-34,-1,-26,-26,14,-10,-1,-11,2,-8,-24,-36,-20,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-28,11,21,-29,-14,-9,-26,14,-23,-16,-1,2,5,2,-3,-9,-21,-27,-18,12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-29,39,23,-33,-13,1,-33,8,-27,-22,18,-10,9,2,0,-9,-29,-34,-18,16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-25,-6,-14,-25,50,-15,-32,-12,-26,-17,4,-17,-14,-13,0,-15,-25,-18,-24,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-14,-2,1,-13,-7,-2,-9,3,-13,-6,3,-9,-1,0,3,-1,-6,-19,-8,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-15,-26,-15,-10,-4,-18,8,-12,-8,-12,-7,-13,2,-7,-10,-8,-8,-14,-5,19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-21,-26,-17,3,-29,-20,15,-17,33,15,-25,-27,-17,-13,-24,-9,11,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-26,-18,-30,-24,0,-30,-26,27,-24,19,12,-23,-24,-21,-22,-13,-1,26,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-29,47,29,-35,-12,-2,-35,2,-27,-26,12,-3,5,-8,3,-8,-28,-37,-20,17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-14,-9,-2,-19,-22,1,-17,10,-17,-6,-5,-17,6,8,-3,-1,-10,-24,-4,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-24,-14,1,-26,-14,9,-11,29,19,-22,-25,-11,-4,-24,-10,3,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-30,59,14,-39,1,-3,-40,-3,-30,-29,17,-11,-3,-11,0,-11,-30,-37,-21,6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-20,-13,-4,-14,-22,-12,-3,-2,-8,-4,-8,-15,-6,-2,0,5,3,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,-15,-23,-15,-14,-4,-19,0,-13,-3,3,-12,-14,-11,-19,2,-1,4,-21,-15,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-28,-6,-9,-27,42,-1,-35,-15,-27,-17,2,-17,-11,-15,2,-16,-27,-24,-21,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,7,-23,7,12,-32,-11,3,-22,2,-25,-10,10,-11,32,1,13,0,-24,-29,-15,22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,0,9,-29,-17,-10,-29,41,-30,-11,1,-10,9,24,-3,-6,-19,-23,-11,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-13,-6,0,-13,-20,-17,-13,-7,-11,-11,0,-9,-6,-9,17,41,-4,-30,-11,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-28,-5,4,-24,-21,-10,-24,36,-20,-7,-3,-13,6,28,-10,-6,-16,-21,-9,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-12,-13,-12,-9,-21,-21,-3,-12,-8,-7,-3,-12,-11,-12,16,38,5,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-11,-15,-11,-16,-4,-19,-7,-13,-13,-10,-7,-14,-11,-16,15,8,5,-29,-18,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-29,-9,11,-20,-26,-8,1,0,-4,4,-8,-12,14,-4,-9,-10,-8,-23,-9,11;
MA   /M: SY='N'; M=-2,17,-18,16,8,-24,-8,-4,-23,-3,-25,-19,18,-11,3,-6,17,10,-19,-36,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-11,-19,-10,-21,4,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-10,-20,11,0,-2,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,43,32,-35,-14,0,-34,8,-26,-23,13,-7,10,-2,0,-10,-29,-34,-19,21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-21,-26,-19,9,-25,-15,14,-23,27,13,-19,-26,-17,-18,-19,-7,6,-16,5,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-29,-6,-11,-30,45,-7,-35,-12,-28,-16,4,-19,-5,-10,0,-17,-30,-22,-23,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-18,-18,-8,-8,-27,-21,14,-14,3,4,-16,-18,-14,-16,-5,5,20,-28,-10,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,76,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-16,-25,-19,0,-24,-20,14,-21,21,12,-20,-23,-17,-18,-11,3,14,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-20,-7,-3,-20,-13,-17,-17,-10,-24,-17,-3,25,-7,-13,17,19,-14,-33,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-18,-27,-20,3,-28,-22,20,-26,29,13,-23,-26,-19,-20,-16,-2,16,-24,-4,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00390;
//
ID   G_GLU_TRANSPEPTIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00462;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gamma-glutamyltranspeptidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3581381; R2=0.0125485; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=877; N_SCORE=15.353; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-21,-10,-11,-11,-13,-15,-5,-14,-9,-8,0,-17,-9,-15,3,2,-6,-10,-8,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-17,-5,-1,-14,-11,-4,-14,2,-18,-9,0,-12,5,-2,11,8,-11,-18,-1,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-7,-21,-4,6,1,-19,14,-8,-5,-1,-2,-8,-14,1,-5,-10,-8,-12,-4,20,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-27,-19,-16,8,-27,0,5,-7,-4,0,-13,-22,-8,-9,-10,-6,-2,2,36,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-31,4,12,-25,-17,-6,-27,15,-25,-15,-2,-13,12,12,-5,-10,-24,-2,-8,12;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-27,-16,-8,-18,-21,-21,-7,-13,-12,-10,-19,40,-14,-19,-6,0,-9,-28,-21,-14;
MA   /M: SY='E'; M=14,-2,-23,-1,17,-26,8,-12,-25,-4,-19,-16,-4,-8,0,-12,4,-9,-19,-24,-22,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-24,-13,21,-28,-14,3,-20,10,1,-22,-11,-20,-17,-18,-9,0,-9,10,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-4,-24,-3,-4,-11,-15,-4,-16,-1,-17,-12,-6,-4,-5,-8,0,-4,-14,-12,8,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-30,-7,-10,-17,-9,-20,-12,-15,-13,-12,-11,7,-13,-18,-7,-1,-14,-9,-13,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-32,-5,-6,-21,3,3,-25,-3,-25,-14,0,11,-6,-8,-6,-12,-26,-21,-8,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-26,25,24,-27,-16,8,-24,0,-20,-17,10,-11,4,-5,-1,-9,-19,-34,-14,13;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-26,19,9,-30,8,-9,-31,-7,-29,-23,6,1,-3,-12,9,-5,-25,-33,-23,3;
MA   /M: SY='G'; M=7,-1,-21,-6,-10,-23,21,-2,-25,-12,-23,-15,7,-16,-9,-13,9,-2,-19,-27,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-29,7,-2,-33,29,-6,-33,-8,-28,-16,10,-16,5,-9,1,-14,-30,-25,-23,1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=21,-4,-10,-13,-9,-15,-10,-19,-11,-10,-12,-11,-3,-10,-9,-14,18,27,-1,-27,-15,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-20,-30,-25,30,-30,-13,13,-23,19,8,-25,-30,-25,-18,-20,-8,13,-3,23,-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=13,-25,-11,-27,-24,-4,-22,-26,18,-18,9,6,-25,-25,-24,-20,-7,-1,32,-26,-12,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-4,28,-24,39,9,-33,1,-6,-33,-5,-27,-25,12,-11,-4,-12,7,-6,-23,-35,-21,3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-25,7,22,-27,-14,-6,-27,16,-23,-16,1,-8,9,12,2,-5,-20,-27,-16,15;
MA   /M: SY='D'; M=-19,23,-31,34,6,-26,-14,7,-28,-5,-21,-13,5,-15,-2,-10,-9,-14,-25,-11,-6,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-2,25,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,41,-16,0,-4,22,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=36,-15,-10,-23,-15,-15,-8,-23,1,-13,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,14,-23,-17,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,-14,-23,-17,-5,-14,-17,4,-15,3,-1,-18,-20,-16,-19,-3,-2,11,-16,-2,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-17,-7,-4,-9,-15,-3,-13,-7,-17,-10,-1,-15,3,-7,16,17,-10,-19,7,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,36,-21,20,8,-21,-3,9,-21,1,-29,-20,52,-17,3,0,9,-1,-30,-39,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-7,-22,-7,-8,-12,-10,-14,-7,-15,7,0,-10,-19,-5,-13,-8,2,-8,-24,-10,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-24,-27,-24,-18,9,-27,-10,2,-19,13,2,-24,-15,-15,-16,-21,-6,-6,12,22,-18;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-18,-36,-27,71,-27,-18,0,-27,9,0,-18,-27,-36,-18,-18,-9,0,9,27,-27; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-27,-9,-18,-27,63,-18,-36,-18,-27,-18,0,-18,-18,-18,0,-18,-27,-18,-27,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-9,-10,-6,-15,-5,-15,-12,-9,-15,-12,-1,-9,-6,-12,20,18,-3,-26,-15,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-11,-4,-13,-11,-18,2,-14,-18,1,-11,-2,-8,-19,-8,-4,-10,-11,-12,-22,-14,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-14,-29,-27,0,-29,-27,32,-20,11,11,-24,-24,-24,-20,-11,-2,40,-24,-6,-27; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-14,-21,-16,-9,-6,-21,10,1,-5,3,17,-12,-19,4,1,-13,-9,-2,-15,7,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-11,-2,-5,-16,-8,-14,-10,-9,-14,-11,-1,-12,-8,-13,15,11,0,-28,-15,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-31,-5,-2,-24,-5,-12,-21,-3,-25,-17,-4,40,-6,-3,-5,-9,-25,-25,-23,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-1,-24,2,0,-22,4,-11,-19,1,-17,-11,-2,-14,-5,0,-5,-10,-12,-23,-16,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-12,-7,-7,-6,-13,-10,-10,-9,-13,-10,0,-12,-6,-9,18,28,-4,-22,0,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-35,-29,0,-34,-26,39,-24,16,22,-24,-24,-21,-24,-16,-6,35,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-27,-19,-33,-23,34,-26,-20,8,-27,26,8,-23,-27,-27,-20,-21,-9,5,-8,9,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,33,5,-25,-3,7,-25,0,-30,-23,50,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00404;
//
ID   ZN2_CY6_FUNGAL_1_MP; MATRIX.
AC   MP00463;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zn(2)-C6 fungal-type DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2398543; R2=0.0077010; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=338; N_SCORE=6.840; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=294; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-1,-3,-21,-7,-4,-15,-11,-6,-12,-2,-13,0,-1,-7,-3,-5,0,0,-11,-25,-10,-4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-2,-18,-5,-5,-15,-8,-10,-10,-5,-10,-7,1,-10,-5,-7,2,1,-7,-25,-13,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-20,1,3,-20,-9,-4,-17,-1,-19,-12,3,0,0,-4,6,1,-14,-26,-14,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,4,-22,2,2,-23,-2,-6,-22,4,-22,-12,7,-7,3,2,5,0,-18,-26,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-21,-6,-4,-15,-7,-11,-13,-3,-14,-8,0,-10,-4,-5,2,0,-9,-25,-13,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-4,-4,-23,-5,-3,-19,-8,-9,-13,-2,-12,-7,-1,-7,-3,-5,-3,-4,-11,-25,-14,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-22,-7,-3,-18,-11,-8,-15,7,-15,-6,0,-12,-1,7,-1,0,-11,-24,-10,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-25,-6,0,-22,-11,-7,-17,6,-19,-8,-2,-3,5,2,0,-2,-14,-25,-13,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-7,-1,-18,-13,-10,-20,13,-19,-9,-2,-8,3,12,-2,-2,-15,-22,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-9,-1,-21,-15,-2,-21,16,-18,-6,-2,-11,7,26,-5,-6,-15,-23,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-23,-6,0,-20,-11,-1,-20,10,-19,-8,2,-14,4,14,0,-3,-15,-24,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-23,-6,0,-20,-17,-5,-24,22,-21,-10,1,-16,4,36,-5,-6,-17,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=1,-13,-19,-16,-12,-11,-16,-18,0,-9,-5,-3,-9,-12,-11,-10,0,2,4,-26,-11,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-21,-10,-4,-13,-15,-9,-14,2,-16,-8,-1,-10,-2,6,4,3,-9,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-23,-9,-3,-12,-19,-5,-14,6,-11,-5,-3,-15,1,8,-4,1,-11,-21,-5,-2;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-13,-15,-10,-20,7,-18,-14,-12,-16,-13,-6,-10,-10,-18,14,2,-4,-25,-21,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-9,4,-24,7,-1,-16,-19,-10,-9,-9,-6,-8,-3,-17,-5,-11,-5,-2,-7,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-4,-14,-9,-5,-9,-17,-1,-12,-6,-12,-7,2,-17,-2,-2,1,2,-10,-25,-7,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-27,-8,0,-21,-19,10,-29,23,-21,-9,1,-19,8,49,-8,-9,-20,-21,-7,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-26,-8,1,-19,-19,-8,-17,16,-14,-6,-3,-16,7,22,-6,-6,-12,-22,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-27,-9,0,-20,-19,-3,-24,24,-17,-8,-2,-17,7,42,-8,-8,-16,-22,-9,0;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-2,8,-28,-20,0,-30,42,-27,-9,1,-13,11,35,-10,-11,-21,-21,-8,8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-20,-24,-18,-6,-28,-21,17,-12,7,8,-17,-22,-14,-11,-10,-1,18,-23,-6,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,6,-27,-18,-8,-29,40,-26,-10,0,-13,9,38,-9,-9,-19,-21,-11,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-25,47,14,-33,-9,-2,-33,-2,-28,-26,19,-9,-1,-8,4,-4,-26,-38,-20,6;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-27,-7,2,-21,3,-8,-24,4,-18,-10,-4,-14,1,6,-4,-11,-18,-20,-14,1;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-20,-4,1,-17,-8,-7,-14,2,-13,-7,0,-13,2,1,-1,-3,-10,-22,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-24,-5,3,-15,-17,-5,-15,11,-12,-5,-3,-9,5,12,-7,-7,-13,-15,-6,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-19,-5,-1,-14,-6,-9,-11,-4,-13,-9,-8,26,-5,-7,-4,-6,-13,-15,-13,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-16,-11,-5,-11,-14,-8,-8,-5,-12,-5,-7,9,-5,-7,-2,-2,-8,-20,-10,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-7,-20,-9,-4,-14,-4,-11,-16,-7,-14,-9,-2,-15,0,-4,7,2,-12,-22,-11,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,7,-23,1,2,-22,-10,-1,-22,10,-21,-12,15,-15,6,19,1,-3,-20,-28,-15,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-20,-14,-5,-13,-22,-16,1,-5,-2,-1,-10,-16,-5,-4,-3,1,4,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-24,-6,3,-22,-16,-8,-19,17,-19,-9,0,-14,5,16,0,-2,-13,-23,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-22,-11,-8,-5,-18,2,-9,-4,-5,-1,-3,-20,-4,3,-6,-4,-8,-20,2,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,9,-20,5,2,-21,8,-2,-22,2,-21,-13,15,-12,3,1,3,-6,-21,-23,-15,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-19,-17,-9,-2,-25,-15,2,-11,9,3,-15,-20,-10,-8,-12,-3,2,-19,-2,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-16,8,9,-18,-9,-6,-16,2,-14,-11,1,2,2,-3,0,-3,-14,-20,-13,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-9,55,-14,-14,-12,-16,-12,-17,-14,-12,-11,-8,-21,-14,-14,-5,-6,-7,-27,-15,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-12,-2,3,-8,-9,-2,-6,-2,-5,-3,-3,-4,2,-2,-2,-2,-6,-12,-5,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-10,60,-15,-16,-11,-14,-16,-16,-16,-11,-11,-10,-21,-16,-16,-5,-5,-6,-26,-16,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-20,-13,-5,-10,-22,-8,-2,-5,-6,-1,-8,-17,-4,-3,-2,4,3,-25,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-25,-19,-18,23,-23,1,-1,-14,0,-1,-16,-26,-15,-13,-16,-9,-6,10,41,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-5,1,-23,2,1,-17,-15,-4,-14,-4,-13,-8,0,-6,-2,-6,1,-1,-13,-27,-9,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,5,8,-23,-15,-8,-19,2,-18,-13,-1,0,2,0,-2,-5,-16,-28,-16,3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-28,-2,3,-22,-15,-4,-17,5,-20,-10,1,1,4,5,-3,-7,-17,-26,-14,2;
MA   /M: M=-6,-10,-24,-10,-5,-10,-18,-11,-12,0,-10,-6,-8,-3,-6,-1,-4,-2,-10,-22,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-25,-8,-4,-17,-15,-11,-15,6,-12,-7,-4,-14,-1,10,-6,-4,-11,-19,-11,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-27,-5,0,-20,-14,-5,-22,12,-20,-10,-1,-6,1,18,-5,-5,-18,-19,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-24,-7,-1,-17,-15,-8,-19,10,-16,-8,-1,-14,1,14,-3,-4,-15,-19,-9,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-25,-8,-1,-19,-9,-11,-16,6,-16,-8,-4,-10,-1,5,-4,-5,-12,-22,-11,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-24,-6,-1,-17,-14,-10,-13,1,-13,-8,-3,-5,-2,3,-3,-5,-11,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-22,-3,-1,-20,-11,-8,-19,2,-19,-12,-1,-3,-2,1,1,-3,-15,-26,-13,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-23,-6,0,-20,-13,-10,-17,4,-18,-10,-2,-3,1,4,4,2,-13,-27,-14,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: M=-4,-7,-24,-9,-2,-16,-11,-9,-12,-1,-13,-8,-3,-10,-2,-1,0,-2,-11,-24,-10,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00378;
//
ID   RIBOSOMAL_L22_MP; MATRIX.
AC   MP00464;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L22 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3973899; R2=0.0195222; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=179; N_SCORE=9.882; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=6; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-23,7,9,-24,-12,-3,-21,9,-21,-12,12,-13,6,7,3,-2,-19,-29,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-30,-20,8,-29,-19,20,-27,44,23,-28,-28,-18,-19,-27,-9,11,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-23,-18,12,-29,-10,5,-6,1,2,-17,-24,-15,-3,-15,-6,7,-6,19,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,16,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='S'; M=1,-6,-19,-8,-1,-15,-16,-13,-14,6,-17,-9,-3,-13,-2,1,7,6,-6,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-10,3,-26,4,15,-24,-18,23,-25,7,-21,-10,4,-11,10,4,0,-4,-22,-28,-5,11;
MA   /M: SY='V'; M=14,-22,-3,-29,-23,-9,-22,-26,15,-20,3,3,-19,-21,-20,-24,-6,-4,20,-25,-13,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-13,-20,-16,-5,0,-20,-9,-8,-5,-7,-2,-11,-18,-4,-4,-6,-5,-6,-9,4,-5;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-12,-26,-22,-8,-20,-26,16,-17,2,3,-22,-19,-22,-20,-3,0,29,-26,-13,-22;
MA   /M: SY='B'; M=-13,28,-24,28,6,-28,1,14,-30,-4,-28,-20,28,-16,1,-6,3,-8,-29,-36,-16,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-28,4,20,-29,-15,-3,-27,20,-23,-12,1,-9,18,17,-2,-8,-23,-24,-14,19;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-24,-12,-17,-26,47,-20,-30,-18,-25,-17,-2,-18,-17,-19,5,-12,-19,-23,-26,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-30,-16,-9,-18,-16,-19,-8,-11,-15,-8,-14,32,-11,-14,-6,-4,-12,-26,-19,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-17,-16,-10,-9,-23,-19,2,-5,-5,-1,-10,-17,-10,-4,2,11,11,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-21,-27,-17,1,-25,-12,15,-18,23,24,-21,-23,-7,-12,-19,-8,7,-18,-1,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-5,-29,41,-27,-9,1,-13,14,38,-9,-10,-21,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-30,-9,-1,-23,-8,-4,-31,25,-23,-11,0,-19,6,52,-8,-11,-21,-20,-13,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-24,-29,-21,27,-25,-14,0,-17,3,1,-18,-25,-20,-7,-16,-7,-2,8,16,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-20,-16,-8,-12,-22,-4,-9,2,-8,4,-7,-18,2,7,-8,-3,-9,-15,-3,-4;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-29,-13,-5,-23,-17,-18,-16,-11,-23,-16,-18,57,-11,-20,-7,-8,-21,-25,-20,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,7,-30,27,-20,-9,1,-20,10,65,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-12,-18,-10,-21,6,-19,-13,-11,-13,-11,-8,-11,-10,-19,11,-1,-3,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-28,-11,0,-12,-21,5,-20,18,-15,1,-4,-17,10,28,-11,-11,-17,-16,-2,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-27,-8,0,-20,-17,-1,-29,25,-22,-11,1,-18,9,58,-4,-6,-19,-23,-11,1;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-15,-16,-12,-20,8,-19,-12,-13,-14,-11,-6,-13,-12,-19,10,-1,-3,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,5,-18,0,-7,-1,-12,-5,-15,-10,-16,-13,8,-17,-9,-10,8,11,-12,-21,1,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-28,-13,-4,-20,-18,-12,-14,2,-15,-7,-11,16,-2,9,-6,-6,-14,-25,-16,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-29,-33,-24,3,-34,-23,28,-19,11,11,-20,-22,-17,-20,-19,-10,17,-6,6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-25,-1,4,-14,-18,-3,-16,8,-11,-6,5,-17,3,11,-6,-6,-15,-24,-7,2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-26,-2,7,-26,-17,-9,-27,34,-26,-11,2,-11,8,26,-2,-3,-17,-23,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-29,-8,1,-18,-19,-8,-22,6,-21,-13,-6,14,3,17,-4,-4,-20,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-16,-14,-11,-3,-19,-14,-8,-12,-7,-3,-4,-7,-9,-11,9,26,-4,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='C'; M=2,-11,37,-16,-15,-17,-16,-20,-18,-18,-20,-16,-6,-23,-15,-19,14,9,-4,-41,-21,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-18,9,-28,7,1,-21,-16,79,-29,-8,-22,-5,19,-19,8,-1,-6,-16,-30,-32,11,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,24,19,-23,-23,-21,-26,-20,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-20,-3,8,-11,-21,-10,-14,-2,-11,-10,-3,-11,0,-4,6,16,-9,-24,-6,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-33,-27,1,-33,-27,35,-25,19,17,-24,-25,-23,-23,-16,-5,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-18,-23,-16,-6,-27,-23,18,-13,4,8,-19,-21,-16,-15,-8,0,24,-26,-8,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-26,4,-30,-26,27,-24,27,15,-29,-29,-25,-20,-19,-5,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-21,0,7,-24,-2,-10,-24,3,-22,-15,3,-11,1,3,9,3,-17,-28,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-28,21,36,-28,-18,-3,-25,5,-20,-18,5,-4,10,-3,0,-7,-23,-31,-18,23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-6,-24,-7,0,-19,-18,-11,-12,8,-14,-7,-4,-12,1,8,-4,-4,-6,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-24,4,17,-24,-14,-7,-21,5,-20,-14,-1,-3,4,0,3,-2,-16,-28,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,4,15,-19,-16,-5,-18,6,-15,-12,3,-13,4,4,-2,-6,-15,-27,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-22,-3,5,-16,-12,-10,-12,-3,-12,-8,-3,-14,-2,-7,0,-3,-8,-25,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-25,-1,1,-23,-15,-12,-15,7,-17,-9,-4,-8,0,4,-3,-4,-9,-26,-15,0;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-24,5,19,-23,-12,-5,-20,2,-17,-13,1,-2,9,-4,1,-5,-20,-25,-16,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-23,-1,10,-16,-13,-5,-19,10,-15,-10,-3,-11,3,3,-2,-6,-15,-17,-3,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=6,-6,-19,-6,7,-17,-15,-13,-11,0,-8,-8,-7,-8,-2,-5,0,-2,-7,-24,-14,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-17,6,13,-19,-9,-4,-17,11,-16,-10,4,-6,6,4,1,-4,-14,-18,-11,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-23,0,4,-18,-7,-4,-21,-3,-18,-12,0,-8,1,-7,2,-2,-17,-22,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-6,-18,-7,1,-13,-18,-11,-11,-1,-10,-6,-4,-15,1,-3,2,1,-6,-25,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-10,-24,-12,-2,-19,-18,-11,-8,7,-11,-2,-8,-16,5,7,-5,-6,-4,-23,-10,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00387;
//
ID   POU_2_MP; MATRIX.
AC   MP00465;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   POU-specific (POUs) domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6616945; R2=0.0128486; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=803; N_SCORE=14.969; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=144; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=16,-4,-13,-13,-11,-16,-2,-20,-14,-11,-13,-11,-3,-11,-11,-14,14,25,-4,-26,-16,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-28,34,17,-37,-12,6,-29,4,-26,-17,19,-12,24,0,2,-8,-30,-32,-16,20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-10,-26,-10,7,-20,-25,-8,-4,2,-2,2,-10,-15,16,-1,-10,-9,-7,-22,-9,11;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-11,-21,-11,-18,-4,-21,-6,-11,-8,-8,-10,-11,-11,-20,9,2,2,-21,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=16,-7,-18,-11,-12,-23,24,-18,-23,-14,-22,-16,-1,-14,-12,-17,14,3,-13,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-3,-14,-13,-9,-18,-7,-16,-9,-3,-13,-9,-1,-14,-9,-11,6,2,-1,-25,-17,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-16,-21,-16,-1,-26,-19,6,-15,17,5,-17,-22,-15,-7,-8,12,9,-25,-6,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-6,-28,-5,12,5,-24,12,-19,1,-12,-8,-6,-16,-1,-2,-10,-11,-19,-10,14,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-13,-29,-13,-20,-24,56,-20,-31,-21,-18,-14,-4,-21,-20,-20,-4,-19,-24,-20,-26,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-29,-5,1,-26,-16,-15,-21,3,-28,-17,-5,38,-4,-6,1,1,-22,-30,-22,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=21,-6,-15,-7,-2,-18,-12,-18,-5,-9,-8,-8,-11,-14,-10,-16,2,-2,6,-26,-17,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-31,-24,46,-30,-6,5,-23,16,5,-22,-30,-25,-17,-22,-10,-1,9,40,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-11,-5,-4,-16,-10,-15,-16,-6,-21,-15,5,-10,-4,-8,28,32,-6,-34,-15,-4;
MA   /M: SY='T'; M=17,-3,-10,-13,-10,-13,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,33,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,106,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28,-5,-7,-10,-49,-29,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-22,-31,-24,58,-28,6,-6,-26,4,0,-14,-28,-29,-16,-18,-12,-6,1,28,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-26,14,45,-26,-20,-4,-26,6,-18,-18,0,-2,14,-2,4,3,-24,-30,-18,29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-19,-13,-10,-17,-7,-15,-4,-6,-13,-7,2,-14,-7,-12,5,-2,-3,-26,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-20,-25,-14,3,-27,-16,13,-24,37,15,-24,-26,-10,-16,-22,-8,4,-22,-3,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,8,-26,7,9,-29,-17,2,-23,9,-21,-9,9,-13,25,17,2,0,-24,-26,-12,16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-19,-25,-17,2,-25,-19,15,-26,29,11,-20,-24,-16,-19,-14,-4,8,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-14,-1,-1,-19,-7,12,-21,-10,-25,-14,9,-12,1,-8,27,15,-13,-37,-10,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-27,-23,-16,20,-25,-4,-8,-19,-8,-6,-17,12,-22,-17,-14,-10,-9,-13,4,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-4,5,-27,1,9,-30,-15,-4,-24,28,-26,-9,8,-11,17,16,-3,-8,-22,-23,-12,13;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-21,18,13,-22,-4,5,-22,1,-28,-20,41,-14,4,-1,12,0,-28,-38,-20,9;
MA   /M: SY='M'; M=19,-16,-16,-26,-16,-10,-12,-11,8,-11,6,24,-15,-15,-6,-16,-6,-5,6,-20,-10,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-17,31,-22,-13,-21,-27,-16,-14,-15,-14,-7,-15,-26,3,-15,-11,-12,-13,-15,-13,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-27,1,18,-29,-17,-9,-27,33,-25,-12,-1,-8,9,16,-5,-9,-19,-22,-14,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-20,-19,-16,4,-24,-14,11,-24,33,11,-11,-28,-16,-16,-21,-8,1,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-26,-5,2,-22,-20,-9,-26,31,-22,-10,0,-13,6,34,-4,3,-16,-22,-10,2;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-34,-16,-7,-22,-22,-21,-4,-14,-18,-11,-17,52,-11,-21,-7,-7,-14,-28,-22,-14;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-19,-31,-22,-1,-26,-24,23,-24,24,12,-23,-23,-19,-23,-16,-7,18,-21,-6,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,4,-26,5,19,-31,-15,0,-24,16,-25,-11,6,-9,26,9,5,-4,-24,-27,-14,22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-26,-3,12,-27,-16,-9,-26,30,-23,-11,-2,-10,8,23,-5,-8,-18,-21,-13,9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00035;
//
ID   ZF_TFIIS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00466;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger TFIIS-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4901061; R2=0.0131250; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=645; N_SCORE=12.946; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-25,-18,-11,-3,-21,3,0,-9,-3,4,-12,-22,1,-5,-10,-8,-2,-13,11,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-24,23,10,-27,-10,5,-25,-3,-22,-17,11,-12,0,-8,4,-5,-19,-33,-14,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-25,-1,7,-24,-12,-7,-11,-2,-13,-5,-2,-13,10,-6,-2,-7,-11,-26,-14,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-25,-7,-5,-16,5,-6,-15,-10,-15,-5,-3,-13,-2,-12,1,-7,-15,-19,-6,-5;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-21,-5,-1,-12,-10,-11,-18,-4,-18,-12,-1,-4,-1,-8,5,0,-14,-23,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-25,15,5,-20,-18,-9,-17,0,-11,-12,2,-16,-4,-3,-5,-3,-12,-25,-12,1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-22,-10,-2,-19,-17,-17,-11,-4,-16,-10,-11,14,-8,-11,-4,-2,-9,-28,-18,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-2,-20,-4,2,-17,-13,-11,-12,-7,-7,-7,-2,-13,3,-8,4,13,-10,-27,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-12,-24,-12,-11,-13,1,-15,-10,-10,4,-1,-11,-22,-10,-9,-13,-12,-9,-22,-12,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-28,-5,5,-24,-17,-16,-18,-8,-20,-16,-11,39,-6,-15,0,3,-19,-29,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-20,-10,-5,-17,-20,-13,-14,9,-15,-7,-4,-13,0,16,3,11,-4,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-15,-12,-10,-9,-19,-14,-4,-10,-10,-7,-3,-14,-6,-9,13,24,1,-26,-4,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-25,18,5,-23,-13,-6,-21,1,-11,-11,6,-16,-2,0,-6,-6,-17,-30,-14,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-16,-6,2,-25,0,-6,-4,-4,-2,-8,-19,-7,4,-10,-6,-5,-16,4,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-26,-3,11,-23,-19,-10,-21,10,-20,-13,-4,5,4,9,1,1,-17,-26,-16,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-33,-9,-3,-28,-8,-17,-19,-10,-27,-17,-12,52,-6,-17,-3,-8,-24,-29,-26,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,-1,5,-26,-15,-6,-26,31,-26,-11,7,-13,8,27,-3,-7,-19,-23,-13,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-4,-29,-4,-4,-28,20,3,-34,6,-28,-14,2,-16,-3,3,-3,-15,-26,-23,-15,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-9,8,-24,4,6,-24,-12,30,-25,3,-25,-10,16,-15,13,3,6,-5,-24,-31,-5,8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,8,-29,9,12,-26,-16,8,-28,19,-24,-12,9,-10,8,22,-5,-10,-24,-27,-11,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-26,13,22,-25,-6,4,-26,5,-22,-15,16,-11,7,1,1,-7,-26,-31,-17,14;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,10,-19,-16,-14,-13,-16,-7,-13,-7,0,-7,-19,-12,-17,1,3,0,-29,-16,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-15,-19,-18,3,-22,-16,4,-15,-2,-2,-11,-20,-17,-15,2,13,11,-19,3,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-26,-30,-29,-22,38,-27,-7,-5,-19,-3,-5,-23,-14,-22,-16,-21,-13,-12,31,40,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-28,-23,-18,16,-22,7,-8,-13,-4,4,-12,-24,-12,-8,-17,-10,-12,19,23,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-25,-9,6,-22,-23,-3,-6,-3,-4,5,-6,-13,25,-2,-3,0,-12,-22,-8,15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-19,-20,-13,-7,-22,-15,5,-12,8,7,-14,-21,-7,-4,-6,0,6,-25,-8,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,17,-37,-20,21,-21,7,-20,0,1,-11,54,9,-1,-11,-30,-21,-6,35;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-14,-12,-8,-11,-19,-14,-6,-11,-3,0,-4,-13,-3,-9,11,28,-2,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-29,-11,-1,-20,-19,-1,-29,27,-19,-10,-1,-19,9,64,-9,-9,-19,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='S'; M=9,-5,-12,-8,-3,-20,-7,-10,-21,1,-23,-15,2,-14,0,11,18,6,-11,-30,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-14,-16,-9,-20,3,-18,-14,-7,-13,-11,-7,-12,-8,-13,9,-1,-5,-22,-19,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-27,19,47,-28,-19,-3,-28,6,-19,-19,1,-2,14,-2,3,-1,-26,-31,-19,31;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-29,-7,0,-26,0,-15,-21,-10,-25,-15,-9,33,-7,-16,2,-6,-22,-29,-25,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-12,-23,-15,-2,-14,-16,-5,-1,-7,-2,20,-12,-1,5,-9,-6,-6,-6,-25,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-13,-14,-12,-8,-22,-19,-5,-9,-4,-5,-6,-15,-11,-3,9,32,5,-28,-9,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-17,-24,-19,-2,-27,-21,12,-14,12,6,-18,-23,-17,-6,-9,6,17,-25,-7,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-23,-33,-25,56,-29,-12,-1,-19,5,0,-17,-28,-28,-7,-19,-10,-2,7,30,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-9,-25,-23,24,-29,5,0,-17,0,0,-19,-30,-19,-15,-16,-9,1,3,39,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-14,-16,-16,-10,-9,-23,-19,1,-2,-4,-1,-13,-19,-12,-3,-3,7,12,-26,-10,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-7,-8,-7,-6,-14,-11,-1,-9,-1,-3,-1,-8,-8,-9,0,9,0,-20,-8,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=-8,11,-26,11,11,-26,-10,9,-27,9,-24,-14,11,-13,6,7,0,-8,-22,-29,-12,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-27,-7,-11,-28,39,-17,-34,-4,-28,-17,0,-16,-11,-8,3,-11,-24,-22,-24,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-27,-4,-3,-4,-18,37,-20,-2,-17,-5,11,-20,3,1,-8,-12,-23,-19,12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-9,0,-19,-20,1,-15,9,-15,-6,0,-16,7,20,-3,-1,-12,-24,-8,1;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-31,-36,-34,-22,34,-24,-23,-13,-21,-8,-12,-28,-27,-24,-18,-28,-20,-18,77,25,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-24,-6,3,-21,-19,-10,-21,22,-20,-10,-1,-12,4,23,-1,4,-13,-23,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-25,0,17,-7,-15,-10,-21,-6,-17,-16,-5,3,-3,-10,1,-2,-20,-24,-12,8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,4,-5,7,-3,-17,-18,-3,-22,-9,-21,-17,0,-4,-4,-12,-4,-7,-21,-24,-1,-6;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-4,19,-18,18,10,-23,-7,-4,-23,-3,-26,-20,20,-11,1,-6,18,10,-19,-37,-19,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00383;
//
ID   RIBOSOMAL_L2_MP; MATRIX.
AC   MP00467;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4969096; R2=0.0122652; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=569; N_SCORE=11.466; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=164; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-16,-22,-18,-7,-12,-27,-15,5,-3,0,3,-13,-19,-4,5,-11,-6,6,-24,-8,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-15,-4,-6,-17,-12,-10,-9,-1,-18,-10,8,-17,-4,-3,10,5,-3,-33,-15,-5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-25,-18,-14,-4,-19,-13,4,-11,8,5,-11,-22,-12,-11,-16,-10,0,-19,-3,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-14,-28,-16,-20,-8,32,-10,-23,-16,-17,-7,-7,-22,-16,-15,-7,-16,-20,-8,-1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-6,-31,-7,3,-18,-21,-11,-27,37,-25,-10,-4,-14,4,28,-13,-12,-19,-5,-4,4;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-11,-18,-12,-17,-5,-19,-5,-11,-8,-8,-7,-14,-12,-18,8,1,5,-24,-18,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-27,-5,-11,-27,41,-14,-34,-4,-28,-17,5,-17,-11,-5,-1,-15,-26,-20,-23,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-25,-10,-3,-18,-8,-5,-26,16,-19,-10,-1,-17,3,42,-4,-8,-17,-19,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-22,0,-4,-22,8,-7,-24,3,-26,-14,15,-15,-3,-1,9,0,-20,-28,-16,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-11,-12,-14,-6,-18,-22,-9,-21,16,-17,-8,-4,-21,1,39,-8,-5,-12,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-43,-28,-21,1,-19,-13,-21,-10,-20,-16,-24,-26,-13,-9,-30,-24,-28,95,20,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-15,-14,-7,-2,-16,-8,2,-4,14,9,-12,-16,-4,4,-14,-6,-1,-13,-2,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-19,-5,-12,-20,44,-13,-26,-13,-19,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-19,-13,-19,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-19,-13,-8,-6,-17,-10,0,4,-5,0,-7,-13,-4,9,-10,-7,0,-5,-2,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-19,-6,0,-13,-13,-1,-18,18,-12,-6,0,-13,6,41,-7,-6,-12,-13,-6,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-23,-7,0,-19,-20,5,-18,8,-16,-6,0,-15,9,14,0,5,-13,-24,-5,2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-11,-23,-25,-3,-26,-25,20,-17,4,5,-19,-26,-24,-17,-4,7,37,-31,-11,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-12,-23,-22,-6,-22,-25,17,-18,1,3,-18,-23,-21,-19,2,6,30,-30,-12,-22;
MA   /M: SY='A'; M=32,-16,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-4,-3,-16,-17,-17,-20,4,1,16,-24,-17,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-21,-26,-16,-4,-20,-1,14,-3,14,52,-18,-19,2,-5,-19,-10,6,-20,-1,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-9,-26,-18,-18,67,-10,-19,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,0,-28,-28,-4,-29,-27,22,-21,5,6,-21,-29,-26,-21,-10,-2,35,-31,-12,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,2,-27,-3,-4,-8,-18,69,-23,-11,-16,0,13,-21,3,-3,-9,-16,-25,-27,14,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-29,57,-17,-39,-13,-29,-19,0,-20,-16,-7,-1,-19,-29,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,11,-26,12,34,-26,-11,-2,-26,4,-21,-18,8,-6,11,-2,3,-4,-25,-30,-19,23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-18,-7,-12,-19,42,-13,-25,-12,-18,-12,0,-12,-12,-13,0,-12,-18,-13,-19,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,3,-23,-20,12,-29,29,-22,-8,1,-17,9,45,-10,-12,-21,-22,-5,3;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-11,-7,-1,-22,-12,-9,-16,-5,-18,-10,2,-12,8,-7,16,16,-11,-29,-14,3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-28,-8,-5,-22,-7,4,-19,-10,-24,-13,-3,18,-5,-11,2,-6,-20,-30,-15,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,-26,-20,-14,-16,-6,-20,4,-14,-7,-1,-11,-7,-11,-17,-7,-8,1,-22,-13,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-29,-10,-16,-28,50,-17,-36,-14,-29,-19,-1,-12,-15,-12,0,-16,-27,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-2,-29,-3,4,-22,-15,19,-28,17,-21,-8,6,-17,8,32,-8,-12,-23,-24,-6,3;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-11,-28,-10,-1,-23,-15,-5,-23,8,-22,-13,-6,13,0,17,-3,-7,-19,-24,-16,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00384;
//
ID   COBALAMIN_BINDING_MP; MATRIX.
AC   MP00468;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic cobalamin-binding proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7974854; R2=0.0168952; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=559; N_SCORE=15.232; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=42; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=13,-17,-17,-21,-13,-7,-16,-2,0,-19,15,5,-16,-20,-11,-17,-11,-7,0,-21,-5,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-23,-20,-26,-23,22,-26,-5,7,-16,3,1,-21,-27,-20,-16,-13,-6,9,4,34,-23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-16,-15,-7,-19,-9,-14,-16,2,-13,-10,-5,-13,-4,9,5,4,-6,-21,-15,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-20,-30,-23,20,-29,-23,12,-24,14,5,-26,-12,-27,-20,-18,-7,15,-17,0,-25;
MA   /M: SY='E'; M=15,2,-22,4,31,-26,-12,-8,-22,2,-16,-16,-4,-4,8,-8,4,-6,-18,-26,-20,19;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-30,2,4,-25,-17,29,-27,16,-27,-9,10,-4,6,10,-7,-12,-26,-27,-4,3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-21,5,0,-19,-19,-13,-12,8,-14,-8,1,-10,-2,0,0,7,-7,-24,-9,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-13,-23,-14,-12,2,-21,-6,2,-16,11,2,-10,-7,-12,-13,-16,-7,-7,-13,7,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-16,-20,-21,-15,14,-19,10,0,-14,5,12,-13,-21,-10,-11,-13,-9,-3,-6,18,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=2,-17,-18,-24,-17,8,-20,-10,3,-15,9,11,-16,-20,-13,-15,-8,3,2,-11,9,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-26,-10,-2,5,-11,6,-13,-13,-3,-5,-6,-21,-9,-11,-12,-12,-16,-11,12,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-26,-7,3,-27,-4,-5,-17,-5,-15,-6,-4,-4,20,-5,2,-6,-21,-24,-15,11;
MA   /M: SY='S'; M=3,5,-19,8,-3,-26,19,-11,-29,-11,-30,-22,9,-13,-6,-13,22,4,-19,-34,-23,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-34,-4,3,-27,-20,37,-24,-7,-24,-8,-4,27,9,-7,-9,-14,-30,-29,-5,2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-19,-32,-26,44,-29,-10,6,-26,11,4,-20,-29,-30,-18,-18,-9,10,-7,17,-26;
MA   /M: SY='S'; M=4,13,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,26,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-10,-27,-27,-1,-29,-29,24,-19,7,7,-26,-27,-27,-19,-6,7,43,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-9,-4,-24,33,-13,-26,-12,-18,-7,-4,-15,-9,-15,-2,-15,-21,-22,-23,-6;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-18,-30,-22,0,-22,-6,22,-12,18,50,-22,-22,-6,-12,-18,-8,18,-22,-2,-14;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-4,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,7,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-19,-13,-17,-17,18,-21,-17,-16,-16,-11,-4,-17,-17,-16,7,12,-6,-26,-19,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-30,-20,-34,-24,35,-30,-20,13,-30,36,13,-26,-30,-27,-20,-26,-10,6,-9,11,-24;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-19,-30,-21,4,-26,-13,21,-20,32,35,-26,-26,-13,-16,-23,-9,16,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-5,-30,-2,14,-5,-24,6,-18,12,-14,-9,-8,-15,5,4,-11,-10,-19,-3,24,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,9,-24,1,-2,-17,-13,0,-18,12,-15,-10,20,-20,1,22,-5,-6,-20,-28,-13,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-6,-20,-8,-2,-5,-14,-11,-20,9,-22,-12,0,-15,-3,8,9,2,-12,-23,-7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,1,-24,-12,-15,-7,-21,-11,15,-17,2,2,14,-21,-11,-15,-8,-6,1,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-26,-30,-26,-16,12,-27,-21,2,-22,1,-2,-22,21,-22,-21,-17,-10,-6,-15,-4,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-19,6,0,-16,-11,-2,-8,-4,-18,-12,27,-20,-5,-5,3,-1,-8,-36,-17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-8,-11,-28,34,-18,-31,-16,-30,-20,-3,10,-14,-18,5,-10,-26,-26,-28,-14;
MA   /M: SY='S'; M=-3,8,-22,12,6,-29,0,-6,-27,3,-29,-17,8,-11,8,-2,15,1,-20,-32,-18,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-9,-28,-8,12,-21,-25,-5,-5,-1,-1,1,-8,-14,20,3,-10,-10,-13,-22,-9,14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-30,4,26,-26,-20,-1,-30,25,-21,-14,0,-10,14,35,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='N'; M=1,7,-25,0,-4,-26,9,-6,-23,-7,-26,-16,16,3,-1,-10,3,-7,-26,-29,-23,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-5,-30,-2,-5,-2,-23,8,-19,9,-13,-9,-5,-23,0,25,-13,-10,-17,-2,25,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-16,-30,-19,-4,-13,-29,-13,5,1,-2,2,-9,-17,-2,16,-13,-10,1,-21,-7,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00428;
//
ID   NDP_KINASES_MP; MATRIX.
AC   MP00469;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nucleoside diphosphate kinases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6765928; R2=0.0142110; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=545; N_SCORE=12.412; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=129; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=14,-3,-20,-3,8,-20,-12,-13,-14,-3,-7,-9,-7,-8,-2,-11,-1,-5,-10,-25,-16,2;
MA   /M: SY='P'; M=0,-14,-32,-9,4,-25,-17,-17,-18,-6,-23,-17,-15,53,-7,-15,-6,-8,-23,-27,-24,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-6,-18,-30,65,-18,-39,-19,-30,-20,3,-20,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-11,-10,-10,-11,-18,-19,-8,-11,-11,-10,0,-11,-9,-11,21,43,0,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-29,-33,-26,-1,-37,-27,41,-28,22,17,-19,-21,-19,-28,-20,-10,24,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10,0,-20,-19,0,-30,28,-20,-10,0,-20,10,66,-8,-9,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-26,-11,-12,-26,34,-18,-30,-7,-25,-16,-3,-11,-12,-10,1,-12,-21,-21,-24,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-29,57,19,-36,-12,-1,-35,0,-26,-26,15,-11,2,-8,0,-9,-27,-38,-19,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-33,-25,54,-30,-8,3,-25,14,3,-21,-30,-28,-17,-22,-10,-1,10,38,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-11,-15,-12,-23,19,-19,-20,-14,-18,-14,-5,-14,-12,-19,10,-4,-10,-23,-23,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-12,-19,-14,-12,-8,-22,-18,7,-16,10,4,-13,-20,-13,-16,-9,-1,7,-26,-9,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-4,12,-20,16,9,-23,-10,-4,-21,-6,-23,-18,9,-11,1,-9,15,5,-15,-34,-15,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-23,-23,-17,-5,-28,-22,20,-15,7,9,-15,-20,-15,-16,-11,-3,17,-24,-6,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-26,2,-4,-27,24,-13,-28,-10,-24,-16,2,-11,-6,-11,4,-7,-22,-26,-22,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-27,4,20,-24,-17,-3,-26,17,-19,-13,-1,-9,9,23,-4,-9,-21,-24,-14,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-14,-25,-20,-6,-19,-23,13,-20,7,4,-17,-21,-18,-20,-4,1,17,-26,-10,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-13,-31,-27,-2,-31,-29,30,-22,10,10,-23,-24,-24,-23,-10,1,35,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=18,-3,-11,-5,-3,-21,5,-13,-19,-11,-26,-18,5,-11,-3,-13,31,13,-9,-35,-21,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-29,-12,2,-17,-24,-18,-3,-10,-7,-6,-18,22,-9,-15,-11,-8,-5,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-28,19,47,-29,-18,-2,-27,6,-21,-19,2,-2,15,-2,3,-7,-26,-31,-20,31;
MA   /M: SY='S'; M=4,5,-13,1,1,-19,-5,-9,-19,-6,-25,-18,13,-11,-1,-7,28,21,-12,-36,-18,0;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-11,-20,-11,-18,1,-19,-11,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,-1,-1,-19,-18,-11;
MA   /M: SY='E'; M=3,3,-25,3,21,-29,-13,-4,-23,12,-20,-12,1,-8,17,5,2,-7,-21,-25,-16,19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-28,-10,-2,-14,-21,-1,-21,19,-16,-7,-2,-19,5,40,-9,-8,-15,-17,-4,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-38,-28,2,-37,-27,43,-28,21,19,-21,-22,-20,-27,-20,-9,27,-19,1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-16,-4,-1,-24,-2,-12,-23,4,-21,-14,2,-12,-3,1,4,-4,-15,-26,-19,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-23,-29,-21,24,-30,-9,12,-23,23,10,-23,-28,-19,-18,-22,-10,4,-3,24,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-32,-32,-37,-28,46,-27,-18,-6,-25,-1,-6,-27,-29,-29,-19,-27,-17,-11,58,32,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-24,1,3,-26,-6,-9,-24,5,-27,-16,4,4,3,3,8,0,-20,-30,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-28,14,22,-30,-5,-7,-29,4,-24,-19,2,0,6,-3,0,-9,-26,-28,-21,13;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-18,8,8,-18,-12,-6,-18,-7,-12,-12,1,-14,-3,-8,2,-2,-13,-30,-14,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00409;
//
ID   IDH_IMDH_MP; MATRIX.
AC   MP00470;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Isocitrate and isopropylmalate dehydrogenases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4515676; R2=0.0153361; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=312; N_SCORE=10.226; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-25,-10,3,-20,-17,0,-15,4,-14,-4,-5,-14,23,5,-3,-8,-17,-14,-4,13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-22,-26,-15,2,-25,-13,13,-18,20,19,-19,-22,-5,-15,-17,-9,5,-17,0,-11;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-11,-30,-25,-3,-27,-25,23,-21,12,12,-23,-24,-22,-21,-11,-2,29,-26,-8,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-19,-16,-9,-10,-21,-14,-2,-6,4,3,-9,-17,-3,-3,-3,8,-2,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,10,-27,10,10,-27,-14,-3,-28,24,-26,-15,11,-13,8,23,-2,-7,-23,-27,-14,8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-36,-10,-1,-27,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,70,-9,-18,-3,-6,-27,-25,-26,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-23,1,16,-24,-11,-1,-22,5,-20,-13,1,-10,10,2,5,-2,-19,-25,-12,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-26,-6,5,-23,-3,-6,-22,3,-19,-9,-3,-12,13,6,-2,-7,-20,-21,-13,8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-24,-30,-25,41,-12,-13,-6,-24,5,-1,-17,-28,-29,-18,-18,-12,-7,4,20,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,32,-27,40,8,-17,-11,-1,-29,-5,-23,-22,17,-15,-6,-10,-2,-8,-24,-29,-8,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-13,-30,-29,0,-31,-30,31,-21,10,10,-27,-28,-28,-21,-10,1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-36,-27,2,-31,-24,30,-24,16,20,-25,-24,-18,-23,-22,-11,21,-1,2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=12,-24,-13,-27,-23,-5,-22,-24,18,-19,8,6,-23,-24,-22,-20,-7,-2,30,-26,-11,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=4,-10,12,-20,-16,-11,-19,-19,-7,-15,-3,2,-10,-18,-13,-16,3,17,0,-30,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-26,6,12,-26,-14,-9,-23,6,-23,-13,-1,11,3,-2,3,0,-20,-30,-18,6;
MA   /M: SY='N'; M=-9,38,-20,19,0,-20,-1,9,-20,1,-30,-20,57,-19,0,1,10,0,-29,-39,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-22,-27,-20,10,-28,-9,16,-21,28,21,-23,-26,-14,-16,-22,-5,7,-11,14,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-1,-24,-4,-13,28,-21,2,-12,-15,-7,-9,1,-24,-18,-12,-11,-9,-13,-5,22,-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-18,-30,65,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,0,-19,-29,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-17,44,-28,58,15,-35,-8,0,-36,-1,-29,-28,21,-11,-1,-9,2,-7,-28,-38,-18,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-35,-28,4,-36,-23,39,-25,15,16,-22,-23,-20,-25,-18,-8,28,-15,9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-23,-27,-16,-3,-30,-18,21,-21,25,15,-21,-23,-6,-17,-20,-9,11,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-12,2,-2,-20,-2,-11,-20,-10,-26,-19,10,-11,-3,-10,32,22,-11,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-14,-23,-15,2,-9,-25,-16,6,-13,8,3,-14,-16,-5,-15,-9,-5,3,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=18,-15,-3,-20,-17,-15,0,-22,-7,-17,-5,-7,-13,-20,-17,-20,1,-3,3,-26,-18,-17;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-13,-12,-8,-21,8,-16,-17,-11,-19,-15,-2,-9,-8,-17,17,3,-8,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='A'; M=15,-11,-18,-15,-7,-21,-2,-13,-8,-9,-10,-1,-9,-15,2,-12,3,-4,-3,-23,-16,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-20,-26,-20,-5,-13,-20,12,-24,19,10,-20,-25,-15,-20,-18,-11,6,-21,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-14,-24,-20,4,-23,-19,7,-18,-1,1,-16,-13,-19,-18,-4,4,11,-19,-1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-9,-18,-30,67,-19,-40,-19,-30,-20,0,-19,-19,-19,0,-20,-30,-20,-30,-18;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-18,-5,-9,-23,26,-15,-27,-14,-28,-19,5,-14,-9,-14,22,7,-17,-31,-23,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-25,-30,-20,0,-29,-21,23,-25,25,17,-24,-11,-17,-22,-21,-9,11,-21,-5,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-32,-24,7,-30,-20,26,-25,31,25,-26,-26,-19,-20,-23,-8,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='M'; M=11,-20,-15,-26,-18,-5,-18,-17,12,-17,14,17,-20,-20,-13,-17,-9,-3,13,-22,-8,-16;
MA   /M: SY='P'; M=1,-14,-29,-11,-4,-25,-16,-20,-17,-10,-23,-17,-14,54,-10,-18,-1,3,-20,-28,-25,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-16,-3,-6,-23,17,-13,-25,-13,-29,-20,6,-10,-6,-13,27,10,-15,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-12,-19,-12,-18,0,-21,-6,-13,-8,-7,-12,-15,-12,-19,4,-3,3,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-17,5,-3,-15,-6,-3,-13,-9,-15,-13,25,-18,-4,-7,12,5,-16,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-32,-24,8,-32,-17,27,-25,24,18,-23,-25,-19,-21,-21,-8,18,-17,6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,9,-10,6,-7,-25,15,-9,-28,-11,-26,-19,13,-18,-10,-13,8,-2,-21,-32,-22,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-1,-30,4,5,-25,-7,-5,-24,-3,-24,-17,-1,17,-2,-5,-2,-8,-24,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,16,12,-25,-9,-6,-22,-3,-17,-15,5,-12,2,-7,3,-1,-17,-31,-16,7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-13,-25,-14,-14,-12,8,-12,-19,-9,-17,-11,-8,-9,-12,-6,-5,-6,-15,-15,-5,-15;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-22,-9,-5,-17,-5,-12,-19,2,-18,-11,-5,-6,-7,-2,-1,-4,-12,-22,-14,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-19,-17,-15,-3,-13,-9,-2,-15,-3,0,-8,-18,-14,-14,-3,4,2,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-23,-26,-20,23,-18,-18,-1,-21,2,-1,-16,-6,-24,-19,-14,-9,-3,-10,4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-26,6,30,-18,-19,0,-19,2,-17,-14,-2,-8,9,-4,4,-3,-20,-23,-5,18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00389;
//
ID   SMALL_CYTOKINES_CXC_MP; MATRIX.
AC   MP00471;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Small cytokines (intercrine/chemokine) C-x-C subfamily signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4433570; R2=0.0132350; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=910; N_SCORE=16.477; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=4,-12,-12,-16,-12,-10,-11,-18,-5,-16,-2,-5,-9,-16,-13,-16,2,5,-1,-22,-13,-12;
MA   /M: SY='A'; M=3,-16,1,-18,-12,-14,-15,-19,-8,-17,-2,-6,-14,-8,-12,-18,-5,-5,-5,-29,-17,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-6,-18,-7,1,-17,-9,-9,-17,-5,-18,-12,-2,-8,-3,-2,4,1,-13,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-23,-13,-7,-23,9,-8,-19,-6,-16,-9,-5,-14,-3,-5,0,-9,-13,-22,-17,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-18,-15,-13,-15,2,-19,-10,-13,-11,-8,-8,-12,-14,-15,2,-1,-2,-23,-16,-14;
MA   /M: SY='A'; M=3,-12,-20,-13,-6,-18,-17,-14,-3,-8,-9,-3,-10,-9,2,-9,1,0,2,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-26,-12,-10,-17,16,-18,-16,-16,-6,-7,-11,-14,-14,-14,-8,-12,-12,-23,-19,-13;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-19,-13,-2,-11,-12,-17,-7,-11,-11,-9,-8,-6,-9,-14,4,2,-3,-24,-14,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-21,-12,-3,-20,-13,-16,-14,-5,-14,-9,-13,13,-8,-5,-6,-8,-12,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-19,-17,-11,-6,-21,-9,7,-15,7,9,-16,-21,-12,-15,-9,-5,10,-24,-4,-12;
MA   /M: SY='A'; M=4,-7,-18,-8,-11,-5,-13,-11,-6,-13,-7,-7,-8,-18,-13,-15,1,1,1,-19,-1,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-21,-5,0,-20,-9,-8,-22,8,-20,-12,5,-14,2,16,6,7,-15,-26,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-26,19,32,-27,-16,-2,-27,6,-22,-19,9,-6,12,1,5,0,-25,-32,-18,22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-20,-28,-21,4,-19,-21,15,-27,35,14,-26,-28,-21,-20,-24,-10,10,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-8,2,-22,-19,0,-29,28,-21,-10,0,-18,14,60,-7,-9,-20,-21,-10,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-11,-21,-13,-5,-15,-22,-9,-3,-5,0,4,-9,-19,8,2,-4,0,-2,-25,-9,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-33,-25,2,-33,-26,34,-28,26,16,-23,-24,-20,-24,-19,-7,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-25,1,5,-28,-5,-3,-26,15,-26,-11,5,-12,12,9,3,-3,-21,-25,-14,8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-17,-14,-8,-8,-24,-21,0,-13,-5,-5,-8,-4,-12,-14,6,24,4,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-7,-20,-10,-10,-12,-13,8,-7,-15,-7,-3,-2,-18,-7,-12,2,4,-5,-28,-3,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-19,0,2,-22,-10,-8,-17,-5,-22,-13,3,0,5,-5,16,7,-14,-33,-18,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-26,-7,-4,-26,12,-12,-26,2,-22,-12,-2,-15,1,3,0,-4,-19,-22,-18,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-14,-11,-7,0,-12,-11,-4,-8,-7,-6,-9,13,-10,-10,-3,1,-4,-11,-5,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-36,-30,12,-34,-28,34,-26,16,13,-24,-26,-27,-24,-17,-6,32,-19,1,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-15,6,-29,5,1,-23,-11,44,-28,0,-24,-10,14,-9,4,5,-5,-13,-28,-30,-1,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-23,-30,-19,-10,-8,-24,-17,-4,-15,0,-1,-22,31,-14,-15,-17,-10,-11,-22,-12,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-28,-2,7,-26,-17,-6,-28,34,-25,-11,3,-13,10,33,-6,-8,-20,-22,-12,7;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-1,-20,-7,-7,-1,-15,4,-8,-12,-7,-3,6,-19,-8,-9,-1,-3,-10,-25,-3,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-29,1,-38,-28,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-28,-21,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,5,-25,7,14,-30,-9,-5,-26,12,-24,-13,3,-9,15,5,4,-2,-22,-26,-15,15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-22,10,13,-26,-10,-5,-27,12,-27,-18,10,-10,6,10,11,1,-20,-32,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-31,-22,5,-29,-22,24,-27,36,18,-27,-27,-20,-21,-23,-8,17,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-26,4,23,-27,-18,-2,-24,15,-20,-10,1,-9,19,13,1,-4,-22,-26,-14,21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-30,-26,-3,-30,-26,29,-20,11,12,-26,-26,-21,-20,-11,-3,39,-27,-8,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-24,-32,-24,6,-33,-24,28,-23,14,13,-16,-20,-18,-21,-13,1,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-30,-7,3,-19,-11,-13,-20,-4,-22,-16,-11,27,-6,-11,-4,-7,-21,-22,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=14,-11,-23,-11,-2,-24,-10,-17,-16,-7,-21,-15,-10,25,-6,-13,6,-1,-14,-28,-23,-6;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,49,-17,-34,-17,-29,-20,3,-17,-14,-17,11,-7,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-32,-7,-3,-23,-18,-14,-14,-9,-20,-14,-5,46,-6,-14,-7,-6,-23,-30,-23,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-27,-3,-3,-18,-5,47,-26,-9,-21,-7,9,-19,6,-2,-1,-12,-26,-25,5,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=1,0,-27,3,6,-26,-11,-10,-21,-5,-24,-18,-1,27,-4,-13,3,-2,-21,-31,-22,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-25,0,5,-25,-16,5,-23,18,-24,-9,10,-15,14,18,0,-4,-20,-26,-10,8;
MA   /M: SY='T'; M=1,-14,-16,-17,-14,-12,-21,-22,2,-9,-8,-4,-12,-6,-14,-12,4,14,11,-29,-13,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,54,-31,-20,1,-29,10,-20,-17,0,-1,26,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,0,-38,-29,46,-29,20,20,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='A'; M=32,-16,-12,-23,-16,-14,-10,-23,4,-14,-4,-3,-15,-14,-15,-21,3,-1,13,-23,-16,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-18,-11,-9,-12,-19,-19,-13,-1,-15,-11,-5,-13,-8,-4,9,28,-5,-11,-7,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-21,-26,-16,3,-27,-16,13,-19,33,21,-24,-21,-14,-14,-23,-7,6,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-27,-3,6,-26,-20,-12,-25,40,-26,-9,-2,-12,6,23,-7,-7,-14,-22,-10,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,30,-21,20,1,-22,-5,7,-21,1,-25,-15,38,-17,0,-2,7,1,-24,-36,-16,0;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-29,-3,-10,-30,43,-15,-37,-4,-30,-18,4,-17,-10,-8,-1,-16,-28,-22,-25,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-26,0,10,-26,-13,-1,-26,18,-23,-12,2,-13,11,23,-1,-7,-19,-25,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-29,3,24,-28,-21,-4,-19,18,-18,-6,-3,-9,19,8,-5,-9,-18,-24,-13,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-20,-27,-21,-5,-28,-22,18,-12,7,7,-18,-22,-16,-5,-11,-2,22,-24,-7,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,50,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-38,-10,0,-29,-20,-18,-19,-8,-26,-17,-19,77,-6,-15,-10,-10,-28,-29,-27,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-28,12,25,-31,-18,1,-27,16,-22,-13,2,-8,21,11,-2,-8,-25,-26,-14,23;
MA   /M: SY='A'; M=25,-3,-13,-8,0,-21,-4,-13,-15,-5,-18,-13,0,-10,-2,-10,16,5,-7,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-33,-5,7,-28,-19,-15,-22,11,-25,-14,-11,37,-1,-1,-9,-9,-23,-26,-21,0;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-21,-30,-24,-17,0,-21,-17,-5,-14,2,1,-21,-24,-9,-10,-20,-12,-10,31,5,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-19,-31,-26,4,-31,-21,27,-22,14,11,-24,-26,-22,-21,-15,-5,28,-17,6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,13,-33,-20,-2,-26,34,-26,-6,0,-11,29,25,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-26,-2,5,-23,-18,-8,-22,27,-19,-9,1,-14,5,22,-7,-7,-16,-23,-11,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-34,-26,3,-33,-26,33,-26,23,18,-23,-24,-21,-24,-18,-5,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-34,-27,2,-32,-24,34,-24,22,22,-25,-25,-20,-22,-18,-7,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,4,18,-33,-16,-1,-27,24,-25,-9,1,-10,26,17,-3,-10,-25,-23,-13,22;
MA   /M: SY='K'; M=2,-7,-25,-9,2,-23,-18,-8,-17,19,-17,-6,-6,-9,1,9,-6,-8,-10,-22,-11,1;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-23,-34,-26,16,-30,-20,21,-24,18,16,-24,-26,-22,-20,-21,-9,16,-6,6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-21,-16,-4,-4,-23,-13,3,-16,20,7,-17,-21,-6,-9,-12,-4,-1,-24,-7,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00434;
//
ID   SMALL_CYTOKINES_CC_MP; MATRIX.
AC   MP00472;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Small cytokines (intercrine/chemokine) C-C subfamily signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6285367; R2=0.0121778; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=592; N_SCORE=11.828; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=2,-18,1,-23,-17,-6,-22,-18,2,-18,10,5,-18,-23,-13,-16,-9,1,5,-25,-8,-15;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,-9,-14,-12,-8,-12,-12,-14,-7,-11,-9,-7,-6,-4,-6,-12,4,4,-5,-24,-13,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-17,-1,8,-18,-12,4,-14,-1,-12,-6,1,-1,12,-2,-1,-5,-16,-19,-9,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: M=-1,-10,-18,-10,-9,-15,-14,-6,-5,-11,-4,-3,-10,-12,-9,-12,-7,-6,0,-26,-11,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-18,-19,-19,-12,-4,-19,-16,-1,-19,3,-2,-16,-9,-15,-18,-10,-5,-3,-15,-7,-14;
MA   /M: SY='A'; M=12,-6,-8,-10,-7,-17,-7,-10,-14,-11,-16,-11,-4,-11,-9,-15,8,2,-7,-28,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=6,-8,-15,-11,-5,-19,-8,-10,-13,-10,-16,-9,-4,-7,1,-12,9,4,-9,-28,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-30,-10,1,-20,-18,-9,-14,-6,-16,-11,-13,28,-5,-12,-7,-6,-17,-24,-13,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-3,4,-24,6,-1,-19,-5,-2,-21,-4,-17,-11,2,-16,-1,-2,1,-6,-16,-24,-9,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=10,-9,-20,-12,-9,-19,15,-16,-16,-13,-16,-9,-5,-14,-10,-15,5,-4,-10,-20,-18,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=2,-7,-9,-8,-6,-7,-6,-6,-1,-7,-4,-2,-5,-6,-4,-8,2,1,2,-15,-7,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-5,14,-21,13,0,-21,-6,-1,-18,-4,-20,-13,13,-7,-2,-8,3,-1,-16,-29,-14,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-20,-10,-8,-13,-21,-16,1,-12,-8,-5,-6,-9,-11,-14,3,8,4,-29,-12,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=2,-4,-24,-3,-2,-22,-5,-13,-19,-7,-23,-16,-2,23,-7,-13,4,-3,-19,-28,-21,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-16,-7,-2,-10,-15,-12,-10,-6,-13,-10,-1,-13,-5,-4,11,12,-4,-27,-10,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-2,6,-20,9,3,-19,-14,-12,-17,-6,-17,-15,1,-5,-5,-10,8,9,-10,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-21,-29,-21,36,-28,-15,4,-23,18,5,-20,-27,-23,-15,-18,-3,1,-4,19,-21;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-18,2,4,-21,-6,-7,-19,-3,-21,-15,6,-12,0,-4,15,8,-12,-32,-17,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-23,-24,-22,27,-28,3,6,-14,4,4,-21,-28,-17,-13,-16,-6,3,11,48,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-11,-17,-18,-14,-3,-21,-15,4,-15,-1,-1,-7,-17,-12,-14,3,12,6,-24,-4,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-22,3,6,-24,-10,7,-24,6,-25,-13,9,-9,7,4,9,1,-20,-31,-12,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-28,-7,0,-20,-11,6,-25,18,-19,-8,-1,-16,7,26,-8,-11,-20,-16,-4,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-9,-28,-10,2,-24,-20,-12,-12,10,-17,-6,-7,3,7,3,-5,-7,-12,-23,-14,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-33,-24,1,-34,-25,33,-27,25,16,-21,-22,-18,-22,-19,-8,19,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-36,-8,0,-28,-18,-8,-21,-7,-28,-17,-13,63,-5,-11,-5,-8,-27,-30,-24,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-11,-19,-10,-8,-20,-13,-10,-6,-2,-1,-12,-18,-5,6,-12,-9,-9,-19,-8,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-23,-6,1,-20,-16,-4,-18,10,-15,-7,2,-16,9,16,2,0,-14,-25,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-19,-25,-22,-14,7,-25,-8,-3,-6,5,2,-13,-24,-11,8,-17,-10,-3,-11,2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-29,-20,6,-31,-22,25,-24,25,16,-25,-25,-20,-20,-20,-8,21,-22,-2,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-23,-8,1,-20,-19,-10,-8,9,-12,-1,-4,-15,4,4,-5,-5,-4,-25,-11,2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,5,-15,6,1,-22,2,-6,-23,-9,-23,-16,6,-14,-4,-11,11,0,-17,-32,-16,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-18,-25,-23,32,-29,6,-4,-15,-2,-3,-22,-31,-17,-14,-21,-12,-10,30,60,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-25,-16,-6,11,-24,-2,-14,2,-8,-5,-8,-21,-5,13,-9,-4,-12,-7,14,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-30,-7,7,-15,-21,-4,-16,9,-14,-8,-6,-7,6,16,-10,-10,-17,-8,-1,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-11,-11,-10,-11,-16,-18,-7,-10,-9,-7,1,-12,-10,-11,15,35,1,-28,-11,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=3,10,-15,8,2,-22,2,-7,-23,-6,-29,-20,17,-12,-1,-7,26,11,-16,-37,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-20,4,3,-24,8,-10,-24,-8,-26,-18,6,-9,-2,-10,17,3,-18,-33,-21,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-26,2,5,-26,-6,-5,-22,6,-19,-10,2,-13,9,4,1,-7,-19,-26,-14,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-5,0,-25,4,1,-25,-12,-10,-22,-6,-27,-19,1,24,-4,-8,10,4,-20,-34,-21,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-27,-8,0,-19,-22,-6,-11,14,-9,1,-4,-17,8,12,-12,-10,-11,-19,-7,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-3,-31,2,12,-27,-16,-12,-22,-1,-24,-18,-6,36,-1,-9,-4,-7,-25,-29,-23,3;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-16,-17,-13,-23,22,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-23,13,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,70,-30,-20,3,-30,16,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-23,-17,-10,-7,-26,-4,2,-5,3,4,-12,-21,-6,-3,-12,-5,3,-22,-1,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-11,-13,-12,-6,-21,-20,-5,-13,-6,-7,-4,-13,-12,-12,15,39,4,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-8,-28,-9,0,-19,-22,-11,-17,27,-17,-6,-5,-13,2,25,-11,-9,-10,-21,-9,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,3,-22,-20,-4,-22,25,-16,-6,-3,-15,10,33,-10,-9,-17,-21,-9,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,4,-25,2,-8,-26,30,-9,-31,-5,-26,-17,11,-16,-9,-5,1,-12,-25,-24,-22,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-29,-9,0,-18,-21,0,-24,28,-17,-5,-3,-17,6,40,-11,-10,-17,-19,-5,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,2,-26,4,21,-29,-15,-1,-23,9,-20,-9,0,-9,23,9,3,-6,-22,-26,-15,21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-19,-33,-27,1,-32,-28,33,-25,18,14,-24,-25,-23,-24,-15,-5,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-10,-19,-12,-16,-6,-21,-5,-11,-8,-8,-11,-13,-12,-19,10,5,7,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,34,-25,39,11,-30,-8,2,-29,-1,-28,-23,26,-9,1,-7,6,-4,-27,-38,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-38,-8,0,-29,-19,-19,-20,-9,-29,-20,-18,81,-9,-19,-8,-8,-28,-30,-29,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-23,4,7,-24,-12,4,-26,14,-26,-13,11,-13,7,12,6,0,-20,-29,-12,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-27,12,16,-30,-16,-3,-22,13,-22,-11,5,-11,17,5,-1,-7,-20,-28,-14,16;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-27,2,6,-26,-16,-3,-25,20,-24,-12,2,-3,4,11,-4,-5,-19,-25,-12,4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-33,-44,-33,-24,3,-19,-25,-19,-13,-19,-17,-32,-27,-14,-9,-32,-24,-25,111,21,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-30,0,-30,-30,30,-21,12,11,-30,-30,-29,-20,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-29,1,16,-34,-19,1,-23,20,-22,-6,0,-7,35,16,-3,-9,-25,-22,-11,25;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-27,15,16,-27,-16,-1,-26,15,-22,-13,9,-12,11,13,-3,-7,-23,-27,-13,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-18,-10,-22,-18,3,-23,-1,-3,-15,-4,-3,-16,-25,-13,-16,-10,-7,-3,2,22,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-22,-32,-24,2,-29,-20,28,-19,18,24,-21,-23,-16,-17,-18,-7,22,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-5,4,-24,1,7,-24,-14,0,-23,17,-24,-12,9,-13,8,13,2,-4,-19,-26,-12,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-1,-26,0,-2,-9,-21,6,-13,1,-8,-2,-4,-18,-1,0,-9,-7,-12,-17,8,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-27,-17,5,-29,-18,16,-26,41,18,-27,-26,-14,-18,-26,-9,7,-21,-2,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00434;
//
ID   GNRH_MP; MATRIX.
AC   MP00473;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gonadotropin-releasing hormones signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1002246; R2=0.0086643; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=837; N_SCORE=7.351; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=739; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-43; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=38,-66,-80,-72,-52,-73,-71,-32,-72,48,55,-75,-76,-68,-72,-62,-56,59,-77,-59;
MA   /M: SY='W'; M=-59,-78,-72,-66,-61,57,-67,-59,-66,30,54,-64,36,40,-69,-61,-66,-64,85,-59;
MA   /M: SY='W'; M=11,-75,-83,-76,-49,13,-78,22,-74,47,-45,-77,-77,-70,-75,-67,-64,17,114,-50;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-68,-84,-76,-45,-83,-68,-29,-74,68,83,-79,-80,-69,-72,-73,-59,43,-75,-54;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-68,-84,-76,-46,-84,-71,-27,-75,68,56,-80,-81,-71,-74,-73,-58,59,-76,-55;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-68,-84,-77,34,-85,-73,-28,-77,68,-35,-81,-83,-75,-75,-73,-59,59,-71,-50;
MA   /M: SY='C'; M=-54,89,-69,-69,-62,-72,-73,-47,-67,6,-53,-59,-72,-68,-72,21,69,42,-88,-66;
MA   /M: SY='C'; M=12,61,-77,-72,-54,-72,-70,-38,-71,48,55,-70,-77,-67,-72,19,-54,43,-79,-60;
MA   /M: SY='C'; M=-51,89,-71,-69,-63,-67,-70,-44,-67,-53,54,-61,-74,-64,-70,63,-48,58,-87,-65;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=12,-67,-82,-74,-50,-77,-69,-30,-72,48,83,-76,-77,-68,-72,-67,-57,59,-77,-57;
MA   /M: SY='E'; M=13,-71,-48,66,-73,-62,-57,-69,-51,4,-61,-54,-63,42,-57,63,-50,-64,-78,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-77,-60,-54,31,14,56,20,-55,-58,-54,35,-72,85,-57,-55,-60,15,-73,-52;
MA   /M: SY='C'; M=14,89,-69,-72,-74,69,-73,-68,-69,-71,-67,-56,-73,-68,-75,21,-58,14,-81,-74;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-56,89,-72,-71,-67,-67,-71,-65,-71,29,-60,-62,-79,-65,-74,74,-52,-63,-88,-71; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=38,106,-73,-73,-80,15,-76,-80,-72,-77,-73,-62,-79,-70,-77,46,-57,-69,-90,-79; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-85,-54,-34,-90,-67,-47,-76,-39,-71,-57,-50,-66,131,-40,-48,-62,-77,-72,-61;
MA   /M: SY='H'; M=-70,-81,-54,-54,-62,-71,146,-83,-58,-67,-53,-44,-71,-48,-53,-59,-68,-84,-91,28;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-100,-100,-80,-39,-74,-94,-72,-72,-70,-72,-94,-80,-71,-75,-81,-86,-86,176,30;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-70,-79,10,-63,18,-76,102,-60,-64,13,-49,-58,-77,-58,-61,-64,-65,-65,-52,96;
MA   /M: SY='G'; M=-53,39,10,3,-74,90,-66,-86,-66,-81,-73,-51,-69,-63,-73,-52,-66,-80,-71,22;
MA   /M: SY='W'; M=-69,-78,-87,-76,17,-80,35,-44,-74,60,-43,-82,-81,-70,-73,-76,-70,-1,131,-39;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-74,-61,-55,-61,-65,-57,-65,44,10,-58,16,-70,22,35,42,-54,-65,63,24;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='N'; M=12,-72,32,66,-80,-58,-51,-78,-48,-79,-71,79,-64,-45,-57,22,-51,-73,-87,-72;
MA   /M: SY='V'; M=12,-68,-78,-74,-52,-78,-77,49,-72,33,-40,-72,-75,-71,-75,-61,26,59,-79,-60;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-66,-85,57,78,-89,13,-61,-90,22,-85,-80,-53,-65,-47,-57,-60,-65,-84,-88,-77; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-63,-80,-59,22,-67,14,56,-68,-63,-73,-67,34,36,-59,-68,20,-60,13,-77,42; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-83,-77,35,-83,-63,-34,-75,68,56,-79,-82,-70,-72,-74,-62,18,-61,44;
MA   /M: SY='Q'; M=-56,-75,29,24,-72,-70,-62,-48,-55,-61,-58,-57,36,68,-60,20,-53,57,-83,-66;
MA   /M: SY='E'; M=12,-75,58,78,-82,-63,-54,-80,-48,-78,-73,36,-61,-43,-57,21,-54,-73,-86,-72;
MA   /M: SY='S'; M=-44,-63,-56,-58,-72,-55,-62,-68,-57,-72,-67,-45,-62,-52,-63,92,70,-60,-84,-66;
MA   /M: SY='F'; M=10,-72,-72,21,76,-78,-63,22,-69,32,-45,-73,-77,-67,-70,-67,-62,-47,-53,45;
MA   /M: SY='Q'; M=-56,-78,-52,50,-79,14,-56,-67,-45,-69,-62,-54,-66,85,28,21,-57,13,-77,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-58,-74,-38,87,-76,-65,-51,-73,-46,-69,53,62,-61,-41,-55,21,-54,-70,-83,-69;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-86,-85,-49,-91,-86,108,-79,-32,-35,-76,-74,-76,-83,-74,-58,-19,-73,-56;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00432;
//
ID   RIBOSOMAL_L3_MP; MATRIX.
AC   MP00474;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L3 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5400114; R2=0.0151083; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=496; N_SCORE=13.024; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-4,-28,-3,-1,-4,-15,-6,-17,-6,-14,-12,-5,-17,-5,-8,-7,-9,-17,4,7,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-1,-2,-13,-3,-4,-10,-8,-9,-3,-8,-4,-2,-3,-7,-6,-9,-1,0,-1,-19,-9,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=10,3,-19,1,2,-23,-2,-11,-19,-4,-19,-14,3,-10,-3,-9,8,0,-13,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-26,4,7,-19,-9,-8,-19,0,-13,-11,-2,-14,-1,-1,-5,-9,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-17,-22,-20,-10,11,-23,-11,3,-16,4,0,-15,-21,-14,-15,-11,-6,1,-10,11,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-26,2,14,-21,-19,1,-18,6,-17,-9,2,-9,8,2,-1,-5,-17,-26,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-19,-25,-20,5,-28,-22,17,-22,19,9,-23,-21,-21,-20,-17,-6,18,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-29,-4,-5,-29,49,-16,-37,-14,-28,-20,0,-16,-12,-16,2,-16,-28,-23,-28,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,8,-25,8,8,-31,-8,-5,-26,13,-25,-12,6,-11,15,5,3,-4,-22,-26,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-24,0,15,-22,-20,-10,-12,-1,-12,-9,-5,-6,6,-6,1,0,-10,-28,-15,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-21,-33,-26,9,-33,-22,29,-27,25,15,-25,-26,-23,-23,-20,-8,24,-20,1,-26;
MA   /M: SY='T'; M=1,3,-19,-1,-1,-21,-7,-12,-20,-2,-20,-14,5,-7,-2,-4,12,15,-13,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-15,-29,-25,-2,-27,-27,24,-20,10,9,-25,-21,-24,-21,-10,-1,33,-26,-9,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-24,27,16,-29,-4,-1,-29,1,-24,-20,12,-10,4,-4,5,-3,-24,-31,-17,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-19,-21,-19,-5,-27,-16,18,-19,10,7,-17,-23,-17,-17,-10,-2,21,-27,-6,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-24,4,17,-26,-12,-3,-21,8,-21,-13,6,-10,10,3,4,-3,-19,-28,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=0,1,-21,2,8,-24,-14,-11,-15,-1,-17,-11,-2,-5,1,-8,1,-4,-10,-29,-17,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-26,-3,-15,-24,32,-16,-23,-16,-22,-15,4,-20,-16,-17,0,-12,-16,-26,-23,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-27,14,28,-32,-16,1,-26,9,-22,-13,4,-7,25,4,2,-6,-26,-28,-16,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-23,-22,-15,10,-26,-10,2,-4,6,8,-16,-23,-12,-4,-16,-8,1,-10,12,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-17,-32,-28,0,-33,-29,34,-23,15,13,-25,-25,-25,-23,-13,-2,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-12,-29,-25,-4,-27,-28,23,-20,7,7,-23,-24,-24,-21,-6,3,34,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='T'; M=3,-10,-14,-17,-11,-13,-20,-18,1,-13,-6,-3,-6,-14,-5,-13,8,15,3,-25,-10,-9;
MA   /M: SY='G'; M=17,-9,-22,-13,-15,-26,42,-19,-29,-16,-24,-17,-3,-16,-15,-19,6,-11,-19,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-19,-20,-17,-6,-28,-19,12,-11,2,4,-15,-20,-13,-10,-6,7,17,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-28,-12,-2,-20,-24,-13,-9,24,-15,0,-6,-14,2,16,-11,-9,-6,-21,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-2,-30,-2,6,-26,-20,5,-30,38,-26,-9,1,-14,10,36,-10,-11,-21,-21,-7,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-20,-33,-26,58,-28,-15,0,-24,6,-1,-17,-27,-31,-17,-14,-2,0,5,28,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-2,-18,-6,7,-27,-12,-6,-17,2,-18,-9,-1,-10,18,-3,10,3,-15,-25,-15,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-18,-18,-16,-7,-17,-17,2,-14,-6,-4,-15,-5,-16,-16,-2,3,8,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,-19,-24,-17,-8,-26,-15,17,-13,6,19,-17,-20,-4,-13,-9,0,17,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-28,-1,8,-28,-18,-7,-29,41,-29,-10,1,-10,9,25,-5,-7,-19,-22,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-24,-40,-25,-19,4,-21,18,-21,-17,-18,-11,-20,-26,-10,-13,-27,-24,-27,74,28,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-26,3,-9,-25,30,9,-31,-11,-28,-17,23,-20,-8,-10,2,-13,-30,-29,-19,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-19,-33,-25,45,-29,-19,6,-24,7,3,-18,-26,-28,-18,-13,-1,7,-4,17,-24;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-23,-5,0,-25,-5,-4,-25,13,-23,-12,1,-13,4,12,4,-3,-17,-24,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-26,-13,-10,-19,5,-13,-18,3,-15,-5,-5,-18,-6,10,-6,-8,-12,-22,-14,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-27,-13,-10,-20,16,-11,-18,-12,-7,-3,-7,-20,0,-8,-8,-14,-18,-20,-16,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-34,-1,2,-24,-16,-11,-23,1,-25,-17,-9,37,-4,-2,-7,-10,-25,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,-21,-16,-8,-17,-4,-6,-12,0,-8,5,-8,-16,-2,4,-4,-8,-8,-21,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-18,-2,-1,-22,-6,-13,-22,9,-24,-14,3,-11,-1,2,14,14,-12,-29,-15,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-26,-1,-2,-19,-18,72,-26,-10,-19,-3,8,-18,6,-3,-3,-7,-24,-30,12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-27,-8,-13,-27,42,0,-34,-15,-27,-16,2,-18,-10,-14,2,-15,-26,-23,-20,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-1,1,-19,-4,-2,-20,-10,-6,-17,6,-22,-12,9,-16,1,11,10,3,-10,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-24,-4,-2,-27,12,-9,-28,5,-28,-15,3,-14,3,2,8,-5,-21,-26,-18,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-9,-23,-14,-14,0,-11,-6,-4,-13,2,-1,-3,-23,-12,-8,-11,-8,-7,-17,2,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00385;
//
ID   RIBOSOMAL_L15_MP; MATRIX.
AC   MP00475;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L15 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1981153; R2=0.0058710; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1826; N_SCORE=12.913; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=733; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-35; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=44,-67,8,29,-70,-46,-64,-31,0,-20,-26,-33,-38,-54,-61,25,45,1,-81,-67;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=3,-70,-11,-70,-47,-80,-69,-5,-10,78,-13,-75,-80,-67,-70,-70,-61,-5,-74,-57;
MA   /M: SY='K'; M=-48,-76,-68,-29,-37,-76,-64,14,54,-8,7,-65,39,-32,12,-46,-58,38,-69,35;
MA   /M: SY='A'; M=47,-71,7,29,-71,-66,-27,-13,21,-19,-57,-36,-68,24,6,-39,-38,26,-79,-66;
MA   /M: SY='A'; M=66,-68,-28,-12,-43,-45,-29,31,13,-24,-55,-22,-69,-33,-17,1,-54,-7,-77,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-56,-76,46,-39,-82,73,-59,-85,27,-84,-74,52,-68,-56,-16,-51,-60,-81,-81,-73;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-83,-76,-48,-59,-76,33,-76,61,-36,-79,-46,-73,-76,-69,-57,56,-77,-58;
MA   /M: SY='I'; M=-20,-5,-33,-36,-51,-82,-78,64,-73,26,-40,-44,-76,-72,-76,-67,-16,59,-11,-32;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-27,-96,-78,-72,-96,-45,-76,-96,17,-95,-85,9,21,-66,60,-26,-6,-91,-98,-87; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-94,-48,-71,-96,-11,-75,-65,37,-96,-86,21,-49,-65,47,1,-34,-91,-97,-86; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-91,10,-8,-35,-44,-76,-87,-16,-68,-84,25,-87,-9,12,6,-22,-25,-14,-83; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=5,-89,-21,-75,-82,-86,-82,21,35,-23,-11,2,-87,-23,-46,-38,-48,-7,-95,-81; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-47,-28,43,-17,4,-13,-55,-23,39,-6,-26,-19,-42,12,-36,8,-39,-26,-62,62;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-41,-88,-19,-72,-9,38,-74,-82,16,-20,-75,-4,31,-69,13,-25,-48,-59,-12,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=18,-68,-31,-34,-2,-41,-30,15,-70,6,-45,-26,-76,-69,-72,-32,-37,73,-75,13;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-78,-56,-43,-78,-71,-57,-80,101,-77,-65,-49,-65,-40,51,-58,-59,-75,-73,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-70,-84,-79,-49,-87,-81,64,-77,35,-36,-79,-78,-75,-78,-71,-56,70,-79,-58;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-70,-85,-78,-43,-87,-72,40,-78,80,-11,-82,-82,-72,-76,-76,-61,11,-73,-54;
MA   /M: SY='G'; M=38,-70,-68,-70,-69,75,-69,-66,-68,25,-58,-57,-70,-64,-73,6,-60,-63,-74,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-72,36,-1,-48,-11,8,-77,50,-77,-68,36,-66,-13,13,45,0,-72,-82,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='E'; M=-46,-77,28,76,-48,-70,26,-55,34,-58,-67,-18,-61,8,13,-5,4,-72,-81,-66;
MA   /M: SY='L'; M=-21,-70,-84,-78,-46,-85,-76,59,-77,62,-34,-79,-79,-73,-77,-72,-59,39,-75,-56;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-13,-73,8,3,-47,-19,-27,-72,33,-74,-67,-52,43,-31,-15,32,59,-67,-81,-37; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=15,-73,-15,-9,-72,-20,-6,-32,59,-42,-27,-19,-68,-13,45,-5,-8,14,-78,-65;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=42,-75,-61,-25,-79,-46,-64,-51,67,-75,-65,-36,74,-29,-47,-19,-38,-50,-76,-71;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-69,-84,-78,7,-86,-76,34,-77,56,1,-80,-80,-74,-76,-72,-57,64,-75,-54;
MA   /M: SY='T'; M=2,-67,-38,-5,-66,-68,-28,20,21,-47,-55,23,-66,-17,-59,2,67,27,-83,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-70,-84,-79,17,-86,-80,53,-77,34,-38,-79,-79,-76,-77,-71,-56,73,-75,-54;
MA   /M: SY='K'; M=-35,-76,-35,38,-74,-71,-5,-25,64,-69,-62,-19,-65,25,40,-19,18,-7,-77,-35;
MA   /M: SY='A'; M=56,-66,-70,-68,-69,48,-74,-49,-67,-48,-57,-61,-70,-66,-72,-25,10,52,-79,-69;
MA   /M: SY='H'; M=17,-27,17,-40,-41,-50,71,12,5,2,-54,13,-12,-56,10,-6,-16,5,-81,-32;
MA   /M: SY='K'; M=37,-73,-41,-11,-14,35,-60,-49,44,-22,-27,-57,-41,-53,24,-19,-59,-65,-8,34;
MA   /M: SY='F'; M=48,-25,-80,-73,74,-71,-74,13,-72,-23,-49,-73,-77,-74,-74,-60,-57,50,-63,-44;
MA   /M: SY='S'; M=-45,-63,-56,-58,-71,-55,-62,-67,-57,-71,-66,-45,-62,-53,-63,89,75,-59,-85,-66;
MA   /M: SY='K'; M=25,-75,-23,17,-78,-27,-59,-27,80,-73,-64,-32,-10,7,23,-54,-39,-68,-75,-67;
MA   /M: SY='G'; M=26,-70,-60,-29,-76,51,-64,-74,5,-59,-67,-51,-22,-5,5,50,23,-49,-78,-70;
MA   /M: SY='A'; M=99,-61,-68,-60,-76,-49,-69,-65,-63,-67,-61,-62,-66,-59,-67,-41,-52,-52,-76,-71;
MA   /M: SY='R'; M=-37,-78,-58,37,-43,-76,-60,28,43,-14,-54,-59,-69,34,58,-61,-60,9,-75,-62;
MA   /M: SY='E'; M=47,-72,-10,69,-77,-64,-25,-72,16,-36,-65,-34,-62,14,1,1,-25,-49,-78,-69;
MA   /M: SY='K'; M=65,-69,-61,-24,-75,-45,-63,-70,75,-29,-61,-55,-65,-13,-9,-50,-55,-62,-74,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-74,-85,-82,-49,-89,-85,94,-78,1,-36,-77,-76,-76,-81,-72,-57,47,-76,-57;
MA   /M: SY='E'; M=-46,-78,-25,95,-79,-74,-23,-38,39,-57,-67,-55,-59,-21,-31,-41,-17,-21,-79,-70;
MA   /M: SY='A'; M=61,-69,-23,27,-78,-24,-60,-72,53,-73,-65,0,-64,13,-21,2,-54,-48,-77,-69;
MA   /M: SY='A'; M=82,-64,-70,-44,-66,-57,-70,-18,-14,-13,-24,-65,-69,-61,-66,-34,-36,30,-76,-36;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-6,-65,-76,-83,102,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-69,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='S'; M=10,-69,-36,20,-75,-61,-60,-68,51,-72,-65,-31,-63,-13,-4,60,30,-12,-79,-67;
MA   /M: SY='V'; M=-13,60,-82,-77,-55,-81,-34,54,-75,-16,-43,-75,-14,-75,-78,-66,-54,76,-84,-62;
MA   /M: SY='E'; M=-26,-74,-46,77,-72,-54,-26,-7,22,-51,-60,-35,-62,7,-23,-54,32,23,-80,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-35,-26,-41,48,-34,-42,-68,18,-45,45,10,-70,-72,-59,-44,-46,-39,44,-77,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-70,-71,-25,-55,-49,-70,39,-25,37,-44,-66,8,-63,-1,-5,37,22,-76,-26;
MA   /M: SY='A'; M=64,-70,15,54,-79,1,-10,-74,-14,-74,-67,-23,-4,-50,-29,-1,-55,-65,-79,-71;
MA   /M: SY='P'; M=47,-72,-64,-56,-70,-10,-63,-66,9,-39,-62,-59,61,26,0,9,13,-30,-73,13;
MA   /M: SY='A'; M=52,-72,-13,5,-76,-4,-63,-22,36,-68,-61,-57,16,36,9,-50,-14,-4,-77,-68;
MA   /M: SY='A'; M=60,-70,-56,23,-77,-60,13,-73,53,-72,-64,-4,-5,-48,13,-12,-11,-64,-77,-68;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=29,-77,15,69,-81,-69,-61,-72,8,-74,-69,-58,-66,3,12,5,-59,-2,-83,-72; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=39,-75,17,57,-74,-67,-63,19,-12,-68,-64,-3,-66,4,-9,-13,-10,-59,40,-67; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=40,-80,-7,36,-87,28,-69,-79,-13,-80,-73,-62,-72,43,-65,-13,-65,-22,-85,-78; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,-77,-41,91,-80,20,-59,-75,-7,-74,-69,-57,3,-43,-56,-53,-6,-19,-79,-73;
MA   /I: I=-5; E1=0; MI=-27; IE=-27; DE=-27;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00386;
//
ID   FATTY_ACID_DESATUR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00476;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fatty acid desaturases family 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5480099; R2=0.0127576; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=893; N_SCORE=15.931; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-7,8,-19,0,-2,-18,-10,-4,-21,5,-23,-15,18,-16,1,17,12,11,-16,-32,-15,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-6,-27,-17,-16,-9,-25,-13,16,-11,-2,3,7,-20,-9,-5,-9,-7,4,-26,-8,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-15,-2,-3,-15,-12,-11,-11,-12,-9,-9,2,-15,-2,-10,14,13,-8,-33,-13,-3;
MA   /M: SY='P'; M=2,-15,-31,-10,-2,-27,-14,-18,-18,-10,-27,-18,-14,59,-8,-18,1,-4,-22,-30,-27,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-26,-12,-2,-20,-16,-4,-26,21,-18,-10,-2,-18,6,50,-6,-8,-16,-20,-12,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-28,31,30,-34,-14,4,-29,5,-25,-19,16,-8,19,-1,2,-8,-30,-32,-18,24;
MA   /M: SY='N'; M=-13,28,-23,14,0,-20,-6,37,-23,-3,-27,-14,45,-20,3,0,4,-6,-30,-37,-8,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-36,-26,15,-30,-26,20,-27,16,8,-25,-25,-22,-24,-23,-12,9,12,8,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,31,-29,35,19,-27,-27,-21,-23,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-10,-21,-21,-5,-25,-25,11,-15,1,1,-16,-21,-21,-15,4,23,27,-30,-10,-21;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-34,-24,23,-31,-20,20,-28,34,19,-25,-28,-23,-21,-25,-10,11,-13,7,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-19,-24,-25,-7,2,-25,6,-22,6,3,-20,-27,-25,-20,-11,-9,16,-25,-14,-25;
MA   /M: SY='A'; M=22,-6,0,-16,-11,-15,-12,-21,-11,-11,-11,-11,-6,-12,-11,-16,13,22,-1,-27,-16,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-15,-25,-20,12,-23,-20,10,-23,16,6,-20,-26,-21,-18,-8,-1,14,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-30,-10,-18,-29,62,-18,-39,-16,-29,-19,0,-20,-17,-12,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-16,-23,-24,-22,49,-25,-3,-3,-19,1,-3,-7,-28,-24,-14,-15,-8,-8,8,38,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-7,-16,-8,8,-18,-15,-16,-8,-6,-10,-9,-9,-11,-5,-12,5,4,1,-27,-17,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-9,-26,-15,-15,7,-17,-6,-12,-12,-14,-12,-4,-22,-11,-11,-4,1,-15,24,21,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-24,-7,0,-20,-14,-3,-27,17,-23,-13,3,-17,7,45,6,0,-17,-26,-13,0;
MA   /M: SY='N'; M=11,15,-15,1,-5,-18,-4,-6,-15,-5,-19,-15,25,-15,-5,-9,12,11,-14,-31,-18,-5;
MA   /M: SY='A'; M=29,-7,-13,-12,-8,-22,11,-17,-18,-12,-19,-15,-2,-12,-8,-17,18,3,-8,-26,-22,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-28,-19,-6,5,-31,-6,12,-15,10,5,-17,-20,-8,-16,-17,-10,1,-6,21,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-8,6,-17,-22,-6,-19,17,-6,-5,-7,-18,5,34,-13,-10,-15,-21,-9,3;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-33,-46,-33,-28,1,0,-28,-24,-20,-22,-20,-31,-28,-20,-20,-31,-28,-30,113,17,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-18,2,-28,-2,-6,-4,-19,55,-18,-8,-16,-4,11,-23,1,-3,-9,-12,-24,-13,30,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-28,-5,6,-21,-22,-4,1,-5,-9,-1,7,-14,15,-6,-4,-8,-11,-26,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-3,-25,-12,-16,25,-20,8,-6,-11,-7,-6,5,-27,-13,-9,-10,-7,-14,3,37,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-18,7,-25,13,-5,9,-21,-11,-14,-16,0,-10,-4,-21,-17,-15,-13,-10,-12,-20,0,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-1,-26,-3,-3,-21,-16,-13,-17,-8,-24,-17,4,34,-8,-12,4,11,-20,-32,-21,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-12,-14,-12,-6,-22,-20,-3,-14,3,-3,-7,-14,-12,-12,9,37,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-22,-15,-7,9,-23,-15,-16,12,-13,-7,-6,-16,-10,5,-7,3,-9,-13,3,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-23,-28,-24,-1,-27,-27,11,-19,-1,-1,-20,-21,-19,-19,-9,7,12,11,1,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00399;
//
ID   ALPHA_2_MACROGLOBULIN_MP; MATRIX.
AC   MP00477;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-2-macroglobulin family thiolester region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1185703; R2=0.0147574; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=643; N_SCORE=14.598; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-30,0,30,-20,-27,-10,-3,-3,-7,-7,-7,-7,7,-10,-7,-10,-10,-27,-13,17;
MA   /M: SY='G'; M=-9,1,-27,8,-8,-20,12,-14,-20,-17,-3,-10,-4,-20,-14,-17,-10,-14,-17,-26,-17,-11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,23,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-14,-20,-16,-3,-20,-20,10,-20,11,4,-17,-23,-16,-17,-1,3,15,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='S'; M=14,12,-16,14,3,-26,-3,-10,-23,-7,-23,-20,6,-10,-3,-13,18,4,-13,-33,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-27,-18,-11,-19,-3,-13,-8,-12,-10,8,-15,21,-8,-17,-9,-10,-12,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-30,2,18,-33,13,-4,-30,-1,-24,-13,0,-11,19,-4,0,-14,-30,-23,-20,18;
MA   /M: SY='N'; M=-9,7,-27,0,-7,-24,19,-4,-30,2,-27,-17,20,-20,-4,14,0,-10,-27,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-13,-23,-20,0,-27,-24,14,-20,15,6,-20,-23,-20,-17,-6,14,21,-27,-7,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=12,-4,-23,-7,6,-30,-13,-7,-19,15,-19,-7,-4,-10,19,5,1,-6,-16,-20,-14,13;
MA   /M: SY='H'; M=-9,17,-23,23,7,-27,-9,27,-30,-7,-27,-17,13,-13,3,-7,12,-2,-23,-37,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-27,-14,-6,-17,-24,-12,-9,20,-13,-2,-8,-18,-1,28,-11,-8,-2,-22,-9,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-17,-24,-17,1,-24,-13,11,-17,22,24,-18,-21,-10,-14,-12,8,7,-23,-3,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-11,-24,-12,-6,-6,-17,3,-14,2,-13,-7,-7,-19,5,10,-2,-4,-13,-6,17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-16,9,-4,-16,-7,-1,-16,-4,-23,-16,38,-16,-4,-4,14,18,-19,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-27,-20,-20,5,0,-5,-5,-20,8,1,-17,-27,-16,-16,-17,-13,-9,-2,20,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-33,-23,30,-27,-14,13,-24,28,25,-24,-27,-21,-17,-24,-10,7,-10,10,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-17,-10,-17,-6,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,15,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,13,-13,0,-7,-13,-13,-10,-13,-7,-17,-13,20,-13,-7,-7,17,33,-10,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,33,-27,28,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-17,-23,-24,-19,5,-27,-10,11,-16,2,2,-14,-20,-13,-17,-7,6,6,-6,22,-19;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-13,-19,-16,-4,-19,-19,8,-20,9,2,-15,-23,-16,-16,2,4,15,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-19,21,-29,25,7,-27,-14,43,-32,-1,-25,-14,19,-17,5,5,-4,-13,-29,-33,-2,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,53,13,-33,-7,3,-33,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00440;
//
ID   LIM_DOMAIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00478;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LIM zinc-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0485334; R2=0.0106697; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=330; N_SCORE=8.560; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=137; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-3,-8,-22,-9,0,-12,-17,-12,-11,-4,-6,-5,-8,-7,-3,-5,-3,-1,-9,-24,-11,-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-24,-15,-9,-14,-21,-16,-3,-12,-6,-5,-16,17,-12,-15,-9,-5,-5,-25,-13,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-15,-24,-16,-14,13,-22,3,-5,-10,-1,-3,-14,-22,-11,-9,-12,-6,-8,4,31,-14; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-12,56,-17,-16,-18,-20,-20,-23,-18,-17,-13,-12,-26,-15,-19,-3,-5,-11,-39,-22,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-7,-23,-6,4,-17,-7,-9,-17,-1,-12,-9,-6,-10,0,0,-1,-4,-13,-23,-12,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-23,-6,0,-18,-16,-7,-17,8,-15,-8,-2,-8,3,12,-1,-2,-13,-23,-11,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-14,10,-13,15,1,-23,-15,12,-24,-6,-17,-12,3,-12,-4,-9,-6,-9,-19,-32,-9,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-14,-23,-17,-13,11,-18,5,-9,-10,-7,-4,-11,-20,-9,-7,-7,-4,-9,-1,26,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: M=-8,-6,-15,-8,-4,-7,-13,0,-16,-11,-14,-10,-4,-12,-5,-12,-4,-7,-16,-13,-1,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-21,-2,4,-21,-9,-7,-18,2,-17,-11,0,-7,1,3,3,-2,-13,-26,-15,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-23,-7,-1,-16,-13,-10,-14,-1,-8,-4,-6,-7,-1,2,-6,-6,-13,-24,-12,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-12,-19,-17,-10,8,-15,-10,-10,-8,-5,-5,-8,-17,-11,-6,-7,-4,-8,-13,3,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-17,-8,-7,-18,8,-14,-20,-6,-17,-12,-2,-14,-8,-6,5,-2,-13,-25,-17,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-24,2,4,-23,-12,-6,-19,-5,-19,-13,-3,10,-1,-8,-1,-3,-18,-26,-16,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-12,-22,-16,-10,-9,-21,-15,-4,1,-5,-1,-8,-17,-7,5,-4,3,0,-23,-8,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-20,-7,0,-16,-11,-6,-15,-7,-16,-11,-4,-5,-4,-10,6,2,-9,-26,-12,-3;
MA   /M: SY='R'; M=0,-9,-24,-11,-8,-15,-1,-11,-16,-1,-13,-8,-6,-18,-6,2,-3,-7,-11,-18,-8,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,8,-25,9,4,-27,5,-2,-29,1,-26,-16,10,-14,3,0,5,-6,-24,-26,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-27,-3,7,-18,-14,0,-21,13,-18,-7,2,-14,7,11,-5,-7,-18,-22,-8,7;
MA   /M: M=-6,-13,-26,-14,-8,-10,-11,-7,-10,-10,-9,-6,-9,-3,-8,-9,-6,-6,-10,-21,-6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,4,-36,-28,39,-27,21,18,-24,-24,-23,-26,-19,-8,31,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-8,-23,-10,-6,-2,-16,-3,-11,-8,-11,-7,-6,-12,-6,-7,-1,1,-10,-15,6,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-5,-20,-4,-3,-15,-6,-12,-13,-6,-14,-10,-4,5,-7,-10,0,-3,-11,-22,-14,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: M=0,-8,-12,-10,-4,-11,-7,-10,-8,-8,-6,-3,-6,-12,-4,-8,-2,-3,-5,-17,-9,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-21,7,13,-24,1,-7,-25,-3,-20,-15,0,-6,2,-8,0,-8,-21,-25,-17,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-22,-8,0,-16,-21,-9,-14,9,-9,-4,-8,-14,1,15,-10,-8,-9,-19,-8,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-20,-8,-23,-17,2,-25,-12,8,-12,5,7,-18,-23,-14,-11,-13,-6,11,-17,4,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-14,-16,-18,-14,0,-19,-11,12,-11,7,10,-12,-14,-8,-8,-9,-1,8,-9,3,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-9,-17,-10,2,-10,-20,-12,-6,-5,-3,-4,-8,-16,-3,-3,-3,-1,-4,-24,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-6,-14,-8,-13,-10,-12,-12,-10,-10,-9,-8,-16,-8,-13,5,-1,-4,-23,-12,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-24,-4,3,-14,-6,-7,-12,-5,-3,-1,-4,-16,-2,-3,-9,-10,-13,-22,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-25,9,0,-29,27,-10,-33,-10,-26,-19,6,-16,-6,-13,1,-12,-26,-26,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-28,-4,4,-18,-21,6,-19,15,-15,-5,0,-16,9,20,-10,-11,-17,-22,-5,4;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-9,-9,-11,-9,-11,-21,4,-13,-4,-11,-5,-5,-20,-7,-1,-6,-5,-7,-26,-3,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-29,-26,-32,-25,28,-26,-12,-11,-17,-7,-9,-26,-30,-21,-12,-26,-17,-16,62,38,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-28,-8,0,-18,-22,-11,-9,0,-11,-6,-9,6,-4,3,-8,-6,-10,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-24,8,14,-23,-8,1,-25,1,-22,-16,5,-8,5,-3,5,-2,-21,-27,-12,9;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-16,94,-25,-25,-20,-28,-7,-30,-26,-20,-16,-15,-36,-23,-25,-10,-12,-14,-46,-21,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-35,-27,63,-28,-13,0,-27,11,1,-20,-29,-33,-19,-19,-10,-1,7,29,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-4,-14,-9,-16,-21,-10,-14,5,-14,-7,-5,-20,-5,11,-5,-1,-5,-27,-11,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-19,-9,0,-8,-13,-5,-12,-7,-11,-7,-6,-15,-4,-8,3,1,-6,-23,-6,-2;
MA   /M: M=-7,-2,-24,-1,-3,-15,-17,-8,-10,-3,-8,-6,-3,-17,-3,-2,-5,-4,-7,-24,-6,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-5,4,-25,3,6,-22,1,2,-26,3,-23,-14,9,-14,2,2,3,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-6,-18,-10,-2,-19,-18,-8,-12,6,-12,-4,-3,-16,4,6,-2,0,-9,-25,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-21,-9,-6,-14,-18,-7,-9,-6,-11,-3,-2,-1,-2,-7,-2,2,-10,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-23,19,-31,-20,21,-29,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-10,12,-16,4,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-20,-3,-3,-18,0,-12,-19,-7,-19,-14,0,-12,-7,-9,4,0,-14,-23,-16,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-23,-2,-3,-22,4,-13,-19,-9,-17,-11,-3,1,-7,-12,-2,-6,-16,-27,-20,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-26,-2,-3,-24,19,-6,-27,-5,-20,-13,2,-16,-2,-2,-1,-11,-22,-23,-18,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-2,5,-17,7,4,-16,2,-5,-17,-5,-13,-11,4,-8,-1,-7,3,-2,-14,-20,-11,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-13,-3,4,-11,-7,-2,-9,1,-9,-5,-2,-2,3,1,0,-1,-9,-12,-5,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-10,-16,-11,-8,15,-19,13,-8,-11,-3,-2,-8,-19,-8,-8,-10,-8,-10,-2,23,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-16,-22,-21,-16,11,-23,-10,5,-12,1,3,-13,-22,-15,-13,-11,-4,3,-8,15,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-11,-24,-11,-2,-1,-18,-9,-10,-9,-7,-6,-10,-13,-6,-9,-5,-5,-10,-8,2,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-24,-12,-10,-8,-21,-5,0,-11,3,1,-11,-17,-10,-8,-12,-7,0,-23,-3,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,3,-26,2,0,-21,-7,-1,-18,-1,-17,-9,4,-9,1,-2,-3,-7,-16,-26,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-28,15,10,-28,12,-6,-33,0,-25,-19,8,-13,0,-1,0,-12,-27,-27,-20,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-26,10,8,-25,-15,-1,-21,8,-19,-11,6,-11,8,7,0,-4,-18,-28,-12,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-26,-13,-7,-18,-8,-16,-8,-9,-12,-5,-10,11,-8,-12,-5,-6,-10,-25,-17,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-21,-19,-15,10,-26,0,0,-10,3,2,-14,-24,-12,-8,-12,-2,-1,-6,23,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-22,48,-29,-25,0,-28,-21,-14,-25,-4,-8,-20,-33,-24,-22,-14,-9,-6,-22,-9,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00382;
//
ID   ZF_DAG_PE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00479;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger phorbol-ester/DAG-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=82;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=77;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8908076; R2=0.0098795; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=441; N_SCORE=9.238; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-22,-8,1,-17,-12,-12,-13,2,-14,-6,-6,-9,-4,-2,-4,-4,-10,-21,-12,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-20,-3,3,-19,-7,-11,-19,-3,-18,-12,-2,-8,-1,-6,4,0,-14,-24,-14,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-12,-8,-15,-17,-17,-8,-6,-8,-4,-8,-4,-9,-9,0,6,-4,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,2,2,-17,-17,0,-17,0,-15,-8,-2,-5,4,1,-3,-6,-17,-23,-6,2;
MA   /M: M=-2,-6,-20,-7,-6,-17,-13,-12,-11,-2,-13,-8,-3,-9,-5,-2,0,-2,-7,-26,-12,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-27,3,4,-21,-16,-10,-14,1,-12,-9,-1,-6,-1,-3,-5,-6,-13,-26,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-8,-25,-8,3,-12,-17,-10,-15,0,-13,-11,-7,-8,-2,-1,-4,-4,-13,-12,-6,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-27,-1,1,-20,-12,-8,-19,2,-16,-11,-4,-1,-1,2,-5,-6,-16,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-26,4,6,-22,-15,-7,-21,6,-17,-12,0,-3,1,3,-4,-6,-18,-26,-14,3;
MA   /M: M=-5,-1,-22,-1,-5,-17,-14,-7,-8,-9,-9,-6,-1,-9,-7,-12,-4,-5,-8,-28,-11,-7;
MA   /M: M=-2,-5,-19,-7,-4,-20,-2,-6,-17,-5,-17,-10,-2,-13,-5,-6,-2,-7,-12,-25,-13,-5;
MA   /M: M=-8,-1,-21,0,-1,-20,-8,-1,-21,-3,-18,-12,-1,-6,-4,-6,-4,-7,-18,-25,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=1,-7,-20,-9,-8,-16,-9,-8,-11,-5,-11,-5,-4,-13,-7,-2,0,-1,-5,-26,-12,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-3,-23,-11,-7,-14,-17,-6,-2,-1,-7,4,3,-17,0,1,-5,-2,-5,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-27,-10,-6,-17,-5,-8,-19,-6,-17,-10,-8,8,-7,-8,-4,-4,-17,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-22,1,1,-22,-15,8,-20,5,-18,-9,6,-16,8,11,0,-3,-17,-27,-8,2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-32,-28,-39,-29,54,-28,-22,-2,-27,5,-2,-26,-29,-32,-20,-26,-15,-6,42,27,-27;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-11,-21,-12,-2,-15,-21,-12,-2,0,-7,-2,-9,-16,2,-1,-3,-3,2,-24,-10,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-24,-4,6,-18,-19,-9,-11,-2,-13,-7,-7,0,-1,0,-1,-2,-8,-28,-14,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-11,-28,-13,-10,-12,0,1,-19,0,-16,-7,-5,-19,-6,1,-9,-12,-16,-12,0,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-17,-3,-6,-14,-9,-9,-14,-7,-18,-13,12,-13,-4,-5,13,15,-11,-30,-12,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-11,-27,-23,27,-24,-17,2,-22,6,0,-15,-26,-25,-17,-14,-7,3,-6,10,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: M=-8,-6,-23,-7,-4,-12,-17,-8,-10,-1,-11,-5,-4,-1,-5,-2,-3,-1,-10,-23,-9,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-6,-20,-8,-6,-18,2,-13,-17,-1,-16,-10,-1,-13,-6,0,4,1,-10,-24,-15,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-15,-20,-13,-7,-18,-15,-15,-12,-11,-15,-10,-13,26,-10,-14,-1,0,-12,-27,-18,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-17,-10,-6,-18,-8,-13,-13,-5,-14,-9,-1,-13,-3,-8,9,13,-6,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-12,-26,-15,-8,0,-19,-9,-16,2,-16,-8,-7,-17,-4,2,-6,-5,-15,6,5,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-15,11,4,-20,-16,-5,-19,-3,-16,-13,0,-16,-4,-6,-1,-4,-12,-29,-10,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-14,-23,-15,-8,-10,-20,5,-4,-7,-5,0,-11,-18,-4,-3,-10,-9,0,-22,-1,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-7,0,-26,-1,0,-23,1,3,-23,-1,-17,-8,3,-16,3,3,-2,-7,-20,-25,-12,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-26,1,5,-21,-14,-3,-22,17,-21,-8,1,-13,7,11,-2,-6,-17,-22,-6,5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-17,-22,-20,-12,6,-22,-13,0,-13,6,3,-14,-15,-11,-8,-9,0,-3,-17,1,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-6,-33,-25,2,-32,-22,24,-26,23,21,-24,-26,-19,-23,-21,-9,17,-24,-4,-24;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-16,-27,-16,-11,-10,-11,-12,-12,-3,-11,-7,-14,-11,-9,-1,-13,-10,-9,6,-3,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-8,-11,-13,-12,16,-14,-15,-13,-10,-8,-6,-15,-12,-13,-2,-7,-10,-13,-14,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,-12,-11,-9,2,-14,-6,3,-9,4,2,-6,-14,-6,-7,-5,1,2,-10,5,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=0,-9,-19,-12,-10,-9,0,-12,-9,-6,-9,-4,-3,-15,-8,-4,-1,-5,-6,-18,-10,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-24,-12,-6,-5,-22,0,-10,7,-2,1,-9,-19,-3,13,-14,-10,-8,-15,4,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-18,-1,8,-24,-17,2,-18,3,-16,-5,2,-13,23,2,1,-1,-19,-24,-10,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-21,-5,-14,-27,39,-16,-31,-16,-25,-18,0,-17,-15,-18,4,-12,-21,-24,-25,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-24,-18,-26,-20,16,-27,-10,4,-16,15,7,-21,-28,-17,-9,-20,-8,2,-4,17,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-8,1,-20,-16,0,-22,20,-17,-6,-2,-16,6,28,-8,-8,-16,-21,-7,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-7,-22,-7,2,-16,-19,-12,-10,2,-9,-6,-7,-12,0,0,-2,-1,-5,-24,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-2,-27,-5,-1,-12,-16,-8,-17,-5,-18,-14,-1,-17,-4,-6,-6,-4,-16,10,-4,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-28,-1,-1,-25,7,1,-29,8,-26,-13,6,-14,4,8,-2,-11,-25,-23,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-19,-26,-20,10,-24,-16,11,-16,13,12,-18,-23,-17,-15,-13,-3,11,-15,5,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-2,-17,-8,-6,-10,-15,-9,-13,1,-13,-4,2,-14,-4,-1,4,10,-9,-25,-7,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-23,28,-30,-26,0,-27,-26,2,-24,0,-2,-21,-29,-26,-23,-9,-4,13,-30,-12,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-26,2,5,-24,-14,0,-20,9,-21,-11,5,-7,4,3,-1,-5,-18,-27,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-28,1,11,-26,-11,0,-27,14,-22,-12,0,-12,11,15,-3,-8,-22,-21,-12,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: M=0,-12,-17,-14,-6,-12,-18,-9,-6,-3,-4,0,-9,-18,-2,-1,-2,0,-1,-25,-9,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,8,-24,11,9,-25,-9,4,-25,3,-23,-15,7,-9,3,1,5,-2,-20,-30,-13,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: M=-4,-8,-19,-11,-3,-12,-14,-6,-11,-3,-4,-3,-6,-18,-2,0,-5,-3,-9,-23,-7,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=1,-23,-13,-26,-22,-1,-26,-21,17,-20,14,8,-22,-25,-20,-19,-12,-3,21,-24,-6,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-24,-8,-2,-21,-12,-8,-16,-6,-19,-12,-6,30,-3,-10,-2,-4,-19,-26,-18,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-2,-21,-2,0,-17,-15,-8,-10,-6,-10,-6,-3,3,1,-8,0,1,-11,-24,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: M=-10,-4,-16,-5,0,-11,-20,-6,-12,-4,-9,-5,-6,-9,-4,-5,-8,-7,-11,-23,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-19,112,-29,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29,-8,-7,-9,-49,-29,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-2,-24,1,-4,-23,3,-12,-23,-3,-21,-13,-3,-5,-8,-7,-5,-10,-18,-26,-18,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-15,-18,-17,-13,-5,-13,-10,-5,-12,-2,3,-12,-14,-9,-10,-11,-9,-5,-20,-6,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-25,-5,-6,-18,4,-9,-22,-1,-20,-12,-2,-5,-6,-2,-1,-6,-17,-18,-13,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-22,-7,2,-17,-13,-6,-10,-5,-9,-3,-4,-1,2,-4,-2,-4,-12,-24,-12,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-19,-6,1,-14,-15,-10,-13,-6,-7,-6,-7,-6,-2,-8,-4,-3,-12,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-26,-8,0,-16,-18,-8,-12,1,-10,-4,-8,-5,1,2,-6,-6,-11,-24,-10,-1;
MA   /M: M=-1,-2,-22,-1,-2,-19,-11,-10,-14,-3,-14,-10,-3,-8,-4,-7,0,-3,-9,-26,-13,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-5,-23,-8,-4,-9,-16,7,-15,0,-11,-5,1,-14,0,5,-5,-6,-15,-20,-2,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-8,-8,-27,-9,-6,-17,-10,-11,-6,-7,-8,-4,-6,-13,-5,-5,-7,-8,-7,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-15,-23,-18,-11,-8,-19,-16,0,-10,1,0,-12,-10,-10,-5,-8,-3,-1,-23,-9,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-26,-14,-10,-10,-20,-12,-4,-13,3,0,-15,6,-11,-12,-13,-7,-8,-22,-8,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-24,-13,-7,-11,-10,-13,-14,-9,-12,-9,-12,9,-10,-12,-5,-6,-14,-21,-10,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-14,-14,-9,-14,-14,-19,-3,-13,-5,-5,-11,-9,-12,-16,-1,0,0,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-21,1,4,-14,-17,-3,-14,-5,-12,-9,-2,-13,-2,-6,-3,-7,-13,-24,-6,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-25,12,-1,-29,20,-11,-33,-3,-30,-21,7,-14,-6,-8,9,-5,-23,-30,-22,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00379;
//
ID   CITRATE_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP00480;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Citrate synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8712668; R2=0.0140874; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=416; N_SCORE=10.722; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-28,3,18,-27,-13,-7,-27,16,-23,-15,-1,1,6,12,-3,-8,-23,-25,-18,11;
MA   /M: SY='D'; M=5,9,-24,13,13,-27,-10,-9,-25,0,-22,-19,1,-5,2,-9,3,-6,-19,-20,-17,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-30,-24,-22,33,-27,-1,-4,-17,-1,-4,-22,-29,-19,-15,-22,-13,-10,39,50,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-21,-31,-25,4,-31,-22,30,-25,24,19,-21,-25,-20,-21,-19,-7,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-5,-31,-4,-1,-14,-14,-9,-23,-1,-20,-15,-7,-18,-2,-1,-11,-12,-21,20,-2,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,8,-27,8,7,-28,-5,-3,-30,19,-27,-15,9,-13,4,14,-1,-7,-23,-26,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=7,-12,-14,-18,-12,-13,-20,-18,-2,-2,-7,-3,-11,-17,-11,-5,0,7,8,-25,-11,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-22,-23,-14,-2,-28,-18,10,-9,24,13,-22,-24,-13,-8,-23,-9,7,-21,-3,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='B'; M=-5,25,-22,24,11,-26,-7,0,-25,4,-25,-19,24,-12,4,-1,6,-3,-24,-33,-18,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-2,4,-20,0,3,-23,-9,-4,-22,14,-25,-13,12,-13,7,15,9,1,-17,-28,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-27,2,1,-27,14,-8,-30,13,-29,-16,12,-14,-1,5,-2,-11,-25,-24,-19,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-24,12,19,-24,-12,-1,-25,13,-20,-13,5,-9,12,15,-1,-7,-21,-23,-13,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-22,-14,-8,-16,-24,-15,-7,18,-12,-2,-11,-20,-5,21,-10,-6,7,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-32,-26,3,-31,-26,31,-26,25,17,-27,-27,-23,-22,-19,-6,30,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-27,-23,-14,-10,-20,-9,6,-11,0,26,-19,13,-5,-14,-14,-9,-4,-17,-9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-22,-34,-27,62,-29,-10,0,-24,7,0,-20,-29,-31,-17,-19,-9,-1,13,41,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-26,-12,-4,-21,-8,-7,-26,15,-19,-11,-3,-12,2,39,-5,-9,-17,-21,-15,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,24,-30,8,6,-16,15,6,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-4,15,56,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-29,-4,6,-26,-20,-7,-29,39,-25,-10,0,-13,10,41,-8,-7,-19,-21,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-22,3,-1,-19,-13,-3,-17,9,-21,-12,18,-15,-1,5,3,4,-15,-29,-11,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-11,-24,-14,-11,0,-10,-6,-13,-7,-11,-7,-9,-13,-9,-7,-4,3,-12,-7,14,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,19,-39,-10,-1,-38,0,-29,-29,19,-10,-1,-10,0,-10,-28,-40,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-36,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16,78,-9,-19,-4,-6,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=16,-15,-17,-20,-14,1,-12,-6,-5,-13,-5,-5,-13,-19,-13,-16,-2,-4,1,-9,8,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-8,-25,-8,1,-21,-20,-9,-15,10,-17,-7,-6,-1,3,8,-3,0,-11,-25,-12,1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-1,-25,-21,-8,-24,-17,11,-20,0,3,-16,-22,-18,-21,-4,0,16,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-23,-24,-13,-1,-26,-9,12,-14,17,24,-18,-22,2,-11,-17,-9,4,-18,-1,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-29,-5,8,-24,-21,-5,-24,31,-20,-6,-2,-14,12,35,-9,-10,-17,-21,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-28,12,24,-30,-10,-5,-28,15,-24,-16,2,-8,11,7,-2,-9,-23,-27,-17,18;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-19,-18,-26,-18,20,-22,-15,2,-18,7,5,-15,-22,-18,-15,-7,2,3,-12,7,-17;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,2,-22,-14,-13,-9,-19,-8,-13,-5,-4,-12,-16,-12,-19,3,-2,0,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-27,6,13,-21,-19,4,-19,5,-9,-5,-2,-14,7,5,-8,-10,-18,-26,-9,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,7,23,-25,-18,-2,-26,16,-21,-13,1,-8,15,11,-1,-6,-22,-25,-12,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-21,-22,-17,-3,-27,5,9,-16,15,13,-18,-26,-12,-9,-18,-9,10,-25,1,-16;
MA   /M: SY='L'; M=2,-20,-16,-23,-16,2,-16,-17,2,-20,12,3,-16,-19,-17,-18,-10,-4,1,-20,-6,-16;
MA   /M: SY='P'; M=1,1,-26,3,7,-27,-10,-10,-21,2,-24,-15,0,10,3,-6,3,-4,-20,-28,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-28,8,13,-24,-16,2,-21,8,-18,-12,2,-9,4,5,-5,-10,-17,-28,-12,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00422;
//
ID   THIOL_CYTOLYSINS_MP; MATRIX.
AC   MP00481;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thiol-activated cytolysins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0182238; R2=0.0112671; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1298; N_SCORE=18.633; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=221; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-34,-16,-12,5,-26,4,-8,-10,-12,-8,-20,19,-10,-14,-16,-10,-18,5,35,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-36,-6,4,-30,-20,-16,-24,15,-30,-16,-12,49,-2,0,-10,-10,-26,-26,-22,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,6,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,20,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-2,24,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,40,-16,0,-4,22,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-30,-12,-8,5,-26,8,-12,15,-12,-4,-12,-22,-2,6,-16,-10,-14,10,43,-8;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-18,-28,-18,-12,-16,-24,15,-18,2,2,-14,-14,-14,-24,-2,-4,12,-20,-12,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-16,-13,-26,-16,11,-9,-20,-7,-16,-4,-7,-13,-16,-19,-20,1,-3,0,-11,-4,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-30,-32,-26,12,-36,-10,30,-22,12,12,-20,-24,-16,-22,-20,-10,14,0,33,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,36,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-30,41,16,-36,-14,-4,-36,20,-30,-22,12,-10,4,6,-4,-10,-26,-32,-16,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-22,-10,-4,-16,-20,-8,-22,14,-16,-10,0,-16,2,37,2,15,-12,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,40,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,44,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,4,-24,-8,2,-24,20,-30,-16,35,-16,4,12,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00436;
//
ID   DIHYDROOROTASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00482;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroorotase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2862830; R2=0.0182968; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=211; N_SCORE=10.137; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-5,-23,-7,1,-11,-21,-3,-4,-3,-2,14,-8,-14,2,-4,-8,-2,-5,-24,-6,1;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-15,-17,-11,-7,-19,-17,9,-13,2,3,-13,-10,-12,-14,-3,1,11,-23,-9,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-11,-17,-12,-7,-2,-16,-13,6,-9,2,2,-9,-13,-9,-8,-8,-5,5,-14,-4,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-14,17,2,-10,-9,-5,-18,-4,-15,-14,5,-4,-6,-7,-1,-5,-14,-20,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=5,-9,-13,-12,-9,-8,-7,-12,-1,-8,-3,-3,-7,-14,-9,-10,-1,-1,4,-17,-7,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-2,1,-15,-1,0,-14,-4,-7,-13,6,-12,-7,2,-9,-1,3,0,0,-9,-17,-10,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-27,7,2,-29,11,-7,-28,0,-25,-15,6,-5,4,-4,0,-9,-26,-25,-19,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-11,-9,1,-14,-12,-7,-16,-7,-6,-7,-7,-18,-3,-5,-5,-4,-14,-25,-8,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-19,-31,-24,9,-30,-24,23,-24,23,12,-24,-26,-22,-18,-18,-5,21,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-17,-20,-19,-6,-26,-24,14,-15,5,3,-15,-20,-18,-17,-4,10,20,-27,-8,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-17,-28,-20,0,-26,-21,18,-24,25,14,-21,-23,-17,-21,-16,-4,12,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-32,-18,-9,-10,-18,-20,-10,-14,-15,-11,-17,42,-15,-18,-10,-7,-16,-22,-17,-15;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,-26,-8,-10,-25,23,-15,-28,-6,-21,-15,-3,-11,-10,-2,-2,-12,-20,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-25,-22,-15,6,-19,-20,-3,-19,-2,-3,-18,11,-19,-19,-10,-4,-6,-19,-7,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-11,-15,-12,-18,-10,-28,-23,16,-20,4,3,-14,-21,-18,-22,-11,-5,18,-29,-9,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=0,-25,-24,-29,-20,1,-21,-20,7,-19,8,9,-23,-17,-16,-19,-16,-9,5,7,-1,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-12,-30,-28,0,-29,-28,28,-21,15,11,-29,-29,-27,-20,-12,-2,42,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-17,-32,-25,22,-30,-23,19,-27,30,13,-28,-30,-27,-20,-22,-7,20,-17,3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-5,-29,-7,0,-20,-18,1,-29,27,-21,-11,6,-20,9,63,-8,-9,-21,-22,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-30,25,27,-29,-11,-4,-29,0,-19,-19,3,-9,9,-6,-3,-9,-26,-23,-16,18;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-31,-7,-8,-23,11,-15,-24,-12,-27,-19,0,27,-12,-17,-3,-11,-27,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='G'; M=8,-4,-25,-4,-1,-29,29,-14,-30,-8,-23,-16,-1,-14,-5,-13,2,-13,-23,-22,-24,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-14,-23,-15,-4,-10,-11,-10,-4,-7,1,6,-12,-18,-1,-2,-10,-9,-4,-20,-9,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-13,-6,9,-13,-21,-13,-11,-8,0,-7,-8,-14,-3,-9,0,7,-9,-29,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-27,9,8,-21,-17,6,-23,8,-20,-13,0,-9,2,2,-4,-8,-18,-22,-2,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-28,-7,-2,-17,-16,-7,-21,17,-17,-8,-7,-16,-1,7,-12,-10,-16,-2,0,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-22,3,26,-20,-21,-10,-12,-1,-12,-11,-7,-10,3,-7,2,0,-5,-31,-16,14;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-17,2,-7,-17,-9,-16,-12,-12,-11,-11,-1,-14,-11,-14,9,16,-4,-31,-14,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-27,-25,-14,4,-25,-18,7,-17,3,1,-18,-8,-14,-15,-15,-10,1,-10,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-25,3,10,-12,-17,6,-20,0,-13,-11,-3,-14,1,-1,-4,-8,-17,-18,3,4;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-13,-10,-7,-12,-18,-18,-5,-12,-11,-9,-2,-12,-8,-12,17,29,3,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=16,-9,-21,-12,-13,-25,34,-18,-27,-13,-23,-16,-2,-15,-13,-14,8,-8,-17,-23,-25,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-17,-3,1,-16,-15,-12,-16,-3,-13,-11,0,-12,-2,3,11,16,-9,-29,-13,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-23,-16,-9,-7,-13,-9,-7,-10,3,1,-12,-14,-5,-6,-9,-6,-8,-19,-4,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-10,-14,-15,-10,-4,-1,-14,-12,-13,-12,-8,-6,-17,-13,-16,4,-3,-6,-19,-9,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00401;
//
ID   DIHYDROOROTASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00483;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroorotase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8246503; R2=0.0139577; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=224; N_SCORE=7.941; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,41,-30,58,17,-37,-12,17,-38,-2,-28,-25,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-13,8;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-20,-22,-14,-8,-25,-12,9,-7,9,16,-19,-24,-3,2,-14,-7,13,-23,-7,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-25,5,18,-22,-15,-7,-20,8,-16,-11,2,-10,6,3,-1,-4,-17,-27,-14,11;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-16,-18,-9,-17,-7,-15,-13,-3,-10,-9,-9,-14,-7,-3,4,-2,-5,-16,-14,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-20,7,-30,-20,19,-26,43,18,-28,-29,-19,-16,-28,-10,11,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-27,-28,-21,0,-26,-21,11,-14,10,5,-21,-25,-16,-5,-19,-10,8,-1,0,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,7,19,-19,-16,-3,-20,4,-15,-12,0,-10,6,-1,-1,-7,-18,-23,-9,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=12,-6,-18,-10,-12,-18,14,-15,-14,-13,-11,-10,-1,-13,-13,-16,0,-7,-10,-22,-19,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=2,-21,-18,-25,-16,4,-23,-17,13,-19,17,9,-19,-20,-16,-18,-13,-5,10,-15,0,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-14,-18,-18,-12,-3,-19,-16,2,-9,5,1,-12,-18,-11,-7,-7,1,3,-14,-5,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-19,19,8,-24,-8,-4,-23,2,-22,-16,10,-10,5,-2,11,2,-17,-31,-15,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-27,-2,-12,-29,45,-15,-35,-13,-27,-19,1,-17,-14,-16,1,-15,-25,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-4,-20,-7,-7,-9,-20,-3,-8,-7,-6,-5,-2,-18,-6,-3,0,7,-4,-26,-4,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-27,-26,-19,-5,-30,-22,20,-16,3,6,-17,-4,-17,-19,-14,-7,14,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,29,-29,39,12,-32,-13,1,-33,10,-27,-22,14,-10,3,5,-2,-8,-26,-32,-14,7;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-25,-2,-33,-26,19,-29,-24,12,-25,7,5,-19,-26,-26,-22,-12,-4,13,-17,1,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-35,-27,16,-34,-24,29,-28,26,15,-25,-26,-24,-24,-22,-9,21,-16,5,-27;
MA   /M: SY='A'; M=27,-11,-17,-16,-14,-22,23,-20,-19,-14,-17,-13,-7,-15,-14,-20,7,-6,-8,-22,-23,-14;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-11,-16,-14,-10,-19,-14,4,-10,-6,-10,29,37,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-23,0,0,-20,-14,64,-26,-10,-22,-6,10,-17,6,-3,5,-5,-23,-33,7,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=7,-9,-17,-13,-8,-11,-11,-13,-12,-13,-11,-10,-6,-2,-10,-14,8,13,-7,-26,-12,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-25,-10,0,-15,-22,-5,-9,5,-6,-2,-8,-17,0,7,-8,-6,-7,-21,-7,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-25,9,20,-22,-12,2,-26,1,-21,-16,2,-8,6,-5,3,-7,-22,-23,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-27,20,33,-28,-15,-1,-28,7,-21,-19,8,-7,10,2,2,-7,-25,-31,-18,21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-17,-2,9,-19,-16,-2,-18,-1,-14,-11,1,-15,3,1,-5,-8,-18,-21,-10,5;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-8,-5,-9,-6,-9,-8,-8,-5,-2,-5,1,-6,-10,-3,-1,-3,-2,-1,-16,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-18,11,10,-18,-2,0,-18,-2,-16,-13,6,3,1,-5,1,-5,-17,-20,-13,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-15,-14,-17,-13,11,-16,-8,7,-11,6,7,-12,-10,-11,-10,-11,-5,4,0,9,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-14,6,9,-13,-9,-5,-13,3,-9,-8,-1,-6,2,1,-2,-3,-11,-9,-7,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-15,-5,-2,-7,-12,-7,-6,1,-4,-3,-3,-10,-3,-1,-4,-4,-5,-13,-4,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=20,-5,0,-12,-9,-22,-4,-15,-18,-10,-19,-15,-2,-5,-10,-16,8,0,-11,-29,-22,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=7,-11,-21,-10,-3,-18,-11,-14,-13,-6,-17,-11,-9,26,-6,-12,2,0,-13,-22,-16,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-2,-16,-10,-5,-17,-18,-16,-16,-18,-14,-10,13,-15,-18,0,-3,-15,-28,-15,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-30,-12,-20,-28,58,-20,-33,-19,-27,-17,-2,-17,-20,-19,-2,-18,-25,-21,-28,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,8,-32,-26,2,-30,-22,14,-24,5,9,-18,-21,-20,-24,-14,-7,10,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-15,-20,-12,-17,-16,-18,-3,-15,-9,-6,-15,9,-13,-20,-2,-2,-1,-25,-17,-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-18,-26,55,-18,-35,-17,-28,-19,0,-20,-17,-17,1,-17,-27,-15,-24,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-8,-29,-23,0,-29,-24,20,-25,22,12,-23,-27,-21,-22,-16,-6,20,-26,-7,-23;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-14,-23,-14,-1,24,-23,-4,-8,-11,-3,-6,-12,-11,-11,-10,-12,-9,-11,1,21,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,7,-12,-1,-5,-14,-3,-10,-15,-8,-18,-13,13,-11,-5,-8,19,23,-10,-29,-14,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-12,-12,-2,-18,-6,-11,-9,-5,-9,-4,-6,-9,2,-11,7,2,-5,-19,-14,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-31,-6,2,-19,-21,-7,-13,-5,-16,-8,-13,27,-5,-11,-9,-8,-17,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-16,-18,-13,-5,-15,-10,0,-15,-7,-4,-4,-16,-12,-16,6,6,3,-25,-7,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00401;
//
ID   THYROGLOBULIN_1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00484;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thyroglobulin type-1 repeat signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5171580; R2=0.0111421; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=669; N_SCORE=11.961; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=2,-10,-13,-13,1,-13,-18,-12,-8,-8,3,-2,-10,-18,-2,-5,-6,-5,-7,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-20,-13,-6,-4,-15,-8,-12,-4,-10,-6,-1,-18,2,2,-1,-4,-10,-19,-6,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-24,-8,3,-22,-12,-6,-14,0,-14,-8,-4,-7,5,0,2,-4,-13,-25,-13,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-7,-24,-6,3,-17,-18,-9,-9,-4,0,-1,-10,-12,5,-6,-9,-8,-10,-23,-10,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-24,-2,10,-25,-19,-8,-15,7,-17,-8,-1,-6,13,1,2,3,-14,-26,-13,11;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-24,-1,8,-17,-18,15,-20,-2,-12,-7,0,-14,8,3,-1,-4,-18,-26,-5,7;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-7,-3,-8,-1,-20,-7,1,-23,-7,-18,-12,-4,-15,-3,-7,-1,-6,-18,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=6,-13,-21,-15,-11,-18,-7,-16,-6,-9,-13,-6,-9,-5,-9,-12,0,-3,0,-26,-17,-11;
MA   /M: M=-6,-11,-23,-13,-11,-9,-5,-10,-12,-11,-5,-4,-7,-14,-9,-6,-6,-2,-9,-21,-8,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,6,-19,11,10,-18,-13,-3,-15,7,-11,-7,0,-9,4,5,-5,-6,-11,-20,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: M=-8,-3,-4,-2,-3,-22,-13,-9,-20,-3,-19,-13,-3,-10,-8,-8,-3,-6,-13,-31,-15,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-11,-25,-13,-5,-15,-20,-6,-5,-5,-2,-1,-6,-7,2,-1,-10,-8,-10,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-29,1,0,-14,-21,0,-17,3,-12,-9,-5,-6,0,7,-10,-9,-17,-17,3,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-25,1,-9,-26,28,-13,-29,-8,-26,-18,10,-16,-10,-11,5,-8,-23,-27,-23,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-22,-20,-6,1,-25,-15,6,-15,12,7,-17,-20,-7,-12,-13,-8,4,-20,-4,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-24,-23,-19,26,-26,10,-2,-16,-1,0,-16,-23,-17,-14,-14,-9,-3,4,37,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-24,-21,-21,-7,-16,-23,16,-20,8,6,-17,-23,-19,-18,-14,-9,16,-24,-9,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13,-3,-24,-21,-20,-14,-13,-18,-14,-21,72,-11,-20,-13,-10,-24,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,19,-25,13,12,-28,-11,5,-22,6,-23,-13,24,-14,19,5,4,-5,-27,-31,-16,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,43,-27,56,15,-35,-9,0,-34,-1,-27,-26,22,-12,-1,-10,1,-8,-27,-38,-19,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-30,6,23,-29,-19,4,-26,15,-21,-11,-1,-2,17,11,-5,-10,-25,-25,-13,19;
MA   /M: SY='N'; M=-12,16,-26,15,6,-23,-8,7,-26,7,-23,-15,19,-16,2,7,-1,-7,-24,-30,-12,3;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-10,-24,-15,-10,13,-22,7,-9,-11,-2,-1,-3,-23,-2,-4,-11,-9,-13,-10,14,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-27,-4,3,-22,-19,8,-20,18,-18,-5,4,-16,8,21,-8,-10,-17,-24,-7,4;
MA   /M: SY='P'; M=7,-12,-26,-12,-3,-23,-14,-16,-16,1,-18,-12,-11,22,-5,-6,-2,-5,-15,-25,-20,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-22,-9,-2,-18,-19,-10,-13,12,-12,-3,-3,-16,3,11,-2,2,-7,-25,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-18,93,-26,-25,-17,-29,-26,-29,-19,-20,-18,-17,-36,-24,-19,-10,-10,-11,-43,-25,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-17,11,-29,13,9,-24,-16,32,-30,7,-24,-12,11,-16,7,10,-6,-13,-27,-24,-1,6;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-18,-8,-4,-15,-3,-7,-12,-2,-12,-1,-4,2,2,1,0,0,-12,-18,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-20,-4,-6,-19,21,-5,-22,-5,-18,-10,1,-6,-2,-1,-1,-10,-19,-15,-15,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-19,4,8,-20,-9,-4,-20,8,-20,-12,3,-9,8,7,7,2,-15,-22,-10,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-16,-8,-4,-15,-13,-10,-16,2,-16,-10,0,-9,-1,13,10,14,-8,-25,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-28,-4,-15,-30,58,-18,-38,-18,-30,-21,2,-18,-17,-18,3,-16,-28,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-11,-27,-9,0,0,-25,-5,-8,-4,-4,-4,-12,-10,-3,-7,-12,-7,-11,-10,12,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-19,96,-28,-27,-19,-26,-28,-24,-27,-18,-17,-19,-36,-27,-28,-7,-7,-5,-46,-27,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,20,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,129,30,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,32,-27,40,9,-20,-13,1,-27,-4,-20,-21,18,-16,-4,-9,-3,-8,-24,-29,-7,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-27,-8,-1,-24,-10,-13,-21,7,-23,-13,-6,13,-1,7,-1,-4,-17,-25,-18,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-7,0,-22,-1,0,-9,-16,-2,-10,-8,-9,-4,-1,-16,-4,-10,-1,2,-9,-20,2,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-24,-9,0,-19,-21,-6,-14,13,-12,-2,-3,-18,8,23,-7,-5,-9,-24,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-5,-31,0,19,-26,-20,-7,-26,16,-22,-14,-5,10,7,19,-6,-9,-23,-26,-17,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-30,-22,4,-31,-22,24,-23,31,17,-25,-27,-19,-15,-23,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-31,-9,3,-26,-19,-14,-16,-6,-20,-12,-13,42,3,-13,-4,-2,-21,-27,-21,0;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-9,-31,-8,-17,-23,40,-16,-33,-17,-26,-19,-4,-21,-17,-18,-6,-17,-26,2,-17,-17;
MA   /M: SY='T'; M=2,-6,-15,-11,-8,-11,-11,-15,-11,-8,-13,-8,-2,-14,-7,-9,14,19,-5,-23,-9,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-28,6,10,-25,-18,-7,-23,7,-19,-13,-2,3,5,11,-4,-6,-20,-28,-16,6;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-17,-5,-1,-12,-18,-13,-9,-7,-8,-7,-4,-13,-6,-10,7,17,-3,-26,-7,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-19,-4,4,-14,-9,-5,-6,-4,-9,-5,-3,-7,-1,-7,-2,-5,-6,-20,-10,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-27,-8,-4,-23,-1,-9,-22,5,-18,-10,-1,-11,2,16,-4,-10,-18,-22,-16,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-20,-4,-3,-18,8,-9,-19,-3,-17,-11,-3,-4,-6,-3,-1,-4,-13,-19,-15,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-13,-12,-15,-13,-16,3,-10,-15,-14,-7,-2,-9,-17,-11,-12,-6,-8,-11,-26,-15,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-24,26,7,-27,-12,-7,-23,-4,-24,-20,10,-4,-3,-7,7,1,-17,-36,-18,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-2,-1,3,-14,-15,-10,-14,-7,-13,-11,-7,7,-4,-10,-3,-5,-12,-23,-14,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,1,-12,-1,6,-26,-16,-8,-23,0,-26,-16,4,12,3,-5,1,-3,-24,-32,-21,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00377;
//
ID   A_DEAMINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00485;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenosine and AMP deaminase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4755731; R2=0.0161530; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=307; N_SCORE=10.425; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=16,-2,-16,-6,4,-20,-10,3,-17,-7,-15,-11,-1,-10,-1,-11,11,7,-11,-27,-12,1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-23,15,9,-25,-14,2,-25,1,-19,-16,5,-11,1,3,3,2,-18,-30,-13,4;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-6,-20,-10,-11,-12,-18,26,-5,-13,-5,0,1,-22,-7,-10,-7,-8,-2,-29,-1,-11;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,71,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,26,-27,35,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,24,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-28,-11,-2,-22,-22,-9,-16,15,-17,-7,-9,-2,5,25,-9,-8,-9,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-23,0,15,-21,-20,-9,-23,15,-19,-13,0,-9,6,16,3,10,-16,-26,-13,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-35,-27,61,-30,-14,3,-27,15,3,-22,-30,-32,-18,-22,-10,0,8,33,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-26,-16,13,-28,-18,7,-15,28,11,-23,-26,-17,-10,-25,-10,3,-15,3,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-25,33,26,-30,-10,0,-30,2,-27,-23,20,-9,7,-5,8,-3,-27,-37,-20,16;
MA   /M: SY='H'; M=6,3,-23,3,0,-24,-11,10,-25,3,-18,-12,2,-14,1,9,-1,-8,-16,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-30,1,-10,-31,44,-16,-38,-4,-30,-19,2,-17,-12,-9,-2,-17,-28,-22,-25,-11;
MA   /M: SY='V'; M=6,-26,-15,-30,-25,-2,-26,-27,24,-21,14,9,-24,-24,-23,-22,-11,-3,31,-25,-9,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-8,-27,-12,-7,-14,-17,-6,-7,-4,-6,6,-2,9,-3,2,-11,-8,-14,-27,-14,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-23,-19,-30,-23,28,-23,-11,6,-18,6,9,-20,-25,-21,-16,-13,-7,7,-2,20,-21;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-3,-2,-20,0,-12,-18,-10,-27,-18,7,-10,-2,-12,35,17,-8,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-5,26,-20,12,-3,-22,11,2,-23,-5,-30,-20,43,-18,-3,-5,13,0,-27,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='T'; M=11,-2,-10,-8,-7,-15,-10,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-12,25,32,-3,-32,-15,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=11,-20,-18,-23,-17,-7,-3,-20,0,-22,17,3,-18,-22,-17,-20,-12,-8,0,-20,-12,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-25,-24,-17,5,-30,-6,15,-16,10,9,-20,-25,-6,-14,-17,-8,8,-6,23,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-22,-33,-21,59,-28,-15,-3,-23,5,0,-17,-27,-23,-15,-17,-10,-5,5,23,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-7,-30,-7,-11,-28,39,0,-37,-5,-28,-15,2,-18,-10,-7,-3,-18,-28,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='S'; M=6,-13,-16,-16,-15,-3,5,-18,-11,-17,-15,-11,-6,-19,-17,-16,10,1,-1,-24,-13,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,1,-23,0,-6,-4,-22,0,-15,-2,-12,-10,-3,-18,-5,3,-1,11,-12,-11,17,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-6,-23,-7,-8,-14,-20,-11,4,-13,7,9,-10,-17,-2,-15,-11,-8,-1,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,11,-23,15,17,-25,-15,10,-25,-3,-19,-15,4,-9,4,-7,4,1,-19,-30,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-24,15,20,-26,-18,-4,-16,0,-16,-12,3,-12,9,-5,-1,-7,-12,-31,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-3,14,-7,5,-23,-23,-12,-21,-7,-17,-12,-5,-16,7,-9,4,10,-15,-33,-17,6;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-19,-21,-24,-15,-10,-24,-13,12,-8,4,17,-16,-20,-2,-3,-11,-7,11,-22,-7,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-10,-22,-18,-10,-16,-24,5,-14,-2,-2,-15,-18,-18,-18,5,11,19,-26,-14,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00419;
//
ID   DNA_MISMATCH_REPAIR_2_MP; MATRIX.
AC   MP00486;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA mismatch repair proteins mutS family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6169357; R2=0.0165796; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=211; N_SCORE=9.105; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=54; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-29,20,44,-29,-19,15,-29,5,-20,-17,3,-5,16,-1,-2,-11,-28,-31,-13,29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-18,-29,-20,1,-22,-6,19,-14,23,47,-21,-22,-6,-13,-19,-9,12,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-20,-5,-3,-16,-17,-12,-8,-2,-9,-4,-1,-15,-3,-4,2,5,-4,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-28,20,39,-30,-15,1,-27,7,-22,-18,9,-3,16,-1,2,-8,-28,-31,-19,27;
MA   /M: SY='I'; M=1,-15,-16,-23,-17,-6,-24,-20,13,-16,6,9,-13,-17,-13,-17,-2,13,13,-25,-7,-16;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,-13,-16,-10,-16,-8,-18,-6,-9,-9,-7,-7,-14,-9,-14,8,2,2,-25,-16,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-22,-1,0,-12,-12,-2,-15,-1,-14,-7,4,-16,-1,-2,0,-2,-13,-22,-3,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-25,-33,-24,1,-31,-25,31,-23,11,12,-17,-19,-18,-22,-12,-7,20,-20,-2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-21,6,-30,-21,21,-27,39,17,-27,-25,-20,-20,-25,-6,13,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-11,11,-26,9,9,-25,-14,10,-24,10,-23,-12,14,-11,10,10,1,-5,-23,-30,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-9,10,-25,6,4,-21,-13,11,-21,6,-19,-9,14,-16,7,4,-2,-6,-21,-27,-6,4;
MA   /M: SY='A'; M=34,-11,-9,-19,-10,-19,-6,-19,-7,-11,-10,-8,-10,-10,-8,-18,8,2,0,-23,-17,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,12,-16,6,-5,-18,-8,-12,-17,-8,-18,-15,12,-13,-8,-10,14,25,-11,-32,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-23,6,12,-23,-10,-4,-25,4,-23,-16,4,-4,4,0,3,-3,-21,-27,-14,7;
MA   /M: SY='N'; M=-14,16,-27,13,9,-26,-13,6,-27,16,-26,-15,21,-12,9,19,-2,-7,-26,-30,-14,7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,-2,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-27,-19,8,-10,-1,-10,37,23,-9,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,14,-30,-20,19,-30,47,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,10,-18,2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,16,13,-27,-27,-26,-23,-14,-3,41,-26,-7,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-32,-24,15,-24,-20,19,-27,26,16,-23,-26,-22,-21,-22,-10,11,-15,3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-33,-26,12,-32,-24,27,-27,28,15,-26,-28,-24,-22,-22,-8,23,-18,3,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-14,-12,-21,-29,58,-21,-38,-21,-28,-20,-2,-22,-21,-21,-1,-18,-27,-23,-30,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-26,-9,0,-21,-16,-2,-27,24,-20,-10,-1,-17,7,46,-5,-8,-17,-21,-11,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-10,-11,-17,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-10,-10,21,47,-1,-30,-11,-10;
MA   /M: SY='S'; M=5,11,-17,14,6,-25,-2,-8,-23,-6,-25,-18,10,-10,-1,-10,20,6,-15,-35,-20,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-18,-10,-9,-14,-20,-19,-6,-12,-11,-8,-5,4,-11,-14,9,25,-2,-30,-13,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-11,-23,-13,-9,6,-23,-2,-3,-11,-4,-3,-8,-20,-8,-11,-6,-1,-5,-9,16,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,33,-28,48,26,-35,-12,-1,-34,1,-26,-25,13,-8,5,-7,3,-7,-26,-37,-19,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-19,-25,-16,4,-24,-15,8,-18,13,9,-17,-19,-13,-14,-12,-4,4,-19,-1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-6,-14,-8,-21,2,-17,-15,-11,-17,-14,-4,-12,-8,-17,17,4,-5,-27,-21,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26,4,-35,-26,36,-30,33,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=33,-13,-8,-20,-13,-13,-4,-20,-7,-14,-5,-7,-11,-14,-13,-19,6,1,1,-22,-17,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-20,-29,-24,-14,-3,-19,-12,-3,-13,-5,-2,-19,-21,-6,-14,-16,-13,-10,26,12,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-6,-11,-12,-7,-20,3,-16,-15,-10,-18,-14,-2,-10,-7,-16,20,6,-5,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-8,-32,-26,-3,-30,-27,26,-23,11,10,-21,-24,-22,-24,-11,-2,27,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-11,-27,-20,0,-26,-21,15,-23,20,11,-20,-23,-17,-20,-13,-1,12,-24,-6,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-28,13,36,-26,-20,1,-25,9,-17,-15,0,-7,12,5,-3,-8,-22,-29,-15,23;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-5,-28,-6,-7,2,-21,32,-16,-6,-13,-6,-2,-22,-2,-3,-10,-11,-18,-3,32,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-23,10,-30,-22,22,-27,33,16,-28,-28,-21,-21,-25,-10,14,-10,2,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-13,-20,-16,-11,-11,-19,10,-3,-12,0,4,-7,-19,-5,-8,-6,-6,-3,-25,-2,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-22,12,16,-25,-13,-3,-26,10,-23,-16,12,-11,7,8,2,-3,-22,-30,-16,11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-16,-9,-3,-16,-21,-6,-11,3,-10,-5,-2,-17,0,4,-4,0,-9,-25,-8,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00388;
//
ID   IMP_DH_GMP_RED_MP; MATRIX.
AC   MP00487;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   IMP dehydrogenase / GMP reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1436090; R2=0.0145928; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=763; N_SCORE=16.268; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-12,-3,-7,-13,-19,-18,-13,-9,-12,-12,2,-10,-9,-10,18,45,-3,-31,-11,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-29,-11,-6,-25,4,-12,-23,1,-21,-9,-8,8,-3,3,-5,-11,-20,-22,-20,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-26,14,40,-24,-17,-1,-25,4,-18,-18,-1,-5,12,-4,2,-7,-24,-25,-12,25;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-22,-13,-4,-25,4,-8,-14,-6,-13,2,-6,-13,11,-9,0,-8,-14,-20,-16,4;
MA   /M: SY='V'; M=16,-16,-11,-23,-18,-2,-17,-23,4,-15,-2,-2,-15,-18,-19,-18,3,10,17,-23,-10,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-25,-4,13,-23,-16,-7,-24,18,-18,-11,-3,-12,7,23,-3,-7,-17,-23,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-6,20,-24,21,20,-22,-11,2,-24,1,-22,-19,17,-11,4,-5,4,-5,-24,-29,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-27,-24,-7,-6,-31,-22,23,-18,7,7,-15,-15,-11,-21,-12,-9,13,-22,-6,-12;
MA   /M: SY='B'; M=-4,15,-22,15,9,-22,-11,-4,-19,-1,-15,-14,14,-14,-1,-6,3,-3,-18,-32,-16,4;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-10,-17,-9,-19,-1,-19,-10,-10,-12,-11,-8,-11,-9,-19,14,3,1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-5,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,7,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-16,-12,-23,-19,-9,5,-22,-7,-18,-8,-7,-12,-18,-18,-21,0,-7,0,-19,-15,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-18,-28,-22,1,-30,-25,23,-23,20,11,-20,-23,-20,-20,-12,6,21,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-22,-34,-27,0,-31,-21,35,-21,17,30,-23,-23,-16,-21,-17,-7,29,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-21,-8,-4,-26,-7,-18,-22,-12,-29,-20,-9,42,-9,-18,5,-1,-23,-33,-27,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-15,-1,1,-21,-5,-9,-22,2,-29,-18,8,-11,2,4,28,13,-12,-35,-18,1;
MA   /M: SY='I'; M=3,-25,-20,-32,-26,-4,-30,-28,31,-23,11,11,-20,-20,-20,-25,-10,-3,28,-23,-6,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-17,-21,-27,-21,-4,-31,-26,24,-21,7,7,-11,-16,-16,-21,-2,16,17,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,9,-29,-20,1,-27,28,-22,-7,0,-15,26,42,-7,-10,-23,-20,-10,15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-9,-25,-8,12,-15,-27,-15,2,-3,-3,-2,-11,-13,-2,-8,-8,-6,1,-26,-11,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-20,-16,-10,-15,-26,-19,3,9,-8,2,-16,-20,-6,1,-9,-5,15,-25,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-10,-4,-18,-12,-12,-16,-17,-6,-8,-2,1,-10,-16,-10,-12,1,11,0,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-24,-13,-17,-27,48,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,12,-33,-30,15,-31,-28,13,-25,5,2,-25,-31,-31,-23,-13,-5,24,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-21,-15,-10,-7,-22,-6,-11,5,-9,-3,-8,-20,-4,21,-4,6,-3,-16,3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-10,-8,-30,16,-20,-28,-14,-30,-20,-12,46,-14,-20,-6,-14,-30,-26,-30,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-30,-2,11,-38,1,3,-25,3,-22,-5,0,-12,41,3,0,-12,-30,-20,-15,26;
MA   /M: SY='W'; M=7,-24,-26,-29,-21,-5,-9,-24,0,-20,2,-3,-22,-22,-17,-21,-15,-12,-2,19,-3,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-15,-6,-1,-19,-16,-11,-14,-5,-16,-10,2,-10,8,-5,19,30,-9,-30,-12,4;
MA   /M: SY='A'; M=36,-15,-12,-22,-12,-13,-7,-20,-3,-15,4,-3,-15,-15,-12,-20,1,-2,2,-20,-15,-12;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-15,-29,-25,-5,-26,-27,25,-20,7,7,-22,-23,-22,-22,-6,-1,33,-26,-10,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00391;
//
ID   PAL_HISTIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00488;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phenylalanine and histidine ammonia-lyases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9689436; R2=0.0144962; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=541; N_SCORE=12.801; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-16,-20,-19,-11,-8,-25,-19,9,-12,7,4,-14,-18,-11,-11,-8,2,9,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='A'; M=8,4,-21,3,8,-24,-8,-10,-20,3,-16,-13,2,-11,0,-5,3,-2,-15,-26,-17,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-32,-22,19,-26,-15,16,-24,30,24,-24,-26,-18,-18,-23,-9,8,-14,5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-23,20,-31,-21,20,-29,39,16,-28,-29,-24,-21,-26,-9,13,-16,4,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,30,-20,14,1,-21,-3,6,-18,0,-26,-17,46,-18,3,0,8,-1,-25,-36,-19,2;
MA   /M: SY='A'; M=12,-1,-20,-6,0,-22,-10,8,-19,4,-17,-9,3,-13,1,0,2,-4,-14,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-7,11,-26,7,-2,-22,21,-6,-30,-6,-27,-18,18,-17,-6,-8,3,-10,-27,-27,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-5,-33,-29,-2,-33,-29,30,-24,12,11,-25,-27,-26,-24,-14,-5,35,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-13,-19,-18,-16,-1,-26,-2,5,-15,1,1,-10,-19,-12,-14,-2,14,5,-19,9,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,84,-9,-19,-7,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-25,13,-29,-26,-2,-30,-20,9,-21,1,2,-23,-30,-23,-20,-13,-6,18,-21,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-19,-39,-10,0,-29,-20,-14,-21,-9,-29,-19,-18,82,-8,-16,-10,-10,-30,-30,-27,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-8,-16,-6,11,-17,-20,-9,-9,-8,0,-4,-10,-15,7,-8,-3,-5,-9,-27,-13,9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-5,7,-24,-21,-1,-26,30,-22,-7,-1,-15,19,36,-8,-10,-21,-17,-5,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,20,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-24,-9,-15,-25,44,-19,-32,-17,-27,-18,1,-17,-15,-17,9,-2,-22,-25,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,3,-19,-11,-20,-3,-20,-13,-12,-13,-12,-9,-13,-11,-20,11,1,-2,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,0,-20,-14,-16,-9,-21,-5,-14,-10,-8,-11,-16,-14,-20,9,2,6,-28,-19,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,0,-30,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,87,-10,-19,-9,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-30,-6,-6,-4,-23,75,-20,-10,-14,0,0,-23,4,-3,-13,-17,-24,-11,39,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-15,-32,-24,2,-29,-17,26,-22,26,31,-24,-25,-14,-20,-21,-9,18,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-8,-16,-10,-18,-3,-19,-10,-11,-13,-11,-7,-12,-10,-18,14,6,2,-26,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=7,-19,-20,-22,-17,-8,2,-20,-3,-21,13,2,-17,-22,-17,-18,-12,-9,-3,-20,-12,-17;
MA   /M: SY='A'; M=7,-19,-18,-21,-17,-11,-10,-23,1,-17,0,-2,-17,-7,-18,-19,-5,1,7,-25,-15,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,8,-29,-17,23,-25,39,28,-26,-27,-16,-19,-26,-10,12,-19,1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-23,-21,-29,-22,-1,-28,-22,24,-23,18,15,-19,-21,-16,-21,-12,0,17,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-27,4,28,-22,-21,1,-19,6,-12,-10,-2,-11,12,9,-5,-9,-18,-27,-13,19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-32,-10,-14,-29,41,-15,-35,-13,-29,-18,-4,1,-14,-11,-3,-17,-29,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-27,18,23,-29,-9,-2,-29,11,-26,-18,13,-9,10,3,2,-6,-27,-30,-18,17;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-11,-21,-14,-13,-11,-18,2,-14,-5,1,-10,-15,-10,-19,7,1,7,-26,-14,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-29,-13,-4,7,-23,-7,-16,7,-13,-7,-11,-19,-6,7,-14,-11,-14,7,14,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-17,-10,-20,-18,0,-17,-4,-3,-15,-6,-4,-15,-24,-15,-15,-4,-3,4,-11,12,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-5,-1,-16,-16,-4,-15,1,-17,-9,-2,0,1,-1,-6,-8,-14,-23,-8,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-26,-8,-16,-25,40,-16,-29,-15,-23,-15,-1,-19,-17,-16,0,-10,-18,-23,-23,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-27,-4,8,-25,-14,-12,-18,2,-20,-12,-7,10,4,-2,-1,-2,-16,-27,-18,5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-25,-6,-8,-15,-10,-3,-14,-4,-10,-7,1,-19,-6,6,-5,-6,-12,-21,-10,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00424;
//
ID   RNA_POL_PHAGE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00489;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacteriophage-type RNA polymerase family active site signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.9955330; R2=0.0211251; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=208; N_SCORE=11.380; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-23; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-6,22,-23,26,9,-28,-4,-6,-28,-1,-25,-21,14,-11,-1,-7,8,3,-21,-34,-19,4;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-21,-10,4,-18,-15,-15,-12,0,-6,-7,-10,-4,-3,-8,-3,-2,-9,-23,-15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-26,-2,14,-19,-7,-10,-23,7,-16,-12,-3,-11,3,0,-2,-8,-19,-23,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-28,8,13,-24,-20,-10,-18,8,-15,-11,-2,-5,2,1,-6,-6,-16,-27,-14,6;
MA   /M: SY='S'; M=-5,5,-23,5,0,-25,0,-7,-22,0,-24,-14,9,-14,4,0,10,-2,-18,-30,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-21,-3,7,-7,-17,-7,-11,-7,-9,-8,-4,-14,-4,-10,0,-1,-9,-21,-4,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-21,1,8,-18,-16,-8,-14,0,-10,-6,-3,-14,1,1,3,-1,-9,-30,-13,4;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-14,-20,-20,-17,0,-20,-1,3,-11,-2,3,-9,-22,-12,-9,-8,-6,5,-15,8,-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-2,-16,-7,-6,-15,-11,-13,-9,-11,-4,-7,-2,-15,-5,-13,5,7,-5,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,2,-25,-1,9,-27,-13,-2,-23,15,-21,-10,7,-13,17,18,0,-7,-21,-24,-14,12;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-26,-25,-29,-20,11,-23,-22,1,-16,10,1,-25,-25,-19,-15,-22,-12,-1,19,6,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-16,-9,-6,-26,-16,11,-16,15,9,-14,-20,-10,-11,-14,-7,4,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-22,10,5,-23,-14,0,-17,2,-19,-12,9,-16,2,1,2,-4,-11,-31,-14,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-13,-26,-17,-18,-5,-12,-12,9,-19,1,5,-7,-20,-12,-18,-8,-8,1,-18,1,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-27,-9,-8,-16,6,-13,-19,2,-20,-10,2,-17,-5,-3,-2,-9,-16,-21,-13,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-28,11,-33,-26,30,-27,23,14,-26,-27,-26,-23,-19,-7,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-6,14,-19,10,3,-19,-14,-9,-15,-6,-18,-15,13,-12,-4,-9,12,17,-12,-34,-15,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=0,3,-9,0,5,-24,-12,-10,-25,13,-27,-16,7,-13,2,4,9,0,-17,-31,-17,4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-25,-17,-28,-25,2,-29,-24,26,-23,21,13,-21,-28,-23,-20,-16,-5,28,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-16,-28,-25,-1,-30,-27,26,-21,12,9,-21,-23,-23,-20,-8,7,31,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-31,-4,9,-30,-20,-2,-27,29,-24,-8,-1,-8,23,34,-7,-10,-23,-21,-11,14;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-17,-13,-12,-16,0,-17,-11,-13,-14,-5,-5,-6,-10,-14,11,12,-4,-29,-17,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-34,-29,10,-32,-28,31,-24,16,12,-26,-28,-28,-22,-15,-4,36,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-13,-10,-9,-12,-20,-20,-11,-10,-12,-11,-2,1,-10,-11,17,43,-3,-30,-12,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-14,-23,-20,-15,-6,-25,-16,13,-9,9,12,-9,-21,-10,-10,-12,-6,8,-24,-6,-14;
MA   /M: SY='P'; M=3,-18,-21,-18,-12,-15,-18,-20,0,-13,-10,-1,-17,16,-13,-17,-2,2,4,-28,-18,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-27,0,-13,-27,47,-10,-33,-13,-30,-20,20,-20,-13,-13,3,-13,-30,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-14,-20,-16,-11,-19,-22,8,-9,-5,-1,-14,-19,-15,-13,3,2,20,-28,-13,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-14,-6,-4,-16,-17,-16,-16,2,-17,-12,2,-10,-4,-2,17,33,-6,-30,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-14,8,-27,10,11,-15,-18,3,-20,4,-15,-9,4,-15,3,7,-4,-4,-19,-20,2,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-22,-25,-20,22,-25,-8,3,-15,4,1,-17,-25,-18,-9,-12,-6,3,-2,24,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-22,-11,-16,-21,33,-19,-26,-17,-19,-15,-1,-17,-16,-17,7,3,-18,-24,-22,-16;
MA   /M: SY='I'; M=2,-24,-9,-30,-24,-1,-18,-25,13,-24,11,5,-20,-24,-22,-23,-13,-8,13,-22,-8,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-27,-13,-6,-15,-13,-7,-18,13,-15,-7,-4,-18,0,29,-7,-5,-13,-16,-4,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-28,15,22,-28,-18,-3,-25,16,-19,-12,5,-10,14,7,-5,-9,-23,-27,-14,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,2,-28,4,10,-25,-19,17,-20,2,-19,-5,1,-14,33,2,-1,-8,-25,-17,5,21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-13,-24,-14,1,-11,-25,-13,2,-2,3,5,-12,-17,-3,-1,-11,-7,1,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-27,24,29,-30,-14,-3,-31,11,-26,-20,7,-7,9,5,5,-5,-24,-32,-18,19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-27,1,0,-19,-13,3,-22,9,-14,-8,-1,-17,3,11,-8,-7,-18,-20,-2,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00410;
//
ID   MOLYBDOPTERIN_PROK_2_MP; MATRIX.
AC   MP00490;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic molybdopterin oxidoreductases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2456479; R2=0.0183459; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=418; N_SCORE=13.904; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=14; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-15,-11,-9,-19,-5,-19,-9,-11,-9,-10,-9,-8,-11,-19,5,0,-2,-24,-18,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-19,-28,-18,-11,14,-25,-18,-4,-19,7,-3,-21,-24,-18,-16,-22,-13,-7,18,7,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-27,0,12,-28,-7,-2,-26,11,-22,-11,2,-11,14,10,0,-5,-22,-24,-14,12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,4,-27,4,8,-28,-16,-3,-28,28,-27,-12,7,-13,14,28,-2,-7,-22,-25,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-9,-27,-18,0,-28,-20,9,-25,27,12,-27,-12,-19,-20,-23,-10,4,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-29,34,38,-33,-16,0,-31,5,-23,-21,7,-5,15,-3,1,-6,-28,-33,-18,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-14,-26,-19,14,-26,-12,6,-22,20,11,-18,-25,-18,-16,-14,3,5,-19,3,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-18,-34,-28,14,-32,-26,28,-26,21,13,-26,-28,-27,-22,-18,-6,29,-20,0,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='V'; M=5,-15,-4,-20,-19,-8,-20,-23,7,-16,-4,-2,-12,-22,-19,-17,4,11,21,-31,-13,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-16,-15,-21,-12,-13,-27,-12,12,-16,4,7,-11,-20,1,-15,-9,-7,5,-25,-7,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-30,62,23,-38,-11,0,-38,1,-29,-28,20,-9,2,-8,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-7,-27,-23,12,-29,-14,9,-23,4,2,-13,-22,-22,-20,-14,-8,7,-19,3,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-10,-25,-15,-7,5,-21,8,-10,-5,-8,0,-3,-20,3,3,-8,-9,-13,-11,11,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-29,-29,-34,-24,7,-23,-18,8,-19,9,18,-28,-25,-14,-17,-25,-15,0,33,9,-18;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-10,-8,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-15,-13,2,-10,-7,-11,25,39,-3,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='E'; M=10,2,-20,4,12,-26,-4,-11,-23,-2,-23,-18,1,-2,1,-9,12,0,-16,-30,-21,6;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-10,-10,-9,-12,-16,-19,-11,-10,-12,-11,0,-10,-9,-11,22,43,-1,-30,-12,-9;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,19,-22,-14,-20,-7,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-17,-14,-22,6,-2,-2,-27,-22,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-27,-8,4,-19,-19,-9,-20,18,-14,-8,-6,-15,6,21,-8,-9,-16,-13,-9,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-25,-22,-17,25,-25,11,-5,-11,0,4,-14,-25,-13,-6,-16,-11,-8,3,34,-16;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-29,3,-36,-26,39,-26,17,16,-24,-24,-22,-25,-18,-7,32,-20,2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,32,-23,18,13,-28,-28,-27,-22,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=24,2,-15,-1,0,-22,-6,-15,-15,-8,-15,-14,-2,-10,-6,-16,11,4,-7,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='C'; M=11,-8,25,-17,-14,-16,-15,-22,-17,-15,-15,-14,-7,-18,-14,-18,12,18,-4,-34,-19,-14;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,5,-10,-10,-13,-17,-19,-14,-12,-15,-13,0,-13,-10,-12,20,38,-3,-34,-14,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-19,-29,-20,-14,3,-17,-11,-14,-13,-16,-12,-16,-17,-8,-13,-7,-5,-17,38,18,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-20,-22,-24,-19,15,-16,-10,-1,-19,5,-1,-17,-24,-17,-17,-10,-7,-3,1,18,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-29,-1,5,-25,-19,5,-28,25,-22,-9,2,-15,15,40,-6,-7,-21,-22,-9,7;
MA   /M: SY='B'; M=-14,31,-25,31,14,-26,-10,9,-25,0,-23,-15,26,-13,4,-4,1,-7,-26,-36,-16,9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-30,40,13,-36,12,-6,-39,-5,-29,-26,12,-12,-3,-12,0,-13,-30,-33,-23,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-20,-22,-11,4,-27,-18,10,-18,14,9,-16,-19,-14,-16,-10,5,7,-21,-2,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-3,-18,-6,-8,5,-17,-13,-8,-13,-5,-5,-3,-18,-14,-14,-2,1,-4,-21,-4,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-11,-15,-17,-13,-9,-15,-17,1,-14,-1,3,-9,-16,-9,-13,6,17,5,-28,-10,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-1,13,-19,7,-4,-12,-10,-4,-14,-7,-17,-14,15,-16,-7,-10,6,4,-13,-26,-6,-6;
MA   /M: SY='G'; M=4,-3,-23,-5,-12,-22,19,-15,-20,-10,-16,-7,-3,-16,-12,-14,0,-7,-12,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-23,16,11,-20,-8,-4,-22,-3,-19,-11,6,-12,1,-5,4,-4,-18,-30,-15,6;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-12,-21,-12,-13,-9,-1,13,-21,-6,-17,-8,-6,-23,-7,0,-8,-12,-17,-11,13,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-23,-4,-2,-22,-3,-11,-23,1,-22,-15,-1,-2,-2,7,7,-1,-17,-29,-18,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-19,-10,-14,8,-15,-1,-4,-13,-9,-4,13,-23,-14,-11,-3,-4,-6,-23,-2,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-12,-28,-15,-3,-20,-24,-7,-3,-1,-8,7,-9,-2,14,5,-7,-5,-9,-22,-9,3;
MA   /M: SY='H'; M=0,-10,-23,-11,-8,-17,-1,8,-19,-7,-10,-6,-3,-18,-5,-1,-2,-8,-14,-25,-9,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00392;
//
ID   PROLINE_PEPTIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00491;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminopeptidase P and proline dipeptidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2131600; R2=0.0145550; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=271; N_SCORE=9.148; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,54,-33,-23,17,-30,13,7,-20,-27,-33,-23,-20,-10,10,0,20,-30;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-3,-17,-10,-18,-2,-21,-10,-13,-11,-9,-12,-17,-14,-18,2,-2,2,-26,-20,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,3,-30,7,10,-23,-21,-4,-21,13,-17,-12,1,-15,6,29,-8,-10,-17,-26,-12,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-17,22,13,-21,-8,-1,-20,8,-17,-13,8,-6,6,1,1,-5,-16,-20,-10,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-21,-18,-10,-9,-21,-4,2,-7,-4,1,-9,-16,-8,-5,-7,-6,3,-21,-4,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-23,-32,-24,-1,-24,-22,27,-25,21,19,-22,-23,-18,-23,-18,-9,19,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-16,-23,-19,-10,-3,-21,-17,-3,-9,-5,-5,-14,-18,-11,-12,-6,1,-1,1,1,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-26,16,22,-30,-8,-5,-28,9,-24,-17,6,-8,9,0,2,-7,-23,-28,-18,15;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-21,-14,-7,-13,-14,-9,-11,-2,-9,-6,-7,-18,-1,3,-2,-4,-7,-11,-5,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-29,4,1,-29,29,-2,-34,-8,-27,-18,9,-16,-4,-7,0,-15,-29,-26,-22,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-21,-28,-21,16,-27,-11,12,-22,21,9,-23,-27,-18,-18,-19,-8,7,-5,19,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-20,4,-1,-28,12,-10,-32,2,-25,-18,4,-16,-5,4,-2,-12,-23,-26,-21,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,8,12,-23,-17,-8,-16,3,-15,-11,-3,1,3,1,-4,-8,-13,-25,-14,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-23,-22,-27,-22,41,-26,-5,2,-19,9,2,-20,-26,-22,-14,-20,-10,-3,18,39,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-22,-22,-29,-23,44,-28,-4,1,-19,6,6,-18,-27,-22,-14,-16,-4,-2,9,39,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-28,-21,-15,-13,-17,-19,6,-15,-2,6,-17,12,-14,-18,-13,-9,0,-25,-14,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-1,-29,-1,-1,-20,-19,93,-29,-10,-19,-1,9,-19,9,-1,-9,-19,-28,-29,18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-25,-8,-11,-22,29,-11,-30,-8,-26,-17,2,-18,-9,-1,8,-7,-22,-22,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-18,-24,-18,0,-28,-22,14,-22,20,8,-16,-20,-16,-18,-8,14,10,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-12,-29,-14,-13,-14,26,-15,-23,-15,-18,-6,-5,-14,-14,-16,-8,-16,-22,-6,-15,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,30,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-30,-20,6,-29,-18,20,-24,40,24,-27,-27,-16,-17,-27,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-16,38,25,-33,-14,-1,-33,1,-26,-23,15,-11,6,-6,0,-9,-28,-37,-20,16;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-15,-29,-25,-2,-31,-28,30,-20,10,10,-26,-26,-25,-21,-11,-3,41,-28,-9,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-22,3,-24,-20,-5,-18,-19,-3,-17,-6,-1,-20,-27,-16,-17,-11,-8,6,-8,-5,-17;
MA   /M: SY='P'; M=4,-14,-29,-11,-6,-26,3,-19,-22,-12,-26,-18,-11,38,-11,-19,1,-5,-22,-27,-26,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-16,-11,-12,-14,3,-10,-17,-5,-17,-9,-1,-20,-9,-2,1,-2,-10,-22,-8,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-22,-21,-20,2,-12,-13,7,-18,2,1,-9,-24,-18,-17,-10,-7,5,-15,4,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-20,-10,-9,-13,-6,-12,-10,-8,-17,-8,1,-6,-8,-5,6,0,-7,-29,-16,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-24,-4,5,-26,-7,-5,-18,-1,-19,-8,1,-8,15,0,3,-2,-17,-26,-16,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-3,-27,0,-3,-5,-3,0,-20,-7,-16,-13,-4,-19,-7,-8,-4,-9,-18,-8,14,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-25,13,8,-21,-11,0,-22,4,-22,-15,11,-15,5,4,1,-5,-19,-26,-9,5;
MA   /M: SY='D'; M=-9,9,-27,13,10,-22,-14,-3,-23,0,-24,-18,7,5,2,-6,4,-2,-23,-27,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-23,-19,-13,-8,-13,-13,-5,-7,1,0,-13,-16,-12,-1,-11,-6,-1,-22,-8,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-12,-22,-12,-9,-11,-25,-18,6,-10,1,0,-12,-14,-11,-9,-8,0,8,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-25,-11,-11,-10,-14,-9,-3,-14,9,5,-15,-11,-12,-13,-17,-11,-5,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-8,-5,7,-17,-16,-12,-12,-5,-9,-6,-5,-17,-4,-7,-5,-5,-7,-30,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-29,-6,14,-19,-21,-8,-13,-5,-10,-8,-11,13,10,-8,-7,-9,-19,-23,-14,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00417;
//
ID   CLUSTERIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00492;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clusterin signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0827899; R2=0.0105629; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1812; N_SCORE=23.213; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=229; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-10,-19,-12,-6,4,-16,-13,-14,1,-13,-8,-4,-17,-9,-2,4,1,-9,-20,-3,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-33,-3,13,-37,-20,0,-20,3,-23,-7,-7,23,37,0,-3,-10,-30,-23,-17,23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-30,6,23,-30,22,-9,-35,-4,-25,-20,0,-9,1,-9,0,-15,-30,-25,-25,12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,15,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,27,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-19,-28,-19,2,-23,-8,16,-16,25,40,-21,-22,-7,-13,-18,-3,9,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,11,-31,-20,50,-24,1,-20,0,4,-14,38,6,-4,-14,-30,-24,3,22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-17,-37,-30,56,-30,-23,9,-27,10,3,-23,-30,-37,-20,-17,-7,15,-2,18,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-13,-30,-27,0,-27,-21,27,-17,13,25,-27,-27,-21,-17,-13,-3,38,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,30,-30,18,-20,-7,3,-20,10,49,-10,-13,-23,-23,-1,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00431;
//
ID   CLUSTERIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00493;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clusterin signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1112270; R2=0.0105747; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1752; N_SCORE=22.628; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=226; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-22,27,4,-24,-13,7,-26,-4,-22,-18,19,-13,-2,-7,7,10,-20,-36,-12,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,0,-22,-20,-4,-28,22,-22,-12,-4,2,6,52,-10,-10,-22,-22,-14,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-13,-17,-13,-7,-20,-13,0,-10,0,13,-7,-13,-7,-10,7,30,3,-27,-7,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,0,-20,-20,67,-30,3,-20,-3,7,-20,10,23,-10,-17,-27,-27,10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=16,-3,-10,-13,-10,-13,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,34,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-30,54,12,-38,6,-4,-40,-4,-30,-28,16,-12,-4,-12,0,-12,-30,-36,-22,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,7,33,-37,-20,7,-23,10,-20,-7,0,-7,47,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,10,-30,-20,5,-25,20,-20,-5,0,-15,35,40,-5,-10,-25,-20,-10,20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=20,-1,-14,-3,7,-22,-4,-11,-19,-6,-22,-17,2,-8,0,-11,23,8,-10,-32,-20,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=6,-2,-17,-9,0,-22,-16,-10,-13,-3,-13,-7,-2,-10,13,-5,12,22,-10,-25,-12,6;
MA   /M: SY='N'; M=-3,20,-15,7,-3,-17,-7,-3,-17,-5,-23,-17,32,-15,-3,-5,19,20,-17,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,36,7,-27,-3,7,-27,0,-30,-23,47,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=13,-12,-10,-16,-14,-12,-13,-20,0,-13,-9,-6,-9,-17,-14,-15,14,15,13,-31,-15,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00431;
//
ID   BACTERIAL_LUCIFERASE_MP; MATRIX.
AC   MP00494;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial luciferase subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5857983; R2=0.0126314; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=998; N_SCORE=17.182; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-18,-31,-27,3,-30,-19,29,-19,13,22,-25,-26,-20,-19,-15,-5,32,-21,2,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-14,-18,-15,-3,-22,-19,6,-18,12,3,-11,-21,-15,-15,-2,15,9,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-18,3,18,-19,-17,-11,-19,-2,-17,-15,1,-6,3,-6,15,23,-13,-31,-15,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-13,-13,-3,-19,-14,-8,-12,-2,-13,-3,-9,-6,-4,-9,-1,-5,-6,-26,-14,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-20,6,15,-21,0,8,-23,-3,-20,-14,8,-9,4,-5,8,-3,-20,-27,-13,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-11,-17,-17,-7,-23,-23,5,-14,-4,-3,-10,-17,-16,-14,10,28,16,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-11,-24,-24,-3,-28,-27,19,-18,4,4,-20,-23,-23,-18,-1,15,33,-29,-9,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-24,11,31,-22,-20,-6,-18,2,-13,-10,-2,-7,7,-5,1,1,-15,-30,-16,19;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-35,-45,-35,-26,7,-22,-25,-14,-14,-16,-15,-34,-28,-17,-16,-35,-25,-23,114,27,-18;
MA   /M: SY='A'; M=37,-14,-12,-22,-12,-13,-7,-20,-3,-14,3,-3,-14,-14,-12,-20,1,-2,2,-20,-16,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,3,21,-29,-21,-6,-25,32,-24,-10,-1,-8,14,20,-7,-10,-21,-23,-12,17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-29,-9,-1,-12,-23,2,-20,23,-15,-5,-5,-18,6,27,-13,-10,-17,-11,8,0;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,52,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-20,24,-28,44,23,-28,-28,-18,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21,6,-27,-14,22,-23,39,33,-26,-26,-13,-17,-26,-10,11,-20,0,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-16,-27,-24,-2,-30,-26,24,-21,11,8,-19,-22,-21,-20,-6,10,27,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-32,-24,44,-30,-12,8,-26,23,8,-24,-30,-27,-18,-24,-10,2,3,28,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-22,-3,4,-24,-12,-7,-26,22,-27,-14,4,-13,6,25,9,1,-16,-28,-14,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-26,11,0,-20,-20,-13,-1,-13,-10,-8,1,-13,-6,-17,0,-4,-3,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-16,20,-30,28,1,-25,-21,-11,-6,-11,-11,-11,5,-14,-8,-18,-8,-10,-7,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='S'; M=-1,5,-17,-2,-6,-17,-6,-11,-13,-10,-21,-14,14,-7,-6,-10,18,16,-11,-34,-17,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-7,2,-18,-7,-8,-9,-17,-9,-3,-11,1,-3,8,-20,-5,-9,-1,10,-6,-30,-10,-7;
MA   /M: SY='E'; M=3,11,-21,11,19,-26,-9,1,-23,0,-22,-17,12,-9,10,-5,10,-2,-21,-32,-18,14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-26,15,32,-27,-20,-5,-22,7,-18,-15,-1,-7,11,-1,0,-4,-17,-30,-17,22;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-28,-4,13,-18,-24,-3,-13,14,-11,-5,-7,-13,4,5,-10,-10,-11,-21,-4,7;
MA   /M: SY='E'; M=7,-1,-22,-3,12,-22,-13,-10,-16,6,-17,-12,0,-10,3,1,4,-3,-12,-26,-16,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-27,-15,-5,-2,-26,6,-3,-7,5,5,-15,-22,14,-5,-15,-10,-13,-2,26,3;
MA   /M: SY='L'; M=4,-21,-20,-26,-18,4,-20,-8,9,-16,17,17,-20,-22,-11,-16,-15,-7,4,-10,11,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,11,23,-28,-12,-4,-22,7,-21,-14,6,-9,12,0,1,-7,-22,-29,-17,17;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-21,-24,-22,-13,4,-26,-4,-1,-10,19,7,-16,-26,-10,10,-21,-11,-4,-18,1,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-23,5,-1,-17,-11,8,-13,-2,-12,-8,27,-20,5,-1,-2,-5,-21,-31,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=15,0,-21,0,23,-25,-12,-10,-21,4,-16,-15,-4,-5,5,-6,4,-3,-15,-25,-19,14;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-14,-27,-24,-4,-26,-27,23,-19,5,6,-21,-23,-22,-20,-4,4,33,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-12,-19,-9,-20,-2,-18,-12,-7,-11,-10,-9,-11,-8,-13,8,-1,-2,-20,-19,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=6,3,-19,2,2,-24,-6,-8,-17,-2,-15,-10,0,-11,8,-6,5,0,-14,-24,-14,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,8,32,-29,-17,-4,-27,20,-23,-15,0,-5,17,8,0,-7,-23,-26,-16,24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-7,-28,-10,-12,7,-16,39,-15,-11,-11,-4,0,-25,-5,-7,-12,-13,-20,-3,36,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,11,-26,5,-10,-22,32,-5,-30,-11,-28,-19,22,-20,-11,-11,2,-11,-28,-25,-17,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-17,-22,-19,-16,-8,-26,9,9,-13,-2,5,-11,-22,-11,-12,-9,-7,12,-25,3,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,62,21,-38,-10,1,-38,1,-29,-28,22,-10,2,-8,1,-9,-30,-39,-20,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,21,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='S'; M=6,5,-16,4,0,-22,-6,1,-21,-4,-24,-16,10,-12,-1,-7,20,10,-13,-34,-14,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-11,19,-25,13,7,-23,-4,6,-23,2,-21,-14,26,-16,4,-1,0,-7,-26,-32,-16,5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,30,-30,44,22,-34,-14,0,-36,8,-26,-24,12,-11,5,10,-2,-10,-28,-34,-18,12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,4,-10,2,-30,-23,-5,-19,2,-18,-5,-5,-18,24,4,-4,-9,-19,-27,-14,13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22,23,-29,-17,16,-27,37,21,-26,-29,-21,-19,-26,-10,8,-14,6,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00397;
//
ID   APPLE_MP; MATRIX.
AC   MP00495;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Apple domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=116;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=111;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8298259; R2=0.0143489; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3164; N_SCORE=50.220; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-12,-26,-13,0,-8,-24,-8,-10,7,-1,2,-10,-18,11,5,-13,-10,-13,-16,-2,6;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-13,-4,-4,-16,-11,3,-18,-10,-21,-13,6,-12,-2,-8,25,26,-9,-35,-10,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-30,-7,-2,-28,8,-6,-32,14,-25,-12,0,-17,8,27,-5,-13,-25,-20,-16,1;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-11,-27,-11,-4,-13,-23,22,-14,4,-1,2,-6,-21,1,11,-16,-13,-14,-23,2,-4;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-10,-5,-4,-17,-5,-14,-16,-10,-22,-16,5,-10,-4,-11,31,25,-6,-35,-17,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-16,-16,-17,-12,-3,-20,-12,8,-5,7,5,-12,-17,-8,7,-11,-5,9,-15,-4,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-1,-34,-1,0,-27,-14,-11,-20,-7,-30,-20,5,56,-7,-14,-4,-7,-30,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-21,-11,8,-8,-26,-15,4,-12,11,2,-18,-18,-8,-12,-12,-7,7,-27,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=6,-20,-25,-22,-12,6,-17,-20,-11,-16,-12,-11,-17,23,-19,-20,-7,-7,-12,-15,-9,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-9,-30,-12,-9,-14,-26,60,-5,-16,-8,6,1,-20,1,-9,-13,-17,-11,-27,14,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-7,-18,-9,-4,-6,-10,-8,-20,0,-21,-14,3,-16,-2,13,16,7,-12,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-24,22,10,-30,-11,-7,-30,16,-30,-19,9,-10,4,5,8,-1,-20,-32,-16,7;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-30,-27,-40,-30,24,-37,-27,35,-30,17,14,-20,-23,-26,-27,-20,-10,21,-11,9,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-30,-6,0,-25,-15,4,-23,-4,-27,-15,-5,32,-2,-1,2,-4,-24,-31,-17,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-25,16,-5,-27,26,-3,-31,-8,-30,-22,31,-18,-8,-9,5,-9,-30,-32,-24,-6;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-10,-18,-18,-6,-24,-24,5,-14,-2,-2,-12,-18,-18,-14,8,31,19,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-4,17,-21,27,0,-25,-15,-12,-14,-8,-15,-15,0,-16,-11,-14,-2,-6,-1,-34,-17,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,58,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='A'; M=10,-11,-21,-12,3,-15,-4,-15,-10,-13,3,-5,-12,-15,-7,-15,-6,-8,-9,-22,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-30,15,-8,-33,45,-14,-40,-14,-30,-23,6,-17,-14,-17,0,-17,-30,-26,-27,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-27,4,35,-18,-23,-6,-14,-2,2,-8,-9,-9,8,-6,-9,-10,-18,-27,-14,21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-27,20,41,-27,-14,3,-27,7,-23,-20,19,-6,14,0,3,-7,-30,-33,-20,28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=7,-18,-16,-22,-18,-9,-20,-22,15,-19,-2,1,-12,-18,-15,-20,5,3,19,-29,-11,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,15,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,19,31,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-15,-17,-17,-19,22,-22,-20,2,-19,1,-3,-16,-24,-26,-18,-9,-5,11,-15,2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=31,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,5,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,19,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-12,1,-33,7,11,-34,-18,-7,-26,14,-28,-14,-3,21,14,4,-6,-10,-27,-26,-18,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,12,-24,18,-2,-30,24,-11,-34,-11,-30,-23,9,-14,-8,-14,12,-5,-24,-32,-24,-5;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-16,-15,-10,-17,-10,15,-10,-11,-10,-4,-7,-16,-7,-14,1,-6,-2,-24,-6,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,12,-25,14,14,3,-18,-5,-22,-6,-15,-16,7,-15,-6,-9,-5,-9,-21,-21,-4,5;
MA   /M: SY='V'; M=22,-21,-10,-26,-21,-9,-17,-26,12,-16,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,14,-34,-20,7,-23,16,-20,-3,0,-13,44,29,-3,-10,-27,-20,-10,28;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-30,5,26,-27,-20,-3,-30,28,-23,-14,0,-9,14,31,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-18,-22,-18,-4,-28,-23,13,-19,8,4,-11,-16,-15,-18,0,22,11,-25,-5,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,12,-27,6,4,-24,-14,30,-27,16,-27,-10,21,-16,7,12,-4,-10,-26,-29,-4,4;
MA   /M: SY='H'; M=1,-4,-18,-10,-7,-15,-14,22,-13,-10,-12,2,0,-15,-1,-8,6,8,-9,-29,-2,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-30,-29,-21,-9,-32,-27,25,-22,3,6,-22,13,-18,-25,-15,-8,14,-25,-11,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-24,-10,-3,-17,-20,-6,-24,18,-17,-10,0,-17,4,45,-1,9,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-27,-9,8,-24,-23,1,-8,-2,2,6,-9,-16,35,1,-9,-10,-18,-20,-7,21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-12,-13,-12,-9,-22,-21,-4,-12,-7,-7,-2,-11,-11,-12,16,44,3,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-9,-13,-14,-11,13,-12,-15,-12,-16,-15,-12,-1,-16,-14,-13,18,15,-5,-23,-3,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-23,-15,-8,-11,-18,-17,-5,-18,1,-5,-15,13,-11,-17,-2,-1,-8,-29,-15,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-13,-20,-15,-3,-15,-18,-9,-3,-12,7,3,-12,-18,9,-9,-4,-4,-7,-23,-9,3;
MA   /M: SY='P'; M=9,-11,-28,-10,3,-30,-14,-11,-17,-4,-21,-11,-11,29,11,-11,-1,-7,-21,-24,-21,5;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-11,-33,-10,12,-18,-17,-10,-21,-2,-18,-14,-14,-13,13,-7,-11,-15,-25,30,-2,14;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-27,24,8,-31,-10,-9,-28,-6,-30,-24,5,21,-3,-13,9,-1,-24,-37,-23,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-14,73,-21,-18,-23,-27,-24,-30,-5,-23,-17,-14,-31,-18,-11,-10,-10,-13,-41,-24,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-27,12,22,-27,-14,-1,-27,22,-27,-16,18,-10,10,12,-1,-7,-26,-29,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-21,4,20,-26,2,-9,-26,-3,-23,-19,2,-7,4,-9,14,-1,-20,-30,-22,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-30,5,23,-33,7,-3,-30,1,-23,-14,0,-9,20,-3,0,-13,-30,-24,-20,22;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-30,-6,0,-27,2,-9,-32,27,-27,-12,0,-16,3,30,-8,-12,-22,-20,-15,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-11,28,-15,-18,-23,3,13,-33,-21,-23,-14,-5,-28,-15,-18,-7,-16,-22,-35,-14,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-27,-9,1,-18,-23,-13,-14,25,-5,-1,-9,-16,1,14,-16,-10,-11,-20,-7,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-21,-21,-17,19,-23,-5,1,-19,10,1,-16,-25,-15,-15,-9,-3,-2,-5,24,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-24,-17,4,-27,-20,11,-24,31,11,-21,-24,-17,-17,-14,9,7,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-18,-4,12,-18,-14,-9,-13,-4,-12,-5,-3,-8,2,-8,10,11,-9,-29,-15,7;
MA   /M: SY='D'; M=-8,31,-21,33,8,-28,-4,0,-28,-3,-30,-24,29,-13,0,-7,15,2,-24,-40,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-9,-13,-9,-6,-11,-9,-13,-8,-16,-5,-8,-2,-16,-6,-13,18,11,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-24,-7,0,-20,-20,-9,-24,24,-20,-10,0,-14,4,33,-1,9,-14,-23,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-24,-30,-31,-21,-6,-34,-21,25,-11,8,11,-14,-20,-11,1,-17,-10,14,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-19,-27,-19,-2,-26,-23,18,-22,17,8,-17,-19,-16,-21,-9,6,12,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-8,-24,-11,-11,2,-24,32,-12,-10,-9,-3,-5,-21,-4,-7,-5,6,-13,-7,34,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-30,-3,0,-30,30,-14,-36,6,-29,-17,0,-14,-5,-2,-3,-16,-27,-21,-22,-3;
MA   /M: SY='I'; M=0,-14,-20,-23,-16,-9,-23,-18,9,-10,1,7,-10,-16,-9,-5,-3,9,7,-23,-7,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-3,-30,-3,2,-31,7,29,-29,-5,-23,-6,3,-16,20,-2,-3,-16,-30,-23,-7,9;
MA   /M: SY='G'; M=17,-8,-21,-12,-14,-25,38,-18,-28,-15,-24,-17,-2,-15,-14,-18,9,-8,-18,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-18,-19,-21,-15,-5,-21,-19,14,-22,10,5,-12,-19,-12,-19,0,2,8,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,6,-26,-20,3,-27,24,-20,-7,0,-17,26,51,-7,-10,-23,-20,-10,12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-23,-21,-14,1,-27,17,4,-24,28,14,-18,-27,-11,-14,-24,-13,-2,-23,6,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-29,0,5,-25,-17,-4,-29,37,-27,-11,9,-15,9,38,-7,-9,-21,-23,-11,5;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-13,-20,-18,-14,-7,-22,22,2,-14,5,20,-10,-21,-5,-9,-11,-3,2,-26,3,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-9,-10,-9,-10,-11,3,-13,-5,-11,-11,-7,-4,-13,-10,-11,10,3,5,-23,-13,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-15,11,4,-14,-15,-9,-5,-5,-7,-7,-4,-12,-7,-9,-3,-4,4,-23,-11,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-27,21,6,-29,-9,-7,-26,-6,-30,-23,11,20,-3,-12,8,-1,-25,-37,-23,0;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-16,-4,-9,-15,-11,-11,-4,-10,-18,-11,9,-8,-10,-11,10,5,0,-36,-18,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-4,-21,-1,-4,11,-24,-15,-6,-14,-4,-7,-10,-21,-18,-15,-9,-7,3,-20,-2,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-16,-7,-7,-13,-20,17,-16,-10,-13,-7,3,-13,-4,-7,11,28,-9,-30,-1,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-19,-10,-7,-16,-20,-20,-13,-10,-16,-13,-6,21,-10,-13,11,31,-9,-30,-16,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,7,-27,-14,-10,-27,31,-30,-13,3,-10,7,18,6,-1,-17,-26,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-24,-36,-27,23,-34,-25,26,-27,13,9,-17,-22,-25,-24,-14,-1,16,-12,8,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,4,-25,-1,-3,-8,-15,4,-17,11,-21,-11,10,-19,0,5,-1,-3,-18,-12,14,-3;
MA   /M: SY='N'; M=8,7,-18,-3,-5,-19,-9,-11,-15,-7,-19,-15,13,2,-7,-11,10,13,-14,-31,-19,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00376;
//
ID   PII_GLNB_UMP_MP; MATRIX.
AC   MP00496;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   P-II protein uridylation site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5027599; R2=0.0134664; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1142; N_SCORE=19.871; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=149; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-16,-17,-14,-9,-21,-21,7,-16,-6,-3,-4,-13,-11,-16,12,23,7,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,44,-30,-20,-3,-30,23,-23,-17,0,-3,17,10,-3,-10,-27,-27,-17,30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-24,-3,4,-24,-14,-7,-27,25,-27,-13,3,-13,7,28,6,0,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,12,-32,-20,47,-24,2,-20,0,4,-14,39,6,-4,-14,-30,-24,2,24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-18,-26,-18,-8,-8,-24,-8,-9,5,9,2,-12,-24,-2,33,-18,-10,-8,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-25,11,44,-28,-15,-5,-25,5,-18,-18,-2,-2,13,-5,2,-8,-23,-28,-20,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-11,-12,-15,-13,-9,-16,-15,1,-12,-6,4,-7,-16,-10,-12,12,18,10,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,57,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,15,-7,5,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,54,-33,-23,16,-30,13,6,-20,-27,-34,-23,-20,-10,10,0,20,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-13,8,-34,18,12,-36,-17,-6,-26,-1,-27,-18,-2,31,12,-9,-4,-10,-30,-31,-21,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,3,-33,-27,34,-26,24,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,34,-26,22,16,-27,-27,-24,-23,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00439;
//
ID   TYROSINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00497;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tyrosinase CuA-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5189352; R2=0.0154360; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=361; N_SCORE=11.081; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-23,-4,-6,-5,-18,-6,-15,-2,-14,-11,-1,-8,-7,-4,-1,7,-12,-15,5,-8;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-17,3,-20,-9,11,-25,-17,-5,-20,8,-2,-16,-23,-17,-16,-11,-3,-4,-21,-3,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-8,-14,-11,-10,0,-10,-9,4,-15,17,5,-4,-18,-10,-10,-12,-6,-2,-17,-5,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-23,-9,-12,-17,28,-13,-23,-11,-14,-11,-2,-17,-11,-6,-5,-13,-19,-10,-16,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=9,-2,-13,-3,-4,-15,5,-10,-13,-6,-13,-10,-1,2,-6,-10,3,-3,-9,-16,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-23,-7,-26,-22,16,-22,-10,-7,-16,-5,-5,-21,-25,-17,-15,-19,-13,-9,34,26,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-5,-23,-3,-1,-20,-2,-5,-21,1,-20,-12,-2,0,-1,2,1,-5,-17,-21,-11,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,1,-25,4,2,-15,-16,-6,-13,-3,-13,-9,-4,-12,1,-2,-4,-7,-11,-21,-4,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-12,-22,-15,-14,-12,-16,-18,6,-15,-5,0,-8,1,-13,-17,-4,0,3,-26,-13,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-23,15,-3,-23,7,-9,-26,-7,-23,-19,10,-16,-9,-9,4,-4,-18,-29,-19,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-10,-22,-14,-11,19,-10,-4,-12,-16,-7,-7,-5,-15,-15,-12,-7,-8,-13,-10,6,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-17,-4,-1,-11,-7,-6,-9,1,-11,-6,-1,-4,-1,-1,-3,-3,-9,-9,-5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-19,0,-1,-8,-8,-2,-17,6,-13,-8,-2,-11,-2,7,-7,-8,-13,-2,-2,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: M=-2,-9,-15,-10,-8,-4,-4,-10,-8,-5,-5,-4,-7,-8,-8,-6,-3,-2,-6,-12,-4,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-15,-6,-1,-16,11,-9,-15,-5,-11,-7,-4,-9,-4,-7,0,-7,-10,-15,-14,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,4,-11,-12,3,-17,-5,-2,-13,4,-1,-11,-18,-10,-11,-10,-5,-3,-8,11,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-9,39,-12,-8,-18,-14,-12,-19,-11,-14,-10,-8,-17,-3,-12,-3,-5,-12,-27,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='V'; M=9,-14,-14,-17,-14,-13,-10,-17,-1,-14,-9,-5,-11,-13,-13,-16,7,7,10,-29,-15,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-25,2,7,-24,13,-6,-28,-3,-24,-17,10,-14,2,-3,5,-8,-25,-27,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-18,-4,-7,-20,10,-9,-18,-11,-19,-7,5,-15,-3,-12,13,1,-13,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-25,-33,-24,-15,-12,-20,-25,-6,-15,-15,-11,-24,19,-16,-21,-14,-10,-10,17,-8,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=6,-18,-19,-21,-16,-7,-6,-20,-3,-20,7,-1,-16,-18,-15,-18,-6,-1,-1,-16,-11,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-25,-25,-16,6,-27,-21,5,-22,11,2,-24,9,-20,-20,-17,-6,0,-20,-6,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-23,-8,-3,-20,-18,-12,-15,-9,-20,-13,-5,25,-6,-12,6,15,-14,-31,-18,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-44,-40,-30,24,-22,-28,-16,-22,-14,-16,-36,-30,-24,-20,-36,-26,-24,122,30,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-22,-31,-22,-14,1,-20,-12,-7,-13,-3,-5,-21,-8,-13,-11,-18,-11,-12,16,12,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-28,-21,-18,29,-28,24,-3,-15,2,1,-16,-28,-12,-11,-19,-12,-10,13,56,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-18,-27,-19,6,-28,-19,16,-25,38,19,-25,-26,-17,-18,-22,-1,10,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-22,-22,-16,4,-21,-11,5,-13,17,8,-20,-25,-13,-12,-18,-8,2,-11,11,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-16,-24,-18,-7,6,-25,-6,-4,-11,4,1,-14,-22,-1,-5,-15,-10,-8,-7,6,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-26,-30,-24,27,-23,-11,3,-21,13,8,-23,-28,-21,-17,-23,-12,-3,18,25,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-28,0,9,-27,-18,1,-23,16,-20,-8,3,-14,22,30,-4,-9,-21,-23,-12,13;
MA   /M: SY='A'; M=10,-3,-22,-5,-1,-19,-16,-15,-3,-9,-7,-7,-5,-12,-6,-13,-1,-3,-2,-25,-14,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-15,-31,-21,6,-30,-20,21,-28,39,21,-27,-28,-18,-21,-26,-10,11,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-27,-10,-1,-20,-4,-2,-21,3,-17,-5,-4,-17,16,13,-4,-10,-20,-17,-6,6;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-25,-1,9,-25,-5,-8,-25,15,-23,-11,3,-12,4,10,2,-5,-18,-26,-16,6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-21,-24,-17,-3,-25,-2,12,-19,18,15,-17,-23,-12,-15,-15,-8,8,-24,-1,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=0,-14,-10,-20,-15,-4,-19,-16,12,-15,7,7,-11,-14,-11,-15,-4,5,10,-19,-5,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-22,4,1,-23,13,-5,-20,-5,-18,-11,6,-8,5,-6,0,-9,-20,-19,-16,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-27,37,12,-33,0,-3,-33,1,-27,-23,17,-12,1,-7,2,-7,-27,-33,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-13,-26,-10,0,-15,-19,-17,-9,-11,-16,-12,-12,24,-9,-16,-1,-2,-10,-27,-17,-6;
MA   /M: SY='S'; M=5,5,-16,0,-5,-18,-6,-9,-15,-8,-19,-13,9,-13,-6,-10,15,13,-9,-32,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-20,-21,-26,-22,36,-24,-19,1,-18,3,0,-15,-26,-26,-14,-15,-8,4,-7,11,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-6,-18,-10,-5,-23,9,-17,-20,-7,-19,-13,-3,-9,-6,-12,9,4,-12,-24,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-31,-23,14,-30,-18,21,-26,31,18,-24,-27,-20,-20,-23,-7,12,-14,8,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00398;
//
ID   TYROSINASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00498;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tyrosinase and hemocyanins CuB-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2143269; R2=0.0180899; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; N_SCORE=12.445; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=16; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-13,-22,-15,-13,-14,-3,-14,-3,-16,1,0,-9,-20,-8,-14,-6,-6,-2,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-7,-26,-6,6,-7,-10,-6,-19,-5,-15,-11,-5,-13,-1,-7,-2,-5,-18,-9,-2,3;
MA   /M: M=-4,-4,-24,-5,-3,-18,-6,-6,-11,-7,-11,-3,-1,-9,-1,-9,-2,-6,-12,-25,-12,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-26,-4,-5,-10,1,-9,-20,-9,-22,-16,11,3,-10,-10,-1,-8,-23,-25,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-30,-8,-11,-22,46,-12,-33,-15,-25,-17,-3,-19,-14,-16,-3,-17,-27,-14,-14,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-1,-19,2,-7,-19,-9,-4,-10,-11,-13,-8,-4,-18,-9,-12,1,0,1,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-21,-29,-20,-1,-19,-4,18,-12,18,47,-19,-21,-3,-10,-18,-10,9,-19,0,-12;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-6,-6,-19,14,-10,-21,-11,-20,-12,-1,-15,-8,-13,9,-3,-14,-24,-13,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-23,22,9,-25,-12,9,-23,-4,-20,-15,12,-10,4,-7,4,-2,-21,-33,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-17,-19,-19,-11,6,-24,-18,1,-16,2,-2,-15,-8,-16,-15,-6,3,4,-21,-5,-13;
MA   /M: SY='H'; M=2,-1,-23,-2,3,-15,-9,9,-19,-7,-18,-12,0,-9,1,-9,4,-4,-17,-21,0,1;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-14,-14,-14,-5,-13,-15,-5,-14,-6,-5,-7,-17,-13,-13,9,22,2,-23,-2,-14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-10,-11,-6,-17,-3,-16,-14,-10,-18,-14,-1,-10,-7,-15,23,14,-4,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='A'; M=16,-13,-19,-17,-11,-16,-1,-16,-9,-13,-7,-1,-11,-1,-10,-17,2,-1,-6,-24,-17,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-25,-10,-8,2,-19,-1,-15,3,-8,-6,6,-24,-5,22,-10,-8,-15,-16,3,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-34,-27,8,-33,-26,32,-27,21,14,-23,-24,-23,-24,-18,-7,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-27,-28,-30,-25,34,-29,-6,3,-19,3,0,-24,-30,-21,-16,-23,-12,-2,34,45,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-11,-21,-13,-4,-23,-14,-3,-8,10,4,-15,-25,-9,4,-15,-8,-2,-22,-6,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-15,-32,-15,-12,-6,-22,45,-17,-15,-8,-1,-10,-25,-3,-8,-20,-20,-21,15,22,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-7,-10,-5,-20,-8,-14,-18,0,-20,-13,-1,-14,-4,-2,12,7,-8,-29,-17,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-2,-23,-14,-17,29,-18,-2,-9,-14,-9,-9,9,-26,-18,-11,-10,-7,-15,2,20,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-30,-26,-1,-31,-26,29,-21,12,14,-22,-23,-22,-21,-10,4,32,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,6,-25,3,0,-18,-13,2,-24,10,-20,-13,12,-18,2,25,-1,-5,-19,-26,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-34,-25,6,-33,-22,32,-27,30,23,-25,-25,-19,-23,-23,-9,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-33,-31,-39,-29,48,-26,-24,-6,-26,-1,-7,-27,-29,-31,-20,-27,-16,-10,60,28,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=0,6,-24,6,10,-24,-12,3,-21,0,-20,-13,5,-12,11,-3,3,-5,-20,-21,-9,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-26,-6,15,-16,-24,-11,-3,-1,-3,-1,-9,-12,3,-4,-7,-7,-6,-26,-11,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-42,-30,-23,11,-22,1,-18,-17,-16,-13,-27,-28,-14,-15,-31,-24,-26,94,37,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-27,-7,4,-23,-21,-7,-16,20,-12,0,-5,-14,15,15,-8,-6,-15,-21,-8,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-23,4,9,-22,-15,-5,-21,6,-16,-12,1,-12,4,9,1,-1,-15,-25,-12,5;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-21,-15,-8,-11,-20,-13,-5,-1,-1,0,-6,-18,-4,7,-4,2,-3,-24,-9,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-10,-26,-12,-8,-7,-9,8,-12,-12,-2,-1,-4,-18,-2,-7,-11,-12,-16,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-30,-4,1,-25,-7,2,-24,3,-24,-12,-2,9,6,-1,-3,-7,-24,-23,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-27,-1,-2,-19,-14,-9,-19,0,-22,-14,-3,15,-6,-7,-2,-3,-18,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-26,-10,-8,-5,-20,3,-11,2,-11,-4,-5,-14,-3,12,-7,-5,-10,-13,11,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-8,-25,-10,-11,-11,-4,-11,-18,-9,-15,-11,-5,-13,-11,-3,-2,2,-13,-12,-8,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00398;
//
ID   THYMOSIN_B4_MP; MATRIX.
AC   MP00500;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thymosin beta-4 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3367963; R2=0.0117751; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; N_SCORE=17.668; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=184; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,6,-28,3,8,-28,-17,-7,-28,42,-30,-12,9,-12,8,25,-7,-8,-22,-23,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-25,46,9,-31,-11,-3,-26,-3,-24,-22,19,-15,-5,-10,0,-7,-18,-38,-18,2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-27,-18,8,-24,-11,11,-8,14,28,-20,-23,-11,-8,-18,-9,10,-17,1,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-24,-3,1,-25,19,-14,-29,-2,-25,-17,1,-12,-5,-7,8,0,-21,-26,-21,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=6,0,-22,-1,19,-27,-15,-5,-19,2,-16,-10,-2,-7,20,-3,6,2,-18,-25,-15,20;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-19,0,6,-26,-9,-7,-23,11,-28,-14,5,-10,12,5,19,6,-16,-31,-15,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-16,-5,-1,-20,-12,-14,-19,8,-22,-13,2,-10,-1,1,16,18,-9,-29,-14,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-4,-6,1,-26,-22,-14,-27,29,-26,-12,-3,-15,1,15,-6,-2,-16,-26,-13,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,23,-24,23,27,-26,-13,0,-26,3,-23,-20,20,-9,7,-3,6,1,-26,-34,-19,17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,7,-26,5,24,-31,-14,3,-21,6,-20,-10,7,-9,30,1,3,-7,-25,-26,-16,27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-27,13,48,-26,-21,-4,-22,6,-16,-16,-4,-4,13,-3,-1,-9,-19,-30,-19,30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-20,-10,-7,-17,-20,-20,-13,-10,-17,-13,-7,23,-10,-13,10,30,-10,-30,-17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-13,-1,-8,-13,-20,-18,-9,-10,-10,-10,-1,-13,-11,-11,13,34,2,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-30,35,48,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-27,2,18,-31,-17,-1,-25,21,-24,-10,1,-10,26,18,2,-6,-23,-24,-13,22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,2,-16,-15,-23,17,-20,-23,-16,-20,-16,-6,-17,-15,-20,7,-6,-12,-26,-25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=4,-5,-24,-2,13,-24,9,-13,-21,-6,-17,-14,-6,-12,-4,-12,0,-10,-14,-25,-22,5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-21,2,17,-22,-13,-9,-17,3,-22,-15,2,-8,6,-3,14,3,-14,-32,-17,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00433;
//
ID   SPASE_I_1_MP; MATRIX.
AC   MP00501;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Signal peptidases I serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.0052953; R2=0.0224873; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-14; N_SCORE=6.658; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-22; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=8,-24,-16,-27,-20,0,-22,-20,14,-20,18,8,-23,-24,-19,-20,-13,-5,17,-19,-2,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-22,-30,-22,20,-28,-10,13,-25,19,9,-20,-25,-21,-20,-19,-10,7,-11,12,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-19,-26,-20,0,-22,-22,15,-21,15,8,-19,-23,-16,-18,-11,2,14,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-33,-26,1,-33,-25,34,-26,22,19,-22,-23,-19,-24,-17,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-8,-3,-18,-15,4,-24,16,-16,-8,3,-19,4,39,-7,-5,-18,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-4,0,-19,-7,-7,-11,-7,-9,-9,-9,-9,-4,7,-17,-7,-9,4,6,-9,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-19,-28,-23,47,-23,-12,-2,-22,1,-3,-11,-26,-27,-16,-10,-5,-2,0,23,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-18,-27,-18,6,-28,-23,20,-21,15,8,-23,-24,-21,-20,-14,-6,22,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='F'; M=2,-21,-14,-27,-21,22,-20,-15,-2,-19,-2,-4,-17,-24,-22,-18,-7,-5,3,1,14,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-27,3,23,-25,-18,1,-21,4,-19,-13,-2,1,10,1,1,-5,-20,-28,-15,15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-31,-11,-7,-15,-19,-17,-7,-13,-16,-11,-8,34,-12,-19,-8,-8,-14,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-22,-23,-20,23,-26,-3,0,-11,0,-1,-17,-26,-16,-6,-12,-3,1,4,33,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-14,-22,-14,-4,-10,-25,-9,0,-4,1,2,-14,-20,3,-3,-9,-3,1,-18,1,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-19,-33,-28,-1,-34,-29,36,-24,13,13,-23,-24,-24,-24,-12,-1,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-33,2,17,-26,-20,-10,-22,5,-19,-14,-9,26,4,0,-8,-10,-24,-27,-19,8;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,38,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,18,-2,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-24,5,13,-25,1,-5,-25,-2,-21,-16,1,-11,0,-7,5,-3,-18,-29,-18,6;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,8,18,-19,-18,-2,-15,1,-7,-4,-1,-12,8,-4,-7,-9,-17,-25,-9,13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,85,-9,-19,-7,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,45,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-20,17,-30,44,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-9,0,-25,0,7,-18,-17,22,-20,0,-14,-6,4,-16,8,2,-3,-9,-19,-27,-4,6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-25,7,0,-23,-11,-11,-14,-5,-17,-12,0,-5,-5,-6,-2,-6,-9,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-15,-8,-13,-26,33,-14,-32,-13,-26,-17,4,-19,-9,-10,5,-7,-24,-26,-24,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-25,36,24,-30,-11,0,-30,1,-26,-23,20,-9,5,-5,6,-2,-26,-36,-19,15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-27,-10,-2,0,-17,-9,-15,-1,-4,-6,-7,-20,-6,14,-12,-11,-12,-17,-4,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-12,-30,-23,5,-31,-20,20,-26,28,13,-24,-27,-20,-21,-21,-5,13,-20,3,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-29,-18,-34,-26,25,-30,-24,19,-27,23,11,-25,-28,-28,-21,-20,-7,19,-14,5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-15,-26,-25,-4,-20,-17,17,-20,8,7,-23,-27,-23,-19,-10,-4,30,-27,-8,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,19,-20,13,3,-19,-12,-3,-15,-1,-20,-15,22,-16,-3,-4,5,5,-14,-33,-14,0;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-28,1,3,-23,-19,-8,-20,27,-18,-5,3,-14,4,18,-10,-9,-16,-23,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-24,-28,-21,19,-27,-14,5,-17,5,2,-17,-23,-20,-15,-15,-5,2,1,12,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-11,-15,-14,-13,-11,-11,-14,-1,-10,-8,-2,-5,-20,-11,-6,6,3,8,-31,-14,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-27,-14,-6,7,-26,6,-8,-2,-5,-3,-13,-17,-7,-3,-15,-10,-10,-2,28,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,0,-29,3,-4,-16,-8,2,-20,-4,-14,-10,-3,-19,-1,-2,-8,-12,-19,-10,3,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00418;
//
ID   POLYGALACTURONASE_MP; MATRIX.
AC   MP00502;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Polygalacturonase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3669467; R2=0.0136762; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; N_SCORE=8.747; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-19,104,-29,-28,-20,-26,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-36,-28,-29,-8,-9,-9,-46,-29,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=17,-4,-17,-7,-1,-24,0,-12,-20,1,-23,-13,0,-11,3,-6,15,3,-12,-27,-18,1;
MA   /M: SY='I'; M=0,-16,-22,-19,-15,-4,-26,-22,17,-18,4,3,-15,-19,-17,-21,-9,-6,17,-23,-7,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-23,-2,-4,-20,9,-6,-19,-2,-17,-10,11,-17,0,0,-1,-8,-18,-24,-16,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=3,5,-18,7,7,-22,-7,-9,-20,-4,-23,-18,4,3,0,-8,15,6,-15,-31,-19,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-3,-1,-29,33,-14,-33,-11,-27,-20,1,0,-10,-15,0,-14,-29,-25,-27,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-12,-4,0,-16,-11,-13,-15,-8,-19,-13,4,-10,-2,-9,26,30,-7,-34,-15,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-19,-2,6,-19,-13,-3,-19,12,-17,-8,3,-10,12,20,4,2,-15,-20,-10,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,27,-22,14,0,-22,2,7,-22,1,-27,-16,41,-18,3,1,6,-4,-27,-34,-18,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-23,-34,-26,0,-32,-26,35,-26,21,16,-22,-22,-20,-25,-17,-8,25,-21,-3,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-15,-24,-18,-12,-4,-22,-10,-4,-12,-1,-3,-13,-20,-9,-10,-8,3,-5,2,4,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-29,-19,-35,-28,24,-31,-25,23,-26,16,10,-23,-26,-28,-23,-17,-7,23,-14,5,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-19,-10,0,-8,-18,-11,-12,-2,-8,-5,-4,-14,0,-1,3,9,-9,-22,-8,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,14,-27,10,-1,-25,9,21,-30,-4,-27,-15,23,-18,-1,-1,0,-11,-29,-31,-12,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-5,-7,-13,-18,-11,-7,-15,-1,-17,-5,-3,4,-25,-16,-16,-6,-6,0,-31,-15,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-7,-20,-11,-9,1,-23,1,-5,-13,-2,-3,-6,-19,-9,-11,-3,7,-3,-19,6,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-23,73,-33,-29,8,-29,-25,-18,-29,-9,-9,-20,-36,-30,-26,-13,-10,-6,-32,-12,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-26,-6,-10,-19,20,-7,-25,-8,-23,-14,3,-19,-5,-4,3,-8,-22,-19,-9,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-33,-9,-8,-22,5,-3,-24,-13,-25,-15,-7,26,-10,-16,-5,-10,-26,-22,-13,-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,65,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,3,-17,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-34,-25,4,-33,-24,34,-27,30,22,-25,-25,-19,-23,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='S'; M=8,-5,-10,-5,-5,-16,-5,-14,-11,-12,-23,-15,3,-14,-5,-12,31,16,1,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-21,-16,-2,-5,-27,-5,6,-16,17,6,-19,-22,-10,-14,-16,-9,6,-26,-5,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-24,-11,-17,-23,40,-19,-28,-17,-21,-11,-1,-17,-16,-17,4,-1,-19,-23,-23,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-25,2,-2,-25,15,-7,-29,3,-24,-15,6,-15,0,3,1,-9,-23,-23,-17,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-5,-22,-5,-10,-7,19,-5,-20,-10,-15,-11,-2,-16,-11,-10,-4,-11,-17,-7,1,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-25,-13,-10,-16,-16,-13,-6,2,-12,-4,-4,-11,-6,8,-7,-6,-1,-26,-13,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-4,5,-20,7,-1,-18,-8,0,-19,-7,-22,-15,6,-15,-4,-9,11,3,-12,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-27,34,27,-30,-12,1,-30,5,-25,-22,20,-9,7,0,2,-5,-28,-35,-19,17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-1,-17,-7,-6,-15,-15,-10,-1,-4,-9,-1,3,-19,-6,-8,-1,-2,4,-30,-14,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-8,1,-21,2,-2,-16,-19,-7,-11,-10,-6,-8,-3,-8,-5,-11,-1,9,-8,-29,-10,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,26,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,45,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-23,12,22,-25,-15,-7,-24,7,-22,-17,4,-8,7,0,8,4,-18,-31,-16,15;
MA   /M: SY='B'; M=-11,27,-26,27,1,-26,13,-1,-31,-6,-28,-22,26,-17,-6,-9,3,-8,-28,-32,-19,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-22,-7,-27,-25,1,-29,-24,21,-22,12,8,-18,-28,-24,-20,-13,-4,26,-28,-8,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-15,-18,-21,-17,1,-26,-7,6,-14,0,2,-9,-20,-15,-13,-7,1,6,-22,0,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00415;
//
ID   PECTINESTERASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00503;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pectinesterase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3246164; R2=0.0155411; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=432; N_SCORE=12.028; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=76; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-13,-13,-12,-4,-22,-15,-5,-13,-2,-5,-6,-15,-11,-11,10,34,0,-23,0,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-20,-17,-8,0,-25,-15,10,-20,27,9,-16,-25,-13,-15,-19,-8,4,-25,-6,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-23,-14,-15,13,-24,5,-3,-11,-1,-3,-7,-24,-10,-10,-8,5,-8,3,39,-15;
MA   /M: SY='V'; M=5,-5,-15,-8,-13,-13,-17,-18,2,-12,-8,-6,-5,-14,-16,-15,1,4,12,-31,-15,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,-3,1,-21,-17,43,-21,0,-17,2,8,-17,16,9,-4,-11,-23,-27,2,6;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-3,-17,-5,-5,-15,-6,-6,-13,-8,-19,-11,4,-16,1,-8,15,9,-8,-26,-7,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-27,-4,-6,-25,8,-9,-17,-10,-23,-12,9,-2,1,-11,3,-7,-21,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-5,-29,-7,0,-20,-18,1,-29,27,-21,-11,6,-20,9,63,-8,-9,-21,-22,-11,0;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-2,-21,-6,8,-30,-14,-2,-16,1,-17,-5,-1,-10,31,-1,8,3,-18,-23,-13,19;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-25,53,-30,-11,5,-26,17,5,-22,-30,-29,-18,-22,-10,0,7,34,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-24,-30,-26,39,-31,-5,9,-20,7,3,-21,-29,-23,-17,-19,-9,5,10,43,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-24,-13,-6,-16,-22,-13,-10,13,-13,-5,-5,-17,-1,22,-4,1,-3,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-14,39,-25,38,11,-30,-6,5,-29,3,-29,-22,37,-14,4,-2,4,-5,-30,-38,-19,8;
MA   /M: SY='C'; M=0,-11,42,-16,-15,-18,-16,-20,-18,-20,-21,-16,-5,-23,-14,-20,14,5,-6,-42,-22,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-11,-25,-10,-14,16,-24,4,-6,-11,-3,-4,-11,-25,-13,-7,-11,-7,-6,-1,31,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-20,2,19,-22,-14,-6,-20,-1,-19,-14,1,-7,11,-5,13,9,-16,-28,-13,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,17,-17,17,1,-22,-14,-13,-21,-6,-17,-17,6,-10,-6,-11,12,24,-11,-33,-15,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-13,-29,-28,-1,-30,-29,29,-20,9,9,-25,-26,-26,-20,-8,4,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-38,-29,64,-31,-17,7,-28,10,3,-20,-29,-34,-20,-20,-10,3,8,31,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-19,-35,-26,66,-26,-19,-3,-27,5,-3,-16,-27,-35,-19,-12,-6,-1,3,23,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,11,-24,7,8,-25,-11,0,-24,12,-24,-14,16,-14,10,17,2,-5,-22,-28,-16,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=22,-9,-19,-14,-12,-24,25,-18,-24,-11,-20,-15,-4,-15,-11,-12,7,-6,-14,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=23,-9,-13,-18,-11,-9,-10,-18,-11,-8,-9,-9,-7,-13,-10,-8,9,13,-2,-21,-12,-11;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-12,-22,-18,-13,-7,-23,2,-14,-5,-4,-15,-18,-18,-19,3,3,15,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-31,-15,-31,-29,2,-29,-29,24,-21,10,8,-31,-30,-28,-20,-14,-4,39,-11,-5,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-21,-39,-29,64,-31,-21,7,-30,16,4,-21,-29,-36,-21,-21,-10,4,4,24,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,15,-29,18,16,-36,-16,18,-26,5,-23,-9,10,-12,35,3,0,-10,-30,-27,-10,25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-24,17,0,-25,7,1,-28,2,-29,-20,34,-18,-2,4,5,-5,-28,-34,-20,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-18,64,-25,-25,-15,-26,-27,-14,-23,-13,-13,-17,-31,-25,-23,-1,3,4,-42,-22,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-26,20,14,-26,-17,-5,-25,9,-18,-15,6,-12,5,7,-3,-3,-20,-29,-14,9;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-26,-38,-28,21,-36,-26,33,-30,22,15,-22,-24,-25,-26,-22,-10,20,-13,7,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-12,-23,-14,-8,-10,-22,13,-7,-2,-4,6,-7,-22,2,10,-11,-10,-4,-24,-1,-5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-17,7,-21,-18,-9,-19,-19,-4,-16,-9,-7,-16,-13,-17,-19,0,3,6,-25,-8,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-22,-15,-9,-13,-23,-11,-12,12,-11,-5,-8,-21,-3,36,-6,0,1,-24,-10,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00413;
//
ID   FRD_SDH_FAD_BINDING_MP; MATRIX.
AC   MP00504;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fumarate reductase / succinate dehydrogenase FAD-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5500565; R2=0.0160286; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=513; N_SCORE=13.763; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,13,-25,7,15,-29,-11,3,-22,9,-23,-12,18,-12,22,4,3,-6,-26,-28,-16,19;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-4,-28,1,15,-27,-14,-11,-24,5,-28,-18,-4,24,3,-4,6,-2,-23,-31,-21,7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-29,-4,-12,-29,44,-2,-35,-14,-28,-16,9,-19,-7,-13,0,-17,-30,-23,-22,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-27,-16,9,-27,-13,13,-22,32,21,-23,-26,-9,-15,-23,-10,4,-17,2,-12;
MA   /M: SY='K'; M=2,7,-20,4,1,-23,-10,-9,-22,10,-23,-15,9,-12,0,7,9,6,-15,-29,-15,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,3,-24,-22,-7,-28,-26,11,-20,0,0,-14,-21,-20,-20,0,16,18,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,-17,-21,-11,-18,-10,-20,-2,-5,-8,-5,-10,-12,-9,-14,2,-3,2,-20,-15,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-2,-31,-25,3,-31,-25,20,-27,28,13,-28,-30,-24,-22,-21,-7,21,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,24,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-28,-11,-1,-18,-25,-15,-9,23,-8,0,-8,-15,0,12,-15,-10,-7,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-30,-24,-17,28,-27,-7,-7,-17,-6,-7,-20,10,-21,-17,-17,-10,-13,3,26,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-30,-17,-10,-20,-23,-23,-3,-13,-17,-10,-23,50,-17,-20,-10,-7,-3,-30,-23,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-6,-20,-13,-7,-13,-20,-10,-7,10,-7,12,-6,-13,0,3,-3,11,-3,-24,-7,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-12,-29,-26,-4,-26,-28,25,-19,7,7,-25,-25,-25,-21,-7,-1,39,-27,-11,-26;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,10,-17,-11,-20,-5,-19,-15,-13,-16,-14,-7,-15,-11,-19,14,3,-4,-29,-22,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,33,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,47,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=5,-21,-22,-30,-21,-6,-24,-20,25,-20,9,17,-15,-17,-12,-22,-8,-5,16,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='A'; M=13,7,-16,-3,-1,-22,-6,-6,-16,-4,-19,-12,13,-13,6,-7,13,7,-14,-29,-17,3;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,-13,-20,-14,-19,7,-21,-9,-13,-10,-9,-11,-14,-14,-20,6,-3,2,-21,-20,-14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-15,-10,-20,-15,-14,-10,-21,1,-13,-7,-5,-13,-16,-15,-18,9,4,14,-27,-17,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-27,-21,3,-29,-23,20,-25,29,13,-23,-25,-20,-19,-16,3,17,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-28,-3,-9,-29,39,-11,-34,-5,-29,-17,9,-18,-5,-8,0,-15,-29,-23,-24,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,26,-20,16,7,-22,-6,0,-21,-1,-24,-18,33,-14,0,-4,9,5,-23,-35,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-22,1,5,-19,-15,4,-16,3,-14,1,0,-12,4,-2,3,2,-12,-29,-9,4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-30,22,9,-32,7,6,-36,4,-28,-19,8,-13,0,-3,-3,-14,-28,-29,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-22,5,26,-21,-14,-3,-18,0,-16,-6,0,-7,10,-5,9,0,-16,-31,-16,18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,9,-25,16,-2,-15,-3,-2,-22,-10,-16,-15,1,-18,-7,-12,0,-6,-18,-19,3,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-18,-33,-18,-10,-4,-2,-19,-24,-8,-22,-17,-14,-20,-11,-10,-11,-14,-23,38,2,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-16,6,-32,13,13,-28,-18,28,-30,5,-24,-13,4,2,6,6,-7,-13,-28,-30,-7,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00393;
//
ID   PEPCK_GTP_MP; MATRIX.
AC   MP00505;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5377607; R2=0.0138069; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=723; N_SCORE=14.510; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=143; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-30,-7,-3,-26,8,-9,-33,21,-26,-13,0,-17,1,30,-7,-13,-23,-20,-16,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,15,-14,1,-6,-14,-12,-9,-14,-6,-18,-14,23,-14,-6,-6,16,31,-11,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,9,-21,2,-8,-24,27,-8,-28,-11,-30,-20,22,-17,-8,-11,15,-1,-24,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,6,-30,12,37,-26,-20,38,-30,2,-20,-12,4,-8,16,0,-4,-14,-30,-30,-5,25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-9,-24,-9,-2,-21,-23,-16,-11,28,-18,-4,-9,-16,-2,15,-10,-7,2,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-9,-19,-16,-10,12,-23,-17,-13,2,-10,-7,-6,-16,-13,-1,-2,13,-6,-15,2,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,15,-27,45,-9,-10,-6,0,-11,-27,-4,-7,-17,-13,-16,11,61,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,58,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-16,-10,-16,-8,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,19,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-18,-16,-14,-24,27,-20,-21,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-11,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=15,-11,-14,-18,-11,-12,-8,-9,-2,-10,-5,14,-8,-14,-3,-13,8,2,1,-26,-12,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-2,25,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,41,-16,0,-4,21,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-16,-22,-16,2,-26,-20,9,-22,27,9,-19,-22,-16,-16,-11,13,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-24,-34,-24,3,-31,-18,31,-24,29,32,-23,-23,-14,-21,-23,-10,18,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,5,-31,2,3,-27,-14,-8,-23,12,-30,-17,11,25,-1,2,-4,-7,-27,-30,-21,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-36,1,23,-30,-20,-12,-24,-2,-26,-20,-12,56,1,-12,-6,-10,-30,-30,-26,9;
MA   /M: SY='N'; M=-1,15,-14,5,-3,-17,-6,-5,-17,-6,-24,-17,26,-14,-3,-6,22,22,-15,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-29,-18,-11,-19,-24,-24,-1,-14,-15,-9,-24,44,-18,-20,-10,-6,1,-30,-22,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-6,-42,2,-11,-9,-16,-19,-28,-12,-24,-24,-17,-22,-12,-16,-25,-22,-30,77,11,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-24,24,8,-28,-16,-9,-28,12,-24,-18,8,-10,0,2,3,9,-18,-31,-14,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00421;
//
ID   BETA_AMYLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00506;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-amylase active site 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5326591; R2=0.0134806; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1093; N_SCORE=19.257; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=7,-12,-13,-19,-13,-5,-19,-20,0,-17,10,0,-12,-17,-13,-15,1,19,3,-25,-9,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,11,-31,-20,-1,-27,31,-24,-7,0,-13,27,34,-7,-10,-23,-20,-10,17;
MA   /M: SY='K'; M=6,-1,-25,-1,17,-29,-15,-7,-23,18,-21,-10,-3,-8,16,7,-1,-7,-19,-22,-15,17;
MA   /M: SY='C'; M=30,-13,34,-23,-17,-20,-10,-23,-17,-17,-13,-13,-13,-20,-17,-23,3,-3,-3,-30,-23,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-37,-40,-37,-27,10,-23,-27,-6,-23,4,-6,-37,-30,-20,-20,-37,-23,-16,93,20,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-17,-20,-13,-14,-27,-16,13,-10,0,7,-20,-23,0,-10,-7,-3,23,-27,-10,-6;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,56,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-28,-12,32,-18,20,44,-20,-20,-8,-18,-20,-10,18,-20,0,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-10,-13,-20,-17,20,-23,-20,-7,-17,-3,-7,-7,-17,-20,-13,6,30,0,-16,4,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-5,-25,-7,6,-29,-15,-4,-21,17,-19,-7,-3,-12,22,18,-1,-7,-18,-20,-13,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-18,15,-5,-19,-19,-15,-8,-9,-11,-11,-2,-17,-13,-13,2,9,5,-34,-14,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-26,42,-30,-30,-8,-30,-30,6,-24,-2,-2,-26,-34,-30,-24,-10,-4,26,-38,-18,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-17,0,3,-23,-7,-10,-23,10,-30,-17,7,-10,3,4,23,10,-13,-33,-17,3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,26,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,34,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-28,-32,-28,-20,4,-19,-23,-6,-21,2,-6,-26,-26,-16,-18,-20,-13,-12,53,10,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-3,17,-17,21,4,-24,-9,-9,-24,-7,-25,-21,11,-10,-3,-10,21,18,-14,-37,-17,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-30,-14,-4,-20,-27,-17,-3,23,-13,0,-7,-13,0,10,-13,-10,-3,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-30,11,-9,-33,49,-15,-40,-15,-30,-23,5,-17,-15,-17,0,-17,-30,-25,-27,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00414;
//
ID   NI_HGENASE_L_1_MP; MATRIX.
AC   MP00507;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nickel-dependent hydrogenases large subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5148997; R2=0.0153541; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=736; N_SCORE=16.806; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=65; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-6,17,-28,26,27,-33,-6,-4,-31,4,-23,-20,5,-7,9,-5,1,-10,-26,-30,-20,18;
MA   /M: SY='N'; M=-5,17,-25,17,9,-28,12,-4,-30,-4,-27,-21,19,-13,0,-8,5,-8,-28,-31,-22,5;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-3,-28,-11,-15,-18,9,-15,-6,-11,-14,-6,9,-19,-12,-13,-5,-11,-10,-25,-16,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-22,-18,-14,-13,-26,-21,7,2,-7,1,-15,-11,-13,-5,-10,-5,15,-26,-11,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-21,-19,-11,-9,-27,-21,14,-11,2,3,-14,-15,-14,-14,-10,-3,16,-27,-10,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,4,-26,8,11,-26,-19,-7,-23,18,-21,-12,0,-13,7,17,-3,-6,-14,-27,-13,8;
MA   /M: SY='B'; M=4,18,-23,16,1,-28,7,-7,-27,-1,-25,-19,16,-14,-5,-8,4,-7,-22,-30,-21,-2;
MA   /M: SY='A'; M=16,-2,-18,-4,4,-18,-11,-11,-13,-4,-12,-11,-4,-12,-4,-9,3,-1,-6,-23,-12,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-28,-22,-17,6,-26,-12,0,-5,-2,-1,-17,-25,-13,-5,-19,-11,-2,16,18,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-16,-9,-18,-9,1,-19,-17,-1,-19,7,-1,-14,-21,-14,-16,-2,0,2,-26,-8,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-4,-14,-9,-8,-14,-15,12,-9,-12,-13,0,4,-16,-2,-10,9,7,-7,-32,-6,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-16,-22,-19,-21,-16,16,-23,-5,-20,-11,-6,-9,-20,-19,-20,0,-6,2,-24,-18,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-13,-16,-16,-5,-18,-17,-1,-13,-5,-2,-9,-17,-14,-13,7,27,8,-23,-2,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-11,-25,-12,-1,-13,-19,-10,-1,-9,-1,8,-11,6,-5,-12,-11,-8,-6,-27,-14,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-25,-31,-26,26,-27,-10,2,-21,2,0,-25,-29,-24,-17,-21,-12,4,25,21,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-23,-37,-27,33,-32,-22,21,-29,25,15,-23,-27,-26,-22,-23,-10,12,-9,11,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-9,-24,-10,0,-19,-24,-13,-8,14,-9,0,-8,-15,4,6,-8,-3,-4,-23,-8,2;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-29,-26,-39,-29,22,-36,-25,33,-29,19,17,-21,-23,-24,-26,-21,-10,20,-12,8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-17,-29,-21,4,-26,-18,20,-23,32,23,-27,-27,-18,-18,-21,-7,18,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-27,-2,15,-25,-22,-8,-16,18,-17,-7,-4,-11,12,11,-5,-6,-12,-24,-12,13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-7,-17,-29,59,-16,-38,-16,-30,-20,6,-20,-17,-14,0,-18,-30,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-28,-9,1,-20,-20,0,-24,26,-16,-7,-3,-17,6,40,-11,-10,-17,-21,-8,1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,10,-31,20,5,-28,-16,1,-26,-6,-25,-20,0,24,-4,-13,-4,-7,-26,-30,-14,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-20,-16,-20,-11,-16,-20,-21,-8,-15,-15,-8,-18,36,-14,-21,-9,-8,-13,-26,-20,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-30,3,26,-23,-19,7,-28,12,-20,-14,-2,-11,12,21,-6,-12,-25,-15,-10,17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,20,-28,28,18,-22,-17,-4,-29,8,-22,-18,6,-11,4,-1,-3,-7,-23,-27,-12,12;
MA   /M: SY='A'; M=32,-14,-14,-21,-15,-17,-1,-22,-3,-14,-8,-6,-11,-14,-14,-20,6,-2,5,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-35,-16,-8,-19,-14,-19,-14,-13,-22,-14,-17,28,-6,-17,-8,-10,-21,5,-13,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-15,-25,-21,-12,-8,-23,5,4,-8,-2,9,-9,-18,-3,-4,-11,-10,1,-21,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-28,-22,-36,-26,31,-30,-23,18,-28,19,9,-21,-25,-27,-23,-19,-9,11,-8,9,-26;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-11,-21,-19,-7,-20,-24,9,-16,1,0,-16,-20,-19,-17,4,13,22,-29,-12,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-29,3,25,-31,-18,-1,-21,3,-20,-9,-3,8,26,-1,2,-6,-25,-27,-17,25;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-25,-36,-28,3,-35,-29,39,-27,15,15,-20,-21,-22,-27,-15,-5,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-30,66,-19,-40,-18,-30,-20,0,-20,-19,-16,0,-20,-30,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-21,-5,-1,-17,-16,-12,-16,-8,-19,-13,-3,11,2,-10,11,15,-15,-28,-14,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-16,-23,-20,-19,-1,-15,-3,3,-16,-3,0,-12,-22,-14,-15,-6,2,4,-13,12,-19;
MA   /M: SY='T'; M=10,-12,-6,-17,-13,-14,-16,-20,-2,-14,-9,-6,-10,-12,-11,-17,8,11,6,-29,-15,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-9,-15,-12,-14,-10,6,-13,-13,-11,-7,-6,-17,-9,-14,3,4,-4,-24,-5,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-23,-28,-19,4,-27,-19,12,-21,29,15,-25,-25,-16,-16,-23,-6,5,-5,1,-17;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,10,-18,-12,-19,-7,-21,-14,-13,-14,-13,-8,-15,-12,-19,11,7,-3,-28,-20,-12;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-14,-5,-6,-12,5,-11,-19,-12,-24,-17,9,-14,-7,-12,24,9,-12,-31,-16,-6;
MA   /M: SY='V'; M=12,-21,-4,-26,-23,-7,-22,-26,13,-17,1,1,-20,-23,-22,-20,-2,5,27,-28,-13,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,1,19,-22,-19,-4,-24,19,-19,-10,-1,-10,10,21,-2,-3,-19,-24,-10,13;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,9,-22,-15,-18,-7,-22,-9,-14,-10,-10,-13,-16,-15,-21,5,-1,3,-25,-20,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-24,-19,-29,-23,-3,-30,-24,27,-20,12,14,-21,-22,-16,-20,-11,0,27,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-14,26,-30,40,44,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='B'; M=-4,24,-23,22,4,-26,-7,9,-26,0,-25,-18,24,-15,0,0,5,-5,-23,-34,-15,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00400;
//
ID   NI_HGENASE_L_2_MP; MATRIX.
AC   MP00508;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nickel-dependent hydrogenases large subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7691855; R2=0.0135753; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=440; N_SCORE=10.732; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-19,-16,-4,-16,-16,-18,0,-11,-5,-4,-13,-6,-7,-16,0,-1,3,-24,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-26,17,1,-19,-10,-1,-23,1,-20,-15,7,-15,-4,-2,-4,-9,-19,-24,-6,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-32,-18,-10,-18,-24,-5,-1,-15,-10,-2,-17,33,-10,-19,-13,-10,-9,-27,-13,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-27,-3,6,-11,-20,2,-15,4,-11,-4,-4,-16,4,0,-8,-8,-17,-10,4,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,12,-27,8,17,-29,-14,5,-24,15,-24,-12,18,-13,23,15,0,-7,-27,-27,-15,19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-33,-17,-9,-5,-23,-8,-9,-14,-12,-9,-19,35,-13,-18,-13,-10,-17,-14,1,-15;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-16,-28,-22,-3,-18,-22,16,-20,16,13,-23,-24,-19,-19,-12,-5,20,-23,-9,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,18,53,-29,-19,0,-29,8,-21,-20,3,3,17,-1,0,-9,-30,-31,-21,35;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-23,-30,-24,-3,-30,-6,28,-20,12,24,-19,-23,-14,-19,-16,-9,23,-24,0,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-14,-11,-15,-12,1,-9,-12,8,-14,17,7,-13,-15,-11,-11,-12,-5,6,-11,-3,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-16,-5,0,-10,-10,0,-16,16,-10,-5,0,-10,5,37,-5,-5,-10,-10,-5,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-13,-21,-21,-5,-21,-25,11,-17,3,2,-15,-21,-20,-17,1,18,21,-28,-10,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-28,2,-34,-26,36,-25,21,19,-25,-25,-22,-24,-18,-7,32,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,0,-20,-20,45,-30,12,-20,-5,5,-20,10,38,-10,-15,-25,-25,4,0;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,51,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,59,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-14,-4,-26,-23,-21,-11,-13,-24,-15,-20,76,-11,-21,-11,-10,-22,-29,-26,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-20,-31,-22,4,-29,-22,24,-26,34,19,-26,-26,-19,-21,-22,-8,18,-21,-3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-11,-10,-6,-21,5,-15,-17,-11,-21,-15,0,-11,-6,-15,24,8,-7,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-12,-14,-9,-21,8,-18,-16,-11,-17,-13,-4,-11,-9,-18,16,2,-6,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,-10,-17,-16,-8,-22,-23,2,-13,-4,-4,-9,-16,-16,-14,11,32,15,-29,-11,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,2,-22,-20,93,-29,-8,-20,0,9,-19,14,1,-9,-19,-30,-29,18,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-12,-19,-22,-5,-25,-25,17,-16,4,6,-21,-25,-23,-18,-5,4,33,-30,-11,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-25,2,-32,-20,34,-24,26,29,-23,-23,-16,-22,-21,-9,22,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-8,7,-23,13,-1,-22,-3,-4,-19,-10,-15,-13,1,-17,-8,-10,1,-6,-10,-32,-15,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=3,-6,-23,-5,1,-22,-9,-13,-16,-1,-17,-11,-7,7,-2,-5,0,-3,-11,-24,-18,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-25,28,21,-28,-14,1,-24,5,-20,-14,8,-9,6,-2,-2,-9,-20,-30,-14,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-24,-2,-1,-23,12,-14,-23,-7,-20,-13,-2,-3,-7,-10,2,-2,-17,-24,-20,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-23,3,11,-17,-7,-2,-20,3,-17,-11,11,-13,7,2,0,-6,-21,-24,-13,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-24,7,26,-21,-20,-6,-16,1,-10,-11,-3,-6,8,-1,-3,-4,-15,-26,-14,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-20,-20,-11,-2,-25,-17,8,-7,11,7,-17,-20,-11,-4,-15,-7,9,-20,-5,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=0,-6,-17,-8,-1,-13,-16,2,-6,-10,-9,-5,-3,-13,-4,-10,6,6,-2,-28,-7,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-19,-16,-11,-11,-22,-16,3,0,-3,1,-11,-18,-7,1,-5,-1,9,-23,-8,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-20,-18,-23,-16,10,-27,-14,11,-14,3,4,-17,-22,-19,-14,-11,-3,16,-16,4,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-27,4,8,-25,-19,-4,-22,19,-20,-10,3,-15,10,22,-5,-7,-15,-26,-13,7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-12,-21,-18,-5,-28,-22,16,-16,8,5,-21,-24,-19,-18,-12,-5,23,-26,-7,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00400;
//
ID   RAS_GTPASE_ACTIV_1_MP; MATRIX.
AC   MP00509;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ras GTPase-activating proteins domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4854565; R2=0.0154031; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=407; N_SCORE=11.745; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=17,-23,-10,-27,-23,-7,-20,-27,16,-17,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,33,-27,-13,-23;
MA   /M: SY='A'; M=35,-16,-10,-23,-16,-14,-9,-23,2,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,15,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='C'; M=3,-7,35,-10,-10,-20,-10,-17,-23,-17,-27,-20,0,-20,-10,-17,23,10,-10,-43,-23,-10;
MA   /M: M=-9,-13,-14,-14,-3,-16,-18,-6,-6,-9,-1,0,-12,-20,0,-9,-12,-11,-6,-25,-9,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-12,-6,2,-17,-19,-4,-24,15,-22,-11,2,-16,3,16,-3,-3,-17,-25,-9,1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-24,-30,-21,39,-25,-12,-3,-23,0,-3,-16,-17,-24,-18,-14,-9,-5,5,16,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-32,-2,3,-27,-17,-12,-19,-5,-23,-15,-11,48,-1,-9,-5,-7,-24,-28,-22,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,18,-25,22,6,-27,1,-5,-24,-5,-22,-17,13,-12,1,-9,3,-5,-21,-30,-17,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-21,12,7,-20,-12,10,-23,5,-19,-13,11,-12,4,12,2,-1,-19,-26,-9,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-22,8,8,-20,-12,-5,-16,-3,-13,-11,1,3,3,-5,0,-4,-17,-26,-14,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-5,12,-21,15,14,-24,-5,5,-23,-1,-19,-14,8,-8,7,-5,4,-3,-20,-26,-13,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-14,-25,-21,1,-25,-20,23,-18,15,15,-20,-21,-18,-16,-11,0,26,-21,-4,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-8,-18,-10,-2,-14,-14,-7,-4,1,-8,-2,-4,-4,6,4,-2,-4,-6,-15,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-17,-14,-12,7,-27,-5,-1,-13,4,-1,-14,-24,-12,-10,-15,-6,-5,-7,21,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-5,-22,-10,-8,-14,-14,-12,-6,-1,-10,-5,3,-17,-5,2,1,1,-6,-27,-11,-8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-19,-15,-25,-18,-9,-9,-22,6,-19,7,2,-18,-19,-17,-21,-5,-5,10,-22,-13,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-18,-34,-29,-1,-32,-29,36,-24,13,13,-25,-25,-25,-24,-13,-4,39,-25,-6,-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-23,26,-14,-27,-14,-29,-19,6,-14,-8,-14,23,6,-17,-32,-23,-8;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-17,-2,-7,-23,20,-11,-25,-11,-28,-19,12,-14,-7,-12,21,3,-18,-32,-23,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-24,-18,-31,-22,43,-24,-18,1,-26,12,1,-17,-26,-28,-18,-12,-5,1,-6,13,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-32,-26,9,-31,-24,27,-26,28,18,-27,-28,-23,-21,-21,-7,26,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-14,-36,-29,62,-31,-15,2,-27,7,0,-20,-30,-34,-20,-19,-10,0,7,32,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-20,12,-29,-13,17,-26,41,20,-28,-29,-17,-18,-28,-10,7,-13,12,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-29,72,-30,-17,1,-28,12,1,-21,-30,-36,-19,-21,-10,0,10,32,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-36,-27,39,-31,-21,17,-28,21,13,-23,-27,-28,-21,-22,-9,12,-7,13,-26;
MA   /M: SY='C'; M=7,0,33,-11,-15,-21,-6,-15,-22,-15,-21,-17,7,-24,-15,-18,4,-4,-14,-37,-24,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-36,-12,-3,-27,-19,-21,-16,-11,-26,-17,-20,74,-12,-20,-9,-9,-22,-29,-28,-12;
MA   /M: SY='A'; M=46,-12,-10,-21,-12,-18,-3,-21,-7,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,4,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-17,-31,-24,4,-29,-22,26,-24,30,21,-28,-28,-21,-19,-21,-6,26,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='S'; M=11,7,-13,1,-3,-20,2,-8,-19,-8,-26,-18,17,-13,-3,-10,27,12,-13,-36,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-27,18,8,-27,-14,5,-28,14,-26,-15,9,-13,8,9,1,-6,-22,-27,-8,7;
MA   /M: SY='L'; M=8,-15,-16,-19,-10,-6,-17,-17,2,-17,14,5,-15,-18,-11,-16,-4,3,2,-24,-9,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-20,-29,-16,55,-25,-17,-5,-23,3,-4,-15,-24,-29,-17,-12,-7,-4,0,18,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-13,23,-26,21,8,-26,-6,15,-26,2,-24,-13,24,-15,5,-1,0,-9,-26,-33,-13,6;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-26,-34,-25,7,-35,-22,33,-28,31,18,-24,-25,-19,-24,-24,-10,18,-16,7,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-22,-22,-25,-19,-4,-29,-20,14,-11,11,7,-17,-23,-14,0,-13,-1,15,-23,-6,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-24,17,8,-28,-12,-9,-22,-2,-24,-18,4,2,2,-8,8,0,-18,-33,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-26,4,11,-21,-20,6,-14,0,-10,-3,-2,-14,9,0,-5,-9,-13,-28,-8,8;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-3,-12,-7,-5,-13,-15,15,-18,-5,-17,-8,3,-19,1,-3,3,-1,-16,-23,3,-4;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-28,-14,-5,-21,-16,-6,-13,-12,-13,-10,-14,34,-9,-17,-6,-6,-17,-26,-17,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,18,-24,23,3,-28,4,-8,-28,-8,-24,-21,11,-8,-5,-12,8,-4,-22,-34,-21,-1;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-26,1,1,-25,-1,-8,-22,-10,-19,-15,-5,11,-6,-15,0,-7,-20,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-25,-1,6,-25,-18,-2,-18,8,-17,-8,3,-14,17,17,0,-1,-18,-24,-12,10;
MA   /M: SY='T'; M=5,-11,-15,-17,-13,-9,-19,-19,0,-9,0,-2,-8,-17,-12,-8,1,13,6,-25,-10,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00438;
//
ID   MALATE_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP00510;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Malate synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4072881; R2=0.0126710; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1423; N_SCORE=22.428; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-13,-9,-9,-11,-20,-2,-13,-10,-11,-9,1,-11,-7,-9,16,40,-4,-30,-6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-27,-15,-7,-15,-22,-20,-8,-15,-6,-8,-16,33,-12,-17,-6,8,-12,-28,-17,-12;
MA   /M: SY='A'; M=41,-13,-13,-23,-13,-17,-6,-21,-1,-13,-6,-6,-11,-11,-11,-21,6,-1,4,-20,-17,-13;
MA   /M: SY='A'; M=26,-12,-10,-17,-12,-15,-7,-20,-3,-12,-11,-8,-9,-15,-12,-17,14,6,10,-28,-18,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,8,35,-36,-20,6,-24,10,-20,-8,0,-6,45,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-16,29,48,-23,-23,-6,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-28,33,29,-30,-14,16,-32,2,-25,-20,17,-9,9,-3,0,-10,-30,-35,-14,18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,14,-27,46,-10,-10,-6,0,-10,-27,-4,-7,-17,-13,-16,11,61,-14;
MA   /M: SY='E'; M=13,1,-22,3,29,-27,-12,-7,-21,2,-16,-14,-4,-5,12,-7,4,-6,-18,-25,-19,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-30,51,31,-37,-13,1,-36,3,-27,-25,13,-7,10,-6,0,-10,-30,-36,-19,20;
MA   /M: SY='H'; M=-19,6,-29,3,0,-20,-17,87,-29,-9,-21,-3,17,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,14,0;
MA   /M: SY='S'; M=15,-10,-15,-14,-10,-15,-10,-17,-1,-15,-13,-8,-2,-12,-7,-17,18,8,2,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='S'; M=16,-12,-10,-14,-12,-14,-10,-19,-2,-13,-13,-8,-7,-16,-12,-15,17,9,11,-32,-17,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=4,-18,89,-28,-25,-20,-23,-28,-25,-25,-18,-18,-18,-33,-25,-28,-5,-8,-8,-43,-28,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,2,-35,-23,39,-27,27,26,-22,-22,-17,-25,-22,-10,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-23,-23,-20,14,-29,-7,9,-16,2,2,-14,-22,-14,-15,-8,8,3,-1,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,7,-20,-2,-3,-17,-15,-7,-20,10,-20,-12,14,-15,0,16,7,16,-14,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,57,-30,-20,6,-30,23,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-31,-7,5,-27,-20,-1,-27,23,-22,-9,-2,-3,19,42,-8,-10,-23,-21,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=5,25,-19,13,1,-23,-2,1,-19,-2,-24,-17,32,-15,1,-6,8,-2,-22,-33,-19,1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-25,0,0,-18,-18,43,-22,-6,-17,-5,3,-16,10,-4,-3,-6,-21,-22,10,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-32,-8,-1,-27,-8,-12,-26,8,-27,-16,-7,25,-2,12,-5,-9,-24,-25,-21,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-29,18,9,-32,-13,-4,-26,6,-29,-18,10,12,8,-2,1,-6,-27,-32,-19,7;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-12,-27,-15,-10,6,-13,14,-23,1,-14,-6,-3,-22,-8,13,-12,-13,-18,-14,6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-21,-33,-25,19,-32,-25,21,-26,18,10,-25,-19,-26,-22,-19,-8,19,-16,2,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00441;
//
ID   CRF_MP; MATRIX.
AC   MP00511;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Corticotropin-releasing factor family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9497385; R2=0.0155388; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=281; N_SCORE=9.306; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=2,-6,-17,-10,-5,-17,-12,-10,-17,2,-17,-8,0,-14,0,14,12,12,-8,-28,-13,-4;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-25,-9,-10,-23,33,-12,-24,-13,-15,-9,-3,-17,-3,-12,-3,-14,-21,-17,-19,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=7,-3,-15,-3,12,-13,-10,-7,-9,-3,-4,-3,-5,-7,2,-7,1,-3,-8,-19,-11,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=16,-7,-7,-12,-7,-7,-6,-12,-2,-8,2,-2,-7,-8,-7,-11,2,4,1,-13,-8,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=8,-4,-14,-4,-1,-16,19,-10,-17,-7,-13,-10,-2,-8,-6,-10,2,-7,-12,-13,-15,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-16,0,15,-4,-13,-2,-14,5,-8,-8,-2,-7,3,10,-4,-6,-13,-11,-4,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-17,17,11,-23,-8,2,-18,2,-16,-10,6,-6,17,-1,4,-3,-17,-20,-10,14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,4,-23,5,1,-24,10,-9,-21,-8,-19,-10,4,-14,-5,-12,4,-6,-16,-29,-20,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-36,-10,1,-30,-18,-17,-19,-8,-27,-17,-17,70,-3,-17,-7,-9,-27,-28,-27,-5;
MA   /M: SY='P'; M=1,-8,-22,-5,-1,-23,-10,-15,-19,-10,-27,-19,-3,29,-5,-14,18,12,-16,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-21,29,1,-24,-17,-12,-15,-7,-15,-15,2,-16,-10,-13,-1,1,-2,-36,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=4,-11,-18,-17,-14,-3,-17,-14,5,-19,20,5,-7,-23,-14,-16,-13,-6,-1,-24,-9,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-23,-8,-3,-21,-16,-18,-17,-10,-23,-17,-7,34,-8,-14,11,17,-15,-32,-21,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-21,-35,-25,32,-30,-18,17,-27,28,19,-24,-27,-24,-20,-24,-10,9,-10,10,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,23,-28,33,15,-30,-14,34,-33,-3,-25,-17,13,-12,6,-5,1,-10,-28,-35,-6,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,28,15,-30,-30,-25,-20,-19,-5,32,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,9,-26,5,15,-29,-16,0,-22,15,-23,-10,11,-10,23,9,2,0,-24,-26,-13,19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-14,-4,0,-11,-11,-4,-14,13,-11,-5,0,-8,3,23,-2,2,-8,-12,-5,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-15,-17,-12,5,-15,-12,6,-15,18,6,-17,-16,-11,-11,-17,-8,0,11,4,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-19,-19,-20,-9,-3,-23,-12,11,-16,18,21,-19,-21,-8,-13,-13,-5,8,-25,-6,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-23,-23,-15,-1,-28,-15,17,-22,27,13,-15,-25,-8,-16,-20,-9,5,-22,-3,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-26,-27,-17,-3,-29,-15,18,-10,17,22,-18,-21,-9,-4,-20,-10,9,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='A'; M=24,1,-15,-6,6,-21,-7,-13,-15,-5,-14,-13,1,-9,-3,-12,9,5,-9,-26,-19,2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-24,-4,3,-24,-16,-7,-23,21,-21,-10,4,-13,9,22,-1,0,-17,-23,-12,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,3,-28,8,17,-29,-20,-2,-22,14,-19,-10,0,-12,19,17,-4,-9,-18,-26,-13,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-21,-10,-2,-19,-14,-2,-7,1,-7,12,-2,-15,14,-1,-1,-4,-10,-24,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-10,-24,-10,4,-20,-20,-7,-11,7,-7,-2,-9,-16,11,12,-7,-8,-8,-22,-11,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-26,0,13,-23,-18,-7,-22,16,-14,-9,-3,-12,9,17,-6,-9,-17,-23,-13,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-16,-13,-9,-18,2,-13,-14,-7,-11,-10,0,-15,-8,-7,5,-3,-8,-24,-18,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-3,-24,-5,9,-26,-6,7,-23,1,-18,-10,-2,-12,11,2,1,-9,-19,-23,-13,9;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-22,6,10,-24,-2,-4,-21,-4,-18,-14,11,-13,7,-6,6,-4,-21,-30,-18,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00442;
//
ID   ALPHA_GALACTOSIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00512;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-galactosidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3970871; R2=0.0142673; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=322; N_SCORE=8.981; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-3,-19,-12,-10,-9,-14,-6,-2,-8,3,8,3,-20,-5,-2,-5,-1,-6,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-29,12,29,-30,-11,-2,-28,10,-24,-17,5,-2,15,5,0,-9,-28,-28,-19,22;
MA   /M: SY='T'; M=0,2,-16,-3,-1,-15,-13,-9,-10,-7,-11,-1,2,-12,-2,-9,12,18,-6,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-17,-15,-7,-14,-9,-10,-11,-2,-12,-8,-9,-14,-4,-10,4,-2,-5,-14,-2,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,11,-26,19,5,-21,-21,-12,-8,-7,-7,-9,-2,-16,-7,-12,-8,-8,-4,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-24,-11,2,-19,-18,-6,-15,8,-7,-1,-7,-15,10,16,-6,-5,-12,-21,-10,5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-26,-23,-17,-10,-13,-8,9,-18,5,16,-13,-13,-7,-17,-13,-8,1,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='V'; M=6,-19,-17,-22,-17,-3,-20,-16,8,-14,7,6,-17,-21,-14,-15,-6,-2,12,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='A'; M=10,-3,-18,-5,3,-20,-13,-13,-8,-5,-13,-9,-4,-13,-1,-11,5,-1,-2,-28,-16,1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,12,-27,18,18,-23,-18,-5,-20,1,-11,-13,4,-12,3,0,-4,-5,-18,-30,-14,10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-30,-5,-3,-23,32,-3,-33,-10,-24,-16,-1,-17,-8,-8,-3,-17,-27,-18,-13,-7;
MA   /M: SY='W'; M=3,-25,-23,-28,-19,7,-19,-21,0,-22,12,0,-23,-24,-18,-19,-16,-9,-3,15,3,-17;
MA   /M: SY='R'; M=1,-7,-25,-9,0,-22,-16,-2,-23,21,-17,-8,-3,-15,4,26,-6,-8,-14,-21,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-4,25,-26,35,15,-35,-11,-4,-30,5,-24,-20,9,-10,7,-5,1,-8,-23,-31,-18,11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-19,-29,-19,5,-26,-19,17,-26,38,19,-26,-26,-18,-20,-23,-8,11,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-24,-25,-25,-23,18,-31,0,14,-16,8,6,-23,-29,-16,-15,-18,-8,9,7,45,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-28,8,19,-27,-18,7,-23,9,-22,-12,6,-1,13,3,-2,-8,-23,-29,-13,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-21,-18,18,-28,10,1,-8,6,9,-19,-28,-8,-2,-20,-10,-6,12,49,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-21,-35,-27,23,-33,-24,25,-28,25,13,-25,-27,-27,-23,-21,-8,20,-14,6,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-7,-10,-16,-19,-9,-23,-16,10,-13,-4,0,2,-24,-15,-9,-7,-4,11,-31,-12,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,5,-33,-22,32,-28,35,25,-25,-25,-18,-23,-25,-10,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,42,-29,60,16,-35,-12,-2,-34,-3,-22,-25,15,-12,-2,-11,-3,-10,-26,-38,-18,7;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-15,61,-21,-24,-23,4,-25,-32,-25,-24,-20,-11,-31,-24,-25,-2,-10,-16,-40,-29,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=0,-18,-18,-24,-18,20,-18,-12,0,-18,-1,3,-12,-20,-16,-16,-2,-2,0,-11,9,-16;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-23,-2,4,-25,12,-14,-25,-2,-22,-15,-2,-12,-4,-9,5,-7,-16,-26,-21,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,4,-24,7,-2,-15,-2,13,-20,-6,-15,-10,4,-8,-4,-7,-6,-11,-20,-18,0,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-20,0,2,-21,14,-5,-20,-4,-18,-11,3,-2,4,-6,2,-8,-20,-17,-16,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,32,-23,38,7,-24,-9,-2,-26,-4,-25,-22,21,-15,-4,-9,5,-3,-20,-37,-17,2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=11,4,-15,1,0,-23,2,-9,-20,-7,-24,-17,10,-11,1,-10,22,9,-14,-33,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-1,-23,-2,1,-13,-20,-9,-4,-9,3,-2,0,-18,-1,-9,-7,-3,-8,-27,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-25,19,6,-21,-12,-1,-26,4,-22,-15,13,-15,5,11,3,-3,-22,-30,-13,5;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-33,-28,-34,-24,12,-27,-23,8,-25,22,7,-32,-30,-21,-20,-30,-15,1,33,10,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-20,-18,-11,1,-24,-10,6,-11,1,7,-11,-22,-4,-10,-10,-6,7,-19,1,-8;
MA   /M: SY='P'; M=12,-18,-23,-19,-11,-18,-15,-22,-7,-12,-14,-11,-18,21,-14,-19,-3,-2,-4,-16,-18,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-28,45,12,-33,-8,1,-32,1,-30,-25,28,-3,-1,-7,2,-7,-30,-38,-21,5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-6,-31,-1,8,-25,-16,4,-23,-2,-22,-14,-6,25,0,-5,-5,-7,-24,-29,-16,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,1,-24,0,6,-26,-8,-4,-19,2,-19,-10,3,-12,11,0,3,-2,-18,-26,-14,8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-7,2,-23,-19,-7,-27,32,-22,-10,0,-15,7,43,-6,-4,-17,-21,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-27,-19,-37,-27,66,-26,-20,-1,-27,7,-1,-19,-27,-36,-20,-16,-9,0,6,23,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-37,-6,0,-29,-17,-16,-20,-9,-30,-20,-9,75,-9,-17,-7,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-10,8,-23,3,0,-20,-10,44,-25,-5,-25,-10,20,-17,5,3,8,-4,-24,-34,-1,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00443;
//
ID   ADENYLOSUCCIN_SYN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00513;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenylosuccinate synthetase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8271670; R2=0.0142822; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=646; N_SCORE=14.043; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-26,5,17,-23,-18,-1,-21,7,-16,-10,3,-12,15,9,0,-4,-20,-26,-11,15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-25,10,34,-25,-14,-4,-27,6,-19,-17,0,-6,10,3,2,-7,-23,-28,-18,22;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-22,-1,12,-22,-15,-5,-22,12,-18,-11,0,-11,8,10,0,-5,-17,-24,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=1,-10,-21,-12,-2,-6,-14,-9,-11,-5,-5,-5,-7,-17,-5,-5,-3,-5,-8,-20,-6,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-23,-6,3,-18,-19,-5,-16,12,-11,-4,-1,-17,5,16,-7,-6,-13,-25,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-25,-3,-2,-27,21,-14,-28,-4,-24,-16,0,-14,-5,-7,5,-7,-20,-25,-22,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-25,12,6,-28,3,-7,-27,6,-27,-18,11,-13,0,-1,5,-6,-22,-30,-19,3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-24,9,7,-25,-10,-2,-24,10,-23,-14,11,-13,5,8,3,-4,-20,-29,-15,6;
MA   /M: SY='K'; M=-1,3,-22,0,4,-22,-10,-8,-23,16,-24,-12,6,-12,3,10,4,-2,-17,-26,-14,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-26,-5,-8,-27,25,-10,-32,3,-27,-15,5,-17,-7,-1,-1,-13,-24,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-5,5,-25,-20,-4,-29,35,-24,-10,1,-16,12,47,-9,-10,-21,-21,-11,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=13,-10,29,-19,-16,-16,-16,-23,-15,-16,-13,-13,-10,-20,-16,-20,8,13,-2,-33,-20,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-20,-1,16,-22,-11,-7,-18,-1,-16,-8,-2,-9,8,-4,9,1,-14,-29,-17,12;
MA   /M: SY='D'; M=-14,38,-26,53,14,-33,-9,-3,-35,-3,-28,-27,17,-10,-1,-10,7,-3,-25,-38,-18,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,-13,-26,-21,-2,-22,-20,14,-17,2,4,-18,-21,-18,-20,-5,-1,19,-19,-2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-17,-8,-4,-20,9,-14,-20,-10,-20,-14,1,-13,-6,-13,13,2,-12,-26,-20,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-21,-10,-9,-13,-17,-11,-6,-1,-10,-5,3,-18,-6,6,0,3,-3,-27,-10,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-11,-17,-28,54,-20,-34,-18,-26,-18,-1,-18,-17,-20,3,-15,-24,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-35,-27,3,-36,-25,38,-28,25,18,-23,-24,-21,-25,-21,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-31,-26,2,-27,-22,26,-19,14,21,-26,-26,-21,-19,-13,-4,33,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-13,7,-17,-15,-17,-2,-6,-17,-15,-14,-7,-9,-23,-10,-16,-4,-10,-11,-26,-11,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-19,42,-30,59,20,-37,-12,11,-38,0,-28,-26,18,-10,2,-8,-1,-11,-30,-38,-16,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,10,-30,-21,22,-29,45,20,-29,-29,-20,-20,-28,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-20,-21,-25,-16,15,-25,-13,6,-16,14,9,-16,-24,-15,-11,-16,-8,3,-13,6,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-25,34,13,-30,-7,11,-30,-2,-27,-20,22,-13,3,-6,5,-6,-26,-37,-16,7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-30,2,6,-22,-17,-11,-16,1,-16,-10,-5,9,-2,-3,-8,-10,-17,-23,-15,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-26,17,15,-18,-15,-6,-26,6,-21,-17,4,-9,3,-2,-1,-7,-21,-26,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-25,-7,-1,-13,-19,-9,-10,0,-7,-5,-6,-14,-4,3,-7,-5,-7,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-25,-22,-29,-19,29,-23,-19,5,-24,20,6,-21,-26,-23,-17,-21,-11,1,-9,8,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00444;
//
ID   FIBRIN_AG_C_DOMAIN_MP; MATRIX.
AC   MP00514;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fibrinogen beta and gamma chains C-terminal domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4572778; R2=0.0117632; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=584; N_SCORE=11.317; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,21,-24,12,-1,-23,-1,7,-24,0,-26,-17,30,-11,-1,1,4,-2,-26,-34,-17,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-25,50,13,-31,-11,-2,-30,-2,-22,-23,16,-11,-2,-9,1,-4,-23,-35,-17,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-24,0,2,-23,-13,-5,-16,8,-18,-7,8,-15,8,8,1,-3,-15,-27,-13,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-14,-16,-15,-15,0,-10,-2,-14,-14,-13,-10,-9,-17,-11,-14,-4,-6,-15,1,15,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-4,3,-21,6,6,-20,-12,-8,-15,-5,-11,-9,0,-12,0,-6,4,0,-11,-31,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-14,-11,-10,-21,9,-17,-19,-7,-18,-10,-3,-17,-10,-10,2,-4,-13,-27,-18,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,24,-20,12,2,-22,-4,10,-21,1,-29,-17,38,-17,5,1,13,2,-25,-37,-16,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-11,-17,-9,-21,4,-19,-13,-11,-14,-12,-7,-11,-9,-19,13,1,-3,-22,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-8,-22,-7,8,-17,-20,-1,-9,0,-4,-2,-9,-15,2,-4,-6,-7,-6,-26,-9,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-10,-23,-12,-3,-9,-18,-2,-6,-8,-3,2,-7,-18,3,-7,-5,-3,-9,-15,0,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-8,-25,-5,-11,9,-24,15,-7,-14,-1,-2,-9,-24,-11,-11,-13,-9,-8,-7,28,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-27,-3,1,-26,4,11,-29,4,-25,-11,3,-15,6,7,2,-8,-23,-25,-11,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-25,-10,-17,-26,48,-19,-31,-18,-26,-18,1,-18,-16,-18,7,-8,-22,-24,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-24,-13,-17,-27,48,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-26,-28,-23,41,-29,4,4,-17,6,8,-20,-29,-18,-14,-20,-10,-3,16,53,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-23,17,2,-25,-3,8,-26,3,-27,-18,29,-16,1,2,6,-4,-25,-34,-16,1;
MA   /M: SY='N'; M=4,6,-20,2,4,-22,-9,-2,-22,4,-21,-14,10,-13,3,8,8,1,-16,-29,-15,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-27,-6,-4,-18,-7,47,-23,-11,-14,-2,1,-19,6,-6,-6,-15,-23,-24,6,-2;
MA   /M: SY='A'; M=6,-11,-20,-13,-6,-12,-15,5,-9,-11,-4,-3,-8,-13,-4,-9,-1,-3,-7,-23,-4,-6;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-12,-9,-6,-21,6,-15,-17,-11,-21,-16,1,-11,-6,-15,24,8,-7,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-21,18,0,-20,-2,21,-21,-1,-29,-18,54,-20,1,0,8,-2,-30,-39,-15,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-28,-18,6,-29,-20,16,-28,43,16,-29,-19,-19,-20,-28,-10,6,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-25,-19,-9,-10,-26,-11,0,4,1,6,-12,-21,0,14,-14,-9,1,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-31,-20,-20,28,-29,21,-3,-11,-2,-1,-19,-29,-10,-10,-20,-12,-12,31,71,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-26,-19,-17,14,-18,11,-3,-16,6,2,-14,-27,-12,-13,-17,-11,-9,3,36,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-27,-8,-3,-9,-18,4,-18,-3,-14,-7,-5,-9,1,4,-7,-7,-17,-13,-3,-2;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-24,-9,-13,-24,37,-15,-29,-15,-25,-16,0,-17,-10,-15,8,-5,-21,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-27,-10,-8,-22,16,-17,-21,-9,-18,-12,-6,-5,-11,-11,-1,-9,-16,-25,-21,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-10,1,-24,-1,-4,-14,-13,30,-19,-6,-15,-6,5,-14,-1,-4,-3,-4,-18,-23,6,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-26,-12,-6,-3,-17,7,-13,-3,-9,-6,-8,-20,-4,-2,-8,-6,-12,-3,18,-7;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-21,-2,2,-19,-4,-9,-21,-4,-19,-13,0,-9,3,-1,10,0,-16,-28,-16,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-9,-27,-9,-6,-10,-11,-4,-18,1,-18,-11,-8,-11,-6,-2,-5,-8,-14,-6,4,-7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-18,-12,-7,-16,-16,-15,-8,-2,-7,-5,-7,-15,-5,0,1,5,-1,-24,-12,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-23,13,0,-17,-4,3,-19,-4,-21,-12,19,-17,0,-7,3,-4,-20,-26,-5,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-11,-29,-13,-14,-19,16,-16,-22,-10,-21,-13,-3,-20,-9,-7,-3,-10,-18,-1,-13,-12;
MA   /M: M=-8,-8,-27,-9,-4,-16,-17,-13,-1,-5,-11,-4,-6,-8,-3,-10,-5,-7,-3,-24,-8,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00445;
//
ID   SVP_II_MP; MATRIX.
AC   MP00515;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Seminal vesicle protein II repeats signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4586833; R2=0.0116260; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=859; N_SCORE=13.435; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=262; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-17,-3,1,-23,-2,-12,-23,6,-28,-16,4,-11,1,0,20,7,-13,-31,-18,1;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-13,-21,-16,-14,4,6,-13,-10,-17,-10,-7,-6,-18,-16,-16,-1,-7,-9,-12,-1,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-12,-3,-5,-17,12,-11,-19,-10,-22,-15,5,-10,-5,-10,22,12,-11,-27,-17,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,18,-38,-20,9,-21,12,-20,-1,0,-11,54,17,-1,-10,-29,-20,-10,35;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-14,-26,-21,3,-24,-17,21,-19,23,22,-24,-24,-17,-15,-17,-5,23,-21,-4,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-12,-1,-2,-21,9,-11,-22,-11,-30,-20,9,-11,-2,-11,35,15,-12,-38,-21,-2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-17,-25,-21,38,-23,-7,3,-17,3,0,-16,-24,-22,-14,-12,-5,3,6,30,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-23,2,-9,-25,40,-13,-31,-13,-25,-18,4,-14,-12,-14,5,-11,-23,-22,-23,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-21,0,14,-29,-14,7,-14,7,-14,0,0,-7,43,7,0,-7,-21,-14,-7,29; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-13,-11,-17,-14,0,-18,-12,10,-12,12,14,-13,-15,-10,-10,-7,7,11,-18,-3,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-21,0,7,-21,-14,-7,-21,36,-21,-7,0,-7,7,21,-7,-7,-14,-14,-7,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=13,-2,-7,-3,-2,-14,0,-9,-13,-7,-18,-13,4,-7,-2,-9,24,11,-6,-26,-14,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-7,-21,-7,3,-23,-10,-5,-13,-7,-10,-4,-3,-15,19,-5,7,-1,-15,-27,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-27,15,24,-30,8,-7,-32,-2,-25,-21,4,-8,4,-8,7,-8,-27,-30,-23,14;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-19,-30,-21,1,-26,-23,21,-25,27,13,-24,-24,-19,-22,-17,-7,17,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-30,-10,-18,-29,59,-18,-39,-14,-29,-19,0,-20,-16,-9,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,0,17,-35,-17,9,-17,9,-17,0,0,-9,52,9,0,-9,-26,-17,-9,35; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-17,-16,-8,-13,-21,-8,6,-4,0,13,-14,-18,7,-1,-7,-5,9,-21,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-26,0,9,-26,-17,-9,-26,43,-26,-9,0,-9,9,26,-9,-9,-17,-17,-9,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='S'; M=15,-2,-9,-3,-2,-17,0,-10,-16,-9,-23,-16,5,-9,-2,-10,30,14,-7,-31,-17,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-12,0,5,-19,-5,-2,-14,-2,-18,-9,4,-7,16,-2,18,6,-12,-23,-11,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-11,-3,-5,-14,19,-8,-17,-8,-17,-12,3,-8,-5,-8,13,1,-11,-18,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-21,0,13,-27,-14,5,-15,12,-15,-1,0,-7,36,9,-1,-7,-20,-14,-7,24; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-18,-23,-14,0,-25,-14,16,-19,27,17,-21,-22,-7,-14,-19,-8,9,-18,-2,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-24,0,8,-25,-15,-7,-24,33,-25,-9,1,-9,11,20,-2,-5,-17,-20,-10,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-12,-2,-3,-19,12,-10,-21,-10,-26,-17,7,-10,-3,-10,28,11,-12,-31,-19,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-20,-27,-23,46,-14,-10,-5,-21,2,-2,-15,-25,-27,-15,-15,-10,-6,9,28,-23; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-20,-6,-12,-23,41,-14,-29,-14,-26,-17,3,-14,-12,-14,11,-6,-20,-23,-23,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-19,-22,-14,-8,-25,-12,10,-7,8,17,-19,-23,-2,-1,-13,-6,14,-24,-7,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,-2,7,-27,-20,-12,-27,40,-27,-10,0,-10,7,23,-5,0,-17,-22,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=13,-2,-13,-3,2,-23,-3,-8,-18,-7,-25,-15,5,-10,8,-8,29,12,-12,-33,-18,5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-13,-16,-16,-11,22,-15,-8,-8,-14,-8,-6,-6,-18,-10,-10,4,1,-7,-8,11,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00446;
//
ID   ALKYLBASE_DNA_GLYCOS_MP; MATRIX.
AC   MP00516;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alkylbase DNA glycosidases alkA family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9276524; R2=0.0147333; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=923; N_SCORE=18.516; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-14,5,-32,11,8,-30,-18,-8,-30,23,-28,-16,0,9,4,19,-8,-10,-24,-26,-16,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-16,-18,-20,-16,-4,1,-8,3,-14,11,23,-14,-18,-8,-12,-14,-10,0,-16,-6,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,27,-18,23,4,-24,-2,0,-24,-4,-30,-22,33,-14,0,-6,19,5,-22,-40,-20,2;
MA   /M: SY='B'; M=-12,8,-22,8,3,-2,-18,-8,-12,-8,-12,-12,5,-18,-11,-10,-4,-6,-7,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,50,-30,-20,-2,-30,18,-22,-18,0,-2,18,6,-2,-10,-28,-28,-18,34;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,26,44,-34,-18,2,-30,8,-22,-18,4,-4,24,0,0,-10,-30,-30,-18,34;
MA   /M: SY='A'; M=17,-22,-14,-26,-18,-4,-18,-22,10,-20,17,6,-22,-22,-18,-20,-9,-4,14,-22,-10,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-26,-24,-8,-6,-28,-12,22,-14,12,28,-16,-16,-4,-16,-16,-10,10,-22,-4,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,39,-30,-20,-4,-30,26,-24,-16,0,-4,16,12,-4,-10,-26,-26,-16,28;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-16,0,-2,-18,-8,-6,-20,0,-24,-16,16,-14,0,7,20,16,-14,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-18,-12,-6,-16,-20,-14,-2,-10,-10,-4,-2,-12,4,-10,12,20,-2,-28,-10,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,9,-24,2,6,-26,-16,-4,-22,20,-24,-10,13,-12,13,12,2,4,-20,-26,-12,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-38,-30,16,-36,-28,36,-28,16,14,-22,-24,-26,-26,-18,-8,28,-16,4,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-32,-4,6,-28,-20,-10,-28,34,-28,-12,-4,8,6,28,-10,-10,-22,-22,-14,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-14,-30,53,-18,-38,-7,-30,-18,0,-18,-14,-10,-2,-18,-28,-20,-26,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-34,-10,0,-24,-20,-8,-26,13,-24,-14,-8,26,2,32,-10,-10,-24,-24,-18,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=29,-18,-14,-26,-18,-12,-13,-24,9,-16,-1,-1,-16,-16,-16,-22,1,-2,15,-22,-14,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,20,-26,16,25,-26,-12,2,-26,14,-26,-18,25,-10,10,6,2,-6,-28,-32,-18,17;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-20,-24,-26,-20,12,-24,8,12,-10,12,35,-20,-24,-4,-10,-20,-10,2,1,33,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-20,-32,-26,41,-30,-14,10,-24,16,6,-24,-30,-28,-18,-20,-8,10,0,26,-26;
MA   /M: SY='L'; M=6,-20,-16,-22,-14,-2,-18,-18,6,-22,22,6,-18,-22,-14,-18,-8,-2,4,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-36,-26,2,-34,-22,38,-26,26,28,-22,-22,-16,-24,-22,-10,22,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-22,-19,-11,18,-20,-10,-17,-1,-11,-8,-5,-22,-11,19,-3,-4,-10,-13,3,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,8,-12,-16,-22,19,-20,-28,-18,-24,-18,-2,-20,-16,-18,9,3,-16,-32,-24,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-32,-26,-32,-22,10,-28,-22,12,-28,36,12,-32,-30,-20,-20,-32,-14,2,15,6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-28,0,2,-28,1,-2,-28,15,-26,-12,11,-16,13,19,-2,-10,-26,-24,-16,6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-24,-18,-8,1,-18,-8,-20,9,-12,-8,-6,-20,-4,33,-8,-8,-12,-14,-4,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-5,-28,-1,-2,-18,-20,-10,-10,0,-4,5,-10,5,-4,-6,-14,-10,-12,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-26,54,14,-34,-12,-4,-34,-2,-26,-26,16,-10,-2,-10,4,2,-24,-38,-18,6;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-14,-30,-26,-4,-26,-28,26,-20,8,8,-24,-24,-24,-22,-8,-2,36,-26,-10,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-20,-36,-26,50,-26,-12,8,-22,14,23,-20,-26,-25,-16,-20,-10,4,-1,19,-22;
MA   /M: SY='P'; M=3,-20,-30,-16,-6,-20,-18,-20,-10,-14,-9,-10,-20,44,-12,-20,-10,-8,-15,-26,-22,-12;
MA   /M: SY='P'; M=13,-18,-27,-20,-10,-20,-17,-22,-2,-14,-12,-8,-16,30,-12,-22,-5,-6,-6,-24,-20,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-18,-22,-18,6,-24,-12,10,-20,16,6,-20,-26,-16,-16,-10,-2,10,-16,10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-20,-12,-14,-16,19,-18,-18,-18,-10,-10,-4,-18,-14,-16,5,3,-12,-26,-18,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='K'; M=1,-10,-26,-14,-4,-20,-20,-14,-9,17,-14,-4,-6,-14,0,14,-8,-8,-5,-20,-10,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-14,13,-26,5,4,-24,-12,26,-24,6,-24,-10,25,-18,16,17,0,-8,-28,-30,-8,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-26,-2,3,-26,20,-10,-32,-2,-26,-18,2,-14,-2,4,6,-8,-24,-26,-22,0;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-24,-22,-32,-24,35,-26,-15,8,-22,6,2,-18,-24,-25,-20,-14,-8,4,2,24,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-28,-4,4,-26,-16,-10,-26,21,-28,-14,-2,9,4,19,1,-4,-20,-26,-16,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-30,-10,0,-13,-8,-9,-10,0,-12,-6,-8,-16,-4,-6,-10,-12,-12,-13,3,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-30,-22,26,-28,-7,12,-22,26,20,-24,-28,-18,-16,-24,-10,4,-4,23,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-14,-22,-18,-12,8,-24,6,-10,-10,3,0,-8,-22,-10,4,-10,0,-8,-18,5,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-26,-2,-4,-24,6,-8,-26,-2,-28,-18,10,5,-4,3,7,-3,-24,-30,-22,-6;
MA   /M: SY='L'; M=0,-7,-20,-7,-9,-9,-18,-12,1,-15,15,11,-13,-20,-10,-16,-13,-8,-1,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,5,-26,2,6,-28,-12,-4,-22,9,-28,-14,11,7,13,3,6,-2,-24,-30,-18,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00447;
//
ID   RNASE_3_1_MP; MATRIX.
AC   MP00517;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonuclease III family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0918503; R2=0.0147093; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=343; N_SCORE=10.127; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-23,11,12,-23,-14,-6,-22,10,-15,-13,0,-11,3,9,-4,-8,-16,-24,-14,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-8,-28,-8,5,-23,-22,7,-16,9,-7,1,-5,-17,23,15,-10,-11,-19,-21,-5,13;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-14,-9,-17,-5,-19,-11,-10,-13,-11,-4,-10,-9,-16,17,16,-1,-26,-17,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-17,-25,-17,4,-23,-16,16,-22,33,16,-22,-22,-15,-17,-20,-7,9,-17,-2,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-12,-16,-13,4,-20,-17,-3,-11,-4,-4,-5,-13,-13,-8,7,26,3,-20,-3,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-2,-26,-2,-1,-16,-18,76,-23,-8,-13,1,6,-18,7,2,-10,-17,-24,-25,15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=3,-3,-13,-6,-5,-19,-8,-10,-17,2,-17,-11,1,-9,-4,7,2,-3,-10,-25,-16,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-10,0,-1,-19,-2,-10,-19,-10,-28,-19,11,-10,-1,-10,37,22,-10,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-17,-22,-21,-16,7,-22,-3,2,-11,-1,2,-15,-22,-8,-10,-8,-3,1,-3,23,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='A'; M=8,-7,-20,-10,-7,-20,2,-13,-14,-5,-16,-8,-2,-4,-5,-8,4,-4,-11,-24,-17,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-2,5,-16,0,0,-6,-5,-4,-14,0,-16,-11,12,-8,-4,-3,4,-2,-14,-19,-9,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-16,9,17,-16,-10,-1,-12,1,-12,-9,7,-5,8,-2,2,-3,-14,-19,-10,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-2,-15,-2,-1,-14,-11,21,-12,-4,-9,-2,0,-11,5,-1,-2,-6,-9,-18,0,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-4,0,-7,0,0,-13,-5,-7,-12,-6,-8,-8,1,-9,-2,-5,3,0,-10,-21,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,-10,-17,-13,-10,-11,-3,-16,-4,-12,-4,-4,-8,-7,-10,-12,-1,3,-2,-19,-12,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-8,-20,-9,-2,-14,-12,-12,-10,-1,-11,-7,-6,-15,-5,-2,3,3,-4,-24,-8,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-26,1,11,-22,-7,-4,-23,3,-19,-13,-3,-8,6,1,0,-6,-20,-20,-8,7;
MA   /M: SY='H'; M=-10,14,-15,8,-1,-20,-11,32,-24,-7,-24,-13,23,-18,1,-5,7,0,-23,-36,-6,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,9,-25,-1,-10,6,-16,15,-10,-5,-14,-10,18,-25,-5,-5,-6,-5,-20,-4,32,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,40,-35,-20,5,-26,10,-20,-11,1,-5,37,4,0,-10,-30,-26,-15,39;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-29,-9,2,-22,-20,0,-28,27,-20,-9,0,-18,15,59,-8,-7,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,16,-28,-16,18,-26,39,27,-27,-28,-18,-18,-27,-10,9,-16,4,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-22,-39,-30,75,-30,-19,-1,-29,8,-1,-21,-30,-38,-20,-21,-11,-2,17,32,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,40,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-13,-12,-6,-20,0,-12,-17,-6,-18,-13,-2,-12,-5,-7,17,4,-7,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-22,7,-30,-21,23,-27,41,21,-29,-29,-20,-20,-26,-9,17,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,14,-27,16,4,-31,12,-4,-31,-3,-27,-18,13,-14,4,-4,4,-9,-27,-29,-21,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-28,-19,22,-27,-9,8,-22,25,11,-22,-27,-19,-16,-23,-10,2,-9,14,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-18,-27,-21,2,-29,-24,22,-20,11,8,-21,-23,-21,-20,-10,1,26,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-18,-31,-26,-4,-28,-27,30,-22,10,12,-21,-22,-21,-23,-9,-3,31,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-12,-14,-11,-18,1,-19,-11,-12,-15,-11,-5,-13,-11,-17,15,8,0,-27,-19,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-27,14,22,-26,-16,-2,-26,10,-19,-15,7,-11,10,11,-1,-6,-23,-29,-16,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-16,-16,-20,-12,9,-23,2,-3,-10,0,6,-16,-23,-8,-11,-13,-9,-4,-5,21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-24,-29,-24,44,-29,-1,4,-19,9,5,-21,-29,-22,-15,-20,-10,-1,13,47,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-27,0,7,-15,-20,-3,-18,8,-14,-9,0,-15,5,13,-6,-7,-16,-22,-8,5;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-23,-7,-2,-18,-14,8,-20,8,-16,-8,3,-17,4,16,-2,-4,-16,-22,-5,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-24,-24,-29,-24,52,-27,-10,-2,-23,5,-2,-19,-28,-28,-17,-18,-10,-5,15,36,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00448;
//
ID   ZF_RING_1_MP; MATRIX.
AC   MP00518;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger RING-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.172; R2=0.014753; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=577; N_SCORE=7.337; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=520; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=0; E1=-10; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-5;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,119,10,0,-20,-30,10,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-21,-10,-4,-17,-14,-10,-11,-8,-14,-8,-6,4,-5,-10,0,-1,-10,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-24,-32,-25,-1,-32,-25,32,-22,16,15,-21,-23,-19,-21,-17,-7,25,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,119,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-19,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-17,-14,-9,-1,-19,-7,-7,-9,2,2,-11,-21,-8,-7,-12,-8,-7,-17,1,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-22,12,17,-24,-13,-3,-23,2,-20,-15,5,-11,6,-2,3,-2,-19,-29,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,-4,1,-16,-17,-8,-12,-2,-12,-8,-2,-5,-3,-3,-3,-2,-11,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-24,-21,-13,7,-24,-11,4,-15,6,7,-16,-13,-12,-13,-15,-9,-2,-12,6,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-22,-2,0,-17,-15,-8,-13,1,-13,-8,-2,-13,-2,-2,-1,-1,-9,-24,-9,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-24,8,6,-22,-12,-7,-18,-4,-17,-13,4,-5,-1,-6,1,-2,-16,-30,-15,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-21,-6,-1,-21,-11,-12,-16,-6,-18,-12,-5,9,-4,-9,0,-2,-14,-28,-17,-4;
MA   /I: II=-4; MI=0; MD=-10; IM=0; I=0,0,-20,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: M=-2,-6,-9,-8,-5,-4,-11,-8,-4,-3,-4,-2,-4,-7,-6,-3,-3,-1,-2,-13,-5,-6; D=-3;
MA   /I: DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-14,-16,-12,-4,-15,-14,3,-10,0,1,-13,-3,-11,-9,-8,-3,4,-14,-6,-12; D=-3;
MA   /I: DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-14,-19,-13,-9,-21,-14,1,-7,-3,1,-13,-19,-11,-5,-6,-2,7,-24,-8,-13; D=-3;
MA   /I: DM=-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-9,-22,-15,-5,-22,-17,3,-16,4,3,-16,-19,-12,-14,-11,-5,3,-21,-7,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-18,-16,-11,-6,-17,-15,-2,-14,4,1,-11,-15,-11,-12,-7,0,-2,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-3,-24,-1,3,-23,-13,-7,-20,-3,-21,-14,-2,14,-3,-6,-2,-3,-20,-30,-18,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,117,-29,-29,-20,-29,-30,-30,-30,-20,-20,-19,-39,-29,-30,-9,-10,-10,-50,-30,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-24,-7,-9,-21,22,-8,-26,-8,-20,-12,1,-19,-7,-7,-2,-12,-22,-22,-16,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,0,-1,-1,-18,-20,88,-28,-8,-19,-1,9,-20,9,1,-10,-18,-28,-28,19,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-11,-17,-15,-10,-10,-19,-15,-1,-8,-3,-1,-8,-17,-8,-7,0,5,3,-26,-10,-10;
MA   /I: I=-8; MI=-10; MD=-20; IM=-10; DM=-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-33,-26,42,-26,-16,7,-25,11,5,-20,-27,-28,-19,-17,-8,4,0,21,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-10,70,0,-10,-10,-10,40,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-23,-9,-3,-7,-19,-1,-13,-2,-9,-5,-5,-18,-2,2,-7,-5,-12,-14,2,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-23,-2,3,-18,-10,-2,-19,-1,-17,-10,1,-8,1,-3,2,-3,-16,-25,-11,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-20,-29,-23,3,-29,-22,22,-23,17,11,-20,-23,-19,-21,-16,-7,16,-16,1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-22,-3,0,-15,-17,-6,-13,0,-11,-7,-1,-15,-1,2,-3,-3,-10,-25,-8,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-24,-1,4,-22,-11,-5,-20,7,-19,-10,4,-11,5,6,2,-1,-16,-25,-13,4;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-24,-25,-26,-19,4,-23,-14,-3,-17,-3,-2,-21,-23,-14,-15,-20,-13,-8,34,13,-16;
MA   /I: II=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; I=0,0,-20,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: M=-3,-3,-12,-4,-3,-4,-7,-2,-7,-1,-6,-3,-2,-7,-2,0,-3,-3,-6,-9,-2,-3; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: M=-5,-6,-15,-8,-4,-5,-10,-6,-5,-5,-3,-2,-4,-13,-4,-4,-3,-2,-4,-15,-4,-4; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: M=-5,-4,-19,-5,-2,-12,-11,-5,-10,-4,-8,-5,-1,-12,-2,-3,-1,-1,-8,-23,-9,-2; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-19,0,0,-18,-6,-5,-17,1,-17,-10,5,-12,0,2,4,0,-13,-25,-12,0; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-21,-4,-2,-17,-4,-10,-15,-3,-13,-8,0,-11,-3,-3,1,-2,-11,-24,-13,-3; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-21,-3,-1,-15,-6,-5,-16,-2,-17,-10,4,-11,-3,-2,2,-2,-14,-24,-11,-3; D=-2;
MA   /I: DM=-11;
MA   /M: M=-6,-8,-24,-11,-8,-12,-15,-10,-9,-5,-11,-5,-4,-9,-5,-5,-5,-5,-8,-18,-8,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-20,-7,0,-16,-15,-8,-15,2,-15,-8,-1,-11,1,2,2,3,-11,-25,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-36,-11,-2,-26,-20,-19,-17,-9,-26,-17,-18,72,-10,-18,-8,-8,-25,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-19,-20,-12,-1,-23,-16,7,-14,7,5,-13,-20,-11,-13,-8,-1,7,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-10,80,30,0,-10,-10,30,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-28,-2,3,-23,-12,1,-28,21,-23,-11,6,-17,10,37,-4,-8,-22,-23,-10,4;
MA   /I: E1=0;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00449;
//
ID   HTH_ASNC_1_MP; MATRIX.
AC   MP00519;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AsnC-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8558059; R2=0.0169462; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=687; N_SCORE=17.488; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-21,-27,-20,2,-28,-22,15,-15,10,6,-17,-21,-17,-11,-11,1,14,-20,-3,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-15,-26,-17,-5,-12,-26,-11,1,2,2,7,-12,-19,0,12,-14,-9,-1,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-26,-8,-1,-24,-11,-1,-18,14,-19,-6,-1,-15,5,8,-6,-10,-13,-22,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,23,-28,42,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,12,-26,10,11,-24,-12,4,-27,14,-24,-16,16,-14,6,20,0,-6,-23,-29,-14,7;
MA   /M: SY='I'; M=0,-12,-22,-13,0,-11,-23,-17,7,-14,5,1,-13,-15,-8,-17,-7,-6,5,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-16,-5,5,-27,-15,1,-16,1,-18,-1,2,-13,27,3,8,1,-18,-27,-13,16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-28,3,16,-30,-9,0,-28,17,-23,-11,0,-10,15,13,-3,-11,-24,-23,-14,15;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,44,9,-29,-5,5,-29,0,-30,-25,41,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-7,-13,-11,-22,15,-17,-21,-13,-20,-15,-1,-15,-11,-18,11,-2,-11,-26,-23,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-26,-9,1,-19,-19,-3,-25,21,-18,-7,-1,-17,7,49,-4,-2,-16,-23,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-20,-22,-27,-18,-4,-28,-21,18,-15,15,13,-16,-19,-13,-16,-13,-1,11,-21,-4,-17;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-17,-7,-4,-18,-13,-17,-16,-10,-21,-16,-2,13,-7,-13,19,24,-10,-33,-18,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-11,-21,-16,-16,12,-22,-3,3,-16,7,3,-5,-26,-14,-12,-12,-5,-2,-10,18,-16;
MA   /M: SY='T'; M=4,-9,-18,-13,-4,-15,-17,-14,-9,-1,-7,-5,-7,-14,-2,2,2,8,-3,-25,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-28,21,48,-30,-17,0,-29,7,-21,-19,4,-3,17,-2,1,-9,-28,-30,-20,32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,8,-31,-21,26,-29,43,22,-28,-28,-19,-21,-28,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-12,-13,-8,-21,7,-17,-16,-11,-18,-14,-3,-11,-8,-17,18,4,-6,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,6,-30,11,23,-28,-19,-3,-31,27,-24,-15,2,-10,12,28,-6,-10,-24,-25,-14,16;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-27,-5,6,-22,-19,-8,-17,19,-17,-7,0,-13,7,17,-6,-7,-14,-23,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-14,-31,-26,10,-29,-25,23,-22,18,13,-27,-28,-26,-19,-15,-2,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-26,-2,-14,-27,48,-12,-33,-14,-29,-20,16,-20,-14,-15,3,-14,-29,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-27,-20,3,-28,-22,18,-25,28,12,-22,-24,-18,-19,-15,2,14,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-28,-8,5,-23,-18,-15,-17,1,-20,-13,-11,25,-4,-3,-4,-4,-15,-27,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-17,-6,-5,-20,0,-13,-18,-9,-20,-13,3,-8,-2,-10,16,18,-12,-29,-17,-4;
MA   /M: SY='P'; M=12,-10,-21,-13,-5,-21,-12,-17,-16,-6,-18,-14,-9,19,-7,-8,6,7,-12,-26,-20,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-25,50,-33,-30,-10,-33,-30,6,-28,-2,-2,-22,-32,-27,-28,-13,-8,13,-37,-17,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-14,-26,-16,-6,-11,-18,0,-15,-1,-8,-4,-10,-19,4,5,-10,-10,-15,-1,-1,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-23,-4,1,-20,-15,-5,-19,16,-19,-11,7,-17,2,25,-3,-4,-13,-26,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-17,-32,-27,1,-32,-28,32,-24,18,13,-26,-27,-25,-22,-14,-2,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-28,4,17,-27,-19,-5,-28,28,-24,-13,1,-10,12,25,-5,-6,-21,-24,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-25,-7,2,-22,-16,-8,-24,26,-20,-9,0,-15,5,30,-5,-7,-16,-22,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-26,5,28,-24,-21,-6,-23,15,-18,-13,-3,-8,10,13,-2,-3,-17,-27,-15,18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-28,17,29,-31,-16,-3,-29,16,-24,-16,3,-7,16,7,0,-8,-25,-28,-16,22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-22,-3,4,-16,-17,-10,-9,-6,2,-2,-8,-15,0,-8,-6,-6,-9,-26,-11,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-29,6,-34,-25,34,-24,15,13,-25,-26,-24,-23,-16,-6,33,-19,3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-26,-6,6,-21,-22,-10,-17,20,-15,-5,-3,-12,6,17,-5,1,-12,-23,-10,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-28,-7,-10,-29,39,-15,-34,-3,-28,-16,2,-17,-8,-7,-1,-15,-26,-21,-24,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-12,-25,-15,-13,19,-24,-1,-10,-5,-6,-5,-11,-23,-10,-1,-11,-4,-10,2,29,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-17,-15,-12,-11,-22,-12,-3,-2,-9,-4,-8,-18,-9,5,3,12,8,-28,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-14,-22,-14,-14,-12,-22,3,-14,-4,-4,-10,-13,-12,-20,6,7,8,-23,-14,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-23,-26,-21,-1,-30,-22,26,-22,21,15,-20,-23,-17,-20,-17,-7,19,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-30,-23,1,-31,-25,26,-25,24,13,-27,-15,-22,-22,-20,-7,21,-24,-6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,35,-23,41,10,-30,-5,0,-30,-3,-30,-25,27,-12,0,-8,12,0,-25,-40,-20,5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-35,-10,3,-25,-21,-13,-16,-8,-21,-14,-16,56,-6,-14,-10,-10,-23,-28,-23,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-26,8,15,-28,-16,-2,-25,17,-25,-13,3,-10,12,11,2,-5,-20,-28,-13,13;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-24,-9,0,-14,-17,-10,-20,21,-18,-8,-3,-14,2,12,-6,-8,-14,-17,-5,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,11,-32,-23,26,-29,37,18,-27,-28,-22,-22,-25,-9,18,-20,0,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00520;
//
ID   INTERLEUKIN_10_MP; MATRIX.
AC   MP00520;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukin-10 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0928645; R2=0.0181321; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=258; N_SCORE=10.761; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=23; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-30,34,20,-40,-15,5,-30,5,-25,-15,10,-10,31,0,0,-10,-30,-30,-15,25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-27,-8,2,-12,-22,-6,-3,-2,-8,-2,4,-16,8,-4,-7,-8,-11,-22,-7,4;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-8,-22,-10,-9,-11,-24,-17,-1,-7,3,1,-10,-10,-9,-9,-6,8,-1,-25,-8,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,34,-25,39,12,-30,-4,3,-31,-2,-29,-24,27,-13,1,-7,8,-4,-27,-38,-19,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-14,-23,-20,1,-22,-17,22,-15,8,8,-17,-18,-16,-16,-9,-3,23,-13,3,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-22,-2,-1,-19,-14,-4,-24,12,-21,-13,9,-16,3,31,6,7,-16,-28,-13,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-31,-23,3,-32,-23,28,-23,29,19,-25,-25,-19,-20,-23,-9,20,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-31,-24,-33,-23,8,-31,-23,21,-29,39,16,-29,-28,-20,-22,-29,-12,10,-5,3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-14,-24,-14,-8,-14,-7,-13,-10,-3,-1,-1,-9,-19,-4,1,-8,-8,-9,-23,-11,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,8,-13,8,1,-13,-10,-6,-14,3,-12,-10,5,-7,-2,2,5,12,-9,-19,-8,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-25,-1,9,-21,-5,-10,-19,-1,-12,-9,-5,-4,3,-5,-3,-4,-18,-23,-15,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-23,5,22,-26,-14,-6,-25,13,-24,-15,3,-7,12,5,10,4,-19,-30,-16,17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-17,-15,-20,-17,-1,-23,-19,10,-20,17,6,-14,-24,-17,-16,-7,5,12,-28,-8,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-19,-26,-17,17,-26,-17,11,-20,32,12,-23,-26,-19,-14,-24,-9,5,-13,4,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,2,-27,4,20,-27,-18,7,-25,18,-20,-9,1,-10,23,21,-4,-10,-24,-22,-10,20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-24,23,7,-28,3,-3,-25,-4,-23,-17,15,-12,2,-8,3,-7,-22,-30,-18,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-17,-33,-28,21,-31,-26,23,-25,15,9,-24,-27,-28,-21,-15,-3,26,-17,3,-28;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-21,0,6,-24,-12,-9,-24,28,-27,-12,3,-9,6,15,6,0,-15,-24,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-24,-2,-7,-24,16,-14,-23,-11,-22,-13,-3,6,-9,-15,4,-7,-19,-25,-22,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-15,-9,-19,-15,-3,-13,-7,-8,-9,-3,0,-14,-22,-10,-12,-8,-7,-6,-10,11,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,7,-28,14,11,-18,-19,-8,-18,-4,-5,-11,-3,-16,-2,-8,-12,-11,-18,-14,-9,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-24,-8,-9,-23,16,-11,-23,-5,-22,-12,3,-19,-4,3,3,-7,-15,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-11,9,-13,-6,-12,-24,1,-16,-8,-15,-7,-10,-23,11,-8,-5,-7,-17,-14,11,1;
MA   /M: SY='L'; M=7,-24,-16,-29,-20,10,-21,-20,10,-22,20,10,-22,-24,-20,-19,-14,-6,12,-17,-3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-18,-24,-15,-2,-23,-13,11,-17,22,21,-19,-22,-7,-14,-14,-1,7,-22,-4,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-24,8,9,-25,-12,10,-27,11,-27,-15,10,-12,6,11,7,-2,-21,-31,-11,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-28,4,18,-24,-16,11,-23,1,-21,-12,6,-12,19,-1,1,-6,-27,-14,-8,18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-30,-22,6,-27,-16,22,-23,35,29,-27,-27,-16,-17,-24,-8,16,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-23,7,-33,-23,29,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-24,0,8,-25,-14,-2,-23,15,-23,-11,10,-13,15,19,3,-1,-21,-26,-14,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-21,-37,-27,67,-29,-18,-2,-25,10,0,-19,-29,-34,-12,-20,-10,-1,6,25,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-26,-20,-19,28,-28,10,-2,-12,-1,-2,-17,-27,-13,-11,-14,0,-8,19,61,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-19,6,-28,-17,17,-23,40,21,-27,-28,-17,-13,-27,-9,10,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-28,27,34,-30,-17,-2,-27,9,-22,-19,8,-7,9,-1,-1,-9,-23,-32,-18,21;
MA   /M: SY='E'; M=-14,11,-27,16,17,-25,-19,-5,-23,6,-18,-15,3,-11,4,11,-2,-2,-18,-29,-14,9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-20,-36,-26,47,-27,-14,9,-24,19,20,-22,-27,-26,-17,-22,-10,4,-3,17,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-32,-10,-1,-20,-14,-15,-20,6,-19,-10,-11,22,-2,-2,-11,-11,-21,-22,-15,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,8,-27,7,5,-28,-14,-3,-20,3,-23,-13,9,2,11,2,-1,-7,-21,-29,-17,7;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-11,-24,-14,-8,-9,-10,11,-12,-9,-7,-3,-9,-19,2,-10,-6,-9,-13,-8,13,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-27,12,25,-31,-16,16,-26,3,-23,-11,5,-9,27,1,5,-7,-27,-29,-11,25;
MA   /M: SY='B'; M=-9,15,-22,15,12,-22,-13,5,-22,-2,-18,-15,15,-13,2,-5,5,2,-20,-34,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-29,-3,1,-23,-19,12,-22,8,-21,-9,0,1,6,18,-8,-10,-19,-26,-9,0;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-1,-24,-1,-7,-3,1,-10,-17,-14,-15,-13,1,-18,-13,-14,0,-5,-15,-18,-3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-16,-13,-4,-20,-22,-3,-13,-10,-11,-6,-14,14,-3,-9,-10,-10,-13,-28,-14,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,5,-21,11,10,-21,-3,-7,-20,1,-18,-14,0,10,0,-5,-2,-7,-18,-19,-15,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-16,-21,-17,12,-22,-10,16,-16,11,7,-15,-18,-14,-14,-13,-5,12,-4,14,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-28,-6,5,-20,-21,2,-20,28,-18,2,-4,-14,8,21,-11,-11,-16,-18,-2,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-21,-4,10,-20,-22,-11,-9,1,-12,-6,-4,-11,7,-3,2,8,-6,-27,-12,8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-10,-21,-9,-4,-6,-22,11,0,-15,13,6,-10,-18,-6,-11,-16,-11,-4,-21,1,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-16,-1,10,-6,-13,-4,-14,12,-11,-7,-2,-7,3,10,-5,-6,-11,-10,-4,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,20,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00450;
//
ID   P5CR_MP; MATRIX.
AC   MP00521;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7318225; R2=0.0161637; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=248; N_SCORE=9.730; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-9,-27,-12,-1,-23,-8,1,-13,4,-10,13,-6,-16,22,12,-8,-11,-16,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=6,-5,-12,-12,-9,-12,-13,-9,-7,-10,-9,-1,-3,-12,-6,-11,14,23,0,-28,-10,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-17,-24,-20,7,-20,-17,10,-20,17,14,-20,-24,-18,-17,-13,-6,12,-20,-3,-18;
MA   /M: SY='L'; M=0,-13,-20,-16,-6,-7,-20,-14,2,-9,12,6,-13,-20,-9,-9,-12,-7,2,-24,-9,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-28,-7,-13,-27,53,-16,-35,-17,-27,-19,3,-19,-15,-17,3,-15,-27,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-12,-18,-12,-9,-7,-18,-7,-12,-8,-5,-8,-13,-12,-16,10,10,1,-22,-13,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-13,-16,-9,-20,5,-19,-13,-11,-12,-11,-7,-12,-11,-18,8,-1,-3,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-25,-2,3,-21,-14,-8,-22,17,-22,-11,-2,-8,4,10,0,-1,-17,-21,-7,2;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-21,-29,-21,1,-18,-10,18,-18,26,39,-22,-23,-9,-15,-22,-11,9,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-18,-27,-20,1,-20,-22,15,-22,20,11,-24,-26,-21,-19,-16,-7,18,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-11,-22,-10,2,-12,-22,-13,-4,-3,7,2,-13,-17,-3,-6,-11,-5,-4,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-26,6,23,-26,-18,1,-22,8,-18,-11,0,-9,16,5,1,-4,-21,-28,-13,19;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,6,-16,5,6,-15,-10,-8,-16,-3,-18,-14,8,-11,-2,-6,12,10,-10,-30,-14,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-28,-2,-2,-24,17,-14,-22,-12,-17,-13,-4,-3,-8,-15,-4,-12,-20,-23,-21,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-6,-24,-4,7,-15,-21,-3,-10,6,-10,-3,-8,-15,8,2,-7,-7,-8,-16,1,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-2,-26,-3,3,-19,-19,39,-21,-6,-16,-6,4,-11,6,0,-1,-4,-20,-29,1,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-34,-12,-1,-23,-19,-19,-16,-11,-21,-16,-19,63,-10,-19,-9,-9,-23,-27,-25,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=13,0,-18,0,3,-25,7,-13,-24,-8,-23,-18,1,-5,-5,-14,11,-2,-17,-29,-23,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-5,-23,-7,10,-21,-19,-6,-9,1,-9,1,-6,-11,14,-2,-1,-1,-10,-24,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,8,-31,-22,24,-30,45,20,-29,-29,-20,-21,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-30,-11,-1,-21,-24,-8,-15,25,-16,-4,-4,-16,8,35,-11,-10,-12,-20,-8,1;
MA   /M: SY='D'; M=-5,22,-26,27,22,-30,-11,1,-29,4,-23,-20,13,-9,5,-2,2,-8,-24,-32,-18,13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,11,-26,8,8,-26,-10,-2,-23,13,-22,-9,12,-13,9,9,-1,-5,-21,-27,-14,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='C'; M=5,-7,29,-16,-15,-16,-18,-22,-17,-16,-16,-14,-6,-19,-15,-17,12,21,-4,-36,-19,-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-10,-5,-5,-16,-7,-14,-14,-11,-22,-15,5,-11,-5,-11,32,27,-4,-37,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-37,-8,2,-30,-20,-17,-22,5,-30,-17,-15,63,-5,-7,-10,-10,-27,-27,-25,-5;
MA   /M: SY='G'; M=5,-2,-26,-6,-14,-27,43,-15,-32,-11,-27,-18,7,-18,-14,-14,2,-13,-25,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,0,-16,-14,-11,-20,-22,-5,-14,-8,-8,-6,-15,-13,-15,12,30,4,-30,-13,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=5,-19,-25,-25,-14,-12,-21,-22,18,-18,4,6,-14,-16,-9,-21,-8,-8,11,-21,-9,-14;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-21,-4,12,-24,-7,-1,-21,1,-17,-12,-3,-9,3,-5,4,-5,-15,-25,-15,7;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-23,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,28,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-20,-3,0,-21,-18,11,-22,8,-14,-6,-1,-18,6,18,-6,-9,-17,-26,-6,1;
MA   /M: SY='V'; M=11,-14,-15,-15,-5,-9,-18,-18,1,-11,-5,-4,-15,-17,-12,-15,1,1,12,-25,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,19,-30,-19,17,-29,44,19,-28,-30,-22,-20,-28,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-29,23,46,-31,-17,1,-30,9,-22,-19,7,-4,19,1,0,-9,-30,-31,-19,33;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-25,9,21,-28,-14,-6,-27,17,-24,-16,2,-8,10,9,3,-5,-21,-27,-16,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-24,-3,-3,-25,11,-3,-27,5,-24,-11,5,-15,3,6,2,-8,-22,-23,-16,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-12,-29,42,-11,-34,-11,-28,-17,-1,-10,-9,-11,-1,-16,-28,-21,-24,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-28,-18,-34,-27,30,-26,-24,14,-26,14,6,-23,-27,-29,-21,-16,-7,16,-11,7,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-29,-4,7,-24,-15,0,-29,23,-22,-11,3,-16,14,47,-5,-9,-22,-23,-12,7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-23,-1,-2,-19,6,-4,-21,-8,-18,-9,-1,-15,-2,-9,4,-6,-16,-21,-8,-3;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-15,-22,-15,-9,-12,-20,2,-16,5,2,-13,-16,-13,-18,0,6,6,-22,-12,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-30,-18,-35,-29,21,-32,-26,26,-26,17,11,-25,-28,-29,-22,-17,-6,28,-16,4,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-10,-25,-14,-8,-10,-23,-4,8,-13,0,9,-10,-16,-4,-15,-9,-8,1,-19,1,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,6,-27,4,15,-26,-15,8,-25,13,-22,-11,11,-13,16,18,-1,-8,-24,-26,-12,14;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-2,-21,-14,-20,2,-21,-12,-13,-11,-10,-11,-15,-14,-21,6,-3,0,-23,-21,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-6,-32,-27,3,-29,-24,23,-21,12,16,-24,-27,-23,-21,-14,-5,28,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-27,1,17,-27,-20,7,-18,7,-17,-7,2,-12,23,9,-2,-7,-19,-26,-11,19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-2,-18,-7,6,-23,-7,-7,-18,1,-16,-12,-1,-10,2,-4,5,-4,-12,-24,-17,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00451;
//
ID   DNA_POLYMERASE_X_MP; MATRIX.
AC   MP00522;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA polymerase family X signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9746437; R2=0.0153222; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=347; N_SCORE=10.281; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='B'; M=-10,17,-26,17,13,-26,-14,-4,-23,14,-25,-16,16,-12,4,5,1,-5,-20,-31,-16,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-19,-7,8,-23,-12,-12,-13,-2,-14,-10,-4,-9,6,-9,7,2,-9,-25,-16,6;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-14,-28,-23,3,-24,-24,17,-21,18,8,-25,-26,-23,-20,-12,-4,25,-23,-7,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-13,-25,-14,-11,-14,-18,-1,-11,-6,-14,-6,-9,-22,-2,-2,-14,-14,-11,5,-1,-7;
MA   /M: SY='K'; M=4,-5,-22,-9,-4,-21,-5,-14,-18,7,-20,-11,-1,-13,-1,-1,3,1,-13,-16,-13,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-23,-35,-26,27,-31,-23,18,-22,11,7,-19,-25,-25,-15,-17,-8,14,-10,8,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-20,12,-3,-14,-14,-6,-7,-10,1,-2,2,-17,-7,-11,-8,-7,-7,-27,-10,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-35,-11,-2,-24,-19,-19,-15,-12,-21,-15,-18,67,-10,-19,-7,-7,-24,-30,-26,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-28,36,21,-34,2,-5,-35,-2,-28,-25,10,-9,2,-9,5,-8,-28,-34,-22,11;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-5,-20,-14,-9,-9,-14,-10,-10,-2,-5,-14,-21,-13,-14,-7,-7,-6,-16,-3,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-15,-24,-21,-12,-3,-28,-16,16,-18,12,8,-9,-20,-7,-16,-13,-6,6,-22,-4,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-1,-31,-27,-5,-25,-28,21,-24,7,6,-23,-26,-24,-24,-11,-5,27,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-15,-13,-6,-12,-23,-18,1,-10,-5,-3,-9,-14,-6,-11,6,20,8,-28,-11,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=5,-24,-19,-30,-21,-1,-24,-21,20,-23,24,16,-23,-23,-17,-21,-16,-7,15,-21,-6,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-13,32,-20,-18,-14,-25,-22,-10,-17,-10,-8,-13,-24,-13,-17,2,13,4,-36,-17,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-19,-4,-9,-24,31,-14,-29,-14,-30,-20,6,-14,-9,-14,22,2,-19,-31,-24,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-33,-26,57,-30,-8,2,-24,11,2,-21,-30,-28,-17,-21,-10,-2,13,42,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-5,-29,-7,0,-20,-18,1,-29,27,-21,-11,6,-20,9,63,-8,-9,-21,-22,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-11,-30,60,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-15,-18,0,-19,-30,-21,-29,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-1,-27,-2,9,-22,-17,-6,-24,29,-23,-10,-1,-11,6,14,-6,-8,-18,-17,-3,7;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-26,-2,13,-23,-18,-10,-19,16,-18,-7,-5,-1,5,5,-3,-6,-15,-26,-14,9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-18,-15,-10,-8,-20,-12,-2,-2,-7,4,-7,-16,-4,-5,3,11,1,-23,-4,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,9,-15,-18,-21,21,-20,-27,-21,-19,-15,-6,-23,-18,-20,3,-8,-17,-31,-24,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-1,-27,-4,-10,-24,24,26,-31,-13,-25,-12,9,-19,-6,-11,-1,-16,-27,-26,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-33,-29,0,-32,-27,34,-22,14,17,-26,-26,-24,-22,-14,-4,41,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-19,-34,-27,23,-30,-21,22,-25,22,18,-25,-27,-25,-20,-20,-8,20,-15,5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-36,-26,11,-35,-24,34,-29,28,21,-23,-24,-21,-25,-23,-10,20,-17,3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-15,-16,-14,3,-22,-17,-2,-14,-6,-6,-5,-15,-13,-13,10,30,2,-21,1,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-7,-16,-8,-5,-19,-18,29,-18,-6,-19,-4,-2,-9,-1,-5,-1,-7,-13,-32,-3,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-35,-10,-1,-28,-17,-19,-19,-10,-29,-19,-17,75,-9,-19,-4,-7,-26,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,6,-28,11,10,-17,-7,2,-27,1,-21,-15,3,-13,-1,-1,-3,-11,-22,-25,-10,4;
MA   /M: M=-4,-11,-8,-16,-8,-7,-10,-15,-15,-4,-13,-4,-8,-18,-7,-8,-3,-3,-10,-21,-9,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-24,-3,-2,-22,0,0,-26,7,-23,-12,7,-15,-1,10,1,1,-20,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-20,6,9,-22,-13,-9,-20,3,-18,-13,2,-11,4,-2,11,5,-14,-31,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-23,12,16,-22,-18,6,-21,-4,-13,-12,2,-11,5,-6,2,3,-18,-31,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-24,3,13,-26,-16,-8,-25,20,-24,-13,2,-9,10,14,4,1,-18,-26,-14,11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-5,2,-23,3,11,-22,5,15,-25,-5,-19,-12,5,-11,2,-6,0,-9,-23,-24,-11,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-12,-17,-12,-2,-7,-20,-12,5,-3,6,4,-12,-13,-4,-5,-11,-6,4,-16,-5,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-13,-16,-9,6,-17,-9,5,-12,13,6,-13,-16,-4,-8,-11,-5,3,-10,1,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=1,-1,-18,4,1,-19,-7,-9,-15,-5,-18,-13,-3,24,-4,-11,3,-2,-14,-21,-16,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-14,-2,3,-18,-14,-4,-14,11,-16,-7,3,-8,7,10,-3,-5,-11,-20,-10,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-31,-22,6,-31,-20,27,-27,37,22,-25,-25,-18,-21,-25,-10,15,-19,0,-21; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-15,-22,-15,7,-22,-15,15,-22,37,15,-22,-22,-15,-15,-22,-7,7,-15,0,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-1,-16,0,1,-12,-10,43,-15,-4,-11,-1,4,-7,8,0,-5,-10,-16,-15,7,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-10,-12,-8,-5,-11,-11,6,-8,2,7,-11,-13,-9,-9,-4,0,12,-17,-7,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-9,-20,-11,0,-9,-18,-6,1,3,0,9,-8,-12,1,6,-10,-7,-2,-16,-5,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-12,2,-14,1,-7,-9,-20,-13,-10,-10,-9,-9,0,-18,-10,-5,-2,1,-7,-28,-9,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00452;
//
ID   SULFATASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00523;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sulfatases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9394960; R2=0.0170494; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=327; N_SCORE=11.505; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-16,-13,0,-22,-6,-15,-16,3,-14,-11,-7,-10,-3,-3,5,-3,-7,-21,-18,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-31,-22,5,-29,-17,25,-24,35,30,-26,-26,-15,-19,-25,-9,15,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-16,-16,-5,-20,-2,-15,-14,-2,-12,-7,-8,-12,-5,-5,4,-4,-6,-21,-18,-6;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-22,2,8,-19,-13,-3,-17,0,-17,-12,1,-12,2,-2,4,-3,-14,-24,-7,4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-29,1,15,-28,-4,0,-26,4,-21,-10,-2,-3,12,5,-3,-12,-25,-25,-17,12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,60,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,6,-14,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-16,-28,-22,-1,-24,-20,19,-20,20,18,-23,-24,-18,-19,-14,-3,21,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-27,-8,6,-17,-23,-5,-17,14,-9,-6,-5,-16,4,27,-9,-6,-13,-23,-9,3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-26,49,-29,-19,9,-29,26,11,-24,-29,-30,-19,-24,-10,4,-3,17,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-4,-1,-17,-17,-6,-15,-3,-16,-11,2,-10,0,-1,12,20,-9,-30,-11,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,21,-22,16,7,-27,-7,8,-23,0,-27,-15,28,-14,15,-1,12,0,-26,-35,-16,11;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-11,-22,-17,-15,3,-2,4,-14,-14,-10,-8,-6,-20,-13,-14,-4,-9,-12,-7,11,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-27,-24,-21,34,-30,13,2,-17,4,2,-18,-29,-16,-13,-20,-11,-6,15,55,-21;
MA   /M: SY='T'; M=8,-13,-11,-18,-16,-9,-18,-22,4,-14,-6,-4,-11,-18,-16,-15,10,18,17,-30,-13,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=11,-5,-8,-9,-6,-15,-3,-13,-12,-8,-13,-10,-4,-1,-5,-11,9,10,-7,-21,-14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-16,-2,-1,-22,-12,-5,-15,-6,-17,-10,2,-12,6,-8,14,12,-9,-30,-13,2;
MA   /M: SY='P'; M=3,-13,-28,-9,-2,-26,-8,-18,-20,-11,-27,-19,-10,47,-8,-18,5,-2,-21,-31,-26,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-16,-26,-21,0,-26,-20,19,-21,18,16,-21,-24,-17,-18,-11,1,20,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,98,-25,-25,-20,-25,-27,-28,-27,-22,-20,-15,-35,-25,-27,-1,-5,-10,-48,-28,-25;
MA   /M: SY='C'; M=8,-7,24,-15,-13,-18,-10,-20,-19,-16,-19,-16,-5,-19,-13,-17,14,15,-7,-36,-20,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-5,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-24,-17,5,-10,-3,-12,32,19,-7,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-10,-12,-7,-18,-3,-16,-12,-10,-17,-13,-2,-11,-7,-15,22,12,-2,-29,-19,-7;
MA   /M: SY='S'; M=15,-2,-14,-8,-5,-19,-3,-10,-13,-8,-17,-7,4,-12,0,-11,16,9,-8,-29,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-23,-35,-25,24,-33,-22,24,-29,31,16,-24,-27,-24,-23,-24,-10,13,-13,7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,10,-28,-18,19,-26,38,24,-28,-28,-18,-19,-27,-11,10,-12,2,-19;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-12,-11,-9,-11,-19,-18,-12,-7,-11,-10,-1,-11,-8,-4,17,42,-2,-29,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-27,-8,2,-21,-20,-2,-18,17,-13,-2,0,-17,15,31,-8,-7,-16,-22,-9,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-26,-17,-14,15,-25,2,-3,-12,4,-1,-16,-21,-10,-9,-15,-8,-8,3,35,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-27,-9,-3,-24,-13,-10,-14,-9,-22,-12,-9,29,-3,-14,0,-5,-15,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-9,-24,-12,-10,-14,-23,22,1,-15,-5,3,-3,-20,-3,-12,-7,-10,-1,-28,1,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,6,-26,-1,1,-21,-16,16,-22,9,-20,-9,17,-18,11,26,-2,-6,-22,-27,-8,3;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-17,-9,-8,-9,-15,8,-12,-12,-11,-6,5,-16,-6,-10,8,12,-9,-28,-5,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-28,-6,-13,-25,39,-2,-33,-11,-26,-14,8,-20,-11,-6,-1,-16,-27,-24,-21,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-26,-18,-30,-24,9,-28,-20,21,-20,16,21,-24,-21,-20,-18,-15,-3,23,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-24,-19,-17,8,-16,-1,-4,-14,-3,-2,-15,-24,-10,-12,-10,-3,-5,2,23,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-5,6,-20,5,-4,-21,1,1,-22,-10,-21,-12,7,-11,-5,-10,11,8,-16,-32,-14,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,5,-21,-2,-4,-11,-10,-3,-10,-8,-15,-6,14,-12,-4,-8,2,-2,-13,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-3,-22,-10,-10,-10,-11,-9,-6,-13,-9,-8,4,-12,-10,-13,-2,0,-9,-18,-10,-11;
MA   /M: M=-3,-6,-26,-6,-1,-18,-11,-11,-11,-5,-10,-5,-6,-12,-1,-4,-6,-9,-11,-16,-12,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-5,-25,-7,-3,-9,-18,-2,-9,-5,-11,-8,-3,-10,-6,-5,-6,-5,-10,-13,4,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00117;
//
ID   SMB_1_MP; MATRIX.
AC   MP00524;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Somatomedin B domain (SMB) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0712152; R2=0.0065106; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=568; N_SCORE=7.766; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=374; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-4,-30,-4,11,-31,-20,6,-24,19,-20,-4,0,-14,38,36,-4,-10,-26,-20,-10,23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-30,-2,2,-30,45,-15,-37,-12,-27,-20,0,-15,-9,-15,0,-17,-30,-23,-27,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-9,30,-12,-10,-20,-14,-15,-25,-9,-25,-18,-2,-22,-8,-1,13,4,-12,-39,-21,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-5,5,45,-4,-13,-21,-17,-15,-25,-16,-22,-19,7,-26,-16,-18,1,-1,-15,-42,-24,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-21,-1,7,-22,-13,-6,-20,24,-20,-7,1,-9,11,14,0,-4,-15,-19,-9,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-13,3,-26,7,-9,-2,8,-12,-23,-16,-13,-12,-1,-20,-17,-16,-8,-13,-18,-19,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-5,-30,-3,0,-23,-9,-2,-32,22,-22,-13,2,-19,6,53,-8,-11,-22,-22,-13,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-12,-23,-16,-18,-5,18,-17,-19,-18,-11,-10,-6,-20,-18,-16,-1,2,-14,-15,-6,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-29,13,41,-30,-17,-3,-26,5,-20,-17,-2,5,17,-3,0,-9,-27,-28,-20,29;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=0,-9,-17,-13,-12,-2,-2,-12,-11,-7,-12,-8,-5,-17,-12,-9,1,1,-5,-15,-2,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-19,-22,-22,-14,25,-23,-6,-9,-4,1,-2,-12,-23,-13,14,-15,-9,-7,-2,16,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,1,-17,-1,0,-10,-13,-7,-3,-9,4,0,1,-14,-5,-10,-7,-5,-6,-22,-9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=6,-4,-19,-4,11,-20,-13,-8,-16,5,-12,-9,-4,-10,5,3,2,-2,-11,-23,-14,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-25,16,6,-27,4,3,-30,-2,-25,-18,11,-14,-1,-1,3,-7,-24,-30,-17,2;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-21,-10,-6,-14,-2,2,-22,0,-19,-11,2,-16,-4,5,2,-6,-15,-22,-10,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-24,-17,-3,-11,-24,-15,2,-6,9,4,-16,-13,-4,-8,-14,-8,0,-22,-9,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-6,1,-23,2,1,-15,-14,20,-19,-6,-20,-10,3,-16,9,-5,8,-2,-18,-20,9,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-3,25,-22,31,8,-29,-7,8,-29,-5,-26,-21,16,-12,0,-9,9,-3,-22,-36,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-27,16,18,-27,-15,-8,-24,2,-18,-16,-1,2,2,-6,-2,-7,-20,-30,-18,9;
MA   /M: SY='D'; M=-15,6,-24,9,-1,-3,-20,-8,-16,-8,-5,-9,-2,-18,-5,-5,-7,-3,-13,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-21,-1,3,-18,-16,-8,-14,2,-9,-7,2,-15,3,-1,2,0,-13,-28,-12,3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-27,-5,3,-19,-8,-1,-22,6,-18,-10,-3,-15,10,11,-2,-7,-20,-15,-1,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-26,-13,-4,4,-25,7,-12,0,-4,-3,-10,-21,-4,9,-12,-6,-12,-7,19,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-26,1,-5,-28,18,-8,-26,-1,-25,-13,10,-17,1,-4,0,-11,-22,-26,-20,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-24,39,11,-31,-10,-4,-31,2,-28,-23,18,-11,0,-5,8,2,-22,-37,-18,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=6,-12,-23,-14,-4,-18,-18,-19,-7,-7,-11,-8,-11,13,-8,-13,-1,5,-7,-25,-16,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-26,-3,7,-20,-18,-9,-18,10,-16,-7,-6,-13,7,5,-4,-6,-15,-10,-9,7;
MA   /M: SY='S'; M=7,6,-15,9,2,-22,-6,-11,-18,-8,-22,-17,5,-11,-4,-12,20,9,-8,-35,-19,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-19,-26,-16,26,-28,-17,8,-19,8,3,-21,-26,-22,-16,-14,-7,13,-11,9,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-7,-25,-7,6,-22,-19,-6,-16,11,-9,-3,-6,-15,15,12,-6,-7,-15,-22,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-32,11,17,-31,13,-10,-33,-5,-26,-21,-1,6,-1,-11,-2,-14,-30,-28,-25,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-26,-3,17,-22,-24,0,-8,1,-11,-4,-7,-12,11,-3,-6,-9,-7,-27,-10,13;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-10,-22,-9,-1,-16,-20,-5,-9,1,-10,-5,-9,-7,-5,-3,-3,-1,-3,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-4,-23,-4,-2,-20,-10,-3,-17,-9,-22,-14,1,13,-6,-12,7,5,-15,-32,-17,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-37,-22,-15,-5,-17,-17,-20,-8,-22,-17,-20,-8,-9,-3,-14,-13,-23,55,8,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-20,-17,-17,-6,-8,-11,-5,-17,-8,-5,-12,-10,-18,-16,-2,0,3,-26,-10,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-27,19,12,-30,-3,-9,-29,-5,-27,-22,3,10,-2,-12,7,-2,-24,-33,-23,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-25,5,12,-23,-17,-5,-18,-3,-20,-15,-4,7,0,-6,4,-3,-13,-32,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-5,0,-22,-2,-8,-4,-17,-12,-8,-12,-9,-4,-2,-7,-11,-15,-1,2,-7,-24,-7,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-11,29,-18,-12,-19,-20,-15,-16,-11,-12,-4,-10,-22,-4,-13,-1,1,-8,-33,-17,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-27,-4,5,-24,0,-11,-16,-5,-16,-6,-5,-1,0,-11,-2,-9,-16,-26,-18,1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-10,-13,-10,-5,-18,-8,-18,-22,-9,-22,-17,-8,1,-9,-13,3,5,-18,-11,-15,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-7,-24,-9,0,-16,-19,-11,-4,4,-10,0,-6,-13,-1,-4,-3,-5,-4,-22,-6,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00453;
//
ID   RIBOSOMAL_L6_1_MP; MATRIX.
AC   MP00525;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L6 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3983445; R2=0.0126820; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=530; N_SCORE=11.110; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-25,-1,15,-29,-20,1,-12,4,-15,-3,0,-13,32,2,-1,-7,-15,-25,-12,24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-1,12,-22,-22,-7,-19,18,-12,-6,-5,-14,9,19,-10,-9,-14,-23,-11,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-24,-16,-20,-6,34,-20,-27,-20,-19,-14,-4,-20,-22,-18,0,-4,-19,-16,-15,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,12,-27,9,24,-33,-15,8,-22,7,-23,-9,15,-10,36,5,3,-7,-30,-27,-15,30;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-15,-33,-29,32,-30,-25,16,-24,9,5,-23,-28,-32,-20,-13,-1,25,-13,7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-12,-21,-11,-16,-4,-16,-5,-10,-6,2,-11,-12,-8,-18,6,-1,1,-21,-16,-9;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-12,-15,-7,-20,-2,-7,-14,-10,-15,-11,-5,-11,-6,-16,14,2,-5,-25,-16,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-24,13,7,-24,-12,-1,-17,5,-23,-14,24,-14,6,0,4,-4,-20,-32,-16,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,41,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=5,1,-19,-5,-2,-21,-8,-6,-21,8,-22,-14,10,-15,1,18,8,0,-15,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-25,-2,-28,-24,13,-29,-19,10,-23,14,5,-24,-29,-24,-19,-15,-2,15,-17,7,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-11,-33,-8,2,-26,-21,-13,-22,18,-22,-11,-10,26,0,12,-12,-10,-21,-24,-17,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-32,-7,0,-27,-15,-17,-20,-10,-30,-20,-12,65,-7,-17,3,-2,-25,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,23,-26,29,35,-29,-12,1,-29,4,-25,-22,16,-7,10,-3,5,-5,-28,-35,-20,22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-24,-26,-22,-14,-1,-23,-23,-2,-16,-10,-7,-22,28,-21,-20,-10,-7,-1,-22,-13,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,7,-27,-20,2,-27,27,-21,-7,0,-16,25,47,-7,-10,-23,-20,-10,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,13,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='K'; M=3,1,-22,1,8,-24,-14,-10,-21,12,-19,-12,-1,-11,5,8,3,0,-13,-25,-15,6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,19,-24,11,-6,-20,15,-1,-25,-7,-26,-19,28,-19,-7,-8,4,-4,-26,-28,-14,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-30,-20,-2,-30,17,-22,-18,0,-2,18,6,-2,-10,-28,-28,-18,34;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-21,-24,-16,6,-26,-17,7,-10,0,3,-15,-21,-11,-8,-9,-2,9,-15,2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-22,-32,-26,-1,-34,-28,34,-25,14,13,-18,-20,-20,-24,-11,3,27,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-11,-4,-18,-22,3,-16,20,-15,0,-6,-19,2,29,-11,-9,-7,-23,-6,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-15,-23,-16,-8,-9,-24,-12,-8,5,3,0,-11,-21,-5,21,-11,0,-3,-22,-7,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-11,-18,-10,3,-16,-21,-16,-1,-7,-7,-4,-14,-11,-3,-11,-1,0,7,-28,-15,0;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=5,-3,-20,-6,1,-23,-13,-12,-22,18,-23,-12,0,-11,2,13,7,5,-12,-25,-14,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00454;
//
ID   RIBOSOMAL_L19E_MP; MATRIX.
AC   MP00526;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L19e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5863490; R2=0.0131042; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=669; N_SCORE=13.343; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=147; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-36,-26,0,-32,-18,38,-22,20,37,-20,-20,-12,-22,-20,-10,22,-20,0,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-31,-22,0,-22,-5,23,-12,19,53,-21,-21,-4,-12,-19,-9,14,-21,-1,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=0,-9,-16,-14,-11,-11,-14,-11,-1,-8,-6,9,-6,-7,-6,-10,3,7,2,-27,-11,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,28,-22,30,11,-26,-8,-1,-25,-2,-25,-19,23,-12,1,-7,10,3,-22,-37,-18,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-30,-22,16,-30,-19,18,-27,37,15,-28,-30,-23,-19,-25,-8,14,-16,7,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-23,-3,5,-25,-14,-7,-25,22,-26,-12,3,-12,10,23,7,2,-17,-26,-13,6;
MA   /M: SY='L'; M=3,-20,-16,-26,-18,3,-22,-19,10,-20,18,11,-19,-21,-17,-18,-10,3,10,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-22,7,-31,-20,25,-28,42,23,-28,-28,-19,-21,-27,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=4,12,-19,18,18,-27,-7,-7,-26,-3,-25,-21,7,-8,4,-9,18,4,-18,-35,-20,11;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-34,-29,1,-34,-29,38,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-18,-28,-19,3,-24,-20,15,-25,35,15,-26,-26,-18,-20,-21,-8,10,-21,-4,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-30,7,1,-31,10,-11,-35,18,-29,-16,3,-14,-1,11,-5,-13,-25,-23,-18,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-24,62,-30,-30,-11,-30,-30,-3,-26,-7,-7,-24,-36,-30,-26,-10,-6,17,-41,-21,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-28,-9,8,-17,-27,-14,-2,9,-6,-1,-9,-13,0,0,-12,-10,-4,-23,-9,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,22,-24,15,6,-24,-2,7,-26,5,-28,-18,31,-16,2,6,5,-4,-27,-34,-17,3;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-29,-5,2,-22,-18,-1,-29,32,-23,-11,5,-18,9,55,-8,-9,-21,-22,-11,2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-32,-46,-32,-22,2,-20,-26,-22,-7,-22,-18,-32,-26,-14,-11,-34,-26,-28,118,22,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-36,-27,21,-33,-25,27,-28,24,14,-24,-27,-26,-23,-21,-8,22,-15,5,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-27,53,12,-33,-11,-2,-30,-2,-26,-25,20,-13,-3,-10,0,-8,-22,-39,-19,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-39,-7,6,-30,-20,-18,-21,-8,-29,-20,-18,81,-7,-18,-9,-10,-30,-30,-29,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,23,-24,23,27,-26,-11,0,-26,3,-23,-20,20,-9,7,-3,5,-2,-26,-34,-19,17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-27,-1,15,-18,-18,0,-20,9,-13,-10,0,-14,10,14,-5,-8,-20,-19,-5,11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-22,-25,-17,-5,-25,-19,15,-18,15,9,-17,-22,-10,-12,-12,-2,11,-23,-6,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,17,-25,24,26,-29,-4,-3,-30,0,-25,-22,11,-8,6,-6,8,-4,-25,-34,-21,16;
MA   /M: SY='E'; M=-15,23,-30,35,36,-33,-16,-1,-34,11,-25,-22,8,-6,11,4,-2,-10,-28,-32,-18,23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-18,-5,9,-25,-8,-10,-19,5,-19,-12,-2,-8,7,-4,10,-1,-13,-25,-17,8;
MA   /M: SY='S'; M=-6,2,-21,-1,0,-19,-3,-4,-14,-5,-14,3,3,-14,2,-5,4,-1,-13,-29,-14,1;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,-1,-19,-11,-10,-12,-11,-7,-10,-9,-19,14,4,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-7,-22,-17,-17,-5,-22,-13,16,-18,8,9,2,-22,-13,-16,-11,-6,6,-27,-8,-16;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-29,33,30,-36,-15,3,-30,6,-24,-18,11,-8,23,-1,1,-9,-30,-31,-17,27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,32,-26,40,16,-33,-5,-1,-32,-1,-27,-24,20,-11,3,-7,4,-7,-27,-36,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00455;
//
ID   RIBOSOMAL_S14_MP; MATRIX.
AC   MP00527;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S14 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2672651; R2=0.0135779; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=349; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=239; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-30,-4,7,-29,-18,-12,-26,34,-28,-11,-4,6,6,17,-8,-9,-20,-22,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-22,-20,-25,-17,-1,-26,-20,16,-18,21,10,-19,-23,-16,-17,-16,-7,12,-23,-6,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-24,-4,5,-25,-15,-6,-17,11,-16,-6,0,-14,15,8,-2,-5,-15,-24,-12,10;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-24,-9,-2,-19,-12,-11,-17,3,-16,-10,-6,-12,2,-2,0,-3,-14,-8,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-24,-14,-7,-7,-21,-4,-5,-7,5,3,-10,-13,-5,-7,-13,-7,-8,-20,-3,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-8,-31,-4,2,-26,-16,-9,-24,5,-26,-15,-5,28,0,9,-4,-7,-24,-28,-19,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-27,-8,-1,-19,-18,4,-19,12,-18,-7,0,-10,3,22,-7,-8,-16,-22,-8,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-27,8,2,-25,-7,-4,-22,1,-26,-17,13,8,0,-4,0,-6,-24,-30,-18,0;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-21,2,4,-24,-11,-7,-25,15,-26,-14,4,-12,4,14,10,4,-15,-29,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-10,-20,-14,-7,1,-15,-10,-13,-3,-11,-9,-4,-15,-8,0,1,0,-9,-16,-2,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-26,-15,-8,-3,-19,-10,-11,-4,-10,-6,-13,6,-9,-8,-7,-5,-12,-14,2,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-12,-14,-16,-18,-13,3,-21,-6,-16,-10,-4,-8,-19,-17,-16,4,8,5,-27,-16,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-21,-8,2,-24,-20,-1,-28,25,-21,-9,-2,-17,13,45,-8,-10,-20,-22,-10,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-1,-14,-23,-15,-10,-11,-3,-11,-5,-13,0,-1,-10,-19,-6,-12,-8,-9,-5,-17,-6,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-23,-13,-8,-6,-20,9,-11,0,-9,-4,-7,-20,-3,7,-5,-4,-8,-15,12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-12,13,-23,5,0,-19,-12,2,-20,5,-19,-12,22,-18,3,14,2,2,-20,-31,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-28,-8,2,-20,-17,-2,-28,22,-20,-11,-1,-17,8,52,-6,-8,-19,-21,-11,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-20,-14,-3,-9,-20,-11,-13,0,-12,-6,-9,-13,-2,5,-6,-4,-10,-13,-6,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-20,-14,-1,-24,-15,3,-7,5,3,-14,-23,-10,5,-11,-6,5,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-12,56,-21,-20,-15,-25,-25,-19,-21,-13,-14,-11,-27,-20,-21,3,14,-5,-40,-20,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-17,-28,56,-18,-36,-18,-29,-19,0,-13,-18,-19,1,-16,-28,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-27,-6,-1,-19,-18,3,-25,19,-19,-10,4,-19,6,47,-5,-6,-16,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-31,-8,-1,-23,-14,-10,-21,0,-25,-15,-9,36,-5,-5,-3,-5,-22,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-29,-4,2,-23,-16,18,-29,18,-22,-9,3,-17,10,37,-6,-10,-22,-23,-6,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=15,-5,-20,-7,-11,-24,28,-17,-26,-14,-23,-17,-1,-13,-13,-18,9,-6,-16,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-21,-21,-24,-23,14,-28,-8,14,-18,10,6,-18,-28,-19,-16,-16,-6,14,-8,22,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-26,-25,-30,-24,18,-32,-10,20,-21,16,12,-22,-27,-19,-19,-20,-8,12,-3,27,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-29,-7,2,-23,-15,0,-29,25,-22,-10,2,-18,13,52,-6,-9,-21,-21,-11,4;
MA   /M: SY='K'; M=-13,7,-28,10,5,-24,-18,-3,-24,23,-22,-11,4,-14,3,14,-8,-9,-17,-24,-8,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-21,-31,-24,57,-28,-9,-1,-23,6,0,-18,-28,-28,-16,-16,-8,-3,10,37,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-28,-1,-10,-29,40,-13,-36,-6,-28,-18,5,-18,-10,-6,-1,-16,-28,-23,-24,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,7,-31,-20,26,-27,37,24,-27,-27,-19,-21,-25,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-13,65,-19,-19,-18,-19,-22,-24,-23,-19,-18,-10,-29,-19,-22,7,1,-9,-45,-25,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-29,-8,-1,-21,-13,-1,-30,25,-21,-11,3,-20,8,60,-8,-10,-21,-21,-12,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-14,-27,-17,-10,-13,-27,12,7,-13,-1,7,-7,-20,4,-8,-11,-10,0,-23,2,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-19,54,-26,-23,-16,-26,-25,-11,-18,-11,-8,-18,-30,-21,-20,-8,-7,3,-37,-21,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-19,-35,-25,46,-29,-20,9,-29,25,8,-24,-29,-31,-20,-22,-9,6,-4,15,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-9,0,-20,-19,0,-30,29,-20,-10,2,-20,10,67,-9,-10,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-28,15,39,-26,-18,-1,-25,9,-17,-15,3,-6,15,1,-2,-9,-25,-29,-17,27;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-23,-23,-16,-1,-25,-5,8,-13,13,17,-18,-17,-9,-10,-18,-8,3,-17,4,-14;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,-13,-22,-14,-16,-2,-21,-4,-14,-7,-7,-11,-13,-13,-21,6,-2,3,-21,-17,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-6,-24,-9,-7,-4,-15,22,-15,-9,-12,-3,1,-14,-3,-4,-4,-7,-16,-21,7,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-24,7,12,-26,-12,-5,-23,10,-20,-13,5,-12,9,7,0,-5,-19,-26,-15,10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-2,-8,-14,-19,33,-14,-25,-14,-19,-13,-1,-16,-14,-14,-1,-12,-18,-18,-20,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-17,-3,6,-10,-15,-4,-5,-4,3,0,-6,-10,6,-4,-7,-6,-8,-15,-4,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-15,-23,-17,3,-23,-17,22,-19,23,13,-18,-18,-14,-16,-16,-6,15,-14,-1,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-32,-15,-6,-20,-21,-17,-5,-13,-12,-5,-16,43,-8,-18,-9,-7,-14,-28,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-9,-19,-28,62,-19,-37,-19,-29,-19,2,-19,-19,-19,2,-15,-28,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-14,-32,-27,20,-27,-25,17,-23,11,6,-24,-28,-29,-20,-12,-2,26,-18,1,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-22,-8,-1,-19,-20,-11,-15,16,-16,-7,-3,-14,-1,13,-2,3,-6,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-2,7,-28,-20,-10,-28,44,-27,-9,0,-11,9,32,-9,-8,-18,-20,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=10,-9,-16,-12,-9,-5,-8,-6,-12,-9,-14,-10,-4,-16,-7,-12,11,4,-8,-17,3,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-26,15,6,-22,-11,-2,-28,5,-25,-19,10,-15,3,13,4,-3,-22,-21,-11,3;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00456;
//
ID   RIBOSOMAL_S4E_MP; MATRIX.
AC   MP00528;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S4e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4043255; R2=0.0125909; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=836; N_SCORE=14.920; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-14,-14,-8,-10,-9,-11,-2,-1,-4,0,-7,-11,-5,1,-3,-4,1,-14,-8,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-18,-6,0,-13,-12,-2,-15,17,-13,-2,-1,-11,5,28,-4,-5,-10,-15,-7,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-19,-7,-13,-19,41,-13,-24,-13,-19,-13,-1,-13,-13,-13,1,-12,-18,-13,-19,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-26,-10,-3,-17,-16,-15,-7,-10,-15,-10,-13,45,-8,-15,-5,-5,-14,-22,-18,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-24,0,10,-23,-16,-7,-24,31,-23,-10,1,-9,8,24,-3,-3,-16,-20,-10,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-26,-3,2,-21,-18,-7,-22,26,-19,-9,5,-15,4,25,-5,-2,-16,-24,-10,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-23,-20,-8,-7,-27,-11,8,-16,24,13,-20,-23,6,-10,-19,-9,0,-21,-4,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,14,-31,-21,21,-29,42,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,13,-18,2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,3,-13,-5,-3,-21,-2,-11,-17,-4,-22,-15,9,-12,-3,-9,18,6,-10,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='A'; M=34,-14,-10,-21,-14,-15,-7,-22,-1,-12,-7,-6,-13,-15,-14,-19,7,2,12,-24,-18,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-23,-5,-2,-18,-18,-3,-16,17,-20,-8,1,-16,0,10,-2,-3,-8,-22,-4,-2;
MA   /M: SY='H'; M=2,0,-18,-3,-2,-19,-9,23,-22,-7,-23,-11,8,-14,2,-3,16,6,-16,-33,-6,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-26,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,140,34,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-14,-29,-14,-2,-15,-21,-7,-7,3,-7,10,-15,13,1,-4,-14,-10,-12,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,31,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,26,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-32,18,13,-31,-3,3,-31,-5,-27,-20,5,14,-1,-10,-3,-12,-30,-32,-20,4;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-31,-6,4,-25,-20,-6,-29,35,-25,-11,-2,-7,8,46,-10,-10,-21,-21,-12,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-11,-26,-11,-1,-16,-24,-14,-12,22,-2,1,-11,-17,-1,12,-17,-10,-9,-20,-6,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-22,-10,-8,-21,19,-18,-19,-14,-18,-13,-3,-15,-12,-16,6,0,-11,-26,-21,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-26,-5,-8,-18,22,0,-27,-10,-23,-15,5,-19,-8,-9,1,-11,-23,-18,-7,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-18,-11,-5,-19,-22,-17,-11,17,-15,-6,-6,-14,-4,6,-3,6,-1,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-34,-38,-29,44,-26,-19,-9,-23,-4,-9,-29,-30,-28,-19,-29,-19,-14,73,36,-24;
MA   /M: SY='A'; M=23,-11,-12,-20,-14,-13,-13,-22,0,-13,-5,-5,-10,-13,-13,-18,8,14,8,-24,-14,-14;
MA   /M: SY='P'; M=1,-20,-19,-18,-14,-14,-21,-23,3,-14,-10,-6,-19,13,-17,-18,-1,3,11,-31,-18,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-28,-6,3,-23,-20,-6,-28,33,-23,-10,0,-15,8,45,-6,-3,-18,-21,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-16,-33,-11,-2,-26,-17,-20,-18,-10,-25,-18,-16,65,-10,-19,-4,-2,-23,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-18,-5,-5,-16,2,-7,-20,-6,-21,-15,5,-16,-3,1,17,5,-14,-28,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=3,-14,-29,-10,-1,-26,-15,-17,-17,-9,-24,-16,-13,49,-5,-16,0,-1,-21,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00457;
//
ID   RIBOSOMAL_S24E_MP; MATRIX.
AC   MP00529;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S24e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5766945; R2=0.0192180; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=447; N_SCORE=15.157; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-3; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-26,16,0,-28,12,-6,-29,2,-29,-19,20,-16,-5,-3,3,-8,-24,-31,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=16,-13,-14,-18,-12,-12,-15,-20,-1,-8,-3,-3,-12,-16,-12,-13,3,7,8,-25,-13,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,30,-27,37,15,-33,-11,-1,-29,0,-26,-22,18,-5,6,-7,3,-4,-27,-35,-19,10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-8,-29,-6,8,-24,-20,-14,-16,10,-18,-10,-8,13,1,0,-6,-7,-16,-25,-16,3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,23,-26,29,30,-31,-12,1,-30,5,-26,-21,16,-8,11,-2,5,-5,-27,-34,-19,20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-15,-19,-11,-5,-23,-17,3,-12,13,3,-16,-22,-13,-8,-11,-1,6,-25,-9,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-16,-30,-26,2,-31,-27,27,-23,20,12,-26,-26,-24,-21,-14,0,32,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-17,-30,-25,10,-30,-23,22,-21,9,8,-23,-26,-22,-19,-11,-4,28,-19,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-33,-29,-2,-32,-29,33,-23,12,12,-25,-26,-25,-24,-12,-4,39,-26,-7,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,5,-28,8,7,-9,-20,3,-24,6,-17,-11,1,-15,6,8,-7,-11,-21,-20,-2,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-6,-1,-17,-5,-5,-25,17,-22,-11,-1,-16,0,14,-6,-8,-20,-14,1,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-23,-24,-31,-25,12,-32,-22,28,-26,18,14,-14,-24,-21,-23,-18,-9,16,-18,2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,1,-27,4,4,-20,-19,-3,-24,20,-21,-11,0,-16,2,24,-7,-8,-14,-24,-9,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-15,-5,1,-18,-17,-12,-15,-5,-16,-10,2,-10,7,-6,19,30,-9,-30,-12,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-27,-1,10,-17,-13,10,-18,0,-12,-7,0,-15,5,-2,-6,-10,-19,-21,-1,6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-22,-30,-24,50,-28,-8,-2,-21,4,-2,-17,-27,-26,-16,-14,-3,-3,11,39,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-22,-11,-5,-20,4,-11,-17,2,-14,0,-5,-15,-3,-2,-1,-7,-12,-23,-15,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-8,-29,-8,-9,-23,17,1,-27,-8,-21,-11,-1,-10,-2,-4,-5,-13,-25,-20,-12,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-29,-6,12,-18,-24,-8,-13,15,-12,-6,-6,-13,5,15,-10,-10,-11,-21,-7,6;
MA   /M: SY='S'; M=13,-5,-12,-10,-7,-16,-8,-16,-9,-12,-17,-12,1,-11,-6,-14,25,20,-2,-32,-16,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-22,-8,-1,-10,-21,-10,-14,11,-13,-7,-4,-16,-3,9,-3,4,-8,-20,-2,-2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-14,-21,-15,-21,-24,43,-22,-24,-20,-21,-14,-6,-21,-21,-21,-2,-15,-14,-22,-25,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-20,-14,26,-28,7,-7,-4,-3,-3,-15,-26,-10,3,-17,-10,-11,13,48,-15;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-12,-21,-15,-16,-2,-22,-5,-13,-6,-6,-13,-15,-15,-19,5,1,6,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-27,-5,1,-19,-20,4,-19,21,-13,-1,0,-16,4,16,-12,-10,-16,-23,-5,2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-22,-34,-28,1,-33,-27,36,-25,17,14,-24,-24,-22,-25,-16,-6,32,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-11,30,-27,37,17,-31,-11,0,-31,6,-26,-22,17,-11,4,-3,0,-8,-26,-32,-15,10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,25,-19,27,6,-26,-7,-5,-26,-5,-27,-22,20,-12,-2,-8,17,11,-19,-38,-18,2;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-11,-24,-11,1,-18,-21,-14,-9,6,-11,-4,-11,-3,-3,2,-7,-5,-4,-25,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,14,-28,22,34,-31,-15,-4,-29,10,-22,-20,2,-1,10,-2,0,-9,-25,-30,-19,22;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-22,-9,-4,-14,-17,0,-12,0,-12,-4,-2,-16,1,7,1,0,-10,-22,-3,-3;
MA   /M: SY='M'; M=16,-19,-16,-26,-16,-6,-14,-15,7,-16,16,17,-19,-19,-10,-17,-10,-6,6,-20,-9,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-25,-9,4,-20,-20,-8,-14,16,-9,2,-7,-14,9,11,-9,-7,-12,-21,-9,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,-1,6,-16,-21,-6,-16,12,-10,-6,-4,-15,4,7,-7,-5,-13,-20,-3,4;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-21,-32,-27,22,-32,-20,23,-24,12,9,-20,-27,-26,-21,-16,-7,20,-11,12,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-35,-9,3,-27,-20,-11,-19,-6,-23,-14,-15,57,-1,-11,-8,-8,-26,-28,-22,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-29,17,26,-30,-19,2,-29,17,-22,-14,3,-8,14,7,-4,-9,-25,-27,-13,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-12,-29,-12,-11,8,-25,44,-12,-9,-9,-1,-8,-25,0,-6,-13,-12,-17,5,52,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-21,-25,-24,-12,-6,-29,-16,16,-10,10,13,-16,-20,-9,-1,-16,-9,11,-22,-5,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,42,20,-28,-28,-20,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-9,-25,-9,3,-15,-15,-15,-7,-1,-9,-6,-8,-15,-5,-3,-6,-8,-3,-23,-12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='N'; M=-13,31,-23,24,1,-22,-8,14,-20,-3,-25,-17,37,-19,-1,-4,3,-5,-23,-36,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-26,-7,-8,-25,19,-16,-28,2,-23,-14,0,-12,-9,-4,0,-5,-20,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-25,-23,-16,-7,-9,-17,7,-21,13,6,-17,-22,-15,-18,-16,-11,3,-21,-8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=0,-7,-24,-7,4,-18,-16,-11,-9,-1,-12,-7,-9,-7,2,-7,-3,-5,-7,-22,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-25,5,25,-26,-12,-6,-22,7,-18,-13,0,-8,12,0,1,-5,-20,-27,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-29,3,13,-28,-15,-10,-21,14,-22,-12,-3,1,7,3,-4,-8,-18,-25,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-27,-2,12,-20,-17,-11,-17,11,-17,-10,-4,-8,3,1,-5,-6,-13,-23,-12,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00458;
//
ID   RNASE_T2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00530;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonuclease T2 family histidine active site 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5402088; R2=0.0128188; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=208; N_SCORE=7.197; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=5,-22,14,-28,-22,-7,-22,-20,5,-20,9,11,-22,-26,-18,-20,-11,-6,12,-28,-13,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-23,1,-4,-15,-17,-12,-5,-11,-7,-7,0,7,-8,-14,-5,0,-9,-26,-13,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-16,5,15,-15,-12,-4,-12,7,-12,-8,4,-7,3,2,-1,-4,-9,-20,-11,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-16,41,-21,-19,-8,-24,-14,-14,-18,-11,-6,-16,-16,-17,-19,-9,-4,-8,-25,-5,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,6,-21,3,13,-24,-9,-3,-21,3,-21,-15,11,-11,9,4,9,-1,-19,-29,-18,10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-22,-3,3,-12,-17,-14,-9,-12,-5,-9,-10,-17,-6,-12,-1,-3,-6,-13,-9,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,6,-21,2,6,-21,-11,13,-18,10,-18,-6,12,-12,18,15,-1,-7,-20,-20,-7,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-22,-1,-3,-15,-17,-5,-15,5,-16,-9,2,-16,0,3,0,5,-10,-20,-1,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=1,0,-24,0,11,-28,-12,-6,-21,2,-25,-14,2,8,14,-3,8,-1,-22,-29,-19,11;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,81,-22,-20,-21,-19,-26,-29,-24,-20,-19,-15,-32,-23,-25,-5,-4,-12,-44,-27,-21;
MA   /M: M=-9,-5,-4,-5,-6,-8,-9,-12,-20,-10,-13,-12,-6,-20,-12,-12,-2,-2,-14,-23,-6,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-11,6,-25,1,-8,-14,-3,5,-17,-6,-18,-11,13,-19,-6,-3,-2,-4,-18,-22,-1,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-15,2,2,-15,-7,-4,-14,10,-17,-9,8,2,2,5,2,-1,-13,-17,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-26,-11,-3,-18,-15,-14,-12,-5,-13,-10,-14,35,-7,-4,-8,-7,-16,-21,-18,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-20,12,-2,-17,-16,-12,-11,-10,-5,-10,-4,-7,-9,-13,-4,1,-6,-28,-13,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-9,3,-21,-1,-5,5,-17,-10,-11,-8,-7,-9,4,-20,-13,-9,-7,-6,-9,-21,-4,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-20,-1,-9,-16,14,-11,-20,-12,-13,-12,-2,-15,-11,-14,2,-3,-14,-19,-10,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-33,-29,-39,-29,51,-27,-23,-4,-27,5,-4,-27,-30,-32,-20,-27,-16,-8,49,27,-26;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,-13,-14,-16,-12,-6,-22,-6,-14,-10,-8,-6,-16,-16,-14,11,25,6,-29,-14,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-25,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,137,35,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-25,17,5,-25,-2,2,-25,-3,-25,-16,13,-15,10,-5,6,-4,-24,-26,-8,7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-22,3,-4,-11,-11,3,-14,3,-17,-11,23,-20,-2,0,0,-2,-19,-24,-1,-4;
MA   /M: SY='A'; M=4,4,1,3,-1,-27,-12,-12,-23,-5,-23,-17,1,-5,-2,-12,3,-4,-17,-33,-21,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-25,10,6,-25,-8,2,-25,9,-24,-14,10,-15,1,7,0,-7,-18,-30,-14,3;
MA   /M: SY='G'; M=8,-6,-23,-7,-8,-27,39,-16,-31,-14,-26,-19,1,-15,-11,-16,9,-8,-22,-25,-26,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-17,-3,-4,-17,-8,-12,-15,5,-14,-9,-2,-13,-5,6,0,4,-5,-21,-12,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-10,-25,-10,-11,-4,-8,-4,-13,-10,-12,-10,-12,-7,-10,-14,-8,-9,-14,6,16,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=10,-15,-23,-14,-6,-21,-14,-17,-9,-9,-15,-10,-15,28,-7,-16,-2,-5,-8,-24,-20,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-8,-21,-7,3,-18,-15,-8,-10,-4,-11,-7,-4,-4,7,0,5,0,-11,-26,-13,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-23,5,-7,-6,4,0,-20,-9,-19,-14,12,-19,-9,-10,0,-6,-20,-15,3,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-18,85,-26,-26,-18,-29,-12,-23,-26,-17,-14,-17,-36,-25,-25,-10,-10,-6,-45,-21,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-27,33,9,-30,-11,-3,-29,2,-28,-23,21,1,-1,-5,2,-2,-26,-36,-20,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-30,-4,3,-24,1,-5,-30,11,-24,-15,4,-9,2,28,-5,-11,-25,-24,-18,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-21,-4,6,-5,-16,-8,-20,3,-18,-13,4,-14,-2,6,5,4,-15,-24,-8,2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-15,-35,-10,0,-25,-20,-9,-25,11,-25,-15,-9,31,1,28,-10,-10,-25,-25,-19,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00459;
//
ID   RNASE_T2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00531;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonuclease T2 family histidine active site 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0252638; R2=0.0139267; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=185; N_SCORE=7.592; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=0,-19,-30,-20,-12,-20,-9,-21,-3,-14,-13,-7,-14,21,-13,-16,-8,-10,-8,-24,-19,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-26,6,4,-21,-16,6,-19,8,-18,-6,6,-15,12,2,-4,-6,-20,-20,0,7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-19,-28,-19,3,-23,-9,18,-17,29,39,-22,-23,-8,-13,-21,-7,9,-20,0,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,15,-20,12,6,-22,-9,-3,-22,5,-24,-14,18,-12,4,3,10,5,-19,-32,-16,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-9,3,-8,-21,-8,-13,6,-9,-2,-7,-14,5,2,-6,-4,-12,-17,-3,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-8,-22,-8,-5,6,-21,-4,-5,-11,-6,-6,-8,-20,-10,-12,-4,-3,-5,-10,15,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-27,-34,-28,-20,9,-16,-21,-14,-12,-12,-13,-27,-21,-14,-12,-27,-20,-20,93,20,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-23,-7,-2,-19,-10,-13,-13,2,-16,-9,-9,24,-5,-5,-5,-5,-14,-19,-15,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-5,14,-12,14,1,-17,0,-4,-18,-6,-16,-14,13,-11,-4,-7,7,1,-14,-26,-14,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-17,1,7,-12,-11,-1,-12,4,-11,-5,-1,1,5,5,-2,-4,-13,-14,-5,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-1,-14,-4,-9,-1,-10,-4,-6,-8,-7,-6,1,-15,-8,-7,-4,-3,-7,-11,5,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=0,5,-14,0,-3,-18,-7,-5,-17,-2,-19,-13,10,-14,-2,-1,6,2,-14,-28,-14,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-25,-11,-16,-18,27,-14,-22,-14,-19,-13,-1,-17,-15,-15,0,-9,-17,-19,-13,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-25,11,3,-25,-5,-6,-23,-2,-24,-17,12,3,-1,-4,4,0,-22,-32,-19,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-19,15,1,-27,1,4,-31,1,-27,-18,14,-16,-2,0,2,-6,-24,-32,-16,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-19,2,18,-25,-16,-3,-20,2,-17,-10,-1,-11,16,0,2,-5,-19,-26,-13,16;
MA   /M: SY='S'; M=-3,1,-15,0,4,-20,-12,-6,-23,4,-24,-15,5,-5,3,1,8,0,-18,-30,-16,3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,47,-30,-20,9,-30,29,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-34,-46,-34,-22,7,-21,-24,-18,-17,-16,-16,-35,-28,-14,-17,-35,-26,-27,119,26,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-24,-6,8,-21,-18,-9,-14,7,-15,-8,-4,-13,6,10,0,-2,-9,-25,-13,6;
MA   /M: SY='H'; M=-18,4,-29,6,0,-20,-15,74,-29,-9,-20,-5,9,-19,6,-3,-8,-15,-28,-28,15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,55,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,25,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-41,-34,-27,24,-24,-14,-12,-18,-11,-12,-32,-30,-19,-17,-32,-22,-21,98,45,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-2,14,-21,7,9,-21,-8,-3,-19,5,-22,-15,20,-14,2,1,6,-1,-19,-32,-18,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,-1,9,-29,-20,-10,-29,47,-29,-10,0,-10,9,30,-9,-8,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-14,-13,-10,-11,-18,-19,-9,-9,-10,-9,-3,-12,-9,-9,13,32,-2,-20,-9,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=5,-14,10,-21,-17,-5,-17,-18,-4,-19,-6,-5,-9,-22,-16,-19,1,-1,0,-27,-9,-17;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-19,-7,-2,-10,-2,-12,-16,-6,-14,-11,1,-14,-6,-7,7,1,-12,-24,-12,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-17,1,0,-16,-13,-10,-15,-6,-16,-12,1,6,-2,-8,9,15,-12,-25,-11,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-20,-24,-18,11,-23,-12,11,-19,15,9,-20,-19,-16,-16,-16,-7,6,-8,12,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-13,7,-25,8,3,-13,-16,2,-16,0,-11,-9,6,-12,1,1,-7,-8,-18,-22,-4,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-19,-5,0,-16,-12,-9,-9,-2,-13,-7,-6,20,1,-3,-2,-2,-12,-17,-12,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-25,6,13,-22,-15,12,-22,2,-17,-11,4,-12,8,0,1,-3,-20,-28,-7,9;
MA   /M: SY='C'; M=-3,1,20,-1,-4,-27,-19,-13,-24,-7,-20,-15,-4,-15,-1,-13,-3,-8,-16,-34,-21,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-30,-23,-21,32,-30,13,0,-13,2,0,-21,-30,-13,-12,-21,-11,-9,32,71,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-18,-22,-23,-18,39,-25,-12,-6,-20,0,-4,-12,-19,-24,-15,-11,-6,-5,-6,13,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-23,2,3,-19,-11,-8,-14,-2,-7,-7,-1,-16,1,-2,-4,-6,-12,-26,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-24,-14,-10,-5,-18,-13,-7,-6,2,-2,-12,-20,-8,-7,-12,-1,-8,-1,4,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-16,-14,-7,-17,-1,-13,-10,-7,-11,-3,-6,-14,-7,-10,4,-2,-4,-22,-14,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-25,-10,-5,-17,-17,-10,-8,-9,-13,-8,-8,15,-2,-12,-2,-4,-10,-24,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-26,17,17,-28,-13,-5,-29,14,-24,-18,5,-10,6,13,2,-6,-21,-29,-16,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00459;
//
ID   PEPCK_ATP_MP; MATRIX.
AC   MP00532;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2862577; R2=0.0124410; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1685; N_SCORE=25.239; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-10,-16,-10,-16,-7,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,18,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-29,64,18,-39,-9,-1,-38,-1,-29,-29,19,-10,0,-10,2,-9,-28,-39,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-35,-7,4,-28,-18,-6,-21,-8,-27,-17,-14,61,-4,-16,-6,-9,-27,-29,-23,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,13,-23,9,4,-24,-9,12,-25,7,-26,-14,19,-14,4,4,5,-2,-23,-31,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-25,-10,-3,-6,-22,-7,-15,10,-11,-6,-5,-14,-2,9,-7,0,-12,-14,5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,1,-15,-22,-27,46,-22,-36,-22,-27,-19,-5,-24,-22,-22,-2,-17,-23,-26,-29,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=1,10,-11,11,-1,-24,2,-10,-25,-9,-26,-21,11,-13,-5,-12,19,9,-16,-36,-20,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-29,36,23,-33,-13,-3,-31,7,-26,-22,12,-2,4,-3,-1,-9,-26,-34,-19,13;
MA   /M: SY='N'; M=-12,12,-25,11,4,-23,-8,6,-26,5,-23,-15,14,-16,1,9,1,-3,-21,-29,-11,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-28,-10,-19,-28,62,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-20,-19,-19,2,-17,-25,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-35,-27,67,-27,-17,-2,-27,6,-2,-17,-28,-34,-18,-14,-7,-2,7,28,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-26,-39,-29,37,-35,-23,25,-29,15,10,-20,-25,-28,-25,-20,-10,15,-4,17,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=2,-17,50,-25,-23,-14,-24,-25,-11,-21,-10,-7,-17,-28,-22,-23,-3,3,3,-37,-20,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,20,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-13,25,-27,24,4,-28,3,4,-31,4,-29,-20,26,-16,-1,3,1,-9,-28,-33,-18,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='S'; M=6,5,-12,5,1,-21,-2,-9,-21,-8,-29,-20,12,-10,0,-9,34,18,-12,-39,-19,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-28,-2,14,-27,-16,-6,-24,14,-23,-13,-5,7,9,10,-3,-8,-22,-24,-16,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00460;
//
ID   PORPHOBILINOGEN_DEAM_MP; MATRIX.
AC   MP00533;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Porphobilinogen deaminase cofactor-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0100374; R2=0.0172028; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=231; N_SCORE=9.974; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-11,-32,-23,9,-31,-23,20,-28,33,15,-26,-29,-22,-21,-23,-8,14,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='K'; M=8,2,-21,0,4,-24,-7,-6,-22,9,-22,-13,3,-11,3,1,6,-2,-15,-25,-14,3;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-7,-23,-7,3,-19,-13,-11,-16,-1,-17,-10,-7,4,0,-4,-1,-5,-13,-26,-16,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-24,9,-32,-23,28,-29,35,18,-26,-26,-21,-23,-24,-9,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,21,-19,17,6,-24,-9,18,-25,-3,-24,-15,25,-16,2,-3,3,-4,-25,-35,-12,3;
MA   /M: SY='H'; M=-17,23,-23,29,7,-29,-14,40,-33,-5,-25,-16,15,-16,3,-5,-3,-12,-28,-36,-4,3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-7,-28,-4,8,-23,-17,-5,-17,1,-14,-10,-7,8,1,-2,-6,-7,-17,-26,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-28,9,15,-25,-15,-7,-22,2,-21,-16,0,8,4,-2,-2,-7,-21,-28,-17,7;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-12,-10,-9,-12,-15,-19,-9,-11,-13,-11,-1,-12,-9,-12,19,34,0,-27,-12,-9;
MA   /M: SY='R'; M=0,-12,-20,-16,-9,-3,-16,-9,-13,-5,-6,-6,-9,-19,-7,3,-4,-1,-9,-12,-2,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-11,-20,-12,-5,-11,-23,-9,0,-8,2,1,-12,-19,-5,-7,-11,-7,0,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='C'; M=2,-11,15,-14,-5,-17,-20,-17,-14,-9,-10,-10,-11,-20,-10,-7,-3,-2,-5,-31,-18,-8;
MA   /M: SY='V'; M=6,-22,6,-27,-24,-7,-24,-26,12,-19,1,3,-21,-25,-22,-21,-5,1,24,-30,-14,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-20,-13,-3,-10,-21,-12,-4,-7,1,-1,-9,-16,-5,-4,-4,5,-3,-22,-8,-5;
MA   /M: SY='A'; M=33,-13,-2,-21,-13,-18,-8,-22,-7,-14,-9,-9,-12,-9,-13,-21,5,0,1,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,31,-20,-10,0,-20,10,69,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-15,-13,-4,-19,-4,-17,-12,-7,-13,-10,-6,-12,-7,-11,10,6,-3,-25,-17,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-18,-34,-26,35,-28,-20,12,-25,18,12,-23,-28,-28,-19,-18,-7,13,-9,10,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-18,-21,-17,1,-23,-15,13,-22,25,13,-12,-25,-15,-17,-16,-5,6,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-24,-5,5,-22,-13,-3,-22,13,-19,-11,2,-14,7,20,-1,-5,-17,-22,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-24,-5,6,-18,-11,-1,-17,1,-14,-8,-3,-14,2,2,-2,-4,-13,-22,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-17,-30,-21,10,-29,-19,19,-28,42,21,-28,-29,-20,-19,-27,-9,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,17,20,-31,6,-1,-32,2,-26,-19,9,-11,6,-3,0,-12,-29,-29,-20,13;
MA   /M: SY='G'; M=11,-11,-25,-13,-18,-26,48,-20,-30,-18,-22,-16,-4,-18,-18,-20,2,-14,-20,-20,-26,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-26,-5,-15,-28,52,-14,-35,-17,-30,-20,6,-18,-15,-17,7,-12,-27,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-24,-4,6,-24,-16,14,-19,1,-18,-5,2,-13,22,7,5,-2,-19,-26,-7,13;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,-8,-23,-21,-7,-22,-25,12,-17,0,1,-16,-21,-20,-18,2,12,24,-29,-12,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-27,-19,-20,82,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,4,-36,-28,40,-27,20,18,-23,-24,-23,-26,-18,-8,32,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-14,-16,-26,43,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-9,-20,-18,-17,5,-23,-6,-16,-10,-7,-12,-19,-18,-20,3,-4,6,-25,-19,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-27,-17,-14,16,-27,18,-3,-13,2,1,-11,-26,-9,-9,-16,-9,-9,2,39,-14;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-7,-16,-10,-17,1,-18,-14,-12,-15,-12,-6,-12,-10,-18,14,5,-4,-25,-19,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-23,-3,8,-18,-20,-6,-14,2,-13,-7,-2,-13,8,4,1,3,-11,-25,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-22,-26,-19,3,-28,-15,14,-18,13,8,-21,-20,-16,-16,-17,-7,10,-11,7,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-23,7,10,-19,-17,-7,-17,2,-12,-10,3,-13,3,-1,0,1,-15,-28,-12,6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,7,-17,9,3,-19,11,-5,-21,-3,-17,-13,5,-6,-2,-5,1,-6,-17,-18,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-15,10,6,-17,5,-2,-17,-2,-15,-12,8,-7,0,-4,3,-5,-15,-18,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,12,-24,13,4,-26,7,-6,-27,1,-24,-17,11,-13,-2,-3,2,-8,-22,-26,-18,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-22,1,6,-19,-9,-5,-19,1,-16,-11,1,-13,4,0,2,0,-16,-24,-10,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-24,-20,-14,-2,-24,-12,12,-18,17,11,-14,-22,-11,-15,-18,-9,5,-22,-4,-14;
MA   /M: M=-8,-9,-21,-10,-2,-9,-20,-7,-12,-2,-10,-7,-7,-16,-4,0,-4,0,-9,-15,-3,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-25,-17,8,-25,-15,11,-22,25,14,-20,-24,-15,-15,-19,-7,5,-19,0,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-11,-21,-14,-6,-9,-21,-10,-4,-5,-3,-1,-8,-17,-4,0,-5,4,-4,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-21,-12,-10,-20,10,-17,-16,-11,-11,-9,-7,-16,-11,-10,0,-6,-8,-23,-18,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00461;
//
ID   FERROCHELATASE_MP; MATRIX.
AC   MP00534;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ferrochelatase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0698681; R2=0.0156617; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=139; N_SCORE=7.237; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=0,-14,-20,-19,-14,-10,-19,-20,14,-20,-6,-1,-4,-15,-10,-20,11,6,9,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-2,3,-23,1,3,-22,-11,1,-19,3,-16,-10,5,-15,4,2,0,-4,-15,-27,-12,2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='S'; M=4,3,-18,2,6,-20,-10,-5,-19,0,-20,-14,4,-10,4,-1,13,7,-14,-27,-13,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-19,-30,-23,-1,-32,-24,28,-23,19,13,-22,-21,-17,-22,-18,-8,20,-22,-4,-22; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-19,-8,4,-14,-17,-10,-7,1,-5,-4,-6,-13,0,2,-4,-4,-5,-22,-11,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-24,6,13,-24,-13,0,-22,11,-19,-11,3,-10,10,9,-1,-6,-19,-20,-11,11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-18,-5,3,-12,-10,0,-14,-5,-13,-9,-2,-11,0,-8,5,3,-11,-19,-4,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-22,-24,-17,7,-20,-15,5,-17,9,3,-16,-21,-13,-13,-15,-9,-1,6,6,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='A'; M=9,1,-18,-1,3,-21,-6,-8,-16,2,-14,-9,1,-10,5,-3,3,-3,-12,-21,-14,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-20,-2,8,-18,-16,-4,-13,7,-13,-6,1,-11,7,4,0,0,-11,-22,-9,7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-25,-7,-1,-19,-10,-14,-13,-8,-19,-13,-11,48,-7,-13,-5,-6,-18,-20,-19,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-4,14,-21,19,15,-23,-7,-2,-21,0,-16,-14,7,-7,5,-5,0,-7,-19,-24,-13,10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-14,4,8,-12,-10,-3,-11,6,-8,-6,-1,-6,1,3,-3,-4,-7,-14,-6,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-14,-7,-3,-5,-10,3,-8,1,-6,-2,-3,-11,-1,8,-5,-5,-5,-8,-1,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-4,5,-15,7,7,-16,-4,-1,-15,1,-13,-9,3,-4,4,0,2,-4,-13,-16,-9,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-19,14,9,-19,-5,-2,-20,5,-17,-13,5,-3,3,2,0,-5,-17,-19,-11,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-5,-7,-6,-7,-11,-13,-5,-9,-5,-6,-7,-11,-10,-12,1,3,2,-19,-10,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-14,-16,-16,-11,-6,-22,0,-6,-1,-5,1,-12,-22,-8,4,-10,-8,1,-20,1,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-25,12,-32,-24,27,-29,34,17,-27,-28,-23,-22,-24,-9,19,-19,1,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-17,-33,-26,8,-32,-25,27,-26,27,15,-27,-28,-24,-22,-20,-7,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-15,-35,-27,49,-28,-19,5,-26,13,6,-21,-28,-31,-20,-18,-7,6,-3,17,-26;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=14,-17,-16,-24,-17,12,-16,-11,-3,-14,-3,-5,-15,-20,-17,-17,-3,-1,1,-4,14,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-21,-6,-11,-26,39,-16,-31,-16,-30,-20,4,-16,-11,-16,17,-3,-21,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-33,-26,4,-33,-25,33,-26,28,20,-26,-26,-21,-23,-21,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-24,-8,6,-18,-23,-9,-8,8,-7,2,-9,-15,7,5,-7,-3,-5,-24,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=2,-7,-20,-10,-3,-17,-10,-10,-21,10,-18,-11,-2,-13,-1,16,3,-2,-13,-23,-12,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-15,-22,-18,-17,7,-24,5,3,-14,1,3,-13,-23,-11,-14,-11,-5,-1,-5,26,-16;
MA   /M: SY='V'; M=1,-14,-20,-16,-14,-9,-24,-18,11,-15,4,3,-14,-20,-15,-16,-8,-5,14,-25,-8,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-26,17,18,-28,-14,0,-25,8,-21,-15,8,-11,8,5,0,-7,-20,-30,-15,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-22,-6,1,-12,-16,-5,-16,4,-9,-6,-2,-16,-1,5,-5,-5,-12,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-20,-9,-17,-26,49,-17,-34,-18,-27,-19,3,-20,-17,-18,4,-13,-25,-25,-27,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-30,53,12,-38,7,-4,-40,-4,-30,-28,16,-12,-4,-12,0,-12,-30,-36,-22,4;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-26,-6,-3,-23,-18,-16,-17,-9,-23,-16,-13,52,-10,-16,-8,-7,-22,-26,-20,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-18,27,-30,20,-1,-9,-1,0,-19,-29,-7,-9,-19,-10,-11,28,76,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-26,-13,-4,-18,-19,-8,-10,-5,-14,-6,-11,11,-1,-6,-3,-5,-11,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-16,3,11,-26,-16,-3,-24,5,-20,-13,-1,-9,10,6,0,-7,-20,-28,-15,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-30,3,24,-31,-21,14,-21,7,-18,-6,0,-10,35,8,-3,-11,-26,-24,-9,28;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-22,48,-28,-26,-10,-30,-19,-4,-26,-1,-2,-21,-32,-24,-24,-13,-7,6,-37,-15,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-26,-2,13,-21,-13,-1,-19,5,-13,-7,-1,-13,11,4,-4,-8,-19,-23,-11,11;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-24,4,11,-21,-15,2,-20,3,-15,-10,-2,-12,6,-1,-2,-7,-16,-22,-6,7;
MA   /M: SY='T'; M=4,-3,-1,-11,-9,-14,-16,-16,-14,-9,-13,-11,-1,-13,-9,-11,15,29,-4,-31,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=15,-10,-13,-18,-14,-9,-11,-20,-1,-13,-7,-6,-7,-16,-14,-16,7,11,7,-25,-13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-28,8,10,-24,-16,0,-25,13,-18,-12,5,-15,9,20,-5,-9,-21,-26,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=4,-22,-12,-25,-16,-1,-19,-19,6,-21,24,8,-21,-24,-16,-17,-17,-8,3,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-32,-25,2,-32,-26,30,-26,25,15,-25,-26,-22,-22,-17,-5,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=8,-15,-20,-20,-11,-12,-15,-14,-2,-3,-3,6,-12,-12,-6,-1,-6,-5,0,-21,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-24,9,21,-27,-12,-6,-21,1,-17,-14,0,-8,10,-4,2,-6,-18,-28,-17,15;
MA   /M: SY='E'; M=4,-3,-23,-4,11,-23,-11,-9,-20,9,-16,-10,-3,-11,6,6,0,-5,-15,-24,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-18,-24,-16,5,-22,-17,10,-24,26,11,-19,-24,-16,-18,-12,-3,5,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-3,5,-25,10,4,-29,10,-11,-30,-4,-29,-21,4,-1,-4,-9,11,-3,-23,-32,-23,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00462;
//
ID   COMPLEX1_49K_MP; MATRIX.
AC   MP00535;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2259068; R2=0.0155109; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=660; N_SCORE=15.453; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-32,-23,12,-30,-21,22,-28,38,20,-28,-29,-22,-20,-25,-9,16,-19,1,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-18,42,20,-33,-12,-2,-34,1,-28,-25,17,-11,2,-7,3,-7,-27,-38,-20,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-22,1,5,-15,-19,-8,-11,1,-14,-8,4,-15,2,-3,-1,0,-8,-27,-11,4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-22,-32,-27,-3,-33,-29,33,-23,10,11,-25,-13,-24,-24,-14,-5,33,-26,-8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-17,-23,-15,-5,-29,-24,21,-15,7,7,-22,-24,-19,-16,-11,-4,30,-28,-10,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-17,25,-29,34,18,-28,-15,1,-32,10,-25,-21,12,-12,5,9,-3,-9,-26,-29,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=23,-17,19,-25,-19,-15,-15,-23,-4,-17,-6,-4,-16,-21,-17,-23,-1,-4,6,-28,-19,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-27,26,21,-27,-19,-6,-21,1,-17,-16,2,-11,2,-3,-3,-8,-14,-33,-17,11;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-22,-13,-19,-12,-16,-26,-18,-8,-16,-17,-11,-20,38,-15,-22,-13,-10,-15,-24,-11,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-2,-28,0,1,-20,-14,30,-18,-6,-15,-5,1,-18,0,1,-8,-14,-15,-28,-2,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-27,2,-35,-24,39,-27,26,24,-23,-23,-18,-25,-22,-10,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-29,-14,-21,-16,57,-20,-35,-21,-25,-17,-3,-21,-23,-20,-3,-19,-26,-16,-22,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,24,-30,7,6,-16,16,6,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-4,14,55,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-27,-20,5,-29,-10,17,-26,33,16,-26,-29,-19,-18,-23,-9,15,-23,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-27,-10,-1,-19,-20,-3,-27,24,-19,-10,0,-19,7,59,-6,-1,-17,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='M'; M=0,-14,-17,-23,-17,-2,-22,-16,10,-15,4,14,-11,-16,-11,-16,-1,13,8,-23,-5,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-22,-27,-20,3,-28,-18,22,-24,29,19,-17,-24,-16,-19,-20,-6,11,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='M'; M=9,-19,-5,-28,-20,-9,-15,-18,9,-18,7,14,-17,-20,-13,-21,-9,-7,7,-23,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-23,-7,-9,-9,-4,11,-19,-6,-17,-10,5,-19,-5,-1,1,1,-17,-16,8,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-3,-29,36,-24,-9,0,-15,15,48,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-17,-9,-8,-10,-16,2,-11,-10,-12,-2,0,-10,-4,-9,10,19,-8,-26,-1,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-15,-24,-24,6,-15,-8,-6,-17,-9,-7,-18,-29,-17,-17,-18,-14,-9,25,27,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-23,-16,-10,-1,-26,10,1,-17,9,5,-12,-22,-9,-12,-12,-1,-2,-19,11,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-26,1,13,-33,-15,5,-19,10,-22,-3,8,-12,38,8,3,-6,-25,-25,-12,25;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-13,-9,-6,-11,2,-6,-19,-10,-16,-13,-3,-18,-8,-14,0,-7,-16,-14,1,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-33,-26,4,-33,-25,32,-26,29,19,-26,-26,-22,-23,-21,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-31,-9,-3,-24,-20,-7,-18,-10,-24,-15,-11,51,-8,-15,-2,5,-22,-30,-19,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-25,-22,38,-30,7,2,-16,8,2,-21,-30,-17,-13,-21,-10,-6,20,61,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-19,-14,-25,-21,22,-21,-21,2,-20,1,-2,-14,-22,-24,-17,-1,7,10,-16,2,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,30,-26,43,17,-32,-13,-5,-32,-2,-25,-24,11,-3,0,-9,5,2,-24,-37,-19,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-22,-31,-24,4,-27,-22,19,-23,21,17,-28,-27,-19,-19,-22,-9,15,0,1,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-9,45,16,-32,-12,-3,-33,-2,-24,-24,11,-11,-1,-10,-1,-9,-24,-35,-19,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-11,-20,-21,17,-19,9,-8,-14,-6,-5,-18,-30,-14,-14,-17,-11,-12,14,54,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00521;
//
ID   UBIQUITIN_ACTIVAT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00536;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin-activating enzyme signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6571884; R2=0.0160975; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=549; N_SCORE=14.485; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-27,-10,-8,-23,-1,-20,-21,-12,-23,-17,-9,31,-12,-17,3,9,-20,-28,-23,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-17,-25,-21,-3,-27,-21,19,-17,7,15,-15,-19,-15,-17,-4,13,20,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='N'; M=4,15,-16,1,-8,-16,-6,-5,-7,-6,-17,-12,27,-20,-8,-8,6,0,-7,-34,-18,-8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-17,-35,-28,36,-28,-20,14,-23,12,15,-23,-28,-29,-18,-17,-7,19,-10,10,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-26,-40,-30,33,-36,-26,29,-30,16,12,-20,-24,-28,-26,-20,-10,18,-8,12,-30;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,-17,-31,-25,-5,-26,-28,27,-21,9,9,-22,-22,-22,-23,-9,-3,31,-24,-9,-25;
MA   /M: SY='A'; M=23,-17,-14,-22,-19,-15,3,-23,-2,-15,-7,-5,-15,-19,-19,-20,1,-4,12,-23,-18,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-27,-10,6,-23,-23,0,-6,-4,4,7,-10,-17,32,0,-10,-10,-16,-20,-7,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-17,-23,-27,-10,5,-27,6,-20,-4,0,-20,-27,-27,-20,-7,-7,22,-27,-17,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-30,-22,6,-28,-17,22,-23,35,28,-28,-28,-17,-18,-24,-8,18,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=29,-17,-17,-27,-17,-13,-14,-23,11,-17,0,0,-13,-13,-13,-23,0,-3,10,-20,-13,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-23,71,-30,-27,-10,-30,-27,-13,-30,4,-6,-23,-37,-27,-27,-17,-10,-3,-40,-20,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,52,-33,-23,17,-30,13,7,-20,-27,-33,-23,-20,-10,10,0,20,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-23,15,0,-20,-17,15,-17,-7,-12,2,4,-14,0,-8,-2,1,-14,-31,-5,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-37,-7,7,-33,-20,-10,-20,-3,-27,-13,-13,55,14,-10,-7,-10,-30,-27,-23,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-27,26,-32,-26,-3,-32,-26,10,-30,18,6,-24,-31,-23,-26,-21,-10,8,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-28,-15,-7,-8,-22,2,-12,17,-9,9,-9,-20,4,27,-14,-10,-11,-10,10,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-23,-3,10,-30,-20,0,-17,3,-17,-3,0,-10,36,3,7,11,-20,-23,-10,23;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-32,-31,-40,-30,35,-31,-26,13,-28,6,2,-25,-27,-28,-23,-25,-15,3,33,20,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-35,-25,46,-28,-16,9,-26,22,18,-22,-28,-27,-18,-22,-10,5,-4,16,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,23,-30,6,7,-17,17,7,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-3,13,52,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-6,-20,-19,-20,45,-20,-10,-7,-20,-4,-7,8,-27,-26,-13,-10,-7,-10,-7,13,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-30,46,17,-37,-13,-3,-37,17,-30,-23,13,-10,3,4,-3,-10,-27,-33,-17,10;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-2,-17,-5,5,-27,-7,-5,-18,-3,-22,-11,2,-10,19,-5,19,5,-15,-28,-17,12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-25,-23,-15,-6,-27,-22,8,-21,14,4,-27,12,-18,-20,-19,-8,4,-25,-12,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,20,-27,20,39,-27,-13,3,-27,7,-23,-20,21,-7,13,0,3,-7,-30,-33,-20,26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,11,-11,-7,-23,-14,-18,-22,-15,-28,-20,-8,18,-11,-18,11,2,-17,-39,-26,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-23,-23,-23,-13,0,-27,-13,3,-9,26,10,-20,-27,-10,11,-23,-10,0,-20,-3,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-37,-7,3,-30,-20,-17,-23,11,-30,-17,-13,55,-3,-3,-10,-10,-27,-27,-23,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00463;
//
ID   CYTOCHROME_B559_MP; MATRIX.
AC   MP00537;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome b559 subunits heme-binding site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7941041; R2=0.0139963; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=845; N_SCORE=16.611; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-13,-19,-24,-17,-3,-17,0,14,-9,12,47,-11,-19,0,-9,-14,-8,5,-23,-3,-9;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,-3,-13,-7,-2,-18,-9,-11,-13,-5,-16,-11,0,-5,2,-8,17,16,-8,-26,-14,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=7,-4,-9,-9,-8,-9,0,-11,-5,-8,-6,-5,-2,-8,-7,-10,6,8,-2,-15,-9,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-21,-7,-9,-19,22,-14,-21,-10,-19,-13,-4,7,-11,-11,0,-8,-17,-17,-19,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-15,-5,-6,-14,-5,-8,-10,-2,-13,-4,5,-13,-3,-3,7,6,-7,-25,-12,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-15,-1,-1,-16,-9,-7,-14,1,-16,-9,10,-6,2,-1,8,15,-12,-23,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,13,-23,13,22,-23,-14,-3,-20,1,-17,-14,10,-10,7,-4,3,-1,-19,-31,-17,14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-26,0,15,-24,-17,0,-24,17,-19,-10,3,-11,20,28,-1,-5,-21,-22,-12,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-29,-10,-3,-22,-19,-19,-11,-10,-20,-13,-16,50,-11,-17,-5,-4,-12,-28,-23,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,-22,-28,-20,23,-28,-17,3,-9,2,2,-16,-25,-20,0,-15,-7,7,-10,9,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-4,-12,-9,-8,-12,-11,-15,-8,-10,-16,-11,1,-15,-8,-10,19,18,1,-32,-14,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,5,-30,12,-6,5,-23,13,-14,-6,-11,-11,-6,-23,-6,-10,-13,-10,-17,5,44,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-36,-21,-11,-19,-27,-24,5,-17,-12,-6,-20,51,-14,-24,-14,-10,-9,-26,-19,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-16,-29,-23,48,-26,-20,-4,-23,3,-4,-13,-23,-29,-16,-6,11,0,-4,16,-23;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-34,-30,11,-33,-29,31,-24,13,11,-26,-27,-29,-23,-14,-4,37,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26,17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,107,48,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-34,-30,-34,-24,9,-27,-24,7,-26,23,5,-33,-30,-20,-20,-33,-17,-2,40,10,-21;
MA   /M: SY='A'; M=25,-16,-12,-22,-16,-12,-12,-23,5,-14,-4,-3,-14,-16,-15,-19,5,4,15,-25,-15,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,40,-26,17,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-13,-12,-10,-19,7,-18,-16,-12,-18,-13,-2,-12,-10,-16,17,11,-6,-27,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,30,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=23,-6,-13,-15,-12,-18,3,-20,-15,-12,-13,-12,-5,-12,-12,-16,12,17,-5,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=10,-1,-10,-8,-7,-15,-11,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-11,25,33,-3,-32,-15,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,4,-31,-26,29,-25,26,15,-29,-29,-25,-21,-18,-5,33,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-19,-38,-28,75,-28,-19,-1,-29,8,-1,-18,-29,-38,-19,-17,-8,-1,7,27,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-38,-30,52,-32,-23,14,-29,13,6,-22,-28,-34,-22,-19,-9,13,-2,18,-30;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-18,-25,-17,0,-16,-20,8,-23,25,8,-21,-23,-17,-20,-14,-6,5,-21,-7,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=15,-19,-25,-23,-15,-10,-5,-21,-17,-14,-19,-16,-16,-18,-12,-18,-2,-7,-14,37,-2,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='F'; M=6,-13,-14,-22,-16,19,-16,-19,-8,-17,-5,-8,-8,-17,-20,-16,6,13,-1,-14,1,-16;
MA   /M: SY='A'; M=29,-16,-11,-22,-16,-13,-11,-23,4,-14,-4,-3,-15,-17,-16,-20,5,1,16,-25,-16,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-16,-19,-13,-7,-13,-4,6,-10,2,31,-9,-16,0,-10,1,1,3,-27,-7,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-23,-4,9,-29,-20,-1,-16,3,-16,-4,0,-10,35,3,7,11,-19,-24,-10,22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-24,-29,-26,38,6,-20,-14,-26,-3,-6,-13,-26,-32,-20,-13,-14,-10,-2,7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-27,3,-36,-27,39,-30,30,20,-24,-24,-20,-26,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00464;
//
ID   CHEMOTAXIS_TRANSDUC_1_MP; MATRIX.
AC   MP00538;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial chemotaxis sensory transducers signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9401586; R2=0.0112316; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1789; N_SCORE=24.023; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=228; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-7,-8,-15,-22,-13,1,-6,-9,-4,-2,-16,-5,3,-1,-3,0,-27,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=9,-14,-16,-22,-16,-7,-21,-22,7,-18,7,1,-12,-16,-14,-18,1,15,8,-24,-9,-16;
MA   /M: SY='S'; M=15,-2,-14,-4,1,-24,-4,-9,-18,-6,-24,-14,4,-10,8,-9,27,11,-11,-32,-18,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-27,-34,-26,-3,-34,-27,40,-27,13,14,-16,-19,-17,-27,-11,-6,24,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-10,-17,-11,-16,-6,-19,-5,-12,-11,-9,-9,-14,-11,-17,14,5,7,-27,-18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=34,-5,-14,-12,2,-21,-6,-16,-14,-6,-12,-12,-7,-8,-5,-15,9,4,-5,-23,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=6,23,-16,6,-4,-19,-2,-1,-16,-4,-23,-16,35,-16,-4,-6,11,6,-19,-34,-19,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,30,-37,-20,7,-23,10,-20,-5,0,-7,50,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=38,1,-14,-4,-5,-24,-2,-16,-15,-8,-14,-14,-5,-10,-8,-18,8,-2,-5,-24,-20,-6;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-14,-16,-7,-20,-4,-15,-15,-3,-14,-11,-6,-12,-5,-3,10,0,-5,-22,-18,-7;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=2,6,-26,12,46,-28,-16,-4,-26,6,-18,-18,-2,-2,14,-4,2,-8,-24,-28,-20,30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,11,42,-35,-20,5,-25,10,-20,-11,0,-5,38,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-30,-2,4,-30,-2,-12,-32,36,-30,-12,0,-12,4,20,-8,-12,-22,-20,-14,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-30,57,30,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,15,-7,5,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,26,-30,20,-20,-7,3,-20,10,52,-10,-13,-23,-23,-2,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,15,-35,-20,33,-23,5,-20,0,3,-13,47,7,-3,-13,-30,-23,-2,30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-30,4,23,-33,-20,13,-26,18,-23,-7,1,-9,34,12,-4,-11,-27,-23,-9,28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00465;
//
ID   PYROKININ_MP; MATRIX.
AC   MP00539;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyrokinins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7972047; R2=0.0095662; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=649; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=492; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-52; D=-20; I=-20; B1=-800; E1=-800; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-81,-60,-48,-77,-74,-54,-82,66,-76,-65,-53,-71,-40,100,-60,-63,-76,-75,-63;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-75,-88,-64,54,-75,-89,-72,-71,52,34,-63,-73,-78,-58,-57,-75,-73,-72,-87,-76; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-64,-86,-75,-80,-61,45,-66,-84,-76,-82,-76,-66,-83,-70,-79,50,-66,-82,-66,75; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=41,-83,-87,-84,64,-80,-68,-69,-81,-65,-66,-82,-90,-80,-81,-70,-74,-68,-56,76; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-68,-83,61,-59,-92,-66,-63,-91,-65,-94,-87,67,-80,-63,-73,51,-58,-88,-106,-82; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-69,-90,61,-58,-95,-72,-72,-90,-70,-94,-87,-60,69,-68,-79,50,-62,-88,-100,-85; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-76,-88,-62,-62,-90,-77,-63,-92,53,-91,-79,66,-83,-55,59,-66,-68,-89,-93,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-72,-84,-71,53,-68,-94,-80,-50,-74,35,-57,-84,-83,-68,-78,-78,-70,45,-92,-74; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=41,-82,-85,-84,63,45,-82,-77,-82,-73,-74,-74,-85,-83,-86,-65,-74,-74,-72,-60; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-76,-93,-60,54,-92,-87,-67,-95,53,-89,-80,-66,-76,-50,59,-71,-73,-88,-88,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-55,-72,-51,-54,-78,46,-55,-74,-52,-75,-65,67,-66,73,-58,-44,58,-70,-81,-69;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-72,-74,-60,-59,-75,-58,-37,-59,-39,116,-66,-71,73,-59,-63,-58,47,-77,-55;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-84,-51,54,-67,-66,-62,-77,-54,-79,-72,66,69,-53,-63,-60,-61,-80,119,-58;
MA   /M: SY='F'; M=-76,-71,-88,-84,122,-83,-68,-49,-79,-40,-51,-77,-86,-90,-76,-74,-67,-54,-40,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-48,-67,-64,-67,-68,46,-70,-52,-64,-63,-60,-53,-67,-62,-69,52,58,46,-83,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-70,-74,-19,-78,-37,-56,-65,-53,-50,-72,-83,-61,-62,-66,-65,-62,-27,135;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-86,-85,-49,-91,-86,108,-79,-32,-35,-76,-74,-76,-83,-74,-58,-19,-73,-56;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='V'; M=-52,-66,-83,-77,-54,-84,-86,-19,-75,-39,-42,-78,-79,-77,-76,-66,-50,103,-88,-62;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00466;
//
ID   FERRITIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00540;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ferritin iron-binding regions signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5647058; R2=0.0132426; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1160; N_SCORE=19.916; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=147; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-12,-30,-28,-2,-30,-28,30,-20,10,10,-28,-28,-26,-20,-10,-1,45,-29,-9,-27;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,18,-30,-20,18,-30,45,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-30,4,20,-28,-19,7,-28,18,-26,-13,-1,6,9,8,-4,-9,-25,-27,-12,13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-27,0,-10,-27,36,-6,-33,-6,-30,-18,17,-19,-10,-8,1,-13,-29,-26,-23,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-28,-15,-32,-26,28,-26,-24,13,-24,14,5,-24,-28,-30,-20,-14,-5,20,-13,5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,-14,-16,-11,-22,12,-16,-17,-12,-16,-12,-6,-12,-10,-19,11,-2,-7,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-13,2,-30,3,15,-27,-20,21,-30,27,-26,-9,3,-11,12,17,-8,-13,-24,-24,-3,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-29,-8,2,-21,-21,-6,-25,32,-17,-7,-3,-17,7,43,-12,-10,-17,-20,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-30,15,44,-28,-19,12,-30,12,-22,-16,4,-5,17,4,-2,-11,-29,-29,-14,30;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-10,-20,-11,-2,-17,-15,-5,-9,-8,-3,-2,-6,-16,8,-3,3,-1,-9,-26,-10,3;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-15,8,-29,14,29,-25,-20,35,-28,1,-18,-11,4,-10,12,-1,-6,-14,-28,-30,-4,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,44,-30,-20,2,-30,20,-23,-16,0,-4,17,8,-3,-10,-27,-27,-15,30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-29,-3,-5,-22,2,67,-32,-12,-22,-5,7,-20,2,-5,-7,-19,-29,-27,7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-11,-20,-11,-17,-2,-17,-9,-10,-9,-9,-11,-11,-10,-19,8,-1,-1,-17,-13,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-20,17,-30,43,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-23,-20,-30,-20,1,-23,-12,20,-18,25,35,-22,-22,-10,-17,-19,-9,11,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,5,23,-30,-20,-7,-30,40,-27,-13,0,-7,13,22,-7,-10,-23,-23,-13,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-25,-23,-20,23,-27,4,6,-15,11,14,-20,-27,-13,-13,-20,-10,-1,7,42,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-28,1,13,-32,-20,-2,-20,20,-21,-5,0,-10,30,12,-3,-5,-21,-22,-10,21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-28,-12,-21,-26,58,-21,-32,-20,-25,-16,-4,-21,-21,-20,-1,-18,-20,-21,-28,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=12,-25,-14,-29,-24,-5,-24,-27,22,-19,8,7,-23,-23,-23,-22,-7,-2,32,-25,-11,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-25,-17,12,-27,-18,7,-15,13,6,-20,-25,-14,-10,-15,-4,10,-17,1,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-29,-21,-32,-23,31,-30,-15,12,-28,33,12,-26,-30,-24,-19,-26,-10,5,-6,18,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-27,-3,10,-29,-19,20,-18,0,-14,0,0,-14,36,3,0,-8,-23,-24,-5,22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,30,-28,44,13,-35,-9,-5,-33,-3,-29,-26,12,4,-2,-12,5,-5,-26,-38,-21,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-18,-1,8,-27,-19,-6,-20,20,-22,-9,3,-14,13,11,-3,-5,-16,-26,-13,10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-26,1,4,-28,-5,-11,-29,26,-28,-13,3,-12,3,13,-1,-5,-19,-24,-15,3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-12,-2,-28,-21,-21,-16,-11,-27,-18,-21,81,-12,-20,-10,-9,-24,-30,-28,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-24,4,12,-23,-15,-12,-17,-6,-18,-15,-3,9,-1,-11,7,4,-16,-31,-19,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-25,-3,9,-25,-16,-3,-24,17,-22,-10,2,-12,17,25,4,1,-19,-25,-12,12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-28,49,25,-34,-13,-2,-34,1,-25,-25,13,-8,3,-8,2,-3,-26,-37,-19,14;
MA   /M: SY='E'; M=-14,5,-27,11,30,-2,-21,-5,-23,-2,-13,-16,-3,-9,1,-7,-5,-10,-22,-21,-7,17;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-22,-41,-19,-10,7,-20,-21,-21,-14,-17,-19,-25,-23,-14,-16,-27,-22,-26,84,17,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00181;
//
ID   TP1_MP; MATRIX.
AC   MP00541;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nuclear transition protein 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0388012; R2=0.0095850; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1541; N_SCORE=18.809; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-25,-7,-15,-27,52,-17,-35,-17,-30,-20,3,-17,-15,-17,10,-10,-25,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,30,-17,15,0,-20,0,5,-20,-3,-30,-20,47,-17,0,-3,18,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=22,-4,-10,-11,-7,-16,-7,-17,-13,-10,-15,-13,-1,-10,-7,-14,21,23,-3,-29,-16,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,58,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-3,-14,-22,-28,52,-22,-38,-22,-28,-20,-4,-24,-22,-22,-2,-18,-26,-25,-30,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,27,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,24,4,-18,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-13,1,-4,-17,-4,-8,-13,-9,-24,-16,17,-16,-4,-9,25,12,-6,-39,-19,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-15,42,-20,-25,-25,22,-25,-35,-25,-25,-20,-10,-30,-25,-25,-5,-15,-20,-34,-30,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,30,-17,15,0,-20,0,5,-20,-3,-30,-20,47,-17,0,-3,18,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00467;
//
ID   COMPLEX1_30K_MP; MATRIX.
AC   MP00542;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3334136; R2=0.0152710; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=715; N_SCORE=16.242; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-29,-11,-4,-19,-22,0,-14,10,-15,-3,-8,-1,0,13,-11,-9,-11,-23,-7,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-14,-34,-29,0,-34,-29,34,-25,16,13,-26,-27,-26,-24,-15,-5,38,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-19,-5,4,-28,-18,-17,-23,-9,-28,-20,-12,51,-7,-17,-1,-6,-25,-34,-27,-4;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-10,-3,-3,-17,-5,-12,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,26,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-15,-31,-27,5,-30,-27,26,-23,15,11,-26,-27,-26,-21,-13,-1,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-11,-18,-14,-4,8,-24,-14,-4,-12,-5,-6,-10,-17,-13,-12,1,11,1,-18,2,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-10,-25,-9,-8,-16,-2,-18,-25,-10,-25,-19,-9,-10,-9,-14,-2,-8,-21,17,-8,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-18,-34,-27,18,-32,-25,25,-26,23,13,-26,-28,-27,-22,-19,-6,26,-18,2,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-35,-33,-26,36,-26,-9,-8,-20,-5,-8,-27,-30,-22,-17,-27,-18,-15,69,45,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-27,0,4,-26,-9,-9,-24,10,-27,-15,3,7,2,6,3,-3,-21,-29,-18,2;
MA   /M: SY='S'; M=8,7,-15,0,-5,-20,7,-9,-20,-9,-25,-18,17,-14,-5,-10,22,11,-15,-34,-20,-5;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-10,-19,-1,-19,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-19,12,3,0,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-23,29,4,-26,1,2,-25,-2,-28,-21,36,-17,-3,-6,5,-5,-26,-37,-20,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-42,-40,-30,29,-23,-27,-14,-23,-12,-14,-34,-30,-26,-20,-34,-24,-22,111,30,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-28,-19,-10,3,-26,3,-2,-13,8,5,-17,-24,4,-9,-18,-12,-11,5,21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=5,-17,-9,-22,-19,-9,-21,-23,12,-19,-3,0,-12,-19,-16,-20,5,7,17,-30,-12,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-24,-31,-25,-21,20,-21,-6,-10,-16,-11,-10,-21,-26,-15,-14,-15,-11,-15,52,39,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,27,51,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-36,-28,63,-30,-16,4,-27,14,3,-22,-30,-34,-19,-21,-10,2,7,30,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-30,-10,-18,-29,60,-18,-39,-14,-29,-19,0,-20,-17,-10,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-24,-34,-29,-3,-25,-29,34,-26,11,13,-21,-23,-23,-26,-15,-8,29,-23,-6,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-15,-17,-19,-15,10,-19,-12,-2,-14,-3,-2,-9,-21,-13,-9,3,5,1,-17,6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-18,-23,-26,-23,50,-26,-3,-3,-19,1,-3,-10,-29,-24,-14,-16,-8,-7,10,41,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-23,7,13,-16,-19,-6,-13,-7,-5,-9,-2,-13,0,-9,-2,-1,-12,-28,-11,6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-24,-4,-11,-19,22,-10,-21,-12,-15,-12,13,-21,-11,-11,-1,-9,-21,-27,-20,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,2,-22,-20,79,-30,1,-22,-2,8,-18,10,6,-10,-18,-28,-28,14,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-37,-8,2,-30,-19,-18,-22,1,-30,-18,-15,68,-6,-10,-8,-9,-27,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,31,-25,41,17,-31,-13,4,-34,4,-26,-23,17,-13,3,3,-1,-9,-28,-34,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-24,-16,4,-24,-18,12,-26,35,12,-22,-26,-16,-18,-17,-4,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,0,-28,-4,1,-21,-16,1,-28,25,-22,-12,11,-19,8,54,-6,-8,-22,-24,-12,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-20,10,-29,-16,19,-27,44,23,-28,-29,-17,-18,-28,-10,9,-17,4,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-16,-21,-16,-2,-22,-12,7,-14,13,22,-13,-18,-8,-12,-5,16,6,-24,-4,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-16,18,-35,33,10,-33,-14,-9,-31,-5,-29,-26,1,27,-5,-14,-6,-11,-30,-26,-21,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-5,-30,-1,11,3,-25,12,-13,-2,-9,-8,-10,-18,4,-6,-11,-10,-19,4,37,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-25,1,-11,-28,41,-13,-34,-15,-29,-20,4,-16,-13,-16,9,-7,-25,-27,-25,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-28,-28,-32,-24,34,-21,-21,-9,-23,-5,-9,-21,-26,-25,-18,-16,-11,-11,44,19,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-23,-5,10,-17,-21,-12,-4,-3,-9,-6,-6,-13,0,-5,1,-3,-2,-29,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-28,-16,-22,-9,51,-20,-32,-22,-22,-16,-4,-22,-24,-20,-4,-18,-24,-14,-19,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-7,-33,-11,-12,-1,-18,33,-21,-12,-18,-9,2,-24,-5,-8,-16,-17,-26,24,20,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-21,-31,-20,25,-29,-18,13,-27,35,15,-25,-29,-20,-18,-25,-10,5,-12,7,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13,-3,-15,-22,-4,-20,19,-7,-4,-6,-21,4,51,-14,-10,-14,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,57,18,-38,-12,-2,-38,10,-30,-26,16,-10,2,-2,-2,-10,-28,-36,-18,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00468;
//
ID   HLYD_FAMILY_MP; MATRIX.
AC   MP00543;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HlyD family secretion proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1160278; R2=0.0093846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1748; N_SCORE=16.520; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=681; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-39; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=16,-72,-60,27,-66,-68,-65,51,52,-56,32,-57,-65,-51,-51,25,7,-47,-76,-63;
MA   /M: SY='D'; M=-61,37,49,-56,-63,-76,-68,26,-64,11,-50,-62,40,44,-68,-63,-57,47,-83,-64;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-73,10,54,-72,-66,-59,-1,4,-66,-62,14,-66,-47,32,40,-52,19,-82,-67;
MA   /M: SY='K'; M=42,-73,10,29,-79,-62,34,-76,69,-74,-65,-51,-64,21,-42,2,-55,-69,-78,-65;
MA   /M: SY='T'; M=16,-69,-51,5,-76,-61,-57,-70,26,-73,-64,56,15,45,-52,4,58,-65,-82,-68;
MA   /M: SY='T'; M=16,37,7,1,-60,-72,-69,40,-64,25,-49,-59,-68,-63,-70,-52,67,-44,-81,-63;
MA   /M: SY='T'; M=16,-67,-67,-68,-57,-6,-67,25,-66,44,-46,13,-71,-63,-70,25,46,-46,-78,-62;
MA   /M: SY='S'; M=-53,-71,-62,2,-66,-6,-64,39,2,-57,31,-55,-67,-53,31,60,8,-2,-78,-63;
MA   /M: SY='N'; M=-61,-73,10,-57,-62,-5,-54,-65,2,-70,-63,67,41,-56,6,-50,46,-6,-73,47;
MA   /M: SY='D'; M=31,-73,78,6,-80,35,-61,-73,1,-75,-71,-47,-66,-55,-62,2,-56,-7,-85,-71;
MA   /M: SY='G'; M=-59,-76,10,43,-73,46,-58,-73,41,7,-63,40,-67,-49,8,-55,-60,-72,-78,-69;
MA   /M: SY='K'; M=-64,-79,50,8,-79,-70,61,-82,86,-78,-67,-45,-65,-42,13,-57,-59,-78,-81,-62;
MA   /M: SY='H'; M=-63,-77,-54,43,-57,18,61,-65,26,23,-55,13,14,-51,-55,-60,-62,-67,-68,48;
MA   /M: SY='I'; M=-66,-78,-74,0,-54,-83,-73,74,-66,37,-41,-74,57,-66,4,-70,-60,-36,-74,-61;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-81,11,44,-80,-66,-55,-73,-51,-17,-65,55,78,61,-58,-55,-57,-75,-81,-71;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-72,-85,-79,-43,-88,-74,69,-78,73,-31,-81,-80,-72,-78,-76,-61,-30,-72,-54;
MA   /M: SY='R'; M=-54,-75,-55,28,-78,35,-58,-81,42,-78,-69,-50,-66,-45,59,51,-54,-75,-77,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-72,-57,2,-52,-61,-52,-65,-58,-15,-60,39,41,-54,-63,60,-50,-65,-61,76;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-69,-84,-74,-48,-78,-57,-34,-69,39,134,-73,-73,-60,-66,-72,-61,-42,-73,-50;
MA   /M: SY='Q'; M=51,-70,-57,5,-78,-59,-60,-70,26,-71,-63,-53,15,61,-52,26,31,-63,-77,-68;
MA   /M: SY='V'; M=17,-70,-76,-75,-61,45,-79,42,-72,-48,-49,-67,-73,-72,-76,-59,-56,69,-80,-65;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-72,-53,29,-74,-70,-60,-2,53,-66,-60,-50,-62,62,-45,-47,74,-59,-79,-65;
MA   /M: SY='A'; M=70,-63,-65,-62,-71,-3,-69,-56,-62,-64,-60,-57,-66,-60,-68,27,47,20,-80,-69;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-72,11,77,36,-76,-62,-55,-54,-60,-61,-58,-63,-51,-61,-55,46,34,-76,-58;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-71,-76,-75,-52,-83,-78,80,-72,14,-40,-68,-71,-71,-76,-60,58,26,-78,-59;
MA   /M: SY='K'; M=-65,-76,-65,-54,36,-76,-63,39,75,-58,-56,-57,-69,-50,49,-60,5,-54,-68,-54;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-66,-64,-64,-60,-74,-70,40,0,11,-49,-54,-64,-63,-65,-46,95,-42,-82,-62;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-58,26,-83,98,-68,-90,-65,-85,-75,-51,-66,-61,-73,-50,-67,-83,-74,-77;
MA   /M: SY='M'; M=-59,-75,-48,71,-72,-71,-56,-67,62,-62,75,-54,-61,-42,-43,1,6,-65,-77,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-82,-61,-49,-77,-75,-53,-82,55,-76,-64,-54,-72,-40,105,-60,-63,-76,-75,-63;
MA   /M: SY='S'; M=-48,-66,-57,-56,-73,-58,-59,-71,-48,-73,-66,-47,-64,-50,47,85,59,-63,-82,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-72,-82,-78,15,-83,-69,29,-74,14,-42,-78,-80,-73,-74,-70,-58,69,61,65;
MA   /M: SY='I'; M=-68,-75,-84,-81,65,-85,-67,74,-75,-3,60,-75,-78,-73,-75,-73,-62,-34,-55,49;
MA   /M: SY='N'; M=-51,-68,-45,4,-77,-53,-50,-75,-50,-79,-69,84,-67,46,-55,74,-43,-72,-85,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-72,-83,-74,-75,21,-78,-43,-58,-67,-54,-52,-75,-83,-63,-65,-68,-68,-64,91,126;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-70,-84,-77,54,-83,-63,-36,-76,73,61,-80,-83,-71,-73,-75,-64,-43,-60,24;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-70,-82,-74,39,-85,-68,-36,-3,83,-32,-80,-83,-70,-69,-75,-63,-43,-66,-48;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-69,62,-47,-78,-55,-57,-77,26,-79,-73,-42,-64,-48,-55,89,-42,-71,-85,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-65,-88,-65,-53,-81,-70,-68,-3,41,-77,-66,-67,115,-60,-60,-63,-59,-71,-77,-77;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-71,-85,-79,38,-86,-72,43,-78,73,-32,-81,-82,-74,-77,-76,-62,4,-67,-48;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-75,-51,77,12,-75,-53,-57,-54,-10,87,-64,-65,-47,-59,-62,-61,-58,-64,48;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-80,62,77,-84,46,-57,-86,-49,-81,-75,-49,-62,-45,6,-55,-62,-80,-83,-73;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-62,-81,-73,-70,-81,-71,33,-79,-63,-76,57,-62,-79,-60,30,73,-58,-76,-94,-72; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=14,-81,-87,-79,-72,-86,-86,26,23,-57,31,-80,-85,-76,-73,-73,-66,55,-92,-74; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-82,7,-68,-83,-8,89,-84,-71,-82,-73,-57,-77,-67,-73,0,66,-78,-104,-67; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-69,-87,-54,77,-85,-83,-70,-78,1,-18,-75,-69,-73,-54,-65,23,-67,-9,-92,-81; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=42,-75,-72,-70,-87,-62,-74,-83,-71,-86,-80,-62,-77,-64,-75,79,-53,-73,-93,-80; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-70,-75,-82,-75,-53,-88,-71,-45,-68,72,-41,-77,-84,-69,30,-72,29,-50,-80,-62; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-77,-60,-59,-77,55,34,-81,-41,-77,-66,15,-71,-50,82,-52,5,-75,-78,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-77,-37,92,-81,-70,-55,-78,-46,-76,-70,39,42,-41,-56,-52,30,-73,-83,-73;
MA   /M: SY='R'; M=-63,-78,-56,4,-72,-70,-53,-3,-35,-15,-59,39,-72,46,87,1,-59,-66,-78,-63;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00469;
//
ID   METMALONYL_COA_MUTASE_MP; MATRIX.
AC   MP00544;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Methylmalonyl-CoA mutase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6758671; R2=0.0142793; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1267; N_SCORE=22.758; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,14,-21,0,-9,-10,-13,-3,-1,-11,-5,-5,28,-22,-7,-9,-3,-4,-12,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='P'; M=12,-11,-23,-10,-3,-24,-9,-17,-17,-10,-24,-17,-8,33,-7,-17,10,2,-16,-30,-24,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-34,-26,47,-17,-20,0,-29,16,3,-20,-29,-32,-20,-20,-11,-1,-2,14,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-28,52,12,-36,-1,-4,-37,-3,-28,-27,16,-11,-3,-11,2,-6,-27,-37,-20,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-26,3,29,-13,-22,4,-18,0,-13,-10,-5,-10,9,-4,-5,-10,-17,-24,-8,19;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-16,-14,-3,-21,-7,-18,-13,-8,-13,-12,-9,4,-7,-17,8,4,-6,-23,-20,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-27,-19,9,-27,-13,20,-23,31,18,-23,-24,-15,-17,-23,-9,9,-11,10,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-23,-12,-12,-28,36,-16,-28,-13,-22,-14,-3,-15,-7,-16,3,-12,-20,-20,-24,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-24,-14,1,-28,-16,11,-23,34,14,-23,-25,-9,-15,-20,-2,4,-21,-2,-12;
MA   /M: SY='P'; M=0,-16,-33,-10,-1,-28,-15,-19,-19,-10,-27,-19,-15,65,-9,-19,-1,-5,-24,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='T'; M=1,10,-16,8,3,-19,-15,-14,-18,-6,-15,-15,3,-9,-5,-10,13,25,-9,-31,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,26,-26,38,7,-32,-1,-8,-30,-3,-24,-22,9,-13,-6,-11,-1,-9,-19,-34,-20,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-21,-36,-26,69,-29,-19,-3,-22,6,-1,-18,-28,-35,-15,-19,-10,-2,7,26,-26;
MA   /M: SY='S'; M=17,-4,-13,-5,-2,-21,-2,-13,-18,-10,-26,-18,3,0,-3,-13,29,13,-10,-35,-21,-3;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-18,-14,0,-18,-10,-13,-14,-1,-8,-8,-9,-13,-3,2,1,-4,-7,-21,-16,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-12,-9,-6,-14,-20,-16,-11,-8,-11,-9,0,-10,-2,-8,18,43,-4,-29,-10,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-28,-2,12,-35,-10,4,-23,7,-22,-5,1,-12,42,11,3,-8,-27,-22,-13,27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-32,-23,4,-33,-24,30,-28,32,17,-23,-24,-19,-23,-21,-5,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-34,-26,11,-34,-22,30,-27,26,15,-25,-26,-22,-23,-22,-9,21,-15,7,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-7,-26,-8,7,-26,-20,-2,-12,4,-5,2,-7,-14,30,3,-7,-9,-17,-20,-9,19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-30,15,49,-31,-20,8,-28,9,-20,-15,1,-3,27,2,-1,-11,-30,-28,-16,37;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,6,-8,-8,-17,-9,-16,-15,-13,-22,-16,1,-15,-8,-13,26,19,-3,-39,-19,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-28,-3,-5,-23,18,25,-29,-13,-20,-10,7,-19,-5,-10,-5,-16,-27,-26,-9,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-24,-18,-30,-24,9,-31,-25,22,-23,16,9,-21,-24,-23,-21,-11,4,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-3,8,-6,-12,-23,1,-20,-26,-15,-21,-18,-5,-9,-15,-18,3,4,-15,-32,-23,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-29,-5,4,-24,-19,-3,-29,36,-24,-11,3,-16,9,52,-9,-9,-21,-21,-11,4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-13,-22,-19,-5,-27,-26,17,-16,3,3,-23,-19,-22,-17,-5,6,32,-30,-12,-21;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-22,-28,-23,-4,-27,-23,27,-23,13,10,-14,-21,-18,-23,-12,-6,20,-23,-6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=7,-24,-28,-28,-19,-3,-13,-23,-11,-17,-8,-11,-23,-21,-15,-19,-13,-12,-12,49,4,-15;
MA   /M: SY='G'; M=14,-9,-23,-12,-16,-27,46,-19,-30,-17,-25,-17,-2,-17,-16,-19,6,-12,-20,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-23,-31,-24,-21,19,-24,4,-6,-12,-6,-6,-23,-27,-12,-14,-20,-13,-13,49,55,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-24,-21,32,-28,12,3,-13,4,9,-20,-28,-12,-11,-20,-10,-6,20,61,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-32,-28,0,-31,-25,33,-21,14,20,-26,-26,-23,-21,-14,-4,40,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-19,0,10,-20,-11,-9,-22,1,-24,-17,3,-10,3,1,18,10,-15,-24,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-16,27,-28,27,4,-22,-10,8,-27,0,-26,-20,25,-18,-1,1,-2,-8,-28,-19,-7,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-26,21,24,-29,-13,-1,-29,7,-25,-19,7,-9,13,9,7,-4,-24,-32,-17,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,38,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=25,-15,-15,-20,-16,-10,-1,-15,-6,-13,-8,-6,-14,-17,-14,-18,1,-4,3,-14,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-16,5,-30,10,23,-26,-19,16,-31,15,-22,-14,4,-11,12,24,-6,-12,-26,-27,-9,15;
MA   /M: SY='K'; M=4,-4,-24,-6,9,-26,-14,-8,-24,20,-20,-10,-3,-11,10,20,-2,-7,-16,-21,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00470;
//
ID   ALDOSE_1_EPIMERASE_MP; MATRIX.
AC   MP00545;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldose 1-epimerase putative active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0380301; R2=0.0138771; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=435; N_SCORE=11.065; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-34,-27,3,-34,-27,34,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-15,-10,-7,-15,-17,-17,-8,2,-16,-8,-4,-15,-7,-2,11,15,4,-30,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-35,-28,1,-33,-25,37,-25,21,22,-24,-24,-21,-23,-18,-7,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-24,8,29,-20,-19,-5,-18,0,-10,-13,4,-9,7,-4,0,1,-19,-30,-16,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,14,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-28,5,29,-28,-18,-3,-27,18,-20,-14,-1,-8,17,18,-2,-9,-23,-24,-16,22;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-12,-14,-9,-21,8,-17,-16,-11,-17,-14,-4,-11,-9,-17,16,3,-6,-25,-21,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-20,-8,0,-9,-18,-8,-10,13,-12,-2,-6,-13,7,7,-7,-6,-6,-14,-3,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-17,-11,-18,-14,3,-18,-14,16,-16,20,10,-16,-16,-12,-13,-13,-4,13,-12,-1,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-12,-5,-8,-13,-11,-13,-4,-10,-9,-3,-4,-14,-8,-12,10,9,4,-28,-13,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-13,-5,-15,-15,-19,3,-19,-16,-5,-17,-10,-9,-21,-14,-5,-1,-7,-3,-27,-19,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,4,-24,8,0,-24,-1,-8,-23,-5,-15,-12,2,-16,1,0,1,-2,-18,-28,-16,0;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-29,21,18,-32,-4,-2,-31,12,-27,-18,12,-11,10,3,-1,-10,-28,-29,-18,14;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-16,-2,-5,-20,-9,-16,-13,-10,-19,-14,-2,-1,-8,-14,16,10,-4,-33,-19,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,5,-12,-12,-11,-21,-21,-12,-12,-11,-11,-2,-14,-12,-12,16,43,-1,-32,-12,-12;
MA   /M: SY='P'; M=15,-16,-24,-16,-9,-23,-3,-21,-13,-12,-18,-13,-15,27,-13,-20,-1,-6,-10,-25,-24,-13;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-16,-32,-27,7,-28,-27,25,-23,14,9,-25,-26,-26,-22,-13,-4,31,-22,-4,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,35,-19,17,0,-20,0,7,-20,-1,-30,-20,53,-19,0,-1,14,3,-27,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-29,-19,2,-27,-15,19,-22,29,28,-25,-13,-13,-18,-24,-10,8,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-10,-10,-10,-12,-13,-18,-6,-12,-15,-10,-2,-14,-10,-12,22,25,7,-35,-15,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-33,-28,-40,-30,62,-27,-23,-5,-27,2,-5,-25,-30,-35,-20,-25,-15,-8,47,30,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='N'; M=6,15,-20,10,4,-25,6,-5,-24,-5,-24,-19,19,-13,-3,-10,10,-3,-21,-32,-21,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,13,-25,10,1,-27,8,-6,-30,9,-30,-18,18,-15,-1,2,5,-6,-24,-30,-19,0;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-9,-17,-10,0,-4,-15,-13,-9,-2,-9,-7,-9,2,-7,-7,-3,0,-5,-16,-8,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-18,-1,12,-19,-12,2,-11,8,-10,2,-2,-6,23,5,-3,-6,-14,-13,-6,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-12,8,2,-15,4,-1,-14,-2,-14,-9,10,-7,4,-3,5,-2,-14,-16,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-20,6,14,-22,-1,-1,-21,5,-20,-12,9,-8,11,1,5,-4,-20,-22,-14,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=3,-6,-22,-5,2,-23,-11,-12,-20,10,-24,-14,-4,15,0,0,5,-1,-16,-25,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,21,-18,23,4,-24,-8,-7,-24,-6,-25,-21,16,-11,-3,-9,19,15,-16,-37,-17,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-26,7,10,-20,-16,-1,-26,14,-22,-15,3,-14,6,21,1,-4,-20,-23,-5,6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-27,6,-3,-29,36,-11,-34,-11,-29,-21,10,-16,-9,-13,5,-11,-28,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,0,-19,-4,-4,-16,-18,33,-20,-10,-17,-7,6,-14,0,-6,9,16,-14,-31,2,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-28,2,21,-23,-23,5,-17,9,-16,-9,-1,-9,8,2,-4,-5,-17,-26,-9,13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,3,-33,-27,32,-26,26,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,-1,12,-32,-20,-2,-22,22,-22,-5,0,-10,31,14,-1,-1,-22,-21,-10,22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-22,-27,-19,-3,-27,-22,23,-25,15,9,-15,-20,-15,-22,-7,-2,14,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-26,-19,-26,-26,13,-30,-8,17,-16,6,6,-26,-30,-21,-16,-14,-4,23,-3,30,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00471;
//
ID   CYSTEINE_SWITCH_MP; MATRIX.
AC   MP00546;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Matrixins cysteine switch.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9601808; R2=0.0137420; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; N_SCORE=8.564; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,11,-19,-11,-14,-27,-20,2,-13,-5,-1,-19,-25,-9,-15,-7,-5,15,-32,-15,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-23,-10,-6,-19,-20,-20,-14,-10,-19,-14,-9,34,-10,-14,7,23,-13,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-27,-9,-10,-28,33,2,-31,-13,-24,-13,0,-17,-3,-13,0,-16,-25,-22,-18,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-5,-23,-7,6,-18,-24,-14,-7,3,-11,-5,-5,-11,3,-2,0,8,-4,-26,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-25,-20,-8,-12,-25,-15,4,-8,10,6,-17,-9,-2,-9,-15,-9,-3,-21,-8,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-29,46,18,-35,2,-2,-37,-2,-28,-26,18,-11,0,-9,1,-11,-30,-35,-22,9;
MA   /M: SY='E'; M=5,-4,-19,-5,8,-19,-14,-10,-14,-2,-10,-8,-4,-11,6,-6,7,4,-11,-27,-14,7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-21,-1,4,-17,-18,-14,-10,-10,-9,-10,-8,1,-6,-13,3,3,-6,-32,-16,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=6,-5,-15,-12,-8,-15,-17,-20,-12,-10,-13,-12,-5,5,-10,-13,14,33,-5,-28,-15,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-17,-23,-20,-14,-10,-9,0,-1,-15,7,8,-12,-21,-10,-14,-13,-11,-3,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,10,19,-21,-4,-3,-27,2,-22,-17,1,-11,4,-4,2,-7,-23,-22,-6,11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-11,-19,-15,-9,-14,-10,-14,-10,-11,-14,-2,-8,1,-6,-14,8,6,-8,-16,-13,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-25,-25,-32,-22,3,-22,-8,14,-15,18,42,-25,-23,-6,-13,-25,-13,4,6,5,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-17,9,-28,8,5,-25,-16,9,-30,21,-25,-13,13,-17,7,35,-6,-9,-24,-27,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-2,-29,2,3,-28,-15,-12,-25,11,-25,-16,-5,19,-1,7,-5,-8,-21,-26,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,60,-16,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-11,-24,-26,-2,-26,-25,24,-18,5,6,-19,-29,-26,-18,-8,0,41,-31,-11,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,41,-30,59,17,-37,-11,0,-39,4,-29,-27,17,-11,1,1,-1,-10,-29,-37,-19,9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=4,-15,-16,-18,-12,-10,-18,-17,8,-8,1,3,-12,-16,-7,-11,-3,-2,11,-21,-9,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-14,-7,-6,-14,7,-12,-13,-8,-13,-9,-4,7,-8,-10,3,2,-10,-15,-14,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-17,-3,-6,-17,15,1,-20,-3,-17,-10,7,-12,-5,-6,1,-8,-16,-17,-12,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-27,-21,-16,11,-12,-16,-10,-18,-11,-9,-16,10,-21,-18,-10,-5,-11,-11,3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-26,1,14,-24,-15,-2,-20,4,-20,-9,4,4,10,7,2,-4,-21,-29,-17,10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,6,-25,11,9,-10,-22,-11,-11,-9,-6,-10,-3,-14,-7,-12,-6,-4,-9,-26,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=2,-11,-19,-16,-12,0,-3,-15,-15,-6,-13,-5,-6,-16,-12,-8,2,0,-8,-18,-7,-11;
MA   /M: SY='P'; M=3,-16,-24,-13,-2,-15,-17,-17,-7,-14,-2,-7,-15,16,-9,-17,-4,-4,-10,-27,-17,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-1,3,-19,-2,-7,-21,14,-10,-25,-6,-26,-17,13,-16,-6,-2,15,6,-19,-31,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-23,-8,-12,-18,3,-17,-9,-9,-10,-7,-2,-18,-12,-13,-5,-9,-5,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-15,-32,-12,-2,-21,-21,-8,-23,13,-17,-11,-9,13,1,35,-12,-10,-21,-23,-15,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,13,-24,4,0,-21,-12,-1,-20,18,-25,-13,24,-18,2,19,-1,-5,-18,-30,-14,0;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-25,-35,-25,-17,1,-16,-17,-18,-5,-16,-14,-23,-22,-9,4,-25,-19,-22,81,15,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-14,2,-22,5,5,1,-16,8,-19,-2,-11,-9,0,-14,-3,3,-7,-9,-16,-15,2,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-26,-4,9,-21,-22,3,-17,16,-16,-6,-5,-15,3,15,-8,-9,-8,-26,-8,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00472;
//
ID   TRANSGLUTAMINASES_MP; MATRIX.
AC   MP00547;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transglutaminases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8001142; R2=0.0138179; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1290; N_SCORE=22.615; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-13,8,-34,19,17,-33,-17,-9,-29,9,-28,-21,-2,27,2,-4,-6,-10,-28,-31,-21,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-6,9,-24,-22,-2,-19,17,-11,-2,-5,-15,22,23,-10,-10,-19,-21,-9,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-28,4,18,-33,-16,5,-23,13,-23,-7,8,-11,36,14,2,-7,-27,-25,-13,27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-40,-31,-25,19,-24,-5,-14,-17,-12,-11,-29,-29,-16,-16,-30,-22,-22,90,43,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-24,-15,-10,-1,-23,-5,-4,-1,4,1,-11,-24,-7,5,-14,-7,-5,-12,11,-10;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-21,-7,0,-20,-16,-12,-16,12,-18,-10,2,-12,0,8,4,6,-10,-26,-12,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-18,-6,-9,-18,7,-9,-21,-10,-19,-14,6,-15,-8,-7,14,14,-14,-30,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-5,-30,-4,2,-28,15,-2,-33,7,-25,-13,1,-16,3,14,-4,-14,-26,-22,-17,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,5,-13,-15,-2,13,-12,-17,-15,-11,-9,-6,-17,-16,-13,-5,-9,-11,-11,-7,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-25,-8,1,-20,-19,0,-16,13,-15,-1,-1,-16,17,20,-3,-4,-14,-20,-5,7;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-34,-10,-1,-28,-16,-18,-19,-9,-27,-18,-16,66,-6,-18,-4,-7,-25,-29,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-22,-9,-1,-16,-22,-2,-23,22,-20,-9,-6,-13,6,27,-11,-10,-19,-13,5,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-14,-28,-14,-9,28,-28,8,-6,-11,-2,-4,-15,-25,-11,-11,-16,-10,-12,14,51,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-28,63,-20,-38,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-14,-28,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=1,-18,95,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28,-6,-8,-8,-44,-28,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-19,-35,-26,60,-28,-19,2,-28,14,2,-19,-28,-33,-19,-17,-8,1,1,21,-26;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=18,-9,-22,-13,-15,-26,42,-19,-29,-16,-23,-17,-3,-16,-15,-19,6,-11,-19,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-11,-28,-28,-1,-29,-29,27,-19,8,8,-26,-27,-27,-19,-7,5,43,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=10,-20,-16,-26,-17,5,-18,-18,6,-20,18,11,-19,-21,-16,-18,-11,-3,5,-17,-4,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-7,2,45,-10,-16,-17,-19,-16,-22,-16,-20,-17,8,-26,-16,-16,4,9,-13,-42,-22,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-11,-30,-27,6,-26,-28,21,-20,7,6,-26,-27,-28,-20,-8,-1,38,-24,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-8,-28,-20,4,-27,-17,14,-25,35,21,-25,-28,-16,-19,-23,-8,7,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=8,-16,67,-24,-22,-21,-14,-26,-25,-23,-18,-17,-14,-29,-22,-26,-1,-6,-8,-39,-27,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,23,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,30,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-36,-11,-1,-28,-18,-19,-20,-8,-27,-18,-18,73,-9,-15,-8,-9,-26,-28,-28,-9;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-13,-8,-17,-5,-18,-12,-10,-14,-12,-3,-10,-8,-15,19,18,-2,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-11,-22,-22,-5,-24,-25,16,-17,1,2,-18,-23,-21,-17,2,12,31,-31,-11,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,26,-18,10,-4,-18,-1,0,-18,-4,-25,-17,40,-17,-4,-4,12,12,-22,-36,-18,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,64,-30,-7,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,46,-27;
MA   /M: SY='B'; M=-7,23,-21,22,7,-21,-8,-2,-25,-1,-25,-20,23,-14,-1,-2,9,1,-22,-34,-17,3;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,38,18,-9,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='A'; M=47,-10,-11,-19,-11,-21,5,-20,-12,-11,-11,-11,-9,-11,-11,-20,9,-1,-2,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,4,-24,-20,83,-28,-6,-20,0,8,-18,20,2,-8,-18,-30,-28,14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-29,52,11,-37,6,-3,-39,-4,-30,-27,19,-13,-4,-11,1,-11,-30,-36,-22,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00473;
//
ID   RIBOSOMAL_S3_MP; MATRIX.
AC   MP00548;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S3 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5388865; R2=0.0155677; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=524; N_SCORE=13.686; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-14,-26,-14,-3,-15,-24,-14,-6,8,2,2,-14,-10,0,3,-16,-9,-7,-22,-8,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-1,-34,-27,-6,-31,-29,26,-25,8,8,-21,-24,-22,-26,-13,-7,24,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,1,19,-27,-20,-5,-25,28,-21,-10,-2,-10,15,23,-7,-10,-21,-22,-12,16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-33,-28,-1,-34,-29,37,-24,13,13,-21,-22,-22,-24,-12,0,34,-24,-4,-28;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-14,-16,-18,-8,-17,-23,-11,3,-6,-4,3,-11,-19,7,-5,-7,-7,1,-24,-9,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,0,-33,-28,-2,-33,-28,26,-26,14,12,-24,-27,-24,-25,-16,-7,27,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='S'; M=17,-3,-10,-5,-3,-21,2,-13,-19,-9,-25,-18,5,-11,-3,-12,29,13,-9,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,68,-19,-40,-19,-30,-20,0,-20,-19,-19,0,-20,-30,-20,-30,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,7,-31,-22,24,-29,42,19,-28,-28,-20,-21,-26,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-22,4,-4,-23,12,-8,-26,-3,-25,-17,16,-16,-5,-2,7,2,-22,-29,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-19,-5,-12,-20,44,-13,-26,-13,-19,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-19,-13,-19,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=21,-10,-17,-15,-12,-21,9,-19,-15,-7,-16,-11,-6,-15,-11,-13,6,-3,-4,-23,-20,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,13,-28,20,43,-30,-16,-1,-28,6,-20,-19,3,-3,16,-3,1,-9,-27,-30,-19,30;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-20,-28,-26,-16,-8,-28,-13,13,-3,5,16,-12,-20,-5,12,-16,-10,7,-20,-4,-14;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-17,-9,-20,2,-19,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-9,-19,14,2,-2,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='T'; M=2,-9,-12,-12,-10,-10,-17,-15,-6,-6,-11,-7,-7,-17,-10,-6,6,10,3,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-28,12,45,-25,-20,-1,-23,7,-15,-11,-3,-4,16,-1,-3,-10,-23,-28,-17,31;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-13,-20,-15,-8,-14,-13,-16,-23,8,-22,-11,-11,-19,-5,2,-13,-13,-19,16,-3,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-28,-22,30,-24,-9,5,-20,7,4,-18,-26,-21,-16,-16,-8,2,0,26,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-24,-10,-3,-18,-17,-5,-14,12,-12,-1,-1,-16,3,15,-5,-5,-10,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-28,13,26,-21,-18,-2,-23,5,-16,-14,-1,-9,8,2,-4,-9,-20,-24,-9,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-25,-11,-3,-8,-22,-5,-14,10,-12,-6,-5,-18,1,21,-7,-4,-10,-16,2,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-17,-30,-25,0,-29,-22,28,-20,17,21,-24,-25,-20,-19,-14,-1,30,-25,-5,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-21,-5,-1,-25,-13,-15,-21,-8,-29,-19,-4,41,-6,-14,7,1,-22,-34,-25,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-22,-19,-6,6,-20,-4,-25,18,4,-18,-26,-19,-18,-18,-13,-5,-21,-12,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-11,7,-28,8,16,-29,-16,34,-26,1,-22,-8,9,-12,25,2,0,-11,-28,-28,-4,19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-19,-12,-8,-14,-20,-19,-11,-8,-14,-10,-7,11,-9,-11,8,26,-6,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='L'; M=1,-27,-19,-31,-22,7,-27,-23,20,-25,26,12,-24,-25,-21,-22,-18,-7,16,-19,-2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,2,-28,2,11,-24,-16,-1,-28,22,-22,-13,6,-15,10,38,-5,-8,-21,-25,-13,8;
MA   /M: SY='A'; M=20,0,-18,-2,3,-22,-8,-10,-17,-2,-16,-12,-3,-11,1,-10,6,-1,-11,-22,-12,2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,7,-27,8,-1,-14,-17,-4,-13,1,-13,-8,5,-16,-4,-4,-8,-9,-14,-23,-4,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,59,22,-37,-10,1,-37,1,-29,-28,22,-10,2,-8,1,-9,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-14,-27,-15,-14,14,-25,14,-7,-4,-6,-3,-12,-25,-6,-1,-11,-3,-11,9,49,-14;
MA   /M: SY='A'; M=19,-11,0,-17,-16,-20,17,-19,-23,-16,-19,-15,-7,-18,-15,-20,5,-6,-12,-23,-20,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-13,-20,-15,6,-24,-9,-4,-13,-4,-2,-12,-18,-13,-11,-5,1,-1,-14,5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=9,-9,-14,-13,-7,-13,-6,-8,-16,-5,-14,-10,-7,-17,-5,-5,1,-3,-10,-16,-3,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-25,-4,12,-17,-23,-2,-11,-3,-10,-7,-5,-4,2,-5,-1,3,-11,-27,-9,6;
MA   /M: SY='A'; M=34,-15,-11,-23,-15,-14,-9,-23,2,-13,-4,-4,-14,-15,-15,-20,5,2,13,-23,-16,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-25,-10,-2,-14,-21,4,-12,6,-7,2,-7,-18,4,11,-10,-9,-10,-20,-2,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-13,-16,-13,-5,-22,-18,-1,-14,5,4,-8,-15,-11,-12,6,31,3,-27,-7,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-25,-12,-5,-18,-23,-15,-9,10,-13,-5,-5,-7,-1,8,-3,6,-6,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-27,-17,-12,11,-26,5,-4,-10,-1,-1,-15,-15,-4,-9,-14,-7,-11,2,33,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-19,-25,-21,-6,-29,-21,21,-16,6,8,-18,-22,-17,-16,-9,0,24,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-22,-33,-24,6,-33,-23,30,-28,29,17,-24,-25,-20,-24,-22,-9,18,-18,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-28,3,12,-29,-19,-7,-28,37,-27,-11,2,-10,13,23,-5,-6,-21,-23,-11,12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-32,-29,32,-22,11,11,-27,-28,-27,-22,-11,-1,44,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-28,-41,-28,-19,-2,-20,-23,-17,-2,-18,-13,-27,-25,-12,-3,-29,-22,-21,81,14,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-29,1,-38,-29,44,-28,20,18,-21,-22,-21,-28,-19,-8,30,-21,0,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-14,-19,-21,-18,18,-22,-5,3,-16,3,8,-8,-23,-14,-13,-9,-2,-1,-9,18,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-28,-10,-2,-17,-22,-4,-15,16,-12,-4,-8,-9,2,17,-12,-9,-12,-19,-4,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-31,0,-3,-28,18,-15,-30,-9,-28,-20,-3,16,-10,-14,-1,-11,-27,-26,-25,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-28,16,23,-23,-15,-1,-24,3,-18,-14,6,-6,7,-4,-3,-7,-24,-23,-12,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-9,-18,-11,-12,-7,-18,-14,3,-7,-4,-2,-8,-14,-12,-9,-5,-3,7,-20,-5,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: M=-7,-11,-21,-10,-1,-7,-18,-11,-6,-4,0,-2,-10,-6,-5,-4,-8,-6,-7,-19,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: M=-5,-7,-20,-6,-1,-14,-9,-12,-9,-6,-5,-5,-6,-5,-5,-8,-4,-4,-8,-22,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-7,0,-25,4,0,-24,4,-8,-24,1,-22,-14,0,4,-3,-1,-3,-9,-20,-22,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,8,-27,12,12,-28,-12,-4,-27,15,-23,-14,4,-12,6,10,-3,-6,-20,-27,-14,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00474;
//
ID   BACTERIOFERRITIN_MP; MATRIX.
AC   MP00549;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterioferritin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2746496; R2=0.0153591; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=829; N_SCORE=17.997; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-2,-26,35,-26,-6,0,-10,29,22,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-29,46,19,-34,-12,7,-35,7,-28,-23,19,-11,4,-2,-1,-10,-29,-36,-16,11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-31,-9,2,-28,-18,-14,-20,7,-24,-13,-11,33,2,1,-6,-7,-20,-25,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-24,4,14,-24,-16,-10,-19,11,-15,-11,-2,-10,3,1,-2,-6,-15,-26,-14,8;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,40,-29,27,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-25,10,18,-26,-13,-1,-26,10,-22,-16,9,-11,9,16,2,-6,-22,-29,-17,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-27,-15,-6,10,-25,14,-10,-6,-1,-1,-11,-23,-3,4,-15,-11,-13,-6,23,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,32,-20,15,-2,-19,-3,14,-17,-2,-27,-17,50,-21,-1,-1,7,-1,-24,-39,-16,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-27,8,23,-28,-12,-8,-28,19,-23,-15,0,-7,8,7,-1,-5,-21,-25,-16,16;
MA   /M: SY='L'; M=2,-14,-20,-18,-9,-10,-20,-12,4,-15,14,6,-12,-21,-1,-13,-11,-7,0,-22,-8,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-12,-10,-10,2,-15,-20,-1,-18,-11,-3,-17,-10,4,3,4,-11,-22,-12,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-20,-9,-12,-15,13,-14,-15,-16,-8,-9,3,-19,-12,-15,3,-2,-13,-27,-18,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-29,13,47,-27,-21,5,-25,6,-14,-14,-2,-4,19,-1,-3,-11,-27,-29,-15,33;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=12,-12,-13,-19,-17,-12,-9,-23,0,-14,-6,-5,-11,-17,-17,-17,6,15,11,-26,-14,-17;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,4,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-27,-30,-21,-6,-32,-22,25,-13,7,10,-16,-20,-13,-4,-15,-8,18,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-11,39,-22,33,6,-26,-3,5,-26,-1,-30,-23,43,-16,0,-4,10,-1,-28,-40,-20,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-32,-26,-40,-30,66,-28,-22,-4,-28,4,-4,-24,-30,-36,-20,-24,-14,-6,38,30,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-13,-13,-8,-5,-6,-11,-12,-12,-16,-12,-3,-14,-8,-15,17,7,-5,-21,-5,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-21,-31,-21,4,-25,-10,23,-19,31,42,-24,-24,-9,-15,-24,-10,12,-20,0,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-17,-27,-19,-9,9,-27,3,-1,-11,7,5,-16,-24,5,-7,-16,-10,-10,1,28,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-27,21,22,-31,-14,-1,-29,15,-27,-17,11,-9,15,6,3,-6,-25,-30,-16,18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00475;
//
ID   HEMERYTHRINS_MP; MATRIX.
AC   MP00550;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hemerythrin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5599065; R2=0.0158735; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=421; N_SCORE=12.233; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='B'; M=0,19,-22,17,7,-27,-2,-4,-26,4,-26,-19,19,-12,0,-3,7,-3,-22,-32,-19,4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-11,-12,-12,-7,-11,-14,-7,-12,-10,-8,4,-18,-12,-12,4,6,-6,-27,-11,-12;
MA   /M: SY='A'; M=16,-6,-18,-9,-2,-20,-11,-13,-11,-1,-10,-5,-7,-13,-2,-5,2,-3,-4,-24,-15,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-25,16,8,-25,-10,-4,-20,-7,-17,-14,4,-8,2,-10,4,-1,-17,-32,-15,4;
MA   /M: SY='A'; M=4,-3,-19,-11,-8,-15,-16,-6,-2,-10,-4,-2,2,-18,0,-10,-2,-2,-3,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-22,-28,-19,3,-24,-19,17,-23,35,19,-25,-26,-17,-17,-25,-11,8,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-26,12,7,-24,-9,-6,-23,8,-18,-14,7,-15,0,7,-4,-8,-17,-29,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=4,4,-23,4,25,-25,-13,-2,-24,7,-19,-15,2,-7,8,1,3,-4,-20,-27,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-7,-29,-21,8,-25,-21,11,-26,30,12,-25,-28,-21,-20,-20,-8,9,-20,-3,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-23,-25,-18,-3,-30,-18,15,-8,11,9,-19,-24,-14,-4,-17,-8,15,-19,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-25,12,13,-24,-16,-8,-18,5,-17,-13,3,-12,1,2,-2,-7,-13,-29,-16,6;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-17,5,-19,-21,3,-27,-5,1,-18,0,3,-18,-29,-19,-17,-13,-8,8,-20,8,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-16,-15,-24,-18,8,-24,-22,6,-19,6,1,-13,-18,-19,-17,-1,15,8,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='E'; M=2,-4,-19,-6,4,-17,-8,-14,-10,-8,-10,-9,-4,-14,-7,-11,2,2,-3,-28,-17,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-22,-3,-6,-10,-17,-9,-10,2,-8,1,0,-18,-5,1,-6,-4,-6,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,-8,-18,-12,-6,-14,-15,-5,-13,-2,-7,-5,-5,-16,-4,1,2,5,-7,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-25,24,11,-17,-13,6,-26,-4,-20,-18,14,-13,-2,-8,1,-4,-22,-30,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,58,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,22,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,15,46,-32,-18,3,-27,9,-21,-15,5,-4,28,2,1,-9,-30,-28,-18,37;
MA   /M: SY='A'; M=13,1,-20,1,5,-25,2,-13,-20,-6,-17,-14,-3,-11,-3,-13,4,-4,-12,-26,-20,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-23,-25,-15,4,-24,-10,6,-16,15,16,-21,-24,-4,-13,-19,-10,0,-1,7,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-20,-31,-21,6,-22,-3,19,-13,22,52,-21,-22,-5,-12,-21,-10,9,-18,2,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-27,2,17,-26,-19,-5,-18,8,-14,-9,-3,-10,15,8,-4,-9,-17,-24,-14,15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-2,-20,-3,7,-23,-11,-12,-19,8,-19,-13,-3,-11,1,2,5,-2,-10,-25,-17,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-16,-20,-13,-6,-13,-17,-1,-12,-7,-5,-9,-15,-12,-16,5,1,4,-19,-6,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-25,11,10,-29,3,-3,-28,5,-27,-17,16,-13,8,-1,5,-7,-26,-29,-19,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-27,-6,6,-19,-11,-12,-18,-1,-20,-12,-8,9,2,-7,-1,-7,-17,-24,-16,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-27,8,1,-11,-7,2,-24,-5,-20,-15,6,-8,-6,-8,-4,-10,-22,-21,-4,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-21,-23,-19,15,-26,-6,7,-20,11,4,-17,-25,-16,-16,-11,-1,4,-8,20,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-9,4,-26,7,6,-18,-12,-1,-22,-1,-20,-14,2,-3,-3,-3,-3,-6,-17,-27,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-12,-4,10,-22,-13,-2,-21,-4,-18,-10,-4,-4,1,-6,4,-2,-17,-30,-16,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-27,-3,5,-25,-20,-10,-27,37,-25,-10,0,-12,7,31,-5,0,-17,-22,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-3,3,-26,3,6,-26,-9,-8,-24,17,-20,-12,3,-13,4,11,-4,-9,-19,-24,-14,5;
MA   /M: SY='I'; M=0,-11,-24,-15,2,-14,-24,-16,6,-8,-1,3,-10,-12,-4,-13,-5,-1,2,-24,-10,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-28,32,30,-31,-14,0,-32,9,-25,-22,12,-8,9,4,1,-8,-27,-33,-18,19;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-25,13,5,-25,-2,-9,-23,0,-20,-15,7,-13,-3,-6,2,-2,-18,-30,-17,1;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-38,-29,62,-30,-20,8,-28,12,7,-21,-28,-35,-20,-19,-9,7,2,22,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-32,-23,2,-32,-22,27,-22,26,19,-24,-25,-18,-15,-21,-8,21,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-26,2,10,-25,-11,0,-23,9,-16,-10,-2,-12,6,6,-4,-10,-19,-24,-12,8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-23,-4,2,-19,-20,-13,-16,14,-13,-8,-5,-14,-1,11,-4,1,-7,-25,-11,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-8,-32,-25,5,-28,-22,20,-23,18,17,-24,-26,-21,-21,-17,-7,20,-22,-4,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-28,3,7,-24,-6,-8,-24,10,-18,-12,0,-14,1,14,-5,-10,-19,-25,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-27,4,12,-27,19,-1,-32,-6,-25,-18,6,-12,-1,-9,4,-9,-27,-27,-21,5;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-29,-29,-31,-25,8,-21,-23,4,-19,5,0,-27,-27,-21,-17,-24,-14,3,30,10,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-26,-4,-1,-18,-16,-6,-17,14,-17,-8,1,-16,3,15,-4,-6,-14,-21,-5,0;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-19,-13,-12,-16,-4,-18,-6,-12,-8,-7,-7,-16,-11,-12,2,-1,-1,-24,-15,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-3,-31,5,3,-28,-17,-12,-23,5,-26,-17,-6,28,-3,1,-4,-7,-21,-30,-21,-3;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-19,-20,-11,-6,-17,-22,2,-11,-3,-3,-20,-21,-17,-14,-9,-6,12,-11,-9,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00476;
//
ID   MOLYBDOPTERIN_PROK_1_MP; MATRIX.
AC   MP00551;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic molybdopterin oxidoreductases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5285350; R2=0.0071100; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1051; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=840; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-35; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=56,-67,-54,1,-36,-23,-58,-62,-19,-48,4,72,2,-55,-34,-6,-51,1,-81,-68;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-73,-4,-35,-1,-73,-63,-8,20,23,-51,1,-33,-23,54,-22,-33,23,-76,-60; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=51,-70,-17,-20,-67,-41,-18,23,-38,-41,6,1,21,-7,-37,-19,-4,31,-80,-66; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=26,-68,-70,-39,-61,-8,-70,-26,-22,-28,-14,-63,-32,-27,3,-53,44,59,-78,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=6,-72,7,25,-71,25,-64,-34,-57,-33,-59,-10,-69,32,-6,19,-15,41,-82,-68; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=23,-72,-13,25,-71,39,-60,-42,-56,-51,-65,3,-11,18,-18,45,-53,-16,-75,8;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-76,48,39,-80,-27,-56,-27,3,-72,-65,-49,-29,71,-2,-7,18,-68,-80,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-75,7,17,-70,-67,-59,-37,-7,-15,-58,-10,2,78,-54,-8,18,7,47,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-16,-70,-1,51,-69,-28,-58,-61,-8,6,18,26,-64,18,-57,13,47,-26,-81,-66;
MA   /M: SY='A'; M=46,-72,14,21,-38,-7,-15,-27,42,-50,-19,-26,-66,18,13,0,-56,-64,-75,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-75,-23,-5,-27,-81,-75,80,-72,26,29,-72,-73,-67,-75,-67,-8,-32,55,-55;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-75,-32,-46,-39,-70,4,-72,93,-73,-64,-49,-31,-44,22,-34,34,-31,-75,-63;
MA   /M: SY='W'; M=-48,-91,-86,-5,-23,-75,-89,-6,-42,-47,-65,-84,-76,-31,-72,-74,-13,-11,164,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-73,92,-27,-72,-64,-59,-25,-58,-68,-67,-22,-68,-57,-65,35,10,26,-89,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-79,-32,-44,-76,-70,-17,-77,96,-76,-65,-26,0,-18,32,-58,-35,-49,43,-63;
MA   /M: SY='A'; M=82,-62,-62,-59,-74,-51,-66,-66,-60,-69,-63,0,-65,-57,-65,37,31,-55,-79,-70;
MA   /M: SY='P'; M=1,-79,-69,-60,-72,-69,-71,-3,-64,-26,-59,-69,103,-30,-73,-23,21,19,-80,-73;
MA   /M: SY='C'; M=-61,152,-79,-80,-71,-76,15,-79,-76,-69,-68,-66,-91,-82,-82,-64,-61,-67,-101,-79;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-20,-64,-19,-74,-76,-57,-70,-32,-71,-62,-59,35,-46,102,-60,-9,2,-78,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-73,-73,-77,-78,107,-50,-58,-52,-72,-45,4,21,-84,-77,-71,-69,-65,-57,-41,65;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-23,-74,-63,-73,-81,96,-70,-86,-68,-83,-73,-50,-67,-65,-75,12,0,-79,-75,-76;
MA   /M: SY='T'; M=-51,-63,-62,-64,-35,-19,-70,-49,-61,-58,-18,-51,-63,-64,-68,8,99,34,-86,-64;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-76,-63,-72,-82,97,-68,-89,-64,-85,-74,-50,-68,-29,-1,6,-65,-82,-74,-76;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-23,-73,-62,-67,-79,83,-67,-82,-25,-58,-72,-50,0,-60,-69,53,-33,-76,-76,-74;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-69,-84,-77,-51,-84,-82,27,-75,14,20,-79,-79,-75,-76,-69,-54,88,43,-57;
MA   /M: SY='M'; M=-63,-70,-37,-12,-52,-48,-59,-16,-24,59,74,38,-75,-9,-8,-26,-19,-48,-76,-57;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-67,-82,-76,-53,-81,-80,14,-74,7,29,-77,-78,-74,-75,-65,-53,89,-83,-60;
MA   /M: SY='G'; M=35,-72,-66,-69,-67,75,28,-43,-66,-70,-64,-55,-70,-29,-40,-19,-61,3,-70,30;
MA   /M: SY='T'; M=-25,-64,-64,-39,-64,-71,-71,-44,-59,-56,-55,-55,-32,-63,-9,0,90,54,-87,-65;
MA   /M: SY='Q'; M=-42,-79,-16,-25,-79,-69,-54,-71,70,-38,-19,-26,-32,91,9,-34,-35,-32,-74,-63;
MA   /M: SY='D'; M=-43,-77,71,25,-84,-8,-51,-80,-8,-80,-71,67,-14,60,-54,-51,-33,-79,-87,-70;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-54,-76,24,-39,-80,85,-18,-52,-62,-83,-73,51,-33,-9,-69,-50,-62,-80,-78,-31;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-63,-79,-59,-30,-75,-20,-55,-47,54,-39,-62,-11,-70,37,87,-57,-20,-47,-75,-64;
MA   /M: SY='V'; M=-17,-68,-80,-75,-55,-52,-82,40,-73,-41,-43,-74,-76,-33,-75,-25,-16,89,0,-61;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-67,-78,-73,-55,-82,-80,-5,-15,-31,-44,-73,-76,-72,-23,-63,10,94,-85,-26;
MA   /M: SY='A'; M=85,-65,-19,-61,-18,-14,-67,-66,-39,-67,-62,-1,-68,-59,-38,-17,-54,-38,55,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-16,80,-35,-12,-67,-69,-70,-3,-39,-60,-59,-55,-68,-63,-39,26,77,20,-87,-68;
MA   /M: SY='Q'; M=-43,-82,-29,21,-77,-46,85,-48,13,-70,-59,-49,-66,99,-2,-53,-37,-76,-76,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-16,-77,-64,-43,-83,92,-70,-86,-67,-84,-74,-52,-1,3,-74,-32,-1,-80,-76,-77; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,-80,108,-36,-84,-42,-15,-84,-56,-83,-80,14,-69,-8,-64,-35,-58,-81,-2,-30; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-45,-82,-37,-37,-19,-72,-70,23,-13,-36,2,-16,101,-30,-70,-61,20,-40,-79,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-78,76,25,-41,-18,-15,-78,22,-41,-69,12,-67,41,-5,-34,-8,-74,-83,-29; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=75,-16,-19,-60,-71,-24,44,-28,-24,-69,-62,-29,-68,-58,-64,26,-17,-58,-77,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-44,-85,19,58,-82,-70,-18,-47,-54,-56,-69,-61,100,-24,-37,-38,-19,-74,-81,-76;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-69,-36,-67,-62,-20,-68,-11,-62,-51,-50,58,-16,-30,0,-37,-30,81,-87,-65;
MA   /I: I=-6; E1=0; MI=0; IE=0; DE=-32;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00392;
//
ID   HTH_MERR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00552;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MerR-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5675335; R2=0.0142496; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=549; N_SCORE=12.381; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=136; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-19,-21,-29,-19,-1,-20,0,17,-8,18,56,-19,-20,1,-5,-19,-10,8,-20,-1,-9;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-12,4,12,-13,-7,-3,-12,3,-13,-9,2,3,4,-1,5,1,-11,-16,-10,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-17,7,13,-14,-11,0,-16,12,-14,-9,4,-6,5,7,-3,-5,-14,-13,-3,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,10,-14,10,11,-16,-6,-1,-15,6,-15,-11,10,-6,4,1,3,-2,-14,-18,-11,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-3,-10,-3,-6,-4,-12,-8,3,-9,6,1,-4,-12,-8,-8,-5,0,3,-15,-5,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-15,-2,5,-13,-10,-5,-13,7,-12,-8,-2,6,2,9,0,0,-11,-14,-9,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=4,-8,-15,-9,-3,-12,-8,-8,-8,0,-8,-3,-7,7,-3,-1,-2,-3,-7,-15,-11,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-18,-13,-10,1,-16,-6,0,-10,6,4,-9,-19,-8,-7,-8,-1,-2,-13,7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-22,-24,-19,27,-25,-1,5,-16,10,7,-19,-24,-15,-13,-19,-9,-2,14,37,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-18,-3,-4,-18,-13,-11,-17,0,-21,-14,8,-4,-4,2,13,17,-11,-32,-16,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-27,-34,-26,-2,-36,-28,39,-26,14,14,-19,-15,-19,-27,-14,-3,25,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-24,-8,-15,-27,50,-18,-34,-17,-29,-19,2,-17,-15,-18,10,-10,-24,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-27,9,26,-25,-21,-7,-16,5,-15,-11,-3,-9,9,-1,-4,-9,-13,-28,-15,17;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-14,-29,-23,8,-24,-24,16,-22,16,8,-24,-26,-24,-20,-12,-4,23,-20,-5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-11,-18,-10,-18,-2,-17,-8,-10,-10,-4,-8,-11,-8,-18,11,2,0,-23,-18,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,6,16,-29,-14,-7,-28,27,-23,-11,0,-11,11,16,-7,-11,-22,-23,-13,13;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-21,-21,-12,-4,-22,-15,0,-4,11,7,-16,-21,-9,2,-15,-7,0,-19,-5,-11;
MA   /M: SY='C'; M=10,-10,17,-18,-15,-14,-17,-22,-10,-17,-11,-10,-9,-18,-15,-19,9,14,0,-32,-17,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-28,2,-3,-30,36,-11,-35,-9,-28,-19,5,-16,-6,-9,2,-14,-28,-25,-25,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-12,-32,-27,2,-32,-27,29,-25,21,14,-28,-28,-25,-22,-17,-5,34,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,8,-14,0,-3,-18,-7,-4,-17,-4,-22,-15,16,-13,-3,-6,20,17,-12,-34,-15,-3;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-19,-16,-10,-17,-16,-21,-3,-7,-13,-7,-14,5,-12,-13,1,1,4,-28,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-25,0,9,-20,-19,-4,-19,14,-19,-10,-3,-14,9,15,-2,-5,-13,-22,-5,7;
MA   /M: SY='T'; M=9,-3,-13,-11,-6,-16,-15,-15,-10,-7,-11,-6,-3,-10,0,-10,14,28,-4,-26,-12,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-25,5,-34,-25,33,-30,36,20,-26,-26,-20,-24,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-29,-10,-2,-14,-21,15,-28,20,-18,-8,0,-21,7,54,-11,-12,-20,-20,-3,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-25,-20,-16,26,-24,13,-7,-15,-1,-1,-13,-25,-13,-12,-14,-10,-10,5,37,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-32,-22,-21,28,-29,14,-2,-11,-2,-2,-22,-30,-11,-11,-22,-12,-12,43,74,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,29,44,-34,-18,2,-31,8,-22,-19,5,-4,22,-1,0,-10,-30,-31,-18,33;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-28,4,18,-27,-18,1,-28,21,-22,-13,1,-11,14,24,-2,-7,-22,-25,-12,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-10,-28,-13,-3,-12,-25,-1,-2,4,-6,2,-6,-17,3,1,-12,-8,-7,-17,4,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-29,-4,-15,-30,57,-16,-38,-16,-29,-19,5,-19,-13,-17,1,-18,-30,-22,-28,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-26,11,-33,-24,30,-27,28,19,-25,-26,-23,-23,-22,-8,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=0,-8,-22,-8,0,-17,-15,-11,-15,1,-19,-11,-4,3,-4,-4,6,4,-11,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-33,-5,4,-27,-13,-9,-22,-8,-28,-19,-8,51,-5,-15,-1,-6,-27,-31,-24,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=5,-7,-17,-6,3,-16,-11,-12,-11,-6,-14,-11,-8,19,-4,-11,2,2,-9,-21,-16,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-6,-23,-4,0,-17,-17,-11,-2,-5,-5,0,-9,-12,1,-8,-8,-8,-1,-23,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-30,-5,1,-22,-16,-2,-31,29,-22,-11,1,-18,8,59,-9,-10,-21,-21,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-18,2,1,-20,-12,-11,-19,-2,-23,-16,8,0,-3,-6,16,20,-14,-33,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-25,13,26,-23,-15,1,-24,3,-18,-16,2,-8,7,-4,2,-6,-21,-26,-11,16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-3,-24,-6,-13,-23,36,-13,-29,-13,-27,-18,7,-18,-12,-14,8,-6,-23,-23,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,2,-25,-2,-11,-26,38,-11,-32,-10,-30,-19,14,-18,-10,-9,7,-9,-26,-27,-25,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-10,-27,-13,-10,5,-19,22,-11,-7,-9,-2,-4,-22,-1,0,-11,-9,-14,-4,27,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-29,-12,-2,-17,-21,-2,-24,23,-12,-7,-3,-21,7,60,-12,-10,-17,-20,-9,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-20,-16,-11,4,-20,-6,-3,-4,3,3,-8,-19,-5,7,-10,-1,-4,-11,6,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-26,-24,-21,41,-28,9,0,-14,2,0,-19,-28,-17,-12,-19,-9,-7,23,63,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-17,4,-3,-21,2,-11,-23,-5,-25,-18,11,-13,-4,-6,19,14,-15,-33,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-25,-3,3,2,-19,-8,-21,2,-12,-12,-3,-17,-6,13,-7,-9,-15,-16,-3,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00477;
//

ID   LAMBDA_PHAGE_CIII_MP; MATRIX.
AC   MP00553;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lambdoid phages regulatory protein CIII signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9899321; R2=0.0138914; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=983; N_SCORE=18.635; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-23,-37,-27,30,-30,-17,22,-24,16,25,-20,-24,-21,-20,-20,-10,13,-9,11,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-3,-24,-6,10,-34,-14,0,-17,4,-17,-3,-3,-10,37,0,3,-7,-20,-20,-13,24;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-26,-30,-23,13,-33,-11,24,-24,25,14,-24,-27,-17,-20,-24,-10,10,-5,24,-23;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-30,-19,-23,-21,37,-23,-13,-23,-15,-8,-6,-20,-20,-23,-6,-17,-12,-20,-21,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-3,-7,-6,-3,-14,0,-10,-11,-7,-14,-11,1,-7,-3,-10,18,8,-4,-21,-14,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-20,-7,-14,-20,47,-14,-27,-14,-20,-14,0,-14,-14,-14,0,-14,-20,-14,-20,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-23,-22,-23,-20,-3,-17,-24,-1,-17,-12,-9,-20,-24,-17,-17,-3,-3,6,21,-1,-17;
MA   /M: SY='P'; M=9,-17,-23,-21,-11,-16,-14,-12,-2,-10,-5,13,-17,16,-6,-16,-7,-7,-5,-23,-16,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-12,-16,-12,-9,-14,-16,-13,-8,0,-15,-8,-5,-19,-6,13,9,4,5,-31,-14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=31,-13,-13,-23,-13,-14,-6,-14,0,-10,0,13,-13,-13,-7,-17,0,-3,3,-20,-14,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-18,-26,-21,-24,11,32,-20,-25,-24,-15,-12,-8,-24,-28,-20,-8,-16,-19,-9,-7,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-23,22,-26,-26,5,-30,-11,1,-19,-3,-3,-23,-33,-22,-19,-14,-7,9,-14,18,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-34,-16,-6,-17,-23,-20,-7,-16,-4,-7,-23,51,-13,-20,-16,-10,-17,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-24,0,0,-20,-14,67,-27,-10,-23,-6,10,-17,7,-3,5,-8,-24,-33,8,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-11,10,-5,-26,-12,1,-15,24,5,-19,-19,-5,-12,-19,-10,-5,-24,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-6,19,-22,29,25,-29,-9,-4,-29,-1,-27,-23,10,-7,6,-7,15,1,-22,-37,-20,15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-22,-30,-29,-19,-8,-32,-19,20,-7,5,9,-12,-20,-9,8,-16,-10,11,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-10,-18,-18,-6,-24,-24,5,-14,-2,-2,-11,-18,-18,-14,9,31,19,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-2,-26,35,-26,-6,0,-10,29,22,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-18,-30,-21,-11,-12,-28,-11,0,7,-5,1,-8,-20,-1,32,-14,-10,-1,-20,-6,-11;
MA   /M: SY='R'; M=3,8,-24,11,3,-26,-11,-6,-27,8,-20,-16,3,-14,1,17,-1,-7,-17,-26,-16,0;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='W'; M=6,-29,-35,-32,-22,-1,-12,-26,-16,-16,-16,-16,-29,-22,-16,-20,-21,-19,-19,86,11,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-24,-19,-5,-9,-26,-9,5,-15,24,12,-19,-22,10,-9,-19,-10,-5,-20,-4,3;
MA   /M: SY='L'; M=9,-24,-20,-30,-20,-3,-23,-23,19,-24,22,10,-21,-21,-17,-23,-14,-7,13,-20,-6,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='I'; M=13,-22,-22,-32,-22,-8,-25,-26,27,-22,9,9,-16,-16,-16,-26,-9,-6,19,-20,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-12,12,0,-12,0,6,-12,0,-19,-12,37,-12,0,0,6,0,-19,-25,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-19,0,12,-25,-12,6,-12,6,-12,0,0,-6,37,6,0,-6,-19,-12,-6,25; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-25,-6,0,-19,-12,-12,-12,-6,-19,-12,-12,56,-6,-12,-6,-6,-19,-19,-19,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-19,-6,-12,-19,44,-12,-25,-12,-19,-12,0,-12,-12,-12,0,-12,-19,-12,-19,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-6,-19,-19,0,-19,-19,19,-12,6,6,-19,-19,-19,-12,-6,0,31,-19,-6,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-25,-6,0,-19,-12,-12,-12,-6,-19,-12,-12,56,-6,-12,-6,-6,-19,-19,-19,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=0,0,-12,0,3,-16,-6,-6,-16,12,-19,-9,3,-6,3,6,10,3,-9,-19,-9,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-9,12,-16,6,0,-12,-6,35,-16,-3,-16,-6,21,-12,3,0,0,-6,-19,-22,0,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-19,20,0,-22,18,-6,-25,-6,-19,-16,6,-9,-6,-9,0,-9,-19,-19,-16,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-6,-13,-6,-6,4,-10,3,-6,-6,-9,-6,-3,-13,-3,-6,6,3,-6,-2,20,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-2,78,-15,-21,-20,-21,-18,-27,-21,-23,-20,4,-34,-21,-21,-4,-7,-16,-47,-27,-21;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-17,-10,-17,-6,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,15,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-20,22,-27,-23,3,-26,-4,-2,-16,1,16,-20,-29,-13,-16,-17,-10,-2,-15,14,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-30,-4,-3,-30,20,-14,-34,19,-30,-14,0,-14,-3,8,-6,-14,-24,-20,-19,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00478;
//
ID   TEA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00554;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TEA domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4948874; R2=0.0124310; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1421; N_SCORE=22.149; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-29,-21,-11,-14,-20,-9,1,-10,-3,22,-20,32,-5,-15,-15,-10,-9,-25,-14,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-35,-5,5,-30,-20,-15,-25,22,-30,-15,-9,37,1,7,-10,-10,-25,-25,-19,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-2,43,-15,-19,-15,-19,-11,-14,-16,-13,1,3,-29,-13,-16,-7,-7,-11,-39,-19,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-24,-10,-3,-17,-20,-6,-24,18,-17,-10,0,-17,4,47,-1,8,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-24,-10,-3,-17,-20,-6,-24,18,-17,-10,0,-17,4,47,-1,8,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-33,-35,-40,-30,3,-35,-30,32,-27,10,10,-25,-23,-20,-27,-25,-15,14,24,8,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-16,-1,2,-22,-8,-11,-22,8,-27,-16,6,-10,2,2,23,15,-12,-33,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,11,-30,19,21,-24,-23,-9,-10,-5,-12,-12,1,-9,2,-12,-6,-10,-12,-30,-14,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-1,-30,3,27,-24,-20,0,-30,21,-20,-14,0,-11,14,39,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-27,-1,-14,-27,50,-11,-34,-14,-30,-20,18,-20,-14,-14,3,-14,-30,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=8,-3,-24,-6,4,-27,-14,-13,-24,32,-24,-10,-3,-10,4,15,-4,-7,-14,-20,-13,4;
MA   /M: SY='M'; M=-5,3,-17,-8,-9,-11,-9,0,-2,-7,-8,16,11,-17,0,-7,4,1,-7,-31,-11,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-27,-8,10,-14,-23,-6,-15,7,0,-4,-9,-18,4,26,-13,-10,-14,-23,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-30,-17,-17,24,-29,30,-4,-10,-3,0,-16,-29,-7,-9,-19,-11,-13,22,72,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-5,-30,-5,2,-14,-23,-2,-22,34,-22,-7,-5,-15,5,20,-13,-10,-17,-7,13,2;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-13,-26,-13,-6,-9,-24,18,-8,-3,9,6,-11,-22,-3,-1,-19,-13,-9,-23,3,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-27,-12,-2,-15,-23,-8,-17,20,-5,-2,-8,-20,2,35,-15,-10,-12,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,8,-13,-13,-11,-21,-21,-13,-13,-11,-11,-3,-14,-13,-13,16,42,-1,-33,-13,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-27,-1,-14,-27,50,-11,-34,-14,-30,-20,18,-20,-14,-14,3,-14,-30,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,25,-30,-20,-7,-30,38,-27,-13,0,-7,13,21,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-11,-18,-19,-13,14,-23,-15,-12,-5,-7,-7,-6,-18,-14,8,1,17,-5,-16,2,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-33,-29,-33,-23,10,-27,-23,8,-27,30,8,-33,-30,-20,-20,-33,-16,-2,30,9,-20;
MA   /M: SY='A'; M=14,8,-21,9,4,-28,-8,-12,-24,10,-21,-15,1,-10,-2,-3,2,-6,-14,-25,-17,1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-4,3,-23,-15,-6,-27,25,-26,-13,3,-14,7,38,3,-2,-17,-25,-13,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-22,-16,-9,7,-23,-12,-16,6,-11,-7,-5,-18,-9,18,-4,8,-9,-15,0,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-27,-16,0,-11,-28,-17,6,-1,7,5,-14,-16,-5,-6,-16,-10,1,-22,-6,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-11,-26,-14,-1,-21,-22,-10,-3,5,-4,3,-9,-15,12,0,-9,-9,-7,-20,-8,5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,6,-23,1,-5,-23,13,-4,-28,1,-27,-17,19,-18,-3,12,8,-4,-24,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-30,29,15,-34,0,-7,-36,12,-29,-21,8,-11,2,1,-3,-12,-27,-29,-19,8;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-7,-33,-4,-1,-19,-27,-18,4,-14,-8,-5,-10,13,-8,-20,-11,-10,-5,-28,-14,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,13,-26,18,13,-33,-14,-2,-28,15,-27,-14,7,-10,19,7,4,-4,-23,-29,-14,16;
MA   /M: SY='W'; M=4,2,-26,5,-5,-18,-8,-15,-23,-10,-22,-20,-5,-15,-8,-15,0,-7,-18,14,-7,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-24,5,20,-27,-14,-7,-27,22,-27,-16,3,-7,10,11,7,-1,-20,-28,-16,15;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-24,-21,-11,-3,-26,-13,0,-3,21,8,-18,-25,-8,10,-22,-10,-2,-20,-4,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-22,-11,-4,-14,-23,-16,-11,12,-3,-2,-8,-15,-4,5,-6,8,-6,-23,-7,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00479;
//
ID   ICOSAH_VIR_COAT_S_MP; MATRIX.
AC   MP00555;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Plant viruses icosahedral capsid proteins 'S' region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1894670; R2=0.0175848; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=497; N_SCORE=14.919; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=18; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-11,-17,-8,-20,-1,-18,-12,-8,-13,-11,-7,-10,-8,-15,13,2,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=8,6,-20,6,6,-29,-10,-6,-20,-2,-20,-12,3,-10,15,-6,12,4,-16,-28,-16,11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,10,-21,-1,-6,-12,-12,1,-4,-8,-2,3,21,-22,1,-5,-5,-5,-14,-30,-11,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-28,-31,-31,-26,43,-28,-5,-4,-19,-1,-4,-24,-30,-22,-16,-24,-14,-11,50,52,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,31,-23,36,14,-29,-6,0,-29,-2,-29,-24,25,-11,2,-7,13,0,-25,-39,-20,8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-7,5,-25,-20,-5,-16,22,-16,4,-3,-12,18,13,-5,-2,-15,-21,-8,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-32,-25,-22,24,-30,8,5,-14,1,1,-22,-29,-12,-14,-22,-12,-6,34,64,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-22,-13,-6,-16,-18,-8,-15,13,-14,-4,-5,-19,1,33,-4,-3,-5,-23,-11,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-33,-29,-39,-29,48,-28,-24,1,-27,7,-1,-26,-29,-31,-21,-26,-15,-4,40,25,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-18,-4,-9,-12,-16,-9,-4,-5,-10,-7,16,-18,-8,-6,3,11,-5,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='S'; M=12,-3,-13,-5,-2,-20,-5,-12,-19,-1,-24,-16,4,-11,-1,-2,25,13,-9,-32,-18,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,5,-31,-25,1,-31,-25,17,-27,25,11,-27,-31,-24,-23,-21,-7,19,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-22,-9,-1,-16,-19,-8,-18,11,-14,-9,-3,-17,2,32,0,5,-9,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-22,-34,-26,18,-33,-21,26,-26,23,13,-25,-27,-24,-22,-21,-8,20,-13,10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-22,-7,-2,-17,-22,-3,-12,3,-12,-6,-3,-15,1,9,0,9,-6,-26,-8,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-33,-23,-21,27,-29,13,-3,-11,-3,-3,-23,-30,-11,-11,-23,-13,-13,47,73,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-19,-20,-11,-7,-25,-21,16,-17,4,4,-16,-20,-14,-18,-3,-1,19,-29,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-36,-10,-1,-27,-20,-20,-19,-10,-27,-19,-17,76,-10,-19,-6,-2,-26,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-19,-21,-13,4,-20,-14,0,-8,9,10,-14,-20,-11,-8,-10,-1,0,-18,-2,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-15,60,-23,-23,-15,-25,-26,-16,-22,-14,-13,-14,-29,-23,-22,1,8,1,-42,-22,-23;
MA   /M: SY='P'; M=10,-8,-24,-9,-6,-24,0,-17,-19,-11,-23,-17,-4,23,-9,-17,7,1,-17,-28,-24,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-14,-2,-8,-6,-17,-16,-11,-11,-13,-12,0,-14,-11,-12,14,26,-2,-29,-9,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-14,-5,0,-15,-18,-15,-14,-6,-14,-11,1,-9,0,-7,18,36,-6,-30,-12,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-15,-1,5,-15,-17,-13,-15,-5,-15,-14,6,-9,-3,-7,17,32,-9,-32,-14,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-15,-3,-5,-19,-2,-10,-14,-9,-21,-13,10,-15,-1,-9,19,12,-8,-34,-17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-25,-10,-3,-14,-16,-2,-22,16,-19,-10,-2,-18,4,34,-1,-4,-15,-16,0,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-12,-15,-9,-18,-5,-8,-10,-11,-13,-9,-6,-13,-8,-16,13,3,0,-26,-16,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-21,-31,-21,4,-26,-11,23,-19,31,41,-24,-24,-9,-16,-24,-10,12,-20,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-16,-21,-21,-17,-5,-1,-11,-5,-15,-4,-4,-13,-19,-14,-18,-5,-8,-4,-8,6,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-32,-26,-40,-30,61,-29,-23,1,-28,6,-2,-23,-29,-35,-21,-23,-13,-2,31,27,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-24,30,6,-25,-15,-5,-19,-6,-13,-14,9,-16,-1,-10,-3,-4,-15,-34,-15,2;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-28,-1,-1,-13,-19,0,-21,13,-21,-12,-4,-8,1,13,-5,-6,-18,-13,9,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=13,-8,-15,-12,-7,-11,-7,-7,-12,-7,-15,-7,-3,-14,-3,-7,14,5,-6,-21,-4,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=3,0,-22,-3,11,-26,-13,0,-14,1,-14,0,1,-11,23,-2,4,-5,-17,-25,-14,17;
MA   /M: SY='D'; M=-18,34,-29,50,14,-32,-14,-4,-31,1,-19,-21,11,-13,-2,-8,-5,-10,-24,-35,-16,6;
MA   /M: SY='P'; M=2,-10,-21,-10,-5,-19,-15,-18,-14,-11,-18,-14,-8,25,-8,-15,10,14,-12,-31,-20,-8;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-25,-15,-2,-15,-17,-19,0,-14,-1,-3,-16,4,-10,-18,-9,-8,-3,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-16,-8,-9,-14,-18,-16,-3,-10,-8,-6,0,-15,-6,-12,7,18,3,-29,-12,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-3,19,-21,25,3,-28,2,-10,-29,-7,-25,-22,9,-11,-5,-12,11,6,-19,-34,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-15,-25,-15,-8,-14,-23,-10,-12,15,-8,-3,-10,-22,-2,37,-12,-8,-1,-22,-9,-8;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-17,-12,-2,-17,-15,-15,-2,-8,-8,-5,-6,-14,-4,-13,2,2,3,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-25,11,21,-32,-5,-3,-26,1,-22,-15,2,-8,17,-5,5,-7,-24,-27,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-33,-25,13,-32,-24,26,-28,32,16,-27,-28,-24,-22,-23,-8,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,-14,-11,-8,-10,-6,-8,-12,-10,-17,-12,-3,-14,-6,-14,17,7,-6,-19,-1,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,20,-22,12,4,-25,-7,3,-22,4,-25,-15,27,-16,11,8,7,-2,-24,-32,-17,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-23,-12,-27,-22,11,-29,-9,12,-21,11,9,-20,-26,-16,-19,-16,-8,5,-7,22,-22;
MA   /M: SY='A'; M=3,-10,-21,-10,-5,-12,-5,-9,-13,-3,-15,-10,-7,-17,-7,-5,2,-3,-6,-17,-2,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-9,-29,-8,-4,-24,-5,10,-22,3,-21,-8,-4,-3,2,3,-7,-13,-18,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='S'; M=1,-12,-4,-13,-10,-8,-15,-2,-10,-17,-4,-6,-7,-20,-8,-14,6,2,-6,-28,-4,-10;
MA   /M: SY='V'; M=12,-19,-15,-24,-18,-10,-20,-24,13,-12,0,2,-16,-19,-17,-17,-1,2,21,-25,-12,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,11,-19,11,19,-22,-14,-7,-22,-2,-20,-18,8,-7,4,-6,14,15,-17,-33,-17,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00480;
//
ID   HOK_GEF_MP; MATRIX.
AC   MP00556;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hok/gef family cell toxic proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6987987; R2=0.0128020; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=881; N_SCORE=15.967; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-22,-25,-15,-2,-22,-6,12,-5,19,41,-19,-21,-3,-6,-21,-10,5,-20,-2,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-13,-13,-7,-4,-11,-1,4,3,4,24,-9,-10,1,0,-10,-6,1,-11,-1,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-31,-13,-1,-21,-22,-11,-9,-2,-8,3,-16,25,5,-7,-13,-10,-17,-24,-15,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-24,-4,4,-24,-20,20,-21,2,-17,-4,2,-14,21,9,3,6,-20,-25,-3,11;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-26,1,6,-26,-15,-6,-27,33,-28,-13,9,-13,7,28,-1,-5,-20,-25,-13,6;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-12,-22,-14,-11,0,-18,-3,-9,-10,-11,-9,-11,-5,-9,-13,1,6,-9,-6,20,-13;
MA   /M: SY='L'; M=6,-20,-18,-27,-17,9,-18,-15,3,-15,13,12,-18,-21,-14,-10,-13,-7,2,-15,-2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,26,-27,37,17,-29,-29,-23,-21,-24,-7,22,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-33,-27,2,-29,-24,25,-21,14,18,-27,-26,-20,-20,-20,-9,25,-2,0,-24;
MA   /M: SY='C'; M=14,-13,18,-21,-17,-18,-1,-18,-15,-17,-12,-3,-11,-21,-14,-20,1,-5,-6,-29,-20,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-29,29,-21,10,10,-25,-25,-25,-23,-10,-3,38,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,38,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-19,-32,-23,8,-28,-24,22,-25,24,12,-24,-25,-22,-22,-18,-7,19,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=0,-28,-18,-32,-26,0,-30,-27,30,-24,20,13,-25,-25,-23,-23,-15,-5,30,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,23,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-20,24,-26,-26,-5,-14,-26,-5,-24,-7,-6,-16,-28,-26,-23,-7,-2,5,-30,-15,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-18,-36,-26,63,-26,-20,-2,-26,6,-2,-17,-26,-35,-19,-14,-4,0,4,22,-26;
MA   /M: SY='T'; M=10,-7,-10,-14,-12,-11,-15,-20,-4,-12,-9,-8,-6,-13,-12,-14,16,28,7,-30,-13,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-31,-29,-31,-23,13,-27,-17,7,-25,25,7,-31,-30,-19,-19,-31,-15,-3,32,18,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-31,-23,4,-29,-18,26,-23,31,29,-26,-26,-16,-19,-22,-8,20,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-15,-13,-23,-20,5,-24,-23,7,-17,1,-1,-13,-19,-20,-17,2,19,15,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-22,-6,-3,-32,22,-22,-12,0,-20,5,56,-8,-12,-22,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-30,33,23,-36,-16,-2,-33,18,-27,-19,9,-9,13,6,-3,-10,-27,-30,-16,18;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-16,10,2,-22,-7,-8,-24,-3,-26,-19,9,-11,0,1,23,14,-14,-36,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-20,101,-29,-29,-14,-30,-24,-26,-27,-17,-17,-20,-39,-27,-27,-11,-10,-10,-40,-16,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-30,15,46,-30,-4,-3,-32,5,-22,-20,0,-3,13,-3,0,-12,-30,-28,-22,30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-34,-25,24,-31,-23,21,-28,29,13,-26,-29,-27,-21,-23,-8,17,-15,5,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,1,-25,-4,-2,-18,-17,17,-25,12,-20,-10,10,-18,5,34,-2,-1,-20,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-35,-28,15,-35,-21,31,-26,17,13,-23,-25,-23,-24,-19,-8,22,-11,12,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-30,-3,9,-25,-20,13,-29,26,-23,-8,1,-15,16,39,-8,-11,-23,-22,-7,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,13,-26,18,18,-30,-17,-1,-26,7,-21,-14,5,-10,19,8,2,1,-23,-28,-14,18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-30,-7,-10,-28,47,-15,-37,-9,-27,-18,0,-18,-12,-4,-2,-17,-28,-21,-26,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-11,25,-23,18,6,-26,-7,19,-24,0,-27,-15,33,-16,12,0,7,-4,-28,-35,-13,8;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-20,-14,-10,-9,-24,-14,-5,-1,-8,-4,-5,-15,-7,2,2,20,-1,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-24,4,32,-21,-23,-9,-11,1,-11,-11,-9,-9,4,-6,-3,-7,-5,-30,-17,18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-14,-32,-27,16,-30,-26,23,-24,21,11,-28,-30,-29,-20,-17,-4,31,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='A'; M=22,-11,-16,-17,-7,-20,-11,-15,-8,-1,-10,-5,-10,-14,0,-4,2,-3,1,-22,-15,-4;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-10,-23,-16,-14,-10,-23,3,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,16,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-15,-28,-22,30,-27,-22,4,-22,9,1,-17,-24,-26,-17,-7,11,9,-13,7,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00481;
//
ID   FMN_HYDROXY_ACID_DH_MP; MATRIX.
AC   MP00557;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1709991; R2=0.0148418; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=708; N_SCORE=15.669; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-29,2,9,-22,-21,-6,-21,18,-14,-9,-2,-15,6,27,-10,-10,-16,-24,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-26,2,4,-16,-21,-9,-12,2,-1,-5,-6,-17,-2,8,-12,-10,-11,-25,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,5,-21,-12,-20,-3,-21,-12,-12,-11,-11,-11,-13,-12,-21,8,-1,-1,-23,-21,-12;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-15,-30,-25,-4,-25,-26,25,-20,10,11,-23,-23,-22,-21,-9,-3,33,-25,-9,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,7,-27,10,17,-30,-16,-4,-28,19,-23,-14,2,-10,15,15,-2,-8,-22,-25,-15,15;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-10,-24,-13,-5,5,-21,24,-11,-15,-9,-3,-3,-18,-7,-11,-5,-9,-11,-20,8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,59,-15,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=23,-20,-12,-26,-19,-9,-16,-24,10,-17,6,2,-20,-20,-18,-21,-3,-2,19,-23,-13,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-8,27,-26,36,13,-34,-10,-1,-30,2,-26,-20,13,-11,10,-3,4,-6,-25,-33,-18,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-20,-32,-28,4,-33,-24,32,-23,15,13,-26,-27,-24,-22,-16,-5,33,-19,4,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,2,-30,-27,0,-30,-27,20,-24,17,9,-29,-31,-27,-21,-15,-4,32,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-19,-29,-19,7,-27,-20,17,-28,43,17,-28,-28,-19,-20,-25,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-12,-12,-12,-10,-9,19,-11,-27,-16,-19,-15,-8,-22,-15,-16,-6,-15,-22,-13,-3,-13;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-12,-22,-22,-8,-11,-25,10,-17,-2,0,-18,-23,-22,-18,0,3,26,-28,-14,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-27,-22,-12,-7,-25,-17,4,-14,11,5,-19,3,-11,-6,-17,-8,-3,-23,-10,-14;
MA   /M: SY='A'; M=28,-7,-13,-11,-5,-21,-2,-16,-15,-10,-20,-15,-3,1,-6,-16,19,7,-7,-29,-21,-6;
MA   /M: SY='T'; M=6,-7,-18,-8,-4,-20,-12,-17,-16,-10,-22,-16,-3,17,-7,-14,17,19,-11,-32,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=5,-24,-21,-32,-23,-4,-26,-23,27,-22,15,16,-20,-20,-17,-23,-13,-6,21,-21,-6,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,17,-28,26,23,-30,-15,0,-31,10,-23,-17,7,-10,9,10,-1,-8,-25,-31,-16,15;
MA   /M: SY='A'; M=26,-18,5,-25,-19,-13,-14,-25,2,-16,-4,-4,-18,-20,-19,-21,1,-1,16,-27,-18,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,22,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=6,-12,-28,-10,3,-25,-15,-16,-19,-4,-22,-16,-12,37,-5,-8,-2,-5,-19,-26,-23,-4;
MA   /M: SY='E'; M=3,3,-26,8,37,-29,-15,-4,-24,4,-19,-16,-3,0,16,-4,3,-7,-23,-27,-19,26;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-17,-29,-25,-3,-29,-27,28,-22,8,9,-20,-23,-21,-22,-6,3,32,-28,-8,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00482;
//
ID   EUKARYOTIC_PORIN_MP; MATRIX.
AC   MP00558;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic mitochondrial porin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.6197858; R2=0.0193341; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=14.363; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-6; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-12,-24,-15,-11,-11,-20,26,-21,-13,-15,-7,-7,-24,0,-9,-18,-19,-25,22,11,-6;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-16,-3,-1,-20,-10,-11,-20,5,-24,-14,6,-11,0,3,19,17,-11,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='F'; M=6,-15,-18,-21,-12,8,-16,-16,-7,-6,-2,0,-11,-18,-13,-9,-4,-4,-3,-15,-2,-11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-18,-6,-8,-21,14,-16,-24,-13,-25,-18,3,-6,-9,-14,20,13,-15,-31,-21,-9;
MA   /M: SY='S'; M=0,6,-17,2,1,-20,-2,-8,-21,-5,-24,-17,14,-12,-2,-3,20,15,-15,-34,-18,0;
MA   /M: SY='N'; M=-4,19,-19,9,2,-22,-5,-1,-22,9,-30,-18,31,-15,2,4,14,3,-22,-35,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,19,-17,14,17,-23,-10,-1,-23,0,-23,-19,22,-12,4,-5,8,1,-23,-35,-19,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-16,-6,-10,-13,-14,-11,-5,-9,-13,-5,8,-8,-8,-10,9,15,-2,-33,-14,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-3,2,-20,-4,-5,-19,-5,-8,-20,3,-21,-13,11,-15,-2,11,9,9,-14,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,37,-33,-23,20,-30,24,11,-23,-27,-29,-23,-23,-10,12,-7,13,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-22,-2,5,-21,3,-13,-19,-8,-17,-14,3,-11,-5,-11,6,7,-15,-27,-18,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-36,-29,26,-33,-26,27,-27,15,11,-24,-27,-29,-23,-17,-7,26,-14,6,-29;
MA   /M: SY='G'; M=20,-12,-20,-16,-17,-23,32,-21,-21,-16,-18,-13,-7,-17,-17,-20,3,-10,-10,-21,-24,-17;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-12,-9,-14,-13,-19,-11,-10,-11,-11,-2,-10,-9,-13,18,33,-1,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,13,-33,-20,1,-25,28,-24,-5,0,-12,33,28,-5,-10,-25,-20,-10,22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-13,-30,-13,-13,12,-26,49,-11,-10,-7,0,-9,-26,-3,-6,-16,-14,-17,8,58,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-9,-21,-11,-2,-19,-18,-9,-11,5,-10,-3,-6,-16,8,8,0,0,-7,-24,-11,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-25,-29,-19,1,-30,-22,20,-26,29,13,-26,-8,-19,-22,-24,-10,9,-22,-5,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-19,-6,-2,-27,-14,-17,-21,-11,-28,-20,-10,44,-8,-18,4,-2,-22,-34,-26,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-10,-21,-10,-10,-9,-21,-5,0,-15,7,1,-10,-20,-10,-10,-9,-4,1,-26,-6,-12;
MA   /M: SY='T'; M=14,-2,-10,-9,-7,-16,-9,-17,-13,-10,-17,-13,1,-10,-7,-12,25,29,-3,-31,-16,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-6,-13,-7,-8,-17,-13,-10,-13,-8,-6,-6,-17,-2,-11,9,11,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-32,-28,8,-32,-28,29,-24,18,12,-28,-28,-28,-22,-16,-4,37,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-25,-1,7,-27,-15,-9,-28,35,-29,-12,2,-11,8,22,2,-3,-18,-25,-12,7;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-13,-18,-11,-21,8,-20,-14,-11,-13,-11,-8,-11,-11,-19,9,1,-4,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-34,-30,8,-33,-29,32,-24,13,12,-26,-27,-28,-23,-14,-4,40,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-2,30,-18,13,-2,-19,-1,4,-18,-2,-27,-18,46,-18,-2,-3,13,4,-24,-37,-19,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-11,39,-22,31,5,-25,-3,6,-25,-1,-30,-23,46,-17,0,-3,10,-1,-28,-40,-20,3;
MA   /M: SY='S'; M=11,-3,-15,-7,-5,-12,-6,-7,-16,-6,-20,-14,5,-14,-4,-5,18,7,-10,-25,-7,-5;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-24,-7,-12,-26,42,-15,-33,-13,-29,-19,3,-17,-12,-9,11,-7,-23,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-23,-21,-12,-7,-27,-17,9,-2,13,12,-18,-21,-7,-5,-18,-9,7,-21,-5,-10;
MA   /M: SY='A'; M=21,-18,-14,-25,-19,-10,-17,-24,12,-16,1,1,-16,-17,-17,-21,0,3,19,-24,-13,-19;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-17,-4,-8,-21,17,-13,-23,-12,-25,-17,10,-14,-8,-12,18,9,-16,-31,-21,-8;
MA   /M: SY='L'; M=13,-23,-17,-28,-19,-4,-21,-23,15,-22,19,8,-21,-21,-17,-22,-12,-5,13,-21,-8,-19;
MA   /M: SY='G'; M=6,-16,-20,-17,-15,-12,9,-18,-10,-20,3,-4,-11,-20,-15,-18,-2,-6,-7,-24,-16,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-28,-26,-23,20,-32,2,15,-17,9,7,-21,-28,-14,-16,-20,-9,5,11,50,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-24,-4,5,-26,-20,-4,-13,8,-17,-4,3,-12,23,4,2,5,-16,-24,-10,13;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-5,-28,-5,3,-21,-22,40,-19,0,-16,0,-1,-18,23,8,-7,-13,-20,-20,9,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-22,4,17,-17,-17,-6,-16,-1,-10,-11,7,-11,3,-4,2,5,-16,-30,-14,10;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-31,-29,-32,-23,11,-26,-23,4,-25,20,4,-30,-28,-20,-19,-28,-11,-4,35,10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-27,-6,0,-20,-16,-1,-26,24,-21,-9,6,-18,8,47,-4,-6,-19,-24,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-36,0,7,-30,-18,-14,-23,-1,-29,-20,-7,58,-4,-11,-7,-9,-29,-30,-26,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-29,4,-3,-30,23,-12,-35,9,-30,-17,7,-15,-5,1,-3,-14,-26,-24,-21,-4;
MA   /M: SY='V'; M=2,-16,-13,-19,-17,-8,-20,-22,12,-17,-5,-1,-11,-19,-16,-17,9,10,20,-32,-12,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-11,-20,-15,-8,1,-22,-16,-10,3,-5,-4,-8,-17,-10,-1,-4,6,-4,-19,-3,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-15,-33,-25,25,-30,-22,14,-29,30,11,-27,-30,-26,-21,-25,-10,9,-9,7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-15,-12,-14,-14,2,-21,-14,-13,-13,-11,-3,-14,-14,-13,12,28,-3,-27,-15,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,28,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-17,-3,-7,-23,24,-13,-27,-13,-30,-20,7,-13,-7,-13,26,6,-17,-33,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-19,-17,-14,-17,12,-18,-16,-13,-15,-8,-8,-15,-11,-17,5,-3,-10,-8,-16,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00483;
//
ID   MOLYBDOPTERIN_EUK_MP; MATRIX.
AC   MP00559;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic molybdopterin oxidoreductases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4678860; R2=0.0165308; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; N_SCORE=10.847; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-29,-10,-1,-19,-17,1,-18,-3,-16,-10,-10,18,-4,-3,-7,-9,-18,-22,-9,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-4,-27,-24,-2,-28,-27,20,-21,12,7,-27,-28,-25,-20,-11,-1,34,-29,-10,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-34,-6,5,-28,-18,-16,-21,-5,-28,-19,-13,62,-4,-13,-3,-5,-26,-30,-26,-3;
MA   /M: SY='B'; M=3,11,-21,11,1,-25,-10,-7,-21,6,-21,-15,8,-14,-2,3,2,-4,-13,-29,-16,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-1,9,-22,5,3,-19,-8,1,-14,-7,-13,-11,12,-16,-3,-10,-1,-6,-14,-30,-14,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,13,-29,18,14,-29,-16,-2,-30,17,-25,-17,8,-8,9,19,-2,-7,-24,-29,-15,10;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-30,-27,-31,-24,-3,-27,-27,10,-21,-2,-2,-27,-9,-20,-23,-19,-12,6,20,-1,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-9,-20,-8,-5,-11,-18,-11,-1,-13,3,5,-12,-12,-8,-14,-6,-4,2,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-8,9,11,8,-3,-21,-17,-13,-19,-10,-19,-17,5,-20,-10,-13,3,3,-10,-39,-19,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-24,-39,-24,-17,1,-21,7,-21,-7,-17,-11,-20,-26,-7,3,-26,-21,-25,66,27,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-18,-10,0,-14,-21,-15,-7,0,-9,-7,-9,-15,-5,4,2,8,4,-28,-13,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-20,-22,-22,-15,2,-27,-19,5,-1,5,5,-18,-23,-15,-1,-16,-7,10,-19,-2,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-27,2,17,-23,-18,7,-28,15,-21,-13,2,-12,11,29,0,-5,-22,-27,-11,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-17,-33,-28,1,-31,-25,33,-22,17,20,-26,-26,-23,-21,-15,-5,37,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-18,0,-2,-23,12,-12,-24,-11,-20,-16,1,-16,-9,-13,4,0,-15,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=6,-20,-21,-23,-17,-7,-1,-19,-2,-21,13,5,-18,-16,-16,-19,-13,-10,-3,-20,-12,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-27,-16,-30,-26,25,-27,-24,13,-22,6,3,-24,-17,-30,-19,-13,-4,23,-14,3,-27; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-29,1,5,-29,25,-13,-34,2,-27,-18,0,-13,-4,-3,-1,-14,-26,-23,-23,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-28,-2,7,-27,-19,-1,-27,32,-25,-9,4,-14,14,34,-6,-7,-21,-22,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-28,-5,9,-24,-19,-16,-15,-7,-21,-16,-12,36,-4,-14,0,-2,-16,-31,-23,0;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-18,-23,-17,3,-19,-18,5,-19,11,5,-15,-21,-16,-16,-6,6,5,-20,-2,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-22,-6,2,-19,-17,-7,-24,22,-22,-11,-1,-15,3,27,-1,-2,-15,-24,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-19,-25,-19,11,-20,-18,7,-22,14,6,-14,-22,-18,-18,-9,0,4,-18,-1,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-14,-7,-7,-16,-7,-15,-12,-9,-18,-13,6,-12,-7,-10,20,24,-6,-32,-15,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-17,-12,-20,-15,7,-17,-9,14,-13,18,22,-16,-17,-10,-11,-14,-6,10,-12,1,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-17,17,10,-19,-9,-2,-20,7,-16,-13,5,-7,3,8,0,-4,-15,-20,-11,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-20,21,20,-23,-11,1,-20,5,-16,-12,5,-5,14,2,0,-7,-19,-20,-11,17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-14,-20,-14,6,-20,-14,16,-20,30,13,-19,-19,-13,-14,-19,-7,8,-13,0,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-13,-11,-16,-12,-1,-15,-11,11,-7,8,10,-12,-13,-8,-5,-9,-4,11,-13,-3,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-4,7,-15,5,7,-16,-7,10,-16,1,-15,-9,10,-8,8,2,5,-1,-15,-20,-7,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-18,10,13,-19,-6,-1,-18,9,-16,-10,6,-6,8,7,-1,-6,-17,-17,-10,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-18,-15,-23,-18,40,-19,-7,0,-16,5,0,-14,-20,-20,-12,-14,-7,-2,13,26,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-23,7,6,-21,-11,-7,-16,-2,-18,-13,-5,31,1,-7,-4,-6,-19,-20,-16,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,-9,-20,-13,-7,-15,-18,-10,-1,-4,-9,-2,-4,-16,0,-6,1,-1,-1,-25,-9,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-22,-22,-24,-19,0,-28,-4,11,-12,8,10,-17,-25,-13,-3,-16,-8,12,-19,5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=8,2,-18,0,18,-21,-13,-11,-19,-2,-16,-15,-1,-6,3,-8,13,13,-13,-29,-17,10;
MA   /M: SY='F'; M=2,-21,-17,-27,-21,15,-23,-17,7,-19,8,2,-18,-23,-21,-18,-8,2,9,-11,9,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-29,-16,-8,-20,-21,-22,-6,-13,-17,-11,-17,43,-13,-20,-4,1,-10,-28,-21,-14;
MA   /M: SY='V'; M=7,-23,-7,-27,-24,-5,-25,-27,18,-18,5,4,-22,-24,-23,-20,-4,4,31,-28,-11,-24;
MA   /M: SY='T'; M=16,-4,-11,-13,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-8,-10,-13,16,32,-1,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-22,22,-30,-20,17,-29,40,17,-28,-30,-23,-20,-27,-10,10,-15,5,-22;
MA   /M: SY='V'; M=16,-19,-13,-22,-16,-13,-18,-21,9,-12,-1,2,-19,-20,-10,-16,-2,-1,21,-25,-13,-13;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=30,-14,-14,-24,-14,-13,-9,-17,2,-12,-1,7,-13,-14,-10,-18,1,-1,6,-21,-14,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-17,-27,-17,-20,-16,35,-20,-19,-23,-2,-6,-10,-23,-20,-20,-10,-17,-16,-20,-20,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-12,38,-23,30,13,-26,-5,7,-26,1,-29,-22,43,-15,3,-2,7,-3,-30,-39,-20,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,2,-30,5,1,-25,-5,-3,-33,17,-23,-15,5,-18,4,41,-6,-11,-23,-24,-15,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-27,7,26,-29,-17,-7,-29,27,-27,-15,1,-7,12,14,1,-6,-22,-26,-15,19;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-10,-25,-14,1,-20,-21,5,0,-1,0,28,-10,-15,28,-1,-10,-10,-10,-21,-5,14;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-19,0,-7,-9,-11,-3,-6,-11,-2,-4,22,-22,-7,-8,-1,0,-13,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-24,-30,-20,-4,-29,-16,25,-13,12,27,-18,-20,-8,-12,-16,-7,17,-21,-3,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-11,-22,-21,-3,-25,-25,14,-17,4,3,-18,-22,-21,-16,1,17,28,-30,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-29,-7,-3,-27,12,-10,-33,17,-26,-13,0,-16,0,22,-6,-13,-23,-20,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-29,-2,6,-30,5,-9,-29,12,-26,-12,-1,-7,10,4,-2,-8,-25,-22,-18,8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-18,-10,-8,-16,-11,-12,-16,2,-17,-10,-2,-17,-4,16,9,10,-4,-28,-14,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-8,-28,-10,-4,-18,-23,23,-10,6,-12,1,-3,-17,1,2,-11,-12,-10,-24,2,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-13,-30,39,-20,-33,-17,-30,-20,-7,18,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-27,63,-30,-14,3,-27,14,3,-21,-30,-33,-19,-21,-10,0,9,33,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-20,-3,-2,-11,-13,-7,-7,-12,-1,-6,9,-14,-6,-10,-1,-2,-12,-31,-14,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-31,-40,-33,-26,5,-2,-27,-21,-20,-19,-18,-28,-26,-20,-20,-27,-24,-25,93,14,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-4,-30,-3,-7,-29,26,-13,-36,8,-28,-16,1,-17,-6,10,-4,-15,-26,-21,-21,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-13,-21,-16,-12,-2,-16,-5,-6,-11,-10,-7,-11,-8,-9,-15,1,2,-6,-7,16,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00484;
//
ID   CARBOXYPEPT_SER_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00560;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine carboxypeptidases, histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7463908; R2=0.0165821; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=183; N_SCORE=8.771; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-11,1,-25,3,-1,-12,-15,-4,-14,-2,-12,-8,-3,-18,-3,-4,-5,-5,-11,-20,0,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-6,-19,-6,-7,-14,-12,-9,-6,-11,-8,-4,-7,-17,-7,-13,2,1,1,-27,-9,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-24,13,0,-25,8,-7,-27,-4,-21,-17,10,-15,-6,-6,2,-3,-21,-29,-18,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-27,-1,1,-23,15,-5,-27,-4,-21,-14,1,-15,0,-5,-1,-11,-24,-19,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-25,0,15,-29,-9,-3,-21,6,-20,-9,-1,-10,21,3,2,-5,-20,-24,-15,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-19,-21,-14,-3,-20,-21,10,-15,2,2,-19,-22,-18,-16,-9,-3,18,-22,-6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-19,-13,-11,-20,15,-16,-18,-9,-14,-8,-3,-15,-10,-14,3,-6,-11,-22,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-7,-18,-29,64,-17,-38,-18,-30,-20,5,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-29,-23,-13,17,-26,-6,-5,-11,-3,-3,-18,-23,-11,-9,-18,-11,-10,22,26,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-14,-17,-12,-5,-21,-17,3,-9,-1,1,-11,-17,-9,-10,0,10,10,-22,-7,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-26,-1,10,-23,-20,4,-20,14,-16,-6,1,-13,13,9,-5,-4,-17,-25,-8,11;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-22,1,0,-15,-11,-5,-14,-3,-14,-10,5,-17,-2,-2,1,1,-11,-24,-5,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-12,-24,-11,-6,13,-23,6,-9,-9,-7,-7,-13,-22,-8,-11,-11,-9,-12,8,35,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-26,-3,-6,-22,14,-8,-25,0,-19,-12,2,-16,-5,7,-4,-11,-19,-21,-16,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-23,2,-5,-22,12,2,-24,-7,-24,-15,16,-9,-4,-6,4,-5,-23,-28,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-23,18,-31,-22,21,-30,39,17,-27,-29,-23,-21,-26,-10,13,-16,4,-23;
MA   /M: SY='T'; M=1,4,-10,-1,-5,-17,-14,-13,-15,-8,-15,-9,3,-12,-4,-9,15,24,-7,-32,-14,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-34,-24,55,-29,-13,0,-26,10,1,-21,-29,-30,-18,-21,-11,-2,12,28,-24;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-15,-26,-20,-2,-23,-23,16,-21,17,8,-22,-24,-20,-20,-10,-1,20,-24,-8,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-16,-8,-3,-14,-18,-15,-14,0,-11,-9,-1,-12,-4,2,11,25,-6,-28,-11,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-14,-29,-27,-1,-30,-29,29,-21,9,9,-24,-26,-25,-21,-8,2,40,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-28,-12,-6,-2,-22,5,-18,13,-14,-6,-3,-21,-1,24,-11,-8,-15,-9,13,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-27,2,-10,-28,39,-12,-32,-14,-26,-18,10,-18,-10,-14,2,-13,-27,-26,-25,-10;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-11,-17,-10,-20,2,-19,-11,-11,-13,-11,-7,-11,-10,-18,14,3,-1,-24,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-11,-22,-16,1,-3,-21,-3,2,-6,5,26,-13,-15,4,-8,-11,-7,-4,-21,-4,3;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-12,-28,-25,-5,-26,-27,24,-18,6,8,-26,-26,-22,-19,-8,-1,39,-28,-11,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-14,-22,-17,-7,4,-23,-6,-3,-11,4,4,-12,-20,-1,-8,-7,0,-6,-13,9,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,15,-28,23,1,-7,-18,2,-23,-6,-16,-16,2,-18,-8,-10,-8,-10,-19,-12,7,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-28,-1,9,-30,-20,-2,-22,22,-21,-6,-2,-13,25,23,-5,-9,-19,-22,-11,16;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-35,-11,-1,-28,-16,-19,-19,-10,-27,-19,-17,72,-9,-19,-5,-7,-25,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-28,-2,8,-25,-8,-8,-23,11,-18,-10,-4,-9,6,12,-6,-10,-18,-23,-15,6;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-21,-7,1,-19,-14,-7,-12,-2,-15,-9,-2,-5,2,-2,0,-3,-9,-21,-14,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-10,-12,-7,-17,-2,-14,-11,-10,-13,-9,-3,-11,-6,-15,18,7,-3,-27,-17,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-22,-21,-23,-15,12,-27,-10,7,-18,23,9,-20,-25,-14,-8,-20,-6,3,-13,9,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-23,0,4,-20,-12,-3,-15,-1,-14,-8,-1,-13,8,-2,1,-2,-13,-22,-8,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-20,-28,-19,2,-22,-5,15,-18,20,32,-19,-22,-9,-15,-17,-8,7,-20,0,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-35,-28,26,-31,-23,20,-26,17,9,-25,-28,-28,-21,-20,-8,20,-4,10,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-24,3,8,-23,-14,2,-23,9,-22,-11,8,-13,12,11,6,0,-20,-28,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,2,-24,-2,2,-20,-9,3,-20,0,-22,-12,10,-16,6,7,5,-3,-19,-20,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-32,-22,-38,-29,48,-28,-21,-4,-26,3,-5,-26,-30,-31,-20,-25,-15,-8,43,27,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-30,-22,3,-30,-22,24,-26,30,17,-23,-25,-18,-21,-19,-4,17,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-23,1,2,-19,-6,-1,-20,-4,-19,-13,8,-16,2,-3,3,-4,-18,-19,-12,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,8,-26,4,-4,-27,25,-8,-31,-3,-28,-19,15,-17,-7,-3,3,-10,-26,-27,-23,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-24,-1,1,-22,-15,-3,-19,11,-19,-10,2,-9,1,7,-1,0,-13,-27,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00122;
//
ID   CBM2_A_MP; MATRIX.
AC   MP00561;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CBM2a (carbohydrate-binding type-2) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4344053; R2=0.0136846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=466; N_SCORE=10.801; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=151; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=11,1,-14,-8,-4,-16,-13,-16,-13,-8,-14,-12,2,-5,-7,-12,14,25,-6,-28,-15,-6;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-3,-14,-9,-13,-7,-7,-11,4,-11,-3,-1,3,-17,-12,-11,-3,-3,5,-22,-10,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=6,-11,-13,-14,-10,-8,-13,-16,-5,-13,-8,-7,-6,-17,-10,-10,14,14,3,-30,-12,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,2,-13,-1,4,-16,-11,-1,-10,1,-10,-3,3,-6,17,1,5,8,-11,-15,-6,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-14,5,5,-21,-5,-9,-21,-7,-26,-19,11,-10,1,-8,29,19,-13,-38,-19,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-12,-30,61,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-14;
MA   /M: SY='S'; M=8,3,-15,0,-5,-21,8,-12,-22,-10,-25,-18,9,-12,-6,-12,22,13,-13,-33,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=5,11,-17,2,-3,-20,3,1,-19,-6,-22,-14,21,-15,0,-7,11,3,-18,-30,-16,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-26,-20,-26,-26,13,-29,-10,15,-16,4,4,-26,-30,-21,-16,-16,-6,22,3,28,-25;
MA   /M: SY='T'; M=6,-2,-10,-9,-9,-13,-14,-17,-9,-11,-14,-11,1,-12,-9,-11,20,32,1,-32,-14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=35,-16,-12,-24,-16,-14,-9,-23,3,-14,-4,-4,-15,-15,-15,-21,4,-1,12,-22,-16,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-18,-7,-4,-18,-10,-13,-20,4,-19,-13,2,-13,-2,11,13,20,-10,-28,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-2,14,-24,5,-3,-23,4,-4,-22,-6,-28,-19,26,5,-5,-9,6,-3,-26,-34,-23,-5;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-15,-28,-22,0,-23,-20,19,-20,21,19,-25,-25,-18,-18,-15,-5,22,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-24,-1,-5,-27,17,-15,-28,-12,-30,-21,1,9,-8,-15,14,-1,-22,-32,-25,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-48,-36,-27,7,-20,-16,-21,-19,-20,-18,-35,-29,-17,-18,-37,-29,-30,131,29,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-23,-10,-14,-25,38,-17,-30,-13,-25,-17,0,-16,-13,-12,8,-6,-20,-24,-24,-14;
MA   /M: SY='T'; M=2,8,-12,0,-4,-16,-8,-10,-16,-8,-22,-16,16,-12,-4,-8,26,29,-10,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-24,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='P'; M=10,-7,-24,-7,8,-28,-12,-10,-18,-3,-20,-12,-7,16,11,-10,5,-4,-19,-26,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=1,-14,-29,-13,-3,-25,-18,-17,-12,-9,-20,-12,-14,42,-3,-16,-2,-1,-17,-27,-22,-6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=16,-5,-20,-9,-1,-28,6,-9,-20,-5,-19,-10,-2,-12,13,-9,9,-4,-16,-22,-18,6;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=15,-20,-11,-25,-21,-7,-20,-26,14,-16,2,2,-20,-21,-21,-19,-1,6,27,-26,-13,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,17,-23,26,24,-30,-10,-3,-29,0,-26,-21,9,-7,10,-6,14,1,-23,-36,-19,17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-38,-29,57,-31,-22,11,-29,14,5,-22,-29,-35,-21,-20,-9,9,0,20,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-39,-29,62,-31,-22,9,-29,13,4,-21,-29,-36,-21,-20,-9,8,2,22,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,13,-24,4,6,-26,-13,5,-14,1,-18,-6,21,-17,24,2,2,-5,-22,-29,-14,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-29,-11,-21,-28,64,-21,-36,-20,-27,-18,-2,-21,-21,-20,-1,-19,-25,-21,-29,-21;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-12,1,0,-18,-6,-9,-16,-8,-24,-17,13,-12,-2,-9,28,19,-9,-37,-18,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-30,-9,-9,-13,1,12,-27,-2,-22,-11,0,-19,-6,-3,-9,-13,-24,-1,0,-8;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-19,-2,-7,-20,5,-12,-20,-9,-24,-17,12,-2,-8,-11,13,11,-17,-31,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-25,-13,-18,-24,42,-20,-25,-19,-23,-15,-2,-18,-16,-20,4,-12,-18,-23,-24,-18;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-19,-7,-7,-23,17,-14,-24,-11,-24,-15,2,-13,-3,-12,17,8,-16,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-18,3,-3,-17,-9,-4,-16,-4,-20,-15,25,-11,-3,-1,12,12,-17,-35,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=11,-9,-18,-11,-6,-19,-11,-16,-14,-7,-18,-13,-6,7,-7,-7,12,10,-7,-29,-19,-8;
MA   /M: SY='E'; M=5,2,-20,-2,7,-23,-13,-7,-13,-3,-17,-11,4,-7,7,-7,6,1,-12,-28,-17,7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-19,-10,-7,-21,-18,-16,-13,-7,-21,-14,-7,26,-10,-7,-2,-4,-12,-32,-22,-11;
MA   /M: SY='P'; M=3,-14,-25,-16,-9,-18,-20,-21,-4,-10,-13,-8,-12,22,-11,-16,0,7,-6,-26,-17,-12;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-12,-6,-5,-18,-6,-15,-14,-11,-16,-14,1,-11,-6,-14,22,16,-5,-31,-17,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00485;
//
ID   CBM1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00562;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CBM1 (carbohydrate binding type-1) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1132913; R2=0.0090397; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=847; N_SCORE=11.769; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=265; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-19,-13,-8,-13,-19,-17,-8,-9,-9,-8,-7,2,-8,-5,7,19,-5,-29,-13,-10;
MA   /M: SY='T'; M=5,-8,-18,-9,-8,-13,-15,-18,-9,-12,-11,-10,-8,4,-12,-16,6,11,-3,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='P'; M=6,-9,-21,-10,-4,-18,-6,-15,-15,-11,-17,-13,-7,9,-8,-15,8,7,-11,-26,-16,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-22,-2,3,-22,-5,-11,-19,-6,-22,-16,3,6,-2,-8,10,8,-16,-31,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=5,-8,-22,-6,0,-22,-2,-14,-21,-8,-25,-17,-3,13,-5,-10,13,3,-17,-30,-21,-4;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-23,-8,-3,-24,-2,-13,-21,2,-23,-14,-2,4,-1,-2,5,0,-16,-26,-19,-3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-21,-13,-12,-20,15,-15,-16,-14,-13,-5,-6,-13,-7,-15,3,-3,-11,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-3,-13,-12,-23,6,-19,-21,-15,-22,-16,-5,0,-14,-18,4,-2,-14,-30,-24,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-9,-9,-2,-20,-12,-13,-14,-6,-15,-9,-5,-15,2,-8,7,11,-6,-29,-15,0;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-18,-13,-6,-21,-12,-12,-4,-7,-10,-3,-7,-16,6,-10,2,-3,0,-25,-14,0;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-23,-7,-7,-23,4,-17,-21,-10,-21,-16,-5,11,-9,-13,6,7,-17,-27,-21,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-11,-22,-13,-7,-14,-21,15,-7,-7,-3,3,-8,-20,1,0,-8,-8,-4,-25,-2,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26,17,-24,-11,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,105,49,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-25,-13,-14,-24,37,-15,-28,-14,-22,-14,-4,-17,-10,-17,1,-13,-21,-16,-17,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-11,-23,-18,-10,-14,-22,-12,12,-13,-3,7,-4,-16,3,-13,-2,-2,4,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-5,-15,-29,54,-15,-37,-12,-30,-19,8,-19,-15,-14,1,-17,-29,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-29,-35,-31,-25,26,-23,-11,-10,-18,-9,-10,-26,-28,-19,-16,-24,-16,-17,73,42,-20;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-11,-7,-6,-14,-10,-13,-12,-10,-16,-9,4,-11,-5,-10,24,27,-4,-33,-14,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-19,-8,-4,-25,-12,-17,-21,-11,-27,-19,-7,42,-10,-17,2,-1,-23,-33,-26,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-13,-11,-9,-10,-21,-20,-9,-9,-7,-8,-3,-6,-10,-10,13,39,-2,-29,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,1,-14,-11,-16,-14,-15,-12,-9,-12,-5,-4,-17,-6,-7,6,13,-4,-29,-15,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-10,-16,-13,-2,-19,-14,-16,-7,-5,-10,-6,-11,-9,-2,-12,3,2,1,-24,-16,-2;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-16,-3,2,-22,1,-13,-21,-9,-26,-18,3,0,-3,-12,25,12,-14,-34,-21,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-34,-10,-12,-30,35,-20,-32,-16,-30,-20,-8,23,-16,-20,-4,-16,-30,-24,-30,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,-20,-12,-12,6,-13,1,-9,-11,-10,-8,-4,-20,-8,-11,3,4,-9,-5,25,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-17,-9,-5,-16,-20,-17,-13,5,-14,-8,-1,-10,-3,0,10,28,-5,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-10,-19,-12,-4,-17,-20,-5,-4,-1,-9,2,-8,-16,4,-4,1,2,2,-27,-9,0;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-11,-22,-12,-7,-12,-22,-12,-8,14,-13,-4,-11,-18,-6,5,-7,-1,1,-16,2,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-24,-19,-10,-10,-24,-14,11,-17,13,8,-14,-19,1,-15,-12,-8,2,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-19,17,0,-20,-1,12,-20,-2,-30,-19,52,-19,0,-1,12,1,-28,-40,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-31,39,22,-36,-14,-4,-32,0,-27,-24,7,10,5,-9,-2,-10,-29,-35,-21,13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-28,-33,-30,-25,29,-27,-4,-2,-17,-1,0,-25,-29,-17,-15,-25,-15,-10,53,48,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-12,-3,-1,-19,-3,-10,-19,-5,-27,-18,6,-11,0,-8,31,15,-10,-34,-16,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-26,-17,4,-29,-17,16,-22,29,14,-25,-27,-11,-16,-21,-8,11,-19,1,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-38,-7,0,-29,-18,-17,-20,-9,-30,-20,-12,80,-9,-18,-8,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-26,-6,-12,-23,28,-6,-22,-11,-19,-3,10,-19,-4,-11,-2,-13,-22,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-19,-5,-2,-21,-7,13,-20,-9,-23,-13,5,-1,-1,-11,14,1,-16,-32,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=9,-8,-22,-11,-4,-24,-6,-15,-17,-8,-18,-12,-7,13,0,-13,5,7,-15,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-17,-6,3,-18,-6,-16,-14,-8,-15,-12,-3,-12,-6,-11,11,15,-5,-29,-17,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-24,-16,-10,-13,-20,-19,0,-17,-6,-5,-12,14,-11,-18,1,5,-4,-29,-15,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-18,-3,5,-19,-13,-11,-20,-1,-21,-15,2,-3,0,3,17,18,-13,-32,-16,1;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-14,-6,-5,-17,-12,-16,-15,-10,-21,-15,2,3,-6,-11,24,30,-8,-34,-17,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-13,-4,-2,-18,-11,-12,-16,-7,-20,-13,4,-10,3,-7,26,30,-8,-33,-14,1;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-14,-12,-9,-15,-16,-20,-11,-10,-13,-11,-5,3,-10,-13,14,32,-4,-28,-15,-10;
MA   /M: SY='T'; M=6,-5,-16,-11,-6,-16,-13,-13,-17,2,-16,-11,-1,-13,-3,12,11,17,-7,-26,-13,-6;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-26,-8,-4,-27,7,-15,-23,-11,-27,-17,-5,22,-4,-15,8,-3,-21,-28,-25,-6;
MA   /M: SY='P'; M=1,-12,-27,-11,-7,-24,-3,-20,-19,-12,-23,-16,-11,35,-12,-17,2,5,-19,-27,-24,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00486;
//
ID   STATHMIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00563;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Stathmin family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2784300; R2=0.0121806; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=996; N_SCORE=16.400; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=183; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=0,0,-20,0,5,-25,-10,-10,-25,20,-30,-15,5,-10,5,10,15,5,-15,-30,-15,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-32,-8,0,-26,-15,-15,-21,-5,-29,-19,-10,52,-5,-6,2,-3,-24,-31,-25,-6;
MA   /M: SY='S'; M=3,12,-15,17,5,-25,-2,-8,-25,-8,-30,-22,12,-10,0,-10,30,13,-15,-40,-20,2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-26,-24,-14,11,-25,-16,-1,-12,6,7,-20,4,-16,-12,-19,-10,-6,-15,-1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-20,22,8,-24,-14,-10,-17,-6,-19,-16,3,-14,-5,-11,7,0,-5,-36,-18,1;
MA   /M: SY='S'; M=8,-9,-22,-8,-6,-25,13,-16,-24,-13,-27,-19,-2,11,-9,-16,14,0,-18,-30,-25,-9;
MA   /M: SY='E'; M=1,-8,-22,-5,17,-17,-22,-14,-2,-5,-6,-6,-11,-11,-2,-11,-4,-6,2,-27,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=10,-13,-25,-10,-2,-25,-10,-18,-18,-10,-25,-18,-10,41,-8,-18,7,0,-18,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-11,1,-35,12,25,-31,-19,-10,-26,-1,-26,-21,-7,42,3,-11,-5,-10,-30,-31,-25,12;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-22,-29,-20,17,-28,-15,7,-12,10,10,-18,-25,-17,2,-18,-9,8,-14,4,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-18,-9,-8,-10,-17,-15,-7,-13,-4,-7,0,-4,-10,-12,6,17,-7,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=10,-18,-16,-22,-14,-6,-17,-19,7,-20,12,3,-14,-19,-13,-19,-2,0,5,-25,-10,-14;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-7,-5,-17,-5,-15,-15,-10,-20,-15,3,-10,-5,-12,28,23,-5,-33,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-15,-23,-11,-5,-16,-15,-16,-10,-15,-10,-10,-11,22,-9,-16,4,2,-12,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-6,-29,43,-27,-9,0,-11,16,33,-9,-10,-21,-20,-10,12;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='P'; M=1,-20,-2,-22,-16,-12,-22,-23,-2,-18,-1,-4,-20,3,-18,-20,-8,-1,2,-29,-17,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-30,16,51,-30,-9,-2,-31,6,-21,-20,0,-2,15,-2,0,-11,-30,-29,-21,33;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-26,-4,6,-28,-16,-12,-26,39,-26,-10,-2,-10,6,21,-6,-8,-16,-20,-12,6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-11,-10,-1,-16,-6,-7,-13,-7,-7,-5,-18,-8,-11,11,16,-5,-17,10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00487;
//
ID   ARGININOSUCCIN_SYN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00564;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Argininosuccinate synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8540525; R2=0.0145467; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=375; N_SCORE=10.299; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-11,-4,-6,-15,10,-11,-17,-9,-18,-13,4,-9,-6,-9,18,12,-10,-24,-15,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,8,-22,12,7,-22,-13,-3,-24,23,-20,-11,4,-9,5,22,-5,-7,-17,-18,-9,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=4,-9,-15,-15,-9,-9,-14,-12,3,-1,-2,8,-8,-10,-4,-5,-4,1,3,-16,-6,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-24,4,15,-22,-15,-3,-19,22,-19,-4,6,-9,9,11,-5,-8,-18,-23,-11,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-12,4,-29,3,13,-26,-18,-4,-29,33,-26,-13,7,-12,10,32,-6,-9,-23,-24,-13,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-11,-29,-26,-1,-26,-27,23,-20,13,9,-27,-27,-26,-20,-10,-1,37,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-11,-17,-9,-16,-4,-18,-8,-13,-6,-8,-8,-13,-9,-18,11,3,-1,-24,-17,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,9,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,67,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-32,-30,10,-31,-29,29,-22,11,10,-28,-29,-30,-21,-12,-2,41,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-18,52,-26,-23,-15,-23,-22,-10,-23,-10,-3,-15,-28,-19,-24,-4,-5,-1,-38,-20,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,43,-29,22,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-35,-7,1,-29,-11,-15,-26,10,-29,-16,-10,39,-3,4,-9,-11,-26,-25,-22,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-32,-37,-32,-25,15,-25,-14,-5,-20,2,-5,-32,-30,-17,-17,-32,-20,-15,77,36,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-18,23,-27,43,26,-28,-28,-17,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,6,-29,5,14,-30,-8,-4,-28,25,-27,-13,8,-11,13,14,-4,-10,-25,-24,-15,13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-28,13,47,-30,-18,-1,-27,8,-19,-16,-1,-2,23,-1,1,-9,-27,-28,-19,35;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-24,8,24,-25,-17,-3,-22,7,-20,-14,8,-8,14,2,5,6,-22,-29,-15,19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-24,-23,-19,23,-24,-4,-1,-16,4,-1,-20,-24,-15,-13,-18,-6,-7,28,36,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-30,59,-19,-39,-11,-30,-19,0,-19,-16,-14,-1,-19,-29,-20,-27,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-20,-3,-25,-21,13,-23,-6,-2,-16,-2,-3,-19,-27,-18,-17,-10,-6,2,-2,26,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-7,27,-28,39,32,-34,-13,-2,-32,3,-24,-24,8,-6,7,-7,1,-9,-26,-34,-20,19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-9,-20,-18,0,-20,-18,21,-14,7,7,-17,-17,-17,-14,-7,-1,28,-17,-5,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-30,15,45,-28,-20,24,-30,5,-20,-15,2,-5,18,0,-2,-12,-30,-30,-10,30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00488;
//
ID   ARGININOSUCCIN_SYN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00565;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Argininosuccinate synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4250574; R2=0.0153172; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=481; N_SCORE=12.783; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-11,-23,-13,-10,-24,-17,8,-17,12,7,-18,-22,-3,-16,-12,-7,5,-23,-9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-16,-31,-27,1,-30,-27,29,-24,20,13,-27,-27,-25,-22,-16,-4,35,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-25,9,33,-28,-15,-4,-26,12,-23,-17,1,-5,14,3,7,-4,-23,-29,-18,24;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-20,-26,-19,-3,-22,-16,11,-13,3,3,-17,-21,-14,-11,-9,-5,12,-14,3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-12,-22,-12,-16,-4,-16,-4,-10,-4,4,-12,-12,-8,-18,4,-2,2,-20,-16,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-30,0,17,-28,-20,-2,-29,31,-24,-10,0,-12,19,35,-7,-10,-23,-22,-12,16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-29,9,35,-30,-19,-3,-28,22,-23,-15,0,-5,18,13,-3,-10,-25,-25,-16,26;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-25,5,7,-13,-23,1,-8,-10,-4,-6,-5,-15,-4,-12,-8,-7,-7,-27,-6,1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-30,12,-9,-33,48,-15,-40,-15,-30,-23,5,-17,-15,-17,0,-17,-30,-25,-27,-12;
MA   /M: SY='A'; M=25,-15,-2,-22,-17,-14,-9,-23,-2,-14,-6,-6,-15,-18,-17,-20,4,4,12,-26,-17,-17;
MA   /M: SY='B'; M=-11,15,-23,14,4,-21,-14,-3,-22,7,-22,-15,14,-15,0,6,3,1,-17,-29,-10,1;
MA   /M: SY='A'; M=11,-18,-12,-25,-19,-7,-15,-13,5,-18,-2,0,-14,-19,-14,-21,-6,-7,4,-15,1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-31,-26,-34,-28,6,-30,-25,21,-23,13,8,-29,-28,-23,-22,-23,-11,18,13,8,-26;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-8,-13,-11,-20,10,-18,-17,-14,-19,-14,-3,-15,-11,-17,16,2,-6,-29,-22,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,10,-30,14,4,-24,-18,80,-32,-8,-22,-6,12,-18,8,-2,-8,-18,-30,-32,12,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=9,-9,39,-15,-13,-20,-11,-19,-22,-18,-23,-18,-5,-21,-13,-19,16,5,-8,-40,-24,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-28,-13,-17,-13,40,-13,-30,-17,-22,-15,-3,-21,-14,-16,-2,-15,-24,-13,-11,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,6,-26,-20,-8,-25,42,-24,-3,-2,-12,9,29,-11,-10,-17,-20,-9,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-30,-8,10,-32,-24,2,-6,2,-12,4,-4,-12,44,2,-4,-10,-18,-20,-8,26;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-10,-22,-11,-2,-29,-22,14,-18,8,4,-22,-24,-18,-18,-12,-5,21,-27,-9,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,10,-30,19,36,-20,-20,5,-25,5,-18,-16,-1,-8,14,-3,-4,-10,-26,-19,0,24;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-19,-22,-14,-5,-21,-15,4,-11,14,8,-17,-23,-11,-1,-11,-5,6,-23,-8,-13;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-11,-19,-17,-7,-4,-14,-7,-14,-9,-7,-12,-20,-15,-17,1,-1,1,-15,0,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-22,-14,-27,-24,6,-7,-20,-2,-21,-4,-4,-18,-25,-23,-21,-11,-10,2,-3,3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-12,-1,-11,-22,1,-14,11,-4,0,-9,-19,1,19,-14,-10,-12,-16,3,-2;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-17,-12,-11,-10,-15,-16,-1,-16,5,-2,-11,-17,-12,-18,-3,-1,0,-21,-7,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-17,-22,-15,5,-25,-19,6,-20,23,7,-17,-22,-16,-14,-11,8,4,-22,-3,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='B'; M=4,12,-19,9,-4,-19,7,-5,-19,-6,-18,-12,11,-14,-6,-11,2,-6,-16,-23,-13,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-34,0,2,-27,-16,-15,-19,-8,-26,-18,-13,68,-8,-16,-8,-9,-26,-27,-25,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-3,19,-21,20,10,-26,-4,-2,-24,1,-23,-18,15,-10,4,-4,7,-3,-21,-30,-17,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-23,7,-30,-16,25,-24,29,22,-26,-27,-18,-19,-23,-9,17,-16,7,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,8,22,-32,-19,-5,-27,23,-25,-12,0,0,18,12,-4,-7,-25,-25,-14,20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-34,-28,-1,-34,-27,36,-24,14,17,-22,-23,-22,-24,-13,-2,34,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-33,-27,7,-35,-19,34,-24,17,14,-23,-25,-20,-23,-19,-8,24,-12,14,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00488;
//
ID   FIBRILLARIN_MP; MATRIX.
AC   MP00566;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fibrillarin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4305425; R2=0.0125264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1019; N_SCORE=17.185; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=27,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='S'; M=20,-1,-11,-6,-4,-19,-2,-13,-16,-9,-23,-16,6,-11,-4,-12,28,16,-7,-33,-19,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,-19,-22,-17,-13,-21,-25,7,-15,-6,-3,-22,10,-20,-20,-6,-3,15,-28,-18,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-12,-32,-29,0,-32,-28,31,-22,14,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,41,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='S'; M=24,-3,-10,-7,-3,-20,0,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,13,-7,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-38,-30,7,-37,-29,41,-28,18,17,-22,-23,-23,-27,-19,-8,30,-19,1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=11,-23,-14,-27,-24,-7,-20,-27,19,-19,4,5,-21,-22,-22,-21,-5,-2,30,-26,-12,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-25,5,5,-26,22,-12,-30,-7,-24,-18,1,-6,-5,-11,3,-8,-24,-24,-22,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-19,-5,4,-10,-11,-9,-9,-4,-8,-7,-10,16,-3,-7,-8,-7,-13,0,-7,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-23,19,25,-25,-12,-1,-24,5,-21,-16,11,-7,9,0,4,-2,-22,-30,-16,17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-28,61,-19,-37,-19,-29,-20,1,-19,-18,-19,4,-14,-27,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-26,-21,-12,-11,-25,-17,4,-2,2,5,-16,-7,-9,0,-14,-8,3,-22,-9,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-25,-2,-31,-28,29,-21,10,10,-23,-24,-23,-21,-9,1,36,-27,-8,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,0,-16,-13,-22,11,-20,-19,-14,-18,-14,-6,-15,-13,-20,10,-2,-8,-26,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,32,-22,13,12,-29,-29,-28,-21,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-29,71,-30,-17,1,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,2,10,33,-29;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-9,-4,-20,0,-14,-16,-10,-21,-16,1,-10,-4,-14,27,11,-6,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-34,-8,0,-24,-18,5,-20,-9,-25,-14,-11,49,-4,-14,-6,-9,-26,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,4,-21,-20,-1,-30,30,-21,-10,0,-18,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-22,-21,-16,-11,-23,-21,11,-16,-5,4,-18,8,-15,-19,-4,-2,12,-29,-14,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-21,-27,-23,8,-5,-15,6,-20,9,20,-18,-24,-18,-17,-15,-11,5,-16,-3,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,4,-21,-19,-1,-28,24,-20,-11,0,-17,11,55,-5,-5,-19,-22,-11,3;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,32,43,-33,-17,-1,-33,12,-24,-22,6,-4,13,0,-1,-10,-29,-32,-19,28;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,28,-30,-20,15,-30,40,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,4,-33,-23,32,-27,31,22,-26,-26,-20,-23,-23,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-7,8,-27,13,13,-23,-6,-8,-24,-5,-18,-17,3,0,-2,-9,0,-6,-22,-29,-19,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-15,-26,-22,-2,-23,-20,19,-19,14,15,-22,-24,-18,-18,-9,-2,24,-26,-8,-20;
MA   /M: SY='C'; M=20,-12,23,-18,-16,-18,-14,-23,-11,-16,-11,-11,-13,-21,-18,-21,2,-2,4,-32,-21,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-27,8,21,-28,-16,-1,-26,18,-23,-12,6,-10,16,15,-1,-7,-24,-26,-15,18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-26,5,14,-26,-8,-3,-27,13,-24,-14,1,-11,8,10,1,-7,-20,-26,-13,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-2,-31,0,6,-26,-16,-10,-24,13,-24,-14,-1,14,1,11,-5,-5,-22,-26,-17,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,36,-20,18,0,-19,-1,9,-20,2,-28,-19,55,-19,1,4,9,-1,-28,-38,-19,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-26,2,-33,-24,35,-25,25,23,-24,-24,-19,-23,-20,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-29,-21,-35,-29,24,-32,-23,24,-25,12,9,-22,-26,-27,-23,-16,-7,23,-11,10,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00489;
//
ID   PHOSPHORIBULOKINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00567;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoribulokinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7438450; R2=0.0141325; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=980; N_SCORE=18.584; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,27,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,25,5,-18,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,37,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-28,-15,-9,4,-26,0,-6,7,1,1,-15,-23,-5,2,-19,-10,-9,0,28,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,32,-28,33,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-8,14,-30,22,-4,-34,38,-12,-40,-12,-30,-24,8,-16,-12,-16,0,-16,-30,-28,-26,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=9,-16,-10,-17,-16,-10,-15,-21,6,-15,-8,-4,-12,-20,-16,-16,12,8,21,-33,-15,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-1,-34,2,9,-28,-15,-10,-22,-4,-28,-20,3,49,-3,-12,-4,-8,-30,-32,-26,0;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-14,-21,-12,6,-12,-28,-18,9,-10,0,0,-16,-16,-8,-14,-8,-6,15,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,4,-24,-8,2,-24,20,-30,-16,36,-16,4,12,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,26,-32,-22,20,-30,36,15,-26,-28,-25,-22,-26,-10,11,-13,7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=5,10,-24,10,34,-26,-12,-3,-24,4,-19,-18,7,-6,10,-5,4,-6,-23,-29,-20,22;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-18,-24,-18,0,-24,-18,30,-18,12,12,-12,-12,-12,-18,-12,-6,18,-12,0,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-18,0,12,-24,-12,6,-12,6,-12,0,0,-6,36,6,0,-6,-18,-12,-6,24; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-32,-10,1,-22,-23,33,-12,-6,-14,2,-3,-17,23,-2,-10,-15,-20,-10,6,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-10,-23,-16,-8,-12,-20,-5,-7,12,-4,18,-8,-16,3,17,-9,0,-5,-22,-6,-4;
MA   /M: SY='A'; M=26,-2,-15,-10,-3,-22,-4,-14,-17,4,-19,-12,1,-11,-3,-6,11,1,-8,-25,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-25,8,34,-27,-18,-3,-23,5,-17,-14,-1,-4,19,-2,5,2,-22,-27,-16,27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-30,-9,-9,2,-24,65,-17,-10,-11,0,-3,-24,1,-4,-14,-16,-21,-3,47,-9;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-12,-19,-16,-12,-1,-24,-11,-4,-9,5,-1,-10,-20,-9,0,-3,17,-2,-17,6,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=25,6,-14,5,-1,-24,-2,-13,-19,-8,-19,-17,1,-10,-5,-15,15,3,-9,-29,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-18,-14,-8,-10,-22,-14,-6,2,-1,6,-8,-15,-5,-2,-1,17,-2,-24,-7,-7;
MA   /M: SY='D'; M=8,26,-22,34,8,-32,-6,-8,-28,-4,-22,-22,8,-10,-4,-14,4,-6,-18,-32,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=6,-5,-10,-8,-8,-14,-11,-16,-9,-12,-18,-12,1,-13,-8,-12,26,25,3,-36,-16,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-9,-21,-10,1,-7,-22,-11,3,-13,12,5,-8,-20,-7,-11,-13,-7,0,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=3,-9,-22,-11,-3,-20,-12,-7,-23,14,-19,-11,-1,-16,3,35,2,-3,-13,-23,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-27,-8,0,-20,-17,-2,-28,24,-22,-12,2,-18,8,57,-2,-5,-18,-23,-12,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-24,-18,-8,-12,-20,-4,0,14,0,32,-12,-16,4,6,-16,-10,-2,-20,-4,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-14,-37,-5,8,-23,-21,-5,-20,-7,-25,-17,-15,56,-4,-14,-9,-11,-28,-24,-14,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,40,-27,55,15,-37,-8,-3,-35,-2,-27,-27,15,-10,-2,-12,2,-8,-25,-37,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-6,-18,-4,-15,-11,-25,-21,10,-15,-1,-1,-12,-20,-18,-18,-5,4,20,-31,-11,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00490;
//
ID   MYELIN_P0_MP; MATRIX.
AC   MP00568;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myelin P0 protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9115245; R2=0.0111107; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1188; N_SCORE=17.101; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=233; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,0,-30,11,-13,-33,26,-30,-13,0,-13,0,13,-7,-13,-23,-20,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-23,-10,-3,-17,-20,-7,-23,16,-17,-10,0,-17,3,43,0,11,-13,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-14,-18,-14,-18,-17,17,-21,-11,-17,-16,-10,-8,-21,-18,-17,7,-3,3,-29,-21,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-23,-7,0,-20,-13,-3,-27,16,-23,-13,3,-17,7,43,7,0,-17,-27,-13,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,17,-37,-20,3,-23,24,-23,-3,0,-10,43,17,-3,-10,-27,-20,-10,30;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-25,-10,-11,-22,11,-20,-23,-13,-22,-16,-5,13,-13,-16,5,10,-18,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-13,-17,-23,-17,-3,-20,-7,10,-10,10,36,-13,-17,-3,-10,-6,11,7,-23,-3,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,7,-27,-20,69,-27,-3,-20,0,7,-17,27,3,-7,-17,-30,-27,10,14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=13,-6,-17,-13,-13,-19,16,-20,-20,-13,-17,-13,-3,-13,-13,-16,11,13,-10,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-6,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-23,-17,4,-10,-3,-12,31,18,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-20,-7,-13,-20,46,-13,-26,-13,-20,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-20,-13,-20,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=6,-25,-17,-27,-17,2,-22,-20,12,-25,34,12,-25,-25,-17,-20,-20,-7,7,-20,-5,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00491;
//
ID   MYELIN_MBP_MP; MATRIX.
AC   MP00569;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myelin basic protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0294933; R2=0.0121254; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=964; N_SCORE=15.708; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=204; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,12,-32,-20,45,-24,2,-20,0,4,-14,41,6,-4,-14,-30,-24,2,24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,0,16,-33,-17,15,-18,7,-17,0,1,-9,49,8,-1,-9,-26,-18,-7,32; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-21,-8,-9,-21,20,16,-25,-12,-19,-9,1,-15,-7,-11,-1,-13,-19,-20,-10,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=19,-7,-14,-11,-11,-18,24,-15,-18,-11,-14,-11,-4,-11,-11,-15,4,-7,-10,-15,-18,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-17,-4,-4,-13,7,14,-19,0,-13,-6,2,-11,0,9,-4,-10,-15,-13,-4,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-28,-6,6,-29,-19,-8,-18,-2,-22,-10,-6,25,18,-6,3,4,-23,-27,-17,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-22,-6,2,-27,-5,-7,-20,-3,-18,-7,0,-12,19,-3,8,12,-18,-24,-13,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,48,38,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='N'; M=-2,24,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,41,-16,0,-4,22,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,70,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-36,-26,0,-32,-18,38,-22,20,36,-20,-20,-12,-22,-20,-10,22,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-14,-30,-26,0,-26,-18,26,-16,14,29,-26,-26,-18,-16,-14,-4,34,-26,-6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-6,-2,-18,-20,-16,-18,13,-18,-10,0,-10,-2,6,8,27,-8,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='P'; M=13,-16,-28,-14,-4,-26,-12,-20,-16,-10,-22,-16,-16,51,-10,-20,-2,-6,-18,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-28,-18,-12,-18,-24,-24,-1,-14,-14,-8,-24,43,-18,-20,-10,-6,1,-30,-22,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-3,-19,-5,4,-24,-11,-1,-13,-2,-18,1,1,-12,23,-2,14,3,-14,-29,-13,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-27,-8,-7,-28,23,-16,-31,9,-27,-14,-2,-14,-7,-1,-2,-13,-21,-20,-21,-7;
MA   /M: SY='K'; M=13,-4,-22,-8,2,-26,-12,-14,-22,27,-22,-10,-4,-10,2,11,-2,-6,-12,-20,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-30,-8,-10,-28,35,-14,-36,3,-28,-16,0,-18,-8,8,-4,-16,-26,-20,-22,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00492;
//
ID   RING_HYDROXYL_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00570;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial ring hydroxylating dioxygenases alpha-subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5319934; R2=0.0155962; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=878; N_SCORE=19.215; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-19,-33,-26,6,-29,-24,27,-24,19,16,-24,-25,-22,-22,-16,-6,26,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-21,-16,-25,-22,21,-24,-16,6,-18,1,-1,-17,-25,-23,-16,-5,4,13,-10,14,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-28,15,9,-33,9,0,-29,-1,-26,-16,14,-14,14,-4,2,-11,-30,-28,-20,12;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-27,-5,3,-25,-16,-11,-24,22,-25,-13,0,4,2,17,-3,-3,-19,-24,-15,1;
MA   /M: SY='D'; M=-4,28,-25,37,12,-33,-1,-5,-32,-3,-26,-24,14,-11,-2,-11,6,-6,-24,-35,-21,5;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-29,-8,-11,-31,44,-15,-34,-8,-27,-16,-1,-17,-6,-11,0,-16,-27,-20,-25,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-20,-1,5,-20,-13,-8,-20,5,-20,-13,0,-14,2,16,8,1,-10,-29,-16,2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-31,-25,0,-32,-27,29,-24,18,13,-26,-17,-23,-23,-17,-6,28,-25,-7,-26;
MA   /M: SY='G'; M=6,-2,-23,-7,-6,-24,11,-11,-26,4,-23,-14,6,-16,-4,7,3,-7,-18,-24,-19,-6;
MA   /M: SY='A'; M=29,-18,-11,-24,-17,-11,-12,-23,5,-15,2,-1,-18,-18,-17,-20,0,-1,17,-23,-15,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-35,-26,39,-28,-17,12,-24,19,18,-23,-28,-26,-18,-20,-9,11,-8,12,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-8,-26,-4,-2,-3,-26,-8,2,-14,10,1,-14,-20,-9,-14,-16,-9,-2,-16,7,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-23,24,8,-25,-5,3,-24,-1,-29,-22,37,-6,1,-4,8,-2,-28,-38,-21,4;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-16,-21,-19,-10,0,-21,-9,-6,-4,-6,-2,-12,-20,-1,3,-7,-6,-1,-13,2,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-30,-10,-2,-23,-16,-10,-20,2,-23,-10,-9,29,-1,10,-2,-4,-20,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-11,-18,-29,59,-18,-38,-15,-28,-19,-1,-19,-17,-13,0,-18,-28,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-16,-19,-13,-12,-15,-5,-1,-6,-3,9,-12,-16,-8,-11,-3,-1,6,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-5,-23,-4,5,-24,-15,-7,-21,3,-23,-13,-1,5,9,9,10,7,-18,-29,-16,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-29,43,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-20,23,-24,-22,0,-24,-19,-3,-23,-4,-5,-16,-28,-21,-21,-3,-2,4,-28,-5,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-25,-15,-10,-2,-21,3,-9,0,-2,2,-8,-23,-2,16,-9,-6,-9,-12,12,-9;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-23,-12,-15,-18,31,-11,-27,-14,-22,-15,-2,-18,-14,-12,4,-10,-18,-21,-19,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,8,-27,13,14,-19,-17,5,-29,11,-22,-15,4,-13,5,15,-3,-8,-22,-26,-9,8;
MA   /M: SY='A'; M=7,-12,-11,-17,-15,-16,-5,-18,-3,-12,-10,-5,-7,-20,-11,-12,0,-4,4,-27,-17,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-30,-1,8,-30,23,-10,-34,1,-26,-17,0,-13,2,0,-2,-15,-28,-23,-22,5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-22,24,13,-25,-5,4,-24,1,-26,-21,36,-14,2,-4,7,-3,-27,-36,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-21,-10,-7,-24,11,-16,-24,3,-22,-13,-2,-13,-6,-2,5,-3,-14,-22,-19,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-25,-3,-2,-26,7,-11,-29,15,-27,-14,6,-14,-2,9,1,-6,-20,-24,-17,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=10,-6,-8,-10,-9,-9,0,-13,-5,-8,-6,-5,-5,-9,-9,-10,5,7,2,-14,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-23,-33,-24,33,-31,-12,14,-28,23,10,-21,-28,-25,-20,-23,-11,6,-7,17,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-17,-16,-13,-10,-23,-17,-3,-3,-7,-4,-7,-17,-9,7,4,21,6,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-13,-10,-12,-10,-20,-3,-18,-16,-15,-17,-12,-9,3,-9,-16,4,1,-11,-31,-21,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,13,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-45,-38,-28,10,-22,-28,-13,-22,-8,-13,-38,-30,-20,-20,-38,-27,-23,122,25,-20;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-18,-11,-4,-17,-8,-17,-12,-2,-10,-8,-7,-14,-7,-8,3,5,-4,-25,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-22,-33,-25,50,-28,-7,5,-21,10,15,-20,-28,-24,-15,-20,-10,0,7,33,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-23,20,2,-30,10,-9,-31,-3,-28,-21,11,-13,-4,-9,9,-4,-22,-32,-21,-1;
MA   /M: SY='C'; M=0,-9,6,-18,-18,-10,-20,-19,2,-18,-3,-4,-3,-23,-17,-18,-2,1,6,-32,-15,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-1,24,-22,27,15,-28,-8,-4,-27,-2,-24,-21,15,-10,1,-8,9,0,-21,-35,-19,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-25,8,11,-24,-13,-2,-25,21,-26,-15,20,-13,6,16,1,-2,-23,-29,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,7,-27,-21,1,-28,-23,7,-26,25,7,-23,-28,-21,-20,-17,1,8,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-17,-26,-18,-4,-25,-21,17,-20,19,10,-23,-24,-14,-18,-13,-5,18,-23,-7,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,-23,15,9,-25,-9,7,-26,6,-27,-17,19,-13,4,1,7,-3,-22,-33,-14,6;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-15,-26,-20,-5,-23,-16,18,-13,9,24,-22,-23,-10,-14,-11,-4,25,-25,-8,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-35,-10,-1,-27,-21,-17,-19,4,-26,-15,-15,51,-6,-2,-10,-9,-21,-27,-23,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00493;
//
ID   AMIDASES_MP; MATRIX.
AC   MP00571;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Amidases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1248159; R2=0.0107408; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1188; N_SCORE=16.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=222; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-18,-19,-14,-7,-11,-12,-4,-13,-4,-3,-12,-15,-11,-14,-3,-3,-1,-16,-3,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-22,-26,-20,33,-26,-7,3,-19,6,1,-17,-20,-21,-15,-16,-7,-1,6,26,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-27,-10,-15,-22,41,-15,-29,-13,-23,-15,-2,-13,-14,-15,-2,-16,-23,-15,-21,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-25,-11,-4,-18,-17,-12,-12,-4,-16,-10,-11,25,-5,-7,-4,-2,-13,-23,-15,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-11,-15,-13,-8,-20,-21,-1,-12,-6,-5,-9,-8,-14,-13,8,26,9,-26,-11,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-24,-11,-4,-13,-18,1,-13,8,-7,-2,-6,-18,0,20,-10,-8,-9,-20,-4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,33,-21,16,-1,-17,-2,12,-20,-1,-28,-18,51,-20,-1,0,8,0,-28,-36,-15,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-38,-10,0,-29,-18,-19,-20,-8,-29,-19,-18,80,-9,-18,-8,-9,-28,-30,-29,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-29,-40,-29,-21,1,-20,-17,-16,-12,-14,-13,-27,-26,-13,-8,-28,-21,-21,84,17,-15;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,34,-22,35,8,-29,-3,2,-29,-1,-28,-22,30,-14,-1,-5,5,-5,-27,-37,-19,4;
MA   /M: M=-7,-12,-24,-11,-2,-13,-21,-8,-7,-8,0,-2,-11,-3,-5,-6,-7,-2,-8,-26,-10,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-2,11,-22,12,11,-27,-1,-6,-26,0,-24,-18,10,-11,4,-4,10,1,-21,-31,-19,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-22,-18,-10,-3,-24,-3,-10,3,-1,-1,-13,-22,-5,14,-16,-10,-9,-8,8,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-15,-20,-18,-7,-24,-23,11,-16,-2,1,-13,-19,-16,-17,1,11,17,-23,-9,-18;
MA   /M: SY='P'; M=4,-17,-17,-15,-7,-24,-16,-20,-15,-12,-22,-14,-16,43,-12,-20,-3,-6,-16,-30,-25,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-11,-29,-11,-20,-29,64,-20,-37,-20,-28,-19,-1,-20,-20,-20,0,-19,-26,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-12,-1,-2,-21,6,-11,-22,-11,-30,-20,9,-11,-2,-11,36,16,-12,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-8,-15,-28,53,-18,-35,-18,-30,-20,2,-18,-15,-18,10,-10,-25,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-8,-1,5,-20,-5,-11,-19,-8,-25,-18,4,-10,-1,-11,29,13,-9,-37,-20,2;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-16,-15,-11,-23,20,-19,-20,-13,-17,-14,-5,-13,-12,-19,9,-4,-10,-22,-23,-11;
MA   /M: SY='A'; M=36,-11,-10,-19,-11,-16,-5,-18,-7,-11,-10,-9,-10,-13,-11,-18,10,3,3,-22,-15,-11;
MA   /M: SY='A'; M=29,-14,-8,-22,-13,-11,-9,-20,-3,-15,-1,-3,-13,-16,-13,-19,3,0,4,-23,-15,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,1,-31,-29,31,-22,15,12,-28,-28,-27,-21,-13,-1,41,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-18,-10,-21,5,-19,-13,-11,-13,-11,-8,-11,-10,-19,12,0,-3,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-11,-14,-10,-20,4,-17,-14,-10,-15,-11,-5,-13,-9,-15,10,0,-6,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-26,-3,-10,-16,21,-9,-30,-8,-21,-15,3,-20,-11,-2,-3,-13,-23,-21,-15,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-23,-17,-8,-8,-15,-11,3,-17,10,7,-15,-21,-5,-15,-14,-10,-2,-20,-5,-8;
MA   /M: SY='C'; M=12,-17,14,-22,-19,-14,-10,-23,-5,-18,-9,-5,-15,-23,-19,-20,2,-1,8,-31,-19,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-29,-4,-4,-16,-20,-15,-11,-12,-12,-10,-13,26,-11,-16,-8,-5,-13,-26,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-18,-29,-23,7,-13,-21,10,-24,13,9,-19,-23,-21,-21,-14,-9,8,-17,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=29,-7,-14,-13,-9,-21,12,-18,-18,-12,-18,-14,-3,-12,-9,-17,16,3,-8,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-21,-27,-20,1,-30,-13,20,-24,23,13,-20,-24,-16,-19,-17,-3,15,-23,-1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-12,-4,-6,-16,-5,-14,-16,-10,-20,-15,9,-12,-6,-10,25,30,-8,-34,-16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,68,21,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-16,-14,-13,-12,-13,-20,-5,-13,-8,-6,-4,-13,-10,-13,11,30,1,-27,-11,-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-29,-7,-18,-30,64,-19,-39,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,0,-19,-29,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,18,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-16,-24,-19,-7,-10,-26,-11,5,-11,4,6,-12,-19,9,-7,-12,-9,-3,-15,-4,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-9,-17,-9,-19,-1,-19,-11,-11,-12,-11,-8,-11,-9,-19,13,3,-2,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-8,-11,-6,-20,-2,-10,-16,-11,-19,-14,-1,-11,-6,-15,20,7,-6,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-6,-32,-26,34,-29,-10,1,-25,8,3,-21,-30,-26,-19,-20,-11,0,2,20,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-5,56,-16,-19,-18,-20,-20,-22,-19,-19,-16,-2,-28,-18,-19,1,5,-10,-42,-23,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-26,-8,-16,-25,51,-15,-34,-17,-28,-19,5,-19,-16,-17,4,-14,-26,-23,-26,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-11,-28,-24,0,-30,-26,21,-23,17,9,-22,-25,-22,-21,-11,4,24,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-7,-27,-25,6,-28,-21,16,-19,6,5,-24,-28,-24,-18,-9,2,27,-21,3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-20,-29,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,1,-18,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-34,-25,21,-31,-21,21,-28,28,14,-24,-27,-24,-22,-23,-9,14,-14,6,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-11,-7,-7,-13,-16,-17,-13,-9,-15,-12,2,-10,-6,-9,24,41,-3,-32,-12,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-29,-18,-16,17,-22,17,-9,-8,-5,-2,-14,-27,-8,-2,-16,-11,-13,14,47,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-9,-19,-27,65,-19,-38,-19,-29,-20,1,-20,-20,-19,0,-19,-29,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-25,-13,-6,-14,-17,-7,-17,10,-7,-4,-5,-21,0,35,-8,-4,-11,-22,-10,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00494;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00572;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 1 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.6918833; R2=0.0066346; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1311; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1084; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-37; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-69,-84,-76,-41,-85,-66,-32,-76,86,61,-82,-82,-69,-73,-76,-63,-40,-71,-53;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-80,-64,-11,3,-75,21,-65,-7,-60,17,-62,-2,-51,65,-14,-63,-67,-48,97;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-27,12,80,-12,-11,-71,-58,-1,-17,-32,-66,-51,-72,-58,8,-18,7,-65,35,39; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-24,-71,-78,-72,-51,-29,-72,44,-22,44,36,-72,-75,-5,-70,-21,-14,40,35,-56;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-85,-77,-4,-85,-68,22,-76,77,63,-80,-81,-70,-74,-76,-62,-11,-71,-52;
MA   /M: SY='M'; M=-61,40,25,5,-63,-70,11,-16,-17,4,78,42,-71,-55,8,-18,8,-1,-83,-61;
MA   /M: SY='Y'; M=-27,-80,-63,19,-7,-27,-55,-21,7,-30,9,-63,-9,-51,66,-61,-16,-65,64,67;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-73,-83,-78,30,-82,-72,60,-75,30,36,-76,-78,-73,-76,-69,-14,26,-67,25; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-82,-13,-15,-61,-75,36,-72,60,-34,-64,-60,-74,-1,11,-20,-16,-27,63,50; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-75,38,39,-80,-64,12,-79,19,-79,-70,70,-67,23,10,-15,22,-75,-88,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-81,59,32,-81,-72,-56,-26,56,-77,-70,-49,-67,2,57,-18,-60,-74,-82,-68; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-76,-86,-76,-78,5,-83,-42,-61,-70,-57,-54,-77,-88,-66,-67,-71,-70,-66,-32,128; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-83,-12,-17,-81,53,10,-82,-61,-83,-72,31,72,36,-68,-17,-63,-82,-79,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-71,13,-55,-67,-23,-53,-61,28,25,-57,86,-9,-1,-11,-16,-53,-24,-83,-66;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-75,-93,-79,-69,-74,-83,35,14,-23,0,-63,-78,88,-6,-77,-75,-70,-25,-84,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-82,10,5,-78,-27,-69,-68,16,-1,-66,-9,81,-62,-66,-61,21,-26,-85,-76; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-62,13,-84,-80,-49,-87,-79,80,-77,36,14,-76,-77,-74,-78,-71,-14,35,-76,-57;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-73,-81,-78,-79,43,-83,-48,4,-72,-8,-49,-77,-86,-69,-70,-71,-67,-20,-37,115; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-73,-85,-81,-50,-88,-85,88,-78,-1,-37,-77,-76,-76,-80,-71,-56,60,-78,-58;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-63,-62,-63,-63,-70,-68,-48,-60,-26,34,-52,-63,-63,-67,-11,102,24,-86,-63;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='A'; M=61,-68,-78,-71,14,-67,-73,59,-71,15,36,-71,-72,-67,-73,-58,-57,-11,-71,-57;
MA   /M: SY='G'; M=45,56,-62,-67,-78,65,-67,-78,-64,-77,-69,17,-69,-61,-70,37,-55,-68,-79,-74;
MA   /M: SY='Y'; M=7,-73,36,5,48,-71,11,-18,-62,-9,9,-59,-8,-3,-65,-57,33,-57,-60,60;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-76,37,-13,11,-24,-56,-68,55,-72,-65,51,32,-51,11,-17,-56,-5,-75,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=8,-77,93,9,-15,11,-58,-78,-17,-75,6,-2,-67,-54,-62,-16,-58,-74,34,-65;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-79,-105,-94,-105,-112,70,-101,-118,-99,-114,-104,-80,-97,-97,-106,-78,-24,-111,-105,-107; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-83,-98,51,-73,-103,-90,7,-96,-81,-100,-96,-70,-93,-81,-21,24,20,-33,-119,-92; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-88,10,-91,15,10,-105,-90,-24,-27,-16,-77,-94,-101,-87,-90,-28,-85,8,-90,21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-91,-107,-18,-23,-98,-96,7,-100,-25,-44,-91,12,30,18,-86,-27,-22,-100,-106,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-34,-99,23,17,-92,-95,-79,-89,-65,-4,-81,-78,-12,-70,48,-81,-21,-88,-102,-87; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-85,38,-75,1,-103,-31,-83,-99,-24,-103,-92,40,71,-79,-86,-79,-79,-99,-106,-100; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,-79,11,30,-65,-74,-59,-21,44,-13,-60,-58,-70,48,-10,-19,-15,-4,-71,38; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-75,-68,17,-57,-77,-70,49,-20,-52,-53,-68,-9,-64,-70,2,22,39,-73,38; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='H'; M=-62,-75,-10,19,-67,-68,52,15,-58,-11,34,50,16,21,-62,3,22,-60,34,-60; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=26,-75,87,-10,-78,-65,-59,-67,-16,-34,-69,18,-70,-56,8,-55,-57,10,-91,-70; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='D'; M=-24,-77,61,-53,-76,-71,12,17,-17,-31,-65,-52,-71,23,-65,19,51,-61,-91,-68; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-76,-3,-7,-52,-16,65,-60,-58,-22,-56,-58,28,8,-5,-9,-5,7,-63,72;
MA   /I: I=-2; E1=0; IE=-105; DE=-12;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00495;
//
ID   PYRIDINE_REDOX_2_MP; MATRIX.
AC   MP00573;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases class-II active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6693730; R2=0.0131177; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=874; N_SCORE=16.124; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-27,-3,-6,-24,20,-5,-27,-9,-23,-15,8,-7,-7,-10,0,-9,-25,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-18,-31,-26,0,-18,-26,20,-26,15,9,-21,-25,-23,-24,-17,-10,17,-21,-6,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-29,-10,1,-22,-18,-17,-14,-5,-14,-11,-15,35,-6,-12,-7,-5,-18,-26,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,1,-25,-2,-8,-26,35,-12,-32,-9,-29,-19,11,-17,-9,-10,7,-9,-26,-27,-25,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,19,49,-26,-18,1,-28,7,-20,-19,2,-3,16,-1,1,-8,-28,-28,-15,32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-28,26,24,-32,-8,-1,-30,4,-24,-19,10,-9,13,-3,2,-8,-27,-32,-18,18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-26,3,24,-23,-16,-2,-22,9,-16,-11,-2,-9,11,2,-2,-5,-20,-24,-11,17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-25,52,-30,-12,5,-26,18,5,-22,-30,-29,-18,-22,-10,0,7,33,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-18,-32,-20,-10,-5,-20,-10,-8,-6,-7,-4,-16,-20,-7,-4,-16,-11,-12,21,7,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-27,-2,-9,-29,38,-8,-31,-11,-28,-17,14,-18,-3,-11,3,-12,-29,-25,-24,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-29,-6,3,-20,-20,-6,-27,34,-23,-9,0,-15,7,42,-10,-10,-19,-19,-9,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-29,-11,-20,-29,65,-20,-37,-20,-28,-19,-1,-20,-20,-20,0,-19,-26,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-11,-3,-2,-19,-3,-7,-19,-10,-26,-17,7,-10,-1,-11,33,19,-9,-37,-17,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-17,-22,-21,-17,12,-20,-1,-3,-12,-4,-4,-16,-23,-13,-14,-7,-2,-4,10,35,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=31,-11,-16,-16,-7,-21,-3,-20,-12,-10,-13,-11,-11,2,-10,-18,6,0,-4,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-18,-24,-20,-4,-28,-8,16,-18,6,10,-15,-22,-16,-16,-7,5,20,-27,-3,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-21,-18,-12,6,-14,-14,-12,-15,-11,-10,-13,8,-17,-18,-3,-6,-10,-16,-6,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-22,-36,-26,40,-31,-21,16,-29,24,13,-23,-28,-28,-21,-23,-10,9,-6,14,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-29,-3,10,-25,-16,-6,-27,29,-21,-9,-2,-13,10,31,-9,-11,-20,-21,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-25,21,-1,-27,16,4,-30,-6,-29,-21,33,-18,-5,-8,4,-9,-30,-34,-21,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-29,0,11,-30,-19,-4,-26,35,-26,-6,2,-11,20,24,-7,-9,-22,-21,-10,15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,9,-28,17,17,-29,-17,-3,-28,4,-24,-19,0,11,2,1,-4,-8,-24,-31,-19,8;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-15,-31,-26,2,-30,-27,28,-24,21,13,-28,-28,-25,-21,-16,-4,34,-25,-6,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,-18,-16,-25,-19,-3,-9,-22,4,-17,-2,-2,-15,-18,-18,-21,-1,-3,11,-18,-9,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,17,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-6,-16,-30,59,-18,-39,-16,-29,-20,1,-19,-17,-14,0,-18,-29,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,-1,-16,-31,61,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='B'; M=-14,42,-24,40,8,-28,-6,4,-28,-1,-29,-24,39,-15,-1,-5,6,-1,-28,-39,-19,4;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-13,-4,-4,-16,-7,-12,-16,-10,-23,-16,4,-5,-4,-11,29,23,-9,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-13,-19,-11,-21,9,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-3,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-11,-31,-26,-1,-29,-25,26,-22,15,15,-25,-26,-22,-22,-14,-5,30,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-29,16,49,-29,-19,0,-26,8,-18,-14,0,-2,20,-1,0,-9,-27,-29,-18,35;
MA   /M: SY='E'; M=2,6,-25,12,44,-28,-15,-4,-26,5,-19,-18,-1,-2,13,-4,4,-6,-23,-29,-20,29;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-12,-17,-10,-21,6,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,12,2,-4,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-23,-25,-16,-2,-29,-19,21,-21,18,15,-15,-20,-11,-18,-14,0,11,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-11,-25,-14,-18,37,-25,-1,-6,-16,-2,-5,-10,-27,-21,-14,-15,-9,-8,7,38,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=17,-3,-11,-10,-6,-17,-8,-17,-14,-6,-17,-13,0,-10,-6,-11,21,23,-4,-29,-16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,5,-26,3,1,-25,-2,-3,-29,15,-27,-15,12,-16,2,21,1,-5,-22,-27,-15,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-27,-32,-25,25,-33,-8,20,-24,13,11,-19,-25,-20,-20,-20,-10,9,-1,28,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-14,-10,-21,-16,-17,3,-22,-6,-14,-9,-7,-13,-16,-16,-20,4,-2,6,-23,-19,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-5,10,-22,9,6,-25,-10,-5,-26,14,-27,-17,13,-13,4,13,9,2,-19,-31,-16,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00496;
//
ID   FATTY_ACID_DESATUR_2_MP; MATRIX.
AC   MP00574;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fatty acid desaturases family 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4433122; R2=0.0149439; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=648; N_SCORE=15.117; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-19,1,-30,2,7,-21,-20,89,-30,-8,-20,-2,9,-18,11,0,-9,-19,-30,-30,15,5;
MA   /M: SY='L'; M=0,-20,-16,-25,-17,8,-23,-20,6,-22,22,6,-18,-22,-18,-18,-11,6,5,-19,-2,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-27,-11,31,-17,20,46,-20,-20,-7,-17,-20,-10,17,-20,0,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-32,-18,-15,15,-28,10,-5,-10,-7,-5,-20,0,-10,-12,-18,-10,-15,15,53,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-15,-30,-17,-22,-23,43,-22,-18,-22,-18,-10,-5,-20,-20,-22,-5,-18,-15,-20,-23,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-4,8,-24,-17,-2,-28,23,-23,-11,1,-14,14,41,-1,-6,-20,-24,-12,9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,30,-28,43,8,-10,-15,-5,-30,-7,-20,-23,10,-15,-10,-12,-5,-10,-23,-28,-8,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,27,-30,40,11,-27,-15,2,-33,6,-24,-22,11,-15,1,10,-5,-10,-25,-27,-6,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,16,-25,5,-3,-20,-8,1,-14,-4,-23,-8,28,7,-2,-6,1,-4,-24,-35,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=5,-25,-18,-28,-18,3,-23,-20,13,-25,35,13,-25,-25,-18,-20,-20,-8,8,-20,-5,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-25,-18,-35,-25,55,-23,-20,-2,-25,5,-2,-18,-25,-33,-20,-13,-8,0,3,18,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-30,45,30,-36,-14,-1,-36,10,-27,-24,11,-7,7,-1,-1,-10,-29,-34,-19,19;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-32,-5,-7,-13,-15,44,-25,-10,-23,-10,11,-22,0,-5,-12,-17,-30,12,12,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-20,-23,-19,35,-23,-6,-3,-19,0,-3,-13,-25,-20,-15,-6,-3,-5,1,30,-19;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-6,-4,-19,-3,-14,-16,-10,-22,-16,4,-10,-4,-12,30,20,-6,-34,-19,-4;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-15,-18,-8,-7,-28,-23,15,-13,3,3,-23,-23,-18,-15,-8,-2,30,-30,-12,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-13,-28,-13,-1,-17,-22,-3,-15,11,-3,0,-7,-20,13,35,-13,-10,-15,-20,-8,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-13,-24,-22,-19,-2,-27,-17,23,-23,17,10,-3,-23,-15,-19,-16,-8,9,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-7,-20,-20,0,-20,-20,20,-13,7,7,-20,-20,-20,-13,-7,0,33,-20,-7,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-2,-25,-1,-10,7,-24,6,-10,-8,-8,-8,-8,-21,-8,-10,-6,5,-11,2,40,-12;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-10,-13,-13,-9,-20,-21,-2,-12,-8,-7,-6,-15,-13,-12,16,33,11,-31,-11,-13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-15,-16,-9,-18,-7,9,-12,-11,-11,-6,-7,-14,-7,-15,4,-5,-4,-23,-9,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-12,4,-14,-7,-21,-22,-17,-29,18,-25,-14,-11,-21,-4,11,-14,-13,-19,-2,-9,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,2,-20,-13,-20,-13,-23,-11,-14,-14,-12,-16,8,-15,-21,0,-4,-3,-28,-23,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,35,-30,50,15,-35,-12,0,-38,7,-28,-25,15,-12,2,10,-2,-10,-28,-35,-18,8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-32,-34,-39,-29,2,-34,-28,30,-26,10,13,-25,-22,-18,-26,-25,-15,14,22,7,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-31,-25,5,-31,-25,28,-26,31,16,-29,-29,-24,-21,-21,-6,27,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-30,27,54,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-19,-30,-25,42,-28,-1,2,-24,5,2,-17,-28,-28,-16,-16,-9,7,-7,18,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-28,-19,8,-29,-14,17,-29,46,19,-28,-29,-18,-19,-29,-11,8,-21,1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,20,-30,-28,-7,-28,-29,14,-23,2,2,-25,-30,-27,-23,-9,-3,29,-33,-15,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-13,17,-28,19,2,-29,8,22,-33,-7,-27,-16,18,-17,2,-7,-1,-13,-30,-31,-12,1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,6,-30,11,6,-26,-18,-1,-32,26,-24,-15,5,-16,8,44,-8,-10,-22,-25,-12,4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-45,-40,-30,8,-25,-30,-3,-22,-10,-10,-35,-28,-20,-22,-35,-25,-15,108,23,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,16,-26,8,8,-25,-12,-1,-26,26,-29,-14,24,-14,7,20,-2,-6,-24,-28,-14,7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='H'; M=1,3,-25,5,13,-26,-6,17,-27,1,-21,-13,2,-11,4,-4,-1,-11,-22,-27,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-26,-1,8,-21,-19,-11,-7,3,-14,-7,1,-11,2,-4,-2,-6,-9,-27,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-25,-26,-16,5,-26,-17,8,-22,22,14,-25,1,-16,-19,-23,-10,-1,-20,-5,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-16,-10,-8,-13,-18,11,-13,-10,-10,-3,0,-13,-4,-9,9,23,-7,-28,-3,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-30,-8,-15,-28,48,10,-38,-18,-28,-15,2,-20,-13,-15,-2,-20,-30,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,17,-30,-20,18,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00399;
//
ID   MYELIN_PLP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00575;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myelin proteolipid protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3635688; R2=0.0122790; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1414; N_SCORE=21.716; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-15,-31,-27,-3,-27,-28,28,-21,9,9,-24,-24,-24,-22,-9,-2,37,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-15,-18,-8,-22,-4,-20,-12,-10,-14,-12,-12,8,-10,-20,6,-2,-5,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,15,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-26,-32,-27,-3,-19,-27,28,-27,16,12,-20,-23,-21,-25,-17,-11,19,-21,-6,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,88,-30,-28,-13,-30,-28,-19,-30,-4,-11,-22,-38,-28,-28,-15,-10,-5,-43,-23,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,69,-30,-11,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,41,-28;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-12,-17,-12,0,-10,-18,-9,-14,-11,-10,-6,-14,-13,-16,14,13,0,-23,-9,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-12,-30,-28,0,-28,-25,28,-18,12,19,-28,-28,-25,-18,-12,-2,43,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,7,36,-22,-23,-8,-14,2,-12,-12,-8,-8,7,-5,-3,-7,-9,-30,-17,21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=18,-3,-10,-10,-7,-16,-7,-17,-13,-10,-17,-13,0,-10,-7,-13,24,25,-3,-30,-16,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-7,-30,-7,-12,-28,41,3,-37,-8,-28,-15,2,-19,-10,-9,-3,-19,-29,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-10,-13,-13,-9,-21,-21,-4,-11,-7,-7,-4,-13,-13,-11,16,43,7,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,3,29,-20,-23,-10,-9,0,-10,-10,-10,-10,3,-7,-3,-7,-2,-30,-17,16;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-21,-8,-4,-19,-17,-11,-13,13,-16,-7,0,-16,0,12,-1,1,-5,-25,-12,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-16,-9,-7,-11,-20,-13,-6,-10,-2,-4,1,-15,-2,-8,7,25,-5,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-11,-29,-13,-15,18,-25,29,-6,-9,-6,-2,-7,-28,-6,-8,-15,-10,-15,15,62,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00497;
//
ID   GRAM_NEG_PORIN_MP; MATRIX.
AC   MP00576;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   General diffusion Gram-negative porins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2138872; R2=0.0180488; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=328; N_SCORE=12.124; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=16; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=8,1,-24,-1,-10,-27,32,-6,-30,-13,-24,-17,4,-16,-12,-16,2,-13,-22,-24,-22,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-8,-25,-10,-3,-18,-10,-13,-17,15,-8,-4,-5,-17,-3,8,-11,-10,-12,-21,-11,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-10,11,-27,10,-2,-24,0,-7,-18,-3,-20,-13,10,-15,-1,-8,-2,-7,-18,-27,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-22,-7,2,-12,-14,-14,-2,-12,0,-3,-7,-15,-7,-13,-6,-3,-2,-25,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-27,1,10,-21,-10,-7,-21,5,-21,-14,4,-6,1,6,-4,-8,-19,-21,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-26,-6,-14,-27,40,-17,-32,-12,-25,-17,0,-18,-14,-10,2,-12,-22,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-17,-24,-19,-14,-4,-25,-11,1,4,-6,0,-16,-21,-10,-3,-12,-7,6,-6,12,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-1,-25,-1,-6,-27,27,-14,-31,2,-25,-16,1,-14,-8,-5,-1,-13,-22,-20,-20,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-16,2,-3,-12,10,-7,-17,-7,-14,-9,1,-10,-2,-7,2,-2,-13,-14,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-25,27,11,-30,8,-5,-32,-5,-29,-23,15,-12,-1,-10,9,-5,-26,-35,-22,5;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-25,11,12,-28,-8,-1,-22,5,-22,-13,14,-13,12,0,2,-7,-21,-29,-17,12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,37,-24,46,12,-32,-9,-3,-32,-2,-27,-25,20,-11,-1,-9,8,3,-24,-39,-19,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-21,-21,-11,-3,-24,-14,6,-17,23,9,-18,-24,-6,-7,-15,-6,1,-23,-5,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-17,-26,-25,9,-27,-12,16,-16,5,5,-25,-28,-21,-17,-12,-3,25,-8,20,-25;
MA   /M: SY='B'; M=-12,25,-27,24,12,-29,-11,-1,-29,21,-30,-18,23,-13,5,10,-1,-7,-26,-31,-16,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-29,-14,-7,9,-27,14,-7,-4,-6,0,-13,-23,12,-4,-13,-10,-16,11,45,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,5,-34,-29,36,-25,14,14,-25,-26,-26,-24,-15,-5,39,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-26,17,3,-24,-20,-10,-7,-9,-12,-9,1,-14,-1,-13,-2,-6,-5,-32,-13,0;
MA   /M: SY='V'; M=11,-25,-12,-28,-25,-4,-23,-27,21,-19,9,6,-25,-25,-24,-20,-7,-1,35,-26,-11,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-14,-11,-22,-15,-13,-10,-21,0,-13,-3,-2,-14,-15,-14,-19,4,4,10,-23,-16,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-7,11,-19,11,3,-17,-19,-11,-17,-6,-14,-14,3,-10,-5,-10,9,24,-10,-29,-8,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,4,-29,10,-7,9,-23,10,-14,-8,-10,-10,-6,-23,-9,-11,-13,-10,-16,4,42,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-3,26,-17,13,0,-20,0,3,-20,-3,-30,-20,43,-17,0,-3,20,7,-23,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,23,-23,10,0,-20,-7,7,-23,10,-27,-17,39,-20,3,24,3,-3,-27,-33,-17,0;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-14,-17,-23,-17,-3,-21,-8,10,-11,11,33,-14,-17,-5,-11,-7,11,7,-23,-3,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,7,-12,3,0,-20,0,-7,-20,-8,-30,-20,19,-12,0,-8,35,17,-13,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-10,-17,-12,-14,-11,-21,-6,-11,-8,-8,-8,-12,-12,-16,12,21,5,-25,-15,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-27,-28,-31,-24,30,-31,-8,9,-22,13,5,-24,-29,-21,-18,-24,-12,0,19,37,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-23,46,13,-33,-7,-3,-33,-3,-30,-27,17,-10,0,-10,14,0,-23,-40,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-17,-26,-19,-18,11,-9,6,-8,-11,-6,-5,-15,-25,-11,-13,-11,-9,-11,13,44,-18;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-27,-8,-2,-26,0,-14,-24,20,-23,-10,-3,-14,-1,13,-6,-11,-16,-20,-15,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-33,-36,-40,-30,11,-32,-29,21,-27,5,4,-27,-24,-22,-26,-27,-17,6,42,13,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,16,-20,3,-7,-10,-10,0,-6,-10,-2,-6,29,-23,-7,-7,-4,-3,-16,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-26,-13,0,-15,-24,-8,-4,2,9,7,-13,-19,12,1,-16,-10,-10,-20,-6,6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-23,-18,-2,-4,-27,-14,5,-13,21,7,-19,-22,-8,-4,-19,-9,2,-23,-6,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,29,-29,37,8,-34,6,-4,-36,3,-30,-24,19,-13,-3,-5,0,-11,-29,-33,-21,2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,10,-22,9,11,-25,-13,-7,-25,14,-26,-16,11,-10,4,5,9,6,-18,-31,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-27,26,0,-31,21,-5,-34,-7,-30,-24,23,-16,-7,-11,4,-10,-29,-33,-23,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-7,24,-25,24,0,-26,-3,-6,-19,-7,-21,-17,20,-15,-6,-12,1,-7,-18,-33,-18,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-1,-27,1,-4,-3,1,-10,-25,-3,-18,-14,-2,-18,-12,-7,-7,-10,-19,-14,-1,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-19,-11,-8,-3,-19,-13,-8,-3,-1,-4,0,-19,-9,-4,-2,7,-7,-24,-6,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-3,-24,-4,-9,-11,2,-6,-21,-4,-19,-13,-1,-18,-8,-5,2,3,-16,-14,5,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00498;
//
ID   AVIDIN_MP; MATRIX.
AC   MP00577;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Avidin / Streptavidin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0567455; R2=0.0136407; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=14.350; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,2,-28,-3,-3,-7,-19,5,-17,18,-20,-9,6,-19,1,10,-9,-8,-19,-7,19,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-4,-21,-9,-1,-19,-20,-7,-11,9,-11,6,-4,-12,12,4,1,11,-9,-23,-8,6;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-24,-5,8,-14,-21,-4,-5,-8,7,1,-3,-18,10,-6,-11,-8,-14,-25,-9,9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-19,-8,-4,-16,-16,-9,-21,7,-18,-12,2,-14,1,25,11,18,-11,-27,-12,-4;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-14,-4,-5,-13,-7,-9,-10,-13,-11,-10,8,-16,-5,-11,18,9,-8,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='A'; M=11,-12,-18,-17,-14,-15,8,-11,-8,-12,-8,10,-7,-16,-7,-15,3,-4,-5,-24,-15,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-10,-26,-26,-2,-28,-28,21,-18,6,6,-23,-26,-26,-18,-3,11,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='B'; M=-3,20,-17,19,3,-23,-7,-6,-23,-6,-26,-20,20,-12,-2,-8,20,15,-17,-38,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-23,31,18,-27,-16,-7,-27,-1,-21,-21,9,-8,1,-8,7,11,-20,-34,-17,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-20,29,-28,-23,-7,-28,-23,11,-23,2,2,-16,-23,-19,-23,-12,-8,10,-26,-10,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=11,-1,-19,-2,10,-26,0,-8,-22,-4,-22,-15,1,-9,9,-8,16,1,-17,-29,-19,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-28,42,19,-27,-12,4,-30,1,-25,-23,21,-12,3,-6,0,-8,-28,-32,-11,11;
MA   /M: SY='D'; M=-1,9,-26,12,-4,-22,-18,-15,-2,-13,-8,-8,0,-13,-9,-19,-5,-8,-3,-29,-13,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-26,-43,-26,-16,-4,-20,-23,-23,4,-23,-17,-26,-23,-10,-3,-30,-23,-27,91,16,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-30,-6,4,-25,-22,-10,-22,38,-23,-7,-2,-13,7,31,-11,-10,-15,-20,-9,4;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,21,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,14,-13,0,-7,-13,-13,-10,-13,-7,-17,-13,21,-13,-7,-7,17,33,-10,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-26,-16,-6,-12,-22,-6,-11,14,0,8,-10,-20,2,30,-16,-10,-9,-20,-6,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-28,-4,0,-16,-20,27,-12,-3,-14,-1,7,-18,19,-1,-6,-11,-21,-17,11,7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,48,11,-31,-6,4,-31,0,-30,-26,37,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='B'; M=-9,12,-24,9,2,-23,-17,-9,-18,12,-21,-12,12,-13,-1,4,1,5,-14,-29,-12,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-30,-40,-30,56,-27,-23,-7,-27,0,-7,-27,-30,-33,-20,-27,-17,-10,59,30,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-19,-24,-19,-12,3,-28,-1,6,-11,7,6,-19,-25,1,-9,-15,-8,2,-5,23,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-16,2,20,-26,-21,5,-30,18,-22,-13,-1,-13,10,21,-7,-11,-24,-27,-12,13;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-23,-7,3,-25,-20,-10,-16,-3,-18,-9,-4,12,14,-5,7,16,-17,-27,-14,7;
MA   /M: SY='S'; M=5,-10,-12,-10,-8,-15,-12,-15,-3,-11,-16,-8,-4,-17,-4,-11,19,10,8,-35,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=1,-9,-24,-12,9,-3,-21,-14,-7,-4,-7,-7,-9,-12,-5,-10,-6,-8,-7,-18,-7,2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-1,-19,-3,21,-24,-9,-11,-19,-1,-14,-14,-6,-6,3,-11,6,-4,-13,-24,-20,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-25,-6,0,-18,-12,-12,-12,-6,-18,-12,-12,55,-6,-12,-6,-6,-18,-18,-18,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-22,0,12,-32,-12,2,-20,2,-24,-8,4,-10,37,2,15,2,-22,-28,-14,25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-36,-22,-12,-18,-28,-24,7,-18,-11,-5,-20,48,-14,-24,-14,-10,-7,-26,-18,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00499;
//
ID   RIBOSOMAL_S6E_MP; MATRIX.
AC   MP00578;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S6e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0135627; R2=0.0141435; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=553; N_SCORE=12.825; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-15,-11,0,-12,-22,-19,0,-9,-5,-5,-12,-15,-10,-12,3,12,11,-29,-13,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-19,-36,-30,16,-34,-28,31,-26,14,12,-24,-26,-28,-24,-16,-6,33,-18,2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-27,45,18,-32,-12,-3,-31,-3,-22,-23,13,-7,0,-10,1,-7,-25,-37,-19,9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-27,-9,-15,-26,48,-17,-32,-13,-24,-16,1,-19,-15,-15,0,-15,-25,-22,-25,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-1,14,-23,17,8,-28,7,-8,-29,-4,-25,-20,11,-12,-2,-9,8,-3,-22,-31,-21,3;
MA   /M: SY='I'; M=8,-21,-19,-27,-18,-6,-23,-23,17,-19,13,7,-17,-19,-15,-20,-9,-3,13,-22,-8,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-28,-18,-32,-27,15,-31,-26,25,-25,16,10,-23,-26,-26,-22,-14,-5,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-4,-12,-31,59,-17,-39,-17,-29,-21,1,-18,-16,-18,0,-19,-30,-22,-29,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-24,-9,-3,-7,-24,-14,3,-15,18,7,-16,-17,-9,-13,-17,-8,-2,-25,-7,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-29,21,29,-30,-15,-6,-27,1,-24,-21,0,18,5,-8,0,-8,-26,-31,-21,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-16,-1,6,-15,-9,-6,-13,13,-14,-7,-3,9,2,5,-4,-5,-11,-12,-9,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-28,2,-13,-30,55,-16,-38,-16,-28,-20,3,-17,-16,-17,0,-17,-28,-22,-27,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-19,-24,-21,-18,17,-25,5,2,-13,4,1,-19,-26,-12,-13,-14,-4,-3,11,47,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-23,-8,3,-18,-23,-16,-7,12,-13,-5,-7,-13,-2,3,-3,1,0,-26,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-33,-24,23,-30,-20,19,-26,30,19,-26,-28,-24,-20,-23,-9,15,-15,5,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-29,3,22,-28,-20,-4,-28,29,-23,-12,0,-9,16,25,-5,-7,-23,-23,-13,18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,24,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,28,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-14,-11,-8,-13,-18,-15,-13,-2,-11,-8,-1,-12,-6,5,13,31,-4,-27,-11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-3,2,-4,-18,-8,-11,-19,-9,-24,-18,13,-14,-5,-10,24,22,-11,-38,-18,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,64,17,-39,-4,-1,-40,-1,-30,-29,19,-11,-1,-11,0,-11,-30,-39,-21,8;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-26,-1,-1,-21,-15,-8,-16,13,-19,-9,4,-14,2,7,-3,-5,-14,-22,-7,0;
MA   /M: SY='Q'; M=2,10,-20,13,11,-29,-9,-4,-23,-2,-23,-15,8,-10,14,-5,14,3,-19,-32,-17,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-22,-33,-23,51,-26,-17,-4,-18,4,-2,-16,-26,-28,-5,-16,-9,-2,1,18,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-37,-12,-3,-27,-21,-21,-15,-11,-26,-17,-21,79,-12,-20,-10,-9,-23,-30,-28,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-9,-2,-17,-20,11,-22,18,-19,-6,-2,-19,4,32,-8,-9,-13,-23,-4,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-34,-5,7,-28,-15,-9,-21,0,-26,-14,-11,39,7,-8,-5,-9,-27,-24,-17,4;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-28,28,3,-33,22,-10,-37,-9,-28,-24,9,-14,-8,-14,2,-9,-27,-30,-23,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-15,-30,-27,0,-31,-21,28,-22,15,12,-26,-28,-25,-20,-14,-4,37,-27,-5,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-12,-30,-8,-2,-16,-21,-1,-12,-12,-5,-6,-11,19,-7,-10,-12,-10,-17,-28,-12,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-25,-12,-18,-23,44,-20,-29,-19,-19,-14,-3,-19,-18,-19,1,-8,-20,-21,-24,-18;
MA   /M: SY='P'; M=4,-9,-24,-8,-4,-23,-7,-16,-17,-7,-24,-16,-5,26,-8,-13,7,1,-15,-30,-23,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-21,-4,-3,-20,-8,-8,-19,3,-17,-11,-2,-16,-3,10,3,1,-8,-27,-14,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-27,-10,-1,-18,-21,-5,-24,25,-15,-8,-2,-18,6,48,-9,-4,-16,-21,-9,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-17,-21,-18,-12,-12,-25,-14,3,4,-5,4,-15,-21,-5,4,-10,-6,12,-21,-5,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-28,-4,9,-21,-19,-3,-26,26,-22,-11,-1,-14,8,35,-6,-8,-19,-19,-6,6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-31,-23,1,-32,-25,29,-26,25,14,-24,-19,-20,-23,-19,-7,21,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-30,-20,9,-29,-19,18,-28,45,20,-30,-29,-19,-19,-30,-11,8,-12,1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-19,-26,-19,2,-24,-19,13,-23,24,13,-22,-24,-16,-18,-15,-4,9,-15,-3,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00500;
//
ID   RIBOSOMAL_L29_MP; MATRIX.
AC   MP00579;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L29 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3416553; R2=0.0142014; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=180; N_SCORE=7.888; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-29,13,42,-28,-19,0,-26,10,-18,-15,1,-5,20,6,-1,-9,-26,-28,-17,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-24,-13,2,-28,-12,11,-21,34,15,-24,-26,-5,-13,-23,-10,1,-17,2,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-19,-33,-24,43,-25,-18,4,-25,14,6,-18,-26,-28,-19,-16,-7,3,-4,13,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-24,14,13,-26,-9,1,-25,7,-25,-16,19,-12,9,5,5,-1,-24,-32,-16,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-23,-11,4,-27,-12,11,-21,34,15,-24,-25,-13,-15,-24,-10,3,-18,2,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-29,-9,-1,-20,-18,-2,-26,27,-19,-8,1,-19,9,57,-9,-10,-18,-21,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-18,-31,-23,32,-24,-17,7,-21,9,9,-18,-25,-24,-17,-13,-5,8,-9,9,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-27,-2,13,-29,-18,1,-18,13,-18,-4,0,-12,30,8,-1,-7,-21,-22,-9,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=5,-10,-20,-13,-6,-16,-15,-8,-9,0,-5,-2,-7,-17,-1,2,-2,-3,-5,-24,-11,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-12,-17,-9,-17,-4,-16,-8,-8,-10,-5,-7,-11,-8,-15,10,4,0,-23,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-17,-13,-13,-14,-3,-15,-8,-14,-9,-6,-3,-15,-10,-14,7,15,-3,-26,-13,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-27,-8,-12,-25,39,-13,-32,-9,-24,-14,1,-18,-9,-4,0,-13,-24,-20,-23,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-3,-25,-3,11,-30,-15,-2,-18,5,-18,-6,-2,-6,28,3,3,-4,-20,-23,-13,19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-22,-19,-12,-3,-22,-16,4,-20,20,5,-20,-10,-14,-15,-16,-6,0,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-25,10,19,-21,-14,-6,-23,2,-20,-16,2,-6,7,-3,3,-3,-20,-28,-15,13;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-25,9,7,-27,-10,2,-23,18,-28,-13,27,-14,14,11,3,-4,-26,-30,-15,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-26,-10,-5,-19,-19,-17,-13,-11,-16,-13,-9,37,-10,-15,1,10,-16,-30,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-5,-23,-7,-6,-20,0,31,-23,-10,-19,-5,3,-15,-1,-7,2,-9,-18,-28,-4,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-27,-6,9,-20,-22,-5,-17,14,-9,-4,-6,-15,11,21,-8,-8,-14,-23,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-36,-27,14,-34,-24,32,-27,22,18,-23,-24,-23,-24,-20,-9,22,-16,3,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-27,-2,4,-25,-13,-6,-29,30,-26,-12,5,-14,7,34,-3,-7,-20,-24,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-25,2,14,-22,-17,5,-18,3,-14,-7,2,-13,10,1,-2,-5,-16,-28,-11,12;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-15,-27,-23,-2,-26,-25,21,-21,12,8,-21,-23,-21,-20,-8,2,27,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-5,5,-25,-20,7,-30,33,-24,-9,1,-16,12,44,-10,-11,-21,-21,-7,6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,19,-23,21,9,-26,-11,-3,-25,1,-22,-18,14,-12,4,1,7,3,-20,-33,-16,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-28,2,-38,-28,44,-29,24,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-27,-8,3,-24,-20,0,-27,25,-20,-8,-1,-18,18,52,-8,-9,-21,-21,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-20,-33,-26,1,-32,-26,33,-25,22,18,-25,-25,-22,-23,-18,-7,29,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-11,-25,-13,-5,-9,-23,-11,-6,7,7,3,-9,-21,-5,5,-17,-9,-7,-20,-4,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-11,-11,-11,-9,-20,-19,-8,-10,-8,-7,-1,-11,-10,-10,17,46,0,-29,-8,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-18,-29,-22,-2,-29,-26,25,-21,14,10,-23,-24,-21,-20,-13,-4,29,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-24,-21,-7,-4,-27,-15,11,-16,21,12,-19,-21,-6,-14,-18,-9,3,-21,-3,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-18,-1,-2,-20,-9,-3,-22,5,-22,-13,13,-16,1,13,8,6,-16,-30,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-28,10,40,-29,-18,-1,-24,7,-19,-14,-1,-4,22,0,1,-8,-25,-25,-17,31;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-28,-6,6,-22,-21,-7,-21,25,-17,-7,-3,-14,8,30,-8,-8,-16,-21,-9,5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-24,1,10,-24,-10,-6,-22,10,-18,-11,2,-12,8,7,-1,-6,-18,-24,-14,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-23,-6,-2,-16,-13,-9,-16,3,-6,-6,-5,-18,-2,10,-9,-9,-12,-23,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-23,-2,8,-23,-6,-7,-20,3,-18,-11,3,-13,6,4,4,-4,-16,-27,-16,6;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-22,-9,-2,-17,-9,-13,-9,-5,-10,-7,-2,-13,-6,-9,-3,-5,-8,-19,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-22,-1,8,-23,-12,-5,-17,4,-15,-8,-1,-13,5,0,-1,-6,-14,-26,-14,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-24,-2,2,-21,-10,-5,-19,7,-19,-11,6,-13,5,11,0,-4,-16,-25,-13,2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,6,-26,5,15,-28,-9,-5,-25,16,-24,-13,7,-11,12,7,0,-6,-22,-26,-16,13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00501;
//
ID   RIBOSOMAL_L32E_MP; MATRIX.
AC   MP00580;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L32e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4958062; R2=0.0122041; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684; N_SCORE=12.833; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=165; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,46,39,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='Q'; M=21,-5,-20,-10,4,-30,-10,-6,-15,0,-15,-5,-5,-10,24,-6,5,-5,-14,-20,-15,14;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-26,-10,-1,-20,-18,-6,-24,25,-19,-9,-3,-17,5,47,-7,-7,-14,-21,-11,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-25,-21,-10,-7,-24,-19,5,-20,14,3,-21,5,-13,-19,-15,-7,-2,-24,-11,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-21,-26,-16,6,-25,-14,9,-15,24,16,-22,-25,-12,-10,-20,-9,5,-16,1,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-25,-9,-1,-16,-20,-9,-13,12,-12,-6,-5,-10,0,11,-8,-4,-9,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-14,-24,-16,-8,-12,-25,-1,0,-1,-1,5,-11,-19,-3,2,-11,-7,1,-24,-4,-7;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-29,-11,-3,-20,-21,-10,-14,15,-17,-7,-5,1,0,24,-10,-8,-11,-23,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-23,-5,1,-15,-16,-7,-14,13,-11,-4,1,-8,2,9,-8,-6,-14,-20,-9,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-15,-24,-17,-8,-10,-26,-15,8,3,-2,3,-11,-16,-6,2,-12,-7,8,-18,-4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-20,-18,-23,-16,-6,-23,-11,13,-14,10,15,-18,-22,-8,-11,-11,-5,15,-23,-6,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-26,-3,5,-24,-16,-9,-25,32,-26,-11,-1,-7,6,21,-3,-6,-17,-20,-9,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-25,-7,1,-24,-8,-9,-21,20,-20,-7,-4,-14,5,18,-6,-9,-13,-20,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-28,-3,3,-23,-14,2,-28,29,-25,-10,3,-14,7,31,-6,-9,-20,-20,-7,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-22,-5,1,-21,-17,-10,-23,21,-22,-11,2,-13,3,24,3,8,-14,-25,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-31,-11,-3,-23,-22,-13,-13,7,-21,-9,-12,27,-5,-4,-9,-7,-13,-26,-16,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-30,5,19,-30,-17,0,-28,24,-24,-12,0,-6,17,17,-5,-9,-24,-24,-13,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-11,-26,-15,-8,-12,-24,-8,0,5,0,4,-6,-19,-4,5,-14,-9,-3,-22,-5,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-6,-29,-6,2,-14,-22,35,-18,-3,-15,-2,-2,-13,21,0,-6,-9,-23,-14,15,9;
MA   /M: SY='E'; M=-14,12,-12,18,19,-31,-19,8,-28,-1,-20,-14,3,-13,16,-5,-4,-11,-26,-32,-14,17;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-14,-25,-15,-11,-7,-9,-10,-19,-13,-24,-17,-9,-18,-7,-13,7,0,-17,26,5,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,18,-29,25,3,-14,-15,18,-29,-8,-21,-17,9,-17,-5,-10,-7,-13,-25,-16,0,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-30,-7,3,-23,-20,-4,-29,36,-22,-9,-1,-17,9,54,-10,-10,-19,-20,-10,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-21,-23,-18,33,-28,3,-7,-8,-3,-3,-16,-27,-16,-5,-18,-10,-9,10,42,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-28,-8,-3,-15,-21,-2,-14,12,-15,-4,-7,-13,1,4,-10,-9,-12,-10,3,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-6,3,-23,-20,-5,-29,36,-23,-10,0,-16,9,52,-9,-7,-19,-20,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-19,-32,-26,12,-32,-25,26,-26,26,14,-26,-27,-25,-22,-19,-5,24,-20,0,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-27,3,-3,-28,23,-12,-32,-1,-28,-19,7,-11,-6,-6,3,-10,-25,-26,-23,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-26,10,18,-24,-17,-1,-27,9,-21,-16,4,-7,7,13,2,1,-21,-28,-14,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,5,-18,0,-1,-19,-8,-5,-19,6,-24,-13,13,-14,1,3,14,6,-15,-29,-12,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-9,1,-31,-20,-18,-20,-9,-29,-19,-19,83,-5,-18,-9,-10,-30,-29,-29,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-7,2,-18,-21,-2,-27,32,-22,-9,-1,-16,6,41,-10,-8,-18,-18,-4,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-15,-27,-21,-13,-11,-28,-13,12,-6,0,5,-7,-18,-5,-3,-10,-6,5,-23,-5,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-18,23,-28,33,9,-24,-16,19,-29,-6,-18,-15,10,-15,2,-8,-5,-10,-24,-32,-6,5;
MA   /M: SY='N'; M=2,13,-15,6,-2,-21,7,-4,-22,-8,-30,-20,26,-14,-2,-8,26,9,-19,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-19,-7,0,-26,-13,-12,-27,27,-25,-11,-4,-12,2,25,-8,-10,-17,-23,-14,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-18,-24,-17,-6,-26,-15,17,-14,12,20,-21,-23,-5,-13,-12,-4,19,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-13,-27,-13,-1,-14,-23,-8,-13,11,-2,-2,-8,-19,2,31,-13,-9,-10,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-30,-4,5,-24,-8,5,-29,20,-23,-10,0,-16,10,29,-7,-12,-23,-20,-7,5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-18,-31,-22,30,-30,-17,9,-25,19,6,-24,-28,-25,-19,-22,-10,5,-2,17,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-26,-6,1,-25,-11,-11,-26,28,-24,-11,-1,-13,3,25,-4,-4,-16,-22,-13,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-28,-9,-14,-24,45,-10,-34,-14,-26,-17,-1,-19,-14,-13,0,-16,-26,-18,-18,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-26,-7,2,-14,-21,-4,-19,18,-17,-7,-3,-16,8,18,-6,-2,-14,-15,2,3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-31,-18,-12,-15,-11,-16,-6,-14,-10,-5,-15,12,-8,-15,-11,-9,-12,-12,-9,-12;
MA   /M: SY='P'; M=5,-8,-23,-6,-1,-20,-13,-15,-15,-8,-13,-12,-9,13,-6,-10,1,-3,-13,-28,-19,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00502;
//
ID   CLATHRIN_LIGHT_CHN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00581;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clathrin light chain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8078709; R2=0.0176022; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=554; N_SCORE=15.549; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=40; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=10,-24,-18,-31,-24,-6,-25,-27,27,-21,8,8,-20,-20,-20,-24,-8,-4,27,-23,-9,-24;
MA   /M: SY='L'; M=19,-20,-15,-25,-15,-5,-15,-20,5,-20,21,5,-20,-20,-15,-20,-11,-5,5,-20,-10,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-32,-2,13,-34,-20,-3,-24,23,-26,-7,-3,6,28,13,-6,-10,-26,-22,-13,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-25,43,-35,-30,-10,-35,-30,11,-30,1,1,-20,-30,-25,-30,-15,-10,11,-35,-15,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,55,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,32,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-23,-26,-13,30,-27,-11,-1,-18,10,4,-16,-24,-7,-11,-16,-10,-6,-5,12,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-21,30,6,-26,-3,3,-26,-2,-30,-23,37,-15,0,-5,14,2,-26,-40,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-15,16,-35,31,10,-35,-15,-10,-30,-5,-30,-25,1,39,-5,-15,-5,-10,-30,-35,-25,0;
MA   /M: SY='K'; M=7,-3,-24,-6,4,-27,-14,-13,-24,33,-24,-10,-3,-10,4,15,-4,-7,-14,-20,-13,4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-22,12,0,-24,-13,-13,-16,-9,-22,-17,-1,8,-8,-14,8,1,-9,-36,-20,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-4,1,-22,-3,5,-16,-16,-10,-2,-9,-13,-8,9,-13,-1,-12,8,1,-7,-32,-14,0;
MA   /M: SY='K'; M=3,-11,-26,-16,-6,-19,-21,-18,-2,13,-11,-1,-8,-13,-3,1,-8,-8,-1,-20,-9,-6;
MA   /M: SY='H'; M=2,-5,-26,-7,-2,-29,10,15,-26,-7,-21,-8,0,-15,12,-7,0,-13,-24,-22,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=7,-11,-7,-14,-20,-27,45,-21,-34,-20,-25,-18,-4,-21,-20,-21,0,-15,-22,-24,-28,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-26,54,16,-36,-8,-2,-36,-2,-30,-28,18,-10,0,-10,9,-3,-26,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-18,-16,-20,-17,-8,-25,-19,4,-3,-3,0,-15,-23,-14,8,-3,8,19,-27,-10,-17;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-14,4,13,-22,-4,-8,-22,-6,-28,-20,8,-8,4,-8,31,13,-14,-38,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-20,-32,-22,22,-26,-13,16,-23,30,30,-24,-26,-17,-16,-24,-10,8,-13,7,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-20,10,31,-25,-10,-5,-25,0,-25,-20,5,-5,10,-5,19,5,-20,-35,-20,21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,37,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-28,-20,14,-30,-12,16,-26,40,16,-28,-30,-18,-18,-28,-10,6,-10,15,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,5,-32,-21,31,-27,34,25,-25,-25,-17,-22,-25,-10,18,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-20,-3,0,-20,-10,14,-25,2,-25,-13,7,-15,5,15,16,4,-17,-32,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-26,-4,6,-28,-16,-12,-26,37,-26,-10,-2,-10,6,19,-6,-8,-16,-20,-12,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-30,-3,6,-35,6,-3,-28,10,-25,-8,0,-13,26,6,-2,-13,-28,-20,-16,16;
MA   /M: SY='N'; M=-1,29,-19,21,1,-23,-5,-1,-21,-3,-24,-19,32,-15,-3,-7,9,4,-21,-35,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=12,-13,-25,-11,-3,-25,-10,-18,-17,-10,-24,-17,-10,39,-8,-18,7,0,-17,-29,-25,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-6,-25,-12,-9,-10,-22,-12,2,0,3,2,1,-20,-7,-3,-13,-8,-4,-24,-7,-9;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-14,-15,-6,-21,-9,-14,-7,-8,-11,-6,-9,-13,2,-13,9,1,1,-24,-16,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-31,-12,-6,-21,-22,0,-13,-7,-19,-10,-14,34,-8,-5,-10,-10,-13,-29,-15,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-9,-33,45,-12,-35,-12,-27,-15,0,-17,2,-12,0,-17,-30,-20,-25,-4;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-15,-15,-5,-23,-5,-17,-15,6,-15,-10,-7,-10,-5,-6,5,-3,-5,-20,-17,-5;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-21,-10,-15,-21,28,-20,-26,-15,-21,-15,0,-15,-15,-15,9,13,-16,-25,-21,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00196;
//
ID   RIBOSOMAL_L33_MP; MATRIX.
AC   MP00582;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L33 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7473083; R2=0.0157063; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=485; N_SCORE=13.355; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-10,-23,-16,-10,-13,-25,-17,-3,4,-8,-2,-5,-15,-5,9,-2,12,0,-24,-7,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=3,11,-18,2,-7,-19,20,-5,-20,-7,-21,-15,22,-15,-7,-8,5,-6,-20,-24,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-6,-10,-4,-19,-19,-7,-23,11,-17,-7,-1,-21,0,29,-6,-6,-14,-27,-14,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-10,-14,-10,-3,-17,-24,-17,-2,-4,-10,-5,-11,-10,-8,-6,-6,-5,4,-30,-14,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-26,-6,0,-20,-17,-9,-15,18,-15,-5,1,-15,4,15,-7,-7,-12,-22,-10,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-21,-26,-21,-3,-29,-23,26,-18,8,9,-14,-20,-17,-18,-11,-3,22,-23,-5,-22; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-23,-6,-3,-19,-10,-10,-19,9,-20,-11,5,-8,-2,9,2,4,-14,-25,-14,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-20,-26,-18,3,-26,-20,15,-23,34,16,-25,-25,-18,-17,-23,-8,10,-22,-4,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-22,-6,1,-18,-16,-9,-7,1,-11,-6,1,-15,0,-3,-2,-4,-6,-26,-12,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-8,36,-12,-9,-22,-16,-14,-26,-6,-25,-17,-4,-22,-9,-9,7,-1,-13,-38,-20,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-18,0,7,-19,-15,-10,-18,5,-18,-13,4,-10,1,3,11,15,-11,-30,-14,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=12,-2,-16,-4,5,-18,-8,-8,-17,-6,-17,-13,-2,-10,-2,-11,9,0,-10,-27,-15,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-4,31,-7,-11,-18,0,-15,-23,-15,-17,-15,-4,-19,-14,-16,0,-5,-13,-28,-20,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-24,-7,-11,-23,25,-17,-28,-7,-22,-15,0,-16,-12,-8,5,2,-19,-24,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-24,-4,-5,-20,5,-11,-12,-10,-16,-10,4,-18,-8,-10,0,-8,-10,-28,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-21,-14,-9,-3,-20,3,-12,0,-13,-6,-4,-20,-4,13,-2,-4,-7,-19,3,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-15,3,-23,-7,-9,4,-16,-2,-15,0,-12,-8,15,-22,-7,14,-5,-3,-16,-20,-2,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-31,-21,-20,29,-30,18,-1,-10,-1,-1,-21,-30,-10,-10,-21,-11,-11,36,78,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-17,-19,-17,-5,-24,-18,9,-17,3,1,-8,-19,-15,-16,-1,13,11,-23,-5,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-10,-10,-11,-19,-19,-9,-8,-11,-9,-1,-11,-10,-9,18,42,1,-30,-11,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-1,-22,-3,2,-20,-18,-9,-17,4,-17,-8,-1,-6,7,4,5,10,-13,-26,-11,4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,35,-18,18,0,-19,0,8,-19,-1,-28,-19,53,-18,0,-1,11,1,-27,-37,-19,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-6,3,-25,-17,-7,-26,27,-24,-11,-1,-8,8,34,-3,-6,-18,-23,-13,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-27,-7,3,-21,-18,5,-26,23,-18,-8,-1,-16,8,40,-8,-9,-18,-21,-8,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-5,24,-18,10,-2,-19,-3,0,-19,-1,-24,-17,36,-16,-3,-2,11,10,-21,-34,-17,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-6,6,-19,0,-2,-16,-16,-4,-14,-3,-13,-6,7,-12,-1,-5,6,15,-11,-30,-10,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-13,-29,-10,-2,-24,-18,-18,-17,-8,-23,-16,-12,49,-6,-14,1,6,-20,-29,-23,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-25,20,19,-28,-3,-5,-28,0,-24,-20,11,-9,3,-6,6,-2,-23,-32,-20,11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,5,-25,-20,-4,-29,37,-24,-10,0,-15,12,51,-10,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22,8,-30,-19,24,-27,40,24,-27,-27,-18,-20,-26,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,8,36,-24,-19,-6,-19,2,-16,-15,-2,-5,11,-4,4,-1,-16,-30,-17,23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-29,-20,12,-29,-19,17,-24,35,18,-25,-27,-19,-17,-24,-8,10,-18,1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-27,-4,4,-23,-18,-5,-23,30,-21,-5,4,-14,7,29,-8,-7,-17,-23,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,49,-30,5,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,21,60,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-12,3,65,3,-13,-26,-22,-19,-32,-19,-24,-23,-6,-29,-19,-23,-4,-8,-16,-46,-26,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-34,-8,0,-26,-18,-16,-21,-2,-28,-18,-12,58,-6,-8,-4,-6,-25,-29,-24,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-22,-15,-12,-3,-23,-4,-5,4,-10,-3,-9,-22,-8,6,-9,-6,1,-12,8,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-18,52,-24,-19,-14,-26,-25,-11,-23,-6,-9,-19,-30,-22,-23,-9,-7,2,-38,-21,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,4,-26,-1,-1,-18,-12,7,-25,16,-22,-12,15,-20,6,33,-5,-8,-23,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-27,-4,7,-28,-17,-8,-24,32,-24,-8,-1,-11,12,23,-5,-8,-17,-21,-11,9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-28,-4,-2,-18,-21,75,-24,-6,-18,0,5,-19,7,4,-10,-17,-22,-28,14,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,-12,-10,-18,-16,-8,-23,-22,5,-12,-3,-1,-12,-18,-15,-13,6,24,17,-29,-11,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-23,-24,-16,-3,-30,-22,22,-20,16,11,-19,-19,-16,-20,-15,-5,17,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-12,-25,-15,-12,16,-24,53,-17,-16,-9,0,-3,-24,-8,-8,-14,-16,-18,-11,30,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-28,-6,1,-24,-12,-8,-26,28,-22,-9,0,-15,4,30,-8,-8,-18,-21,-11,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-20,-17,-10,-12,-15,-20,5,-15,-5,-2,-9,-15,-11,-17,3,6,7,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-6,-30,46,-29,-10,0,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-9,9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-28,-23,-12,-12,-30,-21,14,1,1,7,-13,-17,-8,-4,-15,-9,8,-20,-5,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00503;
//
ID   PFKB_KINASES_1_MP; MATRIX.
AC   MP00583;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   pfkB family of carbohydrate kinases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.4508753; R2=0.0186845; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=96; N_SCORE=8.235; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,48,38,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='A'; M=6,-7,-22,-10,0,-13,-15,-8,-12,1,-13,-8,-6,-15,0,-5,-2,-4,-9,-12,-3,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-22,-5,-4,-20,-16,-14,-14,-10,-14,-11,-11,20,-9,-12,-9,-9,-16,-27,-16,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-5,-20,-2,-10,-14,-10,-16,-3,-13,-5,-5,-8,-21,-14,-15,-5,-4,6,-28,-13,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-19,2,0,-23,-14,-15,-18,-10,-17,-15,-5,14,-6,-15,3,4,-16,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-17,-19,-18,-7,-25,-23,14,-16,5,3,-19,-17,-19,-17,-7,-2,22,-29,-11,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-2,-20,-9,-10,-7,-18,-5,2,-11,-6,-2,5,-21,-10,-11,-3,-2,1,-26,-4,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-27,-1,7,-22,-16,-4,-23,13,-19,-11,-1,-6,5,18,-4,-6,-18,-24,-11,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-13,-22,-17,-8,-23,-23,14,-16,4,3,-20,-17,-16,-18,-7,-3,22,-27,-12,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-23,2,6,-23,-7,-9,-20,3,-19,-12,2,-6,3,-1,2,0,-16,-27,-16,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,5,-24,5,7,-26,-9,-3,-25,8,-21,-13,6,-13,11,11,3,-1,-20,-27,-15,8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-20,-21,-14,0,-22,-18,10,-18,6,4,-13,-18,-13,-15,-7,-1,9,-23,-6,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-21,-5,5,-16,-14,-7,-12,-2,-10,-8,-2,-15,-2,-1,1,0,-8,-28,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-22,-5,2,-13,-21,-11,-12,8,-9,-3,-5,-15,-2,1,-10,-7,-8,-23,-8,0;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-2,-12,-7,-5,-12,-18,-1,-16,-3,-13,-8,1,-17,-2,4,2,6,-12,-26,-6,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=6,-17,-27,-15,-7,-21,-16,-17,-10,-11,-17,-12,-15,36,-10,-17,-4,-4,-12,-25,-19,-12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-5,-13,-10,-5,-23,-8,-16,-16,8,-17,-10,-5,-13,-6,-3,1,-4,-6,-23,-17,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-19,-9,-10,-20,24,-14,-20,-11,-18,-12,-5,4,-11,-14,0,-9,-16,-16,-20,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=14,-19,-19,-25,-18,-10,-8,-22,5,-18,6,2,-15,-19,-15,-18,-7,-7,6,-21,-12,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-13,-29,-26,-1,-30,-27,28,-19,10,12,-27,-27,-25,-19,-10,0,42,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-17,-9,-19,-3,-19,-11,-10,-11,-11,-7,-10,-9,-18,13,8,-1,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-16,-19,-19,-13,-7,-23,-11,0,-2,0,5,-12,-21,-7,7,-10,-4,5,-23,-7,-12;
MA   /M: SY='N'; M=4,-1,-13,-10,-15,-10,-7,-12,-2,-12,-11,-7,7,-22,-15,-14,0,-3,3,-28,-13,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-19,-34,-26,3,-32,-24,31,-28,28,19,-24,-25,-20,-24,-22,-9,21,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-15,-11,-6,-20,-4,-14,-15,-1,-17,-12,-2,-11,-5,-9,11,3,-6,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-2,1,-23,2,7,-22,-14,-2,-21,6,-15,-11,0,-14,4,12,0,-5,-15,-27,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-31,-22,16,-30,-20,18,-29,39,16,-28,-29,-22,-20,-27,-10,10,-12,5,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-20,-9,-9,-18,6,-11,-14,-13,-14,-9,-4,-18,-12,-14,-2,-10,-9,-25,-16,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-27,12,9,-26,-11,0,-27,10,-25,-16,10,-7,7,11,0,-5,-24,-28,-14,7;
MA   /M: SY='V'; M=12,-16,-7,-19,-16,-12,-16,-22,2,-15,-8,-5,-14,-11,-17,-18,6,6,15,-31,-16,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-19,-13,-8,-16,-6,-12,-11,-8,-10,-8,-6,-15,-7,-9,3,3,-6,-21,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=3,-22,-13,-28,-21,11,-23,-21,10,-23,17,6,-19,-25,-22,-20,-14,-6,11,-18,-3,-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-18,-25,-21,-2,-21,-21,15,-21,10,8,-17,-22,-18,-19,-7,2,17,-24,-7,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-25,-10,-16,-23,45,-18,-31,-18,-24,-17,0,-18,-17,-18,6,-8,-22,-23,-24,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-14,-26,-18,12,-25,-19,0,-14,7,1,-20,-19,-20,-9,-16,-8,3,-11,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-17,-29,-23,2,-29,-25,23,-23,21,11,-24,-25,-22,-21,-14,0,24,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-27,6,1,-27,6,-8,-24,-1,-21,-11,1,-14,1,-5,-2,-10,-19,-24,-16,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-20,43,12,-26,-3,-1,-26,-1,-20,-19,12,-7,-1,-7,0,-7,-20,-25,-13,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-26,6,10,-10,-16,-10,-20,-5,-17,-15,-4,2,-5,-10,-4,-7,-17,-22,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=2,-7,-20,-14,-9,4,-16,-9,-9,-11,-7,-8,-2,-16,-12,-12,-2,0,-9,-10,2,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-6,-25,-8,-12,-28,40,-17,-31,-12,-25,-17,0,-16,-12,-16,3,-13,-22,-22,-25,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-25,6,11,-24,-14,3,-23,4,-18,-12,2,-12,10,6,0,-5,-20,-24,-9,9;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-17,-21,-21,-15,12,-18,-9,-2,-13,2,5,-13,-21,-14,-10,-10,-7,-2,-12,6,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-30,-22,17,-31,-18,21,-27,32,17,-24,-27,-21,-21,-25,-10,11,-14,7,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-24,-10,3,-16,-19,-11,-10,2,-5,-5,-8,-16,1,5,-7,-6,-8,-19,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-23,4,10,-23,-11,0,-22,4,-19,-12,6,-13,9,4,3,-4,-20,-27,-13,9;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-9,-24,-10,-2,-12,-20,2,-7,-6,0,1,-8,-18,0,-2,-8,-5,-8,-23,-3,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-15,-30,-21,14,-28,-20,16,-27,34,17,-25,-28,-21,-20,-23,-7,10,-18,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=0,8,-23,8,7,-26,-10,-6,-24,7,-22,-15,7,-8,3,5,3,-3,-19,-28,-17,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-2,-22,-3,2,-20,-9,1,-20,2,-18,-10,1,-14,5,2,4,-1,-15,-24,-8,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00504;
//
ID   PFKB_KINASES_2_MP; MATRIX.
AC   MP00584;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   pfkB family of carbohydrate kinases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9025459; R2=0.0172756; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=94; N_SCORE=7.523; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=35; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-23,2,-2,-19,-1,-2,-20,-1,-21,-13,11,-15,-3,-1,3,-3,-17,-25,-13,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-4,10,-24,12,5,-27,6,-5,-27,-2,-23,-16,8,-10,0,-6,5,-4,-21,-28,-18,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-24,1,12,-19,-15,-1,-20,4,-17,-11,0,-9,7,1,0,-1,-17,-24,-9,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-16,-18,-18,-10,3,-17,-13,-5,-9,-5,-3,-12,-18,-10,-7,-6,-6,-1,-16,0,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-17,-25,-19,-12,0,-17,-7,-4,-9,-4,-2,-15,-17,-9,-9,-12,-9,-4,-7,8,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-22,-13,-8,-10,-23,0,-5,-5,-3,0,-9,-18,-4,2,-11,-7,-3,-19,-3,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=4,-8,-10,-9,-6,-6,-11,-11,3,-7,-1,-1,-8,-6,-8,-9,-2,-1,6,-14,-6,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-3,-2,-14,-3,-3,-8,-7,-5,-8,0,-9,-5,0,-1,-2,-1,-2,-2,-7,-12,-5,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=0,-13,-10,-15,-10,-5,-14,-13,8,-11,3,4,-11,0,-8,-12,-6,-3,5,-14,-6,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-26,-15,-7,-8,-20,-14,-8,-10,-13,-8,-15,21,-9,-12,-10,-9,-12,-20,-9,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-12,-4,-1,-13,-4,-6,-11,3,-12,-7,-1,3,-2,0,-2,-4,-9,-14,-10,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-14,-17,-14,-8,-15,-21,-18,-4,3,-10,-4,-13,-11,-9,0,-4,-1,7,-26,-13,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-6,-13,-7,-3,-7,-10,-7,2,-7,-1,-1,-5,-8,-5,-8,-3,0,2,-14,-5,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-25,8,16,-27,-15,-4,-24,15,-24,-14,9,-8,12,8,3,0,-22,-28,-15,14;
MA   /M: SY='V'; M=6,-22,-14,-24,-19,-7,-23,-24,13,-18,2,2,-20,-13,-18,-19,-5,-1,20,-26,-12,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-29,-25,-1,-28,-24,26,-19,11,12,-24,-26,-21,-18,-14,-5,31,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-14,41,-26,50,14,-34,-7,0,-34,0,-30,-26,26,-12,0,-7,6,-4,-27,-39,-20,7;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-15,-11,-9,-13,-19,-20,-9,-11,-14,-11,-4,4,-11,-12,15,33,-2,-31,-14,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-13,-16,-17,-2,-22,-20,6,-15,-2,-1,-5,-19,-17,-14,4,20,13,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,2,-17,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-19,-30,68,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=18,-4,-12,-9,-7,-18,1,-15,-15,-11,-19,-13,1,-11,-7,-14,22,15,-6,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-18,-31,-25,43,-27,-14,4,-22,7,7,-18,-26,-27,-17,-13,-2,5,-2,20,-23;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-17,-22,-20,-7,-22,-18,16,-15,4,7,-13,-22,-17,-15,-7,-3,20,-27,-10,-19;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-17,-15,-13,-23,25,-20,-21,-14,-18,-14,-5,-14,-13,-19,8,-6,-11,-21,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-34,-25,34,-30,-20,14,-28,27,12,-24,-28,-27,-20,-23,-9,9,-8,12,-24;
MA   /M: SY='L'; M=5,-22,-17,-26,-18,-2,-22,-21,15,-22,20,11,-20,-21,-16,-20,-11,-1,12,-23,-7,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,-15,-13,-12,-3,-14,-3,-8,-10,-10,-7,-4,-19,-9,-9,4,5,-3,-17,5,-12;
MA   /M: SY='A'; M=15,-6,-14,-9,-8,-24,14,-14,-22,-9,-20,-14,-3,-15,-5,-13,7,-5,-14,-24,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-24,-32,-22,14,-30,-19,19,-26,33,14,-26,-28,-20,-19,-26,-11,9,-8,8,-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-14,-13,-16,-12,-8,-15,-18,0,-15,4,-1,-13,-20,-14,-16,-1,2,6,-26,-11,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,4,7,-22,-13,4,-21,5,-18,-10,4,-13,5,2,0,-4,-17,-26,-9,5;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,4,-4,-27,28,-5,-32,-9,-25,-17,8,-17,-5,-10,1,-11,-27,-25,-20,-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=0,-7,-20,-8,0,-18,-9,-9,-15,2,-10,-4,-6,-14,1,-2,-5,-7,-12,-21,-10,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-23,16,5,-24,-9,-7,-23,-7,-23,-18,6,1,-2,-11,10,5,-19,-33,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-24,-18,-15,3,-26,-14,9,-21,16,5,-17,-21,-15,-18,-17,-9,3,-14,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-24,3,15,-20,-17,-6,-20,4,-14,-12,-3,-7,4,1,-1,-2,-17,-25,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-26,21,22,-27,-16,-1,-25,3,-20,-17,7,-9,10,-3,3,-1,-22,-30,-13,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=12,-8,2,-12,-9,-16,-12,-14,-10,-13,-7,-6,-7,-18,-9,-15,4,1,-3,-29,-16,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-8,-22,-17,-5,-20,-21,6,-19,8,3,-19,-22,-17,-17,-12,-7,9,-24,-10,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-26,-6,5,-23,-17,-7,-21,18,-16,-8,-4,-11,7,24,-7,-8,-15,-22,-13,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00504;
//
ID   RIBOSOMAL_S5_MP; MATRIX.
AC   MP00585;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S5 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4496012; R2=0.0126942; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=592; N_SCORE=11.955; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-14,17,-29,27,35,-25,-18,2,-28,4,-20,-18,4,-7,11,-4,-3,-10,-27,-27,-10,23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-29,3,20,-24,-21,-4,-26,24,-21,-12,-2,-12,10,26,-7,-9,-19,-23,-10,13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-13,-30,-26,-1,-30,-25,25,-22,16,15,-27,-21,-23,-21,-16,-5,30,-26,-8,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-32,-25,4,-31,-24,30,-25,27,21,-27,-27,-21,-21,-20,-7,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,9,-25,13,12,-27,-14,-2,-23,9,-22,-13,4,-12,8,1,0,-6,-16,-28,-14,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,0,-35,-28,38,-24,16,16,-23,-24,-22,-22,-16,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-23,2,0,-20,-10,-1,-21,14,-23,-11,19,-17,2,16,1,-3,-19,-28,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-29,-12,-4,-17,-21,-5,-17,14,-13,-4,-3,-7,2,37,-11,-9,-15,-23,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-3,-29,-28,-3,-29,-29,23,-20,6,6,-25,-28,-27,-21,-8,2,39,-30,-11,-28;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-15,-8,-1,-16,-15,-9,-13,-6,-16,-8,-1,-13,11,-6,14,13,-9,-27,-11,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-28,0,6,-26,-17,-7,-28,38,-27,-11,7,-13,8,30,-6,-7,-20,-23,-11,6;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-17,-17,-21,-14,-10,-24,-12,11,-10,3,18,-17,-21,0,-10,-7,0,16,-25,-8,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-10,-17,-17,-6,-24,-22,5,-14,-3,-2,-11,-18,-17,-14,8,30,18,-30,-10,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,7,-29,11,8,-29,-16,-6,-29,31,-27,-13,3,-12,6,22,-6,-8,-19,-25,-12,6;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-23,-9,-9,-23,32,-17,-28,-11,-24,-17,-1,-15,-12,-15,6,-9,-19,-22,-23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-4,9,-25,-20,-1,-29,30,-22,-10,0,-15,17,47,-8,-10,-22,-21,-11,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-27,-11,-4,-18,-22,-9,-11,16,-13,-3,-1,-17,3,26,-9,-6,-8,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-18,-18,-24,-17,12,-23,-12,4,-15,8,9,-14,-22,-16,-12,-9,1,5,-18,2,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-19,-4,-1,-21,-5,-8,-24,7,-25,-15,5,-14,2,16,15,7,-15,-29,-16,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-21,-37,-28,65,-30,-16,4,-26,10,5,-20,-29,-33,-19,-20,-10,2,8,30,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-22,-7,0,-19,-13,-6,-23,14,-22,-12,1,-14,4,23,7,2,-14,-23,-9,0;
MA   /M: SY='A'; M=32,-17,-7,-24,-17,-14,-11,-23,3,-14,-4,-4,-16,-17,-17,-21,3,-1,15,-24,-17,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-31,-23,15,-31,-21,21,-27,30,15,-25,-27,-22,-20,-21,-5,15,-17,4,-23;
MA   /M: SY='V'; M=3,-22,-13,-26,-24,-4,-26,-26,22,-19,6,7,-20,-24,-22,-19,-5,5,32,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-12,-29,-25,-4,-25,-27,23,-19,9,7,-25,-25,-24,-21,-8,-1,36,-26,-11,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-14,-31,-29,0,-31,-28,31,-21,12,14,-27,-27,-26,-21,-11,0,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,9,-29,-4,6,-29,0,-30,-24,43,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-5,-23,-4,3,-25,9,-6,-29,5,-22,-11,0,-15,0,7,-3,-12,-23,-23,-16,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-26,25,12,-29,-11,0,-29,12,-27,-19,20,-13,7,8,1,-6,-25,-32,-17,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-9,-26,-10,-5,-9,-18,13,-13,1,-11,-2,-5,-20,4,5,-8,-8,-13,-12,13,-3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-28,29,-21,11,10,-25,-25,-24,-22,-10,-3,36,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-22,-31,-25,23,-29,-15,14,-22,17,11,-25,-28,-23,-18,-21,-9,12,2,18,-24;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-18,-28,59,-20,-36,-18,-27,-19,-1,-18,-18,-20,2,-17,-26,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-20,-21,-12,-2,-28,-13,9,-11,2,4,-15,-20,-11,-11,-10,-3,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-27,-11,-15,-28,49,-19,-34,-11,-27,-17,-1,-18,-15,-13,0,-16,-24,-20,-26,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-17,-4,5,-27,-21,-8,-28,38,-27,-10,-2,-14,5,25,-10,-9,-17,-23,-11,5;
MA   /M: SY='A'; M=36,-5,-12,-11,-7,-22,3,-17,-15,-10,-16,-13,-4,-11,-8,-18,15,2,-5,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-25,0,4,-23,-13,-8,-22,17,-22,-12,5,-10,2,16,-1,-3,-17,-26,-14,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-29,25,41,-33,-16,1,-30,8,-22,-18,4,-5,21,1,1,-9,-29,-30,-18,30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-14,-28,-25,0,-28,-24,21,-17,11,9,-25,-27,-23,-14,-11,-1,33,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=3,-13,-24,-15,-10,-19,-7,-18,-9,-10,-15,-8,-9,10,-10,-11,1,0,-8,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-1,-23,1,-4,-18,-8,-15,-12,-10,-11,-10,-4,-7,-10,-14,-3,-2,-7,-29,-16,-8;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-37,-29,8,-36,-27,38,-26,15,15,-22,-23,-23,-24,-18,-8,29,-18,3,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-29,-6,7,-25,-19,-2,-24,24,-20,-7,-1,-15,19,35,-7,-10,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-29,-1,7,-30,-11,-10,-29,39,-29,-11,2,-11,8,22,-7,-10,-21,-21,-12,7;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-14,-16,-11,-22,14,-19,-17,-12,-16,-13,-6,-12,-11,-19,11,-2,-7,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-19,-26,-20,-7,-24,-17,17,-13,7,16,-16,-21,-12,-15,-14,-7,13,-23,-6,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-26,4,7,-22,-11,-9,-15,0,-17,-12,4,-13,0,-2,-1,-4,-14,-25,-14,2;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-23,9,3,-21,-13,-5,-17,0,-14,-9,4,-14,1,-1,0,-5,-14,-26,-10,1;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-10,-19,-11,-21,6,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-27,-6,2,-23,-20,-7,-22,31,-22,-8,-2,-15,5,30,-7,-8,-12,-23,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-26,-11,-3,-13,-22,-1,-13,13,-2,3,-6,-19,1,17,-15,-10,-11,-21,-4,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,19,-21,8,0,-20,-5,12,-21,2,-26,-15,32,-18,3,3,8,-1,-23,-33,-12,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-33,-24,4,-31,-20,31,-25,31,27,-25,-25,-17,-21,-23,-9,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-22,-30,-24,3,-31,-14,24,-19,9,14,-18,-23,-18,-18,-14,-5,22,-21,2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-30,1,9,-18,-19,2,-22,7,-21,-13,-2,7,2,2,-5,-6,-22,-21,-4,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-34,-30,1,-34,-30,36,-24,14,13,-26,-26,-26,-24,-14,-4,40,-26,-6,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00505;
//
ID   RIBOSOMAL_L16_1_MP; MATRIX.
AC   MP00586;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L16 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7220974; R2=0.0136066; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=193; N_SCORE=7.338; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=11,3,-16,-3,-2,-20,-4,-7,-18,-3,-23,-15,11,-12,0,0,18,6,-13,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-9,1,-23,-17,-1,-26,23,-20,-9,1,-17,12,46,-6,-9,-19,-21,-11,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-28,-4,13,-33,-21,7,-14,4,-16,1,-1,-11,45,4,0,-6,-22,-21,-8,28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-30,16,50,-30,-9,-2,-31,6,-21,-20,0,-2,15,-2,0,-11,-30,-29,-21,33;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-12,-14,-6,-21,-3,-8,-13,-9,-14,-10,-5,-11,-4,-15,13,3,-5,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,-10,-22,-16,-6,-2,-21,-8,-15,-8,-8,-12,-16,-17,-20,4,-1,1,-19,-13,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,8,-30,27,-20,-9,1,-20,10,64,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-18,-28,-21,-12,-12,-27,-13,1,7,-5,1,-9,-21,-4,29,-13,-9,3,-21,-7,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-10,-20,-12,-16,-6,-21,-5,-11,-8,-8,-11,-13,-12,-19,9,6,6,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-24,-34,-24,0,-29,-15,32,-20,21,38,-20,-20,-10,-20,-20,-10,19,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-11,-5,-7,-14,-12,-13,-12,-9,-16,-11,7,-12,-6,-9,22,31,-4,-34,-14,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-2,-22,-9,-3,-31,25,-22,-11,0,-20,6,57,-9,-11,-21,-20,-12,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-7,-27,-8,-3,-6,-22,29,-15,0,-13,-3,-5,-20,11,0,-8,-8,-19,-5,29,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-20,-33,-25,16,-29,-21,22,-24,17,17,-21,-24,-21,-21,-16,-5,18,-16,3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,5,-26,-16,-6,-30,39,-26,-10,0,-14,9,44,-10,-10,-20,-20,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-25,1,-9,-25,27,-11,-28,-11,-24,-16,11,-18,-7,-11,4,-6,-23,-26,-22,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-21,-11,-19,-29,59,-20,-37,-20,-28,-19,-1,-20,-19,-20,1,-17,-27,-22,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-29,-2,8,-29,-20,-8,-27,41,-26,-9,-1,-12,13,31,-9,-10,-19,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-27,2,-33,-26,36,-25,22,20,-25,-25,-22,-23,-19,-7,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-30,11,-20,-29,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,147,31,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-37,-29,45,-27,18,19,-22,-22,-21,-27,-18,-8,33,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-4,-29,-6,0,-20,-18,1,-29,28,-22,-11,7,-20,9,60,-8,-9,-21,-22,-11,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-29,40,-25,16,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28,70,-30,-17,2,-29,13,2,-21,-30,-36,-19,-21,-10,0,9,31,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,75,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,42,-29,58,17,-37,-11,13,-38,-2,-28,-26,18,-11,1,-9,-1,-11,-29,-38,-15,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-26,-13,-4,-17,-24,-10,-9,18,-9,2,-8,-16,1,15,-12,-6,-6,-21,-7,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-32,-9,-1,-27,-16,-18,-19,-9,-28,-19,-14,64,-8,-17,0,-3,-24,-31,-27,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-22,-31,-25,2,-32,-21,29,-19,15,15,-23,-25,-19,-19,-17,-7,26,-18,5,-24;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='K'; M=3,-6,-24,-8,0,-23,-2,-12,-21,13,-20,-8,-4,-13,1,4,-2,-8,-14,-21,-14,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,7,-27,-20,-6,-30,44,-27,-10,0,-12,10,37,-10,-9,-20,-20,-9,7;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-28,-19,-18,76,-10,-20,-7,-8,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,-14,-20,-12,-12,-11,-19,-2,-15,2,-3,-11,-13,-12,-18,2,4,2,-22,-14,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,54,-31,-16,-1,-31,8,-21,-20,1,-1,18,-1,0,-10,-30,-30,-20,36;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-10,-20,-20,-6,-24,-24,10,-15,-1,0,-15,-20,-20,-15,6,22,25,-31,-11,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-21,-28,-17,-3,-20,1,17,-8,17,55,-18,-19,5,-8,-18,-10,7,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00506;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F17_MP; MATRIX.
AC   MP00587;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 17 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6289892; R2=0.0166319; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=104; N_SCORE=7.349; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-18,-27,-22,12,-27,-17,16,-22,22,15,-25,-27,-21,-18,-18,-6,17,-17,4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-26,41,9,-30,-14,-5,-24,-5,-17,-18,8,-14,-1,-11,-3,-7,-16,-35,-16,4;
MA   /M: SY='A'; M=20,-5,-15,-10,-2,-16,-5,-14,-15,-5,-16,-13,-3,-11,-5,-11,14,7,-7,-24,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-19,-24,-18,-5,-20,-16,13,-19,14,10,-19,-23,-13,-17,-12,-5,14,-24,-7,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-26,-18,-11,6,-27,6,3,-10,0,2,-16,-23,-2,-10,-13,-8,-2,1,33,-10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-15,-18,-19,-12,3,-17,-11,-5,-12,-5,-5,-12,-19,-12,-11,-2,0,0,-12,1,-11;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-15,-12,-4,-18,-8,-16,-10,-7,-9,-9,-7,-13,-7,-10,7,0,-2,-24,-17,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-20,-25,-14,-2,-25,-13,14,-18,26,22,-22,-23,-6,-14,-19,-7,8,-21,-4,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-24,2,17,-19,-19,-9,-16,3,-16,-12,-3,-10,4,-4,3,2,-13,-20,-9,10;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-22,-6,-1,-20,-12,-10,-19,15,-20,-9,2,-14,2,10,-1,0,-13,-22,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-18,-17,-11,-12,-10,-16,-3,-9,2,0,-8,-18,-10,-12,-3,-2,-1,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-13,-8,-16,-25,36,-16,-30,-16,-26,-18,6,-21,-16,-15,4,-10,-21,-28,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-14,-17,-18,6,0,-10,-14,-18,-11,-9,-8,-22,-19,-17,-4,-5,-10,-13,4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-27,-7,-10,-26,26,-16,-30,-8,-27,-17,1,-2,-10,-10,4,-5,-24,-25,-24,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-22,14,2,-23,-6,1,-25,2,-26,-17,19,-14,-1,-2,9,4,-21,-29,-13,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-19,-28,-22,-2,-28,-22,23,-16,14,17,-22,-24,-17,-16,-13,-4,25,-25,-6,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-28,8,12,-26,-13,-8,-25,7,-25,-17,5,11,1,2,0,-2,-24,-30,-19,5;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-29,10,-34,-28,34,-26,16,13,-25,-26,-27,-24,-16,-6,35,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-19,-32,-27,5,-27,-26,20,-21,9,9,-27,-26,-24,-21,-15,-7,25,-4,-1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-15,-6,-8,-20,12,-16,-22,-13,-24,-17,4,-13,-8,-13,23,19,-12,-32,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-9,-9,-8,-14,-12,-17,-9,-12,-16,-12,1,-12,-8,-12,24,29,0,-34,-14,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-29,11,-21,-27,-19,-19,-19,-19,-39,-30,-19,-19,-39,-29,-29,142,33,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-11,-2,-3,-17,-7,-12,-17,-9,-23,-17,9,-11,-3,-9,32,29,-8,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='D'; M=0,12,-23,14,11,-24,-12,-7,-25,8,-23,-16,6,-10,4,-1,3,-5,-19,-27,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-10,-18,-29,61,-19,-37,-18,-28,-19,-1,-19,-17,-19,1,-18,-27,-20,-29,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-2,9,-26,13,4,-28,7,-9,-26,-9,-23,-18,4,-8,-6,-14,4,-6,-20,-30,-20,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-23,-10,-6,-7,-15,-14,-13,-9,-17,-11,-4,6,-7,-11,5,6,-12,-25,-11,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-1,3,-24,-1,-5,-14,1,1,-21,-3,-20,-12,6,-18,-3,-7,0,-8,-19,-17,-1,-5;
MA   /M: SY='A'; M=13,-3,-21,-5,9,-24,6,-13,-22,-6,-16,-14,-4,-10,-1,-12,4,-4,-16,-24,-20,4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-18,-3,-2,-17,-10,-12,-13,-7,-17,-12,4,-8,-6,-10,10,14,-7,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-8,-18,-13,-12,-12,-1,-14,-8,-14,-7,-7,-5,-18,-11,-16,2,-3,-4,-20,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=6,0,-21,2,-3,-19,-11,-13,-8,-9,-10,-8,-5,-13,-8,-15,-2,-6,-2,-25,-13,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,-23,2,-4,-18,-7,-6,-18,-7,-23,-16,16,6,-6,-10,6,5,-20,-29,-14,-7;
MA   /M: SY='A'; M=21,-10,-8,-16,-12,-16,-8,-19,-5,-14,-11,-9,-6,-12,-11,-18,11,5,2,-28,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-23,-3,2,-19,-18,-8,-15,8,-13,-6,-5,-16,3,11,-4,-3,-8,-23,-9,1;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-20,8,5,-21,-11,-6,-19,1,-19,-15,14,-13,-1,0,6,6,-15,-30,-16,1;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-3,-21,-13,-14,7,-15,-1,-6,-11,-8,-7,3,-21,-11,-12,-4,-3,-9,-7,17,-14;
MA   /M: SY='N'; M=0,0,-22,-6,-4,-13,-15,-2,-9,-4,-8,-5,4,-18,3,-2,-3,-5,-11,-20,-3,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,6,-22,3,6,-24,-15,-6,-17,5,-19,-11,7,-11,9,2,6,6,-15,-28,-13,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00507;
//
ID   FLAGELLA_BB_ROD_MP; MATRIX.
AC   MP00588;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Flagella basal body rod proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1670077; R2=0.0082152; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1027; N_SCORE=8.268; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=812; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-34; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='K'; M=-65,-73,-67,-55,-55,-77,-63,-49,80,63,-43,-62,-72,-52,-42,-66,-60,-54,-72,-59;
MA   /M: SY='M'; M=-53,-67,-72,-67,-57,-65,-55,-45,-63,-39,129,-59,-68,-54,-63,62,-50,-49,-77,-54;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-70,-82,-75,18,-3,-58,-38,-69,33,127,-71,-74,-62,-68,-70,-62,-44,-70,-49;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-73,54,-56,-66,-67,-54,-54,-60,-49,112,39,-70,5,-63,10,-7,-58,-85,-60; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=3,-74,18,-54,-76,-17,-63,-16,26,-29,-66,-53,41,5,-6,57,-5,-66,-81,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='M'; M=-17,-71,-85,-77,17,-80,-64,10,-73,46,110,-76,-77,-67,-72,-72,-24,-43,-72,-51; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='M'; M=-65,-75,28,-10,24,-75,-62,21,-67,28,62,15,-76,-16,-69,11,-25,-52,-73,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-78,-22,-57,-78,7,21,-78,5,-76,17,48,16,22,45,20,-58,-75,18,-67; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=54,-66,-66,-64,-68,-13,-68,26,-64,-22,-4,-57,-68,-59,-68,63,10,-50,-79,-67; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-71,-85,-79,52,-85,-70,30,-77,65,47,-79,-82,-73,-76,-35,-62,-6,-66,-46; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-37,-80,36,-7,-18,-69,-54,-33,-7,-25,-63,42,-74,-13,40,-11,-61,-70,85,62; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-33,-70,-68,-11,32,-75,-6,60,-66,-16,-47,1,-71,-17,-70,3,44,25,-74,-53;
MA   /M: SY='A'; M=73,-66,-63,-59,-75,29,20,-70,-61,-43,-63,-55,-66,21,-64,34,-21,-60,-77,-68;
MA   /M: SY='M'; M=24,-71,-66,-28,-66,20,19,12,12,-20,44,-59,-69,31,-24,2,-24,28,-78,-62;
MA   /M: SY='S'; M=-48,-67,-53,5,-73,-14,-59,-35,-51,-73,-67,17,-64,-12,18,80,49,-64,-83,-67;
MA   /M: SY='G'; M=60,-70,-65,-67,-74,74,-67,-76,-64,-75,-67,-55,-68,-17,-29,-46,-26,-67,-71,6;
MA   /M: SY='M'; M=3,-69,-79,-70,-47,-76,-62,-37,-70,69,93,-25,-77,5,-68,-68,-61,-43,-73,-54;
MA   /M: SY='N'; M=-17,-71,47,-6,-70,-62,-54,10,-26,-40,33,65,-68,32,-59,21,18,-60,-83,-15;
MA   /M: SY='A'; M=75,-66,-25,-59,-68,-57,-66,-27,-28,-3,-55,14,-69,20,-26,-48,-23,8,18,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-57,-5,-26,-68,21,-63,-47,21,-52,15,-70,98,10,-26,-25,-65,-75,-59;
MA   /M: SY='Q'; M=18,-72,-22,-21,-76,-60,-55,-70,-47,-14,-60,3,-67,84,27,57,-51,-67,-77,-64;
MA   /M: SY='Q'; M=-18,-73,10,-7,-23,-71,-60,26,-25,5,-52,15,-69,58,8,-26,43,-12,-76,-14;
MA   /M: SY='R'; M=10,-76,-55,-23,-72,-66,-51,-77,31,-75,-64,57,-71,10,84,-54,-58,-72,-74,7;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-73,-74,-61,-53,-79,-61,15,-63,54,78,-69,-75,71,-62,-65,-26,2,-73,-55;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-73,67,50,-81,-60,-52,-80,-23,-80,-73,66,-65,-46,-5,27,-52,-75,-89,-70;
MA   /M: SY='V'; M=-31,-68,-78,-75,-55,-81,-81,52,-72,-41,0,-70,-73,-73,-75,-60,44,78,-84,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-18,-72,-81,-78,-50,-83,-79,80,-74,11,-39,-73,-74,-72,-77,-32,8,48,-75,-13;
MA   /M: SY='A'; M=71,-63,-62,-60,-75,9,-65,-70,-61,-72,-66,-53,-65,-55,-65,70,-18,-59,-78,-70;
MA   /M: SY='N'; M=4,-68,38,6,-78,-53,-50,-76,-51,-80,-71,94,-68,-50,-59,47,-19,-72,-90,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-73,-85,-81,-46,-88,-78,84,-78,51,4,-79,-78,-73,-79,-74,-59,16,-74,-56;
MA   /M: SY='A'; M=96,-61,-66,-60,-76,-49,-68,-66,-62,-68,-62,-20,-66,-58,-67,-4,-51,-53,-76,-71;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='A'; M=66,-66,-74,-68,-59,-63,-71,28,-67,-31,34,-68,-71,-64,-70,-9,-53,46,-74,8;
MA   /M: SY='N'; M=-33,-71,64,-5,-28,-56,-50,-77,-50,-80,-72,86,-69,-50,-5,46,-48,-75,-90,-68;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-51,-63,-58,-61,-69,-65,-67,-60,-58,-66,-62,-48,-61,-60,-66,39,105,-28,-88,-66; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-32,-70,-25,-63,-23,-69,-68,13,-63,-58,-56,25,59,-65,-70,3,60,41,-81,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-76,-62,-72,-80,90,-68,-39,-31,-80,-71,16,-69,-64,-9,-50,6,-40,-77,-75; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-39,-3,-7,-34,92,-7,-56,-57,-71,-51,-55,-69,-82,-73,-71,-67,-28,-60,-42,85; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-35,-77,-57,-44,-79,-36,-3,-77,93,-76,-65,-50,27,23,4,-55,7,-73,-74,-66;
MA   /M: SY='R'; M=37,-74,29,-6,-77,-63,-58,-74,16,-74,-66,-17,1,-11,70,20,-55,-36,-79,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-73,-3,-25,-77,44,-61,-16,13,-73,-65,-50,-67,47,18,46,-23,-35,-77,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-76,42,-21,-5,-5,-57,-74,35,-44,-65,-15,-68,32,61,-26,25,-70,-77,-62;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=36,-73,-7,-70,11,-37,-75,20,-71,-37,-58,-1,15,-71,-76,-28,25,33,-82,-65; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-33,-73,11,29,13,-67,-55,1,-27,-22,-5,34,-70,7,-61,32,-5,-2,-65,56;
MA   /M: SY='F'; M=-21,-73,-80,-74,101,-79,-66,-8,-64,-6,-3,-24,-25,-73,32,-69,-65,-28,22,-30;
MA   /M: SY='E'; M=37,-72,-55,45,10,-64,-59,-14,-6,-66,-62,-56,-66,41,39,27,-23,-33,-74,-61;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=3,-77,75,-4,-84,-64,-59,-80,27,-81,-74,4,1,21,-56,27,-5,-75,-89,-72; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-17,-72,-24,30,-18,-75,-59,-21,-9,45,69,-21,-72,33,-24,-63,-24,-10,-72,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-71,-28,-68,2,-80,-5,31,-66,37,23,-22,1,6,-7,-66,-4,51,-76,-56;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-86,-45,83,-85,-72,-61,-79,-51,-80,-72,-64,98,-47,-62,-60,-60,-78,-80,-78;
MA   /M: SY='V'; M=-52,-66,-83,-77,-54,-84,-86,-19,-75,-39,-42,-78,-79,-77,-76,-66,-50,103,-88,-62;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00508;
//
ID   PTS_HPR_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00589;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTS HPR component serine phosphorylation site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9307346; R2=0.0176571; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=246; N_SCORE=10.264; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-29,2,14,-32,-18,-3,-26,28,-24,-8,0,-10,24,20,-5,-9,-23,-21,-12,19;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-11,-18,-11,2,-9,-20,-14,-2,-6,8,0,-13,-15,-6,-8,-8,0,-1,-22,-9,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-11,-22,-13,-4,-7,-16,-3,-12,-3,0,-12,-13,-12,-17,2,-2,3,-15,-10,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-4,3,-20,3,6,-24,-3,-1,-23,5,-23,-13,6,-10,8,3,9,1,-18,-26,-14,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-28,-3,2,-27,3,-9,-29,14,-26,-14,3,-9,4,12,-1,-8,-23,-23,-17,2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-23,-23,-29,-18,58,-29,-10,-3,-21,5,-2,-18,-27,-27,-16,-18,-10,-5,10,35,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-23,9,6,-26,-12,-8,-20,-1,-23,-16,6,1,2,-7,8,2,-17,-32,-18,3;
MA   /M: SY='S'; M=16,-6,14,-10,-8,-20,-5,-16,-20,-14,-24,-18,0,-15,-8,-16,24,10,-8,-37,-22,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-26,18,28,-28,-15,-2,-25,6,-21,-17,6,-8,13,1,3,-4,-22,-31,-17,20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-19,-32,-26,-2,-31,-28,32,-24,15,12,-23,-23,-22,-24,-13,-3,32,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-20,-9,-3,-13,-19,-7,-13,-3,-10,-5,-2,-11,-1,-1,2,13,-10,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-18,-33,-26,7,-32,-25,29,-26,26,16,-27,-28,-24,-22,-20,-6,28,-22,-2,-26;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-13,-6,0,-11,-14,-6,-7,3,-7,-3,-2,-9,4,10,1,6,-4,-15,-6,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-2,2,-13,4,3,-13,-2,-6,-10,-2,-9,-8,0,-7,-2,-3,2,-2,-6,-16,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-15,-7,-4,-8,-7,-5,-14,3,-13,-8,-2,-6,-2,9,2,2,-10,-12,-2,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='B'; M=-6,19,-19,17,12,-21,-6,-1,-21,3,-21,-16,19,-9,2,-2,6,0,-20,-28,-15,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-28,2,-4,-29,41,-15,-36,-13,-27,-20,2,-15,-11,-15,3,-12,-27,-25,-26,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-6,3,-24,-20,-11,-18,26,-21,-7,-3,-13,8,19,-4,-3,-10,-23,-10,4;
MA   /M: SY='E'; M=0,-6,-15,-6,6,-19,-17,-12,-14,-2,-12,-10,-6,-8,1,-3,4,4,-9,-28,-15,3;
MA   /M: SY='V'; M=19,-21,-13,-25,-21,-10,-10,-25,9,-17,-1,0,-19,-21,-21,-21,-2,-2,23,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,30,-21,22,8,-24,-4,4,-23,-1,-28,-20,38,-15,4,-3,12,2,-26,-38,-19,6;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,-17,-20,-15,-16,9,-20,-9,-16,-3,-6,-12,-16,-14,-20,0,-7,-4,-20,-18,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,6,-29,6,9,-29,-18,-7,-30,40,-29,-12,6,-12,8,29,-8,-9,-22,-23,-12,8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,27,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-24,-21,-33,-24,11,-26,-11,24,-18,20,41,-21,-22,-11,-16,-20,-10,14,-16,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=7,-2,-23,-6,-7,-25,20,-13,-28,0,-26,-16,5,-15,-7,-4,6,-7,-19,-25,-21,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-31,-25,29,-25,28,18,-28,-28,-23,-21,-20,-6,29,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-26,-16,-2,-24,-8,16,-15,24,34,-22,-23,-2,-12,-20,-9,9,-21,-2,-9;
MA   /M: SY='M'; M=6,-10,-16,-18,-12,-11,-9,-9,-1,-10,-1,17,-7,-15,-2,-12,2,4,-1,-25,-10,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,23,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=14,-1,-23,-1,-5,-28,30,-16,-29,-12,-22,-18,-1,-14,-11,-17,3,-11,-20,-23,-25,-8;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,-15,-24,-16,-8,-17,-21,10,-19,7,2,-15,-19,-15,-20,-1,-1,12,-24,-11,-16;
MA   /M: SY='A'; M=5,-8,-22,-10,-5,-23,5,-15,-20,0,-20,-12,-4,-9,-6,-2,4,-3,-11,-25,-19,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-21,-5,6,-26,-19,2,-20,15,-21,-6,-2,-13,22,9,-2,-5,-19,-20,-5,13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,61,-16,-37,-17,-30,-20,8,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-18,-1,-3,-21,-2,-7,-22,-4,-21,-14,3,-12,-2,-3,14,12,-13,-29,-15,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-24,4,12,-23,-17,1,-17,3,-15,-9,5,-13,11,5,0,-3,-16,-28,-12,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,7,-35,-27,35,-28,26,17,-25,-25,-23,-25,-21,-8,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-19,-5,2,-15,-20,-5,-14,-3,-8,-8,-3,-14,-2,3,3,14,-8,-27,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-35,-27,11,-33,-25,32,-27,25,18,-25,-26,-23,-23,-20,-8,25,-19,1,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-5,-15,-6,2,-16,-18,5,-15,-2,-17,-9,-2,-15,1,-3,5,3,-10,-27,-3,0;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-13,-22,-15,-14,-12,-22,2,-14,-4,-4,-12,-13,-13,-20,6,7,9,-23,-14,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-27,21,28,-29,-16,0,-29,10,-23,-18,7,-7,12,4,2,-3,-25,-31,-16,20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-19,-1,15,-25,-14,-11,-20,-2,-21,-17,-2,11,1,-10,4,-4,-19,-30,-21,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00318;
//
ID   LIF_OSM_MP; MATRIX.
AC   MP00590;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LIF / OSM family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2745285; R2=0.0145815; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=723; N_SCORE=15.807; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-30,-12,-2,-21,-26,-16,-6,26,-15,-1,-6,-13,1,12,-13,-10,-5,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-33,-17,-14,12,-27,8,-6,-10,-9,-6,-20,5,-10,-13,-17,-10,-16,12,48,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-22,-6,0,-17,-11,-11,-11,-6,-17,-11,-11,50,-6,-11,-6,-6,-17,-17,-17,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-6,-6,-6,-6,-11,-11,-6,-6,-6,-6,0,-6,-6,-6,11,28,0,-17,-6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-2,-30,-2,10,-30,-20,31,-26,14,-22,-3,3,-14,30,20,-6,-13,-27,-23,-1,18;
MA   /M: SY='V'; M=6,-19,-16,-20,-17,-11,-21,-24,6,-14,-5,-3,-19,2,-19,-18,-1,7,16,-28,-16,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-30,5,-13,-32,55,-16,-40,-16,-30,-22,4,-18,-16,-18,0,-18,-30,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-28,-4,0,-22,-16,38,-26,-4,-24,-10,2,5,4,5,-1,-9,-25,-30,-3,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-19,-21,-19,-24,-17,26,-24,-9,-20,-12,-7,-13,-24,-24,-20,-4,-11,5,-24,-21,-24;
MA   /M: SY='D'; M=6,14,-25,22,5,-31,-9,-11,-25,-6,-23,-21,1,11,-6,-16,1,-7,-20,-31,-22,-1;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-10,-15,-15,-9,-18,-21,4,-14,-8,-5,-10,-19,-15,-14,14,18,19,-33,-13,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-19,-4,3,-16,-11,-3,-13,5,-13,-6,-4,14,9,10,-4,-6,-15,-13,-10,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-26,-12,-6,-17,-18,-18,-10,-14,-10,-10,-14,31,-10,-17,0,5,-13,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-11,-14,-9,-16,-23,-15,-17,-13,-20,-15,-16,35,-13,-18,-6,1,-19,-24,-10,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-10,-9,-12,-13,-6,-1,-15,1,-10,-3,-2,-9,-13,-13,-10,0,5,10,-17,-9,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-26,-8,-2,-20,-16,-16,-14,-8,-20,-14,-12,52,-8,-14,-2,3,-18,-24,-20,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-22,29,9,-24,-9,-4,-22,-2,-20,-18,5,15,-2,-9,-2,-7,-20,-24,-15,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-14,-4,-7,-13,-17,3,-14,-9,-14,-10,10,-13,-6,-7,14,32,-9,-31,-7,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-27,-6,0,-26,-11,-16,-20,-10,-30,-20,-7,46,-6,-16,12,3,-21,-34,-26,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,0,-21,4,-1,-23,5,-12,-21,-8,-21,-16,-1,12,-7,-13,5,-4,-17,-24,-20,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-17,0,4,-21,-9,-8,-21,18,-24,-12,4,-8,4,10,10,3,-13,-24,-12,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,28,-26,40,27,-33,-11,-2,-33,1,-27,-25,12,-7,6,-7,9,-4,-26,-37,-20,17;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-10,-21,-17,-11,-14,-23,3,-13,-3,-3,-15,-17,-17,-18,5,11,17,-25,-15,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,7,-28,4,16,-36,-16,10,-20,8,-22,-4,11,-12,49,8,2,-8,-30,-24,-12,33;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-26,-9,0,-20,-20,-5,-26,26,-20,-10,0,-17,6,49,-4,1,-16,-22,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-26,-19,-9,-10,-27,-17,3,5,9,7,-15,-19,-7,0,-19,-10,0,-20,-4,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-26,-14,-3,-10,-8,-13,-10,-9,9,0,-13,-21,-7,2,-15,-12,-10,-22,-11,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,2,-24,-2,-12,-26,42,-12,-32,-14,-30,-20,15,-18,-12,-14,10,-8,-26,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-6,-30,-6,1,-33,16,-4,-30,1,-24,-10,0,-16,20,8,-2,-14,-28,-20,-18,10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,49,-30,-20,9,-30,28,9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,4,-3,17,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-11,-14,-34,-14,-14,-19,20,1,-33,-8,-24,-15,-6,-22,-9,2,-11,-20,-28,10,-7,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-24,-9,-13,-24,30,-19,-30,-7,-24,-16,0,-16,-13,-10,4,2,-20,-23,-21,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,4,-24,-20,51,-30,17,-24,-4,6,-16,10,13,-10,-16,-26,-26,7,4;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,9,-29,-20,4,-26,21,-20,-6,0,-16,32,43,-6,-10,-24,-20,-10,18;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-37,-30,45,-31,-24,16,-27,11,6,-23,-29,-34,-21,-17,-7,19,-6,14,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-29,-13,33,-19,20,42,-20,-20,-9,-19,-20,-10,19,-20,0,-19;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-21,-7,-5,-22,6,6,-26,-3,-23,-13,3,-16,-1,5,10,-3,-18,-27,-13,-5;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-10,-15,-15,-9,-18,-21,4,-14,-8,-5,-10,-19,-15,-14,14,18,19,-33,-13,-15;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-13,-28,-23,-1,-24,-25,19,-21,17,9,-26,-26,-23,-20,-12,-3,28,-25,-9,-23;
MA   /M: SY='G'; M=14,-13,-21,-16,-19,-22,34,-22,-21,-17,-18,-12,-8,-19,-19,-20,1,-11,-9,-22,-24,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,7,-23,17,-20,-3,0,-13,43,31,-3,-10,-27,-20,-10,26;
MA   /M: SY='V'; M=22,-21,-10,-26,-21,-9,-17,-26,12,-16,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,65,-30,-20,4,-30,19,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-24,-7,0,-20,-14,-3,-27,19,-23,-13,3,-17,7,47,4,-1,-17,-26,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-30,3,15,-30,14,-10,-34,10,-27,-17,0,-10,2,1,-3,-14,-27,-23,-21,9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-30,17,-7,-33,43,-13,-40,-13,-30,-23,7,-17,-13,-17,0,-17,-30,-27,-27,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00509;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F10_MP; MATRIX.
AC   MP00591;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 10 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.5031122; R2=0.0079190; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1182; N_SCORE=8.855; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=885; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-34; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-58,-72,45,-55,-61,-9,-57,-5,-3,-18,-60,35,10,-57,-62,36,27,-8,-73,43;
MA   /M: SY='I'; M=11,-74,-71,-18,-61,32,-74,57,-70,7,-48,-8,34,-67,-75,-61,-58,27,-77,-65;
MA   /M: SY='S'; M=46,-69,38,22,-78,-19,-59,-75,6,-75,-68,-3,-65,1,-11,56,-49,-66,-81,-69;
MA   /M: SY='N'; M=10,-73,39,40,-76,13,-54,-77,-50,-76,-69,52,-66,39,-12,19,-11,-72,-80,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-25,-74,-81,-79,42,-83,-69,72,-74,-17,-42,-74,-77,-73,-75,-68,-13,35,-58,61;
MA   /M: SY='E'; M=-24,-77,-8,53,-76,-69,-57,-23,39,-33,-64,-54,18,3,52,18,-12,-68,-78,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=35,-71,-53,32,-79,23,-59,-73,20,-73,-64,18,-64,58,-53,-46,43,-66,-78,-69;
MA   /M: SY='A'; M=77,-62,-59,-59,-74,-51,-64,-66,-59,-70,-63,32,-65,-56,-65,39,35,-56,-80,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-72,-85,-79,-3,-86,-72,65,-77,63,54,-79,-79,-71,-76,-75,-61,-7,-71,-52;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-77,-5,48,-79,-65,-51,-76,52,-35,-65,66,-6,59,-6,-53,-56,-75,-80,-68;
MA   /M: SY='K'; M=41,-69,-61,-55,-68,-63,-60,-60,57,2,35,32,-69,-51,26,-15,-12,-21,-77,-64;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-72,-73,-84,-80,95,-83,-62,-12,-76,36,-44,-78,-84,-77,-73,-74,-66,-50,40,63;
MA   /M: SY='A'; M=77,-64,-66,-63,-69,-19,-68,3,-63,-10,-56,-7,-68,-60,-68,30,-10,-17,-77,-68;
MA   /M: SY='S'; M=29,-69,13,-14,-77,24,-59,-75,-15,-76,-68,19,-66,0,10,60,11,-67,-81,-69;
MA   /M: SY='L'; M=41,-68,-74,-68,-54,-71,-70,38,-69,52,-41,-68,-73,-3,-71,-17,24,-12,-75,-60;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-12,-73,-83,100,-70,-90,-69,-86,-75,-50,-7,-67,-76,-50,-67,-84,-75,-78;
MA   /M: SY='V'; M=-23,15,-75,-71,-6,-79,-73,10,-21,45,-42,-69,-75,-70,-70,-60,50,51,-78,-58;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-62,-81,61,84,-81,-72,-55,-1,7,-73,-69,-51,-5,25,-52,-57,-59,-70,-83,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-71,-76,-77,-53,-82,-78,76,-73,-16,-40,30,-76,-73,-76,-67,-54,68,-81,-60;
MA   /M: SY='H'; M=46,-74,-60,-51,-71,-63,88,-22,-14,-65,10,-53,-7,72,-10,-14,-59,-64,-77,2;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-75,-86,-83,31,-88,-82,95,-78,-34,15,-76,-76,-76,-80,-73,-58,30,-70,-51;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-60,-68,-67,-68,-59,-57,-64,-60,-46,-59,-61,-66,-7,114,-51,-88,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-70,-84,-77,-40,-86,-68,11,-78,87,-29,-83,-83,-71,-75,-77,-63,-38,-69,2;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-80,118,-32,-88,-64,-53,-86,-55,-84,-83,2,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-74,-85,-81,-5,-86,-77,87,-76,-13,73,-76,-75,-72,-77,-72,-58,37,-74,-54;
MA   /M: SY='S'; M=36,-68,-56,-14,-75,-20,12,-73,-49,-73,-65,18,-66,1,44,60,25,-65,-81,-66;
MA   /I: I=-3; MD=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-70,13,-17,-81,-65,-30,-76,37,-78,-7,79,14,-84,-76,-81,-74,-16,24,-90,-69; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-98,-84,-24,12,-93,-77,-88,0,-87,-83,13,-97,-82,-82,-79,5,-87,-78,60; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-82,-100,-15,2,-106,29,-81,-109,-22,-107,-97,42,-93,-76,6,-23,-83,-104,-107,-97; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-76,46,-56,12,-21,-63,-75,-61,-76,-72,32,45,-59,-68,55,-53,-73,81,-60; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-71,-8,21,-70,-63,-58,-20,-15,-68,9,43,45,0,-60,37,43,-22,-80,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-60,-74,86,10,-13,-64,-57,-72,-15,-75,-72,20,18,-54,-61,19,35,-25,-89,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-25,-78,-11,-15,-52,-68,14,-68,-15,-31,-60,17,17,38,10,28,-12,-69,-59,80; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=21,-69,-10,-15,-9,-22,-61,-51,-55,5,12,44,-72,0,25,6,-10,33,-79,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-73,40,-12,-65,-21,-54,-66,20,-68,10,54,-5,24,-55,-50,36,-23,-73,41;
MA   /M: SY='V'; M=11,-72,12,-62,-56,-2,12,-46,-65,15,-51,-6,34,-2,-68,-17,-56,46,-71,41;
MA   /M: SY='V'; M=29,-69,-62,32,16,-24,-63,-48,-61,6,12,-7,-70,-1,-65,-55,25,33,-69,26;
MA   /M: SY='N'; M=29,-71,-6,33,-10,-61,-52,-69,7,-31,-62,67,-68,40,-54,-13,-10,-66,-73,26;
MA   /M: SY='A'; M=52,-72,28,-12,-70,-63,-61,-18,-14,-29,-59,-57,19,39,11,-13,-11,0,-76,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00510;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F9_1_MP; MATRIX.
AC   MP00592;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 9 active sites signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0341287; R2=0.0148182; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=437; N_SCORE=11.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=28,-14,-16,-20,-14,-16,6,-20,-9,-16,-1,-6,-12,-16,-14,-20,0,-6,-3,-20,-18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-27,-5,7,-23,-20,-6,-20,22,-17,-7,-3,-14,11,26,-6,-7,-15,-23,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=1,4,-21,5,6,-26,-10,-8,-25,11,-25,-15,4,-11,6,9,11,3,-16,-29,-16,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-29,-3,10,-37,-2,2,-23,3,-21,-4,-1,-12,40,2,1,-11,-28,-20,-14,25;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-18,-31,-26,-3,-28,-26,29,-22,13,13,-22,-23,-21,-23,-11,-3,30,-24,-7,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,38,-26,49,15,-33,-8,2,-34,-1,-29,-26,23,-11,1,-8,7,-4,-27,-39,-19,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-19,27,-29,25,-2,-10,-1,0,-18,-29,-9,-9,-19,-11,-11,26,76,-19;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-21,-32,-24,0,-29,-24,28,-24,23,17,-23,-23,-19,-23,-17,-7,21,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-22,19,-30,-20,18,-30,43,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,9,-16,4,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-15,11,2,-25,-12,-8,-22,3,-23,-16,8,-14,-1,3,6,-1,-16,-32,-16,0;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-19,17,-1,-19,-2,7,-19,-1,-28,-19,54,-19,-1,-1,12,5,-27,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-33,-12,-8,-23,-2,-17,-19,-12,-25,-16,-15,44,-13,-17,-6,-10,-22,-24,-20,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-12,-20,-15,-7,-6,-18,-4,-1,-4,7,12,-10,-18,1,3,-12,-7,-4,-16,0,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,6,-25,6,2,-26,3,-7,-26,9,-25,-15,7,-5,1,4,-1,-8,-22,-24,-17,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-22,-19,-10,-11,-22,-7,1,0,1,17,-10,-18,3,8,-8,0,-1,-22,-6,-5;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-15,-31,-26,1,-28,-21,28,-19,17,26,-26,-26,-20,-18,-15,-4,34,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-10,-25,-25,-2,-28,-28,20,-18,5,5,-23,-25,-25,-18,-3,12,38,-30,-10,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-25,-26,-22,38,-28,1,3,-18,9,4,-17,-29,-20,-14,-20,-9,-4,11,45,-22;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-23,-1,8,-21,-17,-12,-13,0,-15,-11,-2,-2,0,-5,2,2,-10,-28,-16,3;
MA   /M: SY='N'; M=-13,15,-25,6,3,-23,-11,2,-25,22,-27,-15,27,-17,5,27,-1,-5,-25,-29,-15,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-29,-19,-13,11,-23,-4,-8,-13,-10,-8,-18,11,-14,-15,-11,-5,-13,0,24,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-36,-14,-5,-20,-22,-21,-13,-13,-20,-14,-21,68,-14,-20,-12,-9,-20,-27,-24,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-25,-10,2,-22,-18,-6,-14,13,-14,-1,-3,-14,11,15,-4,-4,-12,-22,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,5,-27,-1,3,-20,-15,11,-24,13,-22,-10,15,-18,13,29,-3,-8,-24,-25,-9,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-25,-29,-20,-13,-16,-26,-24,5,-16,-9,-5,-23,37,-18,-21,-12,-7,2,-28,-19,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-19,4,-29,7,1,-21,-19,81,-28,-10,-17,-3,9,-19,7,-2,-10,-18,-28,-31,14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-23,-15,-16,-11,23,-19,-24,-15,-18,-14,-5,-12,-17,-12,1,-3,-17,-18,-16,-17;
MA   /M: SY='A'; M=25,-11,-16,-17,-10,-14,-5,-17,-14,-11,-16,-14,-8,-13,-9,-17,11,4,-7,-2,-10,-9;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-16,-5,-4,-18,-2,11,-21,-11,-23,-13,5,-13,-2,-10,20,8,-13,-31,-8,-4;
MA   /M: SY='I'; M=0,-19,-23,-23,-19,-10,-8,-18,8,-21,2,4,-14,-14,-16,-21,-7,-6,5,-23,-11,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=2,-11,-21,-9,-4,-20,-12,-14,-10,-9,-19,-12,-8,24,-5,-13,5,0,-9,-27,-19,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-4,-22,-2,-3,-15,-13,-13,-18,-9,-18,-16,-5,-11,-6,-11,4,2,-15,-2,-8,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-4,0,-20,-3,-10,-11,-12,-9,-6,-11,-10,-7,2,-18,-11,-13,1,0,-3,-27,-8,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-2,1,-24,-1,-2,-21,-13,-11,-13,6,-17,-9,2,-13,-2,2,-1,-5,-9,-26,-13,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-2,1,-23,1,1,-19,-14,-9,-16,-3,-18,-13,0,-13,-1,-7,1,-2,-12,-13,-11,0;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-26,-2,3,-11,-19,14,-14,-4,-11,-2,-2,-16,3,-2,-6,-7,-15,-21,4,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-31,-9,-4,-22,-10,-13,-20,-3,-24,-14,-8,32,-6,-6,-3,-3,-22,-24,-16,-8;
MA   /M: SY='W'; M=1,-8,-14,-12,-5,-15,-11,-16,-18,-8,-19,-15,-6,-17,-6,-10,0,-3,-15,4,-9,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-21,-13,-6,-12,-20,-14,-18,-5,-18,-13,-13,24,-10,-6,-8,-7,-17,-24,-15,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-13,-21,-13,-13,-11,-6,-17,3,-12,-5,-2,-10,-1,-13,-14,-7,-7,3,-18,-11,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-9,-20,-10,-10,-6,-17,-8,-6,-9,-4,-6,-8,-14,-9,-7,-2,0,-3,-18,2,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00511;
//
ID   HEME_OXYGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP00593;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heme oxygenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9334948; R2=0.0129249; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1080; N_SCORE=17.882; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=199; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,7,-31,-30,-3,-31,-30,24,-23,7,7,-27,-30,-29,-23,-11,-3,39,-32,-12,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-27,39,14,-30,-9,18,-31,-1,-28,-21,30,-14,3,-4,2,-8,-30,-38,-14,8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,4,-24,-20,2,-28,26,-20,-8,0,-18,19,59,-8,-10,-22,-20,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,41,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-1,-30,1,13,-22,-20,51,-30,5,-20,-7,5,-16,12,19,-8,-15,-27,-27,3,8;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-28,0,19,-14,-23,6,-17,2,-13,-8,-5,-12,19,-1,-3,-3,-21,-11,11,18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-25,-10,-12,-25,33,-15,-32,-7,-25,-17,0,-17,-10,0,4,-10,-22,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,14,-26,15,11,-33,-13,15,-24,2,-22,-10,11,-12,25,-1,1,-9,-26,-28,-11,18;
MA   /M: SY='N'; M=-7,21,-20,10,7,-20,-10,-1,-20,5,-24,-16,29,-13,2,1,9,10,-21,-34,-16,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,18,-24,21,22,-29,-10,-1,-26,1,-23,-18,13,-9,11,-5,8,-4,-24,-32,-19,16;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,-1,-20,-24,-12,-30,-20,-16,67,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-32,14,47,-30,-20,-4,-28,6,-22,-20,-4,19,14,-4,-2,-10,-30,-30,-22,29;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-21,-21,-14,1,-22,8,1,-19,17,7,-17,-24,-11,-15,-16,-10,-3,-15,11,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,1,-12,-9,-18,-12,6,-18,-12,-16,-10,-2,-16,-7,-14,9,6,-9,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-6,-10,-12,-12,-10,-18,-20,-3,-12,-9,-8,-4,-14,-12,-12,17,34,9,-32,-12,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-26,-10,-2,-18,-20,-4,-26,23,-18,-10,0,-18,6,55,-4,1,-16,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,31,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,61,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,27,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-30,5,-13,-32,55,-16,-40,-16,-30,-22,4,-18,-16,-18,0,-18,-30,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='K'; M=4,-4,-26,-6,1,-28,-3,-14,-27,27,-26,-11,-2,-11,1,12,-4,-9,-17,-20,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-26,-26,-11,-6,-31,-18,27,-17,12,20,-17,-17,-9,-19,-15,-9,16,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=22,-9,-12,-19,-12,-13,-10,-16,-4,-10,-4,5,-9,-12,-8,-15,7,13,2,-23,-13,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,18,-38,-20,9,-21,12,-20,-1,0,-11,54,17,-1,-10,-29,-20,-10,35;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-25,-2,-1,-23,-1,-5,-28,16,-26,-15,11,-17,3,27,2,-5,-22,-26,-16,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00512;
//
ID   AROMATIC_AA_PERMEASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00594;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aromatic amino acids permeases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0102301; R2=0.0138793; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=893; N_SCORE=17.394; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-21,-3,8,-21,-16,-9,-18,14,-19,-5,0,-10,5,5,6,6,-12,-27,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,3,-32,2,0,-25,-13,6,-21,-7,-29,-17,12,37,-4,-10,-3,-8,-30,-33,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-20,-3,-1,-24,5,-11,-27,7,-29,-17,5,-13,0,6,16,3,-17,-30,-18,-1;
MA   /M: SY='L'; M=1,-17,-17,-23,-17,-2,-24,-21,10,-20,17,6,-16,-19,-15,-18,-6,12,8,-23,-6,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-34,-25,23,-30,-19,21,-25,25,20,-24,-27,-23,-20,-22,-9,15,-14,6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-26,-15,-19,-19,32,-21,-24,-18,-23,-16,-8,-21,-18,-18,0,-12,-15,-2,-17,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='A'; M=12,-14,-13,-19,-18,-12,-5,-23,-1,-15,-6,-5,-12,-18,-18,-17,5,12,12,-26,-15,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-26,-19,-32,-23,22,-26,-13,16,-21,24,31,-23,-26,-17,-16,-22,-9,11,-14,6,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,36,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,41,-28,22,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-18,-21,-16,-19,10,-22,-7,-16,-10,-7,-9,-14,-14,-22,3,-6,-2,-20,-19,-16;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-10,-11,-10,-11,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,43,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,-15,-25,-21,-5,-22,-18,16,-15,7,18,-17,-20,-14,-16,-5,7,20,-25,-8,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-16,-17,-13,-23,21,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,48,-30,-20,9,-30,29,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-20,-24,-18,3,-23,-10,15,-20,30,29,-16,-25,-11,-14,-22,-9,5,-22,-2,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-17,-26,-21,1,-29,-24,19,-22,20,10,-20,-23,-20,-19,-11,8,20,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='T'; M=10,-3,-16,-7,-10,-15,-15,-19,-3,-13,-9,-8,-4,-13,-11,-16,8,12,4,-28,-14,-11;
MA   /M: SY='M'; M=2,-13,-15,-19,-13,-7,-14,-9,4,-13,5,20,-11,-17,-5,-12,1,5,3,-26,-8,-9;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,-17,-29,-21,-7,-21,-23,20,-18,7,12,-18,-18,-16,-22,-7,-4,21,-22,-10,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-30,-43,-30,-27,-4,11,-27,-27,-20,-23,-20,-26,-27,-20,-20,-26,-27,-30,91,9,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,-27,-24,-20,4,-3,-22,-2,-22,-8,-5,-12,-3,-21,-22,-8,-10,-5,-17,-8,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-15,-30,-19,-22,5,5,-14,-16,-17,-15,-12,-8,-26,-19,-16,-14,-15,-16,24,8,-19;
MA   /M: SY='S'; M=12,-3,-13,-8,-8,-18,2,-16,-18,-11,-20,-15,2,-11,-8,-13,23,22,-8,-31,-18,-8;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-18,-25,-17,-1,-21,-18,13,-22,22,13,-19,-22,-14,-19,-11,-4,8,-23,-6,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-28,-20,-34,-26,23,-30,-24,21,-27,20,10,-23,-26,-26,-23,-18,-8,17,-13,5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=3,-26,-22,-32,-22,-1,-28,-24,27,-26,24,14,-21,-21,-18,-24,-17,-8,17,-20,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-22,-33,-25,11,-33,-26,27,-25,16,11,-19,-22,-22,-23,-13,1,21,-18,2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-27,-26,-24,2,2,-18,3,-24,4,2,-15,-24,-21,-22,-15,-13,-1,-11,2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=2,-21,-17,-26,-20,-1,-26,-23,16,-22,19,8,-19,-21,-18,-20,-10,5,16,-24,-6,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-32,-19,-35,-27,1,-18,-28,-20,-20,-18,-18,-32,-28,-20,-21,-27,-22,-22,93,13,-20;
MA   /M: SY='F'; M=6,-23,-18,-33,-23,32,-21,-22,5,-23,5,0,-17,-21,-26,-22,-10,-7,5,-5,8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,11,-27,-21,8,-24,-17,1,-24,14,10,-19,-28,-19,-19,-13,-6,2,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-5,20,-15,27,50,-22,-22,-5,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00513;
//
ID   AA_TRANSFER_CLASS_5_MP; MATRIX.
AC   MP00595;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminotransferases class-V pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6331978; R2=0.0154990; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=175; N_SCORE=8.337; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-19,-31,-22,16,-23,-9,15,-16,17,35,-21,-23,-13,-14,-18,-9,11,-14,6,-17;
MA   /M: SY='V'; M=13,-14,-8,-17,-15,-11,-14,-20,2,-14,-8,-5,-11,-18,-15,-16,11,10,15,-30,-14,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-2,-16,-3,7,-28,-12,0,-18,-1,-21,-8,2,-11,26,-2,14,3,-18,-28,-14,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='S'; M=14,3,-10,-3,-5,-20,-1,-12,-17,-9,-19,-15,6,-12,-6,-13,16,9,-10,-30,-19,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-19,-30,-24,7,-29,-23,23,-23,17,11,-23,-20,-22,-21,-15,-5,21,-19,-1,-24; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-18,-20,-18,-18,-14,16,-19,-14,-20,-5,-3,-13,-12,-17,-18,-10,-13,-12,-22,-18,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-4,-15,-6,-3,-19,-5,13,-25,0,-23,-11,3,-15,-1,-1,6,-4,-17,-27,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-14,-20,-16,-6,-12,-19,-10,-4,-3,-3,0,-11,-19,-5,5,-10,-7,-1,-22,-8,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-34,0,7,-28,-18,-10,-23,2,-27,-17,-9,41,-1,-5,-7,-9,-26,-26,-21,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-23,-31,-25,7,-33,-23,28,-23,17,13,-22,-22,-21,-22,-18,-8,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-28,39,12,-29,-11,1,-30,1,-26,-23,18,-7,1,-6,0,-7,-26,-32,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-32,-27,9,-30,-24,27,-23,20,18,-26,-27,-24,-20,-17,-5,30,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-4,12,-23,14,8,-26,-10,-2,-25,5,-25,-17,11,-9,5,1,7,-1,-20,-31,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-26,8,16,-29,-12,-3,-26,13,-22,-14,4,-10,13,9,0,-6,-22,-26,-15,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-21,-25,-25,-17,12,-24,-9,-1,-18,5,2,-19,-23,-11,-14,-15,-6,-6,13,16,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-28,0,-8,-29,38,-14,-34,-9,-28,-19,3,-12,-10,-11,1,-14,-27,-23,-25,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,9,-24,-21,-3,-24,-21,16,-19,6,5,-17,-20,-18,-18,-10,-5,18,-21,-7,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-22,48,13,-29,-6,2,-29,-1,-22,-21,14,-8,0,-7,0,-8,-22,-29,-14,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-27,-15,-33,-25,22,-28,-19,16,-23,19,17,-24,-27,-23,-19,-19,-8,15,-14,6,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-25,-22,-30,-22,8,-27,-16,20,-22,20,14,-22,-24,-17,-21,-18,-8,13,-13,8,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-17,-18,-21,-17,8,-17,-9,0,-15,-2,-2,-13,-21,-15,-16,-1,0,3,-9,14,-17;
MA   /M: SY='A'; M=11,-16,-14,-23,-17,5,-7,-19,-5,-19,-2,-4,-11,-19,-18,-19,0,-1,-1,-17,-6,-17;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-14,-7,-10,-24,28,-16,-28,-15,-28,-19,3,-15,-10,-15,19,1,-18,-31,-24,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-15,-10,-10,-22,17,-17,-21,-13,-22,-16,0,-13,-10,-16,18,5,-11,-27,-22,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,0,10,-30,-20,52,-25,1,-20,0,5,-15,35,7,-5,-15,-30,-25,4,20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-8,0,-6,-9,1,-3,-10,-5,-13,-9,13,-12,-5,-5,1,-3,-10,-11,-8,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-16,-23,-16,12,-21,-12,15,-19,23,15,-18,-19,-14,-14,-18,-7,8,-9,6,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-23,-20,-17,3,-22,7,5,-17,6,9,-10,-24,-10,-14,-13,-9,-1,-13,16,-16;
MA   /M: SY='G'; M=11,-12,-24,-15,-17,-23,39,-20,-24,-18,-19,-13,-5,-18,-17,-19,1,-13,-16,-21,-24,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-36,-12,-3,-25,-20,-19,-14,-11,-22,-15,-17,69,-10,-19,-10,-9,-23,-29,-26,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=8,-4,-19,-7,-3,-19,-12,-15,-17,2,-20,-13,-3,1,-5,-4,9,9,-10,-27,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-18,-31,-25,3,-31,-25,28,-25,23,16,-24,-25,-21,-22,-17,-3,25,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-21,-9,-14,-23,33,-18,-27,-15,-24,-17,1,-15,-14,-16,11,3,-17,-25,-23,-14;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-16,-31,-25,5,-26,-26,20,-23,12,7,-22,-21,-24,-23,-12,-5,22,-21,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-16,-30,-23,2,-28,-23,22,-24,25,13,-25,-26,-21,-21,-17,-6,21,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-21,-18,-25,-21,9,-29,-4,9,-19,2,2,-17,-25,-14,-18,-13,-6,1,2,27,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-15,-29,-25,4,-19,-24,16,-22,8,6,-21,-25,-23,-21,-12,-7,19,-20,-4,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-23,-5,1,-22,-14,-1,-27,20,-24,-12,4,-13,6,34,2,-4,-18,-26,-12,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-29,9,13,-27,-16,-2,-29,18,-25,-16,4,-2,8,21,-3,-7,-23,-27,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-27,19,11,-30,-2,-6,-31,8,-26,-19,8,-12,3,5,2,-6,-24,-29,-18,7;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-19,-25,-16,-2,-23,-17,8,-19,17,8,-21,-16,-15,-15,-14,-5,8,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-24,-24,-14,-3,-23,-16,4,-12,16,8,-20,-20,-10,-4,-20,-10,0,-11,-3,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-22,8,10,-22,0,-5,-21,0,-18,-13,3,-9,1,-5,1,-7,-17,-24,-15,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-20,-6,1,-15,-14,-5,-12,8,-12,-6,0,-14,3,9,-3,-5,-9,-19,-7,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-20,-26,-17,3,-22,-15,9,-18,13,11,-19,-18,-11,-17,-12,-5,5,-15,0,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-29,-1,7,-22,-16,-3,-21,5,-18,-11,-5,5,4,4,-5,-8,-21,-23,-10,4;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-28,-7,1,-24,-12,-11,-20,-3,-23,-15,-6,28,-4,-6,0,-2,-20,-28,-21,-4;
MA   /M: M=-6,-16,-23,-18,-11,-4,-22,-14,-4,-10,-2,-3,-14,-10,-10,-6,-11,-7,-5,-12,-5,-11;
MA   /M: M=-5,-11,-13,-13,-2,-15,-23,-14,-5,-2,-3,-2,-10,-17,0,-5,-5,-1,-3,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-9,-30,-8,5,-20,-22,2,-20,14,-17,-8,-4,-7,5,32,-10,-10,-16,-23,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-29,-12,-20,-26,61,-20,-35,-21,-23,-16,-3,-21,-20,-20,-3,-19,-26,-20,-27,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00514;
//
ID   HIPIP_MP; MATRIX.
AC   MP00596;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   High potential iron-sulfur proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9943619; R2=0.0109060; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=456; N_SCORE=8.957; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-26,-5,-7,-28,30,-15,-33,2,-30,-17,2,-15,-7,-3,5,-9,-23,-24,-22,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-21,25,24,-23,-9,2,-23,3,-20,-17,18,-7,7,-2,2,-5,-23,-27,-15,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-11,18,-24,8,3,-23,-11,17,-22,8,-25,-12,29,-16,10,6,3,-1,-25,-31,-10,6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-2,5,-10,7,2,-13,-4,10,-14,-4,-14,-9,6,-6,1,-4,10,2,-10,-20,-5,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-10,4,-4,-9,-6,-2,-6,-3,-12,-8,21,-12,-4,-3,5,6,-7,-23,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-16,-18,-8,-16,-13,-13,-2,-10,0,2,-12,-16,1,-13,0,-3,0,-22,-13,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-18,-22,-24,-15,28,-25,-11,0,-19,11,4,-12,-25,-11,-12,-16,-9,-6,-8,10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-27,-32,-25,38,-27,-5,2,-20,5,8,-21,-27,-21,-16,-22,-13,-4,25,35,-22;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-16,-8,1,-10,-16,-5,4,-5,1,3,-5,-10,7,-5,-6,-5,-1,-14,-5,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=6,-7,-19,-6,-3,-21,-6,-13,-13,-7,-16,-10,-7,11,-1,-12,3,1,-11,-23,-17,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-25,31,8,-29,12,-4,-31,-4,-25,-21,14,-11,-4,-9,1,-10,-25,-28,-20,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-16,-11,-6,-15,-6,-12,-10,-4,-14,-9,-7,0,-5,-10,5,-1,-5,-19,-10,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-3,-8,-3,-5,-11,-2,-10,-6,-7,-10,-7,-2,-9,-6,-9,9,3,2,-19,-11,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-11,-7,0,-14,-8,-10,-9,-4,-9,-7,-4,0,2,-8,6,8,-6,-16,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=1,10,-17,11,5,-22,0,-7,-21,-1,-19,-14,7,-9,0,-6,6,1,-15,-24,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=16,3,-20,5,7,-26,3,-12,-22,-6,-18,-16,-2,-5,-4,-14,4,-7,-16,-24,-21,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-27,-37,-27,-17,-5,-17,-22,-16,-14,-18,-15,-27,-6,-10,-16,-22,-18,-21,71,8,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-28,-6,-9,-28,30,-1,-34,-4,-27,-15,2,-18,-4,-1,0,-14,-26,-23,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-26,-10,-11,-23,25,-15,-27,-12,-25,-17,-4,-1,-11,-11,4,-9,-21,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-3,-24,-4,5,-27,-15,-9,-21,12,-24,-11,-1,2,13,4,6,4,-18,-26,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-19,-27,-22,2,-29,-8,19,-24,24,14,-24,-28,-20,-18,-19,-8,20,-25,-1,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-37,-29,54,-31,-20,11,-27,11,4,-22,-29,-34,-21,-18,-8,11,1,23,-29;
MA   /M: SY='P'; M=6,-11,-29,-7,-2,-27,-14,-19,-18,-9,-23,-17,-13,50,-9,-19,-2,-4,-20,-28,-25,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,-1,-7,-31,46,-14,-37,-10,-29,-19,3,-17,-9,-13,0,-17,-29,-23,-26,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-24,-2,0,-19,-17,-1,-17,20,-22,-9,7,-16,1,10,-3,-5,-12,-24,-5,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-18,-11,-3,-7,-20,-10,1,-13,16,6,-13,-18,1,-9,-11,-3,-3,-20,-5,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=6,7,-18,0,2,-22,-7,-5,-18,1,-22,-14,14,-13,4,0,13,2,-14,-31,-17,3;
MA   /M: SY='P'; M=4,-11,-25,-10,-1,-21,-11,-17,-12,-10,-14,-11,-10,20,-9,-16,-4,-7,-11,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,20,-24,16,8,-26,0,-3,-27,3,-26,-19,22,-13,0,-3,5,-2,-24,-32,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-47,-37,-29,13,-21,-23,-17,-19,-17,-17,-37,-30,-19,-19,-37,-27,-27,134,37,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-16,-3,-5,-17,-13,-15,-8,-11,-11,-9,-2,-13,-5,-14,11,9,-2,-30,-14,-6;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-10,-15,-10,-17,-4,-18,-8,-11,-14,-10,-6,-13,-10,-17,17,6,4,-28,-19,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-32,-39,-33,-26,26,-25,-11,-10,-18,-9,-10,-30,-30,-19,-16,-30,-20,-19,90,48,-21;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-13,-22,-17,-10,-17,-24,7,-15,-2,-2,-13,-16,-16,-19,4,11,15,-25,-13,-17;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-25,-16,-9,-16,-15,-12,-7,-9,-6,-4,-16,11,-12,-13,-10,-8,-6,-25,-14,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-26,-7,3,-25,-17,-7,-23,30,-20,-4,-3,-13,9,28,-8,-9,-15,-20,-11,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=16,0,-14,-4,3,-19,-6,-11,-16,3,-17,-12,2,-8,-1,-5,10,4,-9,-23,-15,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=9,0,-25,0,-11,-29,40,-17,-32,-14,-25,-19,1,-16,-14,-18,3,-13,-22,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00515;
//
ID   PLANT_LTP_MP; MATRIX.
AC   MP00597;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Plant lipid transfer proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6746202; R2=0.0136998; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=8.651; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,-15,-21,-13,-13,-8,-19,-1,-15,2,-1,-12,-15,-11,-19,0,0,2,-21,-14,-12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-15,-15,-8,-18,-4,-15,-11,-5,-11,-5,-7,-13,-4,-9,7,3,-4,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='A'; M=10,-1,-18,-6,-3,-21,-3,-11,-18,1,-19,-12,5,-13,0,-2,9,2,-12,-27,-17,-2;
MA   /M: SY='A'; M=7,-6,-20,-8,-5,-21,-1,-15,-19,1,-18,-12,-3,-9,-6,-2,7,3,-10,-26,-17,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-21,-24,-20,4,-19,-16,11,-20,2,3,-11,-21,-16,-19,-5,-1,8,-17,4,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-8,-22,-7,-4,-18,-9,-10,-18,-2,-18,-12,-4,2,-4,-4,7,5,-14,-28,-13,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-26,1,-10,-27,34,-13,-33,-11,-28,-19,8,-13,-11,-9,4,-9,-26,-26,-25,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-33,-25,3,-34,-24,32,-26,27,17,-24,-25,-20,-21,-22,-9,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,28,-23,19,4,-24,-7,3,-25,12,-29,-18,37,-16,2,9,4,-2,-26,-34,-17,3;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-23,-9,-8,-12,-11,-10,-7,-12,-4,-4,-8,-6,-8,-15,-7,-6,-9,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,8,-26,6,2,-29,17,-7,-30,0,-27,-17,11,-14,2,-5,2,-10,-26,-26,-21,2;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-22,-11,-9,-5,-18,-10,-6,0,-3,-3,3,-21,-8,4,-9,-6,-6,-23,-8,-9;
MA   /M: SY='A'; M=35,-16,-11,-23,-15,-13,-9,-22,1,-14,-1,-3,-16,-16,-15,-20,3,-1,11,-22,-16,-15;
MA   /M: SY='A'; M=32,-5,-11,-12,-5,-19,-2,-15,-13,-10,-14,-12,-2,-11,-6,-16,17,5,-4,-27,-19,-6;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-23,-1,4,-26,16,-11,-29,-2,-26,-18,4,-13,-2,-3,9,-5,-22,-27,-22,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-22,-6,-6,-24,18,-13,-28,1,-27,-16,1,-14,-6,-4,10,-4,-18,-24,-18,-6;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-25,-7,3,-25,-17,-3,-21,23,-19,-5,-3,-13,8,14,-6,-7,-14,-21,-9,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-28,-3,-14,-28,49,-14,-36,-11,-29,-19,8,-19,-14,-12,1,-16,-28,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-19,6,-1,-20,-10,-1,-18,3,-23,-14,19,-16,-1,4,10,4,-13,-34,-15,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-20,-31,-25,-1,-31,-25,32,-23,14,15,-20,-22,-20,-23,-11,-1,28,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-31,-6,-3,-27,-6,-16,-22,-6,-28,-18,-5,44,-8,-13,-1,-4,-25,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-26,-25,-22,31,-30,4,6,-17,9,4,-22,-30,-17,-14,-21,-9,-1,15,54,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-30,-7,2,-27,-17,-16,-22,9,-27,-15,-9,35,-2,-2,-3,-3,-21,-26,-20,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,3,-38,-30,45,-29,18,18,-21,-22,-22,-28,-19,-9,32,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-12,3,0,-20,-3,-10,-21,-8,-28,-19,9,-10,-1,-8,34,20,-11,-38,-19,0;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-24,-14,-6,-20,-17,-18,-11,-5,-16,-8,-13,26,-9,-13,-1,5,-9,-27,-19,-9;
MA   /M: SY='S'; M=1,15,-15,10,1,-21,-4,-4,-21,-5,-27,-19,22,-13,0,-6,23,13,-17,-37,-19,1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-14,-20,-17,0,-24,-21,5,-15,0,2,-9,-16,-16,-14,6,28,11,-25,-5,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,48,11,-31,-6,4,-31,0,-30,-26,37,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=2,13,-19,8,6,-23,-5,0,-22,2,-27,-17,20,-12,4,-2,16,4,-19,-34,-17,5;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-19,-4,1,-20,-14,-11,-21,13,-22,-13,4,-11,1,11,10,13,-12,-28,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,39,-25,17,15,-25,-25,-25,-25,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-13,3,-28,0,5,-25,-11,24,-26,10,-23,-8,9,-16,15,13,-4,-11,-25,-25,-4,8;
MA   /M: SY='V'; M=3,-11,-11,-13,-15,-10,-15,-18,4,-14,-11,-5,-5,-21,-15,-14,13,9,17,-35,-15,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-15,-20,-15,0,-25,-20,5,-20,19,5,-15,-20,-15,-15,-4,21,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-15,-30,-21,-15,-10,-30,33,11,-20,1,10,-5,-20,-5,-15,-15,-15,1,-25,10,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,9,-25,-1,-10,6,-15,15,-10,-5,-15,-10,19,-25,-5,-5,-5,-5,-20,-4,31,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00516;
//
ID   CHROMO_1_MP; MATRIX.
AC   MP00598;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chromo domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4097729; R2=0.0124896; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=456; N_SCORE=10.095; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=168; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-28,29,-21,9,9,-24,-24,-24,-22,-9,-2,37,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-28,17,44,-27,-18,10,-27,5,-19,-14,2,-4,16,-2,0,-10,-27,-31,-15,29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-19,-7,-3,-9,-16,-7,-21,11,-19,-11,-2,-17,-2,15,0,-3,-14,-19,-2,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-33,-26,0,-27,-26,31,-26,17,14,-20,-23,-19,-24,-18,-10,21,-20,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-13,-22,-15,-5,-29,-20,11,-17,14,6,-19,-21,-15,-10,-18,-9,9,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-2,14,-19,17,10,-29,-12,-7,-27,5,-24,-19,7,-4,1,-2,1,-7,-21,-31,-19,5;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-4,-28,-3,1,-20,-15,25,-24,11,-20,-5,1,-17,7,15,-7,-12,-20,-21,3,2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-5,3,-22,-13,0,-27,20,-21,-11,1,-16,6,34,-2,-6,-18,-24,-11,2;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-12,-19,-14,-11,-9,-24,-16,7,-6,3,6,-12,-21,-10,-7,-9,-1,12,-27,-9,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,6,-25,8,0,-23,-8,-8,-20,3,-17,-12,3,-16,-1,6,-3,-6,-13,-28,-15,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-17,0,4,-17,-4,-6,-17,11,-15,-9,-2,2,1,7,-3,-6,-13,-14,-10,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-21,1,5,-22,-12,-6,-21,24,-23,-10,7,-10,7,15,1,-2,-16,-22,-11,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-28,-3,-8,-26,41,-12,-34,-10,-27,-19,4,-18,-11,-10,1,-15,-27,-21,-22,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-26,-2,2,-23,-12,-2,-19,11,-16,-6,1,-15,7,7,-6,-7,-16,-23,-9,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-20,-22,-20,-13,-2,-25,-15,8,-16,6,3,-20,-10,-15,-16,-12,-3,9,-16,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-28,7,26,-20,-22,9,-19,3,-14,-9,-4,-11,15,-1,-5,-10,-20,-20,0,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-24,-21,34,-30,10,2,-15,7,2,-21,-30,-15,-12,-21,-10,-6,21,64,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-25,-16,11,-28,-11,9,-17,28,13,-23,-27,-13,-9,-24,-10,2,-11,11,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-6,-33,-29,0,-33,-29,29,-25,15,11,-27,-28,-26,-23,-15,-5,35,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-26,-11,1,-18,-22,-9,-15,19,-7,-1,-8,-17,4,23,-13,-9,-10,-21,-8,1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-29,1,-13,-29,51,-14,-37,-14,-30,-20,9,-19,-15,-13,1,-16,-30,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-28,-31,-29,-23,27,-28,-4,0,-19,7,0,-27,-30,-18,-16,-27,-15,-9,44,46,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,6,-27,11,2,-27,-6,-6,-25,-8,-28,-20,6,21,-5,-13,6,-1,-24,-34,-22,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,6,-27,11,6,-15,-16,8,-21,-4,-19,-14,0,-11,2,-8,0,-6,-20,-15,7,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,7,-20,10,6,-22,-11,-7,-22,1,-21,-16,5,-12,2,-1,13,7,-15,-31,-13,4;
MA   /M: SY='H'; M=-11,9,-27,14,18,-20,-18,19,-24,-1,-18,-13,2,-12,10,-4,-2,-8,-24,-22,3,13;
MA   /M: SY='N'; M=-4,25,-1,20,0,-25,-7,-3,-25,-6,-27,-22,26,-18,-5,-10,8,-1,-22,-40,-21,-3;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-29,19,58,-30,-19,0,-30,9,-20,-20,0,0,19,0,2,-9,-29,-30,-20,38;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-34,0,4,-29,-16,-15,-22,-8,-30,-21,-9,61,-6,-16,-1,-6,-27,-33,-27,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-28,4,26,-18,-18,-4,-18,1,-9,-11,-7,-7,5,-4,-7,-10,-19,-21,-7,14;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-23,6,22,-26,-14,-3,-20,2,-18,-13,3,-8,12,-3,4,-3,-19,-28,-16,16;
MA   /M: SY='N'; M=-11,21,-23,13,-3,-19,-3,13,-18,-7,-18,-11,29,-20,-4,-6,0,-7,-21,-34,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-18,-29,-20,2,-32,-22,25,-27,29,15,-22,-25,-18,-22,-22,-9,14,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-8,-20,-8,-7,-13,-11,-14,-5,-11,-5,-3,-7,-17,-6,-11,1,-2,-2,-27,-12,-7;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,15,-16,17,4,-18,2,1,-18,-3,-15,-10,12,-9,-1,-6,2,-5,-16,-21,-12,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-13,60,-19,-18,-11,-19,-18,-12,-18,-9,-9,-12,-23,-17,-18,-6,-6,-3,-28,-16,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-24,-11,0,-9,-18,-11,-13,-1,-15,-10,-10,6,-5,-4,-4,-4,-11,-18,-5,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-25,7,16,-24,-12,-4,-23,6,-16,-13,4,-12,7,8,-1,-5,-20,-27,-16,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-6,-23,-15,0,-28,-9,3,-16,12,5,-19,-26,-14,-13,-17,-9,4,-23,-1,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-32,-24,0,-34,-24,32,-21,22,18,-22,-23,-18,-20,-20,-9,23,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-26,11,16,-28,-16,0,-23,9,-18,-10,1,-10,11,2,-3,-9,-20,-26,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=8,3,-22,4,18,-27,-12,-3,-21,2,-19,-13,0,-8,10,-5,6,-4,-17,-27,-16,14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-25,-33,-26,58,-29,-6,-1,-22,5,-1,-21,-30,-28,-16,-21,-11,-5,26,48,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-27,-10,1,-5,-21,-2,-12,-4,-11,-6,-7,-19,-1,-4,-10,-10,-12,0,2,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-25,3,7,-23,-10,-4,-21,12,-22,-11,12,-13,7,11,1,-3,-20,-28,-15,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-26,3,5,-22,-17,-5,-26,18,-19,-12,2,-15,5,31,-3,-5,-18,-26,-12,3;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-28,-3,9,-21,-11,13,-20,2,-12,-6,-1,-15,8,1,-8,-13,-21,-23,-5,7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-28,0,14,-27,-18,8,-27,23,-23,-9,0,-11,15,21,-5,-10,-22,-23,-9,13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00517;
//
ID   AA_TRANSFER_CLASS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00599;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminotransferases class-II pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.3714874; R2=0.0080262; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1059; N_SCORE=8.126; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=857; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-38; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='A'; M=47,9,-68,-22,-1,22,6,-35,-65,-2,-15,-62,20,-62,-69,13,-31,8,-71,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-45,20,-74,-69,-1,-80,28,21,-12,26,-47,-68,-37,-63,38,-42,-9,28,2,38; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-19,56,13,39,-19,-18,-69,-22,-37,-65,-53,40,4,-8,15,1,-46,27,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-59,-73,-19,-25,-14,51,-19,-36,-40,47,-49,-1,-73,-10,-22,-37,14,-58,28,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-17,-81,-75,-47,-85,-22,49,-74,55,-36,-77,-79,1,-74,-70,-34,52,-74,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-40,-103,22,10,-102,-57,-23,-104,8,-101,-93,-18,-19,12,14,-31,-47,-99,-104,-37; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-19,48,35,-77,-3,56,-75,22,-73,-21,-9,0,-21,27,-3,-34,-21,-84,-64;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-32,-79,3,-35,37,-33,30,-68,26,-34,-58,-59,-75,-24,61,-39,-64,-68,-55,76; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-82,-105,16,16,-103,-87,-83,-56,-47,-100,-91,-80,83,-34,-85,-9,-76,-95,-102,-97; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-71,6,-23,-66,-64,19,28,-36,-45,2,93,-74,-58,-63,-35,-52,30,-88,-28; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-63,-72,70,-56,-56,-77,-19,18,-68,50,-45,-59,-75,-65,-71,-41,-19,34,-83,-60;
MA   /M: SY='I'; M=1,-17,-83,-78,0,-81,-77,68,-75,26,44,-76,-76,-72,-76,-68,-57,46,-74,-55;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-74,-82,-75,-2,-85,-77,57,-45,-9,19,-75,-78,11,-74,-27,-34,66,-77,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-17,-67,-13,-29,-73,-66,18,-65,40,37,-2,-71,-29,-69,24,47,22,-79,-59;
MA   /M: SY='R'; M=-39,-79,-63,-58,-79,67,-17,-50,-43,-76,-66,-53,-70,40,75,-34,-21,-50,-75,-68;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-70,-86,-79,81,-84,-67,-37,-77,67,44,-80,-83,-75,-74,-75,-64,-30,-57,-37;
MA   /M: SY='S'; M=1,-66,-58,-61,-76,44,-62,-76,-60,-78,-70,-47,-65,-53,-65,91,-2,-68,-80,-69;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='A'; M=85,-62,-64,-59,-75,-21,-66,-68,-61,-70,-64,-56,-66,-56,-66,54,-47,-56,-77,-70;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-76,-79,-76,84,-81,-56,5,-66,9,-47,-74,-83,-70,14,-71,-66,-35,32,85;
MA   /M: SY='G'; M=25,-72,-63,-70,-80,88,-69,-83,-66,-81,-72,-51,-67,-63,-73,33,-59,-75,-75,-75;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=19,55,-77,-72,-28,-48,-71,-14,-72,55,7,-70,-77,-68,-73,9,-7,28,-77,-60;
MA   /M: SY='A'; M=71,-65,-69,-23,-4,-26,-67,-20,-64,-22,17,-64,-70,-9,-67,11,-53,28,-73,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-75,-64,-74,-82,100,-70,-88,-69,-85,-74,-50,-68,-66,-76,-18,-66,-81,-74,-77;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-42,-99,-110,-103,-74,-110,-97,14,-102,34,34,-105,-106,-41,-101,-99,-88,-10,-100,-35; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-95,-112,-92,-80,-104,-105,-80,-111,-52,-103,-92,-85,-104,-68,88,-89,-94,-104,-104,-91; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-58,18,-112,-106,-41,-112,-106,-4,-104,18,-67,-106,-109,-103,-105,-97,-84,42,-107,-86; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-75,-65,-74,-82,100,-71,-88,-69,-84,-74,-51,-68,-66,-76,-48,-67,-80,-74,-77;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,5,-76,-76,70,-77,-48,-52,-70,-18,4,-73,-83,-68,-67,-67,-64,-25,-36,109;
MA   /M: SY='I'; M=40,-17,-76,-73,-58,18,-76,52,-71,8,-13,-68,-73,-69,-75,-58,-7,43,-77,-63;
MA   /M: SY='A'; M=46,6,-75,-71,7,-46,-72,42,-70,29,-45,-68,-73,-68,-73,-4,2,19,-73,-25;
MA   /M: SY='G'; M=61,32,-66,-66,-76,62,-69,-72,-65,-52,0,-55,-68,-62,-71,17,-7,-63,-77,-72;
MA   /M: SY='S'; M=-26,-70,6,-32,-75,-57,61,-47,-2,-75,-66,51,10,16,-32,66,11,-70,-86,-63;
MA   /M: SY='P'; M=20,-75,-54,44,-76,-28,-61,-71,21,-40,-66,-30,69,-6,-17,28,-17,-45,-77,-30;
MA   /M: SY='E'; M=26,-74,-3,49,-75,-29,-17,-28,22,-28,-63,24,25,24,-16,-21,-18,-29,0,-67;
MA   /M: SY='I'; M=-30,-70,-84,-78,1,-84,-75,57,-76,56,21,-78,-79,-73,-76,-71,-35,39,-73,-54;
MA   /M: SY='I'; M=19,5,-80,-75,-54,-79,-80,83,-28,-29,7,-72,-74,-70,-24,-65,-56,42,-77,-60;
MA   /M: SY='D'; M=1,-77,90,37,-83,-2,-56,-50,12,-78,-74,-7,-65,6,-56,-34,-19,-74,-88,-70;
MA   /M: SY='W'; M=27,6,-74,-68,25,-70,30,-60,-24,-58,28,-68,-75,-63,-19,-60,16,-27,110,73;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-70,-85,-79,35,-86,-74,45,-78,63,-34,-80,-81,-75,-77,-74,-60,40,-69,-49;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-79,-68,-57,-64,-79,-59,21,6,7,-53,-61,-75,-48,96,-63,-19,-24,30,-59;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00518;
//
ID   AA_TRANSFER_CLASS_3_MP; MATRIX.
AC   MP00600;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminotransferases class-III pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9640055; R2=0.0140512; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=618; N_SCORE=13.638; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-24,-33,-26,53,-27,-11,-4,-22,2,-3,-21,-29,-28,-16,-21,-12,-7,29,39,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-21,-27,-20,16,-28,-16,14,-26,31,13,-19,-28,-20,-18,-24,-9,6,-14,5,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-26,-2,14,-26,-18,-4,-20,13,-18,-9,-4,-8,15,13,-3,-7,-16,-24,-13,14;
MA   /M: SY='A'; M=6,-3,-23,-4,2,-24,5,-10,-26,3,-21,-14,-1,-12,-1,-1,2,-6,-18,-23,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-18,-29,-22,3,-27,-22,21,-25,30,16,-25,-26,-20,-20,-20,-7,18,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-27,-8,3,-17,-18,0,-19,13,-15,-7,0,-17,10,26,-6,-8,-17,-19,-6,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-27,18,23,-29,-15,-4,-28,12,-22,-17,4,-8,10,6,0,-7,-23,-28,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-23,-32,-23,6,-32,-23,26,-26,27,15,-23,-24,-20,-21,-21,-7,17,-18,0,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-16,63,-24,-23,-15,-24,-26,-17,-23,-12,-13,-15,-29,-23,-23,-2,4,-2,-40,-22,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-27,4,6,-25,-18,10,-26,16,-20,-9,3,-14,9,20,-5,-7,-20,-25,-7,6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-26,8,19,-28,-15,-4,-26,19,-23,-14,5,-10,11,14,-1,-7,-21,-26,-15,14;
MA   /M: SY='H'; M=-13,3,-25,-2,-2,-11,-17,36,-20,-3,-17,-6,12,-20,3,3,-5,-9,-21,-22,9,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,13,-29,16,-3,-31,33,-8,-36,-10,-29,-21,13,-17,-8,-13,1,-14,-29,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='V'; M=11,-19,-11,-25,-20,-8,-16,-23,9,-18,0,3,-16,-20,-17,-20,-2,0,15,-23,-11,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-28,-20,7,-28,-17,17,-24,34,16,-26,-27,-19,-18,-23,-8,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-15,-31,-23,20,-29,-19,14,-27,29,15,-25,-29,-23,-19,-22,-8,10,-16,5,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-26,-37,-29,0,-37,-27,43,-27,19,19,-22,-22,-21,-27,-19,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-17,-28,-22,12,-25,-16,12,-20,11,8,-22,-25,-20,-19,-13,-6,14,-11,9,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-10,-26,-13,2,-24,-23,-2,0,-2,-5,11,-9,-15,30,-2,-6,-9,-8,-21,-7,15;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,8,-14,-13,-13,-18,-20,-12,-13,-12,-10,-4,-15,-12,-14,15,31,-1,-32,-14,-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,2,-34,-27,33,-25,-21,2,-27,10,3,-21,-30,-30,-21,-18,-10,4,-11,9,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-27,-11,-13,-25,35,-13,-34,-4,-25,-16,-1,-20,-10,8,-3,-15,-25,-20,-21,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-20,-18,-10,-5,-22,-9,-12,6,-6,-4,-9,-22,-5,28,-9,-6,-4,-20,-6,-10;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-12,-10,-8,-13,-13,-14,-11,-10,-13,-9,0,-11,-7,-10,19,30,-3,-30,-12,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-21,-7,-14,-21,49,-14,-28,-14,-21,-14,0,-14,-14,-14,0,-14,-21,-14,-21,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-23,-6,-1,-11,-17,-6,-18,10,-16,-8,-2,-14,-1,7,-1,2,-13,-18,0,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-20,-23,-24,-18,11,-9,-13,-5,-19,4,2,-15,-21,-17,-15,-13,-10,-6,-5,2,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-13,-15,-14,-14,1,10,-13,-15,-12,-11,-9,-9,-12,-13,-11,-9,-11,-13,17,-1,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-11,-18,-12,-15,3,-19,-15,-13,-15,-13,-9,-14,-12,-19,8,-2,-7,-11,-15,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-14,-18,-12,10,-24,17,-13,-13,-9,-3,-10,-24,-4,-10,-11,-11,-14,-4,22,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-25,13,21,-30,-4,-2,-27,1,-21,-14,3,-9,13,-5,2,-8,-25,-28,-18,17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-11,-27,-12,-5,-9,-21,15,-9,-9,-6,-2,-8,-14,0,-8,-10,-10,-12,-10,8,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='W'; M=2,-8,-11,-10,-4,0,-9,-4,-6,-7,-3,-4,-9,-10,-6,-8,-6,-5,-6,6,3,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-2,-12,-1,0,0,-11,-3,-6,-4,-1,-3,-4,-10,-4,-5,-5,-5,-6,-9,1,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-18,4,-1,-19,16,-4,-21,-5,-17,-12,3,-7,-4,-6,0,-9,-17,-17,-14,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-20,-32,-26,2,-29,-26,29,-25,19,13,-25,-25,-23,-23,-17,-6,27,-19,-3,-26;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-22,-4,2,-17,-17,-3,-11,1,-12,-6,-6,0,1,-1,-3,-3,-9,-22,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-36,-11,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-19,76,-11,-20,-8,-9,-25,-29,-29,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,69,20,-40,-10,2,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-19,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-20,-34,-26,7,-32,-23,30,-26,26,21,-24,-25,-20,-23,-21,-9,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-17,-29,-24,6,-29,-21,21,-20,13,14,-21,-24,-21,-18,-11,3,25,-21,0,-23;
MA   /M: SY='T'; M=7,-8,6,-17,-15,-12,-19,-22,-7,-15,-8,-8,-7,-16,-14,-16,10,26,3,-30,-14,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-19,-31,-23,29,-26,-17,10,-23,19,13,-21,-27,-23,-17,-17,-6,9,-9,10,-22;
MA   /M: SY='G'; M=18,-7,-18,-10,-11,-24,29,-17,-25,-14,-24,-17,0,-14,-11,-17,14,-3,-15,-26,-24,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-22,-17,-13,-18,-3,-20,-4,-8,-12,-5,-9,-12,-11,-13,0,-5,0,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-32,-24,7,-31,-22,27,-25,28,21,-24,-25,-19,-21,-20,-6,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-23,-9,-11,-25,31,-14,-27,-13,-23,-13,0,-16,-6,-14,8,-5,-20,-24,-23,-8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-21,-6,-15,-25,40,-16,-30,-15,-26,-18,7,-19,-15,-16,5,-8,-22,-26,-25,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-24,-11,-18,-21,49,-16,-31,-18,-24,-16,-2,-19,-18,-18,-1,-16,-24,-16,-19,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-30,-22,26,-28,-16,14,-25,27,14,-23,-27,-22,-18,-22,-9,7,-9,12,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-35,-11,-2,-21,-19,-18,-17,-10,-25,-17,-18,74,-10,-18,-9,-9,-25,-25,-23,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-14,-32,-24,8,-28,-21,21,-24,18,14,-22,-24,-20,-22,-17,-8,15,-17,1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=15,-7,-19,-10,-11,-24,26,-8,-26,-14,-23,-15,0,-15,-10,-16,11,-5,-17,-26,-21,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=25,-11,-11,-17,-12,-16,-6,-18,-6,-12,-4,-6,-10,-16,-13,-17,1,-4,2,-23,-16,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-14,-25,-19,11,-27,-17,9,-18,6,6,-19,-21,-20,-17,-10,2,13,-17,5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=0,-18,-16,-21,-17,-11,0,-19,-1,-19,4,2,-15,-22,-16,-19,-10,-10,1,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-14,-18,-19,-19,-6,11,-20,-12,-18,-8,-6,-9,-20,-19,-18,0,-1,-4,-20,-13,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-24,-6,-2,-19,-16,-5,-20,13,-20,-10,5,-13,1,23,0,2,-14,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=0,-2,-27,1,7,-26,-12,-11,-20,0,-20,-14,-4,13,0,-4,-2,-5,-19,-27,-20,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-28,22,34,-30,-16,1,-30,12,-24,-19,7,-5,12,2,1,-7,-26,-31,-17,23;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-25,-21,-30,-23,-1,-30,-25,27,-21,15,12,-22,-23,-20,-21,-15,-7,24,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='M'; M=1,-14,-22,-19,-12,-4,-16,-7,2,-11,3,17,-14,-8,-7,-14,-12,-8,-3,-14,0,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-26,21,18,-22,-11,-1,-26,3,-22,-18,7,-11,4,-4,0,-7,-23,-25,-9,11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00519;
//
ID   IRF_MP; MATRIX.
AC   MP00601;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tryptophan pentad repeat (IRF family) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5726538; R2=0.0128979; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1678; N_SCORE=26.205; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=150; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-21,9,-31,-21,23,-29,45,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-19,-23,-11,-3,-30,-22,20,-19,16,9,-23,-23,-17,-18,-15,-6,23,-26,-8,-15;
MA   /M: SY='E'; M=5,3,-21,2,9,-23,3,-7,-20,-5,-18,-9,4,-11,0,-10,7,-4,-17,-28,-19,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-28,1,24,-37,-18,6,-21,8,-19,-4,-1,-8,48,6,1,-9,-27,-22,-12,36;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-8,29,-22,30,14,-27,-6,1,-27,-1,-29,-23,28,-12,3,-5,13,1,-25,-39,-20,8;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-12,-3,-1,-18,-4,-10,-16,-11,-21,-15,5,-12,1,-10,30,15,-9,-37,-17,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-12,-6,-16,-27,43,-15,-34,-17,-29,-20,9,-21,-16,-17,3,-13,-27,-28,-28,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-8,-15,-10,3,-24,-22,6,-13,-2,-6,4,-7,-17,26,0,-7,-7,-17,-24,-7,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-27,-28,-23,28,-32,-1,12,-19,13,7,-22,-28,-17,-17,-22,-10,2,10,46,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-36,0,19,-29,-20,-12,-24,0,-26,-19,-12,52,1,-6,-7,-10,-29,-29,-25,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='C'; M=2,-13,8,-19,-9,-21,-22,-15,-6,-10,-11,-4,-10,-19,3,-12,-3,-6,-4,-28,-15,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-23,-13,-9,-5,-28,-19,14,-20,19,7,-18,-22,-14,-18,-18,-8,10,-25,-6,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-15,41,-25,39,8,-28,-5,12,-29,-1,-29,-23,40,-16,1,-4,5,-5,-30,-39,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-28,5,20,-28,-9,-9,-28,13,-23,-16,-2,0,6,6,-2,-7,-23,-26,-18,12;
MA   /M: SY='E'; M=8,10,-22,15,20,-28,-5,-8,-26,-2,-21,-19,2,-7,3,-10,7,-4,-19,-30,-21,12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-29,-2,9,-25,-19,0,-29,33,-25,-11,1,-13,10,38,-6,-8,-20,-23,-10,7;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-18,-9,-5,-15,-18,-13,-14,7,-14,-3,-2,-12,-2,6,7,22,-6,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-23,-14,-28,-20,-5,-29,-16,15,-11,10,17,-17,-23,-11,-1,-17,-9,11,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-23,-9,3,-22,-21,2,-26,20,-19,-7,-2,-19,19,46,-8,-10,-21,-19,-6,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-3,7,-27,-20,-8,-27,44,-26,-6,-1,-12,9,31,-11,-10,-18,-20,-9,8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-16,-18,-14,-6,7,-17,-14,-14,-12,-11,-4,-16,-16,-18,4,-5,-7,-17,-14,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-12,-18,-17,-15,-17,15,-20,-15,-17,-7,-8,-8,-17,-15,-18,2,0,-8,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-29,-8,2,-21,-21,-4,-27,32,-18,-8,-2,-18,8,52,-11,-10,-18,-20,-9,2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-1,-30,-1,10,-30,-20,37,-26,11,-22,-2,3,-14,30,15,-6,-13,-28,-23,0,18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-29,43,7,-36,13,-6,-39,-6,-30,-27,14,-13,-6,-13,3,-11,-29,-34,-23,1;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-26,-27,-27,-19,9,-22,-18,-3,-19,0,-5,-24,-6,-19,-19,-18,-11,-6,17,9,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-24,18,9,-29,-12,0,-26,4,-25,-16,14,-12,14,6,9,2,-23,-32,-15,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-26,-2,17,-24,-20,3,-12,2,-12,0,-4,-11,21,1,-2,-7,-15,-26,-11,18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,18,-25,25,32,-29,-12,-3,-28,3,-22,-21,8,-6,8,-6,5,-5,-24,-32,-20,20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-16,-1,7,-17,-4,-4,-14,8,-13,-5,-2,-7,8,3,-2,-6,-11,-14,-9,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,67,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-13,-17,-13,-2,-7,-16,-7,-12,-8,-8,-1,-17,-15,-17,3,-2,-1,-19,-11,-13;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-5,-10,-3,-23,-2,-15,-23,-7,-19,-14,-5,-9,-3,-8,5,2,-15,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-38,-28,7,-37,-27,41,-30,26,19,-22,-23,-21,-27,-22,-10,24,-18,2,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,10,-30,-20,-5,-28,40,-27,-8,0,-12,18,34,-8,-10,-22,-20,-10,13;
MA   /M: SY='A'; M=42,-6,-11,-15,-8,-20,0,-17,-12,-9,-14,-12,-3,-11,-8,-18,13,2,-3,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-23,-19,-7,-9,-29,-20,13,-6,5,5,-17,-19,-11,-10,-13,-7,14,-25,-8,-10;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-19,-15,-1,3,-14,5,-15,-12,-9,-7,-7,-15,-9,-13,-3,-8,-10,-16,-1,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-18,-6,-2,-18,-16,-12,-20,11,-20,-12,2,-12,0,13,12,20,-10,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-14,-30,63,-18,-39,-18,-29,-20,0,-18,-17,-18,0,-19,-30,-21,-29,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-5,-27,-7,3,-25,-17,-8,-27,33,-23,-10,-2,-14,7,36,-7,-8,-17,-20,-12,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-32,-23,-20,25,-27,19,-7,-14,-5,-3,-19,-29,-12,-11,-22,-15,-15,39,58,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-26,-4,7,-25,-21,-11,-20,15,-21,-10,-5,5,8,8,-2,3,-16,-25,-14,7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-3,-32,5,18,-29,-11,-12,-23,-4,-23,-19,-8,30,-1,-13,-4,-10,-24,-29,-24,6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-26,-6,-15,-28,53,-16,-35,-17,-30,-20,7,-18,-15,-17,7,-12,-27,-25,-28,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-9,-16,-9,-3,-14,-9,-14,-5,-1,-9,-5,-8,-13,-6,-3,-1,-3,3,-21,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-28,43,17,-33,-14,-4,-31,7,-25,-22,10,-12,1,1,-3,-9,-22,-34,-17,9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-28,15,13,-28,-11,-8,-25,14,-23,-15,7,-11,3,4,-3,-7,-20,-28,-15,8;
MA   /M: SY='P'; M=2,-17,-31,-13,-8,-25,2,-20,-19,-14,-20,-15,-15,40,-13,-20,-6,-10,-22,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,25,-29,36,11,-34,-1,2,-34,-4,-27,-23,9,-3,-2,-12,-1,-11,-27,-33,-19,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00522;
//
ID   ALDOLASE_CLASS_II_1_MP; MATRIX.
AC   MP00602;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fructose-bisphosphate aldolase class-II signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5878005; R2=0.0157194; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=256; N_SCORE=9.602; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=59; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-12,-18,-7,-21,-3,-17,-10,-9,-9,-8,-10,-11,-4,-17,8,-1,-3,-20,-18,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=10,-2,-20,-3,0,-11,-11,-11,-14,-7,-13,-12,-4,-13,-6,-11,4,-1,-9,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-10,-24,-13,-10,-13,-24,-11,7,-7,-5,0,-6,-12,-9,-11,-8,-6,6,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=8,-14,-15,-22,-16,1,-15,-14,4,-14,-1,8,-10,-18,-12,-15,0,2,6,-20,-4,-14;
MA   /M: SY='L'; M=8,-20,-12,-24,-18,-6,-9,-21,2,-22,14,3,-19,-23,-18,-20,-11,-5,5,-22,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-17,-19,-10,-15,-12,-15,-7,-4,-5,-4,-11,-16,-5,1,0,-3,0,-22,-14,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-3,1,-25,0,7,-24,-8,22,-25,2,-22,-10,6,-9,6,-1,1,-9,-23,-28,-8,5;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-23,-23,-13,10,-25,4,6,-17,17,19,-18,-23,-9,-13,-19,-11,-1,-13,12,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-17,-32,-27,-2,-30,-27,31,-22,11,14,-23,-24,-22,-22,-11,-2,35,-25,-7,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-26,-6,4,-15,-19,19,-17,1,-10,-4,-3,-16,3,4,-7,-9,-16,-22,2,1;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-17,-15,-10,-15,-4,-15,-6,-13,-7,-7,-5,-15,-9,-16,5,1,-3,-23,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-20,-28,-19,-2,-23,-18,17,-21,23,19,-22,-17,-14,-20,-17,-8,10,-21,-6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-14,-2,-20,-12,-16,-14,-16,-3,-11,-6,-3,-13,-17,-12,-17,0,-4,5,-26,-15,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-27,10,32,-28,-17,-6,-25,10,-22,-17,-2,4,10,-1,0,-7,-22,-29,-19,21;
MA   /M: M=-1,-6,-21,-8,-2,-11,-17,0,-11,-2,-10,-3,-4,-15,0,-4,0,-1,-9,-21,-1,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-16,-14,-12,11,-13,6,2,-9,5,8,-11,-16,-7,-7,-12,-7,-3,4,25,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-17,-6,-3,-14,-4,-10,-10,-5,-14,-7,-6,21,-5,-9,0,-3,-10,-18,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-15,-11,-10,17,-15,8,0,-6,0,0,-10,-15,-6,-5,-10,-5,-5,14,38,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-27,9,3,-27,5,9,-29,-6,-24,-16,8,-7,-1,-8,1,-5,-26,-29,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-34,-28,-1,-34,-22,37,-24,14,18,-22,-24,-21,-24,-16,-7,34,-24,-3,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,0,-28,-18,-17,-20,-9,-29,-20,-12,77,-9,-18,-7,-7,-29,-31,-28,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,31,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='A'; M=18,-19,5,-26,-21,-11,-19,-26,7,-18,-2,-2,-18,-21,-20,-22,-2,-1,18,-27,-16,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,6,-30,-19,26,-26,38,27,-26,-26,-16,-20,-26,-10,14,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-11,-19,-14,-5,-11,-22,-12,-3,-12,7,2,-10,-17,5,-9,-1,12,-5,-25,-7,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-23,-7,-8,-28,24,-4,-35,5,-28,-14,0,-18,-7,0,-5,-16,-26,-22,-18,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,16,-23,14,11,-25,-12,3,-25,8,-25,-17,17,-11,4,2,7,3,-21,-33,-14,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-16,-7,-5,-10,-12,-8,-8,-3,-7,-4,2,-15,-4,-4,5,4,-6,-24,-7,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-24,-25,-15,16,-27,-15,6,-22,19,5,-24,-12,-19,-18,-21,-9,0,-12,7,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-20,24,16,-25,-7,-5,-23,-1,-18,-17,4,-3,1,-8,2,-6,-18,-25,-16,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,0,-25,4,-1,-23,-11,-14,-17,-7,-20,-15,-2,12,-7,-11,3,3,-14,-31,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-24,33,-30,-26,-4,-25,-22,-13,-22,-12,-12,-23,-30,-21,-23,-17,-13,-9,13,3,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-23,-24,-14,-3,-26,-14,11,-10,10,11,-17,-22,-7,-5,-15,-8,8,-19,-1,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-25,13,9,-27,-14,-5,-25,8,-21,-15,4,-13,7,12,2,-1,-17,-29,-15,7;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-8,-13,-7,-26,5,-17,-23,-7,-22,-15,-7,-2,-7,-13,3,-7,-16,-26,-23,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-35,-26,3,-34,-25,36,-27,28,22,-25,-25,-20,-24,-22,-9,25,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-27,-8,2,-12,-24,1,-11,1,0,0,-8,-18,5,10,-13,-11,-12,-22,-4,2;
MA   /M: SY='A'; M=11,1,-18,-1,7,-21,-10,1,-16,-6,-15,-11,1,-12,-1,-10,6,-3,-11,-29,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-26,-10,-14,-26,47,-18,-31,-16,-24,-17,-1,-18,-16,-18,1,-15,-22,-21,-25,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-19,-36,-28,57,-30,-18,6,-26,12,3,-22,-30,-34,-19,-19,-8,8,3,26,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-16,-4,-1,-19,-15,-14,-19,9,-21,-12,2,-10,-1,3,15,24,-9,-29,-12,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00523;
//
ID   TK_CELLULAR_TYPE_MP; MATRIX.
AC   MP00603;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thymidine kinase cellular-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0851064; R2=0.0167267; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=147; N_SCORE=8.534; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='B'; M=-6,5,-16,3,-6,-17,-14,-12,-8,-12,-13,-8,5,-15,-7,-14,4,2,-7,-31,-13,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-14,10,-25,8,1,-3,-16,7,-21,-5,-16,-12,10,-18,-3,-1,-3,-6,-20,-22,-1,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-22,-6,-13,-23,32,-16,-28,-14,-24,-17,4,-17,-13,-15,9,1,-20,-26,-23,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-25,-5,5,-21,-20,-7,-14,15,-14,-4,-2,-14,9,9,-7,-7,-11,-23,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-29,-11,-3,-22,-18,-11,-18,5,-20,-12,-9,20,-4,12,-6,-7,-15,-25,-18,-7;
MA   /M: SY='V'; M=7,-19,-18,-24,-16,-8,-22,-21,11,-10,5,5,-17,-19,-14,-14,-8,-2,14,-22,-8,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=0,1,-12,-2,-5,-9,-3,-5,-9,-6,-9,-7,3,-9,-6,-7,3,2,-6,-18,-8,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-6,-26,-8,-6,-6,-15,0,-15,-1,-12,-9,-4,-17,-4,3,-8,-6,-15,-4,10,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-27,27,24,-29,-8,2,-30,3,-25,-20,15,-9,7,-3,2,-7,-27,-33,-18,15;
MA   /M: SY='G'; M=-7,9,-24,13,4,-30,16,-11,-34,-1,-27,-20,6,-13,-4,-7,3,-8,-25,-28,-22,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-29,9,21,-28,-12,-8,-24,1,-22,-17,-1,12,5,-6,-1,-7,-24,-29,-21,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-13,-25,-15,-2,-19,-26,-8,3,-5,-1,5,-11,-17,17,-2,-8,-6,-3,-22,-7,6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-22,-26,-17,-5,-32,-25,28,-18,9,10,-19,-20,-17,-20,-12,-3,26,-25,-7,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-20,-12,-3,-10,-24,-13,3,-13,14,6,-16,-20,-2,-11,-15,-9,0,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-23,-36,-29,0,-35,-29,40,-26,18,16,-23,-23,-23,-26,-17,-7,34,-23,-4,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-18,-31,66,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-23,-3,-13,-27,44,-17,-33,-15,-25,-18,1,-17,-15,-18,2,-13,-23,-22,-26,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-20,4,1,-21,-9,2,-18,2,-22,-13,21,-15,4,-1,8,1,-18,-30,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-14,26,-30,40,44,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='R'; M=1,-8,-19,-10,-3,-16,-15,-11,-14,6,-13,-7,-3,-15,-2,8,5,4,-7,-26,-12,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-10,-23,-9,8,-14,-25,-7,0,-6,-4,-1,-11,-15,1,-9,-6,-5,1,-24,-6,4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-18,-10,-4,-22,-7,-17,-15,-10,-22,-16,-6,15,-7,-16,15,7,-10,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-21,-12,-22,-17,-7,-26,-17,2,-2,1,2,-17,-26,-13,12,-12,-4,14,-25,-9,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-9,0,-20,-19,0,-30,29,-21,-10,2,-20,10,66,-9,-10,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-5,0,-18,-18,6,-18,13,-15,-6,2,-17,5,14,-8,-9,-15,-22,-5,1;
MA   /M: SY='C'; M=-15,-9,40,-14,-14,-20,-25,40,-30,-19,-20,-9,-4,-29,-9,-14,-10,-15,-21,-39,-3,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-22,-18,25,-26,26,-9,-17,-2,-1,-14,-27,-13,-11,-20,-15,-14,18,43,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-24,-8,-1,-7,-20,-10,-11,5,-11,-5,-1,-16,-1,3,-6,-6,-9,-21,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-24,-2,5,-14,-20,-8,-8,-5,-9,-7,-3,-8,-3,-8,-5,-5,-7,-28,-11,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-26,-7,3,-21,-11,-12,-17,-3,-16,-12,-7,17,-4,-8,-3,-5,-17,-26,-18,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-9,-7,-22,-10,-6,-11,-15,-10,-9,-2,-10,-2,-4,-6,-5,-1,-6,-2,-9,-23,-9,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-28,-6,-3,-21,-1,-13,-18,4,-19,-11,0,-11,-5,2,-5,-8,-15,-20,-14,-5;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-26,-1,6,-24,-16,-9,-18,9,-17,-9,-4,0,7,4,-3,-3,-15,-24,-14,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: M=-4,-9,-22,-11,-5,-14,-17,-7,-6,-4,-8,-3,-6,-13,0,-3,-4,-5,-5,-23,-8,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-20,-11,-7,-14,-16,-14,-8,-6,-8,-6,-6,-7,-8,-7,-2,5,-6,-22,-11,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-4,-19,-6,2,-16,-17,-9,-10,-2,-8,-5,-3,-11,4,-2,-2,-2,-9,-24,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-21,2,3,-19,-8,-9,-15,-6,-16,-10,-2,0,-2,-10,3,-1,-12,-26,-14,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-23,-1,3,-16,-14,-9,-15,1,-12,-10,-1,-11,-1,3,-2,-1,-13,-16,-10,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-26,-2,3,-18,-19,-7,-16,7,-18,-9,0,3,-2,-1,-4,-2,-15,-26,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-3,-6,-23,-9,-6,-15,-17,-7,-4,-3,-7,-3,-1,-12,-5,-6,-6,-6,-4,-25,-9,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-25,-6,2,-9,-16,-12,-16,5,-11,-8,-3,-8,-5,0,-6,-4,-14,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-12,-30,-10,0,15,-27,15,-8,-5,-5,-5,-15,-22,-2,-7,-15,-10,-15,15,54,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00524;
//
ID   SYNAPTOP_MP; MATRIX.
AC   MP00604;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Synaptophysin / synaptoporin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2479563; R2=0.0125624; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1592; N_SCORE=24.237; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-17,-3,-7,-23,23,-13,-27,-13,-30,-20,7,-13,-7,-13,27,7,-17,-33,-23,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,12,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,25,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-30,10,34,-30,10,-7,-33,0,-23,-20,0,-7,7,-7,0,-13,-30,-27,-23,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,7,-27,-20,4,-26,23,-20,-6,0,-16,28,48,-6,-10,-24,-20,-10,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,42,-30,-20,-4,-30,25,-24,-16,0,-4,16,11,-4,-10,-26,-26,-16,29;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,53,13,-33,-7,3,-33,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=3,15,-14,7,0,-20,0,-3,-20,-6,-30,-20,28,-14,0,-6,29,13,-17,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,37,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=10,3,-23,7,37,-27,-13,-7,-23,3,-17,-17,-3,-3,10,-7,3,-7,-20,-27,-20,23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=10,3,-23,7,37,-27,-13,-7,-23,3,-17,-17,-3,-3,10,-7,3,-7,-20,-27,-20,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00525;
//
ID   ATPASE_C_MP; MATRIX.
AC   MP00605;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP synthase c subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8593974; R2=0.0159568; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=427; N_SCORE=12.663; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=18,-9,-21,-13,-15,-26,39,-19,-28,-16,-23,-17,-3,-16,-15,-19,7,-9,-18,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-23,-34,-27,2,-34,-26,36,-26,22,17,-24,-24,-21,-25,-18,-7,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-12,-19,-28,60,-19,-35,-19,-26,-16,-2,-19,-18,-20,0,-18,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-12,-24,-16,-7,-8,-26,-14,10,-12,-1,5,-10,-19,-1,-12,-9,-7,6,-19,-6,-5;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-26,-11,-18,-28,56,-20,-34,-18,-27,-18,-1,-18,-18,-20,3,-15,-24,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-14,-23,-22,-19,2,-27,-12,17,-19,10,9,-6,-22,-13,-17,-12,-3,8,-20,2,-18;
MA   /M: SY='I'; M=6,-25,-18,-30,-22,-2,-25,-25,23,-23,18,10,-22,-23,-20,-22,-12,-5,22,-23,-7,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-20,-19,-27,-23,19,-7,-20,-4,-21,-2,-1,-15,-23,-24,-18,-7,-3,2,-8,1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=13,-2,-19,-7,-9,-24,23,-14,-25,-9,-25,-17,6,-15,-9,-12,13,-3,-17,-27,-23,-9;
MA   /M: SY='K'; M=4,1,-19,-4,-2,-24,0,-9,-23,8,-23,-13,6,-14,1,2,5,-4,-17,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-14,-25,-18,8,-20,-19,3,-21,15,3,-18,-22,-19,-18,-10,3,3,-17,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-21,-30,-24,4,-30,-24,27,-24,18,12,-20,-24,-20,-22,-15,-5,23,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-25,5,25,-24,-17,-1,-19,5,-16,-11,2,-8,12,-1,2,-3,-19,-28,-14,18;
MA   /M: SY='G'; M=15,-7,-20,-10,-13,-25,34,-18,-27,-15,-24,-17,0,-15,-13,-17,12,-4,-17,-25,-25,-13;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-16,-28,-24,-2,-26,-24,22,-20,8,9,-20,-22,-20,-21,-7,1,27,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-11,-16,-9,-20,2,-18,-13,-11,-14,-12,-6,-11,-9,-18,15,6,-3,-24,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,18,-25,9,11,-31,-11,10,-20,5,-25,-9,28,-15,32,5,5,-5,-30,-29,-15,22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,14,-25,21,33,-29,-10,-3,-28,2,-24,-21,7,-6,9,-5,9,-4,-24,-33,-20,21;
MA   /M: SY='L'; M=9,-20,-17,-24,-15,-4,-18,-17,10,-18,17,13,-20,-20,-13,-18,-11,-5,9,-22,-8,-14;
MA   /M: SY='K'; M=3,-7,-23,-9,2,-20,-12,-10,-15,6,-13,-7,-6,-14,3,5,-2,-5,-11,-21,-11,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-29,0,1,-29,14,-13,-30,-4,-29,-19,-1,10,-4,-10,3,-8,-26,-28,-24,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-24,-3,6,-22,-19,-4,-16,10,-13,-4,-1,-13,13,8,-1,2,-15,-25,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,8,-32,-23,26,-29,37,18,-27,-27,-21,-22,-24,-8,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-16,-25,-19,-6,10,-24,-7,-10,-3,-2,1,-10,-21,3,12,-12,-9,-12,-11,4,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-17,-8,-8,-17,-4,-15,-15,-8,-16,-12,0,-8,-8,-7,12,16,-8,-30,-16,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-22,-17,-12,1,-19,-7,-3,-10,3,4,-10,-17,-7,-9,-8,3,-6,-13,8,-10;
MA   /M: SY='M'; M=3,-18,-19,-26,-17,2,-16,-12,6,-14,8,21,-16,-19,-9,-15,-10,-3,3,-14,-3,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-38,-28,35,-33,-24,22,-30,20,11,-23,-26,-28,-24,-22,-10,13,-4,13,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,3,-32,-22,33,-26,28,24,-25,-25,-18,-22,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-25,-13,-19,-21,43,-21,-26,-19,-22,-15,-4,-20,-19,-19,2,-11,-16,-22,-24,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-24,-17,-30,-22,21,-23,-19,10,-21,11,9,-20,-24,-22,-18,-11,-5,12,-14,3,-20;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-16,-17,-12,-23,16,-20,-18,-12,-16,-13,-8,-8,-12,-20,7,-5,-8,-20,-23,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-34,-24,28,-30,-21,17,-29,34,15,-26,-29,-25,-20,-25,-10,11,-12,8,-24;
MA   /M: SY='V'; M=8,-18,-11,-23,-18,-8,-19,-21,11,-17,3,6,-15,-19,-15,-18,0,4,16,-27,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='A'; M=34,-9,-12,-16,-10,-19,4,-19,-13,-11,-14,-12,-6,-12,-10,-18,13,4,-3,-24,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-18,-25,-19,2,-26,-21,15,-20,10,9,-16,-20,-16,-18,-6,8,15,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,-23,-16,-13,-11,3,-19,-15,-15,-16,-12,-11,7,-16,-18,0,-3,-11,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-34,-25,16,-31,-21,26,-27,28,21,-23,-25,-20,-22,-22,-9,15,-16,4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-25,-33,-26,29,-33,-12,20,-23,12,10,-21,-27,-22,-20,-19,-9,12,0,28,-26;
MA   /M: SY='A'; M=16,-6,-6,-12,-12,-21,10,-18,-19,-14,-17,-14,-2,-16,-13,-18,8,1,-10,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-23,13,-31,-22,21,-28,36,16,-28,-27,-23,-21,-25,-8,16,-19,0,-23;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-16,-28,-25,1,-16,-21,16,-19,9,15,-22,-25,-21,-19,-11,-6,23,-22,-7,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-35,-27,17,-31,-23,27,-25,17,18,-22,-25,-23,-22,-17,-7,22,-16,4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-14,-13,-9,-21,9,-17,-16,-12,-17,-12,-4,-9,-9,-17,14,3,-8,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-20,-35,-26,40,-29,-20,13,-28,23,11,-23,-28,-28,-20,-21,-9,8,-6,13,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-23,-32,-23,7,-30,-19,24,-25,26,17,-24,-25,-18,-21,-22,-9,15,-12,5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-19,-33,-24,14,-30,-21,22,-26,26,15,-24,-26,-22,-22,-21,-8,16,-16,5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-23,-27,-19,1,-24,-19,16,-19,22,13,-21,-24,-15,-16,-19,-8,10,-19,0,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00526;
//
ID   B_KETOACYL_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP00606;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-ketoacyl synthases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9534535; R2=0.0169860; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=10.886; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-26,-12,-6,-19,-18,-10,-10,-5,-16,-8,-8,16,-4,-5,-3,-2,-10,-26,-14,-8;
MA   /M: SY='N'; M=6,15,-11,6,-3,-21,0,-5,-20,-7,-26,-19,25,-15,-3,-8,20,8,-17,-37,-20,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-15,-17,-21,-17,-3,-13,-13,4,-14,0,12,-12,-19,-11,-14,0,6,7,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='M'; M=11,-19,-17,-27,-18,-4,-16,-18,11,-18,12,13,-18,-19,-14,-19,-8,-3,11,-21,-8,-17;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-10,-11,-6,-21,-5,-16,-15,-11,-20,-15,-3,2,-7,-16,17,7,-8,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=20,-4,-15,-11,-12,-23,23,-16,-23,-12,-21,-15,3,-16,-12,-15,6,-7,-15,-24,-24,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-17,-8,3,-18,-19,0,-23,3,-16,-11,-2,-20,6,14,-10,-11,-22,-5,-7,3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-32,-27,2,-33,-27,32,-25,23,15,-26,-26,-24,-23,-17,-4,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='S'; M=20,3,-12,-4,-4,-20,-1,-10,-16,-8,-23,-16,11,-12,-4,-12,25,11,-10,-33,-20,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-23,-29,-27,-19,8,-28,-9,9,-18,7,7,-20,-23,-11,-16,-19,-8,0,14,21,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-11,-21,-15,-11,7,-21,-9,-5,-12,4,0,-10,-18,-13,-9,-10,-3,-5,-16,3,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-26,-20,-30,-22,28,-27,-14,8,-24,22,8,-22,-27,-23,-17,-20,-9,5,-6,16,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-27,11,-1,-30,26,-11,-35,-2,-30,-20,8,-15,-7,-7,3,-11,-26,-27,-23,-4;
MA   /M: SY='L'; M=7,-23,-18,-27,-18,6,-20,-21,8,-22,17,5,-20,-22,-18,-20,-12,-6,6,-12,-3,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-26,-3,11,-21,-18,1,-23,16,-19,-8,-1,-13,11,22,-2,-4,-18,-22,-7,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-37,-12,-3,-26,-21,-21,-14,-11,-24,-16,-21,76,-12,-20,-11,-9,-22,-30,-27,-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-15,-7,-10,-14,-10,-12,-1,-12,-14,-9,10,-17,-9,-13,12,6,1,-33,-16,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-23,-18,-14,-2,-19,-3,0,-8,-2,4,-9,-21,-10,-8,-9,-3,0,-16,6,-13;
MA   /M: SY='T'; M=11,-9,-7,-14,-12,-14,-8,-18,-8,-13,-11,-7,-6,-15,-11,-15,13,16,2,-30,-16,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-19,-28,-23,-3,-29,-26,21,-20,9,8,-24,-11,-22,-21,-12,-1,26,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-1,8,-16,13,-2,-21,-12,-13,-14,-9,-19,-15,3,-14,-8,-12,14,9,-2,-36,-17,-5;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-13,-7,-9,-16,-3,-18,-16,-11,-16,-13,1,-11,-9,-12,19,30,-6,-30,-15,-9;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-8,-19,-12,-22,10,-20,-16,-12,-14,-12,-9,-13,-12,-20,8,-4,-5,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=25,-4,-10,-11,-7,-18,-5,-17,-13,-10,-17,-13,-1,-10,-7,-14,23,18,-3,-29,-18,-7;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-10,-5,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-21,-16,5,-10,-4,-11,31,30,-6,-35,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=14,-6,-19,-8,-10,-24,30,-16,-27,-14,-26,-18,2,-14,-10,-16,17,-1,-17,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='L'; M=0,-17,-18,-21,-17,-2,-20,-18,11,-21,20,7,-13,-24,-17,-18,-13,-4,8,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,3,-23,5,2,-17,-19,19,-12,-8,-11,-4,2,-18,-3,-8,-6,-9,-7,-30,-3,-2;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,3,-14,-11,-20,1,-18,-16,-13,-18,-14,-3,-15,-11,-18,14,2,-5,-30,-22,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-28,4,-34,-27,36,-26,21,17,-25,-25,-23,-24,-18,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-27,4,-5,-26,20,13,-32,-11,-24,-14,7,-17,-4,-11,-1,-13,-26,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-23,-1,-4,-12,-17,9,-8,-10,-5,-1,2,-18,-2,-9,-5,-6,-11,-24,0,-5;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-13,-18,-11,-21,9,-20,-14,-11,-13,-12,-8,-11,-11,-20,10,-2,-4,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,3,-29,-25,11,-26,-19,7,-20,2,2,-21,-27,-24,-20,-9,-3,15,-17,4,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-12,10,-28,14,22,-31,-15,5,-28,11,-23,-14,8,-11,22,14,0,-9,-27,-28,-15,21;
MA   /M: SY='A'; M=8,-15,-17,-19,-11,-6,-14,-13,-1,-16,5,2,-11,-18,-7,-15,-1,0,-1,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-36,-27,2,-36,-28,39,-28,24,18,-23,-23,-21,-26,-20,-7,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-27,-10,1,-21,-18,-2,-21,16,-16,-7,-4,-17,12,32,-7,-8,-16,-16,-9,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-20,-1,2,-10,-16,-2,-16,-5,-7,-9,-2,-18,-2,0,-3,-4,-14,-24,-6,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-9,-18,-30,64,-18,-39,-18,-30,-19,2,-20,-17,-17,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-28,20,16,-28,-15,-2,-28,13,-23,-15,5,-11,10,10,-1,-8,-23,-27,-12,12;
MA   /M: SY='A'; M=22,-11,12,-20,-11,-20,-12,-19,-11,-13,-12,-9,-10,-17,-6,-18,5,0,-3,-28,-19,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-28,37,17,-34,-11,0,-34,7,-27,-22,11,-8,5,3,1,-8,-26,-33,-17,10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-15,-28,-23,-2,-24,-23,21,-20,14,13,-23,-24,-20,-20,-10,-2,26,-25,-8,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00529;
//
ID   PDEASE_II_MP; MATRIX.
AC   MP00607;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   cAMP phosphodiesterases class-II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0262303; R2=0.0146579; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=718; N_SCORE=15.541; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-5,-22,-7,-2,-20,-22,11,-14,4,-15,-3,-3,-15,8,2,-1,5,-8,-26,-4,2;
MA   /M: SY='S'; M=13,-5,-15,-10,-11,-19,12,-18,-20,-13,-19,-15,0,-13,-11,-15,17,15,-10,-27,-19,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-25,-38,-25,-18,10,-24,-2,-11,-11,-11,-8,-25,-27,-3,-11,-25,-18,-21,71,45,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-12,-23,-17,-7,11,-25,-13,6,-19,14,3,-7,-22,-14,-15,-15,-8,-2,-19,0,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-27,-20,10,-25,-21,15,-24,16,7,-19,-24,-20,-20,-9,-2,14,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-15,-9,-27,-10,6,7,-23,-10,-20,13,-14,-9,-6,-16,-4,13,-11,-10,-16,-12,1,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,21,-26,16,13,-33,-11,9,-23,5,-25,-11,24,-14,31,4,4,-6,-30,-30,-15,22;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-26,-2,-3,-22,0,17,-29,4,-25,-13,13,-19,2,19,2,-8,-24,-28,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,23,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-23,-5,1,-21,-17,-4,-14,15,-15,4,5,-13,12,8,-3,1,-14,-24,-9,6;
MA   /M: SY='S'; M=-1,13,-17,11,-1,-22,3,-9,-24,-8,-26,-19,16,-13,-5,-10,19,13,-17,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-33,-25,46,-30,-14,7,-27,23,7,-24,-30,-28,-18,-24,-10,2,2,27,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-14,-6,-8,-18,7,-16,-20,-12,-23,-16,4,-12,-8,-12,25,23,-10,-32,-18,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,13,-13,-9,-22,-10,-18,-19,-14,-23,-17,-6,0,-11,-18,13,4,-11,-35,-24,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,-11,3,-14,-14,-11,3,-10,-20,-15,-20,-15,-6,-21,-12,-17,7,-2,-13,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-16,-28,-20,2,-24,-22,15,-24,31,12,-26,-26,-20,-20,-18,-6,14,-22,-6,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-4,14,-18,3,-9,-17,4,-5,-13,-8,-22,-14,27,-21,-9,-8,8,0,-12,-35,-19,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=12,-16,-29,-14,-4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16,53,-10,-20,-3,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-17,-4,4,-14,3,-5,-11,-5,-9,2,-3,-9,1,-7,2,-4,-10,-20,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-6,-18,-7,-12,22,-20,-12,0,-16,1,-3,-7,-16,-18,-14,-11,-7,-1,-7,7,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-3,-20,-6,-11,1,4,5,-12,-8,-11,-7,3,-18,-8,-8,-6,-8,-15,0,19,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-22,-5,7,-14,-17,-10,-10,2,-4,-5,-10,11,-1,-3,-10,-7,-12,-18,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-2,-13,-4,5,-19,-7,0,-9,2,-9,-2,-2,-6,20,0,2,-4,-11,-11,-8,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-15,7,12,-15,-7,0,-15,12,-15,-9,13,-6,5,6,0,-4,-15,-17,-9,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='B'; M=-9,26,-14,25,5,-17,-3,3,-17,0,-18,-14,25,-9,0,-3,3,-3,-18,-24,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-13,14,2,-14,-6,-2,-11,-3,-10,-1,4,-8,0,-6,3,-1,-8,-20,-9,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-21,2,2,-24,-7,-8,-22,2,-30,-18,12,9,-1,-4,16,5,-20,-35,-21,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-22,1,4,-20,-13,-3,-22,28,-22,-10,10,-12,6,28,-5,-6,-18,-19,-10,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-30,-10,-2,-18,-20,-16,-24,23,-24,-12,-8,-14,0,12,-10,-1,-18,12,-2,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-25,-27,-20,-7,-31,-26,23,-21,5,6,-14,-3,-16,-23,-7,8,13,-24,-7,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-14,-24,-14,-18,-6,-30,-22,23,-22,13,8,-16,-22,-18,-22,-16,-8,19,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-23,-29,-23,-24,8,-7,-6,-6,-16,-8,-5,-21,-28,-18,-16,-17,-13,-5,27,31,-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-13,-24,-14,-9,-21,12,-13,-15,-14,-4,-4,-9,-18,1,-13,-6,-12,-15,-20,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,1,-21,-2,-3,-18,-9,-9,-14,-11,-18,-14,9,8,-5,-11,10,3,-17,-35,-19,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-6,-11,-6,-11,0,-11,-6,-6,-6,-6,-6,-6,-6,-11,6,0,0,-11,-11,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=7,12,-12,16,3,-18,-3,-5,-15,-3,-12,-12,3,-6,-3,-8,3,-3,-9,-18,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-6,-6,-6,-6,-11,-11,-6,-6,-6,-6,0,-6,-6,-6,11,29,0,-17,-6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-32,-11,-9,-18,-21,-15,1,-13,-15,-8,2,27,-10,-18,-8,-7,-12,-30,-18,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00530;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00608;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 2 acid/base catalyst.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1310272; R2=0.0148764; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=245; N_SCORE=8.766; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-20,-36,-19,-18,7,-17,-19,-19,-16,-18,-18,-21,-24,-16,-16,-18,-14,-22,72,18,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-9,-27,-7,9,-16,-23,2,-13,3,0,-1,-9,-13,5,3,-13,-11,-14,-23,-7,6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-26,-2,7,-26,-11,-4,-21,5,-21,-12,-1,4,5,0,-1,-5,-19,-26,-16,5;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-16,-20,-13,-13,-13,-3,-1,-15,0,0,-10,-17,-11,-17,-3,-5,3,-23,-9,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-17,-16,-23,-18,7,-23,8,1,-18,0,5,-12,-23,-15,-15,-9,-6,3,-17,9,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-21,-24,-14,1,-26,-17,15,-18,23,15,-20,-23,-13,-15,-17,-7,9,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-28,28,26,-31,-15,5,-28,2,-20,-17,6,-9,13,-3,0,-9,-26,-32,-15,19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-9,-12,-8,-17,-19,-8,-19,11,-16,-9,0,-23,-3,33,-7,-7,-8,-27,-14,-8;
MA   /M: SY='M'; M=12,-20,-14,-27,-18,-7,-19,-17,12,-16,9,13,-18,-19,-11,-19,-9,-5,12,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-25,0,11,-23,-17,-6,-23,16,-20,-12,1,-13,7,23,0,0,-16,-26,-13,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-24,11,20,-26,-14,-3,-24,6,-21,-16,7,-10,10,8,5,-3,-21,-30,-17,14;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-18,-17,-14,-5,-18,-3,7,-12,9,23,-5,-20,-6,-10,-8,1,2,-26,-5,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-19,-33,-29,11,-33,-23,30,-23,12,13,-25,-27,-25,-22,-15,-5,32,-17,7,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-26,-3,16,-21,-19,-1,-18,9,-10,-3,-5,-12,12,10,-6,-6,-17,-24,-11,13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-27,-13,-4,-15,-20,-7,-21,14,-12,-8,-6,-14,2,40,-8,-4,-15,-17,-9,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,26,-27,37,7,-17,-15,-5,-24,-8,-12,-17,8,-16,-6,-12,-7,-10,-20,-30,-11,1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-6,-30,-6,4,-24,-20,-9,-27,39,-25,-10,-3,-14,7,36,-12,-11,-18,-12,-8,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-1,-17,-21,92,-28,-9,-19,0,8,-21,9,2,-11,-19,-29,-26,22,-1;
MA   /M: SY='P'; M=3,-16,-30,-12,-4,-25,-16,-20,-16,-10,-23,-16,-15,55,-10,-19,-1,-1,-18,-29,-25,-10;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,3,-6,-4,-20,-3,-13,-20,-12,-26,-19,4,-13,-4,-13,31,14,-9,-38,-21,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-20,-33,-26,5,-31,-27,30,-25,18,13,-23,-24,-23,-24,-16,-6,27,-21,-3,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-23,-33,-24,11,-29,-17,26,-23,21,27,-20,-22,-16,-20,-18,-8,15,-17,3,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,-4,-12,-4,-6,-19,5,-13,-17,-12,-26,-17,5,-13,-6,-12,30,13,-6,-37,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-7,-28,-24,0,-20,-24,13,-26,23,10,-25,-29,-24,-21,-19,-8,16,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-26,-12,-16,-27,46,-18,-33,-12,-25,-17,-2,-18,-15,-10,1,-15,-23,-20,-26,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,-16,-5,1,-24,-8,-11,-20,-6,-26,-16,0,9,4,-6,19,6,-16,-33,-21,1;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-15,-9,-13,-5,10,-6,-15,-12,-12,-9,-6,-17,-12,-13,-3,-7,-12,-6,6,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-14,-9,-8,-4,-4,-2,-11,-9,-11,-8,-3,-13,-7,-11,6,2,-7,-12,2,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-22,-9,-13,-16,37,-8,-27,-13,-20,-13,-1,-16,-13,-10,-1,-13,-20,-15,-16,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=4,-1,-7,-1,4,-14,-4,-7,-13,2,-12,-8,-1,-7,0,-1,4,0,-8,-16,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,17,-11,11,-1,-11,-4,1,-8,-2,-13,-10,22,-12,-3,-3,3,-1,-10,-22,-11,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-15,-16,-12,7,-17,6,7,-13,6,8,-8,-13,-8,-10,-11,-7,2,-10,6,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-23,-11,-1,-13,-23,-13,0,-9,4,1,-14,-13,-3,-10,-11,-8,0,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=8,4,-24,5,8,-29,-11,-7,-23,7,-21,-14,-1,1,5,-3,0,-7,-18,-26,-17,6;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-10,-25,-10,-10,-15,-9,-10,-5,-12,-3,12,-12,2,-6,-14,-9,-9,-7,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=12,-2,-20,-6,-3,-12,-11,3,-15,-4,-14,-10,-1,-15,-2,-9,2,-4,-12,-14,4,-4;
MA   /M: SY='D'; M=5,8,-23,10,3,-27,-1,-3,-26,0,-20,-15,2,-13,-3,-2,1,-7,-18,-27,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-31,-22,-20,21,-23,1,-7,-12,-6,-6,-14,-28,-13,-8,-20,-13,-15,39,43,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-18,-18,-23,-14,16,-24,-14,0,-12,2,-1,-14,-21,-16,-12,-10,-5,0,-10,10,-15;
MA   /M: SY='K'; M=12,3,-21,-2,9,-25,-10,-10,-21,16,-21,-13,4,-10,3,4,1,-5,-15,-24,-16,6;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-20,-24,-16,-3,-23,-11,10,-15,17,28,-19,-9,-8,-14,-14,1,4,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-25,10,5,-25,-10,0,-25,24,-30,-15,31,-15,5,15,0,-5,-25,-30,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-27,11,24,-30,-15,3,-25,17,-25,-13,16,-10,22,9,0,-7,-28,-28,-15,23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,9,-30,14,-6,-20,-25,-15,6,-15,-4,-4,0,-15,-10,-20,-10,-10,1,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00531;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F32_MP; MATRIX.
AC   MP00609;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 32 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9011369; R2=0.0135948; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=776; N_SCORE=15.441; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-24,-7,2,-15,-15,-3,-12,0,-16,-6,0,-12,7,-3,3,-1,-13,-22,-4,3;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: M=-1,-7,-20,-8,-9,-14,-11,-11,-5,-9,-4,-2,-5,-13,-9,-11,-2,-3,-2,-27,-12,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: M=-6,-6,-25,-6,-4,-16,-15,-14,-10,-7,-12,-9,-6,-6,-4,-8,-3,-1,-10,-14,-11,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-18,-5,2,-21,-7,-14,-17,-5,-19,-14,-3,3,-4,-10,12,7,-12,-29,-19,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-3,1,-20,-2,-2,-19,-10,-7,-11,-1,-15,-7,6,-16,3,-1,4,-1,-8,-29,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=6,-4,-18,-7,-9,-11,-14,-9,-6,-8,-9,-7,-4,-16,-8,-8,2,1,-2,-20,-3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-18,-13,-12,-5,-18,-7,-1,-9,-2,2,-3,-20,-7,-5,-2,3,1,-21,0,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-20,-1,0,-16,-10,-5,-14,-5,-10,-8,2,-15,3,-6,3,0,-13,-26,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-19,9,10,-23,-8,-7,-20,-4,-20,-14,6,-7,3,-8,12,3,-16,-32,-18,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-26,-11,-4,-9,-19,-12,-10,-7,-7,-8,-14,1,-8,-10,-8,-4,-11,-7,0,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-7,-30,-9,-11,-2,-17,11,-13,-12,-8,-6,-4,-24,-5,-10,-15,-13,-18,12,16,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11,-3,-11,-22,5,-25,22,-17,-8,-3,-21,6,51,-12,-10,-18,-13,4,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-28,-5,-1,-24,-19,-16,-17,-8,-22,-13,-9,40,-3,-13,2,9,-19,-30,-21,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-5,-17,-9,-5,-21,-1,-7,-16,-7,-13,-7,0,-16,3,-7,3,-2,-14,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-27,-31,-26,31,-31,-6,10,-21,6,4,-21,-28,-22,-18,-20,-11,5,15,37,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-23,-35,-27,41,-32,-15,14,-27,17,8,-21,-27,-28,-21,-21,-10,8,-2,22,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-2,-19,-6,5,-21,-16,-7,-14,-2,-14,-6,-2,-10,16,-4,10,12,-13,-25,-12,11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-17,-11,-28,-18,-21,84,-11,-20,-10,-9,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-28,1,10,-25,-18,-9,-17,4,-19,-11,-3,10,5,-3,-2,-5,-17,-28,-17,6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-22,-3,3,-17,-18,-7,-14,6,-15,-6,-1,-13,2,0,1,3,-9,-26,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,-3,-15,-27,50,-7,-35,-15,-29,-19,14,-20,-14,-15,2,-16,-30,-25,-25,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-36,-39,-37,-27,15,-24,-26,-7,-24,3,-7,-36,-30,-21,-20,-36,-23,-16,90,21,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-21,-31,-21,2,-26,-12,24,-20,28,37,-23,-23,-10,-17,-22,-9,13,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-25,-27,-17,11,-27,-19,7,-23,19,9,-25,1,-20,-19,-22,-10,0,-18,-2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-12,-31,-24,8,-26,-21,12,-22,7,11,-21,-25,-19,-20,-14,-7,10,-4,1,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-20,-17,29,-29,15,-2,-9,-1,-1,-18,-28,-9,-8,-18,-10,-11,23,67,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-6,-26,-5,-13,20,-23,1,-12,-14,-7,-9,-9,-24,-16,-13,-12,-8,-12,6,27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=2,9,-23,2,1,-25,-5,-6,-23,17,-25,-12,14,-14,1,9,0,-6,-19,-26,-16,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-5,-8,-30,50,-17,-37,-11,-29,-19,0,-17,-12,-13,1,-16,-28,-22,-27,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-8,-4,-9,-21,-12,-11,2,-10,-7,-10,-20,-5,3,-12,-10,-8,-1,-2,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-26,-36,-27,-23,24,-26,5,-8,-14,-7,-7,-25,-30,-14,-13,-26,-17,-17,67,59,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,1,-30,0,-1,-18,-20,93,-28,-10,-20,-1,11,-20,9,0,-10,-19,-29,-28,21,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-19,-29,-20,5,-28,-20,20,-25,34,18,-26,-26,-19,-20,-22,-8,15,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-22,-34,-26,64,-29,-11,-1,-25,6,-1,-19,-29,-31,-17,-17,-9,-3,12,39,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-27,-23,-21,38,-29,18,-3,-15,1,0,-17,-29,-16,-12,-19,-11,-9,19,62,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-22,-34,-24,-21,18,-24,7,-9,-14,-9,-7,-19,-28,-13,-13,-23,-16,-16,53,46,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00532;
//
ID   NA_NEUROTRAN_SYMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00610;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:neurotransmitter symporter family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7325115; R2=0.0134018; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=886; N_SCORE=16.597; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,56,-30,-1,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,54,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,30,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,12,-28,-15,19,-25,41,28,-27,-28,-17,-18,-27,-10,9,-18,2,-18;
MA   /M: SY='A'; M=26,-4,-10,-10,-6,-18,-3,-16,-14,-10,-18,-14,0,-10,-6,-14,24,16,-4,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-18,30,-23,-19,-15,-25,-20,-4,-17,-8,-1,-18,-27,-11,-17,-5,-4,9,-35,-17,-15;
MA   /M: SY='I'; M=3,-27,-20,-33,-27,-3,-30,-29,34,-23,12,12,-22,-22,-22,-25,-12,-5,33,-24,-7,-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-21,-25,-18,37,-24,-7,-2,-18,0,-3,-16,-25,-21,-15,-10,-6,-2,4,31,-19;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-2,-15,-10,-17,-8,-19,-11,-12,-14,-12,-4,-13,-9,-17,17,14,-2,-29,-18,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-14,-30,-27,-2,-27,-26,28,-19,10,15,-26,-26,-23,-20,-10,-2,38,-27,-9,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-30,-2,-13,-31,53,-17,-39,-10,-30,-20,2,-18,-15,-13,-1,-18,-29,-22,-27,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-20,11,-29,-21,15,-27,33,13,-28,-17,-22,-20,-25,-9,8,-19,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-2,25,-2,9,-4,-20,-3,1,-20,-5,-27,-19,39,-20,-4,-6,11,1,-23,-39,-21,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-17,-31,-27,8,-31,-27,27,-23,15,11,-24,-26,-26,-21,-13,0,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-36,-11,-2,-29,-14,-20,-20,-10,-28,-19,-18,74,-10,-20,-7,-9,-27,-28,-29,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-19,6,-28,-18,17,-25,38,20,-25,-27,-17,-16,-23,-4,10,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-22,46,-29,-26,-11,-25,-28,-11,-23,-11,-11,-22,-31,-25,-24,-9,-4,4,-18,-16,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-27,-19,-15,15,-15,3,-7,-13,0,0,-15,-25,-5,-10,-15,-11,-12,5,32,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-24,3,15,-25,-17,-3,-21,14,-21,-8,6,-10,16,8,2,1,-20,-27,-13,15;
MA   /M: SY='N'; M=-9,23,-21,11,-2,-16,-6,22,-20,-4,-26,-15,38,-19,1,-2,9,-1,-25,-33,-6,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-11,-13,-20,-28,52,-21,-36,-20,-27,-19,-3,-21,-20,-21,0,-17,-25,-23,-29,-20;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-10,-18,-11,-18,-4,-19,-7,-11,-11,-9,-9,-12,-11,-18,13,3,4,-25,-19,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-14,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-18,-29,-20,5,-26,-20,19,-25,36,18,-27,-27,-19,-20,-23,-8,14,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-21,-34,-26,1,-31,-27,32,-25,18,13,-23,-23,-22,-24,-15,-6,28,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-37,-15,-5,-23,-23,-21,-8,-14,-17,-12,-21,66,-12,-21,-13,-10,-19,-28,-24,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,14,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-1,-31,-25,7,-30,-24,16,-27,18,8,-22,-27,-23,-23,-16,-6,14,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-10,-36,-29,8,-35,-27,30,-28,17,14,-22,-25,-24,-26,-19,-9,23,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='M'; M=4,-20,-18,-28,-19,0,-19,-12,14,-15,14,30,-19,-19,-10,-16,-12,-5,11,-19,-4,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-19,-30,-20,10,-26,-18,17,-26,38,20,-27,-27,-19,-19,-24,-9,10,-19,-1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-8,-35,-27,15,-31,-25,20,-27,15,8,-22,-26,-25,-25,-17,-8,16,-17,1,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-5,-32,-25,14,-31,-24,16,-27,24,10,-25,-29,-25,-22,-20,-6,16,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,0,-20,-11,-15,-14,-22,0,-17,-5,-5,-14,-19,-15,-20,-4,-5,6,-28,-16,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,60,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,6,-14,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-34,-26,0,-34,-25,35,-22,20,19,-22,-23,-19,-22,-19,-8,26,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00533;
//
ID   HISOL_DEHYDROGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP00611;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histidinol dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8762195; R2=0.0120308; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=874; N_SCORE=14.381; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=219; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-26,-22,-12,-12,-26,-17,11,-9,2,5,-15,-8,-4,-9,-11,-8,5,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-27,-29,-30,-25,47,-29,-2,-3,-19,1,-3,-23,-30,-23,-15,-23,-13,-9,38,54,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-11,-29,-30,-1,-27,-30,28,-20,9,9,-29,-30,-30,-20,-10,-1,48,-30,-11,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-12,-14,-9,-16,-13,-17,-7,-9,-9,-7,-5,-13,-5,-13,10,17,2,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='A'; M=17,-8,-18,-12,4,-15,-13,-12,-9,-8,-5,-7,-10,-12,-3,-13,1,0,-6,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-10,-1,-14,-20,-5,-21,22,-15,-5,-4,-18,4,34,-9,-7,-15,-17,-2,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-24,-17,-4,-7,-24,-6,1,-12,11,7,-15,-20,3,-8,-14,-9,-5,-17,0,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-10,-30,-27,3,-30,-27,25,-24,21,12,-29,-30,-27,-21,-16,-4,35,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-16,-20,-21,-16,26,-19,-8,-9,-12,-7,-7,-8,-22,-16,-5,-2,-2,-7,-5,18,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-27,-5,-12,-29,45,-16,-33,-14,-28,-18,2,-17,-11,-15,4,-13,-25,-23,-25,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-26,-1,-1,-17,-23,-6,-5,-4,-8,-3,-5,-13,4,-5,-7,-5,-5,-24,-6,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-13,-28,-27,-1,-29,-28,26,-20,9,8,-25,-26,-26,-20,-8,2,38,-27,-9,-27;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-26,2,-7,-29,37,-12,-33,-13,-26,-19,5,-16,-11,-15,3,-13,-25,-25,-25,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-28,-37,-28,-2,-37,-29,43,-27,16,17,-19,-15,-19,-28,-17,-6,26,-21,-2,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-30,59,17,-39,-2,-2,-40,-2,-30,-29,17,-11,-1,-11,0,-11,-30,-37,-21,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-20,-21,-15,-3,-5,-10,-1,-15,3,16,-12,-20,-7,-13,-6,-5,-3,-21,-7,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-28,-25,-13,-2,-30,-22,16,-21,11,6,-21,3,-15,-22,-18,-9,6,-22,-7,-17;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-13,-16,-3,-21,-3,-17,-12,-8,-11,-11,-9,-7,-6,-17,8,-2,-4,-20,-18,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,89,-10,-20,-10,-9,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,22,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-25,-19,-30,-24,-1,-30,-26,29,-24,15,11,-21,-23,-21,-23,-11,-1,27,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-14,-28,-21,0,-21,-21,15,-23,22,14,-23,-25,-19,-20,-16,-6,14,-22,-7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-30,-20,-34,-29,0,-34,-29,38,-25,17,15,-25,-25,-24,-25,-16,-5,37,-24,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-35,-27,7,-35,-23,34,-27,23,17,-24,-25,-21,-24,-20,-8,25,-17,5,-27;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,1,-19,-12,-19,-6,-21,-9,-13,-10,-10,-10,-14,-12,-21,7,-1,0,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,67,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-27,20,17,-29,3,-4,-31,-1,-25,-20,6,-10,3,-6,3,-8,-25,-29,-19,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-14,-3,-1,-15,-11,-12,-16,-4,-19,-13,3,-10,-1,-6,19,21,-9,-29,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-11,-17,-12,-17,-3,-19,-7,-11,-10,-9,-7,-13,-12,-18,9,4,4,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-26,36,10,-30,-8,6,-29,1,-29,-22,29,-8,2,-4,4,-5,-28,-37,-18,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=5,-17,-29,-14,-5,-22,-10,-18,-14,-11,-17,-13,-16,36,-11,-18,-6,-8,-17,-24,-21,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-23,14,18,-27,-10,-5,-26,5,-20,-17,2,-9,3,1,-1,-8,-19,-30,-18,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-23,-27,-26,-20,14,-25,-3,1,-19,6,3,-20,-26,-15,-16,-20,-12,-5,19,21,-18;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-16,-32,-26,-2,-29,-27,28,-23,14,11,-23,-24,-22,-23,-12,-5,30,-24,-7,-26;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-11,-21,-12,-17,-5,-21,-4,-11,-6,-7,-12,-12,-12,-19,6,0,5,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-16,-20,-13,-5,-15,-12,-2,-12,3,4,-13,-19,-9,-11,-3,-1,0,-16,-2,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,19,-40,-7,-1,-40,-1,-30,-30,19,-10,-1,-10,0,-10,-30,-39,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-31,-21,10,-28,-19,19,-26,37,21,-27,-28,-19,-20,-25,-9,12,-19,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-22,15,-31,-21,20,-25,32,15,-25,-27,-22,-18,-24,-9,13,-17,3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-13,-13,-9,-19,2,-17,-11,-13,-16,-12,-3,-12,-8,-17,18,5,-3,-28,-19,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,2,24,-39,-20,9,-21,10,-20,-2,0,-9,56,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='A'; M=42,-12,-11,-20,-11,-17,-3,-19,-7,-12,-5,-6,-11,-12,-10,-20,7,0,1,-21,-18,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-11,23,-30,34,3,-35,23,-8,-39,-8,-30,-25,12,-12,-8,-14,1,-13,-30,-32,-24,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-30,-3,11,-22,-17,-10,-17,-4,-21,-15,-9,29,-2,-10,-3,-6,-20,-26,-17,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='B'; M=-8,10,-21,10,-1,-15,-15,-4,-10,-9,-5,-4,7,-17,-5,-9,-3,-1,-11,-29,-10,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-11,-6,-20,1,-16,-15,-10,-19,-14,-1,-10,-6,-16,23,10,-5,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-8,-19,-9,0,-17,-12,-7,-15,-4,-17,-8,-5,-6,8,-4,7,0,-13,-23,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-5,-17,-13,-16,-10,-20,-5,-14,-11,-9,-10,-11,-13,-18,10,6,4,-29,-18,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-34,-28,9,-32,-22,26,-23,11,9,-25,-26,-22,-22,-20,-9,21,4,13,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-14,-30,-21,9,-29,-21,19,-29,41,17,-29,-30,-21,-21,-26,-9,13,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-33,-27,4,-32,-27,31,-25,20,14,-25,-26,-24,-23,-16,-4,32,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-2,-9,-9,-13,-15,-19,-13,-12,-15,-13,1,-12,-9,-12,22,37,-3,-33,-14,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-25,11,4,-23,-15,-2,-22,-5,-21,-16,4,9,-4,-10,2,6,-19,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='S'; M=0,16,-17,22,8,-26,-4,-6,-26,-6,-29,-23,14,-10,0,-10,25,9,-17,-39,-20,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-21,-2,8,-22,-9,-9,-21,4,-16,-11,-5,-9,1,4,-3,-7,-16,-24,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-24,8,20,-25,-14,-5,-24,8,-20,-14,1,-8,10,2,3,-4,-19,-26,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00534;
//
ID   OSTEONECTIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00612;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Osteonectin domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2381239; R2=0.0087984; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1542; N_SCORE=17.804; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=258; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,37,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='A'; M=11,-6,-24,-5,9,-25,-3,-15,-21,-6,-19,-16,-7,11,-3,-14,3,-1,-17,-26,-22,2;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-19,7,0,-23,-8,-12,-16,-10,-23,-17,4,0,-4,-14,17,5,-11,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='E'; M=1,15,-22,18,21,-26,-11,-5,-25,0,-21,-19,9,-8,4,-7,9,2,-20,-33,-19,13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-30,15,51,-28,-20,0,-30,13,-20,-18,0,-3,18,11,-2,-10,-28,-28,-18,34;
MA   /M: SY='G'; M=-7,9,-26,8,2,-27,12,-9,-30,4,-27,-18,11,-14,-3,-2,2,-4,-24,-27,-20,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-22,7,12,-22,-12,-4,-19,9,-24,-15,17,-13,3,3,6,-1,-16,-33,-17,8;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-18,1,15,-19,-12,-7,-17,-4,-18,-9,2,-8,5,-7,17,12,-13,-33,-16,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-5,10,-21,-8,-9,-19,5,-15,-11,-6,-16,0,15,-5,-9,-10,-25,-16,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-25,-4,14,-20,-16,-14,-8,2,-11,-7,-9,-13,-1,-5,-6,-9,-3,-26,-15,6;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-14,-25,-13,-8,-19,-19,15,-10,-12,-15,-5,-11,13,-8,-14,-7,-9,-7,-28,-8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-12,-16,-9,-15,-5,-17,-8,-13,-7,-8,-7,-13,-9,-17,13,4,-1,-26,-17,-9;
MA   /M: SY='E'; M=3,-5,-25,-3,16,-25,-17,-13,-18,8,-18,-12,-9,6,2,-3,-3,-7,-13,-26,-18,8;
MA   /M: SY='N'; M=-13,38,-25,35,5,-28,4,3,-29,-2,-30,-24,39,-16,-2,-6,5,-6,-30,-38,-21,2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-27,-10,-3,-21,-15,-17,-14,-13,-18,-14,-12,40,-8,-17,3,-1,-18,-32,-22,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-25,-8,10,-19,-21,-2,-10,3,-4,8,-7,-13,16,8,-7,-4,-13,-23,-9,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,37,-21,28,4,-24,-2,6,-24,-1,-30,-22,46,-17,0,-3,11,0,-28,-40,-20,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-14,-25,-19,-14,27,-25,44,-16,-19,-6,0,-4,-25,-13,-9,-15,-15,-16,-11,25,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,0,10,-30,-20,53,-25,0,-20,0,5,-15,36,5,-5,-15,-30,-25,4,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-30,-2,4,-30,-1,-12,-32,35,-30,-12,0,-12,4,19,-8,-12,-22,-20,-14,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-13,-34,-13,-6,-14,-20,26,-28,7,-20,-9,-5,-22,4,29,-16,-17,-25,13,8,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,0,-30,0,7,-27,-20,24,-30,31,-27,-7,3,-13,10,21,-10,-13,-23,-23,-1,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-19,-20,-9,-7,-29,-23,18,-15,4,4,-19,-20,-15,-17,-7,0,24,-28,-10,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-26,0,19,-25,-22,-8,-16,16,-17,-7,-6,-11,13,7,-5,-8,-10,-25,-13,16;
MA   /M: SY='V'; M=12,-19,-11,-23,-19,-6,-20,-24,10,-17,5,2,-19,-21,-19,-18,-1,9,22,-26,-12,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-30,53,12,-38,7,-4,-40,-4,-30,-28,16,-12,-4,-12,0,-12,-30,-36,-22,4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-31,11,23,-33,-19,-4,-28,21,-26,-13,0,3,19,10,-5,-10,-26,-25,-15,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,9,-26,5,10,-30,-14,12,-23,12,-25,-9,15,-13,26,9,3,-6,-26,-27,-10,17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-27,0,-14,-27,48,-10,-34,-14,-30,-20,19,-20,-14,-14,3,-14,-30,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-24,2,15,-25,-18,-10,-25,22,-24,-13,1,-8,7,11,4,6,-17,-26,-13,11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-19,-12,-9,-11,-18,24,-8,-12,-4,10,-3,-17,-1,-8,0,4,-8,-28,1,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-17,-21,-11,-6,-29,-24,20,-15,5,5,-22,-22,-18,-17,-9,-4,30,-28,-11,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-30,-8,9,-32,-24,2,-5,2,-12,4,-4,-12,43,2,-4,-10,-17,-20,-8,25;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-24,55,16,-32,-8,0,-32,0,-24,-24,16,-8,0,-8,0,-8,-24,-32,-16,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-32,-8,0,-24,-16,-16,-16,-8,-24,-16,-16,71,-8,-16,-8,-8,-24,-24,-24,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=10,-3,-14,-4,6,-18,-10,-13,-13,-7,-18,-14,-1,-10,-2,-11,19,12,-4,-33,-18,2;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-14,-7,-4,-18,-12,-16,-16,3,-19,-12,1,-10,-4,-3,17,23,-6,-29,-14,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=9,0,-10,-1,9,-12,-6,-6,-10,-1,-7,-7,-2,-3,1,-5,4,3,-6,-14,-10,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-11,-9,-5,-4,-11,-10,-1,-10,3,-1,-8,2,-6,-9,-2,4,-2,-15,-7,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,4,-20,12,4,-21,-8,-8,-18,-5,-20,-16,-1,25,-3,-10,3,-2,-17,-24,-17,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=10,-11,-17,-16,-15,-15,2,-21,-6,-15,-11,-8,-6,-15,-14,-17,8,10,1,-26,-16,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,7,-30,12,2,-32,11,-11,-35,17,-30,-17,4,-13,-2,6,-5,-13,-25,-24,-19,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-31,1,7,-22,-23,-16,-6,-9,-14,-10,-11,21,-6,-16,-8,-9,-10,-30,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-22,-32,-23,33,-28,-10,10,-23,23,19,-23,-28,-21,-16,-23,-10,4,-3,22,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,43,31,-35,-15,-2,-35,11,-27,-24,10,-7,8,-1,-2,-10,-28,-34,-18,20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,12,-32,-20,-2,-27,34,-25,-7,0,-12,26,30,-7,-10,-23,-20,-10,18;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-12,-29,-26,-4,-25,-28,24,-19,7,7,-25,-25,-25,-21,-7,-1,38,-27,-11,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-23,-11,-15,-27,47,-19,-31,-17,-26,-18,-1,-17,-15,-19,7,-11,-21,-22,-27,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-3,13,-13,0,-7,-13,-13,-10,-13,-7,-17,-13,20,-13,-7,-7,17,33,-10,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,59,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,17,-37,-20,3,-23,23,-23,-3,0,-10,43,17,-3,-10,-27,-20,-10,30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00535;
//
ID   OSTEONECTIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00613;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Osteonectin domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5129266; R2=0.0130120; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=876; N_SCORE=15.901; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-36,2,24,-30,-20,-12,-24,-2,-26,-20,-12,54,2,-12,-6,-10,-30,-30,-26,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-30,-12,-8,6,-26,8,-12,14,-12,-4,-12,-22,-2,6,-16,-10,-14,10,44,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=22,14,-18,16,2,-28,-4,-12,-22,-6,-18,-18,2,-10,-6,-16,6,-4,-12,-28,-20,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-36,2,24,-30,-20,-12,-24,-2,-26,-20,-12,54,2,-12,-6,-10,-30,-30,-26,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-16,-22,-16,2,-26,-20,8,-22,26,8,-18,-22,-16,-16,-10,14,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,36,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,16,-21,14,24,-24,-8,0,-24,1,-26,-20,21,-9,8,-3,15,2,-24,-36,-20,16;
MA   /M: SY='H'; M=-14,6,-30,12,36,-26,-20,40,-30,2,-20,-12,4,-8,16,0,-4,-14,-30,-30,-4,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,36,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-10,-11,-7,-17,-6,-17,-13,-10,-16,-13,-1,-10,-7,-14,22,21,-3,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,44,-34,-20,4,-26,10,-20,-12,0,-4,36,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-24,-10,12,-6,-26,-12,0,-14,22,4,-18,-18,-4,-12,-18,-10,-6,-24,-8,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-33,-23,0,-26,-9,29,-16,20,48,-20,-20,-6,-16,-20,-10,16,-20,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=14,-10,-22,-14,-10,-23,14,-14,-25,-1,-19,-13,-4,-16,-7,8,1,-9,-15,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-12,-26,-16,-6,14,-24,-14,-18,18,-14,-6,-8,-18,-10,10,-14,-10,-12,-8,6,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,8,-28,-8,10,-20,4,-26,-12,36,-16,24,4,6,-4,-30,-32,-16,16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,36,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-18,-18,-14,-12,-26,-22,6,8,-6,2,-18,-22,-14,0,-10,-4,22,-26,-10,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-18,5,21,-21,-14,-9,-21,-2,-20,-17,3,-6,5,-6,18,17,-15,-33,-17,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-30,-12,-8,6,-26,8,-12,14,-12,-4,-12,-22,-2,6,-16,-10,-14,10,44,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,40,-30,-20,-4,-30,26,-24,-16,0,-4,16,12,-4,-10,-26,-26,-16,28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,26,-30,38,12,-32,-14,0,-36,12,-26,-22,12,-14,4,22,-4,-10,-26,-32,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-3,-23,-9,-14,-11,9,-11,-10,-18,2,-4,6,-24,-14,-14,-9,-10,-14,-26,-15,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-14,24,-24,12,0,-20,-8,46,-24,-4,-26,-12,40,-20,4,0,2,-8,-30,-36,-4,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,4,-24,-8,2,-24,20,-30,-16,36,-16,4,12,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00535;
//
ID   IGPS_MP; MATRIX.
AC   MP00614;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Indole-3-glycerol phosphate synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0098610; R2=0.0153170; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=174; N_SCORE=7.665; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-6,-11,-24,-11,-3,-11,-19,-10,-8,-3,-6,-3,-8,-4,-5,-4,-5,-4,-8,-24,-9,-5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-3,-10,-2,-2,-12,-6,-9,-9,-4,-9,-7,-4,6,-5,-7,-1,0,-7,-16,-11,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-14,-4,-6,-22,-8,-8,4,-5,-3,-9,-17,-2,16,-9,-7,-7,-17,-1,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-2,11,-20,12,2,-23,-2,-5,-25,-2,-25,-19,12,-9,-1,-1,12,1,-19,-32,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-35,-26,42,-29,-21,12,-28,22,8,-23,-28,-30,-21,-21,-9,9,-5,14,-26; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-14,-23,-16,-9,-5,-21,-7,-1,-7,-5,-1,-11,-11,-8,-7,-5,-3,-1,-17,4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-4,13,-24,15,10,-26,-8,-3,-24,4,-21,-16,10,-12,4,1,3,-5,-20,-30,-16,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-11,-19,-11,-6,-10,-15,-11,-8,-9,-8,-8,-16,-9,-6,5,1,-4,-20,-11,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-22,-24,-16,1,-27,-17,18,-22,28,15,-17,-24,-15,-18,-20,-8,8,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-25,-5,3,-23,-12,-8,-21,17,-19,-10,0,-14,4,19,-3,-6,-15,-23,-13,2;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-14,1,7,-16,-5,-3,-14,4,-12,-7,2,-6,6,3,3,-3,-11,-16,-10,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=2,-3,-9,-4,-3,-11,-3,-4,-10,-3,-11,-7,-2,1,-3,-4,2,-1,-8,-11,-8,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-18,0,-2,-16,2,-8,-17,1,-16,-10,0,-8,-4,-1,-2,-7,-13,-17,-10,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-3,3,-21,-7,-2,-24,11,-20,-10,2,-11,5,15,-3,-7,-19,-23,-12,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-22,-20,-14,-4,-23,-19,5,-15,4,1,-15,-4,-15,-13,-9,0,4,-24,-9,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-18,-11,-7,-22,4,-15,-18,-7,-20,-13,-5,-2,-6,-12,8,-1,-11,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-27,11,-33,-24,29,-26,24,15,-26,-27,-24,-23,-20,-7,26,-18,3,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-39,-29,0,-38,-27,46,-28,20,23,-20,-21,-18,-28,-20,-10,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-6,-21,-12,-16,-5,-20,-7,-13,-3,-6,-12,-14,-12,-20,5,0,0,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-27,-6,-32,-28,10,-33,-20,21,-23,9,8,-24,-28,-24,-22,-16,-7,22,-16,10,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-28,-7,2,-24,-19,-7,-25,27,-24,-11,-2,-6,6,36,-5,-7,-17,-23,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-14,-14,-6,-18,-9,-12,-16,3,-15,-10,-6,-13,-4,0,5,0,-7,-20,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-11,-1,0,-19,-3,-11,-19,-7,-28,-18,8,-10,0,-8,35,21,-9,-37,-18,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-9,-25,-10,-3,-18,-10,-12,-17,14,-13,-5,-7,-16,-2,8,-8,-7,-10,-19,-8,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-29,-9,-16,-22,48,-18,-32,-18,-23,-16,-1,-18,-18,-18,-3,-17,-25,-20,-24,-17;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-5,-20,-4,-7,-13,-16,-13,-2,-11,-1,-2,-8,-13,-8,-10,-7,-4,1,-22,-10,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-23,-30,-22,3,-31,-23,32,-25,22,15,-18,-20,-17,-22,-18,-8,19,-18,0,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,0,-18,-4,-2,-17,-12,-3,-19,9,-16,-10,6,-16,0,18,0,-3,-14,-24,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-23,-2,10,-20,-16,-11,-13,-2,-10,-8,-6,-1,0,-6,-2,-3,-12,-26,-15,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-27,28,12,-29,-7,1,-26,0,-23,-18,15,-12,2,-5,0,-7,-23,-32,-16,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-17,-19,-22,-14,17,-20,-13,-3,-11,0,-2,-13,-17,-16,-4,-9,-4,-1,-8,6,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-20,32,6,-29,-8,-1,-28,-1,-26,-21,19,-12,-1,-4,2,-6,-23,-37,-19,2;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-23,-29,-21,-11,-13,-23,-21,2,-18,0,-2,-21,26,-14,-21,-13,-8,-5,-24,-14,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=6,-13,-21,-14,-4,-11,-17,-15,-2,-12,-4,-5,-13,-6,-10,-15,-4,-4,0,-23,-11,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,10,25,-26,-16,-3,-23,8,-19,-13,-1,-8,14,1,0,-7,-21,-25,-12,19;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-20,-27,-24,-13,-4,-30,-10,16,-15,9,12,-16,-20,3,-13,-15,-10,5,-13,7,-7;
MA   /M: SY='A'; M=28,-15,-14,-22,-14,-12,-9,-19,0,-13,-1,-2,-14,-16,-13,-18,2,-1,6,-21,-13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-3,5,-22,-16,-6,-21,15,-17,-9,1,-13,9,20,-2,-5,-17,-25,-12,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-6,-20,-8,-7,-10,-18,-13,-3,-7,-6,-4,-7,-17,-7,-9,-2,-1,1,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-28,-20,-20,22,-28,13,4,-11,2,6,-19,-28,-10,-11,-18,-9,-4,19,62,-19;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,5,22,-26,-15,-3,-20,6,-17,-11,-1,-9,11,0,0,-7,-17,-26,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-24,1,10,-22,-13,-1,-21,8,-16,-9,2,-13,6,6,-2,-7,-18,-24,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-20,-15,-14,-8,4,-1,-13,-14,-10,-6,-5,-20,-11,-15,-3,-8,-11,-13,3,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-24,-13,-15,-24,36,-18,-26,-12,-21,-14,-3,-17,-14,-12,0,-13,-17,-20,-23,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=30,-8,-13,-15,-7,-18,-6,-18,-6,-11,-12,-9,-6,-11,-8,-18,13,4,0,-25,-17,-8;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-14,-22,-14,-14,-12,-22,1,-14,-4,-4,-10,-12,-12,-20,7,9,6,-22,-14,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00536;
//
ID   C_TYPE_LECTIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00615;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   C-type lectin domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6865158; R2=0.0118925; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=176; N_SCORE=6.770; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-2,16,-20,22,6,-27,-6,-2,-27,-6,-28,-22,12,-3,-1,-10,17,4,-19,-38,-19,2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-15,1,-6,-16,22,-8,-19,-6,-15,-10,1,-9,-7,-4,0,-8,-14,-12,-14,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,-8,-9,-10,-9,-4,-2,-11,-2,-10,3,0,-7,-11,-9,-9,-2,4,1,-13,-6,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-17,-5,-4,-12,-10,-5,-10,-5,-10,-6,6,-16,-1,-3,8,3,-10,-27,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-18,-25,-21,0,-27,-24,14,-20,8,4,-25,-6,-23,-19,-12,-3,21,-26,-10,-23;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-17,6,2,-22,-8,-6,-20,-2,-20,-15,5,-12,-1,-5,14,6,-13,-32,-16,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-19,-13,26,-28,8,-2,-13,1,-1,-16,-25,-13,-12,-16,-9,-7,9,45,-15;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-21,2,7,-16,-18,-5,-19,8,-15,-10,0,-11,1,7,0,5,-12,-24,-9,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-19,-4,-7,0,-11,-2,-12,-7,-14,-10,11,-14,-8,-9,1,-1,-14,-18,1,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-42,-33,-24,8,-20,-26,-13,-19,-9,-13,-34,-27,-18,-18,-34,-24,-22,108,22,-17; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='A'; M=2,-1,-15,-4,-5,-17,-11,-4,-10,-6,-14,-8,2,-15,-4,-8,2,-3,-7,-26,-10,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-1,-22,2,6,-21,-9,-9,-19,0,-19,-14,-1,14,0,-3,2,-1,-17,-24,-17,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-20,0,-6,-19,19,-8,-22,-6,-18,-13,6,-13,-7,-5,1,-7,-18,-17,-16,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-21,8,22,-24,-13,2,-18,7,-16,-8,3,-5,23,4,2,-5,-20,-20,-11,23; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-26,-7,0,-20,-13,-13,-14,-7,-21,-14,-13,58,-7,-13,-5,-6,-20,-21,-20,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='B'; M=-6,18,-16,18,4,-17,-4,0,-19,0,-20,-15,18,-10,0,0,7,0,-17,-21,-12,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-16,6,-2,-11,3,-1,-16,-4,-16,-12,16,-10,-4,-4,3,-2,-16,-21,-11,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: M=-4,-10,-20,-10,-4,-10,-9,-8,-11,-1,-11,-6,-8,-6,-3,-2,-7,-7,-11,-2,-1,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-14,-5,-3,-9,0,-4,-11,-1,-8,-4,-1,-6,1,1,-1,-3,-10,-11,-6,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-17,-2,0,-17,10,-6,-19,-2,-18,-12,5,-10,-3,-4,5,-4,-15,-19,-13,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,3,-26,2,3,-20,-1,-7,-22,-1,-19,-13,6,-11,-2,-1,-1,-6,-20,-24,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-28,6,27,-27,-6,-5,-28,8,-23,-16,1,-5,12,3,1,-9,-26,-26,-18,19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,14,-22,16,5,-21,-16,6,-23,4,-20,-14,10,-15,0,2,-3,-6,-20,-28,-7,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-15,-27,-23,1,-13,-23,10,-19,5,3,-20,-23,-23,-20,-7,-4,18,-20,-8,-23;
MA   /M: M=-3,-9,-22,-10,-1,-10,-17,-2,-7,-7,-7,-4,-8,-17,-3,-8,-3,-4,-4,-21,-2,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-19,-30,-21,7,-27,-18,19,-23,22,19,-21,-23,-16,-19,-17,-8,13,-19,-1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-20,1,0,-15,-18,-3,-17,2,-16,-11,2,-17,-2,1,-3,-3,-13,-18,-3,-2;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-12,-3,-1,-14,-6,-7,-13,1,-13,-9,1,-6,-2,-3,7,9,-7,-19,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-20,3,2,-17,-8,-4,-19,-2,-17,-13,2,-12,-2,-2,4,2,-13,-21,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-20,12,4,-22,-3,-3,-22,-3,-22,-16,11,-8,1,-6,9,3,-18,-29,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-22,-2,-6,-22,29,-11,-26,-8,-21,-14,5,-12,-7,-9,1,-10,-21,-20,-20,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-7,-18,-9,-3,-17,-12,-4,-14,-1,-10,-3,-4,-16,3,1,-3,-3,-12,-24,-9,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-39,-47,-39,-29,10,-21,-29,-17,-21,-14,-17,-39,-30,-20,-20,-39,-28,-27,135,27,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-23,1,-5,-11,-12,1,-13,-4,-14,-9,17,-19,-4,0,0,-4,-15,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,32,-24,40,11,-31,-7,-1,-32,0,-29,-25,22,-12,1,-2,10,-1,-24,-38,-19,5;
MA   /M: M=-6,-4,-22,-5,-4,-12,-19,-9,-3,-7,-5,-2,-4,-17,-5,-7,-4,-2,-2,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-24,-2,-2,-16,-11,0,-18,-1,-20,-13,3,-2,-4,-3,0,-4,-16,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-24,9,7,-25,-2,0,-24,-4,-21,-15,10,-10,3,-3,4,-3,-22,-31,-16,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-1,-23,-1,2,-19,-11,-4,-18,2,-18,-10,0,-14,5,1,3,-2,-14,-23,-9,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-26,-9,-1,-16,-19,-7,-16,6,-15,-7,-6,-7,2,6,-5,-3,-14,-14,-6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-24,-12,-6,-4,-21,4,-12,3,-5,-1,-4,-21,0,7,-12,-9,-13,-15,7,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-28,-11,-7,-13,-11,-2,-15,-6,-13,-9,-6,5,-6,-5,-7,-8,-17,-19,-4,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,-22,-29,-23,34,-23,-15,-2,-20,0,-4,-20,-26,-24,-17,-12,-7,0,16,23,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-19,-33,-28,0,-33,-28,35,-24,16,15,-24,-25,-23,-23,-14,-4,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-29,5,25,-26,-20,-2,-26,24,-22,-12,-1,-8,14,13,-5,-9,-22,-21,-9,19;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-17,-17,-22,-15,15,-24,-13,-5,-3,-3,3,-14,-21,-14,-2,-12,-6,-2,-11,7,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-28,-8,1,-20,-16,-11,-17,1,-18,-11,-8,17,-1,-2,-3,-3,-18,-23,-13,-2;
MA   /M: SY='A'; M=2,-13,-21,-17,-10,-5,-17,-14,-5,-9,-1,-3,-10,-10,-11,-8,-5,-1,-4,-20,-7,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-6,-9,-16,-11,-8,-11,-19,-15,-3,-13,-8,-6,-7,-7,-11,-15,-5,-4,-2,-24,-11,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-8,-2,-10,-5,-4,-15,-11,-6,-14,-3,-13,-8,0,-17,-1,-1,-2,-3,-12,-18,-8,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-8,-6,-3,-14,-12,-12,-12,-5,-10,-9,-3,-9,-5,-3,2,3,-8,-25,-13,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-1,-8,-6,-8,-3,-10,-7,-10,-8,-5,-8,-5,-7,0,-6,-8,-2,-2,-5,-14,-10,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-7,-15,-6,2,-9,-13,-10,-6,-5,-9,-6,-5,0,-3,-8,3,2,-5,-20,-9,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,22,-14,-10,-10,-14,-14,-9,-13,-6,-6,-11,-14,-11,-12,-6,-5,-4,-23,-11,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-9,-4,-3,-4,-5,-3,-7,-6,-9,-6,0,-6,-4,-6,7,6,-5,-13,-2,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-15,-4,0,-12,-5,-4,-12,2,-12,-7,-1,1,2,4,0,-1,-11,-13,-6,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-12,0,-28,4,4,-19,-14,7,-24,-2,-21,-13,-1,8,0,0,-3,-5,-22,-26,-10,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-28,0,2,-23,-8,3,-18,-9,-15,-10,-5,7,-1,-11,-5,-9,-19,-27,-13,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-23,6,15,-22,-14,-1,-16,-4,-15,-11,-4,-7,2,-8,0,-6,-10,-29,-14,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-26,-24,-13,0,-25,-14,3,-15,19,7,-24,-25,-6,-11,-24,-12,-5,7,6,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-26,-13,-7,0,-19,-14,-12,-5,-11,-9,-5,7,-12,-8,-7,-5,-14,-21,-8,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00537;
//
ID   HIS_ACID_PHOSPHAT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00616;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histidine acid phosphatases phosphohistidine signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5092692; R2=0.0161863; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=127; N_SCORE=7.552; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-25,-15,-5,-6,-21,-14,-5,-12,0,-3,-11,4,-8,-9,-9,-4,-9,-24,-10,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=3,-3,-18,-6,-9,-11,-3,-8,-11,-10,-10,-8,-2,-17,-7,-12,1,0,-7,-18,-3,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-24,-5,0,-11,-13,-14,-10,-12,-8,-9,-7,3,-9,-14,-3,-5,-10,-25,-13,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-10,-22,-14,-9,0,-18,-5,-4,-12,-4,-3,-7,-19,-6,-12,-2,-1,-7,-6,11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-15,-17,-17,-16,-14,8,-19,-9,-15,-11,-4,-10,-17,-16,-16,-3,-8,-3,-25,-17,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-23,-27,-18,-1,-27,-21,17,-21,12,8,-19,-13,-13,-20,-13,-6,11,-21,-5,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-16,-3,-4,-11,-9,-10,-11,-9,-15,-10,-3,1,-7,-12,9,4,-7,-23,-10,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=0,-9,-20,-13,-7,-12,-18,-13,-6,-2,-9,-5,-5,-13,-4,3,1,3,-2,-24,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-21,21,15,-28,-11,-7,-24,-2,-21,-16,4,-8,3,-9,3,-4,-20,-33,-18,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-19,-19,-14,-4,-19,-17,4,-15,1,0,-12,-14,-12,-13,-5,-1,7,-24,-9,-14;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-30,-12,-3,-21,-19,-15,-8,-9,-16,-9,-14,43,-3,-12,-7,-7,-16,-24,-18,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-20,6,21,-22,-14,-3,-18,2,-14,-12,-1,-6,9,-4,3,0,-14,-24,-14,15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,9,-19,9,-2,-20,11,-2,-22,-8,-19,-14,9,-12,-4,-9,5,-2,-18,-24,-15,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,44,-17,-19,-13,-22,-18,-16,-17,-8,-5,-15,-28,-18,-18,-10,-7,-6,-33,-14,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-25,1,17,-25,-18,-3,-21,11,-20,-11,0,-7,11,9,1,-1,-17,-27,-13,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,6,-31,-22,27,-27,35,22,-27,-27,-20,-21,-24,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-25,8,14,-25,-20,-9,-20,12,-19,-12,1,-9,6,5,0,4,-15,-27,-13,10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-14,-24,-19,-6,15,-23,-2,-9,-11,-4,1,-9,-20,6,-6,-7,-8,-13,-8,10,2;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-11,-29,-27,-2,-26,-28,25,-19,10,8,-28,-28,-27,-20,-9,-1,42,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-25,-9,2,-22,-22,17,-10,-5,-7,2,-5,-16,21,-2,-5,-5,-13,-24,-2,10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-15,-27,-21,-1,-24,-19,18,-18,17,20,-22,-23,-16,-17,-12,2,21,-24,-6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-31,-25,4,-30,-23,27,-25,30,21,-28,-28,-21,-20,-21,-7,26,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-15,-23,-19,-13,5,-8,-13,-14,-13,-14,-8,-9,-19,-9,-12,1,-4,-12,6,3,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=4,9,-22,14,15,-24,-12,-9,-19,-5,-12,-14,-1,-10,-1,-11,2,-5,-13,-30,-17,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=10,-6,-18,-12,-11,-4,-9,-3,-10,-10,-13,-10,-3,-17,-8,-12,7,5,-8,-11,12,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-37,-10,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-29,-19,-18,81,-10,-20,-7,-8,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-16,-19,-14,-7,-23,-20,6,-16,4,1,-10,-17,-11,-15,3,19,8,-27,-8,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-23,-2,2,-18,-12,-9,-14,-2,-11,-9,-7,-12,-5,-6,-3,-5,-7,-25,-12,-2;
MA   /M: SY='S'; M=3,9,-18,5,-2,-21,1,-8,-20,-7,-23,-17,15,-10,-4,-9,16,8,-16,-34,-19,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-17,-3,-1,-14,-15,-9,-9,5,-7,-4,-1,-13,-1,3,-4,0,-5,-21,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,-11,-27,-10,-8,-26,10,-18,-23,-12,-24,-16,-8,21,-9,-17,3,-2,-21,-26,-25,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=1,-3,-21,-6,-2,-18,-15,-12,-11,10,-12,-5,-1,-13,-2,2,-2,-3,-7,-23,-11,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-20,9,4,-17,-15,-9,-13,-3,-12,-8,0,-12,-1,-8,2,1,-8,-26,-11,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-12,-25,-10,-6,-5,-22,-7,2,-12,2,1,-13,1,-6,-13,-13,-8,-5,-12,5,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=3,-6,-17,-9,-3,-9,-15,-4,-4,-5,-7,-1,-6,-12,-5,-9,-1,-1,-1,-19,-4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=3,-3,-20,-2,7,-23,-13,-12,-16,8,-18,-10,-4,-12,2,-1,4,0,-7,-27,-15,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-17,-8,-7,-12,-13,-15,-7,-10,-2,-5,-5,-17,-9,-10,3,7,-2,-29,-12,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-28,-35,-31,-23,4,-24,-22,-2,-19,-7,-7,-26,-20,-17,-19,-21,-10,-9,57,17,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,0,-24,1,1,-12,-17,-6,-13,-6,-13,-10,-3,-2,0,-10,-2,-2,-14,-17,-1,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-25,-8,0,-12,-17,-8,-19,16,-18,-10,-4,-9,-1,8,-6,-7,-15,-14,0,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00538;
//
ID   RECF_1_MP; MATRIX.
AC   MP00617;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RecF protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.7157764; R2=0.0202309; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=229; N_SCORE=11.339; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-10; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-20,-20,-12,-12,-16,-16,4,-11,1,3,-15,-18,-6,-11,-8,-6,5,-21,-8,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-7,-1,-21,-16,-4,-17,12,-18,-7,2,-15,5,18,-1,-4,-12,-25,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-23,-6,1,-22,-14,-7,-24,18,-23,-12,1,-10,4,21,5,3,-15,-25,-13,1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-23,-21,-12,-7,-24,-15,6,-15,13,7,-16,-13,-7,-11,-14,-5,0,-18,-7,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-17,-3,-3,-19,-2,-11,-18,-4,-19,-13,4,-14,-3,-1,14,5,-11,-30,-17,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-28,29,28,-32,-13,-1,-29,4,-22,-19,7,-8,13,-2,1,-8,-26,-31,-18,20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-26,-20,11,-28,-11,14,-24,30,13,-24,-28,-18,-18,-23,-9,8,-13,11,-20;
MA   /M: SY='I'; M=6,-22,-12,-28,-20,-3,-23,-23,15,-22,14,6,-20,-21,-18,-22,-10,-3,14,-23,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-28,-1,-5,-30,31,-11,-34,-5,-27,-17,1,-13,-6,-8,0,-14,-26,-23,-23,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-20,-18,-12,-4,-22,-2,-1,-11,0,3,-11,-18,-6,-7,-8,-5,-1,-18,1,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-31,-23,15,-27,-21,17,-26,29,15,-25,-27,-23,-20,-20,-6,14,-18,1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-26,-5,-2,-23,-12,-8,-20,1,-23,-15,2,19,-3,4,-1,-5,-22,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-5,-26,-22,-6,-23,-23,13,-19,7,8,-20,-20,-19,-20,-7,1,19,-27,-11,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-13,-27,-21,-6,-30,-23,22,-18,9,10,-23,-25,-13,-17,-11,-4,28,-27,-8,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-26,-28,-20,2,-24,-20,11,-22,18,11,-24,-25,-15,-18,-21,-9,4,7,3,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-21,-37,-28,47,-32,-22,14,-29,19,8,-23,-28,-32,-22,-21,-9,11,-4,16,-28;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-13,-7,-4,-15,-7,-11,-15,-9,-18,-13,2,-11,-5,-10,21,19,-6,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-31,-11,-2,-27,-17,-17,-18,-11,-27,-18,-16,66,-9,-19,-4,-7,-24,-31,-27,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,9,28,-24,-16,-3,-21,3,-12,-10,-2,-8,10,-4,-2,-8,-20,-28,-16,19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-25,37,8,-31,-4,-3,-29,-4,-23,-16,12,-12,0,-10,4,-5,-22,-35,-18,4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-16,-22,-16,-12,8,-26,-9,5,-20,19,6,-17,-24,-15,-14,-18,-8,1,-18,4,-14;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-21,6,8,-26,-2,-6,-25,0,-21,-15,4,-12,4,-2,6,-2,-19,-28,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,13,-32,-22,25,-30,41,19,-27,-28,-21,-22,-27,-10,13,-18,2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-18,-34,-28,14,-32,-27,28,-26,20,13,-26,-28,-27,-22,-18,-6,30,-19,1,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-21,-7,0,-13,-19,-9,-18,12,-13,-8,1,-16,-1,15,-3,1,-12,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-1,-6,-30,49,-16,-37,-14,-29,-21,2,-16,-12,-16,3,-15,-28,-24,-27,-9;
MA   /M: SY='G'; M=7,-1,-23,0,-3,-26,21,-14,-28,-11,-25,-19,2,-7,-9,-15,10,-4,-20,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-34,-10,-1,-28,-14,-19,-19,-10,-28,-19,-15,68,-9,-19,-2,-6,-25,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-20,-1,5,-25,2,-11,-23,0,-23,-15,1,-11,3,-4,11,0,-16,-27,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-24,3,6,-14,-19,-5,-10,-7,-7,-7,-5,-14,-1,-7,-7,-7,-9,-24,-7,1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-27,-6,2,-22,-18,0,-24,20,-18,-8,0,-16,12,32,-6,-8,-18,-21,-9,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-24,-37,-29,66,-29,-16,-2,-26,6,-2,-22,-30,-34,-19,-22,-12,-4,27,36,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22,9,-31,-20,24,-28,41,23,-27,-28,-19,-21,-27,-10,14,-19,1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,68,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,22,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-16,-31,-17,-10,-10,-17,-12,-11,-5,-7,-2,-15,-21,-3,3,-16,-13,-13,17,0,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-21,-15,-6,-10,-6,-17,-2,-18,6,1,-14,-20,-11,-17,-12,-11,-3,-23,-12,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-14,-32,-25,5,-30,-24,24,-25,26,15,-26,-27,-22,-22,-19,-7,22,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-18,-14,-22,-18,14,-9,-17,-6,-21,-1,-4,-11,-22,-20,-17,-3,-1,-4,-15,1,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-2,-25,-4,4,-25,-17,24,-18,0,-17,-1,3,-15,22,3,0,-7,-19,-25,-4,12;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-21,-14,-25,-20,0,-23,-17,9,-16,9,7,-16,-25,-16,-9,-13,-6,10,-22,-4,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-26,25,25,-29,-14,2,-29,5,-24,-19,10,-9,11,1,4,-5,-25,-32,-15,18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-33,-7,1,-27,-18,-9,-21,-4,-27,-16,-12,54,-5,-12,-5,-6,-25,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-23,-8,-2,-17,-14,-10,-11,2,-10,-5,-5,-16,0,5,-3,-5,-7,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-26,-24,-20,32,-28,17,-1,-17,4,5,-16,-28,-15,-12,-19,-11,-7,10,48,-19;
MA   /M: SY='L'; M=3,-18,-18,-22,-17,4,-12,-14,-2,-17,8,0,-16,-22,-16,-16,-10,-6,-2,-13,2,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-3,1,-24,2,3,-16,-7,6,-22,-4,-18,-12,1,-13,-1,-5,1,-6,-18,-22,-4,0;
MA   /M: M=-2,-6,-19,-9,-9,-9,-19,-8,-2,-11,0,-2,-5,-21,-9,-8,-7,-5,0,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-27,-28,-29,-20,2,-24,-21,3,-17,12,3,-26,-26,-15,-12,-23,-13,-1,22,5,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00539;
//
ID   RECF_2_MP; MATRIX.
AC   MP00618;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RecF protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8773575; R2=0.0142776; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=416; N_SCORE=10.807; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-31,-22,14,-29,-20,19,-27,37,18,-26,-27,-20,-19,-25,-9,11,-17,2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-11,-18,-9,-21,1,-18,-12,-10,-12,-11,-8,-10,-8,-18,12,1,-2,-22,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-26,5,29,-31,-17,6,-23,5,-19,-10,0,-7,29,1,3,-6,-25,-26,-14,29;
MA   /M: SY='A'; M=3,-20,-12,-25,-21,1,-3,-20,-2,-22,2,0,-14,-22,-20,-21,-9,-9,-1,-17,-7,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-26,9,21,-23,-18,3,-20,4,-15,-11,3,-12,11,5,-3,-8,-19,-28,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-20,-24,-20,-17,14,-27,-1,6,-22,21,8,-18,-27,-15,-16,-21,-10,-1,-7,19,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-21,-28,-20,8,-28,-17,18,-23,24,15,-22,-25,-16,-18,-18,-4,12,-17,4,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-23,-8,1,-17,-16,-6,-17,11,-16,-7,-2,-14,4,12,-2,0,-13,-22,-8,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-24,3,15,-23,-11,-3,-23,5,-19,-13,3,-11,8,5,2,-5,-19,-26,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-23,-4,7,-16,-22,-8,-5,-5,-1,0,-9,-14,2,-8,-7,-4,-4,-26,-10,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-15,-12,-10,-4,-15,-10,-9,-5,-8,-6,-3,-16,-8,-2,2,10,-4,-20,-3,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-23,0,-7,-28,29,-12,-33,-7,-26,-18,6,-17,-9,-8,1,-11,-25,-26,-23,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-26,-3,9,-20,-16,-9,-12,1,-13,-7,-4,-8,2,-1,-4,-5,-11,-25,-13,4;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-24,-2,0,-15,-18,4,-16,-5,-15,-9,-3,-9,2,-6,-5,-5,-16,-13,1,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-8,-14,-6,-28,-21,-22,-22,-14,-28,-20,-19,61,-14,-22,-9,-9,-25,-34,-30,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-27,3,-34,-27,35,-26,24,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-30,-22,20,-30,-14,16,-26,34,15,-27,-29,-20,-19,-26,-10,8,-9,16,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-8,-30,-21,5,-29,-22,16,-29,38,15,-27,-29,-21,-22,-25,-9,10,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-22,6,-31,-20,26,-27,39,24,-27,-27,-18,-21,-26,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-17,-34,-29,14,-32,-27,28,-25,18,12,-26,-28,-28,-22,-17,-5,32,-20,0,-29;
MA   /M: SY='F'; M=2,-19,-20,-24,-16,9,-16,-8,-3,-19,4,2,-15,-12,-17,-17,-9,-6,-4,-16,-1,-16;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-12,-7,-5,-19,-3,-14,-14,-10,-18,-14,0,-12,-6,-13,21,9,-4,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-23,13,41,-28,-17,12,-30,6,-21,-17,1,-6,14,-1,-2,-12,-29,-30,-15,27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-23,1,3,-21,-12,-8,-17,-5,-16,-12,0,0,1,-7,2,-2,-16,-27,-16,1;
MA   /M: SY='H'; M=-5,1,-24,-1,3,-21,-7,7,-21,0,-19,-9,5,-14,7,-1,3,-1,-19,-24,-7,4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-7,-30,-7,1,-21,-20,14,-30,26,-21,-9,1,-19,10,55,-10,-11,-21,-21,-6,1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-27,-9,2,-22,-21,-1,-19,17,-15,-4,-2,-18,17,38,-8,-9,-16,-21,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-25,2,10,-25,-9,-4,-22,4,-18,-11,1,-12,10,4,1,-5,-19,-23,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-21,-14,-6,-10,-19,1,-11,1,-4,-1,-9,-20,4,7,-9,-8,-11,-15,3,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,13,-31,-22,22,-29,41,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,15,-19,1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=5,-24,-11,-29,-20,4,-22,-20,12,-23,20,12,-22,-24,-18,-21,-15,-7,11,-20,-5,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-25,15,15,-28,-9,0,-26,4,-22,-14,6,-11,10,2,4,-3,-22,-30,-15,12;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-18,-19,-10,-1,-21,-13,-1,-12,9,2,-14,-21,-9,-4,-9,-3,0,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-18,-29,-22,4,-27,-23,20,-25,25,12,-24,-25,-20,-21,-16,-5,19,-22,-4,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-23,-3,4,-21,-10,-7,-19,3,-18,-11,0,-6,2,0,1,-2,-14,-26,-15,2;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-20,5,8,-27,4,-9,-26,-4,-24,-18,4,-7,1,-9,9,-2,-21,-30,-21,4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=0,-10,-18,-14,-10,-6,-16,-12,-3,-9,6,0,-9,-19,-10,-8,-6,1,-2,-20,-4,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=3,-9,-13,-11,-6,-16,-1,-11,-13,-13,-11,-6,-7,-16,-10,-16,-1,-6,-7,-25,-15,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-9,-23,-21,-5,-23,-24,12,-17,4,3,-18,-22,-20,-18,0,11,24,-29,-11,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27,49,-30,-22,9,-29,20,6,-24,-29,-32,-21,-23,-10,6,4,18,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-16,-33,-27,1,-32,-26,31,-24,15,16,-23,-24,-22,-23,-14,-4,30,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=13,-5,-9,-13,-10,-9,-10,-18,-12,-12,-13,-12,-2,-12,-11,-14,18,26,-3,-27,-13,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00539;
//
ID   PTN_MK_1_MP; MATRIX.
AC   MP00619;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTN/MK heparin-binding protein family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1047044; R2=0.0113778; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1610; N_SCORE=22.413; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=16,-9,-10,-15,-12,-13,-12,-20,-3,-12,-10,-8,-7,-14,-12,-15,15,18,9,-30,-15,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-26,22,24,-31,-17,-2,-26,3,-20,-16,5,-7,17,-3,4,3,-23,-30,-15,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=39,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,11,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-17,-20,-20,-17,16,-23,-8,-17,-11,-7,-13,-20,-20,-20,0,-7,5,-23,-20,-20;
MA   /M: SY='K'; M=9,-3,-24,-6,4,-27,-14,-13,-24,31,-24,-10,-3,-10,4,14,-4,-7,-14,-20,-13,4;
MA   /M: SY='K'; M=1,4,-25,-1,5,-27,-13,-9,-25,32,-26,-12,7,-12,5,17,-3,-7,-18,-23,-13,5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,10,-30,16,21,-32,-18,-6,-32,34,-28,-15,3,-8,10,17,-6,-10,-24,-25,-14,16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-32,26,29,-35,-17,-2,-30,3,-25,-20,2,12,15,-5,-2,-10,-30,-31,-20,21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,7,28,-30,-20,-6,-30,36,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-14,-22,-16,-12,-15,-10,-16,-4,7,-9,7,-13,-20,-9,0,-10,-8,6,-23,-11,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=3,-7,-23,-9,-1,-23,-18,-15,-16,27,-19,-7,-7,-13,-1,12,-6,-6,-4,-22,-12,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-27,0,11,-26,-4,-10,-26,15,-24,-14,-3,8,3,4,-5,-10,-22,-21,-17,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-23,-6,-5,-24,17,-14,-26,10,-23,-12,-2,-12,-5,1,-2,-11,-18,-17,-17,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-21,-8,-7,-26,19,-13,-24,-10,-22,-13,0,-14,0,-12,10,1,-18,-24,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-2,-21,-6,3,-24,-17,12,-17,-3,-15,-5,0,-12,19,-3,6,8,-16,-25,-6,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-23,-6,-13,-26,45,-16,-33,-16,-30,-20,4,-16,-13,-16,14,-6,-23,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-21,-25,-16,-11,-18,-21,-22,-2,-14,-16,-9,-19,32,-16,-18,-2,-2,2,-31,-21,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-17,-27,-24,-3,-30,-27,24,-20,7,7,-17,-20,-20,-20,-4,12,28,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,13,-13,3,-4,-16,-7,-7,-16,-7,-23,-16,23,-13,-4,-7,23,24,-13,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=6,8,-12,4,0,-20,0,-6,-20,-8,-30,-20,19,-12,0,-8,34,16,-14,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-30,-4,-1,-30,12,-14,-34,25,-30,-14,0,-14,-1,12,-6,-14,-24,-20,-17,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-17,-29,-20,2,-24,-19,17,-22,30,20,-26,-26,-17,-19,-19,-7,15,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-13,-17,-21,-18,25,-25,-13,-5,-16,-2,-5,-10,-20,-19,-13,0,21,-2,-7,19,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-16,66,-23,-19,-20,-26,-19,-30,-8,-20,-16,-13,-33,-16,6,-10,-10,-14,-39,-23,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-23,-7,-10,-25,28,-17,-29,-6,-26,-17,2,-15,-10,-9,9,2,-19,-25,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,4,-24,6,2,-29,20,-13,-29,-9,-22,-19,0,-12,-7,-15,3,-10,-21,-25,-24,-3;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-26,3,26,-31,-16,-2,-23,13,-20,-10,-2,-7,25,5,0,-8,-23,-23,-15,25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-17,3,17,-19,-16,-11,-19,-3,-17,-15,2,-6,3,-6,16,23,-13,-32,-15,10;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-10,24,-14,-5,-26,-24,-8,-27,2,-20,-10,-7,-24,11,15,-7,-10,-20,-31,-17,2;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-27,-22,-9,-11,-30,-12,15,-16,16,13,-16,-20,9,-12,-16,-10,2,-20,-4,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-23,-5,0,-20,-20,4,-23,16,-20,-9,1,-13,3,18,1,10,-14,-25,-6,0;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,70,-28,-26,-15,-30,-28,-13,-26,-11,-11,-16,-31,-25,-26,-6,1,-1,-41,-21,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-17,-26,-23,-4,-30,-26,22,-20,6,6,-16,-20,-20,-20,-3,15,25,-27,-7,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-6,7,-34,-20,-9,-20,-3,-26,-13,-13,54,15,-9,-6,-10,-30,-26,-23,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00540;
//
ID   PTN_MK_2_MP; MATRIX.
AC   MP00620;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTN/MK heparin-binding protein family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9296088; R2=0.0105346; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2370; N_SCORE=28.887; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=244; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-12,-16,-21,-18,24,-25,-14,-5,-16,-2,-5,-9,-19,-19,-13,1,22,-2,-8,17,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-23,10,36,-24,-17,-6,-24,3,-20,-18,2,-4,10,-4,11,7,-20,-32,-18,23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=10,-2,-13,-9,-5,-17,-13,-17,-15,0,-17,-12,0,-10,-5,-5,16,25,-5,-28,-14,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-4,-30,22,-15,-35,18,-30,-15,0,-15,-4,7,-5,-15,-25,-20,-19,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=7,7,-24,8,17,-32,-12,-2,-22,2,-19,-11,0,-8,23,-4,3,-7,-21,-25,-16,20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-23,3,22,-26,-20,-4,-20,3,-16,-10,0,-7,21,-1,7,12,-19,-27,-13,21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-15,-18,-14,-8,-20,-16,5,-13,-2,8,-6,-14,-8,-13,8,23,5,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,10,-30,-20,-1,-27,31,-24,-7,0,-13,25,37,-7,-10,-23,-20,-10,16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-23,-7,0,-20,-20,-11,-23,22,-20,-10,0,-13,3,27,1,12,-13,-24,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-27,-22,-8,-12,-29,-12,14,-15,15,13,-16,-20,10,-12,-16,-10,1,-20,-4,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-30,-4,5,-25,-20,9,-30,34,-25,-9,1,-15,10,41,-10,-11,-21,-21,-6,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-30,18,31,-35,-18,2,-28,15,-23,-13,3,-7,30,7,-2,-10,-28,-26,-15,30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-3,-26,35,-26,-6,0,-10,29,23,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='N'; M=8,13,-17,6,8,-22,-3,-4,-20,-3,-24,-18,21,-12,1,-7,17,4,-18,-34,-20,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=8,7,-24,11,19,-29,2,-9,-27,-3,-20,-19,0,-8,1,-11,3,-9,-21,-27,-22,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,40,-25,51,14,-34,-7,0,-34,-2,-30,-27,25,-12,0,-8,8,-4,-27,-40,-20,7;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-23,-17,-13,-18,12,-20,-15,-17,-7,-8,-13,-1,-15,-20,-5,-10,-12,-22,-21,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,15,-22,12,0,-25,3,-7,-27,2,-27,-18,17,-14,-3,-3,9,4,-21,-32,-18,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-17,-19,-12,-6,-25,-17,6,-16,14,6,-16,-21,-5,-12,-7,10,7,-25,-6,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=7,-11,-10,-18,-17,-8,-20,-23,3,-13,-3,-3,-11,-17,-17,-15,9,27,16,-29,-11,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-16,-2,4,-24,-10,-6,-18,-4,-23,-12,5,-10,16,-4,24,17,-14,-32,-15,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-13,-11,-9,-12,-16,-18,-4,-13,-13,-9,1,-12,-8,-13,21,29,1,-32,-12,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00540;
//
ID   TISSUE_FACTOR_MP; MATRIX.
AC   MP00621;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tissue factor signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3476667; R2=0.0127789; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1855; N_SCORE=28.043; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-19,-27,-23,-4,-31,-26,25,-21,7,7,-15,-18,-18,-21,-4,13,23,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,32,5,-25,-2,8,-25,0,-30,-22,51,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-7,-30,-7,-3,-6,-24,54,-17,-6,-13,0,-3,-22,13,-2,-12,-14,-23,-7,35,1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-10,-23,-23,-4,-26,-26,16,-16,3,3,-19,-23,-23,-16,1,18,32,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-23,18,3,-25,-16,-13,-23,-6,-21,-19,3,11,-6,-12,7,16,-17,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=1,-13,-14,-13,-9,-7,-13,-14,-2,-19,6,-2,-8,-19,-9,-14,9,7,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-5,-30,-3,6,-26,17,-8,-34,5,-24,-16,0,-15,0,17,-4,-14,-26,-22,-21,1;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,30,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,52,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-17,5,-3,-12,-5,3,-17,-6,-25,-17,25,-17,-2,-6,18,7,-18,-29,-4,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-18,-35,-27,65,-28,-20,-2,-27,7,-2,-17,-27,-35,-18,-14,0,0,4,24,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-17,-24,-17,-16,6,-8,-2,-6,-16,1,-2,-13,-25,-12,-14,-8,-6,-8,-3,24,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=12,-2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,38,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-28,48,25,-33,-10,2,-33,2,-28,-26,24,-10,5,-6,2,-8,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,59,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-25,-3,-5,-22,5,-9,-27,10,-24,-14,10,-16,-3,14,1,1,-20,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-12,-37,-10,11,-20,-20,-6,-22,-1,-20,-11,-14,-15,23,-3,-14,-17,-30,38,2,19;
MA   /M: SY='T'; M=10,-2,-10,-12,-10,-12,-16,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,40,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-24,-12,8,-7,-24,-8,2,-11,18,15,-17,-17,-1,-11,-17,-10,-4,-24,-7,4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,24,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00541;
//
ID   HTH_LUXR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00622;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LuxR-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3070159; R2=0.0176421; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=347; N_SCORE=12.419; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=11; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=1,-11,-18,-12,-7,-16,-15,-15,-4,-11,-10,-5,-6,-5,-5,-10,6,4,-2,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-22,18,-30,-20,19,-30,44,18,-28,-30,-22,-20,-28,-10,10,-16,4,-22;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-28,-1,10,-27,-16,-5,-22,8,-22,-13,-2,11,8,4,-2,-5,-22,-26,-17,7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-28,-9,1,-21,-20,-2,-28,27,-20,-9,0,-18,11,57,-7,-5,-19,-21,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,19,58,-31,-20,1,-29,10,-20,-19,0,-1,22,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-13,-14,-7,-14,-20,-11,-12,3,-10,-5,-6,-20,-2,13,-7,-5,-9,-18,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-26,11,30,-28,-17,-2,-22,4,-17,-13,2,-7,19,-1,1,-5,-23,-28,-16,24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-11,-33,-29,-1,-33,-28,33,-23,13,15,-26,-27,-25,-23,-14,-4,37,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-19,-30,-20,7,-27,-19,19,-25,37,21,-27,-27,-18,-19,-24,-9,12,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-22,-7,5,-19,-14,0,-20,5,-13,-7,-4,-16,10,10,-5,-7,-18,-21,-6,6;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-24,-27,-27,-16,1,-20,-13,0,-14,9,11,-24,-24,-9,-12,-24,-15,-7,24,9,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-13,-31,-24,2,-27,-24,16,-23,14,10,-23,-25,-20,-21,-16,-5,14,-8,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-13,-18,-11,-12,-10,-15,-4,-11,-4,-1,-11,-15,-9,-14,4,2,2,-22,-10,-11;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-23,7,10,-24,-11,-5,-19,3,-19,-11,5,-11,7,-3,4,-2,-16,-27,-14,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-24,-10,-20,-30,64,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-21,-20,-20,0,-19,-29,-22,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-12,-26,-13,-3,-6,-23,-3,-10,6,-1,2,-11,-19,0,3,-15,-10,-10,-14,2,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-16,-2,-3,-18,-8,-13,-17,-5,-19,-11,2,-8,-4,-6,17,18,-9,-32,-15,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-2,15,-17,3,-7,-13,-8,-2,-11,-6,-20,-13,27,-19,-6,-7,11,8,-12,-31,-10,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-28,-4,5,-22,-17,-9,-18,16,-20,-9,0,-13,7,8,-7,-8,-17,-11,-8,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-27,12,29,-29,-16,-2,-21,3,-16,-11,0,-7,19,-3,0,-8,-22,-28,-16,24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,31,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-13,-14,-9,-21,9,-18,-16,-11,-17,-13,-4,-11,-9,-18,15,2,-6,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-23,2,5,-18,-16,-8,-16,3,-14,-9,-2,-14,1,2,-2,-3,-11,-23,-9,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-6,-26,-8,4,-20,-21,-11,-4,2,-10,-4,-4,-13,5,0,-5,-7,-7,-23,-11,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-17,-29,-20,8,-28,-16,17,-26,41,23,-27,-28,-17,-18,-26,-8,9,-20,1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-9,4,-19,2,-9,-10,9,-6,-25,-12,-20,-15,8,-20,-11,-10,-1,-10,-21,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-17,-34,-26,0,-35,-26,31,-25,20,15,-22,-24,-20,-20,-20,-9,23,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-9,-4,-2,-21,-2,-9,-20,-5,-26,-17,5,-11,-2,-8,28,14,-10,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-26,0,16,-23,-14,-5,-18,-1,-17,-12,-1,5,2,-5,-1,-4,-19,-28,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-25,-2,1,-23,-11,-8,-24,20,-23,-12,4,-14,3,21,0,-2,-16,-25,-13,1;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,2,-10,-9,-10,20,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,8,-24,5,11,-25,-13,-1,-24,19,-27,-14,12,-12,9,11,5,-1,-21,-27,-12,10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-15,-17,-15,9,-18,-14,-3,-15,-7,-6,-3,-19,-16,-14,5,13,2,-19,2,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-5,-29,-5,-5,-10,-22,71,-21,-9,-15,0,2,-22,6,-2,-10,-15,-22,-17,29,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-18,-26,-20,-12,-10,-27,-11,5,2,3,6,-13,-21,-6,8,-16,-9,4,-21,-5,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-22,-8,-4,-17,-2,-7,-21,3,-18,-11,0,-16,-3,5,3,1,-15,-21,-8,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,23,-21,10,0,-20,-5,14,-22,2,-27,-16,39,-19,2,9,8,-1,-26,-36,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-21,-33,-25,0,-31,-25,32,-25,21,17,-23,-23,-20,-23,-16,-6,26,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-20,-23,-23,-14,10,-26,-5,4,-9,10,15,-18,-24,-4,-5,-17,-9,0,-8,14,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-25,-5,5,-22,-14,-4,-19,13,-16,-4,0,-14,10,19,-3,-5,-16,-24,-12,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-18,-31,-22,9,-30,-19,21,-27,38,23,-26,-27,-18,-20,-26,-9,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-26,6,1,-27,16,-3,-30,1,-28,-17,16,-16,-1,-1,3,-10,-27,-28,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-10,-26,-22,-5,-23,-25,15,-19,8,4,-21,-22,-21,-20,-5,3,25,-26,-11,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-3,-23,-6,-3,-19,-9,7,-18,-2,-18,-9,2,-10,-1,-1,2,-1,-14,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-3,22,-17,13,0,-22,2,3,-22,-5,-30,-20,35,-16,-1,-5,20,6,-22,-39,-19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-26,-4,-2,-18,-18,-7,-19,13,-11,-7,-3,-18,1,30,-9,-7,-13,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-14,-17,-12,-12,-21,-18,-1,-7,-7,-2,-12,-12,-7,-7,0,8,6,-26,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,7,22,-28,-18,5,-19,2,-16,-8,-2,-10,21,-2,-1,-8,-18,-27,-13,21;
MA   /M: SY='A'; M=19,-19,-16,-25,-15,-7,-15,-20,6,-19,14,5,-18,-16,-14,-20,-7,-4,6,-21,-11,-15;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-18,-29,-24,2,-26,-22,21,-20,8,6,-20,-22,-20,-21,-9,-1,23,-18,1,-24;
MA   /M: M=-5,-6,-18,-8,-8,-14,-19,-1,-7,-7,-5,-2,-4,-19,-4,0,-3,-2,-3,-28,-8,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-17,-24,-19,-9,2,-25,-8,3,-9,7,9,-16,-21,-7,-7,-14,-7,-1,-9,8,-9;
MA   /M: SY='A'; M=27,-13,-13,-20,-13,-11,-4,-18,-5,-14,-4,-5,-11,-15,-13,-18,4,0,2,-22,-14,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-16,-24,-19,-11,-6,-22,-12,3,-9,0,4,-12,-17,-8,-6,-11,-8,2,-19,-5,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00542;
//
ID   GMC_OXRED_1_MP; MATRIX.
AC   MP00623;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GMC oxidoreductases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3940902; R2=0.0157544; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=180; N_SCORE=8.220; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-27,-1,6,-20,-3,-9,-21,-4,-15,-10,-6,-1,-2,-5,-3,-5,-19,-23,-13,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-21,-26,-17,-10,-16,-22,-22,-1,-14,-9,-7,-22,30,-16,-19,-8,-3,1,-29,-20,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-14,-1,19,-21,-21,-8,-14,-3,-10,-8,-7,-12,10,-6,0,-2,-12,-29,-15,15;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-30,4,7,-25,-17,-10,-21,2,-16,-13,-6,15,1,1,-7,-9,-21,-27,-18,2;
MA   /M: SY='H'; M=0,-7,-20,-11,-8,-4,-5,6,-16,-13,-11,-8,0,-19,-9,-8,1,-5,-13,-22,-4,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-21,-18,-25,-19,0,-22,-18,14,-18,14,13,-19,-20,-14,-16,-12,-1,11,-9,-2,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-22,8,-4,-19,4,-5,-20,-7,-22,-14,17,-10,-5,-9,3,-5,-21,-17,-15,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-13,3,3,-22,10,-5,-26,-2,-23,-16,12,-15,-3,1,2,-8,-23,-27,-20,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,1,-30,5,6,-27,-17,-1,-29,20,-24,-13,2,-9,12,37,-5,-9,-23,-25,-13,6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-3,-2,-23,-2,-10,-23,2,-21,-13,-1,-9,-1,11,3,-1,-15,-26,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-21,-13,-29,-22,-1,-26,-20,20,-22,12,14,-15,-22,-16,-21,-12,-7,13,-23,-5,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-21,-1,-2,-8,-18,-7,-10,-7,-9,-9,-2,-15,-6,-10,0,3,-8,-20,1,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-20,-11,-25,-24,-2,-24,-18,3,-19,-6,-4,-16,-27,-19,-19,-15,-9,4,13,4,-21;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-27,-17,-11,-11,-11,-16,-12,-9,-15,-10,-15,17,-13,-12,-7,-8,-10,-18,-9,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-21,-9,2,-21,-17,-5,-23,16,-18,-10,-3,-17,9,38,-4,-7,-15,-23,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-18,-4,2,-24,-18,-5,-29,30,-25,-12,6,-17,6,38,-8,-9,-20,-25,-13,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-11,-23,-24,-11,3,-25,1,-22,-3,-2,-15,-24,-23,-21,-7,-4,10,-26,-16,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-31,-23,7,-30,-23,22,-27,36,16,-30,-29,-22,-21,-25,-9,19,-15,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-16,-5,-8,-21,18,-15,-24,-13,-26,-18,5,-13,-8,-13,24,13,-14,-32,-21,-8;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-11,-3,-4,-18,-2,-13,-18,-11,-24,-17,7,-11,-4,-11,32,27,-8,-36,-18,-4;
MA   /M: SY='L'; M=1,-14,-16,-15,-8,-7,-16,-15,2,-17,6,3,-11,-18,-9,-15,3,2,3,-29,-11,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-36,-28,1,-35,-27,39,-26,21,20,-24,-24,-22,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-20,19,0,-20,-1,14,-20,0,-30,-19,58,-20,0,0,9,-1,-30,-40,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=13,-11,-22,-14,-17,-19,39,-19,-28,-17,-22,-16,-3,-17,-17,-19,4,-11,-18,-19,-22,-17;
MA   /M: SY='M'; M=4,-13,-21,-18,-16,-13,7,-10,-4,-13,0,19,-11,-18,-8,-15,-9,-11,-4,-21,-13,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-5,-27,-23,-2,-22,-17,14,-19,8,18,-20,-25,-17,-18,-11,-3,18,-25,-4,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-21,-29,-24,-20,22,-24,5,-4,-12,-4,-4,-21,-27,-13,-13,-18,-11,-10,36,55,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-19,-25,-19,-6,-25,-21,14,-16,3,8,-19,-20,-11,-16,-7,2,16,-13,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-29,-9,1,-16,-21,0,-27,24,-18,-10,-1,-19,8,57,-9,-7,-19,-17,-4,0;
MA   /M: SY='G'; M=13,-13,-27,-13,-12,-27,25,-20,-26,-14,-24,-17,-8,12,-14,-20,0,-11,-21,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-12,20,-24,14,2,-20,-10,28,-25,0,-25,-14,27,-17,2,0,3,-4,-25,-33,-6,1;
MA   /M: SY='A'; M=8,-4,-22,-6,0,-22,-12,-12,-18,5,-17,-12,-3,-5,-2,6,3,-1,-11,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-15,1,4,-20,-5,-10,-17,-7,-16,-11,1,-13,-3,-10,9,0,-11,-31,-18,1;
MA   /M: SY='D'; M=-18,24,-29,35,8,-19,-17,-1,-24,-5,-16,-17,6,-15,0,-10,-6,-10,-21,-25,-3,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-24,-30,-25,44,-30,-5,6,-21,11,4,-22,-30,-24,-16,-21,-10,1,12,44,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,28,-25,37,22,-31,-10,1,-31,0,-27,-23,16,-9,5,-7,7,-4,-26,-36,-19,13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-23,10,12,-27,-7,4,-25,1,-23,-15,9,-11,11,1,7,-4,-22,-30,-15,11;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-32,-41,-33,-25,4,-20,-27,-12,-19,-16,-15,-30,-25,-17,-19,-25,-16,-20,99,19,-18;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-22,-8,6,-20,-6,-11,-15,-6,-10,-9,-9,-8,-3,-7,-1,-7,-10,-25,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-6,-25,-6,6,-24,-11,-12,-16,4,-19,-10,-4,-1,3,-1,2,-2,-13,-26,-16,3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-8,-22,-7,2,-15,-16,-11,-10,-5,-6,-6,-10,-12,0,-4,-5,-6,-8,-12,-10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-20,1,-7,-22,30,-12,-27,-7,-22,-15,2,-12,-9,-10,3,-9,-19,-19,-19,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=4,-2,-14,-6,-7,-11,-2,-9,-5,-10,-6,-2,2,-13,-6,-11,4,-1,-5,-22,-11,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-25,7,24,-21,-14,-4,-22,3,-19,-16,-1,2,8,1,-1,-6,-23,-13,-13,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-22,1,-2,-19,18,-7,-25,-5,-20,-15,6,-14,-6,-4,1,-5,-21,-19,-14,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-32,-43,-35,-27,12,-19,-24,-15,-18,-15,-11,-30,-28,-18,-18,-33,-25,-24,110,24,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-3,10,-21,10,-1,-19,-5,3,-23,-6,-22,-16,10,-15,-3,-6,9,3,-17,-27,-6,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-29,-18,-17,9,-22,-4,-7,-13,-6,-4,-16,-17,-12,-14,-16,-8,-13,27,29,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-3,15,-26,22,8,-27,-12,-6,-25,1,-19,-17,4,-5,1,-4,-2,-8,-20,-29,-15,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-25,21,5,-19,-17,8,-25,-1,-19,-16,6,-14,-1,-1,1,5,-19,-26,0,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00543;
//
ID   GMC_OXRED_2_MP; MATRIX.
AC   MP00624;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GMC oxidoreductases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5548954; R2=0.0156311; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=276; N_SCORE=9.859; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-5,-23,-7,-4,-20,1,-1,-16,-7,-17,-8,1,-17,0,-6,2,-5,-12,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-21,-13,-7,-8,-13,-9,-8,-6,-8,-1,-2,-17,1,-2,0,2,-8,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-11,-13,-13,-4,-13,-21,3,-11,-6,-8,-3,-7,-19,0,2,-5,-5,-7,-25,-6,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-5,-22,-7,-2,-12,-19,-6,-13,-1,-11,-8,-4,-9,-5,0,0,4,-9,-24,-7,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-16,-20,-20,1,-24,-22,11,-16,4,2,-15,-23,-20,-15,-6,3,20,-25,-7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-23,-14,-8,-5,-24,-7,-8,6,-8,-3,-9,-19,-6,10,-8,0,-2,-16,5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-16,-16,-11,-17,-7,-12,-8,-11,-8,-7,-11,-9,-12,-16,2,-1,1,-25,-15,-12;
MA   /M: SY='R'; M=0,0,-24,-5,0,-23,-7,-3,-25,16,-23,-12,6,-15,3,21,0,-6,-18,-24,-14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-28,3,1,-25,-2,0,-30,15,-26,-14,4,-15,2,18,-3,-9,-22,-23,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-29,11,40,-29,-13,3,-29,7,-20,-16,0,-5,18,3,0,-10,-28,-27,-17,29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-33,-24,1,-35,-27,35,-26,22,16,-24,-24,-21,-24,-18,-7,29,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,34,17,-29,-29,-23,-21,-22,-7,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='S'; M=15,-6,13,-10,-8,-20,-6,-16,-19,-14,-23,-17,0,-15,-8,-16,24,11,-7,-37,-21,-8;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-2,-16,-12,-20,6,-19,-16,-14,-14,-13,-7,-15,-12,-19,10,-1,-6,-26,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-11,-13,-7,-19,-3,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-8,-7,-16,19,12,-3,-27,-19,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-34,-26,15,-31,-26,25,-25,15,10,-21,-24,-25,-23,-14,-3,23,-17,2,-26;
MA   /M: SY='N'; M=0,4,-22,-2,-3,-16,6,-7,-19,-6,-20,-14,13,-17,-6,-5,4,-5,-17,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,84,-9,-19,-7,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-26,-7,4,-25,-15,7,-17,4,-13,0,-3,-14,23,6,-3,-5,-19,-22,-7,13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-34,-25,4,-34,-25,34,-29,32,20,-25,-25,-20,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-14,-24,-17,-1,-9,-23,-2,0,-5,7,20,-13,-18,14,-1,-14,-10,-8,-19,-3,7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-16,-25,-16,-7,-7,-24,-5,-5,-2,10,4,-11,-24,2,16,-17,-10,-9,-17,0,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,19,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-3,-32,3,2,-27,-10,-13,-21,-7,-23,-16,-6,36,-7,-13,-5,-9,-24,-29,-24,-5;
MA   /M: SY='A'; M=10,-7,-21,-10,0,-15,-8,-8,-19,1,-17,-11,-5,-6,-4,-5,2,-3,-13,-22,-12,-2;
MA   /M: SY='D'; M=1,11,-22,14,14,-27,-10,-1,-25,-1,-24,-18,8,-3,4,-7,10,0,-20,-33,-18,9;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-7,-27,-5,1,-9,-23,21,-12,-4,-9,0,-6,-19,2,-1,-11,-12,-12,-13,11,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-25,1,9,-27,-9,-4,-25,13,-23,-12,4,-12,15,16,4,-3,-21,-25,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-23,5,20,-26,-13,1,-24,4,-22,-15,2,-5,11,1,9,1,-20,-30,-15,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-20,-23,-16,-3,-24,-7,10,-18,16,10,-17,-23,-12,-15,-15,-8,9,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-27,4,-8,-30,37,-11,-34,-10,-28,-19,11,-17,-8,-12,2,-14,-28,-25,-25,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-33,-27,-1,-33,-28,36,-25,15,14,-22,-24,-22,-24,-13,-4,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-2,2,-25,3,4,-25,-13,-4,-23,2,-24,-16,2,10,-1,-2,5,1,-19,-30,-17,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-17,-15,-14,-13,-24,-21,2,-15,-4,-4,-18,8,-16,-17,-8,-1,7,-30,-16,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-17,-26,-21,-4,-27,-24,18,-13,8,7,-21,-24,-19,-10,-10,-1,26,-25,-8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=4,-17,-12,-19,-14,-10,-20,0,1,-14,2,4,-14,-22,-10,-13,-7,-6,7,-25,-4,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00543;
//
ID   RCC1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00625;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Regulator of chromosome condensation (RCC1) signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1082506; R2=0.0144371; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=735; N_SCORE=15.710; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=97; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=9,-25,-15,-27,-20,0,-22,-22,14,-22,24,10,-25,-25,-20,-20,-14,-5,17,-22,-8,-20;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,21,-22,-15,-20,-7,-22,-15,-15,-12,-12,-12,-17,-15,-22,5,-2,-2,-27,-22,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-5,25,-20,35,10,-30,-5,-5,-30,-5,-30,-25,15,-10,0,-10,20,5,-20,-40,-20,5;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-30,3,13,-27,1,20,-32,7,-25,-12,3,-13,5,2,-5,-15,-28,-25,-9,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-25,24,23,-30,-13,-5,-30,12,-27,-20,8,-7,8,2,7,-3,-23,-33,-18,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,4,-22,0,-10,-25,35,-10,-30,-13,-30,-20,17,-17,-10,-13,13,-5,-25,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,5,-27,0,5,-25,-15,5,-25,18,-23,-10,15,-18,19,38,-3,-7,-25,-25,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-40,-30,-25,20,-25,-5,-10,-15,-10,-10,-30,-30,-15,-15,-30,-20,-20,89,55,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-43,-40,-30,26,-22,-28,-15,-22,-13,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-23,117,30,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-20,49,-25,-28,-17,-6,-28,-16,-25,-14,-12,-18,-33,-28,-25,-8,-10,2,-37,-25,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-20,16,12,-23,-15,-10,-15,-5,-17,-15,0,-13,-3,-10,7,0,-5,-35,-17,4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-8,-30,-6,-1,-14,22,-4,-27,-10,-19,-15,-5,-18,-8,-13,-5,-15,-25,-9,2,-6;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,0,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,28,-27,43,9,-26,-15,-5,-24,-8,-8,-16,6,-15,-5,-13,-8,-10,-19,-35,-15,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=0,-5,15,-7,-4,-23,-13,-15,-25,2,-28,-17,0,-17,-4,-4,15,5,-13,-37,-20,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-10,17,-23,17,3,-25,-15,-2,-14,-2,-18,-11,14,-17,7,-5,0,-5,-11,-33,-15,5;
MA   /M: SY='A'; M=20,-3,-20,-5,15,-28,-10,-7,-17,0,-15,-10,-5,-8,16,-7,5,-5,-15,-22,-17,15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-30,-2,3,-30,1,-12,-32,34,-30,-12,0,-12,3,18,-8,-12,-22,-20,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,18,-25,29,35,-30,-13,-2,-30,3,-25,-23,8,-5,10,-5,9,-3,-25,-35,-20,22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-25,3,28,-25,-22,-5,-13,3,-13,-8,-7,-10,18,-2,-2,-8,-11,-27,-15,23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-9,-20,-16,-15,0,-20,-7,9,-17,21,19,-3,-25,-10,-12,-17,-7,-1,-25,-5,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-23,-3,0,-23,9,-10,-26,19,-23,-10,0,-10,0,9,-5,-10,-18,-15,-13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-23,54,15,-31,-8,0,-31,0,-23,-23,15,-8,0,-8,0,-8,-23,-31,-15,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-23,-24,-17,-8,-27,-17,16,-1,4,20,-17,-20,-9,-6,-15,-8,16,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-27,24,2,-27,-18,-13,-16,-8,-19,-17,-3,8,-10,-15,-5,-7,-8,-35,-20,-6;
MA   /M: SY='G'; M=7,6,-25,9,-7,-30,30,-15,-32,-12,-25,-20,3,-15,-12,-17,3,-12,-22,-25,-25,-9;
MA   /M: SY='B'; M=-13,24,-27,23,10,-30,-12,-2,-30,24,-30,-18,21,-13,5,12,-2,-7,-25,-31,-15,7;
MA   /M: SY='D'; M=-13,29,-23,35,3,-26,-12,-5,-19,-5,-21,-18,18,-17,-7,-10,0,-5,-11,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00544;
//
ID   RCC1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00626;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Regulator of chromosome condensation (RCC1) signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2868462; R2=0.0184184; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=115; N_SCORE=8.395; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-24,-7,2,-20,-18,-12,-11,7,-15,-7,-7,-7,-3,0,-4,-3,-5,-26,-13,-1;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-26,-9,-3,-22,-20,-12,-11,-8,-18,-10,-16,39,-6,-14,-9,-8,-13,-27,-19,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-17,-11,-5,-15,-17,-6,-8,3,-8,-1,-6,-17,-1,4,-4,-1,-3,-24,-8,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-21,-19,-13,-7,-20,-16,5,-15,8,3,-17,-8,-13,-12,-11,-4,5,-24,-10,-14; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-12,-22,-18,-6,-20,-22,15,-18,2,4,-16,-20,-17,-18,-3,2,21,-27,-10,-19; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-28,8,20,-29,-19,-4,-23,15,-21,-10,-1,-2,17,7,-3,-6,-21,-25,-14,18; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='H'; M=2,-1,-19,-6,-6,-11,-5,8,-14,-10,-10,-7,4,-17,-7,-9,-1,-5,-12,-24,-7,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-20,-14,-13,3,-23,-15,7,-19,18,5,-14,-18,-13,-15,-15,-4,2,-20,-3,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-15,-3,-1,-14,-13,-4,-12,1,-10,-7,1,-11,-2,4,-1,-3,-9,-24,-10,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-25,12,0,-25,4,-6,-24,-4,-23,-17,9,-4,-6,-9,0,-6,-20,-29,-18,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-25,-7,4,-21,-11,-7,-17,10,-16,-7,-5,-10,8,11,-5,-8,-14,-20,-10,4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-25,-3,4,-22,-15,-1,-18,12,-20,-9,2,-8,4,9,-3,-6,-14,-25,-11,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-19,-31,-25,3,-25,-24,26,-22,11,13,-21,-23,-21,-22,-12,-5,26,-22,-4,-25; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-16,-17,-17,-12,-9,-24,-18,3,-6,4,2,-14,-22,-11,-2,-9,-3,8,-26,-9,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-24,-1,5,-15,-18,1,-15,-1,-11,-6,-3,-15,10,-2,0,-4,-16,-22,-2,7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-16,-32,-28,-2,-30,-29,32,-22,11,11,-25,-25,-25,-23,-11,-3,39,-26,-8,-28;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-8,-13,-8,-20,3,-17,-16,-11,-18,-14,-3,-12,-8,-16,19,8,-6,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='C'; M=3,-16,71,-24,-23,-21,-12,-26,-27,-24,-20,-18,-14,-30,-23,-26,-1,-7,-11,-41,-28,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-22,3,9,-22,4,-6,-24,-6,-21,-16,3,-11,0,-9,9,-4,-19,-28,-18,4;
MA   /M: SY='H'; M=-11,8,-24,3,-1,-12,-7,18,-21,-6,-21,-11,15,-19,4,-5,2,-6,-23,-22,3,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=7,-3,-11,-8,-7,-14,-11,-16,-11,-11,-15,-12,2,-11,-7,-12,24,30,-3,-33,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=7,-25,-15,-28,-21,-1,-23,-23,18,-21,20,12,-24,-24,-19,-20,-13,-5,20,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=18,-20,-14,-26,-18,1,-15,-20,6,-18,11,6,-19,-20,-17,-19,-7,-4,10,-18,-8,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,20,-28,-28,-20,-21,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-3,-9,-12,-12,-19,-19,-6,-13,-6,-6,-7,-17,-14,-15,6,19,4,-31,-13,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-25,8,19,-28,-14,-2,-25,13,-23,-12,5,-9,17,9,5,-4,-22,-28,-15,18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-19,13,6,-24,-15,-7,-20,2,-15,-12,6,-14,1,-2,-1,-4,-16,-30,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-30,-4,-11,-28,39,-16,-34,-9,-27,-18,-1,-10,-13,-9,-2,-16,-27,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-19,-4,5,-21,-13,-5,-17,0,-13,-8,-2,-11,4,1,-1,-5,-15,-27,-14,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-18,-24,-19,-4,-27,-11,16,-18,13,12,-22,-22,-14,-16,-14,-6,20,-26,-5,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-18,-17,27,-27,-1,-3,-16,1,-2,-17,-18,-16,-14,-17,-10,-8,7,37,-18;
MA   /M: SY='T'; M=12,-2,-13,-8,-6,-18,-8,-15,-13,-9,-15,-11,-1,-11,-4,-12,17,21,-4,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-30,-23,-34,-25,29,-25,-24,-11,-19,-5,-9,-26,-24,-25,-17,-26,-17,-14,50,18,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-23,-9,-14,-28,52,-19,-36,-16,-27,-18,-2,-19,-17,-17,-1,-18,-26,-22,-28,-15;
MA   /M: M=-9,0,-22,0,-3,-10,-17,-6,-17,-3,-15,-12,0,-14,-2,-3,-5,-8,-17,-10,-2,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-25,4,-9,-19,21,-9,-24,-12,-22,-16,10,-20,-13,-13,-1,-11,-19,-24,-16,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-22,1,8,-24,-11,-8,-23,1,-20,-14,-1,1,3,3,0,-6,-21,-29,-18,4;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-18,-7,-5,-9,-22,15,-15,1,-12,0,-5,-20,0,3,-9,-8,-11,-19,8,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00544;
//
ID   GHMP_KINASES_ATP_MP; MATRIX.
AC   MP00627;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GHMP kinases putative ATP-binding domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7423586; R2=0.0062062; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=845; N_SCORE=6.983; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=767; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-30; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=4,8,6,20,-12,-29,7,-9,-8,26,-13,1,-33,-56,24,-36,-17,-4,-72,20;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-19,-35,-25,-6,65,-19,-7,-40,-20,-20,23,8,-29,-40,-3,-36,-30,-71,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-75,3,-23,-31,28,36,-40,-4,-36,-19,8,16,-27,1,3,-20,2,-65,61;
MA   /M: SY='E'; M=-20,-75,4,40,24,-31,-18,7,24,-35,-20,22,24,-24,-7,-4,-8,-18,0,-59;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,8,-14,12,-52,-74,14,1,12,1,-37,34,-68,-24,-28,-64,9,-81,-65; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=1,-19,-6,-54,-39,3,27,-66,28,-52,-63,-12,47,22,2,20,20,-4,-78,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-77,-35,-41,-82,81,-21,-83,-41,-83,-72,-12,63,-63,-72,4,-21,-79,-77,-76;
MA   /M: SY='F'; M=14,-18,-80,-74,50,-77,1,22,-72,38,43,-73,-77,-33,-72,-65,-20,34,-67,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-43,-77,53,31,-75,-45,50,-48,47,-54,-66,18,-66,-46,31,3,-19,-49,-83,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-21,-18,-83,-79,21,-36,-77,66,-76,38,-10,-76,-78,-74,-77,-44,-58,43,-72,-53;
MA   /M: SY='R'; M=-41,-73,-34,21,-60,-72,36,-21,11,-10,-54,-13,-70,-24,38,14,15,34,-74,30;
MA   /M: SY='I'; M=-20,20,-81,-46,7,-82,-76,64,-72,-3,49,-74,-76,-33,-43,-67,-34,58,-76,-56;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-19,-73,4,26,-36,-30,17,0,29,-67,-21,0,-66,-23,21,37,15,-29,26,5;
MA   /M: SY='S'; M=-37,5,-55,-37,-73,47,-59,-71,28,-22,-1,53,-68,-54,-57,54,-16,-46,-80,-69;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-73,30,34,-78,14,-15,-48,-10,-77,-69,77,-1,-7,-19,-10,-7,-48,-86,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-73,-85,-81,-49,-88,-81,82,-77,23,8,-78,-77,-75,-79,-72,-57,55,-77,-57;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-91,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-25,-84,-70,-72,126,-65,-73,-63,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='L'; M=-21,-73,-20,-24,-55,-49,27,20,-26,44,18,7,29,2,-66,-14,-8,1,-76,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=37,-70,-64,-68,-80,79,-69,-80,-66,-80,-71,-52,-67,-62,-72,41,-19,-71,-77,-74; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=36,-18,-64,-57,-73,-18,-60,-72,-43,-21,-63,-55,-71,-49,78,52,-32,-65,-78,-66; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-84,-76,-41,-85,-67,-32,-77,89,45,-82,-83,-69,-74,-77,-63,-40,-71,-53;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-72,-61,-69,-80,86,-67,-84,-65,-83,-74,-48,-67,-60,-71,63,-54,-77,-76,-74;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='A'; M=84,-63,-65,-61,-76,20,-67,-69,-62,-71,-64,-57,-66,-58,-67,41,-50,-57,-77,-71;
MA   /M: SY='A'; M=76,-16,-63,-59,-75,-34,-66,-68,-60,-70,-64,-54,-65,-56,-65,62,17,-56,-79,-69;
MA   /M: SY='A'; M=50,6,-74,-69,20,-65,-69,11,-69,37,-14,-67,-74,-65,-71,27,-54,12,-71,-25;
MA   /M: SY='I'; M=19,20,-59,56,-62,-73,-70,59,-61,-20,-50,-65,-67,-56,-67,2,-18,21,-79,-65;
MA   /M: SY='V'; M=11,31,-79,-74,-55,-77,-77,12,-72,0,36,-18,-77,-72,-74,-63,-32,81,-84,-62;
MA   /M: SY='A'; M=71,6,-69,-66,-70,43,-70,-60,-66,3,-58,-60,-69,-63,-70,5,-55,-1,-76,-70;
MA   /M: SY='G'; M=39,-68,-69,-70,-66,54,-72,14,-68,0,-17,-59,-69,-66,-73,-32,36,15,-77,-67;
MA   /M: SY='I'; M=25,-70,-75,-73,-55,28,-74,46,-72,33,-44,-68,-73,-69,-75,-38,1,31,-75,-27;
MA   /M: SY='M'; M=28,-18,-67,10,-31,-32,-20,11,9,2,42,-65,-71,-28,-36,-57,8,36,-72,23;
MA   /M: SY='A'; M=69,-65,-72,-67,5,-2,-70,10,-67,13,3,-65,-70,-64,-70,-10,-7,1,-73,-61;
MA   /M: SY='A'; M=58,5,-76,-70,6,-19,-72,29,-70,30,5,-70,-74,-68,-73,-57,-34,21,-73,-59;
MA   /M: SY='N'; M=-30,-18,30,-19,-37,-59,-50,-28,-2,-14,-21,92,-71,14,-18,10,-51,-68,-1,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=22,-74,5,43,-70,-10,18,-71,6,-51,-63,0,-66,44,16,-11,8,-31,-73,23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-70,-76,-6,32,-35,-20,-6,-72,64,7,-75,-78,-67,-72,-28,-61,8,2,8;
MA   /M: SY='F'; M=18,20,-73,-72,73,2,2,-34,-44,10,-16,-16,-76,-69,-70,-14,0,-7,-58,33;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-74,29,-2,-79,59,-17,-31,-12,-77,-69,58,-34,14,-36,-10,-57,-33,-81,-71;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00545;
//
ID   RIBOSOMAL_S19E_MP; MATRIX.
AC   MP00628;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S19e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2518039; R2=0.0149706; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=605; N_SCORE=14.299; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=16,-6,-18,-9,0,-21,-4,-12,-20,2,-19,-13,-2,-12,-1,5,10,1,-11,-25,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-21,-32,-23,30,-29,-14,14,-26,29,18,-25,-28,-22,-18,-25,-10,6,-7,15,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-13,-9,-3,-20,-13,-8,-25,10,-19,-11,0,-18,2,27,-2,1,-16,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-24,-5,2,-21,-20,-11,-23,27,-20,-9,-1,-12,3,24,-2,7,-13,-23,-10,2;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-20,-29,-24,1,-28,-19,24,-22,9,9,-18,-22,-19,-22,-10,-4,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-30,-17,-17,23,-29,22,-4,-5,-3,-1,-17,-28,-7,-6,-19,-11,-12,23,70,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-16,-30,60,-17,-38,-17,-29,-18,0,-19,-13,-17,2,-18,-29,-21,-28,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-28,-1,-14,-30,56,-17,-38,-17,-30,-21,3,-18,-16,-18,3,-16,-28,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-23,-5,0,-20,-15,-4,-24,14,-21,-12,6,-16,8,32,5,4,-17,-26,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-27,-4,6,-24,-21,-6,-22,30,-22,-7,-3,-13,14,20,-7,-5,-16,-18,-4,9;
MA   /M: SY='R'; M=-16,6,-27,2,1,-21,-13,2,-27,19,-23,-14,17,-19,7,45,-2,-6,-23,-27,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,7,-27,0,-1,-17,-14,4,-24,18,-22,-13,18,-20,5,37,-4,-7,-23,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-30,-9,-17,-29,57,-10,-39,-15,-29,-18,1,-20,-16,-11,-1,-19,-29,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-13,-16,-15,-7,-19,-9,4,-14,-7,0,-10,-20,-13,-13,7,10,14,-28,-4,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-15,-13,-4,-16,-19,-4,-20,12,-16,-8,-6,-19,0,27,-6,-7,-11,-20,-6,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-21,0,7,-21,-9,1,-20,-6,-24,-16,6,6,0,-10,12,1,-19,-31,-15,2;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,4,-24,-20,67,-29,5,-22,-2,7,-17,14,10,-9,-17,-28,-27,10,5;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-20,-24,-26,-18,42,-27,7,-10,-14,-2,-1,-12,-26,-21,-5,-17,-12,-9,1,27,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-12,17,-17,-13,-14,-21,-14,-16,-7,-15,-10,-8,-23,-7,1,0,3,-7,-29,-10,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-27,3,4,-23,-20,-9,-22,24,-18,-9,-2,-15,2,23,-8,-6,-13,-24,-11,2;
MA   /M: SY='G'; M=16,-8,-14,-11,-12,-24,29,-18,-26,-15,-24,-17,-1,-15,-12,-18,13,-4,-16,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=12,0,-12,-2,-2,-21,5,-11,-21,-10,-28,-19,9,-11,-2,-11,33,15,-11,-37,-21,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-30,-3,-13,-30,51,-17,-39,-10,-29,-19,1,-18,-14,-10,-1,-18,-29,-21,-26,-14;
MA   /M: SY='N'; M=9,6,-17,-1,-5,-22,11,-9,-22,-5,-26,-17,16,-14,-5,-9,16,2,-17,-31,-21,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-5,-34,-29,-3,-33,-30,31,-24,10,10,-24,-26,-25,-25,-13,-5,35,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-20,-14,-12,-14,-17,-17,7,-15,-3,-2,-4,-13,-8,-18,0,-2,3,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-27,-2,3,-21,-19,2,-25,27,-24,-10,5,-14,5,23,-5,-3,-19,-20,-3,3;
MA   /M: SY='V'; M=19,-21,-15,-28,-21,-8,-19,-25,17,-18,5,4,-19,-19,-19,-22,-4,-3,23,-23,-12,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,19,-39,-20,14,-20,9,-20,0,0,-10,58,10,0,-10,-30,-20,-9,38;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-2,-20,-5,9,-29,-12,-3,-17,0,-19,-7,0,-10,27,-2,11,2,-17,-25,-15,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,56,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,24,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-24,0,5,-25,-8,-8,-23,12,-19,-10,-1,-12,3,3,-2,-3,-16,-24,-13,4;
MA   /M: SY='I'; M=4,-21,-21,-28,-18,-5,-23,-18,19,-19,16,18,-18,-19,-10,-20,-12,-6,11,-21,-6,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-29,-4,-7,-29,30,-13,-34,7,-30,-16,5,-16,-7,1,-2,-14,-26,-22,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-26,-34,-26,12,-30,-18,21,-23,17,18,-25,-26,-18,-20,-23,-11,12,5,12,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-32,-29,1,-32,-29,32,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,18,42,-30,-13,-3,-29,10,-22,-18,1,-5,14,0,-1,-10,-26,-29,-19,28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-7,3,-23,-22,-11,-19,30,-18,-5,-4,-14,6,21,-9,-5,-12,-21,-9,4;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-24,22,5,-25,-15,11,-21,-7,-20,-14,8,-14,-2,-10,4,-1,-15,-35,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-32,-1,12,-29,-18,-12,-22,-2,-24,-17,-10,40,3,-8,-3,-5,-25,-28,-23,5;
MA   /M: SY='B'; M=-8,24,-25,23,12,-28,-3,-1,-28,7,-28,-20,24,-13,2,0,5,-5,-26,-33,-19,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-3,-17,-31,63,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-29,-8,-12,-27,37,-12,-36,-2,-27,-17,4,-19,-9,8,-3,-16,-27,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-13,-7,-18,-10,-8,-20,12,-17,-9,-4,-21,-1,37,-4,-6,-9,-23,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-13,-27,-14,-5,-15,-23,-9,-14,19,-8,-3,-8,-20,1,37,-13,-9,-7,-21,-8,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00546;
//
ID   IMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00629;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Inositol monophosphatase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7522116; R2=0.0138987; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=204; N_SCORE=7.578; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-17,-8,0,-18,-4,-15,-14,-10,-16,-13,-2,-5,-7,-14,5,0,-10,-27,-18,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-3,-16,-12,-8,-14,-17,4,-16,3,0,-11,-17,-13,-16,-7,-4,5,-22,-10,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-28,14,22,-27,-13,-2,-25,2,-21,-17,-1,2,6,-6,0,-8,-23,-27,-14,13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-18,0,15,-18,-14,-4,-17,-4,-16,-13,-3,-9,2,-8,5,-3,-12,-28,-13,8;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: M=-2,-6,-19,-6,-4,-16,-3,-12,-14,-9,-10,-8,-4,-12,-4,-10,0,-3,-11,-25,-14,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-2,-27,-1,-6,-17,18,-7,-26,-11,-20,-15,1,-18,-10,-11,-2,-10,-21,-16,-10,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-14,-3,3,-9,-13,-7,-5,-5,-6,-5,-3,-9,-2,-4,3,3,-3,-18,-5,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-13,-4,-2,-9,-8,-2,-8,-7,-10,-7,0,-12,-3,-8,2,-2,-6,-18,-5,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-8,-9,-18,-10,-3,-17,-9,-12,-9,-7,-8,-6,-7,-16,-7,-6,-7,-8,-6,-26,-14,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,0,-20,1,-1,-19,-1,-9,-17,-1,-17,-11,1,3,-1,-4,2,-1,-15,-22,-15,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-20,6,8,-22,-11,5,-22,1,-18,-12,3,-7,5,-1,3,1,-18,-27,-11,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-25,9,9,-21,-9,-6,-23,0,-21,-17,5,-5,1,-5,1,-4,-21,-15,-13,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-26,11,6,-27,4,-9,-24,-5,-21,-16,4,-10,0,-7,2,-7,-20,-28,-19,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: M=-11,-19,-26,-18,-12,-6,-23,-10,-4,-8,-3,-3,-15,-5,-10,0,-12,-6,-4,-13,-1,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-18,-20,-15,1,-27,-5,4,-13,1,4,-12,-20,-10,-9,-6,5,4,-18,7,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-43,-39,-30,17,-22,-29,-14,-21,-14,-15,-37,-30,-23,-20,-35,-25,-20,120,27,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-23,-11,-27,-22,1,-26,-23,23,-21,12,9,-19,-21,-19,-20,-12,-4,23,-20,-4,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,35,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,4,-35,-26,35,-29,32,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,23,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-19,-14,-9,-3,-22,-9,-10,3,-10,-4,-8,-18,-5,5,-3,5,-4,-15,5,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-24,12,8,-26,5,4,-24,0,-27,-17,34,-16,8,-2,6,-5,-30,-33,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-33,-26,58,-27,-11,-1,-23,6,-1,-19,-28,-30,-18,-17,-9,-2,11,36,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-19,-29,-23,0,-30,-25,26,-23,18,12,-20,-23,-20,-21,-12,2,23,-24,-5,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-15,1,-29,0,5,-22,-18,29,-28,15,-23,-9,8,-13,8,20,-7,-11,-24,-25,-1,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-28,-7,-13,-27,43,-15,-34,-10,-26,-17,2,-19,-12,-7,0,-15,-25,-22,-25,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-12,-23,-15,-12,7,-24,-12,4,-17,2,0,-8,-20,-13,-14,-8,-4,1,-18,2,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-3,-31,4,2,-27,-9,-12,-22,-6,-25,-18,-6,46,-7,-11,-5,-9,-25,-27,-23,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-5,-17,-9,-6,3,-16,4,-3,-10,-2,1,-2,-16,-5,-8,-7,-5,-5,-15,2,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-23,-30,-25,36,-28,-10,6,-20,4,1,-21,-28,-24,-17,-15,-7,5,11,33,-24;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,9,-16,-12,-19,-6,-20,-17,-10,-17,-13,-7,-16,-12,-15,10,6,-5,-29,-20,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-14,-27,-25,0,-28,-27,23,-20,6,6,-23,-22,-25,-20,-6,3,34,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-2,-4,-6,-17,-4,-7,-17,-12,-19,-13,10,-17,-6,-12,18,7,-12,-37,-18,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-25,-32,-22,2,-34,-22,30,-24,22,17,-21,-23,-13,-21,-19,-9,19,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-14,-15,-15,-24,30,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-16,-15,-20,7,-8,-14,-22,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-18,-33,-25,16,-31,-23,22,-28,29,14,-26,-28,-24,-22,-22,-8,17,-16,4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-20,-25,-16,7,-23,-20,7,-17,6,2,-17,-21,-16,-14,-9,-3,8,-13,-2,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-12,-25,-9,5,-14,-24,-11,-5,1,-10,-5,-13,-4,-4,-3,-8,-7,0,-23,-8,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-20,9,5,-23,-6,-2,-23,3,-23,-14,16,-16,4,3,4,-5,-22,-30,-15,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00547;
//
ID   IMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00630;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Inositol monophosphatase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9503274; R2=0.0144574; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=200; N_SCORE=7.832; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=20,0,-20,0,25,-25,-10,-10,-20,0,-15,-15,-5,-5,5,-10,5,-5,-15,-25,-20,15;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-11,-14,-3,-19,-9,-18,-7,-10,-9,-8,-10,-12,-8,-18,3,-4,0,-24,-18,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-7,-14,-10,-4,-10,-7,-5,-9,-6,-1,-8,-13,-6,-11,3,3,-2,-12,2,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-28,-12,-19,-24,54,-18,-31,-20,-20,-13,-2,-21,-19,-19,-4,-18,-24,-21,-25,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-24,-11,-3,-17,-14,-6,-20,13,-15,-7,-3,-18,4,30,-3,-3,-13,-21,-9,-2;
MA   /M: SY='L'; M=5,-24,-11,-29,-21,12,-22,-20,8,-22,15,5,-22,-25,-22,-20,-13,-6,10,-15,1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,32,-29,46,16,-37,-11,-3,-33,-1,-28,-25,11,1,3,-10,1,-8,-27,-36,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-3,-22,-18,-14,-3,-19,-6,-19,-5,-5,-12,-20,-15,-21,-2,-5,0,-25,-16,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-20,-26,-23,-19,30,-26,2,-3,-10,-2,-2,-18,-26,-16,-10,-16,-9,-6,19,48,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-26,-27,-27,-23,13,-26,-18,6,-19,2,2,-24,-18,-20,-18,-19,-11,4,19,14,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-26,19,29,-27,-14,-3,-29,7,-22,-19,4,-7,10,6,4,-1,-24,-31,-18,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-25,-19,-16,7,-17,-5,-2,-14,3,4,-14,-19,-14,-10,-15,-10,-4,-9,8,-16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-28,-5,-8,-26,30,-12,-29,-5,-24,-13,3,-17,-8,-4,-2,-12,-23,-23,-22,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-5,-18,-9,-3,-25,-18,4,-17,10,3,-15,-19,-13,-15,-9,3,5,-24,-7,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-27,-6,-3,-16,-7,5,-25,9,-23,-11,3,-17,1,10,-4,-10,-21,-11,-3,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-15,-17,-17,-5,-16,-22,-20,1,-10,-7,-4,-13,2,-9,-15,-6,-6,-1,-27,-15,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-38,-46,-38,-30,10,-21,-28,-16,-20,-17,-17,-38,-30,-20,-20,-37,-27,-23,132,29,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-3,-22,-19,-7,-24,-5,4,-17,-1,6,-13,-22,-14,-16,-4,4,9,-28,-4,-18;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,9,-21,-13,-20,-4,-21,-13,-13,-11,-11,-11,-14,-13,-21,7,-1,-1,-24,-21,-13;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-11,-21,9,-20,-14,-11,-14,-12,-8,-11,-11,-20,10,-2,-4,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-25,-11,-16,-27,44,-19,-30,-17,-26,-18,-3,-11,-16,-19,5,-12,-21,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-7,-21,-8,-2,-13,-16,4,-10,-10,-10,-6,-5,-18,-5,-11,-5,-7,-9,-16,-3,-4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-10,-30,-23,1,-27,-25,19,-24,17,8,-24,-22,-22,-23,-15,-6,20,-23,-7,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-27,3,-36,-26,40,-29,28,21,-23,-23,-20,-26,-22,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-5,-30,-24,-2,-27,-26,19,-23,17,9,-25,-27,-23,-22,-14,-5,24,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-26,-5,8,-21,-15,1,-20,9,-16,-8,-1,-14,7,14,-4,-6,-16,-22,-8,6;
MA   /M: SY='E'; M=2,6,-26,11,44,-28,-16,-4,-26,8,-18,-18,-2,-2,14,-3,2,-8,-24,-28,-20,29;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,-11,-20,-12,-16,-5,-19,-4,-11,-7,-4,-11,-13,-11,-18,8,3,5,-23,-17,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-30,66,-14,-40,-20,-30,-19,0,-20,-19,-19,0,-20,-30,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-20,-21,-15,-7,-22,-12,2,-8,2,3,-15,-18,-11,-7,-13,-7,3,-19,-4,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-12,-30,-27,0,-30,-22,27,-22,14,14,-25,-27,-23,-21,-14,-4,33,-26,-4,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-10,-18,-16,4,-19,-13,-5,-17,-3,-4,-8,-19,-15,-14,4,17,2,-24,-3,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-13,35,-27,48,16,-34,-7,-4,-34,-2,-25,-25,14,-11,-1,-10,2,-5,-25,-36,-19,7;
MA   /M: SY='A'; M=3,-19,-22,-23,-13,2,-18,-17,1,-17,1,1,-17,-15,-14,-18,-8,-6,0,-6,-1,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-8,13,-22,10,3,-20,-11,5,-23,0,-21,-13,14,-14,3,1,6,4,-19,-31,-11,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-23,-9,-15,-21,41,-17,-32,-17,-25,-18,-4,-9,-17,-18,-3,-16,-25,-19,-22,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-26,3,7,-27,8,-9,-28,4,-25,-17,4,-9,1,1,3,-8,-22,-27,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-1,-22,3,11,-26,-15,-7,-22,-5,-22,-16,-3,18,0,-11,-1,-5,-21,-31,-20,4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-23,-18,-15,6,-19,-14,1,-21,17,3,-17,-24,-17,-17,-17,-9,-2,-10,0,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-27,17,3,-21,-11,-6,-20,-4,-19,-15,7,-11,-2,-9,-1,-3,-19,-22,-9,0;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-23,-26,-19,20,-24,-10,6,-17,11,5,-16,-26,-18,-12,-17,-9,2,-5,18,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-22,4,-2,-18,-3,-8,-17,-6,-15,-8,8,-13,-4,-7,2,0,-15,-29,-15,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: M=-2,-4,-22,-3,0,-20,-13,-11,-14,0,-12,-8,-3,-7,0,-4,0,-2,-10,-28,-14,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00547;
//
ID   CYTOSOL_AP_MP; MATRIX.
AC   MP00631;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytosol aminopeptidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9966531; R2=0.0151689; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=493; N_SCORE=12.465; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,54,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-30,-29,4,-31,-23,29,-20,10,10,-27,-29,-26,-20,-13,-3,39,-20,4,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-2,-19,-4,5,-18,-16,-9,-21,5,-18,-13,2,-12,2,15,12,18,-12,-29,-13,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-16,-13,-13,-13,-1,-14,-10,-12,-10,2,-3,-14,-8,-12,10,19,-5,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-20,-25,-23,-17,10,-26,4,5,-8,12,21,-19,-26,-6,0,-20,-10,-2,-2,28,-14;
MA   /M: SY='S'; M=0,7,-16,11,2,-20,-6,-9,-19,-11,-19,-17,7,-13,-3,-11,21,9,-12,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,9,-29,-20,-6,-22,24,-22,-7,0,-10,21,15,0,3,-19,-22,-10,15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-13,-30,-27,-3,-27,-29,27,-20,8,8,-26,-26,-26,-21,-8,-1,40,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-13,-23,-24,-22,-4,-27,-17,27,-19,7,15,-3,-21,-14,-19,-12,-6,17,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-21,-19,-16,-9,-4,-18,-5,-12,4,0,-13,-23,-15,-2,-9,-2,0,-23,-12,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-6,33,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,51,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-32,-24,5,-31,-21,28,-25,33,25,-26,-26,-18,-21,-23,-9,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,43,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=22,-9,-18,-14,-14,-23,26,-20,-22,-14,-18,-14,-4,-14,-14,-19,7,-1,-12,-21,-23,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-20,-13,-12,-3,-9,-19,-14,-13,-11,-13,-12,-16,-15,-19,-4,-7,-9,7,-5,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-27,-19,-17,14,-28,8,-2,-2,-3,-1,-17,-28,-8,7,-16,-9,-4,10,47,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=5,-11,13,-15,-7,-23,-17,-13,-13,-10,-15,-8,-9,-20,5,-12,4,-2,-6,-31,-18,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,2,-30,6,30,-31,-20,1,-27,21,-22,-11,0,-8,28,19,-3,-10,-27,-24,-14,28;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,12,-27,12,8,-17,-16,0,-23,6,-20,-11,10,-15,15,2,-3,-9,-24,-23,-7,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,-2,-25,-8,-8,-6,-2,-10,-18,3,-13,-8,6,-20,-10,-1,-8,-10,-17,-20,-9,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-7,-11,-3,-28,-22,-19,-25,4,-28,-17,-14,37,-8,-7,-10,-10,-23,-31,-24,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00548;
//
ID   RIBOSOMAL_S4_MP; MATRIX.
AC   MP00632;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S4 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6493649; R2=0.0167802; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=385; N_SCORE=12.100; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=27,-1,-16,-8,-3,-24,-1,-13,-17,-1,-17,-12,0,-11,-3,-10,7,-3,-10,-23,-19,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,1,-21,-1,0,-20,-6,-7,-18,2,-17,-10,4,-13,-1,4,1,-3,-13,-26,-15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-24,-5,2,-21,-16,-4,-22,20,-18,-8,1,-14,6,25,-4,-4,-15,-22,-10,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-16,-20,-20,-11,-7,-21,-12,2,-9,11,9,-14,-20,-5,-4,-11,-4,1,-22,-6,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,12,-30,18,14,-29,-17,-2,-30,19,-26,-16,4,-3,6,11,-5,-9,-24,-26,-12,9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-2,-29,0,-10,-21,31,-11,-29,-14,-22,-16,-1,-18,-13,-15,-3,-14,-23,-18,-13,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-6,-19,-7,-12,-13,-19,-16,4,-10,-8,-4,-4,-15,-12,-11,-1,-1,10,-31,-13,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-15,-17,-12,-2,-21,-16,-2,-16,6,-1,-9,-16,-13,-13,3,21,1,-25,-5,-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-24,-7,-13,-21,36,-16,-29,-15,-24,-16,1,-17,-14,-16,6,-9,-21,-24,-22,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-23,2,13,-14,-20,-5,-9,-7,3,-4,-3,-15,2,-7,-8,-6,-13,-27,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,12,-20,2,-2,-17,-11,-3,-12,-1,-19,-11,20,-16,-1,-4,6,4,-13,-31,-13,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-17,-27,-19,7,-28,-20,17,-23,28,15,-25,-26,-20,-18,-18,-3,17,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-24,-20,-4,1,-28,-15,9,-16,17,8,-19,-18,-10,-14,-17,-8,3,-20,-2,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-24,8,4,-23,-9,-6,-19,0,-18,-11,6,-14,6,-3,2,-4,-17,-27,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-29,-21,13,-29,-19,20,-25,27,17,-22,-26,-20,-20,-21,-8,14,-18,2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,9,-30,-19,21,-29,47,22,-29,-29,-19,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-30,20,56,-30,-19,0,-30,10,-20,-20,0,-1,19,1,0,-10,-29,-30,-20,37;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-20,-12,-5,-17,-11,-5,-19,10,-14,0,-2,-18,3,27,-3,-4,-13,-24,-12,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,46,22,-39,-13,2,-33,3,-26,-21,13,-9,18,-4,0,-10,-30,-34,-17,20;
MA   /M: SY='N'; M=1,13,-15,-1,-7,-13,-10,-7,-12,-7,-17,-12,22,-16,-7,-8,12,18,-11,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-18,-29,-24,2,-29,-24,25,-22,15,12,-22,-24,-20,-20,-12,-1,26,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-7,-31,-28,0,-31,-28,28,-24,16,11,-28,-29,-27,-22,-15,-4,37,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-25,-26,-22,37,-29,7,1,-18,6,4,-19,-29,-18,-13,-19,-10,-4,12,47,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-8,2,-22,-19,-3,-29,31,-22,-10,0,-18,9,58,-8,-7,-19,-21,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=3,-17,-20,-21,-11,-6,-19,-12,3,-9,14,13,-16,-20,-8,-9,-13,-7,1,-21,-6,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-6,-15,-27,48,-15,-33,-11,-27,-16,6,-19,-14,-13,-1,-16,-27,-23,-25,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25,43,-30,-17,11,-27,24,13,-23,-29,-27,-19,-23,-10,5,-3,18,-24;
MA   /M: SY='A'; M=32,-12,-10,-20,-14,-15,4,-21,-11,-14,-11,-10,-10,-15,-14,-20,7,-2,-1,-21,-18,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-25,-7,-2,-22,-14,-11,-17,5,-21,-12,-1,9,-2,4,0,-3,-16,-28,-17,-5;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-11,-16,-14,-10,-19,-14,4,-10,-6,-10,29,37,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-26,-28,-19,-6,-30,-19,20,-11,7,12,-16,-18,-12,-2,-15,-8,15,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-13,-24,-15,-9,-1,-19,4,-14,-3,-10,-5,-9,-10,-7,1,-8,-7,-12,-14,6,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-3,-25,-3,11,-25,-9,12,-21,-1,-18,-6,-1,-12,22,-2,1,-9,-23,-22,-9,16;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-11,-18,-9,-19,-2,-19,-9,-11,-12,-10,-7,-10,-9,-19,14,3,0,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,0,-30,31,-21,-10,0,-19,11,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-28,-4,13,-34,-21,4,-14,8,-16,1,-3,-12,47,7,-2,-9,-21,-21,-10,30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-33,-23,25,-30,-19,17,-28,35,20,-26,-28,-23,-20,-26,-10,9,-13,7,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-18,-3,-4,-14,-13,-8,-10,-3,-15,-10,12,-17,-4,0,8,7,-8,-32,-14,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-1,-30,-1,0,-20,-17,85,-28,-9,-19,-1,8,-20,12,0,-9,-19,-29,-26,18,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-29,-8,-11,-27,37,-12,-35,-2,-28,-17,2,-19,-9,3,-2,-15,-26,-21,-23,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-28,-1,-2,-18,-16,73,-25,-8,-19,-2,12,-20,6,-1,-7,-15,-26,-28,14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-38,-30,8,-37,-29,40,-28,17,16,-22,-23,-24,-27,-18,-8,32,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-14,-14,-18,-11,-4,-21,-12,-3,-9,5,2,-11,-20,-10,-4,-8,-1,-1,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-31,-29,1,-31,-29,32,-22,15,13,-29,-29,-28,-21,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,33,-22,23,1,-24,4,4,-25,-2,-29,-21,43,-18,-2,-3,8,-3,-28,-37,-21,0;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-29,0,-10,-28,39,-12,-35,-6,-29,-19,7,-18,-11,-9,-1,-15,-28,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-28,-3,8,-27,-18,-4,-25,29,-23,-8,1,-13,17,30,-6,-8,-19,-22,-11,11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-26,-17,-9,-14,-25,-14,-2,10,-7,1,-11,-14,-5,15,-12,-6,2,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-14,-28,-25,-3,-29,-27,26,-20,10,9,-25,-25,-24,-20,-9,-1,38,-27,-9,-25;
MA   /M: SY='B'; M=-11,32,-22,29,5,-25,-8,0,-25,0,-26,-21,31,-14,-1,-2,8,5,-23,-37,-18,2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-25,-30,-22,-4,-31,-20,28,-19,8,10,-16,-20,-15,-16,-12,-6,20,-21,-1,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00549;
//
ID   BROMODOMAIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00633;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bromodomain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6638341; R2=0.0129482; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=744; N_SCORE=14.287; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-19,-10,-3,-14,-16,-11,-9,-1,-11,-7,-2,-14,-1,-5,3,5,-6,-23,-9,-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-14,-15,-17,-10,1,-16,-13,6,-11,9,5,-12,-12,-9,-11,-9,-3,3,-13,-3,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-17,13,-21,-16,0,-20,-13,1,-17,12,8,-16,-19,-14,-12,-15,-7,1,-19,-6,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,-1,10,-19,-17,-6,-15,6,-11,-8,-3,-13,7,8,-2,-5,-11,-24,-11,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-21,0,6,-15,-15,-4,-15,6,-15,-8,3,-13,2,4,1,-2,-12,-24,-8,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-20,-24,-19,0,-27,-19,20,-19,11,8,-14,-19,-16,-16,-12,-3,16,-21,-3,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-20,-18,-14,3,-26,-13,10,-17,23,9,-20,-24,-15,-14,-19,-7,8,-18,3,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-26,7,8,-24,-15,-2,-22,9,-19,-11,2,-8,5,5,-2,-3,-18,-28,-12,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-24,8,19,-23,-16,-2,-20,3,-17,-13,5,-9,11,0,2,-1,-19,-29,-14,15;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-20,-15,-11,-4,-21,-13,8,-16,19,14,-15,-22,-10,-13,-16,-7,5,-23,-6,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-23,2,6,-21,-15,-3,-16,10,-16,-5,1,-11,11,6,-1,-5,-14,-21,-7,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-4,1,-20,-1,-2,-19,3,0,-24,-2,-20,-13,6,-15,-3,0,3,-3,-19,-25,-12,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-21,-5,-3,-15,-20,19,-17,1,-12,-4,-2,-19,0,7,-7,-9,-12,-25,0,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-28,8,13,-27,-15,-7,-25,6,-23,-16,0,8,7,2,0,-4,-22,-28,-18,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-8,-20,-6,-7,-5,-20,-8,-5,-12,1,-2,-10,-16,-10,-10,-8,-6,-4,-21,-1,-10;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-13,-8,-7,-13,0,-13,-16,-11,-20,-15,6,-13,-7,-13,21,10,-9,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-18,-33,-18,-9,-2,-16,-15,-16,-9,-13,-13,-18,-19,-10,-10,-18,-14,-19,42,8,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-23,-28,-19,-9,-17,-25,-22,-2,-16,-10,-7,-21,43,-14,-21,-13,-9,-9,-27,-20,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-22,-17,-7,-5,-22,-6,1,-9,10,9,-13,-21,-4,-3,-13,-8,-2,-19,0,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-28,4,22,-25,-19,1,-23,15,-19,-10,1,-10,18,10,-3,-8,-21,-24,-10,19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-34,-15,-5,-19,-22,-20,-10,-13,-9,-9,-22,53,-12,-18,-15,-10,-19,-27,-21,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-25,-22,-8,-27,-27,17,-17,0,2,-27,1,-25,-20,-10,-3,30,-30,-15,-25;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-8,25,-21,28,7,-27,-7,-4,-26,-2,-27,-22,19,-6,-1,-7,12,4,-21,-37,-19,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-9,-28,-8,1,-21,-19,-12,-18,15,-15,-8,-8,3,0,15,-9,-8,-15,-22,-13,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-24,6,7,-24,-16,-7,-20,14,-21,-11,4,-12,6,11,1,-3,-14,-27,-13,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-26,13,27,-21,-11,-2,-22,1,-14,-13,3,-9,8,-4,-3,-9,-22,-25,-14,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-14,-25,-19,3,-23,-17,11,-19,13,5,-22,-24,-18,-19,-12,-5,14,-16,3,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-36,-8,2,-28,-19,-12,-20,-8,-28,-18,-16,69,-7,-17,-7,-9,-26,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-28,47,16,-34,-1,-2,-36,-2,-28,-26,19,-11,-1,-9,2,-7,-29,-36,-21,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-27,-21,-18,27,-28,12,-3,-11,3,1,-17,-28,-13,-7,-18,-9,-8,13,52,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-28,24,21,-30,-15,-3,-25,8,-20,-13,5,-9,9,0,-2,-8,-22,-30,-16,15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-33,-27,2,-33,-24,34,-24,14,14,-22,-24,-22,-24,-15,-5,31,-22,-1,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-28,3,16,-27,-20,-5,-28,33,-25,-12,0,-10,9,22,-6,-7,-19,-24,-11,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,9,-22,6,8,-20,-14,6,-24,10,-23,-14,13,-14,4,9,1,-2,-21,-28,-9,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-19,88,-10,-20,-9,-9,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-21,-32,-23,0,-25,-10,27,-15,19,46,-21,-21,-8,-15,-19,-9,19,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,33,-13,45,10,-35,-10,-6,-34,-5,-26,-26,11,-13,-4,-13,2,-8,-23,-38,-21,3;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-33,-23,26,-30,-19,17,-29,36,18,-26,-29,-24,-20,-26,-10,9,-13,7,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-2,4,-22,5,6,-25,3,-8,-26,2,-26,-15,7,-12,3,-3,10,-2,-20,-29,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-16,-4,-7,-15,-20,-17,-10,-4,-12,-9,1,-12,-8,-6,11,28,-2,-29,-11,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-24,-36,-27,0,-33,-22,38,-23,19,29,-22,-22,-16,-23,-19,-8,27,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-26,-5,7,-22,-17,-4,-21,18,-17,-7,-1,-14,9,24,-4,-6,-17,-23,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-27,8,19,-26,-17,-4,-25,19,-22,-12,4,-10,12,13,-2,-6,-21,-26,-13,15;
MA   /M: SY='K'; M=-13,4,-28,0,5,-25,-17,3,-28,32,-26,-11,10,-15,8,32,-6,-7,-22,-24,-9,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-13,-32,-24,3,-30,-23,24,-26,29,19,-26,-27,-20,-22,-22,-8,19,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-25,10,16,-24,-14,-2,-23,9,-21,-13,8,-9,8,8,2,-4,-21,-29,-15,11;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=1,8,-15,2,-1,-22,-5,-6,-20,2,-23,-15,15,-14,-1,0,9,2,-16,-31,-17,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-18,-3,-7,-18,4,6,-25,-8,-19,-10,5,-20,-5,-3,-5,-12,-22,-19,-9,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,0,13,-21,-16,1,-22,13,-18,-8,1,-13,14,11,-3,-7,-21,-21,-6,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-23,-1,5,-22,-16,-5,-21,10,-19,-11,0,-11,7,11,-1,-3,-17,-22,-11,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-4,13,-18,11,3,-21,-10,-5,-21,-1,-23,-17,15,-12,-1,-5,16,15,-15,-35,-15,1;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-21,-24,-15,-3,-22,-18,6,-11,8,6,-18,-14,-13,-7,-12,-6,7,-21,-7,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-28,10,20,-25,-13,2,-25,4,-20,-14,2,-9,12,-2,-1,-8,-23,-21,-10,16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-26,16,28,-29,-15,-3,-24,4,-18,-14,2,-7,15,-3,2,-5,-23,-29,-17,21;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-17,-36,-28,60,-29,-18,3,-28,14,5,-21,-29,-34,-19,-20,-8,2,3,24,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-15,-18,-6,-10,-24,-17,5,-9,3,3,-16,-19,-10,-8,-8,-5,9,-26,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-23,4,6,-23,-12,-2,-19,2,-16,-11,1,-12,3,-4,1,-5,-15,-24,-10,4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-29,68,19,-39,-10,-1,-39,0,-29,-29,19,-10,0,-10,0,-10,-29,-39,-20,9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-33,-26,18,-27,-22,20,-23,16,15,-23,-26,-24,-20,-16,-6,21,-16,2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-26,-9,-3,-16,-19,-3,-11,5,-10,1,-2,-18,6,12,-9,-8,-12,-13,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-21,-23,-12,-1,-27,-14,8,-17,29,13,-21,-24,-6,-9,-20,-5,1,-20,-2,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-22,-34,-26,1,-30,-18,33,-20,20,33,-23,-23,-14,-20,-19,-8,25,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-7,-34,-25,43,-28,-21,-1,-24,7,-1,-20,-26,-30,-19,-18,-10,-1,-2,13,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-21,8,2,-19,-12,-3,-19,-2,-20,-13,11,-14,3,-4,8,5,-17,-25,-10,2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=19,-15,51,-25,-20,-17,-15,-24,-19,-20,-15,-15,-14,-25,-20,-24,0,-4,-5,-34,-23,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-23,-13,-2,-8,-22,4,-15,5,-9,-2,-9,-20,3,11,-12,-11,-14,-9,6,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-20,-12,-2,-10,-22,-15,-6,-3,-4,-4,-7,-14,-4,-6,1,11,-3,-23,-7,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,37,-20,18,-1,-18,-2,9,-19,-1,-28,-19,56,-20,-1,-1,9,1,-29,-38,-17,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-24,3,8,-25,-9,-12,-24,-3,-21,-17,-4,13,-3,-7,0,-5,-21,-30,-21,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,2,-31,8,16,-30,-11,-8,-28,5,-26,-19,-1,18,4,0,-2,-8,-26,-29,-21,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,15,-26,19,6,-28,6,-4,-31,-2,-26,-21,12,-11,-2,-3,4,-5,-25,-31,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-14,0,-1,-19,-8,-3,-19,-7,-23,-15,10,-12,0,-6,25,20,-11,-35,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-26,-6,2,-16,-19,-7,-9,-6,-8,-6,-8,-7,-1,-6,-6,-6,-9,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-22,-24,-22,10,-26,-12,16,-19,4,5,-18,-26,-20,-18,-13,-6,16,-11,15,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-23,-20,-19,10,-21,4,2,-15,0,1,-14,-25,-13,-15,-13,-6,-2,1,33,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-26,-5,6,-23,-19,-10,-19,21,-18,-8,-3,-7,4,16,-5,-6,-14,-24,-12,4;
MA   /M: M=-6,-1,-8,-1,-9,-12,-16,-7,-12,-10,-8,-1,-6,-14,-9,-12,-8,-7,-10,-23,-5,-10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,-13,-17,-13,-19,8,-16,-13,-14,-11,-8,-7,-15,-11,-18,7,-2,-6,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-1,-23,-3,-1,-17,-18,-3,-10,-1,-9,-6,1,-16,0,1,-3,-2,-9,-27,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-24,-6,-1,-17,-20,-9,-13,11,-12,-5,-3,-16,0,12,-6,-4,-7,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-26,-16,5,-28,-15,16,-23,35,20,-25,-26,-13,-16,-24,-8,7,-19,1,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00550;
//
ID   RIBOSOMAL_L30_MP; MATRIX.
AC   MP00634;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L30 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.7733359; R2=0.0201545; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=201; N_SCORE=10.814; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-13; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-16,-21,-18,-7,-27,-24,11,-11,-1,1,-14,-16,-17,-13,0,17,19,-28,-9,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-28,-9,3,-21,-22,-2,-16,11,-5,-1,-6,-18,19,27,-11,-10,-17,-20,-8,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-20,-26,-22,-4,-21,-22,18,-21,8,7,-16,-22,-19,-20,-8,2,18,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-30,-7,3,-23,-19,-5,-28,28,-23,-11,-1,-6,7,44,-8,-8,-20,-22,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-19,-7,-10,-23,26,-15,-26,-13,-26,-17,3,-15,-10,-12,17,1,-16,-29,-23,-10;
MA   /M: SY='A'; M=2,-15,-21,-17,-11,-13,-15,-18,1,-13,-5,-3,-11,-8,-9,-13,1,1,2,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-14,-21,-22,-20,-7,-25,-21,22,-19,4,6,-7,-20,-16,-20,-7,-2,18,-26,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-3,-10,-28,37,-11,-34,-4,-29,-18,9,-18,-9,-7,1,-14,-27,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-14,-24,-17,-7,-26,-17,10,-9,1,6,-16,-23,-13,-2,-10,-4,14,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-29,-10,-3,-20,-19,-6,-15,2,-14,-8,-9,13,-3,4,-7,-7,-16,-26,-14,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-32,-7,2,-23,-15,-6,-22,2,-23,-14,-8,20,1,0,-7,-8,-24,-14,-12,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,11,-27,13,11,-28,-14,-7,-28,23,-26,-15,6,-9,5,12,-3,-5,-21,-27,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-11,-25,-14,-6,-19,-22,13,-3,-11,-9,1,-7,-8,6,-10,-6,-8,-6,-25,-4,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-28,-9,2,-19,-19,-3,-22,23,-18,-8,-3,-16,8,34,-8,-9,-16,-17,-5,2;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-25,14,10,-28,-14,-8,-24,14,-21,-14,2,-11,4,6,-2,-7,-17,-27,-15,7;
MA   /M: SY='T'; M=3,-10,-12,-17,-15,-8,-22,-22,4,-14,-4,-3,-8,-15,-14,-15,10,29,12,-29,-10,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,7,-30,-20,24,-26,38,22,-28,-28,-20,-20,-25,-8,19,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-25,-2,7,-24,-17,0,-22,16,-20,-9,1,-13,12,18,-1,-3,-17,-23,-9,8;
MA   /M: SY='M'; M=1,-15,-19,-20,-15,-9,-3,-14,-2,-15,6,10,-12,-19,-10,-12,-5,-1,-2,-23,-11,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,11,-30,-20,20,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-7,-29,-8,-10,-25,25,-9,-34,4,-25,-15,4,-20,-5,22,-4,-14,-25,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,21,-30,49,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-6,-2,-20,-12,12,-24,12,-19,-8,3,-18,3,25,-6,-8,-17,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-30,-2,11,-27,-17,6,-29,26,-23,-9,1,-14,17,35,-7,-11,-23,-22,-9,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-32,-24,-1,-33,-24,30,-21,17,14,-20,-20,-18,-17,-16,-5,23,-22,-4,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-23,6,-6,-16,11,5,-24,-5,-26,-17,34,-20,-5,-3,5,-6,-27,-30,-16,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-9,6,-22,2,2,-22,-13,38,-23,-6,-22,-8,15,-15,11,-2,7,1,-22,-32,-2,5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-8,1,-12,-10,-21,6,-18,-21,-15,-18,-13,-5,-18,-10,-16,6,3,-12,-29,-21,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-13,-26,-25,-3,-28,-25,19,-13,5,6,-24,-27,-23,-8,-8,3,37,-29,-10,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-21,-28,-19,23,-30,-21,14,-21,10,5,-19,-24,-23,-18,-14,-5,13,-13,7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-22,-21,-23,-17,-6,-29,-15,13,-7,7,8,-18,-24,-13,-3,-15,-7,17,-24,-5,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-31,6,23,-29,-20,-7,-25,19,-24,-14,-2,8,10,9,-6,-10,-23,-26,-17,15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,15,-25,24,8,-20,-17,-9,-15,-8,-7,-12,1,-16,-7,-12,-7,-8,-10,-32,-14,1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,15,-14,2,-5,-15,-12,-8,-14,-6,-18,-14,22,-14,-5,-5,16,27,-12,-34,-14,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-33,-4,5,-29,-17,-16,-22,4,-26,-16,-11,44,-4,-8,-7,-9,-23,-27,-23,-2;
MA   /M: SY='A'; M=21,-5,-14,-9,-2,-21,-8,-7,-14,-7,-13,-10,-3,-12,0,-11,9,1,-7,-26,-15,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-19,-24,-21,6,-28,-16,15,-18,5,4,-15,-22,-18,-17,-6,8,16,-16,10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-25,-18,-9,-7,-22,-9,-10,6,-4,-2,-11,-21,-3,21,-12,-7,-6,-11,-1,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-30,-5,-9,-29,44,-16,-35,-13,-29,-19,2,-6,-12,-15,0,-15,-29,-24,-28,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-20,-26,-18,1,-21,-4,17,-14,23,44,-17,-22,-5,-12,-19,-9,7,-22,-2,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,32,-28,31,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,8,-25,2,5,-25,-12,4,-23,15,-23,-11,16,-15,14,20,0,-6,-23,-26,-13,8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-13,-23,-15,-7,-15,-23,-16,-3,10,-6,0,-10,-17,-4,5,-9,-5,1,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-14,-31,-28,-2,-28,-29,29,-21,10,10,-26,-26,-26,-22,-10,-2,41,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='E'; M=0,0,-22,-1,10,-18,-12,-8,-22,10,-21,-14,3,-9,3,5,5,-2,-17,-25,-13,6;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-33,9,3,-19,-19,27,-24,-8,-22,-13,-2,15,-1,-10,-9,-13,-27,-23,4,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-25,-26,-21,22,-29,1,10,-19,22,14,-24,-29,-14,-14,-24,-10,0,5,39,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=6,-6,-18,-10,-3,-18,-13,-16,-12,3,-14,-8,-5,-12,-4,-3,5,10,-3,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-22,-31,-28,12,-28,-21,15,-19,4,3,-28,-29,-25,-19,-17,-8,21,13,15,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-28,0,8,-29,28,-12,-33,-4,-25,-18,0,-12,-4,-9,0,-14,-27,-24,-24,2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-29,2,19,-14,-19,-4,-19,6,-15,-11,-6,-8,4,0,-7,-10,-18,-17,-1,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-20,-27,-20,-11,-17,-23,-22,5,-15,-8,-4,-18,23,-12,-20,-8,-5,1,-26,-17,-14;
MA   /M: SY='B'; M=-7,26,-21,26,12,-27,-6,-1,-27,-1,-28,-22,25,-12,3,-5,14,2,-24,-38,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-22,-15,-5,-5,-19,-5,-5,-10,7,1,-11,-20,-4,-9,-11,-7,-7,-18,-1,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-24,8,15,-27,-4,-5,-28,11,-26,-17,6,-10,5,2,5,-5,-21,-28,-17,10;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-13,-7,-7,-15,-2,-16,-16,-12,-18,-14,3,-12,-7,-12,24,28,-7,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-20,-24,-21,1,-29,-23,21,-22,18,10,-20,-23,-20,-20,-14,-3,19,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-26,-9,0,-20,-16,-6,-17,11,-16,-9,-2,-10,1,22,-5,-5,-12,-24,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-22,1,15,-23,-15,-9,-19,2,-17,-12,-2,-3,7,-4,6,2,-15,-28,-16,11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-20,-27,-19,3,-24,-19,15,-25,35,16,-25,-27,-16,-18,-22,-6,9,-21,-3,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-33,-25,2,-29,-25,30,-26,21,15,-22,-24,-19,-23,-19,-9,22,-20,-2,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00551;
//
ID   PILI_CHAPERONE_MP; MATRIX.
AC   MP00635;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gram-negative pili assembly chaperone signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2068620; R2=0.0157087; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; N_SCORE=10.318; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-20,-12,-4,-23,-2,-17,-16,-10,-19,-12,-9,14,-7,-17,7,-2,-12,-26,-22,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,5,-24,1,3,-24,2,-7,-24,12,-22,-12,9,-13,3,5,-1,-7,-20,-23,-15,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,1,-18,-1,2,-20,-7,-4,-16,3,-17,-7,4,-11,9,4,8,2,-14,-24,-12,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-24,3,10,-25,-1,-5,-26,5,-22,-13,4,-11,10,8,3,-2,-22,-25,-16,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-22,1,-1,-25,4,-3,-20,-5,-24,-13,17,-15,10,-5,11,2,-21,-30,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-20,-10,-5,-16,-20,-10,-8,-2,-9,-3,-4,-15,4,6,3,11,-5,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-24,5,-31,-24,26,-25,32,16,-27,-28,-22,-19,-22,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-27,1,-35,-27,40,-27,20,18,-22,-23,-20,-26,-18,-7,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-21,-27,-20,-3,-28,-21,21,-14,9,13,-18,-20,-14,-16,-11,-2,19,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-26,-9,-6,-8,-18,-5,-13,6,-12,-3,-4,-13,-2,7,-8,-5,-12,-16,3,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-13,-12,-9,-12,-12,-14,-6,-8,-7,-1,-3,-11,-4,-9,8,21,-1,-23,-10,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-17,-5,-9,-14,11,-11,-12,-11,-14,-9,6,-13,-9,-11,5,2,-10,-21,-14,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,9,-24,7,-4,-25,11,-10,-23,-8,-22,-16,11,-13,-7,-12,4,-4,-19,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-25,-5,0,-20,-14,-5,-12,-1,-13,-7,2,-4,3,-4,-3,-4,-14,-27,-13,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-20,-32,-22,27,-30,-18,15,-29,38,16,-27,-30,-24,-19,-27,-10,7,-11,10,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-35,-10,-1,-28,-17,-18,-19,-9,-28,-19,-15,72,-9,-19,-7,-8,-26,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-26,4,10,-27,-13,-9,-22,15,-22,-12,-1,-9,7,7,-1,-5,-16,-26,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-27,59,16,-36,-8,1,-36,-1,-30,-28,25,-11,0,-9,4,-7,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,6,-24,-20,-1,-29,32,-22,-10,0,-16,14,55,-9,-10,-21,-21,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-30,-21,6,-29,-19,22,-25,37,21,-27,-28,-18,-17,-25,-9,16,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-21,-25,-27,-17,39,-27,-9,-8,-12,-2,-2,-15,-25,-14,-5,-17,-11,-10,10,25,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-30,-40,-31,-22,18,-23,-15,-14,-17,-12,-13,-30,-28,-17,-16,-29,-19,-21,92,37,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-32,-23,19,-30,-19,19,-27,31,16,-24,-27,-22,-20,-23,-6,11,-14,7,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-8,16,28,1,-10,-20,-10,-6,-23,-11,-27,-20,28,-26,-10,-11,7,-1,-21,-43,-23,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-28,2,-31,-27,31,-23,18,15,-28,-28,-26,-21,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-9,3,-18,-21,-8,-18,17,-8,-4,-6,-16,6,24,-9,-5,-13,-21,-9,3;
MA   /M: SY='E'; M=7,4,-23,7,13,-27,10,-11,-28,-5,-22,-19,1,-10,-1,-12,7,-5,-21,-28,-22,6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-24,-37,-29,0,-36,-28,43,-26,17,20,-23,-23,-21,-26,-17,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-16,-32,-9,-1,-27,-15,-18,-19,-10,-28,-19,-14,64,-8,-18,0,-4,-24,-31,-27,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-7,-23,-11,-4,-19,-14,-14,-12,15,-14,-3,-4,-15,-3,6,-6,-5,-6,-22,-11,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-25,9,13,-24,-15,-7,-22,2,-22,-16,4,6,3,-5,4,1,-21,-30,-16,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-27,11,13,-29,-7,-10,-28,18,-25,-15,1,-11,3,6,-4,-9,-19,-26,-16,8;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-1,13,-21,17,8,-26,-3,-5,-25,0,-24,-18,10,-8,2,-3,9,-2,-19,-30,-18,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-20,2,7,-20,-13,-5,-15,4,-15,-10,4,-11,4,1,2,-1,-12,-25,-13,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-7,-25,-6,5,-10,-10,-9,-18,3,-16,-11,-8,-11,2,-1,-8,-10,-19,20,-1,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-16,-8,-11,-14,8,-13,-7,-12,-10,-7,0,-14,-11,-13,1,-4,-4,-20,-14,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=0,6,-20,3,5,-20,-9,0,-16,3,-18,-11,9,-10,-1,-1,0,-5,-13,-27,-14,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-22,7,-1,-22,4,-3,-23,4,-25,-16,24,-16,-2,3,4,-3,-21,-30,-18,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-19,-11,-3,-17,-19,-9,-5,-2,-10,-4,-6,-16,1,-6,0,1,1,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-5,-21,-8,-6,-8,-16,-7,-2,-13,9,2,-3,-21,-9,-11,-10,-5,-6,-27,-9,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-27,-3,5,-25,-9,-4,-14,2,-15,-3,1,-14,15,1,-2,-8,-17,-25,-13,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-22,-13,4,-24,-17,4,-10,7,4,-15,-17,-13,-4,-13,-4,3,-17,-2,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=14,-5,-16,-11,-3,-20,-12,-13,-13,4,-14,-6,-5,-11,3,-3,7,7,-6,-23,-13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-19,-27,-19,2,-26,-16,17,-21,26,23,-20,-22,-13,-16,-15,4,10,-22,-2,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-21,-2,10,-27,-17,2,-15,4,-15,-2,0,-9,36,4,4,5,-19,-19,-9,23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-18,-7,-8,-10,-17,9,-10,-13,-4,-4,5,-18,-6,-9,4,12,-9,-30,-4,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00552;
//
ID   DNAJ_1_MP; MATRIX.
AC   MP00636;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nt-dnaJ domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8106742; R2=0.0141623; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=341; N_SCORE=9.630; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-14,-8,-19,-3,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-16,18,11,-2,-26,-19,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-26,-7,2,-19,-19,-6,-19,29,-14,-2,-4,-14,6,31,-11,-9,-13,-18,-7,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-27,1,7,-26,-9,-7,-27,27,-25,-11,3,-12,6,18,-5,-9,-20,-22,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-19,-26,-21,-18,22,-26,5,0,-13,5,1,-17,-27,-13,-11,-18,-9,-7,13,43,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-1,-28,-1,1,-19,-19,84,-28,-9,-19,-2,8,-19,8,-2,-7,-16,-27,-28,17,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-9,0,-30,-20,-19,-20,-9,-30,-19,-18,85,-8,-18,-9,-10,-30,-30,-29,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-29,57,15,-35,-12,-1,-33,-2,-25,-25,15,-11,-1,-11,-1,-9,-26,-36,-16,7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-26,-9,1,-21,-20,-12,-16,22,-16,-6,-6,-14,3,20,-8,-7,-8,-22,-11,0;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-18,7,-1,-17,-8,5,-15,-2,-20,-13,30,-18,-1,-1,6,0,-19,-33,-14,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-8,-27,-6,2,-26,-11,-9,-22,7,-24,-13,-6,21,1,0,-3,-6,-21,-25,-18,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-4,10,-21,13,7,-23,10,-5,-24,-5,-20,-16,8,-7,-1,-8,2,-8,-21,-24,-18,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,-12,8,4,-14,-3,-1,-14,4,-15,-9,10,-7,1,1,4,-1,-11,-17,-9,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-22,-4,6,-19,-14,-9,-14,1,-16,-11,-7,19,-1,-5,-2,-4,-14,-22,-15,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-20,9,10,-21,-3,-4,-20,0,-17,-13,4,-10,2,-4,2,-4,-15,-24,-14,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-15,-13,-9,-17,-5,-15,-9,-8,-11,-7,-7,-13,-7,-14,6,-2,-2,-21,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-23,3,17,-19,-14,-8,-17,-1,-13,-12,0,-10,3,-5,2,-1,-15,-27,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-28,17,27,-29,-14,5,-29,7,-22,-17,5,-6,11,4,0,-8,-25,-30,-15,18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-9,-1,-15,-21,-7,-16,19,-14,-4,-3,-16,4,20,-9,-6,-13,-18,-4,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-27,-4,6,-26,-21,-4,-20,27,-21,-6,-2,-13,12,20,-7,-8,-14,-22,-9,8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-19,-3,15,-20,-21,-9,-12,1,-7,-6,-8,-13,7,-1,-6,-8,-11,-26,-13,10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-29,-21,-34,-27,0,-32,-28,34,-25,20,15,-24,-24,-22,-24,-17,-6,31,-23,-5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,5,-17,-2,-2,-23,-3,-5,-19,-2,-21,-12,12,-15,6,-3,10,4,-16,-30,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-25,4,22,-22,-17,-1,-22,10,-17,-11,2,-9,11,4,-2,-5,-20,-26,-13,16;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-10,-20,-11,-19,-2,-20,-8,-11,-10,-9,-10,-11,-10,-20,10,1,2,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-14,-28,-17,-17,23,-26,22,-5,-11,-4,-2,-11,-27,-10,-9,-15,-8,-12,16,59,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,16,-25,21,31,-30,-13,-2,-27,3,-22,-19,8,-6,13,-4,5,-5,-25,-31,-19,22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-18,-31,-26,-1,-31,-27,30,-22,12,13,-22,-23,-22,-22,-10,1,33,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-12,-5,-4,-20,0,-12,-19,-7,-25,-16,5,-12,-3,-9,24,14,-11,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,59,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,29,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=0,-4,-27,1,8,-26,-14,-13,-19,-3,-23,-17,-5,23,-2,-10,4,-1,-18,-30,-21,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-25,9,16,-26,-15,-4,-21,7,-19,-12,5,-11,12,4,2,-3,-18,-29,-15,14;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-27,-5,6,-25,-20,-8,-21,29,-19,-6,-2,-14,11,23,-8,-8,-15,-21,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=9,-5,-21,-9,3,-22,-12,-10,-16,6,-14,-9,-3,-10,4,5,1,-3,-11,-23,-15,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-7,-25,-10,1,-17,-20,-5,-5,-3,-7,-1,-4,-16,5,-3,-6,-7,-7,-18,-9,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-29,63,17,-37,-10,0,-37,-1,-28,-28,22,-11,-1,-9,0,-9,-29,-39,-19,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-25,-2,10,-24,-17,0,-20,11,-19,-7,1,-13,19,15,1,-4,-19,-22,-8,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-20,-21,-18,17,-22,-1,-3,-14,-1,0,-16,-25,-14,-11,-14,-7,-5,5,27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-28,-10,-14,-20,29,-16,-25,-13,-13,-11,-5,-21,-14,-8,-7,-15,-19,-20,-19,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-2,-24,-2,2,-13,-18,6,-15,-3,-14,-7,-1,-9,1,-3,-1,-3,-14,-23,-3,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=3,-3,-18,-5,-1,-16,-11,-4,-12,-9,-8,-7,-3,-14,-5,-10,-2,-4,-8,-27,-12,-4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-9,-9,-11,12,-15,-22,-10,-18,-14,-3,-15,-12,-12,-2,-10,-17,-9,-13,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-2,-7,-19,-9,-7,-1,-13,-15,-4,-13,-1,-5,-7,-17,-13,-14,-6,-4,-2,-20,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-7,5,-22,5,4,-17,-9,-4,-18,0,-18,-12,6,-10,0,-2,1,-3,-16,-25,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-1,-17,-3,0,-16,2,-3,-14,-3,-14,-7,2,-6,4,-4,1,-6,-14,-17,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-21,-5,-7,-17,10,-12,-20,-10,-18,-12,-2,-10,-8,-12,0,-6,-15,-20,-13,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-6,-7,-24,-9,-8,-7,-2,-6,-16,-10,-15,-9,-3,-6,-9,-8,-2,-6,-15,-19,-6,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-5,-5,-26,-6,-3,-15,0,-9,-20,-8,-18,-12,-1,-4,-3,-8,-1,-8,-19,-21,-14,-4;
MA   /M: M=-8,-6,-26,-7,-5,-11,-2,-4,-18,-5,-15,-7,-2,-13,-5,-4,-4,-8,-16,-20,-6,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00553;
//
ID   PII_GLNB_CTER_MP; MATRIX.
AC   MP00638;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   P-II protein C-terminal region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2204618; R2=0.0150661; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=734; N_SCORE=16.269; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,14,-25,23,28,-29,-14,-5,-25,1,-21,-19,4,-4,5,-8,3,-6,-20,-32,-20,17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-27,14,7,-25,-17,-2,-17,-1,-13,-9,2,-7,4,-7,-5,-9,-17,-29,-13,4;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-12,-27,-24,-4,-25,-27,21,-16,8,7,-25,-25,-24,-18,-8,-2,35,-27,-11,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-13,30,-28,43,27,-34,-12,-1,-33,2,-27,-25,13,-4,7,-7,4,-7,-28,-36,-20,16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-25,-3,5,-20,-17,-6,-17,9,-11,-5,-1,-15,8,13,-4,-4,-15,-24,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-5,-29,-26,-5,-26,-28,21,-20,6,6,-24,-25,-25,-22,-7,0,35,-28,-12,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-32,-28,-1,-33,-29,33,-23,12,12,-23,-24,-24,-23,-11,1,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,36,-30,-12,-3,-30,9,-21,-19,3,-6,11,0,-2,-11,-27,-29,-18,24;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-17,-20,-14,-11,-19,-21,5,-12,-1,-1,-10,-14,-12,-16,3,10,8,-24,-11,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-28,-38,-29,-1,-37,-29,45,-28,18,18,-20,-20,-20,-29,-18,-9,29,-20,-2,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-13,-16,-18,-14,-11,-18,-15,6,-8,-4,8,-8,-18,-7,-9,-1,-1,7,-27,-10,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-1,-26,-1,13,-27,-9,-8,-27,21,-24,-13,0,-11,8,16,-1,-8,-20,-23,-16,10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-8,-12,-14,-12,-14,-12,-19,-3,-9,-10,-7,-5,-16,-12,-13,11,12,8,-29,-15,-12;
MA   /M: SY='A'; M=30,-1,-13,-11,-8,-19,1,-14,-12,-10,-12,-11,4,-14,-8,-16,9,0,-7,-25,-19,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-29,-8,2,-14,-21,6,-22,20,-19,-6,-3,-17,14,26,-9,-10,-20,-12,7,6;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-30,-8,-18,-30,65,-19,-39,-19,-29,-20,0,-19,-19,-19,0,-19,-29,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,9,-26,8,14,-28,-13,-1,-26,19,-27,-14,12,-11,14,15,3,-4,-23,-28,-15,14;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-28,-34,-25,11,-34,-21,28,-24,11,12,-20,-13,-20,-24,-18,-9,16,-12,8,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-22,-40,-30,76,-29,-21,-1,-29,8,-1,-21,-30,-39,-20,-21,-11,-2,18,30,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-6,-2,-10,-8,-8,-14,-9,-12,-13,-15,-11,-1,-18,-6,-13,13,9,-8,-26,-3,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-31,6,8,-29,-14,-11,-24,-7,-28,-20,-5,43,-4,-14,1,-4,-26,-32,-24,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,15,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-27,24,38,-30,-17,-3,-27,4,-21,-19,4,-5,12,-4,3,-5,-25,-32,-19,25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-27,16,24,-28,-15,3,-27,8,-22,-16,9,-10,15,10,1,-5,-25,-29,-15,18;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,-12,-25,-19,-10,-16,-25,10,-16,0,0,-17,-18,-18,-20,1,3,21,-24,-14,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-33,-27,7,-35,-17,33,-22,13,14,-22,-25,-19,-22,-18,-8,24,-10,17,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-24,-8,-3,-17,-19,-5,-24,16,-18,-11,4,-17,4,42,0,8,-15,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10,0,-20,-19,0,-30,28,-20,-10,0,-20,10,66,-8,-9,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-28,-6,-13,-27,45,-14,-36,-8,-29,-18,6,-19,-12,-5,1,-15,-27,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-29,23,49,-30,-17,-1,-30,9,-22,-21,3,-2,16,0,2,-8,-28,-31,-20,32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-19,-4,8,-20,-19,-7,-20,8,-15,-10,-4,-8,2,10,-1,2,-15,-27,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-28,2,-13,-29,51,-13,-37,-15,-30,-21,11,-19,-15,-16,2,-16,-30,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-7,-25,-5,9,-12,-18,-5,-12,-7,-3,-5,-8,-8,-2,-7,-6,-5,-13,-25,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=1,16,-25,23,20,-29,-13,-7,-23,-1,-17,-17,3,-8,3,-9,0,-8,-18,-30,-18,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00439;
//
ID   THIOL_PROTEASE_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00639;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic thiol (cysteine) proteases histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0800975; R2=0.0070433; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=984; N_SCORE=6.848; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=935; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-30; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-48,-74,-30,-15,-18,-73,45,20,-10,-8,57,0,-70,72,-56,-33,8,10,-74,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-68,-97,-19,-91,19,-42,-4,-6,-64,9,-73,25,-59,-89,-92,-47,-30,-77,-91,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-78,-70,-57,4,-53,-27,-38,-30,-8,-32,-69,-80,-61,-63,-52,-11,-42,-10,120;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-73,-6,-23,-41,-5,21,-22,54,-69,-63,-15,-19,-11,9,46,-11,-9,-75,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-44,-71,-37,-3,-72,37,-25,-35,3,-16,-63,-50,-66,20,14,64,13,-35,-78,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-44,-76,-50,-57,-80,93,-44,-34,5,-81,-71,-50,-39,-63,-68,0,-28,-55,-75,-74;
MA   /M: SY='V'; M=1,-70,-78,-73,-43,-78,-31,60,-24,-14,-43,-55,-56,-38,-72,-10,-53,71,-79,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-43,-45,-36,-47,50,-29,-51,-2,-61,-33,13,-51,-58,-25,18,2,-33,-22,-17,96;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-56,-15,2,-19,-31,-74,19,-67,11,-70,-65,7,-17,24,-15,5,35,1,-29,54; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-66,-84,-1,30,-59,32,54,-33,-37,-30,-69,13,45,-33,-55,-36,-2,-77,-85,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-25,-26,26,1,3,-55,9,-33,-7,-26,-62,22,41,-9,-20,38,19,-25,-75,11;
MA   /M: SY='C'; M=-18,134,-69,-58,-68,-43,-68,-75,-65,-70,-67,23,-60,-38,-6,6,-15,-66,-87,8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-33,9,4,-17,-39,24,-29,-57,-41,-57,-79,32,-12,-68,-60,32,7,-57,-92,-29; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-28,-74,17,3,-10,41,-24,-52,-18,-75,-68,25,39,-31,-8,38,-6,-52,-30,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-45,-44,29,16,-25,-27,3,-18,7,-31,42,1,0,17,-6,9,34,-34,25,2;
MA   /M: SY='H'; M=-35,-74,24,13,-33,7,60,-55,0,2,17,44,-30,10,-6,-4,-20,-31,-81,-22;
MA   /M: SY='L'; M=6,-68,-76,-73,-51,16,-70,-17,-72,62,21,-25,-77,-69,-73,-63,-7,35,-76,-59;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-72,66,-51,-58,32,-33,-78,-54,-70,-72,90,-70,-55,-62,-34,4,-77,-87,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='A'; M=81,-39,-65,-44,-77,50,-69,-71,-64,-72,-65,-57,-67,-60,-69,2,-55,-60,-76,-73;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-67,-83,-77,-52,-84,-80,17,-74,-10,55,-78,-78,-74,-75,-68,-52,92,-84,-59;
MA   /M: SY='L'; M=21,-12,-57,-46,-52,-74,-67,-41,-6,65,-40,-7,-76,-63,-5,-61,11,9,-76,-59;
MA   /M: SY='V'; M=39,-68,-80,-73,-52,-74,-75,43,-73,42,0,-75,-76,-70,-74,-63,-56,52,-77,-60;
MA   /M: SY='V'; M=-27,-66,-81,-76,-54,-82,-83,18,-74,-11,-42,-76,-77,-75,-76,-64,2,94,-86,-61;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-47,-68,-49,17,-74,-44,-57,-65,-56,-53,27,-81,-62,-64,-65,-64,-17,86,118;
MA   /M: SY='G'; M=13,-74,2,-69,-82,93,-43,-86,-67,-83,-73,-2,-68,-64,-74,-34,-64,-79,-76,-76;
MA   /M: SY='T'; M=-29,-70,-24,5,10,-71,-64,10,33,-40,-23,11,-51,1,-30,4,42,38,-76,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-22,-75,44,66,-72,-37,-57,-18,-20,-10,-62,-7,-64,26,-38,-4,11,-8,-81,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-12,-72,32,-1,-77,27,-21,-62,20,-78,-69,77,-39,-8,-45,16,-28,-34,-84,-36;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-47,-74,28,-34,-77,74,-59,-66,-4,-49,-71,56,-69,-57,-22,-3,-26,-77,-79,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-37,-71,-31,-22,-52,-1,-63,4,30,-23,7,31,4,13,-30,9,31,30,-80,-65;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-42,-81,54,15,-62,-36,-38,-63,38,-54,-45,15,71,17,-22,-19,-31,-75,-82,-71; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-58,-28,-52,-5,30,-20,25,-31,10,-57,-54,-64,-57,-23,-31,-26,-51,-63,-14,110;
MA   /M: SY='W'; M=-71,-92,-92,-43,-27,-46,-92,-32,-40,-22,-66,-64,-44,-69,-25,-63,-62,-5,167,-33;
MA   /M: SY='I'; M=-36,-74,-76,-59,-52,-36,-47,78,1,34,-26,-53,-24,-37,-56,-46,13,-12,-75,-58;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-42,-76,-64,-53,-10,-61,-81,57,-25,-5,-46,-59,-45,-76,-77,-50,-40,62,-78,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-83,-65,-5,-79,-54,-68,-7,77,-78,-70,-47,-73,-52,24,-17,-52,-61,39,-50; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-64,-82,-53,-71,-79,-48,-38,-85,-52,-78,-80,104,-86,-64,-70,-50,-62,-62,64,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-76,-62,-65,-80,-45,-66,-65,-30,-73,-76,44,0,-23,-44,76,3,-64,33,-51; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-64,-48,-79,-57,-49,-49,-48,-18,-45,-68,-67,-2,8,-47,-45,31,-35,-15,154,0;
MA   /I: I=-5; E1=0; IE=-105; DE=-25;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00126;
//
ID   THIOL_PROTEASE_ASN_MP; MATRIX.
AC   MP00640;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic thiol (cysteine) proteases asparagine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1869454; R2=0.0114528; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1007; N_SCORE=15.710; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-1,21,-15,11,0,-20,0,1,-20,-5,-30,-20,36,-15,0,-5,24,9,-21,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-16,0,5,-16,-11,-5,-16,26,-16,-5,0,-5,5,16,-5,-5,-11,-11,-5,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-19,-5,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,46,11,-31,-5,5,-31,0,-30,-25,39,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-28,0,-1,-20,-16,88,-29,-10,-21,-2,10,-19,8,-1,-6,-17,-28,-31,16,-1;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-15,-16,-12,-20,12,-18,-15,-13,-15,-12,-6,-14,-12,-19,6,-5,-7,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-15,-27,-26,-3,-28,-27,27,-19,8,9,-24,-27,-24,-19,-10,-2,39,-28,-9,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-10,-15,-13,-10,-8,-20,-14,-2,-9,7,0,-7,-22,-10,-5,-6,1,-1,-27,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-17,-28,-22,-3,-22,-24,20,-22,15,9,-21,-23,-19,-21,-10,-4,21,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=1,-23,-15,-26,-25,-2,-22,-24,20,-20,7,6,-20,-26,-23,-20,-8,-2,29,-26,-8,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-8,-19,-29,64,-19,-39,-19,-29,-20,1,-19,-19,-19,1,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-33,-23,-18,16,-23,2,-8,-11,-6,-6,-22,-27,-11,-11,-20,-13,-15,46,49,-16;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-15,-27,52,-18,-33,-17,-27,-18,0,-19,-17,-18,2,-15,-23,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-8,-19,-12,-11,-6,-17,-14,-1,-10,-7,-4,-5,-18,-11,-10,-1,3,4,-23,-5,-11;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-23,7,21,-20,-16,-5,-20,-1,-16,-15,-1,-4,5,-7,4,-1,-17,-28,-13,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-3,11,-15,7,-1,-17,4,-1,-17,-2,-18,-12,16,-11,-2,-3,5,-1,-15,-23,-13,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-16,1,-2,-16,10,-6,-16,-3,-16,-10,8,-6,-3,-4,1,-5,-15,-17,-13,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-16,-2,-3,-15,15,-9,-16,-5,-14,-9,1,-8,-5,-7,2,-6,-12,-15,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-6,-20,-9,-6,-13,-19,-13,-1,1,-9,-2,-4,-14,-4,-4,-3,1,2,-23,-8,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-12,7,-31,13,10,-28,-14,-6,-26,6,-27,-19,3,20,0,-2,-3,-8,-26,-29,-17,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-26,-22,-21,34,-30,16,-1,-13,0,0,-19,-30,-14,-11,-20,-10,-9,25,70,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-39,-49,-40,-30,9,-21,-30,-16,-21,-18,-18,-39,-29,-20,-21,-39,-29,-27,141,28,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-34,-25,2,-35,-26,36,-28,26,17,-22,-22,-20,-25,-19,-5,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-16,-33,-28,2,-31,-28,32,-24,14,12,-25,-26,-25,-24,-14,-5,34,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-27,-5,5,-26,-16,-9,-27,35,-25,-10,-2,-12,8,31,-7,-9,-17,-20,-12,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-28,-4,-15,-29,54,-13,-37,-17,-29,-20,6,-19,-16,-17,3,-15,-28,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-21,-2,6,-20,-15,-13,-17,0,-17,-13,-1,1,-2,-6,7,13,-13,-29,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-24,20,9,-25,-6,-4,-27,-1,-25,-19,12,-7,1,-5,7,-1,-22,-31,-16,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-40,-30,13,-21,-29,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-29,143,31,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-29,19,36,-26,-19,-2,-22,4,-16,-12,2,-6,11,-4,-3,-10,-23,-29,-16,24;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-25,15,11,-28,-5,-1,-27,10,-27,-17,19,-13,8,6,4,-5,-25,-31,-17,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-29,-25,-23,39,-30,9,-1,-15,2,-1,-21,-30,-17,-13,-21,-11,-9,31,66,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-35,-27,27,-27,-20,20,-25,15,15,-21,-25,-25,-21,-19,-9,14,-9,11,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-29,-10,-1,-15,-21,-4,-23,25,-15,-7,-3,-19,5,42,-12,-10,-17,-15,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-34,-26,5,-31,-21,32,-24,23,27,-23,-24,-18,-21,-20,-8,24,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,-10,-15,-11,-3,-16,-17,-11,-8,-4,-7,-5,-9,-17,-1,-4,-1,-3,-3,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-28,-10,1,-21,-20,-4,-23,25,-18,-5,-2,-17,11,45,-8,-7,-16,-20,-10,3;
MA   /M: SY='N'; M=-6,18,-25,14,-3,-26,21,-5,-30,-8,-28,-21,23,-17,-7,-10,5,-7,-27,-30,-21,-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-20,-11,-6,-12,-19,-11,-5,2,-9,-3,-4,-15,-3,6,-2,1,0,-22,-8,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,27,-23,20,2,-25,6,2,-26,-2,-28,-20,34,-16,-3,-5,7,-2,-27,-35,-20,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-4,-20,-7,-2,-11,-16,6,-9,-5,-7,-1,-2,-15,-1,-6,-4,-4,-7,-22,-4,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,97,-25,-25,-20,-25,-24,-28,-27,-19,-17,-17,-36,-25,-27,-8,-10,-11,-47,-27,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-25,-10,-16,-27,51,-17,-33,-17,-24,-15,-2,-20,-16,-18,-1,-17,-25,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-25,-34,-26,0,-34,-23,36,-24,18,20,-20,-22,-18,-23,-18,-7,26,-21,-1,-25;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-20,-5,5,-17,-4,-11,-17,-5,-13,-12,-4,-12,-4,-9,2,-4,-12,-21,-13,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=0,10,-17,5,3,-21,-5,-4,-20,-2,-24,-16,16,-12,2,-4,18,12,-16,-33,-17,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-18,-5,2,-6,-17,-5,-11,-7,-6,-4,-7,-17,-2,-7,-5,-6,-10,-17,1,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=8,-19,-19,-22,-15,-7,-19,-19,5,-16,0,0,-17,-3,-15,-19,-5,-3,7,-21,-8,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,-12,-17,-17,-15,-8,-15,-11,3,-15,-2,-2,-8,-18,-13,-16,0,-1,7,-24,-6,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00126;
//
ID   COMPLEX1_75K_1_MP; MATRIX.
AC   MP00641;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0483479; R2=0.0134252; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=691; N_SCORE=14.315; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-24,-7,-14,-26,44,-17,-31,-16,-27,-19,4,-17,-14,-16,9,-5,-23,-25,-26,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-6,7,-19,7,0,-20,-14,-9,-20,3,-19,-10,4,-12,-1,4,10,13,-12,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,8,-14,-3,-7,-12,-12,-10,-11,-9,-12,-11,15,-15,-7,-9,13,23,-9,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,28,14,-30,-30,-26,-20,-19,-4,32,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-31,-23,7,-31,-18,26,-25,31,21,-26,-27,-18,-20,-23,-9,18,-17,6,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,11,-29,17,22,-35,-16,3,-26,8,-22,-12,4,-10,30,8,0,-9,-27,-26,-15,25;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-7,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='C'; M=11,-18,63,-27,-23,-18,-20,-27,-17,-22,-13,-13,-18,-29,-23,-26,-3,-6,0,-38,-25,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-11,-22,-11,9,-3,-22,-13,-5,-12,7,-2,-13,-15,-6,-13,-9,-6,-6,-21,-8,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-23,-3,9,-22,-15,6,-17,3,-17,-5,1,-12,14,4,6,-2,-16,-28,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-15,-18,-13,-8,-13,-15,3,-16,6,2,-7,-19,-12,-16,-2,-2,4,-25,-12,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-31,-24,9,-32,-20,24,-18,13,12,-22,-25,-20,-17,-18,-8,21,-14,8,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-27,21,21,-22,-15,5,-24,2,-21,-17,15,-12,10,-3,1,-4,-26,-26,-6,15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-25,-14,-10,0,-24,9,-12,1,-5,-3,-8,-22,-3,15,-9,1,-11,-8,20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28,68,-30,-18,3,-29,15,3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,1,7,29,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-16,-34,-14,-17,12,-22,0,-12,-12,-12,-11,-18,-26,-11,-13,-17,-13,-18,50,45,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-6,-30,-5,2,-15,-21,65,-23,-11,-11,-1,0,-20,5,-4,-14,-18,-25,-16,14,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-33,-1,15,-30,-19,-12,-24,13,-27,-16,-8,31,5,0,-5,-9,-25,-26,-20,8;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-25,-5,-4,-17,-19,1,-14,3,-6,-5,-5,-19,-2,14,-9,-9,-9,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-26,-16,5,-29,-19,14,-20,40,16,-26,-27,-16,-14,-27,-10,6,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-26,-3,-2,-26,12,-14,-26,-6,-26,-15,-2,7,-6,-11,6,-6,-21,-28,-23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-6,-18,-13,-17,-21,-21,-2,-18,-14,-9,-12,10,-13,-21,2,-1,-2,-33,-19,-16;
MA   /M: SY='I'; M=12,-23,-18,-29,-20,-4,-22,-24,18,-22,17,8,-21,-21,-18,-22,-11,-5,16,-21,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='S'; M=17,8,-13,-2,-5,-19,-3,-9,-15,-7,-20,-15,17,-13,-5,-11,18,11,-11,-32,-19,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-13,-23,-18,-5,-16,-21,0,5,-3,3,30,-13,-17,20,-3,-11,-9,-1,-21,-5,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=10,-20,-16,-24,-15,-3,-18,-19,8,-22,21,6,-19,-21,-15,-19,-9,-3,6,-23,-8,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-27,7,30,-26,-20,-6,-27,20,-21,-15,0,-6,12,14,-1,-2,-22,-26,-15,20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-20,-29,-21,-5,-31,-22,27,-19,13,15,-22,-23,-11,-18,-14,-6,26,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-28,2,15,-9,-12,3,-17,-2,-15,-12,0,-15,2,-6,-5,-9,-19,-13,9,7;
MA   /M: SY='G'; M=-8,2,-28,4,-3,-27,14,-11,-29,5,-21,-13,3,-16,-3,-2,-6,-13,-23,-24,-18,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-21,4,-2,-21,-4,-5,-16,-7,-20,-14,16,-6,1,-8,8,-1,-18,-33,-19,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-25,-12,-3,-13,-17,-11,-13,2,-10,-7,-10,12,-2,5,-8,-7,-14,-20,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-26,0,11,-23,-18,4,-23,27,-19,-7,0,-10,11,20,-8,-10,-18,-19,-6,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-16,-1,-7,-23,-12,-19,-16,-14,-17,-14,-12,18,-15,-19,-8,-9,-12,-32,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=4,-15,-19,-19,-13,-13,-20,-17,3,-8,-3,2,-13,-8,-9,-10,-5,-1,8,-25,-13,-12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-5,-20,-7,-3,-24,-9,-15,-15,-3,-16,-12,-8,5,-4,-10,2,-4,-9,-24,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=17,-3,-6,-5,-3,-12,0,-9,-9,-6,-13,-9,1,-6,-3,-9,16,7,-3,-19,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,70,-17,-17,-12,-17,-17,-17,-17,-12,-12,-12,-23,-17,-17,-6,-6,-6,-29,-17,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-25,4,-10,-27,34,-16,-33,-14,-25,-19,4,-16,-14,-16,5,-1,-23,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-9,-3,-20,-19,-11,-13,15,-17,-6,-6,-17,3,17,0,-2,-2,-26,-12,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00554;
//
ID   COMPLEX1_75K_2_MP; MATRIX.
AC   MP00642;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7467079; R2=0.0124486; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=886; N_SCORE=15.766; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,5,-25,-20,3,-27,25,-20,-7,0,-17,23,54,-7,-10,-23,-20,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=3,0,-23,0,12,-25,-13,5,-25,14,-23,-12,1,-10,6,5,4,-4,-18,-27,-11,9;
MA   /M: SY='G'; M=10,-5,-12,-10,-14,-25,33,-17,-29,-16,-25,-18,3,-18,-14,-18,8,-8,-20,-27,-26,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-17,-31,-26,2,-29,-21,29,-21,22,25,-26,-26,-20,-19,-18,-6,30,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-15,-31,-26,1,-28,-20,27,-19,18,27,-26,-26,-19,-18,-16,-5,32,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,25,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-24,-36,-26,44,-28,-19,5,-27,19,9,-25,-29,-28,-19,-25,-12,0,15,19,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-19,-25,-16,4,-28,-18,14,-25,38,15,-24,-26,-13,-17,-22,-2,6,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-32,-22,22,-28,-16,16,-26,36,23,-26,-28,-20,-18,-26,-10,8,-14,6,-20;
MA   /M: SY='I'; M=10,-17,-17,-25,-17,-6,-21,-21,12,-18,11,9,-15,-17,-13,-19,-5,5,10,-22,-8,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-22,20,12,-22,-4,8,-22,2,-28,-20,48,-16,4,0,8,-2,-30,-38,-20,8;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-2,-30,-2,-4,-22,-2,76,-32,-12,-22,-4,8,-20,4,-4,-8,-20,-30,-28,10,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-36,-4,0,-28,-16,-14,-20,-8,-30,-20,-4,68,-8,-16,-6,-8,-30,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-16,-25,-16,-11,-4,-25,36,-3,-21,18,11,-11,-25,-6,-11,-21,-15,-9,-25,9,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-17,-25,-21,-5,-25,-23,21,-19,4,8,-14,-19,-16,-19,0,6,22,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,47,39,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,5,25,-32,-20,-4,-28,33,-26,-11,0,-7,21,19,-6,-10,-24,-23,-13,23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,56,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,4,23,-24,-13,1,-25,7,-20,-15,4,-9,9,9,3,-6,-21,-28,-16,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,7,-31,11,19,-29,-17,26,-27,0,-23,-12,7,3,18,-2,-3,-12,-30,-30,-9,16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-5,37,-25,45,11,-33,-7,-3,-31,-2,-26,-25,20,-11,-2,-11,3,-7,-24,-36,-20,5;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-22,-18,-7,-15,-22,-3,3,-1,0,22,-13,-19,14,4,-10,-8,2,-22,-6,3;
MA   /M: SY='T'; M=12,-7,-14,-13,-13,-16,3,-20,-13,-13,-14,-11,-4,-14,-13,-15,13,17,-2,-27,-17,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-18,-29,-25,13,-27,-9,18,-16,11,23,-24,-27,-17,-15,-16,-6,21,-11,15,-22;
MA   /M: SY='E'; M=3,-5,-21,-6,12,-18,-14,-5,-12,0,-9,4,-6,-10,6,-2,1,-4,-10,-26,-14,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-19,-18,-17,10,-23,1,0,-13,-3,-2,-10,-23,-15,-12,-5,4,3,-8,22,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-28,6,-11,-30,47,-16,-38,-15,-28,-21,4,-17,-15,-17,2,-13,-28,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-10,-26,-11,-4,-15,-20,21,-11,-3,-6,9,-6,-8,5,1,-9,-10,-14,-25,-2,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,4,-22,-2,-10,-12,1,-3,-13,-9,-13,-1,8,-18,-6,-10,1,1,-14,-22,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-21,2,8,-12,-21,-12,-11,-4,-11,-10,-6,-15,-6,-4,-1,0,-1,-28,-12,1;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-20,-2,0,-22,-2,-7,-26,8,-27,-16,10,-14,2,16,14,3,-17,-30,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-7,-29,-9,-3,-14,-20,3,-25,23,-18,-10,2,-21,7,54,-10,-9,-20,-15,1,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-29,-6,5,-24,-20,3,-24,8,-20,-11,-3,6,10,21,-3,-1,-22,-25,-12,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00554;
//
ID   COMPLEX1_75K_3_MP; MATRIX.
AC   MP00643;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0483518; R2=0.0125471; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=528; N_SCORE=11.663; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-4,-23,-4,-1,-17,-19,10,-10,-6,-12,-6,-2,-16,-2,-1,-1,-3,-6,-29,-6,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-1,14,-25,-22,-8,-21,28,-21,-8,-5,-11,10,15,-8,-9,-14,-21,-8,12;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-27,27,4,-27,-13,3,-23,-5,-24,-19,14,3,-5,-10,-2,-8,-20,-36,-17,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-27,-3,-1,-21,-24,-1,-6,4,-9,0,-5,-16,8,0,-10,-10,-6,-24,-6,2;
MA   /M: SY='H'; M=-16,4,-30,5,-1,-12,-17,16,-20,-3,-20,-13,7,0,-2,-1,-7,-9,-24,-17,9,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-21,-31,-21,2,-27,-19,24,-24,30,24,-23,-23,-15,-21,-21,-9,14,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,37,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,19,-1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-32,-6,6,-26,-18,-13,-20,-8,-25,-17,-12,52,-5,-15,-2,-2,-24,-30,-24,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-22,-24,-13,16,-27,-14,2,-12,12,6,-18,-24,-9,-8,-17,-9,0,-12,5,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-15,-27,-17,-6,-10,-24,-18,-3,1,-3,-2,-14,-17,-6,-4,-13,-6,-5,-2,-3,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-19,-17,-13,-3,-24,7,0,-18,14,10,-11,-21,-9,-12,-9,7,-1,-25,1,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-25,22,22,-27,-13,3,-24,-1,-20,-17,10,-9,5,-7,2,-7,-22,-32,-16,13;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-17,-23,-22,-13,-8,-21,-3,2,5,4,28,-13,-21,1,20,-15,-9,2,-21,-5,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-9,23,-21,18,16,-23,-12,-2,-23,0,-22,-19,24,-11,3,-4,9,9,-22,-35,-17,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-10,-22,-13,-4,-8,-15,7,-12,-11,-4,-1,-6,-18,7,-7,-3,-5,-13,-20,-2,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=2,-6,-20,-11,-4,-12,-18,-4,-12,-1,-12,-6,-6,-14,7,-4,3,11,-10,-13,7,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-12,-28,-26,-2,-29,-28,25,-19,8,8,-23,-25,-25,-19,-6,8,39,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-6,7,-21,-20,0,-30,28,-20,-11,0,-18,11,61,-9,-10,-21,-21,-11,5;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-33,-26,55,-29,-8,3,-23,11,7,-21,-29,-27,-16,-21,-10,-1,11,39,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-15,-6,-21,-16,2,-18,-12,-3,-16,-7,-6,-11,-20,-14,-18,2,2,-1,-14,7,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-24,11,13,-24,-12,-2,-26,13,-25,-17,16,-12,6,14,5,0,-22,-31,-16,9;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,42,32,-37,-15,2,-33,5,-25,-22,10,-7,17,-3,0,-10,-30,-33,-18,25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-23,-27,-23,3,-32,-17,23,-13,6,9,-21,-24,-18,-15,-15,-6,23,-13,12,-23;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-13,-19,-11,-19,-4,-21,-8,-11,-11,-9,-12,-3,-11,-20,8,0,2,-22,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-28,-1,-14,-30,54,-17,-38,-17,-30,-21,3,-18,-16,-18,5,-14,-28,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-26,3,-11,-23,11,-17,-14,-15,-15,-11,-2,-16,-14,-19,-3,-11,-9,-26,-19,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-25,1,9,-21,-19,-12,-18,-1,-18,-14,-4,12,-2,-1,1,6,-14,-30,-18,1;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-25,12,11,-19,-17,-6,-18,3,-14,-7,-2,-12,3,-4,-5,-8,-13,-26,-11,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,5,-33,-23,33,-29,35,23,-25,-25,-19,-23,-25,-10,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-8,2,-29,6,-5,-19,32,-14,-34,-14,-24,-20,2,-17,-14,-16,-2,-16,-26,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='T'; M=4,-15,-14,-19,-14,-3,-18,-17,2,-14,0,2,-12,-19,-10,-14,3,8,8,-25,-8,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-24,-28,-21,5,-32,-18,21,-20,7,8,-16,-20,-13,-19,-10,3,14,-14,9,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,4,13,-28,20,-3,-32,-6,-26,-19,6,-12,0,-9,5,-10,-28,-28,-22,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00554;
//
ID   COMPLEX1_51K_1_MP; MATRIX.
AC   MP00644;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3205366; R2=0.0127503; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1498; N_SCORE=23.410; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,21,-23,5,-8,-17,0,-1,-9,-8,-21,-13,38,-20,-6,-8,3,-4,-19,-34,-17,-8;
MA   /M: SY='A'; M=13,-19,-22,-26,-20,-11,-4,-23,9,-21,4,2,-14,-18,-17,-23,-7,-8,6,-20,-13,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-18,13,-24,-23,-5,5,-20,-16,-23,-6,-3,-14,-27,-22,-21,-10,-12,-10,-24,-15,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-30,-10,-16,-28,53,-16,-38,-11,-28,-18,0,-20,-14,-3,-2,-18,-28,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='S'; M=14,-2,-10,-7,-5,-17,-7,-15,-15,-10,-19,-15,3,-10,-5,-12,28,27,-5,-33,-17,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,0,-15,-31,60,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-25,-35,-27,61,-29,-11,-2,-24,5,-2,-22,-30,-31,-17,-22,-12,-5,28,43,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,43,-26,56,15,-35,-8,0,-35,-1,-30,-28,23,-11,0,-9,6,-5,-28,-40,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,2,-30,15,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-29,47,25,-33,-13,0,-31,1,-22,-17,11,-9,5,-8,-2,-10,-25,-35,-18,15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,29,-26,30,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,28,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-26,-18,-15,14,-26,22,-9,-7,-5,-1,-10,-26,-9,4,-15,-11,-7,-4,29,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-2,-29,-2,2,-22,-21,75,-24,-7,-18,1,6,-19,17,1,-8,-17,-25,-28,12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-23,-14,-6,-15,-18,4,-16,10,-10,4,-4,-18,3,29,-6,-3,-11,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,-11,-21,-11,-18,-2,-18,-7,-10,-7,-2,-11,-11,-9,-19,7,-1,1,-20,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-12,-19,-9,-20,-2,-18,-12,-6,-11,-10,-9,-11,-8,-10,8,-1,-2,-20,-19,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,3,-34,-23,37,-28,30,25,-23,-23,-18,-24,-23,-10,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-11,22,-28,26,41,-29,-14,2,-29,6,-24,-21,16,-6,13,-1,2,-8,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,4,-32,-24,3,-32,-24,16,-30,32,13,-26,-30,-22,-24,-25,-10,10,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-29,-6,4,-23,-21,-9,-24,36,-18,-6,-4,-15,6,33,-12,-10,-16,-20,-9,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-29,-10,1,-23,-18,-4,-26,23,-21,-10,-3,-9,9,45,-7,-9,-19,-21,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,7,-23,0,4,-24,-15,-2,-17,12,-19,-4,12,-13,15,7,2,4,-18,-26,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-17,-27,-20,4,-26,-19,17,-24,31,17,-25,-27,-18,-18,-18,-5,15,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00555;
//
ID   COMPLEX1_51K_2_MP; MATRIX.
AC   MP00645;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6715751; R2=0.0119256; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=869; N_SCORE=15.025; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-7,28,-22,35,8,-31,1,-4,-31,-5,-30,-25,19,-12,-2,-10,14,0,-23,-38,-21,3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-24,-34,-24,2,-29,-15,31,-22,26,37,-22,-22,-12,-19,-22,-10,17,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-31,-28,2,-31,-28,30,-23,19,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-22,16,25,-28,-11,-5,-28,6,-26,-20,7,-6,8,-1,14,1,-21,-34,-19,17;
MA   /M: SY='L'; M=15,-22,-18,-28,-18,-4,-20,-22,14,-22,19,8,-20,-20,-16,-22,-11,-6,10,-20,-8,-18;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-14,-30,-26,-3,-26,-24,25,-19,10,15,-24,-24,-22,-20,-10,-3,35,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-19,-13,-21,-14,-6,-21,-11,-16,-1,-6,-7,-15,-25,-7,14,-15,-11,-12,5,3,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-13,30,-25,23,6,-26,-8,4,-27,11,-29,-19,35,-16,3,12,2,-5,-27,-34,-17,4;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-24,-26,-28,-20,-1,-32,0,23,-26,22,16,-17,-24,-14,-20,-21,-12,11,-22,4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,-6,-22,-8,12,-16,-20,-10,-4,-5,-4,5,-8,-10,2,-10,-3,0,-5,-25,-12,6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-30,8,33,-31,-20,0,-28,21,-22,-12,0,-7,25,18,-3,-10,-27,-25,-15,28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,59,-30,-3,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,51,-26;
MA   /M: SY='A'; M=11,-7,-16,-8,2,-19,-12,-15,-10,-1,-16,-10,-5,-13,-4,-7,11,3,0,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-2,-30,0,12,-22,-20,41,-30,9,-20,-8,4,-16,12,27,-8,-14,-26,-26,0,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-18,-29,-21,-9,-5,-27,-13,3,-7,4,5,-15,-20,5,-7,-17,-12,-5,-3,1,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-10,-14,-14,-8,-22,-22,-2,-12,-6,-6,-6,-14,-14,-12,14,40,10,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=1,11,-23,18,21,-26,-15,-9,-20,-1,-16,-16,-1,-9,1,-10,1,-6,-12,-31,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,3,-20,-20,-3,-24,-18,7,-21,13,3,-10,-29,-20,-17,-14,-5,10,-31,-11,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-27,-6,-8,-15,-19,-14,-8,-11,-15,-11,-15,21,-13,-17,-7,-7,-7,-21,-7,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-13,-39,-9,-7,3,-19,-18,-23,-13,-18,-19,-19,-22,-13,-15,-23,-20,-26,66,12,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-24,-26,-15,-5,-26,-12,20,-17,16,24,-17,-20,-1,-15,-14,-8,8,-22,-3,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-12,-15,-16,-17,-10,-20,3,5,-14,-4,1,-7,-24,-15,-13,-4,-4,16,-30,-7,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-12,9,-27,4,5,-25,-14,-2,-27,32,-28,-13,17,-15,7,30,-4,-7,-23,-26,-13,5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-25,-28,-19,-3,-32,-23,23,-12,17,13,-20,-22,-15,-14,-19,-9,17,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-18,-31,-23,16,-29,-19,19,-25,32,21,-27,-29,-22,-19,-23,-8,17,-18,2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=5,1,-25,3,27,-26,-15,-7,-25,14,-19,-15,-3,-6,9,6,0,-7,-19,-25,-17,18;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-13,-26,-14,-7,-15,-15,-15,-19,9,-21,-12,-10,-17,-4,8,-4,-6,-12,10,-5,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-34,-26,14,-33,-25,28,-28,28,15,-26,-27,-25,-23,-22,-8,22,-18,2,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-11,-27,-9,7,-11,-15,-10,-3,-9,-6,-5,-11,-15,-5,-13,-8,-10,-4,-18,-1,-1;
MA   /M: SY='R'; M=1,-4,-23,-8,3,-25,-16,-7,-21,18,-19,-8,-2,-12,13,19,0,0,-15,-21,-12,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-29,-4,-11,-29,41,-14,-35,-2,-30,-18,7,-18,-11,-6,-1,-15,-28,-22,-24,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00555;
//
ID   RIBOSOMAL_S13_1_MP; MATRIX.
AC   MP00646;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S13 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3212366; R2=0.0143865; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=478; N_SCORE=12.188; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-18,-6,9,-13,-19,-10,-16,3,-13,-9,-6,-14,2,1,-5,-5,-13,-21,-8,5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-19,-19,-10,-6,-25,-17,9,-10,4,3,-16,-21,-11,-8,-9,-3,14,-24,-7,-11;
MA   /M: SY='R'; M=0,-5,-22,-7,0,-20,-9,-8,-21,7,-18,-9,-1,-14,6,15,2,-1,-15,-23,-13,2;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-6,-22,-7,2,-14,-17,-6,-7,-5,2,5,-6,-16,3,-2,-8,-7,-9,-25,-10,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,39,-24,41,10,-30,-6,2,-29,-1,-29,-24,33,-14,0,-6,7,-3,-27,-39,-20,5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,8,-27,8,14,-27,-14,-4,-25,22,-25,-13,9,-12,8,14,-3,-8,-20,-27,-15,11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-27,-11,-2,-16,-20,-3,-23,21,-13,-7,-2,-20,5,50,-10,-7,-16,-21,-9,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-23,-12,1,-25,-15,9,-13,28,18,-22,-24,-11,-11,-22,-9,3,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-10,-25,-16,-9,-14,-22,-11,2,8,-6,11,-6,-17,-2,6,-11,-7,2,-23,-7,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-28,17,17,-28,-15,-6,-25,16,-23,-13,5,-10,6,6,-2,-8,-20,-29,-15,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-37,-28,1,-37,-27,42,-28,23,20,-21,-22,-19,-27,-20,-8,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-4,-29,-4,-5,-25,13,-6,-31,5,-26,-15,2,-17,0,10,-3,-12,-25,-14,-15,-4;
MA   /M: SY='C'; M=7,-7,35,-13,-13,-19,-12,-18,-22,-16,-22,-18,-2,-21,-12,-17,15,7,-9,-40,-23,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-31,-20,-19,22,-28,22,-4,-11,-3,-2,-19,-29,-9,-10,-20,-12,-12,33,66,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-28,-7,3,-22,-19,-2,-28,28,-21,-10,0,-17,12,53,-6,-7,-19,-21,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-24,-28,-20,1,-28,-18,17,-15,14,14,-20,-24,-13,-9,-18,-9,12,-11,1,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-10,2,-10,-21,-7,-15,10,-13,-7,-4,-16,2,21,-5,-6,-11,-20,-6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-27,-12,-6,-12,-22,-6,-11,5,-1,1,-10,-21,0,14,-15,-11,-10,-11,-3,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-27,-4,-13,-28,46,-12,-35,-12,-28,-18,5,-19,-13,-13,2,-14,-27,-24,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-27,-17,5,-28,-17,15,-24,42,17,-26,-28,-15,-16,-26,-10,6,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-16,-37,-8,2,-29,-20,-17,-23,4,-29,-17,-15,63,-5,-4,-10,-10,-27,-27,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,8,-30,-29,-2,-30,-29,19,-23,10,7,-28,-31,-28,-21,-12,-2,35,-32,-12,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,2,-30,29,-20,-10,1,-20,10,67,-10,-10,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-29,-7,0,-20,-18,11,-29,23,-21,-10,4,-19,9,54,-7,-9,-21,-23,-7,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-30,-7,1,-22,-20,9,-27,25,-23,-8,-2,-17,7,32,-10,-11,-19,-13,-4,2;
MA   /M: SY='T'; M=2,3,-9,-5,-7,-14,-11,-15,-15,-9,-18,-14,7,-12,-7,-9,23,35,-6,-33,-14,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,28,-17,11,-3,-17,-6,1,-17,-3,-24,-17,42,-17,-3,-3,13,15,-21,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=31,-11,-14,-18,-14,-17,16,-20,-18,-14,-14,-12,-8,-14,-15,-20,6,-6,-8,-19,-20,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-9,1,-21,-19,-1,-29,29,-21,-11,1,-19,9,62,-7,-8,-19,-21,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-15,-10,-7,-10,-19,-16,-14,-1,-13,-10,-1,-13,-6,3,13,31,-5,-27,-9,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-14,-12,-8,-22,3,-12,-27,4,-20,-13,-5,-17,-5,19,-6,-11,-17,-24,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-26,-8,0,-20,-14,-7,-23,24,-21,-8,-3,-13,4,27,-5,-7,-15,-19,-7,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-24,-8,-11,-24,24,-17,-29,-4,-24,-16,1,-15,-10,-5,6,3,-19,-24,-20,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-15,-24,-15,-9,-17,-19,-18,-3,-4,-10,-4,-12,5,-9,-8,-6,-5,-1,-26,-15,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-28,-8,-7,-23,9,-11,-25,9,-22,-12,3,-17,-4,15,-4,-11,-18,-22,-17,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-14,-22,-15,-9,-13,-24,-16,-2,12,-8,0,-12,-19,-7,9,-10,-5,8,-23,-8,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00556;
//
ID   THYMID_PHOSPHORYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00647;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thymidine and pyrimidine-nucleoside phosphorylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2155743; R2=0.0149938; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=471; N_SCORE=12.268; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-29,-19,-31,-22,5,-29,-23,23,-27,35,16,-27,-27,-21,-21,-22,-8,19,-22,-3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=7,-19,-18,-22,-20,-13,-4,-22,2,-13,-5,-2,-15,-22,-18,-10,-5,-6,13,-24,-15,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-38,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,82,-10,-20,-8,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-25,-34,-25,-1,-34,-24,35,-25,18,21,-18,-19,-16,-24,-15,-2,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,19,12,-30,-30,-28,-20,-14,-2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-10,-20,-12,-17,-6,-21,-5,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-19,8,5,6,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='C'; M=3,-15,27,-23,-20,-3,-20,-13,-11,-21,-5,-7,-12,-27,-21,-20,-7,-7,-2,-29,-11,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-30,8,-11,-32,52,-16,-40,-16,-30,-22,4,-18,-16,-18,0,-18,-30,-24,-28,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-22,-23,-20,-1,-1,-17,1,-24,17,5,-20,-26,-19,-19,-17,-11,0,-16,-2,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-18,-25,-18,-15,4,-12,-9,-7,-17,-1,-4,-15,-6,-15,-16,-8,-3,-10,-10,10,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='P'; M=8,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,60,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-27,-10,0,-20,-20,-7,-14,31,-14,12,-6,-13,7,17,-13,-10,-10,-20,-7,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-19,-26,-19,-2,-29,-22,18,-21,15,12,-15,-18,-15,-19,-7,12,13,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-3,-1,-20,0,-11,-19,-10,-27,-19,7,-10,-1,-11,36,17,-9,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-23,-6,-13,-26,44,-16,-33,-16,-30,-20,4,-16,-13,-16,15,-5,-23,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-23,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-23,-10,-16,-23,36,-20,-29,-16,-23,-16,0,-16,-16,-16,7,6,-19,-24,-23,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-23,-8,-8,-3,-11,35,-20,-13,-17,-7,2,-19,-4,-8,2,-3,-17,-21,12,-8;
MA   /M: SY='T'; M=14,-5,-12,-13,-9,-15,-14,-20,-11,-10,-12,-11,-5,-2,-10,-14,15,31,-2,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-9,-24,-10,-16,-27,49,-19,-32,-17,-27,-18,0,-17,-16,-19,7,-11,-22,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=17,-21,-19,-29,-19,-7,-19,-23,16,-21,14,6,-18,-18,-15,-23,-9,-5,12,-20,-9,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-23,-7,0,-20,-22,-15,-17,25,-17,-6,-5,-13,0,13,-5,4,-7,-23,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-19,-31,-22,10,-27,-14,20,-23,34,31,-26,-27,-16,-17,-24,-9,13,-19,1,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-9,13,-28,24,51,-30,-17,-1,-30,7,-22,-21,3,-2,16,-2,3,-8,-28,-32,-20,34;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-10,-18,-15,-13,-11,-21,2,-14,-8,-5,-12,-17,-15,-17,11,6,16,-29,-16,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-35,-27,10,-34,-26,32,-27,25,16,-25,-26,-24,-24,-20,-7,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,-22,-9,-5,-24,0,-15,-19,-5,-22,-15,-1,12,-7,-13,5,-4,-16,-26,-23,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-14,-11,-16,-14,16,-16,-6,7,-10,4,2,-13,-16,-14,-9,-9,-3,9,0,17,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,15,-20,11,1,-19,0,-1,-20,5,-22,-14,21,-6,-1,4,1,-5,-21,-24,-15,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-8,-19,-18,4,-20,-20,11,-14,3,2,-15,-18,-19,-13,-2,10,23,-19,-4,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-11,28,-24,27,11,-28,-9,3,-23,0,-26,-18,28,-14,9,-4,7,-3,-25,-36,-18,10;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-22,-29,-21,16,-28,-23,12,-23,8,3,-20,-7,-24,-21,-13,-3,10,-17,0,-23;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-18,2,1,-10,-4,-11,-21,-10,-20,-16,3,-13,-4,-11,15,7,-14,-28,-12,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-25,-26,-23,-16,-9,-26,-23,11,-20,4,1,-22,14,-17,-21,-13,-6,7,-27,-14,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-25,30,19,-31,-13,-4,-30,6,-26,-20,9,-8,7,-2,7,1,-23,-34,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,18,38,-27,-17,-1,-24,4,-21,-19,10,2,11,-4,0,-8,-27,-32,-20,24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=2,-9,-20,-14,-6,-13,-17,-13,3,-5,-5,2,-5,-14,-5,-6,-1,-3,3,-24,-10,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-26,1,6,-23,-19,-7,-21,26,-15,-6,-2,-13,10,21,-10,-9,-16,-20,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-15,-23,-19,-1,29,-23,-12,-12,-10,-3,-7,-11,-19,-15,-4,-11,-9,-10,-7,7,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00557;
//
ID   RIBONUCLEASE_P_MP; MATRIX.
AC   MP00648;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial ribonuclease P protein component signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9402776; R2=0.0139202; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=287; N_SCORE=8.925; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-26,5,7,-24,-7,-7,-22,4,-20,-14,6,-5,1,2,-1,-5,-19,-29,-17,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-23,5,7,-23,-5,-4,-24,1,-22,-15,7,-10,4,2,4,-3,-21,-26,-15,5;
MA   /M: M=-2,-11,-21,-12,-6,-13,-11,-10,-7,-9,-2,-2,-8,-17,-3,-8,-3,-4,-6,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-2,1,-25,3,-2,-23,3,-11,-24,-5,-21,-16,0,-3,-6,-8,1,-5,-19,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-25,-5,-5,-13,-11,20,-20,-6,-18,-9,3,-12,-2,-2,-5,-7,-19,-19,3,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-22,-20,-13,1,-20,-19,-6,-15,-7,-7,-16,7,-16,-16,-6,-2,-6,-13,-6,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-29,-10,0,-17,-20,0,-26,25,-18,-8,-1,-19,8,55,-9,-10,-18,-20,-8,0;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-18,-31,-24,9,-29,-22,23,-24,25,14,-26,-27,-23,-21,-19,-7,22,-18,2,-24;
MA   /M: SY='G'; M=6,-11,-27,-12,-19,-27,57,-20,-34,-19,-25,-17,-2,-19,-19,-20,0,-17,-25,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-34,-26,14,-33,-23,28,-28,29,16,-25,-27,-23,-23,-23,-9,20,-17,4,-25;
MA   /M: SY='T'; M=7,-10,-12,-14,-12,-12,-14,-19,0,-12,-11,-7,-6,-16,-11,-13,15,16,10,-32,-14,-12;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-13,-31,-28,-2,-29,-29,30,-22,11,10,-26,-26,-26,-22,-11,-2,40,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=11,-4,-16,-5,-5,-22,10,-12,-22,-10,-26,-18,4,-6,-6,-13,22,8,-14,-32,-21,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,11,37,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-27,-3,6,-27,-18,-9,-27,39,-27,-10,0,-11,7,26,-6,-6,-17,-21,-11,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-18,-30,-25,13,-29,-22,21,-23,15,9,-22,-27,-24,-20,-15,-5,23,-17,4,-25;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-5,-8,-28,28,-14,-33,3,-28,-16,2,-14,-8,0,-1,-13,-24,-22,-22,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-16,-2,0,-13,-7,1,-16,10,-14,-7,5,-11,2,15,-1,-3,-12,-16,-6,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-14,-23,-24,-2,-27,-11,18,-17,4,6,-20,-27,-22,-16,-8,1,32,-27,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-20,-6,1,-18,-19,-12,-7,0,-10,-4,-8,-16,0,-2,-4,-2,-1,-23,-12,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,37,-21,19,0,-20,-1,16,-21,-1,-29,-19,57,-20,1,0,9,-1,-30,-39,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-28,-12,-2,-15,-21,-4,-20,20,-10,-5,-6,-20,4,40,-12,-9,-14,-17,-3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-22,-34,-27,4,-33,-27,34,-26,18,14,-22,-23,-22,-25,-16,-6,28,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-29,-3,7,-28,-19,-9,-29,43,-27,-10,-1,-11,9,32,-9,-9,-19,-20,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-24,-18,-8,-12,-25,-9,-4,1,1,3,-12,-21,4,17,-14,-9,-5,-17,-5,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-33,-25,3,-32,-25,32,-26,26,17,-25,-25,-21,-23,-20,-7,26,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-24,7,26,-25,-14,13,-24,0,-18,-12,1,-8,11,-5,3,-7,-22,-29,-12,18;
MA   /M: SY='A'; M=9,-17,-16,-24,-17,-8,-18,-21,9,-18,2,2,-13,-18,-13,-20,-2,-1,9,-17,-9,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-26,-16,-34,-25,34,-27,-19,11,-25,14,9,-21,-26,-26,-20,-17,-7,9,-7,12,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-10,-3,-17,-17,-1,-23,16,-15,-7,-2,-19,6,41,-9,-9,-16,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-21,-6,2,-16,-19,-5,-9,-5,-2,-3,-7,-15,1,-4,-6,-5,-9,-26,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-10,-23,-15,-10,-6,-21,0,0,-10,3,3,-3,-21,-5,-3,-11,-8,-4,-23,-4,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-17,-9,1,-17,-19,-9,-12,5,-10,-4,-8,-16,6,5,-6,-7,-9,-19,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-4,0,-21,0,-1,-22,-8,3,-20,-4,-21,-12,3,2,-1,-6,-1,-7,-20,-27,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-23,3,7,-20,-17,-1,-17,0,-14,-10,2,-11,5,1,-4,-7,-17,-25,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-20,-23,-18,5,-28,-18,16,-25,27,11,-19,-23,-18,-20,-20,-8,8,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-28,-7,-1,-22,-11,-9,-14,-3,-17,-8,-4,14,-2,-7,-4,-6,-17,-27,-17,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=2,0,-18,1,0,-18,-6,-5,-16,-5,-15,-11,-1,5,-3,-8,3,-1,-13,-23,-14,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: M=-5,-11,-15,-12,-9,-5,-9,-9,-6,-5,-5,-1,-10,-16,-7,-7,-8,-8,-3,-8,-1,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-24,24,5,-23,-9,-7,-23,-4,-17,-15,5,-14,-3,-10,-1,-7,-17,-29,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00558;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00649;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8968616; R2=0.0127979; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; N_SCORE=10.185; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-15,5,14,-28,-18,3,-25,4,-18,-11,0,-13,16,6,0,-7,-22,-29,-13,14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,0,-14,-2,4,-15,-11,3,-13,3,-10,-3,1,-10,8,2,-1,-5,-12,-17,-6,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-9,1,13,-3,2,-19,-16,-5,-25,-3,-20,-16,3,-19,-4,0,-1,-3,-18,-33,-17,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-20,-17,-4,-8,-20,-15,-1,-11,11,4,-16,-17,-7,-9,-13,-7,-3,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-18,2,12,-17,-15,-5,-20,0,-15,-11,3,-13,5,-2,2,0,-18,-27,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-22,-7,1,-17,-15,-14,-6,-8,-3,-4,-9,-10,-2,-11,-5,-6,-5,-25,-14,-1;
MA   /M: SY='A'; M=6,-9,-20,-10,-5,-14,-16,-16,-6,-9,0,-4,-10,-6,-8,-12,-4,-1,-6,-25,-13,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-25,-3,0,-14,-16,-5,-13,-6,-8,-6,-8,5,-4,-5,-6,-5,-14,-21,-7,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-5,-26,-5,-3,-22,1,-8,-21,-5,-20,-12,-2,4,-1,-7,0,-4,-19,-24,-17,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-11,-18,-12,-5,-1,-15,-3,-6,-10,-2,-1,-9,-5,-3,-9,-4,-2,-7,-13,2,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-25,6,12,-23,-10,-1,-21,5,-20,-12,10,-2,9,6,-1,-5,-23,-26,-16,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-26,0,2,-16,-10,-8,-16,-8,-14,-12,1,0,-3,-10,-3,-5,-17,-26,-14,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-19,3,9,-21,-8,-9,-20,-2,-20,-15,3,-5,2,-4,13,10,-14,-30,-17,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-25,2,-3,-26,19,-11,-28,-10,-23,-17,1,-11,-8,-11,4,-5,-20,-27,-21,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: M=-4,-12,-18,-12,-8,-10,-9,-12,-5,-10,-3,-2,-8,-1,-7,-7,-1,0,-5,-22,-11,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-14,-27,-17,-16,-1,4,-9,-15,-13,-14,-10,-9,-14,-14,-12,-8,-11,-14,-3,7,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-23,4,2,-16,-9,-3,-17,-4,-21,-15,21,1,-2,-5,4,-2,-22,-32,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-28,-13,-9,-23,10,-15,-24,-2,-22,-14,-6,-1,-8,4,-4,-10,-19,-18,-19,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-15,-11,-4,-8,-18,-12,-6,-9,-5,0,-6,-13,-5,-10,8,20,-1,-25,-6,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-39,-39,-29,26,-24,-26,-9,-23,-8,-11,-33,-30,-24,-20,-33,-22,-16,96,28,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-25,-1,-7,-22,14,-3,-21,-7,-19,-8,15,-18,-2,-6,0,-7,-22,-27,-18,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-29,-33,-26,9,-31,-17,21,-23,15,12,-26,-26,-18,-21,-24,-12,11,13,18,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=2,-10,-14,-16,-14,-7,-18,-17,3,-16,3,1,-6,-18,-12,-14,3,13,6,-28,-10,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30,13,-20,-30,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-29,144,30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-2,-36,8,4,-31,-17,-13,-25,-3,-30,-21,-6,55,-6,-11,-7,-9,-29,-32,-26,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-8,2,-26,7,4,-21,-15,-3,-22,-2,-20,-15,-1,7,0,-2,2,-1,-19,-27,-11,0;
MA   /M: SY='T'; M=13,-5,-13,-11,-10,-17,2,-18,-16,-12,-17,-13,-1,-12,-10,-14,18,20,-5,-29,-17,-10;
MA   /M: SY='P'; M=9,-10,-24,-10,-4,-22,-10,-14,-15,-8,-18,-13,-10,21,-6,-15,0,-1,-14,-25,-19,-7;
MA   /M: SY='P'; M=12,-19,-23,-19,-11,-17,-15,-21,-6,-12,-13,-9,-18,18,-13,-17,-4,-5,-4,-17,-18,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-1,-27,-5,-16,-28,54,-15,-35,-16,-29,-19,10,-19,-16,-16,2,-15,-28,-24,-28,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-20,-3,10,-22,-15,-8,-16,4,-16,-10,-1,-10,8,2,5,4,-11,-26,-14,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-17,-22,-16,1,-23,-15,7,-17,11,9,-17,-20,-14,-14,-8,6,8,-15,-2,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=13,-22,-10,-24,-22,-7,-18,-25,14,-16,0,1,-20,-23,-22,-19,1,2,30,-29,-14,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-18,-11,-2,-8,-18,-11,-6,-6,-7,-5,-6,-17,-6,-6,0,2,0,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-20,-21,-12,-11,-25,-15,8,-6,5,9,-18,-22,-2,-2,-11,-6,12,-23,-8,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-30,-4,4,-24,-16,-8,-19,-5,-24,-15,-7,34,1,-11,1,-4,-23,-28,-17,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-38,-12,-2,-22,-21,-20,-18,-12,-27,-18,-20,81,-12,-20,-11,-10,-28,-27,-25,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,7,-30,12,8,-22,-13,-5,-27,4,-22,-18,1,-11,0,-1,-7,-11,-24,-4,-9,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-22,-16,26,-26,3,2,-14,2,2,-18,-26,-14,-13,-16,-9,-3,11,46,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-35,-25,40,-30,-21,14,-29,25,10,-23,-28,-29,-21,-23,-9,9,-6,13,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-8,-29,-7,-3,-12,-19,3,-17,1,-19,-10,-3,8,1,4,-6,-7,-21,-16,4,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-3,-32,-1,-11,-17,7,-6,-21,-14,-15,-9,-4,-20,-11,-15,-12,-17,-21,6,-7,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-33,-26,36,-25,-16,7,-26,10,3,-21,-27,-28,-20,-19,-10,5,1,17,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-22,11,3,-22,-9,5,-24,2,-25,-16,15,-15,4,6,9,2,-20,-30,-10,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-1,-26,-2,-3,-14,-13,13,-19,-6,-21,-12,4,0,-1,-7,2,-2,-20,-21,4,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-23,3,1,-18,-18,-8,-13,6,-16,-10,4,-16,-3,4,-1,-2,-7,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-2,2,-24,0,4,-23,-5,-3,-19,-3,-19,-12,5,-5,3,-6,3,-1,-19,-28,-16,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-22,-11,-9,-17,2,-8,-17,-5,-16,-9,-4,-14,-7,-4,0,0,-10,-23,-12,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-19,-8,-8,-18,5,-11,-15,-6,-15,-10,-2,-15,-4,-5,4,-3,-8,-22,-14,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-12,-1,-22,-9,-12,4,-18,-1,-7,-9,-6,-6,8,-23,-10,-6,-6,-2,-11,-12,6,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=1,-8,-20,-10,-8,-9,-14,-15,-12,2,-13,-8,-7,-18,-10,3,-2,-2,-1,-22,-10,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00559;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00650;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0343518; R2=0.0173166; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=81; N_SCORE=7.427; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=27; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=2,-14,-16,-16,-9,-9,-13,-17,-5,-12,-1,-4,-12,-16,-11,-10,-3,-2,0,-23,-12,-10;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-22,-7,-5,-12,-7,-11,-16,-5,-16,-11,2,-15,-5,-1,4,-1,-13,-17,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-22,-17,-8,-5,-20,-13,2,-11,2,3,-14,-19,-9,-10,-9,-5,4,-18,-5,-9;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-16,-29,-24,-3,-28,-26,25,-20,9,8,-24,-22,-23,-21,-9,-1,33,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-20,-26,-17,21,-25,-11,-5,-9,0,5,-17,-21,-13,-4,-17,-9,-6,2,13,-14;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-20,-7,-6,-15,-15,1,-7,-11,-4,2,-5,-16,-2,-10,0,-1,-6,-27,-8,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-16,-22,-21,18,-27,8,-1,-15,-2,-1,-17,-25,-14,-14,-17,-10,-6,7,44,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-15,-30,-22,14,-27,-21,14,-26,26,11,-23,-27,-22,-20,-19,-4,10,-17,2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-13,-23,-17,-3,26,-24,-4,-9,-12,-2,-2,-10,-20,-13,-9,-11,-8,-9,-7,14,-7;
MA   /M: SY='T'; M=7,-10,-16,-15,-11,-12,-8,-6,-8,-15,-2,-3,-6,-16,-10,-14,4,10,-4,-26,-9,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-22,-18,-29,-23,7,-18,-24,13,-24,6,4,-16,-22,-22,-22,-8,-3,12,-19,-3,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-27,-19,-32,-23,26,-28,-20,14,-27,26,12,-23,-27,-24,-20,-20,-6,9,-13,6,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-9,1,-8,-17,-2,-4,-16,-9,-18,-12,22,-21,-6,-10,3,-2,-18,-32,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=8,-6,-7,-8,-7,-17,-5,-6,-14,-12,-20,-11,1,-15,-6,-12,21,11,-4,-34,-15,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-33,-24,42,-28,-19,6,-27,22,6,-22,-28,-28,-19,-19,-5,3,-4,16,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-29,-3,17,-36,-21,7,-17,7,-14,2,-3,-12,53,7,-3,-10,-27,-20,-9,35;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-17,-33,-25,34,-28,-20,11,-27,23,11,-24,-28,-28,-20,-21,-8,10,-9,9,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-18,-35,-27,48,-28,-20,7,-26,13,6,-21,-27,-31,-19,-17,-5,9,-4,16,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,38,-25,16,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='F'; M=9,-20,-15,-26,-18,20,-17,-18,-1,-20,5,-2,-15,-21,-21,-19,-5,-3,2,-11,3,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-19,-30,-23,2,-30,-23,26,-24,23,16,-22,-24,-19,-21,-15,-1,22,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-22,-33,-25,27,-31,-13,16,-27,20,11,-21,-27,-25,-20,-21,-10,12,-12,10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-14,-29,-15,-14,13,-19,39,-12,-13,-6,-1,-9,-26,-7,-9,-16,-14,-17,4,46,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-26,-18,-32,-24,33,-25,-20,8,-25,16,5,-22,-26,-27,-20,-16,-7,8,-7,11,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-8,-28,-19,4,-27,-19,7,-20,24,12,-24,-27,-17,-14,-22,-8,4,-15,-2,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-11,27,-23,16,3,-23,-6,6,-23,6,-28,-18,39,-17,6,9,7,-2,-27,-35,-18,4;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-27,-3,5,-26,1,-4,-27,10,-22,-12,2,-14,6,13,-1,-7,-22,-24,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,20,37,-32,-18,-1,-30,17,-24,-17,6,-5,18,6,-2,-9,-28,-29,-17,27;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-11,-30,-29,-1,-29,-30,30,-20,10,10,-29,-29,-29,-21,-10,-1,47,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-31,-5,8,-28,-19,6,-24,16,-20,-6,0,-16,32,33,-6,-11,-26,-13,-8,18;
MA   /M: SY='E'; M=6,0,-19,-1,9,-23,-12,-3,-19,3,-16,-9,-2,-11,4,-4,2,-3,-14,-26,-14,6;
MA   /M: SY='E'; M=7,-2,-15,-1,20,-24,-16,-10,-16,-2,-14,-12,-6,-9,7,-9,3,-3,-13,-28,-18,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-29,-28,-31,-25,18,-29,-14,10,-22,15,5,-27,-29,-20,-19,-25,-13,3,25,26,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-28,-11,-2,-17,-17,-6,-21,19,-16,-5,-5,-18,5,32,-10,-9,-16,-11,-5,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-22,-7,1,-22,-18,-1,-26,24,-23,-10,-1,-12,4,29,-7,-7,-18,-21,-8,0;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-4,-16,-10,-12,-16,-10,-20,1,-15,-8,-8,-21,-4,5,-9,-10,-15,-4,-6,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-28,-11,-32,-25,15,-23,-22,-7,-22,-2,-6,-26,-28,-22,-19,-22,-14,-9,41,13,-21; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-18,-6,0,-17,-15,2,-19,4,-16,-10,0,-6,0,10,-1,-2,-15,-24,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-6,-1,-21,-5,2,-21,3,-17,-9,1,-7,5,14,-4,-7,-19,-22,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-19,-17,-20,-15,4,-17,-6,-10,-12,-9,-7,-16,-21,-10,-11,-14,-11,-11,31,15,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-19,-4,0,-16,-17,3,-15,7,-11,-5,-1,-12,7,13,-5,-5,-14,-18,-3,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-9,-22,-8,-7,-8,-14,-15,-4,-15,3,-3,-12,-8,-11,-15,-10,-6,-5,-13,-8,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-22,-6,3,-22,-8,-7,-17,-4,-16,-10,-2,-4,4,-3,5,0,-15,-27,-16,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00559;
//

ID   RIBOSOMAL_L9_MP; MATRIX.
AC   MP00651;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L9 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7377825; R2=0.0140979; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=516; N_SCORE=12.002; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=6,-10,-21,-16,-6,-17,-15,-9,-8,13,-8,14,-10,-13,1,3,-8,-7,-4,-20,-9,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-21,-1,5,-22,-12,-7,-21,29,-21,-9,3,-9,5,16,-4,-6,-14,-17,-10,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-27,-7,-1,-16,-24,-10,-12,17,-12,-5,-6,-16,0,17,-10,-6,-8,-19,-3,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-21,-28,-18,-3,-22,-3,17,-9,15,47,-19,-19,0,-6,-18,-9,10,-21,-2,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,4,19,-31,-20,-4,-27,32,-25,-10,1,-9,21,20,-6,-9,-23,-22,-12,20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,17,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-14,-23,-17,-10,-7,-25,-15,3,-4,11,6,-11,-20,-8,-2,-14,-2,0,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-29,11,32,-31,-18,0,-27,18,-23,-14,2,-6,21,8,-1,-9,-26,-26,-15,27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,33,-28,44,15,-34,-12,-2,-34,5,-28,-24,16,-7,1,-1,0,-6,-26,-35,-18,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-14,-31,-28,1,-31,-28,30,-23,12,11,-25,-26,-26,-22,-11,-2,38,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-25,2,6,-26,-14,-9,-21,12,-21,-12,0,-5,3,6,-2,-5,-16,-26,-15,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-25,2,-2,-24,13,-6,-27,6,-26,-15,13,-15,-3,1,1,-8,-23,-24,-17,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-21,-23,-15,1,-27,-17,11,-16,29,12,-23,-26,-13,-10,-22,-9,6,-20,-2,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-27,1,7,-23,-16,-4,-26,27,-25,-11,5,-13,8,22,-3,-6,-20,-22,-9,7;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-9,-23,-11,-2,-17,-19,-13,-8,5,-9,-1,-8,-9,-2,2,-4,-4,-5,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-28,-7,-18,-25,57,-16,-36,-18,-29,-19,7,-20,-18,-17,1,-17,-29,-22,-27,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-28,41,29,-35,-14,-1,-32,3,-25,-22,10,-7,11,-5,2,-6,-27,-34,-18,20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-19,-29,-23,-2,-32,-25,27,-20,15,12,-22,-24,-20,-19,-14,-2,28,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,-17,-24,-20,-6,-29,-21,17,-7,5,9,-21,-24,-18,-10,-13,-5,27,-26,-7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-25,19,22,-27,-15,-3,-25,9,-22,-17,11,-9,7,1,2,-2,-21,-31,-16,14;
MA   /M: SY='V'; M=3,-29,-10,-29,-29,-1,-28,-29,28,-19,9,9,-29,-29,-29,-20,-9,0,47,-29,-11,-29;
MA   /M: SY='K'; M=3,-5,-24,-6,2,-25,-13,-11,-23,21,-24,-12,-2,-2,3,15,1,-4,-16,-24,-15,1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-24,21,5,-28,-10,-8,-24,-4,-24,-20,6,5,-4,-10,4,-2,-19,-33,-20,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,9,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,67,-23;
MA   /M: SY='A'; M=30,-12,-16,-19,-15,-15,12,-19,-14,-14,-12,-10,-10,-15,-15,-20,5,-5,-4,-18,-17,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-28,-8,1,-20,-19,2,-24,21,-19,-8,4,-18,12,47,-7,-8,-19,-22,-9,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,39,-20,19,0,-20,-1,13,-20,0,-30,-19,58,-20,0,0,9,-1,-30,-40,-19,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-3,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-23,-36,-26,20,-34,-24,28,-29,27,16,-24,-26,-24,-24,-23,-9,18,-14,7,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-36,-8,1,-29,-18,-17,-22,2,-29,-18,-14,61,-6,-7,-8,-9,-26,-28,-25,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-27,-1,6,-25,-15,0,-23,21,-23,-8,8,-15,17,23,-3,-6,-22,-23,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-28,-1,-5,-29,26,-11,-33,6,-29,-16,8,-16,-4,1,-1,-13,-26,-23,-21,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-25,-20,-10,3,-26,-12,-1,3,9,9,-16,-21,-9,0,-20,-10,-3,-13,6,-9;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-20,3,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,-1,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-21,-21,-12,-9,-26,-18,11,-7,4,8,-16,-19,-8,-9,-10,-4,13,-24,-8,-11;
MA   /M: M=-7,-15,-26,-15,-2,-11,-23,-13,-3,-6,-2,-3,-14,-2,-7,-1,-11,-7,-4,-23,-10,-7;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-13,-22,-13,-12,-8,-17,-5,-13,-4,-5,-14,-16,-12,-19,1,-3,2,-12,-10,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,6,-12,-3,-7,-14,-10,-13,-14,-9,-17,-14,11,-12,-7,-9,21,34,-8,-33,-14,-7;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-27,0,9,-27,-15,-10,-22,11,-23,-14,-1,10,4,3,-2,-6,-19,-26,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=4,-2,-24,-2,2,-24,12,-10,-26,-3,-22,-15,0,-12,-2,-7,3,-8,-20,-24,-19,0;
MA   /M: SY='N'; M=4,8,-16,-3,-8,-15,-9,-8,-7,-7,-14,-9,17,-18,-7,-9,7,5,-7,-31,-16,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-23,-23,-12,-3,-29,-18,14,-15,22,12,-20,-22,-10,-11,-20,-9,8,-21,-4,-12;
MA   /M: SY='K'; M=2,1,-24,-2,8,-25,-12,-7,-24,20,-23,-12,3,-11,7,16,0,-5,-18,-24,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-24,-6,7,-16,-21,-5,-9,-1,-6,-3,-6,-14,7,-2,-6,-6,-10,-23,-8,7;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-22,-28,-18,16,-28,-12,9,-19,15,10,-20,-25,-14,-12,-18,-9,6,-10,8,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-26,9,23,-27,-16,-6,-24,16,-21,-14,2,-9,9,6,-2,-8,-19,-27,-16,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-4,-24,-6,1,-20,-10,-4,-15,2,-11,-4,-3,-15,4,0,-3,-7,-13,-23,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-5,8,-16,-22,-5,-13,7,-10,-3,-5,-15,10,11,-8,-9,-13,-21,-6,8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-6,6,-21,-20,-6,-18,17,-11,-4,-4,-15,12,20,-9,-9,-16,-21,-9,8;
MA   /M: SY='K'; M=2,-2,-24,-1,13,-25,-16,-3,-22,14,-18,-10,-2,-10,8,10,-2,-7,-16,-24,-13,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-1,-25,-2,12,-25,-17,-6,-16,10,-16,-7,-1,-11,13,6,-1,-6,-15,-24,-13,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-12,-26,-12,5,-12,-23,-11,-4,-2,3,0,-11,-16,2,3,-12,-9,-7,-22,-9,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00560;
//
ID   TNFR_NGFR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00652;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   TNFR/NGFR family cysteine-rich region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-4.936; R2=.0214; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=512; N_SCORE=6.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=488; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=0; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-25,-1,3,-23,-13,-11,-19,-2,-21,-15,-1,13,-2,-4,3,4,-17,-30,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-7,-25,-5,4,-24,-12,-3,-21,1,-20,-11,-5,5,3,0,-2,-7,-18,-24,-14,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-27,4,11,-23,-12,-7,-21,-2,-20,-15,-4,11,-1,-9,-1,-6,-20,-27,-17,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-27,1,-9,-28,39,-11,-34,-9,-29,-19,10,-17,-10,-10,4,-12,-27,-26,-25,-9;
MA   /I: II=-7; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-7,-23,-9,1,0,-21,2,-12,-8,-7,-3,-6,-16,-1,-6,-4,1,-12,-14,4,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-25,-26,-22,44,-29,7,-2,-17,2,0,-18,-29,-20,-13,-18,-10,-7,16,52,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-8,5,-12,-8,-14,-19,-11,-13,-12,-10,-8,-4,-18,-5,-10,1,3,-9,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-21,11,3,-21,-12,-1,-21,-3,-18,-15,7,-11,-1,-4,3,-1,-17,-29,-11,0;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-23,-3,1,-18,-8,-4,-17,-4,-14,-10,-2,-12,0,-5,2,0,-13,-24,-9,-1;
MA   /I: MD=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-5,-20,-6,-3,-13,-6,-8,-15,-2,-15,-11,-3,-10,-3,-5,-1,-3,-13,1,-6,-3; D=-4;
MA   /I: MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=0,6,-14,2,-1,-15,1,3,-15,-4,-17,-11,13,-8,-2,-4,7,0,-14,-23,-11,-2; D=-4;
MA   /I: MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-4,-13,-5,0,-5,-9,6,-8,-3,-6,-2,-2,-7,3,-1,-2,-3,-8,-7,2,1; D=-4;
MA   /I: II=-4; MI=0; IM=0; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: SY='C'; M=0,-10,9,-12,-9,-4,-14,-9,-6,-12,-3,-4,-8,-15,-10,-10,-1,1,0,-19,-7,-9; D=-4;
MA   /I: DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-27,7,7,-23,-4,-5,-26,2,-24,-16,6,-5,2,2,2,-5,-23,-27,-16,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-24,-9,1,-15,-19,0,-10,-1,-10,-4,-4,-11,2,0,-3,-4,-10,-24,-7,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-16,-8,-3,-8,-16,-2,-6,-1,-4,-2,-5,-14,-2,3,-5,-2,-3,-17,-3,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-20; MD=-20; IM=-20; DM=-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-21,-4,1,-17,-12,-7,-12,-3,-14,-9,-4,14,1,-1,0,-3,-14,-21,-14,-1; D=-6;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-19,78,-26,-25,-17,-28,-14,-27,-25,-18,-16,-18,-36,-22,-24,-13,-13,-14,-28,-17,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-19,-7,-4,-15,-15,-9,-16,2,-16,-9,0,-13,0,8,9,14,-9,-26,-9,-3;
MA   /I: II=-6; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-3,-16,-18,-2,-11,0,-12,-5,-2,-6,0,1,-4,-3,-11,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-27,5,9,-24,-10,-6,-22,0,-21,-15,3,5,2,-4,1,-3,-21,-29,-18,4;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-28,-5,-1,-21,-11,-10,-16,-5,-17,-11,-5,19,-6,-9,-4,-6,-17,-27,-18,-5; D=-4;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-26,-1,-7,-24,31,-11,-29,-10,-24,-16,5,-17,-10,-11,1,-11,-23,-23,-21,-9; D=-4;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-22,-6,0,-7,-12,0,-13,-8,-6,-2,-4,-16,1,-7,-4,-2,-13,-20,-2,0; D=-4;
MA   /I: II=-7; MI=0; IM=0; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: M=-6,-9,-20,-9,-3,-8,-7,-7,-10,-4,-10,-6,-7,-16,-6,0,-4,-6,-5,-17,-4,-5; D=-4;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-11,-18,-8,-8,-23,-19,5,-13,3,3,-18,-18,-14,-14,-9,-4,11,-27,-11,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-20,-15,-8,-11,-21,-14,0,-3,-2,2,-10,-18,-5,-5,-5,1,4,-24,-8,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-4,-23,-7,3,-20,-15,-5,-16,7,-16,-6,-1,-13,10,7,2,-3,-13,-24,-11,6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-28,1,2,-20,-14,-9,-16,-5,-16,-12,-3,12,-5,-9,-4,-6,-17,-28,-16,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-16,73,-23,-23,-22,-10,-22,-29,-24,-21,-18,-14,-32,-24,-24,-6,-11,-13,-41,-27,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-17,-4,-5,-17,-12,-15,-14,-7,-15,-12,2,-6,-6,-9,12,23,-8,-30,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=1,-3,-24,-3,2,-22,-7,-9,-20,1,-18,-12,-2,-6,0,3,2,-3,-15,-24,-16,0;
MA   /I: MD=-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,4,-19,1,1,-17,-14,-8,-15,-1,-17,-11,6,-9,0,-4,7,12,-12,-26,-11,1; D=-6;
MA   /I: II=-7; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-21,-2,1,-23,-4,-5,-22,1,-21,-12,4,-13,7,5,9,5,-17,-28,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-12,34,-26,37,11,-30,-8,3,-29,1,-28,-23,26,-8,1,-5,4,-5,-27,-37,-19,6;
MA   /M: SY='T'; M=7,-7,-13,-14,-11,-12,-17,-19,-7,-8,-9,-8,-5,-11,-11,-7,11,25,4,-28,-13,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-20,-16,-10,-11,-27,-15,10,-9,1,3,-16,-18,-10,-11,-9,-3,16,-27,-9,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,115,-29,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-20,-20,-18,-39,-29,-29,-9,-10,-10,-49,-30,-29;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00561;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00653;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 1 N-terminal signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8239284; R2=0.0136040; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=488; N_SCORE=11.453; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-20,-1,-27,-20,-5,-17,-12,7,-17,12,27,-19,-23,-10,-16,-14,-8,6,-25,-8,-15;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=2,-2,-12,-4,-4,-10,1,-6,-8,-6,-9,-5,1,4,-4,-7,1,-2,-9,-15,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-14,2,5,-12,-9,-4,-10,-1,-8,-7,2,1,2,-1,0,-1,-11,-17,-9,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-11,1,5,-12,-8,-7,-9,-4,-10,-8,0,-2,-1,-7,7,6,-6,-17,-10,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-4,3,-17,4,0,-14,-8,-4,-8,-3,-5,3,-3,-5,1,-6,-5,-6,-8,-18,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=0,-3,-13,-5,-2,-9,-3,-6,-4,-6,-5,-4,1,-9,-4,-7,0,-3,-5,-16,-8,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-12,-12,-15,-8,13,-15,-10,1,-12,6,2,-10,-11,-11,-10,-7,-2,0,-8,2,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-3,-13,-7,-7,-2,-9,-3,-4,-7,-2,1,2,-14,-4,-5,-1,0,-5,-16,-3,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-15,-3,-1,-9,-11,-3,-10,0,-11,-6,-2,-9,1,1,3,2,-8,-13,2,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-3,-6,-22,-6,-7,-10,0,-10,-15,-5,-9,-7,-4,-17,-8,-7,-4,-7,-12,-18,-6,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-18,-2,-2,-17,-12,-9,-14,-3,-18,-11,6,-10,1,-2,11,11,-10,-25,-13,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-39,-29,69,-30,-20,3,-29,14,4,-21,-30,-37,-20,-21,-10,3,5,25,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-38,-9,1,-30,-17,-19,-21,-10,-30,-20,-18,81,-9,-19,-8,-9,-29,-30,-29,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-26,9,17,-28,-12,-6,-26,17,-23,-14,4,-10,9,8,0,-7,-21,-26,-16,13;
MA   /M: SY='G'; M=-6,12,-26,16,-2,-30,21,-6,-34,-7,-28,-21,11,-15,-7,-10,5,-8,-25,-30,-21,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-22,-26,-18,-1,-26,-19,17,-18,21,13,-19,-23,-14,-13,-17,-6,11,-22,-4,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-39,-40,-30,32,-23,-26,-12,-23,-9,-11,-33,-30,-26,-20,-33,-23,-19,100,29,-23;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-10,-18,-29,61,-19,-37,-19,-29,-19,0,-19,-18,-19,3,-16,-27,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=7,-19,-19,-22,-21,-11,2,-24,-5,-17,-10,-7,-16,-21,-20,-19,-3,-2,6,-6,-12,-20;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-13,-15,-10,-21,9,-18,-16,-11,-16,-13,-5,-11,-10,-18,14,1,-6,-24,-21,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-15,-9,-4,-16,-16,-13,-9,-9,-11,-7,-1,-13,3,-8,16,23,-4,-30,-12,-1;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-11,-13,-7,-20,3,-17,-15,-10,-17,-14,-3,-10,-7,-17,19,6,-5,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-13,-15,-10,-22,12,-19,-17,-12,-16,-13,-5,-12,-10,-19,13,-1,-7,-23,-22,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-15,-26,-20,-19,36,-26,12,-4,-15,-2,-2,-9,-28,-17,-11,-16,-9,-11,12,49,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-18,-29,-24,7,-27,-25,21,-22,5,6,-17,-22,-22,-21,-5,2,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-28,-13,-20,-25,54,-17,-30,-18,-21,-6,-3,-20,-17,-18,-3,-18,-23,-20,-25,-18;
MA   /M: SY='G'; M=24,-9,-18,-13,-13,-24,27,-19,-23,-14,-20,-15,-3,-14,-13,-19,10,-4,-13,-23,-24,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-18,-30,-20,-18,2,-22,-17,-11,-12,-12,-11,-18,-18,-14,-11,-13,0,-12,39,14,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-25,7,3,-22,-13,0,-20,9,-19,-12,13,-3,4,9,-4,-7,-21,-27,-13,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-22,0,16,-22,-5,-8,-19,1,-13,-11,-3,-8,7,-5,1,-3,-17,-22,-16,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-25,31,5,-30,8,-2,-33,-4,-26,-22,11,-12,-3,-6,4,-8,-24,-30,-18,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-26,-4,-9,-30,49,-16,-38,-13,-28,-20,0,-18,-13,-12,-1,-18,-29,-23,-27,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-25,-3,5,-23,-16,-5,-25,33,-23,-9,3,-13,8,35,-7,-8,-18,-19,-10,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-26,-10,-17,-24,49,-18,-28,-15,-23,-15,-1,-17,-16,-16,-1,-14,-21,-18,-23,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-27,-10,-4,-14,-18,-12,-7,-10,-4,-4,-6,15,-8,-9,-11,-7,-13,-27,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-8,-3,-5,-17,-4,-12,-16,-10,-23,-16,9,-13,-5,-10,28,20,-7,-37,-18,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-11,-23,-13,-17,-8,-28,-21,20,-19,6,6,-11,-19,-16,-21,-10,-2,16,-27,-7,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-36,-39,-36,-27,6,-20,-28,-17,-19,-18,-17,-35,-29,-19,-19,-32,-24,-22,117,21,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,38,-28,54,15,-32,-11,10,-34,-1,-26,-24,16,-11,0,-9,-2,-10,-27,-33,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-16,-12,-12,-10,-15,-13,-4,-5,-7,-2,-8,-17,-10,-5,1,10,5,-24,-7,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-27,-35,-25,47,-27,-16,-2,-23,3,-1,-22,-28,-26,-18,-21,-13,-6,30,28,-23;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,37,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00495;
//
ID   ANTITERMINATORS_BGLG_MP; MATRIX.
AC   MP00654;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transcriptional antiterminators bglG family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5121102; R2=0.0152635; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=238; N_SCORE=9.135; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=65; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-29,-2,9,-25,-11,13,-24,12,-17,-6,-1,-14,11,7,-9,-13,-22,-23,-7,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,11,41,-33,-20,2,-27,15,-21,-13,0,-4,31,7,-1,-10,-29,-26,-16,36;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-26,-23,-26,-18,10,-29,-10,10,-19,32,13,-24,-29,-14,-7,-26,-10,3,-10,14,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-25,6,-5,-23,8,-8,-25,-4,-16,-14,7,-18,-6,2,-3,-10,-20,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-17,3,-22,-19,-15,-2,-22,-10,-16,-3,-4,-14,-24,-18,-18,-10,-11,-6,-26,-17,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-26,0,4,-25,-17,-10,-24,25,-26,-12,6,0,3,13,-2,3,-19,-26,-14,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-33,-25,20,-31,-23,22,-28,30,14,-27,-29,-26,-21,-23,-8,19,-16,4,-25;
MA   /M: SY='B'; M=-10,14,-23,13,5,-23,-13,0,-16,-4,-12,-9,14,-16,11,-4,1,-4,-20,-31,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,32,-29,41,19,-32,-12,1,-34,7,-27,-23,19,-12,5,8,-1,-9,-28,-35,-18,11;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-23,-5,-2,-12,-15,10,-21,7,-22,-11,1,-16,2,10,6,0,-16,-19,7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-27,-39,-29,17,-37,-27,36,-30,22,16,-21,-23,-24,-27,-21,-10,22,-14,6,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-30,-19,-17,12,-29,30,2,-14,-1,4,-13,-26,-7,-11,-18,-12,-7,5,50,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-34,-28,6,-36,-20,35,-24,14,14,-22,-24,-21,-24,-18,-8,27,-13,13,-28;
MA   /M: SY='S'; M=12,-8,-12,-15,-10,1,-10,-16,-12,-14,-13,-12,-3,-14,-12,-14,17,15,-4,-23,-8,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,37,-28,51,12,-32,-12,0,-28,-2,-20,-13,12,-12,0,-10,-4,-10,-22,-36,-16,6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,11,-35,-28,-3,-35,-28,22,-30,17,10,-22,-28,-23,-28,-20,-10,15,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-10,10,-24,12,2,-16,-13,17,-21,-5,-22,-13,10,-16,7,-5,6,-3,-21,-23,6,3;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-18,-20,-24,-9,39,-22,-16,-8,-18,0,-6,-14,-20,-23,-16,-10,-8,-6,-4,11,-13;
MA   /M: SY='A'; M=37,-14,-12,-24,-14,-1,-6,-20,-8,-14,-6,-8,-12,-14,-16,-20,4,-2,0,-14,-10,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-28,-34,-26,8,-36,-18,35,-26,22,16,-22,-24,-18,-24,-22,-10,18,-10,16,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-30,8,30,-31,-20,-4,-29,30,-25,-13,0,-6,19,16,-5,-10,-25,-24,-14,25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-12,-26,-17,-17,6,-7,6,-6,-18,-1,-1,-5,-25,-14,-14,-13,-12,-10,-10,14,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-27,-1,13,-33,-17,2,-23,18,-23,-6,1,-11,35,19,2,-6,-24,-23,-11,23;
MA   /M: SY='Q'; M=2,8,-24,1,8,-30,-11,2,-19,8,-22,-8,13,-12,26,4,3,-6,-23,-25,-14,17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-29,-12,-20,-23,41,-18,-20,-20,-20,-12,3,-20,-18,-20,-3,-16,-18,-22,-23,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-7,-15,-5,-11,-5,-19,-12,7,-13,11,9,-13,-19,-12,-13,-12,-6,11,-22,-6,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-5,-15,0,-10,-7,-19,-15,5,-14,7,1,-12,-19,-15,-14,-10,-5,11,-24,-8,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-19,-28,-21,3,-28,-21,29,-23,24,15,-20,-20,-17,-20,-18,-7,20,-17,-1,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-31,-3,12,-34,-20,0,-24,20,-24,-6,-2,0,33,20,-5,-10,-26,-21,-12,21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-24,20,23,-24,-8,6,-24,4,-26,-20,37,-12,8,0,6,-4,-30,-36,-20,15;
MA   /M: SY='P'; M=2,-8,-23,-10,-7,-21,-6,-19,-19,-5,-20,-14,-6,14,-9,-11,5,13,-14,-26,-19,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-16,-24,-16,6,-22,-12,16,-20,35,24,-22,-22,-12,-14,-22,-8,8,-16,0,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-16,-20,-13,-1,-23,-14,13,-17,23,12,-20,-22,-7,-12,-16,-6,10,-18,-3,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-3,-38,0,-7,-15,-15,-2,-25,-10,-25,-20,-5,0,-8,-13,-16,-17,-30,32,1,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-35,-28,14,-35,-27,31,-26,13,11,-19,-22,-24,-25,-14,-2,24,-17,3,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-2,-30,-2,7,-27,-20,16,-29,30,-25,-7,2,-14,16,29,-9,-12,-23,-22,-4,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-25,-4,-7,-17,-21,-12,-6,1,-9,-5,-5,-18,-6,13,-8,-8,0,-25,-11,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00562;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F6_1_MP; MATRIX.
AC   MP00655;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 6 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6562281; R2=0.0136751; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=725; N_SCORE=14.561; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=6,-5,-22,-5,-2,-19,-6,-17,-6,-11,-9,-8,-8,-15,-10,-17,-2,-7,0,-26,-17,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-20,-22,-21,-17,7,-23,-3,2,-8,3,1,-18,-25,-12,-3,-13,-6,3,-2,25,-17;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-18,-15,-7,-14,-20,-13,-3,-3,-1,4,-10,-16,1,-5,-2,8,0,-24,-9,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-13,-17,-5,-23,-3,-15,-12,-7,-12,-8,-8,-10,1,-15,8,-2,-5,-20,-18,-2;
MA   /M: SY='N'; M=6,10,-20,5,0,-24,-10,-7,-16,4,-19,-12,11,-15,2,-3,2,-4,-12,-29,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-15,-15,-4,-24,-5,-15,-14,0,-14,-9,-8,-10,1,-10,6,-2,-6,-20,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-13,-19,-9,-20,-3,-17,-13,-5,-11,-10,-9,-11,-7,-8,7,-1,-3,-20,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,61,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-23,-29,-17;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-23,-4,4,-26,-3,-8,-23,20,-21,-8,-1,-10,10,10,-3,-9,-17,-17,-12,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-1,-19,-9,-9,-8,-18,-10,4,-6,0,0,6,-16,-7,-7,-5,1,-2,-23,-7,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-25,-11,-5,-18,-16,-16,-7,-9,-16,-10,-16,49,-11,-15,-7,-6,-10,-22,-19,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-14,-10,-5,4,-15,3,1,-6,5,3,-10,-13,2,-4,-10,-5,-5,2,18,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=11,-11,-7,-13,-10,-4,-9,-12,5,-9,6,2,-11,-11,-10,-11,-3,-1,9,-12,-6,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=3,-11,-9,-14,-12,6,0,-12,-2,-11,-2,-2,-8,-12,-14,-11,-3,-4,3,-7,-3,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-24,-13,-6,-18,-23,-6,7,-7,-4,9,-2,-18,14,-7,-6,-7,-1,-25,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-34,-25,14,-31,-22,27,-26,28,20,-25,-26,-22,-21,-22,-8,20,-18,2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-18,-28,-25,-5,-30,-28,25,-20,5,7,-27,-10,-25,-22,-12,-3,34,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-2,25,-23,30,5,-27,-8,-3,-22,-4,-18,-11,11,-13,-2,-11,0,-7,-17,-33,-17,2;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-22,-32,-22,3,-29,-21,25,-26,33,21,-24,-24,-17,-22,-22,-9,14,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-10,13,-26,12,-7,-13,18,-8,-29,-12,-24,-19,16,-19,-14,-13,-1,-11,-25,-25,-16,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=16,-13,-21,-18,-18,-9,28,-20,-23,-18,-16,-13,-7,-18,-19,-20,1,-11,-14,-15,-17,-18;
MA   /M: SY='A'; M=25,4,-15,-7,-7,-21,7,-11,-17,-9,-19,-15,11,-14,-7,-14,12,0,-12,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='H'; M=1,-13,-23,-14,-8,-13,-18,24,-10,-16,1,1,-9,-9,-6,-13,-11,-11,-11,-25,-1,-9;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-15,-5,-6,-23,19,-14,-24,-13,-28,-19,5,-13,-6,-14,26,7,-14,-33,-23,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,16,-25,6,-9,-25,33,-4,-29,-9,-30,-20,32,-20,-9,-9,5,-9,-30,-31,-25,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=13,-2,-21,0,25,-23,-14,-11,-16,-1,-13,-13,-7,-7,4,-9,3,-5,-10,-26,-19,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-23,-30,-21,-13,6,-22,-14,-7,-16,-4,-7,-22,17,-16,-17,-18,-11,-14,9,7,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-16,-2,-1,-22,-3,-11,-19,-9,-28,-19,8,4,-3,-12,25,11,-14,-36,-22,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-23,-20,-8,5,-23,6,0,-18,9,4,-13,-20,-11,-15,-14,-11,-3,-18,4,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=10,4,-8,2,-2,-12,-4,-8,-9,-4,-8,-8,0,-5,-4,-8,6,6,-4,-15,-9,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='B'; M=-7,18,-13,16,4,-15,-4,1,-15,6,-16,-11,18,-8,1,2,1,-3,-15,-19,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=11,14,-16,13,1,-24,-5,-9,-21,-6,-22,-18,11,-11,-4,-12,15,7,-13,-33,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=17,-8,-23,-10,-8,-26,35,-18,-28,-13,-22,-16,-4,-14,-12,-18,4,-12,-19,-21,-25,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-20,-22,-23,-18,12,-23,-1,3,-16,12,3,-20,-25,-13,-15,-16,-8,-2,4,33,-18;
MA   /M: SY='N'; M=13,9,-18,-3,-4,-20,-4,-5,-18,2,-20,-14,18,-16,-2,6,6,-2,-15,-27,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,3,-25,1,11,-24,-13,-4,-26,20,-24,-14,7,-12,7,23,1,-5,-20,-26,-15,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-39,-29,-25,21,-25,-4,-9,-15,-9,-9,-29,-30,-15,-15,-29,-19,-19,87,56,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-9,-25,-11,-4,-19,-22,-16,-5,16,-15,-3,-6,-14,-2,6,-4,-4,-1,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-23,19,0,-29,16,-8,-31,-8,-27,-22,14,-14,-7,-13,9,-6,-23,-32,-23,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-6,-22,-4,17,-12,-23,-11,-9,-8,6,-4,-10,-12,0,-9,-5,4,-10,-27,-11,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-20,-38,-30,43,-32,-25,18,-28,12,7,-22,-28,-33,-22,-18,-8,18,-6,14,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00563;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F6_2_MP; MATRIX.
AC   MP00656;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 6 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4296455; R2=0.0127670; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=316; N_SCORE=8.454; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=13,10,-19,13,14,-27,-6,-9,-23,-4,-21,-19,3,-8,1,-11,12,0,-15,-31,-20,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-22,-29,-24,-4,-29,-26,31,-24,7,9,-16,-20,-18,-24,-5,-2,25,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=1,27,-24,32,6,-32,3,-6,-30,-5,-25,-23,15,-12,-5,-13,4,-8,-22,-33,-21,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-26,-4,11,-21,-21,-9,-18,6,-12,-9,-6,0,7,7,-3,3,-16,-25,-13,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-39,-30,34,-35,-26,27,-29,15,11,-21,-25,-29,-25,-19,-9,19,-8,12,-30;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-14,-17,-7,-21,-4,-17,-14,0,-13,-10,-8,-11,-6,-6,6,-2,-4,-20,-18,-7;
MA   /M: SY='A'; M=14,0,-22,-2,0,-30,9,-9,-23,-5,-20,-12,-2,-12,9,-10,4,-8,-19,-22,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-14,-29,-16,-15,-20,19,-18,-12,-13,-10,-5,-7,-19,-9,-14,-8,-15,-12,-20,-17,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,30,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-26,1,3,-28,-8,-10,-24,18,-22,-10,-2,-14,6,11,-5,-9,-15,-23,-14,4;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,7,-16,3,6,-13,-8,2,-16,10,-14,-9,13,-10,5,20,-1,-4,-15,-17,-9,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-24,-6,0,-18,-12,-12,-12,-6,-18,-12,-12,54,-6,-12,-6,-6,-18,-18,-18,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-12,4,13,-14,-6,0,-11,2,-10,-7,6,-4,9,-1,2,-3,-12,-14,-9,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-10,-12,-12,-10,15,-12,2,-1,-7,0,-1,-9,-13,-8,-7,-7,-4,-3,8,26,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-10,1,7,-12,-4,-5,-11,-3,-14,-10,1,6,1,-5,11,4,-9,-18,-11,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,20,-13,28,8,-18,-4,-1,-18,-1,-15,-14,9,-5,0,-5,5,-2,-13,-20,-10,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-9,-15,-13,-1,-16,-14,15,-11,5,5,-10,-11,-11,-11,-4,4,16,-13,-3,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-13,-2,3,-13,-8,-1,-13,12,-12,-5,1,-7,9,18,1,-2,-10,-12,-6,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=11,-19,-12,-25,-20,1,-19,-22,11,-16,3,2,-16,-18,-19,-18,-3,2,19,-19,-7,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-17,-29,-24,0,-26,-22,22,-20,10,8,-23,-24,-21,-21,-11,-4,25,-18,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-16,-30,-24,-2,-26,-26,23,-22,16,10,-24,-24,-22,-22,-12,-4,28,-24,-8,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-33,-28,-1,-34,-29,35,-24,13,13,-22,-23,-23,-24,-11,1,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-11,-11,-6,-17,-3,-15,-12,-12,-14,-12,-2,-12,-6,-15,21,9,-4,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,-23,-13,-8,-25,9,-19,-20,-12,-22,-16,-9,17,-11,-19,5,-5,-16,-25,-25,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-21,12,0,-17,-9,2,-11,-4,-14,-10,28,-17,2,-4,0,-4,-18,-30,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-29,-20,9,-27,-10,18,-22,36,29,-26,-27,-13,-16,-26,-10,8,-15,9,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-16,-20,-21,-10,-5,-24,5,-18,-5,-2,-13,-21,-20,-18,2,6,16,-28,-14,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,13,-14,11,-1,-17,-12,-11,-17,-6,-17,-15,9,-10,-5,-8,15,26,-9,-31,-13,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-9,6,48,-8,-17,-21,-8,-13,-27,-17,-25,-20,15,-30,-17,-17,-1,-7,-20,-43,-26,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-21,-19,-26,-18,1,-24,-14,17,-20,24,25,-19,-22,-11,-16,-14,-1,9,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-21,12,0,-26,10,-2,-26,-6,-29,-19,24,-15,3,-7,15,0,-24,-34,-21,2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-23,-7,1,-20,-18,-1,-10,-7,-15,-8,-3,3,-1,-10,-1,-2,-8,-29,-14,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-25,-5,-3,-17,-9,-12,-16,-9,-18,-11,-7,5,0,-12,-1,-7,-14,-24,-15,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,4,-25,6,15,-30,-15,-2,-23,18,-21,-8,1,-8,23,9,-2,-8,-21,-21,-12,19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-16,46,-22,-15,-21,-27,-17,-19,-11,-16,-10,-12,-28,-5,-3,-9,-10,-11,-35,-19,-11;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-19,-4,3,-24,-10,-11,-15,-1,-13,-10,-5,-12,2,-4,3,-4,-7,-24,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-25,7,15,-25,-7,-2,-21,5,-22,-13,14,-13,8,0,1,-7,-20,-30,-18,12;
MA   /M: SY='A'; M=18,-16,-16,-22,-12,-6,-13,-16,-7,-6,-2,-4,-12,-18,-11,-1,-3,-4,0,-18,-10,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-27,-6,14,-14,-23,-7,-13,3,3,-4,-10,-16,4,15,-13,-10,-14,-24,-10,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00563;
//
ID   FORK_HEAD_1_MP; MATRIX.
AC   MP00657;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fork head domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3560305; R2=0.0154295; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=176; N_SCORE=8.062; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-2,-9,-24,-12,-8,-9,-7,-13,-11,-8,-9,-4,-5,-10,-8,-8,-4,-7,-10,-19,-11,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-26,-6,2,-20,-13,-8,-16,-2,-18,-10,-8,2,3,-6,-3,-6,-15,-10,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-20,-8,-5,-15,-6,-10,-12,-6,-11,-6,-3,-9,-2,-5,2,-2,-9,-25,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: M=-5,-2,-24,0,-3,-16,-7,-10,-17,-2,-15,-10,-4,-2,-6,-5,-3,-4,-14,-21,-9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-21,-6,-3,-19,-8,-12,-15,-1,-17,-11,-5,10,-3,-1,1,0,-11,-22,-15,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-23,0,2,-12,-16,-8,-19,3,-15,-12,0,-10,-1,4,1,1,-15,-23,-7,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-25,-2,1,-20,-8,-13,-17,-2,-16,-12,-3,-1,-4,-5,-1,-2,-14,-27,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-24,-1,5,-19,-5,-5,-18,-3,-15,-6,-2,-11,5,-4,1,-6,-17,-23,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-27,-10,-3,-14,-21,-7,-11,6,-11,-6,-10,-18,-2,7,-11,-9,-8,-7,-1,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-27,6,10,-27,-14,-5,-24,12,-22,-12,2,-4,10,10,-2,-7,-20,-27,-15,9;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-20,-5,-4,-15,-13,-12,-8,-9,-11,-9,-1,-5,-8,-11,3,3,-6,-30,-14,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-1,-23,-2,-1,-10,-10,4,-15,0,-11,-6,3,-17,-1,4,-4,-6,-15,-17,2,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-25,0,-2,-20,-13,-8,-18,4,-19,-12,0,-3,-3,3,-2,-4,-14,-24,-11,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-8,2,-24,0,-2,-14,-17,7,-12,-6,-12,-6,5,-14,-2,-3,-2,-3,-13,-26,-3,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-8,-14,-8,3,-21,-14,-12,-10,-4,-14,-7,-7,-15,4,-7,2,-1,-4,-28,-15,3;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-37,-9,1,-30,-20,-18,-19,-8,-28,-18,-17,76,-4,-17,-7,-6,-28,-29,-27,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-22,-19,26,-29,13,2,-13,4,2,-20,-29,-11,-11,-19,-10,-5,17,60,-19;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-18,-16,-10,-15,-13,-14,3,-13,-8,1,-3,-14,-3,-15,8,2,2,-27,-13,-8;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-7,-15,-9,-15,-10,-17,-9,-13,-7,-8,-7,-15,-7,-15,9,7,-3,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-26,-34,-25,-2,-35,-27,38,-27,16,15,-17,-19,-18,-26,-13,-3,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-4,-19,-12,-9,-16,-14,-7,-11,-7,-3,-11,-17,-7,-14,3,8,0,-21,-6,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-18,-21,-25,-15,3,-23,-4,11,-12,14,35,-17,-20,1,-10,-16,-6,3,-17,3,-7;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-2,-20,-11,-19,-4,-21,-11,-11,-11,-11,-10,-12,-11,-20,10,3,-1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-17,-38,-29,-1,-37,-27,40,-29,18,20,-20,-22,-19,-28,-19,-10,25,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-25,-5,7,-20,-18,0,-13,0,-6,-2,1,-16,15,7,-5,-6,-17,-23,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,-21,6,5,-25,-6,9,-23,-1,-24,-12,13,-13,10,-3,11,-1,-21,-32,-13,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=17,-1,-10,-5,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-23,-17,6,-10,-3,-12,30,19,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-33,-5,5,-29,-18,-15,-20,-5,-27,-17,-12,55,-1,-13,-3,-4,-25,-29,-25,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,14,-25,17,18,-27,-10,-2,-27,4,-22,-18,9,-10,6,1,3,-3,-22,-30,-17,12;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-25,-4,2,-28,-5,-11,-30,30,-27,-12,-1,-14,5,23,-7,-9,-21,-21,-14,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-18,-14,-7,-17,-14,-5,-15,11,-11,7,-6,-19,4,23,-10,-9,-11,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,6,-30,-18,26,-25,37,29,-26,-26,-16,-20,-25,-10,15,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-15,-8,-6,-15,-16,-18,-14,-10,-18,-14,-1,7,-8,-12,19,34,-7,-32,-15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-28,-20,7,-29,-21,19,-27,41,17,-28,-28,-20,-19,-24,-4,13,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-15,-1,0,-21,-6,-10,-20,2,-26,-16,11,-11,0,-3,23,14,-12,-34,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,14,-28,21,23,-32,1,-4,-31,0,-24,-19,6,-9,9,-7,1,-11,-27,-29,-21,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-29,-35,-28,-2,-37,-27,44,-27,16,17,-13,-20,-18,-27,-17,-9,25,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-27,-20,-20,29,-30,19,-1,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,28,78,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00564;
//
ID   FORK_HEAD_2_MP; MATRIX.
AC   MP00658;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fork head domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8020101; R2=0.0139668; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=12.180; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-22,-30,-25,-15,26,-17,-11,-12,-17,-7,-8,-18,-25,-14,-14,-18,-15,-16,32,24,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-38,-29,17,-36,-27,36,-29,20,15,-22,-24,-25,-26,-20,-9,24,-15,5,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-18,-15,-8,-11,-20,-12,-2,-9,0,3,-7,-16,-1,-4,4,13,-2,-27,-8,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-3,6,-25,8,5,-25,-7,10,-28,1,-20,-14,4,-14,1,6,0,-6,-20,-27,-11,1;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-9,-23,-13,-9,-10,-21,10,-4,0,1,12,-5,-21,-2,4,-14,-10,-5,-25,-2,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-31,-25,-37,-29,57,-28,-19,0,-26,4,-2,-24,-30,-33,-19,-22,-12,-1,30,31,-28;
MA   /M: SY='P'; M=5,-16,-30,-13,-3,-26,-15,-17,-19,-4,-23,-16,-14,46,-7,-6,-5,-7,-20,-26,-24,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-5,7,-23,-20,-3,-30,34,-23,-11,0,-16,11,55,-9,-10,-21,-21,-11,5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-2,-27,-6,-4,-3,-6,0,-20,3,-17,-11,4,-20,-5,3,-7,-10,-20,-10,10,-6;
MA   /M: SY='N'; M=3,14,-5,7,-2,-22,-5,4,-22,-8,-25,-17,21,-17,-3,-9,13,2,-18,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-2,-25,-5,-4,-10,-18,-1,-14,-2,-18,-11,2,1,0,-6,1,5,-17,-16,6,-4;
MA   /M: SY='E'; M=6,2,-22,2,14,-25,-14,-8,-19,6,-15,-7,-3,-8,8,-3,1,-3,-14,-25,-15,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-23,-6,-13,-23,29,-14,-28,-10,-24,-16,8,-17,-12,-8,5,-2,-21,-25,-22,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,12,-32,-20,-2,-27,34,-25,-7,0,-12,26,30,-7,-10,-23,-20,-10,18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-21,27,3,-23,-2,7,-23,-1,-30,-22,49,-17,0,-3,11,0,-28,-40,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,35,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-18,12,-5,-17,-5,4,-12,-3,-24,-15,46,-22,-5,-3,7,0,-17,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,10,-5,-5,-20,-5,-13,-22,-13,-28,-20,5,-15,-5,-13,32,15,-10,-42,-22,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-20,-21,-13,5,-23,-17,4,-14,21,7,-18,-24,-14,-11,-14,-5,1,-21,-2,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-13,15,-2,4,-6,-16,-12,29,-23,-8,-23,-13,28,-24,-3,-5,-1,-8,-25,-33,-3,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,12,-28,17,16,-32,-16,-3,-30,22,-27,-15,6,-10,15,15,-1,-7,-24,-27,-14,15;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-17,62,-24,-20,-16,-24,-24,-20,-19,-10,-12,-16,-30,-20,-20,-7,-6,-7,-39,-22,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-10,-23,-9,-9,-12,-27,-17,8,-8,-2,0,-12,-20,-11,-3,-10,-7,13,-27,-10,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-27,-7,2,-23,-22,-11,-21,35,-22,-7,-5,-15,4,29,-10,-8,-9,-22,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,16,12,-30,-30,-28,-20,-13,-2,44,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-30,-4,11,-24,-20,0,-16,-6,-13,-9,-10,21,7,-9,-5,-8,-22,-28,-15,7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-23,-3,-1,-20,-16,-7,-18,20,-21,-10,7,-17,1,22,-2,-4,-10,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,13,-28,23,32,-28,-18,-3,-27,8,-20,-18,2,-9,9,8,-3,-9,-21,-31,-17,20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00564;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F5_MP; MATRIX.
AC   MP00659;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 5 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6956547; R2=0.0075005; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=841; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=641; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-26; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-75,37,12,-53,-48,-60,38,-22,-21,-53,-59,-71,-8,1,-23,15,12,29,56;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-19,-83,-47,67,-79,-77,33,-73,8,-15,6,-80,-74,-75,-73,-39,-5,126,-36; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-72,-19,17,68,-20,-19,-23,15,-9,-56,-61,-71,-28,-7,-23,34,-26,56,-44;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-102,-11,-16,-107,-15,-87,-105,13,-70,-95,-19,-95,0,-12,-1,-84,-99,-108,-97; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-43,-79,-14,52,12,-48,29,-43,45,-36,-19,-55,-66,63,-13,-58,-36,-20,55,-55;
MA   /M: SY='M'; M=-31,-73,-78,-75,2,-80,-61,54,-44,20,74,-72,-76,-66,-70,-42,1,5,-59,65;
MA   /M: SY='A'; M=70,-65,-62,-60,-75,21,-65,-68,-12,-52,-64,-11,-32,-56,-64,52,-15,-40,-78,-70;
MA   /M: SY='E'; M=20,-71,13,35,-76,19,-59,-71,-1,-53,-66,24,-65,16,10,17,30,-30,-81,-69;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-76,-5,23,-69,-71,4,-66,38,15,-57,-12,-14,-5,63,-4,-19,-44,-77,-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-47,-78,-20,16,65,-50,-13,-22,-65,-28,-52,-16,-78,-29,-65,-65,-64,-27,32,100;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-15,-92,-42,-69,-94,34,-79,-36,59,-92,-83,-68,-18,-66,2,-70,-44,-86,-91,-85; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-12,-74,57,-18,-33,10,-13,-73,-2,-53,-66,71,-71,-24,-58,-2,-55,-73,-70,58;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-48,-83,41,-2,-35,-33,-18,-73,-14,-14,-69,23,-79,3,-68,19,-21,-33,-76,51; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-61,-76,76,-5,-74,-17,-54,-77,-1,-79,-72,40,36,-24,-7,20,2,-75,-82,15;
MA   /M: SY='P'; M=-41,-18,29,35,-72,-69,-18,-40,-36,-69,-64,-12,66,-56,-64,-10,59,4,-82,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-62,-73,-33,-64,-32,-70,76,36,-37,-40,-51,68,-75,-59,1,-59,-55,46,-82,7;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-71,-85,-79,-48,-87,-80,67,-77,41,-36,-79,-78,-75,-78,-72,-56,64,-78,-57;
MA   /M: SY='I'; M=12,-74,-75,-77,-32,58,-77,71,-73,-19,-14,-64,-72,-70,-78,-59,-61,-1,1,-63;
MA   /M: SY='W'; M=-34,-77,-83,-80,78,-81,-64,49,-74,-16,-47,-77,-81,-74,-73,-71,-65,-19,80,74;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-80,41,99,-84,-4,-54,-85,-44,-78,-74,-11,-58,-1,-54,-55,-60,-78,-82,-73;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-71,-79,-77,-48,-6,-74,62,-75,59,-36,-72,-76,-71,-76,-27,15,7,-74,-57;
MA   /M: SY='M'; M=32,21,-76,-69,-29,-32,3,13,2,34,79,-69,-74,-63,-65,-62,-58,13,-74,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='P'; M=-65,-90,-68,-56,-83,-69,-71,-67,-64,-79,-68,-74,125,-67,-76,-64,-58,-5,-80,-82;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-73,-32,-60,-3,-69,69,-37,-50,32,-51,64,-76,-53,51,-13,-34,-28,-78,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-55,48,28,-12,-39,74,-20,-75,-41,-14,-22,-53,-1,-29,-70,-3,-36,-48,1,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-40,-74,18,-20,-70,4,-17,-59,-11,-49,15,34,61,-8,-20,20,-6,22,-80,-9;
MA   /M: SY='V'; M=3,-70,24,-59,-68,30,-63,-22,-23,-64,-61,30,-1,-9,-37,25,10,38,-80,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-18,11,-23,-15,9,3,10,-63,13,-55,34,-70,-61,-68,10,41,-7,64,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-78,53,-20,-65,19,-63,-46,-37,-54,-69,10,30,-27,-38,10,15,-72,101,7;
MA   /M: SY='M'; M=2,-71,-6,6,-34,9,-59,-57,-11,-9,73,23,-69,15,-19,10,9,-16,43,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-19,42,41,-72,18,-62,-46,-9,-53,-68,1,-13,6,9,-34,25,-31,78,-63;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-79,37,-34,-64,9,-63,1,25,-27,-63,29,-71,22,3,-37,-36,-30,105,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-70,-19,-38,-32,-30,-19,32,-4,20,28,29,-70,-9,-36,15,34,-21,27,-59;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-74,4,-9,-18,22,-62,-15,47,-6,-19,0,18,-54,11,-35,9,-28,-73,-8;
MA   /M: SY='W'; M=2,-76,5,7,-67,4,-58,-41,16,-67,26,34,36,40,-56,-21,-19,-10,55,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-72,18,-10,21,-67,-56,-24,-58,9,-17,17,-1,22,-20,15,26,-58,3,52;
MA   /M: SY='Y'; M=26,-76,24,38,8,-44,-55,-67,-2,-36,-61,-13,-33,15,-58,-22,-20,-66,65,68;
MA   /M: SY='W'; M=29,-18,-32,38,-61,-68,-60,9,-10,9,3,28,-69,23,-7,-36,-34,-15,43,6;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00565;
//
ID   FERM_1_MP; MATRIX.
AC   MP00660;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FERM domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8579502; R2=0.0135572; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=249; N_SCORE=8.224; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-14,11,-25,15,5,-13,-19,-2,-14,-8,-9,-6,1,-14,-4,-11,-5,-2,-12,-28,-7,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-26,-17,-12,25,-26,7,-3,-7,-2,-2,-16,-24,-11,-8,-16,-9,-8,14,49,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-21,-22,-31,-23,57,-26,-16,-6,-17,2,-3,-12,-27,-30,-8,-16,-9,-5,2,21,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-29,-12,-16,-25,41,-20,-28,-19,-21,-15,-5,-5,-17,-20,-2,-15,-23,-23,-26,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-23,-10,-2,-27,-16,11,-16,27,13,-22,-23,-9,-13,-21,-9,4,-21,-4,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-27,-5,10,-23,-17,-3,-18,3,-16,-9,-3,-14,18,5,-4,-8,-20,-5,-8,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-24,-22,-19,32,-29,3,-2,-12,1,-1,-16,-27,-17,-11,-18,-10,-7,10,44,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-14,-7,-16,-14,-8,-22,-15,-3,-13,-3,-2,-13,-19,-9,-12,-6,1,0,-16,-5,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-26,34,13,-28,-13,6,-25,-4,-20,-18,15,-13,1,-9,2,-7,-22,-36,-14,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-18,-1,1,-19,-11,-2,-17,1,-18,-8,4,-9,0,-1,8,5,-11,-28,-12,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=2,7,-22,7,6,-27,-10,-8,-23,8,-25,-15,6,-5,6,0,8,1,-18,-29,-17,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-25,10,2,-27,3,-2,-24,-4,-23,-14,9,-14,3,-7,5,-5,-21,-29,-16,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-20,-4,4,-15,-18,4,-14,-4,-14,-6,3,-16,13,-4,0,-4,-16,-21,-3,8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-24,-13,-8,-15,-13,-15,-14,2,-11,-7,-9,-8,-7,5,-5,-3,-9,-17,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-3,0,-20,-8,-9,-13,-10,-3,-13,-2,-15,-9,8,-18,-6,3,1,3,-9,-25,-9,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,22,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-29,41,24,-35,-14,-1,-34,12,-28,-22,14,-9,9,1,-1,-9,-28,-33,-18,16;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-25,-16,-10,-8,-17,-6,-4,-17,4,1,-12,6,-11,-15,-11,-7,-10,-26,-10,-12;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-19,5,2,-19,-4,-8,-18,-8,-15,-12,6,-13,-4,-11,8,4,-14,-29,-15,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,9,-29,-20,-7,-29,43,-27,-9,0,-12,13,37,-9,-10,-21,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-27,-3,5,-23,-18,-13,-18,5,-22,-14,-3,16,-1,-1,2,2,-17,-29,-18,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,31,-27,30,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-22,-14,-7,-14,-20,-12,-8,9,-7,2,-8,-17,-2,12,-5,-1,-2,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-28,8,24,-29,-17,-5,-28,26,-24,-14,2,-8,12,16,-4,-9,-23,-25,-15,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,0,16,-36,-20,28,-22,6,-20,0,2,-12,50,8,-2,-12,-30,-22,-4,32;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-18,8,0,-16,8,-7,-17,-5,-9,-7,0,-11,-5,-7,-5,-9,-13,-18,-12,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-13,-21,-17,0,-21,-18,20,-16,12,8,-18,-12,-16,-15,-11,-4,20,-17,-5,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-16,-4,2,-19,-14,-3,-22,23,-19,-9,1,-12,5,28,-4,-6,-15,-19,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-19,-5,-2,-11,-6,-3,-17,9,-16,-8,2,-12,-1,8,-1,-3,-12,-16,-5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-23,-1,6,-18,1,-12,-21,-8,-18,-15,-4,-2,-4,-12,3,-6,-17,-25,-17,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-28,4,12,-22,-11,-8,-22,0,-21,-16,4,11,0,-6,-1,-6,-23,-29,-19,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-29,0,7,-24,-8,-1,-21,-5,-24,-16,1,34,-2,-10,-4,-9,-26,-27,-19,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-19,-10,-9,-4,-24,-14,-5,-14,-4,-7,-18,-12,-14,-16,-15,-10,-4,-3,4,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-10,-15,-15,-11,-11,-24,-10,3,-14,0,1,-7,-18,-5,-12,-1,11,5,-28,-7,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-19,-33,-24,30,-30,-21,14,-27,26,12,-24,-28,-26,-20,-20,-5,11,-11,9,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-19,-16,-11,2,-24,3,-8,-3,-2,-1,-10,-22,-9,0,-11,-4,-6,-14,12,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-26,57,-29,-20,5,-29,21,5,-22,-29,-33,-20,-21,-9,3,0,20,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-18,-12,-9,-17,-4,-7,-20,5,-14,-5,1,-21,-3,23,-7,-9,-14,-24,-14,-8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-14,-26,-22,-1,-24,-24,13,-10,2,3,-21,-24,-21,-9,-8,-2,27,-24,-9,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-29,-4,6,-26,-21,-10,-24,41,-23,-5,-3,-13,7,28,-11,-10,-15,-20,-9,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-26,-27,-23,45,-29,5,1,-17,5,4,-20,-29,-19,-13,-20,-10,-5,20,58,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-28,-21,-14,-2,-24,-19,-1,-16,-10,-7,-20,26,-18,-20,-11,-7,-4,-18,-6,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-5,-28,-1,14,-19,-16,-10,-20,-4,-22,-17,-4,25,-1,-8,1,-5,-22,-29,-19,5;
MA   /M: SY='D'; M=-15,42,-27,55,18,-35,-8,0,-35,-1,-30,-27,22,-11,1,-9,5,-6,-28,-40,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-20,-26,-18,-10,-18,-22,-17,0,-13,-9,-4,-19,23,-10,-17,-9,-7,-1,-27,-17,-12;
MA   /M: SY='N'; M=8,11,-13,2,-2,-21,4,-7,-20,-7,-24,-18,20,-15,-4,-9,16,5,-17,-34,-21,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-4,-25,-4,10,-20,-20,-1,-12,5,-13,-5,-4,-13,16,3,-5,-7,-13,-16,-5,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-20,-24,-15,3,-26,-17,10,-19,33,13,-23,-26,-14,-10,-21,-7,4,-22,-3,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-26,-10,-2,-18,-22,-5,-9,7,-13,-3,-1,-16,12,11,-4,-3,-10,-20,-4,3;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-30,29,35,-36,-17,3,-30,7,-23,-17,6,-6,27,0,0,-10,-30,-30,-17,31;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-32,24,35,-32,-17,-4,-29,3,-25,-22,3,17,8,-7,-2,-9,-30,-33,-22,20;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-22,-32,-25,3,-31,-23,30,-23,14,12,-21,-23,-19,-23,-15,-7,24,-18,2,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-14,-8,-5,-15,-20,-14,-13,-4,-12,-8,0,-11,2,-1,15,37,-6,-28,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-28,-16,-4,-16,-24,-6,-10,9,-3,1,-8,-20,9,32,-13,-10,-10,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-5,-28,-8,-7,6,-22,25,-13,-2,-11,-5,0,-24,-2,3,-12,-10,-18,0,36,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-20,-24,-21,-9,0,-27,-7,6,-16,23,12,-20,-24,4,-10,-20,-10,-4,-14,6,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-21,-33,-25,45,-30,-14,8,-26,22,7,-24,-30,-28,-18,-23,-10,3,2,26,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-21,6,-28,-24,26,-26,-9,-6,-20,-2,-5,-19,-29,-23,-18,-13,-6,-3,-2,26,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00566;
//
ID   FERM_2_MP; MATRIX.
AC   MP00661;
DT   01-NOV-1997 CREATED; 01-JAN-2003 DATA UPDATE; 01-JUN-2007 INFO UPDATE.
DE   FERM domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=295;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=290;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4604; R2=0.03198256; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=336; N_SCORE=13.202; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-24,-20,-14,-2,-16,-13,-1,-10,-2,2,-10,-15,-9,-2,-10,-6,-2,-18,-3,-13;
MA   /M: M=-8,-13,-20,-15,-12,-4,-16,-13,-6,-8,-6,-3,-10,-14,-12,-6,-6,-2,-2,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,3,-29,-23,-1,-28,-22,13,-24,14,7,-22,-27,-21,-22,-14,-5,16,-27,-8,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-22,-3,3,-21,-17,-1,-21,11,-19,-10,2,-10,6,16,0,-2,-16,-26,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,2,-32,-30,34,-23,13,12,-27,-28,-28,-22,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-13,-21,-16,-10,5,-25,16,-10,-9,-4,-1,-8,-22,-5,-2,-10,-5,-10,-12,18,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-17,-27,-19,18,-26,-10,7,-24,25,12,-20,-27,-19,-16,-20,-7,2,-16,5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-23,-22,-13,4,-25,-7,5,-18,15,9,-20,-13,-13,-16,-16,-6,-1,-15,7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,24,-23,29,4,-24,-7,1,-28,-5,-23,-20,15,-15,-4,-8,1,-4,-23,-30,-13,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,6,-25,8,0,-28,18,-10,-31,-4,-26,-19,6,-12,-5,-8,5,-7,-23,-28,-21,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-20,-2,2,-21,-8,-9,-18,-3,-18,-12,2,-11,4,-2,10,9,-13,-28,-14,3;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-21,-7,-2,-9,-18,-11,-9,-6,-9,-7,-5,-13,-4,-4,1,3,-5,-25,-8,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-22,-10,-2,-11,-19,-3,-10,1,-6,-2,-7,-16,-3,0,-10,-8,-8,-22,-4,-3;
MA   /I: I=-9; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-20,-5,4,-19,-9,-7,-16,-3,-15,-10,-2,-5,-1,-6,5,3,-12,-27,-15,1; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-11,-31,-23,17,-31,-22,16,-25,17,8,-22,-27,-23,-20,-18,-8,15,-18,1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-22,-4,4,-19,-14,-7,-17,3,-12,-8,-2,-13,2,6,0,3,-12,-26,-12,2;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-27,-8,-32,-27,15,-31,-17,17,-24,9,7,-22,-28,-25,-21,-16,-7,19,-16,8,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-26,25,16,-29,-9,-1,-28,0,-24,-20,12,-5,6,-4,5,-3,-25,-34,-18,11;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-17,-3,2,-20,-11,-12,-17,0,-21,-12,-1,-4,-2,-4,9,2,-10,-30,-17,0;
MA   /M: SY='N'; M=1,0,-22,-3,0,-22,-2,-2,-23,4,-22,-12,5,-14,2,3,5,-3,-17,-26,-14,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-13,-5,0,-17,-14,-10,-15,-6,-15,-10,-1,-12,-2,-8,12,16,-8,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-4,-20,-8,-5,-11,-20,-11,-8,-3,-7,-6,-2,-15,-5,-2,3,13,-6,-23,-4,-6;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-5,-20,-20,-16,5,-23,-7,-18,-11,-7,-12,-21,-19,-21,1,-4,4,-26,-19,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-28,1,16,-24,-17,4,-24,13,-20,-10,0,-12,17,16,-2,-8,-22,-24,-10,15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-27,20,27,-27,-16,1,-24,3,-19,-16,2,-9,9,-2,-2,-8,-20,-30,-14,17;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-11,-31,-24,5,-30,-24,22,-26,24,13,-25,-27,-22,-22,-18,-6,21,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,9,-31,-25,10,-31,-21,9,-28,17,6,-23,-30,-24,-23,-19,-9,8,-23,-1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-25,11,8,-18,-16,-3,-17,-2,-16,-12,8,-15,1,-3,-2,-4,-15,-25,-11,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-23,-5,2,-19,-18,6,-14,1,-11,-3,-2,-16,10,3,-2,-2,-13,-24,-5,5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-13,-29,-24,-2,-28,-26,23,-22,15,10,-23,-24,-22,-21,-11,-1,27,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='C'; M=7,-16,22,-23,-19,-8,-16,-22,-10,-19,-8,-9,-13,-25,-18,-19,-2,-3,1,-27,-15,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-28,3,14,-27,-15,2,-25,14,-19,-9,1,-13,19,17,-4,-10,-23,-23,-10,15;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-25,-3,3,-20,-13,8,-20,6,-16,-8,0,-15,4,8,-3,-7,-16,-24,-6,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-7,-28,-20,1,-26,-18,12,-24,21,12,-21,-26,-17,-19,-18,-8,8,-23,-4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-25,-1,-3,-26,20,-7,-29,-4,-25,-16,7,-16,-3,-2,4,-9,-23,-26,-21,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-25,3,-33,-24,33,-27,29,21,-23,-24,-19,-23,-21,-7,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-22,-5,-1,-19,-16,-11,-13,3,-13,-8,-2,-12,1,5,2,3,-8,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-30,13,20,-28,-11,-6,-25,0,-23,-18,1,11,4,-8,-2,-8,-25,-29,-19,11;
MA   /M: M=-7,-9,-18,-12,-9,-15,-21,-6,-4,-5,-10,-3,-5,-10,-6,-5,-4,-2,-1,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-2,1,-10,3,1,-15,-16,-6,-19,-8,-14,-13,-4,-16,-7,-11,-2,-5,-13,-22,-10,-3;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-18,-21,-20,-15,9,-12,0,-6,-17,4,3,-14,-25,-13,-12,-14,-10,-8,-8,16,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,9,0,-20,-30,-35,-19,-20,-10,-1,12,36,-28;
MA   /M: SY='G'; M=16,-8,-20,-11,-13,-24,33,-18,-27,-15,-24,-17,-1,-15,-13,-18,11,-4,-17,-24,-24,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-17,-31,-21,8,-31,-21,22,-30,45,19,-29,-29,-20,-21,-28,-10,11,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-16,-18,-20,-10,-1,-20,-10,-9,-5,-7,-2,-12,-20,-3,3,-8,-6,-7,-5,1,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-13,-21,-16,-11,15,-24,-8,0,-15,5,3,-12,-22,-15,-12,-11,-4,0,-13,9,-12;
MA   /M: M=-4,-11,-15,-11,0,-14,-21,-11,-6,-7,-4,-4,-11,-12,-4,-8,-5,-4,-5,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-8,8,-23,8,1,-19,-14,-1,-16,-3,-14,-10,6,-16,2,-3,0,-3,-14,-28,-9,1;
MA   /I: I=-4; MD=-7;
MA   /M: M=-5,-1,-23,-1,-2,-17,-11,-7,-15,-2,-14,-7,0,-5,-4,-5,0,-2,-12,-26,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-7;
MA   /M: SY='D'; M=-4,1,-19,2,-2,-17,-3,-3,-15,-5,-13,-9,1,-9,-4,-7,2,-2,-11,-24,-11,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-20,-2,6,-18,-5,-7,-16,2,-14,-9,0,-9,1,-1,1,-2,-12,-22,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-22,3,5,-14,-11,2,-15,-1,-12,-8,-2,-10,3,-1,-4,-7,-13,-17,-3,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-7;
MA   /M: M=-4,-5,-15,-6,-1,-9,-11,-8,-5,-1,-7,-2,-5,-8,-2,-1,-3,-2,-3,-12,-6,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: M=-3,-10,-18,-12,-6,-14,-12,-10,-11,-2,-12,-4,-6,-14,-3,-1,0,-2,-7,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-18,-1,-5,-15,-14,3,-16,-4,-12,-7,-1,-17,-4,-4,-7,-8,-14,-22,-1,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-35,-38,-37,-27,9,-21,-27,-13,-20,-11,-13,-35,-29,-19,-20,-33,-24,-19,104,21,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-24,-15,5,-29,-15,14,-20,27,11,-24,-23,-15,-15,-21,-8,7,-17,5,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-26,15,12,-27,-13,7,-26,1,-24,-16,6,-2,6,-2,3,-5,-23,-30,-13,7;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-29,-7,0,-20,-20,-9,-12,-6,-9,-8,-10,21,-4,-9,-10,-9,-17,-27,-16,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-15,0,-2,-13,-13,-4,-14,-9,-11,-7,4,-15,-3,-9,1,-1,-13,-28,-11,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-23,-2,9,-22,-20,5,-21,13,-16,-6,-1,-14,8,12,-6,-7,-18,-24,-7,7;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-23,-6,1,-20,-15,-8,-16,5,-18,-10,0,-4,2,8,2,3,-13,-26,-14,0; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-34,-25,15,-30,-23,24,-26,23,15,-24,-26,-23,-21,-22,-9,17,-12,5,-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-14,-9,-3,-17,-12,-7,-16,0,-15,-8,-1,-15,0,2,4,4,-11,-26,-12,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,2,9,-26,-15,-4,-21,14,-19,-10,-2,-10,8,9,-4,-8,-16,-25,-12,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-22,-6,4,-20,-17,1,-12,-5,-12,-5,-6,-11,11,-5,-3,-5,-12,-23,-7,6;
MA   /M: M=-3,-5,-18,-5,-1,-17,-13,-12,-11,-6,-8,-5,-6,-14,-4,-6,-3,-4,-7,-27,-14,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-25,7,7,-24,-9,-4,-19,2,-18,-11,1,-11,3,-2,0,-6,-14,-28,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-19,-5,1,-17,-11,-6,-14,4,-13,-8,-2,-9,0,6,-2,-4,-11,-23,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: M=-7,-8,-20,-8,-4,-8,-6,-6,-9,-3,-9,-4,-7,-7,0,-5,-6,-7,-11,-7,0,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-15,-4,1,-10,-7,-7,-6,-4,-4,-4,-2,-7,-2,-6,-3,-4,-7,-13,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=0,-5,-21,-4,3,-19,-13,-9,-14,-5,-14,-10,-5,-2,-2,-6,-2,-5,-12,-26,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-3,-28,-1,6,-23,-15,-4,-17,-5,-21,-14,-1,19,-2,-9,0,-4,-18,-31,-18,0;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-27,-25,-18,7,-26,-12,0,-18,4,2,-23,-15,-14,-17,-22,-13,-7,20,16,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-23,-10,-4,-16,-19,-10,-9,8,-9,-3,-6,-18,-2,11,-6,-3,-4,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-14,-31,-23,17,-30,-19,17,-27,30,14,-26,-29,-22,-20,-23,-8,11,-15,7,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-11,-21,-11,-5,1,-23,14,-10,-9,-4,-1,-8,-22,-5,-4,-10,-9,-9,-16,12,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-34,-25,49,-30,-14,6,-25,17,6,-22,-29,-28,-16,-22,-10,2,3,26,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-26,-11,-1,-20,-17,-4,-24,22,-17,-6,-2,-19,7,48,-9,-9,-17,-21,-11,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-20,-24,-19,-3,-27,-19,15,-7,5,11,-16,-23,-15,-8,-13,-6,19,-23,-6,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-28,-3,7,-24,-18,-1,-27,29,-23,-9,1,-14,11,35,-6,-8,-20,-21,-9,7;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-18,-33,-26,50,-29,-12,3,-25,11,4,-20,-29,-29,-18,-19,-9,2,3,28,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-25,-28,-23,39,-28,0,1,-18,7,3,-20,-29,-21,-13,-20,-10,-3,14,44,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-21,-24,-23,-15,6,-24,-20,0,-16,-5,-4,-18,9,-18,-16,-8,-2,0,-18,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-22,7,12,-26,-15,-7,-24,2,-24,-17,4,8,5,-1,5,0,-22,-32,-19,7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-25,24,6,-25,-8,-3,-26,-4,-26,-21,16,-12,-1,-7,6,-1,-23,-24,-15,3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-30,-18,-13,-8,-19,-12,-6,-13,-8,-6,-18,1,-12,-14,-15,-12,-8,0,-3,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-7,0,-17,-2,-2,-10,-14,0,-13,-8,-13,-8,2,-16,-5,-7,0,-3,-11,-26,-6,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: M=-7,-7,-22,-8,-2,-13,-8,-11,-15,-4,-11,-7,-4,-11,-4,-1,-5,-6,-12,-24,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-22,-21,-12,-5,-23,-17,8,-15,16,8,-17,-19,-9,-10,-14,-4,5,-22,-6,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-24,-4,5,-15,-20,-4,-12,1,-6,-4,-4,-15,4,3,-4,-3,-11,-26,-9,3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,29,-25,41,18,-33,-14,2,-31,-1,-23,-21,11,-11,4,-7,0,-6,-25,-36,-16,11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-30,10,16,-28,-11,-7,-26,4,-25,-18,0,15,3,-3,-2,-8,-26,-28,-18,8;
MA   /M: SY='A'; M=1,-11,-17,-16,-11,-6,-17,-13,-4,-6,-8,-4,-7,-15,-11,-7,-3,-2,1,-21,-6,-11;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-9,-10,-4,-14,-14,-17,-11,-10,-11,-10,-4,-13,-6,-12,13,19,-2,-29,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-17,-20,-12,-1,-24,-8,-6,-3,3,2,-11,-23,-7,14,-13,-5,-4,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-26,-1,5,-5,-21,10,-14,-2,-11,-7,0,-18,1,-2,-8,-9,-16,-15,10,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-19,-26,-21,-13,16,-28,3,2,-15,11,6,-17,-26,-5,-11,-19,-10,-6,1,32,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-23,-29,-22,28,-30,-8,11,-24,23,10,-23,-28,-21,-17,-22,-9,4,-2,25,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-23,-20,-28,-24,42,-29,2,0,-19,3,0,-19,-29,-22,-15,-18,-10,-4,14,49,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-22,-14,-3,-9,-22,-3,-2,-10,7,3,-13,-20,0,-8,-11,-8,-3,-19,-2,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-30,3,20,-39,-19,13,-21,9,-20,-2,2,-10,54,9,0,-10,-30,-22,-10,37;
MA   /M: SY='V'; M=2,-22,-9,-26,-20,-5,-19,-23,10,-22,12,6,-20,-24,-19,-20,-11,-4,13,-22,-10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-24,-9,0,-19,-21,-6,-20,22,-17,-6,-4,-17,7,29,-8,-8,-13,-22,-9,2;
MA   /M: SY='H'; M=-11,8,-27,8,9,-22,-13,12,-25,6,-22,-13,11,-13,7,11,-1,-8,-24,-26,-7,6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,30,-24,38,13,-33,-3,-3,-32,-1,-26,-22,16,-12,0,-9,2,-8,-26,-35,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-20,-33,-26,22,-32,-21,23,-26,22,13,-25,-28,-25,-21,-20,-8,20,-12,10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-28,-19,5,-29,-15,16,-19,23,14,-23,-26,-17,-14,-21,-9,12,-16,1,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-19,1,7,-20,-15,7,-20,-1,-17,-9,6,-14,7,0,4,0,-18,-29,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-25,-2,-4,-28,33,-9,-34,-9,-26,-17,1,-16,-9,-9,1,-14,-26,-24,-23,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-28,-4,2,-17,-19,1,-19,10,-16,-9,1,-18,6,23,-7,-9,-17,-16,-5,2;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-18,-27,-21,9,-25,-10,11,-21,16,8,-21,-26,-18,-19,-17,-8,8,-11,13,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-27,-7,-2,-20,-13,-5,-20,-3,-22,-14,-8,18,-2,-5,-5,-7,-21,-18,-9,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-19,31,-24,-18,-13,-26,-21,-10,-15,-6,-5,-17,-20,-16,-14,-11,-7,-1,-33,-17,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,2,-25,5,5,-22,-13,-10,-18,-3,-20,-15,2,2,-1,-4,4,-1,-16,-28,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-23,-1,2,-16,-17,-10,-14,0,-11,-8,-4,-10,-1,-1,0,-2,-10,-26,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-24,9,18,-22,-13,-5,-20,0,-16,-13,3,-9,4,-3,2,-3,-17,-29,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-22,1,10,-18,-15,-4,-17,-1,-14,-11,-2,-9,2,-5,3,4,-14,-24,-8,6;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-15,-6,0,-18,-13,-9,-10,-8,-10,-7,-3,-14,-2,-12,4,0,-6,-26,-13,-2;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=7,-15,-14,-18,-5,-7,-21,-18,2,-13,2,-1,-15,-17,-10,-16,-6,-4,5,-23,-10,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-11,-6,-11,2,-14,-21,-11,-11,-4,-4,-3,-10,-18,0,-3,-6,-6,-8,-27,-12,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-16,-30,-22,8,-30,-21,20,-27,37,19,-27,-28,-20,-20,-24,-6,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-13,-17,-14,-21,16,-19,-20,-13,-17,-14,-8,-16,-13,-16,4,-7,-12,-15,-20,-14;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-5,-19,-13,-14,-3,-15,-8,-14,-6,-1,-10,-17,-10,-17,4,-1,-3,-25,-14,-12;
MA   /M: SY='L'; M=1,-23,-20,-26,-17,11,-23,-12,6,-20,21,8,-21,-25,-16,-16,-17,-8,2,-11,8,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-15,-13,-19,-10,-13,-14,-15,-1,-10,-2,0,-14,-19,-8,-12,-5,-5,5,-23,-12,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-3,-30,-23,4,-28,-22,15,-24,21,10,-25,-28,-22,-20,-18,-7,15,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-20,0,8,-25,-20,8,-21,3,-16,-5,-2,-16,28,8,-5,-10,-23,-22,-6,17;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-17,-22,-14,-6,-19,-14,6,-12,2,6,-14,-19,-11,-11,-4,-2,10,-22,-7,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-23,6,18,-20,-18,-3,-19,1,-13,-9,-3,-12,12,-3,-2,-6,-19,-22,-8,15;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-21,-22,-25,-17,18,-28,-1,3,-17,10,5,-16,-26,-13,-8,-18,-10,-2,-8,17,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-26,-8,-14,-24,36,-14,-27,-13,-22,-13,-2,-18,-13,-15,0,-12,-20,-22,-20,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-3,24,-24,31,11,-29,-10,-5,-27,-3,-24,-22,12,-4,-2,-11,4,-3,-22,-33,-18,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-15,-20,-18,-15,11,-23,2,-3,-9,-1,4,-12,-24,-10,-8,-14,-8,-6,-4,25,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-25,9,10,-24,-14,-5,-19,1,-18,-11,7,-5,6,-2,0,-1,-18,-30,-16,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-24,-2,6,-25,-11,-3,-21,1,-21,-12,-3,3,4,-2,-1,-5,-19,-27,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-26,7,8,-21,-7,-4,-22,0,-20,-14,7,-5,0,-5,0,-4,-22,-25,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-21,-6,6,-20,-20,-10,-10,3,-11,-5,-6,-11,4,-1,-4,-4,-8,-24,-11,4;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-24,-6,-4,-17,-12,17,-16,-10,-11,-6,-1,-8,0,-6,-2,-4,-16,-27,-5,-4;
MA   /M: M=-2,-5,-20,-5,-2,-18,-13,-12,-13,-4,-11,-8,-7,-7,-3,-8,-3,-4,-9,-25,-13,-3;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-25,-1,2,-23,-6,-9,-19,2,-18,-11,-5,1,0,-4,-3,-7,-16,-19,-15,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-12,1,4,-14,-10,-3,-11,1,-11,-8,-1,-2,-1,-4,-1,-4,-9,-17,-8,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: M=-4,-6,-12,-7,-5,-4,-9,-5,-2,-7,-2,-1,-5,-8,-5,-6,-2,-1,-1,-10,-4,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-17,-4,-3,-13,-4,-8,-9,5,-10,-4,2,-11,-2,2,-4,-5,-8,-16,-8,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-5,-18,-4,1,2,-17,2,-14,-2,-11,-8,-6,-16,-3,-2,-7,-5,-14,-6,16,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-17,-20,-21,-14,2,-24,-15,8,-15,7,4,-14,-22,-12,-14,-10,-3,7,-16,1,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-5,-14,-4,-4,-19,-2,-10,-19,-5,-16,-11,-2,-17,-6,-4,7,-1,-11,-30,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-24,-19,-11,4,-22,-11,4,-16,12,3,-16,-20,-12,-13,-14,-6,-1,-13,8,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-28,7,10,-19,-15,-5,-22,9,-18,-11,-1,-9,3,2,-6,-8,-19,-21,-6,6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,2,-23,3,5,-21,-15,-4,-20,5,-16,-11,2,-12,3,9,3,0,-15,-28,-13,3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-25,-8,-31,-24,37,-30,-11,2,-24,10,2,-21,-30,-25,-18,-19,-8,0,-1,25,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-18,-32,-24,16,-30,-20,20,-27,26,14,-24,-27,-23,-21,-21,-8,14,-17,3,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-35,-11,-1,-28,-20,-20,-18,-11,-26,-18,-19,77,-10,-20,-9,-8,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-23,3,7,-23,-11,-7,-22,9,-21,-12,6,-8,4,7,4,0,-18,-28,-16,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-19,-1,5,-23,-15,-4,-20,1,-19,-10,-1,-14,12,2,1,-3,-18,-20,-11,8;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-17,-23,-18,3,-27,-16,10,-18,13,8,-20,-21,-16,-14,-13,0,10,-17,2,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-12,-11,-15,-9,-8,-18,-6,-2,-8,2,2,-9,-18,-4,-3,-9,-6,-2,-16,-4,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-17,4,8,-20,-9,-1,-19,8,-17,-8,4,-10,6,7,1,-4,-15,-21,-11,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-16,-1,2,-14,-7,-2,-14,0,-15,-9,3,-4,2,-2,5,2,-12,-20,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-11,-18,-13,-8,-8,-11,-5,0,-7,-2,1,-8,-14,-5,-3,-7,-7,0,-11,-3,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-18,2,2,-16,-7,-1,-17,6,-16,-9,1,-5,3,4,0,-5,-13,-18,-9,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-7;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-17,-3,1,-16,-9,-7,-12,4,-11,-5,-3,-1,4,2,-1,-2,-10,-17,-10,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-22,3,12,-22,-14,-7,-22,9,-21,-13,1,-6,4,4,1,-3,-18,-27,-14,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-24,-2,4,-16,-14,1,-19,5,-18,-9,1,-14,4,7,-4,-6,-17,-19,-4,3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-23,-30,-22,7,-23,-21,9,-22,11,6,-22,-24,-17,-18,-19,-10,3,7,4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-27,-1,17,-21,-16,-5,-23,13,-17,-12,-2,-9,8,16,-4,-7,-20,-23,-12,11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,8,-26,9,11,-24,-13,-4,-26,15,-23,-15,7,-10,6,12,-1,-7,-21,-26,-13,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-23,-5,-1,-15,-16,-7,-13,3,-8,-3,-4,-17,-1,7,-5,-4,-9,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-36,-28,12,-34,-26,33,-28,24,17,-24,-25,-24,-24,-20,-8,25,-18,2,-27;
MA   /M: M=0,-14,-22,-17,-7,-9,-19,-14,-3,-6,-2,0,-12,-11,-4,-4,-6,-2,-2,-21,-9,-7;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-23,7,14,-27,-13,0,-22,5,-20,-13,6,-11,13,4,3,-4,-19,-28,-15,12;
MA   /M: M=-3,-13,-14,-17,-10,-1,-18,-13,-7,-9,-2,-3,-11,-20,-12,-8,-7,-3,-4,-15,-4,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-17,-25,-19,-15,6,-25,32,-10,-17,-4,0,-12,-25,-9,-11,-18,-15,-13,6,27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-28,-1,11,-28,-16,-5,-26,28,-23,-10,1,-12,14,24,-5,-9,-21,-22,-12,12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-25,3,12,-25,-17,-3,-22,14,-18,-9,3,-11,14,10,-1,-2,-19,-26,-12,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-15,-20,-19,-15,11,-24,8,-1,-17,3,5,-10,-24,-11,-12,-12,-8,-3,-14,13,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-8,-22,-10,-2,-17,-10,-9,-13,1,-14,-6,-4,-15,3,1,1,-4,-10,-21,-9,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-27,-2,-7,-24,26,-9,-29,-8,-25,-17,8,-14,-7,-9,2,-11,-25,-22,-17,-8;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-14,-20,-10,-8,-25,-12,6,-13,12,13,-15,-21,-2,-12,-14,-6,1,-22,-4,-6;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-16,-4,-5,-18,-3,-12,-17,-7,-20,-14,6,-11,-5,-5,19,15,-11,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-28,-2,7,-25,-17,-11,-18,0,-20,-12,-7,18,3,-2,-1,-4,-17,-28,-19,3;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-23,-1,10,-20,-12,-6,-15,-2,-14,-9,-3,-10,2,-5,1,-5,-13,-25,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-27,16,27,-28,-15,-1,-24,7,-20,-13,5,-8,15,1,1,-6,-23,-30,-16,21;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-7,-20,-13,-11,-12,-16,-5,-12,-4,-5,-12,-17,-12,-15,2,0,2,-22,-11,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-27,-2,14,-20,-22,-5,-14,14,-12,-1,-6,-12,6,7,-9,-10,-12,-23,-9,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-23,-18,-9,-1,-25,-7,3,-11,9,5,-15,-22,-8,-8,-15,-8,1,-15,3,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-27,2,11,-25,-18,3,-22,17,-20,-7,4,-13,14,15,-5,-9,-20,-24,-9,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-25,-24,-21,36,-29,3,2,-17,4,2,-19,-28,-18,-14,-17,-8,-3,14,50,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-33,-24,12,-31,-22,25,-27,34,20,-27,-28,-22,-21,-24,-9,18,-19,1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-22,1,9,-24,-15,-1,-18,6,-16,-7,2,-13,9,3,-2,-6,-17,-26,-12,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-12,-20,-15,-6,-8,-26,-13,4,-11,3,1,-10,-16,-7,-12,-8,0,2,-24,-5,-8;
MA   /M: SY='L'; M=11,-21,1,-27,-19,-2,-20,-22,4,-21,12,2,-20,-24,-20,-21,-9,-4,9,-24,-10,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-22,-2,12,-23,-15,-3,-22,10,-18,-11,-1,-13,10,13,1,-4,-17,-25,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-26,-1,4,-22,-12,3,-24,7,-20,-11,1,-12,7,13,0,-4,-19,-22,-9,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-20,-23,-18,5,-26,-13,9,-23,28,11,-22,-27,-17,-17,-23,-10,3,-11,1,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-28,-1,10,-21,-17,-8,-20,0,-20,-15,-8,11,0,-6,-3,-5,-19,-15,-11,3;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-8,-13,-13,-11,-7,-11,-10,-7,-11,0,5,-5,-19,-9,-9,-4,2,-6,-25,-9,-10; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-23,-22,-26,-22,31,-29,1,2,-16,5,1,-20,-28,-18,-13,-19,-8,-3,14,47,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-27,-4,-14,-22,41,-12,-32,-16,-25,-16,5,-19,-15,-16,0,-14,-25,-22,-21,-15;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-7,-19,-14,-9,-15,-18,1,-14,-6,-1,-10,-19,-12,-16,1,1,7,-27,-12,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,10,21,-24,-16,12,-26,5,-19,-14,4,-10,8,6,0,-6,-22,-29,-11,13;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-18,-24,-17,8,-24,-15,3,-17,7,4,-18,-20,-13,-12,-11,-3,2,-9,4,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-23,-21,-28,-23,47,-28,8,-5,-22,2,0,-15,-28,-25,-15,-18,-11,-5,4,35,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-22,-2,6,-19,-16,-4,-20,3,-18,-11,-5,-2,-1,2,-2,-4,-16,-25,-11,1;
MA   /M: SY='V'; M=13,-21,-1,-26,-22,-9,-17,-25,8,-18,1,1,-20,-21,-21,-21,-5,-2,19,-27,-15,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-18,-7,1,-15,-20,-1,-17,8,-16,-8,-3,-15,1,7,-1,2,-10,-23,-4,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,0,-23,3,-1,-16,-15,-1,-15,-6,-9,-7,-3,-14,-4,-3,-8,-9,-13,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-23,-2,2,-21,-12,-6,-16,1,-15,-9,0,-10,1,-1,2,-1,-13,-28,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-24,2,9,-22,-14,-1,-18,6,-18,-9,4,-13,7,2,2,-4,-16,-27,-11,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-27,-5,-5,-21,13,-12,-23,-7,-17,-11,-4,-12,-8,-9,-3,-11,-18,-20,-16,-7;
MA   /I: I=-4; MD=-9;
MA   /M: M=-4,-6,-21,-4,-1,-14,-5,-11,-15,-5,-14,-11,-6,0,-3,-6,-3,-5,-14,-3,-9,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-16,-1,2,-12,-9,-3,-10,2,-12,-7,6,-5,4,2,2,-1,-11,-18,-9,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-9;
MA   /M: M=-2,-5,-14,-5,0,-10,-7,-6,-7,0,-6,-4,-3,-4,0,-1,-2,-3,-7,-13,-6,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-18,-8,-7,-14,-16,-15,-3,-8,-7,-5,-3,-17,-7,-11,0,2,0,-28,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-26,13,14,-26,-13,-4,-24,1,-22,-16,4,3,4,-6,4,-2,-22,-30,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-21,-26,-19,2,-25,-14,14,-20,17,10,-22,-25,-16,-16,-17,-7,13,-17,1,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-24,-18,-12,-3,-23,-11,4,-15,2,2,-14,-21,-11,-15,-12,-5,3,-3,1,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,6,-32,-22,26,-26,33,18,-26,-27,-20,-18,-23,-8,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=8,-12,-23,-15,-17,-22,33,-16,-21,-17,-16,-9,-6,-19,-15,-18,-1,-13,-13,-21,-22,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-19,-29,-24,-3,-30,-26,26,-22,11,9,-21,-17,-21,-22,-9,0,27,-26,-8,-24;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-15,1,-6,-17,8,-5,-21,-9,-22,-14,15,-16,-7,-10,10,3,-18,-29,-16,-7; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=2,-4,-19,-6,0,-16,-13,-4,-16,-2,-16,-10,-2,-4,-3,-4,-1,-4,-13,-17,-10,-3; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-24,-6,0,-18,-14,-9,-12,4,-12,-4,-2,-15,-1,2,-3,-1,-8,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-26,-11,-19,-26,60,-19,-37,-19,-28,-19,0,-20,-19,-19,0,-18,-28,-20,-27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-34,-27,1,-32,-26,36,-26,21,19,-23,-24,-21,-24,-18,-7,28,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-8,-20,-10,-5,-9,-12,-3,-10,-9,-7,-4,-2,-18,0,-6,3,1,-10,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-26,-31,-24,5,-30,-18,19,-19,9,9,-23,-25,-16,-16,-19,-9,14,2,8,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-17,-25,-19,14,-27,-9,3,-13,5,3,-18,-26,-14,-6,-15,-8,3,-5,17,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,7,-24,10,8,-24,-17,3,-21,2,-17,-11,3,-12,5,1,-3,-4,-17,-29,-11,5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,4,-25,3,2,-24,-5,1,-21,-2,-22,-13,7,-5,0,-3,2,-5,-19,-30,-15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-26,-2,3,-24,-5,-9,-19,0,-18,-11,-1,-8,2,-2,-1,-5,-15,-26,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-23,5,9,-20,-10,-6,-20,0,-19,-13,5,-10,3,-3,6,3,-17,-29,-14,5;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-21,-4,4,-24,-8,-9,-24,12,-21,-9,-1,-13,5,12,1,-1,-17,-25,-15,4;
MA   /M: M=-4,-4,-22,-6,0,-17,-13,-10,-8,-4,-10,-5,-3,-14,-3,-6,-1,-1,-4,-28,-13,-2;
MA   /M: M=-6,-7,-23,-9,-6,-14,-15,-6,-7,-7,-6,-3,-3,-12,-3,-5,-5,-4,-8,-23,-9,-5;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: M=-2,-10,-17,-11,-4,-10,-16,-9,-2,-8,0,-1,-8,-6,-3,-7,-4,-1,-2,-20,-8,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-5;
MA   /M: M=-3,-5,-11,-7,-1,-10,-13,-2,-5,-3,-5,-2,-3,-12,-1,-1,-1,-1,-3,-19,-6,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-20,-9,-2,-1,-14,-10,-11,-10,-6,-8,-3,-17,-8,-7,1,4,-9,-22,-4,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-2,-29,-23,21,-26,-12,0,-24,7,0,-19,-27,-24,-20,-15,-7,1,-10,10,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,2,-22,6,5,-21,-13,-10,-22,-2,-21,-16,0,2,0,-4,3,-1,-18,-29,-16,1;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-35,-25,34,-25,-20,-7,-23,0,-7,-29,-29,-25,-19,-29,-19,-14,68,30,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-25,-5,1,-23,-15,-11,-18,0,-22,-14,-3,15,1,-2,5,2,-17,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-27,11,20,-25,-17,4,-23,8,-17,-12,6,-11,12,6,-2,-7,-22,-29,-13,15;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-24,-35,-27,1,-34,-27,35,-25,16,15,-22,-22,-19,-25,-16,-6,27,-18,-2,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-20,-11,-7,-16,-14,-9,-8,-3,-8,-2,-6,-17,-2,-1,0,4,-2,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-9,6,-21,2,3,-24,-14,4,-24,14,-23,-9,9,-14,6,10,-1,-2,-19,-28,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-33,-25,9,-31,-25,24,-25,19,12,-24,-25,-21,-22,-19,-7,19,-9,2,-24;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-17,-3,-5,-19,-4,-7,-14,-10,-20,-12,3,-12,-3,-11,15,7,-7,-31,-15,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-18,-29,-21,24,-24,-15,5,-21,5,2,-17,-21,-22,-18,-12,-7,3,-9,11,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-18,3,10,-23,-14,-8,-24,13,-24,-14,5,-10,4,7,3,-3,-18,-29,-15,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-21,4,11,-26,-10,-5,-28,13,-23,-15,5,-12,6,16,-1,-7,-22,-28,-17,7;
MA   /M: SY='K'; M=-4,6,-24,7,10,-26,-15,-7,-24,16,-21,-12,2,-10,5,7,1,0,-17,-27,-13,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-21,5,8,-23,-15,-5,-20,8,-20,-12,6,-10,6,3,2,-1,-17,-27,-12,6;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-17,-22,-21,-13,18,-25,-17,0,-12,-2,-1,-12,-16,-16,-11,-10,-5,0,-14,3,-14;
MA   /M: M=-6,-9,-17,-11,-5,-7,-17,-8,-7,-7,-7,-4,-8,-19,-8,-8,-2,0,-2,-23,-3,-7;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-22,-27,-20,-3,-26,-21,21,-17,16,13,-18,-22,-15,-17,-14,-6,15,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-24,-3,4,-20,-18,-6,-15,7,-14,-6,-2,-14,6,8,0,1,-11,-25,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-20,-23,-18,0,-23,-19,10,-16,9,7,-15,-18,-15,-12,-9,1,9,-22,-4,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-22,-15,-13,-10,-11,-11,-1,-12,-5,0,-8,-20,-9,-10,-4,-4,2,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-26,15,7,-28,-3,-8,-25,-3,-21,-16,4,-5,1,-8,2,-5,-21,-30,-19,3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-24,-1,5,-16,-14,-5,-11,-6,-5,-7,-2,-14,-4,-9,-6,-7,-11,-26,-11,0;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-19,3,1,-18,-7,2,-19,1,-18,-11,4,-5,1,0,4,1,-15,-23,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: M=-3,-2,-12,-3,-2,-10,-6,-3,-9,-2,-7,-5,0,-11,-3,0,-2,-4,-7,-16,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-13,-4,2,-13,-1,-6,-9,-4,-8,-5,-2,-6,1,-6,1,-3,-7,-15,-10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-20,0,6,-17,-15,-4,-11,4,-13,-6,-2,-1,4,1,-2,-1,-10,-20,-9,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-13,-7,-5,-17,-17,-13,-11,-4,-13,-8,-5,-10,-7,-6,0,3,-4,-30,-14,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-23,-19,-13,1,-20,-4,1,-13,8,9,-13,-22,-9,-9,-14,-7,-1,-15,3,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-9,-22,-8,2,-15,-8,-14,-9,-10,-8,-7,-7,-12,-5,-12,1,0,-7,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-21,-31,-21,33,-29,-18,11,-25,17,7,-21,-26,-25,-19,-18,-7,7,-7,14,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-8,-25,-9,2,-9,-21,-2,-11,2,-6,-3,-7,-17,4,1,-8,-4,-11,-17,3,2;
MA   /I: I=-11; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-18,-9,-25,-17,10,-22,-15,2,-18,9,8,-15,-22,-14,-14,-9,-1,1,-17,0,-15; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-6,-22,-6,-4,-18,-14,-11,-9,-9,-11,-7,-4,0,-4,-9,2,1,-8,-28,-15,-6; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-15,1,3,-16,-8,-6,-20,-5,-22,-15,7,-13,1,-6,16,11,-15,-30,-12,2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-21,-8,-3,-15,-12,-3,-14,-5,-10,-7,-3,-13,-4,-2,2,4,-10,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-23,1,6,-23,-12,-4,-20,6,-20,-10,3,-8,6,6,4,0,-16,-28,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-23,4,11,-21,-14,-7,-16,-1,-12,-11,1,-11,2,-6,-1,-4,-14,-26,-14,6;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,5,-16,-12,-18,-8,-19,-11,-14,-11,-9,-8,-15,-13,-19,5,1,-2,-28,-19,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-26,-2,10,-18,-20,-7,-17,13,-13,-7,-4,-11,6,9,-6,-7,-14,-23,-9,8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-19,0,0,-15,-13,4,-17,-3,-15,-10,5,-17,1,-1,3,-2,-16,-25,-2,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-18,-34,-25,23,-31,-20,20,-27,26,18,-24,-27,-23,-21,-22,-9,13,-14,6,-24;
MA   /M: SY='W'; M=2,-21,-24,-23,-19,-4,-19,-22,1,-17,-1,-3,-21,-23,-16,-17,-12,-8,4,15,0,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-1,4,-20,4,4,-25,-11,-4,-22,7,-21,-12,3,-13,4,4,4,-2,-15,-28,-14,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-9,-27,-19,6,-27,-15,10,-25,30,12,-24,-28,-18,-19,-22,-9,5,-19,2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,9,-30,-23,-3,-28,-24,12,-24,9,6,-20,-25,-19,-23,-12,-4,12,-27,-9,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,0,-22,2,-6,-16,-16,-15,-6,-6,-8,-6,-4,-17,-10,-10,-4,-2,0,-28,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-25,0,2,-23,17,-9,-26,-10,-22,-16,1,-13,-6,-13,4,-7,-20,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-11,-23,-14,-12,5,-22,15,-7,-8,-7,1,-8,-23,0,-6,-10,-6,-12,-1,33,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-15,-15,-12,-3,-24,32,-8,-16,-5,2,-5,-23,-4,-11,-11,-11,-11,-20,14,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-24,-2,4,-22,-12,-6,-23,11,-18,-10,1,-14,7,20,1,-1,-17,-25,-13,4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-23,-30,-21,25,-27,-17,9,-23,20,8,-23,-27,-21,-16,-21,-9,4,-3,11,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-18,-21,-23,-17,15,-25,-9,2,-14,6,7,-14,-22,-12,-8,-9,1,0,-10,13,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-11,-20,-14,-9,-11,-15,-9,-6,-2,-3,2,-6,-19,-4,6,-4,-2,-3,-24,-9,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-10,6,-20,9,5,-23,-16,-5,-20,5,-13,-9,1,-16,2,3,-6,-7,-15,-28,-13,3;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-4,-19,-7,-6,-14,-15,-6,-15,2,-13,-6,-2,-14,-4,4,-3,-4,-11,-19,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,0,-22,-2,0,-19,-13,3,-19,3,-17,-8,3,-15,3,8,3,0,-14,-26,-9,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00566;
//
ID   T2SP_E_MP; MATRIX.
AC   MP00662;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial type II secretion system protein E signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0604711; R2=0.0149032; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=648; N_SCORE=14.708; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=97; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-3,12,-22,6,-3,-19,-11,7,-15,-2,-16,-10,18,-18,-3,-1,-1,-6,-15,-31,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,2,-28,7,4,-26,0,-2,-27,-8,-24,-17,0,10,-5,-12,1,-1,-24,-29,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-25,-8,3,-21,-19,-7,-17,16,-10,-3,-5,-16,11,17,-6,-6,-14,-23,-9,6;
MA   /M: SY='A'; M=1,0,-23,-1,-7,-22,-4,-4,-12,-11,-13,-8,-2,-15,-5,-14,0,-3,-8,-27,-12,-7;
MA   /M: SY='G'; M=4,-2,-15,-5,-8,-25,11,-16,-25,-5,-21,-15,-1,-15,-7,-10,5,3,-16,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-17,-24,-21,2,-25,-17,19,-20,22,19,-18,-27,-18,-16,-17,-5,19,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-6,12,-20,15,1,-24,-9,-13,-23,-8,-22,-19,5,1,-6,-12,12,18,-15,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-20,-33,-24,48,-24,-13,1,-22,7,6,-18,-26,-27,-18,-15,-8,0,4,24,-23;
MA   /M: SY='A'; M=25,-1,-16,-5,9,-23,-5,-11,-17,-4,-17,-14,0,-8,2,-12,12,0,-11,-26,-20,5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,5,-25,4,3,-23,-10,12,-24,4,-21,-12,9,-17,4,13,-1,-8,-19,-28,-11,1;
MA   /M: SY='A'; M=15,-18,-18,-21,-17,-11,6,-20,-5,-20,6,-1,-15,-20,-17,-20,-7,-8,-2,-20,-15,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-29,-5,6,-26,-19,-2,-28,31,-23,-9,1,-15,17,45,-6,-8,-21,-21,-11,9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-10,-5,-19,-1,-15,-15,-10,-19,-15,0,-10,-5,-15,24,12,-5,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-16,-23,-16,0,-16,-20,3,-18,-1,-3,-10,-16,-15,-19,4,6,5,-20,-7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,7,-28,-16,21,-25,40,29,-28,-28,-16,-18,-26,-9,13,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-6,-27,-6,10,-21,-21,13,-13,2,-5,8,-6,-15,23,7,-9,-11,-18,-23,-5,15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,33,-30,47,14,-34,-13,0,-37,8,-27,-24,14,-13,3,13,-3,-10,-27,-34,-17,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-24,-21,-27,-21,-6,-29,-20,17,-8,4,9,-19,-24,-15,4,-13,-6,24,-24,-7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-21,-31,-22,4,-27,-13,24,-20,30,38,-24,-24,-11,-17,-23,-9,15,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,26,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-36,-27,1,-33,-22,38,-24,20,29,-22,-22,-16,-23,-19,-9,26,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-5,-3,-26,1,-1,-22,1,-12,-19,-6,-9,-9,-5,-11,-4,-9,-6,-10,-17,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=8,0,-24,3,29,-26,-14,-9,-22,1,-18,-17,-5,7,6,-9,3,-3,-20,-27,-20,17;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-12,-9,-13,-13,-19,-11,-10,-11,-11,-2,-10,-9,-13,18,34,-1,-28,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-23,-21,-29,-20,-6,-17,-24,6,-18,3,-1,-21,-19,-17,-22,-10,-7,7,5,-5,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-20,2,14,-17,-10,-2,-15,6,-11,-5,-2,-9,9,10,-4,-7,-12,-18,-11,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=7,-20,-21,-28,-20,-3,-25,-21,19,-21,12,7,-16,-18,-15,-22,-8,0,13,-18,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=25,-16,-15,-22,-14,-5,-12,-14,-1,-15,6,-1,-16,-18,-12,-18,-4,-4,1,-12,0,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-19,-29,-22,3,-29,-23,23,-26,27,14,-24,-26,-20,-21,-16,-5,19,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-22,-3,4,-24,-15,-7,-23,15,-24,-11,3,-12,11,17,9,7,-16,-27,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=38,-6,-13,-12,1,-22,-3,-16,-14,-7,-13,-12,-7,-8,-5,-16,10,0,-5,-23,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-15,-24,-17,-11,-11,-23,-1,-14,-8,-7,-18,-18,-16,-19,1,-2,9,-2,-11,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-23,-5,10,-16,-21,-6,-4,-5,0,1,-4,-16,8,-6,-8,-7,-7,-27,-11,9;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00567;
//
ID   VINCULIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00663;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Vinculin family talin-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8466063; R2=0.0167986; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=17.293; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=6,-15,-17,-17,-11,-15,-20,-21,0,7,-9,-1,-15,-19,-11,-2,-6,-4,15,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='L'; M=10,-19,-14,-22,-16,-5,-17,-20,7,-19,12,3,-17,-21,-16,-18,-2,0,12,-26,-11,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-30,7,30,-28,-20,-4,-30,29,-24,-14,0,-7,14,24,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='N'; M=-6,9,-16,-2,-13,-11,-13,-7,2,-9,-13,-7,21,-24,-13,-9,1,0,5,-36,-16,-13;
MA   /M: SY='A'; M=26,-19,-14,-26,-19,-11,-15,-24,12,-16,1,1,-17,-17,-17,-22,-1,-2,18,-22,-14,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-22,5,21,-24,0,-9,-26,-3,-22,-18,2,-7,3,-7,11,6,-20,-30,-20,12;
MA   /M: SY='N'; M=0,15,-14,5,-2,-18,-5,-5,-18,-6,-25,-18,27,-14,-2,-6,24,19,-15,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-5,-26,-6,18,-19,-20,2,-6,1,-3,19,-9,-11,19,-3,-9,-10,-13,-24,-9,18;
MA   /M: SY='Q'; M=1,10,-26,14,23,-34,-14,0,-24,4,-20,-12,2,-8,25,-2,2,-8,-24,-26,-16,24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=6,-14,-20,-18,-12,-18,-2,-12,-3,-10,-5,8,-13,-18,0,-12,-4,-7,2,-22,-14,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-10,12,-23,8,0,-22,-18,-6,-9,-6,-14,-8,12,-14,7,-7,3,6,-12,-30,-12,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-5,-26,-11,-7,9,-21,4,-13,-1,-11,-6,2,-23,2,9,-9,-8,-17,-6,17,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-17,-26,-22,19,-26,-11,8,-16,5,11,-17,-24,-18,-14,-9,6,10,-9,16,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='B'; M=-1,20,-24,19,18,-30,-10,1,-24,2,-23,-17,16,-10,13,-4,4,-6,-25,-31,-18,16;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26,35,-32,-22,18,-30,28,12,-24,-28,-28,-22,-24,-10,10,-8,12,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-26,-6,-11,-28,40,-16,-34,-5,-30,-18,2,-16,-11,-9,6,-10,-24,-24,-24,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-14,-36,-8,2,-28,-20,-14,-24,9,-28,-16,-12,50,-2,7,-10,-10,-26,-26,-22,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-24,3,12,-22,2,-9,-18,-5,-18,-14,5,-15,-3,-9,0,-8,-13,-30,-20,4;
MA   /M: SY='M'; M=3,-22,-16,-28,-20,-2,-20,-13,16,-16,19,30,-22,-22,-11,-16,-15,-6,15,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-21,2,-8,-19,-3,6,-17,-12,-15,-9,0,-18,-10,-12,1,2,-7,-30,-9,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,12,-30,18,21,-32,-18,-6,-32,32,-28,-16,4,-8,10,16,-6,-10,-24,-26,-14,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-30,-22,6,-28,-17,22,-23,35,27,-28,-28,-17,-18,-24,-8,18,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=6,7,-17,-7,-10,-14,-12,-11,-3,-10,-12,-8,17,-16,-8,-12,6,8,-6,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-28,-7,-5,-11,-21,-3,-8,13,-15,-5,5,-18,-1,5,-10,-8,-11,-14,8,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-4,-22,-4,-6,-16,-20,-4,2,-6,0,20,-10,-18,5,-8,-10,-8,2,-26,-8,-1;
MA   /M: SY='A'; M=26,-19,-15,-27,-19,-11,-15,-24,12,-17,1,1,-16,-16,-16,-22,-1,-2,17,-22,-13,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,14,-17,9,-1,-25,-2,-9,-19,-6,-19,-17,11,-12,-6,-14,8,-2,-13,-29,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-28,-4,13,-20,-22,-8,-20,20,-9,-6,-6,-14,6,21,-12,-10,-16,-22,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-21,-4,1,-21,-20,-14,-21,24,-21,-10,0,-10,1,13,3,16,-11,-24,-10,1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,28,-30,39,11,-31,-14,44,-36,-4,-26,-17,16,-14,4,-6,-4,-14,-30,-36,-3,6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-30,-9,3,-29,-22,-9,-11,-3,-19,-6,-13,25,17,-7,-6,-8,-16,-26,-18,8;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-6,-26,-3,8,-24,-6,12,-18,-6,-16,-6,-4,-16,8,-6,-4,-12,-13,-26,-10,7;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-10,2,-12,-10,-14,-24,52,-21,-18,-7,0,-3,-26,-4,-10,-14,-16,-19,-32,6,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-25,37,17,-29,-17,-7,-22,-3,-19,-19,4,-13,-3,-10,-2,-8,-12,-36,-18,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,1,-28,2,8,-21,-22,-4,-2,-5,-4,8,-5,-12,11,-9,-9,-10,-8,-26,-9,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,39,35,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=26,-19,-14,-26,-19,-11,-15,-24,12,-16,1,1,-17,-17,-17,-22,-1,-2,18,-22,-14,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,2,-16,-9,-6,-20,-4,-9,-16,1,-17,-12,8,-14,-4,3,6,-2,-11,-25,-18,-6;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,17,-17,-12,-20,-6,-20,-16,-14,-17,-14,-7,-16,-12,-20,13,3,-4,-31,-22,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-26,-19,-9,-11,-20,0,-8,13,-3,21,-9,-20,6,35,-14,-10,-7,-20,-6,-4;
MA   /M: SY='G'; M=3,14,-24,12,-5,-28,24,-9,-30,-9,-26,-20,16,-16,-9,-13,4,-10,-24,-29,-24,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00568;
//
ID   VINCULIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00664;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Vinculin repeated domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5907569; R2=0.0133278; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=886; N_SCORE=16.389; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=144; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,21,-25,11,9,-29,-9,10,-20,5,-25,-11,32,-15,28,5,5,-5,-30,-31,-15,19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-21,-25,-21,-11,-4,-25,-11,-4,-2,17,6,-16,-25,-6,22,-21,-10,-4,-20,-5,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-9,0,-19,-5,-5,-15,-20,37,-19,-10,-15,-5,5,-15,-1,-5,6,17,-14,-30,4,-5;
MA   /M: SY='A'; M=18,-17,-16,-20,-20,-16,11,-23,-6,-16,-9,-6,-14,-20,-20,-20,0,-6,8,-23,-20,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,1,-23,-6,-13,-13,11,-9,-12,-16,-3,-6,11,-23,-13,-13,-7,-10,-16,-27,-16,-13;
MA   /M: SY='A'; M=15,-3,-17,-6,0,-23,-7,-13,-20,10,-24,-14,0,-10,0,1,14,4,-10,-27,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,3,3,-23,-14,0,-27,28,-26,-13,18,-17,7,35,-4,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-33,-17,-7,-16,-23,-20,-6,-17,-3,-6,-23,49,-13,-20,-17,-10,-16,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-10,-13,-7,-20,0,-17,-13,-10,-17,-13,-3,-10,-7,-17,20,7,-3,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-13,14,-27,7,4,-24,-13,30,-27,15,-27,-10,24,-16,7,11,-3,-10,-26,-30,-4,4;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-17,-10,-17,-6,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,15,0,-23,-17,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-7,-13,-7,-13,0,-13,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-13,7,0,0,-13,-13,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-24,-17,4,-24,-17,24,-21,25,14,-17,-17,-14,-17,-17,-7,14,-14,0,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=15,0,-17,1,18,-24,-7,-10,-20,-3,-20,-17,0,-6,4,-10,17,3,-14,-30,-20,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-27,0,-13,-27,46,-10,-33,-13,-30,-20,20,-20,-13,-13,3,-13,-30,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-24,-34,-24,3,-30,-17,31,-23,29,34,-23,-23,-13,-20,-23,-10,17,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-24,-2,1,-18,-16,1,-8,-6,-2,-1,11,-20,15,-3,-6,-7,-18,-27,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-3,-30,0,20,-23,-20,0,-30,23,-20,-13,0,-13,13,46,-7,-10,-23,-23,-13,14;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-23,46,13,-33,-7,-3,-33,-3,-30,-27,17,-10,0,-10,14,0,-23,-40,-20,7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-10,-23,-13,-16,-2,4,-6,-16,-13,-13,-10,-7,-20,-13,-13,0,8,-13,-6,15,-16;
MA   /M: SY='V'; M=14,-23,-13,-27,-20,-4,-20,-24,13,-20,15,6,-23,-23,-20,-20,-9,-3,21,-24,-10,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,23,-27,36,6,-23,-17,-7,-20,-10,-3,-13,3,-17,-7,-13,-10,-10,-16,-33,-13,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,30,-30,43,13,-33,-13,0,-37,10,-27,-23,13,-13,3,17,-3,-10,-27,-33,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-30,-10,-13,-26,38,-13,-36,-2,-26,-16,0,-20,-9,12,-4,-16,-26,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-2,21,-21,-23,-3,-11,-2,1,-1,-9,-13,22,-3,-9,-10,-18,-23,-10,22;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-4,-23,-7,6,-30,-13,-7,-20,17,-20,-7,-4,-10,18,6,0,-6,-16,-20,-14,12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-13,-27,-13,-6,-21,9,-10,-15,-13,-2,-1,-9,-20,7,-10,-9,-14,-18,-20,-14,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00568;
//
ID   DHDPS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00665;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydrodipicolinate synthetase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9501929; R2=0.0170876; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=222; N_SCORE=9.734; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-16,-15,-2,-12,-12,-16,-5,-13,5,-3,-12,-15,-8,-16,0,-2,-2,-24,-14,-5;
MA   /M: SY='A'; M=17,-7,-14,-11,-5,-20,2,-16,-16,-7,-17,-12,-4,-13,-6,-11,11,2,-8,-27,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-22,-29,-21,11,-23,-17,12,-24,24,11,-23,-25,-19,-19,-20,-8,5,-7,7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-26,0,15,-25,-14,-4,-24,12,-19,-12,-2,-10,9,17,-3,-9,-19,-24,-14,10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-25,2,11,-24,-13,-4,-26,18,-23,-13,3,-12,8,21,0,-5,-20,-25,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-21,-25,-20,5,-29,-15,19,-25,32,14,-20,-27,-18,-19,-23,-9,11,-21,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-18,-31,-24,-2,-27,-26,26,-23,17,11,-23,-23,-21,-23,-13,-5,27,-24,-7,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,17,-26,20,17,-27,-13,0,-28,9,-23,-18,13,-12,8,10,1,-6,-24,-29,-15,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-28,-17,-13,15,-23,14,-11,-9,-7,-1,-11,-24,-7,-3,-14,-11,-14,11,30,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-8,-25,-10,-2,-15,-22,16,-6,-10,5,6,-4,-21,13,-4,-12,-11,-14,-24,-1,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-19,-30,-22,0,-32,-24,33,-23,17,14,-20,-20,-18,-23,-16,-7,25,-20,-3,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,11,-26,15,21,-28,-12,-3,-26,9,-22,-16,5,-9,7,1,1,-7,-21,-29,-17,14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-22,2,2,-22,-2,6,-21,3,-21,-11,14,-14,5,1,2,-6,-20,-26,-12,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-5,-7,-28,40,-10,-34,-9,-27,-17,4,-17,-10,-12,0,-15,-26,-23,-24,-9;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-11,-18,-17,-10,-14,-22,5,-16,-5,-2,-12,-20,-17,-17,6,11,15,-30,-13,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-26,40,16,-31,-10,5,-32,2,-28,-22,21,-11,5,-4,4,-6,-27,-36,-17,10;
MA   /M: SY='G'; M=17,-9,-22,-13,-16,-26,43,-19,-29,-16,-24,-17,-3,-16,-16,-19,6,-11,-19,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,31,-27,31,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-31,-28,13,-31,-23,25,-23,15,10,-27,-29,-27,-20,-16,-4,32,-18,5,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-20,-26,-20,-2,-26,-23,16,-20,9,5,-23,-9,-20,-20,-11,-4,18,-23,-7,-22;
MA   /M: SY='C'; M=7,-16,8,-22,-20,-9,-8,-22,-5,-20,-3,-5,-13,-24,-20,-21,-5,-6,3,-28,-16,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-10,-11,-11,-14,-20,-12,-11,-11,-11,0,-11,-11,-11,19,46,-2,-29,-11,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,-14,-6,-6,-15,8,-13,-20,-12,-24,-17,6,-13,-7,-13,23,8,-12,-31,-18,-6;
MA   /M: SY='P'; M=6,-14,-18,-16,-8,-8,-14,-15,-12,-14,-12,-10,-11,12,-11,-17,1,-1,-11,-24,-14,-11;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-12,-11,-8,-12,-16,-15,-8,-10,-9,-5,-2,-12,-4,-10,16,30,-1,-30,-11,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-28,-18,5,-28,-16,17,-24,37,23,-25,-26,-13,-17,-23,-6,9,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='T'; M=4,3,-12,-2,-4,-17,-6,-11,-17,-9,-22,-16,10,-10,-4,-9,26,27,-9,-35,-16,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-24,-11,-10,-2,-21,1,-8,-12,-6,-4,-10,-19,-10,-12,-10,-4,-6,-4,6,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-1,14,-25,21,30,-29,-12,-5,-27,4,-21,-19,4,-6,8,-5,3,-7,-23,-30,-19,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,21,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-3,-30,-3,4,-20,-21,29,-25,16,-21,-5,2,-17,12,20,-10,-13,-23,-19,8,5;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-23,-9,1,-14,-23,-10,-5,4,-5,0,-8,-16,-2,0,-11,-9,-5,-23,-7,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-23,0,10,-22,-15,-3,-18,5,-15,-8,1,-12,9,2,1,-2,-16,-25,-11,9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-15,-30,-24,4,-30,-24,23,-25,29,16,-27,-27,-22,-21,-20,-5,23,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-19,-33,-25,12,-29,-24,24,-25,21,13,-24,-26,-24,-22,-17,-6,23,-19,0,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-21,1,16,-25,-13,-5,-24,10,-19,-11,-1,-11,10,10,0,-7,-19,-26,-16,12;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-14,-21,-20,-11,5,-22,-10,-1,-10,-2,-1,-11,-18,-11,-10,-6,0,0,-14,4,-12;
MA   /M: SY='V'; M=12,-16,-8,-22,-18,-9,-18,-24,5,-15,-3,-2,-15,-19,-18,-18,3,10,17,-23,-12,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-4,-26,-21,-5,-26,-23,12,-13,3,4,-21,-25,-19,-12,-10,-4,22,-27,-9,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,16,-26,22,28,-29,-14,-3,-28,7,-22,-18,7,-7,10,-1,3,-3,-23,-31,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-13,-13,-16,-3,-8,-23,-9,-3,-11,1,-1,-11,-18,-6,-11,-7,-4,-2,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-8,-21,-19,-7,-17,-22,6,-13,-3,-1,-15,-23,-19,-16,-1,0,19,-27,-13,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-4,13,-25,13,1,-25,2,-7,-24,1,-19,-15,12,-16,-3,-4,-2,-9,-21,-28,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-28,3,-7,-28,28,-12,-32,-3,-27,-17,6,-16,-8,-5,-1,-13,-24,-25,-22,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00569;
//
ID   DHDPS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00666;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydrodipicolinate synthetase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2385044; R2=0.0153646; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=462; N_SCORE=12.327; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-26,-30,-26,-3,-33,-25,38,-25,12,13,-10,-21,-19,-25,-15,-7,24,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='S'; M=17,7,-12,-1,-3,-20,0,-8,-17,-8,-24,-17,16,-12,-3,-11,24,9,-12,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-32,-7,-6,-9,-22,75,-24,-11,-17,-2,0,-23,4,-3,-14,-19,-27,-4,31,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-25,3,13,-23,-14,-4,-25,14,-22,-13,3,-11,8,14,3,-1,-19,-26,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-17,-7,2,-19,-12,-11,-15,1,-15,-9,-3,-11,0,-4,8,7,-8,-24,-12,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,34,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-16,-19,-13,-12,-12,-16,1,-15,2,-2,-10,-16,-12,-19,0,-3,3,-23,-13,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,17,-26,22,23,-29,-13,0,-28,5,-23,-19,10,-5,9,1,3,-6,-25,-31,-18,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-15,-8,-2,-19,-7,-10,-13,-4,-14,-7,-2,-13,-4,-8,8,1,-6,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='T'; M=10,-13,-9,-18,-17,-12,-11,-22,1,-15,-7,-5,-11,-18,-16,-17,8,12,12,-29,-15,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-25,22,10,-28,0,-3,-29,1,-25,-19,10,-7,1,-5,3,-5,-24,-30,-18,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-19,-22,-17,0,-26,-16,17,-17,18,10,-12,-23,-15,-15,-17,-8,10,-22,-4,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-7,0,-28,-18,-17,-20,-8,-29,-19,-16,76,-9,-17,-9,-10,-29,-28,-26,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-20,-31,-24,-2,-30,-22,28,-22,17,19,-21,-23,-16,-21,-15,-3,24,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-19,-35,-27,2,-33,-22,34,-24,19,25,-22,-23,-18,-23,-19,-8,25,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,6,-32,-25,30,-28,32,17,-27,-27,-22,-23,-23,-8,23,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,32,-19,19,1,-22,-1,6,-21,-2,-29,-20,45,-17,0,-3,13,1,-26,-39,-19,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-32,-28,2,-33,-27,35,-24,12,13,-19,-24,-23,-24,-14,-6,32,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-7,-21,-8,-9,-19,18,-16,-23,-13,-23,-16,-1,-9,-10,-16,12,-2,-16,-26,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-12,-20,-13,-5,-15,-22,-5,-21,15,-8,-5,-4,-23,2,45,-13,-10,-14,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-10,-9,-8,-13,-13,-18,-11,-10,-14,-12,0,-11,-8,-11,23,36,-1,-31,-13,-8;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-21,-10,-17,-24,40,-18,-26,-17,-23,-16,1,-20,-17,-18,3,-11,-17,-25,-25,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-7,-22,-18,-7,-23,-19,12,-16,5,6,-17,-23,-12,-15,-7,0,18,-27,-10,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-24,21,9,-25,-10,-4,-26,0,-26,-21,18,-2,-1,-5,4,-2,-24,-31,-18,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-34,-24,6,-31,-20,31,-25,28,25,-23,-24,-17,-22,-22,-9,19,-19,1,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-22,-2,4,-17,-13,-6,-16,-7,-15,-12,-2,1,-2,-10,7,6,-14,-28,-11,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-20,-26,-17,-10,-15,-23,-22,1,-15,-5,-5,-20,23,-15,-19,-9,-3,0,-28,-17,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-27,27,32,-31,-15,-3,-30,4,-23,-21,4,-1,9,-4,1,-8,-26,-32,-19,20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-15,-13,-8,-12,-21,-16,-3,-10,-4,-1,-7,-14,-2,-10,8,26,2,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-19,-32,-27,8,-30,-24,27,-23,16,16,-24,-25,-23,-21,-15,-4,28,-20,0,-26;
MA   /M: M=-1,-9,-21,-11,-5,-14,-9,-13,-11,-3,-7,-6,-6,-18,-6,-1,-6,-7,-6,-23,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-24,-4,9,-22,-17,-7,-23,16,-19,-11,0,-12,7,22,-1,-1,-16,-23,-12,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,10,-31,-21,22,-29,46,20,-29,-29,-20,-21,-28,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-12,-18,-12,-4,-10,-16,-7,-12,-9,-7,-8,-16,-12,-13,9,4,1,-20,-9,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-4,1,-12,1,5,-10,-9,-3,-10,4,-7,-5,1,-7,2,6,-1,-1,-8,-14,-6,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-19,11,16,-22,-9,1,-20,5,-18,-12,4,-7,9,0,3,-4,-18,-22,-10,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-11,-11,-16,-15,-1,-23,14,-3,-17,1,1,-4,-25,-11,-12,-11,-9,-6,-23,7,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-32,2,12,-28,-17,-13,-23,1,-27,-18,-7,40,0,-8,-1,-6,-25,-31,-23,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-22,8,0,-18,-6,4,-20,5,-24,-14,32,-18,1,5,4,-1,-23,-31,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-18,-36,-29,3,-36,-28,37,-27,17,17,-23,-24,-23,-26,-18,-8,30,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-16,-27,-22,-3,-25,-22,17,-16,7,7,-20,-23,-19,-17,-11,-5,20,-19,-3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-22,-12,-15,-26,43,-19,-30,-16,-24,-17,-2,-16,-15,-19,7,-11,-20,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-33,-28,5,-32,-26,32,-25,19,16,-25,-26,-24,-23,-17,-5,32,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-28,31,26,-25,-15,1,-29,1,-21,-20,6,-9,6,-7,-1,-9,-25,-28,-12,16;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,7,-15,-11,-18,-9,-19,-14,-13,-15,-13,-5,-14,-11,-17,15,13,-3,-31,-19,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-4,-15,-8,-9,-17,-1,-15,-12,-9,-17,-12,3,-15,-9,-11,15,12,-4,-30,-17,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-28,-2,-12,-28,38,-15,-32,-12,-27,-19,3,-11,-14,-14,0,-14,-25,-23,-25,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-23,35,9,-27,-8,3,-28,-2,-26,-21,20,-12,0,-5,8,-1,-23,-35,-14,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-18,-30,-22,13,-28,-20,20,-24,24,15,-23,-24,-21,-19,-18,-5,17,-17,2,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,6,8,-12,-13,-4,-19,-3,-16,-14,0,-12,-1,-6,1,-1,-16,-21,-3,3;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-26,-10,0,-14,-18,3,-17,6,-11,-5,-4,-18,10,18,-7,-8,-17,-14,0,3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-11,-30,-24,2,-27,-23,19,-23,17,13,-24,-22,-21,-22,-16,-6,19,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-20,-2,9,-22,-9,-10,-18,0,-17,-12,-2,-11,4,-3,8,3,-12,-28,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-26,3,17,-23,-18,1,-23,8,-16,-10,-1,-11,14,11,-3,-7,-21,-23,-10,14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-24,-29,-20,6,-31,-15,22,-21,20,15,-21,-24,-13,-18,-19,-8,13,-14,9,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-15,-25,-20,-12,-12,-24,-15,2,2,-3,2,-10,-18,-6,8,-10,-6,3,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-24,2,10,-21,-15,1,-19,5,-15,-9,1,-13,7,4,-1,-6,-17,-25,-9,7;
MA   /M: SY='A'; M=2,-4,-21,-6,0,-17,-15,-7,-12,1,-10,-6,-3,-15,-2,1,-1,-2,-8,-25,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,3,-21,-16,-4,-25,-13,-2,-13,-4,-2,-13,-22,-15,-13,-5,3,5,-26,-5,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00569;
//
ID   COMPLEX1_ND1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00667;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6794982; R2=0.0134949; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=576; N_SCORE=12.443; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-19,-15,-14,-25,32,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-14,-20,6,-9,-14,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-17,-25,-19,-15,6,-14,-2,-9,-9,-5,-4,-14,-23,-11,-4,-11,-9,-9,7,22,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-17,-31,-24,7,-25,-17,17,-19,12,23,-21,-23,-16,-18,-16,-8,13,-9,1,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-38,-20,20,-21,8,-20,0,1,-11,54,9,-1,-11,-30,-21,-7,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-24,-4,-3,-12,-20,-5,-5,-6,-2,1,1,-19,4,-1,-8,-7,-10,-25,-7,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-17,-27,-20,-12,-7,-27,-11,5,2,0,7,-13,-17,-6,1,-15,-9,3,-17,2,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-29,-20,-19,-20,-10,-29,-20,-20,88,-10,-20,-10,-10,-30,-29,-28,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-9,26,-18,15,8,-20,-6,4,-19,0,-23,-16,37,-15,3,-2,7,0,-24,-35,-18,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-25,-15,-8,-5,-23,-5,-6,9,-8,-1,-9,-20,-4,16,-11,-7,-2,-13,6,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-11,-26,-23,-4,-24,-24,20,-17,5,6,-22,-23,-23,-19,-5,1,34,-26,-10,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-28,-10,-19,-27,60,-19,-35,-18,-27,-17,-1,-19,-18,-18,0,-17,-27,-16,-26,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-30,-18,-9,-6,-20,-17,-10,-12,-12,-10,-19,31,-13,-17,-12,-9,-15,-9,-7,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-23,-25,-19,18,-18,-8,0,-16,8,8,-18,-24,-15,-12,-18,-10,-4,5,16,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-20,-29,-21,4,-28,-20,21,-22,24,17,-22,-24,-16,-17,-17,-5,16,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-30,-21,13,-28,-21,17,-28,34,15,-26,-21,-21,-21,-25,-10,8,-17,1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-29,-1,18,-39,-19,9,-19,9,-19,1,-1,-10,57,9,0,-10,-28,-20,-10,38;
MA   /M: SY='P'; M=2,-16,-27,-13,-4,-19,-16,-18,-11,-12,-16,-12,-15,31,-10,-18,-2,-3,-13,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-33,-26,20,-31,-22,22,-26,21,12,-24,-27,-25,-22,-19,-8,18,-13,7,-26;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-11,-18,-10,-17,-2,-18,-12,-9,-12,-10,-8,-12,-9,-14,10,1,-3,-19,-17,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=19,-13,-21,-19,-17,-20,22,-19,-14,-16,-12,-4,-8,-16,-14,-20,0,-10,-8,-20,-20,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-32,-25,4,-31,-23,28,-25,25,19,-24,-25,-20,-22,-19,-6,23,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,29,-9,-9,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-21,9,-30,-18,20,-28,43,21,-28,-29,-19,-19,-27,-9,11,-18,3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-28,-20,-34,-25,33,-27,-21,13,-28,24,11,-23,-27,-27,-21,-21,-9,9,-9,9,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-20,-13,-26,-20,13,-21,-20,4,-21,8,3,-16,-23,-20,-17,-9,1,5,-18,-1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,10,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,56,-31,-18,0,-30,9,-20,-19,0,-1,21,0,0,-10,-30,-29,-20,39;
MA   /M: SY='D'; M=-12,9,-26,16,2,-23,-18,-8,-15,-7,-16,-10,0,-4,-1,-11,-4,-7,-13,-27,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-24,-32,-25,5,-29,-24,22,-24,14,10,-23,-23,-21,-22,-19,-8,16,-3,1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-24,-26,-20,-2,-26,-21,16,-14,7,7,-15,-21,-15,-12,-12,-2,13,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-25,-21,-20,-16,-11,-26,-16,-20,79,-11,-20,-11,-10,-25,-29,-27,-11;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-19,-8,-7,-10,-12,-13,-11,-7,-9,-8,-3,-11,-8,-8,3,2,-7,-25,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-3,-23,-8,-7,-7,-5,-9,-16,-3,-14,-8,2,-16,-7,-2,-2,-4,-13,-20,-7,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-12,-11,-9,-17,3,-15,-12,-11,-16,-10,-3,-12,-8,-15,18,7,-2,-28,-18,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,32,-23,35,10,-29,-6,0,-29,-1,-29,-23,26,-13,1,-5,10,0,-25,-38,-19,6;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-26,-7,0,-19,-13,-9,-20,14,-19,-9,-4,-6,1,11,-4,-4,-15,-20,-8,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-27,-29,-22,18,-23,-20,1,-20,2,-1,-21,-17,-21,-16,-17,-8,-2,13,9,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-18,-29,-22,2,-28,-23,21,-24,23,13,-24,-20,-20,-21,-16,-5,18,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-34,-26,63,-30,-10,1,-24,7,1,-20,-29,-30,-17,-20,-10,-2,13,39,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-16,-20,-22,-17,4,-24,-15,6,-15,6,3,-12,-22,-14,-9,-8,2,5,-15,2,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-22,-31,-22,6,-29,-23,24,-26,25,14,-22,-21,-20,-22,-19,-7,15,-19,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00570;
//
ID   COMPLEX1_ND1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00668;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8739829; R2=0.0141064; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=506; N_SCORE=12.002; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-15,-33,-25,39,-23,-18,3,-26,13,5,-20,-27,-28,-20,-17,-9,2,-4,14,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-11,-28,-21,0,-25,-22,16,-23,15,9,-20,-22,-19,-21,-12,-4,14,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-22,-18,-28,-22,-4,-27,-23,21,-21,10,12,-18,-17,-17,-21,-11,-2,18,-21,-7,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-18,-34,-27,42,-28,-11,-6,-23,-1,-5,-23,-30,-26,-18,-23,-14,-9,37,35,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-27,-15,-32,-25,32,-24,-19,3,-25,12,3,-22,-28,-27,-20,-18,-9,3,2,14,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-35,-28,7,-33,-27,33,-26,15,13,-21,-23,-23,-25,-15,-5,27,-20,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-1,-13,-9,-18,-6,-16,-12,-12,-17,-11,-3,-13,-8,-16,19,10,-3,-31,-19,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-9,-17,-16,-14,4,-17,-12,-14,-12,-2,-7,-19,-13,-11,2,1,-5,-26,-16,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-31,-24,11,-30,-22,23,-26,28,16,-25,-27,-23,-20,-20,-6,21,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,-14,-21,-13,-17,0,-21,-6,-14,-5,-6,-11,-13,-12,-21,4,-2,1,-20,-18,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,15,45,-26,-20,-4,-23,5,-15,-16,-3,-4,12,-4,-1,-9,-21,-30,-18,29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-8,0,-16,-15,-10,-16,-20,-7,-14,-6,-4,-7,-16,-13,-15,9,25,1,-29,-12,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-23,9,-1,-20,0,20,-23,-2,-24,-14,34,-19,0,-1,3,-6,-27,-34,-12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10,0,-20,-20,-2,-30,31,-21,-10,-1,-19,9,63,-11,-10,-20,-16,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-18,-15,-10,-13,-15,-1,-6,-14,-1,-2,-9,-11,-9,-15,-2,1,-4,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-20,-27,-18,14,-28,-15,12,-21,24,13,-22,-27,-14,-15,-20,-8,8,-15,5,-15;
MA   /M: SY='P'; M=6,-16,-23,-16,-9,-19,-17,-20,-6,-12,-15,-8,-16,29,-12,-18,-1,2,-5,-28,-20,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=20,-9,-12,-13,-13,-24,27,-19,-25,-15,-22,-16,-3,-15,-13,-19,10,-5,-14,-25,-25,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,20,59,-29,-20,0,-29,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-29,-29,-20,39; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-18,-1,3,-25,-1,-5,-21,-4,-25,-14,8,-11,12,-4,20,7,-17,-31,-17,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-29,23,54,-30,-18,0,-30,8,-21,-21,2,-1,18,-1,2,-9,-29,-31,-20,36;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-21,-29,-20,6,-29,-21,22,-28,38,17,-25,-27,-18,-21,-23,-8,12,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-13,-27,-24,-2,-26,-25,21,-18,6,7,-24,-25,-20,-18,-7,-1,33,-26,-9,-22;
MA   /M: SY='A'; M=18,0,-17,-1,3,-24,1,-12,-21,-6,-20,-16,0,-9,-1,-11,14,2,-13,-28,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-26,-24,-19,34,-27,6,-5,-18,0,-2,-16,-15,-19,-14,-17,-8,-9,5,36,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-21,-5,-8,-10,-16,24,-7,-10,-7,5,14,-21,-1,-7,-7,-8,-14,-28,1,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-14,-22,-20,-5,-26,-25,15,-18,4,3,-14,-19,-18,-17,2,19,22,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,23,55,-30,-19,0,-30,9,-21,-21,4,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-22,-21,29,-30,14,4,-13,5,2,-21,-30,-12,-12,-21,-10,-7,24,70,-21;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-14,-5,-5,-20,6,-13,-20,-11,-26,-18,4,-7,-5,-13,27,13,-11,-33,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-25,-9,-15,-26,45,-18,-33,-16,-28,-19,1,-17,-14,-15,8,-9,-23,-20,-25,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-16,-21,-21,-19,-4,-1,-12,2,-16,2,18,-12,-20,-12,-16,-8,-8,1,-21,-8,-15;
MA   /M: SY='K'; M=1,-9,-26,-10,-5,-19,2,-13,-23,5,-22,-12,-4,-2,-6,1,-1,-8,-18,-21,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-22,-38,-29,68,-29,-19,1,-29,10,0,-21,-29,-36,-20,-21,-11,-1,15,29,-28;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-15,-18,-15,-19,13,-21,-12,-14,-11,-9,-10,-16,-15,-19,5,-3,-1,-22,-20,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-29,-20,8,-27,-16,19,-25,38,25,-25,-28,-17,-18,-25,-9,11,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-20,-35,-26,55,-28,-18,5,-27,12,5,-19,-27,-31,-19,-17,-8,3,2,22,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-22,-32,-23,54,-27,-14,-3,-19,3,1,-17,-24,-28,-14,-16,-9,-4,4,25,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00570;
//
ID   GAS_VESICLE_A_2_MP; MATRIX.
AC   MP00669;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gas vesicles protein GVPa signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5383658; R2=0.0151652; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=11.594; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-17,-31,-26,-4,-27,-28,28,-21,9,9,-22,-22,-22,-23,-9,-3,33,-25,-9,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-12,-23,-17,-9,-14,-21,-13,-7,4,-8,-4,-5,-17,-3,22,-3,3,-3,-22,-9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-12,-3,-4,-19,3,-13,-20,-11,-26,-18,7,-11,-4,-11,32,22,-10,-36,-19,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-32,-25,5,-32,-25,29,-26,30,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-15,-22,-22,-13,2,-25,2,-17,-5,-3,-17,-22,-22,-20,-2,-5,16,-25,-18,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,17,-28,26,-1,-33,28,-10,-38,-10,-30,-24,10,-15,-9,-15,4,-12,-28,-31,-25,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-23,-34,-27,-1,-35,-29,38,-25,14,14,-19,-21,-21,-25,-13,0,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-32,14,48,-30,-20,-4,-28,6,-22,-20,-4,18,14,-4,-2,-10,-30,-30,-22,30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-20,-9,-9,-22,16,-18,-24,-5,-22,-14,-1,-13,-9,-9,9,7,-14,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-26,18,31,-28,-14,-3,-29,10,-24,-19,5,-7,11,7,6,-4,-24,-32,-18,20;
MA   /M: SY='L'; M=14,-22,-17,-28,-19,-5,-20,-23,15,-21,18,7,-20,-20,-17,-22,-11,-5,13,-21,-9,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=14,-23,-14,-28,-21,-5,-21,-25,17,-20,12,6,-22,-22,-20,-21,-8,-3,23,-23,-10,-21;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-13,-28,-22,-6,-21,-26,17,-19,8,5,-22,-22,-21,-21,-6,-2,27,-25,-11,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-19,-33,-28,-2,-32,-29,35,-23,13,13,-24,-24,-24,-24,-13,-4,37,-25,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-15,-3,-5,-23,19,-13,-25,-13,-30,-20,7,-13,-5,-13,29,9,-15,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-13,-31,-28,11,-28,-23,24,-19,12,19,-27,-28,-25,-18,-13,-3,35,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-26,42,23,-32,-14,-4,-32,0,-24,-24,11,-8,3,-8,4,2,-24,-36,-18,13;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-14,-8,-6,-14,-20,-18,-14,2,-14,-10,0,-10,-6,-2,14,38,-4,-28,-10,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-19,-22,-25,-18,11,-17,-4,-1,-13,0,8,-18,-21,-11,-15,-11,-8,-3,9,22,-16;
MA   /M: SY='L'; M=0,-15,-19,-19,-11,-6,-22,-18,0,-7,14,4,-15,-19,-11,-8,-10,4,1,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-28,4,25,-27,-18,7,-28,17,-21,-12,0,-9,15,19,-4,-10,-24,-25,-12,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-29,-27,-23,31,-32,4,10,-17,5,4,-20,-28,-16,-15,-20,-10,-1,17,57,-23;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,38,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-26,-8,16,-11,-25,-8,0,-8,9,9,-13,-13,2,-10,-13,-10,-7,-25,-9,9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-11,-14,-4,6,-8,-12,-6,-9,-4,-6,-8,-10,-10,-12,0,-3,-3,-8,-3,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-15,19,19,-17,-7,1,-17,3,-13,-12,9,-4,5,-2,1,-4,-16,-19,-11,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-20,-6,-24,-17,4,-25,-22,-2,-18,-6,-7,-17,-26,-20,-18,-15,-11,1,8,-1,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-16,-36,-19,-18,-11,5,-20,-24,-15,-24,-19,-11,-9,-15,-17,-15,-18,-27,45,-3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-25,9,11,-19,-20,-8,-18,3,-6,-9,-3,-14,0,5,-7,-2,-15,-27,-12,5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-18,-15,-13,-12,-4,-17,-4,-16,-1,-4,-3,-17,-12,-16,2,4,-3,-26,-14,-13;
MA   /M: SY='D'; M=0,16,-21,19,10,-27,-13,-8,-23,-3,-19,-17,5,-9,3,-9,8,9,-16,-31,-16,6;
MA   /M: SY='H'; M=-12,2,-28,8,3,-24,-17,14,-20,-9,-15,-10,-1,6,3,-10,-4,-9,-22,-31,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=1,-10,-24,-12,0,-10,-17,-2,-12,5,-9,0,-9,-16,1,8,-7,-7,-10,-11,5,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-7,-24,-6,12,-20,-21,3,-10,-4,-2,-1,-9,-14,15,-5,-7,-9,-12,-24,-9,13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-23,-1,3,-22,-9,-7,-19,1,-15,-10,-1,-15,6,9,3,-3,-14,-27,-15,3;
MA   /M: SY='S'; M=8,-9,-15,-9,-4,-17,-12,-17,-8,-11,-17,-12,-6,-3,-8,-14,16,11,1,-33,-18,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-24,-4,14,-21,-17,-6,-21,14,-15,-6,-3,-11,7,18,-3,-4,-15,-24,-13,9;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-22,-6,-4,-24,21,-16,-27,-6,-24,-16,0,-13,-8,-10,8,0,-18,-25,-21,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00207;
//
ID   D_2_HYDROXYACID_DH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00670;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0686827; R2=0.0179149; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; N_SCORE=12.598; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=25; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-26,4,16,-24,-16,-9,-16,1,-18,-12,0,6,2,-7,-2,-7,-16,-29,-18,8;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-21,-7,-1,-13,-18,-8,-8,-2,-4,-3,-6,-17,-4,1,-6,-5,-4,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=9,-2,-23,0,15,-24,-5,-12,-20,-5,-14,-14,-5,-2,0,-12,3,-6,-16,-27,-20,7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,1,14,-20,-18,-9,-18,7,-9,-9,-4,-12,2,4,-6,-7,-14,-25,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-25,5,15,-26,-5,-4,-27,8,-24,-15,2,-10,8,3,4,-6,-21,-27,-16,11;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-15,-22,-18,-8,1,-27,-13,8,-16,6,4,-12,-14,-12,-16,-12,-6,2,-21,-2,-12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-27,-8,-11,-25,34,-16,-27,-14,-20,-14,0,-18,-11,-15,-1,-12,-22,-19,-22,-11;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-8,-20,-14,-4,-17,-19,0,-12,-1,0,-15,-20,-16,-14,-5,-2,8,-22,-8,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,2,-26,3,10,-20,-15,-1,-22,8,-19,-11,2,-13,11,8,-1,-2,-20,-19,-2,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-23,-24,-18,16,-27,-6,2,-10,6,4,-19,-26,-14,-4,-17,-8,2,1,23,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-8,-12,-6,-7,-11,-20,-9,1,-9,-4,-2,-11,-18,-10,-8,-3,-1,11,-27,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,13,-21,18,7,-26,-9,-6,-26,-2,-26,-20,8,-3,0,-7,14,8,-18,-35,-18,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-32,-22,20,-29,-20,16,-27,34,14,-26,-28,-23,-18,-24,-9,10,-15,4,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-30,39,33,-34,-14,-1,-33,6,-26,-24,10,-2,8,-4,0,-9,-29,-34,-20,21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-26,22,31,-28,-17,0,-27,3,-19,-18,4,-6,9,-4,3,0,-23,-32,-16,20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-19,-30,-21,6,-27,-18,20,-24,34,23,-26,-26,-18,-19,-23,-8,14,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-23,15,-30,-18,16,-26,29,12,-28,-29,-21,-20,-26,-11,9,-2,12,-23;
MA   /M: SY='K'; M=6,-2,-22,-4,5,-25,-11,-7,-21,7,-23,-13,1,0,6,1,7,0,-17,-27,-17,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-25,3,14,-26,-18,-3,-19,9,-18,-8,1,-12,18,8,1,-3,-18,-27,-13,16;
MA   /M: SY='S'; M=20,-7,14,-12,-9,-20,-5,-17,-18,-14,-21,-17,-2,-15,-9,-17,21,8,-7,-35,-22,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,65,19,-39,-10,2,-39,0,-30,-28,21,-11,2,-9,0,-10,-30,-39,-19,10;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-18,-35,-30,20,-33,-27,28,-25,13,10,-25,-27,-30,-23,-15,-5,32,-17,3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-36,-30,6,-35,-29,37,-26,17,15,-24,-25,-25,-25,-16,-6,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-8,-7,-8,-13,-13,-17,-10,-12,-15,-12,0,-13,-9,-12,22,29,0,-34,-14,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,28,-29,39,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-16,9,-27,2,-3,-18,-16,63,-20,-9,-19,-4,22,-20,5,-3,-5,-13,-25,-32,7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,16,-28,-25,-5,-27,-25,9,-22,6,5,-23,-28,-24,-21,-9,1,21,-32,-13,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=2,-20,-19,-21,-11,-3,-19,-18,5,-18,24,7,-20,-22,-13,-15,-16,-7,2,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-13,-8,-9,-11,-19,-1,-9,-12,-7,-6,6,-16,-8,-10,8,23,-6,-31,-7,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-32,5,12,-30,-17,-10,-25,7,-26,-17,-6,31,0,-4,-5,-8,-25,-28,-21,4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,13,-26,19,27,-30,-11,-2,-29,7,-23,-18,5,-7,9,-2,3,-6,-24,-30,-18,18;
MA   /M: SY='T'; M=0,7,-12,-4,-7,-13,-14,-14,-13,-8,-16,-13,11,-12,-7,-8,21,38,-6,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-27,-9,-2,-8,-22,11,-18,12,-15,-6,-5,-18,2,18,-9,-7,-15,-12,13,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-13,3,-29,1,-4,-22,5,43,-30,-8,-23,-9,11,-19,2,-4,-5,-16,-28,-25,2,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-32,-22,7,-28,-15,24,-23,34,32,-25,-25,-14,-18,-25,-10,13,-19,1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-24,-37,-28,23,-34,-24,29,-28,22,16,-22,-25,-25,-24,-21,-9,19,-13,7,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,26,-22,18,-2,-25,14,0,-27,-6,-30,-21,36,-18,-4,-7,10,-4,-28,-36,-22,-3;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-21,4,13,-26,-13,-7,-23,12,-21,-14,1,-10,4,2,1,-5,-16,-26,-16,8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-27,9,28,-28,-14,-6,-27,13,-22,-17,1,-2,9,4,1,-7,-23,-27,-18,18;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-20,-8,6,-18,-18,-9,-12,-3,-6,-3,-6,-12,7,-3,2,8,-10,-25,-12,6;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-38,-28,35,-34,-24,23,-30,23,12,-22,-26,-28,-24,-22,-10,13,-8,12,-28;
MA   /M: SY='A'; M=13,-1,-20,-3,3,-26,0,-12,-23,6,-22,-14,1,-11,1,-3,7,-3,-15,-25,-18,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-26,-6,5,-21,-20,1,-18,16,-11,-3,-3,-15,9,12,-9,-9,-16,-22,-7,7;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-15,-30,-21,4,-22,-7,16,-14,18,43,-20,-22,-7,-13,-18,-7,10,-20,-1,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,0,10,-30,-20,-10,-29,47,-30,-10,-1,-7,11,28,-10,-10,-21,-20,-11,10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,10,-31,16,11,-32,-16,-6,-29,17,-28,-17,4,7,8,9,-4,-9,-26,-28,-17,9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-26,-8,-16,-27,54,-18,-35,-18,-29,-19,3,-18,-16,-18,6,-10,-26,-24,-27,-16;
MA   /M: SY='A'; M=26,-16,-11,-22,-16,-11,-12,-22,2,-13,-5,-4,-15,-17,-16,-18,4,2,14,-24,-15,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-25,-25,-30,-23,13,-30,-15,16,-17,9,8,-20,-25,-18,-12,-17,-8,11,-2,16,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-22,-34,-25,8,-33,-25,30,-28,31,17,-26,-26,-22,-24,-22,-8,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00063;
//
ID   D_2_HYDROXYACID_DH_3_MP; MATRIX.
AC   MP00671;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2686586; R2=0.0185046; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=268; N_SCORE=11.218; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=13; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,1,-17,-5,-3,-15,-18,-7,-11,-6,-12,-9,4,-7,-5,-8,6,17,-9,-30,-12,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-31,-4,4,-18,-17,-2,-21,1,-21,-14,-9,20,-3,-7,-7,-9,-22,-18,-5,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-28,11,21,-30,-14,-3,-27,8,-24,-16,0,5,9,-1,0,-7,-24,-28,-17,14;
MA   /M: SY='T'; M=-1,8,-12,-3,-7,-13,-14,-13,-13,-8,-16,-13,13,-12,-7,-8,20,37,-7,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-11,-27,-12,-5,-6,-22,14,-14,0,-10,-3,-8,-20,0,4,-11,-8,-13,-6,13,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-29,-1,-4,-20,-3,59,-29,-9,-20,-5,8,-20,4,-4,-8,-17,-28,-25,8,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,8,-29,-17,23,-25,39,29,-26,-27,-16,-19,-26,-10,13,-20,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-36,-27,15,-33,-24,27,-27,18,13,-22,-24,-24,-24,-18,-9,19,-15,5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-9,31,-23,25,2,-25,5,2,-26,-4,-28,-21,37,-17,-3,-6,8,-3,-27,-37,-21,-1;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-23,5,13,-26,-13,-7,-22,10,-19,-13,1,-10,5,2,0,-6,-16,-26,-15,9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-26,10,22,-25,-15,-7,-24,8,-20,-16,2,-4,6,0,0,-6,-21,-27,-16,14;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-20,-16,-5,-4,-21,-13,-4,-9,1,0,-10,-14,-3,-5,-4,3,-4,-21,-6,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-36,-26,29,-32,-22,22,-29,29,15,-24,-27,-26,-22,-24,-10,12,-11,9,-25;
MA   /M: SY='A'; M=7,0,-22,-2,4,-24,-5,-9,-21,7,-18,-11,1,-12,3,2,3,-5,-15,-25,-16,4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-24,-6,3,-22,-16,-1,-17,11,-13,-3,-3,-14,9,7,-4,-7,-14,-23,-9,5;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-15,-30,-21,8,-24,-10,16,-18,24,35,-23,-25,-12,-15,-21,-8,9,-18,2,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-30,-2,8,-29,-19,-6,-28,38,-28,-10,0,-3,11,27,-9,-10,-22,-21,-11,8;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-31,14,10,-32,-15,-7,-28,13,-28,-17,2,12,7,5,-3,-8,-25,-28,-18,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-26,-1,-13,-28,45,-15,-34,-14,-28,-20,7,-18,-14,-15,5,-9,-26,-25,-26,-14;
MA   /M: SY='A'; M=24,-14,-10,-20,-13,-14,-11,-20,-3,-11,-7,-6,-12,-14,-11,-15,5,2,7,-25,-16,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-26,-34,-27,12,-32,-20,22,-22,10,9,-23,-26,-20,-18,-21,-11,15,6,14,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,10,-32,-23,27,-29,37,18,-27,-28,-22,-22,-25,-9,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-29,1,-34,-28,38,-25,18,17,-25,-25,-24,-24,-16,-6,37,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=12,-10,1,-19,-15,-10,-17,-20,-5,-15,-6,-5,-8,-16,-14,-17,5,14,3,-27,-13,-15;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-3,-14,-10,-21,7,-18,-18,-13,-19,-15,-4,-14,-10,-18,15,2,-7,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,68,-20,-40,-20,-30,-20,0,-17,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-22,-5,-4,-24,2,-16,-20,-6,-20,-15,-4,6,-8,-13,4,-2,-15,-26,-22,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-32,-26,3,-32,-24,30,-25,23,15,-27,-28,-24,-22,-18,-5,32,-25,-4,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-12,-33,-29,-1,-33,-28,33,-23,13,15,-25,-26,-24,-23,-14,-4,37,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-27,51,16,-33,-11,-1,-30,-1,-26,-24,19,-12,-1,-9,0,-8,-23,-38,-19,7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-20,3,10,-19,-16,-7,-15,-1,-16,-12,12,-11,2,-3,7,11,-14,-31,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-27,12,14,-30,-12,-3,-24,5,-22,-14,4,-2,12,-1,-1,-8,-23,-27,-16,13;
MA   /M: SY='A'; M=29,5,-15,3,-1,-24,-3,-14,-18,-8,-15,-15,-2,-10,-7,-17,8,-1,-8,-26,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-30,-22,8,-29,-22,21,-27,38,18,-29,-29,-22,-20,-24,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-23,-18,-27,-20,-1,-27,-19,17,-18,16,9,-21,-23,-17,-17,-14,-6,16,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-26,15,18,-29,-14,-3,-27,11,-22,-15,4,-10,11,7,0,-6,-21,-27,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-9,-19,-11,-18,-2,-18,-9,-11,-10,-9,-9,-13,-11,-16,6,-2,-1,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-17,-28,-20,6,-30,-21,20,-27,38,17,-27,-28,-20,-20,-25,-9,13,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,11,-27,12,13,-28,-15,-2,-25,17,-23,-13,8,-12,10,10,-3,-7,-21,-27,-14,11;
MA   /M: SY='S'; M=2,6,-15,5,7,-24,-7,-7,-21,-2,-23,-16,9,-12,4,-5,15,5,-16,-33,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-9,-16,-28,52,-17,-35,-13,-28,-18,1,-19,-14,-12,0,-17,-27,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-2,6,-24,-21,4,-21,16,-19,-7,-1,-12,10,12,-7,-6,-19,-18,-6,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-19,-25,-20,-4,-28,-23,21,-21,16,10,-19,-21,-18,-20,-18,-9,15,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-19,-17,-11,-9,-2,-13,-11,-10,-6,-6,-8,-18,-11,-7,-2,-6,-7,-20,-11,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00063;
//
ID   V8_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP00672;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, V8 family, histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3613310; R2=0.0154908; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=534; N_SCORE=13.623; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=74; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-18,-28,-15,-8,-6,-25,-1,-3,-8,-9,-3,-18,2,2,-10,-11,-8,-7,-7,16,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,2,-20,-6,-11,0,-18,-1,-4,-11,-1,-4,9,-23,-9,-9,-4,6,-10,-18,9,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-6,-19,-8,-6,-8,-14,-3,-17,-1,-18,-12,0,-16,-1,8,13,12,-11,-20,4,-6;
MA   /M: SY='I'; M=5,-25,-22,-34,-25,-5,-29,-28,33,-24,11,11,-20,-20,-20,-26,-11,-6,27,-22,-6,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-30,-13,-7,-25,6,-14,-13,0,-17,-5,-5,-16,3,-5,-7,-13,-14,-20,-15,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-11,-16,-16,-19,2,-23,-10,8,-13,-2,-1,-8,-25,-17,-13,-4,7,14,-18,9,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-13,-25,-9,2,-17,-23,8,-7,-9,-12,-5,-13,5,-6,-11,-8,-9,-2,-30,-10,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-10,-20,-22,-19,19,-19,-15,5,-19,-1,-2,0,-21,-20,-18,-7,-6,0,-14,2,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-16,-15,-13,-13,-19,-21,-1,-13,-12,-7,-12,3,-15,-15,8,14,9,-32,-16,-15;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-17,-2,1,-21,-11,-12,-21,11,-26,-15,5,-10,1,4,19,16,-11,-31,-15,1;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,38,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,18,-2,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-18,-13,-8,-14,-21,-16,0,-11,-8,-3,-3,-12,1,-11,11,21,0,-28,-10,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-21,-18,-19,13,-4,-11,-13,-16,-8,-8,-9,-21,-18,-14,-2,8,-9,-6,14,-19;
MA   /M: SY='S'; M=0,-14,-20,-16,-14,-13,2,-18,-3,-20,-5,-5,-6,-18,-12,-18,6,-1,-3,-28,-15,-14;
MA   /M: SY='C'; M=23,-15,49,-25,-19,-20,-14,-25,-19,-19,-15,-15,-15,-24,-19,-25,1,-5,-5,-34,-25,-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-32,-21,-35,-30,20,-28,-28,12,-22,3,1,-30,-30,-30,-20,-19,-9,21,20,8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-30,-22,6,-28,-17,22,-23,35,27,-28,-28,-17,-18,-24,-8,18,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-15,-28,54,-13,-35,-15,-30,-20,14,-20,-15,-15,2,-15,-30,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,-35,-5,5,-30,-20,-15,-25,23,-30,-15,-9,35,1,7,-10,-10,-25,-25,-19,1;
MA   /M: SY='N'; M=-12,33,-24,26,6,-26,-7,3,-26,11,-30,-20,38,-16,2,5,3,-4,-28,-35,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,-14,-28,-22,-1,-23,-24,17,-21,20,9,-25,-25,-22,-20,-13,-4,24,-24,-9,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=17,17,-15,2,-5,-20,0,-4,-15,-5,-21,-15,28,-15,-5,-9,10,0,-16,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-10,-30,-10,-11,-18,19,-7,-29,4,-23,-13,-4,-20,-7,7,-7,-15,-23,-11,-3,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-25,42,-34,-30,-9,-34,-30,10,-28,0,0,-22,-31,-26,-28,-14,-8,16,-35,-15,-30;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-15,-29,-23,-7,-22,-27,21,-19,5,5,-21,-21,-21,-22,-5,-2,28,-24,-11,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-25,28,10,-30,-11,-4,-32,11,-28,-21,11,-12,3,11,6,-3,-22,-33,-17,6;
MA   /M: SY='Z'; M=3,-5,-20,-9,6,-8,-18,-10,-14,-5,-11,-8,-5,-11,6,-7,3,6,-12,-19,-7,7;
MA   /M: SY='S'; M=15,8,-15,7,-1,-22,-6,-13,-19,-8,-19,-17,3,-10,-5,-13,17,12,-9,-31,-18,-3;
MA   /M: SY='H'; M=1,5,-20,0,-2,-20,-9,39,-22,-8,-22,-10,15,-16,2,-6,8,-4,-20,-32,-3,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-15,-30,54,-18,-38,-7,-30,-18,0,-18,-15,-11,-2,-18,-28,-20,-26,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-18,10,-30,11,-6,2,-15,-10,-23,-11,-19,-19,5,-21,-14,-13,-12,-13,-23,14,3,-8;
MA   /M: SY='P'; M=17,-15,-26,-15,-5,-25,-11,-20,-15,-10,-21,-15,-15,45,-10,-20,-1,-5,-16,-25,-25,-10;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-19,-2,-5,-22,12,10,-27,-12,-28,-16,8,-14,-3,-10,21,3,-19,-33,-14,-5;
MA   /M: SY='T'; M=7,5,-15,-5,-5,-17,-12,-13,-15,2,-17,-12,9,-12,-5,-4,11,21,-9,-28,-14,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-18,-27,-21,2,-27,-21,29,-22,20,14,-19,-19,-17,-20,-16,-6,22,-17,-2,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-13,-7,-3,-9,-11,-9,0,3,-7,-2,-2,-7,-2,-1,1,-1,0,-14,-5,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=15,-15,-13,-25,-17,17,-15,-20,-7,-17,-3,-7,-11,-17,-20,-18,2,8,0,-12,-1,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00571;
//
ID   V8_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00673;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serine proteases, V8 family, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6312108; R2=0.0151082; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=482; N_SCORE=12.903; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=58; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-34,-11,1,-27,-23,-13,-10,5,-19,-7,-11,27,7,-4,-10,-10,-17,-24,-16,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-17,-23,-21,-9,-9,-27,-21,20,-18,2,4,-12,-16,-10,-20,-3,-3,14,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='R'; M=2,-13,-19,-16,-7,-15,-19,-12,-5,-3,-1,0,-11,-18,3,4,-4,0,-1,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-23,-22,-18,2,-27,-12,14,-18,1,2,-11,-19,-12,-18,-2,6,8,-13,14,-18;
MA   /M: SY='T'; M=7,-7,-18,-10,2,-14,-16,-15,-5,-11,-5,-7,-6,-12,-5,-14,7,8,-3,-28,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-7,-26,-5,14,-17,-10,-7,-13,0,-3,4,-9,-13,3,-5,-10,-11,-14,-24,-13,9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-17,-14,-15,1,3,-18,-17,-16,-14,-12,-2,-16,-17,-14,11,16,-9,-21,-9,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,1,-28,-1,7,-3,-20,10,-16,4,-14,-11,4,-19,3,8,-7,-8,-21,-7,20,2;
MA   /M: SY='K'; M=-3,8,-28,12,11,-31,0,-10,-31,16,-26,-17,3,-10,2,4,-3,-11,-23,-25,-18,6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-18,-24,-16,3,-23,-16,12,-24,31,17,-21,-25,-14,-17,-15,-4,6,-24,-4,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-3,-26,-5,8,-28,-20,1,-21,12,-18,-5,0,-13,32,24,1,1,-21,-22,-10,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,1,-20,0,-8,5,-17,-8,-14,-11,-9,-11,-4,-17,-13,-14,-2,3,-9,-12,9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-15,-22,-19,-18,-10,11,-16,-8,-19,3,8,-11,-21,-14,-16,-8,-2,-7,-22,-13,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,10,-23,16,-1,-1,-15,-2,-20,-10,-17,-16,3,-17,-9,-12,2,-3,-16,-18,8,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-22,-14,-6,5,-27,-4,2,-9,-2,-2,-17,-22,-10,-11,-8,0,5,-7,23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-16,-28,-14,-19,-24,35,-22,-23,-18,-22,-14,-9,-3,-20,-20,-4,-14,-14,-24,-26,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-2,-14,-22,-28,51,-22,-38,-22,-28,-20,-4,-24,-22,-22,-2,-18,-26,-26,-30,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-24,12,8,-28,-8,10,-20,4,-26,-12,37,-16,23,4,6,-4,-30,-32,-16,15;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-10,-7,-30,13,-20,-27,-14,-30,-20,-13,49,-14,-20,-6,-14,-30,-26,-30,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-12,25,-24,14,12,-22,-8,6,-24,8,-26,-18,37,-16,6,13,4,-4,-28,-34,-18,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-23,-1,4,-21,-3,-4,-16,-7,-11,-8,7,-16,8,-6,3,-4,-19,-28,-15,6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-24,0,1,-15,-14,-1,-21,18,-24,-12,9,-15,3,9,1,-2,-18,-18,3,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,6,-20,1,-7,-24,26,-9,-27,-11,-30,-20,19,-16,-7,-11,18,0,-22,-33,-24,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-26,23,35,-31,-14,-1,-29,4,-24,-19,6,-5,17,-3,8,-4,-26,-33,-19,26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-18,-22,-17,-2,-26,-18,7,-12,15,6,-18,-24,-15,0,-12,4,12,-24,-6,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-27,-32,-28,-6,-16,-28,29,-26,8,10,-18,-22,-22,-26,-14,-10,22,-22,-8,-28;
MA   /M: SY='G'; M=7,-12,-28,-12,-14,-28,39,-20,-30,-16,-26,-18,-6,4,-16,-20,0,-14,-24,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,0,-38,-30,-4,-38,-30,34,-30,12,12,-20,-24,-22,-30,-18,-10,22,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,0,0,-20,-16,78,-28,-10,-22,-4,10,-18,8,-2,0,-12,-26,-32,12,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-12,-22,-12,-10,-4,-10,-7,-16,-12,-22,-16,-6,-18,-6,-12,12,4,-14,10,11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,50,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,11,-9,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-30,-4,-2,-30,16,-14,-34,22,-30,-14,0,-14,-2,10,-6,-14,-24,-20,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-16,-24,-27,-10,2,-27,8,-20,-3,0,-20,-27,-27,-20,-7,-6,24,-27,-16,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00571;
//
ID   AAA_MP; MATRIX.
AC   MP00674;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AAA-protein family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2330637; R2=0.0150086; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=348; N_SCORE=10.446; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-2,16,-18,4,-4,-16,-5,-1,-13,-7,-18,-11,29,-15,-3,-7,10,3,-17,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-1,-25,-2,13,-31,-4,-4,-22,1,-19,-9,-1,-10,24,-3,4,-3,-22,-23,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-31,-23,24,-29,-20,15,-27,32,14,-24,-28,-24,-20,-24,-9,9,-14,5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-28,-19,7,-28,-17,19,-26,43,22,-26,-28,-15,-18,-27,-10,8,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='T'; M=3,1,-13,-8,-10,-12,-13,-13,-4,-10,-12,-6,6,-16,-9,-11,13,19,1,-32,-13,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-26,3,24,-26,-19,-2,-18,4,-11,-7,-4,-9,23,0,-3,-8,-21,-24,-12,23;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-25,-25,-30,-21,4,-26,-15,18,-21,24,28,-24,-24,-12,-18,-24,-10,8,-4,3,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,64,19,-39,-10,1,-38,1,-30,-28,21,-11,1,-7,0,-10,-30,-39,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-9,-16,-29,56,-17,-37,-16,-28,-18,2,-19,-14,-14,1,-15,-28,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-25,-19,-29,-25,19,-28,-23,18,-24,13,8,-20,-26,-26,-20,-15,-6,20,-16,3,-25;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-17,14,13,-17,-10,-4,-18,1,-15,-13,6,-7,3,-4,4,0,-15,-23,-11,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-19,-1,3,-20,-4,-7,-18,-1,-17,-11,1,-3,3,0,5,1,-15,-23,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-21,4,2,-18,-11,-2,-19,0,-14,-11,8,-16,0,5,3,0,-15,-30,-13,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-26,15,12,-26,-1,-4,-28,1,-24,-18,8,-11,3,-3,4,-3,-24,-25,-16,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-25,9,2,-26,12,-2,-27,-2,-24,-16,17,-15,1,-2,3,-8,-25,-28,-19,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-18,-30,-26,-2,-32,-27,29,-18,11,11,-23,-25,-22,-14,-12,-2,35,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-22,-30,-23,5,-31,-20,23,-17,18,15,-22,-25,-18,-16,-19,-8,20,-18,3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-16,-32,-28,-1,-32,-29,33,-23,12,12,-25,-26,-25,-22,-11,0,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-24,-35,-25,11,-33,-22,31,-27,29,23,-24,-25,-20,-23,-23,-10,19,-17,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=11,-13,-7,-19,-18,-18,20,-18,-19,-16,-13,-3,-8,-19,-15,-19,-1,-9,-11,-23,-20,-16;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-11,-18,-11,-17,-2,-19,-9,-10,-9,-6,-8,-11,-10,-17,10,9,-1,-22,-17,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,36,-19,18,0,-20,0,8,-20,-1,-30,-20,55,-19,0,-1,13,2,-28,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-28,-14,-6,-10,-23,3,-16,11,-9,-3,-2,-21,1,34,-12,-10,-13,-19,-2,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-33,-14,-3,-20,-22,-19,-8,-11,-16,-11,-17,46,-10,-17,-9,-6,-15,-27,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-31,28,22,-28,-14,-3,-30,1,-24,-22,6,-10,7,-5,-3,-10,-28,-11,-12,15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-6,-21,-6,-3,-14,-21,-14,-3,-5,-2,0,-8,-16,-6,-6,-5,0,1,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-24,6,-34,-24,32,-29,36,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-2,-27,3,11,-27,-14,-12,-21,0,-24,-17,-4,23,-1,-8,2,-4,-20,-30,-22,3;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-22,-33,-23,11,-31,-23,25,-29,35,17,-26,-26,-21,-23,-24,-9,15,-18,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-26,-17,-1,-27,-15,11,-11,20,16,-20,-25,-11,3,-19,-7,9,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-5,-29,-3,2,-22,-18,0,-30,26,-21,-12,2,-19,9,60,-7,-9,-20,-22,-11,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-23,-6,0,-17,-12,-11,-12,-5,-17,-12,-11,49,-5,-9,-5,-5,-17,-18,-17,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-18,-6,-12,-18,41,-12,-24,-12,-18,-12,0,-12,-12,-12,0,-12,-18,-12,-18,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-30,-11,-1,-17,-21,1,-28,28,-19,-9,-1,-21,9,65,-11,-10,-19,-17,-5,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-20,-35,-26,37,-28,-20,13,-26,19,11,-22,-27,-28,-20,-19,-9,10,-7,11,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-29,41,19,-32,-13,-4,-29,-1,-23,-20,9,-2,1,-10,-1,-8,-24,-35,-19,10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-13,-4,-15,-23,-10,-9,14,-9,-1,-7,-18,0,22,-10,-6,-4,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-25,-6,6,-23,-21,-1,-20,19,-16,-6,-3,-15,13,23,-7,-8,-15,-23,-9,8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-23,-30,-20,5,-31,-21,23,-20,14,13,-20,-22,-14,-18,-16,-8,17,-18,0,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-9,-25,-10,1,4,-25,6,-6,-8,-1,-2,-9,-20,-3,-8,-12,-8,-11,-7,21,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-15,-36,-30,15,-34,-28,30,-26,13,11,-24,-26,-28,-24,-16,-6,29,-19,1,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-3,-29,1,-1,-28,10,-13,-28,-8,-30,-20,1,20,-7,-13,4,-7,-26,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-24,-17,-11,-5,-24,-7,2,-16,15,6,-13,-10,-8,-10,-17,-9,-5,-23,-5,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-27,-12,-3,-29,-20,-21,-20,-11,-28,-20,-20,76,-11,-21,-9,-10,-27,-31,-30,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,28,-23,34,10,-28,-6,-4,-29,-4,-27,-23,19,-10,-2,-9,9,2,-23,-36,-19,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=7,5,-18,8,2,-19,-10,-9,-15,-8,-14,-13,-1,-10,-5,-13,6,-1,-9,-26,-11,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-21,2,9,-15,-15,-4,-20,4,-16,-11,-1,-10,2,-1,1,0,-15,-22,-9,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-20,-7,6,-25,-8,-9,-18,-1,-15,-9,-3,-10,12,-3,6,3,-14,-23,-16,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00572;
//
ID   SIGMA54_INTERACT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00675;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-54 interaction domain ATP-binding region A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6411729; R2=0.0162433; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=239; N_SCORE=9.513; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-22,-2,6,-16,-14,-1,-18,1,-15,-10,3,-14,6,4,2,-3,-16,-25,-11,5;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-19,-29,-23,0,-26,-24,23,-24,23,13,-25,-26,-20,-21,-17,-7,22,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-21,-15,-24,-18,3,-25,-9,6,-13,9,7,-19,-25,-13,-10,-17,-9,5,-14,10,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-27,15,21,-28,-15,7,-26,8,-22,-15,8,-10,12,7,0,-8,-24,-29,-14,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-23,-14,-5,-4,-24,-10,0,-10,1,2,-8,-19,3,-7,-8,-2,-3,-20,-4,-1;
MA   /M: SY='I'; M=11,-21,-19,-28,-21,-3,-16,-24,13,-21,7,4,-16,-19,-19,-23,-7,-4,13,-19,-8,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-26,1,7,-25,-11,-2,-25,15,-21,-11,0,-13,4,17,-3,-8,-18,-24,-13,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-24,-12,-3,-18,-22,-2,-11,9,-11,0,-6,-18,8,17,-6,-6,-6,-23,-7,0;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-15,-28,-24,0,-24,-25,21,-21,13,9,-23,-25,-23,-20,-10,-3,28,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='A'; M=36,-11,-11,-20,-11,-16,-4,-17,-6,-10,-7,-1,-10,-12,-8,-18,8,1,2,-22,-17,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-28,1,6,-23,-16,-5,-19,6,-16,-7,0,0,7,10,-5,-8,-19,-26,-15,5;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,-15,-11,-10,-7,-9,-13,-12,-14,-11,-10,-3,-15,-9,-13,14,17,-6,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-28,28,14,-31,-10,-3,-31,4,-27,-21,12,-2,5,3,3,-6,-26,-34,-19,8;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-16,-20,-15,-5,-15,-17,4,-17,2,1,-8,-18,-13,-17,2,1,6,-24,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,6,-22,6,-1,-22,-12,-11,-18,-8,-24,-18,8,13,-6,-12,11,12,-17,-34,-20,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-27,31,-24,20,15,-28,-28,-26,-22,-16,-4,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,44,23,-29,-29,-18,-19,-28,-10,11,-19,2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,37,-29,29,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-5,-13,-7,-14,-17,-6,-12,-7,-7,-4,-4,-19,-3,0,0,1,-8,-29,-11,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,23,57,-31,-19,0,-30,9,-21,-20,1,-1,19,0,0,-10,-30,-30,-20,38;
MA   /M: SY='T'; M=4,1,-11,-3,-1,-16,-10,-14,-16,-9,-20,-15,5,-9,-3,-9,28,32,-7,-35,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-10,-11,-11,-10,-18,-20,-6,-11,-10,-9,-3,-13,-11,-11,19,37,6,-32,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-28,24,42,-30,-14,-3,-30,5,-21,-21,4,-4,12,-4,3,-5,-27,-31,-20,27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-13,-24,-14,4,-28,-20,11,-22,26,10,-23,-25,-17,-17,-18,-3,10,-23,-4,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-19,-34,-27,17,-32,-25,26,-26,23,14,-26,-28,-26,-22,-20,-7,25,-18,2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-11,-20,-10,-18,-2,-19,-9,-11,-7,-9,-10,-11,-10,-19,9,0,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-28,-3,5,-24,-18,7,-26,23,-23,-8,5,-16,18,35,-5,-9,-22,-22,-7,9;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-15,-19,-10,-15,-8,-16,-7,-7,-4,-6,-11,-14,-8,-10,3,-2,-1,-20,-13,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-14,-36,-28,1,-36,-28,35,-29,23,16,-23,-25,-21,-27,-21,-9,23,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-29,-3,-2,-13,-21,92,-28,-11,-18,0,8,-21,7,-1,-11,-19,-28,-27,21,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,4,-24,2,4,-16,-12,4,-18,-1,-15,-10,7,-16,5,1,-1,-4,-19,-21,-2,3;
MA   /M: M=-6,-11,-23,-14,-5,-5,-16,-5,-11,-7,-4,-4,-7,-20,-2,-4,-10,-10,-13,-8,-1,-4;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-12,-3,-3,-19,3,-12,-18,-11,-27,-18,7,-12,-3,-11,34,16,-8,-38,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-4,-29,-1,3,-25,-8,-9,-23,0,-21,-15,-4,13,-3,1,-3,-8,-20,-27,-19,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-24,-12,-3,-13,-21,-2,-28,23,-18,-10,-1,-21,5,59,-10,-10,-19,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='A'; M=10,-3,-20,-6,-2,-22,-8,-11,-19,6,-18,-12,0,-13,0,10,5,-1,-11,-24,-16,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-1,4,-24,3,2,-23,1,0,-25,2,-22,-14,6,-14,-1,-2,3,-5,-19,-27,-13,0;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-27,-7,-3,-25,4,-10,-26,13,-22,-10,1,-12,1,13,-5,-11,-20,-22,-17,-2;
MA   /M: SY='P'; M=0,-15,-31,-12,-3,-21,-16,-17,-16,-8,-20,-14,-13,47,-10,-15,-6,-7,-20,-26,-22,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00579;
//
ID   SIGMA54_INTERACT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00676;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-54 interaction domain ATP-binding region B signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4044414; R2=0.0156537; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=305; N_SCORE=10.169; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-29,1,0,-30,42,-15,-36,-12,-27,-20,1,-15,-10,-15,1,-16,-28,-23,-27,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-4,-23,-3,-6,-3,-23,39,-15,-12,-11,-3,-2,-22,-6,-8,-10,-12,-11,-22,14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-7,-22,-6,8,-15,-23,-13,-2,-2,-4,-1,-10,-15,-3,-7,-7,-6,2,-27,-12,2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,1,9,-23,-6,-8,-28,19,-25,-14,3,-9,3,14,-2,-8,-22,-24,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-4,-11,-28,49,-14,-35,-15,-30,-20,9,-16,-14,-16,4,-14,-29,-25,-27,-13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-14,-15,-10,-17,-8,-19,-3,-13,-7,-7,-9,-13,-11,-19,7,0,3,-24,-16,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-31,-21,51,-28,-15,-2,-22,8,0,-19,-21,-28,-13,-19,-10,-4,2,22,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-12,-8,-7,-13,-14,-18,-13,-10,-13,-12,1,-10,-8,-10,20,41,-4,-30,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-30,0,-12,-30,46,-9,-38,-11,-28,-19,3,-19,-13,-8,-2,-18,-29,-23,-24,-13;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-14,-12,-6,-18,-6,-16,-9,-10,-6,-8,-6,-13,-9,-17,4,-2,-2,-23,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-2,-8,-13,-9,-8,-12,-9,-11,-5,-6,-7,-3,-6,-9,-5,-7,-2,-2,-2,-19,-8,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,0,15,-21,-14,-6,-21,5,-13,-11,-1,-9,6,8,-2,-3,-18,-26,-15,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-22,7,7,-24,-6,-1,-20,1,-18,-11,10,-13,9,3,3,-5,-19,-27,-15,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-25,-8,0,-22,-18,6,-27,22,-21,-9,0,-17,7,38,-6,-8,-18,-22,-8,1;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-25,-2,4,-21,-18,-11,-14,3,-9,-7,-6,-6,2,0,-5,-5,-12,-25,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-22,-9,-7,-6,-22,-7,-13,2,0,-4,-9,-22,-5,17,-14,-9,-10,-17,0,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-19,-36,-28,38,-31,-23,16,-28,18,8,-23,-28,-31,-21,-19,-8,15,-8,11,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-29,14,48,-31,-20,2,-27,10,-20,-15,0,-3,27,3,0,-9,-28,-28,-18,37;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-9,-25,-9,8,-19,-20,-4,-12,1,-4,-3,-8,-12,11,7,-7,-8,-13,-23,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,27,-25,24,9,-28,-9,19,-26,-1,-26,-16,29,-15,10,-2,4,-6,-28,-35,-13,9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-6,-13,-29,51,-16,-37,-9,-29,-19,4,-18,-14,-12,0,-16,-28,-22,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-14,-15,-13,-9,-22,-20,0,-14,-6,-4,-3,-12,-11,-14,14,35,5,-29,-9,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,26,-28,40,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28,68,-30,-18,3,-29,14,3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,1,7,29,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,8,-31,-20,23,-29,45,22,-28,-28,-19,-21,-28,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,54,-30,-20,-1,-30,15,-21,-19,0,-1,19,4,-1,-10,-29,-29,-19,36;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,46,-29,20,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-24,8,1,-29,24,-8,-32,-11,-25,-19,4,-15,-8,-15,0,-13,-25,-27,-23,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-27,20,25,-23,-17,-1,-27,8,-21,-18,3,-9,7,1,1,-4,-23,-24,-6,15;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-21,-31,-21,5,-27,-14,23,-21,29,33,-23,-23,-12,-17,-21,-8,13,-20,0,-17;
MA   /M: SY='P'; M=8,-8,-24,-6,-3,-25,-8,-17,-18,-10,-24,-17,-7,32,-8,-17,7,2,-17,-30,-24,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-26,-19,-9,-12,-22,-15,-3,-9,4,2,-19,8,-8,-2,-15,-9,-6,-24,-13,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-22,3,13,-21,-14,-6,-16,0,-14,-5,-1,-7,4,-1,3,-1,-14,-29,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-18,-24,-16,5,-19,-17,8,-21,18,12,-18,-22,-15,-17,-11,-1,6,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-30,2,24,-39,-20,9,-21,10,-20,-2,0,-9,56,9,0,-10,-30,-21,-11,40;
MA   /M: SY='A'; M=20,-1,-14,-8,-5,-18,-7,-14,-10,-8,-15,-12,3,-10,-7,-13,12,6,-3,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-26,-7,2,-24,-17,-8,-24,31,-21,-6,-2,-13,6,30,-7,-7,-15,-21,-11,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-18,-27,-18,6,-26,-19,16,-27,39,16,-25,-28,-18,-19,-21,-6,9,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,11,-31,-21,23,-30,44,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,13,-19,1,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-9,1,-20,-20,0,-25,22,-18,-8,-1,-18,13,50,-6,-3,-19,-19,-6,3;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-14,-28,-24,7,-25,-24,14,-15,4,4,-22,-26,-24,-10,-8,-1,27,-22,-5,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00579;
//
ID   DAO_MP; MATRIX.
AC   MP00677;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-amino acid oxidases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9609065; R2=0.0133715; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=841; N_SCORE=16.196; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,8,-30,14,-8,-33,46,-14,-40,-14,-30,-23,6,-17,-14,-17,0,-17,-30,-26,-27,-11;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='P'; M=14,-20,-21,-19,-12,-18,-16,-23,-2,-13,-11,-8,-20,20,-16,-20,-3,-4,4,-27,-21,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-7,-30,-6,8,-21,-20,0,-30,27,-20,-11,0,-17,11,61,-9,-10,-21,-21,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=8,-25,-16,-29,-21,-1,-24,-24,18,-22,21,10,-24,-24,-20,-21,-14,-5,20,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-27,6,33,-31,-17,-1,-25,13,-20,-12,-1,-5,26,4,0,-9,-25,-25,-16,29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-27,-3,10,-23,-21,-11,-22,30,-16,-7,-4,-12,5,17,-9,-5,-15,-22,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-30,11,41,-30,-20,0,-29,18,-21,-15,0,-5,22,14,-3,-10,-27,-26,-16,31;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-11,-26,-14,-4,-17,-26,-14,-3,9,-4,2,-9,-15,4,3,-10,-3,-4,-21,-6,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-19,-21,-14,0,-23,-15,11,-16,21,9,-16,-21,-11,-7,-14,-5,5,-20,-4,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=4,-6,-11,-7,0,-10,-11,5,-4,-6,-5,-2,-6,-10,-4,-7,-2,-4,2,-17,-5,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-15,-10,-6,0,-3,-7,-12,-2,-8,-5,-3,-12,-3,5,-2,0,-9,-9,-3,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-18,6,2,-23,0,-8,-21,-7,-25,-17,4,4,2,-9,17,4,-17,-30,-19,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-23,6,5,-26,-1,-5,-26,12,-24,-12,4,-11,10,9,3,-6,-20,-23,-14,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-23,7,13,-23,-17,-8,-20,8,-19,-14,0,-12,3,9,3,0,-11,-30,-15,7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-19,-25,-23,10,-15,-18,6,-21,11,4,-20,-26,-23,-18,-12,-2,11,-14,5,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-27,-16,-4,-2,-21,-16,-11,-11,-11,-5,-14,9,-10,-13,-7,3,-14,-3,-5,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-31,-29,1,-31,-29,31,-22,16,12,-29,-29,-28,-21,-14,-2,43,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,22,-21,9,-1,-20,-6,31,-21,-4,-25,-13,37,-19,1,-3,4,-6,-26,-35,-9,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-5,-26,-8,-5,-7,-19,68,-23,-13,-15,-1,3,-20,1,-5,-9,-16,-22,-23,16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=10,-6,-20,-8,-11,-25,35,-16,-29,-15,-27,-19,2,-15,-11,-16,16,-3,-19,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,36,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,19,-1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-24,-10,-14,-12,10,-8,-19,-11,-19,-14,4,-20,-11,-14,-2,-10,-19,2,-2,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-26,-31,-25,32,-32,-7,15,-22,14,8,-21,-28,-21,-19,-21,-10,5,6,38,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-1,-18,-5,3,-24,-15,-7,-15,-2,-17,-8,1,-10,18,-3,15,18,-13,-27,-12,11;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,-21,-21,-15,-9,-14,-16,8,-18,8,9,-15,-21,-7,-15,-8,-5,7,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-2,-22,-2,-5,-22,9,29,-29,-12,-26,-12,8,-16,-1,-9,11,-5,-22,-31,-7,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26,17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,106,48,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=5,-9,22,-17,-15,-14,-16,-18,-13,-15,-12,-5,-7,-19,-12,-16,9,14,-3,-34,-17,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-8,-24,-5,3,-10,-25,-12,4,-12,9,8,-13,-17,-6,-14,-14,-9,2,-26,-9,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,17,-29,24,41,-29,-16,13,-30,5,-22,-19,11,-6,14,-1,0,-10,-30,-32,-15,27;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,0,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-10,-20,-15,-12,-13,-22,0,-12,-5,-5,-12,-15,-15,-17,8,14,12,-25,-15,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-26,1,6,-26,-14,13,-25,13,-24,-9,11,-15,19,21,2,-6,-24,-27,-9,11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-30,-21,12,-31,-16,21,-27,40,17,-27,-29,-19,-20,-27,-10,10,-13,11,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-11,-31,-30,11,-30,-29,26,-21,10,9,-29,-30,-31,-20,-11,-1,43,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-26,14,8,-24,-3,-6,-23,-1,-15,-10,6,-14,-1,-6,-2,-8,-19,-29,-16,3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-28,13,26,-27,-19,-5,-29,19,-23,-16,2,-8,10,15,-2,-3,-22,-27,-15,17;
MA   /M: SY='C'; M=14,-20,17,-28,-21,-11,-20,-25,2,-21,1,-2,-18,-23,-20,-24,-6,-5,9,-28,-16,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-27,-21,8,-18,-22,10,-25,17,6,-23,-14,-23,-21,-19,-10,7,-19,-5,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-26,-3,8,-23,-10,9,-20,0,-13,-5,-2,-14,12,-1,-4,-4,-20,-24,-8,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=0,0,-19,2,6,-19,-13,-8,-17,5,-14,-11,-2,-12,0,11,0,-2,-9,-23,-13,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=3,-18,-23,-19,-11,-6,-20,-13,-2,-8,7,1,-18,-6,-11,-12,-14,-8,-5,-15,0,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00573;
//
ID   WD_REPEATS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00678;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Trp-Asp (WD) repeats signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; TOPOLOGY=CIRCULAR; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6920; R2=0.02636350; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=199; N_SCORE=7.933; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=144; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;
MA   /I: B1=0; E1=0; IM=-10; MI=-10; I=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-20,-21,-14,6,-23,-12,4,-18,10,4,-15,-20,-14,-14,-14,-6,1,-16,3,-15;
MA   /M: M=-5,-2,-21,-2,0,-17,-13,-6,-16,-1,-15,-9,0,-11,0,-1,0,-1,-13,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-22,-6,-7,-22,18,-12,-24,-10,-20,-13,-1,-14,-9,-12,2,-7,-17,-24,-19,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-27,0,0,-19,-16,57,-25,-7,-19,-5,6,-15,5,-2,-6,-13,-24,-27,8,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-21,0,3,-20,-11,-8,-18,0,-17,-11,2,-9,1,-1,4,3,-14,-28,-13,1;
MA   /M: SY='B'; M=-2,4,-21,4,1,-22,-1,-6,-22,-3,-20,-13,4,-13,-1,-6,3,-4,-17,-27,-15,-1;
MA   /M: M=-2,-7,-23,-7,-3,-16,-9,-11,-16,-6,-17,-12,-5,-5,-5,-7,-1,-3,-14,-17,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-12,-30,-26,-1,-29,-26,25,-21,11,9,-23,-25,-23,-21,-12,-3,30,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-17,-10,-9,-7,-16,-8,-11,-7,-10,-7,0,-19,-7,-4,-1,4,-9,-16,-4,-8;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,0,-4,-6,-19,-7,-12,-20,-10,-19,-14,-1,-17,-7,-11,8,2,-11,-31,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-10,-29,-23,2,-27,-23,18,-23,17,11,-23,-26,-21,-20,-14,-5,20,-24,-6,-23;
MA   /M: SY='A'; M=5,-1,-15,-3,-2,-20,-11,-10,-17,-2,-16,-11,-2,-14,-2,-4,4,-1,-10,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-24,-31,-24,25,-24,-19,0,-22,1,-2,-22,-25,-23,-18,-19,-11,-3,25,16,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-16,1,-3,-17,-9,3,-17,-8,-18,-12,8,-15,-3,-8,9,2,-14,-31,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-28,-3,1,-23,-12,-8,-20,-4,-22,-15,-5,24,-3,-8,-2,-6,-21,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-22,16,4,-21,-10,-2,-22,-3,-20,-16,10,-12,-2,-6,3,-1,-18,-30,-13,1;
MA   /I: I=-12; MI=-15; MD=-25; IM=-15; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-19,-1,-3,-19,13,-8,-20,-7,-18,-12,2,-8,-5,-8,2,-6,-16,-21,-15,-4; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-20,-1,0,-17,-9,-4,-17,0,-16,-10,4,-8,1,1,1,-2,-15,-22,-10,0; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-21,-18,-13,1,-23,-7,0,-10,3,2,-12,-22,-9,-6,-12,-5,-1,-11,6,-12; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-31,-23,13,-29,-21,19,-25,23,13,-23,-26,-22,-20,-19,-7,15,-16,2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,-13,-27,-21,0,-19,-21,10,-20,8,4,-19,-22,-19,-20,-8,-3,14,-19,-6,-20;
MA   /M: SY='T'; M=8,-6,-8,-10,-9,-13,-9,-15,-11,-12,-15,-11,-1,-13,-9,-13,20,21,-1,-32,-15,-9;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-9,-14,-16,-21,22,-20,-22,-16,-19,-14,-5,-18,-16,-18,6,-5,-11,-26,-23,-16;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-13,-5,-8,-19,11,-12,-23,-13,-23,-16,2,-15,-8,-14,16,3,-14,-29,-17,-8;
MA   /M: M=-4,-2,-21,-2,-1,-16,-10,-7,-17,-4,-14,-9,-2,-14,-3,-4,-1,-4,-14,-18,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-28,52,16,-35,-8,0,-35,0,-28,-26,19,-11,1,-8,2,-7,-27,-37,-19,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-22,-4,-6,-22,11,-5,-27,-1,-23,-13,6,-16,-4,1,1,-8,-22,-24,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-17,-6,-4,-14,-16,-8,-11,-4,-12,-7,0,-15,-2,-4,6,11,-7,-27,-9,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-14,-32,-25,0,-30,-26,27,-24,17,12,-23,-24,-22,-23,-15,-5,26,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-23,-10,-3,-15,-19,-5,-16,13,-14,-5,-3,-17,2,18,-7,-6,-12,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-18,-31,-24,6,-30,-22,23,-24,19,13,-23,-26,-21,-20,-17,-6,22,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-35,-42,-36,-28,17,-22,-21,-13,-20,-12,-14,-34,-29,-20,-18,-33,-24,-22,109,32,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,32,12,-29,-9,-1,-29,2,-26,-21,16,-11,3,-3,4,-4,-24,-34,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-20,-19,-24,-18,0,-23,-18,9,-18,10,6,-18,-18,-16,-16,-12,-3,8,-17,-3,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,1,-23,1,4,-20,-13,-5,-19,3,-17,-11,2,-9,3,5,1,-2,-15,-26,-13,2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-19,0,0,-18,-10,-8,-18,-2,-18,-12,5,-11,-1,-3,8,8,-13,-28,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-23,-5,-5,-19,4,-10,-20,-7,-17,-10,-1,-11,-6,-7,-1,-7,-17,-23,-15,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-22,0,6,-21,-13,-6,-19,4,-18,-11,1,-10,4,3,1,-2,-16,-25,-12,4;
MA   /M: M=-6,-9,-10,-11,-5,-14,-18,-11,-11,-7,-9,-6,-8,-11,-6,-6,-6,-4,-9,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-20,-15,-9,-9,-21,-15,2,-11,1,1,-11,-14,-9,-10,-7,-2,3,-24,-9,-10;
MA   /M: M=-6,-8,-21,-9,-5,-13,-15,-3,-12,-3,-10,-4,-5,-15,-2,-1,-5,-5,-10,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-18,-8,-4,-13,-17,-11,-9,-5,-10,-6,-4,-13,-4,-5,2,5,-4,-26,-10,-5;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00574;
//
ID   BETA_AMYLASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00679;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-amylase active site 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2252445; R2=0.0124389; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=853; N_SCORE=14.826; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=183; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,67,-30,-20,4,-30,17,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-18,-20,-14,-4,-20,-18,10,-22,13,4,-13,-20,-12,-18,-1,2,6,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-4,12,-22,18,17,-28,-10,-6,-28,9,-28,-20,8,-8,6,1,13,2,-20,-34,-18,12;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-18,-20,-14,0,-12,-4,-6,-10,-6,-6,-14,-18,-10,-16,-2,-4,-4,0,19,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-8,-30,35,-16,-36,7,-30,-16,0,-16,-8,0,-4,-16,-26,-20,-22,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-12,-22,-12,-19,-9,-29,-23,22,-19,5,5,-15,-22,-19,-22,-12,-6,25,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,14,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,20,30,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-30,43,16,-36,-14,-4,-36,20,-30,-22,12,-10,4,6,-4,-10,-26,-32,-16,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-2,-30,4,29,-7,-24,8,-18,2,-12,-12,-8,-12,8,-4,-8,-10,-22,-7,19,17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,43,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,16,-4,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-20,7,-22,-22,-12,9,-22,-14,-26,3,-4,-16,-28,-22,-22,-14,-14,-10,-27,-18,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=3,-18,-33,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,68,-10,-20,-6,-8,-23,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,3,-32,2,0,-26,-12,-8,-20,-6,-30,-20,11,47,-6,-12,-2,-6,-30,-34,-26,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-34,1,21,-34,-20,-4,-22,2,-24,-12,-8,31,24,-4,-4,-10,-30,-26,-20,20;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,12,-32,-20,45,-24,2,-20,0,4,-14,40,6,-4,-14,-30,-24,2,24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,14,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,20,30,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-22,-26,-26,-18,-8,-30,-18,15,-5,2,6,-14,-22,-10,11,-14,-8,15,-22,-6,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-22,12,37,-26,-12,-4,-26,2,-24,-20,4,-4,12,-4,16,2,-22,-34,-20,24;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,53,-30,-20,8,-30,26,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-2,18,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00414;
//
ID   MAP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00680;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Methionine aminopeptidase subfamily 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5422997; R2=0.0159125; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=677; N_SCORE=16.305; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-27,-36,-27,0,-37,-24,40,-27,19,17,-20,-21,-19,-26,-18,-7,27,-22,-1,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-28,6,28,-30,-19,14,-23,6,-20,-9,3,-9,32,3,1,-7,-27,-24,-8,29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-22,12,11,-25,-7,-5,-25,5,-25,-17,14,-11,3,0,9,2,-20,-31,-18,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-18,-17,-15,10,-25,19,-7,-12,-4,-2,-12,-25,-9,-9,-11,-5,-9,1,40,-15;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-14,-26,-19,-6,-15,-24,8,-16,0,-1,-16,-17,-18,-21,0,-1,15,-21,-12,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-24,11,27,-26,-17,-6,-25,10,-20,-16,4,-6,10,1,3,2,-21,-28,-16,19;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-24,-2,8,-24,-12,-8,-23,13,-23,-12,2,-2,4,9,2,-3,-18,-26,-16,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-4,-25,-8,-3,3,-20,10,-16,0,-14,-7,3,-19,0,4,-5,-6,-17,-12,12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-29,-3,-11,-29,44,-13,-35,-8,-29,-18,6,-18,-9,-9,0,-14,-28,-23,-25,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-20,-33,-26,55,-30,-7,2,-23,7,1,-20,-30,-28,-17,-20,-10,-2,13,43,-26;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-16,-4,-7,-15,4,-11,-18,-9,-24,-16,7,-15,-7,-10,21,9,-10,-31,-15,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-15,-29,-26,-2,-30,-28,26,-21,10,9,-27,-19,-26,-21,-11,0,37,-28,-10,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-30,-28,0,-31,-29,29,-22,14,11,-29,-26,-27,-21,-13,-2,42,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-30,-1,7,-21,-20,-3,-27,27,-19,-10,-1,-16,8,42,-10,-10,-20,-20,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-27,21,24,-31,-10,-2,-30,4,-23,-18,6,-9,14,2,3,-5,-26,-30,-18,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25,52,-30,1,1,-19,5,2,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,19,54,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-18,37,-23,-25,-14,-13,-27,-11,-22,-11,-10,-16,-29,-25,-22,-3,2,6,-36,-21,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-6,-35,-30,-2,-35,-30,34,-26,12,12,-24,-26,-25,-26,-15,-6,34,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-8,-18,-29,62,-14,-38,-19,-30,-19,3,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-27,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-11,-2,-15,-23,-10,-9,7,-10,-4,-6,-12,3,13,-7,-4,-8,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-7,-22,-8,0,-16,-15,-13,-12,6,-10,-6,-6,-15,-3,0,-5,-4,-6,-23,-11,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-35,-26,41,-29,-21,10,-26,14,7,-23,-20,-30,-20,-19,-9,9,-6,12,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-8,9,31,-26,-18,-6,-26,1,-20,-18,1,-8,9,-6,3,-2,-23,-33,-20,20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,18,-26,25,28,-30,-8,-4,-30,2,-24,-21,9,-4,6,-6,4,-7,-26,-32,-21,17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-27,-21,-20,-17,-12,-24,-17,-21,80,-11,-20,-12,-10,-27,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-23,-7,0,-7,-20,2,-6,-8,-7,-3,0,-19,4,-7,-4,-5,-10,-20,1,2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-23,-30,-19,-10,-9,-23,-18,-4,-18,2,-4,-23,33,-15,-20,-17,-10,-12,-22,-12,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-16,17,-26,9,0,-20,-11,61,-26,-6,-24,-9,32,-20,6,0,-1,-11,-30,-34,3,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-28,-19,-19,24,-27,18,-2,-12,-2,-1,-15,-29,-12,-10,-18,-10,-8,19,59,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-24,-5,-9,-18,9,-10,-22,-3,-15,-11,-2,-18,-8,3,-3,-10,-15,-20,-12,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-20,-1,5,-22,-15,-1,-21,10,-22,-12,8,-7,4,8,-1,-4,-20,-26,-12,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-29,9,3,-25,-10,-5,-25,9,-27,-17,10,8,0,6,-2,-7,-25,-28,-16,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-20,6,5,-24,7,-10,-30,4,-25,-17,5,-14,-3,-1,-1,-10,-23,-26,-19,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=5,-9,-16,-12,-8,-13,-7,-15,-10,-4,-12,-8,-5,-11,-7,-6,5,5,-3,-23,-13,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-26,-3,-6,-24,18,-9,-25,-4,-25,-14,9,-10,-8,-8,1,-8,-20,-27,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-23,-17,-12,-13,-10,-20,0,-14,-6,-4,-14,4,-14,-17,-6,-2,1,-23,-15,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-26,-16,-10,-13,-24,-14,-1,4,-5,-1,-7,-13,-6,13,-11,-6,0,-24,-10,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-19,-28,-19,6,-25,-15,16,-23,32,25,-23,-25,-14,-17,-20,-7,8,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-25,-8,3,-24,-13,-8,-17,14,-16,-5,-5,-15,10,13,-5,-6,-12,-22,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-33,-5,9,-27,-18,-12,-20,-5,-23,-16,-12,47,0,-12,-4,-8,-25,-29,-23,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-7,-16,-29,57,-17,-37,-13,-30,-19,5,-19,-16,-15,0,-17,-29,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-22,-26,-15,-6,-21,3,16,-9,14,48,-16,-19,6,-9,-17,-10,5,-20,0,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-14,-22,-20,-4,-27,-25,12,-12,1,2,-16,-20,-19,-13,-1,14,23,-27,-8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00575;
//
ID   CHAPERONINS_CPN10_MP; MATRIX.
AC   MP00681;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins cpn10 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9940567; R2=0.0124267; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=363; N_SCORE=8.495; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-21,-31,-21,0,-21,-2,22,-12,21,56,-20,-20,-2,-11,-20,-10,11,-20,0,-11;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=2,-6,-11,-10,-7,-3,-9,-6,-2,-3,-4,3,-3,-10,-4,-5,0,1,0,-12,-2,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-10,-10,-13,-9,-3,-13,-7,8,-2,4,15,-10,-11,-4,-4,-7,-3,9,-12,-2,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-5,3,-21,-4,-4,-16,-13,-4,-10,5,-13,4,8,-15,1,3,1,0,-10,-28,-11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-35,-26,14,-34,-24,30,-29,29,17,-24,-26,-23,-24,-23,-9,20,-16,4,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-29,-7,3,-24,-22,-8,-21,32,-20,-6,-3,-14,9,32,-10,-8,-14,-21,-9,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-31,-21,23,-29,44,19,-28,-28,-20,-21,-27,-8,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-28,-7,-7,-17,22,11,-28,-14,-20,-11,2,-19,-8,-12,-4,-16,-25,-21,-9,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,58,24,-37,-10,1,-37,1,-29,-28,21,-10,3,-8,1,-9,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,15,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,7,-32,-25,29,-27,29,16,-27,-27,-23,-23,-21,-7,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,33,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,3,20,-30,-20,-4,-28,32,-25,-11,0,-9,19,25,-6,-9,-23,-22,-12,19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-27,-15,-7,-14,-23,-7,-11,6,-12,-4,-10,-4,-2,21,-10,-8,-6,-23,-10,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-10,-21,-12,-4,-14,-19,-14,2,-4,-2,1,-9,-15,-2,-7,-6,-5,2,-22,-9,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-29,14,37,-29,-19,-3,-25,12,-20,-15,0,-3,16,2,-2,-9,-23,-28,-17,26;
MA   /M: SY='E'; M=8,-2,-20,-2,14,-24,-12,-9,-16,2,-17,-11,-3,-9,6,-5,5,-3,-11,-27,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-29,18,44,-30,-19,-2,-29,11,-22,-18,1,0,17,2,-1,-8,-28,-29,-19,30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-22,6,26,-24,-16,-5,-22,4,-18,-15,3,-6,11,0,7,6,-19,-28,-16,18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-23,-4,7,-24,-20,-10,-19,22,-19,-6,-3,-12,9,13,-3,1,-12,-24,-11,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-10,-8,-7,-13,-14,-17,-12,-8,-14,-11,1,-10,-7,-9,21,37,-3,-30,-12,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-19,-12,-1,-20,-15,-14,-10,6,-13,-6,-9,-11,-4,-3,-1,-4,-1,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-23,-6,-13,-26,45,-16,-33,-16,-30,-20,4,-16,-13,-16,15,-5,-23,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-29,66,-20,-39,-19,-30,-20,0,-20,-19,-19,0,-19,-30,-19,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-38,-28,11,-37,-27,39,-30,24,18,-22,-23,-22,-27,-22,-10,23,-17,3,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-18,-31,-27,8,-32,-22,27,-22,17,13,-26,-28,-24,-20,-17,-5,31,-18,5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-25,-10,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='P'; M=3,-13,-27,-12,-4,-24,-16,-19,-16,-10,-22,-16,-13,48,-9,-18,1,5,-18,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-28,33,15,-33,9,-6,-36,-4,-28,-24,11,-11,-1,-10,5,-9,-28,-33,-22,7;
MA   /M: SY='S'; M=5,5,-15,-2,-2,-19,-9,-10,-17,0,-22,-14,11,-12,-1,-4,19,18,-11,-32,-16,-1;
MA   /M: SY='A'; M=36,-7,-11,-14,-8,-20,2,-15,-14,-10,-16,-13,-3,-11,-8,-17,16,4,-4,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-24,-5,4,-26,-17,-6,-22,25,-23,-8,-2,-12,10,16,-2,-4,-14,-23,-11,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-27,16,42,-28,-15,-2,-27,8,-20,-17,3,-4,16,0,1,-7,-26,-28,-18,29; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-28,-1,9,-28,-18,-10,-28,41,-27,-11,-1,-10,8,24,-6,-6,-18,-21,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-28,-6,-2,-23,-17,-17,-16,-9,-20,-14,-10,38,-7,-14,2,3,-17,-31,-21,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,5,-23,0,5,-24,-16,-2,-16,5,-16,-4,7,-13,17,3,3,3,-17,-27,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-26,-1,17,-22,-20,-5,-18,10,-16,-7,-3,-11,13,13,-1,-2,-16,-25,-12,14;
MA   /M: SY='G'; M=13,-8,-24,-11,-16,-27,48,-19,-31,-16,-25,-17,0,-17,-16,-19,3,-14,-22,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,0,21,-22,-22,-10,-15,9,-15,-10,-4,-9,6,2,-1,1,-11,-27,-14,13;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-13,-31,-29,-1,-30,-30,31,-21,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,45,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-30,-22,-1,-32,-26,30,-22,17,12,-24,-24,-21,-21,-15,-5,30,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00576;
//
ID   ZP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00682;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ZP domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4473581; R2=0.0149844; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=472; N_SCORE=12.510; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=10,-14,-18,-16,-11,-16,-15,-21,-5,-12,-13,-9,-13,12,-13,-17,6,9,2,-29,-19,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-7,-27,-3,7,-11,-19,-2,-12,-3,-12,-8,-10,-3,-3,-9,-8,-8,-11,-16,4,0;
MA   /M: SY='K'; M=-6,7,-24,7,10,-27,-11,-6,-26,14,-25,-15,7,-11,9,10,6,0,-20,-28,-15,9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,11,15,-29,-1,-5,-26,-2,-21,-14,2,-6,10,-5,3,-8,-24,-29,-19,12;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-9,-22,-10,-11,-7,0,-4,-16,-10,-17,-12,-5,-14,-8,-11,5,0,-13,-11,10,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-32,-10,0,-25,-18,-19,-15,-8,-24,-16,-16,55,-9,-17,-4,-6,-18,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-23,-16,-28,-24,18,-28,-20,12,-21,11,5,-21,-26,-24,-18,-10,4,18,-14,8,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-15,-24,-21,11,-25,-18,12,-18,3,4,-20,-25,-22,-16,-5,1,22,-19,4,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-17,-17,-12,-5,-22,-14,4,-1,9,5,-16,-21,-10,6,-14,-6,9,-19,-6,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-16,5,7,-18,-9,4,-16,-2,-15,-10,2,-1,5,-5,5,0,-14,-21,-9,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-10,-12,-11,-4,-3,-17,-12,2,-11,10,2,-11,-13,-8,-10,-5,6,4,-18,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-17,7,7,-18,7,-3,-20,-1,-19,-14,12,-9,0,-1,5,-4,-18,-21,-15,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,14,-25,20,19,-32,-7,-2,-27,1,-24,-17,7,-9,16,-5,7,-5,-25,-31,-18,18;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-8,-28,-6,-7,-12,-21,-3,-9,-11,-13,-7,-7,13,-11,-12,-9,-9,-9,-27,-11,-11;
MA   /M: SY='I'; M=2,-27,-19,-31,-23,0,-28,-25,25,-25,24,13,-24,-24,-20,-23,-17,-7,21,-22,-5,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-29,-18,-17,26,-28,30,-5,-12,-3,0,-15,-28,-9,-9,-18,-12,-13,18,65,-17;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-14,-29,-24,1,-27,-24,23,-22,21,15,-27,-27,-23,-19,-15,-4,30,-25,-7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-30,6,23,-33,8,-4,-31,0,-23,-15,0,-9,18,-4,0,-13,-30,-24,-20,21;
MA   /M: SY='V'; M=18,-21,-10,-25,-21,-8,-19,-26,13,-16,1,1,-21,-21,-21,-19,-1,4,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-24,-3,14,-15,-18,-6,-15,2,-13,-6,-3,-11,6,5,3,-2,-14,-26,-11,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-17,-31,-26,1,-29,-26,28,-24,21,13,-26,-26,-24,-22,-15,-5,31,-24,-6,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-8,5,-20,2,1,-17,-18,-1,-14,-2,-12,-8,6,-15,1,-4,2,9,-11,-29,-8,1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-30,-7,-6,-26,16,1,-34,8,-25,-13,1,-18,-1,20,-6,-15,-25,-21,-15,-6;
MA   /M: SY='S'; M=10,-3,-16,-8,-9,-17,4,-15,-16,-12,-14,-12,1,-14,-9,-13,13,10,-9,-28,-18,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-18,35,-27,49,15,-32,-11,17,-34,-1,-25,-22,17,-11,2,-7,-1,-10,-27,-34,-11,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-11,-11,-6,-9,-12,-10,0,-9,0,1,-7,-12,-1,-8,2,5,1,-18,-7,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-5,-17,-2,-1,-15,-9,-10,-10,-6,-16,-11,-4,24,-5,-10,4,1,-11,-21,-14,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,2,-26,2,3,-21,-12,2,-23,3,-24,-15,8,1,1,11,2,-4,-21,-29,-14,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-21,-34,-24,27,-31,-21,19,-30,36,15,-26,-29,-25,-21,-26,-10,10,-12,8,-24;
MA   /M: SY='K'; M=0,-7,-24,-10,-6,-21,-3,-14,-16,7,-16,-8,-3,-16,-4,5,-4,-7,-9,-23,-15,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,17,-30,-21,19,-29,42,17,-29,-30,-23,-20,-27,-9,13,-18,2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-25,-16,-30,-23,20,-25,-19,10,-21,15,8,-22,-26,-24,-15,-14,-4,15,-15,3,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-31,-24,5,-30,-22,26,-26,33,21,-28,-28,-21,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-26,31,11,-30,-13,13,-29,1,-25,-18,19,-13,8,0,2,-3,-26,-34,-12,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-23,11,4,-23,-13,11,-22,1,-22,-12,18,-14,9,1,6,5,-22,-30,-9,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-32,-32,-33,-28,19,-26,-18,0,-19,-4,-5,-31,-30,-23,-18,-25,-15,-1,60,30,-24;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-13,-21,-12,-18,-2,-21,-5,-13,-7,-7,-11,-9,-11,-21,6,-2,1,-20,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-8,-8,-13,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,24,41,-2,-32,-13,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-35,-11,-2,-25,-19,-19,-16,-12,-23,-16,-18,69,-10,-19,-7,-6,-24,-30,-26,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-16,-8,-8,-7,-8,-4,-15,-10,-18,-12,0,-15,-6,-9,17,18,-9,-22,2,-8;
MA   /M: SY='P'; M=3,-8,-23,-7,2,-22,-9,-12,-18,-3,-21,-10,-5,13,-2,-7,8,2,-15,-29,-20,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,41,-25,44,12,-31,-5,3,-31,0,-30,-25,33,-14,1,-6,6,-5,-29,-39,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-31,-3,0,-20,-16,-11,-21,-3,-24,-16,-9,26,-1,-7,-3,-7,-23,-18,-13,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-19,-3,-9,4,-14,-9,-11,-12,-7,-7,6,-18,-12,-12,-1,2,-10,-22,-5,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,9,2,-18,-12,-3,-20,-3,-18,-15,3,-14,0,-1,8,4,-15,-25,-5,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-12,-23,-13,-3,-14,-18,-10,-7,-6,-9,1,-9,1,5,-8,0,-1,-9,-25,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-22,-26,-17,-10,-13,-22,-20,-1,-17,-2,-4,-21,25,-15,-19,-9,-5,-3,-29,-17,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,2,-28,2,8,-25,-20,15,-22,10,-20,-6,1,-14,23,10,-3,-5,-23,-20,1,14;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-25,-38,-25,-21,14,-24,14,-13,-14,-11,-8,-23,-28,-11,-12,-26,-20,-21,68,50,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-4,-24,-6,-6,2,-20,-13,-14,-10,-14,-11,-3,5,-9,-11,-3,3,-14,-21,-6,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-28,2,-37,-27,42,-29,26,20,-22,-22,-20,-27,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,40,-27,23,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-23,7,8,-21,-18,-5,-15,3,-14,-6,1,-15,5,7,-1,-3,-10,-29,-14,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-26,24,6,-28,-5,16,-30,4,-28,-18,22,-15,2,0,3,-7,-26,-34,-12,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-28,-13,-18,-25,45,-19,-28,-16,-24,-15,-1,-19,-16,-12,0,-15,-21,-22,-24,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-29,-12,0,-20,-21,-17,-8,-11,-9,-8,-18,33,-6,-16,-9,-8,-13,-27,-20,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-2,-15,-6,-7,7,-12,7,-7,-4,-7,-5,3,-15,-5,-1,-3,-1,-9,-3,17,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,1,-11,-1,2,-10,-10,-5,-6,1,-6,-4,1,-7,3,-1,1,3,-6,-14,-6,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-22,-12,-8,-13,-6,-13,-11,3,-6,-3,-10,-19,-8,6,-9,-8,-4,-19,-9,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,17,-22,13,6,-20,6,-3,-26,-5,-26,-20,23,-14,-2,-7,10,-1,-24,-32,-19,2;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-18,-14,-12,2,-21,-2,-5,-13,-1,-3,-8,-19,-9,-11,3,16,-4,-14,15,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-24,-20,-13,-8,-27,-11,8,-7,-2,3,-12,-20,-2,0,-7,-2,6,-18,3,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-7,3,-22,1,3,-22,-12,-4,-18,0,-15,-9,2,-13,5,-2,3,8,-14,-27,-11,4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-14,-16,-18,-12,-4,-20,-18,1,-10,-7,-3,-11,-15,-8,-11,3,6,8,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-23,-15,-5,13,-23,4,-6,-12,-1,-1,-11,-21,-9,-9,-8,-5,-7,-9,18,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-22,2,14,-20,-15,5,-14,-6,-18,-11,1,-11,4,-8,10,0,-11,-33,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=8,4,-22,-2,-2,-23,-6,-9,-17,-6,-25,-17,12,15,-4,-12,8,-1,-20,-31,-22,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-18,-23,-20,-17,-3,4,-21,-11,-12,-11,-7,-13,-11,-20,-14,-7,-10,-4,-18,-12,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-26,-3,6,-26,-16,-4,-26,26,-26,-11,2,-13,15,30,2,-4,-19,-24,-12,9;
MA   /M: SY='V'; M=6,-14,-17,-13,-14,-13,-19,-22,3,-14,-4,-4,-17,-3,-17,-18,-3,2,13,-28,-16,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00577;
//
ID   RHODANESE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00683;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rhodanese C-terminal signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4818764; R2=0.0148446; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=11.083; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-12,-11,-7,-20,4,-16,-16,-11,-19,-15,-1,-11,-7,-15,21,11,-6,-29,-20,-7;
MA   /M: SY='C'; M=3,-8,12,-14,-14,-17,-10,2,-16,-17,-13,-9,-3,-23,-12,-16,-1,-6,-8,-33,-14,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-6,-22,-8,3,-16,-21,11,-9,-9,-6,-3,-5,-14,2,-9,-2,0,-7,-27,-5,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-31,-26,10,-29,-24,14,-21,3,2,-23,-25,-22,-20,-14,-1,14,12,10,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-23,-21,-29,-20,20,-25,-18,8,-18,13,5,-20,-24,-21,-16,-16,-8,6,-9,9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-16,-28,-23,4,-28,-22,21,-23,28,17,-27,-27,-21,-18,-18,-1,24,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-19,-19,-25,-18,2,-9,-17,1,-19,8,1,-17,-20,-17,-20,-9,-7,1,-13,-1,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-11,-18,-17,-7,-16,-12,-15,-11,2,-5,-5,-10,-15,-6,3,-2,-2,-4,-20,-13,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-29,-13,-2,0,-22,8,-14,-3,-6,-5,-12,-20,-3,-1,-15,-12,-16,7,19,-4;
MA   /M: SY='L'; M=6,-21,-18,-25,-17,2,-21,-16,8,-21,24,8,-21,-23,-16,-18,-15,-3,5,-16,2,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,13,-29,-22,-1,-27,-22,7,-25,22,11,-25,-30,-21,-21,-19,-8,9,-28,-9,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-16,-27,45,-19,-29,-14,-24,-16,-1,-19,-16,-17,-3,-17,-23,-21,-24,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-28,-17,-14,0,-15,-1,-12,1,-12,-5,-14,-23,-10,-3,-15,-12,-8,7,18,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-36,-6,5,-31,-19,-12,-21,-1,-28,-15,-10,56,5,-9,-7,-9,-29,-28,-24,2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-26,36,8,-30,-4,2,-31,5,-29,-23,31,-15,1,2,2,-7,-29,-36,-19,4;
MA   /M: SY='V'; M=6,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,26,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,44,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-27,-5,8,-24,-16,-7,-26,20,-23,-13,-2,-3,6,27,-2,-6,-19,-24,-15,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-16,-21,-22,-21,-3,-20,-20,19,-22,14,8,-9,-25,-19,-19,-14,-7,14,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,36,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,74,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-30,46,22,-36,-12,-4,-34,0,-27,-26,10,3,2,-10,0,-9,-28,-36,-21,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-12,-2,-2,-21,6,-12,-21,-11,-29,-19,8,-11,-2,-12,34,15,-11,-37,-21,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,17,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,136,30,-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-14,-12,-12,-5,-9,-15,-10,-13,-13,-10,-4,-16,-12,-13,14,21,-1,-24,-5,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-47,-37,-29,13,-21,-23,-17,-19,-17,-17,-37,-30,-19,-19,-37,-27,-27,132,37,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-20,-14,-16,-3,11,-14,-17,-17,-17,-12,-4,-19,-16,-15,8,2,-9,-19,-6,-16;
MA   /M: SY='H'; M=3,1,-18,-5,-3,-17,-9,8,-12,-8,-13,-3,8,-16,4,-7,8,0,-13,-30,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,1,-26,3,-1,-18,-19,1,-14,6,-9,-3,-1,-16,1,16,-9,-7,-11,-24,-7,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=13,-13,-20,-12,-2,-20,-13,-18,-9,-10,-16,-12,-12,15,-9,-16,5,0,-4,-29,-21,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-28,13,2,-29,-2,-8,-29,4,-26,-18,7,-1,0,4,-1,-4,-24,-29,-19,0;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-25,-10,-7,-16,-17,-12,-9,-7,-10,-6,-3,13,-8,-5,-6,-3,-13,-28,-17,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-37,-2,16,-31,-20,-13,-22,-4,-27,-19,-14,62,2,-13,-7,-10,-30,-29,-26,5;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-20,-20,-23,-22,-1,-28,-17,15,-18,2,3,-20,-24,-20,-18,-10,1,20,-9,3,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-9,-25,-8,8,-18,-12,-16,-9,-4,-11,-9,-11,-13,-4,-10,-5,-7,-5,-17,-14,2;
MA   /M: SY='T'; M=1,-15,-18,-20,-14,-9,-22,-20,2,-12,2,-1,-13,-10,-13,-8,-2,12,6,-25,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-24,-7,-9,-25,36,-17,-28,-15,-24,-17,-1,-17,-13,-16,7,-6,-18,-26,-24,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-27,5,21,-27,-17,-6,-23,4,-23,-16,3,11,11,-2,4,1,-24,-30,-19,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-23,10,-1,-21,4,-5,-24,0,-16,-14,7,-15,-3,7,-2,-8,-19,-24,-15,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-28,-1,-1,-26,-6,-12,-26,8,-23,-15,-3,5,-2,10,-3,-5,-20,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00322;
//
ID   SASP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00684;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Small, acid-soluble spore proteins, alpha/beta type, signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7716331; R2=0.0138072; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=792; N_SCORE=15.697; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,39,-28,27,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,-20,8,6,-26,-6,4,-20,0,-27,-14,28,-14,17,0,16,3,-24,-34,-17,11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-30,12,45,-18,-22,4,-24,6,-16,-16,-4,-6,14,-2,-4,-10,-26,-18,-1,28;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-19,-22,-26,-10,36,-25,-10,0,-17,7,13,-16,-21,-17,-13,-16,-10,-3,-6,12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,57,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,41,-26,42,11,-31,-7,5,-30,1,-29,-23,35,-14,5,-4,4,-6,-30,-38,-19,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-25,-21,-14,8,-28,-7,5,-9,20,8,-21,-26,-11,-8,-23,-10,-2,-6,21,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-21,1,-10,-21,36,-8,-27,-10,-24,-16,17,-16,-10,-10,3,-10,-24,-22,-21,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-12,-29,-10,-11,-28,27,-19,-29,-15,-28,-19,-6,17,-14,-19,2,-11,-25,-25,-28,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-15,-19,-14,-1,-23,-19,3,-20,17,3,-13,-20,-14,-15,-2,18,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-10,-9,-9,-12,-15,-18,-8,-11,-14,-11,0,-12,-9,-11,22,36,3,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,2,-13,-5,-21,-22,-8,-30,20,-21,-12,-4,-23,2,43,-10,-10,-18,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=18,-4,-20,-9,5,-30,-10,-5,-16,0,-17,-6,-3,-10,25,-5,8,-3,-15,-22,-15,15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,23,20,6,-9,-20,-9,-2,-23,-9,-27,-20,37,-26,-9,-9,4,-3,-24,-43,-23,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-10,-16,-12,-10,11,-12,-6,-12,-14,-16,-12,-2,-18,-10,-12,16,8,-8,-16,10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-12,-32,-30,17,-30,-28,24,-22,10,8,-28,-30,-32,-20,-12,-2,39,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-30,12,45,-18,-22,4,-24,6,-16,-16,-4,-6,14,-2,-4,-10,-26,-18,-1,28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-28,-12,32,-18,20,44,-20,-20,-8,-18,-20,-10,18,-20,0,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-9,-10,-16,-16,-7,-23,-23,2,-13,-4,-4,-9,-16,-16,-13,11,36,14,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,2,-12,-4,-22,-22,-8,-30,21,-22,-12,-4,-22,2,41,-10,-10,-18,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-28,7,34,-31,-18,1,-25,10,-19,-12,-1,-6,29,9,0,-9,-26,-25,-16,31;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-25,-15,-1,-17,-22,-2,-2,2,5,20,-12,-17,18,1,-14,-10,-9,-20,-5,9;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-20,-18,-11,-6,-13,-4,-11,-2,-9,-7,-11,-18,-6,2,-3,-5,-7,-6,11,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,29,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-2,8,-28,-16,-3,-25,23,-26,-10,2,-12,20,24,3,-3,-20,-24,-12,13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-21,-1,7,-27,-1,1,-18,1,-19,-6,2,-9,27,1,6,-5,-21,-19,-12,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-21,-31,-21,4,-27,-12,24,-21,32,38,-24,-24,-11,-17,-24,-10,13,-20,0,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,7,-23,2,-5,-25,21,-8,-29,0,-30,-18,17,-16,-5,-4,10,-4,-24,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,49,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,12,-8,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-27,-9,-2,-14,-22,-3,-22,23,-18,-8,-3,-17,4,35,-7,-1,-15,-14,4,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-10,-18,-16,-14,5,-21,-4,-6,-10,-6,-6,-10,-18,-10,-12,2,17,-4,-4,25,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,7,-27,-14,-4,-27,35,-30,-13,18,-13,7,21,-4,-7,-23,-26,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00276;
//
ID   NFYB_HAP3_MP; MATRIX.
AC   MP00685;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NF-YB/HAP3 subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4182143; R2=0.0129525; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1598; N_SCORE=25.106; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-18,-8,3,-24,-1,-13,-18,-7,-20,-14,-4,1,0,-13,12,0,-13,-27,-21,1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-19,8,-2,-18,-8,22,-20,-5,-24,-14,33,-17,0,-3,11,7,-22,-36,-9,-2;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-16,-16,-13,-22,17,-20,-18,-13,-16,-13,-6,-13,-13,-19,8,0,-8,-21,-22,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,11,-30,15,12,-32,-18,-8,-32,39,-30,-14,4,-10,8,21,-8,-10,-22,-24,-12,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,50,-32,-19,1,-30,9,-21,-18,2,-2,23,0,0,-10,-30,-30,-19,37;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-8,42,-18,-18,-14,-24,-24,-18,-18,-14,-14,-8,-22,-18,-18,8,26,-4,-38,-18,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-17,-32,-27,1,-30,-23,32,-21,17,23,-26,-26,-21,-20,-16,-5,35,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,26,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-10,-29,-27,-3,-26,-29,25,-19,7,7,-27,-27,-27,-20,-7,0,43,-29,-11,-27;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-22,-35,-27,61,-30,-11,2,-26,12,2,-21,-30,-31,-18,-21,-10,-1,11,38,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-1,-9,-13,-24,27,-17,-30,-17,-29,-20,1,-19,-13,-17,15,-2,-19,-32,-26,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,7,1,1,-3,-20,-3,-8,-21,-10,-29,-20,18,-15,-3,-10,28,13,-14,-41,-21,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-3,-29,35,-24,-9,0,-15,16,48,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-24,-4,6,-27,-18,19,-19,-1,-17,-3,1,-12,27,0,3,2,-20,-24,-5,15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-26,-8,3,-24,-16,-2,-25,19,-21,-9,0,-15,16,38,-1,-6,-19,-22,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-30,22,47,-31,-10,-2,-32,6,-22,-21,2,-3,14,-3,0,-11,-30,-30,-21,31;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-29,3,11,-31,-17,-3,-26,34,-28,-9,8,-11,20,22,-5,-9,-24,-23,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-17,10,-3,-17,-7,0,-17,-3,-23,-17,40,-17,-3,-3,13,17,-20,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-33,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,23,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-31,-25,-32,-22,9,-29,-22,17,-29,38,15,-31,-29,-20,-21,-31,-13,6,3,4,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00578;
//
ID   NFYA_HAP2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00686;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NF-YA/HAP2 subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7689297; R2=0.0103744; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1292; N_SCORE=17.163; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=264; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-17,14,-30,21,12,-32,-17,23,-31,7,-23,-12,9,-14,20,14,-4,-12,-28,-29,-7,14;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-20,-15,-8,-12,-11,-12,-1,-11,-6,10,-11,-5,-7,-13,0,1,2,-28,-13,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-22,-8,-5,-15,-5,-1,-17,10,-13,0,4,-17,3,29,-7,-8,-14,-19,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-17,-27,-22,-1,-27,-20,28,-18,12,17,-18,-19,-16,-18,-11,-1,26,-20,-3,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-30,-13,-4,-21,-18,-18,-8,-11,-18,-11,-16,55,-10,-18,-8,-8,-16,-23,-21,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-19,-18,-14,2,-22,-14,9,-23,28,9,-11,-26,-14,-16,-15,-5,1,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-37,-7,4,-31,-20,-15,-22,1,-29,-16,-15,65,0,-9,-9,-10,-28,-27,-25,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-15,-9,-18,-15,-3,-12,2,-10,-16,-6,2,-12,-15,-11,-15,-7,-8,-10,-17,5,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,18,-21,25,28,-23,-11,5,-23,3,-17,-16,9,-4,8,-2,0,-7,-22,-25,-13,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=0,-13,-13,-19,-13,-2,-16,-11,10,-12,10,16,-12,-13,-7,-11,-7,3,7,-16,-4,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-25,-9,3,-16,-20,-14,-5,-9,-8,-7,-14,23,-5,-13,-7,-4,-8,-24,-15,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-23,0,26,-19,-20,-10,-11,-3,-5,-9,-10,-10,3,-9,-4,-7,-8,-27,-16,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,16,-19,17,18,-22,-10,2,-19,3,-17,-13,13,-7,13,-1,3,-2,-20,-24,-13,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-30,16,40,-32,-6,-2,-31,5,-22,-18,1,-5,17,-2,0,-12,-30,-28,-20,29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-34,-10,-5,-27,-6,-20,-22,-12,-27,-18,-14,57,-12,-18,-4,-2,-25,-28,-27,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-34,-27,12,-33,-26,29,-26,23,14,-26,-27,-26,-23,-19,-6,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,18,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-2,-30,-1,5,-17,-21,71,-25,-6,-18,-2,4,-18,15,0,-9,-17,-28,-21,20,6;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-24,-13,-10,-23,16,-13,-27,2,-20,-13,-3,-17,-6,14,-1,-10,-17,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-30,-19,25,-28,42,25,-27,-27,-18,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,2,23,-28,-21,7,-21,12,-19,-6,-2,-10,37,8,-4,-10,-26,-16,-1,29;
MA   /M: SY='A'; M=25,-6,-15,-11,-3,-22,-5,-8,-16,-5,-17,-11,-2,-11,3,-7,14,2,-9,-25,-16,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=8,-24,-17,-27,-17,1,-21,-20,11,-24,32,11,-24,-24,-17,-20,-18,-7,7,-20,-6,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=17,-6,-16,-7,10,-15,-10,-11,-10,-6,-2,-7,-9,-9,-2,-11,0,-4,-7,-20,-14,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,5,-24,5,19,-24,-15,3,-22,12,-18,-10,7,-10,21,20,-1,-7,-23,-22,-12,19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-19,-4,-7,-10,-5,-5,-9,-4,-2,-4,11,-19,-6,0,-7,-6,-13,-23,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-22,-28,-22,-2,-13,-23,15,-26,22,10,-21,-24,-20,-22,-18,-10,10,-21,-8,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-25,-20,-11,-15,-24,-17,13,-16,-5,2,-9,-5,-1,-17,1,-2,4,-26,-10,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-27,-6,3,-23,-20,-7,-27,32,-23,-10,0,-14,7,40,-5,0,-17,-22,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=6,-2,9,-4,3,-21,-16,-16,-19,-9,-16,-15,-6,-15,-7,-15,6,5,-8,-33,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-4,-30,-19,-18,81,-8,-15,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,30,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00578;
//
ID   ALDEHYDE_DEHYDR_GLU_MP; MATRIX.
AC   MP00687;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldehyde dehydrogenases glutamic acid active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.8480062; R2=0.0198442; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3; N_SCORE=6.898; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-17; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-8,-22,-11,-2,-12,-21,-9,-7,1,-4,-2,-6,-17,-1,0,-6,-2,-5,-22,-6,-2;
MA   /M: SY='M'; M=1,-14,-21,-18,-11,-12,-16,-3,-2,-9,1,3,-11,-19,-4,-7,-8,-5,-1,-21,-4,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-21,-22,-16,-7,-28,-9,16,-17,7,8,-16,-22,-11,-15,-10,-6,16,-26,-4,-15;
MA   /M: SY='M'; M=2,-12,-21,-16,-7,-14,-13,-11,-5,-1,-2,5,-10,-18,-3,2,-7,-7,-1,-22,-11,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-7,-24,-8,2,-20,-18,-5,-12,3,-6,-3,-6,-15,10,7,-5,-7,-12,-23,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=5,-3,-9,-6,-5,-14,-9,-7,-17,-10,-14,-10,-3,-11,-7,-13,3,-1,-12,-27,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=20,-11,-14,-16,-12,-20,6,-19,-14,-9,-15,-11,-8,-11,-12,-14,4,-3,-5,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,-5,-21,-8,-1,-20,0,-8,-18,-3,-17,-9,-4,-13,5,-8,3,-6,-15,-18,-9,1;
MA   /M: SY='Q'; M=4,3,-23,1,7,-27,-7,-6,-23,7,-23,-14,5,-7,9,3,6,-4,-19,-27,-17,8;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-22,-2,-6,-17,-4,0,-19,-4,-21,-12,11,-10,-5,2,4,0,-16,-30,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-22,-22,-16,5,-20,-16,9,-21,19,11,-20,-19,-16,-18,-18,-9,5,-19,-1,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-28,-9,-1,-23,-15,-15,-18,22,-21,-8,-5,-5,-1,12,-7,-6,-12,-22,-12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-32,-9,0,-23,-21,-9,-20,17,-20,-8,-7,11,3,24,-10,-10,-18,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-14,-26,-23,0,-27,-24,20,-21,16,8,-23,-26,-22,-19,-9,2,27,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='T'; M=7,-12,-14,-18,-13,-11,-18,-17,0,-15,-4,-3,-10,-16,-9,-16,4,12,4,-20,-9,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-20,-28,-20,4,-18,-18,13,-24,28,18,-23,-25,-17,-19,-20,-9,8,-19,-4,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-10,-27,-19,2,-25,-17,12,-23,29,19,-22,-25,-15,-18,-18,-3,7,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-26,4,5,-24,-14,-4,-23,29,-25,-9,17,-14,6,17,-5,-7,-21,-26,-12,5;
MA   /M: SY='N'; M=2,25,-18,19,2,-24,-2,-1,-22,-4,-27,-21,30,-14,-1,-7,15,3,-21,-37,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=16,-15,-22,-17,-8,-14,-13,-20,-12,-12,-15,-12,-14,26,-13,-19,0,0,-10,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-15,-21,-18,2,-18,-3,4,-18,3,8,-7,-23,-15,-15,-10,-8,3,-23,-2,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-24,-37,-29,3,-35,-29,40,-27,19,16,-22,-23,-22,-27,-18,-8,30,-21,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-15,-31,-29,1,-31,-27,31,-21,11,11,-27,-27,-26,-22,-12,-3,41,-25,-4,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-11,-15,-14,-13,19,-23,-4,-7,-16,3,4,-11,-23,-17,-13,-14,-8,-6,-15,6,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-27,23,18,-30,-13,-7,-26,4,-23,-19,6,-1,3,-4,1,-6,-21,-31,-19,10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,31,-25,43,11,-32,-10,1,-29,-4,-26,-22,15,-12,1,-10,6,-4,-22,-38,-17,6;
MA   /M: SY='A'; M=28,-11,-1,-18,-12,-17,-9,-15,-9,-13,-11,-9,-10,-12,-11,-20,3,-3,-3,-23,-14,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-29,46,11,-28,-9,-4,-31,-4,-22,-23,13,-10,-4,-10,-3,-10,-25,-34,-17,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-20,-18,-17,-2,-25,-19,13,-19,14,8,-15,-22,-16,-15,-11,-1,12,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-14,19,-27,29,19,-28,-16,2,-27,0,-17,-17,6,-11,5,-1,-1,-6,-23,-33,-14,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-24,-6,-1,-17,-15,-7,-11,-5,-4,-3,-7,-17,3,-7,-8,-9,-12,-14,-8,1;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-12,-18,-13,-16,-9,-21,-1,-11,-6,-5,-14,-15,-12,-18,4,-1,11,-24,-17,-13;
MA   /M: SY='V'; M=11,-22,-13,-26,-21,-7,-22,-25,16,-17,5,5,-21,-22,-18,-19,-5,0,28,-26,-11,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-23,0,16,-19,-18,-4,-15,0,-14,-10,-5,-8,5,-3,1,-3,-11,-26,-11,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00068;
//
ID   SIGMA54_INTERACT_3_MP; MATRIX.
AC   MP00688;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-54 interaction domain C-terminal part signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7726803; R2=0.0169553; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=264; N_SCORE=10.239; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-24,-16,-5,-17,-24,-16,-7,-4,-7,-5,-16,13,-7,-2,-12,-9,-8,-26,-15,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-27,3,5,-27,0,-3,-27,3,-23,-14,1,-10,3,5,-1,-8,-21,-26,-16,3;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-22,-35,-27,29,-29,-23,19,-29,23,11,-23,-27,-28,-22,-22,-9,13,-11,8,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-8,-3,-5,-20,-1,-9,-19,-12,-20,-15,2,-13,-6,-13,19,11,-10,-33,-17,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-6,-30,-2,6,-30,-5,-12,-23,-4,-24,-15,-7,25,4,-9,-2,-8,-25,-26,-23,3;
MA   /M: SY='D'; M=1,12,-24,18,14,-28,-5,-7,-25,-3,-18,-15,3,-10,3,-8,2,-7,-19,-29,-18,8;
MA   /M: SY='A'; M=23,-16,-12,-22,-15,-10,-13,-22,3,-16,5,-1,-16,-18,-15,-19,1,3,11,-24,-13,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-15,-19,-16,-4,-12,-24,-9,-2,-2,3,9,-12,-20,3,6,-12,-8,-4,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-26,16,23,-28,-16,-2,-25,9,-21,-13,5,-9,13,5,1,-3,-22,-29,-16,17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-21,-22,-15,-1,-18,-13,2,-10,1,1,-14,-21,-14,-5,-10,-6,5,-18,-2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,19,-30,-20,19,-29,42,19,-28,-29,-22,-20,-28,-10,10,-16,4,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-21,-11,-4,-14,-15,-5,-9,-4,-4,1,-3,-16,1,1,-1,4,-8,-26,-9,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-3,1,-22,-2,0,-22,-7,5,-24,8,-25,-13,10,-14,5,13,8,0,-18,-29,-12,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-16,-17,-17,-15,9,-26,27,-11,-10,-6,-2,-13,-27,-7,-6,-16,-12,-14,7,44,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-1,4,-23,7,6,-25,-8,-1,-26,2,-22,-16,3,-9,2,8,6,-2,-18,-29,-16,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-45,-40,-30,21,-22,-28,-17,-22,-15,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-25,127,30,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,18,14,-27,-27,-26,-23,-16,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,29,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-26,4,19,-27,-17,0,-24,14,-21,-12,0,-10,15,13,1,-6,-19,-26,-14,16;
MA   /M: SY='N'; M=-9,29,-21,13,-1,-20,-4,23,-21,-3,-27,-16,46,-19,1,-1,7,-1,-27,-37,-13,-1;
MA   /M: SY='V'; M=9,-15,-4,-20,-14,-9,-19,-17,4,-13,0,4,-15,-21,-14,-16,-4,-1,11,-25,-10,-14;
MA   /M: SY='I'; M=3,-24,-13,-30,-23,-4,-26,-24,22,-22,14,13,-20,-22,-18,-22,-12,-4,20,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-29,8,32,-26,-17,4,-27,11,-20,-14,0,-7,18,9,-1,-7,-25,-24,-11,24;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-11,-4,-14,-16,-1,-24,16,-15,-8,-2,-21,5,43,-11,-11,-19,-9,-2,-3;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-10,-24,-16,-1,-16,-14,1,-18,5,3,-14,-19,-15,-18,-4,-1,4,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-14,-24,-19,-5,-20,-19,10,-14,6,7,-19,-22,-16,-14,-5,2,18,-23,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-16,-22,-20,-2,-24,-20,15,-19,10,5,-13,-23,-18,-18,-7,4,17,-25,-6,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-26,-20,7,-10,-17,3,-20,14,9,-18,-25,-17,-13,-17,-11,1,-16,-3,-18;
MA   /M: SY='A'; M=10,-14,1,-21,-17,-6,-17,-15,-1,-17,3,1,-12,-22,-16,-18,-5,-2,5,-26,-11,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-23,-1,4,-22,-7,-9,-19,-4,-18,-14,3,0,-1,-3,5,0,-17,-29,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-25,4,-4,-26,11,-13,-25,-10,-23,-17,0,-2,-7,-12,6,-4,-19,-29,-22,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,4,-27,7,7,-21,-7,-4,-21,-4,-14,-12,1,-8,0,-6,-4,-7,-20,-26,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-25,-5,5,-18,-10,-9,-12,-5,-12,-7,-6,-7,0,-7,-4,-7,-11,-23,-11,1;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-15,-21,-19,-13,-6,-25,-20,15,-18,7,4,-13,-19,-14,-19,-8,-1,13,-24,-6,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00579;
//
ID   GLYCO_HORMONE_BETA_2_MP; MATRIX.
AC   MP00689;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycoprotein hormones beta chain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3285151; R2=0.0092869; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=857; N_SCORE=12.287; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=234; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-24,-23,-23,21,-30,5,9,-13,3,3,-23,-30,-16,-13,-17,-7,8,12,53,-23;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-21,14,42,-21,-14,0,-21,7,-14,-14,0,0,14,0,0,-7,-21,-21,-14,28; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-7,-21,-21,0,-21,-21,21,-14,7,7,-21,-21,-21,-14,-7,0,35,-21,-7,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-21,0,7,-21,-14,-7,-21,35,-21,-7,0,-7,7,21,-7,-7,-14,-14,-7,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-27,-3,9,-19,-20,11,-23,12,-17,-9,-1,-16,8,23,-8,-11,-19,-20,-3,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24,11,-32,-23,26,-29,37,19,-27,-28,-22,-22,-25,-9,17,-19,1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-7,6,-29,-20,-16,-21,-4,-28,-18,-17,66,-2,-13,-10,-11,-29,-22,-25,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-30,2,-13,-31,56,-17,-40,-16,-30,-21,3,-18,-16,-18,0,-18,-30,-23,-28,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-32,-13,-3,-25,-17,-18,-17,-7,-22,-16,-16,55,-9,-11,-6,-8,-21,-27,-25,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-30,-7,-1,-21,-20,2,-15,-7,-16,-10,-9,22,-5,-6,-7,-9,-16,-29,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-29,-7,-11,-25,31,14,-34,-13,-26,-13,3,-19,-7,-9,-2,-17,-28,-19,-13,-11;
MA   /M: SY='V'; M=11,-22,-11,-26,-23,-6,-21,-26,17,-17,3,4,-21,-23,-22,-19,-2,3,32,-28,-12,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,34,-25,42,12,-30,-12,-4,-28,-3,-24,-22,19,-11,-2,-9,4,2,-22,-37,-17,5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-29,-7,0,-24,-14,-16,-17,-9,-25,-17,-12,58,-7,-16,0,-3,-22,-28,-24,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-19,-21,-16,9,-23,1,5,-13,9,9,-15,-22,-12,-8,-13,-5,5,-12,11,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-16,-27,-24,27,-27,-13,13,-19,7,5,-21,-26,-25,-16,-14,-5,18,-5,18,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-9,-6,-5,-11,-10,-12,-10,-9,-14,-11,2,-9,-5,-9,21,26,-3,-27,-10,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-26,-23,36,-30,7,5,-16,5,3,-21,-29,-17,-14,-20,-10,-3,19,60,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,87,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-19,-23,-16,0,-27,-19,10,-16,23,9,-20,-24,-15,-8,-16,2,9,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-14,5,5,-22,-3,-3,-21,-7,-28,-19,15,-11,3,-8,29,12,-15,-38,-19,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-15,5,-29,9,13,-23,-19,27,-28,8,-21,-11,5,-14,10,14,-6,-11,-25,-25,0,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-22,-8,-12,-23,28,-17,-25,-14,-23,-16,2,-16,-12,-14,9,-2,-17,-26,-22,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-11,-24,-12,-3,-18,-17,-14,-14,9,-8,-5,-9,-4,-3,6,-7,-4,-11,-23,-12,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,20,-25,17,4,-25,-10,1,-25,7,-26,-18,23,-10,2,10,2,-2,-24,-32,-17,1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-17,-16,-11,-9,-18,-13,-3,-8,-2,6,-7,-13,-6,-3,4,15,-1,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-4,24,-24,33,12,-32,-3,-5,-32,-1,-27,-23,11,-10,-1,-9,8,-4,-22,-34,-20,6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-17,-3,-7,-9,-14,-4,-12,-8,-16,-12,9,-15,-5,-7,13,18,-9,-24,0,-7;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-12,-2,-4,-16,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-11,27,31,-6,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-19,41,-30,58,18,-33,-12,2,-35,0,-27,-26,15,-12,0,-9,-2,-10,-28,-33,-10,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-20,-9,-14,-18,12,-20,-17,-15,-15,-12,-2,-15,-14,-16,7,13,-9,-26,-17,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-15,-24,-17,-15,-10,-11,3,-5,-11,-9,-1,-9,-17,-11,-3,-8,-9,0,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-11,-29,-8,10,-13,-20,-9,-15,0,-7,-7,-10,-1,3,5,-10,-10,-16,-21,-11,5;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-22,-7,-5,-22,7,-8,-24,-1,-24,-15,2,-9,-4,0,9,-2,-17,-25,-15,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-12,-19,-12,-10,-9,-15,-15,2,-17,10,4,-12,-20,-10,-16,-8,-3,2,-26,-10,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-27,-2,4,-25,2,8,-26,1,-21,-10,1,-15,11,2,-1,-10,-24,-21,-8,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-31,-14,-7,-21,-19,-21,-9,-12,-18,-11,-16,49,-12,-19,-5,1,-14,-28,-21,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-23,8,-1,-19,-13,-8,-15,-11,-11,-12,3,1,-7,-13,0,-2,-16,-32,-16,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-14,-20,-17,-15,13,-13,-6,-9,-13,-8,-7,-9,-21,-14,-9,0,1,-7,-6,18,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-3,1,-19,0,-6,-16,-9,-9,-9,-11,-9,-1,1,-13,-6,-13,5,5,-7,-31,-13,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-21,-10,-7,-3,-17,-6,-14,1,-13,-8,-2,-15,-8,0,-1,0,-9,-20,-2,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-28,1,3,-27,-11,2,-22,-5,-26,-15,2,25,5,-7,2,-6,-25,-29,-18,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-26,-4,6,-23,-15,-3,-15,1,-13,-7,-4,-2,11,4,-5,-6,-17,-23,-12,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-14,-22,-15,-8,-7,-15,-13,-3,-6,2,3,-12,-12,-8,-4,-10,-7,-4,-20,-7,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-24,-9,0,-4,-18,-6,-14,-3,-12,-8,-7,2,-2,-3,-4,-5,-15,-19,-4,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-6,-16,-5,-10,-5,0,-2,-9,-11,-7,-5,-5,-15,-9,-12,-5,-7,-8,-10,4,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-15,-10,-9,-3,-13,-4,0,-12,4,2,-9,-11,-8,-10,-7,-4,-2,-15,1,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: M=-2,-8,-13,-8,-6,-9,-5,-1,-4,-10,-1,0,-6,-13,-4,-8,-2,-4,-2,-17,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-11,-6,-4,-1,2,-8,-9,-9,-6,-5,-2,-9,-7,-8,3,0,-6,-12,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-11,-11,-12,-8,10,-13,-6,1,-7,7,4,-9,-13,-8,-6,-8,-4,0,-5,6,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-8,-16,-7,-3,-9,-8,-7,-9,-5,-13,-9,-7,14,-4,-8,0,-2,-11,-4,-4,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-15,-15,-18,-15,6,-8,-12,5,-14,1,7,-11,-12,-13,-13,-6,-5,5,-12,-2,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-29,13,45,-32,-19,2,-27,9,-21,-14,1,-3,30,2,3,-8,-29,-28,-17,37;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00234;
//
ID   DEAH_ATP_HELICASE_MP; MATRIX.
AC   MP00690;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DEAH-box subfamily ATP-dependent helicases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7598574; R2=0.0095767; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=652; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=495; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-29; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-46,19,-1,14,-60,-74,-62,27,-59,-13,79,29,-72,16,-3,-45,-56,41,-81,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-6,23,-67,29,-5,-66,-14,-72,68,-2,-26,4,-39,-73,-36,-62,-36,-71,-53;
MA   /M: SY='L'; M=-60,-70,-69,-47,-53,-74,-66,25,-3,55,-17,32,-76,2,-65,11,-38,30,-77,-59;
MA   /M: SY='R'; M=-46,-74,-42,-28,-65,-73,-61,-13,4,10,-54,-22,-25,-15,75,4,28,18,-78,-62;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-76,-52,65,-66,-40,55,24,5,-10,-7,-36,-65,12,-38,-57,3,-16,14,-33;
MA   /M: SY='D'; M=-1,27,42,-40,8,-51,-61,16,4,22,23,30,-73,-34,14,-31,-17,-40,-77,-59;
MA   /M: SY='M'; M=-37,-28,-43,1,-10,-74,-57,-5,9,42,57,-40,-73,54,-39,-9,-41,-52,-65,39;
MA   /M: SY='N'; M=5,-68,-37,-12,-16,-1,-25,-14,-57,-7,5,55,-41,11,-29,40,19,-1,-80,-63;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-29,73,29,-44,6,-59,-16,-42,19,-60,13,-24,-32,-43,-7,-57,-19,-84,-66;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-74,-43,-43,9,-21,6,-56,-15,31,-53,10,70,-36,-44,-2,9,-34,-71,12;
MA   /M: SY='S'; M=-19,-72,21,19,-43,20,-59,-34,24,17,-9,18,-68,-52,-8,38,-15,-63,-78,-36;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-28,-47,-66,-51,-78,-63,-2,-20,69,-16,-14,-79,-34,48,1,-60,-36,-74,-57;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-73,-15,18,19,-38,-25,11,-4,-49,-58,-10,-69,-5,35,31,9,-24,-67,38;
MA   /M: SY='K'; M=-26,-74,8,-17,-74,23,-6,-74,47,-19,-64,41,-41,12,33,23,-55,-53,-78,-36;
MA   /M: SY='W'; M=-67,-78,-30,-49,3,-75,-23,9,-24,-4,-51,28,-79,-64,-65,-66,-63,15,97,94;
MA   /M: SY='S'; M=40,-65,-59,-59,-75,13,31,-74,-59,-75,-68,-48,-65,-52,-63,88,-43,-65,-81,-66;
MA   /M: SY='H'; M=-14,63,-70,-68,-56,-76,73,32,-62,-34,-50,-62,-75,-63,17,-43,18,46,-79,25;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-71,-85,-80,46,-86,-77,64,-77,22,32,-78,-78,-76,-77,-72,-58,55,-69,-48;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-74,-85,-81,-50,-87,-81,91,-76,-26,55,-76,-75,-74,-79,-72,-57,46,-76,-57;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-70,-85,-79,6,-86,-77,59,-77,48,11,-79,-79,-74,-77,-72,-58,57,-74,-54;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='A'; M=86,-63,-72,-64,-68,-56,-73,13,-66,-46,-54,-66,-69,-63,-70,-47,-52,32,-77,-68;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='E'; M=-61,51,-37,90,-80,-69,-52,-82,-43,-77,-71,64,-63,-40,15,-54,-57,-76,-85,-73;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-79,-70,-61,-40,-81,42,43,-41,-1,-50,-62,-76,-52,89,-65,-62,13,-77,-57;
MA   /M: SY='D'; M=-57,-70,61,-35,26,-64,-60,-49,29,-69,-67,-6,-65,-54,-38,42,60,-64,-80,-59;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-28,-61,-21,-60,9,-26,21,-61,35,-21,55,-74,48,-64,-31,-39,24,-79,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-72,-35,-30,2,-62,47,-9,-56,-52,-9,81,-25,3,-41,-38,9,-13,75,6;
MA   /M: SY='T'; M=-41,28,-56,-59,-73,28,-62,-49,-28,-70,-64,38,-65,22,-2,7,81,-46,-84,-68;
MA   /M: SY='D'; M=-62,-29,97,-41,-77,-64,47,-12,-57,-73,-71,-25,-67,-55,-63,23,22,-39,-95,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-75,30,-31,45,8,-69,58,3,-32,-22,-61,-73,21,-44,-45,-41,20,-70,-52;
MA   /M: SY='L'; M=-30,-71,-72,16,46,-80,-66,19,-47,62,-16,-72,-77,-37,-11,-17,-28,-33,-66,-49;
MA   /M: SY='F'; M=-67,-73,-82,-75,62,-81,-67,25,-67,50,54,-75,-80,-68,17,-27,-63,-33,51,-22;
MA   /M: SY='G'; M=5,-74,-67,-45,-71,59,-66,11,-43,-49,49,-58,18,27,3,-1,-27,-1,-76,-67;
MA   /M: SY='V'; M=-27,-68,19,-67,-3,-56,-70,1,-70,43,-3,-41,-75,-69,-72,-32,31,55,-78,-32;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-6,-50,-73,-28,-58,-66,-4,-73,67,-15,-16,-81,-39,-72,-49,-59,32,-68,35;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-7,-61,-52,-68,-53,-60,18,77,0,-56,6,-69,-47,49,-2,-39,-44,-75,-63;
MA   /M: SY='K'; M=-36,-76,38,20,-78,13,-25,-39,66,-59,-67,-48,-65,-3,28,-12,9,-52,-79,-67;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00039;
//
ID   DNA_PHOTOLYASES_1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00691;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA photolyases class 1 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8214226; R2=0.0141331; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1302; N_SCORE=23.213; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=21,-12,-21,-17,-17,-23,28,-21,-18,-17,-16,-12,-6,-16,-16,-21,2,-10,-11,-20,-23,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-28,-11,-1,-20,-18,-2,-28,27,-19,-10,-1,-19,8,63,-8,-9,-18,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,32,-36,-20,5,-24,14,-21,-7,0,-7,42,9,-1,-10,-29,-23,-13,37;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-6,-28,-11,-10,-9,-15,3,-15,-5,-10,-8,1,-22,-5,1,-13,-12,-19,8,0,-8;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-19,-10,2,-20,-10,3,-15,-5,-14,-8,-5,-12,8,-9,5,-4,-13,-18,-5,4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-15,-7,2,-11,-21,-16,-9,-9,-3,-7,-4,-11,-6,-10,9,29,-4,-29,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-41,-34,-27,24,-24,-15,-12,-18,-11,-12,-32,-30,-20,-17,-32,-22,-21,99,44,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-32,-22,2,-26,-10,25,-18,27,44,-22,-22,-8,-16,-22,-10,13,-20,0,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-25,2,0,-20,-14,70,-27,-9,-23,-6,15,-18,7,-2,2,-10,-26,-33,8,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,26,2,-22,-1,9,-22,0,-30,-21,55,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=6,-22,-7,-27,-20,-5,-23,-23,13,-23,13,5,-19,-23,-18,-22,-9,-4,13,-25,-10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-18,-30,-22,0,-22,-6,22,-12,18,50,-22,-22,-6,-12,-18,-8,18,-22,-2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-26,-31,-25,-2,-33,-24,37,-25,15,14,-12,-22,-19,-24,-16,-8,23,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='V'; M=11,-17,-10,-22,-20,-7,-21,-25,10,-15,0,0,-17,-20,-20,-17,3,14,25,-28,-12,-20;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,18,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-12,-2,1,-22,-2,-9,-19,-8,-27,-16,7,-10,6,-9,32,14,-11,-35,-19,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-18,-29,-19,12,-24,-20,11,-26,33,11,-25,-26,-20,-20,-20,-8,7,-17,-1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-12,-22,-21,-6,-23,-25,14,-17,1,2,-17,-21,-20,-17,3,13,27,-29,-11,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='B'; M=-14,21,-23,21,0,-15,-14,8,-20,-7,-19,-15,18,-18,-7,-8,0,-2,-16,-32,-9,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-23,-25,-15,4,-29,-9,14,-23,32,15,-23,-27,-9,-16,-24,-10,4,-16,7,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-32,36,10,-34,-12,-5,-30,-3,-30,-25,13,21,-3,-12,-2,-8,-30,-37,-23,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,4,-24,-20,-1,-29,33,-22,-9,0,-17,14,57,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-20,-35,-20,-5,-7,-18,-16,-18,-2,-14,-10,-20,-19,-5,-1,-20,-17,-20,50,5,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-12,-12,-21,-29,58,-21,-39,-21,-29,-20,-2,-22,-21,-21,-1,-19,-28,-24,-30,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-26,2,29,-17,-19,0,-15,2,-9,-1,-7,-8,10,-5,-5,-9,-17,-21,-5,19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-29,7,19,-25,-20,-4,-27,20,-17,-13,0,-12,9,27,-8,-10,-21,-25,-13,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-32,-21,-18,11,-23,18,-10,-12,-9,-5,-18,-26,-9,-12,-19,-15,-16,39,47,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-23,-29,-28,-18,-2,-22,-10,3,-6,5,21,-20,-23,-5,4,-23,-14,-3,14,4,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-26,24,20,-30,-13,10,-30,4,-26,-18,9,-9,11,-1,7,-5,-25,-33,-13,15;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-21,-8,-4,-14,-21,8,-12,-3,-4,-2,0,-17,2,0,-3,6,-12,-26,-3,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-23,-32,-24,3,-31,-22,28,-25,24,14,-23,-24,-19,-23,-19,-8,19,-17,3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-26,-11,-16,-27,46,-7,-33,-17,-25,-16,-1,-18,-15,-18,1,-16,-24,-21,-23,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00331;
//
ID   NIFH_FRXC_2_MP; MATRIX.
AC   MP00692;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NifH/frxC family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3254037; R2=0.0128822; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=939; N_SCORE=16.412; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-30,18,39,-32,-19,-1,-30,19,-23,-16,2,-5,20,7,-2,-10,-28,-27,-16,30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-30,7,28,-28,-20,8,-30,24,-24,-13,1,-8,14,19,-6,-11,-25,-25,-10,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-20,-26,-18,4,-24,-10,17,-20,33,31,-19,-26,-11,-15,-23,-9,7,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-28,7,-7,-29,34,-10,-35,-5,-30,-20,15,-18,-10,-8,1,-13,-29,-27,-24,-8;
MA   /M: SY='V'; M=14,-18,-12,-24,-19,3,-17,-23,5,-17,-2,-2,-16,-20,-21,-18,2,5,17,-22,-8,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-25,-26,-21,39,-27,13,-2,-18,4,7,-15,-27,-18,-13,-18,-12,-6,6,40,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-31,23,7,-18,-14,-4,-26,-5,-20,-20,-1,-15,-4,-12,-8,-12,-23,3,3,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,23,-30,34,24,-33,-16,-2,-34,17,-27,-21,9,-9,8,11,-3,-10,-27,-31,-17,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-16,-28,-20,-18,21,-26,0,2,-15,1,-1,-11,-15,-15,-14,-16,-9,-8,3,34,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-28,-18,-32,-28,21,-32,-20,22,-22,10,8,-25,-28,-27,-20,-15,-5,28,-11,13,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,22,-32,-22,22,-30,36,16,-26,-28,-24,-22,-26,-10,12,-14,6,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-34,-26,59,-30,-12,3,-26,14,3,-22,-30,-31,-18,-22,-10,0,9,35,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-15,-24,-26,9,-29,-26,22,-21,8,6,-23,-27,-28,-20,-12,-3,34,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-16,-16,-10,-22,9,-19,-16,-12,-17,-13,-7,-3,-10,-19,10,-2,-8,-23,-22,-10;
MA   /M: SY='M'; M=9,-16,-15,-23,-16,-6,-16,-14,7,-14,9,18,-16,-18,-10,-15,-4,3,9,-23,-9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-4,8,-24,0,3,-25,-11,2,-21,10,-22,-11,18,-16,15,20,2,-5,-22,-26,-15,8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-17,15,11,-17,-9,-1,-19,11,-14,-11,4,-6,4,12,-3,-6,-14,-16,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-17,15,1,-18,10,7,-21,-5,-16,-11,6,-9,-3,-7,-1,-9,-17,-17,-9,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-20,-15,16,-26,3,-1,-2,3,9,-17,-24,-8,-4,-19,-10,-6,5,36,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,47,25,-39,-14,2,-34,4,-26,-22,13,-9,17,-4,0,-10,-30,-34,-18,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-2,-29,3,13,-7,-23,2,-15,4,-8,-8,-8,-16,2,-2,-12,-10,-17,-9,16,6;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,15,-29,-25,-9,-24,-28,10,-21,0,0,-22,-26,-24,-23,-7,-3,23,-31,-15,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-25,-8,-28,-25,11,-32,-8,13,-21,10,6,-22,-29,-18,-19,-19,-9,8,-4,28,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,43,-29,23,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=17,-5,-13,-12,-10,-17,2,-19,-16,-12,-15,-13,-2,-12,-10,-15,16,20,-6,-27,-17,-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,11,-14,13,2,-22,-6,-10,-22,-8,-26,-20,10,-10,-2,-10,27,20,-12,-38,-18,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-30,32,1,-35,28,-10,-40,-10,-30,-25,10,-15,-10,-15,0,-15,-30,-30,-25,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00580;
//
ID   ENT_VIR_OMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00694;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Enterobacterial virulence outer membrane protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9067822; R2=0.0142510; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=10.597; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,31,15,-30,-30,-25,-20,-21,-5,29,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-34,-10,-12,-30,36,-20,-32,-16,-30,-20,-8,22,-16,-20,-4,-16,-30,-24,-30,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-22,-12,-12,11,-19,9,-8,-10,-11,-8,-9,-22,-6,-10,3,1,-10,3,42,-12;
MA   /M: SY='A'; M=27,-18,-14,-24,-14,-9,-11,-20,1,-18,13,1,-18,-18,-14,-20,-5,-4,4,-20,-12,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-22,0,12,-32,-12,2,-20,2,-24,-8,4,-10,37,2,15,1,-22,-28,-14,25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,27,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,25,5,-18,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-9,11,-30,16,1,-33,17,-11,-37,9,-30,-20,6,-14,-4,-1,-3,-14,-27,-26,-21,-1;
MA   /M: SY='D'; M=7,6,-18,11,-5,-21,-14,-16,-8,-9,-11,-11,-5,-17,-13,-16,0,-4,5,-31,-17,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-22,-4,9,-29,-20,-1,-16,2,-16,-4,0,-10,33,2,8,13,-19,-24,-10,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-30,19,5,-36,18,-5,-34,-5,-27,-18,7,-14,10,-8,0,-14,-30,-27,-21,7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-27,-16,-33,-27,26,-27,-18,17,-20,13,21,-24,-27,-25,-17,-16,-6,22,-14,6,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-2,12,-19,6,3,-23,-7,-4,-23,13,-30,-17,21,-13,3,6,15,4,-19,-33,-17,3;
MA   /M: SY='H'; M=-14,13,-27,7,3,-23,-13,39,-27,11,-26,-9,24,-17,7,9,-3,-11,-27,-30,-2,3;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-30,-18,30,-24,31,32,-24,-24,-14,-20,-24,-10,17,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-30,-6,-2,-27,6,-10,-33,23,-27,-13,0,-16,1,29,-7,-13,-23,-20,-16,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-37,-30,23,-34,-27,29,-27,14,11,-23,-26,-29,-24,-17,-7,28,-15,5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-13,8,-26,17,16,-18,-21,-8,-14,-9,3,-8,-5,-15,-2,-11,-11,-10,-15,-29,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-22,39,9,-29,-14,-8,-29,-4,-22,-22,12,-10,-4,-10,8,13,-19,-36,-16,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-17,33,8,-21,-4,3,-21,0,-20,-17,25,-10,0,-4,3,-4,-20,-27,-13,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-6,0,0,-12,0,-6,-12,-6,-19,-12,6,-6,0,-6,25,12,-6,-25,-12,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-29,-6,0,-26,-12,-16,-20,-10,-30,-20,-9,52,-6,-16,9,1,-22,-34,-26,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,47,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,13,-7,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-13,-33,-30,26,-30,-27,20,-23,10,7,-27,-30,-33,-20,-13,-3,34,-17,3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-36,-26,0,-32,-19,39,-22,20,35,-20,-20,-12,-22,-20,-10,22,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-16,-11,-10,-23,20,-17,-22,-13,-22,-16,-1,-13,-10,-17,17,1,-12,-27,-23,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,38,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-4,-18,-7,-11,-21,21,-17,-25,-14,-24,-17,3,-14,-11,-14,19,13,-15,-29,-21,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,49,-30,5,0,-18,4,0,-20,-30,-21,-14,-20,-10,-6,22,61,-24;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-15,-25,-15,-6,-14,-20,4,-19,18,4,-19,-19,-15,-20,-9,-5,5,-20,-11,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00582;
//
ID   ENT_VIR_OMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00695;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Enterobacterial virulence outer membrane protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=24;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=22;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4516196; R2=0.0157313; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=632; N_SCORE=15.384; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-18,-33,-25,14,-25,-25,18,-23,8,5,-20,-22,-24,-23,-10,-5,20,-15,0,-25;
MA   /M: SY='S'; M=19,-5,-14,-8,-7,-22,15,-15,-22,-12,-24,-17,2,-12,-7,-15,23,5,-12,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-30,-10,-11,-17,23,-3,-25,-10,-20,-10,-5,-20,1,-10,-5,-15,-25,-7,3,-6;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-28,-1,-3,-25,10,-6,-31,14,-28,-15,13,-17,-1,18,-3,-11,-25,-24,-18,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-21,-22,-26,-19,-3,-26,-22,22,-24,13,8,-14,-20,-14,-22,-5,-1,13,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-26,13,-1,-28,13,-8,-33,-1,-28,-20,7,-15,-3,6,6,-6,-23,-30,-21,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-6,27,-21,38,11,-31,-5,-5,-31,-5,-30,-25,15,-10,0,-10,18,4,-21,-40,-20,5;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-26,-22,-28,-26,1,-25,-28,7,-18,-3,-3,-26,-26,-23,-18,-12,2,16,22,2,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-15,9,-30,14,9,-29,-18,-5,-32,32,-27,-15,5,-13,8,32,-8,-10,-22,-25,-12,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-14,-26,-24,-3,-29,-27,23,-19,6,6,-19,-22,-22,-19,-4,12,31,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-8,18,-28,20,-4,-31,32,-8,-36,-10,-30,-23,19,-17,-10,-13,2,-13,-30,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-20,-10,-15,-20,26,-20,-25,-15,-20,-15,0,-15,-15,-15,10,14,-15,-25,-20,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-35,-40,-30,46,-25,-25,-10,-25,-5,-10,-30,-30,-30,-20,-30,-20,-15,79,30,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-12,-25,-24,-21,-4,-26,-14,27,-18,9,21,-2,-20,-10,-18,-13,-8,12,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='V'; M=9,-25,-13,-28,-23,-2,-23,-25,18,-20,15,8,-25,-25,-23,-20,-10,-3,28,-25,-10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=13,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,20,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,37,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00582;
//
ID   ETF_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00696;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Electron transfer flavoprotein alpha-subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4553199; R2=0.0134324; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1506; N_SCORE=24.675; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-22,-1,-4,-18,-6,12,-20,-1,-19,-11,16,-18,0,4,3,-4,-19,-28,-8,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-4,15,-23,23,20,-28,-11,-5,-25,-2,-20,-19,6,-9,6,-8,8,-2,-20,-34,-18,13;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-17,-8,-4,-23,5,-13,5,1,1,-10,-24,-1,29,-17,-11,-12,-14,3,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-5,-30,-5,10,-23,-22,12,-15,5,-15,0,-5,-15,43,5,-5,-10,-25,-8,12,25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-28,-9,8,-30,-24,0,-5,1,-11,4,-6,-14,39,1,-4,-9,-13,-21,-9,23;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,60,-16,-37,-17,-30,-20,8,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-26,-7,2,-21,-22,-14,-17,31,-15,-4,-7,-15,2,18,-13,-9,-8,-21,-9,2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-16,-14,-22,-19,-3,-25,-21,12,-16,8,10,-15,-19,-15,-15,-2,18,17,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,31,-24,22,14,-28,-28,-26,-22,-17,-4,36,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='R'; M=3,-6,-24,-9,-3,-24,-1,-11,-26,16,-23,-12,-2,-14,0,19,-1,-6,-16,-21,-16,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-34,-8,0,-28,-16,-18,-20,-10,-30,-20,-14,70,-8,-18,0,-4,-26,-32,-28,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,15,22,-30,-17,-5,-29,23,-26,-16,7,-8,11,11,-1,-5,-23,-28,-15,16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,40,-29,26,19,-24,-24,-21,-26,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,6,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='C'; M=3,-23,16,-29,-24,-7,-25,-24,8,-22,8,6,-22,-27,-21,-22,-11,-6,15,-30,-13,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='S'; M=8,3,-11,4,1,-21,-1,-9,-21,-9,-30,-21,11,-10,0,-10,38,18,-11,-40,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=32,-7,-15,-13,-2,-25,-5,-12,-13,-5,-14,-8,-6,-10,8,-12,10,-1,-8,-22,-18,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,-31,-1,0,-21,-20,92,-29,-10,-21,-1,8,-12,9,-1,-10,-19,-30,-30,17,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-22,-22,-26,-16,-1,-24,-9,9,-9,22,26,-20,-24,-7,4,-21,-10,5,-20,-3,-13;
MA   /M: SY='A'; M=28,-18,-10,-24,-18,-11,-13,-24,7,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,1,21,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=1,-19,-19,-27,-20,-6,-10,-10,12,-13,9,33,-18,-20,-9,-15,-12,-8,11,-21,-7,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,13,-25,10,14,-27,-13,-1,-25,16,-26,-14,16,-11,14,8,4,-1,-24,-29,-15,14;
MA   /M: SY='G'; M=-5,11,-27,15,-2,-29,24,-1,-34,-10,-26,-20,10,-15,-8,-13,1,-11,-27,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=23,-6,-10,-10,-6,-18,-3,-15,-12,-11,-19,-14,-1,-12,-6,-14,25,11,-1,-32,-19,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-31,23,13,-35,-14,-5,-32,20,-29,-17,5,-2,11,8,-5,-10,-26,-28,-16,11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-4,-23,-21,-2,-26,-20,9,-17,6,7,-18,-23,-18,-16,-4,13,18,-26,-4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-18,-34,-29,10,-32,-28,30,-24,12,11,-24,-26,-27,-23,-14,-5,34,-21,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-24,-2,4,-24,-19,-11,-24,30,-24,-11,3,-11,4,20,-1,6,-15,-24,-11,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,68,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-33,-1,16,-28,-21,-13,-23,14,-26,-15,-9,30,3,1,-8,-9,-23,-27,-20,7;
MA   /M: SY='N'; M=-11,29,-25,26,13,-26,-1,6,-28,-1,-27,-21,30,-14,2,-4,5,-4,-29,-36,-19,7;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-37,-6,1,-29,-18,-18,-21,-10,-30,-20,-16,78,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,72,-29,-18,2,-28,11,6,-20,-29,-36,-19,-20,-10,1,7,27,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,16,-27,16,14,-31,-15,0,-25,14,-25,-13,13,-11,20,7,1,-3,-25,-28,-14,17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-32,-27,27,-31,-18,18,-22,9,6,-22,-27,-26,-20,-15,-4,19,-6,19,-27;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-1,-21,-11,-20,-2,-21,-11,-11,-11,-11,-11,-12,-11,-21,9,-1,-1,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-19,37,-30,51,16,-36,-13,17,-37,3,-28,-23,16,-12,3,-5,-3,-12,-29,-36,-12,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-24,-25,-23,28,-30,2,8,-17,9,4,-23,-30,-18,-14,-19,-8,4,11,49,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00583;
//
ID   DNA_LIGASE_A1_MP; MATRIX.
AC   MP00697;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-dependent DNA ligase AMP-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7873199; R2=0.0096150; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=495; N_SCORE=6.546; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=491; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-28; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-37,-72,22,2,-66,-41,-65,45,-61,-41,-56,21,22,-58,-36,55,-27,21,-83,-65;
MA   /M: SY='S'; M=11,-72,-1,22,-32,-41,-15,13,-8,-44,-58,3,35,-23,-62,36,-14,19,-76,9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-75,-53,48,-70,-69,8,27,31,-32,-58,21,-10,11,27,0,-56,-12,-78,-65;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-74,17,54,-14,-29,-61,7,37,-20,31,-27,-66,-50,-54,-35,-4,9,-75,-4;
MA   /M: SY='A'; M=39,-72,-16,16,-63,-43,-66,36,-8,6,7,-62,-69,8,13,-8,-15,-9,32,-62;
MA   /M: SY='L'; M=27,-14,-3,-7,25,-43,-63,-53,37,37,8,12,-11,-58,-31,-36,-58,-22,-72,-57;
MA   /M: SY='K'; M=5,-72,-3,-33,-13,-71,-63,14,47,17,-13,-9,-70,-22,32,-20,19,-11,-75,-60;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-75,-12,46,35,-7,-59,-39,57,-21,46,-9,-29,-49,0,-35,-4,-64,-70,-56;
MA   /M: SY='M'; M=-27,25,28,42,10,-29,22,-19,1,10,47,-10,-70,-4,-32,-60,-33,9,-78,-58;
MA   /M: SY='G'; M=-39,-78,23,22,-75,54,22,-73,-20,-25,39,14,45,-4,-64,-33,-34,-72,5,-67;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-75,-13,-18,-17,52,-14,-44,20,-75,-67,34,22,27,-31,15,-15,-45,5,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-74,29,36,-72,23,-60,-40,21,-70,-18,-24,4,-21,6,14,6,1,-77,-5;
MA   /M: SY='F'; M=52,-13,-78,-71,78,-27,-68,-30,-70,-16,53,-70,2,-70,-72,-59,-59,-2,-60,-43;
MA   /M: SY='W'; M=15,-74,-37,-10,49,-46,-67,33,-67,-3,-51,-68,-74,-7,-70,-60,24,-9,84,43;
MA   /M: SY='C'; M=30,70,-79,-75,31,-46,-77,54,-73,-46,-11,-70,-76,-73,-76,-10,-55,45,-75,-57;
MA   /M: SY='E'; M=-61,-81,27,105,-84,-74,-11,-84,-42,-77,-73,-54,-57,14,-52,-56,-60,-77,-82,-72;
MA   /M: SY='Y'; M=-62,25,-60,50,-8,-48,-60,28,-60,-28,-54,-65,-70,-57,-35,-60,34,4,61,70;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='Y'; M=-30,-76,-75,-74,31,-48,-48,-48,-67,34,41,-73,-82,-64,-18,-68,-64,-53,-41,107;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-80,117,-32,-87,-64,-53,-86,-54,-84,-83,10,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='E'; M=34,-75,19,87,-77,-68,-59,-12,-49,-68,-65,-57,-61,0,-57,-32,-57,2,-81,-70;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='M'; M=37,10,-78,-73,-58,-7,-73,39,-70,-43,75,-70,-73,-68,-73,-60,-55,59,-79,-61;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-82,-56,-37,-18,-68,-49,-69,-25,-34,-56,-7,-68,125,-42,-50,-61,-29,-72,-59;
MA   /M: SY='I'; M=0,-70,-83,-77,-51,-82,-77,65,-75,22,49,-76,-76,-72,-76,-68,-56,60,-78,-58;
MA   /M: SY='H'; M=-68,24,-54,-16,-68,-71,144,-83,-58,-68,-55,-44,-70,-19,-53,-59,-67,-51,-101,-39;
MA   /M: SY='K'; M=-41,-75,-64,-52,-13,-45,-58,-35,81,-30,58,-56,-68,-2,11,-36,-58,2,7,21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,9,70,-47,-72,-65,-13,-24,21,-15,30,40,-69,-3,14,-18,6,-41,-86,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-75,10,31,-80,76,-60,-83,-59,-56,-73,48,-30,-56,-67,15,-58,-79,-80,-74;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-75,85,13,-37,14,-53,-78,-18,-79,-74,56,-67,-53,-61,-7,-15,-48,-86,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-76,29,49,-78,40,8,-75,34,-52,-68,-7,-29,-49,-2,1,-32,-17,-80,-69;
MA   /M: SY='F'; M=-39,-14,-68,14,52,-75,-66,22,-39,-16,-49,-12,-74,-27,-68,13,-3,49,-65,30;
MA   /M: SY='K'; M=11,-71,-3,-58,25,-69,7,19,33,-56,-14,-58,-70,-5,7,19,6,20,-69,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-44,-77,-19,-40,46,-80,-15,58,-24,3,-46,-71,28,-68,-37,-69,-61,1,9,61;
MA   /M: SY='F'; M=-45,-15,-79,-77,87,6,-61,9,-25,-23,-51,-72,-81,-74,-70,-68,-65,-3,35,71;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-68,-61,-62,18,9,-57,-67,-59,-34,-17,-51,-68,-55,-17,85,8,-63,-66,47;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-16,-63,-54,-2,-71,-54,-76,2,-36,-62,-55,-74,-44,100,36,-58,-71,-73,-23;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00295;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F9_2_MP; MATRIX.
AC   MP00698;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 9 active sites signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5419507; R2=0.0163325; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=303; N_SCORE=10.481; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=59; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-17,-24,-21,0,-27,-23,17,-21,13,6,-17,-20,-20,-19,-9,4,19,-25,-6,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-23,-15,-2,-26,-9,7,-20,19,7,-18,-17,-13,-13,-16,-3,1,-18,-2,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-12,-19,-15,-14,-3,-23,-11,7,-13,-2,0,-11,-15,-13,-15,-5,4,8,-17,5,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-9,-14,-27,47,-17,-33,-12,-26,-16,-1,-17,-12,-14,1,-13,-25,-19,-24,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-13,-18,-8,-19,-4,-17,-11,-9,-11,-9,-9,-8,-6,-17,8,2,-3,-19,-16,-8;
MA   /M: SY='I'; M=1,-23,-17,-27,-20,-1,-24,-20,19,-21,18,14,-21,-23,-17,-19,-11,-3,19,-25,-7,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-14,-27,-24,2,-28,-25,18,-11,5,6,-24,-28,-24,-7,-11,-2,34,-26,-7,-24;
MA   /M: SY='G'; M=2,-12,-28,-13,-17,-25,43,-20,-29,-16,-19,-14,-5,-13,-17,-18,-4,-16,-23,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-28,-3,-13,-29,47,-17,-36,-11,-29,-19,2,-17,-14,-13,2,-12,-26,-23,-26,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-35,-12,-3,-27,-19,-21,-16,-11,-25,-17,-19,71,-11,-19,-7,-5,-22,-29,-27,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,21,-31,28,4,-32,6,-7,-32,-6,-30,-24,14,8,-6,-13,-1,-10,-30,-34,-24,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-3,-22,-5,4,-24,-9,-7,-17,3,-19,-7,0,-8,11,1,7,-1,-14,-26,-15,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-22,0,-3,-12,-12,6,-20,2,-19,-11,10,-16,-2,2,2,1,-17,-24,-4,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,31,12,42,6,-34,-16,-8,-37,-8,-27,-27,9,-18,-8,-16,-3,-10,-24,-43,-23,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-15,0,1,-18,4,-5,-15,-2,-14,-8,2,-9,3,-3,3,-4,-12,-18,-13,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-28,-29,-25,47,-29,1,-2,-18,2,-2,-22,-30,-22,-15,-22,-12,-8,33,57,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-22,-12,-9,-15,-20,-13,-1,-10,-7,-4,-8,-2,-10,-12,-2,2,0,-27,-12,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-25,15,12,-25,-14,3,-21,-1,-18,-13,3,-12,4,-5,1,-7,-16,-31,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-16,-29,-20,-10,-13,-27,-11,-2,7,-5,1,-7,-19,0,29,-12,-7,-3,-20,-7,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-20,19,6,-28,-8,-4,-24,-3,-23,-16,11,-9,6,-7,8,1,-21,-33,-18,6;
MA   /M: SY='B'; M=-3,24,-13,21,1,-23,-7,-2,-23,-5,-25,-20,23,-16,-4,-9,9,0,-20,-35,-16,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-33,-27,-23,31,-28,4,-4,-14,-3,-4,-24,-30,-16,-13,-24,-14,-13,55,63,-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,1,-18,-1,4,-22,-10,-7,-14,-4,-20,-12,6,-13,8,-4,15,5,-11,-32,-16,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-16,-8,-3,-16,-19,6,-15,-3,-11,-5,-1,-16,8,-1,2,7,-14,-23,-1,1;
MA   /M: SY='N'; M=4,18,-15,5,-3,-18,-4,-3,-17,-5,-24,-17,30,-15,-3,-6,18,13,-17,-36,-18,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-23,-29,-21,-13,-15,-25,-24,6,-17,-6,-3,-21,30,-16,-22,-11,-5,0,-27,-17,-18;
MA   /M: SY='T'; M=21,-4,-10,-14,-10,-14,-11,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,29,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-8,-22,-19,-5,-27,-23,10,-20,7,2,-12,-19,-16,-18,-2,18,11,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,8,-24,5,-7,-1,-15,8,-12,-6,-14,-11,8,-22,-6,-9,-4,-5,-16,-7,24,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-22,-34,-27,-24,2,-13,-17,0,-19,-8,-6,-17,-24,-16,-19,-19,-14,-9,39,16,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='P'; M=11,-14,-28,-13,-8,-27,9,-20,-22,-13,-24,-17,-12,31,-13,-20,-1,-10,-21,-24,-27,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,33,-30,-20,13,-30,36,14,-26,-30,-26,-20,-26,-10,7,-10,10,-23;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,-13,-25,-21,-5,-22,-24,16,-18,5,6,-20,-22,-20,-19,-2,3,27,-28,-11,-21;
MA   /M: SY='G'; M=2,-16,-29,-18,-19,-13,28,-19,-27,-16,-21,-16,-10,-21,-17,-14,-6,-16,-22,11,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-17,-11,-22,-16,-11,-14,-21,5,-15,0,1,-16,-13,-16,-19,-1,-1,13,-26,-15,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-18,-28,-19,5,-23,-21,14,-26,34,13,-25,-26,-19,-20,-21,-6,9,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-12,-16,-11,-18,3,-19,-9,-12,-13,-10,-7,-13,-11,-18,12,2,1,-25,-19,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-16,-25,-20,-14,8,-11,-7,-13,-5,-11,-7,-12,-21,-11,-3,-9,-9,-11,7,16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-32,-23,24,-28,-18,15,-25,26,15,-25,-27,-23,-19,-22,-9,11,-11,9,-22;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-16,-14,-12,-10,-13,-14,-3,-13,-5,-6,-7,-17,-11,-16,3,3,1,-17,-6,-12;
MA   /M: SY='D'; M=4,10,-22,11,8,-27,4,-6,-26,-3,-23,-18,8,-11,-1,-8,7,-5,-20,-30,-20,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-24,-5,1,-15,-7,1,-16,-6,-16,-9,1,-13,3,-7,3,-4,-16,-24,-7,1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-24,-4,-6,-16,3,1,-23,-8,-21,-13,-1,-7,-5,-9,1,-6,-20,-19,-2,-8;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-20,-7,-7,-21,13,-12,-22,-8,-19,-13,0,-16,-8,-7,8,-2,-13,-27,-19,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00511;
//
ID   NITROGENASE_1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00699;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitrogenases component 1 alpha and beta subunits signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0462379; R2=0.0174059; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=172; N_SCORE=9.030; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=27; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-4,-17,-1,-11,-8,-16,-17,-3,-17,2,-4,-10,-21,-17,-19,-10,-8,1,-26,-10,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-19,-28,59,-19,-36,-17,-28,-18,-1,-20,-18,-14,-1,-18,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-7,-17,-9,-20,-1,-17,-15,-6,-14,-12,-7,-13,-8,-8,8,-1,-5,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-8,-24,-11,-2,-21,-13,-8,-13,14,-14,4,-6,-15,7,11,-5,-7,-9,-22,-10,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-18,-30,-26,14,-31,-21,21,-23,19,10,-26,-28,-25,-19,-17,-3,24,-16,7,-26;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,0,-26,-19,-13,-15,-25,5,-17,-2,-2,-17,-19,-18,-22,-1,-2,14,-25,-16,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-19,-22,-18,5,-3,-18,-4,-22,9,2,-14,-22,-18,-18,-7,-4,-3,-18,-6,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-24,-18,-12,-13,-7,-13,-1,-16,6,7,-13,-15,-3,-14,-11,-7,-5,-22,-11,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-33,-11,-11,-28,20,-21,-26,-15,-27,-18,-12,32,-16,-20,-5,-14,-25,-25,-29,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-36,-27,9,-34,-24,35,-26,22,22,-22,-23,-20,-24,-20,-9,24,-18,2,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-23,-1,5,-22,-17,-6,-21,18,-20,-11,2,-12,2,13,0,4,-13,-25,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-29,40,9,-33,1,2,-36,0,-28,-24,19,-14,-1,0,0,-11,-29,-34,-19,3;
MA   /M: SY='V'; M=7,-16,1,-22,-19,-9,-14,-18,0,-15,-4,2,-15,-21,-16,-17,-1,4,10,-25,-10,-18;
MA   /M: SY='I'; M=9,-22,-20,-30,-21,-4,-23,-20,20,-20,15,15,-19,-19,-15,-22,-12,-6,15,-19,-5,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-9,-34,-5,0,-26,-16,39,-26,-9,-25,-9,-3,26,4,-8,-9,-15,-30,-29,-5,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-32,-23,8,-32,-16,26,-26,30,21,-24,-26,-18,-21,-23,-10,16,-18,5,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-14,-26,-23,2,-25,-24,20,-20,6,8,-20,-24,-22,-19,-4,3,29,-27,-7,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=4,-12,-27,-8,-3,-26,-5,-17,-20,-11,-27,-19,-9,40,-8,-17,8,-1,-20,-31,-26,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-13,-25,-16,-3,-19,-24,-8,5,-8,1,6,-10,-17,17,-8,-8,-8,-3,-21,-8,6;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=10,-8,-10,-12,-6,-15,-9,-18,-12,-11,-14,-12,-6,-14,-9,-14,11,13,-2,-22,-15,-7;
MA   /M: SY='S'; M=6,-10,-19,-13,-11,-8,2,-8,-14,-12,-14,-6,-5,-17,-6,-13,8,2,-10,-16,0,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-3,-17,-7,-14,24,-21,-2,-11,-15,-8,-9,1,-25,-18,-13,-9,-7,-13,-5,23,-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,-15,-13,-13,-10,-3,-13,-11,-14,-14,-10,-4,-16,-13,-14,12,14,-1,-26,-10,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-27,-39,-27,-17,-2,-21,-18,-19,-1,-12,-11,-24,-26,-9,11,-27,-20,-21,64,11,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-22,6,-5,-17,-12,-3,-13,-10,-10,-8,-1,-18,-6,-11,-2,0,-6,-27,-7,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-20,-12,-11,-5,-11,-9,-3,-15,0,-3,0,-21,-12,-13,-4,2,-4,-24,-5,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-17,-21,-20,-10,2,-25,-11,-11,5,1,-1,-11,-23,-7,23,-16,-10,-8,-16,-2,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-22,-10,-12,-18,5,-13,-16,-3,-17,-10,1,-20,-9,7,2,-4,-7,-27,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-23,-9,-3,-10,-17,-1,-18,5,-16,-9,0,-18,6,19,2,2,-15,-17,2,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-6,-27,-7,-5,-16,-19,32,-16,-6,-10,-3,-3,-11,0,-2,-10,-13,-16,-23,5,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-14,-16,-19,-15,25,-16,-13,-8,-18,-9,-7,-6,-20,-18,-14,8,7,-4,-14,7,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,7,-23,9,6,-26,-13,-3,-28,16,-27,-16,7,-12,5,15,7,1,-18,-30,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-28,12,21,-28,6,-5,-30,1,-26,-20,10,-5,4,-5,3,-9,-29,-30,-22,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00085;
//
ID   RIBOSOMAL_L6_2_MP; MATRIX.
AC   MP00700;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L6 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4263616; R2=0.0160164; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=762; N_SCORE=17.621; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-1,-27,-9,-9,-16,-18,-11,3,-12,-12,-6,10,3,-6,-15,-3,-5,-8,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,38,-24,44,11,-31,-6,0,-31,-2,-30,-26,27,-12,0,-8,10,-2,-26,-40,-20,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-25,-25,-16,-8,-31,-22,18,-4,7,9,-17,-20,-12,-9,-17,-8,15,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,17,54,-27,-21,2,-28,9,-19,-18,-1,-2,20,0,-1,-10,-29,-26,-14,37;
MA   /M: SY='B'; M=0,7,-22,6,1,-14,-13,-1,-18,-3,-12,-11,5,-15,-5,-7,-2,-6,-14,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-4,-29,-29,-1,-30,-30,26,-20,8,8,-29,-30,-29,-20,-9,1,46,-31,-11,-29;
MA   /M: SY='G'; M=12,-7,-20,-8,-11,-25,34,-17,-28,-15,-26,-18,2,-15,-11,-17,15,-3,-18,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,-1,16,-37,-15,8,-22,10,-21,-2,2,-12,50,13,0,-10,-29,-21,-11,32;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-11,-6,-7,-13,-13,-16,-13,-9,-16,-13,5,-11,-7,-10,24,38,-4,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,-5,-21,-12,-19,-3,-19,-9,-11,-8,-5,-11,-12,-10,-20,7,-1,0,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,28,-22,20,0,-19,-8,3,-18,-4,-16,-15,34,-20,-3,-2,0,-4,-23,-36,-16,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,15,44,-31,-18,2,-27,12,-22,-16,5,-4,25,4,0,-9,-29,-28,-17,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-27,-3,14,-33,-19,5,-16,4,-14,0,-2,-12,45,5,2,-6,-24,-22,-10,29;
MA   /M: SY='A'; M=21,-12,-17,-18,-10,-15,-12,-18,-3,-7,-4,-4,-10,-14,-8,-13,3,-1,1,-23,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,17,-13,-13,-13,-20,-21,-15,-14,-14,-13,-3,-16,-13,-14,16,34,-3,-35,-15,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-27,-4,2,-22,-18,3,-26,26,-23,-9,4,-15,6,29,-6,-5,-19,-21,-5,2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-23,-4,2,-22,-18,-11,-22,26,-23,-10,2,-13,3,21,0,4,-13,-25,-11,2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,18,-28,18,3,-29,13,-4,-33,3,-29,-20,19,-16,-3,2,1,-10,-28,-30,-21,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-9,-30,-11,-2,-7,-22,-8,-23,27,-20,-8,-7,-17,0,23,-14,-11,-17,-2,6,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-19,-29,-21,-13,-13,-27,-18,5,-6,-6,-1,-13,5,-9,3,-10,-3,1,-24,-11,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-18,-24,-21,-14,-12,-29,-22,12,5,-3,5,-15,-19,-11,-3,-13,-7,17,-23,-7,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-12,-23,-13,0,-17,-20,-5,-4,-8,5,7,-11,-17,19,-5,-6,-6,-10,-22,-8,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,46,-29,20,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,34,-30,17,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,76,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,19,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-14,-16,-16,-1,-19,-11,2,-13,-8,-4,-11,-21,-13,-13,8,9,11,-20,7,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-29,16,34,-30,-18,4,-30,17,-23,-16,3,-6,17,9,-2,-10,-27,-28,-14,25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-27,0,10,-26,1,-12,-26,-4,-23,-18,-4,10,-2,-8,2,-4,-23,-27,-22,3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-18,-13,-13,-10,-6,-15,-6,-9,-11,-6,-2,-20,-10,-10,1,4,1,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-28,-25,-14,-11,-32,-21,20,-6,3,9,-14,-18,-7,-8,-15,-9,13,-21,-5,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-23,-9,-1,-21,3,-17,-13,-8,-15,-10,-10,-10,-8,-12,-2,-6,-5,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-28,-2,10,-20,-13,-12,-10,-6,-7,-7,-7,-6,0,-10,-6,-9,-13,-26,-15,4;
MA   /M: SY='E'; M=5,1,-20,3,10,-18,-16,-12,-13,-7,-5,-10,-6,-12,-3,-12,0,2,-8,-27,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-26,9,20,-17,-18,-2,-19,0,-13,-5,-2,-10,13,-5,-4,-9,-19,-23,-10,17;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-14,1,10,-19,-9,-11,-19,-6,-23,-17,5,-8,1,-8,27,22,-11,-35,-17,5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00454;
//
ID   RIBOSOMAL_L16_2_MP; MATRIX.
AC   MP00701;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L16 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3296494; R2=0.0160339; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=463; N_SCORE=12.743; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=73; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-27,-9,0,-19,-20,-3,-26,26,-18,-9,1,-19,7,54,-10,-8,-18,-21,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-29,-21,-34,-28,1,-33,-28,36,-25,16,15,-24,-24,-23,-25,-15,-6,34,-23,-4,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-15,-37,-27,64,-29,-19,-1,-28,9,-1,-21,-24,-36,-20,-20,-10,-2,4,24,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-30,-13,-4,-22,-20,-20,-19,-12,-26,-18,-19,71,-12,-20,-9,-7,-25,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-18,34,-28,44,12,-29,-12,19,-33,-3,-26,-21,20,-14,1,-7,-1,-10,-28,-35,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-12,-26,-14,-6,-13,-24,-15,-10,16,-8,-2,-11,-18,-4,13,-13,-6,-4,-14,-5,-5;
MA   /M: SY='P'; M=2,-13,-28,-10,-3,-24,-14,-17,-16,-10,-24,-15,-11,47,-8,-17,4,1,-19,-30,-24,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-30,-24,4,-31,-21,26,-20,19,14,-25,-27,-21,-19,-18,-6,26,-19,4,-24;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-4,-9,-9,-12,-17,-19,-13,-11,-14,-12,1,-11,-9,-11,22,42,-2,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-23,-8,2,-20,-12,-9,-17,15,-18,-6,-3,-13,3,8,-1,-5,-11,-22,-11,2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-4,6,-25,-21,-4,-27,38,-23,-8,-1,-13,8,32,-10,-9,-18,-21,-8,6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-16,-33,-10,-3,-28,-8,-19,-21,-11,-28,-19,-14,61,-10,-19,-2,-7,-25,-29,-28,-10;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-15,-20,-13,-11,-13,-18,2,-13,1,-1,-10,-15,-12,-15,0,0,5,-24,-13,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-30,21,39,-31,-1,-4,-33,3,-23,-21,3,-5,10,-5,0,-12,-30,-29,-22,25;
MA   /M: SY='V'; M=5,-16,-10,-20,-19,-7,-22,-24,9,-15,-1,-1,-15,-20,-19,-16,5,18,24,-30,-12,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-21,-1,4,-25,-10,-9,-25,21,-28,-14,6,-11,4,13,9,1,-16,-28,-15,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,68,-20,-40,-19,-30,-20,0,-20,-19,-18,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=16,3,-15,-3,-4,-20,2,-11,-18,-9,-21,-15,9,-11,-5,-12,18,8,-12,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-28,-18,-12,-14,-24,-21,-2,-14,-14,-9,-22,40,-17,-19,-10,-5,-2,-28,-19,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-27,20,36,-27,-17,-2,-28,7,-20,-19,2,-5,11,-2,0,-7,-25,-27,-14,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-26,-15,-13,6,-11,5,-13,-8,-10,-4,-10,-23,-10,-7,-10,-10,-12,0,21,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-45,-37,-27,14,-21,-27,-19,-15,-17,-17,-34,-29,-19,-13,-35,-26,-26,120,26,-19;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-13,-29,-26,-2,-26,-26,25,-19,8,10,-25,-26,-24,-20,-9,-2,37,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='A'; M=28,-14,2,-23,-15,-8,-10,-19,-7,-14,-7,-6,-13,-17,-15,-20,3,-1,2,-20,-12,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-13,-23,-14,-8,-10,-23,-16,-2,-2,-10,-4,-10,-3,-10,0,-8,-6,3,-26,-12,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-15,-31,-28,0,-31,-29,31,-22,15,12,-27,-27,-26,-22,-13,-3,40,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-3,8,-28,-19,-6,-27,35,-26,-9,-1,-7,12,26,-7,-8,-20,-22,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-34,-11,-3,-25,-20,-18,-17,-6,-24,-16,-16,59,-9,-10,-7,-5,-21,-28,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-6,-16,-29,61,-17,-38,-17,-30,-20,6,-20,-17,-18,1,-18,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-25,-6,2,-22,-18,-5,-24,23,-21,-9,1,-14,7,30,-2,2,-16,-23,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-37,-29,0,-36,-27,42,-26,18,21,-23,-23,-21,-26,-18,-8,33,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-31,-22,6,-30,-19,25,-26,37,25,-27,-25,-17,-20,-26,-10,14,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,65,-30,-9,1,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-2,15,43,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-35,-26,10,-31,-21,30,-24,21,23,-23,-24,-20,-22,-19,-8,22,-18,1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=1,7,-23,8,9,-26,0,-7,-25,0,-22,-16,6,-11,3,-5,7,-3,-20,-29,-19,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00506;
//
ID   GM_CSF_MP; MATRIX.
AC   MP00702;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6302814; R2=0.0132787; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1015; N_SCORE=18.098; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,11,-25,4,5,-25,-15,-6,-25,29,-27,-13,16,-13,5,17,-1,0,-20,-27,-13,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,3,-25,1,0,-27,31,-10,-32,-10,-28,-20,11,-15,-7,-12,9,-8,-26,-28,-25,-3;
MA   /M: SY='P'; M=9,-15,-28,-11,-3,-26,-12,-19,-17,-10,-25,-17,-13,50,-9,-19,2,-3,-19,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-13,-10,-8,-12,-20,-17,-13,-3,-12,-10,0,-12,-7,3,15,40,-3,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,26,52,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-23,-33,-23,2,-27,-12,28,-19,26,42,-22,-22,-9,-17,-22,-10,15,-20,0,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-17,6,2,-22,-4,-4,-22,4,-30,-18,24,-13,2,1,21,8,-18,-36,-18,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-30,4,22,-33,-20,-3,-27,32,-25,-9,0,-8,25,19,-5,-10,-25,-22,-12,24;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-25,-3,11,-31,-20,-1,-19,10,-19,-4,0,-10,35,7,4,6,-21,-23,-10,23;
MA   /M: SY='H'; M=-17,11,-27,5,0,-20,-15,76,-27,-7,-23,-5,23,-20,7,0,-5,-15,-30,-33,9,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-33,-17,-7,-16,-24,-20,-6,-17,-2,-6,-24,48,-14,-20,-17,-10,-16,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-37,-3,14,-31,-20,-12,-22,-4,-27,-17,-14,60,5,-12,-7,-10,-30,-29,-26,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,7,-25,16,5,-29,-9,-10,-25,-7,-30,-23,3,22,-3,-13,13,2,-22,-37,-23,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-25,10,42,-27,-15,-5,-25,5,-17,-17,-3,-3,12,-5,3,-7,-22,-27,-20,27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-15,-18,-15,-7,-25,-23,6,-15,-2,-2,-5,-13,-13,-15,9,34,8,-27,-7,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,31,-37,-20,7,-23,10,-20,-5,0,-7,49,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-8,-15,-15,-16,-8,-18,-16,8,-14,-5,3,-2,-19,-12,-14,5,10,12,-31,-11,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-25,-32,-25,-3,-35,-27,34,-25,12,12,-15,-17,-17,-25,-9,6,22,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-12,-5,-8,-12,-17,-15,-12,-8,-13,-12,9,-12,-8,-8,18,42,-5,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,5,24,-31,-20,-5,-29,35,-26,-12,0,-7,18,20,-6,-10,-24,-23,-13,21;
MA   /M: SY='S'; M=-1,20,-17,22,5,-25,-3,-4,-25,-6,-30,-23,21,-12,0,-8,24,9,-19,-40,-20,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-30,-11,-1,-22,-25,-15,-9,29,-17,-2,-5,-13,2,14,-13,-10,-7,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-30,24,39,-32,-18,-3,-32,19,-25,-19,4,-5,14,6,-3,-10,-27,-29,-17,26;
MA   /M: SY='N'; M=-6,26,-20,13,2,-22,-3,3,-22,6,-30,-18,41,-16,2,3,12,2,-25,-37,-18,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00584;
//
ID   OKR_DC_1_MP; MATRIX.
AC   MP00703;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Orn/Lys/Arg decarboxylases family 1 pyridoxal-P attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3127546; R2=0.0185011; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=276; N_SCORE=11.409; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=11; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-26,-2,25,-17,-20,0,-8,1,-3,15,-9,-9,11,-4,-9,-10,-13,-26,-11,18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-1,-20,-13,-9,-23,-17,-7,-14,5,-2,-16,-12,-12,-5,-11,-6,-6,-29,-13,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-18,-29,-16,-16,-18,19,-20,-17,-21,-5,-8,-14,1,-18,-20,-11,-15,-18,-22,-21,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-24,-23,-8,-2,-27,-12,17,-17,24,25,-20,-20,-7,-15,-20,-10,7,-22,-3,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-20,7,1,-21,-9,-11,-18,-11,-20,-17,2,4,-4,-13,15,6,-14,-36,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=6,3,-26,6,0,-30,29,-14,-32,-10,-24,-20,1,-13,-9,-16,2,-12,-23,-25,-25,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,4,-25,10,5,-14,-20,-6,-7,-10,7,7,-7,-17,-3,-12,-14,-10,-9,-28,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-29,-2,1,-26,-1,17,-28,6,-23,-9,9,-18,14,20,-3,-12,-27,-24,-10,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-14,-8,-1,-9,-15,-13,2,-7,-5,-3,-13,7,-8,-10,-5,-3,6,-18,-11,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=12,12,-20,5,17,-23,-7,-4,-20,0,-19,-16,14,-10,3,-7,7,-3,-19,-29,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-30,15,-8,-33,45,-14,-40,-14,-30,-23,6,-17,-14,-17,0,-17,-30,-26,-27,-11;
MA   /M: SY='P'; M=3,-12,-30,-9,1,-28,-16,-17,-21,8,-26,-15,-12,38,-4,-5,-6,-8,-20,-25,-22,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-24,0,-12,-20,5,-19,-11,-15,-13,-10,-3,-18,-15,-18,-1,-1,-4,-28,-17,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-22,-19,-27,-21,31,-25,-11,12,-20,13,6,-17,-22,-20,-16,-17,-8,5,2,22,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=17,-10,-16,-11,5,-17,-15,-17,-4,-7,-7,-7,-13,-13,-7,-14,1,-3,6,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='T'; M=11,-8,-10,-16,-14,-10,-17,-22,-3,-12,-6,-6,-8,-14,-14,-14,12,30,9,-28,-12,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,-2,10,-30,-20,19,-19,2,-18,-2,2,-12,36,4,3,2,-23,-24,-5,22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-10,-21,-21,-5,-25,-25,11,-15,1,1,-16,-21,-21,-15,4,24,26,-30,-10,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-23,-21,-8,-7,-25,-8,8,-15,24,20,-19,-22,8,-9,-19,-10,-2,-20,-3,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-25,-16,-8,-14,-5,-11,-6,-15,11,5,-14,-22,5,-11,-14,-12,-11,-20,-10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=29,-1,-16,-11,-11,-22,15,-15,-18,-11,-18,-14,4,-14,-11,-17,8,-4,-12,-23,-22,-11;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,-16,-12,-11,-23,22,-18,-21,-13,-21,-15,-2,-13,-11,-18,14,-2,-11,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,43,-30,-20,11,-30,31,11,-25,-30,-29,-20,-25,-10,5,-6,14,-25;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-10,-12,-8,-17,-6,-18,-12,-10,-14,-12,-2,-10,-8,-15,20,20,-2,-28,-17,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-17,-27,-21,-10,-6,-28,-3,11,-11,9,17,-15,-20,10,-10,-15,-10,-1,-11,11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-18,9,-28,4,0,-20,-16,80,-28,-8,-22,-4,21,-20,8,0,-6,-16,-30,-32,11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-21,-22,-15,-9,-26,-17,12,2,1,16,-17,-20,-10,-4,-14,-7,17,-23,-6,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-30,26,24,-33,10,-6,-36,-2,-26,-23,6,-9,2,-9,0,-13,-30,-30,-23,13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-26,10,5,-30,20,-11,-34,-2,-29,-20,5,-12,-4,-7,6,-9,-25,-28,-23,1;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-16,-28,-17,-12,-3,-27,25,-2,-11,5,6,-10,-24,-4,1,-17,-13,-7,-16,16,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-4,-24,-8,-16,-14,-9,-18,6,-17,-6,-2,-1,-21,-16,-19,-7,-8,6,-28,-13,-18;
MA   /M: SY='E'; M=5,1,-22,3,19,-26,-12,-9,-24,15,-24,-15,1,-7,7,4,7,-2,-17,-27,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-30,-4,9,-25,4,-13,-19,3,-18,-11,-3,-12,-1,-5,-6,-13,-18,-23,-17,3;
MA   /M: SY='B'; M=-2,16,-22,14,8,-29,-12,-1,-21,0,-21,-13,13,-12,16,-4,6,3,-21,-29,-15,12;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-15,-23,-17,-15,30,-25,-13,-8,-13,5,-2,-12,-25,-20,1,-17,-10,-6,-8,9,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,2,-19,-4,-7,-16,-13,-5,-12,3,-18,-10,13,-21,-4,15,5,0,-6,-32,-15,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00585;
//
ID   PROK_CO2_ANHYDRASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00704;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic-type carbonic anhydrases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2590537; R2=0.0152527; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=806; N_SCORE=17.543; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-30,22,37,-32,-18,-3,-32,21,-25,-19,3,-5,13,8,-3,-10,-27,-29,-17,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-32,5,30,-35,-20,1,-23,6,-22,-11,-4,13,33,1,-2,-10,-30,-25,-17,30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-14,-14,-5,-22,-4,-17,-15,2,-16,-11,-6,-10,-5,-9,10,1,-5,-23,-18,-5;
MA   /M: SY='K'; M=0,6,-23,6,4,-25,-14,2,-25,13,-22,-12,3,-11,1,4,0,0,-16,-26,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-7,-30,-7,-11,-30,41,5,-35,-14,-27,-14,2,-18,-3,-12,-2,-18,-30,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='H'; M=7,-2,-16,-6,-4,-18,-10,21,-20,-10,-20,-10,4,-13,0,-9,15,8,-13,-31,-6,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-5,4,-24,-20,13,-30,31,-24,-8,2,-16,10,44,-10,-12,-22,-22,-5,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-21,-26,-23,23,-30,-9,11,-18,5,3,-19,-26,-20,-16,-12,1,10,0,31,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,35,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-32,-21,-36,-30,39,-28,-25,8,-25,5,0,-27,-30,-33,-20,-20,-10,13,19,15,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-30,-26,-40,-30,29,-36,-26,32,-30,16,13,-20,-24,-27,-26,-20,-10,19,-9,11,-30;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,3,-15,-13,-20,4,-20,-19,-14,-18,-14,-5,-15,-13,-18,12,8,-8,-29,-21,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,32,-23,18,13,-28,-28,-27,-22,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-12,1,26,5,-9,-25,-22,-19,-22,-16,-20,-19,-9,-7,-17,-21,-7,-8,-11,-40,-24,-14;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18,73,-10,-20,-7,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-20,13,19,-23,-6,-1,-23,0,-27,-20,23,-10,6,-4,18,4,-23,-37,-20,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-21,-20,-13,-4,-27,0,5,-11,17,10,-18,-25,-12,-8,-19,-10,6,-24,0,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-18,-29,-24,0,-31,-26,27,-23,16,11,-21,-23,-21,-21,-11,5,27,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-14,-17,-14,-3,-24,-20,1,-17,12,1,-11,-17,-14,-14,2,28,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,13,-28,13,9,-35,3,2,-27,1,-25,-12,13,-14,24,-1,2,-10,-30,-27,-17,17;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-18,-18,-19,-12,8,-19,-14,-4,-15,7,-1,-11,-22,-13,-3,-3,-1,-3,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-30,11,38,-32,-3,-2,-30,4,-22,-17,0,-6,19,-2,0,-12,-30,-26,-20,29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-32,-16,-8,-21,-21,-17,-6,-11,-15,-1,-21,54,-11,-18,-12,-9,-12,-28,-22,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /M: SY='L'; M=12,-23,-16,-26,-16,-1,-19,-20,9,-23,28,9,-23,-23,-16,-20,-15,-6,6,-20,-7,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,22,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,10,40,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-27,-32,-25,-3,-35,-8,33,-25,12,15,-17,-22,-17,-23,-17,-10,23,-23,2,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00586;
//
ID   PROK_CO2_ANHYDRASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00705;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic-type carbonic anhydrases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4993863; R2=0.0152113; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=704; N_SCORE=16.198; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=10,-19,-26,-20,-11,-19,-18,-23,0,-14,-11,-7,-18,27,-14,-22,-5,-6,-2,-25,-20,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-1,3,-28,0,0,-25,-11,-9,-20,1,-27,-17,10,27,-4,-7,-1,-5,-24,-31,-23,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-26,-18,-12,1,-25,-9,0,-14,-3,-2,-14,-1,-7,-14,-7,0,-6,-12,9,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-7,10,-6,-15,-2,-22,-11,-11,-16,-11,-11,-10,-26,-17,-17,-4,-4,-2,-23,3,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-11,-30,-13,-10,-16,-1,3,-13,-2,-15,-4,-5,-18,-3,-5,-10,-14,-14,-15,2,-9;
MA   /M: SY='H'; M=6,-1,-20,-5,-2,-21,-11,8,-19,-2,-21,-11,4,-3,-1,-5,7,3,-15,-29,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-23,1,20,-24,-17,-10,-23,13,-19,-14,-2,-7,6,5,3,3,-16,-25,-15,13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,16,-27,20,1,-13,-14,4,-21,-5,-22,-18,11,-8,-4,-9,0,-4,-22,-19,7,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-18,-20,-20,-17,-3,5,-19,-8,-22,5,-2,-13,-22,-18,-19,-6,-7,-6,-20,-11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,2,-23,-3,-12,-24,36,-13,-30,-14,-27,-19,13,-17,-12,-14,10,-2,-24,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-15,10,-18,-9,-10,-26,-22,-1,-16,1,-3,-17,-23,-16,-17,-5,4,10,-33,-14,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-26,-15,-15,-18,18,-19,-14,-13,-8,-6,-7,-20,-14,-14,-6,-12,-12,-22,-17,-15;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,18,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='A'; M=22,-9,-10,-15,-11,-15,-8,-19,-5,-12,-12,-9,-6,-14,-11,-16,17,13,7,-29,-17,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-28,1,-33,-26,36,-25,20,20,-25,-25,-22,-23,-18,-6,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,52,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,28,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-7,-9,-12,-14,-18,-19,0,-17,3,-3,-12,-20,-15,-20,-7,-6,4,-27,-13,-14;
MA   /M: SY='H'; M=10,-12,1,-17,-13,-16,-16,15,-11,-15,-11,-4,-9,-21,-10,-15,-3,-8,-1,-29,-7,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-29,3,14,-28,-7,-7,-30,28,-27,-14,5,-11,7,19,-5,-10,-24,-24,-15,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-25,13,29,-28,-12,3,-24,5,-24,-16,15,-8,20,0,9,-3,-27,-32,-18,25;
MA   /M: SY='H'; M=-13,13,-26,11,7,-24,-15,27,-22,4,-22,-10,17,-16,8,2,-2,-9,-22,-31,-6,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-30,6,-35,-29,39,-26,15,15,-24,-25,-25,-25,-16,-6,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-23,78,-33,-30,-14,-33,-30,-8,-30,-9,-9,-20,-34,-27,-30,-13,-10,1,-42,-22,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-12,-4,-4,-13,-7,-9,-16,-10,-23,-16,5,-12,-3,-10,30,24,-8,-31,-8,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-8,17,-26,17,2,-26,-2,15,-29,0,-24,-16,17,-16,0,4,0,-10,-25,-31,-12,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,42,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-6,-35,-27,-3,-32,-22,30,-24,14,25,-21,-24,-17,-24,-18,-9,22,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-28,-2,4,-28,-9,0,-28,26,-26,-9,1,-12,9,15,-5,-6,-21,-22,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=20,-7,-17,-12,-12,-22,23,-19,-22,-14,-20,-15,-2,-14,-12,-17,11,2,-12,-24,-22,-12;
MA   /M: SY='L'; M=3,-25,1,-29,-22,-2,-25,-24,12,-25,21,8,-24,-27,-21,-22,-16,-7,12,-25,-9,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-19,-25,-18,0,-24,-1,12,-20,25,23,-21,-25,-12,-15,-19,-9,8,-22,0,-15;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,-17,-6,2,-17,-13,-13,-15,0,-13,-10,-2,-12,-2,-4,12,12,-8,-29,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-5,-9,-12,-15,4,-22,-13,1,-20,8,0,-1,-26,-17,-17,-13,-8,-4,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,1,-31,1,6,-29,-17,9,-23,7,-26,-11,6,16,14,2,-4,-10,-28,-28,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-12,21,10,-24,-15,-5,-29,0,-22,-19,5,-14,2,0,1,-7,-21,-31,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-4,-25,0,11,-14,-15,-9,-9,-10,7,1,-11,-16,-2,-11,-13,-11,-12,-26,-12,5;
MA   /M: SY='G'; M=7,-1,-23,-3,-6,-28,20,-13,-26,-9,-21,-14,0,-14,-1,-13,5,-4,-20,-23,-21,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-23,-3,4,-13,-21,-3,-10,-12,2,-4,-8,-8,-5,-11,-5,2,-10,-28,-9,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,0,0,-19,-23,-2,-8,2,-12,-1,-5,-1,-2,-5,-11,-11,-11,-23,-4,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00586;
//
ID   PRION_2_MP; MATRIX.
AC   MP00706;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prion protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0868888; R2=0.0144783; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=936; N_SCORE=18.629; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,14,-26,7,13,-33,-13,10,-20,6,-24,-7,22,-14,38,6,4,-6,-30,-27,-14,26;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-23,-4,-4,-16,-20,57,-23,-10,-16,-4,6,-16,3,-4,1,5,-19,-30,9,-4;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-17,-12,3,-11,-26,-19,8,-9,-1,-1,-19,-19,-12,-13,-6,-4,21,-30,-14,-5;
MA   /M: SY='T'; M=18,-4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,32,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-10,-17,-17,-6,-24,-24,4,-14,-3,-3,-11,-17,-17,-14,9,32,18,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='T'; M=18,-4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,32,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=18,-4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,32,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='K'; M=12,-4,-23,-7,3,-26,-13,-14,-23,28,-23,-10,-4,-10,3,12,-3,-6,-13,-20,-14,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,8,-26,1,-13,-26,45,-9,-33,-13,-30,-20,22,-20,-13,-13,4,-13,-30,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,46,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,34,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='N'; M=-6,26,-16,9,-4,-16,-7,-1,-16,-4,-23,-16,38,-16,-4,-4,14,18,-19,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-16,-24,-18,3,40,-26,-13,-11,-16,-1,-7,-13,-19,-18,-13,-13,-10,-11,-4,12,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-10,-17,-17,-6,-24,-24,4,-14,-3,-3,-11,-17,-17,-14,9,32,18,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-14,-17,-14,-6,-20,-13,1,-10,1,15,-7,-14,-6,-10,6,28,4,-26,-6,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-30,52,34,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-4,-19,-14,-18,-7,-20,-13,15,-14,-1,6,6,-23,-14,-14,-6,-3,13,-31,-11,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-26,-19,-33,-26,0,-29,-19,31,-19,16,32,-24,-24,-16,-19,-16,-6,30,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-25,-18,-31,-25,0,-26,-15,28,-16,16,37,-24,-24,-14,-16,-16,-6,27,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-23,9,35,-23,-20,-7,-23,3,-16,-16,0,-4,9,-4,7,12,-19,-30,-16,22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,3,-30,9,38,-26,-20,0,-30,17,-20,-16,0,-7,16,25,-4,-10,-26,-26,-16,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,7,34,-36,-20,6,-24,10,-20,-7,0,-6,46,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-17,-31,-28,-1,-32,-29,33,-22,11,11,-23,-24,-24,-22,-10,2,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-17,-6,1,-21,-20,-9,-14,-3,-14,-6,0,-10,15,-3,13,28,-11,-26,-10,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-3,-30,-1,17,-32,-20,5,-25,17,-20,-6,0,-13,38,31,-4,-10,-26,-21,-11,26;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-30,4,25,-27,-20,-3,-30,29,-23,-14,0,-9,14,32,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-1,-30,6,31,-8,-24,7,-19,3,-13,-13,-7,-11,9,-4,-7,-10,-23,-8,16,18;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-20,-6,-3,-13,-11,-2,-21,4,-22,-14,2,-16,2,19,14,5,-14,-23,-3,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-26,-6,15,-20,-24,-3,-8,-4,5,3,-11,-15,22,-3,-11,-10,-16,-22,-9,18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-23,-13,-13,12,-19,9,-7,-10,-11,-7,-9,-23,-6,-10,2,1,-10,5,44,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-15,-27,-16,-19,2,10,0,-16,-14,-12,-9,-11,-24,-14,-15,-9,-12,-16,5,27,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-1,-30,-1,2,-26,-25,-6,1,-6,-7,1,-3,-14,19,-8,-7,-10,-8,-24,-8,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-30,-6,3,-29,-3,0,-28,13,-22,-8,0,-16,22,31,-4,-12,-26,-20,-14,11;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-17,-26,-17,-16,-14,16,-16,-16,-14,1,-4,-11,-24,-14,-3,-13,-14,-14,-20,-15,-16;
MA   /M: SY='H'; M=7,-5,-21,-9,-3,-20,-11,28,-22,-2,-18,-7,1,-16,2,6,2,-7,-16,-26,-4,-3;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-21,-4,0,-24,-7,-14,-20,-10,-30,-20,-1,26,-4,-14,22,9,-17,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='A'; M=24,-14,-11,-20,-14,-13,-9,-18,1,-12,-6,1,-12,-16,-12,-17,8,3,11,-26,-15,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00263;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F31_2_MP; MATRIX.
AC   MP00707;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 31 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7301521; R2=0.0137360; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1472; N_SCORE=24.940; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=129; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-30,-8,-5,-23,-14,-17,-12,-12,-22,-14,-7,38,-9,-18,-1,-2,-17,-30,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-24,-6,-3,-23,13,-8,-19,-8,-16,-1,0,-15,2,-9,1,-5,-18,-25,-17,0;
MA   /M: SY='M'; M=1,-21,8,-30,-23,-7,-23,-18,12,-19,6,21,-19,-23,-14,-20,-12,-7,12,-27,-10,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,13,-28,-16,20,-26,39,27,-26,-27,-17,-18,-26,-10,10,-17,3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-20,8,14,-23,-11,-2,-19,-1,-22,-15,14,-11,10,-4,13,4,-18,-34,-17,12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-27,59,-29,-18,6,-28,19,10,-22,-29,-32,-19,-22,-10,3,1,21,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-24,1,-8,-27,31,-8,-29,-10,-29,-18,18,-17,-4,-10,10,-7,-27,-29,-24,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,7,-30,-18,24,-27,41,26,-27,-27,-17,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-17,-30,-23,37,-24,-17,4,-23,8,3,-18,-26,-26,-18,-10,-4,6,-8,13,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,1,-34,-26,38,-24,19,22,-24,-24,-21,-24,-18,-7,33,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-28,-8,-1,-26,-13,-12,-20,-10,-28,-18,-9,48,-6,-16,6,-1,-22,-32,-24,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-21,-32,-23,32,-26,-8,11,-20,19,25,-22,-26,-18,-15,-22,-10,4,-3,21,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-22,12,-28,-25,5,-28,-26,8,-23,0,-1,-18,-26,-25,-21,-6,5,17,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-13,-14,-19,-10,-20,-5,-21,-8,-11,-11,-10,-13,2,-11,-20,6,-1,0,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-29,66,18,-38,-11,-1,-38,-1,-29,-29,19,-10,-1,-10,1,-7,-28,-39,-19,9;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-19,-32,-27,-2,-31,-28,33,-23,11,11,-21,-22,-22,-24,-10,-1,33,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,90,-26,-28,-22,-10,-28,-32,-28,-22,-20,-16,-36,-28,-28,-8,-12,-14,-44,-30,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30,78,-30,-19,0,-29,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,11,32,-30;
MA   /M: SY='F'; M=1,-4,-19,-15,-14,9,-12,-10,-4,-15,-1,-3,5,-22,-14,-13,-5,-5,-8,-19,-4,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-26,-4,-5,-25,21,-1,-29,-4,-23,-14,7,-17,-4,-4,0,-12,-24,-25,-18,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-12,41,-22,32,5,-25,-3,7,-25,0,-30,-23,48,-17,0,-3,9,-2,-29,-40,-20,3;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-13,-7,-6,-15,-14,-17,-14,-10,-18,-14,1,1,-7,-11,23,35,-6,-33,-15,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-23,25,15,-26,-14,-6,-26,-2,-22,-20,12,-5,1,-8,8,10,-20,-35,-18,8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-29,4,26,-20,-11,-3,-22,0,-17,-13,-6,2,6,-7,-2,-9,-23,-21,-8,15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-30,18,55,-29,-20,9,-30,8,-20,-18,1,-2,19,0,-1,-11,-30,-30,-16,36;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,92,-30,-28,-14,-30,-28,-20,-30,-6,-12,-22,-38,-28,-28,-14,-10,-6,-44,-24,-28;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-9,-11,-11,-14,-11,-15,-10,-7,-14,-10,0,-17,-9,-3,11,13,1,-31,-15,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-21,-28,-20,2,-24,-4,18,-13,14,40,-18,-20,-5,-13,-15,-3,9,-16,7,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-2,-27,-3,17,-36,-18,6,-18,7,-17,1,-2,-10,48,6,0,-9,-25,-20,-11,33;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-30,-22,6,-29,-19,23,-25,37,24,-28,-28,-19,-19,-25,-8,18,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-28,-10,-19,-29,63,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-20,2,-17,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-17,-25,-20,-15,21,-27,4,-2,-13,2,0,-16,-25,-7,-10,-12,-3,-8,8,42,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,71,-30,-13,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,39,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-14,-18,-18,-14,14,-16,-4,-5,-14,-7,0,-9,-20,-11,-13,3,1,-5,-9,17,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,36,-20,22,2,-23,-1,6,-22,-1,-28,-20,47,-18,-1,-3,9,-1,-27,-38,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-1,24,-5,9,-4,-20,-3,1,-20,-5,-27,-19,39,-19,-4,-6,12,2,-22,-39,-21,-4;
MA   /M: SY='A'; M=8,-4,-19,-8,-9,-15,-10,-2,-6,-12,-12,-7,1,-16,-8,-14,4,-1,-4,-26,-8,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-23,-21,-11,-5,-27,-16,13,-18,19,9,-13,-21,-7,-13,-16,-6,4,-23,-5,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,8,-26,9,-8,-19,25,-10,-30,-13,-25,-19,9,-18,-13,-14,1,-11,-25,-23,-16,-10;
MA   /M: SY='T'; M=7,-7,-14,-14,-10,-3,-15,-13,-10,-11,-10,-9,-4,-14,-8,-12,12,22,-4,-19,-1,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-18,-26,-22,-16,-12,-18,-17,6,-5,-2,5,-11,-19,-8,3,-11,-6,5,-22,-8,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-30,2,5,-24,-17,-2,-26,8,-23,-16,-2,10,2,19,-4,-8,-23,-26,-14,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,17,-37,-20,8,-22,13,-20,-2,0,-12,52,20,-2,-10,-28,-20,-10,33;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13,-3,-25,-21,-20,-15,-13,-20,-15,-21,75,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-24,-29,-26,-22,20,-24,-3,-3,-14,-4,-4,-23,-27,-16,-15,-19,-12,-7,40,45,-20;
MA   /M: SY='R'; M=0,-15,-19,-17,-11,-8,-18,-12,-5,-6,1,-2,-11,-20,-8,6,-3,0,0,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-38,-39,-29,31,-24,-26,-10,-24,-3,-10,-33,-30,-26,-20,-33,-22,-17,89,27,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00120;
//
ID   PRO_ENDOPEP_SER_MP; MATRIX.
AC   MP00708;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prolyl endopeptidase family serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1972041; R2=0.0181248; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=583; N_SCORE=16.754; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=17; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-29,-32,-33,-24,21,-22,-24,-5,-23,-6,-8,-24,-25,-22,-20,-19,-13,-10,55,16,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-15,-15,-9,-3,-16,-7,7,-4,7,11,-9,-13,-4,5,-11,-6,3,-12,-2,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-12,-26,-12,-10,2,-23,43,-11,-13,-2,1,-7,-24,-3,-8,-12,-11,-15,-9,33,-10;
MA   /M: SY='A'; M=8,-1,-19,0,8,-19,-11,-11,-16,-4,-11,-11,-3,-11,-1,-9,7,0,-11,-29,-16,4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-11,-19,-9,-15,-11,-15,-20,6,-18,4,0,-14,-21,-18,-19,-9,-6,12,-27,-12,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-28,-6,-10,-21,21,-9,-27,-9,-26,-17,3,-2,-10,-7,0,-10,-25,-21,-14,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-3,-4,-22,-6,-11,-23,12,-20,-11,0,-16,-1,20,-4,-3,-15,-23,-13,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-26,-9,-5,-8,-19,6,-17,10,-11,-1,5,-20,0,21,-10,-9,-16,-21,-3,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-19,-24,-14,-3,-25,-15,13,-19,25,15,-23,-24,-6,-14,-18,-8,9,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-28,-1,-9,-28,37,-9,-33,-6,-29,-17,14,-18,-6,-8,1,-13,-29,-25,-24,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-25,4,8,-24,-20,7,-22,17,-21,-9,0,-13,3,8,-5,-3,-14,-27,-7,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-31,-13,-2,-6,-23,0,-15,7,-13,-4,-11,-19,14,8,-13,-12,-19,9,15,5;
MA   /M: SY='B'; M=-12,29,-26,28,28,-27,-10,4,-27,4,-26,-22,28,-10,8,-2,4,-6,-30,-36,-20,18;
MA   /M: SY='V'; M=5,-19,1,-22,-21,-7,-22,-25,9,-17,-2,-1,-18,-23,-21,-18,2,10,25,-32,-14,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-13,14,-26,15,15,-21,-16,0,-25,11,-22,-16,12,-12,5,8,-1,-3,-23,-25,-7,9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-17,-23,-20,-8,12,-26,-5,-3,-10,-3,2,-13,-22,6,-7,-10,-8,-5,-7,12,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-29,-26,-15,-11,-23,-18,19,-19,10,11,-15,-19,0,-18,-15,-11,6,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='A'; M=4,-3,-7,-6,0,-7,-15,-13,-17,-10,-14,-12,-4,-15,-4,-12,4,1,-11,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-16,-1,-22,-19,-16,0,-24,-6,-16,-9,-7,-14,-20,-19,-21,1,-3,7,-26,-20,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-28,12,26,-28,-17,-2,-30,19,-24,-16,3,-9,14,20,0,-7,-24,-27,-15,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-26,-13,-4,-3,-22,9,-11,-2,-6,0,-9,-19,10,-2,-10,-10,-15,-6,17,2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-22,-32,-25,26,-29,-19,11,-26,23,8,-28,-30,-25,-19,-24,-10,9,7,15,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-19,-23,-23,-15,-9,-17,-19,10,-16,9,6,-15,-20,-9,-16,-10,-7,6,-22,-8,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-6,10,-27,14,16,-32,-15,-4,-28,20,-26,-14,4,-9,15,9,1,-7,-22,-27,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-7,-24,-8,11,-12,-21,-4,-3,-7,9,11,-9,-16,6,-7,-12,-9,-9,-25,-9,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-28,-2,-2,-27,32,-14,-32,-11,-26,-19,3,-5,-10,-14,2,-9,-27,-25,-26,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-26,-25,-21,43,-28,17,-5,-18,1,0,-15,-28,-19,-13,-18,-12,-9,12,49,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-16,-24,-23,7,-18,-24,7,-20,1,0,-15,-22,-23,-18,-2,11,16,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,28,-23,40,12,-32,-7,-3,-32,-1,-29,-25,15,-11,1,-4,13,0,-22,-39,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=1,-3,-28,0,12,-27,-15,-13,-21,0,-23,-17,-5,28,-1,-10,1,-3,-21,-29,-22,3;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-24,12,9,-27,-9,-5,-27,12,-26,-16,11,-11,8,7,7,1,-21,-30,-16,8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,-2,-15,-22,15,-23,18,-13,-5,-3,-20,5,36,-13,-12,-18,-18,3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-6,-33,-27,0,-31,-24,26,-24,18,20,-25,-27,-21,-22,-17,-7,26,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-14,-16,-11,-15,2,-15,-13,-11,-13,-11,-7,-13,-10,-17,10,3,-5,-18,-10,-11;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-23,-33,-23,0,-29,-25,29,-26,25,14,-22,-22,-18,-25,-18,-8,18,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-19,-31,-25,-18,4,-18,-12,-9,-8,-8,5,-14,-23,-9,-1,-18,-13,-14,35,8,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-23,-38,-23,-23,-13,25,-23,-31,-16,-25,-19,-17,-24,-18,-13,-17,-23,-29,51,-3,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-1,-24,-7,-10,1,-16,24,-11,-8,-12,-6,5,-22,-4,-8,-6,-7,-16,-5,28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-24,-27,-22,29,-29,-1,8,-20,20,12,-23,-29,-17,-15,-23,-10,0,6,38,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-31,-23,7,-31,-23,24,-28,39,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='T'; M=2,-12,-11,-16,-15,-9,-18,-18,3,-13,-6,1,-9,-17,-13,-13,12,20,14,-32,-12,-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,-13,3,-16,-16,-18,13,-19,-20,-20,-11,-12,-8,-22,-16,-19,2,-6,-12,-29,-21,-16;
MA   /M: SY='A'; M=8,-12,-19,-16,-9,-14,-16,3,-6,-2,-4,5,-10,-17,-5,-6,-7,-7,-2,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-1,-23,-19,-7,-21,-24,4,-18,5,0,-17,-21,-19,-18,-1,11,15,-28,-12,-19;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,-21,-31,-21,1,-26,-20,23,-24,27,21,-22,-22,-15,-21,-19,-8,14,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='N'; M=1,9,-22,3,3,-23,13,-8,-25,-6,-23,-17,15,-14,-4,-9,7,0,-22,-29,-21,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-22,-7,5,-25,-15,-1,-13,4,-15,4,-2,-12,25,2,6,2,-15,-25,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-28,-4,-5,-18,1,-2,-25,4,-19,-11,-2,-19,2,15,-6,-11,-21,-14,-1,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-30,-1,-3,-28,-1,-17,-25,-11,-28,-20,-7,38,-10,-17,2,-2,-24,-30,-26,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-28,17,16,-29,10,-9,-30,-5,-23,-19,2,-12,-2,-11,-1,-12,-22,-29,-22,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-18,-26,-19,10,-27,-19,10,-20,25,9,-21,-26,-19,-10,-16,1,9,-20,-1,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-22,-32,-25,53,-27,-8,1,-22,6,3,-19,-28,-27,-17,-18,-9,-2,11,37,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-3,1,-27,-2,0,-31,23,-28,-12,2,-14,4,20,-4,-10,-22,-23,-12,1;
MA   /M: SY='C'; M=6,-20,37,-25,-25,-15,-12,-27,-10,-22,-10,-9,-18,-28,-25,-24,-5,-6,7,-34,-22,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00587;
//
ID   RIBOSOMAL_L30E_1_MP; MATRIX.
AC   MP00709;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L30e signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6695366; R2=0.0168814; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=803; N_SCORE=19.215; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=50; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-23,-6,5,-21,-15,-7,-18,19,-18,0,-3,-12,6,15,-1,-4,-12,-24,-12,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-18,5,11,-18,-11,-3,-18,4,-19,-12,5,-8,8,0,10,5,-15,-23,-8,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-9,-19,-13,-9,-15,-9,-4,-4,-10,-7,6,-4,-18,1,-9,2,-1,-2,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-22,0,6,-18,-20,-6,-5,-4,-6,6,-5,-14,5,-7,-4,-1,-3,-28,-11,6;
MA   /M: SY='D'; M=-4,18,-20,22,8,-26,-1,-6,-27,-5,-27,-22,15,-11,-1,-9,16,7,-20,-36,-20,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-38,-29,19,-35,-27,33,-28,17,13,-22,-25,-27,-25,-19,-8,26,-15,5,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,23,-23,17,19,-24,-5,2,-24,2,-25,-19,29,-12,5,-3,6,-4,-27,-34,-20,12;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-4,-21,-9,-5,-12,-3,-10,-21,2,-19,-12,3,-16,-2,6,5,1,-15,-22,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-26,-2,17,-26,-13,-9,-22,16,-19,-11,-3,-9,8,10,-3,-8,-17,-23,-15,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-27,-7,5,-27,-15,-5,-25,24,-21,-8,-2,-13,15,29,-4,-8,-19,-20,-12,8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-13,-18,-14,-12,-5,-23,-17,3,-12,12,5,-14,-21,-12,-11,-8,6,6,-26,-7,-12;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-12,-26,-20,-5,-20,-24,13,-19,13,5,-23,-23,-20,-20,-7,-1,22,-24,-11,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-18,-29,-22,0,-27,-16,23,-18,22,29,-24,-25,-12,-16,-18,-7,22,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-13,11,-30,17,16,-31,-18,-6,-32,33,-28,-15,5,-10,9,23,-7,-10,-23,-25,-13,12;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-11,-16,-14,-10,-19,-14,4,-10,-6,-10,29,37,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-27,3,5,-27,-13,-9,-26,34,-27,-11,6,-13,4,19,-7,-9,-18,-24,-13,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-25,-20,-26,-25,15,-31,-7,17,-16,6,6,-25,-29,-21,-16,-15,-5,21,-2,32,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-14,-26,-23,-5,-27,-26,20,-17,5,6,-19,-22,-21,-16,-5,6,29,-27,-9,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,17,-29,-18,18,-28,42,22,-28,-29,-20,-19,-28,-10,9,-16,4,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-9,-17,-13,-11,4,-16,-6,-9,-12,-11,-9,-6,-17,-9,-12,10,13,-6,-12,15,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-29,0,8,-28,-18,-5,-28,39,-28,-10,6,-12,13,31,-7,-9,-22,-22,-11,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-24,-1,11,-28,-16,-2,-23,14,-23,-10,2,-11,23,16,7,1,-20,-26,-13,16;
MA   /M: SY='T'; M=11,-5,-10,-12,-10,-13,-14,-19,-8,-11,-12,-10,-3,-12,-10,-13,19,30,3,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-34,-24,4,-35,-25,34,-29,33,19,-24,-25,-19,-24,-24,-10,20,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,-1,9,-29,-20,-8,-28,42,-27,-9,0,-11,14,30,-8,-7,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,-16,-14,-12,-1,-15,-9,-3,-13,-1,0,-4,-18,-10,-13,4,9,-3,-20,1,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-19,-31,-22,3,-29,-23,24,-26,31,15,-26,-26,-21,-22,-21,-7,19,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,41,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-3,-21,-8,-2,-18,-14,7,-12,-8,-8,0,1,-16,9,-6,2,3,-13,-27,-7,3;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,58,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,2,17,-28,-11,-8,-30,28,-24,-13,-1,-10,8,19,-7,-11,-23,-22,-14,12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-13,-16,-16,-14,-19,11,-21,-12,-14,-15,-11,-9,-12,-15,-19,7,-3,-1,-25,-21,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-9,-30,48,-30,-10,0,-10,12,29,-10,-10,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-19,-28,-19,3,-19,-18,13,-25,35,19,-25,-26,-16,-19,-22,-9,6,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,1,-34,-28,38,-26,20,18,-25,-25,-23,-24,-17,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=7,6,-19,2,1,-23,4,-8,-23,-2,-25,-17,12,-13,-2,-4,14,2,-17,-31,-20,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,33,-18,15,-2,-18,-4,5,-18,-2,-26,-18,49,-18,-2,-2,12,9,-25,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-18,41,-26,-22,-11,-25,-25,-8,-24,-1,-6,-17,-27,-21,-23,-6,3,0,-35,-17,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-35,-11,-1,-27,-18,-15,-22,-1,-26,-17,-14,56,-5,1,-8,-9,-25,-27,-24,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-30,-7,5,-28,-13,-14,-20,4,-23,-13,-10,26,3,-6,-5,-9,-20,-25,-21,2;
MA   /M: SY='D'; M=-14,11,-27,20,12,-19,-21,-9,-12,-10,0,-9,-3,-15,-4,-13,-11,-10,-13,-30,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-22,-24,-24,-15,-4,-28,-15,6,-5,13,7,-17,-25,-10,13,-18,-9,7,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-29,-3,9,-26,-21,-8,-27,40,-23,-9,-2,-13,9,35,-11,-10,-19,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,10,-22,16,23,-28,-11,-4,-26,2,-24,-19,6,-7,10,-1,12,0,-21,-33,-19,16;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,43,34,-35,-15,-1,-35,10,-26,-24,10,-6,9,-2,-1,-10,-29,-34,-19,22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,43,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-27,2,29,-12,-22,-3,-17,5,-9,-4,-7,-9,8,-2,-8,-10,-18,-21,-6,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-26,-17,-16,18,-25,18,-4,-10,-4,-2,-14,-25,-8,-10,-11,-3,-10,14,57,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00588;
//
ID   PGM_PMM_MP; MATRIX.
AC   MP00710;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoglucomutase and phosphomannomutase phosphoserine signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0075097; R2=0.0152067; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=255; N_SCORE=8.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-32,-7,0,-27,-15,-17,-20,-10,-30,-20,-12,63,-7,-17,4,-2,-25,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-13,-12,-12,-10,-18,-20,-6,-11,-9,-8,-1,-13,-11,-9,14,37,3,-29,-11,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-34,-13,-2,-25,-20,-19,-12,-11,-20,-13,-17,57,-8,-19,-7,-8,-19,-28,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-18,-20,-10,-12,-6,-17,-5,-11,-1,-1,-12,-15,-10,-13,-3,-6,-2,-20,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,-18,-25,-15,-1,-25,-21,16,-19,17,9,-22,-22,-17,-19,-13,-6,18,-23,-7,-16;
MA   /M: SY='S'; M=10,-10,-16,-13,-9,-10,-11,-9,-10,-9,-13,-10,-6,-12,-7,-8,11,5,-4,-21,-2,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-18,-24,-19,25,-23,2,-3,-17,2,-1,-14,-26,-18,-11,-14,-9,-4,-2,25,-19;
MA   /M: SY='L'; M=3,-14,-19,-19,-15,-6,-11,-15,1,-16,4,0,-10,-21,-11,-14,-6,-3,1,-20,-6,-14;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-18,-22,-17,-9,-18,-21,9,-14,-1,3,-11,-17,-13,-15,1,8,12,-25,-10,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-24,-4,0,-15,-15,-5,-19,15,-15,-6,-1,-15,2,26,-7,-8,-13,-20,-8,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-3,3,-23,2,2,-24,-8,-4,-22,10,-20,-11,3,-13,3,5,0,-4,-16,-25,-13,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-10,-23,-10,-5,-8,-13,-9,-8,-9,2,-2,-9,-20,-5,-3,-8,-5,-9,-20,-4,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-22,5,0,-27,4,-6,-30,11,-28,-16,11,-13,-1,7,-1,-9,-24,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='A'; M=25,-14,-9,-21,-14,-10,-5,-18,-6,-13,-2,-3,-13,-17,-13,-18,0,-4,0,-19,-12,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-13,6,0,-17,-8,-10,-18,-6,-15,-13,2,-12,-4,-10,8,6,-11,-26,-13,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-23,-12,-14,-17,19,-19,-18,-17,-16,-12,-6,-12,-16,-19,1,-9,-12,-21,-19,-15;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-25,-10,-17,-28,54,-19,-34,-18,-27,-19,0,-18,-17,-19,5,-13,-24,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-35,-29,13,-34,-28,32,-26,17,13,-25,-26,-27,-24,-17,-6,32,-19,1,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-21,-29,-20,-3,-27,-14,26,-16,14,31,-18,-21,-10,-16,-16,-8,20,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-27,3,-34,-26,35,-27,26,20,-25,-25,-21,-24,-21,-8,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=35,-11,-16,-17,-11,-23,14,-20,-17,-12,-16,-13,-9,-6,-12,-20,7,-5,-8,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-17,13,-4,-18,-5,5,-13,-4,-25,-16,50,-21,-3,-4,6,-1,-24,-38,-18,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-8,-25,-8,-2,-11,-13,-14,-13,-5,-15,-10,-7,7,-9,-11,-3,-3,-11,-23,-12,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-29,21,27,-26,-13,4,-28,2,-21,-18,5,-5,8,-3,-2,-9,-27,-27,-10,17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-20,31,-30,45,12,-25,-15,4,-32,1,-23,-22,10,-14,0,-2,-5,-10,-25,-25,-1,5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,18,-21,2,-9,1,-3,0,-16,-8,-20,-14,33,-22,-10,-6,2,-3,-22,-23,-8,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-36,-28,16,-35,-23,32,-26,18,15,-22,-24,-23,-24,-19,-9,23,-13,10,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-23,-33,-26,31,-31,-12,17,-23,15,13,-22,-27,-23,-19,-20,-9,10,-1,26,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-5,-16,-15,-18,18,-20,-3,-2,-14,-5,-2,4,-26,-17,-12,-9,-6,-5,-11,15,-17;
MA   /M: M=-8,-5,-23,-4,-9,-13,-10,-10,-9,-10,-5,-1,-7,-13,-9,-8,-9,-9,-9,-19,-7,-10;
MA   /M: SY='P'; M=2,-4,-26,-1,5,-26,-2,-9,-25,-1,-24,-16,-3,9,-2,-5,3,-6,-21,-27,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-27,23,4,-26,4,3,-30,-6,-23,-18,13,-15,-5,-9,0,-7,-25,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-28,-4,-16,-30,57,-18,-37,-17,-28,-20,1,-18,-17,-19,1,-17,-27,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-22,-11,-1,-12,-4,-12,-13,-9,-11,-8,-6,-11,-8,-10,-2,-3,-9,-23,-13,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00589;
//
ID   LIPOXYGENASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00711;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipoxygenases iron-binding region signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2506762; R2=0.0133877; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=881; N_SCORE=17.035; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-23,-18,-6,-7,-24,-8,4,-11,20,15,-16,-22,5,-4,-18,-10,-4,-21,-4,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,43,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-2,-22,-16,-6,-17,-22,-2,-16,-5,-6,-10,-16,-16,-19,5,12,3,-24,-11,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-38,-27,-21,8,-23,8,-15,-17,-14,-9,-24,-28,-13,-14,-27,-22,-20,70,31,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-11,-30,-29,0,-29,-29,29,-21,13,10,-29,-29,-28,-20,-11,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-20,-17,-10,-14,-11,-11,-14,3,-6,-4,-8,-22,-5,23,-9,-9,-8,-22,-12,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-13,-10,-12,-10,-12,-12,-1,-11,-12,-8,2,-20,-12,-12,11,7,7,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='N'; M=11,7,-16,-1,-3,-20,-3,11,-19,-8,-23,-14,17,-14,-1,-9,16,3,-16,-33,-13,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='F'; M=4,-14,-16,-20,-11,20,-16,-16,-8,-17,-5,-8,-9,-18,-18,-16,3,2,-4,-14,1,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-2,-15,-6,-8,-21,12,-1,-24,-10,-21,-12,6,-20,1,-10,0,-11,-24,-23,-11,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-22,-23,-25,-21,15,-27,-5,8,-19,8,4,-18,-27,-18,-16,-15,-7,7,-1,22,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,1,-21,-20,96,-30,-9,-20,0,10,-20,12,0,-10,-20,-30,-30,19,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-30,10,39,-35,-20,5,-25,10,-20,-10,0,-5,41,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-22,-19,-26,-18,2,-24,-18,14,-23,31,16,-21,-25,-16,-18,-19,-5,7,-21,-4,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-14,-22,-21,-17,-2,-26,-13,16,-16,4,8,-8,-22,-8,-15,-11,-6,12,-23,-4,-13;
MA   /M: SY='T'; M=7,-2,-12,-8,-8,-10,-11,-14,-11,-11,-16,-12,3,-14,-8,-11,21,22,-2,-30,-12,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-34,-32,-35,-25,13,-26,-24,2,-26,19,2,-34,-30,-21,-20,-34,-18,-7,52,14,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-29,-19,7,-27,-19,18,-28,44,19,-28,-28,-19,-20,-27,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,2,-18,-2,4,-23,-17,9,-27,13,-22,-11,11,-19,11,32,-3,-8,-23,-28,-12,5;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-12,-10,-11,-14,-7,-19,-14,-11,-14,-12,0,-11,-11,-12,18,37,-4,-29,-14,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=10,-23,-4,-27,-18,-2,-20,-21,6,-23,24,7,-23,-24,-18,-21,-15,-7,5,-23,-9,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,4,-27,-23,-6,-26,-24,13,-20,6,8,-20,-24,-20,-20,-7,2,20,-29,-11,-22;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-10,-19,-15,-13,-13,-18,0,-14,-6,3,-12,-9,-12,-17,3,5,6,-28,-15,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=6,-20,-23,-17,-11,-18,-18,-22,-3,-13,-13,-8,-19,25,-15,-19,-3,-3,1,-29,-21,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-23,-37,-28,61,-31,-15,7,-27,10,3,-20,-29,-32,-20,-20,-10,2,9,35,-28;
MA   /M: SY='V'; M=10,-19,3,-26,-21,-11,-17,-25,7,-20,-3,-2,-15,-21,-19,-23,-2,-1,13,-28,-15,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,3,-34,-25,35,-27,29,20,-25,-25,-21,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='T'; M=10,-5,-11,-14,-11,-10,-16,-19,-7,-11,-5,-5,-5,-12,-10,-13,13,32,1,-27,-11,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-25,-9,-9,-7,-16,8,-5,-10,-2,7,7,-22,0,-7,-11,-9,-14,-11,1,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-3,-3,4,-28,-18,12,-22,-3,-21,-7,7,-18,23,-1,1,-4,-24,-30,-11,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='P'; M=8,-10,-23,-7,-2,-24,-8,-16,-18,-10,-27,-18,-6,32,-6,-16,14,4,-17,-33,-24,-6;
MA   /M: SY='A'; M=5,-11,-19,-12,-5,-17,-9,-8,-8,-9,-11,-4,-8,-8,-4,-9,4,-2,-3,-28,-14,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-20,9,-26,-21,-6,-23,-18,7,-20,8,14,-19,-25,-15,-19,-9,-3,10,-29,-11,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00077;
//
ID   RIBOSOMAL_S17E_MP; MATRIX.
AC   MP00712;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S17e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1385140; R2=0.0147216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=607; N_SCORE=14.065; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-23,10,3,-20,-9,-8,-19,-2,-12,-11,6,-15,-3,-4,0,1,-15,-30,-14,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,57,17,-37,-11,-1,-37,7,-30,-27,20,-11,1,-4,-1,-9,-29,-37,-19,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-15,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,12,36,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-13,18,-30,28,39,-32,-17,9,-31,6,-23,-18,8,-6,18,-1,0,-10,-30,-32,-16,28;
MA   /M: SY='H'; M=-7,7,-21,4,9,-18,-17,11,-21,-2,-17,-12,7,-11,2,-4,5,11,-17,-28,-5,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-29,0,9,-27,-19,-5,-29,34,-25,-11,0,-13,13,37,-8,-10,-21,-21,-11,9;
MA   /M: SY='I'; M=0,-22,-20,-26,-19,-4,-26,-23,18,-15,13,9,-20,-22,-16,-16,-13,-4,18,-23,-7,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,6,-30,-27,-2,-29,-28,18,-23,12,7,-28,-31,-27,-21,-13,-3,32,-31,-11,-27;
MA   /M: SY='E'; M=0,10,-24,15,26,-27,-14,-6,-23,1,-19,-17,2,-6,9,-7,6,-2,-19,-30,-18,18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,8,36,-27,-18,-5,-25,13,-20,-15,-1,-5,14,5,0,-6,-22,-27,-17,25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-20,-29,-23,11,-28,-12,19,-20,22,18,-25,-27,-18,-17,-20,-7,16,-12,14,-22;
MA   /M: SY='A'; M=16,-13,-13,-20,-14,-10,-15,-19,2,-14,1,2,-12,-16,-12,-16,4,11,8,-25,-12,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-25,2,-1,-19,-17,-8,-9,0,-14,-8,10,-6,-2,-3,-2,0,-13,-30,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-17,-24,-21,-21,-6,-31,-22,25,-18,6,7,-15,-18,-18,-20,-13,-7,22,-24,-4,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-24,-8,3,-21,-17,-14,-12,-2,-18,-9,-10,12,-2,-6,1,-1,-8,-29,-18,-1;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-28,-6,0,-23,-16,-3,-24,20,-23,-10,0,-4,3,24,-6,-5,-18,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-17,-29,-23,6,-29,-23,21,-23,24,14,-24,-26,-22,-19,-15,1,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-30,-13,-3,-18,-22,-3,-20,24,-15,-4,-3,-20,7,55,-11,-10,-14,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-28,-9,2,-23,-20,-5,-20,26,-18,-3,-3,-15,12,36,-9,-10,-15,-20,-9,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-15,-31,-25,-1,-31,-26,28,-25,19,12,-23,-24,-21,-23,-14,-4,26,-24,-6,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-11,-11,-10,-20,-20,-8,-10,-9,-9,-1,-11,-11,-10,19,48,2,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-29,-6,0,-20,-19,38,-29,14,-20,-6,4,-19,9,39,-9,-14,-23,-24,2,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-25,-21,-13,5,-28,-7,3,-6,17,7,-20,-25,-10,-4,-22,-10,-2,-7,18,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-23,-18,-28,-22,-2,-25,-16,21,-14,12,24,-22,-23,-14,-13,-14,-6,23,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-25,-4,0,-21,-13,-8,-20,19,-19,-9,4,-17,1,21,-5,-7,-13,-25,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-14,-4,-13,-21,-6,-12,13,-10,3,-5,-17,6,25,-9,-6,-10,-20,-6,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-12,-26,-15,-8,-16,-16,-13,-3,3,-5,6,-8,-13,-1,-1,-10,-9,-5,-22,-9,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-25,-2,10,-25,-18,-5,-21,22,-19,-7,0,-11,15,18,-4,-6,-17,-22,-11,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-24,0,13,-19,-17,1,-20,7,-18,-11,2,-9,4,6,-1,-5,-15,-27,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-28,-4,0,-27,5,-7,-27,11,-26,-12,1,-9,7,6,-1,-9,-23,-20,-13,3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-5,-25,-4,8,-24,-16,-10,-16,5,-19,-11,-5,10,4,-1,-2,-6,-14,-26,-18,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-10,-20,-9,2,-15,-23,-16,-2,8,-9,-3,-11,-14,-5,0,-6,-3,7,-24,-10,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-20,-9,-1,-15,-13,-6,-17,7,-10,-7,-1,-16,1,24,-1,-4,-11,-22,-11,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,1,13,-29,17,-10,-30,-5,-24,-17,-3,2,1,-10,-1,-13,-27,-24,-23,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-23,-24,-13,-7,-27,-20,23,-18,7,10,-13,-15,-11,-20,-8,-3,15,-23,-6,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=4,0,-13,1,16,-14,-9,-4,-10,1,-8,-7,-3,-4,7,-3,1,-4,-8,-15,-10,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-14,-3,2,-14,-6,-6,-17,-8,-23,-16,3,-12,-1,-10,26,11,-11,-28,-7,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00590;
//
ID   NA_DICARBOXYL_SYMP_1_MP; MATRIX.
AC   MP00713;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:dicarboxylate symporter family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4705985; R2=0.0140950; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=322; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=215; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=2,-27,-22,-34,-27,-3,-31,-28,35,-24,13,13,-21,-21,-21,-26,-13,-6,30,-22,-6,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-24,-21,-11,6,-19,-13,-4,-9,3,0,-15,-17,-13,1,-14,-9,-3,-15,0,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-25,-17,-11,-12,-16,-7,-4,-15,-5,-3,-15,7,-10,-16,-8,-6,-6,-22,-6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-22,-13,-14,-11,19,-15,-21,-14,-14,-11,-4,-19,-14,-12,3,-6,-15,-21,-13,-14;
MA   /M: SY='N'; M=0,3,-21,-3,-5,-17,-13,5,-14,-4,-15,-9,8,-13,-2,-3,2,2,-12,-28,-8,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-29,-20,11,-26,-20,8,-24,18,7,-25,-16,-20,-20,-21,-10,2,-2,3,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-9,-22,-10,-7,-7,-8,8,-19,-8,-19,-11,-2,-18,-4,-6,5,-3,-16,-8,5,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-31,-5,-2,-20,-19,-12,-15,-6,-16,-12,-8,35,-5,-9,-9,-7,-21,-25,-16,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-14,1,3,-12,-9,-5,-12,-1,-8,-7,-1,-9,2,1,1,0,-10,-10,-7,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-22,11,11,-22,-15,0,-20,1,-17,-13,6,-12,5,0,4,1,-15,-30,-13,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,-18,-27,-21,8,-27,-22,16,-19,13,7,-20,-25,-21,-16,-11,-3,18,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-19,-14,-11,-14,13,-16,-18,-11,-16,-9,-5,-16,-10,-14,6,-3,-10,-22,-16,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-11,-23,-13,-9,-5,-8,-4,-8,-9,-5,-2,-9,-20,-5,-10,-6,-5,-8,-11,9,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-7,-24,-8,-7,3,-22,-8,-3,-14,1,-2,-7,-19,-9,-14,-10,-8,-5,-17,2,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-18,-20,-22,-15,-6,-16,-16,8,-17,13,10,-13,-21,-11,-13,-9,-5,4,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-22,-18,-9,19,-21,-13,-15,3,-12,-7,-7,-19,-11,2,-5,-5,-10,-11,5,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-17,-30,58,-20,-37,-19,-30,-20,-3,-6,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,30,-27,44,31,-34,-12,-1,-34,2,-27,-25,12,-7,7,-7,5,-6,-27,-37,-20,19;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-21,-24,-26,-22,-9,-1,-23,8,-23,7,6,-15,-21,-18,-22,-11,-9,5,-21,-11,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27,49,-31,-21,12,-30,23,8,-23,-29,-32,-21,-23,-10,7,-3,17,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-21,-33,-25,2,-30,-20,32,-22,23,29,-24,-24,-17,-20,-20,-8,25,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-29,-1,13,-26,-19,7,-27,24,-22,-8,3,-14,19,33,-7,-10,-23,-23,-9,13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-19,-30,-22,4,-27,-16,22,-22,31,29,-26,-26,-16,-18,-22,-8,17,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-33,-25,4,-32,-22,31,-26,29,23,-26,-26,-19,-22,-22,-8,24,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,-1,11,-28,-20,-7,-29,41,-27,-10,0,-11,12,35,-8,-9,-21,-21,-11,11;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-21,-27,-20,-3,-9,-5,12,-13,17,45,-18,-21,-5,-12,-18,-11,5,-20,-4,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-26,3,-32,-23,33,-25,27,24,-25,-25,-19,-22,-21,-8,25,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,3,-37,-30,42,-27,17,16,-23,-23,-24,-27,-17,-7,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=8,-22,-17,-26,-18,-2,-18,-18,12,-20,22,14,-21,-22,-15,-19,-13,-6,10,-21,-7,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,77,-9,-19,-4,-6,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-21,-33,-24,4,-31,-21,30,-25,30,26,-25,-25,-18,-21,-22,-8,22,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-25,-19,-32,-25,30,-27,-19,14,-23,8,10,-17,-24,-24,-19,-11,-5,13,-12,8,-24;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,10,-8,-9,-13,-9,-13,-17,-15,-18,-15,5,-19,-9,-14,17,7,-10,-37,-18,-9;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-14,-6,-5,-17,-11,-16,-14,-10,-21,-15,1,2,-6,-12,24,26,-6,-35,-17,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-26,3,-32,-24,32,-25,27,20,-26,-26,-22,-22,-20,-7,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-19,-18,-20,-7,-27,-24,22,-19,6,6,-17,-21,-19,-21,-9,-2,25,-27,-9,-22;
MA   /M: SY='T'; M=8,-9,-13,-14,-13,-12,-7,-19,-5,-14,-8,-7,-6,-15,-12,-15,12,17,3,-29,-14,-13;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-26,-13,-18,-23,47,-20,-29,-20,-18,-14,-4,-20,-18,-20,-1,-15,-21,-21,-25,-18;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-21,-32,-23,1,-29,-24,27,-25,25,16,-24,-24,-19,-23,-18,-7,21,-21,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-7,-17,-8,-21,-4,-19,-14,-3,-14,-11,-8,-11,-8,-14,8,-1,-3,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-23,-7,-6,-26,22,-9,-28,-7,-26,-15,2,-15,-1,-5,10,-4,-21,-25,-20,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-16,-18,-22,-18,-1,-21,-12,14,-17,19,22,-13,-24,-12,-14,-14,-5,10,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-28,21,3,-24,5,-3,-31,-3,-23,-19,6,-16,-5,-4,-2,-10,-24,-22,-8,-2;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00591;
//
ID   NA_DICARBOXYL_SYMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00714;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:dicarboxylate symporter family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1318021; R2=0.0146746; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1051; N_SCORE=20.545; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-11,-24,-10,12,-9,-23,-5,0,-7,12,18,-15,-15,3,-9,-15,-10,-6,-24,-8,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,23,58,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-24,5,2,-24,-7,12,-25,12,-27,-13,23,-16,6,11,2,-6,-24,-30,-11,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-7,-12,-15,-15,2,-17,-5,-1,-14,3,3,-2,-24,-12,-13,-9,-6,-4,-17,5,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-16,-30,57,-15,-39,-12,-30,-18,0,-19,-16,-14,-1,-19,-29,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='C'; M=1,-24,30,-30,-28,-9,-28,-29,8,-23,-1,-1,-23,-29,-26,-25,-9,-5,21,-34,-16,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-27,20,9,-30,-12,-7,-29,6,-27,-20,4,6,1,3,3,-4,-22,-32,-19,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-29,-5,4,-25,-20,-9,-26,33,-25,-10,-2,-8,6,35,-8,-8,-17,-22,-12,3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-22,-6,0,-21,-11,0,-24,6,-24,-14,2,-5,3,22,10,1,-17,-29,-14,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-32,-29,0,-33,-30,35,-23,12,12,-25,-26,-26,-23,-12,-1,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-15,-10,-18,-18,-7,-22,-23,9,-15,-3,-2,-13,-20,-18,-15,8,19,24,-32,-12,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-27,-8,-9,-24,22,-10,-33,2,-26,-16,2,-18,-5,18,3,-9,-23,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,50,-30,-20,9,-30,27,9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,4,-3,17,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-14,-18,-15,-6,-22,-21,5,-17,3,-1,-9,-17,-14,-15,6,23,10,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=7,-17,-21,-20,-15,7,-18,-1,-2,-13,2,-2,-16,-22,-11,-15,-8,-5,-4,2,29,-15;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-9,-15,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-10,31,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-38,-29,43,-32,-24,18,-28,15,8,-22,-28,-32,-22,-19,-8,16,-6,14,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-20,19,0,-20,-1,9,-20,0,-29,-20,57,-20,0,0,10,2,-29,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-11,-29,-20,1,-25,-13,14,-21,28,31,-25,-19,-12,-17,-23,-10,6,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-13,-10,-8,-7,-14,-15,-12,-10,-13,-11,2,-12,-6,-10,17,27,-5,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='A'; M=20,2,-4,-7,-7,-19,-4,-13,-16,-9,-20,-15,8,-14,-7,-13,18,10,-8,-32,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,36,-30,15,0,-12,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,28,74,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-10,-26,-9,11,-12,-23,-2,-4,-6,7,10,-13,-16,12,-6,-13,-10,-11,-20,-3,11;
MA   /M: SY='T'; M=17,-6,6,-14,-11,-16,-11,-20,-14,-12,-15,-13,-4,-14,-11,-16,17,22,-3,-31,-17,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-16,-31,-25,3,-29,-21,26,-22,26,24,-27,-27,-20,-19,-19,-6,28,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,0,-21,-15,-15,-10,-22,-5,-13,-8,-8,-12,-16,-15,-19,7,6,8,-26,-18,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-17,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-28,2,-38,-28,44,-29,24,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,19,-39,-20,14,-20,9,-20,0,0,-10,58,10,0,-10,-30,-20,-9,38;
MA   /M: SY='A'; M=16,-21,-6,-26,-18,-6,-18,-22,7,-20,14,4,-21,-22,-18,-21,-9,-4,11,-23,-12,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-9,0,-18,-9,-11,5,-18,-1,-9,-11,-8,-8,7,-19,-10,-9,3,13,-10,-18,8,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-7,16,-25,8,-4,-27,23,-1,-28,-6,-29,-18,28,-18,1,-6,5,-9,-30,-30,-22,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-14,-17,-20,-18,-5,-25,-19,13,-15,1,4,-10,-20,-12,-15,-1,10,16,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-31,24,18,-33,-15,0,-29,1,-27,-20,3,17,7,-7,-1,-9,-28,-33,-19,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='S'; M=5,8,-15,5,-1,-21,-4,-10,-20,-8,-24,-18,11,-7,-4,-11,22,17,-13,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-22,-33,-23,18,-30,-21,21,-28,32,17,-25,-26,-22,-22,-23,-9,12,-15,4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-21,-14,-16,-18,20,-19,-19,-16,-18,-11,-5,-18,-15,-17,6,0,-10,-17,-18,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,14,-30,20,25,-37,-18,8,-28,9,-23,-11,5,-9,34,4,-1,-10,-29,-27,-13,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-14,-26,-15,1,-18,-27,-9,6,-8,2,7,-13,-17,16,-8,-10,-9,-1,-22,-7,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-26,8,-34,-25,32,-28,28,17,-24,-25,-22,-24,-21,-7,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-13,-17,-14,-5,-22,-20,2,-17,6,-1,-10,-17,-13,-15,5,25,6,-27,-8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-27,3,-34,-25,36,-26,26,21,-25,-25,-21,-24,-21,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00591;
//
ID   SIGMA70_1_MP; MATRIX.
AC   MP00715;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-70 factors family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7846303; R2=0.0165308; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=389; N_SCORE=12.205; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=44; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=10,-21,-16,-25,-19,-6,-20,-20,7,-11,1,1,-19,-22,-16,-9,-7,-4,17,-16,-6,-19;
MA   /M: SY='H'; M=0,-7,-21,-7,-6,-13,-5,9,-19,-5,-18,-10,-1,-17,-3,-6,7,-2,-14,-20,3,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-25,-28,-20,-7,-30,-16,20,-11,6,10,-15,-21,-13,-6,-14,-8,17,-22,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-17,-13,-24,-15,-12,-11,-22,4,-15,1,-1,-15,-16,-14,-21,1,-1,11,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-25,-9,1,-19,-18,-4,-17,17,-15,-1,-4,-15,11,20,-5,-6,-14,-19,-5,4;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-25,-9,-6,-21,-3,-11,-21,12,-20,-10,-1,-19,-3,22,-3,-7,-10,-24,-15,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-22,-20,29,-18,7,-8,-12,-3,-3,-15,-28,-16,-5,-17,-11,-11,12,45,-20;
MA   /M: M=-6,-11,-21,-13,-3,-7,-18,-11,-7,-7,0,-2,-7,-16,-4,0,-4,-3,-6,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-7,2,-28,-1,-5,-24,10,-8,-24,-5,-24,-16,10,4,-7,-8,0,-8,-25,-29,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-26,-14,-9,-10,-16,-5,-15,5,-13,-7,-7,-13,-3,17,-6,-3,-12,-12,5,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-26,-4,-14,-27,50,-14,-34,-16,-30,-20,10,-18,-14,-16,7,-11,-27,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-20,-20,-7,-4,-25,-17,10,-17,16,9,-22,-16,-13,-16,-15,-7,9,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,2,-29,7,11,-24,-15,1,-20,-5,-17,-10,-2,12,3,-10,-5,-9,-22,-28,-14,5;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-22,-23,-13,1,-24,-8,4,-11,5,9,-16,-18,-6,-7,-13,-8,3,-18,-1,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-24,11,18,-21,-10,-7,-20,-5,-10,-13,-1,-11,2,-9,-1,-7,-18,-28,-16,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,11,-31,-23,24,-29,39,18,-28,-29,-22,-21,-25,-9,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-36,-28,7,-34,-26,36,-25,18,20,-23,-24,-22,-24,-18,-7,30,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-24,0,14,-34,-14,5,-20,4,-23,-6,3,-10,41,4,12,-1,-24,-26,-13,27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-23,-4,18,-17,-22,-13,-4,-5,-6,-7,-10,-11,0,-11,-3,-5,-2,-28,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-7,-6,-12,-13,-8,-6,-8,-9,-12,1,15,-20,-7,-9,2,5,-9,-32,-15,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-36,-27,6,-35,-26,36,-28,26,19,-23,-24,-21,-25,-21,-9,24,-19,0,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-25,-25,-30,-20,4,-31,-14,27,-21,23,25,-22,-23,-13,-19,-21,-10,14,-15,8,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-12,8,-29,8,10,-29,-11,-4,-30,27,-27,-13,9,-13,11,22,-5,-9,-24,-25,-14,10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-12,-16,-9,-21,7,-19,-14,-11,-15,-12,-6,-11,-9,-19,13,1,-4,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-18,-33,-28,-1,-32,-29,34,-23,15,14,-25,-25,-24,-24,-14,-4,37,-25,-6,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-13,12,-29,19,29,-29,-17,-2,-31,19,-24,-18,6,-8,12,16,-2,-9,-26,-29,-16,20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-27,2,6,-26,-17,-6,-29,33,-26,-12,5,-13,7,32,-4,-5,-20,-24,-12,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,69,-30,-11,0,-26,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,14,41,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,51,18,-35,-9,0,-35,3,-29,-26,23,-11,2,-5,3,-7,-28,-38,-19,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-30,-15,-5,-11,-20,-10,-10,-11,-12,-10,-18,24,-10,-17,-10,-9,-14,-11,-3,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-23,10,17,-24,-5,-8,-25,-1,-20,-17,3,-10,3,-4,9,2,-19,-31,-18,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-29,-10,0,-20,-23,-4,-15,23,-14,0,-5,-16,8,27,-12,-10,-13,-19,-4,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-29,-1,-10,-28,45,-15,-34,-13,-24,-18,3,-18,-14,-15,-2,-17,-27,-23,-25,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-17,-17,-24,-21,15,-25,-17,9,-18,4,1,-12,-24,-21,-17,-7,4,12,-14,8,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-25,-5,5,-26,-15,-8,-26,29,-25,-11,0,-12,10,28,-1,-5,-17,-22,-12,6;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,59,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-17,-1,6,-21,-10,-13,-16,-3,-19,-14,-2,-4,-2,-9,13,6,-8,-31,-18,2;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-12,-10,-8,-13,-17,-19,-12,-10,-13,-12,-1,-4,-9,-11,20,40,-3,-30,-13,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00592;
//
ID   SIGMA70_2_MP; MATRIX.
AC   MP00716;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-70 factors family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3913431; R2=0.0153192; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=9.839; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=73; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-27,22,35,-31,-15,-2,-30,10,-24,-19,5,-5,15,3,4,-6,-26,-31,-18,25;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-15,-5,0,-11,-10,0,-15,16,-11,-5,0,-10,5,34,-5,-5,-10,-10,-5,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-15,14,27,-16,-9,0,-16,4,-11,-11,2,-1,9,-1,0,-5,-15,-16,-10,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-25,-2,8,-25,-16,-3,-22,26,-21,-7,-1,-4,18,24,-6,-8,-19,-17,-9,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-23,1,5,-11,-17,3,-12,-3,-2,-1,-2,-15,2,-1,-9,-8,-13,-22,-5,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,40,-26,17,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-33,-26,6,-32,-25,30,-27,29,18,-27,-27,-22,-22,-22,-7,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-23,-4,3,-17,-19,-3,-16,5,-14,-9,-1,-15,3,12,0,2,-11,-24,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-21,-22,-11,-5,-19,-10,5,-13,19,19,-18,-21,-5,-9,-17,-9,0,-21,-5,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-28,-13,-4,-9,-21,-1,-25,21,-16,-9,-3,-21,4,55,-10,-7,-17,-15,-2,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-26,-28,-30,-24,41,-29,-6,-1,-17,1,-2,-21,-29,-22,-10,-21,-12,-5,27,42,-23;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-19,-11,-14,-13,29,-14,-16,-16,-5,-4,-6,-16,-14,-14,-6,-12,-13,-14,-15,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-9,-15,-10,-9,-1,-16,-11,5,-14,15,7,-10,-16,-9,-11,-12,-5,2,-17,-4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-4,8,-17,13,7,-17,-8,-4,-15,-3,-10,-10,0,-4,-1,-6,-2,-4,-12,-21,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-16,12,2,-16,5,-5,-16,-4,-12,-9,2,-3,-4,-7,-2,-7,-13,-16,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-2,-23,-4,-5,-10,4,-3,-16,-5,-15,-8,2,-16,-3,-6,-4,-10,-16,-13,-2,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,5,-22,8,16,-25,-16,5,-26,9,-21,-13,4,-13,10,10,-2,-7,-22,-27,-10,12;
MA   /M: SY='P'; M=-7,3,-30,8,15,-28,-9,-9,-26,2,-25,-17,-1,17,1,-7,-1,-7,-25,-29,-22,7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-24,-11,-3,-16,-19,-1,-13,10,-7,0,-6,-17,3,11,-9,-7,-10,-22,-5,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,3,-11,-7,-8,-12,-17,-17,-12,-9,-13,-12,6,-11,-8,-9,21,43,-3,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-23,-10,-2,-28,-13,10,-20,33,15,-23,-25,-1,-13,-23,-10,0,-20,-2,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-26,7,19,-26,-17,4,-23,10,-19,-9,1,-10,12,6,-1,-6,-19,-28,-12,15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,25,51,-32,-18,1,-30,9,-21,-20,4,-2,20,-1,0,-10,-30,-31,-19,35;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-19,-33,-27,1,-33,-28,33,-25,20,14,-25,-26,-24,-23,-16,-3,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=21,-9,-20,-13,-14,-25,35,-19,-26,-15,-22,-16,-3,-15,-14,-19,8,-8,-16,-22,-25,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-26,8,13,-27,-16,-1,-23,9,-17,-11,3,-12,15,9,-2,-7,-21,-26,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-7,-25,-8,5,-17,-22,-1,-6,2,-8,1,-7,-16,5,2,-8,-8,-4,-25,-7,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-23,-32,-24,27,-31,-12,16,-25,24,14,-23,-28,-22,-19,-23,-10,8,-5,21,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-28,7,-6,-29,37,-11,-34,-9,-28,-20,11,-17,-11,-12,1,-14,-28,-26,-25,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-34,-28,5,-34,-27,35,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-12,-4,-4,-17,-5,-14,-17,-10,-23,-17,5,-6,-5,-11,29,28,-8,-35,-17,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-28,-7,7,-25,-18,-2,-25,17,-19,-9,-2,-10,17,37,-4,-7,-20,-21,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-24,8,34,-25,-16,-5,-21,2,-18,-14,-2,0,10,-5,6,-4,-19,-31,-19,22;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-18,-21,7,-26,23,-19,-8,-1,-19,13,51,-10,-10,-21,-16,0,3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-18,-34,-29,-1,-33,-30,37,-24,13,13,-25,-25,-25,-24,-13,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-16,-8,-1,-20,-14,-5,-27,14,-23,-14,2,-18,5,39,6,0,-16,-28,-14,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,15,-35,-20,8,-22,15,-20,-2,0,-12,48,25,-2,-10,-28,-20,-10,30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,36,-30,33,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,15,48,-30,-20,14,-29,7,-20,-15,1,-4,23,1,-1,-11,-30,-29,-14,35;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-20,-9,-3,-20,-16,-14,-14,15,-19,-8,-3,-14,-2,9,2,2,-4,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-28,1,12,-27,-17,-1,-27,27,-25,-11,7,-12,15,26,-4,-7,-22,-24,-12,12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-13,-21,-12,-17,-3,-21,-4,-13,-8,-7,-10,-12,-11,-20,8,1,3,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,10,-30,-20,23,-24,31,21,-25,-26,-19,-19,-24,-9,15,-17,1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-26,-1,6,-22,-18,-7,-24,25,-20,-8,0,-13,7,23,-5,-6,-17,-23,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-30,-2,9,-28,-20,0,-27,34,-23,-7,-1,-13,17,30,-9,-10,-21,-21,-8,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,8,-29,-18,21,-27,44,25,-29,-29,-18,-19,-28,-10,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-29,-5,4,-21,-19,-2,-27,30,-23,-10,4,-17,12,45,-8,-9,-21,-20,-9,5;
MA   /M: SY='H'; M=-7,1,-25,1,8,-23,-15,15,-21,5,-17,-7,2,-14,9,3,-2,-7,-18,-27,-7,7;
MA   /M: SY='P'; M=3,-10,-26,-10,1,-18,-15,-8,-12,-5,-11,-8,-9,9,-3,-10,-5,-7,-14,-22,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-21,-20,-25,-17,1,-22,-18,13,-17,12,12,-17,-22,-14,-14,-12,-5,11,-21,-4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-26,-5,0,-16,-13,0,-15,3,-14,-7,4,-17,3,13,-4,-7,-15,-22,-7,-1;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-22,3,7,-23,-9,-5,-24,8,-23,-15,5,-11,4,6,7,0,-18,-27,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-22,1,3,-16,-17,-7,-12,-1,-9,-4,1,-15,2,-2,-2,-2,-11,-27,-11,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-4,-10,-26,-10,-4,-19,-8,-7,-13,-1,-12,-4,-8,-5,-2,-1,-7,-10,-11,-22,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-21,-21,-14,-3,-16,-16,6,-16,15,8,-15,-21,-10,-12,-12,-6,2,-21,-6,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,2,-24,1,9,-21,-14,-4,-21,11,-17,-8,4,-14,5,17,-1,-5,-17,-27,-14,6;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-23,12,6,-23,-11,-9,-18,0,-16,-11,2,-13,-2,-6,1,-5,-12,-30,-16,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-25,-10,-8,10,-20,-4,-11,-8,-5,-7,-9,-21,-10,-6,-9,-7,-11,-1,18,-9;
MA   /M: SY='L'; M=0,-20,-21,-24,-15,1,-21,-14,4,-11,11,11,-18,-15,-12,-8,-14,-8,2,-17,-2,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-24,8,11,-20,-17,-8,-14,-1,-6,-6,-4,-14,2,-4,-4,-6,-12,-28,-13,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00592;
//
ID   SIGMA54_1_MP; MATRIX.
AC   MP00717;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-54 factors family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2321091; R2=0.0148208; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=807; N_SCORE=17.182; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-27,3,23,-25,-18,9,-27,12,-19,-12,0,-10,14,17,-2,-7,-23,-26,-11,17;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-8,-30,-8,-1,-10,-23,32,-20,4,-15,-3,-2,-20,15,17,-10,-13,-22,-11,19,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-8,3,0,-22,-16,-6,-24,6,-21,-14,-1,-17,3,5,-1,-6,-17,-24,-8,0;
MA   /M: SY='G'; M=4,13,-25,17,0,-31,20,-11,-32,-9,-25,-21,7,-13,-8,-15,3,-11,-23,-28,-23,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,49,-30,-20,9,-30,28,9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,4,-3,17,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-25,20,17,-25,-16,-7,-21,1,-15,-14,2,-10,1,-6,-1,-4,-16,-31,-16,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-4,-25,-7,-3,-5,-19,26,-14,-1,-12,-2,3,-17,5,1,-9,-11,-17,-17,9,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-25,-5,5,-20,-17,-14,-11,-5,-15,-11,-13,23,-6,-9,-5,-6,-9,-26,-19,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=6,-1,-24,0,17,-25,-10,-8,-21,6,-18,-13,-2,-9,7,2,2,-6,-16,-25,-17,11;
MA   /M: SY='H'; M=10,-4,-22,-7,1,-20,-8,18,-21,-2,-18,-9,-1,-13,1,-6,1,-8,-16,-22,-4,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,35,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-9,-1,-20,-21,-8,-22,27,-19,-8,-3,-17,4,42,-7,-2,-12,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-16,-9,-11,-12,-18,-14,-4,-1,-12,-6,2,-20,-10,2,4,10,6,-30,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-4,8,-19,-18,-1,-21,13,-14,-9,2,-15,5,23,-4,-2,-17,-25,-11,4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-27,38,22,-31,-14,2,-30,0,-23,-21,10,-8,3,-8,2,-4,-24,-34,-16,12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-26,22,15,-26,-9,9,-25,-4,-17,-15,10,-13,4,-7,0,-8,-24,-33,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=14,-3,-12,-4,16,-23,-12,-11,-21,1,-15,-14,-5,-9,2,-2,3,-3,-14,-26,-19,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-18,-30,-24,10,-31,-25,23,-25,23,12,-24,-26,-24,-21,-16,0,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-28,8,10,-30,20,-8,-33,-2,-27,-19,8,-13,1,-7,3,-11,-28,-27,-23,5;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-23,-21,-27,-18,3,-25,0,15,-20,31,35,-22,-25,-9,-14,-24,-11,6,-21,2,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-26,0,0,-20,-16,77,-28,-10,-22,-4,10,-18,8,-2,1,-12,-26,-32,12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-25,4,30,-23,-20,-10,-15,0,-14,-13,-9,0,5,-8,-2,-7,-11,-29,-19,17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=18,-22,-12,-27,-22,-8,-20,-26,17,-17,4,4,-21,-21,-21,-21,-4,-1,29,-25,-13,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-14,-20,-18,-6,-26,-24,11,-16,0,0,-10,-16,-16,-16,5,27,17,-28,-8,-18;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-14,-6,-4,-18,-9,-12,-17,-1,-20,-14,5,-12,-3,0,19,18,-8,-30,-16,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-25,13,3,-28,2,2,-25,0,-26,-15,25,-16,11,1,5,-3,-27,-31,-18,7;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-29,-24,-21,24,-27,5,0,-14,3,4,-22,-28,-13,-12,-21,-9,-8,31,53,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-27,-22,-33,-23,3,-29,-16,29,-22,29,33,-24,-24,-14,-19,-23,-9,18,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-8,-24,-10,3,-21,-17,11,-12,-5,-7,-1,-5,-15,14,-2,-4,-9,-14,-23,-6,7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,0,-13,-13,-7,-21,-16,-11,-12,-11,-10,-4,-15,-11,-12,14,36,-3,-25,-2,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-36,-5,5,-30,-9,-14,-23,-7,-28,-18,-10,54,-2,-14,-6,-11,-30,-28,-27,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-25,-10,-3,-15,-18,-2,-23,18,-17,-7,-1,-19,5,45,-3,-1,-15,-20,-5,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-30,-9,-14,-30,52,-15,-37,-12,-28,-17,0,-19,-8,-9,-1,-18,-29,-20,-26,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-19,-24,-18,-2,-26,-9,14,-21,16,9,-17,-22,-16,-18,-12,1,12,-24,-3,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-23,-36,-28,55,-31,-16,9,-28,15,5,-21,-29,-31,-20,-21,-10,4,5,29,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00593;
//
ID   SIGMA54_2_MP; MATRIX.
AC   MP00718;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-54 factors family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6942163; R2=0.0135280; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=588; N_SCORE=12.639; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-26,30,9,-29,-11,-2,-33,7,-27,-22,12,-13,3,15,6,-3,-23,-34,-17,5;
MA   /M: SY='K'; M=10,-6,-23,-10,0,-24,-13,-11,-23,23,-20,-10,-4,-12,3,21,-3,-6,-13,-20,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=19,-22,-12,-26,-20,-6,-17,-24,11,-18,10,4,-22,-22,-20,-20,-6,-2,21,-24,-12,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-26,14,21,-30,-18,-3,-25,12,-22,-13,3,-8,19,4,2,1,-23,-27,-14,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-13,1,-28,-15,13,-23,37,16,-25,-26,-5,-15,-25,-10,3,-20,-2,-9;
MA   /M: SY='L'; M=12,-23,-18,-28,-18,-3,-21,-22,15,-23,21,9,-20,-20,-16,-22,-13,-6,11,-20,-7,-18;
MA   /M: SY='E'; M=3,0,-27,2,19,-28,6,-10,-29,6,-23,-16,-2,-8,3,-3,0,-11,-23,-24,-21,11;
MA   /M: SY='E'; M=-14,6,-28,14,27,-23,-20,-4,-23,5,-9,-13,-2,-11,7,8,-7,-10,-21,-28,-14,16;
MA   /M: SY='Q'; M=12,-4,-23,-7,7,-30,-13,-5,-18,11,-18,-6,-4,-10,23,3,2,-6,-17,-20,-14,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-30,-8,-16,-28,51,5,-38,-18,-28,-16,2,-20,-14,-16,-2,-20,-30,-22,-19,-16;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-22,-32,-22,0,-29,-24,27,-26,27,15,-22,-22,-18,-24,-19,-8,17,-20,-4,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-26,-7,3,-24,-22,-8,-17,27,-19,-5,-5,-16,11,25,-8,-8,-9,-22,-10,6;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,14,-32,-26,-3,-30,-22,15,-24,14,17,-24,-28,-20,-22,-18,-8,16,-29,-9,-24;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-2,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=16,6,-12,-6,-8,-16,-8,-13,-12,-8,-15,-12,11,-12,-8,-11,14,20,-7,-29,-16,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-21,7,26,-28,-11,-2,-24,1,-24,-16,4,-6,20,-2,17,3,-21,-32,-18,23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-17,-5,7,-12,-19,-13,-10,-9,-3,-8,-5,-12,-3,-10,8,17,-7,-30,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,1,-28,-4,-11,-25,33,-9,-33,-4,-28,-18,13,-20,-8,6,0,-13,-28,-24,-23,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-23,-31,-23,-1,-33,-26,30,-25,18,13,-17,-19,-18,-23,-12,5,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=24,-14,16,-21,-13,-22,-11,-22,-17,-15,-16,-14,-14,1,-15,-22,1,-4,-8,-29,-24,-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-15,-2,0,-22,-3,-12,-20,-10,-30,-20,5,7,-2,-12,31,15,-13,-38,-22,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-7,-17,-7,-7,-1,-11,1,-13,-10,-19,-13,-1,-17,-4,-10,18,9,-10,-14,17,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,27,41,-35,-18,2,-30,8,-22,-18,5,-5,24,0,0,-10,-30,-30,-18,33;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=20,-20,-15,-25,-15,-5,-15,-20,5,-20,20,5,-20,-20,-15,-20,-10,-5,5,-20,-10,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00593;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00719;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3327203; R2=0.0152751; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=675; N_SCORE=15.633; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-24,5,11,-26,-5,-11,-20,-5,-20,-16,-1,2,-1,-11,3,-6,-16,-29,-21,5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,4,-22,9,-2,-14,-18,-5,-12,-9,-6,-8,-2,-18,-6,-6,-3,-4,-7,-29,-9,-4;
MA   /M: SY='M'; M=1,-17,-19,-23,-11,-4,-19,-8,8,-11,10,25,-17,-19,-1,-12,-12,-7,5,-20,-5,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-23,-16,-5,-12,-25,-2,3,-5,-1,2,-12,-19,-6,-1,-11,-8,6,-25,-6,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-6,-30,-6,7,-23,-18,1,-25,20,-23,-10,-5,-13,9,12,-9,-12,-21,-2,-4,8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-24,-33,-23,7,-31,-16,25,-26,20,13,-19,-22,-19,-23,-18,-10,14,-17,2,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,3,-24,1,6,-22,-15,-6,-13,4,-11,-3,2,-13,7,-2,-4,-7,-13,-25,-13,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-12,-24,-19,3,-27,-19,13,-25,27,10,-17,-26,-18,-19,-17,-1,7,-24,-4,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-22,-19,-30,-20,4,-21,-7,17,-16,24,42,-22,-22,-8,-14,-20,-9,9,-19,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-30,3,8,-28,-20,2,-28,34,-24,-9,1,-13,11,26,-10,-11,-21,-22,-8,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-8,-33,-6,12,-24,-19,-4,-24,11,-20,-10,-8,-14,22,15,-10,-13,-26,9,-5,17;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-23,-12,-12,-1,-16,14,-4,-18,4,2,4,-24,-10,-11,-11,-10,-10,-25,1,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,21,-24,9,-5,-22,13,19,-27,-7,-28,-16,36,-20,-3,-5,4,-9,-30,-33,-15,-5;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-10,-34,-25,8,-29,-26,21,-26,13,8,-20,-23,-23,-25,-14,-8,15,-18,-2,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-13,-18,-11,-13,-7,-16,-6,-13,-6,-7,-9,-13,-10,-18,8,3,0,-20,-11,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-16,-28,-27,9,-31,-24,25,-21,9,8,-25,-28,-27,-20,-13,-4,34,-20,2,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,3,-11,-12,-12,-20,-20,-13,-12,-12,-12,1,-14,-12,-12,16,41,-3,-33,-13,-12;
MA   /M: SY='S'; M=15,-3,1,-6,-4,-20,-3,-13,-19,-12,-26,-18,4,-13,-4,-13,31,14,-8,-37,-21,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,18,-26,11,3,-18,-12,9,-19,2,-23,-13,24,-14,10,0,0,-6,-26,-22,0,5;
MA   /M: SY='Q'; M=8,2,-20,1,3,-26,-9,9,-21,-3,-21,-11,4,-12,10,-3,10,-2,-17,-28,-12,5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-28,-7,6,-21,-20,-15,-12,-2,-15,-11,-11,20,-3,-9,-3,-3,-13,-29,-18,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-12,-29,-9,5,-15,-19,-7,-17,0,-11,-10,-11,-8,-1,4,-9,-9,-17,-3,-7,1;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-32,-27,-38,-29,42,-26,-23,0,-24,2,0,-27,-29,-30,-19,-24,-14,0,42,22,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-25,-23,-19,19,-28,3,7,-18,18,9,-22,-29,-13,-14,-21,-9,-2,6,42,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-28,29,25,-30,-15,3,-29,5,-23,-18,12,-10,15,1,0,-7,-28,-29,-13,20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-25,-24,-16,0,-21,-7,4,-17,23,15,-21,-26,-12,-9,-24,-13,-2,-9,1,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-18,92,-28,-27,-14,-26,-28,-25,-27,-17,-17,-18,-35,-27,-27,-7,-6,-8,-43,-25,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,22,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,0,-30,3,27,-26,-21,0,-24,16,-18,-10,-1,-9,22,20,-5,-10,-23,-23,-11,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-26,-21,-18,12,-26,9,6,-16,7,4,-14,-25,-11,-14,-16,-10,-3,0,34,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-23,-35,-25,19,-33,-22,26,-29,30,19,-24,-26,-23,-23,-24,-10,15,-14,6,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-26,-26,-23,21,-29,-3,7,-18,10,4,-26,-30,-18,-15,-22,-10,3,20,41,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-30,-28,1,-29,-26,28,-20,15,16,-29,-29,-26,-19,-13,-2,42,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-37,-27,16,-32,-20,31,-24,17,26,-21,-23,-20,-22,-19,-9,21,-15,5,-25;
MA   /M: SY='D'; M=3,21,-23,29,12,-30,-5,-8,-27,-4,-20,-20,6,-10,-2,-12,3,-6,-19,-32,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-30,17,55,-29,-20,0,-30,12,-20,-19,0,-2,19,6,-1,-10,-29,-29,-19,37;
MA   /M: SY='T'; M=10,-4,6,-15,-14,-15,-15,-18,-8,-14,-11,-8,0,-17,-12,-17,7,11,-2,-31,-16,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-8,21,-28,20,4,-28,-8,-4,-24,-4,-29,-22,21,16,-4,-10,2,-5,-28,-36,-23,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-23,-25,-20,-6,-7,-21,7,-20,13,6,-18,-24,-18,-14,-15,-11,5,-21,-10,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-26,3,29,-18,-20,-9,-16,0,-13,-13,-10,-9,5,-6,-6,-10,-13,-8,-11,17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-15,-5,-5,-19,4,-12,-19,-9,-20,-13,3,-11,0,-9,19,17,-12,-28,-16,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-6,-26,-7,-6,-6,-21,66,-17,-13,-9,2,2,-20,1,-5,-12,-16,-19,-21,20,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-26,-14,-19,-21,36,-19,-19,-20,-15,-10,-2,-21,-18,-20,-4,-14,-15,-22,-22,-19;
MA   /M: SY='M'; M=3,-16,-16,-21,-17,-1,-9,-18,0,-18,3,4,-13,-20,-15,-17,-2,3,4,-22,-8,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-15,-1,-3,-14,-9,-5,-10,-7,-13,-9,-1,0,-3,-9,4,0,-6,-22,-11,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-28,-3,7,-27,-10,-3,-18,-1,-14,-4,-3,-2,18,-1,-4,-8,-22,-24,-15,12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-15,-25,-16,-11,-8,-7,-14,-10,-2,-5,2,-12,-10,-10,-5,-11,-10,-8,-18,-7,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-15,-22,-23,-19,11,-16,-10,5,-14,6,16,-10,-22,-14,-13,-13,-6,1,-14,5,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00531;
//
ID   RASGEF_MP; MATRIX.
AC   MP00720;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ras Guanine-nucleotide exchange factors domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6161313; R2=0.0134624; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=480; N_SCORE=11.068; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-15,-26,-18,-13,15,-25,26,-11,-9,-5,0,-8,-24,-9,2,-15,-13,-11,-9,23,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-24,-5,2,-21,-14,-5,-25,25,-22,-11,3,-14,6,35,-1,-4,-16,-22,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-1,-19,-7,-2,-19,-14,-11,-12,5,-12,-5,1,-14,0,-2,1,4,-7,-25,-13,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-30,-20,-15,11,-29,4,3,-6,1,2,-17,-21,-6,-6,-18,-10,-6,8,43,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-27,-12,-2,-17,-20,-4,-22,20,-10,-6,-5,-20,6,47,-11,-9,-15,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-25,5,8,-22,-16,2,-15,-6,-10,-8,1,-6,5,-8,-4,-7,-17,-29,-13,6;
MA   /M: SY='A'; M=4,-12,-15,-16,-8,-15,-16,-17,-7,0,-4,-3,-10,-17,-7,-1,-6,-3,-3,-23,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-19,-20,-12,10,-25,-17,7,-22,23,7,-20,-24,-18,-17,-16,-6,5,-20,-2,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-1,-22,-5,-1,-21,-6,0,-22,8,-20,-9,4,-14,1,10,2,-1,-16,-26,-12,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-20,0,2,-17,0,-9,-24,3,-26,-16,9,-13,-1,-1,14,2,-18,-29,-15,1;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-22,-6,-27,-20,-6,-29,-19,14,-16,10,12,-20,-25,-12,-11,-14,-5,15,-26,-8,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-20,7,2,-19,-2,-5,-15,-4,-19,-11,14,-14,-2,-6,6,-2,-14,-30,-16,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-30,-8,1,-25,-9,-14,-17,-8,-20,-13,-12,39,-1,-13,-4,-8,-21,-25,-22,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-36,-10,-6,-30,7,-20,-25,-13,-29,-20,-14,55,-13,-20,-6,-13,-29,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-19,61,-25,-24,-12,-28,-25,-14,-21,-10,-10,-19,-32,-24,-21,-8,-1,1,-37,-16,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,62,-30,-6,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,48,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-20,-32,-23,21,-29,-18,17,-24,25,19,-22,-25,-21,-19,-20,-5,11,-15,5,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-13,-29,-11,-15,-27,37,-20,-29,-17,-27,-18,-6,4,-17,-19,0,-13,-22,-25,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-17,-26,-20,1,-28,-21,17,-20,22,13,-21,-24,-18,-15,-13,5,18,-24,-5,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-25,-29,-23,32,-31,-5,12,-22,17,8,-23,-29,-20,-17,-23,-10,2,7,39,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,12,-31,-21,23,-30,44,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,12,-19,1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-1,-19,-4,1,-21,-16,-11,-21,14,-22,-11,2,-11,5,11,10,16,-12,-27,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,6,-31,-21,27,-27,38,23,-27,-27,-19,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-12,-17,-15,-6,-21,-20,2,-14,1,0,-10,-17,-14,-13,8,27,10,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-20,-32,-22,43,-24,-11,0,-17,6,11,-17,-24,-23,-13,-17,-10,-1,-3,16,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-20,-25,-20,0,-28,-22,20,-22,18,9,-14,-22,-18,-19,-11,5,15,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,11,-28,16,13,-22,-17,28,-29,1,-20,-13,6,-14,5,2,-5,-12,-25,-27,-1,7;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-22,7,22,-23,-18,-4,-18,-1,-14,-13,-2,-8,6,-6,3,2,-14,-29,-15,14;
MA   /M: SY='G'; M=10,-9,-26,-11,-16,-28,48,-19,-33,-13,-26,-17,-2,-17,-16,-16,1,-15,-23,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-19,9,-2,-17,-6,3,-15,0,-21,-11,37,-18,-1,-1,8,3,-21,-35,-16,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-12,3,-32,8,9,-31,-18,-2,-27,16,-28,-15,-1,17,7,4,-6,-10,-26,-27,-16,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-25,33,8,-26,-13,-7,-28,-4,-24,-23,11,-12,-3,-10,5,6,-21,-23,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-25,-24,-16,32,-29,-5,3,-18,7,1,-16,-26,-19,-15,-17,-9,-2,4,33,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-29,-21,9,-30,-20,19,-26,30,13,-23,-26,-20,-20,-19,-1,13,-18,3,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-28,16,25,-24,-17,4,-26,10,-21,-16,4,-10,11,3,-2,-8,-24,-24,-6,17;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,18,-20,18,2,-21,3,3,-23,2,-21,-15,19,-12,-1,3,1,-7,-21,-24,-13,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-8,10,-26,6,0,-25,17,-5,-30,3,-27,-17,18,-16,-3,4,1,-10,-27,-26,-20,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-21,-23,-17,5,-27,-12,13,-19,25,13,-18,-27,-13,-14,-20,-8,7,-17,6,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-21,-38,-28,70,-29,-15,2,-27,10,5,-20,-29,-35,-18,-20,-10,0,9,31,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-3,14,-22,18,24,-28,-10,-2,-26,1,-25,-19,12,-8,11,-4,13,0,-23,-34,-19,18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-26,-20,-10,2,-22,-4,-11,8,-2,9,-9,-22,-2,33,-15,-10,-8,-15,-1,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-28,-3,-2,-18,-16,6,-26,11,-21,-12,4,-19,3,32,-5,-6,-21,-12,-6,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-26,-10,1,-21,-20,-4,-13,20,-12,11,-6,-14,14,17,-9,-5,-12,-21,-7,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-12,-24,-16,-3,-7,-27,-14,11,-12,2,6,-9,-17,-5,-14,-9,-5,7,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-13,-23,-17,11,-15,-18,-4,-16,-4,-6,-12,-18,-19,-17,3,5,4,-15,-1,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-26,12,20,-27,-14,5,-27,12,-23,-15,12,-11,12,9,0,-8,-25,-29,-14,15;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-23,-34,-27,-2,-34,-28,36,-25,13,13,-19,-20,-20,-25,-12,-1,28,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-18,-31,-25,4,-29,-26,25,-23,17,11,-23,-24,-23,-22,-13,-1,26,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='R'; M=2,0,-23,-1,1,-25,-1,-8,-26,7,-22,-15,4,-14,2,14,4,-5,-18,-25,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-23,3,20,-16,-13,-3,-19,-1,-16,-10,5,-10,10,-4,4,0,-20,-27,-13,15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-23,-35,-25,10,-31,-23,29,-26,22,18,-22,-23,-21,-24,-19,-9,19,-17,2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-30,-7,2,-23,-23,1,-15,16,-14,-3,-2,-16,14,25,-10,-11,-15,-21,-7,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-9,-23,-10,0,-14,-23,14,-16,3,-9,-1,-6,-20,16,11,-9,-10,-18,-15,9,6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,1,-30,-23,27,-29,-13,-1,-22,13,2,-21,-31,-23,-13,-21,-10,-2,-8,17,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00594;
//
ID   FTHFS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00721;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Formate--tetrahydrofolate ligase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1817369; R2=0.0110973; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684; N_SCORE=11.762; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=209; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-11,8,-28,6,13,-27,-15,3,-27,23,-27,-14,12,-4,8,14,-3,-8,-25,-28,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-10,-15,-11,-14,-9,-19,-5,-12,-12,-9,-7,-14,-11,-15,16,14,7,-29,-16,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-20,-19,-27,-22,-4,-24,-23,19,-20,9,11,-16,-19,-17,-20,-6,7,18,-24,-7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=10,-19,-21,-25,-21,-12,-1,-23,7,-20,2,3,-14,-19,-17,-22,-7,-9,7,-21,-13,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,11,-20,-15,-18,-9,-21,-9,-14,-11,-10,-9,-18,-15,-20,4,-2,3,-27,-20,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-32,-23,7,-32,-23,28,-29,39,21,-27,-27,-20,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,41,-35,-20,5,-25,10,-20,-10,0,-5,39,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-19,-26,-17,2,-22,-10,15,-19,26,32,-20,-23,-9,-14,-16,-6,7,-23,-3,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-14,-4,-26,-22,-21,-11,-12,-24,-15,-20,76,-11,-21,-11,-10,-23,-29,-26,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,5,-19,-19,-5,-25,-20,0,-16,-5,-5,-13,-22,-18,-16,4,21,12,-27,-4,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-19,-35,-25,51,-25,-17,3,-24,12,9,-19,-26,-29,-18,-17,-9,2,0,17,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,61,-16,-37,-17,-30,-20,8,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-21,-30,-23,-1,-28,-21,29,-22,16,21,-19,-22,-15,-21,-12,-5,22,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-26,-9,-16,-27,52,-19,-35,-18,-28,-19,1,-18,-16,-18,7,-8,-25,-24,-27,-16;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-12,-19,-11,-21,7,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-10,-13,-8,-17,-6,-18,-12,-10,-14,-12,-3,-10,-8,-15,20,19,-2,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-10,-17,-28,59,-19,-36,-18,-29,-19,0,-18,-17,-19,5,-15,-26,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-28,-14,-7,2,-25,0,-12,12,-5,-2,-12,-22,-3,12,-17,-10,-11,-4,21,-7;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,3,-11,-7,-20,-3,-16,-17,-12,-21,-16,-1,-13,-7,-16,23,9,-6,-33,-21,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-26,-2,15,-23,-18,1,-19,5,-18,-5,-1,-11,34,4,4,-3,-23,-21,-8,25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,2,-32,-28,0,-32,-28,23,-25,16,10,-27,-30,-26,-23,-16,-5,30,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-22,-19,-7,-8,-28,-17,9,-11,12,7,-16,-19,-6,-11,-12,-1,6,-23,-6,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-11,-36,-6,0,-27,-18,-2,-21,-9,-28,-17,-8,62,-7,-15,-7,-8,-29,-31,-22,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-23,-24,-15,0,-20,-10,6,-14,7,24,-19,3,-9,-14,-14,-7,-2,-21,-6,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,18,-27,28,41,-30,-14,-1,-30,5,-24,-22,8,-4,12,-3,6,-6,-27,-34,-20,27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,6,-30,14,12,-28,-19,-7,-24,13,-18,-13,-1,1,5,5,-8,-10,-22,-27,-15,8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-38,-29,16,-36,-27,36,-29,19,15,-22,-24,-25,-26,-20,-9,25,-15,5,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-20,23,2,-22,-3,5,-22,-1,-29,-21,48,-17,-1,-3,11,3,-27,-39,-19,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-10,-31,-22,7,-29,-22,10,-29,35,11,-30,-31,-21,-21,-29,-12,3,-2,1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-29,-7,-9,-18,11,48,-30,-14,-20,-4,4,-20,-3,-8,-7,-19,-27,-24,2,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,53,-30,-20,8,-30,25,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-2,18,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,6,-12,-12,-12,-19,-20,-13,-12,-13,-12,-2,-14,-12,-12,18,40,-2,-33,-13,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00595;
//
ID   FTHFS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00722;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Formate--tetrahydrofolate ligase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6179552; R2=0.0164357; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=305; N_SCORE=10.621; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=54; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,3,-38,-29,44,-29,21,18,-22,-22,-22,-28,-20,-9,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-25,-6,2,-24,-20,-13,-18,34,-22,-7,-4,-14,2,18,-8,-8,-7,-22,-11,2;
MA   /M: SY='C'; M=3,-14,51,-20,-18,-17,-19,-22,-19,-20,-16,-15,-11,-27,-18,-19,4,1,-5,-40,-23,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-31,-10,0,-22,-19,-4,-28,21,-22,-12,-3,0,6,50,-8,-9,-21,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-13,-20,-17,-10,-1,-22,-15,1,-8,4,1,-11,-19,-12,-9,-8,0,2,-20,-2,-11;
MA   /M: SY='G'; M=9,-8,-17,-11,-11,-19,16,-16,-18,-15,-17,-11,-2,-16,-10,-15,14,3,-10,-28,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-7,7,-30,13,-2,-32,33,-8,-37,-12,-29,-22,6,-10,-10,-15,-1,-16,-30,-27,-24,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-22,-19,-12,4,-25,-14,5,-12,19,10,-16,-23,-11,-9,-18,-6,1,-20,-2,-11;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-18,-1,-1,-21,-14,-10,-19,7,-20,-12,2,-8,0,2,5,6,-12,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-36,-14,-5,-24,-22,-21,-10,-13,-20,-14,-21,69,-13,-20,-11,-9,-18,-29,-25,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-6,28,-23,28,9,-28,-7,5,-27,1,-26,-20,25,-13,1,-2,6,-4,-24,-35,-17,4;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,26,-24,-17,-17,-12,-23,-12,-18,-7,-10,-15,-21,-17,-23,0,-4,0,-29,-21,-17;
MA   /M: SY='V'; M=14,-17,-11,-21,-19,-9,-19,-24,9,-15,0,1,-18,-20,-19,-18,1,8,24,-27,-13,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-33,-25,4,-33,-25,32,-28,31,18,-25,-26,-21,-24,-22,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-20,-10,-20,-1,-20,-9,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,1,1,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-18,-32,-26,0,-30,-27,30,-24,18,13,-25,-25,-23,-23,-14,-5,32,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,1,-21,-20,0,-30,29,-20,-10,0,-20,12,67,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-13,-16,-10,-22,11,-19,-16,-12,-15,-13,-6,-12,-10,-19,12,-1,-6,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,8,-31,-20,25,-29,43,23,-28,-28,-19,-21,-28,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,0,11,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,33,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-17,-20,-15,1,-21,14,0,-13,5,18,-13,-23,-5,-11,-13,-8,-4,-12,17,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-17,14,-27,7,0,-20,-13,69,-27,-7,-23,-7,27,-20,7,0,-3,-13,-30,-33,6,0;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-10,-17,-28,59,-19,-36,-18,-29,-19,0,-18,-17,-19,5,-15,-26,-22,-28,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-28,-10,-18,-26,58,-19,-34,-17,-24,-16,-2,-19,-18,-17,-2,-18,-26,-19,-26,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=3,-12,-18,-14,-15,-13,-3,-18,-2,-15,-3,-3,-10,-22,-14,-14,-4,-5,7,-26,-15,-15;
MA   /M: SY='P'; M=1,-3,-25,-2,-1,-16,-14,-9,-18,-1,-19,-13,-4,5,-2,-5,0,-5,-16,-22,-9,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-26,-6,0,-18,-19,-14,-14,11,-13,-7,-9,-2,-3,4,-11,-8,-11,-12,-9,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-8,-4,-24,0,-1,-14,-20,-13,-6,-10,-2,-5,-10,-8,-8,-13,-9,-4,-4,-26,-9,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-19,8,7,-20,-13,-7,-16,5,-17,-12,5,-11,0,1,3,1,-10,-26,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-16,-22,-15,-10,-9,-19,-17,4,-17,8,1,-17,7,-12,-18,-13,-7,-2,-21,-11,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-25,-7,-13,-23,32,-11,-29,-9,-25,-16,4,-18,-12,-11,2,-8,-22,-21,-17,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-22,-3,9,-19,-17,-6,-12,4,-6,0,-6,-11,8,0,-5,-4,-12,-23,-11,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-4,-32,4,28,-29,-18,-10,-24,-1,-24,-19,-8,36,5,-10,-1,-8,-27,-30,-24,14;
MA   /M: SY='N'; M=-12,18,-22,12,-3,-15,-12,-2,-9,-10,-6,-7,21,-20,-6,-9,-4,-5,-15,-33,-13,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-24,-19,-15,-10,-19,-20,6,-18,4,1,-17,3,-17,-19,-13,-7,4,-26,-14,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,12,-29,18,31,-31,-16,-4,-29,13,-24,-19,4,2,10,1,-1,-8,-26,-29,-19,20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-15,-14,-2,-21,-3,-16,-13,-4,-12,-10,-8,-11,-5,-11,5,-3,-5,-22,-19,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-28,-24,7,-25,-17,18,-22,23,12,-26,-29,-21,-19,-19,-7,19,-16,7,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-27,-10,0,-17,-23,-13,-13,23,-3,0,-10,-17,0,13,-17,-10,-10,-20,-7,0;
MA   /M: SY='T'; M=10,-7,-17,-13,-7,-17,-14,-13,-17,3,-13,-10,-3,-13,-3,13,7,14,-7,-23,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00595;
//
ID   POLYPRENYL_SYNTHET_1_MP; MATRIX.
AC   MP00723;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Polyprenyl synthetases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2451563; R2=0.0160543; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=532; N_SCORE=13.776; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=13,-14,-17,-18,-9,-14,-13,-11,-2,-13,3,1,-13,-17,-2,-14,-3,-3,0,-23,-11,-6;
MA   /M: M=-2,-8,-15,-9,-5,-13,-19,-12,-7,-6,-3,-2,-10,-18,-4,-5,-8,-7,-6,-21,-8,-6;
MA   /M: SY='T'; M=1,-12,-22,-13,-10,-14,-18,-14,-6,-7,-11,-7,-10,-2,-10,-5,-2,2,-1,-23,-10,-12;
MA   /M: SY='I'; M=1,-25,-16,-29,-23,0,-24,-24,19,-24,19,10,-23,-23,-21,-22,-14,-5,18,-23,-7,-23;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-17,-15,-13,-22,19,-19,-18,-13,-17,-13,-3,-14,-12,-18,8,-2,-10,-22,-22,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-17,-11,-18,-6,-12,-20,-19,-14,-9,-12,-11,-18,-20,-8,-12,-11,-9,-10,14,-6,-6;
MA   /M: SY='A'; M=12,-19,9,-27,-21,-10,-18,-23,4,-20,-1,0,-17,-22,-18,-22,-4,-3,10,-27,-14,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-17,-29,-25,-1,-30,-27,27,-22,14,10,-21,-23,-22,-21,-10,4,29,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-30,18,55,-30,-15,-1,-30,8,-21,-20,0,-1,18,-1,1,-10,-30,-30,-20,36;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-27,-22,-32,-22,9,-26,-15,18,-22,27,29,-25,-25,-14,-17,-25,-11,9,-6,4,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-34,-25,6,-34,-25,33,-28,30,20,-25,-25,-20,-24,-22,-8,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,5,-25,-20,78,-28,-5,-20,0,8,-18,22,2,-8,-18,-30,-28,13,10;
MA   /M: SY='T'; M=13,1,-8,-9,-8,-15,-11,-14,-10,-9,-13,-9,5,-13,-8,-12,12,17,-4,-29,-16,-8;
MA   /M: SY='F'; M=13,-17,-15,-24,-17,15,-15,-10,-5,-15,-3,-4,-14,-20,-16,-17,-3,-4,-3,-4,14,-17;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-12,-11,-9,5,-10,-14,-14,-15,-18,-14,1,-15,-11,-12,23,17,-6,-27,-7,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-32,-27,3,-32,-26,32,-24,23,18,-27,-27,-23,-22,-18,-5,33,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-9,-25,-12,-8,-13,-21,47,-10,-15,-5,3,-2,-20,-1,-9,-9,-13,-11,-27,8,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-27,3,-33,-25,34,-26,25,20,-26,-26,-21,-23,-20,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-23,-26,-13,-2,-25,-8,19,-12,13,36,-18,-19,-2,-13,-16,-9,10,-21,-2,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='B'; M=-9,25,-24,24,14,-27,-8,7,-27,2,-27,-19,25,-13,7,0,7,-4,-26,-35,-17,10;
MA   /M: SY='S'; M=8,12,-11,15,3,-26,-4,-10,-24,-8,-26,-21,8,-11,-3,-13,21,6,-14,-37,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-25,10,6,-20,-17,-3,-14,-4,-14,-11,2,-10,-3,-9,-3,-6,-12,-29,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-19,-22,-16,2,-25,-14,7,-19,13,7,-16,-21,-14,-16,-8,9,6,-16,1,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-30,67,-15,-40,-20,-30,-19,0,-20,-19,-19,0,-20,-30,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-26,-9,3,-16,-22,-5,-15,13,-13,-3,-6,-15,13,13,-7,-7,-13,-20,-6,8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-35,-13,-3,-25,-21,-16,-13,-9,-21,-13,-17,58,-9,-17,-9,-8,-20,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,21,-16,-15,-13,-20,-22,-12,-16,-13,-12,-7,-19,-15,-16,12,24,1,-36,-17,-15;
MA   /M: SY='W'; M=3,-19,-13,-24,-21,-6,-16,-23,-2,-17,-9,-8,-16,-24,-18,-19,-9,-7,2,13,-5,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-1,-28,-5,-6,-3,-19,54,-21,-8,-16,-4,9,-22,0,-3,-10,-14,-24,-12,23,-6;
MA   /M: SY='K'; M=0,-9,-21,-12,-6,-17,-18,-11,-8,7,-11,-4,-6,-17,-2,7,-3,-3,-1,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-22,-18,-9,-13,-24,-16,5,0,0,4,-14,-18,-7,-5,-11,-6,8,-23,-8,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-24,-31,-26,-16,31,-26,-10,-8,-17,-6,-8,-21,-8,-20,-16,-20,-13,-14,26,29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-2,-12,-29,49,-15,-36,-12,-29,-19,6,-18,-12,-14,2,-15,-28,-23,-26,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-21,0,8,-16,-20,-11,-3,-6,-9,-7,0,-15,-5,-10,-1,-1,1,-32,-15,1;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-28,-6,-5,-27,9,-14,-26,-1,-25,-16,-4,9,-7,-5,-1,-10,-22,-24,-22,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-20,-20,-12,-5,-21,-11,8,-11,8,18,-12,-19,-4,-10,-9,-2,4,-23,-5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-14,-14,-11,-16,-10,-20,-2,-13,-8,-7,-7,-13,-11,-19,8,6,4,-25,-15,-12;
MA   /M: SY='I'; M=7,-25,-20,-32,-24,-4,-27,-26,27,-22,13,12,-21,-21,-19,-24,-12,-5,25,-22,-7,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00407;
//
ID   SRP1_TIP1_MP; MATRIX.
AC   MP00724;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Stress-induced proteins SRP1/TIP1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8414183; R2=0.0141042; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=461; N_SCORE=11.333; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-30,9,32,-30,12,-7,-34,-1,-24,-20,0,-7,6,-7,0,-14,-30,-26,-24,19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-24,-34,-24,4,-31,-18,31,-25,31,31,-24,-24,-15,-21,-24,-10,17,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,32,-23,45,13,-33,-6,-4,-33,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,14,1,-23,-40,-20,6;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-29,-26,41,5,-20,-14,-26,-4,-7,-13,-26,-33,-20,-13,-14,-11,-1,9,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-1,34,-25,46,12,-35,-7,-5,-32,-3,-25,-25,12,-10,-3,-13,3,-7,-22,-35,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=13,0,-22,-1,23,-29,-12,-5,-20,2,-16,-11,-4,-6,19,-5,4,-6,-19,-24,-17,21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-25,-6,1,-21,-20,-9,-25,27,-21,-10,0,-14,5,33,-2,6,-15,-23,-10,1;
MA   /M: SY='M'; M=10,-10,-14,-20,-14,-9,-15,-13,1,-10,1,15,-10,-14,-6,-13,3,15,4,-24,-9,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-35,-22,42,-25,20,31,-20,-20,-15,-25,-20,-10,25,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-10,-23,-23,-4,-26,-26,16,-16,3,3,-19,-23,-23,-16,1,18,32,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-30,-4,2,-33,12,-8,-31,15,-27,-11,0,-14,13,7,-4,-14,-26,-20,-17,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-19,-5,9,-16,-12,-4,-9,-5,-10,8,-3,-11,5,-7,8,1,-8,-30,-13,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-25,-6,-7,-26,19,-16,-27,-14,-30,-20,-2,13,-10,-16,13,-2,-22,-30,-26,-10;
MA   /M: SY='E'; M=11,3,-23,6,35,-26,-13,-7,-23,3,-16,-16,-4,-4,9,-7,4,-6,-19,-26,-20,22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-15,-18,-12,-15,-11,-19,2,-15,-9,-6,-6,-13,-9,-19,13,4,4,-27,-15,-12;
MA   /M: SY='A'; M=29,-3,-17,-6,15,-24,-7,-13,-17,-3,-14,-14,-6,-6,1,-13,6,-4,-11,-24,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-15,-15,-2,-25,-5,-12,-13,-5,-13,-7,-7,-10,9,-12,7,-3,-8,-20,-17,3;
MA   /M: SY='S'; M=3,14,-14,7,0,-20,0,-3,-20,-6,-30,-20,28,-14,0,-6,29,13,-17,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-18,-17,-20,-21,-16,13,-24,-5,-17,-9,-6,-14,-21,-21,-20,-1,-7,8,-24,-20,-21;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,43,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,15,-5,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-34,-29,-19,-11,-32,-26,23,-22,1,5,-20,22,-16,-26,-16,-10,7,-24,-11,-22;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00596;
//
ID   GERMIN_MP; MATRIX.
AC   MP00725;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Germin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7721868; R2=0.0141981; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=703; N_SCORE=14.743; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-21,15,-3,-18,-3,7,-14,-3,-26,-17,53,-20,-2,-3,7,-1,-25,-38,-18,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-16,-10,-13,-16,5,-20,-18,-13,-16,-13,0,-13,-13,-13,14,31,-8,-27,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,7,-31,-21,25,-28,42,21,-28,-28,-20,-21,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-20,-29,-24,0,-31,-10,25,-24,18,14,-22,-26,-20,-20,-17,-8,25,-25,-1,-24;
MA   /M: SY='S'; M=4,7,-13,4,-1,-20,-1,-9,-20,-9,-27,-19,16,-12,-2,-9,30,19,-13,-38,-19,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-18,-30,-23,4,-28,-18,23,-22,28,27,-25,-26,-17,-18,-20,-5,20,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-4,-11,-13,-10,-18,-4,-16,-8,-10,-13,-10,0,-14,-10,-16,12,3,0,-27,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-28,-11,-3,-17,-19,1,-23,23,-15,-1,1,-20,8,54,-10,-9,-17,-21,-9,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-22,-28,-24,-2,-18,-24,19,-25,19,10,-20,-24,-21,-22,-16,-5,15,-22,-6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-19,36,-29,52,16,-23,-13,-3,-34,-3,-24,-25,13,-12,-4,-11,-3,-10,-26,-33,-13,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-24,-32,-24,30,-31,-12,15,-25,25,11,-24,-29,-23,-19,-24,-10,6,-1,25,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-18,-9,4,-24,8,-15,-20,-7,-16,-14,-6,-10,-5,-15,6,-6,-12,-22,-22,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-16,-32,-12,-4,-27,-7,-18,-20,-7,-24,-16,-14,46,-8,-11,-6,-9,-22,-26,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-8,-3,-13,-25,28,-9,-33,-14,-27,-19,3,-21,-14,-15,0,-13,-25,-27,-20,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-18,-23,-17,-7,-27,-20,17,-17,8,7,-18,-22,-9,-15,-6,1,20,-26,-8,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-8,8,-21,-5,-14,-9,-16,-7,7,-11,-9,-4,20,-22,-11,-11,-2,-3,0,-30,-9,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13,-3,-25,-21,-20,-15,-13,-19,-15,-21,74,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-22,-33,-18,-8,-7,-22,-18,-10,-14,-14,-5,-20,52,-14,-19,-14,-10,-18,-22,-15,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-13,-16,-14,-7,-22,-21,2,-15,-2,-3,-7,-15,-13,-14,11,31,9,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10,-5,-22,2,-5,-32,18,-22,-12,0,-20,3,48,-8,-12,-22,-20,-15,-5;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-12,-17,-10,-21,6,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,12,0,-4,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-35,-29,0,-34,-26,39,-24,16,22,-24,-24,-21,-24,-16,-6,35,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-21,-20,-18,1,-12,-17,6,-22,17,5,-10,-25,-18,-17,-14,-5,2,-23,-7,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-18,-29,-25,31,-28,-19,11,-23,12,4,-16,-27,-27,-18,-14,-3,12,-11,10,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-4,-31,-30,-1,-31,-30,28,-23,11,10,-28,-29,-28,-22,-12,-3,41,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-17,-28,-21,-3,-24,-21,20,-19,16,16,-22,-22,-15,-19,-12,-4,21,-23,-7,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-26,9,23,-29,-17,-5,-24,15,-23,-13,1,-8,16,6,3,-3,-20,-28,-15,19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-18,-6,1,-18,-19,-15,-12,6,-15,-8,-4,-12,-1,0,7,16,-2,-28,-12,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-34,-25,16,-32,-24,26,-28,31,16,-26,-28,-24,-22,-23,-8,20,-17,3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-16,-17,-17,-9,16,-27,-14,1,-20,13,1,-16,-23,-17,-16,-17,-7,-2,-14,7,-13;
MA   /M: SY='V'; M=23,-21,-10,-25,-21,-9,-16,-25,11,-15,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,27,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,74,-31,-21,4,-30,11,2,-20,-29,-38,-21,-20,-10,2,8,28,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-33,-28,13,-32,-27,28,-25,19,12,-27,-28,-28,-22,-17,-5,32,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-16,3,-3,-18,-3,-13,-17,-12,-15,-14,2,-13,-6,-13,16,11,-10,-33,-17,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00597;
//
ID   AP_NUCLEASE_F1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00726;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 1 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5686464; R2=0.0184618; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=180; N_SCORE=9.882; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-3; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-22,-13,-8,-16,-11,-13,-17,4,-18,-12,-3,-17,-5,6,-1,-5,-11,-3,-10,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-13,-8,-21,-17,-1,-17,-17,-9,-9,-11,-5,-10,-23,-15,-12,-10,-9,-6,3,-3,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-25,-15,-1,-12,-23,-12,-6,3,4,0,-12,-18,-2,11,-14,-9,-6,-21,-8,-3;
MA   /M: SY='K'; M=3,-5,-23,-4,3,-25,-11,-13,-23,12,-28,-15,-1,8,1,2,10,2,-16,-29,-18,1;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-25,-8,-3,-9,-20,12,-14,6,-14,0,3,-18,4,4,-8,-9,-12,-22,0,0;
MA   /M: SY='E'; M=1,7,-23,10,11,-30,-1,-6,-26,1,-25,-16,4,-10,11,-4,10,-2,-21,-29,-19,11;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-23,-19,-26,-23,13,-11,-17,3,-21,7,2,-20,-26,-23,-19,-13,-8,7,-10,7,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-23,-13,0,-9,-15,-15,-5,-9,12,1,-14,-19,-8,-9,-13,-4,-7,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-25,6,21,-30,-14,-1,-23,6,-20,-12,0,-9,23,5,4,-6,-22,-25,-16,21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-10,-32,-25,2,-32,-23,19,-25,13,7,-21,-25,-19,-23,-18,-4,10,-8,4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-18,-32,-25,11,-28,-25,22,-25,21,11,-24,-26,-24,-22,-17,-6,22,-19,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-28,15,24,-31,-19,-3,-22,11,-20,-12,0,-9,19,3,-3,-9,-19,-28,-15,22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-27,2,23,-24,-18,-7,-24,19,-16,-12,-4,-9,9,13,-5,-9,-19,-24,-14,16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-28,3,28,-14,-23,6,-15,-3,-1,-7,-8,-12,7,-6,-10,-11,-19,-22,-2,16;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-25,20,14,-31,-10,5,-24,3,-25,-15,24,-13,20,0,4,-6,-28,-31,-17,17;
MA   /M: SY='P'; M=14,-17,-25,-18,-8,-12,-13,-20,-13,-12,-17,-13,-16,33,-14,-20,-3,-6,-14,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-36,-27,9,-35,-26,35,-29,28,17,-24,-25,-23,-25,-22,-9,24,-19,1,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-17,77,-25,-26,-22,-8,-27,-29,-26,-21,-19,-15,-33,-26,-27,-6,-11,-12,-41,-29,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,41,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,18,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-13,-16,-13,-6,-23,-21,0,-15,1,-3,-6,-14,-12,-13,9,36,4,-28,-8,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,3,-32,-26,-1,-31,-24,21,-24,18,16,-25,-28,-22,-22,-18,-7,22,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=5,3,-19,-2,4,-25,-10,5,-18,-2,-20,-9,8,-12,18,-3,12,4,-18,-28,-12,10;
MA   /M: SY='D'; M=-5,9,-26,13,6,-26,-15,-9,-21,6,-21,-15,3,-2,-2,2,-3,-7,-14,-30,-18,1;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-27,27,18,-31,-7,-4,-32,11,-28,-21,12,-10,5,1,3,-7,-25,-32,-18,11;
MA   /M: SY='N'; M=5,6,-21,3,0,-26,1,-6,-20,-1,-20,-9,7,-13,5,-6,6,-4,-17,-27,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-22,-32,-24,24,-30,-23,14,-26,17,7,-25,-15,-27,-21,-19,-8,12,-14,4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-30,1,8,-26,-19,-15,-22,0,-24,-17,-8,38,-3,-9,-1,3,-22,-30,-21,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-27,-2,17,-18,-21,-4,-16,9,-9,-6,-7,-12,11,3,-8,-9,-17,-18,-3,14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-31,9,24,-30,-21,-5,-18,7,-18,-11,-2,3,17,-1,-5,-10,-22,-27,-15,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-27,-14,-3,-9,-26,4,-2,-5,0,2,-13,-12,1,-6,-14,-10,-7,-17,6,-3;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-17,-14,-5,-15,-17,-15,-3,-2,-7,2,-11,-14,-3,-7,0,5,4,-25,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-24,-2,10,-20,-21,-13,-9,-4,-12,-10,-8,0,-3,-6,-2,-1,-6,-28,-16,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-16,-21,-20,-16,-3,-26,-16,11,-8,10,6,-13,-24,-14,-9,-15,-7,11,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-29,-12,2,-14,-15,-8,-5,-15,3,-2,-14,-1,-7,-15,-14,-12,-11,-25,-11,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00598;
//
ID   AP_NUCLEASE_F1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00727;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 1 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9588952; R2=0.0143611; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=227; N_SCORE=8.209; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,46,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,34,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-26,13,47,-28,-16,-4,-26,6,-18,-18,-2,-2,14,-4,2,-8,-24,-28,-20,31;
MA   /M: SY='R'; M=-20,1,-30,5,4,-24,-18,0,-32,24,-22,-14,4,-18,8,55,-8,-10,-22,-24,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=3,-1,-20,-1,10,-23,-17,-9,-11,-2,-12,-8,-6,-11,9,-7,2,1,-6,-27,-15,10;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-18,-29,-20,-17,-13,2,-21,-12,-14,-17,-11,-11,-19,-13,-16,-4,-10,-12,14,-7,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,4,-32,-26,30,-19,-14,-5,-23,2,7,-18,-29,-25,-19,-16,-11,-3,-9,11,-24;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-15,-7,-9,-18,-4,-16,-11,-11,-15,-10,-3,-15,-6,-12,12,13,-1,-30,-16,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,11,-27,7,16,-26,-14,5,-25,13,-23,-13,19,-14,18,23,0,-7,-27,-28,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-22,-23,-7,17,-28,-16,7,-23,29,9,-22,-24,-17,-16,-22,-10,1,-16,2,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20,11,-29,-15,18,-27,44,21,-29,-29,-18,-19,-29,-10,8,-16,7,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=6,8,-19,11,12,-23,-2,-7,-22,2,-18,-15,2,-7,1,-6,4,-5,-16,-23,-16,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-14,-26,-16,-9,-10,-21,-15,-11,9,-11,-6,-14,-18,-7,2,-12,-5,-6,6,3,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-29,-14,-17,-24,42,-16,-26,-17,-21,-5,-6,-6,-15,-18,-5,-17,-23,-21,-24,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-23,-27,-16,28,-28,-10,3,-20,17,7,-20,-26,-11,-13,-20,-10,-3,-4,18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-15,-16,-11,-11,-24,-22,5,-2,-4,-1,-16,-19,-14,-7,-3,6,19,-28,-11,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-15,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,12,36,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,0,-22,-20,-4,-28,23,-22,-12,-4,0,6,53,-10,-10,-22,-22,-14,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,7,-27,-20,57,-27,6,-22,-2,6,-16,23,8,-7,-16,-28,-26,7,12;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-20,-22,-11,-1,-23,-14,4,-14,10,6,-18,-22,-1,-12,-11,-7,4,-18,-4,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,4,-27,-2,-9,3,-18,32,-13,-7,-14,-7,13,-25,-3,-5,-8,-8,-21,-5,34,-9;
MA   /M: SY='P'; M=2,-17,-33,-12,-4,-28,-7,-20,-20,-11,-26,-18,-16,61,-11,-20,-5,-9,-24,-27,-28,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-23,12,-3,-26,2,-9,-19,-7,-20,-13,7,-17,-2,-10,1,-4,-13,-30,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=1,-15,-15,-19,-15,-9,-23,-21,4,-5,-1,0,-15,-20,-14,-5,-2,10,16,-26,-10,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-26,0,18,-23,-17,-8,-16,2,-16,-9,-4,6,3,-6,-3,-7,-15,-28,-18,10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,4,-30,10,-3,-25,31,-9,-34,-11,-25,-20,2,-17,-10,-15,-3,-16,-27,-19,-13,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-17,-15,-7,-1,-12,-12,-15,3,-13,-8,-5,-14,-7,6,1,-3,-8,-15,-6,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-9,-28,-8,-15,28,-26,7,-7,-13,-3,-6,-13,-26,-15,-12,-16,-10,-11,13,50,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-31,-35,-34,-27,38,-26,-13,-8,-20,-5,-8,-28,-30,-24,-17,-28,-18,-15,72,44,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-38,-40,-30,39,-24,-26,-12,-24,-8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18,93,30,-24;
MA   /M: SY='T'; M=3,9,-16,9,-2,-22,-4,-14,-21,-9,-20,-17,5,-11,-7,-12,17,19,-11,-32,-17,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-22,-18,32,-29,12,-2,-12,0,0,-18,-28,-8,-10,-18,-10,-10,21,62,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-18,-27,-22,-12,-9,-25,-8,1,4,4,13,-11,-21,-1,25,-16,-10,-1,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-7,-19,-10,-6,-19,0,0,-19,-4,-18,-5,0,-15,-1,3,9,-1,-12,-27,-13,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-7,5,-28,1,-1,-28,10,-9,-31,20,-30,-15,12,-15,-1,9,-3,-11,-25,-24,-18,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-22,-12,-15,-26,43,-19,-30,-16,-24,-17,-2,-16,-15,-19,7,-10,-20,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-15,-28,-18,-9,11,-24,-2,-18,11,-11,-6,-8,-23,-5,31,-14,-10,-14,-4,15,-9;
MA   /M: SY='S'; M=2,5,-18,8,-1,-22,-10,-12,-14,-5,-20,-14,4,-13,-4,-10,14,4,-6,-34,-16,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-27,13,2,-28,1,-7,-31,12,-27,-17,10,-14,-1,12,-1,-5,-23,-27,-17,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,33,-16,16,0,-16,0,8,-16,0,-24,-16,49,-16,0,0,8,0,-24,-33,-16,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-20,-18,-22,-18,-8,-27,-20,9,-2,-2,3,-17,-23,-15,5,-8,1,21,-26,-9,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-36,-38,-38,-28,23,-24,-26,-7,-24,1,-7,-34,-30,-24,-20,-34,-22,-16,86,23,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00598;
//
ID   AP_NUCLEASE_F1_3_MP; MATRIX.
AC   MP00728;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 1 signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7062049; R2=0.0141485; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=512; N_SCORE=11.940; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-9,4,-28,9,-6,-22,12,-10,-26,-2,-22,-15,0,-18,-10,-8,-5,-12,-17,-21,-9,-8;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-20,-12,-5,-21,-3,-11,-17,8,-16,-2,-5,-14,-1,5,1,-5,-10,-22,-15,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-21,-27,-22,30,-21,-15,0,-18,0,-3,-21,-23,-22,-14,-18,-11,-1,34,22,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=2,15,-18,13,-1,-24,0,-9,-23,-7,-23,-19,14,-12,-5,-11,15,10,-16,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-18,-29,-19,-15,17,-27,16,0,-8,0,8,-18,-26,0,-8,-18,-10,-10,17,58,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-17,-25,-19,-9,-8,-23,-5,-7,7,6,12,-12,-23,0,31,-17,-10,-6,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='S'; M=9,-5,-18,-8,-5,-20,1,-1,-19,-3,-20,-7,1,-13,-2,-7,12,0,-12,-28,-14,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-7,11,-27,4,-3,-27,14,-6,-30,12,-30,-16,20,-16,-3,5,0,-10,-26,-27,-20,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=15,-12,-20,-15,-15,-20,27,-19,-20,-17,-13,-11,-6,-17,-15,-19,4,-8,-13,-22,-22,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-13,-28,-16,-6,2,-22,-6,-23,19,-14,-8,-5,-21,-2,44,-12,-10,-15,-13,-1,-6;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-22,1,-4,-21,-16,-16,-9,-6,-17,-11,-4,0,-8,-12,4,-1,-4,-31,-17,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-24,16,6,-26,-12,-4,-28,14,-26,-17,13,-13,3,15,5,1,-20,-31,-15,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-17,-21,-20,-15,-5,-26,-13,3,0,-4,1,-14,-22,-11,7,-9,1,11,-17,3,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-32,-38,-32,-24,6,-20,-25,-11,-21,-5,-11,-31,-27,-17,-19,-27,-18,-18,84,16,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-27,-22,-19,29,-29,17,0,-15,6,3,-18,-29,-14,-12,-20,-11,-8,15,57,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-12,-38,-29,33,-31,-25,9,-29,11,3,-24,-29,-29,-23,-23,-12,4,10,13,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-11,-26,-24,-3,-25,-26,19,-18,9,6,-24,-25,-24,-19,-6,5,33,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-25,0,13,-23,-16,7,-17,3,-11,-6,3,-13,14,0,-4,-8,-19,-25,-10,13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-5,2,-24,-14,-8,-26,18,-27,-14,0,0,4,25,5,-1,-18,-27,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,15,-32,-22,25,-30,39,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-11,-17,-16,-3,-15,-13,-15,-4,-5,-2,2,-13,-14,-6,-11,-3,-4,1,-22,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-30,18,23,-30,-16,-6,-28,4,-23,-20,0,12,5,1,-2,-9,-26,-30,-21,12;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-4,-7,-1,-24,-15,-8,-25,13,-23,-13,3,-17,5,16,1,-5,-17,-28,-16,1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-28,12,-33,-29,-4,-33,-29,22,-27,11,8,-24,-29,-26,-26,-16,-7,25,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='K'; M=0,-8,-6,-11,-3,-18,-20,-7,-13,3,-14,-7,-8,-17,-6,-3,-3,0,-2,-28,-11,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-6,17,-27,25,18,-29,-16,-7,-22,4,-19,-17,4,-9,2,-6,-2,-9,-18,-30,-16,10;
MA   /M: SY='S'; M=14,-5,-12,-9,-7,-17,-8,-5,-12,-11,-18,-11,0,-13,-6,-12,20,13,-2,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-29,15,6,-26,4,-7,-30,-2,-26,-20,2,-2,-4,-8,0,-10,-25,-24,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-28,-39,-29,9,-36,-25,41,-28,19,23,-20,-21,-20,-26,-20,-10,24,-17,3,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-24,-7,-7,-13,-20,0,-7,-8,0,-2,-6,-19,-5,2,-8,-7,-6,-26,-6,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-25,-2,-3,-15,-15,-8,-16,-6,-15,-13,-7,8,-5,-5,0,-3,-15,-22,-6,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00598;
//
ID   AP_NUCLEASE_F2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00729;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5639791; R2=0.0167601; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=130; N_SCORE=7.733; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-15,-21,-23,-20,26,-4,-17,-12,-18,-4,-6,-7,-23,-24,-15,-9,-6,-9,-9,3,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-14,-10,-5,-18,-12,-1,-20,8,-13,-4,-2,-18,2,19,-7,-9,-15,-23,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-17,-3,7,-16,-12,-8,-13,2,-12,-9,1,-9,1,2,5,2,-10,-23,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=0,-6,-20,-6,6,-10,-16,-2,-10,-3,-5,-5,-6,-12,0,-4,-6,-7,-9,-19,-6,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-13,-21,-17,-3,-20,-14,9,-13,12,18,-19,-21,-11,-14,-16,-8,8,-13,-4,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-19,5,15,-26,-17,-4,-26,19,-22,-13,5,-11,11,15,-2,-5,-21,-26,-14,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-25,-6,9,-14,-18,-8,-18,10,-17,-10,-4,-8,4,1,-4,-7,-15,-18,-7,6;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=0,3,-18,-2,-6,-9,-12,16,-15,-9,-12,-8,8,-16,-4,-8,2,1,-13,-22,1,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-20,-1,-10,-13,18,-5,-20,-10,-19,-14,18,-18,-10,-9,3,-6,-20,-22,-13,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-21,-20,-13,-5,-13,-18,2,-18,11,2,-17,-11,-13,-16,-11,-6,-2,-14,-7,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-22,16,14,-24,-9,-1,-24,-2,-21,-17,9,-11,2,-6,8,0,-18,-34,-16,8;
MA   /M: SY='B'; M=-11,12,-23,12,9,-25,-10,0,-24,-2,-25,-17,12,2,6,-7,0,-7,-27,-28,-13,6;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-21,-32,-26,0,-31,-25,31,-23,16,15,-22,-22,-20,-23,-14,-4,27,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-19,-32,-26,11,-30,-18,25,-22,20,20,-25,-27,-21,-19,-19,-7,24,-16,6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-11,-22,-20,-11,-19,-25,9,-17,-5,-2,-20,-6,-21,-20,-3,-1,20,-31,-16,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=33,-4,-15,-9,-8,-23,9,-17,-18,-11,-16,-14,-4,-11,-10,-18,10,-2,-8,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-30,-8,-3,-26,-5,-16,-19,-11,-27,-17,-9,40,-6,-16,4,-4,-22,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-34,-24,10,-33,-23,29,-30,38,19,-26,-27,-21,-23,-26,-10,16,-19,1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-29,-36,-28,-1,-37,-26,44,-28,19,20,-17,-20,-18,-27,-19,-10,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-17,-28,-19,1,-28,-21,12,-24,21,10,-25,-7,-19,-21,-20,-9,6,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-12,-17,-15,-24,26,-20,-23,-15,-18,-14,-7,-15,-15,-20,5,-8,-12,-21,-24,-15;
MA   /M: SY='N'; M=5,13,-15,5,-1,-20,-2,5,-20,-6,-27,-17,26,-14,0,-7,22,8,-18,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-28,-11,-5,-23,-10,-14,-18,-9,-20,-14,-11,35,-9,-15,-1,0,-19,-27,-21,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-25,23,10,-27,-10,-6,-25,4,-24,-19,14,-6,0,-4,4,1,-21,-33,-17,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-28,7,13,-27,-3,-9,-27,6,-25,-18,1,7,1,-1,0,-8,-24,-27,-20,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-22,10,24,-24,-14,-5,-21,2,-18,-15,3,-7,8,-2,5,-1,-17,-29,-17,16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-21,-12,-5,-14,-23,-12,-5,5,-8,-2,-5,-15,-5,-1,-4,6,-1,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-18,-24,-21,-12,3,-21,-10,-9,-3,1,-2,-13,-23,-7,13,-13,-8,-6,-7,2,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-25,11,26,-28,-13,-5,-23,5,-20,-15,2,-7,11,-3,3,-5,-21,-28,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-13,-27,-14,-4,-3,-24,-12,-14,14,-6,-2,-10,-14,-3,13,-15,-10,-12,-15,-2,-3;
MA   /M: SY='S'; M=21,-5,-13,-8,-7,-21,9,-15,-19,-11,-23,-16,2,-11,-7,-15,24,9,-9,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-23,-22,-25,-19,3,-28,-16,10,-7,6,7,-18,-25,-15,4,-15,-7,14,-18,1,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-25,18,19,-24,-15,-5,-20,1,-16,-15,8,-11,3,-5,-1,-6,-18,-32,-16,11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=5,-16,4,-22,-16,4,-17,-18,-3,-17,-1,-3,-13,-20,-15,-17,-3,-3,3,-19,-6,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-20,-34,-24,41,-28,-18,10,-27,23,12,-22,-28,-27,-19,-21,-9,5,-7,13,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00599;
//
ID   AP_NUCLEASE_F2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00730;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7966447; R2=0.0138655; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=369; N_SCORE=9.903; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-30,25,39,-33,-18,9,-30,7,-22,-16,5,-5,24,0,-1,-11,-30,-30,-15,31;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,17,-31,-21,21,-30,42,18,-28,-29,-22,-21,-28,-10,11,-17,3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-18,-15,-7,-21,-2,-14,-16,1,-14,-6,-6,-12,-2,-3,3,-2,-8,-21,-16,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-25,-5,6,-14,-18,2,-16,6,-15,-8,-2,-15,12,5,-4,-5,-17,-11,8,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,28,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-25,-30,-30,-22,-2,-32,-19,20,-12,5,10,-18,-22,-12,-6,-19,-11,11,-3,5,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,25,-27,34,16,-30,-11,-4,-30,-2,-25,-23,10,-10,3,-8,3,-4,-25,-23,-15,10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-5,-16,-8,-7,-24,6,-10,-22,-1,-18,-9,1,-20,0,1,-5,-11,-17,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-28,1,-32,-28,32,-23,16,13,-26,-27,-25,-22,-13,-1,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-24,8,9,-25,-7,-4,-26,11,-25,-15,12,-11,2,3,4,0,-21,-29,-15,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-26,25,10,-22,-13,8,-24,-3,-20,-16,17,-15,6,-5,1,-7,-24,-31,-9,8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-27,0,5,-23,-15,-5,-20,11,-21,-12,7,10,4,11,-5,-7,-22,-25,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,12,-20,18,17,-22,-12,-6,-18,-3,-15,-15,4,-7,2,-8,5,0,-15,-28,-15,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-30,-8,-1,-22,-12,-5,-28,21,-21,-11,0,-9,4,42,-9,-10,-21,-22,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-34,-28,7,-32,-27,30,-26,20,13,-27,-27,-25,-23,-19,-7,29,-14,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-20,-12,-12,-20,23,-14,-24,-12,-21,-15,-2,-16,-11,-13,10,-4,-15,-21,-16,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-17,-34,-29,22,-32,-27,25,-25,14,10,-26,-28,-30,-22,-16,-5,31,-17,3,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,93,-26,-26,-18,-28,-28,-26,-26,-18,-18,-16,-34,-26,-26,-4,2,-8,-46,-26,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-22,-33,-25,28,-31,-18,18,-27,28,14,-25,-28,-24,-20,-24,-9,11,-9,13,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-18,-24,-20,-6,-20,-22,14,-18,5,8,-14,-18,-16,-19,-3,10,15,-25,-8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-22,-29,-27,-21,33,-24,6,-11,-21,-4,-5,-14,-27,-21,-14,-21,-16,-14,29,26,-19;
MA   /M: SY='D'; M=10,20,-20,25,4,-29,-7,-10,-24,-5,-20,-19,5,-11,-6,-14,6,-2,-13,-31,-19,-1;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-18,-9,-19,-1,-19,-11,-10,-11,-11,-8,-10,-9,-19,13,5,-1,-22,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-28,-15,-12,23,-27,17,-3,-8,-2,-2,-17,-26,-7,-9,-17,-9,-11,23,67,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,41,-26,53,14,-34,-8,-1,-33,-1,-26,-26,20,-10,-1,-9,2,-8,-26,-36,-19,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-37,-27,11,-36,-26,36,-29,26,17,-23,-24,-23,-26,-22,-9,23,-17,3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-19,-8,-4,-14,-18,-11,-12,6,-15,-8,-2,-16,-4,8,3,10,-4,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-21,14,7,-23,-11,-4,-23,5,-25,-18,20,-12,2,3,10,8,-20,-34,-16,4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-28,8,2,-24,-10,-11,-23,-3,-21,-17,0,8,-5,-8,-3,-6,-22,-20,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-6,-24,-5,16,-2,-23,-6,-12,-5,-7,-8,-8,-13,3,-7,-4,-4,-12,-17,0,10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,13,-25,21,5,-28,7,-10,-27,-8,-20,-19,4,-14,-7,-14,1,-9,-19,-30,-21,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-21,-25,-22,-18,0,-7,-16,-9,-12,-8,-6,-17,-25,-16,-9,-16,-14,-7,12,6,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00599;
//
ID   AP_NUCLEASE_F2_3_MP; MATRIX.
AC   MP00731;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   AP endonucleases family 2 signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2560353; R2=0.0150852; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=641; N_SCORE=14.916; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,28,-30,40,11,-31,-14,43,-36,-4,-26,-17,16,-14,4,-6,-4,-14,-30,-36,-3,6;
MA   /M: SY='A'; M=28,-19,-10,-24,-19,-11,-13,-24,7,-14,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,22,-24,-16,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-19,-33,-24,22,-30,-20,16,-23,23,16,-24,-27,-22,-18,-22,-10,11,-10,6,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-1,15,-24,17,14,-28,-11,-4,-26,9,-23,-17,10,-10,6,3,2,-5,-21,-29,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-26,9,24,-26,-15,1,-24,6,-18,-14,2,-8,10,2,1,-6,-21,-28,-15,16;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-22,-37,-27,44,-31,-22,15,-29,21,9,-22,-27,-30,-22,-21,-10,9,-4,15,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-27,37,15,-29,-9,-4,-29,1,-24,-21,13,-11,0,-6,0,-7,-22,-33,-17,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-25,6,10,-24,-15,0,-26,14,-22,-13,2,-12,8,16,0,-4,-19,-24,-9,7;
MA   /M: SY='I'; M=0,-18,-20,-24,-16,-7,-23,-21,14,-14,5,6,-16,-19,-14,-16,-8,0,14,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-20,-31,-26,0,-30,-27,29,-23,13,11,-23,-21,-23,-21,-14,-3,30,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-18,-29,62,-19,-37,-19,-27,-19,-1,-20,-19,-20,-1,-19,-28,-21,-28,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-29,-20,18,-27,-16,13,-23,25,13,-24,-25,-19,-18,-22,-9,7,-5,9,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-21,14,13,-27,-8,0,-26,4,-22,-16,7,-9,6,-2,2,-7,-22,-28,-15,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-13,-27,-15,-11,10,-23,9,-13,2,-8,-5,-8,-24,-5,17,-13,-9,-13,1,29,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,36,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-25,-3,2,-19,-18,-6,-26,23,-23,-11,-1,-12,5,26,-5,-7,-18,-20,-6,2;
MA   /M: SY='A'; M=12,-19,-11,-22,-20,-12,3,-22,-2,-18,-2,-2,-16,-22,-20,-20,-5,-7,8,-23,-15,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-21,-35,-27,16,-31,-21,26,-23,16,21,-23,-25,-22,-21,-19,-8,22,-12,4,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-12,-31,-23,4,-30,-23,21,-28,34,15,-27,-28,-21,-22,-23,-9,16,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,21,-39,-8,-1,-40,0,-30,-29,19,-10,0,-10,0,-10,-30,-39,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-3,-2,-20,0,-12,-18,-10,-27,-18,7,-10,-2,-12,35,17,-8,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-6,4,-24,-21,-10,-21,36,-20,-3,-4,-13,7,23,-11,-9,-13,-21,-9,5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-21,1,-6,-11,-7,-4,-17,-1,-19,-12,11,-18,-7,-2,2,-2,-13,-26,-9,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-29,6,15,-28,-11,-11,-23,2,-22,-16,-4,13,1,-7,-3,-8,-21,-28,-21,7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,2,-28,-20,6,-26,-16,3,-20,16,8,-21,-28,-18,-13,-18,-9,3,-22,-4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-3,-28,-6,-16,-28,56,-15,-36,-16,-29,-19,7,-19,-15,-17,2,-16,-29,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-11,-4,-2,-20,0,-12,-18,-9,-25,-17,5,-10,-2,-11,31,16,-9,-35,-19,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-28,-2,0,-22,-10,17,-28,15,-23,-10,12,-18,7,31,-5,-10,-24,-25,-8,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-13,-24,-14,-7,-16,-25,-17,-4,18,-10,-1,-11,-18,-5,13,-12,-7,5,-23,-9,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-9,1,-19,-21,2,-27,25,-16,-9,-1,-20,9,60,-11,-10,-19,-21,-9,1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=8,2,-22,3,21,-25,-13,10,-23,-2,-17,-13,-1,-8,7,-7,2,-6,-19,-27,-12,13;
MA   /M: SY='N'; M=-9,14,-16,5,-3,-18,-9,16,-19,-6,-21,-13,27,-13,-1,-3,5,-3,-23,-36,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-29,-8,-18,-28,61,-18,-37,-18,-27,-19,1,-20,-18,-17,-1,-19,-28,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-25,-3,13,-12,-19,-4,-18,7,-12,-6,-5,-13,8,4,-4,-7,-17,-19,-4,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-22,-6,2,-8,-21,7,-16,2,-12,-3,-1,-16,5,0,-6,-3,-16,-18,4,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-2,-16,-31,62,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-26,-15,-1,3,-20,-14,-8,-7,-4,-5,-12,-14,-10,-9,-11,-8,-10,-7,-1,-5;
MA   /M: SY='D'; M=2,12,-24,18,17,-29,-3,-8,-28,-1,-22,-20,3,-6,1,-9,4,-5,-21,-30,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=5,-12,-13,-16,-13,-10,-7,-17,-8,-16,-6,-7,-7,-8,-15,-17,-1,-2,-5,-25,-14,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-22,-35,-25,42,-31,-20,12,-26,22,11,-22,-28,-28,-19,-23,-10,7,-5,15,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-20,-7,2,-18,-18,-4,-14,8,-13,-6,-1,-17,1,14,-3,-4,-9,-27,-12,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00599;
//
ID   RIBOSOMAL_S16_MP; MATRIX.
AC   MP00732;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S16 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=25;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=23;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6170387; R2=0.0149934; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=325; N_SCORE=9.480; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-16,-30,-26,2,-31,-26,27,-23,20,12,-26,-27,-24,-21,-14,0,32,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-27,-6,3,-24,-21,-12,-21,35,-23,-7,-3,-13,4,24,-8,-6,-10,-22,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-37,-27,3,-36,-26,40,-29,28,21,-23,-23,-19,-26,-23,-10,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=8,-2,-20,-7,0,-23,-14,-15,-20,20,-21,-11,-2,-10,0,7,4,6,-10,-23,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-18,-7,-24,-20,3,-9,-14,-3,-20,2,4,-14,-25,-17,-18,-12,-9,-3,-16,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=6,-7,-24,-10,0,-23,-14,-10,-24,23,-20,-10,-3,-14,4,29,-4,-7,-14,-20,-13,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-29,-5,4,-25,-22,-10,-20,35,-23,-7,-3,-9,5,22,-10,-8,-13,-21,-9,4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-29,-3,5,-23,-17,0,-27,30,-24,-9,4,-15,13,32,-8,-10,-22,-21,-9,8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-26,-4,6,-22,-16,-1,-21,14,-18,-6,4,-15,15,24,-2,-5,-19,-23,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-33,-11,-3,-27,-16,-20,-17,-10,-25,-17,-16,65,-10,-19,-5,-6,-23,-29,-27,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-17,-15,-23,-17,25,-23,-11,-5,-18,-4,-4,-11,-22,-17,-14,-3,1,-2,-11,10,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-3,-29,-5,3,-23,-18,6,-28,24,-22,-10,6,-18,14,50,-6,-9,-22,-23,-9,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-36,-28,1,-35,-26,40,-26,22,21,-23,-23,-20,-25,-19,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-11,-30,-29,-1,-29,-29,28,-20,9,9,-28,-28,-28,-20,-9,0,46,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=10,-26,-12,-29,-25,-4,-25,-28,23,-19,8,7,-25,-25,-24,-21,-7,-1,36,-27,-11,-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-9,-25,-17,-11,-15,-19,6,-15,0,8,-13,-16,-12,-19,-1,2,8,-23,-12,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-28,49,21,-34,-10,5,-34,2,-28,-25,24,-11,3,-4,1,-8,-30,-38,-19,12;
MA   /M: SY='S'; M=14,-2,-11,-6,-6,-18,-3,-12,-12,-10,-21,-14,6,-14,-6,-12,25,11,-3,-35,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-9,0,-19,-19,-3,-24,17,-16,-9,-1,-17,9,44,-3,1,-16,-23,-10,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00600;
//
ID   RIBOSOMAL_S26E_MP; MATRIX.
AC   MP00733;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S26e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3393388; R2=0.0125026; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1059; N_SCORE=17.570; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=17,-23,-10,-27,-23,-7,-20,-27,16,-17,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,33,-27,-13,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,14,-27,46,-10,-10,-6,0,-10,-27,-4,-7,-17,-13,-16,11,61,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,9,-27,16,3,-26,-17,-14,-23,-7,-23,-20,0,24,-7,-13,3,10,-20,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-30,4,21,-33,9,-3,-30,0,-23,-13,0,-10,21,-3,0,-13,-30,-23,-20,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-10,-23,-16,-14,-10,-23,3,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,16,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=6,-13,-24,-20,-13,-13,-20,17,3,-17,-3,4,-7,-17,-7,-17,-7,-10,0,-23,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='H'; M=4,-3,-23,-7,-3,-20,-13,59,-23,-10,-17,-3,3,-17,3,-7,-3,-13,-20,-27,6,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,14,-27,46,-10,-10,-6,0,-10,-27,-4,-7,-17,-13,-16,11,61,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='S'; M=24,-3,-10,-7,-3,-20,0,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,13,-7,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=23,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,30,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,3,-23,-20,63,-30,10,-23,-3,7,-17,10,10,-10,-17,-27,-27,10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-6,-13,-13,-20,-7,-20,-16,13,-13,-4,0,1,-27,-20,-13,-3,0,23,-33,-13,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=14,6,-20,-4,-10,-23,24,-10,-23,-10,-23,-17,16,-17,-10,-14,7,-7,-20,-26,-23,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,53,13,-33,-7,3,-33,0,-30,-27,34,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00601;
//
ID   THIOLASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00737;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thiolases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9910355; R2=0.0141983; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=10.348; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-11,-24,-19,0,-13,-17,4,-18,7,7,-18,-23,-17,-18,-8,-5,9,-19,-4,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-12,-20,-14,3,-19,-15,14,-17,23,11,-18,-18,-14,-13,-15,-5,12,-15,-2,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-17,-17,-14,-11,6,-14,-12,-10,-12,-9,-10,-17,-13,-15,2,-5,-4,-14,-6,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-3,2,-6,-10,-17,-17,-12,-12,-5,-17,-11,2,-23,-10,2,2,-1,-3,-35,-17,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-8,-21,-11,-5,-17,-19,-12,-2,-5,-5,-2,-4,-17,1,-3,-4,-4,-4,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-28,-1,8,-27,-8,-4,-27,21,-24,-10,3,-13,11,20,-4,-7,-22,-23,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-24,8,13,-25,-15,-5,-20,8,-15,-9,-1,-11,7,0,-2,-7,-16,-26,-14,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-17,-27,-21,8,-28,-19,18,-26,33,16,-21,-28,-20,-19,-23,-8,12,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-27,2,-5,-26,29,-6,-32,-6,-27,-18,13,-17,-8,-7,2,-9,-27,-26,-22,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-31,-23,0,-25,-25,23,-26,21,12,-23,-18,-20,-23,-21,-10,14,-15,-4,-24; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-30,27,5,-32,-2,-9,-29,-5,-27,-21,6,12,-5,-13,-1,-9,-26,-33,-23,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-27,-11,-3,-15,-19,-10,-5,-6,-2,6,-11,9,-4,-10,-12,-8,-11,-25,-13,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,12,-26,17,21,-26,-13,-4,-26,0,-24,-20,7,-6,8,-6,6,-3,-25,-20,-15,15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-29,-5,5,-26,-22,-8,-21,37,-23,-6,-3,-13,8,23,-10,-10,-13,-21,-9,6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-16,-31,-27,14,-30,-26,23,-24,18,10,-25,-27,-27,-20,-15,-1,28,-20,0,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-17,-25,-20,-8,-28,-24,17,-19,4,4,-21,-4,-18,-21,-12,-6,18,-27,-12,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-12,0,-28,-7,-9,-8,-13,4,-16,-7,-15,-10,8,-22,-5,-5,-8,-10,-21,10,2,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-11,-17,-9,-18,-2,-18,-10,-11,-10,-10,-7,-11,-9,-18,13,3,-1,-24,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-27,39,-28,25,19,-24,-24,-21,-26,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-25,-18,4,-28,-16,15,-19,25,12,-21,-24,-15,-15,-18,-4,8,-17,5,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-33,-24,27,-32,-17,18,-28,30,13,-25,-28,-23,-20,-25,-10,9,-7,16,-24;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-18,-28,59,-20,-36,-18,-28,-19,-1,-18,-18,-20,3,-16,-26,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,15,-21,-14,-19,-6,-19,-14,-14,-10,-6,-12,-18,-13,-20,2,-5,-4,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-11,2,-20,-13,-16,-8,-20,-9,-14,-7,-9,-10,-16,-13,-19,6,2,1,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-27,-11,-1,-21,-17,-3,-27,23,-19,-10,-1,-18,9,54,-7,-9,-17,-20,-11,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-19,-28,-17,-5,-31,-18,22,-21,21,16,-20,-23,-6,-18,-19,-9,12,-22,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-5,-27,-23,1,-26,-23,14,-21,10,6,-21,-25,-22,-20,-8,2,21,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=12,-15,-13,-21,-17,-9,-14,-22,4,-15,0,1,-14,-17,-16,-17,2,12,13,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-19,-6,1,-18,-18,8,-18,-2,-15,-8,1,-12,5,3,7,16,-13,-27,-6,2;
MA   /M: SY='L'; M=0,-24,-18,-27,-18,2,-24,-20,14,-24,31,13,-23,-25,-17,-19,-17,-3,10,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='L'; M=0,-24,-2,-28,-21,5,-25,-22,9,-25,21,7,-23,-26,-21,-21,-16,-6,9,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-28,-2,-6,-12,-11,29,-21,-5,-20,-10,13,-18,-1,1,-5,-10,-25,-11,8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-24,-5,16,-19,-20,-6,-11,1,-6,-2,-7,-12,10,1,-5,-7,-11,-25,-13,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-19,8,-28,-16,16,-23,37,23,-27,-23,-16,-17,-26,-10,7,-19,0,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-11,4,-28,3,10,-26,-18,2,-27,26,-24,-11,6,-13,11,25,-5,-8,-21,-24,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-31,-4,9,-26,-13,-4,-28,18,-23,-11,-3,-9,14,28,-7,-11,-24,-15,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-28,2,13,-22,-9,-4,-28,12,-21,-13,2,-13,8,23,-3,-9,-22,-24,-14,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00092;
//
ID   ADOHCYASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00738;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3114991; R2=0.0153264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=631; N_SCORE=14.972; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,17,-30,-20,18,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=5,-23,-19,-29,-23,-6,-22,-24,23,-21,8,11,-19,-21,-18,-22,-8,-4,23,-24,-9,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-3,-28,2,30,-19,-24,-7,-12,1,-4,-8,-7,-9,8,-1,-8,-10,-15,-26,-13,18;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-11,-13,-11,-8,-20,-20,-6,-13,-2,-6,-5,-13,-11,-12,13,38,1,-28,-9,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,22,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=2,-8,-17,-12,-4,-20,-16,-10,-11,7,-13,-4,-7,-15,1,1,-1,0,-4,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='A'; M=21,-2,-19,-4,6,-23,-10,-13,-15,1,-12,-11,-6,-10,-1,-9,2,-5,-9,-23,-17,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-20,-24,-21,-19,-11,16,-21,-9,-23,7,-1,-15,-23,-19,-20,-13,-14,-8,-16,-14,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-28,19,34,-31,-17,2,-28,11,-23,-16,9,-7,21,5,0,-7,-28,-29,-17,28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-6,-30,-28,-2,-29,-29,26,-21,9,8,-26,-28,-26,-21,-9,-1,39,-29,-10,-28;
MA   /M: SY='R'; M=3,-13,-21,-15,-7,-15,-16,-9,-14,9,-11,-6,-8,-19,-2,23,-4,-5,-4,-20,-8,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-32,-34,-36,-26,5,-26,-24,10,-23,9,8,-30,-26,-17,-21,-29,-18,-2,48,11,-21;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,4,-18,-13,-15,-13,-21,-8,-14,-11,-10,-7,-15,-12,-18,12,14,0,-29,-17,-13;
MA   /M: SY='G'; M=14,-6,-18,-8,-9,-24,22,-16,-24,-13,-26,-18,1,-9,-9,-16,19,2,-15,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,82,-21,-21,-20,-21,-24,-27,-24,-23,-20,-11,-31,-21,-24,5,-1,-10,-47,-27,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-36,-22,-12,-18,-28,-24,8,-18,-10,-4,-20,46,-14,-24,-14,-10,-6,-26,-18,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-21,-31,-23,31,-30,-14,12,-27,31,13,-26,-30,-23,-18,-26,-10,5,-5,19,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-29,4,15,-34,-19,13,-20,4,-16,-2,0,-12,42,4,-3,-11,-26,-23,-8,28;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,62,18,-38,-6,0,-38,-1,-30,-29,22,-11,0,-9,1,-10,-30,-39,-20,9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,21,-27,30,13,-26,-10,16,-30,-3,-24,-19,10,-12,3,-7,2,-7,-25,-30,-6,7;
MA   /M: SY='V'; M=18,-23,-10,-26,-23,-7,-19,-26,15,-16,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,32,-26,-14,-23;
MA   /M: SY='A'; M=38,-11,-10,-19,-12,-17,-5,-20,-6,-11,-9,-8,-10,-13,-12,-19,10,4,6,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-6,-14,-12,-1,-22,-4,-16,-14,-6,-12,-11,-7,-9,-3,-14,8,-2,-6,-22,-19,-2;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-6,-17,-10,-20,0,-19,-13,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,13,2,-2,-24,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-31,-23,5,-28,-23,23,-28,35,17,-27,-28,-21,-22,-24,-9,16,-22,-3,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-13,-17,-11,-16,-12,-19,-5,-4,-10,-6,-10,-16,-10,-7,6,3,8,-25,-15,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-22,-3,10,-20,-18,-5,-15,6,-14,-9,-3,-13,3,5,0,1,-9,-27,-12,6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=1,6,-15,8,-1,-15,2,-7,-15,-6,-9,-10,1,-9,-5,-9,0,-3,-10,-17,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-22,0,11,-10,-15,3,-14,2,-13,-7,-4,0,2,-2,-4,-7,-16,-13,2,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-27,-2,-10,-28,47,-13,-34,-14,-29,-20,10,-18,-12,-15,5,-13,-28,-26,-27,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-20,-31,-25,0,-30,-24,28,-22,13,16,-19,-21,-18,-21,-11,1,24,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='P'; M=0,-8,-27,-7,-1,-24,-13,-10,-19,-7,-24,-16,-5,34,-6,-13,3,3,-20,-30,-21,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,1,-24,-24,-3,-24,-24,18,-18,4,6,-21,-25,-22,-18,-6,0,32,-28,-10,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-20,-25,-24,-17,48,-28,-3,-4,-18,2,-3,-17,-27,-23,-14,-18,-10,-7,12,42,-19;
MA   /M: SY='A'; M=40,-5,-13,-13,-7,-22,2,-17,-14,-8,-13,-12,-5,-11,-9,-17,9,-2,-5,-22,-20,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-24,-39,-23,-12,-9,-22,-19,-15,-2,-18,-12,-22,-9,-6,1,-23,-18,-20,49,5,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-30,-6,4,-23,-20,-3,-28,35,-23,-9,-1,-16,11,44,-10,-10,-19,-18,-6,5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-10,-19,-29,62,-19,-37,-19,-28,-19,1,-19,-19,-19,1,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-18,3,30,-22,-21,-3,-15,0,-11,-8,-7,-9,7,-7,-4,-9,-12,-30,-16,18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,12,-16,10,-1,-19,-14,-13,-19,-7,-19,-17,8,-6,-6,-10,17,28,-10,-34,-15,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00603;
//
ID   ADOHCYASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00739;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9385958; R2=0.0140666; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=929; N_SCORE=17.996; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-17,-24,-17,-1,-23,-21,10,-22,24,8,-19,-21,-16,-18,-11,6,7,-22,-6,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-24,-28,-22,1,-26,-23,16,-22,12,6,-21,-17,-19,-21,-18,-9,11,-3,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,45,-28,63,18,-38,-9,-2,-38,-1,-28,-28,18,-10,-1,-11,1,-9,-28,-38,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-26,-9,-16,-27,52,-18,-34,-17,-28,-19,3,-18,-16,-18,5,-11,-25,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,43,-29,24,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-24,-12,-6,-15,-18,-8,-6,12,-7,9,-1,-16,0,8,-10,-8,-7,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-11,-2,-19,-17,0,-26,25,-17,-5,0,-20,8,59,-10,-10,-18,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-13,-15,-11,-19,6,-19,-15,-11,-14,-12,-5,-12,-11,-17,11,8,-5,-23,-19,-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-9,0,-10,-10,-10,20,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,49,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-18,-29,-23,3,-28,-18,22,-21,20,17,-24,-26,-20,-17,-16,-5,24,-24,-3,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-19,-28,-18,3,-23,-11,17,-20,31,33,-23,-24,-10,-15,-20,-8,8,-22,-2,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-27,9,-34,-23,32,-26,22,18,-24,-24,-21,-24,-22,-10,21,-10,5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-13,-16,-11,-22,12,-19,-16,-12,-16,-13,-6,-12,-11,-19,12,-1,-6,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,32,-9,-9,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-19,-6,-9,-14,-19,-10,-1,-6,-9,-4,6,-19,-4,-6,0,5,2,-29,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=19,-22,-7,-26,-22,-7,-18,-26,12,-17,1,1,-21,-22,-22,-20,-2,-1,27,-26,-14,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-11,-30,-27,2,-30,-27,27,-22,19,14,-29,-30,-27,-20,-15,-3,39,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='C'; M=16,-17,30,-26,-21,-15,-15,-24,-8,-20,-8,-6,-16,-23,-19,-24,-3,-5,2,-30,-19,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,17,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,16,-36,28,4,-19,-15,-7,-30,-6,-24,-24,-1,-17,-6,-12,-13,-16,-29,22,2,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,30,-30,-30,-6,-30,-30,12,-23,1,1,-27,-33,-30,-23,-10,-3,32,-36,-16,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-26,-20,-7,-30,43,-26,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-19,33,-25,-23,-12,-25,-25,1,-23,-8,-5,-15,-26,-21,-23,-1,-1,9,-37,-17,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=46,-10,-6,-19,-10,-20,-1,-20,-11,-11,-12,-11,-9,-11,-10,-20,11,1,-1,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-23,-10,4,-22,-17,0,-9,0,-9,5,-5,-13,18,-2,-2,-6,-12,-23,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=7,-5,-18,-8,-1,-21,-8,-9,-22,8,-22,-14,2,-13,2,17,13,3,-12,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=11,-22,-16,-27,-17,2,-18,-18,9,-21,24,13,-21,-22,-15,-19,-14,-6,6,-19,-6,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-26,-7,2,-23,-16,-6,-26,26,-21,-11,-1,-15,6,39,-5,-7,-16,-21,-12,2;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-27,-9,-13,-29,47,-16,-33,-15,-26,-16,0,-17,-8,-16,3,-14,-26,-21,-26,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-15,-22,-18,-4,-6,-21,-4,1,-11,10,14,-15,-19,6,-9,-13,-9,-5,-17,0,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-7,-17,-29,61,-17,-38,-17,-30,-20,5,-20,-17,-17,1,-18,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='A'; M=40,-11,-1,-20,-12,-19,-2,-19,-10,-12,-10,-7,-10,-13,-11,-20,8,-1,-1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-26,-7,-4,-17,-18,-5,-14,9,-16,-8,9,-18,3,28,-3,-2,-13,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-29,-28,-1,-29,-28,27,-17,8,9,-28,-29,-28,-15,-10,-1,46,-29,-10,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-25,-29,-21,-1,-31,-19,21,-14,7,11,-19,-22,-14,-14,-17,-8,14,-9,5,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-10,-13,-12,-10,-19,-21,-5,-11,-8,-8,-4,-12,-12,-12,16,39,6,-30,-11,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-29,17,55,-28,-21,-2,-27,8,-18,-18,-2,-2,17,-1,-1,-9,-25,-30,-19,36;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-34,-28,-1,-34,-29,39,-25,13,14,-22,-23,-23,-25,-13,-5,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00603;
//
ID   MAM_1_MP; MATRIX.
AC   MP00740;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MAM domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9954009; R2=0.0168103; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=579; N_SCORE=15.719; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=31; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-31,-20,-12,-7,-25,-23,-3,-16,-13,-9,-22,43,-19,-21,-12,-8,-7,-24,-16,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-8,-17,-14,2,-17,-14,16,-13,13,8,-15,-15,-14,-11,-9,-2,18,-14,-3,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-16,-7,-10,-12,-17,-12,-6,-6,-13,-9,10,-16,-8,-2,10,20,-2,-31,-12,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-11,-15,-9,-11,-19,-8,-8,-15,-8,-6,-8,-5,-6,-15,2,4,-7,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-12,-29,-14,-10,-3,-16,2,-11,-6,-10,-5,-8,-14,-5,-7,-12,-11,-15,-2,12,-9;
MA   /M: SY='T'; M=4,-3,-16,-9,-1,-15,-17,-16,-11,-7,-11,-7,-5,-1,-5,-11,10,25,-6,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-9,-14,-30,47,-19,-35,-11,-29,-19,-3,-6,-15,-15,-2,-17,-28,-21,-27,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-35,-8,0,-28,-13,-12,-22,-10,-28,-18,-13,62,-8,-17,-4,-6,-27,-30,-25,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-24,-7,3,-11,-19,-6,-11,1,-12,-6,1,-10,1,3,-3,-2,-12,-22,-6,1;
MA   /M: M=-2,-13,-21,-16,-13,-3,0,-13,-10,-14,-7,-3,-7,-20,-9,-10,-2,-6,-6,-20,-9,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-31,47,14,-35,-9,-5,-32,-4,-27,-25,11,2,-3,-12,-2,-11,-27,-36,-21,5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-7,-28,-7,-3,-11,-19,53,-23,-12,-18,-5,1,-4,1,-7,-7,-14,-23,-25,8,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-12,-8,-6,-10,-14,-14,-8,-9,-9,-8,-3,2,-7,-9,12,25,-4,-24,-11,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-7,0,-14,-6,-8,4,-8,-2,-6,-7,-4,-4,5,-15,-8,-6,-3,-1,-8,-10,4,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-31,-5,-11,-30,37,-18,-33,-15,-28,-20,-4,7,-15,-19,-1,-15,-27,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-19,5,0,-23,0,-1,-20,-7,-22,-15,10,-14,-1,-9,11,1,-14,-32,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-29,-8,-12,-29,58,-18,-37,-17,-28,-19,-1,-18,-16,-18,1,-18,-28,-21,-29,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-1,-20,-5,-7,1,-12,16,-16,-11,-18,-11,8,-19,-5,-8,9,1,-15,-19,11,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-23,-25,-28,-24,42,-15,-5,-5,-21,2,-2,-17,-29,-25,-16,-17,-11,-8,12,39,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-25,-23,-35,-25,13,-28,-14,26,-21,21,36,-21,-22,-14,-18,-21,-10,15,-16,4,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-26,-22,-18,22,-28,16,1,-14,4,9,-17,-27,-9,-11,-18,-11,-5,6,44,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-26,-19,-31,-25,20,-29,-24,19,-25,12,7,-19,-25,-25,-21,-11,-2,19,-17,3,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,21,-23,20,18,-25,-9,1,-24,0,-23,-18,22,-12,8,-3,9,-1,-25,-35,-18,13;
MA   /M: SY='T'; M=18,-3,-10,-11,-8,-15,-10,-18,-12,-10,-14,-12,-1,-10,-8,-13,21,28,-2,-29,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-19,12,2,-24,-8,-11,-21,-8,-26,-20,5,4,-4,-12,20,10,-14,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-23,1,6,-23,-4,-5,-21,-1,-19,-12,4,-12,3,-4,6,3,-18,-28,-15,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-23,-7,-5,-19,6,3,-20,-6,-17,-6,1,-17,-3,-1,3,-6,-15,-27,-13,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-1,-24,-2,2,-26,-15,3,-15,-4,-19,-8,1,1,11,-7,0,-6,-16,-28,-14,5;
MA   /M: SY='E'; M=2,-7,-25,-6,5,-19,0,-12,-21,-3,-19,-14,-7,0,-5,-8,0,-7,-17,-22,-15,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-11,-17,-27,58,-20,-37,-18,-28,-20,-2,-19,-18,-19,-1,-17,-29,-11,-25,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-28,3,28,-32,-19,1,-21,10,-18,-8,-2,-7,32,6,-1,-9,-24,-23,-14,30;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-8,-19,-10,-5,-18,-16,-12,-15,11,-17,-9,-4,-16,-2,17,4,5,-4,-26,-13,-5;
MA   /M: SY='A'; M=36,-15,-11,-23,-15,-10,-8,-22,-1,-13,-5,-5,-15,-15,-16,-20,4,-1,10,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-27,-12,-7,-17,-8,13,-20,4,-11,0,-4,-21,0,22,-11,-13,-15,-22,-5,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-21,-17,-3,-7,-26,-16,10,-15,12,7,-18,-20,-8,-14,-11,-6,10,-26,-9,-6;
MA   /M: SY='S'; M=4,-7,-12,-8,-6,-8,-8,-13,-12,-15,-13,-12,1,-15,-6,-12,24,14,-6,-33,-13,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-32,-12,-1,-21,-21,-9,-18,5,-13,-8,-12,19,3,19,-12,-10,-20,-24,-16,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-25,-15,-8,-17,-21,-19,-2,-13,-12,-7,-12,20,-8,-16,1,5,-4,-29,-17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-32,-23,20,-30,-20,19,-28,36,18,-27,-29,-23,-20,-25,-9,14,-16,4,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,0,-17,2,-2,0,-12,5,-10,-1,-8,-7,-3,-12,-1,1,-4,-4,-10,-2,18,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-3,-11,-7,-24,-10,-18,-23,-6,-23,-16,-10,14,-10,-12,-1,-5,-18,-32,-23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-21,-3,13,-24,-17,-10,-17,9,-17,-10,-4,-9,8,1,3,2,-11,-25,-14,10;
MA   /M: SY='N'; M=-9,4,-26,1,-1,-21,-12,-5,-21,2,-22,-15,12,6,-1,10,1,-4,-22,-31,-19,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-26,15,8,-30,15,-10,-33,-2,-27,-21,6,-12,-3,-8,5,-8,-24,-29,-22,2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-22,-5,-4,-12,-14,-14,-15,-4,-15,-10,-5,-3,-3,-8,1,5,-11,-23,-11,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-9,-27,-12,-4,-19,-23,31,-6,-10,-7,4,-4,-18,12,-6,-9,-12,-10,-25,3,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-32,-24,5,-31,-23,28,-26,32,20,-28,-28,-21,-21,-22,-7,24,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-22,13,16,-27,-16,1,-23,0,-21,-14,5,-9,14,-3,10,8,-20,-31,-13,15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-21,-29,-24,-18,12,-18,-2,-13,-16,-12,-10,-17,-23,-14,-14,-12,-9,-15,38,23,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,15,2,-12,6,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,24,71,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-11,-28,-13,-10,8,-25,44,-15,-8,-8,0,-6,-24,-4,-4,-15,-14,-17,-6,34,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-19,-25,-19,3,-20,-4,15,-13,17,40,-12,-22,-6,-11,-17,-8,7,-22,-2,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-13,-12,-13,8,-19,2,-10,-12,-12,-9,-8,-22,-9,-12,3,5,-9,-4,30,-13;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-17,-9,-16,-27,48,-18,-35,-18,-29,-20,1,-19,-16,-18,9,-10,-24,-26,-28,-16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,-7,-17,-7,2,-15,-10,-13,-11,-12,-7,-9,-4,-10,-4,-12,12,7,-8,-31,-15,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-28,-1,-6,-26,22,5,-30,-11,-28,-17,11,-4,-7,-12,1,-12,-28,-28,-19,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-19,-10,-5,-16,-18,-15,-3,-7,-12,-7,-6,1,-6,-10,2,3,1,-28,-15,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,0,-30,3,-12,-24,41,-8,-35,-15,-26,-19,1,-19,-14,-16,-3,-17,-28,-18,-14,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-18,-10,-5,-14,-19,-12,-11,-1,-6,-5,-2,-15,1,3,3,17,-8,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-28,-18,8,-28,-18,15,-23,39,19,-26,-27,-17,-16,-25,-7,7,-20,0,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-20,0,-4,-15,-5,0,-13,-7,-12,-9,18,-20,-5,-4,3,-2,-15,-32,-14,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-25,-22,-29,-21,-4,-33,-25,28,-16,9,10,-21,-22,-18,-15,-14,-6,29,-25,-6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-29,-16,-14,7,-24,5,-5,-6,1,-1,-12,-26,-8,-6,-19,-12,-12,14,31,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-18,-29,-23,1,-31,-24,25,-23,23,14,-25,-26,-19,-20,-16,-2,25,-24,-5,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-25,-10,-2,-16,-19,-5,-19,15,-11,-6,-3,-18,3,31,-5,-3,-13,-24,-9,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-25,-5,0,-16,0,-5,-22,3,-20,-12,0,-17,-2,8,-1,-7,-16,-20,-6,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-24,17,16,-21,-13,0,-23,-1,-21,-17,3,-11,8,-7,6,-3,-20,-24,-4,11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,2,-28,6,11,-28,-13,-9,-23,2,-22,-13,-2,12,6,-5,1,0,-22,-29,-18,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00604;
//
ID   DH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00741;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dbl homology (DH) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0013671; R2=0.0181529; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=340; N_SCORE=12.163; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=28; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-23,-17,-5,12,-23,-13,-9,-2,-3,-4,-10,-20,-12,2,-11,-8,-5,-14,1,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-19,-28,-21,26,-27,-17,7,-19,15,7,-19,-27,-23,-13,-17,-7,8,-11,9,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-22,-5,6,-20,-17,1,-13,3,-9,2,-6,-15,10,-1,-8,-10,-15,-22,-6,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,12,19,-26,-15,0,-23,6,-20,-14,7,-5,7,3,-1,-8,-22,-29,-16,12;
MA   /M: SY='C'; M=0,-9,7,-14,-8,-14,-18,-12,-13,-8,-8,-8,-6,-21,-7,-8,-3,-2,-8,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-2,-19,-1,10,-22,-19,-5,-16,1,-10,-7,-6,-14,12,1,-4,-6,-14,-25,-11,11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-15,-6,-4,-20,1,-10,-19,-4,-17,-10,4,-16,-3,-5,5,-1,-15,-28,-18,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-23,-3,-1,-16,-12,-7,-17,4,-12,-9,-3,-8,-4,1,-5,-7,-14,-23,-11,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-28,1,1,-25,-15,-11,-18,-1,-22,-14,-3,19,0,-5,-2,-6,-19,-23,-18,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-23,-5,-2,-16,-11,-5,-13,-5,-11,-7,-1,-14,2,-2,-1,-6,-13,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,1,17,-3,-5,-23,-18,-7,-23,-12,-22,-14,2,-5,-6,-14,-1,-4,-20,-38,-20,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-11,-3,-4,-14,7,-4,-16,-6,-14,-9,5,-12,-6,-5,1,-1,-13,-19,-12,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-26,0,3,-21,-14,-8,-18,14,-21,-11,3,-14,2,14,-1,-5,-14,-25,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-21,-26,-18,9,-27,-16,13,-20,21,11,-19,-26,-15,-12,-17,-7,9,-18,2,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-4,0,-22,0,1,-22,-8,-12,-15,-7,-19,-12,1,-5,-1,-10,9,7,-12,-30,-17,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-26,8,14,-24,-14,-7,-24,4,-22,-16,2,-7,6,1,3,0,-20,-21,-14,10;
MA   /M: SY='S'; M=3,9,-17,10,3,-24,-3,-10,-23,-7,-23,-18,7,-11,0,-10,18,13,-15,-33,-18,1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-21,-29,-22,29,-24,-14,7,-25,20,6,-21,-28,-23,-18,-18,-8,2,-6,17,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-17,-21,-18,-2,-26,-15,12,-19,7,8,-15,-17,-14,-19,-9,-2,8,-20,3,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-7,1,-17,-21,-11,-14,17,-16,-6,-5,-14,0,10,-3,0,-7,-22,-5,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-8,3,-30,-20,-18,-20,-8,-29,-19,-18,82,-6,-18,-9,-10,-30,-30,-29,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-20,-33,-26,15,-29,-19,23,-19,13,22,-22,-25,-20,-15,-17,-7,22,-17,3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-27,0,11,-27,-19,4,-16,3,-14,2,-2,-13,38,3,-2,-9,-22,-21,-8,25;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,0,-29,30,-20,-9,0,-19,13,65,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,33,-27,28,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,0,-9,-8,-15,-22,-19,-12,-14,-8,-9,-11,2,-13,-16,-2,10,-7,-32,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-29,-4,6,-26,-19,-6,-30,40,-26,-10,0,-14,10,44,-8,-9,-20,-21,-10,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-27,-19,-19,24,-28,14,0,-11,0,0,-18,-28,-10,-11,-15,-7,-7,20,65,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-30,-11,-2,-23,-20,-11,-12,-8,-20,-12,-13,38,-6,-14,-4,-3,-15,-29,-19,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-19,8,-29,-20,16,-28,43,16,-26,-28,-19,-19,-24,-3,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-29,-20,9,-30,-20,19,-26,35,15,-26,-27,-18,-19,-23,-6,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-30,-21,9,-30,-21,22,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,7,-28,7,10,-29,-17,13,-26,18,-23,-8,7,-13,16,13,-5,-10,-24,-25,-8,12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-28,24,37,-32,-15,3,-28,7,-23,-18,13,-7,20,0,2,-8,-30,-32,-18,29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-33,-23,6,-32,-21,29,-27,37,24,-26,-26,-18,-22,-25,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-22,-21,-8,-1,-26,-17,9,-17,23,9,-20,-22,-10,-12,-19,-9,3,-21,-4,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-26,-4,5,-24,-16,-9,-23,28,-21,-10,1,-13,5,22,-5,-7,-16,-22,-12,5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-5,-28,-6,-3,-11,-18,48,-20,-6,-10,-2,2,-21,2,1,-11,-14,-21,-20,15,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-11,-10,-10,-18,-16,-7,-10,-9,-3,-1,-11,-8,-10,17,39,0,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-1,-31,6,17,-31,-17,-4,-24,0,-25,-17,-5,29,8,-8,-2,-8,-27,-29,-20,10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,6,7,-21,-10,-1,-19,-6,-16,-13,-2,-5,-3,-9,-3,-7,-16,-20,-12,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-25,10,12,-25,1,-6,-26,-1,-22,-17,4,-6,2,-5,3,-6,-23,-25,-16,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-10,3,-18,0,1,-17,-15,45,-23,-7,-19,-8,10,-17,4,-2,1,-6,-22,-29,4,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-21,-5,4,-25,-18,-15,-18,-6,-23,-16,-11,36,-4,-11,-2,-5,-19,-30,-23,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,42,28,-33,-11,1,-33,3,-25,-23,12,-8,9,-6,0,-10,-29,-32,-16,18;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-5,-28,-6,2,-15,-20,32,-24,7,-17,-6,1,-18,6,18,-8,-10,-20,-21,5,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-26,1,17,-25,-17,-5,-19,6,-20,-12,-1,1,12,-1,2,-2,-18,-26,-14,14;
MA   /M: SY='H'; M=-10,6,-25,9,8,-20,-16,10,-21,0,-15,-11,4,-11,3,-1,-1,-5,-19,-27,-5,4;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-29,-18,-30,-23,6,-30,-23,23,-27,37,17,-28,-28,-22,-21,-23,-7,20,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-17,3,15,-25,-21,-6,-22,8,-13,-9,-3,-13,13,7,-5,-6,-19,-27,-13,13;
MA   /M: SY='K'; M=-6,4,-25,6,12,-23,-16,0,-23,13,-20,-12,1,-12,6,8,-1,-6,-18,-24,-8,8;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-11,-19,-11,-19,1,-20,-9,-11,-10,-10,-10,-12,-11,-20,10,0,1,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-23,-24,-13,-4,-27,-13,14,-15,19,14,-19,-22,-9,-12,-18,-9,8,-22,-3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-26,47,23,-34,-10,-2,-34,0,-28,-26,14,-8,3,-8,8,-4,-26,-38,-20,13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00605;
//
ID   PEP_ENZYMES_2_MP; MATRIX.
AC   MP00742;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PEP-utilizing enzymes signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9326720; R2=0.0140566; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=607; N_SCORE=13.455; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-13,-34,-27,4,-34,-27,30,-27,19,13,-24,-26,-23,-24,-17,-5,26,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-17,-11,-28,-18,-21,83,-11,-20,-10,-9,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='S'; M=14,-6,-14,-8,-4,-19,-5,-11,-18,-2,-21,-14,1,-13,-2,4,20,8,-7,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=32,-5,-12,-15,-11,-17,-5,-16,-6,-10,-10,-7,-2,-13,-10,-17,8,2,1,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-18,0,-25,-19,-13,-14,-24,4,-15,-3,-2,-18,-19,-18,-21,0,-1,16,-26,-16,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-24,-32,-23,13,-28,-21,14,-25,25,11,-27,-28,-21,-20,-25,-10,8,5,8,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-22,-27,-19,-3,-23,-16,17,-18,18,20,-17,-21,-10,-14,-14,-4,9,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='A'; M=28,-16,-16,-24,-15,-13,-12,-22,7,-17,1,-1,-13,-14,-13,-22,1,-2,8,-21,-13,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-30,38,27,-34,-14,0,-33,4,-27,-24,10,0,6,-3,0,-9,-29,-35,-19,15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-23,8,18,-27,-19,8,-24,10,-19,-11,1,-11,12,5,-3,-7,-20,-28,-10,14;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-20,-37,-27,27,-34,-23,24,-29,21,12,-22,-26,-26,-24,-22,-10,15,-10,11,-27;
MA   /M: SY='A'; M=21,-18,-5,-24,-16,-11,-10,-21,-1,-19,7,-1,-16,-19,-15,-21,-5,-5,3,-23,-14,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,5,-28,7,17,-30,-18,-1,-26,20,-24,-11,3,-6,19,15,-2,-6,-24,-25,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-1,-28,4,27,-17,-22,6,-19,4,-12,-9,-4,-10,9,1,-6,-8,-20,-21,-1,17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-9,-27,-22,4,-21,-23,11,-19,3,3,-19,-22,-22,-20,-4,-1,19,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-27,48,19,-36,-10,-1,-34,2,-29,-25,16,-10,6,-6,6,-5,-27,-37,-19,13;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-23,-33,-27,57,-12,-17,-7,-27,2,-4,-16,-28,-34,-19,-16,-12,-6,6,22,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-38,-29,58,-31,-22,9,-29,15,5,-22,-29,-35,-21,-20,-9,9,0,20,-29;
MA   /M: SY='S'; M=14,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,37,18,-9,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-38,-28,22,-35,-26,31,-30,22,14,-22,-25,-26,-25,-21,-10,20,-13,7,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=5,-6,-13,-16,-13,-10,-21,-22,-1,-13,-5,-5,-5,-12,-12,-14,13,35,6,-28,-10,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-25,-21,-19,16,-23,4,2,-14,8,5,-18,-26,-12,-12,-16,-3,-5,8,43,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-12,-15,-13,-8,-20,-21,-2,-14,-3,-5,-6,-14,-12,-13,12,33,6,-29,-10,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-32,-23,30,-30,-17,14,-28,34,14,-26,-30,-24,-19,-26,-10,6,-8,14,-23;
MA   /M: SY='G'; M=24,-9,-19,-14,-14,-25,33,-19,-25,-15,-20,-15,-4,-15,-14,-19,7,-8,-15,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='I'; M=0,-24,-19,-29,-23,3,-27,-20,21,-20,13,12,-21,-23,-19,-20,-12,-3,21,-18,2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-9,32,-23,45,13,-33,-6,-4,-33,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,15,1,-23,-40,-20,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-27,30,16,-30,-6,0,-27,-1,-21,-13,13,-11,5,-7,-1,-9,-24,-33,-18,11;
MA   /M: SY='N'; M=-9,26,-21,24,4,-25,-6,2,-25,0,-28,-21,29,-15,0,1,12,1,-22,-38,-18,2;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-23,-2,5,-21,-3,-12,-19,-5,-20,-14,0,-2,-2,-10,5,-3,-15,-27,-18,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-18,-12,-4,-5,-17,-9,-2,-3,6,2,-7,-17,-6,2,-10,-6,-2,-19,-6,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-19,-23,-18,-7,-27,-24,14,-10,5,5,-22,-15,-18,-12,-11,-2,21,-27,-10,-19;
MA   /M: SY='S'; M=11,-11,-15,-16,-11,3,-2,-16,-15,-13,-15,-12,-4,-16,-14,-14,12,4,-7,-20,-8,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-4,-27,-6,0,-11,-21,14,-10,-3,-7,-2,-1,-13,-1,-1,-11,-10,-14,-20,5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-26,-20,-11,-5,-25,-12,4,-17,15,8,-21,-7,-9,-13,-20,-11,-4,-14,-3,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-24,-21,-17,21,-25,-1,0,-12,1,0,-14,-25,-12,-11,-12,-5,-4,3,33,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-27,30,16,-32,-13,1,-27,5,-23,-15,14,-12,12,0,0,-8,-24,-32,-16,14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-27,-3,13,-21,-18,-11,-16,-1,-16,-12,-9,14,1,-6,-2,-4,-16,-27,-16,6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-28,-13,-10,-10,-15,-11,-8,-6,0,0,-13,-11,-7,1,-14,-9,-10,-14,-3,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,15,-24,7,0,-21,-11,38,-23,-5,-25,-11,28,-13,5,-2,4,-4,-27,-34,-5,0;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-12,-38,-1,9,-31,-19,-16,-23,-7,-29,-21,-15,72,-6,-17,-8,-10,-30,-31,-28,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00527;
//
ID   BETA_LACTAMASE_B_1_MP; MATRIX.
AC   MP00743;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-lactamases class B signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2692690; R2=0.0148158; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=568; N_SCORE=13.675; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-14,-21,-20,-16,-5,-27,0,8,-20,9,6,-10,-19,-11,-16,-7,8,4,-25,1,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-11,26,-24,24,15,-26,-11,-1,-26,7,-25,-19,23,-11,3,0,5,2,-24,-34,-17,9;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-20,-31,-22,-5,-2,-21,-11,-3,-11,3,13,-23,-20,-4,-12,-23,-16,-11,28,4,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-25,-22,-30,-23,7,-32,-25,22,-13,7,9,-20,-23,-21,-15,-15,-7,23,-19,0,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-9,-21,-10,0,-7,-20,-8,-8,0,-9,-6,-11,-16,-5,-6,-3,2,-3,-13,7,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,6,-30,10,16,-28,-19,-4,-31,31,-25,-14,3,-11,10,32,-7,-10,-23,-24,-13,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-25,-8,-4,-22,-3,-12,-23,16,-23,-11,-2,-17,-2,18,-1,-6,-11,-24,-15,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-16,-21,-18,-16,4,-9,7,-7,-20,-2,-1,-9,-24,-16,-14,-7,-8,-3,-21,1,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-7,-27,-8,-6,-16,-1,10,-23,-1,-18,-8,-2,-18,2,4,-3,-3,-20,-15,4,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-24,-5,4,-24,-14,-12,-21,24,-23,-10,-5,9,2,10,-6,-7,-16,-19,-13,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-31,-5,5,-26,-20,-8,-29,35,-26,-11,-3,-1,7,38,-10,-10,-21,-21,-13,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,31,-23,18,13,-28,-28,-27,-22,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-12,-22,-18,-11,-10,-26,-17,1,-1,0,1,-8,-17,-7,4,-5,9,2,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-1,-24,0,-1,-15,-7,-10,-9,-11,-1,3,-6,-16,-6,-13,-7,-3,-9,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-10,-17,-17,-19,4,-20,-17,10,-17,-3,-1,-1,-23,-18,-16,-1,0,12,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,45,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-21,-16,-11,-13,-15,-16,2,-16,-3,-4,-5,-2,-11,-18,0,-2,-3,-27,-14,-12;
MA   /M: SY='T'; M=2,6,-11,-2,-5,-15,-11,-12,-15,-9,-19,-15,12,-11,-5,-9,25,33,-8,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-19,5,-29,3,0,-20,-17,88,-29,-9,-21,-3,16,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,15,0;
MA   /M: SY='A'; M=11,-16,-20,-21,-15,6,-11,-14,-11,-14,-12,-11,-13,-18,-14,-16,1,-3,-8,11,8,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=15,6,-17,6,-3,-25,5,-14,-23,-9,-20,-17,3,-11,-8,-15,12,4,-13,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-6,-10,-4,-20,-18,11,-28,8,-22,-11,0,-21,3,32,-2,-7,-19,-29,-9,-4;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-16,-25,-16,-12,-16,-23,9,-16,0,0,-12,-13,-13,-22,2,4,10,-22,-12,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-17,-30,55,-20,-37,-18,-30,-20,-3,-1,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-21,-26,-22,1,-28,-19,25,-23,23,16,-15,-25,-18,-19,-18,-7,17,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=10,-1,-23,-1,17,-26,-1,-11,-24,3,-19,-15,-3,-8,2,-6,3,-5,-18,-24,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-15,-29,-15,-6,9,-24,2,-10,-8,-8,-8,-17,-21,-6,-10,-13,-6,-15,28,38,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-31,-24,-34,-24,26,-29,-21,10,-29,32,10,-29,-30,-24,-20,-29,-13,3,9,11,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-28,2,5,-30,-3,-6,-29,26,-29,-12,9,-13,11,15,-4,-10,-24,-23,-15,8;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-23,0,12,-23,-13,-5,-26,15,-25,-15,4,-11,8,23,9,1,-18,-29,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-16,-29,-18,-8,-13,-26,-11,-6,12,-3,1,-8,-20,-1,30,-15,-10,-5,-20,-6,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=23,-19,-17,-28,-19,-11,-18,-25,16,-18,3,3,-16,-16,-16,-23,-3,-3,17,-21,-12,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-32,-2,10,-31,-20,-9,-27,35,-29,-10,-3,5,14,20,-9,-10,-23,-22,-13,11;
MA   /M: SY='T'; M=10,-11,-10,-16,-15,-10,-17,-22,1,-13,-7,-5,-9,-16,-15,-15,12,22,14,-30,-13,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-16,-24,-18,-16,9,-23,21,-3,-11,-4,0,-14,-25,-9,-11,-12,-9,-4,3,40,-16;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,13,-13,1,-5,-15,-11,-9,-15,-7,-19,-15,20,-13,-5,-7,20,30,-11,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='K'; M=10,-3,-23,-5,11,-27,-13,-8,-22,15,-19,-10,-4,-10,12,10,0,-6,-16,-22,-15,11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-23,-17,-1,-7,-23,-5,6,-11,18,25,-17,-19,5,-9,-17,-10,-2,-22,-5,2;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='B'; M=7,8,-21,5,-3,-22,-11,-10,-12,-4,-15,-12,7,-14,-5,-4,1,-5,-10,-28,-16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-22,20,20,-25,-15,-7,-20,-2,-20,-18,3,-10,1,-8,7,-2,-12,-35,-18,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=9,-22,-17,-27,-17,-1,-19,-17,10,-21,27,16,-22,-22,-14,-19,-16,-7,7,-20,-6,-15;
MA   /M: SY='K'; M=14,-4,-22,-8,2,-26,-12,-14,-22,26,-22,-10,-4,-10,2,10,-2,-6,-12,-20,-14,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00606;
//
ID   BETA_LACTAMASE_B_2_MP; MATRIX.
AC   MP00744;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-lactamases class B signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6803193; R2=0.0136829; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1232; N_SCORE=21.528; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=3,-20,-30,-16,-6,-21,-18,-20,-11,-14,-11,-11,-20,47,-12,-20,-9,-8,-16,-26,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-9,-34,-5,1,-30,-4,-15,-28,16,-30,-15,-7,23,-3,3,-8,-12,-25,-24,-21,-3;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=9,-2,-10,-12,-10,-12,-16,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,41,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='P'; M=8,-8,-24,-7,7,-24,-15,-16,-17,-6,-19,-15,-10,27,-4,-14,3,4,-16,-27,-22,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-9,25,-23,11,-4,-22,13,14,-25,-5,-29,-18,42,-20,-3,-4,6,-7,-30,-35,-18,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-12,-32,-30,17,-30,-28,24,-22,10,8,-28,-30,-32,-20,-12,-2,39,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-46,-36,-28,14,-22,-19,-16,-18,-16,-16,-36,-30,-18,-18,-36,-26,-26,124,41,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,44,-30,-20,10,-30,31,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-26,16,17,-30,-18,-4,-27,15,-23,-14,4,-9,15,6,1,1,-22,-27,-14,16;
MA   /M: SY='E'; M=-15,9,-30,17,29,-19,-20,4,-26,7,-18,-17,0,-10,9,6,-5,-10,-25,-19,1,17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-27,6,10,-30,-14,2,-24,24,-27,-10,17,-13,23,15,-1,-7,-26,-26,-13,16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-26,-17,-30,-26,30,-27,-15,10,-20,6,3,-23,-28,-27,-18,-13,-5,16,-3,21,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-4,-16,-28,55,-14,-36,-16,-30,-20,13,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-25,-36,-26,13,-33,-21,32,-26,24,25,-22,-23,-19,-23,-22,-10,18,-16,4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,33,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=-3,8,-22,16,16,-27,-9,-7,-26,-4,-28,-22,6,6,3,-9,17,4,-21,-36,-21,9;
MA   /M: SY='N'; M=2,1,-23,-6,-7,-16,3,-7,-20,3,-20,-12,6,-16,-6,-3,1,-2,-17,-18,-5,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,12,-20,18,6,-26,3,-3,-24,-3,-22,-15,7,-9,8,-6,8,-3,-20,-25,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-6,-6,-3,-13,0,-9,-10,-6,-14,-10,1,-6,-3,-9,17,7,-4,-20,-13,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-16,-2,3,-16,-13,-8,-16,21,-16,-6,0,-6,3,12,-1,4,-9,-15,-6,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,23,-16,33,9,-22,-5,-2,-22,-2,-19,-18,11,-6,0,-6,7,-1,-16,-26,-13,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-13,22,-21,5,-7,3,-8,5,-15,-6,-20,-15,38,-23,-8,-5,2,-3,-23,-25,-2,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,32,-28,32,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=14,-6,-18,-8,-10,-24,29,-16,-26,-14,-26,-18,2,-14,-10,-16,18,0,-16,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,22,-28,33,20,-12,-17,-4,-29,-4,-19,-21,6,-12,-3,-9,-4,-10,-24,-27,-9,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,16,-29,21,-1,-5,-18,11,-19,-5,-16,-15,7,-21,-5,-9,-8,-9,-21,-7,27,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,8,30,-30,-20,-6,-30,34,-26,-14,0,-6,14,18,-6,-10,-24,-24,-14,22;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00606;
//
ID   RF_PROK_I_MP; MATRIX.
AC   MP00745;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0844083; R2=0.0133340; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=446; N_SCORE=10.021; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-18,-20,-16,-4,-22,-20,12,-15,3,3,-15,-22,-17,-13,-7,-3,18,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-28,29,29,-30,-14,3,-30,5,-23,-19,9,-8,9,-2,1,-8,-26,-33,-16,19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-21,-30,-25,0,-31,-26,25,-21,8,8,-25,-21,-22,-20,-15,-6,28,-13,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-24,9,18,-25,-17,-2,-21,7,-18,-12,0,-10,7,0,0,-5,-16,-28,-13,13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-33,-24,1,-35,-26,35,-26,17,14,-22,-15,-20,-25,-19,-9,23,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='B'; M=-8,17,-27,17,6,-28,-11,0,-26,5,-27,-18,17,2,2,2,0,-6,-26,-32,-18,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,3,-30,10,11,-29,-15,-9,-24,0,-25,-16,-3,25,2,-7,0,-4,-24,-31,-21,5;
MA   /M: SY='D'; M=2,10,-22,13,9,-28,-3,-9,-27,5,-25,-18,7,-10,0,-3,8,-2,-18,-30,-19,4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-29,47,29,-36,-13,0,-35,3,-26,-24,12,-7,9,-6,2,-9,-29,-35,-19,19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,30,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-30,0,15,-26,-20,-2,-29,29,-23,-12,0,-13,15,39,-7,-9,-22,-22,-12,13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-36,-28,4,-35,-25,37,-26,18,18,-23,-23,-20,-25,-19,-8,26,-13,3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-26,42,20,-33,-9,-3,-33,-1,-26,-24,13,-9,4,-8,6,-2,-25,-36,-19,12;
MA   /M: SY='T'; M=1,-13,-13,-20,-18,0,-23,-21,4,-15,-2,-2,-12,-18,-18,-15,5,23,14,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-21,-28,-21,29,-24,-8,5,-19,6,10,-16,-24,-18,-16,-12,-6,1,-2,23,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-10,0,-20,-19,4,-29,27,-20,-10,0,-20,9,64,-9,-10,-20,-20,-9,0;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-19,-3,-2,-25,11,-9,-24,-7,-27,-16,5,-13,5,-6,21,6,-18,-31,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-17,-15,-6,-23,-6,-14,-15,-6,-17,-12,-9,9,-8,-15,6,-2,-9,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='H'; M=-11,12,-19,5,-3,-20,-6,42,-25,-8,-25,-11,25,-20,2,-4,3,-8,-26,-33,-2,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-23,-5,2,-22,-20,-13,-22,27,-22,-9,-1,-11,3,18,0,10,-12,-23,-10,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-11,-16,-15,-7,-23,-22,1,-12,-1,-3,-9,-17,-15,-10,8,32,12,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,24,-25,33,25,-30,-10,-2,-29,1,-25,-21,13,-8,6,-7,7,-4,-24,-36,-19,15;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-13,-18,-9,-21,2,-19,-14,-5,-13,-11,-9,-11,-9,-15,8,-2,-4,-20,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-25,-4,2,-19,-16,0,-26,23,-17,-9,1,-16,9,53,-8,-8,-18,-18,-9,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-21,-31,-22,1,-29,-21,30,-23,24,21,-21,-21,-16,-21,-19,-8,19,-19,-2,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-11,-15,-14,-5,-21,-20,1,-11,-4,-4,-7,-14,-13,-9,9,30,10,-26,-8,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-19,1,-29,0,-1,-16,-19,88,-27,-9,-19,-1,11,-21,8,-1,-9,-18,-29,-26,22,-1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-25,-27,-18,0,-31,-17,20,-18,23,14,-20,-23,-14,-16,-21,-8,11,-20,0,-18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-37,-8,2,-29,-19,-16,-21,-5,-28,-19,-14,70,-7,-11,-8,-9,-28,-29,-27,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-12,-11,-11,2,-19,-18,-11,-13,-10,-10,-1,-13,-13,-12,16,35,-2,-25,-5,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,-1,-11,-31,52,-16,-38,-12,-30,-20,3,-18,-14,-15,0,-18,-29,-23,-27,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-34,-24,-2,-35,-25,37,-25,20,18,-21,-22,-15,-24,-19,-8,24,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-15,-22,-19,-7,-23,-22,10,-11,2,3,-20,-19,-18,-9,-6,0,23,-27,-11,-19;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-12,-25,-21,-5,-26,-27,21,-17,6,6,-24,-25,-23,-19,-7,0,37,-28,-11,-22;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-18,-5,4,-14,-13,-6,-15,-3,-18,-10,1,-12,3,-5,12,6,-10,-27,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-15,66,-23,-21,-17,-23,-20,-18,-21,-15,-6,-13,-30,-17,-21,-3,-5,-6,-42,-22,-19;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-27,-6,10,-25,-20,5,-15,4,-15,1,-3,-12,40,4,0,-4,-22,-17,-3,25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00607;
//
ID   NIFH_FRXC_1_MP; MATRIX.
AC   MP00746;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NifH/frxC family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6881714; R2=0.0116039; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=734; N_SCORE=13.195; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=157; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-22,-26,-20,-12,-13,-24,-22,3,-12,-1,-2,-21,17,-15,-17,-13,-7,2,-26,-15,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,17,29,-29,2,6,-32,0,-24,-19,8,-9,7,-5,0,-12,-30,-30,-18,17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-28,4,-32,-24,29,-22,14,12,-27,-28,-26,-21,-14,-3,37,-22,1,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-5,-34,-28,-1,-34,-28,30,-27,18,13,-24,-27,-24,-26,-18,-7,27,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-16,-23,-19,-9,19,-26,-8,-7,-6,-4,-3,-13,-22,-10,-2,-10,-3,-4,-5,16,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,-1,17,-20,-23,-12,-12,7,-13,-9,-3,-8,4,-1,0,5,-11,-26,-12,10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-23,-23,-17,37,-25,2,-2,-14,1,0,-15,-24,-12,-10,-15,-9,-7,14,43,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-26,-6,-12,-21,23,-12,-27,-7,-26,-18,10,-19,-11,-11,-1,-12,-24,-7,-18,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,8,-28,13,0,-7,-20,-2,-20,7,-15,-7,-1,-17,-4,-1,-11,-10,-16,-15,8,-2;
MA   /M: SY='C'; M=0,-17,70,-26,-25,-18,-17,-27,-21,-24,-16,-15,-16,-31,-25,-25,-4,-4,-4,-41,-25,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-13,-28,-26,1,-28,-24,24,-20,16,16,-26,-27,-23,-18,-12,1,35,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-11,-15,-9,-15,-7,-18,-7,-13,-7,-8,-7,-13,-9,-16,13,9,1,-27,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-33,2,23,-29,-18,-11,-24,3,-24,-18,-10,38,3,-8,-4,-9,-26,-28,-24,11;
MA   /M: SY='P'; M=18,-17,-23,-17,-8,-22,-12,-21,-10,-11,-16,-12,-17,32,-12,-20,-1,-4,-7,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-14,-16,-14,-8,-18,-15,0,-9,-8,-5,-11,-20,-12,-5,7,8,12,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=22,-10,-21,-14,-16,-26,39,-20,-27,-16,-21,-16,-4,-16,-16,-20,4,-11,-17,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-14,-30,-14,-9,2,-24,9,-17,12,-11,-6,-9,-24,1,35,-14,-10,-16,2,30,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-19,-21,-19,-24,-17,26,-24,-9,-20,-12,-7,-13,-24,-24,-20,-4,-11,5,-24,-21,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-30,-27,-26,-13,8,-26,10,-26,-2,2,-11,-20,-20,-26,-11,-14,4,-20,-13,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-21,1,16,-20,-21,3,-17,-2,-14,-10,-1,-9,8,-4,5,11,-13,-29,-10,12;
MA   /M: SY='T'; M=11,-5,-12,-10,-10,-16,-1,-18,-13,-12,-16,-12,-1,-13,-10,-14,19,21,-2,-30,-17,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-35,-30,10,-33,-29,33,-25,13,12,-25,-27,-28,-23,-15,-5,37,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-8,16,-24,13,12,-26,-12,-3,-26,17,-27,-16,19,-11,5,8,4,0,-22,-31,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-31,-22,23,-30,-16,15,-28,38,15,-27,-30,-22,-19,-27,-10,6,-10,13,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,35,-31,-20,-4,-29,28,-24,-14,0,-5,19,14,-4,-10,-26,-25,-15,27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,38,-32,-20,-1,-28,22,-23,-13,0,-5,25,11,-3,-10,-27,-25,-15,31;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-11,-22,-16,-6,-3,-19,4,-1,-12,7,15,-8,-19,0,-10,-12,-9,-6,-21,-2,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-28,4,-8,-28,34,0,-35,-7,-29,-18,13,-18,-9,-9,0,-15,-29,-26,-21,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00580;
//
ID   GLUTR_MP; MATRIX.
AC   MP00747;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamyl-tRNA reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6875615; R2=0.0164176; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=510; N_SCORE=14.051; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=50; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-24,-17,8,-26,-18,13,-22,21,10,-20,-24,-16,-17,-19,-9,7,-17,2,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-21,-8,-3,-13,-6,-11,-19,-1,-15,-9,-3,-12,-4,1,1,-1,-14,-23,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-27,2,8,-25,-11,-3,-22,4,-22,-13,2,4,3,-1,0,-5,-20,-28,-17,4;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-5,-24,-5,-8,-8,-11,14,-16,-6,-14,-6,-2,-21,-3,-4,-7,-10,-17,-14,12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=0,-22,-18,-26,-18,8,-22,-18,6,-21,15,7,-20,-16,-18,-18,-12,-4,4,-17,-2,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-25,-15,-14,17,-25,-4,-2,-12,-1,-2,-11,-23,-14,-9,-11,-5,-5,-1,25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-21,-17,-25,-21,1,-26,-19,15,-17,4,7,-16,-23,-18,-13,-8,-2,19,-22,-4,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-16,-24,-18,-11,6,-25,6,-5,-6,5,3,-12,-24,-8,2,-17,-10,-7,-10,16,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-19,-8,2,-11,-16,0,-18,2,-13,-8,-4,-17,0,7,-6,-8,-15,-21,-3,0;
MA   /M: SY='G'; M=-8,10,-28,14,0,-27,17,3,-32,-7,-25,-17,9,-16,-4,-8,0,-13,-27,-26,-15,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-20,9,12,-24,-18,-7,-17,0,-16,-11,0,-10,5,-5,-1,-5,-15,-30,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-26,23,21,-29,-6,-2,-29,1,-22,-19,6,-8,5,-6,2,-8,-24,-29,-17,13;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,3,-20,-12,-19,-4,-20,-12,-12,-12,-11,-10,-13,-12,-20,10,2,-1,-25,-20,-12;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-17,-30,-24,4,-27,-26,23,-22,12,8,-21,-23,-22,-22,-10,-1,25,-22,-5,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-25,-2,8,-15,-18,3,-21,10,-16,-7,3,-15,6,20,-3,-4,-18,-23,-7,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-1,-19,-20,98,-29,-10,-19,0,9,-20,9,0,-10,-20,-29,-28,22,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-21,9,-30,-20,21,-28,43,20,-28,-28,-20,-20,-27,-9,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-20,-34,-25,45,-27,-13,8,-24,18,17,-21,-27,-25,-17,-21,-9,3,-2,20,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-21,-5,7,-21,-19,-3,-25,17,-18,-11,-1,-16,8,34,-3,-5,-18,-25,-12,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,12,10,-30,-30,-30,-20,-11,0,48,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-7,-17,-11,-18,-3,-20,-10,-12,-12,-11,-7,-12,-10,-18,13,8,-1,-25,-18,-11;
MA   /M: SY='S'; M=12,-7,17,-11,-10,-20,-3,-17,-21,-15,-23,-18,-1,-17,-10,-17,20,9,-9,-37,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-27,-9,-17,-29,60,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-21,13,-29,-20,20,-29,43,20,-28,-28,-20,-20,-27,-10,10,-18,2,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-18,38,-30,54,27,-36,-13,3,-36,2,-27,-26,14,-9,6,-7,-1,-10,-29,-35,-16,16;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-20,-28,-18,1,-24,-10,18,-17,28,35,-23,-24,-8,-13,-21,-9,10,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-17,-31,-27,-2,-30,-27,31,-22,10,11,-23,-24,-23,-22,-9,-2,36,-27,-8,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-32,-24,4,-32,-25,28,-25,27,16,-26,-26,-22,-21,-20,-7,24,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-29,-11,-20,-27,66,-20,-38,-20,-28,-19,-1,-20,-20,-20,0,-19,-28,-19,-28,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,22,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='D'; M=-6,6,-24,7,-1,-22,-4,-5,-23,-8,-21,-16,4,-1,-4,-11,4,6,-19,-27,-12,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,4,-30,7,29,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,1,-8,47,9,0,-10,-30,-23,-13,38;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-27,-16,3,-27,-18,16,-24,36,16,-25,-26,-12,-17,-23,-7,7,-20,-2,-14;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-25,-10,-15,-27,46,-18,-33,-13,-27,-18,0,-17,-14,-13,5,-11,-23,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-32,-28,2,-31,-27,32,-23,17,16,-27,-27,-25,-21,-15,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,9,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='B'; M=-8,11,-24,11,10,-26,-11,-1,-25,6,-22,-14,10,-12,11,9,4,-1,-21,-29,-15,10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-6,-19,-11,-18,-4,-19,-9,-11,-10,-8,-9,-12,-10,-19,10,4,1,-24,-19,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-26,-26,-22,29,-28,2,3,-16,5,2,-20,-28,-17,-12,-19,-10,-3,17,44,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-23,-3,2,-15,-16,-9,-15,2,-8,-7,-3,-15,1,3,-4,-4,-11,-23,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-23,-16,-7,-6,-23,-11,-1,-4,4,3,-12,-19,-4,-3,-10,-4,-2,-20,-2,-6;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-8,-15,-10,-19,6,-18,-16,-12,-16,-13,-5,-13,-9,-18,14,1,-6,-25,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-23,-11,0,-17,-21,-7,-12,7,-10,-3,-5,-16,10,12,-5,-5,-10,-21,-8,4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,10,25,-28,-15,-2,-27,15,-23,-15,4,-8,14,10,1,-5,-24,-27,-15,19;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-19,-5,1,-13,-12,-4,-13,-5,-10,-7,0,-16,-3,-6,-2,-5,-11,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-2,-28,-3,-2,-28,21,-8,-31,3,-25,-14,4,-16,-1,2,-2,-13,-25,-23,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-10,-13,-9,-6,-11,-14,-15,-9,-11,-9,-4,-16,-10,-8,5,13,-8,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-1,-22,-19,-5,-23,-22,6,-20,3,0,-14,-21,-17,-19,0,10,12,-29,-10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-25,2,-7,-28,30,-14,-32,-11,-28,-20,5,-10,-10,-13,8,-6,-24,-28,-25,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-26,-8,1,-17,-17,-11,-18,7,-19,-10,-5,5,0,5,-2,-1,-15,-24,-13,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00608;
//
ID   F_ACTIN_CAPPING_A_1_MP; MATRIX.
AC   MP00748;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   F-actin capping protein alpha subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9108105; R2=0.0170982; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=261; N_SCORE=10.363; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=35; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-25,-11,-18,5,-28,-5,10,-14,1,1,-16,-25,-15,-16,-14,-7,9,-6,26,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-7,23,-20,21,12,-24,-9,-3,-24,-2,-25,-20,22,-11,2,-6,14,9,-21,-37,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-29,-12,-6,-22,-19,-20,-10,-12,-22,-14,-17,48,-12,-18,-2,-3,-10,-32,-24,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-24,8,11,-3,-17,-5,-21,-6,-16,-13,1,-13,3,-7,2,-5,-19,-22,-5,8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-13,-21,-13,-5,-11,-6,-18,-5,-15,3,-3,-13,-19,-12,-15,-6,0,-1,-25,-13,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-10,4,-20,3,-4,-15,-20,-12,-15,-4,-6,-9,-1,-15,-6,3,2,16,-8,-29,-10,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,8,-22,10,10,-30,-15,-2,-21,0,-21,-11,5,-10,24,-1,12,8,-20,-29,-14,17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-17,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-13,-10,-8,-14,-18,-18,-8,-2,-14,-9,-3,-14,-8,-5,14,25,3,-30,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-30,-7,9,-20,-24,-7,-16,19,-15,-7,-4,-14,7,31,-10,-10,-13,-22,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-27,3,-34,-27,36,-28,28,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,1,-23,2,1,-2,-17,-7,-20,0,-18,-11,1,-15,1,-2,1,-4,-16,-20,-3,2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-26,7,4,-31,-5,-5,-18,-3,-18,-8,-1,-15,17,-5,-2,-10,-15,-26,-15,11;
MA   /M: SY='A'; M=32,-17,-10,-24,-17,-13,-11,-24,4,-14,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,18,-24,-16,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,14,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-13,5,-30,12,44,-27,-20,0,-30,15,-20,-17,0,-5,17,18,-3,-10,-27,-27,-17,29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,25,9,35,14,-33,-17,-8,-36,-6,-26,-26,6,-16,-5,-14,-3,-10,-25,-41,-23,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-15,-25,-15,-23,-22,44,-23,-22,-20,-19,-12,-8,-23,-23,-20,-3,-15,-9,-23,-25,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-15,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,1,15,-27,-20,26,-28,16,-22,-7,3,-13,20,22,-7,-13,-26,-24,-4,16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-20,-35,-27,35,-31,-23,18,-29,25,11,-25,-29,-29,-21,-22,-9,14,-9,11,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-23,12,16,-25,-16,-9,-19,8,-20,-14,0,-11,2,-1,4,-3,-10,-31,-16,9;
MA   /M: SY='S'; M=12,-10,-10,-13,-11,-13,-12,-19,-3,-13,-12,-9,-6,-15,-11,-14,18,17,9,-32,-16,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-21,-2,3,-23,-15,11,-21,4,-22,-9,4,-12,13,2,11,9,-17,-29,-7,7;
MA   /M: SY='K'; M=2,0,-26,0,15,-28,-16,-10,-26,30,-24,-12,-2,-8,8,14,-4,-8,-18,-22,-14,11;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-24,35,7,-14,-12,-6,-28,-8,-23,-22,10,-14,-7,-12,5,-4,-20,-31,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-24,-35,-25,18,-34,-24,27,-30,32,17,-25,-26,-23,-24,-25,-10,16,-15,5,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,11,-30,17,26,-35,-18,1,-28,19,-24,-12,4,-8,27,9,-3,-10,-27,-26,-14,27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-26,29,25,-31,-12,-4,-31,10,-27,-22,9,-7,7,0,6,-4,-24,-34,-18,16;
MA   /M: SY='S'; M=15,0,-14,0,9,-22,-4,-10,-20,-6,-24,-18,4,-8,2,-10,26,10,-12,-34,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-4,-22,-2,-3,-13,-23,-10,-4,-13,11,2,-9,-19,2,-10,-10,0,-7,-25,-7,0;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-22,-13,1,-12,-27,-18,6,-12,-2,-2,-7,-11,-6,-14,1,13,3,-26,-9,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-9,0,-18,-2,-14,1,-20,-15,1,-14,-6,-6,-1,-24,-20,-14,-6,-4,10,-27,-7,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00609;
//
ID   F_ACTIN_CAPPING_A_2_MP; MATRIX.
AC   MP00749;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   F-actin capping protein alpha subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5204186; R2=0.0138895; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=547; N_SCORE=12.108; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=143; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=5,-3,-20,-6,8,-20,-16,-10,-12,-1,-10,-7,-3,-12,7,-6,2,3,-9,-25,-14,7;
MA   /M: SY='S'; M=8,7,-19,8,7,-23,-9,-10,-18,-1,-19,-15,3,-11,-2,-8,9,0,-9,-31,-18,3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,14,-32,-22,24,-30,40,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,-25,16,14,-24,-13,-2,-16,-3,-20,-15,19,-12,6,-6,5,-3,-19,-34,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-24,3,18,-19,-19,-6,-14,6,-13,-10,2,-14,3,4,-4,-6,-10,-29,-15,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=8,8,-17,1,4,-21,0,-5,-18,0,-20,-13,13,-11,3,-5,9,-1,-16,-26,-17,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-31,-25,49,-30,-6,4,-23,15,4,-22,-30,-26,-17,-22,-10,-1,11,41,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-18,-6,-2,-17,-11,-7,-12,-6,-17,-8,2,-15,10,-6,12,5,-8,-28,-12,4;
MA   /M: SY='T'; M=-7,9,-21,9,9,-22,-15,-4,-21,3,-21,-14,7,-11,8,-1,9,10,-18,-28,-9,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-11,20,-21,37,37,-26,-26,-11,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='N'; M=5,10,-19,2,-3,-22,5,-6,-21,-8,-27,-19,21,-4,-4,-10,16,3,-20,-34,-22,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-29,40,33,-34,-13,2,-32,5,-25,-23,15,-7,12,-4,1,-9,-30,-35,-19,23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-23,-1,3,-23,-1,-12,-25,9,-23,-14,6,-12,-2,2,4,7,-18,-26,-16,1;
MA   /M: SY='T'; M=13,-3,-16,-9,-2,-21,-12,-13,-14,-1,-15,-9,-2,-10,6,-6,12,16,-8,-25,-14,2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,72,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=11,3,-21,0,-2,-22,4,-13,-16,-10,-18,-14,5,-13,-7,-15,7,-4,-12,-28,-19,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,48,23,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,1,9,-29,-18,-1,-21,12,-16,-6,-1,-13,25,16,-4,-9,-21,-22,-11,16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,4,-11,-7,-9,-11,-18,-17,-11,-9,-12,-11,6,-11,-9,-9,19,45,-3,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-16,-7,0,-21,-15,-10,-14,-4,-15,-9,0,-10,11,-6,16,23,-10,-27,-13,5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-28,-7,3,-21,-22,-11,-19,31,-12,-4,-6,-15,4,22,-14,-10,-14,-20,-8,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-38,-30,8,-37,-29,41,-28,17,16,-22,-23,-24,-27,-18,-8,31,-19,1,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-12,30,-26,29,16,-28,-8,3,-27,1,-28,-22,31,-2,3,-5,4,-5,-30,-37,-21,9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-28,7,13,-30,7,8,-30,-3,-25,-14,6,-12,13,-5,2,-11,-28,-27,-16,12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,7,-13,3,2,-13,-5,0,-13,6,-15,-8,13,-9,5,9,5,0,-13,-18,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=5,-3,-17,-5,0,-18,-4,-9,-17,17,-16,-8,-2,-8,1,10,-2,-5,-10,-14,-10,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-33,-28,-1,-34,-29,36,-24,13,13,-22,-23,-23,-24,-12,0,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-23,-15,-15,-15,14,-19,-14,-14,-4,-5,-10,-21,-15,-13,-5,-7,-8,-23,-16,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-1,10,-20,4,-2,-24,13,-4,-24,-7,-29,-18,23,-15,2,-7,18,2,-23,-34,-21,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-15,-28,-16,-19,30,-29,5,0,-15,1,-2,-16,-27,-16,-14,-18,-10,-7,14,51,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-25,-9,-1,-18,-18,-6,-23,19,-16,-8,-2,-18,5,39,-3,-5,-15,-24,-11,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-27,-20,3,-28,-17,23,-25,31,19,-17,-26,-16,-19,-22,-9,10,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-23,-14,-15,-18,21,-18,-21,-13,-11,-10,-6,-19,-13,-8,-1,-4,-14,-21,-19,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00609;
//
ID   TCP1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00750;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins TCP-1 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0339980; R2=0.0140750; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=584; N_SCORE=13.244; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=105; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-24,-21,-11,-9,-27,-12,7,-7,10,9,-16,-22,1,2,-15,-9,5,-22,-5,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-25,-16,-7,-10,-24,-12,0,0,2,3,-11,-18,-1,2,-10,-5,-2,-20,-4,-5;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-19,-7,-3,-18,-8,-9,-14,0,-17,-8,1,-16,0,6,8,1,-8,-29,-15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-6,31,-19,15,0,-20,-1,13,-20,-2,-28,-18,49,-19,0,-2,12,1,-27,-38,-17,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-20,-38,-30,7,-37,-29,39,-29,16,15,-21,-23,-24,-28,-18,-9,28,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=2,-2,-19,-8,-1,-16,-14,-8,-6,-7,-7,-1,2,-15,2,-8,2,1,-7,-28,-13,0;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-12,-18,-11,-21,8,-20,-13,-12,-13,-11,-9,-12,-11,-20,9,-2,-3,-21,-21,-11;
MA   /M: SY='A'; M=25,-16,9,-24,-18,-16,-9,-24,-5,-17,-8,-7,-14,-19,-17,-22,1,-2,5,-27,-19,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-25,-11,-1,-20,-23,-10,-13,19,-15,-3,-5,-16,5,24,-9,-7,-9,-22,-9,0;
MA   /M: SY='A'; M=18,-7,-18,-10,1,-20,-2,-16,-12,-9,-13,-11,-6,-11,-6,-15,6,0,-6,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-34,-27,5,-33,-26,33,-27,27,17,-26,-27,-23,-23,-20,-7,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-17,-12,-3,-23,0,-8,-15,-8,-14,-9,-6,-12,2,-13,7,-3,-9,-23,-17,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-26,34,22,-32,-10,1,-30,2,-27,-22,17,-10,10,-3,7,-4,-27,-35,-19,16;
MA   /M: SY='I'; M=0,-21,-19,-28,-21,-3,-27,-22,22,-20,11,13,-18,-20,-14,-20,-9,1,19,-23,-6,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-12,-31,-25,1,-31,-25,26,-24,21,14,-24,-26,-22,-22,-16,-2,26,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-29,-7,4,-21,-21,-5,-26,31,-17,-8,-3,-17,8,46,-11,-10,-18,-20,-10,3;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,1,-5,-7,-17,-9,-14,-17,-11,-21,-16,8,-14,-7,-11,23,23,-8,-36,-18,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-29,-20,13,-29,-13,17,-26,40,20,-28,-29,-17,-18,-28,-10,7,-13,11,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-19,-4,0,-22,-18,-6,-22,22,-21,-9,5,-17,5,25,-5,-5,-16,-26,-12,2;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-10,-18,-29,61,-19,-37,-19,-28,-19,0,-19,-18,-19,3,-16,-27,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-17,-20,-24,-16,-3,-21,-7,9,-8,15,33,-17,-20,-4,-4,-15,-2,5,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-25,35,6,-24,-12,-2,-22,-6,-13,-14,17,-16,-4,-10,-4,-6,-20,-35,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-32,-22,1,-26,-9,27,-17,24,46,-21,-21,-7,-16,-21,-10,14,-20,0,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-32,-23,8,-31,-22,26,-28,38,20,-28,-28,-21,-21,-25,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-17,-28,-23,-1,-30,-23,26,-20,15,13,-25,-26,-17,-18,-14,-4,31,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,33,-23,39,11,-30,-5,-1,-30,-3,-29,-25,24,-12,0,-8,11,0,-24,-39,-20,5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-27,2,1,-27,3,1,-28,-5,-27,-17,0,8,-3,-8,4,-7,-24,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-21,-14,-12,-8,-15,-13,1,-12,7,7,-12,-20,-9,-8,-10,-7,1,-23,-8,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-6,-9,-28,48,-15,-35,-12,-27,-18,0,-16,-10,-11,1,-15,-27,-20,-25,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-28,31,15,-33,-3,-4,-33,8,-28,-21,13,-11,4,-1,0,-9,-27,-31,-19,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-15,-32,-26,-2,-33,-27,30,-23,16,12,-22,-24,-21,-22,-16,-5,27,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-15,-16,-21,-17,6,-25,-19,4,-9,0,4,-13,-19,-16,-10,-3,13,11,-21,-2,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-27,2,-34,-26,37,-27,24,20,-24,-24,-21,-24,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,18,1,-21,-2,8,-21,6,-30,-19,53,-19,1,4,8,-1,-29,-38,-19,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=30,-2,-14,-12,-7,-20,-4,-10,-12,-4,-14,-10,2,-13,-7,-12,7,-2,-5,-24,-17,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00610;
//
ID   TCP1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00751;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins TCP-1 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4326053; R2=0.0132221; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=762; N_SCORE=14.498; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=157; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-20,-4,1,-22,-18,-7,-22,24,-22,-9,5,-17,5,26,-5,-5,-15,-25,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-27,-10,-18,-29,61,-19,-37,-19,-29,-19,0,-19,-18,-19,3,-16,-27,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-17,-20,-24,-16,-3,-21,-7,9,-7,15,35,-16,-20,-3,-4,-14,-2,5,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-25,36,7,-25,-13,-2,-22,-6,-13,-14,16,-16,-4,-10,-4,-6,-20,-35,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-22,-32,-22,1,-25,-8,26,-16,23,48,-21,-21,-6,-15,-21,-10,14,-20,0,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,8,-32,-22,27,-28,37,20,-27,-27,-20,-22,-25,-9,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-18,-25,-19,-5,-29,-21,20,-15,10,10,-23,-25,-13,-15,-12,-5,26,-24,-5,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,30,-22,35,10,-28,-5,-2,-28,-3,-26,-23,21,-11,-1,-8,10,2,-23,-36,-19,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-26,3,1,-27,4,2,-28,-6,-28,-17,3,5,-3,-9,7,-5,-23,-31,-18,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-11,-21,-14,-11,-9,-16,-12,0,-9,5,7,-10,-20,-7,-5,-9,-6,0,-23,-9,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-28,-7,-12,-28,54,-15,-36,-15,-27,-18,2,-18,-12,-14,0,-17,-28,-20,-26,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-28,31,15,-33,-2,-4,-33,6,-27,-21,11,-10,5,-3,0,-8,-26,-31,-18,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-17,-32,-26,-1,-33,-27,31,-22,14,12,-22,-23,-22,-22,-14,-4,29,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-17,-22,-17,3,-26,-21,6,-9,0,3,-13,-19,-16,-10,-4,11,12,-21,-3,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-27,2,-34,-26,36,-26,24,19,-25,-25,-22,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,17,1,-21,-3,7,-21,6,-30,-19,52,-19,1,4,7,-1,-29,-37,-19,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=28,-2,-14,-12,-8,-19,-5,-8,-11,-5,-14,-10,2,-14,-7,-12,6,-2,-4,-25,-16,-8;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-6,-14,-13,-10,-20,-22,-5,-12,-8,-8,-5,-13,-13,-13,14,37,6,-30,-12,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-38,-28,1,-37,-26,43,-28,24,23,-22,-22,-19,-27,-21,-10,26,-20,0,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,8,-30,-20,22,-28,45,22,-29,-29,-19,-20,-28,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-27,6,9,-26,-17,0,-28,24,-25,-13,8,-13,9,26,-3,-4,-21,-26,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-27,7,31,-23,-19,2,-20,4,-12,-9,-1,-8,15,-1,-2,-8,-22,-28,-14,23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22,3,-28,-13,26,-21,29,38,-24,-24,-11,-18,-23,-10,15,-20,0,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-27,29,23,-33,-9,-2,-30,1,-24,-20,8,-6,10,-6,3,-7,-26,-32,-19,16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,38,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-24,5,9,-25,-19,-5,-10,-3,-11,-5,-3,-14,15,-6,-1,-6,-10,-27,-13,11;
MA   /M: SY='H'; M=-17,7,-28,3,0,-20,-16,81,-28,-8,-22,-4,18,-20,8,0,-5,-15,-29,-32,12,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-39,-9,1,-30,-20,-16,-20,-9,-29,-18,-18,80,-5,-18,-9,-10,-29,-29,-28,-7;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-11,-20,-13,-15,-10,-21,-3,-12,-7,-7,-10,-12,-12,-18,9,12,6,-23,-16,-13;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-11,-20,-12,-19,1,-21,-8,-11,-9,-9,-11,-12,-12,-20,8,-1,2,-21,-20,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-27,-1,8,-27,-18,-9,-26,37,-28,-11,1,-11,8,25,-3,-6,-17,-23,-12,8;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-22,-14,-26,-20,-1,-24,-17,17,-20,17,21,-19,-23,-14,-17,-11,-1,15,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-32,-23,5,-30,-19,28,-26,35,27,-26,-26,-17,-20,-25,-9,17,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-14,-31,-27,-3,-28,-29,29,-21,10,10,-25,-25,-25,-22,-10,-2,38,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-29,22,31,-30,-17,0,-26,10,-20,-12,5,-7,15,3,-3,-10,-25,-29,-16,23;
MA   /M: SY='I'; M=8,-23,-17,-29,-21,-3,-23,-23,19,-21,17,11,-22,-22,-18,-21,-12,-4,19,-22,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-10,-6,-19,-2,-16,-14,-10,-19,-14,0,-10,-6,-14,25,14,-4,-30,-19,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-26,-3,10,-25,-18,-4,-24,23,-21,-8,-1,-11,12,22,-3,-3,-18,-22,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-8,-14,-14,-7,-17,-9,-14,-8,-9,-9,-4,-6,-13,-1,-12,10,10,-1,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,-1,18,-39,-20,12,-19,9,-19,0,0,-11,56,9,-1,-10,-28,-21,-9,37;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,29,-37,-13,0,-37,4,-28,-27,15,-8,5,-6,0,-10,-30,-37,-20,17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-26,20,15,-22,-16,-1,-22,1,-19,-16,7,-11,2,-5,0,-6,-18,-29,-11,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00610;
//
ID   XPA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00752;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   XPA protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3459015; R2=0.0119294; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1353; N_SCORE=20.476; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-25,-28,-25,-20,1,-30,-13,14,-17,0,2,-22,2,-17,-20,-15,-8,8,-11,13,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-21,-18,-5,-8,-30,-22,18,-14,4,4,-19,-19,-13,-17,-10,-5,22,-28,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,3,-25,-3,-5,-13,-17,32,-15,-7,-5,-2,13,-22,0,4,-9,-11,-19,-29,0,-5;
MA   /M: SY='D'; M=4,7,-26,12,12,-32,-12,-7,-23,-1,-21,-15,-1,7,11,-9,1,-7,-22,-27,-19,11;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-3,-38,10,5,-32,-18,-15,-25,-8,-30,-22,-10,65,-8,-18,-8,-10,-30,-32,-28,-5;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-25,-14,-10,-26,16,-20,-22,-13,-22,-16,-10,15,-13,-20,1,-9,-18,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-38,-17,-7,-23,-25,-22,-3,-15,-18,-10,-20,63,-12,-22,-12,-10,-15,-28,-23,-15;
MA   /M: SY='V'; M=10,-14,-16,-13,0,-13,-20,-19,3,-9,-3,-3,-17,-17,-11,-14,-2,-3,15,-28,-15,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-20,-25,-24,-17,-3,-28,15,13,-21,17,22,-14,-23,-8,-15,-20,-13,4,-23,6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-32,-8,13,-23,-26,-12,-3,-6,-11,-6,-11,15,7,-12,-8,-10,-13,-26,-15,8;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-20,3,-25,-22,19,-22,-21,-2,-22,-5,-6,-14,-26,-25,-18,1,1,8,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-15,23,-30,33,17,-37,-15,0,-32,17,-28,-17,9,-10,18,6,-3,-10,-27,-29,-15,17;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-17,-24,-20,-17,16,-22,9,-3,-10,-3,-3,-17,-24,-10,-13,-12,-7,-7,16,52,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-26,-10,6,-14,-24,-16,-6,-12,1,-5,-17,13,-7,-14,-10,-4,-8,-27,-15,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-12,-30,-14,4,-16,-29,-17,7,3,-4,2,-9,-12,-2,-6,-12,-10,1,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-28,-14,2,-12,-14,-17,4,-16,7,1,-13,-16,-8,-17,-13,-12,-3,-23,-11,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-30,-7,-14,-27,45,14,-37,-17,-27,-14,3,-20,-12,-14,-3,-20,-30,-23,-16,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-12,4,-30,6,1,-24,-23,-13,-10,15,-16,-7,-1,-13,-1,3,-10,-10,-8,-25,-10,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,21,-20,21,23,-21,-8,3,-21,3,-19,-16,20,-7,7,-1,3,-5,-23,-27,-15,15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-13,-13,-19,-13,0,-16,-8,19,-11,11,21,-11,-11,-6,-11,-11,-5,11,-11,0,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-19,-23,-23,-5,49,-27,-14,-8,-19,2,-6,-14,-22,-23,-14,-14,-10,-8,-1,16,-10;
MA   /M: SY='M'; M=5,-18,-18,-28,-18,-5,-15,-5,13,-10,13,43,-18,-18,-2,-12,-13,-8,8,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-18,-3,0,-23,-6,-13,-20,-10,-30,-20,2,18,-3,-13,26,12,-16,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-24,-23,-23,22,-30,6,8,-13,3,3,-23,-30,-16,-13,-17,-7,7,13,55,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-14,-22,-20,-14,12,-20,22,-4,-15,0,18,-8,-21,-7,-10,-10,-9,-6,-18,11,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-13,37,-24,31,9,-29,-6,7,-26,2,-28,-20,39,-16,9,-1,6,-4,-30,-37,-18,9;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-22,-3,-8,-14,-18,41,-11,-10,-14,-2,11,-23,-4,-6,-5,-9,-7,-32,2,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,21,-30,30,7,-35,7,-8,-37,9,-30,-22,9,-12,-2,-1,-3,-12,-27,-29,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-24,-27,-24,-17,3,-26,8,1,-23,22,9,-22,-28,-13,-15,-27,-16,-6,4,10,-15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-21,-8,3,-27,-9,-9,-17,-4,-21,-12,-4,8,12,-9,11,0,-16,-27,-19,7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-23,-23,-3,-27,-27,16,-17,3,3,-20,-23,-23,-17,0,17,33,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,50,17,-37,-13,-3,-37,14,-30,-24,14,-10,3,1,-3,-10,-27,-34,-17,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,10,-23,5,8,-28,-11,1,-22,13,-27,-12,17,-12,19,8,9,-1,-23,-29,-15,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='H'; M=15,-5,-21,-9,-2,-22,-11,16,-21,5,-18,-7,-2,-13,1,-2,-1,-8,-13,-23,-6,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-14,19,-33,33,26,-34,-16,-6,-32,0,-27,-24,3,21,3,-10,-3,-10,-30,-34,-23,13;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-11,-30,-11,-11,7,-25,57,-14,-10,-9,0,-6,-25,-1,-5,-15,-15,-19,2,52,-11;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-19,-11,-1,-25,-9,-15,-19,18,-19,-10,-5,-10,-1,3,1,-5,-9,-20,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00611;
//
ID   XPA_2_MP; MATRIX.
AC   MP00753;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   XPA protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2937617; R2=0.0126429; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1290; N_SCORE=20.593; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-24,-29,-24,-17,2,-25,10,-2,-23,17,6,-21,-27,-12,-15,-27,-17,-9,13,12,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-7,-23,-8,4,-29,-11,-8,-17,-3,-21,-10,-5,8,16,-8,8,-2,-18,-25,-18,9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-24,-24,-3,-27,-27,17,-17,4,4,-20,-24,-24,-17,0,16,34,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,16,-36,-14,-4,-36,18,-30,-23,13,-10,4,4,-4,-10,-26,-33,-16,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,5,-22,3,9,-29,-11,0,-22,9,-26,-11,11,-11,23,5,13,2,-21,-29,-15,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-30,52,34,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='H'; M=15,-5,-21,-9,-3,-22,-11,24,-21,0,-17,-6,-1,-14,1,-4,-1,-9,-14,-24,-4,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-14,14,-34,27,25,-34,-16,-7,-30,-1,-27,-24,0,28,2,-11,-4,-10,-30,-34,-24,12;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-11,-30,-11,-11,6,-25,58,-14,-10,-9,0,-6,-25,-1,-5,-15,-15,-19,2,52,-11;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-19,-11,-1,-25,-9,-15,-19,18,-19,-10,-5,-10,-1,4,1,-5,-9,-20,-15,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=29,-14,36,-24,-17,-20,-11,-24,-17,-17,-14,-14,-14,-21,-17,-24,3,-4,-4,-31,-24,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-27,6,34,-32,-17,0,-23,7,-18,-11,-2,-5,28,0,2,-8,-25,-25,-17,31;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-30,-20,-34,-24,35,-30,-20,13,-30,36,13,-26,-30,-27,-20,-26,-10,6,-9,11,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-23,-4,3,-23,-20,-14,-23,29,-23,-10,0,-10,3,16,1,11,-13,-24,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,63,-23,-19,-24,-26,-26,-26,-23,-24,-20,-20,6,-23,-26,-10,-10,-17,-43,-30,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-30,52,34,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-33,-23,21,-32,-22,21,-30,38,17,-27,-28,-23,-22,-27,-10,11,-15,5,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-26,43,20,-31,-8,4,-31,2,-28,-25,30,-12,4,-5,4,-6,-30,-38,-20,12;
MA   /M: SY='K'; M=-14,18,-30,25,14,-34,-16,-6,-34,32,-30,-17,7,-10,6,16,-6,-10,-24,-27,-14,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-30,1,21,-24,-20,0,-30,23,-20,-14,0,-13,14,45,-6,-10,-24,-24,-14,14;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-33,-17,-7,-16,-24,-20,-6,-17,-2,-6,-24,48,-14,-20,-17,-10,-16,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='F'; M=0,-21,-17,-27,-19,19,-23,-21,2,-10,-1,-1,-18,-23,-23,-11,-10,-5,11,-12,2,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-19,-24,-19,-13,-1,-26,22,2,-23,25,13,-16,-26,-9,-13,-23,-14,-4,-24,7,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-33,-25,47,-30,-13,7,-27,22,7,-24,-30,-28,-18,-24,-10,2,3,28,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-16,-28,-17,4,-9,-31,-18,16,-16,11,6,-15,-15,-6,-18,-15,-10,5,-24,-7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-14,-19,-14,-9,-13,-21,-18,-1,5,-5,-1,-12,-19,-9,-1,-4,-2,9,-27,-10,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-9,-34,-5,5,-28,-20,-12,-26,25,-28,-14,-7,24,3,19,-10,-10,-24,-24,-17,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-26,7,6,-26,-13,-3,-26,32,-30,-14,21,-14,6,19,-3,-6,-24,-27,-14,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00611;
//
ID   NA_NEUROTRAN_SYMP_2_MP; MATRIX.
AC   MP00754;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:neurotransmitter symporter family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9061718; R2=0.0131588; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=759; N_SCORE=14.884; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-26,-19,-29,-23,32,-30,-5,5,-23,15,5,-22,-30,-21,-17,-22,-11,-1,7,34,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-10,-33,-26,6,-31,-25,24,-26,22,13,-26,-28,-24,-23,-18,-7,25,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=9,6,-20,-2,-9,-22,17,-11,-21,-11,-23,-16,14,-16,-9,-13,10,-2,-17,-29,-22,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-19,-30,-23,10,-29,-23,22,-24,16,12,-20,-24,-21,-20,-12,-1,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,20,-22,4,-8,-15,-10,-1,-2,-8,-17,-10,37,-20,-5,-8,4,-2,-13,-35,-15,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-15,-28,-25,-2,-28,-25,25,-20,10,12,-22,-24,-22,-19,-7,5,33,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,44,-28,19,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-19,-23,-26,-21,0,-28,-20,25,-24,21,13,-12,-23,-16,-21,-16,-7,13,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-2,-18,-12,-19,2,-20,-14,-13,-12,-11,-8,-14,-12,-19,9,2,-4,-25,-20,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-37,-45,-37,-28,12,-23,-24,-12,-20,-12,-14,-36,-29,-19,-19,-36,-26,-22,119,33,-21;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-13,-16,-12,-16,-3,-20,-6,-13,-11,-9,-7,-14,-12,-17,12,8,3,-26,-17,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-31,-22,14,-30,-21,19,-28,33,15,-24,-27,-21,-20,-22,-6,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-29,-29,-24,43,-28,5,-6,-19,0,-3,-20,-29,-22,-14,-22,-14,-10,32,47,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,32,-30,18,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,78,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22,22,-29,-18,16,-28,40,20,-27,-29,-22,-19,-27,-10,8,-14,6,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-32,-25,45,-27,-18,7,-26,9,2,-18,-26,-29,-19,-13,-6,6,-4,18,-25;
MA   /M: SY='S'; M=5,5,-18,-1,1,-23,-8,3,-17,-1,-22,-11,12,-13,9,-3,13,3,-15,-31,-14,5;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-6,-1,-1,-20,-1,-11,-20,-11,-30,-20,9,-11,-1,-11,38,19,-10,-40,-20,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,71,-29,-19,2,-29,13,5,-21,-29,-37,-19,-21,-10,1,7,27,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-18,-5,3,-24,-18,-6,-14,-2,-16,-7,1,-11,20,-2,13,20,-13,-27,-11,12;
MA   /M: SY='S'; M=-7,-3,-20,-4,-5,-3,-16,0,-15,-10,-15,-10,-1,-12,-6,-10,7,6,-11,-22,-1,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,1,-28,6,13,-25,-17,-10,-19,-2,-22,-16,-2,19,-1,-8,0,-3,-18,-32,-21,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-21,9,-31,-21,22,-29,46,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-16,-5,1,-20,-5,-14,-16,-6,-18,-14,0,-10,-4,-10,16,12,-9,-29,-17,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-6,2,-20,-1,-1,-15,-13,11,-17,-3,-19,-10,8,-16,2,-4,8,5,-14,-26,-1,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,6,-26,3,-3,-24,1,-8,-23,-5,-27,-18,12,12,-6,-7,4,-3,-24,-30,-21,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-11,12,-22,4,-4,-14,-12,19,-13,-10,-11,-7,22,-18,-3,-6,-2,-6,-18,-33,-8,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-20,1,2,-17,-12,-12,-15,-7,-20,-15,1,2,-4,-11,11,9,-12,-24,-15,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-33,-42,-33,-24,6,-19,-23,-15,-15,-13,-11,-32,-27,-15,-13,-31,-23,-22,100,21,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,33,-18,16,-1,-20,-1,6,-19,-2,-29,-19,51,-18,-1,-2,13,4,-26,-39,-20,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-15,-3,-6,-17,-5,-9,-19,-6,-18,-13,3,-12,-6,-3,16,22,-10,-29,-13,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-2,-25,1,14,-24,-13,-9,-22,-3,-22,-16,-4,19,0,-9,5,3,-20,-29,-19,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-24,6,-3,-22,5,7,-23,-4,-21,-13,18,-18,-2,-3,0,-9,-22,-29,-14,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-15,88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22,-7,-7,-7,-37,-22,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-11,-14,-11,-1,-15,-9,2,-8,1,5,-9,-14,-8,-9,0,7,6,-16,0,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-20,15,18,-19,-8,0,-19,1,-14,-13,7,-8,5,0,0,-5,-18,-23,-13,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=2,-7,-16,-9,-9,-4,-8,-8,-8,-10,-10,-7,-5,-8,-11,-11,0,-1,-4,-16,-4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-18,-12,-8,-2,-16,-2,-9,-5,-4,-2,-7,-10,-4,1,-5,1,-7,-15,0,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: M=-6,-12,-23,-14,-11,0,-18,-13,-7,-6,-7,-5,-9,-14,-12,-4,-7,-6,-5,-13,-1,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-22,3,4,-18,-15,-2,-13,-5,-10,-8,-1,-11,0,-4,-2,-5,-10,-27,-11,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-25,4,10,-23,-15,-7,-16,0,-19,-13,6,2,2,-4,2,-2,-18,-30,-17,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-24,11,14,-18,-6,1,-23,-3,-20,-16,11,-13,4,-6,4,-5,-23,-27,-11,9;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-12,38,-18,-17,-18,-16,-22,-17,-19,-15,-13,-10,-25,-18,-19,1,1,-5,-38,-21,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-22,7,14,-23,-11,-6,-21,2,-19,-14,8,-10,6,-2,7,4,-17,-30,-16,10;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-3,-19,-7,-9,-14,-6,-7,-12,-3,-13,-8,4,-19,-6,-3,-4,-6,-11,-16,-9,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-8,-5,-3,-14,-3,-10,-12,-8,-17,-12,3,-8,-3,-9,23,16,-5,-26,-14,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-9,-3,-4,-14,4,-10,-15,-8,-18,-13,4,-8,-4,-8,21,15,-8,-25,-14,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,-12,-8,-4,-15,-6,-13,-11,-7,-14,-11,-4,9,-5,-11,10,7,-7,-21,-15,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-16,-9,1,-11,-20,-16,-3,-11,-3,-5,-9,-15,-8,-12,6,11,5,-31,-13,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-12,-22,-17,-7,-15,-19,-7,7,-10,-3,14,-7,-15,10,-10,1,-2,-1,-25,-8,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00533;
//
ID   SECY_1_MP; MATRIX.
AC   MP00755;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein secY signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0617895; R2=0.0147555; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=338; N_SCORE=10.039; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,31,-26,44,12,-35,-2,-4,-35,-1,-29,-25,14,-11,1,-9,6,-6,-25,-36,-20,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-29,-9,-2,-17,-17,-11,-10,-8,-16,-8,-8,32,-3,-13,-7,-7,-17,-23,-15,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-21,-32,-24,28,-29,-19,13,-25,18,8,-21,-26,-24,-18,-17,-7,9,-9,11,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-2,-23,-5,-5,-7,-4,-2,-15,-9,-13,-10,2,-18,-4,-10,0,-3,-15,-14,5,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-25,-26,-29,-20,14,-24,-17,4,-20,13,8,-22,-26,-15,-15,-22,-11,-4,18,10,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-29,-19,20,-28,-16,12,-23,26,14,-24,-26,-18,-17,-22,-10,6,-9,7,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-19,5,-6,-18,-5,-5,-10,-8,-17,-7,20,-17,-5,-10,6,0,-11,-33,-16,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-20,-30,-23,1,-27,-19,24,-20,18,23,-20,-22,-15,-19,-14,-2,19,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-25,46,-29,-20,9,-29,25,10,-24,-29,-30,-19,-23,-8,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='A'; M=25,-4,-13,-8,-7,-22,9,-15,-19,-11,-21,-16,0,-11,-7,-16,20,5,-9,-29,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-17,-7,-14,-26,42,-17,-33,-17,-29,-20,4,-18,-14,-17,12,-7,-23,-28,-27,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-4,9,-25,4,-6,-26,32,-8,-31,-9,-29,-19,19,-18,-8,-9,6,-9,-28,-29,-24,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-9,-6,-5,-13,8,-8,-11,-6,-11,-8,0,-7,-3,-9,7,-1,-7,-14,-12,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-14,-10,-17,-12,12,-15,-11,8,-14,15,7,-12,-14,-12,-11,-11,-3,5,-7,3,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-11,-5,-4,-8,0,-7,-7,-6,-7,-5,0,-7,-4,-6,3,-1,-6,-15,-8,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-7,2,-21,-18,-4,-19,13,-17,-7,0,-12,11,25,-3,-3,-15,-23,-11,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-20,-25,-23,-21,-4,10,-19,-5,-20,1,1,-13,-23,-19,-17,-12,-13,-4,-17,-9,-21;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-13,-6,-7,-17,2,-16,-19,-12,-22,-16,4,-12,-7,-12,25,26,-9,-33,-17,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-34,-26,7,-34,-25,32,-28,31,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,24,-21,-1,-26;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-16,-34,-24,31,-27,-17,12,-24,20,18,-21,-26,-23,-19,-20,-9,7,-9,10,-22; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-17,-5,12,-22,-11,-11,-16,-3,-14,-11,-4,-7,6,-9,9,5,-11,-25,-17,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-30,-21,12,-29,-19,19,-28,43,21,-28,-29,-20,-19,-27,-9,11,-19,1,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-29,-9,-19,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,2,-20,-19,-19,1,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-28,21,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-15,-19,-18,-17,-6,4,-15,-5,-17,-5,5,-9,-20,-14,-16,1,-1,-1,-24,-12,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-28,-27,-24,21,-32,-3,18,-19,7,7,-17,-26,-16,-18,-18,-9,6,6,40,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-30,3,-36,-29,42,-27,17,18,-23,-23,-23,-26,-17,-7,34,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,7,-12,-2,-5,-14,-10,-11,-15,-8,-20,-15,13,-12,-5,-8,24,31,-9,-34,-14,-5;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-16,-2,-4,-24,16,-12,-25,-11,-29,-19,7,-13,-2,-11,27,9,-16,-34,-22,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,5,-35,-23,38,-27,26,25,-22,-22,-18,-25,-22,-10,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-23,-36,-28,2,-35,-28,38,-26,16,16,-22,-22,-22,-26,-16,-5,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-27,-19,-33,-25,14,-29,-18,23,-22,22,25,-24,-26,-20,-19,-19,-8,21,-18,2,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,1,21,-40,-20,10,-20,10,-20,-1,0,-10,59,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-22,14,-31,-22,22,-29,41,18,-28,-29,-22,-21,-27,-9,14,-18,2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-30,-20,11,-29,-20,19,-29,48,20,-29,-30,-20,-20,-29,-10,10,-19,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=8,-11,-15,-14,-10,-16,-11,-16,-4,-10,-9,-5,-8,-16,-3,-11,7,9,4,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-23,-13,-15,-19,19,-16,-17,-10,-15,-6,-6,-19,-12,-12,-1,-7,-9,-22,-17,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=5,3,-9,3,-1,-11,-4,-7,-10,-5,-8,-8,1,-7,-4,-7,7,7,-5,-17,-9,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-11,-22,-13,-6,-13,-21,-13,-1,-1,-4,0,-10,-17,-3,-5,-7,-5,1,-23,-8,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-23,-32,-24,11,-32,-15,25,-25,25,16,-23,-26,-20,-21,-21,-9,16,-15,9,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-34,-21,-11,-16,-27,-23,6,-17,-5,-3,-21,39,-14,-22,-16,-10,-7,-25,-17,-17;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-24,1,5,-25,-6,-6,-23,9,-24,-14,4,-7,3,3,4,-3,-18,-26,-15,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-32,-25,20,-30,-23,20,-28,32,14,-28,-30,-26,-20,-23,-8,19,-17,3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-24,19,16,-27,-10,-3,-24,3,-23,-17,12,-11,7,-2,5,-3,-21,-32,-18,11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-26,-1,7,-14,-20,-7,-14,7,-6,-2,-5,-12,2,6,-10,-7,-14,-24,-9,4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-24,-12,-4,-5,-19,-13,-4,-12,7,2,-13,-19,-7,-12,-12,-5,-7,-9,-4,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-24,-1,3,-24,-16,-3,-15,5,-16,-6,4,-10,13,3,1,-2,-15,-27,-12,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,3,10,-30,-17,-5,-27,31,-28,-12,4,-1,11,18,-5,-8,-23,-24,-13,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,14,31,-29,-13,-2,-26,4,-22,-16,4,-1,15,-2,5,-5,-25,-31,-19,23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-29,7,19,-30,12,-7,-32,0,-24,-18,2,-10,6,-1,2,-11,-28,-26,-22,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00612;
//
ID   SECY_2_MP; MATRIX.
AC   MP00756;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein secY signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1118050; R2=0.0145694; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=399; N_SCORE=10.915; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-19,-30,-23,13,-22,-23,13,-25,18,7,-22,-26,-23,-21,-17,-8,11,-11,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-20,-23,-14,2,-27,-19,12,-18,16,9,-18,-22,-12,-15,-12,0,10,-22,-3,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-20,-19,-26,-20,-1,-26,-18,18,-20,11,12,-17,-20,-15,-19,-7,3,15,-22,-1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-16,-30,-25,1,-25,-27,21,-22,6,6,-20,-19,-23,-22,-9,-2,24,-23,-7,-25;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-19,-31,-23,4,-28,-24,23,-25,22,12,-23,-24,-21,-22,-16,-5,19,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-11,-16,-14,-5,-18,-19,-12,-3,-8,-6,-1,-9,-16,9,-9,1,3,-2,-22,-11,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-31,-21,6,-28,-16,23,-25,39,29,-27,-27,-16,-18,-26,-10,13,-20,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=3,-12,-14,-21,-17,-2,-22,-22,5,-16,1,0,-11,-16,-16,-16,4,22,11,-24,-7,-17;
MA   /M: SY='A'; M=9,-16,-15,-22,-17,0,-14,-21,2,-18,3,-1,-13,-18,-17,-18,0,8,7,-21,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-26,-11,-18,-28,57,-20,-35,-18,-27,-19,-1,-18,-18,-20,3,-16,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,-3,-12,-8,-9,-18,5,-17,-19,-12,-20,-15,2,-12,-9,-13,22,21,-9,-31,-18,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-23,-17,-29,-22,8,-26,-14,16,-18,13,19,-21,-22,-16,-18,-15,-6,14,-15,7,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-34,-26,21,-32,-23,23,-28,25,14,-24,-25,-25,-22,-21,-8,17,-14,5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-17,-29,-24,1,-26,-24,23,-23,21,13,-24,-25,-22,-20,-14,-2,25,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-20,-30,-22,2,-27,-16,24,-20,23,31,-22,-23,-13,-17,-18,-3,17,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-34,-37,-36,-27,23,-25,-22,-5,-23,0,-6,-32,-30,-22,-19,-32,-20,-13,78,28,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-33,-23,11,-31,-19,25,-27,36,24,-26,-26,-19,-21,-26,-10,14,-18,2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,11,-25,16,-3,-31,28,-12,-34,-11,-28,-22,7,-14,-10,-16,6,-10,-24,-29,-24,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-16,-24,-18,-8,-11,-26,-11,6,-10,10,9,-13,-21,6,-4,-13,-6,1,-22,-6,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-13,-3,-2,-18,-11,-11,-16,-7,-20,-13,7,-11,2,-7,25,29,-9,-33,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-30,13,24,-29,-19,-3,-26,21,-23,-14,1,-8,14,10,-5,-9,-23,-24,-11,19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-16,-31,-17,-10,-2,-23,-6,-16,10,-13,-7,-14,-22,-4,13,-19,-14,-16,22,17,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-18,-30,64,-19,-39,-16,-30,-19,0,-19,-18,-17,-1,-19,-29,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,7,-34,-27,35,-28,25,16,-25,-26,-24,-24,-20,-8,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-20,-29,68,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,1,-18,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-2,24,-16,12,0,-20,-1,2,-20,-4,-29,-20,40,-16,0,-4,21,9,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-22,-21,-29,-22,-5,-27,-24,25,-20,7,12,-17,-14,-16,-22,-8,0,21,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-12,-2,-3,-21,7,-12,-22,-11,-29,-19,8,-11,-3,-11,34,17,-12,-37,-21,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,26,-29,42,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-35,-26,28,-33,-23,21,-29,27,13,-24,-25,-26,-23,-23,-10,13,-11,9,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-28,-37,-28,-1,-38,-28,44,-28,18,20,-19,-19,-18,-28,-17,-6,27,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-25,-18,-33,-24,41,-24,-20,3,-24,11,2,-19,-25,-28,-20,-14,-6,4,-4,13,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-15,-20,-14,-13,-14,-21,3,-15,-3,-3,-10,-14,-11,-18,6,9,7,-24,-13,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-25,-1,-12,-26,43,-11,-32,-13,-30,-20,18,-19,-12,-13,7,-10,-28,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-25,-36,-29,-1,-36,-28,42,-27,16,17,-19,-22,-21,-27,-16,-6,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='V'; M=8,-20,-8,-26,-19,-7,-21,-22,12,-20,7,5,-17,-21,-17,-21,-4,-2,15,-27,-11,-19;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,-17,-5,6,-24,-9,-9,-16,-2,-19,-11,-1,-10,9,-7,15,4,-11,-28,-17,7;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-21,-8,-5,-18,-3,-8,-19,-3,-18,-11,1,-15,2,3,7,6,-14,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-35,-26,18,-33,-23,27,-28,29,18,-24,-26,-23,-23,-23,-10,17,-15,5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-22,-31,-18,-9,-8,-23,-20,-8,-14,-14,-10,-20,43,-15,-17,-11,-7,-12,-23,-16,-15;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-23,-11,-8,-14,-4,-15,-17,-5,-20,-14,-4,-16,-6,-8,3,-2,-12,-1,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-20,-6,-7,-17,8,-13,-21,-5,-19,-13,2,-16,-9,-7,5,-3,-13,-25,-17,-8;
MA   /M: SY='L'; M=0,-24,-19,-30,-21,10,-22,-21,14,-24,20,11,-21,-24,-20,-21,-15,-7,10,-17,-1,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-18,-25,-22,-15,10,-13,-17,-3,-15,0,-1,-12,-22,-15,-13,-13,-10,-5,-6,1,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00612;
//
ID   PROK_SULFATE_BIND_2_MP; MATRIX.
AC   MP00757;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic sulfate-binding proteins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4390187; R2=0.0126644; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1172; N_SCORE=19.272; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=0,13,-13,3,-3,-17,-7,-7,-17,-7,-23,-17,23,-13,-3,-7,24,24,-13,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-16,-26,-23,-3,-30,-27,23,-20,6,6,-17,-20,-20,-20,-3,14,26,-27,-7,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,56,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,10,-30,17,-6,-33,43,-13,-40,-13,-30,-23,7,-17,-13,-17,0,-17,-30,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-24,-3,3,-23,-14,-7,-27,24,-27,-13,3,-13,7,31,6,0,-17,-26,-13,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-10,-13,-20,-17,20,-23,-20,-7,-17,-3,-7,-7,-17,-20,-13,6,30,0,-16,4,-17;
MA   /M: SY='P'; M=11,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,56,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-27,0,-13,-27,46,-10,-33,-13,-30,-20,20,-20,-13,-13,3,-13,-30,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-27,17,-23,-13,-13,-17,-13,-13,-33,-30,-17,-17,-33,-23,-23,109,47,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,26,-17,10,-3,-17,-7,0,-17,-3,-23,-17,40,-17,-3,-3,13,17,-20,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=14,-10,-16,-13,-10,-4,-10,-4,-10,-10,-14,-10,-6,-16,-7,-13,11,4,-7,-11,12,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,4,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-20,11,-3,-14,-20,-13,-11,-13,2,-7,-3,-16,-10,-13,-3,11,-7,-30,-10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,14,-27,7,7,-27,-13,39,-23,0,-23,-7,23,-17,24,3,0,-10,-30,-30,-4,14;
MA   /M: SY='H'; M=10,-3,-16,-10,-7,-17,-13,18,-16,-10,-13,-7,0,-13,-4,-10,7,11,-10,-27,-4,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-27,27,0,-30,21,-4,-34,-7,-30,-23,26,-17,-7,-10,3,-10,-30,-33,-23,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00337;
//
ID   ARGE_DAPE_CPG2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00758;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1026595; R2=0.0080137; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=995; N_SCORE=7.869; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=824; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-41; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-23,-70,-13,17,-58,9,-69,8,-66,28,-47,30,-74,-64,-70,-61,-56,62,-81,-63;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-83,-92,-91,-26,-14,-97,-81,15,-86,-61,89,-14,-91,-82,-88,-82,19,-65,-92,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-99,-31,-90,11,27,-86,-96,-89,-52,-89,-1,-99,3,-93,-14,-85,-94,-91,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-84,-89,-60,-79,-94,-75,-67,-92,-32,-33,-86,96,-95,-73,-78,-68,-28,-94,-114,-91; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-90,-100,-94,-2,-95,-88,-27,-92,18,55,-94,-98,-88,-92,-16,-78,16,-91,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-44,-94,-104,-98,-21,-102,-92,22,-95,23,-60,-100,-100,-92,-95,-91,-81,23,65,24; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=83,0,-69,-65,-76,24,-72,-68,-66,-42,-64,-61,-69,-63,-71,-44,19,-57,-79,-73; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-32,24,-64,-8,14,-36,-65,-11,14,-62,-60,-58,-69,-58,19,14,61,-13,76,25;
MA   /M: SY='L'; M=-35,-72,-73,-10,-16,-81,-4,24,3,61,-39,-71,-22,-62,8,-67,-5,3,-72,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-87,-108,-84,-12,-33,-92,-87,-97,11,-102,-91,-87,84,-78,-9,-38,-81,-99,-98,-95; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=31,-71,-23,-67,-80,81,-67,-81,-65,-80,-72,-50,-67,-61,-71,44,-56,-73,-76,-74;
MA   /M: SY='N'; M=-31,-69,-15,-6,-75,-29,23,-73,6,-45,-66,87,-68,10,-2,35,20,-71,-87,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-29,-1,11,-66,-70,68,-68,2,-30,-23,-61,4,-70,-64,-28,4,-5,22,-79,-69;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=4,-79,49,32,-83,-33,-61,-77,-8,-80,-72,17,79,-54,-63,4,-4,-74,-85,-75; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-39,-93,-27,-64,-90,21,-6,-86,28,-51,-77,-69,84,-67,8,-68,-71,-86,-87,-83; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=13,-71,-67,-65,-69,22,-70,-27,4,-11,-59,-18,17,-62,8,-24,54,23,-82,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-73,-85,-81,-47,-88,-80,82,-78,44,-34,-79,-78,-74,-79,-73,-58,39,-75,-56;
MA   /M: SY='G'; M=25,-71,-71,-73,-60,70,-68,-57,-71,47,-1,-62,-73,-66,-74,-56,-63,-58,-71,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-71,-70,-86,-80,91,-84,-68,-3,-78,60,3,-80,-84,-79,-75,-76,-65,-44,-54,-33;
MA   /M: SY='I'; M=38,0,-27,-69,-58,-68,-70,58,-68,15,36,-20,-71,-64,-71,21,-3,-5,-77,-61;
MA   /M: SY='G'; M=58,-68,-63,-65,-78,66,-67,-76,-64,-76,-69,-53,-66,-59,-69,48,-53,-66,-76,-73;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-68,-75,-69,-54,-76,-64,17,-66,22,100,-65,-71,7,-67,-10,45,26,-78,-56;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-62,-61,-63,-64,-71,-71,-47,-60,-57,-56,-51,-62,-65,-68,-40,106,39,-88,-65;
MA   /M: SY='V'; M=39,-64,-74,-69,-61,-67,-76,-32,-68,-49,-50,-67,-73,-67,-71,34,-48,83,-84,-64;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-69,-90,29,-57,-80,-37,-69,-75,-66,-83,-73,-67,108,-68,-76,-64,8,-39,-81,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,-83,71,-25,38,-78,-70,1,-69,-40,-67,-60,1,5,-74,-66,-27,7,-83,-62; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=14,-75,43,-63,-28,86,-66,-84,-65,-81,-74,5,-68,-63,-72,-49,-63,-78,-77,-73;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-25,-103,-6,40,-91,-102,-8,30,-37,-29,-78,-86,-92,-20,-86,-87,-85,-73,-105,-89; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-43,-98,18,-82,-6,4,-8,-37,-16,-87,-85,-25,-1,-86,-88,-16,-80,12,-103,-85; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-88,-103,-31,-78,-97,-45,-81,-97,3,-19,-85,-2,-98,-18,58,-16,-85,-95,-103,-89; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-91,-110,-118,-103,-67,-101,-118,18,-97,-45,-79,-111,-101,-96,-100,-100,-95,5,135,-59; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-72,15,46,-77,-14,23,-35,-23,-76,-68,80,-66,-11,-58,-22,45,-70,-89,-69; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-71,-3,-28,15,-3,-2,-19,4,-54,-53,27,-74,-61,10,-9,-55,64,-73,26;
MA   /M: SY='N'; M=-33,-77,50,9,-78,9,-54,-76,-6,-79,-70,64,51,24,-3,-24,-56,-38,-82,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-35,-86,-67,-25,-76,-35,-69,-30,-64,-43,-64,-72,116,-66,-74,-62,-23,-3,-77,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-65,-77,-65,-2,72,-76,2,-5,-23,5,-50,-62,-74,91,-55,-61,-63,-28,-59,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-31,-75,-68,19,-14,-77,-70,60,7,-14,-49,-67,-70,-11,-64,-7,13,16,81,15;
MA   /M: SY='V'; M=-21,-70,-82,-76,-48,-83,13,51,-75,50,19,-76,-78,-71,-75,-70,-57,56,-78,-56;
MA   /M: SY='E'; M=-62,-81,46,99,-84,-74,-53,-84,1,-78,-74,-52,-58,-37,3,-57,-60,-78,-82,-72;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00613;
//
ID   ARGE_DAPE_CPG2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00759;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ArgE / dapE / ACY1 / CPG2 / yscS family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5807271; R2=0.0152335; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=222; N_SCORE=8.953; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,85,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-21,-33,-25,62,-28,-8,-2,-26,7,0,-17,-28,-31,-17,-17,-9,-3,5,30,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-23,-3,8,-22,-14,-9,-18,8,-18,-10,1,-11,8,5,4,6,-14,-26,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-22,-23,-14,-4,-22,-12,6,-21,21,11,-22,-10,-12,-17,-19,-9,1,-22,-7,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-15,-13,-8,0,-22,-17,-6,-11,-7,-7,-7,-10,-12,-11,7,25,2,-22,-3,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-15,-10,-8,3,-16,-1,1,-4,3,1,-10,-14,-6,-5,-11,-6,-1,1,15,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-27,3,12,-20,-23,-8,-7,0,-7,-6,-6,-9,2,-6,-8,-9,-8,-26,-12,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-27,-3,1,-25,13,-9,-27,2,-23,-14,0,-15,-4,1,-1,-10,-19,-25,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-28,23,18,-30,-10,10,-30,5,-25,-17,12,-11,11,0,0,-8,-27,-31,-13,14;
MA   /M: SY='G'; M=-5,9,-24,7,-5,-25,21,-11,-29,-10,-24,-19,11,-15,-10,-12,6,2,-22,-29,-21,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-18,-25,-19,-11,-2,-26,-11,1,2,8,7,-16,-22,-8,4,-19,-10,-1,-14,5,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-35,-26,9,-33,-25,31,-28,26,18,-24,-25,-21,-24,-22,-9,21,-15,1,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-23,-21,-19,22,-27,-1,-2,-12,-2,-2,-16,-25,-16,-11,-10,4,-2,9,38,-19;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-21,-11,-15,-22,32,-20,-27,-16,-22,-16,-1,-16,-15,-16,9,6,-17,-24,-22,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-18,10,-29,18,5,-23,-17,-3,-26,8,-14,-13,4,-15,1,23,-9,-10,-20,-28,-13,0;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-10,-14,-8,-18,-5,-18,-11,-10,-14,-11,-4,-10,-8,-16,17,13,-1,-26,-18,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-5,-9,-6,-10,-8,-10,-4,-6,-6,-4,-3,-8,-3,-8,5,7,1,-16,-9,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='B'; M=-12,18,-19,18,-1,-20,-12,0,-13,-5,-11,5,11,-16,-1,-9,-5,-7,-14,-32,-13,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=16,-8,-16,-12,-14,-25,35,-18,-28,-16,-23,-17,-1,-17,-14,-19,7,-8,-18,-24,-25,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-17,-26,-18,-17,-6,18,-20,-19,-19,-16,-12,-10,-2,-20,-20,-4,-11,-15,-18,-16,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-20,-30,-24,13,-29,-23,22,-26,19,11,-20,-25,-22,-21,-15,-5,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=30,-15,-14,-24,-15,-13,-11,-21,3,-15,1,0,-13,-14,-12,-20,1,0,7,-21,-14,-14;
MA   /M: SY='E'; M=7,-7,-17,-9,9,-9,-12,-13,-14,-7,-10,-10,-8,-13,-3,-12,0,-4,-9,-21,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-28,-33,-24,1,-30,-20,26,-21,12,18,-22,-21,-15,-22,-20,-11,15,1,6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-22,-32,-24,10,-30,-15,26,-22,25,26,-24,-25,-17,-19,-21,-9,17,-16,7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-7,3,-20,1,6,-15,-19,-5,-10,-7,-11,-10,2,-13,-3,-9,5,10,-7,-29,-9,1;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-11,-20,-11,-18,-1,-20,-8,-12,-6,-8,-11,-12,-11,-20,7,1,1,-21,-18,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-25,-16,-30,-22,-1,-26,-21,22,-22,20,19,-22,-23,-17,-20,-15,-5,20,-23,-6,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-20,2,14,-21,-15,-8,-18,6,-16,-12,-1,-12,3,3,0,-5,-14,-26,-13,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-23,-9,-4,-7,-20,-1,-8,-1,-7,-4,-5,-19,-2,6,-7,-5,-7,-15,6,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-22,19,-30,-16,18,-28,35,16,-26,-29,-22,-20,-26,-10,10,-14,9,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-26,1,0,-21,-21,-10,-11,10,-13,-6,1,-15,2,5,-6,-5,-8,-26,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-24,-5,9,-20,-16,-4,-13,2,-14,-8,-3,-12,3,-4,-3,-7,-12,-19,-11,6;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-7,5,-21,5,9,-18,-14,13,-18,2,-13,-7,5,-11,6,0,-2,-6,-17,-22,-4,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-1,-27,-2,-2,-24,6,-8,-24,-5,-25,-16,5,12,-3,-9,1,-6,-25,-26,-20,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-24,-1,10,-16,-16,1,-16,3,-15,-8,-4,0,9,0,-4,-8,-17,-18,-6,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-8,-26,-10,-9,-10,-26,-13,8,-10,4,3,-6,-19,-7,-8,-13,-9,2,-24,-6,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-24,-4,2,-14,-18,-3,-18,3,-17,-10,-4,5,-4,-3,-8,-8,-18,-23,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-3,-29,-1,4,-23,-19,37,-25,5,-22,-7,2,2,8,4,-8,-12,-25,-25,1,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-14,-11,-15,-20,29,-16,-23,-10,-18,-12,-5,-18,-14,-7,-3,-12,-13,-19,-20,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='B'; M=-10,11,-25,11,6,-25,-15,-8,-24,6,-24,-17,9,6,-1,2,2,6,-21,-31,-17,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-29,26,19,-24,-24,-21,-26,-21,-9,27,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-20,-9,-3,-12,-20,1,-18,9,-14,-6,-5,-19,1,18,-7,-7,-12,-18,1,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-19,-35,-28,21,-31,-23,26,-25,16,16,-24,-26,-26,-21,-18,-7,25,-15,5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=8,-19,-10,-23,-18,-8,-8,-22,1,-21,9,1,-16,-22,-17,-21,-8,-4,3,-24,-13,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-26,-19,-34,-24,34,-25,-21,9,-26,14,4,-19,-24,-27,-21,-15,-8,6,-6,9,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-3,-16,-8,-6,-14,-7,-18,-12,-11,-11,-10,-1,-14,-10,-11,10,24,-3,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-20,-13,-8,-21,-5,-20,-18,-13,-22,-16,-12,29,-12,-19,2,-1,-16,-28,-23,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-28,50,11,-33,-4,-1,-32,-3,-25,-19,17,-13,-2,-10,-1,-10,-26,-36,-19,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-18,-22,-17,-9,-21,-22,11,-15,-2,1,-11,-17,-14,-17,2,8,13,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-25,-4,-10,-26,38,-15,-32,-13,-26,-17,3,-16,-12,-14,6,-6,-23,-25,-24,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=2,-8,-13,-11,-7,-7,-9,-1,-3,-8,-1,7,-6,-11,0,-7,0,0,-3,-12,-4,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-12,-23,-13,-2,-12,-22,-7,-7,2,-5,-2,-9,-17,-2,8,-7,-5,-3,-22,-6,-3;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-29,-4,-16,-30,59,-18,-38,-17,-29,-20,2,-19,-17,-19,1,-18,-28,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-17,-21,-13,-16,-1,-19,-5,-14,-3,-2,-13,-8,-12,-19,0,-4,-1,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,10,-27,13,14,-27,-16,3,-28,14,-22,-14,6,-12,9,15,-1,-4,-22,-28,-12,10;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-6,-25,-7,0,-8,-21,5,-10,-2,-6,-4,-6,-17,-3,-4,-9,-8,-10,-17,5,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-22,-32,-22,42,-29,-15,5,-22,19,7,-21,-28,-26,-15,-22,-10,2,-3,17,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-1,4,-21,6,-7,-18,-18,-16,-2,-12,-7,-7,-3,-14,-12,-17,-3,-4,3,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-19,-12,-7,-12,-22,-15,1,-4,-5,0,-12,-19,-6,-5,-5,-4,10,-26,-10,-7;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-23,3,14,-22,-12,-1,-23,4,-20,-15,2,-7,4,2,4,-3,-18,-27,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-25,0,7,-22,-7,-7,-22,4,-18,-11,-1,-8,2,2,-1,-3,-18,-24,-13,3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-20,-23,-24,-13,22,-25,-11,-3,-15,2,-1,-15,-14,-18,-13,-13,-8,-4,-9,9,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-8,-2,-24,-3,-8,-7,-6,-13,-11,-12,-7,-5,-3,-13,-12,-12,-6,-6,-10,-22,-9,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,-7,-6,-10,-5,-20,-14,-13,-16,-1,-15,-11,-6,-13,-7,-1,0,-2,-6,-28,-17,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-28,37,20,-35,-13,-1,-33,9,-27,-20,11,-10,12,2,2,-8,-27,-33,-17,16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00613;
//
ID   SPASE_I_2_MP; MATRIX.
AC   MP00760;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Signal peptidases I lysine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5466843; R2=0.0159009; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=307; N_SCORE=10.418; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-19,-25,-24,-25,22,23,-20,-21,-25,-11,-11,-9,-25,-29,-20,-9,-15,-16,-6,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-29,62,18,-38,-10,1,-37,1,-29,-27,22,-11,4,-8,1,-9,-30,-39,-19,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-18,-29,-17,-5,-33,-23,27,-22,12,13,-19,-16,-15,-23,-17,-9,17,-24,-6,-19;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-16,-30,-25,-3,-26,-25,25,-20,11,12,-22,-23,-21,-21,-10,-1,30,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-15,-27,-26,1,-30,-26,27,-22,19,12,-27,-28,-25,-21,-15,-4,35,-27,-7,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-21,-20,-28,-19,28,-23,-18,2,-19,5,1,-15,-22,-19,-16,-10,-6,1,-8,8,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-25,-2,1,-20,-17,8,-18,10,-16,-6,6,-17,6,11,-4,-7,-15,-27,-7,2;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-5,-29,-4,-1,-18,-1,10,-24,2,-20,-9,-3,-13,4,-2,-7,-13,-23,-13,5,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,2,-33,8,9,-30,-10,-11,-26,-1,-28,-20,-1,36,-3,-11,-4,-9,-28,-30,-25,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-8,11,-23,10,10,-20,-14,-3,-21,8,-22,-15,11,-7,2,1,4,4,-19,-26,-9,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,22,-16,23,6,-18,-5,2,-16,-1,-15,-10,17,-9,1,-4,2,-3,-16,-24,-12,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-25,-8,-4,-15,-12,-3,-15,-4,-14,-7,-5,11,-5,-7,-2,-5,-16,-25,-12,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-23,9,-1,-25,7,0,-26,5,-27,-17,23,-15,-2,0,4,-6,-24,-29,-17,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-13,-23,-14,-8,-12,-27,-11,9,-11,1,3,-12,-19,-7,-10,-10,-4,10,-26,-7,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-6,21,-23,23,5,-26,-9,15,-27,-1,-23,-17,17,-14,1,0,2,-7,-22,-32,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-28,-24,40,-31,2,6,-18,7,3,-20,-29,-20,-15,-20,-10,-2,17,55,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-13,-36,-30,-1,-36,-30,38,-26,14,14,-24,-25,-24,-26,-16,-6,35,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-29,-19,-33,-27,1,-31,-27,32,-25,20,14,-26,-26,-23,-23,-16,-5,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-35,-29,-1,-36,-29,41,-26,15,15,-22,-22,-22,-26,-15,-3,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-25,-15,1,-27,-15,10,-13,30,18,-23,-26,-12,-6,-24,-10,5,-20,-2,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-3,-30,-7,-20,-23,-11,-30,-20,-17,74,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,58,25,-39,-12,1,-37,2,-28,-27,16,-9,7,-7,0,-10,-30,-37,-19,16;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-19,-8,-2,-16,-20,-15,-15,8,-13,-8,-2,-12,-2,7,5,20,-7,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-27,-1,17,-23,-21,-4,-17,9,-13,-7,-1,-12,16,13,-4,-6,-18,-24,-12,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-24,-22,-28,-24,24,-28,-3,12,-16,10,16,-23,-28,-17,-14,-18,-8,10,1,33,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-25,18,7,-20,-15,-7,-24,11,-23,-16,11,-13,-1,2,0,-1,-19,-28,-12,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-26,5,-3,-21,-10,-7,-12,-7,-19,-13,13,3,-5,-10,-2,-6,-16,-32,-18,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-12,17,-27,25,7,-25,-2,0,-26,-7,-20,-18,7,-15,-4,-11,-1,-9,-20,-29,-11,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-23,-6,-2,-17,-20,-2,-11,1,-13,-6,1,-16,8,6,1,5,-11,-22,-3,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-16,-23,-16,-12,-7,-27,-18,7,-5,14,7,-17,-22,-12,-7,-18,-8,7,-23,-6,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-14,-27,-14,-7,16,-27,10,-8,-6,-3,-3,-13,-23,-7,-4,-13,-6,-12,6,41,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-23,-31,-23,-2,-33,-25,28,-17,16,13,-22,-24,-19,-14,-17,-7,26,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-9,27,-22,15,0,-22,-2,6,-23,3,-27,-18,38,-17,-1,0,7,1,-26,-35,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-28,-1,-14,-23,22,-17,-16,-17,-17,-12,2,-19,-16,-19,-4,-13,-12,-26,-20,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-12,-7,2,-23,-22,-12,-14,15,-17,-6,-6,-16,6,6,-6,-5,-6,-26,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-29,-11,0,-15,-23,-10,-11,4,-8,-3,-12,7,-1,-1,-11,-6,-13,-20,-6,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-19,-21,-21,-4,-13,-20,11,-19,5,3,-10,-25,-19,-17,-9,-4,14,-26,-10,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-3,7,-15,7,7,-19,-15,-2,-21,2,-19,-14,2,-15,3,-5,-1,-6,-19,-21,-2,4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,10,38,-26,-19,-5,-24,9,-19,-16,0,-4,13,2,3,-4,-22,-29,-17,25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00418;
//
ID   SPASE_I_3_MP; MATRIX.
AC   MP00761;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Signal peptidases I signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0538589; R2=0.0093508; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1063; N_SCORE=9.885; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=701; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-34; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-62,16,-8,-54,-63,-69,88,-62,-14,10,13,20,10,47,-57,-14,32,-37,-81,4;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-79,-66,8,-7,-77,-62,-16,-10,33,-8,-67,67,-54,65,-65,-30,-59,-74,-62;
MA   /M: SY='G'; M=-20,-70,-8,-33,-66,47,-64,-29,-33,-42,-59,46,-26,-21,-67,-28,32,41,-79,1;
MA   /M: SY='H'; M=17,-73,4,8,-58,14,40,13,-61,11,38,-58,-70,25,-63,6,-28,-55,-70,36;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,36,3,-33,-38,-55,-74,66,-77,-67,55,42,17,-20,-55,-56,-25,-80,-68;
MA   /M: SY='F'; M=-63,-8,3,-63,48,-73,-66,21,-4,-6,-52,27,42,-1,-66,-60,19,22,13,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-77,-9,-58,4,50,85,-75,27,-31,-62,-52,-5,-54,27,-56,-64,-42,-77,-56;
MA   /M: SY='P'; M=-36,-76,-52,53,-65,-68,-57,-36,-13,-45,-62,-23,61,16,-59,26,26,-21,-70,42;
MA   /M: SY='W'; M=-61,-74,-65,-32,7,-71,-69,-11,50,-58,-57,45,-73,-59,-54,-33,-28,52,102,-52;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-75,22,-25,-66,-73,-9,6,62,-40,-56,-21,-69,41,6,-57,2,34,-76,2;
MA   /M: SY='V'; M=-35,-69,-11,-71,-57,-76,-73,43,-69,-29,-45,50,-76,-70,-73,-62,-52,80,-86,-62;
MA   /M: SY='P'; M=-62,-87,-29,-58,-85,38,-68,-77,-63,-85,-72,-6,115,-66,-75,-59,-60,-80,-79,-81;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-79,53,19,-80,-68,63,-81,60,-77,-67,-48,29,-14,23,-31,-59,-76,-83,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-55,-77,35,-66,-74,81,-11,41,-67,-68,-63,-2,-69,-22,-74,-54,-63,-60,-78,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-10,-54,3,-32,-70,68,-78,84,-73,-62,-49,-65,53,0,-31,-60,-76,-74,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-77,-77,-77,68,-81,-49,8,-71,-10,-6,-74,-83,-69,-68,-69,-64,-5,-37,108;
MA   /M: SY='W'; M=-72,-74,-89,-80,90,-83,-72,-44,-77,54,-43,-82,-84,-79,-75,-77,-68,-51,97,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-66,-76,-72,-5,-79,-74,-14,-69,-41,71,-68,-72,-70,-72,-58,53,79,-82,-58;
MA   /M: SY='M'; M=-63,-72,-67,22,-55,-77,-59,-10,47,36,104,-65,-70,-53,-52,-67,-60,-28,-74,-56;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-69,-37,-56,-76,-52,58,-77,-49,-82,-68,120,-73,-49,-56,-45,-48,-79,-97,-66;
MA   /M: SY='R'; M=-66,-79,-54,-53,-73,-69,50,-81,-31,-76,-64,62,-75,-43,99,-57,-61,-77,-80,-18;
MA   /M: SY='D'; M=17,-75,63,50,-32,8,-58,-20,-53,-10,-64,11,-66,16,-11,-54,-28,-66,-82,-67;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-70,-52,-32,-65,-38,73,-49,-56,-61,-56,83,-74,-19,-11,-29,-52,57,-89,-18;
MA   /M: SY='S'; M=-46,-67,53,-50,-77,-52,-57,-76,-56,-79,-73,-15,-64,-50,-61,98,-39,-69,-86,-67;
MA   /M: SY='M'; M=5,-73,60,-52,32,-66,-57,-33,27,-7,60,28,-71,-19,-57,-15,-57,-61,13,4;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,109,-35,-84,-67,-53,-44,-47,-81,-77,-39,-69,-51,50,-57,-59,-79,-95,-68;
MA   /M: SY='S'; M=-42,-66,-57,-60,-76,39,-61,-77,-59,-79,-72,-45,-64,-52,-64,99,-40,-69,-81,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-78,-62,-56,-65,-74,30,-65,-35,30,-53,34,-77,-47,96,-62,-63,-65,-78,-59;
MA   /M: SY='Y'; M=30,-72,-62,-67,28,-65,16,-58,-62,-58,-55,45,-76,-60,-64,-3,-27,-8,-49,96;
MA   /M: SY='W'; M=-41,-80,-73,-67,68,25,12,-68,43,-63,-64,-6,-74,-64,-58,-65,-68,-72,124,-37;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-77,-9,-71,-83,99,-69,-90,-36,-86,-75,-19,-25,-66,-74,-50,-67,-84,-75,-77;
MA   /M: SY='Q'; M=-65,-76,-72,-60,63,-74,-61,-52,-33,40,-6,-68,52,64,-63,-5,-61,-57,-62,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-71,-70,-71,18,-78,56,51,-36,-19,-45,34,-28,-68,-70,-64,-27,63,-79,-53;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-10,44,-55,-66,-65,-68,-20,-32,-73,-69,-23,67,-60,-32,26,2,-70,110,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-73,-89,-59,65,-11,-86,-68,-40,14,-4,-69,-71,-6,-18,2,-38,-34,-43,-81,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,-75,53,18,-68,14,-60,-63,48,30,-57,-2,-68,2,-52,-57,-59,-37,-79,-65;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-75,32,47,-75,-64,-50,-71,-24,3,-62,77,-68,61,4,-52,-56,-72,-83,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-77,-87,-87,-78,-66,-95,-84,55,46,27,-53,-80,-86,-73,-67,-81,-72,-15,-86,-71; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-73,-70,-33,-6,-44,48,45,43,-4,-46,-64,-27,-61,-57,-35,-57,56,-78,-56;
MA   /M: SY='G'; M=13,-74,53,-59,-73,69,-67,-6,-35,-10,-63,-51,-69,-21,-70,-29,-61,-9,-79,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-74,-62,-29,-71,34,49,-58,59,-66,-60,-54,-26,-53,14,-3,-57,41,-79,-63;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00418;
//
ID   WHEP_TRS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00762;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   WHEP-TRS domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5239482; R2=0.0153462; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=523; N_SCORE=13.540; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=5,-8,-19,-10,1,-16,-9,-9,-8,-5,-7,5,-7,-13,1,-8,4,-2,-5,-26,-13,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-1,-9,-20,-10,-2,-14,0,-13,-8,-7,-6,-5,-7,-8,-6,-8,-4,-8,-8,-18,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-1,-3,9,-19,-16,-10,-20,-1,-17,-14,-6,7,-1,-2,-1,-3,-16,-25,-17,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,-22,-7,10,-26,-9,-10,-17,-3,-16,-10,-7,0,9,-9,3,-4,-14,-24,-19,9;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-21,1,7,-21,-13,-3,-17,0,-19,-11,2,-12,6,0,12,2,-12,-31,-13,6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-26,-23,-13,-9,-25,-20,6,-16,9,2,-21,9,-14,-13,-16,-8,0,-24,-12,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-16,-10,-1,-18,-11,-10,-10,1,-6,-3,-7,-11,6,-4,1,-3,-8,-19,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=10,-7,-23,-5,13,-23,-15,-14,-15,-4,-16,-14,-10,14,-2,-13,1,-3,-12,-27,-21,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-15,4,-28,-18,12,-17,37,15,-25,-27,-15,-12,-27,-10,5,-20,-2,-15;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-17,-20,-14,14,-20,-12,-6,-6,-3,1,-9,-19,-12,5,-4,4,-1,-14,2,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='B'; M=0,10,-18,10,5,-21,-9,1,-17,-4,-14,-10,8,-11,7,-6,4,-3,-15,-26,-12,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=6,3,-16,3,15,-20,-7,-6,-19,2,-19,-14,4,-7,5,-2,12,2,-14,-26,-16,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,34,-24,18,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='K'; M=6,3,-21,-2,6,-22,-12,-8,-21,10,-19,-13,6,-11,2,8,4,2,-15,-26,-16,3;
MA   /M: SY='A'; M=8,-5,-14,-7,5,-21,-14,-12,-17,3,-13,-9,-5,-12,3,-3,4,2,-11,-26,-15,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-30,-2,15,-33,-21,10,-19,10,-18,-1,-2,-12,51,12,-2,-10,-28,-16,-3,32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-19,-29,64,-12,-39,-19,-29,-19,1,-20,-18,-19,-1,-20,-30,-21,-27,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,25,-26,27,27,-28,-11,2,-28,5,-24,-21,20,-9,8,1,3,-7,-28,-34,-19,17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-21,-24,-16,1,-26,-7,9,-16,18,9,-19,-25,-15,-11,-18,-9,8,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,31,-20,-10,0,-20,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-24,8,11,-28,1,-10,-28,7,-25,-17,2,-10,1,-2,5,-6,-20,-27,-19,6;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-29,-19,8,-28,-20,18,-28,45,18,-28,-28,-19,-20,-27,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-19,-8,5,-25,3,-13,-19,-6,-16,-12,-5,-10,1,-13,6,-3,-13,-22,-20,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-28,9,15,-31,-7,-1,-27,11,-25,-13,7,-11,20,9,2,-8,-26,-26,-16,17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-29,1,5,-28,-10,-7,-29,35,-29,-12,8,-13,6,25,-6,-9,-22,-23,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=6,-2,-24,3,4,-27,-9,-14,-21,-7,-25,-19,-4,25,-4,-15,9,0,-19,-32,-23,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-1,-27,-2,10,-29,-17,-9,-26,35,-26,-10,-2,-9,12,19,-6,-8,-18,-21,-12,11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-27,19,12,-24,-17,-8,-14,-5,-18,-15,7,-4,-2,-11,-1,-6,-14,-33,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-27,15,20,-29,-16,-3,-19,1,-16,-11,-1,-11,17,-4,-3,-9,-17,-29,-15,19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-9,34,-27,47,22,-35,-11,-3,-34,3,-26,-25,12,-8,2,-8,1,-9,-26,-35,-19,12;
MA   /M: SY='A'; M=11,-5,-20,-6,7,-23,-11,-13,-17,4,-20,-13,-3,-3,1,-2,8,0,-12,-27,-17,3;
MA   /M: SY='A'; M=25,-2,-18,-3,20,-24,-8,-12,-18,-2,-14,-14,-6,-6,3,-12,6,-4,-13,-24,-20,11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-18,-10,2,-24,-12,-13,-14,5,-14,-8,-7,-11,5,-4,3,-2,-7,-22,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,1,21,-25,-20,-3,-20,23,-17,1,-4,-9,15,12,-8,-10,-18,-23,-11,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-22,-19,-12,-2,-25,-16,6,-9,24,10,-16,-25,-12,-7,-22,-9,2,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='A'; M=12,3,-19,2,3,-26,-9,-11,-21,7,-22,-13,1,-10,4,-2,9,2,-13,-27,-16,4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-26,-16,3,-28,-16,9,-17,34,13,-23,-28,-13,0,-26,-10,3,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=9,-9,-20,-14,-5,-17,-14,-12,-13,10,-9,0,-8,-14,-2,9,-4,-2,-6,-21,-11,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-5,-24,-4,11,-24,-19,-5,-11,1,-12,-4,-4,-12,21,-1,2,-4,-12,-26,-12,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-24,-24,-24,-18,14,-29,-5,9,-16,26,10,-24,-28,-14,-12,-25,-10,0,-2,28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-25,0,14,-27,-1,-11,-27,13,-24,-15,-1,-9,3,2,2,-7,-20,-24,-18,9;
MA   /M: SY='A'; M=5,-1,-20,1,4,-19,-14,-5,-14,-9,-8,-9,-4,-9,-1,-12,2,0,-10,-28,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-17,-5,-7,-18,-13,-17,-8,-4,-7,-7,-8,-15,-10,-11,0,0,2,-25,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,5,33,-22,-20,-5,-17,2,-12,-7,-4,-5,10,-5,0,0,-17,-28,-15,21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-27,-13,-16,-21,33,-19,-21,-16,-15,-10,-5,-20,-16,-16,-3,-13,-17,-22,-21,-16;
MA   /M: SY='K'; M=2,-2,-23,-2,14,-23,-17,-12,-18,15,-18,-11,-3,-9,4,3,1,-1,-12,-25,-14,9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,1,-27,9,9,-21,-19,-8,-14,-8,-3,-7,-6,-2,4,-10,-8,-8,-17,-28,-14,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-14,-27,-16,-7,-2,-22,-3,-8,-1,-9,-3,-13,-8,1,-5,-10,-9,-12,-5,15,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-6,-30,-2,7,-13,-19,-13,-22,7,-23,-15,-7,18,-4,-2,-6,-8,-21,-23,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-20,-19,-12,-15,-20,-22,1,-4,-9,-4,-15,-1,-13,-12,-3,0,8,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,-1,-26,4,3,-19,-17,-13,-9,-11,-7,-9,-6,1,-8,-15,-6,-7,-9,-29,-16,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00614;
//
ID   GLUTATHIONE_PEROXID_2_MP; MATRIX.
AC   MP00763;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutathione peroxidases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2330432; R2=0.0147125; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=417; N_SCORE=11.358; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=87; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-20,17,-30,44,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-27,11,24,-30,-15,4,-24,14,-24,-13,16,-10,24,8,1,-7,-28,-28,-16,24;
MA   /M: SY='P'; M=2,-11,-27,-11,2,-14,-20,-10,-9,1,-13,-8,-11,3,-3,-8,-7,-8,-11,-14,0,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-27,-21,-15,16,-29,6,4,-14,13,6,-21,-28,-5,-11,-21,-10,-6,9,45,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-27,19,37,-30,-15,-4,-28,10,-21,-19,1,-4,11,-1,1,-8,-24,-29,-19,24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-24,-5,8,-23,-22,-9,-17,18,-17,-6,-5,-13,11,15,-4,-1,-9,-24,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,15,2,-12,6,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,24,71,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,-2,8,-28,-20,-8,-25,34,-25,-8,0,-10,15,20,-3,0,-18,-22,-10,11;
MA   /M: SY='A'; M=10,6,-21,9,3,-27,-8,-12,-23,2,-24,-18,1,1,-3,-8,7,-2,-15,-29,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-14,8,-30,14,23,-26,-20,22,-25,3,-19,-10,3,-11,23,0,-4,-12,-28,-22,1,22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,26,-30,-20,15,-30,41,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-16,-6,7,-14,-23,-16,-5,-6,-7,-7,-9,-13,-6,-10,5,16,5,-30,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,33,17,-29,-29,-23,-21,-22,-7,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=21,0,-20,-2,-9,-27,23,-17,-25,-12,-20,-17,-2,-13,-12,-18,5,-9,-15,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,104,-26,-26,-20,-26,-28,-29,-28,-21,-20,-16,-36,-26,-28,-4,-6,-10,-49,-29,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,31,-22,15,-3,-22,12,5,-23,-3,-30,-20,50,-20,-3,-3,8,-3,-30,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-26,-16,-15,-14,18,-8,-20,-7,-14,-4,-7,-20,-9,-2,-6,-12,-16,-12,-4,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-25,3,5,-20,-2,7,-21,-2,-15,-10,14,-17,-1,-3,-4,-10,-23,-29,-13,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-27,13,48,-28,-17,-3,-27,7,-18,-18,-2,-2,15,-3,2,-8,-25,-28,-20,32;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-22,-37,-15,-5,-11,-22,-20,-17,-13,-23,-17,-20,69,-15,-20,-12,-10,-25,-23,-20,-13;
MA   /M: SY='G'; M=6,-2,-24,0,12,-27,18,-12,-29,-7,-23,-18,0,-10,-2,-12,8,-7,-22,-27,-23,5;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-1,15,11,-28,-14,-9,-30,3,-27,-21,4,-13,0,-5,8,-2,-20,-37,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-24,29,15,-27,-8,13,-28,-1,-27,-20,25,-12,4,-5,8,-4,-27,-37,-15,9;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-29,-3,2,-23,-6,6,-18,6,-19,-8,6,-15,0,1,-6,-12,-18,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,45,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-18,-13,-6,-17,-10,-7,-5,-7,-3,4,0,-16,3,-10,-1,-4,-7,-23,-13,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=7,1,-24,-4,5,-28,-11,-5,-19,8,-22,-10,4,0,15,0,1,-6,-20,-24,-17,9;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-21,-30,-27,37,-3,-22,-6,-26,-1,-4,-16,-27,-33,-20,-13,-11,0,-5,7,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00396;
//
ID   ENDONUCLEASE_III_1_MP; MATRIX.
AC   MP00764;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endonuclease III iron-sulfur binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2448158; R2=0.0121650; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=488; N_SCORE=11.171; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-25,-25,-26,-19,-5,-22,-24,-13,-12,-14,-13,-25,-9,-16,-12,-19,-8,-14,43,3,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-22,-6,-2,-22,9,-11,-21,-7,-19,-10,2,-14,-2,-6,7,2,-15,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,8,-28,14,5,-22,-17,0,-20,1,-17,-11,2,-2,-1,-2,-6,-8,-18,-28,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-26,-13,-35,-26,37,-28,-22,9,-27,12,3,-19,-26,-29,-22,-16,-6,6,-7,11,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-9,25,-20,13,0,-20,-4,25,-22,-4,-28,-16,41,-18,2,-2,11,-1,-27,-38,-12,0;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-5,-29,-5,3,-26,-11,37,-20,-6,-15,0,1,-17,22,-1,-7,-15,-25,-24,0,10;
MA   /M: SY='A'; M=7,-16,-25,-19,-13,-13,-1,-11,-17,-9,-10,-9,-12,-19,-9,-3,-7,-10,-13,4,-8,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-20,-30,-21,3,-27,-18,22,-23,31,24,-25,-25,-16,-19,-21,-8,14,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-22,-34,-26,1,-30,-18,33,-20,20,34,-22,-22,-14,-20,-19,-8,25,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,5,-27,12,6,-5,-9,-8,-20,-11,-8,-13,-3,-17,-9,-12,-9,-11,-18,-20,-5,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-20,-25,-25,-18,20,-29,16,4,-24,10,8,-12,-25,-16,-15,-19,-13,-2,-14,15,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=12,-9,-21,-13,-2,-23,-11,-8,-20,10,-16,-9,-4,-14,8,23,0,-6,-12,-20,-14,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-23,-20,-13,-2,-23,-4,2,-6,3,10,-13,-21,-2,2,-10,-2,-2,-12,11,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-19,-26,-21,-6,-30,-18,22,-19,6,8,-16,-21,-14,-18,-7,5,23,-26,-5,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-20,-14,-7,-14,-21,-3,-6,-3,-4,1,-6,-15,-2,-5,-2,8,-4,-24,-5,-5;
MA   /M: SY='P'; M=12,-13,-26,-13,-3,-25,-12,-17,-18,-3,-22,-15,-12,32,-6,-8,0,-5,-16,-25,-23,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-10,0,-22,-20,-5,-13,10,-15,-4,-3,-16,15,24,-1,-4,-11,-23,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-27,0,4,-24,-15,-3,-27,29,-26,-13,11,-15,7,36,-2,-6,-21,-25,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-26,-12,-3,-18,-15,-11,-18,18,-9,-4,-7,-17,0,22,-11,-9,-12,-20,-10,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,7,-22,3,2,-25,13,-8,-26,-7,-25,-17,13,-13,-1,-9,10,1,-22,-30,-21,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-11,-23,-12,2,-13,-23,-8,-1,-6,-1,-1,-10,-15,-2,-6,-6,-3,-1,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-25,-18,-9,-15,-19,-20,-9,-16,-11,-9,-20,36,-13,-19,-13,-10,-14,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-12,-29,-22,3,-30,-21,21,-26,29,16,-21,-28,-19,-21,-22,-8,14,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=0,-4,-24,-6,6,-23,-15,-7,-18,12,-16,-8,-1,-13,9,13,0,-5,-14,-24,-13,6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-23,5,6,-18,-13,-1,-21,5,-22,-14,9,-13,3,2,5,-2,-18,-28,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-12,-24,-11,-10,-5,-19,-9,-3,-16,12,1,-14,-22,-11,-13,-15,-5,-5,-13,0,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-24,-10,4,-21,-23,-14,-13,1,-16,-10,-10,16,-2,0,-8,-8,-15,-27,-17,-2;
MA   /M: SY='A'; M=17,-8,-16,-12,-5,-7,-9,-9,-13,-7,-15,-11,-5,-14,-6,-12,11,3,-7,-17,0,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-11,-24,-14,-12,6,-14,6,-11,-6,-10,-6,-8,-22,-6,-6,-6,-7,-12,1,28,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-25,-7,5,-23,-13,-7,-14,3,-12,-5,-2,-13,13,5,-3,-5,-15,-23,-12,8;
MA   /M: SY='R'; M=-1,1,-24,-3,4,-21,-9,-4,-18,7,-16,-10,6,-15,1,8,-3,-7,-16,-25,-14,1;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-13,-9,-7,-18,-9,-13,-15,2,-14,-8,-2,-19,-5,3,-2,-2,-7,-28,-15,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-25,12,8,-21,-2,-5,-26,1,-26,-19,15,-6,-1,-4,5,-5,-24,-30,-18,3;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-17,-26,-20,-13,-8,-22,-19,-6,-5,-9,-5,-15,-19,-6,-6,-8,1,-4,13,0,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-26,0,9,-17,-5,-12,-19,0,-18,-12,-2,-12,-3,-6,-1,-8,-15,-24,-14,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-29,-4,8,-28,-11,-7,-24,11,-22,-11,-4,5,12,11,-2,-8,-23,-25,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-16,-25,-14,-6,6,-28,-8,5,-16,14,4,-18,-23,-11,-15,-18,-9,1,-11,13,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-25,-11,-8,-16,-13,-14,-12,-7,-11,-9,-6,10,-9,-2,-3,0,-11,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-3,-7,-10,-4,-19,-4,-14,-16,-7,-10,-10,0,-17,-8,-12,0,-6,-11,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-25,-6,6,-21,-18,-9,-22,21,-16,-9,-3,-13,5,23,-4,-4,-15,-23,-12,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00615;
//
ID   P_GLUCOSE_ISOMERASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00765;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoglucose isomerase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7608848; R2=0.0165609; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=122; N_SCORE=7.771; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=45; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-13,-21,-14,-6,-15,-20,-10,-6,2,-7,-1,-12,-8,-6,1,-7,-4,1,-25,-11,-7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=1,-4,-20,-6,0,-19,-13,-9,-12,3,-12,-2,-3,-13,3,0,1,1,-7,-25,-13,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-25,1,11,-18,-19,-10,-9,-3,-5,-6,-4,-12,0,-9,-5,-7,-10,-26,-13,5;
MA   /M: SY='F'; M=4,-14,-19,-19,-15,18,-15,-16,-9,-17,-5,-7,-12,-20,-20,-17,-6,-5,-5,-1,5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-28,8,-2,-29,23,-12,-32,-5,-25,-18,3,-13,-7,-9,-1,-11,-24,-26,-22,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-12,-24,-18,-13,-13,-22,-17,10,-7,-3,3,-6,-16,-7,-12,-5,-3,6,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-27,18,14,-26,-9,4,-27,2,-24,-18,13,-6,4,-1,1,-7,-26,-30,-14,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-27,-2,-3,-18,1,-10,-19,-7,-18,-13,-2,-2,-7,-11,-1,-5,-18,-20,-8,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-9,-25,-9,-4,-3,-22,-4,-6,-7,0,-4,-10,-20,-6,-7,-11,-6,-9,-5,12,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-26,7,14,-25,-13,5,-23,5,-22,-14,13,-6,8,7,1,-5,-24,-29,-15,10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-13,-21,-15,-8,-23,-12,9,-14,0,9,-13,-19,-9,-14,-2,6,12,-26,-6,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-16,-38,-28,63,-30,-20,3,-30,17,3,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28;
MA   /M: M=-4,-10,-24,-9,-3,-15,-6,-9,-13,-10,-14,-9,-8,-3,-8,-12,-1,-3,-9,-25,-12,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-36,-28,28,-32,-23,24,-26,18,15,-23,-26,-26,-22,-19,-8,19,-11,9,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-26,-41,-22,-12,-8,-19,-18,-18,-14,-21,-17,-26,16,-12,-18,-22,-18,-26,51,6,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,35,-27,47,26,-34,-11,-1,-34,1,-27,-26,16,-8,5,-7,4,-7,-28,-37,-20,15;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-5,-29,-6,-12,-9,-6,-16,-24,-13,-24,-21,-5,-22,-12,-14,-9,-12,-25,41,1,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,63,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-11,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-2,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,21,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-15,-27,-22,1,-26,-24,18,-21,15,9,-23,-23,-22,-19,-10,1,25,-25,-7,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-24,-26,-21,5,-22,-23,-4,-22,5,-4,-25,-26,-19,-19,-23,-10,-9,37,7,-18;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-11,-3,-4,-18,-1,-13,-19,-11,-25,-18,7,-11,-4,-11,33,25,-9,-36,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-14,-15,-8,-20,-7,-17,-12,-10,-15,-8,-9,8,-8,-17,9,3,-7,-27,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-16,-31,-28,-1,-30,-28,32,-22,11,12,-25,-26,-25,-22,-11,-2,39,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-19,-30,67,-19,-39,-19,-30,-20,2,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-15,-27,-20,8,-21,-19,14,-25,30,14,-22,-25,-19,-19,-22,-8,8,-17,-1,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-18,-12,-20,-15,10,-19,-15,12,-17,19,8,-17,-18,-16,-13,-13,-3,11,-12,0,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=0,-16,-25,-12,-6,-20,-15,-19,-10,-13,-17,-12,-13,31,-11,-17,3,1,-10,-31,-22,-11;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-20,-31,-22,2,-28,-23,24,-25,25,15,-23,-23,-19,-22,-18,-7,18,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=18,-14,-14,-20,-15,-14,0,-15,-5,-12,-4,4,-11,-16,-10,-16,-1,-4,-1,-21,-13,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-13,-31,-23,12,-27,-23,16,-25,19,9,-23,-26,-23,-21,-15,-6,16,-19,-1,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=22,-10,-4,-16,-11,-14,-10,-16,-9,-10,-9,-7,-9,-15,-9,-14,7,4,0,-23,-12,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-13,-19,-15,6,-19,-13,17,-15,11,8,-13,-14,-13,-13,-10,-4,13,-9,4,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-29,-10,-19,-27,63,-19,-38,-18,-29,-19,1,-20,-19,-18,0,-18,-29,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-22,-21,-25,-19,9,-22,-13,1,-17,0,0,-18,-12,-18,-16,-14,-8,-1,-3,7,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-27,33,24,-31,-12,0,-30,5,-25,-21,16,-9,7,-1,3,-7,-26,-34,-19,15;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-7,-23,-13,-12,-14,-12,-12,1,-9,-9,-3,0,-15,-8,-9,-4,-5,-1,-25,-10,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-11,-21,-14,-12,30,-23,-14,-10,-12,-5,-6,-9,-22,-21,-10,-9,-7,-5,-10,8,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,-1,12,-22,-16,-4,-17,7,-14,-6,-1,-12,10,5,-2,-6,-15,-25,-13,11;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-10,-24,-11,1,-13,-21,-12,-2,-5,3,3,-12,-16,-1,-6,-11,-8,-3,-23,-9,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00157;
//
ID   THF_DHG_CYH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00766;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5157776; R2=0.0139234; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=792; N_SCORE=15.533; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=143; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=5,-23,-12,-28,-23,-4,-24,-25,19,-21,12,8,-21,-23,-20,-21,-9,-1,23,-25,-9,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-30,-10,-20,-29,68,-20,-39,-20,-29,-20,1,-20,-20,-20,0,-20,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-35,-26,14,-30,-22,28,-25,18,19,-20,-23,-21,-23,-19,-9,18,-15,4,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-25,1,5,-19,-20,-3,-15,8,-15,-8,0,-14,3,5,-4,-5,-11,-23,-6,2;
MA   /M: SY='S'; M=12,-3,-10,-6,-2,-14,-4,-12,-17,-11,-23,-16,3,-12,-3,-12,27,14,-9,-32,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-24,-8,6,-11,-23,-10,-7,1,-7,-5,-8,-15,-2,0,-6,-4,-5,-23,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-11,-18,-12,-7,-4,-19,-7,-3,-15,5,-1,-9,-20,-9,-13,-5,1,-2,-24,-4,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-26,-18,-13,-1,-28,3,6,-14,1,4,-13,-22,-9,-13,-16,-12,0,-7,13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-25,0,4,-20,-17,6,-21,11,-17,-8,4,-16,6,15,-5,-7,-17,-26,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-29,-20,19,-29,-16,12,-23,33,14,-25,-28,-19,-16,-26,-10,5,-10,10,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-9,-34,0,6,-29,-15,-13,-23,-7,-29,-20,-10,55,-4,-15,-1,-6,-27,-32,-25,-3;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-20,-2,10,-22,-9,-10,-18,1,-17,-13,-1,-9,2,-4,7,-1,-13,-26,-17,6;
MA   /M: SY='B'; M=-6,23,-20,23,9,-25,-9,-3,-25,-2,-25,-20,19,-12,1,-6,12,8,-20,-36,-17,5;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-18,-24,-18,-5,-25,-24,16,-19,4,3,-14,-18,-16,-19,-1,10,17,-24,-8,-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-12,-3,-3,-16,-12,-12,-16,-7,-19,-14,5,-9,-3,-7,22,27,-8,-32,-13,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-29,11,43,-31,-20,2,-25,8,-17,-12,-1,-4,30,2,0,-8,-28,-27,-16,36;
MA   /M: SY='E'; M=5,3,-21,3,13,-23,-13,-9,-18,1,-18,-13,0,-8,5,-6,6,0,-13,-27,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-29,25,45,-32,-18,-1,-31,11,-23,-20,4,-3,17,1,0,-9,-29,-31,-19,31;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,25,-28,40,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,41,21,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=8,5,-21,3,9,-25,-7,-8,-22,3,-20,-14,4,-10,3,-2,6,-2,-16,-27,-18,6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-19,-21,-20,-12,-4,-26,-16,5,-5,13,6,-17,-23,-11,-4,-18,-8,4,-20,-2,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-5,12,-25,14,14,-25,-14,4,-22,3,-20,-14,8,-11,6,-1,1,-5,-20,-29,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-25,8,18,-28,-12,-3,-25,9,-22,-14,3,-9,13,7,4,-4,-21,-28,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20,12,-30,-16,19,-28,43,18,-29,-30,-19,-19,-28,-10,9,-14,9,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-20,1,8,-23,-9,-4,-19,2,-17,-11,4,-13,6,-2,2,-3,-17,-26,-14,7;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-28,60,16,-36,-8,1,-36,-1,-30,-28,25,-11,0,-9,4,-7,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-30,6,8,-28,-16,-10,-21,0,-24,-17,-3,27,0,-8,-2,-5,-22,-30,-21,2;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-20,5,6,-20,-7,-4,-20,-2,-20,-14,11,-13,2,-3,10,5,-17,-30,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-34,-29,3,-33,-29,35,-24,13,13,-25,-25,-25,-24,-14,-3,37,-22,-4,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-26,24,6,-26,-13,43,-30,-6,-25,-14,16,-15,4,-5,2,-7,-26,-35,-2,3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-28,-10,-19,-29,64,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-20,2,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-29,7,-38,-28,43,-30,21,18,-21,-22,-22,-28,-20,-10,27,-18,2,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-21,26,-29,41,22,-27,-27,-19,-22,-27,-10,14,-19,1,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-31,-28,2,-31,-28,30,-23,18,13,-29,-29,-27,-21,-14,-3,41,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-22,8,-30,-22,23,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-16,-39,-5,0,-28,-20,-17,-20,-9,-29,-20,-17,79,-9,-19,-10,-10,-29,-28,-25,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-25,0,7,-27,-11,-10,-25,15,-26,-15,0,2,2,8,0,-6,-20,-27,-18,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-28,-1,1,-23,-9,57,-28,-8,-22,-5,7,-14,10,-3,-2,-13,-27,-29,4,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-37,-27,6,-35,-26,38,-29,26,20,-23,-23,-20,-26,-22,-10,23,-19,1,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-25,43,12,-30,-7,2,-31,0,-29,-25,30,-13,1,-6,7,-4,-28,-39,-19,7;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-24,3,18,-25,-14,-6,-22,3,-21,-15,0,4,8,-4,5,1,-21,-28,-16,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-25,6,11,-24,-13,5,-20,3,-18,-10,9,-13,12,3,1,-3,-21,-27,-11,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-25,-6,4,-21,-17,-6,-21,17,-17,-9,-1,-9,3,17,-3,-2,-15,-24,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-20,-33,-28,0,-32,-28,34,-25,17,14,-24,-25,-24,-24,-15,-5,33,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-19,-31,-23,4,-32,-23,26,-26,24,14,-20,-23,-18,-22,-18,-3,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-23,12,21,-23,-11,0,-23,1,-19,-16,12,-10,7,-4,6,-3,-22,-31,-16,14;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,-15,-13,-4,-20,-6,-12,-16,-1,-15,-11,-4,-11,-3,-3,10,4,-7,-24,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-38,-29,0,-38,-29,45,-27,18,19,-21,-21,-21,-27,-18,-9,32,-21,-2,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-1,17,-18,22,5,-26,-10,-7,-22,-5,-20,-18,8,-13,-4,-10,6,-2,-15,-34,-17,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00616;
//
ID   THF_DHG_CYH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00767;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8625588; R2=0.0132954; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=435; N_SCORE=10.636; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,30,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-25,-31,-22,51,-28,-15,-4,-23,0,-4,-20,-5,-30,-19,-18,-10,-8,4,24,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-6,23,-26,25,20,-29,-11,-2,-28,11,-25,-20,17,-10,5,1,1,-7,-25,-32,-18,12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,8,-25,9,-1,-28,15,-9,-31,4,-30,-19,12,-14,-4,-2,7,-6,-23,-29,-21,-2;
MA   /M: SY='V'; M=13,-23,-16,-30,-23,-7,-23,-27,23,-20,7,7,-20,-20,-20,-23,-7,-3,27,-24,-10,-23;
MA   /M: SY='A'; M=3,-9,-20,-10,3,-15,-18,-15,-3,-6,-6,-5,-8,-13,-4,-10,3,-1,-1,-28,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-29,12,24,-27,-10,-7,-27,14,-19,-14,-1,-9,6,4,-6,-11,-23,-26,-16,15;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-13,-21,-13,-7,-17,-24,-19,-4,20,-13,-1,-13,-19,-7,8,-10,-6,10,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,0,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='E'; M=7,0,-21,0,14,-26,-3,-10,-25,7,-24,-16,1,-8,4,-2,10,-2,-17,-28,-19,9;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-25,-33,-26,-22,17,-23,-1,-8,-13,-8,-8,-25,-27,-13,-15,-22,-15,-15,59,50,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-32,-31,-39,-30,2,-34,-30,33,-26,10,10,-26,-24,-21,-26,-23,-13,21,14,5,-28;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,22,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,10,40,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,60,-19,-39,-12,-30,-19,0,-19,-17,-14,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-25,-22,-35,-25,17,-27,-11,23,-19,18,38,-20,-22,-13,-17,-20,-10,13,-14,6,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-17,-32,-27,-3,-29,-29,31,-22,10,10,-24,-24,-24,-23,-10,-3,36,-25,-8,-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-14,-22,-16,-7,-18,-22,6,-17,7,1,-14,-17,-15,-18,0,10,10,-24,-10,-16;
MA   /M: SY='M'; M=4,-6,-16,-17,-13,-8,-14,-9,2,-11,4,16,-3,-17,-6,-12,-3,5,0,-25,-9,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21,6,-28,-15,24,-24,37,32,-26,-26,-14,-18,-26,-10,13,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-27,7,25,-28,-17,8,-27,17,-24,-12,3,-8,17,9,2,-7,-24,-27,-11,21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-14,-17,-14,-3,-24,-20,1,-17,11,1,-11,-17,-14,-14,2,29,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-23,-33,-27,3,-27,-22,18,-20,11,17,-29,-27,-19,-19,-21,-10,19,11,2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-23,-10,5,-17,-24,-11,-2,2,-7,3,-10,-14,5,-3,-5,-1,1,-25,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-14,-15,-18,-12,-11,-12,-18,1,-17,0,-3,-9,-15,-10,-18,7,3,3,-26,-13,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=12,-15,-7,-21,-16,3,-16,-3,-7,-12,-6,-6,-15,-22,-12,-16,-6,-5,-5,0,24,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-27,-2,22,-21,-22,-10,-12,6,-8,-7,-7,-9,5,-2,-7,-9,-13,-25,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-2,-25,-7,-1,-17,-15,-1,-19,13,-18,-9,3,-16,7,16,-4,-7,-17,-15,0,1;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-3,-21,-8,-6,-12,-18,16,-9,-9,-8,-2,1,-19,3,-7,-3,-2,-10,-22,3,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00616;
//
ID   TRANSTHYRETIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00768;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transthyretin signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5856633; R2=0.0164879; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=328; N_SCORE=10.984; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=3,-19,-20,-26,-16,-6,-19,-10,12,-14,14,29,-19,-12,-5,-15,-14,-8,5,-21,-6,-11;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=0,-9,-15,-8,-6,-13,1,-14,-8,-10,-12,-8,-7,-1,-10,-11,4,1,-2,-21,-14,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-14,-9,-5,-16,-6,-11,-7,-8,-13,-9,-1,1,-3,-12,9,3,-6,-22,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-3,-16,-4,-2,-14,-11,10,-13,-6,-11,-4,0,-13,-1,-6,5,3,-8,-25,-5,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-21,-4,-2,-22,24,-13,-23,-9,-19,-14,1,-13,-8,-12,2,-9,-17,-21,-21,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=2,-6,-18,-7,-2,-15,-10,-8,-12,-8,-11,-9,-2,5,-5,-7,5,4,-11,-25,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=11,-6,-14,-9,-3,-15,1,-10,-8,-4,-9,-5,-5,-8,-2,-8,0,-5,-5,-14,-11,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=0,5,-18,9,5,-21,-11,-7,-14,-2,-14,-11,-1,-4,1,-5,1,-4,-8,-24,-14,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-19,-2,1,-21,-5,-8,-16,-5,-19,-12,-1,9,4,-8,10,2,-15,-26,-16,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-20,-7,-2,-18,-7,-8,-16,11,-15,0,-2,-11,4,8,0,1,-11,-21,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='C'; M=1,-8,18,-13,-16,-24,10,-19,-27,-18,-24,-18,-2,-12,-17,-20,0,-9,-19,-32,-27,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-30,-12,-4,-23,-13,-15,-16,2,-22,-12,-9,21,-5,3,-4,-7,-16,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-13,-13,-10,-10,-15,-12,-4,-10,-6,8,-3,-13,-4,-10,13,25,0,-30,-10,-7;
MA   /M: SY='T'; M=9,-14,-10,-20,-18,-8,-21,-24,6,-14,-2,-2,-14,-18,-18,-16,6,21,20,-28,-12,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,3,-23,-20,67,-30,8,-23,-3,7,-17,10,9,-10,-17,-27,-27,11,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='T'; M=11,-9,-16,-16,-9,-15,-16,-16,-2,-11,-6,-3,-7,-13,-1,-13,7,13,1,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-13,-17,-11,-15,-13,-17,1,-11,-7,-1,-11,-17,-6,-14,8,5,10,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-11,-10,-7,-19,-7,-2,-25,1,-19,-12,-1,-19,-2,16,3,1,-15,-28,-13,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-6,-14,-8,-3,-20,-15,-13,-17,9,-21,-11,0,-14,-1,8,8,5,-9,-29,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-12,-19,-11,-21,7,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='A'; M=22,-12,-16,-17,-12,-19,-1,-12,-10,-10,-12,-8,-9,-10,-11,-16,4,-2,-1,-24,-16,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,13,-26,10,-7,-28,32,-8,-32,-9,-29,-21,19,-18,-10,-11,4,-11,-28,-29,-24,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-28,2,-31,-27,31,-23,19,15,-28,-28,-26,-21,-15,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-2,-23,-3,6,-26,-8,-8,-21,6,-20,-11,-1,-8,9,4,2,-3,-16,-24,-16,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-24,-2,4,-20,-14,-2,-18,7,-12,-8,-3,-14,1,4,-4,-4,-13,-25,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=0,-28,-16,-29,-22,3,-27,-23,20,-24,30,13,-28,-28,-22,-20,-19,-6,22,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-18,-21,-21,-9,33,-25,-7,-9,-13,-4,-7,-14,-23,-17,-12,-12,-8,-10,6,26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-29,-9,1,-22,-23,-9,-18,29,-19,-5,-4,-15,7,33,-11,-9,-11,-21,-9,2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-27,-19,-9,-11,-26,-15,1,4,3,6,-15,-20,-2,2,-17,-10,-1,-12,-4,-6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-18,-1,2,-20,-8,-11,-14,-5,-14,-11,2,-13,-2,-9,6,3,-9,-29,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=2,10,-24,10,12,-28,12,-7,-28,-4,-24,-19,10,-11,-1,-10,5,-8,-24,-29,-23,5;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-23,28,15,-29,-6,-1,-28,0,-27,-21,21,-11,5,-5,10,0,-25,-36,-19,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-27,-5,-1,-26,12,-12,-23,-7,-19,-12,-3,-8,0,-8,-2,-8,-21,-23,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-10,-27,-11,-9,-11,-14,-16,-17,-7,-14,-10,-10,-14,-8,-3,-5,5,-15,11,-4,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-32,-16,-5,-12,-20,-15,-17,-8,-16,-13,-16,-2,-3,-10,-10,-2,-20,25,-1,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-28,4,19,-24,-17,-2,-20,3,-16,-11,-1,-4,13,-2,-2,-7,-22,-21,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-26,-23,-12,-2,-29,-19,14,-21,17,8,-21,-8,-12,-19,-19,-9,6,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-11,-22,-18,-14,10,-10,-12,-8,-11,-6,-5,-5,-21,-13,-9,-7,-6,-7,-13,1,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00617;
//
ID   TRANSTHYRETIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00769;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transthyretin signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9110761; R2=0.0139469; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=563; N_SCORE=12.753; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,24,-30,7,6,-16,16,6,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-4,14,54,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,18,-31,30,9,-32,-15,1,-30,-5,-27,-22,5,20,-3,-12,-2,-4,-27,-35,-18,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-20,-15,10,-28,-1,8,-13,3,3,-19,-25,-10,-13,-14,-7,5,0,34,-15;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-14,-30,-25,-5,-25,-28,25,-20,7,7,-23,-23,-23,-22,-7,-2,34,-26,-10,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-26,16,11,-26,-16,-11,-21,-5,-22,-18,-1,14,-3,-12,3,2,-16,-34,-20,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-17,-33,-28,1,-32,-26,33,-23,18,18,-27,-27,-24,-22,-16,-5,37,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-15,-19,-14,-10,-13,-22,-15,-2,2,-6,-3,-13,-22,-9,14,-7,-5,12,-26,-12,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30,74,-30,-21,2,-29,10,1,-21,-30,-39,-20,-19,-9,4,7,27,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-21,-7,-5,-22,3,-5,-22,-5,-19,-11,3,-14,2,-2,8,10,-17,-26,-14,-2;
MA   /M: SY='I'; M=11,-23,-18,-30,-22,-5,-23,-24,22,-21,12,10,-20,-20,-18,-23,-10,-5,21,-22,-8,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=8,10,-16,1,-1,-19,1,-6,-17,-4,-20,-15,18,-13,-3,-5,11,4,-15,-28,-18,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-27,48,20,-34,-10,1,-34,4,-29,-25,23,-10,3,-5,3,-7,-29,-38,-19,12;
MA   /M: SY='A'; M=16,-8,-16,-11,-3,-18,-10,-16,-12,-4,-13,-10,-6,-5,-6,-9,9,7,-5,-27,-17,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,11,-25,13,-2,-29,23,-8,-31,-8,-27,-19,12,-15,-3,-11,5,-8,-25,-28,-22,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-27,0,12,-27,-7,-4,-26,9,-20,-12,-1,-13,13,18,-3,-10,-21,-23,-16,11;
MA   /M: SY='H'; M=-19,2,-29,1,0,-20,-19,95,-29,-9,-21,-1,13,-20,9,0,-9,-19,-30,-31,18,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-30,-23,-21,33,-29,14,-1,-12,0,-1,-21,-30,-13,-11,-21,-11,-10,34,73,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-24,-3,-3,-17,-20,62,-24,-10,-17,-3,7,-17,4,-3,-1,2,-21,-30,11,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-32,-28,-1,-33,-29,34,-23,12,12,-24,-25,-25,-23,-11,0,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='P'; M=9,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,58,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='L'; M=5,-25,-17,-28,-19,2,-23,-21,14,-25,33,12,-25,-25,-19,-20,-19,-7,11,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-26,-16,3,-29,-18,15,-24,38,16,-26,-27,-12,-17,-24,-7,8,-21,-2,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-22,7,-30,-21,24,-27,39,21,-28,-28,-20,-20,-25,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-6,-4,-18,-3,-14,-16,-10,-22,-16,4,-10,-4,-12,30,20,-6,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-9,1,-31,-20,-18,-20,-9,-29,-19,-19,84,-6,-18,-9,-10,-30,-29,-29,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-31,-28,-24,36,-23,-1,-6,-17,-3,-4,-22,-29,-20,-15,-22,-14,-12,42,53,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,30,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,23,3,-18,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-11,-1,1,-21,-3,-9,-19,-9,-28,-18,9,-10,3,-9,36,20,-11,-38,-19,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-10,-11,-11,-9,-21,-21,-7,-11,-9,-9,-2,-11,-11,-11,18,47,3,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-24,-17,-17,17,-27,7,-3,-10,-3,-3,-14,-24,-10,-10,-7,9,-7,11,52,-17;
MA   /M: SY='R'; M=2,-10,-24,-13,-3,-20,-14,-6,-24,17,-17,-10,-3,-17,4,42,-4,-7,-14,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-16,-25,-17,-23,-21,38,-23,-16,-21,-16,-10,-9,-22,-22,-21,-4,-15,-7,-22,-23,-23;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,-10,-9,-9,-14,-9,-16,-4,-13,-17,-11,-3,-16,-9,-13,24,14,9,-37,-17,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,43,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-32,-15,-8,-22,-23,-23,-7,-13,-19,-12,-23,58,-15,-20,-10,-7,-9,-30,-25,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-3,6,-26,-20,-10,-23,27,-23,-9,0,-10,12,16,0,7,-16,-23,-10,9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,20,-29,27,45,-30,-16,1,-30,7,-23,-21,12,-4,14,-1,1,-9,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00617;
//
ID   AA_TRANSFER_CLASS_4_MP; MATRIX.
AC   MP00770;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aminotransferases class-IV signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1125603; R2=0.0144760; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=509; N_SCORE=12.471; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-12,-24,-15,-9,-2,-18,-1,-11,6,-11,-6,-12,-18,-5,-3,-8,-7,-9,1,25,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-27,3,-5,-28,36,-11,-33,-11,-29,-20,13,-12,-10,-13,4,-12,-29,-27,-26,-8;
MA   /M: SY='C'; M=1,-19,14,-25,-21,4,-19,-13,-13,-17,-9,-9,-17,-27,-19,-17,-10,-9,-7,-3,10,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-5,13,-24,20,7,-21,-12,-3,-22,-5,-19,-16,3,-13,2,-10,3,-5,-17,-26,-8,4;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,31,35,-36,-17,3,-30,7,-23,-17,7,-6,25,0,0,-10,-30,-30,-17,30;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-6,-22,-19,-13,-7,-23,1,-16,-5,-4,-14,-20,-19,-20,0,-3,14,-26,-17,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-19,-34,-26,5,-34,-25,32,-29,30,18,-25,-26,-21,-24,-23,-9,22,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-26,-24,-28,-21,12,-25,-14,-2,-19,5,0,-25,-27,-13,-16,-23,-12,-8,34,21,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-27,-18,6,-29,-6,15,-27,40,19,-25,-28,-16,-18,-27,-11,6,-21,2,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-23,33,6,-16,-9,2,-23,-3,-19,-18,12,-13,-4,-8,-2,-6,-20,-21,-1,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-24,2,8,-16,-19,-4,-16,3,-14,-11,-1,-13,1,7,0,1,-12,-24,-6,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-9,8,-23,8,8,-24,0,8,-25,5,-21,-11,10,-12,8,5,-1,-9,-23,-23,-11,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-8,5,-27,3,-1,-26,16,-3,-32,2,-26,-16,9,-16,-4,2,0,-8,-25,-26,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-9,-27,-12,-8,0,-22,3,-9,-1,-10,-5,-6,-21,-2,-3,-11,-6,-12,3,20,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-12,-5,9,-17,-19,-15,-12,-7,-12,-11,-4,-10,-3,-11,9,16,-7,-30,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-3,-22,-24,-13,4,-24,-4,-20,-6,-3,-16,-25,-23,-20,-5,-4,9,-28,-18,-23;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-13,-10,-13,-21,19,-18,-23,-15,-22,-16,1,-15,-12,-16,15,9,-13,-29,-21,-13;
MA   /M: SY='S'; M=11,-6,-15,-11,-11,-16,7,-17,-16,-13,-17,-11,-1,-13,-10,-15,16,13,-8,-27,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=8,-8,-5,-13,-6,-15,-12,-10,-7,-10,-7,8,-8,-15,-4,-13,4,1,-3,-28,-14,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-18,-34,-27,7,-33,-27,31,-26,20,13,-24,-25,-24,-24,-17,-7,27,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-25,-25,-29,-23,12,-13,-23,2,-22,3,0,-21,-24,-23,-20,-16,-11,2,9,3,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-13,-30,-26,2,-31,-23,23,-18,8,8,-23,-27,-22,-15,-13,-5,29,-21,0,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-30,-12,-2,-13,-22,-14,-19,20,-18,-8,-9,-16,-1,13,-12,-7,-15,4,0,-2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-26,32,13,-30,0,-3,-30,0,-26,-21,17,-12,1,-6,2,-8,-25,-33,-20,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-26,2,-2,-25,21,-9,-28,-3,-23,-15,11,-17,-6,-4,-1,-11,-25,-26,-21,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-8,-17,-9,5,-18,-22,-15,-7,4,-11,-6,-9,-14,-2,-2,-3,1,0,-26,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-25,9,-32,-24,29,-27,27,17,-25,-26,-22,-23,-21,-8,22,-19,0,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-22,-21,-25,-22,13,-27,-11,12,-16,3,3,-18,-24,-18,-15,-10,-4,12,-6,21,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-36,-9,-1,-28,-19,1,-21,-10,-27,-16,-14,64,-7,-17,-9,-11,-28,-29,-21,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-24,-7,2,-25,-10,-9,-22,-6,-24,-16,-9,35,-5,-11,-2,-7,-23,-28,-22,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-22,-17,-25,-18,3,-25,-20,16,-22,24,10,-20,-21,-18,-18,-15,-2,13,-20,-4,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-5,19,-14,16,3,-23,-9,-2,-23,-3,-24,-19,20,-15,-2,-4,10,4,-19,-35,-16,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-26,0,-4,-25,19,-6,-27,-9,-23,-15,8,-11,-4,-9,3,-7,-24,-27,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-17,-12,-10,-9,-10,-10,-7,-12,-9,-5,-3,-17,-8,-10,9,8,-3,-24,-5,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-26,-34,-27,0,-24,-27,32,-28,13,13,-18,-21,-20,-27,-17,-11,18,-19,-3,-27; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,5,-29,6,9,-27,-11,-7,-23,0,-26,-19,8,25,-1,-6,-1,-6,-26,-31,-23,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-11,-13,-12,-9,-20,-19,-5,-11,-6,-2,-4,-12,-10,-11,14,40,4,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,9,-28,12,10,-27,-17,-1,-23,15,-21,-9,5,-13,14,14,-5,-9,-21,-25,-10,11;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-12,-8,-6,-12,-10,-13,-12,-7,-19,-12,2,-15,-5,-9,19,11,-3,-31,-14,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-17,-35,-27,1,-34,-27,35,-27,22,16,-24,-25,-22,-25,-19,-7,29,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-31,-21,2,-32,-21,25,-22,29,19,-23,-24,-16,-19,-23,-9,14,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,8,21,-25,-16,-4,-24,8,-20,-14,0,-9,9,2,-1,-4,-20,-20,-13,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-16,-31,-23,5,-32,-21,24,-27,32,16,-24,-27,-20,-22,-24,-9,15,-20,1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=34,-14,-6,-22,-14,-16,-6,-21,-5,-15,-3,-6,-13,-15,-13,-21,3,-3,1,-22,-17,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-27,-2,12,-25,-18,-1,-23,20,-20,-9,1,-12,13,21,-4,-8,-19,-23,-11,11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-26,26,25,-30,-14,-1,-29,5,-24,-19,9,-8,11,-1,5,-1,-25,-33,-17,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-28,-16,-4,-7,-23,-11,-2,-11,4,-1,-14,-20,-2,-9,-15,-11,-9,3,0,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-24,-5,-10,-25,39,-14,-31,-14,-22,-16,4,-19,-12,-14,-1,-14,-25,-24,-24,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-25,-22,-12,9,-30,-11,14,-18,14,9,-19,-22,-13,-17,-18,-9,6,-10,15,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-29,-4,12,-17,-19,-9,-20,2,-21,-13,-7,19,4,-5,-3,-6,-22,-24,-14,7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-18,-24,-18,3,-27,-20,11,-11,6,5,-20,-24,-18,-9,-11,-3,20,-21,-2,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00618;
//
ID   BARWIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00771;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Barwin domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2871084; R2=0.0116886; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1687; N_SCORE=23.996; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=190; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=17,-16,-27,-14,-4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16,46,-10,-20,-1,-6,-17,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-30,-6,0,-20,-20,44,-30,12,-20,-6,4,-20,10,39,-10,-14,-24,-24,3,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,17,-37,-20,8,-22,13,-20,-2,0,-12,52,19,-2,-10,-28,-20,-10,34;
MA   /M: SY='A'; M=17,14,-17,16,3,-27,-4,-11,-23,-6,-21,-19,5,-10,-5,-15,12,0,-13,-31,-20,-1;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-26,-6,5,-25,-16,1,-26,17,-22,-9,2,-16,21,40,2,-5,-21,-24,-12,11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-14,-8,-6,-14,-20,-18,-14,2,-14,-10,0,-10,-6,-2,14,38,-4,-28,-10,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-18,-10,-7,-15,-20,-20,-13,-10,-15,-13,-5,16,-10,-13,12,34,-8,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-25,-13,-10,-24,20,-13,-29,0,-21,-14,-3,-17,-7,11,-1,-11,-19,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-4,-16,-28,57,-14,-36,-16,-30,-20,12,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,10,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-2,-26,-4,12,-34,-16,1,-20,13,-20,-4,-2,-10,38,8,0,-8,-22,-20,-12,25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-15,-22,-19,-5,-27,-25,13,-17,2,2,-11,-16,-16,-17,4,25,17,-27,-7,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=13,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,19,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,37,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00619;
//
ID   BARWIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00772;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Barwin domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1245546; R2=0.0122738; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=745; N_SCORE=13.259; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,7,-23,17,-20,-3,0,-13,43,30,-3,-10,-27,-20,-10,27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,53,13,-33,-7,3,-33,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-16,-18,-22,-21,19,-24,-16,9,-22,15,5,-9,-28,-23,-16,-15,-6,8,-19,1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,5,-26,-3,-12,9,-17,16,-8,-6,-13,-8,14,-26,-6,-6,-7,-6,-18,0,38,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,0,16,-36,-20,28,-22,6,-20,0,2,-12,50,8,-2,-12,-30,-22,-4,32;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,7,-23,17,-20,-3,0,-13,43,30,-3,-10,-27,-20,-10,27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-17,13,-27,7,0,-20,-13,70,-27,-7,-23,-7,27,-20,7,0,-3,-13,-30,-33,7,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-7,-27,-20,-20,-7,-27,-17,27,-20,3,7,7,-20,-13,-20,-10,-7,10,-27,-7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,32,5,-25,-2,8,-25,0,-30,-22,50,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,7,33,-37,-20,7,-23,10,-20,-7,0,-7,47,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,42,9,-29,-4,6,-29,0,-30,-24,42,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,52,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-24,20,22,-24,-7,6,-24,4,-26,-20,38,-13,7,0,6,-4,-30,-36,-20,15;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,36,-30,34,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,37,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,19,-1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-14,-20,-14,-4,-21,-25,-9,4,-4,-6,5,-14,-20,17,-4,-5,-5,8,-25,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-25,-26,-20,-14,-16,-25,-25,4,-15,-11,-6,-25,33,-20,-20,-10,-5,8,-30,-20,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=0,0,-20,0,5,-25,-10,-10,-25,19,-30,-15,5,-10,5,9,16,6,-15,-30,-15,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00619;
//
ID   CHITINASE_19_1_MP; MATRIX.
AC   MP00773;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitinases family 19 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0837364; R2=0.0117777; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1338; N_SCORE=19.832; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=206; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,1,-21,-1,5,-19,-13,-5,-22,3,-20,-14,5,-8,1,9,10,13,-16,-30,-14,2;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-20,10,10,-28,-8,-6,-23,-3,-25,-17,4,-2,10,-8,16,3,-18,-32,-19,9;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-20,-12,-4,-11,-19,-10,-1,-9,9,10,-13,-17,-2,-9,-10,-3,-3,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,20,-28,26,6,-10,-15,-6,-24,-8,-16,-19,8,-17,-8,-11,-7,-10,-22,-15,-7,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,18,-27,15,14,-32,-13,6,-24,7,-24,-12,19,-13,28,7,2,-7,-28,-29,-15,21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-17,-23,-24,-20,-9,8,-7,1,-14,5,33,-14,-21,-7,-14,-14,-13,-2,-20,-10,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24,12,-33,-23,28,-30,38,19,-26,-27,-21,-23,-26,-10,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-11,-25,-14,-6,-16,-21,-16,-4,7,-6,-1,-8,-10,-4,0,-9,-6,-4,-23,-10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-15,12,-25,7,-1,-13,-13,47,-24,-8,-22,-9,22,-20,2,-3,-1,-9,-26,-29,7,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,6,-26,-20,3,-27,24,-20,-7,0,-17,26,51,-7,-10,-23,-20,-10,12;
MA   /M: SY='N'; M=9,22,-18,6,-2,-21,-1,-1,-18,0,-24,-16,34,-16,-2,-4,9,-1,-20,-32,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,33,-28,44,11,-35,4,-4,-36,-4,-28,-26,17,-12,-3,-11,2,-10,-28,-35,-22,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=7,4,-20,2,-6,-25,21,-10,-25,-10,-24,-17,9,-12,-7,-13,8,-5,-20,-26,-22,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=13,-4,-18,-9,-8,-21,14,-12,-22,-5,-19,-13,2,-14,-6,-3,7,-4,-14,-22,-19,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=4,-12,-30,-9,5,-27,-15,-13,-18,-5,-22,-13,-13,39,5,-13,-3,-8,-22,-25,-22,2;
MA   /M: SY='G'; M=20,-9,-21,-13,-15,-25,38,-19,-27,-15,-22,-16,-3,-15,-15,-19,7,-9,-17,-21,-25,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-27,-2,6,-27,-18,-4,-25,35,-26,-9,2,-12,10,24,-6,-8,-17,-22,-10,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-25,1,-10,-26,36,-9,-31,-11,-30,-20,20,-15,-11,-11,7,-9,-28,-29,-25,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-30,-17,-14,14,-27,14,-9,2,-6,-3,-14,-27,-4,15,-17,-10,-13,14,52,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,38,-26,47,13,-33,-8,7,-33,-2,-29,-25,24,-12,1,-8,7,-5,-27,-39,-17,6;
MA   /M: SY='A'; M=39,-4,-11,-13,-8,-20,0,-16,-12,-9,-15,-12,-1,-11,-8,-17,15,3,-4,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-18,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-27,8,-35,-26,35,-28,27,17,-25,-25,-23,-25,-22,-8,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='A'; M=17,0,-13,-7,-3,-18,-7,-13,-10,-8,-16,-12,4,-13,-6,-12,14,7,-3,-30,-18,-5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-14,-11,-22,-14,-15,-7,-21,-2,-13,-3,-5,-14,-14,-14,-19,5,2,8,-22,-17,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-23,9,9,-23,-6,0,-25,12,-27,-17,25,-14,5,12,6,-2,-24,-32,-17,6;
MA   /M: SY='S'; M=20,-5,-12,-9,-3,-14,-5,-15,-15,-10,-18,-14,0,-11,-6,-14,22,13,-6,-29,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,64,-30,-7,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,46,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-37,-9,-1,-28,-19,-18,-20,-8,-28,-19,-15,75,-9,-15,-7,-5,-28,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='G'; M=1,7,-26,6,-9,-29,38,-12,-33,-13,-28,-20,10,-17,-12,-15,4,-12,-26,-26,-26,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,48,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-15,-5,-7,-14,-14,-3,-13,-5,-14,-8,12,-14,-5,-2,11,24,-9,-30,-10,-6;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-15,-11,-10,-14,-12,-19,-9,-6,-13,-9,-2,-13,-9,-9,13,24,0,-29,-13,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-15,-11,-19,-26,55,-19,-35,-19,-26,-18,-2,-20,-19,-19,-1,-17,-25,-20,-27,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-21,37,9,-27,-5,-5,-28,-4,-23,-21,12,-9,-2,-9,8,3,-19,-32,-16,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-20,19,9,-22,-15,-9,-16,-4,-14,-14,3,-10,-2,-10,3,5,-10,-29,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=3,11,-17,12,3,-19,-11,-10,-15,-6,-12,-13,3,-11,-5,-11,4,5,-8,-28,-15,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=6,2,-15,-1,-3,-16,-15,-15,-11,-7,-10,-8,-3,-12,-8,-11,8,17,-1,-29,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-21,-8,-2,-21,-13,-5,-27,18,-21,-12,2,-18,4,41,-2,-2,-18,-24,-13,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,22,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,5,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00620;
//
ID   CHITINASE_19_2_MP; MATRIX.
AC   MP00774;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitinases family 19 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4031439; R2=0.0117143; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=819; N_SCORE=13.987; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-19,-26,-17,17,-26,-16,6,-18,9,5,-19,-25,-11,-13,-13,-7,8,-14,4,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-16,43,-27,49,12,-33,-7,2,-32,-1,-30,-26,31,-8,-1,-7,3,-7,-30,-39,-21,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-23,-24,-20,-2,1,-20,1,-27,25,8,-21,-27,-20,-20,-21,-13,-2,-20,-9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-1,18,-23,9,-3,-25,15,-3,-26,-4,-26,-18,27,-17,-3,-5,5,-7,-26,-30,-22,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-6,27,-24,25,15,-29,-8,2,-26,3,-25,-19,26,-12,9,-2,4,-5,-27,-34,-19,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-29,48,33,-35,-13,1,-35,4,-26,-26,16,-7,7,-6,1,-9,-30,-36,-20,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-25,-16,1,-28,-19,12,-16,27,12,-20,-24,-14,-8,-20,-4,6,-21,-3,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,12,11,-30,-30,-29,-20,-11,-1,48,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-13,-11,-5,-22,7,-16,-17,-10,-18,-14,-3,-11,-7,-16,17,3,-8,-26,-21,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-16,-3,-3,-17,-13,-9,-17,-2,-19,-13,11,-13,2,3,18,24,-11,-32,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-27,-15,-6,-24,-14,-21,-12,-11,-20,-14,-17,43,-12,-20,-2,-5,-12,-27,-25,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-13,-25,-23,-3,-28,-27,20,-18,5,5,-18,-21,-21,-18,-1,15,30,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='S'; M=19,-3,-11,-5,-3,-20,3,-13,-18,-10,-25,-18,5,-10,-3,-13,31,14,-8,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-30,3,13,-29,-20,-7,-30,41,-27,-12,1,-11,11,32,-9,-10,-21,-22,-11,11;
MA   /M: SY='T'; M=8,-1,-10,-10,-9,-13,-15,-19,-11,-10,-13,-11,0,-10,-9,-11,22,39,-1,-30,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-12,-16,-10,-21,8,-19,-15,-11,-15,-12,-6,-11,-10,-19,13,0,-5,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24,16,-32,-22,25,-29,36,18,-26,-27,-22,-22,-26,-10,14,-16,4,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-21,-31,-21,0,-22,-4,24,-12,20,55,-20,-20,-2,-12,-20,-10,12,-20,0,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-7,10,-18,0,-2,-18,-14,-5,-17,3,-19,-12,17,-14,4,7,10,19,-15,-30,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=6,-6,-25,-7,-1,-24,-11,-3,-20,-2,-24,-14,-2,21,-4,-9,2,-4,-19,-28,-18,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-13,-22,-13,-3,-21,-24,1,0,-5,-7,4,-12,-19,17,-4,-5,-7,4,-25,-7,7;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-22,-1,2,-25,-8,3,-24,1,-25,-14,4,-6,8,9,11,0,-19,-30,-14,3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-34,-9,-5,-20,-12,-13,-18,-10,-25,-17,-10,48,-10,-16,-6,-5,-25,-23,-14,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-7,-14,-15,-3,-6,-15,9,-10,2,2,-13,-15,-15,-10,-4,-2,18,-15,-7,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-13,-26,-17,-7,-15,-24,-16,0,12,-4,6,-11,-15,-3,3,-14,-9,-1,-20,-7,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-28,-7,0,-21,-14,-14,-14,-7,-21,-14,-14,63,-7,-14,-7,-7,-21,-21,-21,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,12,-16,6,0,-21,-2,-4,-20,-7,-30,-20,24,-5,-1,-7,26,11,-18,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-9,41,-14,-5,-28,-22,-11,-25,-11,-21,-12,-8,-24,12,-11,0,-6,-18,-36,-20,3;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-4,-30,-4,-8,-24,18,49,-34,-14,-24,-8,6,-20,-3,-8,-6,-20,-30,-26,-1,-8;
MA   /M: SY='F'; M=0,1,-20,-4,-4,10,-14,-10,-14,-12,-10,-12,3,-17,-14,-13,-3,-6,-12,-17,-3,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-17,-23,-27,-10,4,-27,6,-20,-4,0,-20,-27,-27,-20,-7,-7,22,-27,-17,-27;
MA   /M: SY='I'; M=13,-22,-22,-32,-22,-8,-25,-26,27,-22,8,8,-16,-16,-16,-26,-8,-6,18,-20,-8,-22;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-13,-15,-13,-10,-21,-21,-2,-13,-6,-6,-4,-11,-11,-14,14,37,4,-28,-10,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00620;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F3_MP; MATRIX.
AC   MP00775;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 3 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3270121; R2=0.0181044; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=250; N_SCORE=10.843; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=10; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-9,-24,-22,-3,-28,-22,16,-19,10,6,-21,-26,-21,-16,-11,-4,23,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='B'; M=-9,32,-24,31,7,-26,-8,1,-22,-2,-23,-17,29,-15,-1,-7,3,-5,-23,-36,-18,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-27,-9,-9,-23,10,-15,-17,-13,-19,-12,-1,3,-7,-15,0,-8,-18,-26,-21,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-22,-2,6,-19,-20,0,-13,-1,-9,-5,-2,-15,9,2,0,1,-11,-27,-9,6;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-36,-12,-6,-16,-17,-2,-19,-10,-23,-15,-16,42,-8,-13,-12,-12,-26,-9,-3,-11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,0,-18,-12,-20,1,-20,-15,-13,-14,-12,-8,-14,-12,-19,10,3,-4,-25,-21,-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,-8,1,-11,-14,-20,13,-19,-23,-16,-23,-16,-2,-18,-14,-17,14,6,-11,-32,-22,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-13,-24,-14,-4,5,-4,-10,-13,-13,-7,-4,-9,-19,-6,-11,-7,-10,-12,-13,-1,-4;
MA   /M: SY='S'; M=6,12,-14,7,0,-21,-1,-5,-20,-7,-29,-20,22,-13,-1,-8,28,12,-15,-39,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-23,-3,6,-15,-14,-3,-22,6,-21,-13,0,-8,3,8,7,0,-17,-24,-8,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-11,-30,-9,-7,4,-24,3,-13,1,-11,-7,-11,-22,-3,4,-15,-12,-15,11,27,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-32,-32,-34,-25,8,-26,-24,5,-24,14,5,-32,-28,-19,-20,-30,-16,-4,49,11,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-28,-20,6,-28,-17,21,-25,37,22,-23,-27,-17,-19,-25,-9,12,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-6,7,-21,0,4,-21,-16,-7,-16,7,-19,-10,10,-12,7,2,7,13,-14,-29,-13,5;
MA   /M: SY='D'; M=-12,10,-28,15,13,-28,-11,5,-25,4,-20,-9,3,-12,14,1,-3,-9,-23,-26,-10,13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,27,17,-26,-26,-23,-24,-21,-7,28,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-28,14,14,-31,2,4,-31,3,-25,-16,7,-12,10,-2,0,-11,-28,-28,-16,11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-30,14,38,-32,-19,2,-28,14,-21,-14,1,-6,26,12,-2,-10,-28,-27,-16,32;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-31,-29,-33,-23,9,-27,-19,10,-24,24,12,-31,-29,-18,-19,-31,-15,0,27,11,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-28,-9,-16,-29,53,-14,-35,-14,-27,-15,0,-19,-13,-15,-2,-18,-27,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-23,-36,-28,67,-29,-11,-2,-27,6,-1,-20,-30,-34,-18,-21,-11,-4,17,34,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-26,27,17,-33,-13,2,-30,10,-26,-17,15,-12,16,6,-1,-9,-28,-31,-16,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-10,-32,-28,18,-30,-25,20,-23,11,9,-24,-28,-28,-21,-13,-2,27,-19,1,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-30,-26,-1,-32,-28,30,-22,12,11,-22,-23,-23,-22,-10,4,33,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-17,-34,-27,33,-28,-19,15,-22,14,17,-24,-28,-27,-18,-17,-7,19,-11,9,-25;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-10,3,-34,9,-5,-16,-13,-9,-27,-10,-23,-22,-8,-18,-8,-15,-13,-16,-25,37,2,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-25,-27,-22,5,-9,-22,3,-26,18,5,-21,-26,-21,-20,-20,-10,-1,-3,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=13,0,-19,-5,-10,-22,15,-16,-20,-12,-20,-15,4,-14,-11,-16,9,2,-13,-26,-21,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-19,-23,-15,-2,-20,-2,12,-11,11,34,-15,-18,-1,-10,-12,-3,7,-20,-1,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=3,-1,-22,-4,6,-18,-11,3,-17,5,-14,-7,1,-12,5,-1,-2,-7,-16,-18,-4,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,2,-22,1,-3,-26,25,-13,-29,-11,-25,-19,5,-14,-8,-14,10,-4,-21,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='A'; M=12,-15,-12,-21,-16,-14,-5,-17,-3,-16,-3,-4,-10,-18,-13,-16,-1,-2,0,-24,-14,-16;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,-15,-15,-12,-10,-10,-14,-6,-9,-10,-7,-4,-17,-11,-10,3,0,0,-23,-10,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-4,0,-22,2,-6,-15,-4,-12,-14,-7,-15,-11,-2,-17,-10,-11,0,-5,-7,-25,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-18,-13,-9,-10,-10,-2,-8,-9,-8,2,-8,-17,-7,-9,0,-3,-2,-23,-6,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-17,-18,-20,-21,-10,25,-22,-16,-22,-10,-9,-10,-22,-21,-21,-6,-14,-11,-19,-17,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-15,5,-5,-20,-3,-11,-18,-10,-16,-14,9,-13,-9,-11,2,-2,-16,-32,-18,-8;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-20,-18,-12,-7,-16,-13,-2,-11,-8,-4,-9,-8,-9,-12,-1,-1,-1,-18,-4,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-11,-10,-4,-9,-11,-13,-1,-8,-2,-3,-10,-4,-8,-10,0,0,4,-18,-10,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-18,13,14,-22,-2,-2,-20,1,-15,-12,3,-6,8,-2,1,-6,-17,-19,-13,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,10,-23,13,4,-27,-13,-5,-29,11,-23,-17,6,-10,1,20,-3,-8,-21,-28,-17,1;
MA   /M: SY='V'; M=6,-17,-18,-22,-14,-5,-16,-18,6,-16,2,6,-15,-14,-14,-17,-4,-1,9,-23,-10,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00621;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F11_1_MP; MATRIX.
AC   MP00776;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 11 active site signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7228954; R2=0.0120757; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=13.386; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-2,-29,-3,-2,-23,-12,-10,-18,-8,-27,-18,4,39,-7,-14,1,-4,-24,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-20,0,-7,-21,10,-7,-20,-7,-25,-15,17,-18,-4,-4,12,0,-16,-32,-20,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-1,-13,-30,51,-16,-38,-15,-30,-21,3,-18,-15,-14,3,-15,-28,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-9,19,-20,6,-5,-8,-9,6,-15,-4,-21,-15,31,-20,-3,-4,8,7,-20,-24,2,-5;
MA   /M: SY='S'; M=11,0,-16,-3,-7,-23,19,-12,-24,-12,-27,-19,10,-14,-7,-13,23,5,-16,-32,-23,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,16,2,-12,5,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,25,72,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,8,-30,-21,24,-28,42,22,-28,-28,-20,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='C'; M=9,-9,20,-15,-15,-21,3,-20,-23,-17,-21,-17,-5,-20,-15,-19,12,5,-11,-34,-23,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,35,-25,20,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-11,-13,-12,-2,-19,-19,-7,-13,-9,-9,-3,-13,-13,-12,16,36,3,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-24,-7,0,-21,-19,-3,-19,13,-17,-7,2,-17,13,32,-1,0,-14,-24,-11,4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,30,-20,20,1,-18,-4,7,-21,-2,-28,-20,41,-18,-1,-3,11,1,-25,-34,-12,0;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-37,-10,0,-29,-18,-20,-20,-10,-29,-20,-18,81,-10,-20,-7,-8,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-28,-17,6,-29,-18,17,-27,44,18,-28,-28,-14,-18,-28,-10,7,-20,-1,-15;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-15,-31,-27,-2,-28,-27,29,-20,10,13,-25,-25,-24,-21,-10,-3,38,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-29,0,-30,-27,31,-21,14,16,-28,-28,-26,-20,-13,-3,42,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,38,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,29,-21,30,6,-28,1,-1,-28,-4,-30,-24,27,-14,-1,-8,15,1,-24,-39,-21,2;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-27,-39,-30,-25,20,-22,-14,-13,-17,-13,-13,-24,-29,-18,-16,-28,-20,-22,88,37,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-15,-26,-16,-20,-13,34,-10,-23,-21,-14,-10,-7,-23,-20,-18,-6,-16,-16,-19,-16,-20;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-18,19,7,-23,-12,-5,-21,-3,-20,-16,12,-10,3,-6,11,13,-16,-31,-14,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-23,-32,-23,-20,20,-23,3,-6,-12,-7,-6,-23,-27,-12,-12,-22,-14,-15,58,55,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,8,-26,6,4,-22,-15,-3,-22,12,-22,-14,13,-8,2,20,-3,-6,-18,-30,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,81,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-12,-2,-6,-26,10,-15,-27,-12,-25,-17,0,-6,-6,-14,8,3,-20,-30,-22,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=11,-3,-14,-6,-8,-19,19,-12,-20,-11,-20,-14,3,-11,-8,-12,14,2,-12,-23,-19,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-16,8,3,-20,4,-1,-18,-2,-18,-11,12,-10,7,-4,7,-2,-17,-21,-13,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-16,-14,-12,-12,11,-15,-13,-12,-9,-9,-8,-13,-11,-14,-1,-7,-9,0,-11,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-20,-5,-4,-22,5,-13,-22,-3,-20,-13,3,-13,0,-6,9,13,-16,-26,-17,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-5,-22,-8,-9,-3,-19,3,-5,-6,-10,0,-2,-18,-3,-7,-4,-4,-5,-16,10,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-26,-6,-1,-19,-22,-11,-15,22,-10,-2,-7,-17,0,18,-13,-9,-8,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-27,-6,-12,-27,40,-16,-34,-5,-28,-17,4,-17,-12,-9,1,-10,-25,-22,-24,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-16,-13,-10,-6,-12,-19,-8,-14,-9,-8,-3,-13,-12,-13,12,27,-2,-26,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-32,-30,8,-31,-29,29,-22,11,10,-28,-29,-30,-21,-12,-2,43,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-5,4,-16,-5,-7,-10,-18,-10,-13,-1,-15,-11,8,-14,-6,-3,10,28,-9,-24,-2,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00622;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F11_2_MP; MATRIX.
AC   MP00777;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 11 active site signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8075957; R2=0.0136907; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=411; N_SCORE=10.424; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-19,-3,16,-25,-9,-10,-20,2,-17,-14,-3,-7,6,-4,7,-3,-14,-25,-19,11;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-21,-2,7,-25,-7,0,-24,5,-24,-13,3,-12,10,8,12,0,-18,-28,-14,8;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-13,-23,-15,-7,-12,-19,9,-6,-4,4,8,-11,-19,0,-4,-13,-10,-7,-22,-2,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-24,-22,-32,-22,12,-23,-8,15,-17,23,40,-23,-24,-10,-14,-23,-11,7,-7,5,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-11,8,-28,6,-2,-25,2,0,-28,3,-27,-17,15,-4,-2,7,-1,-7,-26,-29,-18,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-12,-25,-19,1,-24,-12,15,-20,24,25,-15,-26,-12,-16,-20,-8,7,-25,-5,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-8,14,-23,13,6,-26,-13,-4,-24,11,-25,-15,14,-12,9,6,7,5,-20,-30,-14,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-15,-23,-20,-14,8,-22,25,-2,-16,6,20,-10,-23,-7,-10,-15,-11,-6,-19,11,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,6,-24,-2,-10,2,-15,16,-9,-6,-12,-6,13,-23,-5,-6,-6,-6,-17,-7,27,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-8,-30,-5,10,5,-26,11,-12,0,-9,-8,-12,-18,2,-4,-12,-10,-18,6,39,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-9,-23,-11,1,-24,-20,-5,-6,-2,-10,4,-9,-9,22,-3,-2,-2,-7,-23,-11,11;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-18,-26,-19,-9,-22,-24,17,-14,1,4,-16,-19,-16,-18,-4,-2,21,-24,-10,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-15,-31,-26,10,-29,-23,23,-23,24,17,-28,-29,-25,-19,-18,-5,29,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=26,1,-13,-10,-8,-17,-4,-13,-10,-9,-10,-10,6,-14,-8,-14,7,4,-6,-26,-17,-8;
MA   /M: SY='V'; M=1,-18,-14,-24,-22,-5,-26,-26,17,-18,3,3,-16,-20,-20,-18,0,16,25,-28,-9,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-35,-24,-22,20,-19,5,-8,-13,-7,-6,-23,-29,-13,-13,-23,-15,-16,54,59,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-26,-7,4,-20,-6,-1,-22,2,-19,-7,-1,-15,24,8,1,-8,-23,-19,-10,14;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-15,-3,-5,-23,18,-13,-25,-13,-30,-20,7,-13,-5,-13,30,10,-15,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='S'; M=15,2,-11,-2,-2,-20,-1,-10,-18,-9,-26,-18,10,-11,-2,-11,32,16,-10,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-16,-2,-1,-15,-8,-6,-16,-4,-23,-15,8,-14,-1,-3,21,11,-10,-30,-9,-2;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-11,-17,-9,-12,-3,-18,-11,-12,-13,-11,-6,-12,-10,-18,14,4,-2,-22,-16,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,22,-19,21,5,-25,-5,-1,-25,-2,-28,-21,25,-13,2,-3,18,6,-21,-38,-19,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-18,-32,-27,-2,-33,-28,34,-22,12,13,-25,-25,-22,-22,-13,-4,39,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-5,0,-16,-8,-9,-7,-18,-9,-10,-4,-12,-7,3,-14,-6,-6,10,27,-6,-22,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-17,-23,-20,-3,-26,-20,16,-12,3,4,-18,-23,-18,-14,-6,1,23,-23,-2,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-19,-9,-7,-7,-13,-8,-9,-10,-12,-6,4,-18,-2,-9,6,2,-9,-17,-7,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-4,12,-13,11,8,-24,-10,-6,-24,1,-26,-18,13,-12,4,-3,15,8,-18,-35,-18,6;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-23,-25,-20,-7,-21,-12,15,-18,6,17,-20,-8,-15,-18,-14,-8,14,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-17,-11,-11,-4,-10,-11,-14,-8,-13,-11,1,-16,-10,-5,8,18,-8,-20,-2,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-4,-27,-6,-8,-19,-19,-15,5,-14,-5,0,-5,-15,0,-16,-6,-3,-1,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-8,-13,-27,42,-18,-34,-6,-27,-17,0,-17,-13,-9,1,-9,-24,-21,-24,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=13,-4,-23,-9,-12,-26,34,-16,-28,-8,-24,-16,3,-16,-12,-13,3,-11,-20,-22,-24,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-18,2,-2,-21,2,17,-24,-10,-28,-15,15,-15,0,-7,20,4,-19,-36,-12,-2;
MA   /M: SY='P'; M=0,-10,-25,-5,-2,-25,0,-15,-22,-11,-30,-20,-4,32,-7,-15,14,2,-21,-33,-25,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-21,8,-4,-17,-6,-13,-15,-14,-5,-10,-1,-17,-9,-14,2,3,-11,-31,-14,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00622;
//
ID   HIS_ACID_PHOSPHAT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00778;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histidine acid phosphatases active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.8710289; R2=0.0227006; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-27; N_SCORE=7.225; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=6,-11,-21,-15,-11,-12,-10,0,-10,-8,-7,-4,-6,-18,-7,-2,-3,-5,-6,-20,-4,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-23,0,1,-17,-17,-11,-14,-6,-15,-12,1,0,-2,-8,5,7,-13,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-6,-23,-8,-9,-10,-12,-7,-7,-11,2,-3,-4,-15,-10,-9,-9,-7,-8,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-26,10,2,-17,-6,-8,-21,-1,-13,-10,4,-16,-3,-5,-6,-7,-17,-26,-12,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-8,-20,-11,-4,-10,-13,-10,-10,-3,-6,-2,-4,-17,-2,-3,1,-1,-7,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-3,-15,-6,-7,-12,-18,-9,-8,-6,1,-3,1,-22,-5,1,-8,-5,-8,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='S'; M=0,-6,-11,-7,-7,-20,-13,-16,-14,-6,-18,-11,-5,0,-9,-9,3,2,-7,-31,-18,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-9,-20,-12,-3,-17,-15,-10,-8,-3,-11,-5,-7,-15,5,-2,2,3,-4,-21,-8,0;
MA   /M: SY='S'; M=0,9,-19,9,2,-23,-3,-10,-22,-5,-21,-17,7,-12,-2,-7,12,8,-14,-32,-18,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-6,-26,-5,2,1,-23,-7,-11,-3,-7,-7,-7,-13,-7,-3,-10,-7,-11,-15,4,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-26,-11,-6,-19,-7,-18,-13,-11,-14,-11,-9,17,-10,-14,-2,0,-14,-27,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-7,-22,-8,2,-12,-19,-8,-7,-5,4,-1,-4,-18,2,-2,-7,-5,-10,-26,-10,2;
MA   /M: SY='D'; M=-4,9,-26,12,4,-25,-11,-9,-23,1,-21,-17,4,5,-4,-7,-1,-2,-20,-28,-15,-1;
MA   /M: M=0,-13,-23,-16,-9,-12,-15,-12,-5,-8,-1,-2,-10,-7,-4,-5,-7,-4,-7,-20,-8,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-28,-1,6,-27,-17,-10,-25,28,-28,-12,2,2,6,14,-2,-2,-20,-25,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-17,-32,-26,20,-29,-22,20,-25,24,16,-27,-29,-26,-19,-20,-6,23,-17,3,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-24,-26,-28,-22,21,-27,-8,5,-18,6,1,-22,-26,-18,-17,-18,-7,-1,21,34,-21;
MA   /M: SY='F'; M=2,-23,-17,-30,-22,21,-15,-19,4,-21,10,7,-19,-24,-23,-19,-12,-7,7,-11,2,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-4,-24,-2,-8,-4,-18,-3,-7,-12,-6,-8,-5,-13,-8,-13,-4,-4,-10,-14,12,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-19,-16,-24,-19,27,-13,-18,-5,-21,-6,-6,-11,-22,-24,-17,2,0,2,-14,3,-19;
MA   /M: SY='S'; M=13,-7,-17,-11,-11,-20,12,-18,-17,-14,-19,-14,-1,-13,-10,-16,16,8,-9,-28,-20,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=2,8,-14,0,-2,-19,-9,-8,-16,-6,-21,-14,15,-12,3,-6,21,22,-12,-33,-15,1;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-21,17,0,-18,-8,0,-19,-5,-20,-16,24,-16,-2,-6,7,7,-20,-31,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-27,2,-33,-24,35,-26,25,22,-25,-25,-20,-23,-20,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=9,-18,-18,-24,-17,-4,-20,-16,10,-17,7,5,-16,-19,-11,-18,-6,-1,8,-17,1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=13,-1,-19,-5,-3,-24,3,-11,-19,-8,-23,-15,5,0,-1,-12,13,1,-16,-29,-21,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-33,-26,17,-32,-23,23,-27,28,14,-27,-28,-25,-21,-22,-8,21,-16,5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-24,-21,-8,5,-21,-13,2,-14,16,9,-17,-22,-6,-11,-18,-11,-4,-16,-1,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-12,-17,-17,-14,-6,-3,-17,-9,-14,-10,-4,-8,-17,-11,-14,4,8,-2,-17,-10,-12;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-17,-10,-18,-3,-20,-10,-10,-11,-10,-7,-10,-10,-18,13,9,0,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-19,-29,-19,5,-25,-18,16,-25,38,19,-26,-26,-17,-19,-23,-9,9,-20,-3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-30,9,-4,-33,40,-12,-38,-10,-29,-20,4,-16,-7,-13,0,-16,-30,-25,-25,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-32,-24,18,-30,-22,19,-23,22,11,-23,-27,-24,-16,-20,-8,17,-16,3,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-25,-19,-15,15,-25,-5,0,-7,-2,-1,-11,-14,-13,-9,-14,-6,-5,-1,24,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-12,15,-27,15,1,-21,-12,0,-19,-5,-22,-17,15,2,-2,-9,-2,-5,-23,-20,-11,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-8,0,-24,2,-10,-15,6,-10,-15,-12,-15,-12,-2,-13,-12,-14,-3,-6,-11,-19,-6,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-19,-9,-5,-14,-15,-7,-5,-6,-5,-2,-2,-15,0,-6,-1,4,-4,-24,-9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,-3,1,-16,-18,-5,-12,-2,-8,-7,-1,-7,0,-2,-5,-1,-13,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-28,-5,-4,-22,-12,-7,-19,-8,-20,-14,-4,24,-7,-9,-2,0,-20,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-12,-26,-7,3,-16,-24,-13,-5,-9,3,-2,-15,2,-1,-11,-13,-9,-7,-26,-13,0;
MA   /M: SY='H'; M=-11,1,-26,4,0,-14,-18,10,-17,-6,-16,-10,0,-7,4,-7,-1,-2,-19,-18,8,0;
MA   /M: SY='A'; M=3,-4,-23,-6,-7,-11,-4,-9,-16,-8,-13,-9,-4,-9,-6,-11,-1,-5,-14,-18,-6,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,0,7,-16,-15,-11,-17,-7,-13,-13,-2,-13,0,-9,3,4,-16,-10,-10,4;
MA   /M: M=-8,-10,-1,-11,-7,-18,-20,-6,-18,-8,-19,-12,-8,0,-4,-5,-2,-2,-15,-28,-10,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00538;
//
ID   GLYCO_HORMONE_ALPHA_1_MP; MATRIX.
AC   MP00779;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycoprotein hormones alpha chain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9279106; R2=0.0104429; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1522; N_SCORE=19.822; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=247; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,9,-29,-20,-6,-29,42,-27,-9,0,-12,15,36,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-32,11,40,-30,-20,-6,-28,14,-24,-18,-4,14,13,2,-4,-10,-28,-28,-20,25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,4,-23,-2,1,-19,-17,-9,-18,19,-16,-8,8,-15,1,11,-3,3,-14,-26,-11,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-25,-24,-29,-23,13,-31,-13,17,-16,9,7,-20,-26,-18,-9,-17,-8,14,-7,19,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-16,-5,-2,-15,-6,-12,-19,-11,-27,-19,3,7,-5,-12,27,13,-13,-35,-18,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-12,9,-26,2,3,-23,-14,-1,-24,27,-25,-8,17,-16,6,26,-4,-7,-21,-26,-12,4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-16,-15,-9,-3,-16,-10,5,-12,12,10,-16,6,-8,-11,-14,-6,-2,-14,-6,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-23,8,-7,-26,35,-12,-31,-12,-25,-18,5,-14,-11,-14,4,-11,-23,-22,-22,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=12,-8,-16,-12,-8,-14,-12,-13,-4,-3,-6,-4,-7,-13,-6,0,-2,-4,1,-18,-11,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-31,-8,0,-23,-16,-14,-18,-3,-23,-15,-14,59,-6,-5,-8,-8,-23,-23,-22,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-24,-21,29,-28,13,4,-12,5,11,-20,-28,-11,-11,-20,-10,-5,19,61,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=6,-12,-15,-19,-13,-10,-15,-12,2,-7,-2,15,-10,-15,-6,-10,2,7,6,-25,-10,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-15,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-9,1,-21,-19,0,-29,27,-21,-10,1,-19,13,62,-7,-8,-20,-21,-11,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=4,-25,-16,-28,-20,1,-23,-20,16,-21,26,17,-25,-25,-18,-19,-17,-6,17,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-28,-6,5,-25,-20,-5,-19,33,-19,5,-4,-13,14,23,-11,-10,-15,-20,-8,9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,43,-28,-8,0,-10,19,26,-8,-10,-22,-20,-10,15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-17,-23,-16,3,-25,-19,10,-24,29,10,-20,-24,-16,-17,-13,5,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,2,-31,-20,-17,-20,-8,-29,-18,-18,80,-3,-17,-9,-10,-30,-29,-28,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00623;
//
ID   GLYCO_HORMONE_ALPHA_2_MP; MATRIX.
AC   MP00780;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycoprotein hormones alpha chain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5148826; R2=0.0117182; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=804; N_SCORE=13.926; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-16,-6,4,-20,-8,3,-18,-7,-17,-12,0,-10,-1,-11,13,6,-11,-28,-13,1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-20,-21,-25,-17,34,-24,-8,-3,-19,4,-1,-14,-25,-14,-13,-10,-6,-6,-1,23,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-13,-10,-10,-2,-17,-8,2,-9,-3,-2,0,-12,-8,-9,3,16,1,-13,4,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-30,-8,1,-17,-21,-1,-26,32,-21,-9,-3,-18,7,43,-11,-10,-19,-13,3,1;
MA   /M: SY='V'; M=9,-15,-16,-16,-5,-15,-20,-17,4,-9,-4,-1,-16,-18,-5,-13,-2,-3,14,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-11,-15,-14,-7,-21,-19,-1,-11,-4,1,-7,-14,-12,-11,11,36,8,-29,-9,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-14,-23,-15,-3,-29,-24,20,-17,11,7,-26,-26,-21,-17,-11,-3,32,-29,-10,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-17,-30,-23,0,-23,-9,23,-13,17,45,-23,-23,-9,-13,-17,-7,22,-23,-3,-16;
MA   /M: SY='G'; M=4,4,-26,3,-11,-28,40,-13,-33,-13,-27,-20,10,-17,-13,-16,3,-13,-26,-25,-26,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,30,-24,24,-1,-26,14,1,-29,-5,-30,-21,38,-19,-5,-7,5,-6,-30,-35,-22,-1;
MA   /M: SY='I'; M=1,-27,-21,-34,-27,3,-31,-28,32,-24,12,11,-21,-22,-22,-25,-13,-6,28,-20,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-27,3,-31,-27,30,-24,23,14,-29,-29,-26,-21,-17,-4,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-27,7,36,-24,-21,-4,-21,9,-16,-13,-4,-8,13,7,-3,-9,-17,-27,-17,24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-1,16,-26,20,22,-34,-13,-1,-26,3,-21,-15,4,-9,21,-4,2,-8,-24,-27,-17,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,-3,-13,-21,89,-26,-10,-17,0,6,-21,7,-1,-11,-19,-27,-22,28,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,15,2,-12,6,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,24,70,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-29,-18,-17,26,-28,33,-7,-13,-3,0,-13,-28,-10,-9,-18,-12,-13,13,59,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-15,-18,-20,-15,7,-18,-18,4,-20,-7,-4,-5,-17,-14,-18,10,5,4,-24,-4,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00623;
//
ID   PEPCASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00781;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoenolpyruvate carboxylase active site 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6465192; R2=0.0168719; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=399; N_SCORE=12.368; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-27,-7,-1,-17,-15,-15,-15,-6,-15,-12,-9,21,-6,-11,-3,-4,-16,-27,-17,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-28,16,20,-31,-10,1,-28,5,-23,-16,3,-6,13,-1,0,-8,-25,-28,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-24,12,23,-26,-16,5,-24,2,-19,-13,5,-8,12,-3,3,-1,-22,-30,-13,17;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-18,-31,-24,1,-28,-24,26,-24,24,15,-25,-25,-21,-22,-17,-6,25,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-10,-24,-12,-1,-6,-19,1,-12,1,-8,-3,-8,-17,4,1,-7,-8,-11,-14,4,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-26,11,16,-29,-15,-2,-27,15,-23,-14,8,-11,13,14,-1,-6,-23,-27,-15,14;
MA   /M: SY='L'; M=2,-17,-15,-23,-16,-1,-22,-14,3,-18,5,1,-15,-20,-11,-16,-7,2,3,-15,-3,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-18,-31,-24,16,-30,-23,20,-27,33,14,-28,-29,-25,-20,-22,-6,18,-19,1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-14,9,13,-27,-14,-6,-26,7,-24,-17,6,-8,6,2,4,-2,-21,-31,-18,9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,7,-24,2,3,-23,-6,9,-25,6,-24,-13,16,-15,6,11,4,-2,-22,-29,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=4,-19,-19,-22,-11,-7,-21,-14,7,-17,19,10,-19,-21,-2,-14,-13,-6,2,-21,-7,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-5,11,-20,11,2,-18,-13,-8,-15,-6,-11,-12,9,-16,-5,-9,3,3,-12,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,36,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-23,5,15,-22,-14,-8,-18,1,-14,-12,-3,-12,3,2,1,-4,-11,-29,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-25,-27,-22,-12,-8,-24,-21,4,-21,13,2,-24,18,-16,-20,-18,-9,-4,-24,-13,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-11,-29,-28,-1,-30,-29,27,-20,9,9,-27,-28,-28,-20,-8,4,44,-30,-10,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-33,-24,26,-31,-21,18,-30,36,15,-27,-29,-25,-21,-26,-10,11,-13,7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,50,-33,-20,3,-27,10,-20,-15,0,-3,30,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='V'; M=5,-20,-15,-26,-22,-6,-24,-25,19,-19,3,4,-16,-20,-19,-20,-1,7,25,-27,-10,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-9,-20,-12,-5,-18,-18,-9,-8,1,-10,-4,-4,-18,5,11,-1,0,-3,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-29,-7,3,-23,-19,5,-28,27,-21,-8,0,-17,14,51,-8,-10,-21,-21,-9,5;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-6,-6,-15,-10,-16,-14,-10,-19,-14,4,-10,-6,-10,29,35,-4,-34,-15,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-31,-24,4,-31,-23,28,-26,31,20,-26,-26,-20,-21,-21,-6,23,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-23,-27,-17,5,-29,-16,13,-16,22,13,-20,-25,-11,-4,-21,-9,7,-18,-1,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-15,13,-28,19,10,-24,-17,18,-25,1,-20,-12,6,-14,11,0,-3,-8,-22,-25,0,9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-27,-7,1,-20,-16,-5,-23,26,-19,-7,-3,-14,2,18,-9,-8,-16,-19,-6,1;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-27,-4,6,-16,-21,27,-15,-4,-9,0,-1,-17,17,-2,-7,-8,-20,-19,8,10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-5,-1,-20,-15,-6,-14,4,-12,-5,-2,-16,2,11,-4,-4,-9,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-27,-3,8,-21,-18,6,-23,12,-16,-9,-1,-15,6,26,-6,-10,-18,-24,-9,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-36,-28,42,-27,19,19,-23,-23,-22,-26,-18,-8,33,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,0,-19,-6,-4,-20,-12,-1,-15,0,-16,-9,4,-16,1,5,4,0,-9,-27,-13,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-1,1,-23,0,7,-22,-13,5,-23,7,-19,-12,3,-13,6,13,2,-3,-18,-25,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,10,-24,-14,-1,-25,-19,1,-24,17,5,-21,-27,-16,-19,-18,-9,-1,-27,-9,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-22,6,10,-25,-12,-8,-23,5,-22,-15,2,-8,4,6,8,0,-15,-29,-17,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00330;
//
ID   TFIIB_MP; MATRIX.
AC   MP00782;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transcription factor TFIIB repeat signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.4318290; R2=0.0201442; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=301; N_SCORE=12.485; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=4; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-23,-10,-3,-15,-22,-8,-3,2,-9,-3,-1,-17,-3,4,-5,-2,-2,-26,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-30,14,31,-24,-20,5,-27,14,-21,-15,1,-8,13,7,-4,-10,-25,-23,-6,21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-25,-35,-25,2,-34,-26,35,-29,28,18,-23,-23,-19,-26,-21,-9,21,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='I'; M=5,-22,-21,-28,-20,5,-24,-14,14,-20,13,6,-19,-22,-16,-20,-13,-7,9,-9,12,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-28,6,13,-29,-17,1,-27,25,-25,-11,3,-11,14,17,-3,-8,-21,-25,-11,13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-18,-5,0,-18,-19,-1,-18,9,-12,-5,1,-17,3,14,-6,-2,-15,-26,-9,0;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-3,-21,-15,-13,-11,-18,-2,-14,-4,2,-12,-17,-11,-18,4,1,5,-26,-15,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-23,-3,8,-21,-16,0,-15,6,-15,-5,-3,-13,5,3,-1,-6,-11,-25,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-27,29,21,-32,-11,-4,-31,9,-25,-21,8,-9,5,1,1,-8,-24,-31,-18,13;
MA   /M: SY='D'; M=-8,4,-25,6,6,-22,-17,-1,-15,6,-13,-1,-1,-14,6,4,-6,-8,-12,-27,-11,5;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-32,-2,-7,-25,22,-15,-33,1,-28,-18,0,-18,-9,-5,-7,-17,-28,0,-15,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-19,-28,-21,0,-27,-21,22,-23,20,14,-20,-23,-17,-20,-12,-1,18,-24,-5,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-13,-16,-17,-14,-1,-23,-7,1,-17,6,1,-10,-20,-13,-13,0,14,3,-25,0,-14;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-19,-4,7,-23,-9,-11,-21,5,-22,-15,0,-6,2,2,13,3,-13,-29,-18,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='S'; M=-2,8,-20,7,-2,-23,8,-7,-27,-4,-28,-19,14,-14,-3,0,17,4,-19,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-35,-11,-1,-27,-20,-16,-15,-8,-24,-11,-17,64,-3,-16,-8,-9,-24,-29,-25,-5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-19,-8,-4,-17,-14,-17,-3,-11,-8,-6,-7,-13,-7,-15,3,5,2,-27,-14,-7;
MA   /M: SY='G'; M=7,-7,-23,-9,-14,-26,44,-18,-31,-16,-27,-18,1,-16,-14,-17,10,-6,-21,-25,-26,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-26,6,-35,-25,34,-28,28,17,-25,-25,-22,-24,-22,-8,25,-20,1,-26;
MA   /M: SY='A'; M=34,-14,-13,-23,-13,-13,-7,-18,-1,-12,-2,-1,-14,-14,-11,-19,2,-2,5,-18,-12,-13;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=27,-12,30,-21,-15,-20,-9,-22,-17,-16,-15,-14,-11,-19,-15,-22,7,-1,-4,-31,-23,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,38,-28,25,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,26,-30,12,4,-14,10,4,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-6,20,63,-20;
MA   /M: SY='I'; M=0,-25,-23,-33,-23,-2,-28,-22,29,-23,20,21,-20,-20,-16,-23,-17,-8,19,-20,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-11,-18,-10,-21,5,-19,-13,-11,-12,-11,-8,-11,-10,-19,11,0,-3,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='C'; M=12,-8,31,-14,-12,-19,-11,-19,-20,-16,-21,-17,-4,-20,-12,-18,16,8,-7,-38,-23,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-20,-24,-20,-10,-7,-26,-11,0,-3,12,6,-15,-24,-2,16,-18,-9,-1,-21,-6,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-23,-20,-7,-9,-23,-9,3,-7,15,15,-16,-20,3,-3,-16,-9,-2,-20,-5,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,0,-14,-4,3,-11,-13,1,-16,-9,-12,-10,4,-16,-4,-9,3,2,-13,-29,-10,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-26,13,6,-28,14,-5,-30,0,-28,-20,20,-14,-2,-5,2,-9,-28,-30,-22,2;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-7,-20,-4,11,-11,-24,-2,-11,-2,-5,-5,-9,-16,-2,-4,-10,-9,-9,-25,-7,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-30,-5,2,-25,-17,-4,-26,20,-25,-13,1,6,4,26,-7,-9,-22,-24,-15,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-3,-18,-22,-7,-19,23,-16,-6,-4,-19,4,47,-10,-7,-10,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-27,-11,2,-14,-22,11,-12,-4,-12,0,-6,-9,23,-2,-6,-10,-17,-18,-1,12;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-24,-5,2,-23,-16,-9,-23,25,-22,-9,1,-13,4,22,0,0,-14,-23,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,19,50,-30,-19,-1,-30,12,-21,-19,1,-2,17,4,-1,-10,-28,-29,-19,33;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,2,-37,-30,42,-27,17,16,-23,-23,-24,-27,-17,-7,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=17,-11,4,-16,-12,-20,-3,-18,-13,-13,-16,-11,-8,-18,-9,-17,10,1,-2,-30,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-21,7,12,-24,-14,-4,-18,-2,-17,-13,1,-11,5,-5,6,0,-12,-30,-15,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00624;
//
ID   RIBOSOMAL_L13_MP; MATRIX.
AC   MP00783;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L13 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5909247; R2=0.0164512; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=349; N_SCORE=11.322; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-4,-3,-27,22,-12,-31,1,-24,-15,1,-16,-3,2,-1,-12,-24,-22,-21,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-30,-2,8,-24,-21,-11,-12,-3,-17,-11,-8,17,3,-10,-5,-7,-16,-25,-16,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-28,-19,14,-27,-15,11,-15,19,15,-21,-25,-17,-10,-20,-9,7,-13,7,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-15,-25,-17,-9,-3,-23,12,-3,-10,2,5,-10,-21,-3,-3,-11,-9,-6,-17,9,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-26,-6,2,-12,-11,-10,-20,-5,-18,-13,-4,9,-4,-6,-4,-7,-20,-22,-13,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-5,3,-23,-18,-5,-27,31,-23,-10,3,-15,8,40,-6,-6,-19,-21,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-24,-4,-2,-17,-12,9,-20,5,-16,-8,4,-17,1,11,-3,-6,-16,-23,-5,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-37,-11,-1,-26,-19,-19,-19,-11,-28,-19,-18,79,-10,-19,-7,-8,-27,-29,-27,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,11,-22,18,19,-26,-11,-7,-22,-3,-20,-17,4,-10,3,-9,5,-4,-16,-33,-19,11;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-27,-4,4,-19,-15,-3,-25,19,-18,-9,1,-17,7,33,-7,-9,-19,-20,-9,3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-23,-34,-26,0,-33,-27,35,-26,20,16,-23,-20,-21,-25,-18,-8,27,-22,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-34,-27,23,-32,-24,24,-27,22,12,-25,-28,-27,-22,-20,-7,22,-14,6,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-31,-2,16,-17,-21,-3,-24,17,-19,-10,-6,-12,7,12,-10,-11,-22,-3,-1,11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-27,-9,-1,-16,-21,3,-15,12,-9,0,-1,-18,4,22,-10,-7,-13,-23,-6,-1;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-10,-16,-10,-17,-6,-20,-9,-11,-11,-10,-7,-11,-10,-17,14,13,1,-24,-17,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-29,-7,2,-19,-20,-4,-26,32,-21,-9,-2,-17,7,42,-9,-9,-17,-17,-3,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-29,56,-17,-38,-12,-29,-18,0,-20,-15,-7,-2,-18,-28,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-18,81,-10,-19,-7,-6,-28,-30,-29,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-28,4,8,-28,-14,-2,-29,33,-28,-12,7,-12,7,22,-4,-7,-21,-25,-11,7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-20,-1,-6,-19,4,-9,-20,-3,-20,-14,16,-16,-6,-4,9,10,-17,-30,-17,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-6,-23,-6,0,-21,-15,-6,-18,8,-18,-10,-3,-4,0,9,0,-2,-12,-26,-13,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-21,-18,-10,-4,-23,-12,-1,-4,17,6,-15,-22,-7,10,-17,-7,-2,-19,-5,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-28,-9,-16,-28,54,-17,-37,-14,-29,-19,1,-19,-15,-11,3,-15,-27,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-27,-6,4,-23,-17,0,-27,25,-21,-10,1,-16,9,44,-6,-9,-19,-21,-11,3;
MA   /M: SY='Q'; M=0,1,-24,0,11,-26,-15,-4,-22,12,-20,-10,1,-11,13,10,2,-3,-18,-25,-13,11;
MA   /M: SY='M'; M=9,-16,-19,-23,-11,-11,-17,-11,4,-11,7,15,-15,-17,0,-11,-9,-7,2,-17,-8,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-29,-21,18,-22,-13,10,-22,19,16,-20,-23,-17,-17,-20,-10,4,-11,8,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-25,2,10,-25,-14,-8,-25,21,-22,-12,2,-11,7,17,0,-2,-18,-25,-14,8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-27,1,3,-24,-13,0,-27,26,-26,-12,14,-16,8,33,-2,-6,-22,-26,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-21,22,-28,43,19,-30,-30,-21,-20,-27,-8,16,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-4,-29,-5,3,-19,-21,6,-25,29,-23,-8,1,-16,7,29,-10,-11,-20,-18,0,3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-13,-30,-27,-2,-28,-28,28,-21,11,10,-26,-26,-26,-21,-10,-2,40,-27,-9,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-26,-23,42,-30,7,1,-16,4,1,-21,-30,-19,-13,-20,-10,-5,22,62,-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,-6,-22,-7,0,-20,-13,-13,-11,-1,-13,-7,-7,-7,-4,-4,-2,-5,-5,-26,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-28,2,-13,-30,52,-14,-37,-16,-30,-21,9,-19,-15,-17,2,-16,-29,-25,-28,-14;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-18,-5,-3,-18,-15,-15,-5,-12,-13,-9,-2,-5,-9,-16,2,-2,-3,-31,-17,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,1,-32,8,19,-28,-18,-9,-23,1,-25,-18,-3,30,2,-8,-3,-7,-26,-30,-21,8;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-4,-30,-5,-2,-17,-21,48,-20,-5,-17,-3,2,-6,3,-2,-9,-14,-22,-24,10,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-4,-34,2,11,-28,-17,-12,-23,-3,-27,-20,-5,48,-3,-12,-5,-8,-28,-28,-24,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-9,-27,-10,-4,1,-24,43,-12,-12,-5,3,-5,-22,-1,-7,-14,-14,-16,-13,24,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-1,9,-24,12,16,-27,-14,-6,-21,5,-18,-11,1,-9,10,-3,2,-4,-17,-28,-15,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-18,-8,-5,-23,1,-15,-15,-2,-16,-11,-4,-12,-4,-10,4,-5,-8,-22,-18,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-28,-1,13,-31,-20,2,-18,11,-16,-3,0,-12,33,11,-3,-8,-22,-22,-11,22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-24,-1,10,-28,-19,-4,-20,20,-22,-8,3,-11,18,12,-3,-6,-18,-25,-12,14;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-15,-32,-12,-4,-17,-20,-14,-15,-4,-18,-10,-11,37,-7,-3,-8,-6,-20,-26,-18,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-11,-23,-11,3,-13,-25,-14,3,-7,2,3,-12,-15,-1,-10,-8,-3,3,-25,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-20,-16,-14,-9,-20,-19,2,-9,-6,-2,-13,-11,-16,-10,-6,-1,11,-27,-11,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-24,-16,10,-28,-13,11,-21,18,7,-21,-25,-17,-17,-18,-6,7,-10,10,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-28,14,17,-27,-15,-3,-25,0,-24,-19,4,12,3,-6,1,-5,-24,-31,-18,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00625;
//
ID   RIBOSOMAL_L34_MP; MATRIX.
AC   MP00784;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L34 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1824903; R2=0.0100871; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=818; N_SCORE=12.424; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-10,-15,-18,-14,-6,-10,-9,2,-10,3,21,-9,-15,-5,-10,-1,9,2,-22,-7,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-2,9,-26,-20,-9,-28,45,-28,-9,-1,-11,11,27,-10,-10,-20,-19,-8,10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11,-1,-20,-18,-1,-28,27,-19,-8,-1,-18,9,64,-10,-10,-19,-20,-10,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-9,-10,-10,-20,-19,-10,-10,-10,-10,1,-10,-10,-10,20,49,-1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-27,-25,-30,-23,37,-30,-6,5,-22,17,5,-24,-30,-22,-16,-24,-11,-2,14,39,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-28,0,16,-36,-5,3,-24,4,-22,-6,1,-11,40,3,3,-9,-28,-23,-15,28;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-36,-7,-5,-29,6,-17,-25,-12,-30,-20,-8,51,-12,-18,-6,-12,-30,-28,-29,-12;
MA   /M: SY='S'; M=0,8,-16,2,0,-20,-8,-2,-20,1,-26,-15,16,-12,0,-1,20,15,-15,-34,-14,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-22,1,-1,-20,-13,-1,-19,13,-23,-11,14,-16,1,10,2,1,-14,-29,-12,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-26,-15,-6,-13,-23,-8,-13,13,-5,-3,-7,-21,0,39,-12,-6,-8,-21,-8,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-28,-6,3,-22,-20,-6,-22,30,-23,-8,-3,-11,7,26,-7,-8,-15,-19,-5,3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,1,-21,-18,4,-29,25,-22,-10,2,-18,9,53,-5,-8,-20,-23,-9,1;
MA   /M: SY='K'; M=4,-8,-22,-11,-4,-19,-17,-13,-8,11,-14,-5,-5,-15,-2,3,-2,-4,-2,-24,-11,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-7,2,-22,-18,-4,-27,30,-21,-9,1,-17,8,49,-9,-9,-19,-21,-10,2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-18,-12,-6,-13,-22,-17,-4,0,-7,-4,-7,-16,-8,0,1,12,4,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-22,-2,-2,-17,-14,53,-23,-11,-21,-6,8,-17,4,-5,7,-5,-20,-32,5,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-14,-28,-14,-4,-14,-22,-4,-20,18,-6,-3,-6,-22,4,52,-14,-10,-14,-20,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=21,-10,-13,-15,-9,-16,-10,-16,-6,-7,-9,-7,-7,-14,-9,-12,8,3,3,-26,-15,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-19,-27,-18,-2,-18,-1,16,-10,15,52,-17,-19,0,-10,-14,-7,8,-22,-2,-9;
MA   /M: SY='R'; M=9,-6,-21,-8,0,-23,-9,-10,-21,12,-21,-11,-1,-13,4,14,6,-2,-13,-24,-15,1;
MA   /M: SY='T'; M=1,1,-10,-8,-9,-11,-17,-18,-11,-10,-13,-11,2,-10,-9,-10,22,46,-2,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='K'; M=0,-9,-26,-9,0,-23,-16,-6,-21,14,-20,-10,-6,3,1,14,-5,-7,-15,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='N'; M=3,8,-17,1,-4,-22,3,-8,-20,-7,-22,-15,14,-15,-1,-9,12,6,-17,-29,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-19,-30,68,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,1,-21,-20,0,-30,29,-20,-10,0,-20,12,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-24,-4,4,-23,-14,-6,-23,22,-21,-11,5,-14,5,21,-2,-6,-17,-23,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-32,-29,0,-33,-29,34,-23,13,12,-25,-25,-25,-23,-12,-1,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=4,1,-22,-4,1,-23,-10,-7,-23,18,-23,-13,7,-14,3,18,3,-3,-16,-25,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=10,-3,-19,-9,-2,-20,-10,-5,-19,6,-17,-11,2,-14,1,14,4,-1,-12,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00626;
//
ID   5_NUCLEOTIDASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00785;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   5'-nucleotidase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0629492; R2=0.0170234; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=170; N_SCORE=8.947; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=26; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-13,-17,-13,-3,-23,-20,0,-17,11,0,-10,-17,-13,-13,3,29,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,26,-33,42,13,-37,-13,-7,-33,-3,-30,-27,6,24,-3,-13,-3,-10,-30,-37,-23,3;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-14,-21,-16,3,-21,-17,13,-21,25,10,-20,-23,-16,-15,-13,-3,12,-21,-4,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='A'; M=21,-13,-13,-18,-13,-13,-3,-18,1,-13,-6,-4,-10,-13,-12,-17,4,-1,7,-20,-14,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-4,-12,-12,-9,-15,0,-15,-10,-11,-8,-9,-1,-12,-9,-14,8,6,-5,-23,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-12,-4,2,-8,-10,-3,-3,-5,3,0,-1,-10,4,-4,-5,-4,-7,-13,-5,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-15,2,-18,-12,-11,-19,-16,-8,-12,-2,-1,-14,-2,-11,-10,-7,1,-6,-26,-14,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=10,-11,-18,-16,-9,-9,-14,-16,-8,-4,-9,-7,-9,-2,-9,-6,0,2,-4,-18,-10,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=2,-8,-22,-9,4,-15,-16,-11,-14,-2,-12,-8,-8,4,4,-7,0,-1,-14,-21,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=16,-7,-16,-13,-5,-14,-9,-11,-6,-11,-2,-1,-4,-15,-4,-13,4,-1,-5,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-13,-28,-12,-10,-8,-16,-13,-15,-7,-13,-12,-14,-9,-9,-11,-9,-6,-15,17,6,-10;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-24,2,9,-27,-7,-11,-20,0,-20,-14,-4,0,3,-8,3,-5,-15,-27,-19,6;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-21,-8,0,-23,-7,-9,-17,4,-16,-9,0,-14,5,5,1,-3,-11,-24,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=13,11,-20,13,3,-27,-7,-1,-24,-2,-21,-16,4,-11,-2,-10,6,-4,-15,-29,-16,0;
MA   /M: SY='K'; M=7,-4,-23,-7,-2,-25,0,-14,-25,16,-24,-12,-2,-12,-1,7,2,-3,-15,-22,-16,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,2,-18,1,-4,-18,-15,-15,-15,-10,-12,-13,-2,1,-8,-13,10,18,-9,-31,-15,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-28,-23,-31,-27,31,-29,-12,8,-19,4,1,-25,-30,-25,-17,-19,-9,10,18,32,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-31,23,30,-33,-18,-4,-31,15,-26,-19,3,3,13,3,-3,-10,-28,-29,-18,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-16,-11,-8,-13,-20,-15,-11,-2,-12,-9,-1,-13,-5,8,12,28,-4,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,6,-30,-20,26,-26,37,25,-27,-27,-18,-20,-25,-9,17,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-13,1,-28,2,9,-22,-18,74,-28,-7,-19,-4,7,-16,10,-2,-7,-17,-28,-29,10,5;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-15,-18,-15,-7,-25,-23,6,-15,-2,-2,-5,-13,-13,-15,9,34,8,-27,-7,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,30,-18,13,-2,-18,-5,3,-18,-2,-25,-18,46,-18,-2,-2,12,12,-23,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-17,-21,-18,-15,-6,-25,28,2,-18,9,12,-13,-25,-9,-11,-16,-11,4,-27,5,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=18,-5,-15,-7,-7,-22,16,-15,-22,-12,-25,-18,3,-12,-7,-15,23,6,-12,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-3,-28,-6,-4,-7,-19,23,-23,8,-17,-8,8,-22,2,29,-9,-11,-21,-18,6,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-34,-25,36,-28,-18,13,-26,26,17,-24,-28,-26,-18,-23,-9,9,-9,11,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-4,-31,-1,18,-15,-19,-9,-19,-3,-14,-7,-11,-12,4,-8,-11,-10,-21,13,-4,12;
MA   /M: SY='E'; M=-14,9,-32,17,21,-34,-18,-1,-28,7,-24,-15,1,8,20,6,-3,-10,-29,-28,-18,19;
MA   /M: SY='T'; M=-9,0,-18,-8,-6,7,-18,-2,-13,-11,-12,-10,7,-17,-11,-9,6,14,-11,-23,-1,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-26,25,20,-29,-11,0,-28,4,-27,-21,19,-2,7,-3,5,-4,-27,-35,-20,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-11,-25,-12,-9,6,-24,5,-3,-9,0,3,-14,-22,-2,-10,-11,-4,-8,1,33,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-12,1,-30,6,-1,-16,7,-2,-28,0,-21,-15,-1,-18,-5,-1,-7,-13,-23,-12,3,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-22,-1,12,-20,-16,-10,-15,6,-17,-11,-1,-10,4,-1,7,1,-12,-29,-14,7;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-24,14,-3,-13,-5,3,-20,-6,-20,-16,16,-18,-5,-9,2,-3,-20,-20,3,-5;
MA   /M: SY='A'; M=5,-9,-22,-12,-8,-20,3,-18,-18,5,-14,-8,-7,-16,-8,-3,-3,-5,-9,-22,-16,-8;
MA   /M: SY='C'; M=0,-14,28,-21,-17,-16,-20,-19,-13,-19,-7,-5,-12,-9,-16,-21,-9,-7,-9,-34,-20,-17;
MA   /M: SY='T'; M=9,-10,-16,-16,-13,-10,-2,-18,-11,-13,-8,-8,-7,-15,-10,-14,5,11,-4,-22,-12,-11;
MA   /M: SY='E'; M=4,9,-23,9,21,-28,-12,-3,-22,2,-19,-14,6,-8,15,-4,5,-2,-21,-28,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-28,-4,9,-30,-18,-3,-25,28,-23,-7,-1,-12,23,26,-5,-9,-21,-20,-11,15;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-1,-21,-1,-4,2,-18,-12,-17,-1,-12,-10,-2,-16,-10,-4,-1,1,-11,-21,-3,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00627;
//
ID   5_NUCLEOTIDASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00786;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   5'-nucleotidase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7967010; R2=0.0165556; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=363; N_SCORE=11.796; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-20,-19,-12,1,-24,-16,9,-20,25,8,-22,-24,-15,-17,-18,-8,7,-20,-1,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-27,-20,-16,9,-3,-5,-9,-17,1,-1,-14,-25,-10,-14,-14,-13,-12,-2,18,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-13,9,-30,15,13,-31,-12,-4,-32,24,-26,-15,4,-12,11,21,-5,-11,-25,-25,-14,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-9,-19,11,-19,-16,-15,-17,-13,-7,-17,-12,-18,-3,-12,-13,-5,-14,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-2,8,-21,3,10,-21,-12,14,-22,-1,-20,-13,13,-12,4,0,6,3,-20,-31,-10,6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-15,-30,-11,3,-22,-20,-18,-8,-9,-16,-11,-16,35,-8,-17,-6,-7,-11,-28,-22,-5;
MA   /M: SY='T'; M=7,2,-15,2,-8,-17,-16,-18,-6,-10,-9,-9,-6,-16,-13,-15,3,8,7,-30,-15,-11;
MA   /M: SY='A'; M=15,-17,-16,-24,-18,6,-17,-14,1,-15,-2,-3,-15,-19,-16,-18,-2,1,5,-9,8,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-27,12,14,-26,-18,13,-26,11,-21,-12,3,-13,6,9,-5,-10,-19,-28,-9,8;
MA   /M: SY='F'; M=0,-22,-8,-29,-23,17,-11,-19,-2,-23,7,4,-18,-25,-24,-20,-12,-9,1,-14,-1,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-32,-22,2,-25,-9,26,-17,25,46,-22,-22,-7,-15,-22,-10,14,-20,0,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-23,18,11,-23,-5,6,-23,7,-28,-19,44,-16,4,3,6,-3,-29,-36,-19,7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-19,-10,-7,-16,-16,-9,-7,-7,-5,-5,-6,-14,-8,-11,-1,3,-3,-24,-10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-20,-29,-22,2,-22,-21,20,-25,29,17,-24,-26,-19,-21,-20,-9,15,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-9,9,-29,10,-3,-29,22,-8,-35,2,-28,-19,12,-17,-6,4,-1,-13,-27,-26,-21,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-22,-18,29,-28,3,-4,-14,-4,-4,-20,-5,-17,-14,-18,-10,-12,13,46,-20;
MA   /M: SY='D'; M=1,23,-23,29,14,-30,-9,1,-28,-2,-22,-20,11,-10,0,-10,3,-5,-21,-33,-17,7;
MA   /M: SY='A'; M=21,-18,-12,-24,-18,-3,-14,-20,5,-15,-2,-2,-17,-20,-18,-19,1,0,16,-19,-6,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-17,-22,-24,-20,-1,12,-12,-6,-16,-1,18,-12,-20,-13,-16,-10,-12,-6,-16,-8,-16;
MA   /M: SY='T'; M=15,2,-11,-8,-8,-15,-9,-15,-12,-9,-15,-12,6,-11,-8,-12,17,25,-5,-29,-15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,26,-29,40,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,57,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,30,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='H'; M=-10,10,-25,3,0,-9,-14,18,-17,1,-19,-11,18,-19,1,-1,-3,-7,-22,-17,11,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-29,-10,-16,-28,49,-20,-34,-18,-28,-19,-2,-5,-18,-19,1,-11,-27,-22,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-15,-19,-18,-16,-5,-22,-18,7,-18,12,3,-12,-12,-17,-16,-11,-1,7,-27,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,21,-27,28,30,-30,-16,-3,-30,9,-23,-20,10,-7,8,0,2,-2,-25,-32,-18,19;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-13,-28,-12,-14,-11,24,-9,-20,-15,-17,-11,-9,-22,-15,-16,-6,-14,-15,-9,2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-22,-19,-11,-11,-22,-11,0,-1,3,3,-13,-19,-8,1,-12,-8,2,-21,-7,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-23,18,16,-25,-12,1,-24,13,-20,-13,10,-8,12,10,-1,-7,-21,-23,-12,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-27,-16,-5,-16,-18,-16,-8,-12,-13,-8,-14,26,-4,-16,-4,-6,-13,-23,-16,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-25,-13,18,-30,-14,11,-23,27,10,-23,-26,-17,-17,-23,-10,3,-11,12,-15;
MA   /M: SY='L'; M=0,-10,-22,-12,-4,-11,-19,-5,-6,-4,7,1,-8,-19,-6,-6,-12,-8,-7,-23,-7,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-29,-12,-10,-17,7,-12,-21,-6,-18,-12,-5,-12,-6,-9,-8,-13,-21,2,-7,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=16,-1,-18,-3,6,-21,8,-11,-19,-5,-16,-13,0,-9,-3,-11,4,-6,-15,-21,-19,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=0,-15,-8,-15,-12,1,-14,-13,11,-13,14,7,-15,-15,-12,-11,-9,-3,14,-13,-3,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-26,11,12,-27,-16,-6,-27,27,-27,-14,11,-11,6,14,-2,-2,-21,-27,-13,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00627;
//
ID   CHORISMATE_SYNTHASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00787;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chorismate synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2633643; R2=0.0158443; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=565; N_SCORE=14.205; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,-19,-29,-19,-2,-18,-2,18,-10,17,53,-19,-19,-1,-11,-17,-9,10,-20,-2,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='A'; M=9,-4,-9,-8,-6,-10,-4,-8,-4,-7,-8,-1,-1,-8,-4,-9,9,3,0,-20,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-21,-15,-14,-11,14,-8,-11,-10,-8,10,-7,-14,-8,-9,-5,-10,-10,-17,-11,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-6,20,-15,10,-2,-9,-3,2,-16,-5,-22,-15,32,-15,-4,-4,11,2,-19,-29,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-11,-5,-5,-11,-9,-10,-12,-7,-16,-12,3,-10,-4,-4,21,22,-5,-26,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-31,-22,38,-27,-16,8,-23,16,6,-19,-25,-25,-15,-19,-8,4,0,16,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-28,-11,-18,-26,59,-19,-34,-19,-23,-16,-2,-20,-18,-19,-2,-18,-26,-19,-27,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-6,2,-20,0,4,-23,-11,2,-23,8,-22,-12,7,-12,5,9,3,0,-18,-27,-12,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-19,-27,-20,5,-25,-15,16,-18,20,20,-20,-24,-15,-13,-16,-6,13,-20,0,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-35,-25,40,-28,-16,11,-26,24,17,-23,-28,-25,-18,-23,-10,5,-3,15,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-25,-8,2,-22,-19,-4,-27,27,-21,-10,0,-17,9,49,-6,-6,-18,-22,-11,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-29,-24,-32,-26,16,-29,-18,15,-21,12,8,-27,-29,-23,-19,-21,-10,14,12,17,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-14,-15,-12,-6,-20,-18,-1,-15,0,-3,-6,-15,-11,-13,10,27,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-12,-12,-11,-9,-20,-20,-5,-12,-6,-7,-3,-12,-11,-12,16,40,3,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='F'; M=4,-22,-16,-30,-21,31,-18,-17,-7,-20,-2,-6,-17,-23,-24,-19,-9,-7,-4,10,15,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-28,20,54,-30,-18,-1,-30,8,-21,-20,1,-1,18,-1,3,-8,-28,-31,-20,36;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-23,-11,-20,-30,65,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-21,-20,-20,0,-20,-29,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-6,-30,-1,6,-27,-12,-12,-22,5,-23,-15,-7,21,0,-1,-5,-7,-21,-27,-20,1;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-18,-13,-8,-22,12,-14,-18,-10,-17,-11,-5,-13,-4,-14,9,-4,-11,-22,-18,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-32,-25,4,-31,-24,29,-25,30,19,-28,-28,-22,-21,-21,-7,27,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-23,-14,-20,-20,34,-21,-20,-19,-18,-11,-6,-20,-19,-19,1,-6,-10,-23,-22,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,14,-22,-19,-16,-8,-24,-8,-17,-10,-9,-14,-22,-19,-21,3,0,7,-30,-20,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-33,-27,0,-33,-27,34,-24,16,15,-23,-24,-22,-23,-13,-1,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,22,17,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-29,45,34,-34,-14,-1,-34,3,-25,-25,11,-6,8,-6,2,-7,-28,-36,-20,21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-30,66,-14,-40,-20,-30,-19,0,-20,-19,-19,0,-20,-30,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-25,20,-31,-26,3,-29,-22,8,-24,10,11,-23,-29,-23,-22,-16,-7,12,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-29,-20,-20,-18,-10,-28,-19,-20,84,-11,-20,-10,-10,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='A'; M=23,-13,-20,-16,-7,-22,-9,-20,-11,-11,-17,-13,-12,20,-10,-19,6,-1,-8,-26,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-29,-7,-15,-29,52,-13,-36,-13,-28,-18,5,-19,-13,-10,0,-17,-29,-22,-26,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-32,-25,9,-32,-22,27,-26,30,18,-27,-27,-22,-21,-22,-8,22,-19,2,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-4,-30,0,15,-24,-17,-7,-23,7,-22,-15,-5,18,3,1,-4,-7,-23,-26,-17,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,7,-34,-26,32,-28,29,18,-26,-26,-23,-24,-22,-8,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-16,13,2,-23,-11,-8,-23,-5,-23,-18,6,-5,-4,-8,13,12,-15,-35,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-23,1,21,-19,-18,-6,-16,0,-10,-10,-6,-8,4,-5,-1,-4,-13,-26,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=6,8,-23,12,22,-27,-10,-7,-24,1,-19,-17,1,-7,5,-7,5,-5,-18,-29,-19,14;
MA   /M: SY='D'; M=-15,16,-27,25,10,-13,-17,-1,-22,-5,-13,-14,2,-15,-4,-10,-7,-9,-19,-23,-2,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-29,4,-37,-28,41,-28,23,18,-23,-23,-22,-27,-20,-9,29,-20,0,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,8,-24,5,12,-30,-14,3,-18,4,-21,-8,11,-13,29,4,5,-4,-22,-28,-14,20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-25,-5,0,-16,-17,-1,-17,6,-16,-9,-1,-9,1,7,-4,-6,-14,-22,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-29,16,31,-26,-18,2,-25,4,-19,-15,0,-8,18,-3,-2,-10,-26,-19,-8,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00628;
//
ID   CHORISMATE_SYNTHASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00788;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chorismate synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3675394; R2=0.0125026; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=492; N_SCORE=10.509; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-23,-24,-25,-21,28,-25,-4,1,-17,3,-1,-20,-19,-20,-16,-16,-8,-2,7,36,-22;
MA   /M: SY='T'; M=13,-4,-11,-12,-10,-14,-13,-19,-8,-11,-11,-10,-2,-10,-10,-13,16,27,1,-29,-14,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-29,-18,-19,7,1,2,-13,-12,-9,-5,-14,-26,-13,-10,-14,-13,-15,13,34,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-11,-28,-12,-7,-5,-8,-8,-14,-9,-11,-3,-9,-18,-6,-7,-10,-11,-14,1,0,-6;
MA   /M: SY='M'; M=0,-16,-22,-19,-10,-10,-19,-9,1,-5,3,8,-14,-19,-3,-6,-11,-8,1,-17,-5,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-30,-2,7,-25,-21,-7,-28,44,-27,-9,-2,-12,8,29,-11,-10,-19,-16,-3,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,37,-30,12,1,-14,3,1,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,25,70,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-29,-3,-12,-29,45,-11,-37,-9,-29,-18,5,-19,-12,-7,-1,-17,-29,-23,-24,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-16,-25,-23,-18,12,-28,6,7,-20,4,5,-8,-23,-13,-15,-14,-9,1,-15,12,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-28,1,1,-19,-17,1,-24,14,-20,-11,2,-14,6,30,-6,-9,-19,-21,-5,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,42,-27,55,17,-36,-9,-1,-35,0,-28,-27,21,-10,0,-9,2,-8,-27,-38,-20,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-19,-26,-20,-16,8,-23,2,-2,-14,3,1,-18,-18,-12,-13,-15,-9,-6,5,27,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-28,-6,3,-22,-15,0,-29,22,-22,-12,4,-18,10,52,-4,-8,-21,-23,-12,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-29,-3,-14,-27,44,-14,-31,-15,-28,-19,10,-12,-15,-16,0,-15,-28,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-26,-16,-22,-20,37,-21,-18,-20,-18,-11,-7,-22,-21,-20,-3,-14,-10,-20,-19,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-30,0,6,-30,40,-13,-37,-10,-27,-20,0,-13,-7,-13,0,-17,-30,-23,-27,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-29,-12,-2,-14,-21,3,-26,23,-17,-8,-1,-21,7,59,-11,-10,-18,-19,-6,-2;
MA   /M: SY='S'; M=19,-7,-12,-11,-7,-11,-1,-15,-14,-13,-16,-13,-1,-13,-8,-15,21,8,-6,-28,-16,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-27,5,35,-20,-21,-6,-18,2,-10,-10,-7,-8,9,-3,-5,-7,-18,-21,-14,22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,-14,-25,-18,-10,-16,-24,10,-16,2,1,-16,-17,-16,-21,0,2,16,-23,-13,-18;
MA   /M: SY='A'; M=16,-12,-17,-17,-14,-19,9,-17,-12,-14,-13,-5,-8,-6,-12,-18,2,-5,-7,-24,-20,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-14,-28,-15,-7,-13,-23,-1,-15,11,-7,-3,-5,-21,2,39,-13,-9,-11,-17,-5,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-10,-29,-29,0,-30,-30,28,-20,9,9,-29,-29,-29,-20,-9,2,48,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-12,-22,-12,-17,-5,-21,-4,-12,-7,-6,-11,-12,-11,-20,7,1,3,-21,-17,-12;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-12,-20,-14,-18,5,-21,-8,-14,-9,-8,-11,-14,-14,-20,4,-3,1,-22,-20,-15;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-11,-17,-10,-16,-4,-17,-9,-10,-11,-10,-8,-12,-10,-17,12,6,1,-22,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-28,9,-33,-27,31,-25,19,14,-26,-27,-26,-23,-17,-5,33,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-7,-21,-11,-18,-3,-20,-9,-12,-8,-9,-11,-12,-11,-20,8,0,1,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-29,-2,9,-27,-20,-8,-27,39,-24,-9,-1,-12,11,30,-9,-10,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-6,-24,-8,1,-22,-17,-11,-17,21,-16,-4,-4,-14,4,12,-4,-5,-10,-23,-11,2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-25,-33,-25,19,-30,-19,17,-26,23,10,-26,-28,-22,-21,-24,-11,10,5,14,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,46,19,-29,-29,-20,-21,-28,-9,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='K'; M=3,-3,-23,-4,5,-23,-8,-9,-23,11,-20,-12,-1,-9,3,11,1,-4,-16,-24,-15,3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-26,2,19,-23,-12,-3,-22,7,-17,-10,-1,-8,15,4,-1,-8,-21,-23,-12,17; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-20,-18,-23,-17,17,-24,-1,2,-18,9,4,-17,-22,-14,-14,-15,-8,-3,-4,22,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-27,2,-11,-28,46,-13,-35,-13,-28,-20,8,-17,-13,-14,2,-15,-28,-24,-26,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-22,-31,-26,-1,-33,-25,33,-24,14,14,-19,-22,-20,-23,-13,-1,28,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-24,6,20,-22,-19,-6,-22,10,-18,-14,0,-10,6,8,-1,-3,-17,-26,-14,13;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-32,-28,1,-30,-29,30,-24,11,10,-24,-23,-25,-23,-13,-4,33,-25,-6,-28;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-14,-20,-17,-10,-7,-20,-11,-4,-4,2,0,-11,-20,-6,5,-8,-2,-2,-18,-3,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=14,-8,-18,-12,-12,-18,17,-16,-18,-15,-16,-12,-1,-16,-12,-17,9,-2,-10,-26,-20,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00628;
//
ID   CHORISMATE_SYNTHASE_3_MP; MATRIX.
AC   MP00789;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chorismate synthase signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0774794; R2=0.0178813; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=258; N_SCORE=10.681; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=24; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-11,-6,-6,-14,-11,-15,-13,-11,-18,-14,5,-11,-6,-11,27,32,-4,-34,-15,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-15,-30,-26,-1,-29,-27,31,-21,11,11,-23,-24,-23,-21,-10,-2,37,-25,-7,-26; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-25,45,13,-30,-10,0,-31,0,-26,-24,21,-11,0,-6,4,-1,-25,-35,-16,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-20,-22,-23,-16,1,-27,-17,13,-14,12,8,-16,-22,-14,-10,-17,-9,8,-13,1,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-26,14,15,-26,-14,-1,-25,8,-20,-15,6,-11,6,7,-1,-6,-21,-28,-14,9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,1,-12,-2,-4,-13,0,-12,-15,-5,-14,-11,3,-9,-6,-6,11,18,-8,-22,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-4,-23,-6,-7,-19,16,0,-22,-2,-16,-5,0,-15,-5,-3,-5,-12,-18,-19,-12,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-27,15,38,-27,-16,1,-26,7,-20,-17,5,-6,13,0,1,-7,-25,-30,-17,25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-27,8,20,-27,-15,-9,-23,0,-22,-17,-2,18,4,-9,2,-4,-23,-30,-21,11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-8,-10,-9,-6,-10,-11,-1,-7,-5,-3,-6,-12,-8,-8,2,6,5,-16,-5,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-6,-23,-7,3,-3,-20,-9,-12,-5,-9,-9,-7,-14,-3,-7,-3,-1,-10,-13,1,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-16,-24,-15,-7,-27,-20,12,-10,7,7,-17,-21,-11,-12,-12,-4,11,-23,-7,-14;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-17,-14,-4,-18,-11,-16,-7,-8,-10,-7,-8,-8,-4,-13,6,2,-3,-25,-16,-5;
MA   /M: SY='T'; M=4,-12,-16,-17,-15,-11,-13,-18,1,-15,-4,-3,-9,-14,-14,-16,4,12,6,-27,-12,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-11,-25,-14,-7,-14,-22,-5,-5,7,-10,-1,-7,-18,-3,6,-10,-7,-1,-22,-4,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-29,-2,3,-30,37,-13,-34,-10,-26,-18,-1,-15,-4,-13,0,-16,-27,-23,-25,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-23,-1,-1,-18,-13,59,-26,-10,-23,-7,9,-17,5,-4,7,-6,-22,-33,6,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-31,-12,-5,-24,-19,-20,-12,-12,-23,-15,-18,57,-12,-19,-3,-4,-14,-31,-25,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-16,80,-25,-24,-17,-25,-27,-22,-24,-17,-17,-15,-32,-24,-25,-1,2,-5,-44,-25,-24;
MA   /M: SY='V'; M=16,-23,-14,-28,-23,-7,-21,-26,19,-18,6,5,-21,-21,-21,-22,-5,-2,28,-25,-12,-23;
MA   /M: SY='V'; M=6,-22,-14,-23,-22,-10,-4,-25,4,-19,0,-1,-19,-19,-22,-20,-7,-6,15,-26,-16,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-35,-20,-10,-19,-26,-23,3,-17,-11,-6,-20,49,-13,-23,-13,-9,-9,-27,-19,-16;
MA   /M: SY='R'; M=3,-10,-24,-13,-3,-20,-14,-7,-23,16,-17,-10,-4,-13,3,38,-4,-7,-14,-20,-14,-4;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-13,-20,-13,-19,4,-20,-9,-12,-10,-8,-10,-12,-12,-20,7,-3,0,-20,-20,-13;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,-15,-20,-19,-11,-7,-23,5,-17,-5,-2,-14,-18,-19,-18,3,2,15,-28,-15,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-23,-27,-18,-12,-17,-24,-24,1,-14,-12,-7,-22,36,-17,-20,-8,-4,3,-29,-20,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-29,35,-23,14,14,-27,-27,-26,-23,-13,-3,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=17,-20,8,-26,-21,-11,-17,-24,4,-17,-2,1,-19,-23,-20,-21,-3,-2,17,-28,-16,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-5,-15,-9,-20,0,-15,-14,-11,-15,-12,-3,-13,-9,-17,12,2,-5,-25,-20,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-23,-17,-30,-22,0,-23,-11,21,-15,19,39,-23,-23,-11,-14,-17,-7,21,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-13,-26,-22,-2,-24,-22,18,-18,13,12,-23,-24,-20,-18,-8,3,27,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-13,-15,-8,-19,-2,-17,-11,-9,-11,-10,-7,-11,-8,-17,9,0,-3,-20,-17,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-15,-32,-24,11,-28,-23,16,-27,23,11,-23,-26,-22,-22,-20,-6,10,-11,1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-14,-18,-12,-7,-26,-23,12,-12,1,1,-19,-21,-18,-14,-3,7,27,-30,-11,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-28,38,20,-28,-28,-20,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-16,-13,-23,-15,-12,-10,-18,2,-13,1,4,-15,-16,-12,-17,0,-2,8,-22,-14,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-28,49,15,-35,-12,0,-35,5,-28,-24,17,-11,4,-2,1,-6,-27,-36,-17,9;
MA   /M: SY='H'; M=4,-10,-20,-14,-4,-7,-16,18,-11,-11,-4,2,-7,-17,-2,-11,-7,-10,-11,-19,2,-4;
MA   /M: SY='L'; M=0,-23,-17,-28,-20,3,-24,-17,15,-19,18,15,-22,-24,-16,-18,-15,-6,12,-17,1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-18,-30,-20,7,-28,-19,19,-27,42,21,-28,-28,-18,-20,-26,-9,11,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-2,10,-16,-21,-4,-16,6,-7,-5,-4,-15,5,17,-9,-9,-15,-23,-9,6;
MA   /M: SY='H'; M=-9,3,-26,2,6,-25,-11,17,-26,9,-23,-9,7,-14,13,9,-1,-8,-23,-25,-7,8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-16,-26,-19,-11,10,-10,-10,-17,-2,-7,-5,-8,-22,-10,12,-11,-11,-13,-11,1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-16,-11,-12,-15,15,-15,-21,-14,-17,-12,-4,-17,-11,-15,4,-6,-13,-21,-16,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00628;
//
ID   RECEPTOR_TYR_KIN_V_1_MP; MATRIX.
AC   MP00790;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Receptor tyrosine kinase class V signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6980758; R2=0.0137011; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1449; N_SCORE=24.541; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-17,-19,-11,-8,-27,-21,11,-9,0,2,-18,-21,-15,-5,-6,2,22,-28,-11,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-9,-15,-6,-17,-22,-6,-25,15,-12,-8,-6,-24,1,47,-12,-10,-15,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-19,7,10,-24,-3,-7,-25,-2,-26,-17,7,-10,3,0,19,5,-17,-34,-19,6;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-19,-36,-28,34,-32,-24,19,-28,21,10,-24,-28,-30,-22,-20,-8,17,-10,10,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,65,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,3,-17,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-17,-38,-9,-1,-29,-14,-9,-23,-8,-29,-18,-15,68,-8,-13,-9,-11,-29,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-11,-3,-1,-17,-8,-13,-17,-9,-22,-16,6,-10,-3,-10,31,30,-7,-36,-16,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,7,-27,-20,-4,-29,38,-25,-9,0,-14,15,43,-9,-10,-21,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-2,0,-24,-5,0,-22,-13,0,-24,19,-21,-11,7,-16,4,31,-3,-7,-18,-23,-12,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,66,-30,-20,4,-30,18,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-19,27,-29,24,-2,-10,-1,0,-18,-29,-9,-9,-19,-11,-11,27,77,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,17,-37,-20,22,-21,7,-20,0,1,-11,53,9,-1,-11,-30,-21,-6,35;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-24,-19,-12,-7,-26,-12,6,-13,0,2,-16,-6,-4,-13,-8,-1,2,-17,3,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-31,-12,-21,-28,65,-21,-39,-20,-29,-20,-2,-21,-20,-20,-2,-21,-30,-10,-26,-20;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-12,-17,-10,-21,8,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,11,-1,-4,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-19,-32,-25,2,-28,-18,28,-20,22,31,-25,-25,-16,-18,-19,-7,25,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,32,-25,22,15,-28,-28,-25,-22,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,17,12,-30,-30,-28,-20,-13,-2,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,2,-22,-20,10,-30,27,-21,-8,1,-19,12,56,-10,-11,-22,-21,-7,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-13,-30,-27,1,-29,-27,27,-22,18,12,-28,-28,-26,-21,-14,-3,37,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-34,-27,63,-26,-10,-2,-25,6,-1,-19,-30,-32,-18,-19,-10,-4,14,40,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-26,-18,-18,30,-26,10,-4,-13,-3,-3,-15,-27,-13,-12,-13,-7,-9,17,57,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-30,-4,6,-21,-22,-2,-24,33,-23,-7,-3,-14,14,26,-10,-10,-20,-12,4,8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-3,6,-26,-20,-8,-27,37,-25,-9,0,-12,10,33,-6,-4,-18,-21,-10,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=1,-17,-33,-12,-3,-26,-15,-19,-19,-8,-25,-18,-16,56,-9,-15,-5,-7,-23,-21,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=4,-9,-21,-10,4,-12,-13,-10,-17,-3,-12,-11,-6,-14,0,1,3,-3,-13,-14,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-17,-15,-23,-19,-4,-25,-22,13,-17,8,9,-15,-19,-16,-17,-2,15,18,-26,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-16,-29,-25,1,-31,-27,26,-23,17,11,-23,-25,-23,-21,-12,3,30,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-25,-7,2,-21,-18,4,-18,10,-14,-5,0,-16,12,20,-4,-5,-15,-23,-9,5;
MA   /M: SY='N'; M=-2,16,-22,6,-7,-23,22,-1,-26,-8,-29,-19,31,-19,-7,-9,9,-5,-27,-32,-22,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-31,-23,26,-19,-20,8,-29,30,10,-24,-29,-26,-20,-24,-11,3,-11,5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,5,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-22,-10,-7,-13,-18,0,-6,-6,-8,0,-4,-17,0,1,0,-1,-5,-24,-3,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-37,-8,2,-30,-19,-16,-20,-8,-29,-18,-16,73,-2,-16,-6,-8,-29,-30,-27,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,23,-29,35,43,-33,-16,-1,-32,6,-23,-23,6,-4,12,-4,1,-9,-28,-33,-20,27;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-10,-11,-10,-11,-19,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,47,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-19,-28,-20,1,-28,-21,21,-21,20,14,-23,-25,-14,-18,-16,-6,20,-22,-4,-18;
MA   /M: SY='P'; M=10,-9,-19,-11,-6,-20,-13,-19,-14,-10,-18,-14,-8,21,-9,-16,10,16,-11,-29,-20,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00629;
//
ID   RECEPTOR_TYR_KIN_V_2_MP; MATRIX.
AC   MP00791;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Receptor tyrosine kinase class V signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8621459; R2=0.0088875; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1167; N_SCORE=14.233; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=297; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=4,-10,-11,-11,-10,-14,-13,-16,-2,-12,-14,-8,-5,-17,-7,-12,18,14,10,-34,-15,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-9,72,-14,-19,-22,-21,-23,-27,-22,-21,-20,-11,-29,-21,-24,-1,-6,-11,-44,-26,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-18,-22,-19,-8,-18,-18,15,-19,1,4,-17,-23,-19,-19,-6,-4,23,-28,-10,-20;
MA   /M: SY='N'; M=5,2,-20,-2,0,-20,-11,-10,-12,-2,-18,-13,6,-3,-5,-6,4,-2,-9,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,19,-24,15,9,-25,-1,14,-27,-2,-26,-17,25,-15,2,-4,5,-7,-27,-33,-15,5;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-15,-8,-2,-22,9,-15,-20,-10,-21,-16,-1,-11,-6,-15,18,3,-11,-28,-22,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-24,4,21,-22,-22,-3,-13,1,-12,-9,-6,-11,7,-4,-3,-5,-8,-29,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-24,1,21,-24,-16,-4,-21,-2,-18,-15,-5,10,4,-9,3,0,-19,-28,-18,12;
MA   /M: M=-1,-5,-22,-4,-1,-20,-4,-14,-15,-2,-13,-10,-6,-16,-6,-2,-1,-4,-6,-26,-16,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-4,16,-23,22,7,-27,-3,-8,-24,-6,-24,-20,9,-7,-4,-12,7,-3,-17,-34,-20,1;
MA   /M: SY='S'; M=2,-12,-17,-12,-13,-15,-8,-19,-5,-14,-15,-9,-7,-2,-14,-15,8,6,4,-32,-18,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-21,-6,-2,-16,-7,-11,-11,-7,-14,-10,-10,41,-6,-11,-6,-6,-16,-16,-16,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-31,-9,-2,-23,-17,-17,-14,-9,-22,-15,-17,66,-9,-16,-8,-8,-20,-24,-23,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-28,-5,4,-24,-18,-6,-27,33,-24,-10,0,-15,8,40,-5,-7,-18,-22,-11,4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-29,-19,4,-25,-9,19,-19,33,40,-24,-24,-8,-14,-24,-10,9,-20,0,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-10,-30,-11,-10,7,-25,59,-15,-11,-10,0,-5,-25,-1,-5,-15,-15,-20,-1,48,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-1,10,-19,3,-4,-21,9,-5,-24,-4,-28,-18,23,-16,-3,0,16,4,-20,-34,-20,-4;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-20,-12,-6,-23,17,-18,-20,-12,-18,-14,-7,-8,-11,-17,4,-6,-12,-23,-23,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-30,18,45,-31,-16,0,-30,11,-21,-18,1,-4,21,4,-1,-10,-29,-28,-18,32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-19,-29,-19,4,-24,-15,17,-22,35,27,-25,-25,-14,-17,-23,-9,9,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-12,-25,-20,-3,-29,-27,23,-17,7,7,-27,-27,-25,-18,-9,-1,41,-30,-11,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-35,-11,0,-29,-17,-18,-19,-9,-27,-17,-17,70,-6,-18,-7,-9,-26,-28,-27,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-34,-28,0,-35,-29,38,-25,16,15,-23,-24,-23,-25,-15,-3,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-28,60,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-12,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-28,-5,0,-26,0,-6,-29,19,-25,-12,3,-16,6,25,-4,-11,-22,-21,-15,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-18,-18,-13,-8,-20,-11,4,-12,3,8,-10,-18,-6,-7,0,6,5,-27,-7,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=2,2,-23,-1,7,-26,-12,-6,-22,16,-23,-11,6,-11,12,11,4,-3,-18,-25,-15,9;
MA   /M: SY='P'; M=22,-12,-21,-14,-4,-23,-10,-19,-14,-9,-17,-14,-12,25,-9,-18,4,1,-11,-25,-23,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20,34,-29,22,-4,-14,0,0,-16,-29,-14,-11,-19,-11,-10,18,62,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,49,-33,-20,3,-27,10,-20,-15,0,-3,31,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-28,4,26,-29,-15,-8,-23,4,-22,-17,-5,16,10,-5,2,-6,-24,-28,-21,17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,-12,-18,-15,-9,-16,-14,-11,-6,3,-10,-4,-9,-16,-6,2,-3,-4,3,-22,-11,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-26,10,15,-27,6,-5,-30,1,-24,-19,10,-12,2,1,3,-9,-26,-29,-21,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-24,9,-1,-22,2,-12,-24,-1,-21,-15,3,-15,-5,-6,2,-1,-15,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-17,-15,-8,-13,-12,-13,-5,-9,-6,-4,-9,-15,-6,-12,2,4,2,-24,-11,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-28,-2,15,-29,-20,7,-22,14,-18,-5,-1,-13,30,22,-4,-8,-22,-23,-10,21;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,-16,-18,-10,-21,0,-20,-12,-11,-13,-11,-12,3,-12,-20,6,-3,-4,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,113,-29,-29,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-34,-29,-30,-10,-10,-11,-49,-30,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-31,-8,0,-27,-5,-14,-25,2,-27,-17,-8,29,-4,2,-2,-8,-24,-27,-23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-28,-11,0,-22,-19,-13,-12,-4,-17,-10,-10,20,1,-2,-2,-4,-14,-27,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-29,-11,-19,-28,61,-20,-36,-18,-27,-18,-2,-20,-19,-17,-1,-18,-25,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-20,-33,-26,58,-28,-14,-1,-24,7,1,-17,-27,-31,-17,-15,-2,-1,6,29,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-27,-21,-20,36,-27,11,-2,-13,-1,-2,-13,-29,-15,-11,-17,-9,-10,20,61,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00629;
//
ID   DHPS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00792;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydropteroate synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2402058; R2=0.0156562; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=397; N_SCORE=11.446; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-29,0,15,-25,-21,10,-23,20,-16,-5,-2,-12,15,12,-9,-12,-21,-23,-6,14;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-2,-16,-12,-6,-14,-10,2,-12,2,11,-11,-11,-7,-11,-2,-1,3,-22,-8,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-14,-18,-16,-10,0,-16,-14,-4,-13,-1,-1,-12,0,-11,-12,-5,4,-5,-4,-3,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-11,-20,-12,0,-1,-20,-7,-2,-9,1,0,-10,-6,1,-8,-8,-3,-7,-12,1,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=3,2,0,3,3,-21,1,-11,-22,-5,-17,-14,-2,-11,-5,-10,0,-7,-14,-23,-17,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-21,-3,-4,-8,3,-6,-13,-8,-9,1,-3,-14,-3,-9,-7,-10,-13,-9,-7,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-17,-11,-9,-12,-5,-11,-6,-4,-10,-6,-1,-13,-5,3,2,1,-3,-20,-11,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-10,-17,-12,-8,5,-15,-10,-5,-8,0,-3,-6,-3,-10,-4,-7,-2,-7,-14,-3,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-6,0,-10,-1,2,-14,-1,-4,-18,6,-15,-10,4,-10,1,12,0,-5,-14,-17,-11,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=4,-11,-12,-13,-10,-8,-12,-15,4,-14,-4,-3,-6,-14,-9,-14,10,6,7,-26,-11,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-6,-18,-8,-11,6,-9,-10,-8,-13,-2,-6,-6,-13,-14,-13,-6,-3,-8,-12,2,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=6,-10,-16,-13,-10,-12,-3,-8,-7,-9,-3,0,-6,-16,-8,-10,-1,-4,-3,-22,-11,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=1,3,-22,7,3,-25,-10,-12,-21,-2,-24,-18,-1,17,-4,-10,7,2,-17,-29,-20,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-22,0,1,-20,-13,-2,-19,10,-19,-11,2,2,0,10,-2,-4,-15,-23,-12,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-16,-14,-11,-13,-21,-20,-4,-11,-8,-6,-10,2,-10,-13,6,23,3,-29,-13,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-25,-15,-6,-8,-25,2,-3,-2,1,6,-12,-20,7,-3,-12,-5,-7,-13,11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,21,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-14,-32,-23,8,-23,-7,18,-15,17,45,-20,-22,-8,-14,-20,-10,10,-18,2,-15;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-31,-26,10,-30,-25,25,-26,28,14,-29,-30,-26,-20,-20,-6,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-17,-28,-22,2,-27,-23,17,-17,14,8,-23,-26,-21,-11,-13,-2,24,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-12,5,-34,15,10,-32,-16,-11,-26,-5,-29,-23,-2,47,-4,-14,-4,-8,-29,-34,-26,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,61,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,27,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-22,-39,-29,60,-31,-20,10,-29,14,7,-20,-28,-34,-21,-20,-10,6,2,22,-28;
MA   /M: SY='S'; M=2,-7,-14,-8,-7,1,-8,-8,-15,-13,-21,-15,2,-15,-7,-12,24,12,-8,-25,-1,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-27,-5,-4,-27,36,-15,-34,-8,-26,-18,0,-15,-9,-8,2,-9,-25,-23,-24,-7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-12,-17,-15,-2,-15,-21,-11,-6,-1,-1,1,-11,-17,1,4,-8,-5,-5,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-25,-21,-17,28,-26,16,-9,-13,-3,-2,-11,-25,-14,-5,-13,-5,-10,2,36,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-19,-20,-17,19,-21,-14,3,-22,15,3,-7,-26,-19,-15,-11,-4,-2,-18,2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=2,12,-21,16,13,-24,-9,-3,-23,-3,-22,-18,6,-10,5,-8,12,0,-18,-29,-12,9;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=6,-18,-19,-18,-11,-9,-16,-18,3,-15,4,-1,-17,9,-12,-17,-9,-5,0,-19,-12,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-24,14,18,-26,-13,-6,-21,3,-19,-15,2,-3,7,-2,2,-6,-18,-27,-16,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-21,4,2,-26,-5,-10,-25,7,-23,-15,3,-12,2,4,8,3,-16,-27,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,-11,-19,-10,-20,-3,-19,-8,-9,-9,-8,-11,-11,-7,-18,8,-1,2,-21,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-18,-28,-22,-1,-28,-23,20,-18,18,10,-23,-26,-19,-12,-16,-6,23,-24,-6,-22;
MA   /M: SY='A'; M=14,-1,-19,-8,-4,-18,-11,-7,-12,-3,-13,-8,1,-13,0,-9,3,-1,-9,-23,-12,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-4,4,-26,5,5,-27,-15,36,-25,-1,-19,-7,5,-14,16,2,-3,-12,-24,-27,-2,9;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-13,-22,-16,-16,-2,-23,-1,-14,-6,-5,-14,-16,-16,-21,3,-3,9,-22,-18,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-29,0,19,-19,-23,4,-13,4,-9,-6,-2,-12,6,3,-8,-11,-16,-26,-9,11;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-25,-5,9,-23,-18,-9,-23,24,-18,-10,-3,-12,6,23,-5,-6,-16,-22,-12,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00630;
//
ID   DHPS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00793;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydropteroate synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0271034; R2=0.0141779; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=423; N_SCORE=11.014; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=2,17,-19,21,11,-26,-6,-6,-25,-4,-25,-21,13,-10,1,-9,17,6,-18,-36,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-24,-15,-12,-9,-22,-18,1,-17,5,-1,-20,6,-15,-19,-13,-7,0,-23,-9,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,19,-25,24,15,-30,-11,-4,-25,2,-23,-18,9,-6,6,-6,3,-6,-22,-31,-18,10;
MA   /M: SY='D'; M=-1,8,-24,10,5,-29,-5,-8,-27,8,-24,-15,4,-12,6,3,4,-2,-19,-27,-16,5;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-12,-22,-13,-17,-5,-21,-3,-12,-6,-6,-12,-12,-12,-21,6,-1,5,-21,-18,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-30,-24,0,-29,-25,24,-20,18,11,-25,-26,-21,-15,-15,-5,28,-24,-6,-24;
MA   /M: SY='K'; M=4,1,-22,-1,0,-21,-15,-8,-16,5,-15,-8,-2,-12,2,-2,0,0,-11,-23,-11,1;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-3,-26,-3,2,-23,-17,32,-21,-2,-13,-3,0,-16,15,4,-5,-12,-20,-25,-1,6;
MA   /M: SY='A'; M=27,-16,-1,-22,-18,-16,-2,-23,-5,-15,-8,-7,-15,-18,-18,-21,2,-3,8,-25,-19,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-3,-29,-1,17,-21,-22,1,-17,13,-12,-7,-3,-12,7,10,-9,-11,-16,-25,-9,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=2,-3,-24,-4,12,-25,-16,-8,-23,19,-18,-11,-3,-10,8,16,-2,-5,-16,-22,-14,9;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-24,-19,-30,-20,7,-23,-10,17,-19,29,36,-23,-24,-11,-15,-21,-9,9,-18,0,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-33,-26,16,-30,-19,24,-24,18,16,-23,-25,-22,-21,-18,-8,19,-13,9,-25;
MA   /M: SY='A'; M=15,3,-18,-1,-1,-21,-9,-11,-16,-2,-12,-11,1,-13,-3,-5,3,-1,-10,-25,-16,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-25,14,26,-27,-13,2,-23,0,-18,-15,0,-9,8,-6,0,-9,-18,-29,-16,16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-13,-30,63,-18,-39,-18,-29,-20,0,-18,-17,-18,0,-19,-30,-21,-29,-15;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-10,-17,-10,-19,-2,-19,-9,-11,-12,-10,-8,-11,-10,-18,14,4,2,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-21,20,2,-26,-7,-3,-23,-5,-22,-17,6,-13,-5,-10,7,2,-13,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-30,0,-36,-29,42,-26,17,19,-23,-23,-22,-26,-17,-7,36,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,44,-28,20,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-33,-29,9,-32,-28,30,-24,17,12,-27,-28,-28,-22,-16,-4,36,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-29,-11,-16,-29,48,-20,-34,-17,-28,-19,-4,-2,-17,-20,0,-16,-27,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,-6,-11,-5,15,-24,-20,-9,-13,-2,-13,-8,-9,-13,12,-7,-1,-7,-9,-28,-16,13;
MA   /M: SY='S'; M=19,-3,-12,-5,-2,-21,-2,-13,-18,-5,-25,-17,4,-10,-2,-9,28,13,-8,-33,-19,-2;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-10,-9,-8,-13,-14,-18,-12,-10,-14,-12,1,-10,-8,-11,23,40,-2,-31,-13,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-16,2,-28,-3,-2,-21,-8,10,-29,16,-23,-12,14,-20,5,41,-5,-10,-24,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-29,6,-8,-30,36,-12,-36,-5,-29,-20,10,-17,-10,-6,-1,-15,-28,-25,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-8,-13,-6,-18,-10,-5,-10,-11,-13,-9,-7,-15,-8,-15,8,0,0,-29,-14,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-26,-5,4,-19,-20,-7,-14,9,-14,-7,-3,-14,7,13,-3,-4,-12,-21,-7,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-6,-23,-4,6,-15,-21,-4,-14,-1,-13,-6,-7,2,8,1,-7,-7,-17,-18,-4,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-14,-28,-26,-3,-22,-27,21,-21,10,8,-24,-26,-25,-20,-9,0,33,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='S'; M=1,11,-17,14,6,-24,-5,-8,-24,-7,-29,-21,12,-5,0,-10,26,11,-16,-39,-20,3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-23,-15,-5,-14,-23,-12,1,-13,-5,-3,-17,5,-11,-16,-7,-5,4,-29,-13,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,13,-26,19,28,-30,-15,-5,-28,9,-21,-18,3,-7,9,2,1,-6,-22,-29,-18,18;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-25,14,29,-27,-20,-4,-21,3,-17,-14,0,-8,14,-3,2,-1,-17,-30,-16,21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-29,16,53,-28,-21,-2,-26,8,-18,-18,-2,-2,16,-1,-1,-9,-24,-30,-19,35;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-29,-33,-25,2,-30,-25,22,-25,13,9,-22,-23,-17,-23,-19,-8,10,11,4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-21,-2,7,-16,-15,-4,-19,0,-14,-11,1,-13,4,6,5,1,-15,-26,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-18,-24,-17,-4,-28,-24,22,-19,9,7,-20,-22,-18,-19,-7,0,26,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00630;
//
ID   HPPK_MP; MATRIX.
AC   MP00794;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7787280; R2=0.0142188; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=405; N_SCORE=10.527; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-7,-23,-6,11,-10,-23,-11,-12,3,-8,-7,-8,-14,-1,6,-5,0,-5,-24,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,0,-28,-21,-4,-27,-24,12,-24,15,6,-19,-23,-18,-23,-12,0,10,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-10,-27,-10,3,-15,-23,1,-12,6,-3,2,-8,-17,17,5,-12,-11,-15,-18,-3,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-8,-24,-9,5,-12,-18,-2,-12,5,-8,0,-8,-14,4,3,-6,-7,-12,-15,2,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-28,8,-37,-24,38,-27,19,16,-22,-23,-21,-26,-20,-9,26,-15,8,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-22,-5,2,-19,-15,-6,-15,7,-14,-8,3,-16,6,13,0,-3,-12,-27,-13,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-25,4,20,-25,-14,-4,-25,14,-22,-15,4,-10,11,15,3,-5,-21,-27,-16,15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-19,-29,-19,21,-25,-18,7,-23,22,8,-22,-26,-18,-17,-18,-8,5,-12,5,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-28,-6,-12,-30,48,-15,-36,-10,-29,-18,4,-18,-10,-12,2,-15,-28,-22,-26,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,14,65,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-10,-18,-9,-10,-13,-23,-20,6,-5,-4,-1,-14,-20,-15,-11,-6,-2,18,-29,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-27,-7,4,-22,-17,-3,-28,26,-21,-11,0,-16,8,50,-5,-8,-18,-22,-12,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-23,0,4,-20,-5,1,-20,-4,-14,-10,-1,-15,-2,-4,1,-3,-14,-28,-12,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-25,-21,-6,12,-27,-14,2,-14,4,1,-16,-15,-8,-10,-14,-9,-1,-15,1,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-16,3,-30,6,7,-27,-19,7,-31,31,-26,-11,4,-14,9,34,-9,-11,-22,-24,-8,6;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-19,-43,-21,-19,-1,-16,-20,-22,-12,-23,-20,-18,-26,-14,-13,-28,-23,-29,97,16,-13;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-36,-9,2,-29,-18,-19,-20,-9,-28,-19,-17,74,-8,-19,-6,-8,-27,-30,-28,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-7,-9,-7,-13,-19,-18,-10,-11,-11,-10,-2,-6,-10,-12,11,28,-3,-32,-14,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-25,-35,-25,3,-34,-25,34,-29,31,19,-24,-24,-20,-25,-23,-10,20,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-26,4,-34,-26,34,-29,32,19,-26,-26,-21,-24,-23,-9,24,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,5,-33,-24,31,-28,34,20,-26,-26,-20,-23,-24,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-22,-18,-28,-20,24,-21,-14,4,-22,15,7,-19,-24,-20,-18,-13,-6,2,-8,11,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-5,-29,-25,40,-30,-4,-2,-20,1,-2,-21,-31,-25,-17,-18,-9,-3,9,42,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-26,-5,-6,-17,21,-8,-25,-9,-19,-14,3,-18,-9,-11,-1,-11,-22,-18,-9,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-28,24,13,-33,-8,4,-28,5,-26,-16,19,-13,18,6,1,-8,-29,-31,-17,15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-22,2,20,-23,-17,-8,-20,8,-19,-13,-1,-8,8,3,6,3,-14,-28,-15,14;
MA   /M: SY='V'; M=5,-13,-18,-17,-9,-14,-19,-17,8,-13,-5,0,-8,-17,-5,-15,3,0,10,-27,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-25,-27,-21,3,-16,-19,11,-18,9,6,-17,-23,-18,-18,-16,-10,7,-13,3,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-22,4,11,-21,-12,0,-22,6,-20,-13,7,-12,10,11,6,-2,-19,-24,-10,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-8,10,-13,10,3,-20,-17,-6,-20,-5,-18,-14,5,-13,3,-8,8,15,-15,-28,-8,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-19,6,20,-24,-19,0,-22,7,-19,-13,3,-10,6,0,-2,-5,-19,-29,-13,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-26,-1,-2,-19,-8,-9,-19,-3,-17,-13,1,-16,-1,3,0,-6,-16,-13,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-8,-19,-14,-1,-26,-19,7,-23,27,8,-22,-26,-17,-19,-20,-9,5,-25,-7,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-4,-22,-8,0,-14,-22,-13,-2,2,-9,-4,-2,-12,-3,-1,-2,5,-2,-24,-9,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-1,-24,-15,-5,-30,-24,15,-20,11,5,-23,-25,-19,-20,-14,-6,21,-29,-11,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00631;
//
ID   INVOLUCRIN_MP; MATRIX.
AC   MP00795;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Involucrin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=25;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=23;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2932324; R2=0.0130154; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=855; N_SCORE=15.411; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,11,-31,-20,49,-24,1,-20,0,4,-14,38,6,-4,-14,-30,-24,3,22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-30,-4,-1,-13,-22,69,-22,-7,-16,0,2,-20,14,0,-10,-16,-26,-16,27,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,40,17,-30,-30,-23,-20,-25,-7,20,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,32,16,-30,-30,-24,-20,-21,-6,28,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=6,-9,-17,-8,-2,-15,-7,-11,-9,-6,-13,-9,-9,31,-6,-11,-2,-4,-11,-15,-15,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,32,16,-30,-30,-24,-20,-21,-6,28,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='S'; M=6,-13,-10,-13,-13,-11,-13,-19,2,-14,-12,-7,-8,-19,-13,-14,18,11,16,-36,-16,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-30,11,36,-30,-4,-6,-32,13,-24,-18,0,-6,11,2,-2,-12,-28,-26,-20,23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-25,-15,-7,-13,-18,-17,-6,-17,-1,-6,-16,21,-11,-17,-4,-2,-10,-29,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,10,-30,14,12,-32,-18,-8,-32,40,-30,-14,4,-10,8,22,-8,-10,-22,-24,-12,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-16,-10,-8,-14,-20,-20,-12,-10,-14,-12,-4,10,-10,-12,14,38,-6,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-21,-4,0,-24,-7,-14,-20,-10,-30,-20,-1,26,-4,-14,22,9,-17,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00632;
//
ID   1433_1_MP; MATRIX.
AC   MP00796;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   14-3-3 proteins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3224425; R2=0.0125716; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=948; N_SCORE=16.230; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-9,10,-19,-16,-11,-19,-6,-3,-6,-2,23,-6,-23,-5,-9,-12,-8,-4,-30,-11,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-25,-3,4,-25,-18,-12,-22,33,-26,-9,-2,-12,4,18,-2,-4,-11,-24,-12,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-25,-4,4,-26,-18,-11,-22,16,-24,-11,-2,5,8,6,3,6,-17,-26,-14,6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-17,-26,-21,-7,-23,-21,16,-15,4,14,-24,-7,-18,-18,-10,-4,24,-27,-12,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-12,-22,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,8,-3,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-7,-4,-9,4,-24,-19,-11,-19,9,-17,-9,-8,-16,5,6,-4,-7,-11,-27,-16,4;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-20,-11,-9,-10,-19,-9,1,-3,3,18,-11,-18,-4,-6,-8,-5,3,-26,-7,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-10,10,-28,8,-5,-27,22,-6,-33,-1,-28,-19,17,-19,-6,6,0,-12,-28,-28,-22,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-20,27,2,-24,-11,-6,-20,-5,-22,-18,18,-15,-6,-9,8,5,-13,-37,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,53,-30,-20,-1,-30,15,-21,-19,0,-1,19,4,-1,-10,-29,-29,-19,36;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,9,-12,-1,-5,-15,-10,-11,-15,-8,-20,-15,16,-12,-5,-8,23,31,-9,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-12,-19,-23,-4,-23,-21,19,-16,1,3,-10,-28,-23,-16,-6,0,32,-32,-12,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-26,-12,-2,-20,-16,-4,-26,21,-18,-10,-2,-18,6,50,-6,-8,-16,-20,-12,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,26,-29,40,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-15,-18,-12,-22,17,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-13,-30,-27,-3,-27,-28,27,-20,8,8,-26,-26,-26,-21,-8,-1,40,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,17,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-35,-25,1,-32,-19,36,-23,24,33,-21,-21,-13,-22,-21,-10,21,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,23,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,30,-22,-2,-29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00633;
//
ID   1433_2_MP; MATRIX.
AC   MP00797;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   14-3-3 proteins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1608758; R2=0.0123235; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1260; N_SCORE=19.678; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=190; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,15,-27,23,40,-30,-15,-3,-29,5,-20,-20,2,-4,11,-5,2,-8,-25,-30,-20,25;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-38,-29,0,-37,-27,44,-27,19,23,-21,-21,-19,-27,-19,-9,30,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-12,-12,-5,-21,-6,-15,-13,-8,-15,-11,-3,-10,0,-13,16,11,-5,-26,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,29,45,-32,-18,-1,-32,12,-23,-21,5,-3,14,1,-1,-10,-29,-31,-19,30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-30,50,20,-36,-6,9,-38,-1,-28,-25,15,-11,2,-8,-1,-12,-30,-36,-17,10;
MA   /M: SY='T'; M=3,1,-12,-3,2,-16,-13,-14,-16,-8,-19,-15,4,-9,-3,-9,25,32,-7,-34,-15,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,26,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-22,1,-1,-24,4,-9,-25,1,-30,-18,13,-2,-2,-4,14,2,-21,-33,-21,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,9,-4,11,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='S'; M=6,5,-11,1,-2,-18,-3,-9,-18,-9,-27,-18,14,-11,-2,-9,33,23,-11,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-12,-1,-2,-21,9,-11,-22,-11,-30,-20,9,-11,-2,-11,35,15,-12,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-2,20,-12,24,55,-21,-21,-2,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,16,-30,-20,18,-30,47,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-18,-11,-2,-20,-21,4,-30,23,-20,-10,-1,-22,7,57,-10,-11,-20,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,18,-30,47,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-11,-7,-8,-12,-15,-16,-12,-9,-13,-12,6,-11,-8,-10,20,40,-4,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,5,-13,7,2,-23,-1,-10,-22,-9,-28,-20,9,-10,-1,-11,32,14,-12,-38,-20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-26,52,24,-33,-10,0,-33,2,-24,-24,14,-7,3,-7,0,-9,-26,-33,-17,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,2,-25,-19,-6,-25,-13,10,-19,11,18,-12,-25,-9,-17,-16,-9,3,-27,-8,-15;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-25,0,16,-29,-3,-7,-24,-2,-23,-15,-2,4,13,-7,8,-4,-23,-28,-20,14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,17,-21,24,14,-24,-3,-6,-25,-2,-19,-18,7,-7,0,-7,3,1,-19,-26,-15,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-31,45,10,-37,3,-6,-37,-5,-30,-27,11,1,-5,-13,-1,-12,-30,-35,-23,2;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-23,-2,-2,-26,21,-15,-26,-11,-24,-18,-1,-7,-9,-15,7,-7,-18,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='E'; M=14,0,-21,-1,19,-24,-4,-11,-22,-2,-16,-15,-4,-7,2,-10,6,-1,-16,-25,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,10,-23,14,15,-26,-6,2,-26,-4,-20,-17,4,-9,1,-9,4,0,-20,-30,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-26,11,29,-28,-14,-7,-25,1,-22,-19,-2,9,7,-8,5,-5,-23,-30,-21,17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-10,-32,-8,10,-21,-17,-15,-6,-4,-12,-7,-9,7,-2,-11,-9,-11,-11,-25,-16,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-29,3,14,-30,-8,-3,-28,23,-26,-12,6,-12,16,17,-4,-10,-25,-23,-15,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-25,14,20,-27,2,-1,-26,1,-21,-15,8,-8,13,-3,1,-9,-26,-24,-17,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=2,6,-22,11,13,-27,-11,-4,-20,0,-18,-13,-1,5,11,-6,1,-6,-19,-23,-16,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=13,-9,-20,-10,-3,-23,-8,-14,-18,-5,-23,-16,-5,15,-4,-6,12,3,-14,-29,-21,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00633;
//
ID   ALDOKETO_REDUCTASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00798;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aldo/keto reductase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0836034; R2=0.0145883; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=565; N_SCORE=13.316; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-3,-22,0,5,-25,-11,-12,-21,-3,-23,-16,-4,16,-2,-8,2,-3,-19,-31,-21,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,1,1,-24,-8,-10,-22,9,-23,-14,3,5,-2,5,-3,-6,-20,-26,-17,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-2,10,-24,13,10,-29,6,-7,-29,0,-27,-19,9,-11,2,-6,9,-4,-23,-31,-21,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,9,17,-24,-20,-5,-17,7,-15,-10,-1,-11,11,1,-3,-5,-15,-26,-11,14;
MA   /M: SY='T'; M=8,-14,2,-19,-18,-10,-15,-22,-3,-16,-6,-6,-13,-20,-17,-17,5,13,10,-28,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=4,-10,-21,-15,-5,-13,-16,-10,-4,-2,-5,0,-9,-15,-5,-8,-3,-1,-2,-21,-7,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,12,-24,15,23,-27,-13,1,-25,2,-19,-16,5,-8,8,-4,3,-5,-21,-30,-16,15;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-14,-16,-8,-20,-4,-16,-8,-10,-12,-8,-7,-12,-3,-15,11,2,-1,-24,-17,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-16,-29,-26,-2,-29,-26,27,-20,11,12,-22,-24,-22,-21,-9,3,33,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-23,-11,-5,-9,-23,-4,-10,11,-8,-3,-7,-19,-1,6,-12,-8,-9,-14,8,-4;
MA   /M: M=-5,-8,-23,-11,-3,-11,-21,-4,-6,-4,-6,-3,-5,-17,-3,-2,-5,-2,-5,-19,-4,-4;
MA   /M: SY='A'; M=46,-10,-11,-19,-10,-20,3,-20,-12,-10,-12,-11,-9,-10,-10,-20,11,0,-2,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-27,3,-37,-27,40,-29,27,19,-23,-23,-21,-27,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-25,20,23,-31,-15,-5,-31,17,-26,-18,6,-8,8,6,0,-6,-24,-30,-17,16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-4,-19,-14,-10,-19,-20,3,-16,2,-1,-15,-21,-14,-17,-2,2,10,-27,-12,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,36,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,74,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-7,-26,-8,-5,-13,-20,60,-17,-15,-4,3,0,-21,2,-6,-11,-14,-18,-28,11,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-39,-29,29,-35,-26,29,-29,17,12,-21,-25,-28,-25,-20,-9,20,-10,10,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,15,-14,-15,-16,-6,-21,-19,-16,-15,-14,-5,-19,-15,-17,10,20,-8,-33,-18,-15;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-12,-14,-6,-10,-18,0,-14,-3,-12,-7,-9,-19,-2,-3,-4,-6,-9,-13,3,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-10,-22,-11,-11,-9,-23,-15,8,-16,7,3,-10,-19,-12,-16,-10,-7,6,-25,-8,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-20,-20,29,-30,19,0,-10,0,0,-19,-29,-10,-10,-19,-8,-10,28,77,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-26,-2,1,-29,17,-6,-29,-2,-24,-14,2,-14,4,-4,1,-12,-24,-23,-19,2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,25,-18,9,-5,-16,-6,1,-12,-4,-23,-15,40,-20,-5,-4,9,5,-16,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,19,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-19,0,0,21,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-26,2,15,-26,-12,-4,-22,10,-20,-11,-2,-4,7,1,-2,-7,-19,-26,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-20,8,31,-26,-13,-1,-27,1,-19,-16,-2,-6,13,-5,-1,-10,-25,-28,-17,22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-31,-29,0,-31,-29,31,-22,13,11,-28,-28,-27,-22,-13,-2,42,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-27,5,23,-27,-19,-3,-19,8,-15,-9,-1,-9,18,4,-3,-9,-20,-25,-14,20;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,23,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-4,-25,-7,1,-24,-17,-8,-19,21,-19,-8,0,-14,9,21,-4,-6,-13,-22,-12,4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-19,5,16,-22,-9,-5,-22,7,-21,-15,6,-8,6,5,8,-1,-17,-27,-16,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=11,-5,-10,-9,-3,-15,-8,-12,-14,7,-14,-8,-4,-10,-3,-1,0,-4,-8,-10,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-16,-24,-18,3,-23,-17,26,-18,14,13,-14,-15,-13,-17,-13,-6,17,-13,0,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,3,-16,3,8,-17,-9,-1,-17,12,-15,-9,4,-7,5,8,0,-4,-13,-17,-9,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-20,19,22,-21,-11,-3,-21,3,-14,-14,3,-5,5,-1,0,-5,-17,-23,-13,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-3,-22,-3,-10,-25,37,-15,-30,-12,-25,-17,2,-15,-11,-14,7,-8,-21,-23,-23,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,-16,-20,-18,-16,-10,-5,-20,-1,-18,0,-2,-12,-15,-15,-17,-1,2,2,-26,-13,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-14,-25,-27,-5,-20,-28,22,-20,5,6,-24,-27,-27,-20,-9,-3,37,-29,-12,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-27,1,4,-27,-14,-10,-25,21,-27,-14,3,5,3,11,-2,-5,-20,-26,-16,2;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,-1,-21,-14,2,-30,24,-22,-11,1,-19,8,56,-7,-9,-20,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,17,-28,25,32,-31,-16,0,-31,14,-24,-19,7,-6,10,3,-1,-9,-26,-30,-17,21;
MA   /M: SY='E'; M=-3,16,-27,25,40,-31,-15,-3,-29,5,-21,-21,3,-4,11,-5,2,-8,-25,-31,-20,25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-31,-23,5,-30,-20,26,-25,33,24,-27,-27,-19,-20,-23,-8,21,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-26,-34,-25,49,-29,-18,0,-25,2,-2,-21,-11,-31,-20,-19,-11,-4,10,22,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00061;
//
ID   GRANULINS_MP; MATRIX.
AC   MP00799;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Granulins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0996251; R2=0.0082175; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1682; N_SCORE=17.920; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=293; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-2,2,-24,1,0,-24,-8,-9,-20,-8,-30,-20,10,26,-4,-11,14,4,-22,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-4,-26,-6,9,-31,-16,2,-20,11,-18,-4,-2,-12,34,18,0,-8,-22,-20,-12,20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-11,-32,49,-13,-35,-13,-28,-15,0,-18,-1,-13,0,-18,-30,-20,-25,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-3,9,-24,15,-14,-22,-8,-18,-14,-6,-14,-7,-12,-2,-12,-14,-26,-22,1;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-21,-42,-17,5,-5,-20,-18,-24,-8,-20,-20,-25,-18,-5,-12,-25,-22,-30,81,11,3;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,-18,-16,-14,-24,27,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-24,-14,-6,-14,-24,-13,-9,17,-4,0,-11,-20,-3,20,-14,-8,-2,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-30,8,32,-32,-20,-1,-28,25,-24,-11,0,-6,26,14,-4,-10,-26,-24,-14,29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=0,-18,-21,-20,-10,-8,-19,-12,-6,-3,9,2,-14,-21,-6,14,-13,-8,-4,-20,-9,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-30,-10,-15,-28,49,-15,-38,-8,-28,-18,0,-20,-13,1,-2,-18,-28,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-18,-30,-22,-12,-12,-28,-12,1,7,-5,2,-8,-20,-2,32,-14,-10,-1,-20,-6,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-10,-18,-14,-12,-18,7,-18,-9,-16,-16,-11,-2,-14,-10,-18,14,2,-5,-28,-18,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-18,-16,-28,-22,45,-26,-20,-4,-22,2,-4,-12,-22,-28,-16,-5,13,0,-5,15,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-14,-22,-14,-12,-12,-24,26,-7,-4,-8,1,-8,-24,-5,9,-10,-10,3,-28,1,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=8,17,-18,22,5,-28,-4,-9,-25,-6,-25,-21,9,-10,-2,-12,18,4,-15,-35,-20,1;
MA   /M: SY='A'; M=27,-2,-18,-5,17,-24,-8,-12,-18,-2,-14,-14,-6,-6,2,-12,6,-4,-12,-24,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,15,-30,23,9,-29,-16,-2,-34,22,-26,-18,8,-14,6,32,-6,-10,-24,-28,-14,6;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-6,-30,-6,-12,-26,35,26,-36,-16,-26,-12,4,-20,-8,-12,-4,-20,-30,-24,-11,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-4,-18,-10,-6,-14,-20,-12,-18,5,-14,-10,0,-14,-2,21,8,27,-8,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,8,-28,-20,4,-26,22,-20,-6,0,-16,29,47,-6,-10,-24,-20,-10,15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,8,29,-30,-20,-6,-30,35,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,-17,-24,-17,-11,-19,-23,10,-17,0,0,-10,-13,-13,-20,3,11,10,-23,-11,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00634;
//
ID   PECTINESTERASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00800;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pectinesterase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4016032; R2=0.0079704; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=524; N_SCORE=6.576; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=515; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-42; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-79,80,-36,-85,-63,-50,-80,23,-79,-69,52,-67,85,-48,-51,-57,-79,-86,-67;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-75,-79,-78,89,-81,-52,-47,-72,-45,-49,-75,-84,-73,-69,-69,-64,16,-37,101;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-75,5,-45,-74,-70,-58,-71,85,-20,-62,-49,-65,17,31,-53,41,-68,-76,-64;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-61,-56,-60,-68,-67,-66,-59,-57,-64,-60,12,-60,-61,-65,-36,113,-52,-89,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-71,-85,-80,-49,-87,-81,71,-77,34,-36,-79,-78,-75,-78,-71,-56,66,-78,-58;
MA   /M: SY='S'; M=47,-67,-58,-55,-77,16,-61,-71,-2,-73,-65,11,-65,41,-58,56,27,-63,-79,-68;
MA   /M: SY='E'; M=26,-77,47,91,-83,-68,-55,-80,-46,-76,-71,-53,-59,18,-55,-53,-59,-72,-82,-72;
MA   /M: SY='A'; M=99,-61,-68,-60,-76,-49,-69,-65,-63,-67,-61,-62,-66,-59,-67,-41,-52,-52,-76,-71;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-67,-83,-77,-51,-85,-82,10,-75,24,-39,-79,-80,-76,-76,-68,-53,93,-84,-60;
MA   /M: SY='A'; M=65,-69,45,-51,-73,-59,-61,-66,37,-18,26,10,-68,-53,4,-50,-55,-60,-79,-67;
MA   /M: SY='A'; M=88,-63,-66,-58,-73,-53,-68,-63,21,-18,-59,-60,-66,-57,-60,-44,3,-53,-76,-69;
MA   /M: SY='C'; M=70,77,-75,-68,-64,-62,-74,-47,-69,6,-52,-68,-74,-67,-72,-52,-54,42,-81,-68;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-85,-64,-55,-83,-64,-67,-74,-3,-83,-70,-65,117,-61,-68,35,-54,-76,-79,-79;
MA   /M: SY='D'; M=-62,-78,66,60,-82,-70,-56,-79,38,-77,-71,-47,11,17,5,-54,26,-74,-84,-69;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-74,5,-46,-72,-9,-58,-76,93,-75,-66,-48,-64,-45,-34,-2,2,-71,-70,16;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-66,-48,-59,-76,17,-54,-75,-55,-79,-70,79,-67,-51,-61,80,6,-70,-86,-69;
MA   /M: SY='T'; M=-10,-72,-58,0,-72,-9,-62,-65,48,-19,26,10,53,-53,-53,-1,53,-63,-79,-68;
MA   /M: SY='T'; M=-56,-73,6,39,-76,30,-62,-70,48,-72,-66,-50,-63,-49,5,-1,53,-10,-80,-68;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-80,-64,-54,-74,-75,-55,-74,-31,-70,26,-57,36,-45,103,-58,25,-70,-77,-64;
MA   /M: SY='Y'; M=-69,77,-74,-70,70,-78,-50,-59,-66,-53,-53,-69,-83,39,-65,-65,-65,-61,-41,100;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-78,-75,-55,-81,-81,58,-72,-41,-43,-70,-74,-73,-76,-4,27,79,-83,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-77,-86,-84,-49,-90,-86,106,-79,-32,-36,-76,-74,-76,-82,-73,-58,9,-74,-57;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-80,-67,-65,50,-77,85,-64,-55,-57,-53,-62,-79,-56,42,-65,-66,-67,-45,100;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-74,-85,-82,-50,-88,-86,92,-78,-34,-37,-77,-75,-76,-80,-71,-56,61,-78,-58;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-77,-51,26,-79,-70,-57,-80,105,-78,-67,-49,-62,-39,-26,-57,-57,-75,-73,-66;
MA   /M: SY='A'; M=74,-68,-58,38,-75,-58,-62,-68,-49,-67,26,-59,-66,-50,42,0,-55,-59,-77,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-68,-72,-70,-58,-77,-76,48,-64,-46,-47,-63,-70,-67,0,-3,62,65,-83,-62;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-70,-74,-19,-78,-37,-56,-65,-53,-50,-72,-83,-61,-62,-66,-65,-62,-27,135;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-76,30,-47,-75,-70,-56,-68,71,-72,-64,35,-69,-45,64,-57,-57,13,-80,-65;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='N'; M=-61,-72,-42,-50,-73,-56,-45,-73,-46,-76,-64,104,-71,77,-52,-46,3,-75,-80,16;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-83,-78,-53,-85,-86,41,-75,-38,-41,-78,-78,-77,-77,-67,-52,96,-85,-61;
MA   /M: SY='E'; M=-62,-77,57,66,-64,-73,-55,-5,-51,-65,-63,10,-66,-49,2,-57,2,14,-74,43;
MA   /M: SY='V'; M=-58,-70,-84,-79,-50,-86,-81,65,-76,12,30,-78,-77,-75,-77,-70,-55,75,-80,-58;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-77,29,-51,-80,-64,-65,-72,21,-78,-69,-55,93,-58,-61,21,42,-70,-82,-74;
MA   /M: SY='K'; M=12,-73,-57,-46,-75,-65,-60,-72,96,-20,-63,-50,-64,-44,-32,21,-54,-68,-73,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-60,-75,-55,2,-73,-68,-56,-71,85,-19,26,11,-66,-43,31,20,-55,-69,-75,-64;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-75,-61,-52,-73,-72,29,-65,85,-66,53,-53,-67,-49,-38,-3,26,-10,-79,-63; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-63,-75,-62,-65,-65,14,-63,-66,21,-65,70,62,-71,-59,-60,-56,41,-68,102,-58; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-69,-39,-54,-71,-54,-44,-75,37,-80,-68,114,-72,-48,-49,-47,-49,-77,-83,15;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-71,-85,-80,-48,-87,-80,71,-77,42,-35,-79,-78,-75,-78,-72,-57,60,-77,-57;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-70,-83,-75,48,-78,-61,24,-69,-32,125,-70,-73,-64,-68,-68,1,-1,-67,-44;
MA   /M: SY='M'; M=-65,-72,-86,-80,69,-84,-71,64,-75,-5,83,-75,-77,-74,-75,-72,-60,21,-63,-41;
MA   /M: SY='Y'; M=-65,-74,-82,-79,50,-84,-64,57,-74,11,30,-76,-80,-72,-73,-71,-60,33,-54,72;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-81,112,8,-88,-65,-52,-85,-52,-82,-79,-37,-66,41,-59,-55,-58,-82,-97,-69;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-75,-63,-74,-81,98,-71,-86,-68,-83,-73,-50,-67,-67,-76,-47,25,-79,-75,-76;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=36,-76,-56,33,-79,-66,-60,-76,59,-75,-66,-57,46,-45,54,-55,-58,-70,-76,-69;
MA   /I: I=-6; E1=0; MI=0; IE=0; DE=-29;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00413;
//
ID   TRANSKETOLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00801;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transketolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1241765; R2=0.0175594; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=199; N_SCORE=9.608; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=22; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-26,-2,3,-22,-16,-3,-23,19,-21,-9,2,-8,4,18,-4,-7,-18,-24,-11,2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-25,2,0,-24,-5,-7,-22,4,-20,-12,6,-7,2,2,1,-5,-19,-27,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-22,-20,-13,3,-25,-12,8,-16,17,12,-16,-23,-9,-13,-16,-7,3,-18,1,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-23,1,0,-16,-11,-11,-21,-3,-23,-17,2,0,-3,-6,8,4,-17,-20,-12,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-7,-7,-23,-9,-4,-12,-21,-13,0,-8,-1,0,-8,-14,-6,-10,-7,-2,-2,-24,-6,-7;
MA   /M: SY='E'; M=1,7,-21,9,16,-26,-13,-5,-24,5,-21,-15,3,-7,7,0,5,-2,-19,-29,-16,11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-26,-1,10,-22,-18,-9,-10,-3,-11,-6,-5,-10,10,-7,-2,-6,-12,-23,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-12,-23,-9,-7,-5,-24,-6,0,-16,21,6,-15,-23,-10,-10,-18,-10,-3,-25,-4,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-27,2,14,-26,-15,-7,-22,10,-21,-12,-1,-2,9,6,-1,-4,-20,-24,-15,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-5,-24,-5,3,-19,-17,-8,-13,3,-5,-4,-6,-15,5,4,-7,-6,-12,-23,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=1,-23,-14,-27,-19,0,-24,-21,15,-23,23,12,-21,-24,-17,-20,-13,-2,13,-24,-6,-19;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,2,-23,-16,-15,-11,-22,-2,-15,-7,-5,-13,-18,-15,-21,4,-1,8,-27,-18,-16;
MA   /M: SY='B'; M=-7,18,-24,17,10,-26,-10,0,-23,4,-22,-16,17,-13,6,2,3,-4,-22,-32,-16,8;
MA   /M: SY='E'; M=3,3,-19,3,18,-23,-16,-8,-21,2,-17,-14,-1,-8,8,-3,6,6,-16,-26,-14,12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-35,-26,4,-33,-26,34,-29,27,18,-23,-24,-21,-25,-22,-10,22,-20,-1,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: M=-2,-5,-17,-8,-3,-5,-17,-7,-11,-7,-9,-7,-4,-17,-5,-8,-2,-3,-8,-21,-4,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-18,-23,-19,-10,11,-25,-10,0,-11,14,4,-15,-24,-12,-4,-17,-8,-4,-12,9,-12;
MA   /M: SY='I'; M=5,-18,-19,-22,-16,-7,-19,-14,10,-20,6,3,-12,-19,-13,-19,-2,-1,9,-26,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-22,-33,-25,1,-32,-24,32,-25,24,19,-23,-23,-19,-23,-18,-6,24,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-27,36,22,-33,-13,1,-31,4,-25,-21,13,-9,10,-3,4,-3,-26,-34,-17,16;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-12,-17,-12,-13,-12,-18,-2,-11,-6,-3,-9,-16,-10,-14,7,8,6,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-8,-29,-27,-1,-30,-28,25,-21,12,9,-26,-28,-26,-20,-10,2,37,-29,-9,-27;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-20,2,14,-25,-4,-8,-22,-3,-21,-15,2,-9,8,-7,13,3,-17,-29,-19,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-18,-14,-6,-17,-9,-10,-11,-2,-11,-6,-7,-15,-4,-4,1,-3,-4,-20,-10,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-20,3,-1,-20,-1,-5,-20,1,-24,-15,21,-15,-1,-1,10,5,-19,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='G'; M=4,-3,-21,-4,-10,-25,36,-14,-30,-15,-30,-20,7,-16,-10,-15,18,-1,-21,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-25,-30,-22,-12,-1,-26,-21,0,-20,4,-2,-23,29,-18,-21,-18,-10,-9,-21,-11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=14,-9,-22,-12,-15,-26,41,-19,-29,-16,-24,-17,-2,-16,-15,-19,7,-8,-19,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='S'; M=9,-11,-18,-12,-7,-17,-7,-14,-10,-12,-13,-5,-7,5,-7,-15,11,5,-7,-30,-18,-8;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-19,-5,-6,-24,3,-14,-21,-11,-26,-18,4,15,-9,-15,7,-1,-20,-32,-24,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-15,-30,-20,5,-26,-13,18,-23,37,33,-26,-27,-13,-17,-26,-10,9,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=13,-19,-9,-25,-20,-7,-18,-20,11,-16,7,10,-19,-21,-16,-18,-5,1,18,-25,-11,-18;
MA   /M: SY='V'; M=18,-20,-12,-25,-20,-9,-18,-24,13,-16,1,3,-19,-20,-19,-20,-1,2,24,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-31,20,38,-31,-17,-3,-29,3,-23,-21,-1,14,9,-6,-2,-10,-29,-31,-21,22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-32,-22,5,-29,-20,25,-26,35,24,-26,-26,-17,-20,-24,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=14,-8,-14,-17,-14,-13,-9,-20,-4,-13,-7,-5,-6,-13,-12,-16,9,19,2,-25,-13,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-21,-23,-15,0,-28,-9,15,-18,9,7,-18,-22,-15,-17,-13,-4,14,-18,6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-8,-21,-16,-14,-6,-23,-2,-14,-6,-6,-14,-17,-16,-19,4,3,10,-25,-17,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,9,-30,-19,21,-29,47,22,-29,-29,-19,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-18,-31,-20,-16,16,-24,35,-16,-17,-8,-3,-11,-26,-10,-10,-20,-18,-19,21,33,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-25,-7,-4,-5,-18,2,-17,5,-14,-7,-3,-18,2,9,-5,-4,-15,-12,9,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-13,-20,-13,-9,-10,-23,-10,-2,-1,-4,-1,-11,-21,-8,4,-7,-1,7,-24,-5,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-21,-29,-22,38,-28,-7,2,-23,8,2,-16,-26,-23,-16,-14,-2,0,-3,22,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-11,5,-21,4,-4,-13,-16,-4,-6,-9,1,5,3,-19,-4,-9,-8,-7,-9,-29,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-14,-6,-3,-18,-15,-9,-19,6,-18,-11,3,-11,-2,8,6,8,-13,-29,-14,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00635;
//
ID   TRANSKETOLASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00802;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transketolase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5063605; R2=0.0162973; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=507; N_SCORE=13.759; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-5,-27,-6,7,-26,-21,22,-14,-1,-9,6,-3,-14,33,2,-6,-10,-21,-23,-3,19;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-25,8,11,-26,-3,-1,-28,14,-27,-16,17,-13,5,10,0,-8,-26,-29,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-20,-17,-22,-13,-2,-23,-16,8,-21,23,9,-19,-23,-10,-16,-13,-4,4,-23,-6,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-4,-34,-1,1,-28,-9,-8,-24,-1,-29,-18,-1,39,-3,-5,-6,-10,-29,-29,-23,-4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-23,-13,-26,-25,-4,-27,-24,23,-18,6,7,-21,-26,-22,-19,-7,1,36,-29,-10,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-12,-20,-19,-15,-5,-25,-17,7,-9,0,2,-6,-19,-12,-3,-4,8,8,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-23,-32,-24,40,-30,-7,7,-24,13,7,-20,-27,-24,-18,-20,-11,2,2,26,-23;
MA   /M: SY='V'; M=11,-23,-3,-27,-23,-9,-20,-26,13,-19,1,3,-21,-20,-22,-22,-6,-3,23,-27,-14,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-25,-29,-23,4,-18,-17,16,-23,17,12,-20,-24,-17,-21,-19,-11,7,-10,6,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,29,-21,37,8,-28,-12,-8,-28,-4,-24,-22,12,-10,-3,-10,11,13,-18,-37,-17,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-30,-6,0,-20,-20,43,-30,13,-20,-6,4,-20,10,40,-10,-14,-24,-24,3,0;
MA   /M: SY='A'; M=19,9,-5,9,-2,-27,-3,-14,-23,-9,-19,-18,0,-13,-9,-17,5,-4,-12,-30,-21,-5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,48,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,13,-7,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-34,-27,7,-34,-26,33,-27,22,15,-24,-23,-23,-24,-19,-8,25,-19,1,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-14,-25,-21,-1,-27,-25,19,-19,13,7,-22,-24,-22,-18,-8,6,28,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,-1,-16,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-23,7,25,-26,-11,-6,-22,0,-19,-17,-1,-1,6,-8,5,-4,-19,-29,-19,15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=10,-12,-28,-9,5,-27,-13,-17,-18,-7,-22,-16,-14,42,-5,-17,-2,-7,-20,-27,-25,-2;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,2,-22,-20,92,-29,-8,-20,0,9,-19,15,1,-9,-19,-30,-29,17,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,3,-21,-2,7,-28,-14,10,-17,1,-17,-1,6,-14,27,0,0,-8,-22,-25,-11,17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-13,-31,-11,-13,-28,33,-20,-30,-16,-27,-17,-8,15,-16,-20,-2,-15,-26,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='I'; M=2,-22,-15,-27,-21,-3,-24,-20,19,-19,11,13,-19,-22,-16,-19,-9,-3,19,-24,-6,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-13,-30,-12,7,14,-23,-11,-16,-10,-7,-11,-15,-18,-9,-11,-15,-13,-18,18,11,1;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-28,46,16,-36,-12,10,-34,0,-27,-21,16,-11,10,-6,1,-7,-28,-35,-14,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-21,-29,-21,5,-29,-20,22,-25,28,18,-23,-22,-18,-20,-20,-5,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-12,-12,-7,-20,2,-17,-15,-11,-18,-14,-3,-7,-7,-16,19,7,-6,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-21,-26,-20,17,-22,-7,8,-19,9,12,-16,-23,-16,-16,-12,-6,3,-10,14,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-15,-31,-22,20,-28,-18,12,-27,33,17,-26,-28,-21,-19,-24,-8,6,-12,5,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-27,-9,-2,-22,-6,-4,-28,16,-22,-12,2,-18,7,41,-2,-8,-20,-22,-14,-1;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,3,-21,-16,-11,-17,-19,-1,-18,-4,-4,-11,-16,-15,-20,1,1,4,-28,-14,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-20,-32,-26,1,-32,-24,32,-23,19,20,-23,-24,-20,-22,-15,-2,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-40,-9,2,-30,-20,-19,-20,-9,-30,-20,-19,88,-9,-19,-10,-10,-30,-30,-30,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-23,9,-5,-22,14,3,-24,-3,-28,-17,37,-19,-4,-3,5,-5,-28,-33,-20,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-16,-30,-22,7,-27,-15,20,-22,19,25,-20,-24,-15,-18,-17,-7,13,-21,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-14,-12,-11,-10,-20,-11,-3,-7,-7,-3,-5,-20,-8,-4,1,8,4,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-16,-31,-27,2,-32,-25,29,-22,15,12,-25,-26,-24,-21,-13,-1,33,-24,-2,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-23,-22,-31,-21,12,-20,-14,7,-17,7,19,-21,-22,-14,-16,-16,-9,3,7,6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=15,-12,-11,-18,-9,-15,-12,-10,-15,1,-12,-8,-9,-17,-5,9,-1,-4,-7,-18,-8,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-35,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,78,-10,-20,-8,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-2,-14,-8,-20,-10,-15,-19,1,-18,-11,-5,-17,-5,4,5,1,-8,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-24,62,17,-38,-10,-1,-38,-1,-30,-29,19,-11,-1,-10,2,-8,-28,-40,-20,8;
MA   /M: SY='E'; M=6,0,-23,0,16,-25,-3,-8,-21,-2,-17,-13,-2,-9,6,-7,3,-6,-17,-25,-17,11;
MA   /M: SY='A'; M=5,0,-19,-4,-2,-17,-14,-8,-7,-4,-12,-8,2,-16,-4,-7,1,-2,-3,-28,-13,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00635;
//
ID   CALRETICULIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00803;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calreticulin family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3167644; R2=0.0153563; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=596; N_SCORE=14.459; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-32,-7,6,-25,-19,-16,-14,-6,-22,-15,-12,43,-5,-14,-3,-5,-18,-30,-23,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-24,-20,-33,-27,51,-29,-20,8,-26,10,3,-15,-28,-32,-19,-17,-8,6,-3,17,-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-16,3,-1,-18,-8,-10,-12,-10,-18,-13,8,-14,-4,-12,17,7,-6,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-20,0,-5,2,-11,-2,-10,-10,-9,-10,24,-21,-9,-8,0,-2,-17,-27,-8,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-28,8,15,-29,-18,-8,-29,27,-26,-14,1,-4,7,16,-5,-6,-21,-25,-14,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,9,-26,12,1,-29,22,-12,-32,-9,-25,-20,6,-13,-8,-13,4,-5,-24,-28,-23,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-29,5,5,-30,-3,-8,-31,29,-29,-13,6,-13,6,17,-6,-11,-24,-23,-15,5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-17,1,-4,-18,-18,-17,-16,-9,-17,-15,0,5,-8,-11,14,32,-9,-32,-15,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-22,11,-29,-20,20,-26,36,19,-27,-28,-21,-19,-23,-6,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-32,-27,7,-31,-27,28,-25,23,14,-28,-29,-26,-21,-18,-5,34,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-21,11,27,-24,-15,-7,-24,0,-21,-18,4,-5,7,-5,14,11,-18,-33,-18,17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-13,-30,-29,-1,-31,-29,31,-21,10,10,-27,-27,-27,-21,-10,1,44,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-12,5,-28,2,7,-27,-17,-5,-28,38,-28,-12,10,-13,8,32,-7,-8,-22,-23,-12,7;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-18,-26,-20,-14,16,-26,24,-8,-21,3,2,-11,-13,-14,-13,-17,-14,-11,-16,13,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-30,21,41,-35,-18,3,-28,8,-22,-15,3,-5,30,2,0,-10,-30,-28,-17,35;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,16,-27,13,21,-32,-14,6,-24,9,-24,-12,19,-11,29,6,2,-7,-29,-29,-15,25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,8,-26,10,-4,-29,25,-12,-33,-5,-29,-20,8,-15,-8,-9,6,-6,-24,-28,-23,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-24,-32,-22,2,-32,-21,29,-26,31,20,-24,-25,-15,-21,-23,-9,17,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-25,35,25,-30,-14,-3,-28,1,-23,-22,11,-8,4,-7,4,-2,-22,-35,-19,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=28,-10,-19,-16,-14,-24,30,-20,-23,-14,-19,-14,-6,-14,-14,-20,6,-9,-13,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-26,3,-33,-25,35,-26,27,21,-25,-25,-21,-23,-21,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-28,-22,12,-30,-15,18,-25,35,15,-28,-30,-20,-18,-25,-8,14,-14,11,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-22,17,-28,-17,18,-26,38,24,-27,-28,-20,-18,-26,-10,11,-17,3,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-23,-5,-2,-24,-3,-11,-23,-1,-24,-16,-1,4,0,3,9,-1,-18,-28,-20,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-21,3,6,-28,8,-13,-29,-6,-27,-20,-1,4,-4,-11,6,-6,-23,-30,-24,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-25,13,2,-18,-7,-6,-23,-4,-20,-14,5,-8,2,-7,0,-1,-21,-24,-9,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-11,-19,-12,-6,-12,-15,-16,0,-10,-1,2,-11,-17,-9,-13,-3,-1,5,-27,-12,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-12,6,8,-13,-5,3,-13,2,-12,-8,6,-5,2,-2,3,-2,-11,-16,-8,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-13,-10,-9,-7,7,-11,-5,-8,1,-1,-7,-12,-9,-7,-6,-7,-2,-11,-8,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,18,-32,24,14,-24,-15,0,-26,-3,-23,-20,8,-13,1,-9,-7,-12,-27,-5,-9,8;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-12,-22,-15,-3,-16,-19,-11,-5,-4,2,3,-12,-9,6,-6,-7,-2,-8,-22,-10,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=3,-3,-25,-1,8,-24,-11,-13,-21,8,-18,-12,-5,1,0,-2,-2,-5,-16,-25,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-12,17,-28,18,17,-31,-15,-1,-28,22,-27,-15,14,-11,15,12,-2,-8,-26,-28,-14,16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-21,-25,-17,34,-14,-5,-8,-21,-1,2,-11,-23,-21,-15,-10,-9,-7,-8,11,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-9,-26,-12,-11,2,-8,24,-16,-14,-12,-4,-1,-22,-6,-10,-7,-11,-17,-13,14,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,16,-28,22,-2,-33,29,-11,-37,-10,-28,-23,10,-15,-10,-15,1,-13,-28,-29,-25,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-28,19,17,-27,-14,-3,-27,10,-25,-19,8,-2,4,0,0,-7,-24,-28,-13,10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-38,-6,9,-31,-20,-15,-21,-6,-28,-18,-16,70,1,-15,-8,-10,-30,-29,-27,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00636;
//
ID   CALRETICULIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00804;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calreticulin family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7076254; R2=0.0138952; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=540; N_SCORE=12.201; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=129; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=13,-3,-20,-3,7,-25,13,-13,-25,-8,-22,-17,-1,-10,-3,-13,11,-4,-18,-27,-23,2;
MA   /M: SY='G'; M=5,0,-25,1,0,-19,7,-8,-24,-3,-19,-15,-3,-14,-6,-10,-2,-10,-18,-16,-6,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-30,-23,-31,-24,3,-23,-25,9,-22,14,3,-30,-27,-21,-20,-22,-11,9,19,2,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-26,26,9,-29,-13,-5,-29,16,-27,-19,16,-12,2,6,1,0,-22,-31,-15,6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-9,-31,-7,5,-26,-21,21,-17,-5,-13,-2,-6,9,19,-4,-9,-13,-25,-25,-6,10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-28,-6,-1,-15,-8,-1,-21,14,-21,-9,-4,-16,7,6,-5,-8,-19,-10,9,1;
MA   /M: SY='A'; M=12,1,-23,0,-1,-29,10,-11,-25,-1,-21,-14,-1,-12,2,-9,2,-9,-18,-23,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-25,-32,-22,52,-27,-20,-5,-25,0,-5,-20,0,-32,-20,-17,-10,-8,0,15,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-30,39,7,-35,10,8,-39,-7,-29,-23,13,-14,-4,-11,-1,-14,-30,-33,-17,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-21,-5,-13,-23,30,-15,-28,-14,-25,-17,8,-16,-13,-14,12,5,-20,-27,-23,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,33,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,5,-3,15,-3,0,-10,-30,-33,-20,32;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-7,-4,-4,-11,-8,-12,-11,-7,-14,-11,3,-7,-4,-7,22,27,-3,-26,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-35,-7,-1,-30,12,-18,-28,-12,-29,-20,-11,41,-10,-18,-5,-14,-30,-26,-29,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-25,-23,-23,22,-30,7,8,-13,3,3,-23,-30,-15,-13,-17,-7,5,15,57,-23;
MA   /M: SY='S'; M=2,8,-16,8,15,-23,-5,-5,-23,-4,-27,-20,14,-9,5,-6,26,10,-18,-37,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,35,-29,31,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-17,-30,-23,0,-23,-8,23,-13,17,47,-23,-23,-8,-13,-17,-7,20,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-28,-25,-19,1,-32,-12,16,-7,3,7,-16,-22,-11,-5,-17,-9,10,-9,17,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,52,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-27,-13,-9,-18,-4,-16,-17,-11,-19,-14,-12,25,-11,-17,-1,0,-17,-20,-13,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-15,-1,9,-16,-18,-14,-16,-5,-15,-14,1,-7,-1,-7,17,32,-9,-31,-14,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-11,18,-25,9,4,-24,-10,1,-25,23,-29,-15,30,-16,5,21,0,-5,-25,-30,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-5,0,-28,3,-10,-33,28,-28,-13,0,-15,2,27,-7,-13,-23,-20,-15,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,16,12,-30,-30,-28,-20,-13,-2,44,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,5,-25,-20,77,-27,-5,-20,0,7,-17,23,3,-7,-17,-30,-27,12,10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-28,-15,-34,-28,37,-27,-24,11,-24,8,3,-23,-28,-33,-20,-13,-5,20,-9,9,-28;
MA   /M: SY='I'; M=5,-25,-25,-35,-25,-5,-30,-27,35,-25,12,12,-17,-17,-17,-27,-12,-7,22,-20,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-35,-26,21,-33,-24,25,-28,28,14,-25,-27,-26,-23,-22,-8,19,-15,5,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-21,11,1,-21,-5,3,-22,9,-29,-18,38,-17,2,10,10,1,-24,-35,-18,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-10,-30,-10,-8,3,-25,32,-15,5,-12,-3,-8,-23,0,2,-15,-12,-17,3,43,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-24,-5,0,-23,-20,-10,-12,21,-18,-5,-1,-16,7,11,-6,-6,-5,-25,-11,4;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-28,26,-1,-31,24,-5,-35,-8,-30,-24,22,-16,-8,-12,2,-12,-30,-32,-24,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-35,1,19,-30,-20,-12,-25,8,-27,-18,-10,43,3,-4,-7,-10,-28,-28,-23,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00636;
//
ID   CALRETICULIN_REPEAT_MP; MATRIX.
AC   MP00805;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calreticulin family repeated motif signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0871778; R2=0.0101373; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=664; N_SCORE=10.818; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=239; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-38,-4,12,-30,-20,-16,-22,-6,-28,-20,-16,73,-4,-16,-8,-10,-30,-30,-28,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-24,18,26,-17,-17,-6,-25,-1,-19,-19,3,-8,3,-7,5,2,-21,-29,-14,15;
MA   /M: SY='D'; M=-1,26,-24,36,6,-32,-1,-8,-29,-5,-23,-22,8,-12,-6,-14,2,-8,-19,-33,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-22,-5,5,-19,-20,-13,-14,17,-14,-7,-6,-13,0,7,-3,1,-6,-26,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-4,6,-26,-20,-9,-23,42,-23,-1,-3,-11,9,25,-11,-10,-16,-20,-9,7;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-18,-38,-10,-1,-25,-21,-15,-19,-4,-27,-17,-18,69,-8,-14,-11,-10,-27,-24,-18,-9;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-21,9,17,-22,-16,-11,-15,-3,-13,-13,-4,-10,-1,-10,2,-1,-7,-30,-17,8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-28,34,6,-33,17,-5,-36,-6,-30,-25,19,-14,-6,-11,2,-12,-30,-33,-23,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-44,-36,-28,17,-22,-19,-17,-20,-15,-15,-34,-30,-20,-18,-35,-26,-25,118,33,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-28,53,24,-35,-13,-2,-33,0,-25,-25,12,-10,1,-9,-1,-9,-24,-37,-19,13;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-14,26,-28,40,23,-33,-13,-2,-31,4,-25,-22,9,3,6,-5,-1,-9,-27,-32,-18,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-22,-1,16,-16,-17,-8,-6,-3,-9,-7,-7,14,2,-8,-5,-7,-11,-19,-12,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-38,-10,0,-28,-20,-16,-22,-1,-28,-18,-16,65,-6,0,-10,-10,-28,-28,-26,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=4,-6,-20,-6,9,-17,-16,-11,-13,5,-6,-7,-7,-11,1,2,-4,-4,-9,-22,-12,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-24,2,7,-13,-17,2,-18,7,-17,-6,3,-14,2,2,-2,-2,-16,-22,-1,4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-28,-38,-29,0,-38,-28,46,-28,19,22,-21,-21,-19,-28,-19,-9,30,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-32,-5,4,-26,-20,-17,-16,-3,-23,-15,-15,46,-7,-13,-7,-7,-17,-29,-23,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-28,61,16,-36,-12,-3,-34,-2,-26,-26,16,-12,-3,-11,-1,-9,-23,-39,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-31,-10,1,-24,-20,-17,-14,-3,-21,-11,-16,43,-7,-12,-7,-6,-16,-28,-22,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-23,26,25,-28,-10,-2,-28,1,-26,-22,15,-8,6,-5,12,1,-24,-36,-20,16;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-12,-13,-9,-20,-4,-19,-9,-10,-10,-10,-9,-12,-11,-19,8,0,2,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='K'; M=0,-8,-21,-8,3,-20,-20,-15,-9,12,-14,-6,-9,-14,-1,2,-3,-2,1,-25,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-30,27,47,-31,-18,10,-32,6,-22,-20,5,-4,15,-2,-1,-11,-30,-32,-16,30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,65,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,46,34,-35,-15,-1,-35,8,-26,-25,11,-6,8,-3,-1,-10,-29,-35,-19,21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-27,19,29,-27,-14,0,-29,9,-23,-19,10,-9,10,10,2,-7,-26,-31,-18,18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-21,8,28,-19,-15,-2,-16,3,-10,-4,-3,-4,10,-3,-2,-5,-16,-23,-13,19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-27,33,10,-29,-11,-6,-26,-3,-24,-21,4,22,-3,-11,-3,-8,-24,-29,-19,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-25,-13,-13,-23,28,-16,-21,-13,-19,-11,-4,-11,-9,-13,-2,-13,-17,-19,-21,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-28,11,28,-24,-18,2,-24,7,-19,-13,0,-9,19,6,1,-6,-24,-23,-8,23;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-35,-39,-39,-30,5,-29,-30,13,-24,-1,-1,-31,-26,-21,-24,-29,-19,1,66,14,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-28,2,16,-21,-23,-13,-9,-5,-13,-11,-8,8,-1,-12,-4,-4,-9,-30,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=2,18,-26,26,7,-31,-9,-9,-27,-3,-24,-21,4,5,-4,-10,1,-7,-21,-31,-21,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-35,-5,8,-29,-17,-16,-21,-7,-29,-20,-13,65,-5,-16,-2,-6,-27,-31,-27,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-21,5,13,-24,-14,-4,-19,2,-18,-8,6,-10,12,-2,7,5,-17,-29,-15,12;
MA   /M: SY='A'; M=14,-13,-20,-19,-15,-13,-19,-22,12,-14,0,1,-12,-16,-14,-20,-5,-5,12,-23,-11,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-9,-20,-7,-7,-15,-20,-19,-1,-12,-7,-6,-12,-1,-13,-16,-1,4,5,-30,-15,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-25,10,6,-26,-10,2,-24,21,-29,-14,31,-15,9,13,1,-5,-26,-30,-15,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-32,-18,-8,-15,-24,-20,-5,-18,0,-5,-24,44,-14,-20,-18,-10,-15,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-19,9,28,-25,-9,-5,-25,-1,-25,-20,5,-5,9,-5,21,6,-19,-35,-20,19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00636;
//
ID   ALDOLASE_CLASS_II_2_MP; MATRIX.
AC   MP00806;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fructose-bisphosphate aldolase class-II signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4881687; R2=0.0153066; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=238; N_SCORE=9.121; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-16,-23,-22,-16,-7,-28,-17,15,-11,9,10,-11,-20,-9,-9,-11,-1,9,-23,-5,-14;
MA   /M: SY='T'; M=6,-9,8,-16,-15,-12,-18,-22,-7,-14,-11,-9,-8,-17,-15,-16,12,23,6,-33,-15,-15;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-23,-4,5,-27,-13,-10,-24,26,-25,-11,0,-10,9,15,2,-4,-16,-23,-13,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-28,10,29,-30,-17,-4,-28,21,-24,-15,1,-7,16,13,-1,-8,-24,-26,-15,22;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-18,-28,-25,13,-30,-15,19,-21,17,10,-27,-30,-23,-18,-18,-5,24,-12,15,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-9,-28,-24,5,-28,-24,18,-24,19,9,-24,-27,-23,-20,-13,-1,22,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-27,16,24,-29,-17,1,-29,16,-23,-16,3,-8,9,5,-2,-6,-23,-28,-13,16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-16,-26,-19,-13,5,-24,-6,-2,-2,3,7,-12,-22,-7,10,-16,-10,-4,-11,9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,3,-23,-15,-16,-10,-19,-5,-13,-6,0,-12,-15,-11,-20,3,0,2,-24,-17,-13;
MA   /M: SY='H'; M=1,-2,-23,-3,-1,-22,-15,35,-22,0,-19,-6,2,-15,4,-1,-2,-10,-16,-26,0,0;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-25,-8,0,-21,-13,-11,-18,7,-18,-11,-1,-5,1,2,-3,-6,-17,-13,-13,0;
MA   /M: SY='M'; M=0,-15,-21,-21,-13,-8,-22,-10,3,-4,-2,8,-12,-17,-6,-6,-7,-2,5,-21,-5,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-29,7,-3,-30,30,-11,-35,0,-29,-19,11,-16,-7,-6,0,-14,-28,-26,-23,-5;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-9,-29,-23,-6,-25,-21,20,-18,7,16,-21,-23,-15,-19,-10,-5,24,-25,-9,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,-9,-17,-12,-9,-8,-10,-15,-10,-14,-18,-10,-1,-14,-7,-13,19,12,-6,-16,-9,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-31,-27,3,-31,-27,28,-24,23,14,-29,-29,-26,-21,-17,-4,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=13,-19,-19,-26,-19,-10,-8,-21,9,-19,6,7,-16,-19,-16,-21,-7,-7,10,-21,-12,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,29,-28,34,18,-28,-28,-22,-22,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,1,-22,-17,-11,-27,-21,4,-13,-4,-1,-12,-21,-11,-8,-2,6,9,-29,-11,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-16,-26,-21,1,-29,-24,18,-22,20,9,-20,-23,-19,-19,-10,9,19,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-20,-28,64,-19,-36,-19,-27,-14,-1,-20,-19,-19,-1,-19,-27,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,61,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-26,-1,25,-20,-23,-6,-9,-2,-4,-3,-8,-10,12,-6,-6,-6,-12,-26,-12,18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-17,44,-27,60,16,-36,-11,-3,-36,-1,-27,-27,17,-10,-1,-10,3,-2,-26,-39,-19,7;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-29,7,-11,-31,50,-14,-39,-15,-30,-22,8,-18,-15,-17,1,-17,-30,-25,-27,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-19,-27,-20,-3,-31,-24,27,-17,11,13,-23,-23,-19,-18,-14,-5,31,-26,-7,-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-19,6,-4,-21,-9,-13,-10,-10,-15,-11,2,-15,-6,-13,7,2,-3,-32,-16,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-2,6,-21,0,-4,-20,11,-9,-17,-9,-21,-14,14,-18,-9,-10,4,-5,-13,-31,-21,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=1,11,-21,14,18,-26,-10,-4,-23,1,-22,-17,7,-8,9,-5,10,1,-19,-30,-17,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-18,1,8,-18,17,-7,-21,-4,-15,-12,-1,-7,-2,-7,1,-9,-17,-15,-16,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,18,17,-25,-16,3,-20,4,-17,-13,2,-10,3,-3,-3,-9,-15,-28,-12,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-11,-21,-10,-13,-10,-11,-16,1,-14,4,0,-10,-20,-13,-8,-10,-7,3,-23,-10,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-21,-2,-6,-15,-12,4,-12,-10,-12,-9,-3,-15,-6,-15,1,-5,-8,-19,0,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-1,3,-21,-5,-7,-12,-2,-3,-14,-8,-13,-10,11,-16,-9,-9,-2,-7,-14,-27,-13,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-6,4,-17,4,2,-14,-13,-2,-5,-4,-9,-6,2,-9,-2,-6,0,-1,-5,-21,-7,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-16,-18,-18,-14,14,-19,0,4,-12,7,2,-15,-19,-11,-11,-12,-6,-1,6,29,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-22,8,14,-21,-20,-12,-17,-4,-16,-15,-2,2,-2,-9,5,12,-12,-31,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-26,23,19,-29,-4,-3,-30,5,-26,-20,16,-10,4,-2,4,-3,-26,-32,-19,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00523;
//
ID   ADP_GLC_PYROPHOSPH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00808;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ADP-glucose pyrophosphorylase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7527895; R2=0.0136679; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1044; N_SCORE=19.012; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-11,-20,-14,-3,-14,-15,-5,-9,2,-4,13,-9,-16,1,12,-11,-9,-9,-24,-10,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-16,-8,-5,-2,-10,-4,-9,-1,-6,-4,-2,-14,-2,4,-3,-3,-8,-11,2,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: M=-5,-3,-16,-5,-5,-10,-13,-3,-5,-1,-9,-4,0,-7,-3,0,-2,-2,-3,-18,-6,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-16,-3,-1,-11,-11,2,-13,1,-14,-8,1,-8,1,2,4,1,-10,-16,0,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=2,-5,-21,-8,-2,-18,-10,-6,-9,-2,-11,-3,-4,-5,2,-2,-2,-5,-8,-21,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-4,-20,-2,-6,-10,-17,-11,-1,-11,6,5,-9,-14,-7,-13,-9,-6,-2,-23,-8,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=1,-9,-21,-10,-5,-18,-9,-14,-13,1,-15,-7,-7,5,-5,-4,0,2,-9,-22,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,-3,4,-25,-16,-7,-25,25,-24,-11,2,-7,8,26,-6,-8,-20,-23,-13,4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,13,-25,13,14,-27,-8,1,-27,9,-25,-17,15,-12,8,8,4,-4,-24,-30,-16,10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-5,-24,-22,-5,-25,-24,14,-17,3,7,-18,-22,-20,-18,-2,11,25,-29,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,-18,-29,-21,5,-25,-20,18,-24,26,14,-24,-25,-19,-20,-17,-6,14,-19,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-15,-16,-12,-21,15,-20,-16,-13,-15,-12,-7,-13,-12,-19,9,-2,-6,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-33,-25,9,-31,-17,28,-23,24,27,-23,-24,-17,-20,-21,-9,18,-16,5,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,19,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-26,1,16,-26,-17,-3,-23,14,-19,-11,0,-11,15,18,-1,-5,-19,-24,-14,14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-12,-5,-3,-18,-9,-14,-17,-4,-22,-15,4,-10,-3,-7,27,26,-7,-33,-16,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,0,-29,30,-21,-9,0,-19,13,64,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-25,-16,-10,7,-13,2,-14,-1,-9,-1,-8,-21,-7,1,-11,-11,-13,-9,11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-34,2,11,-29,-17,-12,-21,-3,-25,-17,-9,43,0,-11,-6,-9,-25,-30,-24,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-23,11,12,-26,-13,-5,-24,10,-22,-13,4,-10,6,4,3,-3,-18,-28,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-27,6,4,-19,-16,-3,-25,9,-21,-14,5,-15,3,12,-4,-4,-21,-12,-8,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-24,-13,-3,-18,-19,-5,-20,16,-13,-6,-4,-20,6,44,-9,-8,-13,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,5,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-28,-1,8,-28,-20,-11,-28,43,-28,-10,0,-10,8,25,-6,-3,-18,-21,-10,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,14,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-18,-36,-11,-3,-19,-21,-5,-17,-10,-23,-14,-17,57,-8,-17,-10,-9,-25,-21,-9,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-38,-29,56,-31,-21,10,-28,13,6,-22,-29,-34,-21,-19,-9,9,1,21,-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-28,-9,-18,-29,62,-18,-37,-18,-29,-19,3,-19,-18,-19,1,-18,-28,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-28,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,0,-7,-1,-25,-18,-12,-26,21,-25,-13,0,-17,0,14,-4,-5,-16,-28,-15,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-27,-21,-19,31,-28,16,-4,-12,-2,-1,-16,-28,-13,-8,-16,-9,-10,18,60,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-36,-26,4,-35,-25,37,-29,31,21,-24,-24,-20,-25,-23,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,20,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-39,-30,59,-32,-23,12,-29,12,5,-21,-28,-35,-22,-19,-9,9,2,22,-30;
MA   /M: SY='P'; M=9,-15,-21,-16,-10,-18,-16,-22,-7,-12,-14,-10,-15,23,-13,-18,2,6,-2,-28,-20,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-30,-21,7,-28,-17,22,-25,41,27,-28,-28,-17,-18,-26,-9,13,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=8,4,-11,2,0,-20,-1,-8,-20,-9,-29,-20,15,-11,0,-9,36,19,-12,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00638;
//
ID   ADP_GLC_PYROPHOSPH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00809;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ADP-glucose pyrophosphorylase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6975403; R2=0.0136619; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=348; N_SCORE=9.442; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-28,-1,4,-22,21,-1,-31,-8,-24,-16,4,-15,-1,-7,1,-13,-27,-24,-18,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-15,-15,-18,-15,32,-17,-3,-2,-13,1,-2,-10,-18,-16,-10,-8,-4,-3,7,27,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-16,-32,-29,3,-32,-29,32,-23,14,12,-27,-27,-27,-22,-13,-3,40,-25,-6,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-20,10,14,-22,-16,-7,-20,-3,-17,-15,2,-9,3,-7,9,12,-14,-30,-13,8;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-22,-30,-23,-4,-30,-26,27,-23,11,11,-22,-12,-20,-23,-13,-5,24,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-18,-29,-22,6,-29,-23,21,-26,34,15,-28,-29,-22,-20,-22,-6,20,-21,-3,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-29,-6,2,-24,-14,-12,-16,-6,-23,-14,-12,55,-1,-12,-3,-6,-23,-24,-21,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=23,-14,-23,-16,-6,-24,-9,-20,-14,-10,-19,-14,-14,34,-10,-20,1,-4,-13,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-8,-24,-10,1,-10,-18,3,-12,-2,-12,-3,-7,-16,16,-2,0,-5,-16,-9,11,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-8,-20,-12,-2,-20,-18,-5,-5,-3,-7,8,-7,-14,17,-4,2,4,-6,-24,-9,7;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-13,0,6,-14,-3,-1,-11,3,-11,-5,1,-6,9,0,2,-3,-11,-12,-6,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-9,-3,2,-9,-7,-4,-7,-1,-7,-1,0,-6,2,-1,5,5,-4,-14,-7,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-19,-1,11,-16,-13,1,-18,14,-13,-7,0,-9,13,28,-4,-6,-15,-14,-8,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-10,-18,-10,-1,-9,-19,-6,-2,-6,1,1,-9,-15,-4,-7,-4,0,0,-23,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-26,1,-1,-27,28,-10,-31,-11,-26,-17,4,-10,-6,-13,5,-10,-25,-27,-24,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-27,-2,0,-25,2,-15,-22,-1,-23,-15,-3,6,-7,-8,-1,-7,-17,-27,-21,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-25,1,5,-21,-7,-3,-24,12,-20,-12,6,-15,2,16,-2,-6,-19,-24,-12,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,51,-30,3,0,-18,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,22,59,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-26,-1,13,-26,-18,-4,-20,15,-17,-6,-1,-11,18,12,-2,-6,-18,-24,-12,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-28,50,14,-34,-10,17,-35,-2,-28,-24,21,-12,2,-8,2,-9,-29,-38,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,40,-26,18,16,-24,-24,-24,-26,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-27,-20,-16,22,-26,8,-5,-7,0,-1,-13,-27,-11,1,-16,-8,-9,9,44,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-30,2,21,-37,-20,16,-23,11,-21,-2,1,-10,48,10,-2,-11,-29,-22,-8,34;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-19,7,-5,-4,-6,5,-16,-6,-23,-16,38,-21,-6,-4,8,1,-22,-29,-7,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-25,-31,-21,2,-32,-16,25,-23,29,21,-22,-24,-15,-17,-24,-10,14,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-14,13,-31,14,0,-18,-11,4,-26,-5,-25,-19,11,-18,-2,-6,-6,-11,-27,6,-2,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-23,-32,-25,22,-31,-16,20,-25,21,13,-23,-27,-22,-20,-21,-8,12,-7,17,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-35,-26,6,-34,-25,34,-27,27,20,-25,-25,-21,-24,-21,-8,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-27,14,21,-24,-14,5,-26,6,-21,-16,7,-11,10,5,0,-6,-24,-26,-9,15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-25,19,12,-26,-9,-4,-26,1,-21,-16,7,-12,7,1,4,-4,-22,-30,-16,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-8,-26,-8,0,-2,-21,9,-9,-7,-8,-5,-8,-19,-1,-9,-8,-8,-12,-3,21,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-26,19,9,-24,-12,2,-25,6,-22,-16,12,-14,6,3,0,-6,-22,-26,-8,6;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-31,-11,-3,-26,-16,-19,-16,-9,-25,-17,-16,58,-10,-17,-3,-6,-19,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-29,26,25,-31,-16,5,-32,15,-25,-18,9,-9,10,7,-2,-9,-26,-30,-14,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-28,-15,-13,16,-27,12,-4,-7,-1,-1,-15,-25,-8,-8,-17,-10,-10,10,49,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00638;
//
ID   ADP_GLC_PYROPHOSPH_3_MP; MATRIX.
AC   MP00810;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ADP-glucose pyrophosphorylase signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5636573; R2=0.0155337; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=176; N_SCORE=8.288; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-23,-33,-21,-12,-17,-27,-23,7,-15,-8,-2,-20,38,-14,-21,-14,-9,-3,-26,-17,-17;
MA   /M: SY='A'; M=8,-8,-18,-11,-4,-12,-14,-10,-6,-9,-2,-4,-8,-16,-5,-11,-1,-2,-4,-23,-8,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-26,16,10,-24,6,0,-29,-5,-24,-19,15,-14,-2,-7,3,-8,-25,-31,-18,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-23,-30,-20,-9,0,-23,-20,-7,-18,-4,-7,-21,33,-17,-20,-15,-9,-14,-20,-11,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,1,-28,7,13,-27,-17,-11,-22,2,-22,-16,-4,18,2,-6,1,-1,-20,-30,-20,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-5,-22,-3,11,-24,-7,-8,-24,-1,-20,-15,-4,3,1,-1,2,-4,-20,-28,-19,5;
MA   /M: SY='M'; M=4,-15,-19,-21,-13,-11,-20,-17,5,-5,2,10,-13,-14,-8,-10,-8,-3,4,-22,-9,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-35,-10,0,-27,-18,-18,-18,-4,-24,-15,-17,61,-7,-14,-8,-9,-24,-28,-25,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-27,11,9,-28,11,-7,-31,0,-25,-19,6,-11,-1,-7,1,-10,-25,-27,-19,4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,9,-26,10,5,-20,-15,5,-20,5,-18,-7,8,-15,8,6,-2,-6,-19,-26,-7,5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-28,-19,-19,-19,-10,-29,-19,-17,81,-9,-19,-8,-8,-28,-29,-28,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-21,20,13,-24,-4,-4,-25,7,-20,-16,7,-7,2,0,1,-5,-19,-23,-14,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-16,-6,0,-9,-12,-3,-10,1,-11,-3,0,-11,2,3,3,1,-7,-19,-6,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-3,-15,-14,-2,-14,-10,-10,-13,-11,-10,-4,-19,-13,-15,5,6,-5,-18,2,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-30,-21,12,-31,-20,20,-23,29,14,-22,-26,-19,-18,-23,-9,10,-16,4,-21;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-2,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,10,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-12,-23,-22,-22,-5,-27,-20,27,-20,5,7,-1,-22,-17,-20,-10,-5,19,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,13,13,-26,-26,-26,-24,-14,-4,40,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-30,72,-30,-21,4,-29,10,1,-21,-30,-39,-20,-19,-9,4,7,27,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-21,16,8,-24,-9,-2,-25,7,-27,-18,20,-12,3,3,11,5,-21,-34,-17,5;
MA   /M: SY='W'; M=2,-11,-23,-16,-10,-11,-16,-16,-16,2,-15,-9,-10,-15,-6,0,-2,7,-10,8,-2,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-29,31,23,-33,-14,2,-32,11,-26,-20,10,-8,11,4,0,-8,-27,-32,-16,17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-17,-28,-23,15,-26,-18,11,-17,7,5,-21,-26,-22,-13,-11,-2,18,-14,7,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-19,-26,-17,12,-29,-14,6,-11,10,6,-17,-24,-15,-6,-18,-10,3,-13,7,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-27,23,21,-31,-14,-2,-28,8,-24,-18,11,-7,12,1,2,-5,-25,-31,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=3,-16,-19,-19,-7,-4,-21,-12,2,-14,11,4,-17,-20,-7,-13,-11,-5,1,-18,-2,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,13,-30,-20,20,-30,46,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,11,-19,1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-25,-6,8,-20,-23,-5,-14,11,-13,-6,-4,-14,8,16,-7,-6,-11,-24,-10,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-27,11,21,-25,-16,0,-26,10,-21,-15,2,-10,8,8,-1,-7,-22,-22,-13,14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,28,-26,38,11,-33,-9,-2,-32,2,-24,-21,11,-12,2,-3,-1,-9,-24,-32,-16,6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-19,-14,-3,-5,-13,-8,-10,-7,-9,-8,-7,-13,-7,-12,-1,-5,-7,-16,-2,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-26,4,10,-26,-12,-7,-22,3,-20,-14,-2,7,3,-3,0,-5,-20,-28,-17,5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-20,15,2,-24,-2,-4,-23,-2,-22,-17,19,-16,-2,-3,5,-2,-21,-33,-18,0;
MA   /M: SY='P'; M=3,-4,-23,-2,8,-23,-10,-11,-20,-5,-19,-15,-5,11,-2,-11,3,-2,-18,-28,-19,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,23,-23,20,6,-25,-4,2,-23,-2,-24,-18,24,-14,0,-6,5,-3,-22,-34,-18,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00638;
//
ID   OLEOSINS_MP; MATRIX.
AC   MP00811;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Oleosins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0477009; R2=0.0113710; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=905; N_SCORE=14.329; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=216; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-29,-10,-4,-23,-20,-20,-16,-10,-23,-16,-13,55,-10,-16,1,11,-19,-30,-23,-10;
MA   /M: SY='I'; M=13,-23,-19,-30,-22,-6,-23,-25,22,-21,11,8,-19,-19,-18,-24,-9,-5,20,-22,-9,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,-14,-14,-11,-10,-17,-18,0,-16,-5,-5,-3,-14,-9,-14,15,23,2,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-12,-24,-21,-4,-23,-25,14,-18,9,4,-20,-23,-21,-18,-4,10,25,-27,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-12,-16,-14,-9,-21,-22,0,-13,-5,-5,-6,-13,-13,-14,12,33,7,-28,-10,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-10,-19,-12,-16,-7,-21,-6,-11,-8,-8,-10,-12,-12,-18,10,10,5,-23,-17,-12;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,16,12,-30,-30,-28,-20,-13,-2,44,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-24,-34,-27,-2,-36,-28,38,-26,14,14,-18,-20,-20,-26,-12,1,28,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=18,-10,-23,-14,-16,-26,45,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-13,-1,-21,-16,-8,-19,-19,0,-15,3,5,-13,-18,-13,-16,0,14,6,-27,-11,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-28,1,-30,-26,29,-21,18,17,-28,-28,-25,-20,-15,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-14,-17,-14,0,-24,-21,-1,-14,-4,-5,-4,-13,-14,-14,11,37,4,-25,-5,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,40,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,55,-30,-20,7,-30,24,7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-27,3,-31,-27,29,-25,25,15,-29,-29,-25,-21,-18,-5,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-12,-21,-13,-12,-10,-21,-3,-14,1,-4,-13,-15,-13,-18,4,6,5,-22,-14,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-35,-28,10,-34,-27,34,-28,24,16,-25,-26,-24,-24,-20,-8,27,-19,1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=20,-11,-11,-19,-13,-11,-14,-21,-3,-13,-1,-5,-11,-14,-13,-16,7,17,6,-25,-13,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,40,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=19,-12,-21,-17,-17,-16,33,-20,-24,-17,-18,-14,-6,-17,-18,-20,2,-11,-15,-17,-21,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-19,-28,-19,6,-27,-17,16,-25,39,22,-25,-26,-16,-17,-23,-3,9,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='A'; M=29,-16,-15,-25,-15,-12,-11,-19,4,-15,4,5,-15,-15,-11,-20,-2,-4,6,-20,-13,-14;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,-14,-29,-25,-3,-26,-25,25,-19,9,12,-23,-24,-22,-20,-8,1,33,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='T'; M=17,-7,-12,-17,-12,-12,-13,-16,-4,-10,-4,3,-7,-12,-8,-14,9,20,2,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,70,-31,-21,6,-30,11,3,-20,-29,-37,-21,-20,-10,4,6,26,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=17,-3,-10,-10,-8,-15,-9,-18,-12,-10,-15,-12,0,-10,-8,-13,22,29,-2,-30,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00639;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F8_MP; MATRIX.
AC   MP00812;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 8 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0914612; R2=0.0170369; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=421; N_SCORE=13.254; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=24; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-19,-34,-20,-17,-14,7,-17,-21,-5,-18,-12,-11,-22,-10,9,-14,-17,-19,16,-7,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-14,1,-27,4,-1,-6,-22,-4,-17,9,-15,-9,-5,-18,-2,2,-10,-9,-12,-13,8,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-22,-1,0,-21,-15,-10,-14,8,-13,-7,0,-15,2,1,-1,-4,-9,-27,-13,1;
MA   /M: SY='N'; M=4,7,-23,6,7,-26,-9,-8,-22,3,-25,-17,9,6,-1,-6,6,-2,-20,-30,-20,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-24,13,-3,-26,11,-9,-25,-9,-27,-20,14,-8,-8,-12,8,-4,-20,-33,-22,-6;
MA   /M: SY='N'; M=1,20,-19,15,2,-23,-4,11,-23,-5,-25,-17,25,-15,0,-7,11,-1,-21,-35,-15,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-22,-16,-8,-9,-22,-16,-4,-1,-9,-3,-10,-7,-3,-6,-3,4,-2,-21,-7,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-9,-33,-10,-8,-14,-17,-13,-17,-4,-18,-8,-10,-5,-2,-8,-14,-9,-21,25,-1,-4;
MA   /M: SY='P'; M=1,-4,-27,-3,0,-26,8,-13,-25,-9,-27,-19,1,18,-7,-14,6,-5,-24,-29,-25,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-20,-23,-18,-9,-29,-11,16,-10,1,8,-18,-23,-11,-11,-11,-6,23,-26,-5,-16;
MA   /M: M=-6,-4,-26,0,-2,-18,-13,-16,-6,-14,-4,-7,-10,-3,-11,-17,-9,-9,-6,-27,-15,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-28,40,8,-34,6,4,-37,-6,-29,-24,14,-13,-3,-11,4,-9,-28,-35,-18,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-25,-5,-2,-15,-17,-14,-14,5,-19,-11,-4,-1,-5,-3,0,-4,-11,-24,-11,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-24,23,0,-26,13,2,-28,-4,-30,-22,40,-18,-4,-6,6,-6,-30,-36,-22,-2;
MA   /M: SY='S'; M=13,10,-13,2,-2,-20,0,-6,-18,-7,-26,-18,21,-13,-2,-9,25,10,-14,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,47,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-20,-19,-5,-4,-27,-16,11,-16,18,11,-19,-20,-11,-15,-14,-3,10,-25,-7,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-1,-33,7,-7,-10,-19,-15,-16,-15,-3,-12,-13,-22,-12,-16,-21,-16,-18,22,1,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-34,-21,41,-24,20,32,-20,-20,-14,-24,-20,-10,24,-20,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-30,-32,-30,-25,15,-27,-12,1,-19,6,-1,-30,-30,-18,-17,-28,-16,-5,53,34,-21;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,24,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-28,-22,3,-18,-22,16,-28,32,14,-25,-28,-21,-21,-23,-10,11,-21,-5,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-26,-10,8,3,-24,-9,-14,2,-1,-5,-10,-17,-3,9,-13,-10,-13,-17,-3,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-28,7,-4,-29,20,11,-33,-10,-25,-15,5,-16,-2,-11,-1,-15,-26,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-29,-1,6,-26,-18,-5,-29,40,-27,-11,5,-14,9,39,-8,-9,-21,-22,-11,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-25,-13,-2,-17,-24,-8,-6,6,1,3,-12,-19,10,10,-13,-9,-6,-21,-7,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,19,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,132,30,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-29,-2,0,-32,19,-6,-30,4,-27,-12,7,-15,12,0,-1,-13,-28,-22,-19,6;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-20,10,12,-24,-10,-8,-24,1,-22,-18,5,-10,3,1,14,7,-16,-32,-18,6;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-22,-2,2,-24,-10,-10,-20,-2,-27,-16,4,14,3,-6,15,8,-19,-33,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=-11,-1,-30,2,-3,-29,18,-7,-34,3,-25,-15,3,-17,3,16,-3,-14,-27,-23,-19,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-14,-26,-15,-14,8,-12,6,-10,-6,-10,-6,-12,-23,-8,-8,-8,-7,-12,8,39,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-23,-29,-20,4,-29,-22,17,-18,9,6,-14,-19,-16,-12,-10,1,11,-18,-1,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-3,21,-22,13,9,-26,-9,2,-21,1,-23,-15,25,-13,13,-2,7,0,-24,-32,-17,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-3,-25,0,-10,-1,-21,-1,-4,-10,-6,-6,-9,-21,-10,-14,-9,-8,-5,-6,23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=11,-11,-20,-13,-10,-19,11,-15,-15,-14,-9,-8,-7,-17,-5,-15,4,-5,-12,-23,-18,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,6,-23,6,6,-26,-16,-3,-17,4,-16,-2,2,-11,18,0,4,5,-16,-27,-11,12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-5,-17,-7,11,-19,-10,-13,-13,-6,-8,-10,-8,-9,-1,-13,5,-2,-9,-25,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=9,-22,-21,-28,-20,-6,-14,-23,14,-23,15,7,-18,-20,-17,-23,-12,-8,9,-20,-9,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-25,-13,-4,-9,-24,-5,-8,4,2,2,-12,-20,6,7,-13,-5,-10,-14,5,0;
MA   /M: SY='N'; M=3,10,-22,5,-1,-25,1,-9,-24,8,-24,-15,12,-13,-3,-1,3,-1,-18,-27,-18,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00640;
//
ID   IF4E_MP; MATRIX.
AC   MP00813;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic initiation factor 4E signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4746547; R2=0.0127981; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=946; N_SCORE=16.572; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=159; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-16,-34,-25,12,-33,-24,25,-30,33,16,-25,-27,-22,-24,-25,-10,14,-19,1,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-28,-19,-16,18,-28,26,-2,-11,-1,5,-15,-27,-6,-9,-17,-11,-9,11,54,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-15,18,7,-24,-9,1,-22,1,-25,-18,30,-17,3,-2,5,-3,-23,-37,-19,5;
MA   /M: SY='H'; M=-4,11,-21,3,-1,-20,-10,33,-21,-6,-22,-10,21,-16,4,-4,6,-1,-22,-32,-5,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-37,-28,5,-36,-26,40,-27,20,21,-20,-21,-19,-26,-19,-7,24,-19,1,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-9,-26,-10,-2,-12,-19,1,-15,2,-13,-6,-4,-3,2,0,-7,-8,-15,-22,-6,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-10,-32,-6,5,-24,-19,-5,-21,5,-20,-12,-7,23,3,8,-7,-9,-23,-26,-17,1;
MA   /M: SY='P'; M=6,-14,-28,-11,-3,-25,-13,-19,-17,-10,-24,-17,-13,51,-9,-18,2,-1,-19,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-14,-2,-3,-20,2,-4,-22,-9,-26,-17,9,-12,-2,-7,27,15,-13,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-27,4,12,-26,-3,-7,-26,13,-21,-11,2,-12,5,4,-3,-9,-22,-25,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-31,-21,9,-29,-20,19,-28,42,20,-30,-29,-19,-20,-30,-11,8,-9,2,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-4,-16,-8,-6,-20,-16,-12,-12,-7,-19,-9,1,13,-7,-11,-1,1,-12,-32,-19,-8;
MA   /M: SY='A'; M=2,-9,-22,-8,-9,-15,-7,-12,-9,-16,-7,-8,-8,-10,-11,-17,0,-4,-7,-20,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-29,-6,-6,-25,14,-9,-28,4,-23,-13,0,-6,-6,-2,-4,-12,-23,-24,-18,-7;
MA   /M: SY='S'; M=15,-7,16,-12,-9,-19,-7,-17,-19,-14,-22,-17,-2,-16,-9,-17,21,11,-7,-37,-21,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,22,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-27,-27,-23,33,-31,2,8,-18,10,5,-21,-29,-18,-15,-21,-10,-1,15,52,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-23,-1,-3,-12,-14,47,-21,-9,-21,-8,12,-19,3,-4,5,-5,-21,-25,13,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,2,-31,-26,16,-30,-21,11,-26,20,9,-26,-31,-26,-21,-20,-8,14,-19,2,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-30,-4,6,-25,-20,-8,-28,40,-23,-9,-1,-14,9,39,-11,-10,-19,-20,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-4,23,-24,26,16,-29,-11,0,-28,4,-24,-19,14,-10,3,-4,3,-4,-23,-32,-17,9;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-30,6,-9,-30,38,-14,-34,-8,-28,-19,6,-17,-12,-12,-1,-16,-27,-25,-24,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-30,4,27,-28,-20,0,-29,23,-22,-13,0,-10,20,30,-5,-10,-25,-24,-14,22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-8,-25,-9,8,-16,-21,-6,-7,11,-4,14,-10,-13,5,3,-12,-9,-6,-23,-9,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-15,41,-28,58,15,-36,-11,-3,-33,-2,-26,-26,15,-12,-3,-11,0,-9,-22,-38,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-30,-4,6,-26,-13,-16,-18,-7,-22,-16,-13,37,-6,-13,-4,-8,-18,-29,-24,-3;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-22,-8,6,-22,-15,-4,-9,-3,-12,-6,-3,-11,7,-8,1,-6,-10,-24,-13,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,15,7,-8,-20,-8,0,-23,-8,-27,-20,40,-25,-8,-8,5,-3,-25,-43,-23,-8;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-4,-14,-7,-20,-13,-16,-17,4,-17,-8,-8,-16,-3,-5,1,-4,-8,-19,-14,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,20,-20,10,3,-24,-10,2,-24,13,-27,-15,29,-17,7,12,3,-2,-25,-32,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-17,-21,-15,-5,-22,-20,9,-19,11,4,-13,-18,-12,-17,-2,10,8,-25,-8,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-24,-36,-28,17,-34,-22,31,-25,16,18,-22,-24,-23,-23,-18,-8,23,-13,8,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-20,-12,-6,-12,-21,-10,-7,-3,-10,-4,-2,-16,5,4,3,10,-5,-24,-8,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-21,-13,-27,-21,17,-25,-20,10,-24,15,5,-16,-25,-22,-20,-13,-5,7,-18,1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-7,11,-25,8,5,-26,-7,-4,-26,11,-28,-17,16,-3,2,9,4,-4,-23,-31,-18,3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-29,-5,2,-26,-9,-5,-29,31,-26,-10,-1,-15,5,29,-9,-11,-19,-21,-11,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-18,-5,-2,-20,11,-9,-18,-1,-17,-9,-2,-11,1,-4,2,-5,-13,-17,-14,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-24,-8,0,-20,-19,-5,-17,15,-14,-5,-2,-16,6,19,-5,-3,-12,-23,-10,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-20,-10,-8,-15,0,-12,-16,-5,-10,-9,-1,-17,-6,2,4,3,-11,-25,-14,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-1,4,-24,8,5,-26,-8,-8,-24,-4,-23,-17,1,6,-1,-7,7,3,-19,-30,-19,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-24,8,13,-24,-15,-5,-24,9,-22,-16,8,-7,7,10,5,4,-20,-30,-16,9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-7,-9,-11,-10,0,-16,-6,1,-12,0,3,-4,-16,-10,-12,-6,-5,0,-18,-3,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-19,29,18,-22,-8,0,-21,1,-17,-16,9,-1,3,-4,0,-6,-19,-23,-13,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-37,-40,-37,-27,9,-24,-27,-4,-23,3,-6,-36,-29,-20,-21,-36,-23,-15,91,20,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-11,-26,-7,17,-10,-26,-12,-1,-11,14,1,-15,-15,-1,-12,-15,-10,-7,-25,-9,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00641;
//
ID   ADX_MP; MATRIX.
AC   MP00814;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adrenodoxin family, iron-sulfur binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5770168; R2=0.0113247; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=703; N_SCORE=12.528; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,38,37,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-28,26,27,-27,-16,3,-27,4,-22,-18,10,-9,14,-3,0,-6,-27,-27,-10,20;
MA   /M: SY='V'; M=11,-24,-14,-27,-23,-6,-16,-25,15,-20,8,5,-22,-23,-22,-21,-8,-3,25,-25,-12,-23;
MA   /M: SY='A'; M=45,-12,-10,-21,-12,-18,-3,-21,-6,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,5,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-16,-24,-19,-13,-8,-27,10,6,-15,6,7,-11,-22,-5,-8,-12,-6,3,-25,1,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-26,3,7,-27,-1,-5,-28,10,-25,-15,6,-14,8,15,2,-7,-23,-26,-17,6;
MA   /M: SY='N'; M=-2,26,-20,11,-2,-20,-3,20,-20,-3,-25,-15,41,-18,0,-3,7,-3,-25,-35,-14,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,13,-25,4,-10,-25,35,-6,-30,-11,-30,-20,28,-20,-10,-11,6,-9,-29,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-26,22,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-14,15,-32,27,23,-30,-17,-4,-29,4,-25,-21,1,14,3,-6,-4,-10,-28,-29,-15,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-37,-27,2,-35,-23,40,-27,25,26,-22,-22,-17,-25,-22,-10,23,-20,0,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-25,18,25,-24,-20,0,-18,-1,-15,-14,-2,-11,2,-7,-3,-8,-11,-32,-15,13;
MA   /M: SY='G'; M=10,-7,-24,-10,-12,-24,25,12,-28,-14,-21,-12,0,-17,-9,-15,0,-14,-21,-23,-14,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=26,5,-17,5,8,-26,-5,-13,-19,-5,-16,-16,-2,-8,-3,-15,6,-4,-11,-26,-20,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-30,10,21,-31,21,-9,-35,-4,-25,-21,1,-10,1,-10,0,-14,-30,-26,-24,11;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-28,-9,-13,-30,47,-17,-35,-7,-28,-17,-1,-17,-11,-11,-1,-16,-26,-20,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=12,-1,-12,-4,-1,-21,-4,-11,-18,-8,-24,-16,5,-10,3,-10,31,18,-9,-35,-18,1;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-21,61,-29,-25,-12,-26,-26,-12,-27,0,-7,-21,-33,-25,-26,-12,-8,-1,-37,-20,-25;
MA   /M: SY='A'; M=35,-13,-11,-21,-13,-15,-6,-19,-2,-12,-6,-2,-13,-14,-12,-19,6,0,8,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=22,-4,-10,-10,-6,-17,-5,-16,-14,-10,-18,-14,0,-10,-6,-14,24,21,-4,-30,-17,-6;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,0,-20,-20,91,-30,-6,-20,-1,9,-20,10,7,-10,-19,-29,-29,17,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,12,-30,-28,-4,-29,-28,17,-23,8,5,-26,-30,-27,-23,-12,-4,29,-31,-12,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-22,-30,-26,-17,10,-34,-6,21,-18,8,8,-18,-22,-12,-19,-18,-10,7,0,32,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-34,-30,9,-32,-28,31,-24,14,12,-26,-28,-28,-22,-14,-4,38,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-15,15,-31,22,25,-29,-16,-1,-30,10,-24,-19,6,-10,12,9,-4,-11,-28,-19,-14,18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-30,18,23,-30,-16,2,-29,7,-26,-19,2,11,6,-2,-1,-8,-27,-31,-17,13;
MA   /M: SY='G'; M=7,2,-25,4,1,-28,11,-2,-28,-9,-22,-17,0,-4,-6,-14,1,-11,-21,-26,-19,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-29,-32,-34,-26,31,-26,-12,-3,-21,-2,-5,-24,-27,-23,-18,-24,-16,-9,49,31,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-14,-19,-14,-16,11,-23,-12,1,-17,6,-1,-15,-23,-18,-16,-9,-2,4,-13,11,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-24,31,24,-31,-10,-1,-30,1,-27,-22,13,-8,10,-5,11,-2,-25,-36,-19,17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-13,-25,-15,-5,-14,-24,-16,-5,13,1,2,-12,-17,-4,5,-16,-9,-4,-20,-7,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-17,-21,-16,4,-22,-18,7,-21,15,4,-14,-20,-18,-16,-8,1,7,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-33,1,11,-29,2,-13,-25,-3,-24,-17,-6,18,-3,-11,-5,-12,-25,-27,-23,2;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-15,0,11,-22,-14,-13,-23,0,-21,-17,-5,-6,0,-7,3,-2,-18,-15,-15,5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-12,-22,-14,-4,-19,-14,-18,-5,-8,-14,-9,-8,6,-7,-15,5,-1,-5,-26,-17,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00642;
//
ID   AIPM_HOMOCIT_SYNTH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00815;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-isopropylmalate and homocitrate synthases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9022341; R2=0.0177297; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=250; N_SCORE=10.325; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=34; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-28,-8,-6,-16,-15,-12,-10,-8,-13,-1,-10,22,-7,-13,-7,-6,-14,-26,-16,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,4,-17,5,-1,-10,-7,-4,-13,-6,-14,-11,5,-7,-5,-8,4,-1,-11,-21,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-21,-8,0,-13,-15,-8,-9,7,-6,3,-5,-11,1,3,-6,-5,-8,-21,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-16,-4,-3,-12,-14,-8,-9,-1,-12,-6,-2,-10,-2,-2,5,9,-4,-21,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-10,-23,-14,-10,-8,-21,-13,8,-9,2,3,-6,-9,-6,-9,-10,-7,1,-20,-7,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-21,0,-2,-18,-14,-10,-11,-5,-12,-2,-3,-2,-4,-9,0,3,-7,-28,-14,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-22,5,8,-23,-15,-5,-22,11,-19,-10,3,-11,6,11,-1,-3,-17,-27,-14,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=6,-3,-21,-5,1,-22,-11,-7,-19,8,-19,-10,-1,-10,3,5,1,-4,-13,-23,-12,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-28,-21,-1,-30,-26,17,-21,3,3,-24,6,-22,-23,-15,-8,14,-19,-8,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-28,-18,-8,-10,-26,-9,3,-2,-1,2,-9,-18,0,4,-12,-8,-2,-15,-1,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-33,-32,-38,-29,9,-32,-28,23,-26,10,7,-27,-25,-22,-25,-25,-15,12,28,9,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,15,-31,-26,26,-29,-19,-1,-26,4,-1,-18,-31,-28,-22,-17,-9,1,-14,8,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-9,34,-24,47,16,-34,-8,-3,-34,-2,-29,-26,15,-10,0,-10,10,-3,-24,-39,-20,8;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-10,-12,-12,-10,-19,-20,-5,-12,-10,-8,-3,-13,-12,-12,18,37,7,-31,-11,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,14,-16,12,-1,-19,-17,-14,-19,-7,-16,-16,6,-10,-7,-10,15,33,-9,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,17,-26,17,38,-26,-13,1,-26,6,-22,-19,16,-6,12,-1,4,-6,-28,-32,-20,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=14,-7,-9,-14,-9,-9,-9,-16,-13,-9,-14,-11,-3,-13,-9,-10,16,14,-4,-26,-13,-9;
MA   /M: SY='P'; M=0,-19,-27,-16,-4,-13,-20,-18,-5,-15,2,-4,-20,23,-11,-18,-13,-8,-11,-24,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-29,-14,-17,-22,29,-19,-18,-16,-19,-11,-3,-12,-15,-18,-4,-14,-16,-22,-21,-17;
MA   /M: SY='V'; M=7,-7,-15,-7,-9,-14,-18,-19,2,-11,-5,-4,-11,-18,-14,-16,-2,-2,12,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='P'; M=5,-7,-17,-8,-6,-15,-11,-15,-15,-11,-21,-15,-1,14,-9,-15,10,5,-12,-30,-19,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-26,-20,-33,-23,28,-26,-12,14,-22,26,29,-23,-26,-18,-16,-23,-10,7,-11,9,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-1,11,-16,8,-2,-21,-3,-9,-21,-7,-24,-18,14,-11,-4,-8,19,17,-15,-35,-18,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-19,-16,-11,-10,-19,-13,-1,-11,-3,-2,-12,-7,-12,-12,-2,4,3,-27,-10,-13;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-24,9,23,-27,-15,-5,-21,5,-19,-14,2,-8,11,-2,3,-4,-18,-28,-17,17;
MA   /M: SY='E'; M=-12,9,-27,16,32,-30,-19,0,-29,14,-22,-16,2,-8,19,11,-2,-9,-26,-27,-15,25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-22,-28,-19,0,-29,-20,19,-18,24,15,-22,-24,-16,-12,-20,-8,15,-22,-4,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-25,0,17,-24,-16,-5,-24,12,-18,-12,-2,-11,11,18,0,-4,-18,-24,-15,12;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-26,-36,-28,8,-34,-21,37,-25,18,24,-21,-22,-18,-24,-19,-9,23,-16,6,-26;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-14,-25,-15,5,-8,-20,-8,-15,-6,-8,-13,-16,-18,-20,1,-3,-1,-7,-6,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-28,-1,8,-21,-18,3,-25,21,-19,-9,-1,-15,8,24,-8,-10,-20,-22,-7,6;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-20,-14,-2,-17,-16,-8,-8,-2,-2,2,-9,-15,6,-4,-4,-3,-7,-21,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,9,-30,-20,20,-30,48,19,-29,-29,-20,-20,-29,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-20,17,8,-22,-17,-11,-14,-7,-12,-13,-2,-15,-5,-13,-3,-6,-6,-31,-15,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-26,14,15,-29,-14,-3,-28,14,-24,-16,8,-11,11,13,1,-5,-22,-28,-16,12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-32,-23,13,-27,-18,19,-23,26,23,-24,-25,-18,-19,-21,-9,13,-13,3,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-18,-30,64,-19,-39,-17,-30,-20,1,-20,-18,-16,0,-19,-30,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-33,-29,15,-31,-25,26,-23,12,10,-26,-28,-28,-21,-14,-4,32,-18,3,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-29,29,14,-33,-13,3,-33,12,-28,-19,8,-5,4,2,-3,-9,-25,-31,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-12,-25,-12,6,-7,-27,-9,3,-8,-2,-1,-13,-16,0,-11,-9,-7,2,-18,1,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00643;
//
ID   AIPM_HOMOCIT_SYNTH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00816;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-isopropylmalate and homocitrate synthases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9803233; R2=0.0137987; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=439; N_SCORE=11.028; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=3,-13,-17,-20,-14,-8,-16,-5,5,-13,3,17,-10,-16,-5,-13,-1,4,3,-25,-6,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-1,-22,-3,0,-8,-17,5,-13,-2,-12,-8,0,-17,0,2,-4,-5,-12,-16,4,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-14,0,-27,5,20,-13,-21,3,-19,5,-9,-10,-5,-13,6,6,-9,-10,-19,-17,3,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-19,-25,-17,2,-25,-17,19,-19,25,13,-18,-20,-13,-12,-18,-8,11,-16,-2,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-20,-31,-23,14,-29,-22,20,-20,10,10,-18,-21,-21,-18,-13,-3,18,-15,3,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-25,2,12,-16,-16,1,-21,9,-16,-11,-2,-12,7,9,-3,-6,-18,-17,0,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-5,-26,-5,-4,-4,-12,-6,-16,-5,-14,-11,-6,-17,-6,-6,-6,-5,-15,6,8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-22,-29,-19,8,-29,-16,16,-19,24,19,-21,-25,-13,-12,-21,-8,9,-18,1,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-16,-11,-19,-15,-3,-21,-14,-1,-10,-6,-2,-11,-20,-13,-6,-5,-3,4,-23,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-23,-2,7,-23,-12,-7,-24,15,-20,-12,2,-14,5,20,-1,-3,-17,-25,-15,4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-23,2,3,-19,-13,4,-21,7,-20,-12,13,-16,3,12,1,-2,-19,-28,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-30,-25,1,-29,-26,25,-24,23,13,-26,-27,-23,-21,-17,-5,27,-25,-6,-25;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-24,-3,0,-21,-14,-10,-16,5,-20,-12,-4,14,-2,4,-2,-3,-13,-24,-16,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-20,8,5,-21,-1,-1,-22,3,-22,-15,18,-10,3,6,5,-3,-21,-27,-16,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-13,-10,-7,-4,-11,-7,2,-2,0,2,-4,-10,-3,5,-6,-4,0,-10,-3,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-21,10,6,-15,-15,-6,-11,-3,-9,-9,-1,-13,-4,-5,-6,-7,-7,-20,-9,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,7,-25,7,6,-26,-6,-4,-26,12,-26,-15,8,-5,5,4,3,-3,-22,-27,-14,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-12,-27,-22,-7,-20,-25,16,-20,7,6,-20,-20,-20,-21,-9,-4,20,-25,-11,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-21,-12,-9,-17,-25,-17,4,-16,-6,-3,-13,6,-11,-20,-10,-8,-1,-28,-14,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-36,-28,11,-34,-26,31,-28,22,16,-25,-25,-23,-24,-22,-9,22,-11,3,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,3,-15,4,12,-23,-2,-6,-24,-6,-26,-19,7,-9,2,-9,23,7,-16,-35,-20,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-10,-29,-24,1,-27,-24,20,-22,13,10,-22,-24,-22,-20,-11,0,24,-26,-7,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-17,54,-23,-21,-17,-17,-25,-23,-22,-18,-17,-15,-15,-23,-24,-5,-5,-11,-37,-24,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,35,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,48,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-21,-28,-19,25,-27,-16,2,-18,19,6,-19,-27,-20,-3,-19,-6,0,-11,7,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-6,-27,-20,2,-25,-13,11,-19,21,27,-20,-24,-12,-15,-16,0,7,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-12,-18,-11,-21,8,-20,-14,-11,-13,-11,-8,-11,-11,-20,10,-2,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-13,-25,-23,-3,-28,-26,20,-19,7,6,-19,-22,-22,-18,-3,13,30,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-12,-19,-11,-20,3,-20,-11,-11,-11,-10,-9,-11,-10,-20,10,-1,-2,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-1,32,-19,15,-1,-20,0,5,-19,-2,-27,-19,48,-18,-2,-3,10,0,-25,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-10,-9,-6,-14,-7,-16,-14,-11,-18,-14,1,-11,-7,-13,25,22,-4,-30,-15,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-23,-9,3,-31,-18,16,-21,24,10,-21,-22,-14,-18,-20,-10,8,-20,0,-12;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-11,-18,-8,-9,-12,-16,-5,-14,1,-2,-12,-15,-10,-17,1,1,-1,-22,-11,-9;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-18,-31,-24,3,-29,-23,26,-23,18,13,-24,-25,-21,-21,-15,-5,26,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-27,-4,14,-19,-21,-2,-13,8,-6,3,-7,-13,11,7,-9,-10,-14,-24,-9,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=31,-4,-15,-13,-10,-22,11,-14,-17,-11,-16,-13,0,-13,-10,-17,8,-3,-9,-23,-21,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-11,-20,-11,-18,2,-20,-11,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,-1,-1,-19,-19,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,9,-24,11,4,-23,-15,-7,-25,9,-20,-15,5,-14,1,15,2,5,-16,-29,-14,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-7,-27,-8,5,-22,-19,9,-18,5,-15,-3,-3,-15,23,15,-4,-9,-19,-17,-5,13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-15,-33,-28,2,-31,-28,30,-24,15,12,-25,-26,-25,-23,-14,-4,34,-24,-6,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-27,18,33,-28,-14,13,-29,3,-23,-17,9,-7,15,-2,4,-7,-28,-32,-14,23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00643;
//
ID   EPO_TPO_MP; MATRIX.
AC   MP00817;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Erythropoietin / thrombopoeitin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0415325; R2=0.0109926; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1134; N_SCORE=16.497; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=224; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='S'; M=9,-13,0,-16,-15,-12,-15,-21,-2,-15,-11,-8,-9,-19,-15,-16,14,12,12,-34,-16,-15;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-15,-30,-22,16,-23,-22,12,-23,19,7,-24,-26,-24,-20,-14,-5,15,-16,-1,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-20,-31,-22,5,-27,-15,24,-22,33,34,-25,-25,-14,-17,-24,-9,15,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-18,-25,-18,5,-25,-19,15,-26,35,13,-24,-27,-18,-18,-18,-5,10,-24,-4,-18;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,16,-30,-20,18,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-23,0,-2,-23,-15,-16,-18,-9,-22,-17,-4,25,-8,-14,9,14,-15,-32,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-28,-18,5,-29,-20,15,-28,40,15,-29,-16,-19,-20,-28,-10,5,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-5,-9,-14,-25,34,-18,-32,-18,-29,-20,1,-19,-14,-18,12,-5,-21,-30,-27,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-17,-21,-14,6,-20,-17,5,-23,19,5,-16,-23,-15,-17,-5,0,2,-24,-4,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-16,-5,-16,-16,0,-16,-16,16,-11,5,5,-16,-16,-16,-11,-5,0,27,-16,-5,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-12,-15,-9,2,-15,-11,8,-15,21,8,-15,-7,-10,-11,-15,-5,2,-12,-2,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-16,-5,-11,-16,38,-11,-22,-11,-16,-11,0,-11,-11,-11,0,-11,-16,-11,-16,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-7,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-36,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,78,-10,-20,-8,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18,73,-10,-20,-7,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-16,-5,0,-11,-11,0,-16,16,-11,-5,0,-11,5,38,-5,-5,-11,-11,-5,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-11,-16,-11,5,-16,-11,11,-16,27,11,-16,-16,-11,-11,-16,-5,5,-11,0,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=17,-21,-21,-31,-21,-9,-22,-25,23,-21,6,6,-15,-15,-15,-25,-6,-5,16,-20,-9,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=1,-10,-21,-7,-2,-20,-10,-15,-15,-12,-21,-15,-5,22,-6,-15,15,6,-14,-34,-21,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,24,13,-30,-30,-27,-20,-17,-3,36,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,19,-24,18,33,-25,-11,2,-25,4,-25,-20,22,-8,11,-1,8,-3,-28,-35,-20,22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-25,-25,-20,20,-29,4,9,-17,19,14,-23,-29,-12,-13,-23,-10,-1,7,43,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-21,-25,-21,-11,-4,-25,-11,-3,-3,18,6,-16,-25,-6,21,-21,-10,-4,-20,-5,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-30,41,38,-35,-11,-1,-35,4,-25,-25,9,-6,9,-6,0,-11,-30,-34,-21,23;
MA   /M: SY='A'; M=32,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-3,-30,-3,2,-19,-21,34,-27,20,-22,-5,2,-17,8,21,-11,-14,-23,-19,10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-23,-3,21,-14,-25,-12,-5,-6,3,-4,-14,-14,-1,-9,-9,-8,-2,-28,-13,10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-19,-16,-24,-15,-7,-10,-20,2,-20,16,3,-19,-20,-15,-20,-9,-6,3,-20,-11,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-15,5,-30,11,33,-25,-20,46,-30,1,-20,-11,5,-9,15,0,-5,-15,-30,-30,-2,22;
MA   /M: SY='N'; M=-1,22,-15,11,0,-20,0,1,-20,-5,-30,-20,37,-15,0,-5,24,9,-21,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-18,-23,-21,-13,-12,-23,-15,0,2,-5,0,-11,-21,-7,19,-9,-6,7,-22,-10,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-15,-19,-15,-1,-25,-20,4,-19,17,4,-14,-19,-15,-15,-3,23,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='M'; M=0,-9,-15,-15,-10,-10,-11,-6,-1,-10,-5,18,-5,-15,-1,-10,10,8,0,-30,-10,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-2,-35,29,-6,-31,-6,-25,-11,0,-15,17,-6,0,-15,-30,-20,-21,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=19,-14,-24,-14,-5,-25,-9,-19,-15,-10,-21,-15,-13,36,-9,-19,3,-3,-15,-26,-25,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-17,-21,-18,-20,-14,7,-14,-2,-19,-10,-4,-10,-22,-18,-18,-1,-7,7,-27,-15,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-3,34,-6,-13,-18,-22,0,-25,-16,-21,-16,-4,-16,-14,-18,-8,-10,-19,-33,-9,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-26,-6,0,-25,-11,-13,-21,-5,-29,-19,-5,35,-3,-5,11,3,-20,-33,-23,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,32,-30,-20,14,-30,37,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='N'; M=0,11,-19,5,-1,-22,3,-5,-21,-7,-30,-20,24,-3,-3,-8,20,6,-21,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-25,0,24,-19,-24,-11,-8,-4,-9,-9,-4,-7,4,-9,0,4,-10,-28,-13,13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,13,-29,6,0,-25,-9,-4,-20,-5,-30,-20,23,30,-5,-9,1,-5,-30,-35,-25,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-20,-35,-30,9,-34,-29,35,-25,14,13,-25,-26,-27,-24,-15,-5,36,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,-15,-19,-15,-1,-25,-20,4,-19,17,4,-14,-19,-15,-15,-3,23,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,28,15,-30,-30,-25,-20,-19,-5,32,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=12,23,-21,29,6,-31,-5,-9,-26,-5,-21,-21,6,-10,-5,-15,5,-5,-16,-31,-20,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00644;
//
ID   DPS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00818;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dps protein family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6749439; R2=0.0164263; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=607; N_SCORE=15.636; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-6,-23,-9,-2,-19,-18,-1,-6,-7,-2,2,-4,-17,11,-4,-5,-7,-10,-24,-8,4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-17,-28,-22,3,-29,-22,22,-24,30,15,-28,-29,-19,-18,-20,-6,24,-24,-5,-21;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-13,-19,-10,-19,-6,-19,-5,-11,-9,-7,-9,-11,-7,-19,9,0,1,-22,-17,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,25,-22,27,8,-28,-6,-3,-27,-3,-26,-20,20,-12,3,-7,10,5,-23,-35,-18,5;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-23,-28,-21,17,-24,-17,3,-22,14,2,-23,-26,-20,-17,-17,-4,0,11,14,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-6,-24,-13,-10,-9,-17,-8,3,-12,-8,-1,2,-19,0,-11,-2,-3,-3,-21,-2,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-3,-18,2,-7,-14,-22,-17,0,-9,-4,-4,-11,-20,-14,-12,-5,-2,13,-31,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-30,-20,16,-28,-17,15,-27,38,16,-27,-28,-20,-19,-25,-9,7,-14,6,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-15,-21,-18,-15,12,-20,6,-5,-13,-4,-4,-12,-22,-11,-13,-5,-2,-7,1,32,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-16,-24,-19,1,-25,-20,15,-22,22,12,-20,-24,-17,-18,-11,1,15,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-27,-10,-3,-19,-23,-12,-4,13,-12,-1,-1,-15,4,5,-8,-5,-5,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-25,-20,8,-28,-19,12,-21,18,7,-20,-24,-19,-17,-11,8,13,-19,4,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-1,-30,-1,6,-26,-20,38,-29,20,-24,-5,4,-15,14,20,-9,-14,-25,-24,2,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-27,4,6,-29,-6,12,-25,11,-25,-9,16,-15,20,9,-1,-10,-28,-26,-11,13;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-20,-20,-25,-20,20,-23,-1,2,-17,1,0,-16,-24,-18,-16,-11,-7,3,-2,24,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30,16,-21,-29,-18,-21,-18,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-28,139,30,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-13,21,-23,12,-3,-9,-11,14,-17,-4,-21,-14,29,-20,-3,-4,1,-1,-23,-22,7,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-17,-32,-27,0,-29,-21,31,-20,17,26,-25,-25,-19,-19,-16,-5,33,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-25,-10,-2,-17,-22,-6,-17,20,-16,-6,-4,-18,5,30,-7,-5,-8,-20,-5,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=4,-11,-25,-12,-5,-21,-15,-11,-12,-7,-19,-12,-8,22,-7,-10,1,-1,-12,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-11,17,-26,13,14,-22,-7,9,-24,0,-23,-14,21,-14,13,-1,2,-8,-28,-29,-13,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-25,-31,-22,27,-31,-16,9,-15,8,5,-17,-25,-21,-6,-18,-10,6,-6,15,-22;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-17,-3,-6,-18,-3,-11,-16,-9,-16,-13,1,-14,-5,-12,10,8,-9,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,34,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,26,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-29,9,40,-26,-20,-4,-23,6,-14,-14,-5,2,14,-2,-4,-9,-24,-27,-18,26;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-14,-22,-19,-8,-6,-20,-10,-3,5,3,16,-13,-18,-1,0,-14,-9,-3,-18,-4,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-23,-32,-24,31,-28,-14,10,-24,20,13,-23,-27,-22,-18,-22,-8,3,3,19,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-28,17,31,-29,-7,-6,-30,4,-23,-20,2,0,7,-5,2,-5,-26,-30,-20,19;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-23,-25,-15,18,-26,-7,5,-20,12,8,-16,-23,-9,-14,-14,-8,-1,-11,11,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-27,-21,-18,13,-28,7,2,-5,0,5,-17,-27,-8,3,-17,-9,-2,8,43,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-20,13,7,-23,-7,-10,-21,-5,-19,-17,8,-11,-3,-9,9,10,-14,-32,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-22,6,21,-24,-12,-3,-21,1,-17,-14,2,-8,8,-5,6,-3,-18,-29,-17,14;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-17,-30,-23,11,-27,-23,19,-25,24,11,-24,-26,-23,-20,-17,-4,19,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=5,-6,-19,-11,-10,-12,-9,-15,-11,-4,-10,-8,-2,-16,-10,-4,1,2,-5,-23,-12,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-27,18,13,-28,2,-9,-29,-5,-21,-20,5,-5,-2,-11,1,-5,-24,-30,-21,5;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-25,-8,-4,-10,-18,38,-18,-4,-14,-1,2,-19,4,0,-5,-9,-18,-19,12,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-21,-32,-24,7,-26,-23,23,-24,17,14,-21,-24,-19,-21,-16,-8,19,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,46,-30,64,18,-38,-11,8,-39,-1,-29,-28,19,-11,1,-9,-1,-11,-30,-39,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,15,-23,20,27,-26,-16,-6,-25,1,-19,-19,5,-6,6,-6,6,7,-20,-32,-17,16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-33,-25,3,-33,-24,32,-25,21,17,-23,-24,-18,-22,-19,-8,25,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-12,-18,-10,-21,6,-19,-13,-11,-13,-12,-8,-11,-10,-19,11,0,-3,-21,-21,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00645;
//
ID   DPS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00819;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dps protein family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8865724; R2=0.0164416; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=12.914; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=38; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,36,16,-30,-30,-24,-20,-23,-6,24,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-28,11,43,-27,-19,-3,-24,8,-15,-14,-3,-4,16,0,-2,-9,-24,-27,-17,30;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-23,-20,-10,0,-21,-9,-2,4,3,17,-13,-18,-2,0,-15,-9,-3,-16,-1,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-22,-33,-24,41,-28,-17,5,-26,18,8,-23,-28,-27,-18,-21,-7,1,6,19,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-29,35,44,-32,-16,1,-32,6,-24,-23,10,-4,13,-3,1,-9,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-25,18,31,-28,-9,-5,-29,4,-23,-20,4,-6,8,-3,7,-1,-24,-32,-19,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-23,-21,-13,6,-24,-4,5,-17,8,8,-13,-21,-4,-13,-10,-6,-1,-16,6,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-28,-19,-18,20,-28,13,-2,-5,-2,-1,-18,-28,-9,2,-18,-9,-7,18,59,-18;
MA   /M: SY='B'; M=-6,15,-20,13,5,-21,-7,-8,-20,-5,-20,-17,14,-12,-4,-8,10,12,-15,-34,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-24,12,24,-27,-6,-1,-27,2,-24,-18,7,-8,7,-4,9,-3,-23,-31,-18,16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-16,-29,-22,12,-26,-23,15,-24,23,9,-24,-27,-24,-19,-15,-3,18,-20,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-19,-17,-10,-17,-11,-17,-4,-5,-9,-4,-8,-14,-5,-7,2,2,1,-23,-13,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-25,24,15,-27,-6,-8,-27,-4,-17,-18,4,-10,-1,-10,1,-2,-20,-31,-18,7;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-24,-9,-4,-10,-17,34,-18,-3,-13,0,2,-18,4,2,-6,-9,-17,-21,7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-20,-34,-28,12,-33,-25,30,-25,20,17,-25,-26,-25,-23,-18,-7,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,43,-30,60,17,-37,-11,15,-39,-1,-29,-26,19,-11,1,-9,-1,-11,-30,-39,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,19,-23,24,25,-27,-15,-5,-26,1,-20,-20,9,-7,5,-6,6,5,-21,-33,-18,15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-34,-27,2,-33,-25,35,-26,24,20,-25,-25,-21,-23,-20,-7,29,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-13,-19,-11,-21,10,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-3,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-20,-32,-23,0,-28,-23,26,-24,25,17,-23,-23,-18,-22,-18,-7,19,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-15,-18,-19,-16,-3,-22,-15,7,-13,15,5,-11,-26,-14,-5,-14,-5,8,-25,-8,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-3,-20,-7,0,-26,-1,-9,-19,-5,-19,-9,0,-11,14,-6,11,7,-16,-25,-16,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-3,-16,-30,61,-17,-39,-18,-30,-21,4,-19,-18,-18,0,-18,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-13,-26,-14,-20,-20,37,-10,-24,-18,-20,-12,-6,-22,-18,-18,-3,-15,-14,-19,-15,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-11,-18,-14,-9,-7,-20,-6,-6,-4,-10,-4,-8,-18,-5,-6,1,5,2,-21,-1,-7;
MA   /M: SY='P'; M=7,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,61,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-14,-23,-18,-12,-3,-23,-17,8,-17,6,1,-10,-8,-15,-17,-12,-6,4,-25,-9,-15;
MA   /M: SY='G'; M=18,-4,-19,-11,-13,-22,24,-16,-20,-13,-20,-14,3,-16,-13,-17,7,-6,-12,-25,-23,-13;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-13,-10,-8,-12,-16,-8,-12,-9,-10,-9,0,-13,-6,-6,15,27,-4,-30,-10,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-20,-23,-17,12,-23,-10,4,-17,9,11,-17,-15,-14,-14,-10,2,1,-13,10,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-3,-22,-4,5,-25,-6,-9,-21,7,-20,-10,-1,-12,9,1,7,-1,-16,-26,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-25,6,24,-26,-13,-6,-22,8,-19,-14,2,-9,10,1,1,-4,-19,-28,-17,17;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-21,-27,-21,23,-26,-10,8,-21,12,4,-20,-26,-20,-17,-14,-6,5,-3,23,-21;
MA   /M: SY='L'; M=6,-17,-16,-21,-16,-4,-19,-18,9,-20,16,5,-14,-22,-15,-18,-8,-1,7,-24,-9,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-26,7,30,-28,-17,-6,-26,17,-22,-15,0,-6,14,6,2,-2,-22,-27,-16,22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-20,-18,-11,-4,-25,-13,7,-15,15,6,-12,-21,-12,-12,-12,2,4,-25,-5,-12;
MA   /M: SY='S'; M=17,-4,-12,-10,-6,-17,-7,-15,-15,-7,-17,-13,0,-11,-5,-7,21,20,-5,-29,-16,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-6,-2,-7,0,-24,-10,-10,-24,-4,-24,-15,-1,-8,5,1,10,2,-18,-32,-19,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-19,-32,-25,12,-30,-25,25,-25,18,11,-23,-26,-24,-22,-14,-5,24,-20,0,-25;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-26,-1,13,-28,-16,-9,-24,20,-24,-12,-2,-1,11,8,0,-4,-19,-24,-15,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00645;
//
ID   GLUCOAMYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00820;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucoamylase active site region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5050912; R2=0.0163921; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=442; N_SCORE=12.740; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=8,-9,-27,-9,1,-27,-14,-16,-21,14,-24,-13,-9,20,-2,0,-4,-7,-17,-23,-19,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-22,-21,-25,-17,-3,-24,-21,19,-21,16,9,-19,-7,-15,-20,-15,-7,11,-19,-6,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-16,-32,-27,-3,-29,-29,30,-22,10,10,-24,-24,-24,-23,-10,-3,36,-25,-8,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-26,-10,0,-14,-18,-10,-24,27,-20,-9,-4,-15,2,27,-8,-9,-15,-17,-7,0;
MA   /M: SY='N'; M=-11,6,-31,1,-1,-22,-12,-7,-22,6,-29,-18,15,11,-3,-1,-5,-8,-28,-13,-15,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-18,25,-28,39,7,-21,-17,-1,-23,-7,-11,-17,5,-17,-5,-12,-8,-10,-20,-26,-2,0;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-18,-28,-18,5,-25,-20,15,-26,39,15,-26,-26,-18,-20,-23,-8,8,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-25,17,13,-29,-12,-3,-28,7,-23,-17,6,-12,10,12,5,-4,-21,-30,-16,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-25,-29,-24,47,-30,-2,3,-21,11,3,-21,-30,-23,-15,-21,-10,-3,15,49,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-16,-31,-28,-1,-32,-29,31,-22,11,11,-24,-25,-25,-22,-10,2,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=22,-20,-18,-29,-20,-10,-18,-25,17,-19,4,4,-16,-16,-16,-24,-4,-4,17,-21,-11,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-25,4,4,-25,-8,-4,-20,4,-16,-8,5,-15,12,1,-1,-7,-20,-26,-14,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-4,-23,-10,-14,3,-19,17,-1,-9,-5,7,3,-25,-6,-7,-10,-7,-7,-10,24,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-33,-42,-35,-28,13,-5,-27,-21,-21,-17,-17,-30,-28,-23,-20,-30,-25,-26,99,19,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-20,9,0,-22,-7,-6,-20,-6,-27,-19,19,5,-3,-9,15,10,-20,-37,-20,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-17,4,5,-22,-7,-1,-19,7,-24,-12,16,-11,11,4,13,3,-18,-27,-14,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-20,-8,-7,-19,-7,-18,-17,-11,-21,-15,-4,15,-9,-14,13,22,-13,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,11,-14,-20,-26,37,-21,-35,-21,-27,-20,-4,-24,-20,-21,2,-13,-23,-30,-29,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-24,-23,-31,-20,54,-28,-11,-4,-21,4,0,-16,-26,-19,-14,-16,-10,-6,7,28,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-26,-16,5,-28,-16,11,-19,38,15,-25,-28,-15,-4,-26,-10,5,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-16,-20,-19,-13,-8,-26,-18,13,-9,0,3,-12,-23,-14,-4,-9,-4,20,-28,-10,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-24,3,2,-11,3,-1,-22,-5,-21,-14,22,-18,2,-5,1,-8,-26,-25,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,55,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=1,-15,-17,-18,-15,-3,-18,-9,1,-9,-5,2,-12,-21,-10,-6,1,3,8,-18,4,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-20,-6,-4,-5,-13,34,-21,-13,-20,-9,6,-17,-2,-7,10,-1,-17,-28,4,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-22,-32,-22,46,-24,-20,-5,-23,0,-5,-19,-6,-30,-20,-14,-9,-5,-2,12,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-22,-29,-23,44,-25,-5,-2,-19,3,-2,-18,-26,-24,-16,-15,-8,-4,12,39,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-22,-27,-18,-2,-25,-13,17,-14,17,25,-18,-22,-9,-8,-15,-7,11,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-17,-17,-23,-16,-10,-1,-18,-2,-18,9,5,-16,-19,-13,-19,-7,-7,0,-20,-13,-15;
MA   /M: SY='V'; M=22,-21,-10,-26,-21,-9,-17,-26,13,-16,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-23,-1,15,-26,-17,-1,-16,2,-16,-2,-1,-9,26,0,7,4,-18,-26,-12,21;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-14,-25,-14,-9,-8,-24,22,-9,-3,-4,2,-9,-23,2,9,-13,-11,-6,-17,12,-7;
MA   /M: SY='R'; M=9,-6,-21,-9,0,-23,-11,-11,-22,19,-21,-11,-2,-13,2,20,2,-4,-12,-22,-14,0;
MA   /M: SY='G'; M=28,-10,-19,-16,-14,-24,30,-20,-23,-14,-19,-14,-6,-14,-14,-20,6,-9,-13,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-10,-17,-11,-11,-10,-22,-19,1,-7,3,0,-13,-19,-13,-10,-6,4,9,-26,-10,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00646;
//
ID   CYTO_HEME_LYASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00821;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome c and c1 heme lyases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0301008; R2=0.0140120; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=825; N_SCORE=16.580; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=105; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,19,-25,18,-2,-20,9,0,-27,-7,-26,-20,20,-18,-6,-10,3,-7,-25,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-2,-33,3,-1,-11,-11,-10,-24,-9,-19,-18,-9,-18,-7,-12,-11,-8,-23,26,7,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-24,30,11,-27,-12,-3,-25,1,-24,-20,15,-14,0,1,4,-4,-18,-35,-18,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-25,-10,-11,-14,-25,-21,3,-16,-3,-4,-15,10,-15,-19,-8,1,3,-29,-14,-15;
MA   /M: SY='S'; M=0,10,-20,10,2,-24,-6,7,-23,-7,-27,-18,14,-2,-1,-9,15,3,-20,-36,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-29,-5,9,-26,-8,-11,-16,0,-19,-10,-4,3,6,-6,0,-7,-17,-26,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-25,27,22,-29,-14,-5,-29,7,-24,-21,8,-7,5,-2,6,2,-22,-33,-17,14;
MA   /M: SY='D'; M=5,29,-22,33,7,-31,-5,-5,-27,-3,-23,-22,15,-11,-3,-12,5,-5,-20,-33,-20,2;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-25,-15,-30,-25,0,-25,-14,25,-15,15,37,-25,-25,-14,-15,-15,-5,29,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-31,5,28,-22,-21,-3,-25,16,-21,-15,-5,5,9,4,-7,-10,-25,-19,-5,17;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-15,-6,-9,-13,-12,-12,-3,-11,-15,-9,12,-17,-8,-11,15,12,0,-35,-15,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-23,-34,-25,0,-29,-16,33,-19,19,37,-21,-21,-12,-19,-19,-9,24,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-27,-5,9,-28,-15,-7,-21,2,-23,-13,-6,17,12,2,2,-5,-22,-26,-19,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=4,-17,-17,-24,-14,24,-17,-14,-8,-17,-5,-5,-10,-19,-13,-14,-1,-3,-6,-9,5,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-20,-19,-18,-1,-24,-15,15,-21,20,8,-5,-26,-16,-16,-16,-6,8,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-6,-30,-5,1,-29,22,-8,-33,2,-25,-15,0,-16,4,11,-3,-15,-27,-21,-21,1;
MA   /M: SY='A'; M=38,-14,1,-22,-15,-17,-7,-22,-6,-13,-8,-8,-14,-15,-15,-21,5,-1,6,-24,-19,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,10,-25,5,8,-28,-12,3,-23,12,-26,-11,18,-14,22,15,5,-3,-25,-28,-14,14;
MA   /M: SY='E'; M=-13,10,-30,19,39,-24,-20,4,-26,6,-19,-16,0,-7,17,-2,-3,-10,-27,-22,-5,27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-21,-22,-13,-2,-27,-19,8,-7,23,10,-22,-25,-13,-6,-22,-9,8,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-22,1,17,-27,-15,-7,-23,13,-22,-12,0,-8,13,4,6,2,-18,-26,-15,15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-7,13,-26,14,7,-29,-12,-1,-27,13,-23,-15,11,-14,10,18,-1,-7,-22,-27,-15,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-28,-9,3,-19,-10,-10,-17,2,-6,-5,-9,-8,3,6,-11,-11,-17,-22,-13,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-17,-27,-19,-11,5,-21,14,-11,-14,-4,-2,-13,-22,-2,-10,-15,-14,-15,10,17,-7;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-23,-10,-14,-24,32,-5,-29,-15,-22,-14,0,-17,-13,-16,4,-4,-20,-23,-19,-14;
MA   /M: SY='E'; M=1,0,-26,3,9,-29,-1,-10,-26,3,-25,-16,-1,2,5,-5,4,-6,-22,-27,-20,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-29,14,37,-30,-4,-1,-29,4,-23,-18,8,-7,16,-2,1,-10,-30,-29,-20,26;
MA   /M: SY='C'; M=3,-11,19,-17,-13,-15,-19,-20,-14,-10,-8,-9,-10,-21,-13,-13,1,8,-5,-32,-16,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-11,19,-14,-10,-15,-18,-3,-14,-7,-12,-1,-10,-4,-8,-9,-9,-8,-10,-26,-12,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-14,1,-17,-17,-16,7,-18,-15,-10,-13,-9,-10,-21,-15,-6,-4,-8,-3,-23,-18,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-30,2,12,-31,30,-10,-35,-7,-26,-18,0,-12,1,-10,0,-16,-30,-24,-25,7;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-24,-40,-19,-9,-20,-23,-23,-10,-14,-21,-14,-23,57,-13,-21,-16,-13,-21,-3,-17,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,2,15,-28,-17,-8,-29,34,-28,-13,1,-10,10,24,-2,-6,-20,-24,-13,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-12,-24,-15,-2,-10,-25,-14,2,-1,6,9,-12,-16,-4,-5,-12,-1,-1,-23,-6,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-20,-5,0,-20,-10,-5,-25,11,-25,-15,5,-15,5,31,14,5,-15,-30,-15,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00647;
//
ID   CYTO_HEME_LYASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00822;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome c and c1 heme lyases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6280684; R2=0.0133904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=572; N_SCORE=12.277; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-22,-24,-22,-16,7,-28,13,5,-22,26,12,-19,-28,-12,-14,-24,-12,-2,-13,19,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-3,0,-14,-9,-7,-11,-4,-13,-8,2,-7,7,-4,15,18,-7,-21,-9,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-26,-32,-22,-13,-11,-23,-21,-3,-16,-6,-1,-26,27,-15,-19,-18,-11,-8,-3,-11,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-18,-5,-20,-11,-9,-25,-13,-11,0,6,0,-15,-26,-7,16,-18,-10,-7,-24,-9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,37,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-31,-16,-4,-14,-21,-6,-20,11,-10,-6,-10,-22,8,36,-16,-13,-18,4,-3,0;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-37,-27,21,-35,-25,30,-30,26,15,-23,-25,-25,-25,-23,-10,17,-13,7,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-24,-13,-11,12,-19,-5,-13,-1,-6,-6,6,-24,-10,17,-10,-7,-13,-17,0,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=1,14,-16,9,8,-21,-3,-2,-21,-4,-29,-20,24,-12,3,-6,25,10,-19,-39,-20,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-19,-7,-2,-13,-16,8,-16,9,-9,-4,-1,-13,2,19,-5,-1,-11,-18,-2,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-31,-30,-36,-27,37,-29,-18,5,-25,8,1,-26,-29,-26,-20,-26,-15,-3,37,29,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-14,-13,-15,-12,0,-5,-9,5,-14,16,12,-13,-15,-9,-10,-13,-7,1,-12,-3,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=5,1,-21,-3,-8,-23,20,4,-26,-12,-26,-16,11,-16,-6,-12,12,-4,-21,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-23,-15,-11,-1,-15,-3,-7,-11,-2,-2,-11,-20,-2,-10,-5,6,-9,-7,18,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-26,10,27,-24,-17,-6,-16,0,-15,-14,5,-7,6,-8,0,-7,-18,-29,-17,16;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-29,-14,-7,-16,-14,-17,-11,-3,-2,-3,-16,10,-9,-7,-16,-11,-13,-23,-14,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-19,-26,-24,-16,2,-31,-9,16,-16,9,8,-16,-21,-5,-15,-13,-2,5,-9,17,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-9,13,-22,12,1,-18,-13,-4,-13,-9,-6,-9,12,-18,1,-8,0,-3,-16,-32,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-13,9,1,-16,6,-5,-18,1,-16,-11,4,-7,-2,-2,4,-3,-12,-16,-11,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,72,-18,-18,-12,-18,-18,-18,-18,-12,-12,-12,-24,-18,-18,-6,-6,-6,-30,-18,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-30,7,7,-31,35,-12,-37,-9,-27,-21,2,-13,-6,-13,0,-16,-30,-25,-26,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-23,-1,-1,-19,-15,-3,-23,17,-22,-13,15,-16,3,30,1,5,-18,-27,-13,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,4,-19,1,1,-20,3,-6,-21,13,-22,-11,9,-10,1,6,2,-4,-16,-20,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-4,-21,-6,8,-23,-17,-5,-8,-1,-10,-3,-4,-9,19,-4,2,1,-11,-20,-10,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-18,-16,-10,-13,-14,-21,3,-6,-6,-1,-17,-21,-16,-10,-7,-6,18,-27,-14,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-28,5,9,-30,-16,-3,-27,22,-23,-11,2,-12,18,23,-4,-9,-21,-23,-13,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-9,-30,-6,8,3,-26,13,-11,-2,-8,-6,-12,-19,8,-4,-12,-10,-18,6,39,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-15,-27,-25,-5,-28,-28,22,-18,3,5,-28,-10,-27,-20,-10,-2,37,-30,-13,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-25,-32,-30,-20,-8,-33,-23,25,-17,5,8,-17,-2,-13,-12,-17,-10,12,-22,-7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00647;
//
ID   DEHYDRIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00823;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dehydrins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8412752; R2=0.0142163; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=318; N_SCORE=9.352; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-22,16,14,-24,-13,12,-26,-4,-22,-16,8,-10,4,-6,11,6,-20,-34,-11,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,6,-10,-10,-5,-19,35,-17,-12,-11,-4,-4,-21,-4,-8,-10,-11,-15,-15,18,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-26,-5,1,-28,35,-15,-32,-11,-24,-18,-2,-13,-9,-15,2,-14,-24,-22,-26,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-22,22,5,-27,-18,-8,-17,-4,-16,-12,3,-14,4,-8,2,3,-9,-32,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-26,23,39,-28,-18,-4,-28,4,-20,-20,4,-4,10,-4,4,2,-24,-32,-18,24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-26,-8,-11,-28,35,-14,-30,-12,-24,-14,0,-16,-3,-12,4,-4,-24,-22,-22,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-8,2,-22,4,-8,-20,-2,4,-18,-12,-16,-10,0,-18,-10,-12,1,2,-8,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-32,-4,0,-30,35,-16,-34,-12,-28,-20,-4,5,-10,-16,-2,-16,-30,-24,-28,-6;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-26,8,35,-28,-16,-6,-26,15,-20,-16,-2,-4,12,3,0,-8,-22,-26,-18,23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-24,0,8,-24,-16,-8,-24,40,-24,-8,0,-8,8,24,-8,-8,-16,-16,-8,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,57,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,7,-13,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-34,-24,4,-32,-20,31,-26,33,28,-24,-24,-16,-22,-24,-10,18,-20,0,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-22,-23,-13,-5,-22,-6,8,0,14,36,-17,-20,-2,-3,-20,-10,3,-20,-2,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-22,-7,-6,-8,-17,4,-6,-4,-9,5,6,-18,7,-4,-2,3,-13,-17,7,0;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-2,-30,-2,-1,-24,-3,52,-32,2,-24,-6,6,-18,4,3,-8,-18,-28,-26,4,-1;
MA   /M: SY='P'; M=8,-6,-27,-2,20,-27,-14,-12,-21,-2,-20,-17,-9,26,1,-12,0,-7,-21,-27,-23,9;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-6,15,-9,-6,-23,-23,26,-30,3,-23,-9,-2,-23,-2,0,-10,-14,-21,-33,-5,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-6,1,-21,-20,-9,-14,-2,-14,-6,0,-10,17,-2,12,27,-11,-26,-10,9;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,21,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,28,8,-16,-34,-23,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-15,-3,4,-18,-14,-3,-11,1,-11,-3,0,-7,20,1,6,12,-11,-17,-7,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=16,-1,-13,-1,15,-17,-6,-8,-13,-1,-10,-10,-4,-4,3,-8,4,-3,-10,-17,-14,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-13,3,15,-13,-14,-8,-13,-1,-10,-10,0,-4,3,-4,8,16,-10,-21,-10,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-13,6,19,-17,-6,-4,-17,-1,-18,-14,4,-4,6,-4,15,4,-13,-25,-14,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-13,-4,-1,-13,-14,-11,-13,12,-13,-7,0,-7,-1,6,4,16,-6,-18,-7,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-13,-4,-1,-13,-14,-11,-13,12,-13,-7,0,-7,-1,6,4,16,-6,-18,-7,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-13,18,3,-17,-11,-8,-17,-4,-13,-13,6,-7,-4,-7,8,16,-10,-24,-10,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-13,5,-31,3,0,-24,-14,26,-23,-7,-27,-14,14,22,-1,-8,-4,-10,-30,-33,-12,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00285;
//
ID   EF1BD_1_MP; MATRIX.
AC   MP00824;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Elongation factor 1 beta/beta'/delta chain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1300344; R2=0.0113211; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=262; N_SCORE=7.086; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=210; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,-12,-18,-11,-12,-10,-18,-6,-11,-8,-7,-10,-14,-8,-15,8,7,3,-22,-13,-9;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-26,5,7,-24,-10,-10,-22,0,-24,-18,3,4,-2,-8,1,-6,-21,-17,-17,2;
MA   /M: SY='P'; M=7,-16,-25,-13,-3,-21,-16,-20,-9,-10,-17,-12,-16,29,-11,-18,-2,-4,-6,-28,-22,-9;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-20,-10,5,-17,-13,-15,-13,-3,-15,-12,-10,2,-5,-11,2,-3,-8,-24,-17,-1;
MA   /M: SY='A'; M=13,4,-17,4,-1,-23,-8,-14,-17,-4,-19,-15,-1,-6,-6,-11,10,4,-8,-30,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=15,-1,-19,-5,-2,-23,2,-16,-21,-2,-18,-14,-2,-11,-6,-9,6,4,-11,-24,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-18,-11,-7,-16,-6,-13,-16,-3,-18,-12,-4,-6,-7,-9,9,9,-9,-21,-8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=8,-4,-22,-3,7,-26,10,-13,-26,-4,-24,-17,-1,-3,-3,-10,9,-4,-19,-27,-22,2;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-14,-8,-5,-22,-3,-17,-15,-9,-17,-14,-5,0,-7,-17,13,2,-7,-26,-21,-7;
MA   /M: SY='A'; M=17,-9,-23,-11,-3,-24,6,-18,-20,-10,-19,-15,-8,11,-9,-17,3,-3,-16,-24,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-19,-15,-7,-24,1,-19,-17,-3,-17,-12,-9,2,-8,-13,4,-5,-10,-21,-21,-8;
MA   /M: SY='A'; M=26,-2,-14,-7,-2,-21,-8,-16,-15,-3,-14,-12,-4,-9,-6,-12,9,8,-6,-24,-17,-4;
MA   /M: SY='E'; M=5,14,-24,20,24,-31,-11,-5,-26,1,-20,-18,2,-7,9,-8,3,-7,-21,-29,-19,17;
MA   /M: SY='A'; M=15,8,-18,11,13,-26,-6,-10,-22,-4,-20,-18,2,-8,0,-12,12,0,-14,-30,-20,7;
MA   /M: SY='E'; M=1,15,-25,21,22,-30,-13,-7,-28,11,-23,-18,3,-7,5,-1,0,-8,-21,-28,-18,14;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,46,32,-36,-9,-1,-36,2,-26,-26,11,-7,6,-7,0,-11,-30,-35,-21,19;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,59,21,-38,-5,-1,-39,0,-29,-28,17,-10,0,-10,0,-11,-30,-38,-21,11;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,26,-37,-13,-1,-37,6,-28,-27,15,-8,4,-5,-1,-10,-29,-37,-19,15;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-37,-29,12,-35,-26,35,-27,19,18,-23,-24,-24,-25,-19,-8,27,-18,2,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-13,-29,-13,-20,-24,56,-20,-31,-21,-19,-14,-4,-21,-20,-20,-4,-19,-24,-20,-26,-20;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-14,13,12,-21,-5,-6,-21,-4,-24,-18,8,-7,3,-7,23,8,-14,-33,-17,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-8,27,-24,39,26,-30,-10,-2,-29,2,-21,-21,9,-6,5,-7,1,-8,-23,-30,-17,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-20,25,18,-23,-14,-6,-23,-1,-18,-18,7,-6,2,-6,6,9,-17,-29,-14,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-26,17,51,-26,-17,0,-26,9,-17,-17,0,0,17,0,0,-9,-26,-26,-17,34; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-24,13,44,-23,-18,-2,-21,6,-15,-15,-2,-2,13,-2,-1,-8,-19,-26,-16,29; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,19,-25,30,35,-28,-13,-1,-28,4,-20,-20,5,-4,9,-4,1,-8,-24,-28,-17,22; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-24,19,12,-26,-13,-7,-25,11,-23,-16,4,2,2,2,0,-2,-19,-26,-15,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-21,3,22,-24,-13,-7,-21,16,-18,-12,-2,-5,8,4,-1,-6,-16,-21,-14,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=23,-2,-15,-4,15,-20,-7,-10,-15,-2,-12,-12,-5,-5,2,-10,5,-3,-10,-20,-17,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=19,-5,-16,-8,6,-18,-9,-12,-12,2,-8,-8,-7,-8,-1,-7,1,-4,-7,-19,-14,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-23,6,19,-23,-13,-5,-23,16,-18,-13,0,-7,8,13,-2,-7,-18,-21,-14,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-7,-23,-7,8,-15,-19,-9,-10,8,-5,-4,-7,-11,2,8,-8,-8,-9,-19,-9,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-22,-13,-5,-11,-21,-11,-6,11,-1,1,-9,-17,-2,18,-13,-8,-3,-18,-6,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=3,-8,-22,-9,3,-21,-17,-10,-16,12,-15,-8,-7,-14,5,17,-3,-6,-8,-23,-14,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00648;
//
ID   EF1BD_2_MP; MATRIX.
AC   MP00825;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Elongation factor 1 beta/beta'/delta chain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7349987; R2=0.0139532; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=526; N_SCORE=12.064; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=4,-8,-18,-8,-9,-18,15,-15,-19,-16,-16,-13,0,-16,-9,-15,16,3,-12,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-15,-21,-17,-3,-24,-21,10,-20,12,4,-15,-21,-16,-17,-1,12,13,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,63,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='B'; M=-7,22,-23,21,9,-23,-10,-1,-19,-3,-14,-10,17,-14,0,-8,-1,-6,-19,-33,-16,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-29,-9,13,-21,-27,-9,3,-5,-5,1,-9,-11,15,-8,-7,-9,-5,-24,-10,12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,55,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,25,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-18,21,13,-22,-9,-3,-22,10,-20,-15,7,-6,4,2,3,-3,-16,-23,-12,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-7,-15,-7,0,3,-15,7,-5,-6,1,0,-7,-12,2,-4,-8,-7,-8,-5,10,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-24,-31,-24,-2,-31,-26,33,-26,13,12,-17,-20,-18,-25,-10,-4,23,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-22,5,28,-21,-19,-6,-18,1,-14,-8,-2,-6,8,-4,6,8,-16,-30,-15,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-27,1,10,-28,-5,-13,-25,-1,-25,-18,-5,18,-1,-10,3,-6,-22,-28,-23,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-8,-22,-16,-19,40,-23,-13,-3,-21,-1,-5,-2,-25,-26,-16,-12,-8,-6,-8,12,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,18,-27,20,44,-27,-15,3,-27,7,-23,-20,16,-5,15,0,3,-7,-30,-33,-20,29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,52,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-12,-29,-11,-6,13,-26,37,-12,-9,-7,-2,-9,-24,-3,-7,-15,-13,-17,5,48,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,13,-26,-23,-6,-26,-21,7,-18,2,11,-19,-25,-19,-18,-6,7,19,-32,-12,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,8,-15,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,23,-25,-15,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-23,-38,-28,54,-27,-17,2,-24,9,11,-22,-28,-29,-18,-22,-12,-1,19,23,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,32,-21,20,4,-24,-3,7,-22,0,-29,-18,44,-17,7,-1,11,0,-28,-38,-19,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,26,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,27,-21,-1,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00648;
//
ID   MARCKS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00826;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MARCKS family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4319086; R2=0.0123827; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1127; N_SCORE=18.377; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=168; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-21,-13,-1,-13,-25,-14,-2,3,-6,-3,-14,-20,-7,14,-8,-5,10,-27,-12,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-24,-8,-3,-21,-20,-18,-17,3,-21,-13,-7,23,-6,-5,4,18,-14,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='A'; M=21,-12,-23,-15,-11,-25,19,-20,-22,-13,-21,-15,-9,8,-13,-20,3,-9,-16,-22,-25,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-30,14,43,-30,-1,-4,-32,4,-22,-20,0,-4,12,-4,0,-12,-30,-28,-22,27;
MA   /M: SY='E'; M=10,3,-23,7,37,-27,-13,-7,-23,3,-17,-17,-3,-3,10,-7,3,-7,-20,-27,-20,24;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=23,-21,-10,-25,-21,-9,-16,-25,11,-15,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,27,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='G'; M=27,-10,-19,-15,-15,-25,33,-20,-24,-15,-19,-15,-5,-15,-15,-20,5,-9,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-13,-7,-20,0,-17,-13,-10,-17,-13,-3,-10,-7,-17,20,7,-3,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=5,-16,-10,-16,-16,-9,-16,-21,7,-15,-9,-4,-11,-21,-16,-15,13,9,22,-35,-15,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-15,-25,-15,-6,-14,-20,4,-19,18,4,-19,-19,-15,-20,-9,-5,5,-20,-11,-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-19,-11,-1,-25,-9,-15,-19,18,-19,-10,-5,-10,-1,3,1,-5,-9,-20,-15,-1;
MA   /M: SY='G'; M=27,-10,-19,-15,-15,-25,33,-20,-24,-15,-19,-15,-5,-15,-15,-20,5,-9,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=22,-1,-19,-1,23,-25,-9,-11,-19,-1,-15,-15,-5,-5,4,-11,5,-5,-14,-25,-20,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-30,6,23,-30,22,-9,-35,-4,-25,-20,0,-9,1,-9,0,-15,-30,-25,-25,12;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-25,3,26,-27,-13,-9,-23,-1,-21,-18,-4,14,5,-9,6,-4,-21,-29,-22,15;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,37,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,19,-1,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='P'; M=10,-13,-28,-11,-1,-27,-13,-18,-19,3,-23,-15,-13,37,-6,-10,-3,-7,-18,-25,-23,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00649;
//
ID   MARCKS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00827;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MARCKS family phosphorylation site domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8855596; R2=0.0096250; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1704; N_SCORE=20.277; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=272; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=9,-10,-22,-8,-2,-24,-8,-16,-18,-10,-26,-18,-6,31,-6,-16,14,4,-16,-32,-24,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-36,-6,8,-34,-20,-8,-20,-2,-26,-12,-12,49,19,-8,-6,-10,-30,-26,-22,11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-30,1,12,-30,1,-10,-32,27,-28,-14,0,-10,5,13,-6,-12,-24,-22,-16,9;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,9,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=11,18,-22,24,15,-30,-8,-8,-26,-2,-20,-20,4,-8,0,-12,4,-6,-18,-30,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-8,-30,33,-16,-36,9,-30,-16,0,-16,-8,1,-4,-16,-26,-20,-22,-8;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-18,-16,-14,-24,29,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='T'; M=4,7,-18,7,14,-22,-15,-12,-20,-3,-15,-15,1,-7,0,-9,10,15,-12,-29,-16,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-23,-6,0,-18,-12,-12,-12,-6,-18,-12,-12,53,-6,-12,-6,-6,-18,-18,-18,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=12,-10,-10,-11,-10,-14,-9,-17,-5,-13,-16,-10,-4,-16,-10,-14,22,12,8,-35,-17,-10;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-29,-10,-2,-26,-13,-18,-18,-10,-26,-18,-13,53,-8,-18,3,-3,-21,-30,-26,-8;
MA   /M: SY='P'; M=2,-8,-22,-4,0,-24,-8,-14,-20,-10,-30,-20,-2,31,-4,-14,19,8,-18,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-2,8,-20,4,4,-24,-8,-6,-24,17,-30,-16,16,-12,4,9,13,3,-18,-32,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-18,-6,0,-12,-12,0,-18,18,-12,-6,0,-12,6,41,-6,-6,-12,-12,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=2,-8,-22,-4,0,-24,-8,-14,-20,-10,-30,-20,-2,31,-4,-14,19,8,-18,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,51,-30,-20,8,-30,27,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-2,18,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,50,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=26,-9,-18,-14,-13,-24,29,-19,-23,-14,-20,-15,-4,-14,-13,-19,9,-6,-13,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-30,8,27,-30,17,-8,-34,-2,-24,-20,0,-8,3,-8,0,-14,-30,-26,-24,15;
MA   /M: SY='G'; M=-8,15,-30,23,-3,-34,37,-12,-40,-12,-30,-24,8,-16,-12,-16,0,-16,-30,-28,-26,-8;
MA   /M: SY='A'; M=23,-6,-14,-10,-8,-22,14,-16,-20,-12,-22,-16,0,-12,-8,-16,20,4,-10,-28,-22,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-22,12,35,-26,-12,-4,-26,2,-24,-20,4,-4,12,-4,17,2,-22,-34,-20,23;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-22,12,35,-26,-12,-4,-26,2,-24,-20,4,-4,12,-4,17,2,-22,-34,-20,23;
MA   /M: SY='G'; M=9,-6,-20,-7,-11,-25,34,-16,-29,-15,-28,-19,3,-15,-11,-16,18,-1,-19,-28,-25,-11;
MA   /M: SY='P'; M=10,-15,-29,-13,-7,-27,3,-20,-21,-12,-24,-17,-13,40,-12,-20,-2,-9,-21,-25,-27,-12;
MA   /M: SY='T'; M=20,-4,-10,-14,-10,-14,-12,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,30,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-2,-20,-2,18,-25,-1,-12,-21,-3,-16,-15,-5,-7,1,-12,5,-6,-16,-24,-21,10;
MA   /M: SY='E'; M=6,8,-24,13,36,-28,-13,-6,-25,3,-18,-18,-1,-4,9,-7,3,-7,-21,-28,-20,23;
MA   /M: SY='E'; M=6,-1,-24,2,17,-27,13,-11,-28,-5,-22,-18,-1,-9,0,-11,6,-8,-22,-26,-23,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00649;
//
ID   RIBOSOMAL_L36_MP; MATRIX.
AC   MP00828;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L36 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0209513; R2=0.0103451; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=861; N_SCORE=12.928; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,-1,20,-10,20,59,-20,-20,-1,-10,-20,-10,11,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-8,-29,46,-29,-9,0,-11,13,31,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-12,-3,-15,-22,-5,-17,16,-9,-4,-6,-20,5,36,-11,-8,-11,-19,-5,-2;
MA   /M: SY='A'; M=19,0,-15,-7,-5,-20,-4,-13,-15,-8,-21,-15,6,-2,-6,-13,17,8,-10,-30,-20,-6;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,31,-25,23,15,-28,-28,-25,-22,-17,-5,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-30,-3,6,-27,-15,-8,-31,41,-27,-11,0,-13,8,38,-9,-11,-21,-20,-11,6;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-22,-5,2,-25,-13,-12,-22,18,-24,-12,-1,-4,2,10,4,0,-14,-25,-15,2;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-20,-23,-25,-19,-1,-26,-20,21,-21,18,14,-17,-20,-15,-19,-16,-8,12,-20,-3,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,52,-18,-14,-21,-24,-20,-26,-3,-21,-15,-12,-20,-14,-6,-10,-9,-13,-35,-21,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-29,7,15,-27,-14,-5,-29,18,-25,-16,2,-3,8,22,-3,-8,-24,-26,-16,9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-27,27,9,-30,-6,3,-31,10,-28,-19,19,-13,2,3,1,-8,-26,-32,-16,5;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-8,93,-16,-23,-22,-25,-23,-30,-24,-22,-21,-9,-35,-24,-25,-7,-9,-14,-48,-28,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-28,-8,2,-22,-20,-5,-21,25,-19,-6,-3,-16,12,30,-9,-10,-16,-18,-6,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-25,2,-31,-24,30,-25,26,19,-24,-23,-20,-22,-20,-8,24,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,16,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,3,-23,-20,-4,-29,34,-22,-10,-1,-17,9,54,-10,-10,-19,-21,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-28,-1,4,-23,-17,9,-28,27,-25,-10,7,-15,9,33,-6,-9,-22,-23,-7,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-29,-8,-14,-28,48,-15,-37,-8,-28,-18,3,-19,-12,-3,-1,-17,-28,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-13,-6,-17,-23,-9,-14,19,-14,-5,-5,-20,0,37,-10,-7,-4,-23,-9,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-32,-26,2,-33,-26,31,-24,22,15,-25,-27,-23,-20,-18,-6,31,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-27,-23,-17,15,-26,4,0,-5,3,10,-16,-25,-8,5,-18,-10,-5,3,33,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-23,13,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-37,-28,1,-38,-27,43,-27,20,18,-21,-22,-20,-25,-20,-9,28,-20,1,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-6,87,-18,-23,-20,-23,-20,-28,-23,-22,-20,-1,-35,-23,-23,-5,-8,-15,-48,-28,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-22,-4,4,-22,-18,-12,-19,21,-22,-10,0,-11,3,11,1,0,-11,-25,-12,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-1,-2,-11,-9,-9,-7,0,-10,-6,0,-8,-3,-3,7,8,-1,-19,-8,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-21,24,5,-23,-4,6,-22,0,-26,-19,41,-16,3,-2,8,0,-26,-36,-18,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-35,-10,-1,-27,-18,-17,-19,-5,-26,-17,-15,63,-7,-12,-7,-8,-25,-29,-26,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-29,-3,4,-24,-18,-4,-29,36,-25,-11,4,-15,9,46,-7,-8,-20,-22,-11,4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-11,-27,-14,-10,11,-23,54,-19,-14,-9,0,-1,-23,-6,-2,-14,-16,-19,-17,20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,1,9,-29,-19,-8,-29,46,-30,-11,4,-11,9,30,-9,-9,-21,-21,-11,9;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-4,-22,-7,9,-32,-15,-1,-15,3,-16,-2,-4,-11,36,0,2,-7,-18,-21,-13,22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-27,-11,-2,-20,-21,-4,-24,28,-19,-8,-3,-20,6,55,-10,-9,-13,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-17,-29,57,-18,-37,-13,-29,-19,1,-19,-16,-13,0,-18,-28,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-30,-9,-11,-27,35,-13,-36,1,-27,-16,0,-19,-8,11,-4,-16,-26,-20,-22,-11;
MA   /M: SY='P'; M=7,-11,-27,-10,-1,-26,-14,-18,-19,5,-23,-14,-11,31,-5,-7,-3,-3,-17,-25,-21,-5;
MA   /M: SY='K'; M=10,-3,-23,-7,2,-26,-13,-7,-23,26,-22,-9,-3,-11,3,11,-3,-7,-14,-21,-12,2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-27,-12,-3,-18,-18,-3,-19,19,-15,3,-4,-11,6,36,-8,-8,-14,-22,-10,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-21,0,7,-21,-14,-7,-21,34,-21,-7,0,-7,7,21,-7,-7,-14,-14,-7,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-21,-5,2,-17,-15,-6,-16,25,-15,-5,-1,-10,5,25,-8,-7,-11,-14,-6,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-21,-5,2,-16,-14,-2,-21,25,-16,-7,0,-12,7,40,-7,-7,-14,-14,-7,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-30,-6,1,-26,-6,-7,-32,31,-26,-12,0,-16,5,40,-8,-12,-22,-20,-13,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00650;
//
ID   GREAB_1_MP; MATRIX.
AC   MP00829;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic transcription elongation factors signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4813628; R2=0.0150203; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684; N_SCORE=15.745; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-5,8,-23,3,7,-23,-12,-6,-20,11,-22,-11,11,-12,6,6,4,1,-17,-28,-14,6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-8,-22,-11,-6,-15,-15,-15,-13,8,-15,-7,-5,-14,-3,3,0,4,-5,-23,-9,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-22,-16,-13,4,-23,-8,3,-12,1,0,-5,-18,-13,-12,-10,-4,0,-16,6,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-23,-33,-21,-13,-6,-24,-16,-5,-12,-8,-6,-23,16,-13,-15,-18,-10,-12,7,3,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-21,-30,-22,0,-27,-15,25,-19,19,32,-19,-21,-11,-18,-15,-3,16,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-11,-11,-10,-10,-19,-20,-8,-11,-10,-9,0,-11,-10,-11,19,45,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-11,-24,-12,-2,-18,-18,-9,-10,0,-10,-4,-9,-7,4,4,-3,-4,-8,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,8,27,-26,-15,2,-26,9,-20,-14,0,-8,12,6,-1,-8,-23,-26,-14,19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-26,-9,-15,-27,50,-17,-34,-15,-27,-16,1,-18,-14,-14,5,-13,-24,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-20,-25,-22,-15,14,-23,1,-4,-13,2,-1,-17,-24,-13,-12,-16,-11,-6,8,23,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-24,11,17,-26,-14,3,-23,6,-21,-14,12,-11,12,3,3,-3,-22,-30,-15,14;
MA   /M: SY='K'; M=2,-5,-24,-8,4,-24,-16,-9,-22,23,-18,-7,-4,-13,7,21,-5,-7,-14,-21,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-29,-19,5,-29,-19,19,-23,39,21,-26,-27,-16,-17,-27,-10,10,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-27,6,21,-29,-19,-4,-29,29,-24,-12,0,-9,15,21,-6,-10,-23,-24,-13,17;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-24,4,16,-27,-14,-3,-22,10,-17,-11,1,-10,12,3,-1,-7,-19,-25,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,56,-30,-20,-1,-30,13,-21,-19,0,-1,19,3,-1,-10,-29,-29,-19,37;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-20,8,-30,-17,21,-29,45,19,-28,-29,-19,-20,-28,-10,11,-20,1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-29,16,23,-28,-18,7,-28,13,-22,-14,6,-10,16,9,-3,-9,-26,-26,-10,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,0,-28,3,4,-7,-20,12,-19,-2,-14,-9,-2,-18,5,1,-6,-9,-20,-10,14,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-20,8,-30,-19,20,-27,46,20,-28,-29,-18,-17,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-29,-17,-7,-12,-23,-17,-8,8,-9,-3,-15,-18,-4,2,-16,-10,-7,9,-1,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-9,6,-24,5,4,-24,-4,0,-24,4,-21,-12,9,-14,6,6,2,-1,-21,-27,-13,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-10,-18,-9,0,-14,-21,-16,0,-1,-6,-3,-11,-13,-8,-6,-4,-2,9,-26,-12,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-28,3,23,-24,-19,0,-25,17,-19,-12,1,-10,14,16,-5,-9,-22,-24,-11,17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-14,-29,-16,-6,-15,-21,-3,-17,18,-12,1,-6,-20,5,48,-13,-11,-13,-13,-6,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-35,-11,-2,-26,-21,-19,-16,-5,-25,-16,-18,62,-9,-14,-9,-7,-21,-28,-24,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,10,31,-27,-17,-4,-23,10,-18,-13,-1,-7,12,4,-2,-8,-20,-27,-17,21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-23,-26,-24,-4,-30,-22,30,-20,9,10,-10,-23,-18,-18,-12,-6,23,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=6,-15,-15,-21,-17,-8,-21,-22,10,-17,-2,0,-11,-17,-15,-18,6,14,15,-28,-11,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-28,3,19,-29,-18,-3,-24,19,-21,-10,1,-10,20,16,-3,-8,-22,-24,-14,19;
MA   /M: SY='E'; M=4,-3,-24,-4,11,-23,-16,-10,-15,8,-14,-9,-4,-10,5,3,-2,-6,-12,-24,-14,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=14,1,-20,-3,3,-25,-1,-11,-20,1,-20,-13,2,-11,2,-6,7,-1,-14,-25,-18,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-29,8,17,-21,-18,-10,-19,0,-16,-15,-5,-11,2,-6,-6,-9,-17,-8,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-20,-1,-19,-11,-9,-10,-10,-10,-10,-9,-17,9,0,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-11,-24,-14,-4,-18,-15,-6,-22,16,-13,-8,-5,-18,3,41,-6,-7,-13,-20,-12,-4;
MA   /M: SY='E'; M=12,2,-19,3,17,-25,-3,-9,-23,-3,-21,-17,1,-7,4,-9,13,0,-16,-29,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-14,-25,-14,-3,0,-25,13,-3,-15,13,6,-11,-22,-3,-10,-17,-12,-9,-19,7,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-25,-23,-25,-15,2,-27,-15,7,-15,32,12,-22,-27,-12,3,-25,-10,2,-20,-3,-15;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-18,-2,2,-22,-8,-8,-24,12,-28,-16,6,-12,4,14,19,7,-14,-32,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-12,-14,-9,-21,6,-18,-15,-11,-17,-13,-4,-11,-9,-18,16,3,-5,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-30,28,47,-32,-13,-1,-33,6,-23,-22,4,-3,14,-3,0,-11,-30,-31,-21,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,8,-27,11,7,-24,-19,30,-23,0,-18,-8,6,-14,7,-1,-4,-8,-21,-30,-2,5;
MA   /M: SY='A'; M=22,-12,-16,-18,-10,-2,-10,-11,-8,-11,-9,-8,-10,-15,-10,-16,4,-1,-4,-11,4,-11;
MA   /M: SY='A'; M=36,-5,-14,-15,-9,-22,6,-16,-15,-8,-14,-12,-2,-12,-7,-15,8,-3,-7,-22,-20,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-5,-29,-5,5,-24,-21,-8,-26,37,-20,-7,-3,-15,7,37,-12,-10,-17,-20,-9,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,15,35,-28,-17,-1,-29,15,-23,-18,8,-7,13,12,-1,-9,-27,-29,-17,23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-28,6,24,-26,-19,-2,-24,14,-16,-10,0,-10,16,16,-5,-9,-22,-25,-14,19;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-8,-27,-9,8,-26,-22,2,-11,2,-3,6,-7,-16,36,8,-8,-10,-19,-20,-7,21;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-22,-11,-10,-23,19,-14,-26,-5,-21,-14,-2,-16,-6,1,5,-6,-17,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-13,-25,-15,2,8,-23,-7,-12,-2,-4,-1,-10,-18,-1,5,-11,-10,-12,-12,1,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-10,-30,-23,-2,-32,-23,24,-25,20,12,-21,-26,-17,-22,-18,-7,17,-25,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-29,25,37,-31,-16,0,-29,7,-21,-17,6,-5,16,-1,0,-8,-27,-31,-18,26;
MA   /M: SY='G'; M=4,-4,-23,-6,-1,-23,7,-11,-25,2,-21,-14,1,-14,-2,6,4,-5,-18,-24,-19,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-29,-7,6,-21,-20,0,-27,26,-19,-7,-1,-17,13,55,-9,-10,-20,-21,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-28,0,-36,-28,40,-24,18,16,-22,-23,-21,-24,-18,-8,31,-22,-3,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00651;
//
ID   GREAB_2_MP; MATRIX.
AC   MP00830;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic transcription elongation factors signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5205245; R2=0.0162172; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=267; N_SCORE=9.841; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-19,-11,-4,-15,-20,-8,-12,0,-8,-5,-4,-15,3,8,3,14,-8,-25,-9,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-28,-37,-28,1,-38,-28,43,-29,22,18,-20,-21,-19,-28,-19,-6,26,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-13,-28,-25,0,-28,-26,22,-18,15,10,-27,-28,-24,-14,-13,-3,35,-27,-8,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-28,-9,-16,-29,56,-17,-36,-17,-29,-18,1,-18,-13,-17,4,-14,-28,-22,-27,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-21,2,4,-24,-15,-11,-21,-6,-24,-18,-5,20,-3,-10,4,-2,-20,-31,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-2,-25,1,1,-15,-10,-13,-22,-9,-16,-16,-9,-16,-5,-14,-9,-11,-19,10,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-29,21,41,-26,-16,-2,-27,4,-19,-19,0,-6,11,-4,-2,-10,-24,-28,-14,26;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-13,-18,-11,-12,-4,-19,-7,-13,-11,-9,-6,-12,-11,-18,12,5,0,-23,-15,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-12,35,-25,41,9,-26,-8,2,-29,-2,-26,-23,23,-14,-2,-9,3,-6,-25,-33,-12,3;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-30,-16,-10,-17,-6,-20,-12,-16,-17,-12,-14,32,-14,-20,-5,-8,-15,-25,-20,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-25,8,6,-11,-15,-9,-21,5,-16,-11,0,-13,-4,-1,-4,-5,-15,-22,-8,2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-25,-2,13,-22,-15,-8,-17,9,-14,-9,-1,-12,6,5,-2,-6,-14,-26,-14,9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,5,-21,4,-1,-29,24,-6,-34,-4,-28,-18,9,-17,-5,-8,0,-14,-28,-27,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-17,-29,-19,-12,-7,-27,-14,-1,6,-5,0,-14,-20,-7,5,-15,-8,-2,-2,6,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-28,-36,-27,5,-37,-23,39,-27,22,17,-22,-23,-19,-26,-21,-10,23,-15,9,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-11,-25,-16,-16,-2,-24,-11,11,-17,1,1,-5,-11,-14,-17,-11,-6,2,-20,2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-26,23,17,-30,-10,0,-27,7,-24,-15,14,-11,10,1,1,-7,-25,-31,-17,14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-3,-30,-19,-18,78,-8,-14,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-24,8,-32,-21,29,-26,31,24,-25,-26,-19,-22,-23,-9,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-4,6,-26,-12,-1,-27,20,-22,-10,1,-14,15,29,-2,-7,-21,-23,-12,9;
MA   /M: SY='A'; M=23,0,-16,-7,-4,-22,10,-13,-19,-9,-20,-15,5,-12,-7,-14,12,-1,-13,-26,-22,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-21,7,-29,-18,23,-26,41,26,-28,-28,-17,-19,-27,-9,14,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-34,-25,6,-34,-24,33,-28,31,18,-25,-26,-20,-24,-23,-9,21,-19,2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-29,1,-12,-31,48,-16,-38,-9,-30,-20,5,-18,-14,-13,-1,-17,-29,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-28,-4,5,-23,-18,2,-27,32,-25,-9,0,-13,7,26,-7,-9,-19,-21,-7,5;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-23,-3,9,-23,-15,-6,-23,18,-20,-10,-1,-12,8,12,0,-2,-17,-24,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-17,-19,-10,-7,-28,-22,14,-13,6,4,-20,-21,-16,-14,-9,0,23,-28,-10,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,10,-29,14,-7,-32,43,-12,-38,-13,-30,-23,10,-17,-13,-16,1,-16,-30,-27,-26,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-20,4,15,-20,-18,-10,-14,0,-14,-11,-3,-10,3,-5,5,5,-8,-29,-14,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-15,-30,-25,5,-27,-25,21,-19,11,8,-24,-26,-24,-15,-12,-3,30,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-21,-7,1,-18,-14,-12,-10,-3,-10,-7,-2,-14,1,-4,3,3,-7,-27,-13,0;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-20,-33,-28,16,-32,-22,26,-24,13,10,-24,-27,-26,-22,-16,-6,27,-13,10,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-22,2,12,-25,-18,1,-19,3,-19,-9,4,-8,14,2,2,0,-18,-29,-13,12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-15,-15,-20,-18,-8,-12,-23,4,-18,2,-1,-13,-19,-18,-17,1,13,11,-26,-11,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-38,-8,0,-30,-15,-18,-22,-3,-30,-19,-13,69,-8,-13,-9,-10,-29,-29,-27,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-22,4,2,-22,4,-7,-23,0,-23,-16,12,-14,-3,-5,6,-2,-18,-27,-16,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-29,-9,-15,-25,43,-3,-35,-13,-26,-15,0,-20,-13,-12,-2,-16,-27,-19,-17,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-23,5,12,-19,-18,-9,-15,7,-17,-11,0,-12,1,0,0,-3,-10,-27,-11,6;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-23,-17,-11,-8,-23,-12,1,-2,-4,4,-11,-12,-6,-4,-7,-2,1,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-21,2,8,-20,-17,-7,-15,4,-16,-11,0,-13,0,-1,3,2,-8,-28,-12,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-21,-15,14,-24,-7,-3,-11,-3,-3,-17,-25,-12,-8,-11,-7,-3,10,24,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-12,-26,-11,3,-3,-27,-12,-1,-2,-4,-3,-12,-16,-5,-6,-11,-9,-1,-15,1,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00651;
//
ID   RIBOSOMAL_L27_MP; MATRIX.
AC   MP00831;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L27 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9345093; R2=0.0143286; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1101; N_SCORE=20.700; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,9,-29,-20,-4,-28,38,-26,-8,0,-13,18,38,-8,-10,-22,-20,-10,12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-12,-30,-13,-4,-9,-22,3,-23,21,-15,-6,-4,-22,5,53,-12,-10,-17,-11,7,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-13,-27,-23,-6,-25,-27,20,-18,4,5,-24,-18,-22,-20,-7,-1,32,-27,-12,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-23,-14,-5,-17,-22,-11,-11,16,-9,-2,-8,-18,-1,22,-11,-8,-5,-21,-9,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-19,-21,-24,-20,29,-13,-7,-7,-18,-4,-5,-14,-24,-20,-16,-8,-6,-7,4,27,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-30,15,0,-33,37,-12,-39,-11,-29,-23,5,-15,-10,-15,0,-16,-30,-27,-26,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-29,-1,-14,-30,56,-16,-38,-16,-30,-21,5,-19,-16,-17,1,-17,-29,-23,-28,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-29,7,33,-35,-19,7,-24,9,-20,-8,1,-7,42,5,1,-8,-29,-25,-13,37;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-17,-20,-20,-14,10,-22,-13,0,-12,0,1,-14,-19,-14,-10,-7,-2,3,-14,5,-14;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-11,-29,-26,-4,-26,-28,24,-19,7,7,-25,-26,-25,-21,-7,0,39,-28,-11,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-24,-10,-4,-15,-19,-11,-9,7,-9,-4,-2,-15,-3,7,-4,1,-7,-24,-8,-5;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-19,-16,-9,-21,-4,-20,-12,-10,-15,-12,-10,10,-11,-18,5,0,-7,-24,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-3,15,-20,8,8,-23,-5,0,-20,-1,-25,-16,24,-13,9,-3,14,5,-22,-33,-17,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-19,-30,-27,7,-31,-19,27,-20,12,13,-25,-27,-22,-20,-15,-5,30,-15,10,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,1,-11,-10,-10,-10,-19,-18,-9,-10,-9,-9,2,-11,-9,-10,18,44,-1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-27,-1,7,-26,-18,0,-27,31,-25,-10,4,-13,11,27,-5,-7,-20,-23,-9,8;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-23,-37,-29,37,-32,-21,19,-27,11,8,-21,-26,-29,-22,-19,-9,14,-1,16,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-7,-30,-7,-5,-7,-22,56,-22,-2,-16,-2,-1,-21,3,2,-13,-16,-23,-10,26,-4;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-34,-12,-2,-27,-17,-20,-17,-10,-24,-17,-18,69,-10,-20,-7,-8,-24,-28,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,-1,5,-17,-18,-8,-11,2,-11,-7,0,-14,2,-2,-4,-4,-9,-25,-11,3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,35,-21,17,-2,-20,6,8,-22,-2,-30,-20,54,-20,-2,-2,9,-2,-30,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-10,-29,-29,-1,-29,-29,28,-19,9,10,-28,-28,-28,-19,-9,2,46,-29,-10,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-29,-8,-17,-29,58,-19,-37,-15,-28,-19,0,-19,-17,-17,0,-18,-27,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-21,-12,-26,-16,-6,-27,-13,9,-9,10,18,-17,-23,-6,-1,-17,-10,5,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-2,2,-27,-5,-9,-30,29,-27,-13,3,-14,4,27,-5,-9,-21,-22,-14,2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,12,-29,16,1,-13,-18,50,-27,-8,-19,-9,10,-19,1,-5,-8,-14,-26,-23,15,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-10,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-11,-10,-13,-11,-6,-10,-8,-18,15,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-24,-15,0,-28,-18,10,-13,29,14,-22,-25,-14,-10,-23,-7,5,-21,-3,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00652;
//
ID   25A_SYNTH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00832;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   2'-5'-oligoadenylate synthetases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9414039; R2=0.0149111; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=971; N_SCORE=19.410; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=105; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-26,-5,-1,-17,-17,0,-18,11,-10,-6,9,-21,8,32,-8,-8,-18,-25,-11,1;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-11,23,-12,-20,-22,14,-22,-28,-23,-15,-15,-9,-27,-22,-22,-8,-14,-17,-32,-25,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-14,-15,-16,-9,-4,-16,-12,-1,-10,11,2,-11,-17,-8,-1,-6,1,0,-19,-6,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,19,-23,22,4,-26,-10,-4,-24,2,-22,-18,13,-15,-2,5,3,-4,-16,-33,-17,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-27,-2,10,-27,-18,25,-20,1,-20,-3,2,-14,35,3,2,-8,-25,-20,3,21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,4,-30,15,13,-30,-14,-11,-26,-5,-29,-22,-2,34,-1,-13,4,-4,-26,-34,-24,4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-13,-28,-26,-2,-29,-28,25,-19,8,8,-23,-25,-25,-19,-6,8,37,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-12,-12,-3,-21,-17,-8,-26,19,-19,-11,-4,-18,2,37,-6,-8,-15,-23,-14,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-14,-24,-22,-6,-28,-26,18,-6,2,6,-24,-26,-22,-10,-10,-2,36,-28,-10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-21,-22,-26,-19,-3,-26,-22,23,-24,13,9,-14,-19,-14,-22,-5,-1,14,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,42,-28,-8,0,-10,20,26,-8,-10,-22,-20,-10,16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-15,-25,-15,-22,-23,47,-22,-24,-20,-21,-13,-7,-22,-22,-20,-2,-15,-12,-22,-25,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-12,-11,-9,5,-11,-14,-13,-15,-17,-13,1,-15,-11,-12,22,19,-6,-27,-7,-9;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-28,5,8,-28,-15,-5,-28,39,-30,-12,14,-12,8,23,-5,-8,-22,-25,-12,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=17,-10,-10,-18,-15,-11,-15,-22,-1,-12,-5,-5,-10,-15,-15,-16,10,21,11,-27,-13,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,1,-29,-2,4,-24,-17,-2,-29,33,-25,-11,9,-16,9,44,-7,-9,-21,-23,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-21,-6,-11,-22,23,0,-28,-14,-25,-15,4,-16,-9,-13,12,3,-20,-28,-17,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-25,-9,-5,-21,-2,-9,-27,13,-21,-12,0,-17,0,30,-1,2,-17,-22,-14,-5;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-15,-2,0,-20,-5,-8,-22,-1,-28,-18,8,-12,2,8,29,13,-12,-35,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-13,-19,-10,-18,-10,-18,-2,-9,-7,-4,-13,-15,-4,-16,4,-1,7,-22,-16,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,26,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-11,-28,-24,-3,-23,-26,19,-19,11,7,-25,-25,-24,-20,-8,-1,33,-26,-11,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-24,-16,4,-28,4,10,-26,36,16,-22,-28,-14,-16,-26,-12,2,-22,4,-16;
MA   /M: SY='N'; M=2,16,-14,8,0,-20,0,-2,-20,-6,-30,-20,29,-14,0,-6,28,12,-18,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-5,53,-13,-16,-21,-17,-17,-25,-18,-25,-20,1,-18,-16,-19,4,-2,-16,-44,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,53,-30,-20,8,-30,26,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-2,18,-26;
MA   /M: SY='S'; M=-4,0,-19,-3,-1,-19,-14,12,-21,2,-22,-11,5,-12,1,0,13,13,-14,-31,-6,-1;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-13,-1,2,-22,-5,-8,-19,-7,-27,-16,8,-10,8,-7,32,18,-12,-36,-18,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-23,3,23,-26,-20,-4,-20,3,-17,-10,0,-7,23,0,7,11,-20,-27,-13,23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,19,-26,30,37,-31,-13,-2,-31,3,-25,-23,8,-5,10,-5,8,-4,-26,-35,-20,24;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-2,-25,-5,13,-35,-15,3,-18,5,-18,-2,-2,-10,44,3,2,-8,-23,-20,-12,29;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-20,-17,-10,-15,-2,-18,-10,-5,0,-3,-12,-17,-10,-10,-7,-8,-5,-20,-14,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,24,-24,11,2,-22,-7,4,-24,16,-29,-16,38,-18,4,17,3,-4,-26,-33,-16,2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,5,-29,4,13,-23,-17,23,-29,16,-23,-11,11,-15,11,24,-5,-11,-26,-27,-7,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,23,-30,21,-20,-8,2,-20,10,54,-10,-12,-22,-22,-3,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00653;
//
ID   25A_SYNTH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00833;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   2'-5'-oligoadenylate synthetases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2545242; R2=0.0123800; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=742; N_SCORE=13.430; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,34,-30,47,13,-33,-13,33,-37,-3,-27,-20,17,-13,3,-7,-3,-13,-30,-37,-7,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-30,7,30,-33,-20,0,-27,24,-23,-10,0,-7,30,13,-3,-10,-27,-23,-13,30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-17,0,13,-17,-20,-13,-17,-3,-13,-13,0,-7,0,-7,13,30,-10,-30,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-23,-7,-7,-23,17,-10,-30,0,-27,-17,3,-17,-3,13,10,-4,-20,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,17,-30,24,13,-33,-17,-7,-33,33,-30,-17,7,-10,7,16,-7,-10,-23,-27,-13,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,64,-30,-7,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,46,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-27,-10,-3,-13,-23,23,-13,4,0,3,-7,-20,0,3,-17,-13,-13,-23,3,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-23,-3,7,-27,-13,0,-23,10,-23,-10,3,-13,24,23,10,0,-20,-27,-13,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,7,-23,17,-20,-3,0,-13,44,30,-3,-10,-27,-20,-10,27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=13,-10,-20,-13,-7,-20,-13,-20,-13,-10,-17,-13,-10,24,-10,-17,7,13,-10,-27,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,53,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,37,7,-27,-3,7,-27,0,-30,-23,47,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,24,13,-30,-30,-27,-20,-17,-3,36,-27,-7,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=16,-7,-13,-10,-10,-17,23,-13,-17,-10,-13,-10,-3,-10,-10,-13,3,-7,-10,-13,-17,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-20,-7,-13,-20,46,-13,-26,-13,-20,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-20,-13,-20,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-17,30,-27,30,7,-27,-10,37,-30,-3,-27,-17,30,-17,3,-3,0,-10,-30,-37,-6,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-30,0,0,-23,-13,-3,-23,7,-27,-17,14,16,0,17,-3,-7,-27,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='W'; M=7,-13,-30,-14,6,-13,-13,-17,-20,-7,-17,-17,-17,-13,-3,-13,-10,-13,-20,33,-3,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,20,-17,-17,-23,6,-17,-33,-6,-23,-17,-7,-27,-13,7,-7,-13,-20,-30,-23,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,14,-30,20,7,-27,-17,33,-33,7,-23,-13,10,-17,7,20,-7,-13,-27,-30,-3,3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-23,-23,-23,-13,0,-27,-13,4,-10,27,10,-20,-27,-10,10,-23,-10,0,-20,-3,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00653;
//
ID   OMPTIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00834;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartyl proteases, omptin family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3398018; R2=0.0123886; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1396; N_SCORE=21.624; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,19,-19,9,0,-20,-4,22,-22,-5,-28,-16,34,-17,2,-3,15,2,-24,-38,-12,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-10,-15,-5,-18,-10,-25,-23,13,-15,0,0,-18,-25,-23,-18,-8,-2,30,-32,-12,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-5,-30,-5,3,-15,-22,25,-20,14,-18,-3,-3,-17,16,9,-10,-12,-22,-10,19,7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-1,-20,-14,-14,-6,-14,3,7,-7,4,35,5,-20,0,-7,-10,-7,-3,-26,-6,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-20,27,5,-25,-2,4,-25,-2,-30,-22,41,-16,0,-4,14,2,-26,-40,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=5,2,-15,5,15,-22,-5,-8,-22,-5,-28,-20,8,-8,5,-8,30,13,-15,-38,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-24,13,8,-24,12,1,-27,-2,-28,-20,34,-16,0,-5,6,-7,-30,-33,-22,4;
MA   /M: SY='T'; M=-5,0,-19,-5,4,-24,-20,-6,-15,-1,-15,-5,0,-10,22,-1,11,23,-14,-25,-10,13;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-33,-8,0,-28,-15,-18,-20,-10,-30,-20,-13,65,-8,-18,2,-3,-25,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-30,1,13,-33,19,-5,-31,-3,-24,-14,0,-12,15,-5,0,-14,-30,-22,-21,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-10,-5,-12,-12,-2,-14,-14,7,-9,1,1,-10,-12,-12,-9,1,11,16,-16,-5,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,2,20,-29,-20,28,-27,9,-20,-7,2,-12,28,18,-5,-12,-28,-25,-5,22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-21,-31,-23,-16,-6,-19,-18,-8,-8,-14,-9,-14,-21,-8,1,-9,-9,-10,29,2,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='B'; M=1,32,-22,32,6,-29,-4,-2,-26,-2,-25,-22,25,-13,-2,-9,6,-4,-23,-35,-20,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,8,-23,3,0,-20,-11,32,-25,2,-25,-11,20,-18,5,14,5,-4,-24,-32,-5,0;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,32,15,-30,-30,-25,-20,-21,-5,28,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-13,24,-23,10,0,-20,-6,7,-23,10,-27,-17,41,-20,3,22,4,-3,-27,-34,-17,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,7,-30,14,-2,-5,-21,33,-20,-7,-15,-10,0,-21,-2,-8,-11,-12,-21,-7,33,-5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-2,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,54,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,23,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,37,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00657;
//
ID   OMPTIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00835;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartyl proteases, omptin family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5290179; R2=0.0128649; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1537; N_SCORE=24.292; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,26,-30,-20,15,-30,41,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,15,-26,7,10,-30,-13,5,-22,15,-26,-10,22,-14,27,11,1,-6,-28,-27,-14,18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-28,24,25,-30,4,-2,-32,0,-26,-22,14,-10,4,-6,2,-10,-30,-32,-22,15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-26,11,13,-23,-15,-10,-19,-7,-14,-15,-3,8,-1,-12,2,-3,-19,-33,-19,5;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,40,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,44,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=14,-22,-16,-26,-16,-2,-18,-20,8,-22,26,8,-22,-22,-16,-20,-14,-6,6,-20,-8,-16;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-25,-12,-18,-28,54,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,4,-34,-26,35,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-18,-24,-18,-4,-23,-13,13,-13,8,25,-12,-16,-7,-13,-4,14,9,-24,-4,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-32,-40,-30,52,-26,-24,-8,-26,-2,-8,-28,-30,-32,-20,-28,-18,-12,67,30,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,16,-14,2,-6,-14,-12,-8,-14,-6,-18,-14,24,-14,-6,-6,16,30,-12,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-20,-13,-8,-12,-20,-8,-13,6,-9,2,-3,-16,0,22,1,15,-6,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-5,-12,-18,-10,-25,-18,8,-10,-2,-10,35,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-26,-32,-24,-4,-32,-26,36,-26,10,12,-14,-18,-16,-26,-8,-4,22,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=0,18,-16,19,4,-24,-2,-4,-24,-6,-30,-22,22,-12,0,-8,26,10,-18,-40,-20,2;
MA   /M: SY='N'; M=-6,20,-22,16,24,-24,-8,2,-24,2,-26,-20,26,-10,8,-2,12,0,-26,-36,-20,16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,14,-26,8,4,-26,24,-4,-30,-6,-28,-20,24,-16,-4,-8,4,-10,-30,-30,-24,0;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-26,-6,2,-26,20,-12,-30,-2,-22,-16,-2,-14,-4,3,0,-12,-22,-22,-22,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-14,-30,-14,-20,-6,30,-4,-24,-16,-18,-12,-8,-24,-16,-16,-8,-16,-22,0,15,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-18,-27,-21,28,-25,-20,5,-23,1,-1,-11,-21,-23,-18,-2,7,5,-13,7,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-30,-10,-8,-24,16,-8,-34,10,-24,-14,0,-20,-2,34,-6,-14,-24,-20,-18,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,30,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,52,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,0,-26,2,7,13,-22,-10,-20,-1,-12,-12,-4,-16,-10,-5,-10,-10,-16,-14,2,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-29,-14,-6,-20,-24,-20,-6,-4,-16,-8,-12,29,-9,-11,-5,4,-10,-26,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-30,-6,-10,-28,34,7,-36,-4,-28,-14,2,-18,-8,-6,-4,-18,-28,-22,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=22,-8,-18,-12,-12,-24,28,-18,-24,-14,-22,-16,-2,-14,-12,-18,12,-4,-14,-24,-24,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00657;
//
ID   ALADH_PNT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00836;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alanine dehydrogenase & pyridine nucleotide transhydrogenase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5215554; R2=0.0133740; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=637; N_SCORE=13.031; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,7,-27,-14,-10,-27,33,-30,-13,3,-10,7,18,4,-1,-17,-26,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-2,20,-12,23,56,-21,-21,-2,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-10,-26,-12,-3,-16,-24,-13,-11,18,-6,-1,-8,-16,-1,16,-12,-4,-8,-21,-7,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='G'; M=11,-13,-23,-15,-19,-24,42,-21,-25,-18,-21,-14,-6,-19,-19,-20,1,-13,-13,-21,-25,-19;
MA   /M: SY='I'; M=2,-27,-20,-33,-27,-3,-31,-29,34,-23,12,12,-23,-23,-23,-25,-12,-5,34,-24,-7,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-34,-15,-6,-21,-22,-21,-9,-14,-15,-11,-22,60,-14,-20,-13,-9,-15,-29,-24,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-28,-3,6,-26,-20,-8,-28,40,-26,-10,0,-12,8,36,-8,-5,-18,-21,-10,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-21,-26,-26,-17,-6,-31,-20,16,-9,11,9,-15,-20,-11,-3,-16,-5,9,-21,-4,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-12,-25,-14,-5,-8,-24,-14,-12,19,-8,-2,-11,-19,-5,14,-14,-9,-4,-18,-4,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,15,-26,8,11,-27,-12,2,-22,8,-26,-14,22,-4,15,4,3,-2,-27,-31,-17,12;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-22,14,-4,-22,15,4,-24,-4,-30,-20,47,-20,-4,-4,8,-4,-30,-36,-22,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-7,14,-20,7,-4,-14,-1,-7,-22,-2,-23,-16,20,-16,-7,-5,8,6,-19,-30,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-10,-27,-27,-1,-29,-29,25,-19,7,7,-26,-27,-27,-19,-6,6,44,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-13,-19,-11,-21,9,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-3,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-25,-5,-32,-23,-3,-28,-22,19,-25,19,15,-21,-24,-17,-23,-17,-8,13,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=13,0,-21,0,18,-25,-7,-10,-22,6,-20,-15,-2,-7,4,-4,7,-3,-16,-26,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-21,-11,-18,-19,26,-19,-18,-16,-18,-12,1,-21,-18,-16,2,-2,-8,-26,-21,-18;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-10,-29,-27,-3,-26,-29,25,-19,7,7,-27,-27,-27,-20,-7,0,44,-29,-11,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-7,-25,-8,1,-24,-7,6,-18,3,-17,-4,-3,-16,9,6,-3,-10,-14,-24,-10,4;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-3,-22,-5,6,-23,-15,-3,-16,6,-12,-6,-2,-13,11,1,0,-4,-15,-24,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-16,-27,-23,-1,-29,-26,22,-21,13,8,-20,-22,-21,-19,-7,10,26,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-12,9,-29,12,11,-29,-8,1,-32,21,-28,-15,7,-12,6,14,-4,-10,-24,-27,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-20,-13,-3,-17,-15,-11,-9,-1,-3,-2,-7,-16,3,0,-3,-4,-8,-22,-12,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-13,-27,-17,-13,21,-25,48,-16,-17,-7,0,-4,-25,-10,-8,-15,-15,-17,-8,31,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-2,10,-23,10,19,-24,-14,-7,-23,7,-20,-16,7,-8,5,1,5,4,-19,-29,-16,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,13,11,-30,-30,-29,-20,-11,-1,47,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=0,-22,-20,-27,-20,-2,-27,-21,20,-21,16,9,-19,-21,-14,-20,-11,0,15,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,57,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,23,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-20,-4,1,-22,-15,-2,-20,10,-21,-10,2,-11,6,4,9,11,-13,-27,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,16,-27,16,-3,-30,32,-7,-35,-10,-30,-22,19,-17,-9,-12,3,-12,-30,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,-15,-21,-14,-19,3,-21,-6,-14,-8,-7,-10,-12,-12,-21,5,-3,1,-20,-19,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-22,-19,-4,-1,-26,-16,9,-17,11,4,-16,-19,-8,-16,-10,-6,5,-22,-5,-7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,-27,-13,-16,-19,36,-14,-27,-12,-19,-13,-5,-20,-15,-14,-4,-15,-21,-14,-11,-16;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-22,-9,-10,-13,18,-13,-24,-8,-23,-15,2,-17,-11,-10,8,-4,-17,-21,-13,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00654;
//
ID   ALADH_PNT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00837;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alanine dehydrogenase & pyridine nucleotide transhydrogenase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4350228; R2=0.0154774; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=849; N_SCORE=18.565; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-23,-25,-23,-8,-8,-22,13,-20,2,11,-13,-19,-16,-20,-7,0,11,-23,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-24,-20,-11,-10,-8,-10,0,-16,16,14,-17,-22,0,-12,-17,-12,-6,-20,-8,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-27,-20,-32,-24,3,-30,-19,28,-23,28,29,-25,-25,-16,-20,-22,-8,22,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-21,-9,-12,-20,16,2,-25,-14,-20,-12,1,-16,-10,-13,6,7,-17,-25,-13,-12;
MA   /M: SY='G'; M=17,-6,-23,-8,-2,-26,28,-16,-27,-11,-21,-16,-4,-13,-9,-16,4,-11,-19,-22,-25,-6;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-13,-18,-17,-11,-14,-19,8,-13,-4,-2,-6,-20,-17,-17,0,-1,16,-27,-15,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-29,-13,-13,-24,13,-21,-18,-15,-23,-15,-12,20,-17,-19,-2,-10,-14,-27,-26,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-27,7,-5,-29,23,-14,-33,0,-27,-18,4,-15,-8,-6,1,-6,-23,-25,-21,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-33,-4,7,-27,-17,-6,-23,-5,-27,-18,-10,49,-2,-8,-2,-7,-27,-31,-22,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-33,-10,-4,-27,-2,-15,-25,-1,-26,-17,-10,35,-7,1,-7,-11,-25,-25,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-17,-13,-10,-23,16,-17,-21,-9,-20,-14,-3,-13,-9,-11,11,-2,-11,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,4,-26,5,6,-26,-19,-9,-28,30,-25,-12,2,-11,5,24,-3,1,-18,-24,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-29,-28,5,-31,-21,27,-19,9,9,-27,-29,-25,-19,-13,-3,37,-18,7,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-14,-23,-20,-1,-26,-21,13,-18,15,11,-19,-22,-18,-16,-6,13,19,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-24,-39,-30,26,-36,-27,31,-29,16,12,-21,-24,-28,-26,-19,-9,22,-11,9,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-13,-23,-15,-19,-23,39,-21,-23,-18,-20,-13,-7,-19,-19,-20,1,-13,-11,-21,-25,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-13,-25,-24,-4,-28,-26,21,-17,5,6,-22,-24,-21,-17,-4,8,35,-29,-9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-5,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,7,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-13,-16,-19,-15,2,-25,-15,2,-17,13,2,-13,-20,-14,-14,-3,21,2,-19,4,-15;
MA   /M: SY='N'; M=2,20,-20,7,1,-23,-4,10,-19,-1,-23,-13,32,-16,7,-3,7,-3,-23,-32,-16,4;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-15,-25,-15,-15,-10,-23,5,-15,-2,-2,-13,-13,-13,-23,2,-3,8,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='K'; M=0,2,-25,-3,-3,-26,6,-9,-27,14,-26,-14,9,-15,-1,11,-1,-9,-21,-24,-18,-3;
MA   /M: SY='I'; M=6,-21,-18,-29,-22,-6,-25,-24,23,-20,7,10,-17,-18,-17,-22,-6,3,21,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=46,-10,-12,-19,-11,-21,5,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-2,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-6,-20,-11,-10,-9,-21,-13,0,0,3,1,-2,-23,-10,-3,-11,-6,2,-27,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-26,-8,-13,-26,41,-15,-34,-10,-29,-19,2,-18,-11,-4,7,-10,-24,-24,-25,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-5,-16,-28,57,-15,-36,-16,-30,-20,11,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,3,-25,5,-1,-19,-23,-15,-4,-1,-10,-6,-4,-14,-7,-8,-5,-1,0,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-11,-19,-18,-13,-9,-24,-14,1,-5,-2,6,-7,-15,-6,4,0,17,3,-25,-7,-11;
MA   /M: SY='I'; M=8,-23,-21,-30,-24,-8,-16,-26,21,-22,5,6,-17,-19,-19,-24,-8,-7,20,-22,-10,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-22,-33,-25,18,-32,-24,23,-27,21,11,-19,-23,-23,-22,-17,-1,14,-15,5,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-18,-28,-22,2,-30,-24,21,-24,23,11,-22,-24,-20,-20,-13,5,20,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-12,19,-23,7,0,-20,-7,5,-24,10,-26,-16,34,-19,4,25,5,-2,-25,-33,-16,0;
MA   /M: SY='P'; M=12,-5,-25,-3,-4,-24,-13,-18,-11,-11,-16,-13,-9,19,-9,-19,-1,-6,-11,-27,-21,-9;
MA   /M: SY='D'; M=3,16,-23,23,19,-29,-12,-8,-24,1,-19,-18,3,-9,1,-9,1,-7,-16,-31,-19,10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-23,-12,-5,-18,-19,-10,-18,17,-15,-8,-4,-17,1,34,-3,1,-7,-23,-11,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-24,-24,-14,-2,-29,-19,13,-10,24,12,-21,-23,-12,-9,-23,-10,6,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-30,3,25,-26,-20,-1,-30,25,-22,-13,0,-10,16,34,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-30,-2,16,-27,-22,11,-17,6,-16,-2,-4,-13,44,6,-4,-10,-26,-12,5,29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-17,-31,-24,15,-30,-23,20,-27,35,15,-29,-30,-25,-20,-24,-7,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-30,31,28,-37,-16,2,-31,11,-25,-17,8,-8,23,2,-1,-10,-29,-30,-16,25;
MA   /M: SY='D'; M=-1,25,-20,34,9,-30,-5,-6,-29,-5,-28,-24,13,-10,-1,-11,16,2,-19,-38,-20,4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-23,-25,-12,0,-26,-12,18,-18,27,30,-21,-21,-8,-15,-21,-10,8,-21,-2,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-25,-25,-25,31,7,-13,-15,-23,-6,-7,-13,-26,-27,-18,-13,-14,-13,3,17,-25;
MA   /M: SY='G'; M=19,-11,-4,-16,-17,-25,30,-21,-27,-17,-21,-16,-6,-18,-17,-21,3,-11,-16,-24,-26,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00654;
//
ID   INTERLEUKIN_4_13_MP; MATRIX.
AC   MP00838;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Interleukins -4 and -13 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4395299; R2=0.0125264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=735; N_SCORE=13.636; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=165; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,20,-30,-20,17,-30,44,17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=34,-12,-12,-19,-9,-16,-8,-21,-3,-11,-6,-6,-12,-13,-11,-19,6,2,7,-23,-17,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-15,55,-21,-21,-14,-15,-23,-22,-23,-15,-15,-12,-28,-21,-23,1,-1,-8,-39,-22,-21;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-19,-11,-7,-17,-18,-20,-13,-10,-16,-13,-7,20,-10,-14,10,27,-9,-29,-17,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-20,-7,-10,-23,31,-14,-28,-11,-26,-17,3,-14,-9,-10,14,-3,-18,-26,-23,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-25,2,-1,-22,-11,8,-20,-7,-26,-16,15,15,-3,-8,6,2,-24,-34,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-32,-27,37,-24,-14,5,-24,5,1,-21,-29,-30,-18,-17,-9,10,3,18,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-22,-24,-18,-11,-25,-24,12,-15,-2,1,-18,1,-17,-16,-7,0,14,-26,-13,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-6,-30,-5,2,-23,-19,41,-24,-2,-18,-4,1,-3,12,9,-7,-13,-25,-27,1,3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-24,-7,-13,-23,42,-9,-31,-12,-24,-15,2,-16,-12,-9,3,-12,-23,-20,-21,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-7,12,-10,-7,-16,-19,22,-19,-8,-14,-5,-3,-20,1,-3,-5,-7,-13,-27,-3,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,14,-20,12,5,-21,-9,4,-22,13,-23,-13,17,-11,4,10,3,-3,-19,-25,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,12,-16,-13,-1,-13,-6,-15,-10,-9,-7,-10,-15,-13,-7,-10,-9,-10,-16,-2,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,22,-25,27,9,-29,-4,1,-29,-4,-28,-22,17,-2,-1,-9,6,-5,-26,-36,-20,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-17,-19,-23,-18,-5,-25,-21,20,-19,6,6,-11,-11,-14,-19,-5,3,14,-22,-6,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=13,-7,-15,-15,-11,-15,-10,-13,-9,-12,-11,-8,-5,-7,-10,-15,10,19,-3,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-30,-4,10,-28,-19,-4,-27,29,-24,-10,-2,-6,17,33,-7,-10,-22,-21,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-27,3,-36,-27,40,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-30,7,24,-28,-14,7,-30,23,-25,-13,4,-9,11,12,-5,-11,-26,-26,-12,17;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-19,-4,9,-15,-21,-12,-8,-6,-9,-6,0,-9,-1,-9,7,19,-7,-29,-12,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-18,11,-5,-17,-6,0,-12,-5,-22,-15,35,-20,-6,-6,9,1,-12,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-24,-7,-4,-16,-19,-7,3,-10,-7,-2,11,-17,3,-10,-1,-3,-7,-29,-11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-32,-25,3,-32,-25,29,-26,28,16,-25,-26,-22,-22,-19,-4,24,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-12,-6,-9,-11,-20,-19,-10,-11,-8,-10,0,-11,-10,-11,15,42,-1,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=3,0,-25,0,18,-30,-4,-5,-24,4,-20,-11,-1,-9,19,-2,3,-7,-22,-24,-17,19;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-2,9,-26,-12,-4,-27,28,-23,-9,0,-12,14,30,-7,-10,-21,-19,-11,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-23,-3,0,-23,-2,-12,-22,12,-22,-12,4,-13,-2,3,1,0,-15,-25,-16,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,10,-20,6,-2,-20,-13,-11,-18,-7,-22,-17,11,8,-6,-10,12,18,-16,-34,-18,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-23,-16,-9,-10,-19,-18,-3,-18,5,-3,-16,11,-12,-17,-5,0,-7,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,6,-16,-7,-10,-10,-14,-5,-4,-7,-7,9,12,-16,-4,-7,5,16,-6,-30,-10,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-29,9,30,-29,3,-7,-32,7,-24,-19,1,-7,8,-1,1,-11,-27,-27,-21,19;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-17,-21,-14,-1,-19,-13,8,-20,19,17,-16,-22,-10,-15,-7,-1,4,-26,-6,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-11,-19,-17,-14,0,-21,-12,1,-12,1,16,-12,-5,-10,-13,-5,8,1,-23,-5,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='W'; M=3,-19,-30,-21,-12,-12,-15,-22,-15,-11,-17,-13,-19,6,-11,-16,-10,-4,-17,27,-5,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-10,34,-23,44,12,-32,-6,-2,-32,-3,-30,-26,21,-11,0,-9,13,0,-24,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-14,-30,-26,-3,-26,-28,26,-21,10,9,-24,-24,-24,-22,-9,-2,34,-26,-9,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,31,-30,-20,14,-30,38,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-13,-16,-11,-16,-5,-20,-9,-12,-11,-9,-5,-11,-11,-16,13,19,-1,-25,-16,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-9,-17,-10,-16,-4,-19,-7,-10,-9,-8,-9,-11,-10,-17,10,5,3,-21,-17,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-26,-8,-6,-24,2,-17,-23,-10,-26,-18,-5,23,-9,-11,8,6,-20,-30,-23,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-21,0,7,-21,-14,-6,-21,34,-20,-7,0,-7,7,22,-7,-7,-14,-14,-7,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-7,28,-14,14,0,-14,0,7,-14,0,-21,-14,42,-14,0,0,7,0,-21,-28,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-7,-7,-6,-8,-12,-13,-8,-7,-8,-8,0,-7,-6,-7,15,32,-1,-21,-8,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-8,-1,-4,-10,-12,-12,-10,-6,-10,-9,2,-7,-6,-7,14,29,-3,-22,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-21,18,32,-22,-7,-1,-23,4,-16,-15,2,-3,9,-3,0,-8,-21,-21,-15,20; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-18,0,4,-18,-12,-6,-19,25,-19,-8,3,-8,5,18,-2,-2,-13,-17,-8,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-22,13,34,-22,-9,-1,-21,4,-14,-12,0,-3,10,-2,-1,-8,-21,-22,-15,22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-14,-17,-19,-14,-7,-12,-16,3,-16,7,7,-12,-17,-10,-14,-4,7,3,-22,-8,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-22,-34,-27,41,-32,-15,14,-25,13,6,-22,-28,-28,-20,-19,-9,10,1,27,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-14,-19,-11,-17,-8,-17,-9,-4,-9,-7,-11,-14,-9,-3,4,-2,3,-21,-17,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00655;
//
ID   SUMT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00839;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uroporphyrin-III C-methyltransferase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7529936; R2=0.0139097; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=469; N_SCORE=11.267; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-20,-23,-17,-4,-21,-5,13,-7,14,42,-18,-21,-3,-6,-18,-9,10,-22,-3,-10;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-13,-1,1,-14,7,-5,-14,-4,-14,-9,2,3,0,-6,4,-3,-13,-15,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-13,-6,-5,-9,-5,-8,-3,-5,-6,-4,0,2,-5,-7,-2,-2,-5,-14,-8,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-1,-13,-1,-3,-7,-6,-7,-8,1,-6,-3,-3,-9,-4,-2,-3,-4,-4,-13,-6,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-16,0,2,-14,-3,-2,-14,2,-9,-7,1,-10,-1,-2,-3,-5,-12,-17,-9,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-3,-18,-8,-7,-8,-14,-2,-3,-2,-2,4,2,-11,-3,2,-7,-3,-5,-20,-7,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-24,-8,-13,-23,43,-14,-29,-9,-22,-13,-1,-16,-12,-6,-2,-15,-22,-16,-21,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-17,-6,3,-18,-21,-13,-20,18,-19,-10,-3,-13,1,13,-1,4,-11,-25,-11,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,30,-24,21,14,-29,-29,-26,-21,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-29,-19,-18,9,-24,3,-1,-14,-6,-4,-17,-25,-11,-14,-14,-10,-7,23,36,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-21,-30,-23,18,-17,-21,10,-27,23,8,-21,-26,-24,-21,-20,-10,5,-13,2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-11,-17,-10,-17,-5,-19,-9,-11,-8,-9,-8,-11,-10,-18,12,8,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=0,30,-23,41,11,-33,-7,-6,-31,-3,-25,-24,12,-10,-2,-12,6,-5,-21,-35,-20,4;
MA   /M: SY='P'; M=3,-17,-29,-13,-5,-24,-16,-19,-14,-7,-22,-14,-16,46,-10,-14,-4,-6,-14,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-28,26,22,-32,7,-6,-35,-2,-27,-23,7,-9,2,-9,4,-9,-28,-32,-22,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,10,-29,-16,19,-27,45,23,-29,-29,-18,-19,-29,-10,9,-18,3,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,4,-35,-26,36,-29,33,19,-25,-25,-21,-25,-24,-9,22,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-26,4,-33,-26,32,-26,27,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,30,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-30,-5,3,-26,-11,-2,-31,31,-26,-10,0,-15,9,37,-9,-11,-22,-20,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=27,-10,-19,-15,-15,-25,32,-20,-24,-15,-19,-15,-5,-15,-15,-20,5,-9,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=4,-15,-21,-17,-7,-12,-20,-12,-3,-4,5,3,-15,-19,1,-3,-10,-7,-2,-19,-5,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-28,2,9,-28,-18,1,-26,21,-22,-10,6,-14,21,32,-4,-7,-23,-23,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=3,-20,-14,-23,-12,-6,-24,-20,11,-19,14,6,-20,-21,-12,-18,-12,-6,11,-24,-9,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-3,-27,-3,8,-31,1,-5,-26,9,-23,-10,-1,-12,18,7,0,-10,-24,-22,-16,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,3,-23,3,18,-29,-12,0,-22,5,-23,-11,5,-9,26,4,12,0,-22,-28,-16,22;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,2,-21,-12,-17,-6,-20,-10,-14,-7,-9,-12,-15,-12,-20,6,-1,-1,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,34,-32,51,20,-38,-13,-3,-35,0,-29,-26,11,6,3,-10,-2,-10,-30,-37,-21,11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-15,-32,-29,-1,-31,-30,33,-22,11,11,-27,-27,-27,-22,-11,-2,43,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,3,-32,-28,-1,-32,-28,24,-26,15,10,-26,-29,-26,-24,-16,-6,29,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-19,-30,-23,5,-28,-20,22,-24,25,13,-25,-26,-20,-21,-19,-7,19,-18,3,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-16,-26,-18,-16,16,-23,20,-5,-10,-4,-2,-15,-25,-8,-11,-13,-9,-10,15,56,-16;
MA   /M: SY='D'; M=0,20,-25,28,6,-26,-10,-2,-27,-6,-22,-20,6,-3,-5,-14,0,-8,-20,-30,-16,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-23,-8,-7,-22,9,-12,-25,3,-21,-13,-3,-15,-5,4,2,-7,-16,-20,-15,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00656;
//
ID   SUMT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00840;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uroporphyrin-III C-methyltransferase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2954206; R2=0.0180124; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=402; N_SCORE=13.526; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,9,26,-18,-18,-2,-22,1,-16,-14,-2,-9,12,-5,-1,-5,-21,-21,-7,19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-26,-34,-25,-1,-32,-27,30,-25,13,11,-20,-21,-18,-25,-15,-6,20,-9,-1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=0,1,-21,-6,-2,-15,-16,2,-4,-10,-9,-5,8,-16,-5,-11,0,-1,-6,-29,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=5,6,-22,4,11,-25,-11,-3,-21,4,-18,-12,5,-11,9,3,3,-4,-18,-26,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-19,-21,-11,-5,-22,-18,4,-11,14,4,-17,-21,-12,-8,-12,-4,5,-21,-7,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-29,-21,5,-24,-16,19,-23,31,23,-24,-26,-16,-19,-22,-9,11,-18,1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-15,-24,-15,-3,-21,-22,11,-17,8,3,-19,-20,-18,-19,-6,0,17,-23,-9,-17;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-24,7,20,-25,-14,-8,-24,11,-19,-15,-1,-8,6,2,1,-4,-18,-25,-16,13;
MA   /M: SY='A'; M=5,-11,-20,-13,-3,-11,-13,3,-10,-7,-5,0,-9,-16,-5,-8,-5,-7,-6,-23,-7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=5,-13,-13,-14,-10,-11,-16,-11,-3,-14,5,-1,-14,-21,-12,-11,-8,-6,2,-25,-11,-12;
MA   /M: SY='K'; M=7,2,-22,1,7,-24,-12,-9,-20,9,-16,-11,0,-12,5,2,0,-5,-14,-25,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=10,3,-22,1,15,-26,-11,-7,-22,10,-20,-13,1,-9,9,2,3,-5,-17,-25,-17,11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-28,-3,-15,-29,54,-14,-37,-17,-28,-20,3,-19,-16,-18,1,-17,-28,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-27,0,3,-22,-11,-6,-22,14,-15,-8,3,-16,6,17,-8,-10,-19,-24,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-7,6,-24,7,5,-21,-17,-6,-19,7,-16,-11,2,-13,3,5,-1,1,-14,-25,-9,4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-31,-13,-31,-30,1,-29,-30,26,-20,8,8,-31,-30,-29,-20,-12,-2,44,-17,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=18,-20,-4,-25,-21,-11,-12,-25,6,-18,-1,-1,-18,-21,-20,-21,-2,-2,17,-26,-15,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-28,-11,-6,-11,-23,-6,-17,13,-10,-6,-5,-21,0,41,-12,-9,-10,-20,-7,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-25,-3,3,-24,-18,13,-25,19,-23,-8,2,-13,8,15,-1,-1,-18,-25,-5,4;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-22,-8,-3,-21,10,-14,-18,-12,-16,-11,-2,-14,-3,-13,7,-1,-14,-26,-18,-3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-29,64,18,-38,-11,-1,-38,-1,-29,-29,19,-10,-1,-10,1,-6,-28,-39,-19,9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-21,-35,-14,-4,-24,-20,-20,-13,-13,-18,-14,-21,66,-12,-20,-11,-9,-20,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-16,-7,-21,-17,16,-20,-13,-5,-19,0,-1,-11,-22,-17,-15,0,5,-2,-17,6,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-35,-28,11,-34,-27,33,-27,23,15,-25,-26,-25,-24,-20,-7,28,-19,1,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-27,-33,-27,55,-29,-7,-2,-22,3,-2,-22,-30,-27,-17,-22,-12,-7,32,47,-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-23,-6,-13,-26,44,-16,-33,-16,-30,-20,4,-16,-13,-16,15,-5,-23,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='R'; M=2,-7,-20,-11,-4,-19,-13,-9,-21,10,-18,-12,-1,-15,1,27,6,5,-11,-24,-14,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-20,-26,-22,-23,-2,12,-17,-9,-20,-7,-3,-15,-24,-20,-19,-11,-14,-6,-2,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=6,-11,-24,-14,-15,-22,27,-16,-20,-12,-18,-6,-4,-17,-12,-13,1,-10,-14,-22,-20,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-29,10,39,-17,-21,11,-25,3,-17,-15,-1,-7,12,-2,-2,-10,-26,-23,-5,25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-27,2,29,-23,-23,-3,-14,1,-5,-6,-8,-10,19,-3,-6,-9,-17,-26,-13,24;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-20,-28,-21,3,-22,-8,7,-22,10,6,-19,-24,-16,-19,-17,-11,2,-5,5,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-1,-25,2,10,-18,-21,-7,-14,3,-4,-6,-4,-16,4,8,-8,-6,-12,-26,-11,6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-10,-25,-11,1,-8,-18,-11,-17,2,-9,-9,-9,-17,-3,12,-7,-5,-13,-8,-6,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,14,-30,-21,20,-29,42,17,-28,-29,-22,-21,-27,-9,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-19,-6,1,-16,-13,-10,-18,5,-16,-10,-4,-14,-3,5,1,3,-9,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-17,5,16,-26,-16,-3,-27,12,-22,-15,3,-12,10,14,0,-7,-21,-28,-16,12;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-8,-26,-9,-1,-17,-17,18,-20,3,-13,-6,-2,-11,3,15,-7,-10,-18,-22,-2,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-23,-4,-12,-24,44,-11,-29,-12,-24,-15,7,-16,-10,-12,1,-13,-25,-19,-22,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-19,-32,-23,9,-34,-23,28,-24,11,10,-21,-23,-21,-23,-16,-8,22,-16,6,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-30,6,9,-24,-14,-9,-20,-5,-21,-17,-4,13,-3,-11,-5,-10,-21,-19,-17,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-26,-18,-28,-23,18,-27,-14,7,-19,4,1,-24,-19,-22,-18,-16,-8,8,0,19,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-24,12,30,-26,-18,-5,-21,3,-17,-15,-1,-7,12,-2,3,-1,-17,-30,-17,21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-33,-28,2,-33,-25,34,-23,18,18,-25,-26,-23,-22,-17,-6,34,-23,-2,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-30,-27,0,-31,-28,29,-22,13,11,-25,-26,-25,-21,-10,3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-37,-6,0,-29,-17,-16,-20,-9,-30,-20,-8,74,-9,-17,-7,-9,-30,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,40,-26,17,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-15,-7,-5,-16,-14,-17,-15,-10,-19,-15,-1,7,-7,-12,21,31,-8,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-8,-4,-20,-1,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,14,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='F'; M=8,-19,-19,-26,-20,11,-4,-20,-3,-20,-1,-1,-14,-20,-21,-20,-5,-7,1,-13,-4,-20;
MA   /M: SY='L'; M=4,-20,-18,-26,-17,6,-21,-20,9,-21,10,4,-16,-20,-16,-19,-6,-2,7,-19,-3,-17;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-16,-18,-13,-22,17,-19,-16,-13,-14,-9,-8,-13,-12,-20,6,-6,-7,-20,-22,-13;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,1,-21,-16,-17,-3,-22,-7,-16,-10,-8,-11,-17,-15,-21,5,-2,2,-26,-19,-16;
MA   /M: SY='A'; M=24,-13,-18,-17,-9,-18,-8,-20,-12,-11,-13,-12,-12,7,-10,-18,5,3,-8,-15,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-11,-9,-19,-11,-15,-9,-20,-4,-13,-6,-7,-10,-14,-11,-18,8,6,4,-25,-16,-11;
MA   /M: SY='A'; M=4,-6,-18,-10,-7,-7,-14,-7,-9,-8,-6,-7,-4,-18,-7,-7,2,3,-7,-18,3,-8;
MA   /M: SY='A'; M=17,-19,-5,-25,-17,-8,-15,-21,3,-19,11,3,-18,-21,-16,-20,-7,-3,6,-23,-12,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,0,-7,-30,31,-12,-34,-1,-28,-17,5,-16,-5,-4,-1,-14,-26,-23,-23,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-24,-31,-23,2,-31,-22,25,-19,13,14,-18,-21,-16,-13,-15,-5,18,-19,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-37,-2,15,-30,-20,-15,-23,-5,-27,-20,-15,67,-2,-15,-7,-10,-30,-30,-27,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00656;
//
ID   XPG_1_MP; MATRIX.
AC   MP00841;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   XPG protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5139785; R2=0.0154754; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=465; N_SCORE=12.700; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,24,-28,42,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-7,-20,-9,-5,-17,-10,-7,-8,-6,-12,-2,-2,-16,6,-6,7,1,-7,-26,-9,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-14,-27,-17,-21,-2,35,-15,-26,-20,-18,-13,-6,-22,-22,-18,-5,-13,-20,-9,-5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,3,-32,-24,12,-27,-21,9,-25,15,11,-21,-27,-22,-22,-17,-9,7,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-36,-27,39,-30,-19,15,-27,21,15,-23,-27,-27,-20,-21,-9,11,-7,13,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-8,-30,-9,-5,-2,-23,17,-16,11,-14,-4,-5,-21,4,11,-13,-11,-18,0,32,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-29,-13,-5,-9,-16,-3,-25,16,-15,-8,-4,-21,4,46,-11,-11,-18,-15,-3,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-16,-14,-22,-18,0,-25,-23,9,-18,8,2,-14,-19,-18,-16,0,19,14,-25,-6,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-10,-1,-16,-14,-14,-21,-15,1,-18,-5,-4,-6,-14,-11,-18,-4,-5,-1,-31,-14,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-6,0,-22,-7,-4,-15,-14,-4,-11,8,-10,5,7,-17,1,9,-4,-5,-11,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22,12,-30,-20,23,-28,39,21,-27,-28,-20,-20,-26,-9,14,-19,1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-27,-18,6,-28,-18,15,-18,27,18,-24,-26,-15,-14,-22,-9,12,-19,-1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-24,6,25,-10,-18,-4,-22,0,-17,-16,-1,-9,4,-3,3,-2,-20,-23,-6,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-9,-22,-14,-9,12,-19,5,-9,-11,-4,-5,-3,-22,-11,-7,-8,-7,-10,-11,13,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-30,-3,-8,-29,41,-14,-37,-5,-28,-18,2,-18,-10,-3,-2,-16,-28,-22,-25,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-36,-29,0,-37,-29,42,-27,19,17,-22,-22,-22,-27,-17,-6,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-4,6,-25,-21,-9,-24,35,-23,-9,-1,-12,7,31,-8,-6,-16,-21,-10,6;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-17,-11,-28,-18,-21,83,-11,-20,-10,-9,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-14,-33,-28,2,-34,-25,31,-24,13,12,-24,-26,-23,-24,-16,-6,31,-21,1,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-24,-32,-25,42,-31,-8,9,-24,16,6,-22,-29,-25,-18,-22,-10,2,7,37,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-22,-40,-30,75,-29,-21,-1,-29,8,-1,-21,-30,-39,-20,-21,-11,-2,20,30,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-15,4,6,-29,-4,-10,-31,13,-26,-16,0,-14,2,8,-4,-10,-22,-26,-18,4;
MA   /M: SY='P'; M=2,-12,-25,-11,-6,-21,-16,-14,-13,-11,-20,-14,-10,34,-10,-16,2,3,-12,-30,-21,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-30,-16,-8,-13,-23,-13,-6,-17,-4,-6,-18,34,-12,-18,-11,-5,-13,-26,-15,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-30,4,12,-22,-19,-3,-20,-5,-18,-14,-6,20,-1,-10,-5,-8,-21,-28,-16,4;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-12,-25,-17,6,-24,-17,8,-21,20,11,-20,-25,-15,-16,-13,-5,7,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,3,-23,1,1,-24,-7,-8,-23,12,-24,-13,7,-13,3,11,5,-2,-16,-27,-15,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-26,8,19,-26,-11,3,-25,5,-19,-13,1,-11,12,5,0,-8,-21,-28,-14,14;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-17,-3,11,-16,-21,-14,-12,-4,-11,-11,-4,-9,-2,-8,9,22,-4,-30,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-25,-17,1,-5,-29,-17,12,-17,16,6,-19,-19,-9,-16,-17,-9,6,-20,-6,-5;
MA   /M: SY='E'; M=5,-2,-21,-3,11,-23,-13,-8,-19,6,-19,-12,0,-10,7,5,7,1,-14,-26,-16,8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,2,11,-26,-17,-6,-27,25,-24,-13,1,-12,9,25,-2,-6,-19,-24,-13,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-8,2,-22,-17,-4,-24,23,-20,-9,-1,-16,10,39,-3,-6,-16,-22,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,13,26,-27,-17,-4,-24,11,-17,-12,0,-9,11,5,-3,-8,-21,-28,-15,18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-26,-12,-2,-20,-20,-5,-15,15,-15,-3,-4,-16,8,26,-6,-7,-10,-22,-9,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-29,-8,2,-22,-20,0,-29,32,-22,-10,0,-18,9,58,-9,-9,-20,-21,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-27,9,27,-29,-19,-3,-22,10,-16,-10,-2,-8,19,2,-3,-9,-21,-26,-15,23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,8,22,-28,-11,-5,-27,13,-23,-15,3,-8,11,7,3,-4,-22,-27,-17,16;
MA   /M: SY='A'; M=17,3,-15,-6,-6,-16,-5,-8,-14,-5,-17,-13,10,-15,-5,-8,11,3,-10,-25,-12,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00658;
//
ID   XPG_2_MP; MATRIX.
AC   MP00842;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   XPG protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0492067; R2=0.0178548; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=548; N_SCORE=15.824; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=26; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-29,-5,0,-26,-8,2,-25,6,-25,-10,-3,11,3,3,-2,-8,-23,-26,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-26,11,25,-31,-16,-2,-23,6,-21,-12,1,-8,22,0,4,-6,-21,-28,-16,24;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-14,-23,-21,-14,-6,-20,29,5,-10,8,42,-11,-20,3,-7,-17,-13,-2,-23,6,-7;
MA   /M: SY='A'; M=14,-1,-11,-14,-13,-3,-10,-13,-6,-13,-10,-9,8,-18,-13,-16,2,-3,-6,-23,-11,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-28,2,9,-19,-19,7,-20,5,-10,-8,-5,-15,2,0,-11,-12,-18,-15,-5,5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-11,15,34,-29,-20,-5,-31,10,-22,-19,0,-9,9,3,-3,-10,-26,-32,-19,21;
MA   /M: SY='C'; M=1,-21,28,-27,-23,-9,-25,-26,3,-24,0,-2,-19,-28,-22,-23,-6,-4,11,-34,-16,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-30,-17,-4,-21,-28,-12,7,3,-6,6,-8,-14,14,-2,-11,-10,-2,-20,-6,3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-22,4,17,-25,-21,0,-26,16,-20,-13,0,-13,8,22,-7,-11,-21,-27,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-20,-23,-12,3,-23,-13,7,-20,25,8,-22,-24,-14,-17,-18,-8,3,-14,5,-14;
MA   /M: SY='L'; M=0,-25,9,-28,-20,-1,-25,-22,5,-27,26,7,-25,-29,-20,-22,-20,-8,4,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-4,6,-25,-12,-3,-28,20,-23,-12,2,-15,13,37,0,-6,-21,-24,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-20,-20,-11,-1,-24,-17,8,-20,23,8,-17,-22,-12,-13,-11,-1,4,-25,-6,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-15,-13,-24,-19,-10,13,-22,9,-6,-8,0,14,-7,-21,-4,0,-14,-11,-8,-14,7,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-28,-7,-17,-29,60,-17,-37,-18,-30,-20,5,-19,-17,-18,4,-16,-29,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,40,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-1,-37,10,8,-32,-18,-13,-26,-4,-29,-22,-8,55,-5,-11,-7,-10,-29,-32,-26,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,1,-23,-22,17,-28,0,-3,-16,-3,-3,-20,-31,-17,-15,-13,-7,-1,2,39,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-28,21,18,-24,-24,-22,-26,-19,-8,33,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-18,-14,-12,-11,-26,-18,13,-12,0,3,-13,-21,-9,-14,-6,-2,20,-29,-11,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-5,-23,-19,11,-19,-3,-4,-15,-2,8,-15,-25,-10,-13,-11,-6,-6,-7,19,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-12,-17,-8,-21,-1,-19,-12,-10,-14,-12,-9,-3,-9,-19,12,1,-3,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-29,1,22,-38,-19,8,-21,9,-21,-3,1,-9,54,8,2,-8,-29,-22,-11,38;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,61,-30,-26,-9,-28,-22,-9,-26,4,5,-22,-34,-22,-24,-16,-10,-2,-37,-17,-24;
MA   /M: SY='A'; M=38,-13,-10,-21,-13,-16,-6,-21,-3,-12,-7,-7,-13,-14,-13,-19,8,1,9,-23,-18,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-17,-25,-21,-11,11,-21,-6,-4,-9,-4,-2,-16,-20,-11,-13,-12,-9,-7,9,23,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,48,23,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-4,9,-4,7,9,-21,-15,-7,-18,-7,-14,-14,8,-17,-3,-10,-2,-6,-16,-34,-19,3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-29,-5,10,-24,-22,-6,-17,21,-14,-4,-5,-13,15,18,-10,-10,-16,-21,-9,12;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-17,-5,-1,-16,-9,-8,-12,-3,-13,-7,7,-14,-2,-6,9,4,-10,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-28,26,2,-30,15,2,-34,-4,-29,-22,22,-16,-5,-8,1,-11,-29,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-25,-23,-12,-4,-28,-16,11,-6,11,12,-17,-20,-5,-7,-17,-9,6,-19,-2,-10;
MA   /M: SY='V'; M=7,-23,-13,-27,-24,-5,-25,-27,21,-19,6,6,-22,-23,-23,-20,-5,4,33,-27,-10,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,6,-27,11,8,-14,-18,5,-19,-2,-17,-10,0,-15,15,-4,-2,-7,-21,-14,9,10;
MA   /M: SY='G'; M=22,-11,-21,-15,-15,-21,31,-17,-24,-15,-19,-14,-6,-16,-15,-19,3,-10,-15,-17,-18,-15;
MA   /M: SY='I'; M=2,-24,-22,-32,-25,-4,-30,-27,31,-23,11,11,-17,-19,-19,-25,-10,-1,24,-22,-6,-25;
MA   /M: SY='I'; M=9,-24,-21,-33,-24,-6,-27,-27,30,-23,10,10,-18,-18,-18,-26,-10,-6,24,-21,-7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00658;
//
ID   DALA_DALA_LIGASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00843;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-alanine--D-alanine ligase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2232161; R2=0.0158017; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=358; N_SCORE=10.870; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-4,-8,-21,-10,-5,-9,-14,-11,-7,-9,-5,-5,-4,-15,-7,-9,-4,-4,-7,-20,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-24,-6,-5,-19,1,-13,-15,-6,-15,-10,-2,-12,-5,-8,-1,-6,-12,-24,-16,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-23,-7,1,-7,-14,-10,-10,-7,-2,-5,-6,-17,-5,-8,-7,-5,-11,-20,-4,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-24,-6,7,-17,-19,-11,-13,7,-12,-7,-5,-8,2,2,-6,-7,-10,-24,-12,4;
MA   /M: M=-5,-7,-24,-7,0,-13,-19,-8,-10,-3,-8,-6,-7,-5,-4,-4,-5,-5,-10,-23,-7,-3;
MA   /M: M=-6,-9,-25,-12,-4,-15,-21,-13,-1,-4,-3,-1,-8,-15,-2,-7,-10,-8,-4,-17,-8,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-7,2,-25,5,4,-27,-1,-9,-26,3,-24,-15,1,-4,-1,0,-1,-8,-21,-27,-18,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-17,-30,-23,13,-28,-23,15,-23,6,4,-20,-13,-24,-22,-14,-7,12,-16,1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-29,55,21,-37,-12,3,-36,0,-27,-25,15,-9,4,-8,1,-8,-28,-37,-18,12;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-23,-9,-27,-22,8,-28,-20,10,-16,6,4,-20,-26,-21,-11,-12,-2,16,-19,2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-15,-29,-24,-1,-23,-26,18,-20,8,5,-23,-23,-22,-21,-9,-4,25,-17,-8,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-22,-36,-28,55,-31,-17,8,-27,14,4,-22,-29,-32,-20,-21,-10,4,7,28,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-30,-11,-8,-17,-20,-15,-2,-14,-11,-8,-2,27,-10,-17,-8,-7,-13,-30,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-4,-27,-22,-6,-21,-25,12,-21,9,4,-21,-23,-21,-21,-8,-2,18,-26,-12,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23,8,-33,-23,28,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-25,-9,-6,-16,-9,-10,-19,0,-17,-11,-4,0,-6,4,-1,1,-15,-23,-12,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-4,-26,-5,-9,2,-16,-3,-12,-12,-9,-7,-2,-9,-11,-12,-10,-7,-15,-11,5,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-27,-10,-20,-30,68,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-27,59,16,-36,-9,0,-36,-1,-29,-27,23,-11,-1,-9,3,-5,-28,-39,-19,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-10,-6,-5,-18,-14,-16,-15,-1,-15,-11,-2,-13,-6,-5,11,16,-5,-29,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-27,5,-33,-26,33,-26,25,18,-25,-26,-22,-23,-20,-7,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-28,-1,17,-37,-18,9,-20,7,-20,-2,0,-8,51,7,2,-8,-27,-21,-11,34;
MA   /M: SY='G'; M=11,-9,-23,-11,-15,-27,47,-19,-32,-17,-26,-18,-1,-17,-15,-19,7,-11,-22,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-29,-22,15,-28,-16,16,-25,30,15,-26,-28,-20,-19,-22,-8,11,-13,9,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-17,-32,-22,26,-28,-20,13,-29,35,14,-26,-29,-24,-20,-25,-10,7,-13,6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-28,25,33,-31,-15,0,-30,11,-24,-19,9,-7,13,4,0,-8,-27,-31,-18,23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-17,-28,-21,12,-27,-18,13,-22,18,13,-21,-24,-18,-18,-15,-3,10,-14,4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-18,-27,-19,6,-22,-15,12,-21,18,15,-20,-23,-15,-18,-14,-5,7,-16,3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-28,4,-5,-27,23,-1,-32,-5,-27,-16,10,-17,-3,-3,1,-12,-27,-25,-17,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-31,-23,1,-33,-24,29,-19,19,16,-21,-22,-18,-19,-19,-7,21,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-37,-10,0,-29,-19,-19,-20,-5,-29,-19,-18,75,-8,-15,-9,-9,-27,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-21,-26,-23,37,-30,6,1,-16,3,0,-20,-30,-18,-14,-20,-10,-6,19,60,-23;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-13,-20,-19,-3,-23,-22,11,-17,0,0,-12,-20,-19,-16,3,14,20,-28,-9,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-26,-10,-19,-29,61,-16,-38,-20,-29,-19,0,-20,-19,-19,0,-18,-29,-21,-27,-19;
MA   /M: SY='C'; M=2,-9,18,-11,-10,-22,-8,-18,-23,-16,-26,-19,-4,-3,-11,-18,14,5,-14,-39,-24,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-29,6,-6,-29,35,-10,-36,-7,-28,-20,8,-17,-10,-6,0,-15,-28,-25,-24,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-17,-28,-24,-3,-29,-23,23,-21,9,9,-22,-18,-22,-21,-10,0,29,-27,-8,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00659;
//
ID   DALA_DALA_LIGASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00844;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   D-alanine--D-alanine ligase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6589432; R2=0.0162323; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=358; N_SCORE=11.460; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-21,-18,-8,-10,-23,-14,6,-10,5,4,-13,-19,-6,-9,-8,-4,7,-25,-8,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-21,-6,6,-13,-20,-5,-11,-1,-9,-6,-7,-14,2,-3,0,2,-9,-20,-1,3;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-24,6,14,-26,-14,-4,-22,9,-18,-12,3,-11,10,5,0,-5,-19,-26,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-25,-1,14,-24,-19,-5,-21,13,-15,-8,-4,-13,14,14,-5,-6,-18,-23,-11,13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-20,-32,-25,2,-30,-24,29,-25,24,16,-24,-25,-20,-22,-18,-6,24,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-27,-6,7,-26,-18,-3,-18,15,-15,-2,-3,-14,21,18,-5,-8,-18,-21,-10,13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-25,7,20,-26,-15,-4,-22,8,-19,-12,2,-9,12,3,1,-3,-19,-27,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-17,-18,-22,-14,-2,-24,-13,13,-18,16,15,-15,-22,-10,-17,-15,-7,6,-20,-1,-13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-11,-18,-12,-9,-7,-19,-8,-13,-10,-9,-8,-13,-13,-18,12,6,2,-22,-14,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-13,-23,-14,0,-9,-25,-15,3,-7,7,3,-13,-17,-6,-9,-12,-7,1,-23,-7,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-27,-3,6,-24,-19,-7,-22,23,-18,-8,-2,-13,9,23,-6,-6,-16,-21,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=24,-17,-9,-25,-18,-12,-14,-23,6,-17,1,-1,-16,-17,-16,-22,-1,-1,12,-23,-14,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-15,-26,-22,34,-27,8,-7,-19,-2,-3,-17,-29,-19,-14,-18,-12,-10,15,42,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,6,-27,5,8,-25,-17,-2,-24,18,-22,-11,6,-14,11,20,-3,-7,-20,-25,-12,8;
MA   /M: SY='A'; M=16,-8,-15,-13,-7,-15,-11,-15,-4,-12,-7,-5,-7,-13,-9,-16,4,1,1,-25,-14,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-19,-30,-22,6,-28,-21,21,-25,29,18,-24,-25,-19,-20,-19,-6,17,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-7,5,-25,4,-4,-19,19,-9,-29,-6,-24,-17,9,-17,-8,-9,0,-11,-25,-24,-17,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-16,47,-21,-19,-18,-12,-23,-20,-22,-10,-11,-15,-29,-21,-23,-9,-10,-9,-36,-23,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-23,-2,4,-22,-7,-8,-25,11,-22,-14,1,-13,2,15,5,0,-17,-25,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-26,-10,-17,-26,46,-13,-30,-18,-24,-15,-2,-19,-17,-18,1,-15,-20,-22,-24,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-28,-20,8,-25,-15,7,-21,12,9,-24,-22,-16,-18,-21,-11,0,11,12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-10,-17,-14,-17,2,-20,-7,-16,-13,-9,-7,-16,-13,-19,10,1,1,-27,-19,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,3,-29,-25,-6,-26,-27,17,-22,4,4,-20,-25,-22,-23,-7,-1,24,-29,-11,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,22,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-19,-36,-28,55,-28,-19,6,-26,10,5,-21,-29,-34,-19,-17,-8,8,0,20,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-35,-25,38,-30,-18,13,-22,14,14,-19,-26,-24,-13,-20,-10,7,-6,14,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-18,-27,-21,6,-30,-18,18,-20,21,12,-25,-27,-18,-15,-19,-6,18,-18,4,-20;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-22,19,10,-24,-17,-8,-21,-1,-18,-16,5,-9,1,-6,4,6,-16,-31,-14,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-23,9,14,-24,-8,-4,-23,5,-20,-15,4,-3,4,-1,2,-5,-19,-25,-15,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-21,20,15,-23,-8,-3,-23,4,-21,-16,11,-8,4,-1,5,1,-19,-27,-15,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-25,5,-8,-25,35,-9,-30,-10,-26,-17,14,-17,-9,-10,1,-12,-26,-24,-23,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-26,5,20,-25,-18,-3,-21,14,-19,-12,4,-10,12,11,-2,-6,-19,-26,-14,15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-31,-23,14,-31,-24,18,-24,13,7,-24,-9,-25,-22,-18,-8,15,-17,0,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-28,-27,-23,24,-27,-4,0,-16,1,-1,-23,-29,-18,-12,-21,-12,-4,32,39,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-32,-24,11,-30,-23,22,-28,32,15,-27,-28,-23,-22,-24,-9,16,-15,1,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,4,-19,-6,-10,-7,-13,-6,-1,-14,5,-1,13,-24,-10,-10,-6,-4,-8,-30,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,59,-30,-20,0,-30,11,-20,-20,0,0,20,1,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-20,-33,-27,-1,-32,-27,34,-23,14,15,-23,-22,-22,-23,-14,-3,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-15,-10,-8,-14,-19,-20,-12,-10,-13,-12,-3,5,-10,-12,15,38,-5,-30,-14,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-19,-24,-17,-1,-25,-11,14,-20,13,13,-13,-21,-11,-17,-11,-5,7,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-19,-29,-20,21,-21,-8,9,-16,12,31,-17,-22,-12,-13,-13,-6,5,-14,6,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-11,-13,-12,-6,-21,-19,-7,-12,-4,-5,-3,-12,-11,-11,14,42,1,-28,-8,-11;
MA   /M: SY='P'; M=5,1,-24,2,5,-27,-9,-9,-22,0,-23,-16,0,9,2,-7,6,-1,-19,-29,-20,3;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-6,-22,-13,-11,-4,-21,7,-5,-12,-5,-1,0,-19,-6,-9,-4,2,-7,-18,2,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-12,-2,-2,-14,-3,-7,-18,-10,-27,-18,7,-12,-1,-10,33,17,-10,-32,-8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-28,-19,5,-27,-15,19,-22,31,28,-24,-19,-14,-18,-24,-10,9,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-21,-32,-26,36,-30,-13,10,-22,9,4,-23,-29,-26,-18,-18,-8,10,5,29,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-36,-8,2,-27,-20,-18,-19,-7,-24,-17,-17,66,-8,-16,-10,-9,-26,-29,-26,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-27,4,9,-24,-18,-3,-18,13,-14,0,-2,-10,10,6,-7,-8,-16,-25,-11,9;
MA   /M: SY='L'; M=6,-16,-17,-21,-13,-1,-17,-15,3,-17,8,6,-13,-19,-10,-16,-4,-2,2,-21,-6,-11;
MA   /M: SY='W'; M=14,-20,-22,-26,-18,-3,-11,-22,-9,-14,-8,-9,-19,-17,-16,-18,-10,-10,-7,23,-2,-15;
MA   /M: SY='K'; M=2,0,-23,0,9,-25,-13,-9,-20,10,-18,-11,-1,-11,7,7,1,-3,-14,-25,-15,7;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-18,-10,-6,-15,-9,-1,-11,-6,-13,-8,0,-15,-3,-7,4,0,-7,-22,-7,-6;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-16,-16,-12,-9,-13,-12,-2,-10,-2,2,-9,-17,-9,-12,1,0,1,-24,-9,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00659;
//
ID   CAP_GLY_1_MP; MATRIX.
AC   MP00845;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CAP-Gly domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4973426; R2=0.0129829; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=565; N_SCORE=11.823; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-23,-3,-4,-11,-22,-10,-12,2,-9,-7,-6,-20,-3,15,-7,-3,-3,-24,-8,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-12,-14,-10,-5,-10,-24,-17,3,-15,7,1,-15,-21,-11,-15,-9,-2,8,-28,-11,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-19,-18,-11,-11,-17,-20,2,-7,3,1,-16,-16,-12,-10,-11,-6,6,-24,-11,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-12,-22,-21,-8,-20,-25,13,-20,3,2,-18,-18,-20,-21,-6,0,18,-28,-12,-22;
MA   /M: SY='G'; M=1,-1,-23,-5,-12,-21,22,-12,-22,-13,-21,-14,6,-18,-10,-14,3,-7,-16,-25,-20,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-13,-2,-3,-13,6,-6,-14,-2,-15,-9,6,-7,-3,-2,7,2,-11,-18,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-25,-7,-6,-21,8,-13,-16,-12,-15,-10,-3,-7,-7,-14,-1,-5,-14,-26,-18,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-3,-29,0,17,-20,-13,2,-24,12,-17,-9,-3,-13,10,17,-7,-11,-22,-19,-6,12;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-24,-12,-3,-8,-20,-2,-14,3,-11,-4,-7,-11,0,10,-4,-3,-12,-18,0,-3;
MA   /M: SY='G'; M=9,-11,-15,-13,-19,-27,49,-21,-33,-19,-25,-18,-3,-19,-19,-21,1,-15,-23,-22,-28,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-17,-19,-14,0,-25,-20,3,-13,-2,-2,-8,-16,-11,-11,3,22,6,-23,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,20,13,-29,-29,-27,-21,-16,-3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-28,-13,-3,-19,-20,-7,-17,22,-15,-3,-4,-17,4,39,-10,-9,-11,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-25,1,-29,-25,-2,-28,-25,16,-19,5,4,-23,-27,-23,-20,-11,-4,25,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,-1,-16,-31,61,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-24,-9,4,-17,-20,-15,-6,-7,-8,-6,-13,8,-7,-12,-6,-4,-4,-28,-17,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-15,-14,-21,-18,-4,-26,-23,11,-18,8,3,-14,-19,-17,-16,0,21,17,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,8,-31,17,10,-30,-15,-4,-26,0,-25,-18,1,19,3,-7,-2,-8,-25,-31,-19,4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-25,-23,-17,27,-11,-18,-11,-21,-5,-8,-12,-5,-25,-18,-12,-8,-12,-9,3,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-20,-13,-5,-19,-13,-16,-14,7,-16,-9,-8,-14,-4,0,-2,-3,-6,-10,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-3,-27,1,9,-26,-15,-12,-20,4,-22,-13,-6,18,0,-6,-1,-4,-18,-28,-19,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-28,-10,-20,-27,60,-20,-34,-19,-27,-18,0,-21,-20,-19,0,-18,-24,-21,-28,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-24,-19,-13,4,-27,-8,5,-7,3,6,-14,-19,-10,-9,-13,-3,2,-10,15,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-35,-40,-38,-28,23,-21,-25,-14,-21,-12,-14,-33,-29,-23,-20,-32,-23,-21,105,29,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,5,-28,-25,4,-28,-18,10,-21,9,4,-24,-29,-23,-20,-14,-6,17,-19,4,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-29,22,44,-29,-19,-2,-27,8,-19,-18,2,-4,13,1,-2,-10,-25,-30,-18,28;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-26,-32,-23,17,-27,-17,10,-25,27,14,-29,-29,-19,-18,-29,-13,1,16,14,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,29,-29,43,14,-30,-15,-4,-29,-3,-16,-20,8,-8,-2,-7,-6,-10,-23,-35,-17,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-26,15,24,-27,-13,0,-25,8,-24,-17,14,-5,9,1,2,-6,-25,-31,-18,16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-28,-6,1,-24,-11,-3,-18,-8,-22,-14,-8,42,-5,-14,-4,-8,-22,-26,-19,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: M=-4,-10,-23,-10,-1,-12,-19,-11,-8,-4,-6,-6,-7,-4,-6,-8,-3,-2,-7,-26,-11,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,6,-28,3,8,-28,-17,-7,-28,42,-30,-12,9,-12,8,25,-7,-8,-22,-23,-12,8;
MA   /M: SY='N'; M=-14,21,-26,8,-3,-17,-7,29,-23,-5,-26,-15,36,-21,0,-2,-1,-8,-30,-16,-4,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,42,-27,56,16,-36,-9,0,-36,0,-30,-27,21,-11,0,-6,4,-6,-28,-39,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-13,-7,-5,-16,-10,-13,-16,-4,-19,-13,2,-12,-3,2,22,21,-5,-32,-15,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-18,-30,-26,14,-29,-12,18,-22,7,7,-21,-26,-24,-19,-13,-6,24,-17,6,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-8,19,-26,21,9,-25,-3,-3,-26,0,-23,-15,13,-13,4,-6,1,-8,-24,-30,-16,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-30,2,-14,-32,58,-17,-40,-17,-30,-22,3,-18,-17,-18,0,-18,-30,-23,-28,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-18,-12,-12,-27,-20,6,2,-4,2,-13,-19,-9,0,-7,1,13,-25,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-6,5,-24,-19,5,-23,17,-19,-6,-1,-15,16,31,-4,-6,-17,-23,-9,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,27,-30,13,3,-13,8,3,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-7,22,67,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-4,-39,-30,69,-30,-21,-3,-30,7,-2,-20,-31,-39,-21,-19,-10,-1,3,23,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-6,9,-22,9,9,-25,-10,-7,-22,2,-22,-14,7,-11,7,-2,9,6,-18,-30,-16,8;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-20,58,-28,-25,-6,-27,-27,-15,-25,-11,-12,-18,-25,-26,-25,-7,-3,-2,-35,-18,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-25,5,11,-27,-15,-7,-22,11,-22,-12,1,-6,10,6,2,-3,-17,-27,-15,10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-30,-9,4,-22,-19,-17,-12,-7,-16,-11,-17,41,-7,-15,-8,-8,-15,-27,-22,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-26,2,6,-24,-4,-5,-26,15,-25,-13,10,-13,5,10,-1,-4,-22,-24,-12,5;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-6,-20,-7,-7,-8,-9,24,-20,-7,-18,-9,1,-19,-3,-6,2,-4,-17,-17,14,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-27,-10,-18,-27,57,-20,-35,-18,-27,-18,0,-18,-18,-19,3,-11,-25,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='I'; M=0,-17,-19,-22,-18,-7,-20,-20,16,-20,4,6,-10,-19,-13,-19,-1,0,13,-27,-9,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-36,-27,62,-29,-20,3,-29,16,3,-20,-29,-34,-20,-19,-9,1,2,22,-27;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-15,-27,-22,-3,-24,-24,20,-20,14,8,-21,-24,-21,-20,-11,-3,25,-25,-9,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-33,-7,1,-25,-16,4,-27,14,-24,-12,-4,11,6,26,-9,-12,-25,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-31,-17,-6,-15,-19,-19,-2,-15,-9,-6,-16,26,-10,-19,-9,-9,-10,-25,-16,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-13,-3,-3,-13,-9,1,-17,-4,-21,-12,10,-15,0,-2,14,6,-13,-28,-8,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-4,6,-21,-20,-2,-21,17,-19,-8,-2,-15,14,25,-4,-6,-16,-19,-5,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00660;
//
ID   HTH_ARSR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00846;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial regulatory proteins, arsR family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1775999; R2=0.0144990; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=824; N_SCORE=17.115; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-2,14,-16,4,-2,-18,-9,-6,-18,1,-24,-16,23,-13,-2,-2,17,19,-15,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=1,-27,-17,-28,-20,4,-25,-22,17,-25,35,14,-27,-27,-20,-20,-21,-7,15,-22,-5,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,1,15,-28,-6,-7,-32,25,-26,-14,0,-11,8,23,-6,-12,-24,-22,-16,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-14,-26,-21,-1,-24,-19,16,-18,16,18,-22,-23,-16,-16,-10,3,21,-25,-6,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-21,-13,-12,8,-19,13,-4,-12,0,-1,-10,-21,-7,-9,-6,-4,-7,-1,32,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-7,-17,-8,-2,-14,-14,-16,-5,-12,4,-4,-12,-16,-10,-16,-4,-5,0,-24,-14,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=5,-17,22,-22,-17,-12,-19,-20,-9,-16,-3,-7,-15,-25,-16,-12,-3,-3,0,-32,-17,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-25,-2,13,-24,-18,8,-21,5,-15,-7,0,-13,20,13,1,-3,-20,-26,-9,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-5,6,11,-18,-16,-5,-17,0,-9,-6,-3,-12,1,1,-6,-8,-14,-25,-13,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-27,6,4,-30,27,-9,-33,-8,-27,-19,7,-14,0,-10,5,-11,-28,-27,-24,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,54,-30,-20,-1,-30,15,-21,-19,0,-1,19,4,-1,-10,-29,-29,-19,36;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-18,-25,-17,5,-26,-19,13,-26,36,13,-23,-26,-17,-18,-18,0,7,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=6,-28,-10,-29,-28,-2,-26,-29,25,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,44,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,105,-28,-29,-21,-20,-29,-31,-29,-21,-20,-18,-38,-29,-29,-9,-11,-12,-47,-30,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-32,-23,7,-32,-23,28,-29,39,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=27,-13,10,-22,-14,-15,-11,-22,-10,-16,-5,-8,-13,-17,-14,-20,3,3,0,-26,-18,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-21,8,13,-22,-10,1,-18,1,-20,-12,22,-12,9,-3,6,2,-22,-32,-17,11;
MA   /M: SY='I'; M=11,-19,-23,-28,-19,-10,-23,-11,19,-20,4,7,-13,-16,-13,-23,-8,-8,12,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-23,-36,-27,21,-33,-22,27,-27,24,19,-23,-25,-23,-23,-22,-9,18,-14,6,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-30,18,22,-33,5,-5,-33,4,-26,-19,4,-9,10,-3,-1,-13,-29,-27,-20,16;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-16,-23,-16,-2,-22,-19,9,-15,-1,2,-17,-21,-10,-15,-3,-2,16,-22,-7,-13;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-6,-23,-6,11,-24,-21,-6,-7,-1,-11,-3,-7,-12,20,-4,-1,-3,-8,-24,-12,15;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-18,-11,-4,-23,-6,-17,-16,-10,-22,-16,-6,18,-7,-17,14,4,-12,-29,-23,-7;
MA   /M: SY='T'; M=9,3,-17,-5,-3,-20,-11,-13,-17,8,-19,-12,7,-12,-3,0,7,12,-10,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='V'; M=8,-19,-14,-24,-18,-5,-22,-23,11,-19,11,4,-18,-20,-17,-19,-4,8,16,-24,-9,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-4,-30,-4,-2,-14,-21,75,-26,-4,-18,-2,5,-21,8,10,-11,-17,-26,-21,22,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,4,-24,-20,82,-28,-6,-20,0,8,-18,20,2,-8,-18,-30,-28,14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-26,-6,1,-22,-15,-5,-26,26,-22,-11,4,-16,6,40,-5,-7,-18,-22,-13,1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-15,-18,-20,-15,-1,-20,-17,8,-19,3,6,-9,-17,-12,-17,3,9,6,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-12,-5,-13,-23,1,-15,16,-9,-3,-8,-21,0,27,-13,-10,-8,-18,0,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-26,23,18,-30,-12,-2,-30,17,-28,-19,17,-10,6,6,3,-5,-25,-32,-17,12;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-5,-20,-8,0,-18,-15,-5,-8,-8,-2,-1,-1,-17,13,-6,1,-3,-12,-26,-11,6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-29,-3,-4,-27,33,-10,-34,-4,-27,-18,7,-18,-7,3,-1,-14,-28,-24,-24,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,30,-28,35,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-14,-30,-25,-1,-27,-27,25,-21,15,10,-26,-26,-24,-21,-11,-3,34,-26,-9,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-7,5,-20,1,-2,-17,-16,-9,-16,4,-12,-9,7,-15,-3,4,3,9,-12,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-3,-25,-2,-8,6,-22,3,-13,-3,-12,-9,-6,-20,-7,-6,-5,0,-12,-2,30,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-7,-30,-6,7,-21,-20,9,-30,24,-20,-10,1,-18,11,55,-9,-11,-22,-22,-8,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-2,7,-27,-20,-10,-28,41,-27,-10,0,-11,8,29,-6,-3,-18,-21,-10,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00661;
//
ID   MCM_1_MP; MATRIX.
AC   MP00847;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MCM family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2484488; R2=0.0157820; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=387; N_SCORE=11.346; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-9,10,-28,13,-6,-21,26,-11,-34,-9,-26,-20,10,-18,-12,-12,-1,-14,-27,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-27,16,20,-31,-3,-5,-31,9,-26,-18,5,-9,10,1,3,-7,-25,-29,-19,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-17,-19,-21,-14,25,-18,-9,-7,-6,-1,0,-11,-19,-14,7,-13,-8,-6,7,11,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-13,-17,-16,-8,-24,-21,2,-9,-4,-3,-11,-19,-15,-3,5,24,16,-29,-10,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-2,5,29,-28,-22,-8,-30,13,-23,-17,-4,-10,8,3,-5,-10,-23,-31,-19,19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-19,-16,-11,-24,15,-20,-19,-13,-18,-14,-9,2,-13,-20,5,-7,-12,-21,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,9,-15,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,23,-25,-15,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-33,-23,16,-30,-17,23,-25,32,26,-24,-26,-18,-20,-24,-10,12,-16,4,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-17,-24,-20,-7,-25,-21,14,-15,2,11,-22,-3,-18,-17,-8,3,21,-28,-12,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-18,-25,-17,-3,-5,-25,-11,-3,-5,18,5,-16,-23,-5,12,-19,-10,-5,-21,-6,-5;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,9,0,-22,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-23,50,13,-30,-7,1,-30,0,-24,-23,22,-10,0,-7,1,-7,-24,-32,-16,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-26,-3,4,-19,-6,-5,-19,4,-11,-8,5,-18,3,12,-7,-10,-20,-25,-14,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-17,-31,-27,-1,-32,-29,31,-22,11,11,-22,-24,-24,-22,-9,4,36,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='C'; M=1,-23,41,-29,-25,-9,-26,-27,-2,-25,2,-3,-23,-31,-25,-24,-11,-6,11,-35,-18,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-20,101,-29,-28,-18,-28,-29,-25,-28,-15,-17,-20,-37,-28,-29,-10,-9,-8,-46,-27,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,29,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,70,-30,-20,3,-30,16,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,34,-23,40,9,-29,-8,-2,-29,-3,-27,-24,23,-12,-1,-8,10,4,-23,-39,-19,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-27,-2,12,-24,-21,-10,-21,30,-21,-9,-4,-12,6,22,-8,-9,-12,-23,-12,9;
MA   /M: SY='M'; M=-11,9,-21,0,-8,-12,-12,3,-1,-5,-3,22,11,-19,0,-7,-8,-7,-9,-29,-9,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-23,17,5,-25,-9,-1,-24,11,-27,-14,23,-14,3,4,6,-2,-21,-33,-16,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,5,-16,10,0,-12,-11,-7,-5,-7,-4,-6,-1,1,-5,-9,-5,-5,-7,-17,-8,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-25,6,17,-25,-14,9,-23,10,-22,-9,10,-11,15,5,3,-5,-23,-29,-12,16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-23,24,-1,-20,-19,-12,-9,-11,-4,-10,-3,-19,-12,-15,-8,-7,-1,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-25,-11,-2,-14,-18,3,-15,8,-14,1,-4,-18,13,22,-2,-4,-14,-17,1,3;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-15,-4,-8,-15,-19,-18,-7,-3,-11,-8,-6,-15,-11,-8,5,16,5,-29,-12,-9;
MA   /M: SY='A'; M=17,-10,-19,-15,-8,-8,-12,-7,-12,1,-12,-8,-10,-15,-6,-7,0,-3,-7,-8,9,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,3,-35,-24,37,-28,30,24,-23,-23,-18,-25,-23,-10,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-8,-23,-8,-5,-12,-19,46,-14,-15,-3,2,-1,-21,0,-7,-6,-10,-15,-29,7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-30,16,49,-30,-8,-3,-31,6,-21,-20,0,-3,15,-3,0,-11,-30,-29,-21,32;
MA   /M: SY='A'; M=28,-19,-10,-24,-19,-11,-13,-24,7,-14,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,22,-24,-16,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-22,-20,-32,-22,15,-22,-4,16,-14,18,49,-20,-22,-8,-12,-20,-10,8,-14,6,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00662;
//
ID   COX5B_MP; MATRIX.
AC   MP00848;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0182490; R2=0.0146014; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1084; N_SCORE=20.836; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=102; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-21,1,-7,-2,-11,9,-13,-6,-19,-13,19,-21,-4,-6,6,1,-18,-14,16,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-23,-30,-29,-23,2,-35,3,26,-23,9,13,-15,-22,-13,-21,-18,-12,12,-13,18,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-23,-15,-1,-11,-28,-19,9,-13,0,0,-8,-12,-7,-16,-1,12,5,-26,-8,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,30,-18,-24,-26,30,-24,-36,-24,-26,-20,-8,-28,-24,-24,-4,-16,-22,-32,-30,-24;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-23,6,19,-26,9,-8,-29,-4,-26,-20,4,-8,3,-8,15,-1,-23,-31,-22,11;
MA   /M: SY='P'; M=-12,9,-34,21,29,-32,-18,-7,-29,0,-26,-22,-3,30,4,-10,-4,-10,-30,-32,-24,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=11,-4,-11,-6,-7,-14,17,-10,-15,-8,-14,-10,0,-8,-7,-10,9,-1,-9,-16,-14,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-30,29,15,-34,17,-7,-38,-5,-28,-24,8,-11,-3,-11,0,-14,-30,-30,-24,6;
MA   /M: SY='N'; M=-3,18,-19,13,14,-22,-5,0,-22,-1,-28,-20,27,-12,5,-4,19,5,-23,-38,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-4,-5,-5,-19,-18,53,-26,-13,-20,-7,5,-20,1,-7,1,-5,-21,-34,4,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-6,19,-17,16,0,-20,-12,-9,-20,-6,-20,-18,17,-12,-5,-8,16,24,-14,-35,-15,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-35,-26,2,-33,-22,35,-25,26,26,-23,-23,-17,-23,-21,-9,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-43,-40,-30,27,-22,-28,-15,-22,-13,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-23,117,30,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-21,-22,-27,-19,29,-26,12,0,-22,12,14,-15,-26,-17,-13,-19,-12,-4,-10,17,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-16,-30,-20,-14,-6,-20,-22,-18,-3,-18,-14,-16,-18,-10,-7,-9,7,-16,43,6,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-19,-26,-21,-3,-28,-25,18,-21,15,7,-28,-8,-23,-20,-16,-5,23,-27,-11,-23;
MA   /M: SY='H'; M=0,-6,-22,-10,-8,-9,-17,35,-16,-10,-12,-4,-2,-18,-2,-8,-1,-1,-14,-17,16,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-26,-1,15,-25,-22,-10,-18,24,-19,-8,-6,-11,9,12,-7,-8,-10,-24,-12,12;
MA   /M: SY='G'; M=-8,12,-28,12,-2,-30,21,-8,-34,4,-30,-19,15,-16,-6,-3,-1,-12,-28,-27,-22,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,39,-30,-20,-4,-30,27,-24,-16,0,-4,16,13,-4,-10,-26,-26,-16,27;
MA   /M: SY='P'; M=5,-17,-19,-18,-12,-12,-18,-20,-1,-15,-3,-5,-16,7,-14,-18,-1,3,3,-28,-16,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-4,-22,-8,4,-26,-16,-4,-18,5,-16,-6,-2,-12,21,10,5,6,-16,-22,-12,12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-15,-30,-17,-7,-15,-25,-7,-11,16,-10,-3,-5,-20,3,46,-12,-10,-8,-20,-8,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-26,-37,-20,-10,-13,-22,-22,-10,-17,-9,-10,-26,39,-14,-20,-20,-14,-20,6,-12,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,20,-26,26,27,-28,-12,0,-29,5,-25,-21,15,-9,8,3,7,-4,-26,-34,-19,17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-15,-5,1,-22,-11,-9,-16,-5,-20,-11,3,-10,10,-6,21,19,-11,-30,-15,6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-18,-18,-18,-18,-8,-26,22,6,-16,-2,6,-14,-26,-14,-12,-10,-8,18,-30,2,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-20,-8,-8,-16,-20,-14,-4,13,-14,-4,-1,-20,-8,5,-6,-4,6,-28,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-15,-31,-12,-5,-7,-20,10,-19,-14,-20,-12,-10,33,-10,-14,-7,-9,-23,-24,-6,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-18,-25,-22,-16,-6,-28,10,13,-15,4,17,-14,-22,-3,-12,-14,-10,8,-19,8,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-25,-4,1,-32,18,-6,-27,-6,-26,-12,2,-14,17,-6,10,-6,-25,-25,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-7,-18,-5,-10,-9,-18,-13,2,-15,5,5,-10,-20,-11,-14,-3,-1,5,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=9,-11,-26,-8,9,-24,-15,-16,-15,-6,-18,-14,-13,27,-5,-15,-1,-6,-14,-27,-23,0;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-14,5,-5,-14,17,-1,-17,-5,-18,-12,22,-12,-5,-5,4,-5,-18,-19,-14,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=3,10,-14,14,16,-18,-7,-4,-16,1,-12,-12,2,-4,3,-5,2,-4,-13,-18,-12,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-13,9,7,-13,-13,-7,-6,-3,-7,-7,-3,-9,-4,-7,-2,-4,1,-20,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-5,-16,-7,-5,-7,-12,36,-6,-6,-3,14,-1,-12,4,-2,-8,-10,-9,-16,7,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-5,-14,-5,-5,0,-11,21,-9,-6,-9,-4,-1,-13,-1,-4,1,-2,-10,-6,19,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,-5,-8,-22,81,-23,-10,-15,0,3,-22,5,-2,-12,-18,-25,-16,34,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00663;
//
ID   GLY_RADICAL_1_MP; MATRIX.
AC   MP00850;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycine radical domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6258950; R2=0.0153583; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=226; N_SCORE=9.087; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=57; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-14,2,-8,-14,-20,-18,-7,-10,-10,-10,-3,-15,-13,-12,9,25,5,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-26,35,-30,-24,-2,-30,-24,0,-30,23,4,-26,-34,-24,-24,-22,-10,2,-32,-12,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-25,-5,8,-19,-18,-12,-15,2,-11,-9,-7,3,0,-3,-1,-3,-14,-28,-15,3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,23,-30,33,7,-29,-19,-9,-17,1,-18,-15,7,-12,-3,-8,-6,-10,-14,-32,-14,1;
MA   /M: SY='C'; M=16,-18,41,-26,-22,-16,-18,-26,-9,-20,-10,-10,-18,-26,-22,-24,-2,-4,7,-34,-22,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-13,-27,-13,-15,-12,11,-11,-17,-2,-17,-8,-10,-22,-13,-7,-8,-12,-10,-11,1,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-28,23,22,-31,-15,-2,-31,22,-28,-18,14,-9,9,10,-2,-8,-26,-30,-16,15;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-25,-2,0,-20,-20,48,-25,3,-20,-4,6,-16,5,4,-3,-1,-21,-28,7,0;
MA   /M: SY='P'; M=-14,5,-34,15,1,-27,-20,-14,-13,-10,-19,-15,-4,27,-8,-18,-8,-10,-17,-32,-20,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-3,2,-27,7,9,-24,-15,-8,-16,-4,-14,-3,-6,13,0,-12,-5,-8,-17,-28,-18,3;
MA   /M: SY='K'; M=-1,7,-25,1,7,-28,-13,-3,-23,21,-25,-10,11,-12,16,11,0,-6,-21,-24,-14,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-12,-30,-12,-10,-5,-5,1,-20,8,-17,-8,-8,-22,-4,10,-12,-12,-18,0,21,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-13,-26,-11,3,-16,-22,-8,-7,2,-8,6,-13,2,0,6,-10,-8,-6,-25,-13,0;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-25,35,12,-32,-8,3,-29,0,-28,-21,24,-12,10,-4,9,-3,-27,-37,-18,11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-14,-25,-21,2,-28,-24,17,-22,21,9,-23,-25,-21,-18,-11,8,23,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-19,-28,-23,-3,-31,-27,26,-21,8,8,-16,-19,-19,-21,-5,12,24,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-22,-21,-24,-18,-8,-28,-18,10,-2,0,4,-17,-24,-13,14,-12,-6,19,-24,-8,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-14,-27,-25,-2,-30,-28,25,-20,7,7,-21,-23,-23,-20,-5,10,34,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='C'; M=11,-10,41,-16,-14,-20,-12,-20,-22,-18,-22,-18,-6,-22,-14,-20,14,4,-8,-40,-24,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=5,-18,14,-22,-16,-8,-18,-20,-5,-22,7,-3,-16,-24,-16,-20,-3,-2,0,-31,-14,-16;
MA   /M: SY='G'; M=11,-18,-18,-20,-22,-16,16,-24,-6,-18,-10,-6,-14,-22,-22,-20,-2,-8,8,-24,-20,-22;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,0,-14,-6,-7,10,-10,-2,-10,-1,-8,-6,8,-14,-7,8,-4,-4,-10,-10,1,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-12,-10,-18,-14,29,-16,-12,-2,-14,2,-2,-8,-14,-18,-10,-4,7,0,-2,10,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-4,7,-12,1,0,-12,-9,-5,-12,9,-14,-8,10,-8,0,4,4,9,-10,-18,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=8,-6,-10,-9,-6,-1,-6,-2,-6,-6,-7,-6,-5,-10,-4,-8,5,1,-4,-5,9,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-12,-18,-12,6,-18,-12,12,-18,30,12,-18,-18,-12,-12,-18,-6,6,-12,0,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=1,9,-12,1,-4,-16,-8,-9,-16,-8,-22,-16,18,-12,-4,-8,25,27,-11,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-8,2,-30,-20,-18,-22,3,-30,-18,-16,69,-6,-9,-10,-10,-28,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-28,39,31,-31,-12,2,-31,4,-26,-24,22,-8,8,-4,2,-8,-30,-36,-20,19;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-1,-22,-3,18,-30,-12,-4,-19,2,-16,-8,-4,-8,24,-4,4,-6,-19,-22,-16,21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,10,-30,-20,2,-26,26,-22,-6,0,-14,30,38,-6,-10,-24,-20,-10,18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,4,-27,8,-2,-26,3,-12,-29,-3,-24,-18,1,2,-7,0,1,1,-22,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,10,-26,16,9,9,-20,-8,-22,-10,-12,-16,0,-16,-11,-12,-8,-10,-18,-18,0,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-3,-20,-13,-16,-6,-20,-12,13,-17,5,3,7,-24,-14,-14,-9,-4,6,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='I'; M=2,-20,-20,-28,-20,-3,-27,-24,21,-23,16,9,-16,-19,-16,-22,-9,4,14,-22,-5,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,8,-28,-8,10,-20,4,-26,-12,36,-16,24,4,6,-4,-30,-32,-16,16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,8,30,-30,-20,-6,-30,34,-26,-14,0,-6,14,18,-6,-10,-24,-24,-14,22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00665;
//
ID   BETA_ELIM_LYASE_MP; MATRIX.
AC   MP00853;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Beta-eliminating lyases pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5129495; R2=0.0159183; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=815; N_SCORE=18.476; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-19,-17,27,-29,17,-2,-9,-1,0,-18,-28,-6,-9,-18,-10,-11,25,70,-16;
MA   /M: SY='E'; M=7,-1,-24,-1,19,-28,-14,-7,-23,15,-20,-12,-3,-8,13,8,0,-7,-18,-23,-16,15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-27,35,9,-30,2,9,-32,-3,-29,-22,29,-15,-1,-7,2,-9,-30,-36,-18,4;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-11,-32,-11,-7,-15,-18,-17,-20,13,-21,-12,-13,-18,-5,7,-16,-14,-15,24,-1,-5;
MA   /M: SY='S'; M=11,-3,-12,-5,-4,-18,-6,-14,-16,-10,-23,-16,3,-3,-4,-12,28,23,-8,-35,-18,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-25,-35,-28,-2,-36,-29,40,-26,14,15,-23,-16,-22,-27,-17,-7,32,-23,-5,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-6,-27,-5,11,-23,-18,-10,-19,14,-17,-10,-5,-3,4,11,-4,-7,-15,-24,-14,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,13,-27,21,35,-33,-15,0,-28,5,-22,-17,3,-5,21,-2,3,-8,-26,-29,-18,28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-14,-26,-21,-6,-23,-25,16,-18,6,4,-18,-20,-19,-20,-3,7,22,-25,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-29,-10,-2,-14,-22,9,-22,20,-14,-5,-4,-20,5,39,-13,-11,-17,-16,4,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,28,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-8,-23,-15,-8,-19,-6,7,-11,4,31,-13,-19,1,-11,-6,-3,3,-26,-7,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-25,-31,-25,44,-30,-4,7,-21,11,7,-21,-29,-23,-16,-21,-10,0,11,42,-24;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-19,1,4,-25,-8,-8,-23,8,-27,-15,5,-11,8,5,17,5,-15,-31,-16,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-28,-21,-21,28,-30,16,2,-11,1,1,-21,-30,-12,-11,-19,-9,-5,25,73,-21;
MA   /M: SY='A'; M=27,-11,-17,-17,-14,-16,20,-20,-19,-15,-16,-13,-7,-15,-15,-20,6,-6,-10,-19,-20,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=7,-12,-24,-17,-17,-19,24,-8,-16,-16,-12,2,-7,-18,-12,-17,-4,-13,-12,-21,-16,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,10,-32,-24,17,-28,-20,4,-27,21,9,-24,-30,-24,-21,-21,-10,3,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=9,-8,-11,-16,-14,-10,-18,-20,-2,-12,-5,-2,-8,-14,-13,-14,11,28,9,-27,-11,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-4,-17,-13,-24,11,-21,-22,-15,-20,-16,-10,2,-15,-21,1,-8,-14,-26,-26,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-22,12,-29,-16,22,-25,36,28,-26,-27,-17,-19,-26,-10,11,-18,2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-13,-28,-27,-3,-20,-28,20,-20,9,7,-26,-28,-27,-20,-9,-3,36,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-24,14,1,-22,-4,5,-20,-1,-30,-19,45,-2,1,-3,6,-2,-30,-38,-21,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-37,-27,0,-34,-22,41,-24,19,30,-21,-21,-16,-24,-19,-9,26,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-35,-25,32,-29,-21,12,-28,28,12,-27,-29,-26,-20,-27,-12,5,4,12,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,1,-31,-24,3,-31,-24,18,-28,30,13,-27,-30,-23,-23,-23,-8,16,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='C'; M=17,-14,43,-23,-20,-21,-3,-24,-23,-20,-17,-16,-13,-24,-20,-24,0,-7,-9,-33,-26,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-22,-34,-25,27,-30,-19,19,-25,20,18,-20,-24,-22,-20,-19,-6,11,-11,9,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-13,9,-27,3,5,-25,-15,6,-27,29,-27,-12,16,-15,7,27,-5,-8,-23,-26,-10,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-27,50,22,-33,-10,1,-33,2,-26,-25,21,-9,3,-6,1,-8,-28,-36,-19,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-18,29,12,-21,-8,3,-22,5,-17,-14,8,-6,2,-1,-1,-6,-17,-20,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-27,24,33,-31,-14,-3,-29,2,-25,-21,5,2,11,-5,7,-4,-26,-34,-20,22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-27,4,12,-14,-10,-8,-22,-1,-16,-10,-4,-12,0,-7,-4,-9,-19,-12,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-25,-12,5,-29,-17,14,-20,28,14,-22,-24,-13,-11,-23,-10,6,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-13,-23,-15,-13,31,-24,-10,-5,-19,6,-3,-14,-24,-21,-16,-15,-9,-6,-4,18,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-21,-5,4,-20,-15,-1,-12,-3,-14,-7,-1,-15,6,-2,3,4,-7,-28,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-26,-2,8,-11,-20,-2,-15,3,-7,-8,-7,-16,1,2,-7,-7,-14,-15,5,3;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-6,-18,-13,-14,-16,-12,-2,-13,-4,-3,-10,-19,-9,-15,0,1,6,-27,-13,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-10,-1,-13,-7,-23,-6,-13,-28,11,-22,-13,-5,-20,-4,18,-6,-10,-16,-25,-18,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00667;
//
ID   PROTEASOME_B_MP; MATRIX.
AC   MP00854;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Proteasome B-type subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=77;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=72;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1193152; R2=0.0080414; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2119; N_SCORE=16.918; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=824; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-30; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=0,-76,-57,19,-75,17,-8,-4,29,-45,-62,-2,55,28,-7,-12,4,-19,-78,-68;
MA   /M: SY='M'; M=-59,-77,-7,38,-74,33,14,11,-13,-65,45,27,36,25,-11,-15,-29,-64,-79,-66;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-74,3,-57,-29,-40,28,-63,-3,18,-57,-58,-6,33,19,25,19,-37,-78,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-76,-5,-58,8,-46,20,-36,19,-13,81,25,0,7,41,-62,-35,-26,67,-52;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-46,6,-7,-2,21,-51,-20,-12,-23,-24,-19,-33,-78,14,16,-24,26,15,57,-60; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-26,-72,6,-17,-72,-61,-57,-65,-9,-11,17,31,32,51,-32,55,12,-43,2,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-42,-78,-33,7,-67,-3,18,49,17,-43,-16,17,49,15,-6,-37,-18,-13,-77,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-77,-29,61,15,-71,-55,-65,22,-34,27,-31,37,-50,-55,-23,-34,-43,5,56;
MA   /M: SY='M'; M=-18,-71,-19,21,-60,-48,3,12,-12,-27,73,-61,-15,-56,1,9,9,39,-78,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=10,-71,-19,-38,15,-68,44,-34,14,1,16,8,-73,-27,-34,19,-33,14,-64,58;
MA   /M: SY='T'; M=-41,-68,-50,-35,-71,-63,64,-68,32,-51,0,70,-65,-52,-52,-29,74,-64,-88,-61;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-76,-66,-76,-78,98,-69,-80,-69,-75,52,-52,-68,-66,-75,-51,-67,-77,-74,-74;
MA   /M: SY='T'; M=-51,-66,-33,12,-71,40,-66,-67,-58,-69,-65,-48,-61,-58,-66,10,94,-59,-82,-33;
MA   /M: SY='T'; M=5,36,-60,-62,-67,-64,-67,-27,-59,-64,-61,-49,-63,-60,-66,38,96,-37,-85,-32;
MA   /M: SY='I'; M=-57,36,-74,-74,-56,-80,-78,64,-70,-7,-44,-65,-71,-71,-75,-38,64,47,-82,-61;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-82,-76,-4,-80,-72,17,-74,49,66,-77,-78,-71,-74,-68,-36,56,-75,-55;
MA   /M: SY='A'; M=78,-66,-66,-65,-78,64,-70,-73,-65,-74,-66,-57,-67,-62,-71,-29,-57,-62,-75,-74;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-71,-85,-79,46,-85,-74,59,-76,20,66,-77,-78,-74,-76,-72,-58,51,-69,-48;
MA   /M: SY='K'; M=24,-71,-60,18,-69,-70,-64,6,51,-60,-56,-58,-67,19,19,-36,16,36,-78,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-45,49,-75,-79,85,62,-66,-62,-74,-43,-59,-64,-78,-76,-75,-61,-66,-32,-54,35;
MA   /M: SY='K'; M=-23,-77,54,17,-81,-65,-54,-78,62,-57,-68,26,-17,52,-4,-14,-35,-75,-81,-67;
MA   /M: SY='D'; M=-61,-23,84,-1,-82,45,60,-85,-57,-82,-74,40,-68,-27,-63,-36,-59,-82,-92,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-29,74,-70,-77,45,80,-68,-76,-71,-69,-67,-57,-75,-71,-76,-37,-66,-72,-64,27;
MA   /M: SY='V'; M=12,17,-81,-75,10,-78,-81,10,-73,-43,-45,-75,-77,-75,-75,-42,-33,89,-81,-59;
MA   /M: SY='V'; M=15,-21,-82,-76,-53,-79,-79,65,-74,-10,39,-75,-75,-72,-76,-65,-55,68,-79,-60;
MA   /M: SY='V'; M=-44,-70,-84,-78,-27,-85,-77,54,-76,49,26,-78,-78,-73,-76,-71,-36,59,-76,-56;
MA   /M: SY='A'; M=86,-19,-67,-64,-77,46,-70,-46,-64,-70,-64,-59,-67,-61,-70,-43,-56,-57,-75,-73;
MA   /M: SY='A'; M=71,-19,-64,-61,-72,-26,-67,-61,-61,-67,-62,-55,-66,-57,-66,61,7,7,-80,-69;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-80,116,4,-87,-64,-53,-86,-54,-84,-83,-36,-66,-53,-63,-15,-56,-82,-101,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-67,-58,-57,-69,-62,-20,-64,2,-29,37,-2,-65,-26,37,64,64,-60,-82,-63;
MA   /M: SY='R'; M=-34,-80,-65,-54,-71,-36,-55,-72,-30,-6,-22,-58,-75,-44,107,-9,-63,-48,-76,-62;
MA   /M: SY='A'; M=63,-65,-71,-66,-8,0,-69,-32,-66,21,13,-36,-71,-32,-70,-22,11,23,-75,-62;
MA   /M: SY='S'; M=-24,-65,-59,-62,-71,28,-64,-43,-60,-69,-24,-27,-64,-57,-66,75,63,-5,-82,-67;
MA   /M: SY='M'; M=41,-21,-62,12,-59,-46,0,-24,-38,-18,48,4,-69,1,-3,-14,21,7,-71,37;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-77,7,-40,-83,88,-64,-86,-61,-83,-72,-12,-67,47,-67,7,-63,-81,-76,-74;
MA   /M: SY='S'; M=15,-71,-20,-7,2,-20,-20,9,-61,-8,12,38,13,-57,-65,48,-32,-56,-69,37;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-76,-77,-76,5,-54,-65,7,-73,16,13,-39,-80,-71,-74,-18,35,7,-1,68; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-72,-83,-78,-30,-83,-82,81,-74,0,-39,-75,-76,-37,-46,-68,-56,58,-77,-58;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=49,-74,-72,-68,-68,-69,50,-60,-63,-5,21,-19,-77,-62,20,5,-38,10,-82,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=12,-68,25,-54,14,-58,0,-46,21,-70,-65,54,-67,-53,-56,48,37,-64,-78,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-76,-9,-49,-73,-48,-55,-48,44,-31,-23,13,-36,41,74,-24,25,-68,-76,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-22,-71,64,-21,-41,-44,-57,-40,-14,-67,-24,59,-69,-55,-3,12,17,27,-87,-32;
MA   /M: SY='F'; M=-15,49,-12,6,51,-51,-2,8,-65,-50,13,-63,-73,8,-68,-8,16,43,-70,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-43,-76,60,32,-81,-63,-55,-78,40,-79,-71,31,26,26,-31,27,-10,-75,-84,-69;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-78,-56,-43,-78,-71,-57,-80,102,-78,-65,-49,-65,-40,47,-58,-58,-75,-73,-65;
MA   /M: SY='I'; M=-61,16,-83,-79,-49,-86,-79,70,-76,42,-11,-77,-78,-74,-78,-47,-22,49,-77,-58;
MA   /M: SY='H'; M=-62,-22,-68,-66,51,-73,76,38,-28,-38,44,-59,-72,-13,-24,23,16,-50,-65,29;
MA   /M: SY='K'; M=-33,-79,-33,42,-1,-72,0,-31,52,-40,-62,-57,50,26,24,-39,-23,-23,-72,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-22,-85,-80,-46,-87,-76,77,-77,49,34,-78,-78,-73,-78,-74,-59,25,-73,-26;
MA   /M: SY='H'; M=7,-71,34,-55,-75,22,79,-77,-56,-76,-66,70,-68,-53,-61,17,22,-73,-90,-62;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-83,84,12,-86,-66,-58,-80,-14,-82,-75,-12,75,25,-61,-7,-36,-79,-89,-73; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-64,-77,-33,-54,-18,-47,82,-74,45,-52,-60,38,-71,-24,41,5,-37,-73,-67,57;
MA   /M: SY='I'; M=-44,16,-75,-73,-52,-80,-72,65,-19,36,33,-20,-73,-68,-71,-42,42,3,-77,-58;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-72,-79,-75,41,-25,-62,-18,-72,41,32,-75,-80,-69,-71,-67,-62,20,51,68;
MA   /M: SY='C'; M=-43,93,-80,-78,-57,26,-72,34,-74,27,68,-69,-78,-72,-76,-66,-61,9,-80,-63;
MA   /M: SY='C'; M=43,68,-65,-67,-74,55,-70,-70,-65,-41,-65,-54,-68,-65,-72,-11,56,-61,-81,-72;
MA   /M: SY='M'; M=18,27,-73,-70,-6,21,-65,1,-64,35,65,-64,-73,-63,10,-1,4,-50,-73,-28;
MA   /M: SY='S'; M=58,-19,-60,-59,-74,-36,-63,-67,-59,-71,-65,-28,-65,-54,-64,82,2,-29,-80,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='S'; M=-56,43,36,22,34,9,-63,-60,-62,14,-22,-55,-70,-59,-67,48,-2,-21,-75,-57;
MA   /M: SY='A'; M=75,-68,-68,-39,-38,-41,12,-16,-61,-61,-57,-63,5,29,-40,-49,-55,15,-3,19;
MA   /M: SY='A'; M=75,-65,-65,-63,-76,47,-69,-70,-63,-71,-64,-56,-66,-61,-69,-2,33,-59,-77,-72;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='C'; M=37,83,-71,-68,9,-48,-71,6,-64,-43,-20,-62,-73,-34,-5,-35,50,23,-79,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-78,-19,11,-72,-71,-54,-40,-20,17,-52,-31,-69,105,-17,-14,-23,0,-75,-61;
MA   /M: SY='T'; M=37,-69,-62,-39,39,-64,-20,-40,-58,-58,22,12,-69,47,-61,-12,52,-40,-64,43;
MA   /M: SY='W'; M=-65,-73,-85,-78,37,-83,-78,38,-75,48,-41,-79,-79,-74,-76,-71,3,30,99,-44;
MA   /M: SY='T'; M=43,-69,-57,29,-63,-65,24,-58,7,-37,-21,-32,-66,11,-35,-21,45,10,-72,32;
MA   /M: SY='R'; M=-63,-81,51,38,-82,-49,-53,-81,28,-76,-68,-49,-66,58,69,-37,-23,-77,-80,-66;
MA   /M: SY='M'; M=-24,-72,-73,-68,-13,-76,-58,4,-26,34,74,10,-77,-30,25,-44,-59,17,-1,50;
MA   /M: SY='L'; M=6,-69,-82,-76,5,-81,-74,48,-76,60,-10,-78,-79,-72,-76,-69,-37,32,-72,-54;
MA   /M: SY='A'; M=43,-71,-20,3,-76,18,-60,-46,35,-70,-3,-3,-66,40,13,2,-11,-22,-77,-67;
MA   /M: SY='Y'; M=24,-73,-38,-38,32,-66,-55,-9,28,-59,-2,-17,-71,24,-1,27,-56,-29,-57,68;
MA   /M: SY='Q'; M=-62,-78,-50,40,-42,-69,-17,-48,24,-31,21,48,-68,63,56,-37,-59,-70,-76,-30;
MA   /M: SY='C'; M=2,75,-74,-29,-54,-76,38,9,-30,43,39,-68,-77,-66,-69,-28,-11,20,-79,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-77,-6,42,-73,-23,33,2,30,-23,-61,34,-67,26,47,-7,-36,-66,-80,-63;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-71,-4,-29,-2,-81,-66,5,-31,74,34,-41,-79,-33,-70,-48,-62,-20,23,-25;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00668;
//
ID   SPASE_II_MP; MATRIX.
AC   MP00855;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Signal peptidases II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3446379; R2=0.0154518; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=185; N_SCORE=8.193; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-10,-3,-19,-15,-8,-19,18,-14,-5,-3,-17,2,28,-8,-7,-13,-22,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-24,-9,-4,-10,-22,-4,-9,4,-5,-2,-4,-19,-1,6,-9,-4,-8,-20,0,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-21,-7,-2,-14,-15,-11,-17,7,-13,-8,-5,-6,-3,6,-6,-5,-13,-20,-9,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-3,-19,-6,3,-19,-15,-4,-15,4,-14,-5,1,-10,2,4,0,-4,-13,-27,-13,1;
MA   /M: M=-8,-10,-24,-10,-6,-11,-10,-3,-12,-5,-6,-4,-7,-19,-7,-3,-8,-7,-8,-21,-6,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-10,13,-21,13,10,-22,-14,3,-25,4,-23,-14,12,-13,9,1,2,-4,-23,-29,-12,9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-23,-16,-9,-8,-23,-14,-10,2,-7,-5,-11,-10,-7,3,-11,-4,-10,-11,-2,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-17,-27,-20,-17,-3,-9,-18,-6,-16,-2,-5,-12,-21,-15,-11,-12,-9,-9,6,-3,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-6,-24,-10,-6,-5,-17,2,-8,-6,-9,-3,-2,-19,-2,-7,-5,-4,-11,-9,7,-5;
MA   /M: SY='N'; M=3,-2,-23,-9,-3,-16,-12,-8,-12,-2,-15,-9,4,-8,3,0,0,-5,-14,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-32,-25,8,-29,-25,20,-24,13,8,-22,-24,-21,-22,-16,-5,15,-3,3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-20,-12,-7,-22,15,-18,-22,-12,-20,-16,-6,-9,-10,-17,7,-5,-14,-14,-20,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-27,-26,-29,-22,17,-29,-10,13,-22,19,9,-24,-28,-18,-18,-23,-10,4,8,25,-21;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-16,-11,-11,-17,6,-16,-13,-14,-14,-11,0,-15,-11,-16,12,5,-6,-27,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-16,-30,-21,12,-25,-17,14,-25,33,21,-24,-27,-18,-18,-23,-7,7,-19,1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-28,2,-35,-26,38,-27,24,20,-24,-24,-21,-25,-20,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-13,-34,-25,10,-29,-23,22,-27,21,15,-22,-25,-21,-24,-20,-10,13,-18,0,-25;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-21,-13,-15,-20,35,-19,-26,-16,-22,-16,-3,-16,-16,-19,7,-9,-17,-21,-22,-15;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,-14,-16,-11,-21,12,-19,-16,-12,-15,-13,-6,-12,-11,-19,11,0,-6,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-21,-34,-26,11,-33,-24,29,-27,27,18,-25,-26,-23,-23,-21,-7,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-18,-29,64,-19,-38,-19,-29,-20,0,-19,-18,-19,3,-17,-28,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-18,-33,-26,29,-27,-22,15,-26,21,10,-25,-29,-29,-20,-19,-7,17,-13,6,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-33,-26,11,-24,-22,24,-26,15,10,-19,-24,-22,-24,-18,-9,14,-12,7,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-12,-2,-19,-22,-4,-22,25,-17,-7,-2,-19,7,57,-11,-10,-15,-20,-9,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-28,-17,-34,-25,23,-30,-22,18,-27,22,12,-23,-27,-25,-22,-20,-8,14,-13,5,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-17,-29,-22,27,-28,-17,5,-19,11,3,-19,-27,-24,-9,-16,-5,7,-8,12,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-12,-25,-13,-8,-3,-23,19,-9,-6,-3,0,-7,-23,-3,5,-11,-8,-9,-16,13,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-3,-11,-30,44,-15,-36,-9,-28,-18,3,-18,-10,-10,1,-15,-27,-22,-25,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-11,-25,-13,-7,0,-10,14,-14,-12,-11,-4,-5,-19,-7,-11,-6,-10,-13,-14,11,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-13,-29,-28,-2,-30,-29,27,-20,7,8,-29,-21,-28,-20,-10,-1,44,-30,-11,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-16,-29,-27,1,-24,-27,24,-21,11,9,-24,-27,-26,-19,-13,-4,33,-25,-8,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-29,64,18,-38,-11,-1,-38,-1,-29,-29,19,-10,-1,-10,1,-6,-28,-39,-19,9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-22,-33,-26,54,-21,-11,-1,-24,6,4,-18,-28,-29,-17,-17,-10,-3,7,29,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-23,-37,-28,23,-34,-26,29,-29,21,13,-23,-26,-27,-24,-20,-9,21,-13,7,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-14,13,-27,20,5,-23,-17,11,-21,-4,-16,-12,5,-15,6,-2,-3,-8,-19,-28,-4,4;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-33,-26,38,-30,-19,9,-25,14,5,-21,-27,-28,-19,-17,-3,8,-1,17,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-28,-1,-3,-13,-10,25,-20,-2,-18,-7,2,-19,2,-1,-7,-12,-20,-16,13,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-30,-30,-36,-28,34,-30,-17,7,-24,4,0,-25,-28,-25,-20,-25,-14,-1,38,31,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-9,-7,-14,-2,-6,-14,-3,-15,-6,-2,-19,1,-3,-6,-11,-14,-17,-5,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00669;
//
ID   GUANYLATE_KINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00856;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Guanylate kinase-like signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5235262; R2=0.0152796; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=366; N_SCORE=11.106; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-16,-21,-19,-10,-4,-22,-12,0,-9,11,4,-14,-21,-7,-3,-13,-7,-1,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-20,-26,-18,1,-26,-19,16,-21,24,13,-20,-24,-15,-18,-18,-7,10,-21,-4,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-10,-18,-12,-7,-8,-17,-13,-3,-10,5,2,-8,-19,-8,-6,-5,2,-2,-25,-9,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-18,0,10,-20,-18,-3,-21,5,-16,-10,-2,-14,5,2,-5,-8,-18,-21,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-24,-1,3,-15,-16,-4,-17,2,-14,-10,2,-11,1,5,-4,-6,-16,-22,-8,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-14,7,2,-9,-8,0,-11,-2,-7,-6,2,-9,-2,-3,-3,-3,-9,-16,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-2,-26,1,4,-19,-15,-5,-16,-7,-14,-11,-3,6,-1,-10,-2,-4,-17,-26,-11,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-20,6,6,-24,-12,1,-24,7,-21,-13,9,-13,6,7,0,-6,-21,-28,-13,5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-22,-32,-25,27,-31,-18,17,-26,21,11,-21,-27,-24,-20,-20,-7,10,-7,14,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-8,-23,-10,-2,-18,-7,-9,-18,0,-17,-9,-4,-15,4,-1,0,-5,-14,-13,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-20,-22,-18,13,-25,-12,5,-16,10,3,-17,-24,-17,-11,-12,-3,5,-12,12,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-11,-5,-4,-19,-7,-14,-15,-11,-23,-16,2,-3,-5,-13,25,15,-7,-35,-19,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-18,-33,-28,-2,-33,-28,34,-23,13,13,-24,-25,-23,-22,-13,-4,36,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-19,-3,1,-23,-7,-13,-20,-10,-29,-20,1,17,-3,-13,25,12,-15,-37,-22,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-11,-16,-15,-12,-3,-19,24,-10,-13,-7,1,-8,-21,-8,-12,-7,-9,-7,-18,11,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-28,-4,4,-23,-14,-11,-19,0,-21,-13,-6,18,2,-5,-1,-5,-19,-26,-18,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-32,-12,-1,-25,-19,-12,-16,3,-21,-8,-13,36,-1,-2,-9,-9,-19,-25,-19,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-30,3,9,-28,-10,-11,-23,0,-24,-17,-4,22,0,-7,-1,-7,-23,-29,-22,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-26,1,-3,-22,22,-5,-29,-9,-24,-16,5,-16,-6,-11,4,-8,-23,-23,-14,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,22,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,1,0,19,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-13,-21,-15,-4,-14,-24,-13,2,-1,-4,4,-10,-17,-1,1,-7,-3,5,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-28,31,22,-30,-13,13,-30,1,-26,-20,17,-4,7,-5,0,-9,-29,-35,-15,14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-20,-30,68,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-13,-24,-13,-3,-16,-25,-12,-2,5,-7,0,-12,-19,1,9,-9,-7,4,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-28,31,18,-30,-10,23,-32,-2,-25,-19,15,-12,6,-5,1,-10,-28,-35,-11,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-11,-26,-15,-14,18,-23,28,-11,-14,-8,-2,-4,-24,-10,-8,-12,-11,-14,-4,29,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-19,-29,-24,-2,-31,-23,26,-17,13,13,-22,-25,-20,-16,-15,-4,29,-25,-5,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-14,7,1,-19,-7,-10,-19,-6,-23,-17,9,-7,-2,-7,23,19,-11,-34,-16,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-6,3,-22,-19,-1,-19,14,-18,-8,-3,-8,5,19,-6,-7,-13,-25,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-26,16,31,-30,-13,-3,-27,6,-20,-17,2,-6,13,0,1,-7,-24,-28,-18,22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-25,11,33,-27,-17,-4,-24,7,-18,-15,0,-6,14,0,2,-3,-21,-28,-17,23;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28,65,-29,-17,4,-27,12,11,-20,-28,-33,-19,-20,-10,2,4,24,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-28,7,26,-25,-19,-2,-22,10,-16,-9,-1,-9,15,5,-3,-7,-21,-23,-13,20;
MA   /M: SY='K'; M=2,0,-20,-2,8,-25,-13,-5,-21,10,-20,-11,1,-12,9,7,2,-4,-17,-25,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-5,-21,-5,-7,-12,-19,-8,-5,-4,6,10,-9,-20,-4,-2,-15,-10,-7,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-23,-31,-22,-3,-34,-24,31,-20,14,14,-19,-22,-16,-18,-16,-8,23,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-25,9,12,-25,-10,-2,-25,8,-22,-14,3,-11,8,2,2,-6,-20,-25,-11,10;
MA   /M: SY='E'; M=7,4,-21,1,9,-25,-4,-4,-22,1,-20,-14,6,-11,6,-2,7,-3,-18,-27,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=-9,16,-27,15,0,-28,21,3,-33,-6,-29,-20,21,-17,-5,-8,2,-12,-30,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,8,18,-24,-10,-4,-26,10,-21,-14,2,-10,8,5,-1,-8,-22,-25,-14,12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-19,-35,-26,52,-29,-14,6,-26,17,10,-22,-29,-29,-18,-22,-10,2,2,25,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00670;
//
ID   PREPHENATE_DEHYDR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00857;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prephenate dehydratase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2867551; R2=0.0183760; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=457; N_SCORE=14.675; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-27,27,12,-31,3,-8,-30,-3,-25,-21,8,-11,-1,-9,3,-8,-23,-32,-20,5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-13,-26,-10,3,-14,-16,-16,-11,-12,-4,-8,-14,3,-8,-14,-8,-2,-12,-16,-13,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-21,-6,-6,-10,-14,-3,-16,-4,-17,-12,8,-3,-7,-3,4,9,-15,-26,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-2,-20,-4,-12,-13,-19,-16,6,-15,-2,-3,-3,-19,-13,-17,-4,-4,8,-30,-12,-14;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-15,-18,-12,-22,17,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=45,-12,-10,-21,-12,-18,-3,-21,-6,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,5,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-19,-32,-25,1,-30,-26,29,-25,23,14,-25,-25,-22,-23,-17,-6,26,-23,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-18,-15,-14,-23,25,-20,-22,-14,-18,-14,-5,-14,-14,-19,7,-3,-12,-21,-23,-14;
MA   /M: SY='S'; M=5,7,-19,1,-4,-22,7,-8,-22,-9,-28,-19,17,-4,-5,-11,18,4,-19,-34,-22,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-26,17,26,-29,-14,-5,-28,7,-26,-20,4,2,8,2,7,-3,-24,-32,-19,16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-20,-16,-10,-3,-21,-12,2,-9,2,7,-13,-19,-9,-6,-8,-3,5,-19,-2,-10;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-16,-15,-12,-23,21,-19,-20,-13,-18,-14,-5,-13,-12,-19,9,-4,-10,-22,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=32,-11,-14,-17,-13,-20,10,-20,-13,-13,-14,-11,-8,-14,-13,-19,10,-1,-2,-23,-21,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-27,6,27,-24,-19,-4,-25,17,-22,-14,0,-7,13,7,1,-3,-22,-24,-9,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-24,-17,-2,-27,1,12,-21,19,17,-15,-22,-11,-16,-15,-2,5,-23,2,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-30,6,0,-30,27,-4,-34,-10,-28,-19,6,-6,-5,-12,-1,-15,-30,-27,-23,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-27,12,24,-30,-16,-3,-28,19,-26,-15,6,-8,17,9,2,-6,-24,-28,-15,21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-22,-30,-24,1,-31,-23,25,-14,9,13,-20,-23,-18,-10,-15,-7,25,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-31,-23,7,-31,-23,24,-28,39,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-19,-6,1,-18,-13,-12,-12,2,-12,-6,-8,-13,-4,-8,-1,-5,-4,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-27,9,19,-25,-19,-5,-28,19,-21,-15,2,-10,9,23,-2,-1,-21,-26,-14,12;
MA   /M: SY='N'; M=-12,27,-14,21,6,-24,-10,0,-21,0,-25,-18,31,-17,-1,-5,2,-5,-23,-37,-19,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-24,-32,-22,-1,-35,-26,35,-25,20,15,-22,-22,-19,-24,-18,-8,26,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-3,-20,-6,14,-28,-10,-7,-17,0,-15,-9,-5,-8,16,-7,5,-5,-15,-22,-17,15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,55,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,32,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-24,-12,-3,-9,-24,-5,-4,0,-4,0,-12,-20,4,1,-8,-6,-3,-15,6,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-29,-6,7,-26,-12,-7,-26,16,-22,-13,-4,0,7,24,-5,-9,-21,-22,-16,4;
MA   /M: SY='B'; M=-10,19,-26,19,2,-29,8,-3,-27,-2,-26,-17,19,-16,2,-5,1,-9,-24,-31,-20,2;
MA   /M: SY='N'; M=2,30,-18,12,-2,-20,0,4,-18,-2,-26,-18,46,-18,-2,-4,10,0,-24,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-23,-15,-9,-3,-21,3,-9,-3,-11,-4,-3,-18,-5,6,-2,-2,-7,-22,0,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-31,-24,-34,-27,4,-32,-27,27,-26,21,12,-28,-27,-23,-23,-23,-10,23,-2,1,-26;
MA   /M: SY='L'; M=0,-28,-17,-31,-24,2,-28,-25,25,-25,26,14,-26,-26,-22,-22,-18,-6,25,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-32,-24,5,-30,-20,28,-25,32,25,-26,-26,-18,-20,-23,-8,21,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=11,-4,-21,-8,-7,-26,20,-12,-25,-7,-23,-14,3,-15,-2,-6,8,-6,-18,-24,-21,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-28,-6,2,-24,-17,0,-26,23,-24,-11,-2,-4,5,29,-5,-8,-19,-23,-11,1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-30,10,19,-31,-18,5,-28,17,-25,-13,4,-1,17,11,-4,-10,-27,-27,-13,17;
MA   /M: SY='P'; M=4,-5,-26,-1,12,-26,-15,-14,-18,2,-20,-15,-9,17,-2,-9,-2,-7,-15,-27,-21,4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-10,-21,-15,-10,-14,-21,-16,2,0,-5,0,-6,-18,-6,-2,-6,-1,5,-25,-10,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-4,-11,-5,-1,-1,-12,-8,-2,-3,-5,-4,-2,-11,-6,-4,-1,-1,3,-15,-5,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-14,-17,-13,-4,-19,-16,14,-10,5,5,-12,-14,-11,-11,-5,-2,14,-18,-5,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-10,-3,-2,-8,-4,-4,-10,-6,-15,-10,1,2,-2,-7,13,6,-8,-16,-4,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-14,3,11,-14,-1,-5,-14,2,-14,-10,0,2,2,-2,4,-2,-12,-15,-11,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-16,-10,-4,-2,-10,-10,-7,-8,-9,-7,-10,25,-9,-10,-5,-4,-10,-10,-8,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-10,1,-4,-2,-11,-9,-10,-7,-8,-8,1,-8,-7,-7,7,15,-4,-17,-4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,0,-27,4,-1,-25,18,-4,-28,-10,-19,-14,1,-16,-7,-11,0,-11,-22,-27,-18,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-22,-1,0,-23,-14,4,-15,-3,-16,-8,3,-7,7,-5,2,-4,-14,-29,-12,3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-26,19,1,-25,-19,-9,-11,0,-16,-11,6,-15,-2,-7,-5,-8,-8,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-4,-28,-4,1,-24,-16,-12,-22,9,-26,-15,0,21,-1,6,1,2,-20,-29,-19,-2;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-17,-11,-8,-13,-11,-14,-15,1,-14,-10,-4,-13,-7,-5,7,19,-7,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-22,2,7,-22,-15,-10,-21,14,-18,-11,0,-12,2,6,4,2,-14,-28,-13,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00671;
//
ID   PREPHENATE_DEHYDR_2_MP; MATRIX.
AC   MP00858;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prephenate dehydratase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4734612; R2=0.0159310; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; N_SCORE=15.930; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=65; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-16,-19,-17,-16,-7,-23,23,1,-14,-4,3,-12,-24,-11,-12,-9,-8,10,-23,8,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-12,9,-28,15,19,-28,-16,-3,-31,20,-25,-17,5,-11,9,22,0,-7,-23,-28,-15,13;
MA   /M: SY='A'; M=30,-17,-12,-24,-15,-10,-11,-21,2,-16,7,0,-17,-17,-15,-20,-2,-2,9,-21,-14,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-4,-20,-8,0,-12,-15,-6,-4,-10,1,4,0,-18,3,-8,0,-1,-9,-29,-11,1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-20,-17,-7,-14,-22,-22,4,-12,-6,-4,-21,5,-15,-17,-6,-4,13,-29,-17,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,59,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='R'; M=5,-6,-20,-10,-5,-15,-13,5,-19,3,-17,-9,-2,-15,0,8,4,2,-12,-20,-2,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-9,-31,-11,-1,-15,-19,-13,-13,1,-18,-10,-5,-16,2,-4,-8,-10,-17,15,-2,1;
MA   /M: SY='H'; M=-15,1,-27,-1,0,-20,-15,38,-28,7,-22,-9,12,-19,8,26,-2,-9,-24,-29,-1,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,14,-27,9,-5,-29,30,-5,-32,-9,-29,-19,21,-18,-4,-10,3,-12,-30,-29,-24,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,37,-29,28,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='B'; M=-12,26,-25,25,2,-24,-12,-4,-14,-7,-20,-16,23,-15,-4,-11,4,-4,-16,-36,-16,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,35,40,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-26,-37,-27,12,-36,-26,36,-30,28,18,-23,-24,-22,-26,-23,-10,21,-17,3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-17,-18,-14,-8,-20,-20,7,-18,-1,-1,-6,-15,-11,-17,10,16,6,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-2,-29,-4,1,-19,-19,9,-26,26,-22,-9,5,-18,7,36,-9,-10,-21,-18,0,1;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-21,-5,-6,-23,11,-15,-26,2,-25,-15,2,-13,-6,-3,12,8,-16,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-23,-7,-11,-19,4,-13,-15,2,-19,-9,4,-21,-10,3,-4,-8,-6,-26,-17,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-21,-26,-21,-11,1,-23,-19,-4,-12,5,-1,-20,9,-15,-14,-16,-9,-8,-18,-7,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-28,-42,-28,-26,-5,15,-26,-28,-20,-24,-20,-25,-26,-20,-20,-25,-26,-30,85,7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-25,12,25,-25,-19,8,-24,1,-18,-13,3,-7,13,-3,4,5,-22,-30,-11,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-11,-30,-9,3,13,-27,14,-9,-4,-6,-6,-14,-21,-1,-7,-14,-10,-16,13,51,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-24,-19,-29,-22,17,-26,-13,10,-13,13,20,-20,-26,-17,-4,-17,-8,12,-15,3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-26,-22,-19,30,-26,11,0,-18,-1,0,-7,-26,-17,-13,-15,-10,-7,1,34,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,38,-29,29,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-7,-36,-28,0,-36,-28,32,-29,20,14,-23,-26,-22,-27,-20,-9,23,-25,-5,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00671;
//
ID   GTP_CYCLOHYDROL_1_1_MP; MATRIX.
AC   MP00859;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GTP cyclohydrolase I signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6604404; R2=0.0132646; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=585; N_SCORE=12.410; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-19,18,-1,-19,-1,8,-19,-1,-29,-19,56,-19,-1,-1,11,4,-28,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-6,-26,-4,-8,-14,-25,-17,4,-9,0,0,-10,-9,-11,-13,-12,-7,2,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-26,-4,0,-22,-18,-14,-15,-7,-19,-13,-9,27,-7,-13,0,5,-14,-29,-19,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-24,-2,9,-15,-17,-6,-16,2,-12,-9,-4,-12,2,-1,-4,-6,-12,-23,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-24,-5,4,-12,-24,-13,2,-8,-2,-2,-7,-15,-5,-11,-7,-5,1,-27,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-21,-12,-7,-9,-21,-10,3,-12,3,1,-13,-20,-11,-14,-10,-7,6,-23,-5,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-4,-21,-11,-11,3,-14,-10,-3,-15,8,-1,3,-24,-13,-11,-11,-7,-8,-24,-6,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-25,3,3,-20,1,-7,-24,0,-22,-15,7,-12,-1,-3,3,-2,-21,-25,-14,1;
MA   /M: SY='A'; M=4,-4,-20,-8,-4,-19,-13,-9,-14,4,-14,-4,-3,-9,-2,1,3,3,-8,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-21,-15,-11,-13,-12,-17,-3,-5,-5,0,-9,-16,-10,-8,-4,3,2,-25,-11,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-21,-33,-23,56,-29,-19,4,-25,8,1,-18,-27,-32,-19,-18,-9,3,1,21,-24;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-21,9,17,-16,-12,-2,-18,0,-15,-13,0,-8,5,-5,2,-3,-16,-20,-6,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-22,17,25,-21,-14,-2,-18,1,-14,-13,1,-6,8,-4,0,-6,-16,-24,-11,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-19,7,3,-20,2,-5,-17,-6,-17,-12,5,-10,-4,-9,-1,-8,-13,-26,-16,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-15,-4,1,-6,-17,19,-17,-4,-13,-6,-1,-15,0,-1,-6,-8,-16,-15,9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-25,30,13,-29,-10,3,-28,0,-24,-19,18,-13,6,-1,4,-5,-25,-35,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-29,29,40,-33,-12,0,-31,6,-23,-21,8,-5,16,-2,1,-10,-30,-32,-20,28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-31,-21,5,-26,-12,21,-18,22,37,-22,-18,-11,-16,-20,-9,12,-19,0,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-29,-22,1,-29,-22,23,-22,24,15,-23,-25,-18,-17,-17,-4,20,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-16,-28,-22,0,-30,-26,26,-21,17,11,-26,-26,-23,-20,-14,-4,33,-26,-7,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-29,0,10,-26,-18,-4,-29,35,-25,-11,4,-13,12,37,-7,-9,-21,-22,-11,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-14,38,-27,46,15,-33,-4,1,-33,0,-29,-26,26,-12,1,-7,4,-7,-29,-38,-20,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-29,1,-39,-29,47,-29,21,21,-21,-21,-20,-29,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-24,8,10,-23,-9,-7,-22,-2,-20,-16,3,0,-1,-7,4,1,-18,-30,-17,4;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-20,-35,-26,37,-29,-19,14,-26,18,11,-23,-27,-28,-20,-20,-8,11,-6,14,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-12,-21,-16,-12,15,-24,4,-6,-12,-5,-4,-8,-22,-11,-9,-4,3,-7,-6,24,-13;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-11,-1,-1,-20,3,-11,-21,-11,-30,-20,9,-11,-1,-11,38,19,-11,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-19,-22,-16,2,-24,0,6,-17,13,18,-14,-21,-10,-13,-11,2,5,-23,1,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-31,18,57,-30,-20,-1,-29,9,-21,-20,-1,5,18,-1,-1,-10,-30,-30,-21,37;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-21,-32,-22,18,-28,-15,18,-24,33,27,-25,-27,-17,-18,-25,-10,9,-15,5,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-16,-29,-22,4,-28,-23,21,-25,30,15,-27,-27,-22,-20,-19,-4,22,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-35,-12,-3,-25,-21,-20,-14,-12,-22,-15,-18,67,-11,-19,-7,-3,-22,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,52,-33,-22,16,-29,13,8,-20,-27,-32,-23,-20,-10,10,0,20,-29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-8,-25,-13,-13,7,-25,-4,4,-15,0,1,-3,-22,-13,-11,-12,-8,-2,-16,8,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-20,-27,63,-19,-36,-20,-25,-16,-2,-20,-19,-20,-2,-19,-27,-20,-28,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-23,-8,-1,-20,-21,-10,-16,23,-18,-5,-4,-15,1,18,-5,1,-6,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='A'; M=24,-20,-9,-26,-20,-11,-16,-25,11,-16,1,1,-18,-19,-18,-21,-1,-2,20,-24,-14,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-19,-3,-3,-19,-17,55,-24,-11,-19,-5,5,-18,3,-6,-1,-8,-21,-28,7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-15,-16,-12,-23,18,-20,-18,-13,-16,-13,-6,-13,-12,-20,9,-4,-8,-21,-23,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-35,-26,4,-35,-24,36,-27,26,18,-24,-24,-20,-25,-21,-8,24,-19,2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-16,-11,-27,-18,-21,81,-11,-20,-10,-9,-24,-30,-29,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00672;
//
ID   GTP_CYCLOHYDROL_1_2_MP; MATRIX.
AC   MP00860;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GTP cyclohydrolase I signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9110808; R2=0.0145403; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=657; N_SCORE=14.454; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-17,-8,1,-24,-18,-10,-25,29,-23,-10,-3,-15,3,25,-8,-9,-16,-21,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,15,14,-26,-26,-26,-24,-15,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=1,-23,-18,-29,-22,3,-27,-24,21,-22,14,9,-19,-22,-20,-21,-10,0,20,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-24,16,-32,-22,24,-30,38,17,-27,-28,-23,-22,-26,-10,14,-17,3,-24;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-12,-1,-2,-21,8,-11,-22,-11,-30,-20,9,-11,-2,-11,35,15,-12,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-29,3,9,-30,-18,-9,-30,43,-28,-11,1,-10,8,27,-8,-9,-20,-21,-11,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-35,-26,7,-34,-25,33,-29,32,19,-25,-26,-21,-24,-24,-9,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-15,-16,-10,-17,-7,-17,-6,-11,-8,-8,-5,-6,-11,-18,4,-2,-2,-24,-18,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-16,-32,-26,-1,-33,-27,30,-25,17,13,-21,-23,-21,-24,-14,-1,26,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-11,-31,-28,-2,-29,-29,29,-21,10,10,-27,-27,-27,-22,-10,-2,42,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-14,28,-29,36,31,-33,-14,2,-32,6,-25,-22,15,-8,12,1,1,-9,-29,-34,-19,21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-20,-25,-21,7,-25,-17,15,-19,9,12,-17,-21,-17,-19,-10,-2,13,-17,3,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-23,-30,-25,43,-30,-6,6,-22,12,4,-22,-30,-25,-17,-21,-9,2,10,41,-25;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-28,-6,3,-23,-18,0,-26,27,-21,-9,0,-16,11,40,-6,-8,-19,-22,-9,4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-25,-31,-20,-10,-8,-25,-20,-2,-19,6,-2,-24,34,-16,-20,-19,-10,-12,-24,-15,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-33,-27,2,-34,-27,34,-26,22,15,-25,-25,-23,-24,-17,-4,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-28,-7,1,-21,-17,-1,-28,28,-22,-11,5,-18,8,55,-7,-9,-20,-22,-11,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,6,-29,-17,24,-26,39,29,-26,-26,-16,-19,-26,-10,13,-20,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-9,-10,-10,-19,-19,-9,-10,-11,-10,1,-12,-10,-10,19,44,1,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-22,-6,7,-20,-18,-10,-12,4,-12,-7,-3,-12,6,1,1,1,-9,-26,-13,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-28,4,27,-35,-20,5,-22,8,-19,-6,0,-7,43,5,2,-4,-27,-24,-13,35;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=41,-12,-12,-21,-11,-17,-4,-20,-7,-11,-3,-6,-12,-12,-11,-19,5,-1,1,-20,-17,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-27,28,21,-29,-14,-5,-24,3,-20,-18,7,-10,4,-5,-2,-8,-20,-32,-17,12;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-3,-18,-13,-11,-11,-17,-8,-13,-11,-9,-8,-15,-12,-17,10,8,1,-23,-10,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-36,-27,10,-34,-25,34,-27,24,19,-24,-25,-22,-24,-21,-9,24,-18,2,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-5,-25,-5,6,-19,-21,2,-5,-1,-4,13,-8,-15,21,-3,-8,-9,-10,-20,-3,13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-26,15,31,-27,-16,-4,-23,4,-19,-16,4,-7,12,-3,2,-3,-21,-30,-17,21;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-15,-20,-19,-15,-4,-19,-15,6,-14,4,2,-11,-20,-13,-14,-6,0,6,-20,-1,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-19,-29,-20,5,-28,-22,19,-26,35,15,-25,-26,-19,-20,-21,-3,13,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-7,10,-27,10,10,-29,4,-3,-29,7,-25,-15,10,-12,5,0,-1,-9,-25,-27,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=7,-15,-18,-14,-5,-25,-15,-20,-17,-11,-22,-16,-15,44,-11,-19,-1,-1,-18,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-7,1,-20,-20,1,-16,11,-8,-2,-3,-17,11,18,-10,-10,-16,-22,-7,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00672;
//
ID   GALANIN_MP; MATRIX.
AC   MP00861;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Galanin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3587151; R2=0.0124217; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=895; N_SCORE=15.466; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-12,-12,-7,-17,-3,-12,-10,-10,-15,-3,-2,-12,-4,-14,20,8,-3,-30,-17,-5;
MA   /M: SY='E'; M=13,2,-22,5,33,-26,-12,-8,-22,2,-16,-16,-4,-4,9,-8,4,-6,-19,-26,-20,21;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-23,-29,-20,-10,-7,-22,-20,-6,-17,-2,-6,-22,34,-16,-20,-14,-9,-13,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='G'; M=13,1,-23,1,-9,-28,32,-16,-30,-13,-23,-18,0,-15,-13,-18,3,-11,-20,-24,-25,-11;
MA   /M: SY='L'; M=0,-14,-15,-14,-10,-6,-14,-15,-1,-20,9,-1,-9,-20,-10,-15,6,6,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-15,-20,-21,-17,-17,14,-22,-15,-15,-15,-12,-13,-17,-16,-20,0,-9,-6,-2,-16,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-28,-11,-4,-20,-16,-15,-12,-12,-17,-7,-13,39,-7,-16,1,-2,-16,-31,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=31,-16,-10,-23,-16,-13,-11,-23,3,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-19,4,3,16,-24,-16,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,0,5,-25,-20,47,-30,19,-25,-5,5,-15,10,14,-10,-15,-25,-25,6,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,0,-30,4,29,-25,-20,0,-30,20,-20,-15,0,-10,15,36,-5,-10,-25,-25,-15,19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-6,-30,27,-15,-35,14,-30,-15,0,-15,-6,4,-5,-15,-25,-20,-20,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-16,-5,-10,-16,36,-10,-21,-10,-16,-10,0,-10,-10,-10,0,-10,-16,-10,-16,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-11,-23,-11,-11,-13,-24,53,-8,-14,-9,4,-4,-24,-4,-7,-10,-13,-1,-30,9,-11;
MA   /M: SY='A'; M=24,-17,-15,-23,-15,-10,-4,-20,-2,-18,10,0,-16,-18,-15,-20,-5,-5,1,-20,-14,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-19,-25,-23,-19,-7,-30,18,15,-20,5,10,-12,-23,-11,-16,-15,-11,12,-26,5,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-15,18,-29,30,5,-26,-10,-9,-23,-10,-10,-16,1,-4,-8,-14,-9,-11,-20,-32,-17,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-24,6,-2,-23,2,-4,-22,-6,-30,-20,26,8,-4,-8,10,0,-26,-36,-23,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-12,0,-25,0,2,-22,-15,63,-26,-8,-22,-5,9,-16,14,-1,3,-9,-25,-31,7,5;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-11,-1,-19,-20,-1,-24,28,-16,-1,-2,-19,9,55,-11,-10,-16,-20,-9,0;
MA   /M: SY='S'; M=17,-4,-12,-7,-6,-20,7,-15,-19,-11,-23,-17,3,-11,-6,-14,26,13,-9,-32,-20,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-7,-22,-11,-8,30,-23,-11,-8,-18,2,-6,-4,-23,-20,-14,-13,-9,-9,-11,8,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-23,4,4,-27,0,10,-23,-3,-26,-12,18,-14,17,-2,11,-2,-25,-31,-14,10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-30,47,13,-37,8,-5,-39,-4,-29,-27,14,-12,-3,-12,0,-12,-30,-34,-22,5;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-30,-4,2,-29,1,-11,-32,31,-29,-12,0,-14,3,23,-8,-12,-22,-20,-15,2;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-29,0,3,-21,-19,49,-28,13,-23,-5,9,-17,8,10,-9,-14,-25,-24,9,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-27,-10,-16,-26,48,-18,-35,-13,-26,-18,0,-19,-15,-8,1,-10,-25,-21,-25,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00673;
//
ID   OX2_COVAL_FAD_MP; MATRIX.
AC   MP00862;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Oxygen oxidoreductases covalent FAD-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2704887; R2=0.0175541; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=374; N_SCORE=12.826; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=14; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-15,-20,-19,-13,0,-23,-14,0,-3,0,2,-13,-20,-11,-3,-8,2,3,-16,3,-13;
MA   /M: SY='B'; M=2,11,-21,10,2,-26,3,-2,-26,-2,-25,-17,11,-13,-2,-7,9,-1,-20,-31,-18,0;
MA   /M: SY='A'; M=2,-6,-18,-9,-11,-5,-15,-5,-3,-12,-8,-4,-4,-18,-10,-14,2,1,1,-22,0,-12;
MA   /M: SY='V'; M=11,-16,-17,-20,-12,-16,-20,-18,7,-8,-3,2,-15,-18,-2,-12,-3,-4,13,-23,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=0,-7,-19,-14,-11,6,-8,3,-16,-11,-13,-9,2,-19,-11,-5,1,-4,-13,-19,-1,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-3,-24,-4,4,-22,-16,-3,-18,5,-16,-9,0,-2,8,4,1,0,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='B'; M=-11,20,-24,19,-1,-21,-6,-6,-17,-9,-15,-14,17,-17,-7,-11,0,0,-17,-33,-16,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-35,-34,-39,-29,40,-25,-25,-8,-25,-1,-8,-30,-30,-29,-20,-30,-19,-13,74,27,-24;
MA   /M: SY='G'; M=20,0,-20,-5,-8,-26,21,-14,-23,-10,-20,-15,2,-14,-7,-16,5,-8,-16,-23,-23,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-8,6,-26,0,-5,-23,11,0,-27,5,-25,-12,16,-18,-3,7,-1,-8,-24,-27,-16,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-14,-11,-20,-15,-11,-23,-20,2,-12,-4,-3,-10,-12,-12,-7,0,10,4,-27,-11,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-21,-20,-16,15,-24,2,-2,-15,0,-2,-12,-22,-13,-13,-6,4,-4,-4,27,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-9,-22,-10,-3,-13,-10,-8,-11,-10,-10,-7,-5,-10,-4,-10,3,1,-8,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='C'; M=6,-11,20,-16,-9,-18,-16,-18,-13,-15,-13,-11,-8,-20,-8,-17,7,1,-5,-34,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-20,-8,3,-16,-21,-10,-21,16,-15,-9,-6,-10,1,19,-8,-6,-16,-23,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=3,-4,-22,-2,13,-23,-9,-8,-18,-4,-14,-12,-4,-4,7,-7,7,-2,-16,-28,-17,10;
MA   /M: SY='A'; M=11,-20,-18,-25,-17,0,-13,-15,1,-16,8,4,-18,-21,-15,-15,-10,-7,3,-10,0,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-30,-27,9,-33,-14,27,-20,10,10,-24,-27,-20,-20,-16,-6,25,-8,21,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-28,-20,-33,-26,25,-29,-21,17,-25,18,9,-23,-27,-26,-21,-18,-7,16,-10,11,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-8,-20,-8,7,-21,-23,10,-12,-1,-9,2,-7,-16,20,2,-8,-11,-15,-22,-3,12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-25,-12,-3,-28,-19,-21,-20,-11,-27,-19,-19,71,-11,-21,-8,-9,-26,-31,-29,-11;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-19,-7,-3,-18,-3,-11,-20,-2,-16,-12,1,-15,-3,7,10,7,-12,-28,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=5,6,-12,6,0,-20,-4,-10,-20,-9,-27,-19,12,-10,-1,-10,32,21,-11,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-16,-18,-11,-10,-24,-22,9,-7,-2,0,-17,-19,-15,-12,-4,2,20,-27,-12,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-26,13,22,-24,-3,-6,-28,-2,-21,-17,1,-9,7,-8,2,-9,-24,-26,-17,15;
MA   /M: SY='E'; M=-14,26,-30,40,44,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='S'; M=8,-9,-17,-12,-5,-19,-13,-11,-11,-1,-14,-7,-5,-15,3,4,9,4,-2,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-24,7,21,-27,-13,-4,-25,10,-22,-15,4,-8,11,6,5,-4,-21,-28,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=3,-21,-16,-25,-19,-2,-23,-21,14,-21,17,10,-19,-21,-16,-19,-8,2,14,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-17,-32,-26,3,-31,-25,29,-24,24,18,-28,-28,-24,-21,-18,-5,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-27,-2,6,-25,-17,1,-27,24,-22,-11,1,-14,10,34,-4,-8,-19,-23,-11,6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-5,-20,-14,-2,-23,-3,-3,-17,9,2,-16,-24,-8,-15,-12,-5,-4,-16,8,-12;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-6,-21,-13,-17,-8,-21,-4,-13,-8,-7,-10,-13,-12,-21,8,2,3,-23,-18,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-9,-12,-15,-9,-10,-17,-9,-15,2,-11,-8,-2,-20,-5,15,-5,-4,-10,-21,-7,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,6,10,-24,-7,-1,-20,-1,-14,-10,2,-13,6,-2,-3,-9,-19,-27,-14,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,2,-23,-1,5,-26,-3,1,-23,2,-23,-12,8,-13,14,5,8,-2,-21,-27,-15,9;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-1,7,-23,1,-2,-24,9,-8,-25,0,-27,-17,16,-10,-3,-1,9,-1,-22,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-18,-29,-19,-10,4,-24,-13,-13,8,-4,-3,-14,-22,-8,12,-19,-12,-12,6,7,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-5,-22,-6,2,-20,-18,-13,-19,1,-20,-13,-3,9,1,3,8,16,-14,-29,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,20,16,-26,-26,-24,-24,-17,-6,36,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-18,-14,-9,-18,-5,-15,-12,1,-13,-4,-7,-15,-6,0,3,0,-2,-24,-15,-8;
MA   /M: SY='V'; M=9,-18,-12,-23,-20,-2,-21,-24,9,-17,5,1,-18,-21,-20,-17,-1,11,20,-25,-9,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-17,-21,-19,-13,-11,-24,-11,-3,7,-5,3,-12,-23,-6,27,-9,-4,8,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-24,-9,-15,-27,51,-18,-34,-17,-28,-19,1,-17,-15,-18,8,-11,-24,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-9,-7,-8,-23,10,4,-28,-12,-25,-14,2,-18,-4,-8,9,-1,-20,-31,-15,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-13,1,-2,-21,6,-9,-22,-10,-30,-20,13,-12,-2,-10,34,15,-13,-38,-21,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-20,-33,-15,-8,-14,-24,-10,-8,-14,-10,-8,-19,40,-11,-18,-13,-7,-17,-21,-8,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,5,-18,3,6,-18,-7,-1,-18,-3,-23,-13,13,-13,6,-2,19,6,-17,-31,-12,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,14,-27,20,-4,-30,32,-10,-35,-10,-27,-22,11,-15,-10,-14,1,-14,-27,-26,-23,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-25,-21,-10,-9,-27,-7,12,-11,9,18,-16,-20,9,-10,-14,-9,3,-17,2,-2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,13,-16,-12,-19,-8,-20,-16,-14,-16,-14,-6,-15,-12,-18,14,9,-4,-31,-20,-12;
MA   /M: SY='C'; M=2,-16,10,-21,-17,-4,-20,-14,-6,-16,-4,-1,-14,-23,-12,-16,-2,0,0,-22,-3,-14;
MA   /M: SY='T'; M=11,3,-13,-4,-7,-16,-13,-16,-12,-9,-12,-12,2,-12,-9,-12,13,25,-3,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-25,32,9,-31,-6,0,-31,0,-27,-22,10,-6,-1,-7,6,-3,-23,-34,-17,3;
MA   /M: SY='G'; M=-3,8,-27,12,7,-30,15,-8,-32,-4,-25,-19,6,-13,1,-6,3,-10,-26,-27,-22,4;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-18,-30,-21,-22,-1,10,-20,-18,-18,-16,-13,-13,-24,-20,-17,-11,-10,-15,25,1,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-27,-21,-2,-23,-20,17,-22,19,17,-25,-14,-19,-19,-19,-8,16,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-3,-33,-29,8,-31,-27,23,-23,9,11,-26,-29,-28,-22,-13,-4,33,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,0,-19,-8,-13,-9,-18,1,2,-11,-3,-1,9,-24,-11,-7,-6,-5,2,-31,-8,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00674;
//
ID   CALSEQUESTRIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00863;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calsequestrin signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3564816; R2=0.0128405; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1071; N_SCORE=18.099; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-18,-22,-21,-15,12,-22,12,-3,-18,7,3,-15,-24,-13,-14,-14,-10,-6,-7,21,-15;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-17,-28,-19,2,-24,-21,15,-24,32,12,-26,-26,-19,-20,-19,-7,13,-21,-6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,11,-32,-28,-4,-30,-23,19,-22,8,17,-24,-28,-21,-22,-14,-6,25,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=4,-26,-16,-28,-20,2,-24,-22,16,-24,30,12,-26,-26,-20,-20,-18,-6,17,-22,-6,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,55,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-14,-21,-17,-1,-24,-21,10,-20,16,5,-17,-22,-17,-16,-4,11,14,-27,-7,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-30,-16,-10,-3,-20,-4,-10,-10,-13,-10,-18,20,-10,-16,-10,-8,-15,-3,17,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-5,-24,-10,-5,-11,-20,-6,-6,-1,6,2,0,-22,2,6,-13,-8,-11,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-18,-23,-15,3,-23,-18,10,-25,31,10,-20,-25,-15,-18,-13,-3,5,-25,-5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=12,-8,-22,-10,-14,-26,41,-18,-30,-16,-26,-18,0,-16,-14,-18,11,-7,-20,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-18,-20,-16,-8,-22,-22,8,-18,3,0,-20,-1,-18,-18,-5,0,13,-30,-14,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-30,-6,1,-27,0,11,-30,9,-22,-8,1,-18,16,26,-5,-14,-26,-21,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,47,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,33,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,49,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,8,31,-22,-20,-8,-22,2,-16,-16,0,-4,8,-4,8,15,-18,-30,-16,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-9,-22,-7,5,-19,-24,-15,-7,15,-13,-5,-11,-15,-3,5,-8,-6,4,-26,-12,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,15,-18,8,0,-20,-4,21,-22,-6,-28,-16,29,-16,2,-4,18,4,-22,-38,-12,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,30,-26,29,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='N'; M=1,15,-14,6,-2,-18,-4,-4,-18,-6,-26,-18,27,-14,-2,-6,25,18,-16,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=13,-6,-20,-6,17,-18,-15,-12,-12,-6,-2,-8,-10,-10,0,-12,-2,-6,-10,-24,-16,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-26,-22,35,-30,4,4,-18,13,4,-22,-30,-18,-14,-22,-10,-4,15,53,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=3,13,-22,3,6,-28,-8,4,-18,2,-22,-10,21,-14,23,0,6,-4,-24,-28,-16,14;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-12,-28,-24,-4,-22,-21,19,-16,8,17,-24,-24,-19,-18,-8,-2,31,-26,-10,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,37,-30,-20,12,-30,35,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-9,11,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00675;
//
ID   CALSEQUESTRIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00864;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calsequestrin signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6220400; R2=0.0049831; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2005; N_SCORE=13.613; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=578; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-27,-11,31,-17,20,45,-20,-20,-7,-17,-20,-10,17,-20,0,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,24,-34,40,13,-36,-14,-7,-33,-4,-30,-26,5,27,-4,-14,-4,-10,-30,-36,-24,3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-10,-23,-16,-14,-10,-23,3,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,16,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-23,13,38,-26,-13,-4,-26,3,-24,-20,4,-4,13,-4,15,1,-23,-34,-20,25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,41,-30,-20,-4,-30,25,-24,-16,0,-4,16,11,-4,-10,-26,-26,-16,29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-9,31,-23,44,13,-33,-6,-4,-33,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,15,1,-23,-40,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,43,9,-29,-5,5,-29,0,-30,-25,42,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00675;
//
ID   UBIQUITIN_ACTIVAT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00865;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin-activating enzyme active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4465218; R2=0.0126449; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=692; N_SCORE=13.187; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-23,-15,-12,-10,-20,-22,-14,-12,-16,-14,-11,5,-12,-14,3,24,-11,3,-6,-12;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-26,12,47,-28,-16,-4,-26,6,-18,-18,-2,-2,14,-4,2,-8,-24,-28,-20,31;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-7,58,-14,-16,-18,-16,-17,-23,-18,-21,-18,-2,-25,-16,-18,7,0,-11,-40,-23,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-20,-22,-25,-20,23,-25,-4,8,-16,4,3,-16,-22,-16,-16,-14,-8,2,7,34,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=1,9,-21,14,22,-25,-2,-6,-25,-1,-20,-18,3,-6,4,-7,7,-4,-20,-27,-19,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=6,-15,73,-23,-21,-20,-19,-25,-24,-23,-19,-18,-13,-29,-21,-25,2,-3,-8,-42,-26,-21;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-12,-4,-2,-18,-9,-12,-16,-8,-22,-15,6,-10,1,-8,30,29,-8,-35,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-16,-28,-16,-2,-12,-27,-13,1,-3,5,3,-14,-10,-1,2,-15,-10,-5,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-30,47,18,-32,-14,0,-34,8,-27,-23,12,-11,3,-2,-3,-10,-27,-30,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-33,-8,4,-27,-18,-18,-19,-8,-25,-18,-15,61,-7,-17,-4,-4,-24,-29,-26,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-31,-9,-2,-25,-18,-19,-18,-10,-27,-18,-13,61,-9,-17,1,4,-23,-31,-25,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-27,4,24,-31,-18,2,-21,10,-19,-7,-2,3,33,5,-2,-9,-26,-21,-13,28; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-11,-23,-12,-4,-17,-23,-13,-1,13,-10,1,-9,-14,2,5,-9,-7,3,-19,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,8,-14,1,0,-17,-9,-6,-15,0,-20,-12,14,-11,3,-2,16,17,-12,-29,-13,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-22,-32,-26,37,-29,-13,10,-22,7,3,-20,-27,-26,-19,-16,-8,8,3,29,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-20,-30,-24,0,-21,-18,22,-21,22,27,-23,-25,-16,-19,-19,-9,19,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,27,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=14,-8,-21,-13,-4,-21,-11,-1,-21,9,-16,-9,-4,-15,1,18,-1,-6,-12,-21,-12,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-19,7,2,-15,-7,9,-19,-4,-25,-16,25,-16,1,-5,15,4,-21,-30,-5,1;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-8,-16,-19,-17,22,-21,-15,-5,-16,-3,-2,-2,-19,-19,-12,1,17,-3,-16,4,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-23,-2,0,-20,-11,8,-26,10,-24,-13,13,-17,6,30,8,-1,-19,-30,-12,0;
MA   /M: M=-4,-4,-4,-9,-4,-14,-19,-11,-10,-8,-2,-5,-1,-20,-3,-9,-5,0,-10,-29,-13,-3;
MA   /M: SY='P'; M=2,-22,-30,-23,-13,-17,-23,-24,7,-17,-8,-4,-18,30,-14,-24,-10,-8,-2,-24,-17,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-28,15,33,-26,-20,-7,-17,0,-14,-14,-1,-6,8,-8,-3,-9,-17,-29,-17,19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,69,-25,-25,-15,-27,-27,-17,-23,-14,-14,-16,-31,-25,-23,-2,7,0,-42,-22,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-34,-27,3,-34,-27,36,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-23,2,25,-24,-20,-6,-15,2,-13,-9,-6,-9,14,-4,1,-2,-12,-27,-15,20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-32,-42,-32,-26,18,-24,-10,-12,-16,-12,-12,-32,-30,-16,-16,-32,-22,-22,103,50,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-11,-24,-16,-14,-10,-23,4,-14,-3,-3,-16,-16,-16,-21,3,-1,14,-22,-16,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-28,-5,2,-20,-18,5,-26,26,-23,-10,0,-16,7,35,-5,-7,-19,-19,-2,2;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-4,-20,-7,-9,-8,-18,4,-4,-13,-3,1,-1,-19,-7,-11,-1,2,-4,-26,0,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-25,-19,-1,2,-30,-17,12,-18,16,6,-18,-19,-11,-17,-17,-9,5,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-19,-23,-23,-9,25,-27,-12,-2,-16,7,3,-16,-23,-7,-11,-15,-9,-5,-8,8,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00463;
//
ID   CPSASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00866;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Carbamoyl-phosphate synthase subdomain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9111261; R2=0.0173716; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=459; N_SCORE=13.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=34; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=10,-20,-13,-24,-19,-8,-18,-24,12,-19,6,3,-19,-20,-19,-21,-7,-4,19,-25,-12,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-23,1,10,-19,-16,-4,-21,6,-18,-12,5,-12,6,8,4,5,-17,-23,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=-3,18,-17,19,4,-23,-7,-6,-24,-5,-26,-20,17,-12,-1,-7,20,13,-17,-37,-18,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-21,-20,-12,-5,-25,-19,11,-13,8,5,-19,-15,-14,-14,-12,-5,12,-23,-6,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,20,-28,29,39,-31,-15,-1,-30,5,-23,-21,8,-5,13,-4,3,-7,-28,-33,-20,26;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-28,17,41,-29,-16,0,-28,8,-21,-17,2,-4,16,-1,2,-7,-26,-30,-18,28;
MA   /M: SY='A'; M=27,-13,-14,-19,-14,-15,1,-19,-5,-14,-5,-4,-11,-16,-14,-18,3,-2,3,-23,-17,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-22,-20,-11,-6,-26,-17,4,-1,7,4,-16,-21,-10,0,-15,-6,7,-20,-4,-12;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-23,1,17,-25,-15,-3,-21,9,-17,-11,-2,-9,10,3,2,-4,-17,-26,-14,13;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-20,-21,-26,-16,18,-25,-20,4,-14,5,1,-16,-22,-20,-14,-13,-7,6,-10,3,-17;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,0,-22,-14,-17,-5,-22,-7,-14,-8,-8,-13,-15,-14,-21,5,0,4,-24,-19,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-27,13,22,-29,-15,-2,-28,16,-24,-16,4,-7,12,9,0,-6,-23,-28,-15,17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-25,7,21,-25,-16,-6,-24,13,-20,-14,2,-9,8,9,1,-3,-19,-27,-15,14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-25,-33,-27,3,-35,-20,35,-25,15,14,-20,-24,-20,-24,-17,-8,26,-19,5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-14,-30,62,-18,-39,-18,-29,-20,1,-19,-17,-19,0,-19,-30,-21,-29,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-25,-23,40,-30,10,1,-15,3,0,-20,-30,-17,-13,-20,-10,-6,23,66,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,0,-32,-29,-1,-32,-29,26,-24,13,10,-27,-29,-27,-23,-15,-4,34,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-32,-24,3,-30,-21,28,-24,28,24,-24,-24,-17,-21,-21,-8,20,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,53,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='P'; M=11,-16,-29,-13,-3,-26,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-16,53,-10,-20,-2,-6,-19,-27,-26,-10;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-5,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-24,-17,5,-10,-3,-12,32,19,-7,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-17,-25,-20,-14,21,-18,5,-7,-14,-3,-4,-15,-24,-14,-13,-13,-9,-9,8,37,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-18,-19,-19,-24,-14,14,-25,-4,-19,-9,-5,-14,-24,-24,-19,-3,-4,10,-26,-19,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-25,-22,-21,-8,12,-21,-3,-26,13,3,-16,-25,-20,-21,-16,-14,-6,-20,-13,-21;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,57,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-21,-12,-4,-19,-19,-10,-15,13,-15,-5,-4,-14,3,21,-3,0,-9,-23,-11,-2;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-22,-14,-16,-26,43,-20,-29,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-21,-29,-20,-2,-16,-5,18,-13,16,47,-18,-20,-4,-13,-17,-10,9,-21,-3,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-26,-2,7,-20,-11,-3,-24,12,-21,-12,6,-15,10,23,-1,-7,-21,-24,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-21,-31,-25,-3,-33,-26,31,-19,13,12,-22,-23,-20,-19,-14,-5,30,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-11,-27,-23,-6,-21,-27,18,-17,4,4,-23,-23,-23,-20,-4,0,32,-26,-13,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-3,-29,-3,-3,-5,-21,22,-20,0,-15,-8,-1,-21,3,9,-10,-10,-20,-5,21,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,20,-18,18,5,-23,-3,-2,-24,-5,-28,-21,24,-13,0,-7,19,9,-20,-38,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-27,15,23,-29,-13,-6,-25,2,-20,-16,0,1,8,-5,0,-7,-22,-30,-19,15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-25,14,25,-27,-10,-3,-26,3,-19,-17,3,-8,8,-4,2,-6,-22,-28,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-29,30,38,-33,-14,-1,-31,7,-23,-21,6,-5,14,-1,0,-9,-28,-31,-19,26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-23,19,-30,-20,19,-28,37,18,-27,-28,-22,-20,-26,-9,11,-15,5,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-25,-5,10,-21,-20,-11,-11,5,-13,-7,-6,-7,4,2,-3,-5,-9,-25,-13,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-26,12,16,-26,-14,0,-25,9,-22,-15,5,-9,7,6,0,-5,-21,-27,-13,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-20,-21,-23,-18,14,-20,-10,3,-16,4,0,-16,-23,-17,-15,-9,-5,2,-6,17,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-18,-33,-25,27,-30,-17,16,-25,22,14,-23,-27,-23,-20,-21,-8,10,-9,13,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00676;
//
ID   CPSASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00867;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Carbamoyl-phosphate synthase subdomain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.3721889; R2=0.0079869; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1098; N_SCORE=8.395; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=861; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-76,-62,-74,-81,97,-69,-24,-68,-82,-72,21,-4,-66,-75,-50,-65,-78,-75,-77;
MA   /M: SY='P'; M=38,-73,-73,-64,-60,-68,-69,-49,-68,49,10,-72,79,-65,-72,-20,-57,-20,-76,-66;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,4,-74,-74,52,55,-68,8,-71,13,52,-62,-73,-69,-73,-5,-21,-53,-66,-52;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-66,-42,-57,-73,-56,5,-29,-51,-74,-65,106,-68,-8,-59,-42,64,-66,-92,-68;
MA   /M: SY='V'; M=-30,-70,-81,-77,6,-82,-78,62,-74,-8,41,-20,-76,-73,-76,-67,-19,70,-77,-56;
MA   /M: SY='Q'; M=-60,-84,-14,65,-87,-70,-50,-78,-41,-73,-63,-52,-16,112,-44,-51,-61,-77,-75,-65;
MA   /M: SY='F'; M=-73,-72,-28,-80,109,-83,-65,8,-77,-1,1,-75,-84,-82,-74,-73,-66,-50,-44,33;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='A'; M=54,-69,-78,-71,-58,-70,-75,47,-30,27,-44,-72,-74,-67,-26,-59,-57,34,-77,-63; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-72,-79,-73,-47,-79,-69,20,-10,-3,2,-75,-20,-69,-69,-66,-57,69,24,60; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-96,45,-7,-100,-85,-77,-40,-10,-94,-88,-19,-86,34,-27,3,8,-89,-106,-88; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-43,-101,-3,16,-98,-42,-4,-98,46,-99,-91,-22,-89,-15,-66,-35,-82,-44,-100,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-81,64,9,-87,18,-61,-86,6,-85,-6,46,-73,-12,-63,15,-23,-83,-94,-77; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-58,-77,41,18,-83,55,-60,-81,-7,-82,-74,52,5,-11,-63,-6,-22,-38,-85,-75; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-62,0,52,67,-78,-15,-58,2,-4,-71,-68,6,-65,-8,12,-56,11,-33,-85,-70; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-65,-74,-81,-76,59,-83,-2,27,-75,23,-45,-77,39,-75,-76,-71,-61,46,-63,29; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-80,-70,-68,32,-78,-45,-57,31,-55,-53,-69,-81,-60,-20,-66,-65,-13,-37,117; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-61,-70,-85,-80,67,-85,-78,45,-77,0,3,-78,-80,-79,-77,-70,-57,70,-66,-44;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-75,-86,-81,-46,-88,-77,90,-78,44,41,-78,-76,-72,-79,-75,-60,-25,-73,-55;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='M'; M=28,72,-80,-73,-57,-74,-72,-14,-71,6,77,-72,-77,-70,-73,-62,-55,62,-82,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-77,-69,-62,-68,-71,-71,6,-65,15,-55,-68,99,-67,-74,-58,42,-10,-79,-71;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='A'; M=62,3,-73,-67,-60,-63,-72,18,-68,27,-48,-66,-72,-64,-71,16,-19,28,-77,-64;
MA   /M: SY='S'; M=2,-68,-56,-49,-78,-53,-56,-74,-52,-75,-66,-47,-64,76,-55,91,-42,-68,-79,-65;
MA   /M: SY='R'; M=-61,-78,-67,-24,-69,-16,-60,-55,-35,-63,-58,-61,-75,-48,99,-62,-61,48,-79,-63;
MA   /M: SY='T'; M=-50,-68,-47,61,-74,-30,-60,-71,-52,-72,-67,-12,-60,-48,-60,61,71,-63,-84,-68;
MA   /M: SY='H'; M=-32,-71,-71,-68,43,-75,93,-17,-68,-46,58,-62,-19,-64,-66,-9,-57,59,-77,-45;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-87,-23,-57,-83,-68,-71,-32,-64,-80,-69,-70,118,-67,-75,-60,11,-73,-81,-81; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-73,-86,-80,100,-84,-73,18,-78,-2,-47,-77,3,-83,-77,-72,-24,27,-53,-32; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-12,-65,-70,-68,-59,-73,-74,1,-66,-15,-48,-62,-70,-15,-70,16,61,71,-85,-63;
MA   /M: SY='S'; M=-24,-68,-48,57,-75,-56,-57,-73,-52,-42,-4,-12,-62,-45,-59,89,-43,-67,-81,-67;
MA   /M: SY='K'; M=-62,1,-59,-2,-70,-72,-59,-62,94,-36,71,-54,-65,-44,-33,-60,-58,-13,-74,-62;
MA   /M: SY='A'; M=57,2,-72,-67,-63,-65,-74,51,-66,-51,-50,-64,-69,-14,-71,-5,30,34,-79,-65;
MA   /M: SY='T'; M=-56,-65,-65,-64,-60,-73,-2,-20,-26,22,1,-56,-66,-62,-3,-20,89,21,-83,-61;
MA   /M: SY='G'; M=1,-75,-21,-29,-82,95,-69,-87,-67,-84,-74,-13,-68,-64,-74,-21,-65,-80,-75,-77;
MA   /M: SY='V'; M=-31,-70,-76,-29,18,-81,22,40,-30,-2,-43,-71,-75,-16,-70,-64,-2,72,-75,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-80,74,-18,-84,-30,-56,-79,-56,-84,-75,62,85,-57,-65,-24,-55,-80,-90,-75;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00676;
//
ID   CYS_MET_METAB_PP_MP; MATRIX.
AC   MP00868;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cys/Met metabolism enzymes pyridoxal-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7836952; R2=0.0162502; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=273; N_SCORE=10.210; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=45; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-8,-9,-2,-6,-21,-17,-13,-10,-11,-11,-2,-12,-9,-10,13,32,-5,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-26,-27,-32,-25,32,-17,-22,-7,-23,-2,-6,-21,-26,-26,-19,-18,-7,-9,34,18,-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-16,-5,-24,-17,-12,-8,-18,0,-16,0,5,-15,-18,-13,-19,-2,-4,5,-24,-15,-15;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-15,-8,-9,-20,9,-17,-20,-12,-22,-16,1,-9,-9,-14,20,17,-11,-30,-20,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-35,-8,-8,-29,17,-18,-28,-13,-30,-20,-7,40,-13,-19,-5,-13,-30,-27,-29,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-24,-22,-26,-21,18,-27,-9,7,-18,10,3,-23,-19,-20,-17,-17,-7,6,-3,24,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-16,-28,-23,17,-24,-20,12,-25,19,8,-17,-28,-24,-20,-18,-8,9,-17,1,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-9,-10,-3,-7,-19,-2,-14,-7,-15,-6,1,-20,12,-5,-1,-5,-17,-20,-2,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-27,0,1,-21,-19,-2,-17,14,-18,-8,6,-17,9,23,-6,-8,-15,-23,-8,3;
MA   /M: SY='P'; M=6,-10,-30,-5,2,-28,-14,-17,-19,-8,-24,-18,-13,49,-7,-18,-3,-7,-22,-28,-26,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-30,-22,6,-30,-17,21,-27,34,16,-27,-28,-20,-20,-25,-10,14,-15,1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=1,0,-22,1,10,-19,-16,-9,-14,0,-7,-8,-2,-13,2,-4,-2,-3,-12,-26,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-24,-24,-16,11,-27,-2,4,-24,22,8,-21,-13,-17,-17,-23,-11,-3,-16,7,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-29,-5,-17,-24,50,-15,-33,-18,-23,-17,-2,-21,-18,-18,-3,-18,-26,-18,-19,-18;
MA   /M: SY='A'; M=35,-14,-6,-24,-15,-16,-9,-22,-1,-15,-5,-5,-12,-13,-13,-22,4,-1,5,-22,-17,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,20,-40,-11,1,-39,1,-29,-28,19,-10,3,-9,0,-10,-30,-39,-19,12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-29,6,-35,-27,37,-26,18,15,-24,-25,-24,-25,-17,-7,32,-20,1,-29;
MA   /M: SY='V'; M=3,-21,-7,-21,-21,-6,-21,-24,14,-17,-3,0,-18,-24,-21,-17,5,6,31,-33,-13,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-7,-30,-26,0,-30,-23,23,-22,12,12,-24,-26,-22,-21,-13,-3,27,-24,-3,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-3,-23,-3,5,-19,-18,42,-20,-7,-17,-5,2,-16,11,-4,-1,-10,-21,-26,6,5;
MA   /M: SY='S'; M=19,-1,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,7,-10,-2,-12,32,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-13,-15,-19,-15,-18,16,-20,-14,-17,-8,-9,-10,-17,-15,-20,1,-7,-8,-21,-20,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-31,-24,-21,23,-30,7,4,-13,0,1,-21,-28,-10,-13,-21,-12,-7,30,59,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-35,-25,18,-33,-23,26,-29,30,18,-25,-27,-23,-23,-24,-9,17,-15,5,-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,1,-20,-3,-11,-21,19,-14,-20,-13,-22,-15,9,-17,-12,-14,9,-2,-13,-29,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,7,-30,9,4,-24,-19,83,-31,-8,-21,-4,11,-18,11,-1,-8,-18,-30,-31,13,3;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-16,-1,-4,-22,13,-4,-25,-11,-29,-19,11,-13,-4,-11,27,8,-17,-35,-20,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-27,53,14,-34,-10,0,-34,0,-28,-26,23,-12,0,-5,3,-4,-27,-38,-19,7;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-14,-27,-24,-2,-22,-26,18,-21,13,8,-23,-25,-23,-20,-10,1,27,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-19,-31,-23,2,-28,-16,26,-20,25,32,-24,-24,-14,-18,-19,-6,21,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=11,-17,-20,-22,-18,-13,6,-20,-1,-19,-1,1,-13,-19,-16,-20,-4,-8,1,-22,-15,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-10,-23,-19,-3,-22,-21,10,-19,7,3,-17,-22,-18,-18,-3,5,17,-25,-6,-19;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,-16,-29,-23,-2,-26,-24,22,-21,16,13,-23,-24,-20,-21,-12,-2,26,-24,-7,-23;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,-8,-25,-22,-7,-22,-26,15,-18,1,2,-19,-22,-21,-20,-1,3,28,-29,-12,-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-11,-10,-13,-15,-3,-19,-10,-15,-7,-8,-8,-18,-14,-17,4,6,-1,-28,-16,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-8,21,-22,11,3,-23,-7,1,-24,12,-29,-17,33,-16,3,11,8,0,-24,-34,-17,2;
MA   /M: SY='D'; M=-2,6,-20,8,2,-27,3,-11,-26,-8,-22,-18,4,-1,-6,-13,1,-6,-22,-30,-22,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-28,4,22,-27,-17,-5,-27,16,-22,-15,-1,-1,11,17,-2,-7,-23,-26,-17,15;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-3,-9,-1,-14,-7,-14,-20,-9,-15,-13,-6,-14,-7,-11,1,-4,-14,-26,-16,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-23,-28,-24,-15,-2,-25,-20,2,-10,4,2,-21,-17,-12,-9,-19,-10,-1,8,0,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00677;
//
ID   RENAL_DIPEPTIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00869;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Renal dipeptidase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1419616; R2=0.0123849; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2060; N_SCORE=29.645; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=191; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=17,-21,-19,-30,-21,-9,-21,-26,22,-20,6,6,-17,-17,-17,-25,-6,-5,19,-21,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,5,-29,10,12,-26,-19,-2,-23,12,-13,-9,0,-14,14,16,-8,-10,-21,-25,-12,12;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-5,-25,-8,1,-32,12,-6,-24,-4,-21,-8,-2,-13,19,-6,2,-11,-23,-20,-18,10;
MA   /M: SY='L'; M=17,-21,-15,-25,-15,-4,-16,-20,6,-21,23,6,-21,-21,-15,-20,-12,-5,5,-20,-9,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-15,8,-20,-7,-14,26,-14,-4,-11,-14,-12,-11,23,-25,-18,-9,-4,-5,-16,-17,3,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,6,-23,7,3,-23,-11,-2,-27,11,-25,-17,11,-15,5,27,9,0,-19,-31,-15,1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,2,-19,0,14,-19,-18,-10,-20,2,-17,-14,1,-8,3,5,11,20,-13,-30,-14,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-5,-30,-5,2,-35,21,-4,-29,-4,-25,-9,0,-15,23,-4,0,-15,-30,-20,-19,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,32,15,-30,-30,-25,-20,-21,-5,28,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-11,61,-16,-16,-20,-16,-21,-25,-21,-25,-20,-6,-26,-16,-21,13,4,-10,-45,-25,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,14,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=7,-4,-11,-4,-3,-16,-4,-11,-14,-13,-18,-14,4,-13,-3,-11,30,16,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=3,10,-12,3,-2,-18,-4,-7,-18,-8,-26,-18,20,-12,-2,-8,29,21,-13,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=18,-8,-19,-11,-12,-25,32,-18,-26,-15,-24,-17,-1,-15,-12,-18,13,-4,-16,-25,-25,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-9,-6,-17,-6,-16,-14,-10,-18,-14,1,-10,-6,-13,25,22,-4,-31,-17,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,48,-30,-20,9,-30,28,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-26,-7,6,-16,-22,24,-11,-4,-4,6,-6,-17,8,2,-11,-12,-11,-26,-1,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-25,-15,-30,-25,0,-25,-16,25,-15,15,33,-25,-25,-16,-15,-15,-5,32,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-27,-12,-9,10,-23,64,-21,-16,-11,0,1,-23,-5,-6,-13,-17,-21,-18,23,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,9,-12,-1,-5,-15,-11,-11,-15,-8,-19,-15,16,-12,-5,-8,22,32,-9,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,50,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00678;
//
ID   CLPAB_1_MP; MATRIX.
AC   MP00870;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins clpA/B signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9901962; R2=0.0121086; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1242; N_SCORE=19.019; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-30,11,47,-26,-23,-4,-18,4,-14,-14,-3,-3,14,-4,-3,-10,-21,-29,-17,30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-33,-26,3,-24,-26,27,-28,22,14,-22,-25,-22,-24,-20,-10,19,-20,-3,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-28,0,0,-20,-18,90,-29,-10,-21,-2,10,-19,9,-1,-5,-16,-28,-31,16,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-17,-12,-7,-14,-12,-14,-8,-10,-6,-1,-5,-14,-2,-9,7,21,-5,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-31,-24,3,-31,-24,27,-25,27,17,-24,-25,-20,-21,-18,-3,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-32,-27,1,-30,-24,31,-21,16,22,-26,-26,-22,-20,-15,-4,36,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-14,-18,-10,-14,-8,-15,-7,-8,-3,-1,-8,-15,-8,-9,3,-1,-2,-22,-15,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-18,-31,66,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=9,-1,-21,-6,-1,-24,-6,-10,-22,16,-22,-12,4,-13,0,13,2,-5,-15,-23,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=14,2,-13,-5,-5,-18,-9,-15,-15,-3,-17,-13,4,-11,-5,-9,16,19,-7,-29,-16,-5;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,16,-20,22,24,-23,-9,-1,-23,2,-20,-17,11,-6,8,-3,8,-2,-20,-28,-16,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-23,-7,-14,-25,49,-16,-32,-16,-27,-18,2,-16,-14,-16,8,-10,-23,-22,-25,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-14,-10,-6,-22,10,-13,-18,-9,-19,-13,0,-11,-3,-14,15,1,-10,-25,-20,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-18,-29,-21,1,-24,-12,22,-16,20,35,-21,-21,-10,-15,-16,-5,17,-21,-2,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-29,66,19,-39,-10,-1,-39,0,-29,-29,19,-10,0,-10,0,-10,-29,-39,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-13,-23,-13,-17,-5,-21,-2,-13,-6,-6,-11,-11,-11,-21,6,-1,4,-20,-17,-13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-15,-13,-10,-22,17,-18,-20,-12,-19,-15,-3,-12,-10,-18,14,0,-10,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,35,-19,17,0,-20,0,8,-20,-1,-30,-20,53,-19,1,-1,14,2,-28,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-34,-24,4,-32,-20,31,-26,33,27,-24,-24,-16,-22,-24,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,9,-31,-21,24,-30,44,21,-28,-28,-20,-21,-28,-10,13,-19,1,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=12,-14,-17,-20,-11,-10,-14,-14,1,-9,5,10,-13,-16,-7,-12,-4,-3,2,-22,-10,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,23,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-13,-15,-8,-22,5,-17,-15,-10,-15,-12,-6,-11,-5,-17,13,1,-6,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,-1,-21,-13,-2,-30,24,-21,-11,1,-19,8,59,-6,-8,-20,-21,-12,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,14,38,-29,-18,-2,-27,17,-21,-15,1,-4,18,6,-2,-9,-25,-26,-16,28; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-29,-5,5,-25,-19,14,-28,23,-22,-7,2,-16,19,40,-6,-10,-23,-22,-6,9;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-24,54,-30,-28,-10,-30,-28,-2,-27,0,-2,-23,-33,-26,-26,-13,-6,10,-38,-18,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-38,-29,-1,-37,-28,43,-28,17,20,-21,-22,-20,-28,-19,-9,30,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-27,-10,-18,-29,60,-20,-36,-19,-28,-19,0,-19,-18,-20,3,-16,-26,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-23,-24,-18,6,-27,-8,12,-23,23,10,-19,-21,-15,-17,-20,-8,3,-16,8,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-10,30,-27,36,17,-33,-11,0,-31,7,-27,-21,19,-11,7,-2,1,-8,-27,-34,-18,12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-8,1,-21,-18,-2,-29,27,-22,-11,1,-18,11,57,-5,-7,-19,-22,-11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00679;
//
ID   CLPAB_2_MP; MATRIX.
AC   MP00871;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins clpA/B signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2314553; R2=0.0127106; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1095; N_SCORE=18.140; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-6,-18,-18,0,-18,-18,18,-12,6,6,-18,-18,-18,-12,-6,0,30,-18,-6,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-6,-6,-6,-6,-12,-12,-6,-6,-6,-6,0,-6,-6,-6,12,30,0,-18,-6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-6,-18,-18,0,-18,-18,18,-12,6,6,-18,-18,-18,-12,-6,0,30,-18,-6,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-18,0,12,-24,-12,6,-12,6,-12,0,0,-6,36,6,0,-6,-18,-12,-6,24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-25,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-10,-15,-12,-14,-10,-19,-1,-13,-12,-8,-8,-16,-12,-16,16,8,12,-31,-17,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-3,8,-27,-21,-8,-26,40,-23,-7,-2,-12,12,30,-10,-10,-19,-20,-9,9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-14,-14,-5,-21,-7,-16,-12,-3,-13,-9,-7,-11,-1,-10,9,4,-3,-23,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-9,-18,-9,-19,0,-19,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-9,-19,11,1,-1,-21,-19,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-25,2,16,-18,-12,-6,-18,1,-10,-10,-3,-12,5,-2,-3,-7,-17,-23,-10,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-4,-13,-7,-9,13,-19,-11,-10,-15,-5,-8,-4,-20,-15,-13,-3,-1,-7,-17,3,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,8,-27,-15,20,-24,39,28,-26,-26,-15,-18,-26,-10,10,-18,1,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-20,-36,-28,72,-28,-16,0,-27,9,0,-19,-28,-35,-18,-19,-9,-1,11,33,-28; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-27,32,3,-31,18,-5,-34,-7,-28,-23,18,-14,-7,-11,2,-11,-28,-31,-22,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,20,-20,23,5,-26,0,-5,-27,-4,-26,-21,16,-11,-1,-8,13,3,-20,-34,-19,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-29,19,41,-30,-13,-2,-30,9,-23,-19,4,-3,14,0,0,-9,-28,-30,-20,27;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-25,23,14,-28,-12,-2,-24,6,-23,-17,14,-11,6,1,3,-5,-21,-32,-16,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=24,0,-14,-9,-3,-18,-4,-6,-12,-7,-13,-7,3,-12,-4,-13,9,0,-8,-26,-16,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-21,-32,-22,3,-28,-14,26,-21,30,36,-24,-24,-12,-18,-23,-9,16,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-34,-28,6,-34,-28,34,-25,16,13,-23,-24,-24,-24,-15,-3,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-10,-2,-20,-13,-3,-30,24,-20,-11,0,-19,7,58,-7,-7,-20,-21,-12,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-37,-28,17,-35,-26,32,-29,24,16,-23,-25,-25,-25,-21,-9,22,-15,5,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-12,-30,-21,-1,-21,-2,17,-11,18,55,-20,-21,-2,-11,-19,-10,9,-22,-2,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,21,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-25,-22,39,-30,9,1,-15,5,1,-21,-30,-17,-13,-21,-10,-7,23,65,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-11,-20,-18,-10,-11,-13,-1,4,-6,3,31,-8,-17,7,-7,-7,-6,-2,-23,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-30,27,54,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-3,7,-27,-19,-7,-29,39,-27,-11,0,-13,10,37,-7,-8,-20,-21,-11,7;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-2,-26,-5,-4,-9,-21,67,-23,-11,-16,-2,6,-20,2,-3,-7,-9,-23,-24,19,-4;
MA   /M: SY='S'; M=22,-4,-10,-9,-6,-18,-4,-16,-14,-10,-18,-14,1,-10,-6,-14,25,20,-4,-31,-18,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-13,-30,-29,-1,-30,-29,30,-21,11,10,-27,-28,-27,-21,-10,0,44,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=15,0,-11,-1,-1,-20,-1,-12,-19,-10,-26,-18,7,-10,-2,-12,34,17,-9,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-29,-5,4,-24,-19,-5,-29,36,-25,-11,1,-15,9,49,-7,-8,-19,-21,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,9,-30,-20,21,-29,48,21,-29,-29,-19,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-35,-27,-1,-36,-28,39,-24,18,17,-21,-22,-20,-24,-19,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-10,-14,-8,-18,-4,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-8,-8,-16,18,14,-3,-26,-18,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-33,-9,-1,-27,-18,-19,-19,-10,-27,-19,-15,68,-9,-18,-2,0,-24,-31,-27,-9;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,71,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,13,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-29,68,-20,-39,-20,-28,-19,-1,-20,-20,-20,-1,-20,-29,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-19,-18,29,-28,24,-4,-12,-2,0,-16,-28,-11,-10,-18,-10,-11,20,66,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-29,36,38,-33,-10,-1,-34,4,-24,-24,8,-5,9,-5,1,-9,-29,-33,-20,24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-27,22,39,-32,-16,0,-29,6,-23,-19,4,-4,20,-2,6,-6,-27,-31,-19,29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-27,-6,-16,-28,52,-16,-34,-16,-29,-19,7,-16,-16,-17,3,-15,-27,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-27,-9,-18,-28,59,-18,-36,-18,-28,-19,3,-19,-18,-19,2,-17,-27,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-25,-5,5,-18,-18,1,-11,0,-13,-2,1,-16,22,0,-2,-7,-16,-20,-4,13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-27,-19,7,-29,-20,16,-27,42,16,-26,-27,-19,-19,-23,-2,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-11,-12,-10,-8,-19,-19,-7,-13,-4,-7,-3,-13,-10,-11,16,38,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00679;
//
ID   NA_GALACTOSIDE_SYMP_MP; MATRIX.
AC   MP00872;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:galactoside symporter family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2307472; R2=0.0155439; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=830; N_SCORE=18.122; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-19,-27,-23,-10,-8,-25,14,-20,2,5,-17,-21,-20,-22,-7,-6,18,-23,-13,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-11,-17,-24,42,-20,-30,-17,-24,-17,-1,-17,-17,-17,6,0,-20,-23,-24,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-17,-14,-14,-11,-11,-18,0,-15,-5,-5,-1,-16,-13,-15,6,15,2,-28,-12,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-33,-24,4,-32,-20,31,-25,31,27,-25,-25,-17,-22,-23,-9,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-21,-37,-28,46,-31,-21,15,-29,19,10,-22,-28,-31,-21,-21,-9,10,-4,16,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-18,-28,-20,9,-27,-18,16,-24,32,20,-24,-27,-18,-18,-20,-4,12,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-16,-32,-28,0,-31,-29,32,-23,15,13,-26,-26,-25,-23,-13,-4,38,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=17,-17,-15,-22,-17,-11,-9,-22,4,-17,0,-2,-14,-18,-15,-20,2,-1,11,-25,-14,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-37,-28,14,-34,-27,33,-28,19,14,-22,-24,-24,-25,-19,-8,24,-16,3,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-23,-34,-26,28,-23,-23,8,-26,14,4,-24,-27,-28,-21,-20,-11,6,7,10,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-25,38,24,-31,-14,-5,-30,0,-23,-23,9,-7,3,-8,4,1,-23,-34,-18,14;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-11,-23,-14,-13,-8,-22,0,-14,0,-3,-15,-15,-14,-20,2,-1,9,-22,-16,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-38,-29,32,-34,-25,26,-29,19,11,-22,-26,-29,-24,-20,-9,18,-9,11,-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-18,-11,-12,-7,-18,-15,1,-14,-4,-5,4,-16,-12,-15,3,10,0,-26,-9,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,18,-39,-6,-1,-40,-1,-30,-29,19,-11,-1,-11,0,-11,-30,-39,-21,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-35,-14,-5,-24,-20,-17,-11,-10,-20,-5,-20,66,-9,-18,-12,-10,-20,-28,-24,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-20,-35,-27,16,-25,-25,21,-29,19,11,-20,-25,-25,-25,-20,-11,12,-15,3,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-22,-30,-22,-1,-27,-19,21,-19,14,22,-19,-20,-13,-18,-13,0,14,-13,-2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-7,-23,-16,-15,-1,-19,-12,3,-15,2,1,1,-23,-12,-10,-9,-4,-4,-11,-4,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-20,-30,-22,-1,-26,-20,24,-22,20,21,-20,-21,-15,-21,-14,-6,17,-22,-4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-18,-30,-25,0,-30,-26,28,-24,18,12,-24,-25,-22,-22,-13,-4,29,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,3,-16,-2,-2,-18,-12,4,-23,7,-23,-14,13,-18,2,19,5,-2,-19,-27,-9,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-15,-11,-9,-12,-20,-16,-13,-1,-11,-9,-1,-13,-6,8,12,34,-2,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,4,-28,1,6,-23,-16,5,-28,26,-25,-12,13,-16,9,38,-5,-9,-23,-25,-11,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,10,-14,2,-3,-17,-9,-8,-17,-2,-23,-16,19,-13,-3,-4,21,22,-13,-35,-16,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-29,-7,1,-22,-17,-5,-27,21,-23,-13,1,-3,5,41,-5,-7,-21,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-40,-27,-18,6,-22,-15,-19,-5,-18,-14,-24,-18,-13,-5,-27,-21,-23,71,19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,-1,8,-28,-20,-1,-30,42,-28,-9,1,-12,12,32,-10,-11,-21,-21,-8,9;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-20,-35,-25,62,-26,-18,-4,-23,5,-2,-16,-27,-33,-13,-15,-8,-2,4,22,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-29,-8,2,-21,-21,-5,-26,33,-18,-8,-2,-17,8,49,-11,-10,-18,-20,-9,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-10,-1,-29,-20,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-19,-8,-6,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-38,-36,-28,32,-25,-17,-11,-20,-8,-11,-31,-30,-23,-18,-31,-21,-18,88,41,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-31,-23,1,-31,-23,26,-23,22,17,-26,-26,-17,-20,-21,-9,21,-13,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-26,-30,-31,-27,12,-14,-18,7,-23,0,0,-20,-25,-22,-21,-19,-14,1,17,16,-25;
MA   /M: SY='G'; M=7,-12,-25,-14,-19,-21,48,-21,-29,-19,-22,-16,-4,-19,-20,-20,0,-15,-19,-19,-24,-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-14,-14,-11,-18,6,-17,-14,-12,-14,-8,-4,-12,-10,-15,13,11,-6,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-21,-34,-26,18,-32,-25,25,-26,17,11,-21,-24,-25,-23,-16,-4,20,-15,4,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-22,-29,-20,-13,-17,-25,-24,4,-16,-11,-6,-21,36,-16,-21,-9,-4,0,-28,-19,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-11,-16,-17,-15,16,-16,-14,-3,-18,-4,-6,-2,-22,-19,-14,2,1,0,-20,-1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-12,-13,-9,-18,1,-16,-12,-11,-15,-10,-4,-12,-8,-16,17,9,-2,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-20,-32,-25,3,-32,-26,30,-26,27,16,-26,-26,-22,-23,-19,-7,27,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-18,-32,-25,19,-29,-24,19,-26,21,10,-24,-27,-26,-21,-17,-4,19,-16,3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=6,-16,-5,-21,-15,-4,-19,-17,-1,-19,10,0,-15,-21,-14,-17,-4,5,1,-22,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-25,-17,-29,-24,10,-30,-23,20,-23,17,9,-23,-26,-23,-19,-13,3,23,-20,1,-24;
MA   /M: SY='L'; M=6,-24,-17,-28,-18,1,-22,-20,14,-23,30,14,-24,-24,-17,-20,-18,-7,11,-21,-6,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,1,-21,-14,-9,-25,-16,4,-19,11,4,-13,-25,-7,-16,-13,-6,0,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-23,-39,-30,73,-29,-19,-1,-29,7,-1,-21,-30,-37,-20,-21,-11,-3,21,32,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-15,-17,-15,-2,-21,-19,-1,-16,-1,-4,-10,-17,-14,-14,6,23,4,-18,-3,-14;
MA   /M: SY='S'; M=5,1,-19,-3,-10,-19,3,-15,-12,-12,-15,-12,4,-16,-12,-15,6,5,-6,-29,-18,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-27,-19,-12,-2,-25,-10,-2,-18,-1,-2,-15,14,-15,-17,-10,0,-7,-22,-6,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00680;
//
ID   NA_ALANINE_SYMP_MP; MATRIX.
AC   MP00873;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:alanine symporter family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1456146; R2=0.0113514; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1499; N_SCORE=21.151; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-10,-15,-15,-8,-21,-22,2,-13,-6,-5,-9,-16,-15,-13,13,30,15,-31,-11,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='A'; M=16,-11,-16,-17,-16,-17,9,-22,-11,-15,-12,-9,-8,-16,-16,-18,6,6,1,-24,-19,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-13,-27,-26,-2,-29,-28,25,-19,7,7,-23,-25,-25,-19,-5,9,37,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-15,-16,-21,-16,-1,-26,-21,9,-20,16,5,-14,-19,-15,-16,-4,20,8,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,14,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-14,-12,-3,-22,-6,-13,-13,-6,-15,-10,-4,-10,4,-12,14,7,-7,-24,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=6,-19,-20,-25,-18,2,-22,-14,9,-18,12,4,-18,-21,-14,-19,-10,-1,5,-11,9,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-39,-6,7,-30,-20,-18,-21,-8,-29,-20,-18,79,-6,-18,-9,-10,-30,-30,-29,-4;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,35,-25,19,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,38,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-31,-27,2,-30,-24,30,-22,20,21,-27,-27,-22,-20,-16,-5,34,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-17,-27,-22,-5,-27,-26,21,-20,6,6,-16,-19,-19,-21,-3,10,24,-25,-8,-22;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,10,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-28,-20,-36,-26,47,-29,-21,10,-28,17,5,-21,-27,-31,-21,-19,-9,6,-2,16,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-37,-28,14,-36,-27,35,-29,23,16,-23,-24,-24,-26,-21,-9,24,-16,4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=5,-15,-17,-24,-15,-7,-13,-5,8,-10,7,35,-14,-17,-2,-12,-6,-4,5,-23,-7,-9;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-16,-9,-18,-3,-19,-11,-10,-12,-11,-6,-10,-9,-17,15,10,-1,-24,-18,-9;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='A'; M=16,-3,-17,-6,0,-23,-7,-13,-20,10,-24,-13,0,-10,0,0,14,4,-10,-27,-17,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,61,-30,-5,0,-22,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,18,49,-26;
MA   /M: SY='V'; M=21,-22,-10,-26,-22,-8,-18,-26,13,-16,2,2,-22,-22,-22,-20,-2,0,29,-26,-14,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=3,-10,28,-13,-13,-17,-13,-19,-15,-17,-21,-15,-5,-22,-13,-17,18,8,-1,-41,-21,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-12,-12,-11,-8,-20,-19,-6,-14,-2,-6,-4,-14,-11,-12,13,36,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-32,-26,-32,-22,10,-28,-22,12,-28,36,12,-32,-30,-20,-20,-32,-14,2,14,6,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-8,-14,-15,-6,-20,-4,-15,-15,-2,-15,-12,-5,-12,-5,-1,11,1,-5,-23,-18,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-26,-5,6,-28,-22,13,-15,10,-17,0,-4,-15,26,7,-5,-10,-14,-23,-5,15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-20,-25,-23,-13,9,-28,-18,4,-4,11,6,-17,-22,-14,-5,-20,-10,1,-14,3,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-29,-26,-23,30,-32,5,10,-16,5,4,-20,-28,-16,-15,-20,-10,-1,18,58,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00681;
//
ID   T2SP_F_MP; MATRIX.
AC   MP00874;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial type II secretion system protein F signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0198441; R2=0.0165771; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=297; N_SCORE=10.933; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-25,2,12,-18,-16,-7,-16,2,-15,-11,2,-12,4,0,-2,-7,-15,-24,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-27,-6,8,-25,-18,-4,-22,20,-16,-7,-3,-14,17,28,-6,-9,-19,-21,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-21,-26,-19,3,-27,-18,19,-25,23,11,-20,-24,-16,-20,-13,-4,12,-21,1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-8,-18,-12,-22,9,-18,-19,-8,-15,-12,-8,-15,-11,-10,5,-5,-8,-22,-21,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-24,20,14,-27,-11,-8,-28,6,-22,-18,5,-9,2,1,3,3,-20,-30,-17,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-26,-16,-14,9,-24,15,0,-11,5,8,-9,-26,-3,-9,-16,-10,-9,-1,34,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-21,-19,-12,-2,-24,-14,1,-8,5,2,-10,-21,-8,1,-9,1,1,-21,-4,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-27,6,33,-25,-20,-7,-19,8,-17,-13,-2,-5,10,-1,0,-7,-18,-27,-16,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,6,-27,6,9,-30,-14,-1,-25,18,-23,-10,6,-13,19,17,-2,-8,-22,-24,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-6,-22,-7,-1,-23,-7,-7,-24,12,-22,-12,1,-14,6,23,7,0,-16,-25,-15,1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,0,-29,5,18,-23,-22,0,-15,2,-8,-6,-3,-12,15,4,-7,-10,-17,-26,-11,15;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-21,-3,15,-27,-11,-4,-19,4,-17,-10,-3,-8,14,-4,5,-5,-16,-24,-16,14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-21,-25,-15,-3,-25,-13,16,-19,22,22,-18,-22,-5,-15,-15,-6,7,-22,-3,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-27,-6,2,-25,-12,-2,-27,24,-22,-9,-1,-14,8,27,-5,-6,-19,-21,-11,4;
MA   /M: SY='S'; M=-1,5,-21,7,3,-25,-4,0,-26,2,-25,-16,6,-13,4,5,11,1,-18,-31,-15,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-7,-29,43,-28,-9,0,-11,15,33,-9,-10,-21,-20,-10,12;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-22,-32,-24,3,-28,-25,21,-25,24,12,-26,-26,-21,-22,-21,-9,17,-8,-2,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-11,-29,-13,1,-19,-27,-10,-1,6,-4,3,-8,-15,11,5,-12,-10,-6,-21,-7,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-25,-2,5,-27,-8,-4,-23,14,-22,-9,4,-14,16,13,2,-5,-20,-25,-13,10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-12,-12,-19,-12,-16,-6,-20,-3,-13,-9,-7,-9,-13,-11,-19,11,3,6,-24,-17,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-8,20,-18,32,44,-24,-24,-8,-14,-24,-10,10,-20,0,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-24,-27,-30,-20,0,-32,-20,21,-14,12,10,-15,-21,-13,-2,-17,-7,12,-19,-2,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-19,-19,25,-29,15,-1,-10,-1,-1,-18,-28,-10,-10,-15,-3,-9,23,70,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-20,-2,-24,-18,-7,-22,-22,9,-22,6,2,-15,-22,-16,-21,-3,-1,10,-29,-11,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-18,-32,-26,9,-28,-21,25,-22,18,22,-24,-25,-20,-20,-17,-6,25,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-31,-23,6,-29,-20,24,-26,36,22,-28,-28,-20,-19,-24,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-20,-29,-22,2,-30,-22,23,-24,24,15,-20,-23,-18,-20,-15,3,17,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-20,-30,-23,6,-21,-24,17,-24,17,8,-20,-23,-21,-22,-14,-5,14,-19,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-13,-27,-25,0,-27,-26,21,-18,7,9,-22,-24,-23,-19,-6,6,33,-26,-8,-24;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-11,-17,-13,-15,-5,-20,-6,-12,-10,-9,-8,-14,-13,-17,12,11,5,-26,-17,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-20,-30,-23,0,-22,-21,21,-24,23,18,-23,-24,-18,-21,-18,-8,16,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='V'; M=2,-20,-9,-22,-21,-10,-2,-21,1,-20,1,2,-16,-24,-19,-19,-5,-6,9,-27,-15,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-15,-30,-26,0,-28,-25,27,-21,17,16,-27,-27,-23,-20,-14,-4,35,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-17,-26,-22,5,-26,-22,18,-20,7,9,-17,-22,-19,-19,-4,4,20,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='A'; M=7,-18,-17,-22,-17,3,-13,-14,2,-17,2,-1,-15,-21,-16,-18,-3,-3,5,-14,4,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-24,-23,-32,-25,7,-17,-22,17,-23,9,12,-17,-21,-20,-23,-13,-9,12,-16,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-20,11,-29,-13,18,-25,41,22,-28,-29,-17,-18,-28,-10,8,-14,9,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-20,-23,-14,1,-25,-14,11,-22,31,16,-21,-25,-8,-15,-18,-7,4,-22,-3,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-18,-15,-14,-7,-8,-8,-4,-17,-3,-3,-9,-20,-12,-15,3,4,0,-24,-4,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-16,-22,-22,-13,15,-23,-13,-2,-7,-2,0,-13,-19,-14,-10,-10,-4,-1,-7,11,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-29,11,-33,-27,30,-25,18,13,-26,-28,-27,-23,-17,-5,33,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-28,5,17,-31,-19,7,-24,15,-22,-8,2,-10,28,9,-1,-4,-24,-24,-9,22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-35,-28,48,-30,-13,8,-26,8,4,-20,-28,-32,-19,-17,-9,11,-4,18,-28;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-18,-8,6,-20,-16,-12,-7,-5,-11,-6,-9,-13,5,-9,5,1,0,-27,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-21,3,12,-25,1,-8,-25,-2,-23,-17,3,-10,5,-4,12,2,-19,-29,-19,8;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-22,-25,-15,-8,-28,-13,19,-14,12,20,-19,-21,1,-13,-14,-8,13,-22,-5,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-31,-25,52,-30,-4,2,-22,11,2,-21,-30,-26,-16,-21,-10,-3,14,46,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-11,-27,-11,2,-21,-22,-12,-6,3,-13,-4,-8,-2,5,1,-5,-6,-7,-25,-13,2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-20,-2,-7,-21,5,9,-21,-12,-22,-12,3,-17,-4,-11,10,0,-13,-31,-12,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-17,-18,-24,-18,18,-20,-10,5,-19,11,16,-11,-23,-14,-14,-9,-4,1,-17,3,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-28,9,0,-28,10,-4,-31,7,-28,-17,17,-16,2,8,0,-10,-27,-27,-19,1;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-14,-23,-19,-7,-17,-17,-11,-4,-7,-7,3,-13,-15,9,-10,-5,-5,-6,-2,-6,1;
MA   /M: SY='E'; M=7,-2,-25,0,22,-27,-14,-9,-21,0,-18,-15,-6,12,8,-9,2,-4,-20,-26,-20,14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-20,-26,-19,3,-17,-20,10,-27,34,12,-23,-27,-19,-19,-21,-5,4,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-33,-11,-3,-25,-19,-20,-14,-11,-25,-17,-18,66,-11,-19,-5,-6,-19,-31,-27,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00682;
//
ID   T2SP_D_MP; MATRIX.
AC   MP00875;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial type II secretion system protein D signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3022890; R2=0.0159867; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=748; N_SCORE=17.250; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-7,-13,-7,-14,-23,-19,0,-14,-8,-6,-8,-11,-10,-15,1,6,2,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-20,-31,-25,13,-31,-26,22,-23,9,7,-17,-21,-23,-21,-8,7,20,-18,2,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-3,19,-19,13,-1,-23,4,-3,-24,-4,-28,-20,27,-15,-3,-4,14,4,-22,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-22,-5,2,-22,-19,-9,-21,16,-20,-9,1,-11,10,16,5,13,-14,-25,-11,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-24,-6,0,-22,-12,-5,-25,16,-22,-11,4,-16,8,32,2,2,-18,-25,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-21,1,13,-21,-15,-2,-18,1,-17,-12,4,-11,7,1,9,7,-15,-31,-13,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,1,-35,-27,38,-26,21,19,-24,-24,-22,-25,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-4,18,-21,12,7,-25,-8,-1,-23,5,-27,-16,23,-13,7,1,12,3,-22,-33,-17,7;
MA   /M: SY='T'; M=1,6,-12,-5,-8,-13,-15,-15,-12,-8,-14,-12,10,-12,-8,-9,19,38,-5,-32,-13,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-6,-21,-10,2,-23,-19,-9,-8,-2,-12,-3,-5,-11,15,-5,4,5,-8,-24,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=22,-21,-12,-26,-21,-9,-17,-25,13,-16,2,2,-20,-20,-20,-21,-2,-1,25,-24,-14,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-16,-22,-20,-9,1,-22,-8,1,-8,10,14,-13,-22,-2,0,-15,-9,-2,-18,-2,-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-14,-31,-27,-1,-29,-28,29,-22,13,11,-26,-26,-25,-22,-11,-3,38,-26,-8,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-6,4,-27,3,11,-27,-10,-6,-25,13,-25,-14,7,0,8,6,0,-5,-23,-27,-17,9;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-24,25,15,-27,-9,10,-27,-1,-26,-19,23,-12,7,-4,9,-2,-26,-36,-16,11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-18,-29,62,-13,-39,-18,-29,-19,1,-20,-17,-16,-1,-20,-30,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,12,24,-35,-5,-1,-29,9,-24,-13,2,-9,24,2,-1,-12,-29,-25,-17,24;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-10,-9,-8,-12,-14,-17,-10,-11,-14,-10,1,-11,-8,-11,23,36,0,-33,-13,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-17,-31,-25,3,-30,-24,27,-24,26,17,-27,-27,-22,-21,-19,-6,28,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-30,-23,15,-31,-13,21,-24,27,15,-25,-28,-19,-19,-23,-9,13,-9,18,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-20,-21,-26,-20,12,-27,-9,11,-20,8,6,-15,-22,-16,-17,-10,1,7,-12,13,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-27,24,11,-26,-11,9,-28,-1,-22,-17,7,-14,4,-1,0,-6,-21,-29,-8,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-27,28,23,-27,-14,-1,-28,6,-22,-19,10,-10,6,0,0,-7,-24,-31,-14,14;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-21,5,9,-21,-12,-5,-21,4,-21,-14,10,-11,6,3,8,5,-18,-29,-15,7;
MA   /M: SY='N'; M=0,9,-19,1,-1,-19,-12,-6,-10,-6,-14,-10,13,-15,2,-8,6,5,-10,-30,-15,0;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-17,-5,-3,-15,-5,-13,-15,-6,-18,-12,4,-13,-4,-8,14,13,-10,-30,-14,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-25,25,17,-29,-13,-3,-26,7,-25,-19,15,-11,6,0,4,-2,-22,-33,-17,11;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-18,1,2,-23,1,-12,-22,-4,-23,-16,3,-11,0,-7,16,11,-14,-30,-18,1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-5,-20,-5,-3,-12,-21,-13,2,-12,2,-2,-7,-19,-8,-13,-6,-4,4,-29,-12,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,14,-20,13,4,-23,-10,1,-21,-2,-23,-16,15,-13,3,-1,12,6,-17,-35,-15,3;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-23,-3,3,-26,-5,-12,-26,21,-28,-14,2,-11,3,10,6,-2,-16,-25,-16,3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-24,-31,-24,25,-18,-21,5,-28,24,7,-25,-29,-26,-20,-25,-13,-1,3,8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-21,12,-30,-20,20,-29,46,20,-29,-30,-21,-20,-28,-10,11,-19,1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-22,-6,-9,-26,38,-16,-31,-15,-28,-19,3,-15,-11,-16,14,-5,-21,-27,-26,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-27,33,15,-32,-13,-6,-32,15,-28,-21,10,-10,3,3,2,-3,-23,-32,-16,9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-35,-26,0,-35,-27,40,-28,21,17,-20,-21,-19,-27,-17,-8,25,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-30,-24,10,-29,-19,17,-23,23,10,-30,-30,-22,-19,-23,-9,16,0,11,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-33,-25,4,-33,-26,32,-27,22,15,-22,-24,-21,-24,-17,-6,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-10,-18,-29,61,-20,-37,-16,-29,-19,-1,-19,-18,-18,0,-18,-27,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=2,-3,-22,-8,-4,-16,-12,-6,-17,1,-17,-11,3,-16,2,4,2,-1,-15,-10,-6,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-19,-28,-19,7,-28,-20,18,-28,42,17,-27,-29,-19,-19,-24,-7,11,-22,-2,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,75,-30,-20,1,-30,13,1,-21,-30,-39,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-27,-6,2,-23,-14,-4,-28,26,-23,-11,1,-16,9,43,-3,-5,-19,-22,-12,3;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-4,-20,-5,-3,-13,-13,13,-20,-1,-21,-11,3,-16,1,5,13,6,-14,-25,3,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-10,6,-24,7,6,-24,-16,1,-27,15,-24,-14,6,-12,4,16,3,3,-18,-28,-11,4;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-16,-3,-2,-22,3,-11,-21,-6,-25,-15,6,-12,2,-7,23,15,-14,-32,-18,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,9,-24,11,11,-27,-15,-6,-24,14,-24,-14,5,-11,9,8,4,0,-17,-29,-14,10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-19,5,8,-20,-11,-4,-19,1,-20,-15,18,-13,3,1,12,10,-18,-33,-16,5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-23,-5,-7,-17,-9,3,-14,-4,-12,-5,0,-17,-5,-2,-2,-1,-9,-27,-9,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-5,8,-22,9,9,-25,-12,-6,-24,4,-25,-17,9,-4,5,3,11,5,-19,-32,-17,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-30,3,10,-27,-18,-4,-28,28,-26,-13,6,-6,11,30,-6,-9,-23,-24,-14,9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-26,-13,-6,-12,-20,-5,-16,15,-13,-3,-2,-20,2,40,-8,-5,-10,-21,-8,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-20,4,12,-20,-17,-5,-13,-1,-16,-11,10,-13,5,-4,5,7,-11,-31,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-23,-14,-3,-24,-13,3,-8,20,11,-19,-25,-9,8,-19,-9,2,-21,-5,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-24,-21,8,-26,-12,16,-19,19,23,-22,-25,-15,-16,-19,-8,14,-17,5,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-17,-35,-29,31,-31,-25,20,-26,15,8,-25,-29,-32,-21,-17,-6,25,-13,7,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00683;
//
ID   IDO_1_MP; MATRIX.
AC   MP00876;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Indoleamine 2,3-dioxygenase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0823283; R2=0.0148118; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=912; N_SCORE=18.581; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-25,-21,-27,-21,-3,-30,-21,19,-12,12,9,-21,-26,-17,-1,-16,-6,22,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-23,15,46,-23,-15,0,-23,8,-15,-15,0,0,15,0,0,-8,-23,-23,-15,31; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-12,-30,-25,14,-23,-25,14,-20,5,3,-23,-25,-28,-20,-8,-2,27,-18,-3,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-14,-31,-12,2,-10,-13,-16,-22,-9,-24,-20,-13,-16,-4,-12,-2,-7,-23,40,0,1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-30,40,20,-35,6,-5,-38,-2,-28,-25,11,-10,0,-10,0,-12,-30,-33,-22,10;
MA   /M: SY='Q'; M=2,10,-22,10,7,-29,-13,-7,-22,6,-20,-12,3,-10,12,-2,4,3,-17,-26,-14,9;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-38,-12,-5,-16,-22,-11,-15,-10,-23,-15,-20,62,-10,-18,-12,-10,-25,-16,-4,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-13,-23,-13,-7,-17,-24,-15,-8,20,-13,-3,-11,-20,-4,21,-10,-6,5,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-21,-14,0,-11,-25,-14,5,-10,0,7,-8,-12,-4,-12,-1,12,2,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-20,-36,-26,51,-26,-13,7,-23,14,22,-20,-26,-26,-16,-20,-10,4,-1,19,-23;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,-17,-19,-13,-13,-14,-20,7,-17,-7,-3,-5,-14,-10,-20,11,5,7,-28,-13,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=36,2,-12,-11,-8,-20,0,-13,-12,-8,-15,-12,6,-12,-8,-15,10,0,-7,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-18,-16,-14,-24,29,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,-16,-27,-20,-3,-24,-24,17,-20,14,7,-20,-21,-19,-20,-8,3,19,-24,-8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-36,-26,33,-29,-15,19,-23,16,26,-20,-24,-21,-19,-20,-10,11,-8,12,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-15,18,-20,-18,-8,-22,-22,-4,-20,0,-5,-14,-24,-18,-18,2,11,5,-34,-14,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,26,-30,-20,15,-30,41,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-20,-19,-22,-9,-11,-20,14,-18,-2,2,-4,-24,-20,-18,-7,-5,17,-28,-13,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-23,-4,5,-25,-20,-9,-20,19,-20,-8,0,-10,14,11,3,12,-15,-24,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,5,-25,-20,79,-28,-5,-20,0,8,-18,22,2,-8,-18,-30,-28,13,9;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-14,-1,6,-17,-13,-13,-17,-6,-19,-15,4,-8,-1,-8,24,29,-9,-34,-15,2;
MA   /M: SY='A'; M=28,-14,-21,-16,-6,-24,-7,-20,-14,-10,-17,-14,-14,26,-10,-20,3,-4,-11,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,17,-28,18,5,-30,23,-6,-34,-7,-29,-22,18,-15,-5,-10,2,-12,-30,-30,-24,0;
MA   /M: SY='K'; M=6,-5,-25,-7,-2,-28,6,-15,-28,20,-25,-12,-2,-12,-2,7,-3,-10,-18,-20,-17,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00684;
//
ID   IDO_2_MP; MATRIX.
AC   MP00877;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Indoleamine 2,3-dioxygenase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1616268; R2=0.0151653; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=913; N_SCORE=18.998; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-16,-21,-16,1,-26,-20,7,-21,24,7,-17,-21,-16,-16,-9,16,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=10,24,-21,31,7,-31,-6,-9,-27,-4,-21,-21,7,-10,-4,-14,4,-6,-17,-31,-20,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,10,-14,3,-5,-14,19,-2,-17,-5,-17,-11,18,-11,-5,-5,3,-5,-17,-18,-14,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-15,-22,-15,7,-22,-15,15,-22,37,15,-22,-22,-15,-15,-22,-7,7,-15,0,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-15,-22,-15,7,-22,-15,15,-22,37,15,-22,-22,-15,-15,-22,-7,7,-15,0,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-27,-2,-15,-27,51,-12,-35,-15,-30,-20,16,-20,-15,-15,3,-15,-30,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='I'; M=8,-25,-21,-33,-25,-5,-27,-27,30,-23,10,10,-19,-19,-19,-25,-10,-5,26,-22,-7,-25;
MA   /M: SY='T'; M=10,-3,-17,-9,-1,-22,-15,-12,-15,4,-15,-8,-3,-10,7,-2,8,14,-9,-24,-13,3;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,4,-24,-20,82,-28,-6,-20,0,8,-18,20,2,-8,-18,-30,-28,14,8;
MA   /M: SY='S'; M=5,2,-13,2,8,-20,-7,-10,-20,-7,-24,-18,6,-8,2,-8,29,21,-12,-36,-18,5;
MA   /M: SY='P'; M=18,-11,-21,-11,-4,-24,-7,-17,-16,-10,-23,-16,-8,26,-7,-17,11,2,-14,-29,-24,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-8,8,-30,13,12,-35,15,-5,-33,-3,-26,-17,4,-12,12,-7,0,-14,-30,-26,-21,12;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-4,-30,22,-15,-35,17,-30,-15,0,-15,-4,7,-5,-15,-25,-20,-19,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,13,-30,20,19,-36,0,0,-31,1,-25,-15,5,-10,21,-3,0,-12,-30,-27,-18,20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-10,0,0,-13,-4,15,-15,-6,-17,-9,6,-8,2,-4,16,5,-10,-24,-5,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=5,-5,-17,-6,1,-17,-9,-10,-14,10,-15,-8,-5,11,-1,1,-2,-4,-11,-15,-12,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=16,-12,-12,-18,-12,-7,-11,-15,10,-12,2,2,-9,-9,-9,-15,-2,-3,8,-13,-7,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=12,9,-20,2,11,-26,-7,-3,-18,0,-19,-12,13,-11,12,-5,6,-4,-19,-27,-18,11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-9,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,44,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,44,20,-40,-14,4,-33,4,-26,-19,13,-10,22,-3,0,-10,-30,-33,-16,21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-27,-11,31,-17,20,46,-20,-20,-7,-17,-20,-10,17,-20,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-26,-5,3,-23,-16,-5,-28,28,-25,-12,2,-15,8,44,0,-4,-18,-24,-12,3;
MA   /M: SY='N'; M=-12,14,-26,9,13,-24,-13,1,-26,21,-26,-15,22,-14,8,22,-1,-6,-25,-29,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-38,-16,-6,-24,-24,-22,-6,-14,-20,-12,-20,69,-12,-22,-12,-10,-18,-28,-24,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-15,-23,1,-27,-17,-15,60,-5,4,-10,-10,-27,-27,-25,-7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-3,-15,-6,11,-23,-5,-13,-17,-5,-16,-14,-4,-7,0,-13,12,1,-10,-26,-20,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,17,-26,13,23,-30,-13,7,-23,6,-24,-13,22,-11,27,4,4,-6,-30,-30,-16,25;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26,53,-28,-17,7,-27,19,14,-22,-28,-29,-18,-22,-10,4,-1,19,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=7,-18,8,-25,-20,11,-19,-11,-9,-17,-6,-8,-16,-25,-19,-19,-7,-6,-5,-7,14,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,13,-24,18,2,-10,-14,22,-26,-10,-20,-15,8,-16,-4,-9,2,-7,-21,-29,-1,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-23,9,35,-23,-20,-7,-23,3,-16,-16,0,-4,9,-4,7,12,-19,-30,-16,22;
MA   /M: SY='S'; M=3,7,-16,3,2,-22,-4,-7,-22,3,-30,-18,16,-12,2,-1,25,11,-15,-36,-18,2;
MA   /M: SY='M'; M=3,-9,-16,-18,-17,-7,-15,-10,10,-11,2,19,-5,-21,-10,-12,-6,-4,11,-27,-10,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,3,-15,-8,-27,-23,-23,-23,-15,-27,-20,-20,55,-15,-23,-10,-10,-25,-35,-30,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,4,-25,0,0,-22,-11,-3,-24,7,-26,-16,15,1,2,20,5,-1,-22,-31,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-23,-22,-16,-11,-29,-23,14,3,-2,5,-16,-20,-13,-5,-13,-6,19,-24,-7,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-17,-23,-17,-11,-13,-24,-11,-8,12,-9,-3,-11,-24,-4,38,-10,-6,5,-24,-10,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-34,9,38,-30,-20,-7,-26,3,-24,-20,-7,32,9,-7,-4,-10,-30,-30,-24,22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00684;
//
ID   ODR_DC_2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00878;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 pyridoxal-P attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7402735; R2=0.0150217; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=100; N_SCORE=7.232; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-25,-3,3,-20,-15,-3,-20,15,-18,-9,7,-16,10,17,-3,-6,-19,-22,-9,6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-17,-19,-13,-5,-11,3,-6,-14,-1,2,-9,-18,-10,-15,-4,-7,-3,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-14,-27,-18,-8,-9,-26,-9,6,-9,4,4,-9,-19,-4,0,-13,-9,1,-22,-5,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-1,-19,-5,6,-18,-15,-2,-18,2,-12,-9,3,-15,6,6,-2,-5,-16,-25,-12,5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-20,-15,-22,-15,7,-24,-16,-10,-14,-8,-7,-18,-25,-14,-10,-16,-11,-10,21,10,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-25,-8,-4,-9,-21,4,-16,9,-11,-5,-5,-20,3,16,-10,-8,-15,-13,9,-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-19,5,9,-19,-12,-1,-18,13,-15,-8,2,-8,9,12,-2,-5,-14,-18,-9,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=10,-7,-9,-11,-4,-11,-10,-8,-4,-7,-5,-2,-6,-10,-2,-9,1,0,-2,-14,-8,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-18,-14,-22,-14,18,-18,-14,7,-17,15,7,-15,-17,-16,-14,-13,-6,5,-8,4,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=2,-5,-20,-3,3,-19,-7,-10,-14,-4,-16,-11,-6,22,-3,-9,0,-3,-14,-20,-16,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: M=-4,-6,-14,-7,-2,0,-9,-5,-7,-3,-3,-3,-4,-5,-2,-4,-4,-3,-7,-8,0,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-16,-5,-6,-15,11,-7,-15,-5,-15,-8,3,-12,-3,-2,5,-3,-11,-18,-12,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-7,-3,-14,-10,-4,-18,4,-16,-7,-1,-7,-3,13,-5,-7,-15,-22,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-12,-22,-13,-13,4,-21,0,0,-13,-3,-2,-12,-22,-11,-14,-8,-6,1,-9,18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-22,-11,-2,-13,-18,-7,-12,2,-7,-3,-4,-18,7,8,-7,-4,-11,-20,-6,2;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-22,-22,-21,-17,-15,-10,-23,2,-18,-6,-3,-19,7,-18,-21,-10,-9,3,-26,-18,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-3,-26,-22,13,-27,-7,1,-19,1,1,-18,-27,-22,-13,-12,-6,9,-18,6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-19,-17,-7,-23,-6,-20,-13,-10,-16,-13,-13,21,-10,-20,4,-3,-9,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-14,-27,-22,-5,-27,-23,22,-19,6,8,-21,-24,-18,-19,-7,-2,29,-26,-8,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=18,-17,38,-24,-20,-17,-16,-25,-11,-19,-11,-11,-16,-24,-20,-23,1,-3,4,-34,-22,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-12,22,-9,5,-8,-5,-8,2,-17,-8,-21,-16,38,-23,-9,-6,2,-3,-23,-30,-12,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-24,2,5,-25,-14,-5,-17,-5,-17,-10,1,1,14,-6,6,0,-19,-29,-15,9;
MA   /M: SY='N'; M=-9,16,-11,12,4,-26,-11,7,-24,-3,-24,-14,18,-16,9,-3,6,0,-23,-34,-15,6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-28,-14,-4,-16,-22,-13,-11,3,-7,-5,-12,4,-4,13,-11,-7,-11,-22,-12,-7;
MA   /M: SY='H'; M=5,-5,-21,-7,0,-18,-7,7,-18,-5,-16,-9,-2,-13,-2,-4,2,-5,-12,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-33,-28,4,-33,-27,33,-25,20,16,-26,-27,-25,-23,-17,-5,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-17,-30,-23,2,-28,-24,24,-24,25,15,-26,-26,-21,-21,-17,-5,25,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-26,4,19,-26,-14,-2,-26,15,-23,-14,6,-11,14,20,3,-4,-22,-27,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-23,-16,-11,-5,-23,-17,3,-16,6,2,-14,-20,-10,-15,-11,-2,0,-8,-4,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-21,-31,-22,4,-29,-21,25,-26,34,21,-26,-26,-18,-21,-23,-9,17,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-17,-12,-8,-16,-12,-17,-3,-9,-7,-5,-9,-16,-10,-10,2,-2,5,-26,-15,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,4,21,-26,-12,-1,-24,7,-20,-14,2,-8,10,3,4,-5,-20,-27,-16,14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-22,-13,4,1,-24,-7,-3,-13,9,1,-13,-18,-5,-12,-11,-6,-7,-20,-1,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,0,-18,-29,-20,-29,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-19,-9,-23,-18,12,-21,-14,1,-21,7,1,-14,-23,-19,-17,-5,1,4,-19,1,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-23,-7,-15,-27,48,-12,-35,-15,-28,-18,4,-19,-14,-15,3,-14,-26,-24,-25,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-28,-19,-33,-24,28,-27,-21,13,-27,27,11,-24,-28,-26,-20,-21,-8,10,-11,7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-29,52,31,-36,-13,-1,-35,3,-26,-26,13,-7,6,-7,1,-9,-28,-37,-20,18;
MA   /M: SY='C'; M=12,-19,27,-27,-22,-13,-20,-26,-1,-21,-6,-6,-18,-25,-21,-24,-3,-3,11,-32,-19,-22;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-11,-20,-20,-15,11,-23,-9,-17,-11,-8,-13,-20,-20,-20,1,-6,4,-24,-20,-20;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-10,0,-1,-19,-1,-10,-19,-10,-29,-19,10,-10,-1,-10,38,22,-10,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-29,-4,3,-27,-6,-12,-24,22,-23,-10,-2,-9,2,11,-8,-11,-18,-22,-14,2;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-25,-8,-10,-25,21,-17,-24,-13,-23,-17,-1,3,-13,-17,3,-6,-19,-25,-25,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,5,-33,-23,32,-28,36,23,-26,-26,-19,-23,-25,-10,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-27,-1,13,-12,-15,3,-15,-1,-10,-3,-7,-14,7,-5,-7,-10,-17,-15,3,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-23,-22,-14,-5,-26,-14,6,-8,10,7,-15,-22,-8,4,-13,-3,5,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='A'; M=25,-19,-11,-25,-19,-10,-15,-24,9,-15,1,0,-19,-19,-19,-20,0,1,22,-24,-15,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00685;
//
ID   ODR_DC_2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00879;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2423024; R2=0.0161313; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=211; N_SCORE=7.633; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-10,-18,-12,-16,-8,-21,-6,-11,-8,-8,-9,-12,-12,-17,11,13,5,-24,-16,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-26,-22,-20,26,-26,1,4,-16,1,0,-9,-26,-16,-14,-15,-8,-4,7,40,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-10,-22,-11,-8,-4,-20,-9,-6,-2,-2,-3,-9,-21,-8,-1,-10,-6,-3,-16,3,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-25,-5,-1,-19,-16,5,-12,-3,-8,-2,-1,-17,6,-1,-6,-6,-12,-25,-7,1;
MA   /M: SY='A'; M=21,-3,-19,-6,-1,-24,6,-6,-21,-9,-18,-14,-3,-8,-5,-15,6,-6,-14,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=7,-23,-17,-28,-21,-1,-21,-20,16,-21,14,9,-20,-22,-19,-21,-11,-4,17,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-21,-6,6,-21,-16,-4,-18,7,-15,-8,-2,-14,6,10,0,-4,-13,-26,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-28,18,23,-29,-17,-1,-26,12,-22,-15,3,-9,10,5,-2,-9,-22,-27,-13,16;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,-14,-21,-14,-14,-13,-20,1,-8,-5,-3,-13,-16,-12,-10,2,1,10,-24,-14,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-14,-16,-18,-11,-8,-15,-12,-7,-4,-6,-1,-9,-19,-8,1,-5,-5,-3,-22,-8,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-20,-3,4,-22,-11,-7,-17,0,-12,-7,-2,-16,8,3,-5,-9,-16,-25,-14,6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-19,-26,-20,3,-25,-18,14,-16,11,7,-20,-23,-19,-16,-12,-4,15,-18,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-19,-31,-24,34,-27,-11,7,-23,18,11,-22,-28,-23,-17,-21,-10,3,-1,24,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-6,-14,-4,-4,-17,-19,-15,-4,-7,-9,-5,-10,-19,-8,-10,-4,-5,6,-29,-13,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-27,7,19,-20,-18,-4,-19,6,-14,-7,-2,-10,10,3,-4,-6,-18,-25,-12,14;
MA   /M: SY='L'; M=1,-19,-23,-21,-14,-7,-9,-15,-4,-14,3,0,-16,-21,-10,-13,-11,-9,-4,-5,-3,-12;
MA   /M: SY='A'; M=4,-13,-19,-16,-7,-10,-17,-9,-4,-9,0,-2,-11,-18,-9,-7,-4,-1,1,-24,-9,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-17,-4,-2,-13,-6,-8,-13,6,-12,-6,0,-10,-1,7,-1,-3,-9,-16,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-19,3,16,-17,-9,-4,-17,2,-12,-8,-2,-7,7,-1,1,-5,-15,-19,-11,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-18,-21,-11,7,-22,-13,6,-17,19,9,-19,-22,-14,-14,-18,-9,2,-14,3,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-28,-8,-17,-27,58,-17,-35,-18,-26,-17,2,-19,-16,-17,0,-17,-27,-20,-27,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=1,-13,-11,-17,-12,8,-14,-6,3,-12,4,4,-12,-13,-12,-11,-7,-3,5,-8,4,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-18,7,7,-18,-10,-2,-17,6,-16,-10,2,-2,2,0,0,-2,-13,-20,-9,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-19,-29,-20,1,-26,-15,23,-20,23,29,-22,-18,-12,-18,-20,-8,13,-21,-2,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-24,2,7,-22,-15,-4,-23,11,-20,-12,3,-11,6,11,2,2,-18,-25,-11,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-17,-18,-14,6,-25,0,2,-18,4,3,-14,-23,-15,-15,-11,-6,3,-17,9,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-25,12,-32,-24,27,-28,34,17,-27,-28,-23,-22,-24,-8,20,-19,1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-16,44,-27,56,15,-35,-8,0,-35,-1,-30,-28,25,-11,0,-9,5,-6,-28,-40,-20,8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-17,-33,-26,1,-31,-26,30,-25,21,16,-25,-25,-22,-23,-17,-6,29,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-20,-34,-24,34,-31,-20,15,-29,31,12,-26,-29,-27,-20,-25,-10,9,-9,12,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-27,-9,-12,-28,36,-19,-32,-16,-28,-19,-4,6,-14,-18,1,-11,-27,-25,-28,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-20,-27,-24,-7,-12,-25,20,-22,3,6,-17,-21,-21,-22,-8,-6,21,-24,-10,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-21,10,-1,-23,-12,-12,-21,-4,-20,-17,-1,1,-7,-5,2,0,-15,-31,-18,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-9,-30,-5,-3,12,-26,16,-9,-6,-5,-5,-12,-23,-4,-8,-15,-10,-15,10,49,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-24,14,9,-23,-16,-1,-22,0,-17,-13,3,-12,4,-1,2,2,-17,-28,-10,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-23,-12,-5,-7,5,-12,-17,-9,-14,-10,-7,-8,-9,-11,-4,-9,-13,-16,-11,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-5,10,-22,9,3,-23,-6,-5,-21,-1,-21,-14,10,-9,-2,-6,7,4,-17,-31,-16,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-27,13,16,-25,-16,-2,-23,6,-17,-13,1,-9,6,5,-4,-6,-19,-27,-13,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-16,4,9,-23,-11,-7,-20,1,-20,-12,3,-8,6,-2,11,5,-15,-30,-16,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-24,-13,-5,-10,-14,-12,-13,-10,-15,-11,-9,11,-9,-11,-2,-3,-12,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-26,-4,2,-16,-18,-8,-10,-9,-13,-10,-1,7,-4,-11,-2,-3,-13,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-4,5,-24,9,6,-22,-14,-2,-19,-3,-17,-13,0,-1,-2,-9,1,-3,-16,-28,-11,1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-9,-18,-14,-12,-23,-20,5,-16,2,1,-14,-15,-11,-17,-6,-1,7,-27,-12,-13;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-20,-7,-3,-17,-7,-12,-15,0,-16,-9,-3,-13,-3,-3,6,1,-9,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-23,5,8,-21,-13,-7,-17,0,-15,-10,0,-12,1,-5,3,-2,-12,-28,-13,4;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-13,-21,-16,-14,8,-18,3,-6,-10,-8,-6,-11,-21,-8,-12,0,3,-7,2,34,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00685;
//
ID   ACB_1_MP; MATRIX.
AC   MP00880;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acyl-CoA-binding (ACB) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1276813; R2=0.0141463; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=438; N_SCORE=11.314; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-27,24,30,-29,-17,-2,-25,1,-16,-16,3,-8,13,-5,-1,-8,-24,-31,-17,22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-29,33,44,-33,-16,1,-32,7,-23,-22,9,-4,15,-2,1,-9,-30,-33,-20,29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-25,0,14,-19,-19,-5,-13,6,-5,1,-3,-13,7,0,-8,-9,-14,-25,-11,11;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-14,-15,-7,-21,-4,-2,-15,-6,-13,-9,-6,-11,-5,-13,7,-3,-6,-22,-14,-7;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,3,-25,-18,-11,-14,-22,0,-17,3,0,-18,-21,-17,-21,-4,-3,9,-25,-15,-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-23,2,18,-24,-11,-7,-23,9,-21,-15,2,-10,6,8,3,-5,-17,-27,-17,11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-5,-22,-7,1,-8,-18,-12,-10,1,-12,-8,-4,-15,-3,-5,-2,-3,-6,-22,-8,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-17,-31,-27,7,-30,-24,26,-22,13,10,-25,-26,-25,-21,-13,-4,31,-19,1,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-29,1,10,-30,-19,-5,-28,38,-28,-9,4,-11,18,27,-7,-9,-22,-21,-11,14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-23,-1,8,-21,-18,-2,-15,4,-15,-8,6,-13,8,2,2,2,-15,-28,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-26,-16,4,-29,-19,13,-19,39,16,-26,-27,-16,-13,-27,-10,6,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,0,-32,5,7,-30,-19,-13,-27,18,-29,-16,-4,24,0,4,-6,-6,-23,-27,-18,2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-19,-14,-9,2,-10,-15,-13,-8,-11,-9,-7,-17,-13,-9,2,8,-6,-17,-2,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-26,0,3,-25,-15,7,-23,8,-21,-10,1,-2,7,8,-1,-7,-20,-27,-11,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-33,-12,-4,-23,-21,-21,-13,-12,-21,-15,-18,63,-12,-19,-7,-1,-18,-30,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-11,-5,-5,-17,-2,-14,-18,-11,-22,-16,5,-11,-5,-11,29,26,-8,-34,-17,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-15,29,-25,29,3,-17,-11,6,-23,-3,-23,-19,25,-17,-3,-7,1,-2,-24,-25,0,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,22,-29,32,39,-34,-16,2,-31,6,-23,-20,9,-5,18,-2,1,-9,-30,-32,-19,28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-27,19,39,-28,-18,-1,-23,5,-18,-14,4,-6,14,-2,-1,-9,-23,-31,-18,27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-25,-17,-7,-8,-23,-10,-4,12,4,16,-13,-18,-2,5,-18,-10,-4,-19,-3,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-28,-18,8,-29,-19,17,-25,45,18,-28,-29,-18,-17,-29,-10,8,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-8,-27,-9,5,-10,-25,-11,-9,7,-6,-3,-8,-15,0,5,-11,-6,-9,-20,-5,2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-33,-25,24,-31,-22,20,-29,32,14,-27,-29,-26,-21,-24,-9,15,-14,6,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-27,-21,-21,26,-30,13,4,-11,1,1,-21,-30,-13,-11,-19,-9,-2,22,68,-21;
MA   /M: SY='A'; M=22,-6,-15,-10,-9,-23,18,-16,-22,-13,-23,-16,0,-13,-9,-16,19,3,-12,-28,-23,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-25,-22,-27,-19,19,-29,-2,9,-26,31,13,-23,-29,-18,-17,-25,-11,2,-12,15,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-28,-21,-19,33,-29,23,-4,-14,-1,0,-16,-29,-13,-11,-19,-11,-11,18,62,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-11,-19,-12,-18,-2,-21,-6,-12,-10,-8,-11,-13,-12,-19,9,1,5,-23,-19,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-11,-11,-10,-9,-18,-19,-7,-13,-5,-7,-3,-13,-10,-11,16,37,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-17,-21,-11,-9,-25,-18,14,-13,6,10,-20,-21,-8,-14,-9,-5,20,-26,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,19,-34,34,11,-35,-15,-9,-31,-5,-29,-25,3,32,-5,-14,-4,-8,-29,-35,-24,1;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-15,21,-22,-23,-6,-25,-17,2,-19,-6,-4,-11,-29,-21,-20,-9,-6,8,-27,-4,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-11,33,-22,24,3,-22,-6,3,-21,0,-24,-18,40,-17,-1,-2,5,0,-25,-37,-18,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-8,-19,-15,-9,-23,-20,3,-12,-2,1,-9,-17,-12,-14,3,17,7,-28,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,3,-30,10,14,-29,-10,-10,-25,-4,-27,-21,-1,29,-1,-12,3,-5,-26,-33,-24,5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-18,-6,6,-22,-21,-8,-25,23,-20,-11,-4,-16,5,33,-8,-9,-15,-24,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-36,-13,-4,-26,-21,-21,-13,-11,-24,-16,-21,73,-13,-20,-10,-9,-19,-30,-27,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,59,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-7,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-24,-20,-33,-23,19,-25,-15,16,-21,17,25,-20,-23,-17,-18,-17,-9,11,-13,5,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-22,-33,-25,41,-28,-21,3,-27,16,3,-23,-28,-28,-19,-20,-5,0,11,16,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-15,42,-26,54,15,-35,-7,0,-35,-1,-30,-27,24,-11,0,-9,7,-5,-27,-40,-20,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-19,7,-27,-18,14,-22,21,18,-25,-7,-17,-19,-21,-9,7,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-28,-12,-3,-20,-24,-14,-10,24,-15,-3,-6,-15,0,21,-11,-8,-4,-21,-8,-3;
MA   /M: SY='G'; M=2,6,-26,7,4,-29,26,-11,-32,-8,-25,-20,6,-13,-6,-13,2,-12,-26,-26,-24,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00686;
//
ID   NI_HGENASE_CYTB_1_MP; MATRIX.
AC   MP00882;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nickel-dependent hydrogenases b-type cytochrome subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5899124; R2=0.0132457; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=972; N_SCORE=17.455; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=145; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-20,-4,1,-21,-15,-12,-22,18,-24,-12,2,-11,2,14,10,13,-12,-27,-12,1;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-20,-9,4,-19,-4,-16,-9,-10,-13,-10,-6,-12,-5,-14,5,-3,-4,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-28,-2,-7,-23,2,-13,-19,3,-18,-10,-2,-18,-7,8,-7,-12,-11,-24,-16,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-21,1,3,-21,-4,-8,-23,4,-23,-15,11,-13,0,5,10,10,-17,-30,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-20,-24,-24,-14,9,-27,-13,-1,-4,-2,1,-13,-23,-7,12,-13,-8,2,-14,2,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-23,-3,12,-22,-22,-12,-14,4,-15,-9,-7,0,5,-3,1,5,-9,-28,-15,8;
MA   /M: SY='S'; M=11,-5,-15,-9,-4,-19,-7,-11,-19,0,-20,-14,1,-13,-1,8,17,10,-9,-29,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-11,-18,-10,1,-12,-24,0,0,-9,-5,-2,-12,-18,-8,-10,-3,1,10,-30,-8,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20,25,-30,10,5,-15,13,5,-23,-30,-13,-13,-23,-10,-5,17,59,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-15,-17,-7,-8,-27,-22,14,-12,2,2,-22,-22,-17,-15,-7,-3,29,-30,-13,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,51,-30,3,0,-18,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,22,59,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-25,12,42,-25,-20,-5,-25,5,-17,-17,0,-3,12,-3,5,6,-22,-30,-17,27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-35,-15,-5,-20,-23,-20,-10,-15,-9,-10,-23,59,-13,-20,-15,-10,-20,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-11,-25,-24,-1,-27,-26,18,-19,10,6,-22,-25,-24,-17,-5,12,32,-29,-9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-33,-30,-36,-27,5,-31,-27,22,-26,16,8,-29,-26,-21,-24,-27,-14,12,23,7,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-35,-24,-39,-30,25,-24,-27,-16,-24,-12,-15,-33,-31,-26,-21,-32,-23,-20,92,24,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,16,-20,4,-3,-17,-11,-1,-20,5,-22,-15,28,-17,0,15,8,11,-19,-32,-15,-3;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-23,-35,-25,23,-33,-23,23,-30,33,16,-25,-27,-24,-23,-25,-10,13,-13,7,-25;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,11,-15,-10,-20,-5,-18,-17,-13,-18,-15,-5,-15,-10,-18,17,5,-5,-31,-22,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-37,-25,45,-27,20,26,-20,-20,-17,-27,-20,-10,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='F'; M=0,-24,-16,-30,-24,18,-25,-24,12,-22,10,4,-20,-24,-25,-20,-9,1,17,-16,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-12,-29,-28,-1,-30,-29,28,-20,9,9,-26,-27,-27,-20,-8,4,42,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=7,-20,-20,-28,-21,-8,-11,-18,15,-18,6,17,-16,-19,-13,-20,-9,-8,13,-21,-10,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,14,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-34,-26,59,-30,-10,2,-25,12,2,-21,-30,-30,-17,-21,-10,-2,12,40,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-23,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='S'; M=3,-6,-18,-9,-6,-7,-13,-4,-14,-1,-18,-11,-3,-15,-3,-5,11,8,-9,-15,9,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-30,-20,23,-29,-20,9,-27,29,9,-26,-14,-24,-20,-25,-10,2,-14,4,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-21,-31,-17,-7,-18,-20,-20,-8,-15,-7,-8,-21,45,-13,-20,-13,-9,-16,-26,-21,-13;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-23,-22,-16,-10,-24,-17,7,-8,-2,11,-21,5,-13,-6,-12,-6,11,-26,-13,-16;
MA   /M: SY='P'; M=0,-16,-28,-16,-7,-21,-20,-18,-1,-13,-14,-6,-12,24,-3,-18,-1,-4,-8,-27,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-12,-30,47,-17,-37,-2,-30,-17,0,-17,-12,-7,-3,-17,-27,-20,-25,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,18,-27,20,44,-27,-15,3,-27,7,-23,-20,16,-5,15,0,3,-7,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00688;
//
ID   NI_HGENASE_CYTB_2_MP; MATRIX.
AC   MP00883;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nickel-dependent hydrogenases b-type cytochrome subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8221426; R2=0.0134325; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=984; N_SCORE=18.030; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-23,-34,-24,18,-32,-20,25,-28,32,21,-25,-26,-21,-22,-25,-10,14,-15,5,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-9,-30,-9,-12,-20,29,-11,-31,0,-25,-14,-3,-19,-10,-5,-6,-16,-24,-12,-6,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-35,-47,-32,-22,-1,-20,-27,-20,-17,-23,-20,-35,2,-17,-20,-32,-25,-30,102,14,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-13,-27,-24,1,-28,-26,21,-21,17,9,-25,-27,-24,-18,-10,6,31,-27,-7,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-22,-16,0,8,-25,-14,7,-14,8,2,-13,-15,-10,-14,-13,-8,1,-14,0,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=2,-15,-18,-13,-12,-15,-3,-18,-5,-12,-13,-8,-12,9,-14,-16,0,-3,1,-24,-18,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-25,-18,7,-24,-8,19,-17,21,24,-19,-20,-10,-14,-19,-8,9,-10,11,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-26,-32,-27,29,-11,-23,-4,-25,2,-3,-23,-28,-29,-20,-20,-14,-2,22,11,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-32,-9,-11,-31,41,-16,-34,-14,-29,-17,-4,2,-7,-16,-2,-17,-30,-22,-27,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-25,7,0,-27,14,2,-25,-3,-28,-15,30,-18,9,-3,5,-8,-30,-30,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=5,-8,-13,-8,-5,-12,-8,-13,-9,-15,-9,-9,-1,-15,-5,-13,21,12,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-6,-23,-10,5,-28,-15,0,-11,1,-11,8,-6,-12,31,-1,-1,-7,-15,-20,-11,18;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-27,46,12,-32,-9,3,-33,4,-29,-25,28,-14,1,4,1,-7,-29,-37,-19,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-29,1,-33,-29,34,-24,18,14,-27,-27,-26,-23,-16,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,0,-20,-20,73,-30,1,-20,-3,7,-20,10,19,-10,-17,-27,-27,12,0;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-11,-8,-14,-11,-18,-12,-10,-13,-12,-1,-10,-8,-13,21,32,-2,-29,-14,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-34,-38,-36,-28,10,-28,-23,6,-23,3,-2,-31,-27,-19,-22,-31,-20,-6,68,23,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,0,-20,-20,83,-30,-3,-20,-2,8,-20,10,12,-10,-18,-28,-28,15,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-10,-17,-25,46,-20,-32,-17,-25,-17,0,-17,-17,-17,5,-1,-22,-23,-25,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-17,-25,-17,-3,-20,-5,12,-10,12,41,-15,-17,-3,-10,-9,6,7,-23,-3,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=17,-19,-15,-25,-17,5,-16,-16,2,-17,6,0,-18,-20,-17,-19,-6,-4,6,-11,3,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-30,-25,-38,-28,23,-35,-25,31,-30,23,15,-22,-25,-25,-25,-22,-10,18,-12,8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-14,-27,-27,-4,-13,-27,17,-21,8,6,-25,-28,-27,-20,-10,-4,32,-27,-12,-27;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-18,-32,-27,-3,-29,-28,31,-22,11,11,-23,-23,-23,-24,-11,-4,33,-24,-8,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-15,-31,-27,-3,-28,-29,30,-21,10,10,-25,-25,-25,-23,-10,-3,38,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-30,-29,-19,-8,-28,-18,22,-18,7,22,-20,9,-11,-21,-17,-10,8,-23,-8,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-18,-29,-28,-5,-15,-28,22,-22,5,7,-23,-26,-26,-22,-10,-6,32,-26,-11,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=11,-19,-16,-27,-18,-5,-16,-12,11,-14,13,26,-19,-19,-9,-16,-10,-6,11,-21,-8,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-14,-25,-22,-2,-26,-25,17,-19,11,6,-19,-22,-20,-18,-5,10,24,-26,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-18,-35,-18,-8,-12,-20,-8,-27,17,-20,-13,-11,-23,2,46,-18,-15,-23,25,1,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,18,-27,20,44,-27,-15,3,-27,7,-23,-20,16,-5,15,0,3,-7,-30,-33,-20,29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,37,-25,51,15,-35,-7,-3,-35,-3,-30,-27,17,-10,0,-10,11,-2,-25,-40,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=7,-25,-22,-33,-25,-5,-28,-27,31,-23,11,11,-19,-19,-19,-26,-11,-6,25,-21,-7,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-19,-21,-25,-16,-5,-21,-4,8,-1,8,35,-16,-21,-1,10,-16,-9,7,-21,-4,-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,-6,-18,-6,-8,-8,0,-3,-17,-11,-22,-15,1,-16,-5,-11,20,7,-12,-19,5,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-2,-33,4,3,-26,-18,-5,-29,14,-24,-16,-2,11,3,33,-8,-10,-24,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,19,-27,17,15,-35,-13,8,-23,6,-24,-10,19,-13,34,4,3,-7,-30,-29,-14,24;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-15,-4,-7,-21,15,-14,-24,-13,-27,-18,6,-13,-7,-13,26,14,-14,-33,-21,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00688;
//
ID   OSTEOPONTIN_MP; MATRIX.
AC   MP00884;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Osteopontin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0620403; R2=0.0123716; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=754; N_SCORE=13.380; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=198; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='C'; M=2,-18,94,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28,-6,-8,-8,-44,-28,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,15,-30,39,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-31,-27,-37,-27,27,-31,-24,17,-29,21,9,-26,-27,-26,-23,-26,-13,7,13,13,-26;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-25,-7,-15,-27,51,-17,-35,-17,-30,-20,3,-17,-15,-17,11,-9,-25,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-26,-37,-27,13,-35,-24,34,-28,24,21,-22,-23,-21,-25,-22,-10,20,-16,4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,6,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='S'; M=15,-7,2,-11,-8,-15,-7,-12,-16,-12,-20,-15,-2,-16,-7,-15,20,8,-7,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=35,-11,13,-20,-13,-20,-5,-21,-15,-14,-14,-13,-10,-15,-13,-21,9,0,-3,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-33,-29,-34,-24,9,-28,-24,13,-27,28,9,-32,-29,-20,-21,-32,-15,1,26,8,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-25,0,7,-27,-15,-10,-27,34,-30,-13,3,-10,7,19,4,-2,-17,-25,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-10,-25,-9,-1,-23,-23,1,-10,9,-15,-2,-9,-8,10,3,-7,-8,-5,-25,-8,4;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-10,-11,-7,-17,-7,-17,-13,-10,-15,-13,-1,-10,-7,-14,21,22,-3,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-27,26,17,-28,-12,1,-31,9,-25,-21,16,-12,6,15,2,-6,-26,-33,-17,10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-12,-7,-5,-2,-5,-12,-16,-14,-23,-16,5,-14,-7,-12,29,15,-8,-31,-11,-5;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-12,-22,-13,-4,-6,-19,2,-5,-6,-1,1,-12,-17,11,-6,-8,-7,-10,-4,15,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-16,-19,-19,-14,-1,-25,1,3,-21,21,8,-15,-23,-12,-14,-13,5,0,-25,1,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-7,-26,-8,-10,5,-20,37,-13,-9,-12,-5,-1,-24,-2,-6,-6,-8,-17,-2,41,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-21,4,0,-20,-8,11,-24,4,-26,-15,24,-17,4,16,11,1,-22,-33,-13,0;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-8,-29,-8,-1,-10,-24,-3,-17,26,-14,-4,-8,-17,2,14,-15,-10,-14,-6,15,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-30,-7,-7,-3,-23,73,-20,-10,-13,0,0,-23,3,-3,-13,-17,-23,-10,40,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-8,-28,-5,4,-28,-16,-10,-19,-5,-24,-13,-6,30,11,-9,6,4,-22,-29,-20,5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-11,-14,-19,-9,-21,-3,-20,-11,-10,-13,-11,-11,4,-10,-20,7,-1,-4,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-31,-29,1,-31,-29,31,-23,17,13,-29,-29,-27,-21,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-44,-38,-28,10,-22,-28,-12,-22,-6,-12,-38,-30,-20,-20,-38,-26,-22,116,24,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00689;
//
ID   EPSP_SYNTHASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00885;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   EPSP synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6029744; R2=0.0157502; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=255; N_SCORE=9.609; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=57; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-6,-19,-11,-13,-15,-20,-5,-14,-4,-6,-12,-8,-13,-18,2,4,-1,-26,-15,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-19,-26,-17,33,-25,-12,-1,-20,5,0,-15,-25,-16,-14,-12,-7,-3,-4,16,-14;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-12,-16,-8,-21,-1,-18,-12,-8,-14,-11,-7,-8,-7,-17,12,2,-3,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-26,14,23,-28,-14,-5,-27,9,-23,-17,4,-5,9,3,4,-2,-22,-30,-17,16;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-26,-8,-15,-24,44,-12,-32,-16,-27,-18,3,-17,-15,-16,5,-10,-25,-21,-20,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-25,-6,1,-21,-12,-16,-16,-2,-18,-12,-7,8,-5,-6,0,6,-11,-27,-17,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-9,-11,-10,-10,-16,-18,-9,-11,-14,-11,-1,-11,-10,-10,20,31,0,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-19,-15,-6,-12,-24,-10,-2,-2,-6,-1,-9,-18,-5,5,-4,2,4,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-35,-26,3,-34,-25,35,-27,23,19,-23,-21,-20,-25,-20,-9,22,-18,0,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-25,-4,1,-16,-18,-3,-20,13,-18,-10,0,-15,2,21,-2,0,-15,-20,-3,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-25,18,-3,-27,20,-1,-30,-7,-29,-21,30,-18,-7,-9,5,-8,-29,-33,-22,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=13,-21,-18,-28,-20,-5,-19,-22,17,-19,7,5,-18,-19,-17,-22,-7,-5,16,-18,-5,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=7,-4,-23,-3,13,-18,-10,-6,-20,2,-15,-12,-5,-11,4,-2,0,-7,-16,-19,-9,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-26,8,19,-24,-11,18,-27,4,-22,-14,12,-12,10,7,2,-7,-26,-30,-11,13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-25,-29,-19,3,-26,-20,11,-24,27,11,-27,-26,-13,-18,-25,-12,3,5,2,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-18,-20,-21,-1,-22,-19,13,-17,4,3,-19,-25,-21,-17,-9,0,21,-20,1,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,9,-29,-20,1,-30,44,-29,-9,1,-11,10,27,-10,-11,-21,-21,-7,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,5,-8,-8,-16,-12,-17,-16,-13,-20,-15,2,-14,-8,-13,25,28,-5,-37,-17,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,46,-27,54,16,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,31,-13,1,-7,3,-7,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-35,-26,5,-35,-23,35,-28,29,19,-24,-25,-20,-24,-23,-9,22,-18,4,-26;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-21,1,7,-20,-13,-2,-18,1,-16,-11,1,-13,2,-2,3,-3,-13,-26,-11,4;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-12,-16,-12,-18,-1,-20,-9,-12,-10,-9,-9,-13,-12,-18,8,4,2,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-17,-32,-24,1,-29,-19,27,-21,19,28,-22,-23,-16,-19,-17,-4,22,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-13,-7,-19,-14,-13,-14,-18,-2,-11,-7,-4,-11,-17,-13,-13,5,6,8,-27,-14,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-3,6,-17,6,6,-21,-15,-7,-19,-3,-18,-14,3,-12,-1,-6,6,8,-12,-28,-14,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-25,10,27,-23,-10,-3,-21,1,-17,-12,8,-8,7,-5,1,-6,-22,-30,-18,17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-20,-31,-21,11,-29,-21,20,-29,42,17,-28,-28,-20,-21,-26,-9,11,-19,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,4,-24,1,5,-25,-8,-4,-25,13,-24,-13,10,-11,8,16,3,-2,-21,-27,-16,5;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-26,-6,4,-23,-18,-9,-23,27,-19,-8,-3,-14,6,26,-6,-6,-15,-22,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-16,-29,-21,16,-26,-15,13,-24,27,19,-22,-27,-19,-18,-22,-9,7,-16,4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=18,-20,-15,-26,-21,-8,-9,-25,8,-18,0,0,-17,-20,-20,-21,-3,-4,17,-22,-13,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-22,9,13,-26,-15,-6,-22,9,-21,-14,5,-12,7,5,0,-4,-18,-29,-15,9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,5,-28,-25,-6,-28,-27,17,-22,4,4,-22,-26,-23,-22,-8,-1,26,-30,-12,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-25,6,20,-23,-16,-3,-23,7,-18,-13,0,-10,9,6,0,-1,-18,-27,-14,14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-29,10,32,-26,-18,-6,-23,1,-19,-17,-5,11,8,-7,-2,-8,-22,-28,-18,19;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-19,-10,-10,-6,-6,-11,-13,-12,-5,-7,-3,-19,-12,-10,-2,5,-10,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-26,5,10,-25,-7,-6,-23,-1,-20,-15,-1,3,0,-6,0,-7,-21,-27,-17,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-28,56,17,-36,-9,1,-36,1,-28,-25,18,-10,2,-7,0,-9,-28,-37,-18,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-27,-6,-14,-20,37,-14,-31,-15,-25,-17,-1,-19,-14,-15,0,-14,-24,-16,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-32,-23,12,-30,-18,22,-26,33,23,-25,-26,-19,-20,-24,-10,12,-17,3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-15,-24,-18,-9,-1,-27,-8,6,-11,1,2,-12,-19,-9,-9,-9,-3,4,-18,4,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,1,-35,-30,42,-27,16,16,-22,-23,-23,-27,-17,-8,33,-22,-3,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-22,-2,5,-13,-20,1,-19,6,-16,-10,-1,-15,3,7,-3,1,-15,-19,0,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-32,-10,-12,-29,31,-19,-31,-14,-29,-19,-8,20,-15,-17,-3,-15,-28,-24,-29,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00097;
//
ID   ILVD_EDD_1_MP; MATRIX.
AC   MP00886;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0197220; R2=0.0140031; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; N_SCORE=11.549; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-11,-25,-21,-8,-19,-21,14,-17,2,9,-17,-22,-16,-18,-6,-2,21,-27,-11,-19;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-13,-27,-20,-3,-23,-19,12,-15,9,11,-19,-22,-15,-11,-10,-4,15,-23,-7,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-3,6,-16,0,0,-20,-1,-2,-22,-2,-24,-14,16,-16,3,1,12,1,-19,-31,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=18,-11,-16,-16,-13,-20,12,-4,-18,-15,-11,-8,-7,-17,-12,-18,0,-9,-11,-22,-15,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-14,1,-30,1,7,-21,-15,43,-23,-5,-19,-5,6,-6,11,-3,-6,-14,-27,-26,3,6;
MA   /M: M=-7,-8,-12,-11,-11,-15,-7,-7,-18,-7,-13,-3,-5,-19,-5,-3,-6,-7,-15,-12,-9,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-21,-28,-21,29,-25,-7,3,-18,9,8,-19,-26,-20,-12,-16,-8,2,-1,23,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,43,-30,61,20,-38,-11,-1,-39,4,-29,-28,17,-10,2,-4,-1,-10,-29,-38,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-19,-15,-14,-25,33,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-14,-20,6,-9,-14,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=0,-24,-17,-28,-21,6,-23,-19,15,-21,17,14,-21,-24,-19,-19,-14,-5,16,-17,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-33,-28,3,-32,-28,32,-24,17,13,-26,-26,-26,-23,-15,-4,36,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='A'; M=7,-17,5,-22,-20,-8,1,-20,-13,-20,-7,-8,-14,-24,-20,-21,-5,-7,-5,-21,-11,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,5,-35,-26,37,-28,25,17,-24,-25,-22,-25,-21,-8,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-11,-25,-11,-11,-26,23,-19,-25,-14,-25,-17,-6,8,-13,-19,5,-8,-19,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-21,-6,-14,-21,23,-14,-19,-14,-21,-14,9,-19,-13,-14,7,-3,-14,-28,-22,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-22,-13,-15,-11,-12,-14,7,-16,-7,-2,9,-18,-11,-16,1,3,0,-29,-12,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-17,-27,-21,-1,-27,-19,19,-19,17,20,-21,-21,-15,-16,-12,3,19,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-4,-24,-19,-6,-17,-12,5,-17,9,21,-16,-22,-11,-15,-9,0,5,-26,-8,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-24,-20,-30,-20,4,-24,-13,19,-20,28,32,-23,-23,-12,-17,-20,-7,11,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-32,-23,1,-26,-10,28,-17,22,44,-20,-21,-7,-16,-20,-10,15,-20,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-16,-17,-13,-23,22,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=16,-18,-16,-24,-16,-7,-15,-17,8,-16,10,12,-16,-18,-11,-18,-5,-3,8,-22,-10,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-20,-14,-26,-18,-7,-13,-21,8,-19,13,7,-19,-20,-16,-20,-9,-5,9,-21,-11,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-26,-9,-1,-20,-16,-2,-27,22,-20,-11,2,-18,7,53,-5,-6,-18,-22,-12,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-16,-27,-18,10,-25,-15,10,-22,21,14,-20,-24,-14,-16,-15,-3,6,-19,1,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-13,34,-24,26,3,-25,-1,19,-27,-3,-29,-19,41,-18,0,-3,5,-6,-30,-37,-15,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-31,-24,1,-32,-24,27,-21,22,14,-24,-26,-20,-15,-19,-7,24,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-29,-19,-19,81,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='S'; M=16,-6,-13,-11,-10,-16,3,-17,-15,-12,-18,-13,-1,-13,-10,-15,19,15,-5,-28,-18,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-20,-35,-29,1,-34,-28,38,-25,15,16,-24,-24,-24,-24,-15,-5,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-27,51,-30,-18,9,-26,16,7,-23,-29,-31,-19,-20,-9,8,0,23,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-11,-31,-27,0,-30,-27,28,-23,17,13,-27,-28,-25,-21,-15,-4,35,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-14,-27,-13,-10,3,-20,2,-10,-10,-14,-10,-12,4,-8,-12,-2,0,-14,-3,27,-13;
MA   /M: SY='G'; M=5,-8,-27,-10,-17,-28,58,-19,-36,-18,-28,-19,1,-18,-17,-19,4,-15,-26,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00690;
//
ID   ILVD_EDD_2_MP; MATRIX.
AC   MP00887;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroxy-acid and 6-phosphogluconate dehydratases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3038063; R2=0.0128906; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=558; N_SCORE=11.487; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-19,-14,-8,-10,-9,-7,-11,-7,-10,-7,-8,-16,-2,-11,3,0,-8,-12,4,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-25,-27,-21,-14,-12,-26,-23,6,-18,1,-1,-25,26,-18,-21,-15,-8,2,-27,-16,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-11,-10,-10,-19,-18,-8,-10,-8,-5,-1,-11,-9,-10,17,44,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=11,-5,-16,-6,-3,-21,-3,-15,-18,-10,-25,-17,1,6,-5,-14,24,14,-11,-34,-21,-5;
MA   /M: SY='A'; M=24,-15,-16,-20,-12,-6,-10,-15,-7,-12,-8,-7,-13,-7,-12,-18,1,-3,-1,-14,-4,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-20,-21,-15,-9,-25,-18,9,2,-2,7,-17,-20,-12,-5,-11,-6,16,-21,-4,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-25,-13,-16,-19,31,-9,-23,-20,-11,-9,-5,-21,-15,-17,-3,-13,-18,-23,-18,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-10,-23,-13,0,-19,-18,-6,-8,4,-2,8,-10,-15,13,1,-8,-8,-9,-20,-9,6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,6,-28,11,-8,-32,44,-14,-38,-14,-30,-23,6,-17,-13,-17,3,-14,-28,-27,-27,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-24,-23,-15,2,-27,-7,8,-14,23,12,-17,-26,-10,-1,-22,-10,1,-17,4,-15;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-16,-10,-19,-29,54,-20,-37,-20,-28,-20,-1,-21,-19,-20,1,-16,-26,-24,-29,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,0,12,-13,-19,-6,-22,17,-19,-10,-3,-10,8,9,-5,-7,-18,-17,-4,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-26,16,11,-30,-13,3,-28,16,-26,-15,8,-11,8,6,1,-6,-22,-29,-12,9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,4,-31,-29,-3,-30,-30,23,-22,7,7,-27,-30,-29,-22,-10,-2,40,-31,-12,-29;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-9,-18,-11,-19,4,-19,-12,-13,-10,-10,-9,-13,-11,-19,8,-1,-3,-22,-20,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,11,-29,-18,21,-27,42,24,-28,-28,-18,-19,-28,-10,11,-19,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-19,-33,-27,10,-32,-25,29,-26,26,16,-26,-27,-24,-22,-20,-7,27,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-38,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-37,-27,60,-28,-15,5,-26,14,11,-21,-28,-31,-18,-21,-10,2,4,25,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=23,-12,-19,-16,-16,-23,29,-21,-20,-15,-17,-13,-7,-16,-16,-20,4,-9,-10,-21,-24,-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-9,-15,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-10,31,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-25,-10,-9,-16,4,0,-26,-4,-22,-13,-1,-18,-5,7,2,-1,-19,-11,-6,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-13,-30,49,-18,-38,-4,-30,-18,0,-18,-13,-8,-2,-18,-28,-20,-25,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-18,-30,-22,10,-27,-22,17,-24,25,13,-26,-22,-22,-20,-19,-7,17,-20,-2,-22;
MA   /M: SY='C'; M=0,-18,6,-19,-14,-16,-19,-21,-7,-17,-13,-7,-15,3,-16,-20,0,-1,0,-34,-20,-16;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-19,-31,-25,-4,-29,-27,30,-23,9,10,-20,-22,-21,-24,-8,-3,31,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,54,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-1,-17,-21,96,-28,-10,-19,0,8,-21,9,-1,-11,-19,-29,-27,23,-1;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-13,-30,-26,-3,-26,-27,26,-19,10,11,-26,-26,-24,-21,-9,-2,38,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-13,-6,-7,-20,5,-16,-19,-11,-20,-16,1,-11,-7,-14,21,14,-9,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=11,-17,-18,-22,-13,0,-17,-13,0,-10,2,2,-15,-19,-9,-13,-7,-6,1,-12,2,-11;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-16,-3,-2,-17,-15,-15,-3,-8,-9,-8,-5,-17,-10,-14,0,-3,7,-30,-16,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00690;
//
ID   CNMP_BINDING_1_MP; MATRIX.
AC   MP00888;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclic nucleotide-binding domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5088339; R2=0.0195937; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=180; N_SCORE=10.018; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=0; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,10,-32,-23,29,-27,29,20,-25,-26,-22,-22,-22,-9,21,-19,1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-19,-14,-24,-17,-9,-11,-22,5,-18,6,1,-17,-19,-17,-20,-3,-3,12,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,23,-25,33,8,-28,-12,-7,-26,0,-18,-18,7,-12,-3,-8,0,-4,-18,-33,-16,3;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-13,-17,-10,-15,-15,-5,-7,-4,-6,-3,-11,-18,-9,-6,-3,-5,2,-24,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-4,-30,-22,3,-29,-21,16,-28,32,15,-25,-29,-20,-21,-22,-8,10,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-27,8,21,-24,-13,8,-27,6,-20,-14,2,-10,10,7,-1,-7,-23,-27,-11,14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-10,-20,-12,-4,-7,-20,-16,-8,-8,-7,-7,-8,-4,-8,-7,2,9,-6,-25,-10,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-6,-21,-5,9,-23,-22,0,-16,6,-16,-7,-5,-9,9,6,-4,-4,-12,-26,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-12,-24,-14,-9,-11,-24,-4,-1,2,-8,1,-9,-19,-4,2,-9,-6,3,-21,-1,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-25,-22,40,-29,4,-1,-16,1,-1,-20,-23,-19,-14,-18,-8,-7,18,55,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-24,1,7,-24,-11,-6,-19,-4,-18,-13,-1,4,3,-8,4,1,-17,-29,-17,4;
MA   /M: SY='P'; M=3,1,-27,4,2,-28,-12,-12,-23,2,-24,-17,-2,19,-3,-3,0,-6,-20,-28,-21,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-30,-4,-12,-30,48,-16,-38,-6,-30,-19,2,-18,-13,-8,-2,-17,-28,-22,-26,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-25,23,19,-29,-14,-2,-25,0,-22,-17,7,-9,9,-3,6,-1,-21,-33,-16,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-11,-23,-13,-7,-2,-23,-1,-9,0,-9,-4,-9,-19,-4,2,-5,3,-5,-11,13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,19,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,35,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-5,-37,-30,-3,-37,-30,35,-28,12,12,-22,-25,-23,-28,-17,-8,28,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-5,2,-20,-17,3,-22,16,-19,-9,-1,-15,4,20,-2,-4,-15,-22,-6,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,1,-27,2,24,-33,-17,-1,-23,15,-20,-9,-1,-7,30,7,0,-9,-24,-23,-14,27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-6,24,-27,35,27,-33,-13,-3,-30,2,-23,-21,8,-7,9,-7,2,-6,-25,-32,-19,18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-28,-10,-4,-20,-21,-15,-6,-1,-12,-5,-11,8,-2,-3,-7,-7,-7,-25,-15,-5;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-20,-13,-18,-27,51,-20,-33,-18,-25,-18,-3,-19,-18,-20,2,-15,-23,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-27,30,22,-30,-13,4,-31,9,-26,-20,14,-10,7,4,1,-6,-26,-33,-16,13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,7,-19,5,10,-18,-10,-7,-21,-2,-21,-16,9,-11,2,-5,13,10,-16,-30,-14,6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26,52,-28,-16,7,-26,19,15,-22,-28,-29,-18,-22,-10,4,-1,19,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-24,-36,-27,22,-34,-22,27,-28,22,13,-23,-26,-24,-23,-21,-9,18,-10,12,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-26,0,19,-20,-22,-6,-12,2,-10,-7,-5,-11,9,-3,-4,-7,-12,-24,-9,13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-22,0,12,-22,-15,-1,-23,10,-20,-12,0,-11,7,7,5,-2,-17,-26,-9,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-20,5,18,-24,-15,-6,-21,5,-20,-12,3,-9,8,0,8,2,-16,-31,-16,13;
MA   /M: SY='V'; M=12,-23,-6,-27,-23,-1,-21,-24,12,-19,6,3,-23,-24,-23,-20,-6,-2,24,-23,-9,-23;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-21,5,7,-25,-9,-8,-19,1,-19,-12,3,-11,5,-4,7,-1,-14,-28,-16,6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-28,-14,-31,-28,-2,-29,-29,30,-21,10,10,-26,-26,-26,-22,-10,-2,41,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-18,-22,-17,9,-25,-16,4,-15,10,3,-16,-23,-16,-11,-8,6,6,-17,5,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-8,-24,-11,-5,-18,-15,-11,-5,2,-8,2,-6,-16,3,-2,-6,-5,-4,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,11,-28,13,12,-28,-8,-5,-29,17,-26,-16,9,-12,6,14,-2,-8,-23,-28,-16,8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,7,-25,12,8,-26,0,-7,-27,2,-22,-17,3,-5,2,2,2,-5,-21,-27,-17,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-24,19,12,-27,-8,-6,-23,4,-21,-16,7,-11,3,-3,2,-5,-18,-30,-16,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,8,2,-29,21,-12,-31,-7,-26,-19,3,-8,-7,-12,1,-10,-24,-27,-24,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-22,-7,-8,-20,3,-12,-16,-2,-18,-10,-1,-17,-8,-4,2,-2,-8,-27,-16,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-23,-3,6,-20,-16,-12,-12,-1,-12,-9,-5,-6,1,-4,1,1,-9,-28,-14,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-3,10,-11,-19,-7,-12,-2,-11,-8,-5,-9,2,-5,-3,-5,-9,-22,-8,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-24,-14,-4,-10,-20,-8,-5,-2,-5,3,-13,-3,-3,-6,-8,-6,-5,-21,-5,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00691;
//
ID   CNMP_BINDING_2_MP; MATRIX.
AC   MP00889;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclic nucleotide-binding domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1488028; R2=0.0147048; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=10.697; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-26,22,13,-29,-8,1,-28,1,-26,-20,10,-2,2,-5,4,-4,-24,-33,-18,7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-28,20,9,-28,11,-5,-32,-4,-27,-21,13,-11,-1,-8,1,-11,-28,-29,-21,4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-26,0,2,-26,13,-10,-27,0,-21,-13,0,-15,1,-4,-3,-12,-23,-22,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-26,4,16,-21,-17,-10,-16,1,-15,-12,-5,-3,2,-6,-2,-5,-13,-26,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-9,-21,-12,-8,-17,-7,-10,-8,-5,-11,1,-6,-14,-4,-5,-1,1,-3,-26,-13,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-24,-15,-3,-6,-25,-10,2,-10,-1,0,-13,-13,-4,-9,-9,-7,2,-22,-4,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-31,-25,8,-32,-22,25,-23,21,13,-25,-23,-22,-19,-19,-7,22,-19,2,-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,-8,-19,-12,-8,-18,-8,-16,-13,2,-15,-9,-4,-13,-6,1,4,6,-4,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-7,-19,-10,-6,-9,-22,-4,-9,-2,-6,-2,-6,-18,0,3,-2,9,-6,-19,2,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-11,-29,-21,9,-29,-16,13,-27,35,13,-27,-30,-19,-20,-25,-10,6,-16,7,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-23,-1,-3,-25,12,-1,-27,-1,-26,-14,7,-15,-1,-4,7,-4,-21,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='K'; M=2,-1,-26,-2,4,-27,-14,-9,-23,14,-23,-13,-1,2,5,9,-1,-5,-18,-24,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-29,-9,-17,-29,60,-15,-38,-17,-29,-19,1,-19,-17,-15,2,-17,-28,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-27,31,13,-33,-2,1,-31,-3,-25,-20,10,-11,7,-8,5,-7,-26,-33,-18,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-19,-25,-22,31,-27,-2,-1,-17,-1,-2,-19,-28,-20,-15,-14,-7,-2,14,43,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,76,-30,-20,2,-30,10,1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,1,9,29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-23,-28,-19,-2,-29,-21,21,-17,21,14,-21,-23,-14,-16,-19,-8,15,-21,-4,-18;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-14,-14,-10,-22,15,-18,-18,-12,-18,-14,-4,-12,-10,-18,14,0,-8,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-30,-20,12,-29,-18,18,-24,29,19,-24,-26,-15,-18,-22,-9,12,-17,2,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-22,4,1,-12,-6,-3,-18,-3,-18,-13,13,-16,-4,-6,4,2,-18,-24,-7,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='B'; M=-11,16,-23,16,4,-21,-13,2,-14,-3,-16,-12,15,-13,-2,-4,-2,-5,-14,-29,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-22,5,0,-20,-13,-6,-16,1,-12,-10,9,-16,1,1,0,-1,-14,-29,-14,0;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-15,-32,-10,2,-22,-22,-14,-16,2,-17,-11,-14,31,-4,4,-10,-9,-16,-27,-19,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=18,-3,-12,-9,-4,-19,-8,-14,-14,-8,-17,-12,0,-10,-1,-11,21,20,-6,-29,-16,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-19,-1,-7,-13,-9,-9,-17,-8,-22,-17,17,-16,-6,-8,13,16,-16,-12,-10,-6;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-16,-32,-28,-2,-31,-29,33,-22,11,11,-26,-26,-26,-23,-11,-3,41,-26,-8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-16,-24,-19,-12,-10,-27,-11,4,1,-4,2,-12,-20,-8,7,-10,-3,8,-21,-2,-12;
MA   /M: SY='A'; M=34,-8,0,-15,-9,-20,-3,-18,-14,-12,-16,-13,-5,-12,-9,-18,16,6,-3,-28,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-11,-23,-14,-4,-13,-24,-8,-4,3,-3,2,-9,-17,-3,2,-8,-1,-1,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-21,-3,-3,-23,17,-15,-26,-9,-23,-17,2,-13,-8,-12,12,6,-17,-28,-21,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,-1,4,-9,-16,-5,-17,-2,-15,-13,-5,-2,-4,-4,-3,-3,-16,-15,1,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=4,-14,5,-19,-19,-10,-17,-22,0,-17,-5,-5,-12,-23,-19,-17,4,9,13,-33,-15,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-25,12,14,-26,-15,-7,-23,14,-23,-15,7,-10,4,6,2,-1,-18,-29,-15,9;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-26,21,-31,-26,0,-29,-26,8,-27,14,4,-25,-31,-26,-23,-17,-7,15,-30,-11,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=7,-24,-18,-29,-20,12,-20,-20,5,-22,15,3,-23,-24,-21,-20,-14,-7,6,-4,2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-1,-14,-7,-14,-15,-20,-9,-8,-10,-8,-12,-19,-13,-11,-1,2,3,-29,-16,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-32,-23,7,-32,-20,27,-27,37,22,-26,-27,-18,-21,-26,-10,15,-18,3,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-7,24,-24,34,7,-32,5,-7,-33,-6,-29,-25,13,-12,-4,-12,11,-1,-23,-36,-21,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-27,-10,-3,-15,-18,-5,-20,23,-18,-7,-6,-18,2,30,-10,-9,-12,-15,0,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-25,11,14,-28,-15,-6,-23,9,-22,-14,2,-6,10,3,2,-3,-18,-29,-16,12;
MA   /M: SY='D'; M=2,9,-21,10,0,-26,0,-11,-26,2,-23,-17,4,-12,-4,-3,7,2,-16,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-36,-27,58,-30,-18,6,-29,21,6,-23,-30,-33,-20,-23,-10,2,2,24,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00691;
//
ID   HIT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00892;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   HIT domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2379793; R2=0.0081264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1000; N_SCORE=7.887; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=830; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-31; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=33,-74,-5,27,-7,-67,43,-62,25,-26,15,-56,-67,64,-5,-54,-59,3,-76,-59;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-63,31,-72,-4,-56,-82,-70,47,-25,36,6,-17,-76,12,14,-67,-20,32,-79,-61; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=72,-68,-63,15,-69,-31,-66,27,4,-35,20,-19,-67,-13,-24,-50,-55,-25,-76,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=7,-100,-84,-14,-100,-92,-87,-5,41,-93,-87,-27,-28,-20,-8,-38,-82,-85,-102,-93; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=32,-74,36,7,-72,-16,-60,-13,43,-25,-6,2,-67,47,-51,-53,-57,-3,18,-65;
MA   /M: SY='E'; M=-18,-75,-56,45,11,-37,20,-30,43,4,-5,-58,1,8,10,-11,-6,-16,-74,-59;
MA   /M: SY='G'; M=-16,-75,-61,3,11,64,-4,-68,20,3,-60,-18,-70,20,-24,-27,-62,-36,-68,8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-36,38,-72,-31,-58,-20,46,42,11,34,-1,-22,-76,5,-65,-32,-61,10,-80,-60; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=28,22,-22,35,-26,-4,-62,-71,20,-72,-66,1,35,-14,-59,-26,17,-36,-74,21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-35,-76,82,-4,-80,-16,-57,-37,14,-77,-72,36,-21,-53,8,-9,17,-38,-90,-70; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=19,-72,-63,-67,-71,79,-65,-76,-64,-76,-68,-52,-68,5,-69,33,-25,-38,-70,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-37,-76,-69,-69,35,-75,22,2,-12,-1,-49,-22,-24,-61,-26,-12,6,-55,-45,101;
MA   /M: SY='R'; M=-63,22,-21,-53,-75,-35,-2,-78,24,-76,-66,57,1,-47,80,-26,17,-74,18,-65;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-71,7,-68,-17,-78,-69,43,-70,39,21,-69,-23,-19,-72,-63,17,34,-73,9;
MA   /M: SY='V'; M=-17,-2,-27,13,-57,-40,-70,23,-64,19,-46,-68,0,-17,-8,-12,-23,60,-78,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-71,-75,-73,45,-78,-70,60,-67,-5,35,-1,-75,-19,-9,0,8,35,-70,-50;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-71,-42,-52,-78,-55,-46,-76,-43,-79,-66,107,-72,47,40,-47,-51,-76,-87,-69;
MA   /M: SY='C'; M=-61,59,52,22,-3,-17,-60,-11,-28,-13,-61,52,-71,-58,-64,-27,8,14,-85,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-75,-60,-33,-27,92,-65,-79,-66,-47,-8,34,-70,-64,-73,-51,-64,-40,-73,-17;
MA   /M: SY='K'; M=23,-75,-62,14,-22,-69,-60,1,51,-23,-57,-61,35,-13,10,-28,-58,-3,-66,42;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-77,47,23,-68,-17,92,9,3,-24,-5,4,-68,-12,-56,-10,-59,-34,-84,-12;
MA   /M: SY='A'; M=74,-67,-67,-66,-70,60,-67,-70,-65,-71,-64,-58,-68,-62,-70,-21,-57,-33,-70,21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-63,-11,-27,81,-6,8,-64,-43,-64,-18,-69,19,-29,-52,-64,-35,-74,-69;
MA   /M: SY='Q'; M=-34,-84,-57,-39,-30,-67,-52,-73,-44,-43,-58,-54,54,120,-46,-51,-61,-75,-72,-62;
MA   /M: SY='S'; M=-27,-68,-48,62,-74,-60,-60,-69,-52,-72,-67,-49,-61,-46,-59,76,44,-16,-83,-68;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-68,-82,-77,-50,-83,-75,27,-73,-38,61,-77,-77,-73,-74,-67,-53,88,-77,23;
MA   /M: SY='F'; M=-66,-76,-26,-64,75,-70,-55,-60,-30,-56,-5,14,48,5,-27,19,-59,-63,-50,71;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-82,-55,-54,-64,-71,144,-84,-57,-68,-54,-45,-71,-11,-21,-59,-68,-84,17,14;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-69,-81,-76,25,-83,-70,10,-75,60,2,-77,-80,-72,-74,-34,-6,49,-69,10;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-71,-84,-79,45,-84,-71,55,-75,43,68,-77,-78,-72,-75,-72,-25,26,-68,-47;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-71,-85,-79,-16,-87,-81,66,-77,37,-36,-79,-78,-75,-78,-71,-56,66,-77,-56;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-72,-85,-79,15,-86,-75,63,-77,57,23,-79,-24,-73,-77,-74,-60,26,-71,-52;
MA   /M: SY='P'; M=-30,-78,-63,-64,-81,66,-67,-80,-64,-83,-72,2,83,-63,-72,32,-57,-78,18,-75;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-57,-78,-64,-60,-27,66,-63,-17,14,-74,-66,-54,-21,40,44,-53,16,-71,-73,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-77,-93,-28,-10,-25,-43,-4,-86,22,-81,-73,-68,-25,-56,75,-72,-75,-84,19,49; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-21,-88,-26,4,-88,-40,-70,-81,42,-31,-74,-22,26,46,-24,10,-67,-42,-88,-79; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-19,-85,-67,-10,-89,37,-5,-17,12,-85,-77,26,-79,21,-68,12,-7,-79,-91,-80; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-82,72,-21,-69,16,-64,-80,5,-79,-75,5,3,-57,-4,-9,-62,-80,116,-56;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-36,-77,-4,-65,73,-75,23,5,-10,-6,37,-20,67,-68,-69,-30,-62,-57,-64,-45; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-78,32,-58,-71,41,-1,-10,-64,-11,-62,-58,76,-13,-71,6,-58,-14,-77,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-72,-18,-4,46,60,2,-29,-62,-37,-64,-11,-69,-60,-22,41,-19,-66,-70,-56;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,15,-61,-63,-71,13,12,-17,5,-30,10,53,46,-61,-64,5,-11,13,-84,-69; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-1,72,40,-13,-8,25,-60,-68,6,-70,-66,35,-72,-59,-63,7,-56,-1,-76,27;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-75,-9,-14,-6,-23,-66,-11,21,38,-50,35,-77,1,-62,-16,-60,28,-80,-62; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-80,15,9,18,-24,-68,21,49,-62,-61,-63,-73,-58,-8,-17,-63,16,69,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-69,-82,-66,-67,-63,0,-59,-18,-13,-70,12,47,-5,1,39,-62,11,-22,-72,55; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=15,-76,-4,13,-79,-18,-63,-72,59,-74,15,24,0,-52,-4,-11,-7,-20,-82,-71; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-75,9,-46,-76,-6,34,-72,90,-74,-64,-49,-65,-45,-35,1,-56,-7,-77,-64;
MA   /M: SY='H'; M=-64,-79,-58,-60,-66,41,131,-76,-62,4,-54,-47,-71,-53,-59,-58,-67,-77,-91,-45;
MA   /M: SY='W'; M=-72,-92,-91,-72,-45,-73,-86,-67,24,-63,58,-83,-76,-64,-63,-77,-79,-78,166,-33;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00694;
//
ID   NUDIX_MP; MATRIX.
AC   MP00893;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nudix hydrolase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3753557; R2=0.0186875; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=67; N_SCORE=7.617; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=7; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-15,-21,-19,-12,-3,-20,-13,0,-10,4,3,-13,-14,-10,-8,-10,-6,0,-21,-6,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-26,-14,-7,-9,-18,-9,-11,-2,-9,-5,-10,-14,-1,3,-9,-7,-11,-2,-1,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-3,-20,-5,-2,-22,-8,-5,-15,-1,-16,-8,0,-13,2,-3,0,-4,-12,-26,-13,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-24,-8,-3,-16,-11,-7,-17,5,-17,-10,-1,-10,1,11,-1,-5,-14,-19,-8,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-24,-5,-3,-13,-9,-5,-19,1,-17,-11,1,-15,-2,9,0,-4,-14,-23,-9,-4;
MA   /M: M=-7,-4,-22,-5,-7,-7,-14,-7,-15,-7,-15,-11,-2,-5,-8,-8,-2,-2,-13,-21,-6,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,0,-26,1,1,-20,-3,-2,-21,-1,-20,-13,1,-2,-2,-4,-2,-8,-19,-20,-10,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-7,-27,-8,-1,-17,-6,-3,-19,-1,-17,-9,-3,-4,1,0,-4,-8,-18,-22,-11,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-25,6,-1,-25,10,-2,-26,-7,-22,-15,8,-13,-6,-9,-1,-10,-22,-28,-17,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-1,-5,-17,-5,-2,-8,-9,-3,-9,-7,-6,-5,-4,-10,-5,-6,-2,-3,-7,-18,-5,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-23,-32,-22,-18,3,-16,-20,-10,-15,-8,-10,-24,-21,-14,-15,-25,-18,-16,76,15,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-19,-10,0,-15,-18,-11,-6,-5,-9,-3,-5,-15,5,-7,-1,0,-6,-25,-10,2;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-17,-29,-22,23,-24,-19,7,-23,12,6,-20,-22,-23,-18,-13,-4,7,-13,6,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-32,-17,-8,-18,-22,-21,-5,-15,-11,-8,-22,49,-14,-20,-13,-9,-12,-27,-21,-14;
MA   /M: SY='G'; M=8,-6,-24,-9,-6,-28,19,-13,-26,-2,-22,-12,-2,-14,1,-6,2,-7,-19,-21,-20,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: M=-8,-13,-25,-15,-12,-4,0,-5,-17,-4,-12,-5,-7,-20,-11,-2,-8,-10,-11,-17,-4,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-18,-31,-25,-1,-29,-25,24,-22,13,12,-25,-20,-21,-22,-15,-6,24,-16,-5,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-24,18,26,-29,-15,-1,-27,9,-22,-17,8,-9,11,1,-1,-8,-25,-30,-17,18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-26,0,8,-23,-17,-11,-18,5,-18,-12,-3,6,1,-2,-2,-5,-15,-27,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-28,10,-3,-30,31,-10,-35,-8,-28,-20,8,-16,-8,-11,2,-13,-27,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,8,-15,5,1,-19,-11,-11,-19,-6,-21,-17,9,-9,-3,-8,21,25,-11,-35,-16,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-27,-17,-13,-9,-25,-19,6,-17,0,0,-18,10,-14,-20,-13,-7,1,-21,-8,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-27,0,15,-17,-18,-8,-14,-1,-9,-9,-8,-9,3,-4,-7,-8,-14,-18,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,11,-25,16,22,-30,-14,-2,-23,2,-19,-14,3,-9,15,-4,2,-5,-21,-29,-16,18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,17,-20,-16,-19,-2,-23,-17,-16,-14,-13,-10,-19,-16,-21,5,3,-5,-29,-22,-16;
MA   /M: SY='A'; M=20,-19,-9,-26,-18,-4,-15,-20,4,-17,7,5,-18,-19,-16,-20,-5,-4,9,-20,-10,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-17,-22,-20,-12,-3,-23,-10,5,-11,4,4,-14,-21,-9,-6,-9,-6,4,-17,1,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,18,56,-28,-20,-1,-28,8,-17,-18,-1,-1,18,-1,-1,-10,-28,-30,-19,37;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-16,-27,-21,2,-25,-23,17,-22,17,9,-21,-23,-20,-19,-10,3,19,-24,-5,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-27,-12,-1,-7,-18,-2,-15,3,-11,-4,-8,-18,0,2,-12,-11,-15,-3,3,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-29,18,57,-30,-19,-1,-29,9,-20,-20,0,0,19,-1,0,-10,-29,-30,-20,38;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=6,-16,-14,-21,-17,-6,-20,-22,8,-17,5,1,-13,-18,-16,-17,2,13,14,-26,-10,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-28,-1,-14,-29,51,-13,-37,-15,-29,-20,9,-19,-15,-14,1,-16,-29,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-22,-31,-24,6,-29,-24,26,-25,21,13,-22,-24,-21,-23,-17,-6,20,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,7,-25,11,8,-22,-18,-3,-20,5,-18,-12,3,-11,2,4,0,-2,-15,-29,-12,4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-17,-19,-19,-16,-10,-11,-20,2,-14,-2,-2,-13,-11,-16,-14,-6,-4,6,-25,-14,-17;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,4,12,-24,-12,-6,-22,7,-20,-13,1,-4,4,2,1,-1,-18,-27,-15,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: M=-9,-2,-23,-3,-5,-6,-20,-5,-5,-9,-4,-3,-1,-16,-5,-9,-7,-6,-7,-22,-3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-20,-15,-5,-22,-16,9,-12,5,5,-16,-20,-13,-11,-9,-2,11,-21,-3,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-21,0,9,-19,-13,-3,-18,2,-16,-11,1,-10,6,5,2,-1,-15,-24,-11,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-19,-22,-21,-16,6,-28,-14,11,-16,8,4,-17,-19,-15,-15,-14,-6,6,-11,8,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-18,-20,-15,-1,-20,-17,4,-16,10,3,-16,-23,-14,-12,-14,-7,4,-19,-4,-15;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-23,-7,-7,-20,12,-15,-21,-10,-16,-13,-2,-10,-10,-12,2,-6,-15,-23,-18,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-6,-19,-7,-2,-11,-16,-7,-10,-5,-12,-6,-2,-16,-2,-4,3,0,-7,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-15,-16,-20,-14,7,-23,-11,-4,-12,-4,-2,-12,-21,-8,-8,-8,-2,-3,-10,5,-11;
MA   /M: M=-10,-9,-23,-9,-1,-9,-21,-5,-14,0,-12,-7,-6,-7,0,0,-7,-7,-14,-18,-3,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-7,-3,-21,-3,-1,-8,-8,-4,-13,-3,-10,-7,-2,-14,-2,-3,-3,-6,-11,-16,-3,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-31,-41,-32,-22,8,-22,-23,-11,-19,-10,-12,-30,-22,-17,-18,-31,-22,-21,90,20,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00695;
//
ID   HTH_DEOR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00894;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DeoR-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3819857; R2=0.0165701; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=201; N_SCORE=8.703; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-15,-21,-23,-17,-3,-19,0,16,-9,16,54,-17,-19,0,-10,-19,-10,7,-21,-1,-9;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-2,-16,1,11,-12,-11,13,-12,-2,-7,-5,-2,4,4,-3,-4,-7,-13,-15,-4,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-15,20,12,-18,-8,-1,-17,4,-13,-11,5,-4,5,-1,1,-2,-13,-17,-9,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-11,-14,-10,1,-12,-1,8,-7,10,22,-8,-12,-2,-6,-9,-3,3,-11,1,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-17,-5,-5,-10,-8,-4,-8,3,-10,-5,6,-13,-3,3,-2,-2,-9,-15,-3,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-22,-9,0,-16,-15,-12,-9,3,-9,-3,-8,0,-1,-1,-5,-2,-8,-21,-11,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-2,-18,-6,-2,-14,-11,-5,-13,1,-13,-8,2,-9,-1,-1,2,-2,-10,-21,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-24,7,21,-23,-16,-2,-17,2,-14,-9,-3,0,12,-2,-2,-7,-18,-23,-12,16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-11,-27,-13,-4,-15,-25,7,-2,-8,2,5,-8,-18,10,0,-11,-8,-8,-23,-2,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,6,-27,6,14,-30,-11,-2,-20,6,-21,-10,6,-11,20,0,1,-7,-22,-26,-15,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-6,-25,-8,6,-22,-18,-10,-11,5,-9,-3,-6,-12,10,0,-4,-4,-11,-23,-11,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27,2,-36,-25,41,-28,26,24,-22,-22,-18,-26,-22,-10,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-22,-26,-17,-1,-23,-21,16,-21,22,11,-21,-24,-17,-16,-18,-6,12,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-28,13,25,-30,-17,7,-26,14,-22,-10,5,-8,21,6,-1,-9,-26,-27,-13,23;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-20,-26,-21,-11,5,-26,-4,5,-10,15,15,-19,-24,-6,-3,-21,-11,-2,-5,15,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,30,-26,29,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=0,-3,-22,-8,-5,-16,-14,-10,-11,1,-12,-8,1,-18,-3,2,-4,-6,-8,-15,-11,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-27,6,19,-29,-17,-1,-21,13,-20,-8,3,-10,22,8,-1,-8,-22,-25,-13,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-27,0,6,-23,-15,12,-22,5,-17,-7,1,-15,16,11,-2,-6,-21,-24,-5,9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-28,-2,-7,-29,36,-14,-35,-6,-28,-18,2,-16,-8,-6,2,-12,-26,-23,-24,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-19,-11,-7,-1,-19,-2,-10,-2,-11,-5,-5,-16,-4,-3,2,7,-6,-15,7,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-12,-30,-24,0,-30,-24,22,-20,19,13,-25,-27,-21,-19,-17,-6,25,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-15,-5,-3,-18,-10,-4,-18,-5,-20,-13,6,-13,1,0,20,17,-10,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-16,-28,-25,-1,-30,-27,26,-21,12,9,-22,-24,-23,-20,-8,7,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-25,9,16,-26,-12,-3,-24,9,-22,-15,10,-11,10,8,3,-3,-22,-29,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-27,21,30,-29,-16,-2,-26,9,-22,-17,8,-8,12,2,0,-8,-23,-31,-18,20;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-19,-30,-21,4,-28,-22,22,-26,33,17,-26,-26,-19,-21,-21,-8,16,-21,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-7,-21,-16,-13,-13,-20,2,-14,-5,-1,-12,-17,-14,-18,6,5,11,-27,-15,-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,8,-26,10,21,-29,-9,-4,-23,5,-20,-14,5,-9,13,-2,1,-8,-22,-27,-17,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-14,-25,-14,-3,-7,-22,-1,-2,-9,4,3,-12,-20,-4,-3,-13,-10,-4,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-16,-34,-25,41,-29,-18,8,-28,25,9,-23,-29,-28,-19,-23,-8,4,-5,16,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,9,-26,9,-3,-30,24,-8,-32,-6,-28,-19,11,-15,-2,-9,4,-10,-26,-27,-23,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-15,-30,-28,1,-30,-26,28,-20,10,10,-26,-27,-26,-21,-10,0,39,-24,-3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=11,-1,-10,-3,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-25,-18,7,-10,-2,-11,34,24,-8,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-28,6,13,-25,-16,-3,-21,2,-21,-14,-4,8,0,-5,-3,-5,-17,-29,-16,5;
MA   /M: SY='M'; M=4,-6,-19,-11,2,-17,-15,-6,-6,-3,-6,7,-6,-13,7,-5,0,-2,-5,-25,-12,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=2,-27,-20,-33,-27,-2,-30,-28,33,-24,14,12,-23,-23,-22,-25,-13,-5,32,-24,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,6,-30,28,-20,-9,1,-20,10,66,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-29,-7,2,-22,-19,-1,-29,30,-22,-10,2,-18,10,57,-8,-9,-20,-21,-11,2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,15,-32,-22,25,-30,39,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-22,5,6,-22,-12,-1,-17,2,-20,-12,19,-15,8,5,5,1,-18,-31,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-27,-2,14,-14,-21,-6,-17,13,-16,-10,-1,-11,5,4,-5,-5,-16,-19,-4,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-27,-17,4,-29,-12,14,-22,37,16,-24,-28,-15,-10,-26,-11,6,-21,0,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-23,6,23,-21,-17,-4,-17,-3,-11,-12,-4,-9,5,-7,2,-3,-14,-29,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-26,7,21,-26,-12,2,-23,6,-21,-12,7,-3,10,-1,0,-6,-23,-28,-16,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,1,-27,5,14,-26,-17,-3,-20,7,-17,-9,-2,-6,17,1,-2,-7,-21,-23,-10,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-28,-10,-17,-24,41,-15,-26,-17,-21,-13,-2,-20,-17,-17,-2,-16,-19,-22,-22,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-13,-21,-16,-13,-5,-23,-15,5,-7,8,6,-12,-21,-12,-9,-12,-4,5,-22,-4,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-22,-31,-22,2,-31,-24,25,-26,29,15,-26,-19,-20,-23,-21,-8,18,-22,-4,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-22,-8,-3,-14,-22,-10,-8,-1,-6,-5,-6,-16,-4,6,-2,6,-3,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-28,-10,-4,-18,-10,-5,-24,18,-15,-8,-3,-19,2,37,-9,-10,-17,-18,-8,-4;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-18,-15,-13,-9,-15,0,-3,-13,-7,-2,-6,-18,-9,-13,1,5,2,-24,-3,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-3,-27,-4,-5,-8,-18,54,-21,-6,-17,-5,6,-21,3,1,-4,-10,-22,-17,24,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-29,-8,-14,-28,52,-17,-33,-17,-26,-18,3,-19,-16,-18,0,-17,-26,-22,-27,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00696;
//
ID   3_HYDROXYISOBUT_DH_MP; MATRIX.
AC   MP00895;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6251192; R2=0.0156328; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=383; N_SCORE=11.602; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=6,-23,-17,-31,-21,28,-20,-20,2,-23,14,2,-19,-23,-25,-20,-12,-7,3,-8,5,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-10,-15,-11,-15,-8,-19,-4,-13,-13,-9,-7,-15,-11,-16,17,8,9,-31,-17,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-13,-15,-13,-10,-13,-15,-14,-6,-3,-14,-7,-6,-19,-8,7,10,5,8,-31,-14,-10;
MA   /M: SY='C'; M=14,-9,34,-15,-13,-20,-10,-19,-21,-17,-21,-17,-5,-20,-13,-19,15,5,-7,-38,-23,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-11,-15,-16,-11,-9,-11,-5,2,-10,-3,24,-6,-15,0,-10,7,4,1,-29,-9,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-20,-19,-10,-10,-18,-3,2,-4,2,27,-10,-16,6,0,-5,3,-1,-23,-5,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,3,-11,-2,-1,-14,-5,-7,-12,5,-14,-9,6,-8,-1,0,7,4,-8,-18,-10,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-1,-17,-1,7,-16,-15,12,-13,-4,-13,-6,0,-10,5,-4,5,5,-9,-25,-5,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-21,-7,-9,-16,7,-6,-12,-8,-14,0,5,0,-6,-10,-3,-7,-15,-23,-16,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,5,-17,5,12,-21,-3,0,-18,0,-19,-11,9,-8,15,-1,10,-1,-18,-23,-13,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-6,-18,-12,-4,-5,-17,-7,-2,-1,-3,11,-4,-15,-3,-4,-5,0,-1,-20,-6,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-18,-11,-5,-5,-15,-10,-12,-3,-14,-9,-5,-2,-4,-6,4,7,-10,-16,-1,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-23,0,0,-20,-16,1,-20,9,-19,-10,6,-9,0,9,1,2,-15,-28,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-19,-32,-27,1,-33,-28,33,-25,19,14,-25,-25,-24,-23,-15,-2,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,42,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-29,53,-31,-18,10,-26,10,4,-22,-29,-33,-20,-18,-8,10,2,25,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-29,8,-37,-28,39,-29,22,17,-23,-23,-23,-27,-20,-9,28,-19,1,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-17,-2,-9,-14,-11,-7,-2,-9,-16,-9,21,-20,-6,-9,8,2,-3,-35,-15,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-21,-27,-16,-4,-20,1,16,-8,16,54,-18,-19,6,-8,-18,-10,6,-20,-1,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=6,-9,-18,-16,-12,-5,-3,-12,-10,-6,-10,2,-4,-16,-9,-9,1,-1,-7,-20,-9,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-34,-7,-4,-28,-1,-10,-25,-9,-29,-18,-8,44,-8,-11,-4,-10,-28,-29,-25,-10;
MA   /M: SY='M'; M=1,-18,-18,-28,-18,-4,-16,-4,14,-10,14,47,-18,-18,-2,-12,-14,-8,8,-20,-4,-10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-10,-18,-10,-19,-2,-19,-9,-11,-11,-10,-9,-11,-10,-19,12,2,2,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-21,-11,-6,-18,-11,-13,-9,2,-11,-5,-3,-16,-1,0,0,-3,-5,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-20,10,0,-20,-5,17,-22,0,-28,-16,38,-18,2,5,11,0,-25,-37,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-9,-30,-22,8,-31,-18,15,-28,37,14,-27,-30,-20,-21,-26,-10,8,-18,5,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-19,-32,-25,2,-30,-25,29,-24,24,17,-25,-25,-21,-22,-18,-6,27,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-13,9,-28,8,5,-27,-9,-4,-30,27,-28,-14,12,-15,5,26,-5,-9,-23,-25,-14,4;
MA   /M: SY='A'; M=20,-1,-20,-7,-5,-20,-6,-6,-17,-7,-17,-12,1,-14,-1,-13,2,-6,-14,-7,-12,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,60,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-8,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-12,-28,-12,-10,-4,-15,39,-14,-11,-3,1,-7,-24,-4,-7,-15,-15,-17,-12,24,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-25,-2,1,-26,-8,-10,-21,5,-23,-12,-2,0,7,2,3,0,-16,-27,-17,3;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-14,-25,-21,1,-27,-23,15,-21,21,9,-22,-25,-21,-17,-10,9,20,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-14,-23,-18,-16,-3,-23,-3,-1,-12,-4,-2,-9,-21,-11,-8,-7,4,0,-5,7,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-18,-24,-27,-10,4,-27,7,-21,-3,0,-19,-26,-26,-21,-7,-7,22,-26,-16,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-20,-23,-26,-21,30,-25,0,1,-18,2,0,-15,-24,-19,-16,-12,-5,-2,4,33,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-16,42,-26,52,13,-33,-10,-1,-33,-1,-27,-26,23,-11,-1,-9,4,0,-26,-39,-19,6;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-24,-23,-25,-18,-5,-29,-19,12,-11,11,7,-20,-17,-14,1,-17,-7,13,-23,-7,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-19,0,-5,-14,-4,-4,-18,-3,-21,-14,22,-17,-2,2,8,8,-18,-29,-14,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00697;
//
ID   LACY_1_MP; MATRIX.
AC   MP00896;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LacY family proton/sugar symporters signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4445872; R2=0.0124258; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1324; N_SCORE=20.886; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=166; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='C'; M=0,-22,64,-29,-28,-14,-26,-29,-9,-24,-9,-9,-22,-33,-28,-26,-8,-6,10,-40,-23,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-8,-24,-19,-18,-4,-25,-15,20,-21,12,7,3,-23,-14,-18,-13,-7,6,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-16,0,6,-26,-6,-4,-20,-4,-27,-14,7,-10,19,-4,27,11,-16,-34,-17,13;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,32,-30,-20,14,-30,37,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-17,-31,-24,52,-27,-20,-3,-24,4,-3,-14,-24,-31,-17,-7,9,0,-3,17,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-9,-4,-20,0,-14,-16,-10,-21,-16,1,-10,-4,-14,27,11,-6,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-19,-24,-17,1,-24,-19,15,-25,24,10,-18,-23,-15,-19,-11,-2,8,-25,-5,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-9,7,-27,-20,7,-7,4,-7,19,-6,-13,41,4,-6,-10,-17,-20,-7,24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-34,-16,-6,-21,-20,-14,-7,-10,-14,5,-20,56,-7,-17,-13,-10,-17,-27,-21,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-20,-35,-26,29,-31,-23,20,-28,26,12,-25,-29,-28,-21,-22,-8,17,-12,8,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-23,-31,-24,47,-30,-7,5,-24,17,5,-23,-30,-26,-17,-23,-10,-1,9,38,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,32,-27,30,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,36,-27,25,17,-26,-26,-23,-24,-19,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-16,0,6,-26,-6,-4,-20,-4,-27,-14,7,-10,19,-4,27,11,-16,-34,-17,13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,41,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,1,-31,0,-2,-17,-16,30,-21,-7,-23,-11,10,13,-1,-7,-6,-11,-28,-25,1,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-14,28,-20,-19,-13,-22,-23,-6,-20,-12,-9,-10,-23,-18,-20,7,10,5,-38,-18,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-34,-21,41,-24,20,33,-20,-20,-14,-24,-20,-10,24,-20,0,-24;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-24,-30,-25,20,-6,-22,4,-27,12,3,-17,-26,-26,-22,-17,-13,0,-11,2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-31,-18,29,-25,33,30,-24,-24,-15,-21,-24,-10,16,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-27,-20,-33,-23,25,-27,-15,15,-25,32,25,-25,-27,-20,-17,-25,-10,7,-12,8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-17,-31,-24,52,-27,-20,-3,-24,4,-3,-14,-24,-31,-17,-7,9,0,-3,17,-24;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-16,-17,-13,-23,22,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-37,-27,55,-27,-14,6,-24,13,19,-20,-27,-27,-17,-20,-10,3,1,21,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00698;
//
ID   LACY_2_MP; MATRIX.
AC   MP00897;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LacY family proton/sugar symporters signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9940000; R2=0.0145703; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1032; N_SCORE=20.021; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,12,-13,-1,-7,-13,-14,-11,-13,-7,-16,-13,19,-13,-7,-7,17,35,-9,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='F'; M=3,-19,-19,-27,-21,15,-3,-14,-4,-18,1,11,-14,-21,-18,-17,-9,-9,-2,-11,-1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-8,-33,42,-11,-34,-11,-27,-14,0,-17,5,-11,0,-17,-30,-20,-24,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,5,32,-21,-23,-9,-11,1,-11,-11,-9,-9,5,-6,-3,-7,-5,-30,-17,18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,5,-32,-25,30,-27,31,17,-28,-28,-23,-22,-21,-7,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,13,-30,-22,3,-30,-22,8,-30,33,10,-28,-32,-22,-22,-25,-10,5,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-23,20,19,-23,-6,7,-23,3,-27,-20,41,-14,6,0,7,-3,-30,-37,-20,12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-20,-24,-17,-1,-24,-20,16,-24,20,9,-16,-22,-14,-20,-8,-2,9,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,16,-37,-30,-6,-37,-30,25,-30,8,8,-20,-26,-23,-30,-17,-10,18,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=2,-24,-17,-34,-24,49,-21,-20,-3,-24,4,-3,-17,-24,-31,-20,-11,-7,0,1,15,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-26,35,-36,-30,14,-33,-27,3,-30,1,-2,-20,-31,-30,-27,-16,-10,5,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-16,-24,-16,-11,-17,-23,9,-16,-1,-1,-11,-13,-13,-21,3,9,9,-22,-11,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-29,-25,-34,-24,26,-22,-22,-1,-24,11,-1,-26,-27,-24,-20,-22,-13,-4,30,13,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-30,-27,-40,-30,25,-37,-27,35,-30,17,14,-20,-23,-26,-27,-20,-10,21,-11,9,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-25,-14,-10,-26,13,-20,-21,-13,-22,-16,-10,18,-13,-20,1,-9,-18,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=38,-8,-10,-18,-10,-18,-5,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,12,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-16,-17,-13,-23,22,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-16,-24,-16,-23,-21,39,-23,-18,-20,-18,-11,-9,-23,-23,-20,-3,-14,-5,-23,-24,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-17,-20,-20,-8,-3,-23,0,-19,2,-1,-14,-22,-20,-17,-3,7,10,-26,-13,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-9,-5,-18,-5,-15,-15,-10,-19,-15,1,-10,-5,-13,26,21,-5,-31,-18,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-32,-27,3,-32,-27,32,-25,25,15,-28,-28,-25,-22,-19,-5,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-20,-28,-20,2,-30,-23,21,-25,27,13,-20,-22,-18,-20,-15,4,13,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,48,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,12,-8,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='C'; M=4,-6,30,-9,-9,-20,-9,-16,-23,-16,-27,-20,1,-19,-9,-16,25,11,-10,-43,-23,-9;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-13,-11,-5,-20,-3,1,-16,-10,-18,-11,-1,-12,-4,-14,16,3,-8,-28,-14,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-18,-31,-22,43,-25,-18,3,-27,16,3,-18,-27,-28,-18,-14,-5,2,-7,13,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00698;
//
ID   EPENDYMIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00898;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ependymins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1705112; R2=0.0156416; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=985; N_SCORE=20.567; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-18,-23,-21,-3,20,-25,-10,1,-15,13,13,-17,-20,-12,-13,-17,-10,-3,-13,5,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-23,-24,-22,17,-28,5,11,-12,6,14,-22,-28,-13,-12,-18,-8,8,6,44,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-32,-24,3,-29,-19,28,-23,27,28,-26,-26,-17,-19,-21,-8,23,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-23,-22,-25,-17,17,-28,7,5,-25,26,11,-19,-28,-17,-15,-23,-12,-1,-16,11,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,44,-30,-20,-3,-30,23,-23,-17,0,-3,17,10,-3,-10,-27,-27,-17,30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-20,-34,-24,38,-27,-14,11,-24,22,24,-22,-27,-23,-17,-22,-10,6,-7,13,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,7,0,-16,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-30,36,29,-38,-16,3,-31,6,-24,-18,9,-8,24,-1,0,-10,-30,-31,-17,27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-19,-8,1,-20,-13,-3,-10,-6,-11,2,-2,-14,17,-5,11,3,-11,-29,-12,9;
MA   /M: SY='K'; M=7,-3,-24,-6,2,-25,-14,9,-24,19,-22,-8,-1,-12,4,8,-4,-9,-16,-22,-7,2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-17,10,-3,-17,-6,0,-17,-3,-24,-17,41,-17,-3,-3,13,16,-20,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,5,26,-34,-20,1,-26,23,-23,-8,0,-8,35,14,-3,-10,-27,-22,-12,30;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-16,0,6,-26,-6,-4,-20,-4,-27,-14,7,-10,19,-4,27,10,-16,-34,-17,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-24,-1,4,-24,-14,13,-27,16,-27,-11,5,-13,7,16,6,-2,-19,-28,-7,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-9,-24,-13,4,-13,-20,-2,-1,6,1,28,-11,-13,7,0,-13,-10,-5,-22,-7,5;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-24,-3,8,-28,-20,12,-18,1,-17,-3,1,-11,31,2,5,8,-20,-25,-6,19;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-19,-5,7,-2,-13,-8,-17,-8,-18,-13,0,-13,3,-8,13,3,-14,-24,-7,6;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-9,-29,-7,-2,-21,-20,15,-23,-1,-21,-11,-4,18,0,8,-4,-1,-22,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='W'; M=0,-19,-31,-22,-14,-3,-17,-13,-16,0,-16,-11,-19,-20,-9,-7,-17,-14,-16,45,18,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,16,-30,23,6,-26,-17,68,-33,-7,-23,-10,13,-17,7,-3,-7,-17,-30,-33,7,3;
MA   /M: SY='P'; M=5,-20,4,-21,-13,-16,-19,-22,-10,-19,-5,-8,-20,12,-16,-22,-10,-7,-9,-29,-21,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,23,-30,36,47,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,39,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=5,-11,-29,-9,4,-31,-15,-10,-17,-4,-22,-11,-11,33,13,-10,-2,-7,-22,-24,-21,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,30,-25,24,0,-27,15,0,-30,-5,-30,-22,36,-18,-5,-7,5,-7,-30,-35,-23,-3;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='T'; M=7,-5,-10,-14,-12,-10,-19,-21,-5,-11,-8,-8,-5,-12,-12,-13,15,37,6,-29,-11,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00699;
//
ID   EPENDYMIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00899;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ependymins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5037737; R2=0.0131035; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=689; N_SCORE=13.522; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-17,-31,-24,52,-27,-20,-3,-24,4,-3,-14,-24,-31,-17,-7,9,0,-3,17,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-1,3,-17,0,0,-20,-5,-5,-23,2,-27,-17,14,-14,3,13,22,9,-15,-35,-17,0;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-7,-19,-19,-20,37,-20,-12,-2,-19,-3,-5,5,-27,-26,-14,-9,-5,-3,-12,8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-20,-17,-26,-19,38,-20,-17,-4,-24,2,-4,-12,-24,-24,-17,-2,0,-2,-10,10,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-30,29,17,-35,8,-4,-35,-2,-27,-21,8,-11,7,-8,0,-13,-30,-30,-21,12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-24,-2,20,-23,-23,-7,-8,0,-10,-5,-10,-12,15,-4,-3,-7,-4,-27,-14,17;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-13,-17,-18,-13,-5,-23,-17,1,-15,9,7,-13,-8,-11,-14,-2,21,2,-26,-8,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-30,9,31,-30,5,-7,-33,7,-24,-19,0,-7,8,-1,-1,-13,-29,-26,-21,20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,13,-30,19,13,-33,-17,-7,-33,37,-30,-15,5,-10,7,19,-7,-10,-23,-25,-13,10;
MA   /M: SY='D'; M=-5,32,-25,40,18,-32,-8,-2,-30,0,-25,-24,17,-10,1,-9,3,-7,-25,-35,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13,-3,-25,-21,-20,-15,-13,-19,-15,-21,74,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-25,9,33,-30,-15,0,-25,5,-23,-15,3,-5,25,0,11,-2,-25,-30,-17,29;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-11,-29,-27,-2,-26,-26,26,-18,9,14,-27,-27,-25,-19,-9,-1,42,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,-8,-11,-14,-14,-10,-17,-20,1,-13,-8,-6,-5,-17,-14,-13,11,22,13,-31,-13,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-34,-16,-6,-17,-23,-20,-7,-16,-4,-7,-23,51,-13,-20,-16,-10,-17,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-21,-24,-21,35,-27,-4,-3,-16,1,-3,-15,-25,-20,-13,-9,6,-4,7,39,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,21,44,-34,-19,3,-29,9,-21,-16,3,-4,28,1,0,-10,-30,-29,-17,36;
MA   /M: SY='G'; M=5,-14,-25,-18,-20,-20,32,-19,-15,-18,-13,-2,-7,-18,-16,-20,-4,-14,-12,-20,-20,-18;
MA   /M: SY='V'; M=12,-25,-11,-27,-23,-4,-22,-26,18,-19,10,6,-25,-25,-23,-20,-7,-1,31,-26,-11,-23;
MA   /M: SY='E'; M=8,1,-22,2,22,-29,-12,-4,-21,2,-19,-12,-1,-7,20,-4,9,-3,-19,-26,-17,21;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,15,-30,39,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,22,41,-31,-19,-3,-31,20,-24,-19,3,-4,14,7,-3,-10,-27,-29,-17,28;
MA   /M: SY='A'; M=13,-8,-15,-15,-3,-13,-13,-12,-4,-7,-3,8,-9,-11,-3,-12,3,8,-1,-24,-12,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-25,-6,-3,-23,0,-14,-20,-10,-26,-17,-6,35,-7,-14,6,-2,-20,-27,-23,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-26,35,30,-30,-13,-1,-30,9,-22,-20,8,-5,8,-1,-1,-9,-25,-29,-16,19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-22,36,7,-27,7,-4,-29,-4,-22,-20,11,-9,-4,-9,0,-9,-22,-25,-16,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-5,19,-8,-5,-18,-17,21,-20,-9,-14,-5,-3,-18,5,-6,-5,-10,-16,-25,-5,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-2,0,-12,0,2,-14,-6,10,-15,5,-17,-7,4,-7,3,3,8,1,-11,-19,-4,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-9,2,-20,-4,-8,-4,-5,-5,-12,-5,-15,-12,8,-15,-5,-5,-8,-8,-18,28,2,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,22,-19,29,7,-27,-8,-7,-27,-6,-26,-23,13,-10,-2,-10,18,12,-17,-38,-18,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-6,22,-23,27,4,-29,9,-5,-31,-7,-30,-24,19,-13,-4,-10,13,-1,-24,-36,-22,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,18,-26,9,0,-20,-11,60,-26,-6,-24,-9,32,-20,6,0,-1,-11,-30,-34,2,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,33,-23,42,10,-30,-13,-7,-30,-3,-23,-23,13,-10,-3,-10,7,11,-20,-37,-17,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00699;
//
ID   RNA_POL_PHAGE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00900;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacteriophage-type RNA polymerase family active site signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8653193; R2=0.0166079; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=140; N_SCORE=8.180; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-25,6,19,-23,-16,-2,-21,7,-19,-13,2,-10,11,0,1,-3,-20,-22,-8,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=9,-19,-5,-26,-18,3,-19,-20,2,-19,9,4,-17,-21,-18,-19,-7,1,6,-20,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-22,-23,-18,1,-19,-13,6,-13,16,10,-21,-26,-15,-7,-19,-9,6,-16,4,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-2,6,-23,6,2,-24,-6,-8,-22,7,-22,-14,7,-15,-1,7,2,-5,-14,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-10,6,-24,9,1,-16,-17,-6,-11,-4,-9,-6,2,-16,-3,-8,-2,-4,-11,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,13,4,-25,-3,10,-28,-3,-25,-17,11,-8,0,-6,6,0,-23,-32,-13,1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-24,18,14,-26,-10,7,-28,6,-27,-18,16,-12,6,4,8,-2,-23,-34,-14,9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-1,-30,3,-4,-24,-10,-10,-13,-11,-19,-13,-3,17,-10,-17,-5,-9,-15,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-27,3,18,-20,-20,-10,-16,-1,-8,-11,-8,5,1,-7,-5,-4,-17,-28,-16,9;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-21,8,6,-20,-8,-6,-21,-1,-24,-18,17,-13,0,-5,9,4,-20,-20,-15,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-19,-20,-25,-23,37,-25,-7,2,-19,1,-1,-13,-28,-24,-15,-12,-6,3,1,29,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-12,-26,-14,-13,-10,-26,-17,9,-9,3,3,-9,-13,-11,-8,-14,-8,5,-25,-9,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,0,-9,-8,-16,-13,-15,-16,-8,-20,-14,0,-16,-6,-3,20,20,-4,-35,-16,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-9,-25,-9,-9,5,-20,46,-14,-11,-10,-2,-3,-21,-2,-6,-8,-11,-17,-6,34,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-21,-19,-14,-2,-25,-15,12,-20,20,8,-8,-23,-10,-15,-14,-1,3,-25,-5,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,37,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-12,-24,-15,-5,0,-22,23,-11,-12,-1,2,-7,-20,5,-7,-11,-12,-14,-17,8,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-15,-25,-18,-3,-2,-24,-3,-2,-8,6,13,-13,-19,17,-5,-13,-10,-10,-15,1,8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=22,-10,-21,-14,-16,-26,39,-20,-27,-16,-21,-16,-4,-16,-16,-20,4,-11,-17,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-19,104,-29,-28,-20,-26,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-36,-28,-29,-8,-9,-9,-46,-29,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-1,22,-16,11,0,-20,0,1,-20,-4,-30,-20,38,-16,0,-4,23,9,-21,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-23,-33,-25,23,-32,-18,22,-27,26,13,-24,-28,-23,-21,-23,-9,14,-9,15,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-4,-30,-5,-4,-18,-22,84,-20,-12,-15,2,6,-20,6,-4,-11,-19,-23,-29,18,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-26,-30,-24,25,-31,-6,16,-21,16,15,-22,-27,-17,-17,-22,-10,6,2,32,-23;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-10,-13,-8,-18,-4,-17,-9,-11,-16,-12,-4,-12,-8,-16,21,9,2,-30,-19,-8;
MA   /M: SY='A'; M=30,-15,-14,-22,-13,-8,-10,-15,-3,-14,3,-3,-15,-16,-12,-19,-2,-3,1,-14,-4,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-31,-21,16,-27,-14,18,-24,36,30,-26,-27,-16,-17,-26,-10,9,-16,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-16,-19,-17,-16,-10,5,-19,-7,-21,3,-3,-11,-21,-16,-17,-2,-1,-3,-26,-14,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-24,-11,-11,-11,-4,-9,-11,-6,2,-3,1,-24,-8,8,-12,-10,-13,-24,-12,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-19,-18,-10,-4,-24,-19,5,-8,-2,0,-11,-18,-12,-10,-2,3,9,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-26,2,10,-17,-22,-11,-9,-1,-8,-8,-5,-15,-3,-6,-9,-9,-7,-19,-11,3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-20,-26,-20,-20,-5,13,-15,-9,-23,9,0,-16,-26,-19,-19,-16,-14,-10,-14,-3,-20;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-18,-16,-13,-17,17,-14,-18,-13,-16,-12,-7,-15,-12,-18,6,-6,-11,-15,-11,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-4,-23,-5,6,-22,-17,-10,-15,11,-19,-9,-1,-11,6,7,4,1,-11,-26,-13,5;
MA   /M: SY='Q'; M=4,0,-24,-4,7,-24,-14,12,-19,3,-18,-7,2,-13,18,-1,0,-8,-20,-20,-4,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00410;
//
ID   CYS_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP00901;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate attachment site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7915683; R2=0.0132441; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=463; N_SCORE=10.914; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=129; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-26,-10,-4,-12,-22,-3,-17,17,-15,-6,-5,-19,3,27,-7,-2,-10,-14,4,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-20,-26,-17,1,-27,-18,11,-18,25,12,-21,-22,-15,-9,-23,-10,4,-16,-3,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-23,6,0,-20,-11,0,-17,8,-21,-12,26,-18,2,11,2,-3,-20,-31,-15,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-27,1,0,-22,-17,-2,-21,11,-21,-12,7,-9,2,22,-2,-4,-17,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-22,-24,-19,3,-27,-15,17,-21,18,11,-21,-25,-18,-18,-18,-9,15,-19,2,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,-12,-20,-14,-12,-11,-2,-17,-10,-13,-11,-8,-8,-11,-10,-12,3,2,-4,-24,-14,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-26,8,6,-22,-13,-9,-16,5,-16,-11,1,0,0,-3,-5,-8,-16,-25,-14,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-26,2,-1,-26,20,-12,-28,-6,-24,-17,0,1,-7,-9,0,-11,-23,-23,-22,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-4,4,-9,-9,-10,-17,-9,-11,-12,-6,-8,-1,-17,-11,-11,-4,-1,-9,-28,-12,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-2,2,-22,0,-6,-21,6,-8,-18,-4,-19,-12,7,-15,-8,-7,-1,-8,-12,-27,-17,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,3,-19,-16,-18,1,-19,-12,-17,-14,-10,-10,-17,-16,-20,4,-4,-1,-28,-20,-17;
MA   /M: SY='B'; M=-9,17,-25,16,16,-26,-12,0,-26,8,-23,-17,17,-12,8,10,3,-3,-24,-31,-17,11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,1,-34,-28,37,-26,21,16,-25,-25,-23,-24,-17,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-26,-24,-29,-22,14,-24,-14,5,-19,9,2,-25,-27,-19,-17,-20,-10,3,18,20,-21;
MA   /M: SY='A'; M=32,-16,-12,-24,-15,-12,-10,-22,2,-15,2,-2,-16,-16,-15,-20,0,-2,10,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-2,-31,-22,2,-29,-23,16,-28,31,12,-26,-28,-21,-23,-23,-9,11,-24,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-15,-23,-18,-15,10,-10,-7,-9,-15,-5,-4,-9,-21,-15,-13,-6,-7,-9,-7,6,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-16,-18,-21,-14,10,-23,-6,-2,-9,6,11,-10,-24,-6,2,-14,-8,-5,-14,6,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-22,20,9,-22,-3,8,-22,2,-28,-20,51,-17,3,0,8,-2,-30,-38,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,81,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,1,-14,-16,-19,22,-20,-27,-18,-22,-17,-4,-20,-17,-19,7,-5,-16,-27,-23,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-17,-10,-15,-14,29,-10,-28,-16,-24,-16,2,-21,-15,-15,3,-10,-21,-21,-14,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-14,-30,-28,-1,-30,-28,29,-20,10,12,-27,-25,-26,-21,-11,-2,42,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-19,40,-9,56,13,-37,-13,-4,-39,-4,-29,-29,15,-14,-4,-13,-1,-10,-27,-41,-21,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-25,-27,-31,-22,-6,-30,-25,28,-23,10,11,-20,-4,-17,-25,-15,-8,16,-22,-8,-23;
MA   /M: SY='G'; M=25,-9,-19,-14,-14,-25,32,-19,-24,-15,-20,-15,-4,-15,-14,-19,7,-8,-14,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-21,-23,-15,6,-24,-9,4,-13,12,5,-19,-24,-11,-8,-15,-8,3,-12,8,-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-20,-2,2,-14,-10,-1,-18,-1,-20,-13,9,-15,3,2,10,2,-16,-23,-3,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-31,-22,1,-23,-6,24,-14,21,50,-21,-21,-5,-13,-20,-10,14,-20,0,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,2,-38,-30,44,-28,18,17,-22,-22,-23,-28,-18,-8,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-28,-4,8,-17,-17,-12,-16,2,-16,-12,-6,-14,0,-2,-5,-5,-14,-4,-8,4;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-27,30,18,-31,-14,0,-30,6,-23,-19,8,-9,7,1,1,-5,-23,-31,-16,12;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-12,-20,-11,-19,4,-20,-11,-12,-9,-9,-10,-12,-11,-20,7,-2,-2,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-27,8,40,-17,-21,-5,-20,1,-8,-13,-5,-7,9,-5,-4,-9,-21,-26,-14,25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-27,3,17,-28,-17,-4,-26,21,-22,-11,1,-10,16,19,-2,-6,-21,-24,-14,16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,8,-24,8,11,-25,-13,-6,-25,13,-22,-15,7,-11,4,10,3,-1,-18,-28,-15,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-9,-18,-29,61,-18,-39,-15,-30,-19,2,-20,-17,-14,0,-19,-29,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-4,-9,-21,-13,-8,0,2,-2,-8,-19,-6,3,-9,-2,-5,-23,-8,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,36,-30,34,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,21,-20,0,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-22,-4,-2,-20,-12,-9,-18,11,-21,-11,4,-10,-3,6,2,5,-10,-28,-13,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-35,-7,4,-29,-18,-15,-22,3,-28,-17,-12,53,-1,-5,-6,-8,-26,-28,-24,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-28,1,-11,-27,41,-9,-35,-12,-28,-19,6,-18,-13,-13,1,-14,-27,-23,-21,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-23,8,5,-24,-8,-11,-21,5,-21,-14,3,-12,-1,-1,4,2,-13,-29,-16,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00700;
//
ID   GLUTAMATE_5_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP00902;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamate 5-kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9205489; R2=0.0170283; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=129; N_SCORE=8.107; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=35; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-6,-6,-21,-7,-3,-10,-18,-5,-4,-9,-10,-6,-4,-8,-7,-10,0,0,-2,-24,-5,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-24,6,11,-21,-16,2,-21,2,-19,-13,5,-8,4,3,2,-1,-17,-28,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-21,-5,2,-16,-12,-7,-13,-1,-13,-9,-3,-15,-2,-2,1,-3,-7,-26,-11,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-25,-16,-10,-8,-21,-17,9,-15,-1,1,-9,-11,-11,-17,-6,-4,4,-24,-8,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-2,7,-20,7,3,-21,-13,-12,-18,-1,-17,-14,3,-6,-4,-7,7,12,-12,-30,-15,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,3,-29,9,11,-25,-15,-5,-20,-2,-19,-14,-2,13,1,-7,-4,-7,-21,-29,-17,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,6,15,-20,-15,-4,-17,-2,-11,-9,-2,-12,6,-6,-2,-5,-15,-27,-12,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-14,-24,-18,-15,-6,-23,-18,14,-18,8,6,-11,-20,-12,-17,-12,-6,7,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-26,0,13,-17,-12,-8,-17,-1,-8,-8,-5,-14,2,-4,-7,-10,-16,-23,-12,7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-19,-12,-5,-14,-13,-12,-6,-4,-8,-5,-7,-16,-5,-7,0,-3,-2,-22,-9,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-15,-16,-22,-16,-6,-19,-11,9,-13,5,16,-12,-20,-8,-13,-6,0,8,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-13,-14,-7,-14,-2,-16,-14,-9,-12,-10,-7,-13,-7,-13,6,-1,-6,-20,-15,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-16,-6,-10,-15,25,-7,-18,-10,-15,-8,0,-12,-9,-9,1,-7,-13,-15,-14,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-25,4,-7,-28,32,-12,-31,-11,-27,-19,7,-14,-10,-13,5,-10,-24,-27,-24,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-20,0,2,-23,-6,-12,-19,-5,-20,-16,-2,5,-3,-10,9,4,-14,-27,-18,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-24,-7,-9,-25,24,-11,-26,-5,-24,-14,3,-15,-9,-8,1,-9,-19,-24,-20,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-15,1,-4,-21,8,-10,-22,-10,-27,-19,14,-13,-5,-10,26,15,-15,-35,-20,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-24,-2,4,-21,-5,-10,-21,4,-19,-12,0,-10,-1,4,2,-4,-15,-26,-16,1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-23,-30,-23,21,-28,-16,7,-21,13,6,-24,-27,-23,-15,-22,-11,7,5,10,-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-26,-9,-17,-28,56,-19,-35,-18,-29,-19,1,-18,-17,-19,6,-13,-25,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-16,-10,-7,-14,-19,-14,-14,2,-13,-9,-1,-14,-5,9,11,26,-3,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-32,-22,0,-24,-5,25,-14,20,53,-20,-20,-4,-14,-20,-10,14,-20,0,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-14,-21,-17,-9,-10,-19,-14,-3,-1,-3,0,-11,-18,-7,1,-5,-1,2,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-10,-7,-7,-15,-10,-17,-14,-10,-17,-14,3,-10,-7,-11,26,34,-4,-32,-15,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-17,-32,-25,4,-32,-25,28,-27,30,17,-27,-27,-22,-22,-21,-7,24,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-25,-2,5,-20,-19,-8,-12,6,-10,-4,-2,-14,5,5,-4,-4,-11,-25,-11,4;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-11,-18,-9,-19,-1,-19,-9,-11,-12,-10,-8,-10,-9,-19,13,2,0,-23,-19,-9;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-10,-19,-11,-19,3,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,10,1,-2,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-28,2,9,-25,-19,-3,-23,19,-17,-8,-1,-15,11,25,-7,-9,-17,-24,-11,8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-22,-25,-28,-19,4,-29,-16,17,-15,14,13,-16,-23,-14,-9,-18,-8,9,-15,2,-18;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-1,-23,-16,-13,-10,-22,-2,-16,0,-4,-16,-18,-15,-21,0,-3,7,-24,-17,-16;
MA   /M: SY='T'; M=8,-9,-15,-16,-11,-5,-12,-14,-5,-13,-3,-1,-5,-16,-9,-13,5,10,-2,-23,-9,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-3,2,-23,2,7,-22,-14,-3,-21,8,-18,-10,3,-13,7,12,2,-3,-16,-25,-11,5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-5,-12,-10,-8,-17,1,-8,-17,-10,-15,-11,1,-16,-7,-10,9,-1,-11,-28,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-6,-16,-30,58,-17,-38,-14,-30,-19,4,-19,-15,-15,0,-18,-29,-22,-28,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,3,-26,-21,-11,-23,-22,9,-19,-1,1,-16,-23,-16,-19,-7,-2,14,-29,-12,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-27,-6,3,-22,-17,-3,-17,1,-19,-9,-5,14,2,-4,-3,-3,-18,-25,-13,0;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-18,-14,-24,-20,-3,-22,-15,14,-14,8,20,-18,-21,-14,-14,-6,7,19,-25,-6,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-18,-29,-22,5,-28,-18,18,-22,12,9,-20,-23,-18,-20,-13,-5,18,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=22,-11,-9,-19,-14,-14,-5,-20,-7,-14,-5,-4,-10,-15,-12,-18,6,7,2,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-19,9,3,-24,-4,-1,-23,-4,-28,-19,19,-4,0,-6,15,3,-21,-36,-19,1;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-27,-10,-18,-29,59,-20,-36,-18,-28,-19,-1,-19,-18,-19,2,-16,-26,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-22,-4,3,-14,-16,-8,-20,10,-17,-11,2,-14,1,13,1,1,-14,-23,-9,1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,6,-25,4,5,-22,-14,-3,-17,3,-17,-11,7,-12,2,4,-1,-5,-15,-28,-13,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00701;
//
ID   CYT_DCMP_DEAMINASES_MP; MATRIX.
AC   MP00903;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytidine and deoxycytidylate deaminases zinc-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4950309; R2=0.0185479; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=402; N_SCORE=12.940; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-8,1,-19,1,-5,-25,15,-10,-32,-3,-27,-19,6,-18,-6,2,0,-10,-25,-20,-19,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-19,-3,8,-20,-21,-4,-10,-1,-12,-7,-1,-14,4,-2,-4,-5,-10,-28,-12,4;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-12,-16,-15,-13,5,2,-12,-5,-11,-5,-2,-7,-14,-12,-11,-5,-7,-4,-8,-1,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-16,-5,-8,-15,26,-5,-19,-8,-15,-9,0,-7,-7,-7,0,-9,-15,-12,-13,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=8,-8,0,-11,-9,-7,-8,-11,0,-6,-2,-1,-7,-11,-8,-8,0,-1,6,-15,-9,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-18,-3,-7,-8,-11,-4,0,-9,-7,-4,13,-15,-7,-8,-1,-3,-6,-24,-8,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-14,-20,-15,-2,-20,-15,8,-12,2,5,-15,-18,-11,-10,-11,-7,8,-5,-2,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-22,9,16,-19,-2,-1,-22,2,-18,-14,8,-10,4,1,1,-7,-21,-22,-12,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-20,-5,4,-6,-13,-5,-14,1,-12,-6,-4,-4,1,0,-2,-4,-13,-16,-5,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-15,-2,-6,-17,13,-9,-19,-8,-16,-12,7,-13,-8,-7,2,-5,-16,-22,-16,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,4,-25,-1,-5,-13,-7,8,-19,-9,-16,-11,9,-18,-4,-7,-2,-4,-19,-14,-3,-5;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-1,-18,-6,-7,-10,-13,8,-9,-9,-8,-5,4,-18,-6,-9,-1,-3,-8,-22,-4,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-11,-6,0,-18,-10,-6,-16,-2,-16,-9,0,-9,2,-3,7,1,-12,-26,-13,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-20,-14,-10,1,-13,-4,-7,-6,-4,-3,-9,-16,-8,-3,-10,-7,-8,-10,9,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-2,-11,-18,-12,-4,-13,-9,-13,-11,-6,-12,-7,-8,0,-4,-9,-2,-4,-10,-20,-12,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: M=-6,-6,-21,-7,-3,-15,-1,-5,-12,-5,-10,-5,-3,-13,0,-5,-4,-6,-12,-18,-7,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-8,-9,-7,-18,-2,-15,-17,-6,-16,-11,-2,-15,-7,-8,6,8,-8,-27,-16,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-15,-9,-19,-15,-12,-22,-18,3,-13,-2,-1,-11,-13,-12,-11,-9,-7,3,-26,-13,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,2,-6,-6,-20,-22,72,-30,-14,-20,-4,4,-24,1,-6,-10,-18,-26,-34,9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-11,-21,-12,-18,0,-21,-7,-11,-9,-8,-12,-12,-12,-20,8,-1,4,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-24,-21,-10,-8,-26,-12,7,-7,7,10,-15,-21,-2,3,-14,-8,5,-21,-6,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-2,-2,-10,-12,-11,-16,-9,-6,-12,-9,-5,6,-21,-9,-11,4,4,-5,-33,-13,-11;
MA   /M: SY='A'; M=30,-15,-13,-25,-16,3,-7,-20,-6,-15,-4,-7,-13,-16,-18,-20,2,-2,2,-14,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-25,4,-34,-25,34,-29,32,21,-25,-25,-20,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-24,1,2,-17,-11,-7,-17,-2,-12,-9,1,-15,0,1,0,-3,-14,-25,-12,1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-26,-1,4,-16,-17,8,-19,6,-16,-7,5,-16,6,3,-4,-5,-19,-19,-2,4;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-8,-24,-16,-6,-11,-20,-1,-14,-3,-1,-13,-17,-14,-19,-1,-4,4,-20,-11,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-11,-13,-12,-11,-7,-12,-13,-5,-7,-9,-7,-9,-10,-9,-7,-4,-1,-3,1,-4,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='S'; M=0,-3,-12,-4,-4,-6,-9,-8,-7,-6,-5,-4,-2,-11,-5,-3,5,4,-4,-18,-7,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-17,0,5,-10,-9,-5,-12,-1,-9,-6,-1,-9,1,-2,-3,-5,-12,-4,-6,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-17,-5,-4,-18,16,-10,-20,-4,-16,-10,0,-12,-6,-4,0,-7,-14,-18,-16,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-18,1,4,-11,-11,2,-14,1,-11,-8,-1,-8,1,0,-1,-4,-11,-16,-3,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-10,-18,-13,-6,-11,-13,-10,-6,1,-2,-1,-8,-14,-4,6,-6,-2,-4,-18,-8,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-27,8,9,-27,-7,-2,-25,8,-23,-14,5,-11,7,3,0,-8,-22,-26,-12,8;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-13,-20,-15,14,-17,-13,11,-17,16,7,-14,-16,-15,-13,-13,-6,8,-8,4,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='B'; M=-4,4,-15,4,-3,-13,-6,-5,-13,-4,-13,-9,4,-13,-4,-3,2,0,-9,-18,-9,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-4,-15,-4,-3,-12,-12,-5,-13,0,-14,-8,-6,4,-3,-5,-4,-4,-12,-9,-2,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-9,-13,-14,-12,-8,-12,-11,5,-9,-2,2,-5,-15,-8,-6,-4,-3,5,-18,-7,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-12,-13,-15,-11,0,-15,-10,2,-10,4,3,-11,-15,-7,-7,-5,3,3,-12,0,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-10,-4,-13,-10,-6,-14,-11,6,-7,-1,1,-8,-13,-6,-5,-4,-2,9,-16,-6,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,0,-11,-9,0,-16,-5,-2,-7,-1,-2,-9,-16,-8,-8,-8,-5,-1,-8,9,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-21,3,-4,-19,15,-8,-25,-6,-21,-15,5,-14,-6,-3,5,-5,-18,-23,-16,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=4,-3,-3,-6,-11,-14,-15,-16,-3,-13,-7,-6,-5,-17,-12,-16,-1,0,3,-26,-12,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-13,-3,-1,-12,-17,-14,-10,-7,-10,-9,0,-9,-5,-8,13,28,-3,-27,-10,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-19,-13,-22,-15,-4,-20,-18,0,-14,3,1,-18,-20,-11,-14,-15,-10,-2,6,-2,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-24,-17,-15,25,-22,1,-4,-9,-2,-3,-12,-23,-13,-6,-14,-8,-7,10,37,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-14,-16,-15,-8,-18,-19,6,-13,2,1,-15,-14,-15,-13,-6,3,13,-24,-10,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-10,-6,-8,-11,-13,-13,-10,-10,-15,-12,7,-13,-8,-9,18,24,-5,-31,-13,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-26,-25,-27,-22,6,-23,-16,4,-21,11,2,-24,-28,-18,-17,-23,-13,-1,21,10,-20;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-15,1,13,-15,-11,-9,-20,-6,-22,-17,2,-8,2,-8,20,11,-14,-31,-14,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-24,-13,-16,-12,13,-16,-18,-17,-18,-12,-4,-9,-16,-17,-5,-11,-17,-13,-12,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-2,-23,-4,2,-16,-17,19,-11,-5,-9,7,-1,-15,4,-4,-4,-8,-11,-27,-3,1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=11,-9,-9,-14,-7,-18,-11,-12,-18,1,-15,-11,-5,-16,-4,12,6,2,-7,-25,-15,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-28,0,7,-29,-2,-2,-24,5,-22,-8,1,-14,21,5,-2,-10,-24,-19,-13,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-14,-17,-19,-9,-1,-15,-13,-4,-11,-1,-2,-12,-18,-12,-13,-4,-5,2,-19,-7,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-26,2,-32,-21,34,-25,26,27,-24,-24,-17,-22,-21,-9,23,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=2,-10,-21,-17,-14,-9,-17,-15,4,-10,-3,-1,-2,-18,-10,-7,-3,-2,2,-24,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-28,10,30,-27,-18,2,-24,7,-16,-11,0,-8,18,1,-3,-10,-24,-24,-13,23;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-20,-17,-25,-18,26,-20,-14,-1,-21,7,-1,-14,-23,-21,-16,-6,-1,0,-10,10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-11,-19,-12,-12,-17,4,-10,-17,-8,-8,-7,-5,-21,-10,-1,-6,-9,-12,-24,-14,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-13,-22,-16,-13,-11,-22,-16,6,-13,-5,-1,-9,-8,-10,-12,-3,0,5,-26,-10,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-26,2,5,-27,-1,-8,-27,9,-25,-15,2,-6,2,3,0,-8,-21,-24,-17,3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-25,3,5,-21,-16,6,-24,11,-21,-12,5,-16,4,14,-5,-8,-20,-19,-5,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-18,-18,-18,-11,-9,-24,-21,3,-11,-4,-3,-18,-2,-14,-13,-5,1,10,-27,-13,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-14,-22,-18,-17,0,-21,-7,6,-15,1,2,-10,-19,-15,-14,-11,-7,7,-21,1,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-24,-18,-26,-22,14,-29,-14,13,-17,9,7,-22,-27,-21,-15,-15,-6,16,-12,13,-22;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-19,-19,-17,-9,-4,-17,-1,-16,-6,-2,-7,-16,-14,-16,-1,-1,0,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-12,-13,-14,-3,-11,-20,-5,-5,-11,6,4,-12,-18,-3,-11,-8,-3,-5,-26,-8,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-3,-12,-4,-3,-4,-9,-6,-4,-7,2,-2,-2,-11,-4,-5,-3,-2,-4,-15,-5,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,5,-28,6,-4,-18,-20,-8,-6,-8,-14,-10,4,-1,-7,-12,-5,-6,-10,-28,-9,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00702;
//
ID   GTP1_OBG_MP; MATRIX.
AC   MP00905;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GTP1/OBG family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7173939; R2=0.0134084; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=826; N_SCORE=15.783; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=133; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-17,-22,-24,-4,-26,-22,24,-18,4,6,-9,-26,-21,-18,-8,-2,29,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-25,-30,-20,-10,-10,-25,-20,0,-20,11,0,-25,29,-15,-20,-20,-10,-10,-25,-15,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-13,-26,-24,-3,-25,-23,21,-17,6,13,-21,-24,-20,-17,-4,3,33,-29,-9,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,30,-25,24,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-26,9,23,-27,-14,-1,-27,17,-25,-16,13,-10,13,14,2,-5,-25,-29,-16,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-24,-21,-20,12,-29,6,7,-14,2,4,-17,-25,-12,-13,-12,0,4,1,38,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-28,22,13,-31,-7,0,-30,13,-27,-18,18,-13,9,9,-1,-9,-27,-30,-17,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-25,-5,-10,-25,42,-14,-31,-8,-25,-16,3,-15,-11,-10,1,-13,-24,-19,-23,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=19,-4,-19,-8,6,-24,-9,-7,-19,6,-17,-11,-4,-10,4,0,4,-4,-12,-23,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,7,-22,4,11,-19,-13,-6,-23,13,-25,-15,12,-11,4,6,7,2,-19,-28,-13,7;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-39,-29,36,-35,-25,26,-30,18,11,-21,-25,-29,-25,-21,-10,15,-7,13,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-13,-23,-15,-4,-20,-26,-9,5,-6,-3,5,-12,-17,17,-6,-5,-3,3,-23,-8,6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-22,-34,-24,8,-30,-18,28,-24,27,29,-24,-24,-17,-20,-22,-9,18,-19,1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=21,-20,-14,-25,-15,-6,-15,-21,5,-19,17,4,-20,-20,-15,-20,-9,-4,7,-21,-11,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-22,-33,-25,3,-32,-25,31,-27,29,17,-25,-25,-21,-24,-21,-8,23,-21,-3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-38,-28,48,-28,20,23,-20,-20,-18,-28,-20,-10,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-29,11,36,-26,-21,-1,-23,7,-19,-14,-4,0,17,-1,-3,-9,-23,-25,-12,26;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,59,-15,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=14,-2,-14,-4,-1,-21,-4,-5,-20,-2,-25,-15,4,-11,0,-6,24,9,-10,-32,-16,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,9,-29,15,21,-31,-10,8,-27,3,-22,-12,4,-10,25,-1,1,-9,-28,-25,-10,22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-10,-24,-13,-4,-13,-19,-12,-16,18,-16,-7,-5,-16,-1,21,-5,-6,-8,-20,-8,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-20,-23,-20,-12,-4,-17,-12,-4,-6,16,5,-15,-24,-8,13,-19,-10,-4,-19,-6,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-26,-16,-9,-11,-25,2,-5,5,-6,1,-8,-20,-3,13,-12,-7,-3,-20,1,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,1,-29,4,18,-29,-19,6,-24,11,-20,-8,0,-12,32,17,-2,-9,-26,-20,-6,24;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-29,-17,-35,-29,39,-29,-24,14,-25,10,4,-23,-28,-33,-21,-15,-6,20,-8,11,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,28,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='K'; M=5,-4,-20,-6,1,-23,-11,-10,-23,16,-23,-12,1,-12,3,16,8,2,-13,-25,-14,1;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-10,-20,-12,-11,-13,-21,38,-8,-13,-9,1,-5,-21,-6,-9,-6,-7,0,-29,4,-11;
MA   /M: SY='I'; M=11,-23,-19,-30,-20,-4,-23,-24,20,-22,17,9,-20,-20,-17,-23,-12,-6,16,-21,-8,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,1,-30,6,31,-25,-20,0,-30,21,-20,-15,0,-9,15,33,-5,-10,-25,-25,-15,21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-22,-9,-5,-17,-12,-9,-23,10,-18,-11,1,-16,0,30,4,12,-13,-25,-12,-5;
MA   /M: SY='C'; M=13,-13,50,-23,-19,-18,-17,-25,-19,-19,-15,-15,-13,-24,-19,-23,3,4,-5,-36,-23,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-27,28,13,-30,-12,4,-32,12,-27,-19,16,-13,5,11,0,-7,-25,-32,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-32,-25,5,-32,-25,28,-27,33,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00704;
//
ID   UROD_1_MP; MATRIX.
AC   MP00906;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uroporphyrinogen decarboxylase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9249358; R2=0.0142911; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=570; N_SCORE=13.061; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-26,37,14,-32,-11,-5,-32,4,-27,-23,11,-5,1,-4,4,-3,-23,-35,-18,7;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-22,-11,-9,-17,-4,-9,-14,-10,-12,-8,-3,-8,-5,-6,3,6,-11,-26,-14,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-23,-36,-27,50,-31,-16,11,-27,16,8,-21,-28,-29,-20,-21,-10,5,3,26,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-28,-20,12,-29,-14,15,-23,27,12,-22,-27,-17,-15,-21,-8,7,-12,13,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,10,-29,14,10,-27,-16,-1,-32,24,-25,-16,9,-15,8,35,-6,-9,-24,-27,-14,7;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-12,-19,-12,-14,-9,-20,-2,-13,-6,-6,-10,-14,-12,-18,9,5,6,-25,-16,-12;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-8,-29,-21,-1,-25,-21,13,-24,20,8,-22,-24,-18,-22,-16,-8,9,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-25,-9,0,-18,-19,-8,-18,17,-11,-5,-4,-17,6,26,-6,-5,-13,-23,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-30,-7,-9,-27,25,-13,-32,-4,-28,-18,1,-2,-9,3,-1,-12,-26,-24,-24,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-27,7,30,-27,-18,2,-24,13,-19,-11,0,-7,25,9,-1,-8,-24,-22,-10,27; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-1,-22,1,3,-20,-15,-11,-13,-2,-16,-12,-2,7,-4,-4,0,-1,-10,-27,-16,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-17,-16,-11,-13,-22,-4,3,-12,-5,1,-10,-18,-3,-11,1,7,9,-28,-7,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,19,-27,26,14,-28,-9,1,-29,1,-25,-19,10,-6,4,-6,1,-8,-25,-31,-16,9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-29,-12,-5,-11,-23,14,-18,12,-15,-5,-5,-18,3,32,-12,-11,-15,-14,10,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-25,-18,-13,-12,-25,-23,1,-15,-10,-6,-15,22,-15,-18,-3,10,0,-27,-15,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-13,-32,-27,-2,-30,-27,29,-23,13,13,-24,-25,-23,-23,-13,-5,32,-25,-7,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-16,-33,-25,26,-29,-15,15,-23,19,18,-23,-27,-22,-19,-21,-9,10,-9,14,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,27,51,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,19,-39,-20,9,-21,11,-20,-1,0,-11,57,13,-1,-10,-29,-20,-10,38;
MA   /M: SY='A'; M=36,-14,-10,-21,-14,-16,-7,-22,-2,-12,-7,-6,-13,-14,-14,-19,8,1,10,-23,-18,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-17,-27,-17,-17,22,-25,15,-3,-10,-5,-3,-15,-27,-8,-10,-11,-5,-10,19,65,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-26,-15,-1,-27,-11,16,-19,30,27,-22,-24,-3,-14,-22,-10,5,-20,-2,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-3,-30,-19,-18,79,-8,-14,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-29,12,44,-31,-18,-1,-26,7,-21,-16,-1,3,22,-1,2,-8,-28,-28,-19,33;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-29,-5,7,-27,-19,5,-24,24,-21,-4,2,-15,23,37,-7,-10,-22,-21,-9,13;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-25,8,27,-28,-14,-7,-25,13,-21,-15,0,-6,10,2,2,-6,-20,-26,-17,18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-19,-27,-21,3,-29,-21,20,-23,23,11,-21,-24,-19,-19,-14,2,17,-22,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-24,1,17,-26,-5,-7,-25,8,-20,-15,2,-9,7,4,2,-5,-20,-25,-18,11;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-25,0,4,-25,-11,1,-25,19,-25,-11,10,-14,11,19,2,-2,-21,-26,-12,6;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-11,-21,-15,-8,-9,-17,0,-10,0,-9,-2,-9,-18,1,3,-3,-1,-7,-12,7,-5;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-25,6,-1,-28,8,-13,-29,-1,-29,-19,3,1,-5,-7,9,-1,-22,-30,-22,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-6,-20,-9,-12,4,-16,-13,-2,-19,8,-2,-3,-23,-15,-15,-8,-4,-5,-23,-5,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00705;
//
ID   UROD_2_MP; MATRIX.
AC   MP00907;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uroporphyrinogen decarboxylase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9116020; R2=0.0136133; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=563; N_SCORE=12.566; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-29,24,31,-32,-18,-2,-28,12,-22,-17,3,-7,16,2,-2,-9,-24,-30,-17,24;
MA   /M: SY='A'; M=24,-13,-14,-22,-15,-14,-11,-22,2,-15,-4,-4,-10,-13,-13,-20,6,8,7,-23,-14,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-17,-34,-27,1,-34,-27,32,-27,21,15,-23,-25,-22,-24,-18,-7,25,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-24,-5,2,-23,-10,-6,-25,17,-23,-12,2,-14,7,24,4,2,-17,-25,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-23,-17,-10,-10,-23,-11,1,-4,5,5,-9,-19,-4,1,-9,-1,-1,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-19,-28,-22,4,-29,-21,21,-24,26,13,-23,-25,-19,-20,-16,1,17,-21,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-22,-12,-5,-17,-20,-8,-18,18,-14,-6,-5,-19,1,37,-6,-2,-8,-23,-10,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-27,3,16,-27,-15,-2,-24,15,-22,-12,2,-9,14,13,-1,-6,-21,-25,-13,14;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-13,5,16,-13,-8,-2,-13,5,-10,-8,0,-3,5,4,0,-4,-10,-14,-9,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-19,-6,5,-15,-17,-10,-6,2,-4,-2,-9,-13,1,-2,-5,-5,-2,-21,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-20,-19,-15,1,-15,-14,6,-20,25,8,-17,-24,-15,-15,-19,-8,0,-18,-2,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,8,-16,12,5,-16,-6,-3,-14,-1,-14,-11,4,11,-1,-5,0,-4,-14,-18,-11,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-21,9,0,-23,10,-3,-24,0,-23,-15,14,-7,-1,-3,3,-6,-22,-24,-17,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-26,10,20,-27,-12,-4,-27,8,-22,-16,4,-6,10,8,2,-4,-23,-28,-17,14;
MA   /M: SY='V'; M=4,-14,-14,-17,-16,-10,-22,-22,8,-10,-3,0,-14,-19,-15,-13,0,9,19,-28,-11,-16;
MA   /M: SY='P'; M=6,-13,-27,-12,-4,-24,-14,-19,-16,-10,-22,-16,-13,46,-9,-18,2,4,-17,-28,-24,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-30,-22,11,-30,-22,21,-28,41,17,-30,-30,-23,-20,-26,-8,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,4,-37,-27,42,-30,26,20,-22,-22,-20,-27,-22,-10,25,-19,1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-20,-19,-20,1,-18,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,9,-19,-14,-17,-10,-21,-9,-14,-12,-10,-10,-17,-14,-19,10,4,4,-30,-20,-14;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-12,-13,-8,-20,4,-16,-14,-11,-17,-11,-3,-11,-7,-16,18,5,-5,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,88,-10,-20,-10,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-38,-39,-30,33,-24,-26,-11,-23,-8,-12,-32,-30,-27,-20,-32,-22,-16,93,29,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-23,7,-30,-22,24,-27,39,19,-29,-29,-21,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=35,-13,-12,-22,-12,-13,-6,-17,-3,-12,-2,3,-13,-13,-9,-18,3,-2,2,-20,-15,-11;
MA   /M: SY='S'; M=9,-5,10,-11,-10,-17,-10,-18,-16,-14,-19,-15,-2,-15,-10,-15,20,20,-5,-35,-19,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-22,-17,-29,-20,-1,-21,-10,18,-16,21,38,-22,-22,-8,-15,-18,-8,12,-21,-3,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-34,-28,0,-34,-29,37,-25,18,15,-24,-24,-23,-25,-16,-4,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-27,17,47,-29,-16,-3,-28,6,-20,-19,0,-2,15,-3,3,-7,-26,-30,-20,31;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-17,-30,64,-19,-40,-17,-30,-20,1,-19,-18,-18,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-29,-6,-7,-28,31,-6,-34,1,-27,-15,1,-16,-6,-1,-3,-16,-26,-21,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-22,-10,-12,-25,27,-18,-26,-15,-26,-18,-4,0,-14,-18,8,-6,-19,-27,-26,-14;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-12,3,1,-21,-3,-10,-21,-6,-29,-19,10,-10,0,-7,33,19,-11,-38,-19,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,0,8,-28,-18,-8,-28,35,-28,-12,0,-4,9,28,-6,-8,-21,-23,-13,7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-23,34,8,-27,-10,-1,-26,-3,-23,-21,22,-13,-2,-8,6,3,-22,-36,-17,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-24,-23,-16,29,-27,11,-5,-15,1,3,-14,-26,-9,-9,-17,-11,-10,4,35,-13;
MA   /M: SY='A'; M=9,-7,-19,-11,-2,-15,-12,-11,-14,-2,-14,-9,-3,-7,-4,-2,6,4,-9,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-26,-10,-3,-17,-18,-6,-16,10,-15,-6,-5,-8,1,8,-7,-4,-12,-19,-8,-2;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-14,-22,-16,-11,-18,-23,8,-16,-2,-1,-10,-15,-14,-19,5,11,11,-26,-12,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-4,-29,-4,5,-26,-21,-4,-25,39,-24,-5,-1,-13,9,31,-11,-10,-17,-20,-8,6;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-20,-10,-2,-20,-12,-10,-16,9,-14,-7,-3,-13,2,7,2,0,-10,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-26,-23,-34,-24,27,-24,-11,10,-19,17,29,-23,-25,-17,-15,-23,-12,3,5,12,-18;
MA   /M: SY='M'; M=6,-20,-19,-27,-17,-5,-18,-15,12,-15,17,21,-19,-20,-11,-16,-14,-7,8,-20,-7,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-16,-28,-18,-19,29,-28,12,-2,-14,0,-1,-14,-27,-14,-12,-18,-10,-9,15,52,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-17,-6,1,-21,-20,-9,-14,-3,-14,-6,0,-10,15,-3,13,28,-11,-26,-10,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00705;
//
ID   MR_MLE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00908;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7655706; R2=0.0162076; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=310; N_SCORE=10.780; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=3,-6,-22,-8,-4,-16,3,-11,-17,-8,-12,-5,-5,-15,-2,-8,1,-5,-14,-22,-14,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-13,-19,-19,-14,-3,-20,-12,0,-9,0,-1,-12,-17,-10,-12,-4,5,1,-12,8,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-24,-17,-7,-8,-22,-5,-8,8,-1,12,-9,-19,3,21,-12,-5,-7,-19,-4,-3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-12,-23,-14,-5,-11,-2,-9,-14,-10,-8,-7,-10,-11,-8,-12,-6,-9,-10,-20,-11,-7;
MA   /M: M=-3,-7,-10,-8,-3,-14,-13,-7,-16,-5,-7,-7,-8,-18,-7,-8,-7,-4,-12,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-24,-29,-22,15,-24,-10,15,-22,24,19,-23,-27,-16,-18,-23,-11,5,-7,17,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-4,-27,-3,3,-18,-10,-1,-22,-2,-19,-13,-5,-15,4,-1,-3,-9,-20,-1,-2,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-31,-9,-5,-24,5,-10,-32,18,-25,-13,-2,-18,0,30,-9,-14,-23,-11,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=2,-15,-20,-18,-13,-8,-12,-13,-4,-9,-3,-3,-10,-19,-9,-2,-2,-1,-1,-19,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-19,-24,-24,-1,0,-24,2,-21,1,-1,-16,-24,-24,-20,-7,-4,10,-21,-10,-24;
MA   /M: SY='P'; M=0,-6,-27,-6,-1,-26,-1,-15,-22,-4,-23,-15,-4,18,-4,-10,1,0,-21,-26,-22,-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-17,-23,-20,-20,-12,10,-21,-2,-21,1,-1,-10,-22,-19,-20,-9,-11,-1,-22,-15,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-17,-3,-9,-11,-12,-6,-3,-7,-9,-6,18,-18,-7,-5,2,4,-6,-28,-12,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-23,-19,-13,-9,-11,-2,-6,-2,-2,13,-11,-20,-4,8,-10,-7,-4,-18,-2,-10;
MA   /M: SY='F'; M=0,-7,-15,-15,-13,13,-12,-11,-9,-15,-10,-5,2,-18,-14,-13,8,5,-6,-20,-2,-12;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,4,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-12,-27,-16,-7,-18,-24,-16,-2,15,-10,0,-8,-15,-2,12,-11,-9,0,-21,-8,-7;
MA   /M: SY='A'; M=29,-3,-3,-11,-7,-20,-2,-15,-15,-10,-18,-14,2,-13,-7,-16,17,5,-6,-29,-21,-7;
MA   /M: SY='A'; M=32,-11,-5,-18,-14,-23,16,-21,-20,-14,-16,-14,-8,-15,-14,-21,6,-6,-9,-22,-24,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,32,-37,-14,1,-36,4,-26,-25,13,-7,9,-6,0,-10,-30,-36,-19,21;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-15,-3,-22,-16,-8,-22,-15,5,-14,4,14,-14,-20,-7,-14,-5,6,7,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-19,-29,-19,7,-27,-20,17,-28,44,17,-28,-28,-19,-20,-26,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-29,-36,-30,-22,8,-24,-4,-9,-22,3,-3,-27,-28,-16,-16,-31,-21,-16,60,19,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,22,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='L'; M=11,-23,-19,-29,-19,-3,-22,-23,18,-23,22,10,-21,-21,-17,-23,-14,-7,12,-20,-7,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-13,-25,-15,-5,-9,-21,-8,-10,5,-4,-1,-12,-18,2,1,-13,-10,-9,-9,-2,-1;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-20,-15,-15,-25,35,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-13,13,42,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=6,-14,-17,-18,-12,-13,-17,-16,-4,-2,-9,-4,-10,-19,-8,8,2,2,7,-26,-13,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-19,-23,-14,-3,-24,-7,9,-20,24,11,-21,-25,-9,-15,-18,-8,7,-22,-3,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-26,9,1,-28,22,-3,-30,-6,-28,-19,24,-17,0,-7,4,-10,-30,-30,-23,1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-16,-24,-17,-5,-23,-19,12,-17,15,11,-21,-23,-12,-15,-10,0,16,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-33,-8,0,-28,-15,-18,-20,-10,-29,-20,-14,65,-8,-18,1,-4,-25,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-26,4,-32,-26,29,-25,26,15,-28,-28,-25,-22,-19,-5,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='H'; M=4,-12,-13,-15,-12,-8,-14,6,-13,-13,-15,-9,-8,-20,-8,-13,3,-3,-7,-8,6,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-28,19,26,-31,-18,-3,-26,12,-22,-14,3,-8,18,3,-1,-6,-22,-28,-15,22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-33,-23,11,-31,-21,26,-28,39,22,-27,-27,-19,-21,-27,-10,14,-19,2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-28,-14,-20,-26,53,-21,-28,-20,-23,-15,-3,-19,-19,-21,-1,-17,-21,-20,-26,-20;
MA   /M: SY='R'; M=5,-5,-20,-11,-5,-17,-14,-11,-16,5,-12,-9,-1,-11,-3,14,0,3,-10,-24,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-19,-26,-19,3,-24,-19,13,-18,8,8,-17,-22,-14,-14,-8,-3,14,-21,-4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-31,-9,1,-22,-20,-1,-28,25,-21,-10,-2,-8,11,57,-9,-10,-22,-21,-12,2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-29,33,26,-33,-15,-3,-31,4,-26,-22,7,2,8,-5,1,-5,-27,-33,-19,16;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-20,-8,-3,-21,2,-13,-20,0,-20,-13,-2,-14,-4,3,8,2,-10,-27,-18,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-31,-23,-2,-33,-24,31,-23,19,15,-23,-24,-16,-21,-17,-7,27,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-28,-4,0,-22,-19,-13,-10,-5,-13,-6,-9,15,-1,-11,-4,-4,-13,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-16,-29,-25,7,-28,-23,21,-20,7,6,-22,-25,-24,-20,-9,2,28,-19,2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-19,-12,-11,-4,-14,-7,-7,-11,-2,-6,-12,-18,-10,-16,-3,-2,-4,-8,11,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-22,-23,-23,-16,-8,-10,-20,-21,-15,-22,-17,-19,-22,-7,-15,-10,-12,-22,54,3,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,-20,-11,-9,-10,-19,7,-15,-11,-14,-9,-4,-9,-7,-10,4,19,-11,-12,3,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-17,-24,-19,-1,-17,-21,10,-23,22,8,-21,-25,-19,-18,-12,-2,11,-24,-8,-19;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-14,-19,-14,-16,3,-20,-8,-14,-6,-7,-11,-16,-14,-19,5,1,1,-23,-18,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00706;
//
ID   MR_MLE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00909;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8368969; R2=0.0164649; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=505; N_SCORE=14.142; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-23,2,9,-22,-13,-6,-19,13,-18,-11,5,-11,4,10,-2,-6,-15,-24,-14,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-9,-25,-10,-8,-10,-23,38,-15,-6,-8,0,-3,-22,-1,7,-9,-7,-11,-22,12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-16,-32,-27,8,-29,-23,27,-21,16,20,-26,-27,-24,-19,-15,-5,33,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-8,-20,-7,1,-16,-20,-15,-3,-3,-7,-6,-11,-16,-7,-2,-4,-5,6,-27,-14,-4;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-16,-10,3,-25,-6,-11,-16,-2,-17,-10,-4,-9,7,-9,11,0,-10,-24,-18,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,45,-28,20,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-26,-10,-1,-21,-19,-6,-19,21,-18,-7,-3,-17,8,36,-5,-7,-12,-22,-11,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-26,6,20,-27,-17,-1,-25,16,-22,-12,9,-10,18,15,1,-2,-24,-27,-14,18;
MA   /M: SY='A'; M=26,-9,-16,-14,-4,-20,-8,-15,-14,1,-14,-10,-7,-12,-4,-1,5,-2,-4,-22,-17,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-30,-16,-33,-27,26,-30,-24,18,-26,23,10,-27,-30,-30,-20,-19,-6,23,-15,5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-31,-8,-12,-32,46,-15,-35,-14,-28,-17,-2,-6,-7,-15,-1,-17,-30,-21,-27,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-27,21,3,-13,-1,-7,-28,-9,-22,-20,10,-9,-9,-12,-1,-9,-24,-27,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,7,-25,8,8,-25,-6,4,-26,12,-23,-12,8,-12,10,13,-1,-8,-22,-24,-12,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=17,-16,-19,-23,-12,1,-9,-20,-2,-16,-4,-5,-12,-15,-16,-20,-3,-6,0,-15,-8,-14;
MA   /M: SY='H'; M=1,-2,-22,-3,4,-20,1,9,-24,-8,-20,-13,1,-13,-1,-9,7,-1,-18,-25,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-17,-32,-27,12,-31,-25,25,-26,25,13,-28,-29,-27,-21,-19,-6,29,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-17,-27,-19,-11,-12,-14,-9,-8,3,0,5,-9,-22,-3,25,-15,-11,-7,-20,-8,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-16,-25,-24,-2,-29,-6,20,-20,10,10,-22,-28,-21,-17,-13,-5,30,-28,-3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-15,-30,-26,10,-26,-20,20,-19,8,11,-24,-26,-24,-19,-11,-4,28,-17,4,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-13,29,-23,14,0,-20,-6,35,-23,-3,-27,-14,46,-20,3,0,4,-6,-30,-37,-9,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-28,-3,11,-29,-9,18,-22,2,-18,-2,0,-13,26,4,-3,-12,-25,-23,-8,17;
MA   /M: SY='R'; M=10,-8,-19,-12,-5,-18,-5,-9,-20,4,-18,-12,-2,-15,-1,15,7,-1,-11,-22,-12,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-36,-37,-36,-27,9,-24,-27,-3,-23,3,-6,-36,-30,-21,-20,-34,-21,-10,83,17,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-8,19,-20,24,5,-25,-11,-7,-27,-2,-24,-20,10,-11,-1,-1,13,12,-17,-35,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=3,-5,-25,-1,21,-24,-17,-11,-18,0,-16,-14,-9,9,2,-5,-1,-7,-14,-27,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-25,-5,3,-19,-17,-10,-9,-9,-11,-8,0,7,2,-10,0,-1,-15,-30,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-22,-4,12,-21,-9,-8,-15,-3,-12,-4,-5,-10,7,-7,2,1,-12,-26,-15,10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-13,-3,-22,-12,-17,-5,-21,-8,-13,-4,-7,-13,-14,-12,-21,4,-2,0,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=15,-15,-18,-21,-13,-13,-16,-20,5,-10,-3,-1,-11,-15,-10,-15,2,-1,7,-24,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-18,-26,-19,-11,-12,-21,-17,-9,9,-12,-5,-15,-20,-7,12,-13,-10,-1,3,-5,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-20,-25,-24,-17,10,-15,-12,-11,-9,-3,-5,-16,-23,-14,0,-14,-11,-10,10,11,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-2,-26,-24,-13,-5,-25,5,-25,-5,-2,-13,-23,-20,-25,-6,-9,5,-28,-15,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-33,-3,10,-33,-20,-6,-24,18,-27,-10,-6,21,20,8,-7,-10,-26,-23,-16,14;
MA   /M: SY='R'; M=2,-8,-21,-8,6,-19,-15,-8,-16,2,-11,-8,-5,-14,4,10,2,-3,-10,-26,-14,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,14,-31,-22,22,-29,41,17,-28,-29,-23,-21,-27,-9,14,-18,2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=7,-1,-23,1,25,-27,-11,-7,-19,1,-16,-12,-5,-7,13,-6,2,-7,-17,-25,-18,19;
MA   /M: SY='D'; M=-2,20,-27,29,16,-34,-11,-5,-28,-1,-24,-20,5,2,5,-10,1,-8,-24,-31,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-10,-21,-12,-6,-8,-4,-8,-10,-12,-4,-7,-7,-18,-9,-14,-2,-6,-10,-14,2,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-9,-28,-9,-13,-26,39,-14,-36,-5,-27,-17,1,-19,-10,6,0,-14,-26,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-9,-29,-25,-4,-29,-25,21,-21,9,11,-26,-16,-23,-21,-14,-5,28,-28,-11,-25;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-21,-1,10,-4,-18,-12,-15,-8,-5,-10,-6,-13,-6,-12,-3,-2,-12,-21,-8,3;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-32,-28,-34,-24,16,-26,-21,7,-25,23,11,-31,-29,-20,-19,-31,-16,-2,30,12,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-35,-27,1,-34,-24,38,-25,22,25,-23,-23,-18,-24,-19,-8,28,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,11,-30,16,28,-38,-18,6,-26,8,-22,-9,3,-8,41,4,0,-10,-30,-26,-14,35;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-6,-24,-22,-4,-28,-25,14,-20,7,4,-18,-22,-21,-18,-3,14,22,-29,-9,-22;
MA   /M: SY='P'; M=8,-18,-25,-16,-8,-18,-10,-19,-10,-15,-8,-9,-17,26,-12,-19,-6,-6,-12,-25,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=18,-10,-19,-15,-6,-22,-4,-12,-15,-1,-14,-8,-5,-14,1,3,4,-4,-9,-21,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-27,7,33,-27,-18,7,-22,2,-17,-12,-1,-6,17,-3,1,-8,-22,-28,-14,24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,32,-23,26,8,-27,-6,7,-23,2,-26,-17,37,-15,11,0,5,-4,-28,-34,-17,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-22,-6,-3,-5,-18,-4,-13,-3,-7,-6,-5,-16,3,2,-4,-1,-12,-14,3,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=6,8,-24,12,28,-29,-8,-6,-25,1,-20,-17,0,-6,9,-7,5,-6,-21,-28,-20,18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,-6,-17,-16,-16,9,-16,-16,-15,-15,-12,-9,-19,-15,-19,4,-5,-6,-20,-12,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-24,-23,-26,-18,19,-28,-2,7,-24,27,11,-21,-28,-15,-15,-23,-11,0,-10,15,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-8,-26,-8,6,-24,-17,-8,-21,12,-18,-10,-6,-3,8,20,-4,-7,-15,-23,-15,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-7,2,-17,-20,-3,-20,17,-10,-7,1,-19,4,37,-11,-9,-17,-23,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24,15,-33,-23,26,-30,37,18,-26,-27,-22,-23,-26,-10,14,-17,3,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-20,-10,-6,-17,-15,-8,-8,-2,-12,-4,4,-15,3,4,6,8,-8,-27,-12,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=2,4,-23,5,8,-28,-12,8,-24,2,-20,-11,3,-12,15,5,4,-6,-20,-26,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00706;
//
ID   UPF0029_MP; MATRIX.
AC   MP00910;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0029 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4119153; R2=0.0157961; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1206; N_SCORE=24.452; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=21,-5,-20,-10,0,-25,-10,-15,-20,19,-20,-10,-5,-10,0,5,0,-5,-10,-20,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=21,15,-15,0,-5,-20,0,-5,-15,-5,-20,-15,24,-15,-5,-10,10,0,-15,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-11,-24,-16,-9,-12,-26,10,2,-14,2,5,-7,-18,2,-11,-7,2,-3,-25,1,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-9,-30,-9,8,-12,-27,1,-1,-4,-6,0,-9,-15,16,-6,-9,-10,-11,-11,11,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-27,-9,8,-25,-23,1,-8,-2,2,6,-9,-16,35,1,-9,-10,-18,-20,-7,21;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-30,11,-4,-32,30,-13,-38,1,-30,-20,5,-15,-8,-6,-2,-15,-28,-25,-23,-6;
MA   /M: SY='C'; M=6,-16,16,-24,-18,11,-16,-20,-14,-21,-11,-11,-11,-23,-21,-20,3,-1,-5,-22,-7,-18;
MA   /M: SY='B'; M=7,19,-17,16,2,-25,-2,-5,-22,-5,-25,-20,19,-12,-2,-10,17,4,-17,-35,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,34,4,47,9,-35,-15,-7,-38,-7,-28,-28,11,-17,-7,-15,-2,-10,-25,-42,-22,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=6,-13,-26,-12,-5,-23,-15,-20,-15,-10,-21,-15,-13,44,-10,-18,2,6,-16,-28,-23,-10;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-15,-13,-10,-22,16,-18,-19,-12,-19,-15,-3,-12,-10,-18,15,0,-9,-25,-22,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-16,-5,-11,-16,38,-11,-22,-11,-16,-11,0,-11,-11,-11,0,-11,-16,-11,-16,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-5,-5,-5,-5,-11,-11,-5,-5,-5,-5,0,-5,-5,-5,11,27,0,-16,-5,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-21,-7,1,-23,-18,-10,-11,11,-18,-5,-5,-15,10,5,4,-1,-4,-27,-12,5;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-15,-35,-10,0,-25,-20,-11,-25,8,-25,-15,-11,40,-1,21,-10,-10,-25,-25,-21,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-5,20,-15,27,51,-22,-22,-5,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=2,1,-19,-1,10,-20,-14,14,-21,-5,-18,-11,2,-10,3,-7,10,7,-15,-30,-8,5;
MA   /M: SY='L'; M=1,-22,-18,-24,-14,-5,-24,-18,11,-18,21,10,-22,-24,-8,-15,-15,-6,11,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-1,-24,-3,13,-22,-20,-5,-16,11,-14,0,-3,-9,14,5,-1,4,-14,-25,-11,13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-30,-15,-11,-21,3,-15,-14,5,-16,-6,-5,-18,-6,10,-9,-13,-11,-20,-14,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,-17,-14,-7,-15,-9,-8,-11,-1,-12,3,-4,-15,0,6,8,2,-5,-26,-13,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-13,17,-28,17,4,-29,1,1,-30,5,-26,-17,18,-16,8,12,0,-9,-28,-29,-18,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,31,-26,28,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,30,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-19,-32,-21,-18,4,6,-20,-24,-6,-19,-13,-14,-22,-18,-8,-16,-18,-21,26,2,-15;
MA   /M: SY='B'; M=-12,33,-25,32,23,-28,-9,5,-28,3,-27,-22,32,-11,6,-2,5,-5,-30,-37,-20,15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-16,-28,-25,-2,-31,-28,27,-21,8,8,-20,-22,-22,-21,-6,9,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-18,13,-25,-20,-7,-26,-23,5,-24,5,0,-15,-24,-18,-22,-5,4,5,-32,-12,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,8,-15,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,23,-25,-15,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=12,-12,-10,-19,-16,-9,-18,-23,2,-13,-4,-4,-12,-16,-16,-15,8,23,15,-28,-12,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-39,-29,-25,21,-25,-3,-9,-15,-9,-9,-29,-30,-15,-15,-29,-19,-19,85,57,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,1,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=6,-19,-21,-29,-21,-7,-26,-25,22,-21,6,6,-13,-15,-15,-23,-4,6,16,-22,-7,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-14,-29,-12,-4,-15,-23,10,-12,-2,-3,-1,-11,4,-4,-4,-16,-12,-15,-25,-4,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=12,-7,-17,-10,-5,-19,-11,-18,-15,-10,-19,-15,-5,13,-8,-15,15,18,-9,-30,-19,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-25,11,-6,-30,36,-13,-35,-13,-30,-22,7,-15,-11,-15,9,-9,-25,-29,-25,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-10,-30,-10,-11,-25,29,-11,-35,3,-25,-15,0,-20,-6,21,-5,-15,-25,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,42,-30,-20,11,-30,32,11,-25,-30,-29,-20,-25,-10,5,-6,14,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-18,-24,-21,-14,-12,-28,-19,7,5,-4,3,-14,-21,-9,10,-12,-7,13,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-30,-4,2,-22,-20,44,-30,15,-22,-5,5,-18,10,32,-10,-15,-25,-25,4,2;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-19,-29,-19,-11,-18,-25,18,-19,4,4,-15,-15,-15,-25,-4,-5,14,-20,-11,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-2,-23,-6,-11,7,-16,11,-9,-8,-14,-9,5,-23,-5,-8,1,-1,-15,-2,34,-11;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-21,-8,-13,-23,33,-18,-29,-15,-25,-18,2,-15,-13,-15,14,5,-19,-27,-23,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-6,0,10,-8,-10,-22,-5,-15,-25,-1,-23,-15,4,-20,-10,-5,2,4,-16,-32,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-16,-12,-11,-23,22,-18,-22,-13,-21,-15,-2,-13,-11,-18,14,-2,-12,-25,-23,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-15,-25,-23,-5,-28,-23,16,-8,3,5,-23,-28,-21,1,-10,-2,34,-28,-10,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,11,-24,12,31,-28,-12,1,-25,4,-24,-17,12,-7,18,-1,11,-1,-25,-32,-19,24;
MA   /M: SY='Q'; M=6,0,-21,-2,16,-26,-15,-6,-18,1,-15,-9,-2,-8,19,-4,7,6,-16,-25,-15,17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00707;
//
ID   DHODEHASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00911;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroorotate dehydrogenase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4146352; R2=0.0143196; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=224; N_SCORE=8.612; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=76; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,41,-28,58,15,-36,-10,-1,-34,-1,-25,-23,15,-11,-1,-11,-1,-9,-25,-37,-19,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,3,-1,-8,-15,15,-10,-18,-9,-14,-11,-1,-11,-9,-11,-1,-8,-12,-16,-14,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-9,-25,-11,0,-3,-21,-7,-14,17,-13,2,-7,-15,-1,8,-10,-8,-11,-14,2,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-22,11,-3,-23,8,-3,-24,-5,-24,-16,23,-16,-4,-7,7,2,-23,-32,-19,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=7,-11,-23,-13,-11,-22,17,-18,-18,-10,-17,-11,-6,-11,-10,-13,0,-7,-11,-21,-20,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,11,31,-24,-18,1,-22,4,-18,-14,1,-8,11,-2,2,-4,-20,-28,-12,21;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,-10,-14,-7,-7,-14,-5,-9,-12,-7,-4,-10,-18,-8,-15,-2,-3,-6,-17,2,-9;
MA   /M: SY='L'; M=3,-23,-20,-28,-19,-3,-24,-21,17,-22,19,12,-20,-17,-15,-21,-13,-5,12,-22,-7,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,20,-28,26,18,-31,-11,-2,-31,10,-26,-19,11,-9,7,7,0,-8,-25,-31,-17,11;
MA   /M: SY='A'; M=2,-10,-23,-11,-2,-12,-6,-10,-12,-7,-7,-7,-8,-16,-5,-5,-3,-6,-9,-18,-7,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-26,-32,-23,14,-29,-17,15,-24,22,12,-26,-27,-19,-20,-24,-12,6,8,15,-22;
MA   /M: SY='D'; M=1,2,-23,4,-4,-16,-6,-5,-17,-9,-10,-9,-3,-15,-8,-13,-4,-8,-13,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-22,-8,-3,-18,-11,-7,-14,1,-9,-7,-2,-14,-3,1,-4,-6,-11,-24,-12,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-6,-10,-17,-13,-8,-3,-10,-11,-7,-13,0,0,-5,-19,-9,-7,-2,-3,-7,-24,-8,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-28,-6,-11,-26,37,-12,-32,-8,-25,-15,-1,-18,-9,-10,-2,-15,-25,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='F'; M=3,-24,-17,-31,-22,33,-21,-20,1,-23,11,1,-19,-24,-26,-20,-12,-6,3,-5,8,-22;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-28,-10,-18,-29,63,-19,-38,-19,-29,-20,0,-19,-18,-19,3,-17,-28,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=8,-17,-19,-23,-18,16,-5,-11,-11,-17,-6,-7,-12,-20,-20,-18,-4,-6,-7,-5,9,-18;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-17,-32,-26,7,-28,-25,25,-23,14,10,-23,-25,-24,-22,-13,-4,27,-20,-2,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-9,-22,-6,15,-15,-24,-12,0,-6,-2,0,-13,-13,-2,-10,-6,-5,3,-28,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-17,-26,-21,-3,-27,-24,19,-20,10,8,-17,-20,-18,-19,-5,12,20,-25,-7,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-4,-30,23,-15,-35,17,-30,-15,0,-15,-4,6,-5,-15,-25,-20,-20,-4;
MA   /M: SY='T'; M=11,-2,-11,-8,-7,-16,-4,-16,-16,-11,-19,-14,2,-11,-7,-12,25,27,-6,-32,-16,-7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-15,-28,-24,0,-26,-26,21,-21,10,7,-21,-23,-22,-20,-7,3,28,-25,-7,-24;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-13,-9,-11,-14,-5,-19,-15,-12,-14,-12,1,-12,-11,-12,18,37,-5,-29,-14,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-27,-17,-9,-14,-20,-19,-3,-11,-5,-4,-16,19,-11,-15,-9,-5,-7,-22,-15,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-26,-1,11,-17,-19,4,-18,6,-12,-7,-1,-15,5,10,-5,-8,-16,-25,-7,7;
MA   /M: SY='P'; M=1,-12,-31,-7,7,-26,-11,-16,-21,-5,-24,-17,-12,42,-5,-14,-4,-9,-23,-26,-24,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-29,-3,10,-30,-19,5,-25,20,-21,-6,4,-15,33,34,-4,-9,-25,-21,-11,20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-28,-1,8,-18,-18,-12,-17,-4,-16,-14,-9,18,-2,-11,-3,-5,-18,-26,-15,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-12,29,-22,13,-3,-12,-5,14,-17,-2,-25,-16,46,-22,-1,-2,5,-2,-27,-29,-3,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-35,2,8,-30,-18,-14,-24,-2,-27,-20,-10,52,-4,-9,-6,-9,-27,-30,-25,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-24,-1,5,-21,-17,-7,-22,15,-20,-12,7,-10,4,17,1,5,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-26,-11,-3,-17,-20,-5,-24,21,-17,-9,-1,-19,5,52,-5,1,-14,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-21,-29,-22,9,-30,-16,21,-21,20,15,-23,-25,-17,-18,-18,-4,16,-14,9,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-26,-16,-33,-26,38,-25,-22,7,-23,6,1,-21,-26,-30,-20,-12,-6,13,-7,10,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,4,-28,9,22,-25,-17,0,-30,17,-22,-16,5,-12,11,32,-2,-8,-24,-27,-15,14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-18,-22,-19,1,-26,-17,11,-21,17,7,-19,-24,-17,-17,-11,4,12,-17,0,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-28,-10,-5,-21,-15,-16,-12,-8,-18,-12,-13,30,-10,-14,-4,-3,-13,-26,-17,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-13,-3,3,-16,-11,-9,-19,-5,-11,-10,-4,-17,-1,-3,-3,-7,-16,-25,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=16,-9,-21,-12,-15,-24,36,-17,-27,-15,-23,-16,-3,-16,-14,-19,7,-9,-18,-20,-22,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-19,-29,-22,2,-26,-21,20,-22,17,15,-21,-24,-17,-19,-13,-5,18,-18,-3,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-36,-26,3,-36,-26,38,-28,27,19,-23,-23,-18,-25,-22,-10,23,-20,0,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=10,-8,-19,-12,-4,-20,-9,-9,-21,8,-18,-12,-2,-15,1,23,6,-1,-11,-24,-15,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-18,-30,-23,2,-27,-10,24,-17,16,34,-19,-23,-10,-17,-18,-9,15,-18,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00708;
//
ID   DHODEHASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00912;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydroorotate dehydrogenase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4115849; R2=0.0151880; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=11.902; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=72; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-15,-18,-12,-22,16,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-15,-17,-15,-8,-25,-22,4,-15,-3,-3,-5,-12,-12,-15,11,36,7,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-25,5,28,-25,-17,-5,-20,6,-16,-13,0,-7,11,0,0,-7,-19,-27,-17,19;
MA   /M: SY='V'; M=15,-16,-12,-22,-19,-8,-15,-21,9,-15,-1,1,-13,-20,-17,-18,-2,0,18,-25,-13,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-33,-26,6,-33,-25,31,-27,29,17,-27,-27,-23,-23,-21,-7,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-8,2,-22,-17,-4,-28,26,-21,-11,-1,-16,7,43,-6,-7,-18,-21,-11,1;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-13,-15,-6,-10,-20,-8,-9,-3,-3,2,-10,-19,-2,5,-9,-6,-6,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-33,-25,9,-31,-22,27,-25,28,20,-26,-27,-21,-21,-21,-8,23,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-26,-14,-11,3,-22,20,-13,-1,-11,-5,-9,-23,-2,4,-10,-9,-14,3,35,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-25,13,18,-30,-13,-4,-26,9,-22,-14,4,-9,14,3,2,-3,-22,-27,-16,16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-15,-20,-16,-9,-6,-23,-8,-2,-4,-1,-1,-12,-23,-8,7,-9,-5,4,-21,-2,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-16,-20,-16,3,-21,-16,4,-12,7,2,-16,-21,-15,-10,-7,4,9,-16,2,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-18,-1,6,-20,-7,-3,-17,11,-17,-7,1,-6,12,8,0,-3,-15,-16,-10,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,2,-20,6,1,-20,5,-7,-20,-3,-19,-14,2,9,-4,-6,0,-6,-18,-20,-16,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-24,16,16,-28,-11,-3,-26,9,-23,-16,8,-9,11,7,4,-3,-22,-28,-15,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-24,-32,-24,0,-32,-24,31,-24,23,18,-22,-21,-18,-22,-19,-8,21,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-28,-10,-3,-22,-21,-19,-14,-8,-22,-14,-17,49,-10,-16,-8,-6,-16,-29,-23,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,3,-36,-27,39,-28,26,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,19,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-26,-10,-17,-28,56,-19,-35,-18,-28,-19,0,-18,-17,-19,5,-14,-25,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,2,-27,-25,-5,-26,-24,16,-18,4,10,-22,-26,-22,-19,-6,2,29,-31,-11,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-7,1,-20,1,1,-6,-16,-6,-16,-6,-13,-9,0,-15,-3,-6,3,2,-13,-23,-4,0;
MA   /M: SY='S'; M=2,8,-13,6,-1,-19,-6,-11,-19,-8,-24,-18,11,-11,-3,-9,27,24,-11,-37,-17,-2;
MA   /M: SY='A'; M=8,-18,-25,-20,-17,-11,8,-19,-14,-16,-13,-10,-15,-11,-17,-19,-7,-11,-10,0,-8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-27,6,23,-27,-18,-4,-23,12,-18,-12,0,-9,15,7,-3,-7,-21,-23,-13,19;
MA   /M: SY='D'; M=-12,35,-27,47,14,-35,-8,-2,-32,-2,-26,-24,15,-11,2,-9,3,-5,-25,-36,-19,8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-27,-25,-15,5,-27,-15,6,-14,10,5,-21,-24,-11,-10,-20,-11,2,5,9,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-27,14,42,-28,-16,-3,-27,7,-19,-18,-1,-4,14,0,1,-7,-25,-28,-19,28;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-13,-26,-16,-7,6,-23,0,-15,12,-9,0,-8,-20,-5,14,-15,-11,-12,-11,7,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-24,-33,-25,6,-31,-21,29,-26,25,20,-23,-24,-19,-23,-21,-9,18,-17,3,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-8,-22,-11,-4,-11,-19,-11,-4,-1,0,5,-8,-17,-3,-2,-8,-3,-4,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,0,-21,-13,-18,-5,-20,-8,-12,-9,-8,-12,-14,-12,-20,7,-1,2,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,5,-16,4,2,-21,-9,-9,-22,-1,-24,-17,8,-11,1,1,21,15,-13,-34,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-17,-26,-17,2,-20,-18,10,-20,23,13,-21,-23,-16,-17,-14,-6,8,-20,-5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-12,-31,-27,1,-31,-27,27,-22,17,12,-28,-29,-26,-19,-15,-4,37,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-2,-28,-3,14,-36,-10,3,-21,5,-20,-4,-2,-7,41,3,1,-10,-27,-21,-14,28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-30,-26,-2,-20,-26,22,-24,17,10,-24,-26,-24,-22,-15,-7,25,-24,-8,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-16,-30,-16,-20,5,12,2,-16,-15,-11,-8,-12,-26,-15,-15,-12,-14,-18,8,31,-20;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-11,-7,-7,-12,-14,-16,-13,-10,-16,-13,2,-11,-7,-10,25,38,-3,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-14,-15,-12,-23,22,-19,-21,-14,-18,-13,-7,-13,-14,-19,4,-8,-12,-23,-23,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-22,-25,-20,21,-25,-16,6,-23,17,5,-14,-24,-22,-17,-19,-8,2,-7,7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-23,-28,-23,14,-30,-16,20,-22,9,8,-18,-23,-20,-21,-15,-7,15,-11,12,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-26,-15,-12,14,-24,4,-5,-5,-3,-3,-15,-24,-9,-7,-14,-6,-8,7,41,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-12,7,-28,10,11,-26,-9,6,-29,11,-24,-14,6,-14,7,14,-2,-9,-23,-26,-12,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-31,-11,-15,-29,46,-19,-34,-15,-28,-19,-5,1,-17,-15,-3,-17,-27,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-20,-32,-16,-9,-7,-17,-17,-13,-12,-16,-11,-18,39,-15,-16,-11,-9,-17,-20,-11,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00708;
//
ID   ADH_IRON_1_MP; MATRIX.
AC   MP00913;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Iron-containing alcohol dehydrogenases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.0610752; R2=0.0200145; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=266; N_SCORE=12.375; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-28; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-29,-1,-3,-28,29,-3,-34,-1,-28,-17,9,-17,-6,-3,-1,-15,-28,-24,-20,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-26,-1,13,-17,-23,-8,-9,1,-11,-6,-4,-14,7,1,-6,-8,-8,-25,-11,9;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-26,-9,1,-9,-20,-13,-23,30,-21,-8,-5,-14,-1,16,-10,-9,-14,-15,-4,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-25,-14,-6,13,-25,-2,-2,-12,7,7,-15,-22,-5,-11,-16,-10,-8,-6,19,-6;
MA   /M: SY='A'; M=1,-11,-23,-13,-8,-18,-9,-5,-9,-9,-13,-5,-7,-2,-8,-9,-3,-6,-5,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-25,-20,-29,-23,14,-29,-12,10,-21,11,4,-23,-27,-18,-18,-20,-7,4,10,23,-22;
MA   /M: SY='A'; M=8,-14,-21,-17,-10,-15,-1,-13,-6,-13,-3,-4,-11,-18,-12,-13,-5,-9,-1,-23,-14,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-25,13,-2,-17,-12,4,-15,-12,-14,-9,4,-16,-6,-13,0,-6,-13,-30,-8,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-28,-13,-9,5,-21,-6,-10,-9,-8,-8,-11,-2,-12,-10,-12,-9,-14,-1,13,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-9,4,-26,8,4,-22,-16,9,-20,-2,-16,-11,2,-3,-1,-3,-3,-7,-18,-31,-11,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-6,-21,-8,-12,-10,-23,-14,6,-8,3,7,-7,-20,-11,-11,-9,-1,7,-27,-8,-12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-17,-11,-9,-9,-14,-6,-8,-8,-8,-3,5,-16,-4,-7,4,10,-7,-25,-9,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-36,-8,-1,-28,-17,-17,-19,-9,-29,-19,-12,74,-9,-18,-7,-8,-28,-30,-28,-9;
MA   /M: SY='B'; M=-8,8,-23,8,0,-14,-15,-2,-18,1,-16,-10,5,-16,-3,-1,-1,-4,-13,-27,-8,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-27,-17,-32,-25,21,-27,-17,18,-22,21,23,-25,-27,-22,-17,-19,-7,19,-16,4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-12,-10,-16,-13,-14,-9,-20,-2,-13,-11,-7,-9,-16,-13,-16,14,9,11,-29,-17,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,4,-35,-28,37,-27,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-7,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-17,-24,-22,0,-26,-20,21,-20,17,12,-16,-27,-20,-18,-14,-4,23,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-27,-11,-4,-24,-15,-19,-16,-10,-23,-16,-13,48,-9,-18,2,5,-18,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-21,0,14,-19,-17,-10,-13,1,-10,-8,-4,-11,1,-6,1,0,-8,-28,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-20,-23,-26,-21,8,-29,-14,20,-22,20,12,-15,-25,-17,-19,-18,-6,9,-14,10,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-15,-18,-23,-18,-5,-24,-11,14,-15,6,17,-13,-18,-11,-15,-4,11,13,-25,-4,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-17,-20,-21,-13,10,-22,-12,5,-16,8,8,-17,-21,-15,-16,-12,-7,5,-12,7,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-3,5,-21,0,-6,-22,10,-12,-25,-1,-24,-16,11,-15,-6,-3,9,8,-18,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='M'; M=9,-19,-16,-25,-17,-6,-18,-16,10,-11,10,18,-19,-20,-12,-14,-10,-5,14,-22,-9,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=0,-9,-28,-7,4,-27,-17,-14,-19,9,-23,-12,-9,20,3,-1,-3,-5,-17,-25,-18,2;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-25,-1,-1,-24,-3,5,-25,6,-24,-13,13,-14,6,16,2,-6,-23,-27,-14,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-22,-21,-12,-1,-26,-5,8,-18,22,11,-21,-25,-3,-12,-19,-9,2,-17,5,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-9,-18,-15,-5,-25,-21,1,-16,8,0,-12,-18,-14,-13,1,23,6,-27,-8,-15;
MA   /M: SY='A'; M=34,-16,-13,-24,-15,-14,-9,-22,2,-15,0,-3,-15,-15,-14,-21,2,-2,8,-21,-15,-15;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-16,-14,-11,-7,-9,-5,-8,-10,-8,-2,-6,-16,-8,-15,2,-3,-5,-15,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-21,-10,-15,-22,31,-20,-27,-16,-22,-16,0,-16,-15,-16,10,10,-17,-25,-22,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-16,-26,-21,-22,-15,19,-20,-4,-20,-7,3,-9,-20,-17,-20,-6,-9,-4,-21,-16,-20;
MA   /M: SY='M'; M=3,-21,-20,-26,-22,-8,-3,-20,9,-19,6,12,-17,-22,-17,-20,-10,-9,10,-22,-11,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-13,-22,-14,-14,-9,-19,0,-12,-4,0,-12,-13,-11,-19,5,3,6,-21,-15,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-31,-21,11,-28,-17,19,-26,41,26,-28,-28,-18,-18,-27,-10,11,-19,1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=17,-7,-10,-13,-10,-14,-10,-19,-7,-11,-12,-10,-4,-13,-10,-14,18,21,5,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,2,-26,-1,-1,-19,-19,63,-26,-4,-20,-4,10,-17,6,1,-4,-5,-24,-30,10,-1;
MA   /M: SY='W'; M=15,-20,-19,-26,-18,-8,-13,-24,-7,-15,-11,-10,-19,-19,-15,-19,-5,-3,-3,23,-4,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-35,-28,29,-32,-20,21,-25,12,10,-21,-26,-26,-21,-17,-6,17,-7,16,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-7,-17,-7,-23,-3,-16,-12,-9,-13,-9,-9,-13,-1,-16,7,-2,-4,-23,-19,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-28,-19,-17,18,-28,11,-3,-3,-3,-1,-17,-28,-8,1,-17,-9,-6,15,55,-17;
MA   /M: SY='V'; M=3,-20,-13,-25,-21,9,-22,-23,10,-19,1,0,-16,-22,-23,-18,-1,5,20,-22,-4,-21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,-2,-13,-10,-14,-12,-5,-11,-14,-11,-6,-4,-17,-8,-14,11,7,-3,-32,-13,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-20,-12,-10,-13,-15,-8,-6,-1,-10,-4,-2,-18,-7,-3,-1,1,-2,-24,-6,-10;
MA   /M: M=-4,-9,-24,-9,-10,-10,-13,-13,-9,-7,-9,-5,-9,-4,-11,-7,-7,-5,-6,-22,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=23,-5,-15,-9,1,-22,-7,-9,-14,-4,-16,-11,-4,-11,2,-10,12,1,-7,-26,-17,2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-23,2,-3,-22,1,-8,-23,-6,-25,-17,13,-5,-2,-5,9,6,-21,-25,-18,-4;
MA   /M: SY='P'; M=10,-8,-25,-6,9,-25,-9,-15,-19,-6,-20,-16,-9,23,-4,-14,2,-2,-18,-26,-23,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-18,-23,-22,-16,7,-27,-14,3,-11,-1,-1,-15,-10,-15,-13,-9,2,2,-11,11,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-14,-16,-13,-4,-22,-18,0,-15,2,-2,-8,-16,-12,-13,7,28,4,-25,-4,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-29,25,10,-31,-15,1,-21,0,-19,-5,6,-3,13,-6,-4,-10,-23,-31,-15,11;
MA   /M: SY='A'; M=17,2,-19,3,-4,-24,3,-15,-19,-11,-13,-14,-3,-10,-9,-17,3,-5,-12,-26,-20,-7;
MA   /M: M=-6,-16,-9,-18,-15,-11,-3,-16,-14,-11,-3,-5,-11,-23,-12,-1,-8,-5,-8,-24,-14,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00059;
//
ID   SYNTAXIN_MP; MATRIX.
AC   MP00914;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Syntaxin / epimorphin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2944026; R2=0.0180803; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=27; N_SCORE=6.773; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=12; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-24,-4,0,-16,-20,0,-8,-6,-2,3,-4,-14,7,-6,-7,-5,-12,-25,-7,3;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-21,1,2,-15,-5,-7,-17,-5,-10,-7,-1,-14,4,-4,0,-2,-15,-22,-11,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,5,-14,6,8,-14,-9,1,-9,0,-7,-2,4,-7,9,-2,0,-3,-11,-17,-8,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-7,-19,-9,-1,-9,-12,-10,-9,-5,-9,-6,-3,-15,-1,-1,1,0,-6,-22,-9,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-23,-5,4,-20,-3,-6,-15,-1,-13,-6,-1,-13,4,-2,-2,-7,-14,-22,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-14,-22,-16,-7,-10,-22,-13,9,-10,1,4,-12,-17,-1,-9,-9,-7,6,-20,-5,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-3,-22,-5,-2,-21,-10,-15,-12,-3,-14,-9,-4,-8,-3,-8,2,4,-8,-26,-15,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-21,-10,0,-6,-17,-4,-10,8,-5,2,-7,-11,4,12,-10,-8,-10,-13,-2,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=0,3,-21,5,10,-25,-12,-5,-20,5,-17,-11,0,-6,11,4,3,-2,-17,-24,-14,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=6,-1,-19,-5,-1,-19,-12,-9,-11,-5,-10,-5,0,-14,4,-7,4,2,-9,-26,-14,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-11,-23,-11,-4,-3,-25,-11,5,-15,13,6,-13,-19,-7,-13,-14,-6,0,-20,-2,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=1,1,-21,-2,-1,-19,-8,-8,-13,-5,-15,-11,6,-11,-4,-3,4,-2,-12,-29,-16,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-28,3,20,-14,-24,-3,-12,2,-8,-7,-7,-12,5,-3,-9,-9,-13,-19,0,11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-23,-23,-18,-8,-28,-15,22,-18,8,14,-15,-19,-8,-18,-10,-5,15,-24,-5,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,7,-28,9,26,-31,-18,4,-24,11,-21,-10,4,-9,27,7,0,-9,-25,-26,-14,26;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=0,6,-21,8,23,-25,-8,-3,-22,3,-20,-15,5,-6,12,-3,9,-2,-20,-27,-17,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-26,-11,-2,-16,-18,-2,-23,22,-14,-7,-2,-18,7,54,-9,-9,-16,-18,-9,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-3,1,-22,2,8,-16,-13,32,-21,-6,-15,-8,3,-13,3,-6,-1,-9,-19,-24,1,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-27,15,18,-30,-13,-2,-27,10,-23,-15,6,-10,15,8,2,-5,-23,-28,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-23,9,20,-27,0,-9,-26,-2,-21,-18,1,-8,4,-9,6,-3,-21,-28,-21,12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-23,-34,-26,3,-33,-25,32,-26,24,18,-25,-25,-21,-24,-21,-9,24,-15,-1,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-26,-3,6,-22,-17,-1,-16,9,-13,-3,-2,-15,10,12,-6,-7,-14,-24,-10,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-26,7,12,-27,-16,0,-20,9,-20,-8,9,-12,19,9,1,-2,-21,-27,-13,15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-27,13,45,-27,-19,1,-25,6,-18,-16,-2,-4,15,-1,0,-8,-23,-30,-17,29;
MA   /M: SY='R'; M=-2,1,-23,-1,2,-24,1,-8,-26,6,-24,-15,6,-13,3,8,6,-1,-19,-27,-17,2;
MA   /M: SY='S'; M=-2,4,-20,3,1,-24,-4,-7,-23,0,-23,-14,7,-12,6,1,14,9,-17,-30,-16,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,2,-35,-26,38,-27,24,20,-24,-24,-21,-25,-20,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-22,-10,-8,-15,-14,-8,-8,-1,-6,0,-3,-18,-2,4,-5,-4,-5,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,17,-28,27,40,-30,-16,-1,-30,6,-21,-20,4,-5,12,-2,2,-8,-26,-32,-19,26;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-18,-30,-22,6,-30,-23,23,-27,36,16,-27,-28,-21,-20,-22,-5,19,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-3,5,-23,1,2,-22,-4,19,-25,0,-24,-12,13,-15,4,1,6,-4,-21,-30,-9,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,9,-27,12,19,-31,-10,10,-27,3,-22,-13,7,-11,21,3,2,-8,-27,-28,-13,19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-26,3,-33,-22,34,-25,27,25,-24,-24,-18,-23,-21,-9,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-19,-35,-25,56,-26,-18,0,-24,7,2,-18,-26,-29,-18,-16,-9,1,2,20,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-10,-23,-12,-3,-13,-22,-6,-5,-1,0,3,-8,-15,1,0,-8,-3,-6,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-29,38,15,-33,-14,-1,-27,0,-22,-18,10,-11,12,-7,-1,-9,-24,-31,-15,14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-20,-31,-22,9,-27,-13,21,-22,32,34,-25,-26,-14,-17,-24,-9,13,-19,1,-18;
MA   /M: SY='A'; M=24,-4,-15,-9,-4,-23,4,-11,-18,-9,-19,-13,0,-11,-2,-13,14,3,-10,-26,-19,-3;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-18,-11,-1,-11,-19,-6,-2,-11,1,3,-10,-16,-5,-12,-2,1,2,-27,-9,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-22,-9,1,-26,-12,11,-15,27,23,-22,-22,-9,-12,-22,-10,4,-21,-3,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-30,-28,1,-30,-29,29,-21,14,11,-28,-29,-28,-20,-12,0,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-26,9,18,-23,-19,0,-15,0,-14,-10,2,-11,8,-4,-2,-6,-15,-29,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-24,9,18,-25,-15,1,-22,2,-17,-11,2,-10,12,-1,4,-2,-19,-29,-14,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-28,-4,-5,-28,39,-15,-32,-13,-25,-17,-1,-16,-9,-15,1,-13,-24,-23,-25,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-26,13,29,-26,-17,-5,-24,4,-19,-17,2,0,8,-1,2,0,-21,-30,-18,18;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-15,-22,-20,-10,-8,-23,-11,10,-10,9,19,-13,-19,-2,-9,-10,-3,5,-24,-6,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-21,-34,-27,1,-32,-26,35,-25,20,18,-24,-24,-22,-24,-17,-6,31,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-27,47,13,-32,-11,-1,-29,-2,-26,-23,22,-12,1,-8,2,-4,-25,-37,-18,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,10,-23,11,5,-23,-12,-3,-24,8,-23,-16,12,-15,3,17,6,0,-17,-32,-16,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-28,34,30,-32,-13,3,-31,1,-23,-21,7,-8,6,-7,0,-9,-25,-34,-18,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-2,-21,-4,-2,-11,-15,-1,-12,-3,-11,-6,-1,-16,1,-5,1,3,-11,-17,5,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-11,21,-22,10,-1,-18,-8,21,-18,-3,-21,-11,35,-19,1,-1,3,-3,-24,-35,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-31,-29,0,-30,-28,31,-21,13,14,-28,-28,-26,-21,-12,-2,42,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-24,13,15,-22,-15,-5,-16,-3,-14,-11,4,-12,4,-7,0,-5,-14,-30,-14,9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,14,-22,10,1,-23,-2,4,-23,1,-25,-16,20,-16,1,3,7,-2,-20,-33,-15,0;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-11,-16,-11,-15,-7,-19,-7,-12,-10,-9,-6,-13,-11,-16,14,14,2,-26,-16,-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-16,-4,-1,-17,-15,-7,-12,-5,-10,-7,-5,-16,-3,-7,2,3,-5,-28,-11,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-2,5,-19,9,7,-20,-15,-9,-13,-8,-12,-12,-2,-13,-4,-11,5,1,-6,-32,-15,2;
MA   /M: SY='N'; M=-11,8,-24,3,-4,-4,-15,12,-16,-3,-16,-11,13,-20,-2,-2,-3,-5,-19,-15,12,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-15,-28,-25,-1,-28,-25,24,-20,13,12,-23,-24,-22,-20,-10,3,31,-26,-7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,6,22,-25,-12,-3,-26,13,-22,-13,3,-9,14,10,-1,-7,-23,-25,-15,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-22,5,11,-26,-8,0,-24,4,-20,-12,7,-14,13,7,1,-6,-23,-28,-15,11;
MA   /M: SY='G'; M=21,-11,-18,-16,-16,-21,23,-21,-19,-15,-16,-12,-7,-16,-16,-19,5,-3,-8,-22,-22,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-7,6,-22,1,1,-21,-15,1,-17,5,-17,-9,9,-15,7,5,2,3,-15,-27,-9,3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,6,12,-27,-9,-4,-23,10,-22,-13,2,-11,7,3,3,-5,-17,-28,-15,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,9,-27,10,18,-30,-15,11,-24,7,-22,-11,9,-11,22,6,1,-8,-25,-28,-12,19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-19,-28,-21,9,-29,-21,19,-25,31,15,-23,-27,-20,-19,-20,-3,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-29,1,4,-23,-20,-6,-26,29,-18,-9,-1,-16,6,37,-11,-10,-18,-22,-10,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00709;
//
ID   PI3_4_KINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00915;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1090980; R2=0.0156004; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=203; N_SCORE=8.266; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-11,-23,-14,-7,-16,-20,-13,-5,4,-13,-4,-6,-14,-1,6,-1,0,-1,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-24,-24,-17,4,-27,-18,14,-21,13,11,-18,-11,-16,-19,-16,-7,7,-19,-1,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-18,-9,-8,-4,-21,-11,-4,-11,-8,-5,-3,-15,-8,-11,2,12,-3,-21,1,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-13,-8,-20,-17,2,-9,-18,-3,-19,-4,-3,-6,-23,-19,-18,-9,-10,-4,-21,-8,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-10,-19,-13,-6,-11,-17,-9,-5,3,-7,-1,-6,-15,-3,6,-4,-3,-1,-19,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-17,0,-7,-20,14,-13,-20,-11,-14,-12,1,-15,-11,-12,-1,-6,-14,-23,-18,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-13,-1,3,-16,-6,-5,-14,-6,-18,-12,2,2,0,-7,16,7,-11,-26,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-24,31,7,-25,-7,4,-25,-2,-20,-16,21,-14,-1,-5,1,-6,-23,-34,-15,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-31,-11,-11,-19,34,-17,-31,-14,-24,-18,-4,-19,-14,-16,-6,-18,-26,2,-16,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-26,6,10,-27,-8,-2,-26,9,-22,-12,4,-10,8,8,0,-5,-21,-27,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-24,-2,5,-15,-20,-10,-10,-1,-6,-7,-2,-10,-2,-1,-5,-2,-10,-27,-12,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-15,-20,-17,7,-28,7,2,-14,0,1,-14,-26,-11,-11,-14,-9,-1,-6,27,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-25,-5,1,-26,0,-10,-25,6,-25,-14,-1,0,1,2,3,-4,-19,-26,-19,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-19,-28,-21,3,-27,-19,19,-18,9,9,-21,-23,-14,-18,-12,-5,20,-18,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-35,-25,3,-33,-23,35,-26,29,25,-24,-24,-18,-23,-22,-9,22,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-6,-34,-27,32,-29,-23,10,-26,14,6,-24,-29,-31,-21,-17,-7,15,-13,7,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-13,-9,-14,-17,12,-8,-17,-12,-17,-11,2,-19,-13,-12,1,-3,-10,-25,-15,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-21,-6,-13,-21,46,-13,-28,-14,-21,-14,1,-14,-13,-14,2,-13,-21,-15,-21,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-29,53,30,-37,-12,-1,-36,2,-27,-27,13,-7,5,-8,0,-10,-29,-37,-20,17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-9,-30,-22,6,-30,-21,18,-28,38,17,-28,-28,-21,-21,-26,-9,12,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-6,-20,-12,-1,-18,-14,-5,-4,-5,-5,9,-4,-14,10,-8,-1,-3,-7,-24,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-23,-27,-17,4,-29,-17,14,-17,24,13,-21,-25,-11,-6,-21,-9,8,-19,-1,-15;
MA   /M: SY='V'; M=6,-19,-16,-26,-20,-3,-21,-16,14,-15,6,15,-18,-20,-14,-17,-6,2,17,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-17,-16,0,-3,-26,-11,4,-13,14,12,-18,-20,-4,-12,-16,-9,0,-22,-4,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-33,-26,10,-30,-22,27,-24,24,22,-26,-27,-22,-20,-20,-7,24,-20,0,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-22,-37,-27,32,-31,-24,20,-28,18,9,-21,-25,-27,-23,-19,-9,13,-8,10,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-22,2,7,-25,-4,-5,-26,5,-23,-14,3,-14,9,6,3,-5,-22,-22,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-21,-23,-14,-6,-26,-16,12,-14,16,11,-18,-21,-5,-12,-14,-5,8,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-9,-31,-24,8,-25,-13,17,-17,15,34,-23,-25,-15,-15,-17,-7,18,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-11,31,-24,31,11,-29,-8,3,-27,2,-27,-20,29,-14,6,-2,6,-4,-26,-36,-19,8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-22,-5,0,-12,-14,-9,-16,5,-16,-10,6,-15,-1,5,2,3,-12,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,10,-33,-24,30,-28,31,17,-25,-26,-22,-23,-23,-9,20,-18,3,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-34,-31,-35,-25,17,-26,-24,3,-26,20,3,-33,-30,-22,-20,-33,-18,-6,48,14,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-23,-6,4,-21,-14,-7,-17,9,-13,-6,-3,-14,7,6,-1,-4,-13,-25,-12,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,5,-24,2,9,-25,-12,-2,-21,11,-19,-10,9,-13,13,7,0,-4,-20,-26,-13,10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-21,27,22,-28,-15,1,-27,0,-22,-19,10,-10,5,-7,1,-6,-23,-33,-16,13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-24,-6,-6,-22,6,-11,-22,2,-23,-13,5,-10,-5,3,3,-4,-17,-26,-19,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-21,-11,3,-9,-23,-15,1,-12,12,2,-15,-17,-7,-12,-11,-6,0,-25,-10,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00710;
//
ID   PI3_4_KINASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00916;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8607788; R2=0.0157641; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=102; N_SCORE=7.459; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-24,-7,1,-19,-14,-9,-14,-5,-16,-11,-5,9,-3,-6,1,1,-14,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,11,-20,11,3,-23,-10,-7,-21,-2,-22,-17,9,-6,-1,-6,12,9,-16,-33,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-28,-8,1,-14,-11,-13,-18,-9,-20,-14,-10,25,-8,-14,-1,-2,-19,-23,-14,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-24,2,12,-14,-11,-6,-16,-5,-12,-10,-2,-12,-1,-9,-2,-6,-15,-25,-12,5;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-25,-7,0,-17,-14,-14,-13,-3,-15,-12,-6,-14,-4,-6,-4,-7,-11,-2,-9,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-25,-32,-28,-23,23,-23,-16,-10,-18,-7,-10,-24,-26,-20,-16,-20,-8,-14,59,29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-13,-25,-13,-2,10,-24,-9,-7,-10,1,-3,-13,-17,-8,-6,-13,-9,-9,-10,6,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-19,1,11,-22,-14,-7,-19,5,-18,-12,2,-11,5,3,6,2,-14,-29,-16,8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-12,-17,-9,-14,-10,-16,-8,-8,-5,-5,-9,-15,-8,-8,5,2,-1,-25,-15,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-13,-26,-14,-3,-17,-22,-5,-13,12,-7,1,-7,-20,9,33,-10,-8,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='B'; M=-6,4,-20,4,4,-17,-15,-7,-14,-5,-10,-10,4,-15,0,-3,4,4,-12,-30,-12,2;
MA   /M: SY='N'; M=-1,9,-20,1,1,-20,-11,4,-19,2,-20,-11,17,-15,4,2,6,5,-18,-30,-12,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /M: SY='T'; M=5,-14,-12,-21,-15,-8,-20,-20,2,-10,-2,-2,-11,-18,-13,-6,1,10,9,-25,-10,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-26,-12,-3,-8,-21,-1,-16,10,-9,-4,-5,-19,4,23,-9,-8,-14,-16,1,-1;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-14,1,6,-21,0,-10,-22,-8,-27,-19,7,-9,1,-9,30,16,-13,-37,-20,3;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-21,16,-26,-22,1,-27,-12,-1,-23,7,2,-19,-29,-20,-19,-13,-3,5,-27,-4,-21;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-13,-15,-2,-20,-5,-18,-9,-8,-10,-10,-10,-10,-8,-17,7,-1,0,-22,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=7,-13,-18,-16,-15,-17,5,-21,-11,-8,-10,-7,-10,-19,-15,-12,-1,-2,0,-24,-17,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-21,-22,-18,9,-24,-2,5,-15,8,12,-17,-24,-10,-14,-14,-5,-1,1,25,-16;
MA   /M: SY='C'; M=4,-10,24,-14,-13,-17,-13,-19,-13,-18,-20,-14,-4,-21,-12,-18,17,7,-2,-40,-20,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-33,-26,1,-31,-21,33,-22,21,27,-24,-24,-18,-21,-18,-7,29,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-16,-27,-22,-3,-23,-25,20,-22,14,8,-22,-24,-21,-21,-9,-2,24,-25,-9,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-11,0,-10,-24,17,-8,-29,-15,-22,-17,2,-18,-12,-15,5,0,-20,-30,-19,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-31,-21,-19,24,-28,23,-6,-12,-4,-2,-18,-29,-10,-10,-21,-13,-14,32,63,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-28,25,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-30,-21,7,-28,-17,21,-25,41,27,-28,-28,-17,-18,-27,-9,13,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-30,-8,-9,-30,41,-12,-35,-7,-27,-15,0,-18,-2,-2,-1,-17,-29,-20,-24,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-22,-27,-22,3,-29,-20,26,-25,23,13,-14,-25,-19,-21,-19,-8,15,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-22,-9,-13,-27,36,-18,-34,-5,-27,-17,-1,-17,-13,-9,0,-8,-23,-23,-23,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-18,2,-29,1,-1,-21,-12,86,-30,-10,-21,-3,13,-20,7,-1,-8,-19,-30,-30,14,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-6,-8,-12,-13,-10,-7,-13,-7,-18,2,-4,1,-20,-14,-15,-7,-5,-10,-30,-15,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-26,28,11,-31,4,1,-31,-3,-27,-20,17,-12,2,-8,5,-7,-27,-34,-19,7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-31,-30,-38,-28,9,-34,-28,31,-28,18,12,-25,-24,-22,-26,-24,-12,17,5,6,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,41,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-26,9,-33,-24,31,-27,27,18,-25,-26,-22,-23,-21,-8,24,-19,2,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-25,34,10,-29,-13,-5,-30,7,-25,-21,13,-11,0,1,2,0,-21,-33,-16,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-8,-14,-9,-1,-7,-15,-5,0,-1,1,5,-6,-10,1,0,-6,-4,-2,-14,-3,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-12,-5,3,-18,-17,-9,-17,2,-17,-10,-1,-14,0,-3,-2,-3,-14,-26,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,5,-19,3,4,-16,-16,-10,-18,-1,-17,-13,3,-11,-1,-5,11,20,-12,-27,-7,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-28,-10,-14,-27,53,-19,-34,-18,-23,-17,-3,-19,-17,-19,-2,-18,-26,-21,-27,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-10,3,-28,6,16,-27,-10,20,-28,4,-24,-13,4,-4,10,1,-1,-10,-26,-29,-10,11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-4,-26,-22,-2,-27,-20,12,-21,10,8,-19,-18,-20,-20,-15,-7,12,-26,-7,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-19,-22,-25,-23,14,-30,-22,21,-23,10,7,-14,-24,-23,-21,-14,-7,17,-19,1,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,2,-29,1,-1,-21,-11,77,-30,-6,-22,-4,12,-19,7,0,-8,-18,-29,-29,11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-29,-34,-23,-2,-35,-28,36,-25,13,13,-21,-20,-18,-26,-18,-10,23,-10,-1,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-19,43,-30,61,21,-38,-11,0,-39,3,-29,-28,17,-10,2,-4,-1,-10,-29,-38,-19,11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00710;
//
ID   ASN_GLN_ASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00917;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Asparaginase / glutaminase active site signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4405808; R2=0.0151877; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=440; N_SCORE=12.113; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-26,-25,-16,-3,-31,-11,19,-16,10,11,-18,-22,-2,-15,-15,-9,10,-13,10,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-12,5,-28,6,14,-27,-18,14,-25,16,-22,-9,6,-13,15,14,-5,-10,-22,-26,-8,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-14,-18,-11,-15,-4,-15,-10,-7,-11,-9,-10,-14,-9,-12,5,-1,-1,-17,-9,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-28,0,15,-28,-18,7,-27,23,-23,-9,0,-11,16,21,-5,-10,-22,-23,-9,14;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-21,-3,1,-22,-5,-6,-22,1,-17,-12,0,-13,0,4,5,0,-14,-26,-15,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-18,-33,-29,-1,-32,-29,35,-23,12,12,-25,-25,-25,-24,-12,-4,39,-25,-7,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-22,1,10,-20,-15,3,-15,3,-17,-8,6,-14,6,1,2,-4,-14,-27,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-28,11,24,-28,-17,0,-28,15,-21,-15,2,-9,12,15,-2,-6,-23,-27,-14,17;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-18,-12,0,-14,-15,-6,-8,-11,0,-4,-9,-14,-3,-13,0,0,-5,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-15,-27,-21,15,-28,-14,11,-23,20,7,-21,-26,-19,-18,-17,-3,6,-10,15,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-1,9,-22,11,12,-26,-12,-6,-23,14,-21,-13,4,-8,9,4,1,-3,-18,-24,-14,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-22,11,10,-25,-11,2,-23,10,-20,-12,4,-9,11,8,2,-5,-18,-23,-11,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-20,3,-6,-21,25,-10,-24,-7,-21,-14,4,-4,-8,-10,1,-9,-20,-18,-18,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=1,8,-15,10,2,-19,7,-6,-19,-4,-17,-14,7,-9,-3,-5,6,-3,-14,-21,-15,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-13,-15,-17,-14,3,-16,0,0,-11,-2,-1,-11,-17,-11,-12,-4,-1,3,-9,11,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-26,27,18,-29,-14,-3,-27,2,-21,-18,8,-11,7,0,2,-5,-21,-33,-17,12;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-34,-29,11,-31,-28,28,-24,11,10,-24,-26,-27,-23,-13,-4,33,-20,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=7,-7,-13,-15,-12,-10,-14,-19,-5,-13,-3,-4,-6,-13,-11,-14,10,26,1,-27,-11,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-15,27,48,-23,-23,-6,-13,-22,-10,11,-20,0,-13;
MA   /M: SY='E'; M=4,0,-23,1,21,-24,-11,6,-21,-1,-17,-9,-1,-8,10,-6,4,-6,-19,-27,-14,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-9,-28,-7,14,15,-26,2,-13,-6,-7,-9,-11,-17,-4,-8,-11,-10,-17,-2,23,5;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-8,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-10,25,39,-3,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=8,-15,-11,-21,-15,12,-15,-11,-7,-16,-5,-7,-11,-20,-16,-16,2,0,-4,-10,9,-15;
MA   /M: SY='F'; M=11,-21,-18,-29,-21,26,-17,-18,-4,-19,-1,-5,-17,-22,-23,-19,-8,-6,0,5,11,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-30,-20,7,-28,-21,20,-28,44,18,-28,-28,-19,-21,-26,-9,10,-20,-2,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,11,-19,11,4,-20,-7,6,-22,-6,-23,-17,12,-13,0,-9,13,2,-17,-30,-9,1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-20,-32,-23,43,-28,-16,6,-27,22,6,-22,-29,-27,-19,-20,-8,2,-3,19,-23;
MA   /M: SY='M'; M=3,-12,-6,-20,-16,-8,-18,-14,2,-12,0,14,-11,-17,-9,-13,2,14,7,-27,-10,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-33,-25,16,-32,-22,25,-27,28,15,-26,-28,-24,-22,-22,-8,19,-15,7,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-28,10,26,-28,-17,-1,-28,17,-24,-16,2,-2,10,11,-2,-8,-24,-27,-16,17;
MA   /M: SY='S'; M=4,7,-11,2,-5,-21,0,-10,-21,-7,-23,-17,13,-15,-5,-7,16,10,-15,-33,-19,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-27,-3,0,-18,-10,-13,-12,-12,-5,-8,-8,5,-7,-14,-9,-8,-14,-27,-17,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00132;
//
ID   DNASE_I_2_MP; MATRIX.
AC   MP00918;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Deoxyribonuclease I signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6956487; R2=0.0133799; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=818; N_SCORE=15.630; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-18,-26,-18,6,-28,-20,13,-26,37,13,-23,-26,-18,-18,-19,3,8,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-29,-34,-34,-27,11,-33,-15,20,-22,5,5,-24,-25,-17,-22,-24,-14,5,32,30,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,22,-28,23,16,-36,-13,7,-25,5,-25,-12,19,-12,31,2,2,-8,-30,-30,-15,23;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,11,-27,8,15,-30,5,1,-27,1,-25,-14,16,-13,17,-2,3,-10,-30,-28,-19,16;
MA   /M: SY='T'; M=-5,5,-15,-6,-9,-8,-16,-11,-6,-12,-2,-6,11,-17,-9,-9,6,22,-6,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,27,-28,33,36,-30,-13,2,-30,5,-25,-23,19,-7,10,-3,2,-8,-30,-35,-20,23;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,44,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,41,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-22,-34,-27,0,-32,-22,36,-22,17,28,-23,-23,-18,-22,-17,-7,31,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-23,-35,-25,20,-31,-18,24,-26,26,24,-23,-25,-20,-21,-23,-10,14,-13,7,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,60,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-11,20,-21,37,38,-26,-26,-11,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-30,52,11,-38,8,-4,-40,-4,-30,-28,16,-12,-4,-12,0,-12,-30,-36,-22,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=16,-3,-15,-6,0,-23,-5,-13,-20,6,-24,-14,2,-10,0,-2,18,6,-10,-29,-17,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-24,-14,-14,15,-21,11,-6,-10,-9,-6,-11,-24,-7,-10,-3,-1,-10,10,51,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-15,-7,-5,-15,-20,-17,-15,6,-15,-10,0,-10,-5,1,12,34,-5,-27,-10,-5;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-16,-10,-2,-23,-6,-15,-18,7,-20,-12,-3,-10,-2,-3,11,2,-8,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-8,2,-26,4,16,-25,-16,21,-28,12,-25,-12,5,-10,10,6,3,-6,-23,-29,-7,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-16,10,-30,16,14,-34,-17,4,-28,13,-23,-11,5,-13,30,22,-3,-10,-27,-25,-13,20;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-37,-41,-37,-27,10,-23,-27,-8,-23,0,-8,-37,-30,-20,-20,-37,-24,-18,101,21,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-30,-5,3,-28,-16,-15,-23,7,-30,-17,-8,39,-2,-3,1,-3,-23,-29,-22,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16,-6,-11,-23,-6,-15,13,0,-1,-9,-23,1,44,-16,-10,-11,-20,-7,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00711;
//
ID   DNASE_I_1_MP; MATRIX.
AC   MP00919;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Deoxyribonuclease I signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7932439; R2=0.0139533; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1124; N_SCORE=20.467; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=3,-28,-15,-31,-28,-2,-29,-29,31,-21,10,10,-26,-26,-26,-22,-10,-2,40,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-1,-29,-26,-3,-26,-28,19,-20,9,6,-26,-28,-26,-21,-9,-2,34,-29,-12,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-13,-32,-15,-5,-15,-20,-11,-19,12,-18,-4,-12,-17,6,10,-14,-9,-19,23,1,1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-27,69,-29,-20,-2,-28,6,-2,-20,-18,-37,-20,-19,-10,-3,6,24,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-5,-18,-6,-1,-13,-11,-1,-18,-9,-22,-13,2,-3,3,-9,18,9,-15,-30,-11,1;
MA   /M: SY='S'; M=6,-9,-15,-9,-5,-15,-8,-14,-11,-14,-12,-11,-3,-4,-6,-14,18,9,-7,-33,-17,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-17,-35,-10,-1,-24,-21,-9,-19,-2,-20,-13,-15,49,-6,-4,-12,-11,-24,-27,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-6,-19,-9,-8,1,-13,-2,-14,-13,-16,-12,3,-7,-9,-11,10,6,-12,-23,-1,-9;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-14,-4,-5,-16,-17,-17,-15,-1,-14,-11,0,-10,-6,-5,13,32,-5,-28,-12,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-19,-12,2,-21,-15,-14,-7,0,-10,-5,-10,-12,3,-7,0,-5,-1,-23,-15,2;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-13,-28,-24,0,-25,-25,21,-21,18,10,-27,-27,-24,-20,-13,-3,30,-25,-9,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-32,1,8,-30,-19,-7,-27,24,-27,-12,-3,9,12,21,-8,-10,-24,-24,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,22,-24,29,28,-29,-10,-2,-29,1,-26,-23,14,-7,7,-6,10,-2,-25,-36,-20,17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-19,-37,-28,57,-30,-21,7,-29,20,6,-23,-30,-34,-20,-22,-9,6,0,20,-28;
MA   /M: SY='V'; M=16,-20,-10,-25,-21,-8,-19,-26,13,-16,1,1,-20,-21,-21,-19,0,5,29,-27,-13,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26,4,-35,-26,37,-30,32,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-27,-16,5,-29,-17,16,-26,43,18,-27,-28,-12,-17,-27,-10,6,-20,-1,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=19,-3,-10,-12,-8,-15,-10,-18,-12,-10,-13,-12,-2,-10,-8,-13,20,28,-2,-28,-15,-8;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-11,-11,-4,-17,-9,-18,-12,-9,-13,-12,-3,-9,-7,-14,16,21,-3,-27,-16,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-24,9,15,-25,-12,3,-26,7,-23,-15,4,-10,5,1,6,0,-20,-31,-13,10;
MA   /M: SY='D'; M=-1,13,-21,17,7,-24,-13,-8,-20,-5,-14,-14,3,-11,2,-10,5,5,-15,-31,-15,5;
MA   /M: SY='A'; M=32,-12,-10,-19,-12,-16,-6,-20,-3,-12,-9,-8,-11,-14,-12,-18,11,4,9,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-17,-17,-7,-9,-26,-22,12,-13,1,1,-22,-14,-17,-16,-8,-3,24,-29,-14,-12;
MA   /M: SY='A'; M=17,-5,-18,-10,-2,-22,-10,-14,-19,13,-19,-11,-4,-11,-1,7,4,1,-9,-22,-15,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,46,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,39,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='A'; M=33,-5,-14,-10,4,-22,-4,-15,-15,-6,-15,-13,-5,-8,-3,-15,13,1,-7,-25,-20,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-25,-20,-20,20,-27,9,2,-11,0,0,-19,-27,-12,-12,-14,-4,-1,15,56,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-26,-25,-23,38,-30,6,3,-15,3,1,-21,-30,-18,-13,-19,-9,-2,20,60,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-17,-25,-17,5,-27,-20,12,-25,35,12,-22,-25,-17,-17,-17,5,7,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,65,22,-39,-10,0,-39,1,-29,-29,20,-10,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-10,-29,-28,-2,-28,-29,27,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,46,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-11,-1,-21,-19,-7,-11,6,-16,-5,-3,-15,13,16,0,-4,-12,-18,-9,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,6,-26,6,9,-31,-8,11,-25,3,-22,-10,7,-13,22,4,2,-9,-25,-26,-12,15;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,2,-30,36,-25,-9,1,-14,12,42,-10,-11,-21,-21,-8,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-29,11,9,-32,4,3,-31,7,-26,-14,9,-13,12,2,-1,-12,-28,-26,-16,10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-14,-15,-12,-6,-18,-17,-2,-15,6,0,-6,-17,-11,-14,3,18,1,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,20,-27,22,31,-29,-14,2,-28,12,-25,-19,18,-8,12,4,1,-7,-29,-32,-18,22;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,54,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-20,-36,-29,15,-33,-25,31,-25,15,17,-23,-25,-25,-23,-17,-7,29,-18,2,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-35,-26,7,-31,-19,32,-23,21,29,-22,-23,-17,-21,-20,-9,23,-19,1,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00711;
//
ID   NITRIL_CHT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00920;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitrilases / cyanide hydratase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6585288; R2=0.0165971; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=542; N_SCORE=14.644; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,2,-16,-7,-11,-16,3,-17,-18,-11,-17,-13,6,-13,-11,-11,14,29,-10,-29,-16,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-29,-18,-31,-25,3,-30,-25,27,-26,27,15,-27,-27,-22,-22,-19,-6,26,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-28,35,13,-31,-16,-5,-29,11,-24,-19,8,-12,1,4,-4,-9,-18,-33,-16,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=21,-8,-12,-18,-12,-13,-13,-21,-3,-12,-7,-7,-7,-11,-11,-17,11,21,3,-24,-13,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-15,-21,-10,-7,-30,-21,18,-19,8,6,-14,-20,-13,-20,-13,-8,13,-27,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-25,7,16,-26,-8,-7,-28,11,-24,-17,3,-10,6,12,6,-1,-21,-28,-17,10;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-21,-31,-23,32,-28,-14,10,-25,21,7,-22,-27,-24,-19,-20,-9,4,-2,21,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-23,-28,-16,-3,-30,-24,26,-22,17,11,-20,-20,-16,-22,-15,-8,19,-22,-6,-18;
MA   /M: SY='R'; M=2,1,-21,-1,1,-20,-13,-9,-16,7,-17,-11,3,-16,-2,9,1,-4,-8,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-28,12,44,-28,-21,-3,-23,10,-18,-14,-3,-5,19,1,-2,-9,-21,-28,-17,31;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-12,-22,-12,-18,-4,-21,-3,-12,-7,-7,-11,-11,-11,-21,7,-1,3,-20,-18,-12;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-19,-12,-1,-23,3,-15,-20,1,-17,-12,-6,-11,-4,-3,3,-6,-11,-21,-19,-3;
MA   /M: SY='E'; M=0,10,-23,15,18,-28,-11,-6,-27,9,-24,-18,5,-8,5,3,7,-2,-20,-30,-18,11;
MA   /M: SY='N'; M=3,8,-21,2,5,-20,-9,-3,-21,8,-22,-14,15,-14,2,6,6,-2,-18,-26,-12,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=23,-11,31,-19,-14,-20,-9,-21,-18,-16,-17,-15,-9,-19,-14,-21,10,1,-5,-34,-23,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-30,20,28,-34,-18,-2,-30,22,-26,-15,4,-7,19,10,-4,-10,-26,-27,-15,23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-19,-32,-22,20,-30,-21,18,-29,41,16,-28,-30,-24,-20,-27,-9,11,-16,4,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='V'; M=21,-21,-11,-26,-20,-8,-17,-25,12,-17,5,2,-21,-21,-20,-20,-3,-1,25,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,71,-31,-21,5,-30,11,2,-20,-29,-38,-21,-20,-10,3,7,27,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-2,-30,-11,-20,-22,-11,-30,-20,-18,79,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=17,-18,-13,-23,-18,-9,-12,-23,5,-17,5,0,-18,-20,-18,-19,-2,2,15,-24,-13,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-31,-37,-28,43,-25,-24,-9,-24,-4,-9,-26,-28,-29,-19,-23,-11,-12,60,26,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-10,-7,-30,13,-20,-27,-14,-30,-20,-13,50,-14,-20,-6,-14,-30,-26,-30,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-31,-17,-11,4,-18,-3,-17,3,-14,-8,-13,-13,-7,11,-15,-12,-17,9,20,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-16,-35,-16,-12,-9,12,1,-29,-16,-22,-15,-11,-22,-12,-14,-15,-21,-28,28,1,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-12,-18,-16,-15,2,-19,-14,5,-16,-1,8,-10,-19,-13,-16,-2,-2,6,-23,-4,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-21,-35,-24,-18,0,-19,-18,-14,-11,-8,-11,-17,-25,-12,-3,-22,-12,-19,57,9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-21,-29,-21,26,-28,-18,7,-15,12,10,-18,-24,-21,-13,-17,-5,7,-10,8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-26,-6,-13,-22,30,-11,-24,-17,-16,-12,-5,-21,-16,-17,-5,-15,-15,-24,-20,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-1,-18,-5,-9,-12,-15,-11,-5,-9,-3,-5,2,-20,-10,-5,-1,1,-1,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-17,-24,-17,-11,-7,-13,-9,-6,-12,-6,-5,-16,-1,-8,-15,-6,-6,-7,-12,5,-12;
MA   /M: SY='L'; M=0,-15,-18,-16,-13,-7,-22,-19,7,-14,10,3,-15,-20,-14,-14,-8,0,9,-26,-9,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-16,-31,-17,-11,-8,13,-14,-24,-14,-19,-13,-12,-20,-7,-14,-10,-17,-23,18,-1,-8;
MA   /M: SY='S'; M=4,-10,-17,-13,-13,-9,-2,-13,-8,-14,-10,-8,-5,-19,-12,-14,7,4,-1,-23,-6,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-18,-24,-19,-12,-6,-24,7,-2,-5,10,13,-13,-24,-4,12,-18,-11,-2,-22,-1,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-24,-3,4,-20,-15,-11,-17,2,-17,-12,2,7,-2,-4,1,1,-17,-29,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-25,-1,5,-8,-18,1,-13,0,-11,-2,-1,-16,5,-4,-6,-8,-15,-15,5,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00712;
//
ID   NITRIL_CHT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00921;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitrilases / cyanide hydratase active site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4878526; R2=0.0159517; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=491; N_SCORE=13.310; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-27,36,5,-25,1,2,-30,-4,-27,-23,23,-16,-4,-9,0,-9,-28,-29,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-2,-28,0,-13,-30,51,-17,-37,-16,-28,-20,2,-17,-16,-19,1,-16,-27,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-12,-3,-1,-19,-5,-10,-20,-5,-26,-17,7,-11,0,-1,31,21,-10,-36,-17,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,21,-22,26,2,-13,-16,-10,-24,-8,-17,-19,7,-13,-9,-11,4,11,-15,-30,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-25,-28,-14,11,-32,-21,21,-24,24,12,-21,-22,-17,-21,-21,-10,10,-17,1,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-31,-14,-4,-21,-21,-16,-6,-12,-12,-7,-15,35,-2,-16,-7,-7,-15,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-10,-27,-27,-1,-29,-29,24,-19,7,7,-26,-27,-27,-19,-6,7,43,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-13,-19,-16,-14,5,-20,8,-6,-13,-7,-4,-9,-21,-11,-12,-1,3,-2,-10,20,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,51,20,-40,-13,3,-35,3,-27,-22,15,-10,16,-5,0,-10,-30,-35,-17,18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-13,-16,-14,4,-21,-18,-5,-13,-4,0,-5,-14,-13,-11,10,35,1,-23,-3,-13;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-29,-2,11,-27,-2,-14,-24,-6,-25,-19,-7,27,-2,-14,3,-6,-24,-29,-25,3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-21,-35,-26,20,-30,-25,23,-26,18,10,-22,-24,-25,-23,-17,-7,18,-14,4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-32,-26,4,-32,-26,31,-26,27,16,-28,-28,-24,-22,-20,-6,31,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-18,-15,-8,-25,15,-16,-19,-10,-16,-11,-6,-13,-3,-16,6,-6,-12,-20,-21,-6;
MA   /M: SY='L'; M=11,-23,-16,-26,-16,-1,-19,-20,9,-23,29,9,-23,-23,-16,-20,-16,-6,6,-20,-7,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-7,-7,-14,-13,-18,-9,4,-14,-11,-6,22,-22,-11,-14,-3,-5,-6,-34,-14,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-36,-45,-37,-27,6,-17,-29,-19,-19,-19,-19,-36,-27,-19,-20,-33,-26,-26,127,23,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-14,25,-24,13,0,-20,-7,43,-24,-4,-26,-13,41,-20,4,0,3,-7,-30,-36,-5,0;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-22,-28,-18,18,-25,-10,3,-10,15,18,-18,-25,-13,4,-20,-10,0,-12,5,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-23,-8,1,-21,-15,4,-6,-1,-8,16,2,-15,23,-1,-1,-5,-13,-25,-9,12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-32,-9,-1,-26,-17,-19,-19,-10,-28,-19,-14,65,-9,-17,0,1,-24,-31,-26,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-29,-20,17,-28,-19,14,-28,38,14,-25,-28,-21,-19,-23,-8,7,-17,3,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-8,-17,-12,-11,-2,-17,-9,-1,-16,6,-1,-3,-21,-10,-13,0,6,-4,-24,0,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-21,-18,-16,20,-23,1,-5,-13,-5,-5,-11,-22,-13,-11,-2,9,-6,3,38,-16;
MA   /M: SY='A'; M=33,-14,-13,-23,-13,-13,-7,-17,-2,-13,2,4,-14,-14,-10,-19,0,-3,3,-20,-14,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-22,-19,-29,-19,1,-21,-10,16,-17,27,36,-22,-22,-9,-15,-19,-9,9,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-20,-25,-21,-20,19,-26,8,3,-11,0,0,-20,-27,-13,-13,-15,-7,0,15,54,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-12,-10,-4,-21,-2,-15,-16,-3,-20,-14,-1,-10,-4,-11,19,6,-6,-27,-19,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-27,-6,9,-21,-21,-5,-16,19,-9,2,-6,-14,12,18,-11,-10,-15,-21,-9,10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-29,-4,-13,-26,39,12,-35,-15,-28,-15,11,-20,-10,-13,-1,-17,-30,-25,-17,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-28,0,28,-19,-26,-11,-4,-3,-7,-7,-8,-8,5,-10,-6,-9,-6,-28,-14,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,2,-28,5,31,-34,-18,3,-22,8,-19,-8,-1,-6,38,3,1,-9,-27,-24,-15,34;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-32,-9,-8,-5,-22,66,-22,-11,-15,-2,-3,-24,2,-5,-16,-19,-25,5,36,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-26,31,-33,-30,-7,-33,-30,14,-26,2,2,-24,-31,-27,-26,-13,-6,24,-35,-15,-30;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='P'; M=18,-11,-21,-11,-4,-24,-7,-17,-16,-10,-22,-16,-8,26,-7,-17,11,2,-13,-29,-24,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00712;
//
ID   TRANSGLYCOSYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP00922;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic transglycosylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.6188884; R2=0.0192245; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=434; N_SCORE=14.952; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-6; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=24,-20,-10,-25,-20,-10,-16,-25,11,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,26,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-8,-23,-12,-4,-9,-10,-12,-19,8,-16,-8,-4,-15,0,5,-2,0,-13,-17,-7,-2;
MA   /M: SY='A'; M=16,-5,-19,-8,9,-19,-12,-7,-13,-3,-10,-5,-7,-10,5,-10,2,-2,-10,-19,-9,7;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-15,-14,-10,-15,-8,-18,-7,-5,-11,-7,-8,-16,-10,-10,7,5,4,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-25,3,8,-18,-16,-1,-20,9,-18,-12,1,-14,6,8,-1,-6,-18,-18,-1,6;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-25,-6,2,-26,-7,-9,-25,22,-23,-11,2,-13,6,18,-3,-8,-17,-21,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-10,-30,-11,-6,0,-16,3,-15,2,-11,-7,-6,-23,-3,9,-13,-11,-17,5,22,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,14,-26,8,7,-26,19,-4,-30,-2,-28,-19,22,-15,-2,-5,3,-10,-29,-30,-23,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-33,-26,2,-32,-23,33,-25,25,23,-25,-25,-20,-22,-20,-7,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-30,33,15,-33,-12,-7,-31,-4,-29,-25,6,18,-1,-12,4,-5,-27,-36,-23,5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-13,-33,-11,6,-12,-23,-9,-10,-3,-12,-4,-14,-2,3,-8,-13,-11,-16,6,1,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-22,8,15,-25,-13,-4,-26,8,-24,-16,5,-10,10,13,11,3,-19,-31,-16,11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-21,16,-30,-17,17,-29,44,17,-29,-30,-21,-19,-29,-10,8,-14,8,-21;
MA   /M: SY='I'; M=6,-25,-19,-31,-23,-2,-26,-25,25,-24,18,11,-22,-22,-19,-24,-14,-6,21,-22,-6,-23;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-19,-23,-14,-1,-20,-15,3,-12,17,12,-18,-21,-11,-7,-14,-4,2,-19,-5,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-13,-11,-7,-19,11,-15,-16,-4,-15,-10,-4,-10,-7,-11,6,-3,-8,-17,-17,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-36,-28,1,-35,-26,39,-26,21,22,-23,-23,-20,-25,-19,-8,31,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-18,-19,-23,-14,-14,-15,-17,4,-12,-3,9,-17,4,-11,-18,-5,-5,4,-23,-15,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-15,-30,-17,-5,-8,-24,-2,-6,-3,-4,-1,-13,-20,10,2,-14,-11,-13,6,13,1;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-11,-19,-16,-9,-15,-26,-15,6,-10,-4,2,-9,-16,5,-10,1,12,6,-25,-8,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,1,-18,1,-1,-23,-2,6,-23,-6,-23,-15,5,-13,-1,-4,14,1,-15,-31,-14,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-29,-30,-35,-28,40,-9,-23,-13,-25,-6,-9,-22,-28,-31,-20,-22,-18,-14,45,19,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-21,24,1,-22,-5,5,-19,-2,-26,-19,45,-19,-3,-4,6,-2,-23,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-18,-35,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,72,-10,-20,-6,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-2,-25,-3,-4,-7,-19,13,-14,0,-14,-4,0,-19,3,1,-3,-2,-15,-12,18,-3;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,-10,-20,-11,-18,-4,-21,-7,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-19,9,3,4,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-19,-15,-11,-9,-25,-15,-1,1,-7,-2,-10,-17,-6,-3,-2,11,6,-20,0,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-9,-31,-7,-3,-21,-5,7,-25,2,-24,-11,-5,6,1,2,-6,-11,-24,-19,-4,-4;
MA   /M: SY='A'; M=16,-7,-12,-13,-9,-16,-11,-18,-8,-5,-13,-9,-5,-13,-9,-10,14,15,3,-28,-15,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-26,13,-5,-26,24,6,-31,-9,-29,-19,27,-19,-7,-9,3,-11,-30,-31,-20,-6;
MA   /M: SY='A'; M=37,-14,-13,-21,-12,-18,-6,-22,-5,-12,-9,-8,-14,-4,-13,-20,5,-1,5,-22,-19,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-17,-21,-21,-13,-8,-21,-14,5,-10,6,8,-12,-19,-7,0,-7,-4,3,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,7,-30,-18,25,-27,40,27,-27,-27,-17,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-24,-26,-32,-22,2,-20,-6,12,-12,12,44,-24,-22,-4,-12,-24,-14,2,14,6,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-28,-5,14,-34,-20,8,-14,7,-14,9,-3,-12,51,7,-3,-10,-24,-20,-8,32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-20,-34,-26,11,-33,-25,29,-28,28,16,-26,-27,-24,-23,-21,-8,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-16,-21,-16,-6,-25,-19,9,-9,3,9,-14,-18,-13,-10,-3,13,15,-26,-7,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-35,-7,4,-31,-19,-14,-22,7,-28,-15,-12,47,4,-4,-8,-9,-26,-26,-22,1;
MA   /M: SY='S'; M=11,3,-17,-3,-5,-20,1,4,-20,-7,-22,-14,12,-14,-3,-7,15,3,-15,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-12,-12,-11,-10,-19,-20,-5,-12,-10,-8,-1,-11,-10,-12,19,40,2,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-12,-18,-10,-21,7,-19,-13,-11,-13,-12,-8,-11,-10,-19,11,-1,-3,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-29,-5,-2,-29,12,-10,-31,13,-26,-12,0,-14,5,10,-3,-9,-24,-21,-17,1;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-4,-23,-7,-4,-14,-14,11,-18,3,-15,-8,3,-18,1,11,0,-5,-15,-21,0,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-14,2,-23,5,-3,-1,-21,-8,-9,-13,3,-2,-7,-19,-10,-13,-10,-2,-8,-20,2,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-17,-22,-19,-18,-17,6,-23,-4,-8,-10,-4,-12,-21,-17,-12,-7,-10,6,-23,-16,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-14,-15,-9,-2,-20,-14,12,-9,11,6,-14,-14,-10,-9,-11,-5,11,-15,-4,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-14,-3,0,-13,-10,-3,-10,6,-11,-2,3,-9,7,8,3,5,-9,-17,-7,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-6,-24,-7,-8,-13,-22,-10,3,-10,2,6,-5,-19,-3,-6,-9,-7,1,-27,-8,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-23,-7,-1,-21,-15,-9,-18,8,-20,-8,0,1,3,9,3,6,-15,-26,-14,0;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-5,-28,-4,-11,-19,18,-11,-27,-10,-22,-16,-3,-8,-11,-8,-2,-5,-22,-18,-10,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-14,5,-32,7,-1,-19,-8,-6,-26,7,-23,-14,1,-17,1,1,-10,-13,-24,5,-1,0;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-26,-11,-8,-13,-5,-9,-18,-8,-22,-15,-8,7,-7,-12,4,-2,-17,-11,-1,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-27,20,11,-31,16,-9,-34,-6,-27,-22,7,-11,-3,-11,4,-7,-27,-30,-23,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,3,-26,4,11,-32,-6,-2,-24,3,-20,-9,1,-11,25,3,2,-6,-24,-24,-15,18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-2,-30,3,2,-26,-14,-9,-24,1,-28,-19,0,28,-2,5,1,-4,-24,-31,-22,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00713;
//
ID   ASP_GLU_RACEMASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00923;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartate and glutamate racemases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.6853070; R2=0.0086692; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=846; N_SCORE=6.648; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=829; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-37; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=13,-75,-37,24,17,-73,-70,-19,-2,28,-52,-69,-72,-26,3,-62,2,7,104,-50;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-77,14,64,-69,-73,-58,27,-48,5,-17,0,-66,46,22,-37,-59,-38,-78,-64;
MA   /M: SY='M'; M=7,32,-43,-76,-1,-51,-74,60,-73,7,71,-73,-75,-70,-75,-66,-57,42,-76,-56;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,7,-68,-64,-66,5,-70,-32,-64,1,-54,-31,-70,13,-68,-18,48,31,-80,-67; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=23,-74,54,25,-79,-28,-15,-75,18,-40,-67,48,-68,16,23,-33,-33,-47,-84,-68; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-46,-74,-8,-12,81,-51,-19,-9,32,-12,28,-67,-76,-66,-35,-68,-63,16,45,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-71,-41,-67,29,-80,-65,-4,-43,71,9,-36,-79,39,-67,-68,-20,-10,-69,-50;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-72,-35,31,-61,-74,4,-29,11,21,67,-63,-70,41,-17,-61,-34,34,-77,-59;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-33,-87,24,44,-91,-4,-67,-89,16,-87,-80,-1,-15,15,2,-24,14,-84,-92,-80; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-46,-77,-63,-19,57,-74,45,-64,37,-32,-17,-30,-73,49,33,-60,-20,-66,-57,57;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-78,54,-18,-82,50,29,-82,-56,-82,-72,48,49,5,-20,-33,-59,-79,-84,-71;
MA   /M: SY='I'; M=2,32,-82,-77,-53,-81,-80,73,-75,21,-40,-76,9,-73,-78,-67,-57,47,-78,-61;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=2,-18,42,4,-80,-66,-16,-79,91,-78,-68,-23,-64,-43,-34,-21,-56,-73,-78,-67;
MA   /M: SY='M'; M=32,-69,-80,-72,-12,-47,-63,27,-69,34,109,-72,-73,-63,-69,-64,-59,-40,-72,-54;
MA   /M: SY='L'; M=11,-69,-82,-75,-48,-79,-73,41,-75,60,21,-77,-78,-70,-75,-43,-58,39,-75,-57;
MA   /M: SY='V'; M=-37,-67,-83,-77,-54,-84,-85,21,-75,-39,-42,-78,-78,-77,-77,-66,-51,99,-87,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-74,-85,-82,-49,-88,-82,91,-77,5,21,-77,-76,-75,-80,-72,-57,46,-76,-57;
MA   /M: SY='A'; M=97,-14,-68,-60,-76,-50,-70,-65,-63,-67,-61,-62,-32,-59,-67,-41,-31,-52,-76,-72;
MA   /M: SY='C'; M=-61,153,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-91,-84,-83,-63,-36,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='T'; M=-51,-61,-57,-60,-68,-67,-67,-59,-57,-64,-60,-46,-59,-61,-65,-3,113,-51,-88,-66;
MA   /M: SY='A'; M=97,-61,-68,-60,-75,-50,-69,-64,-62,-66,2,-62,-66,-59,-67,-15,-52,-52,-76,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-47,-63,-56,-58,-71,-58,18,-66,-57,-70,-64,-45,-62,-54,-63,79,84,-59,-86,-64;
MA   /M: SY='A'; M=74,-62,-63,-60,-71,-55,-67,-61,-38,-65,-60,-28,-65,-59,-65,19,62,-14,-79,-29;
MA   /M: SY='V'; M=48,-67,-76,-70,-1,-70,-72,20,-70,5,-13,-36,-75,-31,-72,-58,-54,63,-72,17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=73,22,-71,-65,-18,-39,-72,-52,-66,-61,-59,-64,-71,-64,-70,26,-30,39,-79,-67; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-32,-71,-85,-77,-22,-84,-71,4,-77,81,-33,-83,-83,-72,-76,-76,-63,-1,56,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-81,31,65,-76,-69,5,-78,-17,-76,-69,-12,69,-4,17,-56,-19,-75,-78,5;
MA   /M: SY='D'; M=35,-73,61,39,-33,-65,19,-27,-56,-49,-63,-52,-32,-53,-36,-20,9,-28,-72,47;
MA   /M: SY='L'; M=1,-70,-83,-76,-45,-81,-71,38,-76,75,31,-79,-80,-70,-75,-71,-61,-6,-73,-55;
MA   /M: SY='R'; M=-64,-83,-59,-27,-80,-73,-51,-80,34,-74,-62,-53,-71,78,93,-57,-63,-76,-74,-62;
MA   /M: SY='E'; M=29,-76,-24,75,-81,-67,-56,-78,41,-75,-67,-11,-62,32,19,-33,-58,-71,-77,-69;
MA   /M: SY='K'; M=2,-75,-56,8,-71,-68,19,-16,57,-50,-19,1,-66,37,44,-33,26,-64,-75,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-46,-17,-80,-76,63,-81,-60,-26,-74,58,-10,-76,-83,-71,-72,-28,-36,-20,-51,69;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=8,-74,70,-28,-81,-26,5,-77,-21,-79,-71,3,53,6,-61,44,-5,-72,-86,-69;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-74,-85,-82,52,-87,-23,82,-77,-12,-10,-77,-77,-77,-79,-72,-59,40,29,-46;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-84,-78,-26,-85,-85,42,-75,-38,-8,-78,-78,-77,-77,-67,-52,94,-84,-59;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00714;
//
ID   ASP_GLU_RACEMASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00924;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartate and glutamate racemases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.7839692; R2=0.0088315; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=875; N_SCORE=6.942; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=825; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-38; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-55,-73,-73,-73,-56,-72,-75,91,-70,-42,-44,-63,-70,-64,-74,62,-49,-30,-76,-59;
MA   /M: SY='A'; M=82,-67,-52,66,-78,-56,-63,-71,-54,-70,-65,-60,-62,-49,-61,-46,-55,-59,-77,-72;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-84,-109,-84,-73,-104,-86,-87,-91,-80,-102,-88,-91,110,-84,-93,-81,-76,-97,-97,-101; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='C'; M=23,113,-83,-80,-63,-78,-81,32,-78,18,-53,-74,-85,-78,-82,-66,-62,5,-88,-71; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='M'; M=7,-76,-90,-82,-58,-85,-80,-10,-80,34,62,-84,-85,-77,-81,-74,-65,54,34,-64; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='Q'; M=5,9,-57,18,-72,-70,34,-26,42,-72,-64,14,-70,46,33,-19,-16,-70,-75,20; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-83,28,52,-20,-13,-58,-80,20,-76,-70,-14,-70,28,15,-60,-23,-77,-73,40; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,46,-71,-6,-51,-36,-62,32,-7,-34,-58,-17,-80,-12,-68,6,-1,-26,-63,78; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='L'; M=-72,-75,-90,-83,40,-91,-76,-39,-83,73,-39,-87,-89,-79,-81,-80,-24,6,-72,-53; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='E'; M=17,-79,-59,36,-78,-70,2,-77,28,-41,-2,-14,-71,28,15,18,-1,-72,-81,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-33,-89,-63,21,-89,-71,-70,-80,-63,-87,-76,5,102,-11,-73,7,-21,-81,-87,-84; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-10;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-82,-94,-85,40,-89,-80,10,-83,56,-46,-90,-88,-80,-82,-83,-73,-24,106,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-76,-23,-25,-62,-80,-71,19,33,34,26,-69,-77,-11,0,-67,-22,15,-80,-65; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,-79,36,42,-84,34,-61,-33,-22,-80,-73,23,-15,13,-21,19,-59,-75,-85,-74; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='Q'; M=24,-77,3,22,-80,-70,2,-31,35,-40,-66,-13,-69,47,2,-54,32,-68,-84,-70; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-63,3,36,12,-82,21,3,-81,35,-79,-2,33,23,14,15,-23,-21,-78,-84,-71; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='I'; M=17,58,-79,-74,-17,-77,-79,64,-74,-3,-49,-73,50,-74,-79,-64,0,-3,-79,-65; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-80,112,17,-87,-65,-53,-85,-21,-83,-81,-37,-66,-7,-60,-23,-57,-82,-98,-70;
MA   /M: SY='T'; M=-26,-64,-61,-61,-66,-31,-69,9,-24,-59,-57,-51,-62,-11,-65,12,98,6,-85,-65;
MA   /M: SY='L'; M=-63,-70,-84,-78,-45,-87,-75,47,-77,68,-33,-81,-81,-73,-77,-74,-59,47,-75,-56;
MA   /M: SY='I'; M=-58,-72,-85,-81,-51,-88,-86,83,-77,-35,-38,-77,-76,-76,-80,-70,-54,74,-80,-59;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-69,-83,-76,10,-84,-66,-34,-76,85,30,-81,-83,-70,-74,-31,-62,-41,-67,-5;
MA   /M: SY='G'; M=12,-75,-65,-74,-82,99,-71,-87,-69,-84,-74,-51,-68,-66,-76,-48,-66,-79,-74,-77;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-15,-1,-69,-71,145,-86,-57,-69,-55,-43,-69,-46,-52,-59,-67,-85,-102,-39;
MA   /M: SY='Y'; M=-73,-76,-78,-78,87,-81,-50,-21,-72,-12,-48,-75,-84,-72,-69,-70,-66,-55,-35,106;
MA   /M: SY='P'; M=-62,-87,-64,-56,-84,-30,-67,-74,-60,-83,-70,-17,119,-63,-24,18,-56,-77,-80,-80;
MA   /M: SY='F'; M=-34,-71,-84,-78,67,-84,1,29,-77,66,8,-78,-82,-74,-75,-74,-63,-40,-62,-41;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-70,-84,-77,-43,-86,-70,31,-77,77,44,-81,-81,-71,-75,-75,-61,19,-73,-54;
MA   /M: SY='K'; M=24,-74,-58,12,-69,-31,-59,-27,55,-20,-59,-13,-68,15,48,-54,0,-10,-74,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-83,37,48,-84,-31,-58,-79,28,-81,-71,8,82,14,-18,-23,-58,-78,-81,-74;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-75,-17,56,4,-34,2,27,-4,5,-53,-62,-15,-8,-20,-6,-58,15,-73,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-32,-75,-82,-30,8,-87,-78,91,-76,32,8,-76,-75,-72,-78,-73,-60,-26,-71,-53;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-78,-50,53,-80,-31,-53,-76,22,-40,-63,-12,-65,80,42,-3,-59,-72,-76,-66;
MA   /M: SY='Q'; M=10,-75,18,13,-76,3,4,-76,29,-41,-65,33,-67,48,26,19,-56,-72,25,-64;
MA   /M: SY='Y'; M=10,30,-69,8,-12,-75,-64,35,-67,7,27,5,-75,-64,-70,-62,-19,41,-67,50;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-70,-83,-77,52,-80,-71,22,-75,39,62,-76,-79,-73,-75,-69,-21,36,-68,-48; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-85,-21,-67,-80,67,26,-81,-28,-80,23,-61,79,-67,-74,-60,-67,-81,-78,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-83,36,42,-79,-12,-64,-32,9,-43,-71,7,50,13,-61,-5,-61,-75,53,-70; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-63,-80,17,11,-80,20,63,-74,34,-76,-68,-12,-16,13,-56,-5,13,0,-88,-67; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-31,-74,-81,-76,19,-85,-79,22,-7,-49,3,-74,-80,-73,-2,-67,13,70,-79,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=20,-71,19,-54,5,-66,-60,-66,30,-36,-62,10,-69,15,28,-1,48,-28,-76,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-71,-23,-74,24,-80,-75,39,-74,46,9,-75,-78,-72,-75,-26,-59,44,57,-50;
MA   /I: I=-3; E1=0; IE=-105; DE=-17;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00714;
//
ID   OLEEI_MP; MATRIX.
AC   MP00925;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pollen proteins Ole e I family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9485745; R2=0.0136705; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=15.889; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=20,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,20,-30,-23,1,-30,-23,6,-30,30,9,-27,-33,-23,-23,-24,-10,4,-29,-9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-16,-14,2,-17,-9,-16,-8,-10,-1,-7,-12,-12,-6,-16,1,-4,-4,-22,-16,-2;
MA   /M: SY='G'; M=6,12,-23,9,-6,-28,24,-10,-29,-10,-25,-20,14,-16,-10,-14,4,-9,-23,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='F'; M=4,-25,-14,-32,-25,26,-23,-24,9,-22,5,2,-22,-25,-29,-20,-9,-4,19,-12,3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=22,2,-20,3,-1,-27,-6,-15,-19,-8,-18,-17,-5,9,-8,-18,4,-4,-13,-27,-22,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,16,-28,16,5,-19,-16,28,-23,-2,-21,-11,15,-18,12,-2,-4,-10,-26,-22,8,6;
MA   /M: SY='P'; M=1,-3,-2,0,-3,-27,-14,-17,-24,-12,-25,-20,-7,20,-10,-19,2,-4,-19,-35,-25,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-22,-3,0,-20,-10,-6,-19,11,-21,-12,7,4,0,11,-2,-5,-17,-22,-15,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-13,-27,-8,6,-18,-8,-15,-11,-11,-5,-8,-14,2,-8,-14,-9,-10,-10,-26,-18,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,1,-26,3,10,-25,-11,-9,-22,-5,-28,-20,5,26,0,-10,10,1,-24,-35,-24,3;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-27,5,-2,-25,-4,9,-22,-3,-18,-9,0,-18,4,3,-5,-12,-15,-27,-11,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-10,-21,-8,-13,5,-25,-12,-1,-5,-5,-3,-14,-23,-17,-9,-11,-6,8,-15,8,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-27,5,28,-32,-20,2,-21,7,-18,-8,0,-7,35,3,3,0,-25,-25,-13,31;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-8,3,-23,-20,-2,-20,27,-17,3,-3,-15,16,35,-10,-10,-17,-20,-8,8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-17,-6,-7,-15,-17,-16,-13,-9,-16,-13,5,6,-9,-10,13,32,-10,-31,-15,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=24,-15,-13,-23,-17,-12,-14,-23,6,-15,-2,-2,-14,-15,-15,-20,3,6,13,-23,-14,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-30,-5,2,-33,13,-2,-29,2,-24,-9,0,-15,23,9,-2,-14,-28,-20,-17,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-22,-14,3,-10,-27,-15,11,-10,3,9,-16,-16,-6,-13,-10,-7,13,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,15,-26,9,13,-25,-13,0,-26,22,-27,-15,22,-14,8,21,-1,-6,-25,-29,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-32,-25,5,-32,-25,28,-26,31,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-24,7,28,-22,-20,11,-24,0,-17,-13,2,-7,9,-3,4,7,-21,-30,-10,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-2,-25,-13,-16,16,-21,2,1,-13,-6,-4,8,-25,-13,-11,-10,-7,-9,-5,25,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-22,-33,-25,2,-30,-19,32,-22,23,31,-23,-23,-16,-20,-20,-8,24,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-28,1,23,-30,-16,-7,-23,9,-21,-13,-5,9,15,-1,-1,-8,-23,-25,-18,18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00715;
//
ID   LYSYL_OXIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP00926;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lysyl oxidase putative copper-binding region signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1519442; R2=0.0112905; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1736; N_SCORE=23.742; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-9,-23,-12,-4,-10,-22,-6,1,-13,15,7,-5,-22,8,-7,-14,-8,-9,-24,-7,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-24,-8,0,-20,-20,-4,-22,14,-17,-8,0,-15,13,35,1,8,-16,-23,-10,4;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-9,-5,-19,-3,-15,-15,-10,-20,-15,1,-10,-5,-14,26,16,-5,-31,-19,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16,-6,-11,-23,-6,-15,12,1,-1,-9,-23,1,43,-16,-10,-11,-20,-7,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,7,-27,-14,-10,-27,32,-30,-13,3,-10,7,18,5,-1,-17,-26,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=6,-1,-19,-10,-6,-17,-11,-7,-15,4,-13,-5,6,-16,-1,13,2,3,-10,-25,-14,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-14,-30,43,-20,-34,-17,-30,-20,-6,13,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,1,-30,3,-3,-8,-22,63,-22,-9,-15,-4,2,-22,3,-4,-12,-16,-24,-13,33,-5;
MA   /M: SY='S'; M=16,-3,-12,-5,-4,-21,7,-13,-20,-11,-26,-18,5,-11,-4,-13,31,12,-10,-34,-21,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-24,-19,-3,-9,-31,-21,20,-15,5,5,-17,-17,-11,-18,-11,-7,18,-26,-9,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,10,-24,16,21,-32,-12,0,-25,2,-25,-15,7,-8,25,-1,12,-1,-24,-31,-16,23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-30,-7,3,-28,-4,0,-29,15,-22,-9,0,-17,20,36,-5,-12,-25,-20,-13,9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-13,-29,-15,-18,24,-27,19,-2,-9,-3,-2,-11,-29,-9,-9,-17,-9,-12,22,69,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-27,-11,31,-17,20,46,-20,-20,-7,-17,-20,-10,17,-20,0,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-17,-3,-9,-29,-21,15,-13,3,3,-19,-19,-13,-16,-9,-5,22,-28,-11,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-8,22,-18,19,1,-21,-13,-9,-21,-5,-20,-18,17,-12,-5,-8,12,23,-14,-35,-15,-2;
MA   /M: SY='L'; M=8,-22,-20,-24,-14,-6,-19,-20,4,-21,18,4,-22,-3,-15,-20,-15,-7,0,-22,-11,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,28,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,45,-17,0,-3,19,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-24,-10,-17,-24,43,-20,-31,-17,-24,-17,0,-17,-17,-17,6,1,-21,-23,-24,-17;
MA   /M: SY='S'; M=0,0,-16,-3,3,-23,-13,-7,-17,-4,-20,-10,4,-10,15,-4,21,21,-13,-30,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00716;
//
ID   TREHALASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00927;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Trehalase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3762937; R2=0.0126037; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=787; N_SCORE=14.285; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-37,-8,8,-27,-22,-17,-15,-8,-24,-16,-17,65,-6,-17,-9,-10,-25,-29,-26,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-28,16,34,-30,-16,-5,-29,11,-25,-19,1,4,11,1,3,-6,-26,-31,-19,22;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-11,-32,-14,-9,-8,-19,3,-20,-1,-18,-10,-6,-21,3,7,-12,-7,-22,25,11,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-23,3,-6,-6,-3,7,-22,-11,-20,-14,2,-18,-7,-11,6,-3,-17,-19,6,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,34,-27,28,17,-26,-26,-23,-24,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-16,-32,-11,-5,-23,-5,-15,-20,-11,-25,-17,-13,45,-10,-18,-3,-7,-23,-23,-18,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-13,-23,-18,2,-22,-17,17,-19,21,16,-21,-23,-16,-15,-13,-3,19,-22,-5,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,2,-28,10,8,-25,-15,-12,-21,-5,-23,-18,-5,38,-4,-12,-2,-1,-22,-28,-21,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-13,11,-27,7,10,-18,-16,27,-22,4,-21,-10,17,-16,11,2,-3,-9,-26,-23,4,9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-32,-8,-6,-28,12,-18,-26,-13,-30,-20,-9,39,-12,-18,1,-9,-27,-28,-28,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-24,-29,-25,48,-30,-1,3,-19,5,1,-21,-30,-24,-15,-19,-9,0,16,51,-25;
MA   /M: SY='I'; M=1,-27,-22,-35,-27,-3,-32,-29,37,-25,13,13,-21,-21,-21,-26,-13,-6,31,-23,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-23,-7,-3,-19,-18,-7,-12,9,-16,-7,4,-17,5,17,0,0,-9,-26,-11,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-34,-27,31,-31,-24,17,-26,15,8,-22,-26,-29,-21,-16,-3,17,-12,9,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-30,-19,-20,22,-17,15,-5,-11,-4,-3,-17,-29,-11,-11,-17,-11,-13,23,65,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=13,2,-11,-2,-2,-19,-2,-11,-18,-9,-26,-18,10,-11,-2,-11,32,19,-9,-37,-19,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-35,-35,-39,-29,35,-25,-25,-7,-25,0,-7,-31,-30,-27,-20,-31,-20,-14,77,26,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-18,-26,-21,-4,-28,-22,20,-18,7,13,-15,-18,-16,-18,-4,14,20,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-22,-20,-31,-22,-3,-23,-12,23,-15,15,37,-20,-20,-8,-17,-15,-8,17,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-12,-25,-8,15,-9,-25,-10,-5,-8,15,1,-15,-17,-1,-3,-16,-10,-9,-24,-9,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=6,-22,-20,-26,-15,-4,-22,-18,12,-21,23,10,-20,-21,-10,-18,-15,-7,6,-20,-6,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-11,-25,-9,12,-8,-24,-9,-1,-10,8,-1,-14,-15,-2,-12,-12,-9,-6,-19,-2,4;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-5,-12,-18,-10,-25,-18,8,-10,-2,-10,35,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-8,12,-29,15,2,-32,27,-7,-34,-7,-28,-20,12,-15,-2,-10,1,-13,-30,-28,-24,0;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-12,-25,-17,-9,-11,-20,16,-5,6,-1,27,-8,-19,5,12,-15,-12,-7,-22,0,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-9,-26,-9,-6,-5,-20,-7,-14,-6,-13,-10,-11,-18,-10,-9,-9,-5,-9,6,1,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-29,50,30,-35,-12,1,-35,3,-27,-26,18,-8,6,-6,1,-9,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-15,-15,-11,-8,-23,-20,-2,-5,0,-2,-10,-16,-11,-6,1,22,5,-26,-8,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00717;
//
ID   TREHALASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00928;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Trehalase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9379568; R2=0.0135289; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=678; N_SCORE=14.101; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-7,6,-19,6,3,-14,-17,-10,-12,-10,-4,-9,3,-15,-5,-10,3,10,-10,-31,-12,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-27,-14,-7,4,-25,10,-11,2,-6,-1,-9,-21,0,4,-12,-6,-13,-5,23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-12,-34,-8,4,-25,-20,-3,-21,5,-22,-9,-10,34,1,7,-10,-11,-24,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-25,-6,-12,-26,42,-5,-34,-16,-29,-18,4,-17,-11,-15,10,-9,-25,-26,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-29,-12,-16,-24,45,-16,-33,-12,-21,-14,-3,-21,-15,-4,-5,-17,-24,-20,-24,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-22,-25,-24,-7,-5,-25,11,-23,7,4,-17,-23,-21,-22,-11,-5,12,-23,-11,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-32,-3,9,-26,-17,-11,-19,0,-23,-12,-6,39,-1,-9,-6,-8,-24,-29,-22,2;
MA   /M: SY='T'; M=6,-9,-13,-17,-17,-9,-19,-21,6,-14,-3,-2,-6,-18,-16,-15,5,16,15,-29,-12,-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-15,-6,-9,-19,12,-16,-22,-13,-23,-17,4,-13,-9,-13,22,19,-12,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-19,-22,-11,2,-24,-17,10,-24,33,11,-22,-24,-14,-17,-18,-6,4,-23,-5,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-19,-6,-4,-5,-20,-11,-5,-10,-7,-5,-8,-18,-5,-11,1,3,1,-23,-3,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-14,8,-28,3,4,-18,-15,9,-23,12,-24,-13,16,-8,4,15,-4,-8,-25,-24,-4,2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-18,-8,-5,-18,-16,-18,-15,-10,-20,-15,-3,17,-8,-13,16,27,-10,-32,-18,-8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-25,-6,-15,-27,51,-16,-35,-16,-30,-20,7,-18,-15,-16,8,-11,-26,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-13,2,-30,6,33,-30,-20,3,-27,15,-20,-12,0,-8,28,22,-3,-10,-27,-25,-15,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-18,-23,-21,-13,21,-23,-4,-5,-10,1,-2,-16,-22,-14,-11,-13,-8,-6,3,28,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,28,-21,11,-4,-7,-5,8,-16,-4,-24,-16,46,-22,-5,-3,5,-2,-26,-29,-7,-4;
MA   /M: SY='G'; M=19,-12,-20,-16,-17,-23,33,-21,-21,-16,-18,-13,-7,-17,-17,-20,3,-10,-10,-21,-24,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=29,-12,-18,-15,-6,-23,-6,-19,-14,-10,-18,-14,-11,18,-9,-19,7,-1,-9,-25,-23,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-24,-16,0,-10,-24,-6,3,-11,17,17,-16,-19,10,-8,-16,-10,-6,-21,-5,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-28,-4,14,-35,-21,5,-14,6,-16,1,-4,-12,49,6,-1,-9,-20,-21,-10,32;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-15,-29,-15,-15,-4,-20,-16,-1,-17,-11,-8,-12,-20,-11,-18,-6,-6,-6,18,8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-34,-25,4,-33,-24,33,-27,30,21,-25,-25,-20,-23,-22,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=23,-20,-14,-26,-19,-9,-16,-24,12,-17,5,2,-18,-18,-17,-22,-3,-3,17,-22,-13,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-30,-24,-33,-28,2,-28,-29,16,-21,2,2,-28,-26,-23,-21,-17,-5,20,21,3,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-25,-2,8,-16,-22,-3,-11,0,-10,-3,-4,-13,10,2,-2,2,-12,-21,-2,8;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,14,-31,-21,22,-30,43,18,-28,-29,-22,-21,-28,-10,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-25,-5,-2,-19,-19,-4,-10,4,-13,-5,0,-17,9,7,-5,-7,-10,-20,-4,2;
MA   /M: SY='N'; M=-13,17,-25,7,2,-22,-10,3,-25,19,-27,-15,30,-18,5,28,0,-5,-25,-30,-15,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-24,-18,-16,11,-23,2,3,-14,-1,-1,-13,-23,-10,-13,-5,-2,-3,0,36,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-29,-4,-14,-28,48,-14,-34,-15,-30,-20,9,-9,-15,-16,1,-15,-30,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-1,-21,0,5,-6,-16,-2,-17,-6,-16,-12,-1,-14,3,-7,9,5,-15,-18,5,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00717;
//
ID   PIR_REPEAT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00929;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Yeast PIR proteins repeats signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2199636; R2=0.0147916; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=385; N_SCORE=10.905; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=87; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-15,-21,-13,-15,-9,-20,2,-15,-7,-5,-8,-12,-10,-20,9,2,5,-24,-15,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-14,-20,-18,-8,-26,-24,9,-4,-2,2,-17,-22,-18,-8,-3,9,25,-28,-10,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-13,24,6,-16,-7,-3,-16,-2,-13,-13,7,-5,-2,-5,3,4,-11,-19,-9,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-2,-19,-4,8,-27,-10,0,-15,2,-17,-5,0,-8,29,0,8,-2,-17,-20,-12,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=1,-8,-21,-10,-14,-13,-21,-20,11,-17,-2,-1,-8,-17,-14,-20,-1,-2,12,-28,-11,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-24,-10,0,-23,-20,11,-9,-6,-11,0,-3,-13,18,-5,0,-1,-12,-23,-5,7;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-14,-17,-8,-19,-11,-16,-6,-8,-9,-5,-10,-13,-1,-13,7,5,2,-23,-15,-4;
MA   /M: SY='T'; M=9,-5,-15,-8,-5,-18,-10,-17,-15,-10,-20,-15,-2,8,-7,-13,20,22,-9,-32,-18,-7;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-17,-7,-5,-22,5,-15,-22,-1,-23,-15,1,-12,-5,-6,15,9,-12,-28,-18,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-3,7,-18,0,0,-20,-13,-10,-20,11,-23,-13,12,-12,0,5,12,17,-13,-30,-13,0;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-14,-8,-5,-17,-14,-17,-15,1,-17,-12,0,-10,-5,-4,16,27,-5,-28,-13,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-18,-3,3,-19,-16,-8,-16,13,-16,-6,0,-8,10,7,4,12,-11,-20,-8,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=9,-1,-15,-1,-5,-16,-10,-12,-9,-3,-10,-8,-5,-13,-7,-2,0,-3,1,-22,-13,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=19,3,-13,1,-2,-21,-5,-14,-18,-9,-20,-16,3,-10,-5,-14,20,13,-8,-31,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-19,-18,-13,-21,5,-21,-12,-13,-14,-11,-13,3,-15,-20,2,-6,-4,-23,-22,-15;
MA   /M: SY='I'; M=5,-26,-19,-33,-26,-4,-29,-28,32,-23,11,11,-22,-22,-22,-25,-11,-5,31,-23,-7,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-16,-3,-5,-20,3,4,-23,-11,-25,-15,7,-13,-3,-10,23,13,-14,-34,-13,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,-13,-16,-10,-15,-10,-19,-3,-13,-11,-8,-4,-12,-9,-17,16,13,2,-28,-15,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,-5,-16,-6,5,-15,-12,-13,-12,-10,-8,-10,-3,-12,-3,-11,13,11,-7,-30,-15,1;
MA   /M: SY='V'; M=9,-13,-14,-17,-17,-13,-1,-22,-3,-15,-10,-7,-10,-19,-17,-17,8,9,10,-28,-17,-17;
MA   /M: SY='S'; M=8,-5,-19,-6,-1,-22,-10,-15,-19,1,-24,-15,-2,8,-3,-6,14,10,-12,-30,-19,-3;
MA   /M: SY='E'; M=11,9,-20,13,20,-27,-9,-8,-24,-1,-20,-19,2,-7,3,-10,10,-2,-17,-30,-20,12;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-16,-7,0,-22,-13,-10,-15,-4,-16,-9,0,-10,12,-6,15,18,-10,-27,-13,6;
MA   /M: SY='T'; M=5,1,-15,-10,-10,-13,-14,-15,-3,-12,-12,-8,8,-14,-8,-13,13,18,-2,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-20,4,4,-20,-15,-13,-9,-9,-13,-11,0,-10,-4,-14,7,5,-6,-30,-15,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-1,-25,1,-4,-23,-14,-14,-13,-9,-20,-15,-2,22,-10,-16,-2,-5,-12,-31,-22,-9;
MA   /M: SY='T'; M=2,-12,-15,-14,-14,-11,-3,-19,-6,-17,-6,-6,-7,-18,-14,-15,10,11,3,-30,-15,-14;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-22,6,3,-27,-12,-10,-20,-5,-22,-16,0,8,3,-11,10,7,-17,-31,-19,2;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-19,-17,-9,-20,-12,-20,-8,-2,-13,-8,-14,4,-11,-12,-1,-3,1,-24,-18,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-9,-21,-7,-1,-22,-15,-13,-12,0,-21,-10,-6,4,3,-5,8,2,-7,-30,-17,0;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-13,-9,-3,-22,-3,-15,-17,0,-21,-14,-1,-10,-3,-8,18,6,-7,-27,-18,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00718;
//
ID   RDS_ROM1_MP; MATRIX.
AC   MP00930;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Peripherin / rom-1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0640445; R2=0.0113904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1842; N_SCORE=25.035; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=214; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-10,-23,-10,-4,-20,-23,-17,-9,26,-16,-3,-10,-17,-4,13,-10,-7,4,-23,-10,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-3,-27,36,-27,-7,0,-10,27,23,-7,-10,-23,-20,-10,20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,30,-18,15,0,-20,0,5,-20,-2,-30,-20,48,-18,0,-2,17,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-17,-27,-17,-7,-10,-23,-7,-13,9,4,0,-10,-23,0,39,-17,-10,-10,-20,-7,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-21,-33,-26,0,-30,-18,33,-20,17,33,-23,-23,-15,-20,-17,-7,27,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,42,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,16,-4,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-5,-12,-18,-10,-25,-18,8,-10,-2,-10,35,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-3,6,-18,3,0,-20,-7,31,-23,-9,-27,-13,17,-15,3,-5,18,3,-20,-37,-6,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-15,-21,-19,-15,1,-20,-6,8,-15,-3,7,-10,-19,-7,-15,1,0,3,-14,13,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,5,30,-38,-20,8,-22,10,-20,-5,0,-8,50,8,0,-10,-30,-22,-12,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,37,7,-27,-3,7,-27,0,-30,-23,46,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,19,-27,10,0,-23,-7,0,-20,-3,-30,-20,32,18,-3,-7,3,-3,-30,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='S'; M=0,-7,-17,-7,-7,-3,-10,0,-13,-10,-20,-13,0,-17,-3,-10,19,10,-10,-16,15,-7;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-33,-17,-13,9,-27,6,-7,-10,-10,-7,-20,12,-10,-13,-17,-10,-17,9,42,-17;
MA   /M: SY='S'; M=3,-10,-13,-10,-7,-10,-10,-13,-6,-17,-2,-6,-4,-17,-7,-13,16,10,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00719;
//
ID   CUTINASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00931;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cutinase, aspartate and histidine active sites.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1875496; R2=0.0145568; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=518; N_SCORE=12.718; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-26,-11,-10,-15,2,2,-18,-6,-5,-5,0,-23,-7,9,-11,-13,-17,-23,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-32,2,-8,-31,35,-16,-36,-8,-30,-20,-1,1,-12,-13,-3,-16,-29,-24,-27,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-28,-8,0,-24,-10,-6,-25,9,-21,-11,-3,-2,10,24,-2,-1,-21,-23,-15,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='P'; M=2,-12,-31,-9,-1,-30,-1,-15,-23,-3,-25,-14,-10,30,0,-11,-3,-10,-24,-24,-23,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-26,20,1,-27,4,-1,-26,-4,-30,-22,32,0,-4,-8,4,-6,-30,-36,-23,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-33,-27,49,-30,-14,7,-25,15,5,-23,-30,-30,-18,-20,-9,6,3,29,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-32,-8,-1,-18,-18,-11,-17,-9,-25,-17,-14,47,-7,-16,-2,-4,-23,-22,-9,-8;
MA   /M: SY='T'; M=12,-3,-16,-8,-2,-21,-12,-13,-16,3,-18,-11,-1,-10,3,-3,13,15,-8,-26,-14,1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,27,-24,39,21,-32,-9,-3,-32,-1,-28,-25,13,-8,4,-8,13,0,-24,-38,-20,12;
MA   /M: SY='R'; M=-14,2,-30,4,8,-28,-19,-6,-31,38,-27,-12,2,-13,9,39,-9,-10,-21,-22,-11,7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-11,-16,-15,-6,-23,-22,0,-14,0,-3,-9,-16,-15,-13,9,35,10,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,6,13,-26,-22,-9,-16,16,-18,-8,-1,-10,10,5,-6,-7,-15,-25,-11,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-18,-25,-25,-3,-28,-23,28,-20,6,8,-12,-25,-22,-20,-10,-3,31,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-27,-27,-23,29,-31,2,10,-18,12,6,-22,-29,-17,-16,-22,-10,0,13,50,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=16,7,-19,1,6,-22,-6,6,-19,-4,-18,-13,9,-12,0,-10,5,-5,-16,-28,-15,2;
MA   /M: SY='V'; M=6,-20,-18,-23,-17,-5,-21,-22,6,-16,0,2,-18,-2,-18,-18,-5,3,11,-24,-11,-18;
MA   /M: SY='G'; M=2,1,-27,3,-11,-30,45,-16,-36,-15,-28,-21,3,-17,-14,-18,4,-13,-26,-25,-27,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=0,-15,-22,-18,-12,-6,-19,-15,3,-18,14,5,-12,-5,-13,-17,-14,-7,-4,-24,-11,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-22,12,0,-11,-18,-5,-17,-7,-12,-12,4,-15,0,-8,1,8,-15,-23,-1,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-16,-9,-12,-17,9,-19,-20,-13,-18,-14,1,-13,-12,-13,16,25,-10,-28,-17,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-20,-23,-17,-1,-9,-19,5,-26,26,8,-20,-26,-17,-19,-16,-8,1,-23,-8,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-18,-25,-29,-24,12,-30,-20,26,-25,14,10,-8,-23,-20,-22,-16,-8,12,-18,2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,43,-27,20,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='L'; M=4,-15,-16,-21,-15,-5,-14,-17,2,-17,12,10,-14,-18,-12,-15,-5,8,3,-23,-8,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=4,-17,-22,-15,-8,-15,-15,-18,-4,-12,-6,-6,-17,28,-12,-17,-7,-5,-6,-22,-17,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=35,-11,-15,-16,-7,-22,-4,-19,-13,-10,-16,-13,-10,8,-9,-19,10,0,-7,-24,-22,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-18,-35,-26,41,-30,-22,12,-28,25,9,-25,-30,-31,-20,-22,-8,12,-8,12,-26;
MA   /M: SY='T'; M=3,-11,-13,-14,-10,-7,-16,-17,-3,-17,4,-3,-8,-17,-10,-14,8,18,0,-29,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-22,-16,-16,-15,11,-18,-10,-18,-3,-3,-11,-22,-12,-16,-5,-6,-4,-23,-16,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-24,1,6,-25,-10,-7,-17,-4,-16,-5,-3,1,7,-9,2,-1,-16,-27,-16,6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,31,-25,41,24,-32,-9,0,-32,1,-28,-25,19,-9,5,-6,8,-4,-27,-38,-20,14;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-13,-14,-12,-17,3,-20,-13,-12,-14,-11,-5,-13,-12,-16,12,14,-2,-25,-18,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-18,-14,-10,-16,6,-11,-13,-6,-11,0,-6,-7,-6,-4,0,-6,-9,-20,-15,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-14,-11,-12,-13,9,-15,-8,-12,-11,-7,-4,-13,-11,-14,7,1,-1,-20,-14,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=6,-1,-25,2,8,-30,-11,-9,-20,-3,-22,-14,-3,14,10,-10,5,-4,-20,-28,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=14,-13,-24,-13,-5,-23,-12,-19,-15,-10,-20,-15,-12,36,-9,-18,4,3,-14,-27,-23,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-21,3,12,-8,-15,-3,-19,2,-14,-11,4,-11,4,7,0,-2,-17,-20,-7,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-19,-34,-27,49,-28,-22,1,-25,4,-2,-20,-27,-32,-18,-14,0,4,9,18,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00140;
//
ID   MOLYBDOPTERIN_PROK_3_MP; MATRIX.
AC   MP00932;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic molybdopterin oxidoreductases signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.2151332; R2=0.0206627; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=359; N_SCORE=14.623; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-34; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-21,-11,-12,-2,-15,-5,-5,-11,-1,-4,-4,-21,-10,-9,-5,0,-7,-13,10,-12;
MA   /M: SY='A'; M=2,-10,-22,-14,-3,-14,-20,-14,-3,-1,1,-1,-8,-16,-4,-4,-8,-5,-4,-22,-10,-4;
MA   /M: SY='A'; M=9,-18,-17,-21,-12,-7,-15,-18,3,-14,5,1,-16,-20,-11,-13,-6,-4,7,-22,-10,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-2,-23,-4,6,-24,-15,2,-16,4,-14,-2,-1,-14,14,8,-2,-8,-14,-24,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-4,-23,-1,-2,-28,12,-15,-30,-11,-28,-21,-3,13,-10,-16,-4,-14,-29,-22,-25,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-29,-1,7,-24,-8,1,-26,6,-22,-13,-2,-2,8,12,-2,-7,-24,-23,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-30,7,17,-31,-8,-4,-24,0,-21,-11,-1,7,15,-6,-2,-10,-26,-27,-19,15;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-14,-26,-15,-4,7,-21,-12,-9,-12,-10,-9,-11,7,-13,-15,-8,-5,-11,-14,1,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,1,-31,-28,-3,-29,-28,23,-22,8,9,-26,-28,-26,-22,-11,-3,36,-30,-11,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-17,-34,-16,2,0,-22,-10,-14,-9,-9,-8,-19,-19,-2,-10,-18,-13,-20,39,13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-37,-27,1,-35,-24,41,-26,22,27,-21,-21,-17,-25,-20,-10,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-7,14,-21,6,-2,-21,0,29,-25,-7,-27,-14,27,-18,1,-4,11,-3,-25,-35,-9,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-33,-2,15,-27,-20,-14,-22,-2,-25,-18,-11,49,-1,-11,-4,-2,-26,-30,-24,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-26,7,15,-24,-19,-7,-16,5,-14,-10,-1,-10,8,0,-2,-4,-15,-27,-13,11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,26,-26,39,8,-25,-16,-7,-23,-8,-9,-16,6,-15,-6,-12,-5,-4,-18,-34,-14,1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=9,2,-20,0,8,-26,-10,-8,-21,7,-21,-12,2,-10,9,1,7,1,-15,-26,-16,8;
MA   /M: SY='E'; M=4,-2,-24,0,10,-23,-15,-10,-20,8,-15,-12,-5,-7,1,7,-3,-7,-13,-24,-16,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-26,-15,-6,-7,-24,-9,-12,11,1,0,-11,-21,-2,24,-15,-7,-9,-17,-1,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-3,-16,-29,56,-16,-37,-17,-29,-20,7,-19,-17,-17,2,-15,-29,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='K'; M=10,-3,-21,-7,3,-24,-12,-8,-18,14,-19,-9,-2,-12,5,6,1,-4,-11,-23,-14,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-26,36,13,-30,-9,9,-30,2,-27,-21,28,-13,5,-3,3,-5,-28,-36,-16,9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-29,-4,-12,-29,52,-15,-37,-13,-29,-20,7,-18,-14,-14,1,-17,-30,-23,-27,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,37,-28,51,19,-37,-10,-1,-34,0,-26,-25,14,-10,5,-9,1,-9,-27,-35,-19,12;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-23,-20,-10,-9,-21,-16,-3,-5,0,4,-16,-18,-5,-6,-11,-2,-2,-2,-4,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,13,12,-28,-28,-28,-22,-13,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-30,-9,5,-18,-22,-8,-20,17,-17,-10,-7,-16,4,30,-11,-9,-15,-6,-7,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-10,-32,-28,1,-32,-28,29,-25,19,13,-28,-29,-26,-22,-16,-5,34,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-16,-25,-20,-10,24,-23,0,-13,-12,-8,-7,-11,-22,-14,-6,-11,-8,-13,7,18,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-3,25,-16,13,0,-20,0,3,-20,-4,-30,-20,42,-16,0,-4,21,7,-23,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-4,6,-24,8,4,-24,-13,-5,-23,11,-21,-14,5,-14,1,15,-1,-6,-15,-27,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-27,-8,-3,-13,-18,-2,-24,19,-16,-9,6,-20,3,45,-8,-6,-18,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-5,-25,-5,12,-14,-19,-3,-17,6,-15,-7,-6,-12,13,1,-2,-7,-16,-17,-2,13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-17,-29,-20,0,-26,-23,21,-23,14,11,-20,-23,-17,-21,-16,-8,17,-22,-5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-17,-19,-10,-4,-26,-10,-3,-6,4,1,-15,-22,-10,-4,-16,-7,-3,-13,-2,-11;
MA   /M: SY='A'; M=24,-14,-14,-22,-15,-10,-9,-21,0,-15,-5,-5,-11,-14,-14,-20,5,4,5,-21,-13,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-26,-8,-4,-24,3,-12,-23,8,-22,-12,-2,-9,-2,9,-3,-8,-16,-23,-18,-4;
MA   /M: SY='A'; M=46,-11,-10,-21,-11,-19,-2,-21,-7,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,4,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-17,-21,-18,-11,-13,-25,-14,4,3,-2,3,-15,-21,-6,1,-11,-6,12,-24,-8,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-29,5,-32,-29,31,-23,15,12,-28,-28,-28,-22,-14,-3,40,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-11,-7,-7,-11,-14,-15,-13,-10,-16,-13,2,-11,-7,-10,24,38,-4,-30,-8,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-14,13,-31,22,15,-32,-17,-1,-29,7,-26,-19,3,11,6,0,-3,-7,-27,-31,-17,9;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-25,-4,-3,-22,0,-6,-28,10,-23,-14,5,-17,1,28,2,-6,-19,-25,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-33,-26,5,-34,-23,31,-25,17,14,-24,-18,-21,-24,-19,-8,24,-18,3,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-27,-12,-5,-19,-19,-13,-11,5,-15,-4,-7,10,-4,4,-7,-7,-11,-25,-15,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-32,-3,6,-29,-18,-14,-23,9,-26,-16,-9,36,0,-1,-6,-7,-23,-27,-21,0;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-28,-2,-15,-20,40,-17,-30,-19,-17,-15,-2,-20,-18,-19,-5,-17,-23,-21,-21,-16;
MA   /M: SY='V'; M=4,-15,-15,-20,-16,-8,-22,-20,10,-11,1,7,-14,-19,-15,-14,-3,6,19,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='I'; M=3,-23,-18,-29,-22,-3,-27,-25,23,-22,15,9,-20,-21,-19,-22,-10,0,22,-24,-7,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-7,-15,-14,-11,3,-18,-6,-8,-7,-7,1,-2,-21,-5,-3,-7,-7,-9,-16,0,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-23,-24,-27,-23,-6,-6,-19,14,-21,12,19,-18,-23,-16,-20,-16,-11,10,-21,-8,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-7,-29,-6,2,-15,-15,17,-20,-2,-18,-8,-5,-2,6,-2,-6,-8,-22,-15,9,1;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-2,-26,0,15,-14,-21,16,-15,-2,-10,1,-4,-13,12,-3,-6,-9,-17,-22,0,12;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-25,-14,-16,-23,29,-8,-20,-17,-18,-10,-5,-20,-13,-17,-2,-14,-12,-22,-19,-15;
MA   /M: SY='W'; M=6,-12,-25,-16,-8,-5,-10,-4,-17,-11,-13,-10,-11,-17,-4,-13,-7,-11,-16,10,0,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00392;
//
ID   FGGY_KINASES_1_MP; MATRIX.
AC   MP00933;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FGGY family of carbohydrate kinases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0025725; R2=0.0171956; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=108; N_SCORE=7.850; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-6,-25,-9,-12,-4,-4,3,-13,-10,-8,-6,-1,-22,-10,-5,-8,-9,-14,-16,5,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-25,-8,-2,-21,7,-13,-17,-9,-15,-10,-5,-11,-2,-11,-1,-7,-14,-24,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-27,15,16,-27,-13,2,-27,8,-22,-16,8,-5,6,3,-1,-5,-24,-30,-15,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-23,-10,-1,-6,-19,-3,-10,-1,-8,-1,-5,-17,1,0,-5,-5,-8,-19,-1,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-34,-26,15,-31,-25,22,-26,20,10,-26,-27,-25,-22,-20,-8,19,-5,4,-26;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-24,-13,-5,-8,-21,-1,-11,7,-6,-2,-8,-19,0,11,-10,-7,-9,-14,4,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-26,12,25,-28,-17,0,-25,9,-21,-14,1,-6,15,4,1,-5,-21,-27,-15,20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-27,-10,-2,-18,-22,-9,-12,20,-12,-3,-3,-16,2,22,-11,-8,-9,-21,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,1,-11,-9,-9,-11,-17,-17,-9,-10,-10,-10,3,-12,-9,-10,17,39,-2,-30,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-30,-9,-16,-28,55,-16,-37,-13,-28,-18,-1,-19,-14,-13,-2,-18,-28,-18,-24,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-12,-19,-18,-15,-1,-22,-15,11,-21,20,7,-6,-25,-15,-16,-13,-2,3,-26,-6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-26,-22,-16,-12,-19,-22,6,-17,-1,0,-19,8,-15,-16,-12,-6,4,-25,-14,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-20,-27,-18,-8,-28,-22,15,-21,9,7,-21,0,-14,-22,-15,-8,8,-24,-10,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-23,11,-1,-14,-15,6,-16,-10,-8,-8,4,-18,-3,-10,-4,-7,-15,-27,-4,-2;
MA   /M: SY='P'; M=4,-7,-25,-5,8,-24,-14,-15,-19,-6,-22,-17,-8,29,-3,-14,6,5,-18,-30,-22,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-17,-27,-19,-20,15,-3,3,-10,-14,-7,-2,-13,-26,-14,-13,-12,-11,-13,8,37,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-20,-32,-25,60,-25,-16,-3,-25,4,-3,-12,-25,-32,-18,-15,-8,-4,3,23,-25;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-12,-5,-4,-17,-9,-15,-16,-10,-22,-16,4,-3,-5,-11,29,30,-7,-35,-17,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-18,-13,-22,-18,-11,5,-21,-6,-21,6,-2,-16,-22,-18,-20,-8,-9,-2,-22,-16,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-18,-10,-8,-11,-13,-16,-13,-12,-17,-13,-5,6,-10,-13,13,19,-8,-28,-11,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-24,-34,-25,5,-32,-24,28,-27,30,19,-27,-26,-20,-23,-24,-10,19,-12,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=0,-10,-21,-13,-6,-15,-17,-6,-10,5,-5,0,-7,-18,-1,8,-6,-4,-6,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,9,-34,-25,33,-28,28,18,-25,-25,-22,-24,-22,-9,24,-19,1,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-22,-19,-9,-5,-25,-15,2,-5,16,7,-17,-22,-5,-3,-17,-6,0,-20,-4,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-28,33,27,-32,-14,1,-30,6,-25,-20,15,-9,13,0,2,-6,-28,-33,-18,20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,24,-24,13,4,-21,-8,41,-24,-3,-26,-13,38,-19,5,0,2,-8,-30,-36,-6,3;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-21,-11,2,-11,-26,-7,2,-6,-3,-1,-15,-19,-8,-7,-8,-6,11,-26,-6,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-36,1,12,-30,-19,-12,-24,-1,-28,-19,-10,53,0,-8,-7,-10,-29,-30,-25,3;
MA   /M: SY='G'; M=-9,7,-28,11,10,-27,14,-8,-30,-4,-20,-17,5,-14,-3,-6,-3,-13,-26,-27,-21,4;
MA   /M: SY='V'; M=12,-19,-13,-25,-19,-8,-20,-23,13,-16,5,3,-16,-21,-17,-19,-6,-3,17,-25,-11,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-16,-27,-18,-9,-1,-19,-8,-16,3,-11,-6,-11,-21,-1,12,-12,-10,-13,5,5,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-25,3,20,-26,-16,-6,-24,17,-22,-13,2,-9,11,11,1,-5,-19,-26,-15,15;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-25,-5,3,-24,-15,-6,-23,21,-19,-8,0,-14,10,25,-4,-7,-17,-22,-12,5;
MA   /M: SY='A'; M=23,-17,-15,-24,-17,-9,-14,-20,7,-15,2,3,-15,-16,-14,-20,-1,0,11,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,8,23,-25,-17,0,-26,16,-21,-14,0,-9,10,11,-3,-8,-22,-24,-11,15;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-19,-3,5,-23,-18,-7,-22,22,-21,-10,0,-15,6,19,-5,-7,-15,-23,-11,5;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-16,-27,-19,-22,2,17,-18,-16,-19,-13,-9,-9,-23,-22,-17,-9,-14,-11,-5,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-26,-4,9,-16,-22,-5,-7,2,-3,3,-7,-15,3,2,-10,-9,-7,-25,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-20,-29,-21,10,-21,-21,14,-27,32,12,-25,-27,-22,-20,-22,-9,9,-18,-2,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-23,-23,-24,-14,-10,-25,-20,7,-17,6,6,-21,12,-14,-19,-16,-9,0,-24,-13,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00408;
//
ID   GLYOXALASE_I_1_MP; MATRIX.
AC   MP00934;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glyoxalase I signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7553291; R2=0.0164702; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=341; N_SCORE=11.362; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-14,4,-17,-9,-8,-22,-17,-2,-17,4,3,-14,-21,-12,-15,-3,5,2,-31,-12,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-11,0,-15,-8,5,-11,-5,-20,-17,-13,-11,-6,-21,-15,-14,-1,-2,-13,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='T'; M=6,1,-18,-1,13,-22,-14,-10,-18,-2,-17,-13,0,-7,7,-7,14,15,-13,-29,-16,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-23,3,5,-17,-21,-9,-10,-2,-2,-4,-3,-16,1,-4,-7,-2,-10,-27,-11,3;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-20,-29,-22,-13,-11,-24,-16,5,-11,-6,-2,-16,10,-11,-11,-11,-8,-2,-17,-4,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-15,22,-31,33,16,-38,-15,-1,-31,8,-27,-18,8,1,16,-1,-2,-10,-29,-31,-17,16;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-7,-30,-3,14,-26,-17,-9,-25,12,-22,-15,-6,15,5,14,-5,-9,-22,-25,-19,7;
MA   /M: SY='G'; M=17,-2,-19,-8,-11,-24,27,-15,-24,-13,-23,-17,6,-15,-11,-16,11,-5,-17,-26,-24,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-12,-20,-18,-12,-11,-20,-14,2,-12,-4,11,-11,5,-7,-14,0,13,-1,-27,-11,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-14,-8,-4,-14,-12,-11,-9,6,-13,-2,-3,-11,-2,0,6,9,-2,-23,-10,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-23,1,-4,-21,7,-6,-17,-7,-18,-7,6,2,-3,-10,-1,-8,-19,-23,-18,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-1,-21,-5,0,9,-12,2,-14,-4,-11,-8,4,-17,-7,-4,-7,-8,-15,-9,9,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-17,-28,-17,-8,-6,-24,-11,-11,6,-8,-4,-11,-5,-4,22,-13,-9,-9,-19,-7,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-34,-24,21,-31,-20,22,-28,33,20,-25,-27,-22,-21,-25,-10,12,-14,6,-23;
MA   /M: SY='B'; M=-12,7,-3,5,-1,-21,-18,-5,-15,-10,-7,-8,5,-21,4,-9,-7,-8,-17,-32,-14,1;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,7,-27,-20,67,-26,-3,-20,0,6,-16,28,4,-6,-16,-30,-26,9,15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-12,-16,-15,-7,-24,-23,2,-14,-4,-4,-7,-14,-14,-14,11,36,11,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-22,-26,-20,-6,-3,-4,9,-12,11,45,-16,-20,-4,-12,-16,-12,2,-20,-6,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-34,-25,16,-33,-24,27,-29,33,17,-26,-27,-23,-23,-24,-9,18,-17,3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-13,-3,-18,-18,-2,-24,22,-16,-4,-3,-19,7,54,-9,-9,-15,-20,-10,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-8,-29,-9,-7,-17,15,-14,-31,12,-25,-13,-2,-17,-7,8,-7,-14,-22,-17,-14,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,56,16,-37,-10,-1,-36,-1,-30,-28,20,0,-1,-10,0,-9,-30,-39,-21,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-26,-30,-25,-15,-7,-29,-22,13,-23,14,6,-24,15,-16,-22,-20,-10,1,-24,-11,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,21,-28,27,20,-31,-15,-3,-31,18,-27,-19,11,-9,8,6,-1,-5,-25,-30,-16,14;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-26,-1,2,-25,-16,-10,-24,21,-22,-12,-3,-7,2,23,-6,-8,-14,-23,-14,0;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-32,-23,2,-33,-23,27,-23,28,16,-23,-25,-18,-14,-22,-9,18,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-4,15,-24,21,16,-30,-13,-6,-28,11,-25,-18,6,-9,6,1,5,-1,-20,-30,-16,11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-29,-21,-20,27,-29,18,2,-10,2,5,-20,-29,-9,-10,-20,-10,-8,25,73,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-14,4,23,-24,-18,-7,-22,0,-19,-15,0,-7,12,-4,10,10,-18,-31,-16,18;
MA   /M: SY='R'; M=-13,12,-28,10,13,-26,-15,0,-28,23,-26,-15,15,-13,10,25,-3,-8,-25,-28,-14,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-10,-27,-25,-3,-24,-26,23,-18,7,7,-24,-24,-24,-19,-7,0,38,-26,-10,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-20,-31,-21,6,-22,-4,19,-14,24,50,-22,-22,-5,-12,-22,-10,9,-18,2,-13;
MA   /M: SY='K'; M=0,0,-22,-3,3,-24,-13,-9,-23,21,-24,-12,4,-12,6,17,5,2,-15,-25,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,17,-30,-21,19,-29,43,17,-29,-30,-23,-20,-27,-9,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-29,-19,5,-30,-21,20,-23,38,17,-26,-27,-18,-17,-26,-9,12,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-18,6,-30,10,7,-27,-18,10,-31,20,-23,-12,5,-16,12,35,-7,-11,-24,-25,-9,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-26,-5,4,-24,-20,-6,-25,28,-22,-9,0,-13,12,34,-3,1,-17,-22,-10,6;
MA   /M: M=-4,-8,-17,-12,-3,-14,-20,-13,-4,-4,-4,-3,-4,-17,-5,-4,-4,-4,-5,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-26,39,27,-31,-15,-4,-31,1,-23,-23,10,-7,4,-7,4,1,-24,-35,-18,16;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-10,-22,-16,-15,15,-22,15,-7,-12,-7,-2,-1,-25,-14,-3,-10,-9,-6,-14,14,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-30,-5,8,-25,-19,-16,-18,-4,-23,-16,-12,43,-4,-12,-1,0,-20,-30,-23,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-25,17,35,-26,-14,-1,-24,3,-22,-19,11,-6,11,-3,7,-4,-24,-33,-19,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-14,-25,-18,-14,-5,1,0,-9,-10,-6,7,-12,-21,-3,-12,-9,-11,-11,-5,14,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-27,1,10,-26,-19,-8,-24,35,-25,-10,3,-12,7,22,-7,-8,-16,-24,-12,8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-21,-32,-26,46,-30,-13,6,-23,7,2,-19,-27,-28,-18,-15,-4,6,4,31,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,2,-15,-4,-2,-15,-13,-13,-10,-9,-17,-12,8,-11,-4,-10,20,25,-6,-33,-14,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00720;
//
ID   GLYOXALASE_I_2_MP; MATRIX.
AC   MP00935;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glyoxalase I signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2690396; R2=0.0139163; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=236; N_SCORE=7.543; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-12,-25,-22,-3,-29,-27,24,-17,7,7,-27,-27,-25,-18,-9,-1,43,-30,-11,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-33,12,43,-30,-20,-6,-27,4,-23,-20,-6,25,12,-6,-3,-10,-30,-30,-23,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-9,-26,-11,-9,-2,-20,48,-15,-10,-11,-2,-5,-22,-1,-8,-10,-12,-17,-6,34,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,29,3,-23,-2,8,-23,0,-30,-22,53,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-29,-40,-29,-22,5,-17,-15,-19,-17,-20,-17,-27,-26,-14,-16,-23,-19,-25,97,25,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-32,-5,-14,-31,50,-19,-37,-17,-30,-21,-2,0,-17,-19,-2,-18,-30,-23,-29,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-11,-19,-18,-6,-25,-24,7,-12,-2,-1,-14,-19,-18,-13,5,25,22,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,12,-26,20,32,-28,-16,15,-29,1,-22,-17,5,-7,11,-4,3,-6,-26,-32,-13,20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-23,5,4,-20,-14,-7,-20,8,-15,-11,4,-15,1,8,2,-2,-15,-29,-13,2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,39,-30,13,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,71,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-17,16,-30,24,17,-29,-17,36,-33,6,-25,-14,10,-12,8,2,-6,-14,-28,-31,-3,11;
MA   /M: SY='N'; M=-11,3,-24,-5,-6,-13,-18,4,-6,0,-4,0,11,-20,-3,-1,-9,-8,-12,-27,-7,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,24,-19,10,1,-21,-8,3,-18,-1,-24,-14,36,-16,8,-1,11,10,-23,-34,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=16,-3,-18,-5,-9,-24,20,-16,-24,-13,-23,-17,1,-13,-10,-16,14,1,-14,-27,-23,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-24,-30,-24,48,-30,-4,3,-22,13,3,-22,-30,-25,-16,-22,-10,-2,13,45,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-30,-8,-17,-28,54,1,-38,-18,-28,-17,2,-20,-15,-17,-2,-20,-30,-22,-21,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-30,7,-38,-29,44,-29,18,18,-21,-22,-22,-28,-19,-9,29,-18,2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-12,11,-20,-16,-22,7,-22,-19,-16,-16,-14,-10,-18,-16,-22,4,-6,-7,-26,-24,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-37,-28,15,-35,-27,33,-28,21,15,-23,-25,-25,-25,-20,-8,25,-17,3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=6,-7,-17,-9,-5,-16,5,-15,-16,-14,-12,-11,-2,-15,-8,-14,13,7,-10,-29,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,22,-28,-28,-6,-29,-29,12,-22,1,1,-25,-31,-28,-22,-7,2,31,-35,-15,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-30,42,16,-35,-11,0,-32,0,-29,-24,19,2,5,-7,0,-8,-30,-36,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-2,44,8,-33,-12,-3,-35,-5,-28,-27,20,-17,-5,-12,0,-8,-27,-42,-22,1;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-17,-29,-23,-4,-25,-25,22,-21,14,9,-21,-22,-20,-22,-10,-2,24,-23,-8,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-8,-21,-11,-12,-1,-9,7,-11,-11,-14,-8,-3,-21,-7,-11,3,-1,-10,-9,20,-12;
MA   /M: SY='E'; M=12,0,-21,1,21,-26,-11,-10,-22,9,-20,-15,-2,-6,6,-2,6,-3,-16,-26,-18,13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,-15,-16,-6,-18,-11,-13,-7,-8,-5,0,-9,-12,2,-12,5,6,-4,-22,-13,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-23,85,-30,-28,-13,-30,-28,-16,-29,-5,-11,-23,-37,-28,-27,-13,-9,-1,-43,-23,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,20,36,-33,-17,0,-29,13,-24,-17,4,-5,21,4,1,-8,-27,-29,-17,28;
MA   /M: SY='R'; M=8,-6,-22,-9,2,-22,-13,-10,-22,17,-18,-11,-3,-13,3,23,-1,-4,-13,-21,-14,1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-36,-28,26,-33,-25,26,-28,20,12,-24,-27,-28,-23,-20,-8,21,-13,7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-27,4,23,-26,-17,-3,-28,19,-23,-15,2,-10,14,24,2,-5,-22,-27,-15,17;
MA   /M: SY='A'; M=9,8,-21,9,8,-27,-10,-7,-19,-1,-17,-14,2,-11,5,-5,3,-5,-13,-28,-17,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-24,-6,5,-20,-18,-6,-12,5,-6,-3,-1,-15,12,2,-6,-7,-15,-24,-11,8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-8,-30,-8,-14,-25,42,5,-34,-16,-26,-14,0,-20,-10,-14,-3,-19,-29,-18,-13,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-20,-21,-20,-24,-15,22,-24,-7,-21,-8,-5,-14,-25,-24,-20,-6,-11,6,-24,-20,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-11,14,-28,11,11,-28,-13,0,-21,7,-25,-14,19,-1,12,1,0,-7,-26,-31,-17,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00720;
//
ID   RIBOSOMAL_L35_MP; MATRIX.
AC   MP00936;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L35 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8994660; R2=0.0106567; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=471; N_SCORE=8.909; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=245; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-15,-15,-10,-10,-10,-5,0,-10,-4,21,-5,-15,0,-10,9,5,0,-30,-10,-5;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-20,-30,-20,-1,-18,-1,19,-10,19,57,-20,-20,0,-10,-19,-10,9,-20,-1,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-36,-12,-3,-24,-20,-17,-14,-11,-23,-14,-17,68,-10,-19,-10,-9,-23,-27,-23,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-1,9,-29,-21,-11,-27,47,-28,-9,-1,-10,9,28,-10,-10,-18,-20,-10,9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-22,-26,-16,-1,-24,-8,15,-12,21,35,-19,-22,-3,-9,-20,-10,6,-20,-1,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=2,2,-11,-6,-7,-13,-14,-16,-12,-10,-16,-13,5,-11,-7,-10,24,38,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-12,3,-26,0,1,-21,-16,22,-23,14,-22,-8,11,-17,5,17,-4,-9,-19,-28,-4,1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-2,-23,-2,4,-24,-13,-7,-26,22,-27,-13,4,-12,7,24,9,1,-17,-27,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=17,-7,-17,-10,-11,-23,24,-16,-23,-14,-23,-15,0,-14,-10,-16,16,-1,-14,-27,-23,-10;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-11,-22,-15,-13,-10,-21,1,-14,0,-3,-15,-16,-14,-20,3,0,10,-23,-16,-15;
MA   /M: SY='A'; M=15,-6,-13,-10,-3,-22,-11,-15,-17,11,-19,-10,-5,-12,-2,0,5,-1,-7,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-29,-1,9,-29,-19,-10,-29,47,-29,-10,0,-10,9,30,-9,-10,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-38,-29,61,-31,-19,8,-28,11,3,-21,-29,-35,-21,-19,-9,6,5,27,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-27,-1,6,-25,-19,-8,-25,34,-25,-10,1,-12,7,25,-5,-6,-17,-22,-10,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-21,-25,-18,-3,-27,-22,13,-9,8,6,-19,-21,-16,-7,-14,-6,17,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-13,-9,-7,-13,-17,-17,-13,-3,-13,-10,0,-11,-7,-4,15,36,-3,-29,-11,-7;
MA   /M: SY='G'; M=14,-8,-22,-11,-9,-25,22,-17,-25,-3,-23,-15,-3,-12,-10,-10,5,-7,-16,-22,-22,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-15,1,-3,-18,-2,-8,-19,-2,-23,-15,15,-13,-3,-4,19,15,-14,-32,-16,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-7,-16,-29,56,-17,-37,-13,-30,-19,5,-19,-16,-14,1,-17,-29,-22,-27,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-23,-4,3,-24,-12,-10,-23,26,-20,-8,-1,-12,5,15,-6,-5,-16,-20,-11,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-20,-34,-28,16,-33,-25,28,-26,20,13,-25,-27,-26,-23,-18,-7,26,-16,4,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-11,-26,-13,-4,-16,-23,-13,-7,20,-6,6,-10,-16,-1,11,-14,-9,-3,-21,-7,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-21,-13,-6,-9,-20,5,-21,10,-15,-8,-4,-21,1,33,-7,-8,-14,-17,1,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-26,-7,-1,-20,0,-5,-26,11,-22,-10,-1,-15,0,12,-2,-6,-19,-21,-11,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-29,-3,6,-27,-18,19,-25,14,-23,-6,2,-8,20,17,-4,-9,-24,-24,-6,11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-12,-15,-8,-19,-2,-16,-11,-10,-13,-8,-6,-8,-6,-16,13,5,-4,-24,-19,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-6,-24,-13,-17,14,1,-2,-15,-15,-13,-10,4,-24,-17,-13,-5,-7,-16,-8,12,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-7,1,-21,-19,-9,-22,28,-17,-6,-4,-14,4,25,-9,-5,-14,-21,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-22,-2,-1,-21,-5,-2,-26,10,-26,-15,11,-16,4,26,9,0,-19,-29,-15,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-26,-26,-19,-1,-23,-19,16,-18,18,10,-16,-23,-14,-12,-19,-10,7,-19,-3,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-19,-25,-17,6,-23,-15,11,-22,29,16,-19,-25,-14,-17,-19,-8,4,-19,-2,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-19,-7,3,-17,-19,-7,-13,-4,-13,-7,-3,-9,3,-4,8,18,-9,-25,-10,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-28,-1,3,-27,-6,6,-30,24,-28,-11,5,-14,6,16,-4,-10,-23,-24,-9,4;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-29,45,-27,-9,0,-12,11,36,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='S'; M=2,2,-15,-1,-3,-19,-8,-13,-18,-8,-23,-17,7,-2,-5,-9,23,23,-11,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-19,-7,-3,-20,-12,-13,-17,2,-20,-12,0,-4,-3,-1,10,15,-10,-28,-15,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,1,8,-28,-16,-8,-27,33,-27,-11,4,-11,10,22,-3,-5,-19,-23,-12,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-27,-4,7,-25,-18,5,-22,14,-18,-5,3,-16,22,30,-3,-7,-21,-24,-10,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-27,-9,-1,-20,-23,-12,-13,25,-16,-4,-3,-14,2,19,-9,-4,-9,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-28,-10,-1,-19,-19,0,-27,26,-18,-9,1,-19,8,59,-9,-8,-18,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-11,4,-26,0,3,-25,-12,17,-23,7,-22,-8,12,-16,16,14,0,-6,-22,-27,-8,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-21,-23,-13,1,-26,-15,10,-20,33,13,-21,-26,-10,-12,-22,-9,2,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-20,-5,0,-22,-11,-1,-28,14,-23,-13,3,-18,4,33,0,-5,-19,-26,-13,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00721;
//
ID   RIBOSOMAL_L20_MP; MATRIX.
AC   MP00937;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L20 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1206846; R2=0.0124603; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=677; N_SCORE=12.546; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=191; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-19,-20,-16,-6,-22,-17,7,-7,3,5,-14,-22,-13,-8,-9,-2,13,-21,-5,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-24,-23,-14,-3,-26,-12,17,-14,14,25,-15,-19,-8,-12,-16,-8,9,-22,-3,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,5,-25,-20,4,-29,35,-25,-8,0,-15,10,39,-10,-11,-20,-21,-7,5;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-11,-15,-8,-20,2,-18,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-8,-17,17,5,-3,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-22,-25,-17,1,-17,-14,8,-18,27,19,-21,-25,-13,-12,-21,-10,3,-19,-3,-15;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-18,-15,-8,-12,-17,-8,-8,-2,-9,-3,-9,-18,-1,0,-2,-1,-2,-18,-5,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-15,-24,-17,-16,24,-23,11,-5,-13,-5,-4,-10,-26,-11,-11,-8,-4,-10,9,48,-16;
MA   /M: SY='A'; M=29,-3,-11,-9,-5,-20,-1,-14,-14,-9,-19,-14,2,-11,-5,-15,21,8,-6,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-16,-27,-18,-17,29,-27,24,-7,-14,-3,-1,-13,-27,-13,-10,-16,-10,-12,11,53,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-14,-6,-14,-20,-5,-15,15,-13,-4,-5,-20,2,40,-8,-7,-7,-21,-7,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-29,51,12,-36,-1,6,-38,-3,-29,-26,18,-12,-2,-10,0,-11,-30,-37,-18,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,4,5,-27,-12,-6,-30,30,-27,-13,5,-14,7,30,-6,-10,-22,-23,-13,5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-24,1,4,-25,-15,-5,-20,15,-19,-9,4,-15,11,15,-2,-6,-16,-25,-13,6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-30,-3,6,-26,-19,-3,-29,37,-25,-10,2,-15,12,44,-9,-10,-21,-21,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-9,-4,-21,-6,-4,-27,17,-21,-11,3,-19,4,46,-5,-9,-19,-22,-13,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-26,31,16,-27,-13,-2,-25,0,-21,-19,15,-12,3,-5,2,-4,-22,-34,-17,9;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-24,-20,-34,-26,61,-27,-15,1,-25,9,5,-15,-28,-32,-17,-18,-9,-1,3,24,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-26,-10,0,-21,-20,-2,-29,30,-20,-10,-1,-20,8,62,-10,-10,-18,-21,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-21,-6,1,-24,-10,-3,-25,14,-23,-11,2,-14,7,21,5,-1,-17,-26,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,21,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-28,-38,-29,0,-38,-29,47,-29,18,18,-19,-21,-20,-29,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-8,-11,-7,-17,-15,-14,-9,-9,-12,-7,-2,-14,0,-11,12,18,-4,-29,-14,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,1,-30,29,-20,-10,0,-20,10,69,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,38,-20,19,0,-20,0,9,-20,0,-30,-20,58,-20,0,0,11,1,-29,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=40,-11,-12,-19,-11,-18,1,-19,-9,-11,-11,-9,-10,-12,-11,-19,9,0,0,-20,-16,-11;
MA   /M: SY='A'; M=31,-13,-13,-20,-14,-14,2,-21,-7,-13,-9,-8,-11,-15,-14,-19,6,-1,3,-21,-17,-14;
MA   /M: SY='A'; M=14,-18,-11,-23,-17,-9,-17,-22,9,-18,2,0,-15,-19,-16,-20,1,3,14,-26,-12,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,0,-21,-17,2,-30,29,-21,-10,1,-19,9,60,-9,-10,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-24,-3,7,-18,-16,-6,-10,-3,-7,-2,-4,-11,5,-6,-4,-6,-12,-24,-10,6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,9,-25,3,5,-10,-16,18,-17,-1,-17,-9,16,-18,6,0,-2,-6,-23,-19,8,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,0,-14,-28,48,-14,-34,-14,-28,-19,8,-19,-15,-15,1,-16,-27,-24,-26,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-30,-21,7,-31,-22,24,-24,27,18,-25,-26,-20,-20,-20,-6,20,-21,-2,-21;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-13,0,-2,-16,-7,-8,-16,-4,-22,-15,15,-11,-2,-4,22,20,-11,-33,-15,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-19,-19,29,-29,19,0,-10,0,0,-19,-29,-10,-10,-19,-10,-10,29,76,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,10,-13,5,-1,-20,2,-5,-21,-7,-30,-20,22,-13,-1,-7,30,14,-16,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-25,-4,6,-21,-19,-3,-21,18,-19,-9,2,-16,9,29,-5,-6,-16,-23,-10,5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-35,-25,46,-30,-20,10,-29,26,8,-24,-29,-30,-20,-23,-10,5,-4,15,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-35,-26,-1,-34,-22,38,-22,18,25,-20,-21,-14,-21,-19,-9,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,13,-24,7,2,-17,-8,21,-21,-3,-23,-12,22,-17,6,-2,3,-5,-24,-27,-3,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-25,-5,-11,-22,28,-12,-26,-12,-19,-14,3,-19,-10,-13,0,-11,-21,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21,11,-30,-19,21,-29,45,22,-29,-29,-19,-20,-28,-10,11,-19,1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-28,-3,4,-22,-19,-6,-22,30,-21,-8,0,-14,7,20,-8,-8,-17,-19,-4,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00722;
//
ID   IF3_MP; MATRIX.
AC   MP00938;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Initiation factor 3 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2647495; R2=0.0124099; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=624; N_SCORE=11.999; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-13,7,-27,2,4,-24,-15,-2,-27,31,-27,-13,16,-16,7,34,-5,-7,-23,-25,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-21,7,-30,-19,21,-26,41,21,-28,-29,-19,-19,-27,-9,14,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-29,-29,2,-30,-27,28,-20,11,10,-29,-30,-29,-19,-11,-1,46,-26,-5,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-10,-23,-6,16,-12,-24,-9,-5,-7,9,2,-14,-15,3,-9,-12,-9,-7,-25,-11,9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-35,-29,41,-25,16,17,-24,-24,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='S'; M=16,-3,-14,-6,-4,-22,6,-12,-19,-10,-24,-16,5,-12,-2,-12,23,7,-10,-32,-20,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-30,-9,-2,-24,-19,-18,-11,-9,-20,-13,-14,42,-7,-16,-4,-6,-14,-29,-22,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-23,11,6,-24,-9,2,-21,4,-24,-12,24,-14,12,2,6,0,-24,-31,-15,9;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-18,-12,-4,-22,-5,-16,-15,-6,-17,-13,-6,5,-5,-14,8,1,-9,-25,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-7,15,-24,18,12,-27,-14,-6,-23,9,-22,-16,9,-12,3,2,1,-4,-16,-31,-16,7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-37,-10,-2,-28,-16,-19,-19,-6,-26,-17,-17,66,-9,-16,-9,-8,-26,-28,-26,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-9,-1,-28,-19,-17,-19,-10,-28,-18,-18,79,-9,-18,-8,-6,-27,-29,-27,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='C'; M=4,-17,69,-26,-24,-17,-23,-27,-18,-23,-14,-14,-17,-30,-24,-25,-3,-1,-1,-40,-24,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-25,-20,-31,-22,3,-25,-11,24,-18,26,40,-24,-24,-10,-15,-21,-9,17,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,57,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,30,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-31,-25,51,-29,-6,2,-23,11,2,-21,-30,-26,-16,-20,-9,-2,12,42,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-28,-7,3,-23,-22,-9,-20,29,-17,-5,-4,-14,8,25,-10,-6,-14,-21,-9,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-28,23,44,-31,-17,2,-29,7,-20,-18,3,-3,19,-1,0,-9,-28,-29,-17,31; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-25,-7,7,-22,-19,-2,-12,6,-7,0,-5,-14,21,5,-6,-7,-15,-20,-7,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,2,-25,2,17,-29,-14,-3,-23,13,-21,-10,2,-9,21,6,4,-2,-21,-26,-14,19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-8,-29,45,-28,-9,0,-11,14,32,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,-1,8,-28,-18,-8,-29,41,-28,-11,2,-12,10,32,-7,-8,-20,-21,-11,8;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-2,-23,-2,11,-25,-15,-7,-18,9,-16,-9,-2,-10,13,2,2,-4,-15,-24,-14,12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-28,-2,6,-26,-17,-2,-28,34,-26,-10,4,-13,9,30,-6,-9,-20,-22,-10,6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-27,17,43,-30,-16,-2,-27,6,-20,-18,1,-3,18,-2,2,-8,-26,-29,-19,31;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-16,-9,-3,-24,-1,-11,-15,-5,-18,-10,0,-12,5,-10,12,0,-10,-25,-18,1;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-2,-29,39,-26,-9,1,-13,12,38,-8,-10,-21,-21,-9,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-28,-1,11,-28,-18,-9,-28,39,-26,-10,-1,-10,9,25,-7,-8,-19,-21,-11,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,7,-27,3,5,-25,-15,4,-27,30,-27,-11,14,-14,7,25,-5,-8,-22,-25,-10,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-29,-2,15,-37,-15,4,-20,6,-20,-3,-1,-5,46,5,1,-6,-27,-21,-12,30;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-22,-5,1,-21,-18,1,-22,17,-21,-9,1,-13,4,13,3,6,-13,-26,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-14,-21,-16,-9,-15,-24,-13,7,-7,-3,4,-11,-19,3,-8,-6,-3,8,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-21,-27,-21,-6,-30,-23,24,-14,7,10,-18,-21,-14,-16,-11,-2,24,-24,-6,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-25,5,18,-26,-17,0,-18,5,-19,-10,6,-11,17,2,3,-2,-19,-29,-14,17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-19,-25,-22,-3,-28,-22,25,-20,10,9,-15,-25,-19,-19,-11,-3,27,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00723;
//
ID   RIBOSOMAL_L1E_MP; MATRIX.
AC   MP00939;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L1e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2058883; R2=0.0146848; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=994; N_SCORE=19.793; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-12,-23,-15,-5,-13,-18,-6,-7,7,-4,14,-9,-14,2,12,-8,-6,-6,-23,-8,-3;
MA   /M: SY='A'; M=26,-16,-13,-26,-17,13,-10,-20,-7,-17,-3,-7,-13,-17,-20,-20,0,-2,0,-10,-3,-17;
MA   /M: SY='H'; M=3,-6,-23,-10,-6,-12,-14,51,-21,-12,-14,-3,1,-18,-1,-8,-4,-13,-18,-23,8,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-29,-20,-17,77,-9,-19,-5,-7,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-31,-11,-4,-23,-20,-20,-16,-11,-22,-16,-14,57,-10,-17,-2,8,-20,-30,-23,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-3,6,-26,-19,-9,-28,39,-27,-10,0,-12,8,33,-6,-4,-18,-22,-10,6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-16,-15,-20,-17,-10,-22,-24,7,-15,-4,-3,-15,-4,-17,-17,2,14,15,-29,-13,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-4,-31,-3,18,-8,-19,-10,-22,-3,-17,-17,-6,-13,2,-7,-9,-8,-25,15,-3,12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-28,-5,5,-25,-19,-7,-28,38,-25,-10,0,-14,8,40,-8,-7,-18,-20,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,4,-28,6,0,-22,-20,-8,-16,15,-18,-9,4,-16,0,18,-8,-9,-11,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-30,-35,-31,-22,6,-25,-15,-4,-17,5,-2,-28,-28,-15,-10,-30,-19,-12,54,17,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-8,-26,-11,-10,-9,-12,31,-17,-10,-16,-6,-2,-20,-4,-8,-6,-10,-17,-7,13,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-7,-26,-3,19,-18,-23,-7,-15,7,-8,-7,-8,-14,6,15,-8,-8,-10,-26,-13,11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,6,-29,9,10,-26,-12,-3,-30,24,-25,-15,6,-14,6,25,-6,-10,-23,-23,-11,7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-19,-34,-29,0,-33,-29,37,-24,15,14,-25,-25,-24,-25,-14,-5,38,-25,-6,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-24,1,2,-21,-21,-8,-16,11,-15,-8,-2,-14,2,8,-3,2,-8,-26,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-25,1,5,-25,-16,-5,-25,31,-26,-11,9,-12,5,20,-3,-1,-19,-24,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,49,-32,-20,2,-26,10,-19,-13,0,-3,29,2,0,-10,-29,-27,-17,39;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-6,4,-24,-20,-5,-28,39,-24,-8,-1,-15,10,48,-10,-10,-19,-20,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-29,-9,1,-21,-21,-4,-26,29,-19,-8,-1,-17,9,51,-9,-8,-18,-20,-10,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-20,-24,-22,-15,8,-25,1,3,-11,14,11,-19,-25,-10,-10,-19,-10,-2,-5,22,-14;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-21,-29,-22,-2,-32,-25,26,-18,17,12,-21,-23,-19,-18,-15,-2,23,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-16,-10,-20,-14,-8,-23,-13,-4,-1,-7,0,-10,-22,-9,9,-9,-6,2,-22,-6,-14;
MA   /M: SY='S'; M=12,0,-10,-1,0,-20,0,-10,-20,-10,-29,-20,9,-10,0,-10,39,19,-10,-39,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,28,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,14,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='A'; M=42,-12,-6,-21,-12,-18,-3,-20,-8,-12,-6,-6,-12,-13,-11,-20,6,-1,1,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-10,-9,-8,-11,-16,-18,-11,-11,-12,-11,1,-11,-8,-10,23,41,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=31,-9,-14,-16,-11,-20,5,-19,-12,-11,-14,-11,-6,-12,-10,-18,10,2,-4,-23,-19,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-9,7,-21,5,-4,-15,-15,-7,-8,-6,-10,-9,9,-19,-7,-5,0,-2,-6,-31,-12,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-15,-29,-12,-2,-20,-18,-15,-11,-6,-17,-9,-15,32,-7,-12,-6,-7,-14,-24,-16,-7;
MA   /M: SY='D'; M=7,14,-21,18,18,-27,-9,-7,-24,-2,-21,-19,6,-8,2,-10,9,-1,-18,-31,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-20,-30,-21,14,-27,-20,14,-26,34,13,-26,-27,-21,-18,-24,-9,8,-13,2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,30,-21,13,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,47,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-24,-10,2,-18,-18,-5,-14,12,-8,4,-5,-15,7,16,-7,-7,-11,-22,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=13,2,-18,1,6,-24,-8,-9,-18,0,-18,-13,2,-10,5,-6,11,1,-13,-28,-17,6;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-14,-19,-16,-8,-14,-25,-14,-2,5,-8,-1,-9,-21,-5,14,-9,-7,6,-25,-10,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-39,-30,36,-34,-26,25,-29,14,10,-21,-26,-30,-24,-19,-9,19,-8,12,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,19,-26,28,32,-31,-14,-3,-31,7,-25,-22,7,-6,9,-2,6,-3,-25,-34,-19,21;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-24,14,18,-26,-3,-3,-26,5,-22,-16,10,-9,7,1,2,-6,-24,-27,-17,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-14,-16,-16,-6,-17,-19,14,-15,3,3,-14,-18,-16,-16,-5,-2,19,-22,-9,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-25,-3,3,-19,-16,-14,-11,-8,-13,-11,-12,28,-7,-14,-5,-5,-12,-26,-18,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-27,10,31,-28,-18,1,-26,7,-22,-16,2,1,16,2,3,-3,-25,-29,-16,23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-32,-24,15,-30,-22,22,-27,33,16,-28,-29,-24,-20,-23,-8,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-32,-24,8,-32,-22,26,-26,31,16,-26,-27,-21,-21,-23,-9,19,-19,2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-11,-30,-28,0,-29,-29,28,-21,12,10,-29,-29,-28,-20,-11,-1,44,-28,-9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-2,5,-18,10,11,-21,-13,-10,-15,-5,-19,-15,2,-12,-2,-9,13,5,-6,-35,-18,5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,38,-27,51,12,-35,-2,-3,-35,-3,-29,-27,19,-12,-2,-10,4,-6,-27,-38,-20,5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,38,16,-29,-11,-4,-28,-4,-21,-22,11,-11,0,-10,7,-3,-21,-37,-18,8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-22,-22,-22,-6,18,-28,-16,5,-22,27,7,-22,-24,-17,-16,-22,-10,0,-15,3,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00724;
//
ID   GAMMA_THIONIN_MP; MATRIX.
AC   MP00940;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gamma-thionins family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8768218; R2=0.0080927; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=8.156; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=325; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-22,-18,-25,-18,21,-22,-14,3,-22,15,3,-18,-25,-20,-17,-11,-4,1,-10,11,-18;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-11,-17,-12,2,-14,-6,12,-11,18,23,-14,-14,-6,-8,-13,-5,7,-12,0,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-14,-9,-17,-13,1,-14,-7,13,-9,12,21,-14,-14,-7,-8,-10,-4,13,-13,-2,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-10,-25,-19,4,-24,-18,19,-21,26,14,-22,-22,-17,-17,-18,-6,16,-18,-3,-18; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-24,-15,-29,-24,29,-25,-21,11,-22,12,4,-20,-24,-27,-18,-12,-2,15,-10,7,-24; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-15,-30,-24,23,-27,-22,17,-23,16,8,-22,-25,-26,-18,-14,-2,20,-14,4,-24; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=32,-12,-12,-20,-12,-13,-7,-18,-4,-12,-4,-6,-10,-12,-10,-18,5,2,2,-18,-12,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='T'; M=9,-4,-16,-11,-7,-12,-13,-10,-9,-8,-9,-8,-2,-7,-4,-11,6,12,-7,-20,-6,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-23,-1,10,-13,1,-10,-22,-5,-16,-13,-3,-12,-2,-9,1,-7,-17,-22,-14,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-18,-6,-3,-17,14,-12,-16,-5,-15,-10,-5,-4,-7,-9,-1,-8,-11,-16,-16,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-21,-12,-5,-13,-17,-13,-1,-9,-7,1,-15,22,-8,-13,-7,-5,-2,-23,-14,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-12,-21,-18,-2,-19,-14,15,-13,8,18,-16,-18,-12,-12,-6,2,20,-21,-5,-15; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-12,-13,-15,-11,-9,-17,-13,3,-7,-2,5,-11,-8,-5,-7,-1,7,8,-21,-9,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-13,-22,-21,-8,-10,-23,9,-17,1,1,-18,-22,-21,-18,-2,0,22,-26,-13,-21; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,18,46,-31,-18,2,-27,9,-20,-15,1,-3,26,1,0,-10,-29,-27,-17,36; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-14,-15,-10,-19,5,-17,-12,-11,-11,-10,-6,-6,-10,-17,5,-3,-6,-21,-19,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-5,5,-26,-17,-4,-29,35,-25,-9,0,-15,13,45,-9,-10,-21,-20,-11,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-18,-22,-16,-4,-27,-18,12,-17,10,7,-14,-19,-14,-14,-5,12,13,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-28,8,35,-27,-19,-3,-26,18,-19,-11,-2,-6,16,11,-4,-9,-23,-26,-16,25;
MA   /M: SY='R'; M=0,-2,-19,-6,-3,-20,-7,-4,-21,4,-21,-12,5,-15,0,10,10,6,-12,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-29,-8,5,-22,-21,-8,-17,9,-12,-6,-9,5,8,12,-9,-9,-18,-24,-13,5;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-10,-3,-2,-19,-2,-12,-17,-11,-27,-18,7,-11,-2,-11,36,18,-6,-38,-19,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-7,7,-26,6,-1,-24,2,11,-24,-4,-18,-9,9,-17,2,-5,-3,-11,-22,-27,-11,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-1,-21,-5,-6,-14,-9,-6,-20,1,-16,-11,3,-16,-5,8,3,11,-14,-24,-8,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-29,-35,-27,53,-27,-11,-6,-24,0,-5,-23,-30,-29,-18,-24,-15,-10,43,37,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-24,-2,4,-24,-14,-1,-25,18,-27,-13,5,-6,6,17,5,0,-18,-28,-12,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-11,-20,-25,66,-20,-38,-20,-28,-19,-1,-20,-21,-20,-1,-20,-29,-19,-27,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-21,-22,-21,-15,-7,-23,-21,4,-16,1,1,-19,9,-17,-18,-10,-3,5,-25,-13,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-27,-23,7,-11,-21,9,-23,11,7,-16,-25,-22,-18,-14,-8,8,-18,-3,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-17,1,-1,-19,-7,-7,-20,2,-25,-16,15,-11,0,4,18,15,-15,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-24,22,6,-24,-11,-6,-26,0,-25,-21,15,-13,-1,-5,5,3,-22,-20,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-23,0,-2,-22,-6,2,-23,2,-23,-14,11,-9,1,9,5,1,-20,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='N'; M=1,17,-20,8,-2,-21,-1,1,-19,-6,-23,-17,27,-10,-3,-8,10,0,-21,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=9,3,-21,3,4,-26,-6,-9,-24,7,-21,-15,2,-12,1,5,4,-5,-15,-25,-17,2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,16,-23,10,4,-24,-11,-1,-19,7,-22,-13,22,-15,7,4,5,-1,-20,-32,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=2,-17,-18,-19,-12,-11,-23,-5,6,-12,-2,3,-15,-21,-6,-12,-6,-5,15,-25,-7,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-28,-12,-6,-16,-25,4,-2,-1,-5,3,-5,-16,1,3,-12,-11,-5,-24,-3,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-21,3,2,-23,-7,-1,-22,6,-25,-14,21,-15,10,10,10,4,-21,-31,-16,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-29,18,56,-29,-19,-1,-29,9,-19,-19,-1,-1,18,-1,1,-9,-28,-29,-20,37;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-30,-3,-8,-27,28,5,-35,-1,-27,-14,4,-18,-6,1,-4,-17,-27,-23,-16,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-27,-24,-34,-24,39,-23,-19,-3,-24,5,-3,-22,-26,-27,-19,-18,-11,-5,25,19,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-23,-7,-6,-19,-9,-15,-14,-6,-15,-10,-3,1,-6,-4,4,5,-11,-28,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-26,12,-4,-28,21,9,-34,-11,-27,-18,9,-16,-6,-12,4,-11,-26,-29,-17,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-23,6,1,-20,-12,6,-23,7,-23,-13,12,-16,2,12,4,-1,-17,-28,-8,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-13,6,-26,6,3,-22,-16,17,-23,8,-20,-10,11,-17,4,16,-3,-8,-20,-29,-7,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-27,-7,-13,-14,18,-12,-21,-11,-17,-12,-2,-17,-14,-12,-4,-12,-17,-17,-9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-17,-24,-18,-17,18,-22,-18,-1,-20,2,-3,-16,-16,-21,-18,-14,-9,-1,-6,4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-18,-24,-21,-11,5,-24,-9,-10,2,4,2,-11,-23,-7,25,-15,-6,-7,-16,-1,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00725;
//
ID   CARBOXYLESTERASE_B_2_MP; MATRIX.
AC   MP00941;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Carboxylesterases type-B signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1106958; R2=0.0146760; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=254; N_SCORE=8.828; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=95; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-1,-14,-1,-2,-23,-3,-12,-20,-7,-15,-11,-2,-16,1,-7,4,3,-14,-28,-16,-1;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-10,-3,-14,-15,13,-17,-12,-3,-17,3,-2,-8,-21,-18,-14,-10,-5,-1,-14,2,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-4,-22,-5,-2,-13,-15,-8,-10,-6,-10,-6,-1,-1,2,-7,-1,-1,-13,-20,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-13,-22,-14,-10,-7,3,-6,-13,-13,-2,-3,-8,-19,-5,-8,-6,-9,-12,-17,-7,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-4,-21,-5,-4,-9,-12,-10,-7,-10,-8,-7,-2,-11,-7,-10,1,1,-7,-21,-5,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-24,0,13,-17,-13,-7,-18,5,-15,-11,0,-5,2,5,-2,-4,-17,-23,-13,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-15,-20,-20,-16,-4,-3,-13,1,-11,2,11,-12,-18,-11,-11,-10,-7,1,-16,-5,-14; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-13,-16,-18,-13,0,-11,-17,-14,-12,-14,-11,-10,-20,-13,-14,-7,-7,-12,18,-1,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-19,1,4,-18,-5,-3,-13,-1,-16,-9,11,-7,7,-3,3,2,-16,-22,-12,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-28,-8,0,-19,-15,-10,-16,0,-21,-13,-10,26,-2,-7,-2,-4,-18,-20,-10,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-2,-16,-6,-8,-11,-6,-10,-5,-8,-7,-5,3,-9,-9,-7,-2,-1,-4,-23,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-17,-11,-8,-11,-16,-12,-2,-7,-1,-1,-10,-11,-3,-2,-4,3,1,-21,-9,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-22,3,5,-18,0,-4,-19,-2,-18,-12,3,2,2,-4,0,-6,-19,-19,-11,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-22,-14,-9,-9,-9,-11,-1,-13,-3,3,-4,-14,-5,-12,-5,-4,-4,-23,-10,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,5,-16,6,3,-22,-3,-8,-18,-7,-24,-17,9,-13,0,-9,21,7,-11,-36,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-29,20,55,-30,-19,-1,-29,9,-20,-20,0,-1,18,-1,1,-9,-28,-30,-20,36;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,18,-39,-6,-1,-40,-1,-30,-29,19,-11,-1,-11,0,-11,-30,-39,-21,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-22,-17,-17,18,-26,4,-4,-11,-3,-4,-13,-23,-11,-10,-6,11,-6,8,46,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-22,7,-31,-23,24,-28,39,18,-28,-28,-21,-21,-24,-7,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-20,24,3,-23,-1,6,-23,-1,-30,-21,48,-17,0,-3,12,1,-28,-40,-20,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-29,1,-33,-29,35,-23,16,13,-27,-27,-27,-23,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-28,-31,-31,-26,30,-29,-8,3,-19,0,-2,-26,-29,-21,-17,-24,-14,-3,44,43,-24;
MA   /M: SY='T'; M=6,-10,-16,-16,-11,-13,-18,-19,-4,-2,-9,-5,-8,-15,-9,-1,4,12,6,-26,-12,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-40,-10,0,-30,-20,-19,-20,-9,-30,-19,-19,86,-8,-18,-10,-10,-30,-30,-29,-9;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-21,-4,3,-20,-14,-6,-16,9,-16,-8,-2,-3,1,5,-1,-1,-11,-22,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-26,3,-3,-21,-3,-7,-18,-6,-18,-13,6,4,-7,-10,-3,-4,-18,-29,-17,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=6,-9,-17,-12,-6,-13,-14,-11,-7,-6,-6,-5,-8,-6,-7,-6,1,3,-3,-23,-11,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-3,-20,-3,0,-17,-14,-4,-15,2,-17,-10,-1,2,1,3,4,3,-12,-23,-9,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-21,-5,2,-16,-14,-2,-15,8,-14,-7,-4,0,5,5,-2,-3,-13,-16,-5,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-19,8,5,-19,8,-2,-22,-1,-21,-15,17,-12,0,1,5,-5,-21,-24,-16,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=7,2,-18,-3,-2,-14,-6,-6,-14,-8,-16,-12,8,-10,-5,-10,9,2,-12,-28,-14,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-15,1,1,-17,-1,-4,-16,6,-18,-10,8,-5,3,3,5,0,-14,-19,-11,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-14,-18,-12,11,-18,-10,4,-12,15,5,-14,-18,-12,-4,-13,-5,2,-9,4,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-33,-9,-2,-27,-10,-19,-21,-7,-28,-18,-13,56,-9,-15,-3,-4,-25,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-14,-22,-22,-6,-28,-25,18,-10,3,5,-23,-27,-23,-11,-10,-2,36,-29,-10,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-21,-26,-17,-1,-21,-11,15,-15,20,31,-22,-20,-10,-12,-19,-9,10,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-9,-25,-24,0,-25,-24,17,-20,9,8,-23,-26,-24,-20,-10,-3,28,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-22,-37,-25,-19,10,-19,-11,-16,-16,-14,-14,-18,-26,-15,-15,-25,-20,-23,73,20,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-23,-32,-25,4,-25,-24,25,-22,11,13,-19,-23,-20,-19,-15,-8,20,-19,-2,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-8,-27,-10,-9,0,-15,41,-20,-8,-14,-4,-1,-21,-4,-4,-9,-10,-19,-13,22,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00112;
//
ID   GLPT_MP; MATRIX.
AC   MP00942;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   glpT family of transporters signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8897829; R2=0.0135117; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=852; N_SCORE=16.392; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-33,-38,-33,-26,4,-19,-27,-12,-19,-16,-15,-32,-27,-19,-19,-24,-18,-14,94,17,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-6,-30,8,-20,-26,-13,-30,-20,-14,56,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-32,-11,-3,-25,-18,-19,-14,-11,-26,-17,-16,60,-11,-18,-2,-4,-18,-32,-26,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,102,-26,-26,-20,-26,-27,-29,-27,-21,-20,-16,-36,-26,-27,-3,-6,-10,-49,-29,-26;
MA   /M: SY='G'; M=10,-11,-21,-15,-16,-11,29,-18,-25,-18,-20,-15,-3,-18,-17,-18,6,-8,-16,-19,-18,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-11,-2,-19,-20,-8,-17,18,-18,-7,-1,-17,4,36,-3,-5,-11,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-12,-18,-16,-4,-24,-22,4,-16,7,0,-12,-18,-16,-14,4,28,11,-28,-8,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-30,-17,29,-24,32,32,-24,-24,-14,-20,-24,-10,16,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=8,-10,-14,-16,-12,-12,-17,-19,-5,-5,-8,-6,-8,-16,-11,0,6,17,7,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-7,5,-26,1,2,-23,-15,36,-26,12,-24,-7,11,-15,6,8,-5,-12,-23,-27,0,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-27,-31,-25,40,-26,-13,-6,-20,-2,-6,-21,-27,-24,-16,-17,-4,-8,36,34,-22;
MA   /M: SY='P'; M=5,-5,-23,-2,9,-25,-10,-12,-21,-6,-26,-19,-3,22,-1,-12,14,3,-19,-33,-23,3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-32,-10,1,-24,-22,-8,-20,20,-20,-8,-5,2,8,30,-10,-10,-18,-22,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-18,-4,0,-20,-10,-8,-23,8,-25,-15,5,-13,3,18,18,11,-13,-31,-15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,45,-32,-20,0,-28,17,-22,-15,0,-3,25,7,-2,-10,-28,-27,-17,35;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-14,-28,-15,-5,-2,-22,-4,-25,19,-15,-8,-4,-22,1,54,-12,-10,-16,-15,-3,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-17,-10,-11,-16,-1,-17,-19,-6,-16,-12,0,-13,-9,-1,12,27,-9,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-31,-33,-35,-26,14,-27,-26,4,-17,-4,-3,-27,-26,-22,-17,-26,-16,-1,51,14,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-30,-31,-31,-26,1,-11,-24,-2,-21,0,0,-29,-28,-20,-19,-25,-17,-3,45,6,-21;
MA   /M: SY='A'; M=25,-6,-13,-10,-8,-22,12,-16,-19,-12,-21,-16,0,-12,-8,-16,21,5,-9,-28,-22,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-22,-37,-29,26,-34,-26,27,-28,18,12,-23,-26,-28,-24,-19,-8,23,-13,7,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-45,-38,-28,10,-22,-28,-13,-22,-8,-13,-38,-30,-20,-20,-38,-26,-23,120,25,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-4,29,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,46,-17,0,-3,18,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-4,-23,-20,-7,-28,-25,10,-19,0,0,-11,-18,-17,-19,2,21,13,-29,-9,-20;
MA   /M: SY='S'; M=26,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,28,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-28,-5,-4,-16,-20,82,-21,-10,-13,11,5,-20,8,-2,-12,-18,-23,-28,16,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=18,-11,-21,-16,-16,-23,33,-18,-22,-15,-17,-7,-6,-16,-14,-19,2,-11,-14,-20,-23,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-24,-30,-24,-1,-17,-24,21,-27,23,12,-22,-25,-21,-23,-20,-11,14,-21,-6,-24;
MA   /M: SY='I'; M=3,-21,-25,-23,-18,-14,-8,-24,4,-19,-2,-2,-17,2,-18,-22,-9,-9,3,-23,-16,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-11,-10,-6,-14,6,-12,-10,-7,-10,-8,-6,2,-7,-12,3,-3,-6,-13,-14,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-33,-13,-6,-25,-4,-20,-18,-14,-20,-15,-17,50,-13,-20,-8,-11,-23,-26,-26,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-34,-26,3,-33,-24,34,-26,27,23,-25,-25,-19,-23,-21,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-14,-29,-24,7,-25,-25,18,-22,18,9,-26,-27,-25,-20,-13,-4,26,-22,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=4,-16,-18,-21,-16,-6,-7,-18,0,-19,13,7,-15,-20,-14,-17,-7,3,1,-22,-10,-15;
MA   /M: SY='L'; M=6,-18,-17,-23,-17,6,-10,-20,-3,-20,9,0,-15,-20,-19,-18,-6,2,0,-17,-5,-17;
MA   /M: SY='G'; M=14,-16,-22,-22,-19,-9,15,-22,-9,-19,-10,-7,-9,-17,-19,-22,-2,-10,-5,-17,-15,-19;
MA   /M: SY='I'; M=2,-22,-18,-29,-21,8,-23,-20,15,-22,12,11,-18,-22,-18,-20,-9,-4,13,-19,-2,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-4,-14,-16,-10,-18,-4,-16,-5,-10,-10,-8,0,-13,-9,-18,7,-1,-2,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-14,-30,-16,-12,-4,-27,-8,7,-14,4,8,-15,-21,0,-14,-17,-12,-3,2,12,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-22,-27,-21,34,-27,-7,4,-22,15,4,-20,-28,-21,-16,-17,-7,-1,1,30,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00726;
//
ID   UBIA_MP; MATRIX.
AC   MP00943;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   UbiA prenyltransferase family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3027387; R2=0.0187763; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=311; N_SCORE=12.132; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=11; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-20,-18,-26,-20,32,-22,-19,-1,-23,10,0,-16,-24,-26,-18,-10,0,1,-9,8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-17,-23,-20,-4,-17,-22,10,-19,5,5,-13,-20,-17,-18,-2,10,13,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-16,-28,-21,2,-27,-22,18,-23,22,12,-22,-24,-19,-20,-14,1,18,-23,-5,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-19,-12,-20,-24,56,-20,-37,-21,-27,-19,-2,-21,-21,-20,0,-17,-27,-21,-27,-20;
MA   /M: SY='T'; M=7,-13,-13,-20,-17,-8,-21,-23,7,-16,0,-1,-12,-17,-16,-17,6,20,15,-27,-10,-17;
MA   /M: SY='A'; M=7,-19,-16,-24,-19,7,-15,-21,2,-19,1,-1,-15,-20,-19,-18,-2,2,7,-14,-4,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-16,-32,-23,13,-31,-22,21,-29,37,17,-28,-29,-23,-21,-25,-9,14,-19,1,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-19,3,-26,-22,-8,-12,-14,5,-17,3,22,-17,-24,-13,-17,-11,-7,8,-27,-11,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-11,-22,-14,-7,-16,-13,-9,-14,6,-14,-5,-4,-17,0,24,1,-2,-6,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='A'; M=21,-8,-9,-13,-12,-22,16,-18,-20,-14,-20,-15,-3,-15,-12,-18,13,0,-10,-27,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-9,-13,-8,-20,4,-17,-15,-11,-18,-14,-3,-12,-8,-17,18,5,-5,-27,-21,-8;
MA   /M: SY='G'; M=17,-9,-21,-12,-14,-26,39,-19,-28,-16,-24,-17,-2,-16,-14,-19,8,-9,-18,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-5,67,-16,-21,-21,-11,-20,-28,-21,-23,-20,0,-32,-21,-22,-3,-7,-16,-43,-27,-21;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-11,-24,-20,-9,-18,-25,11,-16,0,0,-17,-20,-19,-19,1,6,22,-26,-13,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-36,-27,12,-35,-24,34,-28,25,18,-23,-24,-22,-25,-22,-9,21,-16,5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-25,27,4,-24,-12,2,-17,-2,-15,0,15,-15,3,-7,-4,-8,-18,-33,-14,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-25,-28,-24,19,-20,-10,2,-20,5,2,-23,-28,-19,-17,-20,-12,-3,21,27,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-20,-23,-26,-18,3,-19,-14,3,-13,0,0,-16,-20,-13,-12,-9,-6,1,1,9,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,28,-37,-12,2,-38,2,-28,-27,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-19,16;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-25,-12,-3,-20,-21,-8,-20,13,-18,-10,-8,1,1,30,-9,-9,-16,-22,-12,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-29,37,14,-32,-13,9,-33,5,-26,-20,13,-10,3,-2,-3,-10,-27,-30,-13,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-25,-35,-26,25,-33,-20,24,-27,18,12,-20,-24,-23,-23,-19,-7,13,-8,15,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=4,-8,-20,-10,-5,-23,1,-6,-23,4,-21,-10,-3,-10,-2,4,0,-7,-16,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-8,-24,-9,-3,-16,-22,19,-13,3,-8,1,-4,-19,4,3,-12,-11,-12,-23,1,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-25,-15,-30,-25,0,-25,-14,25,-15,15,37,-25,-25,-14,-15,-15,-5,28,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,-2,14,-22,-18,-9,-17,10,-16,-9,-1,-9,6,4,0,-2,-13,-26,-14,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-23,-7,3,-24,-17,-6,-21,19,-20,-8,-1,-15,12,25,-2,-6,-15,-23,-12,6;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,-15,2,1,-19,-6,-5,-18,-3,-19,-12,13,-16,-1,-5,6,2,-16,-31,-16,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-36,-13,-3,-26,-21,-21,-14,-11,-23,-16,-21,74,-12,-20,-10,-9,-22,-29,-27,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-30,-22,6,-30,-22,24,-26,31,17,-25,-26,-20,-21,-20,-5,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=10,-20,-16,-21,-17,-12,-19,-24,6,-15,-5,-3,-20,0,-19,-19,-1,3,17,-28,-16,-19;
MA   /M: SY='R'; M=1,-4,-18,-7,-2,-20,-13,-10,-19,7,-20,-12,2,-13,2,14,11,10,-11,-27,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-29,-8,-18,-27,58,-16,-37,-16,-29,-19,3,-20,-17,-16,0,-18,-29,-20,-25,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-22,-8,-2,-16,-17,-10,-10,0,-4,-3,-6,-16,1,3,-5,-3,-8,-24,-11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-20,-33,-26,2,-32,-26,32,-22,17,16,-24,-25,-22,-21,-16,-6,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-15,-4,-1,-16,-10,-13,-18,-6,-21,-15,2,-6,-3,-5,21,18,-10,-31,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-21,-10,-1,-22,-16,-17,-14,-6,-18,-13,-12,22,-7,-11,-1,-1,-12,-29,-20,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-26,-5,1,-16,-15,-8,-22,14,-19,-10,-1,-13,3,16,-5,-5,-17,-16,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-26,3,24,-24,-18,2,-19,3,-13,-8,-2,-10,17,0,-1,-8,-20,-25,-11,20;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-12,-20,-11,-18,-4,-20,-6,-12,-9,-8,-11,-9,-11,-20,9,1,3,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-30,-22,14,-29,-20,16,-21,24,12,-24,-27,-21,-16,-22,-9,12,-11,5,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-18,-19,-22,-17,-4,-18,-20,4,-17,4,0,-15,-22,-15,-17,-8,-2,4,-9,-6,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-33,-25,37,-28,-19,11,-26,20,8,-22,-28,-28,-20,-19,-7,8,-6,15,-25;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-16,-24,-18,6,4,-20,-11,-20,-3,-6,-12,-20,-21,-20,-4,-8,-6,-14,-8,-18;
MA   /M: SY='V'; M=3,-18,-19,-24,-19,-2,-10,-21,6,-20,4,3,-13,-20,-17,-19,-4,0,7,-22,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=5,-21,-15,-26,-22,1,-13,-23,7,-21,6,2,-17,-22,-22,-21,-7,-3,12,-21,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-12,-23,-14,-2,-26,-16,8,-21,25,13,-20,-24,-8,-15,-16,-2,3,-23,-5,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00727;
//
ID   CKS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00944;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclin-dependent kinases regulatory subunits signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6975422; R2=0.0138118; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1109; N_SCORE=20.005; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=7,9,-22,11,2,-26,-9,-8,-25,5,-19,-16,2,-13,-1,11,1,-6,-15,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-22,6,25,-29,-12,-1,-23,2,-24,-14,4,-7,25,-1,15,1,-22,-31,-17,25;
MA   /M: SY='E'; M=8,4,-24,8,39,-27,-14,-6,-24,4,-17,-17,-3,-3,11,-6,3,-7,-21,-27,-20,25;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16,-6,-11,-23,-6,-15,12,1,-1,-9,-23,1,42,-16,-10,-11,-20,-7,-6;
MA   /M: SY='E'; M=9,-8,-24,-11,11,-18,-20,-15,1,-8,-5,-5,-9,-9,-2,-15,-3,-7,-2,-24,-14,3;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-30,-19,-9,-14,-26,-9,-6,12,-8,-1,-6,-20,1,39,-13,-10,-5,-20,-7,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-20,-32,-24,3,-29,-19,29,-22,26,29,-25,-25,-17,-19,-21,-8,23,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-22,-4,11,-15,-22,-12,-13,4,-4,-6,-7,-12,0,-1,-3,7,-10,-26,-11,6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-11,-24,-15,-3,-12,-20,-7,-1,-1,-1,22,-13,0,1,-6,-9,-1,-5,-24,-9,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=0,-15,-19,-18,-14,8,-3,-16,-11,-18,-6,-8,-10,-7,-17,-16,-1,-4,-8,-16,-6,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-1,-25,-6,-2,-19,-17,14,-11,-3,-15,-4,6,-17,12,2,-1,-7,-15,-23,-2,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-12,24,7,-30,-15,-5,-32,14,-28,-20,14,-16,0,8,-4,-9,-24,-33,-17,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,14,-25,17,12,-32,-14,0,-25,7,-24,-13,9,-11,22,2,6,0,-23,-29,-14,17;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-29,-40,-30,12,-39,-29,43,-30,19,17,-20,-21,-23,-29,-20,-10,26,-16,4,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-14,-29,-14,-11,8,-26,35,-7,-10,-2,2,-11,-25,1,-6,-16,-13,-15,4,46,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-31,37,16,-34,-12,-4,-31,-1,-29,-25,14,15,0,-10,-1,-9,-30,-36,-23,7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-8,-22,-10,-4,11,-19,-2,-11,-10,-8,-9,-9,-18,-9,-12,-3,-2,-10,-5,20,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,10,-28,11,23,-26,-17,17,-23,7,-19,-6,8,-10,15,2,-4,-10,-24,-29,-10,18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-23,-28,-20,-3,-25,5,20,-15,13,38,-17,-21,-6,-14,-18,-11,12,-22,2,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-36,-10,-1,-27,-20,-20,-19,-10,-27,-19,-17,76,-10,-19,-6,-1,-26,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-31,-2,8,-29,-20,-10,-29,42,-29,-11,-2,0,8,28,-10,-10,-21,-21,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=0,25,-25,35,22,-32,-10,-5,-30,0,-22,-22,7,-8,2,-10,3,-7,-22,-32,-20,12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-19,-31,-24,4,-29,-19,27,-22,28,28,-26,-26,-17,-19,-21,-7,23,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-13,-19,-12,-11,-10,-19,-1,-16,2,-3,-12,-17,-12,-18,5,2,5,-26,-14,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=0,-17,-20,-19,-5,-9,-21,-11,5,-12,14,14,-18,-19,0,-11,-13,-7,3,-22,-8,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-23,-3,4,-24,-18,-13,-24,28,-25,-11,1,-10,4,15,3,8,-14,-25,-11,4;
MA   /M: SY='B'; M=-7,26,-18,21,2,-22,-9,-4,-22,-4,-24,-19,26,-13,-3,-7,14,15,-19,-37,-17,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-30,-9,-5,-7,-23,43,-22,5,-15,-4,-1,-23,5,23,-13,-14,-21,-11,24,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,28,-30,-20,15,-30,40,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-6,-20,-17,-15,-4,-16,0,10,-10,11,35,-1,-21,-2,-9,-13,-7,0,-25,-5,-9;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-14,-2,-1,-20,-5,-12,-19,-10,-28,-19,5,4,-2,-11,31,19,-12,-38,-20,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00728;
//
ID   CKS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00945;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclin-dependent kinases regulatory subunits signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4407220; R2=0.0127188; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1160; N_SCORE=19.185; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=1,-1,-23,-3,-8,-27,32,-11,-30,-12,-29,-18,9,-16,-3,-12,14,-4,-24,-28,-24,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-3,11,-31,-20,1,-17,4,-17,-3,0,-10,38,4,6,9,-21,-23,-10,24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-14,-29,-13,1,-20,-23,-6,-9,-4,0,1,-13,1,15,3,-13,-10,-16,-22,-11,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-21,-16,0,-9,-26,-15,12,-10,4,11,-17,-17,-7,-13,-10,-6,15,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-28,-5,-3,-17,-20,83,-22,-10,-13,10,5,-20,8,-2,-12,-18,-23,-28,17,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='M'; M=0,-9,-21,-13,7,-13,-17,-3,-1,-4,2,23,-12,-12,5,-9,-9,-8,-4,-23,-10,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-3,-35,-28,-1,-35,-28,30,-28,18,12,-23,-26,-23,-27,-19,-8,24,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=1,-9,-24,-10,-2,-22,-2,-14,-19,9,-18,-9,-7,-16,-4,9,-4,-9,-8,-23,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-38,-10,0,-28,-20,-16,-22,-3,-28,-18,-16,70,-6,-3,-10,-10,-28,-28,-26,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,53,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-37,0,20,-30,-20,-13,-23,-3,-27,-20,-13,60,0,-13,-7,-10,-30,-30,-27,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-22,-19,-11,-7,-26,-17,1,2,12,6,-18,-23,-9,5,-18,-8,5,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='P'; M=2,7,-23,6,-1,-24,-12,-12,-19,-7,-22,-17,5,15,-7,-13,5,8,-17,-31,-20,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-13,-20,-17,-12,3,-16,2,-1,-2,-1,8,-13,-17,-5,-6,-10,-6,-4,1,23,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-23,-1,13,-23,-17,-7,-18,5,-18,-10,-4,12,12,-1,1,4,-18,-23,-14,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-18,-14,-3,-18,-10,-7,-6,-4,-7,6,-9,0,8,-9,-1,-5,-7,-18,-12,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=3,0,-22,-1,13,-24,-13,-9,-22,25,-20,-10,-2,-7,6,11,-3,-7,-15,-19,-12,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-11,-11,-15,-11,11,-15,-13,-3,-15,2,-3,-7,-15,-13,-11,3,11,0,-15,0,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-17,-9,-8,-11,6,-10,-13,-7,-6,-6,-4,-15,-6,2,0,-4,-9,-19,-12,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=8,-4,-15,-5,-2,-21,11,-7,-18,-6,-17,-10,0,-10,6,-7,9,-2,-14,-19,-15,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=0,7,-17,1,2,-19,-8,20,-15,-2,-15,-6,13,-11,12,-1,2,-6,-18,-21,-6,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-13,-6,-8,-9,-13,-8,-5,0,-9,-5,5,-15,-6,7,1,6,1,-22,-9,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-2,-29,1,-1,-28,2,-12,-28,4,-25,-17,-2,5,-4,5,-3,-10,-22,-25,-21,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00728;
//
ID   CATHELICIDINS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00946;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cathelicidins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6725793; R2=0.0132227; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; N_SCORE=13.641; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-26,-9,-16,-28,55,-18,-35,-18,-29,-20,1,-18,-16,-18,7,-12,-25,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=15,-19,-13,-24,-18,-6,-18,-23,9,-18,11,3,-19,-21,-18,-19,-5,3,16,-24,-11,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-27,-17,-30,-23,3,-27,-17,23,-20,27,30,-27,-27,-17,-17,-20,-7,23,-23,-3,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-1,-15,-10,-28,-8,-22,-26,-16,-28,-20,-17,41,-16,-22,-8,-12,-25,-33,-30,-16;
MA   /M: SY='L'; M=9,-18,-17,-19,-11,-8,-15,-18,0,-19,10,0,-15,-9,-12,-18,-3,-1,-1,-25,-12,-12;
MA   /M: SY='A'; M=28,-15,-18,-23,-16,-17,2,-22,-1,-16,-6,-5,-11,-14,-14,-22,1,-6,2,-20,-17,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=1,-10,-10,-12,-10,-5,-12,-13,9,-11,-3,0,-5,-10,-8,-11,6,3,9,-19,-7,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-17,-17,-12,6,-18,-15,5,-13,-2,-1,-14,10,-15,-14,-9,-5,2,-11,-3,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-16,-11,-7,-21,0,10,-18,-11,-17,-10,-1,-13,-4,-14,10,-3,-11,-26,-11,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-4,-30,-4,13,-33,-20,6,-24,17,-20,-4,0,-14,42,31,-4,-10,-26,-20,-10,26;
MA   /M: SY='V'; M=5,-8,-17,-10,-10,-15,-17,-16,-6,-2,-9,-6,-9,-18,-10,4,0,5,6,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-27,-17,3,-28,-20,13,-27,37,13,-28,-10,-18,-20,-27,-10,3,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-15,-3,-1,-19,-7,-9,-21,-1,-26,-17,7,-12,1,9,26,16,-11,-34,-17,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,-1,18,-27,-20,1,-28,23,-21,-11,0,-13,22,41,-6,-10,-24,-22,-12,17;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,28,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,-1,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=4,-25,-18,-28,-18,3,-23,-20,13,-25,36,13,-25,-25,-18,-20,-21,-8,8,-20,-5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,5,-25,-20,2,-28,25,-20,-8,0,-18,22,56,-8,-10,-22,-20,-10,9;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-30,-26,2,-29,-27,27,-23,21,13,-28,-28,-26,-21,-15,-4,35,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-17,35,-30,50,18,-40,-9,1,-35,1,-28,-22,14,-10,13,-6,0,-10,-30,-34,-18,16;
MA   /M: M=-7,-4,-25,-4,-6,-4,-3,-10,-19,-8,-14,-10,-4,-18,-3,-5,-5,-10,-15,-17,-7,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-24,-32,-24,33,-31,-12,14,-25,22,10,-23,-29,-23,-19,-23,-10,5,0,27,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,40,-35,-20,5,-25,10,-20,-10,0,-5,40,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-30,-6,3,-30,1,-1,-29,11,-23,-9,0,-16,22,24,-4,-12,-26,-20,-15,11;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-15,0,5,-25,-5,-5,-20,-5,-28,-15,8,-10,14,-5,31,13,-15,-35,-18,9;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-16,-5,1,-20,-10,-7,-13,-9,-15,-9,1,-13,11,-7,19,8,-11,-32,-14,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,21,-30,33,25,-34,5,-5,-36,-1,-26,-24,8,-9,3,-9,0,-12,-30,-32,-22,14;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-17,-13,-2,-24,-9,-13,-13,-5,-14,-8,-7,-2,6,-11,8,5,-9,-22,-17,2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-25,13,0,-22,-5,3,-20,-2,-30,-20,41,6,-2,-5,5,-2,-30,-38,-22,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,24,-27,32,36,-31,-13,0,-31,4,-25,-23,14,-6,10,-4,5,-6,-28,-35,-20,23;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-18,-28,-18,2,-22,-18,13,-23,33,17,-24,-24,-16,-19,-20,-8,8,-20,-5,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-25,51,13,-33,-12,-5,-33,-2,-25,-25,15,-10,-2,-10,5,4,-23,-38,-18,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00729;
//
ID   CATHELICIDINS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00947;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cathelicidins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8708868; R2=0.0137254; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1097; N_SCORE=19.918; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-28,-6,5,-24,-19,-12,-20,0,-22,-14,-7,26,2,2,1,5,-20,-28,-19,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-37,-8,4,-29,-20,-16,-20,-4,-26,-16,-16,66,-2,-13,-10,-10,-28,-28,-25,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-26,-4,5,-25,-19,-8,-17,6,-17,-8,-2,7,12,1,-1,3,-19,-26,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,9,-29,17,5,-26,-6,-8,-21,-7,-16,-8,-2,6,-4,-13,-6,-10,-20,-30,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,30,-23,41,11,-31,-9,-5,-28,-4,-25,-23,14,-12,-3,-11,7,-3,-18,-38,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-26,-2,18,-19,-3,-11,-18,-7,-5,-9,-8,-12,-1,-11,-6,-11,-17,-25,-17,9;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-27,49,13,-33,-9,6,-34,3,-30,-25,29,-13,1,-4,1,-8,-29,-38,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-31,-8,0,-26,-16,-16,-19,-8,-26,-17,-12,53,-5,-12,1,-3,-23,-31,-25,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-29,22,2,-28,11,-6,-34,3,-28,-20,10,-15,-5,-5,-3,-12,-27,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='T'; M=8,-4,-12,-11,-9,-13,-14,-18,-8,-12,-12,-10,0,-11,-8,-13,20,32,0,-30,-13,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-12,-24,7,-26,-16,-12,44,-2,18,-10,-10,-26,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-30,-7,3,-25,-24,-12,-14,32,-20,-4,-4,-12,8,17,-11,-10,-11,-20,-8,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-36,-9,0,-28,-18,-18,-21,-8,-29,-19,-16,74,-8,-14,-5,-7,-27,-31,-28,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-29,-27,1,-30,-28,26,-21,17,11,-29,-29,-27,-20,-12,1,40,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-14,3,0,-20,-2,-5,-21,-4,-29,-19,18,-13,1,0,29,13,-15,-38,-19,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-20,-10,-5,-15,-20,-10,-20,10,-15,-10,0,-15,0,30,5,20,-10,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-12,-22,-21,-4,-28,-27,23,-17,6,6,-26,-27,-25,-18,-9,-1,41,-30,-11,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-36,-15,-8,-24,-14,-22,-9,-15,-21,-13,-17,55,-13,-22,-9,-10,-18,-27,-24,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-13,-28,-15,-5,-2,-22,-5,-24,21,-15,-8,-4,-21,1,49,-12,-10,-16,-14,-3,-5;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-13,-12,-9,-12,-18,-19,-10,-8,-11,-8,-3,-4,-9,-9,14,36,-2,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-17,-13,-5,-9,-21,-17,0,-14,0,-3,-6,-14,-8,-14,7,18,1,-29,-10,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,2,-33,7,10,-31,-18,0,-25,6,-23,-11,-2,-5,27,9,-6,-12,-29,-7,-10,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,12,-32,-20,4,-25,21,-21,-5,0,-13,37,32,-5,-10,-25,-20,-10,23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-27,-9,0,-22,-17,-12,-13,-10,-14,-9,-11,26,4,-12,0,-3,-18,-29,-19,0;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-37,-12,-2,-27,-19,-20,-17,-11,-25,-17,-20,76,-10,-20,-9,-9,-26,-29,-28,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-30,14,44,-30,-3,-3,-32,4,-22,-19,0,-4,14,-3,0,-12,-30,-28,-22,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,12,-27,12,18,-32,-16,6,-21,4,-18,-8,12,-12,32,3,0,-8,-27,-27,-14,25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=0,33,-24,44,11,-34,-7,-6,-31,-3,-24,-24,11,-10,-3,-13,3,-7,-21,-34,-20,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,39,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,55,-30,-20,-1,-30,14,-21,-19,0,-1,19,3,-1,-10,-29,-29,-19,37;
MA   /M: SY='N'; M=-11,28,-26,25,4,-30,7,1,-30,-1,-29,-20,29,-16,3,-4,3,-8,-30,-33,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-22,-18,-4,-2,-27,-15,6,-15,25,8,-21,-23,-10,-7,-20,-9,3,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-15,-21,-12,-4,-28,-23,17,-16,10,6,-24,-24,-19,-16,-11,-3,30,-29,-11,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-10,-31,-11,6,-24,-24,-3,-10,7,-13,-2,-6,-15,24,17,-9,-11,-16,-12,-7,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-16,-24,-18,-5,-26,-19,14,-8,4,11,-21,-25,-16,-1,-11,-4,27,-27,-9,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-13,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,35,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-13,-32,-30,15,-30,-28,25,-22,10,9,-28,-30,-31,-20,-12,-2,40,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-11,-15,-15,-8,-22,-22,1,-13,-5,-5,-6,-14,-14,-13,13,36,11,-30,-10,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-24,-14,1,-27,-14,5,-12,29,11,-21,-27,-11,7,-24,-10,1,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-17,27,-27,29,5,-22,-11,5,-27,4,-25,-20,24,-17,1,8,-1,-7,-26,-28,-6,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00729;
//
ID   RIBOSOMAL_S7E_MP; MATRIX.
AC   MP00948;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S7e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6056213; R2=0.0137334; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1192; N_SCORE=20.966; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-25,-27,-22,48,-29,10,-4,-20,2,0,-16,-29,-22,-14,-19,-11,-8,13,49,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-26,-18,-29,-24,13,-30,-19,19,-19,7,7,-23,-27,-20,-17,-13,-5,25,-14,8,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-14,-23,1,-27,-17,-14,59,-4,6,-10,-10,-27,-27,-24,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-12,-20,-13,-2,-15,-17,-9,-4,-11,5,2,-10,-18,10,-9,-2,-3,-8,-24,-9,4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-24,-21,-10,-4,-26,-11,1,-8,22,9,-18,-25,-2,9,-21,-10,-3,-20,-4,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-26,-2,8,-29,-16,-8,-26,34,-27,-10,0,-10,13,19,-2,-6,-18,-22,-12,11;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,-14,-15,-12,-20,11,-19,-14,-13,-16,-12,-6,-14,-12,-18,11,0,-3,-25,-21,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-30,-3,4,-24,-20,55,-28,5,-20,-3,5,-18,19,22,-8,-15,-27,-25,6,7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-10,-36,-30,-2,-36,-30,36,-27,13,13,-23,-25,-24,-27,-16,-7,33,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,12,-32,-20,46,-24,2,-20,0,4,-14,40,6,-4,-14,-30,-24,2,24;
MA   /M: SY='P'; M=0,-14,-23,-15,-8,-17,-20,-17,-2,-12,-8,-5,-12,9,-4,-15,0,6,-4,-27,-15,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-28,-13,-3,-20,-20,-8,-18,22,-16,-7,-3,-17,4,40,-9,-9,-12,-20,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,14,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,20,30,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-17,-4,-2,-24,5,-11,-21,-9,-27,-17,3,-1,1,-11,24,8,-15,-33,-21,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-8,14,-30,23,-4,-34,37,-12,-40,-12,-30,-24,8,-16,-12,-16,0,-16,-30,-28,-26,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-29,-4,4,-24,-18,-3,-29,35,-25,-11,5,-16,9,49,-8,-9,-21,-22,-11,4;
MA   /M: SY='H'; M=-19,16,-30,23,13,-27,-17,59,-33,-5,-23,-11,12,-15,8,-3,-6,-16,-30,-33,4,8;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-38,-29,43,-32,-24,18,-29,17,8,-22,-28,-32,-22,-20,-9,14,-5,15,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-22,3,20,-25,-18,-6,-21,7,-20,-13,1,-7,14,1,9,11,-18,-28,-14,17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,27,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-14,-23,1,-27,-17,-14,59,-4,6,-10,-10,-27,-27,-24,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-33,-4,6,-29,-20,-12,-27,30,-29,-13,-6,17,4,21,-10,-10,-23,-23,-16,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-22,-3,3,-26,-8,-10,-24,16,-25,-12,2,-11,8,8,7,6,-16,-26,-14,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00730;
//
ID   AUTOINDUCER_SYNTH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00949;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Autoinducers synthetase family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5744963; R2=0.0135923; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=674; N_SCORE=13.726; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-3,10,-21,13,0,-23,-3,-9,-23,-7,-21,-18,8,-9,-5,-8,11,5,-17,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-21,-14,14,-18,-1,-7,-8,1,3,-14,-24,-8,-1,-16,-11,-10,-3,19,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-23,2,9,-15,-9,-3,-16,-5,-12,-11,8,-15,2,-7,2,0,-18,-25,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-25,-2,8,-20,-10,-1,-16,-4,-9,-8,-2,-14,4,-2,-3,-6,-16,-26,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-24,-14,2,-26,-11,11,-17,19,18,-20,-15,-12,-12,-18,-6,5,-21,-2,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-28,5,6,-25,-15,-8,-22,-3,-25,-16,-3,22,2,-5,4,-1,-22,-29,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-25,8,13,-23,-14,-6,-23,4,-21,-16,3,-12,5,2,1,-4,-19,-17,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-22,-1,12,-23,-10,-7,-22,7,-19,-12,3,-10,6,6,5,1,-17,-27,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-23,-14,-6,-6,-23,-12,-2,-1,4,3,-14,-20,-7,2,-14,-8,0,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-10,-22,-9,-5,-1,-21,-9,-3,-11,4,-2,-10,-20,-9,-11,-7,-4,-5,-18,4,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-24,7,8,-24,-8,-9,-21,5,-16,-13,2,-14,-1,2,-3,-8,-16,-27,-16,3;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-25,8,26,-26,-9,-4,-23,1,-18,-11,0,-7,11,-5,4,-4,-21,-28,-18,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-30,-21,5,-29,-12,21,-25,36,26,-25,-26,-15,-18,-25,-10,12,-21,1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-25,-21,-18,17,-11,11,-9,-19,0,-1,-12,-25,-16,-14,-14,-12,-11,-4,23,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-24,-4,4,-22,-16,3,-26,17,-23,-12,3,-14,6,29,3,0,-17,-26,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-30,-21,22,-28,-13,12,-25,32,14,-25,-28,-20,-18,-24,-9,5,-8,15,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=1,-2,-24,-5,0,-17,-15,18,-21,9,-19,-7,2,-15,2,3,-5,-9,-17,-18,5,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-28,-1,15,-28,-18,-4,-20,14,-18,-7,-2,-10,20,13,-3,-7,-19,-23,-12,17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-14,-23,-20,-6,-27,-24,16,-16,3,4,-18,-22,-16,-16,-2,12,27,-28,-9,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-8,-21,-9,-5,-20,-10,-15,-13,11,-20,-8,-4,-15,-4,6,3,-1,-3,-27,-14,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-30,38,21,-35,-3,-1,-35,1,-27,-23,12,-10,7,-4,0,-11,-30,-33,-20,14;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-18,12,61,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-28,-18,8,-29,-19,17,-26,46,18,-28,-29,-18,-17,-29,-10,8,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-7,7,-29,10,5,-32,28,-9,-35,-6,-28,-20,7,-14,-1,-10,0,-14,-30,-26,-24,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-5,15,-26,22,17,-31,-14,-4,-27,7,-20,-16,4,-10,11,2,-1,-7,-22,-29,-16,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-5,2,-24,0,1,-21,-15,-10,-13,-1,-20,-12,5,2,-3,-4,2,-1,-11,-31,-18,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-19,23,-25,-22,-11,-23,-23,2,-20,-5,0,-16,-25,-19,-21,-1,1,12,-35,-16,-21;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-6,-22,-9,0,-16,-19,-1,-5,-9,-11,-6,-1,-10,-3,-8,2,0,-5,-29,-9,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,22,-25,23,5,-28,-5,4,-29,3,-25,-19,19,-15,2,6,1,-7,-24,-32,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-28,5,-6,-30,39,-11,-35,-11,-28,-20,9,-17,-8,-14,2,-14,-29,-25,-25,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-20,-10,-26,-16,6,-21,-10,1,-14,9,19,-19,-24,-9,-13,-19,-12,-3,-8,3,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-17,-24,-21,-12,14,-20,-13,-12,-8,-10,-7,-9,-21,-9,4,-4,-2,-10,-1,4,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-28,6,28,-32,-14,1,-25,7,-21,-11,1,-7,31,6,3,-5,-27,-26,-15,29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,10,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,67,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-21,11,3,-21,-8,3,-21,-1,-21,-15,21,-15,-1,0,5,3,-18,-33,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-3,-26,1,7,-18,-16,-12,-17,-8,-13,-13,-6,12,-4,-11,-2,-5,-17,-28,-17,0;
MA   /M: SY='N'; M=-8,16,-25,16,10,-28,-4,15,-28,0,-25,-15,17,-13,9,-3,4,-7,-26,-32,-13,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=12,-8,-17,-13,-8,-18,-14,-20,-12,-10,-15,-12,-8,14,-10,-15,10,21,-7,-27,-18,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-20,-8,-3,-13,-20,4,-14,0,-13,-7,-1,-17,-2,11,1,8,-6,-25,-3,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-31,-21,-21,29,-29,16,-1,-11,-1,-1,-21,-30,-11,-11,-21,-11,-11,39,76,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-22,-33,-25,4,-32,-23,32,-27,31,22,-26,-26,-20,-22,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-30,-23,17,-30,-17,18,-25,30,13,-28,-30,-23,-19,-23,-8,16,-13,11,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-19,-19,-16,-20,17,-21,-12,-16,-13,-9,-7,-15,-15,-21,4,-5,-6,-21,-20,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-14,-11,-19,-9,-7,-26,-15,1,-8,-4,2,-11,-19,-5,-5,-6,-1,3,-24,-7,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,10,-21,13,8,-17,-16,-4,-22,-1,-20,-16,5,-15,1,-6,0,-4,-20,-18,-4,4;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-28,24,24,-31,-6,-4,-31,2,-25,-21,7,-3,6,-3,2,-9,-27,-31,-21,15;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-24,13,5,-27,6,-1,-27,-5,-25,-17,15,-13,3,-7,8,-2,-24,-31,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-3,-28,-2,1,-28,10,-5,-27,-2,-23,-13,-1,-9,5,0,-1,-9,-23,-24,-18,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00731;
//
ID   BACTERIAL_OPSIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00950;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial rhodopsins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6651511; R2=0.0131788; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=497; N_SCORE=11.205; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-6,-11,-24,25,-17,-23,-14,-19,-11,-5,-10,-13,-17,-1,-8,-16,-24,-22,-12;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-16,-13,-18,-15,2,-18,-16,16,-13,5,5,-14,-5,-14,-13,-8,-4,15,-13,-3,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=0,-15,-22,-20,-16,-7,-11,-21,-6,-15,-11,-9,-12,-16,-13,-16,0,7,-4,12,-3,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-17,-20,-19,-15,-7,-27,4,13,-17,2,7,-12,-20,-12,-15,-9,-4,15,-25,0,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=5,-2,-21,-2,8,-21,-15,-10,-11,-5,-10,-8,-5,-4,5,-10,1,1,-10,-24,-14,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-14,-24,-20,1,-25,-23,13,-20,13,5,-19,-22,-20,-18,-5,9,18,-25,-6,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=11,1,-19,-5,-6,-22,21,-12,-23,-10,-21,-15,7,-14,-9,-13,8,-3,-17,-24,-21,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-26,6,-3,-27,34,-14,-30,-12,-23,-18,1,-15,-11,-14,-1,-14,-22,-24,-23,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-20,2,11,-21,-7,0,-21,-1,-18,-13,5,-9,6,-1,8,5,-17,-26,-14,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-15,-7,-3,-9,-12,-2,-7,1,-6,-3,-7,6,-3,8,-6,-5,-6,-13,-7,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-18,-7,-1,-16,-20,-14,-8,-9,-4,-5,-7,-10,1,-10,3,13,-5,-26,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-16,-26,-23,-2,-27,-25,23,-21,10,8,-20,-23,-21,-20,-5,3,28,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-23,-27,-21,27,-28,-8,5,-17,3,5,-21,-19,-17,-14,-16,-8,4,0,25,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-23,-30,-24,-21,-1,2,-19,-14,-16,-10,-10,-21,-22,-16,-16,-19,-17,-15,51,8,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=7,-14,-18,-17,-15,-8,12,-17,-11,-16,-4,-6,-11,-11,-16,-17,-5,-9,-6,-16,-14,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-20,-31,-24,1,-30,-25,29,-25,21,13,-22,-24,-20,-23,-15,-3,24,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-26,52,13,-33,-12,-4,-33,-2,-26,-26,16,-10,-2,-10,4,3,-23,-38,-18,6;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=2,-23,-17,-26,-19,0,-25,-22,15,-23,25,10,-22,-23,-18,-19,-14,1,13,-22,-6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-17,-32,-25,22,-30,-23,19,-27,30,13,-28,-30,-27,-20,-22,-7,19,-17,3,-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-10,-13,-13,-8,-22,-22,-4,-12,-7,-7,-5,-13,-13,-12,15,42,8,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,7,-29,-16,22,-26,41,29,-27,-27,-16,-19,-27,-10,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-24,-28,-19,1,-31,-19,25,-25,29,16,-19,-24,-13,-20,-22,-9,12,-21,-2,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,4,-31,-26,27,-25,28,15,-29,-29,-25,-21,-20,-5,31,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-13,-25,-22,1,-8,-17,-1,-24,13,2,-22,-29,-20,-19,-20,-13,-2,-6,3,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-4,-23,-3,4,8,-18,-6,-15,-9,-9,-11,-8,-16,-9,-12,-6,-8,-13,-10,8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-32,-24,19,-31,-22,20,-29,36,15,-28,-29,-25,-21,-25,-9,15,-17,3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=7,-12,-13,-16,-19,-17,30,-14,-26,-17,-20,-14,-7,-21,-17,-19,-2,-13,-18,-14,-10,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-24,-29,-21,14,-28,-11,13,-23,32,16,-28,-29,-16,-17,-28,-12,3,4,19,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-25,-20,-28,-20,3,-26,-21,20,-26,32,14,-22,-25,-18,-21,-21,-8,12,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=40,-13,-12,-22,-12,-15,-5,-20,-5,-13,0,-5,-13,-13,-12,-20,4,-2,2,-20,-17,-12;
MA   /M: SY='G'; M=4,-4,-27,-3,-6,-28,35,-15,-33,-7,-25,-18,0,-16,-10,-8,0,-14,-24,-22,-24,-9;
MA   /M: SY='A'; M=25,-15,-13,-20,-13,-14,-11,-21,-1,-13,-5,-6,-14,-8,-14,-19,5,4,8,-25,-17,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-3,21,-11,26,4,-29,-1,-7,-30,-7,-28,-23,13,-14,-5,-12,12,-1,-21,-38,-21,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-23,-12,-7,-17,-12,-3,-18,4,-15,-9,-1,-16,-1,20,1,5,-11,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='R'; M=3,0,-20,-6,-1,-19,-11,-7,-18,6,-18,-12,7,-16,0,17,5,1,-12,-27,-15,-2;
MA   /M: SY='T'; M=3,1,-17,1,-2,-19,-15,-6,-13,-5,-15,-11,-1,-13,-6,-9,8,9,-3,-31,-12,-4;
MA   /M: SY='I'; M=2,-20,-20,-27,-20,1,-25,-23,17,-23,13,7,-16,-19,-17,-21,-7,2,12,-21,-4,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00291;
//
ID   ER_LUMEN_RECEPTOR_1_MP; MATRIX.
AC   MP00951;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ER lumen protein retaining receptor signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4393024; R2=0.0128796; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1114; N_SCORE=18.777; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-37,-28,0,-35,-25,43,-25,19,25,-21,-21,-18,-25,-19,-9,29,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-28,-25,-33,-25,21,-33,-15,23,-25,20,12,-23,-27,-21,-21,-22,-9,13,-5,22,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-37,-28,11,-36,-27,36,-29,24,17,-23,-24,-23,-26,-21,-9,25,-18,2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,10,-33,-23,28,-30,39,19,-27,-27,-21,-23,-27,-10,16,-19,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-16,-21,-19,-12,-5,-25,11,3,-17,17,15,-14,-23,-4,-11,-15,-5,-1,-24,2,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-27,1,7,-27,-16,-7,-28,37,-29,-12,7,-12,8,28,-4,-6,-20,-24,-12,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-38,-28,1,-36,-25,43,-28,24,25,-21,-21,-18,-26,-21,-10,25,-20,0,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-18,-35,-20,-12,-7,-23,-11,-15,5,-17,-9,-16,-20,-6,-1,-19,-12,-16,40,12,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-22,-4,2,-22,-17,-12,-23,23,-23,-11,1,-11,3,16,4,9,-13,-25,-12,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-14,-5,-4,-16,-9,-2,-14,-11,-21,-13,6,-12,-2,-10,26,20,-7,-35,-12,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-29,-2,6,-26,-18,-5,-29,39,-26,-11,5,-14,9,42,-8,-9,-21,-22,-11,6;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-14,1,-3,-14,-5,-4,-17,-8,-25,-17,17,-14,-2,-8,25,16,-13,-32,-9,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-22,94,-31,-30,-16,-31,-30,-17,-29,-13,-13,-21,-37,-29,-29,-11,-9,-1,-45,-25,-30;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,-19,-8,0,-19,-13,-16,-3,-11,-10,-8,-5,-11,-5,-17,6,-1,-2,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-21,-9,29,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-6,-25,-22,0,0,-21,-7,-26,11,0,-18,-27,-23,-21,-16,-12,-5,-21,-10,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-11,-7,-5,-15,-9,-12,-12,-10,-18,-7,3,-11,-3,-10,27,26,-5,-35,-15,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-38,-20,21,-21,8,-20,0,1,-11,54,9,-1,-11,-30,-21,-6,35;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-23,-18,-3,-5,-29,-18,13,-18,16,7,-17,-18,-10,-17,-14,-3,8,-24,-7,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,59,-30,-3,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,51,-26;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-13,-24,-15,-1,-12,-20,-2,-17,7,-2,-15,-17,-16,-19,-2,1,2,-18,-9,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,29,-29,38,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,19,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-25,-37,-28,64,-29,-15,-2,-26,5,-2,-22,-30,-33,-18,-22,-12,-5,28,38,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-16,-27,-23,0,-29,-25,21,-21,15,9,-20,-23,-21,-19,-8,9,24,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,6,-14,-12,-13,-19,-21,-12,-12,-11,-11,-4,-14,-12,-14,15,36,-1,-31,-14,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-18,-17,-15,6,-20,-16,-10,-14,-10,-10,-8,-17,-14,-12,6,24,-6,2,8,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-10,13,-21,9,-1,-20,-13,6,-19,3,-21,-13,18,-17,-2,6,3,1,-14,-33,-12,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-28,-29,-32,-26,48,-28,-6,-4,-20,1,-4,-24,-30,-25,-16,-24,-14,-9,44,49,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-22,-27,-22,2,-31,-21,22,-13,6,8,-19,-23,-18,-15,-12,-2,22,-17,5,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-22,23,-29,-20,16,-29,38,15,-27,-29,-24,-20,-26,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,33,-21,15,-2,-14,-4,11,-18,-1,-26,-18,50,-21,-1,-1,6,-1,-28,-32,-8,-2;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-12,-16,-13,7,-18,-19,-9,-14,-8,-9,-4,-14,-15,-13,13,30,-1,-22,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-10,-26,-21,-3,-26,-24,17,-22,12,6,-19,-23,-20,-20,-7,4,20,-27,-8,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00732;
//
ID   ER_LUMEN_RECEPTOR_2_MP; MATRIX.
AC   MP00952;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ER lumen protein retaining receptor signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4402084; R2=0.0128126; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=910; N_SCORE=16.090; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,5,25,-12,-23,28,-22,0,-15,-10,-3,-12,10,-3,-8,-12,-25,-14,15,15;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,30,37,-33,-17,-2,-33,16,-25,-21,6,-5,12,4,-2,-10,-28,-31,-18,25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,65,-30,-8,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,45,-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-14,-14,-12,-11,-19,-19,0,-14,-9,-6,-2,-12,-9,-14,17,28,4,-31,-11,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-28,-32,-22,27,-30,-23,9,-25,2,1,-20,5,-26,-23,-17,-10,1,-9,5,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-12,-19,-18,-11,-7,-23,-13,0,-2,8,14,-12,-18,-6,-4,-9,8,1,-23,-5,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,21,-30,-23,-3,-26,-14,5,-21,16,26,-23,-29,-14,-19,-20,-10,4,-29,-9,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,43,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-18,-35,-27,42,-30,-22,12,-28,22,8,-25,-30,-32,-20,-21,-8,14,-8,12,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,35,40,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-20,-3,4,-24,-10,-3,-23,6,-25,-13,5,-13,16,18,17,5,-17,-30,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-24,-4,3,-23,-14,-6,-27,24,-26,-13,3,-14,7,36,5,-1,-17,-26,-13,3;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-30,-10,-16,-28,50,-16,-38,-9,-28,-18,0,-20,-13,0,-2,-18,-28,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,23,-26,20,34,-26,-11,4,-26,6,-24,-20,26,-9,11,0,4,-6,-30,-34,-20,22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-20,-14,-27,-20,-10,-18,-25,15,-17,2,2,-18,-18,-18,-22,-2,-2,21,-23,-13,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='N'; M=-2,20,-15,8,-2,-18,-4,-2,-18,-5,-26,-18,33,-15,-2,-5,20,16,-18,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,12,-13,-1,-7,-13,-14,-11,-13,-7,-16,-13,18,-13,-7,-7,17,35,-9,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='S'; M=14,-4,-14,-9,-9,-20,10,-17,-19,-12,-20,-15,1,-12,-9,-14,19,15,-9,-29,-20,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00732;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F25_MP; MATRIX.
AC   MP00953;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 25 active sites signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4056396; R2=0.0161426; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=643; N_SCORE=15.775; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-18,8,24,-24,-8,-6,-24,-2,-26,-20,6,-6,8,-6,24,8,-18,-36,-20,16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-22,-24,-28,-18,39,-26,-12,-12,-6,-2,-4,-12,-26,-20,17,-16,-10,-8,-2,14,-18;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-10,-16,-10,-16,-8,-20,-10,-10,-10,-10,-6,-10,-10,-16,14,20,0,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-36,-26,0,-33,-19,39,-23,20,34,-20,-20,-13,-23,-20,-10,23,-20,0,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,1,-30,5,17,-26,3,33,-33,-5,-23,-12,4,-13,6,-5,-4,-16,-30,-27,-7,9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-20,-33,-21,-19,-19,5,-24,-1,-21,-11,-5,-13,9,-17,-24,-10,-14,-7,-23,-19,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-16,-25,-20,-10,-14,-17,-8,-5,-1,-5,16,-14,7,-2,4,-11,-8,-7,-22,-12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=6,2,-15,-1,-11,-15,-14,-14,-1,-10,-9,-7,2,-20,-14,-14,0,-2,9,-31,-16,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-4,-18,-7,-2,-18,-13,-9,-14,9,-18,0,0,-12,2,3,10,8,-8,-28,-12,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-22,-2,-2,-12,-16,-3,-18,11,-21,-11,8,-15,-1,5,4,7,-15,-19,3,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-20,5,-3,-20,-2,-5,-21,3,-24,-15,26,-15,-3,0,9,11,-19,-32,-16,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-5,-20,-4,-12,-10,-24,-16,7,-15,5,5,-11,-20,-14,-16,-8,1,10,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-28,-10,-1,-12,-24,12,-11,4,-2,3,-9,-19,11,3,-14,-11,-15,-14,10,3;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-15,-28,-17,-22,-3,45,-20,-30,-22,-20,-15,-5,-22,-25,-20,-5,-18,-23,-13,-15,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-37,-30,10,-36,-29,38,-27,16,14,-23,-24,-26,-26,-17,-7,33,-19,1,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-12,-7,-4,-15,-3,-9,-16,-10,-22,-16,2,-12,-3,-12,27,12,-8,-28,-9,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-16,-3,-4,-17,-9,2,-15,-4,-22,-12,9,-17,-2,2,17,6,-7,-35,-13,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-21,-37,-21,-19,4,-13,17,-19,-15,-16,-10,-18,-26,-10,-12,-23,-21,-25,55,35,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,7,-28,3,17,-37,-17,10,-20,8,-22,-3,10,-12,50,8,2,-8,-30,-23,-12,33;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-33,-6,-3,-30,33,-17,-33,-13,-29,-20,-5,13,-12,-17,-3,-16,-30,-24,-29,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-10,1,0,-12,-3,-2,-13,1,-17,-11,11,-9,1,7,13,5,-10,-21,-11,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-33,-28,7,-35,-18,33,-23,13,13,-22,-25,-20,-23,-18,-8,25,-10,18,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,52,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,34,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-32,-30,-39,-29,33,-30,-25,11,-28,11,3,-26,-28,-27,-22,-26,-15,2,32,18,-26;
MA   /M: SY='S'; M=11,2,-17,-5,0,-23,-9,-9,-17,2,-20,-11,6,-11,5,-3,13,9,-12,-27,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=12,-8,-20,-10,-10,-24,23,-15,-26,-8,-23,-16,0,-15,-9,-5,10,-4,-16,-25,-22,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-18,-30,-26,2,-29,-21,26,-20,9,9,-24,-25,-22,-21,-12,-4,30,-17,5,-26;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-30,1,16,-20,-21,14,-26,21,-21,-10,-1,-13,10,19,-9,-11,-23,-18,3,11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-24,16,19,-30,-11,-1,-26,9,-26,-17,13,-9,15,3,9,-2,-24,-32,-17,17;
MA   /M: SY='A'; M=19,-1,-16,-8,0,-18,-6,-9,-10,-6,-11,-2,2,-12,-2,-12,7,-1,-8,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=10,-16,-17,-25,-19,-8,-21,-22,14,-17,3,7,-13,-16,-14,-19,-1,9,15,-24,-9,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-20,0,12,-20,-15,-7,-23,5,-20,-15,2,-10,5,14,12,12,-15,-30,-15,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-13,-18,-23,-23,36,-23,-15,2,-20,0,-3,-3,-28,-28,-15,-10,-5,5,-12,8,-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-10,-21,-17,-10,-16,-24,5,-14,-3,-3,-15,-17,-17,-18,5,12,18,-26,-14,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-27,-29,-33,-27,22,-35,-12,26,-23,12,10,-20,-25,-19,-22,-20,-10,12,1,31,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=27,-18,-15,-26,-16,-11,-14,-22,8,-17,6,1,-16,-16,-15,-22,-3,-3,11,-21,-13,-16;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-8,-15,-28,53,-18,-35,-18,-30,-20,2,-18,-15,-18,10,-10,-25,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-17,0,0,-13,-21,-16,-8,-9,-5,-8,-5,-14,-8,-11,5,20,0,-30,-12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-6,9,-19,7,-1,-15,-14,-5,-19,1,-20,-15,8,-14,-3,-3,10,14,-14,-25,-2,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-24,-21,34,-30,9,3,-16,8,3,-21,-30,-15,-13,-21,-10,-6,20,62,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-17,-18,-14,-7,-25,-21,4,-4,6,3,-16,-21,-14,-6,-8,7,12,-25,-8,-14;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,44,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,41,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-30,0,2,-27,-14,-13,-23,-3,-29,-19,-6,40,-4,-3,3,-3,-24,-32,-24,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-13,12,-17,-14,-5,-23,-5,-18,-5,-15,-11,-9,-25,-9,5,-3,0,-11,-17,9,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-23,-21,-28,-22,27,-11,-16,-2,-24,10,1,-18,-26,-25,-19,-15,-10,-3,-4,12,-22;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-19,-1,2,-24,-8,-11,-22,5,-30,-18,3,5,1,-2,20,8,-15,-34,-19,1;
MA   /M: SY='A'; M=14,0,-18,-1,1,-25,-7,-8,-20,-1,-20,-13,1,-11,6,1,13,2,-13,-28,-17,3;
MA   /M: SY='N'; M=-13,10,-25,2,4,-17,-14,5,-19,5,-21,-9,20,-17,19,12,0,-6,-25,-24,-9,12;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-28,-31,-28,-25,17,-27,-7,2,-15,-3,-3,-28,-30,-18,-15,-23,-13,-1,50,43,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-22,11,14,-26,-15,-4,-23,7,-22,-14,10,-10,11,1,8,8,-20,-30,-15,12;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-5,-25,-9,-4,-23,4,-7,-19,-4,-12,-7,0,-17,7,2,-3,-10,-19,-22,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,-14,-11,-5,-21,-3,-16,-15,-10,-21,-15,-4,5,-6,-16,19,6,-8,-29,-21,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-24,-4,-5,-17,-4,-6,-23,10,-22,-12,8,-16,-2,11,0,3,-18,-21,-6,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-1,-24,-4,3,-18,-15,-11,-13,-8,-12,-12,2,11,-5,-12,-1,1,-16,-29,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-19,-12,-4,-15,-16,-16,1,-11,-7,-5,0,-13,-7,-15,3,4,-1,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-10,-17,-25,46,-20,-32,-17,-25,-17,0,-17,-17,-17,5,-1,-22,-23,-25,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00737;
//
ID   IGP_DEHYDRATASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP00954;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7049823; R2=0.0142106; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=766; N_SCORE=15.580; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,-2,-16,-21,91,-28,-10,-18,0,7,-21,8,-1,-11,-19,-28,-22,25,-2;
MA   /M: SY='G'; M=11,-8,-19,-10,-12,-23,29,-15,-24,-14,-23,-12,0,-15,-10,-16,13,-3,-15,-26,-23,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-11,-20,-13,-13,-15,13,-12,-17,-13,-5,-6,-4,-22,-11,-7,-8,-11,-15,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-26,-35,-26,28,-28,-22,13,-26,10,7,-21,-25,-24,-21,-18,-9,6,11,12,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,34,8,-30,-7,-5,-30,-2,-26,-23,13,-12,-1,-4,9,3,-21,-36,-18,4;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-19,-30,-21,5,-27,-18,20,-25,37,23,-26,-26,-17,-19,-24,-9,13,-21,-2,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,3,6,-20,-17,-4,-15,3,-17,-10,5,-13,3,0,2,1,-13,-28,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,33,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,34,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-25,2,10,-21,-16,-3,-19,8,-19,-12,5,-12,6,8,1,-3,-17,-23,-11,7;
MA   /M: SY='C'; M=19,-15,26,-23,-19,-17,-11,-24,-11,-18,-10,-10,-14,-22,-19,-22,2,-1,2,-31,-21,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-23,0,5,-21,-20,-6,-15,10,-16,-8,-2,-13,3,6,-1,1,-9,-27,-11,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-4,-17,-31,64,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,46,-30,64,19,-39,-11,0,-39,3,-30,-29,19,-10,1,-5,-1,-10,-29,-39,-19,10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-19,-27,-19,3,-29,-21,19,-24,31,15,-23,-25,-16,-18,-19,-1,13,-22,-3,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-15,2,-28,5,11,-17,-18,35,-25,-4,-19,-9,3,-12,7,-4,-7,-14,-26,-20,6,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-35,-29,2,-36,-26,40,-25,16,17,-23,-24,-22,-25,-17,-7,32,-19,3,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,48,-30,68,22,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,25,-22,35,12,-31,-9,-6,-30,-4,-24,-22,8,-6,-3,-12,1,-7,-21,-34,-20,4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-12,-14,-12,-8,-21,-20,-2,-14,-4,-5,-5,-14,-12,-13,13,35,5,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-14,-24,-22,-5,-25,-25,18,-18,3,4,-16,-22,-21,-19,-2,8,27,-28,-10,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,68,20,-40,-10,2,-40,0,-30,-29,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-19,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,3,-24,-22,-6,-27,-26,10,-19,1,0,-16,-23,-21,-19,0,15,20,-31,-11,-22;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-17,-15,-16,-26,38,-20,-28,-16,-22,-16,-5,-17,-16,-20,4,-12,-17,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-2,-21,-17,-12,-15,-23,0,-15,-4,-5,-14,-18,-17,-18,5,9,13,-27,-15,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,10,-31,-21,24,-29,42,20,-28,-28,-21,-21,-27,-10,14,-19,1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-26,-3,13,-26,-20,-2,-14,5,-11,-1,-4,-12,25,2,-3,-4,-18,-22,-9,19;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,3,-21,-13,-17,-5,-21,-10,-14,-7,-9,-12,-15,-13,-21,5,1,-1,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-35,-25,24,-32,-23,23,-29,30,14,-25,-28,-26,-22,-24,-9,16,-14,6,-25;
MA   /M: SY='K'; M=2,-4,-22,-6,-1,-20,-12,-8,-18,11,-14,-8,-1,-15,-1,8,-2,-5,-12,-24,-11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-28,7,27,-30,-20,-2,-24,17,-21,-11,0,-8,23,10,-2,-6,-23,-25,-14,25;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-12,-21,-11,-18,-3,-19,-6,-11,-6,-5,-11,-12,-9,-19,6,-1,2,-21,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-21,8,-30,-21,23,-28,41,19,-28,-28,-20,-20,-26,-9,15,-20,-1,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-7,-15,-27,52,-16,-35,-13,-27,-18,0,-18,-15,-15,-1,-17,-27,-19,-23,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,34,-27,43,16,-32,-10,0,-32,-1,-27,-24,19,-8,2,-8,3,-4,-27,-36,-18,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-28,-7,3,-22,-19,-10,-22,32,-21,-6,-4,-13,6,26,-10,-9,-14,-20,-9,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-24,-8,2,-22,-16,-9,-21,20,-17,-8,-3,-14,5,22,-5,-6,-14,-20,-12,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-28,-8,-17,-29,60,-15,-38,-18,-30,-19,3,-19,-17,-18,3,-16,-28,-22,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-29,6,-38,-29,43,-29,20,18,-22,-22,-22,-28,-20,-9,29,-19,1,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-10,-27,-13,-3,5,-23,-13,-20,25,-17,-7,-6,-16,-6,14,-13,-10,-14,-10,3,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00738;
//
ID   IGP_DEHYDRATASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00955;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5397668; R2=0.0156718; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=450; N_SCORE=12.582; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-3,-12,-18,-10,-27,-18,8,-10,-2,-10,37,25,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-35,-26,36,-31,-22,15,-29,28,11,-25,-29,-29,-21,-23,-9,12,-9,11,-26;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,4,-19,-14,-16,-9,-21,-7,-14,-11,-9,-11,-17,-14,-19,10,4,6,-29,-19,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,0,-21,-5,-7,0,-16,-3,-8,-9,-7,-4,3,-21,-7,-6,-3,-3,-9,-20,2,-7;
MA   /M: SY='N'; M=2,11,-20,2,1,-20,-5,15,-20,-4,-21,-12,20,-15,1,-5,6,-1,-20,-30,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=28,-11,-13,-18,-11,-14,-3,-16,-7,-13,-5,-2,-9,-14,-9,-17,8,1,-1,-24,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-28,-9,-7,-24,17,-5,-28,2,-20,-9,0,-18,-2,8,-4,-13,-22,-21,-17,-5;
MA   /M: SY='I'; M=1,-24,-6,-30,-23,-3,-26,-21,19,-22,14,16,-21,-24,-17,-21,-13,-6,18,-25,-8,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,9,-9,-3,-8,-14,-14,-12,-14,-8,-16,-13,15,-13,-8,-8,17,33,-8,-33,-14,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-31,-22,7,-30,-21,23,-28,40,20,-28,-28,-19,-20,-26,-8,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,-1,-19,-20,97,-29,-10,-20,0,10,-20,9,0,-10,-19,-29,-29,21,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-18,-33,-27,5,-32,-26,30,-26,22,15,-25,-26,-23,-23,-18,-7,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-25,6,4,-19,-16,-5,-17,5,-17,-11,4,-15,0,6,-1,-5,-13,-27,-10,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-12,-1,-16,-12,-10,-21,-14,2,-12,-1,1,-10,-21,-7,-11,-5,-1,7,-26,-10,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-19,-22,-15,2,-24,-7,11,-17,20,11,-18,-20,-13,-11,-18,-8,7,-17,0,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-7,-26,-8,-4,-6,-19,6,-17,6,-13,-7,-5,-19,0,13,-8,-7,-15,-6,14,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-30,-11,-20,-29,68,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-20,-20,-20,-1,-20,-30,-16,-29,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-25,2,5,-19,-17,-6,-19,9,-18,-11,1,-14,2,10,-2,-4,-14,-23,-10,3;
MA   /M: SY='N'; M=-11,39,-21,23,2,-21,-2,8,-20,0,-29,-20,54,-19,0,-1,8,-1,-29,-39,-20,1;
MA   /M: SY='D'; M=-2,13,-21,15,4,-24,-8,-7,-22,-6,-20,-17,7,-5,-3,-10,8,5,-17,-33,-17,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-17,-25,-21,-11,-12,-28,-17,11,0,0,8,-13,-18,-5,0,-13,-8,9,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=9,-21,-16,-28,-21,-7,-23,-23,20,-20,7,7,-17,-19,-17,-22,-5,-1,20,-24,-9,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-8,-13,-8,-20,2,-17,-15,-11,-18,-14,-3,-11,-8,-17,19,8,-5,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=4,-18,1,-23,-14,-9,-20,-20,3,-19,7,3,-16,-22,-13,-19,-7,-3,5,-27,-12,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-20,-38,-28,71,-29,-16,1,-28,9,2,-19,-29,-36,-19,-19,-10,1,7,28,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-12,-17,-11,-20,5,-19,-12,-12,-13,-11,-8,-12,-11,-19,12,1,-1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-17,-34,-25,38,-30,-21,11,-28,25,9,-25,-29,-30,-20,-21,-7,11,-9,11,-25;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-19,-15,-14,-25,33,-20,-24,-15,-20,-15,-5,-15,-14,-20,6,-9,-14,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-16,-26,-17,-8,-11,-24,-8,-11,13,-6,-1,-9,-22,-1,37,-13,-9,-5,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-10,-17,-10,-18,-4,-19,-9,-10,-12,-10,-7,-11,-10,-18,14,8,1,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,7,-30,-20,24,-28,42,23,-28,-28,-19,-20,-27,-9,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-29,-2,1,-21,-13,-1,-29,23,-22,-12,2,-18,6,43,-7,-9,-20,-21,-8,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-25,-3,11,-22,-18,-3,-12,4,-10,3,-5,-12,18,0,-4,-7,-15,-22,-10,14;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-9,-20,-11,-20,2,-20,-11,-11,-11,-10,-10,-11,-11,-20,9,-1,-1,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,-9,-26,-22,-3,-29,-25,18,-20,10,6,-19,-23,-20,-19,-7,5,22,-28,-8,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-24,1,17,-23,-15,-7,-23,11,-20,-13,0,-10,8,11,4,1,-17,-26,-13,12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-25,-23,-15,-8,-28,-17,13,-10,2,5,-15,-12,-11,-5,-11,-6,10,-23,-7,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-24,31,14,-27,-12,-3,-25,-3,-21,-19,13,-12,0,-8,3,-1,-19,-35,-17,7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-30,-4,0,-24,8,-11,-25,-10,-23,-17,-5,15,-8,-14,-2,-10,-24,-26,-21,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00738;
//
ID   HYDROPHOBIN_MP; MATRIX.
AC   MP00956;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fungal hydrophobins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4251070; R2=0.0098692; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=229; N_SCORE=6.685; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=2,10,-16,4,-3,-22,12,-6,-23,-9,-30,-20,23,-15,-3,-9,24,7,-19,-37,-22,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-21,-16,-9,1,-21,-15,-3,-7,5,0,-14,0,-12,-8,-12,-1,-5,-16,-4,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-7,-32,-27,0,-31,-27,27,-25,19,12,-26,-27,-24,-23,-17,-6,28,-26,-7,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-8,9,-31,17,-5,-33,34,-13,-38,-12,-30,-23,5,-5,-12,-17,-1,-16,-30,-28,-27,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-21,-19,-14,1,-25,-17,8,-15,9,5,-16,-21,-11,-15,-13,-7,7,-19,-3,-12;
MA   /M: SY='N'; M=0,14,-17,8,-2,-18,-7,-6,-16,-8,-16,-14,19,-15,-5,-9,12,8,-14,-34,-16,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-21,48,-28,-26,-15,-16,-27,-10,-26,-7,-8,-18,-30,-25,-26,-9,-9,1,-36,-21,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-13,-7,-5,-11,-11,-11,-9,-8,-7,-7,1,-14,-5,-7,12,12,-5,-29,-11,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-25,-31,-21,-11,-11,-26,-21,4,-20,8,1,-24,30,-15,-21,-19,-10,-7,-25,-15,-16;
MA   /M: SY='I'; M=2,-20,-22,-26,-23,-9,-7,-25,13,-22,2,3,-15,-20,-20,-22,-7,-3,13,-23,-12,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,9,-4,-4,-11,-6,-9,-12,-8,-15,-11,2,-9,-4,-8,16,12,-5,-24,-12,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-15,-29,-25,-2,-28,-27,25,-21,13,9,-23,-24,-23,-21,-10,1,32,-26,-8,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-19,-24,-21,-5,-29,-21,24,-18,8,9,-15,-24,-14,-17,-11,-4,25,-27,-8,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-7,9,-30,15,-4,-34,37,-11,-38,-11,-29,-21,6,-16,-6,-14,0,-16,-30,-26,-25,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-16,-24,-20,-2,-25,-10,17,-20,13,9,-19,-23,-18,-17,-12,-3,21,-24,-4,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-22,-9,-7,-16,21,-14,-15,-14,-10,-8,-4,-14,-11,-14,-3,-9,-13,-17,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-25,-4,-14,-25,50,-12,-32,-14,-27,-18,11,-18,-14,-14,2,-14,-27,-22,-25,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-2,16,-21,11,3,-25,-5,-1,-21,-3,-28,-18,24,-2,5,-6,14,3,-23,-36,-20,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-21,-6,-2,-14,-13,-7,-14,3,-18,-8,4,-16,7,1,3,0,-11,-24,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-17,-5,-3,-22,1,-14,-22,2,-25,-15,3,-11,-3,-4,18,10,-12,-30,-18,-3;
MA   /M: SY='A'; M=14,5,-18,1,-2,-24,3,-10,-20,-7,-20,-15,7,-12,0,-11,12,3,-14,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-25,-3,7,-28,-18,0,-11,0,-17,-3,5,-12,31,0,5,1,-18,-25,-11,18;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-16,-16,-20,-17,-8,-25,-24,8,-15,-3,-2,-15,-5,-18,-17,2,20,16,-29,-12,-19;
MA   /M: SY='V'; M=11,-19,-12,-21,-18,-10,-19,-24,9,-9,-3,0,-18,-21,-18,-13,-1,1,25,-28,-13,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-26,10,17,-28,-15,-5,-24,6,-24,-15,5,2,13,-1,5,2,-23,-30,-17,14;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-26,12,3,-28,18,0,-30,-6,-27,-19,20,-16,-2,-8,3,-10,-28,-30,-21,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-18,12,-4,-19,1,-6,-16,-7,-20,-15,19,-16,-7,-8,8,3,-12,-32,-17,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-23,1,12,-24,-18,-6,-15,-1,-18,-10,3,-1,13,-4,4,4,-15,-29,-16,12;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-15,-18,-20,-10,21,-17,-9,-7,-12,-3,-2,-11,-17,-4,-9,-9,-8,-8,5,9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-17,11,-2,-16,-11,-5,-11,-6,-17,-13,21,-13,-4,-8,8,11,-12,-31,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-25,-10,-17,-26,57,-18,-33,-17,-25,-17,-1,-17,-17,-18,1,-16,-24,-18,-26,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-2,-27,-20,3,-27,-21,10,-27,30,10,-24,-29,-20,-20,-19,-6,8,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-29,10,-33,-28,33,-25,16,13,-26,-27,-27,-23,-16,-5,35,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='N'; M=2,14,-19,1,-8,-17,2,-4,-13,-8,-15,-12,26,-20,-8,-9,3,-3,-15,-31,-18,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-1,1,-27,3,-8,-28,24,-14,-24,-13,-22,-15,1,-16,-6,-16,1,-12,-20,-25,-21,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-5,85,-17,-22,-20,-22,-20,-27,-22,-23,-20,0,-35,-22,-22,-5,-7,-15,-47,-27,-22;
MA   /M: SY='T'; M=8,-3,-12,-10,-7,-15,-12,-16,-12,-6,-14,-8,0,-11,-6,-9,19,28,-3,-30,-13,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-35,-9,-4,-29,-1,-19,-24,-12,-30,-20,-14,60,-11,-19,-4,-9,-28,-29,-29,-11;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-19,-29,-19,-11,-19,-25,18,-19,4,4,-15,-15,-15,-25,-4,-5,14,-20,-11,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00739;
//
ID   NAD_G3PDH_MP; MATRIX.
AC   MP00957;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7318974; R2=0.0131299; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=558; N_SCORE=12.048; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-37,-28,57,-30,-20,9,-29,18,7,-22,-29,-34,-20,-21,-10,6,0,20,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-10,-2,-18,-20,1,-21,19,-17,-6,-1,-18,6,38,-7,-7,-15,-21,-6,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-8,-28,-23,-4,-28,-26,18,-22,10,7,-24,-16,-22,-21,-12,-2,23,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-27,-16,-17,16,-26,8,0,-11,-3,-2,-13,-26,-11,-10,-14,-7,-5,10,44,-17;
MA   /M: SY='T'; M=2,-10,-16,-13,-11,-11,-16,-8,-8,-11,-12,-8,-7,-6,-11,-11,6,12,-1,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-16,-3,-6,-16,-10,-9,-8,-10,-18,-11,14,-15,-3,-10,17,14,-6,-34,-15,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,8,-20,8,5,-21,-12,-9,-18,-5,-17,-14,7,-9,1,-7,10,11,-14,-32,-15,3;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,66,21,-39,-10,0,-39,0,-30,-29,20,-10,1,-9,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-19,-30,-25,1,-31,-24,27,-21,15,13,-24,-23,-22,-18,-14,-3,29,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-21,-24,-19,-4,-28,-20,20,-16,8,8,-17,-22,-17,-15,-12,-5,21,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-10,-19,-28,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-19,2,-14,-26,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-2,-27,-25,-4,-25,-26,18,-20,8,5,-23,-27,-25,-20,-9,-1,30,-29,-12,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-28,12,42,-32,-18,2,-26,8,-20,-14,0,-4,29,2,3,-8,-28,-27,-17,36;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-19,-33,-26,7,-33,-25,30,-26,23,17,-24,-25,-22,-23,-18,-5,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=7,-13,11,-18,-20,-21,27,-22,-30,-21,-22,-17,-7,-23,-21,-22,0,-12,-18,-26,-26,-20;
MA   /M: SY='G'; M=11,-9,-24,-11,-16,-27,48,-19,-32,-17,-26,-18,-1,-17,-16,-19,6,-12,-22,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='A'; M=36,-12,-11,-20,-12,-17,-6,-21,-4,-12,-8,-7,-10,-13,-12,-19,10,3,6,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-15,-30,-22,11,-28,-20,17,-26,32,15,-26,-28,-21,-20,-22,-7,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,21,1,-21,0,10,-21,0,-30,-20,59,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,17,14,-26,-26,-25,-23,-15,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-34,-26,14,-33,-21,28,-25,21,15,-23,-26,-22,-22,-20,-7,21,-14,9,-26;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-11,-20,-10,-20,2,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,-1,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-28,3,-36,-28,40,-28,23,18,-23,-24,-22,-26,-20,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-14,-19,-13,-19,8,-20,-13,-10,-13,-9,-8,-13,-12,-18,5,-5,-5,-20,-19,-13;
MA   /M: SY='A'; M=12,-13,9,-19,-16,-10,-12,-20,-7,-16,-11,-7,-9,-20,-16,-18,6,3,3,-30,-16,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-22,-34,-26,10,-30,-22,28,-24,18,19,-21,-23,-20,-23,-17,-8,20,-17,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-4,-18,-16,-10,-15,-21,2,-19,2,-2,-14,-22,-17,-19,-3,-2,9,-28,-14,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-24,18,5,-22,-16,-2,-17,-4,-13,-12,3,-14,-2,-8,-3,-6,-13,-29,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=13,-9,-24,-12,-16,-27,48,-19,-31,-16,-25,-17,-2,-17,-15,-19,4,-13,-22,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-23,-21,-10,-6,-24,-12,6,-6,14,14,-17,-21,-4,-4,-17,-9,1,-19,-2,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,1,-1,-26,20,-9,-28,-3,-24,-16,6,-15,-4,-7,0,-11,-24,-23,-18,-3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-23,-29,-20,21,-27,-14,7,-21,17,9,-22,-26,-16,-16,-19,-6,2,3,16,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-29,-20,0,-19,-18,-19,1,-18,-29,-20,-29,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,14,-22,17,10,-21,-14,-4,-18,-5,-15,-14,6,-12,-3,-10,-1,-6,-15,-30,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,35,-19,18,0,-20,0,7,-20,-1,-29,-20,52,-18,0,-1,13,2,-27,-39,-20,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-10,-14,-9,-16,-7,-15,-11,-10,-12,-10,-4,-10,-8,-15,15,18,-2,-25,-15,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-26,-7,4,-21,-18,-2,-20,21,-16,-5,-3,-14,8,25,-7,-8,-14,-22,-9,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=38,-8,-11,-16,-8,-20,-1,-15,-12,-10,-14,-11,-6,-10,-8,-17,14,4,-3,-24,-18,-8;
MA   /M: SY='A'; M=27,-11,-12,-19,-11,-13,-7,-17,-5,-12,-4,-1,-9,-13,-9,-17,7,5,1,-23,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-23,28,-27,35,20,-27,-27,-21,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-24,-32,-22,0,-32,-20,31,-23,22,24,-21,-22,-14,-21,-19,-7,20,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-13,-12,-10,-12,-16,-17,-10,-6,-11,-8,-3,-13,-8,-2,13,28,1,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-26,-14,-5,-14,-19,-6,-18,15,-8,-3,-6,-20,3,38,-10,-8,-12,-19,-8,-4;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-22,-12,-19,-28,54,-20,-34,-19,-27,-18,-2,-19,-19,-20,2,-15,-24,-22,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-22,16,-30,-18,20,-27,38,22,-26,-28,-20,-20,-26,-10,10,-16,4,-21;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-18,-12,-5,-16,-11,-11,-9,-2,-7,-3,-5,-15,-5,-2,-1,-3,-4,-25,-14,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-23,-33,-24,1,-29,-15,31,-20,21,37,-20,-21,-11,-19,-19,-7,18,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-21,-12,-6,-15,-18,-12,-6,-1,-10,-3,-3,-15,1,0,3,7,-4,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00740;
//
ID   TRANSALDOLASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP00958;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transaldolase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9949932; R2=0.0141362; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=397; N_SCORE=10.597; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-28,-4,0,-20,9,-4,-29,4,-23,-13,-1,-15,-2,1,-4,-13,-22,-20,-13,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-21,-31,-21,5,-26,-12,24,-20,29,37,-22,-23,-10,-16,-22,-10,13,-19,1,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-32,-26,-1,-32,-26,35,-24,15,17,-21,-22,-20,-23,-13,-5,30,-23,-4,-26; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-1,8,-24,9,15,-27,-9,-6,-26,12,-23,-15,5,-9,7,6,1,-6,-21,-26,-16,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-26,5,24,-19,-22,-4,-13,-4,1,-2,-8,-12,10,-6,-9,-10,-16,-26,-12,17;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-19,-20,-16,2,-3,-7,-10,-13,-8,-7,-13,-19,-13,-17,-3,-6,-7,-2,14,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-27,1,14,-25,-17,0,-25,19,-21,-11,3,-12,10,21,-4,-7,-20,-24,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-25,4,18,-26,-16,-5,-23,14,-20,-13,-1,-10,9,11,-1,-7,-17,-26,-15,13;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-21,-25,-15,-1,-25,-17,12,-17,20,11,-20,-22,-12,-14,-16,-7,7,-18,-2,-15;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-25,-13,-13,-15,15,-9,-22,-10,-18,-12,-3,-18,-12,-7,-2,-11,-16,-14,-12,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-15,-1,2,-16,-7,-5,-15,13,-15,-8,2,-8,4,10,-1,-4,-11,-12,-8,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=1,-14,-16,-18,-11,-2,-16,-15,11,-13,7,4,-12,-12,-9,-14,-9,-4,6,-3,-2,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-2,7,-14,10,2,-16,6,-5,-17,-3,-15,-12,6,-3,-3,-6,4,-3,-14,-18,-13,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-4,-23,-7,-4,-22,-8,1,-20,7,-19,-9,2,-16,-1,10,-4,-9,-15,-24,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,9,-31,17,16,-31,-15,-8,-28,6,-27,-20,2,19,2,-4,-2,-8,-26,-31,-21,8;
MA   /M: SY='N'; M=-14,17,-26,10,2,-23,-6,4,-26,11,-26,-16,27,-19,5,25,0,-6,-26,-30,-15,2;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-20,-34,-27,0,-32,-28,35,-25,18,15,-24,-24,-23,-24,-15,-6,32,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-8,-29,-24,8,-28,-21,16,-23,23,15,-26,-28,-22,-19,-17,-3,19,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='P'; M=9,-17,-30,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-16,58,-10,-20,-3,-6,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='A'; M=10,-15,-12,-20,-16,-11,-5,-15,0,-14,-2,8,-12,-18,-11,-16,2,-1,6,-26,-14,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-7,-10,-10,-11,-19,-20,-11,-11,-11,-11,0,-11,-10,-11,20,47,-1,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-18,-34,-17,-6,-7,-18,-19,-16,-10,-12,-13,-20,-11,-9,-13,-17,-12,-20,40,2,-6;
MA   /M: SY='E'; M=1,9,-26,16,37,-29,-14,-4,-26,4,-20,-18,0,-2,12,-5,3,-7,-23,-29,-20,24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-27,-10,-20,-30,68,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-24,-3,9,-28,-18,-7,-26,23,-23,-11,-3,-5,11,23,-6,-9,-20,-23,-14,9;
MA   /M: SY='A'; M=48,-11,-10,-20,-11,-19,-1,-20,-8,-10,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,2,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='V'; M=12,-22,-1,-29,-23,-9,-21,-26,13,-20,3,3,-19,-22,-20,-23,-6,-4,19,-26,-13,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-28,6,25,-27,-18,-3,-28,26,-25,-14,2,-8,12,18,-2,-6,-23,-26,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-20,-17,-5,-10,-21,-14,3,-9,-1,2,-13,-16,-4,-12,-4,0,4,-20,-5,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,13,-30,-21,20,-29,44,18,-29,-30,-22,-20,-28,-9,13,-19,1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,0,17,-22,-18,-8,-18,7,-17,-11,-1,-9,8,2,6,4,-14,-28,-14,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=3,1,-23,1,9,-27,-10,-9,-24,15,-23,-12,1,-10,8,6,4,-2,-17,-26,-15,8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-28,13,38,-28,-18,-1,-26,10,-18,-15,1,-6,17,2,-1,-9,-25,-28,-17,27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-28,-6,-16,-29,57,-13,-37,-17,-30,-19,6,-20,-16,-17,2,-17,-29,-23,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-29,-36,-27,0,-37,-22,41,-26,16,18,-19,-21,-18,-24,-19,-10,25,-18,4,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-5,2,-25,-1,1,-23,-14,9,-21,7,-22,-9,7,-4,3,5,0,-4,-19,-28,-11,1;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-15,35,-23,-22,-11,-27,-26,-6,-20,-8,-8,-15,-25,-22,-20,1,15,9,-37,-17,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-20,14,-2,-17,-4,6,-16,-3,-21,-16,48,-20,-2,-2,7,1,-25,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-6,-28,-25,-2,-19,-24,14,-23,15,10,-25,-28,-23,-20,-15,-6,21,-26,-10,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-19,-29,-19,6,-26,-20,16,-27,41,16,-27,-27,-19,-20,-24,-9,9,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-9,-33,-27,2,-33,-27,28,-27,24,14,-26,-28,-24,-24,-20,-7,26,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-14,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-12,1,-4,-20,4,-9,-21,-10,-27,-19,16,-13,-4,-10,28,16,-14,-37,-20,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00741;
//
ID   HISTONE_H3_2_MP; MATRIX.
AC   MP00959;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Histone H3 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5286345; R2=0.0128470; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=810; N_SCORE=14.925; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-26,-5,3,-24,-21,-10,-21,31,-22,-7,-3,-13,7,25,-6,-2,-11,-22,-10,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-26,-26,-22,33,-30,3,5,-19,15,5,-23,-30,-17,-14,-23,-10,-3,13,51,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-38,-20,17,-21,8,-20,0,1,-11,56,9,-1,-11,-30,-21,-8,37;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-2,7,-26,-18,-7,-28,42,-26,-9,0,-11,9,35,-9,-9,-18,-18,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-27,29,28,-30,-14,15,-32,0,-25,-20,10,-8,9,-5,5,-7,-27,-35,-13,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,27,19,-23,-23,-21,-27,-22,-9,26,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,3,-23,-18,9,-28,20,-21,-8,2,-18,17,48,-4,-8,-22,-23,-8,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-6,-5,4,-28,-22,-13,-30,37,-28,-12,-3,-15,4,20,-10,-10,-18,-25,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=13,-20,-16,-24,-15,-5,-17,-20,8,-21,17,5,-18,-20,-14,-20,-7,-3,6,-22,-9,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-4,-7,-6,7,-32,-15,-2,-20,0,-20,-7,-2,-13,31,-2,6,-4,-20,-26,-15,19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-28,-11,-1,-20,-18,-2,-28,26,-19,-10,-1,-19,8,61,-8,-9,-18,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=10,-26,-10,-28,-26,-4,-24,-28,22,-18,6,6,-26,-26,-26,-20,-6,0,40,-28,-12,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-1,-29,32,-22,-9,0,-17,14,58,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-30,18,45,-30,-5,-3,-32,5,-22,-20,1,-4,13,-4,0,-12,-30,-29,-22,29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='C'; M=18,-8,20,-14,-3,-21,-13,-19,-19,-12,-15,-15,-9,-16,-10,-18,6,1,-8,-31,-22,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-25,-5,1,-22,-21,2,-9,2,-8,4,-6,-18,19,9,-7,-9,-9,-24,-8,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-24,14,18,-29,-17,-3,-21,4,-20,-12,2,-10,17,-1,4,-1,-17,-30,-15,17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-21,-17,-27,-20,40,-23,-13,4,-21,8,1,-15,-23,-24,-16,-11,-5,2,0,19,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-21,-8,-1,-20,-19,-14,-16,21,-18,-4,-4,-12,0,10,-1,7,-7,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-9,-7,3,-21,-11,-12,-22,-2,-19,-14,-3,-7,-1,1,6,5,-15,-29,-18,0;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-16,2,-7,-17,28,-9,-21,-9,-17,-12,2,-10,-8,-10,3,-8,-16,-14,-15,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-14,-11,-14,-9,1,-16,-8,8,-11,12,7,-14,-15,-5,-8,-10,-4,8,-10,2,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-28,42,13,-33,-6,0,-35,4,-28,-24,21,-13,1,4,0,-9,-28,-35,-19,6;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-32,-24,34,-30,-17,12,-28,30,11,-26,-30,-26,-19,-25,-9,7,-6,16,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,1,-27,-2,3,-23,-15,2,-26,18,-23,-11,11,-18,15,42,-1,-6,-22,-25,-13,6;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-29,-31,-34,-25,36,-21,-22,-11,-23,-9,-11,-23,-27,-26,-18,-19,-13,-14,59,22,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,0,17,-37,-17,7,-20,7,-22,-3,2,-10,50,7,6,-5,-27,-23,-12,34;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-5,-1,-1,-9,-2,-6,-9,-5,-13,-9,4,-5,-1,-5,18,13,-4,-19,-9,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=18,-5,-7,-8,-6,-11,7,-10,-9,-6,-8,-7,-3,-6,-6,-10,6,-1,-4,-11,-11,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00287;
//
ID   BTG_1_MP; MATRIX.
AC   MP00960;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   BTG family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3728557; R2=0.0124794; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1449; N_SCORE=22.446; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-20,-33,-25,0,-31,-27,31,-25,21,14,-24,-24,-21,-24,-16,-6,27,-23,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-28,21,35,-31,-16,1,-28,12,-24,-18,12,-7,18,4,0,-8,-29,-30,-18,26;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-7,-23,-9,-8,-13,-24,-17,-1,1,-3,-2,-8,-17,-8,1,-7,2,3,-25,-8,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-15,-13,-10,-23,19,-18,-20,-13,-20,-15,-3,-13,-10,-18,14,-1,-10,-25,-23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-25,2,25,-26,-5,-7,-22,-1,-14,-13,-4,-8,10,-7,0,-9,-21,-25,-19,17;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-25,3,20,-28,-15,-9,-26,25,-25,-14,0,-7,9,11,1,-5,-19,-25,-15,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-22,-3,14,-21,-20,-4,-12,0,-9,3,-4,-9,17,-3,2,8,-13,-26,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-22,-2,12,-20,-20,-7,-21,8,-16,-11,0,-10,9,16,5,14,-15,-26,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-21,-32,-23,2,-29,-24,26,-27,30,15,-24,-24,-19,-23,-20,-8,18,-21,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-21,-19,-10,16,-22,-14,-12,0,-8,-5,-9,-18,-10,-2,-7,-1,-8,-9,5,-8;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-26,6,32,-28,-16,-7,-26,17,-21,-15,-2,-5,11,4,-1,-8,-21,-25,-17,22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-28,-1,5,-25,-20,15,-28,29,-25,-8,2,-12,8,19,-7,-6,-20,-23,-3,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-30,4,22,-28,-20,-5,-30,35,-25,-13,0,-9,13,29,-7,-10,-23,-23,-13,16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-24,0,-8,-22,18,16,-28,-11,-26,-14,16,-18,-6,-9,6,-5,-25,-30,-13,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-28,-21,-19,33,-28,25,-6,-15,-1,0,-14,-28,-13,-11,-18,-12,-11,14,57,-19;
MA   /M: SY='P'; M=5,-16,-30,-11,-2,-27,-14,-19,-18,-10,-26,-18,-15,58,-9,-19,0,-5,-22,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,0,-1,0,-26,-18,-10,-28,25,-28,-14,9,-18,0,13,-6,-8,-20,-30,-16,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-11,-1,-14,-12,-6,-16,-8,-8,-14,-8,-3,-7,-20,-8,-13,9,8,-5,-25,0,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=0,0,-20,0,10,-30,-10,0,-20,0,-25,-10,5,-10,30,0,20,5,-20,-30,-15,20;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-20,-15,-15,-25,36,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-7,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,27,-30,19,-20,-7,3,-20,10,51,-10,-13,-23,-23,-2,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,26,-23,12,-5,-23,19,2,-25,-5,-30,-20,44,-20,-5,-5,7,-5,-30,-35,-23,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,3,-30,7,29,-32,-20,28,-26,5,-20,-7,2,-9,34,4,-2,-12,-30,-26,-6,31;
MA   /M: SY='K'; M=1,2,-23,-5,0,-22,-12,-6,-18,19,-19,-4,7,-14,3,13,-3,-6,-14,-24,-13,1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-22,-19,-25,-19,-5,-27,-18,18,-7,10,20,-21,-23,-13,-9,-15,-6,21,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-34,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,69,-10,-20,-6,-8,-24,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-18,-23,-24,-3,-30,-26,27,-22,13,10,-23,-26,-24,-21,-14,-4,33,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-35,-27,12,-34,-26,32,-28,25,16,-25,-26,-24,-24,-21,-8,25,-19,1,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-26,9,36,-25,-9,-5,-25,0,-16,-16,-2,-6,9,-5,2,-7,-24,-29,-19,22;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-29,-7,6,-25,-21,-3,-22,24,-15,-4,-3,-15,20,32,-10,-10,-19,-20,-9,11;
MA   /M: SY='A'; M=44,-13,-10,-21,-13,-17,-4,-21,-5,-11,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,6,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='C'; M=14,-13,54,-22,-18,-20,-15,-23,-21,-20,-18,-17,-12,-25,-18,-23,5,-2,-7,-38,-25,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-25,0,10,-30,-15,-6,-25,26,-28,-10,3,-10,18,16,5,-2,-20,-25,-13,14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-30,2,24,-28,-20,3,-27,19,-20,-11,0,-11,26,33,-4,-10,-26,-23,-13,23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00742;
//
ID   RIBOSOMAL_S28E_MP; MATRIX.
AC   MP00961;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S28e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=29;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2280807; R2=0.0125124; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=675; N_SCORE=12.664; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-8,-28,-8,2,-20,-22,-12,-18,29,-10,-3,-7,-16,3,21,-15,-10,-13,-20,-8,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-18,-18,-5,-4,-28,-20,13,-16,15,6,-23,-23,-15,-15,-14,-5,19,-27,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-21,-29,-21,0,-25,-11,22,-16,19,38,-18,-20,-8,-15,-16,-2,13,-21,-1,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-14,-27,-15,-5,-14,-21,-3,-17,17,-6,2,-6,-21,5,48,-14,-10,-12,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-25,10,43,-28,-15,-5,-25,5,-18,-18,-2,-2,13,-5,2,-8,-23,-28,-20,28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-32,-3,11,-29,-20,-6,-27,26,-26,-11,-4,6,14,26,-8,-10,-24,-23,-14,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-16,4,4,-20,1,-10,-22,-2,-22,-16,5,-9,-1,-6,15,9,-14,-28,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-18,-15,-9,-11,-18,-16,2,-2,-6,-1,-6,-12,-6,-3,0,5,3,-20,-8,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-25,-7,2,-19,-17,-2,-25,29,-19,-8,0,-15,8,53,-8,-8,-17,-17,-8,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00743;
//
ID   RIBOSOMAL_S2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00962;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6007495; R2=0.0173841; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=227; N_SCORE=9.543; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-20,-17,-15,-3,-21,-6,11,-13,19,36,-16,-20,-5,-12,-17,-5,5,-23,-3,-10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,2,-18,1,13,-19,-14,-3,-17,6,-15,-9,3,-8,14,8,5,6,-15,-21,-11,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-21,2,5,-22,-13,-1,-21,20,-19,-8,1,-10,10,18,-4,-7,-16,-18,-9,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=1,-3,-16,-7,-5,-15,-10,-8,-13,2,-14,-9,4,-15,-2,10,8,5,-6,-26,-13,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-21,-23,-13,-3,-19,0,11,-9,10,41,-15,-14,0,-10,-14,-8,3,-19,1,-7;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-6,-13,-5,-1,-6,-14,-9,1,-9,6,1,-7,-10,-4,-9,-4,0,-1,-17,-6,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: M=-1,-9,-19,-12,-6,-13,-15,-10,-14,0,-12,-7,-7,-9,-6,-4,-4,-2,-11,-8,-6,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-22,-2,10,-14,-19,-9,-7,-5,-3,-4,-4,-8,-2,-7,-6,-5,-8,-26,-12,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-20,-18,-11,-3,-27,-21,15,-17,8,4,-17,-19,-16,-18,-10,-4,16,-23,-7,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-5,9,-20,11,0,-21,-13,-11,-16,-8,-20,-16,6,-2,-5,-12,11,11,-10,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-19,-32,-25,4,-29,-21,28,-23,24,23,-25,-25,-19,-20,-19,-7,25,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-27,6,14,-27,-17,-4,-23,16,-20,-10,1,-11,13,14,-2,-6,-19,-26,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-26,12,21,-27,-17,-4,-24,12,-19,-11,2,-9,12,4,-1,-5,-21,-28,-14,17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-21,-30,-21,15,-27,-8,16,-21,30,29,-25,-27,-14,-15,-25,-10,7,-11,12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-15,-31,-22,11,-29,-18,18,-27,39,22,-27,-29,-19,-20,-26,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=9,5,-20,5,16,-23,-9,-8,-21,-1,-19,-16,3,-9,4,-7,8,-2,-16,-28,-18,10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-4,-17,-10,-19,-4,-19,-12,-11,-13,-12,-7,-11,-10,-18,14,8,-2,-25,-19,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-28,-6,-11,-28,44,-14,-35,-10,-28,-18,5,-18,-11,-8,2,-14,-27,-23,-25,-11;
MA   /M: SY='V'; M=11,-23,-10,-26,-23,-5,-22,-26,16,-17,5,4,-22,-24,-23,-19,-3,3,32,-28,-12,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,-2,-16,-21,93,-27,-10,-18,0,7,-21,8,-1,-11,-19,-28,-25,25,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26,37,-32,-22,17,-30,29,12,-24,-28,-28,-22,-24,-10,9,-8,12,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-23,-4,-2,-19,-15,53,-24,-8,-19,-5,6,-16,5,-2,1,-3,-21,-29,6,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-26,-2,8,-26,-16,3,-22,11,-20,-7,2,-13,24,14,1,-4,-22,-23,-9,15;
MA   /M: SY='T'; M=3,4,-16,-6,-7,-14,-14,-11,-8,-7,-14,-9,10,-14,-3,-8,11,17,-6,-29,-13,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-14,-3,0,-12,-6,0,-15,10,-13,-7,2,-10,3,21,1,-1,-10,-14,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-12,-6,-1,-7,-13,-3,-13,12,-9,-4,-3,-11,2,19,-7,-6,-9,-9,0,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-30,-24,-31,-23,-1,-22,-26,-13,-14,-12,-12,-30,-22,-18,-14,-26,-19,-15,66,9,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-21,18,3,-22,-6,5,-22,-1,-25,-18,36,-16,2,-1,8,5,-25,-36,-17,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-31,-12,-4,-12,-19,-11,-16,-6,-21,-13,-13,36,-8,-11,-6,-7,-19,-22,-11,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,4,-28,6,8,-24,-18,5,-26,21,-24,-10,3,-13,14,17,-5,-9,-22,-21,-5,10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-19,-17,-29,-20,7,-21,-3,14,-12,15,47,-18,-21,-4,-11,-18,-8,7,-18,2,-11;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-24,-1,15,-22,-16,-7,-21,13,-18,-10,-3,-10,11,5,-1,-5,-17,-22,-13,13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-32,-7,3,-28,-13,-10,-22,5,-24,-12,-7,23,8,6,-4,-8,-24,-25,-19,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-22,43,-30,10,0,-16,2,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-8,24,65,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-23,-36,-29,0,-35,-29,41,-26,17,16,-23,-23,-23,-26,-16,-7,34,-23,-4,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-28,-23,-21,38,-30,15,-1,-14,1,0,-19,-30,-15,-12,-20,-10,-9,24,68,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-29,-1,1,-27,-2,-7,-32,26,-27,-13,4,-15,3,29,-7,-11,-23,-22,-15,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00744;
//
ID   RIBOSOMAL_S2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00963;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2911425; R2=0.0166376; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=368; N_SCORE=11.404; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=73; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-17,-18,-14,-8,-24,-21,6,-11,-1,-1,-9,-13,-12,-12,3,19,9,-27,-8,-14;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-20,-1,5,-19,-13,-2,-20,28,-18,-6,1,-8,8,24,-6,-6,-14,-14,-6,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-13,-20,-14,7,-20,-13,13,-20,32,15,-20,-20,-13,-13,-20,-7,7,-13,0,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-18,5,17,-17,-12,-2,-14,5,-10,-7,0,-6,11,3,-1,-5,-13,-18,-10,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-16,-3,2,-16,-13,-5,-17,22,-15,-6,0,-9,4,18,-5,-4,-11,-15,-7,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-5,-10,-9,-9,8,-12,4,-6,-8,-7,-5,-1,-16,-7,-8,-1,-1,-8,-4,17,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-14,-21,-15,15,-20,-12,11,-19,26,10,-19,-20,-15,-13,-18,-7,5,-8,7,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-30,-6,-5,-25,21,-16,-29,-12,-27,-19,-3,15,-11,-15,0,-11,-27,-25,-25,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,66,-19,-39,-18,-30,-20,0,-20,-19,-17,0,-19,-29,-20,-29,-19;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-17,-25,-19,0,-24,-19,29,-18,13,13,-15,-15,-14,-18,-12,-5,21,-15,-1,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-18,-4,3,-16,-12,-6,-14,20,-14,-4,-2,-9,5,18,-6,-6,-9,-14,-7,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-24,16,5,-21,-10,5,-24,5,-23,-15,14,-13,3,2,2,-3,-21,-25,-6,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-14,-20,-20,-14,-6,-10,-5,5,-11,8,29,-12,-14,-4,-10,-11,-6,0,-21,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-7,-22,-11,-8,1,-10,-9,-17,0,-14,-9,-3,-16,-7,0,-3,0,-13,-13,2,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-26,-8,-2,-18,-7,-9,-20,12,-18,-7,-2,-16,0,17,-5,-7,-14,-21,-10,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-25,-14,4,-6,-26,-14,2,-9,11,3,-15,-15,-5,-8,-15,-9,-3,-22,-7,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-29,38,14,-33,-7,2,-35,3,-27,-22,13,-12,3,3,0,-9,-27,-33,-17,8;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-12,-29,-23,-1,-26,-24,21,-23,17,11,-23,-25,-21,-21,-12,-3,22,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-32,-26,4,-32,-24,30,-26,28,19,-27,-27,-22,-22,-21,-7,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-37,-30,30,-33,-26,25,-27,14,10,-23,-27,-30,-23,-18,-7,24,-12,8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,1,-33,-29,35,-25,18,14,-26,-26,-25,-24,-15,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-17,-24,-21,-3,-28,-24,19,-20,5,4,-15,-16,-19,-20,-5,6,19,-26,-7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-16,42,-29,55,13,-36,0,-1,-37,-2,-30,-28,23,-12,-2,-10,1,-10,-30,-38,-21,5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-11,0,-27,-20,-14,-12,-7,-20,-10,-13,37,6,-12,-4,-4,-18,-26,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-25,-2,0,-22,-10,-3,-20,9,-20,-10,6,-14,6,16,0,-4,-16,-26,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-26,0,3,-19,-14,2,-20,10,-18,-9,2,-15,4,8,-4,-5,-16,-22,-4,2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,25,-28,34,37,-31,-15,1,-30,4,-22,-22,13,-7,10,-4,0,-9,-29,-34,-19,24;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-4,-25,-7,-2,-15,-19,17,-16,4,-14,-4,0,-17,2,5,-5,-6,-14,-22,2,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-25,-9,-4,-17,-21,-3,0,-5,-8,1,6,-16,10,-6,-3,-1,-9,-24,-5,1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-12,-20,-11,-18,-4,-20,-8,-11,-9,-9,-12,-5,-11,-20,7,0,1,-22,-19,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,17,-26,-26,-23,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-24,-7,0,-20,-15,-6,-17,12,-12,-4,-1,-16,6,12,-5,-4,-13,-23,-10,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,24,-21,-15,-20,-7,-22,-16,-15,-14,-13,-11,-18,-15,-22,6,-2,-4,-29,-23,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-22,-8,-5,-13,-15,-8,-9,0,-13,-7,7,-17,-1,6,2,-1,-9,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-26,-7,1,-16,-20,-6,-16,17,-17,-7,-2,-15,4,14,-5,-3,-13,-18,-1,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-30,-23,5,-29,-23,23,-27,35,16,-27,-28,-21,-21,-22,-7,19,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-27,0,-9,-27,35,-6,-32,-7,-29,-18,18,-19,-6,-5,2,-13,-29,-26,-23,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,88,-10,-20,-10,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-15,-26,-24,-3,-28,-26,23,-19,6,7,-18,-22,-21,-19,-3,9,30,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-30,4,-35,-29,39,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-17,-7,35,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-4,-16,-12,-21,8,-19,-18,-13,-17,-14,-6,-14,-12,-19,11,2,-7,-25,-22,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-18,-33,-25,11,-32,-23,25,-27,27,18,-25,-24,-22,-22,-22,-9,17,-19,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,12,-29,-25,-3,-29,-27,13,-24,11,5,-24,-29,-25,-22,-12,0,22,-31,-11,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-11,-9,-9,-11,-17,-17,-10,-10,-11,-8,0,-11,-8,-10,21,42,-1,-31,-11,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-12,36,-24,29,8,-25,-6,4,-23,-1,-27,-21,40,-16,1,-4,6,-3,-27,-38,-19,5;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-4,39,-10,-14,-19,-16,-15,-21,-17,-22,-17,1,-24,-14,-18,8,2,-10,-41,-21,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-27,27,7,-26,-11,-4,-25,-4,-23,-20,17,3,-3,-9,1,-5,-25,-35,-19,2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-32,-12,-5,-21,-21,-19,-11,-13,-16,-12,-16,53,-11,-18,-8,-3,-19,-29,-22,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-8,18,-23,23,11,-27,-10,-5,-26,2,-23,-19,12,-12,3,0,7,1,-20,-33,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-22,-15,-14,0,-13,-9,-1,-18,7,2,-8,-20,-13,-15,-14,-9,-6,-18,1,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-17,-29,-25,-3,-30,-24,27,-21,9,9,-21,-23,-22,-21,-8,2,32,-26,-7,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00744;
//
ID   SYNDECAN_MP; MATRIX.
AC   MP00964;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Syndecans signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4807763; R2=0.0132286; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=882; N_SCORE=16.138; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-23,-24,-23,-20,-4,6,-20,-2,-26,21,6,-19,-26,-20,-20,-19,-14,-4,-20,-11,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-17,-34,-27,32,-30,-23,16,-27,22,9,-26,-30,-31,-20,-20,-7,20,-13,7,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-20,-17,-30,-23,49,-27,-20,-3,-23,3,-3,-13,-23,-30,-17,-6,11,0,-4,16,-23;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,21,-34,-27,26,-30,-23,-2,-30,15,1,-23,-33,-30,-23,-20,-10,0,-18,2,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='L'; M=8,-24,-17,-27,-17,1,-21,-20,11,-24,32,11,-24,-24,-17,-20,-18,-7,7,-20,-6,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,55,-30,-20,7,-30,24,7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-27,-17,-30,-23,4,-27,-18,23,-21,27,28,-27,-27,-18,-17,-20,-7,24,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-33,-23,0,-27,-10,30,-17,20,46,-20,-20,-7,-17,-20,-10,17,-20,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=13,15,-17,18,4,-27,-4,-10,-24,-6,-23,-20,7,-10,-3,-13,15,2,-14,-33,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-30,26,17,-33,16,-7,-37,-4,-27,-23,7,-11,-1,-11,0,-14,-30,-30,-24,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-13,-24,4,-26,-16,-13,50,-3,13,-10,-10,-26,-26,-23,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-34,-4,13,-36,-20,-1,-20,3,-24,-7,-7,26,35,-1,-4,-10,-30,-24,-17,22;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-20,2,0,-20,-7,-1,-23,7,-27,-17,21,-16,3,20,14,4,-19,-33,-17,0;
MA   /M: SY='P'; M=15,-13,-26,-14,-10,-26,14,-20,-22,-13,-23,-16,-10,21,-13,-20,0,-9,-19,-23,-26,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-10,-19,-10,-13,1,10,1,-12,-9,-9,-6,-7,-16,-9,-9,-7,-9,-12,4,18,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=32,-17,-10,-24,-17,-13,-11,-24,4,-14,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,18,-24,-16,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-23,-13,-13,13,-20,10,-7,-10,-10,-7,-10,-23,-7,-10,1,0,-10,6,46,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-7,-30,-7,6,-16,-23,13,-13,3,-13,0,-7,-17,36,3,-7,-10,-23,-3,21,19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00745;
//
ID   PMI_I_1_MP; MATRIX.
AC   MP00965;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphomannose isomerase type I signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8186603; R2=0.0140603; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=16.071; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,46,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,39,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=9,4,-24,7,37,-27,-14,-6,-24,4,-17,-17,-3,-3,10,-6,3,-7,-20,-27,-20,24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-4,-20,-11,-13,-1,-19,-9,5,-19,20,5,4,-26,-13,-13,-15,-6,-5,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=9,-4,-23,-5,15,-23,-13,-7,-23,9,-16,-13,-4,-10,6,15,1,-6,-16,-23,-17,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-30,-4,2,-33,14,-7,-31,11,-27,-11,0,-14,15,5,-3,-14,-27,-20,-17,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-7,-34,-4,0,-24,-20,55,-26,-10,-24,-7,-1,21,3,-7,-10,-16,-30,-30,1,-4;
MA   /M: SY='M'; M=9,-20,-17,-27,-17,-3,-17,-13,10,-16,20,25,-20,-20,-9,-16,-13,-7,7,-20,-6,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-7,19,-24,26,14,-34,-10,0,-27,0,-27,-18,11,-10,18,-4,13,0,-24,-34,-17,16;
MA   /M: SY='A'; M=27,9,-16,9,0,-26,-3,-14,-20,-7,-16,-16,0,-10,-7,-17,7,-3,-10,-26,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=12,-16,-29,-14,-4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16,53,-10,-20,-3,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-20,14,41,-20,-14,0,-20,7,-14,-14,0,0,14,0,0,-7,-20,-20,-14,27; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-21,-4,3,-17,-14,-3,-21,27,-17,-7,0,-11,7,36,-7,-7,-14,-14,-7,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-16,15,-26,7,0,-20,-13,66,-26,-6,-24,-7,29,-20,6,0,-3,-13,-30,-34,5,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-6,4,-30,-20,-16,-24,12,-30,-16,-13,53,-3,-1,-10,-10,-26,-26,-23,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=5,6,-28,13,3,-30,-11,-14,-23,-7,-24,-20,-4,27,-7,-17,-1,-7,-21,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-7,20,-17,31,45,-24,-24,-7,-14,-24,-10,10,-20,0,-14;
MA   /M: SY='A'; M=31,-17,-10,-24,-17,-13,-11,-24,5,-14,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,19,-24,-16,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-20,-37,-30,30,-33,-26,25,-27,13,9,-23,-27,-31,-23,-17,-7,25,-12,8,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-13,3,-37,16,6,-33,-17,-14,-26,-7,-30,-23,-7,58,-7,-17,-7,-10,-30,-33,-27,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-8,-26,-5,18,-18,-24,-4,-8,-5,6,1,-11,-14,17,-4,-11,-10,-15,-23,-9,18;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-16,-17,-13,-23,21,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-33,-23,29,-26,-13,14,-23,26,28,-23,-26,-19,-16,-23,-10,7,-10,10,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,2,68,-11,-19,-20,-19,-15,-26,-19,-24,-20,10,-33,-19,-19,-3,-6,-17,-46,-26,-19;
MA   /M: SY='G'; M=19,-10,-23,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00746;
//
ID   PMI_I_2_MP; MATRIX.
AC   MP00966;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphomannose isomerase type I signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5412407; R2=0.0138091; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1758; N_SCORE=28.808; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,-1,15,-23,-21,-9,-22,22,-19,-11,-3,-11,6,20,-4,-3,-13,-25,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-27,6,9,-29,-14,-1,-26,30,-29,-11,17,-13,14,19,-3,-7,-24,-26,-13,11;
MA   /M: SY='P'; M=9,-14,-26,-12,-3,-25,-12,-16,-18,-5,-22,-16,-11,34,-6,-7,1,-4,-17,-27,-23,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=0,-20,-21,-30,-21,-4,-25,-18,24,-18,12,24,-16,-17,-11,-19,-10,0,15,-21,-4,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-15,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-28,-8,7,-4,-10,-8,-25,8,-16,-12,-4,-16,-2,18,-8,-11,-20,-16,-7,2;
MA   /M: SY='A'; M=42,-11,-14,-19,-9,-21,-3,-20,-11,-10,-13,-11,-11,4,-10,-20,7,-1,-4,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,28,-25,23,17,-27,-9,3,-27,11,-28,-20,31,-13,6,4,3,-5,-28,-34,-18,12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,11,-20,14,5,-20,-18,-9,-14,-5,-11,-6,0,-12,-4,-10,2,10,-7,-32,-13,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-14,-4,-26,-23,-21,-11,-13,-23,-15,-20,76,-11,-21,-11,-10,-22,-29,-26,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-22,2,14,-27,-14,-5,-23,12,-24,-12,3,-9,17,5,12,5,-18,-28,-14,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-26,49,9,-32,-14,-6,-25,-4,-22,-22,9,-14,-6,-12,-2,-8,-13,-38,-18,2;
MA   /M: SY='C'; M=3,-22,26,-32,-26,-11,-28,-28,10,-26,0,0,-18,-25,-21,-28,-10,-8,10,-30,-15,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-34,-27,2,-33,-26,35,-25,23,20,-26,-26,-22,-23,-19,-7,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-22,92,-30,-30,-16,-30,-30,-17,-28,-14,-14,-22,-38,-30,-28,-10,-8,3,-46,-26,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=3,16,-2,8,-3,-21,-7,-8,-21,-8,-23,-18,19,-16,-6,-11,12,7,-16,-36,-20,-5;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-10,-25,-25,-2,-28,-28,20,-18,5,5,-23,-25,-25,-18,-3,12,38,-30,-10,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-24,20,14,-29,-29,-26,-21,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,32,-30,-20,14,-30,38,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-32,-25,53,-30,-6,3,-23,12,3,-21,-30,-27,-16,-21,-10,-2,13,44,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-15,-30,-20,-10,-15,-29,-18,7,11,-6,4,-9,-16,-4,8,-15,-10,3,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-13,9,-33,20,21,-33,-17,-8,-29,8,-28,-21,-1,24,3,-4,-5,-10,-28,-31,-21,11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,14,-19,7,10,-20,-11,-3,-21,1,-22,-17,20,-12,3,3,13,12,-19,-34,-17,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,3,-30,-29,-1,-30,-29,23,-22,11,8,-29,-31,-29,-21,-12,-2,40,-31,-11,-29;
MA   /M: SY='E'; M=7,8,-20,7,25,-24,-9,-5,-22,0,-21,-18,8,-7,7,-6,12,0,-19,-31,-20,16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-7,-20,-19,-16,-4,-16,2,12,-8,9,43,-3,-20,0,-8,-14,-8,2,-24,-4,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,11,-18,5,0,-20,-14,-11,-20,5,-21,-14,11,-11,-2,0,12,21,-12,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-22,23,23,-26,-15,-7,-26,0,-21,-20,6,-7,4,-7,10,10,-20,-34,-17,14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00746;
//
ID   NMU_MP; MATRIX.
AC   MP00967;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Neuromedin U signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7212296; R2=0.0137609; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=154; N_SCORE=6.830; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=130; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,34,-30,-20,13,-30,36,13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,7,-10,10,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='P'; M=11,-16,-29,-14,-4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16,54,-10,-20,-3,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-17,-27,-20,-23,8,36,-20,-26,-23,-16,-13,-7,-23,-27,-20,-7,-17,-20,-10,-10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-17,-23,-20,-7,-23,-23,20,-20,0,3,-13,-20,-16,-20,4,3,22,-30,-10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-27,-12,1,-18,-23,-2,-11,5,1,3,-9,-19,19,21,-12,-10,-15,-20,-7,8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-17,-34,-27,32,-30,-23,16,-27,24,10,-26,-30,-30,-20,-20,-7,19,-12,8,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00747;
//
ID   ANTENNA_COMP_ALPHA_MP; MATRIX.
AC   MP00968;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Antenna complexes alpha subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7788944; R2=0.0133294; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=458; N_SCORE=10.874; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=130; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-16,-32,-27,22,-28,-23,18,-23,11,9,-23,-27,-28,-19,-12,-3,25,-17,3,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-28,37,11,-32,-10,-2,-31,8,-30,-23,20,-2,1,-2,1,-7,-27,-35,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-36,-14,-4,-20,-21,-21,-15,-12,-24,-16,-21,73,-14,-20,-11,-9,-22,-27,-24,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-21,-11,-4,-18,-12,-8,-21,10,-17,-8,-1,-16,2,28,4,5,-12,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-14,-19,-18,-13,-8,-24,-14,-1,-1,-4,2,-10,-20,-7,12,-3,8,7,-24,-8,-12;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=4,-8,-10,-12,-12,-4,-11,-13,1,-9,-4,-3,-7,-13,-11,-10,-1,5,7,-4,-5,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-12,-20,-13,10,-16,-11,10,-15,17,13,-14,-15,-12,-12,-13,-5,6,-9,2,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-10,-17,-15,-3,-18,-17,14,-12,3,3,-16,-8,-15,-13,-5,2,21,-18,-7,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-11,-13,-11,-11,7,-14,-4,-10,-6,-4,-7,-10,-10,-13,1,-4,1,-13,-12,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-14,-15,-8,7,-17,-9,4,-11,9,5,-10,-14,-2,-8,-9,-3,0,-9,2,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-25,-15,-17,-13,26,-11,-26,-17,-21,-15,-5,-19,-16,-17,0,-10,-20,-7,-13,-16;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-19,-31,-24,-1,-29,-26,26,-24,18,12,-22,-23,-21,-22,-13,-2,25,-23,-6,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-29,-26,-17,21,-26,-19,-5,-20,-5,-7,-23,15,-24,-19,-17,-10,-9,-1,5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-19,-28,-20,9,-20,-20,11,-27,34,12,-25,-27,-20,-20,-22,-9,5,-18,-2,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-19,-29,-22,27,-21,-20,4,-25,16,5,-18,-24,-24,-19,-14,-2,3,-11,6,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-17,-29,-24,4,-25,-24,21,-26,30,14,-28,-29,-24,-20,-21,-7,24,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-23,-23,-22,-7,2,-22,4,-24,10,4,-17,-24,-20,-21,-12,-10,5,-23,-12,-22;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-11,-19,-10,-20,1,-20,-10,-11,-11,-10,-9,-11,-10,-19,11,0,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-20,-33,-25,16,-31,-24,24,-27,28,14,-25,-27,-24,-22,-21,-8,19,-17,2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=2,-25,-19,-29,-20,2,-24,-20,18,-24,30,17,-24,-24,-17,-20,-19,-7,12,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-25,-18,-32,-23,40,-23,-19,2,-25,14,2,-20,-25,-28,-20,-15,-8,2,-3,14,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-18,-18,-26,-18,-12,-7,-22,7,-18,2,3,-14,-16,-15,-22,-4,-6,8,-20,-13,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-4,-29,-25,1,-29,-26,20,-24,20,10,-27,-29,-24,-21,-15,-4,27,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-13,-4,-2,-20,3,-13,-20,-10,-24,-17,5,-11,-4,-11,28,18,-10,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='T'; M=1,5,-15,-3,-5,-16,-12,6,-17,-8,-18,-12,12,-13,-3,-8,16,21,-11,-33,-9,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-7,7,-24,9,9,-24,-14,-12,-22,-5,-21,-18,2,11,-3,-10,6,13,-19,-32,-19,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-16,-3,3,-14,-3,-3,-17,11,-13,-8,0,-9,3,22,-2,-5,-12,-13,-9,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-17,-14,-21,-16,35,-19,-6,2,-16,9,2,-14,-19,-18,-11,-14,-6,0,6,23,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-16,9,-3,-17,-7,-1,-17,-4,-23,-17,38,-16,-3,-4,15,17,-19,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-34,-25,26,-30,-21,17,-27,26,12,-26,-28,-25,-21,-25,-10,10,-2,11,-24;
MA   /M: SY='E'; M=6,3,-24,7,19,-27,-12,-10,-23,-2,-21,-18,-3,10,4,-10,6,-3,-20,-30,-21,10;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-21,-13,-12,-14,8,-16,-15,-9,-12,-9,0,-17,-13,-12,-1,-5,-10,-21,-15,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=8,-14,-21,-18,-13,2,-4,-8,-13,-9,-10,-7,-10,-19,-10,-12,-3,-7,-10,-5,11,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-18,-29,-18,-8,-10,-18,-15,-12,-7,-10,-6,-17,0,-7,-9,-12,-8,-14,11,-2,-8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=15,-6,-17,-10,-9,-20,19,-15,-20,-5,-17,-12,-3,-12,-9,-10,3,-4,-12,-17,-18,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-18,-8,-5,-17,3,-13,-13,0,-11,-7,-4,-13,-7,-6,-2,-7,-6,-19,-14,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-23,-7,2,-19,-12,-7,-13,-4,-15,-9,-8,11,2,-6,-1,-4,-13,-22,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-19,-13,-12,-12,7,-12,-11,-6,-8,-3,-7,-16,-10,-9,-5,-8,-6,-15,-7,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=6,-8,-20,-11,-3,-15,-14,-7,-12,7,-11,-5,-7,-14,3,2,-3,-5,-8,-15,-2,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=10,-9,-13,-14,-9,-12,-14,-15,-5,-4,-4,0,-8,-13,-7,-8,4,11,2,-23,-11,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=26,-4,-11,-7,-7,-18,-4,-15,-10,-9,-13,-11,-4,-11,-8,-15,13,3,1,-25,-17,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-13,-18,-8,-12,-12,-18,1,-11,-1,-1,-15,-10,-11,-16,-1,-2,8,-22,-14,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,-13,-18,-13,-15,-8,-18,1,-12,-6,-5,-6,-14,-12,-18,4,-1,6,-22,-16,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-27,-6,7,-25,-18,-9,-16,5,-19,-8,-8,13,7,2,-2,-5,-15,-27,-17,5;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,24,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00748;
//
ID   ANTENNA_COMP_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP00969;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Antenna complexes beta subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5257897; R2=0.0131444; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=876; N_SCORE=16.030; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=151; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=2,-9,-17,-16,-14,-9,-16,-8,5,-10,5,26,-12,-16,-5,-12,-6,1,5,-24,-8,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='A'; M=19,11,-16,13,4,-24,-4,-10,-19,-5,-16,-16,1,-8,-4,-13,5,-4,-11,-24,-18,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-26,45,24,-31,-12,-1,-29,1,-22,-22,11,-7,4,-7,-1,-9,-24,-32,-17,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-4,0,-18,2,-3,-13,-14,-9,-7,-3,-2,-3,-4,-12,-6,-4,-7,-5,-4,-22,-9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=0,5,-12,0,-2,-12,-7,-5,-9,4,-12,-7,8,-10,-2,2,3,2,-6,-19,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-28,7,11,-27,-14,-6,-27,21,-24,-13,0,3,8,15,-6,-9,-22,-23,-14,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-19,-13,-7,-12,-15,-16,-3,-6,-4,-3,-14,-2,-10,-5,-5,-4,2,-23,-13,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-9,0,0,-14,1,-7,-14,-2,-19,-12,5,-7,0,-3,19,9,-8,-23,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-21,-13,5,-23,-16,6,-20,16,5,-21,4,-16,-17,-19,-8,-2,-15,-2,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-13,-5,-2,-17,-10,-13,-17,-4,-21,-15,4,-10,-2,-3,24,24,-8,-32,-16,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-29,-12,-18,-27,49,-21,-31,-19,-26,-17,-5,-8,-19,-20,-1,-15,-23,-22,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-30,-21,9,-30,-21,22,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-11,-10,-5,-18,-18,-11,-12,-12,-11,0,-12,-11,-11,20,41,-2,-29,-9,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-24,13,14,-22,-16,-9,-15,-5,-13,-13,2,-7,-1,-10,0,-4,-12,-31,-17,6;
MA   /M: SY='E'; M=7,7,-24,8,22,-28,-4,-7,-25,2,-20,-17,3,-8,6,-6,3,-7,-21,-27,-20,14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,46,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,34,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='A'; M=38,-4,-12,-10,-6,-22,-1,-17,-14,-9,-15,-13,-4,-10,-7,-17,15,3,-4,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-31,2,27,-26,-21,-4,-22,13,-19,-11,-5,-9,19,7,-6,-11,-22,-12,-11,23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-28,13,48,-26,-19,-3,-25,5,-14,-16,-3,-3,15,-3,-1,-9,-25,-28,-18,32;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-19,-34,-25,30,-31,-22,17,-29,30,12,-26,-29,-28,-21,-23,-9,14,-12,8,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,0,-21,-16,91,-30,-10,-20,-1,9,-20,10,-1,-9,-20,-30,-29,17,1;
MA   /M: SY='K'; M=2,3,-23,3,2,-27,-4,-12,-27,16,-25,-15,2,-11,0,5,3,-1,-17,-25,-16,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-25,-21,-15,0,-26,5,8,-16,5,7,-15,-24,-5,-13,-15,-10,3,-12,15,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-19,-32,-27,31,-30,-17,13,-23,13,6,-26,-30,-28,-18,-19,-7,17,0,20,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-20,-29,-22,-4,-30,-22,26,-17,10,18,-19,-21,-14,-18,-11,0,24,-24,-5,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-21,22,7,-27,-12,-6,-24,-1,-22,-18,10,-11,3,-5,11,8,-18,-34,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-22,-7,-13,-25,42,-17,-32,-16,-28,-19,3,-16,-13,-16,14,-2,-22,-27,-25,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-17,-15,-26,-20,22,-23,-21,1,-20,6,-1,-13,-20,-22,-17,-3,12,5,-14,4,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-23,-17,-10,-6,-19,-7,-11,4,-8,-1,-9,-21,-4,21,-6,-4,-5,-13,0,-9;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-17,-25,-22,-5,-9,-24,8,-20,3,1,-19,-19,-22,-21,-7,-6,16,-23,-12,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-29,73,-30,-18,1,-28,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,2,9,31,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-21,-22,-25,-22,-2,-4,-22,6,-23,6,4,-15,-22,-20,-21,-10,-7,6,-20,-9,-22;
MA   /M: SY='A'; M=21,-17,-15,-22,-19,-15,2,-24,0,-16,-6,-4,-15,-19,-19,-20,0,-4,12,-23,-18,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-33,-27,0,-33,-26,35,-24,19,19,-23,-23,-21,-23,-16,-3,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=10,-24,-16,-29,-23,-4,-24,-25,22,-21,14,9,-22,-22,-20,-22,-10,-4,24,-23,-9,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-34,-29,13,-32,-27,28,-25,18,12,-26,-28,-28,-22,-16,-5,33,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='A'; M=47,-11,-10,-21,-11,-19,-2,-21,-7,-11,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,3,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-28,-19,-33,-26,26,-30,-21,18,-25,19,9,-24,-28,-27,-21,-18,-7,18,-11,10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-19,-29,-19,7,-27,-20,17,-28,43,17,-28,-28,-19,-20,-25,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,-18,-10,-23,-19,-11,-14,-24,8,-15,-2,-1,-18,-19,-19,-19,3,3,22,-26,-15,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-28,-34,-32,-25,24,-23,-11,-8,-17,-6,-6,-27,-28,-19,-17,-25,-17,-14,66,38,-20;
MA   /M: SY='V'; M=10,-18,-16,-24,-18,-8,-20,-22,14,-18,4,5,-15,-18,-15,-20,0,4,16,-25,-10,-18;
MA   /M: SY='W'; M=0,-29,-34,-32,-23,6,-17,-21,-12,-17,-9,-12,-28,-24,-17,-19,-23,-18,-16,74,19,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-22,-7,-1,-19,-18,-5,-23,16,-20,-11,1,-15,3,30,4,10,-13,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-33,-24,20,-29,-22,20,-29,33,14,-25,-28,-24,-22,-24,-10,12,-15,4,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-9,-31,-7,-3,-26,-2,25,-27,-9,-24,-11,-3,14,0,-8,-6,-15,-27,-26,-10,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-15,-30,-17,-22,-23,43,-22,-18,-22,-18,-10,-5,-20,-20,-22,-5,-18,-15,-20,-23,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-2,-30,-9,-20,-22,-11,-30,-20,-18,77,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-3,8,-26,5,14,-27,-14,-6,-26,26,-26,-14,10,-10,7,13,-2,-7,-21,-26,-15,11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-29,-12,-20,-25,58,-20,-33,-21,-20,-15,-4,-21,-20,-20,-4,-19,-25,-20,-26,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-32,-38,-32,-26,16,-25,-12,-7,-16,-9,-9,-32,-30,-18,-16,-29,-19,-13,85,43,-21;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-10,-19,-13,-15,-7,-21,-2,-12,-9,-7,-11,-15,-13,-18,11,4,10,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='N'; M=17,18,-16,2,-4,-20,0,-3,-16,-4,-21,-16,29,-16,-4,-9,10,0,-17,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-21,-10,-16,-21,30,-20,-27,-16,-21,-16,0,-16,-16,-16,9,11,-17,-24,-21,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00748;
//
ID   TP2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00970;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nuclear transition protein 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0233798; R2=0.0096679; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1697; N_SCORE=20.429; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,41,-28,-8,0,-10,21,26,-8,-10,-22,-20,-10,17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-12,-15,-12,-8,-20,-15,-3,-10,-3,6,-5,-12,-8,-10,11,36,2,-28,-8,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,13,-33,-20,41,-23,3,-20,0,3,-13,43,7,-3,-13,-30,-23,0,26;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-4,-23,-17,-17,-8,-24,-17,17,-17,-1,2,6,-18,-12,-17,-3,7,7,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-10,-12,-10,-12,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,42,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,-6,-17,-11,-8,-16,-18,-20,-12,-10,-15,-12,-6,13,-10,-14,12,30,-7,-29,-16,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,0,15,-35,-20,31,-22,5,-20,0,2,-12,48,8,-2,-12,-30,-22,-3,31;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-33,-17,-7,-16,-23,-20,-6,-17,-3,-6,-23,49,-13,-20,-17,-10,-16,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,31,-18,15,0,-20,0,5,-20,-2,-30,-20,48,-18,0,-2,17,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-30,-8,1,-26,-6,-1,-29,18,-22,-9,0,-18,17,43,-6,-12,-24,-20,-13,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-13,-2,-3,-22,11,-12,-23,-12,-30,-20,8,-12,-3,-12,34,14,-13,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,0,-20,-20,66,-30,4,-20,-3,7,-20,10,24,-10,-17,-27,-27,10,0;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-8,-9,-7,-12,-8,-14,-9,-8,-10,-9,-2,-8,-7,-11,15,22,-1,-22,-12,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-7,1,46,-8,-13,-13,-13,-10,-17,-13,-16,-13,5,-22,-13,-13,-2,-4,-11,-31,-17,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-13,8,0,-13,-2,15,-14,-3,-19,-11,26,-12,1,-2,9,1,-17,-25,-8,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-23,0,13,-29,-16,19,-17,5,-16,0,1,-9,41,7,-1,-9,-23,-17,-4,26; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,94,-23,-23,-16,-23,-23,-23,-23,-16,-16,-16,-31,-23,-23,-8,-8,-8,-39,-23,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=14,-2,-10,-10,-7,-15,-10,-17,-13,-10,-15,-13,0,-10,-7,-12,23,30,-3,-30,-15,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-2,-27,-2,2,-22,-17,50,-27,1,-22,-5,7,-17,15,15,-1,-10,-25,-28,4,5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,15,-35,-20,8,-22,15,-20,-2,0,-12,48,24,-2,-10,-28,-20,-10,31;
MA   /M: SY='T'; M=2,6,-12,-2,-5,-15,-10,-12,-15,-8,-20,-15,13,-12,-5,-8,26,32,-8,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00749;
//
ID   TP2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00971;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nuclear transition protein 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3808875; R2=0.0105031; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1289; N_SCORE=17.909; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,0,-20,-20,69,-30,2,-20,-3,7,-20,10,21,-10,-17,-27,-27,11,0;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-4,-30,-4,0,-16,-21,60,-24,-1,-17,-2,3,-20,15,11,-10,-16,-26,-19,19,3;
MA   /M: SY='C'; M=2,-8,44,-12,-12,-20,-12,-18,-24,-18,-26,-20,-2,-22,-12,-18,19,8,-10,-44,-24,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,-7,-15,-10,-6,-17,-8,-13,-11,-10,-17,-6,-2,-1,-4,-13,18,13,-6,-31,-17,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-6,-13,-10,-12,-15,-2,-18,-12,-13,-16,-12,-1,-15,-12,-13,19,22,0,-32,-16,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-13,-15,-13,-4,-19,-17,10,-13,1,1,-6,-10,-10,-13,3,18,8,-18,-4,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-10,-27,-10,-6,-12,-23,51,-16,-9,0,4,-3,-23,2,5,-16,-16,-17,-26,10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-22,-3,0,-20,-12,24,-26,2,-24,-11,7,-16,6,17,11,0,-19,-31,-6,0;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-14,56,-20,-23,-23,5,-24,-32,-24,-24,-20,-10,-30,-23,-24,0,-9,-16,-39,-29,-23;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-13,-1,0,-20,-3,-9,-21,-4,-29,-19,9,-11,1,1,33,16,-11,-37,-19,0;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-14,58,-20,-20,-15,-27,15,-27,-22,-18,-12,-11,-33,-16,-19,-11,-13,-16,-35,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11,59,-7,-17,5,-1,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-22,17,2,-22,-3,7,-22,8,-30,-18,51,-18,2,5,7,-2,-28,-37,-18,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,28,-17,11,-3,-17,-6,1,-17,-3,-24,-17,42,-17,-3,-3,13,15,-21,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-18,-33,-24,28,-30,-22,16,-28,33,13,-27,-30,-27,-20,-24,-8,13,-13,7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=5,-27,-13,-28,-24,0,-25,-26,21,-21,18,10,-27,-27,-24,-20,-13,-3,31,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-4,11,-20,2,-3,-18,-9,-5,-11,-1,-22,-13,24,-16,-2,-3,12,3,-13,-34,-16,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=11,-13,-19,-19,-12,-17,-1,-11,-3,-10,-4,12,-12,-17,0,-13,-4,-7,-1,-21,-13,-6;
MA   /M: SY='V'; M=12,-24,-13,-29,-24,-6,-23,-27,22,-19,6,6,-23,-23,-23,-22,-6,-2,33,-26,-11,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-22,-14,-8,-14,-17,-13,-4,-3,-13,-6,-1,-16,-3,9,8,2,-2,-28,-11,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,15,-35,-20,1,-25,28,-25,-5,0,-10,37,19,-5,-10,-25,-20,-10,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,14,-34,-20,7,-23,16,-20,-3,0,-13,45,28,-3,-10,-27,-20,-10,28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,15,-27,45,-9,-10,-6,0,-11,-27,-4,-7,-17,-13,-16,12,62,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='T'; M=12,-5,-13,-13,-8,-15,-14,-17,-13,-4,-12,-10,-3,-12,-7,-1,12,26,-3,-25,-13,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-27,-9,0,-20,-20,-4,-27,27,-20,-10,0,-17,7,53,-6,-2,-17,-21,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,3,-23,-20,2,-28,27,-20,-8,0,-18,18,61,-8,-10,-22,-20,-10,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00749;
//
ID   UCH_2_1_MP; MATRIX.
AC   MP00972;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0102587; R2=0.0169286; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=100; N_SCORE=7.693; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-24,3,7,-21,-11,-7,-18,3,-18,-11,2,-9,-1,-3,1,-2,-13,-28,-14,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-21,-9,-3,-11,-17,-5,-12,2,-12,-4,-4,-12,-1,1,-2,-2,-10,-20,-2,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-7,-5,-24,-5,-1,-13,-13,-11,-8,-8,-7,-6,-5,-12,-6,-9,-5,-4,-8,-23,-9,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,0,4,-20,-15,-11,-16,2,-14,-10,-4,-3,-1,-2,-3,-3,-13,-27,-14,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-3,-11,-2,5,-13,-9,-3,-10,-1,-11,-6,-2,3,2,-3,1,-3,-10,-17,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-14,-1,1,-10,-4,-4,-10,-1,-8,-6,-2,0,-2,-3,-2,-4,-9,-13,-6,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: M=-8,-6,-24,-5,-2,-14,-14,-9,-11,-7,-7,-7,-6,-10,-5,-7,-5,-6,-11,-23,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-24,1,4,-20,-12,-6,-18,-1,-16,-10,-2,-11,1,-5,-2,-6,-15,-18,-11,2;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: M=-2,-9,-23,-10,-5,-14,-14,-14,-8,-6,-11,-7,-6,-7,-6,-8,-2,-4,-6,-19,-11,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-22,-8,-4,-15,-17,-6,-12,3,-11,-3,-6,-6,-2,6,-8,-7,-10,-21,-7,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-13,-1,-1,-10,-7,-1,-10,-1,-10,-6,0,-4,-1,2,0,-1,-8,-14,-5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: M=-3,-4,-25,-4,0,-19,-1,-9,-19,-7,-16,-10,-3,-3,-3,-10,-1,-5,-16,-25,-16,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-7,-5,-23,-5,-3,-17,-14,-6,-12,-4,-12,-8,-4,0,-3,-5,-4,-3,-13,-23,-9,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-24,-14,-14,-13,13,-14,-18,-12,-14,-9,-6,-18,-12,-11,-5,-9,-15,-13,-10,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-21,-20,-14,-2,-20,-15,0,-13,1,-1,-18,-4,-14,-14,-12,-6,-1,-15,-1,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-4,-17,-12,-11,-22,-17,-5,-6,-9,-5,-11,-16,-10,-3,0,7,4,-27,-11,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,14,-32,-21,24,-29,39,19,-27,-28,-21,-22,-27,-10,13,-17,3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-25,-11,-1,-17,-22,-6,-7,3,-11,-3,-6,-12,3,4,-5,-4,-6,-21,-7,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-20,19,-1,-20,3,9,-21,-1,-30,-20,57,-20,-1,-1,10,-1,-30,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-22,-23,-15,1,-26,-9,9,-19,23,12,-19,-23,-10,-12,-19,-7,4,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-28,-11,-20,-27,61,-18,-37,-19,-28,-19,-2,-20,-19,-20,-1,-19,-28,-18,-24,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-3,31,-19,13,-1,-21,0,6,-19,-1,-27,-17,47,-18,1,-3,10,0,-26,-36,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-10,-11,-12,-11,0,-11,-9,-11,19,38,-2,-29,-11,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-21,-28,-24,42,-30,3,-2,-18,1,-2,-21,-30,-21,-15,-20,-11,-8,26,57,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-15,-32,-22,12,-26,-13,18,-21,26,33,-23,-25,-14,-17,-22,-10,10,-18,2,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-5,32,-19,18,0,-21,-1,5,-20,-2,-29,-20,47,-18,-1,-3,14,3,-25,-39,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=19,-5,-2,-8,-6,-19,-3,-15,-16,-12,-22,-16,1,-13,-6,-14,27,12,-5,-35,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-14,-27,-22,-3,-26,-25,19,-21,11,7,-19,-22,-20,-20,-6,6,23,-26,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-31,-22,6,-30,-21,26,-27,35,21,-26,-26,-19,-21,-23,-8,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,-2,18,-34,-20,9,-19,8,-19,0,-1,-11,55,9,-1,-10,-29,-19,-8,37;
MA   /M: SY='C'; M=3,-11,26,-18,-16,-15,-15,-18,-12,-17,-14,-9,-8,-24,-14,-18,3,0,-2,-34,-17,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-31,-22,13,-31,-19,21,-28,41,18,-28,-29,-21,-20,-27,-10,12,-17,4,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-20,-12,-25,-20,22,-23,-12,-1,-18,2,0,-15,-24,-20,-14,-7,-2,2,-11,12,-19;
MA   /M: SY='H'; M=0,-3,-20,-9,-7,-8,-6,5,-13,-9,-14,-3,4,-17,-2,-9,4,-3,-13,-22,-3,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-13,1,-22,-20,-4,-26,-22,6,-20,1,-1,-8,-21,-17,-19,-3,9,7,-28,-9,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-30,-4,1,-23,-18,-6,-18,-2,-21,-12,-8,29,-3,-6,-5,-6,-20,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-27,2,10,-22,-15,-8,-18,-4,-16,-13,-5,11,2,-8,0,-4,-19,-28,-15,5;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-34,-25,40,-28,-20,9,-28,25,9,-24,-28,-29,-20,-22,-9,6,-4,13,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-13,-21,-16,-9,-12,-21,-10,-8,3,-8,-3,-8,-17,-2,17,-5,0,-3,-21,-6,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-23,18,14,-27,-15,1,-25,6,-21,-15,11,-13,8,7,0,-6,-22,-31,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-13,-21,-16,-14,2,-20,-5,-2,-12,2,0,-12,-21,-11,-11,-11,-6,-3,-11,10,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-18,-31,-24,22,-29,-19,16,-24,20,13,-24,-26,-24,-19,-19,-7,15,-13,8,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-20,-14,7,-25,-13,5,-13,19,8,-16,-24,-14,-11,-18,-8,1,-16,3,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-22,3,6,-19,-13,-3,-19,2,-17,-11,6,-13,3,4,5,1,-16,-29,-13,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00750;
//
ID   UCH_2_2_MP; MATRIX.
AC   MP00973;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3119960; R2=0.0149648; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=163; N_SCORE=7.741; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-17,-7,-1,-11,-17,-11,-15,-1,-13,-9,-4,-10,-5,-1,-1,1,-10,-26,-11,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-6,-3,-19,-3,-1,-11,-16,-11,-8,-7,-6,-6,-4,-6,-5,-9,-4,-4,-9,-23,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-6,-8,-17,-9,-4,-8,-18,-12,-6,-7,-3,-2,-8,-14,-7,-8,-5,-1,-5,-22,-6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-19,-2,2,-14,-12,-8,-7,-5,-6,-4,-5,-2,-1,-4,-3,-3,-8,-20,-10,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-5,-2,-10,-2,0,-11,-8,-7,-11,-4,-10,-6,-2,0,-2,-6,-1,-2,-10,-18,-10,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-9,-20,-10,-7,-4,-20,-5,-10,-7,-10,-5,-8,-8,-6,-8,-6,-4,-10,-17,4,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: M=-5,-5,-19,-7,-2,-14,-16,-9,-9,-4,-9,-4,-4,-14,-3,-3,-2,-2,-6,-26,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-11,-3,-2,-13,-9,-8,-14,-5,-14,-10,2,-8,-2,-5,2,-1,-12,-20,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-15,8,6,-17,-5,-3,-16,1,-15,-10,4,-3,3,-3,3,-1,-13,-17,-10,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,-1,-19,1,1,-15,-13,-11,-15,0,-13,-9,-3,-7,-3,-5,-2,-4,-12,-24,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,0,-17,-3,-5,-14,-6,-10,-13,-5,-13,-9,3,-13,-6,-8,2,0,-10,-26,-11,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-17,2,4,-16,-3,-7,-17,-3,-15,-11,2,-7,-2,-6,3,-1,-13,-22,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-3,4,-21,2,0,-17,-8,-6,-16,-1,-17,-11,6,-9,-1,-4,3,-2,-14,-25,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-7,1,-22,2,2,-23,-6,-10,-18,-3,-17,-11,1,-7,-1,-6,-2,-5,-15,-28,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-22,1,3,-22,-15,-8,-17,-5,-18,-13,-3,7,-1,-9,1,0,-16,-29,-15,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-14,-16,-16,-13,-6,-16,-3,-8,-10,-8,-3,-10,-15,-9,-8,-9,-7,-5,-18,2,-13;
MA   /M: M=-6,-10,-23,-12,-8,-12,-19,-11,-5,0,-6,0,-8,-12,-7,-2,-7,-3,-2,-23,-8,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,31,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-26,14,13,-25,-12,-2,-24,7,-21,-15,9,-13,6,8,0,-7,-20,-29,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-20,-23,-17,14,-26,-2,3,-14,1,3,-14,-23,-14,-11,-11,-5,1,-9,17,-17;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,-14,-12,-11,-23,20,-18,-21,-13,-21,-15,-2,-14,-11,-18,13,-2,-12,-25,-23,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-14,-31,-29,5,-31,-28,30,-22,14,11,-27,-28,-28,-21,-13,-1,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-15,-29,-25,1,-29,-25,25,-23,15,11,-22,-25,-22,-22,-12,-3,26,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-7,-3,-13,-13,-11,-19,-15,1,-13,-9,-4,-1,-22,-13,-14,2,2,8,-32,-13,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-8,-18,-10,-5,-9,-17,6,-12,-5,-12,-3,-4,-17,-2,-3,2,0,-9,-23,1,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,0,-12,-4,-5,-10,-3,-8,-9,-4,-11,-7,4,-10,-4,-4,6,6,-6,-16,-9,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,3,-14,3,2,-17,2,-7,-17,-6,-18,-12,5,-9,1,-7,13,6,-13,-24,-14,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=6,-18,-12,-22,-15,-7,-18,-15,2,-17,5,7,-16,-10,-13,-17,-6,-2,3,-25,-10,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-9,7,-24,5,2,-20,-8,16,-22,-4,-21,-11,11,-16,3,-1,5,-3,-20,-28,-5,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-15,-4,-7,-18,10,-7,-24,-10,-23,-16,5,-17,-8,-8,11,-1,-17,-26,-13,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,31,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-20,-18,-26,-22,4,-28,-18,12,-18,3,3,-18,-22,-17,-17,-8,6,13,-6,7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,5,-15,-11,-17,-9,-19,-12,-13,-14,-12,-5,-15,-11,-17,14,11,-1,-30,-19,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-14,-25,-14,-16,21,-27,9,-5,-15,0,-2,-14,-27,-14,-13,-17,-11,-9,9,40,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,0,-30,-24,-7,-28,-25,17,-19,4,5,-19,-24,-20,-18,-10,-5,20,-27,-11,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-26,-8,-1,-12,-21,-3,-21,24,-16,-7,-2,-18,3,26,-12,-10,-16,-15,2,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='B'; M=-7,13,-21,13,2,-23,-10,-3,-21,3,-22,-15,13,-12,0,-2,3,-3,-17,-30,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-24,-4,3,-14,-12,-7,-16,-1,-15,-10,-1,-6,-1,-2,-1,-4,-14,-24,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-20,1,2,-16,-12,-7,-11,0,-10,-7,-2,-7,0,-3,-2,-2,-9,-22,-10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='B'; M=-8,8,-22,8,3,-16,-10,0,-19,2,-18,-12,8,-10,-1,2,1,-3,-17,-24,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,2,-15,2,-3,-16,15,-5,-17,-5,-14,-9,5,-9,1,-5,2,-6,-14,-14,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-4,3,-23,-5,-6,-22,7,-20,-10,1,-13,6,9,0,-7,-18,-24,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-32,-43,-34,-25,6,-19,-24,-16,-17,-16,-15,-31,-27,-17,-16,-31,-24,-23,106,21,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-22,-22,-17,15,-22,-5,-2,-15,2,0,-17,-23,-15,-12,-16,-10,-4,2,20,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-13,-7,-2,-7,-14,-4,-6,3,-4,-2,-5,-11,-2,1,-5,-1,-4,-11,0,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,6,-14,5,0,-16,-16,-5,-19,2,-16,-12,7,-18,-3,2,-2,-5,-16,-27,-8,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00750;
//
ID   MANNITOL_DHGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP00974;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mannitol dehydrogenases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9518638; R2=0.0140952; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=262; N_SCORE=8.635; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=4,-18,-18,-21,-13,8,-20,-15,-1,-11,2,-1,-16,-21,-16,-13,-8,-5,4,-13,4,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-25,9,18,-25,-16,-5,-20,7,-16,-12,3,-11,10,1,1,-5,-17,-29,-15,14;
MA   /M: SY='K'; M=5,-5,-22,-7,1,-19,-8,-1,-19,6,-16,-9,-3,-14,0,-1,1,-5,-14,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-23,-19,-8,-5,-24,-13,1,-4,11,4,-16,-21,-8,-1,-15,-8,0,-17,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-22,25,6,-15,-13,-7,-22,-7,-19,-19,5,-14,-6,-12,5,-1,-14,-29,-9,0;
MA   /M: SY='E'; M=2,-3,-25,1,18,-22,-17,-11,-17,1,-11,-11,-8,2,1,-7,-4,-8,-14,-27,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-24,12,21,-28,-13,0,-27,10,-24,-16,4,-8,10,1,6,-4,-21,-30,-15,15;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-9,-24,-9,-9,9,-25,-10,0,-15,12,1,-11,-23,-14,-13,-17,-9,-4,-15,7,-12;
MA   /M: SY='A'; M=10,-11,-21,-17,-7,-11,-16,-11,-9,0,-11,-5,-8,-9,-5,-7,-3,-3,-6,-19,-8,-7;
MA   /M: SY='A'; M=14,-8,-21,-11,-8,-23,12,-16,-21,-6,-19,-12,-5,-8,-6,-12,5,-3,-14,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-19,-36,-20,-13,2,-20,-9,-14,-12,-14,-12,-17,-18,-8,-13,-20,-16,-22,56,23,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-20,-33,-25,10,-29,-24,24,-26,24,13,-24,-25,-23,-23,-18,-7,20,-18,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,16,-27,19,28,-29,-8,-2,-29,9,-26,-20,13,-8,9,1,4,-6,-27,-31,-19,19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,13,-25,13,16,-26,-13,-3,-24,9,-19,-15,10,-11,7,4,-1,-7,-21,-28,-16,11;
MA   /M: SY='N'; M=-11,3,-25,-4,-4,-11,-16,9,-16,0,-14,-7,10,-19,2,0,-4,-5,-19,-15,1,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-19,-32,-28,4,-33,-24,33,-22,14,12,-26,-27,-24,-22,-15,-5,35,-19,4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-23,-11,-15,-18,26,-8,-26,-15,-21,-14,-2,-18,-13,-15,5,-1,-18,-19,-10,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-19,-36,-27,70,-27,-19,-2,-28,6,-2,-17,-28,-36,-19,-14,-7,-1,5,25,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-22,-30,-16,-8,-21,-21,-22,-6,-13,-15,-11,-22,51,-15,-20,-10,-7,-8,-29,-23,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-12,35,-17,31,4,-27,0,2,-28,-3,-30,-23,37,-17,-3,-7,7,-4,-28,-39,-21,1;
MA   /M: SY='S'; M=10,-8,4,-13,-12,-17,-5,-19,-14,-14,-17,-13,-4,-16,-12,-16,17,15,-2,-33,-19,-12;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-14,-24,-14,-9,-11,-13,3,-12,6,17,-15,-15,-8,-16,-4,-1,4,-21,-10,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-25,-10,-26,-26,-2,-28,-28,23,-18,6,6,-25,-26,-26,-18,-5,9,41,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,80,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='A'; M=10,0,-20,-9,-7,-17,-10,-10,-10,-6,-11,-9,6,-5,-7,-6,0,-4,-11,-27,-17,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-9,-3,-12,-4,-20,-16,-11,-8,-6,-11,-4,-8,-15,8,-8,3,1,-2,-25,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-19,0,2,-20,-9,-8,-21,9,-18,-11,1,-10,-1,2,4,10,-13,-23,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-12,10,-25,9,2,-20,-15,14,-15,-7,-17,-10,11,-1,-1,-8,-3,-6,-18,-29,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-14,15,-30,23,28,-31,-18,11,-32,17,-25,-16,6,-8,11,7,-4,-11,-27,-29,-11,19;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,29,17,-28,-11,-2,-28,6,-26,-21,20,-10,4,-1,6,0,-24,-35,-18,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-27,-17,-6,-11,-24,-17,2,-9,2,0,-17,10,-9,-7,-15,-9,-4,-22,-11,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-21,-23,-14,-1,-26,-17,8,-14,27,11,-22,-25,-11,-6,-22,-9,5,-21,-4,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,6,-29,10,18,-15,-18,-1,-23,3,-21,-16,3,0,2,-4,-3,-7,-23,-21,-3,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-17,-22,-24,-3,-30,-26,27,-21,12,9,-23,-26,-24,-21,-13,-4,34,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='A'; M=5,-1,-19,-3,0,-15,-14,-7,-10,-6,-10,-3,-5,-13,-1,-11,4,3,-6,-22,-5,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-12,-18,-9,-12,-13,-25,-17,9,-12,2,3,-17,-23,-7,-13,-9,-4,18,-28,-10,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,0,23,-14,-19,0,-19,-3,-11,-11,-4,-9,6,-6,-1,-3,-17,-24,-10,15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-23,-14,-21,-16,-14,-16,-24,-10,-18,-11,-10,-22,14,-18,-21,-13,-8,-10,-10,-16,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00751;
//
ID   NMT_1_MP; MATRIX.
AC   MP00975;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2501664; R2=0.0119777; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=998; N_SCORE=16.194; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-26,-31,-23,-5,-34,-23,28,-15,9,11,-17,-22,-15,-5,-16,-8,22,-22,-4,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-14,-15,-19,-16,-6,-23,-21,9,-18,4,1,-11,-18,-14,-16,5,18,12,-29,-9,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,5,-24,7,4,-24,-15,-6,-27,16,-24,-15,5,-13,4,25,4,4,-17,-28,-13,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,5,-32,-20,30,-27,35,27,-25,-25,-17,-22,-25,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-5,-7,6,-23,-22,-7,-30,20,-22,-13,-3,-18,5,35,-8,-10,-20,-27,-15,3;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-10,-25,-25,-4,-25,-26,21,-18,3,5,-23,-26,-25,-18,-1,4,39,-32,-12,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-3,-28,-7,-4,-11,-18,5,-23,18,-18,-10,7,-22,5,44,-8,-8,-20,-14,5,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,23,-27,33,8,-34,2,-8,-34,4,-27,-22,9,-12,-3,-6,0,-10,-24,-31,-20,2;
MA   /M: SY='K'; M=-12,7,-28,6,16,-27,-17,-3,-28,31,-27,-14,10,-11,10,25,-5,-8,-24,-25,-14,13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-20,-26,-16,-5,-32,-25,27,-19,9,9,-22,-22,-19,-20,-12,-5,31,-27,-8,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-35,-27,2,-33,-24,36,-25,24,24,-24,-24,-19,-23,-20,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,7,-30,10,11,-31,-19,-9,-31,43,-30,-13,3,-10,9,24,-9,-10,-21,-23,-11,10;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-13,-17,-16,-11,-11,-16,-10,2,-3,-5,16,-10,-17,-4,-6,1,1,7,-28,-9,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=26,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25,9,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,24,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-30,25,43,-32,-18,-2,-32,16,-24,-20,4,-4,14,4,-2,-10,-28,-30,-18,29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-18,-32,-24,61,-24,-18,-4,-26,2,-4,-14,-26,-32,-18,-8,-4,-2,0,20,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,0,10,-30,-17,-7,-27,34,-29,-10,2,-10,16,20,0,-5,-20,-23,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-30,-10,-4,-22,-3,-4,-32,20,-22,-12,0,-20,4,53,-8,-12,-22,-20,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-17,-10,-17,-6,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,15,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,30,-25,25,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00752;
//
ID   NMT_2_MP; MATRIX.
AC   MP00976;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0120363; R2=0.0144738; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=849; N_SCORE=17.290; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=103; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,12,-16,-4,-21,-9,-19,-17,-11,-13,-13,-10,-14,-10,-19,5,-3,-6,-27,-22,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,44,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,16,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,20,-18,25,5,-25,-10,-9,-25,-6,-24,-21,11,-10,-3,-10,18,17,-15,-37,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-17,-24,-18,3,-24,-20,14,-25,29,11,-22,-26,-18,-18,-14,-3,12,-25,-5,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-22,-24,-12,-5,-23,-4,12,-12,21,37,-19,-21,6,-9,-19,-10,2,-20,-2,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-30,47,27,-35,-14,15,-36,1,-26,-23,13,-9,7,-6,-1,-11,-30,-36,-14,16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,0,-29,0,10,-27,-15,-10,-23,10,-26,-16,1,23,1,-1,-3,-7,-24,-28,-21,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-22,-13,-7,-4,-22,-8,-7,2,-1,-1,-10,-19,-5,-1,-7,0,-7,-14,8,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-24,-24,-31,-24,47,-30,1,3,-24,6,3,-16,-27,-26,-17,-19,-11,-1,3,32,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-22,-35,-25,29,-32,-22,20,-30,32,14,-25,-28,-26,-22,-25,-10,11,-11,9,-25;
MA   /M: SY='E'; M=1,8,-24,11,18,-28,-13,-8,-27,16,-25,-16,3,-8,6,4,4,-4,-19,-28,-17,12;
MA   /M: SY='D'; M=-14,27,-30,33,11,-33,-12,-3,-31,10,-30,-22,17,3,1,-1,-2,-8,-28,-34,-19,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,5,-26,-17,-2,-29,-18,6,-25,29,10,-25,-30,-13,-18,-23,-10,2,-26,-7,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=3,-8,-3,-9,2,-22,-17,-16,-16,-3,-19,-13,-7,-2,-4,-10,3,-3,-11,-31,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,3,-23,-9,-11,19,-17,1,-10,-11,-11,-8,14,-24,-8,-7,-6,-6,-17,-11,12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,19,-25,10,8,-28,-10,21,-21,3,-25,-10,30,-16,25,4,4,-6,-30,-31,-11,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,52,-30,2,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,58,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-28,-38,-28,-24,22,-26,0,-8,-14,-8,-8,-28,-30,-14,-14,-28,-18,-18,78,60,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,3,-28,0,6,-26,-17,-4,-28,37,-27,-12,9,-14,8,37,-7,-8,-22,-23,-12,6;
MA   /M: SY='C'; M=7,-14,62,-24,-21,-18,-20,-26,-21,-21,-16,-16,-14,-27,-21,-24,1,4,-6,-38,-24,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-34,-12,-4,-21,-15,-14,-19,-8,-24,-16,-10,26,-1,-13,-9,-11,-26,6,-13,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-2,-29,6,4,-29,-13,-13,-24,1,-30,-20,-3,35,-3,-8,4,-2,-23,-32,-23,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-23,-35,-26,0,-31,-18,35,-21,19,35,-21,-21,-13,-21,-19,-9,25,-21,-1,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00752;
//
ID   FAD_G3PDH_1_MP; MATRIX.
AC   MP00977;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6522508; R2=0.0131812; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=897; N_SCORE=16.466; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-25,-6,5,-16,-21,8,-10,-4,-3,2,-6,-16,6,2,-9,-8,-11,-25,-5,4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=2,-13,-16,-19,-14,-4,-18,-16,7,-17,13,6,-10,-18,-12,-15,-6,4,4,-23,-7,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-25,-19,-13,-3,-24,-17,4,-8,1,6,-14,-5,-11,-11,-13,-4,-1,-10,-3,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=0,2,-20,-2,4,-21,-13,-9,-18,8,-20,-11,4,-3,4,3,6,8,-15,-25,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-21,-3,4,-15,-17,-10,-10,1,-4,-6,-3,-10,-3,-1,-7,-3,-9,-24,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-14,-22,-17,-7,-8,-20,-13,1,-8,-1,4,-12,-3,-5,-8,-7,-2,-2,-20,-8,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,6,-23,6,4,-24,-10,-3,-18,3,-13,-8,4,-14,11,3,-2,-5,-18,-24,-12,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=1,7,-19,1,-1,-19,-3,-9,-17,0,-19,-13,12,-12,-4,-5,7,5,-14,-27,-16,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-25,7,24,-26,-14,-3,-25,4,-21,-16,1,-3,10,1,6,3,-22,-29,-16,16;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-19,-2,14,-21,-18,-11,-14,0,-14,-11,-4,-9,5,-5,7,9,-8,-28,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-24,-25,-19,32,-27,-1,0,-13,5,5,-18,-26,-16,-11,-17,-8,-4,7,39,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-31,-26,4,-31,-26,28,-25,25,15,-29,-29,-25,-21,-18,-5,34,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-20,-32,-23,6,-29,-24,25,-26,28,14,-25,-25,-21,-23,-19,-7,19,-20,-2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=8,-24,-23,-34,-24,-6,-28,-27,32,-24,11,11,-18,-18,-18,-27,-11,-7,22,-21,-6,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,9,-13,-3,-8,-12,-15,-13,-11,-8,-14,-12,14,-14,-8,-8,16,34,-5,-33,-13,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-4,-20,-15,-15,-10,-22,-3,-13,-8,-7,-12,-16,-15,-19,8,6,10,-26,-17,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-25,4,-32,-27,-4,-33,-28,22,-25,10,7,-21,-25,-23,-25,-12,-1,23,-29,-9,-27;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,4,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='L'; M=1,-24,-18,-25,-17,-1,-23,-19,9,-17,24,9,-22,-25,-15,-8,-17,-7,9,-21,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-30,55,20,-40,-12,2,-36,2,-28,-24,16,-10,13,-6,0,-10,-30,-36,-18,16;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-3,-19,-12,-20,1,-21,-13,-12,-12,-11,-9,-13,-12,-20,9,2,-3,-23,-21,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-11,-17,-9,-19,-4,-18,-9,-10,-12,-9,-8,-12,-7,-17,12,2,1,-24,-19,-8;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-17,-12,-9,-16,2,-17,-14,-13,-8,-9,-3,-15,-10,-14,7,11,-8,-25,-16,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-26,-11,-2,-20,-16,-4,-26,22,-19,-11,-1,-18,6,51,-4,-7,-16,-21,-12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-24,2,8,-26,-14,-8,-26,28,-28,-13,7,-11,7,19,3,-1,-19,-27,-13,7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-23,-23,-3,-27,-27,17,-17,3,3,-20,-23,-23,-17,0,17,33,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-18,-8,-26,-18,-2,-10,-22,0,-19,3,-2,-16,-19,-19,-21,-4,-5,5,-19,-10,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-21,8,-29,-19,21,-28,44,22,-29,-29,-19,-19,-28,-9,13,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,0,-30,-26,0,-30,-26,20,-25,17,9,-26,-29,-24,-22,-14,-4,26,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-11,-23,-16,-6,-15,-18,-5,-6,11,-3,17,-10,-16,6,11,-11,-9,-6,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,12,-29,17,13,-34,-14,20,-28,3,-22,-9,7,-13,27,4,-1,-9,-28,-27,-8,19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27,55,-31,-21,9,-30,22,7,-23,-29,-33,-21,-23,-10,5,-1,19,-27;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,17,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-8,-1,11,-20,-12,-8,-21,-5,-21,-15,1,-11,9,-7,16,6,-16,-31,-16,10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-28,-8,-13,-28,50,-5,-36,-17,-27,-17,0,-18,-14,-17,0,-18,-28,-22,-23,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00753;
//
ID   FAD_G3PDH_2_MP; MATRIX.
AC   MP00978;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7211213; R2=0.0163774; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=11.902; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=0,18,-23,20,13,-28,-9,-5,-27,7,-26,-19,13,-10,3,-2,7,-3,-21,-32,-18,8;
MA   /M: SY='H'; M=-18,4,-28,8,0,-19,-20,63,-24,-11,-11,-2,6,-20,3,-5,-11,-17,-24,-30,10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=15,-11,-16,-15,-2,-4,-13,-16,-7,-11,-9,-9,-9,-13,-10,-15,5,-1,-1,-21,-11,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-23,-24,-17,-8,-16,-24,18,-20,6,6,-19,-22,-19,-21,-12,-8,19,-25,-11,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-15,-28,-17,-13,9,-5,-17,-20,-12,-13,-13,-12,-21,-17,-7,-13,-14,-17,17,2,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-22,6,7,-19,-19,-10,-9,-1,-13,-10,5,-14,-3,-6,0,2,-5,-31,-14,1;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-22,-6,-9,-26,27,-16,-29,-14,-30,-20,2,-1,-10,-16,16,-1,-21,-30,-26,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-27,13,17,-26,-16,-9,-22,4,-15,-15,-3,3,1,-5,-5,-9,-20,-28,-17,8;
MA   /M: SY='S'; M=16,6,-13,3,-1,-22,-3,-11,-19,-8,-23,-18,8,-11,-4,-12,23,12,-10,-33,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-17,-30,56,-20,-37,-18,-30,-20,-3,-3,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-33,-24,15,-32,-23,24,-29,35,16,-27,-28,-24,-22,-25,-9,17,-18,2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,37,-29,29,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='T'; M=9,-1,-10,-8,-7,-14,-12,-17,-13,-10,-16,-13,2,-10,-7,-11,24,35,-3,-32,-14,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-12,-22,-15,0,-11,-21,-4,-14,-6,-7,-11,-16,-17,-18,6,6,6,-19,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-32,-30,-32,-23,13,-27,-18,6,-25,24,6,-32,-30,-19,-19,-32,-16,-4,35,19,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-11,-12,-11,-9,-20,-18,-6,-10,-6,-2,-2,-11,-9,-10,15,43,1,-29,-9,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-16,-6,-3,-16,-4,-17,-18,-9,-15,-13,0,-10,-8,-10,14,30,-9,-28,-15,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-9,-25,-8,0,-12,-22,9,-11,4,-8,-2,-8,-18,2,1,-8,-8,-8,-19,6,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-3,20,-13,25,54,-22,-22,-3,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,10,-27,17,44,-30,-17,-2,-27,7,-20,-18,0,-3,18,-3,1,-9,-26,-29,-19,31;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-29,36,19,-29,-12,-5,-32,-2,-27,-25,7,-10,2,-9,2,-8,-27,-15,-14,11;
MA   /M: SY='A'; M=19,-13,-14,-22,-16,-11,-17,-23,6,-15,-2,-2,-12,-14,-14,-19,5,12,12,-24,-12,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-17,-30,-25,0,-29,-23,27,-21,17,19,-23,-24,-19,-19,-13,1,28,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,38,-24,41,9,-31,-6,0,-29,-2,-27,-24,27,-13,-2,-9,4,-6,-25,-37,-20,4;
MA   /M: SY='A'; M=8,-10,-22,-12,2,-19,-15,-9,-13,3,-5,-4,-9,-15,7,7,-5,-7,-10,-21,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-12,-27,-21,-4,-20,-24,14,-19,13,6,-23,-23,-21,-20,-8,-2,23,-24,-11,-21;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,0,-26,-21,-9,-24,-24,11,-17,-1,1,-17,-23,-19,-15,-4,-2,19,-29,-13,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-29,4,13,-28,-19,-7,-25,16,-24,-13,-1,6,11,12,-3,-2,-22,-26,-15,11;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-14,-22,-16,-13,13,-25,-15,-7,-4,0,-2,-12,-23,-16,4,-12,-4,-1,-15,2,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-20,-25,-22,-16,7,-21,7,-1,-17,10,6,-13,-25,-13,-5,-18,-13,-4,-17,6,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,2,-27,2,-3,-26,4,1,-28,0,-26,-15,5,-1,-5,-4,0,-3,-23,-27,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-8,-22,-12,-2,-2,-19,-9,-7,-7,2,-1,-5,-19,0,-6,-9,-8,-10,-19,-5,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-26,-1,2,-21,-12,1,-22,11,-16,-2,-1,-15,4,17,-5,-4,-16,-25,-10,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00753;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F3_1_MP; MATRIX.
AC   MP00979;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 3 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7740889; R2=0.0139029; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1162; N_SCORE=20.919; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-15,-29,-26,-2,-31,-28,28,-21,9,9,-22,-24,-24,-21,-7,6,36,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,-15,-29,-24,4,-24,-26,17,-20,5,4,-20,-22,-23,-21,-6,1,25,-21,-6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-24,-14,-11,-26,17,-20,-22,-13,-21,-16,-9,11,-13,-20,2,-9,-17,-22,-26,-13;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-15,-4,-7,-21,14,-14,-23,-12,-26,-18,6,-12,-7,-12,27,15,-13,-33,-21,-7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-11,-23,-12,-14,-7,13,-5,-19,-13,-18,-13,-5,-20,-11,-14,5,-5,-15,-9,8,-14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-15,3,-2,-23,12,-11,-25,-11,-30,-21,9,-12,-4,-12,30,11,-15,-36,-22,-3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-23,-32,-25,-1,-34,-27,33,-25,17,13,-19,-21,-20,-24,-13,2,25,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-24,-11,4,-26,-16,2,-8,1,-8,14,-7,-13,32,0,-3,-8,-14,-20,-9,18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,15,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-15,-15,-3,-25,-5,-13,-12,-5,-12,-8,-8,-10,7,-13,8,-2,-7,-20,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,26,-29,41,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-30,-8,1,-27,-4,-1,-29,16,-22,-9,0,-18,17,39,-6,-12,-24,-20,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-9,5,-26,4,1,-17,-16,15,-21,5,-19,-9,7,-17,9,8,-4,-9,-21,-17,6,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,77,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-32,-18,-15,15,-28,10,-5,-10,-7,-5,-20,-1,-10,-12,-18,-10,-15,15,53,-18;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=22,1,-11,-5,-4,-20,0,-11,-16,-9,-22,-16,9,-11,-4,-12,25,10,-9,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='P'; M=0,-15,-27,-17,-7,-19,-18,-14,-8,2,-12,0,-12,12,-4,2,-8,-8,-9,-23,-15,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-26,29,16,-25,-17,-7,-24,-1,-12,-16,4,-12,0,-7,-4,-3,-19,-32,-15,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,61,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,27,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-27,6,9,-29,-15,-8,-29,36,-30,-13,7,-11,7,20,-2,-6,-20,-25,-13,8;
MA   /M: SY='T'; M=-3,11,-14,1,-5,-15,-11,-8,-16,-4,-20,-15,20,-14,-4,-2,18,26,-12,-34,-15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-13,-28,-13,-1,-16,-22,-3,-16,12,-3,-1,-7,-21,11,37,-13,-10,-14,-20,-8,2;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-2,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,24,-30,34,21,-35,-15,-4,-35,22,-29,-20,9,-9,7,8,-4,-10,-26,-30,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-23,-23,-19,32,-25,0,-1,-18,3,-1,-16,-26,-17,-14,-11,-5,-5,7,40,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-14,-19,-12,-9,-11,-15,0,-16,6,5,-12,-17,-9,-16,2,1,2,-25,-12,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00754;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F3_2_MP; MATRIX.
AC   MP00980;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 3 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3265743; R2=0.0078386; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1096; N_SCORE=12.916; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-3,-34,6,6,-32,-17,-11,-24,-3,-28,-19,-7,44,3,-8,-3,-7,-28,-31,-24,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-9,-25,-9,5,-21,-16,-8,-11,1,-3,0,-8,-15,14,-1,-7,-8,-13,-22,-10,9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-31,-5,6,-26,-18,-15,-15,-2,-21,-14,-12,35,-2,-11,-4,-7,-18,-28,-22,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-7,-18,-29,63,-17,-38,-18,-30,-20,6,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-28,1,22,-24,-21,14,-20,3,-16,-3,-1,-10,30,2,-2,-8,-25,-23,-6,26;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-16,-25,-20,-12,-9,-25,2,1,1,-2,13,-11,-21,-1,13,-14,-10,1,-19,2,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-7,-1,-22,-15,-11,-17,21,-18,-6,-2,-16,2,15,-6,-7,-8,-24,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-18,-23,-17,-7,-24,-20,13,-16,4,9,-16,-11,-12,-16,-4,7,15,-26,-9,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-19,-19,-11,-13,-23,-15,6,-4,-3,5,-12,-18,-2,-2,-5,1,10,-23,-8,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-5,-31,-2,5,-30,13,-12,-32,11,-28,-16,-2,-2,1,3,-5,-14,-26,-22,-21,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-25,-10,-16,-11,30,-18,-24,-19,-18,-14,-2,-20,-18,-18,2,-10,-18,-21,-17,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-15,13,20,-18,-9,1,-15,4,-11,-8,2,-3,14,0,0,-5,-15,-15,-9,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-8,-20,-8,-7,-12,-18,39,-9,-10,-9,3,-3,-11,-2,-6,-7,-8,-6,-23,5,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-10,-21,-10,-6,-18,-17,-3,-10,-11,-17,-9,-6,7,-4,-12,7,8,-6,-31,-13,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-32,-37,-35,-28,35,-25,-15,-9,-21,-7,-9,-29,-30,-23,-18,-29,-19,-17,81,42,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,5,21,-21,-22,6,-13,-4,-10,-9,-2,-9,5,-8,-4,-6,-15,-28,-10,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-20,-14,-5,-10,-25,-18,10,-13,4,4,-14,-18,-9,-15,-6,0,13,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-2,4,-28,9,6,-28,-13,-11,-24,-1,-26,-19,0,24,-3,-8,1,-4,-22,-31,-22,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-29,7,21,-26,-16,-8,-22,4,-18,-13,-5,8,5,-4,-4,-7,-21,-28,-18,12;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-26,5,11,-28,3,-12,-26,-6,-23,-19,-3,10,-3,-13,3,-8,-22,-28,-24,3;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-3,-27,-8,-16,-2,15,1,-20,-12,-18,-12,6,-24,-13,-12,-5,-11,-22,-6,13,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-23,5,21,-24,-17,8,-23,2,-19,-13,4,-9,14,2,7,6,-21,-30,-11,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,43,-30,10,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,67,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-8,-9,-8,-5,-3,-9,-7,-2,-6,4,0,-5,-11,-4,-1,0,2,-1,-14,-5,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-5,17,-12,10,2,-13,-1,4,-12,2,-15,-9,24,-9,3,1,3,-2,-15,-19,-10,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-24,-8,2,-17,-22,5,-7,-1,-5,2,-5,-17,10,3,-8,-6,-8,-25,-6,5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-17,-16,-12,-4,-20,-17,-1,-14,-7,-5,-10,-8,-11,-14,6,13,4,-24,-6,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-29,63,22,-38,-10,1,-38,1,-29,-29,21,-10,2,-9,1,-9,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-25,8,28,-22,-18,-5,-18,1,-8,-8,-5,-8,7,-3,-5,-9,-17,-27,-15,18;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-12,-23,-14,-15,24,-24,0,-6,-17,-1,-2,-10,-20,-18,-14,-11,-5,-6,-7,20,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-17,-6,-3,-15,-17,1,-14,-7,-13,-9,4,-12,-3,-6,11,22,-8,-29,-8,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-23,-5,5,-20,-19,-7,-11,3,-7,-1,-5,-14,10,2,-3,-2,-10,-25,-11,7;
MA   /M: SY='P'; M=2,-3,-24,-1,-3,-19,-9,-11,-17,-6,-15,-12,-6,5,-8,-12,-1,-3,-14,-27,-16,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-33,4,-1,-31,15,-13,-30,-10,-29,-21,0,21,-7,-15,-3,-13,-30,-28,-27,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-2,-25,-3,-4,-16,-9,-7,-14,-6,-10,-8,1,-8,-1,-6,-3,-1,-16,-23,-7,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,17,-28,24,15,-32,12,-4,-35,-3,-27,-22,10,-11,-1,-9,2,-11,-28,-31,-22,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-11,-28,-11,6,-8,-21,4,-10,-6,-4,6,-12,-16,9,-6,-12,-12,-16,-1,3,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-46,-35,-25,5,-20,-25,-22,-11,-20,-18,-33,-28,-15,-4,-35,-26,-28,120,23,-16;
MA   /M: SY='P'; M=9,-12,-24,-9,-2,-25,-9,-17,-18,-10,-26,-18,-8,37,-7,-17,10,2,-17,-31,-25,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-25,-4,-6,-12,-17,-6,-13,-8,-18,-13,6,13,-8,-11,1,8,-18,-23,-5,-9;
MA   /M: SY='E'; M=7,-2,-23,-1,16,-24,-16,-11,-16,6,-16,-10,-6,-4,5,-4,-1,-7,-12,-25,-17,10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,24,-25,22,8,-26,-1,1,-28,4,-28,-20,27,-15,2,6,5,-5,-27,-34,-19,4;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-21,-4,0,-15,-14,2,-16,-2,-11,-8,1,-17,0,6,5,0,-12,-29,-8,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-14,-11,-8,-12,-20,-18,-8,-8,-9,-7,-2,-12,-6,-9,15,35,-1,-29,-10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-21,-9,-9,-22,21,-15,-25,-9,-21,-12,0,-15,-9,-9,9,2,-16,-25,-20,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-18,-25,-21,-12,30,-27,-8,-4,-14,1,-1,-13,-23,-12,-6,-15,-10,-7,-1,20,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00754;
//
ID   G_PROTEIN_RECEP_F3_3_MP; MATRIX.
AC   MP00981;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G-protein coupled receptors family 3 signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3305340; R2=0.0159666; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=362; N_SCORE=11.100; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=74; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-21,-21,-17,0,-5,-19,0,-22,5,0,-11,-21,-17,-19,-3,-1,-1,-22,-8,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-15,86,-24,-24,-19,-25,-26,-26,-25,-20,-19,-14,-32,-24,-25,0,2,-9,-46,-26,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-16,-28,-21,38,-26,-20,-1,-22,7,-1,-14,-22,-26,-16,-6,13,1,-8,12,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-13,-21,-19,7,-23,-17,13,-16,9,5,-16,-20,-18,-14,-7,7,17,-16,2,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-4,-29,-24,24,-31,-8,5,-22,11,3,-22,-30,-21,-19,-20,-10,0,-1,31,-24;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-29,-34,-28,34,-30,-15,7,-22,3,0,-25,-28,-25,-19,-23,-13,1,34,34,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-27,-8,8,-17,-25,-13,-9,14,-2,-1,-10,-14,1,5,-14,-10,-9,-22,-8,4;
MA   /M: SY='T'; M=10,-4,-15,-11,-12,-18,7,-19,-18,-12,-16,-13,-1,-12,-12,-14,15,21,-8,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,10,-27,6,11,-26,-8,-3,-28,24,-27,-15,15,-13,7,19,-3,-8,-25,-27,-16,8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-7,-31,-26,3,-31,-26,23,-26,26,13,-29,-30,-25,-21,-19,-6,28,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-34,-8,0,-28,-16,-18,-20,-10,-30,-20,-14,71,-8,-18,0,-4,-26,-32,-28,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-31,16,36,-31,-18,-4,-27,4,-22,-19,-2,15,14,-5,-1,-9,-28,-30,-21,24;
MA   /M: SY='N'; M=5,19,-17,6,-2,-20,-3,-2,-18,1,-25,-16,30,-15,-2,-3,12,5,-19,-33,-18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-26,54,-30,-10,4,-25,15,4,-22,-30,-29,-18,-22,-10,0,9,36,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-14,-7,-19,-2,-17,-13,-10,-15,-13,-4,-10,-7,-16,19,10,-3,-26,-19,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-22,-2,-28,-23,34,-28,-11,-7,-21,-2,-6,-18,-20,-25,-18,-13,-3,-6,-2,25,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-20,-11,-15,-21,27,-20,-25,-15,-20,-15,-1,-15,-15,-16,9,11,-15,-24,-21,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-38,-28,64,-28,-16,4,-26,12,12,-20,-28,-32,-18,-20,-10,2,4,24,-26;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-18,-30,-22,1,-23,-9,22,-15,23,44,-23,-23,-9,-13,-20,-8,18,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-25,-24,-21,20,-30,2,10,-18,18,8,-24,-30,-15,-14,-22,-9,2,8,45,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-17,-14,-15,-6,-22,-17,7,-16,2,0,0,-19,-13,-14,1,16,6,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-1,-17,-18,6,-22,-18,-4,-16,-6,-7,-3,-22,-20,-14,2,16,4,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-21,47,-28,-27,3,-11,-25,-21,-28,-9,-12,-17,-33,-29,-25,-12,-12,-10,-28,-14,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-22,-32,-26,-2,-31,-25,34,-23,12,17,-19,-21,-18,-23,-11,-4,29,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-22,-17,-27,-22,-5,-24,-20,22,-18,7,16,-17,-20,-15,-19,-5,-2,23,-26,-8,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-36,-17,-38,-30,4,-22,-30,-22,-22,-20,-20,-36,-32,-22,-22,-34,-26,-26,111,18,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=21,-13,-16,-20,-13,-14,-12,-20,4,-16,-7,-4,-7,-13,-10,-20,10,3,6,-26,-14,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-25,-34,-28,52,-10,-21,-10,-27,-1,-6,-18,-28,-34,-20,-18,-14,-9,18,18,-27;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-17,-32,-25,9,-27,-26,22,-23,11,8,-22,-23,-24,-23,-12,-5,25,-19,-3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=2,-16,-28,-15,-6,-14,-17,-20,-15,-12,-19,-15,-15,44,-13,-19,-3,1,-17,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=2,-25,-20,-33,-25,4,-27,-23,25,-21,11,16,-20,-21,-19,-22,-12,-6,22,-19,-3,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-15,-21,-19,-15,20,-19,6,-8,-15,-7,-5,-10,-22,-13,-13,-3,-4,-8,-2,28,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00754;
//
ID   PHYTOENE_DH_MP; MATRIX.
AC   MP00982;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial-type phytoene dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2844973; R2=0.0126458; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=716; N_SCORE=13.329; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=176; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,4,-26,1,17,-33,-16,4,-19,6,-19,-6,4,-10,38,3,3,-4,-25,-24,-13,27;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-15,-20,-16,-4,-21,-20,9,-20,9,3,-14,-21,-15,-17,2,7,12,-29,-9,-16;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-19,-21,-17,-16,11,-21,-8,-18,-3,-5,-11,-17,-16,-21,-3,-8,-4,-20,-18,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=0,-22,-33,-22,-13,-11,-14,-23,-17,-14,-21,-17,-21,11,-13,-18,-10,-9,-21,37,-4,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,65,-30,-20,4,-30,19,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-2,-30,-11,-20,-22,-11,-30,-20,-18,79,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-22,-3,1,-18,-14,25,-23,10,-19,-7,4,-14,7,21,0,-6,-18,-23,-2,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,9,-18,-2,-10,-12,-5,-8,-8,-11,-9,-8,19,-21,-10,-9,2,5,-9,-32,-15,-10;
MA   /M: SY='K'; M=2,-9,-24,-12,0,-22,-18,-10,-13,14,-11,-3,-7,-14,8,12,-6,-8,-11,-20,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-7,20,-23,25,4,-26,-10,-5,-24,1,-23,-19,13,-15,-2,2,5,-3,-16,-34,-17,0;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-19,-3,8,-20,-14,-6,-20,10,-18,-11,1,-10,8,14,6,6,-14,-24,-12,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-3,5,-23,8,5,-24,8,-9,-27,-1,-20,-16,2,-12,-3,2,1,-5,-20,-24,-18,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-21,-31,-25,3,-32,-21,28,-23,18,17,-22,-24,-19,-21,-16,-2,23,-19,4,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-3,2,-26,5,9,-26,-17,-11,-22,15,-21,-13,-3,-2,1,6,-4,-6,-14,-26,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=-6,18,-24,7,-9,-24,31,-3,-29,-9,-30,-20,33,-20,-9,-9,6,-9,-30,-31,-24,-9;
MA   /M: SY='L'; M=0,-26,-18,-29,-19,9,-25,-20,14,-26,37,14,-26,-26,-19,-20,-22,-8,8,-18,-2,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-28,-27,-24,37,-29,1,1,-16,1,-1,-23,-30,-20,-14,-21,-11,-4,31,55,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-34,-24,34,-29,-18,13,-28,33,17,-25,-29,-25,-19,-25,-10,6,-9,11,-23;
MA   /M: SY='V'; M=13,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,20,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,37,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-3,-18,-15,-23,17,-21,-20,-15,-17,-14,-8,-16,-15,-21,5,-7,-9,-23,-24,-15;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,46,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,14,-6,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='T'; M=10,-2,-10,-12,-10,-12,-16,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,40,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-28,-1,1,-21,-20,82,-27,-9,-19,-1,8,-18,12,0,-6,-13,-27,-29,15,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-10,-15,-11,-15,-10,-20,-7,-11,-10,-9,-6,-12,-11,-15,15,19,4,-27,-16,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,19,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-25,-21,-20,-15,-12,-21,-15,-21,76,-11,-20,-12,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-13,-21,-21,-19,-11,-5,-19,4,-18,-3,7,-8,-16,-13,-18,0,7,3,-24,-11,-17;
MA   /M: SY='V'; M=6,-26,1,-30,-27,-5,-26,-28,20,-21,5,5,-25,-27,-26,-22,-8,-2,33,-29,-12,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-20,-31,-22,3,-28,-20,23,-25,31,21,-25,-25,-18,-21,-21,-8,17,-21,-3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=12,-12,-21,-17,-8,-17,3,-19,-6,-15,-5,-5,-9,-15,-11,-19,-2,-5,-4,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-15,-3,-5,-23,19,-13,-25,-13,-30,-20,7,-13,-5,-13,29,9,-15,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='G'; M=25,-9,-18,-14,-13,-24,30,-19,-24,-14,-20,-15,-4,-14,-13,-19,8,-7,-14,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-25,1,10,-25,-16,-6,-25,25,-24,-13,6,-12,7,22,-2,-4,-19,-24,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-21,-26,-18,-2,-26,-3,14,-23,21,12,-18,-23,-14,-19,-17,-9,9,-22,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,-11,-20,-15,-11,-15,-21,2,-12,-3,0,-12,-15,-14,-16,6,15,13,-26,-13,-15;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-18,-9,-19,-1,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-18,13,5,-1,-22,-19,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,22,33,-32,-14,-1,-31,10,-24,-18,5,-7,17,5,1,-9,-28,-30,-18,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-13,-23,-16,-5,-12,-20,-3,-6,-2,-1,4,-12,-19,10,5,-9,-8,-8,-15,1,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-23,-34,-25,1,-31,-22,32,-25,25,23,-23,-23,-17,-23,-20,-8,21,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,5,-24,-18,-6,-26,-21,1,-22,10,4,-19,-10,-17,-19,-12,3,0,-29,-12,-18;
MA   /M: SY='D'; M=0,8,-24,12,8,-27,4,-9,-29,-2,-22,-19,3,-11,-2,-2,4,-4,-21,-28,-20,3;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-30,26,17,-29,-13,2,-30,-3,-24,-21,3,-1,1,-10,-3,-11,-26,-19,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-18,-23,-20,-12,0,-20,-13,-5,-10,3,-2,-16,-7,-12,-4,-10,-3,-6,-15,0,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-14,-26,-18,-14,-12,5,-9,-11,-11,-12,-5,-6,-18,-10,-9,-6,-12,-10,-18,-10,-13;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-17,-13,-7,-19,-12,-18,-9,-4,-17,-10,-10,2,-9,-11,7,2,0,-29,-18,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00755;
//
ID   LY6_UPAR_MP; MATRIX.
AC   MP00983;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ly-6 / u-PAR domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2504663; R2=0.0073216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=7.184; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=308; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-22,-24,-13,-2,-24,-18,11,-18,23,9,-20,-23,-13,-10,-18,-7,6,-22,-5,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-23,-24,-17,-2,-12,-20,5,-25,26,8,-23,-14,-18,-20,-21,-11,-1,-21,-9,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-20,-26,-19,3,-17,-20,12,-27,35,13,-25,-27,-19,-20,-22,-9,7,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='V'; M=7,-16,-16,-18,-11,-8,-20,-20,9,-16,7,2,-17,-20,-15,-18,-5,-2,14,-26,-12,-13;
MA   /M: SY='L'; M=1,-18,-18,-21,-12,-5,-22,-16,3,-14,18,6,-17,-21,-8,-7,-11,0,2,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-18,-17,-7,-11,-4,-14,-10,-12,-4,-6,-11,-15,-7,-15,0,-3,-6,-17,-9,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-19,-19,-16,-6,-21,-18,4,-13,2,0,-13,-16,-16,-8,-9,-2,9,-19,-10,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-16,14,-21,-18,4,-21,-20,-11,-22,-2,-8,-14,-15,-22,-21,-9,-7,-7,-25,-10,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-19,13,-23,-18,-8,-17,-22,-13,-19,-10,-8,-17,-1,-20,-21,-7,-4,-7,-28,-17,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-31,-1,9,-28,-6,13,-27,-4,-25,-13,-2,15,7,-6,-2,-11,-28,-28,-14,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-21,-10,-5,-13,-15,-9,-13,-1,-11,-8,-7,4,-4,7,0,3,-11,-20,-9,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=13,-11,-18,-14,-14,-18,24,-17,-16,-15,-12,-10,-5,-15,-13,-17,2,-8,-11,-18,-19,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-8,0,-26,-3,3,-22,-15,16,-19,-1,-18,-8,6,-11,11,4,-1,-8,-21,-21,-7,6;
MA   /M: SY='G'; M=10,-8,-20,-11,-13,-19,25,-13,-24,-14,-22,-16,-2,-16,-12,-16,11,-2,-16,-20,-13,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-28,-19,12,-28,-15,13,-26,37,14,-25,-28,-19,-16,-24,-8,6,-18,2,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,3,27,-33,-20,5,-25,15,-20,-8,0,-10,37,21,-2,-10,-28,-23,-13,31;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-27,-19,-17,19,-26,21,-2,-10,-2,2,-16,-27,-8,-10,-16,-10,-10,17,60,-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-15,-1,-1,-19,-8,-7,-12,-6,-20,-12,12,-15,2,-7,17,8,-8,-34,-17,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-10,-25,-9,2,-12,-23,-12,-8,-7,-7,-7,-10,4,-5,-10,-3,6,-10,-22,-5,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-23,2,-3,-24,20,-3,-28,-9,-26,-17,12,-16,-4,-10,9,-6,-24,-27,-17,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-6,-19,-6,-5,-15,-13,-11,-6,-7,-14,-8,-2,16,-5,-10,0,0,-6,-24,-15,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-14,-7,-6,-12,-9,-3,-9,-8,-11,-5,-1,0,-5,-9,7,12,-6,-23,-9,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=0,-7,-13,-11,-8,-2,-7,-10,-2,-10,1,-1,-5,-8,-7,-9,-3,1,-3,-13,-5,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='B'; M=-4,7,-12,7,4,-12,-4,-4,-8,-3,-10,-8,7,-7,-1,-5,3,-2,-7,-18,-10,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-1,-21,-4,0,-20,-11,3,-15,-5,-14,-6,2,-14,7,-3,6,4,-13,-28,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-21,17,4,-27,2,-5,-27,-4,-28,-20,14,-13,2,-5,16,2,-21,-35,-20,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-6,-22,-6,4,-19,-17,-14,-15,7,-15,-9,-6,-2,-1,0,2,4,-10,-27,-14,1;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-15,-4,-4,-12,-11,-3,-11,-3,-14,-8,8,-8,-3,1,9,14,-9,-25,-10,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=3,-6,-19,-8,0,-16,-3,-14,-8,-9,-11,-8,-4,-8,-7,-13,2,-2,-4,-23,-15,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=0,-19,-19,-23,-14,-6,-25,-19,15,-17,7,7,-16,-19,-9,-17,-7,0,14,-23,-7,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-20,8,5,-23,-14,-3,-16,-2,-19,-12,15,-14,10,-3,8,9,-15,-32,-14,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-24,-7,-1,-21,-15,-2,-22,4,-22,-13,-1,4,0,13,6,5,-17,-28,-14,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-11,-22,-13,-10,-9,-5,-2,-11,-12,-9,-4,-7,-14,-4,-12,1,-1,-11,-16,4,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,11,-29,13,4,-28,-1,-7,-26,-6,-30,-22,13,20,-5,-11,3,-6,-28,-34,-25,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-23,0,1,-9,-20,-5,-10,-8,-3,2,-5,-16,6,-7,-5,-3,-12,-22,-5,4;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-24,22,8,-25,-4,1,-27,-3,-23,-19,14,-13,-1,-5,4,0,-23,-31,-13,2;
MA   /M: SY='A'; M=6,-12,-17,-17,-9,-3,-15,-2,-7,-12,-6,-1,-8,-17,-3,-12,1,-1,-4,-20,-4,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-24,-27,-17,7,-30,-20,12,-11,17,9,-19,-24,-16,-8,-20,-9,8,-17,1,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-18,-15,-5,-10,-23,-18,2,-11,-4,-3,-9,-14,-6,-13,3,13,6,-26,-9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-11,-14,-16,-11,-17,-8,-18,-5,-10,-9,-5,-9,-15,-5,-13,7,8,4,-25,-15,-8;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-19,-4,1,-14,-17,-8,-10,4,-9,-6,4,-15,0,5,-1,4,-7,-25,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-18,-13,-8,-13,4,-15,-9,-13,-8,-7,-7,-14,-10,-15,2,-3,-5,-18,-11,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-8,-11,-8,-5,-2,-13,-4,1,-6,3,5,-9,-12,-6,-6,-7,-4,3,-12,0,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-7,-14,-11,-7,-5,-12,-12,4,-9,-2,-1,-5,-9,-7,-10,-3,2,2,-5,-3,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-14,-20,-15,-3,-21,-20,14,-16,10,5,-19,-12,-16,-16,-9,-2,17,-21,-8,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-4,-23,-3,-7,-9,-9,-2,-11,-3,-11,-6,-6,-18,-2,-4,-7,-8,-8,-10,9,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-18,2,1,-6,-9,4,-14,-4,-18,-12,16,-16,1,-5,8,1,-17,-19,3,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-5,-28,-4,5,-20,-19,-5,-19,3,-19,-9,-5,10,16,5,-3,-3,-22,-21,-11,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-17,-1,5,-16,1,-2,-19,-2,-15,-11,1,-10,1,1,6,-1,-14,-22,-12,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-16,-7,-6,-4,-15,-3,-5,2,-4,-3,-7,-15,-4,9,-6,-4,-1,-10,5,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-5,12,-9,-5,-21,-19,-15,-21,-1,-21,-12,-3,-6,-7,-7,0,1,-15,-34,-19,-6;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-26,-21,-27,-22,4,-22,-22,9,-18,8,4,-26,-24,-19,-16,-19,-7,11,21,4,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-11,-19,-11,-5,-14,-19,-14,-4,13,-10,-2,-9,-8,-5,9,-8,-5,3,-19,-8,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-12,-16,-19,-16,12,-22,-17,1,-13,-3,-3,-5,-19,-17,-10,0,9,4,-18,0,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-26,3,9,-24,-16,-4,-28,25,-23,-13,3,-13,8,33,-4,-7,-20,-23,-12,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-23,9,1,-24,12,-5,-26,-9,-20,-15,5,-14,-3,-11,5,-4,-20,-28,-17,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,113,-28,-28,-19,-28,-28,-28,-28,-19,-19,-19,-38,-28,-28,-9,-9,-9,-47,-28,-28; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=12,-8,-11,-11,-7,-8,-3,0,-8,-10,-5,-4,-5,-11,-7,-11,3,-2,-3,-16,-6,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-3,-14,-2,1,-13,-7,-1,-12,-7,-14,-10,2,6,-1,-7,10,3,-11,-23,-11,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-9,-17,-11,-8,-3,-2,-10,-11,-8,-12,-5,-4,-13,-5,-8,3,-2,-9,-5,-4,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-13,82,-20,-18,-16,-22,-21,-23,-20,-15,-15,-14,-28,-20,-21,-7,-8,-9,-36,-22,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-7,0,-25,-2,4,-23,-17,-9,-17,1,-20,-12,3,12,5,-4,3,6,-19,-29,-17,3;
MA   /M: SY='S'; M=0,-7,-22,-9,-8,-3,-9,-12,-17,-9,-15,-12,-6,-3,-13,-10,1,1,-12,-20,-8,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-21,11,7,-22,-7,-5,-21,1,-21,-14,14,-12,1,-3,8,2,-18,-32,-17,4;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-26,-3,-7,-8,-14,5,-12,-9,-10,-6,-3,-19,-6,-4,-7,-10,-10,-20,2,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-14,-21,-15,-6,-11,-20,-20,4,-14,-2,-3,-12,-7,-11,-16,-1,5,6,-28,-13,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-20,-2,-5,-14,-8,-10,-13,-6,-12,-7,3,-15,-4,-8,5,4,-10,-28,-12,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,3,-23,2,-1,-15,-5,0,-20,-2,-19,-9,6,-15,1,-3,5,0,-17,-25,-7,0;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-26,-8,-2,-13,-12,-6,-11,-5,-11,-6,-5,-8,2,-4,-5,-8,-13,-17,-3,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-25,-25,-17,6,-15,-14,0,-19,9,2,-18,-19,-15,-13,-18,-12,-4,-2,1,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: M=-2,-8,-10,-9,-6,-16,-12,-12,-9,-7,-9,-4,-6,-14,-5,-8,0,-3,-4,-28,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,-1,11,-18,-10,-9,-12,2,-11,-4,-3,-10,2,-4,-2,-7,-11,-24,-12,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,5,-17,-1,0,-20,-11,-7,-18,3,-21,-13,11,-8,3,2,12,13,-14,-29,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-10,11,-25,8,12,-24,-4,17,-25,3,-23,-13,16,-13,8,1,1,-7,-26,-28,-11,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-17,-23,-18,-3,-24,-21,14,-19,13,6,-16,-22,-16,-14,-6,3,14,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00756;
//
ID   UROTENSIN_II_MP; MATRIX.
AC   MP00984;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Urotensin II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=23;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=21;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8414211; R2=0.0129905; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=484; N_SCORE=11.119; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-22,-16,-13,-7,-9,-11,-10,-11,-10,-10,-3,-19,-10,-15,-5,-7,-12,10,1,-11;
MA   /M: SY='R'; M=6,-9,-24,-12,-7,-23,6,-11,-26,9,-20,-12,-3,-16,-2,20,-2,-9,-16,-20,-17,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-18,-14,-14,-8,-22,-19,8,-18,4,0,-9,-18,-13,-17,1,9,9,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-19,7,-31,12,5,-25,-17,-3,-32,20,-24,-17,3,-17,5,37,-9,-11,-24,-14,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-29,0,4,-27,-8,-7,-30,34,-28,-12,6,-14,6,28,-7,-10,-22,-22,-13,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-29,-11,4,-23,-23,-5,-8,-6,-2,2,-13,6,21,-5,-11,-10,-18,-22,-11,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-17,-23,-20,-16,28,-23,6,-9,-13,-6,-5,-10,-24,-15,-5,-7,-5,-9,0,30,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-24,-2,5,-25,-14,-1,-27,25,-28,-12,4,-12,7,22,5,-2,-18,-27,-11,5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,9,-29,-14,-6,-25,25,-28,-11,3,-10,16,15,7,-1,-19,-26,-13,13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,0,-20,-20,48,-30,11,-20,-5,5,-20,10,36,-10,-15,-25,-25,4,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-25,-8,-13,-24,36,-16,-28,-14,-25,-17,1,-1,-14,-16,1,-9,-23,-22,-24,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-22,-3,-1,-22,5,-12,-20,-5,-23,-15,7,-6,-5,-9,10,1,-17,-30,-20,-3;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-22,-9,-7,-14,-3,-14,-18,0,-16,-11,1,-8,-8,-5,0,2,-14,-23,-14,-8;
MA   /M: SY='P'; M=5,-9,-21,-10,-3,-21,-11,-13,-19,-1,-21,-15,-4,11,-3,3,9,6,-14,-28,-19,-5;
MA   /M: SY='E'; M=0,20,-26,29,31,-31,-12,-4,-29,2,-21,-21,5,-6,6,-8,2,-8,-23,-31,-20,18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00757;
//
ID   SPERMADHESIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP00985;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Spermadhesins family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2860837; R2=0.0152581; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=990; N_SCORE=20.382; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-5,12,-15,9,-3,-17,-18,-15,-17,-8,-15,-15,5,-10,-8,-10,15,36,-7,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-16,-23,-17,1,-23,-19,12,-24,24,9,-21,-25,-17,-18,-10,-1,12,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-10,-17,-11,-17,-9,-26,-23,13,-16,1,1,-13,-20,-18,-18,-3,8,21,-30,-10,-19;
MA   /M: SY='S'; M=3,12,-15,17,5,-25,-2,-8,-25,-8,-30,-22,12,-10,0,-10,31,13,-15,-40,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-20,-13,-16,-17,19,-17,-18,-14,-14,-3,-3,-16,-13,-14,5,9,-11,-24,-17,-14;
MA   /M: SY='A'; M=24,-6,-17,-9,-9,-19,3,-18,-13,-14,-5,-9,-8,-15,-12,-19,0,-6,-6,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-23,-36,-23,-11,-8,-22,-13,-15,-6,-8,-6,-22,-23,5,1,-23,-18,-22,50,8,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-21,-8,-15,-11,-5,-11,1,-15,-6,-4,13,-23,-14,-13,-4,-6,-2,-30,-14,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-28,-4,2,-21,-18,-8,-20,21,-17,-9,2,-4,2,18,-10,-8,-19,-24,-13,0;
MA   /M: SY='G'; M=-12,9,-30,15,-2,-30,20,-8,-37,0,-27,-20,6,-17,-6,8,-3,-14,-27,-26,-21,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-26,-3,-1,-17,-13,-6,-19,2,-26,-15,2,13,-2,-4,6,0,-20,-24,-7,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,10,-28,14,1,-16,-19,27,-25,-1,-18,-11,5,-18,1,5,-5,-5,-21,-21,11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-21,7,8,-20,-12,-8,-17,-1,-12,-12,5,-13,-1,-6,2,-3,-15,-30,-15,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,0,-30,4,-10,-30,42,-13,-38,-9,-28,-20,3,-18,-12,-5,-2,-17,-28,-23,-25,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-27,-18,-30,-24,10,-30,-23,18,-17,14,9,-23,-27,-23,-9,-16,-6,24,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-23,-30,-22,12,-32,-15,21,-27,37,17,-27,-28,-18,-20,-27,-10,10,-11,14,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-27,-6,-1,-24,-4,-10,-29,24,-24,-12,0,-14,2,26,-4,-3,-19,-21,-13,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-27,42,27,-32,-10,3,-32,3,-27,-24,25,-10,6,-4,3,-7,-30,-37,-20,16;
MA   /M: SY='E'; M=-13,2,-28,8,14,-13,-21,-1,-19,-3,-16,-15,-5,3,0,-9,-4,-1,-20,-16,6,5;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-9,-21,-8,-6,-6,-12,-2,-14,-10,-21,-14,-4,-1,-5,-11,14,6,-13,-16,10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-21,-17,-13,-10,-20,-19,-6,-1,-13,-7,-13,-20,-10,1,-3,3,4,-3,-6,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=1,-15,-15,-21,-15,26,-14,-16,-9,-19,-9,-9,-6,-19,-20,-16,8,4,-4,-14,3,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-8,6,-21,-2,-7,-11,-15,-5,-13,-7,-18,-13,12,2,-7,-9,6,16,-16,-24,-4,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-24,-16,-16,17,-24,10,-4,-10,-6,-4,-13,-24,-9,-10,-5,4,-8,11,52,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-14,8,-28,16,10,-19,-20,-4,-21,9,-11,-11,-2,-15,1,1,-11,-10,-18,-21,-1,5;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-27,-11,-16,-27,47,-17,-34,-11,-26,-17,-1,-19,-14,-6,0,-16,-24,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-32,-15,-3,-19,-23,-15,-7,-13,-3,-4,-20,37,-3,-15,-15,-10,-17,-25,-17,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-27,-1,9,-29,-20,-8,-26,36,-26,-9,0,-10,15,21,-4,-1,-19,-21,-10,12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,6,-14,-4,-6,-14,-17,-14,-14,0,-16,-12,9,-12,-6,-3,14,34,-7,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-26,26,21,-24,-14,0,-23,-1,-15,-17,17,-13,3,-6,-2,-7,-24,-34,-17,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-14,-28,-25,0,-30,-27,25,-21,15,10,-24,-26,-24,-20,-10,5,33,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-27,-5,12,-22,-23,-6,-14,12,-4,-1,-8,-14,16,7,-11,-10,-16,-21,-9,14;
MA   /M: SY='M'; M=0,-22,-16,-29,-22,-2,-20,-11,19,-13,13,37,-22,-22,-10,-14,-13,-6,20,-23,-5,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-13,13,-31,21,12,-33,-17,-8,-32,27,-30,-18,4,2,4,11,-7,-10,-24,-28,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,1,-28,5,3,-23,3,5,-25,-4,-13,-10,-1,-16,-3,-6,-8,-14,-22,-26,-12,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-26,-15,-10,14,-23,20,-10,-10,-8,-2,-9,-23,0,-7,-8,-8,-14,3,38,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-30,-3,4,-24,-20,23,-30,28,-24,-7,3,-16,10,34,-10,-13,-23,-23,-2,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-29,1,-33,-29,35,-25,19,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-23,-27,-19,7,-29,-17,10,-12,16,8,-19,-26,-16,3,-19,-9,9,-18,-1,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-16,-30,-24,5,-28,-21,24,-23,30,22,-28,-28,-21,-18,-21,-6,25,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-13,-10,-3,-21,-6,-13,-14,-7,-17,-11,-2,-10,3,-11,18,13,-7,-27,-17,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-17,-34,-12,0,-24,-21,-13,-16,-3,-16,-10,-15,41,1,-1,-12,-10,-23,-26,-20,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00758;
//
ID   SPERMADHESIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP00986;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Spermadhesins family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5009894; R2=0.0159096; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=993; N_SCORE=21.289; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=63; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,0,-28,4,4,-22,1,0,-23,-3,-11,-9,-2,-16,-4,-6,-9,-13,-20,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-13,-27,-14,-10,13,-24,23,-9,-9,-8,-2,-10,-24,1,-7,-10,-9,-15,5,43,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,-3,5,-25,-20,19,-30,29,-25,-8,2,-15,10,35,-10,-12,-22,-22,-3,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-27,-18,6,-29,-17,9,-12,18,9,-19,-26,-14,4,-20,-9,8,-18,-1,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-31,-25,4,-30,-22,27,-23,27,22,-27,-27,-21,-20,-20,-6,28,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=19,-3,-13,-9,-3,-21,-7,-13,-14,-7,-17,-11,-1,-10,3,-11,19,15,-7,-28,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-17,-34,-12,0,-23,-21,-12,-16,-2,-15,-9,-14,35,2,3,-12,-10,-22,-25,-19,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-2,-29,3,-5,-6,-22,-1,-15,-8,-15,-13,-8,7,-8,-13,-7,-1,-18,-9,17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-12,26,-23,13,3,-23,-7,29,-22,-1,-27,-13,41,-19,10,1,4,-6,-30,-35,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-19,-3,1,-28,-16,9,-21,35,11,-24,-24,-11,-16,-24,-10,1,-22,-4,-7;
MA   /M: SY='N'; M=10,12,-13,-1,-5,-17,-6,-8,-15,-7,-19,-15,20,-13,-5,-9,16,17,-12,-32,-17,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,7,-27,0,-13,-27,46,-10,-33,-13,-30,-20,21,-20,-13,-13,3,-13,-30,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-23,-13,-13,13,-20,10,-7,-10,-10,-7,-10,-23,-7,-10,1,0,-10,6,45,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,30,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,19,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-26,-29,-18,8,-31,-18,16,-17,17,11,-18,-23,-11,-7,-19,-10,7,-16,2,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,52,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-14,-31,57,-16,-37,-16,-29,-17,0,-19,-8,-16,0,-19,-30,-20,-27,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-21,-26,-19,-9,-12,-21,-17,-5,-12,5,-2,-19,13,-11,-7,-14,-8,-9,-23,-14,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-20,-33,-14,-4,-23,-19,-20,-13,-13,-15,-13,-20,57,-11,-20,-10,-9,-20,-27,-24,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-27,-2,0,-29,40,-14,-35,-12,-28,-20,1,-14,-9,-14,6,-12,-27,-25,-26,-4;
MA   /M: SY='S'; M=9,-5,-17,-5,-4,-23,7,-14,-22,-11,-28,-19,2,3,-5,-14,24,8,-15,-34,-23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,2,-29,9,9,-29,-6,-11,-27,2,-29,-20,-1,19,-1,-6,4,-5,-24,-31,-22,2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,11,-17,1,-7,-15,-8,-6,-6,-9,-19,-12,24,-18,-6,-9,13,5,-7,-37,-17,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-21,-21,-24,-18,18,-25,-9,7,-21,12,4,-17,-25,-16,-16,-10,-4,1,-8,20,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-13,-29,-13,-16,-22,36,-16,-29,-11,-16,-12,-4,-21,-14,-1,-7,-16,-22,-20,-21,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-36,-28,15,-35,-26,32,-29,24,15,-24,-25,-25,-25,-21,-9,23,-17,3,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=1,10,-25,15,15,-30,10,-9,-31,-5,-24,-21,4,-10,-1,-11,5,-8,-24,-29,-23,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-26,-10,-18,-26,51,-20,-34,-18,-26,-18,0,-18,-18,-18,4,-5,-24,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='T'; M=7,-12,-16,-17,-12,-10,-16,-18,3,-17,-2,-3,-7,-15,-10,-17,10,11,4,-28,-11,-12;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-20,-9,-9,-18,9,8,-20,-15,-14,-9,-1,-17,-7,-13,6,-5,-15,-27,-11,-9;
MA   /M: SY='I'; M=1,-24,-21,-32,-22,10,-25,-20,20,-23,18,16,-20,-21,-18,-22,-16,-8,13,-16,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-8,-19,-4,-1,-11,-24,-17,2,-12,3,-2,-14,-19,-12,-13,-7,0,11,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-13,-26,-19,-19,35,-25,8,-3,-13,-2,-3,-7,-28,-16,-11,-15,-8,-11,14,52,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-24,-11,0,-18,-21,-5,-16,8,-7,-3,-4,-17,13,25,-4,3,-14,-22,-9,5;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-13,-2,-3,-22,11,-12,-23,-12,-30,-20,8,-12,-3,-12,34,14,-13,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='S'; M=4,-4,18,-8,-8,-19,-9,-16,-21,-14,-25,-19,2,-16,-8,-14,26,18,-9,-41,-21,-8;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-16,-6,-6,-19,2,1,-21,-11,-21,-13,4,-13,-5,-11,18,12,-12,-31,-13,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,27,-20,13,-3,-22,11,3,-23,-5,-30,-20,44,-19,-3,-5,13,0,-27,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-16,-24,-19,-6,-24,-21,15,-16,5,11,-13,-17,-14,-17,-1,14,16,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='M'; M=7,-15,-16,-24,-16,-6,-16,-10,8,-12,11,28,-15,-17,-6,-13,-7,2,6,-22,-7,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00758;
//
ID   PTPS_1_MP; MATRIX.
AC   MP00987;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6098990; R2=0.0134794; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1376; N_SCORE=23.148; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-33,-5,15,-22,-22,-14,-15,-8,-11,-12,-16,38,-3,-14,-11,-10,-22,-28,-21,3;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-2,8,-28,-16,-3,-25,22,-25,-10,2,-12,21,24,4,-3,-20,-24,-12,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-2,-18,-3,20,-24,-8,-12,-18,-2,-14,-14,-6,-6,3,-12,6,-4,-13,-24,-20,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-15,-25,-15,-5,-10,-25,-15,-6,11,9,5,-15,-20,-5,6,-20,-10,-5,-20,-5,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-12,6,-30,13,47,-28,-20,0,-30,14,-20,-18,0,-4,18,15,-2,-10,-28,-28,-18,31;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-25,-15,-8,3,-17,-17,-15,-15,-19,-15,-11,27,-15,-17,3,-1,-16,-22,-11,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-15,17,-25,7,-4,-10,-11,36,-19,-5,-21,-11,30,-22,1,-2,-1,-7,-26,-23,11,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-9,-18,-12,-8,-15,-23,-19,-6,12,-12,-4,-9,-16,-8,4,-2,9,7,-26,-10,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-33,-22,-33,-30,3,-27,-30,15,-20,1,1,-33,-30,-27,-20,-19,-9,25,26,2,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-26,3,25,-23,-22,-10,-17,16,-16,-10,-7,-10,6,5,-5,-8,-9,-27,-15,15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-4,-16,-20,-17,-16,9,-16,-10,0,-10,-4,2,11,31,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,22,-30,21,-20,-8,2,-20,10,55,-10,-12,-22,-22,-3,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-33,8,34,-30,-20,-7,-27,13,-25,-18,-5,22,10,1,-5,-10,-28,-28,-21,20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-15,-23,1,-27,-17,-15,60,-5,4,-10,-10,-27,-27,-25,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-15,-18,-16,-8,-24,-19,1,-3,-4,-2,-13,-21,-13,7,-1,13,16,-27,-10,-16;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00759;
//
ID   PTPS_2_MP; MATRIX.
AC   MP00988;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4119925; R2=0.0131173; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1271; N_SCORE=21.074; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=17,-3,-10,-13,-10,-13,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,33,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,50,36,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,43,-30,-20,-3,-30,23,-23,-17,0,-3,17,10,-3,-10,-27,-27,-17,30;
MA   /M: SY='Y'; M=8,-16,-22,-20,-16,10,-18,4,-4,-10,-4,-4,-16,-22,-10,-14,-8,-6,-6,10,40,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-28,-12,32,-18,20,44,-20,-20,-8,-18,-20,-10,18,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,8,32,-22,-20,-8,-22,2,-16,-16,0,-4,8,-4,8,14,-18,-30,-16,20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,6,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,20,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-3,-27,37,-27,-7,0,-10,27,23,-7,-10,-23,-20,-10,20;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-12,-24,6,-26,-16,-12,46,-2,16,-10,-10,-26,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-18,-8,-9,-23,-9,0,9,8,21,-15,-19,-1,3,-19,-10,-2,-20,-4,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-36,2,24,-30,-20,-12,-24,-2,-26,-20,-12,54,2,-12,-6,-10,-30,-30,-26,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,50,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='T'; M=13,-13,-10,-19,-17,-9,-18,-23,3,-13,-3,-3,-13,-17,-17,-16,7,20,17,-27,-13,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-26,-22,-22,-18,-12,-26,-26,10,-16,-6,-2,-26,18,-22,-20,-10,-4,18,-30,-18,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,26,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,34,-26,-6,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00759;
//
ID   CLAT_ADAPTOR_S_MP; MATRIX.
AC   MP00989;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clathrin adaptor complexes small chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1205916; R2=0.0156866; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; N_SCORE=10.397; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-1,-19,-6,-3,-19,-11,-7,-21,7,-20,-13,7,-15,1,23,10,8,-13,-28,-14,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-13,2,-27,4,3,-24,-5,22,-28,8,-21,-9,5,-15,8,14,-6,-13,-24,-22,-5,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-24,-1,1,-21,-12,8,-21,11,-22,-11,9,-1,2,11,-3,-7,-20,-24,-11,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-19,-8,-4,-8,-19,1,-18,9,-14,-7,-1,-13,-2,11,0,9,-11,-19,-2,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,4,-19,4,3,-21,-13,8,-15,-3,-15,-1,3,-11,12,-4,6,3,-14,-27,-8,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=15,-8,21,-14,-11,-19,-9,-19,-19,-15,-20,-16,-4,-17,-11,-18,18,11,-6,-36,-21,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-5,26,-19,21,10,-24,-4,1,-24,-2,-29,-22,31,-13,2,-5,17,4,-24,-39,-20,6;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-23,-39,-29,51,-33,-23,15,-30,17,7,-21,-27,-33,-23,-21,-10,9,-1,19,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-28,-18,-30,-22,4,-28,-23,22,-26,33,15,-27,-27,-21,-21,-21,-7,18,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-25,10,28,-19,-19,-6,-17,-4,-4,-10,-5,-10,5,-7,-4,-7,-17,-29,-15,17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-30,-26,-23,14,-8,-20,-9,-22,2,-6,-17,-27,-22,-18,-22,-16,-14,32,7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-27,15,22,-28,-15,-4,-30,17,-25,-18,5,-9,10,17,2,-5,-23,-29,-16,15;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-27,31,9,-31,13,-3,-34,-4,-29,-24,23,-14,-3,-9,3,-10,-30,-34,-23,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-24,-19,10,-25,-17,14,-21,17,8,-19,-23,-18,-17,-11,1,13,-16,4,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-25,-4,5,-25,-20,-10,-24,28,-23,-9,0,-11,10,21,-1,6,-16,-23,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,0,-33,-27,0,-33,-27,24,-28,22,12,-25,-28,-23,-25,-20,-8,20,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,53,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-24,-3,2,-22,-13,6,-25,12,-24,-12,10,-16,11,31,6,-2,-20,-28,-12,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-26,-12,-15,17,-22,15,-5,-8,-8,-5,-4,-26,-7,-8,-9,-5,-13,11,53,-15;
MA   /M: SY='A'; M=36,-15,-12,-24,-15,-15,-9,-23,3,-14,-4,-4,-14,-14,-14,-21,4,-1,11,-22,-16,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-3,11,-21,13,-3,-25,10,-13,-28,-10,-25,-20,7,-13,-8,-13,14,9,-18,-32,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-20,34,-25,-25,-1,-29,-16,-5,-20,-6,-6,-20,-32,-23,-20,-10,-1,6,-22,6,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,12,-34,-29,23,-30,-24,8,-25,5,6,-23,-30,-30,-22,-15,-7,15,-19,1,-28;
MA   /M: SY='C'; M=5,-22,12,-28,-23,-10,-16,-25,4,-24,3,0,-18,-25,-21,-24,-10,-8,7,-28,-15,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-20,-27,-27,-8,-6,-27,16,-22,2,4,-20,-25,-25,-22,-9,-7,25,-25,-13,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,28,-25,41,23,-33,-9,-3,-33,-1,-28,-25,13,-8,4,-8,11,-2,-25,-38,-20,14;
MA   /M: SY='S'; M=-4,7,-18,8,2,-18,-9,-10,-15,-9,-15,-14,7,-14,-5,-10,10,8,-9,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-25,-7,0,-18,-11,0,-17,1,-13,-5,1,-17,15,8,-2,-4,-19,-18,-3,6;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,44,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='N'; M=-6,31,-18,20,2,-22,-1,4,-22,-3,-30,-21,43,-16,0,-4,17,4,-25,-40,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-29,24,52,-30,-17,1,-30,8,-22,-21,7,-3,17,-1,1,-9,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-28,-18,6,-29,-20,16,-28,42,16,-29,-18,-19,-20,-28,-10,6,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='M'; M=6,-20,-21,-28,-21,3,-7,-20,6,-21,6,7,-15,-20,-18,-21,-10,-9,4,-15,-5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-23,-27,-21,6,-31,-16,20,-22,18,10,-18,-22,-16,-19,-14,3,11,-13,13,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-16,-22,-14,-14,1,-26,-15,11,-23,34,17,-21,-26,-15,-17,-24,-10,4,-23,-3,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00760;
//
ID   CLAT_ADAPTOR_M_1_MP; MATRIX.
AC   MP00990;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clathrin adaptor complexes medium chain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5785818; R2=0.0136833; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=608; N_SCORE=12.888; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-18,2,0,-19,-14,-12,-18,3,-16,-12,2,-12,-2,-2,11,13,-10,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-20,-6,5,-18,-18,-11,-12,4,-10,-6,-5,-14,3,0,3,4,-7,-27,-12,4;
MA   /M: SY='N'; M=-12,10,-25,7,8,-19,-17,1,-18,6,-19,-12,12,-14,8,6,0,-1,-20,-23,-4,6;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-11,-22,-13,-7,-6,-14,-16,-2,-6,-5,-3,-7,-20,-12,-9,-8,-7,1,-23,-9,-9;
MA   /M: SY='G'; M=9,-4,-23,-10,-8,-24,12,-5,-19,-8,-18,-10,2,-15,-2,-11,1,-10,-16,-23,-17,-6;
MA   /M: SY='S'; M=4,5,-21,8,-1,-25,-1,-2,-24,-9,-24,-18,4,-2,-5,-13,12,3,-17,-32,-17,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-1,-29,1,8,-30,-19,-3,-23,11,-22,-10,-1,3,21,15,-2,-2,-23,-25,-14,13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-26,-27,-20,-6,-31,-25,21,-22,10,7,-21,3,-18,-23,-15,-4,13,-24,-9,-22;
MA   /M: SY='P'; M=6,-11,-24,-10,-3,-23,-13,-18,-17,-10,-23,-17,-9,36,-8,-16,9,8,-16,-30,-23,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-10,-18,-14,-9,-14,-19,-16,-4,-4,-11,-4,-5,-10,-7,-2,7,13,1,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-23,-8,-4,-25,17,-7,-25,-10,-20,-13,-1,-14,-2,-12,5,-2,-19,-23,-18,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,-20,-20,-12,-12,-23,-15,10,-9,1,8,-14,-19,-1,-10,-5,-3,10,-25,-9,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-16,-7,-2,-13,-11,-15,-9,-8,-10,-8,-3,0,-6,-10,7,18,-6,-23,-12,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-23,3,2,-24,13,-3,-23,-6,-24,-12,17,-15,2,-7,8,-4,-23,-30,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=8,-6,-18,-12,-7,-17,-14,-14,-4,-10,-13,-7,-2,-5,-3,-13,9,8,-2,-28,-15,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-17,-32,-29,-1,-33,-29,34,-23,12,12,-24,-25,-25,-23,-11,0,40,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-28,-6,-2,-26,-3,-16,-22,-11,-30,-20,-7,42,-7,-16,9,0,-23,-33,-26,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-20,-8,-4,-17,-16,-11,-20,5,-19,-13,0,-6,-1,19,10,17,-12,-28,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=7,-1,-22,1,20,-24,-14,-11,-20,2,-18,-15,-4,0,4,-6,7,1,-15,-28,-19,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-1,-28,1,-13,-30,50,-17,-37,-16,-28,-20,2,-17,-16,-18,1,-16,-27,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-12,-33,-27,-4,-33,-28,32,-26,9,10,-18,-22,-20,-26,-11,-5,26,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-28,-2,6,-26,-20,7,-28,34,-26,-8,2,-12,8,26,-8,-7,-20,-22,-5,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-16,-30,-16,-16,20,-28,36,-6,-10,-4,0,-14,-28,-6,-8,-18,-12,-14,18,68,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-7,4,-20,-19,-10,-20,17,-17,-9,-3,-14,3,25,-2,2,-10,-24,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,13,-26,6,4,-24,-13,-1,-26,28,-28,-14,22,-16,6,26,-3,-6,-24,-27,-14,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-28,18,55,-29,-18,-1,-29,8,-21,-20,1,-1,18,-1,3,-7,-28,-31,-20,37;
MA   /M: SY='I'; M=7,-25,-17,-30,-22,5,-24,-24,18,-23,18,9,-22,-23,-21,-22,-13,-5,18,-19,-5,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,54,-30,1,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,56,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-34,-26,18,-32,-24,24,-28,29,14,-26,-28,-26,-22,-22,-8,20,-17,3,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,31,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-19,-33,-27,1,-33,-28,34,-25,20,15,-25,-26,-24,-23,-16,-3,33,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-18,-1,8,-18,-12,-8,-20,0,-21,-15,3,-11,3,5,17,14,-13,-29,-12,4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-34,-29,9,-32,-26,31,-23,13,16,-25,-27,-26,-22,-15,-5,36,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-13,34,-24,25,5,-25,-6,18,-25,0,-28,-18,42,-17,6,-1,5,-5,-30,-37,-15,5;
MA   /M: SY='L'; M=6,-23,-17,-27,-19,2,-21,-15,12,-20,22,14,-23,-24,-15,-18,-15,-6,10,-17,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-31,-23,5,-32,-24,26,-27,33,16,-25,-26,-20,-22,-21,-4,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-24,-21,-33,-24,8,-26,-17,23,-20,17,27,-21,-22,-15,-19,-17,-8,17,-18,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-20,19,11,-26,-8,-5,-26,-1,-25,-20,13,-11,2,-2,15,6,-19,-35,-18,6;
MA   /M: SY='K'; M=7,-7,-23,-9,2,-19,-14,-10,-19,10,-19,-9,-5,-5,9,2,1,-5,-15,-20,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,10,-23,10,15,-27,-13,-4,-25,14,-26,-15,11,-10,12,6,7,2,-21,-30,-15,13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-14,-30,52,-18,-38,-6,-30,-18,0,-18,-14,-10,-2,-18,-28,-20,-26,-14;
MA   /M: SY='S'; M=0,7,-18,2,1,-24,0,-4,-21,-5,-26,-15,16,-13,9,-5,21,10,-18,-33,-18,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-14,-21,-21,-6,-25,-12,13,-17,0,4,-16,-23,-19,-16,-1,8,26,-30,-7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,39,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-23,-12,-3,-10,-19,-6,-19,9,-13,-8,-2,-18,5,29,0,3,-13,-21,-7,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00761;
//
ID   CLAT_ADAPTOR_M_2_MP; MATRIX.
AC   MP00991;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Clathrin adaptor complexes medium chain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6869383; R2=0.0138126; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=722; N_SCORE=14.650; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=132; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-18,-33,-25,64,-25,-18,-3,-27,3,-3,-15,-27,-33,-18,-10,-5,-2,2,22,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,7,-30,10,3,-23,-19,85,-31,-9,-21,-4,11,-19,9,-1,-9,-19,-30,-31,14,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-29,16,14,-35,-15,-1,-25,1,-26,-14,3,8,24,-3,4,-6,-27,-30,-18,18;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-7,79,-11,-18,-23,-23,-23,-30,-23,-23,-21,-10,-31,-21,-24,-1,-6,-13,-47,-27,-20;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-11,-29,-27,-3,-26,-29,25,-19,8,8,-27,-27,-27,-21,-8,-1,42,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-29,-2,4,-23,-4,-2,-30,17,-23,-14,9,-17,5,37,-5,-10,-24,-24,-15,2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23,21,-31,-21,20,-30,40,16,-27,-29,-24,-21,-27,-10,10,-15,5,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-4,9,-24,10,6,-28,-7,-6,-25,6,-26,-16,10,-5,8,-1,8,0,-21,-30,-17,6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-27,6,16,-26,-16,-5,-28,21,-22,-14,1,-11,8,25,-4,-9,-20,-24,-15,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-29,-23,-36,-27,44,-24,-23,-2,-24,2,-4,-23,-27,-31,-20,-18,-11,0,26,18,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-26,17,34,-17,-20,-5,-25,1,-17,-18,1,-6,6,-5,1,-1,-22,-27,-13,20;
MA   /M: SY='S'; M=0,17,-15,14,2,-22,-3,-5,-22,-6,-28,-20,23,-12,-1,-8,25,14,-17,-39,-19,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-28,18,26,-29,-15,9,-28,0,-22,-18,2,4,7,-7,-1,-10,-26,-31,-15,15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,1,-21,-18,11,-29,22,-22,-10,2,-18,9,50,-4,-8,-20,-23,-7,1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-21,-13,-5,-12,-23,-16,5,-10,-4,-2,-2,-15,-8,-9,0,6,4,-27,-11,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,29,19,-24,-24,-21,-26,-23,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-16,0,6,-19,-11,-3,-20,-4,-22,-15,5,-10,2,-2,22,18,-13,-34,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,70,-30,-20,3,-30,16,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-30,-34,-23,-6,-37,-24,40,-24,14,17,-17,-19,-8,-24,-17,-10,21,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-29,54,17,-38,-13,0,-33,0,-26,-23,14,-11,7,-8,-1,-9,-26,-37,-18,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,14,-27,17,36,-28,-15,-1,-28,14,-23,-18,11,-6,13,4,0,-8,-27,-30,-18,25;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-28,61,-30,-18,5,-28,15,4,-22,-30,-35,-19,-21,-9,4,4,26,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-24,5,15,-21,-20,-7,-19,7,-15,-12,-2,-13,3,15,-1,0,-11,-28,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,0,-31,-22,-1,-24,-10,14,-18,19,39,-22,-25,-9,-16,-20,-10,8,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-21,0,9,-24,-11,-2,-24,7,-24,-14,7,-12,13,17,12,2,-19,-30,-16,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-28,-2,12,-24,-18,13,-27,15,-21,-10,2,-15,18,34,-2,-8,-23,-25,-9,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-16,-25,-19,3,-26,-20,15,-23,28,13,-23,-25,-18,-17,-14,2,14,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='S'; M=2,3,-15,0,0,-20,-8,-3,-20,0,-26,-15,11,-12,0,-3,23,17,-13,-35,-14,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-20,8,9,-23,-12,-8,-24,5,-23,-17,5,-10,2,6,12,9,-15,-31,-16,5;
MA   /M: SY='H'; M=-14,15,-27,17,9,-30,-16,25,-24,0,-22,-10,13,-14,20,-1,0,-7,-25,-30,-7,13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-19,-24,-23,-2,-27,-22,25,-21,11,9,-11,-26,-21,-19,-12,-4,25,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-6,1,-21,-20,-10,-16,16,-13,-6,-2,-1,3,9,-11,-9,-16,-24,-12,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-24,-27,-21,-15,-11,-16,-22,3,-20,3,-1,-22,15,-18,-21,-15,-9,0,-25,-16,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=2,-18,-23,-18,-9,-12,-16,-15,-2,-13,1,4,-18,21,-10,-16,-11,-7,-7,-21,-14,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-37,-30,28,-34,-26,27,-27,14,10,-23,-26,-30,-24,-17,-7,25,-12,8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-18,-36,-16,-6,-16,-20,-10,-26,13,-22,-14,-12,-2,0,33,-16,-14,-24,15,-5,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-8,-32,-27,2,-32,-27,26,-26,23,13,-27,-29,-25,-23,-18,-6,29,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-8,-28,-6,1,-3,-28,-5,3,-10,-2,-2,-12,-18,-6,-13,-12,-9,-1,-11,15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-21,-10,-19,-15,-15,-23,-24,0,-16,-12,-7,-20,14,-19,-19,-3,1,8,-33,-20,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00761;
//
ID   SAA_MP; MATRIX.
AC   MP00992;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Serum amyloid A proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2240219; R2=0.0126745; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1392; N_SCORE=21.857; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-4,-20,-16,-15,-5,-15,3,9,-7,6,38,2,-20,0,-7,-12,-7,-1,-25,-5,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-27,-12,-2,-15,-23,-9,-16,20,-4,-2,-8,-19,2,31,-15,-10,-12,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-35,-22,-19,17,-26,20,-10,-12,-8,-5,-20,-28,-9,-11,-23,-16,-18,50,58,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-30,-10,3,-25,-25,-10,-7,19,-15,0,-5,-13,16,9,-10,-10,-10,-20,-7,8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,22,-24,10,-4,-24,15,0,-26,2,-30,-19,37,-19,-4,-1,5,-6,-29,-32,-21,-4;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-5,-27,39,-27,-7,0,-10,24,25,-7,-10,-23,-20,-10,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,-5,-6,-23,78,-22,-10,-15,0,2,-23,5,-3,-13,-17,-25,-14,36,-5;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,15,-7,5,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-15,-16,-4,-23,-10,-13,-7,-6,-10,-5,-10,-13,7,-12,5,-3,-1,-21,-16,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,15,-35,-20,5,-23,21,-22,-3,0,-12,43,23,-3,-10,-27,-20,-10,28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-32,-7,0,-27,-15,-17,-20,-10,-30,-20,-12,63,-7,-17,4,-2,-25,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=16,-22,-15,-29,-22,-8,-21,-26,20,-19,5,5,-20,-20,-20,-23,-5,-3,26,-23,-11,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-10,-19,-10,-19,-3,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,7,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,2,-30,5,26,-28,-20,-5,-30,33,-25,-13,0,-8,13,26,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-29,-25,-3,-32,-28,29,-15,8,10,-24,-25,-23,-17,-13,-4,36,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-25,48,12,-32,-13,-5,-32,-3,-25,-25,15,-10,-3,-10,5,6,-22,-37,-17,5;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-12,-13,-8,-21,8,-17,-16,-11,-18,-14,-3,-11,-8,-17,17,3,-6,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,46,-30,-20,-3,-30,21,-23,-17,0,-3,17,8,-3,-10,-27,-27,-17,32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-23,1,-9,-8,1,5,-16,-6,-19,-13,22,-22,-6,-8,0,-5,-21,-16,6,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-31,-24,-37,-29,53,-28,-19,1,-25,4,-2,-25,-30,-33,-19,-22,-12,1,28,29,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,19,-39,-20,7,-21,15,-21,-1,0,-10,54,13,-1,-10,-29,-20,-10,36;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-7,-30,-6,-1,-26,19,-10,-34,8,-25,-15,0,-17,-2,19,-5,-14,-25,-21,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-30,-23,17,-15,-21,10,-28,25,9,-22,-27,-24,-21,-22,-12,4,-14,2,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00762;
//
ID   RIBOSOMAL_L30E_2_MP; MATRIX.
AC   MP00993;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L30e signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4416885; R2=0.0165909; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=552; N_SCORE=14.590; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-25,-10,2,-19,-20,-6,-12,21,-11,12,-7,-13,8,13,-10,-6,-10,-21,-7,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-27,-17,8,-27,-19,15,-26,37,15,-25,-27,-17,-19,-22,-7,8,-21,-2,-17;
MA   /M: SY='S'; M=21,-5,-12,-9,-5,-16,-3,-12,-15,-10,-20,-15,0,-12,-5,-13,24,12,-6,-27,-12,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-29,17,9,-30,1,-6,-33,16,-29,-18,13,-13,2,7,-2,-10,-26,-28,-18,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-9,-28,-24,-4,-30,-27,22,-21,6,6,-17,-21,-21,-22,-5,9,25,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-33,-8,-1,-28,-9,-17,-23,-2,-28,-18,-11,49,-7,-11,-4,-6,-25,-28,-25,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-28,-18,-15,15,-27,33,-4,-16,2,4,-12,-26,-9,-11,-18,-13,-10,-1,39,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-9,-23,-8,1,-13,-24,23,-8,-8,-8,-1,-7,-19,1,-6,-7,-6,-4,-25,4,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-27,-23,-21,38,-29,18,-3,-16,1,0,-17,-29,-16,-12,-19,-11,-9,17,59,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-26,4,13,-27,-13,2,-23,7,-25,-14,9,1,13,5,5,-3,-24,-30,-16,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-29,-12,-21,-27,61,-21,-33,-20,-26,-17,-2,-20,-20,-20,-1,-19,-24,-20,-28,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,9,-14,-1,-7,-16,-2,-11,-17,-9,-20,-15,16,-13,-7,-9,19,26,-12,-33,-16,-7;
MA   /M: SY='N'; M=0,17,-17,7,-2,-21,4,-1,-22,-3,-29,-19,31,-16,-1,-1,19,5,-21,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-22,-27,-23,2,-27,-15,22,-19,13,18,-16,-25,-16,-18,-16,-7,17,-15,2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=9,-3,-13,-9,-8,-14,-15,-19,-10,-11,-9,-10,-4,-6,-10,-13,13,28,-3,-28,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=18,-21,-14,-25,-18,-6,-17,-22,10,-19,11,4,-20,-20,-17,-20,-6,-2,16,-23,-11,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-21,83,-29,-27,-15,-27,-27,-18,-27,-9,-9,-21,-35,-26,-27,-11,-9,-2,-43,-24,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-18,-30,64,-19,-39,-16,-30,-19,0,-19,-18,-17,-1,-19,-29,-20,-29,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-34,-15,-6,-13,-23,-9,-11,-11,-11,-9,-19,41,-10,-12,-15,-10,-19,-19,-6,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-22,-23,-29,-22,53,-28,11,-7,-24,2,0,-13,-28,-26,-15,-18,-12,-8,2,32,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-24,-12,-6,-17,-13,-9,-16,8,-15,-3,-5,-9,-1,21,-3,0,-9,-25,-13,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-10,-31,-29,-2,-30,-29,29,-21,10,10,-26,-27,-27,-22,-10,0,41,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,12,-15,-13,-21,5,-18,-21,-16,-20,-12,-5,-18,-12,-18,12,0,-10,-32,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,2,-21,-17,-13,-14,-23,-1,-15,-7,-6,-14,-18,-17,-19,6,8,13,-29,-17,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-22,6,-29,-18,24,-25,36,27,-27,-27,-17,-19,-25,-9,16,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-9,-13,-15,-10,-17,0,-18,-11,-13,-9,-10,-6,-13,-10,-17,12,5,-3,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-20,-28,-21,0,-30,-23,23,-23,21,14,-20,-22,-16,-20,-13,3,18,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,61,25,-38,-11,0,-38,1,-29,-28,19,-9,3,-8,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='P'; M=7,-7,-26,-3,11,-25,-15,-15,-16,-5,-18,-15,-11,22,-4,-14,-1,-6,-14,-28,-22,2;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-9,-18,-28,64,-18,-37,-18,-28,-18,0,-18,-18,-18,0,-18,-28,-18,-28,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-25,37,25,-30,-12,0,-28,1,-21,-20,11,-8,8,-5,2,-7,-25,-32,-17,16; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-9,0,0,-18,0,-9,-18,-9,-28,-18,9,-9,0,-9,37,18,-9,-37,-18,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-26,34,14,-30,-12,-2,-31,9,-24,-20,12,-11,3,8,-1,-7,-23,-30,-16,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-27,-36,-27,1,-36,-27,43,-28,21,18,-19,-19,-18,-27,-19,-9,26,-18,0,-27; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-20,-29,-20,5,-28,-20,22,-25,35,18,-23,-24,-17,-20,-22,-7,12,-19,-1,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='E'; M=6,4,-18,2,11,-21,-11,-9,-19,5,-17,-13,2,-8,2,-1,7,5,-13,-25,-15,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,-10,-16,-15,-8,-7,-17,-15,0,-13,4,1,-10,-14,-6,-13,-1,6,0,-21,-8,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='V'; M=5,-13,-16,-19,-13,-8,-16,-17,7,-14,5,4,-11,-17,-11,-15,-5,1,8,-22,-10,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-5,-26,-5,7,-22,-13,-11,-15,3,-15,-10,-4,2,1,-1,-4,-7,-15,-24,-16,3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-27,7,22,-29,-1,-5,-28,8,-23,-15,1,-8,13,0,2,-7,-25,-25,-18,17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=3,-1,-22,-1,2,-23,-8,1,-21,5,-18,-10,-1,-13,1,1,0,-5,-13,-24,-12,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-2,-24,-2,14,-26,-15,0,-17,6,-14,-1,-4,-10,19,2,-2,-8,-17,-23,-13,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-28,0,17,-32,-4,-3,-23,4,-20,-8,-3,-11,24,1,-2,-11,-22,-23,-16,21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-30,3,14,-30,32,-12,-36,-7,-26,-20,0,-12,-3,-12,0,-16,-30,-24,-26,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00588;
//
ID   FHIPEP_MP; MATRIX.
AC   MP00994;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial export FHIPEP family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2031798; R2=0.0128343; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1598; N_SCORE=24.702; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-36,-28,-1,-37,-29,43,-27,16,16,-19,-20,-20,-27,-16,-4,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-25,9,-33,-24,29,-28,33,17,-27,-27,-23,-23,-24,-8,21,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-17,-24,-21,-3,-29,-25,18,-20,8,5,-14,-18,-18,-19,-2,18,19,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-23,-18,-30,-23,-2,-28,-23,25,-21,13,15,-20,-21,-18,-21,-10,2,24,-24,-6,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-25,10,10,-30,-10,10,-20,5,-25,-10,31,-15,29,5,5,-5,-30,-30,-15,20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-35,-25,2,-32,-19,35,-24,27,31,-22,-22,-14,-22,-22,-10,20,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-10,-12,-10,-12,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,42,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-29,2,9,-29,-18,-8,-29,46,-30,-11,5,-11,9,27,-8,-9,-21,-22,-11,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-7,-11,-13,-7,-19,-3,-17,-10,-11,-16,-12,-3,-11,-7,-17,20,7,-2,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-25,9,33,-26,-7,-7,-27,1,-20,-18,1,-5,8,-5,7,2,-23,-30,-19,20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-15,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-14,-12,-5,-10,-8,-17,16,8,-2,-25,-19,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-17,-12,-9,-22,15,-16,-21,-9,-20,-15,-2,-13,-9,-10,12,-1,-11,-24,-22,-9;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=10,-5,-11,-12,-10,-13,-14,-19,-7,-11,-11,-9,-3,-12,-10,-13,18,30,2,-30,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-14,-17,-12,-22,15,-19,-17,-12,-16,-13,-7,-12,-12,-19,10,-3,-7,-21,-22,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-5,20,-15,28,50,-23,-23,-5,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,23,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-13,-15,-10,-21,9,-18,-16,-11,-16,-13,-5,-11,-10,-18,14,1,-6,-24,-21,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,40,-28,56,22,-37,-10,-2,-36,0,-27,-27,15,-9,1,-10,1,-9,-27,-37,-20,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-20,11,-29,-15,18,-27,44,21,-28,-29,-18,-18,-28,-10,8,-15,7,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,13,-23,4,0,-20,-9,2,-24,12,-26,-16,26,-18,4,27,6,-1,-23,-31,-16,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-2,-12,-11,-8,-20,3,-15,-15,-9,-17,-13,3,-12,-8,-15,15,6,-7,-26,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-30,-9,-19,-30,67,-19,-39,-19,-30,-20,3,-20,-19,-19,0,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-20,-20,-17,0,-24,-3,11,-21,22,13,-11,-26,-14,-15,-18,-8,6,-25,-2,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-22,24,4,-26,-1,-9,-28,-6,-24,-21,13,-12,-5,-10,9,9,-20,-34,-18,-1;
MA   /M: SY='E'; M=9,1,-21,3,18,-26,-14,-8,-16,-1,-14,-11,-5,-9,9,-8,2,-6,-12,-26,-17,14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-28,32,21,-32,-13,7,-31,7,-25,-19,12,-10,8,-1,-1,-9,-26,-32,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-29,13,44,-30,-19,7,-27,9,-20,-14,0,-4,24,2,-1,-10,-28,-28,-15,34;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-28,-5,5,-25,-20,-5,-27,33,-23,-9,0,-14,12,42,-6,-4,-19,-21,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-5,6,-22,-21,-2,-21,21,-19,-8,-1,-13,8,27,-5,-1,-16,-23,-9,5;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-10,1,-20,-21,-1,-26,25,-16,-7,-2,-19,13,56,-10,-10,-19,-20,-9,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00763;
//
ID   TCP1_3_MP; MATRIX.
AC   MP00995;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chaperonins TCP-1 signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1889906; R2=0.0154130; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=617; N_SCORE=14.689; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,38,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,5,-27,10,19,-29,-20,-1,-15,1,-14,-5,-2,-11,24,-2,-3,-9,-17,-27,-13,21;
MA   /M: SY='H'; M=-17,8,-27,4,0,-20,-15,77,-28,-8,-22,-5,20,-20,8,0,-4,-14,-29,-32,10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,2,-31,-20,-14,-20,-8,-29,-18,-17,78,-3,-17,-9,-10,-30,-29,-27,-5;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-12,-20,-13,-15,-10,-21,-2,-12,-6,-6,-10,-12,-12,-18,9,11,6,-23,-15,-13;
MA   /M: SY='A'; M=44,-12,-11,-20,-12,-19,0,-21,-8,-11,-9,-9,-11,-12,-12,-20,8,-1,3,-21,-20,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-26,0,9,-27,-18,-9,-25,35,-27,-10,2,-11,9,20,-3,-6,-17,-24,-12,9;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-12,-29,-22,1,-25,-15,19,-19,22,29,-23,-25,-13,-17,-17,-6,16,-24,-4,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,5,-32,-20,30,-27,35,27,-25,-25,-17,-22,-25,-10,17,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-8,-29,-27,-4,-26,-28,23,-19,7,7,-26,-26,-26,-21,-7,-1,39,-28,-11,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-29,14,34,-27,-19,0,-24,12,-17,-8,0,-6,17,5,-4,-10,-23,-27,-15,25;
MA   /M: SY='V'; M=6,-25,-16,-29,-22,-2,-24,-24,21,-21,18,12,-24,-24,-20,-21,-13,-5,24,-23,-8,-22;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-10,-5,-19,-2,-15,-15,-10,-19,-15,0,-10,-5,-15,24,13,-5,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-25,-1,12,-25,-17,-1,-24,18,-19,-9,-1,-11,10,17,-2,-4,-18,-24,-12,10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-15,-13,-7,-18,-6,-15,-11,-10,-11,-6,-4,-13,-2,-12,12,13,-5,-26,-15,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,27,-37,-13,-1,-37,6,-28,-27,15,-8,5,-5,-1,-10,-29,-37,-19,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-26,9,11,-21,-19,3,-17,0,-17,-11,2,-12,5,-2,-1,-4,-15,-26,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-27,13,35,-23,-20,-6,-19,1,-15,-15,-3,-6,8,-7,-2,-9,-17,-29,-17,21;
MA   /M: SY='V'; M=6,-19,-14,-25,-21,-6,-24,-24,16,-17,4,8,-18,-20,-18,-18,-2,9,24,-26,-9,-21;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,5,-13,-5,-7,-13,-17,-15,-13,-5,-14,-11,8,-11,-7,-6,17,39,-5,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-14,-9,-9,-10,-3,-16,-15,-14,-14,-12,1,-14,-9,-12,20,22,-7,-30,-14,-9;
MA   /M: SY='V'; M=13,-19,-11,-23,-22,-7,-19,-24,14,-16,1,2,-17,-23,-22,-18,-2,1,29,-28,-14,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-7,-29,-27,-2,-28,-26,23,-20,10,12,-26,-27,-25,-20,-10,1,37,-29,-10,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-12,-33,-28,-1,-32,-29,32,-25,16,12,-25,-26,-25,-24,-15,-5,33,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-33,-24,11,-32,-22,26,-28,34,21,-26,-27,-21,-22,-24,-9,17,-19,1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-11,-20,-13,-16,-7,-21,-3,-12,-7,-7,-11,-13,-12,-19,9,4,6,-23,-17,-13;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-27,-11,-18,-29,61,-20,-36,-19,-28,-19,-1,-19,-18,-20,2,-17,-26,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-25,9,39,-27,-12,-6,-25,4,-18,-18,-2,-3,11,-6,3,-7,-22,-28,-20,25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,22,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-27,4,13,-27,-11,-6,-28,24,-26,-14,6,-11,9,19,-1,-7,-22,-25,-15,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-24,-3,11,-25,-18,-1,-15,7,-14,-5,-2,-13,16,5,-3,-8,-13,-25,-12,13;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-10,-19,-10,-19,-1,-19,-10,-10,-11,-10,-9,-11,-10,-19,12,2,1,-22,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00610;
//
ID   RIBOSOMAL_S21E_MP; MATRIX.
AC   MP00996;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S21e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5750713; R2=0.0137459; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1212; N_SCORE=21.225; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='A'; M=37,-6,-14,-11,5,-22,-4,-16,-14,-6,-12,-12,-8,-8,-3,-16,8,-2,-7,-22,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-19,-15,-24,-22,18,-27,-18,7,-17,2,0,-17,-23,-23,-15,-4,13,15,-13,11,-22;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-10,-26,-26,-2,-28,-28,21,-18,6,6,-23,-26,-26,-18,-3,11,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,52,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-8,-36,-30,-2,-36,-30,36,-28,13,13,-22,-25,-24,-28,-16,-8,30,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=33,-6,-10,-14,-7,-19,-3,-17,-13,-10,-15,-13,-4,-10,-7,-16,19,12,-3,-26,-19,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-8,31,-22,15,-4,-22,13,5,-24,-4,-30,-20,49,-20,-4,-4,8,-4,-30,-36,-22,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-26,-7,-13,-23,27,11,-31,-15,-23,-13,3,-18,-10,-13,2,-5,-23,-25,-13,-13;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-14,-14,-6,-21,-3,-18,-14,-10,-17,-14,-7,4,-8,-18,14,3,-6,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-4,-30,-4,-4,-11,-22,85,-25,-10,-16,0,5,-22,6,-2,-12,-18,-26,-19,31,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=23,-3,-10,-7,-3,-20,0,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,13,-7,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00764;
//
ID   G10_1_MP; MATRIX.
AC   MP00997;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G10 protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0607753; R2=0.0102269; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2046; N_SCORE=24.985; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=239; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=4,-5,-25,-8,2,-25,-15,-11,-25,29,-22,-10,-3,-12,5,25,-5,-7,-15,-20,-13,2;
MA   /M: SY='N'; M=6,5,-17,-6,-9,-11,-9,-7,-5,-12,0,-5,14,-20,-9,-12,-2,-3,-10,-28,-14,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-3,11,-31,-20,1,-17,4,-17,-3,0,-10,39,4,6,8,-21,-23,-10,25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-12,17,-25,7,3,-23,-10,2,-25,22,-28,-15,29,-17,5,25,0,-5,-25,-30,-15,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-25,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,11,-27,5,15,-35,-15,10,-20,7,-23,-5,16,-13,44,7,3,-7,-30,-25,-13,29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-4,-16,-20,-17,-16,8,-16,-10,0,-10,-4,2,11,32,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-17,5,-27,-1,0,-20,-14,3,-27,21,-23,-13,18,-20,7,49,-4,-7,-23,-26,-13,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-14,-5,-5,-15,-15,9,-17,-10,-18,-11,5,-12,-3,-8,19,26,-9,-33,-6,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-9,-20,-22,-21,50,-21,-11,-6,-21,-2,-6,4,-27,-28,-14,-11,-7,-9,-5,15,-21;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-33,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=12,5,-12,-7,-8,-15,-10,-14,-12,-8,-14,-12,10,-12,-8,-11,15,26,-6,-29,-15,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=16,-3,-14,-6,-3,-20,-4,11,-19,-10,-22,-13,4,-12,-1,-11,20,5,-11,-32,-11,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-23,0,11,-26,-16,-2,-20,27,-20,-5,0,-8,23,17,-5,-8,-19,-16,-8,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-15,16,-30,27,36,-31,-17,0,-33,12,-23,-21,5,-7,12,13,-2,-10,-28,-31,-18,23;
MA   /M: SY='E'; M=6,5,-25,9,41,-27,-15,-5,-25,5,-17,-17,-3,-3,12,-5,3,-7,-22,-27,-20,26;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-30,14,44,-30,-2,-4,-32,4,-22,-20,0,-4,12,-4,0,-12,-30,-28,-22,28;
MA   /M: SY='R'; M=3,-8,-24,-11,1,-24,-14,-4,-22,13,-17,-8,-3,-15,15,29,-2,-7,-16,-20,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-24,-20,-26,-21,-6,-29,-21,16,-7,3,6,-19,-25,-16,5,-12,-5,25,-25,-8,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-26,-26,-18,-9,-32,-24,22,-4,3,9,-16,-19,-13,-10,-15,-8,19,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,45,-30,-20,-3,-30,22,-23,-17,0,-3,17,9,-3,-10,-27,-27,-17,31;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,74,-24,-27,-23,0,-27,-33,-27,-23,-20,-14,-34,-27,-27,-7,-13,-16,-41,-30,-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,6,-26,-20,73,-27,-4,-20,0,7,-17,25,3,-7,-17,-30,-27,11,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00765;
//
ID   G10_2_MP; MATRIX.
AC   MP00998;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   G10 protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=29;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4337425; R2=0.0097544; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=884; N_SCORE=13.056; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=212; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-23,2,28,-19,-24,-11,-9,-1,-9,-9,-11,-11,2,-7,-4,-6,-1,-30,-16,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,80,-20,-20,-13,-20,-20,-20,-20,-13,-13,-13,-27,-20,-20,-7,-7,-7,-33,-20,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-3,-30,0,20,-23,-20,0,-30,23,-20,-13,0,-13,13,47,-7,-10,-23,-23,-13,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-17,-13,0,-10,-27,-20,10,-10,0,0,-20,-20,-13,-13,-7,-3,23,-30,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,57,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,43,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-15,0,3,-20,-7,-8,-20,12,-24,-13,5,-8,3,5,16,6,-11,-26,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-30,0,8,-28,-20,10,-30,39,-28,-8,2,-12,10,24,-10,-12,-22,-22,-4,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-23,-23,-20,-3,3,-20,0,-27,23,7,-20,-27,-20,-20,-20,-13,-3,-20,-10,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-23,13,19,-23,-18,-7,-25,5,-18,-16,3,-9,5,8,5,10,-18,-30,-15,11;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-5,-23,-3,17,-26,-19,-6,-11,1,-12,-6,-8,-11,18,-4,0,-6,-9,-25,-15,18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-10,-23,-6,5,-20,5,-16,-13,-10,-13,-10,-10,-16,-9,-13,-3,-10,-3,-27,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-23,-5,4,-24,-13,-1,-25,13,-23,-11,3,-15,16,32,8,0,-19,-27,-13,7;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-20,-37,-30,27,-33,-27,26,-27,13,10,-23,-27,-30,-23,-17,-7,27,-14,6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-20,-28,-26,-20,-7,-32,13,21,-22,6,12,-11,-21,-11,-19,-16,-12,12,-24,5,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,47,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,33,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,22,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,10,40,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,2,-22,-20,15,-30,27,-22,-8,2,-18,10,51,-10,-12,-22,-22,-5,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,24,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,34,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,21,1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-17,-10,-14,-17,12,-20,-21,-14,-17,-14,0,-14,-14,-14,13,25,-11,-26,-17,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00765;
//
ID   SSI_MP; MATRIX.
AC   MP00999;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Streptomyces subtilisin-type inhibitors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2729440; R2=0.0118795; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=559; N_SCORE=10.904; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-23,13,15,-26,-4,-9,-24,-3,-19,-17,3,-10,0,-9,4,1,-17,-30,-19,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=4,17,-17,20,4,-26,-5,-8,-24,-6,-26,-21,12,-10,-2,-11,20,9,-15,-36,-19,1;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-11,-17,-9,-18,-4,-18,-10,-8,-12,-10,-8,-12,-9,-13,12,3,1,-24,-19,-9;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-16,-15,-5,-21,-1,-16,-16,-3,-13,-11,-7,-12,-6,-3,6,-2,-7,-21,-19,-6;
MA   /M: SY='T'; M=7,3,-15,0,0,-19,-11,-15,-17,-8,-18,-15,2,-4,-5,-12,19,23,-9,-32,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-12,-15,-9,-18,-6,-19,-9,-11,-14,-11,-8,-4,-10,-17,13,5,1,-27,-19,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-20,-8,-6,-19,2,-1,-20,-11,-18,-12,1,-8,-7,-12,8,9,-13,-28,-14,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-23,-25,-20,-10,-27,-26,16,-18,-2,2,-24,10,-21,-22,-11,-5,19,-28,-15,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-23,-6,11,-21,-20,-5,-9,-4,-3,-1,-8,-14,18,-4,-2,-5,-11,-25,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-9,-17,-9,-17,0,-17,-9,-9,-9,-9,-9,-9,-9,-17,9,0,0,-17,-17,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-9,-23,-23,-1,-24,-24,20,-16,6,6,-22,-23,-23,-16,-4,7,36,-26,-9,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-11,-13,-11,-7,-21,-20,-6,-13,-2,-6,-4,-13,-11,-11,13,42,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=1,3,-12,-4,-6,-14,-12,-13,-15,-7,-18,-14,8,-11,-5,-5,23,33,-7,-33,-14,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=19,-2,-15,-7,-7,-17,-9,-14,-10,-8,-6,-3,-6,-13,-7,-12,3,4,-3,-24,-15,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-23,-11,-9,-20,-3,-18,-17,-1,-19,-11,-6,-1,-10,-4,2,8,-9,-26,-17,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=16,-10,-21,-12,-4,-22,-9,-1,-16,-9,-18,-12,-8,19,-6,-15,3,-4,-14,-25,-16,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-20,-7,-8,-23,19,-13,-27,-8,-26,-17,3,-15,-7,-2,16,4,-17,-29,-21,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-30,-9,-17,-29,57,-3,-39,-19,-29,-17,1,-20,-16,-17,-1,-20,-30,-21,-23,-17;
MA   /M: SY='T'; M=7,1,-11,-6,-7,-14,-14,-18,-13,-9,-13,-12,1,-10,-8,-11,20,36,-3,-30,-13,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-34,-9,0,-26,-17,-17,-17,-9,-26,-17,-17,77,-9,-17,-9,-9,-26,-26,-26,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=21,9,-13,5,-1,-21,-2,-10,-16,-6,-16,-14,6,-10,-5,-13,8,-1,-9,-24,-17,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=24,-13,-21,-15,-6,-23,-9,-20,-14,-10,-17,-14,-13,27,-10,-19,3,0,-11,-25,-23,-10;
MA   /M: SY='A'; M=8,-3,-21,-3,5,-21,-10,-12,-17,3,-12,-10,-5,-13,-2,0,0,-5,-9,-25,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=14,-5,-20,-8,-4,-24,5,-12,-21,-1,-18,-12,-2,-14,-1,-1,5,-5,-14,-23,-18,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=33,-4,-14,-9,1,-21,-5,-16,-14,-7,-12,-12,-6,-9,-5,-16,9,4,-5,-23,-19,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-27,14,36,-32,-16,0,-26,6,-20,-14,1,-5,24,-1,1,-9,-26,-27,-17,30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-8,-25,-11,-1,-21,-15,-2,-25,21,-19,-10,-2,-16,5,39,-5,-8,-15,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-17,-12,-4,-22,3,-15,-16,-6,-14,-11,-5,-12,-3,-11,8,-2,-9,-23,-19,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=25,-15,-10,-21,-17,-12,-13,-23,4,-14,-4,-3,-15,-17,-17,-18,6,6,17,-26,-15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,12,-28,14,-6,-31,33,-6,-36,-12,-28,-21,11,-17,-11,-14,1,-14,-28,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,32,-27,44,13,-36,-5,-4,-34,2,-27,-24,12,-11,1,-6,0,-9,-25,-34,-19,7;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-24,-36,-26,48,-31,-22,9,-28,12,4,-21,-16,-31,-22,-20,-10,3,-2,16,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-2,22,-22,26,4,-28,0,-8,-28,-3,-25,-21,13,-12,-4,-10,8,2,-20,-33,-19,0;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,-20,-13,-3,-21,-6,-13,-19,7,-14,-10,-6,-14,-2,11,0,-6,-10,-21,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,42,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,16,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-14,-20,-15,-10,-13,-20,-19,-5,-8,-6,-5,-13,3,-11,-7,-1,9,-1,-27,-14,-12;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-20,-13,-7,-21,-4,-16,-18,-1,-18,-12,-6,1,-6,-1,5,1,-10,-24,-19,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-2,-24,-3,1,-19,-11,-11,-16,4,-15,-10,-3,-13,-2,2,-1,-2,-11,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-25,4,6,-26,-13,-10,-23,11,-22,-14,-1,-4,2,9,0,-3,-16,-27,-16,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00766;
//
ID   SDH_CYT_1_MP; MATRIX.
AC   MP01000;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Succinate dehydrogenase cytochrome b subunit signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4709020; R2=0.0162584; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=472; N_SCORE=13.135; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-11,-22,-17,-6,-8,-17,-6,-5,5,-5,16,-9,-16,4,0,-7,-6,-5,-19,-4,-1;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-16,4,14,-17,-9,-5,-16,5,-16,-12,6,-6,4,-1,7,4,-13,-22,-13,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-5,-21,-8,5,10,-20,-9,-8,-3,-6,-6,-2,-13,-7,-5,-8,-7,-10,-13,1,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-13,-17,-18,-13,-8,-8,-12,3,-8,4,14,-11,-15,-7,-9,-8,-2,1,-18,-7,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-27,5,26,-21,-17,-6,-24,17,-20,-14,-4,-6,10,7,-7,-10,-22,-4,-9,19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-5,-24,-4,14,-11,-19,-4,-14,6,-10,-6,-4,-11,9,14,-6,-8,-14,-17,-7,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-9,-17,-10,-1,14,-16,-3,-7,-2,-4,-3,-7,-13,-3,-2,-8,-6,-8,-1,12,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-20,-22,-22,-17,1,-10,-14,2,-15,6,7,-18,-18,-11,-13,-18,-12,-4,24,4,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-7,-16,-11,-8,-6,-16,-11,6,-5,3,3,-2,-13,-6,-6,-7,-4,1,-17,-5,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-18,-5,-2,-14,-14,-7,-8,15,-12,-4,1,-11,0,14,-6,-5,-5,-16,-7,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,18,-17,11,8,-19,-5,4,-17,5,-21,-13,27,-11,8,3,7,-1,-21,-27,-14,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-22,-21,-12,-3,-25,-10,5,-5,0,12,-12,-19,-1,-3,-9,0,4,-18,1,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-11,5,-25,1,-4,-14,-12,-1,-17,6,-19,-11,10,-18,-1,8,-1,-2,-16,-20,0,-4;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-21,-12,-7,-16,-15,-13,-4,2,-10,-1,-1,-14,-3,-4,1,-1,-3,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,18,-25,9,7,-27,-11,1,-24,23,-29,-13,27,-15,11,14,0,-5,-26,-29,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-26,2,-33,-27,32,-26,23,15,-23,-24,-22,-23,-17,-3,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='S'; M=12,6,-12,1,-1,-20,0,-8,-19,-8,-27,-19,17,-12,-1,-10,30,13,-12,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-36,-14,-4,-22,-22,-20,-12,-14,-14,-12,-22,67,-12,-20,-14,-10,-22,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,8,-30,12,2,-20,-19,75,-30,-8,-20,-6,10,-19,7,-3,-9,-17,-29,-27,17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-13,-9,-6,-13,-19,-16,-10,-9,-9,-8,-1,-11,-2,-8,17,36,-4,-29,-10,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-25,-32,-24,-4,-35,-27,34,-20,11,13,-18,-19,-18,-21,-13,-2,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-29,-24,-22,31,-31,11,6,-14,3,2,-20,-29,-14,-13,-20,-10,-5,23,67,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-26,0,8,-26,-11,4,-26,15,-24,-11,5,-13,13,17,2,-3,-22,-26,-11,9;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-25,-32,-23,-15,6,-22,-21,-11,-18,-9,-11,-22,16,-18,-19,-15,-9,-16,13,-1,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-28,-1,15,-33,-16,0,-21,2,-24,-9,-2,10,32,0,6,-4,-26,-27,-17,22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-27,-30,-20,1,-30,-21,19,-22,24,15,-25,-16,-16,-19,-25,-11,7,-8,-1,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-17,-9,-6,-16,-15,-16,-12,-10,-17,-9,-3,9,-6,-12,16,25,-8,-32,-16,-7;
MA   /M: SY='W'; M=6,-12,-21,-17,-12,-9,-8,-13,-10,-11,-14,-2,-7,-17,-6,-13,3,-2,-10,10,-5,-8;
MA   /M: SY='I'; M=0,-19,-20,-26,-20,1,-26,-16,15,-18,10,9,-16,-20,-14,-19,-8,4,11,-15,6,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-18,-28,-19,14,-23,-16,10,-23,26,16,-22,-25,-18,-18,-17,-7,6,-17,1,-17;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-26,-32,-25,-5,-25,-26,32,-26,9,11,-15,-19,-18,-26,-9,-6,21,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,3,-32,-26,19,-21,-23,-5,-28,11,-1,-24,-31,-27,-22,-22,-13,-5,3,3,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-26,-31,-26,-5,-15,-25,25,-25,11,14,-18,-22,-19,-25,-16,-11,17,-21,-7,-26;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-11,-20,-27,63,-20,-36,-21,-24,-17,-2,-21,-20,-20,-2,-19,-27,-20,-28,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-6,-30,-28,3,-23,-27,18,-23,8,6,-24,-28,-27,-22,-12,-5,27,-25,-8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=12,-21,-17,-26,-21,-2,-14,-20,9,-19,7,3,-19,-22,-19,-20,-8,-5,14,-17,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-19,-28,-19,6,-27,-16,17,-24,37,25,-25,-26,-15,-17,-22,-3,9,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='F'; M=12,-16,-15,-23,-17,14,-7,-19,-8,-18,-7,-8,-10,-19,-20,-18,4,-1,0,-15,-4,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-22,-21,-27,-21,13,-10,-21,3,-24,12,3,-17,-23,-23,-20,-13,-5,1,-14,-1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=5,-14,-8,-20,-19,-5,12,-20,-18,-19,-10,-8,-9,-20,-19,-19,-1,-2,-10,-20,-14,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-15,-30,-25,18,-27,-22,20,-22,17,13,-24,-26,-25,-18,-16,-5,25,-16,2,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,-11,-9,-12,-11,-9,-5,-11,-13,-14,-11,-10,-7,-10,-10,-14,5,3,-10,-21,-4,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-19,-29,-21,10,-28,-22,18,-25,24,11,-21,-24,-21,-21,-15,-3,13,-19,-1,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-21,-32,-24,42,-20,-18,1,-26,12,5,-19,-21,-28,-19,-17,-10,-2,-5,12,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-18,-22,-22,-19,-4,1,-22,-3,-21,1,-2,-13,-15,-20,-20,-7,-3,-1,-20,-11,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-13,-33,-25,6,-30,-19,12,-25,17,9,-27,-28,-19,-21,-25,-13,3,10,11,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,-13,-16,-14,-11,-8,-6,-16,-6,-19,3,-3,-8,-19,-11,-15,6,7,-3,-29,-12,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00767;
//
ID   SDH_CYT_2_MP; MATRIX.
AC   MP01001;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Succinate dehydrogenase cytochrome b subunit signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5459809; R2=0.0157237; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=368; N_SCORE=11.322; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-32,-24,15,-29,-24,17,-25,15,7,-22,-24,-22,-21,-16,-4,12,-3,5,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-24,-25,-15,3,-24,-21,16,-20,8,6,-16,-20,-15,-19,-12,-4,10,-19,-3,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-17,-29,-19,-12,-9,-20,-9,-7,-3,-13,-6,-15,-9,-8,-9,-11,-10,-7,7,4,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-25,-13,-29,-23,17,-25,-23,6,-24,5,0,-19,-25,-23,-20,-10,-3,8,-3,3,-22;
MA   /M: SY='I'; M=4,-19,-19,-27,-20,9,-21,-20,12,-21,8,3,-12,-21,-19,-21,-8,-5,9,-17,-2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-13,-22,-17,-12,-7,-24,-16,3,5,-2,6,-11,-19,-9,-1,-11,-3,7,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-25,-27,-29,-26,25,-5,-19,-10,-22,-7,-8,-20,-27,-26,-19,-17,-14,-8,27,15,-24;
MA   /M: SY='I'; M=1,-17,-20,-22,-18,-9,-13,-22,12,-20,-1,1,-10,-18,-15,-20,3,2,11,-27,-11,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-22,-32,-22,8,-27,-18,23,-23,23,23,-20,-23,-16,-20,-18,-8,13,-18,1,-20;
MA   /M: SY='L'; M=6,-22,-19,-24,-17,1,-19,-16,5,-19,13,3,-21,-23,-15,-18,-11,-5,4,-5,4,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-12,-11,-15,-13,17,-15,-7,0,-11,-1,-2,-9,-15,-13,-9,-2,3,2,-3,14,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=12,-19,-21,-23,-13,-3,-16,-20,-1,-17,-1,-4,-16,3,-16,-20,-4,-4,-2,-20,-11,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-33,-24,24,-30,-22,15,-28,26,10,-24,-27,-24,-21,-22,-6,7,-4,8,-23;
MA   /M: SY='F'; M=2,-24,-14,-32,-22,17,-22,-20,5,-22,11,7,-21,-24,-21,-20,-15,-9,3,-2,3,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-28,-27,-23,39,-31,6,5,-17,4,2,-20,-29,-18,-14,-20,-10,-4,21,61,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-19,-27,-21,13,-27,-17,13,-22,19,10,-20,-25,-19,-18,-13,1,10,-15,8,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-15,-30,-25,19,-15,-23,4,-27,10,2,-19,-27,-26,-22,-16,-10,2,-7,2,-24;
MA   /M: SY='N'; M=5,13,-18,-1,-9,-18,1,-6,-10,-8,-18,-12,25,-19,-8,-10,5,-3,-11,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-36,-27,1,-36,-27,39,-28,23,17,-21,-22,-20,-26,-19,-5,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-29,-4,-3,-10,-21,88,-27,-12,-17,0,7,-21,5,-2,-11,-19,-27,-26,21,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-22,15,-30,-19,20,-28,41,22,-27,-28,-20,-20,-27,-10,10,-17,3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-21,-31,-24,8,-19,-22,17,-24,17,14,-21,-24,-21,-21,-16,-9,14,-17,-2,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-34,-40,-37,-27,16,-22,-20,-9,-18,-8,-1,-33,-28,-17,-17,-33,-23,-18,96,28,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-18,-23,-13,10,-22,-17,5,-20,14,6,-16,-21,-16,-17,-9,0,3,-18,-2,-14;
MA   /M: SY='G'; M=10,-13,-23,-15,-20,-23,40,-22,-23,-18,-20,-13,-7,-20,-20,-20,0,-13,-11,-22,-25,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-21,-15,18,-28,-5,-3,1,-4,-1,-15,-23,-13,-3,-16,-9,-2,2,29,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-27,-12,-7,-10,9,-15,-17,-16,-6,-9,-7,-20,-13,-15,-10,-14,-17,-7,-12,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-20,-21,-7,4,-27,-17,11,-19,25,12,-23,-24,-14,-16,-19,-8,9,-22,-4,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,15,-22,18,23,-26,-12,-5,-25,2,-23,-19,10,-8,5,-4,11,5,-21,-34,-18,14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-22,-21,-20,-4,-30,-22,22,-22,11,8,-11,-20,-16,-21,-10,3,16,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-29,-1,11,-17,-9,-10,-25,7,-23,-15,-1,5,0,2,-3,-8,-23,-24,-15,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-1,-26,-2,10,-19,-4,-2,-22,0,-19,-11,1,-13,13,-3,2,-7,-22,-19,-8,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-17,-26,-26,-6,-10,-26,15,-21,6,5,-22,-26,-25,-21,-10,-6,25,-25,-12,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-27,-11,-8,-2,-22,9,-11,3,-13,-5,-5,-21,0,4,-8,-5,-14,0,25,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-27,-6,-2,-19,-23,-9,-10,13,-8,1,-5,-16,4,15,-11,-7,-9,-22,-8,-1;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-11,-5,-5,-10,-7,-13,-16,-11,-22,-16,5,-11,-5,-11,31,26,-7,-34,-14,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=11,-7,-19,-10,-13,-22,34,-17,-26,-14,-22,-16,-1,-14,-13,-16,9,-4,-17,-22,-22,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-25,-16,-13,2,-20,-5,-3,-7,-6,-3,-11,-22,-6,-8,-13,-8,-7,16,19,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-15,-9,-23,-16,-5,-21,-22,2,-12,-1,-1,-12,-18,-15,-15,-3,5,6,-22,-8,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00767;
//
ID   TCTP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01002;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Translationally controlled tumor protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2082791; R2=0.0128777; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=229; N_SCORE=7.147; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=178; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-12,-29,-25,5,-23,-26,17,-19,5,4,-23,-24,-25,-21,-7,-2,29,-21,-7,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,27,-29,39,22,-30,-15,-1,-32,8,-25,-21,9,-9,5,-2,-2,-7,-26,-29,-11,13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,10,-14,-18,-23,27,-18,-32,-15,-23,-17,-5,-23,-17,-11,-3,-14,-20,-26,-25,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=0,2,-25,0,6,-27,-14,-8,-25,28,-24,-12,4,-12,7,20,-3,-7,-18,-23,-13,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-19,-25,-24,-17,8,-24,2,4,-13,6,15,-16,-23,-7,-11,-19,-12,-3,5,16,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-19,-28,-22,-2,-32,-26,27,-20,12,10,-22,-23,-20,-18,-12,-1,30,-26,-7,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-4,-17,-8,-1,-16,-20,-15,-8,-1,-12,-7,-4,-13,-3,-5,8,18,1,-29,-12,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-24,-8,2,-16,-21,-7,-10,9,-8,-3,-7,-16,4,21,-9,-8,-5,-21,-9,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-14,-2,2,-15,-7,-5,-12,4,-13,-7,3,-8,5,4,4,6,-9,-17,-9,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-25,3,8,-22,0,-7,-23,1,-19,-14,3,-12,-1,-5,-1,-9,-19,-25,-17,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-22,-3,-7,-16,23,-15,-20,-13,-16,-12,-4,-17,-14,-14,-3,-12,-12,-20,-18,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,28,-24,36,17,-30,-5,-2,-29,0,-23,-21,14,-9,3,-7,2,-7,-24,-31,-18,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-21,-30,-27,2,-34,-27,34,-25,15,13,-22,-24,-24,-24,-16,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-18,41,11,-24,-6,1,-24,0,-19,-18,15,-7,0,-6,1,-6,-19,-25,-12,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-2,-15,-3,5,-18,-9,-4,-12,6,-13,-5,-1,-7,12,4,4,-2,-10,-16,-9,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-13,-19,-13,4,-18,-14,12,-18,27,11,-18,-18,-12,-14,-16,-6,7,-13,-2,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-15,-28,-19,-10,-6,-30,-21,22,-19,6,6,-13,-16,-12,-22,-13,-9,11,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=32,-11,-16,-18,-13,-18,17,-20,-18,-14,-15,-12,-7,-14,-14,-20,7,-5,-8,-19,-20,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=7,-16,-31,-12,-2,-27,-14,-19,-18,-7,-24,-17,-16,56,-9,-17,-4,-7,-21,-27,-26,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-12,-18,-11,-20,5,-20,-13,-11,-12,-11,-8,-11,-11,-19,10,2,-3,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-23,11,14,-23,12,-9,-28,-5,-21,-18,1,-11,-3,-10,-1,-12,-23,-24,-19,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=7,-3,-17,-3,3,-19,18,-10,-20,-6,-15,-12,-2,-8,-4,-10,2,-8,-15,-15,-17,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=0,12,-15,17,12,-19,-1,-4,-18,-1,-14,-13,4,-5,1,-6,1,-5,-14,-18,-12,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,21,-22,31,24,-26,-12,-1,-24,2,-18,-17,6,-6,8,-4,0,-7,-19,-26,-14,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-27,20,45,-29,-13,-2,-28,6,-20,-19,1,-2,13,-3,1,-9,-26,-28,-19,29; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,5,-27,8,-5,-31,38,-14,-36,-12,-27,-21,5,-16,-12,-16,2,-14,-27,-26,-26,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-17,-10,-19,-15,-7,-16,-22,4,-17,4,0,-15,-21,-17,-17,-2,7,12,-28,-12,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-27,32,30,-32,-8,-4,-32,2,-24,-23,7,-7,6,-7,3,-8,-26,-33,-20,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-24,23,15,-29,-2,-7,-27,-4,-24,-20,8,-10,0,-11,7,-4,-21,-33,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-13,-7,-8,-22,14,-11,-25,-11,-22,-15,3,-16,-7,-11,10,5,-17,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='T'; M=9,-7,-14,-11,-4,-14,-12,-18,-7,-11,-8,-8,-7,-13,-9,-13,10,15,2,-28,-15,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-22,0,22,-20,-23,-11,-10,3,-11,-9,-9,-11,3,-4,-2,-2,-2,-29,-15,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-22,-8,0,-20,-17,-8,-16,8,-17,-5,-2,-8,8,12,5,5,-12,-26,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-18,-22,-26,-12,10,-26,2,-20,-6,-2,-18,-26,-26,-20,-6,-8,18,-26,-18,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-12,-13,-19,-21,-6,-25,-11,16,-18,3,4,-5,-25,-18,-17,-9,-5,17,-30,-8,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,53,13,-33,-7,3,-33,0,-30,-27,34,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00768;
//
ID   TCTP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01003;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Translationally controlled tumor protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7387590; R2=0.0122466; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=851; N_SCORE=14.151; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=226; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-1,16,-25,-21,-7,-19,27,-18,-2,-4,-10,11,14,-9,-10,-16,-23,-11,13;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-19,-5,0,-20,-16,-13,-20,16,-21,-11,3,-11,0,9,6,14,-11,-26,-12,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-25,3,-4,-25,14,-4,-29,5,-28,-17,19,-17,-4,3,2,-7,-25,-28,-19,-4;
MA   /M: SY='I'; M=12,-19,-18,-28,-21,-8,-21,-23,20,-19,5,8,-15,-18,-16,-22,-6,-4,19,-23,-10,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-25,4,18,-28,-13,-2,-20,3,-21,-12,7,-2,18,-2,6,-3,-22,-29,-17,18;
MA   /M: SY='G'; M=5,-3,-26,-1,5,-27,9,-14,-27,-1,-23,-17,-3,1,-4,-9,1,-8,-21,-25,-22,0;
MA   /M: SY='F'; M=3,-19,-22,-23,-14,11,-17,-13,-6,-14,-3,-4,-17,-21,-12,-14,-10,-8,-4,7,11,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-16,-28,-23,-1,-26,-22,21,-18,8,15,-19,-21,-18,-18,-7,6,25,-25,-6,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-27,-4,4,-26,-21,-13,-21,40,-24,-7,-4,-13,4,23,-10,-9,-10,-21,-10,4;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-26,3,1,-6,-18,18,-21,0,-16,-7,5,-17,-1,0,-5,-9,-19,-20,6,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,34,-28,28,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,28,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,15,-30,-21,20,-29,41,18,-29,-29,-22,-20,-27,-9,14,-18,2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,-19,-8,-8,-23,13,-15,-22,-9,-23,-16,1,-5,-8,-13,11,1,-15,-27,-22,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,15,-24,9,4,-24,-10,0,-26,19,-28,-16,25,-16,5,22,2,-4,-23,-30,-15,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-38,-28,60,-31,-21,7,-30,19,5,-22,-29,-35,-21,-22,-10,5,2,22,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-28,12,12,-31,-14,-7,-30,32,-29,-14,5,-10,9,17,-3,-8,-22,-26,-13,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,41,-28,51,20,-35,-9,3,-34,2,-28,-25,26,-11,5,-6,2,-8,-30,-38,-20,12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-26,-32,-24,35,-29,-12,4,-24,18,4,-26,-30,-24,-18,-26,-13,-3,23,31,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,5,-29,9,31,-36,-18,5,-24,9,-20,-8,1,-7,40,5,0,-10,-28,-24,-14,35;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-20,-38,-28,72,-30,-14,-1,-29,10,1,-19,-30,-37,-19,-20,-10,-1,7,28,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,62,-30,-6,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,48,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-10,-25,-22,-4,-28,-24,17,-18,4,7,-16,-20,-18,-18,-2,15,22,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-15,0,-1,-21,0,-7,-22,-3,-29,-19,13,-13,1,1,28,12,-14,-36,-19,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-21,-20,-30,-20,1,-21,-4,19,-14,24,50,-21,-21,-4,-12,-20,-10,10,-20,-1,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,27,-25,29,5,-29,-2,12,-30,-3,-26,-20,23,-15,-1,-7,2,-8,-26,-34,-15,1;
MA   /M: SY='P'; M=-13,0,-18,7,5,-25,-19,-7,-22,-7,-22,-14,-8,26,-4,-14,-8,-10,-24,-30,-16,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-30,50,30,-36,-13,0,-35,3,-27,-26,15,-4,5,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='G'; M=13,-9,-23,-12,-16,-26,45,-19,-30,-16,-25,-17,-2,-16,-16,-19,6,-10,-20,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-14,-16,-20,-14,-12,-3,-7,-1,-11,1,25,-11,-18,0,-11,-7,-7,-4,-23,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-27,3,-31,-26,29,-23,23,17,-28,-28,-24,-21,-17,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-13,-25,-20,-11,-9,-25,8,-16,-1,-1,-18,-19,-19,-21,-1,-2,20,-24,-15,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-21,-31,-23,27,-30,-13,15,-25,28,16,-25,-29,-22,-18,-24,-10,8,-7,17,-22;
MA   /M: SY='L'; M=8,-20,-15,-25,-17,-4,-16,-17,9,-19,16,13,-19,-21,-13,-18,-10,-5,8,-23,-9,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,12,-27,12,8,-8,-17,9,-18,0,-18,-14,11,-18,1,-4,-4,-7,-22,-13,16,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-30,-23,-21,34,-30,14,-1,-12,0,-1,-21,-30,-13,-11,-21,-11,-10,33,73,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-29,-6,3,-22,-19,-3,-29,35,-22,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-19,-19,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,17,-29,27,32,-31,-3,-3,-33,5,-24,-21,5,-6,7,-4,-1,-11,-28,-29,-20,20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,32,-22,43,19,-28,-8,1,-28,1,-22,-21,16,-7,3,-6,1,-7,-23,-29,-15,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-30,-5,-7,-30,56,-17,-38,-15,-28,-20,0,-17,-14,-17,0,-18,-30,-22,-28,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-11,-16,-14,-8,-9,-21,-18,4,-10,-4,-3,-10,-15,-10,-13,4,13,10,-25,-7,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,8,-16,6,-6,-16,-17,-15,-10,-9,-13,-12,4,-13,-9,-11,11,24,-2,-33,-13,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-30,-20,-19,87,-10,-20,-9,-9,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-23,-20,-17,11,-27,-5,1,-9,-2,-1,-13,-21,-12,-3,-8,6,0,-3,25,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-19,-33,-24,32,-27,-14,12,-23,21,21,-23,-27,-22,-17,-21,-8,9,-9,13,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-19,-27,-22,4,-27,-20,21,-22,23,19,-23,-25,-19,-19,-18,-7,19,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-19,-32,-26,47,-31,-9,5,-24,10,3,-21,-30,-27,-18,-20,-10,1,8,37,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-31,-25,-37,-28,40,-30,-23,9,-28,15,4,-26,-29,-30,-21,-24,-12,5,18,17,-27;
MA   /M: SY='K'; M=6,-3,-22,-5,3,-26,-12,-12,-24,26,-25,-11,-1,-10,4,14,2,-3,-14,-23,-14,3;
MA   /M: SY='H'; M=-19,22,-31,33,9,-28,-16,36,-33,-5,-25,-17,11,-7,2,-7,-6,-14,-29,-32,-1,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00768;
//
ID   MYELIN_PLP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01004;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Myelin proteolipid protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4014401; R2=0.0127477; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1189; N_SCORE=19.548; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=165; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,31,-23,20,18,-23,-6,7,-23,3,-27,-20,42,-14,6,0,7,-3,-30,-37,-20,12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-7,-14,-7,-14,0,-14,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-14,7,0,0,-14,-14,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-12,-17,-13,21,-13,-9,-1,-13,-1,5,-7,-15,-13,-10,0,0,-1,-9,5,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-37,-4,12,-32,-20,-13,-21,-4,-27,-17,-14,62,5,-13,-7,-10,-30,-28,-26,5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-11,-30,43,-17,-37,1,-30,-17,0,-17,-11,-5,-3,-17,-27,-20,-24,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,-2,7,-27,-20,-12,-27,41,-27,-10,0,-10,7,24,-5,-1,-17,-22,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=10,-25,-17,-31,-25,-5,-26,-27,27,-21,8,8,-21,-21,-21,-24,-8,-4,29,-24,-9,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-24,-10,-17,-24,43,-20,-31,-17,-24,-17,0,-17,-17,-17,6,1,-21,-23,-24,-17;
MA   /M: SY='M'; M=0,-15,-14,-17,-13,-6,-15,-14,4,-17,5,7,-11,-20,-10,-14,5,4,7,-30,-10,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=1,20,-15,6,-4,-17,-5,-3,-16,-5,-23,-16,31,-15,-4,-6,16,16,-17,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,31,-30,-20,14,-30,38,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-16,-15,-5,-9,-15,-16,-3,-15,8,-2,-12,-16,-9,-15,0,4,-1,-25,-12,-7;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-17,-3,-1,-20,-8,-9,-21,6,-24,-15,9,-12,1,8,16,10,-13,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-36,-27,2,-34,-24,39,-26,23,25,-23,-23,-18,-24,-20,-9,26,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,15,-27,10,16,-28,-13,1,-25,22,-27,-13,20,-12,16,13,0,-7,-26,-28,-15,16;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='S'; M=5,9,-16,1,-1,-20,-6,-7,-19,2,-25,-16,18,-13,-1,-2,19,13,-14,-33,-17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,59,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-14,12,-25,8,7,-7,-15,4,-18,-2,-17,-12,15,-17,8,-3,-2,-7,-23,-20,0,8;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-24,-18,-30,-22,2,-24,-9,22,-16,25,43,-24,-24,-9,-14,-21,-8,16,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-20,8,-30,11,3,-23,-18,85,-32,-8,-22,-5,12,-18,8,-2,-8,-18,-30,-32,14,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=24,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25,11,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,26,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,6,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,10,-35,-27,38,-30,-22,0,-30,15,2,-23,-32,-32,-22,-21,-10,1,-12,8,-27;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-7,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,47,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='A'; M=41,-13,-13,-23,-13,-17,-6,-22,-1,-13,-5,-5,-12,-12,-12,-22,5,-2,5,-20,-17,-13;
MA   /M: SY='T'; M=23,-5,-10,-15,-10,-15,-11,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,27,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,43,-29,24,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,17,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-16,-32,-26,17,-30,-24,21,-26,27,13,-28,-30,-27,-20,-20,-6,25,-19,1,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-11,-22,-17,-13,-8,-26,14,2,-17,3,4,-6,-18,-8,-13,-5,7,-1,-26,3,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-20,-31,-23,3,-27,-14,25,-20,27,36,-25,-25,-13,-17,-21,-8,18,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-24,-21,-32,-24,0,-26,-11,28,-16,18,44,-22,-22,-9,-16,-18,-8,21,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-10,-21,-15,-14,-9,-22,1,-13,-6,-5,-14,-16,-15,-19,7,2,14,-25,-17,-15;
MA   /M: SY='T'; M=4,-10,-13,-16,-12,-6,-19,-19,-2,-16,6,-2,-9,-16,-12,-14,6,23,2,-27,-9,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00497;
//
ID   FORMATE_NITRITE_TP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01005;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Formate and nitrite transporters signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4997544; R2=0.0146557; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=447; N_SCORE=12.041; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-26,-6,-2,-7,-17,2,-21,8,-22,-11,4,-3,-4,3,-3,-6,-19,-22,-5,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-26,-16,3,-28,-20,13,-26,36,13,-28,-9,-18,-20,-26,-10,3,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='V'; M=6,-26,-15,-31,-26,-4,-27,-28,28,-21,9,9,-24,-24,-24,-23,-9,-3,36,-26,-9,-26;
MA   /M: SY='G'; M=5,-12,-21,-18,-18,-10,23,-17,-19,-17,-13,-4,-7,-18,-16,-17,0,-5,-12,-18,-15,-17;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,50,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=14,-23,-15,-28,-21,-5,-21,-24,16,-20,13,6,-22,-22,-20,-21,-8,-3,21,-23,-10,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-9,19,-17,-20,-10,-23,-21,-3,-17,-9,-7,-6,-25,-20,-17,2,13,10,-36,-16,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-23,-9,-9,-24,15,-18,-24,-13,-25,-18,-4,9,-11,-17,10,2,-18,-28,-24,-11;
MA   /M: SY='L'; M=3,-25,-17,-30,-22,0,-25,-21,21,-22,23,18,-24,-24,-18,-20,-16,-6,20,-22,-6,-20;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,49,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24,15,-32,-23,24,-29,36,17,-27,-28,-23,-22,-25,-9,17,-18,2,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-23,-33,-25,11,-32,-22,27,-25,20,18,-19,-22,-19,-22,-17,-2,16,-17,3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-29,-20,10,-27,-9,17,-22,35,28,-26,-27,-13,-16,-26,-10,7,-13,11,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,1,-32,-29,-1,-32,-29,25,-24,13,9,-27,-29,-27,-23,-14,-4,35,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='V'; M=13,-24,-13,-28,-24,-6,-23,-27,21,-18,6,6,-23,-23,-23,-21,-6,-1,33,-26,-12,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-32,-26,6,-32,-16,29,-21,18,20,-23,-25,-18,-20,-19,-8,23,-14,12,-24;
MA   /M: SY='C'; M=13,-16,14,-23,-19,-16,0,-20,-13,-18,-5,-1,-14,-22,-16,-21,-5,-8,-5,-27,-19,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-14,-10,-8,-21,10,-17,-19,-12,-20,-15,0,-12,-8,-15,20,9,-9,-28,-21,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-28,39,36,-33,-13,-1,-33,3,-25,-24,10,-5,9,-5,5,-7,-28,-35,-20,23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,71,-31,-21,6,-30,11,2,-20,-29,-38,-21,-20,-10,3,7,27,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,5,-11,-6,-9,-11,-17,-16,-11,-9,-13,-11,8,-11,-9,-9,19,43,-4,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,37,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,19,-1,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,21,-18,10,-1,-19,-5,14,-20,-5,-26,-16,36,-17,0,-3,15,8,-22,-38,-14,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-15,0,-23,-21,-6,-26,-22,9,-17,1,6,-14,-20,-17,-17,0,17,16,-30,-10,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-25,-20,-32,-22,18,-25,-11,16,-21,29,35,-24,-25,-14,-15,-24,-10,8,-15,5,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-21,-23,-19,25,-26,-9,1,-18,-1,-2,-12,-22,-18,-15,-4,6,0,-2,26,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-17,-33,-27,27,-29,-21,17,-24,20,15,-26,-29,-28,-19,-19,-7,21,-14,6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=5,-12,-14,-16,-13,-11,-17,-19,0,-12,-7,0,-11,-5,-12,-14,7,16,8,-29,-14,-13;
MA   /M: SY='F'; M=8,-20,-17,-26,-19,10,-19,-12,5,-16,7,7,-19,-22,-17,-17,-10,-5,7,-9,10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-24,-9,-8,-24,16,-16,-28,4,-23,-14,-1,-15,-7,3,1,-2,-18,-22,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,-13,-25,-20,-7,-19,-24,14,-18,5,3,-19,-21,-19,-20,-2,0,22,-26,-12,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-19,-13,2,-14,-15,-5,-9,9,2,-14,-23,-13,-2,-13,-7,-5,-19,-4,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-25,-2,-6,-25,16,-10,-31,0,-24,-17,2,-16,-5,10,3,-9,-21,-24,-20,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-28,-8,-2,-23,-9,-10,-25,26,-22,-9,-3,-17,2,31,-9,-10,-13,-21,-13,-2;
MA   /M: SY='K'; M=0,-12,-25,-17,-9,-16,-21,-17,1,5,-9,-1,-7,-14,-4,2,-4,-5,1,-23,-9,-9;
MA   /M: SY='I'; M=2,-18,-18,-25,-20,-7,-25,-24,20,-20,3,4,-12,-17,-16,-21,0,9,18,-26,-8,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00769;
//
ID   FORMATE_NITRITE_TP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01006;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Formate and nitrite transporters signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6297998; R2=0.0155207; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=579; N_SCORE=14.606; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=57; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=35,-13,-16,-21,-14,-19,5,-21,-7,-14,-9,-8,-10,-13,-13,-21,5,-4,0,-20,-19,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-29,11,27,-28,-20,-2,-22,9,-13,-9,-2,-9,21,3,-6,-10,-23,-26,-13,24;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-8,-24,-10,-8,-22,3,23,-20,-11,-17,-5,-2,-19,1,-9,-3,-13,-14,-25,-6,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-27,-1,7,-27,-20,-11,-27,41,-27,-10,0,-10,7,24,-6,-1,-17,-21,-10,7;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,-19,-24,-18,-4,-26,-18,15,-9,11,18,-18,-21,-12,-10,-12,1,16,-24,-5,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-8,8,-22,11,8,-23,-13,27,-26,-6,-23,-14,9,-12,4,-6,10,3,-20,-34,-6,5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-14,-26,-15,-10,-7,-20,27,-8,-13,-1,8,-10,-9,-3,-11,-13,-12,-12,-18,11,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-18,-7,-5,-18,-15,-17,-15,-10,-21,-15,-2,15,-7,-13,18,27,-10,-33,-18,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-28,-25,-35,-25,36,-20,-23,-8,-22,-3,-8,-23,-25,-27,-20,-18,-13,-8,39,17,-22;
MA   /M: SY='V'; M=4,-16,-18,-22,-19,-1,-6,-19,2,-17,-3,4,-11,-19,-16,-18,0,1,6,-21,-8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-27,5,29,-29,-21,-3,-19,12,-17,-9,-4,-8,23,4,-3,-9,-18,-26,-14,26;
MA   /M: SY='A'; M=17,-16,-13,-21,-14,-8,-15,-20,2,-16,6,-1,-15,-18,-14,-18,1,6,9,-25,-12,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-18,-36,-29,53,-30,-22,9,-28,16,5,-24,-30,-35,-20,-19,-8,12,-3,17,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-9,-27,-22,16,-23,-19,-1,-23,0,-4,-12,-26,-22,-19,-13,-9,-4,5,4,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-24,-12,-4,-13,-20,-11,-12,10,-1,-2,-8,-19,-1,18,-9,-6,-9,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-24,-13,-17,-27,50,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-23,-35,-26,-3,-31,-25,35,-23,14,19,-20,-20,-18,-25,-14,-7,26,-21,-4,-25;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-22,-23,-19,-6,4,-18,-1,-22,16,9,-18,-23,-17,-19,-15,-12,-3,-20,-11,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-19,106,-29,-28,-20,-27,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-37,-28,-29,-8,-9,-9,-47,-29,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-35,-37,-38,-28,18,-26,-27,-1,-25,3,-4,-33,-29,-23,-21,-33,-21,-11,76,20,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-31,-21,16,-27,-13,17,-23,35,31,-25,-27,-16,-17,-25,-10,9,-16,4,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-29,10,-33,-28,31,-25,17,13,-26,-27,-27,-23,-16,-5,35,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-41,-34,-27,24,-24,-15,-12,-18,-11,-12,-32,-30,-20,-17,-32,-22,-21,101,44,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-21,-31,-21,4,-27,-12,23,-21,33,39,-24,-24,-11,-17,-24,-10,12,-20,0,-17;
MA   /M: SY='S'; M=16,-5,-16,-7,0,-24,-5,-11,-17,-7,-23,-15,0,2,4,-11,21,7,-12,-31,-20,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-25,-30,-23,24,-30,-6,15,-21,20,15,-23,-27,-17,-17,-23,-10,5,1,31,-22;
MA   /M: SY='S'; M=6,-9,-4,-13,-10,-19,2,-12,-19,-8,-18,-7,-3,-17,-6,-4,10,0,-10,-30,-18,-9;
MA   /M: SY='G'; M=14,-9,-18,-14,-13,-18,17,-19,-18,-16,-13,-11,-5,-16,-13,-17,8,2,-10,-24,-20,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-14,7,-30,11,18,-31,-19,-2,-30,27,-25,-13,3,-11,17,26,-6,-10,-24,-24,-13,16;
MA   /M: SY='D'; M=-5,9,-25,15,0,-28,10,-12,-30,-10,-28,-22,5,1,-8,-14,9,1,-22,-32,-23,-5;
MA   /M: SY='I'; M=8,-20,-20,-24,-12,-7,-23,-22,15,-19,12,6,-18,-18,-14,-20,-10,-6,13,-22,-9,-14;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-6,-20,-16,-15,-8,-5,-6,-16,-7,1,-9,-18,-11,-18,-2,-3,-3,-26,-11,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-25,14,-3,-28,10,-13,-26,-3,-22,-17,1,-15,-9,-10,-2,-10,-15,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-29,-5,5,-15,-21,-11,-26,39,-25,-9,-3,-13,3,23,-11,-10,-17,-16,-5,5;
MA   /M: SY='I'; M=2,-25,-23,-34,-24,7,-29,-25,26,-25,15,11,-19,-20,-20,-25,-14,-8,17,-16,-1,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00769;
//
ID   TRANSPOSASE_MUTATOR_MP; MATRIX.
AC   MP01007;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transposases, Mutator family, signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4640059; R2=0.0150480; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=809; N_SCORE=17.628; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-26,23,14,-24,-13,-1,-28,7,-25,-19,7,-12,4,3,5,-3,-21,-27,-7,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-6,-30,-21,6,-29,-19,15,-28,40,20,-28,-30,-19,-20,-27,-10,8,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-6,-25,-8,4,-25,-19,-9,-16,21,-15,-3,-6,-13,12,11,-7,-8,-11,-21,-10,8;
MA   /M: SY='N'; M=10,6,-18,0,2,-22,1,-7,-21,-2,-23,-16,14,-13,-1,-2,13,1,-16,-30,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,16,63,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-3,-31,-24,3,-30,-22,19,-27,30,18,-27,-29,-20,-21,-23,-9,15,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,2,-26,3,22,-32,-18,0,-23,13,-21,-8,1,-8,32,8,3,-2,-24,-25,-13,27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,8,-26,10,1,-32,15,-8,-30,-6,-24,-16,4,-13,5,-10,3,-7,-24,-26,-20,3;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-15,-25,-21,-8,-23,-26,15,-17,1,2,-21,-11,-21,-20,-4,3,24,-27,-13,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-10,-21,-9,6,-5,-19,-14,-9,-10,-6,-8,-10,-5,-7,-12,0,1,-6,-24,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-13,-28,-24,7,-24,-24,20,-20,11,7,-23,-24,-24,-19,-11,-3,28,-20,-4,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-3,-32,-27,-2,-33,-28,26,-25,13,10,-23,-26,-24,-24,-14,-2,27,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,2,-12,-13,-18,4,-19,-17,-15,-20,-14,-3,-18,-13,-16,15,8,-5,-33,-21,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=5,0,-27,1,-12,-30,45,-17,-35,-15,-27,-20,2,-17,-15,-18,2,-15,-25,-23,-27,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-16,-20,-19,-14,2,-21,20,-4,-18,6,4,-11,-23,-11,-13,-12,-10,-2,-21,6,-14;
MA   /M: SY='K'; M=6,-11,-21,-14,-5,-18,-17,-15,-9,14,-8,2,-11,-15,-3,4,-8,-6,-2,-21,-11,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-20,-33,-23,31,-29,-18,14,-28,34,18,-26,-29,-24,-19,-26,-10,7,-11,9,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-19,-31,-15,-4,-15,-22,-20,-11,0,-17,-11,-20,6,-9,-7,-15,-11,-8,7,-8,-7;
MA   /M: SY='A'; M=12,4,-19,3,8,-26,-10,-10,-20,2,-19,-13,0,-9,6,-6,8,3,-14,-27,-17,7;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-12,-22,-12,-18,-5,-21,-3,-12,-6,-6,-11,-11,-11,-21,6,-1,4,-20,-18,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-33,-25,0,-34,-25,32,-22,20,15,-22,-24,-19,-16,-19,-8,26,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-2,0,-23,1,4,-23,-1,-9,-27,3,-21,-16,2,-13,0,11,5,0,-18,-27,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=15,-1,-22,-3,16,-27,-12,-9,-21,10,-18,-11,-4,-7,10,-1,2,-6,-16,-23,-17,13;
MA   /M: SY='V'; M=12,-14,-10,-19,-17,-9,-18,-23,4,-14,-4,-3,-13,-18,-17,-16,8,17,18,-29,-13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-28,-28,-32,-25,38,-30,-9,5,-22,11,2,-24,-29,-23,-17,-24,-12,-3,26,39,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,-1,-28,-20,-20,-19,-10,-28,-19,-18,80,-10,-19,-7,-4,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=2,5,-21,0,10,-23,-12,-2,-15,-2,-13,-9,8,-13,13,-5,4,-3,-18,-28,-15,12;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-10,-16,-13,-13,-12,-21,-4,-12,-9,-7,-8,-14,-13,-16,13,18,8,-27,-15,-13;
MA   /M: SY='A'; M=1,-10,-25,-13,-7,-19,-9,-3,-11,0,-14,0,-6,-5,-3,-6,-4,-8,-9,-24,-11,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-23,-31,-23,-10,1,-23,-17,-7,-12,-10,-6,-23,-23,-3,-12,-18,-14,-8,38,7,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-25,-10,-2,-18,-20,-5,-25,20,-18,-10,0,-18,5,51,-3,4,-15,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-32,-26,-15,-3,-28,-14,7,-14,7,5,-21,-23,-2,-9,-22,-14,-4,16,9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-14,-32,-28,14,-30,-27,24,-22,10,8,-25,-27,-29,-20,-11,1,34,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-23,-26,-18,13,-29,-17,10,-12,16,8,-21,-25,-18,-11,-20,-9,8,-12,8,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-15,-21,-20,-11,-11,-22,-13,9,-14,6,11,-12,-17,2,-13,-4,0,3,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='R'; M=0,-9,-25,-12,-1,-22,-15,-4,-24,17,-17,-9,-3,-16,9,40,-4,-7,-16,-20,-13,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,29,-20,13,-1,-20,-2,17,-20,-2,-26,-16,46,-19,0,-2,8,-2,-26,-36,-15,-1;
MA   /M: SY='I'; M=10,-21,-18,-27,-19,-6,-21,-23,17,-21,11,6,-17,-19,-16,-22,-5,-3,15,-23,-9,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-15,-4,-22,-18,2,-13,-16,-1,-21,12,5,-11,-26,-18,-18,-14,-9,-3,-23,-8,-18;
MA   /M: SY='A'; M=14,4,-17,0,4,-22,-7,-10,-19,-1,-18,-15,5,-11,-1,-2,10,4,-12,-28,-18,1;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-12,-25,-15,-4,-4,-19,-8,-15,0,-9,-7,-11,-16,-7,-4,-9,-6,-12,1,0,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-15,-28,-24,1,-29,-26,22,-22,18,10,-24,-26,-23,-19,-11,5,29,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-28,-6,0,-25,-15,-14,-21,2,-27,-17,-6,33,-3,-1,5,3,-20,-30,-21,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-28,-11,-4,-10,-23,-2,-16,22,-16,-5,-8,-20,1,26,-12,-9,-10,-9,11,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-3,-25,-3,12,-29,-14,-8,-22,14,-22,-11,-3,-1,15,4,2,-5,-19,-24,-16,13;
MA   /M: SY='D'; M=-8,27,-26,35,16,-32,-10,6,-30,-1,-25,-20,16,-11,7,-6,4,-6,-26,-35,-16,11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-28,-10,-3,-20,-10,4,-26,9,-21,-11,-2,-18,7,28,-4,-9,-21,-10,-7,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00770;
//
ID   DNAA_MP; MATRIX.
AC   MP01008;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DnaA protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9211106; R2=0.0175631; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=117; N_SCORE=7.966; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=31,-14,-5,-21,-15,-16,-1,-21,-7,-14,-10,-8,-12,-16,-15,-20,5,-2,4,-23,-17,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-16,-28,-20,-2,-22,-4,19,-13,15,45,-16,-21,-4,-13,-17,-9,9,-21,-1,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-27,-22,-20,29,-26,10,-2,-13,0,-1,-18,-28,-14,-12,-16,-9,-8,21,59,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,14,-31,-21,21,-29,43,19,-28,-29,-22,-21,-28,-10,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,15,-22,-16,-14,-14,-20,-7,-18,-4,-5,-13,-20,-14,-20,2,-1,0,-29,-17,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-5,4,-24,-20,-1,-30,37,-24,-10,0,-16,10,51,-10,-10,-20,-20,-9,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-25,8,24,-27,-16,-3,-22,9,-19,-13,6,-8,15,2,2,-3,-22,-28,-15,19;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-21,-23,-23,-15,5,-25,-6,6,-13,21,13,-20,-25,-11,-10,-22,-11,1,-15,7,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-12,-17,-14,-3,-24,-18,0,-16,6,1,-10,-17,-13,-13,3,28,3,-24,-2,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-6,18,-24,19,9,-27,-8,-4,-24,2,-25,-18,16,-7,2,-4,6,-2,-22,-33,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-9,-19,-12,-7,-8,-20,-1,-4,-9,6,6,-6,-21,-5,-5,-10,-7,-6,-25,-5,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-13,-2,0,-20,-4,-11,-19,-9,-27,-18,7,-5,1,-10,33,20,-11,-38,-19,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-20,-28,-20,15,-28,-14,13,-24,33,18,-24,-27,-18,-17,-22,-5,6,-14,9,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-28,-12,-5,-21,-20,-17,-10,-6,-19,-10,-12,33,-7,-11,-3,0,-11,-29,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-26,8,19,-27,-18,-5,-23,14,-20,-12,1,-9,13,9,0,-4,-19,-26,-14,15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,11,17,-27,-16,-3,-24,14,-21,-13,5,-10,13,9,-1,-6,-21,-26,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=0,-10,-22,-11,2,-8,-19,-10,-6,-6,-3,-4,-9,-16,-5,-6,-5,-5,-4,-21,-6,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-39,-29,69,-30,-20,4,-30,14,4,-21,-29,-36,-20,-21,-10,2,5,25,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-27,-3,-10,-28,45,-14,-35,-11,-29,-19,9,-18,-12,-13,4,-13,-28,-25,-26,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-20,-6,-12,-18,34,-10,-22,-11,-16,-6,0,-14,-10,-10,-2,-12,-17,-16,-17,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-27,54,17,-35,-10,-1,-35,0,-28,-27,19,-10,0,-7,4,-4,-27,-39,-19,8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=7,-2,-11,-7,-6,-15,-11,-16,-14,-10,-18,-14,2,-6,-6,-11,26,32,-5,-33,-15,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-10,-10,-10,-11,-18,-19,-9,-10,-11,-10,-1,-11,-10,-11,20,43,1,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-22,12,12,-29,-29,-28,-21,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-20,-28,-20,1,-26,-17,22,-22,22,23,-20,-23,-13,-19,-14,-5,14,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-1,-27,-2,-3,-10,-18,48,-21,-4,-17,-4,5,-20,3,-2,-5,-11,-21,-18,21,-3;
MA   /M: SY='A'; M=33,-6,-12,-13,-8,-21,7,-16,-16,-11,-18,-14,-2,-11,-8,-17,16,3,-7,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-22,19,-27,-24,-7,-31,-20,9,-23,3,3,-20,-28,-20,-22,-13,-7,14,-30,-9,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-27,4,11,-26,-17,-5,-28,28,-25,-13,5,-13,9,29,-3,-6,-21,-25,-13,9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-21,-5,4,-25,-17,-10,-24,26,-22,-10,0,-12,7,19,-2,-1,-16,-23,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,17,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-24,4,21,-26,-15,-7,-23,10,-20,-14,0,-7,11,3,4,0,-19,-27,-16,16;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-27,9,17,-29,-13,-3,-27,18,-24,-13,5,-10,13,12,-1,-6,-23,-26,-15,15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-24,-8,5,-11,-22,-7,-6,-4,4,4,-10,-16,0,-5,-11,-8,-8,-24,-7,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-25,-28,-18,-4,-29,-16,20,-13,17,20,-18,-22,-8,-7,-19,-9,11,-21,-3,-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,5,18,-23,-12,-7,-21,4,-16,-13,0,-10,6,-2,1,-5,-18,-26,-15,12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-23,6,14,-25,-14,-5,-22,10,-21,-11,7,-10,9,5,5,2,-18,-29,-15,12;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-28,48,17,-34,-6,0,-35,2,-29,-26,21,-11,2,-4,1,-9,-29,-37,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,2,-25,1,2,-22,-7,-6,-23,2,-23,-14,5,-1,0,2,3,-3,-20,-27,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-22,9,13,-25,-10,-4,-24,4,-24,-16,8,-8,6,0,10,3,-19,-32,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-21,-22,-24,-15,11,-28,-18,12,-22,19,9,-19,-23,-15,-17,-17,-5,6,-17,2,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-24,-7,2,-17,-15,-7,-17,11,-15,-7,-2,-15,6,11,-4,-7,-15,-20,-7,3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-23,7,7,-23,-11,4,-23,7,-21,-12,9,-13,5,5,2,-5,-19,-28,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=-6,0,-24,2,1,-19,-19,-9,-7,-7,-5,-4,-4,-15,0,-9,-5,-4,-6,-27,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-32,-25,3,-31,-24,28,-23,15,12,-23,-25,-20,-22,-16,-7,25,-15,1,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00771;
//
ID   CRISP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01009;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CRISP family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4529066; R2=0.0151343; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=297; N_SCORE=9.938; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-11,12,-25,4,-8,-16,-9,-6,-6,-7,-15,-9,19,-18,-7,-8,-2,-5,-12,-28,-10,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-22,-25,-17,28,-24,-15,-5,-12,0,-2,-13,-24,-18,-10,-13,-7,-4,1,13,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-9,-2,-23,-5,-4,-9,-18,-11,-8,-3,-12,-8,1,-18,-7,-3,-2,-2,-6,-19,-6,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-28,-18,-15,23,-27,15,-6,-10,-4,-3,-14,-22,-10,-8,-14,-7,-11,13,52,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-25,14,-3,-27,19,-6,-30,-6,-29,-21,22,-13,-6,-9,6,-6,-27,-32,-23,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-23,-19,-13,12,-26,-8,2,-12,0,0,-16,-18,-15,-13,-12,-6,3,-8,16,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-29,-8,-11,-20,18,-12,-26,-8,-21,-15,-4,-15,-7,-9,-4,-13,-23,-5,-11,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=1,-6,-22,-10,-6,-15,-13,-11,-10,-10,-17,-11,0,6,-4,-12,4,3,-12,-19,-13,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-5,6,-16,2,-2,-21,-14,-10,-19,2,-22,-15,10,-1,-4,-1,4,5,-16,-32,-17,-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-13,-3,-2,-14,9,-7,-14,-1,-13,-8,2,-8,-2,-3,3,-1,-11,-14,-11,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-5,22,-10,-9,0,-13,-9,-11,-9,-8,-7,-2,-16,-9,-9,-4,-4,-8,-16,-6,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-18,-8,-5,-18,-13,-12,-10,-5,-15,-10,2,0,-2,-6,8,10,-8,-27,-15,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-6,-23,-4,-5,-5,-13,-8,-12,-10,-11,-9,-6,11,-7,-11,-6,-4,-14,-17,-6,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-17,3,-6,-13,12,-6,-18,-5,-17,-11,7,-13,-8,-6,1,-6,-14,-17,-10,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-20,-1,3,-22,-7,-4,-18,2,-17,-7,1,-13,2,-2,6,-2,-12,-28,-14,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-13,-16,-14,-15,-10,-14,-3,-5,-10,-1,-12,-21,-11,-8,-3,-3,9,-28,-13,-13;
MA   /M: SY='C'; M=1,-19,18,-27,-24,-9,-27,-27,7,-21,-2,-2,-17,-24,-22,-22,-3,7,16,-32,-14,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-4,-17,-30,61,-18,-40,-17,-30,-20,1,-19,-18,-16,0,-19,-30,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,96,-30,-8,-20,0,10,-20,10,3,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-30,-24,-21,35,-29,14,-3,-14,-1,-1,-20,-30,-15,-12,-21,-12,-11,32,65,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-11,-11,-10,-20,-20,-9,-10,-10,-9,-1,-11,-11,-10,19,47,2,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-29,-1,18,-39,-19,8,-19,9,-19,-1,-1,-10,55,8,1,-9,-28,-20,-11,37;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-17,-32,-27,1,-30,-22,31,-20,17,24,-26,-26,-21,-20,-15,-5,34,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-29,-11,-30,-29,-1,-29,-30,29,-20,9,9,-29,-29,-29,-20,-9,0,47,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=6,-6,-23,-8,-5,-14,-9,-6,-18,9,-16,-10,-5,-16,-3,5,-4,-7,-13,-11,3,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-21,3,1,-22,-8,-2,-23,10,-26,-14,16,-14,2,5,9,5,-18,-30,-13,1;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-10,-4,-5,-15,-11,-14,-15,-10,-19,-15,7,-10,-5,-10,28,35,-6,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-24,-13,-10,2,-23,2,-9,4,-9,-4,-8,-21,-6,2,-9,-3,-7,-6,21,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-26,-3,13,-19,-20,-5,-17,11,-8,-6,-4,-14,9,12,-7,-8,-16,-23,-9,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,21,15,-26,-26,-24,-24,-17,-6,34,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-21,111,-30,-30,-19,-30,-30,-26,-29,-18,-18,-21,-39,-30,-29,-10,-9,-6,-49,-29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=24,-10,-21,-15,-15,-25,37,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=2,-15,-18,-19,-14,-7,-19,-16,2,-6,-6,-2,-10,-19,-11,-2,0,-1,8,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-16,-21,-14,-11,-14,-18,3,-11,-2,-2,-13,-17,-11,-16,0,-2,8,-20,-8,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-24,-10,-2,-5,-19,-4,-12,5,-14,-4,-7,-13,-1,5,-3,-4,-9,-15,6,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-20,85,-28,-27,-9,-28,-22,-23,-26,-15,-16,-19,-36,-26,-26,-10,-9,-9,-34,-12,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-29,-8,-5,-22,-12,-12,-14,-4,-22,-12,-1,22,-6,-3,-1,-5,-17,-29,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-25,21,16,-29,-9,3,-28,3,-26,-18,16,-8,9,-2,6,-3,-26,-33,-17,12;
MA   /M: SY='N'; M=-6,3,-23,1,-1,-19,4,-7,-21,-5,-19,-13,9,-17,-1,-4,3,-4,-17,-27,-16,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-2,-28,-3,-3,-21,1,-12,-25,-1,-25,-17,2,-5,-3,-4,0,-3,-23,-8,-14,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00772;
//
ID   CRISP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01010;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CRISP family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2945428; R2=0.0102407; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=326; N_SCORE=7.633; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=216; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-13,-25,-25,-3,-28,-8,20,-18,5,8,-23,-28,-23,-17,-10,-3,36,-30,-5,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-3,14,-22,-19,-3,-23,15,-15,-10,-2,-14,13,30,-3,-7,-19,-24,-12,11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-18,-32,-26,0,-28,-27,29,-24,19,13,-25,-26,-24,-23,-16,-5,31,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,107,-28,-29,-21,-22,-29,-31,-29,-21,-20,-18,-38,-29,-29,-9,-11,-12,-47,-30,-29;
MA   /M: SY='G'; M=19,-9,-20,-14,-14,-24,29,-16,-25,-13,-20,-14,-4,-15,-13,-16,5,-6,-15,-21,-22,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-20,-18,-13,-8,-21,-14,3,-5,-2,0,-9,-21,-9,3,-4,-2,6,-24,-6,-13;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-17,-21,-16,-13,-9,-20,3,-9,-4,1,-13,-18,-13,-14,-3,-4,10,-23,-14,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-23,-9,0,-7,-19,-4,-12,10,-12,-3,-6,-13,1,12,-7,-5,-9,-13,3,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,60,-24,-23,-8,-27,-20,-19,-19,-15,-13,-16,-32,-22,-20,-8,-6,-7,-31,-8,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-15,-11,-8,-20,-18,-15,-15,-8,-22,-13,-4,21,-9,-9,-7,-8,-19,-23,-19,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,13,-24,11,6,-27,6,-2,-28,1,-27,-18,18,-14,3,-3,7,-3,-25,-31,-19,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-24,9,1,-25,6,-6,-23,-6,-21,-14,11,-16,2,-6,4,-5,-21,-30,-19,2;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-2,1,-15,0,-1,-14,3,-7,-13,0,-14,-9,4,-4,-3,-4,2,-2,-10,-17,-12,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-17,-28,-17,-12,-6,-6,-16,-16,-8,-17,-12,-15,-8,-9,-11,-12,-12,-18,42,2,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-17,-5,-4,-6,-13,2,-8,-4,-4,-4,-1,-8,-2,-2,-4,-1,-10,-12,2,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-25,-11,-9,-18,5,-11,-23,-1,-17,-11,-3,-17,-7,3,-3,-6,-17,-10,-12,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-26,-13,-15,5,-21,11,-8,-12,-8,-5,-11,-24,-11,-12,-12,-9,-8,11,29,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-25,-28,-23,39,-30,3,4,-20,8,3,-20,-29,-21,-15,-20,-10,-2,11,46,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-25,-30,-24,22,-32,-8,18,-21,16,10,-23,-28,-19,-18,-21,-9,9,1,32,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-13,-27,-25,-3,-28,-27,25,-20,6,7,-22,-24,-24,-20,-4,5,36,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-9,23,-22,11,3,-23,-6,17,-22,1,-27,-15,38,-17,10,4,9,-2,-27,-35,-14,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-8,4,17,5,-7,-25,1,-14,-32,-12,-25,-21,1,-22,-13,-16,-1,-10,-21,-34,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-38,-10,0,-29,-19,-13,-21,-8,-28,-18,-17,75,-8,-15,-9,-10,-28,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='A'; M=11,-11,-23,-12,-3,-22,-6,-17,-16,-3,-18,-12,-10,10,-7,-8,1,-4,-10,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-30,-11,-20,-28,65,-20,-37,-20,-26,-18,-1,-20,-20,-20,-1,-20,-28,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-19,-26,-21,-21,19,-27,-5,5,-16,1,1,-18,-27,-18,-15,-18,-10,2,14,33,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-19,-25,-21,-12,-10,-21,-18,6,-14,-1,1,-15,-6,-9,-13,-8,-6,3,-19,-8,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,0,-8,-25,36,-11,-30,-12,-27,-18,10,-9,-11,-13,0,-13,-28,-24,-24,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-24,0,15,-24,-17,4,-20,8,-17,-5,1,-10,16,7,1,-1,-19,-26,-11,14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-23,-8,-1,-9,-18,-12,-16,-2,-15,-12,-7,-5,-6,0,1,3,-11,-15,-7,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-33,-13,-4,-24,-19,-20,-12,-7,-21,-13,-17,55,-10,-16,-9,-8,-18,-26,-23,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-13,-14,24,-28,16,-4,-9,-3,-3,-16,-27,-9,-10,-18,-10,-12,22,67,-16;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-17,-3,5,-14,-15,-9,-10,12,-10,-5,-3,-8,3,5,-3,0,-7,-17,-7,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-22,5,13,-22,-11,2,-20,4,-20,-13,14,-12,10,5,6,0,-21,-29,-15,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-25,-14,-15,-18,20,-17,-17,-11,-16,-9,-8,-21,-14,-9,-4,-11,-7,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-26,-5,9,-24,-19,-9,-16,10,-17,-6,-6,1,8,5,-3,-2,-13,-25,-14,8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-34,-10,-1,-27,-18,-19,-19,-8,-27,-18,-16,67,-9,-17,-4,-2,-24,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-19,78,-26,-26,-10,-29,-26,-19,-29,-6,-12,-20,-36,-27,-27,-14,-10,-7,-40,-20,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-16,-15,-3,-13,-14,-15,-5,-10,1,2,-11,-13,-6,-14,1,6,-2,-23,-13,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00772;
//
ID   FOLYLPOLYGLU_SYNT_1_MP; MATRIX.
AC   MP01011;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Folylpolyglutamate synthase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7877164; R2=0.0136984; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=843; N_SCORE=16.325; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=12,-6,-22,-9,4,-22,-12,-10,-22,13,-17,-11,-4,-12,3,19,0,-6,-13,-21,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-11,2,-13,-6,-20,-20,-7,-29,13,-21,-13,-3,-23,1,41,-4,-7,-17,-28,-15,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-23,-28,-20,-2,-28,-23,26,-25,16,11,-15,-20,-15,-23,-8,-3,16,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-25,-17,-11,5,-25,-2,-3,-5,3,1,-13,-22,-4,0,-11,-3,-6,-6,21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-18,-20,-12,-7,-23,-16,9,-17,13,7,-16,-22,-5,-13,-7,0,8,-26,-7,-9;
MA   /M: SY='A'; M=15,-18,-17,-22,-13,-10,-15,-19,2,-16,6,3,-18,-5,-13,-19,-5,-3,3,-24,-14,-14;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,5,24,-26,-15,2,-24,8,-21,-14,1,-7,12,1,5,-3,-20,-28,-14,18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,17,-28,24,9,-30,-15,15,-32,12,-25,-16,9,-13,5,11,-5,-11,-24,-29,-9,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,16,-30,-21,19,-29,41,17,-29,-30,-23,-20,-27,-9,13,-18,2,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,14,-27,12,-8,-29,37,-8,-35,-11,-30,-22,20,-18,-11,-13,3,-13,-30,-29,-26,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-23,-6,-6,-14,-17,2,-12,4,-8,-5,8,-21,-3,13,-7,-7,-10,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-27,-23,-13,-4,-27,-20,6,-23,23,6,-27,11,-17,-20,-23,-10,-4,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,18,-26,10,11,-28,-11,12,-23,10,-26,-12,27,-14,20,7,2,-6,-28,-30,-13,15;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-17,6,3,-16,-8,-4,-13,1,-13,-9,3,4,3,-3,1,-3,-14,-19,-11,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-12,-2,4,-15,-8,-6,-11,7,-14,-6,-1,-7,5,2,5,1,-6,-17,-9,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=0,-12,-15,-12,-8,-7,-6,-12,-1,-12,1,-1,-9,1,-9,-12,-4,-3,-3,-16,-9,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-10,-14,-12,-8,12,-13,-4,-9,-1,-6,-5,-4,-14,-7,10,-3,-3,-6,-5,7,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-21,-34,-28,5,-32,-25,32,-24,12,12,-22,-24,-23,-24,-14,-6,29,-18,3,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-23,-37,-28,25,-34,-25,28,-29,21,13,-23,-26,-27,-24,-21,-9,20,-13,7,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-2,-26,-4,-4,-17,-21,66,-21,-11,-16,-1,6,-18,4,-4,-4,-4,-20,-29,12,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-7,-14,-15,-11,-19,7,-20,-16,-12,-14,-12,-5,-12,-11,-17,12,11,-6,-24,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-24,12,4,-24,-8,2,-24,19,-30,-16,37,-16,4,11,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-11,-30,60,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-13;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-11,-4,-5,-17,-2,-14,-18,-11,-23,-17,6,-11,-5,-11,31,27,-8,-35,-17,-5;
MA   /M: SY='T'; M=6,-7,-10,-15,-14,-9,-19,-22,-3,-12,-6,-6,-7,-14,-14,-13,13,35,9,-29,-11,-14;
MA   /M: SY='C'; M=1,-17,78,-25,-24,-18,-23,-26,-22,-24,-17,-16,-16,-32,-24,-26,-2,-5,-4,-43,-26,-24;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-17,-12,-5,-20,-7,-8,-17,2,-16,-10,0,-13,-3,0,5,0,-9,-23,-15,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-18,-33,-25,46,-27,-17,4,-24,10,4,-20,-27,-29,-18,-15,-5,5,-1,20,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-18,-26,-20,2,-29,-23,18,-24,25,11,-20,-23,-18,-19,-13,7,15,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-22,11,27,-25,-14,-6,-25,3,-21,-18,3,-6,8,0,10,4,-19,-31,-18,17;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-10,-2,-1,-20,-7,-1,-22,-3,-27,-16,9,-13,0,0,24,12,-14,-36,-15,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-25,-36,-28,2,-35,-26,40,-27,23,22,-23,-23,-20,-25,-20,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-26,-9,5,-20,-18,-4,-12,2,-3,3,-8,-16,18,8,-8,-6,-15,-21,-9,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,11,-24,9,10,-28,-11,12,-23,2,-22,-12,13,-13,17,3,5,-6,-24,-29,-12,13;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-10,-24,-11,-6,-12,-16,8,-12,-6,-16,-7,-5,-5,-1,-9,2,-3,-12,-18,6,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-28,-7,-11,-30,43,-14,-34,-11,-28,-16,1,-17,-5,-12,3,-12,-27,-22,-24,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-17,-25,-17,-9,6,-26,1,2,-10,10,5,-17,-23,-2,-5,-17,-9,-6,-1,26,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-4,7,-27,-20,-3,-24,23,-21,-7,0,-13,21,29,-2,-1,-20,-22,-10,13;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-17,-29,-25,-3,-30,-27,28,-21,8,9,-19,-22,-21,-21,-6,5,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-21,-21,-11,7,-27,-17,3,-12,16,5,-18,-24,-14,-4,-16,-4,4,-19,-1,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-22,42,-29,6,-2,-13,2,-1,-18,-29,-18,-7,-19,-10,-8,20,58,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-11,-7,-7,-13,-14,-16,-14,-8,-16,-13,3,-11,-6,-6,24,39,-4,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-12,-5,-4,-17,-7,-13,-13,-12,-22,-15,6,-11,-3,-12,32,23,-5,-37,-17,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-36,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16,78,-9,-19,-4,-6,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-4,-27,-5,-3,-8,-19,61,-24,-7,-18,-3,4,-20,3,-1,-6,-13,-23,-22,19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-9,-32,-23,5,-31,-22,21,-29,36,19,-27,-28,-20,-22,-26,-10,12,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-21,-31,-25,-1,-31,-23,30,-18,16,22,-23,-24,-18,-18,-17,-7,28,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-25,-3,-1,-22,-7,13,-26,6,-22,-10,10,-17,9,21,1,-3,-22,-26,-9,2;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-20,-30,-26,32,-29,-8,11,-18,8,9,-23,-29,-23,-16,-17,-7,12,2,31,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00773;
//
ID   FOLYLPOLYGLU_SYNT_2_MP; MATRIX.
AC   MP01012;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Folylpolyglutamate synthase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0935326; R2=0.0149033; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=691; N_SCORE=15.382; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=95; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,4,-26,-19,-2,-24,-21,6,-26,21,6,-21,-27,-18,-21,-13,-5,5,-28,-9,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-18,-14,-21,-16,-2,-19,-14,10,-16,14,16,-16,-20,-11,-14,-7,2,10,-23,-6,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=37,-8,-12,-15,-9,-21,6,-18,-15,-11,-16,-13,-5,-11,-9,-18,16,3,-5,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-23,-33,-25,44,-29,-14,5,-26,20,5,-25,-30,-27,-18,-25,-11,0,12,28,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-15,-28,-16,-12,-8,-25,27,-7,-9,-6,2,-9,-22,-5,-3,-15,-14,-6,-11,9,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-24,-21,-25,-23,13,-30,-8,15,-18,13,7,-23,-28,-18,-16,-16,-3,15,-5,27,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='L'; M=2,-17,-22,-21,-13,-7,-22,-15,3,-5,5,3,-15,-20,-10,-5,-11,-6,3,-17,-1,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,4,-26,7,16,-32,-15,0,-25,15,-25,-11,4,-10,27,11,5,-4,-23,-26,-14,21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-27,-2,15,-14,-22,4,-16,6,-11,-8,-7,-14,4,4,-8,-9,-14,-18,2,8;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-25,10,4,-28,2,-1,-26,8,-28,-15,22,-15,9,3,5,-5,-26,-30,-18,7;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-27,26,-30,-28,-4,-30,-28,11,-25,9,3,-27,-33,-28,-23,-14,-5,25,-34,-14,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,19,-39,-14,2,-34,6,-27,-20,13,-10,18,-1,-1,-10,-29,-33,-16,19;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-26,-14,-30,-25,5,-24,-26,5,-21,0,-2,-24,-26,-22,-20,-13,-5,9,13,1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=13,-19,24,-28,-22,-13,-20,-24,0,-20,-4,-1,-18,-23,-19,-24,-5,-5,8,-30,-17,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-25,-32,-25,15,-34,-16,26,-25,22,13,-23,-26,-20,-22,-22,-9,15,-8,19,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,19,57,-30,-20,-1,-30,13,-21,-19,0,-1,19,2,-1,-10,-29,-29,-19,38;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-27,5,18,-25,-18,-4,-28,19,-21,-14,1,-11,9,26,-3,-5,-21,-25,-14,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-24,-22,-15,16,-28,-3,4,-17,15,6,-19,-26,-8,-12,-18,-5,-4,-2,27,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,5,-13,-8,-21,-7,-18,-18,-13,-21,-16,-6,-1,-9,-18,15,4,-9,-33,-23,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-13,-10,-11,-13,-8,-20,-14,-11,-13,-11,0,-11,-11,-11,17,41,-4,-29,-13,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-7,35,-19,17,0,-20,0,7,-20,-1,-30,-20,53,-19,0,-1,14,3,-27,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-35,-29,1,-35,-29,40,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,43,-27,19,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,13,-25,20,20,-29,-13,-7,-27,2,-22,-20,3,1,3,-3,4,-2,-22,-31,-19,11;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-7,-28,-6,-2,-27,4,-14,-28,12,-28,-15,-2,3,-2,6,0,-7,-21,-24,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-30,0,1,-26,-18,-8,-15,-8,-17,-11,-11,29,0,-13,-7,-9,-18,-29,-19,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-7,-9,-10,-9,-3,-11,-10,6,-11,4,1,-3,-13,-8,-9,-1,1,6,-17,-6,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-10,-3,0,-12,-6,-6,-13,5,-13,-8,2,-7,1,8,9,6,-7,-17,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=2,-13,-10,-15,-13,-3,-16,-13,9,-7,1,2,-12,-14,-12,-9,-4,1,15,-13,-1,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=1,-16,22,-19,-18,-6,-18,-19,4,-15,-1,-1,-16,-20,-18,-15,-5,-2,16,-23,-12,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-9,51,-14,-14,-12,-16,-17,-16,-15,-12,-12,-8,-20,-14,-15,1,4,-5,-29,-16,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=9,-17,-20,-20,-22,-17,20,-24,-8,-19,-11,-7,-12,-21,-21,-21,-2,-10,3,-23,-20,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=1,9,-17,2,2,-18,-8,-6,-17,-2,-19,-14,17,-13,-1,-4,14,10,-15,-33,-16,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,31,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=1,1,-27,4,-11,-30,45,-16,-36,-15,-28,-21,3,-17,-14,-17,4,-13,-26,-25,-27,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-28,-32,-24,2,-35,-11,32,-26,20,16,-19,-23,-16,-23,-21,-11,17,-17,9,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00773;
//
ID   OSBP_MP; MATRIX.
AC   MP01013;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Oxysterol-binding protein family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9594641; R2=0.0146608; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=303; N_SCORE=9.392; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=1,-9,-12,-15,-13,-9,-11,-15,-10,-12,-7,-5,-8,-12,-11,-11,4,18,-5,-22,-6,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-25,-32,-30,-24,28,-22,-17,-10,-19,-8,-10,-20,-23,-22,-17,-21,-13,-15,55,26,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-28,23,31,-26,-18,-3,-24,4,-18,-17,1,-3,10,-4,-3,-9,-22,-29,-16,20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-9,-9,-5,4,-15,-7,2,-11,13,3,-11,-14,-8,-9,-11,-5,-1,-9,3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-17,-10,-6,-7,-10,-11,-3,-9,-3,-4,-9,13,-8,-10,-7,-4,-6,-8,-8,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-21,-7,0,-18,-13,-5,-19,9,-18,-10,-2,-1,5,24,2,-2,-14,-22,-13,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,19,-25,23,25,-28,-13,-2,-27,4,-24,-20,12,-5,8,-3,6,1,-24,-34,-18,16;
MA   /M: SY='D'; M=-15,20,-19,25,8,-23,-15,-5,-28,6,-24,-19,11,-15,-2,2,-2,-8,-21,-31,-14,3;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-7,-21,-10,-9,-16,5,-6,-19,-2,-14,-3,-1,-20,-2,0,-5,-10,-17,-19,-7,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-24,1,7,-26,7,-4,-27,3,-24,-14,7,-12,7,0,5,-4,-23,-26,-17,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-19,-17,-24,-20,17,-23,-14,3,-17,5,0,-17,-23,-20,-16,-6,6,7,-9,14,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-26,-13,-3,-1,-23,-3,-18,10,-11,-7,-7,-20,-1,32,-9,-5,-11,-13,4,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-21,-29,-22,39,-27,-10,4,-23,15,4,-20,-28,-24,-17,-17,-7,0,1,29,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-21,-32,-24,9,-32,-25,26,-26,23,13,-22,-24,-22,-22,-16,-1,20,-20,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,2,-13,-9,-19,-5,-18,-14,-12,-17,-14,-4,-14,-9,-17,19,9,-2,-31,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,18,-38,-20,7,-22,16,-22,-2,0,-10,52,13,-2,-10,-28,-20,-10,35;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-11,-29,-29,-1,-30,-29,28,-20,9,9,-27,-28,-28,-20,-8,3,45,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,2,-3,-3,-20,-3,-12,-21,-12,-29,-20,7,-13,-3,-12,36,17,-10,-41,-21,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,0,-20,-20,85,-30,-4,-20,-2,8,-20,10,11,-10,-18,-28,-28,15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-1,-30,-15,-20,-21,-11,-30,-20,-19,84,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-38,-12,-2,-26,-21,-20,-16,-12,-23,-16,-21,79,-11,-20,-12,-10,-26,-29,-27,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-22,-23,-12,-8,-29,-22,20,-13,4,7,-17,-19,-13,-16,-9,-5,20,-25,-8,-15;
MA   /M: SY='S'; M=8,-7,-9,-11,-9,-11,-6,-16,-11,-14,-18,-13,1,-14,-8,-14,22,15,-4,-31,-15,-9;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-5,-18,-11,-21,3,-20,-13,-11,-13,-12,-8,-12,-11,-20,11,0,-3,-23,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-5,-27,-22,32,-25,-1,-8,-20,-2,-4,-15,-27,-23,-16,-13,-6,-6,-2,26,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-28,-17,-14,18,-24,36,-14,-15,-9,-3,-8,-25,-9,-9,-14,-13,-17,6,37,-13;
MA   /M: SY='A'; M=11,-17,-7,-23,-19,-5,-19,-17,5,-16,-3,-2,-15,-20,-16,-19,-1,1,11,-18,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-25,-1,24,-7,-22,-6,-12,-4,-8,-6,-7,-11,3,-8,-4,-7,-12,-22,-7,13;
MA   /M: SY='C'; M=-3,0,9,-8,-11,-17,-8,-5,-15,-14,-20,-11,9,-21,-9,-14,9,1,-11,-37,-17,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-29,-7,3,-18,-20,-12,-19,9,-14,-10,-9,7,-1,11,-9,-7,-17,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-27,16,22,-27,-13,6,-28,16,-26,-17,19,-11,10,9,0,-8,-27,-31,-15,16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-9,-29,-10,-7,-11,-12,-15,-20,-3,-20,-16,-9,-17,-6,-5,-10,-12,-20,36,1,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-27,5,1,-26,0,-11,-23,6,-23,-14,4,-14,-3,1,0,-6,-17,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-16,-35,-28,20,-31,-22,17,-26,14,10,-25,-28,-25,-22,-21,-10,13,1,10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-1,-14,-11,-12,-20,-11,-20,-1,-18,-12,-4,-23,-5,6,-5,-3,-15,-7,-4,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-21,-22,-18,1,-18,-6,6,-17,5,6,-18,-25,-12,-14,-13,-9,9,-18,2,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-24,24,22,-28,-11,5,-27,0,-25,-19,15,-9,9,-4,9,0,-25,-35,-16,15;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-19,-13,-16,-23,25,-21,-22,-17,-21,-15,-6,-8,-16,-19,4,-4,-14,-25,-24,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-13,-23,-14,-10,-11,-23,9,-4,0,-10,0,-8,-21,-6,1,-7,-6,3,-23,3,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00774;
//
ID   NUSG_MP; MATRIX.
AC   MP01014;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transcription termination factor nusG signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1162782; R2=0.0148007; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=419; N_SCORE=11.308; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-26,14,38,-28,-15,0,-27,9,-23,-18,8,-5,17,2,6,-5,-26,-31,-18,28;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-28,18,55,-29,-18,-1,-29,8,-21,-20,1,-1,18,-1,4,-7,-28,-31,-20,36;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-24,-33,-28,5,-35,-21,35,-23,13,13,-23,-25,-21,-23,-17,-7,29,-14,12,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-28,46,17,-33,-11,6,-34,6,-29,-24,23,-12,3,-3,0,-9,-29,-36,-17,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-16,-24,-17,-12,-1,-20,-2,-3,-10,-8,-1,-15,-6,-5,-12,-6,-4,-5,-6,19,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-29,30,43,-31,-18,-2,-29,5,-21,-21,3,-5,11,-4,-1,-9,-24,-33,-19,27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-28,-2,6,-26,-18,6,-28,30,-26,-9,2,-14,11,31,-4,-8,-21,-23,-8,7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-24,-3,0,-18,-4,-5,-24,10,-24,-12,9,-16,6,14,3,-5,-21,-24,-12,3;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-29,-3,9,-24,-21,-7,-27,36,-21,-9,-2,-13,9,35,-11,-10,-19,-21,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,24,-28,41,18,-29,-29,-22,-21,-26,-8,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-27,-2,7,-27,-20,-9,-27,38,-26,-9,0,-11,10,26,-5,-2,-18,-21,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-14,-28,-27,-1,-19,-27,21,-22,13,9,-27,-29,-27,-20,-13,-4,34,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='A'; M=5,-2,-16,-11,-10,-4,-11,-9,-5,-14,-1,-2,5,-20,-10,-13,1,-1,-6,-26,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-18,3,6,-20,-10,-8,-16,-7,-14,-12,5,-12,3,-8,13,7,-13,-32,-16,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-36,-24,44,-26,20,28,-20,-20,-16,-26,-20,-10,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-12,-32,-12,-2,-18,-20,-4,-29,26,-21,-11,-4,-20,7,57,-13,-12,-21,-2,-6,-1;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-21,3,21,-23,-12,-7,-20,-1,-19,-13,2,0,5,-8,10,2,-17,-31,-19,13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-28,19,50,-28,-20,-2,-26,7,-18,-18,-1,-3,15,-2,-1,-9,-23,-31,-19,32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,27,-28,38,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-11,12,-24,17,17,-21,-16,3,-20,-5,-11,-13,6,-13,2,-8,0,-4,-19,-32,-13,9;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-21,-34,-27,61,-29,-9,1,-26,7,1,-19,-29,-33,-18,-19,-10,1,7,32,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-21,16,3,-27,5,-7,-27,-7,-27,-20,13,-12,1,-9,16,5,-20,-34,-20,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-30,2,22,-37,-20,17,-22,8,-20,-2,1,-10,52,8,-1,-11,-30,-22,-8,36;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-29,18,43,-32,-18,1,-29,11,-22,-17,2,-4,24,3,1,-9,-28,-29,-17,33;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-24,-23,-21,-4,-25,-19,24,-22,10,8,-5,-22,-16,-21,-11,-6,13,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-2,-30,-1,3,-17,-28,-3,6,-13,-3,-1,-4,-14,-4,-16,-11,-11,-1,-27,-6,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00775;
//
ID   RIBOSOMAL_L19_MP; MATRIX.
AC   MP01015;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L19 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2707467; R2=0.0118681; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; N_SCORE=9.625; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,3,-23,-20,-1,-29,32,-22,-9,0,-18,14,59,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-11,-16,-17,-17,-8,-23,-20,10,-14,-3,0,-7,-18,-14,-14,3,12,15,-29,-10,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-39,-30,71,-31,-20,4,-29,11,2,-20,-29,-37,-20,-20,-10,3,8,28,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-28,-14,-4,-20,-22,-12,-8,-12,-10,-5,-15,32,-1,-15,-10,-9,-17,-26,-17,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-19,-29,-22,6,-30,-23,20,-24,28,13,-23,-25,-20,-19,-18,-1,17,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-28,-1,-1,-10,-18,62,-22,-8,-16,-4,11,-20,4,-3,-8,-14,-25,-22,18,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,3,-11,0,-1,-20,0,-9,-19,-9,-29,-19,13,-11,-1,-10,36,18,-11,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-39,-8,1,-30,-19,-18,-21,-9,-29,-20,-18,82,-9,-19,-9,-9,-29,-30,-29,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-10,-18,-16,-12,-10,-21,-14,1,-3,-3,0,-2,-20,-8,1,-8,-5,-1,-25,-9,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-28,41,-27,20,18,-23,-23,-22,-26,-18,-8,32,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-23,19,17,-26,-13,-3,-22,1,-21,-17,8,-10,4,-6,5,-1,-16,-33,-17,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,2,-20,0,5,-20,-8,-4,-23,13,-25,-13,8,-12,4,9,9,0,-17,-26,-13,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-28,18,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-27,16,37,-27,-20,-4,-24,7,-18,-16,2,-5,12,-2,1,-3,-22,-29,-17,24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-33,-29,3,-33,-29,33,-24,17,14,-27,-27,-26,-23,-15,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-22,-25,-19,-4,-30,-23,20,-11,13,11,-20,-23,-16,-13,-16,-7,20,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-28,-6,1,-23,-14,-5,-28,26,-23,-11,1,-16,8,41,-4,-5,-19,-22,-12,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-7,1,-18,-19,9,-23,18,-19,-8,-1,-16,6,32,-6,-8,-17,-21,-3,1;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-26,-10,-17,-24,44,-16,-28,-17,-25,-16,2,-19,-16,-18,3,-12,-22,-22,-22,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-28,2,6,-26,-19,-8,-25,30,-23,-10,0,-13,7,25,-8,-9,-16,-23,-11,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-11,-26,-26,-3,-26,-27,23,-18,6,6,-22,-27,-26,-19,-7,1,39,-29,-11,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-26,-8,-1,-20,-17,-2,-27,23,-21,-11,3,-18,7,54,-3,-3,-18,-23,-11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-30,-9,1,-22,-20,-1,-29,31,-21,-10,0,-18,11,62,-9,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-11,-15,-7,-21,0,-17,-14,-7,-15,-12,-5,-10,-7,-15,15,3,-4,-24,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-4,-30,-4,5,-22,-21,-5,-27,40,-25,-9,-2,-14,8,35,-11,-10,-19,-15,-2,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-29,-19,6,-31,-21,21,-25,42,18,-27,-28,-18,-18,-28,-10,11,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-26,-21,-19,32,-27,11,-2,-13,-2,-2,-17,-28,-13,-11,-14,-7,-8,20,62,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,18,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,7,-30,-18,24,-27,42,26,-27,-27,-17,-20,-27,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,14,-25,13,9,-26,0,-4,-27,4,-24,-18,15,-13,1,0,3,-3,-23,-30,-18,5;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-16,-26,-16,-6,-10,-24,-10,-10,10,5,2,-12,-22,-2,26,-17,-9,-8,-20,-6,-6;
MA   /M: SY='S'; M=0,-4,-17,-5,0,-18,-13,-12,-15,1,-19,-12,2,-13,-1,3,16,13,-7,-31,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-17,-30,59,-18,-38,-18,-30,-20,2,-13,-18,-19,0,-18,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-28,-1,7,-28,-19,-10,-27,42,-28,-10,0,-11,8,28,-7,-8,-17,-22,-11,7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-14,-8,2,-23,-4,-14,-17,-2,-18,-13,-3,-9,-1,-11,14,3,-8,-26,-19,0;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-12,-15,-9,-19,-3,-18,-9,-8,-12,-10,-4,-11,-9,-16,11,4,-2,-24,-18,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-34,-27,2,-35,-27,36,-25,23,17,-24,-25,-21,-22,-20,-8,28,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,2,12,-30,-20,-8,-30,45,-29,-11,0,-10,12,29,-9,-10,-21,-21,-11,12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-28,11,42,-27,-20,-3,-23,5,-16,-15,-3,-1,18,-2,0,-7,-24,-28,-18,30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-28,-13,-4,-13,-24,-10,-9,13,-5,-1,-8,-19,0,23,-14,-9,-7,-19,-5,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-15,-24,-19,-10,1,-24,-12,-2,-1,1,3,-10,-20,-9,4,-13,-8,-1,-18,-2,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-26,1,4,-23,-8,-7,-19,3,-19,-11,2,-10,1,3,-1,-5,-16,-26,-14,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00778;
//
ID   GLYCOPROTEASE_MP; MATRIX.
AC   MP01016;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycoprotease family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6395741; R2=0.0156373; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=516; N_SCORE=13.698; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-27,-9,-15,-28,49,-16,-34,-14,-27,-17,2,-18,-12,-13,1,-14,-26,-21,-26,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='G'; M=7,-15,-23,-19,-19,-18,13,-22,-6,-19,-12,-7,-9,-14,-17,-21,0,-6,-2,-23,-19,-19;
MA   /M: SY='G'; M=8,-13,-26,-14,-15,-25,31,-21,-24,-17,-21,-15,-8,-1,-17,-20,-1,-11,-18,-22,-25,-17;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-5,-12,-7,-22,-7,-19,-18,-12,-22,-17,-8,13,-10,-18,10,3,-13,-31,-23,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,48,20,-30,-30,-20,-20,-29,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-24,-19,-11,-9,-24,-1,3,-11,9,8,-12,-21,-2,-1,-13,-9,0,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-12,-21,-19,-7,-21,-24,15,-17,0,2,-18,-23,-20,-18,-1,2,28,-31,-13,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-16,-23,-16,-23,-20,36,-23,-17,-20,-17,-10,-9,-23,-23,-20,-2,-11,-4,-23,-23,-23;
MA   /M: SY='A'; M=18,-20,-13,-24,-18,-8,-13,-22,7,-18,8,2,-19,-20,-18,-19,-3,-2,15,-24,-13,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-16,-10,-12,-10,-18,-15,0,-12,-4,0,1,-16,-10,-13,6,18,2,-29,-10,-11;
MA   /M: SY='F'; M=13,-20,-14,-29,-21,16,-17,-21,3,-18,2,1,-17,-20,-22,-19,-5,-2,10,-13,-1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-20,3,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-10,-10,-20,10,-1,-1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-22,-7,2,-24,-21,-6,-30,35,-24,-11,-1,-17,8,48,-10,-10,-19,-22,-11,2;
MA   /M: SY='S'; M=18,-4,-13,-11,-9,-18,2,-18,-16,-11,-17,-14,-1,-11,-9,-14,19,18,-6,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-30,-21,10,-30,-18,20,-27,40,18,-29,-30,-20,-20,-27,-9,13,-18,5,-21;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-11,-12,-7,-21,4,-16,-16,-11,-19,-14,-2,-11,-7,-16,21,7,-6,-28,-21,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-26,-17,10,-26,-12,8,-18,12,8,-20,-24,-9,-14,-16,-8,4,-5,10,-13;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-16,-15,-8,-12,-8,-16,-6,-11,-1,-3,-9,-16,-8,-11,4,1,-2,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-30,-32,-31,-23,12,-25,-11,0,-22,14,4,-29,-29,-17,-17,-30,-17,-9,44,21,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-12,23,-27,21,5,-29,-1,5,-29,6,-28,-18,25,-16,5,4,1,-8,-28,-32,-17,5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-15,-24,-17,-9,-13,-27,-19,2,11,-3,3,-14,-19,-8,4,-14,-8,8,-22,-7,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-20,-32,-23,17,-29,-22,20,-28,31,14,-25,-27,-23,-22,-22,-8,14,-16,3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-32,-27,5,-33,-24,32,-25,22,15,-26,-27,-23,-22,-19,-6,30,-20,2,-27;
MA   /M: SY='G'; M=7,-13,-21,-14,-15,-25,30,-20,-27,-17,-21,-16,-8,1,-17,-20,-2,-13,-21,-23,-26,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-14,-28,-25,-2,-31,-28,29,-20,10,10,-27,-27,-26,-20,-11,-2,43,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-14,29,-24,19,2,-22,-7,35,-25,-3,-27,-15,41,-19,3,-1,3,-7,-30,-37,-8,1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-24,24,-31,-24,-3,-28,-18,6,-25,17,18,-23,-30,-18,-21,-20,-10,5,-30,-10,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-14,-24,-14,0,-11,-22,-9,3,-10,0,1,-13,-17,-4,-9,-10,-8,3,-22,-5,-4;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-17,-3,-16,-16,-20,5,-12,-19,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-23,-34,-25,5,-32,-26,31,-27,25,15,-23,-24,-21,-25,-19,-8,22,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-12,-14,-9,9,-1,-25,-5,-9,-10,4,-4,-15,-19,-5,-11,-13,-10,-11,-15,7,1;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-16,-22,-15,-11,-14,-16,7,-14,-1,10,-11,-15,-9,-17,3,2,8,-25,-11,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-19,-7,-11,-23,11,-18,-21,-15,-19,-15,-6,4,-15,-18,-2,-7,-16,-28,-23,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-14,-26,-16,-6,-6,-23,1,-12,9,-5,5,-8,-21,3,26,-14,-10,-10,-16,0,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-22,-23,-12,1,-27,-8,13,-19,24,17,-21,-23,-10,-15,-20,-9,6,-19,2,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-26,0,8,-15,-18,-7,-8,-7,-10,-8,0,-13,-1,-9,-2,-3,-9,-27,-10,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-7,5,-20,5,7,-19,-17,6,-20,0,-17,-11,3,-11,5,-2,7,11,-15,-25,-4,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-27,9,0,-29,16,-9,-32,5,-30,-19,12,-11,-4,-2,2,-10,-26,-28,-21,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=10,-14,-19,-18,-12,-10,-13,-18,2,-15,-4,-3,-11,-7,-10,-18,-1,-3,2,-21,-11,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-24,6,14,-21,-19,-2,-17,1,-10,-9,0,-13,7,-2,-2,-2,-15,-29,-12,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,0,-15,-4,-8,3,-17,-6,-14,-9,-14,-11,4,-14,-10,-10,-5,-6,-14,-18,2,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-37,-10,1,-24,-21,-16,-16,-10,-21,-12,-19,66,-8,-18,-11,-10,-25,-26,-21,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-13,-5,-13,-11,-5,-14,-14,6,-10,0,0,-13,-2,-12,-11,-4,0,11,-17,-8,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-11,-15,-13,-9,16,-11,-3,-5,-9,-3,-2,-9,-8,-7,-7,-8,-6,-7,2,14,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-7,-29,-24,5,-29,-24,17,-24,21,9,-25,-28,-24,-20,-15,-1,22,-25,-5,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00779;
//
ID   STEROL_REDUCT_1_MP; MATRIX.
AC   MP01017;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sterol reductase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9469800; R2=0.0153995; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=486; N_SCORE=12.421; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-17,-30,-20,-10,-13,-27,-10,-3,10,-7,0,-7,-20,0,37,-13,-10,-3,-20,-7,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-21,0,6,-24,-12,-9,-24,28,-27,-12,3,-9,6,16,5,-1,-15,-24,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-21,-11,-8,-23,11,-14,-19,-11,-21,-10,-4,1,-5,-15,9,-3,-15,-26,-22,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-25,-12,-11,-5,-4,4,-12,-14,-7,-5,-7,-15,-7,-12,-5,-7,-14,-13,10,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,-4,-21,-11,-12,2,-16,-11,-3,-7,1,-2,4,-24,-13,-6,-10,-6,-4,-23,-6,-12;
MA   /M: SY='F'; M=0,-16,-22,-21,-13,10,-14,-18,-13,-1,-10,-7,-12,-19,-16,-6,-9,-6,-7,-1,1,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-33,-1,4,-29,2,-15,-27,-4,-27,-19,-7,30,-6,-10,-4,-8,-27,-27,-25,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-19,1,6,-19,-14,-8,-15,-1,-14,-8,3,-12,3,-2,8,8,-11,-30,-14,4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,2,-21,2,2,-16,-12,-5,-20,4,-21,-14,7,-16,2,12,9,1,-14,-29,-13,1;
MA   /M: SY='A'; M=3,-10,-23,-10,2,-16,-19,-13,-1,-11,0,-2,-10,-9,0,-14,-4,-6,-5,-25,-12,0;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-11,-14,-10,-8,1,-17,-3,5,-15,21,8,-12,-17,-9,-10,-15,-7,1,-14,0,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=15,-1,-14,-3,1,-18,-6,-5,-16,1,-15,-10,-1,-9,-1,-1,6,-1,-9,-20,-13,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-2,1,-29,7,5,-25,-15,-10,-22,3,-21,-16,-6,17,-3,-8,-5,-8,-20,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,0,-13,-15,-24,14,-6,-27,-18,-23,-15,-6,-10,-15,-18,-1,-12,-18,-30,-21,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-7,-29,-7,-9,-26,28,0,-34,1,-26,-14,1,-17,-6,4,-4,-16,-26,-20,-16,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-10,-18,-17,-16,12,-19,0,-2,-17,-2,1,-2,-23,-16,-12,-4,-1,1,-22,2,-15;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-1,-6,-5,-17,-11,-15,-18,-8,-22,-16,3,-12,-5,-9,25,27,-7,-36,-17,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,33,-20,16,-1,-18,-2,14,-20,-2,-28,-18,51,-20,0,-1,9,0,-28,-36,-13,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-24,-26,-18,7,-27,-3,10,-22,17,14,-19,-13,-15,-18,-20,-11,2,-18,2,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-36,-28,17,-34,-26,30,-28,23,14,-24,-26,-26,-24,-20,-8,24,-17,3,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-18,21,-29,29,-1,-13,-2,2,-14,-27,-9,-10,-18,-12,-10,14,60,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,26,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-30,-31,-35,-27,41,-25,-16,-7,-22,-3,-7,-26,-29,-26,-18,-25,-16,-12,58,36,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-27,-34,-26,43,-26,-10,0,-21,4,7,-24,-28,-23,-16,-24,-14,-6,34,34,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-25,-25,-34,-24,11,-27,-15,21,-20,16,31,-21,-22,-13,-18,-21,-9,10,-3,6,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-16,-26,-21,-12,-12,-23,-7,0,2,-4,5,-9,-19,-3,19,-11,-9,1,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-19,11,42,-30,-20,-3,-28,5,-21,-18,-2,1,18,-3,1,-8,-28,-31,-20,30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,43,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,35,-21,17,-2,-16,-2,11,-18,-1,-28,-18,53,-21,-1,-1,8,-1,-28,-34,-12,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,16,63,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-31,-28,-38,-29,11,-36,-28,35,-29,19,14,-23,-24,-23,-26,-22,-11,22,-6,5,-28;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-19,-14,-21,-26,52,-18,-32,-19,-23,-10,-4,-21,-18,-19,-3,-18,-24,-22,-26,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-24,-1,12,-19,-16,-7,-17,14,-18,-9,1,-5,7,5,-2,-6,-15,-21,-11,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-12,-16,-12,-9,-1,-7,-11,-8,-9,-8,-8,-10,-11,-6,-8,-4,-4,-9,27,3,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-36,-28,40,-31,-23,16,-28,21,9,-24,-29,-31,-21,-21,-8,15,-8,12,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-37,-27,29,-33,-23,24,-30,27,14,-23,-27,-26,-23,-23,-10,14,-10,10,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-18,-14,-21,-10,10,-25,-9,2,-15,8,10,-17,-23,-9,-13,-13,-7,0,-14,7,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-31,-22,-39,-29,71,-29,-21,0,-29,11,0,-22,-30,-37,-20,-22,-11,-1,17,28,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,16,-30,-24,34,-27,-13,-12,-26,-4,-7,-14,-29,-29,-20,-10,-4,-5,-14,8,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-24,13,28,-22,-15,-1,-18,2,-19,-16,15,-11,6,-3,2,-5,-18,-33,-19,17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-8,-23,-20,-8,-7,-20,-4,-17,9,1,-18,-27,-18,-8,-15,-11,1,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-27,-11,-1,-20,-17,-3,-27,24,-19,-10,-1,-19,7,57,-7,-9,-17,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-34,-13,-9,-24,4,-20,-19,-16,-18,-14,-16,41,-14,-20,-10,-13,-24,-26,-25,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00780;
//
ID   STEROL_REDUCT_2_MP; MATRIX.
AC   MP01018;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sterol reductase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8633661; R2=0.0140109; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1400; N_SCORE=24.469; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-24,-35,-28,43,-16,-22,-1,-26,2,-3,-20,-27,-32,-21,-17,-12,-1,13,15,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,15,-24,11,-1,-25,14,-3,-27,-6,-27,-18,22,-17,2,-7,7,-6,-27,-30,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-1,-20,-5,-5,-16,-14,28,-14,-11,-17,-4,9,-16,0,-8,9,3,-13,-32,-2,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-26,-27,-25,-17,-2,-28,-23,10,-21,8,3,-24,14,-20,-21,-18,-8,4,-23,-10,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-24,19,-31,-22,22,-29,36,16,-27,-29,-24,-21,-25,-9,14,-16,4,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-14,-30,-11,-3,-24,-18,-20,-17,-10,-23,-17,-14,57,-10,-18,-1,6,-20,-29,-24,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-32,-22,-21,28,-29,15,-2,-11,-2,-2,-22,-30,-11,-11,-22,-12,-12,43,75,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-18,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-25,-26,-19,-3,-28,-24,16,-20,1,5,-21,7,-19,-21,-12,-6,13,-24,-10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-11,-35,-26,0,-34,-27,30,-28,22,14,-23,-25,-22,-26,-20,-8,22,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,7,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-37,-27,56,-28,-17,6,-27,18,13,-22,-28,-31,-18,-22,-10,3,1,21,-25;
MA   /M: SY='T'; M=9,-14,-16,-21,-16,-2,-11,-21,-2,-18,3,-2,-11,-17,-16,-18,0,10,1,-20,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-25,-10,-32,-26,-3,-30,-27,27,-24,13,11,-21,-23,-21,-24,-13,-3,25,-25,-7,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-19,-33,-27,7,-33,-27,31,-25,16,12,-23,-25,-24,-23,-14,-1,31,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,1,-32,3,-1,-19,-19,82,-30,-10,-21,-4,7,-20,7,-2,-12,-20,-30,-17,18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,0,4,16,-25,-17,-10,-21,-4,-17,-15,-3,-13,2,-11,0,-7,-14,-32,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=1,-12,-22,-15,-8,-6,-18,-12,-9,-1,-4,-4,-8,-18,-4,6,-5,-5,-6,-19,-7,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-30,24,39,-31,-20,-2,-24,4,-19,-17,3,-5,17,-4,-2,-10,-25,-30,-17,27;
MA   /M: SY='H'; M=-3,1,-24,2,2,-21,-16,29,-22,-1,-17,-8,1,-16,2,0,-4,-11,-16,-26,-1,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-30,-3,7,-27,-20,6,-29,34,-25,-8,1,-14,15,38,-9,-11,-22,-21,-7,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-24,-8,1,-22,-15,-4,-24,21,-20,-10,-1,-15,5,28,-1,-5,-15,-23,-11,1;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-23,-3,7,-22,-14,-5,-20,12,-18,-10,4,-14,7,17,1,-4,-15,-26,-14,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-18,-30,63,-19,-39,-15,-30,-19,0,-19,-18,-16,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-25,-2,12,-21,-19,-10,-18,13,-9,-8,-6,-13,3,8,-8,-8,-13,-23,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=-5,23,-25,30,5,-25,-12,1,-22,-6,-19,-18,9,-13,-4,-12,-1,-8,-18,-28,-8,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,16,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,138,30,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,16,-28,25,36,-32,-16,1,-31,10,-23,-19,4,-5,13,0,-1,-10,-27,-30,-17,24;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-29,2,24,-23,-21,-1,-24,18,-14,-10,-3,-11,10,19,-8,-10,-21,-24,-12,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-14,66,-22,-18,-17,-27,-24,-23,-18,-14,-14,-15,-30,-19,-17,-6,0,-9,-41,-22,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-27,-4,10,-27,-17,-4,-25,24,-22,-9,-1,-12,17,28,-3,-8,-20,-22,-12,12;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-15,-24,-19,-10,-13,-21,-4,-2,-1,-2,1,-10,-18,-5,5,-10,-9,-1,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,15,-30,-30,-4,-30,-30,18,-22,4,4,-28,-32,-30,-22,-10,-2,38,-34,-14,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-36,-7,2,-29,-19,-16,-23,7,-29,-17,-13,54,-3,0,-8,-9,-26,-27,-23,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-35,-25,-22,25,-28,9,-5,-12,-5,-5,-25,-30,-12,-12,-25,-15,-15,57,69,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-13,-26,-13,-5,-15,-22,-7,-18,18,-10,-5,-6,-21,2,44,-10,-5,-8,-22,-9,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-28,-26,-36,-26,16,-35,-17,30,-29,20,15,-19,-24,-22,-24,-21,-11,17,-15,7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-36,-27,8,-35,-26,36,-28,27,19,-24,-24,-21,-25,-22,-9,23,-19,1,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,83,-9,-19,-6,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-29,-15,-19,3,11,1,-15,-15,-9,-7,-10,-26,-14,-14,-12,-14,-17,4,27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-33,-27,-1,-34,-20,36,-25,15,15,-22,-24,-22,-24,-16,-7,32,-24,-2,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-28,-24,46,-30,3,1,-19,7,1,-21,-30,-21,-14,-21,-10,-5,19,56,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00780;
//
ID   ARF_MP; MATRIX.
AC   MP01019;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ADP-ribosylation factors family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7972860; R2=0.0136198; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=548; N_SCORE=12.251; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-13,-14,-8,-18,-14,-20,-6,-12,-13,-10,-13,5,-12,-18,3,0,1,-29,-20,-11;
MA   /M: SY='A'; M=18,4,-16,-2,3,-22,-5,-5,-17,-5,-19,-14,7,-11,0,-10,13,4,-13,-29,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-28,21,47,-30,-17,-2,-29,7,-21,-20,2,-2,16,-3,2,-8,-27,-31,-20,31;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-29,1,-36,-28,41,-27,20,19,-23,-23,-22,-26,-19,-8,32,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-16,-6,1,-18,-12,-9,-16,-3,-16,-11,0,-11,1,-5,14,19,-10,-26,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,13,-29,19,27,-31,-17,1,-30,16,-24,-16,7,-8,16,11,-2,-8,-26,-28,-15,21;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-14,-23,-17,-7,-9,-17,-13,-4,2,-3,3,-12,-18,-3,-2,-10,-8,-2,-18,-6,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,18,-30,46,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-26,4,2,-27,16,-1,-30,-2,-25,-17,9,-14,-2,-5,2,-10,-25,-26,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-20,21,-28,45,21,-30,-30,-20,-20,-28,-9,13,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,6,-27,8,10,-26,-11,24,-26,0,-22,-11,7,-10,9,-1,-1,-8,-24,-29,-7,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=2,5,-19,5,10,-23,-10,-8,-22,5,-24,-16,8,-10,4,1,15,8,-16,-32,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-33,-23,31,-29,38,21,-26,-26,-19,-23,-26,-10,17,-20,0,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-21,-6,1,-22,-17,-7,-25,23,-23,-11,0,-10,5,31,0,-1,-16,-24,-12,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='B'; M=-5,22,-21,22,6,-27,-3,-2,-26,-1,-27,-20,21,-13,2,-4,12,2,-22,-35,-19,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-28,-8,0,-20,-20,18,-28,18,-19,-8,2,-19,10,47,-7,-7,-21,-23,-4,1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,2,-21,-1,0,-19,-16,13,-20,-4,-21,-11,7,0,1,-5,2,0,-19,-31,-9,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-39,-30,12,-21,-28,-16,-20,-17,-17,-38,-30,-20,-20,-38,-28,-27,136,31,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-12,-17,-14,-9,3,-24,14,-12,-6,-7,-2,-9,-23,2,-3,-11,-10,-15,-7,23,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-21,-11,4,-16,-22,-1,-11,-2,-12,0,-5,-16,28,-1,-4,-9,-16,-18,-5,17;
MA   /M: SY='P'; M=6,-9,-25,-8,-6,-26,12,-17,-25,-6,-27,-17,-5,13,-9,-13,6,-5,-20,-27,-24,-9;
MA   /M: SY='C'; M=0,-9,35,-17,-17,-15,-21,-23,-16,-17,-15,-14,-8,-21,-17,-18,10,20,-2,-38,-19,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-8,65,-15,-17,-20,-18,-20,-26,-21,-24,-20,-4,-28,-18,-21,8,0,-12,-46,-26,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-17,-23,-18,-2,-27,-17,12,-18,11,6,-16,-21,-16,-13,-6,10,14,-24,-3,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-17,-8,-4,-17,-16,-14,-12,1,-17,-10,1,-11,0,-2,15,21,-6,-29,-12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-28,29,38,-31,-17,1,-29,5,-21,-18,5,-5,15,-3,1,-6,-27,-32,-17,26;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-30,-6,-16,-30,58,-17,-39,-13,-30,-19,2,-19,-16,-13,-1,-18,-29,-21,-28,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-21,9,-30,-21,21,-30,47,20,-30,-30,-20,-20,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-17,-9,-11,1,-24,-4,-5,-10,-1,-3,-13,-20,-9,-11,-11,-4,-5,-10,17,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,40,-32,-18,0,-28,6,-22,-17,1,4,21,-1,1,-9,-29,-30,-19,30;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-26,-11,-17,-28,55,-20,-34,-18,-27,-18,-1,-18,-17,-20,4,-15,-24,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-32,-22,16,-28,-15,19,-25,35,28,-25,-27,-17,-18,-25,-10,10,-16,4,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-27,34,22,-30,-14,-2,-29,3,-23,-20,11,-9,4,-1,2,-4,-24,-34,-18,13;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-33,-47,-33,-23,3,-20,-27,-22,-8,-22,-18,-33,-27,-15,-12,-35,-27,-28,121,23,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-21,8,-30,-21,23,-28,43,21,-29,-29,-20,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='S'; M=3,-10,-3,-14,-11,-12,-16,-11,-7,-13,-11,-7,-5,-17,-9,-14,11,11,-1,-30,-9,-11;
MA   /M: SY='B'; M=-5,19,-23,18,10,-27,-6,-1,-26,3,-25,-18,19,-12,4,-2,7,-1,-23,-33,-17,7;
MA   /M: SY='B'; M=-11,12,-23,8,2,-13,-15,1,-16,-3,-15,-7,12,-16,3,-2,0,-1,-16,-27,-8,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-22,-32,-24,4,-32,-21,28,-26,27,17,-24,-25,-20,-22,-20,-6,21,-21,0,-24;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-23,-7,-2,-20,-8,-11,-17,10,-19,-9,2,-12,0,3,0,-4,-13,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-19,-2,1,-21,-11,-10,-16,5,-20,-12,5,-13,1,0,11,4,-9,-30,-15,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-29,-7,3,-22,-16,1,-27,23,-22,-10,-2,-11,8,35,-7,-9,-20,-20,-7,2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-26,-13,-4,-19,-17,-11,-9,10,-11,-1,-6,-13,3,11,-6,-7,-7,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-11,-26,-13,-5,4,-20,-9,-16,11,-12,-6,-6,-16,-8,8,-12,-10,-12,-13,3,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-17,-14,-8,-11,-19,-13,-2,-6,-5,4,-5,-14,-5,-6,6,16,0,-28,-9,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-21,-16,-10,-7,-21,-14,-2,-8,15,3,-15,-22,-9,2,-14,-7,-2,-22,-7,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-28,27,11,-30,-7,-6,-31,9,-25,-19,7,-12,0,5,-2,-7,-21,-30,-17,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,7,-23,8,6,-30,-5,-4,-23,-2,-21,-12,3,-11,18,-5,8,2,-20,-27,-16,12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-22,-10,-1,-18,-23,-11,-9,8,-6,0,-8,-15,8,4,-5,3,-6,-23,-8,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00781;
//
ID   SAR1_MP; MATRIX.
AC   MP01020;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SAR1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2969799; R2=0.0128603; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1148; N_SCORE=19.051; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=172; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-26,-19,-15,9,-26,25,1,-15,11,14,-16,-26,-6,-10,-20,-12,-7,-4,35,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-20,-9,-3,-13,-17,-5,-6,-7,-6,2,0,-17,10,-5,1,1,-9,-25,-8,4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-5,-14,-11,-11,-22,-21,-9,-14,-6,-9,-8,-1,-13,-14,7,29,-4,-30,-13,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-11,-13,-11,-7,-21,-20,-6,-13,-2,-6,-4,-13,-11,-11,13,42,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-27,-1,7,-27,-17,-9,-29,39,-29,-11,1,-11,9,30,-4,-6,-19,-23,-11,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-2,-11,-32,51,-14,-37,-14,-29,-18,2,-18,-8,-15,0,-18,-30,-22,-27,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,8,-26,6,2,-25,-3,-4,-28,21,-26,-14,12,-15,3,22,-4,-9,-23,-24,-14,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-26,-14,-28,-26,-2,-28,-28,28,-21,7,8,-23,-25,-24,-21,-6,0,38,-29,-9,-26;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,16,-18,10,4,-22,-6,1,-18,-1,-23,-14,23,-8,10,-2,12,3,-21,-30,-16,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-23,-14,4,-25,-15,10,-16,33,13,-22,-24,-13,-7,-23,-9,4,-17,-1,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,-4,-19,-6,3,-18,-13,-10,-12,4,-13,-9,-3,-6,-2,3,-1,-4,-6,-23,-14,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-14,10,9,-15,2,-5,-14,-2,-11,-10,1,-6,-1,-5,-1,-6,-10,-16,-11,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-17,-3,9,-15,-12,-8,-11,-6,-10,-6,-3,-3,1,-8,9,6,-10,-27,-13,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,16,-25,10,-7,-27,28,-6,-30,-9,-28,-20,24,-18,-9,-11,5,-10,-28,-30,-24,-8;
MA   /M: SY='I'; M=0,-15,-21,-18,-9,-17,-23,-14,9,-10,-3,4,-12,-18,7,-11,-3,-4,9,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-20,-33,-26,3,-32,-23,31,-25,27,22,-26,-26,-20,-22,-21,-7,26,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,14,11,-30,-30,-29,-20,-12,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-22,-26,-17,-5,-20,-4,12,-10,11,44,-18,-6,-2,-11,-15,-5,4,-22,-5,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-30,-27,4,-31,-24,28,-22,18,12,-28,-29,-25,-20,-16,-4,35,-22,1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-25,-13,-6,-13,-19,-2,-7,7,-1,13,-3,-20,6,17,-12,-9,-9,-22,-7,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,4,-24,-20,0,-29,30,-21,-9,0,-17,17,56,-9,-10,-21,-20,-10,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-25,-11,0,-12,-19,4,-7,-2,-7,14,0,-17,23,0,-7,-9,-15,-19,-4,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-26,-13,-19,-22,46,-20,-29,-20,-17,-14,-4,-20,-19,-19,-1,-10,-21,-21,-24,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-30,31,51,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,33;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,55,-33,-23,15,-30,13,6,-20,-27,-34,-23,-20,-10,9,1,21,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-2,-29,34,-23,-9,0,-15,16,49,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,42,31,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='S'; M=14,-2,-12,-3,-3,-21,6,-12,-20,-11,-27,-19,7,-11,-3,-12,33,14,-10,-36,-21,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-29,2,17,-37,-18,8,-21,14,-22,-3,6,-11,48,12,0,-9,-29,-22,-11,32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-13,13,-30,19,13,-33,-17,-7,-33,37,-30,-15,5,-10,7,19,-7,-10,-23,-25,-13,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00782;
//
ID   COPROGEN_OXIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP01021;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Coproporphyrinogen III oxidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4019880; R2=0.0131779; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1392; N_SCORE=22.736; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-23,-3,11,-23,-20,-6,-26,29,-22,-10,-2,-12,10,22,-8,-10,-20,-21,-10,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-1,12,-23,10,9,-23,-11,-3,-17,1,-17,-13,11,-12,5,-2,2,-5,-17,-27,-14,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=28,-16,-9,-24,-15,-12,-12,-22,2,-16,2,-2,-15,-16,-14,-21,0,0,7,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,94,-30,-28,-15,-30,-28,-20,-30,-8,-13,-22,-38,-28,-28,-13,-10,-5,-45,-25,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-7,23,-27,31,16,-32,-12,-3,-28,2,-22,-19,10,-7,7,-4,0,-8,-24,-32,-18,11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-32,-7,3,-26,-19,-13,-23,11,-26,-14,-9,26,2,8,-7,-7,-22,-20,-17,0;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-15,-23,-20,-17,23,-22,22,-8,-18,-4,-1,-7,-25,-16,-12,-12,-10,-8,-9,22,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-8,9,-30,13,-5,-30,28,-4,-35,-9,-29,-21,9,-10,-10,-13,-1,-15,-29,-27,-21,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-27,1,8,-24,-15,-14,-15,-4,-18,-14,-7,15,-4,-11,-1,-5,-14,-29,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=0,12,-23,17,18,-27,-12,-7,-24,1,-21,-18,4,-5,4,-7,6,-1,-18,-31,-18,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-15,-24,-15,-16,10,-28,-13,7,-18,8,2,-17,-25,-18,-15,-17,-9,6,-7,12,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-30,-17,-17,22,-28,33,-5,-10,-3,0,-15,-28,-7,-8,-18,-12,-13,20,70,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-33,-5,2,-27,-17,-15,-21,-2,-26,-17,-11,50,-4,-10,-6,-9,-25,-27,-23,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-26,-9,1,-20,-21,-8,-19,23,-17,-7,-5,-17,5,35,-8,-7,-8,-22,-11,0;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-30,-24,53,-29,1,-1,-23,8,1,-18,-29,-26,-16,-20,-11,-5,10,41,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-27,-5,8,-26,-14,-9,-23,19,-21,-11,-4,-3,7,16,-4,-8,-18,-23,-15,7;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-49,-38,-28,7,-20,-28,-20,-19,-20,-19,-38,-29,-17,-19,-38,-29,-29,140,28,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-20,116,-30,-29,-20,-29,-30,-29,-29,-20,-20,-20,-39,-29,-30,-9,-10,-10,-49,-30,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-29,67,18,-39,-11,-1,-38,-1,-29,-29,18,-11,-1,-10,0,-10,-27,-40,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-29,30,42,-31,-17,0,-32,9,-23,-22,7,-5,13,3,0,-9,-29,-32,-19,27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-25,-28,-23,46,-29,4,-1,-18,5,1,-19,-29,-22,-13,-19,-10,-5,15,50,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-31,-4,6,-28,-20,-12,-26,32,-28,-12,-4,10,4,20,-9,-8,-20,-23,-14,3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-1,-18,-20,98,-29,-10,-19,0,9,-20,9,0,-10,-20,-29,-28,22,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-25,20,5,-27,2,1,-28,7,-29,-19,31,-16,3,2,3,-6,-28,-33,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=6,-9,-21,-11,-4,-21,-14,-16,-15,-6,-18,-12,-7,19,-5,-9,7,11,-12,-28,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-35,-28,0,-35,-29,39,-26,17,15,-22,-23,-22,-25,-15,-3,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-23,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,18,-33,30,2,-15,-17,4,-27,-6,-21,-20,1,-18,-5,-11,-11,-13,-25,4,13,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-22,-23,-23,-12,3,-28,-4,7,-20,25,12,-20,-25,-4,-13,-21,-10,0,-16,5,-8;
MA   /M: SY='B'; M=-12,33,-22,31,6,-28,-4,9,-29,-1,-28,-21,32,-16,0,-3,5,-5,-28,-37,-17,3;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-23,6,13,-26,2,-8,-25,-3,-23,-17,2,-7,5,-8,10,-1,-21,-29,-20,9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-15,-27,-14,-12,-11,4,-14,-17,-9,-15,-11,-12,0,-11,-8,-10,-11,-18,12,-4,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,20,-22,27,6,-27,9,-5,-29,-5,-24,-20,12,-7,-4,-9,4,-7,-23,-28,-19,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-24,-27,-18,34,-21,-16,-7,-17,-3,-5,-18,-15,-19,-13,-18,-12,-10,29,17,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-24,28,24,-27,-13,1,-25,2,-17,-15,5,-7,9,-4,-1,-8,-22,-27,-14,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-24,-8,2,-12,-17,4,-16,5,-13,-5,-5,-15,4,6,-2,-3,-14,-14,6,1;
MA   /M: SY='C'; M=-4,2,8,2,-6,-21,-16,-14,-19,-7,-16,-14,-1,-20,-9,-8,0,-4,-11,-34,-18,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-22,-31,-24,47,-13,-19,-5,-26,7,-1,-17,-27,-31,-18,-17,-12,-5,-1,14,-24;
MA   /M: SY='A'; M=10,5,-21,2,6,-24,-6,-8,-19,-2,-20,-15,7,-5,2,-7,7,-3,-17,-28,-19,3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-15,-22,-23,-20,40,-24,-9,-1,-20,4,2,-8,-24,-23,-14,-15,-8,-5,-4,19,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-13,-17,-18,-13,-11,-21,-18,4,-11,-3,3,-11,-8,-10,-13,2,12,8,-27,-11,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,7,-27,-20,4,-26,23,-20,-6,0,-16,29,48,-6,-10,-24,-20,-10,15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00783;
//
ID   PTR2_1_MP; MATRIX.
AC   MP01022;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTR2 family proton/oligopeptide symporters signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0404868; R2=0.0166678; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=441; N_SCORE=13.381; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=28; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-21,-28,-21,5,-30,-22,22,-26,27,13,-18,-24,-19,-21,-18,-2,14,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-18,-26,-22,29,-24,-11,4,-19,3,5,-16,-25,-21,-15,-8,0,6,-6,19,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-5,6,-19,1,-3,-16,-5,21,-21,-9,-23,-13,16,-16,0,-6,14,6,-19,-31,-4,-3;
MA   /M: SY='A'; M=7,-13,-17,-21,-16,1,-15,-19,3,-18,3,-1,-8,-18,-16,-18,-1,4,3,-20,-7,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-28,-24,-34,-27,57,-29,-10,1,-24,9,1,-22,-30,-29,-17,-22,-11,-3,21,40,-26;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-10,-12,-10,-18,-2,-16,-14,-12,-12,-9,-4,-15,-5,-13,10,14,-6,-28,-16,-7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-7,-20,-16,2,-3,-18,-11,-17,-11,-8,-8,-19,-17,-18,6,0,-2,-22,-10,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-30,-21,7,-29,-22,15,-26,31,12,-27,-27,-19,-20,-24,-5,6,0,3,-20;
MA   /M: SY='C'; M=4,-22,38,-27,-25,-11,-24,-27,-1,-22,-6,-6,-21,-30,-25,-23,-4,-2,17,-36,-19,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,18,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-18,-26,-23,2,-15,-21,13,-22,15,13,-21,-26,-20,-18,-13,-5,16,-23,-7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-13,-15,-12,3,-19,-18,-5,-16,0,-5,-6,-16,-14,-13,10,25,0,-25,-5,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-23,-14,-7,-22,-22,-22,-11,-13,-20,-14,-17,51,-13,-20,-6,0,-15,-31,-24,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-27,-21,-31,-22,2,-29,-24,26,-26,27,14,-23,-24,-19,-22,-18,-6,19,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-34,-26,6,-28,-25,29,-28,25,15,-23,-25,-22,-24,-21,-10,20,-19,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=15,-9,-22,-11,-14,-26,41,-19,-29,-16,-25,-17,-1,-16,-14,-19,8,-9,-19,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-30,-31,-33,-25,18,-27,-17,6,-22,6,0,-27,-28,-20,-19,-25,-15,-2,41,26,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-33,-25,5,-32,-23,30,-27,32,20,-27,-27,-21,-22,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=37,-9,-14,-17,-11,-22,15,-19,-17,-12,-15,-13,-7,-12,-11,-19,10,-3,-7,-21,-22,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-4,-21,-6,-2,-22,-3,-4,-24,6,-23,-12,2,-14,3,12,8,3,-16,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-23,-31,-25,21,-28,-19,9,-22,9,3,-25,-28,-24,-18,-19,-5,10,14,18,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-32,-27,-35,-25,16,-30,-23,16,-28,28,11,-29,-28,-22,-22,-29,-14,5,13,9,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-23,-4,1,-21,-16,-7,-24,21,-22,-12,6,-14,4,28,1,4,-16,-25,-12,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-27,-22,-15,20,-23,-5,-12,-2,-8,-6,-14,-24,-12,4,-14,-10,-12,15,28,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-29,-7,-3,-16,-17,-8,-21,17,-19,-8,2,-18,1,18,-11,-8,-19,-1,-5,-1;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-10,-14,-13,-11,-18,-21,-5,-11,-7,-7,-6,-13,-13,-13,14,34,7,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-23,-11,-30,-21,14,-26,-19,10,-20,10,10,-20,-24,-17,-18,-13,-7,11,-16,1,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-24,0,-27,-22,9,-26,-12,-2,-21,4,-2,-22,-29,-18,-19,-17,-10,-4,7,18,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-16,-25,-18,-21,-8,31,-20,-19,-22,-10,-9,-8,-22,-21,-20,-5,-14,-14,-18,-16,-21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-8,-13,-12,-10,-19,8,-17,-15,-12,-18,-13,-3,-13,-10,-16,18,7,-4,-28,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=0,-25,-20,-29,-23,4,-22,-24,19,-24,15,8,-20,-23,-21,-22,-12,-6,16,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-20,-35,-28,17,-33,-26,28,-27,23,14,-25,-27,-26,-23,-20,-7,25,-17,3,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-27,-22,-18,8,-20,0,7,-15,6,9,-15,-25,-8,-14,-17,-10,-3,0,30,-16;
MA   /M: SY='A'; M=10,-17,-14,-25,-18,8,-17,-19,3,-16,1,4,-14,-18,-17,-17,-1,5,8,-17,-4,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-15,-33,-25,4,-32,-26,26,-26,20,12,-22,-24,-22,-24,-16,-4,21,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-27,-12,-7,-12,-24,43,-8,-10,-8,6,-4,-20,7,-6,-11,-14,-12,-19,16,-3;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-17,-28,-22,6,-24,-23,18,-22,11,8,-19,-23,-20,-20,-8,-3,19,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-18,-32,-25,5,-27,-24,24,-23,17,13,-23,-24,-22,-22,-14,-5,24,-20,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-20,11,-29,-21,16,-23,32,13,-25,-27,-21,-17,-22,-4,12,-19,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,-15,-15,-12,-12,2,-19,-11,-14,-14,-10,-4,-14,-12,-17,12,9,-4,-24,-15,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-14,-32,-24,17,-28,-20,10,-25,19,9,-24,-27,-22,-20,-21,-8,6,-3,8,-22;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-18,-3,-3,-22,1,-15,-21,-10,-25,-18,1,5,-6,-14,19,11,-14,-33,-21,-6;
MA   /M: SY='A'; M=17,-7,-14,-12,-7,-14,2,-16,-15,-12,-14,-12,-3,-13,-9,-15,14,7,-7,-26,-17,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-18,-23,-23,-21,-4,-17,-14,14,-22,2,4,-9,-21,-16,-20,-7,-4,11,-24,-5,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-29,-3,-1,-24,-16,-10,-17,-5,-22,-15,-7,34,-7,-11,-3,-6,-19,-30,-20,-6;
MA   /M: SY='S'; M=2,-7,-22,-10,-5,-14,-11,-14,-10,-12,-13,-9,-4,1,-5,-14,5,3,-10,-26,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-16,-16,-17,-16,0,-12,-19,1,-19,6,0,-14,-22,-18,-18,-4,-2,7,-24,-9,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-20,-20,-16,-1,-5,-18,3,-20,3,1,-10,-18,-14,-17,-6,-4,0,-18,-6,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-4,-25,-4,-4,-4,-17,-5,-8,-6,-6,-4,-5,-20,-7,-5,-7,-7,-8,-17,5,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00784;
//
ID   PTR2_2_MP; MATRIX.
AC   MP01023;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTR2 family proton/oligopeptide symporters signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3925037; R2=0.0189054; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=125; N_SCORE=8.746; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=6; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-21,-19,-20,3,0,-21,-3,-22,6,-1,-16,-25,-23,-19,-12,-10,2,-19,-8,-21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-25,7,3,-29,27,-10,-32,-9,-27,-19,4,-13,-3,-12,7,-9,-25,-26,-23,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-26,24,15,-24,-11,0,-30,4,-24,-19,7,-11,2,0,1,-5,-23,-30,-13,8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-6,-19,-11,-12,-26,-15,3,-15,6,4,-15,-22,0,-13,-7,0,2,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-27,-22,-17,27,-30,-5,8,-18,7,2,-17,-25,-18,-17,-18,-10,0,4,35,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-6,-22,-2,7,-19,-17,-14,-12,-8,-13,-12,-8,8,-5,-13,3,2,-9,-31,-18,0;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-28,13,16,-27,-17,-9,-24,11,-20,-15,-2,0,3,3,-5,-9,-18,-28,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-28,14,17,-29,-7,-1,-29,6,-25,-17,6,-4,7,3,1,-6,-25,-30,-17,11;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-27,25,13,-28,-15,7,-26,3,-22,-16,10,-14,10,4,0,-8,-22,-30,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-25,-11,-1,-15,-19,-11,-11,-4,-16,-9,-10,12,-7,-9,-2,-3,-8,-26,-13,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-24,-2,5,-20,-17,-5,-25,19,-20,-12,2,-14,6,36,0,1,-17,-23,-11,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-17,-25,-19,-10,-7,-24,-10,-5,3,9,6,-13,-22,-4,22,-16,-6,-4,-21,-5,-9;
MA   /M: SY='D'; M=0,19,-19,23,6,-27,-7,-6,-25,-5,-25,-20,12,-11,1,-9,15,8,-17,-35,-18,4;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-7,-24,-9,-7,-17,2,-7,-22,2,-16,-10,1,-18,-2,12,-1,-5,-17,-21,-10,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-21,-22,-27,-23,19,1,-19,-6,-22,-4,-5,-14,-23,-25,-20,-9,-10,-3,-7,4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-20,-36,-28,69,-29,-18,-1,-27,8,-1,-18,-28,-36,-19,-16,-5,-1,8,30,-28;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-14,0,-4,-16,-5,-5,-14,-7,-22,-9,18,-14,-1,-7,23,14,-12,-36,-16,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-33,-24,9,-28,-20,20,-21,18,17,-23,-25,-19,-16,-21,-10,15,-9,2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28,69,-29,-16,2,-28,12,4,-21,-29,-35,-19,-21,-10,0,8,30,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-27,-22,-22,30,-30,12,3,-12,2,1,-21,-30,-14,-12,-19,-9,-3,22,67,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-27,-20,-34,-24,34,-25,-18,6,-24,16,11,-23,-26,-25,-18,-19,-10,4,2,12,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-6,-13,-10,-20,8,-16,-17,-13,-18,-11,-3,-14,-9,-17,15,2,-8,-28,-21,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-29,-36,-29,-3,-27,-29,39,-28,14,15,-18,-21,-21,-28,-17,-10,25,-21,-4,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=7,-23,-19,-29,-23,-6,-18,-24,20,-21,10,10,-20,-21,-19,-22,-10,-6,20,-22,-9,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=15,-2,-11,-3,-2,-20,3,-12,-20,-10,-27,-19,7,-10,-2,-12,34,15,-10,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-33,-23,18,-31,-21,22,-29,38,19,-26,-28,-22,-21,-26,-10,12,-15,5,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-22,-31,-23,8,-29,-23,24,-26,18,11,-19,-22,-20,-23,-13,-5,16,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-12,-12,-5,-19,-5,-14,-10,-10,-13,-10,-4,-12,-2,-14,17,6,-3,-28,-17,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-23,-20,-13,-10,-23,-18,5,-15,0,7,-16,10,-11,-17,-6,5,1,-27,-12,-14;
MA   /M: SY='I'; M=4,-20,-21,-27,-19,4,-21,-22,7,-21,5,0,-16,-19,-17,-20,-7,0,4,-4,-1,-18;
MA   /M: SY='I'; M=3,-20,-19,-28,-20,1,-26,-24,17,-22,13,7,-17,-19,-18,-21,-8,5,14,-21,-5,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,5,-16,-14,-6,-18,-18,-1,-14,0,-3,-10,-17,-14,-13,2,15,7,-25,-10,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-28,-11,-9,-23,0,-20,-17,-13,-23,-15,-12,31,-14,-18,0,-1,-15,-29,-24,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-21,-28,-24,-17,6,-26,-11,6,-16,1,3,-19,-22,-12,-16,-15,-5,-1,18,21,-16;
MA   /M: SY='L'; M=0,-26,-6,-30,-22,6,-26,-23,13,-26,23,9,-24,-27,-22,-22,-18,-7,12,-21,-5,-22;
MA   /M: SY='R'; M=1,-4,-26,-4,12,-27,-7,-5,-25,9,-19,-11,-2,-12,14,17,-1,-9,-21,-22,-16,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-24,2,7,-24,-5,-4,-21,-1,-20,-12,0,-13,10,0,4,-5,-17,-23,-11,8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,5,-29,7,4,-25,-8,2,-28,6,-22,-12,5,-16,7,13,-5,-9,-24,-17,-11,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-20,-21,-20,-16,5,-26,-11,3,-5,-4,0,-18,-20,-13,-5,-11,-5,9,-11,12,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-8,-7,-13,-27,30,-8,-33,-14,-27,-17,4,-21,-9,-14,1,-13,-26,-28,-23,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00784;
//
ID   PR55_1_MP; MATRIX.
AC   MP01024;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein phosphatase 2A regulatory subunit PR55 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1420603; R2=0.0124314; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1569; N_SCORE=23.637; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=190; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-28,-3,1,-24,-10,42,-28,1,-22,-6,6,-17,13,14,-2,-12,-25,-27,0,4;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,21,-17,-18,-26,9,-24,-31,-21,-26,-20,-13,3,-21,-24,-6,-14,-23,-34,-30,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,13,-28,11,6,-26,-14,-1,-29,26,-27,-15,16,-15,6,29,-4,-8,-24,-27,-14,5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-19,-31,-27,37,-30,-12,11,-21,7,4,-24,-30,-28,-17,-16,-6,15,1,29,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-26,-20,-14,21,-27,-3,-5,0,1,0,-16,-24,-12,-2,-19,-10,-8,4,32,-14;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-23,9,35,-23,-20,-7,-23,3,-16,-16,0,-4,9,-4,7,12,-19,-30,-16,22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='P'; M=6,-17,-32,-13,-3,-27,-15,-20,-17,-10,-25,-17,-17,63,-10,-20,-5,-7,-22,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-30,3,18,-30,-20,-8,-30,44,-28,-12,0,-8,12,25,-8,-10,-22,-22,-12,15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-26,31,-30,-24,-1,-30,-24,2,-30,24,5,-26,-34,-24,-24,-23,-10,3,-31,-11,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-8,-33,-5,9,-32,-20,-5,-24,15,-25,-10,-6,19,21,14,-7,-10,-26,-23,-16,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-5,-25,-5,5,-27,-18,-6,-19,1,-21,-10,-3,9,18,2,7,8,-20,-27,-15,10;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-17,-10,0,-24,-12,-12,-15,2,-15,-8,-4,-10,9,-4,7,8,-10,-22,-14,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-22,17,3,-23,-3,10,-20,2,-28,-17,51,-18,9,2,8,-2,-30,-37,-18,6;
MA   /M: SY='N'; M=6,4,-23,1,-3,-24,1,-8,-24,1,-22,-16,8,-9,-4,6,2,-7,-19,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-10,-13,-8,-19,-2,-17,-11,-11,-16,-12,-4,-11,-8,-16,20,7,-1,-28,-19,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-13,-26,-13,-8,-6,-25,41,-7,-17,9,8,-9,-24,0,-8,-18,-15,-13,-21,14,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-22,-1,-30,-23,45,-23,-19,-8,-25,-3,-7,-13,-27,-30,-19,-5,-3,-3,-9,11,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00785;
//
ID   PR55_2_MP; MATRIX.
AC   MP01025;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein phosphatase 2A regulatory subunit PR55 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4195657; R2=0.0132355; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1449; N_SCORE=23.588; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-29,-5,2,-29,-4,4,-24,-7,-27,-13,-3,20,8,-9,3,-7,-26,-28,-17,3;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-27,-10,0,-20,-20,38,-11,-3,-7,19,-3,-17,23,0,-10,-13,-17,-23,4,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-20,-20,-12,-4,-25,-15,3,-6,17,13,-16,-21,-9,-6,-15,2,2,-22,-4,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-3,-23,-17,-17,-7,-20,-7,17,-14,3,20,7,-20,-7,-14,-10,-7,4,-27,-7,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,34,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-10,-16,-10,6,-17,-16,-17,-3,-7,-7,-7,-13,-13,-7,-14,0,-3,7,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='A'; M=35,-14,-14,-20,-11,-19,-7,-21,-6,-11,-10,-9,-14,1,-13,-20,4,-1,3,-23,-20,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-19,-8,-5,-11,-15,-5,-19,3,-19,-12,1,-16,0,17,11,13,-11,-22,-2,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,13,-17,-10,-27,-23,-23,-23,-17,-27,-20,-20,47,-17,-23,-10,-10,-23,-37,-30,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,46,-30,7,0,-16,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,24,64,-23;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-13,27,-23,13,0,-20,-7,40,-23,-3,-27,-13,43,-20,3,0,3,-7,-30,-37,-7,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-13,-19,-11,-21,10,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-3,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,15,-17,15,0,-21,-14,-13,-20,-7,-17,-17,5,-10,-7,-11,12,24,-10,-32,-15,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-7,-18,-14,-18,-5,-21,-14,13,-17,6,3,1,-26,-17,-14,-9,-3,12,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,50,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-7,-12,-10,-22,10,-2,-25,-12,-20,-11,-6,-20,0,-12,-3,-13,-21,-19,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,51,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,59,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-35,-25,4,-33,-22,34,-27,32,25,-24,-24,-17,-23,-24,-10,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00785;
//
ID   PHOTOSYSTEM_I_PSAGK_MP; MATRIX.
AC   MP01026;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Photosystem I psaG and psaK proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0965800; R2=0.0142982; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; N_SCORE=11.778; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=99; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-27,0,0,-23,-12,7,-22,12,-20,-8,1,-17,5,11,-7,-11,-15,-23,-5,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=0,-10,-12,-10,-9,-2,-14,-9,2,-8,6,1,-11,-15,-9,-6,-8,-4,5,-12,0,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-27,-2,10,-26,-16,-5,-24,15,-24,-12,-2,6,13,17,0,-5,-22,-24,-15,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-22,-2,0,-22,7,-10,-22,3,-22,-13,6,-14,-4,1,3,-4,-16,-25,-18,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: M=-9,-9,-24,-12,-6,-5,-20,-8,-6,-4,-2,-3,-5,-22,-4,0,-12,-8,-7,-10,0,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-26,-1,-6,-24,17,-14,-26,-9,-25,-18,2,-11,-10,-12,3,-8,-20,-17,-20,-8;
MA   /M: SY='T'; M=5,-8,-20,-11,-6,-18,-10,-18,-13,-8,-17,-12,-5,7,-8,-12,10,12,-9,-29,-17,-8;
MA   /M: SY='A'; M=4,-13,-25,-15,-9,-19,-4,-17,-9,-3,-11,-3,-9,-3,-8,-10,-4,-7,-8,-23,-15,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-29,-21,11,-28,-18,20,-25,30,19,-20,-27,-19,-19,-22,-9,11,-19,1,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-12,-31,-8,5,-28,-18,-15,-17,3,-22,-12,-12,35,2,-8,-6,-9,-20,-25,-21,1;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-14,-10,-8,-13,-12,-14,-6,-12,-10,-8,1,-14,-6,-12,16,17,-2,-31,-14,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=0,6,-19,0,-6,-14,1,-4,-15,-9,-19,-14,16,-11,-5,-9,9,1,-17,-27,-11,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,19,-23,25,5,-25,1,-5,-27,-5,-23,-19,10,-12,0,-10,3,-7,-22,-28,-16,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-24,-30,-23,-13,6,-26,-21,-4,-17,-6,-6,-21,29,-20,-19,-15,-10,-10,-17,-7,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-18,-11,-3,-22,4,-17,-16,-3,-17,-11,-6,-13,-7,-10,5,-4,-6,-24,-19,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-28,-5,-16,-27,47,-17,-31,-17,-26,-17,4,-19,-17,-18,1,-12,-24,-23,-25,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-39,-29,68,-30,-19,5,-29,11,6,-20,-29,-36,-20,-20,-10,3,6,26,-29;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,7,-22,-1,-11,-22,27,-11,-27,-12,-26,-18,17,-17,-11,-12,10,3,-22,-29,-22,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-30,-22,4,-31,-15,24,-27,34,17,-25,-27,-19,-21,-24,-10,16,-22,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=11,-20,-22,-20,-14,-17,-13,-23,0,-15,-10,-6,-18,16,-16,-21,-4,-5,3,-26,-20,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,23,-25,32,27,-31,-12,-5,-30,1,-22,-22,7,-6,5,-8,3,-5,-23,-33,-19,16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-15,-29,-23,8,-29,-24,20,-24,27,12,-27,-28,-24,-19,-17,-1,24,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-29,-19,7,-27,-20,17,-28,45,17,-28,-28,-19,-20,-26,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-14,-18,-12,-22,15,-20,-17,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-14,-9,-21,-17,-6,-18,-22,-13,-15,-13,-10,-14,-19,-13,-15,0,14,-9,16,-2,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-21,-15,-17,-17,19,-15,-16,-14,-11,2,-5,-17,-12,-15,2,4,-10,-23,-17,-14;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-7,-3,-20,-1,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,15,-7,-33,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-33,-24,24,-29,-22,17,-28,29,12,-25,-28,-25,-21,-22,-8,13,-13,5,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-25,-34,-26,-4,-26,-27,33,-26,13,12,-18,-20,-19,-27,-14,-9,22,-20,-5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-34,-27,3,-34,-26,36,-26,25,19,-25,-25,-22,-24,-20,-7,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=9,-9,-25,-11,-17,-28,53,-19,-33,-18,-27,-18,-1,-18,-17,-19,5,-14,-23,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-15,-25,-20,8,-20,-18,7,-17,0,-1,-16,-22,-20,-18,-2,1,14,-15,3,-20;
MA   /M: SY='G'; M=10,-12,-24,-16,-18,-14,33,-15,-25,-17,-19,-14,-6,-19,-17,-19,-1,-13,-18,-12,-11,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=8,-12,-10,-16,-13,-7,-13,-16,7,-12,-1,2,-10,-13,-11,-13,3,6,12,-20,-9,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-19,-33,-29,-1,-34,-29,37,-24,13,13,-24,-24,-24,-24,-13,-2,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-21,-27,-17,4,-29,-18,18,-26,38,16,-25,-26,-13,-18,-23,-8,8,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-19,-28,-20,8,-29,-21,17,-26,35,14,-23,-26,-19,-19,-20,1,10,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=10,2,-19,-5,0,-22,-10,-5,-19,9,-21,-11,6,-12,3,3,6,3,-13,-26,-14,1;
MA   /M: SY='S'; M=3,7,-16,-1,-6,-14,-2,-5,-17,-8,-22,-16,16,-15,-5,-9,19,13,-14,-29,-10,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-12,-20,-18,-15,-4,-22,-14,9,-16,14,8,-6,-23,-12,-10,-11,-3,4,-25,-7,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-22,-7,-17,-28,53,-16,-36,-15,-30,-20,7,-21,-17,-16,1,-16,-29,-24,-28,-17;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,-19,-27,-21,7,-24,-14,12,-17,11,7,-21,-24,-18,-15,-13,-6,13,-12,9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-9,-24,-14,-15,-1,-26,-16,14,-22,17,7,-6,-23,-15,-19,-17,-8,4,-24,-4,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,2,-22,3,1,-23,-2,-8,-20,-5,-22,-14,3,10,3,-8,7,2,-19,-26,-18,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-21,-21,-14,12,-21,-18,-2,-22,7,-2,-16,-4,-18,-18,-7,-3,-4,-20,-3,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00786;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F39_MP; MATRIX.
AC   MP01027;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 39 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5306802; R2=0.0127031; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1060; N_SCORE=17.986; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25,9,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,24,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-20,-5,0,-20,-10,-5,-25,11,-25,-15,5,-15,5,32,14,4,-15,-30,-15,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,0,-20,-20,71,-30,1,-20,-3,7,-20,10,20,-10,-17,-27,-27,11,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-32,-25,49,-30,-9,5,-24,17,5,-22,-30,-27,-17,-22,-10,0,9,37,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-21,2,9,-25,15,-10,-28,-8,-28,-20,5,-10,-1,-10,19,1,-21,-32,-23,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-27,-28,-18,-4,-32,-22,22,-11,17,13,-18,-20,-13,-13,-20,-10,12,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='B'; M=5,21,-22,20,16,-27,-7,-3,-24,0,-22,-20,16,-10,2,-8,5,-5,-21,-32,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,7,-30,14,43,-27,-20,29,-30,4,-20,-14,3,-6,17,0,-3,-13,-30,-30,-9,29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=5,-7,-20,-10,-2,-20,-10,-8,-22,9,-20,-13,0,-15,2,26,9,1,-12,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-25,2,17,-25,-20,-10,-25,26,-23,-12,0,-8,8,13,0,4,-18,-25,-12,12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-8,-25,-13,-12,9,-19,-11,-6,-17,-1,-6,0,1,-17,-14,-11,-7,-13,-21,-6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-15,-27,-24,-3,-30,-27,23,-20,7,7,-19,-22,-22,-20,-4,12,31,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,34,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,49,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-23,-21,-14,1,-27,14,6,-24,30,14,-19,-27,-11,-14,-24,-13,-1,-23,6,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-7,-25,-7,-2,-20,-22,17,-16,16,-18,-2,-4,-18,0,9,-10,-10,-6,-25,-1,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-28,46,25,-33,-10,2,-33,2,-28,-25,25,-10,5,-5,2,-8,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-12,-37,-9,-16,13,-20,-19,-21,-17,-16,-18,-18,-24,-19,-17,-24,-20,-23,62,16,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-12,2,-32,-4,-2,-18,-14,-9,-25,19,-28,-15,8,-18,0,9,-11,-12,-25,15,-3,0;
MA   /M: SY='D'; M=2,13,-20,20,-1,-24,-13,-13,-13,-8,-14,-14,-1,-16,-11,-15,0,-5,0,-32,-17,-6;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-15,-12,-10,-22,17,-17,-20,-12,-20,-15,-2,-12,-10,-17,16,1,-10,-26,-22,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-10,16,-20,10,-3,-17,-13,-2,-11,-5,-11,3,13,-15,-2,-8,1,7,-11,-32,-12,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-22,-5,9,-17,-20,-8,-12,9,-10,4,-5,-10,4,2,-1,7,-9,-25,-10,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-27,-4,16,-24,-20,0,-13,14,-11,10,-6,-10,22,7,-8,-10,-16,-22,-10,19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,49,-33,-20,3,-27,10,-20,-14,0,-3,31,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-17,-30,-17,-20,13,-1,9,-11,-13,-9,-6,-14,-27,-13,-13,-14,-13,-16,16,49,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00787;
//
ID   DEHYDROQUINASE_I_MP; MATRIX.
AC   MP01028;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dehydroquinase class I active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0570416; R2=0.0172016; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=301; N_SCORE=11.225; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=26; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-19,-25,-19,-9,-6,-25,-12,-4,2,15,6,-16,-23,-6,17,-20,-10,-4,-20,-5,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-24,17,42,-24,-14,1,-24,7,-18,-17,9,-3,14,0,1,-7,-25,-27,-17,28; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=10,-1,-13,-3,8,-16,-8,-8,-13,7,-11,-8,-3,-5,2,0,2,-1,-8,-15,-11,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-30,-21,11,-31,-17,21,-28,43,18,-28,-29,-19,-20,-28,-10,10,-15,7,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-11,-25,-19,-19,22,-25,-1,6,-16,2,1,-3,-26,-16,-14,-14,-8,-4,-1,30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-27,6,19,-23,-18,4,-25,11,-16,-12,0,-12,9,18,-3,-8,-21,-27,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=1,-5,-23,-5,11,-19,-18,-2,-13,1,-9,-7,-5,-11,2,-4,-2,-4,-11,-26,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=19,-17,-17,-23,-16,-1,-6,-16,-4,-17,5,-2,-15,-19,-16,-19,-5,-6,-1,-13,-3,-16;
MA   /M: SY='I'; M=6,-22,-18,-28,-21,4,-23,-23,16,-22,10,5,-18,-21,-19,-22,-7,-3,15,-20,-4,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,7,-27,11,12,-28,-11,-5,-28,25,-24,-13,3,-10,10,19,-5,-10,-22,-22,-13,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-8,-9,-7,-14,-14,-14,-13,-2,-19,-12,0,-15,-6,-6,7,6,-9,-13,-10,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-19,-5,-5,-17,15,-10,-18,-4,-17,-10,-4,10,-7,-7,-3,-8,-16,-13,-15,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-24,-9,-11,-9,6,-15,-16,-10,-4,-7,-4,-21,-14,-11,-9,-11,-13,-20,-12,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-2,-27,-21,0,-24,-22,9,-21,3,5,-19,-15,-20,-21,-8,-4,12,-26,-9,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-10,25,-28,36,28,-35,-14,-2,-32,7,-25,-21,8,-7,11,-3,0,-9,-27,-32,-18,20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-22,-32,-24,37,-28,-10,9,-23,22,15,-23,-28,-22,-17,-23,-10,3,0,25,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-19,-31,-25,9,-31,-25,25,-25,24,13,-24,-26,-23,-21,-17,-2,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,37,-29,29,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,24,-28,44,24,-28,-28,-18,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-13,-20,-17,-15,29,-20,-12,-10,-15,-5,-7,-9,-22,-20,-9,-5,-1,-6,-7,13,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-18,-12,-5,-3,-16,-13,-8,-10,-8,-8,-1,-15,-8,-6,7,8,-5,-25,-8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-28,5,4,-27,7,-9,-28,-3,-26,-19,7,6,-4,-4,0,-10,-26,-28,-23,-1;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-25,17,15,-28,-5,-6,-27,2,-23,-17,4,-1,6,-4,4,-3,-23,-28,-18,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=9,1,-11,-1,-4,-10,-6,-8,-5,-8,0,-4,-1,-11,-6,-10,-2,-3,-4,-16,-9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=2,2,-16,0,1,-14,-11,-7,-6,-2,-5,-5,0,-10,0,-6,-3,-5,-7,-18,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-6,-18,-18,-2,-17,-18,16,-12,5,5,-18,-18,-18,-13,-5,0,28,-18,-7,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-2,2,-17,3,8,-17,-11,-6,-15,15,-12,-7,-1,-7,3,6,-4,-5,-11,-15,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-1,14,-22,19,17,-26,-12,-6,-25,6,-19,-17,4,-7,3,0,2,-3,-18,-27,-16,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-18,-28,-20,4,-28,-19,18,-24,31,19,-23,-25,-17,-18,-19,0,13,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-20,-28,-22,8,-31,-19,20,-20,12,9,-21,-25,-17,-18,-13,-1,20,-16,6,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-26,4,4,-21,-9,5,-25,13,-24,-13,11,-15,3,12,-1,-7,-22,-24,-6,2;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-21,-19,-7,5,-24,-12,3,-15,9,1,-15,-19,-11,-15,-10,0,-1,-13,8,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=20,4,-16,-3,6,-21,-6,-10,-16,-4,-17,-14,6,-10,-2,-11,12,5,-12,-28,-19,2;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-4,-25,-5,2,-19,-18,24,-16,5,-16,1,1,-14,5,2,-2,-8,-15,-27,-1,2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-30,-4,11,-26,-11,-8,-26,18,-23,-12,-5,-12,12,11,-7,-12,-23,-6,-11,12;
MA   /M: SY='N'; M=2,-3,-25,-7,-7,-22,3,4,-19,-7,-21,-11,5,-7,-6,-10,1,-8,-17,-27,-14,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-26,1,-8,-9,8,-4,-24,-1,-23,-15,15,-20,-9,-4,-3,-10,-23,-19,-6,-8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-13,-17,-15,-9,-21,-22,6,-9,-6,-2,-11,-18,-14,-11,7,14,17,-30,-11,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-28,-6,3,-19,-21,-8,-21,32,-18,-6,-6,-14,4,18,-12,-9,-15,-14,1,3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-34,-29,1,-34,-29,38,-25,18,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='M'; M=3,-21,-20,-28,-20,-5,-14,-14,15,-17,15,26,-18,-20,-10,-18,-14,-9,8,-20,-6,-16;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,0,-2,-2,-20,-2,-12,-21,-12,-29,-20,8,-12,-2,-12,36,18,-10,-41,-21,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,11,-25,2,-7,-2,-14,31,-15,-5,-18,-9,22,-24,-2,-4,-4,-7,-23,-13,23,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,56,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,31,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-23,-36,-26,60,-30,-21,2,-28,6,-1,-20,-15,-35,-21,-19,-10,-1,3,20,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-28,17,28,-31,-17,15,-29,8,-24,-14,5,-8,19,3,1,-9,-27,-30,-11,22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-29,-5,2,-27,-4,-12,-27,27,-22,-9,-3,-14,4,15,-10,-12,-19,-20,-13,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-16,-8,-2,-13,-21,-18,-11,-9,-9,-10,-4,-1,-7,-10,11,33,-6,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-22,-36,-16,-7,-18,-24,-18,-7,-14,-14,-10,-21,57,-12,-20,-14,-10,-18,-23,-16,-14;
MA   /M: SY='S'; M=11,-5,-14,-4,0,-20,-5,-13,-16,-10,-24,-17,1,-1,-3,-12,26,12,-7,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-8,-16,-11,-3,-15,-17,-10,-21,3,-20,-13,-7,-18,0,-3,-10,-11,-20,11,0,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-30,18,26,-29,-15,-4,-27,2,-21,-18,0,-8,15,-5,-3,-11,-26,-12,-13,21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-27,18,28,-26,-18,-4,-21,5,-19,-16,8,-8,7,-3,0,-4,-21,-31,-16,17;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-24,-35,-25,7,-31,-22,31,-25,22,23,-21,-22,-18,-23,-19,-9,19,-17,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-20,-15,-4,-13,-24,-16,7,-8,-4,0,-14,-19,-5,-5,-3,-2,14,-28,-12,-6;
MA   /M: SY='W'; M=1,-12,-26,-12,1,-13,-12,-15,-19,-9,-19,-16,-11,-15,-1,-12,1,-5,-18,20,-4,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-18,-28,-21,-10,-11,-28,-14,6,1,-2,2,-10,-20,-4,19,-13,-9,5,-22,-7,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-21,-20,-12,-2,-26,-15,8,-14,25,11,-17,-25,-8,-10,-20,-8,3,-22,-4,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00788;
//
ID   DEHYDROQUINASE_II_MP; MATRIX.
AC   MP01029;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dehydroquinase class II signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1291847; R2=0.0123220; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=631; N_SCORE=11.894; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=193; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,19,-10,19,59,-20,-20,0,-10,-19,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-6,-15,-9,-4,-7,-11,-3,-5,-1,-4,4,-4,-10,-1,-3,-3,-3,-4,-15,-4,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-25,-6,-2,-18,-19,5,-16,11,-16,-4,4,-14,2,15,-4,-2,-14,-26,-7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-36,-29,7,-35,-28,36,-27,20,15,-24,-25,-25,-25,-18,-7,32,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-20,-27,-18,7,-28,-14,16,-24,36,20,-24,-27,-15,-17,-24,-8,9,-20,1,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-32,-27,3,-32,-27,30,-25,24,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,33,20,-25,-25,-20,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,29,-22,14,2,-22,-5,24,-22,-1,-27,-15,45,-19,7,1,6,-4,-30,-36,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-22,8,-30,-22,22,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-20,19,-1,-21,3,7,-21,-1,-30,-20,54,-19,-1,-2,10,0,-29,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-22,-26,-16,4,-25,-11,9,-12,26,23,-21,-25,-9,1,-23,-10,4,-19,-1,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-20,9,-30,-20,19,-29,48,19,-29,-29,-20,-20,-28,-8,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-22,-11,-5,-17,-22,-9,-8,6,-9,-3,-6,-16,0,6,-3,4,-4,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,21,55,-31,-19,1,-30,9,-21,-19,1,-1,22,0,0,-10,-30,-30,-19,38;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-35,-10,0,-28,-21,-18,-17,-1,-26,-15,-17,61,-7,-11,-9,-8,-22,-28,-24,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,11,19,-27,2,0,-29,1,-22,-17,7,-11,5,-2,0,-9,-26,-28,-18,12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-23,-31,-25,-1,-33,-18,31,-22,13,13,-20,-23,-19,-21,-15,-6,28,-24,-2,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,32,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,78,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-22,2,2,-20,-9,5,-22,0,-21,-12,6,-11,1,2,7,2,-17,-27,-9,0;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-22,-11,-4,-10,-17,-12,-5,-6,-4,1,-8,-16,-2,-8,-4,2,-4,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,1,-12,-6,-7,-13,-18,-18,-13,-6,-14,-11,2,-10,-7,-7,19,41,-3,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-21,-28,-19,12,-29,-7,14,-27,38,18,-25,-29,-17,-17,-27,-11,5,-17,7,-18;
MA   /M: SY='E'; M=5,10,-23,14,17,-27,-9,-7,-25,1,-21,-18,3,-3,2,-8,5,-3,-19,-30,-19,9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-26,35,23,-35,-14,0,-31,4,-25,-20,9,-9,15,-2,2,-7,-27,-33,-17,19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,38,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-18,4,16,-20,-19,4,-15,-3,-14,-11,4,-14,2,-6,-2,-7,-12,-31,-13,8;
MA   /M: SY='Q'; M=3,2,-23,0,8,-24,-13,-5,-19,7,-16,-10,3,-12,9,5,1,-3,-16,-25,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-8,3,-24,4,-1,-14,-12,-5,-13,-6,-7,-3,1,-17,0,-5,-4,-6,-13,-24,-8,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,4,-32,-24,0,-30,-22,17,-27,24,15,-24,-28,-20,-23,-21,-9,11,-26,-7,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-25,-4,12,-19,-19,-8,-20,15,-17,-9,-3,-12,7,11,-3,-4,-15,-22,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=2,0,-22,0,6,-23,-14,-9,-18,5,-14,-10,-2,-12,6,4,0,-2,-12,-25,-14,5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-10,-25,-10,6,-7,-21,-8,-15,-1,-8,-7,-10,-16,2,2,-9,-8,-15,-7,-3,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00789;
//
ID   RNA_POL_M_15KD_MP; MATRIX.
AC   MP01030;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases M / 15 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6562800; R2=0.0102115; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=291; N_SCORE=7.618; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-24,-22,-34,-24,16,-27,-11,23,-19,18,38,-20,-22,-13,-17,-20,-10,13,-14,6,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,42,26,-35,-15,-2,-35,15,-28,-23,11,-8,7,2,-2,-10,-28,-33,-18,16;
MA   /M: SY='L'; M=2,-19,-20,-21,-11,-6,-22,-18,2,-6,18,7,-19,-21,-11,-8,-17,-8,1,-20,-6,-11;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,0,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-7,2,-23,-1,-4,-22,5,15,-28,-2,-26,-14,14,-18,0,9,7,-5,-23,-30,-12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-15,-19,-18,-15,-11,-25,-24,5,-15,-6,-4,-14,5,-16,-17,2,18,9,-29,-13,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-8,43,-11,-2,-22,-20,-16,-28,-11,-22,-19,-7,-23,-9,-9,4,-3,-15,-41,-24,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-13,-18,-16,-13,-10,-2,-10,-3,-15,0,13,-8,-18,-6,-13,3,0,-3,-27,-11,-9;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-15,0,-2,-20,-6,-10,-18,-9,-27,-18,11,2,-3,-10,26,18,-14,-37,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-21,-20,-26,-21,20,-11,-18,-6,-14,-3,-4,-14,-24,-23,-5,-10,-8,2,-11,1,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-17,-24,-21,-10,-5,-24,-6,6,-5,2,19,-14,-20,7,1,-12,-9,2,-18,-2,-2;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-17,-9,-9,-18,5,-14,-16,-6,-19,-7,-1,-15,-7,-9,13,8,-7,-29,-17,-8;
MA   /M: SY='B'; M=-5,7,-20,6,-3,-19,-6,-6,-15,-3,-16,-1,7,-14,-2,-6,7,4,-12,-31,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-22,-21,-26,-20,13,-26,-14,16,-22,27,25,-22,-25,-17,-17,-22,-9,9,-17,3,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-28,3,9,-23,-21,-6,-16,9,-13,-7,-2,-14,9,12,-7,-9,-15,-25,-11,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-17,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-33,-11,-2,-24,-20,-16,-14,-5,-20,-12,-13,43,-4,-8,-6,-7,-19,-28,-21,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-28,24,21,-31,-9,-6,-32,14,-27,-20,6,-9,5,3,0,-6,-25,-30,-17,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-4,9,-26,1,-11,-26,39,-9,-32,-8,-30,-19,21,-19,-11,-10,3,-12,-29,-27,-25,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-2,27,-17,16,1,-21,-1,2,-21,-3,-29,-20,39,-16,-1,-5,17,5,-23,-39,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-24,-19,-27,-21,0,-18,-10,15,-20,22,26,-22,-26,-15,-16,-19,-9,13,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-29,-21,-10,6,-29,-8,7,-16,6,5,-19,-6,-11,-16,-18,-10,-3,-8,16,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-29,-15,-10,-14,-22,-16,-3,-14,-9,-7,-15,30,-13,-18,-10,-6,-8,-25,-13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-28,-1,7,-26,-17,-9,-24,11,-23,-14,-3,10,6,12,-1,-1,-20,-26,-17,4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-17,7,18,-17,-6,-4,-17,5,-14,-11,0,-5,5,2,0,-5,-13,-19,-12,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-15,3,11,-14,2,-5,-14,-2,-12,-10,2,-7,0,-5,1,-3,-11,-17,-12,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,6,-23,6,-4,-26,15,-12,-24,-7,-22,-17,6,-15,-9,-13,3,-8,-17,-28,-21,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-23,-2,3,-23,-12,-3,-19,19,-19,-7,4,-13,12,20,-4,-7,-15,-20,-10,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-8,1,-17,2,-3,-8,-14,2,-8,-8,1,-3,-1,-15,-5,-7,-6,-3,-8,-20,-1,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-16,-15,-12,-1,-16,-13,-4,-7,0,-3,-7,-17,-10,0,-5,3,0,-9,-4,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-20,-31,-25,28,-29,-18,11,-24,18,6,-25,-29,-26,-18,-20,-6,11,0,16,-24;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-19,-6,2,-20,-15,-16,-10,2,-13,-9,-6,-11,-4,-7,3,2,-2,-25,-15,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-22,-2,-1,-19,-13,-5,-21,11,-20,-12,6,-12,3,25,3,-1,-15,-25,-13,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,4,-21,-2,1,-22,-15,-4,-18,8,-20,-10,10,-14,10,11,7,8,-15,-28,-13,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-30,3,-1,-31,21,-14,-32,-7,-28,-19,-1,4,-6,-12,0,-11,-27,-26,-24,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-21,-18,28,-26,14,-4,-13,-2,-2,-16,-27,-13,-12,-14,-8,-9,16,57,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-22,-7,6,-16,-20,-8,-2,-6,-9,-5,-4,-14,-3,-10,1,-3,0,-29,-12,1;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-5,-29,-3,10,-8,-25,4,-11,1,-11,-5,-5,-14,6,-3,-10,-11,-15,-15,6,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-30,12,18,-26,-17,-7,-20,-2,-22,-18,6,18,2,-9,-1,-5,-24,-32,-21,8;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-17,-22,-13,-8,-19,-22,7,-12,-2,-1,-13,-16,-14,-16,-1,0,12,-22,-10,-14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=1,10,-21,11,8,-25,-2,-10,-25,-2,-22,-18,7,-10,-2,-8,10,6,-17,-31,-19,3;
MA   /M: SY='N'; M=-2,9,-22,7,1,-25,5,-8,-26,-4,-24,-17,11,-13,-1,-3,10,4,-20,-30,-19,0;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-26,-5,4,-16,-19,-5,-16,9,-14,-7,-2,-6,0,3,-5,-6,-15,-25,-9,1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-15,-14,-3,-13,-21,-17,-4,-1,0,-1,-15,-21,-9,-2,-12,-8,4,-26,-12,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-17,-16,-13,-7,-25,-20,10,-12,1,1,-16,-21,-16,-14,-5,1,19,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-3,-27,-3,-7,0,-20,6,-12,2,-10,-7,-2,-22,-4,2,-9,-7,-14,-5,26,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-25,-7,1,-17,-23,-10,-10,10,-11,-6,-7,-18,-1,22,-9,-8,-1,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-4,-28,-7,-4,-12,-22,24,-16,7,-16,-4,2,-18,2,7,-9,-8,-16,-17,13,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00790;
//
ID   PP2C_MP; MATRIX.
AC   MP01032;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein phosphatase 2C signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0522013; R2=0.0176117; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=127; N_SCORE=8.279; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=26; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-21,-6,5,-10,-16,-10,-11,-6,-11,-10,-6,-10,-5,-7,1,3,-6,-23,-6,-1;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-14,10,2,-12,-16,-10,-13,-10,-9,-11,-2,-5,-8,-13,-5,-7,-11,-25,-11,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=1,6,-19,4,6,-19,-9,7,-17,0,-15,-9,6,-6,2,0,0,-6,-16,-23,-11,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-8,-15,-10,-7,-14,-19,13,-14,-7,-14,-6,-2,-7,-1,-2,-7,-9,-15,-23,0,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-19,-12,-9,0,-15,-12,-2,-12,1,-1,-7,-20,-11,-11,-6,-4,0,-20,-3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=-7,-15,-14,-17,-15,-6,-16,-13,-5,-10,-5,-2,-13,-17,-13,-9,-11,-6,-3,-11,-3,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-6,1,-19,4,-5,-18,-10,-12,-17,-8,-13,-12,-2,-8,-9,-6,-4,-6,-13,-28,-16,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-12,-12,-5,-10,-18,-10,-8,-7,-6,-5,-7,-12,-4,-6,2,5,-5,-25,-9,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-4,-6,-5,-8,-7,-4,-14,-8,-12,-8,-12,-9,-6,-1,-7,-8,-2,-2,-11,-15,-2,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: M=-4,-6,-22,-7,-9,-13,-3,-13,-7,-14,-1,-5,-3,-15,-11,-12,-6,-7,-8,-25,-14,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-22,0,6,-21,-18,-3,-15,2,-14,-8,1,-14,7,5,1,1,-11,-28,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-23,13,12,-24,-15,-7,-21,-2,-17,-15,5,-4,4,-6,6,7,-18,-32,-16,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-24,17,9,-27,-11,4,-28,4,-27,-18,11,-5,3,3,7,-3,-22,-33,-15,5;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-21,-22,-22,-20,1,-15,-17,-6,-20,-4,-6,-20,-15,-20,-19,-15,-9,-4,8,-1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=5,-7,-19,-11,-10,-12,5,1,-17,-14,-15,-8,0,-17,-8,-13,7,-2,-13,-24,-8,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-33,-26,44,-29,-13,10,-23,14,10,-22,-29,-27,-18,-20,-9,8,1,26,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-21,-35,-27,59,-28,-15,2,-26,11,1,-21,-29,-32,-19,-19,-9,1,7,31,-27;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-13,-15,-16,-25,34,-20,-27,-16,-21,-16,-5,-17,-16,-20,5,-10,-16,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-29,1,-32,-29,33,-22,14,12,-28,-28,-28,-22,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-26,-9,-34,-27,57,-30,-11,-3,-25,4,-2,-20,-31,-31,-18,-19,-10,-4,9,37,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=11,-11,-25,-13,-18,-26,49,-21,-30,-18,-23,-16,-4,-18,-18,-20,2,-15,-19,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-22,-9,-19,-29,61,-19,-38,-19,-30,-20,3,-21,-19,-19,0,-18,-29,-23,-29,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-6,0,-17,2,1,-21,-15,-2,-16,-8,-19,-13,2,-5,-2,-7,9,4,-12,-33,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-24,1,14,-23,-11,0,-24,4,-19,-12,0,-11,13,4,3,-4,-20,-25,-13,13;
MA   /M: SY='C'; M=13,-19,26,-25,-22,-13,-19,-26,-3,-19,-7,-7,-18,-25,-22,-22,0,0,13,-33,-19,-22;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-10,-11,-6,-19,-2,-16,-13,-11,-18,-14,-2,-11,-6,-15,23,9,-2,-30,-19,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,8,-29,10,24,-32,-18,1,-25,16,-21,-10,5,-9,27,9,-3,-9,-26,-25,-13,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-21,-24,-25,-19,35,-24,-5,-6,-12,-3,-4,-16,-25,-19,-11,-14,-8,-7,15,37,-19;
MA   /M: SY='C'; M=3,-21,33,-26,-22,-9,-23,-25,-4,-23,3,-3,-21,-29,-22,-23,-8,-3,7,-33,-17,-22;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-22,-6,1,-22,-2,-6,-21,1,-21,-13,1,-13,2,7,9,-2,-15,-27,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-25,1,16,-25,-12,-8,-23,12,-21,-13,0,-9,9,7,3,0,-18,-26,-15,12;
MA   /M: SY='H'; M=-12,4,-27,1,1,-20,-13,24,-22,5,-20,-9,11,-18,4,13,-5,-11,-21,-25,-2,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-31,-21,9,-28,-18,17,-25,37,21,-27,-28,-17,-16,-28,-11,7,-9,2,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-16,-31,-15,-9,-5,-19,15,-14,-12,-12,-5,-11,-1,-9,-8,-14,-14,-16,-7,5,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,7,-27,12,13,-22,-14,0,-25,9,-20,-14,2,-12,6,4,-1,-5,-21,-23,-6,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00792;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F16_MP; MATRIX.
AC   MP01034;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 16 active sites.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1636944; R2=0.0154447; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=178; N_SCORE=7.905; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=87; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-14,-25,-14,-4,-12,-25,-15,-7,13,7,4,-14,-19,-4,7,-19,-10,-6,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-19,-14,-10,-12,-22,-21,-6,-13,-5,-7,-11,11,-13,-15,4,23,-3,-29,-14,-13;
MA   /M: SY='V'; M=1,-13,-16,-13,-15,-12,-21,-21,8,-11,-5,-2,-12,-20,-15,-14,1,1,19,-30,-12,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-7,5,-18,3,-5,-4,-17,-13,-18,-8,-14,-14,2,-14,-10,-5,8,17,-9,-25,-7,-7;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-17,-15,-9,-1,-13,-11,-11,-8,-9,-7,-2,-17,-6,-3,3,1,-8,-19,-7,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-17,-18,-22,-19,27,-24,-11,-2,-17,-1,-4,-12,-23,-20,-14,-2,10,1,-5,21,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-29,-22,-18,21,-28,10,-1,-12,3,0,-22,-29,-8,-11,-21,-12,-11,30,59,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-20,-19,-17,-5,-10,-17,2,-20,13,8,-11,-21,-14,-16,-9,4,0,-24,-8,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-3,-17,-5,-6,-21,8,-13,-23,-2,-21,-14,4,-16,-6,-5,9,1,-16,-29,-18,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-17,0,8,-21,-6,-10,-19,-6,-25,-18,2,7,1,-10,21,8,-14,-32,-20,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,-1,3,-19,-2,-7,-22,0,-19,-13,-2,-8,1,-1,0,-4,-19,-15,-8,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-29,3,-9,-21,22,-13,-30,-9,-25,-19,3,-17,-11,-12,-5,-15,-26,3,-14,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-1,3,-21,4,-1,-21,-14,-12,-16,-3,-18,-14,1,-1,-6,-6,4,4,-9,-31,-17,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-3,2,-26,6,7,-27,-13,-11,-19,-5,-20,-14,-4,11,3,-10,1,1,-17,-29,-19,4;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-16,-32,-17,-15,-3,-19,13,-16,-10,-17,-10,-10,-25,-7,-3,-15,-15,-18,34,19,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-25,38,6,-32,3,-5,-31,-6,-27,-24,16,-14,-5,-11,5,-7,-22,-36,-21,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-29,1,-39,-29,47,-29,21,19,-21,-21,-21,-29,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-37,-28,32,-32,-21,23,-26,15,17,-21,-25,-26,-22,-19,-9,17,-9,11,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-25,-7,-32,-25,37,-27,-13,1,-26,8,1,-19,-28,-29,-19,-16,-9,4,-9,11,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-25,-18,6,-28,-15,12,-20,29,13,-23,-27,-16,-11,-20,-2,8,-18,4,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-15,-31,59,-16,-38,-16,-29,-18,0,-19,-11,-16,0,-19,-30,-20,-28,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-12,16,-24,6,1,-16,-11,0,-23,18,-26,-14,28,-17,1,14,-1,-5,-23,-27,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-9,6,-22,5,4,-17,-14,-4,-15,-1,-11,-10,10,-17,-1,6,0,-3,-14,-31,-14,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-21,-7,-4,-18,-16,-5,-18,-5,-20,-13,-2,10,-4,-2,11,18,-14,-31,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-2,-26,-1,-6,-28,38,-16,-34,-13,-25,-19,1,-15,-12,-16,3,-8,-25,-24,-25,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,2,-23,3,7,-27,-14,-1,-21,11,-24,-10,4,-13,15,7,7,-1,-16,-29,-13,11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-2,-22,4,2,-18,-11,1,-15,-5,-17,-11,-5,33,-3,-9,-5,-7,-18,-19,-13,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-17,-11,-10,8,-16,18,-2,-6,-1,5,-9,-16,-3,-5,-10,-7,-6,5,32,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,3,-12,1,-6,-9,-12,-9,0,-7,-5,-4,3,-10,-7,-9,2,6,2,-19,-7,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-16,-30,-25,7,-30,-24,23,-23,22,14,-25,-27,-23,-20,-16,-1,26,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-7,1,-26,-1,7,-28,-16,41,-23,-1,-20,-3,6,-14,28,2,0,-10,-26,-26,0,16;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-18,-12,-14,1,-6,-13,-11,-14,-12,-10,2,-18,-14,-13,6,15,-8,-19,-1,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-20,7,-5,-16,-10,9,-11,-6,-20,-12,37,-18,-3,-5,6,5,-18,-35,-13,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-20,-31,-26,2,-32,-23,28,-21,10,11,-25,-26,-20,-20,-15,-5,31,-15,3,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-25,-27,-23,33,-29,8,1,-20,2,2,-17,-28,-21,-15,-18,-11,-1,8,36,-22;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-16,-12,-6,-11,-18,-16,-12,0,-12,-7,-4,-12,-4,-4,7,19,-4,-23,-9,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-26,2,-2,-28,14,4,-28,0,-28,-14,16,-16,6,-1,3,-10,-27,-27,-17,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-26,-9,-8,-18,12,-4,-22,-6,-19,-10,-2,-18,2,-9,-2,-11,-21,-11,-1,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-15,1,-35,-9,-15,-5,-10,-9,-20,-10,-25,-20,12,-25,-10,-10,-14,-15,-30,52,4,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-10,-35,-5,0,-25,-20,42,-25,-10,-25,-10,-5,33,0,-10,-10,-15,-30,-30,-4,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00794;
//
ID   PTS_EIIB_TYPE_1_CYS_MP; MATRIX.
AC   MP01035;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PTS EIIB domains cysteine phosphorylation site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6939864; R2=0.0169141; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=533; N_SCORE=14.699; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-10,-30,-10,-10,5,-25,60,-15,-10,-10,0,-5,-25,0,-5,-15,-15,-20,0,50,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,4,-23,4,8,-26,-9,-6,-20,1,-20,-11,4,-9,12,-2,6,2,-19,-28,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,5,14,-26,-13,-5,-21,5,-20,-12,2,-10,13,0,5,1,-19,-26,-13,13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-20,-19,-14,-4,-25,-16,12,-17,17,13,-16,-22,-9,-14,-12,0,8,-24,-5,-12;
MA   /M: SY='A'; M=32,-14,-14,-22,-13,-15,-9,-21,1,-14,-4,-3,-12,-10,-12,-20,5,-1,5,-22,-16,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-24,-1,5,-18,-16,-2,-20,6,-19,-11,-1,-6,3,4,0,-3,-16,-24,-9,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,4,-25,5,10,-23,-12,9,-23,2,-18,-11,6,-14,11,5,1,-6,-22,-26,-9,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-27,8,-35,-24,34,-27,23,16,-24,-25,-22,-24,-21,-8,24,-17,6,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-23,-33,-24,4,-33,-24,30,-27,32,18,-25,-26,-20,-22,-23,-7,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-23,7,15,-27,-14,-2,-21,1,-18,-13,4,-7,13,-4,5,1,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-16,-19,-11,-14,-6,-13,-6,-12,1,-3,-11,-16,-11,-15,-2,-5,-2,-21,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-29,-16,-31,-25,7,-30,-24,25,-25,27,15,-28,-28,-24,-21,-19,-6,27,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-28,-6,-17,-28,62,-17,-37,-18,-28,-19,2,-19,-18,-18,0,-18,-28,-20,-28,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-6,-24,-8,3,-23,-17,-11,-16,15,-19,-7,-4,-7,5,9,-1,-3,-11,-24,-13,3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-26,29,16,-31,-1,-3,-30,-2,-26,-22,15,-11,3,-7,6,-5,-25,-34,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-36,-28,42,-27,20,19,-23,-23,-22,-26,-18,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-4,-20,-6,-1,-19,-16,-14,-6,-3,-12,-7,-4,-13,-2,-9,5,3,-2,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='S'; M=8,7,-17,1,2,-22,-6,-4,-20,0,-23,-15,13,-12,3,-3,15,5,-15,-31,-17,2;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,3,-31,-25,-4,-27,-25,17,-24,12,9,-23,-26,-22,-23,-13,-6,20,-27,-10,-24;
MA   /M: SY='B'; M=1,5,-21,3,-7,-20,-1,-14,-12,-12,-14,-10,3,-14,-9,-15,4,1,-8,-29,-16,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-3,12,-23,3,-2,-20,-9,45,-23,-7,-21,-9,23,-18,3,-4,1,-9,-24,-31,-2,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=10,-19,-19,-29,-19,-7,-19,-15,17,-15,9,24,-16,-17,-9,-19,-9,-5,12,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-35,-26,22,-32,-24,24,-29,28,14,-25,-28,-26,-22,-22,-9,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-15,-9,-8,-16,-15,-17,-9,-1,-14,-8,-4,-15,-7,-5,8,15,2,-29,-13,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,4,-31,-25,27,-25,28,16,-29,-29,-24,-21,-19,-5,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-24,-5,-2,-20,-14,9,-18,11,-17,-6,5,-16,1,8,-5,-8,-14,-25,-7,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-28,57,18,-37,-9,2,-35,1,-29,-26,25,-11,4,-7,2,-8,-30,-39,-19,11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-25,12,21,-25,-15,-4,-19,-1,-19,-12,5,-2,8,-7,4,-4,-19,-32,-18,14;
MA   /M: SY='S'; M=12,3,-15,-1,-3,-22,1,-12,-20,-6,-22,-16,6,-12,-4,-10,18,10,-12,-31,-19,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-26,-8,1,-20,-22,-10,-13,20,-9,-2,-4,-16,6,13,-12,-9,-11,-22,-8,3;
MA   /M: SY='V'; M=11,-24,-14,-28,-24,-5,-24,-27,22,-19,6,6,-22,-22,-22,-21,-6,0,32,-26,-11,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-25,44,12,-33,-6,0,-33,0,-27,-24,21,-14,1,-4,0,-9,-28,-37,-19,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-28,2,8,-24,-19,0,-19,6,-20,-10,-2,-1,14,3,-3,-7,-20,-21,-6,9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-26,18,13,-31,-14,-3,-25,6,-23,-16,3,-5,9,-2,1,-5,-20,-29,-16,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,-3,-20,-5,7,-21,-10,-10,-13,-1,-12,-7,-5,-11,3,-6,2,-3,-8,-24,-15,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-15,-31,-22,2,-32,-22,24,-27,31,16,-25,-27,-17,-21,-23,-9,16,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-30,6,12,-19,-16,-9,-29,25,-24,-14,-1,-12,3,13,-9,-11,-21,-16,-9,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,11,-25,8,8,-27,-14,2,-25,17,-26,-13,15,-13,14,16,2,-3,-23,-28,-13,10;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-23,-23,-18,-3,-27,-20,21,-21,19,12,-14,-21,-15,-20,-16,-7,11,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-3,0,-29,5,6,-27,-1,-11,-24,-5,-20,-16,-3,11,-2,-10,-3,-10,-23,-27,-22,1;
MA   /M: SY='G'; M=8,-7,-24,-8,-15,-25,40,-17,-27,-16,-22,-14,-1,-18,-16,-18,2,-13,-18,-23,-25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00795;
//
ID   HSP70_3_MP; MATRIX.
AC   MP01036;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heat shock hsp70 proteins family signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0343370; R2=0.0145102; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=205; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=102; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=24,-5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,26,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-27,0,9,-27,-18,-1,-23,21,-22,-8,4,-13,17,19,-2,-5,-20,-24,-11,12;
MA   /M: SY='A'; M=31,-14,-7,-21,-13,-13,-9,-18,-5,-12,-6,-6,-14,-16,-11,-18,3,-1,5,-19,-12,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-12,-30,-21,9,-30,-21,18,-29,41,17,-28,-30,-21,-21,-27,-9,11,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-27,3,12,-26,-13,-4,-27,20,-23,-13,1,-11,7,16,-2,-7,-20,-22,-13,9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-28,45,16,-36,-5,-2,-34,0,-27,-23,14,-11,5,-8,3,-8,-27,-35,-19,11;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-13,-16,-10,-17,-3,-17,-9,-11,-10,-7,-8,-12,-9,-18,10,3,-1,-22,-16,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-27,2,-1,-27,16,-9,-31,8,-27,-16,8,-15,-2,5,-1,-11,-25,-24,-19,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-30,-22,5,-30,-21,24,-25,33,19,-25,-25,-18,-20,-22,-6,16,-20,-1,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-2,8,-21,8,8,-25,-7,-9,-25,7,-25,-17,7,-10,3,1,11,7,-17,-31,-17,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-13,-23,-15,-8,-15,-19,-17,-6,0,-9,-5,-11,2,-9,-5,-5,-2,-2,-25,-13,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,12,-23,15,16,-27,-5,-5,-26,-1,-25,-20,10,-4,4,-5,11,1,-22,-33,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-12,22,-28,32,27,-32,-15,1,-29,4,-23,-19,9,-9,12,-3,1,-8,-24,-33,-17,20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-26,-35,-27,-1,-36,-28,40,-24,18,17,-21,-22,-20,-24,-18,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-26,29,11,-28,-12,10,-29,2,-24,-18,13,-13,3,-3,1,-7,-24,-32,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-26,11,17,-24,-4,-6,-27,4,-22,-17,2,-10,3,-1,2,-7,-21,-28,-17,10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-29,1,-33,-28,36,-24,17,14,-26,-27,-25,-23,-15,-4,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-21,-26,-15,-3,-32,-24,26,-20,15,10,-22,-22,-17,-20,-15,-6,25,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-31,-22,7,-29,-17,23,-25,37,29,-27,-27,-16,-19,-26,-10,14,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-12,-29,-28,0,-28,-28,27,-20,8,9,-26,-28,-28,-20,-9,-1,43,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,-6,-12,-9,-4,-19,-5,-10,-13,-9,-18,-6,0,-8,0,-11,20,10,-8,-32,-17,-2;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-10,-1,-18,-20,1,-28,27,-19,-9,0,-20,10,63,-10,-10,-20,-18,-5,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-35,-26,1,-31,-20,36,-22,20,31,-22,-22,-16,-21,-19,-8,26,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-21,-17,-9,-10,-15,-11,-6,0,-4,1,-11,-18,-6,-1,-8,-6,-3,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,16,14,-28,-28,-26,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-7,-28,-7,7,-26,-22,0,-16,14,-13,-1,-5,-15,27,19,-7,-10,-18,-20,-8,16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-26,10,24,-29,-16,-3,-26,13,-22,-14,2,-8,17,10,3,-3,-23,-27,-15,20;
MA   /M: M=-1,-12,-20,-14,-4,-11,-21,-13,-4,-2,-1,-2,-11,-17,-3,0,-6,-1,-1,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-16,-32,-27,1,-31,-28,30,-24,20,13,-27,-27,-25,-22,-15,-4,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-22,-5,4,-23,-10,-10,-19,10,-20,-10,-2,-12,6,3,5,-1,-13,-24,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,15,-27,20,24,-29,-14,-3,-29,14,-25,-18,8,-8,10,7,2,-6,-24,-30,-17,17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-27,-22,-34,-25,36,-29,-18,12,-25,15,6,-22,-27,-27,-20,-19,-9,7,-1,18,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-19,-36,-27,58,-29,-21,2,-27,8,0,-20,-22,-35,-20,-17,-6,3,0,19,-28;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-23,-6,-12,-19,32,-13,-28,-8,-23,-15,3,-15,-12,-9,0,-12,-22,-19,-19,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-27,-3,8,-26,-21,-10,-21,31,-23,-8,-2,-12,8,21,-8,-8,-14,-22,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-28,18,26,-29,-16,-5,-26,7,-21,-17,2,1,10,-2,-1,-6,-24,-30,-18,18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-21,-28,-17,-6,-17,-22,-20,-4,-16,-6,-7,-20,36,-13,-20,-13,-9,-12,-27,-19,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-1,-7,-4,-4,-13,-14,-3,-14,-10,-8,-8,4,-20,-6,-6,1,-2,-13,-31,-11,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-20,-9,-2,-15,-18,-10,-18,11,-14,-7,-3,-15,1,11,-1,4,-12,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='S'; M=1,8,-17,6,-4,-21,2,-11,-20,-9,-23,-17,12,-14,-6,-11,17,13,-12,-34,-18,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-32,-26,4,-32,-24,31,-25,24,17,-27,-27,-23,-22,-19,-6,30,-23,-2,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00269;
//
ID   SBP_BACTERIAL_1_MP; MATRIX.
AC   MP01037;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8945174; R2=0.0163321; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=88; N_SCORE=7.322; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=38; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-11,-14,-21,-16,11,-22,-16,-1,-14,1,8,-9,-16,-14,-12,3,24,2,-19,1,-14;
MA   /M: SY='A'; M=12,-3,-16,-7,-6,-11,-11,-15,-16,-2,-14,-12,-3,-13,-8,-4,8,9,-7,-23,-11,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-10,-28,-11,-3,-22,-2,2,-21,-6,-16,-7,-6,-17,12,-2,-5,-12,-22,-2,-6,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-4,-23,1,-3,-9,-22,-7,-8,-2,-5,-5,-9,-19,-7,-6,-8,-6,-3,-18,5,-6;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-22,-5,-4,-19,2,-12,-16,-9,-16,-13,-3,-6,-9,-15,1,-7,-12,-21,-13,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-16,-17,-16,-8,-20,-18,8,-15,-2,2,-10,-11,-15,-16,1,5,14,-31,-13,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-30,1,11,-28,-18,-9,-20,1,-21,-13,-8,19,7,0,-4,-8,-20,-27,-19,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-18,-22,-19,-18,8,-16,-2,-1,-15,3,-1,-16,-25,-13,-14,-9,-2,-2,-1,28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-1,9,-25,5,2,-26,-5,-7,-26,19,-26,-14,12,-14,2,12,-1,-7,-20,-26,-16,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-13,-17,-13,-9,-6,-11,-14,-5,-8,-9,-7,-13,7,-9,-11,-6,-2,-5,9,-4,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-29,-2,-6,-29,28,0,-33,-2,-28,-15,10,-17,-2,-4,-1,-15,-28,-24,-19,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-30,5,6,-29,-11,14,-32,26,-28,-10,4,-13,6,16,-8,-13,-24,-24,-6,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-14,-11,-15,-13,5,-17,-9,9,-12,11,5,-14,-16,-12,-10,-9,1,10,-8,8,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-7,-26,-6,-11,3,-26,-1,-3,-9,-1,-3,-10,-22,-9,-6,-11,-1,-6,-5,25,-13;
MA   /M: SY='W'; M=6,-19,-25,-23,-18,1,2,-21,-18,-17,-17,-15,-14,-20,-17,-18,-3,-9,-15,24,-2,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-21,-27,-20,1,-29,-17,20,-20,18,11,-23,-25,-13,-18,-16,-7,17,-17,4,-18;
MA   /M: SY='P'; M=1,-17,-34,-12,-4,-28,-8,-20,-20,-11,-27,-18,-16,63,-11,-20,-6,-9,-25,-27,-28,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-28,-21,-35,-26,30,-30,-23,18,-28,21,10,-22,-26,-27,-22,-20,-9,13,-10,9,-26;
MA   /M: SY='A'; M=19,4,-14,0,-5,-20,-6,-14,-14,-8,-16,-14,3,-12,-8,-14,13,7,-5,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='A'; M=18,-15,-17,-21,-17,-7,0,-18,-5,-16,-8,-6,-11,-18,-16,-19,2,-4,2,-17,-8,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-25,4,16,-25,-1,-4,-29,6,-24,-17,8,-12,6,13,6,-5,-24,-29,-19,10;
MA   /M: SY='S'; M=11,-4,-12,-9,-9,-12,-10,-12,-9,-10,-15,-11,1,-14,-8,-12,18,17,-1,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-18,-22,-19,-12,0,-23,-13,-4,-7,0,-2,-13,-13,-11,5,-8,0,-1,-19,-2,-13;
MA   /M: SY='A'; M=19,-17,-12,-21,-18,-12,-6,-23,3,-15,-6,-4,-15,-19,-18,-19,4,0,17,-27,-17,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-28,-20,-34,-26,21,-29,-19,22,-24,22,23,-24,-26,-22,-19,-20,-8,17,-14,6,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-22,-29,-26,11,-32,-12,24,-19,9,9,-24,-28,-20,-19,-16,-6,24,-6,24,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,35,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,48,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-29,-2,7,-28,-20,-3,-27,35,-28,-10,-1,-1,7,20,-8,-6,-20,-23,-9,6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,21,-22,24,8,-26,-13,-7,-26,3,-22,-19,11,-11,-1,-1,5,7,-18,-32,-16,3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-13,-25,-15,-5,-14,-22,-14,-6,13,1,5,-12,-17,-3,5,-15,-9,-5,-20,-7,-4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-16,-29,-22,26,-26,-20,14,-24,25,10,-24,-26,-25,-18,-20,-7,14,-11,6,-22; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-19,2,10,-23,-10,-7,-22,15,-25,-13,4,-8,9,7,12,3,-15,-26,-14,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-19,15,19,-20,-10,0,-20,11,-18,-13,11,-6,7,4,0,-5,-19,-21,-12,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-15,-10,-3,-14,-9,-12,-9,1,-7,-5,-9,6,-5,-5,-3,-4,-7,-15,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-16,9,0,-19,16,-5,-19,-5,-15,-10,3,-8,0,-6,0,-8,-16,-14,-12,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-13,-20,-15,4,-20,-13,16,-17,24,15,-18,-18,-12,-13,-16,-6,12,-14,-1,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-16,12,12,-18,-7,2,-16,7,-16,-10,14,-7,9,3,1,-4,-17,-19,-10,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=0,-12,-19,-9,-4,-14,-11,-13,-6,-7,-12,-8,-12,34,-8,-12,-4,-4,-8,-17,-15,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-38,-5,10,-30,-20,-17,-22,-7,-28,-20,-17,75,-5,-17,-8,-10,-30,-30,-28,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-28,0,14,-30,-18,-8,-27,38,-27,-10,-1,-9,13,21,-7,-9,-20,-21,-12,14;
MA   /M: SY='T'; M=3,3,-11,-3,-5,-15,-10,-13,-15,-9,-20,-15,9,-11,-5,-9,27,34,-7,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-34,-30,-36,-28,23,-26,-26,2,-24,8,-1,-32,-30,-26,-20,-29,-16,-1,51,16,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-26,15,11,-23,-18,-7,-18,1,-6,-9,-2,-14,3,-5,-8,-9,-16,-27,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,26,-29,37,41,-33,-15,1,-33,6,-24,-23,12,-5,11,-3,1,-9,-30,-34,-20,26;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-23,-31,-22,19,-31,-13,18,-25,31,17,-25,-28,-19,-19,-25,-10,8,-8,17,-22;
MA   /M: SY='A'; M=10,-13,-20,-13,-3,-19,-17,-19,-7,3,-13,-7,-13,-1,-8,-7,-3,-5,2,-25,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=5,4,-21,1,13,-23,-14,-10,-21,10,-19,-13,3,-8,3,1,5,5,-15,-26,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-27,-19,-11,-12,-23,-19,0,-14,0,-2,-18,16,-12,-12,-11,-6,-4,-27,-15,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-26,14,13,-27,-15,-3,-21,11,-17,-4,1,-10,9,1,-5,-9,-18,-27,-13,11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-30,15,27,-33,-19,-2,-30,25,-26,-14,3,-7,20,13,-4,-10,-26,-26,-14,23;
MA   /M: SY='B'; M=-4,11,-24,11,10,-23,-14,-6,-20,9,-15,-12,8,-13,1,1,-4,-7,-18,-28,-14,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00796;
//
ID   SBP_BACTERIAL_3_MP; MATRIX.
AC   MP01039;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7461839; R2=0.0161462; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=139; N_SCORE=7.977; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-24,-12,-12,-24,23,-20,-25,-14,-22,-16,-6,4,-14,-18,4,-1,-18,-24,-24,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-21,11,5,-25,1,-9,-26,-4,-23,-18,7,-11,-1,-6,10,5,-18,-31,-19,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-26,-21,-17,20,-28,5,3,-14,8,4,-19,-27,-8,-11,-17,-8,-5,9,45,-15;
MA   /M: SY='P'; M=3,-12,-26,-13,-4,-16,-16,-15,-13,-3,-17,-8,-11,22,-8,-11,-5,-5,-13,-22,-14,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,-4,-28,-4,-15,-23,-13,-27,-18,-16,61,-11,-19,-9,-12,-29,-28,-27,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-22,-36,-28,57,-29,-18,2,-26,10,1,-22,-29,-33,-19,-20,-8,1,14,27,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,5,-19,3,10,-23,1,-8,-23,-5,-23,-18,9,-10,0,-9,16,6,-18,-32,-20,5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-21,-21,-24,-19,29,-24,-6,0,-19,7,2,-16,-25,-18,-15,-10,-3,-3,0,29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-25,-11,-3,-18,-20,0,-13,9,-12,-1,-5,-12,2,10,-6,-4,-9,-24,-7,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,28,-24,33,10,-28,2,-1,-29,-2,-25,-21,19,-11,0,-7,3,-6,-25,-31,-18,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=8,-4,-21,-3,6,-23,-5,-12,-19,-2,-19,-14,-5,11,0,-9,3,-3,-16,-23,-19,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='B'; M=-6,11,-19,10,6,-23,-5,-5,-22,7,-22,-14,11,-10,5,1,6,2,-18,-26,-14,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,9,-28,11,-8,-30,42,-11,-36,-13,-30,-22,13,-18,-12,-15,3,-14,-29,-28,-26,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,7,-26,7,15,-28,-11,-6,-28,24,-28,-15,8,-10,9,12,2,-5,-22,-27,-15,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-24,-31,-23,12,-30,-18,19,-25,24,16,-25,-20,-19,-20,-23,-10,10,-8,8,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-16,-8,-5,-15,-19,-17,-3,-8,-9,-6,-6,-14,-7,-11,8,13,5,-29,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28,66,-31,-17,4,-28,13,3,-21,-29,-35,-20,-21,-10,2,7,30,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-30,55,32,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-30,-28,-1,-31,-29,31,-21,10,10,-25,-26,-26,-21,-9,2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-32,-25,10,-30,-22,25,-25,28,19,-27,-28,-23,-20,-21,-7,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=18,-18,-6,-26,-19,-13,-9,-22,-2,-17,-6,-2,-16,-18,-15,-22,-4,-5,2,-9,-12,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-27,6,13,-27,-15,-1,-26,20,-24,-13,12,-13,15,20,-1,-6,-24,-26,-14,13;
MA   /M: SY='A'; M=9,-5,-22,-5,7,-19,-7,-9,-18,0,-13,-11,-7,-12,0,-5,-1,-7,-13,-19,-9,3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-19,-32,-25,3,-30,-24,29,-25,27,18,-26,-26,-21,-22,-20,-7,25,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-14,25,-23,-18,-19,-8,-24,-13,-17,-12,-11,-14,-20,-18,-23,2,-4,0,-29,-22,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-27,4,18,-29,-16,-6,-27,31,-27,-13,5,-9,11,17,-3,-7,-22,-24,-14,14;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-3,-24,-2,10,-25,-14,-1,-25,17,-23,-12,1,-12,11,21,3,-4,-18,-25,-13,9;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-20,-21,-27,-21,-2,-23,-17,22,-21,17,19,-15,-22,-14,-19,-15,-8,14,-23,-5,-19;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,3,-26,1,-4,-29,24,-9,-30,-3,-26,-15,8,-15,1,-7,1,-12,-25,-23,-21,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=3,-13,-18,-19,-15,-2,-20,-14,4,-11,5,3,-11,-20,-13,-12,-7,1,5,-19,-1,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-29,5,15,-29,-11,-8,-30,29,-27,-13,3,-9,9,15,-4,-7,-22,-24,-14,12;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-25,15,-30,-23,-5,-30,-25,7,-23,2,-1,-23,-28,-22,-24,-15,-9,10,-14,-7,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-25,14,22,-27,-18,-7,-23,10,-20,-15,1,-8,8,1,2,1,-17,-29,-15,15;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-25,-31,-24,35,-29,-7,4,-24,10,3,-22,-28,-24,-18,-22,-12,0,14,26,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-20,-14,-9,-16,-23,-16,-3,6,-12,-3,-13,-9,-8,-1,-5,2,8,-27,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=4,-1,-23,0,11,-23,-14,-9,-19,-5,-18,-15,-2,12,-1,-11,4,2,-17,-29,-19,4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-19,-12,-6,-13,-20,-7,-1,-9,-2,5,-4,-17,3,-8,0,6,-1,-26,-9,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-18,6,2,-14,-5,-5,-16,-2,-17,-12,8,-1,0,-5,2,-2,-16,-21,-12,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-24,-24,-28,-21,29,-14,-18,-5,-19,-1,-5,-19,-21,-22,-15,-19,-13,-8,41,17,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,30,-25,38,14,-31,-7,-3,-31,-2,-27,-24,18,-6,0,-9,7,0,-25,-37,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=14,-8,-21,-12,-13,-21,23,-17,-24,-14,-24,-17,-1,-16,-12,-17,9,-5,-17,-10,-19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-23,-29,-19,3,-29,-16,20,-19,31,24,-23,-25,-13,-10,-24,-10,10,-20,-1,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00798;
//
ID   SBP_BACTERIAL_5_MP; MATRIX.
AC   MP01040;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4896369; R2=0.0155163; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=370; N_SCORE=11.221; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=66; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-12,-30,-12,-17,-17,43,-19,-33,-13,-25,-17,-4,-12,-18,-15,-4,-17,-25,-17,-21,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-29,-19,9,-29,-20,18,-29,46,18,-28,-29,-19,-19,-27,-6,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-17,-23,-21,24,-27,-20,7,-23,16,4,-19,-25,-25,-18,-13,2,9,-15,5,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-4,2,-24,2,2,-16,0,-11,-23,-1,-19,-15,1,-14,-6,-3,0,-5,-17,-24,-14,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-20,-10,-12,-1,-20,-10,-1,-12,-3,-4,-3,-20,-10,-10,-2,4,-2,-19,3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-16,35,-28,43,14,-35,-9,0,-34,9,-30,-23,22,-12,4,0,0,-9,-28,-35,-18,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-5,-21,-6,-1,-17,-5,-4,-16,-2,-17,-10,-2,-16,-2,-4,3,-2,-11,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-23,12,8,-21,-11,-4,-23,1,-22,-16,4,-12,4,-4,8,5,-18,-25,-6,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-22,-17,-18,-5,14,-12,-15,-18,-7,-3,-8,-20,-16,-16,-3,-4,-11,-16,-6,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,16,-25,14,15,-26,-13,5,-26,13,-25,-16,19,-12,9,10,2,-3,-25,-31,-14,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-28,-21,7,-29,-19,15,-22,16,8,-26,-10,-21,-20,-19,-8,13,-17,3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-10,-23,-13,-1,-16,-23,-11,0,0,-7,0,-9,-14,-3,-6,-5,-4,2,-24,-9,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-35,-6,0,-26,-12,-15,-19,-8,-24,-17,-7,53,-8,-15,-8,-9,-27,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-22,-7,-6,-19,10,-13,-19,-11,-17,-10,-5,-16,-7,-14,3,-7,-12,-16,-13,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-19,-28,-21,2,-18,-18,15,-23,29,22,-25,-27,-17,-18,-21,-9,12,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-12,-20,-10,-20,-2,-20,-9,-10,-10,-10,-11,-6,-11,-20,8,-1,1,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-25,8,34,-28,-11,-5,-26,5,-20,-17,0,-5,13,-3,6,-4,-23,-28,-19,24;
MA   /M: SY='S'; M=0,12,-19,12,4,-26,-3,-6,-25,3,-29,-19,15,-12,3,-2,18,5,-18,-34,-18,3;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-39,-35,-28,12,-25,-20,-3,-20,-6,-8,-33,-29,-19,-19,-31,-21,-11,86,31,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-22,4,16,-24,-11,-9,-24,8,-22,-15,2,-8,6,1,9,7,-17,-29,-16,11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-15,-18,-13,-6,-23,-14,13,-14,5,5,-15,-20,-12,-14,-7,-2,19,-24,-7,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-14,-3,-4,-13,-8,-10,-13,-12,-15,-13,5,-14,-4,-11,22,15,-8,-32,-11,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-28,29,17,-33,-13,-5,-31,14,-26,-20,9,-6,6,2,-2,-9,-24,-30,-17,11;
MA   /M: SY='D'; M=-17,43,-29,59,17,-37,-4,-1,-38,-1,-30,-28,21,-11,-1,-10,1,-10,-30,-38,-21,8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-26,-8,-12,-23,36,-14,-31,-9,-26,-16,4,-18,-10,-11,1,-13,-24,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-11,-26,-12,-2,-17,-22,-13,-13,20,-5,-1,-9,-17,0,16,-14,-9,-9,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='T'; M=2,-2,-13,-9,-3,-13,-19,-18,-9,-9,-10,-10,-3,-10,-7,-11,15,34,0,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-26,-33,-28,-23,20,-26,-3,-1,-15,-3,-4,-24,-27,-15,-16,-22,-14,-10,50,48,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-14,-6,-8,-11,-21,-17,-10,-8,-8,-9,-1,-12,-9,-5,12,36,-2,-29,-10,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-36,-28,51,-31,-18,11,-27,12,5,-22,-29,-32,-20,-19,-9,9,2,25,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-8,5,-21,1,1,-19,-18,12,-21,4,-19,-10,7,-12,1,1,5,14,-15,-29,-5,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-14,12,-30,18,19,-31,-18,1,-32,26,-27,-16,5,-10,10,18,-6,-11,-25,-27,-12,14;
MA   /M: SY='G'; M=-8,19,-28,22,-3,-32,31,-8,-36,-10,-30,-23,17,-17,-10,-13,2,-13,-30,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='V'; M=13,-23,-13,-27,-22,-5,-21,-24,17,-18,10,8,-23,-23,-21,-20,-8,-2,26,-25,-11,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-29,0,7,-29,-14,-10,-29,40,-30,-12,2,-7,7,23,-7,-9,-21,-22,-13,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-36,-40,-30,42,-25,-25,-11,-25,-6,-11,-31,-30,-29,-20,-31,-21,-16,85,30,-25;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-3,-14,-4,0,-5,-10,19,-11,-4,-9,-2,1,-10,8,-1,-1,-5,-12,-11,6,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-7,-2,-1,-11,-1,-2,-11,-6,-14,-9,3,-6,-1,-6,17,8,-5,-20,-9,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-28,47,18,-34,-11,1,-33,5,-28,-24,22,-11,5,-4,2,-6,-28,-36,-18,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-26,-9,-18,-26,53,-19,-34,-18,-27,-18,2,-18,-18,-18,4,-8,-25,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-23,9,15,-25,-16,-10,-24,7,-22,-16,2,-2,3,-2,7,8,-17,-30,-16,9;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-7,-37,3,18,-26,-19,-13,-25,-4,-25,-21,-13,36,0,-12,-10,-13,-30,-7,-18,7;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-18,-33,-28,30,-31,-20,18,-24,14,8,-25,-29,-29,-20,-17,-6,21,-9,15,-28;
MA   /M: SY='T'; M=3,4,-12,-5,-7,-14,-16,-16,-13,-7,-13,-12,5,-11,-8,-9,16,36,-4,-30,-12,-8;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-18,-17,-6,-22,-7,-20,-11,-10,-14,-12,-13,13,-10,-19,4,-3,-6,-23,-22,-9;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-21,2,4,-23,-11,-6,-18,-1,-17,-11,-1,-12,1,-6,4,4,-10,-28,-14,2;
MA   /M: SY='D'; M=-5,22,-25,29,8,-30,-11,-6,-30,5,-23,-20,8,-12,0,5,1,-4,-20,-31,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-15,-14,-17,-16,9,-22,-17,-3,-12,-4,-5,-16,-23,-19,-14,-10,-7,5,-7,5,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-19,-15,-5,-1,-23,-14,3,-4,1,2,-15,-18,-10,-7,-10,-6,8,-17,-2,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-4,-18,-11,-9,10,-15,-4,-7,-11,-4,-6,2,-18,-10,-10,-4,0,-9,-10,9,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=16,1,-14,-6,-4,-19,-6,-9,-15,-5,-19,-13,6,-12,0,-9,17,10,-10,-27,-14,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00799;
//
ID   STATHMIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP01041;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Stathmin family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6486909; R2=0.0098758; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1312; N_SCORE=16.596; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=289; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,13,-33,-20,43,-24,3,-20,0,4,-14,42,6,-4,-14,-30,-24,1,25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,7,35,-36,-20,6,-24,10,-20,-7,0,-6,45,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,12,-32,-20,44,-24,2,-20,0,4,-14,41,6,-4,-14,-30,-24,1,25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-24,-19,-5,-15,-20,4,5,-2,5,37,-12,-16,23,-2,-12,-10,-5,-20,-4,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00487;
//
ID   HOMOSER_DHGENASE_MP; MATRIX.
AC   MP01042;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Homoserine dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9817104; R2=0.0144347; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=828; N_SCORE=16.924; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-1,2,-24,-2,2,-24,3,-8,-23,5,-20,-12,7,-14,2,2,0,-5,-20,-25,-17,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-7,-23,-14,-8,-13,-12,-2,-3,3,-4,24,-3,-17,4,1,-8,-7,-6,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-10,-23,-10,-5,7,-23,-12,-7,-10,1,-3,-9,-20,-9,-5,-9,-5,-7,-18,0,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-25,13,25,-28,-15,-7,-25,13,-23,-17,2,-7,8,2,4,-4,-19,-30,-17,17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-26,11,21,-27,3,-6,-29,3,-24,-19,9,-10,3,-3,3,-4,-26,-29,-20,12;
MA   /M: SY='G'; M=1,1,-25,0,-8,-28,29,-14,-30,-9,-25,-17,4,-15,-7,-12,5,-5,-23,-25,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=7,-21,-20,-25,-17,-7,-18,-19,3,-12,3,1,-18,-21,-13,-7,-9,-6,6,-8,-7,-15;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-19,9,1,-22,-11,-12,-20,-5,-19,-16,2,-1,-4,-10,12,9,-13,-33,-17,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-33,-26,55,-30,-10,4,-25,15,4,-22,-30,-29,-18,-22,-10,-1,9,37,-26;
MA   /M: SY='S'; M=5,7,-18,10,9,-25,-7,-9,-23,-2,-25,-19,6,-6,1,-7,19,8,-15,-34,-19,5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-27,33,31,-32,-14,-2,-30,3,-24,-21,8,-6,11,-5,5,-4,-26,-33,-19,21;
MA   /M: SY='V'; M=19,-19,-12,-23,-18,-10,-15,-23,9,-16,0,0,-17,-19,-18,-19,2,1,20,-26,-14,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-15,-26,-21,3,-28,-23,17,-23,26,11,-24,-26,-21,-18,-14,5,19,-25,-5,-21;
MA   /M: SY='K'; M=11,-2,-21,-5,1,-24,-13,-14,-20,18,-18,-10,-3,-11,0,7,0,-1,-11,-22,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-27,9,25,-26,-17,-6,-18,4,-14,-11,-3,-9,12,-3,-4,-9,-17,-27,-15,18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-30,-4,9,-29,-19,-2,-25,23,-23,-7,-2,-13,26,23,-5,-8,-23,-12,-8,17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-26,6,21,-29,-15,5,-25,11,-21,-12,2,-9,18,8,0,-8,-23,-26,-13,19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-20,-22,-14,0,-23,-15,10,-20,29,12,-17,-25,-11,-15,-20,-8,2,-22,-5,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-27,-23,39,-31,5,4,-17,6,2,-21,-29,-18,-14,-21,-10,-4,19,58,-23;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,25,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=9,-15,-26,-13,-5,-22,-13,-19,-14,-12,-17,-14,-14,38,-10,-19,0,-1,-15,-27,-23,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-16,-9,-1,-13,-20,-10,-21,8,-16,-11,-1,-15,-1,21,4,15,-11,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-6,22,-24,27,5,-15,-11,-5,-25,-6,-20,-19,11,-14,-4,-11,1,-6,-20,-28,-11,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-31,-25,5,-31,-25,28,-26,31,16,-29,-29,-24,-21,-21,-6,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,15,-21,18,21,-26,-9,-3,-26,3,-27,-21,14,-8,7,-3,15,2,-22,-36,-19,14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-24,-27,-18,-2,-30,-11,20,-18,16,17,-16,-21,-10,-16,-16,-4,10,-20,3,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=22,-19,-10,-24,-20,-10,-16,-25,10,-15,0,0,-19,-20,-20,-19,1,3,25,-26,-14,-20;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-11,-19,-10,-19,-1,-18,-9,-10,-10,-7,-9,-11,-9,-19,11,1,0,-22,-19,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-7,-2,-17,-17,15,-25,12,-18,-9,0,-19,5,33,-6,-9,-18,-19,0,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-18,-30,-22,3,-27,-22,22,-25,30,16,-26,-26,-20,-21,-20,-7,20,-22,-4,-22;
MA   /M: SY='L'; M=11,-19,-14,-24,-17,-5,-20,-21,9,-18,13,7,-18,-20,-16,-18,-6,5,13,-23,-9,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-11,-16,-9,-21,5,-19,-13,-11,-14,-12,-6,-11,-9,-19,14,2,-3,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-23,-3,5,-21,-13,-3,-26,14,-23,-14,6,-15,7,34,6,-1,-18,-27,-15,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=6,-17,-17,-22,-16,0,-18,-19,7,-19,4,3,-12,-18,-14,-18,1,2,7,-24,-7,-15;
MA   /M: SY='G'; M=14,-12,-23,-16,-18,-23,37,-21,-22,-18,-17,-12,-6,-17,-17,-21,0,-13,-15,-20,-24,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-31,-25,35,-29,-9,7,-20,10,7,-23,-29,-23,-14,-21,-10,4,11,32,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-7,0,-27,-1,1,-24,13,7,-29,-2,-23,-13,6,-16,-2,-2,0,-11,-25,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-21,-30,-23,4,-25,-20,21,-22,20,21,-21,-23,-17,-19,-16,-3,16,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-26,15,27,-25,-17,-3,-25,7,-20,-17,7,-6,8,7,0,-3,-22,-31,-17,16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-21,-18,-21,-15,-4,-22,-14,7,-17,15,6,-19,-18,-15,-15,-11,-4,9,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,4,-18,2,1,-22,-14,-12,-20,7,-21,-13,3,-10,2,0,13,16,-11,-29,-14,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00800;
//
ID   TRANSPOSASE_IS30_MP; MATRIX.
AC   MP01043;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transposases, IS30 family, signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7641835; R2=0.0140223; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1339; N_SCORE=23.530; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-19,-7,8,-10,-23,-14,-7,-10,4,-4,-9,-13,-4,-10,0,15,-6,-27,-10,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-1,3,-30,44,-14,-37,-11,-27,-20,0,-14,-9,-14,0,-17,-30,-23,-27,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,25,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-15,12,-30,18,11,-31,-17,-5,-33,31,-28,-16,6,-12,7,28,-7,-10,-23,-26,-13,8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-13,-33,-30,23,-30,-27,21,-23,10,7,-27,-30,-33,-20,-13,-3,36,-19,1,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=8,-17,82,-27,-24,-20,-21,-27,-24,-24,-17,-17,-17,-31,-24,-27,-4,-7,-7,-41,-27,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-17,21,-30,30,11,-31,-16,26,-34,11,-27,-16,11,-13,6,4,-6,-13,-27,-31,-5,7;
MA   /M: SY='P'; M=8,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,61,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-12,-30,-12,-8,5,-26,37,-11,-6,-8,0,-9,-24,8,-4,-14,-12,-18,7,49,-4;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-16,0,0,-20,-6,21,-23,-10,-27,-14,10,-13,3,-7,26,9,-16,-37,-9,0;
MA   /M: SY='P'; M=2,-8,-23,-4,0,-24,-8,-14,-20,-10,-30,-20,-3,32,-4,-14,19,7,-18,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-44,-34,-27,16,-23,-15,-14,-17,-14,-14,-34,-30,-17,-17,-34,-24,-24,115,45,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,43,-34,-20,4,-26,10,-20,-12,0,-4,37,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=14,-3,-10,-13,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,36,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,13,8,-7,-20,-7,0,-22,-7,-28,-20,41,-25,-7,-7,5,-2,-25,-42,-22,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-9,-13,-19,-16,16,-23,-20,-7,-16,-4,-7,-6,-16,-19,-13,8,32,0,-18,2,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,32,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,48,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-26,-38,-28,17,-36,-26,34,-30,25,16,-22,-24,-24,-26,-22,-10,20,-15,5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-15,-30,54,-18,-38,-7,-30,-18,0,-18,-15,-11,-2,-18,-28,-20,-26,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-6,22,-13,-10,-19,-23,-20,-22,1,-19,-13,-6,-19,-10,-4,3,15,-9,-33,-16,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,23,3,31,5,-30,-11,-8,-32,-8,-28,-25,10,-15,-5,-14,10,-1,-20,-42,-22,0;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='S'; M=11,-2,-16,-4,1,-23,-6,-12,-21,8,-26,-15,3,-10,1,0,20,8,-11,-30,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-25,4,31,-25,-22,-5,-14,3,-13,-9,-7,-9,15,-3,-2,-8,-11,-28,-16,23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-26,-21,-26,-23,16,-30,-6,14,-19,17,9,-26,-30,-19,-16,-20,-7,13,-2,31,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,12,-13,1,-5,-15,-9,-9,-15,-7,-21,-15,20,-13,-5,-7,22,28,-11,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,11,-27,6,14,-34,-14,10,-20,7,-23,-6,17,-13,43,7,3,-7,-30,-26,-13,29;
MA   /M: SY='N'; M=-12,14,-27,11,17,-25,-14,18,-27,15,-26,-13,19,-12,9,9,-2,-9,-27,-30,-10,12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-27,0,25,-21,-23,-3,-13,-2,1,-3,-9,-12,20,-3,-9,-10,-18,-24,-11,22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-14,24,-30,35,29,-34,-16,-3,-34,17,-27,-21,8,-7,9,4,-3,-10,-27,-31,-17,19;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-5,-29,-1,-9,-12,-14,-17,-16,-14,-8,-13,-13,-19,-12,-17,-15,-13,-16,23,-2,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00801;
//
ID   SQUALEN_PHYTOEN_SYN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01044;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Squalene and phytoene synthases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.3399215; R2=0.0211259; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=23; N_SCORE=7.816; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-11,28,-26,37,19,-31,-13,-4,-29,3,-24,-22,13,-10,2,-5,1,-5,-22,-35,-18,10;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-21,-24,-19,18,-27,-16,9,-21,18,7,-20,-25,-21,-17,-19,-9,7,-14,6,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-7,3,-22,0,-5,-16,-8,-7,-12,-6,-11,-8,7,-19,-4,-2,-1,-2,-10,-27,-12,-5;
MA   /M: M=-8,-7,-22,-6,-3,-19,-14,-13,-15,-4,-13,-10,-8,-9,-1,-5,-7,-8,-13,-13,-12,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-21,-6,-8,-12,-8,-7,-12,-2,-14,-9,8,-18,-6,0,3,4,-10,-24,-6,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-3,-29,-1,-2,-28,16,-10,-33,3,-26,-17,1,-10,-2,12,-1,-12,-25,-24,-21,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-24,-10,-26,-23,11,-29,-8,10,-18,8,4,-23,-29,-19,-17,-16,-7,11,-5,27,-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,3,-22,2,4,-24,-8,-8,-20,1,-19,-13,3,-8,3,1,4,-2,-16,-27,-17,2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,9,-16,5,-1,-19,-14,-11,-17,-4,-18,-12,7,-11,-2,-6,16,24,-10,-33,-13,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-20,-24,-24,-18,25,-28,-16,5,-18,6,4,-18,-24,-21,-16,-17,-8,3,-1,14,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-4,16,-26,23,23,-31,-13,-1,-29,8,-24,-18,5,-8,10,-2,2,-7,-23,-30,-17,16;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-28,35,29,-32,-9,2,-33,1,-24,-22,9,-7,6,-7,1,-8,-27,-33,-18,17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-27,-21,16,-29,-11,11,-22,25,9,-25,-29,-19,-17,-22,-6,6,0,21,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-14,10,-27,16,2,-16,-13,-6,-13,-11,-5,-10,1,-18,-7,-13,-10,-10,-14,-25,-5,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-23,-10,-4,-10,-23,-11,-5,-2,6,1,-9,-21,-6,8,-13,-6,-3,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-17,88,-26,-25,-18,-24,-25,-24,-25,-17,-13,-16,-34,-23,-26,-5,-6,-8,-45,-26,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-7,-29,-8,-8,-3,-23,43,-14,-7,-11,-2,-4,-22,0,-1,-12,-13,-17,-8,32,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-13,-30,-13,-10,2,-17,20,-18,1,-12,-5,-7,-24,0,15,-13,-12,-18,-1,29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-12,-26,-27,-4,-19,-28,20,-19,3,5,-24,-28,-27,-19,-5,0,38,-30,-13,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-26,-11,-18,-28,56,-19,-35,-18,-27,-19,-1,-18,-18,-19,4,-15,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=2,-17,-15,-22,-18,-3,-24,-22,10,-19,13,4,-16,-20,-17,-17,-4,14,13,-25,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-7,-25,-3,5,-13,-22,-11,-7,-4,6,-2,-11,-17,-4,-2,-13,-9,-7,-25,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-16,-24,-21,-17,-12,9,-9,-4,-15,4,22,-13,-21,-5,-13,-13,-13,-7,-20,-11,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-19,3,-24,-17,-4,-21,-13,4,-20,14,17,-17,-24,-11,-16,-9,-4,3,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='T'; M=6,-14,-6,-19,-14,-9,-19,-20,1,-17,2,-2,-12,-19,-12,-16,3,10,6,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-27,-9,0,-23,-16,-6,-20,6,-21,-11,-5,8,3,14,-2,-6,-16,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-32,-26,4,-32,-26,31,-27,29,17,-28,-28,-23,-22,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-25,-21,-34,-24,26,-27,-16,16,-22,18,23,-20,-24,-20,-18,-18,-7,9,-11,8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-25,-15,-19,-20,27,-15,-16,-16,-17,-8,-6,-21,-16,-13,-1,-12,-9,-24,-19,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-20,-21,-21,-14,-5,-21,-19,9,-18,8,3,-19,-12,-16,-18,-10,-1,9,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-17,-10,-6,-18,-7,-8,-13,-4,-15,-10,-4,-16,-6,-1,7,0,-2,-28,-15,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-15,10,9,-26,-10,-10,-24,4,-23,-17,4,-10,-1,-3,3,-2,-16,-32,-18,4;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-9,-23,-10,0,4,-18,-14,-12,-11,-4,-8,-8,-7,-11,-12,-6,-2,-11,-19,-5,-5;
MA   /M: SY='D'; M=5,5,-24,6,6,-26,0,-9,-25,-2,-23,-18,4,-2,-2,-4,5,-5,-20,-29,-21,1;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-21,8,4,-21,-8,-10,-18,-2,-17,-14,5,-14,-4,-4,5,4,-11,-31,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-9,-24,-7,1,-17,-17,-12,-8,-8,-4,-3,-10,1,-3,-10,-4,-5,-9,-27,-14,-2;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-19,-5,-5,-19,-9,-15,-14,-5,-15,-12,-5,-14,-7,-5,4,1,-6,-18,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-14,-22,-14,-10,-7,-21,-12,-4,-9,5,-1,-14,-10,-10,-3,-10,-4,-4,-20,-3,-12;
MA   /M: SY='A'; M=8,-11,-23,-13,-8,-13,-6,-11,-14,-11,-13,-11,-11,-8,-10,-16,-3,-4,-11,-3,-4,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-10,1,-2,1,10,-23,-19,15,-25,-4,-21,-12,1,-16,7,-5,0,-8,-21,-32,-8,7;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-26,12,3,-25,-12,0,-20,0,-17,-11,6,-8,4,-2,-4,-8,-18,-29,-14,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00802;
//
ID   SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2_MP; MATRIX.
AC   MP01045;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Squalene and phytoene synthases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0489478; R2=0.0157515; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=489; N_SCORE=12.741; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-22,-24,-16,7,-18,-19,5,-20,11,5,-18,-19,-18,-18,-15,-9,3,-10,-2,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-8,-20,-10,-2,-8,-8,-10,-9,-10,-7,0,-6,-15,-4,-10,3,0,-8,-25,-10,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-27,12,7,-27,-1,-7,-27,2,-23,-17,6,-6,-1,3,-1,-8,-22,-29,-19,2;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-25,-7,-5,-21,-14,-17,-10,-8,-15,-10,-12,15,-7,-13,-4,-3,-6,-28,-19,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-23,-8,-2,-18,-14,-11,-14,-1,-11,-8,-6,-16,1,7,-1,-1,-9,-19,-11,-1;
MA   /M: M=-7,-5,-22,-4,-7,-13,-10,-14,-8,-11,-1,-5,-6,-17,-11,-10,-6,-1,-5,-26,-10,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-6,-28,-3,6,-18,-11,-3,-19,-4,-15,-11,-6,5,0,-6,-5,-6,-20,-20,-6,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-26,14,18,-24,-13,4,-24,-1,-21,-17,7,-8,4,-5,1,-7,-23,-22,-12,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-18,-10,-9,-15,-10,-15,-6,-10,-10,-7,-6,-8,-8,-11,2,1,-1,-22,-14,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-24,-15,-4,1,-24,-12,-1,-11,3,1,-13,-12,-6,-12,-10,-5,-5,-17,1,-6;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-24,6,14,-27,-13,-5,-23,4,-20,-14,2,-6,10,5,4,-3,-19,-27,-17,11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-17,-19,-19,-8,-7,-23,-8,-3,-6,10,2,-14,-22,-7,5,-15,-9,-4,-20,-3,-9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-13,-18,-10,-13,-6,-13,-8,-10,-9,-4,-8,-13,-6,-16,9,3,-2,-19,-9,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-7,1,5,-3,2,-18,-18,-6,-16,-8,-14,-12,4,-20,-5,-7,-1,-5,-13,-34,-17,-2;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-18,5,3,-23,-9,-2,-19,-4,-21,-14,3,-12,1,-5,13,2,-10,-32,-15,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-11,20,-21,37,38,-26,-26,-11,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-23,-25,-12,-1,-30,-18,18,-21,28,13,-22,-24,-10,-15,-21,-9,9,-21,-3,-12;
MA   /M: SY='A'; M=20,-19,-14,-28,-19,20,-13,-20,-4,-18,-1,-5,-15,-19,-23,-20,-3,-4,2,-9,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-9,-24,-19,11,-25,-15,8,-24,25,13,-15,-28,-19,-17,-21,-9,2,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-16,-24,-16,-7,-7,-25,-11,-3,6,6,6,-16,-21,-4,2,-17,-9,-2,-16,2,-6;
MA   /M: SY='T'; M=4,-5,-10,-13,-12,-10,-19,-21,-6,-11,-9,-8,-4,-11,-12,-12,16,38,5,-30,-11,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,24,2,-22,-1,9,-22,0,-30,-21,57,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,4,-39,-29,46,-30,22,19,-21,-21,-21,-29,-21,-10,27,-19,1,-29;
MA   /M: SY='I'; M=4,-25,-21,-32,-22,5,-27,-24,23,-25,21,11,-21,-21,-19,-24,-16,-8,15,-18,-2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-30,-8,5,-21,-20,0,-30,28,-20,-11,0,-18,11,64,-9,-10,-21,-21,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-22,-29,-26,11,-32,-12,24,-20,12,10,-24,-28,-20,-19,-17,-7,21,-6,24,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-25,-12,-12,-18,4,-9,-13,-12,-9,-7,-8,-12,-12,-8,-7,-11,-9,-24,-15,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-28,24,44,-29,-19,-3,-28,6,-20,-20,2,-4,12,-3,1,-5,-24,-32,-19,28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=10,-18,-13,-24,-15,-2,-18,-17,3,-18,8,2,-16,-20,-11,-18,-7,-5,3,-18,-4,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,2,-24,4,8,-23,-13,-3,-20,4,-15,-11,1,-15,5,10,-3,-8,-15,-26,-14,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-25,7,8,-22,-15,-8,-16,1,-13,-12,1,-13,0,5,-3,-7,-12,-27,-15,2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-24,-2,-14,-29,51,-16,-37,-14,-30,-20,5,-19,-16,-16,1,-16,-28,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-19,9,-24,-18,-9,-25,-15,3,-18,1,2,-16,-24,-14,-16,-9,-6,5,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,51,-30,3,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,59,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-34,-32,-34,-24,10,-27,-24,6,-26,22,4,-33,-30,-20,-20,-33,-18,-5,46,12,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-25,-9,2,-22,-17,-5,-20,14,-14,-5,-3,-15,15,25,-4,-2,-16,-21,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,19,-28,29,36,-32,-17,-1,-30,5,-22,-20,6,-5,16,-3,3,-4,-27,-32,-18,26;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-15,-26,-15,-10,-8,-25,-21,2,-17,-3,-5,-17,-20,-12,-19,-17,-13,-3,14,-1,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-33,-32,-34,-24,9,-26,-23,4,-25,21,7,-33,-29,-19,-19,-33,-18,-6,46,12,-19;
MA   /M: SY='S'; M=2,1,-21,2,2,-24,-1,-6,-24,0,-22,-15,2,-13,0,0,9,0,-15,-29,-17,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-28,3,12,-27,-11,3,-27,15,-21,-10,0,-12,11,13,-5,-11,-22,-24,-11,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-11,-25,-11,-4,6,-22,7,-8,-8,-2,-4,-12,-20,-7,-10,-12,-9,-11,-3,24,-7;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-22,-12,-14,-18,27,-18,-21,-16,-18,-13,-2,-18,-16,-17,1,-8,-12,-22,-21,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-10,-21,-12,-9,-7,-21,-13,4,-12,6,1,-9,-18,-11,-13,-9,-4,2,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-5,11,-22,12,9,-25,-13,-8,-25,8,-23,-17,7,-8,3,4,8,7,-17,-31,-16,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-18,-23,-17,-10,0,-24,-12,1,-15,9,3,-18,-14,-14,-12,-16,-9,1,-16,-4,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-27,15,22,-29,-11,-4,-25,6,-21,-16,3,-9,11,2,1,-7,-22,-28,-17,16;
MA   /M: SY='D'; M=-12,28,-26,38,12,-30,-9,-1,-29,-1,-22,-18,13,-12,2,-6,1,-7,-23,-34,-16,7;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-26,-20,23,-23,-16,5,-23,14,6,-20,-19,-21,-18,-19,-10,1,-10,9,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00802;
//
ID   LON_SER_MP; MATRIX.
AC   MP01046;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-dependent serine proteases, lon family, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2134838; R2=0.0146549; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=262; N_SCORE=9.043; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-8,5,-27,5,6,-28,-14,-8,-25,16,-28,-15,7,7,5,6,1,-2,-22,-29,-17,4;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-14,-21,-17,-11,6,-21,-7,-11,-1,-10,-6,-9,-16,-11,3,-5,-2,-4,-15,3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-9,29,-25,41,14,-33,-9,1,-33,0,-28,-24,14,-10,1,-8,8,-3,-23,-37,-18,8;
MA   /M: SY='I'; M=2,-23,-21,-31,-24,-4,-29,-27,28,-23,12,10,-17,-19,-18,-24,-9,1,22,-22,-6,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-15,3,-26,1,0,-20,-15,76,-28,-9,-22,-5,14,-18,8,-2,-1,-12,-27,-32,11,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,4,-34,-26,34,-28,31,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-5,-27,-5,-2,-20,-22,67,-19,-9,-15,2,2,-20,11,-2,-9,-15,-17,-29,11,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,-8,-24,-15,2,-29,-24,14,-18,7,4,-23,-25,-22,-18,-11,-4,25,-26,-8,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,6,-33,-20,-11,-20,-4,-27,-14,-14,60,11,-11,-7,-10,-30,-27,-24,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=10,3,-19,6,21,-23,-4,-7,-21,0,-15,-14,-2,-5,4,-8,3,-6,-16,-22,-18,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=27,-9,-17,-14,-2,-14,-3,-11,-13,-8,-11,-11,-9,-12,-7,-16,3,-4,-8,-13,-5,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-20,-18,-19,-13,2,-23,-3,-18,-8,-5,-7,-17,-17,-18,3,12,2,-25,-14,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-37,-5,7,-30,-7,-17,-24,-8,-28,-20,-14,60,-7,-17,-7,-11,-30,-29,-28,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-9,-27,-11,-2,-21,-25,-16,-9,28,-16,-2,-7,-14,0,14,-12,-9,-2,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-13,1,-37,14,6,-33,-17,-14,-26,-7,-30,-23,-8,60,-7,-17,-7,-10,-30,-33,-27,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,49,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,12,-8,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,3,-32,-26,-4,-29,-27,20,-25,12,7,-23,-26,-23,-25,-14,-6,22,-27,-10,-26;
MA   /M: SY='T'; M=24,-5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,26,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-22,-34,-25,2,-30,-19,32,-22,24,31,-23,-23,-15,-20,-20,-9,23,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=11,-20,1,-28,-22,8,-20,-24,2,-20,-1,-3,-17,-22,-23,-21,-4,-1,10,-19,-6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,10,-14,-14,-10,-22,-22,-11,-14,-8,-10,-5,-16,-14,-14,12,37,-1,-33,-13,-14;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-10,-17,-12,-16,-7,-20,-5,-12,-10,-8,-9,-13,-12,-17,12,9,6,-26,-17,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-33,-25,10,-32,-23,28,-27,32,20,-26,-27,-21,-22,-23,-9,20,-20,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-32,-27,6,-31,-27,29,-24,20,13,-26,-27,-25,-22,-16,-5,33,-23,-4,-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,-15,-23,-15,-6,-16,-20,7,-19,13,3,-17,-20,-15,-19,-5,-2,9,-23,-11,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-18,-29,-19,12,-25,-19,13,-26,34,16,-25,-26,-19,-19,-22,-8,7,-17,0,-19;
MA   /M: SY='T'; M=6,-5,-14,-10,-1,-12,-17,-16,-9,-10,-4,-7,-5,-12,-6,-12,9,21,-4,-28,-12,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-28,28,6,-32,7,-3,-34,4,-29,-21,18,-14,1,0,0,-11,-28,-31,-20,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-16,-27,-20,-11,-11,-28,-16,11,-2,4,7,-11,-19,-3,-3,-15,-9,5,-22,-5,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-34,-9,1,-26,-19,-17,-19,2,-24,-15,-14,50,-6,-8,-7,-8,-23,-27,-23,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,32,-23,18,13,-28,-28,-27,-22,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-29,0,1,-24,-16,-3,-24,9,-20,-13,-4,5,0,16,-7,-9,-20,-25,-14,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00803;
//
ID   HMA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01047;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Heavy-metal-associated domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7335200; R2=0.0159017; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=245; N_SCORE=9.619; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-8,-21,-9,-3,-13,-20,-10,0,-7,-3,5,-11,-14,-4,-9,-6,-4,3,-25,-9,-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=0,-6,-15,-8,-6,-14,-11,-11,-5,-3,-10,-2,-4,-9,-3,-5,5,5,0,-24,-11,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-20,-3,9,-17,-10,-5,-13,0,-7,-5,-5,-11,4,0,-4,-7,-10,-20,-11,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=2,2,-19,2,2,-20,-5,-10,-14,-6,-16,-12,1,3,-3,-10,3,-1,-12,-25,-17,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-17,-10,-6,-8,-16,-6,-3,-6,-3,1,-7,-12,-3,-8,-3,0,-3,-16,-1,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-18,-7,-6,-13,-3,-7,-12,-10,-9,-7,-4,-13,-7,-11,0,0,-8,-10,-9,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=4,-5,-19,-6,1,-18,-7,-10,-10,-5,-12,-6,-5,0,-2,-8,2,-2,-8,-23,-15,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=5,-1,-17,-1,3,-19,2,-10,-18,-6,-17,-13,1,-7,-2,-8,10,3,-12,-25,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-19,-9,-6,-13,-14,-12,-2,-10,-2,1,-6,-14,-4,-10,-1,3,-1,-26,-11,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-27,0,8,-25,-13,-5,-20,11,-18,-5,0,-7,11,8,-4,-6,-19,-25,-14,9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-23,-8,-1,-19,-19,-4,-12,9,-14,1,-3,-13,6,8,-1,2,-8,-25,-8,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-14,-21,-18,-10,-9,-22,-7,5,-12,0,3,-10,-19,-3,-12,-8,-3,2,-19,1,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-23,2,14,-22,-19,-5,-16,1,-14,-9,-1,-11,11,0,3,4,-14,-27,-12,12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-32,-23,25,-31,-16,16,-27,30,13,-26,-29,-23,-20,-25,-10,7,-4,16,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-22,0,1,-20,-13,-1,-17,0,-17,-10,5,-10,5,3,5,1,-15,-27,-11,2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,5,13,-26,-10,-4,-24,2,-22,-15,1,1,6,-1,3,0,-21,-29,-17,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-26,-5,-16,-27,55,-16,-35,-16,-28,-19,4,-18,-16,-17,2,-15,-27,-21,-26,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-20,-31,-21,4,-22,-6,20,-14,20,49,-21,-21,-6,-13,-19,-9,12,-19,1,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-15,-1,-5,-15,-14,-6,-16,-8,-16,-12,4,-12,-6,-8,17,29,-8,-31,-9,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-17,-7,-5,-22,2,-15,-18,-9,-18,-14,-1,-6,-6,-14,11,6,-11,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-11,-4,-8,-22,11,-5,-24,-12,-24,-17,7,-15,-8,-14,14,1,-16,-31,-19,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-15,-18,-11,-14,-14,-20,2,-12,-6,-3,-14,-10,-13,-17,3,0,12,-27,-16,-13;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-20,-3,-1,-20,-2,-5,-18,-7,-18,-13,3,-11,-4,-9,8,0,-13,-28,-15,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-23,-4,0,-22,-12,5,-24,13,-22,-10,5,-14,3,15,2,1,-17,-26,-9,0;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-19,-34,-29,6,-31,-28,32,-25,15,13,-25,-26,-26,-23,-15,-5,34,-22,-3,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,10,37,-27,-18,-4,-26,11,-21,-17,1,-5,15,3,1,-4,-24,-24,-16,26;
MA   /M: SY='R'; M=-9,2,-26,1,6,-25,-11,-4,-27,21,-24,-12,5,-14,6,23,-2,-5,-19,-25,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=16,-5,-16,-12,-9,-13,-9,-15,-7,-7,-11,-8,-2,-16,-9,-11,4,0,0,-25,-14,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,24,-28,40,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,19,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-25,4,10,-25,-6,-4,-23,5,-21,-14,9,-10,8,5,3,-2,-22,-28,-17,8;
MA   /M: SY='K'; M=-3,2,-25,2,12,-27,-12,-6,-25,19,-24,-12,4,-11,11,14,1,-4,-20,-25,-15,11;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-20,-26,-19,-3,-28,-19,18,-16,18,11,-21,-23,-15,-15,-16,-5,17,-23,-5,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,0,-29,7,14,-27,-11,-10,-23,-1,-23,-18,-3,25,0,-9,-2,-8,-24,-28,-22,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-29,-10,-16,-20,50,-17,-34,-18,-26,-18,-2,-17,-18,-18,-1,-17,-27,-17,-21,-17;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-12,-25,-26,-3,-28,-28,25,-19,7,7,-26,-27,-27,-20,-9,-1,42,-29,-11,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-19,-3,6,-19,-13,-6,-17,6,-17,-8,2,-10,11,3,6,3,-14,-23,-11,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,3,-24,5,8,-20,-14,-5,-23,9,-20,-13,1,-13,5,7,2,-3,-17,-23,-8,6;
MA   /M: SY='A'; M=25,-17,-5,-25,-18,-9,-14,-23,4,-16,-3,-3,-16,-18,-17,-21,0,-1,12,-22,-13,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-24,8,7,-25,-11,-3,-21,2,-19,-13,3,-12,6,3,4,-3,-16,-30,-14,5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-13,-31,-29,-1,-30,-29,30,-21,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,45,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,24,-19,16,1,-22,-3,0,-20,-4,-25,-18,31,-15,0,-6,13,5,-21,-36,-19,1;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-20,-32,-24,36,-29,-17,11,-27,27,10,-25,-29,-27,-19,-23,-9,6,-6,16,-24;
MA   /M: SY='A'; M=11,-6,-21,-7,2,-22,-3,-15,-18,-5,-16,-13,-5,-2,-5,-9,4,-1,-12,-25,-19,-2;
MA   /M: SY='T'; M=3,2,-18,-3,0,-18,-13,-13,-16,2,-15,-12,4,-12,-3,-1,8,14,-10,-27,-14,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-25,0,11,-25,-3,-5,-28,12,-24,-14,3,-12,8,16,3,-6,-21,-25,-17,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-4,-24,-3,9,-22,-19,-9,-19,17,-17,-9,-3,-13,6,14,-1,-1,-12,-25,-12,7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-18,-10,-24,-17,-12,-10,-23,5,-16,1,-1,-17,-18,-17,-21,-1,-2,13,-23,-15,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-12,-9,-8,-10,-20,-8,-5,-11,-5,-4,-6,-19,-6,-10,-2,3,-1,-27,-8,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-13,-33,-29,5,-32,-29,31,-24,15,12,-27,-28,-27,-23,-15,-4,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-20,3,6,-16,-19,-5,-15,0,-14,-10,-1,-14,-2,-4,-1,2,-10,-22,-5,2;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,-23,-24,-20,19,-11,-12,-6,-19,0,-4,-15,-22,-20,-17,-10,-4,-7,3,18,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-24,26,12,-27,-13,-4,-23,-1,-23,-19,12,-9,1,-7,6,-1,-17,-35,-17,6;
MA   /M: SY='P'; M=1,2,-26,5,8,-24,-9,-6,-22,-6,-19,-16,-2,9,-3,-12,0,-5,-20,-27,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,4,-22,4,6,-20,-3,-10,-21,-4,-21,-16,4,-5,-3,-8,7,0,-16,-29,-18,1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-11,-20,-15,-7,-13,-22,-15,3,-5,-3,0,-9,-16,-5,-8,-4,1,5,-24,-8,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-21,-2,0,-19,-16,-14,-9,-6,-12,-9,-3,-10,-3,-9,4,5,-5,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00804;
//
ID   RIBOSOMAL_S6_MP; MATRIX.
AC   MP01048;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S6 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2578712; R2=0.0187252; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=172; N_SCORE=9.469; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=13; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,2,-24,26,-24,-4,0,-10,40,18,-4,-10,-26,-20,-10,28;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-22,0,12,-32,-12,2,-20,2,-24,-8,4,-10,36,2,16,2,-22,-28,-14,24;
MA   /M: SY='I'; M=2,-24,-18,-29,-22,0,-25,-22,21,-20,15,15,-21,-20,-18,-20,-12,-3,20,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,35,18,-28,-28,-22,-22,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-23,-9,3,-17,-21,-12,-10,4,-11,-7,-2,-12,1,9,0,6,-7,-25,-11,0;
MA   /M: SY='B'; M=-10,19,-26,18,14,-28,-9,-3,-27,14,-27,-18,18,-12,5,5,1,-6,-24,-31,-17,9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-20,5,-3,-10,-3,0,-16,-8,-13,-11,12,-17,-5,-9,0,-5,-16,-22,-5,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-23,-5,-10,-24,37,-13,-30,-9,-25,-16,6,-15,-11,-11,3,-10,-23,-22,-23,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=19,-11,-19,-15,-16,-22,27,-20,-20,-15,-18,-13,-6,-16,-16,-19,6,-6,-9,-23,-23,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-25,4,21,-25,-17,-7,-23,13,-21,-14,1,-8,10,9,4,1,-18,-27,-15,15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-12,-25,-15,-12,-10,-24,-21,18,-18,2,3,-10,-19,-14,-20,-10,-8,15,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-11,-22,-11,-4,-11,-27,7,2,-15,7,4,-11,-20,-6,-13,-15,-12,-2,-26,-2,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-25,2,6,-24,-16,-7,-20,14,-21,-11,2,-13,6,16,1,-2,-14,-27,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-10,-23,-18,-2,-25,-22,14,-20,14,6,-19,-25,-19,-18,-9,2,19,-28,-9,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,9,-30,16,30,-30,-20,-2,-21,6,-16,-12,1,-7,19,-1,-3,-10,-23,-28,-15,24;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-25,12,3,-19,-17,3,-13,-5,-15,-7,6,-12,-2,-9,-2,-5,-12,-29,-7,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-27,-35,-29,-19,2,-22,-17,-11,-6,-6,-3,-23,-25,-10,6,-25,-16,-15,51,10,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-7,1,-19,-21,-7,-20,26,-12,-2,-5,-17,5,34,-13,-10,-14,-21,-8,1;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-25,-9,0,-21,-20,-2,-30,31,-21,-10,-1,-19,9,61,-10,-10,-20,-21,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-17,7,-29,9,11,-28,-17,9,-29,16,-22,-12,8,-15,19,32,-4,-10,-26,-26,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-28,0,19,-23,-18,-8,-19,-3,-17,-14,-8,19,5,-9,-1,-5,-22,-26,-16,11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='N'; M=2,15,-21,5,1,-23,-6,-3,-21,12,-26,-15,25,-15,1,7,5,-2,-20,-30,-17,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,14,-28,13,9,-29,-15,-5,-29,33,-30,-15,14,-12,7,20,-5,-8,-23,-26,-13,8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-26,-8,-2,-8,-22,10,-11,-1,-6,0,-3,-19,8,-1,-10,-10,-14,-18,4,3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,0,-25,-2,2,-22,-15,8,-22,10,-20,-9,6,-8,4,9,-1,-5,-19,-27,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-29,17,24,-30,-17,-3,-31,21,-25,-17,4,-9,12,17,-2,-8,-24,-28,-15,18;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-29,-20,-17,4,-28,16,9,-16,0,5,-5,-23,-9,-12,-15,-11,-1,-12,21,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-18,-29,-25,11,-28,-21,20,-21,10,7,-21,-26,-24,-20,-12,-4,24,-17,5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-23,-20,-9,-10,-26,-12,6,-11,11,10,-19,-23,5,-5,-15,-9,3,-15,-5,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-24,-34,-26,14,-31,-21,25,-24,20,19,-25,-26,-21,-21,-22,-10,17,-6,7,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-21,16,3,-21,-7,3,-22,2,-26,-17,30,-16,4,1,10,2,-23,-32,-12,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-23,-31,-25,26,-32,-8,16,-24,14,9,-20,-27,-23,-19,-19,-10,11,-7,20,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-25,7,23,-25,-16,-2,-24,11,-23,-14,6,-9,15,6,5,-1,-22,-27,-12,19;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-6,-15,-15,-19,12,-19,-16,-16,-16,-10,-4,-18,-14,-18,6,-1,-7,-27,-21,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00805;
//
ID   YJEF_C_1_MP; MATRIX.
AC   MP01049;
DT   01-MAY-2008 CREATED; 01-MAY-2008 DATA UPDATE; 01-MAY-2008 INFO UPDATE.
DE   YjeF C-terminal domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=277;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=272;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4971883; R2=0.0077495; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=969; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=517; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-92; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='T'; M=7,-64,9,18,-36,-7,-72,8,-31,19,17,-50,-28,-38,-19,-10,46,-5,-9,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-253,-3,45,-21,-11,-69,-10,2,10,-46,-1,32,16,4,-43,-4,-63,9,9;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='D'; M=17,-21,44,40,-65,-56,-41,-54,-8,-37,-241,-9,19,1,-50,26,12,-9,20,-51; D=-30;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='D'; M=20,-250,22,12,-32,3,-31,7,-38,19,10,9,-63,-4,-4,3,-7,-29,-61,-80; D=-30;
MA   /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='W'; M=18,4,28,-44,2,-70,1,14,-51,16,-14,-65,1,-25,-51,-10,-36,39,51,-25;
MA   /M: SY='R'; M=20,-37,-19,-56,-82,-36,-23,-47,20,12,-38,-18,3,-6,56,25,3,-12,-255,-241;
MA   /M: SY='A'; M=30,-249,-65,-12,-30,-43,-24,-35,26,-9,-234,17,-4,10,16,12,1,9,9,18;
MA   /M: SY='W'; M=-33,3,-15,-95,-13,-251,1,3,-2,41,0,-17,15,-83,3,-6,-3,20,62,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-57,-252,-47,-105,-10,-112,-249,53,-37,54,-21,-252,30,-51,-30,-104,-53,9,78,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-260,-243,-94,-98,-90,-242,-77,22,2,-55,-87,110,-12,12,-35,-100,-73,-39,-26;
MA   /M: SY='P'; M=11,-253,-99,-14,-246,-245,19,-22,43,1,-31,-28,68,-6,25,-3,-50,-8,-33,-43;
MA   /M: SY='R'; M=-57,-257,-245,-234,-244,-115,-237,-32,-34,26,-232,-241,63,-228,98,-104,-36,-46,-253,-86;
MA   /M: SY='P'; M=10,-252,33,-15,-59,-25,-8,-246,22,-40,-67,-17,55,-4,26,23,14,-42,-255,-15;
MA   /M: SY='P'; M=29,-48,4,8,-44,-56,-40,-99,21,-19,-239,-44,77,-32,27,-9,-47,-45,-11,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-8,-50,70,15,-41,1,-21,-91,-9,-71,-54,49,-86,-25,-11,14,14,-75,-2,-13;
MA   /M: SY='S'; M=48,-244,5,-39,-17,-7,-240,-243,-44,-31,-20,-54,-243,-232,-11,69,39,-71,-27,-241;
MA   /M: SY='H'; M=-119,-256,12,-104,-239,-96,142,-256,-32,-245,-23,11,-247,-226,-66,-25,-50,-90,-262,40;
MA   /M: SY='K'; M=-240,-254,-232,-218,-256,-247,-235,-256,121,-255,-243,-225,-240,-217,-201,-234,-234,-252,-249,-243;
MA   /M: SY='G'; M=-88,-254,-241,-46,-67,96,6,-257,-90,-252,-244,-70,-248,-241,-248,-58,-52,-254,-237,77;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-34,51,2,-253,-66,-64,-100,-26,-247,29,25,-242,65,-15,52,43,-79,-51,-242;
MA   /M: SY='Y'; M=15,18,-86,-67,44,-48,47,-244,-228,-240,-236,23,-252,-3,61,0,-74,-82,-235,79;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /I: I=-32; MI=0; MD=-81; IM=0; DM=-81;
MA   /M: SY='R'; M=-76,-254,-98,-65,-91,-249,84,-247,48,-94,-61,-61,-247,-44,85,-26,11,-1,-256,-19;
MA   /M: SY='V'; M=10,-30,-257,-252,-230,-60,-256,44,-251,33,-218,-252,-254,-250,-253,-99,-16,81,-257,-238;
MA   /M: SY='L'; M=34,19,-254,-250,-37,30,-247,-24,-249,72,-40,-247,-254,-245,-81,-51,-59,-31,-44,-86;
MA   /M: SY='V'; M=-124,-74,-260,-256,-45,-103,-259,73,-253,20,-215,-103,-255,-252,-255,-78,-69,81,-256,-235;
MA   /M: SY='I'; M=-33,-25,-81,-256,-11,-262,-259,86,-253,9,-216,-253,-254,-252,-92,-247,-106,66,-33,-233;
MA   /M: SY='G'; M=57,-6,-242,-247,-256,91,-247,-255,-244,-255,-246,-231,-245,-241,-250,-19,-44,-66,-253,-252;
MA   /M: SY='G'; M=-88,-254,-242,-253,-260,111,-248,-266,-247,-263,-252,-228,-245,-244,-254,-226,-245,-99,-251,-255;
MA   /M: SY='S'; M=-3,56,-24,-48,-74,-4,-29,-252,-235,-253,-247,28,-97,-66,-80,97,-44,-245,-19,-88;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='R'; M=17,-255,2,28,-37,-55,29,-62,5,-32,-26,-55,29,18,37,-14,-20,-32,-251,27; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='G'; M=-67,-257,26,29,-86,52,-11,-45,-14,-55,-245,0,-30,25,23,-29,-7,-31,-33,-45; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-243,-253,-249,-246,35,-253,-224,-227,16,-51,93,-83,-254,-83,-236,-36,-32,-53,-220,115;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-72,-240,-239,-246,22,-22,-23,-237,-33,-19,-55,64,-40,-20,19,74,-34,-256,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='A'; M=107,-239,-244,-237,-253,-71,-246,-243,-239,-245,-239,-238,-243,-236,-244,-4,-228,-230,-253,-248;
MA   /M: SY='P'; M=67,-250,-247,-239,-250,-13,-249,11,-242,-72,-236,-244,89,-242,-249,-31,-92,16,-255,-249;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-6,-252,-69,12,-254,-19,46,-92,16,7,-247,-254,-34,19,-49,-43,29,-238,71;
MA   /M: SY='L'; M=-245,-247,-262,-254,55,-261,-242,-30,-253,83,74,-257,-259,-248,-250,-253,-240,-219,-240,-17;
MA   /M: SY='A'; M=86,24,-241,-238,-251,-64,-244,-97,-239,-245,-240,-233,-243,-235,-244,62,22,-51,-257,-247;
MA   /M: SY='A'; M=81,-7,-243,-240,-249,29,-246,-60,-241,-44,-76,-234,-244,-237,-246,42,8,-22,-255,-247;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-63,-238,38,-63,-46,7,19,14,36,35,-11,-247,-3,26,-6,-24,-43,-252,-49;
MA   /M: SY='A'; M=87,-46,-242,-240,-254,49,-245,-248,-240,-249,-243,-233,-243,-236,-246,37,-34,-237,-254,-249;
MA   /M: SY='A'; M=101,49,-245,-239,-89,-82,-247,-243,-240,-244,-239,-238,-245,-237,-245,-6,-18,-85,-254,-74;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-247,-255,-64,-38,-78,-244,-20,-97,73,35,-251,-255,-3,-26,-34,-236,35,-248,-3;
MA   /M: SY='R'; M=3,-255,-238,-65,-48,-80,16,-59,36,-48,-238,-11,-249,-222,98,-29,-47,-245,-247,29;
MA   /M: SY='S'; M=57,-5,-244,-241,1,-35,-244,-15,-241,-32,23,-234,-245,-237,-245,63,38,10,-254,-239;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-253,-242,-253,-259,110,-248,-265,-247,-262,-251,-228,-92,-244,-254,-226,-43,-72,-251,-255;
MA   /M: SY='A'; M=85,58,-58,-240,-249,-27,-247,-49,-241,-82,-238,-237,-74,-238,-246,38,-14,4,-257,-247;
MA   /M: SY='G'; M=-112,-255,72,-68,-260,96,-242,-265,-242,-85,-253,-223,-245,-240,-250,-66,-241,-259,-257,-252;
MA   /I: I=-28; MD=-71;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-49,-257,-248,-39,-112,-241,-43,5,80,63,-252,-257,-63,-34,-44,-239,-53,3,20; D=-28;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='V'; M=-6,16,-255,-250,-234,-86,-256,-27,-249,-2,-55,-249,-77,-249,-251,3,5,94,-262,-240;
MA   /M: SY='T'; M=-32,-248,-237,-61,10,-119,74,-64,2,-241,-31,-229,-244,9,39,16,76,-82,-248,41;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-19,-258,-253,-50,-96,-251,43,-251,46,15,-253,-255,-249,-252,-244,-32,70,-251,14;
MA   /M: SY='A'; M=72,-23,-252,-247,53,-30,-23,31,-246,5,-227,-245,-251,-244,-249,-34,-234,-8,-45,6;
MA   /M: SY='C'; M=2,87,-89,-245,-242,9,-249,-11,-243,-41,-234,-235,-84,-103,-249,30,67,38,-33,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-69,11,27,-255,-40,44,-101,-232,-95,-243,-235,96,6,0,6,8,-37,-18,-246;
MA   /M: SY='E'; M=31,-252,6,43,-30,-38,-9,-71,35,-76,-22,2,41,2,8,1,-41,-45,-24,-67;
MA   /M: SY='S'; M=7,7,36,46,-92,-31,-6,-58,-18,-54,-243,13,-9,-28,3,55,-16,-33,-260,-244;
MA   /M: SY='A'; M=53,-5,-77,-27,-53,-43,7,15,-240,8,-34,48,-54,-35,-71,-27,-22,31,-255,-24;
MA   /M: SY='A'; M=57,-11,-48,-34,-18,-63,33,5,-25,-10,-26,-14,-24,25,12,4,-56,-12,-251,-2;
MA   /M: SY='P'; M=27,-23,-6,-16,-98,-12,-54,-36,-8,-31,-5,22,62,7,-14,17,-9,-11,-31,-20;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=33,-20,-57,-9,-16,-105,-249,37,-98,-14,-56,-89,38,-2,-71,21,-45,36,-256,-63; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=3,-252,-32,-254,-13,-259,-60,58,-253,45,18,-3,-76,-251,-101,-248,-90,29,-254,-24; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=30,-260,-69,-17,-254,-48,44,-74,50,-6,-71,-11,-89,21,-15,-38,-106,-69,53,-245; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=26,-40,-89,-254,-69,-23,-43,-261,-254,-264,-35,-13,-108,-43,-123,65,17,-41,-276,-261; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-269,-271,-99,-247,-40,-25,34,-263,7,70,-264,-52,-2,-92,-259,-29,-46,-264,20; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-15,-7,-61,-38,-56,-65,-72,19,-65,-19,9,-48,-104,-253,-20,7,24,35,-268,-29; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-29,-263,-113,-56,-245,-264,54,11,-253,5,-236,-256,52,-40,-40,-113,-23,43,3,-5; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-268,-3,16,-260,-104,-7,-26,-244,-65,-1,-250,95,-47,-14,-47,-53,-87,-264,-16; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-53,-94,54,-24,-45,-23,4,-82,27,-40,-54,-5,-76,12,-23,-71,-3,-252,23; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=15,18,-104,-28,-16,-77,-32,7,-93,57,38,-251,-4,-32,-106,-32,-67,15,-44,-237; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-34,-17,2,-5,-93,-9,-80,-8,-107,-16,61,-68,72,-71,-38,-18,-15,20,-11,-14; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-39,-44,-15,74,0,-38,42,-88,-39,-39,-36,-79,-32,-14,-22,-16,18,-4,-44,17; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=35,-252,2,11,-248,-46,-3,-23,10,-21,-46,-12,31,-14,24,-4,10,-22,-14,-33; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-44,-251,15,-25,-74,35,-240,-71,-25,-11,75,-10,-5,-237,-32,22,22,-8,-44,0; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-30,-266,-14,-6,37,-33,-28,-25,-41,-26,-22,-55,-37,-19,-103,2,-22,-9,4,27; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-256,58,49,-18,-6,-26,16,-70,-2,-239,-24,-38,-58,21,-15,-82,-59,-18,-70; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=36,-249,50,7,-71,31,21,-32,-235,-77,-39,-15,-26,-35,-26,29,2,-34,-27,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-54,-50,-6,-36,-242,26,-65,38,17,-10,4,-4,-19,-7,-55,20,26,36;
MA   /M: SY='Q'; M=15,-58,24,35,-12,-17,0,-15,23,-78,-240,-4,22,45,-8,-7,15,-93,-36,-241;
MA   /M: SY='E'; M=-22,-58,61,73,-95,-105,22,-113,-8,-76,-246,13,26,-5,-21,4,-27,-251,-21,-80;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='A'; M=42,-45,-5,-105,19,-118,-11,19,-29,16,-22,-14,-92,-23,-42,-65,-3,26,28,-82; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-47,47,22,-54,-40,-246,-21,-31,15,-38,-70,1,-11,-29,-8,-12,20,-263,-247; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='E'; M=6,-262,12,35,-258,-115,-247,-44,26,-28,8,-18,-94,-5,0,10,-46,-41,-26,-39; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-72,-264,-66,-18,1,-262,7,-74,26,-48,-258,-38,-37,-81,-10,5,-6,-25,-40; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='E'; M=1,-22,-40,13,-16,-270,-59,3,-35,9,-44,-22,-18,-256,-20,-257,-19,-23,-272,-49; D=-18;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-271,-11,38,-271,-39,-27,-89,-12,-88,-261,-37,19,26,-61,-1,-22,-59,-42,-49; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-262,-17,-9,-24,-67,-252,-41,-16,43,6,-75,-262,19,-15,-79,-38,-33,54,-33; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='L'; M=19,-22,12,-43,-1,-60,-251,27,-98,47,16,-103,-7,-248,-54,-26,-108,-5,-257,-240; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='E'; M=-21,-253,32,56,-14,10,0,-76,18,-51,-69,3,-32,26,12,23,-39,-92,-19,-84;
MA   /M: SY='R'; M=1,-255,-27,-47,-67,-27,-12,-59,45,-251,-242,0,-29,1,92,-30,-33,-249,32,-239;
MA   /M: SY='V'; M=38,29,-77,-245,21,-246,-37,14,-37,13,0,-42,-5,-74,-42,11,-51,39,-247,26;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-78,93,-42,-257,-124,66,-256,-29,-254,-247,29,-243,43,-71,20,27,-252,-269,-240;
MA   /M: SY='A'; M=76,19,-247,-242,-244,-100,-249,-74,-243,-111,-61,-61,-247,-240,-247,33,-12,63,-259,-244;
MA   /M: SY='W'; M=-22,23,-260,-111,-24,-259,-256,61,-252,41,-18,-255,-255,-250,-91,-246,-55,59,71,-83;
MA   /M: SY='V'; M=50,2,-255,-249,-82,-41,-254,-6,-249,26,-59,-250,-253,-248,-251,-118,-89,80,-257,-239;
MA   /M: SY='I'; M=-41,34,-261,-257,-13,-262,-257,89,-254,12,-6,-254,-254,-252,-256,-247,-234,53,-252,-36;
MA   /M: SY='G'; M=-122,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='P'; M=-241,-5,-244,-234,-258,-244,-245,-245,-240,-252,44,-40,127,-76,-250,1,-234,-59,-257,-255;
MA   /M: SY='G'; M=-60,-254,-242,-253,-260,111,-248,-267,-247,-263,-252,-228,-245,-244,-254,-226,-245,-260,-251,-255;
MA   /M: SY='L'; M=-46,-247,-261,-253,-11,-102,-245,12,-251,86,52,-257,-258,-246,-46,-251,-239,-31,20,-51;
MA   /M: SY='G'; M=-48,-252,-1,-55,-259,102,-246,-262,-93,-260,-251,-227,-69,-241,-109,-15,-16,-71,-253,-253;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-74; IM=0; DM=-74;
MA   /M: SY='R'; M=-25,-46,-9,-28,-59,-52,-16,-50,-31,4,-26,-22,-9,40,75,-68,40,-4,-255,-239;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-71,78,40,-102,27,-18,-119,-28,-33,-247,16,-87,-59,-69,31,7,-249,-262,-74;
MA   /M: SY='E'; M=23,-254,36,58,-31,-22,-21,-50,-44,-55,-243,14,57,0,1,-34,-22,-117,-257,-246;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='W'; M=18,-253,4,54,12,-7,15,-35,-25,-30,-57,-37,-28,6,-32,-3,-3,-49,73,-5; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='T'; M=49,-245,-32,-84,-93,12,-247,-25,-60,-26,27,-235,-76,-44,-116,12,66,1,-24,-244; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-16,-39,-5,-26,-46,-39,-37,11,26,-2,-76,-67,46,38,-67,-41,-18,43,-60; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='E'; M=19,-252,36,48,-87,-44,-56,-45,30,-51,-79,-35,-83,34,38,11,-5,-109,-255,-36;
MA   /M: SY='L'; M=29,21,-79,-12,28,-251,-245,37,-60,44,10,-51,-252,-52,-26,-39,-2,-7,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-246,-257,-251,15,-110,-251,28,-250,57,-27,-72,-255,-61,-90,-47,-32,59,5,-78;
MA   /M: SY='E'; M=14,-60,-14,39,-87,-45,-5,-29,37,-3,-35,2,-93,18,35,9,-23,-28,-5,-67;
MA   /M: SY='E'; M=6,-251,-42,46,-11,-17,-6,-31,23,-7,23,-9,-91,34,27,3,-36,-43,-46,-15;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='V'; M=30,-22,-84,-251,-22,-254,-252,51,-250,44,-72,-252,-76,-22,-252,-99,-79,53,-22,-24; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='L'; M=-19,-34,-260,-107,15,-261,-80,35,-98,70,29,-256,-258,-65,-48,-109,-49,13,-250,-82; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='Q'; M=-17,-265,-14,54,-264,-64,-244,-259,2,-29,-251,-10,-17,54,8,-5,-36,-62,-266,-68; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
MA   /M: SY='T'; M=20,-249,19,23,-15,7,11,-59,3,-89,-241,27,-43,22,6,18,35,-46,-44,-241;
MA   /M: SY='S'; M=38,19,-92,-19,21,-24,-15,-30,-33,-24,21,0,-24,-32,-32,44,0,4,6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-63,42,40,-256,20,10,-252,32,-80,-244,24,10,17,14,-13,-1,-48,-259,-245;
MA   /M: SY='K'; M=-8,17,-79,-49,-244,15,-242,5,52,6,-24,-44,-3,34,9,-36,-22,24,-254,-242;
MA   /I: I=-22; MD=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-68,-43,-243,-88,-256,-47,-10,-56,-6,-18,-26,5,111,10,-36,-61,-27,-56,-258,-252; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
MA   /M: SY='L'; M=-16,28,-257,-250,-19,-257,-249,29,-29,58,43,-250,-254,-98,-103,-56,-2,48,-44,-233;
MA   /M: SY='V'; M=-233,-246,-261,-255,-229,-262,-261,52,-253,0,-217,-255,-255,-253,-254,-96,-230,99,-260,-237;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-63,-262,-256,-23,-263,-253,68,-254,68,-31,-257,-257,-250,-254,-250,-236,40,-20,-231;
MA   /M: SY='D'; M=-245,-258,130,-208,-265,-242,-230,-263,-232,-262,-261,-212,-244,-231,-241,-233,-234,-260,-281,-248;
MA   /M: SY='A'; M=105,-240,-245,-239,-254,19,-247,-245,-241,-246,-240,-238,-244,-237,-245,-219,-231,-232,-253,-249;
MA   /M: SY='D'; M=-97,-256,122,-212,-78,-1,-232,-261,-233,-106,-257,-214,-244,-82,-241,-1,-72,-257,-274,-247;
MA   /M: SY='A'; M=86,-244,-244,-243,-254,70,-248,-43,-243,-134,-241,-235,-245,-240,-248,-222,-235,-51,-252,-250;
MA   /I: I=-22; MD=-57;
MA   /M: SY='L'; M=-245,-249,-263,-256,-8,-265,-250,53,-256,88,-208,-260,-260,-250,-255,-254,-240,-100,-248,-230; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
MA   /M: SY='N'; M=-28,-248,-13,-94,25,-98,-19,-71,9,-67,-25,85,-67,-35,-35,0,53,-243,49,-22; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-57;
MA   /M: SY='L'; M=25,-8,-253,-80,-13,-28,4,37,-245,53,3,-38,-48,-244,-2,-22,-237,6,-14,-235; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-57;
MA   /M: SY='L'; M=-107,-59,-261,-255,28,-263,-249,53,-254,75,-19,-257,-95,-250,-253,-251,-67,12,-42,-13;
MA   /M: SY='A'; M=74,-58,-2,-56,-253,-6,-56,-245,-24,-248,-36,-26,7,-8,-38,51,-38,-33,-256,-247;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-28,45,42,-254,10,-74,-51,40,-87,-67,12,-14,16,21,-10,5,-118,-257,-41;
MA   /M: SY='H'; M=4,-15,21,23,-86,-13,48,-63,-1,-42,-239,45,-97,24,26,11,-7,-35,-256,-1;
MA   /I: I=-10; MD=-26;
MA   /M: SY='P'; M=1,-266,-252,-62,-262,-1,-57,-35,0,-15,2,3,70,-13,-26,-23,-21,-97,-267,-259; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='D'; M=-40,-269,74,8,-272,-12,-249,-89,-33,-45,-55,5,-27,16,-252,-10,-86,-115,-61,-262; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='W'; M=-116,-20,-65,-1,-24,-38,5,-11,-18,44,-233,-257,-263,16,-42,-76,-250,13,69,-37; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='L'; M=14,-251,-83,-33,-62,-255,-249,11,-57,51,-226,-1,-31,-38,-6,-54,27,11,-22,-242; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='L'; M=-110,-262,-265,-87,8,-47,-29,6,-257,53,-24,-31,-75,-37,-20,-258,-251,-23,1,53; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='P'; M=10,-46,-9,-60,-264,-62,-19,-102,28,-89,-251,13,84,-22,32,-62,-68,-257,-264,-256; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-70,-8,-8,-276,6,-22,-275,27,-273,-264,-20,-84,20,9,-28,2,-268,-277,-265; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='G'; M=31,-13,5,9,-114,34,-13,-75,14,-117,-254,-36,-4,-10,7,-51,-49,-90,-266,-257; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-255,-41,8,-255,-31,28,-252,-13,-84,-60,63,68,17,43,-41,12,-105,-260,-73; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='C'; M=26,59,-17,-244,-9,-103,-36,17,-70,9,-23,-240,-249,-244,-38,-35,58,32,48,-69;
MA   /M: SY='I'; M=-237,-249,-262,-257,-72,-263,-261,80,-253,-3,-217,-255,-254,-253,-255,-247,-61,79,59,-62;
MA   /M: SY='L'; M=-56,-65,-261,-255,14,-262,-248,44,-254,80,18,-257,-258,-249,-253,-251,-238,1,-44,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-229,-238,-234,-238,-245,-245,-245,-236,-234,-240,-237,-224,-236,-239,-243,-213,128,-228,-265,-243;
MA   /M: SY='P'; M=-244,-269,-244,-232,-263,-245,-247,-251,-240,-261,-248,-250,136,-244,-253,-241,-236,-256,-256,-261;
MA   /M: SY='H'; M=-245,-255,-226,-231,-247,-243,150,-261,-233,-248,-234,67,-248,-225,-230,-233,-240,-261,-279,-219;
MA   /M: SY='P'; M=38,-253,-45,-6,-55,-114,1,-18,-7,-14,-60,-71,87,32,-47,-73,-44,1,-253,-33;
MA   /M: SY='G'; M=-17,-251,-240,-91,-252,89,-242,-87,13,-142,64,24,-246,-89,-36,-84,-82,-25,-253,-247;
MA   /M: SY='E'; M=-237,-258,-208,123,-261,-253,-231,-262,-218,-254,-250,-234,-232,-211,-228,-234,-238,-254,-257,-251;
MA   /M: SY='F'; M=31,-248,-259,-251,93,-251,-244,-86,-83,24,76,-251,-255,-48,-248,-243,-82,-83,73,-31;
MA   /M: SY='A'; M=63,-18,-63,15,-91,-17,-238,-103,37,-102,-49,-68,-243,36,21,28,-46,-241,20,-243;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-257,-240,-89,-101,-102,-18,-27,5,-73,-67,-233,-250,-80,114,-41,-40,-246,-252,-69;
MA   /M: SY='L'; M=-243,-59,-261,-102,-4,-262,-246,-5,-254,92,27,-258,-259,-248,-252,-252,-77,-16,-248,-229;
MA   /M: SY='L'; M=1,38,-252,-97,56,-79,-244,-43,-37,57,-15,-245,-253,-245,-58,7,32,-30,-243,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-71,-76,29,-17,-258,79,-34,-95,14,-123,-248,-5,32,4,-11,-24,-41,-255,-18,-249;
MA   /I: I=-7; MD=-17;
MA   /M: SY='C'; M=24,32,-23,6,-243,-41,8,27,5,0,26,-35,-250,-18,-24,-18,15,-22,-39,-20; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-48,-6,59,38,-255,-11,-237,-75,0,-117,-24,4,16,-71,-36,56,14,-248,-1,-247; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-52,-50,-247,-91,-109,-252,47,-65,12,-30,-83,13,-246,-25,-53,49,58,-258,-240; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=31,-251,29,24,-86,16,-238,-251,-6,-253,-246,14,46,8,-15,40,-71,-37,-258,-248; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=11,-253,44,75,-82,-35,-37,-252,-1,-59,-245,-22,-31,24,-39,0,-3,-74,-257,-16; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-109,-257,25,-39,-81,-118,-26,54,-53,-28,-231,-70,-33,41,-33,-23,-93,53,-42,-25; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-262,-16,40,-86,-61,-55,-20,-27,-27,-79,-3,-28,64,-94,-70,17,-22,-267,-253; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=38,-34,-40,2,-263,-48,-20,-93,22,-84,-47,-12,-53,4,-1,-16,-62,-15,-268,-19; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-30,-263,85,16,-265,-49,-20,-87,-6,-118,-259,39,-253,-21,-108,-8,-68,-262,-274,-18; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-28,-264,-86,-238,-260,-73,-56,-32,12,-87,-247,20,37,-45,91,-61,-85,-65,-262,-250; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-256,-59,-29,29,-32,-249,36,-38,23,-19,-33,9,-75,-32,-58,-60,14,-249,21; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=22,-256,37,47,-260,11,-44,-47,13,-79,-69,-72,-246,27,-7,7,3,-249,-262,-250; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=66,-42,-250,-93,-87,-244,-19,18,17,-12,-59,-244,-251,-31,-13,-1,-57,-6,0,5; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=82,8,-251,-99,-86,-101,-252,-14,-246,-27,0,-30,-251,-244,-250,-54,-17,35,-259,-247; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-47,-256,-240,14,-248,-252,6,-41,21,8,-33,-40,-70,52,65,4,-26,-6,-18,-241; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=30,-45,1,62,-256,-245,-235,-253,-1,-57,-75,-10,-244,44,51,8,-69,-87,-257,-80; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=53,-24,-254,-249,48,-248,-247,-10,-35,39,-228,-248,-255,-246,-91,1,-7,-31,-11,9; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=83,-244,-244,-104,-252,-86,-33,-46,-23,-105,-67,-95,-246,22,-32,33,-23,4,-257,-246; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=29,-15,-3,39,-74,-60,-36,-37,43,-39,14,-23,-79,23,35,2,-43,-24,-254,-79;
MA   /M: SY='R'; M=-27,-20,-32,32,-87,-61,-14,-22,42,22,-34,-38,-45,43,47,-28,-18,-99,-42,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-36,12,-102,-49,12,-16,22,-7,-19,23,-16,13,-16,-238,-36,13,16,-112,50,70;
MA   /M: SY='G'; M=-59,-253,14,-50,-256,76,14,-80,12,-123,-247,54,-246,18,14,-12,-113,-255,-256,-80;
MA   /M: SY='C'; M=54,84,-40,-245,-243,5,-46,0,-124,-19,-67,-240,-12,-107,-249,7,-14,40,-259,-245;
MA   /M: SY='T'; M=-45,28,-98,-72,-33,-97,-48,49,-51,-103,-54,-239,-247,-92,-247,-61,81,48,11,26;
MA   /M: SY='V'; M=-73,15,-260,-255,-62,-261,-257,64,-253,27,-217,-254,-255,-252,-254,-246,-29,78,21,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-51,-245,-261,-254,-37,-261,-255,24,-253,59,-60,-257,-257,-251,-253,-247,-233,83,-255,-234;
MA   /M: SY='L'; M=-32,-41,-254,-22,-42,-98,-243,-27,-246,87,-32,-252,-257,21,-24,-47,-238,-30,-248,-50;
MA   /M: SY='K'; M=-240,-254,-232,-219,-62,-96,-235,-256,120,-255,-243,-225,-74,-54,-202,-234,-235,-252,-249,-242;
MA   /M: SY='G'; M=-64,-52,-37,-248,-259,105,-16,-266,-62,-262,-251,-227,-245,-69,-250,2,-242,-259,-252,-252;
MA   /M: SY='A'; M=67,-248,-24,-67,-43,-37,32,-247,-12,-248,-62,10,50,11,4,13,-79,-75,9,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-46,-14,27,-10,-54,28,54,-33,-30,-246,-240,33,4,-17,34,-29,24,7,-42,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-231,-244,71,-90,-250,-241,-239,-243,-234,-247,-243,-221,-78,-67,-241,42,101,-56,-267,-244;
MA   /M: SY='V'; M=-32,-249,-255,-27,-5,-259,-4,63,-61,22,-27,-251,-253,-71,-28,-244,-32,67,21,-232;
MA   /M: SY='I'; M=-69,-71,-261,-258,-77,-264,-261,100,-254,-63,-216,-253,-61,-253,-257,-88,-86,59,-254,-49;
MA   /I: I=-26; MD=-65;
MA   /M: SY='A'; M=63,-9,-266,-262,-54,-45,-65,-254,-261,-70,-255,-260,-268,-91,-58,-23,-54,-6,-265,33; D=-26;
MA   /I: I=-26; MD=-65;
MA   /M: SY='A'; M=25,-31,-4,-17,-33,-41,-24,-93,-108,-87,-264,-45,-85,-41,-51,12,14,-59,-5,-72; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='P'; M=-9,24,-241,-76,-24,-80,26,-41,-37,-55,-74,-237,96,-74,-104,41,36,-61,-256,-46;
MA   /I: I=-32; MD=-81;
MA   /M: SY='D'; M=-61,-31,90,-7,-76,-17,-13,-257,-68,-257,-251,58,-94,31,-100,7,13,-99,-269,-247; D=-32;
MA   /I: I=-32; MI=-81; IM=-81; DM=-81;
MA   /M: SY='G'; M=-103,-47,5,-58,-259,96,-13,-263,-79,-260,-250,8,-82,-13,-20,-7,-30,-257,-255,-251;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-64,30,55,-101,-53,-21,-249,20,-36,-25,21,10,-25,41,18,-59,-60,-256,-22;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
MA   /M: SY='V'; M=17,34,-97,-84,-31,-70,-55,34,-242,-2,-16,-41,-19,-48,-18,-37,48,49,-7,-10;
MA   /M: SY='W'; M=4,-36,-252,-103,39,-74,-7,-33,0,-3,3,-246,-254,-239,23,-55,-38,13,102,73;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-86,-246,12,16,-108,-47,56,-44,8,-223,-68,-250,30,6,-21,-61,46,-39,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-47,55,-40,-57,-7,-63,-59,-1,-235,-1,-49,104,-252,-79,-241,-14,-229,13,-261,-38;
MA   /M: SY='P'; M=-28,-36,24,-50,-75,-71,-82,0,1,-38,29,20,66,-43,3,27,32,-15,-258,-244;
MA   /M: SY='T'; M=16,-67,-31,-11,-62,5,1,-3,-73,-39,-236,-13,-55,7,-29,30,75,-19,-36,-71;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-252,-240,-41,-256,97,-245,-257,-241,-256,-67,-229,-13,-28,-24,-22,-6,-43,-252,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-29,-1,-56,-85,-252,44,2,-59,-233,-253,-244,98,-7,-33,-240,-1,36,-65,-263,-64;
MA   /M: SY='P'; M=29,-13,-80,-77,-256,-14,-37,-248,-238,-112,-245,-67,103,-79,-52,53,-46,-55,-257,-252;
MA   /I: I=-32; MD=-81;
MA   /M: SY='W'; M=40,-252,-101,-50,-30,67,-51,-112,-86,-20,-45,-27,9,-55,-33,-11,-98,-76,90,-11; D=-32;
MA   /I: I=-32; MI=-81; IM=-81; DM=-81;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-248,-253,-242,-229,-254,-237,-218,33,55,117,-245,-251,3,-5,-93,-52,-37,-251,-232;
MA   /M: SY='A'; M=88,-243,-242,-236,-252,-6,-242,-246,-229,-247,-240,-234,-244,-232,52,11,18,-235,-254,-246;
MA   /M: SY='T'; M=-131,66,-241,-239,-244,-105,-245,-24,22,-237,-18,-97,-244,-67,8,22,89,32,-262,-243;
MA   /M: SY='G'; M=60,-248,-242,-246,-257,91,-247,-94,-244,-255,-246,-231,-50,-241,-250,-26,-38,-246,-252,-252;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-241,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-75,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-56,-239,-233,-62,-102,-235,-235,-233,-28,88,-229,-243,68,-236,74,59,-234,-256,-237;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='D'; M=-245,-258,130,-208,-265,-242,-230,-263,-232,-262,-261,-212,-244,-231,-241,-233,-234,-260,-281,-248;
MA   /M: SY='V'; M=-46,-244,-255,-251,-231,-258,-258,35,-249,-5,-220,-249,-252,-251,-252,-238,46,93,-261,-238;
MA   /M: SY='L'; M=-244,-246,-262,-254,-218,-263,-245,-209,-255,102,-48,-261,-261,-248,-252,-255,-240,-217,-248,-230;
MA   /M: SY='T'; M=67,-27,-238,-237,-249,-68,-243,-242,-236,-245,-240,-229,-241,-234,-83,65,77,-68,-259,-245;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='I'; M=-12,6,-256,-252,0,-96,-249,71,-249,28,70,-248,-252,-78,-251,-17,8,20,-250,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-5,4,-259,-255,-228,-260,-257,92,-253,30,-215,-252,-253,-250,-255,-244,-8,35,-253,-236;
MA   /M: SY='A'; M=77,5,-243,-242,-252,61,-247,-93,-242,-56,-241,-70,-74,-239,-247,-7,22,-67,-254,-249;
MA   /M: SY='A'; M=63,-40,-241,-242,-252,62,-246,-244,-241,-96,-242,-231,-244,-238,-247,47,24,-9,-255,-248;
MA   /I: I=-27; MI=0; MD=-68; IM=0; DM=-68;
MA   /M: SY='F'; M=-246,-248,-261,-255,81,-53,-32,-36,-252,73,43,-255,-260,-250,-65,-251,-242,-109,17,-17;
MA   /M: SY='L'; M=4,12,-258,-251,-15,-40,-60,18,-87,74,26,-253,-256,-246,-42,-87,-237,16,-12,-75;
MA   /M: SY='A'; M=89,24,-243,-240,-251,21,-25,-59,-240,-78,-5,-47,-69,-237,-245,29,-70,-116,-255,-247;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,-63,-239,-222,-248,-70,-29,-247,-7,-46,-54,-88,-247,113,47,-54,-70,-45,92,-30;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-64,-28,-245,24,86,44,-110,-13,-253,-247,18,-248,-55,-52,-72,-13,-69,-253,-241; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='M'; M=-25,-57,5,-6,-43,-27,-236,-68,-61,49,74,-15,-65,-9,-36,-93,-58,-17,4,58; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-68,77,43,-258,-37,-234,-255,-50,-256,-250,21,49,-69,-73,45,-6,-251,-264,-249;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-74; IM=0; DM=-74;
MA   /M: SY='P'; M=35,-252,-28,-69,-55,-41,-244,-38,-30,-20,-238,-31,93,-6,-63,13,15,-23,-256,-247;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='F'; M=-32,-251,-48,12,69,-35,18,-49,-50,35,4,-53,-13,12,-57,-53,-11,-30,44,22;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='D'; M=2,-253,59,59,-252,-79,7,-5,-34,-58,-241,1,-26,34,5,3,-9,-48,-44,-49;
MA   /M: SY='A'; M=93,-12,-90,-237,-251,-9,-245,-243,-54,-246,-240,-235,-244,-235,-87,36,-8,-49,-254,-56;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='A'; M=87,25,-65,-242,-77,-236,-249,-20,-243,-5,-230,-242,-247,-241,-247,-32,1,34,-255,-244;
MA   /M: SY='C'; M=51,85,-246,-49,-53,-49,-77,2,-12,17,-12,-91,-99,-40,-10,15,-2,-19,-256,-242;
MA   /M: SY='A'; M=56,31,-55,-97,-48,-66,-245,-17,-62,46,3,-23,-78,-37,-246,-41,-26,14,43,-7;
MA   /M: SY='A'; M=76,-49,-243,-244,-253,76,-246,-251,-242,-251,-244,-233,-245,-239,-248,10,-234,-66,-251,-25;
MA   /M: SY='V'; M=60,60,-250,-245,-241,-100,-253,-93,-245,-72,-230,-243,-250,-245,-249,0,23,76,-261,-244;
MA   /M: SY='W'; M=-52,-6,-251,-249,64,-98,21,-49,-83,-15,-57,-26,-256,-43,-106,2,-49,-52,101,98;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-64,-258,-252,-29,-257,-250,50,-251,66,29,-253,-255,-62,-101,-57,-21,27,29,-85;
MA   /M: SY='H'; M=-60,-45,-232,-234,-29,-38,143,-246,-237,-102,-51,26,-248,-67,-234,-85,-14,11,-272,-220;
MA   /M: SY='G'; M=29,-49,-240,-243,-254,82,-243,-85,-12,-89,-245,-69,-245,-80,-8,43,-17,-80,-253,-63;
MA   /M: SY='R'; M=30,-50,-31,0,-25,-96,-42,-72,-11,37,10,-49,-249,11,56,-55,-4,-46,-34,20;
MA   /M: SY='A'; M=93,24,-246,-240,-246,-233,-248,17,-241,-76,-234,-58,-245,-239,-246,-13,16,-35,10,-245;
MA   /M: SY='G'; M=71,-15,-242,-244,-255,79,-246,-252,-85,-105,-244,-22,-245,-240,-248,-22,-32,-91,-253,-251;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-64,87,48,-262,-248,-236,-38,-67,-258,-253,-41,-247,-23,44,-10,-68,-254,-268,-72; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='L'; M=5,-30,-42,4,-240,-79,-70,16,1,42,15,-10,-255,8,28,-77,-44,-21,-42,-48; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=61,35,-259,-252,-240,-87,-253,-31,-251,47,-230,-254,-259,-65,-38,-22,-241,-14,21,-21; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=54,-262,-260,-47,-85,-37,-257,-255,-36,-32,-30,-255,-264,-52,-41,19,-38,-36,-33,24; D=-16;
MA   /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
MA   /M: SY='F'; M=-31,-274,-33,20,42,-59,-65,-267,15,-90,-261,-44,-55,12,-12,-32,-27,-266,-264,-12; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='E'; M=27,-251,-24,44,-57,-16,-20,-51,34,-51,-240,-19,-82,32,44,16,-29,-82,-252,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-253,-30,34,-7,-24,30,-27,49,-15,-32,-51,-84,36,38,-10,-33,-12,-4,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-23,-7,-22,57,38,-111,31,-37,-52,-25,-44,2,-39,12,-13,-35,-251,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-254,-31,37,-78,58,23,-93,-24,-44,4,-13,26,36,-18,-45,-11,-41,-18,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=8,-254,-29,-7,-97,-3,-34,-5,-51,-21,-37,-39,1,-28,70,-62,-33,-30,-5,71;
MA   /M: SY='G'; M=4,-28,-62,-243,-28,75,16,-87,-242,-76,-243,-88,19,-60,-248,49,-26,2,-254,-69;
MA   /M: SY='M'; M=-40,-64,-255,-251,22,-255,-243,5,-248,50,83,-27,-253,-245,-248,-42,23,39,-247,7;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-56,-65,-240,-61,-249,-38,29,-45,46,-78,-32,-49,33,-68,14,71,-19,-255,-237;
MA   /M: SY='A'; M=90,-244,-244,-237,-253,-95,-247,-31,-240,-246,-239,-239,67,-238,-246,-21,25,-232,-255,-249;
MA   /M: SY='S'; M=-40,-246,-20,0,-87,-4,-12,-96,-87,-25,-14,-227,-45,-18,15,78,56,-82,-257,-35;
MA   /M: SY='D'; M=-49,-28,108,41,-77,-110,-34,-258,-42,-255,-26,-79,-242,-1,-3,-69,-11,-254,-269,-245;
MA   /M: SY='I'; M=-107,-248,-261,-255,-224,-263,-251,72,-253,62,61,-255,-255,-249,-253,-250,-68,37,-252,-233;
MA   /M: SY='I'; M=42,-24,-251,-247,-15,-135,-55,60,-89,27,-2,-22,13,-243,-102,11,-25,6,-252,-100;
MA   /M: SY='E'; M=13,-59,57,63,-104,-31,-22,-69,7,-80,-60,31,19,21,-17,-32,-44,-248,-260,-246;
MA   /M: SY='H'; M=34,-21,-87,37,-39,-102,64,-80,7,-30,26,10,-49,28,-4,2,-32,-43,-250,28;
MA   /M: SY='I'; M=-45,-248,-261,-255,-102,-262,-253,73,-254,65,15,-256,-256,-250,-254,-249,-82,38,-252,-233;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-27,-89,-96,-78,26,-56,-252,-53,-117,-245,-22,111,-31,24,-48,-52,-252,-254,-33;
MA   /M: SY='E'; M=11,-75,-45,40,-54,-19,9,-98,38,-38,-51,-30,-19,29,36,21,2,-71,-45,-7;
MA   /M: SY='A'; M=61,-27,-249,-18,-20,-245,-249,11,-244,19,-225,-58,-74,-51,-248,-39,-6,56,2,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-44,-249,-257,-66,62,-257,-242,26,-86,43,76,-251,-255,-23,5,-246,-40,1,31,10;
MA   /M: SY='N'; M=14,-250,-15,4,-92,-49,-23,-53,54,-30,-39,55,-245,14,31,9,-38,-49,-40,-4;
MA   /M: SY='E'; M=14,-42,1,41,-251,-29,4,-31,24,-50,-10,2,-12,39,36,13,-12,-75,-32,-80;
MA   /M: SY='L'; M=-23,-7,-77,-7,11,-51,15,25,-64,55,14,-70,-2,-30,-33,-39,-65,8,-2,6;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00806;
//
ID   YJEF_C_2_MP; MATRIX.
AC   MP01050;
DT   01-MAY-2008 CREATED; 01-MAY-2008 DATA UPDATE; 01-MAY-2008 INFO UPDATE.
DE   YjeF C-terminal domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=277;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=272;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4971883; R2=0.0077495; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=969; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=517; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-92; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='T'; M=7,-64,9,18,-36,-7,-72,8,-31,19,17,-50,-28,-38,-19,-10,46,-5,-9,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-253,-3,45,-21,-11,-69,-10,2,10,-46,-1,32,16,4,-43,-4,-63,9,9;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='D'; M=17,-21,44,40,-65,-56,-41,-54,-8,-37,-241,-9,19,1,-50,26,12,-9,20,-51; D=-30;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='D'; M=20,-250,22,12,-32,3,-31,7,-38,19,10,9,-63,-4,-4,3,-7,-29,-61,-80; D=-30;
MA   /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='W'; M=18,4,28,-44,2,-70,1,14,-51,16,-14,-65,1,-25,-51,-10,-36,39,51,-25;
MA   /M: SY='R'; M=20,-37,-19,-56,-82,-36,-23,-47,20,12,-38,-18,3,-6,56,25,3,-12,-255,-241;
MA   /M: SY='A'; M=30,-249,-65,-12,-30,-43,-24,-35,26,-9,-234,17,-4,10,16,12,1,9,9,18;
MA   /M: SY='W'; M=-33,3,-15,-95,-13,-251,1,3,-2,41,0,-17,15,-83,3,-6,-3,20,62,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-57,-252,-47,-105,-10,-112,-249,53,-37,54,-21,-252,30,-51,-30,-104,-53,9,78,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-260,-243,-94,-98,-90,-242,-77,22,2,-55,-87,110,-12,12,-35,-100,-73,-39,-26;
MA   /M: SY='P'; M=11,-253,-99,-14,-246,-245,19,-22,43,1,-31,-28,68,-6,25,-3,-50,-8,-33,-43;
MA   /M: SY='R'; M=-57,-257,-245,-234,-244,-115,-237,-32,-34,26,-232,-241,63,-228,98,-104,-36,-46,-253,-86;
MA   /M: SY='P'; M=10,-252,33,-15,-59,-25,-8,-246,22,-40,-67,-17,55,-4,26,23,14,-42,-255,-15;
MA   /M: SY='P'; M=29,-48,4,8,-44,-56,-40,-99,21,-19,-239,-44,77,-32,27,-9,-47,-45,-11,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-8,-50,70,15,-41,1,-21,-91,-9,-71,-54,49,-86,-25,-11,14,14,-75,-2,-13;
MA   /M: SY='S'; M=48,-244,5,-39,-17,-7,-240,-243,-44,-31,-20,-54,-243,-232,-11,69,39,-71,-27,-241;
MA   /M: SY='H'; M=-119,-256,12,-104,-239,-96,142,-256,-32,-245,-23,11,-247,-226,-66,-25,-50,-90,-262,40;
MA   /M: SY='K'; M=-240,-254,-232,-218,-256,-247,-235,-256,121,-255,-243,-225,-240,-217,-201,-234,-234,-252,-249,-243;
MA   /M: SY='G'; M=-88,-254,-241,-46,-67,96,6,-257,-90,-252,-244,-70,-248,-241,-248,-58,-52,-254,-237,77;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-34,51,2,-253,-66,-64,-100,-26,-247,29,25,-242,65,-15,52,43,-79,-51,-242;
MA   /M: SY='Y'; M=15,18,-86,-67,44,-48,47,-244,-228,-240,-236,23,-252,-3,61,0,-74,-82,-235,79;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /I: I=-32; MI=0; MD=-81; IM=0; DM=-81;
MA   /M: SY='R'; M=-76,-254,-98,-65,-91,-249,84,-247,48,-94,-61,-61,-247,-44,85,-26,11,-1,-256,-19;
MA   /M: SY='V'; M=10,-30,-257,-252,-230,-60,-256,44,-251,33,-218,-252,-254,-250,-253,-99,-16,81,-257,-238;
MA   /M: SY='L'; M=34,19,-254,-250,-37,30,-247,-24,-249,72,-40,-247,-254,-245,-81,-51,-59,-31,-44,-86;
MA   /M: SY='V'; M=-124,-74,-260,-256,-45,-103,-259,73,-253,20,-215,-103,-255,-252,-255,-78,-69,81,-256,-235;
MA   /M: SY='I'; M=-33,-25,-81,-256,-11,-262,-259,86,-253,9,-216,-253,-254,-252,-92,-247,-106,66,-33,-233;
MA   /M: SY='G'; M=57,-6,-242,-247,-256,91,-247,-255,-244,-255,-246,-231,-245,-241,-250,-19,-44,-66,-253,-252;
MA   /M: SY='G'; M=-88,-254,-242,-253,-260,111,-248,-266,-247,-263,-252,-228,-245,-244,-254,-226,-245,-99,-251,-255;
MA   /M: SY='S'; M=-3,56,-24,-48,-74,-4,-29,-252,-235,-253,-247,28,-97,-66,-80,97,-44,-245,-19,-88;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='R'; M=17,-255,2,28,-37,-55,29,-62,5,-32,-26,-55,29,18,37,-14,-20,-32,-251,27; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='G'; M=-67,-257,26,29,-86,52,-11,-45,-14,-55,-245,0,-30,25,23,-29,-7,-31,-33,-45; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='Y'; M=-243,-253,-249,-246,35,-253,-224,-227,16,-51,93,-83,-254,-83,-236,-36,-32,-53,-220,115;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-72,-240,-239,-246,22,-22,-23,-237,-33,-19,-55,64,-40,-20,19,74,-34,-256,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='A'; M=107,-239,-244,-237,-253,-71,-246,-243,-239,-245,-239,-238,-243,-236,-244,-4,-228,-230,-253,-248;
MA   /M: SY='P'; M=67,-250,-247,-239,-250,-13,-249,11,-242,-72,-236,-244,89,-242,-249,-31,-92,16,-255,-249;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-6,-252,-69,12,-254,-19,46,-92,16,7,-247,-254,-34,19,-49,-43,29,-238,71;
MA   /M: SY='L'; M=-245,-247,-262,-254,55,-261,-242,-30,-253,83,74,-257,-259,-248,-250,-253,-240,-219,-240,-17;
MA   /M: SY='A'; M=86,24,-241,-238,-251,-64,-244,-97,-239,-245,-240,-233,-243,-235,-244,62,22,-51,-257,-247;
MA   /M: SY='A'; M=81,-7,-243,-240,-249,29,-246,-60,-241,-44,-76,-234,-244,-237,-246,42,8,-22,-255,-247;
MA   /M: SY='E'; M=-14,-63,-238,38,-63,-46,7,19,14,36,35,-11,-247,-3,26,-6,-24,-43,-252,-49;
MA   /M: SY='A'; M=87,-46,-242,-240,-254,49,-245,-248,-240,-249,-243,-233,-243,-236,-246,37,-34,-237,-254,-249;
MA   /M: SY='A'; M=101,49,-245,-239,-89,-82,-247,-243,-240,-244,-239,-238,-245,-237,-245,-6,-18,-85,-254,-74;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-247,-255,-64,-38,-78,-244,-20,-97,73,35,-251,-255,-3,-26,-34,-236,35,-248,-3;
MA   /M: SY='R'; M=3,-255,-238,-65,-48,-80,16,-59,36,-48,-238,-11,-249,-222,98,-29,-47,-245,-247,29;
MA   /M: SY='S'; M=57,-5,-244,-241,1,-35,-244,-15,-241,-32,23,-234,-245,-237,-245,63,38,10,-254,-239;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-253,-242,-253,-259,110,-248,-265,-247,-262,-251,-228,-92,-244,-254,-226,-43,-72,-251,-255;
MA   /M: SY='A'; M=85,58,-58,-240,-249,-27,-247,-49,-241,-82,-238,-237,-74,-238,-246,38,-14,4,-257,-247;
MA   /M: SY='G'; M=-112,-255,72,-68,-260,96,-242,-265,-242,-85,-253,-223,-245,-240,-250,-66,-241,-259,-257,-252;
MA   /I: I=-28; MD=-71;
MA   /M: SY='L'; M=-61,-49,-257,-248,-39,-112,-241,-43,5,80,63,-252,-257,-63,-34,-44,-239,-53,3,20; D=-28;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='V'; M=-6,16,-255,-250,-234,-86,-256,-27,-249,-2,-55,-249,-77,-249,-251,3,5,94,-262,-240;
MA   /M: SY='T'; M=-32,-248,-237,-61,10,-119,74,-64,2,-241,-31,-229,-244,9,39,16,76,-82,-248,41;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-19,-258,-253,-50,-96,-251,43,-251,46,15,-253,-255,-249,-252,-244,-32,70,-251,14;
MA   /M: SY='A'; M=72,-23,-252,-247,53,-30,-23,31,-246,5,-227,-245,-251,-244,-249,-34,-234,-8,-45,6;
MA   /M: SY='C'; M=2,87,-89,-245,-242,9,-249,-11,-243,-41,-234,-235,-84,-103,-249,30,67,38,-33,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-69,11,27,-255,-40,44,-101,-232,-95,-243,-235,96,6,0,6,8,-37,-18,-246;
MA   /M: SY='E'; M=31,-252,6,43,-30,-38,-9,-71,35,-76,-22,2,41,2,8,1,-41,-45,-24,-67;
MA   /M: SY='S'; M=7,7,36,46,-92,-31,-6,-58,-18,-54,-243,13,-9,-28,3,55,-16,-33,-260,-244;
MA   /M: SY='A'; M=53,-5,-77,-27,-53,-43,7,15,-240,8,-34,48,-54,-35,-71,-27,-22,31,-255,-24;
MA   /M: SY='A'; M=57,-11,-48,-34,-18,-63,33,5,-25,-10,-26,-14,-24,25,12,4,-56,-12,-251,-2;
MA   /M: SY='P'; M=27,-23,-6,-16,-98,-12,-54,-36,-8,-31,-5,22,62,7,-14,17,-9,-11,-31,-20;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=33,-20,-57,-9,-16,-105,-249,37,-98,-14,-56,-89,38,-2,-71,21,-45,36,-256,-63; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=3,-252,-32,-254,-13,-259,-60,58,-253,45,18,-3,-76,-251,-101,-248,-90,29,-254,-24; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=30,-260,-69,-17,-254,-48,44,-74,50,-6,-71,-11,-89,21,-15,-38,-106,-69,53,-245; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=26,-40,-89,-254,-69,-23,-43,-261,-254,-264,-35,-13,-108,-43,-123,65,17,-41,-276,-261; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-269,-271,-99,-247,-40,-25,34,-263,7,70,-264,-52,-2,-92,-259,-29,-46,-264,20; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-15,-7,-61,-38,-56,-65,-72,19,-65,-19,9,-48,-104,-253,-20,7,24,35,-268,-29; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-29,-263,-113,-56,-245,-264,54,11,-253,5,-236,-256,52,-40,-40,-113,-23,43,3,-5; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-268,-3,16,-260,-104,-7,-26,-244,-65,-1,-250,95,-47,-14,-47,-53,-87,-264,-16; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-53,-94,54,-24,-45,-23,4,-82,27,-40,-54,-5,-76,12,-23,-71,-3,-252,23; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=15,18,-104,-28,-16,-77,-32,7,-93,57,38,-251,-4,-32,-106,-32,-67,15,-44,-237; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-34,-17,2,-5,-93,-9,-80,-8,-107,-16,61,-68,72,-71,-38,-18,-15,20,-11,-14; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-39,-44,-15,74,0,-38,42,-88,-39,-39,-36,-79,-32,-14,-22,-16,18,-4,-44,17; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=35,-252,2,11,-248,-46,-3,-23,10,-21,-46,-12,31,-14,24,-4,10,-22,-14,-33; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-44,-251,15,-25,-74,35,-240,-71,-25,-11,75,-10,-5,-237,-32,22,22,-8,-44,0; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-30,-266,-14,-6,37,-33,-28,-25,-41,-26,-22,-55,-37,-19,-103,2,-22,-9,4,27; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-256,58,49,-18,-6,-26,16,-70,-2,-239,-24,-38,-58,21,-15,-82,-59,-18,-70; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=36,-249,50,7,-71,31,21,-32,-235,-77,-39,-15,-26,-35,-26,29,2,-34,-27,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-14,-54,-50,-6,-36,-242,26,-65,38,17,-10,4,-4,-19,-7,-55,20,26,36;
MA   /M: SY='Q'; M=15,-58,24,35,-12,-17,0,-15,23,-78,-240,-4,22,45,-8,-7,15,-93,-36,-241;
MA   /M: SY='E'; M=-22,-58,61,73,-95,-105,22,-113,-8,-76,-246,13,26,-5,-21,4,-27,-251,-21,-80;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='A'; M=42,-45,-5,-105,19,-118,-11,19,-29,16,-22,-14,-92,-23,-42,-65,-3,26,28,-82; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-47,47,22,-54,-40,-246,-21,-31,15,-38,-70,1,-11,-29,-8,-12,20,-263,-247; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='E'; M=6,-262,12,35,-258,-115,-247,-44,26,-28,8,-18,-94,-5,0,10,-46,-41,-26,-39; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-72,-264,-66,-18,1,-262,7,-74,26,-48,-258,-38,-37,-81,-10,5,-6,-25,-40; D=-18;
MA   /I: I=-18; MD=-45;
MA   /M: SY='E'; M=1,-22,-40,13,-16,-270,-59,3,-35,9,-44,-22,-18,-256,-20,-257,-19,-23,-272,-49; D=-18;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-271,-11,38,-271,-39,-27,-89,-12,-88,-261,-37,19,26,-61,-1,-22,-59,-42,-49; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-262,-17,-9,-24,-67,-252,-41,-16,43,6,-75,-262,19,-15,-79,-38,-33,54,-33; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='L'; M=19,-22,12,-43,-1,-60,-251,27,-98,47,16,-103,-7,-248,-54,-26,-108,-5,-257,-240; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-45;
MA   /M: SY='E'; M=-21,-253,32,56,-14,10,0,-76,18,-51,-69,3,-32,26,12,23,-39,-92,-19,-84;
MA   /M: SY='R'; M=1,-255,-27,-47,-67,-27,-12,-59,45,-251,-242,0,-29,1,92,-30,-33,-249,32,-239;
MA   /M: SY='V'; M=38,29,-77,-245,21,-246,-37,14,-37,13,0,-42,-5,-74,-42,11,-51,39,-247,26;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-78,93,-42,-257,-124,66,-256,-29,-254,-247,29,-243,43,-71,20,27,-252,-269,-240;
MA   /M: SY='A'; M=76,19,-247,-242,-244,-100,-249,-74,-243,-111,-61,-61,-247,-240,-247,33,-12,63,-259,-244;
MA   /M: SY='W'; M=-22,23,-260,-111,-24,-259,-256,61,-252,41,-18,-255,-255,-250,-91,-246,-55,59,71,-83;
MA   /M: SY='V'; M=50,2,-255,-249,-82,-41,-254,-6,-249,26,-59,-250,-253,-248,-251,-118,-89,80,-257,-239;
MA   /M: SY='I'; M=-41,34,-261,-257,-13,-262,-257,89,-254,12,-6,-254,-254,-252,-256,-247,-234,53,-252,-36;
MA   /M: SY='G'; M=-122,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='P'; M=-241,-5,-244,-234,-258,-244,-245,-245,-240,-252,44,-40,127,-76,-250,1,-234,-59,-257,-255;
MA   /M: SY='G'; M=-60,-254,-242,-253,-260,111,-248,-267,-247,-263,-252,-228,-245,-244,-254,-226,-245,-260,-251,-255;
MA   /M: SY='L'; M=-46,-247,-261,-253,-11,-102,-245,12,-251,86,52,-257,-258,-246,-46,-251,-239,-31,20,-51;
MA   /M: SY='G'; M=-48,-252,-1,-55,-259,102,-246,-262,-93,-260,-251,-227,-69,-241,-109,-15,-16,-71,-253,-253;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-74; IM=0; DM=-74;
MA   /M: SY='R'; M=-25,-46,-9,-28,-59,-52,-16,-50,-31,4,-26,-22,-9,40,75,-68,40,-4,-255,-239;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-71,78,40,-102,27,-18,-119,-28,-33,-247,16,-87,-59,-69,31,7,-249,-262,-74;
MA   /M: SY='E'; M=23,-254,36,58,-31,-22,-21,-50,-44,-55,-243,14,57,0,1,-34,-22,-117,-257,-246;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='W'; M=18,-253,4,54,12,-7,15,-35,-25,-30,-57,-37,-28,6,-32,-3,-3,-49,73,-5; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='T'; M=49,-245,-32,-84,-93,12,-247,-25,-60,-26,27,-235,-76,-44,-116,12,66,1,-24,-244; D=-25;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-16,-39,-5,-26,-46,-39,-37,11,26,-2,-76,-67,46,38,-67,-41,-18,43,-60; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='E'; M=19,-252,36,48,-87,-44,-56,-45,30,-51,-79,-35,-83,34,38,11,-5,-109,-255,-36;
MA   /M: SY='L'; M=29,21,-79,-12,28,-251,-245,37,-60,44,10,-51,-252,-52,-26,-39,-2,-7,-10,-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-246,-257,-251,15,-110,-251,28,-250,57,-27,-72,-255,-61,-90,-47,-32,59,5,-78;
MA   /M: SY='E'; M=14,-60,-14,39,-87,-45,-5,-29,37,-3,-35,2,-93,18,35,9,-23,-28,-5,-67;
MA   /M: SY='E'; M=6,-251,-42,46,-11,-17,-6,-31,23,-7,23,-9,-91,34,27,3,-36,-43,-46,-15;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='V'; M=30,-22,-84,-251,-22,-254,-252,51,-250,44,-72,-252,-76,-22,-252,-99,-79,53,-22,-24; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='L'; M=-19,-34,-260,-107,15,-261,-80,35,-98,70,29,-256,-258,-65,-48,-109,-49,13,-250,-82; D=-17;
MA   /I: I=-17; MD=-42;
MA   /M: SY='Q'; M=-17,-265,-14,54,-264,-64,-244,-259,2,-29,-251,-10,-17,54,8,-5,-36,-62,-266,-68; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
MA   /M: SY='T'; M=20,-249,19,23,-15,7,11,-59,3,-89,-241,27,-43,22,6,18,35,-46,-44,-241;
MA   /M: SY='S'; M=38,19,-92,-19,21,-24,-15,-30,-33,-24,21,0,-24,-32,-32,44,0,4,6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-63,42,40,-256,20,10,-252,32,-80,-244,24,10,17,14,-13,-1,-48,-259,-245;
MA   /M: SY='K'; M=-8,17,-79,-49,-244,15,-242,5,52,6,-24,-44,-3,34,9,-36,-22,24,-254,-242;
MA   /I: I=-22; MD=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-68,-43,-243,-88,-256,-47,-10,-56,-6,-18,-26,5,111,10,-36,-61,-27,-56,-258,-252; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
MA   /M: SY='L'; M=-16,28,-257,-250,-19,-257,-249,29,-29,58,43,-250,-254,-98,-103,-56,-2,48,-44,-233;
MA   /M: SY='V'; M=-233,-246,-261,-255,-229,-262,-261,52,-253,0,-217,-255,-255,-253,-254,-96,-230,99,-260,-237;
MA   /M: SY='L'; M=-62,-63,-262,-256,-23,-263,-253,68,-254,68,-31,-257,-257,-250,-254,-250,-236,40,-20,-231;
MA   /M: SY='D'; M=-245,-258,130,-208,-265,-242,-230,-263,-232,-262,-261,-212,-244,-231,-241,-233,-234,-260,-281,-248;
MA   /M: SY='A'; M=105,-240,-245,-239,-254,19,-247,-245,-241,-246,-240,-238,-244,-237,-245,-219,-231,-232,-253,-249;
MA   /M: SY='D'; M=-97,-256,122,-212,-78,-1,-232,-261,-233,-106,-257,-214,-244,-82,-241,-1,-72,-257,-274,-247;
MA   /M: SY='A'; M=86,-244,-244,-243,-254,70,-248,-43,-243,-134,-241,-235,-245,-240,-248,-222,-235,-51,-252,-250;
MA   /I: I=-22; MD=-57;
MA   /M: SY='L'; M=-245,-249,-263,-256,-8,-265,-250,53,-256,88,-208,-260,-260,-250,-255,-254,-240,-100,-248,-230; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
MA   /M: SY='N'; M=-28,-248,-13,-94,25,-98,-19,-71,9,-67,-25,85,-67,-35,-35,0,53,-243,49,-22; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-57;
MA   /M: SY='L'; M=25,-8,-253,-80,-13,-28,4,37,-245,53,3,-38,-48,-244,-2,-22,-237,6,-14,-235; D=-22;
MA   /I: I=-22; DM=-57;
MA   /M: SY='L'; M=-107,-59,-261,-255,28,-263,-249,53,-254,75,-19,-257,-95,-250,-253,-251,-67,12,-42,-13;
MA   /M: SY='A'; M=74,-58,-2,-56,-253,-6,-56,-245,-24,-248,-36,-26,7,-8,-38,51,-38,-33,-256,-247;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-28,45,42,-254,10,-74,-51,40,-87,-67,12,-14,16,21,-10,5,-118,-257,-41;
MA   /M: SY='H'; M=4,-15,21,23,-86,-13,48,-63,-1,-42,-239,45,-97,24,26,11,-7,-35,-256,-1;
MA   /I: I=-10; MD=-26;
MA   /M: SY='P'; M=1,-266,-252,-62,-262,-1,-57,-35,0,-15,2,3,70,-13,-26,-23,-21,-97,-267,-259; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='D'; M=-40,-269,74,8,-272,-12,-249,-89,-33,-45,-55,5,-27,16,-252,-10,-86,-115,-61,-262; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='W'; M=-116,-20,-65,-1,-24,-38,5,-11,-18,44,-233,-257,-263,16,-42,-76,-250,13,69,-37; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='L'; M=14,-251,-83,-33,-62,-255,-249,11,-57,51,-226,-1,-31,-38,-6,-54,27,11,-22,-242; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='L'; M=-110,-262,-265,-87,8,-47,-29,6,-257,53,-24,-31,-75,-37,-20,-258,-251,-23,1,53; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='P'; M=10,-46,-9,-60,-264,-62,-19,-102,28,-89,-251,13,84,-22,32,-62,-68,-257,-264,-256; D=-10;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-70,-8,-8,-276,6,-22,-275,27,-273,-264,-20,-84,20,9,-28,2,-268,-277,-265; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='G'; M=31,-13,5,9,-114,34,-13,-75,14,-117,-254,-36,-4,-10,7,-51,-49,-90,-266,-257; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-255,-41,8,-255,-31,28,-252,-13,-84,-60,63,68,17,43,-41,12,-105,-260,-73; D=-10;
MA   /I: I=-10; DM=-26;
MA   /M: SY='C'; M=26,59,-17,-244,-9,-103,-36,17,-70,9,-23,-240,-249,-244,-38,-35,58,32,48,-69;
MA   /M: SY='I'; M=-237,-249,-262,-257,-72,-263,-261,80,-253,-3,-217,-255,-254,-253,-255,-247,-61,79,59,-62;
MA   /M: SY='L'; M=-56,-65,-261,-255,14,-262,-248,44,-254,80,18,-257,-258,-249,-253,-251,-238,1,-44,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-229,-238,-234,-238,-245,-245,-245,-236,-234,-240,-237,-224,-236,-239,-243,-213,128,-228,-265,-243;
MA   /M: SY='P'; M=-244,-269,-244,-232,-263,-245,-247,-251,-240,-261,-248,-250,136,-244,-253,-241,-236,-256,-256,-261;
MA   /M: SY='H'; M=-245,-255,-226,-231,-247,-243,150,-261,-233,-248,-234,67,-248,-225,-230,-233,-240,-261,-279,-219;
MA   /M: SY='P'; M=38,-253,-45,-6,-55,-114,1,-18,-7,-14,-60,-71,87,32,-47,-73,-44,1,-253,-33;
MA   /M: SY='G'; M=-17,-251,-240,-91,-252,89,-242,-87,13,-142,64,24,-246,-89,-36,-84,-82,-25,-253,-247;
MA   /M: SY='E'; M=-237,-258,-208,123,-261,-253,-231,-262,-218,-254,-250,-234,-232,-211,-228,-234,-238,-254,-257,-251;
MA   /M: SY='F'; M=31,-248,-259,-251,93,-251,-244,-86,-83,24,76,-251,-255,-48,-248,-243,-82,-83,73,-31;
MA   /M: SY='A'; M=63,-18,-63,15,-91,-17,-238,-103,37,-102,-49,-68,-243,36,21,28,-46,-241,20,-243;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-257,-240,-89,-101,-102,-18,-27,5,-73,-67,-233,-250,-80,114,-41,-40,-246,-252,-69;
MA   /M: SY='L'; M=-243,-59,-261,-102,-4,-262,-246,-5,-254,92,27,-258,-259,-248,-252,-252,-77,-16,-248,-229;
MA   /M: SY='L'; M=1,38,-252,-97,56,-79,-244,-43,-37,57,-15,-245,-253,-245,-58,7,32,-30,-243,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-71,-76,29,-17,-258,79,-34,-95,14,-123,-248,-5,32,4,-11,-24,-41,-255,-18,-249;
MA   /I: I=-7; MD=-17;
MA   /M: SY='C'; M=24,32,-23,6,-243,-41,8,27,5,0,26,-35,-250,-18,-24,-18,15,-22,-39,-20; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-48,-6,59,38,-255,-11,-237,-75,0,-117,-24,4,16,-71,-36,56,14,-248,-1,-247; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-52,-50,-247,-91,-109,-252,47,-65,12,-30,-83,13,-246,-25,-53,49,58,-258,-240; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=31,-251,29,24,-86,16,-238,-251,-6,-253,-246,14,46,8,-15,40,-71,-37,-258,-248; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=11,-253,44,75,-82,-35,-37,-252,-1,-59,-245,-22,-31,24,-39,0,-3,-74,-257,-16; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-109,-257,25,-39,-81,-118,-26,54,-53,-28,-231,-70,-33,41,-33,-23,-93,53,-42,-25; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-262,-16,40,-86,-61,-55,-20,-27,-27,-79,-3,-28,64,-94,-70,17,-22,-267,-253; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=38,-34,-40,2,-263,-48,-20,-93,22,-84,-47,-12,-53,4,-1,-16,-62,-15,-268,-19; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-30,-263,85,16,-265,-49,-20,-87,-6,-118,-259,39,-253,-21,-108,-8,-68,-262,-274,-18; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-28,-264,-86,-238,-260,-73,-56,-32,12,-87,-247,20,37,-45,91,-61,-85,-65,-262,-250; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-256,-59,-29,29,-32,-249,36,-38,23,-19,-33,9,-75,-32,-58,-60,14,-249,21; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=22,-256,37,47,-260,11,-44,-47,13,-79,-69,-72,-246,27,-7,7,3,-249,-262,-250; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=66,-42,-250,-93,-87,-244,-19,18,17,-12,-59,-244,-251,-31,-13,-1,-57,-6,0,5; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=82,8,-251,-99,-86,-101,-252,-14,-246,-27,0,-30,-251,-244,-250,-54,-17,35,-259,-247; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-47,-256,-240,14,-248,-252,6,-41,21,8,-33,-40,-70,52,65,4,-26,-6,-18,-241; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=30,-45,1,62,-256,-245,-235,-253,-1,-57,-75,-10,-244,44,51,8,-69,-87,-257,-80; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=53,-24,-254,-249,48,-248,-247,-10,-35,39,-228,-248,-255,-246,-91,1,-7,-31,-11,9; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=83,-244,-244,-104,-252,-86,-33,-46,-23,-105,-67,-95,-246,22,-32,33,-23,4,-257,-246; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=29,-15,-3,39,-74,-60,-36,-37,43,-39,14,-23,-79,23,35,2,-43,-24,-254,-79;
MA   /M: SY='R'; M=-27,-20,-32,32,-87,-61,-14,-22,42,22,-34,-38,-45,43,47,-28,-18,-99,-42,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-36,12,-102,-49,12,-16,22,-7,-19,23,-16,13,-16,-238,-36,13,16,-112,50,70;
MA   /M: SY='G'; M=-59,-253,14,-50,-256,76,14,-80,12,-123,-247,54,-246,18,14,-12,-113,-255,-256,-80;
MA   /M: SY='C'; M=54,84,-40,-245,-243,5,-46,0,-124,-19,-67,-240,-12,-107,-249,7,-14,40,-259,-245;
MA   /M: SY='T'; M=-45,28,-98,-72,-33,-97,-48,49,-51,-103,-54,-239,-247,-92,-247,-61,81,48,11,26;
MA   /M: SY='V'; M=-73,15,-260,-255,-62,-261,-257,64,-253,27,-217,-254,-255,-252,-254,-246,-29,78,21,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-51,-245,-261,-254,-37,-261,-255,24,-253,59,-60,-257,-257,-251,-253,-247,-233,83,-255,-234;
MA   /M: SY='L'; M=-32,-41,-254,-22,-42,-98,-243,-27,-246,87,-32,-252,-257,21,-24,-47,-238,-30,-248,-50;
MA   /M: SY='K'; M=-240,-254,-232,-219,-62,-96,-235,-256,120,-255,-243,-225,-74,-54,-202,-234,-235,-252,-249,-242;
MA   /M: SY='G'; M=-64,-52,-37,-248,-259,105,-16,-266,-62,-262,-251,-227,-245,-69,-250,2,-242,-259,-252,-252;
MA   /M: SY='A'; M=67,-248,-24,-67,-43,-37,32,-247,-12,-248,-62,10,50,11,4,13,-79,-75,9,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-46,-14,27,-10,-54,28,54,-33,-30,-246,-240,33,4,-17,34,-29,24,7,-42,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-231,-244,71,-90,-250,-241,-239,-243,-234,-247,-243,-221,-78,-67,-241,42,101,-56,-267,-244;
MA   /M: SY='V'; M=-32,-249,-255,-27,-5,-259,-4,63,-61,22,-27,-251,-253,-71,-28,-244,-32,67,21,-232;
MA   /M: SY='I'; M=-69,-71,-261,-258,-77,-264,-261,100,-254,-63,-216,-253,-61,-253,-257,-88,-86,59,-254,-49;
MA   /I: I=-26; MD=-65;
MA   /M: SY='A'; M=63,-9,-266,-262,-54,-45,-65,-254,-261,-70,-255,-260,-268,-91,-58,-23,-54,-6,-265,33; D=-26;
MA   /I: I=-26; MD=-65;
MA   /M: SY='A'; M=25,-31,-4,-17,-33,-41,-24,-93,-108,-87,-264,-45,-85,-41,-51,12,14,-59,-5,-72; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
MA   /M: SY='P'; M=-9,24,-241,-76,-24,-80,26,-41,-37,-55,-74,-237,96,-74,-104,41,36,-61,-256,-46;
MA   /I: I=-32; MD=-81;
MA   /M: SY='D'; M=-61,-31,90,-7,-76,-17,-13,-257,-68,-257,-251,58,-94,31,-100,7,13,-99,-269,-247; D=-32;
MA   /I: I=-32; MI=-81; IM=-81; DM=-81;
MA   /M: SY='G'; M=-103,-47,5,-58,-259,96,-13,-263,-79,-260,-250,8,-82,-13,-20,-7,-30,-257,-255,-251;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-64,30,55,-101,-53,-21,-249,20,-36,-25,21,10,-25,41,18,-59,-60,-256,-22;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
MA   /M: SY='V'; M=17,34,-97,-84,-31,-70,-55,34,-242,-2,-16,-41,-19,-48,-18,-37,48,49,-7,-10;
MA   /M: SY='W'; M=4,-36,-252,-103,39,-74,-7,-33,0,-3,3,-246,-254,-239,23,-55,-38,13,102,73;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-86,-246,12,16,-108,-47,56,-44,8,-223,-68,-250,30,6,-21,-61,46,-39,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-47,55,-40,-57,-7,-63,-59,-1,-235,-1,-49,104,-252,-79,-241,-14,-229,13,-261,-38;
MA   /M: SY='P'; M=-28,-36,24,-50,-75,-71,-82,0,1,-38,29,20,66,-43,3,27,32,-15,-258,-244;
MA   /M: SY='T'; M=16,-67,-31,-11,-62,5,1,-3,-73,-39,-236,-13,-55,7,-29,30,75,-19,-36,-71;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-252,-240,-41,-256,97,-245,-257,-241,-256,-67,-229,-13,-28,-24,-22,-6,-43,-252,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-29,-1,-56,-85,-252,44,2,-59,-233,-253,-244,98,-7,-33,-240,-1,36,-65,-263,-64;
MA   /M: SY='P'; M=29,-13,-80,-77,-256,-14,-37,-248,-238,-112,-245,-67,103,-79,-52,53,-46,-55,-257,-252;
MA   /I: I=-32; MD=-81;
MA   /M: SY='W'; M=40,-252,-101,-50,-30,67,-51,-112,-86,-20,-45,-27,9,-55,-33,-11,-98,-76,90,-11; D=-32;
MA   /I: I=-32; MI=-81; IM=-81; DM=-81;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-248,-253,-242,-229,-254,-237,-218,33,55,117,-245,-251,3,-5,-93,-52,-37,-251,-232;
MA   /M: SY='A'; M=88,-243,-242,-236,-252,-6,-242,-246,-229,-247,-240,-234,-244,-232,52,11,18,-235,-254,-246;
MA   /M: SY='T'; M=-131,66,-241,-239,-244,-105,-245,-24,22,-237,-18,-97,-244,-67,8,22,89,32,-262,-243;
MA   /M: SY='G'; M=60,-248,-242,-246,-257,91,-247,-94,-244,-255,-246,-231,-50,-241,-250,-26,-38,-246,-252,-252;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-241,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-75,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='M'; M=-64,-56,-239,-233,-62,-102,-235,-235,-233,-28,88,-229,-243,68,-236,74,59,-234,-256,-237;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='D'; M=-245,-258,130,-208,-265,-242,-230,-263,-232,-262,-261,-212,-244,-231,-241,-233,-234,-260,-281,-248;
MA   /M: SY='V'; M=-46,-244,-255,-251,-231,-258,-258,35,-249,-5,-220,-249,-252,-251,-252,-238,46,93,-261,-238;
MA   /M: SY='L'; M=-244,-246,-262,-254,-218,-263,-245,-209,-255,102,-48,-261,-261,-248,-252,-255,-240,-217,-248,-230;
MA   /M: SY='T'; M=67,-27,-238,-237,-249,-68,-243,-242,-236,-245,-240,-229,-241,-234,-83,65,77,-68,-259,-245;
MA   /M: SY='G'; M=-226,-254,-242,-253,-260,112,-248,-268,-247,-263,-252,-227,-245,-244,-254,-226,-245,-261,-251,-255;
MA   /M: SY='I'; M=-12,6,-256,-252,0,-96,-249,71,-249,28,70,-248,-252,-78,-251,-17,8,20,-250,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-5,4,-259,-255,-228,-260,-257,92,-253,30,-215,-252,-253,-250,-255,-244,-8,35,-253,-236;
MA   /M: SY='A'; M=77,5,-243,-242,-252,61,-247,-93,-242,-56,-241,-70,-74,-239,-247,-7,22,-67,-254,-249;
MA   /M: SY='A'; M=63,-40,-241,-242,-252,62,-246,-244,-241,-96,-242,-231,-244,-238,-247,47,24,-9,-255,-248;
MA   /I: I=-27; MI=0; MD=-68; IM=0; DM=-68;
MA   /M: SY='F'; M=-246,-248,-261,-255,81,-53,-32,-36,-252,73,43,-255,-260,-250,-65,-251,-242,-109,17,-17;
MA   /M: SY='L'; M=4,12,-258,-251,-15,-40,-60,18,-87,74,26,-253,-256,-246,-42,-87,-237,16,-12,-75;
MA   /M: SY='A'; M=89,24,-243,-240,-251,21,-25,-59,-240,-78,-5,-47,-69,-237,-245,29,-70,-116,-255,-247;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,-63,-239,-222,-248,-70,-29,-247,-7,-46,-54,-88,-247,113,47,-54,-70,-45,92,-30;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='G'; M=-46,-64,-28,-245,24,86,44,-110,-13,-253,-247,18,-248,-55,-52,-72,-13,-69,-253,-241; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='M'; M=-25,-57,5,-6,-43,-27,-236,-68,-61,49,74,-15,-65,-9,-36,-93,-58,-17,4,58; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-68,77,43,-258,-37,-234,-255,-50,-256,-250,21,49,-69,-73,45,-6,-251,-264,-249;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-74; IM=0; DM=-74;
MA   /M: SY='P'; M=35,-252,-28,-69,-55,-41,-244,-38,-30,-20,-238,-31,93,-6,-63,13,15,-23,-256,-247;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='F'; M=-32,-251,-48,12,69,-35,18,-49,-50,35,4,-53,-13,12,-57,-53,-11,-30,44,22;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='D'; M=2,-253,59,59,-252,-79,7,-5,-34,-58,-241,1,-26,34,5,3,-9,-48,-44,-49;
MA   /M: SY='A'; M=93,-12,-90,-237,-251,-9,-245,-243,-54,-246,-240,-235,-244,-235,-87,36,-8,-49,-254,-56;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='A'; M=87,25,-65,-242,-77,-236,-249,-20,-243,-5,-230,-242,-247,-241,-247,-32,1,34,-255,-244;
MA   /M: SY='C'; M=51,85,-246,-49,-53,-49,-77,2,-12,17,-12,-91,-99,-40,-10,15,-2,-19,-256,-242;
MA   /M: SY='A'; M=56,31,-55,-97,-48,-66,-245,-17,-62,46,3,-23,-78,-37,-246,-41,-26,14,43,-7;
MA   /M: SY='A'; M=76,-49,-243,-244,-253,76,-246,-251,-242,-251,-244,-233,-245,-239,-248,10,-234,-66,-251,-25;
MA   /M: SY='V'; M=60,60,-250,-245,-241,-100,-253,-93,-245,-72,-230,-243,-250,-245,-249,0,23,76,-261,-244;
MA   /M: SY='W'; M=-52,-6,-251,-249,64,-98,21,-49,-83,-15,-57,-26,-256,-43,-106,2,-49,-52,101,98;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-64,-258,-252,-29,-257,-250,50,-251,66,29,-253,-255,-62,-101,-57,-21,27,29,-85;
MA   /M: SY='H'; M=-60,-45,-232,-234,-29,-38,143,-246,-237,-102,-51,26,-248,-67,-234,-85,-14,11,-272,-220;
MA   /M: SY='G'; M=29,-49,-240,-243,-254,82,-243,-85,-12,-89,-245,-69,-245,-80,-8,43,-17,-80,-253,-63;
MA   /M: SY='R'; M=30,-50,-31,0,-25,-96,-42,-72,-11,37,10,-49,-249,11,56,-55,-4,-46,-34,20;
MA   /M: SY='A'; M=93,24,-246,-240,-246,-233,-248,17,-241,-76,-234,-58,-245,-239,-246,-13,16,-35,10,-245;
MA   /M: SY='G'; M=71,-15,-242,-244,-255,79,-246,-252,-85,-105,-244,-22,-245,-240,-248,-22,-32,-91,-253,-251;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-64,87,48,-262,-248,-236,-38,-67,-258,-253,-41,-247,-23,44,-10,-68,-254,-268,-72; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='L'; M=5,-30,-42,4,-240,-79,-70,16,1,42,15,-10,-255,8,28,-77,-44,-21,-42,-48; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=61,35,-259,-252,-240,-87,-253,-31,-251,47,-230,-254,-259,-65,-38,-22,-241,-14,21,-21; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=54,-262,-260,-47,-85,-37,-257,-255,-36,-32,-30,-255,-264,-52,-41,19,-38,-36,-33,24; D=-16;
MA   /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
MA   /M: SY='F'; M=-31,-274,-33,20,42,-59,-65,-267,15,-90,-261,-44,-55,12,-12,-32,-27,-266,-264,-12; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='E'; M=27,-251,-24,44,-57,-16,-20,-51,34,-51,-240,-19,-82,32,44,16,-29,-82,-252,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-39,-253,-30,34,-7,-24,30,-27,49,-15,-32,-51,-84,36,38,-10,-33,-12,-4,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-23,-7,-22,57,38,-111,31,-37,-52,-25,-44,2,-39,12,-13,-35,-251,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-254,-31,37,-78,58,23,-93,-24,-44,4,-13,26,36,-18,-45,-11,-41,-18,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=8,-254,-29,-7,-97,-3,-34,-5,-51,-21,-37,-39,1,-28,70,-62,-33,-30,-5,71;
MA   /M: SY='G'; M=4,-28,-62,-243,-28,75,16,-87,-242,-76,-243,-88,19,-60,-248,49,-26,2,-254,-69;
MA   /M: SY='M'; M=-40,-64,-255,-251,22,-255,-243,5,-248,50,83,-27,-253,-245,-248,-42,23,39,-247,7;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-56,-65,-240,-61,-249,-38,29,-45,46,-78,-32,-49,33,-68,14,71,-19,-255,-237;
MA   /M: SY='A'; M=90,-244,-244,-237,-253,-95,-247,-31,-240,-246,-239,-239,67,-238,-246,-21,25,-232,-255,-249;
MA   /M: SY='S'; M=-40,-246,-20,0,-87,-4,-12,-96,-87,-25,-14,-227,-45,-18,15,78,56,-82,-257,-35;
MA   /M: SY='D'; M=-49,-28,108,41,-77,-110,-34,-258,-42,-255,-26,-79,-242,-1,-3,-69,-11,-254,-269,-245;
MA   /M: SY='I'; M=-107,-248,-261,-255,-224,-263,-251,72,-253,62,61,-255,-255,-249,-253,-250,-68,37,-252,-233;
MA   /M: SY='I'; M=42,-24,-251,-247,-15,-135,-55,60,-89,27,-2,-22,13,-243,-102,11,-25,6,-252,-100;
MA   /M: SY='E'; M=13,-59,57,63,-104,-31,-22,-69,7,-80,-60,31,19,21,-17,-32,-44,-248,-260,-246;
MA   /M: SY='H'; M=34,-21,-87,37,-39,-102,64,-80,7,-30,26,10,-49,28,-4,2,-32,-43,-250,28;
MA   /M: SY='I'; M=-45,-248,-261,-255,-102,-262,-253,73,-254,65,15,-256,-256,-250,-254,-249,-82,38,-252,-233;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-27,-89,-96,-78,26,-56,-252,-53,-117,-245,-22,111,-31,24,-48,-52,-252,-254,-33;
MA   /M: SY='E'; M=11,-75,-45,40,-54,-19,9,-98,38,-38,-51,-30,-19,29,36,21,2,-71,-45,-7;
MA   /M: SY='A'; M=61,-27,-249,-18,-20,-245,-249,11,-244,19,-225,-58,-74,-51,-248,-39,-6,56,2,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-44,-249,-257,-66,62,-257,-242,26,-86,43,76,-251,-255,-23,5,-246,-40,1,31,10;
MA   /M: SY='N'; M=14,-250,-15,4,-92,-49,-23,-53,54,-30,-39,55,-245,14,31,9,-38,-49,-40,-4;
MA   /M: SY='E'; M=14,-42,1,41,-251,-29,4,-31,24,-50,-10,2,-12,39,36,13,-12,-75,-32,-80;
MA   /M: SY='L'; M=-23,-7,-77,-7,11,-51,15,25,-64,55,14,-70,-2,-30,-33,-39,-65,8,-2,6;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00806;
//
ID   CALPONIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01052;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calponin-like repeat signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4434786; R2=0.0158206; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=551; N_SCORE=14.151; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-19,-30,-21,-13,-13,-20,-20,6,-4,0,3,-14,-7,-10,-8,-16,-11,0,-21,-9,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-21,-13,-8,9,-18,2,-12,6,-7,-4,-7,-18,-3,23,-11,-7,-10,0,17,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-18,29,16,-22,-8,-1,-22,6,-17,-15,8,-5,3,-1,-1,-6,-17,-21,-11,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,9,-29,14,11,-27,-14,-7,-24,-3,-24,-19,2,18,2,-10,0,-1,-25,-29,-17,4;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-22,-21,-14,19,-15,-17,-9,-7,-9,-6,-8,-20,-17,-8,-4,-4,-6,-12,3,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-14,-19,-17,-8,-5,-23,-18,6,-18,11,2,-12,-18,-10,-16,-2,8,3,-27,-8,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-25,14,18,-28,9,-8,-31,-4,-25,-21,5,-9,1,-9,8,-3,-25,-30,-22,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-5,-25,-7,4,-13,-17,-8,-13,-6,-10,-4,-4,-15,3,-8,-3,-1,-16,-1,-6,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,6,-29,10,21,-34,-20,4,-20,5,-15,-5,0,-11,39,3,-3,-10,-26,-24,-12,30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-6,-14,-9,-7,-2,-14,-7,2,-7,12,4,-2,-16,-7,-5,-11,-5,-3,-16,-4,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-31,-4,8,-29,-20,5,-27,25,-24,-8,-1,-6,21,32,-8,-11,-24,-21,-9,12;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-6,14,-7,9,-24,-22,-14,-23,5,-19,-14,-9,-17,-1,-3,-5,-8,-13,-32,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,13,-25,20,-1,-31,25,-11,-35,-11,-30,-23,9,-14,-8,-14,10,-6,-25,-32,-24,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,10,-25,5,14,-29,-16,1,-22,13,-23,-10,13,-11,24,8,3,0,-24,-27,-13,19;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-20,1,-7,-20,13,-3,-22,-11,-22,-15,20,-18,-7,-10,11,2,-20,-32,-18,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-17,-18,-23,-20,-5,-24,-19,20,-18,4,13,-11,-20,-14,-18,-4,2,20,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-34,-29,0,-32,-26,36,-22,15,21,-25,-25,-22,-22,-15,-5,37,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-24,-6,-8,-25,22,-13,-29,-7,-28,-18,2,-6,-7,-2,12,-3,-21,-28,-23,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=0,-14,-17,-21,-14,-5,-14,-3,6,-10,3,29,-11,-17,-2,-11,-2,-1,3,-21,-1,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-13,-8,-8,-8,-14,-11,-12,-10,-16,-12,1,-13,-6,-10,21,30,-5,-25,-1,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-9,34,-19,16,-1,-19,-3,6,-19,-1,-27,-19,51,-19,-1,-1,11,7,-26,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,8,-28,-20,-4,-29,38,-25,-9,0,-13,17,40,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-17,-26,-18,-22,-6,37,-21,-23,-23,-13,-11,-8,-23,-24,-20,-7,-16,-15,-16,-16,-22;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-11,2,-1,-19,-2,-8,-19,-9,-28,-19,16,-11,-1,-9,34,20,-12,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-17,-11,-2,-23,-7,-11,-18,4,-17,-10,-3,-12,5,4,8,-1,-10,-23,-16,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-23,-24,-11,-9,-21,0,13,-7,11,43,-15,-18,13,-7,-15,-10,2,-20,-2,0;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,4,-12,-5,-7,-11,-13,-12,-6,-9,-12,-9,9,-11,-7,-9,15,26,-4,-28,-11,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-15,-17,-15,-19,-13,21,-19,-7,-16,-10,-5,-10,-19,-19,-16,-3,-9,4,-19,-17,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-24,-30,-24,44,-29,-2,5,-20,11,10,-21,-29,-22,-15,-21,-10,-1,11,42,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-15,-9,-20,-13,-6,-22,-17,-2,-10,10,5,-14,-21,-11,-5,-8,6,0,-25,-8,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-23,-11,-7,-30,7,-19,-27,-13,-28,-19,-12,38,-10,-19,-6,-13,-28,-28,-29,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11,-1,-18,-21,-1,-27,26,-15,-8,-2,-21,8,64,-11,-10,-18,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,7,-27,0,8,-28,-16,5,-13,7,-18,0,13,-14,31,5,-1,-7,-22,-25,-11,19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-21,-30,-25,-3,-33,-27,31,-23,10,10,-17,-19,-19,-23,-8,7,26,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-18,-24,-21,-16,7,-27,-2,7,-14,10,11,-17,-23,-5,-12,-14,0,0,-4,25,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,12,-24,20,1,-10,-16,-6,-18,-11,-8,-13,1,-17,-8,-13,-2,-5,-14,-26,-3,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-32,-3,10,-26,-8,-11,-24,-1,-24,-17,-9,36,-1,-3,-6,-10,-26,-25,-23,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=11,-3,-21,-7,2,-24,-11,-12,-21,25,-21,-9,-3,-9,2,10,-2,-6,-11,-18,-12,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-27,-7,1,4,-10,7,-13,-6,-9,-8,-10,-18,-3,-8,-10,-10,-17,5,32,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-22,48,-28,-26,-14,-13,-27,-23,-25,-13,-15,-20,-32,-24,-25,-13,-13,-12,-11,-17,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-28,-7,-7,-21,2,-17,-18,-7,-11,-10,-10,5,-11,-12,-9,-11,-17,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-26,2,18,-29,-14,-4,-22,9,-22,-12,2,1,16,1,1,-7,-23,-26,-17,17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-30,-12,-2,-16,-4,-17,-12,-16,-2,-6,-16,12,-11,-17,-13,-12,-16,-24,-18,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00808;
//
ID   ARGINASE_3_MP; MATRIX.
AC   MP01053;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arginase family signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8079643; R2=0.0169321; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=340; N_SCORE=11.555; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-22,-6,7,-15,-14,-9,-12,-4,-9,-5,-5,-13,3,-5,-2,-4,-10,-23,-12,5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-3,-19,-5,6,-14,-14,-7,-8,-4,-9,-6,-3,-11,7,-8,0,-5,-8,-19,-10,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-18,-16,-22,-14,1,-23,-19,10,-16,15,7,-17,-20,-15,-15,-10,3,10,-20,-5,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-6,-16,-9,-6,-5,-13,-8,-2,-8,-1,2,-5,-9,-3,-8,-5,-4,-4,-16,-5,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-21,7,14,-24,-11,-6,-19,0,-17,-14,1,-10,1,-7,2,-5,-13,-29,-17,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-23,-21,-12,10,-25,-3,0,-11,6,3,-15,-23,-10,-4,-15,-9,-2,-10,12,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-24,-27,-19,-3,-29,-21,20,-19,19,12,-19,-20,-14,-16,-18,-9,13,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-24,3,3,-22,-16,-4,-17,5,-15,-10,1,-11,1,4,-2,-6,-13,-27,-13,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-22,2,4,-24,-1,-9,-19,-1,-18,-12,0,-6,4,-6,4,-2,-16,-25,-16,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: M=-4,-7,-13,-9,-7,-16,-14,-14,-9,-1,-10,-6,-5,-18,-7,0,-4,-2,-2,-26,-13,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-16,-3,-3,-16,13,-5,-18,1,-15,-9,3,-10,-3,0,0,-6,-14,-15,-12,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-14,11,4,-18,-6,-5,-17,2,-15,-11,5,-9,1,-1,2,1,-11,-21,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-28,23,4,-30,0,-5,-32,5,-24,-18,7,-14,0,9,-2,-8,-24,-29,-17,1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-24,-14,-10,-12,-14,-12,-14,-13,-13,-10,-15,25,-14,-15,-12,-11,-17,-22,-12,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-33,-28,3,-33,-28,33,-25,19,14,-26,-26,-25,-23,-16,-5,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-15,-29,-17,-15,16,-26,38,-8,-12,-5,3,-12,-27,-6,-8,-18,-14,-15,12,53,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-15,-31,-24,5,-31,-23,25,-27,34,18,-28,-29,-22,-21,-23,-8,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-23,-37,-28,27,-34,-23,26,-28,18,11,-22,-26,-27,-23,-20,-9,19,-9,12,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-34,-26,3,-33,-24,34,-26,26,22,-25,-25,-20,-23,-20,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,1,-25,-24,-9,-5,-26,0,-20,-5,-4,-19,-25,-25,-21,-5,-5,16,-27,-17,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-17,-32,-23,19,-31,-21,18,-29,38,15,-28,-30,-24,-21,-26,-9,12,-17,3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-17,32,-33,50,15,-37,-13,-5,-35,-3,-30,-27,10,15,-3,-13,-3,-10,-30,-37,-23,5;
MA   /M: SY='P'; M=7,-16,-31,-12,-1,-28,-14,-18,-17,-9,-24,-16,-16,54,-5,-18,-4,-7,-21,-26,-26,-6;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-13,-15,-10,-16,0,-13,-12,-12,-12,-8,-5,-15,-8,-15,9,2,-6,-24,-14,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-20,-19,-16,12,-26,0,-2,-17,0,-1,-14,-24,-13,-14,-12,-6,-1,-5,16,-15;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-12,-22,-13,-15,-7,-19,-2,-11,-4,0,-12,-13,-11,-19,5,2,6,-21,-16,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-23,-13,-16,-26,45,-20,-30,-16,-24,-17,-3,-16,-16,-20,5,-12,-20,-21,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-14,0,-20,-20,-7,-25,-25,5,-16,-2,-2,-14,-21,-20,-16,5,24,20,-31,-11,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-25,-7,-13,-27,44,-17,-33,-16,-30,-20,1,-9,-14,-17,10,-8,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-12,-13,-10,-13,-13,-16,-11,-10,-11,-10,-3,-11,-10,-13,14,28,-3,-22,-12,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-36,-14,-4,-25,-22,-20,-12,-11,-22,-14,-19,67,-11,-17,-10,-7,-21,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,-12,-14,-13,-4,-16,-10,-19,-3,-11,-7,-6,-14,-17,-12,-16,-1,-3,9,-27,-17,-8;
MA   /M: SY='P'; M=5,-17,-21,-18,-10,-19,-16,-18,-7,-10,-13,-9,-15,19,-11,-12,-5,-5,-7,-26,-19,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-25,-14,-18,-18,38,-15,-28,-15,-19,-13,-6,-22,-17,-12,-5,-16,-21,-15,-14,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-31,-23,5,-28,-23,21,-24,28,15,-27,-27,-21,-19,-21,-8,18,-15,-2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-1,-18,-3,-5,-16,-13,-15,-15,-10,-16,-14,-1,3,-8,-12,14,22,-10,-30,-13,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-19,-22,-21,-16,9,-23,-12,1,-19,8,0,-17,-14,-15,-16,-9,1,-3,-8,11,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-24,2,6,-21,-17,-3,-26,13,-20,-13,0,-11,5,28,-3,-5,-19,-23,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-24,6,28,-23,-21,-3,-18,3,-14,-12,-3,-9,9,1,-2,-5,-15,-29,-15,18;
MA   /M: SY='A'; M=5,-19,-20,-22,-19,-10,1,-20,1,-19,5,3,-15,-21,-17,-18,-8,-8,4,-22,-13,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-24,-11,1,-7,-24,0,-1,-12,14,7,-14,-20,-3,-8,-16,-11,-6,-23,-4,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-7,-24,-10,0,-1,-20,-5,-10,-5,-8,-6,-6,-14,-1,-7,-6,-5,-12,-13,6,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-25,-23,-31,-23,4,-25,-22,24,-25,17,13,-19,-22,-19,-23,-14,-7,16,-19,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-7,-29,-22,1,-27,-20,15,-23,15,12,-20,-24,-19,-20,-13,-2,14,-24,-5,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,2,-29,7,23,-21,-18,1,-24,9,-16,-12,-2,-8,9,11,-6,-10,-22,-25,-11,15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-19,-8,-1,-19,-9,-2,-19,1,-13,-5,-4,-12,0,7,-7,-10,-16,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-18,-34,-26,5,-33,-26,31,-28,27,16,-25,-26,-22,-24,-21,-8,23,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='H'; M=2,-8,-19,-10,-6,-15,-11,9,-15,-7,-10,-5,-5,-18,-1,-5,-5,-9,-13,-20,-2,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00135;
//
ID   TRANSALDOLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01054;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Transaldolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.4604025; R2=0.0222558; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=21; N_SCORE=7.918; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-43; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=9,2,-17,-6,-8,-12,-6,-10,-10,-8,-12,-9,7,-18,-7,-9,3,-3,-7,-26,-14,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-9,6,-22,12,0,-19,-19,-12,-6,-10,-7,-8,-3,-17,-6,-13,-2,-4,-1,-32,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-18,6,2,-22,0,-12,-21,-8,-21,-17,6,-12,-5,-11,15,12,-13,-32,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,7,-28,9,9,-30,24,-8,-33,-6,-26,-20,8,-13,-2,-10,2,-13,-29,-27,-24,4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,3,-26,8,0,-12,-24,-14,0,-14,0,-4,-6,-17,-10,-16,-11,-9,-1,-28,-9,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-15,-26,-17,-6,-4,-26,-12,-1,-1,0,2,-13,-15,-2,0,-13,-7,-4,-17,0,-5;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-24,7,11,-24,-12,-9,-21,6,-15,-13,-2,-12,1,4,-3,-8,-14,-26,-16,5;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-18,-18,-12,-8,-12,-13,0,-16,7,3,-10,-19,-8,-15,-4,-4,-2,-22,-7,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-20,-22,-27,-21,-3,-26,-19,24,-21,9,13,-14,-20,-15,-21,-9,-4,17,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,5,-24,5,9,-21,-15,-6,-21,9,-14,-12,4,-14,3,12,-3,-6,-17,-27,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-9,-22,-12,-5,-11,-22,-10,-5,-1,1,0,-5,-18,-5,1,-6,1,-5,-25,-7,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-15,-27,-17,-14,4,2,-3,-16,-12,-7,-4,-9,-23,-10,-10,-12,-14,-16,-9,6,-12;
MA   /M: M=-2,-10,-25,-12,-7,-21,0,-10,-13,-8,-11,-5,-6,-8,-1,-9,-5,-9,-12,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-24,-29,-21,-4,-31,-26,23,-23,13,9,-25,-2,-21,-23,-17,-7,19,-25,-9,-24;
MA   /M: SY='A'; M=2,2,-5,1,-3,-25,-11,-10,-16,-8,-17,-11,-1,-18,2,-11,2,-5,-9,-31,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=-7,8,-30,14,-7,-33,42,-8,-40,-14,-30,-22,6,-17,-13,-16,0,-17,-30,-26,-25,-10;
MA   /M: SY='V'; M=13,-22,3,-27,-23,-8,-21,-27,12,-19,0,1,-21,-24,-23,-21,-3,-1,26,-29,-15,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=15,-2,-10,-6,-4,-18,-5,-14,-16,-10,-21,-16,4,-10,-4,-12,30,24,-6,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,34,-30,36,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-22,-37,-29,26,-33,-25,27,-27,16,13,-23,-26,-28,-23,-18,-8,23,-13,7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,-12,-12,-16,-4,-16,-15,-14,-9,-5,0,-3,-12,-17,-2,-6,-5,-5,-6,-23,-13,-3;
MA   /M: SY='K'; M=0,3,-26,0,9,-28,-14,-8,-25,30,-26,-11,5,-11,8,16,-3,-7,-19,-23,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=25,-6,-16,-9,6,-21,-4,-15,-14,-6,-14,-12,-7,-10,-4,-14,8,-1,-5,-25,-20,1;
MA   /M: SY='A'; M=4,-18,-24,-22,-16,-9,-3,-20,-1,-14,1,2,-14,-14,-15,-17,-10,-10,-2,-19,-11,-16;
MA   /M: SY='A'; M=2,-8,-22,-9,-3,-19,-7,-13,-13,-1,-10,-7,-6,-16,-2,0,-1,-3,-9,-24,-14,-3;
MA   /M: M=-7,-3,-25,-3,-1,-17,-5,-11,-16,-5,-13,-8,-1,-7,-2,-8,-2,-5,-16,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-25,-9,-8,-9,-6,-15,-13,-14,-16,-12,-3,6,-10,-15,2,-2,-14,-25,-14,-10;
MA   /M: SY='A'; M=7,-7,-23,-9,2,-18,-15,-4,-17,1,-16,-10,-7,-5,0,-6,-1,-1,-12,-14,-7,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-10,-26,-9,-4,6,-26,-4,-2,-9,-1,-3,-12,-20,-9,-12,-12,-7,-5,-6,20,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-15,-22,-17,-12,1,-22,-2,-1,-7,-2,-1,-13,-23,-5,-5,-10,-6,0,-6,20,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-6,1,-25,4,-1,-19,-16,-6,-13,3,-9,-7,-4,-16,-2,-4,-7,-8,-10,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-26,0,3,-18,-19,-11,-11,-3,-3,-5,-8,-6,-4,-4,-10,-9,-11,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-6,-28,-5,12,-15,-26,-10,-4,-2,-4,-3,-8,-13,6,-4,-9,-10,-8,-23,-9,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-12,-27,-15,-13,-8,-29,-13,16,-15,6,6,-9,-19,-11,-17,-14,-9,8,-22,-1,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00741;
//
ID   DNA_LIGASE_N1_MP; MATRIX.
AC   MP01055;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NAD-dependent DNA ligase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2242804; R2=0.0157133; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=928; N_SCORE=19.796; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-24,-5,-2,-19,-20,-9,-21,19,-18,-9,-2,-16,2,33,-3,3,-10,-24,-11,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-12,-17,-17,-12,-5,-18,-13,8,-8,2,3,-7,-16,-7,-5,-7,-4,6,-18,-6,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-25,-12,-4,-5,-17,-8,-10,-5,-11,-8,-1,-18,-5,2,-4,-6,-11,-9,-5,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-11,-22,-14,-5,-8,-21,-13,-2,-6,7,1,-10,-15,-5,-4,-11,-6,-5,-22,-8,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-27,-10,1,-17,-16,-8,-15,6,-11,-6,-7,-16,4,7,-8,-8,-14,-10,-7,2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-20,-21,-13,-3,-25,-17,12,-15,16,11,-16,-21,-13,-14,-14,-2,9,-24,-6,-13;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-7,5,-19,2,-3,-13,1,-2,-16,0,-17,-11,11,-8,-4,1,-1,-6,-16,-18,-7,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-20,-1,11,-16,-9,-5,-14,0,-13,-9,-5,-1,4,-5,-1,-4,-13,-16,-7,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-23,-7,1,-8,-17,-10,-14,0,-12,-9,-5,-2,-3,0,-3,-5,-12,-21,-9,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-19,-17,-12,-8,-17,-17,0,-13,-6,-4,-11,-4,-10,-16,-1,0,3,-23,-10,-12;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-22,-1,6,-18,-12,-5,-19,-6,-16,-13,-3,-2,-2,-7,4,1,-15,-27,-14,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-26,-22,-30,-25,40,-31,-5,6,-21,8,3,-22,-29,-23,-17,-21,-10,0,13,43,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,1,-25,-21,3,-23,-22,1,-20,2,-1,-18,-25,-20,-18,-6,3,8,-14,-5,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-23,47,-28,-27,-10,-27,-28,-2,-24,-3,-5,-23,-32,-27,-24,-8,-4,15,-38,-19,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-28,15,49,-31,-18,1,-28,8,-21,-17,1,-2,25,1,3,-8,-28,-29,-18,37;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-22,-29,-18,-9,-10,-25,-6,-3,-18,8,1,-21,19,-12,-15,-19,-11,-11,-25,-10,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-36,-27,6,-35,-27,36,-28,26,18,-24,-25,-22,-25,-21,-8,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-16,-30,-25,2,-29,-25,25,-24,24,13,-27,-27,-23,-21,-16,-4,29,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-11,-11,-6,-20,3,-16,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-6,-16,22,8,-5,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-15,-33,-28,9,-32,-26,28,-25,20,14,-26,-27,-26,-22,-18,-6,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=14,6,-14,0,1,-20,-3,-9,-17,-6,-22,-17,14,-11,-2,-10,21,11,-12,-33,-19,0;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-21,-31,-21,5,-29,-22,23,-28,38,17,-26,-26,-19,-22,-24,-9,14,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-17,-22,-20,-13,-7,-27,-14,5,-5,3,3,-13,-21,-6,3,-9,1,7,-20,-1,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,1,-29,7,34,-26,-21,-4,-22,14,-18,-13,-3,-7,16,10,-4,-9,-20,-26,-15,24;
MA   /M: SY='N'; M=-14,26,-26,23,11,-26,-10,15,-28,6,-27,-18,29,-15,5,7,2,-7,-28,-35,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-30,-7,-16,-29,57,-17,-39,-14,-29,-19,1,-20,-16,-10,-1,-19,-29,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-24,-18,-10,-7,-27,-7,2,-2,5,4,-14,-22,-8,3,-15,-7,4,-21,0,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,37,-30,-20,12,-30,34,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-8,12,-24;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-3,-22,-22,-4,-24,-23,11,-18,-1,0,-13,-24,-21,-18,-1,7,21,-29,-11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-15,-10,-1,-19,-21,-3,-20,9,-16,-7,-4,-18,12,18,-4,-3,-16,-20,-7,4;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-18,-16,-14,-24,27,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='A'; M=18,-18,-14,-24,-16,-7,-16,-22,7,-18,10,2,-17,-18,-15,-20,-4,2,10,-22,-11,-16;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-16,-22,-18,-10,0,-27,-13,5,-11,6,2,-14,-20,-11,-8,-9,3,4,-17,5,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-20,-8,3,-14,-24,-15,-5,1,-9,-5,-9,-14,-3,-4,0,9,2,-25,-8,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-29,54,20,-34,-12,-1,-33,-1,-23,-25,17,-11,0,-9,-2,-9,-27,-37,-18,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-31,-23,-36,-30,1,-34,-30,36,-25,12,12,-26,-25,-24,-25,-17,-7,34,-11,-2,-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-10,-10,-9,-10,-18,-19,-10,-11,-9,-10,0,-11,-9,-10,20,44,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-1,-20,-5,6,-24,-10,-6,-14,-4,-16,-8,2,-6,11,-8,7,-2,-15,-27,-17,8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,37,-21,18,1,-21,-2,8,-21,4,-30,-19,55,-19,1,2,8,-1,-29,-38,-19,1;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-16,-30,-25,-1,-27,-27,26,-22,17,11,-25,-25,-23,-22,-13,-4,31,-25,-8,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-26,-5,3,-22,-17,-6,-25,27,-21,-10,2,-15,6,34,-3,-5,-17,-24,-11,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-5,-15,-13,-12,-10,-14,-10,-8,-13,-5,-2,-4,-14,-10,-11,9,29,-2,-28,-8,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-38,-28,47,-28,20,23,-20,-20,-19,-28,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-26,-2,3,-24,-15,-4,-26,16,-24,-13,-1,-2,4,23,-1,-6,-19,-25,-14,1;
MA   /M: SY='S'; M=8,10,-16,6,-1,-22,2,-8,-21,-7,-24,-18,15,-12,-4,-10,19,9,-15,-34,-20,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-23,-37,-29,15,-35,-27,34,-28,20,15,-23,-25,-25,-25,-19,-8,26,-17,3,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-38,-11,-2,-28,-21,-21,-16,-11,-27,-18,-21,81,-11,-20,-10,-9,-24,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-14,-26,-13,-5,-11,-24,7,-5,-8,8,8,-13,-13,-1,-3,-17,-11,-8,-24,-3,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-23,-7,1,-21,-18,-9,-23,22,-20,-10,0,-13,5,27,1,8,-14,-23,-11,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00809;
//
ID   DNA_LIGASE_N2_MP; MATRIX.
AC   MP01056;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NAD-dependent DNA ligase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4146514; R2=0.0154214; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=483; N_SCORE=12.853; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=1,-11,-28,-7,2,-27,-14,-13,-19,-2,-25,-14,-9,33,3,-9,3,-3,-21,-28,-22,1;
MA   /M: SY='P'; M=14,-11,-27,-8,-3,-27,-11,-19,-17,-9,-22,-17,-13,41,-9,-19,-1,-6,-17,-27,-25,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-27,-1,20,-22,-23,-9,-14,13,-13,-8,-7,-11,8,7,-7,-9,-10,-25,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-26,-5,19,-11,-21,-9,-13,0,-10,-9,-6,-10,4,-1,-5,-9,-13,-21,-10,11;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,-20,-13,-5,-21,-12,-14,-9,4,-12,-4,-10,-16,1,0,-2,-4,0,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-12,-24,-13,0,-17,-25,-6,4,-7,-4,3,-10,-14,6,-7,-8,-8,3,-26,-9,2;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-10,-11,-10,-11,-17,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,43,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-25,-6,7,-18,-22,-12,-16,17,-15,-8,-4,-12,2,14,-4,2,-11,-23,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,26,-28,37,18,-29,-29,-22,-21,-24,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-22,-14,-7,-9,-23,-12,0,-2,6,6,-10,-20,-4,0,-12,-3,1,-24,-7,-6;
MA   /M: SY='D'; M=3,23,-23,28,5,-31,2,-7,-29,-5,-25,-22,12,-12,-3,-12,6,-5,-21,-32,-21,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-11,-22,-11,3,-14,-24,-12,-2,-4,2,2,-12,-16,3,-4,-7,0,-2,-24,-9,2;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-19,-32,-27,30,-30,-20,17,-24,12,6,-20,-28,-29,-20,-16,-6,19,-10,12,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-22,-2,7,-30,-11,0,-18,1,-20,-7,6,-11,28,0,8,2,-21,-25,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-15,-20,-18,-12,-13,-22,-17,-1,5,-7,0,-12,-19,-9,9,-6,-1,10,-24,-10,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='T'; M=0,5,-12,-5,-7,-13,-15,-15,-13,-7,-16,-13,9,-11,-7,-8,21,38,-5,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-35,-14,-7,-19,-23,-17,-11,-11,-21,-13,-21,59,-13,-19,-11,-9,-16,-23,-14,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-11,-26,-25,2,-28,-26,19,-18,7,5,-23,-26,-25,-18,-5,10,34,-26,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-12,-19,-11,-21,8,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-3,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-8,-24,-8,5,-15,-21,-9,-8,4,-11,-4,-7,-15,6,0,-3,-5,-6,-22,-6,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-22,12,-29,-20,20,-28,42,21,-29,-29,-21,-19,-27,-9,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=1,10,-23,13,29,-25,-15,-6,-24,2,-18,-17,3,-5,7,-6,5,2,-20,-30,-18,18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-18,82,-9,-19,-6,-8,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-5,-24,-8,2,0,-21,1,-10,-2,-6,2,-2,-18,1,0,-8,-5,-13,-15,5,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,31,-27,31,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=13,7,-19,10,5,-27,6,-11,-25,-7,-22,-19,3,-10,-4,-14,11,-2,-16,-30,-21,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,1,-14,-31,59,-17,-40,-17,-30,-21,3,-19,-17,-19,0,-19,-30,-23,-29,-16;
MA   /M: SY='T'; M=3,-10,-13,-13,-11,-12,-18,-19,-3,-5,-11,-6,-8,-16,-11,-8,10,17,11,-30,-13,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-11,-20,-14,-5,-11,-23,-15,-3,2,-2,4,-10,-16,-5,1,-5,6,2,-24,-8,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-18,0,5,-25,-6,-6,-22,2,-26,-14,8,-11,12,-1,21,10,-17,-32,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-26,-8,0,-19,-16,-4,-25,21,-20,-10,2,-17,8,39,-3,-6,-17,-21,-11,2;
MA   /M: SY='A'; M=34,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,16,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='T'; M=2,6,-11,-2,-5,-15,-10,-12,-15,-9,-20,-15,12,-11,-5,-9,26,32,-8,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-30,-5,-6,-13,-9,71,-28,-12,-18,-3,5,-21,2,-5,-10,-19,-27,-22,18,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,34,-19,17,0,-20,0,7,-20,-1,-30,-20,53,-19,0,-1,14,3,-27,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00809;
//
ID   SAICAR_SYNTHETASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01057;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SAICAR synthetase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5347295; R2=0.0156270; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=165; N_SCORE=8.103; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-24,-23,-14,-9,-28,-21,14,-12,6,5,-19,-8,-14,-14,-14,-7,12,-24,-9,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-25,10,14,-24,-8,-7,-27,8,-23,-17,3,-9,3,2,3,-5,-20,-26,-15,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-9,-24,-9,0,-13,-22,-4,-8,0,-3,0,-9,-16,6,0,-8,-6,-9,-19,0,2;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-22,-24,-16,-4,-27,-20,10,-17,11,5,-23,-5,-16,-16,-17,-8,7,-20,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-23,8,6,-23,-7,-4,-21,-5,-20,-15,5,-4,0,-7,7,-1,-18,-32,-17,2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-31,15,11,-31,0,-8,-29,-2,-26,-18,2,10,0,-8,-2,-11,-27,-30,-22,4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-22,-5,-4,-13,-14,-3,-21,11,-18,-10,10,-19,0,26,-2,1,-17,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='A'; M=7,-7,-17,-7,4,-18,-15,-13,-10,-5,-12,-9,-9,-14,-2,-8,2,-2,-2,-21,-14,1;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-19,-24,-14,-2,-24,-11,8,-14,9,18,-18,-22,-2,-12,-12,-5,6,-14,-2,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-31,-23,2,-31,-23,26,-24,26,15,-25,-23,-20,-20,-20,-8,21,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='V'; M=5,-20,-1,-24,-24,-9,-13,-26,7,-19,-3,-1,-18,-25,-23,-20,-4,-1,20,-29,-15,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-29,-4,8,-26,-20,-3,-24,28,-23,-8,-1,-13,15,28,-6,-8,-19,-20,-9,10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-29,-4,7,-26,-18,-5,-27,31,-25,-11,-1,-7,9,32,-6,-8,-20,-22,-12,6;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-23,-4,-26,-22,-1,-24,-20,11,-23,18,8,-22,-27,-21,-20,-15,-5,16,-25,-7,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-26,13,17,-25,-17,-5,-27,16,-23,-16,5,-10,7,8,1,0,-21,-26,-11,11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-25,-30,-21,-5,-28,-19,24,-18,10,23,-22,-3,-14,-19,-17,-8,16,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-36,-29,12,-35,-26,35,-28,20,15,-23,-25,-24,-25,-19,-8,26,-17,4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-38,-9,0,-28,-19,-18,-20,-3,-27,-18,-16,71,-8,-13,-10,-10,-28,-29,-26,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-26,8,-33,-25,30,-27,29,17,-26,-27,-23,-23,-21,-8,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,3,-29,-25,1,-24,-26,10,-20,2,1,-23,-26,-25,-21,-8,-3,22,-19,-8,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-3,-28,-25,-4,-27,-27,19,-21,7,5,-23,-25,-24,-21,-7,2,30,-29,-11,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-25,3,-8,-20,21,0,-27,-7,-26,-17,27,-20,-6,-5,2,-9,-28,-28,-18,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-26,-25,-21,14,-30,-2,13,-13,5,6,-20,-26,-13,-13,-17,-7,7,4,38,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-20,-16,-26,-18,-7,-18,-22,12,-18,12,5,-19,-19,-16,-21,-8,-4,13,-21,-10,-18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-7,-12,-15,-10,-13,-11,-17,-7,-11,-9,-9,-6,-11,-9,-15,13,19,0,-23,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,-1,-10,-20,-10,-29,-20,10,-10,0,-10,39,21,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-22,-25,-20,4,-6,-19,2,-22,12,7,-16,-23,-18,-19,-13,-7,0,-17,-5,-18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-24,-12,-26,-20,-1,-22,-22,-6,-18,-2,-7,-24,-26,-17,-18,-16,-8,-5,25,4,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-1,7,-26,-19,-8,-26,33,-23,-10,0,-12,9,29,-7,-5,-18,-22,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-28,5,10,-25,-18,-2,-26,16,-18,-12,1,-15,11,32,-6,-9,-20,-24,-13,8;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-23,-22,-19,19,-27,0,6,-16,12,5,-17,-27,-14,-13,-17,-3,-2,4,37,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-17,-6,-7,-15,19,-11,-17,-9,-15,-10,-4,7,-9,-11,-1,-8,-15,-13,-15,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-12,-18,-14,6,-16,-13,14,-13,10,8,-12,-14,-12,-10,-10,-5,11,-10,1,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,1,-26,1,15,-28,-16,-5,-23,15,-21,-11,0,-3,15,8,-1,-6,-21,-24,-15,15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-27,7,28,-26,-17,-3,-25,12,-19,-15,0,-4,11,6,-1,-7,-22,-27,-16,19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-9,-15,-24,41,-17,-30,-16,-23,-16,1,-18,-14,-15,5,-5,-22,-24,-24,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-23,-6,2,-17,-2,-9,-17,-6,-15,-10,-2,-14,-2,-7,3,4,-13,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-22,-7,2,-17,-20,-10,-14,7,-15,-9,-5,-10,-1,9,0,4,-6,-27,-12,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-30,-21,14,-30,-23,18,-22,24,11,-25,-27,-23,-18,-20,-7,18,-18,1,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-18,-2,4,-11,-10,-8,-12,-3,-13,-10,-2,10,-3,-6,0,-2,-12,-19,-11,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,60,-18,-18,-15,-21,-5,-23,-20,-17,-14,-10,-28,-16,-19,-3,-6,-11,-35,-13,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-28,-12,-19,-28,61,-19,-35,-19,-26,-15,-2,-19,-18,-19,0,-18,-26,-20,-28,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-17,-25,-18,-17,-5,-31,-22,24,-22,15,9,-17,-21,-17,-22,-16,-8,18,-25,-6,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00810;
//
ID   SAICAR_SYNTHETASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01058;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SAICAR synthetase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2011461; R2=0.0147045; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=351; N_SCORE=10.352; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-34,-27,4,-35,-25,36,-26,22,16,-24,-25,-22,-24,-20,-8,28,-19,3,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-16,1,-23,-10,-15,26,-18,4,-8,-12,-9,-8,12,-26,-15,-9,-8,-6,-15,-4,25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,5,20,-23,-18,0,-21,3,-14,-11,2,-10,11,3,2,2,-19,-28,-13,15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-20,-21,-10,3,-25,-18,6,-12,4,1,-15,-20,-14,-8,-9,-3,8,-20,-4,-13;
MA   /M: SY='L'; M=9,-21,-19,-24,-17,-5,-6,-20,2,-23,20,5,-19,-23,-17,-20,-13,-9,1,-20,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=3,-2,-23,-2,16,-21,-15,-7,-19,7,-18,-11,-3,-9,11,0,3,-4,-15,-24,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-27,4,19,-31,-12,-6,-26,15,-24,-13,-1,-3,16,5,0,-8,-23,-25,-16,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-27,-22,11,-23,-14,14,-22,15,10,-20,-25,-18,-18,-15,-6,9,-12,12,-21;
MA   /M: SY='F'; M=10,-23,-20,-31,-21,19,-16,-21,-3,-19,0,-3,-20,-22,-22,-20,-11,-8,-1,14,5,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-1,6,-24,9,8,-27,-13,3,-24,7,-19,-12,2,-12,9,6,0,-7,-19,-27,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-27,9,21,-25,-15,-5,-24,9,-21,-16,6,0,6,4,0,-6,-23,-30,-18,13;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-10,-11,-2,-22,-20,-3,-17,9,-14,-3,-6,-18,9,13,-6,-8,-12,-25,-11,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-26,-1,-13,-26,43,-5,-33,-14,-29,-19,18,-20,-12,-13,4,-13,-29,-27,-24,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-10,-34,-26,0,-34,-26,29,-28,21,13,-22,-25,-21,-26,-18,-8,20,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-15,-29,-20,-5,-31,-23,19,-17,12,9,-17,-21,-15,-15,-14,-3,12,-23,-5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=9,-23,2,-28,-23,-10,-24,-27,13,-20,1,1,-21,-18,-22,-23,-7,-4,20,-28,-14,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-15,-15,-24,-18,21,-21,-18,-2,-18,3,2,-12,-19,-20,-15,-1,14,2,-14,4,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-25,-35,-26,31,-33,-17,21,-27,20,11,-22,-27,-24,-22,-22,-10,11,-3,22,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,71,-31,-21,6,-30,11,2,-20,-29,-38,-21,-20,-10,3,7,27,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-19,-22,-21,-14,-8,-27,-17,4,-1,4,4,-14,-22,-10,11,-12,-2,9,-23,-7,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-17,27,6,-21,-9,-5,-21,-4,-17,-16,11,-9,-3,-8,7,6,-15,-29,-13,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=1,-7,-23,-8,4,-16,-18,-11,-10,1,-8,-7,-5,-10,-2,0,-3,-3,-8,-23,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-7,24,-23,28,17,-27,-12,-5,-27,-1,-23,-21,14,-9,2,-7,8,5,-21,-35,-18,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-28,-6,-14,-28,52,-16,-35,-10,-28,-18,4,-18,-14,-12,0,-16,-27,-20,-26,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-26,4,24,-28,-17,-1,-24,12,-20,-12,3,-8,21,12,2,-3,-23,-26,-15,22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-22,-34,-25,2,-32,-26,33,-27,26,16,-24,-24,-21,-25,-20,-8,24,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-21,-27,-22,8,-29,-14,18,-22,21,10,-23,-26,-18,-19,-17,-3,14,-11,14,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-16,-24,-16,-13,-7,-18,4,-14,-1,6,-13,-15,-11,-19,0,-3,6,-21,-14,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,12,46,-25,-22,-5,-21,5,-15,-15,-5,-5,12,-3,-2,-8,-18,-30,-18,29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-37,-28,1,-36,-26,41,-27,23,22,-23,-23,-19,-26,-20,-9,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-8,-17,-8,-7,-10,-14,0,-7,-16,0,-1,-4,-18,-5,-12,6,2,-6,-31,-8,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,3,-14,-10,-19,-22,-22,-17,-14,-19,-15,-11,20,-14,-17,4,18,-12,-34,-21,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00810;
//
ID   FLIP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01060;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Flagella transport protein fliP family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6540723; R2=0.0131413; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=932; N_SCORE=16.892; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-29,16,13,-30,-9,-6,-26,-2,-21,-16,0,5,7,-5,-2,-9,-25,-29,-19,9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-7,-1,-18,-20,-9,-10,10,-14,0,-6,-6,1,5,-5,-4,-8,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='P'; M=1,-15,-24,-15,-8,-15,-18,-15,-7,-3,-13,-7,-13,9,-9,-7,-4,-4,-4,-22,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=0,8,-24,11,6,-27,-13,-7,-21,9,-18,-10,0,-12,5,5,-2,-7,-14,-26,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-22,1,8,-23,-4,-8,-21,1,-20,-13,6,-12,4,-1,7,5,-16,-29,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-24,-13,-12,-4,-23,-18,4,-16,5,0,-12,-5,-16,-17,-13,-8,1,-24,-9,-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,11,-22,6,14,-24,-11,-1,-23,9,-23,-15,14,-10,5,2,6,1,-20,-30,-16,9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-26,19,16,-30,-14,-8,-26,8,-24,-18,2,-1,2,-3,0,-6,-19,-30,-18,9;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-2,-22,2,-12,-12,-23,-16,4,-13,-5,-4,-9,-15,-16,-17,-7,-4,11,-28,-7,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,6,-29,15,5,-30,-12,-11,-25,-7,-30,-23,2,34,-4,-14,5,-2,-25,-36,-24,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-28,-20,12,-28,-16,14,-23,29,17,-22,-25,-17,-17,-18,0,8,-17,5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-24,-19,-12,5,-23,3,-8,-6,2,0,-10,-23,-8,11,-12,-7,-7,-16,5,-12;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-17,-28,-23,-4,-27,-26,24,-21,10,8,-20,-22,-20,-22,-7,1,27,-26,-8,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-18,-30,-21,7,-28,-21,21,-27,39,19,-29,-29,-21,-20,-24,-8,17,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-21,-32,-25,1,-31,-26,30,-26,24,15,-24,-24,-21,-23,-18,-5,25,-22,-4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-36,-11,-1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19,77,-10,-20,-7,-9,-26,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,71,-30,-13,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,39,-28;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-17,-27,-20,-5,-23,-20,17,-17,9,16,-17,-19,-14,-18,-6,5,18,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-19,-29,-22,3,-30,-23,22,-25,29,14,-23,-25,-20,-20,-17,1,18,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-13,0,0,-20,-4,8,-21,-10,-27,-16,10,-12,1,-8,31,15,-13,-38,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,57,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,23,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-24,-4,4,-24,-20,-10,-24,28,-23,-9,0,-11,9,21,-1,7,-15,-23,-10,6;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-19,-7,-4,-17,-18,-12,-11,0,-13,-8,-3,-15,0,7,5,10,-3,-27,-12,-3;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,14,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,1,-30,4,26,-31,-20,0,-27,23,-22,-10,0,-9,28,21,-4,-10,-26,-23,-13,26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-38,-28,48,-28,20,23,-20,-20,-18,-28,-20,-10,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-29,-11,-20,-29,66,-20,-37,-20,-29,-19,-1,-20,-20,-20,0,-19,-27,-20,-29,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-22,-39,-29,61,-32,-22,10,-30,15,5,-21,-28,-35,-22,-21,-10,6,2,22,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-20,-27,-20,16,-28,-14,12,-24,31,14,-24,-27,-18,-17,-21,-2,5,-12,11,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26,4,-35,-26,36,-30,33,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-28,-24,43,-30,4,4,-17,5,5,-20,-29,-19,-14,-20,-10,-4,18,56,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-18,-10,-28,-19,-20,82,-11,-20,-9,-9,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-23,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-16,-32,-28,-2,-31,-29,33,-22,11,11,-25,-25,-25,-23,-11,-3,40,-26,-8,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,44,-28,20,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,8,-29,-17,22,-27,43,27,-28,-28,-17,-19,-28,-10,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-13,-7,-19,-1,-17,-13,-10,-16,-13,-3,-10,-7,-16,20,9,-3,-27,-19,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00812;
//
ID   FLIP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01061;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Flagella transport protein fliP family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5767474; R2=0.0129417; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=929; N_SCORE=16.590; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=149; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-21,-31,-21,4,-25,-10,22,-19,31,42,-24,-24,-9,-15,-24,-10,12,-20,0,-15;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-14,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-17,18,10,-2,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,42,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-31,-21,2,-23,-6,22,-15,25,50,-22,-22,-5,-13,-22,-10,12,-20,0,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-21,-20,-10,-12,-19,-5,9,-10,2,25,-10,-16,8,-10,-3,-4,1,-24,-6,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-22,-25,-13,-7,-20,2,13,-7,13,50,-17,-18,10,-7,-17,-10,3,-20,-2,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-15,-31,-26,3,-30,-25,28,-23,24,18,-28,-28,-24,-20,-18,-5,33,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-20,-7,-3,-21,-12,-16,-17,-10,-24,-17,-3,22,-6,-14,17,17,-13,-33,-21,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-14,-16,-20,-14,-8,-19,-11,7,-11,3,19,-13,-18,-4,-11,-1,6,10,-26,-8,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-17,-11,-9,-11,-18,-12,-2,-11,-3,-2,3,-16,-4,-10,5,18,-3,-28,-10,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-30,-21,6,-30,-21,23,-27,37,19,-26,-26,-19,-20,-23,-5,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-38,-28,61,-31,-21,8,-30,18,5,-22,-29,-35,-21,-22,-10,4,2,22,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,6,-31,-19,26,-27,39,26,-26,-26,-17,-21,-26,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-22,10,-29,-19,23,-26,36,24,-27,-27,-19,-19,-25,-9,16,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,15,-31,-21,20,-30,45,18,-28,-29,-22,-21,-28,-10,11,-17,3,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-29,1,-31,-29,31,-22,14,12,-29,-29,-28,-21,-12,-2,45,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-17,-28,-19,3,-24,-20,15,-24,33,15,-26,-26,-18,-19,-20,-7,12,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-17,-31,-24,-2,-26,-22,26,-20,15,19,-23,-23,-19,-21,-13,-5,27,-23,-6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,41,-27,50,12,-34,-2,0,-35,-2,-30,-27,27,-13,-1,-8,4,-7,-29,-39,-21,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=3,5,-17,2,2,-19,-6,-9,-19,-5,-20,-15,7,-12,-1,-6,16,14,-13,-30,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-25,-16,0,-27,-14,7,-11,25,13,-21,-27,-12,5,-22,-9,6,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-18,-28,-21,5,-30,-22,20,-26,35,15,-26,-27,-20,-20,-21,-1,15,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-25,-18,-30,-23,4,-28,-23,23,-24,19,13,-22,-24,-20,-21,-13,-3,22,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-8,6,-27,9,-2,-25,4,15,-28,-5,-19,-12,4,-16,-4,-7,-5,-12,-22,-27,-9,-4;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-22,-5,-8,-26,29,-13,-30,-9,-28,-17,3,-15,-5,-9,13,-2,-21,-27,-23,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-15,-31,-27,20,-27,-25,17,-23,9,5,-23,-27,-29,-20,-10,-3,26,-17,1,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-8,-26,-10,-1,-8,-17,3,-9,-4,-3,-2,-4,-20,4,2,-10,-9,-14,-14,7,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-12,-1,1,-21,-3,-9,-19,-8,-27,-18,8,-10,4,-8,35,21,-11,-38,-18,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-12,-28,-25,43,-30,1,-3,-19,2,-2,-20,-31,-23,-15,-19,-10,-6,15,52,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-16,-25,-18,-9,-11,-15,-10,-6,-5,2,6,-12,-20,1,3,-11,-7,-8,-13,-6,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-10,1,-26,2,-8,-21,3,-11,-16,-7,-13,-3,-1,-16,-7,-5,-4,-4,-12,-26,-15,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-29,-20,-13,-18,-13,-19,5,-15,-7,0,-15,1,-4,-17,-9,-10,1,-24,-14,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00812;
//
ID   HMG_COA_LYASE_MP; MATRIX.
AC   MP01062;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1704335; R2=0.0119947; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1517; N_SCORE=22.356; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-14,-23,-21,-4,-28,-26,16,-18,3,3,-15,-19,-19,-18,1,20,24,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-19,-24,-19,-13,-1,-26,24,2,-23,24,13,-15,-26,-9,-13,-23,-14,-5,-24,7,-13;
MA   /M: SY='V'; M=17,-17,-12,-24,-18,-9,-16,-20,8,-13,1,7,-17,-18,-15,-17,0,5,19,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=12,-4,-23,-7,9,-33,-13,-1,-16,3,-16,-4,-4,-10,34,-1,4,-6,-19,-20,-14,22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-24,-19,-5,-15,-20,4,5,-3,5,38,-13,-16,22,-3,-13,-10,-5,-20,-4,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-17,-4,0,-20,-7,-6,-24,5,-26,-16,6,-14,4,20,22,9,-14,-33,-16,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-10,-23,-23,-4,-26,-26,15,-16,3,3,-19,-23,-23,-16,1,18,32,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-29,-15,-34,-29,30,-29,-22,18,-22,11,13,-25,-29,-30,-19,-15,-5,26,-14,6,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-34,-4,11,-35,-20,-4,-22,9,-25,-9,-7,27,27,2,-5,-10,-28,-24,-17,17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,27,14,-30,-30,-26,-20,-19,-4,33,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00813;
//
ID   SIGMA70_ECF_MP; MATRIX.
AC   MP01063;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sigma-70 factors ECF subfamily signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3482757; R2=0.0186117; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=159; N_SCORE=9.298; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=9; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-15,19,-25,9,0,-20,-11,58,-25,-5,-25,-9,34,-20,5,0,-1,-11,-30,-35,1,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-28,0,0,-15,-18,-6,-19,4,-17,-8,-5,-9,5,1,-7,-7,-18,-6,-1,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-8,-26,-22,6,-29,-22,16,-25,24,12,-25,-28,-22,-20,-20,-8,17,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-14,-24,-16,-10,-2,-21,-2,-8,2,-5,-3,-12,-21,-3,4,-9,-4,-6,-5,18,-9;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-23,-10,-4,-23,3,-11,-22,-1,-21,-12,-3,-14,4,1,5,-1,-17,-14,-14,0;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-25,-28,-20,21,-20,-14,-1,-17,8,1,-19,-26,-19,-8,-19,-11,-4,6,15,-20;
MA   /M: SY='L'; M=9,-23,-12,-29,-21,1,-22,-23,13,-23,17,7,-21,-23,-20,-22,-12,-6,13,-21,-7,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-19,-19,-13,1,-15,-14,-4,-13,3,-1,-12,-21,-9,-7,-5,1,-1,-19,-3,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-22,-9,-3,-16,-15,0,-20,9,-17,-9,-1,-16,2,21,3,1,-13,-23,-6,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-24,-24,-16,10,-26,-4,5,-5,6,16,-17,-23,-7,-1,-17,-9,1,-7,17,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-15,-19,-16,-6,-18,-22,8,-17,5,2,-18,-22,-19,-16,-4,5,19,-28,-11,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-26,-6,-1,-21,-14,-3,-18,12,-18,-8,3,-12,5,18,-4,-6,-15,-25,-12,0;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-24,26,7,-28,-8,6,-27,-2,-29,-21,23,-5,3,-3,9,-2,-26,-37,-18,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=6,-9,-22,-10,-1,-22,-4,-13,-13,-2,-15,-8,-9,-1,0,-8,-2,-7,-8,-22,-17,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=0,8,-21,8,-3,-16,-3,0,-21,-10,-16,-13,6,-16,-5,-12,3,-4,-16,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-24,21,7,-23,-15,-8,-16,-9,-8,-12,2,-14,-2,-12,-2,-6,-14,-32,-14,3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-14,-11,-20,-14,-14,-10,-22,1,-13,-6,-5,-12,-15,-14,-19,8,4,12,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,21,-30,34,32,-32,-17,-3,-30,2,-20,-21,4,1,8,-7,-3,-10,-27,-33,-19,20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,22,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,32,-28,31,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='V'; M=11,-23,-13,-26,-20,-3,-21,-23,13,-20,16,7,-23,-23,-20,-19,-9,0,20,-24,-10,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-21,19,40,-29,-19,-4,-25,3,-19,-19,0,-5,10,-6,-1,-10,-24,-31,-19,25;
MA   /M: SY='T'; M=11,-9,-10,-16,-14,-11,-16,-21,-2,-12,-8,-6,-8,-15,-14,-14,13,24,11,-29,-13,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-11,-38,-29,60,-30,-18,2,-28,9,3,-20,-29,-34,-20,-19,-10,1,3,24,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-22,-30,-22,3,-31,-21,25,-21,30,22,-24,-25,-17,-18,-23,-9,17,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-25,-5,5,-24,-15,-8,-26,26,-23,-11,-1,-13,6,30,-1,-6,-16,-22,-13,4;
MA   /M: SY='A'; M=31,-14,-12,-22,-15,-15,-5,-22,-1,-14,-6,-5,-13,-15,-15,-20,5,2,9,-22,-17,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-30,-28,-21,14,-29,-7,10,-18,10,9,-23,-26,-11,-16,-23,-13,-2,21,31,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-22,-13,-9,-16,-15,-4,-7,-1,-11,-4,-4,-19,-3,7,-2,-2,-1,-26,-9,-8;
MA   /M: SY='S'; M=11,1,-17,-4,-4,-21,0,9,-21,-7,-22,-13,10,-14,-2,-6,13,0,-15,-30,-13,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-26,-16,8,-29,-17,17,-21,26,12,-22,-24,-16,-14,-21,-9,10,-15,4,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-30,9,11,-28,-8,7,-28,-1,-23,-16,0,8,2,-1,-4,-11,-26,-29,-16,4;
MA   /M: SY='S'; M=-5,8,-19,5,1,-21,-10,-5,-22,4,-24,-15,13,-13,4,9,15,12,-16,-32,-15,2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-21,-34,-26,52,-30,-14,6,-26,16,5,-23,-30,-30,-18,-21,-9,4,5,30,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-27,8,10,-26,-17,3,-24,10,-21,-12,4,-13,12,20,0,-7,-20,-28,-12,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-25,4,-3,-25,5,2,-24,-7,-22,-14,5,-5,-3,-7,1,-6,-21,-27,-15,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,2,-30,5,5,-26,-8,-2,-24,2,-21,-14,2,-2,2,8,-5,-11,-22,-27,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-18,-3,2,-22,-3,-9,-22,0,-24,-15,4,-12,4,5,18,9,-14,-30,-17,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=3,0,-22,0,1,-23,-12,-11,-21,8,-22,-14,1,0,-1,2,5,1,-15,-28,-17,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-26,-23,-31,-20,37,-28,-21,5,-24,6,0,-20,-11,-27,-20,-16,-9,2,-6,10,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-27,-6,-1,-14,-21,-5,-15,13,-11,-5,-5,-18,3,17,-8,-7,-13,-17,1,-1;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-16,-10,-6,-18,-12,-18,-14,-10,-18,-14,-4,10,-8,-14,16,23,-8,-30,-18,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,20,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,129,30,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,14,-31,-21,22,-30,44,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,12,-18,2,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-8,-27,-23,24,-30,-3,1,-17,6,3,-20,-30,-18,-12,-19,-10,-3,3,35,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-23,-8,-2,-23,-4,-8,-25,9,-21,-11,0,-15,6,22,4,0,-17,-23,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,31,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-12,-13,-20,-13,-14,-2,-20,-7,-14,-1,-6,-11,-14,-13,-19,3,3,-1,-21,-16,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-14,-20,-16,-9,-13,-20,-15,-6,3,-4,-3,-10,-19,-6,12,-5,0,1,-24,-10,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-14,23,-24,10,0,-20,-8,24,-24,4,-26,-14,39,-20,4,14,2,-6,-28,-34,-11,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-13,-16,-17,-12,-9,-22,-20,-1,-4,2,0,-13,-18,-12,-7,-3,11,7,-25,-9,-12;
MA   /M: SY='V'; M=11,-19,-18,-27,-20,0,-19,-15,11,-16,4,10,-17,-19,-14,-18,-7,-3,12,-14,3,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-25,-24,-15,-10,-26,-18,10,-3,2,5,-13,-19,-9,4,-12,-8,8,-21,-7,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,29,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-18,-26,-21,-15,10,-21,12,-9,-15,-1,-2,-14,-24,-11,-10,-14,-11,-11,8,21,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-24,-26,-18,18,-29,-3,8,-20,18,9,-20,-27,-14,-12,-21,-10,2,-8,19,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-28,-11,-2,-19,-21,-4,-24,26,-18,-8,-2,-20,6,57,-9,-7,-14,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='K'; M=1,-5,-23,-9,0,-16,-16,0,-21,15,-19,-8,-2,-13,3,10,-2,-4,-14,-20,-6,1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-5,4,-25,-18,9,-19,15,-18,-2,2,-15,17,18,-5,-9,-17,-23,-8,9;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-29,-7,-1,-26,3,-7,-28,16,-23,-10,-2,-16,8,17,-5,-12,-22,-17,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-25,-10,-4,-17,-20,2,-18,11,-13,-6,-4,-14,1,27,-5,-2,-11,-25,-7,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00814;
//
ID   PYRIDOX_OXIDASE_MP; MATRIX.
AC   MP01064;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6086407; R2=0.0126274; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1181; N_SCORE=19.512; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=150; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-37,-9,1,-28,-19,-16,-20,-8,-28,-19,-17,74,-8,-16,-7,-7,-27,-30,-27,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-18,-17,-9,-9,-23,-8,-15,11,-8,-4,-9,-23,-4,33,-12,-7,-5,-22,-7,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-19,-20,-9,-30,-20,-19,87,-9,-17,-10,-10,-30,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-29,9,22,-29,-14,-7,-25,0,-24,-19,-3,20,4,-9,2,-6,-24,-30,-22,11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-11,-25,-15,-15,19,-9,15,-17,-17,-10,-6,-3,-24,-16,-11,-10,-12,-16,-9,17,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-29,11,-21,-27,-19,-19,-19,-19,-39,-30,-19,-19,-39,-29,-29,142,33,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-11,-15,-12,-18,-24,40,-20,-28,-19,-24,-15,-3,-20,-18,-19,5,-9,-17,-26,-26,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-29,-11,-21,-28,63,-21,-35,-20,-27,-18,-2,-21,-21,-20,-1,-19,-25,-21,-29,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-27,-27,-31,-25,42,-30,-5,3,-20,5,0,-23,-29,-23,-16,-22,-12,-3,28,47,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-21,-11,0,-17,-21,-3,-19,13,-10,-5,-5,-20,4,35,-11,-9,-13,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,33,-25,23,15,-27,-27,-25,-23,-18,-5,34,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-20,-17,-12,-11,-23,-13,2,-3,-4,0,-9,-20,-7,2,-4,1,7,-24,-7,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-22,-35,-16,-6,-21,-22,-21,-9,-14,-18,-12,-21,63,-13,-21,-12,-9,-18,-27,-23,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-22,8,11,-22,-17,-2,-17,0,-14,-9,4,-13,7,-2,1,-1,-15,-29,-13,9;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-9,-17,-9,1,-15,-17,-10,-10,-2,-11,-7,-7,-16,0,1,3,1,-4,-26,-9,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-22,-35,-27,10,-32,-22,30,-24,18,20,-23,-24,-21,-22,-19,-8,24,-15,3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-27,-4,10,-29,-14,10,-18,3,-16,0,-2,-14,38,4,-3,-11,-24,-19,-6,23;
MA   /M: SY='G'; M=-5,7,-29,11,-5,-31,42,-12,-38,-12,-29,-22,8,-16,-12,-15,1,-16,-30,-26,-26,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-29,-10,-6,-25,13,-8,-31,8,-22,-12,-1,-19,2,27,-5,-13,-23,-20,-17,-4;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-26,1,14,-25,-14,-11,-20,0,-19,-15,-6,11,3,-6,0,-5,-18,-26,-19,7;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-22,4,-2,-1,-10,12,-19,-9,-19,-13,17,-19,-6,-7,2,-5,-20,-23,1,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,29,-20,-10,-1,-20,10,69,-10,-10,-20,-17,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-20,7,-29,-19,21,-26,43,23,-28,-28,-18,-19,-28,-10,11,-20,0,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,1,-30,0,0,-20,-20,98,-30,-10,-20,0,11,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-28,49,23,-34,-12,-1,-33,1,-26,-25,18,-9,3,-8,2,-6,-27,-37,-19,13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-24,-32,-23,26,-31,-16,14,-24,18,8,-21,-26,-23,-18,-21,-10,6,-3,14,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-15,-16,-7,-13,-24,-10,-5,0,-2,0,-10,-22,-1,14,-11,-8,-2,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-25,-23,36,-29,6,1,-15,2,0,-21,-29,-18,-13,-19,-8,-4,25,60,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-23,0,5,-21,-17,-5,-20,6,-16,-11,1,-13,7,12,3,5,-15,-24,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-12,-4,-16,-18,-7,-18,15,-9,-5,-5,-18,1,33,-11,-9,-12,-19,-9,-5;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-19,9,6,-19,-9,-6,-15,-4,-15,-12,4,-12,0,-7,4,-1,-10,-27,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='B'; M=2,6,-15,6,2,-17,-1,-3,-16,-2,-14,-11,5,-7,-1,-5,4,0,-12,-20,-11,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-22,7,2,-24,13,-3,-24,-6,-21,-14,5,-12,-2,-9,3,-8,-19,-24,-17,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-23,0,-2,-22,8,-9,-23,-5,-22,-15,2,-8,-5,-7,5,-2,-17,-25,-16,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-44,-34,-26,7,-16,-26,-18,-18,-19,-17,-33,-25,-17,-18,-33,-26,-27,122,24,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-19,-4,-1,-16,-17,-2,-16,3,-15,-9,3,-16,1,7,3,4,-11,-27,-8,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-19,-20,-14,-10,-24,-15,8,-8,0,3,-12,-20,-12,-9,-7,-3,11,-26,-8,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-26,5,12,-20,-14,-2,-20,2,-18,-12,1,-10,5,3,0,-4,-17,-26,-11,8;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-3,-15,-18,-3,-25,22,-16,-7,-3,-20,5,52,-10,-8,-17,-19,-7,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00815;
//
ID   ETF_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP01065;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Electron transfer flavoprotein beta-subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3209314; R2=0.0153515; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=513; N_SCORE=13.186; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-16,-29,-26,1,-21,-27,21,-22,11,8,-24,-26,-25,-21,-12,-5,29,-24,-8,-26;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-10,-8,-9,-10,-3,-14,-9,-9,-10,-8,1,-11,-9,-9,9,20,-2,-21,-11,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-13,-13,-16,-13,8,-16,0,0,-12,-2,-1,-10,-17,-13,-11,-3,-1,4,-9,9,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=22,-9,-13,-13,-10,-15,-9,-18,-3,-14,-6,-7,-8,-15,-11,-18,8,2,4,-27,-16,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-23,-4,6,-22,-16,-9,-23,20,-20,-11,-1,-12,5,19,1,0,-15,-25,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-26,-18,-9,-16,-28,-18,8,5,-5,4,-11,-16,0,-2,-11,-6,7,-22,-7,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-13,-11,-14,-9,-3,-16,-13,10,-9,7,4,-12,-13,-9,-7,-7,-1,11,-15,-5,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-10,1,0,-9,-5,-5,-12,-6,-15,-11,6,-8,0,-6,16,9,-8,-21,-9,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-10,-18,-16,3,-19,-14,17,-13,10,7,-16,-17,-15,-12,-10,-3,20,-12,2,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-18,22,20,-20,-10,-1,-21,7,-15,-13,5,-4,6,3,-1,-6,-17,-20,-11,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-21,-29,-21,-2,-29,-23,21,-21,19,11,-23,-17,-19,-17,-16,-5,18,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=1,10,-23,11,19,-26,-7,-6,-24,1,-20,-17,6,-9,6,-4,5,-1,-20,-29,-18,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,4,-26,3,-10,-28,37,-13,-33,-11,-28,-20,9,-17,-12,-13,4,-10,-25,-26,-25,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-25,19,5,-28,2,-5,-30,3,-26,-20,14,-14,-1,4,4,-4,-23,-31,-19,1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-23,5,10,-24,-18,-10,-24,17,-21,-14,2,-9,3,9,4,9,-15,-27,-13,6;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-21,-32,-24,3,-29,-25,27,-26,23,13,-23,-23,-21,-24,-17,-7,21,-20,-3,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-21,-8,2,-18,-23,-14,-8,4,-12,-5,-5,-12,4,-1,2,12,-3,-26,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-16,-29,-27,-5,-19,-28,23,-21,6,7,-23,-25,-25,-22,-9,-4,33,-26,-11,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-26,11,40,-25,-20,-4,-26,9,-18,-17,0,-4,13,8,2,1,-23,-29,-17,26;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-27,9,31,-26,-17,-3,-27,11,-19,-16,0,-7,11,14,0,-5,-22,-27,-17,20;
MA   /M: SY='I'; M=2,-22,-19,-26,-19,-3,-22,-23,12,-21,12,4,-19,-21,-17,-20,-8,0,11,-12,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,13,-30,20,1,-33,34,-11,-39,-10,-29,-23,7,-15,-9,-15,0,-16,-30,-28,-26,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-30,3,-6,-31,50,-15,-39,-14,-29,-21,2,-16,-13,-16,0,-18,-30,-23,-28,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-16,-19,-13,-1,-25,-16,10,-15,7,6,-19,-22,-15,-14,-7,4,17,-22,0,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-29,6,35,-22,-21,6,-24,5,-17,-10,-2,-7,28,2,-2,-10,-27,-23,-10,32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-15,-17,-13,-7,-26,-22,7,-11,0,0,-13,-17,-14,-13,1,19,16,-28,-9,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,30,-28,35,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-26,6,27,-26,-16,1,-26,13,-22,-13,1,-8,13,11,3,-5,-22,-28,-15,19;
MA   /M: SY='V'; M=5,-16,-15,-22,-17,-6,-21,-22,10,-18,6,2,-13,-18,-15,-18,1,11,13,-26,-9,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-23,-3,1,-22,-10,-12,-21,8,-24,-14,2,-1,-1,5,7,6,-15,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-10,-27,-20,4,-25,-21,12,-27,34,12,-25,-28,-20,-20,-21,-3,8,-24,-5,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-16,22,-25,-18,-15,-14,-22,-7,-17,-5,-4,-16,-22,-17,-22,-1,-4,4,-29,-19,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,4,-31,-26,27,-25,28,15,-29,-29,-25,-21,-19,-5,31,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=6,-2,-3,-11,-10,-13,-16,-20,-12,-11,-13,-12,-1,-12,-10,-12,19,38,-2,-31,-13,-10;
MA   /M: SY='V'; M=10,-18,-14,-25,-19,-7,-19,-18,12,-14,5,15,-17,-19,-14,-17,-4,4,18,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-23,6,-2,-17,-18,-8,-6,-11,-2,-5,2,-17,0,-11,-3,-2,-9,-30,-11,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-23,0,14,-16,-21,-10,-12,-2,0,-5,-7,-13,3,-5,-6,-1,-12,-26,-11,8;
MA   /M: SY='R'; M=-6,4,-28,7,4,-29,10,-8,-33,6,-25,-18,3,-14,-1,11,-3,-12,-24,-25,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-21,-28,-20,1,-29,-23,22,-25,24,12,-19,-22,-17,-21,-14,1,14,-22,-4,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,23,1,-21,-1,9,-21,0,-30,-21,58,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-20,-1,17,-20,-19,-11,-12,1,-13,-10,-7,-10,3,-6,3,2,-5,-29,-16,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-37,-17,-7,-22,-24,-21,-4,-14,-17,-8,-20,62,-12,-22,-13,-10,-16,-27,-22,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,16,63,-9,-10,-21,-20,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-25,-20,24,-30,0,3,-9,1,1,-16,-26,-13,1,-18,-10,-3,7,38,-20;
MA   /M: SY='P'; M=8,-16,-27,-15,-11,-24,7,-19,-17,-13,-19,-10,-13,23,-13,-19,-3,-9,-15,-24,-24,-14;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-14,1,-2,-21,1,-10,-21,-7,-26,-18,9,-12,-2,-6,28,14,-12,-35,-19,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-31,-22,13,-28,-16,20,-24,34,28,-26,-27,-18,-18,-25,-9,13,-18,2,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,2,-30,8,10,-30,-16,-11,-27,14,-26,-17,-3,16,1,5,-5,-9,-22,-27,-19,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00816;
//
ID   UPP_SYNTHETASE_MP; MATRIX.
AC   MP01066;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1052756; R2=0.0123257; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=696; N_SCORE=12.674; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=195; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,50,-33,-20,3,-27,10,-20,-15,0,-3,30,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-24,13,19,-27,-12,-2,-25,7,-23,-16,6,-9,7,0,6,-2,-19,-31,-16,13;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-20,-9,-8,-4,-19,-8,-2,-13,1,1,-6,-18,-9,-12,-5,3,-3,-21,-1,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-21,-34,-26,22,-32,-24,23,-27,20,12,-21,-25,-25,-22,-18,-4,17,-14,6,-26;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-21,3,11,-22,-6,-7,-22,-2,-22,-16,7,-6,4,-3,11,2,-18,-30,-18,7;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-25,4,14,-27,-14,-3,-25,16,-23,-12,3,-10,13,14,1,-5,-20,-26,-14,13;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-5,-14,-10,-9,-1,-19,28,-17,-9,-12,-3,1,-23,-4,-2,-8,-9,-17,-17,15,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-30,-21,10,-29,-17,19,-26,42,22,-28,-29,-18,-19,-27,-9,11,-18,3,-19;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-7,-22,-6,-9,3,-21,5,-7,-9,-4,0,-11,-18,-5,-11,-10,-6,-10,-4,26,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-17,-9,-8,-12,-12,-14,-8,-10,-7,-4,-4,-12,-9,-10,6,17,-3,-26,-10,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-21,-8,-3,-18,-2,-10,-19,-3,-20,-13,-1,4,-4,-6,5,-3,-16,-24,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-25,13,5,-24,0,-4,-25,-7,-21,-17,4,-9,-4,-9,-1,-9,-21,-27,-16,0;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-20,-19,-24,-17,1,-23,-15,12,-18,16,14,-18,-22,-12,-15,-12,-4,9,-20,-2,-15;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-26,-5,1,-21,-14,-11,-15,-4,-20,-12,-10,44,-4,-6,-4,-6,-19,-22,-19,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-29,41,18,-33,-13,-2,-31,2,-26,-23,12,0,1,-7,-1,-8,-26,-35,-19,9;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-18,-21,-15,-15,-25,-24,3,-17,-8,-5,-24,27,-19,-21,-11,-6,5,-30,-20,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,24,-39,-11,1,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,11,-30,-20,21,-29,45,21,-29,-29,-20,-20,-28,-10,12,-19,1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-34,-25,15,-32,-23,25,-27,29,18,-26,-27,-23,-22,-22,-8,20,-18,2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,22,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-12,-10,-9,-12,-19,-20,-10,-10,-12,-11,-2,-3,-10,-11,18,42,-2,-31,-12,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-15,-5,-8,-24,26,-14,-28,-14,-30,-20,5,-14,-8,-14,23,4,-18,-32,-24,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-9,-19,-29,67,-19,-39,-19,-29,-20,2,-20,-19,-19,0,-19,-29,-20,-29,-19; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-28,19,40,-28,-16,1,-26,4,-19,-18,1,-6,11,-4,-1,-10,-23,-31,-18,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-23,-5,7,-20,-22,-3,-12,5,-11,-3,-5,-15,13,3,-6,-6,-13,-22,-5,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-22,-31,-22,4,-31,-23,27,-27,31,18,-23,-24,-18,-22,-20,-4,16,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,38,-22,25,2,-23,2,7,-24,-1,-30,-21,50,-18,-1,-3,9,-2,-29,-39,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-15,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,36,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,12,-28,-15,19,-25,40,29,-27,-28,-16,-18,-27,-10,10,-18,2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-23,-27,-17,2,-28,-20,14,-25,32,13,-26,-10,-18,-20,-24,-7,5,-22,-5,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-29,11,-21,-28,-18,-20,-18,-18,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-28,142,31,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-36,-20,16,-20,7,-18,0,0,-11,51,8,-2,-11,-29,-21,-7,34;
MA   /M: SY='A'; M=9,-14,-1,-20,-16,-10,-16,-20,0,-18,-1,-2,-11,-19,-14,-19,4,6,5,-29,-13,-15;
MA   /M: SY='A'; M=28,-4,-13,-11,-7,-20,-1,-8,-15,-9,-17,-12,1,-12,-6,-13,14,3,-7,-27,-17,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-14,-29,-14,-13,15,-20,17,-8,-7,-7,-4,-12,-26,-7,-6,-14,-10,-14,15,55,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=24,-4,-10,-10,-6,-18,-4,-16,-13,-10,-18,-14,1,-11,-6,-14,23,16,-3,-30,-18,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-27,14,49,-27,-21,-2,-26,7,-17,-17,-2,-3,17,0,-1,-7,-26,-29,-18,33;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-23,16,-30,-19,20,-26,31,17,-24,-27,-21,-20,-23,-7,11,-15,6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-23,-22,-17,19,-28,0,1,-15,-1,-1,-19,-26,-16,-14,-18,-11,-1,12,33,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-20,-37,-28,67,-29,-18,0,-26,9,0,-19,-29,-35,-16,-18,-9,1,6,27,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,3,-13,-11,-14,-19,-17,-8,-14,-9,-6,-6,-15,-7,-14,7,14,-2,-32,-14,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-29,33,20,-33,-13,-4,-30,0,-26,-22,8,6,4,-8,1,-6,-27,-34,-20,12;
MA   /M: SY='T'; M=2,-13,-13,-17,-10,-12,-22,-20,-2,-4,-8,-4,-12,-10,-11,-9,-1,7,6,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-21,-25,-18,13,-28,-7,10,-22,28,13,-22,-26,-16,-16,-24,-10,2,-11,14,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,16,-19,-29,-18,-21,-17,-18,-37,-30,-22,-20,-37,-28,-27,134,29,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00817;
//
ID   SECE_SEC61G_MP; MATRIX.
AC   MP01067;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein secE/sec61-gamma signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.4613585; R2=0.0177188; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=24; N_SCORE=6.877; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-15,-24,-20,-15,-7,-1,-10,-2,-10,-1,17,-11,-19,-5,-11,-9,-10,-5,-19,-8,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-14,-6,-8,-14,15,-12,-13,-11,-15,-10,1,-10,-8,-11,9,2,-9,-19,-14,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-16,-10,-3,-12,-14,-12,-2,0,-4,-2,-5,-12,-5,-5,-4,-4,1,-19,-10,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=0,23,-24,29,7,-30,-8,-5,-29,2,-23,-21,11,-12,-1,1,2,-7,-20,-31,-18,2;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-3,-22,-8,-3,-22,-3,-7,-15,-2,-11,-6,2,-16,7,-1,-2,-7,-16,-23,-15,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-5,-12,-7,-4,-4,-12,-5,-2,2,-4,-1,-4,-9,-2,0,-2,1,-2,-8,3,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=0,-15,-17,-22,-15,-6,-20,-13,7,-7,3,19,-13,-17,-8,-9,-5,4,9,-23,-6,-12;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-2,0,-20,-2,-3,-13,-5,-11,-14,-5,-15,-10,1,-7,-5,-9,0,-2,-10,-22,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-14,9,13,-16,-5,-2,-16,7,-13,-9,2,-4,6,2,1,-4,-13,-15,-9,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-14,-24,-16,-8,0,-22,-11,-4,-2,-3,1,-11,-3,-7,-3,-13,-8,-7,-15,-1,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-19,-20,-13,-1,-14,-16,4,-13,4,4,-15,-20,-12,-11,-10,-6,6,-18,-6,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,3,16,-22,-16,-6,-19,9,-15,-8,-4,-11,8,0,-4,-6,-16,-22,-9,11;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-27,-9,-1,-19,-13,-11,-20,12,-20,-11,-3,0,-2,14,-5,-7,-15,-22,-14,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-22,-23,-25,-18,-4,-23,-22,11,-17,9,5,-19,-10,-16,-15,-13,-6,8,-22,-8,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-13,-24,-16,-9,-6,-19,-9,-7,1,-7,-3,-9,-19,-6,10,-8,-7,-3,-16,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-2,5,-21,0,4,-21,-13,-6,-16,8,-17,-10,9,-15,3,4,2,-2,-13,-28,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-24,-21,-30,-22,27,-26,-16,8,-21,11,4,-19,-25,-22,-16,-15,-7,6,-5,16,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-28,-1,8,-26,-14,-5,-27,29,-25,-11,5,-13,10,30,-5,-9,-21,-22,-13,8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,15,-28,22,29,-34,-11,0,-29,4,-22,-17,5,-7,19,-3,1,-9,-27,-29,-18,24;
MA   /M: SY='S'; M=7,-13,-9,-16,-15,-14,-6,-20,-2,-16,-12,-7,-7,-18,-14,-17,12,6,8,-32,-17,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-14,-25,-16,-10,-14,-22,-16,-2,9,-9,-1,-10,-18,-6,9,-9,-5,4,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='R'; M=4,-2,-22,-6,-1,-23,-9,-3,-21,6,-18,-8,2,-14,7,12,2,-2,-15,-24,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-25,2,28,-9,-23,-8,-13,-3,-5,-9,-9,-11,2,-7,-7,-9,-12,-25,-11,15;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-17,-30,-22,8,-26,-19,18,-21,21,21,-23,-25,-18,-18,-16,-4,18,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-8,-26,-9,2,-18,-19,-7,-21,22,-14,-7,-5,-16,4,27,-9,-9,-14,-17,-5,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-27,-7,2,-23,-21,-10,-22,36,-22,-7,-4,-15,5,35,-10,-9,-11,-21,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,19,-27,-26,-7,-28,-28,10,-21,0,0,-21,-28,-25,-21,-5,5,25,-34,-14,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-13,-17,-16,-13,-9,-22,-15,2,-5,-7,-2,-10,-18,-10,-6,2,9,12,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-26,-43,-26,-16,-4,-20,-23,-24,5,-24,-16,-26,-23,-9,-2,-29,-23,-26,89,16,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,13,-19,13,1,-24,-4,-10,-23,-4,-22,-17,10,-12,-2,-8,13,14,-16,-32,-17,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-12,-30,-13,-4,-15,-17,-3,-25,21,-16,-7,-5,-21,5,47,-13,-12,-18,-8,-3,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-27,4,18,-29,-17,-5,-26,27,-25,-12,4,-9,15,17,-3,-6,-22,-24,-13,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,49,-33,-20,3,-27,10,-20,-14,0,-3,31,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-24,-19,-28,-22,23,-27,-14,10,-22,19,9,-22,-26,-21,-17,-17,-2,8,-8,15,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-20,-19,-12,-6,-26,-12,4,-10,8,6,-13,-19,-6,-7,-8,6,3,-23,-4,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-22,-4,4,-20,-17,-4,-20,13,-19,-9,1,-12,6,9,3,5,-15,-23,-7,4;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-15,-21,-19,-15,-1,-18,-11,4,-14,-4,-2,-12,-19,-12,-16,-2,3,3,-12,11,-15;
MA   /M: SY='T'; M=12,-5,-10,-13,-11,-10,-14,-19,-8,-11,-11,-10,-4,-12,-11,-13,17,29,2,-28,-12,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-21,-17,-9,-9,-21,-15,-2,-1,0,3,-12,-18,-4,-4,-8,-1,0,-22,-6,-7;
MA   /M: SY='V'; M=11,-22,-17,-28,-22,-7,-23,-25,20,-18,5,5,-19,-20,-19,-19,-6,-1,25,-24,-10,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-12,-26,-25,-2,-29,-28,22,-19,6,6,-21,-24,-24,-19,-4,11,35,-29,-9,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-23,-33,-25,2,-33,-26,32,-27,26,16,-22,-23,-20,-24,-19,-5,22,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-15,-21,-18,-19,-15,20,-20,-12,-18,-11,-6,-9,-20,-18,-19,0,-7,-4,-23,-18,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-23,-17,-31,-25,31,-27,-22,10,-23,6,4,-18,-24,-27,-19,-9,2,13,-11,8,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-21,-10,-26,-22,-3,-27,-25,18,-21,10,6,-19,-23,-21,-20,-5,8,24,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='I'; M=3,-26,-19,-32,-24,3,-27,-24,24,-23,17,12,-22,-23,-20,-23,-14,-6,21,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-34,-26,12,-29,-22,26,-22,16,20,-22,-24,-21,-21,-16,-7,24,-18,1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-17,-23,-23,-21,4,10,-15,-7,-19,-4,7,-11,-21,-18,-18,-8,-10,-6,-15,-6,-19;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-16,-23,-17,4,-20,-19,7,-19,5,4,-13,-19,-16,-18,0,5,9,-23,-5,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-21,-31,-25,-1,-25,-26,26,-24,19,12,-23,-25,-22,-21,-17,-7,24,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-25,-26,-23,7,5,-21,-2,-25,4,0,-14,-24,-23,-21,-13,-12,-4,-13,-3,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-11,-32,-25,33,-29,-14,8,-24,16,10,-23,-30,-26,-18,-20,-9,8,-5,19,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-23,-26,-28,-23,13,-11,-21,-2,-22,2,-3,-19,-23,-21,-20,-15,-8,-5,13,7,-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-19,-29,-25,-3,-18,-26,20,-23,14,9,-23,-25,-23,-22,-13,-6,24,-24,-9,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-13,-19,-14,3,-18,-12,15,-15,17,9,-15,-15,-12,-13,-13,-5,10,-10,3,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,31,-29,44,15,-35,-13,-3,-36,14,-29,-23,13,-11,3,7,-2,-9,-26,-34,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-22,-23,-17,7,-19,-13,6,-20,11,4,-15,-23,-13,-17,-10,-2,1,-13,9,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00818;
//
ID   OMPA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01068;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   OmpA-like domain.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6501665; R2=0.0132040; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=790; N_SCORE=15.071; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-2,-30,2,-2,-7,-22,5,-21,14,-16,-10,-4,-20,1,22,-12,-10,-18,-6,20,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=3,5,-17,3,-2,-19,-5,-7,-14,0,-16,-10,7,-13,-2,-2,4,-2,-8,-25,-14,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-19,-23,-22,-14,-8,-29,-2,14,-17,9,10,-15,-22,-4,-14,-13,-7,10,-24,-1,-11;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-15,-15,-9,-13,-7,-11,-10,-9,-10,-9,-10,-14,-6,-16,4,-3,-4,-12,-2,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,13,-26,16,15,-32,-9,-2,-26,5,-22,-12,6,-10,17,-1,2,-6,-23,-28,-16,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-29,-11,-3,9,-24,-5,-12,-6,-7,-6,-13,-21,-2,-4,-15,-12,-15,10,17,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-31,-22,4,-29,-21,24,-26,34,21,-26,-26,-18,-21,-23,-8,16,-21,-2,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-17,-3,2,-22,-10,-6,-23,16,-24,-12,6,-13,6,19,5,-1,-16,-25,-14,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=3,2,-20,-1,3,-21,-10,5,-18,1,-18,-9,5,-13,10,2,5,-2,-16,-22,-7,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-8,-15,-15,-16,5,-22,2,3,-13,-1,4,-3,-22,-11,-12,-8,-2,-1,-13,14,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,2,-30,7,7,-29,-15,-8,-23,5,-26,-15,-2,29,6,-4,-4,-8,-25,-27,-19,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-15,10,5,-14,-9,-5,-12,-2,-9,-9,0,5,-2,-6,-1,-2,-11,-17,-10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-1,12,-16,9,0,-19,0,-2,-15,-4,-18,-12,16,-11,2,-5,7,-1,-14,-25,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: M=0,-10,-23,-14,-7,-12,-10,-9,-6,-7,-9,-5,-6,-17,-3,-6,-2,-1,-6,-16,-1,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-2,1,-22,2,4,-20,-10,-10,-23,6,-24,-16,3,-4,-1,4,8,2,-16,-28,-15,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-17,-32,-28,0,-32,-29,33,-23,14,13,-25,-25,-25,-23,-13,-2,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-16,-20,-15,-5,-23,-18,8,-12,7,8,-14,-20,-13,-10,-6,8,13,-26,-8,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-14,-31,-28,1,-31,-28,31,-23,16,12,-28,-28,-26,-22,-13,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='E'; M=4,-6,-20,-5,12,-16,-16,-12,-8,-8,-5,-8,-6,-13,-2,-11,2,-2,-5,-28,-15,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-28,62,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-14,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-4,-28,-7,-9,3,-22,54,-16,-10,-12,-2,3,-24,-1,-5,-12,-13,-21,-7,38,-9;
MA   /M: SY='T'; M=20,-4,-10,-14,-10,-14,-12,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,30,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-29,63,18,-38,-9,-1,-38,-1,-29,-29,19,-10,-1,-10,1,-9,-28,-39,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-24,1,16,-19,-14,-5,-25,8,-22,-16,3,-7,6,14,7,-2,-20,-28,-15,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-17,-23,-22,-15,-9,-27,-16,7,-3,-1,5,-10,-19,-8,10,-8,3,8,-23,-7,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-30,-3,-16,-31,63,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-17;
MA   /M: SY='S'; M=2,2,-15,-3,-4,-18,-3,-12,-18,-9,-23,-16,9,-7,-3,-10,24,23,-12,-34,-17,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,9,-28,15,11,-27,-17,-3,-26,9,-22,-16,3,-1,2,11,-4,-7,-20,-29,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=8,1,-24,3,20,-28,-5,-7,-24,4,-20,-14,-2,-7,11,-4,4,-7,-20,-25,-19,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-28,-16,-15,21,-28,8,0,-12,0,-1,-18,-23,-12,-12,-17,-10,-7,13,53,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-20,17,1,-21,-1,8,-20,0,-29,-19,52,-18,3,0,12,1,-28,-39,-19,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-14,-25,-16,-1,-17,-25,-5,5,-7,4,16,-13,-17,19,-6,-11,-9,-3,-21,-6,8;
MA   /M: SY='K'; M=8,-3,-23,-5,1,-24,-10,-11,-22,16,-22,-12,-3,-8,1,8,0,-5,-14,-21,-13,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,20,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,29,9,-16,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-28,10,42,-32,-18,1,-25,8,-19,-14,-1,-4,28,1,1,-9,-27,-26,-17,35;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-1,-30,0,11,-25,-19,1,-29,24,-22,-12,4,-16,15,46,-6,-10,-23,-23,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-26,20,11,-24,-14,0,-25,7,-21,-16,7,-13,5,-2,-2,-8,-22,-22,-4,7;
MA   /M: SY='A'; M=20,-10,-11,-14,-10,-16,-7,-17,-6,-11,-14,-10,-5,-14,-9,-14,18,9,4,-30,-17,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-13,-29,-27,0,-29,-28,27,-21,12,10,-26,-27,-26,-20,-10,2,39,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='R'; M=7,-9,-21,-12,-3,-21,-15,-12,-16,17,-16,-7,-7,-15,1,18,-4,-6,-6,-21,-13,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-25,26,8,-27,-9,2,-26,2,-22,-16,18,-14,3,2,1,-5,-23,-33,-16,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-19,-25,-22,-21,25,-27,7,4,-13,1,3,-17,-28,-14,-12,-16,-8,-1,13,52,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,24,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-17,-17,-8,-13,-23,-19,6,-7,-3,0,-15,-18,-8,-9,-2,2,15,-27,-12,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,-2,-15,-4,-1,-20,2,-11,-19,-6,-21,-14,4,-12,-3,-9,20,8,-11,-32,-19,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-27,-4,4,-21,-20,0,-19,19,-13,-5,-2,-16,9,18,-10,-10,-17,-20,-5,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-29,4,-32,-29,32,-23,16,12,-28,-28,-28,-22,-14,-3,40,-25,-5,-29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=3,-2,-26,4,3,-28,-8,-13,-22,-8,-27,-19,-4,28,-4,-15,8,-1,-20,-32,-24,-2;
MA   /M: SY='A'; M=17,-6,-19,-9,0,-23,-2,-14,-17,-5,-18,-13,-4,-2,-3,-8,7,-1,-12,-25,-20,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-4,25,-24,31,10,-31,-1,-4,-30,-3,-27,-22,16,-11,2,-9,9,-4,-24,-35,-20,6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-28,-7,4,-24,-19,7,-25,23,-19,-6,-1,-16,15,36,-8,-10,-20,-21,-7,7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-37,-28,1,-36,-27,43,-27,21,22,-22,-22,-20,-26,-20,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-19,-4,0,-17,-11,-5,-19,0,-21,-13,4,-13,5,4,14,11,-14,-25,-7,1;
MA   /M: SY='T'; M=12,-13,-13,-21,-17,-9,-19,-23,6,-15,-1,-2,-12,-16,-15,-17,5,16,14,-26,-11,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-14,-22,-14,-3,-16,-25,-13,2,0,-6,0,-12,-18,2,5,-6,-3,7,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-26,-9,-15,-24,43,-18,-33,-17,-29,-20,0,-18,-14,-17,8,-9,-24,-12,-22,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-18,-20,-14,11,-27,5,0,-6,4,9,-18,-26,-7,-8,-19,-10,-6,3,37,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-26,9,23,-28,-15,-5,-27,18,-25,-16,6,-4,11,7,2,-5,-23,-28,-17,17;
MA   /M: SY='E'; M=4,-3,-20,-1,15,-21,-12,-8,-17,-1,-15,-12,-2,-10,6,-1,9,0,-13,-29,-17,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,7,-26,2,4,-18,-16,1,-23,16,-22,-12,14,-17,9,23,-3,-5,-22,-23,-8,5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-34,-9,1,-29,-16,-17,-19,-8,-28,-18,-15,64,-4,-17,-2,-6,-26,-30,-27,-5;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-19,-30,-23,-5,-29,-26,26,-21,11,10,-23,-19,-19,-21,-12,-5,28,-25,-8,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-9,-12,-18,-13,-9,-11,-17,-5,-11,-6,-5,-8,-14,-12,-16,7,12,3,-21,-10,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-6,3,-22,4,-4,-19,0,-8,-17,-11,-16,-13,3,-11,-9,-13,4,-1,-12,-30,-14,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,13,-9,3,-2,-25,5,-3,-25,-3,-26,-16,24,-19,2,-5,4,-7,-26,-32,-21,0;
MA   /M: SY='B'; M=0,6,-20,4,-4,-20,-10,-1,-15,-5,-16,-11,6,-15,-6,-9,4,3,-9,-30,-12,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-1,3,26,1,-8,-22,-17,-17,-24,-12,-20,-19,-2,-19,-12,-16,6,7,-11,-38,-21,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-31,10,18,-26,-16,-10,-23,1,-20,-17,-4,3,3,-6,-6,-11,-22,-15,-15,9;
MA   /M: SY='B'; M=2,11,-22,8,7,-23,-11,-5,-15,-4,-18,-13,11,-12,4,-9,5,-2,-15,-29,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-14,-6,-15,-14,-19,9,-20,-16,-12,-16,-11,-9,-22,-16,-11,0,-7,-3,-28,-21,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-15,-29,-15,-9,-10,-22,-8,-14,11,-16,-7,-12,-20,-4,14,-12,-10,-9,7,6,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00819;
//
ID   DAGK_PROKAR_MP; MATRIX.
AC   MP01069;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic diacylglycerol kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6183782; R2=0.0137148; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=666; N_SCORE=13.742; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-25,8,35,-28,-17,-4,-23,5,-17,-14,-1,-4,19,-2,4,-1,-22,-27,-17,27;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-30,-37,-31,-24,7,-25,-18,-3,-13,-8,-7,-28,-27,-16,-8,-27,-18,-8,64,24,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,-18,-27,-23,-5,-12,-21,14,-20,11,14,-20,-23,-19,-20,-12,-7,17,-23,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=0,-27,-19,-31,-23,14,-27,-23,18,-25,24,11,-24,-25,-23,-22,-18,-7,15,-16,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-32,-22,6,-29,-16,25,-24,37,31,-26,-26,-14,-19,-26,-10,13,-20,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=6,-24,-21,-33,-23,8,-25,-24,20,-24,15,8,-19,-20,-20,-24,-13,-7,13,-15,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-19,-24,-17,1,-24,-19,15,-25,25,10,-18,-23,-15,-19,-11,-2,8,-25,-5,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-17,-12,-8,-11,-15,-16,-6,-16,-2,-6,-8,-2,-9,-15,8,10,-5,-31,-14,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-25,1,-31,-26,8,-29,-26,16,-25,4,3,-19,-26,-25,-23,-8,-4,19,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-4,-30,-24,20,-14,-19,-2,-26,13,8,-20,-28,-25,-20,-19,-12,-2,-15,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-22,-27,-20,4,-15,-20,11,-28,38,14,-25,-28,-20,-20,-25,-12,4,-20,-5,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-13,-26,-23,-3,-23,-18,20,-15,7,21,-21,-24,-16,-15,-6,0,29,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-33,-25,12,-26,-12,23,-18,17,37,-21,-23,-14,-16,-19,-9,17,-17,3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-15,-22,-17,-10,-18,-23,10,-17,-2,-1,-11,-15,-14,-19,6,8,13,-26,-12,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-17,-33,-26,30,-30,-23,16,-27,26,11,-27,-30,-29,-20,-21,-7,18,-13,7,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=0,-27,-21,-31,-21,2,-28,-23,24,-27,31,15,-24,-24,-18,-23,-21,-8,14,-20,-3,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,44,-29,23,19,-22,-22,-21,-28,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-21,3,9,-22,-12,9,-22,3,-22,-13,11,-11,4,-1,8,3,-18,-30,-11,5;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-13,-27,-24,-4,-26,-27,22,-19,6,6,-21,-22,-22,-20,-4,6,32,-27,-10,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-22,-24,-23,-13,8,-26,-12,-4,-5,15,5,-16,-26,-10,17,-20,-10,-4,-16,0,-13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=4,-22,-18,-30,-24,-5,-28,-27,26,-21,8,8,-18,-20,-20,-23,-7,3,27,-24,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-20,-7,-12,-24,34,-17,-29,-15,-27,-18,3,-15,-12,-15,16,4,-19,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-24,18,6,-28,-14,-9,-24,-4,-23,-18,4,6,3,-9,9,10,-19,-33,-18,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-27,11,35,-27,-17,13,-29,10,-23,-15,3,-6,14,3,2,-8,-26,-30,-12,24;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-27,-25,-19,27,-29,9,0,-15,1,2,-13,-26,-15,-5,-17,-12,-5,1,32,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-23,0,0,-20,-13,64,-27,-10,-23,-7,10,-17,7,-3,6,-7,-23,-33,7,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-4,-31,3,29,-25,-20,-6,-19,1,-16,-7,-9,23,8,-8,-6,-10,-24,-28,-20,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,27,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=32,-7,-13,-13,-9,-22,11,-17,-17,-12,-18,-14,-3,-12,-9,-17,16,2,-7,-25,-22,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-30,-4,1,-28,3,-11,-33,29,-28,-13,0,-14,2,24,-7,-13,-23,-20,-15,1;
MA   /M: SY='N'; M=-3,5,-24,-4,-4,-19,-13,-5,-14,9,-18,-9,15,-17,0,15,-2,-5,-14,-27,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00820;
//
ID   NUCLEASE_NON_SPEC_MP; MATRIX.
AC   MP01070;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA/RNA non-specific endonucleases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1609483; R2=0.0154276; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=195; N_SCORE=8.161; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=87; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-25,1,15,-29,2,-8,-27,6,-23,-14,0,-9,10,-1,4,-7,-22,-25,-19,13;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-22,-34,-23,-17,-3,-10,-15,-14,-4,-9,-2,-21,-23,-10,-8,-23,-18,-17,42,12,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-19,-20,-24,-19,25,-23,13,-6,-20,-1,0,-11,-24,-20,-14,-11,-10,-1,-12,14,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-27,-13,0,-9,-23,-2,-17,9,-8,-2,-6,-19,15,29,-11,-10,-17,-16,-3,6;
MA   /M: SY='A'; M=9,-18,-17,-19,-15,-12,-10,-21,1,-17,-2,-3,-16,-8,-16,-18,0,-1,8,-28,-16,-16;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-21,-6,2,-23,-17,-13,-20,19,-20,-9,-2,-10,6,8,3,9,-12,-23,-12,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-26,-7,-8,-12,-17,-10,-5,-14,0,-5,3,8,-10,-13,-11,-7,-15,-30,-15,-10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-17,-12,-2,-17,-3,-15,-13,-9,-7,-9,-7,-14,-6,-9,5,2,-8,-25,-16,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-26,47,12,-32,-10,-2,-29,-3,-24,-17,13,-11,0,-10,4,-5,-22,-37,-17,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-18,-13,-8,1,-18,-13,-16,0,-14,-10,-2,-16,-8,7,8,15,-8,-22,-5,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-8,-15,-9,-13,-27,29,0,-36,-8,-27,-15,0,-21,-11,-5,-4,-17,-26,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='S'; M=23,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-24,-4,-14,-24,48,-12,-31,-14,-25,-17,10,-17,-14,-14,2,-14,-25,-20,-24,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-26,-21,-29,-26,34,-30,-6,9,-19,6,3,-23,-30,-24,-16,-17,-7,11,6,38,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-26,-22,-9,-10,-28,-11,14,-15,17,17,-17,-20,8,-12,-17,-10,1,-20,-3,-2;
MA   /M: SY='A'; M=30,-17,-12,-24,-16,-11,-11,-22,3,-15,4,-1,-17,-17,-16,-20,-1,-2,12,-22,-15,-16;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-29,-11,-5,-27,0,-19,-21,-12,-26,-18,-12,43,-10,-19,1,-6,-22,-28,-27,-10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-15,-17,-11,-8,-9,-11,-6,-13,-4,-6,-10,-16,-9,-16,6,2,-2,-17,-1,-11;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-12,28,-23,34,7,-25,-10,-3,-24,-6,-18,-19,18,-15,-3,-10,4,-3,-21,-37,-17,2;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-9,-22,-15,-10,-23,5,-1,-13,3,8,-12,-22,-8,-6,-13,-10,-2,-25,-4,-14;
MA   /M: SY='R'; M=4,-8,-20,-10,-7,-20,-1,-14,-20,6,-19,-11,-3,-15,-5,8,4,2,-9,-24,-16,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-16,-27,-20,-16,6,7,-19,-22,-6,-16,-11,-10,-21,-18,-9,-11,-14,-17,4,-2,-15;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,-12,-11,-10,-10,-14,-17,-4,-15,-7,-7,-5,-16,-10,-13,17,19,5,-33,-13,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,9,-24,12,18,-32,-15,0,-23,3,-22,-11,5,-9,28,0,9,2,-23,-29,-14,23;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-29,12,13,-26,-3,-5,-26,-1,-18,-15,6,-5,4,-1,-3,-10,-25,-29,-19,8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-10,-20,-15,-12,-2,-9,-19,-14,-13,-11,-13,-13,-16,-15,-19,-4,-8,-9,9,-4,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-11,2,-22,0,0,-13,-17,-2,-1,-5,-1,19,-2,-16,0,-8,-9,-8,-4,-28,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=7,18,-20,21,5,-28,-6,-7,-25,1,-24,-19,12,-11,-2,-7,9,-1,-17,-32,-19,2;
MA   /M: SY='D'; M=-2,9,-23,14,11,-25,-13,-5,-19,-5,-12,-12,1,-12,8,-8,3,-4,-17,-30,-15,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-12,-5,-8,-12,-17,-15,-12,-8,-13,-12,10,-12,-8,-8,18,42,-5,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-21,-28,-23,51,-25,-7,-3,-21,1,-3,-15,-27,-26,-16,-11,-5,-4,8,36,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-15,-24,-19,-18,22,-25,2,3,-16,11,3,-11,-28,-15,-12,-18,-8,-6,3,36,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00821;
//
ID   GRPE_MP; MATRIX.
AC   MP01071;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   grpE protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5001307; R2=0.0162157; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=504; N_SCORE=13.663; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=62; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=15,-16,-14,-22,-17,-10,-18,-23,10,-16,-2,-1,-13,-17,-16,-19,5,8,17,-26,-12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-19,-29,-20,18,-29,-19,16,-27,36,17,-26,-28,-21,-19,-25,-9,10,-17,3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-25,2,16,-25,-11,-3,-22,7,-20,-12,0,-10,9,1,2,-3,-19,-25,-13,12;
MA   /M: SY='K'; M=-7,2,-26,1,7,-26,-8,-8,-27,22,-25,-13,3,-12,5,16,-2,-5,-20,-24,-14,6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-25,-10,-3,3,-22,15,-9,-10,-1,-1,-4,-21,-5,-7,-12,-10,-12,-16,11,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-4,-13,-29,49,-10,-36,-14,-28,-18,6,-19,-12,-15,0,-17,-29,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-32,-27,3,-32,-26,31,-25,24,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-25,1,19,-23,-21,-8,-17,11,-17,-10,-4,-8,6,3,-1,-2,-12,-27,-14,12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-3,-26,-1,17,-24,-15,-9,-18,8,-17,-12,-4,-4,6,3,-1,-7,-15,-25,-15,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-26,-25,-33,-24,13,-33,-19,28,-23,14,16,-20,-23,-19,-22,-18,-8,19,-14,8,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-27,9,7,-28,3,-7,-29,2,-26,-18,5,-1,-2,-2,2,-7,-24,-29,-20,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,-10,-11,-11,-7,-12,-10,-14,-4,-9,-9,-6,-9,12,-9,-12,0,2,-2,-19,-13,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-15,4,12,-15,-6,-4,-14,6,-12,-8,1,-1,4,2,-1,-5,-12,-15,-10,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-26,-7,6,-18,-23,-11,-7,-1,-6,-4,-9,-4,0,-5,-8,-5,-7,-25,-12,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-27,-4,-15,-27,53,-13,-35,-15,-29,-19,10,-19,-15,-16,2,-15,-29,-23,-27,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-25,16,23,-26,-15,-5,-20,4,-17,-13,1,-8,10,-3,-1,-6,-17,-27,-15,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-26,-4,2,-22,-16,-12,-14,5,-15,-7,-7,3,0,-3,-4,-5,-12,-26,-15,0;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-19,2,-29,11,1,-21,-30,-38,-20,-20,-10,1,8,29,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,28,-12,0,-8,3,-7,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-17,-35,-10,1,-27,-18,-16,-19,-9,-26,-18,-17,67,-8,-18,-7,-8,-25,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-9,10,-23,6,7,-16,-14,8,-20,3,-19,-12,13,-15,2,1,1,-2,-19,-26,-5,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-26,-16,8,-29,-16,12,-17,17,8,-21,-25,-15,-10,-19,-9,8,-12,6,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,-27,-2,-2,-19,-20,88,-26,-10,-17,4,8,-20,9,-1,-10,-19,-27,-30,17,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-28,16,37,-30,-18,7,-26,6,-20,-14,5,-6,23,0,1,-9,-28,-28,-14,30;
MA   /M: SY='A'; M=43,-13,-10,-21,-12,-17,-4,-21,-5,-12,-5,-7,-13,-13,-12,-20,6,0,5,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-19,-30,-25,2,-30,-22,29,-22,17,19,-21,-25,-20,-20,-15,-4,27,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-6,-18,-7,3,-14,-6,-7,-15,-8,-11,-4,-5,-15,3,-9,2,-4,-14,-24,-12,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-22,-10,-4,-16,-21,2,-6,-4,-7,3,-6,-16,4,-1,-3,0,-4,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-11,-21,-11,1,-12,-24,-13,5,-9,1,1,-12,-17,-5,-10,-7,-5,8,-27,-11,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-26,4,16,-25,-14,-9,-22,-1,-22,-17,-6,18,2,-9,0,-6,-22,-27,-17,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-16,5,-1,-21,-2,-4,-19,-6,-20,-14,7,-12,-2,-8,14,7,-13,-30,-15,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-2,3,-25,7,9,-25,-5,-9,-22,-3,-21,-16,0,13,-1,-9,1,-5,-21,-26,-20,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-24,27,18,-28,-3,-3,-28,2,-22,-19,9,-8,4,-5,2,-6,-23,-28,-17,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-14,-20,-16,-11,-5,-17,-5,0,-6,-3,3,-12,-18,-6,-8,-8,-5,3,-15,3,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-4,-28,1,15,-26,-14,-7,-20,2,-20,-13,-6,18,7,-5,-3,-6,-21,-25,-18,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=0,2,-25,6,10,-26,-12,-9,-21,-3,-23,-18,0,20,-1,-10,3,-2,-21,-30,-21,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-27,14,1,-27,18,-5,-31,-3,-29,-20,21,-12,-5,-7,2,-9,-29,-30,-22,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-20,-9,-3,-14,-21,-1,-9,-1,-11,-4,-2,-14,0,-3,3,13,-5,-25,-4,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-17,-33,-29,-1,-33,-29,36,-24,14,13,-23,-26,-25,-24,-14,-5,37,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='V'; M=1,-23,-16,-26,-22,-3,-18,-24,14,-20,8,7,-20,-24,-20,-20,-11,-6,19,-23,-9,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,6,13,-22,-13,1,-22,3,-17,-12,2,-11,7,0,1,-1,-19,-26,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-11,-23,-15,-5,-29,-25,19,-17,6,5,-23,-24,-20,-18,-10,-2,31,-29,-11,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-26,-18,13,-26,-12,11,-17,17,15,-19,-25,-15,-12,-18,-7,7,-13,8,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-27,-2,13,-31,-19,1,-20,14,-20,-4,-1,-12,34,14,0,-6,-21,-23,-11,23;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-27,0,5,-25,-17,-9,-23,21,-22,-11,-1,-4,5,15,-3,-4,-17,-25,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-18,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,13,0,-14,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-21,-10,-2,-17,-21,-7,-13,11,-11,-1,-6,-15,4,10,-6,-1,-10,-22,-6,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-30,-22,14,-30,-16,20,-24,31,19,-24,-27,-18,-18,-24,-10,10,-13,9,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-26,2,-3,-22,5,15,-27,3,-26,-13,16,-18,-1,2,-1,-10,-25,-26,-8,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-29,35,18,-34,4,-4,-36,1,-28,-24,12,-10,1,-7,1,-11,-29,-33,-21,9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-28,-9,0,-20,-19,-5,-23,24,-18,-8,-1,-17,7,45,-8,-7,-16,-21,-10,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-16,-28,-24,-1,-30,-26,23,-22,16,10,-25,-21,-23,-20,-13,1,29,-26,-7,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,31,-29,35,19,-27,-27,-21,-23,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11,-1,-19,-21,-2,-26,28,-19,-9,-1,-20,8,63,-10,-10,-17,-20,-10,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-31,-11,-4,-20,-19,0,-17,-9,-20,-12,-12,39,-8,-14,-7,-6,-20,-26,-14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-18,-9,-20,1,-19,-12,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-2,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-12,-23,-17,-7,-13,-20,-5,-2,4,0,18,-10,-17,5,5,-10,-5,-4,-22,-6,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-21,-18,-12,-12,-17,-20,3,-3,-5,1,-12,-18,-10,-7,-6,-1,8,-24,-10,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,12,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-10,-13,-10,-17,0,-16,-11,-12,-15,-11,-3,-15,-10,-16,13,4,-2,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,3,-27,5,13,-27,-18,-6,-24,25,-23,-10,1,-11,11,15,-4,-6,-17,-25,-13,12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-27,-5,0,-23,2,-13,-25,2,-24,-16,-1,-1,-4,-3,-1,-6,-21,-17,-17,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-1,-27,2,6,-27,-7,-11,-22,3,-25,-16,0,10,1,-5,2,-5,-19,-29,-20,2;
MA   /M: SY='E'; M=1,3,-24,2,8,-26,-1,-9,-22,0,-21,-14,3,-7,2,-5,3,-5,-18,-27,-19,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-27,6,8,-24,-10,-5,-24,9,-24,-14,4,0,5,5,-1,-5,-21,-25,-13,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-18,0,7,-24,-7,-9,-21,2,-20,-14,2,-9,3,-1,3,-4,-16,-27,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-24,3,15,-24,-7,-6,-18,-3,-13,-11,2,-12,8,-6,0,-6,-17,-27,-17,12;
MA   /M: SY='D'; M=3,7,-24,9,8,-27,-10,-10,-23,1,-24,-18,4,7,-1,-7,6,0,-19,-31,-20,3;
MA   /M: SY='D'; M=0,13,-22,16,11,-26,-9,-7,-21,0,-20,-16,7,-12,1,-5,4,-4,-15,-31,-18,6;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-22,-3,9,-20,-16,-10,-15,5,-12,-10,-4,-12,1,4,1,-2,-10,-27,-14,4;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-23,4,4,-22,-3,-8,-16,-6,-20,-15,12,-6,-4,-10,4,-4,-15,-32,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,9,-27,15,23,-30,-4,-8,-29,1,-24,-20,2,0,4,-7,3,-7,-24,-30,-21,13;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-29,0,18,-27,-9,-7,-18,0,-17,-10,-3,-3,12,-5,-3,-10,-19,-25,-17,15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00822;
//
ID   RIBOSOMAL_L24E_MP; MATRIX.
AC   MP01073;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L24e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1583323; R2=0.0151846; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=712; N_SCORE=15.960; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-21,-21,-27,-17,-5,-20,-8,14,-12,13,38,-21,-6,-6,-13,-17,-9,7,-22,-6,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-27,2,12,-25,-18,-5,-27,26,-22,-11,1,-12,10,30,-5,-7,-20,-23,-12,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-22,-26,-20,-4,-27,-23,14,-17,4,4,-18,-20,-13,-17,-9,3,13,-4,-2,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-14,2,-29,5,24,-22,-19,6,-27,16,-20,-13,3,-11,13,23,-5,-10,-25,-22,-7,17;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-8,-20,-10,-6,-13,-22,-14,-3,-2,-1,-1,-7,-19,-4,-3,-6,0,1,-26,-10,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-12,103,-18,-24,-22,-28,-27,-31,-27,-21,-21,-15,-37,-27,-28,-9,-10,-12,-49,-29,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-18,-1,-4,-11,-11,0,-17,-7,-19,-14,2,-16,-2,-5,15,7,-12,-21,2,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,69,-30,-11,0,-26,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,14,41,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-13,73,-19,-19,-20,-19,-23,-26,-23,-24,-20,-9,-29,-19,-23,8,1,-10,-46,-26,-19;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-27,-7,-15,-28,55,-15,-36,-17,-30,-20,2,-18,-15,-18,6,-13,-27,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-23,-5,-1,-14,-10,-3,-20,5,-19,-10,0,-15,4,2,2,-2,-16,-17,0,1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-29,5,11,-27,-18,-9,-23,16,-22,-10,-3,7,3,6,-5,-6,-19,-27,-15,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-38,-29,6,-37,-29,41,-28,20,17,-22,-23,-23,-27,-19,-8,30,-20,0,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-9,-30,-5,10,4,-26,8,-11,-4,-7,-7,-13,-12,1,-7,-13,-10,-17,2,33,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-18,-7,-4,-16,-19,19,-21,1,-17,-7,2,-15,0,6,3,10,-14,-26,0,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-13,-25,-17,-9,-11,-26,-17,0,7,-4,2,-10,-14,-6,4,-10,-1,1,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-19,-23,-23,-13,-5,-23,-5,6,-4,15,29,-17,-22,1,5,-19,-10,1,-20,-3,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-24,-30,-26,51,-30,-3,2,-20,6,1,-21,-30,-26,-16,-19,-9,0,16,49,-26;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-14,-31,-28,-2,-29,-29,31,-21,10,10,-26,-26,-26,-22,-10,-2,41,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,3,-22,-20,5,-30,30,-22,-10,1,-18,10,57,-10,-11,-21,-21,-8,3;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-23,2,-5,-21,3,-6,-20,5,-25,-14,20,-17,-4,2,4,-2,-17,-30,-18,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-15,-8,-15,-26,41,-17,-33,-17,-29,-20,3,-18,-15,-17,10,-8,-23,-27,-27,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-2,-21,-4,3,-23,-14,-9,-23,18,-23,-11,2,-12,7,18,7,6,-14,-26,-13,4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-17,-26,-21,-4,-29,-26,24,-19,7,7,-20,-22,-20,-20,-6,4,30,-28,-8,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-21,-33,-25,47,-29,-15,7,-26,20,7,-23,-29,-28,-18,-21,-8,4,1,25,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-29,-18,-10,6,-23,3,-15,0,-8,-5,-9,-23,-4,14,-15,-10,-15,6,15,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,74,-29,-19,1,-29,11,4,-20,-29,-37,-19,-20,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-20,68,-27,-24,-14,-29,-24,-15,-25,-8,-9,-20,-34,-20,-24,-12,-9,-4,-38,-18,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-1,11,-16,5,0,-20,-3,-2,-22,0,-29,-18,24,-15,2,5,23,9,-18,-37,-18,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-16,-3,-2,-22,1,-9,-22,-1,-26,-17,9,-13,-1,1,21,7,-14,-32,-19,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,94,-24,-24,-20,-25,-26,-28,-26,-21,-20,-14,-34,-24,-26,-1,-3,-10,-48,-28,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,4,25,-22,-18,10,-24,10,-17,-8,0,-9,10,6,-4,-10,-22,-26,-10,17;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-23,-2,5,-24,-14,-8,-25,23,-26,-13,3,-13,5,22,5,-1,-15,-27,-14,4;
MA   /M: SY='N'; M=-1,5,-18,-3,-7,-8,-10,-1,-9,-10,-10,-9,15,-20,-6,-9,5,1,-13,-25,-2,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00824;
//
ID   TERPENE_SYNTHASES_MP; MATRIX.
AC   MP01074;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Terpene synthases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5178800; R2=0.0125395; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1074; N_SCORE=17.975; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=159; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=1,-8,1,-13,-10,-16,-18,-7,-14,-4,-15,-9,-5,-18,-8,-3,5,9,-3,-31,-12,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,1,-34,-25,37,-25,21,22,-24,-24,-21,-24,-18,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=1,3,-23,1,13,-24,-12,-6,-24,16,-22,-14,6,-11,7,15,2,-4,-19,-26,-16,9;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-24,6,8,-25,-12,-3,-19,8,-21,-13,13,-13,9,7,3,-4,-19,-29,-15,7;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-16,-17,-13,-23,21,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,35,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-1,12,-26,18,24,-32,-14,-3,-27,9,-22,-15,3,-7,17,0,1,-8,-23,-27,-17,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-6,-34,-26,2,-34,-26,26,-29,27,14,-25,-27,-22,-25,-22,-9,19,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-26,-10,3,-16,-23,-10,-14,17,-6,-3,-9,-18,1,24,-13,-9,-8,-22,-9,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,2,-28,5,12,-26,-17,-5,-30,28,-26,-14,3,-12,9,32,-2,-6,-21,-25,-13,9;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-20,-5,7,-17,-17,-11,-9,-1,-13,-4,-2,-10,2,-5,9,9,-7,-29,-13,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,-4,5,-20,-17,14,-24,12,-16,-8,4,-16,6,23,-6,-10,-20,-25,-7,3;
MA   /M: SY='P'; M=10,-14,-28,-13,1,-24,-15,-19,-12,-9,-18,-13,-14,38,-8,-19,-3,-7,-15,-26,-23,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-30,61,27,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-28,-20,-13,34,-29,9,-4,-12,0,-2,-18,-26,-13,-11,-18,-10,-10,18,57,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-11,-30,60,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-7,-7,-3,-20,-11,-8,-25,5,-25,-16,3,-17,1,21,15,5,-14,-33,-17,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-23,-13,-17,-27,47,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-34,-28,1,-33,-26,35,-24,18,19,-26,-26,-23,-23,-16,-5,36,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,4,63,-10,-18,-20,-18,-14,-26,-18,-24,-20,13,-32,-18,-18,-2,-6,-18,-46,-26,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-17,-21,-17,-5,-27,-23,11,-18,6,2,-9,-15,-14,-17,3,26,10,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=18,-10,-23,-14,-16,-26,45,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=6,-2,-11,-10,-10,-13,-11,-19,-13,-11,-13,-11,0,-11,-10,-12,19,38,-3,-29,-13,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-29,-37,-33,-25,2,-10,-18,-8,-16,-7,9,-28,-25,-13,-16,-28,-22,-16,70,12,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-19,-16,-26,-19,39,-18,-17,-7,-22,-4,-7,-10,-22,-25,-17,1,0,-3,-8,10,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-15,-21,-18,-16,7,-23,-5,-15,-9,-6,-14,-18,-18,-20,2,-5,8,-23,-19,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-17,-28,-21,6,-29,-22,19,-26,35,15,-27,-28,-21,-19,-20,-2,18,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-3,16,-2,13,-26,-12,-13,-30,-2,-23,-19,-5,-16,-2,-8,0,-8,-21,-35,-23,5;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-12,-15,-9,-21,8,-18,-16,-11,-17,-13,-5,-11,-9,-18,15,2,-6,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,18,-30,-20,18,-30,45,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-16,4,-21;
MA   /M: SY='N'; M=5,6,-18,-2,-5,-19,-9,8,-15,-1,-19,-10,14,-17,-3,-4,6,-2,-11,-31,-12,-5;
MA   /M: SY='C'; M=14,-13,19,-21,-17,-15,-15,-21,-8,-16,-9,-5,-12,-20,-15,-19,5,6,3,-31,-18,-16;
MA   /M: SY='V'; M=18,-21,-11,-26,-21,-8,-17,-23,13,-15,3,8,-21,-21,-19,-19,-3,-1,26,-25,-13,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-28,-10,-16,-29,52,-19,-36,-11,-28,-18,-1,-18,-16,-14,0,-17,-26,-20,-27,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-10,-26,-9,-6,-12,-26,-2,1,-6,2,2,-9,-19,-6,-3,-14,-10,0,-25,-4,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,6,-24,9,-2,-8,-19,-8,-20,-6,-16,-15,-1,-4,-9,-5,0,8,-15,-22,-2,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00825;
//
ID   ACETATE_KINASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01075;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acetate and butyrate kinases family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0012383; R2=0.0166528; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=265; N_SCORE=9.404; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-11,2,3,-13,-2,-5,-13,2,-15,-10,4,-4,1,-1,9,4,-9,-18,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-18,-3,-1,-7,-12,-2,-15,11,-15,-8,1,-10,-1,6,-3,-4,-12,-12,0,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-19,-7,-3,-11,-16,-8,-7,8,-4,-1,-4,-14,-2,9,-9,-6,-5,-15,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-33,-26,1,-33,-27,33,-25,16,13,-20,-22,-22,-24,-14,-1,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-20,23,-29,46,22,-29,-29,-19,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,-13,-26,-22,-6,-23,-26,18,-18,3,4,-18,-21,-20,-20,-2,7,27,-27,-11,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-24,-35,-27,2,-35,-27,37,-28,27,18,-24,-24,-21,-25,-21,-8,26,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=14,-13,15,-16,-11,-22,-12,-21,-18,-15,-20,-16,-11,4,-13,-20,6,0,-10,-33,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-1,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-10,39,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-20,-26,-19,0,-29,-21,19,-23,24,13,-20,-22,-14,-18,-14,3,13,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,1,12,-30,-20,-10,-30,48,-30,-10,0,-10,10,29,-10,-10,-20,-20,-10,11;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-33,-26,42,-28,-16,6,-25,8,2,-21,-28,-27,-19,-19,-10,2,13,27,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-4,-16,-7,4,-30,-7,-6,-21,5,-21,-8,-2,-12,19,0,5,-5,-18,-24,-16,12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-32,-24,8,-31,-24,26,-27,34,17,-28,-29,-23,-21,-23,-7,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-33,-26,37,-32,-12,14,-24,16,7,-22,-28,-25,-19,-21,-9,7,3,30,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-29,33,29,-31,-12,7,-32,3,-23,-20,12,-9,8,-4,-1,-10,-29,-33,-16,18;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-6,-25,-10,-10,-11,-15,-7,0,-10,-3,13,-5,-7,-5,-13,-9,-6,-6,-18,-7,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-2,-27,2,14,-26,-16,-10,-20,2,-21,-15,-5,16,3,-6,0,-2,-19,-28,-19,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-24,8,11,-25,-10,-2,-24,8,-23,-14,11,-12,7,7,5,0,-20,-29,-15,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-22,3,15,-24,-6,-5,-22,0,-18,-11,-1,-10,3,-4,2,-5,-18,-29,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-25,-3,4,-19,-18,-12,-9,3,-10,-7,-3,-13,-1,-1,-4,-4,-7,-26,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-17,-22,-15,3,-25,-21,9,-13,7,4,-20,-21,-19,-13,-11,-4,17,-22,-5,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-15,-25,-15,-4,-8,-26,-15,5,-11,9,4,-15,-11,-8,-10,-13,-6,1,-24,-7,-7;
MA   /M: SY='A'; M=10,-8,-16,-11,-1,-17,-14,-14,-8,-5,-6,-4,-9,-14,-4,-8,-2,-4,-4,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-21,-1,4,-21,-15,-7,-17,5,-19,-10,4,-9,6,0,8,8,-13,-29,-13,5;
MA   /M: SY='A'; M=30,-10,-18,-16,-14,-24,28,-20,-22,-14,-18,-14,-6,-14,-14,-20,6,-8,-12,-20,-24,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00826;
//
ID   ACETATE_KINASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01076;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Acetate and butyrate kinases family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7241659; R2=0.0136446; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=525; N_SCORE=11.878; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-3,6,-25,-12,2,-27,16,-22,-11,2,-14,10,26,-2,-8,-21,-24,-12,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-17,-1,10,-14,-12,-2,-15,13,-11,-7,-1,-7,7,21,-3,-5,-12,-14,-8,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=16,-16,-14,-22,-16,-6,-16,-11,1,-13,-2,0,-14,-19,-13,-15,-1,-1,7,-18,-1,-16;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-8,-18,-10,-14,-4,-16,-11,-12,-11,-10,-8,-14,-10,-17,9,0,-3,-22,-16,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-28,3,20,-24,-18,-4,-25,21,-21,-12,-1,-10,11,16,-4,-8,-20,-22,-10,15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-25,-10,6,-5,-25,-10,0,-9,3,3,-12,-16,-2,-10,-10,-7,-3,-21,-4,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-19,-26,-19,3,-27,-16,18,-24,32,20,-22,-27,-15,-17,-21,-8,12,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-26,1,-6,-27,34,-11,-32,-9,-27,-19,13,-17,-8,-11,3,-10,-27,-26,-24,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-27,-8,1,-21,-22,-8,-17,25,-16,-3,-5,-12,3,20,-10,-6,-11,-22,-8,1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,0,-30,5,9,-28,-15,-9,-25,6,-25,-16,-3,22,3,1,-3,-6,-24,-28,-19,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-25,-16,-11,6,-25,-8,3,-14,5,1,-17,-14,-12,-14,-14,-8,-1,-8,16,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,15,33,-27,-16,-3,-26,7,-18,-16,1,-6,10,1,-1,-8,-23,-29,-17,22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,17,-28,22,24,-30,-12,-1,-29,7,-25,-19,10,-3,10,1,2,-7,-27,-32,-19,17;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-22,-16,-24,-18,0,-22,-19,10,-21,20,10,-21,-21,-16,-18,-12,-1,10,-24,-7,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-11,17,-25,8,3,-24,-9,1,-26,20,-28,-15,27,-16,4,21,1,-5,-24,-30,-15,3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-20,-31,-22,5,-29,-21,24,-23,24,18,-23,-24,-17,-20,-18,-5,19,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-12,-24,-22,-5,-27,-25,19,-19,3,4,-16,-21,-20,-19,0,12,26,-29,-9,-22;
MA   /M: SY='C'; M=13,-17,35,-26,-21,-12,-18,-25,-10,-20,-6,-9,-17,-25,-21,-23,-3,-2,3,-31,-19,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-31,-21,7,-29,-17,22,-26,40,27,-27,-27,-16,-19,-26,-10,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-4,18,-21,7,-7,-22,17,-3,-23,-8,-28,-18,33,-19,-7,-8,10,-3,-23,-34,-22,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,1,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-14,-13,-21,-15,-14,-8,-22,2,-16,-7,-5,-9,-15,-13,-20,7,3,7,-25,-15,-15;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-1,-11,-19,-10,-29,-19,9,-10,-1,-10,39,22,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-19,-33,-27,0,-31,-26,33,-23,18,18,-25,-25,-22,-23,-16,-6,32,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='C'; M=10,-9,20,-16,-15,-20,0,-21,-22,-17,-19,-16,-5,-20,-15,-19,9,7,-9,-33,-22,-15;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-6,-21,-12,-18,-4,-21,-7,-11,-9,-9,-12,-13,-12,-20,8,1,4,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-18,-27,-23,-1,-31,1,19,-22,6,10,-15,-24,-17,-19,-14,-9,18,-25,2,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-11,6,-27,8,11,-28,-18,-5,-29,28,-25,-13,4,-12,11,23,-6,-9,-22,-24,-12,10;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,-26,12,1,-26,6,8,-28,2,-27,-16,25,-17,3,1,2,-8,-28,-30,-16,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-28,-6,6,-24,-21,-5,-23,29,-19,-7,-3,-15,11,33,-9,-9,-16,-21,-10,7;
MA   /M: SY='S'; M=9,-12,7,-16,-13,-15,-13,-19,-6,-16,-15,-9,-7,-16,-12,-18,13,6,3,-35,-18,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-28,4,-33,-27,34,-24,17,14,-25,-26,-24,-23,-16,-6,34,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-29,60,21,-37,-11,-1,-37,0,-28,-28,19,-10,1,-9,1,-7,-28,-39,-19,11;
MA   /M: SY='T'; M=2,-9,-10,-15,-15,-8,-21,-22,1,-13,-5,-5,-8,-16,-15,-13,12,33,13,-30,-11,-15;
MA   /M: SY='S'; M=3,10,-13,3,-2,-18,-4,-7,-18,-8,-26,-18,21,-13,-2,-8,28,19,-13,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-2,-21,-14,-14,-7,-10,1,5,-8,4,32,3,-20,-1,-8,-11,-8,-3,-26,-7,-8;
MA   /M: SY='G'; M=9,-9,-25,-12,-17,-27,50,-20,-32,-17,-25,-17,-2,-17,-17,-19,3,-11,-22,-21,-27,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-14,-24,-17,29,-20,-12,8,-19,16,9,-16,-19,-19,-13,-15,-7,4,-3,10,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-7,-6,-6,-7,-12,-13,-7,-7,-8,-7,1,-7,-6,-7,14,32,-1,-20,-7,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-24,-8,-2,-18,-13,-14,-11,-7,-17,-12,-14,51,-8,-13,-6,-6,-15,-20,-19,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-20,-26,-18,5,-26,-18,15,-26,40,15,-22,-28,-17,-18,-24,-9,7,-22,-3,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,16,-27,24,27,-31,-11,-1,-28,1,-23,-20,6,-2,8,-7,2,-8,-25,-31,-19,17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-28,-5,-17,-29,62,-18,-38,-18,-28,-19,1,-18,-18,-18,0,-18,-28,-20,-28,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,21,34,-29,-4,-3,-29,2,-20,-15,2,-7,8,-6,-2,-12,-27,-30,-20,21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,86,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00826;
//
ID   RIBOSOMAL_L37E_MP; MATRIX.
AC   MP01077;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L37e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5494618; R2=0.0108195; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=965; N_SCORE=14.980; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-19,-28,-19,-1,-20,-2,18,-10,18,54,-18,-19,-1,-10,-17,-5,9,-21,-1,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-5,-16,-10,-11,-16,6,-15,-15,-12,-16,-5,0,-14,-8,-13,15,16,-8,-29,-16,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,5,-26,3,7,-28,-14,-9,-27,33,-28,-12,6,-11,6,18,-3,-6,-19,-24,-13,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=9,-11,-24,-10,-3,-25,-8,-16,-18,-9,-22,-15,-9,27,-3,-15,6,2,-17,-27,-22,-5;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-11,-5,-4,-18,-4,-13,-14,-11,-24,-16,3,-8,-4,-12,30,16,-4,-37,-19,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-21,-31,-20,36,-25,-10,4,-17,10,19,-17,-24,-14,-12,-18,-10,0,-5,14,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-27,46,-27,-7,-1,-10,12,27,-10,-10,-19,-20,-10,11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-12,-3,-18,-22,2,-18,21,-14,0,-3,-18,6,42,-12,-11,-13,-21,-6,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-13,7,0,-14,3,3,-13,-1,-16,-10,24,-10,4,-1,4,-2,-17,-19,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-25,1,3,-21,-15,23,-25,17,-23,-9,12,-15,7,23,-5,-9,-22,-24,-4,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-19,1,-4,-20,-3,-8,-19,5,-23,-14,18,-15,-4,0,9,9,-15,-31,-16,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-4,4,-25,-18,-6,-25,25,-25,-11,-2,4,5,22,-5,-4,-19,-23,-12,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-11,-9,-9,-10,-16,-17,-9,-11,-11,-10,1,-12,-9,-10,20,37,-1,-31,-10,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=0,-17,-19,-26,-21,-6,-28,-25,20,-20,5,5,-12,-16,-16,-21,-1,15,18,-25,-7,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-16,-25,-17,-8,-11,-25,-12,-6,7,3,2,-11,-21,-3,22,-15,-7,-3,-21,-7,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-10,-1,-19,-20,-2,-27,28,-19,-9,0,-20,8,61,-9,-9,-17,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-27,-3,5,-22,-16,6,-28,21,-23,-12,4,-16,9,40,-1,-6,-20,-25,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-24,-3,-2,-19,-15,9,-20,13,-21,-9,10,-18,2,22,-1,-5,-14,-28,-9,-2;
MA   /M: SY='S'; M=19,-2,-10,-6,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-23,-17,4,-10,-3,-12,31,18,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-25,-25,-29,-24,50,-30,1,1,-19,7,1,-21,-30,-23,-15,-21,-10,-5,19,55,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-16,16,-26,8,0,-20,-12,64,-26,-6,-24,-8,30,-20,6,0,-2,-12,-30,-34,4,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-29,-26,-1,-30,-27,26,-20,12,10,-24,-25,-23,-17,-11,0,34,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-29,-4,9,-29,-19,10,-25,20,-22,-6,1,-14,27,29,-4,-9,-24,-22,-8,16;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-27,-4,5,-25,-20,-13,-26,36,-26,-10,-2,-11,5,21,-6,0,-17,-14,-8,5;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-26,-2,2,-27,8,-8,-30,14,-29,-15,3,-13,1,6,4,-7,-21,-25,-17,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-13,-24,-14,-10,-3,-24,-1,-8,3,-9,-3,-10,-21,-1,13,-7,2,-5,-8,17,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-11,-13,-8,-20,2,-17,-15,-11,-17,-13,-3,-11,-8,-16,19,9,-5,-27,-20,-8;
MA   /M: SY='A'; M=24,-5,-8,-11,-5,-22,-5,-5,-17,-6,-18,-12,-2,-12,-1,-11,13,2,-9,-28,-16,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00827;
//
ID   MOCF_BIOSYNTHESIS_1_MP; MATRIX.
AC   MP01078;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Molybdenum cofactor biosynthesis proteins signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4035306; R2=0.0154972; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=503; N_SCORE=13.189; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=71; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=8,-24,-17,-27,-17,1,-21,-20,11,-24,32,11,-24,-24,-17,-20,-18,-7,7,-20,-6,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-28,1,19,-30,-20,-1,-24,19,-21,-8,0,-9,27,17,-1,-3,-23,-23,-12,23;
MA   /M: SY='Q'; M=1,1,-25,0,8,-28,-8,9,-24,3,-20,-9,1,-12,14,3,0,-7,-21,-24,-11,10;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-8,-21,-13,-2,-18,-16,-13,-7,-8,-12,-6,-6,-12,7,-10,6,6,-8,-14,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-31,-25,5,-31,-25,27,-26,32,16,-29,-29,-24,-21,-21,-6,27,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-10,-19,-11,1,-19,-23,-11,-7,4,-7,-2,-7,-16,7,2,-6,-7,-9,-24,-10,3;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-21,-4,3,-21,-13,-6,-16,5,-12,-8,-6,-13,-2,-4,-2,-6,-8,-24,-13,0;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-27,-34,-31,-23,-2,-6,-24,-9,-19,-7,-5,-25,-24,-17,-20,-22,-18,-13,54,5,-18;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-20,14,-26,-23,-6,-26,-22,9,-21,-1,0,-17,-24,-20,-22,-6,0,13,-27,-7,-23; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=1,15,-22,21,7,-27,-3,1,-24,-5,-19,-13,5,-11,-1,-11,3,-6,-18,-30,-16,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-24,5,18,-18,-17,-4,-22,4,-18,-13,0,-12,9,8,4,-4,-17,-27,-13,13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-27,11,12,-17,-8,-3,-23,1,-18,-12,4,-13,3,-5,-3,-10,-21,-22,-8,7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-27,29,23,-34,-8,0,-30,2,-26,-19,9,-9,16,-4,6,-6,-27,-32,-18,20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,8,-29,-24,-4,-27,-24,12,-23,11,8,-22,-26,-21,-21,-12,-2,17,-29,-11,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-26,40,13,-31,-11,12,-30,2,-24,-19,17,-11,8,-1,-1,-9,-26,-32,-12,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=2,-26,-5,-29,-23,0,-26,-24,16,-24,22,9,-26,-28,-23,-21,-16,-5,21,-26,-9,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,25,-29,40,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-13,-15,-20,-16,3,-25,-21,5,-19,9,1,-11,-17,-16,-15,0,24,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-3,6,-13,-5,-9,-11,-16,-14,-10,-9,-10,-10,11,-13,-9,-9,14,35,-6,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-28,-33,-23,13,-32,-24,21,-26,15,9,-22,-5,-22,-24,-20,-10,9,-16,1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=29,-7,-12,-15,-10,-19,2,-19,-14,-11,-14,-12,-5,-11,-10,-17,14,12,-4,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-32,1,13,-26,-21,-9,-19,4,-15,-11,-9,19,7,-1,-9,-10,-23,-26,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-30,-10,-2,-21,-10,-2,-31,24,-21,-11,0,-20,7,60,-9,-11,-21,-20,-12,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-23,-16,-24,-20,-7,-28,-22,17,-12,3,6,-21,-25,-14,-7,-8,0,29,-27,-9,-18;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,44,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-34,-20,-12,-16,-27,-21,4,-16,-12,-6,-21,44,-14,-22,-13,-9,-7,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,25,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-12,-18,-8,-21,-2,-19,-12,-5,-12,-10,-9,-10,-8,-16,8,-1,-2,-20,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-21,-16,-27,-22,6,-29,-24,17,-21,13,7,-19,-22,-21,-19,-7,10,20,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-10,-24,-11,0,-16,-19,-12,-14,6,-6,-6,-9,-7,-2,10,-6,-2,-11,-24,-12,-2;
MA   /M: SY='P'; M=0,1,-28,6,8,-29,-15,-12,-23,3,-24,-17,-5,22,0,-7,-1,-3,-21,-28,-20,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-18,-30,-23,11,-29,-23,20,-26,29,13,-26,-28,-23,-20,-19,-6,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-24,-13,-29,-21,9,-17,-22,4,-25,12,3,-20,-16,-23,-22,-16,-10,1,-17,-4,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-23,17,14,-19,-14,1,-24,-4,-19,-16,4,-10,3,-8,4,0,-19,-28,-11,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-17,-9,0,-23,-23,-11,-22,29,-21,-8,-4,-16,4,30,-11,-10,-14,-23,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-30,11,41,-28,-12,-4,-26,4,-19,-14,-4,6,12,-4,-2,-11,-27,-28,-20,26;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-12,-30,-23,2,-29,-20,21,-23,25,21,-25,-26,-18,-19,-18,-4,19,-24,-4,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00828;
//
ID   MOCF_BIOSYNTHESIS_2_MP; MATRIX.
AC   MP01079;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Molybdenum cofactor biosynthesis proteins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6613722; R2=0.0130463; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; N_SCORE=19.433; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-23,-2,11,-13,-18,-12,-21,13,-17,-12,-3,-10,0,3,-1,-1,-14,-21,-10,6;
MA   /M: SY='A'; M=20,-16,-20,-21,-14,-14,-3,-21,-10,-8,-9,-8,-15,-17,-13,-14,-4,-8,-3,-1,-12,-13;
MA   /M: SY='I'; M=0,-10,-21,-13,-9,-8,-19,-16,1,-10,-2,-2,-8,-16,-6,-12,-1,-3,-1,-23,-7,-8;
MA   /M: SY='S'; M=6,-7,-16,-7,2,-16,-11,-10,-11,-11,-8,-8,-3,-14,3,-10,13,5,-8,-30,-14,2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-27,1,12,-27,0,-5,-25,7,-22,-13,4,-14,9,6,-2,-10,-21,-25,-18,10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,2,-19,-18,-9,-15,-16,-1,-14,-7,-6,-9,-23,-17,-17,-1,-2,8,-24,-8,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,37,-30,52,16,-36,-12,0,-38,7,-28,-26,16,-12,2,8,-2,-10,-28,-36,-18,8;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-19,-33,-26,6,-29,-26,27,-25,18,12,-23,-24,-23,-23,-15,-6,26,-20,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,36,-30,34,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,21,-20,0,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-5,-17,-15,-5,-22,-16,-1,-17,-3,-4,-8,-18,-12,-15,6,19,1,-25,-2,-15;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-5,-12,-18,-10,-25,-18,8,-10,-2,-10,35,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-12,-26,-25,-2,-29,-28,22,-19,6,6,-22,-24,-24,-19,-4,11,36,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=1,-21,-16,-26,-20,-5,-22,-15,15,-8,7,25,-21,-22,-12,-11,-12,-5,21,-24,-7,-16;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,61,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-25,21,22,-26,-19,-8,-19,4,-17,-15,-1,-11,2,-4,-3,-8,-11,-32,-17,12;
MA   /M: SY='R'; M=2,-11,-24,-15,-8,-7,-7,-9,-19,7,-15,-9,-7,-18,-6,11,-6,-9,-13,-11,0,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-25,-31,-25,42,-31,-5,9,-22,12,5,-21,-29,-23,-17,-21,-10,1,11,42,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-12,-22,-20,-2,-26,-24,12,-18,11,4,-18,-22,-20,-16,-3,17,22,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,4,9,-27,-20,-13,-21,17,-24,-13,-6,11,0,4,-8,-9,-15,-27,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-22,-2,15,-26,-15,-8,-19,-1,-18,-12,-3,2,13,-6,8,5,-17,-27,-17,14;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,-15,-27,-22,-5,-24,-25,18,-19,8,6,-20,-21,-20,-21,-5,4,24,-25,-9,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-31,-23,-32,-24,8,-30,-24,21,-28,34,14,-30,-29,-21,-21,-27,-11,13,-3,2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-26,12,28,-28,-15,-4,-28,12,-22,-17,2,-7,10,8,3,-6,-22,-29,-18,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-28,20,31,-31,-16,-1,-30,11,-24,-18,5,-7,16,8,3,-7,-26,-30,-17,23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-27,-18,6,-29,-20,16,-22,40,16,-27,-28,-18,-15,-27,-9,10,-21,-2,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-30,-8,-15,-30,53,-5,-37,-17,-28,-16,1,-19,-10,-16,-1,-19,-30,-21,-23,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=6,-5,2,-6,-11,-9,-2,-15,-12,-12,-10,-10,-7,-16,-14,-15,-2,-6,-3,-20,-13,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,0,-24,0,12,-26,-17,-2,-21,21,-20,-7,0,-9,22,17,-2,-2,-19,-19,-9,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-22,-29,-23,-4,-33,-27,29,-16,8,10,-19,-21,-19,-18,-11,0,27,-24,-5,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-13,-27,-17,-14,-2,-25,23,4,-17,2,5,-6,-22,-7,-13,-14,-12,-4,-14,19,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-9,-37,-30,35,-32,-25,16,-28,10,5,-22,-29,-32,-23,-17,-8,18,-11,9,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-9,-31,-9,-8,-18,-1,38,-30,-9,-23,-10,0,-20,-1,1,-8,-16,-27,-3,5,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-28,-5,-4,-27,14,-12,-32,15,-28,-15,1,-15,-2,15,-1,-10,-22,-22,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-14,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,15,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,0,-19,-8,-1,-9,-11,-10,-13,-3,-10,-9,4,-15,-6,-8,0,-4,-11,-22,-12,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-27,-33,-22,-4,-32,-16,33,-19,16,30,-18,-19,-5,-19,-18,-10,17,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-29,-3,7,-26,-21,-11,-25,42,-22,-7,-3,-12,7,25,-12,-10,-17,-20,-9,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-22,-18,-28,-21,23,-26,-16,8,-22,20,15,-19,-24,-19,-16,-14,3,5,-14,6,-19;
MA   /M: SY='T'; M=3,-12,-18,-18,-16,-6,-10,-17,-3,-16,-1,-3,-9,-17,-14,-16,1,14,0,-19,-2,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-39,-30,62,-31,-22,9,-29,11,3,-21,-29,-37,-21,-19,-9,9,2,22,-30;
MA   /M: SY='G'; M=25,-10,-20,-15,-15,-25,34,-20,-25,-15,-20,-15,-5,-15,-15,-20,5,-10,-15,-20,-25,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-24,-10,-1,-16,-23,-5,-5,2,-11,-3,-3,-13,-2,-3,-1,4,-5,-26,-6,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-24,-30,-20,6,-28,-20,15,-17,15,9,-18,-22,-16,-7,-17,-9,9,-17,-1,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-27,16,9,-28,-12,-6,-27,3,-28,-20,9,11,1,1,4,-3,-25,-34,-21,3;
MA   /M: SY='B'; M=-5,18,-23,15,7,-23,-13,-6,-17,1,-19,-15,16,-12,-1,-5,3,0,-16,-32,-16,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-20,-4,3,-20,-13,-11,-18,18,-20,-10,-2,4,1,8,0,1,-13,-19,-12,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-28,-27,-20,0,-27,-20,11,-21,7,3,-23,-10,-17,-20,-17,-9,4,3,4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-28,-22,-34,-28,21,-32,-19,26,-23,13,15,-22,-26,-24,-21,-18,-8,22,-10,13,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,0,-34,-27,26,-31,-24,11,-29,20,7,-24,-30,-29,-22,-21,-9,11,-16,4,-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-11,-24,-15,-18,-24,43,-17,-26,-16,-19,-7,-5,-18,-15,-19,0,-14,-18,-20,-24,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-5,-27,-18,3,-29,-20,9,-22,34,13,-26,-29,-18,-16,-26,-10,5,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-32,-9,-1,-26,-17,-19,-19,-10,-28,-19,-13,65,-9,-17,1,1,-24,-31,-26,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,8,-25,-1,-11,6,-16,15,-9,-5,-14,-9,18,-25,-5,-5,-6,-5,-19,-3,33,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00828;
//
ID   BH1_MP; MATRIX.
AC   MP01080;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Apoptosis regulator, Bcl-2 family BH1 motif signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1882591; R2=0.0146304; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=210; N_SCORE=8.251; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-17,-4,-6,-14,-17,-15,-9,-7,-10,-8,1,-13,-7,-9,11,19,-4,-30,-11,-7;
MA   /M: SY='P'; M=2,-13,-12,-15,-11,-18,-19,-19,-5,-14,-14,-9,-10,14,-12,-18,-1,-1,-4,-30,-20,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-2,-27,1,-1,-8,-3,-11,-18,-9,-14,-11,-3,-17,-7,-8,-6,-11,-14,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,10,-17,5,6,-19,-7,1,-20,-5,-23,-16,17,-12,1,-6,18,14,-17,-35,-15,3;
MA   /M: SY='A'; M=13,-6,-21,-8,-6,-18,-13,-15,-9,-7,-6,-7,-8,-8,-8,-6,-3,-6,-5,-24,-15,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-11,-26,-13,-8,0,-22,3,-13,6,-11,-5,-6,-22,0,16,-10,-8,-11,-6,17,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-4,-26,-5,13,-24,-18,-9,-10,0,-12,-5,-4,-10,14,-4,-1,-1,-13,-24,-12,12;
MA   /M: M=-9,-6,-24,-3,-1,-14,-20,-8,-8,-3,-3,-4,-7,-18,0,0,-5,-5,-7,-24,-5,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-18,-37,-29,57,-30,-22,8,-28,14,4,-23,-30,-36,-20,-19,-8,11,-1,19,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-1,-15,-9,-7,-9,-15,-13,-8,-7,-12,-9,4,-16,-8,-6,8,15,-2,-28,-12,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-27,-9,0,-25,-6,-7,-20,9,-15,-5,-5,-16,13,14,-6,-8,-16,-21,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-16,-25,-20,-4,-29,-24,23,-17,8,11,-22,-23,-20,-18,-8,3,31,-28,-8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=17,-19,-12,-25,-19,-8,-15,-19,11,-14,3,11,-19,-20,-15,-18,-3,-1,20,-24,-12,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=0,8,-19,5,4,-20,-11,-10,-13,-6,-16,-13,8,-13,-4,-10,7,6,-9,-31,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-23,5,20,-25,-14,2,-22,3,-18,-12,1,-9,13,-1,6,-3,-19,-29,-13,16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-19,-21,-11,-2,-26,-16,12,-19,23,13,-22,-24,-11,-15,-16,-6,11,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-19,-19,-27,-19,45,-26,-17,-1,-23,9,-1,-13,-25,-27,-16,-13,-1,-2,-5,14,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-22,4,14,-24,-16,-6,-24,10,-21,-14,2,-9,8,11,7,6,-17,-28,-14,10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-29,47,18,-36,-8,-2,-35,-1,-29,-25,13,-4,4,-9,3,-7,-28,-37,-20,11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-9,-12,-14,-22,22,-9,-27,-14,-18,-12,-6,-12,-14,-14,-6,-14,-20,-23,-19,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-18,-9,-11,-13,7,-13,-7,-11,-11,-7,-3,0,-11,-12,-2,-3,-6,-17,-14,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-22,-28,-21,0,-29,-22,19,-20,8,12,-18,-8,-17,-20,-11,2,15,-23,-5,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-6,30,-18,14,-1,-19,-2,4,-19,-2,-28,-19,47,-18,-1,-2,16,7,-24,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,12,-21,-24,-18,-19,-18,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-28,-28,135,36,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,37,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-3,-32,-29,-1,-32,-29,28,-23,12,10,-27,-29,-28,-23,-13,-3,39,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-14,-15,-12,-19,8,-20,-16,-12,-14,-12,-5,-12,-12,-17,11,11,-6,-23,-19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-22,-34,-24,26,-31,-20,20,-28,32,18,-25,-28,-24,-21,-25,-10,11,-12,8,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-22,-37,-28,29,-33,-25,25,-29,20,12,-23,-27,-28,-23,-20,-9,19,-11,9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,-9,-14,-11,-7,-14,-3,-15,-10,-12,-15,-11,-5,-15,-9,-14,14,8,0,-27,-12,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=11,-7,-12,-9,-9,-25,30,-17,-29,-15,-25,-18,-1,-16,-12,-17,9,-7,-19,-26,-25,-11;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-22,-14,-15,-20,29,-15,-24,-13,-20,-14,-5,-17,-13,-16,4,-9,-16,-16,-14,-15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-20,-21,-14,1,-20,-14,-3,-3,-4,0,-11,-19,-11,1,-5,1,2,-15,0,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-29,-23,7,-29,-17,21,-23,32,22,-28,-29,-19,-18,-22,-7,19,-19,3,-21;
MA   /M: SY='A'; M=19,-16,11,-23,-17,-12,-15,-22,-4,-19,0,-5,-15,-21,-16,-21,-1,-1,3,-28,-16,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-14,-19,-15,-5,-10,-20,-13,0,1,5,8,-15,-17,-6,-3,-12,-7,3,-21,-7,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-29,2,20,-21,-20,5,-24,19,-20,-10,-3,-11,13,13,-6,-10,-22,-17,0,15;
MA   /M: SY='S'; M=4,-13,-3,-15,-14,-12,-9,-19,-6,-18,-7,-7,-8,-20,-13,-17,10,7,2,-32,-16,-14;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-22,-22,-15,-7,-24,-18,7,-8,2,2,-19,-9,-14,-13,-12,-6,9,-19,-2,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-18,17,15,-28,-12,0,-24,0,-19,-15,13,-14,12,-2,-1,-8,-25,-32,-17,13;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-23,-3,5,-20,-18,-6,-15,6,-10,-6,-5,-15,5,7,-3,-3,-10,-25,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-20,4,19,-27,-9,-5,-24,3,-20,-14,4,-10,13,-2,3,-1,-23,-27,-17,16;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-13,-12,-19,-17,-8,-8,-12,0,-16,-1,7,-7,-21,-12,-16,-4,-5,0,-23,-6,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-18,-7,4,-19,-17,-2,-21,1,-19,-12,-4,2,1,1,1,1,-17,-27,-12,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: M=-8,-14,-28,-10,-1,-16,-11,-16,-11,-12,-9,-8,-15,-1,-6,-14,-10,-10,-11,-10,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-9,-24,-8,-4,0,-15,-11,-9,-10,4,-3,-12,-20,-11,-11,-13,-10,-9,-16,0,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00829;
//
ID   HTH_TETR_1_MP; MATRIX.
AC   MP01081;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TetR-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3627849; R2=0.0178624; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=299; N_SCORE=11.694; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=8; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-29,-7,5,-19,-17,-6,-23,18,-18,-10,-5,-8,6,27,-8,-10,-18,-20,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,8,17,-29,-12,-5,-26,11,-22,-14,2,-7,14,8,1,-5,-22,-26,-16,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-25,-3,7,-26,-18,-1,-16,7,-15,-5,-3,-13,18,9,-2,-6,-15,-23,-11,12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-22,-33,-25,4,-33,-25,31,-28,32,18,-26,-26,-21,-24,-22,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-24,-32,-23,3,-33,-24,31,-25,22,16,-22,-23,-17,-23,-19,-8,20,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-23,12,12,-26,-9,-4,-24,3,-21,-16,7,-11,5,1,6,-3,-18,-30,-17,8;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-13,-17,-10,-16,-5,-19,-6,-12,-5,-6,-10,-13,-11,-18,6,3,2,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-11,-16,-10,-17,-5,-20,-10,-10,-11,-10,-6,-10,-10,-17,14,13,-1,-24,-17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-23,-23,-15,2,-24,-13,7,-16,18,12,-18,-23,-12,-10,-18,-8,3,-15,-1,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-24,-2,11,-20,-18,-7,-15,4,-10,-5,-4,-12,6,7,-2,-4,-12,-26,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-21,-12,-24,-17,-1,-24,-20,10,-22,24,8,-21,-24,-15,-18,-13,1,8,-24,-6,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-21,-31,-21,28,-29,-18,13,-25,15,8,-18,-25,-23,-20,-16,-8,9,-11,8,-22;
MA   /M: SY='N'; M=2,4,-20,1,-5,-19,-6,-6,-13,-8,-14,-10,6,-17,-4,-9,4,-2,-9,-28,-12,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-28,12,32,-31,-17,2,-27,10,-21,-14,2,-7,23,7,2,-7,-26,-27,-16,27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-24,-7,-2,-15,-22,-1,-11,8,-13,-4,-5,-18,2,8,-7,-6,-4,-22,-3,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,63,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-23,-21,-27,-21,17,-26,-9,12,-19,11,14,-20,-23,-17,-16,-14,-6,8,-8,18,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-1,10,-24,12,11,-26,-9,5,-23,-3,-20,-15,8,-8,5,-7,3,-6,-21,-30,-15,7;
MA   /M: SY='N'; M=2,5,-24,4,-1,-26,6,-5,-28,1,-23,-16,7,-15,-1,5,4,-7,-20,-27,-18,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=7,-17,-14,-22,-17,-4,-20,-21,8,-18,12,4,-16,-19,-16,-17,-3,10,12,-24,-9,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-20,-16,-26,-21,-2,-26,-20,18,-19,14,15,-18,-21,-16,-17,-8,7,18,-25,-6,-19;
MA   /M: SY='R'; M=5,-2,-23,-3,1,-23,-8,-8,-22,5,-18,-12,-1,-9,2,11,1,-5,-15,-25,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-26,4,17,-23,-18,-5,-18,8,-11,-8,-2,-12,9,5,-5,-8,-17,-26,-13,13;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-7,-19,-11,-19,0,-20,-11,-11,-11,-11,-9,-12,-11,-19,11,3,0,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-26,0,11,-28,-13,-4,-26,21,-23,-11,0,-11,13,18,-3,-8,-20,-23,-13,11;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-3,11,-20,-16,0,-21,9,-14,-10,0,-14,7,15,-1,-6,-17,-24,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-16,-3,-23,-15,-13,-11,-22,-2,-16,1,-4,-15,-18,-15,-20,1,-2,7,-24,-16,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-3,-8,-28,38,-14,-34,-5,-27,-17,5,-17,-10,-8,-1,-15,-26,-23,-24,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-15,-30,-27,-2,-30,-28,30,-21,11,11,-26,-26,-24,-21,-10,-2,40,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-15,0,2,-21,0,-6,-20,-7,-25,-17,10,-11,1,-9,23,12,-14,-34,-18,1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-26,-7,4,-23,-18,-8,-16,6,-17,-9,-4,4,5,5,-3,-4,-14,-26,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=9,-11,-26,-12,-13,-26,29,-19,-27,-14,-24,-17,-6,3,-14,-17,1,-9,-21,-22,-26,-15;
MA   /M: SY='A'; M=16,-9,-14,-17,-12,-12,-14,-17,-1,-14,-4,-5,-6,-13,-10,-16,8,14,2,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-21,-33,-25,12,-31,-24,25,-27,25,14,-24,-25,-23,-23,-20,-8,19,-18,1,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-26,-16,-16,21,-24,15,-6,-10,-6,-4,-11,-26,-9,-8,-10,-5,-11,12,53,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-16,-32,-17,-11,-7,-21,17,-20,-3,-13,-7,-10,-23,-2,11,-17,-14,-20,20,14,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-10,-29,-11,-9,3,-24,53,-16,-8,-11,-1,-5,-24,0,-1,-14,-14,-19,-3,42,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-31,-21,-39,-30,69,-29,-21,1,-29,8,-1,-22,-30,-38,-20,-21,-11,2,16,27,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-29,-5,1,-27,1,-12,-26,9,-26,-14,-1,4,0,6,-2,-8,-22,-25,-19,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-3,18,-19,15,1,-24,3,-5,-25,-5,-28,-20,22,-14,-3,-7,17,7,-20,-36,-20,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,-2,8,-28,-20,-9,-26,43,-26,-6,-1,-11,10,26,-9,-8,-18,-20,-9,9;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-25,16,15,-27,-9,-1,-27,4,-21,-17,9,-11,6,4,2,-4,-22,-30,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-25,7,12,-28,3,-4,-28,0,-22,-16,3,-11,5,-3,3,-7,-22,-27,-18,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21,10,-30,-19,21,-28,43,22,-29,-29,-19,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-32,-24,20,-26,-19,16,-26,26,17,-24,-27,-22,-20,-22,-9,11,-13,6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-23,7,11,-19,-13,-7,-15,-7,-6,-10,1,-14,1,-10,-2,-6,-15,-28,-15,6;
MA   /M: SY='A'; M=21,-4,-17,-8,7,-19,-7,-10,-16,-5,-14,-11,-4,-9,0,-10,9,0,-10,-24,-17,3;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-20,-11,-26,-19,-1,-25,-20,11,-20,15,12,-19,-19,-16,-18,-10,4,11,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-23,-18,-29,-21,6,-24,-16,13,-20,13,15,-20,-21,-16,-19,-14,-6,9,-11,3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-26,5,11,-20,-17,-2,-18,4,-14,-10,3,-14,6,8,-2,-4,-17,-26,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-25,-2,7,-13,-18,5,-17,-2,-13,-9,-2,-14,6,0,-2,-5,-17,-17,-1,6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-24,-23,-17,-2,-25,-11,15,-19,11,11,-16,-22,-12,-17,-14,-9,10,-19,2,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-22,-17,-7,-4,-22,-13,5,-17,13,5,-17,-19,-8,-15,-15,-9,1,-21,-3,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-3,2,-23,4,6,-23,-9,-5,-23,2,-19,-14,3,-13,3,7,5,-1,-17,-27,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-25,2,7,-22,-15,-3,-19,8,-16,-4,0,-11,8,6,-2,-4,-16,-25,-11,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-22,-23,-16,5,-26,-6,8,-19,15,8,-17,-25,-13,-13,-16,-8,5,-14,5,-15;
MA   /M: M=-5,-9,-23,-10,-6,-11,-11,0,-12,-10,-7,-2,-6,-14,-5,-6,-4,-4,-10,-20,-7,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-13,-4,1,-16,-17,-7,-14,-3,-12,-9,-1,-15,1,-2,2,2,-10,-26,-11,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-2,-20,-2,0,-18,-15,-1,-18,-1,-13,-10,-4,-11,-3,2,-2,-2,-12,-24,-8,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00830;
//
ID   RIBOSOMAL_L7AE_MP; MATRIX.
AC   MP01082;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L7Ae signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7070374; R2=0.0162116; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=302; N_SCORE=10.593; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-25,4,18,-25,0,9,-28,-4,-21,-15,4,-10,4,-7,3,-4,-24,-28,-14,10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,60,23,-37,-10,1,-37,1,-29,-28,21,-10,2,-8,1,-9,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-12,-19,-22,-7,-27,-26,19,-18,4,4,-20,-25,-23,-20,-8,-1,31,-30,-11,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-3,17,-23,22,17,-29,-10,-3,-25,0,-21,-18,10,-10,8,-6,7,-3,-22,-32,-18,13;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,79,-9,-19,-4,-7,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='I'; M=3,-15,-25,-18,-4,-13,-22,-19,9,-15,0,-1,-12,-4,-8,-19,-4,-5,3,-25,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-29,26,49,-30,-17,1,-30,8,-22,-21,9,-3,15,-1,1,-9,-30,-32,-20,32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-32,-26,1,-33,-27,32,-25,20,14,-23,-24,-22,-23,-15,0,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-14,-28,-26,2,-27,-22,22,-19,11,8,-26,-27,-24,-19,-11,-3,33,-21,1,-26;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-10,-20,-14,-8,-17,-15,1,-9,1,4,-15,-20,-12,-12,-4,-2,7,-22,-6,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-8,-30,-9,-6,-2,-22,58,-23,-7,-15,-2,0,-22,0,-1,-14,-17,-23,-10,23,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,36,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,21,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-36,-10,-3,-28,-12,-20,-21,-11,-28,-19,-16,69,-11,-19,-6,-4,-27,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-21,-7,-4,-16,-10,-16,-9,-13,-4,-8,-11,-5,-11,-16,-4,-4,-5,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-27,-17,4,-29,-19,17,-20,38,18,-26,-27,-16,-15,-27,-10,8,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-18,100,-27,-26,-20,-25,-28,-28,-27,-20,-19,-17,-35,-26,-28,-4,-7,-9,-47,-28,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-13,14,-29,19,35,-28,-17,0,-30,14,-23,-19,9,-7,13,13,-1,-9,-28,-30,-18,23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,13,-30,21,31,-25,-19,0,-29,15,-22,-17,2,-8,10,4,-5,-10,-25,-23,-6,20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-8,-28,-10,-2,-14,-22,3,-16,25,-14,6,-7,-16,5,18,-14,-10,-13,-13,7,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-28,3,6,-28,12,-9,-31,12,-29,-16,9,-13,0,4,0,-10,-26,-25,-20,3;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-15,-32,-28,-2,-30,-29,31,-22,11,11,-26,-26,-26,-22,-11,-2,41,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,17,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='V'; M=3,-21,-1,-26,-21,-9,-26,-26,13,-14,0,2,-19,-23,-19,-17,-7,-4,21,-28,-12,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-23,-28,-28,-22,29,-31,-5,9,-13,4,4,-18,-25,-18,-13,-19,-10,1,8,38,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-32,-1,14,-29,-19,-11,-26,21,-27,-15,-6,22,5,10,-7,-9,-24,-25,-18,8;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-17,1,-2,-24,10,-8,-24,-5,-29,-18,13,-13,1,-7,23,6,-18,-34,-21,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,9,-29,-20,-5,-28,40,-26,-8,0,-12,18,35,-8,-10,-22,-20,-10,13;
MA   /M: SY='A'; M=15,1,-20,0,7,-26,-9,-10,-19,6,-19,-12,-1,-10,5,-4,6,-3,-12,-25,-17,6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-24,15,9,-26,-15,-6,-23,5,-19,-15,2,-13,4,8,0,-6,-14,-29,-16,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=4,-8,-21,-11,-1,-17,-15,-4,-17,4,-10,-7,-5,-15,0,13,0,0,-10,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-13,-19,-11,-15,-9,-19,-4,-10,-4,-5,-12,-15,-11,-16,5,0,4,-23,-16,-11;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,4,-25,-22,-10,-17,-25,8,-20,-3,-1,-18,-23,-21,-22,-2,-2,19,-30,-15,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-29,-8,-15,-27,46,1,-36,-15,-27,-16,4,-20,-13,-12,-1,-18,-28,-22,-21,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-24,-18,-9,-11,-26,-7,2,-4,4,5,-12,-20,-2,1,-12,-6,1,-23,-4,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-27,4,17,-28,-8,-7,-28,18,-24,-14,2,-10,9,11,0,-6,-22,-25,-16,13;
MA   /M: SY='T'; M=1,-14,-15,-17,-13,-11,-20,-18,-2,-3,-7,-4,-10,-19,-11,6,3,11,11,-27,-12,-13;
MA   /M: SY='P'; M=9,-11,-12,-12,-6,-23,-6,-17,-20,-8,-22,-16,-8,14,-8,-9,6,0,-15,-29,-23,-9;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,3,-18,-14,-14,-13,-21,-5,-14,-10,-8,-10,-17,-14,-18,10,11,7,-30,-17,-14;
MA   /M: SY='A'; M=18,-16,-3,-22,-17,-12,-15,-23,4,-16,-5,-4,-13,-18,-16,-20,5,2,14,-28,-15,-17;
MA   /M: SY='V'; M=11,-18,-12,-21,-18,-7,-18,-22,8,-17,4,1,-17,-21,-18,-18,2,6,19,-28,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=23,-17,1,-24,-18,-13,-14,-24,3,-17,-4,-4,-15,-19,-17,-22,2,-1,13,-27,-17,-18;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,-13,-27,-20,9,-19,-22,7,-21,8,2,-18,-22,-21,-20,-6,-3,11,-18,-4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-18,-28,-24,-3,-31,-27,25,-21,8,8,-17,-20,-20,-21,-5,12,26,-26,-6,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00831;
//
ID   DNA_PHOTOLYASES_2_1_MP; MATRIX.
AC   MP01083;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA photolyases class 2 signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9044123; R2=0.0145618; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1047; N_SCORE=20.141; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-7,-26,-4,16,-16,-24,-10,-12,8,2,-3,-11,-14,3,2,-14,-10,-13,-23,-10,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-17,-23,-17,-11,-2,-27,0,4,-7,-3,3,-17,-24,5,-7,-10,-7,4,-6,22,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-20,-20,-10,-10,-27,-13,10,-14,14,10,-20,-23,4,-10,-14,-7,9,-23,-6,-3;
MA   /M: SY='K'; M=11,-4,-23,-7,3,-26,-13,-14,-23,29,-23,-10,-4,-10,3,12,-3,-6,-13,-20,-14,3;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-14,-26,-14,-7,-9,-24,26,-12,-5,5,4,-7,-24,-1,15,-17,-13,-13,-23,4,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-1,19,-23,-20,0,-30,24,-20,-13,0,-14,13,48,-7,-10,-23,-23,-13,12;
MA   /M: SY='A'; M=18,-4,-16,-7,0,-23,-6,-14,-20,9,-23,-13,0,-10,0,-1,14,4,-10,-27,-17,0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,9,-20,3,0,-20,-7,0,-23,6,-27,-17,22,-16,3,20,14,4,-20,-33,-17,0;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-6,-24,-6,11,-7,-17,0,-14,-3,-10,-10,-10,-13,1,-10,-4,-7,-14,-7,13,4;
MA   /M: SY='P'; M=18,-10,-20,-10,-4,-23,-7,-17,-16,-10,-23,-16,-7,23,-7,-17,13,3,-13,-30,-23,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-30,26,18,-33,15,-7,-37,-4,-27,-23,7,-10,-1,-10,0,-14,-30,-30,-24,9;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-17,7,21,-24,-7,-6,-24,-3,-26,-20,6,-6,7,-6,26,9,-17,-36,-20,14;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-26,36,-30,-30,-7,-30,-30,9,-24,-1,-1,-26,-34,-30,-24,-10,-4,29,-37,-17,-30;
MA   /M: SY='P'; M=12,-10,-21,-13,-6,-20,-14,-20,-14,-10,-17,-14,-10,25,-10,-17,6,13,-11,-27,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,-20,14,21,-24,-7,0,-24,0,-26,-20,23,-10,7,-3,16,3,-24,-36,-20,14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,33,-27,27,17,-27,-27,-23,-23,-20,-7,30,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=10,-23,-17,-27,-17,0,-20,-20,10,-23,30,10,-23,-23,-17,-20,-17,-7,7,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=36,-6,-10,-13,-6,-20,0,-16,-14,-10,-17,-14,-3,-10,-6,-16,21,7,-4,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-16,25,-26,35,6,-26,-14,0,-19,-4,-12,2,6,-14,0,-10,-7,-10,-16,-33,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-24,74,-30,-30,-13,-30,-30,-9,-26,-9,-9,-24,-36,-30,-26,-10,-6,11,-43,-23,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-19,-24,-26,-19,45,-26,23,-11,-23,-1,0,-9,-26,-22,-13,-16,-14,-11,-4,26,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-3,26,-16,13,0,-20,0,3,-20,-4,-30,-20,42,-16,0,-4,21,7,-23,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,12,-33,22,10,-34,-16,-10,-30,14,-30,-20,1,21,0,0,-6,-10,-27,-30,-20,4;
MA   /M: SY='S'; M=3,13,-13,7,0,-20,0,-3,-20,-7,-30,-20,27,-13,0,-7,30,13,-17,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,32,-23,45,13,-33,-6,-4,-33,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,14,1,-23,-40,-20,6;
MA   /M: SY='N'; M=-3,12,-20,6,3,-23,-7,-4,-23,13,-30,-17,22,-13,3,6,14,4,-20,-33,-17,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-17,7,20,-23,-7,-7,-23,-3,-27,-20,7,-7,7,-7,27,10,-17,-37,-20,13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,23,-17,-24,-26,35,-24,-36,-24,-26,-20,-7,-27,-24,-24,-4,-16,-23,-31,-30,-24;
MA   /M: SY='A'; M=29,-17,-14,-24,-14,-9,-11,-20,1,-17,11,1,-17,-17,-14,-20,-4,-4,4,-20,-13,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-34,-16,-13,9,-26,6,-7,-10,-11,-7,-20,13,-10,-14,-16,-10,-17,9,41,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00832;
//
ID   DNA_PHOTOLYASES_2_2_MP; MATRIX.
AC   MP01084;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA photolyases class 2 signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0941591; R2=0.0114993; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2189; N_SCORE=29.256; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=210; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-20,12,-23,-16,-13,-23,-16,-28,0,-20,-15,-15,-28,-9,18,-17,-15,-19,10,-7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='V'; M=23,-21,-10,-25,-21,-9,-16,-25,12,-15,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,27,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-25,60,-30,-30,-11,-30,-30,-2,-25,-6,-6,-25,-35,-30,-25,-10,-5,18,-41,-21,-30;
MA   /M: SY='M'; M=18,-15,-15,-25,-15,-9,-11,-9,6,-10,6,28,-15,-15,-5,-15,-6,-5,5,-20,-9,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=1,-9,50,-14,-14,-20,-14,-19,-25,-19,-25,-20,-4,-24,-14,-19,17,6,-10,-45,-25,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-25,-40,-30,37,-35,-25,27,-30,15,11,-20,-25,-29,-25,-20,-10,16,-6,14,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-11,65,-16,-16,-11,-16,-16,-16,-16,-11,-11,-11,-22,-16,-16,-5,-5,-5,-27,-16,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-16,-30,-22,-12,-14,-31,-21,13,7,-3,6,-11,-15,-6,-2,-15,-10,7,-20,-5,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,11,-31,-20,5,-25,19,-20,-5,0,-15,37,38,-5,-10,-25,-20,-10,22;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,38,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-33,11,41,-30,-20,-6,-27,4,-23,-20,-6,28,11,-6,-3,-10,-30,-30,-23,25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,12,-30,21,-2,-2,-21,11,-18,-5,-14,-14,-2,-21,-5,-10,-11,-10,-19,-2,34,-6;
MA   /M: SY='R'; M=18,-10,-19,-15,-5,-20,-9,-11,-19,8,-15,-10,-5,-15,-1,21,1,-5,-9,-20,-15,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-25,56,-30,-25,-6,-30,-25,-7,-30,12,-2,-25,-35,-25,-25,-19,-10,-1,-36,-16,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,22,-30,33,11,-31,-15,0,-35,14,-25,-21,11,-15,5,27,-5,-10,-25,-31,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=18,18,-19,21,4,-29,-5,-11,-24,-5,-19,-19,4,-10,-5,-15,5,-5,-14,-29,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,48,-33,-20,3,-27,10,-20,-14,0,-3,32,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-2,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-21,-3,19,-16,-25,-14,-2,-4,-6,-6,-14,-14,-3,-9,-5,-5,7,-30,-15,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00832;
//
ID   RIBUL_P_3_EPIMER_1_MP; MATRIX.
AC   MP01085;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribulose-phosphate 3-epimerase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5562558; R2=0.0158529; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=280; N_SCORE=9.985; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=23,-15,-15,-25,-15,-11,-9,-11,4,-10,4,22,-15,-15,-5,-15,-4,-5,5,-20,-11,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,0,-20,-20,45,-30,12,-20,-5,5,-20,10,38,-10,-15,-25,-25,4,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-23,-15,-14,4,-26,-14,8,-19,24,8,-19,-25,-15,-15,-20,-9,2,-18,5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-27,-6,-5,-21,24,-14,-31,-4,-23,-16,-1,-17,-9,-1,-2,-12,-22,-20,-19,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-24,5,21,-26,-18,-6,-26,16,-22,-15,-1,-6,8,15,-2,-7,-20,-27,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-28,16,37,-27,-19,-2,-24,4,-13,-14,-1,-7,14,-1,-4,-10,-24,-29,-16,26;
MA   /M: SY='L'; M=1,-22,-7,-28,-20,-5,-27,-22,15,-22,16,8,-20,-23,-15,-21,-13,-4,13,-24,-8,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-20,-5,4,-20,-12,-10,-18,4,-16,-9,-5,-9,1,-1,-4,-4,-14,-24,-13,2;
MA   /M: SY='K'; M=7,-1,-21,-2,7,-23,-12,-8,-20,10,-20,-12,0,-11,5,6,5,-2,-13,-24,-13,5;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-21,-18,-25,-21,9,-25,-18,14,-20,15,11,-21,-24,-19,-19,-14,-4,15,-17,3,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-7,-24,-6,4,-4,-20,-13,-2,-9,1,-3,-9,-14,-7,-11,-11,-9,-5,-19,-6,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=0,8,-22,7,8,-24,-11,-3,-21,8,-19,-12,7,-12,7,9,0,-6,-16,-25,-14,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=9,0,-18,-1,-4,-18,-3,-7,-15,-11,-12,-11,1,-15,-5,-13,7,0,-11,-26,-12,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-29,0,-14,-30,52,-9,-38,-16,-29,-20,5,-19,-15,-17,1,-17,-29,-24,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,-8,-21,-14,-5,-11,-20,-4,-16,-3,-5,-12,-17,-15,-19,5,1,5,-23,-12,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-17,33,-29,46,12,-35,-4,-3,-36,1,-27,-25,14,-12,1,-1,0,-8,-27,-34,-19,6;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-25,-28,-28,-22,15,-23,-17,2,-21,5,0,-21,-26,-18,-18,-20,-12,-5,31,15,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-35,-26,13,-34,-25,30,-29,29,16,-25,-26,-24,-24,-22,-9,22,-18,2,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-21,-31,-26,22,-31,-16,20,-23,18,12,-25,-28,-23,-19,-20,-8,17,-8,18,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-15,-32,-29,0,-32,-28,34,-22,13,15,-27,-27,-26,-22,-13,-3,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-21,-25,-12,-3,-20,0,15,-8,16,52,-18,-18,2,-9,-18,-10,6,-21,-2,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,4,-20,-1,-10,-22,31,-10,-26,-11,-25,-17,14,-16,-10,-12,8,-5,-22,-25,-22,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-27,-1,2,-22,-18,70,-27,-7,-20,-3,8,-17,13,2,-3,-11,-26,-30,10,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-10,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-35,-1,2,-29,-17,-7,-23,-3,-29,-18,-5,55,-5,-11,-6,-9,-28,-31,-23,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-22,-31,-22,4,-32,-24,27,-28,32,16,-23,-24,-19,-22,-21,-3,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=4,-2,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-9,-11,-11,-10,-1,-11,-10,-11,19,42,2,-30,-11,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-21,-36,-27,37,-29,-20,16,-26,17,15,-21,-26,-26,-21,-19,-9,11,-7,12,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-8,-15,-30,55,-17,-37,-13,-29,-18,1,-18,-13,-15,2,-16,-28,-21,-27,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-32,-15,-8,-21,-10,-14,-11,-13,-16,-6,-16,38,-9,-18,-10,-11,-17,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-20,-14,-3,-12,-13,-16,-9,-9,-6,-2,-14,2,-9,-12,-12,-11,-10,-24,-14,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-19,-29,-25,4,-31,-18,24,-21,8,9,-20,-24,-22,-20,-11,-1,27,-21,2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-6,-31,-25,1,-30,-26,22,-25,22,11,-27,-29,-24,-22,-17,-6,26,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-1,10,-24,12,17,-29,-13,-4,-25,10,-23,-15,6,-9,13,3,4,-4,-21,-28,-16,15;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-12,-6,3,-22,-8,0,-19,-5,-19,-13,1,-12,3,-6,11,0,-13,-29,-15,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-32,-25,7,-32,-24,28,-27,32,19,-27,-28,-22,-22,-22,-8,24,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-25,-8,0,-20,-17,-5,-22,19,-15,-8,0,-17,7,34,-6,-6,-16,-22,-11,1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-27,-1,7,-25,-15,-5,-24,17,-25,-13,6,-1,9,18,0,-3,-21,-26,-15,6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-14,-24,-16,-9,-9,-23,12,-1,-10,0,5,-9,-20,1,-6,-9,-8,-4,-20,6,-6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-16,-6,-9,-15,-3,-15,-14,-11,-13,-11,0,-15,-11,-13,10,16,-5,-27,-12,-10;
MA   /M: M=-10,-4,-25,-3,0,-6,-18,-9,-14,-6,-15,-11,-4,-2,-6,-9,-1,-1,-13,-23,-7,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00833;
//
ID   RIBUL_P_3_EPIMER_2_MP; MATRIX.
AC   MP01086;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribulose-phosphate 3-epimerase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6628695; R2=0.0162745; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=472; N_SCORE=13.334; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-12,-9,-7,-12,-19,-19,-11,-9,-11,-10,-1,-6,-8,-10,18,43,-3,-30,-11,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-31,-3,5,-27,-15,-9,-21,-8,-29,-19,-6,51,-4,-14,2,-4,-26,-33,-24,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-19,-28,-20,2,-30,-24,23,-24,26,13,-25,-25,-20,-20,-18,-4,22,-24,-5,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-21,14,22,-24,-14,-3,-23,0,-20,-16,6,-10,10,-5,6,-3,-20,-31,-16,17;
MA   /M: SY='F'; M=6,-18,-19,-22,-17,7,-18,-17,-1,-17,-1,-4,-15,-9,-18,-18,-6,-4,2,-12,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-25,-27,-27,-22,8,-31,-15,19,-23,22,13,-24,-26,-17,-20,-24,-11,8,0,16,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-26,14,16,-23,-17,-6,-22,4,-16,-14,0,-7,5,0,-1,-5,-18,-29,-15,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-4,-28,-1,3,-8,-19,13,-17,-4,-16,-11,-5,-4,-1,-6,-5,-8,-20,-11,16,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-26,-20,-30,-22,17,-28,-22,15,-23,16,7,-23,-26,-23,-20,-17,-6,16,-9,5,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-25,-19,-29,-18,8,-26,-19,16,-23,27,16,-23,-24,-18,-19,-19,-8,11,-18,-2,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-11,6,-29,12,12,-26,-13,-2,-25,-2,-25,-18,3,16,2,-6,1,-4,-26,-30,-16,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-4,-25,-2,4,-11,-21,-4,-15,3,-13,-8,-5,-11,1,-2,-4,-4,-12,-20,-2,2;
MA   /M: SY='L'; M=1,-26,-1,-30,-23,1,-27,-25,14,-25,19,8,-24,-27,-23,-23,-16,-6,16,-24,-7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,62,19,-37,-7,0,-38,-1,-29,-28,17,-11,0,-10,-1,-10,-29,-37,-18,9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-19,-27,-21,12,-20,-17,10,-20,18,13,-22,-26,-20,-16,-17,-6,11,-16,2,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-16,-32,-28,0,-31,-29,32,-23,15,12,-26,-26,-25,-23,-13,-4,38,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-13,-27,-19,5,-28,-19,14,-25,35,17,-25,-27,-18,-18,-21,-1,10,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-32,-25,5,-32,-25,29,-26,30,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,28,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,32,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-10,-28,-28,-1,-28,-29,26,-19,7,8,-27,-29,-28,-19,-6,1,46,-31,-11,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-11,18,-27,15,19,-24,-12,6,-24,3,-25,-18,22,-2,7,-1,1,-6,-29,-31,-15,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-30,-4,-17,-31,64,-19,-40,-19,-30,-21,1,-19,-19,-19,0,-19,-30,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-22,-32,-24,57,-21,-19,-7,-18,2,-3,-16,-27,-32,-13,-17,-11,-5,4,20,-24;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-17,-10,-14,-28,42,-17,-33,-16,-27,-18,-1,-16,-12,-17,5,-10,-24,-25,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-8,-19,-29,66,-18,-39,-19,-30,-20,3,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=5,-4,-22,-5,3,-25,-11,-10,-23,18,-25,-12,0,-7,5,12,7,-1,-15,-25,-15,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-20,-39,-29,75,-30,-18,1,-28,10,3,-20,-30,-37,-19,-20,-10,0,9,30,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-26,-29,-22,-2,-31,-18,31,-23,18,20,-12,-21,-12,-21,-18,-9,15,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-4,-34,6,14,-30,-17,-8,-24,-5,-27,-20,-8,47,-2,-14,-4,-9,-28,-31,-24,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-21,6,10,-22,-9,-3,-18,-4,-16,-13,3,-11,1,-6,7,-1,-14,-30,-15,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-17,1,-24,-20,-7,-22,-16,8,-15,2,16,-16,-22,-12,-15,-4,6,14,-29,-10,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-11,-32,-23,15,-30,-20,16,-26,27,16,-23,-27,-21,-20,-21,-6,10,-18,2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-26,10,19,-27,-14,-7,-24,2,-24,-19,5,12,3,-6,4,-2,-23,-31,-21,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,1,8,-28,-18,-7,-29,43,-29,-11,6,-12,9,30,-8,-9,-21,-22,-11,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-14,-34,-27,2,-34,-27,32,-27,24,15,-26,-27,-24,-24,-19,-7,29,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-26,-6,8,-24,-17,-1,-23,17,-17,-9,-2,-14,13,28,-4,-8,-18,-22,-11,8;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-9,-25,-12,5,-9,-20,-12,-11,3,-11,-6,-8,-13,1,-2,-6,-8,-10,-12,-6,3;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-14,-27,-22,0,-24,-24,17,-22,21,10,-25,-26,-22,-20,-13,-2,23,-24,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-28,-7,1,-21,-19,1,-26,27,-21,-9,3,-18,7,47,-8,-9,-17,-22,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-25,-1,11,-25,-17,5,-24,14,-21,-10,2,-11,12,12,0,-1,-19,-25,-10,11;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-17,-24,-22,-13,-4,-18,-7,1,-5,4,13,-16,-20,-5,-6,-14,-9,-3,-6,7,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-19,-20,-26,-21,5,-25,-12,10,-15,1,3,-10,-23,-15,-8,-14,-10,5,-16,4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-10,4,-23,11,7,-28,-15,-11,-24,3,-21,-15,-3,7,0,-4,-5,-7,-20,-30,-18,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-23,0,10,-22,-16,-4,-20,8,-17,-9,-1,-12,8,10,2,0,-14,-27,-13,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-11,-23,-15,-10,-8,-18,-8,0,-9,2,2,-6,-20,-7,-4,-8,-3,-2,-23,-4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-23,5,4,-25,20,-10,-31,-8,-26,-19,8,-12,-6,-11,1,-12,-26,-28,-23,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-15,-25,-18,-3,-28,-18,9,-14,6,4,-18,-15,-14,-11,-14,-7,6,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-27,21,18,-27,-10,-1,-29,2,-25,-20,8,-10,5,-4,3,-5,-25,-20,-14,11;
MA   /M: M=-4,-13,-13,-15,-18,-12,-5,-19,-3,-19,-7,-5,-12,-17,-18,-21,-8,-8,0,-22,-9,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00833;
//
ID   RADICAL_ACTIVATING_MP; MATRIX.
AC   MP01087;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Radical activating enzymes signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3543444; R2=0.0116586; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; N_SCORE=8.273; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=185; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-15,-4,-18,-14,-9,-25,-14,6,-13,5,14,-17,-23,-11,-11,-13,-8,10,-28,-10,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-16,-9,-20,-13,-1,-21,-16,6,-8,7,5,-14,-17,-12,-9,-11,-4,6,-17,-4,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=10,-6,-15,-7,-4,-17,13,-13,-16,-9,-15,-11,-3,-11,-8,-12,7,-1,-8,-20,-17,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-26,-5,2,-16,-18,3,-15,6,-8,-3,4,-12,2,15,-10,-9,-17,-26,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-23,-26,-24,6,-30,-14,24,-20,12,10,-16,-26,-18,-19,-16,-7,18,-13,13,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-8,-22,-11,-11,13,-20,27,-15,-17,-8,-4,0,-22,-11,-10,-6,-9,-13,-19,12,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-24,6,2,-28,5,-4,-27,2,-27,-16,12,-14,8,4,10,-3,-23,-29,-18,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-20,-26,-22,10,-28,-15,24,-19,10,9,-17,-19,-17,-18,-13,-5,17,-7,14,-22; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-8,-22,-7,7,-6,-22,-1,-2,-4,-4,-2,-9,-13,6,-6,-8,-7,-6,-9,10,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-28,8,4,-28,-14,-11,-25,3,-28,-19,-1,23,-2,1,3,-1,-22,-32,-21,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-4,-29,-23,17,-28,-15,7,-23,18,11,-22,-28,-21,-18,-18,-5,6,-14,10,-22;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,7,-19,12,-3,-24,22,-9,-28,-9,-24,-18,7,-12,-7,-12,10,-4,-19,-26,-20,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-13,5,-20,-18,-3,-25,-21,1,-20,3,-2,-10,-23,-18,-17,-2,13,5,-29,-9,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-21,-18,-24,-22,-5,-29,-17,22,-14,4,8,-17,-25,-19,-15,-11,-4,29,-27,-6,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-13,36,-26,42,16,-33,-8,2,-31,1,-28,-23,25,-12,7,-5,6,-5,-28,-37,-19,12;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-11,-16,-12,-19,-23,43,-5,-35,-19,-26,-16,-3,-23,-17,-18,-4,-18,-26,-20,-16,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-34,-10,4,-25,-23,-17,-10,-9,-19,-12,-17,48,-4,-16,-9,-9,-16,-28,-22,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-29,-11,-17,-26,52,-19,-33,-15,-22,-15,-3,-20,-17,-16,-4,-18,-25,-20,-25,-17;
MA   /M: SY='I'; M=1,-12,-13,-19,-17,-11,-13,-20,5,-19,-3,-2,-5,-18,-14,-19,2,5,3,-28,-12,-17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-28,-7,2,-22,-18,-3,-29,31,-23,-11,1,-17,9,55,-6,-7,-19,-22,-11,2;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-19,6,-26,-21,8,-25,-20,1,-22,4,-2,-16,-25,-21,-20,-7,3,4,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=2,-19,-14,-24,-22,-5,-26,-25,17,-18,3,3,-16,-20,-20,-19,1,13,26,-28,-9,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-31,-24,5,-31,-24,26,-27,33,16,-27,-28,-22,-21,-21,-5,22,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-17,-29,-23,12,-28,-21,17,-22,20,15,-22,-25,-21,-18,-14,2,18,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-4,-24,-5,4,-18,-18,2,-16,5,-18,-6,-2,-14,20,3,5,4,-17,-16,5,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-20,-5,-7,-13,-13,-8,-7,-8,-6,-6,10,-14,-6,-7,-2,1,-9,-30,-14,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-13,-23,-18,-13,4,-22,21,0,-18,13,16,-7,-24,-8,-11,-18,-12,-6,-22,7,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-26,-3,3,-22,-10,-5,-24,18,-19,-10,7,-16,5,25,-5,-8,-20,-24,-14,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-12,-30,-9,2,-17,-22,-8,-15,9,-11,-6,-11,5,4,7,-12,-9,-17,-18,-5,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-17,-31,-19,-21,14,-5,2,-12,-14,-10,-8,-14,-27,-14,-13,-16,-14,-18,29,41,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-25,-10,-7,2,-20,48,-16,-10,-10,-1,-2,-20,1,-5,-10,-13,-18,-9,28,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-18,12,-3,-8,-3,6,-16,-3,-23,-16,46,-19,-4,-2,6,-1,-24,-31,-13,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-31,-8,2,-23,-19,-12,-18,7,-18,-10,-11,32,2,4,-10,-9,-21,-22,-17,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-30,17,16,-29,-15,-9,-29,6,-28,-21,0,10,2,-4,0,-7,-26,-22,-17,9;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-9,-9,-8,-3,-13,-14,-9,-10,-11,-9,0,-10,-9,-9,17,29,-2,-23,-7,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-26,-32,-29,-21,3,-19,-18,-2,-13,-5,1,-24,-21,-11,-10,-25,-17,-10,64,14,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: M=-1,-5,-21,-6,-5,-15,-10,-12,-12,-5,-5,-7,-3,-11,-7,-5,-2,-3,-10,-27,-14,-7;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-24,-18,-11,-5,-16,-12,-6,2,-3,2,-9,-19,-6,14,-11,-7,-4,-17,-5,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-18,-5,-5,-14,-4,-1,-21,4,-20,-11,2,-17,-3,2,1,-3,-17,-17,1,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-19,-6,-6,-18,-3,-9,-11,-9,-16,-6,8,-7,-2,-10,9,5,-11,-28,-16,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-24,6,-1,-26,17,-11,-25,-4,-22,-15,1,-14,-4,-8,1,-10,-17,-24,-19,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-10,3,-13,5,1,-20,-17,-5,-18,1,-12,-9,-1,-15,2,3,-1,0,-12,-27,-11,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-10,-22,-7,9,-15,-14,-13,-8,-7,-3,-6,-12,-4,-4,-9,-7,-7,-5,-24,-15,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-22,-23,-14,12,-27,-14,7,-9,3,3,-14,-20,-14,-4,-13,-6,6,-10,9,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-1,-10,-1,-4,-9,-18,-9,-12,-9,-4,-8,-4,-16,-7,-6,1,10,-7,-23,-3,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=9,-7,-17,-10,-2,-17,-16,-15,-6,-3,-8,-3,-10,-14,-5,-7,0,1,3,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-15,-4,-14,-11,-14,-9,4,-9,-11,-6,17,-25,-14,-9,1,0,8,-35,-15,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00834;
//
ID   CAP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01088;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CAP protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5077300; R2=0.0141798; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=273; N_SCORE=8.369; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-16,-17,-10,-13,-12,-18,0,-11,-6,-5,-10,5,-10,-17,1,2,0,-19,-13,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='B'; M=-11,32,-19,30,6,-23,-7,0,-23,-2,-23,-19,28,-12,-2,-5,7,4,-21,-33,-16,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-19,-29,-20,12,-23,-10,19,-17,20,32,-18,-20,-11,-14,-18,-9,10,-13,4,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-12,-19,-13,-1,-15,-22,-13,-2,-5,-3,-1,-12,-17,0,-3,-3,2,4,-26,-11,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-6,6,-26,2,7,-27,7,-6,-27,3,-24,-14,10,-13,6,-1,3,-3,-25,-26,-19,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-16,-30,-24,4,-28,-20,24,-22,29,24,-28,-28,-20,-18,-20,-6,26,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-27,7,27,-29,-17,-5,-28,24,-26,-14,1,-7,17,12,2,-6,-23,-26,-15,22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='R'; M=3,-8,-23,-10,5,-15,-15,-6,-20,7,-14,-9,-5,-14,9,18,-2,-7,-15,-18,-10,6;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,-1,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,-13,-10,-19,-19,-6,-24,-24,7,-14,-1,-1,-13,-19,-19,-14,7,28,22,-30,-10,-19;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-17,-7,-9,-18,5,-14,-14,-12,-20,-13,9,-14,-8,-13,16,10,-10,-31,-18,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=16,8,-19,8,3,-27,-6,-9,-22,-2,-19,-15,1,-11,2,-5,7,-3,-13,-27,-18,2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,26,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,34,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-13,-5,3,-18,-10,-14,-12,-8,-17,-13,-1,-11,-4,-11,20,13,-2,-33,-17,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=7,-4,-17,-6,4,-17,-11,-11,-9,1,-14,-8,-2,-8,0,-5,7,1,-6,-23,-13,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-19,-4,-2,-13,5,-4,-20,-3,-19,-13,0,-13,-2,2,8,-1,-15,-17,-4,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-13,-22,-15,-12,-13,5,-14,-4,-16,-1,0,-8,-16,-5,-14,-6,-9,-6,-18,-11,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-5,3,-27,5,5,-25,-3,42,-29,-8,-21,-10,5,-15,3,-7,-3,-15,-25,-28,-2,2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-24,-5,-2,-25,18,-14,-29,0,-25,-16,1,-14,-5,-2,6,-4,-20,-25,-21,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-28,-8,-6,-19,-1,-12,-21,-12,-26,-17,-8,27,-8,-16,6,-2,-21,-24,-13,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-25,-6,-9,-15,-24,-19,0,-15,-3,-5,-13,10,-14,-18,-8,0,0,-29,-14,-14;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-26,-16,-9,-20,-4,-14,-9,-8,-12,-2,-9,-1,-2,-7,-3,-5,-10,-22,-16,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-23,5,-2,-23,7,13,-27,0,-28,-15,24,-17,-1,-1,7,-5,-25,-32,-14,-2;
MA   /M: SY='C'; M=2,-13,43,-20,-16,-18,-18,-19,-19,-11,-16,-6,-11,-24,-13,-15,-1,-4,-7,-36,-20,-15;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-23,-11,-13,-21,24,-2,-24,-17,-16,-11,-2,-18,-11,-16,2,-10,-17,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00835;
//
ID   CAP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01089;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   CAP protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5255532; R2=0.0132419; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=781; N_SCORE=14.857; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=150; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=40,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,8,-8,0,-27,-23,-15,-30,30,-27,-13,-5,-18,0,15,-10,-10,-17,-28,-15,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=6,4,-22,8,35,-26,-12,-6,-24,2,-19,-18,-1,-4,10,-6,9,-3,-20,-29,-20,23;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-22,-32,-22,2,-26,-10,26,-18,25,45,-22,-22,-8,-16,-22,-10,14,-20,0,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-2,9,-11,-15,-8,-19,-11,-6,-19,5,-3,6,-28,-15,-15,-11,-6,-9,-34,-14,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-36,-14,-4,-24,-20,-16,-12,-10,-20,-3,-20,67,-8,-18,-12,-10,-22,-28,-24,-10;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-19,-2,-5,-19,5,-10,-21,3,-20,-12,10,-12,-5,-1,5,8,-15,-24,-15,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-32,11,42,-31,-20,-3,-27,6,-22,-17,-4,17,19,-3,-2,-10,-30,-29,-21,30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-28,44,18,-34,0,-1,-35,-1,-28,-26,21,-11,1,-8,2,-10,-30,-36,-21,10;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-30,30,0,-35,30,-10,-40,-10,-30,-25,10,-15,-10,-15,0,-15,-30,-30,-25,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-26,-21,29,-30,0,7,-20,20,7,-24,-30,-17,-15,-24,-10,-1,9,44,-21;
MA   /M: SY='V'; M=4,-9,-14,-15,-15,-10,-18,-17,1,-7,-6,-4,-5,-20,-14,-4,2,9,13,-28,-13,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-24,-29,-21,42,-28,-8,-2,-16,10,2,-18,-28,-22,-3,-20,-10,-4,4,29,-21;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,57,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-23,-35,-26,42,-29,-11,12,-22,12,16,-20,-26,-23,-18,-20,-10,5,2,27,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-8,0,-18,-6,-6,-14,-20,25,-18,-10,-14,-6,4,-14,-2,-6,9,24,-11,-30,1,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-17,-15,-11,-11,-18,-18,3,-7,-5,-2,-9,-18,-10,-9,5,3,8,-30,-11,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-35,-31,-37,-30,22,-25,-28,1,-22,-4,-6,-32,-30,-28,-20,-26,-16,2,61,17,-25;
MA   /M: SY='N'; M=2,24,-21,15,2,-24,-5,-1,-22,6,-26,-18,30,-15,-1,-1,5,-3,-22,-32,-18,1;
MA   /M: SY='G'; M=-8,4,-32,12,6,-32,19,-12,-34,-9,-28,-22,0,8,-7,-15,-2,-14,-30,-28,-26,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,3,-22,-1,-5,-26,24,-8,-28,-10,-29,-18,13,-15,0,-10,15,-2,-23,-30,-23,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-30,3,18,-30,-20,-8,-30,43,-28,-12,0,-8,12,25,-8,-10,-22,-22,-12,15;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,40,-30,-20,12,-30,33,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-7,13,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-22,-21,-17,-10,-28,-5,12,-5,-1,6,-15,-22,-13,-8,-12,-7,18,-26,-3,-17;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=6,2,-19,1,22,-21,-16,-11,-19,-1,-15,-15,-2,-5,4,-8,9,12,-14,-28,-17,13;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-17,-20,-17,-9,-23,-23,10,-17,-4,-1,-14,-6,-17,-18,3,11,16,-30,-13,-18;
MA   /M: SY='F'; M=3,-16,-13,-24,-20,15,-22,-22,1,-17,0,-3,-13,-20,-22,-16,1,15,10,-18,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-25,15,44,-27,-15,-3,-27,5,-23,-20,3,-3,15,-3,10,-2,-25,-33,-20,30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00835;
//
ID   TATD_2_MP; MATRIX.
AC   MP01090;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TatD deoxyribonuclease family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1694107; R2=0.0145714; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=511; N_SCORE=12.605; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=92; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-9,0,-30,3,5,-21,-16,19,-28,5,-21,-12,-1,-15,4,7,-9,-14,-24,-5,-1,3;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-29,-19,-33,-26,21,-25,-25,9,-23,8,2,-26,-27,-27,-20,-16,-8,15,7,6,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,3,-30,15,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-27,6,13,-25,-9,-8,-24,11,-20,-14,-1,-14,2,14,-5,-10,-16,-26,-16,6;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-22,5,21,-25,-12,-5,-25,9,-23,-17,7,-8,8,7,8,-1,-20,-30,-18,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-30,0,15,-35,-20,31,-22,5,-20,0,2,-12,49,8,-2,-12,-30,-22,-3,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-28,3,10,-22,-18,-1,-25,19,-20,-11,-1,-13,11,20,-6,-9,-20,-18,-3,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,32,-29,35,19,-27,-27,-21,-23,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-4,-24,-8,-2,-21,-19,-14,-11,21,-18,-5,-1,-14,-1,9,-7,-7,-5,-23,-11,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-27,5,12,-26,-18,-4,-22,13,-16,-8,0,-13,16,12,-3,-7,-19,-25,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-25,-20,18,-26,-11,9,-22,20,7,-22,-27,-18,-16,-16,-5,6,-9,18,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-11,24,-24,21,7,-27,-9,11,-28,9,-29,-18,26,-14,3,3,5,-4,-25,-34,-13,4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-14,-26,-15,-7,-6,-24,-8,-5,10,5,9,-14,-20,-3,5,-19,-10,-6,-14,6,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-32,-27,3,-32,-27,31,-26,26,16,-28,-28,-24,-22,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-21,-23,-31,-25,17,-30,-20,24,-23,11,14,-12,-24,-21,-21,-16,-8,16,-16,4,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-34,-25,4,-33,-23,34,-27,29,23,-25,-25,-19,-23,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-7,15,-14,-14,-14,-16,-15,-8,-16,-14,-4,0,-20,-10,-16,9,7,-4,-36,-16,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='B'; M=-9,20,-23,20,12,-26,-9,-1,-27,8,-28,-20,20,-12,4,7,9,-1,-23,-34,-18,8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,11,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-7,2,-5,-22,-9,36,-29,-12,-22,-11,5,-19,-2,-9,1,-7,-22,-34,-3,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,48,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='D'; M=-18,32,-30,45,17,-37,-13,0,-35,10,-28,-22,13,-11,9,6,-2,-10,-28,-33,-17,12;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-21,-17,-28,-21,17,-26,-22,9,-22,13,4,-18,-22,-22,-19,-9,5,10,-16,2,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-20,-33,-26,8,-29,-23,27,-23,17,17,-22,-23,-21,-22,-16,-7,23,-19,-1,-24;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-18,-9,3,-19,-16,-11,-12,2,-11,-2,-4,-10,6,-4,5,11,-8,-24,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-26,-27,-33,-24,8,-33,-10,29,-26,18,20,-18,-22,-17,-22,-20,-11,16,-18,6,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,4,22,-30,-20,-4,-29,34,-25,-11,0,-9,18,25,-6,-10,-24,-22,-12,20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-31,2,23,-28,-20,-2,-28,19,-22,-13,-2,1,16,26,-6,-10,-25,-24,-16,17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-16,-29,-18,-4,11,-26,8,-7,-16,0,-2,-13,-20,-10,-13,-17,-14,-12,3,11,-7;
MA   /M: M=-3,-6,-24,-7,-10,-16,-11,-15,-5,-10,-7,-6,-4,-8,-11,-9,-7,-8,-5,-27,-15,-12;
MA   /M: SY='A'; M=16,-11,-18,-12,-10,-14,-13,-19,-3,-14,1,-4,-14,-6,-13,-19,-5,-4,1,-25,-16,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-30,3,20,-30,-6,-8,-27,4,-26,-17,-3,14,10,-3,1,-8,-27,-28,-21,13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-26,4,1,-12,-18,-10,-21,12,-13,-10,-2,-16,-4,9,-10,-9,-14,-21,-7,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-18,12,-22,-20,-6,-26,-20,-3,-19,-3,-5,-18,-14,-20,-19,-6,6,5,-27,-6,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00836;
//
ID   TATD_3_MP; MATRIX.
AC   MP01091;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TatD deoxyribonuclease family signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0250821; R2=0.0146127; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=177; N_SCORE=7.602; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-25,-10,-32,-25,19,-28,-24,14,-25,10,5,-19,-24,-26,-22,-12,-3,14,-16,2,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-19,-5,-8,-23,21,-15,-26,-13,-28,-19,4,-6,-8,-14,21,7,-17,-32,-23,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-15,-26,-16,-17,-17,22,-21,-20,-13,-14,-11,-10,-20,-17,-15,-6,-10,-13,-8,-16,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-16,-21,-23,-20,-4,-26,-22,12,-18,3,1,-12,-16,-17,-18,-7,8,10,-12,-5,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-11,-29,-25,-7,-23,-27,19,-23,6,5,-23,-14,-23,-24,-14,-7,20,-27,-12,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-6,9,6,4,-7,-18,-18,-16,-19,-11,-17,-16,5,-16,-11,-12,11,25,-9,-36,-16,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-22,-23,-28,-19,45,-28,-11,1,-21,3,-1,-16,-25,-24,-17,-14,-8,-2,4,29,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-25,-6,4,-18,-19,-10,-17,18,-11,-6,-6,-7,2,15,-8,-7,-13,-21,-10,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-26,3,-1,-18,-11,-3,-24,9,-24,-16,11,-10,1,17,-3,-7,-23,-10,-10,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=20,-2,-15,-9,-7,-20,1,-15,-16,-10,-19,-15,2,-4,-8,-15,15,9,-10,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-26,0,17,-19,-17,-8,-18,5,-15,-12,-2,-11,6,-1,-2,-6,-18,-15,-11,12;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-28,6,27,-27,-15,3,-25,14,-21,-13,1,-7,12,5,-3,-10,-23,-26,-14,19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-20,-17,-14,-7,-14,-9,0,-18,7,1,-8,-17,-13,-15,-6,4,-1,-25,-8,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-19,-3,1,-21,-21,6,-23,12,-15,-7,-3,-19,12,24,-10,-11,-20,-22,-4,4;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-25,7,21,-23,-15,-3,-22,6,-18,-14,0,-9,9,-3,0,-7,-20,-21,-8,14;
MA   /M: SY='V'; M=13,-19,-12,-24,-18,-6,-19,-23,9,-18,10,3,-19,-21,-18,-18,-3,4,17,-25,-11,-18;
MA   /M: SY='I'; M=6,-26,-18,-30,-23,-2,-26,-25,24,-23,19,11,-23,-23,-21,-22,-13,-5,24,-23,-7,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-5,-28,-4,9,-27,-17,-6,-25,22,-23,-10,-2,-4,13,23,-4,-8,-20,-22,-14,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-9,-24,-11,-1,-13,-21,3,-8,1,-9,0,-5,-16,6,-1,-4,-6,-9,-21,0,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-33,-25,3,-34,-26,32,-27,28,17,-24,-25,-21,-24,-20,-5,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-36,-3,2,-30,-17,-17,-22,-9,-30,-21,-14,72,-8,-18,-4,-7,-28,-32,-28,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-18,-21,-15,-2,-22,-18,8,-21,21,8,-16,-18,-14,-17,-10,2,4,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,23,-26,29,31,-29,-13,-1,-28,3,-23,-21,13,-7,8,-5,4,-3,-26,-33,-19,19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-14,-12,-4,-16,-20,-6,-22,16,-15,-9,-5,-20,1,32,-8,-8,-14,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-29,-21,6,-29,-19,21,-26,37,21,-26,-27,-18,-19,-23,-5,13,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-19,-28,-23,-1,-30,-25,25,-23,16,10,-19,-22,-19,-21,-9,4,23,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=20,-7,-2,-11,-7,-16,-5,-13,-16,-12,-20,-15,-2,-14,-7,-15,21,8,-6,-28,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-17,-34,-16,-19,18,-26,-1,-5,-14,-6,-6,-19,-27,-14,-15,-22,-14,-13,42,46,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-18,-10,-19,-14,2,-26,-14,5,-21,24,14,-20,-26,-10,-16,-21,-10,0,-22,-3,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=6,-5,-17,-7,-1,-14,-11,-12,-10,-10,-8,-9,-2,0,-6,-12,5,6,-9,-26,-15,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-35,-14,-6,-22,-23,-9,-10,-13,-17,-10,-18,55,-11,-19,-12,-10,-18,-29,-19,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-23,-8,-4,-10,-22,-10,-4,-1,-9,-4,-5,-19,-8,2,-6,-6,2,-25,-8,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-32,-2,-1,-28,3,-13,-25,-6,-26,-17,-8,34,-4,-8,-5,-11,-27,-25,-24,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-17,-18,-22,-16,27,-23,-6,-1,-13,4,1,-14,-21,-16,-10,-12,-3,0,-2,19,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-27,-3,9,-23,-18,6,-24,15,-19,-9,-1,-5,13,28,-5,-5,-21,-22,-9,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-8,-9,-26,37,-12,-28,-11,-22,-13,-1,-14,-3,-12,1,-13,-22,-17,-21,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-24,-3,4,-26,-8,-8,-21,19,-22,-8,0,-11,12,10,-1,-3,-17,-21,-12,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-25,-11,-1,-17,-17,-15,-8,-1,-10,-7,-10,8,-5,-4,-6,-3,-8,-23,-14,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,19,-6,7,-4,-16,-5,0,-16,-7,-20,-15,33,-19,-4,-6,10,2,-19,-36,-17,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-4,-28,-3,15,-17,-20,1,-20,4,-17,-10,-5,-13,18,7,-2,-4,-22,-6,2,15;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-16,-35,-9,4,-22,-22,-11,-17,-5,-19,-12,-16,45,0,-8,-11,-10,-24,-23,-15,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00836;
//
ID   ADENYLATE_CYCLASE_1_1_MP; MATRIX.
AC   MP01092;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenylate cyclase class-I signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0885320; R2=0.0117982; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1605; N_SCORE=23.015; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=205; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,54,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-18,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,53,-30,-20,8,-30,25,8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,37,-30,-20,12,-30,35,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-9,11,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-8,13,-30,20,-5,-34,40,-12,-40,-12,-30,-24,8,-16,-12,-16,0,-16,-30,-28,-26,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-4,-30,-4,12,-32,-20,6,-24,18,-20,-4,0,-14,41,33,-4,-10,-26,-20,-10,25;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-37,-27,28,-34,-24,25,-30,26,14,-23,-26,-26,-24,-23,-10,14,-10,10,-27;
MA   /M: SY='P'; M=2,-8,-21,-4,0,-24,-8,-14,-20,-10,-30,-20,-1,28,-4,-14,21,9,-18,-36,-24,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-24,20,23,-24,-8,6,-24,4,-26,-20,37,-12,8,0,6,-4,-30,-36,-20,15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,21,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,29,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-34,-20,39,-23,4,-20,0,3,-13,44,7,-3,-13,-30,-23,0,27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-10,-8,-4,-20,0,-14,-16,-10,-22,-16,2,-10,-4,-14,29,12,-6,-32,-20,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-19,-22,-25,-19,-8,-25,-22,23,-22,1,5,-9,-16,-12,-22,3,1,15,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,35,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,25,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00837;
//
ID   ADENYLATE_CYCLASE_1_2_MP; MATRIX.
AC   MP01093;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenylate cyclase class-I signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2976484; R2=0.0129775; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1567; N_SCORE=24.623; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-28,0,15,-27,-16,-5,-24,6,-24,-15,-2,10,14,11,4,-4,-23,-28,-18,12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-24,2,1,-19,-14,0,-13,5,-11,-6,19,-19,7,3,-4,-6,-19,-28,-12,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-28,1,27,-24,-22,-1,-15,1,-4,-4,-7,-10,25,-1,-7,-10,-21,-24,-12,26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-28,12,33,-32,-16,6,-24,8,-22,-12,12,-8,31,4,2,-8,-30,-28,-16,32;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-12,66,-18,-18,-20,-18,-22,-26,-22,-24,-20,-8,-28,-18,-22,11,2,-10,-46,-26,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,23,-32,-22,22,-30,35,16,-26,-28,-24,-22,-26,-10,12,-14,6,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-18,-14,-22,-18,-1,-26,-22,10,-19,16,5,-18,-22,-18,-16,-5,17,15,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=4,-12,-12,-12,-10,-10,-12,-16,-1,-16,-5,-6,-7,-18,-10,-14,15,10,7,-34,-14,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-5,31,-18,15,0,-20,0,5,-20,-2,-30,-20,49,-18,0,-2,17,5,-25,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-25,12,29,-29,-13,3,-24,5,-24,-15,13,-8,22,1,8,-3,-27,-31,-18,26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-32,21,30,-34,-18,-2,-28,4,-24,-18,1,13,18,-4,-2,-10,-30,-30,-20,23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,19,-26,13,21,-29,-12,8,-22,6,-24,-13,25,-12,26,4,4,-6,-30,-31,-16,23;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-22,-34,-26,0,-31,-19,35,-21,18,32,-22,-22,-15,-21,-18,-8,27,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,35,18,-28,-28,-22,-22,-23,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-26,11,18,-16,-22,-8,-12,-9,7,-6,-8,-15,-1,-11,-12,-10,-13,-28,-12,8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-25,-2,5,-25,-20,-12,-25,36,-25,-10,0,-10,5,21,-3,4,-15,-22,-10,5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-10,-18,-18,-6,-24,-24,7,-14,-2,-2,-12,-18,-18,-14,8,29,21,-30,-10,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-18,-16,-18,-12,-2,-18,-16,3,-22,17,3,-13,-22,-12,-16,-1,2,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,11,-26,2,-12,-26,41,-8,-32,-12,-30,-20,25,-20,-12,-12,4,-12,-30,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00837;
//
ID   UPF0076_MP; MATRIX.
AC   MP01094;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0076 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8978386; R2=0.0139127; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=304; N_SCORE=9.117; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=34,-3,-13,-12,-7,-22,4,-15,-14,-9,-16,-12,0,-12,-6,-16,12,0,-7,-24,-20,-6;
MA   /M: SY='E'; M=8,5,-20,3,9,-24,-12,-8,-19,3,-17,-13,3,-11,4,0,4,0,-13,-27,-17,6;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-26,-19,-31,-26,13,-21,-20,18,-22,15,18,-23,-26,-23,-19,-16,-8,20,-18,0,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-25,10,24,-28,-12,-5,-27,10,-22,-16,2,-8,11,6,3,-6,-22,-27,-18,17;
MA   /M: SY='V'; M=5,-23,-8,-28,-21,-7,-26,-26,20,-20,5,5,-20,-22,-20,-22,-8,-3,26,-27,-11,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-33,-24,-22,24,-27,9,-2,-12,-2,0,-24,-29,-11,-12,-24,-14,-12,49,65,-19;
MA   /M: SY='D'; M=5,7,-23,9,6,-28,4,-11,-27,0,-23,-17,2,-11,-2,-7,6,-2,-18,-27,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-27,4,21,-29,-13,-3,-26,13,-21,-12,0,-9,18,12,0,-6,-22,-25,-15,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-26,-30,-29,-24,36,-28,0,-3,-18,-1,-3,-23,-30,-20,-15,-23,-14,-9,43,51,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-18,-38,-30,62,-30,-22,7,-28,12,3,-22,-30,-37,-20,-19,-8,10,1,21,-30;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-1,6,-22,8,2,-24,-10,-6,-19,3,-18,-12,2,-8,0,-3,1,-2,-12,-27,-14,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-17,6,11,-17,-10,0,-15,1,-14,-10,0,6,2,-4,0,-2,-14,-18,-10,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-19,-1,0,-21,5,-10,-18,-6,-18,-13,2,-6,-2,-9,6,1,-13,-24,-17,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,3,-21,3,1,-19,-12,6,-17,-6,-20,-13,6,9,-2,-8,5,2,-17,-29,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-16,-26,-18,-10,9,-21,-10,-11,0,-9,-6,-14,-5,-12,-5,-12,-8,-11,-5,12,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-12,-19,-10,-19,-4,-20,-8,-11,-11,-10,-11,-6,-11,-19,9,2,1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-1,-16,-12,-12,-8,-19,-9,-14,-14,-11,-7,-16,-12,-17,15,6,2,-29,-17,-12;
MA   /M: SY='C'; M=13,-11,40,-21,-18,-17,-17,-24,-18,-18,-14,-14,-11,-22,-18,-21,5,10,-4,-34,-21,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-17,-31,-29,7,-32,-22,28,-21,10,10,-26,-28,-26,-20,-14,-4,36,-18,6,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-27,4,28,-32,-9,-1,-24,4,-20,-11,-1,-7,27,-1,1,-10,-26,-24,-17,27;
MA   /M: SY='V'; M=8,-25,6,-28,-26,-6,-24,-28,15,-19,3,3,-25,-27,-26,-21,-6,-1,33,-31,-14,-26;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-17,-12,-6,-23,5,-16,-20,2,-20,-13,-3,-12,-5,-4,8,-2,-10,-23,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=5,-12,-20,-15,-6,-13,-13,-13,-11,-1,-2,-4,-9,-17,-5,7,-3,-2,-6,-23,-12,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-18,-29,-20,5,-26,-20,18,-25,37,19,-27,-27,-18,-19,-23,-8,13,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-36,-1,2,-29,-17,-14,-22,-5,-30,-20,-6,64,-7,-14,-7,-9,-29,-31,-27,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-9,-31,-7,4,-25,-21,-11,-22,23,-20,-9,-8,11,4,17,-11,-10,-20,-22,-14,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,23,-28,25,1,-31,16,1,-34,-3,-29,-22,21,-16,-5,-7,1,-11,-29,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=15,-20,-17,-23,-19,-7,-12,-21,1,-15,-6,-5,-19,-21,-17,-18,-2,-3,10,-2,-4,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-27,-5,2,-19,-18,-10,-17,16,-6,-3,-7,-17,3,12,-13,-11,-14,-22,-9,2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-28,1,-33,-28,34,-24,18,16,-27,-27,-25,-23,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-37,-25,45,-27,20,26,-20,-20,-17,-27,-20,-10,27,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-25,15,32,-27,-18,-7,-22,6,-18,-16,-1,-7,7,-4,0,-6,-17,-30,-18,20;
MA   /M: SY='A'; M=17,-18,-7,-26,-20,-12,-14,-25,8,-19,-1,-1,-15,-18,-17,-23,-2,-2,12,-24,-14,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-23,-35,-28,-1,-36,-29,39,-26,15,15,-20,-21,-21,-26,-14,-2,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='A'; M=42,-12,-7,-22,-12,-17,-5,-21,-6,-13,-5,-7,-12,-13,-12,-21,5,-1,2,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-16,-21,-16,-6,-21,-12,10,-15,2,5,-16,-21,-13,-16,-4,0,16,-23,-3,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-12,-17,-13,-1,-17,-25,-14,-5,5,-5,-1,-11,-18,0,4,-10,-8,-3,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-24,-4,-3,-25,13,-11,-27,1,-25,-16,6,-10,-5,-1,4,-4,-21,-26,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,2,-27,3,8,-29,-15,-8,-23,8,-25,-14,2,12,8,0,1,-2,-22,-28,-18,7;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-22,-35,-25,32,-32,-22,18,-30,31,13,-25,-28,-27,-22,-25,-10,10,-10,10,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-17,-11,-3,-11,-24,-19,-2,-11,-6,-6,-4,-10,-7,-12,9,29,1,-28,-10,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-17,-3,5,-17,-20,-15,-17,5,-15,-12,0,-8,-1,-1,11,29,-9,-28,-12,2;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-18,-2,-2,-24,9,-12,-26,0,-30,-18,6,-12,-2,-4,23,7,-16,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-20,-20,-16,4,-24,-14,12,-24,34,12,-12,-28,-16,-16,-22,-8,2,-24,-4,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00838;
//
ID   CHITINASE_18_MP; MATRIX.
AC   MP01095;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitinases family 18 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0173679; R2=0.0083036; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=977; N_SCORE=8.128; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=781; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-74,26,35,71,-68,-57,-67,18,-62,-62,7,-69,52,-54,16,-57,-67,-64,-46;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-71,-5,-60,-63,20,-66,-57,12,10,-57,2,-69,6,-6,-9,52,6,74,-60;
MA   /M: SY='F'; M=3,23,-75,-77,95,47,-68,-11,-73,-53,-57,0,-78,-76,-75,-61,-64,-59,-54,-37;
MA   /M: SY='G'; M=44,-70,-68,-11,-67,47,18,13,-12,-22,-55,-61,-70,-63,-68,-54,-58,41,-78,-66;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=18,-72,47,-50,-80,-15,-59,-76,38,-78,-70,42,-67,7,-54,27,33,-70,-86,-70; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-47,-67,-2,-53,-72,-56,-58,-14,-55,-26,-63,4,-65,47,-59,88,20,-62,-82,-65;
MA   /M: SY='V'; M=18,-67,19,-61,-58,-66,-65,-44,-12,22,-51,1,-72,-61,-65,37,-4,48,-78,8;
MA   /M: SY='S'; M=-54,-70,20,14,-66,-67,-65,37,27,-22,-56,-53,-66,-54,-58,53,33,9,-81,-64;
MA   /M: SY='R'; M=17,-76,36,-4,-79,-66,-55,-79,49,-76,-67,3,-68,10,73,-9,-58,-72,-79,-66;
MA   /M: SY='P'; M=-20,-78,-77,-69,72,-75,-72,26,-71,-1,-53,-74,83,-74,-76,-66,-7,-53,47,-45;
MA   /M: SY='L'; M=-19,-70,-83,-76,50,-82,-70,30,-72,54,46,-77,-80,-71,-9,-71,-61,25,-66,-47;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-77,35,-52,-72,40,-58,-80,39,-77,-69,3,-69,8,45,12,-59,-76,46,7;
MA   /M: SY='D'; M=3,-75,75,18,-80,-66,-57,-73,54,-74,-68,-45,-64,32,-47,-52,17,-18,-84,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=49,-75,-6,-64,-39,-65,-51,-61,-63,-23,-55,-1,-75,6,-64,-56,-61,-61,75,99;
MA   /M: SY='N'; M=-56,-72,-58,-10,-67,40,46,12,12,-60,-57,52,-71,-59,-61,-10,-55,47,-83,-64;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-71,-85,-79,78,-84,-67,16,-77,59,22,-79,-83,-76,-75,-75,-63,-8,-56,14;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-80,117,-32,-87,-64,-53,-86,-55,-84,-83,8,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-72,-85,-80,39,-87,-80,71,-78,26,-38,-78,-79,-77,-78,-72,-58,56,-70,-50;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-80,117,-32,-87,-64,-53,-86,-55,-84,-83,8,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-73,-86,-81,73,-87,-74,65,-79,50,-36,-79,-81,-77,-78,-75,-63,-34,-60,-40;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-80,117,-32,-87,-64,-53,-86,-55,-84,-83,8,-67,-54,-63,-55,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-85,17,-74,3,-80,-82,69,-73,-17,-51,-77,-76,-71,-76,-75,-69,-44,138,13;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,-31,112,-84,-76,-53,-85,-41,-77,-73,-57,-55,-34,-51,-57,-61,-77,-80,-74;
MA   /M: SY='Y'; M=-61,-75,-63,-67,26,31,22,-64,-63,-23,-56,25,-75,6,-64,26,-59,-66,-49,95;
MA   /M: SY='P'; M=-17,-79,-60,-9,-6,40,19,-76,-11,-78,-69,1,88,-59,-66,26,-56,-75,-77,-69;
MA   /M: SY='G'; M=-15,-73,20,14,-73,48,-65,-65,-11,-71,-67,3,1,-57,-64,37,-5,20,45,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=5,-73,20,-61,-66,41,-61,-71,-63,-6,-65,-54,1,6,-68,59,-54,-68,-73,33; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-60,50,20,14,-81,5,-65,-74,-9,-75,-69,-55,1,46,-6,12,43,-19,-87,-73; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-75,-4,-64,-74,76,62,-76,-12,-6,-64,-52,1,-61,-67,-9,-63,-73,-78,-66;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-74,-59,-10,-49,-65,-54,-12,-59,-3,-57,52,0,6,-63,26,18,-61,75,70;
MA   /M: SY='P'; M=44,-72,47,-6,-77,-58,-59,-70,-57,-28,-66,52,63,-56,-65,-8,-4,-66,-84,-72;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=37,22,47,-7,-4,32,20,-75,-11,-74,-68,2,42,-59,-64,-53,-59,-70,-75,7;
MA   /M: SY='D'; M=3,-71,55,-8,38,-70,-62,-9,-62,30,-52,2,-72,5,-66,-10,17,-13,-74,-54;
MA   /M: SY='A'; M=50,-69,20,14,-3,-64,-66,-54,-11,-3,-57,-60,27,-59,-64,-9,18,21,-78,-64;
MA   /M: SY='T'; M=4,23,20,-53,-71,6,-61,-64,39,-4,-59,3,-68,31,19,-51,43,-16,-80,-66;
MA   /M: SY='A'; M=37,-72,35,15,21,-66,20,-12,-57,-24,-59,-56,27,6,-7,-9,17,-15,-76,-59;
MA   /M: SY='L'; M=6,-73,-2,-7,-58,-15,-62,-52,-7,56,-47,28,30,-58,21,-61,-59,-55,-76,-63;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-77,74,-39,-84,-60,-47,-79,-47,-79,-69,79,-69,85,-52,-49,-55,-80,-88,-67;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00839;
//
ID   PPIC_PPIASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01096;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5615420; R2=0.0131602; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=327; N_SCORE=8.855; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,7,-27,10,11,-26,-17,-3,-24,14,-17,-11,4,-13,10,16,-5,-8,-20,-26,-13,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-19,-3,6,-15,-17,-6,-11,6,-5,-1,-4,-10,6,5,-4,1,-10,-19,-8,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=13,-22,-17,-28,-18,-4,-20,-22,13,-21,19,8,-20,-20,-16,-21,-11,-5,10,-20,-8,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,-2,8,-20,-15,-7,-17,10,-12,-8,2,-14,5,6,-4,-5,-15,-25,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-24,6,13,-27,-5,-7,-22,2,-21,-14,3,-10,8,-4,3,-5,-19,-27,-18,11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-21,-33,-26,11,-32,-23,27,-26,23,13,-24,-26,-23,-22,-19,-6,23,-17,4,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-14,-24,-15,-7,-10,-22,-10,-5,4,1,0,-11,-20,-3,11,-13,-8,-4,-17,-1,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-25,7,18,-28,-14,-4,-25,14,-22,-13,3,-9,13,8,2,-5,-21,-27,-15,15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,9,-30,14,18,-32,-16,0,-30,18,-24,-14,4,-11,19,21,-4,-10,-25,-26,-14,17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-33,-24,2,-34,-25,34,-28,28,17,-23,-21,-20,-25,-22,-9,21,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,4,-24,3,2,-21,-14,-8,-17,11,-15,-9,4,-15,0,7,-5,-6,-13,-26,-13,0;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=5,3,-18,-1,-2,-21,-1,-3,-18,0,-20,-12,9,-13,1,-4,9,0,-14,-26,-14,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-6,-13,-30,53,-17,-38,-14,-29,-19,0,-14,-14,-14,-1,-18,-29,-22,-28,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-21,7,16,-23,-8,-7,-22,8,-19,-14,0,-4,5,0,2,-3,-17,-23,-15,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,24,-23,31,9,-30,-10,-6,-30,4,-27,-22,13,-11,0,-2,9,3,-20,-35,-17,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=24,-3,-18,-5,7,-23,0,-14,-17,-6,-16,-14,-4,-9,-3,-14,8,-3,-11,-25,-20,2;
MA   /M: SY='E'; M=3,6,-24,10,20,-26,-14,-8,-21,3,-17,-13,-1,-3,4,-6,1,-4,-17,-28,-17,12;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-26,-18,-27,-17,2,-26,-19,15,-24,34,14,-26,-27,-15,-18,-21,-8,11,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-26,-5,3,-24,-17,-7,-20,24,-20,-7,2,-13,8,20,-4,-5,-16,-23,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-26,2,18,-27,-17,-4,-22,11,-17,-10,-2,-10,18,12,-1,-5,-20,-24,-14,17;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-27,-4,-6,0,-23,28,-14,-4,-11,-4,-2,-22,-3,-1,-11,-11,-15,-11,24,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,-1,-10,-20,-10,-29,-20,10,-10,0,-10,39,21,-10,-40,-20,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-22,-2,12,-19,-18,-4,-8,-3,-9,-5,-4,-9,7,-7,-1,-2,-10,-23,-10,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-12,55,13,-37,-11,-2,-39,-4,-29,-28,15,-14,-4,-12,-1,-10,-28,-41,-21,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-8,-12,-7,-17,-17,-16,-13,-9,-16,-12,-11,19,-10,-11,-2,1,-13,-26,-16,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-17,-11,-12,-13,14,-13,-11,-14,-9,-7,-3,-14,-11,-14,2,-5,-8,-17,-11,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-11,-2,-1,-19,-4,-11,-18,-9,-26,-17,8,-10,1,-9,35,24,-9,-37,-18,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=28,-7,-16,-13,-6,-22,1,-16,-17,1,-17,-12,-5,-11,-6,-8,8,-2,-8,-21,-17,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-24,0,6,-21,-16,-7,-14,4,-11,-5,-1,-8,4,-1,-3,-5,-14,-26,-14,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,6,-26,2,8,-25,-15,1,-23,19,-23,-10,11,-14,17,20,-2,-6,-23,-23,-10,11;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-30,64,-19,-39,-17,-29,-20,0,-19,-18,-17,0,-19,-30,-20,-29,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-29,45,22,-34,-14,0,-33,4,-24,-22,12,-10,6,-2,-1,-9,-27,-35,-17,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,22,-29,45,23,-28,-28,-19,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-26,-40,-25,-14,8,-19,-20,-19,-13,-17,-16,-26,-19,-14,-15,-26,-21,-24,78,19,-12;
MA   /M: SY='F'; M=0,-19,-18,-26,-18,18,-19,-20,4,-20,3,-1,-15,-22,-23,-18,-7,-3,7,-14,1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-20,0,0,-20,-3,-8,-20,-2,-20,-13,5,-13,-1,-3,8,2,-14,-29,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-31,-4,6,-25,-17,-9,-20,1,-20,-14,-6,27,1,1,-6,-8,-23,-27,-20,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,5,-26,2,-7,-28,35,-11,-32,-10,-28,-19,12,-17,-8,-12,4,-11,-27,-26,-25,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-20,-2,4,-19,-16,-6,-7,-2,-8,-1,-2,-11,11,-5,1,1,-9,-23,-10,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-23,-21,-29,-21,15,-27,-8,14,-19,21,25,-21,-24,-14,-15,-19,-5,6,-10,15,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-8,-22,-4,-8,-15,-21,-13,-2,-10,-9,-6,-13,-3,-7,-14,-5,-3,4,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-33,-4,4,-29,-17,-16,-22,3,-28,-18,-11,49,-4,-8,-4,-7,-24,-28,-24,-3;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-23,0,17,-24,-15,-10,-18,-2,-14,-13,-5,3,5,-9,3,0,-16,-27,-18,10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-38,-28,70,-30,-18,2,-29,14,2,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,7,29,-28;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-26,10,28,-26,-17,-6,-24,9,-19,-15,0,-6,10,5,1,-4,-20,-27,-16,18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-26,22,20,-31,-14,-2,-28,11,-23,-16,8,-9,13,3,1,-5,-24,-29,-16,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=30,-11,-5,-20,-12,-16,-9,-20,-8,-10,-8,-7,-11,-14,-11,-14,6,5,2,-23,-17,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00840;
//
ID   HUPF_HYPC_MP; MATRIX.
AC   MP01097;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydrogenases expression/synthesis hupF/hypC family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=24;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=22;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2373390; R2=0.0142584; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=273; N_SCORE=9.120; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-33,-24,6,-33,-24,31,-29,37,19,-27,-27,-21,-23,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='G'; M=18,-10,-23,-14,-16,-26,44,-20,-29,-16,-23,-16,-4,-16,-16,-20,4,-13,-19,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,20,18,-23,-23,-22,-27,-18,-8,33,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-20,-12,-23,-23,-13,8,-22,-2,-21,-2,3,-15,-24,-20,-20,-9,-11,4,-24,-16,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,4,-24,22,-22,-4,0,-13,39,29,-4,-10,-26,-20,-10,25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,32,-25,22,15,-28,-28,-25,-22,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,-17,-20,-12,-5,-25,-18,9,-10,9,7,-19,-23,-14,-7,-10,-3,17,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='E'; M=8,0,-20,1,22,-23,-14,-10,-19,3,-17,-14,-4,-7,4,-5,6,0,-12,-27,-18,13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-8,-31,-25,0,-26,-25,21,-27,23,12,-25,-28,-23,-23,-20,-9,19,-25,-7,-25;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-8,-20,-10,-7,-13,-6,-11,-4,-12,0,6,-8,-15,-3,-12,-4,-4,-5,-22,-11,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-6,2,-29,9,14,-28,-9,-10,-26,4,-24,-18,-3,20,0,-6,-4,-9,-24,-26,-20,6; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='B'; M=-6,8,-20,8,5,-11,-14,-8,-8,-6,-9,-9,4,-10,-4,-10,-2,-3,-8,-22,-9,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-14,0,1,-12,-10,-2,-6,-2,-5,-3,2,-10,7,2,-1,-3,-8,-16,-7,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-22,0,-8,-14,18,-7,-21,-10,-19,-10,8,-16,-6,-10,2,-8,-19,-21,-14,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-2,-25,-4,-1,-19,-10,-7,-12,-2,-14,-9,0,-6,1,1,-4,-8,-13,-21,-11,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-15,-14,-16,-11,-4,-19,-13,6,-2,9,9,-15,-17,-9,-4,-13,-5,10,-17,-4,-10; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-14,-19,-16,-2,-19,-14,12,-13,6,7,-17,-8,-14,-14,-9,-4,14,-15,-2,-16; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='A'; M=12,4,-10,3,-1,-13,-3,0,-11,-4,-9,-7,0,-6,-3,-8,3,-3,-6,-14,-8,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,2,-10,5,4,-21,-15,-7,-18,-5,-8,-8,-3,-16,5,-3,-5,-5,-16,-27,-13,5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-5,-20,-4,-4,-12,-20,-5,-2,-11,2,-2,-7,-16,-8,-9,-7,-2,0,-25,-7,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,7,-26,9,-1,-29,27,-11,-33,-8,-27,-20,8,-15,-7,-10,5,-10,-25,-28,-24,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00841;
//
ID   LIPASE_GDSL_SER_MP; MATRIX.
AC   MP01098;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipolytic enzymes "G-D-S-L" family, serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=7.1861134; R2=0.0207122; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=43; N_SCORE=8.067; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-33; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=6,-20,-22,-21,-13,-12,-19,-21,4,-18,2,-1,-18,8,-14,-20,-7,-4,2,-25,-15,-15;
MA   /M: SY='L'; M=2,-25,-23,-28,-18,7,-21,-21,1,-22,13,1,-24,-11,-19,-20,-18,-10,-3,1,-1,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-3,-15,-11,-5,-17,-18,-11,-17,-10,-10,-8,-4,-13,-16,8,13,-7,-30,-12,-12;
MA   /M: SY='S'; M=0,-9,-14,-14,-14,-2,-16,-17,2,-15,-10,-6,-1,-19,-14,-14,11,10,8,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-8,-9,-6,-4,-22,-19,-13,-11,-10,-10,-7,-10,-4,2,-12,-3,-5,-8,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='A'; M=14,-16,-22,-18,-9,-15,-14,-5,-8,-15,-2,-4,-14,7,-10,-18,-6,-7,-8,-24,-13,-11;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-17,-16,-7,-10,-14,-16,-8,-4,-11,-6,-6,-13,-4,-9,5,4,-4,-20,-10,-6;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-20,-11,-9,-5,-14,-15,-8,-14,-4,-2,-11,-3,-12,-17,-3,-4,-6,-22,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=7,0,-21,-4,7,-24,-10,-5,-21,6,-19,-12,4,-12,9,12,6,-3,-16,-26,-16,7;
MA   /M: SY='P'; M=4,-6,-26,-7,-2,-24,-11,-13,-19,-4,-24,-17,-2,30,-5,-6,2,-3,-20,-29,-23,-6;
MA   /M: SY='A'; M=7,0,-22,1,3,-27,-10,0,-22,1,-23,-13,0,1,4,-5,7,-3,-17,-28,-15,3;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-20,-4,-1,-25,-10,-14,-17,-7,-17,-13,-6,9,-1,-14,5,3,-13,-26,-20,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-22,-24,-28,-22,14,-27,-11,15,-20,4,4,-16,-22,-16,-20,-10,-6,7,-4,22,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,13,-23,14,11,-27,-8,-3,-24,-2,-28,-19,15,3,8,-6,13,1,-24,-35,-20,9;
MA   /M: SY='K'; M=1,-3,-19,-9,-7,-18,-8,-14,-16,6,-17,-9,1,-16,-6,5,2,6,-6,-25,-14,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-18,-31,-25,4,-30,-23,27,-24,29,20,-28,-28,-22,-20,-21,-6,27,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-18,-30,-24,14,-27,-20,18,-22,17,9,-24,-27,-24,-20,-15,-6,20,-14,6,-24;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-15,-30,-24,6,-23,-23,18,-19,8,11,-22,-23,-22,-20,-9,-4,24,-20,-4,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,48,-30,-20,9,-30,28,9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,5,-4,16,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,-11,-7,-5,-5,-7,-13,-16,-13,-22,-16,5,-13,-7,-11,29,20,-7,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='D'; M=4,29,-23,39,10,-33,-7,-7,-30,-3,-23,-23,10,-10,-3,-13,3,-7,-20,-33,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=10,-6,-19,-12,-14,-21,24,-20,-23,-14,-19,-14,-2,-14,-14,-16,9,9,-13,-24,-21,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-15,-30,-16,-21,-13,34,-12,-20,-19,-17,-11,-7,-22,-18,-19,-7,-17,-18,-9,-1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-27,4,5,-28,-2,3,-25,10,-26,-12,20,-16,18,13,1,-8,-28,-27,-16,10;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-10,-22,-23,-20,11,-22,-8,14,-16,7,21,-2,-22,-12,-14,-13,-8,3,-19,1,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-7,-27,-9,-12,-8,12,-10,-22,-14,-22,-15,1,0,-14,-15,0,-8,-22,-18,-8,-14;
MA   /M: SY='N'; M=2,8,-20,3,-4,-21,0,-8,-17,-6,-22,-15,16,-15,-4,-4,10,0,-14,-32,-18,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-11,-23,-10,0,-13,-19,-12,-10,3,-9,-6,-11,-6,-4,-4,-4,-4,-6,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-22,-8,4,-20,-13,-11,-15,3,-15,-5,-6,1,0,0,3,1,-12,-26,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-19,-10,-8,-10,-7,-11,-14,-6,-15,-9,2,-17,-4,-1,5,4,-8,-24,-11,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-6,-36,-1,-8,-17,-7,-18,-27,-4,-25,-20,-11,-9,-10,-10,-14,-12,-26,31,-3,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-28,-16,-12,-11,-13,-11,-5,-11,-7,-5,-8,3,-10,-9,-10,-9,-11,-18,-5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=2,-15,-20,-18,-12,-3,-10,-17,-4,-11,-1,-3,-10,-18,-12,-12,-2,-3,-3,-21,-8,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-8,4,-24,8,0,-20,-14,-10,-15,-11,-12,-13,1,7,-7,-14,1,-2,-16,-33,-18,-5;
MA   /M: SY='N'; M=1,0,-19,-7,-11,-14,7,-12,-13,-14,-8,-9,8,-19,-11,-13,3,0,-13,-28,-17,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-5,2,-21,-2,-5,-13,-13,-6,-15,-8,-22,-15,9,6,-6,-10,10,12,-17,-26,-6,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-30,-1,6,-25,-3,-5,-28,7,-25,-16,6,3,2,18,-4,-10,-26,-27,-20,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00842;
//
ID   COMPLEX1_24K_MP; MATRIX.
AC   MP01099;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 24 Kd subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0674305; R2=0.0139573; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=460; N_SCORE=11.478; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=103; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=8,-14,-20,-20,-11,-8,-19,-6,-1,-9,-5,-1,-10,-17,-4,-8,-3,-3,0,-17,-1,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,13,-27,-21,1,-27,-21,9,-27,26,9,-24,-28,-20,-21,-21,-9,6,-25,-7,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-24,4,25,-22,-19,-6,-20,15,-13,-10,-3,-7,10,7,-4,-5,-18,-22,-12,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-24,17,21,-25,-14,-3,-26,16,-22,-16,10,-8,8,8,0,-4,-22,-26,-14,14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-24,-6,-2,-13,-20,16,-15,11,-15,-4,-1,-14,2,6,-7,-3,-13,-16,8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,7,-28,-19,23,-27,39,18,-25,-25,-18,-19,-25,-9,12,-18,0,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-22,-10,-14,-18,36,-15,-26,-12,-21,-14,1,-16,-14,-14,1,-12,-19,-17,-20,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-21,-27,-22,-4,-28,-24,28,-21,7,9,-17,-11,-17,-22,-9,-4,23,-23,-6,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-27,1,12,-26,-4,-5,-28,24,-24,-12,0,-10,6,16,-6,-11,-21,-20,-13,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-29,-12,-4,-19,-20,-5,-9,-4,-13,-6,-12,24,-3,-4,-10,-9,-13,-23,-12,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-29,-5,-14,-20,42,-9,-35,-14,-25,-17,1,-20,-16,-15,-3,-18,-27,-20,-19,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-25,13,35,-26,-15,-1,-24,5,-20,-17,9,-6,14,-2,4,-2,-25,-30,-18,25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-12,-17,-15,-5,-22,-21,3,-16,3,-1,-11,-18,-15,-14,7,25,12,-29,-9,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-1,8,-12,-3,-7,-13,-14,-13,-13,-8,-16,-13,13,-12,-7,-8,19,37,-7,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-30,-10,3,-15,-18,-16,-18,0,-21,-14,-13,14,-5,-7,-7,-8,-18,-5,-11,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,62,16,-39,-2,-2,-40,-2,-30,-29,18,-11,-2,-11,0,-11,-30,-38,-21,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-28,-4,-13,-30,50,-16,-36,-14,-29,-19,2,-18,-11,-15,4,-14,-27,-23,-27,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-14,-22,-15,-6,-13,-22,-11,-7,3,2,1,-11,-20,1,13,-10,-3,-4,-22,-8,-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-19,-38,-29,66,-30,-21,4,-29,14,3,-22,-30,-37,-20,-20,-9,5,4,24,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,6,-14,3,-2,-18,-12,-14,-18,-5,-20,-16,6,-10,-4,-7,22,29,-8,-34,-14,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-32,-23,-33,-26,9,-29,-25,17,-26,23,10,-31,-29,-24,-21,-25,-11,15,7,3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-8,-24,-6,10,-19,-12,-10,-9,-8,-5,-5,-8,-14,6,-9,-2,-6,-10,-26,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-30,8,26,-27,-18,3,-25,4,-24,-17,3,16,7,-3,-1,-6,-27,-30,-18,15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-14,-28,-25,-2,-29,-25,25,-19,9,13,-22,-24,-22,-19,-7,7,34,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-4,7,33,-29,-12,-7,-30,0,-21,-19,-3,-10,10,-7,-2,-11,-27,-32,-22,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-21,-23,-14,2,-26,-13,13,-22,34,19,-18,-26,-9,-14,-23,-9,3,-22,-3,-12;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-11,-19,-29,64,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=24,4,0,-8,-8,-20,-3,-12,-15,-9,-18,-15,10,-16,-8,-15,10,0,-10,-30,-21,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-7,0,-19,4,-5,-8,-19,-8,-8,-11,-9,-8,-6,-19,-13,-13,-1,-1,3,-28,-8,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-24,5,4,-18,-12,4,-17,8,-21,-8,22,-16,8,4,1,-2,-22,-26,-7,6;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-15,-18,-12,-22,16,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=1,-16,-14,-23,-20,-5,-20,-14,14,-13,7,22,-15,-21,-13,-14,-7,1,19,-26,-8,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-19,-33,-26,4,-28,-21,29,-20,14,23,-22,-23,-19,-20,-15,-6,27,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-26,-18,-5,-15,-20,-2,-2,-4,-2,22,-13,-16,19,-4,-11,-6,-10,-2,-1,7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,22,-21,10,-5,-13,6,-1,-21,-7,-24,-18,34,-19,-8,-7,5,-4,-24,-30,-17,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-17,27,-32,40,21,-32,-14,-4,-35,8,-27,-24,8,-10,3,-2,-5,-12,-28,-19,-14,13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,31,-30,46,21,-31,-15,1,-33,6,-26,-23,11,-10,3,-4,-3,-10,-27,-29,-9,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-22,-19,-12,12,-25,-10,-1,-15,-2,-3,-12,-12,-13,-14,-4,6,-3,-9,15,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-14,-27,-18,-18,31,-26,20,-6,-14,-3,-2,-8,-28,-14,-10,-16,-10,-12,10,50,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-25,6,14,-27,9,-11,-27,-2,-23,-17,0,-11,-1,-8,3,-8,-20,-28,-21,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-23,20,4,-17,-14,7,-19,-7,-19,-15,12,-17,-5,-9,1,-5,-13,-33,-10,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-13,-14,-2,-6,-24,-11,0,-17,19,4,-12,-23,-5,-13,-17,-9,-6,-26,-8,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-14,-4,-9,-15,-9,-17,-13,-10,-14,-12,3,-13,-10,-11,15,31,-4,-31,-14,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-30,-9,1,-21,-20,-13,-15,-1,-20,-12,-14,33,-3,-10,-6,-4,-17,-22,-12,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00843;
//
ID   NNMT_PNMT_TEMT_MP; MATRIX.
AC   MP01100;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NNMT/PNMT/TEMT family of methyltransferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3965960; R2=0.0133341; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1447; N_SCORE=23.681; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,1,71,-12,-19,-20,-19,-16,-26,-19,-24,-20,8,-33,-19,-19,-3,-6,-17,-46,-26,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='H'; M=4,-14,-20,-21,-14,15,-17,17,-13,-17,-6,-3,-7,-20,-14,-14,-7,-10,-9,-13,10,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,13,-33,-20,-3,-27,36,-27,-7,0,-10,27,23,-7,-10,-23,-20,-10,20;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-17,-21,-17,-6,-27,-24,11,-17,1,1,-7,-14,-14,-17,6,29,11,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=14,-14,29,-20,-20,-23,11,-24,-26,-20,-20,-17,-10,-24,-20,-24,0,-10,-13,-31,-27,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-23,-17,-10,-9,-24,-20,-3,-17,5,-3,-17,14,-14,-17,-7,11,-6,-26,-13,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=14,-3,-23,-3,11,-26,15,-13,-26,-6,-20,-16,-4,-10,-3,-13,4,-10,-19,-23,-23,4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,22,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,0,-23,0,10,-30,-13,-4,-24,17,-27,-10,3,-10,22,10,10,0,-20,-27,-13,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-16,15,-30,25,27,-30,-17,0,-33,14,-23,-20,6,-10,10,21,-3,-10,-27,-30,-17,17;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-14,-17,-14,-3,-24,-20,1,-17,11,1,-11,-17,-14,-14,2,29,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=22,-3,-10,-6,-3,-20,0,-13,-17,-10,-24,-17,4,-10,-3,-13,31,14,-7,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-23,13,39,-27,-13,-3,-27,3,-23,-20,3,-3,13,-3,14,0,-23,-33,-20,26;
MA   /M: SY='H'; M=0,0,-17,0,0,-20,-7,28,-23,-10,-27,-13,10,-13,3,-7,23,6,-17,-37,-6,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-23,3,20,-23,-20,-10,-23,15,-20,-13,0,-7,6,6,4,11,-16,-27,-13,13;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-30,52,34,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-17,-21,-17,-6,-27,-24,11,-17,1,1,-7,-14,-14,-17,6,29,11,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-27,-16,-30,-24,3,-27,-17,24,-20,26,30,-27,-27,-17,-17,-20,-6,24,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,62,-30,-6,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,48,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-13,-17,-13,-3,-23,-20,0,-17,11,0,-10,-17,-13,-13,3,29,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-13,-23,-13,-3,-20,-23,-7,-6,6,-10,0,-10,-20,14,18,-6,-7,0,-23,-10,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00844;
//
ID   CK2_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP01101;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Casein kinase II regulatory subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8211498; R2=0.0133977; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1563; N_SCORE=25.752; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-33,-22,30,-29,38,22,-26,-26,-19,-23,-26,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-6,-23,-8,5,-20,-15,0,-10,-5,-12,-5,-4,-12,11,-8,2,-2,-12,-21,-6,7;
MA   /M: SY='A'; M=13,-2,-21,-5,3,-26,-11,-8,-16,4,-14,-7,-4,-11,13,-3,2,-5,-13,-22,-14,8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=3,-16,-19,-20,-13,-2,-19,-2,-2,-15,6,1,-12,-21,-11,-9,-7,-3,0,-20,0,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-27,16,32,-26,-17,-3,-26,5,-17,-17,1,-8,10,4,1,-7,-23,-30,-17,20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-29,-25,-22,38,-29,10,-1,-14,1,-1,-21,-30,-16,-12,-21,-11,-9,33,68,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-27,6,17,-25,-17,-3,-22,17,-18,-7,3,-11,12,10,-3,-7,-20,-26,-13,14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,2,-26,0,3,-20,-17,4,-21,15,-16,-5,7,-16,6,23,-6,-7,-18,-25,-9,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-10,-10,-15,-22,26,-8,-30,-12,-24,-16,1,-21,-14,-14,-2,-14,-22,-22,-15,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-18,36,-30,51,21,-35,-14,4,-32,-1,-25,-23,14,-10,2,-9,-2,-11,-26,-37,-16,11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-7,-10,-10,-7,-16,-17,0,-15,-2,-17,-9,-1,-17,-3,5,8,6,-8,-30,-8,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-4,-29,-6,0,-20,-17,1,-29,26,-21,-11,8,-20,9,61,-7,-9,-21,-23,-11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-16,-28,-26,3,-29,-21,22,-18,7,7,-24,-26,-23,-19,-10,0,31,-19,5,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-13,-22,-19,-18,29,-22,0,-3,-16,-1,-1,-6,-26,-16,-12,-9,-5,-7,0,30,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-12,14,5,12,5,-23,-15,3,-27,-3,-24,-18,13,-19,-2,-7,0,-7,-23,-35,-13,1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-21,-8,-9,-20,15,-8,-26,-5,-21,-14,3,-20,-4,3,2,-8,-21,-22,-13,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-26,-6,9,-29,-20,10,-13,3,-12,8,-3,-12,38,4,-1,-3,-20,-22,-7,23;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-4,-32,-2,3,-27,-16,9,-23,0,-27,-13,2,27,6,-1,-3,-8,-27,-29,-15,1;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,4,-26,-22,-2,-26,-20,9,-20,14,14,-21,-26,-18,-18,-11,4,14,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-6,-31,-27,-2,-29,-27,25,-22,11,12,-26,-27,-25,-22,-12,-3,35,-28,-9,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-20,-23,-13,-1,-26,-16,11,-22,30,13,-22,-25,-8,-15,-18,-6,6,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-12,-1,-1,-19,-4,2,-20,-10,-27,-17,9,-11,0,-9,32,18,-11,-38,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,42,-27,59,16,-37,-9,-3,-36,-1,-27,-27,16,-10,-1,-11,1,-9,-26,-37,-20,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-18,-27,-25,-2,-30,-26,27,-21,9,9,-17,-23,-22,-21,-9,3,30,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-25,-36,-19,-11,-17,-20,-23,-13,-13,-22,-15,-25,44,-15,-20,-15,-12,-18,7,-15,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-29,-2,-12,-28,43,-8,-37,-10,-28,-18,5,-19,-12,-4,-1,-17,-29,-23,-23,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-25,2,19,-27,-17,-7,-22,17,-22,-12,0,-8,13,7,4,-2,-18,-26,-14,16;
MA   /M: SY='S'; M=6,6,-20,8,7,-24,-9,-1,-21,0,-21,-12,3,-10,1,-6,10,0,-14,-31,-15,4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-12,-14,-9,-14,-19,-13,-7,-9,-8,3,-7,-1,-3,-11,6,21,-5,-29,-12,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-4,-29,-4,6,-26,-20,-7,-27,41,-24,-5,-1,-13,9,36,-11,-10,-18,-20,-9,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-33,-24,5,-34,-24,31,-29,36,19,-25,-25,-20,-24,-24,-8,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20,35,-29,21,-4,-14,0,0,-16,-29,-14,-11,-19,-11,-10,18,61,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-11,-5,0,-23,-15,-7,-27,18,-26,-14,5,-17,3,26,4,-2,-17,-29,-15,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-25,5,16,-20,-16,-1,-14,4,-11,-6,12,-13,8,0,-4,-7,-19,-29,-14,12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-26,52,14,-34,-9,-1,-33,-2,-27,-23,19,-11,0,-9,5,-5,-25,-39,-19,7;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-21,-18,-26,-24,-1,-29,-23,27,-22,15,10,-16,-26,-22,-20,-14,-4,28,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-22,-21,36,-28,11,-1,-14,0,-1,-18,-29,-15,-12,-16,-8,-8,22,65,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-15,-22,-21,-18,-2,-26,-1,12,-18,4,5,-10,-21,-13,-16,-9,0,8,-18,9,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-27,-5,4,-24,-18,-8,-23,24,-22,-9,-2,-7,8,23,-3,-5,-17,-24,-12,5;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-13,-1,-1,-21,-1,-10,-19,-9,-29,-19,10,-3,-1,-11,32,15,-12,-38,-21,-1;
MA   /M: SY='S'; M=0,6,-18,9,5,-25,-7,0,-25,1,-29,-17,9,-11,5,-3,22,7,-16,-35,-15,5;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-26,-10,-5,-9,-20,-1,-23,16,-16,-9,2,-20,2,43,-6,-2,-16,-17,-1,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-8,-29,-9,-3,-5,-16,39,-19,-8,-14,-1,-2,-20,11,-3,-9,-14,-23,-12,19,2;
MA   /M: SY='M'; M=0,-13,-22,-14,-8,-14,-6,-3,-9,-11,1,3,-9,-19,-1,-9,-6,-8,-9,-23,-9,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-11,10,-2,-20,-10,11,-20,-8,-20,-14,23,-19,-3,-8,5,0,-20,-36,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-25,-22,-21,-7,-19,-24,18,-23,9,6,-14,-20,-18,-22,-11,-2,12,-24,-7,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00845;
//
ID   ZF_DKSA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01102;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prokaryotic dksA C4-type zinc finger.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9989457; R2=0.0172710; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=516; N_SCORE=14.901; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=30; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-24,-35,-27,-1,-34,-28,38,-27,19,16,-22,-22,-21,-26,-17,-7,29,-22,-3,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,9,-22,10,13,-22,-13,-6,-15,-5,-15,-13,8,-11,3,-9,5,-2,-16,-32,-16,8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-26,-1,1,-18,-17,6,-17,5,-12,-7,2,-17,5,12,-7,-9,-16,-22,-4,1;
MA   /M: SY='A'; M=20,0,-15,-5,-4,-22,-1,-15,-17,-8,-16,-13,-2,-11,-3,-14,12,8,-9,-26,-18,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-24,-15,0,-5,-26,-13,-1,-7,20,6,-18,-21,-6,2,-20,-10,-4,-22,-6,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-10,-23,-11,-2,-18,-22,-14,-4,8,-13,-3,-7,-15,1,4,-2,-3,0,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,4,-28,4,6,-28,-16,-8,-28,28,-27,-14,4,-4,5,21,-6,-8,-21,-24,-14,4;
MA   /M: SY='I'; M=0,-20,-23,-26,-18,-8,-25,-12,14,-12,5,10,-15,-20,-11,-6,-11,-8,12,-22,-5,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-17,5,20,-23,-21,10,-20,5,-17,-10,-1,-10,7,-1,-6,-11,-19,-27,-9,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-3,17,-25,17,7,-28,9,-6,-29,-2,-26,-20,16,-13,-3,-7,3,-6,-25,-30,-21,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-27,-4,1,-25,14,-15,-21,-4,-19,-13,-4,-14,-7,-10,-3,-12,-15,-24,-20,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,7,-17,8,0,-22,-10,-13,-20,-8,-22,-18,4,-2,-5,-12,19,19,-12,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-22,-22,-26,-22,27,-16,-9,-1,-19,3,-1,-18,-26,-22,-17,-13,-9,-1,3,26,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-9,-28,-8,-16,-13,31,-13,-28,-14,-18,-14,-4,-22,-16,-10,-6,-16,-22,-15,-11,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-26,-22,-13,5,-31,-5,13,-14,7,6,-19,-23,-7,-14,-16,-9,6,-4,25,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-27,20,47,-29,-16,0,-29,7,-22,-20,8,-3,15,-1,5,-6,-28,-32,-20,31;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-16,3,25,-24,-17,-8,-21,5,-19,-15,-3,-9,6,0,4,-4,-15,-30,-18,15;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-14,79,-23,-23,-18,-25,-26,-25,-24,-19,-18,-13,-31,-23,-24,1,6,-8,-45,-25,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-28,2,-12,-31,51,-16,-38,-16,-29,-21,3,-18,-15,-18,2,-16,-28,-24,-28,-14;
MA   /M: SY='A'; M=10,-6,-19,-9,4,-18,-15,-12,-7,-3,-7,-6,-5,-14,0,-8,-2,-5,-4,-25,-15,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-36,3,26,-30,-20,-11,-24,-1,-26,-20,-11,51,3,-11,-6,-10,-30,-30,-26,11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-5,-30,5,-20,-25,-13,-30,-20,-15,60,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-13,-24,-15,1,-2,-26,-12,3,-13,5,1,-13,-16,-4,-13,-9,-3,-3,-17,1,-2;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-19,-10,4,-22,-11,-13,-18,2,-15,-12,-6,-3,-1,1,4,1,-11,-23,-18,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,67,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-24,-14,0,-27,-14,4,-11,28,10,-20,-27,-10,9,-24,-10,0,-20,-3,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-17,3,28,-26,-18,-6,-27,11,-19,-16,-3,-9,9,10,-2,-8,-21,-27,-18,18;
MA   /M: SY='A'; M=41,-13,-12,-23,-13,-17,-6,-22,-2,-13,-6,-6,-13,-13,-13,-21,6,-1,7,-21,-17,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-17,-25,-22,-16,3,-27,-12,7,-9,6,4,-9,-24,-12,5,-15,-8,3,-17,3,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-20,-15,-16,-3,2,-17,-17,-15,-14,-12,-5,-17,-15,-14,6,15,-11,-8,-3,-15;
MA   /M: SY='A'; M=34,-14,-10,-22,-15,-14,-9,-22,0,-12,-5,-5,-14,-15,-15,-19,6,3,12,-23,-17,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-23,4,1,-21,-17,5,-23,6,-19,-11,8,-15,6,18,3,9,-18,-28,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-9,-23,-16,-1,-25,-12,1,-12,14,11,-17,-24,-11,-2,-14,0,0,-21,-1,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-17,78,-26,-24,-17,-25,-26,-22,-25,-13,-15,-16,-32,-24,-25,-4,-3,-7,-43,-24,-24;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-17,-27,-24,-5,-26,-25,25,-20,6,7,-17,-23,-22,-21,-8,-3,30,-26,-10,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,17,-25,26,25,-29,-14,4,-30,3,-24,-20,8,-8,7,-3,7,-1,-23,-34,-15,15;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-19,76,-29,-26,-7,-26,-23,-22,-25,-14,-15,-19,-34,-26,-26,-9,-9,-8,-34,-14,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-26,-4,11,-31,-18,0,-18,12,-16,-3,-2,-12,33,8,0,-7,-21,-22,-11,22;
MA   /M: SY='E'; M=4,-1,-20,-2,12,-20,-15,-5,-17,-2,-16,-11,-2,-9,11,-6,10,8,-14,-23,-8,11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-3,-25,1,4,-13,-22,-7,-6,-7,-1,-4,-7,-17,0,-5,-7,-7,-7,-23,-4,1;
MA   /M: M=0,-12,-22,-13,-11,-7,-19,-9,-6,-9,-6,-4,-13,-20,-8,-11,-8,-8,0,-7,-3,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-28,18,45,-29,-20,-2,-25,7,-18,-16,-1,-4,17,-2,-1,-9,-23,-30,-18,31;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-15,-24,-16,-8,-3,-25,-15,3,-8,5,1,-13,-20,-10,1,-13,-8,3,-21,-5,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-28,4,13,-29,-9,-3,-29,16,-24,-13,2,-12,15,22,-1,-8,-24,-25,-15,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-26,3,18,-23,-16,-5,-24,17,-20,-13,4,-11,8,17,0,-5,-20,-27,-14,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-1,9,-26,-12,-9,-27,30,-25,-11,-2,-1,6,20,-7,-10,-20,-20,-13,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-5,2,-22,0,1,-22,-18,19,-17,-5,-15,-6,1,-14,10,-5,2,4,-14,-28,-4,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-30,-12,-12,2,-25,10,-3,-11,-6,3,-15,-3,-8,-12,-15,-10,-10,-4,28,-14;
MA   /M: SY='A'; M=8,-9,-19,-18,-12,-12,-16,-15,1,-7,-3,1,-4,-16,-8,-4,-1,3,1,-23,-11,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-29,1,-1,-27,23,-12,-31,-7,-25,-18,-2,4,-8,-7,-3,-13,-26,-22,-23,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-7,-2,-26,0,0,-13,-3,-9,-23,-9,-21,-17,-4,-15,-5,-11,3,-1,-20,0,0,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00846;
//
ID   ASD_MP; MATRIX.
AC   MP01103;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aspartate-semialdehyde dehydrogenase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0501461; R2=0.0148223; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=504; N_SCORE=12.511; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-25,-11,2,-25,-10,15,-18,30,32,-23,-23,-8,-14,-23,-10,6,-21,-2,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-24,-10,1,-18,-24,-11,-8,8,-7,-2,-8,-16,6,10,-7,-1,-5,-23,-9,3;
MA   /M: SY='A'; M=1,-7,-19,-15,-14,0,-15,-7,-4,-14,-3,-5,-1,-22,-14,-13,-5,-1,-3,-12,-2,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-12,13,-30,21,46,-29,-18,8,-30,10,-22,-18,5,-4,16,1,-1,-10,-29,-30,-16,31;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-14,-1,-3,-15,-12,-15,-13,-9,-15,-13,4,-12,-8,-10,16,28,-4,-32,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,6,-27,1,0,-26,3,3,-28,12,-26,-13,16,-17,7,17,-2,-10,-26,-26,-15,2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-28,-4,5,-25,-21,-12,-22,39,-21,-6,-4,-13,5,23,-12,-9,-13,-21,-9,5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-21,-22,-9,4,-26,-13,8,-15,24,18,-20,-22,-10,-12,-19,-5,2,-20,-2,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,2,-18,0,-4,-17,19,8,-22,-8,-18,-11,9,-12,-5,-7,2,-9,-19,-19,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: M=-12,-11,-26,-9,-6,-10,-23,-7,-6,-7,-2,0,-10,-4,-7,-2,-11,-6,-7,-25,-8,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=8,-6,-22,-5,4,-23,-6,-13,-18,-2,-21,-15,-5,19,-3,-10,4,-3,-17,-24,-20,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,21,-18,25,14,-22,-6,-1,-22,0,-20,-17,15,-7,3,-5,7,-2,-19,-28,-15,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-22,-34,-25,20,-33,-24,23,-27,21,12,-21,-24,-24,-23,-18,-3,16,-15,5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-28,-11,-2,-19,-15,-14,-12,3,-9,-2,-12,6,-2,-3,-10,-8,-12,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,17,-17,21,5,-26,-3,-6,-25,-6,-29,-22,15,-11,-1,-10,25,9,-16,-39,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=26,-11,-20,-15,-14,-25,28,-20,-23,-14,-19,-15,-6,-8,-14,-20,5,-9,-14,-21,-25,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-15,-12,-8,-10,-19,-10,-6,-13,-2,-4,-4,-15,-4,-11,9,23,-3,-29,-8,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-14,-17,-21,-6,-23,-8,14,-15,-1,3,-8,-27,-20,-14,-6,-2,25,-32,-9,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-29,1,-33,-29,34,-23,15,13,-27,-27,-27,-23,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='P'; M=2,-15,-32,-11,-6,-28,6,-20,-24,-12,-27,-19,-12,44,-12,-20,-2,-10,-25,-27,-28,-12;
MA   /M: SY='V'; M=10,-23,-12,-26,-23,-6,-22,-26,19,-18,3,4,-21,-23,-22,-20,-2,1,32,-28,-12,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-21,-30,-21,20,-27,-17,15,-23,17,15,-19,-24,-17,-18,-16,-7,9,-14,5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,8,-26,13,2,-16,-18,-2,-26,8,-19,-15,4,-17,0,20,-2,-1,-18,-22,-3,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,17,-15,-21,-26,32,-22,-35,-22,-27,-20,-5,-25,-21,-22,2,-12,-22,-31,-29,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-10,-5,-4,-17,-7,-14,-16,-10,-22,-16,5,-10,-4,-11,31,29,-6,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-28,6,34,-27,-22,-1,-18,4,-10,-8,-5,-8,25,0,-4,-9,-21,-26,-14,29;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,7,-13,-9,-20,-5,-17,-16,-13,-19,-15,-3,-14,-9,-17,20,9,-5,-32,-21,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-35,-28,14,-34,-27,31,-27,20,14,-25,-26,-26,-24,-18,-7,28,-19,1,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-18,-13,-12,4,-18,-1,-9,-14,-10,-7,-2,-19,-11,-11,5,10,-6,-13,7,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-21,-33,-26,-1,-30,-25,32,-24,18,17,-22,-22,-20,-24,-16,-7,27,-22,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-29,7,29,-28,-19,-1,-29,26,-24,-14,0,-7,13,17,-5,-10,-24,-25,-14,21;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-19,-30,-22,31,-29,-21,8,-26,21,6,-20,-25,-25,-19,-16,2,5,-11,9,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-28,18,16,-30,-15,-5,-30,25,-27,-17,9,-10,7,14,-2,-8,-23,-28,-15,11;
MA   /M: SY='K'; M=-9,7,-28,8,12,-29,-16,-4,-28,29,-26,-13,6,-12,11,23,-5,-9,-22,-24,-13,11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-30,25,19,-31,-10,-6,-30,3,-25,-21,3,3,2,-2,-3,-10,-24,-31,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-22,-23,-24,-20,2,-27,-23,16,-22,8,5,-19,-8,-21,-22,-14,-7,13,-21,-6,-22;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-22,11,6,-26,-8,-11,-23,-7,-26,-20,2,11,-3,-13,14,4,-18,-34,-22,1;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-23,-24,-17,-7,-27,-23,12,-18,8,4,-22,1,-17,-16,-13,-4,11,-25,-11,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-26,16,32,-27,-17,-6,-25,6,-22,-18,1,0,8,-3,4,-3,-21,-32,-19,20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00847;
//
ID   RIBOSOMAL_L13E_MP; MATRIX.
AC   MP01104;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L13e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6904516; R2=0.0130776; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=857; N_SCORE=15.888; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,63,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18,84,-9,-19,-7,-8,-29,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-14,-21,-18,-16,-9,-25,0,10,-11,-2,4,-7,-23,-10,-5,-9,-7,13,-28,-5,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-16,-27,-26,9,-30,-16,21,-18,12,8,-27,-30,-24,-17,-15,-4,30,-13,15,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-29,-9,-2,-17,-20,24,-24,12,-13,-4,2,-21,6,39,-11,-12,-20,-23,-2,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-19,31,-27,-25,4,-4,-24,-21,-25,-13,-13,-14,-29,-28,-24,-8,-11,-10,-23,-13,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-35,0,21,-32,-20,-7,-23,0,-25,-15,-10,41,15,-7,-5,-10,-30,-28,-22,16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-17,-17,-15,-5,-25,-16,4,-13,-3,-1,-9,-16,-10,-13,5,25,7,-21,2,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-21,-21,-21,-15,0,-24,-17,6,-8,4,3,-17,-10,-14,-2,-14,-7,8,-19,-5,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-26,-3,4,-22,-18,6,-26,30,-22,-8,1,-13,8,33,-8,-8,-18,-19,-6,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-27,-12,-10,11,-24,10,-8,7,-8,-3,-12,-21,-4,2,-15,-9,-12,13,47,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-15,30,-25,27,5,-25,-8,21,-28,2,-27,-18,34,-17,3,5,2,-7,-29,-36,-12,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-7,-19,-11,-5,-13,-17,-10,-9,4,-9,3,-6,0,-2,5,-1,10,-6,-21,-9,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-25,-4,1,-18,-8,-6,-23,27,-22,-8,-2,-12,3,17,-8,-10,-17,-11,-1,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-14,-21,-18,-7,-26,-22,11,-9,3,4,-19,-22,-15,-11,-5,8,23,-27,-9,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-18,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='A'; M=11,-16,-20,-22,-11,-11,-18,-19,6,-12,2,0,-11,-16,-9,-11,-3,-2,5,-22,-11,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-8,-14,-16,-10,-22,-16,6,-10,-4,-10,32,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-22,12,-30,-21,20,-29,44,18,-30,-30,-22,-20,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-29,5,18,-30,6,-7,-31,7,-24,-16,0,-10,8,2,-1,-12,-26,-24,-20,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-22,8,-30,-22,22,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-28,-1,12,-28,-18,-9,-28,37,-26,-11,-1,-10,9,26,-7,-9,-19,-21,-12,10;
MA   /M: SY='A'; M=16,-4,-20,-5,13,-23,-8,-13,-17,1,-14,-12,-7,-9,0,-8,2,-5,-10,-24,-18,7;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-10,-17,-9,-19,-1,-19,-10,-10,-12,-11,-8,-11,-9,-18,14,3,0,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-25,-36,-26,16,-35,-25,31,-30,30,17,-24,-25,-23,-25,-24,-10,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-23,10,0,-24,-4,-3,-22,-6,-27,-19,18,6,-4,-10,11,3,-22,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-24,-15,-6,-20,-19,-18,-5,4,-13,-5,-12,2,-5,-6,-6,-6,-1,-23,-15,-7;
MA   /M: SY='K'; M=0,4,-25,-1,6,-28,-13,-5,-23,25,-25,-10,7,-12,13,15,-2,-7,-20,-23,-13,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-12,-25,-12,3,6,-25,-8,-9,1,-2,-3,-12,-18,-4,-2,-13,-9,-9,-11,8,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-32,-8,2,-24,-20,-6,-28,26,-24,-12,-4,4,6,44,-10,-10,-22,-22,-14,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-18,-7,-2,-18,-19,-16,-18,13,-18,-10,0,-10,-2,5,8,25,-8,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-26,4,-36,-26,38,-29,31,19,-24,-24,-21,-26,-23,-9,24,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-28,56,-17,-38,-12,-28,-18,0,-20,-15,-6,-2,-18,-28,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,44,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-16,-14,-7,-9,-9,-1,-17,-6,-15,-10,-3,-15,-6,-2,8,0,-9,-22,-8,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00848;
//
ID   RIBOSOMAL_L35AE_MP; MATRIX.
AC   MP01105;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L35Ae signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7928529; R2=0.0139616; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=933; N_SCORE=17.809; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-25,-9,-6,-20,-2,-14,-21,10,-14,-8,-4,-16,-4,9,-5,-2,-14,-22,-13,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,-11,-17,-11,0,-14,-16,-15,-6,-5,-3,-5,-11,-15,-6,-9,1,-1,0,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-13,-11,-12,-12,-18,-18,-1,-5,-11,-6,-4,-18,-12,-7,9,16,10,-31,-13,-12;
MA   /M: M=-7,-14,-26,-16,-10,-16,-14,-20,-4,-2,-8,-3,-12,-2,-10,-7,-9,-3,-3,-24,-13,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-17,-36,-16,-7,-14,-5,-6,-26,-5,-23,-15,-15,-11,-7,-9,-16,-19,-26,35,1,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-22,-10,-7,-20,-9,-18,-14,14,-17,-6,-8,-17,-7,5,-5,-2,-1,-24,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-23,-4,-2,-19,-15,10,-20,9,-21,-9,8,-18,2,18,2,-4,-13,-29,-8,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,-11,-25,-9,-9,-23,21,-16,-23,-12,-22,-15,-7,19,-12,-16,-2,-11,-21,-19,-23,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-20,3,8,-22,-9,-8,-20,-5,-26,-19,9,9,0,-9,18,10,-19,-35,-21,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-23,-3,2,-22,-16,4,-25,19,-24,-11,3,-13,5,17,4,4,-16,-27,-8,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-14,-25,-19,-20,-9,4,-17,-4,-19,-8,-4,-8,-19,-16,-19,-2,3,-4,-16,-3,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,5,-30,-28,-5,-27,-29,19,-21,5,5,-25,-28,-27,-22,-9,-2,34,-30,-13,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27,2,-36,-25,42,-28,26,24,-22,-22,-18,-26,-22,-10,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-28,-43,-28,-18,-2,-20,-22,-23,1,-22,-17,-26,-25,-10,4,-30,-23,-27,92,16,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,-2,7,-27,-20,-12,-27,40,-27,-10,0,-10,7,23,-5,0,-17,-22,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=5,-11,-10,-17,-16,-8,-20,-23,3,-13,-5,-4,-10,-17,-16,-14,10,26,16,-30,-12,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,0,-30,3,3,-23,-18,0,-32,25,-22,-13,3,-18,8,57,-8,-10,-22,-23,-12,2;
MA   /M: SY='P'; M=3,-15,-22,-15,-10,-18,-19,-22,-7,-12,-15,-10,-15,28,-14,-17,1,8,-3,-29,-20,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,33,-18,14,-2,-18,-4,4,-18,-2,-26,-18,49,-18,-2,-2,12,9,-24,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-15,0,0,-21,-4,-7,-21,1,-27,-17,14,-12,1,1,22,9,-14,-34,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,-11,-24,-17,-11,-12,-20,6,-13,0,6,-17,-17,-15,-19,0,-1,17,-23,-14,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-10,-20,-12,-17,-5,-21,-4,-12,-8,-8,-12,-13,-12,-19,9,1,7,-23,-18,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-28,-6,3,-23,-20,-6,-28,34,-23,-10,0,-15,8,47,-7,-4,-18,-21,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-23,0,15,-19,-21,4,-20,4,-15,-10,-1,-11,5,9,1,5,-13,-28,-10,9;
MA   /M: SY='H'; M=-9,2,-24,0,2,-22,-13,25,-26,8,-26,-11,11,-15,6,14,6,-4,-21,-30,-5,2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-23,10,-7,-23,24,0,-27,-7,-30,-20,39,-20,-7,-7,7,-7,-30,-33,-23,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=10,-14,-28,-13,-10,-27,17,-20,-24,-13,-24,-17,-10,24,-13,-20,-1,-11,-22,-24,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-28,0,12,-32,-18,-3,-25,29,-27,-8,1,-10,26,18,0,-6,-22,-22,-11,19;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-10,-15,-9,-17,-5,-19,-11,-10,-13,-11,-5,-10,-9,-16,16,15,-1,-25,-17,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-34,-24,25,-30,-19,19,-27,31,20,-25,-27,-23,-20,-25,-10,10,-12,8,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=6,7,-19,6,1,-23,-10,4,-22,-1,-20,-14,4,-11,-1,-6,9,5,-14,-30,-11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-25,-4,6,-12,-17,1,-22,9,-19,-12,-1,-16,5,23,3,-2,-17,-18,2,3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,34,-24,19,14,-27,-27,-26,-23,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-4,9,-20,-20,-3,-27,20,-18,-12,0,-15,9,44,-3,0,-19,-23,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,34,-24,19,14,-27,-27,-26,-23,-16,-4,38,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-21,-28,-19,14,-26,-14,11,-10,12,22,-19,-23,-14,-10,-19,-9,9,-14,4,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00849;
//
ID   RIBOSOMAL_L18E_MP; MATRIX.
AC   MP01106;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L18e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1365781; R2=0.0172422; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=360; N_SCORE=12.334; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=22; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-6,-24,-8,2,8,-20,-10,-18,0,-13,-11,-3,-11,-7,1,-4,-4,-15,-16,-1,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-16,-21,-19,-11,-8,-17,-16,2,-10,10,3,-12,-21,-11,-6,-11,-7,1,-23,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-10,-13,-15,-9,-16,0,-17,-10,-14,-8,-9,-6,-14,-9,-17,12,3,-3,-26,-18,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-18,-4,2,-21,-17,-2,-27,22,-23,-13,6,-18,6,39,-5,-7,-20,-24,-11,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-22,2,15,-27,-15,-4,-30,20,-23,-14,0,-13,11,27,-4,-9,-23,-26,-15,11;
MA   /M: SY='S'; M=-2,5,-17,2,1,-16,-11,-5,-17,-6,-21,-14,9,-13,3,-6,18,17,-14,-28,-7,2;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-24,16,1,-28,10,-6,-30,0,-29,-20,19,-15,-2,-4,7,-3,-25,-32,-20,-1;
MA   /M: SY='A'; M=23,-7,-14,-12,-6,-20,-2,-16,-14,-2,-18,-12,-4,-12,-6,-10,14,3,-3,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-30,-6,0,-26,-17,-16,-20,4,-25,-15,-11,36,-5,-3,-5,-5,-19,-27,-21,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-21,-37,-29,35,-33,-24,21,-28,18,10,-23,-27,-30,-23,-20,-8,18,-9,11,-29;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-10,-39,-18,-19,-1,-13,-15,-20,-13,-24,-20,-3,-26,-13,-13,-21,-19,-30,79,11,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-29,-6,2,-24,-17,-3,-26,30,-22,-8,-2,-16,7,35,-10,-10,-17,-21,-9,3;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-23,20,0,-23,-17,-10,-15,-1,-12,-12,-1,-17,-7,-1,-6,-7,-4,-31,-14,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-17,-33,-29,0,-33,-28,36,-23,14,16,-26,-26,-25,-23,-14,-4,41,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='A'; M=27,-15,-14,-22,-12,-11,-10,-12,-2,-16,8,0,-15,-17,-12,-19,-4,-4,1,-21,-11,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,0,-32,4,23,-25,-21,-7,-25,21,-22,-14,-3,-9,9,14,-9,-12,-22,-11,-11,16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-29,-7,8,-21,-19,-2,-27,23,-17,-11,-1,-17,10,52,-8,-9,-20,-22,-12,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-9,-21,-11,7,9,-18,-11,-13,-11,-7,-9,-8,-14,-6,-11,0,-4,-11,-17,-3,2;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-23,-12,-4,-17,-17,-7,-10,11,-10,5,-3,-16,5,12,-5,-6,-9,-23,-9,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-11,-26,-6,-1,-25,-7,-15,-21,-9,-30,-20,-5,38,-6,-12,12,2,-21,-33,-25,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-27,-7,2,-22,-17,-3,-29,27,-23,-11,1,-17,9,52,-3,-6,-19,-23,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-23,-9,-4,-17,-19,-7,-20,14,-17,-10,3,-16,2,34,1,7,-12,-25,-11,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-24,6,3,-24,-8,7,-22,8,-25,-12,26,-16,12,11,3,-1,-25,-30,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-30,-11,-4,-11,-22,13,-24,19,-16,-7,-3,-22,6,49,-12,-11,-19,-12,10,-4;
MA   /M: SY='P'; M=26,-14,-22,-16,-6,-24,-8,-20,-14,-10,-18,-14,-14,30,-10,-20,2,-4,-12,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-30,-2,13,-19,-19,-7,-19,-4,-21,-16,-10,27,0,-11,-2,-4,-22,-21,-8,4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,1,-33,-27,36,-24,19,17,-26,-26,-24,-23,-16,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='N'; M=0,24,-16,11,-1,-20,0,2,-19,-4,-29,-19,40,-16,-1,-4,19,6,-22,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-32,-25,5,-32,-24,29,-27,32,19,-27,-27,-22,-22,-22,-7,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-17,-6,-7,-11,5,-6,-19,-12,-24,-16,2,-16,-5,-12,21,7,-13,-23,-1,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,41,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27,2,-36,-25,41,-28,27,23,-22,-22,-18,-26,-22,-10,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=0,14,-23,8,2,-21,-12,-5,-9,-6,-16,-11,17,-14,-1,-10,1,-5,-13,-31,-16,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-9,1,-21,-14,-6,-25,23,-19,-10,-3,-18,5,43,-8,-9,-15,-21,-12,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-17,-18,-13,5,-26,9,-7,-5,-2,0,-13,-24,-8,-6,-16,-11,-9,-5,26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=17,-11,-13,-19,-13,-11,-12,-14,-1,-11,0,9,-10,-14,-7,-14,4,11,3,-24,-11,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-26,-2,6,-26,-15,-7,-27,31,-27,-12,3,-12,9,26,0,-4,-18,-24,-12,7;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-19,17,15,-20,-9,-3,-19,2,-15,-14,2,5,3,-1,-1,-6,-17,-20,-13,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-5,13,-17,13,-2,-19,18,-4,-22,-6,-19,-14,13,-11,-6,-8,2,-8,-19,-19,-15,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-18,30,15,-21,-9,-2,-19,0,-15,-15,6,-6,1,-5,-1,-6,-14,-23,-12,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-15,-12,-20,-16,-1,-20,-15,19,-13,8,11,-13,-14,-12,-13,-7,1,18,-15,-3,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-17,-13,-20,-15,-2,-21,-16,20,-14,9,9,-14,-15,-10,-13,-9,-4,19,-15,-3,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-10,-17,-12,-1,-19,-16,16,-12,8,6,-16,-16,-14,-12,-8,-2,22,-17,-5,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-19,-24,-16,-5,-29,-20,16,-13,11,8,-22,-25,-14,-6,-14,-5,22,-25,-8,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-37,-5,9,-30,-20,-13,-22,0,-27,-17,-14,58,1,-6,-8,-10,-29,-28,-25,2;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-26,-9,-17,-27,54,-19,-35,-18,-27,-19,1,-18,-17,-18,5,-8,-25,-23,-27,-17;
MA   /M: SY='R'; M=6,-14,-20,-17,-9,-16,-15,-12,-13,8,-11,-6,-9,-19,-4,25,-4,-5,-1,-22,-13,-9;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-27,0,23,-20,-14,-10,-24,-2,-20,-19,-7,-9,5,-8,1,-7,-22,2,-11,15;
MA   /M: SY='N'; M=-7,21,-18,8,-4,-15,-5,1,-13,-7,-16,-13,35,-20,-4,-5,8,2,-19,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-5,-28,40,-27,-8,0,-11,19,32,-8,-10,-22,-20,-10,14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,1,-19,-8,-8,-13,-20,-15,-4,-1,-12,-6,7,-14,-7,-5,6,20,-3,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=23,-11,-17,-16,-11,-21,5,-20,-13,-3,-14,-9,-9,-15,-11,-11,2,-5,-2,-21,-19,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00850;
//
ID   RIBOSOMAL_L27E_MP; MATRIX.
AC   MP01107;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L27e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=27;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=25;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6829200; R2=0.0139656; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=850; N_SCORE=16.544; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-11,-27,-11,-1,-16,-23,-11,-15,23,-4,-1,-9,-18,1,23,-16,-10,-11,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-27,-6,3,-24,-21,-11,-22,37,-23,-7,-4,-14,5,31,-10,-9,-11,-21,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-20,-2,18,-17,-23,-13,-7,-3,-9,-9,-9,-11,-2,-8,1,5,1,-30,-15,8;
MA   /M: SY='V'; M=18,-23,-10,-26,-23,-7,-19,-26,16,-16,3,3,-23,-23,-23,-20,-3,0,32,-26,-14,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=5,1,-18,-5,-4,-19,-12,-11,-12,9,-19,-9,6,-16,-4,1,4,-1,-4,-28,-15,-4;
MA   /M: SY='K'; M=11,-3,-20,-8,0,-23,-14,-15,-20,19,-20,-10,-3,-10,0,6,2,5,-10,-22,-13,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,68,-30,-20,3,-30,17,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-16,-28,-17,-16,23,-27,38,-9,-13,-4,0,-11,-27,-9,-9,-17,-13,-14,8,53,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,15,-35,-20,0,-25,29,-25,-5,0,-10,36,20,-5,-10,-25,-20,-10,25;
MA   /M: SY='T'; M=15,-3,-10,-13,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,35,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,32,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,50,-18,0,-2,16,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=1,-4,-26,-6,6,-28,-16,-7,-24,28,-23,-8,-2,-12,14,24,-4,-8,-17,-20,-12,9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-17,-5,2,-22,-17,-8,-15,-3,-17,-8,2,-10,16,-3,16,25,-12,-28,-12,9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-32,-2,8,-30,-20,-12,-28,38,-30,-12,-4,10,6,20,-10,-10,-22,-22,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,16,-30,24,-20,-8,2,-20,10,59,-10,-12,-22,-22,-5,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00851;
//
ID   RIBOSOMAL_L24_MP; MATRIX.
AC   MP01108;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L24 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0504604; R2=0.0080366; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1195; N_SCORE=9.650; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=803; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-37; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-72,-78,-67,-55,-76,-53,-42,-52,-35,135,-66,-71,-53,54,-68,-61,-48,-74,-52;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=7,-73,24,56,-66,-70,-58,-52,-2,-28,97,-30,-13,-50,-58,-24,-57,5,-79,-62;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-57,-93,-98,-89,-72,-100,-90,-61,-2,51,-59,-95,14,-86,-86,-35,-81,-20,-95,-80; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-38,-95,-83,-76,-90,-92,-80,-20,15,-60,-79,-5,-92,-32,57,-30,-13,-6,-99,-84; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-37,-96,-66,55,-95,-57,-78,-54,14,-34,-83,-38,-83,3,-40,-8,-26,-55,-99,-89; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-83,-98,-78,-5,-11,-58,-79,-88,50,-35,-3,-39,22,11,-9,-49,-46,-89,-92,-81; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-41,-97,-92,-89,-4,-96,0,5,-52,-29,23,-89,12,-82,-29,-85,-47,-48,-68,75; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-26,-94,-77,-78,-98,29,-82,-91,28,-96,-87,30,-21,-15,-73,-9,-76,-18,-100,-92; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-56,-27,3,-31,-82,-61,-80,8,9,-24,36,-42,-45,-3,20,-78,-29,-2,-96,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-23,-89,-44,3,-83,-84,9,-52,17,-76,43,-1,-83,-4,51,-48,-30,-20,-91,-38; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=2,-85,9,-18,-91,-52,-72,-59,55,-90,-81,8,-78,-60,-37,31,-27,-82,-93,-81; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-72,-70,-32,4,-14,-64,-3,-63,24,71,16,-43,27,-44,-7,-17,2,76,-52;
MA   /M: SY='H'; M=-49,-79,-58,-24,0,-69,66,-75,63,-58,-63,7,60,-28,32,-21,-17,-74,-76,-32;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-72,-85,-81,36,-87,-81,74,-77,14,-38,-78,-78,-77,-79,-72,-57,59,-71,-51;
MA   /M: SY='R'; M=-65,-78,-62,-36,18,-75,-5,-17,68,-34,-8,-20,-71,-45,80,-61,-61,-49,-71,-56;
MA   /M: SY='K'; M=-47,19,-61,-49,-73,-72,-61,-16,86,-54,-27,-53,-1,-26,41,-30,-8,-2,-76,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-76,41,-63,-83,88,-63,-88,-63,-86,-76,47,-69,-62,-71,-49,-62,-83,-80,-76;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-34,-72,-22,51,-69,-71,-60,-31,38,-25,41,-33,-63,6,-5,1,49,0,-80,-65;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-67,-83,-78,-53,-85,-86,28,-75,-39,-41,-78,-78,-77,-77,-67,-51,99,-86,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-76,-61,32,-63,-78,-63,43,40,-3,-5,-62,-69,33,34,-62,-27,23,-75,-33;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-69,-84,-79,-52,-86,-86,59,-76,-37,-40,-78,-77,-77,-78,-68,-53,90,-84,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-49,-73,-85,-79,-47,-86,-75,77,-76,49,59,-78,-77,-71,-77,-73,-59,13,-74,-55;
MA   /M: SY='R'; M=44,-68,-60,-10,-73,-60,-61,-48,-24,-69,-63,-33,-66,-51,55,52,36,-17,-80,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-27,-76,54,-30,-31,-48,18,-78,74,-77,-68,-16,-10,-26,19,17,-25,-74,-80,-64;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-78,92,0,48,-68,39,-73,-29,-44,-68,2,-71,-56,-28,-30,-59,-73,-74,21;
MA   /M: SY='K'; M=0,-76,-57,-44,-78,-68,-58,-78,100,-77,-65,-50,-65,-41,38,-56,-58,-73,-73,-65;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-76,-61,-71,-82,97,-67,-89,-2,-85,-74,19,-68,-36,-69,-49,-65,-83,-75,-76;
MA   /M: SY='K'; M=-47,-76,-56,4,-71,-39,38,-25,66,-28,-26,-18,-66,30,41,-54,29,-27,-77,-33;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-77,-34,56,-73,-40,-58,15,13,-64,-60,-55,-65,50,44,0,18,-1,-78,-65;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=19,-74,-65,-74,-82,97,-71,-86,-69,-83,-73,-51,-68,-66,-76,-48,-66,-78,-74,-77;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-75,-56,35,-70,-73,-63,12,73,-33,-58,-56,-10,-2,-2,-57,10,8,15,-64;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-69,-84,-78,-53,-86,-86,53,-76,-37,-41,-78,-78,-77,-78,-68,-52,92,-84,-60;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-69,-46,-7,-34,-76,-69,26,-8,53,-2,-67,-73,-36,-44,-2,22,24,-76,-58;
MA   /M: SY='K'; M=12,-75,-34,33,-77,-48,-56,-76,64,-58,-65,-8,-64,48,26,17,-25,-70,-75,-36;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-80,-74,-35,-81,-80,40,-68,-21,-43,-74,-77,-72,8,-64,-36,84,-82,-61;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-73,54,-42,11,-75,-25,24,-46,36,8,5,-75,-63,-45,-23,-27,10,-69,39;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-80,12,-17,-70,-72,7,-65,11,3,-27,-61,72,-31,52,-43,-17,-28,-77,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=14,-29,39,14,-77,-50,25,-76,68,-47,-30,-31,-67,6,4,-20,-40,-53,-80,-36; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-49,-79,-6,-3,-79,-39,-62,-52,57,-48,-68,27,-72,-4,40,4,9,-15,-84,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-26,-27,27,2,2,12,-52,-70,-18,-56,-65,69,-70,23,-39,24,-54,-29,16,39;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-77,-40,-2,-68,-71,25,-67,58,-22,-60,-56,-69,13,56,-30,-2,-8,71,-31;
MA   /M: SY='V'; M=18,-68,-81,-76,-34,-79,-82,51,-74,-6,-42,-76,-76,-74,-76,-64,-53,80,-81,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-47,-73,-77,-72,-31,-82,24,65,-49,17,-40,-71,-76,1,-31,-34,-26,50,-71,31;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-67,-83,-77,-53,-84,-84,25,-75,-10,-41,-77,-78,-76,-76,-34,-51,96,-85,-61;
MA   /M: SY='E'; M=-46,-80,29,92,-83,-8,-54,-84,29,-78,-72,-18,-59,1,-12,-55,-60,-77,-80,-71;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-77,7,-47,-80,93,-67,-58,-22,-63,-32,-31,-68,-62,-3,-26,-65,-57,-76,-74;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-71,-84,-79,-49,-87,-82,69,-77,28,-37,-79,-78,-75,-78,-71,-56,70,-79,-58;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00852;
//
ID   RIBOSOMAL_L10_MP; MATRIX.
AC   MP01109;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L10 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2478127; R2=0.0163100; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=236; N_SCORE=9.087; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-24,-19,-9,-18,-13,-14,-5,-10,-9,7,-17,25,-7,-17,-6,-7,-8,-24,-18,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=12,-11,-18,-14,-11,-1,-11,-2,-9,-10,-12,-9,-8,-18,-7,-13,7,2,-7,-7,18,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-13,17,-27,12,-5,-18,-18,-8,0,-11,-11,-8,18,-17,-8,-14,-4,-7,-7,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-13,-30,-13,-6,-5,-23,6,-21,18,-14,-7,-6,-23,4,47,-13,-10,-17,-5,16,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,3,-21,7,27,-25,-14,4,-17,7,-14,-7,0,-4,29,4,0,-7,-21,-17,-10,28; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-14,-21,-14,7,-21,-14,14,-21,35,14,-21,-21,-14,-14,-21,-7,7,-14,0,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=13,12,-11,1,-3,-14,0,-3,-11,-3,-15,-11,19,-11,-3,-7,7,0,-11,-22,-14,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,-1,20,-11,20,58,-20,-20,-1,-10,-20,-10,11,-20,0,-11;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-13,-8,-1,-7,-11,-6,-4,2,2,2,-6,-10,0,4,-7,-4,-4,-12,-4,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=1,5,-19,-1,-2,-17,-13,-9,-9,-3,-14,-9,9,-11,-3,-7,4,4,-9,-28,-14,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-15,-8,-12,-24,-10,-6,8,-2,0,-5,-20,-1,23,-13,-8,-5,-22,-7,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=6,-1,-23,1,17,-25,-13,-6,-20,1,-18,-12,-3,1,9,-6,4,-4,-17,-27,-17,12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-25,11,16,-26,-14,-2,-24,8,-21,-14,6,-10,11,1,1,-3,-21,-27,-14,13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-30,1,10,-30,-19,-9,-30,48,-30,-10,2,-10,10,29,-9,-10,-20,-21,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=3,-5,-23,-6,8,-25,-17,-9,-16,13,-16,-7,-6,-10,11,6,-2,-5,-11,-23,-13,9;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-23,-1,18,-24,-18,-7,-14,1,-11,-8,-6,-10,13,-5,0,-4,-13,-25,-14,15;
MA   /M: SY='I'; M=1,-20,-20,-25,-16,-5,-25,-20,16,-18,9,9,-17,-19,-11,-18,-9,-3,14,-21,-6,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-13,-31,-29,3,-30,-29,29,-22,13,11,-28,-29,-28,-21,-12,-1,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,4,-20,3,9,-25,-6,-10,-22,1,-19,-15,1,-9,2,-5,7,0,-14,-27,-18,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-27,14,30,-25,-16,-1,-25,5,-19,-16,2,-8,9,-2,0,-8,-22,-27,-15,20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-33,-25,8,-32,-23,28,-26,30,19,-27,-27,-22,-22,-22,-8,23,-21,0,-24;
MA   /M: SY='N'; M=7,4,-19,-2,3,-22,-7,-7,-19,5,-21,-13,8,-12,1,-1,8,3,-13,-28,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-26,16,24,-29,-7,-1,-28,5,-24,-18,7,-8,10,-2,4,-7,-25,-30,-18,17;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-13,-23,-16,-6,-12,-21,-16,0,-1,-1,2,-12,-17,-4,-5,-9,-6,1,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-26,-20,-32,-23,27,-26,-20,12,-26,20,9,-21,-26,-24,-20,-17,-7,8,-10,8,-22;
MA   /M: SY='K'; M=1,5,-23,4,5,-27,-6,-7,-24,11,-24,-14,7,-12,7,6,6,-1,-19,-27,-16,6;
MA   /M: SY='B'; M=1,8,-22,7,8,-25,-6,-8,-22,3,-21,-15,7,-11,3,-2,6,0,-17,-29,-17,6;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,-10,-12,-7,-18,-4,-16,-12,-9,-17,-12,-2,-11,-6,-15,20,9,-3,-28,-17,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-4,-25,-4,4,-25,-7,-3,-18,0,-15,-7,-2,-10,11,-3,0,-5,-17,-25,-13,7;
MA   /M: SY='S'; M=13,-7,-14,-11,-9,-16,2,-15,-11,-13,-14,-8,-1,-14,-8,-14,16,7,-4,-30,-17,-9;
MA   /M: SY='V'; M=6,-22,-15,-29,-22,7,-23,-23,14,-21,8,4,-19,-21,-21,-21,-7,0,17,-18,-3,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-18,-32,-28,11,-32,-23,27,-24,17,12,-26,-28,-26,-21,-17,-5,30,-18,5,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-32,-27,12,-30,-26,25,-24,18,11,-25,-27,-26,-22,-15,-4,28,-20,-1,-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-6,-23,-17,-4,-18,-22,2,-17,1,-2,-14,-18,-17,-19,1,9,9,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-17,29,-29,40,26,-32,-14,13,-34,3,-26,-22,15,-10,7,-1,-1,-11,-29,-35,-15,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-19,-18,27,-26,12,-2,-12,-2,-2,-15,-28,-12,-11,-14,-7,-9,18,60,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-9,1,-20,-19,0,-20,14,-12,-5,-3,-17,11,32,-6,-6,-16,-22,-9,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-23,12,-30,-20,23,-27,38,21,-27,-28,-20,-20,-26,-9,15,-19,1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,4,-8,-3,-6,-15,-13,-15,-15,-9,-18,-14,7,-11,-6,-10,23,35,-6,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=7,-26,-10,-28,-26,-3,-25,-28,22,-18,6,6,-26,-26,-26,-19,-6,3,40,-29,-11,-26;
MA   /M: SY='A'; M=21,-3,-17,-7,0,-22,-1,-14,-16,-5,-17,-13,-2,-9,-4,-12,9,-1,-9,-26,-19,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,7,-28,9,25,-33,-17,5,-25,13,-22,-10,3,-8,29,6,0,-9,-26,-25,-13,27;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-21,-20,-26,-19,-1,-24,-16,19,-20,20,22,-20,-22,-13,-18,-15,-6,14,-23,-5,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-16,-3,-1,-16,-16,-12,-15,-2,-15,-12,7,-12,-2,-2,14,27,-9,-30,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,11,-23,14,17,-27,-11,-6,-23,1,-19,-15,5,-10,7,-5,4,-2,-18,-30,-17,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21,12,-30,-19,20,-29,45,21,-29,-29,-20,-20,-29,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-24,-1,2,-23,-10,-7,-22,18,-23,-11,9,-15,3,16,0,-4,-17,-26,-14,2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-24,3,12,-26,-14,-4,-23,14,-22,-11,4,-11,13,12,3,-3,-19,-27,-14,11;
MA   /M: SY='L'; M=3,-24,-19,-28,-19,3,-19,-19,12,-23,26,15,-22,-24,-17,-20,-18,-8,7,-19,-4,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-9,1,-17,-13,-2,-28,20,-20,-11,0,-18,6,46,-6,-8,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-27,8,27,-29,-6,-6,-27,7,-23,-17,2,-5,10,-1,2,-8,-24,-27,-19,18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-15,-9,-3,-16,-8,-10,-10,-2,-13,-8,-1,-12,-3,-7,6,0,-4,-23,-13,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-27,6,-8,-27,35,-7,-34,-12,-28,-20,9,-17,-11,-14,3,-13,-27,-25,-21,-10;
MA   /M: SY='V'; M=11,-18,-13,-21,-21,-12,-3,-24,3,-17,-6,-3,-15,-21,-20,-20,1,-1,15,-27,-17,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-24,0,11,-18,-14,-5,-19,6,-18,-11,-3,-12,5,-1,2,0,-14,-21,-5,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-25,-11,-29,-24,18,-27,-11,10,-21,12,10,-22,-29,-21,-18,-18,-9,8,-7,19,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-26,-6,5,-24,-18,-7,-22,25,-20,-7,-2,-13,9,23,-4,-6,-15,-21,-10,6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-13,-31,-29,-1,-31,-29,31,-20,10,11,-28,-29,-28,-18,-11,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-14,-26,-22,0,-23,-22,15,-19,8,5,-21,-23,-21,-19,-6,1,23,-21,-4,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-11,11,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00853;
//
ID   RNA_POL_H_23KD_MP; MATRIX.
AC   MP01110;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases H / 23 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5939870; R2=0.0131095; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=465; N_SCORE=10.680; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,23,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-30,26,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-11,-19,-20,-13,-7,-20,1,5,-8,6,31,-11,-16,3,-8,-6,7,1,-23,-2,-5;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-15,-15,-19,-13,30,-17,-9,-6,-7,0,-2,-9,-17,-15,6,-11,-6,-4,0,11,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-7,-16,-9,-5,-11,-6,-1,-4,-7,-1,8,-4,-9,4,-6,-3,-5,-7,-18,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=5,2,-14,3,17,-18,-7,-4,-16,0,-15,-12,1,-4,8,-4,10,1,-13,-21,-13,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=9,-3,-11,-5,-3,-15,5,-9,-14,-7,-16,-10,1,-8,-1,-8,15,8,-8,-21,-14,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=1,9,-19,9,11,-22,-9,-6,-21,13,-19,-13,5,-7,4,4,1,-5,-15,-22,-13,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-6,-13,-7,-6,-6,-13,-10,-2,-8,7,2,-8,-13,-6,-8,-5,0,-1,-18,-6,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-9,-22,-9,1,-15,-19,-11,-6,10,-7,3,-10,-6,-1,2,-9,-6,-4,-21,-9,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-18,-22,-20,17,-26,-19,12,-16,5,3,-16,-23,-22,-11,-13,-6,16,-14,3,-21; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-9,23,-22,21,5,-24,-10,-2,-21,5,-25,-17,24,-15,-1,-1,5,-2,-17,-35,-17,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-24,-34,-27,-1,-35,-28,36,-26,16,14,-24,-15,-22,-25,-17,-7,29,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-12,-16,-16,-11,0,-19,-16,-4,-15,4,-2,-8,-18,-10,-9,4,15,-1,-25,-6,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-27,20,14,-28,-14,13,-25,3,-23,-14,13,-12,10,-1,1,-8,-24,-32,-11,11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-26,7,27,-20,-21,-4,-13,1,-12,-9,-2,-10,7,-5,-3,-8,-12,-27,-11,17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-20,-28,-19,8,-27,-16,17,-26,41,20,-27,-28,-17,-18,-25,-9,8,-18,2,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-29,8,31,-29,-20,-6,-29,28,-24,-14,0,-6,13,14,-3,-6,-23,-25,-14,22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-6,-26,-5,15,-17,-25,-4,-7,-1,-8,-6,-7,-12,2,1,-5,-5,-6,-27,-10,7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-22,-30,-24,-3,-33,-26,29,-16,12,12,-22,-24,-20,-14,-16,-6,29,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,6,-31,-20,26,-27,37,24,-27,-27,-19,-21,-25,-9,18,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='S'; M=0,8,-20,9,3,-25,-7,-8,-22,-6,-27,-19,10,4,0,-10,19,9,-18,-36,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-29,6,19,-24,-15,-9,-18,5,-15,-12,-3,-6,4,0,-5,-10,-17,-26,-16,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-28,23,41,-31,-10,-3,-31,4,-22,-21,3,-4,11,-5,2,-9,-27,-31,-21,26;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-29,18,55,-29,-20,-1,-29,9,-19,-19,0,-1,18,-1,1,-6,-28,-30,-19,36;
MA   /M: SY='A'; M=6,-10,-21,-12,0,-16,-19,-16,-6,4,-4,-3,-11,-14,-4,-4,-6,-5,-2,-23,-12,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-28,2,9,-20,-20,-7,-21,18,-21,-12,-4,-5,3,7,-6,-6,-16,-18,-3,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-25,1,18,-19,-11,-7,-23,9,-18,-13,0,-10,6,3,-1,-6,-20,-24,-13,12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,30,-28,33,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,48,20,-30,-30,-20,-20,-29,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=0,3,-25,4,19,-28,-15,-8,-27,23,-24,-14,0,-8,8,11,0,-6,-19,-25,-15,14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,1,-30,5,20,-25,-20,-3,-25,22,-19,-10,0,-11,11,27,-7,-10,-20,-25,-13,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20,22,-30,4,8,-18,20,8,-24,-30,-14,-14,-24,-10,-2,10,49,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-9,2,-28,2,-5,-23,14,-9,-31,5,-24,-16,6,-18,-5,9,-3,-11,-23,-24,-18,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-25,-36,-27,2,-35,-27,38,-28,26,18,-23,-23,-20,-26,-21,-9,25,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,4,-29,7,17,-28,-16,-2,-30,25,-25,-13,2,-10,10,20,-5,-7,-23,-25,-12,13;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-6,-32,-3,12,-24,-22,-11,-16,10,-17,-8,-8,13,2,3,-10,-10,-17,-25,-16,5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-23,8,21,-25,-13,-5,-23,0,-22,-17,4,-8,11,-5,10,3,-21,-23,-15,16;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-29,-1,19,-30,-21,7,-19,7,-18,-2,-1,-11,49,7,-1,-10,-28,-19,-8,35;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00854;
//
ID   RNA_POL_K_14KD_MP; MATRIX.
AC   MP01111;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases K / 14 to 18 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4026999; R2=0.0158482; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=434; N_SCORE=12.271; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-3,-20,4,-9,-10,-23,-16,3,-17,10,0,-13,-23,-16,-17,-14,-7,9,-30,-10,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-18,1,3,-11,-5,-9,-10,-10,1,-5,-5,-13,-5,-10,-4,-5,-9,-21,-11,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-14,-15,-14,-10,-9,-19,-14,1,7,-5,0,-12,-17,-9,8,-8,-4,13,-19,-8,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-27,-34,-24,13,-30,-25,22,-25,7,6,-19,-6,-22,-25,-15,-9,11,-14,1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-9,2,-24,-7,-8,-16,-20,-8,4,-3,-10,-1,12,-18,1,-6,-4,-5,-3,-28,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=4,-9,-27,-8,9,-14,-16,-14,-19,-1,-18,-14,-11,18,-4,-10,-4,-8,-18,-22,-16,2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-11,13,-23,14,1,-21,-16,-8,-11,5,-16,-10,8,-14,-4,-2,-4,-6,-8,-28,-12,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,-22,-3,0,1,-4,-3,-17,-7,-15,-10,12,-17,-1,-6,-2,-7,-20,-17,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-27,3,9,-20,-20,-5,-11,8,-9,7,-4,-12,5,4,-10,-10,-11,-25,-10,6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-24,-6,6,-16,-17,4,-18,11,-10,-2,-3,-14,6,24,-6,-7,-14,-22,-7,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-16,-20,-24,-18,3,-24,-16,19,-19,12,14,-10,-19,-13,-17,-10,-2,10,-20,-2,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-10,-21,-13,-14,-6,-13,-15,-6,-12,-7,-3,-11,-17,-12,-14,-4,7,-3,3,0,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-19,-5,-1,-14,-12,-9,-15,0,-20,-9,3,1,0,-4,10,8,-13,-26,-13,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-5,3,-25,-1,3,-18,-12,-5,-16,-1,-20,-10,9,13,1,-6,-2,-6,-21,-26,-16,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-9,-26,-11,-6,-10,-23,4,-9,10,-12,-2,-5,-20,1,10,-10,-9,-7,-14,10,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-26,-15,13,-28,-11,12,-22,32,19,-24,-26,-15,-16,-24,-10,4,-13,10,-15;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-5,3,-23,-20,-8,-27,33,-23,-10,0,-14,7,39,-5,-1,-17,-22,-10,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-11,-26,-15,-6,-18,-21,-13,-9,14,-12,-4,-6,-15,-1,20,-7,-5,-5,-21,-9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-18,-10,-18,-3,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,8,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-33,-25,0,-35,-26,35,-22,21,16,-22,-23,-19,-22,-20,-9,25,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,27,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='G'; M=9,-9,-24,-10,-16,-27,50,-19,-33,-17,-27,-18,0,-17,-16,-19,7,-12,-23,-23,-27,-16;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-10,-21,-14,-14,-9,-22,-1,-12,-6,-6,-13,-14,-14,-19,7,7,11,-24,-16,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-22,-26,-15,7,-28,-15,13,-24,37,16,-25,-27,-9,-15,-25,-10,3,-18,0,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,21,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-23,-27,-19,-1,-23,2,18,-14,11,36,-15,-20,-4,-14,-14,-8,8,-19,6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-16,-5,-17,-27,48,-14,-35,-17,-29,-20,11,-22,-17,-17,1,-15,-28,-27,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-12,-22,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,8,-3,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-32,-10,-2,-21,-18,-12,-16,-8,-21,-14,-14,45,-4,-11,-4,-5,-22,-25,-15,-6;
MA   /M: SY='V'; M=5,-20,-17,-21,-17,-12,-22,-25,6,-15,-6,-3,-20,5,-19,-18,-2,5,15,-29,-16,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-29,-20,5,-27,-16,19,-24,36,27,-25,-25,-15,-17,-23,-5,10,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,36,-25,20,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,41,33,-35,-15,-2,-35,11,-26,-23,10,-6,9,0,-2,-10,-28,-33,-18,21;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-11,-22,-14,-11,-11,-26,-20,4,-8,0,0,-10,-9,-11,-11,-5,8,4,-25,-8,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,11,-27,16,23,-30,-15,-4,-28,16,-27,-17,7,-3,11,6,2,-6,-25,-30,-17,17;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-17,-4,-1,-18,-2,4,-24,-6,-21,-13,2,-9,-1,-5,-5,-11,-25,-20,-4,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-19,3,3,-18,-11,-12,-15,-7,-11,-12,-1,-14,-4,-6,7,6,-9,-30,-15,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00855;
//
ID   RNA_POL_N_8KD_MP; MATRIX.
AC   MP01112;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases N / 8 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=25;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=23;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2057400; R2=0.0127555; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=559; N_SCORE=11.326; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-23,-25,-28,-22,0,-32,-20,30,-25,25,23,-20,-22,-16,-23,-22,-10,17,-21,-1,-21;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-22,-19,-24,-19,-4,-25,-22,24,-18,6,7,-18,-3,-16,-19,-12,-5,20,-19,-6,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-12,-3,-18,-21,-3,-24,25,-17,-8,-3,-21,6,62,-10,-9,-13,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-24,-4,0,-15,-15,-8,-23,21,-22,-11,7,-15,1,18,-2,-3,-17,-22,-9,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-21,-24,-20,-9,-27,-26,15,-18,1,2,-26,9,-22,-21,-12,-4,21,-29,-15,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,40,-27,21,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=12,-8,-23,-10,-15,-26,44,-18,-31,-16,-26,-18,0,-16,-15,-18,9,-9,-21,-24,-26,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-24,21,15,-26,-12,17,-27,-3,-22,-17,13,-11,4,-6,4,-3,-23,-33,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-10,-26,-9,-7,-5,-25,4,-8,4,-2,0,-11,-22,-5,0,-16,-10,-6,-12,14,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-31,-37,-34,-26,22,-22,-16,-12,-18,-10,-12,-30,-28,-20,-18,-28,-20,-18,86,37,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,10,-27,15,25,-26,-16,-3,-22,1,-19,-16,3,-2,8,-6,0,-8,-21,-28,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,1,23,-22,-18,-8,-17,3,-15,-13,-2,-8,7,3,4,0,-15,-28,-16,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-26,-3,0,-19,-21,-9,-13,11,-8,-4,-2,-16,4,11,-9,-5,-12,-24,-9,1;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-25,0,13,-24,-7,-7,-25,9,-20,-13,1,-11,7,10,2,0,-20,-25,-16,9;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-15,-24,-17,-7,-9,-19,-9,-15,9,-3,-3,-9,-20,-2,29,-12,-8,-9,-18,-7,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-7,-27,-22,-2,-28,-23,15,-19,16,8,-24,-27,-21,-12,-14,-3,21,-26,-8,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00856;
//
ID   GPR1_FUN34_YAAH_MP; MATRIX.
AC   MP01114;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GPR1/FUN34/yaaH family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2070694; R2=0.0151767; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=620; N_SCORE=14.607; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=86; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,6,-24,8,-4,-24,6,-12,-28,-2,-22,-17,4,-15,-6,3,4,7,-18,-28,-17,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-6,-23,-9,3,9,-21,-9,-5,-14,7,-3,-2,-20,-10,-11,-12,-8,-11,-20,-3,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-25,10,25,-21,-14,3,-17,3,-15,-4,15,-10,10,-2,-1,-7,-22,-31,-16,17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-35,-10,-5,-28,4,-16,-27,-5,-28,-18,-11,39,-9,-2,-7,-13,-28,-25,-26,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-25,10,6,-25,18,-2,-28,-4,-28,-20,29,-16,-2,-6,5,-8,-30,-32,-23,2;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-18,15,-25,-23,-11,-13,-25,-3,-24,-1,-3,-14,-25,-21,-23,-7,0,0,-30,-15,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-18,-8,6,-22,-8,10,-18,-6,-14,-10,-4,-10,0,-12,4,-6,-13,-24,-11,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-29,-11,-3,-22,-22,-15,-15,13,-20,-9,-12,16,-4,13,-10,-8,-9,-25,-16,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-19,-21,-22,-14,0,-23,-5,7,-12,10,13,-19,-23,-3,-12,-13,-7,5,-10,12,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-28,-15,-10,-18,-11,-18,-10,-7,-15,-9,-9,13,-9,-2,-4,2,-11,-25,-17,-13;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-7,-22,-7,-7,-10,-14,-6,-10,-10,-19,-13,-1,5,-8,-12,7,2,-10,-23,-2,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,1,-27,1,-4,-18,-22,26,-14,-6,-13,-4,3,-17,0,2,-6,-5,-13,-28,1,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,8,-28,4,10,-30,-16,-2,-26,31,-28,-10,11,-12,19,20,-4,-8,-24,-24,-12,15;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-20,-30,-23,45,-28,-12,1,-23,10,1,-18,-27,-26,-16,-15,0,-1,3,29,-23;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-17,-17,-13,-23,24,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=39,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,-1,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,11,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,-13,-14,-8,-12,-8,-13,-5,-13,-5,0,-5,-15,-6,-14,13,6,-2,-29,-14,-7;
MA   /M: SY='G'; M=19,-8,-19,-11,-12,-24,30,-18,-25,-14,-23,-17,-1,-14,-12,-18,12,-4,-15,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,-16,-12,-11,-23,22,-18,-22,-13,-21,-15,-2,-13,-11,-18,14,-2,-12,-25,-23,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-34,-24,20,-30,-19,21,-27,33,22,-25,-27,-21,-20,-25,-10,12,-14,6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,19,-15,-15,-12,-22,-22,-15,-15,-12,-12,-5,-17,-15,-15,13,36,-2,-35,-15,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-36,-26,29,-33,-23,23,-30,28,14,-24,-27,-26,-23,-24,-10,13,-11,9,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,30,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,21,-30,-20,17,-30,44,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='S'; M=4,12,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,25,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-19,-4,-26,-21,16,-29,13,-3,-24,-2,1,-11,-26,-19,-18,-15,-13,-4,-18,11,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-18,15,-2,-18,-3,5,-18,-2,-27,-18,51,-18,-2,-2,12,8,-25,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25,9,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,24,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-26,4,-3,-26,16,0,-27,-1,-27,-16,25,-18,4,4,3,-9,-29,-28,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=19,-19,-14,-24,-18,-3,-16,-17,6,-16,6,1,-19,-21,-16,-19,-5,-3,12,-15,-1,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00890;
//
ID   RAN_MP; MATRIX.
AC   MP01115;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GTP-binding nuclear protein ran signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3097177; R2=0.0127872; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=991; N_SCORE=16.972; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=172; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,42,31,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-21,-17,-12,-8,-26,4,2,-6,7,7,-15,-24,-10,-5,-16,-9,6,-25,-1,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,60,-30,-20,6,-30,21,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,2,22,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-15,6,-27,0,-1,-10,-17,32,-16,-3,-17,-6,14,-21,12,-1,-5,-9,-24,-14,18,3;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,29,-17,12,-3,-17,-6,2,-17,-3,-24,-17,43,-17,-3,-3,13,14,-22,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-16,-26,-20,-10,20,-24,-11,-17,10,-10,-6,-9,-21,-11,21,-14,-10,-11,-7,7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-27,-7,6,-21,-23,-17,-10,4,-16,-9,-14,14,-5,-5,-8,-7,-4,-28,-18,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-23,-23,-33,-26,21,-33,-25,22,-26,11,8,-16,-21,-24,-23,-11,3,15,-13,7,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,1,-12,-2,-24,-22,-4,-28,13,-20,-10,-4,-22,13,36,-8,-10,-20,-26,-14,2;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,56,-33,-23,15,-30,13,6,-20,-27,-34,-23,-20,-10,9,1,21,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-13,43,-23,35,6,-26,-3,7,-26,0,-30,-23,48,-17,0,-3,7,-3,-30,-40,-20,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-23,-29,-22,31,-30,-8,10,-24,27,10,-25,-30,-21,-17,-25,-10,2,1,30,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,45,-30,8,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,65,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-30,-3,7,-35,5,-3,-28,10,-25,-8,0,-13,27,6,-2,-13,-28,-20,-16,17;
MA   /M: SY='S'; M=19,-5,-14,-8,-7,-22,15,-15,-21,-12,-24,-17,2,-12,-7,-15,23,6,-11,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,22,-27,21,14,-34,-12,8,-24,5,-25,-12,21,-13,30,3,3,-7,-30,-30,-15,22;
MA   /M: SY='C'; M=7,-17,84,-27,-24,-20,-22,-27,-24,-24,-17,-17,-17,-32,-24,-27,-4,-7,-7,-42,-27,-24;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,15,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,0,-34,-22,42,-24,20,31,-20,-20,-14,-24,-20,-10,24,-20,0,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=17,-3,-10,-11,-8,-15,-10,-18,-12,-10,-14,-12,-1,-10,-8,-13,21,29,-2,-29,-15,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00859;
//
ID   XANTH_URACIL_PERMASE_MP; MATRIX.
AC   MP01116;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Xanthine/uracil permeases family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7575169; R2=0.0160696; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=303; N_SCORE=10.617; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,1,-34,-26,38,-25,21,21,-24,-24,-21,-24,-19,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-3,-28,-23,-6,-18,-25,11,-22,9,4,-22,-25,-22,-22,-10,-6,18,-26,-12,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-22,-34,-24,18,-30,-21,22,-27,29,16,-24,-25,-22,-22,-22,-9,12,-14,4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,50,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,11,-9,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-9,-34,-26,22,-30,-21,16,-26,21,16,-24,-28,-25,-21,-20,-9,14,-16,4,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-9,-34,-28,21,-31,-25,19,-26,10,6,-22,-27,-28,-23,-14,-5,21,-17,3,-28;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-33,-11,-7,-29,10,-20,-25,-13,-27,-19,-13,43,-13,-20,-4,-12,-26,-26,-29,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-6,-27,-8,2,-12,-20,-11,-22,32,-20,-4,-5,-13,1,18,-11,-9,-14,-16,-4,2;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-20,-36,-28,32,-30,-23,20,-26,15,11,-22,-26,-28,-22,-18,-8,18,-10,9,-27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-9,-15,-16,-11,-19,9,-15,-13,-12,-13,-4,-6,-13,-9,-16,10,0,-6,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-4,-14,-14,-11,-20,6,-16,-13,-10,-14,-11,0,-14,-11,-17,8,-2,-5,-23,-21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=1,-22,-17,-28,-19,17,-23,-21,7,-23,18,5,-19,-23,-21,-19,-12,0,5,-14,1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-21,-34,-26,21,-31,-25,22,-26,16,9,-20,-24,-25,-23,-15,-3,17,-14,5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=13,-7,-14,-11,-6,-18,-12,-9,-9,-9,-13,-8,-4,-13,0,-11,13,12,-1,-28,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=10,-7,-14,-11,-9,-15,-6,-9,-9,-12,-14,-6,-2,-13,-7,-13,16,13,-2,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=4,6,-16,3,2,-19,-8,-8,-16,-7,-18,-14,10,-12,1,-9,17,12,-12,-33,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=7,-16,-27,-15,-6,-18,-14,-19,-11,-13,-19,-14,-14,37,-11,-19,0,-4,-14,-26,-21,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-28,-21,1,-14,-14,13,-23,28,27,-22,-25,-14,-17,-22,-11,6,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-29,-14,-21,-15,56,-20,-34,-21,-24,-17,-3,-21,-23,-20,-3,-19,-26,-16,-22,-21;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=16,-21,-13,-27,-21,-7,-18,-22,15,-16,8,11,-21,-21,-17,-19,-6,-3,22,-24,-11,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-2,-18,-10,-10,-8,-3,-8,-11,-7,-13,2,5,-16,-6,-8,6,6,-9,-26,-11,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-23,-9,-30,-24,14,-29,-22,13,-24,14,9,-19,-24,-22,-20,-13,2,12,-19,1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-15,-29,-24,12,-27,-23,18,-22,20,12,-25,-27,-24,-19,-15,-1,24,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-17,-30,-23,4,-26,-15,23,-20,28,32,-26,-26,-15,-16,-21,-7,20,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,76,-30,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,12,34,-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,-7,-23,-8,-14,-27,47,-17,-33,-17,-28,-19,2,-17,-14,-17,11,-8,-23,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='M'; M=4,-15,-16,-21,-15,-7,-16,-13,8,-14,3,17,-12,-17,-8,-14,1,5,8,-26,-9,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-35,-29,0,-33,-26,38,-23,16,22,-24,-24,-21,-23,-16,-6,35,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-18,-21,-17,-15,4,-22,-3,-17,-5,-5,-11,-16,-16,-21,1,-3,2,-22,-17,-17;
MA   /M: SY='A'; M=20,-15,-17,-21,-16,-15,-2,-22,1,-16,-7,-5,-10,-16,-14,-21,4,-2,6,-24,-16,-16;
MA   /M: SY='S'; M=9,-12,-13,-14,-11,-8,-12,-14,-3,-14,-6,-6,-8,-18,-10,-15,11,8,4,-25,-6,-11;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-22,-32,-23,9,-30,-21,24,-23,17,15,-21,-23,-16,-20,-17,-8,18,-17,1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=1,-7,-23,-9,-1,-21,-13,-7,-24,18,-21,-11,-1,-15,4,34,1,-4,-14,-23,-14,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-13,-23,-20,-10,-7,-26,-15,18,-14,6,16,-9,-17,-8,-16,-9,-1,10,-25,-6,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-24,17,-30,-21,18,-27,32,16,-28,-29,-23,-20,-25,-10,13,-8,4,-23;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-13,-7,-8,-17,-18,-16,0,-15,-11,-6,-3,-16,-5,-17,6,1,1,-31,-13,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-22,2,5,-16,-14,-6,-23,6,-21,-14,6,-14,4,13,8,4,-17,-27,-12,3;
MA   /M: M=0,-7,-13,-13,-12,-9,-12,-11,-1,-14,-9,-6,-1,-20,-11,-15,-1,-3,-1,-22,-3,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-31,20,15,-31,-11,-6,-31,14,-28,-19,6,2,4,7,-4,-10,-27,-29,-19,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-28,-20,11,-29,-20,11,-15,16,8,-24,-27,-20,-13,-21,-9,12,-6,6,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-8,23,-23,25,13,-27,-13,-6,-26,4,-23,-19,14,-10,1,-3,6,6,-20,-33,-16,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-24,-6,5,-9,-19,-4,-15,5,-12,-9,-3,-17,0,12,-2,-2,-12,-19,0,1;
MA   /M: SY='R'; M=-7,2,-22,0,4,-23,-9,-2,-24,7,-24,-13,11,-14,11,19,10,3,-20,-29,-15,6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,8,-27,4,12,-24,-10,0,-25,15,-23,-13,13,-13,10,14,-2,-8,-24,-24,-11,10;
MA   /M: SY='R'; M=-4,2,-22,-6,-6,-13,-14,1,-13,1,-13,-8,11,-19,-2,12,-1,-1,-13,-24,-6,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00860;
//
ID   HTH_MARR_1_MP; MATRIX.
AC   MP01117;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MarR-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.7245278; R2=0.0189460; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=86; N_SCORE=8.344; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-11; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-21,-22,-26,-16,-3,-26,-14,17,-18,18,19,-19,-21,-6,-16,-15,-6,9,-19,-1,-12;
MA   /M: SY='S'; M=0,3,-16,1,3,-19,-11,-10,-16,-6,-21,-15,7,-11,1,-6,21,17,-10,-34,-16,2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-25,-15,-6,-16,-23,-14,-1,-10,-9,-2,-15,8,2,-11,-5,-3,-2,-25,-13,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-11,-22,-13,-8,-17,-4,-12,-8,-7,-14,-7,-5,-16,-8,-8,3,-2,-3,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-26,11,28,-30,-16,-4,-26,12,-21,-14,0,-6,17,2,1,-6,-23,-26,-16,22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-32,-23,7,-32,-23,28,-29,41,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-13,-19,-11,-16,-9,-20,-2,-10,-6,-5,-10,-14,-11,-16,6,1,5,-24,-16,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-22,1,11,-21,-21,-1,-19,11,-18,-10,0,-13,7,9,-4,-5,-15,-25,-8,7;
MA   /M: SY='R'; M=5,-12,-20,-16,-7,-9,-16,-5,-10,0,-7,-2,-9,-18,-5,6,-4,-5,-3,-19,-5,-7;
MA   /M: SY='L'; M=0,-20,-22,-23,-13,-3,-15,-18,6,-19,13,6,-16,-20,-13,-15,-12,-8,3,-20,-7,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-16,-9,-9,-22,5,-7,-19,-4,-18,-6,-4,-18,-5,-4,0,-8,-11,-26,-16,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-19,-31,-26,5,-30,-23,27,-23,14,13,-22,-25,-22,-21,-12,-4,28,-21,0,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-22,17,11,-23,-15,-3,-22,-2,-18,-16,6,-12,0,-3,7,6,-15,-33,-14,5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-10,-2,-21,-17,-9,-16,9,-15,-7,-4,-4,5,17,-6,-4,-14,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=3,-8,-24,-7,-2,-25,-3,-14,-20,-8,-24,-15,-4,17,1,-12,10,5,-18,-29,-21,-2;
MA   /M: SY='T'; M=7,6,-12,-2,-5,-16,-8,-11,-15,-8,-20,-15,13,-12,-5,-9,23,26,-9,-34,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=5,-24,-19,-29,-20,0,-23,-20,18,-22,26,17,-23,-23,-16,-20,-17,-7,13,-21,-5,-18;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-12,-11,-11,-9,-14,-16,-7,-10,-12,-9,0,-16,-11,-8,14,20,2,-29,-12,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-28,-5,0,-20,-9,-3,-27,15,-22,-13,4,-12,3,32,-4,-6,-21,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-18,-25,-19,1,-26,-17,14,-16,9,11,-18,-22,-14,-14,-9,3,16,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-26,-20,-29,-21,3,-28,-22,22,-26,30,14,-23,-24,-18,-21,-18,-4,14,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-26,17,6,-29,-8,-8,-29,15,-25,-17,7,-12,1,8,-1,-6,-20,-27,-16,3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-24,-7,4,-20,-17,-5,-22,15,-19,-8,-1,-14,14,23,0,-2,-17,-21,-10,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,28,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-27,7,38,-24,-20,-7,-17,2,-12,-13,-5,-5,10,-6,-2,-8,-17,-28,-17,24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,13,-19,17,16,-29,-16,-3,-27,9,-22,-13,5,-12,9,6,-2,-8,-22,-30,-16,12;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-25,3,2,-25,-11,-7,-21,16,-20,-7,2,-14,4,12,-4,-7,-14,-24,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-29,4,-9,-31,50,-16,-39,-15,-30,-22,4,-17,-14,-17,2,-16,-29,-25,-28,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-25,-29,-21,22,-27,-9,4,-24,20,6,-25,-28,-20,-17,-25,-13,-2,14,21,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-14,-35,-29,0,-35,-29,36,-26,17,14,-24,-25,-24,-26,-17,-6,34,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,0,-23,2,7,-20,-18,-7,-19,7,-14,-10,-2,-13,4,9,-1,0,-12,-24,-9,4;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-27,-12,-3,-14,-21,-5,-22,23,-17,-8,-4,-20,3,49,-9,-8,-12,-20,-9,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-23,-7,3,-11,-20,-3,-8,-8,-3,-3,-7,-11,-2,-6,-5,-4,-8,-26,-8,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-26,-7,-3,-21,-18,-10,-12,-3,-18,-11,-5,14,-6,-7,-2,-1,-12,-28,-16,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-5,13,0,-25,-8,-2,-26,-9,-26,-19,9,-12,-4,-9,10,-1,-18,-38,-18,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-26,-6,7,-20,-20,-13,-12,-5,-11,-9,-10,11,-1,-6,-4,-4,-12,-27,-17,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-21,-1,2,-20,-10,-1,-16,2,-19,-12,13,-16,3,8,5,-1,-14,-30,-15,1;
MA   /M: SY='D'; M=-18,47,-28,63,18,-38,-9,0,-38,-1,-30,-29,22,-11,0,-9,3,-8,-29,-40,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-30,-5,2,-27,-5,-6,-31,27,-25,-11,0,-15,10,35,-7,-12,-23,-20,-13,4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='S'; M=3,-6,-16,-8,0,-20,-9,-11,-14,-3,-14,-9,-2,-15,3,-2,5,-1,-10,-27,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-15,-21,-16,-10,-11,-22,-15,-4,7,-5,-1,-13,-20,-8,8,-8,-3,5,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-17,-20,-19,-12,10,-25,-3,-9,-5,2,-1,-12,-19,-12,4,-17,-10,-9,-13,8,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-20,-34,-27,5,-32,-27,32,-26,21,14,-25,-25,-24,-24,-17,-6,29,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-5,-21,-8,-2,-13,-16,4,-19,1,-18,-8,0,-14,4,2,6,7,-14,-18,-4,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-30,-20,5,-29,-20,21,-26,37,21,-28,-21,-18,-20,-26,-9,12,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-27,15,24,-30,-15,-7,-27,9,-24,-18,1,5,8,-2,1,-5,-23,-29,-19,16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-26,4,15,-25,-13,-8,-24,14,-21,-13,0,-6,7,8,2,-4,-19,-27,-15,11;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-27,-10,-18,-28,58,-19,-35,-18,-28,-19,0,-18,-18,-19,4,-15,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-4,-24,-5,8,-19,-17,1,-19,10,-16,-6,-3,-13,6,11,-3,-6,-14,-23,-9,6;
MA   /M: SY='E'; M=1,-5,-25,-5,11,-22,-17,-3,-18,3,-17,-9,-6,2,10,-3,-1,-5,-17,-23,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-19,-32,-24,9,-29,-24,24,-26,27,13,-25,-26,-23,-22,-19,-7,21,-20,-1,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-10,-29,-21,5,-30,-17,11,-20,9,4,-21,-26,-18,-17,-18,-10,6,-6,9,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-28,0,15,-26,-15,-7,-23,11,-22,-14,0,1,9,5,-2,-8,-23,-18,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=1,-7,-24,-8,8,-21,-13,-9,-15,3,-12,-8,-6,-13,6,8,-2,-7,-11,-24,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=4,-21,-8,-24,-19,-3,-23,-22,11,-22,19,8,-22,-25,-19,-20,-14,-6,14,-25,-9,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-16,-7,2,-16,-19,0,-14,-2,-11,-7,-1,-17,3,5,-1,-2,-12,-25,-7,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-27,-3,10,-25,-14,-4,-19,2,-14,-8,-2,0,15,4,-3,-6,-21,-25,-15,11;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-21,-8,3,-20,-16,-15,-7,-4,-9,-7,-11,-5,-4,-10,-2,-5,-2,-25,-16,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-24,-19,-13,-8,-14,-12,-1,-8,-7,-1,-11,-17,-6,-4,-7,-8,1,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-12,5,-24,7,6,-24,-13,7,-19,0,-16,-7,4,-15,7,2,-4,-9,-18,-28,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-25,-2,10,-24,-13,0,-21,9,-19,-9,-1,-8,7,7,-1,-5,-17,-26,-13,8;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-16,-11,-11,-10,-13,-12,-11,-9,-10,-9,-8,-19,-8,-7,-1,3,-6,-10,-2,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00861;
//
ID   COPPER_FIST_1_MP; MATRIX.
AC   MP01119;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper-fist DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2444658; R2=0.0112270; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1584; N_SCORE=22.018; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=201; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-21,-30,-25,-5,-31,-28,28,-21,7,8,-25,-8,-24,-23,-13,-5,31,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,38,-25,18,15,-25,-25,-25,-25,-16,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-28,-40,-30,13,-38,-28,42,-30,18,17,-20,-22,-23,-28,-20,-10,25,-15,5,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,38,-23,27,9,-24,-4,7,-24,1,-29,-21,48,-16,2,-1,7,-3,-30,-39,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-6,-18,-29,62,-16,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-10,-22,-15,-11,-14,-24,-14,9,-4,-5,3,-4,-20,-3,-7,-7,-5,10,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,6,-29,3,9,-29,-17,-7,-29,43,-30,-11,9,-11,9,26,-7,-9,-21,-23,-11,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-27,-23,-20,22,-27,14,6,-10,6,17,-20,-27,-7,-10,-20,-10,-4,16,58,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=1,0,-23,2,8,-22,-2,-11,-15,-6,-12,-6,-6,-13,-4,-12,-2,-9,-9,-27,-18,2;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-21,-9,-4,-19,-16,-13,-15,3,-21,-12,-5,1,-4,7,7,6,-7,-30,-16,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,61,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='S'; M=16,-9,-13,-12,-11,-18,4,-18,-11,-13,-18,-12,-4,-15,-11,-16,18,6,1,-31,-20,-11;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-7,-5,-18,-5,-15,-15,-10,-21,-15,3,-10,-5,-12,28,23,-5,-33,-18,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-18,-4,2,-22,-15,-9,-18,4,-20,-10,3,-10,11,1,16,19,-12,-29,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,10,-24,4,10,-23,-15,-1,-22,12,-22,-12,15,-13,12,14,4,4,-21,-28,-14,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,-17,6,0,-20,-8,-2,-17,-3,-23,-14,27,-14,6,-3,16,16,-18,-34,-16,3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,24,-30,36,29,-34,-16,17,-33,3,-24,-19,10,-9,14,-3,-2,-12,-30,-33,-12,21;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-30,-8,2,-25,-12,0,-29,22,-21,-9,0,-18,17,51,-7,-11,-23,-20,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-26,-14,-2,-19,-19,-16,-5,-9,-11,-1,-18,28,-8,-16,-8,-7,-6,-27,-19,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-25,-29,-19,2,-31,-20,21,-12,7,14,-17,-21,-11,-14,-15,-8,16,-18,0,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-31,-12,3,-20,-23,-11,-8,4,-12,2,-12,15,0,1,-12,-10,-12,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,19,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-28,-8,-1,-23,-20,-17,-19,3,-23,-14,-9,34,-5,-1,-1,8,-18,-28,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-32,-6,4,-26,-20,-7,-28,32,-26,-12,-3,2,7,40,-10,-10,-22,-22,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=3,-16,-19,-17,-11,-10,-17,-18,2,-18,2,-2,-12,-4,-11,-18,2,1,-1,-28,-13,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-8,-16,-10,-7,-13,-16,-17,-10,-13,-10,-10,-5,3,-9,-13,14,23,-6,-31,-15,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-6,2,-14,-8,-17,-21,-11,-10,-8,-9,2,-6,-16,5,-8,5,18,-7,-29,-11,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-11,64,-16,-16,-11,-16,-16,-16,-16,-11,-11,-11,-21,-16,-16,-5,-5,-5,-27,-16,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-2,3,-2,5,3,-25,-9,-13,-24,-3,-15,-15,-4,-17,-7,-10,-5,-9,-16,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-10,-32,-10,-4,-17,-24,24,-13,3,-16,-3,-5,-1,0,-1,-12,-13,-16,-21,6,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-18,96,-27,-25,-20,-28,-25,-30,-20,-20,-18,-17,-37,-24,-14,-10,-10,-12,-45,-27,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,1,-32,6,6,-28,-18,-6,-30,25,-26,-15,0,2,5,30,-8,-10,-23,-25,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=7,-1,-26,1,10,-26,-15,-12,-13,-5,-15,-12,-6,7,2,-13,-1,-7,-14,-26,-18,4;
MA   /M: SY='I'; M=5,-21,-22,-28,-21,-8,-9,-20,13,-21,10,12,-16,-19,-15,-22,-12,-9,7,-20,-9,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-10,0,-18,-22,-6,-22,26,-12,-5,-5,-19,5,43,-13,-10,-15,-20,-8,0;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-13,-28,-12,-2,-22,-24,-13,-8,12,-15,-3,-10,1,4,7,-10,-8,-6,-23,-12,-1;
MA   /M: SY='B'; M=-8,13,3,7,-2,-23,-16,-8,-21,-7,-20,-15,12,-17,0,-8,7,13,-16,-35,-17,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-3,-8,-1,-24,-22,-14,-27,25,-24,-12,-3,-16,0,19,-5,0,-15,-26,-13,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00863;
//
ID   UREASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01120;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Urease nickel ligands signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9956679; R2=0.0146047; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1014; N_SCORE=19.795; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-19,-34,-29,0,-34,-29,37,-24,14,15,-25,-25,-25,-24,-14,-3,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=15,-14,-21,-15,-8,-20,-12,-20,-9,-12,-17,-12,-12,22,-11,-18,5,2,-6,-27,-21,-11;
MA   /M: SY='S'; M=9,-2,-16,-3,-3,-22,14,-13,-24,-11,-27,-19,7,-12,-5,-12,26,9,-15,-33,-22,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-29,31,47,-32,-17,0,-32,7,-23,-22,5,-3,14,-3,2,-9,-29,-33,-20,31;
MA   /M: SY='V'; M=9,-25,-17,-31,-25,-5,-26,-27,27,-21,8,8,-21,-21,-21,-24,-8,-4,30,-24,-9,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-34,-27,0,-36,-21,38,-26,15,15,-19,-22,-19,-25,-16,-8,26,-20,3,-27;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-12,-11,-6,-21,-1,-15,-14,-10,-18,-14,-1,-5,-6,-16,19,6,-6,-28,-21,-6;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-28,18,50,-28,-17,0,-28,8,-21,-20,7,-3,16,-1,2,-8,-29,-31,-20,33;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-29,-5,-13,-27,43,0,-36,-11,-28,-16,7,-20,-11,-9,-1,-17,-29,-23,-21,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-25,-15,-5,-11,-24,-9,-6,9,8,8,-13,-20,-1,10,-19,-10,-6,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,31,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-15,-28,-23,2,-26,-23,19,-22,20,10,-26,-27,-22,-19,-14,-3,25,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-11,-20,-10,-18,-1,-19,-10,-10,-10,-10,-10,-11,-10,-20,9,0,0,-18,-17,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-25,-12,-17,-27,51,-19,-33,-16,-25,-17,-2,-18,-17,-17,2,-13,-23,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-35,-28,4,-34,-25,36,-25,21,21,-24,-24,-21,-24,-19,-8,28,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,2,-15,-13,-11,-17,-20,-7,-15,-8,-8,-6,-16,-12,-15,12,22,2,-32,-14,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-25,-34,-26,51,-29,-13,2,-25,12,2,-24,-30,-28,-18,-24,-12,-3,22,35,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-28,-36,-28,0,-37,-27,43,-28,20,18,-17,-21,-19,-27,-19,-9,26,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='C'; M=3,-8,49,-15,-13,-20,-16,-20,-23,-18,-22,-18,-5,-24,-15,-19,10,3,-10,-42,-24,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,79,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-29,4,20,-37,-16,6,-23,9,-21,-5,1,-10,46,9,1,-9,-28,-22,-12,33;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-12,-27,-15,1,-21,-26,-5,2,-7,3,8,-10,-16,26,-5,-10,-10,-9,-20,-6,13;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-11,-27,-21,-9,-24,-17,15,-19,3,9,-18,-15,-16,-21,-8,-5,16,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,6,-30,14,29,-23,-20,-2,-23,2,-19,-16,-3,-2,11,-5,-4,-8,-24,-18,-8,19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,2,18,-15,-19,9,-18,-4,-14,-11,-3,-11,2,-7,0,-3,-14,-27,-7,9;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-11,-18,-10,-21,4,-19,-12,-11,-12,-11,-8,-11,-10,-19,11,0,-2,-21,-21,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,23,-28,45,23,-28,-28,-18,-20,-28,-10,12,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=11,2,-18,1,4,-21,-4,-8,-16,-6,-15,-7,-1,-11,-1,-12,8,-1,-11,-28,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=6,8,-15,2,-3,-21,7,-7,-21,-9,-28,-19,20,-14,-3,-9,26,10,-16,-36,-21,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-34,-28,0,-34,-28,36,-25,16,16,-22,-23,-21,-24,-14,-2,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,48,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-4,-11,-11,-11,-20,-20,-11,-11,-11,-11,-1,-11,-11,-11,19,47,-1,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-25,-21,-31,-22,10,-27,-9,20,-20,24,32,-22,-24,-14,-16,-21,-10,13,-18,3,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00133;
//
ID   CASPASE_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP01121;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Caspase family histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7335043; R2=0.0165400; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=303; N_SCORE=10.735; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=8,-15,-4,-18,-14,-12,-11,-15,-9,-9,-8,-7,-11,-21,-12,-5,1,-2,1,-24,-10,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-26,5,27,-26,-16,-3,-25,13,-19,-13,1,-8,15,11,1,-7,-22,-26,-16,20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-29,19,27,-31,-6,-3,-29,7,-22,-14,3,-8,10,-2,-3,-11,-26,-28,-18,19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-24,-30,-18,-1,-28,-12,27,-17,20,37,-19,-19,-7,-17,-19,-10,14,-21,-1,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-22,-13,-2,-9,-24,-6,3,-11,7,8,-12,-19,-1,-10,-11,-4,1,-24,-5,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-21,-1,7,-17,-15,-11,-14,1,-8,-8,-5,-13,-2,-2,0,1,-9,-27,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-13,-21,-15,-3,-6,-22,-11,-3,-5,3,0,-12,-17,-7,-6,-9,-2,-2,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-30,-20,2,-30,-18,25,-24,31,24,-24,-25,-12,-19,-23,-10,14,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-1,10,-24,-16,4,-24,18,-18,-7,-2,-14,12,17,-9,-12,-22,-17,-6,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,11,17,-27,-13,-1,-24,10,-22,-13,7,-11,13,4,-1,-8,-23,-25,-12,14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-14,-20,-13,-11,-12,-18,-1,-9,-4,-4,-13,-16,-12,-15,2,1,7,-19,-8,-13;
MA   /M: SY='A'; M=17,-5,-6,-10,-3,-24,-5,-9,-19,-4,-20,-12,-2,-13,2,-9,13,1,-11,-28,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-24,-2,10,-18,-18,-2,-18,6,-10,-8,3,-15,6,13,-2,-2,-17,-27,-11,7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-28,-2,18,-24,-18,-8,-16,-3,-16,-8,-9,19,7,-9,-2,-6,-19,-28,-19,11;
MA   /M: SY='D'; M=-4,25,-24,34,21,-31,-10,-4,-30,0,-24,-23,11,-8,3,-9,7,-3,-23,-35,-20,12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-19,-8,-3,-23,-2,-11,-19,1,-21,-12,0,-13,3,0,12,4,-12,-27,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-6,21,-21,25,6,-26,-10,-5,-23,3,-23,-18,14,-12,-2,-4,6,1,-16,-32,-16,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=7,-5,-16,-9,-6,-16,-3,-11,-15,-3,-15,-9,1,-14,-4,0,11,5,-8,-27,-15,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,40,-26,55,15,-36,-8,-3,-35,-2,-29,-27,17,-10,-1,-11,6,-5,-25,-39,-20,7;
MA   /M: SY='C'; M=0,-10,52,-14,-14,-20,-14,-20,-25,-20,-25,-20,-4,-24,-14,-20,16,6,-10,-45,-25,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,2,-29,-23,28,-26,-22,-3,-24,5,-3,-16,-25,-27,-19,-8,5,1,-14,5,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-19,-34,-27,18,-30,-25,23,-25,16,10,-23,-25,-26,-23,-15,-6,23,-16,2,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-27,31,-31,-27,1,-30,-27,5,-27,10,2,-25,-33,-28,-24,-16,-7,14,-31,-11,-27;
MA   /M: SY='V'; M=12,-23,8,-28,-25,-8,-22,-27,11,-19,1,1,-23,-26,-24,-22,-5,-2,28,-30,-15,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-24,-36,-27,19,-34,-25,29,-29,27,15,-24,-26,-25,-24,-23,-9,19,-14,6,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-3,-11,-19,-10,-27,-19,9,-10,-1,-10,37,24,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-20,8,21,-22,-23,-9,-13,-2,-12,-12,-4,-11,2,-5,-4,-7,-11,-30,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-7,-27,-4,15,-13,-15,-3,-17,1,-5,-4,-8,-14,4,1,-10,-11,-17,-22,-9,9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-28,3,-5,-28,35,-6,-33,-11,-29,-19,14,-13,-9,-12,2,-14,-30,-27,-24,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-16,-22,-19,-19,-11,5,-8,-5,-17,-7,0,-11,-21,-15,-17,-5,-9,0,-19,-6,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,11,-25,-24,17,-31,1,-5,-18,-4,-4,-20,-32,-17,-17,-17,-10,-7,4,43,-24;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-24,-12,-16,-27,49,-19,-32,-17,-25,-18,-2,-17,-16,-19,5,-13,-22,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-17,-11,-9,-11,-21,-15,-7,5,-12,-6,-7,-16,-8,-1,4,16,3,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-28,49,13,-34,-11,-1,-32,4,-26,-20,18,-12,1,-5,-1,-9,-25,-36,-18,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-23,-3,-5,-20,13,4,-26,-12,-20,-13,1,-16,-8,-12,3,-3,-18,-26,-13,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-8,-25,-8,0,-24,-17,-5,-16,8,-21,-8,-5,1,5,3,1,-4,-12,-26,-13,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-13,-24,-14,-2,-4,-26,-10,4,-10,3,0,-12,-15,-7,-12,-10,-4,0,-18,4,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-27,-1,8,-21,-21,-8,-12,6,-11,-7,-6,-6,2,-1,-7,-7,-11,-25,-11,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-25,-14,-4,-14,-23,-15,2,-12,0,-1,-10,1,-4,-13,-8,-4,-4,-26,-12,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00864;
//
ID   CASPASE_CYS_MP; MATRIX.
AC   MP01122;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Caspase family cysteine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2122178; R2=0.0143976; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=282; N_SCORE=9.262; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-25,-35,-25,3,-33,-25,34,-29,31,18,-24,-24,-19,-25,-22,-9,20,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-16,-20,-23,-18,23,-25,-16,-6,-11,-4,-5,-13,-21,-19,-10,-6,10,-3,2,16,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,12,-23,14,6,-26,-3,-1,-28,1,-25,-18,9,-13,0,1,7,0,-21,-31,-16,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-10,-23,-11,-10,-3,-24,4,-1,-16,7,2,-10,-21,-7,-13,-12,-4,-4,-18,8,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-38,-28,59,-31,-21,9,-30,18,6,-22,-29,-34,-21,-22,-10,5,2,22,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,18,-23,11,8,-23,-12,1,-22,8,-23,-15,24,-14,8,10,5,4,-23,-31,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=3,12,-22,6,-7,-25,22,-9,-27,-10,-25,-19,18,-16,-10,-12,6,-3,-22,-29,-23,-9;
MA   /M: SY='A'; M=6,1,-18,1,-3,-18,-13,-13,-13,-5,-8,-9,-4,-15,-7,-7,3,3,-6,-28,-14,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-24,1,-2,-12,-13,-2,-17,10,-17,-10,19,-19,-1,10,-3,-5,-19,-25,-7,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-19,107,-29,-28,-20,-27,-29,-28,-28,-19,-19,-19,-37,-28,-29,-8,-9,-9,-47,-29,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-31,-7,1,-25,-18,-5,-20,0,-23,-13,-9,33,1,-1,-3,-6,-23,-28,-18,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-15,-5,-4,-14,-10,-8,-17,-3,-21,-14,5,-13,-2,0,19,16,-10,-27,-7,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=4,-14,-19,-17,-11,-11,-14,-11,-7,-2,-8,-4,-11,-19,-6,3,-3,-2,1,-18,-4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,11,-25,5,-6,-20,21,-3,-26,-8,-25,-18,20,-19,-8,-10,2,-9,-26,-24,-13,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-33,-26,3,-32,-25,31,-26,27,19,-27,-27,-22,-22,-20,-7,29,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-35,-27,42,-31,-19,14,-28,21,8,-24,-29,-30,-20,-22,-9,10,-4,18,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-25,-39,-29,36,-34,-23,25,-28,15,15,-20,-25,-27,-24,-20,-10,15,-6,14,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-38,-29,8,-36,-27,40,-27,17,19,-22,-23,-22,-26,-18,-8,29,-19,1,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-31,-1,18,-39,-20,7,-20,8,-21,-2,-2,-1,53,7,-1,-10,-30,-21,-12,35;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-11,-22,-12,-11,-3,-20,-9,-12,-8,-9,-11,-12,-13,-20,7,-1,0,-17,-15,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-30,-7,4,-26,-16,2,-28,22,-20,-8,0,-17,22,50,-7,-10,-23,-20,-11,10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-12,-30,61,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-25,22,20,-28,-14,-5,-28,7,-23,-19,9,-9,5,2,4,1,-22,-32,-17,12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,5,-27,4,17,-20,-17,3,-19,5,-13,-9,8,-14,15,10,-4,-8,-23,-24,-8,15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-24,-15,-11,0,-24,1,-7,0,0,0,-8,-23,-7,10,-13,-6,-5,-14,9,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-25,43,15,-31,-10,12,-30,0,-23,-19,13,-9,8,-5,-1,-9,-25,-30,-11,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-15,-3,-3,-17,-10,-5,-15,4,-13,-8,1,-8,-4,2,-5,-7,-11,-24,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-31,-9,-15,-30,54,-19,-38,-12,-30,-19,-1,-11,-16,-15,-2,-18,-29,-21,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-16,-24,-19,-10,1,-24,-9,5,-11,-2,1,-12,-19,-13,-12,-10,-6,6,-20,-1,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-31,-8,2,-20,-23,-16,-8,-11,-11,-9,-13,29,-5,-16,-7,-2,-14,-28,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-11,-23,-13,-12,-11,-20,-17,-3,-8,-7,-5,-11,-14,-11,-10,-9,-3,1,-7,-8,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-23,4,9,-18,-13,-10,-12,-6,-6,-8,-2,-16,-4,-7,-6,-8,-8,-29,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-2,6,-21,10,2,-24,-5,-8,-22,-4,-18,-14,4,-13,2,-5,9,2,-16,-31,-16,2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-18,4,-10,-15,13,-15,-25,-15,-20,-17,1,-18,-15,-16,3,-3,-15,-26,-17,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-1,-19,-3,-3,-12,-15,-11,-10,-3,-16,-11,4,-13,-7,0,5,2,-4,-30,-14,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-28,2,8,-19,-24,-14,-4,-6,-6,-6,-7,-2,-4,-12,-8,-6,-7,-28,-13,0;
MA   /M: SY='P'; M=10,-13,-28,-13,-10,-27,20,-20,-25,-14,-25,-17,-10,21,-14,-20,-1,-11,-22,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-15,-18,-22,-15,-12,-15,-21,10,-18,-4,-1,-8,-14,-11,-21,7,2,9,-25,-12,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00864;
//
ID   TNASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01123;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thermonuclease family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2808137; R2=0.0157690; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=495; N_SCORE=13.076; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=2,-12,-17,-12,-4,-12,-18,-18,-3,-13,-3,-5,-12,-6,-10,-14,3,7,2,-29,-14,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-12,-1,0,-26,-19,-13,-20,4,-22,-12,-5,2,2,-3,0,-1,-14,-30,-17,0;
MA   /M: SY='A'; M=3,-1,-19,-4,-6,-16,-7,-13,-13,-5,-6,-8,0,-16,-7,-8,0,1,-9,-27,-14,-7;
MA   /M: SY='W'; M=1,-21,-10,-24,-17,-7,-20,-9,-7,-15,1,-3,-19,-25,-14,-10,-15,-11,-4,3,-2,-16;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-24,0,14,-23,-13,10,-24,5,-18,-12,4,-12,7,10,0,-8,-20,-26,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-27,10,12,-24,-12,2,-25,6,-15,-11,1,-13,2,0,-6,-7,-20,-27,-11,6;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-8,-26,-9,4,-5,-24,-5,-6,-3,-4,-3,-5,-18,1,1,-9,-8,-8,-17,1,1;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-26,-7,-2,-16,-19,2,-21,9,-20,-10,-3,0,0,11,-1,3,-17,-21,-1,-3;
MA   /M: SY='G'; M=9,-13,-10,-16,-18,-16,23,-14,-24,-16,-18,-14,-8,-21,-16,-19,-2,-12,-16,-14,-8,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-26,-4,10,-20,-21,-7,-23,21,-15,-9,-3,-13,6,28,-6,-1,-16,-23,-11,6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,16,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,44,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-23,-22,-4,-28,-22,22,-14,7,8,-13,-25,-19,-15,-11,-4,26,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-4,-30,-4,3,-23,-20,17,-30,29,-23,-8,2,-17,10,41,-10,-12,-22,-22,-4,3;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-22,-33,-27,-2,-28,-29,24,-22,7,7,-25,-24,-22,-23,-14,-7,26,-2,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-24,-26,-18,-5,-29,-21,19,-13,10,9,-16,-21,-13,-8,-13,-6,14,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-13,7,-28,12,12,-19,-22,-7,-13,2,-14,-11,-1,-12,0,-5,-5,-4,-13,-23,-3,5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-1,-31,-29,0,-31,-29,25,-23,14,9,-28,-30,-28,-22,-14,-3,37,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,0,-22,1,0,-12,-17,-6,-4,-11,4,8,-3,-17,-3,-11,-7,-5,-7,-29,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-10,-18,-10,-12,-8,-21,-14,-1,-2,-7,-3,-13,-20,-12,-8,-5,1,10,-19,1,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-11,26,-25,25,9,-29,-9,-1,-29,15,-30,-19,25,-13,3,6,4,-4,-25,-34,-17,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,2,-28,-2,-9,-26,30,-9,-33,-1,-28,-17,13,-19,-8,5,0,-13,-27,-24,-22,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-30,2,19,-33,-20,15,-25,19,-23,-5,1,-10,35,13,-4,-11,-27,-22,-7,26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-4,-26,-2,3,-25,-16,-10,-16,-2,-16,-10,-6,11,8,-7,0,-1,-18,-27,-16,4;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-27,-19,-7,-12,-25,-14,5,-3,-3,9,-16,-18,2,-7,-14,-10,2,-5,-3,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-26,-5,0,-21,-18,-8,-23,17,-22,-12,3,-1,2,26,-1,4,-18,-25,-14,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-29,13,-33,-28,31,-26,17,13,-25,-27,-27,-23,-17,-6,32,-20,0,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,24,-28,43,24,-28,-28,-18,-20,-28,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-19,-29,-22,4,-27,-18,19,-22,20,10,-23,-25,-19,-20,-16,-6,17,-15,5,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,2,-24,3,-3,-20,10,-12,-20,-13,-8,-11,1,-17,-10,-14,-4,-11,-17,-26,-18,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,18,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=18,-4,-10,-14,-10,-14,-13,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,32,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-20,-8,-2,-19,-19,-15,-13,12,-18,-8,-1,-11,-1,4,7,14,-7,-26,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=1,-11,-20,-12,-8,-18,-11,-5,-12,5,-15,-6,-7,-18,-6,3,-2,-5,0,-26,-11,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-26,-4,6,-27,-20,11,-18,13,-20,-3,-2,-14,22,9,-2,-8,-15,-24,-6,13;
MA   /M: SY='P'; M=4,-9,-27,-7,-2,-23,-15,-14,-15,-6,-13,-11,-11,19,-3,-7,-6,-7,-16,-25,-19,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,2,-22,-7,-8,9,-15,-4,-15,1,-17,-11,11,-20,-9,-1,-1,-3,-15,-16,5,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-25,-12,-14,-19,10,-17,-12,-8,-16,-8,2,-17,-12,-11,-1,-2,-11,-24,-16,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-9,-32,-4,7,-30,-5,-9,-25,-1,-26,-15,-7,25,10,-2,-1,-9,-27,-26,-22,6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-20,-26,-20,-14,-7,-24,-13,-6,3,-10,-4,-17,-16,-10,12,-14,-9,2,-2,2,-14;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-23,2,20,-29,-13,-4,-22,8,-22,-12,0,-7,20,1,8,-3,-20,-26,-16,20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-27,-7,0,-19,-18,-8,-22,16,-23,-12,-4,4,1,14,-2,0,-17,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-4,-29,-2,4,-4,-23,9,-12,3,-10,-2,-8,-18,9,-2,-11,-10,-17,-2,27,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-24,-19,-18,-15,14,-18,-10,-16,-6,0,-9,-19,-14,-12,-6,-7,-8,-21,-16,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-27,-13,1,-12,-24,-13,-5,1,6,5,-16,-2,-4,-3,-17,-10,-9,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='E'; M=7,1,-21,0,15,-20,-12,-9,-16,1,-11,-11,1,-10,2,-6,3,-4,-14,-27,-16,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00865;
//
ID   ROK_MP; MATRIX.
AC   MP01125;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ROK family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6736021; R2=0.0149686; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=434; N_SCORE=12.160; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=56; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-23,-32,-24,-19,9,-23,-12,-7,-14,-7,-5,-23,-26,-13,-14,-21,-15,-10,46,21,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-2,-25,0,-8,5,-22,-11,-10,-11,-4,-7,-8,-20,-12,-12,-12,-9,-7,-11,1,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-26,0,1,-25,20,-10,-28,-8,-23,-16,1,-12,-4,-12,2,-10,-22,-23,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=7,-4,-22,-6,8,-18,-10,-12,-9,-9,-6,-8,-4,-9,-3,-13,-2,-6,-10,-25,-16,1;
MA   /M: SY='A'; M=1,-6,-23,-9,-8,-10,1,-13,-18,-10,-14,-12,-1,-13,-11,-9,-1,-7,-16,-13,-12,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-25,1,3,-24,-8,-8,-21,8,-15,-9,1,-14,7,5,-3,-6,-18,-25,-13,5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-28,21,6,-32,8,-6,-32,-2,-27,-19,10,-10,4,-7,2,-7,-27,-30,-20,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-15,-15,-19,-14,-4,-23,-5,4,-14,-1,0,-13,-21,-9,-15,-6,-3,5,-16,8,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-24,3,5,-26,-16,-2,-23,2,-23,-15,2,10,4,3,0,-4,-22,-30,-17,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,19,-19,15,-1,-18,-10,0,-17,-7,-18,-15,22,-17,-4,-8,8,6,-16,-35,-14,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,-8,-25,-21,-1,-23,-19,15,-18,8,14,-20,-25,-18,-17,-6,0,22,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-20,-33,-24,5,-30,-22,28,-24,25,20,-24,-25,-20,-22,-19,-7,22,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-17,-20,-21,-20,11,-1,-9,-11,-18,-4,-6,-13,-24,-19,-17,-8,-6,-10,-3,15,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-20,-32,-24,2,-30,-24,28,-25,27,17,-25,-25,-20,-22,-19,-7,23,-22,-4,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-18,-17,-14,-7,-22,-18,5,-14,-5,-3,-5,-14,-10,-13,9,22,5,-26,-4,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-26,4,-33,-26,31,-26,28,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-25,-6,-13,-26,42,-2,-34,-16,-29,-17,4,-18,-11,-15,8,-11,-25,-26,-21,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-14,-11,-10,-11,-21,-18,-9,-5,-10,-8,-1,-12,-8,-3,13,38,-1,-28,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-13,-33,-28,17,-31,-25,22,-25,15,12,-24,-27,-27,-22,-16,-4,25,-19,1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=15,-12,-23,-16,-18,-20,39,-20,-26,-18,-20,-15,-5,-17,-18,-20,2,-13,-17,-18,-23,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-34,-27,5,-33,-27,33,-26,23,15,-25,-25,-23,-24,-18,-7,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-23,-35,-29,0,-34,-29,36,-25,15,14,-24,-24,-23,-25,-17,-7,31,-15,-3,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-18,-29,-22,11,-27,-19,18,-23,11,9,-17,-23,-19,-21,-10,-4,13,-17,3,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,33,-25,28,8,-27,2,4,-27,-1,-29,-21,37,-16,2,-4,5,-6,-30,-36,-21,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-26,-4,-8,-29,37,-12,-34,-5,-29,-17,7,-18,-7,-7,0,-15,-28,-24,-24,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-2,9,-26,-19,9,-26,26,-23,-9,2,-13,10,23,-7,-10,-20,-23,-7,8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-23,-28,-20,-2,-28,-24,19,-24,21,10,-25,-7,-20,-22,-19,-8,14,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-23,-25,-26,-19,21,-28,5,2,-20,8,5,-17,-26,-16,-12,-19,-12,-1,-1,20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-21,-6,-3,-18,-17,3,-16,2,-17,-8,4,-15,2,10,6,7,-11,-29,-8,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-24,-11,-4,-18,-14,-3,-13,4,-11,-3,-5,-14,3,9,-4,-7,-10,-23,-9,-2;
MA   /M: SY='N'; M=0,9,-18,1,-3,-18,-3,0,-19,-3,-23,-14,20,-16,0,-2,13,4,-17,-32,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-5,-29,-6,-14,-25,41,12,-35,-16,-26,-14,5,-20,-11,-14,-3,-19,-29,-21,-13,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-16,-17,-20,-12,7,-22,-15,11,-16,9,8,-13,-19,-14,-14,-10,-3,10,-18,-2,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=34,-8,-10,-16,-10,-16,1,-17,-9,-10,-9,-9,-8,-10,-10,-16,9,3,0,-19,-17,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-11,-17,-29,54,-20,-35,-18,-28,-19,-2,-9,-18,-20,1,-15,-27,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-30,16,48,-28,-20,20,-30,6,-20,-16,2,-4,18,0,-2,-12,-30,-30,-12,32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-26,12,-32,-23,28,-25,22,19,-25,-26,-22,-22,-21,-9,21,-12,3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,90,-30,-5,-20,-1,9,-20,10,5,-10,-19,-29,-29,17,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-19,-22,-18,-2,-19,-16,10,-17,6,13,-9,-18,-12,-16,-4,8,6,-23,-5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-22,-16,-8,-11,-24,-10,-7,-3,0,-1,-12,-11,-1,10,-10,-2,-7,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-19,-26,-19,-1,-25,-21,17,-22,20,11,-22,-18,-17,-20,-13,-2,14,-24,-7,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,6,-29,9,0,-23,-10,-10,-16,-8,-16,-14,3,6,-7,-11,-6,-9,-18,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-29,-15,-9,-4,-24,-11,-5,-10,-7,-6,-15,5,-11,-6,-13,-9,-8,-13,-2,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,13,-26,14,5,-22,-11,22,-21,-7,-15,-6,11,-16,3,-6,-3,-9,-21,-32,-7,3;
MA   /M: SY='G'; M=7,-4,-26,-3,-7,-27,13,-17,-23,-12,-21,-16,-5,5,-10,-18,1,-8,-18,-25,-23,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-5,-17,-2,-3,-8,-4,-7,-9,-6,-2,-4,-7,-11,-3,-5,-9,-8,-10,3,-3,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-26,12,2,-14,-16,-4,-21,-5,-18,-16,4,0,-7,-9,-3,-4,-18,-27,-11,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-12,-14,-14,-8,-9,-22,-6,-1,-8,2,2,-10,-15,-8,-4,-10,-5,0,-25,-7,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-4,47,-7,-13,-14,-15,-15,-17,-14,-13,-12,-6,-21,-15,-16,-4,-5,-6,-29,-17,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-23,-13,-15,-4,5,-9,-11,-18,-2,-3,-5,-22,-15,-16,-6,-9,-11,-20,-6,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-10,42,-15,-14,-25,-2,-18,-31,-14,-23,-17,-7,-27,-12,-14,-5,-12,-20,-36,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-28,-8,-9,-22,32,-15,-29,-12,-23,-16,-3,-18,-11,-14,-1,-13,-23,-12,-17,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-13,17,-25,14,3,-22,-12,2,-23,9,-24,-15,21,-17,5,14,0,-5,-21,-29,-11,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00866;
//
ID   EF_TS_1_MP; MATRIX.
AC   MP01126;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Elongation factor Ts signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9509377; R2=0.0156029; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=596; N_SCORE=14.240; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-24,-23,-14,-9,-14,-5,5,-4,4,36,-16,-4,-2,-8,-16,-11,-1,-21,-7,-8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-17,-22,-15,-3,-17,-4,13,-9,11,37,-13,-16,-2,-9,-11,-4,7,-19,-3,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=13,-7,-13,-13,-9,-12,-8,-11,-3,-10,-6,5,-5,-12,-4,-12,8,5,0,-24,-12,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='E'; M=5,6,-21,3,10,-24,-10,0,-19,3,-18,-10,7,-11,6,-3,4,-3,-17,-27,-14,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-21,-29,-24,3,-30,-23,28,-22,8,10,-16,-22,-19,-22,-9,-3,24,-22,-2,-24; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,6,-15,2,-2,-18,-11,-11,-17,-2,-20,-13,8,-11,-2,-5,18,22,-10,-32,-14,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-16,-20,-12,-14,-12,-18,0,-9,-5,0,-11,-9,-10,-15,2,1,4,-23,-14,-11;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-24,8,18,-26,-11,-6,-23,4,-19,-14,1,-9,8,-3,3,-6,-19,-27,-16,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-8,-21,-7,-8,-7,-22,-11,2,-15,17,10,-13,-21,-7,-13,-15,-6,-2,-24,-6,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,18,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-28,-4,6,-26,-19,-8,-24,38,-24,-4,-1,-12,9,26,-8,-8,-17,-21,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-29,11,36,-29,-19,-3,-28,19,-21,-15,0,-6,17,10,-2,-9,-25,-27,-16,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,15,28,-30,-17,-3,-27,13,-21,-15,2,-8,15,6,-1,-7,-23,-28,-16,21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-25,-12,-3,-16,-20,-9,-12,13,-8,1,-6,-16,3,21,-8,-5,-8,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-28,-4,-13,-30,50,-14,-35,-15,-29,-19,6,-18,-10,-15,4,-14,-28,-24,-27,-12;
MA   /M: SY='A'; M=26,-16,-12,-21,-15,-10,-11,-19,2,-14,-2,-3,-15,-17,-14,-19,3,0,11,-21,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-26,-9,-16,-28,56,-19,-35,-18,-29,-19,1,-18,-16,-19,7,-13,-25,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-33,-24,14,-27,-13,22,-19,21,35,-22,-24,-15,-17,-20,-9,16,-17,3,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-19,-21,-26,-19,-4,-13,-9,12,-13,13,34,-17,-21,-8,-13,-15,-7,7,-22,-5,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,37,-29,50,23,-36,-11,-1,-35,5,-28,-25,16,-9,3,-5,0,-9,-28,-36,-19,13;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-20,98,-29,-28,-18,-28,-29,-23,-28,-17,-17,-20,-37,-28,-28,-8,-8,-4,-46,-27,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,3,16,-29,-18,-5,-28,35,-27,-11,4,-10,15,25,-6,-9,-23,-23,-12,15;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-20,-10,-20,-1,-20,-9,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,1,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-5,-22,-4,15,-19,-20,-11,-7,-3,-9,-6,-7,-11,4,-6,0,-1,-4,-28,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-22,13,31,-27,-16,-3,-26,6,-20,-17,1,-6,10,-2,3,-4,-22,-29,-17,20;
MA   /M: SY='T'; M=10,-3,9,-11,-9,-17,-13,-12,-15,-12,-16,-12,0,-17,-10,-14,11,12,-6,-33,-17,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-7,24,-25,23,8,-29,5,-2,-29,1,-28,-21,23,-14,-1,-5,5,-6,-27,-33,-21,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-29,-6,-17,-26,55,-15,-36,-17,-28,-19,3,-20,-17,-18,-1,-18,-29,-17,-22,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,59,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-32,-21,14,-30,-18,23,-24,21,20,-21,-23,-18,-20,-20,-9,14,-15,5,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,17,-28,26,38,-31,-16,-2,-29,9,-22,-19,5,-5,12,-1,-1,-9,-26,-31,-18,25;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-23,-4,6,-24,-17,-10,-19,20,-15,-7,-4,-12,7,9,-6,-7,-14,-22,-12,7;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-23,-26,-16,-6,-31,-23,25,-15,10,11,-19,-20,-15,-17,-14,-7,22,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-9,17,-26,24,20,-29,-15,-5,-25,7,-22,-18,6,-10,5,0,0,-6,-19,-31,-17,12;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-18,-32,-22,-18,7,-22,-13,-4,-15,-4,-6,-15,-25,-14,-14,-20,-13,-12,38,18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-30,-19,22,-28,46,23,-29,-29,-18,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00867;
//
ID   EF_TS_2_MP; MATRIX.
AC   MP01127;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Elongation factor Ts signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6142740; R2=0.0156500; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; N_SCORE=9.720; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=57; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-18,-30,-26,0,-32,-27,29,-23,16,12,-22,-24,-22,-22,-12,3,30,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-16,-27,-17,-22,-21,35,-20,-16,-21,-16,-9,-7,-21,-19,-20,-5,-15,-9,-22,-21,-21;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,-5,-21,-15,-8,-20,-19,3,-17,5,1,-17,-23,-14,-16,-8,-5,8,-26,-11,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-18,-22,-17,-4,-24,-22,15,-18,2,3,-12,-17,-16,-19,-1,7,16,-23,-7,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-14,-20,-17,-14,3,-6,-10,-7,-10,-5,-5,-11,-20,-14,-12,-7,-5,-4,-8,7,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=3,-24,-19,-28,-21,-4,-26,-25,24,-22,12,9,-20,-21,-18,-22,-9,-3,23,-25,-8,-21;
MA   /M: SY='H'; M=1,-7,-19,-10,-4,-14,-16,8,-15,3,-15,-6,-4,-17,0,0,-2,-5,-10,-20,1,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-5,-7,-18,-7,-5,-11,-15,-15,-4,-12,-8,-6,-6,-13,-9,-13,0,0,-2,-27,-12,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,23,-26,28,12,-31,-1,-3,-30,2,-25,-20,14,-12,1,-5,1,-9,-25,-32,-19,7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-24,2,-6,-21,20,-2,-29,-12,-22,-15,6,-16,-10,-13,-1,-13,-24,-25,-17,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-9,5,-24,2,2,-23,-7,2,-23,11,-22,-11,10,-14,4,10,0,-3,-20,-26,-12,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-8,-21,-13,-9,-11,-18,-10,-4,1,-9,-2,-4,-17,-6,-3,-3,0,0,-24,-7,-8;
MA   /M: SY='G'; M=24,-11,-15,-16,-16,-24,28,-21,-22,-15,-18,-14,-7,-16,-16,-20,4,-9,-11,-21,-24,-16;
MA   /M: SY='V'; M=12,-20,-12,-24,-20,-7,-16,-24,10,-17,1,1,-18,-21,-20,-19,0,3,22,-26,-13,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-21,-32,-23,3,-29,-20,27,-24,29,25,-25,-25,-17,-20,-21,-8,20,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-16,-30,-25,2,-29,-25,26,-23,20,12,-26,-27,-24,-21,-14,-2,31,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-29,17,54,-28,-19,-1,-28,8,-18,-19,-1,-1,17,-1,0,-9,-27,-30,-19,36;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,4,-32,-26,32,-25,24,17,-27,-27,-23,-22,-19,-6,31,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-8,30,-18,14,-1,-20,-1,4,-20,2,-29,-18,46,-19,-1,0,9,0,-25,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=1,-12,60,-18,-17,-20,-17,-22,-24,-21,-23,-19,-8,-27,-17,-22,10,2,-8,-44,-25,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,52,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,28,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-19,-38,-28,75,-28,-19,-1,-29,8,-1,-18,-29,-38,-19,-17,-8,-1,7,27,-28;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-10,-30,-29,0,-29,-29,28,-20,11,10,-29,-29,-29,-20,-10,0,47,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-15,-8,-20,-1,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-17,18,7,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-27,-4,4,-24,-18,-6,-24,29,-20,-8,2,-15,10,30,-7,-8,-18,-22,-11,6;
MA   /M: SY='N'; M=-8,30,-20,17,0,-22,1,6,-22,-2,-28,-19,44,-18,1,-3,11,2,-27,-37,-19,0;
MA   /M: SY='D'; M=-4,19,-25,26,22,-31,-11,-1,-28,1,-22,-19,7,-7,7,-7,3,-6,-23,-31,-18,14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-26,15,17,-27,-13,-2,-23,6,-17,-11,3,-11,8,0,-3,-8,-20,-29,-15,12;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,76,-30,-20,1,-30,13,1,-21,-30,-39,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-14,-22,-16,-6,-15,-25,-13,0,2,-3,2,-12,-18,3,0,-9,-4,2,-22,-6,-3;
MA   /M: SY='E'; M=7,6,-19,5,9,-26,-2,-9,-24,2,-22,-16,5,-11,1,-6,5,-4,-18,-28,-19,5;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-20,-33,-23,33,-29,-20,12,-29,32,12,-25,-29,-26,-20,-24,-9,7,-10,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-10,-21,-19,-12,-7,-23,2,-17,-5,-3,-14,-20,-18,-19,2,2,13,-27,-16,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-5,8,-25,5,9,-25,-10,-3,-24,13,-22,-13,11,-13,10,10,0,-4,-22,-26,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-24,11,12,-24,-12,-2,-22,5,-17,-12,7,-12,5,1,0,-4,-19,-29,-14,8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-20,-32,-25,2,-31,-24,29,-24,20,16,-22,-24,-20,-22,-15,-4,25,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-10,-23,-16,-12,-11,-21,2,-16,1,-1,-14,-16,-14,-20,1,2,8,-23,-14,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-25,7,13,-24,-12,-6,-20,8,-16,-6,1,-11,7,0,-2,-6,-17,-27,-14,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-9,-22,-11,0,-14,-20,-5,-6,-4,-2,0,-9,-16,3,-6,-6,-2,-6,-22,-5,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00867;
//
ID   SHIKIMATE_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP01128;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Shikimate kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7029476; R2=0.0160215; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=448; N_SCORE=12.871; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=50; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-12,-16,-16,-8,-14,-20,-10,-6,5,-4,10,-10,-18,0,6,-7,-3,-2,-24,-9,-5;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-16,1,-2,-20,-9,-13,-18,-9,-24,-17,5,2,-4,-10,23,21,-11,-35,-18,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-16,-36,-30,-1,-37,-30,40,-27,15,15,-22,-23,-23,-27,-16,-7,32,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='P'; M=9,-8,-24,-9,-4,-23,-7,-15,-18,-5,-21,-15,-4,19,-6,-9,4,-2,-16,-27,-22,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-28,17,23,-26,-15,-6,-26,2,-21,-18,1,-9,8,-3,-2,-7,-23,-15,-14,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-37,-29,7,-36,-26,40,-27,19,18,-22,-23,-22,-26,-19,-9,28,-18,3,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-19,-38,-30,61,-30,-22,8,-28,11,4,-22,-29,-36,-20,-19,-8,10,1,21,-30;
MA   /M: SY='E'; M=8,2,-21,3,15,-24,-11,-7,-19,1,-16,-13,-2,-10,4,-5,3,-5,-13,-27,-17,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-26,0,14,-21,-21,-3,-16,9,-12,-6,-3,-12,10,9,-5,-5,-15,-24,-9,11;
MA   /M: SY='E'; M=-12,2,-27,6,16,-14,-21,8,-18,0,-10,-9,-2,-14,4,-2,-7,-10,-18,-22,-1,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-18,-29,65,-19,-39,-19,-30,-20,0,-19,-19,-19,1,-18,-29,-21,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-1,-34,7,40,-22,-20,-6,-28,4,-20,-20,-9,-7,12,-4,-9,-14,-30,9,-9,27;
MA   /M: SY='E'; M=6,0,-25,1,8,-26,-10,-9,-18,-2,-18,-13,-3,5,3,-9,0,-6,-17,-27,-19,4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-24,-11,-9,-9,9,-9,-19,-9,-16,-11,-4,-19,-11,-9,-3,-10,-14,-15,-5,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,78,-29,-20,0,-30,9,0,-19,-30,-39,-20,-19,-9,0,9,29,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-25,7,13,-26,-13,-4,-22,10,-19,-11,5,-12,10,9,0,-6,-19,-27,-15,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-22,-19,-10,-7,-20,-9,-3,-5,6,4,-12,-21,-6,6,-14,-8,-3,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=0,-4,-21,-6,4,-16,-16,-9,-17,6,-14,-10,-1,-13,2,8,3,3,-12,-24,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-27,6,20,-27,-15,1,-24,8,-19,-12,2,-10,13,8,-1,-7,-22,-26,-14,16;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,-13,-27,-21,-1,-23,-18,14,-18,6,4,-19,-22,-19,-20,-7,-1,19,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-25,9,-33,-24,29,-28,33,18,-26,-27,-22,-23,-23,-8,22,-20,0,-25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-24,0,6,-21,-14,-2,-19,8,-16,-8,1,-13,9,7,-1,-5,-16,-23,-9,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-24,8,20,-25,-14,-5,-25,7,-19,-15,1,-9,10,7,3,-2,-20,-27,-16,15;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-7,-28,-21,-2,-26,-23,15,-23,20,9,-23,-25,-20,-21,-15,-4,17,-25,-8,-21;
MA   /M: SY='L'; M=1,-16,-6,-20,-15,-7,-18,-20,1,-19,8,0,-14,-21,-15,-17,-3,5,4,-27,-11,-16;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=1,0,-20,-2,5,-22,-11,-5,-16,2,-14,-8,0,-11,8,0,3,0,-13,-24,-13,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-14,-3,2,-9,-11,2,-10,8,-7,-2,-1,-9,5,10,-4,-3,-9,-10,-1,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-27,5,7,-22,-14,6,-24,4,-21,-13,3,-4,4,5,-2,-4,-21,-26,-9,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-24,8,0,-23,0,-2,-26,-3,-24,-17,12,-6,-2,-2,3,-5,-24,-30,-17,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-14,-18,-15,-9,-13,-8,-1,-10,-3,1,-10,-20,-10,-9,-9,-7,-1,-19,-2,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,34,-23,15,13,-28,-28,-27,-22,-13,-3,43,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-34,-27,7,-33,-27,32,-26,24,15,-26,-27,-25,-23,-19,-6,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,24,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-6,-17,-14,-5,-23,-21,-3,-17,6,-2,-9,-17,-14,-14,5,30,3,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=15,-17,-16,-24,-17,-10,-17,-21,11,-17,1,4,-13,-16,-13,-20,2,3,13,-24,-11,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-29,13,-32,-28,30,-25,15,12,-25,-27,-28,-23,-16,-6,32,-20,0,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-22,-16,-1,-6,-25,-13,5,-12,17,11,-17,-19,-5,-11,-15,-5,1,-23,-6,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-5,11,-19,11,2,-22,-10,0,-22,-1,-21,-14,11,-14,3,0,9,4,-17,-31,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-29,6,22,-28,-15,-7,-24,2,-22,-18,-4,20,4,-6,-1,-7,-24,-29,-21,12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-26,8,27,-24,-14,-4,-23,5,-19,-15,1,-6,9,0,1,-7,-21,-27,-15,18;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-15,0,-7,-15,-9,-6,-9,-8,-17,-12,25,-18,-7,-9,10,8,-10,-34,-16,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-15,-28,-16,-6,-10,-22,-5,-21,15,-12,-7,-7,-21,3,43,-14,-11,-15,-7,-4,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,7,-24,5,10,-26,-7,-1,-25,9,-23,-14,9,-13,7,8,1,-7,-21,-27,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-17,-23,-15,6,-24,-13,2,-12,11,5,-17,-24,-13,-5,-16,-8,1,-15,3,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-14,-31,-22,3,-27,-20,20,-26,33,22,-25,-27,-18,-21,-24,-10,12,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-20,-8,-2,-19,-17,1,-18,8,-13,-6,-2,-16,3,14,-3,-4,-13,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=0,8,-24,9,13,-27,-2,-5,-26,3,-23,-16,7,-11,6,-1,6,-4,-21,-29,-18,9;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-4,-25,-7,-3,-13,-9,12,-21,1,-17,-8,3,-18,3,9,-3,-7,-18,-20,-1,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-21,-11,-15,-22,23,-15,-22,-13,-20,-12,-3,-18,-13,-13,-1,-10,-17,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-20,-23,-18,3,-25,-19,9,-15,4,2,-16,-20,-18,-14,-9,1,13,-16,-3,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00868;
//
ID   PSI_RLU_MP; MATRIX.
AC   MP01129;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rlu family of pseudouridine synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8148160; R2=0.0165616; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=158; N_SCORE=8.422; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=42; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-13,-15,-16,-7,-3,-19,-13,-2,-14,3,-2,-11,-19,-10,-14,-5,-1,-3,-20,-2,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-10,-22,-14,-10,-5,-16,-8,-2,-9,-3,-1,-7,-19,-10,-7,-7,-4,-1,-17,2,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-23,-7,-6,-8,-18,3,-9,-3,-4,3,-5,-17,-3,-1,-9,-5,-9,-15,0,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-11,-19,-13,-3,-11,-23,-5,-7,-3,-6,-3,-10,-15,4,-1,-7,-6,-9,-15,5,-1;
MA   /M: M=-7,-7,-24,-9,-6,-11,-19,-4,-9,-5,-7,-3,-5,-10,-1,-1,-4,-1,-10,-21,-2,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-20,-17,-13,-1,-19,-15,2,-17,7,2,-13,-13,-13,-15,-11,-5,0,-22,-5,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-17,-7,-3,-10,-14,-3,-4,1,-7,-2,2,-12,1,3,-2,-2,-5,-18,-5,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,4,-17,6,5,-15,-6,-1,-14,-2,-13,-10,4,0,0,-3,-1,-5,-15,-19,-10,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-24,-5,0,-10,-11,-4,-15,-3,-11,-7,-1,-18,3,-1,-5,-7,-15,-21,-6,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-10,-18,-13,-9,-6,-17,-9,1,-6,-1,-1,-6,-19,-9,-6,-9,-5,1,-18,-1,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-18,-6,-4,-15,3,-8,-12,-7,-14,-7,-4,10,-5,-9,0,-5,-11,-18,-14,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-15,-2,6,-10,-13,-5,-14,4,-13,-8,-2,-8,4,2,-1,-3,-11,-15,-5,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-26,-7,-5,-8,-16,0,-15,-1,-11,-6,-4,-16,-1,8,-7,-8,-13,-18,-2,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-13,-26,-19,-3,-23,-22,3,-19,1,-2,-23,-7,-19,-20,-13,-8,5,-10,-5,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-28,-8,-1,-10,0,0,-24,-1,-17,-11,-3,-18,-2,5,-7,-12,-21,-13,-3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-25,-25,-17,-2,-28,-21,13,-22,9,4,-20,3,-18,-21,-14,-2,6,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,1,-29,-26,-4,-26,-28,18,-21,9,6,-26,-28,-26,-21,-10,-2,32,-29,-12,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-18,2,-29,1,0,-20,-19,84,-28,-8,-20,-2,12,-20,11,0,-8,-16,-29,-29,16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,19,-40,-7,-1,-40,-1,-30,-30,19,-10,-1,-10,0,-10,-30,-39,-20,9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-28,-7,3,-21,-20,-1,-23,28,-19,-3,-2,-15,9,37,-9,-8,-16,-20,-6,4;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-23,19,6,-23,-11,-8,-23,-7,-19,-18,3,0,-6,-13,-2,-8,-20,-30,-16,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-10,-13,-13,-9,-21,-21,-5,-11,-7,-7,-4,-13,-13,-11,16,43,7,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='S'; M=8,-1,-6,-3,-3,-18,-4,-13,-18,-11,-26,-18,7,-11,-3,-11,35,24,-8,-38,-19,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-17,-28,-23,-2,-15,-24,15,-25,20,9,-23,-27,-22,-21,-17,-8,16,-23,-9,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-32,-23,4,-29,-17,26,-23,31,30,-26,-26,-16,-19,-23,-9,19,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-19,-33,-26,10,-31,-24,28,-26,27,18,-27,-27,-23,-21,-21,-7,25,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-18,-32,-26,12,-25,-24,21,-26,19,12,-24,-27,-25,-22,-18,-8,20,-19,-1,-26;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-9,-18,-11,-20,4,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-12,-11,-19,10,0,-1,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-29,-7,3,-22,-22,-10,-21,34,-16,-5,-5,-15,5,28,-13,-10,-15,-20,-8,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-17,4,-3,-19,-5,-2,-19,-2,-24,-15,23,-14,-2,-3,16,15,-17,-34,-15,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-25,-4,0,-20,-17,-9,-15,8,-18,-10,1,-4,1,8,-1,-3,-13,-25,-11,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-24,-3,7,-15,-18,-6,-16,3,-12,-7,-3,-9,4,4,-2,-4,-14,-24,-11,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-11,-15,-17,-12,-13,2,-18,-10,-13,-12,-8,-8,-14,-11,-17,9,1,-3,-17,-15,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=5,-8,-21,-10,-3,-13,-14,6,-11,-10,-2,-3,-8,-17,-2,-9,-4,-6,-10,-21,-2,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-1,-22,-2,-1,-18,-14,-6,-16,2,-12,-9,1,-17,-1,8,-1,-2,-11,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,2,-22,0,11,-20,-14,-2,-17,5,-16,-8,3,-12,4,1,-1,-6,-15,-27,-13,7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,17,-29,-20,18,-27,37,19,-27,-28,-22,-20,-25,-9,11,-16,3,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-4,-19,-5,-1,-21,-11,1,-18,5,-18,-8,0,-16,3,5,3,-4,-11,-28,-11,0;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-26,0,9,-24,-17,-6,-23,17,-19,-11,1,-11,8,21,-3,-5,-17,-25,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-6,-22,-8,4,-23,-16,0,-12,-3,-12,-1,-4,-14,23,-3,4,-3,-13,-23,-10,13;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25,45,-30,-19,10,-28,25,11,-23,-29,-28,-19,-23,-10,5,-4,15,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-25,-7,6,-21,-18,-6,-20,17,-18,-7,-3,-13,12,20,-2,-6,-15,-22,-11,8;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00869;
//
ID   SLC26A_MP; MATRIX.
AC   MP01130;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SLC26A transporters signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1124983; R2=0.0145461; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=617; N_SCORE=14.077; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-4,-21,-14,-11,-12,-19,-2,-18,6,-1,-16,-21,-11,-18,-4,-4,2,-25,-14,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-20,-33,-28,0,-34,-29,36,-25,16,14,-24,-24,-23,-24,-14,-2,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13,-3,-25,-21,-20,-15,-13,-19,-15,-21,74,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-29,-3,18,-32,-21,5,-15,4,-10,1,-4,-12,44,5,-4,-10,-24,-21,-9,31;
MA   /M: SY='G'; M=16,-6,-13,-8,-12,-25,27,-18,-27,-15,-23,-17,-1,-16,-13,-18,10,-6,-16,-26,-25,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-24,-34,-24,2,-30,-17,32,-23,27,35,-22,-22,-13,-20,-22,-10,18,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-7,-15,-12,-9,-22,16,-17,-20,-12,-21,-15,-2,-12,-9,-17,17,1,-10,-26,-22,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-26,-23,-21,35,-29,6,1,-16,7,1,-17,-30,-17,-13,-20,-10,-6,16,55,-21;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-16,-8,-19,-1,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-17,16,7,-2,-24,-19,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-23,-16,-8,-11,-24,-14,2,-3,4,5,-9,-18,-2,-4,-9,0,-1,-23,-6,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-23,-31,-23,4,-25,-23,24,-29,34,16,-25,-27,-21,-23,-24,-10,15,-21,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-10,-19,-11,-18,-3,-20,-8,-11,-10,-9,-9,-11,-11,-19,11,4,3,-23,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,3,-23,-1,-8,-24,22,-3,-28,-8,-25,-16,12,-17,-8,-7,6,-5,-22,-27,-19,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-17,-30,-23,2,-31,-24,25,-24,27,15,-28,-28,-20,-20,-19,-6,26,-24,-5,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-1,-31,8,7,-31,-14,-13,-23,-6,-27,-20,-6,40,-2,-14,-1,-6,-25,-31,-24,0;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-36,-12,-3,-27,-19,-21,-16,-11,-26,-17,-20,75,-11,-20,-9,-9,-23,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-25,-17,-2,-15,-24,-12,7,-8,2,9,-14,-17,5,-10,-11,-9,3,-20,-8,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-23,-15,-25,-23,26,-30,3,4,-16,3,1,-22,-30,-17,-15,-18,-9,0,12,51,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=13,-2,-10,-7,-5,-16,-7,-15,-15,-10,-20,-15,3,-10,-5,-12,28,27,-5,-33,-16,-5;
MA   /M: SY='S'; M=17,-5,-12,-7,-5,-18,1,-13,-16,-12,-20,-15,2,-12,-5,-13,26,11,-7,-33,-19,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-27,-19,-36,-27,52,-26,-21,5,-26,9,1,-19,-26,-33,-21,-15,-8,6,0,17,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-28,-5,-34,-29,22,-32,-24,18,-25,8,5,-24,-29,-30,-22,-15,-6,23,-15,7,-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-30,-14,-8,-25,-4,-20,-14,-13,-22,-14,-13,38,-12,-20,-2,-7,-17,-27,-25,-13;
MA   /M: SY='P'; M=6,-16,-23,-16,-12,-15,-10,-20,-6,-14,-14,-10,-12,16,-15,-19,-1,-4,-3,-26,-19,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-26,23,-32,-23,24,-28,24,13,-23,-26,-25,-23,-21,-9,16,-12,9,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-20,-31,-26,-1,-32,-26,32,-24,15,14,-21,-22,-20,-23,-12,0,29,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-23,-22,25,-32,12,8,-13,3,3,-20,-28,-12,-13,-20,-10,-3,22,66,-22;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-7,-23,-17,4,-7,-20,-10,-19,-8,-9,-11,-19,-18,-19,2,-3,-4,-12,-7,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-18,-34,-26,18,-29,-23,21,-26,21,13,-23,-26,-24,-22,-19,-7,17,-16,3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-19,-34,-24,43,-28,-17,7,-25,20,14,-21,-27,-26,-18,-19,-5,4,-5,15,-23;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,-26,-12,-18,-28,56,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,-13,-7,-9,-16,1,-17,-18,-12,-19,-15,3,-12,-9,-12,23,29,-8,-31,-16,-9;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-12,-3,-2,-19,-4,-11,-17,-7,-26,-17,6,-12,-1,-3,32,16,-6,-37,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-31,-7,2,-24,-19,-5,-28,26,-24,-12,-1,1,6,44,-9,-10,-22,-22,-14,0;
MA   /M: SY='H'; M=-16,11,-29,15,9,-21,-9,33,-30,-6,-21,-12,9,-15,7,-5,-5,-14,-28,-28,-2,6;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-23,-22,-30,-23,-1,-29,-20,29,-22,17,20,-17,-22,-16,-21,-14,-6,21,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-4,-18,-14,-14,-13,-20,0,-16,-10,-6,-8,-16,-12,-19,11,6,7,-30,-16,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-17,-28,-24,-3,-28,-26,28,-22,9,9,-20,-23,-21,-22,-6,-1,31,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-32,-14,-6,-24,-15,-21,-13,-12,-21,-14,-16,53,-11,-20,-5,-4,-18,-27,-24,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-16,-25,-19,22,-23,-22,5,-19,2,0,-18,-24,-26,-17,-7,3,15,-16,2,-21;
MA   /M: SY='A'; M=27,-9,-17,-13,-8,-23,7,-18,-18,-11,-19,-15,-6,2,-10,-18,12,0,-10,-25,-23,-10;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-13,-26,-23,-5,-23,-26,19,-19,6,5,-22,-24,-22,-20,-4,0,31,-28,-11,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-15,-26,-22,4,-26,-17,18,-20,18,22,-22,-24,-17,-18,-17,-7,16,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='S'; M=11,-5,1,-7,-6,-18,-5,-14,-16,-13,-24,-17,2,-14,-6,-13,29,14,-5,-38,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-29,-22,6,-29,-20,21,-25,37,21,-28,-28,-20,-19,-23,-6,18,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-20,-29,-21,0,-27,-15,23,-18,22,30,-23,-24,-10,-16,-19,-8,19,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-16,-28,-23,0,-28,-23,22,-21,18,16,-22,-24,-20,-18,-11,4,25,-25,-5,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00870;
//
ID   RRNA_A_DIMETH_MP; MATRIX.
AC   MP01131;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal RNA adenine dimethylases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1493816; R2=0.0146628; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=324; N_SCORE=9.897; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=3,-22,-10,-29,-22,-1,-26,-25,17,-22,9,6,-18,-21,-19,-22,-8,1,17,-24,-7,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-26,21,15,-28,-12,2,-27,7,-23,-16,13,-12,9,3,1,-5,-24,-30,-14,11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-26,2,7,-26,-13,-6,-26,22,-23,-12,3,-13,8,22,-2,-7,-19,-24,-13,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-28,-38,-29,0,-38,-29,44,-28,18,17,-20,-18,-20,-28,-18,-8,28,-20,-1,-29;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-14,-30,-25,0,-27,-25,25,-21,13,11,-24,-25,-23,-21,-12,-4,31,-24,-6,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,12,-25,14,12,-26,-11,-3,-28,11,-24,-17,10,-12,6,15,3,-4,-22,-29,-16,8;
MA   /M: SY='A'; M=7,-8,-18,-14,-7,-11,-14,-10,-8,-5,-8,-6,-6,-16,-4,-8,0,0,-6,-17,-5,-6;
MA   /M: SY='V'; M=15,-20,-16,-26,-19,-8,-17,-23,13,-19,8,4,-17,-19,-17,-21,-5,-3,16,-23,-11,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,-25,9,5,-26,3,-1,-28,1,-25,-17,11,-8,0,-1,3,-6,-24,-29,-18,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-25,-16,-11,-13,-21,-18,4,-13,-3,-2,-10,5,-11,-14,-7,-4,-1,-26,-13,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: M=-7,-4,-23,-5,-1,-14,-13,-9,-12,-2,-8,-6,-3,-15,-1,-2,-4,-4,-11,-23,-8,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-1,-27,-1,8,-24,-13,-11,-20,3,-22,-15,0,16,0,-3,0,-2,-20,-28,-19,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-26,10,1,-27,6,-6,-27,-7,-24,-18,7,-4,-3,-10,4,-4,-23,-29,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-27,28,13,-27,-12,-2,-26,-1,-19,-17,7,-13,4,-6,-2,-7,-22,-29,-12,8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-3,-21,-8,-5,-13,-16,-6,-11,-5,-13,-9,2,-9,-5,-5,-1,1,-11,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-33,-27,1,-32,-27,32,-24,19,16,-26,-27,-24,-22,-16,-5,34,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-21,-33,-26,11,-32,-23,27,-26,24,14,-25,-27,-23,-22,-21,-7,22,-14,5,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-29,2,-35,-29,40,-27,17,16,-23,-23,-23,-26,-17,-7,34,-22,-3,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=3,-16,-24,-13,-5,-24,-15,-20,-15,-11,-23,-16,-15,46,-11,-19,0,-2,-16,-30,-25,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-24,-15,-8,-8,-23,-14,-2,-6,4,2,-13,-8,-8,-6,-11,-3,-4,-23,-7,-8;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-20,1,-18,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-16,-8,-8,-15,-2,-4,-14,-11,-13,-10,1,-15,-9,-14,6,1,-8,-26,-13,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-32,-22,12,-31,-20,24,-28,39,22,-27,-27,-20,-21,-27,-10,13,-18,2,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-23,-4,7,-13,-19,-6,-15,4,-10,-8,-4,-15,1,7,-4,-5,-11,-22,-7,3;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-26,-9,4,-14,-18,-6,-13,-3,-14,-8,-9,6,-1,-6,-4,-7,-13,-23,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-32,-22,5,-30,-21,26,-26,34,22,-25,-25,-18,-21,-23,-8,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-13,-25,-18,-4,-17,-19,9,-21,17,6,-21,-23,-17,-20,-12,-6,10,-22,-8,-18;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,5,-26,6,15,-26,-14,-1,-25,16,-21,-12,4,-9,10,12,-3,-8,-21,-25,-13,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-19,-6,-2,-13,-10,-4,-9,2,-8,-4,-1,-13,0,4,-4,-5,-8,-18,-7,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-1,-11,-8,-12,-5,-12,-10,-10,-10,-8,-8,0,-10,-13,0,-4,-6,-19,-14,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,5,-25,4,3,-23,-4,-5,-23,7,-19,-13,5,-13,0,4,-3,-8,-19,-24,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-25,-6,2,-14,-16,-3,-21,8,-20,-11,1,-6,4,10,0,-3,-18,-21,-8,2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-17,-30,-25,6,-30,-23,25,-24,26,15,-28,-29,-24,-20,-19,-5,28,-22,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-15,-20,-19,-15,-3,-26,-13,7,-12,4,3,-13,-20,-12,-12,-7,6,8,-19,0,-15;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,-10,-20,-15,-13,-7,-21,-1,-15,-3,-4,-13,-18,-15,-18,5,3,9,-26,-16,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-14,-32,-27,7,-33,-21,27,-24,13,11,-23,-26,-23,-23,-16,-7,25,-18,6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-26,-25,-17,-5,-30,-19,19,-10,12,11,-15,-21,-12,-10,-18,-9,12,-22,-4,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-26,-4,2,-23,-13,-3,-23,7,-23,-13,0,4,4,11,1,-2,-20,-26,-13,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-25,7,4,-23,-11,2,-27,12,-21,-12,7,-15,3,20,-5,-9,-21,-26,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-19,-31,-21,17,-28,-19,13,-26,32,15,-25,-28,-20,-18,-24,-9,6,-10,4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=6,-21,0,-26,-20,-4,-20,-24,7,-21,2,1,-19,-22,-21,-22,-7,-4,14,-25,-11,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-1,-25,1,15,-26,-14,-6,-23,4,-22,-15,-2,7,7,0,0,-6,-22,-27,-18,9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-24,-16,-9,-8,-18,-6,-3,-5,-4,-1,-9,-19,-7,1,-7,-4,-2,-19,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-25,-17,3,-27,-7,11,-25,32,14,-22,-26,-15,-17,-21,-6,5,-20,1,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-25,-3,7,-23,-17,-3,-22,14,-18,-9,2,-12,11,20,0,-3,-18,-25,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-25,4,14,-24,-13,-3,-22,11,-19,-11,5,-12,8,8,0,-4,-19,-27,-14,11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-24,-8,1,-16,-21,-3,-12,6,-6,-3,-5,-16,1,8,-8,-4,-10,-24,-8,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-22,-22,-15,7,-22,-17,2,-17,8,3,-18,-11,-16,-15,-13,-4,1,-17,0,-16;
MA   /M: M=0,-2,-23,-3,-1,-14,-13,-10,-12,-5,-13,-8,-2,-7,-4,-9,0,-4,-10,-25,-12,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,1,-22,3,6,-22,-9,-6,-18,-4,-13,-11,-1,-8,1,-7,-2,-7,-17,-27,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-7,-24,-9,-5,-6,-14,0,-12,-6,-10,-7,-5,-14,-4,-6,-4,-3,-12,-16,4,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00871;
//
ID   ACTINS_ACT_LIKE_MP; MATRIX.
AC   MP01132;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Actins and actin-related proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0621123; R2=0.0147938; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=521; N_SCORE=12.760; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-19,-10,-24,-20,8,-28,-13,7,-20,8,3,-16,-23,-17,-17,-8,6,6,-16,9,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-17,-17,-22,-18,26,-14,-11,-1,-18,0,-2,-11,-20,-19,-14,-6,-3,-1,-3,15,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-9,-27,-10,-6,10,-23,-3,-12,-4,-6,-6,-8,-14,-7,0,-12,-8,-14,-7,15,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-25,9,16,-20,-12,-2,-21,4,-22,-17,14,-13,4,-2,1,-6,-22,-19,-11,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-28,6,27,-23,-18,0,-23,11,-18,-12,0,-10,15,8,-4,-9,-22,-22,-8,20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-19,20,-29,49,22,-30,-30,-19,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-28,-1,2,-22,-11,5,-27,19,-23,-11,7,-17,9,29,-6,-10,-22,-21,-7,3;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-12,-28,-22,1,-26,-25,17,-22,14,7,-21,-23,-21,-21,-10,2,21,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,10,-26,14,15,-22,-15,-6,-23,3,-19,-15,3,-6,5,-4,-2,-7,-20,-27,-14,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-26,-9,-4,-22,-17,-18,-15,-11,-23,-16,-9,41,-8,-16,7,11,-16,-32,-22,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-14,9,20,-26,-12,-4,-27,8,-24,-17,9,-12,6,4,2,-6,-24,-32,-19,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,18,-25,25,26,-29,-11,-3,-29,3,-24,-21,10,-8,7,-1,7,-1,-24,-34,-19,16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-5,-13,-6,-8,-21,4,37,-29,-11,-20,-8,2,-20,-2,-4,-7,-16,-24,-26,-3,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-37,-8,0,-26,-20,-12,-21,0,-28,-16,-15,60,-6,-10,-10,-10,-27,-25,-19,-7;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-13,-31,-24,4,-26,-25,20,-23,14,8,-23,-24,-23,-22,-12,-4,24,-22,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-31,-21,8,-30,-21,22,-29,45,19,-29,-29,-20,-21,-27,-9,13,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=11,-16,-29,-13,-3,-27,-12,-20,-17,-10,-23,-16,-16,53,-9,-20,-3,-7,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-20,-21,-15,-7,-23,-21,-21,-12,-14,-19,-13,-19,50,-13,-21,-8,-7,-16,-30,-25,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-28,-31,-21,6,-25,-17,8,-21,23,17,-29,-27,-14,-16,-29,-15,-1,21,7,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-9,39,-20,19,0,-20,0,9,-20,0,-30,-20,58,-20,0,0,11,1,-29,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-9,-1,-26,-16,-18,-19,-10,-27,-19,-13,61,-8,-17,2,1,-23,-31,-26,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-26,-7,3,-19,-21,-10,-16,13,-11,-6,-5,-7,4,14,-8,-4,-14,-24,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=7,-2,-22,-2,16,-22,-13,-10,-20,8,-17,-12,-3,-9,5,1,3,-2,-14,-24,-15,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-28,15,41,-27,-19,-3,-26,9,-17,-15,-1,-5,16,1,-1,-8,-25,-29,-17,28;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-29,-2,8,-25,-20,-6,-26,37,-26,-9,1,-12,13,25,-8,-8,-20,-19,-7,10;
MA   /M: SY='M'; M=6,-13,-16,-22,-15,-8,-15,-11,7,-12,2,21,-11,-15,-5,-14,0,4,6,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,0,-22,-16,-5,-18,-22,-2,-18,6,-2,-15,-20,-17,-18,-1,9,4,-25,-11,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-33,-20,3,-27,11,-20,-13,0,-4,33,5,0,-10,-30,-26,-16,39;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-34,-28,2,-33,-27,35,-24,14,17,-23,-24,-22,-23,-14,-3,34,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-24,-19,-31,-22,15,-23,-11,15,-19,23,32,-22,-24,-14,-16,-20,-9,9,-15,4,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,68,-30,-20,3,-30,17,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-17,-5,-5,-19,-2,-6,-21,-5,-21,-13,4,-13,-3,-5,16,19,-13,-30,-13,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-22,-34,-25,47,-29,-10,7,-23,15,13,-21,-28,-25,-17,-21,-10,2,4,29,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-7,21,-26,18,11,-29,6,0,-28,-1,-27,-19,24,-14,6,-5,4,-8,-29,-32,-21,9;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-27,-10,-32,-28,26,-27,-25,13,-23,8,4,-24,-28,-31,-20,-12,-3,25,-16,3,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-32,-4,5,-28,-9,-15,-23,-7,-28,-19,-9,49,-5,-15,0,-6,-26,-30,-26,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00340;
//
ID   UPF0017_MP; MATRIX.
AC   MP01133;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0017 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3566813; R2=0.0187497; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=868; N_SCORE=22.621; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=8; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,-20,-23,-14,7,-29,-18,14,-18,9,5,-19,-22,-18,-17,-11,0,16,-17,4,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-26,41,8,-29,-8,2,-24,-3,-26,-22,33,-15,-2,-8,2,-6,-25,-38,-18,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-20,-6,4,-26,-16,10,-18,15,9,-17,-20,-11,-16,-13,-6,4,-21,-3,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-8,10,-27,16,10,-29,-15,-6,-23,4,-23,-16,3,-2,6,2,1,-6,-20,-30,-17,7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-25,-3,12,-18,-19,10,-23,7,-17,-9,-1,-12,10,8,-2,-5,-19,-23,-6,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-17,-31,-25,0,-28,-26,26,-23,20,12,-25,-25,-23,-22,-15,-5,29,-24,-7,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-11,-10,-14,-1,-12,-23,-10,-7,1,-5,2,-12,-17,-3,-5,-11,-9,-7,-19,-2,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-3,-23,-5,3,-24,-15,-9,-24,22,-23,-11,0,-12,8,22,3,2,-15,-24,-12,4;
MA   /M: SY='A'; M=26,-17,1,-26,-18,-4,-13,-23,-3,-17,-5,-6,-15,-18,-18,-22,0,-3,5,-20,-12,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-5,4,-22,-3,-1,-20,-14,-5,-22,16,-21,-12,12,-15,2,24,2,4,-17,-26,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=1,2,-13,-1,-3,-17,-12,-13,-17,-6,-20,-15,5,-11,-4,-4,24,30,-7,-34,-15,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-33,-26,2,-34,-27,34,-26,22,15,-24,-24,-22,-24,-17,-3,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-17,-31,-17,-7,-14,-21,-7,-19,12,-12,-2,-10,-10,2,37,-15,-12,-17,-3,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-30,13,29,-34,0,-2,-30,3,-23,-16,2,-8,20,-3,0,-12,-30,-26,-19,24;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-21,-39,-29,64,-31,-21,8,-30,15,4,-21,-29,-36,-21,-21,-10,4,3,23,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,15,-29,19,18,-28,-7,9,-31,9,-25,-17,13,-12,6,7,-2,-11,-28,-30,-15,11;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-4,-20,-9,-9,-13,-6,-9,-11,-6,-6,-6,4,-21,-7,3,-2,-4,-9,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-22,-31,-25,33,-31,-12,13,-24,20,8,-24,-29,-24,-18,-22,-9,8,0,27,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-11,-16,-15,-7,-22,-20,2,-12,-2,2,-9,-15,-13,-12,9,33,12,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='R'; M=5,-13,-22,-17,-10,-17,-9,-14,-8,-3,-11,-6,-5,-16,-5,8,1,-4,-4,-23,-13,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-27,-6,-5,-21,-22,-16,-11,2,-17,-10,-13,15,-9,3,-9,-7,-4,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='M'; M=0,-17,-18,-24,-16,1,-18,-12,5,-11,2,16,-13,-19,-9,-7,-4,-3,7,-21,-5,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-22,-24,-26,-20,34,-28,12,-1,-21,10,7,-16,-28,-18,-14,-20,-12,-5,0,32,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-29,-7,-18,-29,63,-17,-38,-18,-30,-20,6,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-25,-29,-24,46,-30,-2,3,-21,12,3,-22,-30,-23,-15,-22,-10,-3,14,48,-24;
MA   /M: SY='P'; M=0,-3,-28,-4,4,-28,-14,-7,-21,10,-24,-11,0,12,11,5,-2,-7,-22,-25,-18,6;
MA   /M: SY='S'; M=0,16,-16,16,3,-23,-4,-6,-23,-6,-28,-21,18,-11,-1,-9,25,14,-16,-39,-19,1;
MA   /M: SY='V'; M=7,-19,9,-25,-21,-9,-17,-25,2,-21,2,-2,-18,-24,-21,-21,-6,0,10,-28,-15,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,5,-27,10,10,-25,-12,-8,-16,0,-12,-6,-2,-13,5,-5,-6,-10,-14,-27,-14,7;
MA   /M: SY='D'; M=-14,29,-27,41,31,-32,-15,-3,-32,2,-24,-24,10,-6,6,-6,3,-2,-26,-35,-19,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,16,2,-12,5,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,25,71,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,0,-26,1,15,-24,-18,-7,-27,24,-23,-13,1,-10,9,25,0,0,-19,-25,-13,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,5,-26,4,6,-22,-14,-6,-18,0,-19,-12,4,-15,7,-4,-3,-8,-17,-10,-11,7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-5,-3,-10,-1,-21,-4,-15,-17,-9,-18,-15,-3,-11,-5,-15,17,4,-7,-29,-21,-3;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='S'; M=9,-11,-2,-12,-7,-19,-10,-17,-15,-14,-17,-14,-7,4,-9,-17,12,4,-10,-34,-21,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-14,-20,-20,-14,-3,-19,-9,7,-13,8,12,-9,-21,-8,-9,-8,-4,2,-20,0,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-7,-25,-10,-6,-8,-19,-11,-15,0,-13,-9,-2,4,-7,6,-5,2,-15,-23,-10,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13,-6,-6,-21,0,-14,12,-8,-1,-8,-20,1,23,-10,-7,-12,-11,10,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-34,-25,13,-33,-24,27,-28,31,16,-26,-27,-24,-23,-23,-8,21,-19,1,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-13,18,-29,25,9,-31,-13,6,-30,7,-29,-19,11,3,2,-1,0,-7,-26,-33,-15,4;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-22,-6,-4,-16,-8,-7,-21,10,-20,-12,2,-15,-1,12,4,4,-14,-21,-6,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-26,-10,-4,-18,-10,-7,-19,15,-18,-7,-6,-18,3,18,-8,-9,-12,-15,-3,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-23,-22,-15,-10,-29,-23,13,-2,-1,4,-13,-17,-12,-8,-8,3,14,-24,-6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,80,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,0,-25,-21,4,-26,-21,6,-20,10,7,-18,-24,-19,-17,-7,10,12,-26,-6,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,6,-31,-21,27,-27,37,23,-27,-27,-19,-21,-25,-9,18,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-22,11,-29,-23,6,-28,-21,5,-24,9,1,-20,-27,-22,-22,-13,-2,7,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-11,21,-23,9,0,-17,-8,24,-19,-2,-24,-13,35,-19,6,-1,5,-4,-26,-29,-2,2;
MA   /M: SY='A'; M=40,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-17,-13,-6,-19,-14,-15,-9,3,-13,-6,-7,-14,-2,-1,4,4,1,-25,-14,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,65,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-35,-13,-6,-20,-22,-17,-12,-11,-22,-14,-21,63,-12,-19,-11,-9,-18,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-35,-27,32,-31,-21,19,-27,22,15,-23,-27,-27,-21,-21,-9,15,-10,10,-26;
MA   /M: SY='V'; M=4,-17,-14,-21,-17,0,-18,-19,7,-17,-3,2,-11,-19,-16,-17,6,6,14,-26,-8,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-35,-2,-3,-29,0,7,-28,-11,-28,-16,-6,36,-7,-15,-7,-14,-30,-29,-19,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-7,-24,-2,10,-22,-10,-5,-16,-7,-19,-13,-6,5,-2,-11,4,-3,-11,-31,-18,2;
MA   /M: SY='D'; M=-6,13,-14,16,10,-28,-13,8,-28,-1,-23,-17,9,-14,5,0,3,-6,-22,-33,-14,7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=5,-19,-3,-23,-17,-9,-13,-20,3,-19,6,2,-17,-21,-14,-18,-9,-7,6,-23,-12,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-22,-33,-24,4,-33,-24,33,-27,29,18,-23,-23,-20,-23,-21,-8,23,-20,-1,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-35,-6,5,-27,-20,-5,-21,-8,-26,-17,-12,58,-5,-15,-6,-4,-27,-30,-21,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-19,-31,-22,-11,-5,-29,-17,9,-12,-3,0,-16,-7,-10,-16,-14,-5,0,-1,6,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-7,-28,-2,9,-19,-22,-12,-8,-6,-5,-6,-10,5,1,-10,-8,-8,-13,-27,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,9,10,-28,-18,-9,-20,8,-21,-12,0,0,8,-1,-1,-2,-18,-27,-15,8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-20,-17,-9,-15,-8,-20,3,-15,-7,-4,-8,-14,-10,-19,3,-2,4,-25,-15,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-13,-26,-13,-2,-9,-24,-6,-6,7,4,7,-13,-19,2,6,-17,-10,-8,-15,3,0;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-19,0,4,-24,-9,-10,-24,17,-30,-16,6,-10,4,8,18,7,-14,-31,-16,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00872;
//
ID   FTSZ_1_MP; MATRIX.
AC   MP01134;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FtsZ protein signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7671218; R2=0.0135918; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=730; N_SCORE=14.679; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-1,-27,-5,-1,-18,-17,19,-24,14,-19,-5,9,-19,8,37,-6,-8,-21,-25,-5,0;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-21,-21,-27,-18,3,-23,4,15,-16,24,40,-20,-23,-5,-12,-22,-11,6,-18,7,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-25,-25,-20,-1,-28,-12,17,-17,3,10,-18,-8,-14,-19,-12,-5,10,-16,7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,13,-22,16,24,-27,-12,-1,-26,4,-22,-17,10,-9,10,1,4,-4,-24,-32,-18,17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-20,-6,5,-12,-20,-9,-3,-10,0,-2,-8,-16,-4,-12,-5,-5,-4,-25,-8,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,0,-23,-3,-7,-27,32,-10,-31,-10,-26,-17,8,-17,-7,-10,3,-12,-26,-25,-24,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-18,-28,-24,0,-29,-21,25,-23,17,12,-22,-25,-20,-20,-12,-1,26,-26,-5,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,2,-27,4,24,-30,-15,0,-24,11,-21,-11,1,-8,25,6,2,-5,-24,-25,-15,24;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-25,1,-12,-28,45,-13,-35,-13,-30,-20,12,-19,-13,-13,3,-13,-28,-26,-26,-13;
MA   /M: SY='V'; M=16,-23,-13,-28,-23,-7,-21,-27,19,-18,4,4,-22,-22,-22,-21,-4,-1,30,-25,-12,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-28,24,29,-29,-17,5,-27,7,-21,-16,7,-8,12,-1,-1,-8,-24,-31,-15,20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-20,-34,-25,51,-29,-20,4,-27,13,2,-19,-23,-31,-19,-17,-3,2,-2,18,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-35,-29,17,-35,-22,30,-25,13,11,-23,-25,-24,-24,-19,-9,22,-6,14,-28;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,-4,-21,-13,-17,-6,-21,-6,-12,-8,-8,-12,-14,-13,-20,8,2,6,-24,-19,-13;
MA   /M: SY='I'; M=9,-23,-19,-30,-22,-5,-24,-23,22,-20,12,12,-19,-19,-17,-22,-9,-4,20,-22,-8,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-14,-15,-20,-13,-14,-6,-20,-4,-10,-2,-4,-13,-16,-13,-16,0,-3,4,-22,-15,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-29,0,19,-39,-19,9,-20,9,-20,-1,0,-10,58,9,1,-9,-29,-21,-10,39;
MA   /M: SY='H'; M=14,-2,-20,-5,-2,-22,-9,26,-20,-8,-16,-7,1,-14,2,-10,3,-7,-14,-26,-5,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-23,-9,1,-15,-18,-5,-15,8,-10,-5,-4,-15,2,9,-4,-4,-11,-22,-8,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-25,-7,-2,-12,-19,0,-14,12,-13,-1,1,-17,2,8,-7,-5,-12,-19,0,-1;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-16,-13,-11,-12,-16,-17,1,-12,-10,-6,0,-15,-8,-10,13,15,3,-31,-12,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,0,5,-22,-13,-5,-21,17,-21,-10,3,-11,4,9,-4,-6,-18,-22,-8,4;
MA   /M: SY='A'; M=31,-16,-3,-23,-17,-14,-11,-23,1,-14,-5,-5,-16,-17,-17,-20,3,0,14,-25,-17,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-12,10,-30,16,15,-30,-13,7,-28,5,-25,-16,5,1,10,1,-2,-9,-27,-30,-14,11;
MA   /M: SY='N'; M=-9,6,-22,0,0,-21,-16,-1,-16,9,-20,-9,12,-16,7,10,2,2,-14,-28,-12,3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-24,-8,0,-21,-22,-13,-18,28,-20,-7,-4,-12,1,21,-8,-3,-10,-22,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-23,-34,-25,2,-33,-26,34,-28,27,18,-24,-24,-20,-25,-21,-8,24,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-12,-24,-12,0,-17,-24,-4,-1,-9,10,7,-13,-19,17,-6,-13,-9,-8,-21,-6,8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-35,-26,4,-35,-25,37,-29,30,21,-24,-24,-20,-25,-23,-9,23,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-15,-31,59,-16,-38,-16,-29,-18,0,-19,-10,-16,0,-19,-30,-20,-28,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-24,-2,4,-18,-14,-10,-19,8,-19,-11,-2,-8,1,4,-1,-3,-13,-24,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-24,7,13,-25,-8,4,-25,8,-24,-14,10,-12,7,3,5,-4,-22,-30,-14,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-19,-22,-15,-2,-27,-20,14,-17,14,7,-17,-21,-15,-15,-10,3,13,-23,-4,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,2,-8,-8,-9,-12,-18,-18,-12,-9,-13,-11,4,-11,-9,-9,19,43,-3,-32,-12,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-29,-3,7,-26,-14,-1,-29,29,-24,-10,2,-15,12,37,-7,-10,-22,-21,-11,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-28,-18,11,-29,-19,14,-23,40,16,-27,-28,-19,-14,-28,-10,7,-18,1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-10,-19,-11,-18,-3,-20,-8,-11,-10,-9,-9,-11,-11,-19,11,4,2,-22,-19,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=21,-7,-19,-11,-13,-24,30,-17,-25,-14,-22,-16,0,-15,-13,-18,9,-6,-16,-23,-24,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-12,24,-24,23,3,-22,-11,4,-19,-2,-19,-15,22,-17,0,-5,0,-6,-20,-32,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-27,12,33,-29,-16,-3,-26,10,-20,-15,2,-6,16,3,1,-8,-24,-28,-17,24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-20,-30,-25,-3,-32,-26,29,-15,10,13,-22,-24,-20,-17,-14,-5,32,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-26,-2,15,-22,-17,-2,-23,15,-18,-10,-3,-12,13,19,-4,-8,-19,-20,-8,12;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-2,-24,-2,11,-23,-15,-8,-20,14,-18,-10,-1,-12,7,11,0,-4,-14,-25,-14,9;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-8,-20,-11,-16,-4,-20,-7,-13,-4,-7,-11,-13,-11,-20,6,0,0,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-20,-10,-20,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,2,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-28,5,29,-23,-23,1,-16,3,-10,-7,-4,-8,12,-2,-6,-9,-18,-27,-12,20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-27,14,39,-26,-17,3,-25,3,-17,-13,0,-5,13,-4,1,-8,-23,-30,-16,25;
MA   /M: SY='S'; M=1,7,-12,9,1,-13,-8,-7,-22,-10,-22,-18,5,-14,-6,-12,16,4,-14,-32,-13,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-8,-26,-9,7,-20,-21,-8,-11,7,-10,-4,-6,-13,10,10,-6,-8,-11,-21,-10,7;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-27,26,24,-30,-11,0,-28,2,-23,-19,11,-8,8,-2,2,-7,-24,-33,-18,15;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-25,4,25,-26,-18,-5,-19,5,-15,-11,-3,-8,14,0,0,-5,-17,-26,-16,20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-27,-38,-28,11,-37,-27,39,-30,24,18,-22,-23,-22,-27,-22,-10,23,-16,4,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-2,-25,-4,8,-21,-14,0,-21,14,-18,-9,1,-13,5,17,-3,-8,-17,-23,-10,5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-25,16,25,-27,-15,-5,-26,9,-22,-17,6,-7,9,2,4,-2,-22,-30,-17,17;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-18,-21,-13,-8,-19,-7,5,-15,6,4,-14,-19,-10,-16,-6,-4,6,-22,-5,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00873;
//
ID   FTSZ_2_MP; MATRIX.
AC   MP01135;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FtsZ protein signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3445320; R2=0.0116353; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=707; N_SCORE=12.561; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=186; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-20,-10,-20,-1,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,2,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-29,8,34,-24,-22,7,-21,5,-13,-9,-2,-7,15,1,-5,-10,-22,-27,-12,24;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-26,11,35,-25,-17,7,-23,2,-14,-11,-1,-6,11,-4,-2,-10,-22,-28,-14,23;
MA   /M: SY='S'; M=4,2,-10,3,0,-13,-7,-7,-21,-11,-23,-17,4,-13,-5,-12,19,7,-12,-32,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=1,-11,-24,-13,2,-16,-21,-13,-5,0,-4,-3,-9,-14,1,2,-7,-7,-5,-22,-11,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-25,24,20,-29,-10,-2,-25,1,-22,-18,11,-10,7,-3,3,-6,-22,-33,-19,13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-26,8,30,-27,-18,-4,-21,6,-17,-13,-1,-7,14,0,0,-6,-19,-27,-17,22;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-28,-39,-29,9,-38,-28,41,-30,23,18,-21,-22,-22,-28,-21,-10,24,-17,3,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-26,-6,8,-21,-16,3,-20,14,-17,-6,-3,-13,6,15,-5,-9,-15,-22,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,12,-27,18,31,-29,-16,-4,-28,13,-23,-18,4,-6,11,4,1,-7,-24,-29,-17,20;
MA   /M: SY='A'; M=8,-17,-18,-21,-14,-9,-20,-7,6,-15,6,4,-15,-19,-11,-16,-7,-5,8,-23,-6,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-19,-29,-22,3,-29,-23,23,-26,30,14,-24,-26,-20,-21,-18,-5,19,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-24,17,18,-33,-14,-4,-31,18,-26,-15,4,-11,14,10,-4,-10,-25,-27,-16,15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,13,-27,17,-4,-31,34,-11,-37,-11,-30,-23,11,-16,-10,-15,5,-12,-28,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-14,-16,-11,-4,-7,-14,-11,-12,-12,-10,-6,-14,-11,-15,12,9,-4,-18,-4,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-19,38,-29,51,15,-35,-12,16,-36,2,-28,-23,20,-12,2,-5,-2,-11,-29,-37,-13,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-24,-20,-31,-21,10,-24,-8,19,-18,26,42,-22,-23,-10,-14,-22,-10,10,-17,3,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,7,-30,-28,-3,-30,-29,20,-22,8,6,-26,-30,-28,-22,-11,-1,35,-31,-11,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,64,-32,-22,10,-30,12,4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,6,4,24,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-28,2,-35,-28,38,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='T'; M=3,-4,-5,-12,-12,-11,-19,-21,-8,-12,-10,-9,-3,-13,-12,-12,17,38,4,-31,-12,-12;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,3,-18,-11,-19,-5,-20,-13,-12,-12,-12,-8,-13,-11,-19,11,6,-2,-26,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-21,-28,-17,10,-24,-7,15,-16,24,39,-21,-23,-8,-13,-21,-10,7,-17,2,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-29,-6,-15,-29,54,-16,-37,-11,-30,-19,6,-19,-15,-13,0,-17,-29,-22,-27,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-5,-17,-9,-20,1,-19,-14,-11,-15,-12,-7,-12,-9,-18,13,2,-3,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-17,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-11,-10,-7,-10,-10,-17,14,12,0,-23,-18,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-13,-30,-29,-1,-31,-29,30,-21,10,10,-27,-27,-27,-21,-9,2,44,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-36,-30,8,-35,-29,37,-26,15,14,-24,-25,-26,-25,-16,-6,35,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-11,-17,-10,-19,0,-19,-10,-11,-12,-10,-8,-12,-10,-18,13,2,1,-24,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-29,5,18,-28,-16,-4,-30,29,-25,-13,2,-11,13,27,-5,-10,-23,-24,-13,15;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-20,-34,-26,4,-30,-26,29,-25,12,11,-19,-21,-21,-25,-13,-6,22,-19,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,-12,-21,-12,-15,-6,-20,-3,-13,-3,-5,-12,-13,-12,-20,5,0,4,-22,-17,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-28,-3,7,-27,-18,-7,-29,38,-27,-11,1,-13,10,36,-5,-7,-19,-22,-11,7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-28,17,38,-28,-15,-1,-29,14,-24,-18,9,-6,14,5,1,-8,-27,-30,-18,26;
MA   /M: SY='M'; M=2,-13,-19,-18,-10,-10,-20,-14,1,-5,6,9,-13,-18,-4,-7,-8,-1,2,-22,-8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-28,-10,-18,-28,57,-18,-36,-16,-28,-19,1,-19,-17,-16,1,-17,-27,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=18,-17,-18,-24,-15,-12,-17,-20,8,-12,-2,0,-13,-16,-12,-13,-1,-3,10,-21,-11,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-26,-19,4,-27,-18,19,-26,35,15,-19,-27,-18,-19,-23,-9,8,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-12,-8,-12,-10,-18,-16,-5,-10,-10,-8,6,-16,-12,-10,13,31,3,-32,-12,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-19,-30,-26,-3,-22,-27,25,-21,11,10,-23,-25,-24,-21,-14,-6,30,-25,-8,-26;
MA   /M: SY='G'; M=16,-7,-19,-9,-10,-23,21,-16,-23,-12,-19,-15,-2,-15,-11,-13,9,-4,-14,-25,-22,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-19,-32,-27,5,-31,-26,27,-20,10,11,-24,-20,-25,-18,-14,-5,32,-23,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-12,-26,-23,-6,-25,-25,20,-16,5,7,-25,-26,-19,-17,-7,-1,36,-28,-11,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00873;
//
ID   UPF0034_MP; MATRIX.
AC   MP01136;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0034 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3274651; R2=0.0148883; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=309; N_SCORE=9.918; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-20,-14,-14,10,-25,-15,-3,-9,2,-2,-13,-22,-16,-5,-10,1,2,-16,4,-15;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-21,-20,-24,-14,4,-22,-12,9,-16,23,17,-20,-22,-11,-9,-18,-8,4,-16,1,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-13,-15,-6,-16,-8,-16,-7,-8,-6,-6,-9,-12,-5,-14,5,1,0,-21,-15,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=2,5,-23,7,21,-25,-13,-3,-22,10,-18,-12,0,-7,12,2,0,-7,-19,-22,-14,16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,11,-13,-11,-14,-7,-14,-13,-12,-14,-12,2,-17,-12,-15,6,0,-6,-27,-17,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-11,-21,-12,-17,-6,-20,-5,-9,-7,-5,-12,-13,-11,-17,6,0,5,-21,-17,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-6,-24,-7,8,-20,-18,-9,-15,11,-12,-5,-6,-13,6,10,-4,-6,-11,-24,-12,6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-20,-22,-24,-16,2,-25,-14,13,-14,18,15,-16,-21,-11,-9,-17,-8,7,-18,-1,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=20,-3,-12,-12,-11,-13,-6,-14,-2,-10,-9,-6,1,-15,-11,-14,5,0,4,-24,-15,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-12,-9,0,-19,-16,-14,-9,-4,-11,-7,-9,-15,-2,-7,-1,-4,-2,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-26,17,22,-27,-15,-6,-24,2,-19,-17,3,-2,6,-4,0,-4,-21,-30,-18,13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-13,-19,-15,-10,-4,-14,-7,0,-10,6,5,-10,-18,-6,-5,-9,-6,-2,-11,-3,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-25,-2,-9,-22,29,-9,-30,-11,-22,-16,-1,-19,-12,-13,-3,-14,-24,-19,-13,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-5,-22,-17,-2,-16,-16,-4,-16,-7,-7,-16,-12,-17,-19,-1,-3,3,-17,-2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,18,-26,24,9,-28,-12,2,-28,3,-25,-18,10,-6,5,-3,3,-4,-24,-28,-12,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-23,-14,-7,-10,8,-14,-13,-15,-11,-8,-7,-17,-13,-17,-5,-12,-11,-20,-13,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,19,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-28,59,15,-36,-6,1,-37,-1,-30,-28,26,-12,-1,-9,2,-9,-30,-39,-20,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-25,8,-34,-24,31,-29,34,20,-25,-26,-20,-24,-25,-10,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-24,13,-31,-25,14,-25,-19,4,-22,6,12,-21,-28,-23,-19,-14,-7,9,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-30,-20,-19,85,-10,-20,-8,-9,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-16,-18,-11,-15,-15,-17,2,-8,-8,-1,-10,-15,-5,-12,5,1,8,-26,-13,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,7,-31,12,8,-30,-14,-4,-28,14,-26,-14,1,10,2,4,-6,-10,-24,-28,-16,3;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-5,-26,-8,-2,-13,-21,-10,-14,13,-12,-5,-3,-17,-1,13,-9,-3,-10,-16,-5,-3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,-12,-26,-24,-4,-25,-26,22,-18,6,6,-23,-25,-22,-19,-5,0,36,-29,-11,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-15,-10,-7,-13,-18,-7,-6,-5,-9,-3,2,-18,1,-5,0,4,-7,-23,-4,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-5,2,-26,-2,-1,-24,-1,-2,-27,16,-25,-13,11,-16,2,20,-1,-8,-21,-25,-15,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-22,-1,-1,-26,9,-2,-29,5,-27,-15,8,-15,0,3,3,-7,-23,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-28,-9,-12,-21,25,-5,-27,-7,-19,-8,-2,-20,-9,-5,-6,-15,-22,-17,-13,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-22,-15,-14,-3,6,-13,-14,-12,-12,-7,-5,-18,-14,-14,-2,-8,-10,-14,-4,-14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=26,-8,5,-14,-9,-20,0,-18,-18,-13,-19,-15,-4,-14,-9,-18,18,5,-6,-31,-22,-9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,10,-21,-17,-12,-3,-19,-15,-15,-13,-11,-11,-20,-16,-19,1,-4,-6,-23,-14,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-20,9,-28,-19,18,-28,44,20,-28,-29,-18,-19,-28,-10,8,-17,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-22,-29,-19,1,-27,-14,20,-21,28,28,-23,-19,-10,-17,-21,-7,9,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-20,-3,2,-19,-13,-4,-21,8,-17,-10,2,-16,6,12,-2,-6,-17,-22,-9,3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,14,-21,17,15,-26,-17,4,-29,10,-23,-16,9,-13,8,11,-3,-7,-24,-29,-12,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-34,-9,2,-24,-17,-16,-19,-8,-24,-18,-13,50,-7,-13,-6,-7,-25,-20,-22,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-21,22,18,-30,-12,-5,-27,1,-22,-19,6,-5,5,-5,2,-5,-22,-31,-19,11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-17,-23,-15,-1,-27,-12,7,-15,25,11,-21,-26,-14,-8,-21,-7,5,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='I'; M=1,-26,-18,-31,-24,7,-26,-22,21,-22,18,15,-23,-24,-21,-21,-15,-6,21,-20,-3,-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-10,-15,-13,-5,-14,-9,-2,-14,-8,-12,-7,-8,-14,-3,-12,-3,-8,-11,-18,-3,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-25,14,20,-29,-15,1,-27,9,-22,-14,5,-10,15,9,1,-6,-24,-29,-15,17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,1,-32,-26,-5,-28,-24,21,-25,11,14,-20,-25,-19,-24,-15,-8,16,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-16,-31,-26,3,-29,-27,26,-23,18,11,-26,-26,-25,-21,-14,-3,32,-24,-6,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-25,0,8,-25,-15,-1,-23,18,-22,-10,3,-12,10,15,0,-4,-18,-25,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00874;
//
ID   TATD_1_MP; MATRIX.
AC   MP01137;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TatD deoxyribonuclease family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2276061; R2=0.0084048; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1177; N_SCORE=10.118; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=747; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-50; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-74,-49,-59,-74,-57,-77,-71,-44,-64,-48,-61,109,-35,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='M'; M=-50,-66,-67,-64,-61,-60,-56,-50,-61,-46,116,-55,-67,-53,-63,79,-46,-53,-78,-57;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-86,-45,83,-85,-72,-61,-79,-51,-80,-72,-64,98,-47,-62,-60,-60,-78,-80,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-71,-94,-86,-87,-104,-79,-89,-104,-87,-107,-101,-74,-94,-78,-91,79,-65,-96,-112,-96; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-99,-111,-83,-83,-98,-101,119,-116,-88,-98,-84,-73,-100,-77,-82,-89,-98,-116,-133,-67; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-97,-99,-115,-107,-70,-116,-98,-62,-108,62,-58,-114,-114,-101,-105,-107,-93,-69,-101,-83; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-90,-111,-61,82,-114,-106,-83,-115,-71,-107,-103,-87,-85,-64,-81,-87,-91,-107,-110,-104; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-96,-122,-97,-85,-116,-98,-100,-104,-93,-114,-100,-103,98,-96,-105,-94,-89,-109,-109,-113; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-71,-94,-86,-87,-104,-79,-89,-104,-87,-107,-101,-74,-94,-78,-91,79,-65,-96,-112,-96; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-70,-84,-74,-49,-77,-57,18,-68,9,137,-72,-72,-60,-66,-71,-60,-39,-74,-51;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-70,-79,-68,11,76,2,73,-66,10,-58,42,-63,-77,-61,16,-67,-69,-68,-66,-42; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-68,-72,-84,-79,62,-84,-66,35,-76,61,42,-79,-82,-73,-74,-75,-63,-40,-58,32;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-73,-86,-82,73,-87,-79,77,-78,-36,-41,-77,-78,-80,-79,-72,-59,46,-63,-42;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='T'; M=25,-62,-58,-59,-71,-57,-64,-65,-58,-69,-64,-48,-62,-56,-64,70,83,-56,-84,-67;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='C'; M=0,127,-74,-73,-66,-73,-76,-60,-70,-7,-59,-63,-78,-74,-76,-54,54,3,-92,-72;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-72,-83,-76,21,-85,-71,35,-77,77,-33,-81,20,-72,-76,-75,-62,-38,-69,-51;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-75,99,-39,-83,-58,-49,-82,-52,-84,-78,85,-69,-52,-61,-51,-53,-81,-101,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=23,45,-73,-65,45,1,-63,8,-65,-3,40,-66,-75,52,-66,-59,-60,4,-63,30;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-82,-88,-95,-86,-64,-97,-80,-55,-81,59,40,-93,19,-80,10,-89,-78,-62,-89,-72; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-73,-91,43,86,-95,-82,-63,-95,-56,-90,-86,20,-70,-50,-65,-66,-70,-89,-97,-84; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-59,-77,-57,-53,-70,-63,-56,-65,9,-72,-63,47,78,53,-57,33,-52,0,-73,28;
MA   /M: SY='F'; M=-66,-72,-78,-73,62,-80,-65,34,5,53,-40,-72,-79,-68,-67,5,-60,-43,-58,31;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-99,12,6,-93,-93,-89,2,4,-13,-82,-82,-94,-79,-83,3,-81,-80,-105,-91; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-87,-105,69,9,-112,-90,-80,-109,-77,-107,-102,-68,-91,24,-84,3,-81,-105,-117,-95; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-95,-100,-94,4,43,-108,40,-74,-94,30,-69,-96,-104,-90,-94,-97,-91,-79,-90,-67; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-61,-79,44,63,-79,-67,87,-82,-48,-75,-66,23,-64,54,-52,8,-58,-79,-88,-59;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-82,42,13,-86,0,-59,-82,61,-80,-70,-50,-67,70,-44,-55,12,-78,-81,-70; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-2,-78,41,-67,-68,0,-71,7,-72,17,39,20,-79,-70,-76,-64,12,3,-89,-70; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-83,-87,-85,-72,-85,-87,32,-84,16,-61,-79,-87,-80,-87,31,11,3,-94,-77; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-73,14,-61,19,-74,-65,48,-65,44,-43,-64,-74,53,-66,6,-58,-43,-71,-54;
MA   /M: SY='H'; M=2,-75,62,15,19,-65,90,-75,-55,-69,-64,-46,-67,30,-58,11,16,-71,-83,-52;
MA   /M: SY='R'; M=-57,-74,-61,-55,-71,4,-60,-55,38,-64,-59,24,-71,30,59,10,-55,45,-79,-65;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00836;
//
ID   SCORP_SHORT_TOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP01138;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Scorpion short toxins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8648913; R2=0.0059226; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=541; N_SCORE=7.065; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=445; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-24,1,-4,-9,-5,-14,-17,-13,-17,-15,-2,-15,-10,-15,3,-4,-13,-14,-9,-7;
MA   /M: SY='S'; M=7,4,-8,-2,6,-22,-11,-6,-19,-5,-19,-14,7,-12,3,-9,12,7,-15,-31,-17,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-7,-22,-8,2,-16,-2,-7,-17,-2,-13,-6,-4,-13,11,-3,-1,-8,-17,-17,-10,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-14,-20,-17,-16,-14,-9,-19,2,-14,-7,-2,-11,-20,-9,-15,-2,3,7,-21,-12,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-13,-18,-16,-8,4,-21,-11,-3,-15,-2,-3,-11,-16,-11,-14,-10,-9,-4,-18,-3,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-15,-21,-21,-11,-7,-29,-22,16,-17,5,4,-12,-15,-12,-18,-3,11,13,-26,-7,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-23,18,4,-24,-6,-2,-19,-4,-21,-16,23,-14,0,-7,3,-2,-19,-34,-18,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-17,-24,-18,-8,-25,-24,17,-13,4,6,-20,-21,-16,-16,-8,-1,25,-26,-10,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-24,-4,3,-19,-16,-11,-21,19,-22,-11,-2,-10,1,14,0,-4,-12,-24,-12,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-3,-20,-8,-7,-11,-10,-9,-14,-1,-16,-10,4,-17,-3,3,6,9,-10,-24,-7,-6;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-16,-7,-10,-17,18,-11,-18,-11,-16,-11,0,-13,-10,-11,6,-1,-10,-20,-16,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=1,-8,-17,-7,-3,-14,-10,-11,-12,-11,-15,-12,-3,6,-5,-12,14,10,-10,-28,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-26,-3,3,-25,-7,-7,-27,20,-26,-13,2,-6,7,21,0,-6,-20,-24,-15,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,10,-28,15,21,-31,-14,3,-27,7,-22,-12,4,-10,22,6,2,-6,-25,-28,-14,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-16,-28,-17,-12,-2,-19,-10,-7,-12,-3,-5,-16,-22,-7,-12,-14,-9,-11,20,13,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-23,-3,0,-20,-13,-12,-15,1,-14,-10,-3,-5,-3,0,1,-2,-11,-28,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-27,-10,-6,-19,-18,-17,-10,-8,-19,-12,-13,30,-11,-15,-3,-5,-9,-28,-19,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-23,-7,4,-22,-21,-7,-23,27,-21,-7,-3,-15,9,30,-8,-8,-16,-21,-10,5;
MA   /M: SY='K'; M=-3,5,-25,7,10,-29,-14,-7,-27,20,-25,-14,3,-9,8,14,2,-5,-19,-26,-15,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-9,-14,-10,-1,-10,-14,-8,-1,-3,2,1,-9,-12,3,-1,-6,-5,-1,-15,-7,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-14,-20,-20,-16,6,-21,-9,0,-14,2,1,-10,-21,-14,-10,-6,5,1,-15,7,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-6,-16,-29,56,-16,-37,-14,-30,-19,7,-19,-16,-15,1,-17,-29,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-16,18,-21,-17,-8,-25,-16,-7,-12,-4,-1,-15,-25,-14,-10,-7,0,0,-28,-8,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=0,-6,-21,-6,-3,-17,-12,-6,-17,0,-15,-11,-3,3,-3,4,0,-1,-13,-23,-12,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-3,-21,-9,-5,-10,-11,5,-15,-6,-10,-7,4,-18,-2,1,0,-4,-13,-24,-6,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-24,-12,-16,-27,50,-19,-32,-17,-25,-18,-2,-17,-16,-19,5,-13,-22,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-24,-32,-22,-2,-28,-12,29,-17,17,39,-18,-19,-5,-17,-18,-8,15,-20,-1,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,32,-22,15,-3,-22,11,5,-23,-3,-30,-20,51,-20,-3,-3,8,-3,-30,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-28,0,-2,-26,12,-9,-31,11,-27,-15,7,-17,-2,14,-2,-11,-23,-24,-19,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-26,-4,7,-26,-18,-6,-24,31,-23,-8,-1,-12,9,23,-5,-5,-16,-22,-10,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-28,1,8,-25,-19,2,-25,26,-23,-10,2,-14,8,26,-7,-8,-18,-24,-9,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-17,-25,-19,-19,22,-27,10,1,-12,-1,1,-16,-27,-13,-11,-14,-4,-3,12,53,-19;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-21,-3,-2,-18,2,-8,-18,2,-18,-11,2,10,-4,1,-3,-7,-18,-18,-15,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-17,-9,-5,-20,-10,-2,-20,1,-20,-10,-3,-5,-2,0,-3,-6,-16,-25,-9,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00875;
//
ID   BACT_MICROCOMP_MP; MATRIX.
AC   MP01139;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial microcompartiments proteins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2238498; R2=0.0151269; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=975; N_SCORE=19.963; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-17,-26,-19,1,-22,-12,16,-18,23,29,-21,-24,-11,-15,-15,-5,13,-24,-4,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-27,3,-37,-27,41,-29,27,19,-23,-23,-21,-27,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,55,-31,-20,1,-29,10,-20,-17,0,-1,25,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-10,-13,-13,-8,-22,-22,-3,-12,-7,-7,-5,-13,-13,-12,15,42,8,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-27,-1,-4,-15,-21,-8,-10,4,-4,-4,0,-20,-3,16,-12,-9,-10,-25,-9,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-35,-25,45,-28,-17,10,-27,24,16,-23,-28,-27,-18,-23,-10,5,-4,16,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-23,-26,-18,-13,-16,-24,-24,1,-14,-12,-7,-23,34,-18,-19,-8,-1,5,-30,-20,-18;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-17,-15,-8,-23,6,-19,-17,-11,-18,-14,-8,4,-10,-19,10,-1,-10,-24,-23,-10;
MA   /M: SY='V'; M=16,-21,-15,-27,-19,-6,-18,-22,14,-18,11,9,-20,-20,-16,-20,-8,-4,17,-22,-10,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-27,3,-34,-27,35,-26,24,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='E'; M=6,8,-25,13,21,-29,3,-9,-28,-2,-21,-19,1,-8,2,-10,3,-9,-22,-27,-22,11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-15,-27,-22,3,-28,-24,19,-23,26,12,-25,-27,-22,-18,-15,3,23,-25,-5,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-13,-13,-9,-21,9,-17,-17,-11,-18,-14,-3,-11,-9,-17,16,3,-7,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,15,-27,12,11,-23,-12,3,-27,14,-24,-17,22,-16,7,29,-1,-7,-26,-30,-16,7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-23,-9,-1,-19,-20,-8,-19,15,-15,-4,-2,-14,7,25,0,10,-12,-23,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-15,-31,-27,0,-29,-27,28,-22,16,11,-27,-27,-25,-22,-13,-3,36,-26,-8,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-11,-11,-16,-19,29,-13,-29,-17,-25,-17,-2,-21,-15,-17,7,-8,-20,-21,-13,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-28,-16,-14,11,-27,26,-7,-5,-6,-1,-13,-27,-5,3,-16,-11,-10,7,48,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-29,14,31,-28,-20,-4,-19,6,-18,-13,1,-7,16,-2,-1,-8,-21,-28,-15,23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-17,-24,-20,-11,0,-26,-15,-1,3,0,2,-14,-21,-7,5,-14,-8,2,-17,-2,-9;
MA   /M: SY='I'; M=8,-22,-18,-29,-21,-4,-25,-25,21,-21,13,8,-19,-20,-18,-22,-9,0,19,-22,-8,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-30,7,-3,-32,45,-14,-39,-13,-29,-22,3,-16,-11,-16,0,-17,-30,-25,-27,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-24,1,-3,-26,10,-12,-28,-6,-29,-20,2,3,-5,-3,12,-1,-21,-31,-23,-6;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-25,-14,-10,-2,-22,-3,-7,-1,6,1,-6,-25,-5,17,-16,-9,-9,-15,6,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-27,21,-33,-28,17,-30,-26,4,-27,9,1,-25,-33,-31,-23,-16,-7,14,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-10,-13,-13,-9,-21,-21,-5,-11,-7,-7,-4,-13,-13,-11,16,43,7,-30,-10,-13;
MA   /M: SY='V'; M=11,-25,-13,-27,-22,-2,-22,-24,16,-20,16,8,-25,-25,-22,-20,-10,-3,25,-24,-10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=0,-17,-20,-26,-21,-4,-24,-19,23,-19,11,15,-11,-21,-15,-19,-12,-6,17,-24,-7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-4,12,-24,-20,1,-29,25,-20,-11,0,-16,16,53,-7,-10,-23,-22,-12,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-13,25,-28,37,18,-32,-15,-6,-30,-2,-25,-23,8,5,0,-10,2,1,-25,-35,-19,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-12,-27,-25,0,-28,-27,22,-20,14,9,-25,-27,-25,-18,-9,6,36,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-17,-9,-6,-25,14,-13,-21,-10,-22,-14,0,-12,-1,-13,16,0,-14,-26,-21,-3;
MA   /M: SY='A'; M=19,6,-19,1,15,-23,-7,-8,-19,-1,-17,-15,6,-8,2,-10,7,-3,-16,-27,-20,9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,23,-30,-30,-5,-30,-30,15,-23,2,2,-27,-33,-30,-23,-10,-3,35,-35,-15,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,9,-23,1,3,-23,-13,-3,-23,18,-24,-12,16,-15,7,18,1,-1,-20,-27,-14,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00876;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F45_MP; MATRIX.
AC   MP01140;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 45 active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0932794; R2=0.0148636; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=470; N_SCORE=12.069; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=95; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=9,-18,-15,-20,-13,-5,-15,-17,3,-20,15,3,-15,-20,-13,-17,-3,0,3,-25,-10,-13;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-13,-10,-13,-13,12,-15,-8,-13,-13,-8,-5,-15,-13,-13,6,-1,2,-22,-16,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-8,0,0,-15,0,-8,-15,-8,-23,-15,8,-8,0,-8,30,15,-8,-30,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-13,-23,-18,5,-23,-18,18,-20,28,13,-23,-23,-18,-15,-18,-5,18,-18,-3,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-20,-21,-21,-15,-8,-23,-20,16,-16,0,3,-17,10,-15,-18,-10,-5,12,-20,-10,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-25,-5,-6,-21,10,12,-23,-10,-21,-11,-3,13,-6,-11,-5,-13,-23,-20,-12,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='I'; M=9,-17,-15,-22,-15,-3,-17,-18,14,-17,13,7,-15,-15,-12,-18,-9,-5,10,-15,-6,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-17,25,1,-19,-13,-9,-10,-6,-11,-11,1,-13,-9,-10,-3,-5,0,-28,-12,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-17,-5,-10,-20,33,-12,-25,-12,-23,-15,3,-12,-10,-12,11,-4,-17,-21,-20,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=14,-12,-13,-15,-15,-13,11,-17,-6,-12,-8,-6,-10,-15,-15,-15,1,-5,4,-17,-15,-15; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-13,15,-15,-13,-1,-21,-2,-14,-4,-10,-7,-11,-23,-8,5,-10,-8,-10,-9,13,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='B'; M=1,20,-23,17,5,-28,-8,-5,-25,12,-26,-17,18,-13,1,2,2,-5,-20,-30,-17,3;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-24,-13,-17,-27,50,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-12,-22,-17,-12,0,-23,-1,-6,0,-3,8,-10,-20,-3,9,-6,7,-5,-10,15,-10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-5,-10,-12,-8,-17,-6,-18,-12,-10,-15,-12,-2,-10,-8,-15,20,19,-2,-28,-17,-8;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-44,-34,-27,16,-23,-16,-14,-17,-14,-14,-34,-30,-17,-17,-34,-24,-24,116,44,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,77,-24,-27,-23,-2,-27,-33,-27,-23,-20,-14,-34,-27,-27,-7,-13,-16,-41,-30,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-14,77,-21,-16,-26,-27,-19,-27,-19,-20,-14,-14,-31,-4,-19,-7,-10,-16,-41,-24,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-4,-28,-1,18,-21,-22,-9,-19,21,-9,-6,-7,-12,6,10,-12,-10,-16,-23,-11,12;
MA   /M: SY='P'; M=6,-15,-30,-12,-8,-28,10,-20,-23,-13,-26,-18,-12,36,-13,-20,-3,-11,-23,-25,-28,-13;
MA   /M: SY='S'; M=14,-3,-15,-6,-3,-20,-5,15,-20,-10,-22,-12,4,-13,0,-10,19,4,-12,-32,-10,-3;
MA   /M: SY='C'; M=3,-18,91,-28,-26,-20,-23,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-33,-26,-28,-6,-8,-8,-43,-28,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,54,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-29,-39,-29,-21,1,-14,-24,-20,-17,-23,-20,-26,-24,-14,-17,-17,-16,-24,96,16,-14;
MA   /M: SY='S'; M=15,0,-14,0,11,-22,-4,-10,-20,-6,-23,-18,3,-8,2,-10,24,9,-12,-33,-20,7;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-19,-7,-5,-25,11,-15,-24,2,-25,-15,0,-12,-5,-5,12,-1,-14,-26,-20,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,10,-19,5,5,-19,-9,-2,-19,23,-21,-10,15,-10,5,14,-2,-5,-17,-19,-10,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-7,-17,-12,-9,-8,-17,3,-10,-2,-2,-12,-12,-12,-14,2,0,13,-17,-12,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-6,-30,6,-20,-26,-13,-30,-20,-14,59,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='V'; M=17,-17,-10,-20,-17,-11,-14,-22,6,-15,-6,-3,-14,-19,-17,-17,8,5,21,-30,-15,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-11,-22,-19,-18,27,-23,-4,0,-18,8,0,-3,-28,-19,-13,-15,-8,-7,-5,22,-18;
MA   /M: SY='P'; M=6,-15,-23,-15,-5,-23,-18,-15,-5,-8,-13,-5,-15,13,2,-13,-3,-5,-3,-25,-18,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-35,-16,-9,-16,-15,-20,-20,-13,-27,-20,-18,31,-10,-17,-6,-8,-25,19,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-23,-16,-8,-19,-25,-16,3,-9,-9,0,-19,6,1,-11,-7,-5,7,-27,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-12,-22,-10,-13,16,-26,-16,2,-23,23,4,-16,-26,-20,-18,-21,-10,-1,-17,3,-16;
MA   /M: SY='G'; M=11,-5,-21,-7,-3,-28,15,-10,-23,-8,-23,-13,0,-13,7,-10,12,-3,-19,-25,-20,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00877;
//
ID   T2SP_C_MP; MATRIX.
AC   MP01141;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial type II secretion system protein C signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3094096; R2=0.0156864; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1011; N_SCORE=21.158; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=76; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-39,-9,3,-31,-20,-16,-20,-7,-29,-17,-17,76,0,-16,-9,-10,-30,-29,-27,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-26,-13,-4,-16,-20,-3,-16,19,-11,7,-5,-18,6,37,-9,-4,-11,-21,-8,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-23,8,3,-21,-19,-9,-14,9,-17,-10,2,-17,-3,8,-5,-6,-5,-30,-14,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-23,31,10,-27,7,-2,-29,-3,-23,-20,16,-10,-2,-8,1,-9,-24,-28,-18,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,21,-29,29,31,-32,-2,-2,-33,2,-25,-23,12,-8,7,-6,1,-10,-30,-32,-21,19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-28,-6,1,-27,-4,-9,-24,19,-23,-8,-3,-15,10,18,-6,-11,-17,-21,-14,4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,3,-32,-22,33,-26,29,25,-25,-25,-18,-22,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-18,-19,-18,-13,-3,-24,-10,5,-8,1,3,-17,-23,-7,-8,-7,-3,10,-17,7,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-22,-20,26,-30,13,4,-14,9,4,-22,-30,-12,-12,-22,-10,-6,21,65,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-26,-11,0,-22,-16,-3,-25,20,-18,-9,-2,-17,11,47,-5,-8,-17,-20,-12,2;
MA   /M: SY='L'; M=3,-26,-17,-28,-19,3,-24,-21,16,-25,33,13,-26,-26,-19,-20,-20,-7,14,-21,-5,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-21,13,2,-22,-4,3,-22,8,-30,-18,42,-17,2,4,10,1,-25,-36,-18,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-30,-10,-16,-28,53,-16,-38,-11,-28,-18,0,-20,-14,-3,-2,-18,-28,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='K'; M=4,-4,-24,-5,4,-27,-13,-13,-24,23,-26,-13,-3,1,3,9,1,-4,-16,-24,-16,3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,31,-28,35,6,-32,6,-2,-34,2,-30,-23,24,-14,-3,-5,1,-9,-29,-34,-21,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-31,-13,-4,-20,-20,-15,-14,-6,-13,-11,-15,36,-7,-2,-8,-7,-18,-27,-20,-9;
MA   /M: SY='D'; M=1,14,-19,15,8,-23,-9,-7,-18,-4,-21,-17,12,-13,-2,-9,9,0,-11,-35,-19,3;
MA   /M: SY='L'; M=3,-23,-17,-25,-16,1,-21,-19,10,-24,30,10,-22,-24,-16,-19,-15,-5,6,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-13,11,-25,11,6,-13,-17,2,-20,1,-17,-14,8,-16,0,3,0,3,-19,-19,5,1;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-4,-20,-8,2,-24,-13,-6,-18,4,-18,-9,-1,-12,15,11,9,7,-14,-25,-13,7;
MA   /M: SY='S'; M=7,-13,-14,-15,-11,-11,-13,-17,2,-17,-5,-4,-7,-17,-10,-16,13,7,6,-31,-13,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-28,-14,-20,-23,51,-20,-29,-22,-15,-13,-6,-22,-20,-20,-6,-18,-23,-20,-24,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-6,8,-30,-21,-1,-16,16,-17,-2,-4,-14,31,17,-5,-9,-15,-21,-10,19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-29,26,24,-32,-14,-7,-29,0,-24,-22,2,12,3,-10,0,-9,-26,-32,-22,13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,14,-25,5,-10,-25,36,-5,-30,-10,-30,-20,29,-20,-10,-10,5,-10,-30,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-24,-34,-24,2,-30,-16,31,-22,27,36,-22,-22,-12,-20,-22,-10,17,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-33,-28,2,-33,-28,34,-25,21,15,-27,-27,-25,-23,-17,-5,36,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-14,-13,-6,-20,-4,-14,-16,-3,-17,-12,-3,-12,-4,-1,14,3,-6,-25,-18,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-28,-3,-9,-30,40,-9,-33,-11,-28,-16,11,-18,-1,-11,2,-14,-30,-24,-24,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-24,-12,0,-27,-12,12,-20,34,20,-23,-25,-3,-13,-23,-10,2,-20,-2,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-14,41,-26,57,16,-36,-8,-2,-36,-2,-30,-28,18,-10,0,-10,7,-4,-26,-40,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-20,16,-30,42,16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,8,-14,6,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-20,-10,-5,-15,-20,-10,-20,10,-15,-10,0,-15,0,29,5,21,-10,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,41,-30,57,16,-36,-12,19,-38,-2,-28,-24,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-13,8;
MA   /M: SY='P'; M=3,-6,-29,-6,-1,-26,-13,-14,-19,-1,-26,-17,-4,40,-6,-11,-3,-6,-22,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-6,19,-26,23,19,-28,-11,-2,-29,7,-23,-20,12,-11,5,7,1,-7,-24,-31,-18,11;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-4,-23,-4,15,-29,-18,-3,-13,2,-14,-4,-6,-11,27,-2,1,-7,-13,-23,-14,21;
MA   /M: SY='A'; M=21,-17,-13,-25,-17,-10,-12,-15,7,-12,3,16,-17,-17,-10,-17,-3,-3,13,-22,-12,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-4,-23,-10,-5,-16,-17,-6,-3,1,-11,4,3,-16,5,4,0,-3,-7,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-2,-23,-5,9,-31,-16,-2,-18,8,-18,-4,-2,-10,32,4,3,0,-19,-21,-12,20;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,-13,-25,-16,-8,-14,-21,5,-18,12,2,-19,-19,-16,-20,-6,-3,10,-21,-12,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-25,-20,-31,-21,14,-25,-9,17,-19,28,39,-23,-25,-12,-15,-23,-10,9,-16,4,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=6,-3,-22,-4,10,-27,-12,-4,-21,5,-20,-10,0,-11,19,10,8,-2,-18,-25,-15,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-7,-25,-7,8,-26,-19,1,-14,2,-8,0,-4,-15,31,8,-1,-6,-19,-23,-10,19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,6,-28,-16,21,-24,37,29,-28,-28,-16,-18,-25,-9,16,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='P'; M=12,-10,-23,-13,-7,-18,-12,-16,-9,-12,-8,-9,-7,16,-10,-17,-4,-5,-12,-26,-19,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00878;
//
ID   T2SP_N_MP; MATRIX.
AC   MP01142;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacterial type II secretion system protein N signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4891591; R2=0.0123362; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1097; N_SCORE=18.012; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=164; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-8,-18,-11,-8,-9,-18,11,-9,-16,-1,-2,-3,-18,-5,-10,4,9,-7,-30,-3,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-15,-13,-5,-18,-5,-15,-10,-8,-13,-10,-10,18,-8,-15,3,-3,-8,-18,-18,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-32,-10,-3,-24,-20,-20,-17,-10,-24,-17,-14,62,-10,-17,-2,7,-22,-30,-24,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-32,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-12,62,-7,-17,4,-2,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='E'; M=1,9,-28,18,19,-30,-13,-9,-26,-2,-23,-20,-2,16,0,-12,0,-8,-23,-30,-22,8;
MA   /M: SY='G'; M=-8,19,-28,19,-4,-30,31,-7,-35,-10,-30,-23,20,-17,-10,-12,2,-12,-30,-30,-25,-7;
MA   /M: SY='L'; M=7,-22,-17,-27,-17,-1,-19,-15,12,-20,26,21,-22,-22,-13,-18,-17,-7,7,-20,-6,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-5,13,-23,-22,-5,-14,9,-13,-6,-7,-15,15,17,-5,-8,-9,-25,-13,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-3,-15,-8,7,-20,-10,-15,-15,-5,-12,-12,-5,-8,-3,-13,10,10,-7,-25,-17,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-30,0,9,-33,24,-7,-32,-5,-25,-14,0,-13,11,-7,0,-15,-30,-22,-22,10;
MA   /M: SY='V'; M=9,-17,-15,-25,-20,-7,-23,-25,15,-17,2,2,-15,-17,-17,-20,0,11,20,-25,-10,-20;
MA   /M: SY='S'; M=14,0,-15,1,13,-23,-5,-10,-20,-5,-23,-18,3,-7,3,-10,23,8,-13,-33,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-25,0,15,-35,-15,5,-20,5,-22,-5,2,-10,46,5,10,-3,-25,-25,-12,30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,3,-25,6,26,-33,-15,3,-23,5,-22,-10,2,-7,35,3,9,-3,-25,-27,-15,31;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,-12,-25,-17,-8,-14,-22,6,-17,9,2,-19,-19,-17,-20,-4,-2,14,-22,-13,-17;
MA   /M: SY='H'; M=17,-5,-20,-10,0,-25,-10,20,-18,-5,-15,-5,-2,-13,12,-8,2,-8,-15,-23,-7,4;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,11,-31,-20,5,-25,19,-20,-5,0,-15,37,38,-5,-10,-25,-20,-10,21;
MA   /M: SY='F'; M=7,-24,-15,-30,-22,15,-22,-23,10,-22,14,5,-22,-24,-24,-20,-12,-5,15,-16,-1,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-20,-3,5,-25,-10,-3,-23,5,-25,-13,5,-13,17,15,18,5,-17,-30,-15,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-35,-28,15,-22,-18,-15,-18,-15,-15,-35,-30,-18,-18,-35,-25,-25,121,42,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-7,-25,-10,3,-25,-15,-2,-23,15,-18,-7,-2,-15,18,33,-3,-8,-18,-20,-12,8;
MA   /M: SY='G'; M=2,-5,-21,-8,-13,-23,33,-18,-28,-15,-25,-18,2,-15,-13,-15,14,6,-18,-27,-23,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-20,-18,-4,-5,-25,-13,11,-13,15,18,-20,-20,-8,-13,-15,-7,12,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='S'; M=2,3,-16,3,14,-20,-10,-10,-20,-4,-23,-18,5,-7,3,-7,24,19,-13,-35,-18,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=9,6,-20,6,-6,-25,11,-15,-25,-10,-20,-17,2,-13,-10,-15,8,4,-15,-27,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-18,19,-30,28,9,-21,-18,8,-24,0,-19,-15,4,-16,12,-5,-6,-10,-24,-16,10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,5,-27,0,0,-20,-15,26,-27,13,-23,-10,18,-20,7,36,-5,-10,-25,-27,-6,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,27,-28,33,36,-30,-13,2,-30,5,-25,-23,19,-7,10,-3,2,-8,-30,-35,-20,23;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-22,-35,-25,27,-32,-22,21,-30,32,14,-25,-28,-26,-22,-25,-10,12,-12,8,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-7,7,-23,0,-8,-20,10,18,-26,-10,-23,-13,17,-18,-5,-8,4,1,-23,-30,-10,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-25,-22,-30,-25,36,-6,-20,-4,-28,11,0,-18,-28,-30,-20,-18,-12,-5,-5,8,-25;
MA   /M: SY='S'; M=3,-10,-20,-10,-7,-13,-5,-15,-20,-12,-28,-20,-2,-15,-5,-12,21,8,-15,5,-8,-5;
MA   /M: SY='S'; M=11,9,-15,8,-1,-22,-8,-13,-19,-8,-19,-17,4,-10,-5,-13,18,16,-9,-32,-17,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-33,-28,-35,-25,26,-27,-23,4,-27,21,4,-30,-30,-25,-20,-30,-16,-3,34,15,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-33,-15,-5,-17,-23,-15,-12,-6,-7,-7,-18,33,-8,1,-15,-10,-17,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=7,-15,-23,-19,-20,-2,30,-20,-24,-20,-16,-13,-7,-20,-22,-20,-2,-13,-16,-13,-13,-20;
MA   /M: SY='W'; M=2,-20,-28,-23,-10,-10,-18,-15,-8,-12,-2,-3,-20,-20,3,-12,-16,-13,-14,27,1,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-1,-30,6,-1,-19,-20,18,-17,-13,-7,-7,-5,6,-5,-12,-13,-13,-20,-30,-6,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-10,-30,-10,14,-15,-30,-15,11,-10,0,0,-10,-10,0,-15,-10,-10,0,-25,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-16,-20,-12,-15,-13,-17,-6,-1,-8,-5,-12,-18,-9,5,0,-3,6,-22,-15,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00879;
//
ID   RIBOSOMAL_L31_MP; MATRIX.
AC   MP01143;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L31 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3463817; R2=0.0141982; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=238; N_SCORE=7.716; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-25,-1,12,-24,-6,-9,-24,6,-20,-12,-1,-10,7,2,2,2,-20,-21,-15,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-18,-7,-5,-11,-17,-9,-4,-8,-9,-2,5,-13,-6,-9,5,12,-3,-29,-11,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-22,-13,0,-6,-24,-13,-5,0,-6,-3,-10,-17,-5,6,-6,-1,1,-23,-7,-4;
MA   /M: M=-7,-16,-19,-18,-10,-1,-20,-14,-6,-12,-9,-5,-12,-17,-11,-13,-3,-2,-5,0,0,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-16,-7,4,-6,-19,-7,-9,-4,-7,-6,-5,-11,-3,-5,1,9,-6,-19,-3,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,5,-26,10,2,-17,-16,-10,-19,-6,-18,-16,-2,-16,-5,-9,-7,-7,-17,-1,-4,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-25,-10,-14,-22,40,-17,-28,-15,-24,-15,-1,-18,-14,-14,5,-10,-20,-22,-22,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-18,-4,0,-20,-12,-8,-17,7,-20,-10,3,-12,1,2,9,8,-9,-28,-13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-18,-4,11,-17,-19,-13,-13,-4,-10,-10,-4,-8,0,-8,7,16,-7,-28,-14,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-28,-10,-9,-9,0,-3,-21,7,-18,-9,-7,-20,-5,3,-8,-9,-17,-5,13,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,1,-31,8,7,-29,-13,-7,-24,-1,-25,-17,-2,27,0,-7,-3,-8,-25,-30,-21,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-21,-1,7,-13,-21,-10,-8,-6,-5,-7,-6,-14,-2,-8,-2,2,-5,-25,-7,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-15,-31,-24,9,-30,-20,22,-24,22,18,-23,-26,-20,-20,-18,-7,18,-20,1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=0,1,-21,-4,-2,-18,-13,-1,-17,5,-17,-9,6,-14,1,8,3,1,-13,-24,-8,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-13,-32,-25,2,-31,-26,27,-26,25,14,-27,-28,-23,-22,-19,-5,26,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-29,51,31,-36,-13,-1,-36,3,-27,-26,13,-7,6,-7,2,-8,-29,-37,-20,19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-20,-34,-29,-1,-34,-29,37,-24,14,14,-23,-24,-24,-24,-13,-1,36,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-7,0,27,1,-10,-21,-16,-17,-27,-16,-24,-22,-4,-22,-13,-18,5,0,-16,-24,-18,-11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-19,-1,-2,-22,-1,-11,-20,-10,-27,-18,5,8,-4,-13,20,7,-17,-35,-22,-4;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-22,4,4,-23,-5,-8,-23,6,-22,-14,8,-13,0,1,5,0,-17,-28,-16,2;
MA   /M: SY='C'; M=2,-5,36,-12,-13,-19,-13,-17,-21,-17,-23,-18,1,-22,-13,-17,15,7,-9,-42,-23,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-29,-20,-20,-20,-10,-29,-20,-19,86,-10,-20,-9,-7,-29,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-26,-18,-35,-26,53,-24,-20,0,-25,6,-1,-19,-26,-32,-20,-13,-7,3,2,18,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-27,-33,-30,-25,36,-27,-2,-5,-17,-3,-5,-25,-30,-19,-15,-25,-15,-13,57,56,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-12,-13,-12,-9,-22,-21,-4,-12,-7,-7,-2,-11,-11,-12,16,42,3,-29,-9,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-19,-30,67,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-19,0,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-22,0,5,-24,-13,-8,-22,13,-23,-12,3,-12,6,10,7,4,-14,-27,-14,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-26,-4,9,-28,-17,3,-17,6,-14,-3,-3,-13,29,8,-1,-6,-19,-21,-9,19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-25,-5,2,-22,-18,-5,-24,23,-21,-10,4,-15,10,33,-2,2,-18,-23,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-22,-23,-15,5,-26,-16,9,-14,13,9,-15,-22,-11,-12,-16,-7,5,-18,-1,-13;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-16,-24,-19,-5,-25,-21,17,-17,11,10,-19,-22,-14,-17,-8,1,21,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-10,30,-25,39,13,-32,-11,-3,-30,1,-25,-22,15,-11,2,-6,4,-2,-22,-35,-18,7;
MA   /M: SY='T'; M=5,-4,-14,-10,-7,-15,-14,-14,-11,-5,-14,-10,0,-13,-6,-4,14,22,-2,-29,-13,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-26,1,10,-26,13,-6,-29,-5,-21,-16,0,-11,-1,-7,2,-7,-23,-25,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-7,-30,-8,2,-22,-19,3,-29,26,-20,-9,2,-19,15,60,-8,-10,-22,-21,-10,5;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-13,-30,-27,-3,-27,-28,26,-20,10,9,-26,-26,-25,-21,-9,-2,38,-27,-10,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-2,19,-23,28,24,-30,-10,-5,-29,0,-24,-22,8,-7,5,-8,10,-2,-22,-34,-20,14;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-2,7,-27,-18,-6,-29,38,-26,-10,0,-13,11,37,-9,-10,-20,-21,-11,8;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,9,-23,1,0,-19,-13,0,-15,10,-18,-5,18,-17,4,9,-1,-3,-17,-29,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-27,0,8,-28,-14,-4,-27,30,-27,-11,7,-13,13,24,-3,-7,-22,-24,-13,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-25,55,-30,-2,1,-21,7,1,-20,-30,-26,-16,-20,-10,-4,18,51,-25;
MA   /M: SY='G'; M=4,1,-24,-2,-2,-27,26,-11,-29,-8,-25,-17,7,-15,-5,-11,6,-8,-23,-26,-23,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-23,-9,-9,-18,3,-11,-16,-3,-11,-4,-1,-18,-6,-1,-3,-8,-12,-24,-15,-8;
MA   /M: M=-8,-11,-23,-15,-12,-1,-10,-14,-8,-7,-4,-2,-6,-19,-11,-5,-8,-6,-7,-20,-6,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-24,-6,-6,-19,5,-12,-18,-3,-15,-8,-3,-15,-6,-5,-1,-5,-12,-23,-14,-7;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-22,-7,-1,-14,-11,-11,-15,0,-13,-8,-2,-11,-2,-2,1,-1,-12,-23,-11,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-23,-3,-3,-15,-11,-10,-18,8,-18,-10,7,-14,-3,5,0,-1,-14,-25,-11,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00880;
//
ID   RIBOSOMAL_L31E_MP; MATRIX.
AC   MP01144;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L31e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9000635; R2=0.0136292; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=619; N_SCORE=13.327; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-13,0,-30,1,8,-28,-20,-7,-30,44,-28,-11,1,-12,10,37,-10,-10,-20,-21,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-26,-3,23,-10,-21,-8,-12,-1,-8,-5,-7,-9,3,-7,-6,-9,-13,-22,-10,13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,39,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-8,1,-22,-20,-3,-28,33,-21,-9,-1,-18,9,58,-10,-10,-18,-20,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-28,10,21,-30,-12,-3,-28,21,-25,-14,8,-10,14,12,-2,-9,-25,-26,-16,17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-22,-34,-26,60,-27,-8,-4,-26,5,-1,-17,-28,-31,-18,-18,-11,-4,10,29,-25;
MA   /M: SY='V'; M=14,-23,-14,-27,-20,-4,-20,-24,15,-20,14,6,-22,-22,-19,-21,-9,-4,20,-23,-10,-20;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-19,-7,4,-22,-11,-10,-16,6,-17,-7,-4,-11,5,1,6,-1,-9,-26,-15,4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-29,-7,3,-22,-21,-8,-24,34,-18,-7,-3,-16,7,40,-12,-10,-16,-20,-9,3;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-28,-3,4,-20,-20,52,-22,-1,-17,-2,2,-17,11,1,-8,-15,-22,-23,11,4;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,-18,-28,-19,5,-20,-8,12,-14,16,37,-18,-20,-7,-13,-14,-2,7,-19,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-28,-4,0,-29,8,-13,-31,23,-29,-13,0,-13,2,11,-4,-11,-22,-21,-17,1;
MA   /M: SY='T'; M=12,-10,-11,-17,-14,-11,-17,-22,1,-13,-6,-5,-9,-15,-14,-15,11,22,11,-28,-13,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-28,36,23,-33,-14,-3,-31,4,-26,-22,12,-3,6,-4,2,-4,-26,-34,-19,15;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-22,24,17,-25,-12,-4,-24,4,-20,-17,5,0,3,0,1,-3,-19,-26,-15,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=2,-2,-14,-4,4,-13,-10,-6,-8,5,-8,-4,-1,-6,3,3,-1,-2,-6,-14,-8,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-16,-32,-16,-7,-14,-22,-11,-19,19,-18,-8,-10,-20,0,33,-16,-13,-14,9,-2,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-27,3,-34,-27,35,-28,28,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,27,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-28,55,14,-37,-1,-4,-38,-3,-29,-28,16,-11,-3,-12,2,-10,-28,-37,-21,5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-1,-26,-3,-1,-22,-16,-12,-15,-4,-22,-14,3,23,-4,-9,1,5,-17,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-24,3,11,-24,-16,-8,-25,18,-22,-13,1,-11,6,16,3,0,-17,-27,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,32,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-8,36,-19,18,0,-20,0,8,-20,-1,-30,-20,54,-19,0,-1,13,2,-28,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-28,14,34,-29,-18,-3,-28,19,-23,-16,4,-6,16,8,-1,-6,-25,-28,-16,25;
MA   /M: SY='K'; M=4,-8,-19,-11,0,-11,-17,-6,-16,6,-12,-7,-7,-14,-2,-1,-4,-4,-11,-17,-3,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-23,-35,-27,1,-34,-28,38,-27,22,17,-24,-24,-22,-26,-18,-7,30,-22,-3,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=2,4,-21,5,21,-25,-11,-4,-24,7,-24,-17,4,-7,8,0,13,1,-19,-31,-17,14;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,6,-24,-20,-2,-30,33,-22,-10,0,-16,12,55,-9,-10,-21,-20,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,60,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,6,-14,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-19,-26,-19,-8,-29,-19,15,-10,4,5,-12,-22,-12,0,-13,-8,12,-24,-7,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-28,5,24,-27,-17,-1,-28,20,-22,-14,5,-10,15,24,-3,-9,-24,-25,-15,18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,9,-26,4,3,-26,-4,0,-27,22,-29,-14,16,-14,4,12,1,-6,-23,-27,-14,3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-26,-21,-15,-14,-26,-25,8,-16,-8,-3,-22,27,-18,-21,-10,-3,8,-29,-18,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-39,-9,2,-30,-19,-19,-20,-9,-29,-20,-19,84,-9,-19,-9,-10,-29,-30,-29,-8;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-11,-19,-14,-10,0,-13,-6,-13,-7,-11,-9,-6,-14,-8,-1,4,4,-9,-17,2,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-29,-5,4,-24,-19,-5,-30,36,-25,-10,0,-15,10,50,-8,-9,-20,-21,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-33,-26,3,-32,-24,32,-25,26,20,-26,-26,-22,-22,-20,-7,29,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-27,-6,1,-21,-17,-1,-28,26,-23,-12,5,-18,8,53,-3,-6,-20,-23,-12,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,18,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-29,-9,1,-22,-20,-2,-23,29,-20,-7,-2,-16,6,40,-10,-10,-15,-21,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=9,-25,-16,-30,-23,-3,-25,-26,22,-21,15,9,-23,-23,-21,-22,-11,-4,26,-24,-9,-23;
MA   /M: SY='V'; M=7,-14,-16,-16,-12,-13,-12,-19,3,-13,-9,-4,-9,-17,-11,-14,8,3,10,-29,-14,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-28,-8,0,-22,-21,-9,-20,29,-20,-7,-3,-16,5,37,-8,-8,-11,-22,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00881;
//
ID   RIBOSOMAL_L34E_MP; MATRIX.
AC   MP01145;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L34e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7399850; R2=0.0160344; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=352; N_SCORE=11.374; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=48; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=13,-18,-10,-23,-18,-6,-15,-18,12,-13,5,11,-18,-18,-15,-15,-5,-2,21,-21,-10,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-26,0,15,-33,-17,5,-19,16,-19,-2,0,-9,43,12,-2,-9,-24,-17,-9,29; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-28,-5,-3,-21,-4,-1,-30,18,-23,-13,10,-20,4,45,-5,-10,-23,-23,-15,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,4,-30,-26,1,-30,-26,18,-25,22,10,-29,-31,-26,-21,-18,-5,26,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,6,-19,-17,-7,-24,-23,-3,-17,1,-4,-12,-20,-17,-16,4,25,6,-31,-11,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-28,-24,24,-32,-3,15,-19,10,7,-22,-28,-19,-17,-19,-9,8,7,41,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-24,-18,-10,-11,-21,8,-6,6,-2,20,-9,-21,3,24,-14,-10,-4,-22,-3,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-14,-30,-11,-3,-22,-19,-11,-18,8,-20,-8,-10,20,-2,16,-7,-7,-15,-26,-17,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-26,-6,0,-22,-7,-5,-27,16,-22,-13,3,-16,4,34,-1,-5,-19,-23,-15,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-29,-14,-7,-17,-20,-6,-8,-15,-6,-6,-14,28,-10,-17,-11,-9,-14,-27,-15,-12;
MA   /M: SY='S'; M=7,-7,-19,-10,-5,-20,-4,-5,-18,-4,-18,-8,-2,-7,1,-1,9,3,-12,-27,-15,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-20,-17,23,-29,14,1,-11,5,3,-20,-29,-7,-10,-20,-10,-9,20,63,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,5,-25,-1,0,-21,-12,0,-25,19,-23,-13,16,-18,5,36,-2,-6,-21,-26,-14,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-27,-9,-1,-21,-13,-6,-28,24,-21,-11,0,-17,5,47,-6,-4,-18,-21,-12,-1;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-12,6,-17,-5,-12,1,-14,-1,-9,-11,-9,-9,17,-25,-11,-9,-7,-6,-15,-11,4,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,5,-25,-20,-2,-29,34,-23,-9,0,-16,15,52,-9,-10,-21,-20,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-26,-10,-2,-18,-21,4,-21,17,-17,-7,0,-17,5,37,-5,0,-14,-23,-6,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-25,-19,-12,-13,-26,-14,0,9,-6,1,-11,-21,-6,24,-12,-8,7,-22,-8,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-25,-24,-19,13,-30,-4,9,-10,4,5,-18,-25,-15,-11,-17,-9,6,-4,25,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-16,-22,-19,-7,-26,-22,13,-7,-1,3,-18,-23,-17,-4,-6,1,25,-28,-10,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-5,-12,-14,-12,-6,-22,-20,-5,-14,1,-5,-5,-14,-12,-12,11,39,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,51,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,11,-9,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-5,-16,-28,57,-15,-36,-16,-30,-20,11,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-27,-4,2,-23,-18,-5,-23,28,-23,-10,6,-15,6,35,-4,-7,-17,-24,-11,2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-18,-23,-18,-2,-26,-22,14,-21,14,6,-15,-20,-15,-18,-4,11,12,-26,-6,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-21,-13,-23,-21,-5,-26,-23,12,-10,1,3,-19,-24,-19,-3,-4,8,29,-28,-10,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-17,-25,-24,-21,6,-28,-8,18,-17,4,5,-11,-23,-14,-18,-12,-4,9,-7,22,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-8,-28,-8,-1,-17,-22,48,-17,-7,-4,4,-2,-21,12,4,-13,-15,-20,-25,7,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-15,-27,-17,-15,18,-26,23,-9,-8,-5,-2,-11,-25,-8,-1,-13,-5,-12,6,46,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-22,-5,14,-16,-24,-13,-5,-2,-8,-7,-8,-12,-1,-4,-2,3,-1,-28,-13,6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-26,-11,-2,-18,-22,0,-14,14,-8,-1,-6,-17,3,16,-11,-8,-10,-22,-5,-1;
MA   /M: SY='P'; M=3,-2,-26,-2,-3,-26,4,-13,-24,-6,-26,-18,2,15,-7,-10,3,-6,-22,-28,-24,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-21,3,-2,-23,2,-10,-25,5,-26,-16,13,-13,-3,0,10,8,-18,-30,-17,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-28,-21,-14,-15,-16,-20,1,-2,-9,-2,-13,-10,-10,-3,-12,-10,0,-14,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=8,-14,-29,-12,-3,-25,-13,-2,-18,-10,-22,-14,-12,41,-7,-17,-3,-8,-20,-27,-19,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00882;
//
ID   UPF0033_MP; MATRIX.
AC   MP01148;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0033 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0239501; R2=0.0146857; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=589; N_SCORE=13.671; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-20,-29,-20,0,-20,-1,19,-10,19,57,-19,-20,0,-10,-18,-7,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-15,-4,2,-14,-11,-8,-12,2,-12,-5,1,-5,0,1,5,9,-8,-21,-11,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-10,15,-21,16,7,-18,-11,-1,-16,0,-14,-6,11,-11,5,-3,-1,-4,-16,-24,-10,6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-20,-22,-16,2,-25,-11,17,-17,9,10,-14,-19,-13,-16,-12,-5,13,-17,4,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-23,-4,1,-19,-18,-7,-10,8,-13,-1,-1,-9,4,2,-3,-2,-9,-25,-10,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-14,-17,-15,-9,-15,-17,-17,-2,-7,-9,-2,-12,3,-11,-13,-3,-2,3,-26,-16,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='B'; M=-10,20,-22,20,2,-22,-13,-5,-17,-1,-18,-11,14,-13,-2,-6,3,5,-15,-32,-14,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-28,-8,3,-16,-21,4,-13,10,-14,-4,-6,-15,4,7,-9,-10,-11,-17,2,2;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-11,-19,-16,-10,-13,-25,-17,3,-4,-5,0,-9,-17,-4,-5,0,12,8,-26,-9,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-30,-21,9,-30,-21,22,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,45,-28,57,20,-36,-9,2,-36,1,-29,-27,25,-11,2,-7,2,-8,-30,-39,-20,11;
MA   /M: SY='A'; M=17,-19,-8,-25,-18,-8,-17,-22,7,-17,7,4,-18,-20,-17,-20,-4,1,13,-24,-12,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-13,-22,-16,-9,-11,-25,-16,0,-2,-2,0,-10,-18,-5,5,-5,4,4,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-11,-19,-28,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-19,2,-15,-26,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-21,-15,-4,-4,-23,-14,4,-19,24,7,-18,-22,-7,-14,-15,-7,-1,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-24,-14,-9,-8,-20,-6,-11,6,-12,-6,-6,-16,-4,19,-6,-5,-6,-17,1,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-9,-26,-7,13,-6,-15,-9,-8,-8,-3,-2,-11,-14,-3,-11,-9,-10,-9,-20,-6,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-29,-20,-20,-20,-10,-29,-20,-19,85,-10,-20,-9,-7,-29,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-17,-28,-25,4,-30,-26,25,-23,19,11,-25,-27,-25,-21,-16,-5,30,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-19,-31,-24,5,-26,-13,24,-18,22,37,-24,-24,-13,-16,-19,-8,20,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-9,-23,-11,6,-14,-20,-6,-5,2,-2,11,-10,-14,3,2,-8,-7,-6,-24,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=8,-16,-13,-22,-18,-6,-21,-22,9,-16,6,4,-15,-18,-16,-17,0,13,15,-25,-9,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-29,-9,0,-20,-22,1,-19,24,-17,-5,-2,-16,5,32,-10,-10,-14,-22,-6,0;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-27,-2,10,-26,-18,-8,-23,29,-21,-7,-1,-11,10,17,-6,-8,-17,-22,-11,10;
MA   /M: SY='A'; M=20,-3,-14,-12,-6,-18,-10,-10,-14,-2,-14,-10,-1,-11,-5,-7,9,12,-6,-24,-14,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-32,-24,5,-31,-18,28,-24,29,25,-25,-26,-17,-20,-22,-9,20,-19,2,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,-1,10,-25,-17,-4,-27,24,-22,-12,0,-9,10,34,-6,-9,-21,-23,-14,7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-28,18,21,-29,-15,9,-27,11,-24,-14,13,-11,18,5,-1,-8,-27,-29,-12,19;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-23,-19,-29,-20,2,-23,-11,18,-18,27,35,-23,-23,-10,-15,-19,-8,11,-21,-2,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-26,7,17,-28,-16,-7,-22,14,-21,-13,1,-5,9,4,-3,-8,-18,-26,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-22,5,8,-24,-15,-11,-16,3,-19,-13,-3,-5,2,-4,4,-2,-9,-30,-17,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,60,-16,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,24,41,-33,-10,-1,-31,6,-23,-19,4,-5,18,-2,0,-11,-30,-30,-20,29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-18,-21,-20,-9,-7,-29,-21,16,-12,6,6,-17,-19,-13,-14,-10,0,17,-26,-8,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-29,43,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-10,-23,-8,9,-11,-23,-10,-7,-1,4,2,-12,-16,-1,-2,-10,-6,-6,-24,-9,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,36,-24,17,14,-26,-26,-26,-24,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-24,-26,-27,-17,0,-31,-14,20,-20,18,11,-20,-23,-14,-18,-20,-9,12,-14,3,-18;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,-10,-19,-12,-11,-6,-19,-6,-15,-8,-8,-8,-15,-12,-19,9,2,0,-24,-15,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-22,38,8,-28,-12,-6,-28,-4,-24,-23,16,-11,-3,-9,9,10,-20,-37,-17,3;
MA   /M: SY='D'; M=-18,30,-14,43,8,-29,-15,2,-31,-6,-21,-22,9,-16,-5,-12,-5,-10,-24,-34,-11,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-33,-4,10,-28,-15,-15,-22,-1,-26,-18,-11,47,-3,-11,-4,-5,-25,-29,-24,1;
MA   /M: SY='S'; M=12,-7,-19,-8,-5,-24,11,-13,-21,-10,-23,-13,-1,-4,-1,-13,15,0,-15,-28,-21,-4;
MA   /M: SY='T'; M=17,-4,-10,-12,-9,-12,-10,-18,-12,-11,-13,-12,-2,-11,-9,-14,19,26,-2,-27,-14,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-20,-12,-4,-15,-21,-16,-8,3,-9,-4,-8,-10,-5,1,0,10,-1,-25,-11,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-27,-1,12,-23,-13,-2,-28,20,-23,-14,5,-14,9,35,-2,-7,-22,-25,-14,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00884;
//
ID   PSI_RSU_MP; MATRIX.
AC   MP01149;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rsu family of pseudouridine synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2428813; R2=0.0151796; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; N_SCORE=10.348; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=83; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-24,-18,-11,-3,-26,-17,6,-13,8,3,-14,-13,-11,-11,-12,-3,2,-20,-3,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-19,-9,-9,-5,-22,-9,-2,-12,-2,-4,-4,-18,-8,-11,0,12,-1,-20,4,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-22,-18,-3,3,-26,-16,9,-18,19,6,-18,-15,-11,-15,-17,-9,2,-19,-3,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=0,-12,-17,-14,-7,-5,-17,-12,-7,-2,-3,-3,-9,-16,-4,1,-2,1,-2,-19,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,16,-26,26,10,-25,-12,-7,-21,-3,-14,-15,3,-3,-3,-8,-5,-9,-18,-29,-16,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-11,-23,-11,5,17,-23,-2,-9,-8,-2,-5,-11,-17,-9,-8,-11,-9,-9,-7,12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-28,-6,-3,-17,-19,-11,-9,3,-13,-6,-1,-6,-1,2,-8,-8,-11,-24,-11,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-26,-16,-11,-11,-20,-9,-1,-9,4,3,-12,-3,-10,-8,-15,-10,-5,-25,-9,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-25,-15,-10,-11,-17,-14,-6,-10,-11,-7,-12,10,-9,-10,-3,-2,-7,-21,-7,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-28,-3,6,-24,-11,-8,-24,8,-23,-14,-4,7,2,0,-4,-9,-21,-19,-15,3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,6,-30,10,8,-27,-12,11,-32,17,-24,-14,7,-15,8,28,-6,-12,-25,-26,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-31,-24,-33,-26,12,-29,-26,16,-25,18,7,-29,-26,-24,-21,-23,-10,15,8,4,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-20,-25,-25,-20,22,-27,12,3,-19,1,3,-13,-24,-16,-15,-15,-11,-2,-2,29,-20;
MA   /M: SY='P'; M=5,-11,-25,-11,-5,-17,-12,-12,-14,-12,-21,-14,-7,27,-9,-17,5,-2,-15,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='V'; M=16,-22,-16,-28,-22,-8,-18,-26,18,-19,4,4,-19,-20,-20,-23,-5,-3,23,-23,-12,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-24,-22,-15,5,-26,-8,2,-5,0,2,-14,-23,-10,2,-14,-8,3,-13,7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,39,-25,43,10,-31,-6,1,-30,1,-28,-24,29,-13,-1,-6,4,-6,-27,-37,-20,5;
MA   /M: SY='T'; M=7,0,-10,-5,-5,-16,-9,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,32,-5,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-21,7,29,-24,-18,-6,-23,4,-19,-16,1,-6,12,0,9,8,-19,-30,-17,20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-30,-21,10,-29,-21,19,-28,43,17,-29,-29,-21,-20,-26,-9,13,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-20,24,-27,39,22,-28,-28,-19,-20,-25,-9,17,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,13,-31,-21,21,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-19,1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23,22,-31,-20,19,-29,39,18,-27,-29,-23,-21,-27,-10,10,-14,6,-22;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-11,37,-21,30,5,-25,-5,3,-25,-2,-28,-22,40,-16,-1,-4,9,3,-26,-39,-19,2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-26,50,14,-34,-8,7,-34,-2,-29,-25,23,-12,1,-8,6,-6,-27,-39,-17,7;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,61,-19,-39,-13,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-27,10,24,-29,-17,-4,-22,8,-19,-12,2,-6,17,1,-1,-7,-21,-26,-16,20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-32,-24,-33,-24,14,-29,-23,14,-27,31,11,-31,-30,-22,-20,-29,-12,7,9,6,-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-9,-14,-14,-6,-20,-9,-15,-7,-8,-12,-7,-8,-13,1,-13,10,3,1,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-7,9,-23,2,-2,-18,-11,35,-21,-4,-20,-9,21,-19,2,2,2,-7,-22,-30,-2,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-28,-5,4,-23,-17,-3,-28,26,-21,-11,0,-16,10,45,-7,-9,-19,-21,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-23,10,-32,-22,27,-29,39,20,-27,-27,-21,-22,-26,-10,16,-19,1,-23;
MA   /M: SY='M'; M=0,-12,-16,-20,-12,-6,-20,-13,5,-13,8,16,-12,-16,-7,-13,-2,14,4,-24,-7,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-25,0,0,-20,-18,49,-22,-7,-15,-4,4,-18,8,1,-3,-10,-20,-30,4,1;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-19,-19,-8,-26,-18,-17,69,-9,-16,-7,-8,-25,-28,-27,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-6,2,-25,4,5,-26,-4,-7,-29,16,-27,-15,4,-13,5,18,4,-4,-20,-27,-16,4;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-6,-24,-9,-7,-1,-18,19,-15,-9,-11,-5,1,-21,-1,-3,-4,-7,-16,-13,11,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-28,9,20,-28,-17,10,-29,20,-24,-13,6,-10,12,14,-4,-10,-25,-26,-10,15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00885;
//
ID   COMPLEX1_20K_MP; MATRIX.
AC   MP01150;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3404732; R2=0.0125354; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1135; N_SCORE=18.558; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-19,-2,-9,-12,-11,-6,-2,-11,-12,-8,22,-20,-7,-10,6,2,-6,-34,-14,-9;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-18,-7,-10,-22,24,-16,-25,-14,-26,-18,3,-14,-10,-15,20,8,-15,-29,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-22,-27,-28,-21,7,-28,-3,19,-15,10,26,-20,-15,-9,-16,-19,-10,6,-6,21,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26,60,-30,-4,0,-22,6,0,-20,-30,-28,-16,-20,-10,-4,18,50,-26;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-10,5,-20,3,1,-17,-11,44,-22,-1,-20,-6,14,-14,5,1,2,-7,-21,-26,2,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,13,-26,21,7,-7,-16,0,-21,-5,-15,-16,1,-6,-5,-10,-7,-9,-19,-15,6,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-17,-9,-9,-13,-4,-13,-7,-15,-10,-8,5,-16,-8,-14,12,7,-6,-31,-15,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-26,-17,-17,25,-27,16,-1,-9,-1,-1,-17,-26,-9,-9,-16,-5,-8,23,67,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=17,-4,-3,-8,-6,-19,-5,-4,-18,-11,-21,-15,2,-13,-5,-13,22,10,-8,-33,-16,-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-24,-13,-28,-26,-3,-28,-28,24,-19,7,7,-23,-24,-24,-20,-5,7,36,-28,-9,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-32,-18,-32,-28,4,-28,-28,20,-22,14,7,-32,-30,-26,-20,-19,-7,30,0,-2,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-30,-6,2,-29,2,-3,-29,13,-23,-9,0,-16,18,26,-4,-12,-26,-20,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-8,-19,-29,65,-18,-39,-19,-30,-20,4,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-22,28,-26,-26,-8,-27,-28,5,-21,-4,-3,-22,-30,-26,-21,-4,2,24,-37,-17,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,66,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-27,-4,4,-24,-19,-1,-28,31,-25,-10,1,-14,8,34,-4,-3,-18,-23,-9,4;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-20,-34,-27,8,-31,-27,29,-25,18,12,-23,-25,-24,-24,-16,-6,27,-20,-1,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,40,-26,18,16,-24,-24,-24,-26,-17,-6,36,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-16,-32,-27,5,-29,-26,28,-22,11,13,-24,-25,-24,-22,-12,-4,33,-22,-4,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-33,-22,-19,19,-27,5,-5,-7,-3,-3,-22,-28,-11,-9,-23,-14,-13,43,57,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-14,-36,-29,0,-36,-29,36,-28,20,15,-23,-25,-22,-27,-19,-8,28,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-29,63,-19,-39,-16,-29,-19,0,-20,-18,-13,-1,-19,-29,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-20,-8,-3,-17,-18,-10,-20,11,-17,-11,1,-14,0,25,7,19,-10,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=8,-17,-31,-13,-3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17,61,-10,-20,-4,-7,-21,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='E'; M=1,5,-25,10,41,-28,-15,-3,-25,5,-19,-17,-1,-3,16,-3,5,-6,-23,-29,-19,29;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-14,-14,-4,-20,2,-16,-13,-9,-12,-8,-7,-10,-6,-17,9,-1,-5,-23,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-21,-28,-21,7,-30,-18,20,-24,28,13,-22,-25,-18,-19,-18,0,12,-17,7,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-36,-27,13,-35,-25,33,-28,25,18,-23,-25,-23,-25,-21,-9,22,-17,3,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-3,-28,-1,-2,9,-24,26,-16,-9,-10,-6,-5,-21,-3,-8,-12,-12,-18,-4,31,-5;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-8,-15,-16,-24,28,-21,-26,-16,-20,-16,-5,-17,-16,-20,5,-5,-15,-24,-25,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-34,-26,30,-28,25,15,-25,-26,-25,-24,-21,-8,24,-17,3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-19,-25,-17,-2,-23,-7,11,-20,22,18,-18,-22,-12,-17,-15,-4,6,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-8,-25,-9,2,-22,-22,-7,-10,11,-8,4,-8,-15,16,6,-7,-4,-9,-22,-8,9;
MA   /M: SY='L'; M=0,-27,-18,-28,-19,4,-25,-21,16,-26,37,14,-27,-27,-19,-20,-22,-8,12,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-7,-27,-8,7,-26,-20,7,-15,4,-8,1,-5,-15,31,11,-6,-10,-20,-21,-8,18;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-31,-1,9,-29,-6,-10,-31,27,-28,-13,-2,-2,5,19,-7,-12,-23,-22,-16,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00858;
//
ID   FIMBRIAL_USHER_MP; MATRIX.
AC   MP01151;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fimbrial biogenesis outer membrane usher protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7308450; R2=0.0170216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=542; N_SCORE=14.947; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-28,-7,3,-21,-21,-4,-21,23,-16,-6,-1,-17,10,36,-9,-8,-16,-22,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-13,-31,-29,0,-30,-29,30,-21,13,11,-28,-28,-27,-21,-12,-2,43,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-17,-1,11,-17,-19,-14,-16,-2,-14,-13,-1,-8,-1,-6,13,26,-8,-30,-14,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-35,-29,4,-34,-29,37,-25,16,14,-25,-26,-26,-24,-16,-5,37,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-23,-8,0,-12,-18,-7,-19,11,-15,-9,-2,-16,1,21,1,3,-13,-22,-6,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-1,-30,-1,18,-38,-20,9,-21,12,-20,-1,0,-11,56,15,-1,-10,-29,-20,-10,37;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-22,17,1,-24,3,3,-22,-2,-26,-16,36,-17,3,-4,6,-4,-26,-34,-19,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-28,-8,-18,-29,62,-18,-38,-18,-30,-20,4,-20,-18,-18,2,-17,-29,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-25,-19,-17,13,-26,2,-2,-4,-3,-1,-14,-27,-11,6,-14,-7,0,2,33,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-18,-22,-16,-3,-27,-22,14,-16,15,7,-20,-22,-17,-15,-12,1,17,-25,-7,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,23,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,31,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-28,-15,-13,16,-26,26,-7,-10,-5,-1,-12,-26,-3,-8,-13,-9,-13,10,53,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,7,-22,7,14,-29,-11,1,-22,2,-25,-13,10,-10,25,2,15,2,-23,-31,-16,20;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-21,1,11,-21,-17,-11,-17,3,-18,-12,2,-9,4,-1,11,12,-12,-30,-14,7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-11,-19,-17,-13,-2,-23,-12,5,-12,6,6,-9,-20,-9,-12,-6,6,4,-21,0,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,12,10,-30,-30,-30,-20,-11,0,48,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-33,-8,0,-28,-15,-17,-20,-9,-29,-19,-13,64,-6,-17,1,-4,-25,-31,-27,-7;
MA   /M: SY='P'; M=7,-16,-30,-12,-3,-27,-13,-19,-17,-10,-25,-17,-15,56,-9,-19,-1,-5,-21,-28,-27,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=6,-14,-31,-9,-2,-28,-14,-19,-18,-10,-25,-18,-16,59,-10,-20,-4,-7,-22,-28,-27,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30,78,-30,-18,0,-29,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,11,32,-30;
MA   /M: SY='E'; M=6,-3,-19,-3,12,-20,-15,-6,-14,-3,-14,-11,-3,-10,3,-6,7,4,-9,-28,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-2,15,-19,10,2,-23,-10,-5,-19,-4,-22,-16,17,-7,4,-6,12,12,-18,-33,-17,2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,47,-28,60,16,-36,-9,5,-37,0,-30,-27,26,-12,0,-8,1,-9,-30,-40,-19,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-24,10,-31,-20,23,-26,31,15,-28,-29,-22,-20,-23,-7,20,-17,5,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-10,-29,-9,-7,-9,-17,-2,-12,-7,-15,-9,-7,6,-4,-6,-6,-7,-17,-15,4,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-25,-11,-8,-16,-15,-16,-6,-15,-5,-7,-11,13,-11,-16,-6,-5,-8,-29,-17,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=9,-4,-12,-8,-7,-15,-2,-14,-14,-8,-17,-12,1,-11,-6,-8,19,17,-5,-28,-15,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-23,-12,-16,-17,22,-13,-17,-16,-17,-11,-2,-20,-15,-15,2,-8,-10,-23,-15,-16;
MA   /M: SY='S'; M=-5,0,-22,-3,-5,-14,1,-1,-20,-5,-22,-13,8,-17,1,-2,10,2,-18,-21,-2,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,3,-15,0,-6,-18,19,-7,-21,-9,-23,-16,13,-12,-6,-9,15,1,-16,-25,-18,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-25,-8,-15,-27,52,-18,-35,-17,-29,-20,2,-17,-15,-18,9,-10,-25,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-29,50,22,-36,-13,-1,-35,2,-26,-25,14,-9,6,-4,1,-6,-28,-36,-18,14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,48,19,-30,-30,-21,-20,-29,-9,12,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,7,-25,9,6,-20,-19,6,-17,1,-15,-9,3,-15,6,0,-3,-3,-14,-25,-3,5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-12,-30,-29,0,-29,-27,30,-19,11,15,-29,-29,-27,-19,-11,-1,45,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-20,-8,-1,-15,-20,-14,-12,3,-14,-9,-1,-13,-3,3,5,16,-6,-22,-10,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,16,14,-26,-26,-26,-24,-15,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-24,-2,8,-18,-23,-3,-11,2,-8,-5,-5,-13,4,-2,-5,0,-9,-26,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-30,22,41,-31,-3,-3,-33,4,-23,-21,3,-5,10,-5,0,-12,-30,-30,-22,26;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00886;
//
ID   HESB_MP; MATRIX.
AC   MP01152;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hypothetical hesB/yadR/yfhF family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3604922; R2=0.0108256; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=632; N_SCORE=11.192; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=198; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-11,6,-25,5,2,-13,-18,3,-10,-8,-8,-8,7,-17,-3,-7,-5,-6,-13,-26,-4,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,59,-15,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='T'; M=4,-14,-10,-20,-17,-10,-12,-20,2,-17,-1,1,-11,-18,-14,-17,3,9,7,-27,-12,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-21,-2,10,-21,-19,-6,-17,7,-16,-9,-2,-11,6,5,4,7,-10,-28,-12,8;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-33,-26,3,-32,-23,33,-25,27,23,-25,-25,-20,-22,-21,-8,26,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,64,20,-38,-11,-1,-38,0,-28,-28,18,-10,0,-10,1,-7,-28,-39,-19,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-25,-31,-25,55,-30,-2,-1,-21,5,-1,-21,-30,-26,-15,-21,-11,-5,23,53,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-18,-13,-22,-19,-6,-23,-24,12,-14,1,2,-16,-21,-18,-14,1,11,24,-29,-10,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-26,17,24,-28,-16,-3,-26,12,-22,-16,9,-9,11,4,1,-4,-23,-30,-16,17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,14,-24,18,19,-27,-1,-6,-28,-2,-24,-20,10,-9,2,-8,7,-1,-23,-32,-20,11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-22,-19,-16,-3,-12,-17,3,-18,17,7,-14,-22,-15,-15,-17,-9,0,-22,-8,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-15,-25,-16,-5,-5,-24,-16,11,-17,14,10,-15,-18,-9,-17,-15,-8,3,-23,-6,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,5,-25,1,-5,-26,26,-9,-30,-5,-28,-18,14,-17,-5,-4,7,-8,-25,-28,-23,-6;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-18,-3,1,-21,6,-9,-22,-6,-25,-16,3,-12,1,-9,19,5,-15,-28,-15,1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-8,-26,-8,-8,-23,22,-13,-25,-6,-23,-14,-1,-17,-7,-6,4,-8,-18,-22,-17,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-23,-10,-4,-19,-23,-13,-7,11,-13,-3,-4,-15,3,7,-3,4,-3,-24,-9,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,-19,-35,-27,49,-30,-20,11,-27,14,5,-21,-27,-31,-20,-19,-8,10,0,20,-27; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-17,5,-3,-16,-14,-2,-14,-6,-17,-12,10,-16,-3,-6,7,5,-12,-30,-8,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-11,38,-21,19,0,-20,-1,15,-21,-1,-29,-19,57,-20,1,0,9,-1,-30,-39,-18,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-10,-2,-28,-15,-20,-20,-11,-28,-19,-17,75,-11,-19,-7,-5,-27,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-22,12,3,-23,-6,6,-22,9,-28,-16,40,-17,7,9,7,-2,-27,-34,-17,5;
MA   /M: SY='A'; M=31,-15,-14,-22,-12,-14,-10,-21,1,-14,-1,-3,-13,-14,-12,-20,3,-1,7,-22,-15,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-24,-3,6,-25,-17,-10,-22,23,-22,-10,0,-10,8,14,1,3,-15,-24,-12,7;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-21,2,2,-26,4,-5,-23,-3,-24,-14,10,-13,6,-6,11,2,-20,-29,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-16,-7,-4,-6,-10,-13,-14,-8,-16,-12,3,-14,-7,-9,13,16,-8,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-26,-10,-17,-28,56,-19,-35,-18,-29,-19,0,-18,-17,-19,6,-14,-25,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-28,-8,-18,-29,63,-18,-38,-19,-30,-20,3,-19,-18,-19,3,-17,-29,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-22,6,15,-23,-14,-7,-20,9,-20,-13,5,-11,5,2,6,-1,-16,-31,-16,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-15,4,1,-23,2,-4,-23,-7,-24,-14,8,-13,-1,-8,15,1,-17,-33,-18,0;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-15,-28,-23,-1,-26,-26,19,-20,4,5,-20,-15,-22,-21,-8,0,23,-24,-8,-24; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-23,8,12,-23,-1,-5,-23,1,-19,-15,12,-12,1,-4,3,-4,-21,-28,-18,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,5,-19,3,-4,-12,-14,-7,-8,-7,-1,-3,6,-18,-6,-7,-2,0,-9,-29,-11,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='C'; M=-9,6,20,4,8,-21,-18,-10,-24,-7,-19,-18,3,-16,-4,-11,1,0,-17,-35,-20,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-17,-4,1,-21,-9,-12,-19,8,-23,-13,0,0,0,0,13,7,-12,-26,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,7,-22,4,3,-22,2,-6,-21,-6,-26,-18,15,9,-3,-9,9,-1,-23,-31,-21,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=11,-12,-17,-15,-4,-11,-14,-14,-6,-3,4,-1,-12,-15,-6,-3,-7,-5,-3,-19,-10,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=1,-8,-24,-8,-4,-22,1,-15,-20,0,-21,-13,-7,17,-7,-7,-1,-2,-17,-21,-19,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=9,-9,-15,-10,2,-17,-15,-12,-2,-5,-6,-3,-11,-13,3,-9,0,-3,4,-22,-13,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-26,-2,7,-24,-3,-12,-21,-7,-24,-17,-6,32,-3,-12,3,-5,-22,-26,-22,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='C'; M=0,-17,73,-25,-22,-20,-23,-24,-26,-18,-18,-17,-15,-31,-20,-14,-6,-8,-9,-40,-25,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-14,4,13,-22,-4,-8,-22,-6,-28,-20,8,-8,4,-8,31,14,-14,-38,-20,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00887;
//
ID   NOL1_NOP2_SUN_MP; MATRIX.
AC   MP01153;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NOL1/NOP2/sun family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0671329; R2=0.0148145; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=369; N_SCORE=10.524; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=97; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,7,-6,8,-21,-15,-15,-20,-8,-17,-16,-5,-12,-4,-13,9,8,-12,-32,-20,2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-12,-15,-16,-13,7,-5,-4,-4,-10,-2,2,-10,-15,-10,-11,-6,-6,-4,-1,12,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-25,48,12,-28,-11,-2,-27,-4,-16,-20,11,-11,-2,-10,-4,-9,-21,-32,-15,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-19,-19,-13,-14,1,-16,-4,-14,-2,1,-12,-5,-11,-17,-4,-7,-3,-19,-15,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-24,-7,-1,-18,-14,-1,-24,20,-18,-10,5,-17,6,47,-5,-7,-17,-20,-11,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: M=-5,-4,-23,-4,-3,-12,-10,-12,-12,-1,-10,-7,-4,-18,-6,-5,-6,-8,-6,-23,-10,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-24,0,-7,4,-20,9,-17,-12,-12,-10,-2,-12,-11,-12,-5,-2,-14,-16,9,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-7,-29,-3,-5,-23,13,-16,-23,-9,-13,-12,-7,-3,-11,-12,-9,-14,-21,-24,-20,-9;
MA   /M: SY='E'; M=1,7,-22,6,10,-25,-12,-7,-23,8,-21,-15,6,-10,6,6,6,2,-17,-28,-16,7;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-16,-25,-17,-12,-7,-18,-2,-10,-11,-14,-8,-13,-20,-4,-11,-4,-4,-9,16,9,-8;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-22,-29,-24,-18,0,-23,-22,-1,-18,-5,-6,-19,-2,-18,-18,-16,-6,-4,13,-2,-18;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-26,14,8,-27,0,-7,-25,1,-22,-16,1,10,1,-5,-3,-9,-23,-23,-17,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-22,-2,-7,-12,14,-14,-18,-13,-15,-12,-1,-18,-15,-14,-3,-10,-10,-22,-15,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-8,-25,-5,13,-15,-21,-9,-8,0,-2,-4,-9,-1,1,0,-10,-9,-11,-21,-11,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-24,-12,-5,-9,-10,-10,-11,-1,-8,0,-10,1,0,-4,-10,-10,-13,-15,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30,71,-30,-21,3,-29,10,1,-21,-30,-39,-20,-19,-9,5,6,26,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,66,20,-40,-11,1,-39,1,-29,-28,19,-10,4,-9,0,-10,-30,-39,-19,12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-27,-11,-1,-21,-17,-4,-27,25,-19,-10,-2,-17,7,50,-7,-8,-17,-20,-12,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-28,-22,-35,-28,-2,-33,-29,38,-25,14,14,-22,-22,-22,-26,-14,-6,32,-23,-5,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-27,-7,-29,-21,3,-27,-22,15,-26,32,12,-27,-29,-21,-21,-21,-7,14,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-16,-10,-23,-16,-14,-8,-23,1,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,14,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-33,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-9,5,-19,3,-2,-7,-19,-12,-11,-11,-2,-8,2,-16,-9,-11,1,13,-8,-28,-9,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-30,-13,-21,-27,58,-21,-30,-21,-25,-16,-2,-20,-20,-21,-2,-19,-24,-20,-27,-21;
MA   /M: SY='V'; M=4,-20,-12,-24,-22,-5,-25,-26,17,-17,3,3,-18,-21,-21,-18,-1,13,29,-28,-10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-23,-31,-23,7,-32,-23,25,-18,18,16,-22,-24,-19,-17,-19,-8,19,-19,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-2,-28,0,1,-23,-12,9,-31,16,-23,-12,4,-18,6,42,-4,-9,-22,-25,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='N'; M=-14,25,-26,22,7,-27,-10,17,-27,6,-27,-16,29,-16,9,8,1,-7,-28,-33,-12,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-35,-14,-4,-24,-23,-18,-11,-7,-20,-12,-17,52,-6,-10,-10,-9,-17,-27,-22,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,30,-23,35,14,-31,-7,-2,-29,-1,-25,-23,19,-11,0,-9,6,-5,-23,-35,-20,7;
MA   /M: SY='V'; M=5,-26,-15,-29,-24,-1,-25,-24,23,-21,17,13,-25,-25,-21,-21,-13,-4,28,-24,-8,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-30,-14,-5,-13,-20,-13,-19,14,-12,-8,-11,-19,-1,17,-13,-10,-16,7,-2,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-14,-30,-16,-8,-4,-21,-14,-11,-5,-7,-8,-13,-21,-8,-7,-17,-9,-13,26,7,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-24,6,11,-21,-14,7,-23,4,-17,-13,10,-14,5,10,1,-3,-20,-30,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-35,-6,-2,-18,-19,-8,-28,15,-23,-13,-8,-19,7,27,-15,-15,-25,20,-1,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00888;
//
ID   RNA_POL_L_13KD_MP; MATRIX.
AC   MP01154;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases L / 13 to 16 Kd subunits signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2509513; R2=0.0176425; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=451; N_SCORE=14.198; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=15; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-11,0,-26,3,11,-17,-20,0,-14,3,-11,-5,-3,-14,3,3,-5,-6,-12,-24,-5,5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-21,-28,-22,4,-30,-21,20,-20,18,11,-23,-21,-19,-18,-17,-5,17,-19,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-21,5,14,-26,-15,-4,-26,16,-23,-14,6,-12,9,17,-4,-9,-22,-28,-16,10;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-21,-22,-25,-20,-7,-27,-24,21,-18,6,7,-17,-18,-16,-18,-10,-3,20,-25,-8,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-12,-26,-14,-13,-6,-29,-17,15,-18,11,6,-13,-19,-13,-19,-15,-8,8,-23,-4,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-23,5,12,-24,-9,-8,-25,9,-23,-14,5,-11,4,6,7,2,-18,-29,-16,8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,4,-27,4,10,-23,-18,-6,-22,21,-20,-11,3,-12,7,13,-4,-6,-18,-23,-9,8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-24,18,10,-26,-8,-9,-23,0,-20,-17,6,-12,-2,-6,3,-1,-16,-32,-17,4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-30,13,15,-29,-12,-7,-27,9,-24,-17,3,3,5,5,-4,-9,-24,-28,-18,9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,27,-22,19,1,-24,1,1,-25,-1,-27,-19,33,-16,-1,-4,8,1,-25,-35,-19,0;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-4,-10,1,-7,-17,-8,-13,-11,-8,-9,-7,-18,-6,-13,1,-2,-10,-22,-3,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-17,-27,-21,0,-26,-20,18,-21,20,11,-20,-25,-18,-17,-16,-6,16,-21,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-21,-6,10,-15,-22,-14,-5,-5,-7,-7,-7,-11,-2,-8,2,7,-3,-28,-12,3;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-20,-35,-27,30,-32,-24,21,-28,22,11,-25,-28,-29,-22,-21,-8,19,-12,8,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,-3,15,-18,-23,-8,-10,2,-11,-7,-7,-12,8,-3,-1,2,-7,-24,-7,11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-21,-33,-24,12,-30,-21,25,-26,26,20,-24,-25,-21,-22,-21,-8,18,-18,1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-26,-2,7,-18,-21,-2,-12,5,-14,-8,-1,-10,2,0,-5,-6,-11,-23,-5,3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,3,-28,0,-2,-26,26,-10,-30,-2,-25,-16,10,-17,-6,-5,-1,-13,-26,-25,-22,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-30,19,51,-26,-20,2,-28,8,-19,-19,-1,-3,17,-1,-2,-10,-28,-26,-12,34;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-26,48,14,-33,-7,-4,-34,-2,-26,-25,16,-10,-2,-10,4,0,-25,-37,-19,6;
MA   /M: SY='H'; M=-19,2,-29,1,-1,-17,-19,89,-28,-9,-20,-2,13,-21,8,-1,-9,-18,-29,-28,20,-1;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-32,-23,19,-31,-20,21,-29,38,16,-27,-29,-23,-21,-27,-10,11,-15,6,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-16,-15,-19,-19,-10,19,-19,-17,-21,-7,-4,-11,-19,-19,-19,-6,-12,-13,-21,-16,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-9,32,-20,15,0,-20,-2,7,-20,2,-28,-19,50,-19,0,5,10,2,-27,-38,-19,0;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-22,-17,-24,-17,-3,-23,-19,10,-21,17,9,-21,-13,-16,-19,-12,-3,8,-25,-9,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,41,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-24,-10,-2,-21,-21,-12,-17,25,-18,-6,-6,-16,2,26,-7,-5,-5,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-28,6,13,-19,-6,2,-22,-4,-18,-13,1,-13,2,-8,-2,-9,-22,-16,-5,7;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-14,-23,-18,-6,-9,-23,-11,6,-11,2,6,-12,-16,0,-13,-6,-2,2,-18,-1,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-22,-32,-22,6,-32,-23,27,-29,40,19,-27,-27,-20,-22,-26,-10,15,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-14,-20,-14,-4,-22,-8,4,-14,12,11,-13,-23,-10,-9,-11,-6,1,-24,-3,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-27,1,14,-25,-17,-4,-26,24,-23,-12,4,-11,11,25,-2,-4,-21,-25,-13,12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-25,27,4,-24,-15,-4,-19,-1,-18,-14,12,-15,-2,-7,-1,-4,-15,-32,-12,1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,9,-32,19,19,-32,-16,-7,-28,-1,-27,-21,0,28,3,-8,-1,-8,-29,-33,-23,9;
MA   /M: SY='G'; M=-9,8,-28,9,8,-29,10,1,-32,3,-26,-17,9,-14,3,2,0,-11,-27,-27,-18,5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-30,-29,-1,-30,-30,29,-20,9,9,-29,-25,-29,-20,-10,-1,46,-30,-10,-29;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-24,-1,9,-16,-22,-12,-9,3,-4,-5,-6,-12,-1,-3,-6,-1,-8,-25,-10,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-21,-28,-17,35,-25,-16,1,-19,7,2,-17,-23,-23,-16,-14,-7,1,-4,14,-18;
MA   /M: SY='A'; M=32,-14,12,-23,-16,-17,-10,-23,-8,-15,-9,-9,-14,-17,-16,-22,4,-1,4,-26,-20,-16;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-21,-12,-11,-15,13,-8,-22,-11,-19,-12,-2,-16,-8,-9,6,-2,-15,-20,-12,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,33,-30,18,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,77,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,8,-23,10,3,-17,-10,-4,-23,3,-22,-15,7,-14,0,2,5,3,-18,-24,-5,1;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-21,-30,-23,-4,-30,-22,28,-20,13,16,-19,-22,-14,-20,-14,-5,24,-23,-5,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,2,-31,8,14,-28,-18,-10,-23,4,-25,-18,-2,26,0,-5,-3,-5,-23,-30,-21,5;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-2,-31,-2,-1,-19,-20,87,-28,-10,-20,-2,6,-12,8,-2,-10,-19,-29,-27,19,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-37,-9,3,-28,-21,-19,-18,-9,-27,-18,-19,75,-9,-18,-9,-9,-25,-30,-28,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-20,-21,-15,-2,-24,-16,12,-20,16,9,-13,-22,-9,-16,-9,-2,6,-24,-5,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-24,-8,9,-13,-23,-11,-2,-6,-1,-2,-8,-14,3,-8,-5,-4,-6,-25,-9,5;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='H'; M=-5,6,-19,6,-2,-18,4,8,-19,-6,-16,-7,6,-12,-1,-7,1,-5,-16,-21,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-18,-4,-1,-18,-4,-9,-16,11,-17,-9,0,-2,-1,5,-2,-5,-12,-17,-12,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-27,-23,-15,-4,-25,-21,10,-18,-1,1,-16,17,-16,-21,-13,-8,1,-20,-10,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-24,-10,-2,-12,-24,-4,-1,-5,-4,-1,-3,-17,3,-3,-6,-2,-5,-21,-1,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-22,-31,-23,21,-24,-23,16,-27,19,9,-21,-26,-25,-22,-19,-10,12,-13,4,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-27,-11,-5,-10,-23,4,-19,16,-15,-7,-4,-19,3,33,-8,-3,-14,-12,9,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-24,-34,-28,4,-36,-24,37,-25,16,15,-23,-24,-22,-24,-18,-7,30,-17,7,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-27,-8,5,-25,-23,-4,-12,17,-14,0,-6,-14,17,12,-9,-9,-11,-22,-8,10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-12,-12,-12,-9,-19,-18,-6,-11,-10,-8,-5,-9,-12,-12,15,33,4,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,13,-25,15,7,-25,-13,-6,-26,13,-24,-16,9,-13,1,10,1,0,-19,-28,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-27,4,-1,-28,16,-11,-31,-6,-28,-20,4,0,-6,-6,5,-7,-25,-29,-24,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,2,-23,4,-3,-23,10,-11,-25,-8,-22,-17,1,-11,-6,-12,6,0,-17,-25,-15,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00889;
//
ID   ENDONUCLEASE_III_2_MP; MATRIX.
AC   MP01155;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endonuclease III family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3742957; R2=0.0161607; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=768; N_SCORE=17.776; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-26,-4,10,-21,-19,-8,-19,19,-17,-9,-1,-13,5,20,-6,-7,-14,-24,-12,6;
MA   /M: SY='N'; M=-11,12,-23,2,-4,-8,-11,7,-17,2,-20,-13,25,-21,2,9,1,-3,-22,-21,1,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-13,-29,-15,-6,-11,-27,7,-1,1,-4,4,-9,-19,5,-2,-14,-11,-6,-15,10,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-27,0,13,-28,-11,-5,-27,22,-24,-12,1,-11,14,19,-2,-8,-22,-23,-14,13;
MA   /M: SY='T'; M=6,-12,-15,-18,-13,-8,-12,-18,-2,-16,5,1,-10,-17,-12,-16,3,14,1,-25,-11,-13;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,19,-19,-15,-19,-6,-21,-15,-16,-15,-13,-10,-18,-15,-21,8,1,-2,-31,-22,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-28,-5,8,-25,-19,-1,-24,22,-20,-6,-2,-14,24,28,-6,-9,-21,-18,-7,14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-27,-22,-12,-10,-30,-15,17,-10,6,9,-14,-18,-7,-13,-14,-9,10,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,35,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,23,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-21,-19,-12,-13,-24,-19,7,-1,-2,3,-14,-19,-6,-4,-8,-5,11,-24,-9,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-27,20,29,-30,-14,-3,-28,10,-23,-18,7,-7,13,1,2,-3,-25,-30,-17,21;
MA   /M: SY='K'; M=-13,9,-28,11,16,-25,-17,-3,-25,17,-18,-12,7,-13,9,16,-6,-9,-22,-27,-14,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-25,-26,-21,43,-28,13,-3,-20,4,1,-16,-28,-21,-13,-19,-12,-8,9,44,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-26,11,3,-30,12,-5,-29,-3,-27,-18,14,-10,4,-6,5,-8,-27,-29,-21,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-25,-7,-11,-27,46,-16,-33,-15,-28,-19,3,-17,-13,-17,8,-10,-24,-25,-27,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-13,10,-29,15,18,-27,-18,2,-22,8,-20,-13,6,-11,8,5,-3,-9,-20,-29,-12,11;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-18,-35,-30,18,-32,-27,28,-24,13,12,-25,-27,-29,-22,-15,-5,32,-18,2,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-5,11,-18,10,4,-22,-13,-3,-23,3,-21,-15,10,-15,4,7,3,0,-19,-28,-12,3;
MA   /M: SY='N'; M=-5,15,-18,11,0,-21,-6,-6,-22,-3,-23,-17,17,-13,-1,-2,14,15,-17,-34,-16,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-22,-27,-19,14,-21,-14,3,-13,7,7,-16,-24,-17,-2,-15,-9,4,-12,5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-2,9,-24,13,24,-26,-14,-3,-23,6,-21,-16,4,-8,7,-3,4,-4,-19,-30,-17,15;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-26,17,27,-29,-7,-5,-28,2,-21,-19,5,-7,8,-6,3,-5,-24,-29,-20,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-32,-23,26,-29,38,18,-28,-28,-21,-22,-27,-10,15,-13,1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-17,-23,-10,-5,-26,-18,10,-17,12,7,-20,-21,-10,-17,-15,-8,7,-16,-6,-10;
MA   /M: SY='K'; M=8,0,-20,-2,2,-25,-8,-11,-21,9,-22,-12,0,-10,5,0,8,5,-13,-26,-15,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-16,-23,-16,6,-19,-16,13,-23,36,14,-22,-23,-16,-16,-22,-8,6,-16,-1,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-38,-10,0,-29,-19,-20,-20,-10,-30,-20,-19,84,-10,-20,-8,-9,-29,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-33,-9,1,-24,-20,-3,-27,21,-24,-12,-5,9,5,40,-10,-10,-23,-23,-14,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-25,-3,3,-17,-17,-5,-23,26,-25,-11,-1,-13,4,14,0,-3,-16,-16,3,3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-12,-14,-12,-8,-20,-16,-4,-10,-4,5,-4,-12,-8,-10,11,37,2,-28,-8,-10;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-4,-20,-12,-21,5,-21,-14,-12,-13,-12,-10,-13,-12,-21,8,-3,-4,-22,-22,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-25,-1,-11,-14,18,2,-23,-10,-23,-15,20,-21,-10,-10,1,-9,-25,-21,-7,-11;
MA   /M: SY='V'; M=17,-22,-14,-27,-20,-6,-19,-24,13,-19,12,5,-21,-21,-19,-21,-8,-3,19,-23,-11,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-12,-32,-28,-3,-32,-29,30,-23,10,10,-22,-24,-23,-24,-11,0,32,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-19,-30,-20,6,-26,-17,19,-25,39,25,-27,-27,-16,-18,-25,-9,11,-20,-2,-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-9,-2,-3,-22,0,-7,-21,-8,-26,-16,12,-15,2,-9,18,5,-17,-29,-18,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-14,-23,-18,-1,-27,-15,13,-17,10,8,-13,-24,-16,-15,-13,-5,10,-25,-4,-18;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-14,-18,-13,-17,6,-19,-10,-14,-8,-8,-9,-15,-12,-19,6,-2,-2,-23,-19,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-33,-28,-38,-28,49,-27,-23,-1,-27,10,-1,-27,-30,-31,-20,-27,-15,-6,41,24,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-4,8,-27,5,-8,-28,34,-10,-33,-5,-29,-19,15,-18,-10,-9,1,-13,-28,-26,-24,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-11,-27,-13,-1,-13,-25,-6,-6,8,-6,3,-9,-16,7,3,-12,-8,-8,-15,0,2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-21,-14,-10,-6,-22,-10,-5,-9,-9,-5,-11,9,-11,-12,-10,-6,-8,-19,-5,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=5,-10,-14,-13,-8,-1,-11,-11,-6,-10,-8,-6,-9,-6,-10,-12,2,4,-2,-13,0,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-18,-11,-13,-23,22,-19,-25,-15,-22,-16,-5,3,-15,-17,2,-2,-19,-24,-24,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-38,-29,0,-36,-26,44,-27,20,23,-21,-21,-19,-26,-19,-9,29,-21,-1,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=15,-6,8,-11,-9,-11,-2,-13,-10,-9,-8,-8,-5,-10,-9,-12,4,4,-3,-17,-12,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,19,12,-30,-30,-28,-20,-15,-2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-30,67,22,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,19,-9,1,-9,0,-10,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-17,-13,-16,-16,10,-21,-15,-15,-14,-11,-5,-16,-16,-15,9,16,-3,-26,-17,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-16,16,-26,8,0,-20,-12,64,-26,-6,-24,-8,30,-20,6,0,-2,-12,-30,-34,4,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-33,-30,11,-31,-29,28,-23,11,10,-27,-29,-30,-21,-13,-3,41,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-9,-26,-10,-6,-5,-16,10,-14,0,-12,-3,-5,-19,-7,-2,-11,-12,-11,-19,2,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-32,-27,2,-32,-27,32,-25,21,14,-26,-27,-24,-22,-16,-3,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=1,-22,2,-26,-19,-3,-23,-22,7,-24,17,5,-20,-25,-18,-21,-11,-5,8,-27,-10,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00615;
//
ID   TONB_DEPENDENT_REC_2_MP; MATRIX.
AC   MP01156;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TonB-dependent receptor proteins signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3248324; R2=0.0191179; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=147; N_SCORE=9.125; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=10; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-11,-9,-18,-12,5,-20,-13,-14,-5,-8,-8,-5,-21,-12,8,-2,5,-8,-20,-4,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-9,-11,-8,-8,7,-12,-9,-8,-7,-7,-5,-8,-9,-12,3,-3,-4,-10,-11,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-7,-23,-8,-9,-23,26,-13,-28,-1,-22,-14,0,-15,-8,2,1,-8,-19,-19,-19,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-8,-18,-11,-14,-10,-23,-20,6,-16,1,-1,-8,-13,-15,-17,-3,8,10,-28,-11,-16;
MA   /M: SY='A'; M=5,1,-17,-1,-5,-14,-12,-11,-7,-11,-8,-9,2,-17,-8,-13,4,0,-3,-29,-12,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-7,31,-20,15,0,-19,-2,8,-19,-1,-27,-18,48,-19,2,-1,10,0,-27,-35,-15,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-19,-24,-18,0,-17,-16,10,-18,20,10,-20,-24,-15,-11,-17,-8,9,-18,-3,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-21,-11,-28,-22,29,-21,-20,3,-22,4,-1,-15,-23,-26,-18,-8,-1,7,-10,6,-22; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-25,41,11,-29,-6,-1,-28,-2,-25,-22,22,-8,-2,-8,1,-7,-24,-35,-19,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-29,-1,9,-27,-9,-3,-27,21,-24,-10,1,-13,15,21,-5,-9,-24,-20,-11,11;
MA   /M: SY='D'; M=-6,5,-25,7,6,-22,-15,0,-20,5,-19,-12,3,-12,1,1,0,-3,-15,-26,-8,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-10,-25,-10,-13,8,-18,5,-8,-9,-6,-5,-12,-23,-8,-10,-9,-1,-10,4,38,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-4,-28,-4,-2,-13,1,-2,-20,-6,-19,-12,-1,-15,-3,-8,-5,-11,-20,-8,-1,-3;
MA   /M: SY='T'; M=9,-7,-17,-11,-5,-15,-15,-15,-8,-7,-9,-5,-8,-7,-5,-10,5,10,-3,-24,-12,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=4,-1,-15,-3,-7,-18,18,-11,-19,-10,-19,-13,4,-12,-7,-11,10,1,-12,-22,-17,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=1,-14,-10,-20,-16,-5,-21,-17,7,-18,5,2,-12,-22,-15,-18,-8,-2,8,-22,-3,-17;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-11,-21,-12,-11,13,-16,6,-4,-9,-2,-3,-9,-21,-8,-9,-9,-6,-9,6,36,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-23,-3,-10,-19,19,-10,-20,-12,-21,-14,8,-17,-8,-12,4,-5,-19,-17,-15,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-4,-8,-6,-8,-12,-6,-8,0,-4,-4,-1,-13,-3,10,-4,0,-6,-16,-7,-6; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-24,-24,-20,30,-26,5,0,-14,2,1,-18,-27,-16,-10,-16,-8,-4,11,46,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-6,-24,-10,-7,-4,-16,0,-10,-5,-11,-8,-3,-16,-2,-6,-5,-5,-13,1,14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=14,-6,-21,-8,-4,-25,25,-17,-26,-11,-21,-16,-2,-13,-10,-16,7,-4,-18,-23,-23,-7;
MA   /M: SY='P'; M=2,-2,-27,1,3,-26,-14,-14,-21,-4,-22,-17,-6,26,-3,-9,1,0,-19,-29,-21,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-33,-5,-2,-30,32,-17,-33,-13,-28,-20,-5,12,-11,-17,-3,-16,-30,-24,-28,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-3,15,-18,5,3,-20,-9,-2,-19,0,-22,-15,24,-14,3,3,12,11,-18,-33,-16,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-25,-24,-28,-23,31,-28,-3,6,-18,7,2,-22,-29,-20,-16,-19,-9,2,14,42,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-11,-24,-15,-12,1,-18,-6,-6,-2,-9,-1,-6,-20,-6,-1,-7,-2,-6,-8,10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-18,-30,-21,12,-25,-17,15,-21,23,20,-22,-24,-18,-18,-17,-4,11,-17,1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-12,-2,-3,-19,-3,-10,-18,-9,-24,-17,11,-11,-1,-9,28,21,-11,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='L'; M=2,-23,-18,-26,-22,-1,-13,-22,10,-22,15,6,-21,-25,-21,-20,-13,-6,13,-20,-6,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-5,6,-21,6,8,-24,-8,-7,-22,2,-22,-15,7,-11,6,2,11,7,-17,-31,-16,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-20,-24,-24,-19,16,-20,-3,2,-14,2,6,-18,-24,-12,-14,-13,-7,-2,6,29,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-25,10,11,-27,-15,-2,-25,11,-21,-13,4,-11,9,8,2,-2,-19,-28,-13,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00354;
//
ID   ACID_PHOSPH_CL_A_MP; MATRIX.
AC   MP01157;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Class A bacterial acid phosphatases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8651276; R2=0.0145697; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1060; N_SCORE=20.299; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-5,-23,-7,-2,-20,-22,32,-13,-7,-13,0,-1,-17,12,-3,-2,-1,-11,-27,1,3;
MA   /M: SY='P'; M=8,-5,-22,-2,10,-24,-9,-12,-20,-6,-25,-18,-3,18,0,-12,14,3,-17,-32,-23,3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-15,-18,-15,-7,-25,-23,5,-15,-2,-2,-5,-13,-13,-15,10,35,8,-27,-7,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,11,-21,1,-3,-17,-13,-1,-21,9,-21,-14,22,-17,1,24,5,9,-19,-30,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-5,-27,-2,12,-23,-20,-15,-19,-5,-20,-16,-8,31,-2,-11,3,12,-19,-30,-20,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-30,8,29,-30,-20,-6,-30,35,-26,-14,0,-6,14,19,-6,-10,-24,-24,-14,21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,1,-30,5,30,-31,-20,4,-26,15,-20,-10,0,-9,32,22,-3,-10,-27,-24,-14,30;
MA   /M: SY='B'; M=-12,26,-26,25,21,-28,-11,2,-28,12,-27,-20,26,-11,7,4,2,-6,-28,-34,-18,14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-22,-6,-5,-22,3,-16,-25,9,-22,-13,0,-13,-5,2,4,10,-15,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-6,-23,-6,-5,-23,10,-9,-29,3,-26,-16,4,-16,-1,18,11,-2,-19,-27,-19,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,6,-26,-20,-12,-26,38,-26,-10,0,-10,6,22,-4,2,-16,-22,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-25,26,9,-29,-7,8,-24,3,-27,-17,36,-15,15,0,5,-5,-30,-35,-17,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=30,-6,-10,-14,-8,-17,-5,-18,-12,-10,-14,-12,-4,-10,-8,-16,18,17,-2,-26,-17,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-26,-30,-32,-26,11,-36,-11,31,-22,12,12,-20,-24,-16,-22,-20,-10,15,-1,30,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,55,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,9,-11,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-25,-35,-29,-22,2,-20,-26,-16,-16,-16,-16,-25,-22,-16,-16,-17,0,-19,82,15,-16;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-14,-19,-11,-9,-11,-17,-1,-18,8,-1,-12,-18,-11,-17,2,1,1,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-14,-21,-17,-2,-23,-21,10,-20,14,5,-17,-23,-17,-16,-3,9,15,-28,-8,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-4,-10,-9,-4,-20,0,-14,-16,-10,-21,-16,1,-10,-4,-14,27,11,-6,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,29,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='V'; M=15,-22,-16,-28,-20,-5,-20,-24,16,-20,14,7,-21,-21,-18,-22,-9,-4,17,-22,-10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,3,-26,-7,-8,-15,-18,-4,-6,4,-13,-6,17,-20,-1,19,-5,-6,-11,-27,-11,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00891;
//
ID   MIF_MP; MATRIX.
AC   MP01158;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Macrophage migration inhibitory factor family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.3987570; R2=0.0193245; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=268; N_SCORE=11.568; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=6; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-9,2,-22,1,7,-19,-17,36,-23,-7,-19,-9,6,-13,5,-4,7,6,-19,-32,-1,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-17,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-2,4,-20,2,-6,-18,-14,-8,-12,1,-15,-10,6,-19,-6,8,-1,-4,-4,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='P'; M=2,-16,-30,-15,-9,-24,0,-17,-16,-12,-19,-5,-15,35,-10,-18,-6,-10,-19,-25,-24,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,12,-28,14,-7,-31,40,-10,-37,-12,-30,-22,14,-18,-12,-14,2,-14,-30,-28,-26,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-8,-21,-11,2,-23,-14,-3,-8,-3,-7,6,-6,-13,22,-4,2,-4,-12,-23,-11,12;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-13,-22,-17,-8,-13,-18,-12,-10,0,-4,0,-10,-7,-4,12,-6,1,-7,-23,-11,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-16,30,47,-23,-23,-6,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-12,-21,-18,-6,-20,-23,8,-17,5,1,-16,-20,-18,-17,2,12,18,-28,-11,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-20,-23,-26,-18,28,-25,6,-5,-14,6,10,-13,-25,-16,-1,-18,-12,-6,-9,14,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-25,-4,-14,-27,47,-14,-34,-15,-30,-20,11,-18,-14,-15,8,-10,-27,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-27,-8,-7,-30,30,-14,-30,-3,-25,-14,-2,-15,-1,-7,0,-14,-24,-20,-22,-4;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-12,-6,-5,-14,-8,-13,-12,-13,-14,-12,2,-13,-5,-12,25,20,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-4,2,-17,-1,6,-17,-17,5,-18,-6,-16,-12,3,-10,0,-6,14,23,-12,-31,-8,3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,54,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-23,76,-30,-28,-12,-30,-28,-12,-28,-4,-9,-23,-37,-28,-27,-13,-8,3,-42,-22,-28;
MA   /M: SY='A'; M=36,-9,-13,-17,-9,-19,-5,-20,-11,-10,-12,-11,-9,0,-10,-18,10,7,-3,-23,-19,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-17,-23,-18,-4,-28,-4,14,-18,12,10,-21,-27,-13,-14,-14,-6,21,-27,-3,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-26,38,-32,-26,-4,-32,-26,4,-30,15,3,-24,-33,-24,-26,-20,-10,5,-33,-13,-26;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-15,1,-6,-15,-12,-14,-8,-13,-10,-10,-2,-17,-9,-13,13,7,1,-35,-15,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,32,-28,30,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-22,-3,0,-17,-16,7,-22,11,-23,-10,2,-13,2,6,6,6,-15,-24,0,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-27,-34,-25,-3,-34,-27,39,-27,12,14,-15,-18,-17,-27,-10,-5,24,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-27,-10,-18,-27,55,-20,-35,-18,-27,-18,0,-18,-18,-18,3,-9,-25,-22,-27,-18;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,10,-21,-17,-14,-23,-24,-2,-4,-8,-4,-18,-24,-17,-10,-7,-4,14,-30,-15,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-23,-8,-15,-25,44,-18,-32,-17,-27,-18,2,-17,-15,-17,10,-2,-22,-25,-25,-15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-17,-7,-7,-15,8,-13,-16,-9,-15,-11,-4,10,-9,-11,3,6,-13,-18,-15,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=24,-9,-20,-13,-2,-25,-9,-15,-16,3,-18,-11,-9,6,0,-8,2,-4,-11,-22,-19,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-17,2,20,-12,-15,-5,-4,-1,-5,-5,-3,-3,5,-5,-3,-6,-8,-16,-8,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,2,-25,7,4,-24,-21,-5,-9,-5,-6,-3,-5,-17,15,-6,-7,-8,-8,-27,-11,9;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-18,15,-2,-18,-3,5,-18,-2,-27,-18,50,-18,-2,-2,12,8,-25,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-28,-4,6,-19,-20,-4,-15,13,-16,-9,8,-16,5,26,-6,-8,-15,-25,-12,2;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-17,-1,7,-19,-11,-9,-21,0,-22,-16,4,-10,2,5,20,18,-12,-33,-16,4;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-1,-28,-5,-8,0,-21,53,-16,-8,-14,-3,6,-24,0,-4,-11,-13,-22,-8,37,-8;
MA   /M: SY='T'; M=13,-2,-10,-8,-6,-16,-8,-16,-14,-10,-18,-14,2,-10,-6,-12,26,29,-4,-32,-16,-6;
MA   /M: SY='A'; M=14,-6,-18,-8,5,-21,-13,-15,-13,6,-15,-9,-8,-11,-2,-4,2,-3,-3,-25,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-18,-14,-6,-15,-13,-5,-10,-3,-4,-4,-8,-16,-5,-7,0,-3,-6,-24,-10,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24,26,-32,-22,20,-30,35,15,-26,-28,-25,-22,-26,-10,11,-13,7,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-19,36,-27,-25,16,-28,-16,-14,-23,-7,-10,-17,-31,-25,-20,-9,0,-6,-17,9,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-30,13,27,-31,-6,-6,-32,18,-26,-17,2,-7,9,7,-3,-11,-27,-26,-18,18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-34,-24,39,-29,-18,11,-28,29,16,-24,-29,-26,-19,-24,-10,6,-7,13,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00892;
//
ID   WW_DOMAIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01159;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   WW/rsp5/WWP domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2776; R2=0.0197; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=316; N_SCORE=6.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=315; N_SCORE=6.000; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-9,-25,-10,-3,-21,-5,-13,-15,-7,-16,-9,-6,-1,0,-5,2,1,-13,-26,-17,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-30,-1,-1,-24,-5,-13,-22,-9,-24,-17,-4,27,-6,-13,0,-5,-24,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-19,-24,-18,2,-27,-18,15,-22,29,12,-22,-24,-16,-14,-21,-7,12,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-34,-5,7,-27,-18,-12,-18,-6,-23,-13,-10,49,1,-13,-5,-8,-26,-29,-23,1;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-1,-24,1,-2,-22,-6,-11,-21,-5,-24,-17,2,12,-5,-10,8,1,-19,-29,-17,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-31,-7,-11,-29,34,-14,-30,-16,-27,-18,-3,4,-12,-18,-1,-14,-27,-24,-25,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-25,3,24,-20,-20,-7,-21,15,-18,-10,-3,-8,9,5,-2,-3,-16,-25,-12,16;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-8,-15,-8,7,-19,-15,-11,-13,1,-11,-5,-9,-15,1,1,-3,-5,-6,-26,-15,3;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-16,-23,-18,-12,-7,-20,-4,-7,-1,-7,-3,-12,-21,-7,6,-9,-8,-2,-10,2,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-14,-24,-18,-8,4,-25,-10,-5,-4,-4,1,-12,-19,-4,-5,-10,-2,-5,-7,5,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,17,-20,19,3,-23,-11,1,-22,-6,-20,-14,10,-12,-2,-9,10,10,-15,-34,-13,0;
MA   /M: SY='B'; M=-2,6,-25,6,3,-26,-6,-8,-23,-1,-23,-16,4,3,-3,-8,3,0,-19,-29,-18,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-22,10,8,-21,-13,-6,-22,6,-22,-15,11,-13,1,2,7,2,-16,-31,-15,5;
MA   /I: MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-26,-7,-11,-23,30,-13,-28,-3,-23,-12,2,-17,-10,-7,-2,-11,-22,-18,-17,-11; D=-5;
MA   /I: I=-10; MI=-5; MD=-27; IM=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-25,-12,-3,-14,-17,-7,-18,14,-14,-7,-4,-18,3,34,-7,-4,-11,-20,-8,-3; D=-5;
MA   /I: DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-25,-16,-9,-8,-23,-17,-5,-7,-11,-7,-13,5,-11,-9,-5,3,-4,-14,-5,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-27,-24,40,-30,5,4,-17,4,1,-20,-30,-19,-14,-20,-10,-3,20,59,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-26,-25,-29,-24,10,-29,-9,13,-21,7,5,-22,-26,-19,-18,-18,-8,10,6,14,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-12,40,-22,29,4,-24,-3,12,-24,0,-30,-21,51,-18,0,-2,7,-3,-30,-40,-18,2;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-5,-28,-5,-3,-18,-20,39,-19,-8,-12,-3,-1,-5,0,-4,-9,-10,-19,-28,2,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-23,0,9,-19,-17,-8,-12,2,-13,-9,5,-10,2,-3,-1,-3,-11,-29,-15,5;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-13,-5,-8,-12,-17,-16,-10,-10,-11,-11,5,-12,-8,-11,17,34,-3,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-29,-1,4,-28,-7,1,-29,25,-27,-10,6,-14,11,22,-6,-11,-24,-22,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-23,5,17,-23,-19,-4,-23,10,-20,-13,2,-8,7,5,5,10,-17,-28,-12,12;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-5,-11,-8,0,-19,-19,-5,-16,-3,-14,-7,-3,-15,14,1,7,11,-14,-25,-7,6;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-45,-37,-28,14,-21,-24,-17,-19,-16,-17,-35,-29,-20,-19,-34,-24,-25,124,33,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-25,9,19,-22,-20,-6,-15,0,-14,-11,-2,-10,8,-5,0,-2,-14,-27,-10,13;
MA   /M: SY='D'; M=-15,5,-32,12,8,-29,-18,4,-27,10,-25,-15,1,11,2,8,-8,-11,-24,-29,-14,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-23,0,1,-20,-14,-8,-21,10,-16,-11,2,-16,0,19,-1,0,-13,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-17,-8,-2,-13,-10,-6,-11,-1,2,-12,-11,-11,-8,-11,-6,-6,-20,-6,-10;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50020;
//
ID   KINESIN_LIGHT_MP; MATRIX.
AC   MP01160;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Kinesin light chain repeat.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7698464; R2=0.0140379; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2102; N_SCORE=34.268; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-20,54,-26,-26,2,-30,-8,-17,-21,-11,-11,-20,-36,-21,-21,-14,-10,-10,-15,18,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-4,-30,-4,7,-33,-1,1,-27,8,-22,-7,0,-14,32,17,-2,-12,-28,-20,-14,18;
MA   /M: SY='N'; M=-12,34,-24,27,7,-27,-7,3,-27,11,-30,-20,38,-16,2,4,3,-4,-28,-36,-18,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,16,-36,-20,8,-22,14,-20,-2,0,-12,49,23,-2,-10,-28,-20,-10,31;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-15,-28,54,-13,-35,-15,-30,-20,14,-20,-15,-15,2,-15,-30,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-30,17,34,-31,-19,-4,-31,27,-25,-17,2,-5,13,12,-4,-10,-26,-27,-16,24;
MA   /M: SY='E'; M=-1,7,-27,14,49,-28,-17,-3,-27,7,-18,-18,-2,-2,15,-3,2,-8,-25,-28,-20,32;
MA   /M: SY='V'; M=22,-21,-10,-26,-21,-9,-17,-26,12,-16,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,28,-26,-14,-21;
MA   /M: SY='E'; M=4,5,-25,11,44,-28,-15,-5,-25,5,-18,-18,-2,-2,13,-5,2,-8,-23,-28,-20,29;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-11,-33,-9,-2,-17,-21,17,-24,9,-22,-9,-6,4,2,15,-13,-13,-24,-10,3,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20,21,-30,2,9,-19,22,9,-24,-30,-14,-14,-24,-10,-1,8,45,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-22,4,-24,-22,15,-30,0,-2,-19,7,0,-22,-32,-17,-17,-20,-10,-5,2,38,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,9,-28,5,13,-33,-15,4,-23,19,-25,-7,14,-12,33,13,-1,-8,-27,-25,-12,23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,4,-30,8,5,-25,-18,0,-32,23,-22,-15,5,-18,8,52,-8,-10,-22,-25,-12,2;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=12,7,-22,10,29,-27,-11,-8,-23,1,-17,-17,-2,-5,6,-9,4,-6,-19,-27,-20,18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-16,-30,-16,-11,8,-26,11,-13,8,-9,-4,-11,-26,-1,25,-16,-10,-14,8,40,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,53,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,27,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-23,-2,4,-25,-9,-12,-26,24,-28,-13,3,-11,4,12,7,3,-16,-26,-14,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-21,-7,3,-21,-22,-13,-11,12,-15,-5,-6,-13,6,5,-1,6,-3,-25,-11,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-36,-6,4,-30,-20,-16,-24,16,-30,-16,-11,46,-1,2,-10,-10,-26,-26,-21,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,26,-28,31,8,-28,-13,45,-32,-4,-26,-15,22,-16,4,-4,-3,-13,-30,-36,-2,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=1,31,-20,22,2,-24,-2,1,-22,-2,-25,-20,36,-16,-2,-7,8,-2,-23,-35,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=2,-4,-25,-6,4,-26,-15,-11,-25,33,-24,-10,-2,-12,5,25,-5,-8,-15,-20,-12,4;
MA   /M: SY='T'; M=-2,0,-14,-8,-4,-16,-20,-14,-12,-6,-12,-8,0,-10,5,-6,16,37,-6,-28,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-13,-26,-13,-3,-12,-24,-14,-8,15,5,3,-13,-19,-3,8,-19,-10,-7,-20,-6,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='S'; M=5,-15,-14,-15,-14,-10,-6,-18,-2,-18,-3,-4,-10,-20,-14,-16,8,4,6,-30,-15,-14;
MA   /M: SY='C'; M=2,-22,32,-28,-22,-7,-24,-24,-4,-26,13,0,-22,-30,-22,-24,-15,-8,1,-31,-15,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,2,-22,-22,19,-30,9,-6,-14,-4,-4,-20,-32,-14,-14,-18,-10,-10,13,56,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-19,-24,-19,-11,-10,-5,-14,-2,-19,17,7,-17,-23,-3,-14,-17,-12,-8,-20,-9,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-28,4,8,-28,-16,-6,-28,39,-30,-12,13,-12,8,24,-6,-8,-22,-24,-12,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,15,-35,-20,8,-22,15,-20,-2,0,-12,49,24,-2,-10,-28,-20,-10,31;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-3,2,-25,2,16,-26,-17,-10,-26,26,-24,-13,0,-8,8,12,1,0,-18,-25,-14,12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-29,14,49,-31,-19,1,-27,9,-19,-16,-1,-2,25,1,1,-9,-28,-28,-18,37;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-1,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,11,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-26,-17,-9,-6,-24,-12,0,-12,-7,-5,-13,7,-10,-16,-5,4,-5,-14,5,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-28,-20,14,-30,-11,16,-26,39,16,-28,-30,-18,-18,-28,-10,6,-9,17,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,4,-22,-22,19,-30,9,-7,-15,-5,-5,-20,-32,-15,-15,-18,-10,-10,12,55,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,41,-28,-8,0,-10,21,26,-8,-10,-22,-20,-10,16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-30,2,25,-28,-20,2,-28,19,-20,-11,0,-11,25,33,-4,-10,-26,-23,-13,22;
MA   /M: SY='V'; M=19,-21,-16,-29,-21,-9,-20,-26,19,-19,4,4,-18,-18,-18,-23,-4,-3,22,-22,-11,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-6,-6,-6,-6,-11,-11,-6,-6,-6,-6,0,-6,-6,-6,11,28,0,-17,-6,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-16,-5,6,-24,-2,-7,-32,9,-22,-15,-2,-17,2,26,-6,-12,-23,-25,-18,2;
MA   /M: SY='A'; M=24,-19,-19,-29,-19,-11,-18,-24,16,-19,3,3,-14,-14,-14,-24,-3,-4,13,-20,-11,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-7,-30,-7,-4,-9,-22,60,-24,-1,-16,-2,1,-22,6,14,-12,-16,-23,-15,26,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-27,8,37,-27,-22,-3,-18,5,-15,-11,-5,-7,21,-1,-2,-8,-17,-28,-16,29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-26,-5,4,-24,-20,-6,-24,24,-21,-8,0,-13,14,31,-2,3,-17,-22,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-25,4,29,-23,-22,-9,-16,12,-15,-11,-7,-9,7,2,-4,-8,-10,-28,-16,18;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,49,-30,-20,9,-30,28,9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,4,-3,17,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-24,-6,2,-25,-13,-12,-20,9,-23,-12,-4,10,3,0,4,-1,-16,-27,-17,1;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-11,-20,-11,-18,8,-26,-20,9,-19,1,-1,-13,-23,-22,-19,-9,-5,15,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,0,-20,-20,51,-30,9,-20,-5,5,-20,10,34,-10,-15,-25,-25,5,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00893;
//
ID   GLC_GALNAC_ISOMERASE_MP; MATRIX.
AC   MP01161;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3023262; R2=0.0149532; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=496; N_SCORE=12.709; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-20,-5,-9,-8,-18,-11,-1,-12,0,-1,4,-19,-10,-11,-3,3,-3,-28,-9,-10;
MA   /M: SY='A'; M=24,-2,-15,-7,-1,-23,-4,-13,-16,-3,-17,-12,-2,-10,0,-11,11,3,-9,-25,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=-1,9,-24,14,12,-27,-13,-9,-23,3,-23,-18,3,0,1,-5,6,1,-17,-31,-18,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-26,33,8,-26,-12,-1,-23,-2,-19,-18,22,-15,-1,-5,0,-5,-22,-35,-16,3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-23,-22,-16,-4,-25,-9,10,-19,10,8,-15,-9,-14,-17,-13,-4,5,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-27,11,22,-20,-18,-2,-18,2,-16,-12,4,-10,10,-4,-2,-8,-20,-26,-10,15;
MA   /M: SY='E'; M=8,5,-22,6,12,-26,-10,-4,-21,0,-16,-13,0,-10,6,-7,2,-4,-16,-26,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=0,9,-26,13,39,-25,-15,-2,-25,5,-19,-18,3,-5,11,-4,2,-7,-24,-27,-16,25;
MA   /M: SY='C'; M=1,-18,59,-26,-24,-12,-19,-23,-19,-23,-14,-14,-17,-30,-23,-25,-6,-7,-6,-32,-15,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-26,-2,11,-23,-15,-6,-20,11,-16,-9,-3,-9,5,11,-4,-7,-16,-24,-14,6;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-24,-5,7,-20,-15,-3,-20,10,-15,-10,2,-15,6,22,-2,-6,-16,-25,-13,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-20,-19,26,-29,23,-1,-11,-1,0,-18,-29,-10,-10,-19,-10,-8,21,69,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-28,34,40,-32,-16,0,-32,5,-23,-23,10,-5,11,-4,2,-6,-29,-34,-20,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,10,-25,9,14,-30,-11,0,-24,10,-24,-13,11,-11,19,7,3,-5,-24,-27,-16,16;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-11,-25,-13,-3,-17,-22,-15,-8,15,-6,-1,-10,-16,-2,10,-12,-8,-4,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='K'; M=2,2,-24,2,8,-25,-12,-7,-20,9,-17,-11,0,-12,7,6,-2,-7,-16,-24,-15,7;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-22,3,10,-26,-10,-4,-23,5,-21,-14,3,-11,11,6,8,-1,-18,-26,-14,10;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-7,-20,-10,-3,-4,-17,0,-7,-3,-8,-4,-5,-15,-3,-5,-3,-3,-8,-12,8,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-28,-5,-15,-27,52,-8,-35,-16,-29,-18,9,-19,-15,-16,2,-16,-29,-23,-25,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-30,-7,-9,-28,30,-15,-31,-7,-27,-17,-4,5,-10,-7,-4,-15,-27,-21,-24,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-19,-35,-27,0,-35,-27,35,-26,21,16,-23,-24,-21,-23,-19,-8,26,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-16,41,-29,57,18,-36,-10,6,-36,-1,-27,-25,18,-11,1,-9,0,-10,-28,-38,-17,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,11,-32,-24,27,-29,35,17,-27,-27,-22,-23,-25,-9,17,-16,2,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-13,-19,-16,-2,-5,-23,-6,-10,-7,-8,-1,-11,-19,18,-4,-8,-10,-13,-9,-1,9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-20,-33,-26,7,-32,-24,30,-25,26,20,-26,-26,-22,-22,-20,-7,26,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-23,-26,-20,1,-8,-20,8,-28,31,11,-23,-27,-20,-20,-23,-12,2,-20,-7,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-29,25,19,-24,-24,-21,-26,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=0,-6,-23,-8,0,-20,-15,-7,-13,0,-15,-9,-3,-3,0,2,-1,-2,-9,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-13,39,-23,35,8,-26,-5,5,-25,0,-28,-22,41,-16,0,-4,5,-4,-27,-39,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,2,-30,1,0,-20,-19,97,-30,-10,-20,-1,12,-20,10,0,-9,-19,-30,-30,18,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-39,-29,8,-38,-28,42,-30,21,18,-21,-22,-22,-28,-20,-10,27,-18,2,-29;
MA   /M: SY='G'; M=16,-11,-10,-15,-17,-26,37,-21,-29,-17,-22,-17,-5,-18,-17,-21,3,-12,-18,-23,-27,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-21,-36,-28,65,-22,-18,-2,-28,8,-1,-19,-29,-36,-20,-19,-11,-2,7,26,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-29,16,53,-27,-21,-2,-26,7,-14,-17,-3,-3,17,-2,-3,-10,-27,-29,-18,35;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,86,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-3,-20,-6,-16,-27,46,-17,-34,-17,-27,-19,4,-19,-16,-18,3,-12,-25,-25,-27,-16;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-13,-3,2,-17,-11,-14,-15,-8,-20,-15,4,-9,-2,-10,26,27,-7,-34,-16,-1;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-19,-1,0,-21,-9,-13,-19,-8,-23,-17,1,11,-4,-10,17,11,-14,-34,-20,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-26,-16,19,-28,-8,4,-18,19,7,-18,-26,-17,-7,-21,-11,0,-13,7,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-23,16,10,-19,-11,-5,-22,-2,-20,-16,10,-13,2,-7,4,-4,-19,-29,-14,7;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-16,-3,-3,-19,-4,-3,-16,-12,-24,-15,5,-7,-3,-12,24,10,-10,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-25,-8,4,-20,-15,-9,-20,10,-13,-9,-5,-10,3,19,-5,-3,-14,-23,-13,1;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-1,-6,-10,-8,-13,-20,-18,-12,-9,-11,-10,-1,-11,-5,-9,17,42,-3,-30,-11,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00894;
//
ID   QOR_ZETA_CRYSTAL_MP; MATRIX.
AC   MP01162;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Quinone oxidoreductase / zeta-crystallin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7937269; R2=0.0135696; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=604; N_SCORE=12.980; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-19,-18,-23,-14,13,-25,-19,7,-22,15,4,-16,-22,-18,-17,-9,3,6,-19,0,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=1,-4,-10,-13,-11,1,-18,-18,-8,-11,-7,-8,-3,-11,-12,-11,12,34,0,-21,-5,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-3,-11,-8,-7,-18,-5,-16,-9,-9,-9,-9,-7,-11,-10,-16,6,1,1,-22,-16,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-6,-14,-14,8,-23,-2,-4,-12,-1,-3,-14,-23,-11,-13,-11,-4,-4,-3,24,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-19,-18,-12,8,-22,-8,3,-9,2,4,-13,-20,-11,-4,-8,-2,3,-11,9,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-15,-17,-21,-15,-6,-3,-16,-4,-13,0,5,-12,-18,-12,-15,-3,-5,0,-20,-11,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-31,-22,6,-32,-23,27,-29,37,18,-25,-26,-19,-22,-23,-6,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-6,-22,-11,-10,6,-13,-7,-12,-5,-10,-8,3,-22,-11,2,-4,-5,-10,-17,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-14,9,-30,15,23,-28,-19,15,-30,17,-24,-13,4,-10,13,11,-6,-12,-26,-26,-6,16;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-12,-15,-17,-12,3,-20,-18,1,-16,-1,-3,-8,-19,-15,-15,2,9,6,-24,-6,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=8,-13,-24,-14,-14,-13,15,-10,-19,-13,-16,-12,-9,-5,-13,-17,-3,-10,-16,-9,-2,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,4,-21,3,9,-24,1,6,-28,-1,-24,-16,10,-11,2,2,2,-9,-25,-29,-17,4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-18,-24,-13,5,-27,-21,15,-21,24,9,-24,-25,-18,-18,-18,-7,15,-22,-4,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-24,1,4,-24,-12,-3,-26,22,-27,-14,13,-14,7,27,4,-2,-20,-28,-14,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=1,-6,-28,-3,11,-27,-12,-14,-23,8,-23,-15,-7,19,1,-3,-2,-5,-21,-25,-20,5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-1,-14,-30,56,-16,-38,-17,-30,-21,5,-18,-16,-18,3,-16,-29,-24,-28,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-29,13,24,-30,-19,2,-28,22,-23,-10,2,-8,16,11,-5,-10,-24,-26,-12,20;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-6,-19,-7,-3,-16,-12,-9,-15,0,-21,-12,0,-9,1,2,15,8,-9,-28,-9,-2;
MA   /M: SY='V'; M=1,-28,-15,-32,-27,6,-28,-27,26,-22,12,9,-25,-26,-26,-22,-12,-3,34,-23,-5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-29,12,-33,-28,32,-25,16,13,-25,-27,-27,-23,-16,-5,33,-20,0,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-11,-25,-14,-11,-4,-25,37,-7,-17,1,4,-4,-21,-5,-10,-11,-6,-9,-24,10,-11;
MA   /M: SY='A'; M=15,-2,-18,-11,-12,-20,15,-11,-16,-11,-15,-5,5,-16,-9,-14,5,-5,-12,-25,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-15,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-11,-14,-8,-21,4,-17,-14,-11,-16,-13,-4,-11,-8,-17,17,4,-4,-25,-21,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-10,-27,-27,-1,-29,-29,24,-19,7,7,-26,-27,-27,-19,-6,7,43,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-15,-21,-18,-9,-10,-23,-13,6,-15,8,7,-11,-18,2,-12,-3,2,0,-25,-7,-4;
MA   /M: SY='I'; M=8,-23,-20,-32,-22,14,-23,-23,15,-23,9,5,-17,-20,-22,-23,-10,-7,11,-13,1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=37,-13,-11,-21,-13,-15,-7,-21,-3,-13,-3,-5,-13,-14,-13,-20,5,2,7,-22,-17,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-14,22,-23,-22,-10,-25,-23,2,-20,-4,-3,-11,-25,-19,-21,-3,6,8,-33,-15,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-31,-26,-34,-25,6,-31,-25,23,-27,28,13,-29,-27,-21,-23,-27,-12,14,3,3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,14,-23,-16,-14,-12,-19,-7,-17,-2,-1,-15,-20,-14,-20,-1,-3,0,-27,-17,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-29,-2,8,-28,-19,-8,-29,43,-28,-11,1,-12,9,35,-7,-8,-19,-21,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-17,-18,-10,-9,-14,-3,-8,-7,-5,0,-8,-15,-7,-8,-1,1,-4,-21,-6,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-22,-25,-23,-19,8,-25,-4,2,-12,3,1,-22,-26,-14,-12,-18,-10,2,13,27,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-29,7,-9,-31,42,-13,-37,-8,-30,-21,9,-18,-12,-12,0,-15,-29,-25,-26,-10;
MA   /M: SY='V'; M=13,-22,7,-27,-21,-7,-20,-24,5,-21,9,1,-22,-25,-21,-21,-8,-4,14,-27,-14,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-8,0,-22,-3,1,-21,-19,18,-23,9,-20,-7,3,-13,5,6,3,8,-16,-27,-2,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-13,-29,-27,1,-30,-28,27,-21,15,11,-27,-28,-26,-20,-11,2,39,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-23,-34,-25,15,-32,-25,25,-26,17,11,-19,-22,-22,-24,-15,-3,16,-15,4,-25;
MA   /M: SY='G'; M=12,-9,-23,-12,-16,-25,42,-20,-29,-16,-23,-16,-2,-16,-16,-19,5,-7,-19,-21,-25,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-10,-14,-14,-8,-22,-22,-3,-12,-6,-6,-6,-14,-14,-12,14,41,9,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-15,24,-24,-18,-17,-12,-24,-10,-17,-10,-10,-15,-21,-18,-23,2,-3,4,-29,-21,-18;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-14,-2,-4,-22,14,-12,-24,-12,-30,-20,8,-12,-4,-12,32,12,-14,-36,-22,-4;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-17,-7,-2,-19,-13,-12,-18,-1,-20,-13,1,-5,0,1,17,20,-10,-30,-15,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-24,19,20,-24,-12,-6,-26,-2,-22,-19,3,-4,5,-8,6,-4,-21,-30,-17,13;
MA   /M: SY='E'; M=-1,9,-27,15,39,-31,-16,-2,-26,6,-19,-17,0,-4,19,-3,2,-8,-25,-28,-19,29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00058;
//
ID   GAL_P_UDP_TRANSF_II_MP; MATRIX.
AC   MP01163;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Galactose-1-phosphate uridyl transferase family 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2423105; R2=0.0125653; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1656; N_SCORE=25.040; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-4,11,-24,17,21,-29,-5,-6,-28,2,-25,-19,6,-8,8,-5,10,-1,-22,-32,-19,14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-25,-40,-30,40,-35,-25,25,-30,15,10,-20,-25,-30,-25,-20,-10,15,-5,15,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-24,-16,-25,-19,-2,-30,-25,22,-20,14,9,-23,-24,-21,-19,-11,2,28,-27,-8,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-28,31,21,-34,-5,-1,-32,5,-27,-21,13,-10,10,-3,2,-8,-28,-32,-19,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-12,-28,-15,-2,-20,-26,-9,1,6,-5,7,-9,-15,15,1,-11,-10,-4,-20,-6,5;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-37,-28,67,-30,-16,2,-28,14,2,-21,-30,-35,-19,-21,-10,0,8,31,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-28,0,-2,-23,5,49,-31,-11,-23,-8,10,-18,1,-6,-3,-14,-28,-28,0,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29,73,-29,-18,2,-28,11,5,-20,-29,-37,-19,-20,-10,1,8,28,-28;
MA   /M: SY='V'; M=12,-21,-17,-28,-22,-7,-22,-24,20,-19,6,9,-18,-19,-17,-22,-5,0,22,-23,-10,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-10,-27,-27,-2,-27,-28,24,-19,5,7,-25,-28,-27,-19,-4,2,43,-31,-11,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-10,-1,-1,-19,-2,-11,-19,-10,-28,-19,9,-10,-1,-10,38,23,-9,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-36,-24,44,-26,20,27,-20,-20,-16,-26,-20,-10,26,-20,0,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,-3,-10,-6,-5,-16,-7,-14,-14,-11,-21,-15,4,-11,-5,-11,30,24,-3,-36,-17,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,33,-28,40,30,-32,-11,2,-32,4,-26,-24,22,-9,7,-4,2,-8,-30,-36,-20,19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,41,-30,11,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,69,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-26,-11,-18,-27,54,-20,-34,-18,-26,-18,-1,-18,-18,-19,3,-13,-24,-21,-27,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-26,-4,0,-21,-14,-1,-26,23,-22,-12,11,-18,6,44,-4,-7,-20,-24,-13,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-5,3,-21,2,1,-17,-21,-15,-8,-7,-10,-9,-1,-12,-6,-8,4,13,-3,-29,-12,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='E'; M=10,6,-21,5,16,-23,-10,-7,-17,-2,-13,-7,0,-9,3,-10,2,-6,-14,-27,-17,9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-28,-1,5,-22,-22,-4,-19,23,-15,-6,-3,-14,4,17,-11,-10,-13,-23,-8,3;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-32,1,18,-29,-8,-12,-27,6,-27,-18,-6,25,2,-4,-3,-10,-27,-27,-23,8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-24,-29,-17,5,-29,-20,20,-18,15,15,-18,-20,-15,-18,-17,-9,11,-17,0,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-28,8,31,-25,-19,-3,-23,11,-14,-9,-3,-8,13,6,-5,-9,-21,-26,-15,21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,4,-25,7,15,-20,-16,-8,-26,17,-24,-15,2,-10,5,10,2,-2,-19,-26,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-22,1,7,-18,-20,-6,-13,1,-14,-9,0,-14,5,0,1,6,-9,-25,-7,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00108;
//
ID   COPPER_AMINE_OXID_1_MP; MATRIX.
AC   MP01164;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper amine oxidase topaquinone signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0163703; R2=0.0171485; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=403; N_SCORE=12.917; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=29; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-17,-7,-9,-2,1,-3,-19,-14,-20,-14,9,-17,-10,-11,14,5,-14,-26,-8,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-14,24,-29,31,7,-31,-5,-5,-25,0,-23,-18,13,-13,1,-7,-2,-10,-22,-32,-17,3;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-28,-25,-13,16,-19,-20,-2,-21,5,-2,-19,-11,-20,-19,-18,-13,-7,1,3,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-30,-15,-13,-10,-2,-6,-18,-1,-14,-6,-4,-23,-6,12,-13,-13,-18,4,1,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-1,5,-21,7,6,-17,3,-11,-25,-8,-22,-18,3,-12,-5,-11,11,2,-18,-28,-16,1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,3,-26,0,-4,-25,11,22,-29,-6,-26,-12,14,-18,4,0,3,-10,-27,-28,-11,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-16,-25,-23,-18,21,-25,-10,2,-15,-2,-2,-9,-16,-17,-9,-10,-3,-3,-6,17,-19;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='F'; M=0,-11,-11,-15,-11,18,-12,-3,-2,-9,0,-2,-9,-13,-11,-9,-6,-4,-2,5,18,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=4,11,-12,7,6,-14,-3,-2,-13,-1,-14,-11,13,-7,1,-4,7,0,-12,-20,-12,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-15,-7,4,-4,-17,-7,3,-6,2,0,-10,-11,-4,-8,-7,-5,3,-13,-1,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-18,-12,-16,-18,18,-20,-15,-16,-18,-12,-4,-18,-16,-16,11,4,-3,-29,-20,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-15,-19,-19,-12,-8,-22,-15,-3,-4,5,0,-12,-21,-9,10,-6,6,3,-24,-8,-12;
MA   /M: SY='R'; M=0,-9,-22,-11,-1,-19,-17,-10,-18,13,-15,-9,-5,-16,1,26,-2,0,-8,-23,-13,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-22,4,12,-24,-1,4,-25,-2,-24,-16,10,-12,6,-1,11,-2,-22,-31,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-20,-14,-10,-9,-21,-10,-8,1,-10,-6,-6,-18,-5,15,2,10,-1,-21,-2,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-21,-4,3,-18,-18,-11,-11,10,-16,-8,-1,-16,-2,9,-1,-3,-2,-29,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-29,7,-31,-28,29,-23,15,11,-28,-29,-29,-21,-14,-3,40,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-23,-6,2,-22,-13,-3,-26,14,-24,-13,4,-16,11,37,8,1,-17,-27,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-11,-19,-16,-9,9,-17,-13,-12,-13,-13,-9,-5,-17,-5,-10,8,9,-10,-8,1,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-20,-34,-28,9,-33,-26,30,-24,13,14,-21,-24,-24,-23,-13,-1,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='S'; M=6,-12,-13,-16,-13,1,-14,-18,-3,-16,-10,-8,-5,-16,-14,-15,14,12,4,-26,-8,-13;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-14,-29,-24,-1,-26,-25,22,-21,17,12,-26,-26,-23,-20,-13,-3,30,-25,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=12,-15,-22,-18,-17,-14,20,-16,-16,-18,-6,-8,-11,-20,-16,-19,-4,-11,-11,-16,-11,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,54,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-13,-29,-16,-18,24,-27,19,-2,-9,-3,-2,-11,-29,-9,-9,-17,-9,-12,22,69,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-11,-31,-27,-6,-19,-27,20,-25,8,7,-20,-24,-23,-24,-13,-8,21,-25,-10,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-32,-38,-29,32,-27,-26,2,-25,3,-3,-29,-29,-28,-21,-28,-17,-3,55,21,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-14,20,-28,31,3,-14,-16,5,-23,-4,-18,-18,3,-17,-4,-11,-6,-9,-20,-14,15,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-32,-36,-35,-27,23,-23,-19,-8,-19,-6,-3,-30,-28,-20,-17,-29,-18,-15,80,28,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-19,-24,-21,-12,-4,-29,-6,14,-10,3,11,-17,-21,-10,-12,-14,-8,13,-18,6,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,59,-30,-20,6,-30,22,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-5,-29,-5,-6,-1,-22,34,-17,-1,-12,0,-3,-21,0,3,-13,-13,-18,-10,25,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-15,-28,-13,1,-20,-19,-12,-9,-9,-6,-1,-15,21,3,-13,-8,-8,-15,-25,-16,0;
MA   /M: SY='B'; M=-8,29,-20,29,6,-26,-6,-2,-26,-4,-28,-22,27,-13,-1,-7,15,7,-22,-39,-19,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=21,-10,-12,-15,-12,-16,-3,-20,-8,-13,-12,-9,-7,-14,-12,-16,13,11,4,-27,-17,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-38,-28,1,-37,-26,44,-28,23,24,-21,-21,-18,-27,-21,-10,26,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-28,11,39,-28,-14,-4,-29,12,-21,-17,0,-5,13,7,0,-6,-26,-27,-18,25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-8,-28,-22,8,-26,-24,7,-22,3,0,-20,-12,-24,-21,-10,-1,11,-21,-5,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00895;
//
ID   COPPER_AMINE_OXID_2_MP; MATRIX.
AC   MP01165;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Copper amine oxidase copper-binding site signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9337716; R2=0.0141751; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=883; N_SCORE=17.440; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=111; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,5,-28,8,3,-26,-19,-2,-14,4,-15,-8,1,-14,6,2,-6,-10,-13,-26,-10,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,17,-28,14,4,-29,1,-2,-27,4,-29,-18,21,-2,4,-2,1,-8,-29,-31,-20,3;
MA   /M: SY='B'; M=-11,38,-22,36,8,-28,-4,3,-28,-1,-30,-24,38,-15,0,-5,10,-1,-27,-40,-20,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-27,8,36,-26,-17,-3,-27,12,-19,-16,-1,-6,14,14,-1,-9,-24,-26,-18,24;
MA   /M: SY='N'; M=-6,23,-19,14,3,-23,-8,0,-20,-2,-25,-17,29,-14,6,-3,14,10,-21,-35,-17,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-5,5,-22,10,7,-20,-19,-12,-14,0,-9,-10,-3,-13,-4,-6,-3,1,-7,-29,-14,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,26,-24,18,-3,-26,20,0,-29,-6,-30,-21,37,-19,-6,-7,6,-7,-30,-34,-23,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-22,2,15,-22,-20,6,-21,2,-17,-10,1,-9,10,-1,6,13,-17,-28,-9,12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-25,-20,-18,-1,-31,-21,23,-26,27,13,-19,-23,-17,-22,-22,-10,12,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,15,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-11,-28,-23,4,-19,-25,12,-18,3,2,-22,-23,-24,-20,-4,-1,26,-21,-8,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30,19,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,131,30,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-17,-23,-19,-17,-3,-28,25,6,-16,-1,6,-12,-25,-11,-13,-13,-10,9,-20,15,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-22,-15,-30,-23,35,-23,-22,1,-22,3,-2,-17,-23,-28,-19,-7,2,8,-8,8,-23;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-20,-32,-23,28,-27,-16,13,-22,15,19,-18,-23,-20,-17,-15,-1,8,-11,9,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-19,-20,-15,-3,-26,-5,6,-20,14,6,-12,-20,-12,-15,-7,12,3,-25,-1,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-21,-37,-30,30,-34,-26,26,-27,14,10,-23,-26,-30,-24,-17,-7,24,-12,8,-30;
MA   /M: SY='P'; M=0,-20,-32,-14,-5,-25,-19,-21,-12,-11,-22,-15,-20,60,-13,-20,-7,-7,-15,-29,-26,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-6,-25,-9,-3,-20,-15,30,-25,5,-17,-6,1,-17,5,22,-5,-11,-18,-24,-2,-3;
MA   /M: SY='A'; M=14,-16,-19,-17,-9,-16,-13,-19,-6,-14,-8,-8,-14,12,-12,-18,2,-1,-3,-27,-19,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,63,26,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-34,-33,-39,-30,25,-29,-27,8,-25,1,-2,-29,-27,-26,-23,-27,-17,1,52,18,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=3,-27,-19,-32,-25,-2,-29,-27,30,-24,16,12,-23,-23,-22,-24,-13,-5,29,-23,-6,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-13,-16,-23,-16,-4,-20,-7,9,-10,9,35,-13,-16,-4,-10,-6,11,6,-24,-4,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-22,-35,-14,-5,-23,-22,-21,-12,-13,-18,-13,-22,67,-13,-20,-12,-9,-19,-29,-25,-13;
MA   /M: SY='G'; M=11,-11,-20,-15,-14,-20,16,-18,-19,-9,-16,-11,-6,-17,-13,-6,3,-1,-8,-22,-20,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,23,-26,23,29,-29,-12,5,-26,5,-25,-18,23,-9,16,0,4,-6,-30,-33,-19,23;
MA   /M: SY='S'; M=-7,-7,-12,-10,-10,-17,-8,-14,-23,-8,-24,-18,0,-6,-9,-5,2,0,-20,-8,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-18,-33,-27,-3,-30,-29,32,-23,11,11,-23,-23,-23,-24,-11,-4,35,-25,-7,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,-26,-12,-16,-20,32,-4,-26,-19,-15,-10,-3,-20,-15,-16,-3,-9,-20,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-27,-19,-35,-25,47,-26,-20,4,-27,18,4,-21,-27,-30,-20,-18,-9,3,-2,15,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-21,-29,-19,17,-26,-14,11,-16,25,24,-22,-25,-15,-12,-23,-10,5,-14,5,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-5,-30,-3,12,-25,-20,0,-29,28,-21,-10,0,-15,18,47,-7,-10,-23,-21,-11,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-34,-10,3,-15,-20,14,-28,7,-20,-12,-7,-19,5,24,-15,-16,-26,13,3,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00895;
//
ID   RNA_POL_BETA_MP; MATRIX.
AC   MP01166;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA polymerases beta chain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1778069; R2=0.0156046; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=184; N_SCORE=8.039; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-11,-20,-10,2,-16,-24,-13,-7,4,-6,-2,-11,-12,0,0,-9,-6,-4,-24,-9,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-19,-19,-24,-17,9,-26,-11,6,-12,5,9,-15,-22,-11,-11,-11,-2,3,-11,12,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-17,-31,-27,3,-26,-27,26,-23,13,10,-24,-26,-25,-22,-12,-4,32,-24,-6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-25,-6,2,-22,-18,0,-26,26,-20,-8,-1,-16,5,30,-10,-10,-18,-21,-7,2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-17,-31,-27,9,-30,-24,25,-22,13,14,-24,-26,-24,-20,-13,-1,30,-21,0,-26;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-21,-12,-8,1,-17,0,-13,5,-10,-6,-6,-17,-3,14,-4,-1,-10,-5,16,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-17,-29,-24,1,-29,-24,31,-22,17,14,-22,-22,-21,-20,-15,-5,31,-21,-4,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=1,-16,-20,-20,-13,-9,-14,-14,-5,-2,-5,1,-11,-20,-8,10,-6,-5,3,-21,-10,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-24,-6,2,-19,-21,-6,-9,4,-14,-5,-4,-13,10,-1,1,2,-9,-22,-4,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-26,-1,14,-25,-15,-8,-19,10,-20,-11,-2,-4,8,2,2,-3,-16,-27,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-5,-27,-6,0,-20,-20,-1,-28,24,-20,-11,1,-18,7,51,-5,-2,-18,-22,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=-13,5,-28,3,1,-20,-19,-6,-13,10,-18,-9,7,-12,2,9,-6,-8,-14,-24,-8,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-29,-15,-11,-13,-24,-18,6,-18,2,1,-13,15,-13,-20,-14,-9,-4,-26,-13,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-25,-6,5,-20,-21,-3,-6,-4,-6,-1,1,-15,17,-4,-3,-2,-12,-25,-10,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-22,-18,-14,-7,-29,-21,20,-18,10,10,-18,-18,-15,-19,-14,-7,19,-26,-8,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-29,55,13,-34,-13,-4,-29,-3,-24,-24,14,-12,-3,-12,-2,-9,-20,-38,-18,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-20,-35,-27,31,-29,-19,18,-25,19,19,-23,-26,-25,-19,-20,-9,15,-10,10,-25;
MA   /M: SY='C'; M=19,-8,21,-15,-12,-19,-9,-19,-18,-15,-19,-16,-5,-17,-12,-18,16,8,-6,-34,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=3,0,-19,-3,-8,-23,24,-12,-27,-12,-28,-19,10,-15,-8,-11,20,5,-19,-32,-23,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-28,-15,-5,-16,-22,-4,-18,20,-13,-3,-5,-21,5,53,-11,-9,-10,-21,-9,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-1,-26,-2,-2,-19,-18,75,-26,-10,-19,-3,8,-18,6,-3,-4,-11,-24,-30,12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-28,-9,-18,-29,61,-19,-37,-19,-29,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-27,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,16,-26,8,11,-31,-12,14,-20,5,-24,-8,24,-14,34,6,3,-7,-30,-28,-12,22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-15,-28,-25,-3,-31,-28,26,-21,8,8,-20,-22,-22,-21,-6,9,31,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-12,-33,-27,-1,-32,-26,31,-24,17,16,-24,-25,-22,-24,-16,-6,29,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='S'; M=12,2,-15,-2,-5,-22,13,-11,-22,-10,-27,-18,12,-13,-5,-12,23,6,-15,-33,-22,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-26,-15,-7,-7,-23,-5,-6,6,-4,1,-10,-20,1,12,-11,-7,-6,-13,8,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-20,-23,-26,-19,-7,-28,-23,21,-16,6,7,-13,-18,-14,-18,-6,0,16,-24,-6,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-21,-19,-8,-2,-21,-15,4,-15,10,2,-19,-20,-11,-15,-12,-7,3,-6,1,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-11,4,-30,13,8,-28,-14,-5,-25,-3,-26,-20,-2,31,-2,-7,-1,-5,-25,-31,-20,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-8,-24,-9,5,-16,-22,-7,-7,-2,-4,-3,-7,-14,5,2,-6,-4,-6,-25,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-21,2,18,-21,-17,-8,-14,-2,-15,-12,3,-10,6,-6,7,6,-11,-30,-16,12;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-29,56,28,-37,-12,1,-37,2,-28,-27,18,-8,5,-7,1,-9,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-25,-25,-32,-22,3,-23,-9,16,-16,19,40,-24,-23,-7,-14,-24,-13,5,4,4,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-36,-14,-4,-24,-20,-17,-13,-11,-20,-7,-20,70,-9,-19,-12,-10,-23,-28,-25,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-22,-24,-27,-22,39,-25,2,-3,-17,1,-2,-18,-27,-20,-15,-16,-9,-6,17,45,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-6,-19,-6,-1,-7,-22,-12,-4,-13,6,0,-9,-16,-7,-12,-3,10,-4,-25,-4,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,12,19,-25,-15,-6,-23,3,-22,-16,4,4,6,-5,0,-7,-23,-28,-17,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00896;
//
ID   RIBOSOMAL_L17_MP; MATRIX.
AC   MP01167;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L17 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7336454; R2=0.0169886; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=497; N_SCORE=14.167; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-9,-20,-10,-18,-4,-17,-8,-10,-7,-3,-11,-12,-8,-17,6,-1,0,-22,-17,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-19,-29,-20,4,-25,-12,19,-20,31,34,-23,-24,-11,-15,-21,-5,12,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-31,-22,23,-28,-18,14,-26,30,14,-24,-28,-22,-18,-22,-8,9,-13,8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-26,-8,1,-22,-15,-5,-26,24,-21,-11,1,-16,7,40,-3,-6,-17,-22,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,29,-20,15,1,-23,-1,5,-20,-1,-27,-18,43,-17,4,-2,11,0,-26,-36,-19,2;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-26,-15,-1,-24,-8,15,-16,28,35,-22,-23,-2,-12,-22,-10,6,-20,-1,-8;
MA   /M: SY='A'; M=21,-15,-8,-21,-16,-12,-14,-23,3,-14,-3,-3,-14,-17,-16,-18,5,8,14,-26,-15,-16;
MA   /M: SY='T'; M=2,-6,-1,-14,-13,-13,-17,-19,-6,-11,-11,-8,-2,-17,-12,-12,9,18,1,-31,-14,-13;
MA   /M: SY='S'; M=15,1,-13,1,4,-24,-4,-10,-20,-7,-23,-17,4,-10,3,-11,23,8,-12,-33,-19,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-31,-22,14,-30,-21,20,-29,44,18,-29,-30,-22,-20,-28,-9,13,-19,1,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-23,-37,-28,22,-34,-25,28,-29,24,14,-23,-26,-26,-24,-22,-9,19,-13,7,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-26,-3,12,-20,-20,-5,-18,13,-15,-8,-2,-12,7,13,-4,-5,-15,-24,-10,8;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-28,1,0,-13,-18,64,-24,-8,-19,-5,10,-20,5,-2,-6,-13,-25,-23,18,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-30,10,31,-30,8,-6,-33,3,-24,-19,2,-7,7,-4,0,-13,-29,-27,-22,19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-26,-9,1,-22,-19,-3,-19,17,-17,-5,-2,-16,11,29,-4,-6,-13,-23,-10,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,49,-30,21,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,29,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-23,-1,15,-21,-21,-10,-17,12,-17,-10,-4,-10,6,4,0,2,-10,-26,-13,10;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-10,-10,-12,-11,0,-11,-9,-10,21,45,0,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-11,-10,-10,-11,-17,-20,-11,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,19,47,-1,-30,-11,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-15,-23,-14,-4,-9,-26,-11,3,-8,12,6,-16,-21,-5,-8,-16,-8,3,-24,-6,-5;
MA   /M: SY='P'; M=11,-10,-23,-11,-4,-21,-13,-17,-15,-6,-18,-14,-11,22,-8,-14,3,4,-12,-24,-17,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,-5,-21,-12,-18,-3,-20,-9,-12,-6,-8,-12,-13,-12,-20,6,-1,0,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-29,-2,8,-26,-20,-10,-29,45,-28,-10,-1,-11,8,30,-10,-10,-19,-19,-9,8;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-25,11,35,-26,-16,-5,-23,5,-18,-17,1,-6,10,-3,1,-7,-20,-29,-19,22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-17,-27,-20,4,-27,-22,17,-25,30,13,-25,-26,-20,-19,-17,-1,16,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-8,3,-23,-18,0,-29,27,-21,-9,0,-18,15,57,-7,-9,-21,-21,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-27,-7,0,-24,-13,-10,-24,12,-25,-14,-2,8,2,20,2,-3,-19,-27,-17,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-23,-17,13,-28,4,6,-15,2,4,-16,-25,-15,-10,-14,-8,6,-8,21,-18;
MA   /M: SY='V'; M=15,-22,-14,-28,-22,-5,-20,-25,16,-18,6,4,-21,-21,-21,-21,-5,-1,24,-23,-10,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-32,-5,5,-27,-20,-5,-26,26,-26,-12,-5,11,5,22,-9,-10,-22,-23,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-22,6,-29,-16,24,-24,36,31,-26,-26,-15,-19,-25,-10,14,-20,0,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-27,-38,-29,0,-38,-29,45,-28,18,18,-20,-21,-21,-28,-18,-7,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-9,-9,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-9,-10,20,49,-1,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-24,-14,-1,-26,-14,5,-11,21,10,-21,-25,-11,-3,-22,-9,1,-13,-2,-13;
MA   /M: SY='A'; M=33,-9,-14,-16,-11,-22,14,-19,-17,-12,-16,-13,-6,-12,-11,-19,11,0,-7,-22,-22,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,49,-29,-10,0,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-26,0,5,-22,-18,-8,-19,15,-17,-9,-2,-16,3,21,-6,-7,-11,-25,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,12,-28,14,-5,-31,31,-11,-34,-11,-29,-22,12,-12,-11,-15,2,-13,-28,-28,-25,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-6,18,-20,20,2,-23,-9,-9,-21,-8,-20,-18,11,-12,-5,-11,12,11,-14,-35,-16,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-18,-29,-21,13,-29,-22,16,-25,29,12,-26,-26,-22,-19,-20,-3,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='H'; M=6,2,-20,-5,-4,-19,-11,35,-20,-8,-17,-7,9,-15,1,-7,3,-3,-17,-28,-2,-4;
MA   /M: SY='A'; M=18,8,-15,-1,-4,-21,0,-7,-17,-5,-21,-15,14,-14,-5,-10,13,2,-12,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-29,-9,0,-19,-20,5,-27,24,-18,-8,2,-20,9,58,-10,-10,-20,-21,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-29,-9,0,-20,-19,-1,-30,29,-21,-10,0,-19,10,65,-8,-9,-20,-21,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-9,-25,-10,4,-21,-21,-2,-8,-4,-3,1,-8,-12,17,-1,-7,-8,-12,-23,-9,9;
MA   /M: SY='A'; M=27,-17,-12,-23,-15,-12,-13,-23,5,-14,0,-2,-17,-17,-16,-20,0,-1,16,-24,-15,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-22,-20,-27,-18,18,-23,-14,4,-18,12,5,-18,-23,-17,-15,-14,-7,3,-12,5,-17;
MA   /M: SY='A'; M=14,-2,-18,-4,-2,-24,1,-11,-21,1,-22,-14,2,-12,1,-2,12,1,-13,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-15,-28,-17,-10,8,-24,-4,-11,-1,-7,-5,-11,-23,-7,7,-14,-10,-11,6,16,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-31,-23,4,-32,-19,27,-28,33,18,-24,-26,-19,-22,-23,-8,17,-21,0,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00897;
//
ID   RIBOSOMAL_S27E_MP; MATRIX.
AC   MP01168;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S27e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0851460; R2=0.0140972; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1249; N_SCORE=22.683; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-24,-20,-10,-3,-22,-10,1,-2,6,17,-14,-15,-5,0,-14,-8,-2,-20,-4,-8;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-7,-23,-9,-2,-10,-14,-10,-18,21,-17,-4,-4,-14,-1,15,-8,-8,-10,-15,-5,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-19,-7,-7,-13,-20,-12,-2,-1,-7,-3,-7,-16,-7,7,-6,-3,7,-25,-11,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-20,-23,-15,4,-26,-15,13,-16,29,13,-22,-23,-14,-12,-22,-9,7,-15,3,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-19,-27,-22,0,-28,-24,24,-20,7,7,-20,-8,-20,-20,-11,-2,23,-21,-6,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-31,-5,6,-26,-18,-6,-18,4,-22,-10,-10,34,13,-3,-7,-9,-24,-19,-13,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-20,2,7,-20,-6,3,-18,2,-18,-7,10,-12,10,5,6,0,-18,-26,-12,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-31,-12,-4,-22,-19,-19,-10,-11,-20,-13,-17,61,-10,-18,-8,-5,-17,-26,-22,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,9,-25,3,3,-23,-12,6,-26,20,-27,-13,19,-16,6,25,1,-4,-23,-29,-12,3;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-14,-3,-5,-22,14,-13,-24,-12,-29,-20,7,-12,-5,-12,30,13,-14,-35,-22,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-28,-11,-7,-1,-17,9,-21,10,-16,-7,-2,-21,-2,22,-11,-11,-18,-10,11,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-21,-31,-22,7,-29,-16,24,-24,33,26,-26,-27,-17,-19,-24,-9,16,-19,3,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-16,9,-29,13,10,-26,-17,-3,-29,22,-22,-14,6,-15,6,30,-7,-9,-22,-26,-13,6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-32,-30,32,-22,11,11,-26,-27,-27,-22,-11,0,43,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,1,14,-29,-20,-8,-29,40,-27,-10,0,-10,12,26,-7,-7,-20,-21,-11,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-14,-34,-11,-1,-24,-21,-14,-13,-3,-19,-10,-11,39,-1,-4,-10,-9,-20,-27,-20,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,26,-29,35,10,-35,7,-4,-36,2,-29,-23,15,-13,0,-6,0,-11,-29,-32,-21,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-6,-27,-8,-6,-7,26,-13,-27,-15,-18,-15,1,-19,-15,-15,-4,-14,-23,-17,-14,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-7,32,-21,15,0,-21,-2,13,-21,2,-28,-17,49,-19,1,0,8,-2,-27,-37,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-6,-26,-4,20,-19,-26,-11,-3,-3,-7,-5,-8,-10,5,-6,-5,-5,-5,-27,-13,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-3,12,-32,-19,2,-17,4,-18,-3,0,-10,40,4,7,6,-22,-23,-10,26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-15,-24,-21,-4,-28,-26,18,-18,4,4,-15,-19,-19,-18,0,19,24,-27,-7,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-30,-28,-1,-31,-29,30,-21,10,10,-24,-25,-25,-21,-9,3,39,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=9,3,-16,4,-3,-24,12,-12,-25,-11,-28,-20,7,-12,-5,-13,24,6,-15,-34,-22,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-27,0,1,-21,-16,59,-28,1,-22,-6,12,-18,8,12,-3,-12,-26,-30,6,1;
MA   /M: SY='A'; M=26,-11,-19,-14,-5,-23,-6,-18,-15,-10,-19,-15,-10,19,-8,-18,9,0,-10,-26,-23,-8;
MA   /M: SY='S'; M=10,-2,-16,-6,1,-23,-9,-2,-17,-6,-19,-10,2,-11,10,-7,18,12,-12,-29,-13,5;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-7,-15,-15,-11,3,-18,-15,-11,-9,-10,-6,-3,-15,-11,-2,11,25,-4,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-23,-16,-7,-13,-25,-16,1,-4,-7,-2,-16,-4,-7,-5,-7,-3,7,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-12,-31,-29,-1,-30,-30,30,-21,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,-1,45,-28,-9,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-22,-14,-6,-15,-20,-10,-11,9,-7,0,-7,-16,1,17,-5,3,-6,-22,-9,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-12,-22,-16,-13,-9,-12,-11,4,-18,8,3,-7,-21,-10,-15,-11,-9,0,-25,-10,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-20,-17,-16,-11,-15,-19,9,-14,-7,-1,-4,-19,-13,-15,3,2,10,-29,-12,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=4,-8,-27,-9,-15,-29,53,-17,-35,-17,-28,-18,0,-18,-13,-17,5,-14,-26,-22,-27,-14;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-18,-8,0,-20,-14,-11,-19,6,-17,-11,-1,-12,3,10,8,11,-10,-25,-14,1;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-15,-15,-11,-11,-24,-20,2,-11,-4,-3,-12,-10,-11,-12,4,20,12,-29,-12,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-29,43,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=16,-19,18,-25,-22,-14,-12,-26,-3,-19,-7,-6,-18,-24,-22,-22,-2,-4,13,-30,-20,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-28,0,20,-22,-23,-3,-16,10,-15,-8,-3,-10,17,6,-4,-4,-18,-20,-5,17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-30,-20,-19,85,-10,-20,-8,-9,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-13,-11,-9,-11,-20,-17,-11,-4,-10,-7,-1,-11,-7,-2,14,40,-2,-28,-10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-11,-20,-28,66,-20,-39,-20,-30,-20,-2,-20,-20,-20,-2,-20,-30,-12,-27,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-29,-3,8,-27,-22,-12,-21,36,-24,-8,-4,-6,6,20,-10,-9,-14,-22,-11,6;
MA   /M: SY='A'; M=23,-13,-16,-17,-12,-16,6,-18,-12,-13,-5,-7,-9,-16,-12,-14,3,-4,-6,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,0,6,-24,-18,-8,-22,26,-22,-10,3,-13,5,23,-5,-6,-16,-23,-12,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-22,-32,-24,3,-33,-25,30,-27,28,16,-22,-24,-20,-23,-19,-2,20,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-18,-11,-4,-14,-18,-15,-9,1,-7,-4,-6,-15,-4,-2,3,11,-2,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='G'; M=8,-3,-24,-3,2,-27,20,-14,-27,-8,-21,-16,-2,-12,-3,-13,4,-6,-20,-23,-22,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-30,7,20,-31,1,5,-31,9,-25,-14,2,-10,12,2,-3,-13,-28,-25,-15,15;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-24,17,-31,-28,-6,-33,-29,17,-25,4,4,-21,-27,-24,-25,-10,-1,22,-32,-12,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-19,-19,-13,-7,-23,-20,11,-13,6,4,-15,-20,-13,-13,-4,-1,13,-27,-9,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-6,-27,-4,21,4,-23,-6,-21,4,-12,-12,-6,-13,0,8,-8,-10,-19,-16,-3,11;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-20,-22,-23,-18,-5,-27,-16,10,-6,0,3,-15,-23,-12,6,-9,-2,15,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-22,-25,-17,1,-28,-15,11,-12,23,13,-22,-26,-13,-3,-21,-9,8,-19,1,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-30,13,18,-31,4,-8,-34,14,-27,-18,3,-10,4,3,-3,-13,-27,-26,-19,11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00898;
//
ID   RIBOSOMAL_L21_MP; MATRIX.
AC   MP01169;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L21 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6508126; R2=0.0155676; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=442; N_SCORE=12.522; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-15,-19,-15,-17,3,-20,-6,-13,-10,-7,-10,-16,-14,-17,4,-3,3,-22,-17,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-19,-7,-1,-19,-15,-13,-16,10,-19,-9,-1,-12,0,6,8,9,-7,-27,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-14,-31,-29,-1,-30,-29,32,-21,11,11,-27,-27,-27,-22,-11,-2,43,-27,-9,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-3,-20,-6,0,-17,-20,-8,-11,5,-14,-6,-1,-14,-1,2,2,9,-5,-27,-10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-6,-20,-16,-20,11,-21,-15,-16,-12,-10,-10,-16,-15,-21,3,-6,-5,-23,-21,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-23,2,19,-22,-21,-8,-19,10,-16,-12,-2,-9,6,6,1,5,-13,-28,-14,12;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-33,-29,2,-33,-27,35,-23,15,14,-26,-27,-25,-23,-15,-4,39,-24,-2,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-21,-23,-12,-3,-26,-20,14,-17,20,10,-22,-23,-14,-15,-17,-7,12,-23,-6,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,8,-25,10,16,-27,-5,-2,-27,7,-24,-16,7,-10,7,1,5,-5,-22,-29,-17,11;
MA   /M: SY='H'; M=-14,1,-26,2,8,-24,-18,55,-26,-4,-20,-4,6,-16,19,1,-4,-14,-27,-28,5,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-15,-20,-17,-16,-11,9,-17,-12,-15,-7,-6,-10,-21,-17,-13,-6,-8,-6,-21,-12,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-8,1,-20,-21,-6,-24,29,-15,-7,-2,-17,7,42,-11,-9,-17,-21,-9,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,9,-27,13,-1,-31,24,-6,-34,-9,-26,-19,6,-15,-5,-13,1,-13,-26,-27,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-30,8,15,-29,-17,-7,-28,20,-26,-16,1,7,7,12,-5,-9,-24,-27,-17,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,0,9,-29,-20,-10,-29,48,-29,-10,0,-10,9,29,-9,-8,-19,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-20,-35,-29,0,-35,-29,39,-25,17,15,-25,-25,-24,-25,-15,-5,37,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-13,-21,-17,-13,-8,-25,-18,6,-4,-2,1,-9,-19,-10,-2,-6,3,9,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-18,-30,-25,-3,-29,-27,29,-22,10,9,-20,-22,-21,-23,-8,0,30,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-29,-23,32,-31,-4,10,-20,9,5,-20,-27,-19,-16,-19,-9,4,4,34,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,47,-28,-10,0,-12,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-17,-25,-22,-16,21,-25,7,-3,-5,0,10,-14,-24,-10,-5,-17,-10,-6,2,31,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-29,-5,4,-25,-20,-1,-24,30,-22,-8,1,-15,11,35,-8,-9,-18,-21,-8,5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-27,-6,0,-23,-14,-7,-24,10,-24,-15,3,8,1,23,0,-4,-21,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,12,47,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=-9,0,-27,-1,7,-27,-20,-11,-27,41,-27,-10,0,-10,7,24,-6,-1,-17,-21,-10,7;
MA   /M: SY='H'; M=-11,8,-27,6,-1,-25,3,20,-30,4,-26,-13,15,-17,1,5,-2,-12,-26,-28,-9,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-11,-21,-14,-13,10,-21,9,-7,-12,-8,-3,-7,-21,-8,-10,0,4,-7,-7,26,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-28,-6,3,-21,-20,16,-24,18,-16,-3,1,-17,10,31,-10,-12,-20,-23,-4,4;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-26,-6,3,-23,-20,-8,-25,33,-22,-9,-2,-15,7,38,-8,-6,-16,-22,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-5,-28,-6,4,-21,-21,-6,-23,30,-21,-7,-1,-14,8,30,-9,-7,-17,-19,-8,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-25,-9,-1,-18,-20,0,-10,6,-11,1,-1,-17,14,9,-6,-5,-13,-19,-2,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-29,-3,-3,-11,-21,89,-27,-11,-17,0,7,-21,6,-2,-11,-19,-27,-25,23,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,31,-20,-10,0,-20,10,69,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-29,-1,18,-38,-20,8,-20,10,-20,-1,0,-10,55,12,0,-8,-28,-20,-10,36;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-3,-26,-2,3,-20,-17,-3,-20,0,-20,-13,-2,4,2,-5,-6,-8,-22,-13,-8,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-23,-24,-26,-21,25,-28,-2,8,-19,17,10,-20,-28,-17,-14,-21,-9,1,2,33,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-11,-10,-9,-20,-20,-9,-11,-8,-9,-1,-11,-10,-10,18,46,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-24,-6,4,-20,-20,-5,-18,16,-16,-8,-3,-16,7,23,-6,-7,-12,-22,-9,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-33,-27,8,-33,-27,31,-26,23,15,-27,-27,-25,-23,-19,-6,31,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-8,-25,-9,1,-18,-23,-10,-13,18,-9,-1,-7,-15,2,15,-10,-5,-8,-22,-8,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-7,6,-18,6,3,-18,-17,-12,-13,-5,-12,-11,2,-14,-5,-8,4,10,-6,-31,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-1,7,-19,9,6,-27,6,-9,-29,0,-26,-19,7,-12,-2,-4,8,-4,-21,-31,-21,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-29,5,-38,-28,43,-30,22,18,-22,-22,-22,-28,-21,-10,27,-19,1,-29;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-4,-14,-8,-6,-12,-16,-9,-8,-5,-12,-7,1,-15,-7,-7,2,1,-4,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-15,-17,-14,-9,-4,-9,-8,-15,-4,-3,-6,-18,-13,-16,-2,-5,-4,-23,-11,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-26,7,-2,-23,3,0,-23,-1,-23,-14,12,-15,-4,-5,-2,-10,-20,-27,-13,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-27,-4,-1,-26,22,-7,-31,0,-25,-15,2,-15,-5,-5,-1,-13,-24,-21,-17,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-26,0,6,-27,-12,-10,-26,26,-26,-13,1,-7,4,16,-1,-4,-18,-24,-14,4;
MA   /M: SY='A'; M=7,0,-20,-2,3,-17,-13,-8,-12,-4,-15,-11,-1,-7,-3,-10,2,-2,-8,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-18,-28,-19,-6,-9,-28,-18,9,-11,2,2,-15,-2,-8,-14,-12,-8,1,-23,-8,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00899;
//
ID   RIBOSOMAL_L6E_MP; MATRIX.
AC   MP01170;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L6e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1905141; R2=0.0132222; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1342; N_SCORE=21.925; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-12,-17,-12,-5,-11,-16,-11,-3,-15,5,0,-8,-18,2,-11,4,3,-5,-28,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-23,0,11,-26,-16,30,-18,3,-16,0,3,-10,34,5,-3,-10,-23,-18,0,21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-27,-17,4,-28,-20,14,-27,37,14,-28,-11,-18,-20,-27,-10,4,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='E'; M=0,5,-25,9,26,-30,-4,-4,-27,1,-22,-16,2,-7,14,-5,7,-6,-24,-28,-20,20;
MA   /M: SY='D'; M=-2,21,-18,29,8,-28,-4,-6,-28,-6,-30,-24,14,-10,0,-10,23,8,-18,-40,-20,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-23,-1,-12,-23,41,-9,-29,-12,-25,-17,15,-17,-12,-12,3,-12,-25,-22,-23,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-16,-22,-16,2,-26,-20,8,-22,25,8,-18,-22,-16,-16,-9,15,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,44,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,16,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-24,-23,-27,-20,33,-28,6,2,-24,17,7,-19,-28,-20,-15,-22,-12,-3,-3,26,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-24,-3,3,-24,-17,-12,-20,29,-24,-9,0,-13,3,15,-2,-5,-10,-24,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,32,-25,23,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-30,-10,-13,-27,40,-13,-37,-3,-27,-17,0,-20,-10,10,-3,-17,-27,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-12,-32,-30,13,-30,-28,25,-22,10,8,-28,-30,-32,-20,-12,-2,42,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-13,-25,-23,-3,-28,-27,20,-18,5,5,-18,-22,-22,-18,-2,15,30,-28,-8,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-12,19,-25,9,-3,-22,4,35,-27,-7,-27,-13,34,-20,0,-3,2,-10,-30,-33,-8,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-3,-25,-5,9,-32,-15,17,-19,2,-17,-3,-1,-12,34,1,1,-9,-22,-22,-8,21;
MA   /M: SY='R'; M=1,-7,-25,-9,1,-23,-15,-8,-25,27,-21,-10,-3,-14,5,34,-5,-7,-15,-20,-13,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=6,-6,-12,-15,-12,-8,-18,-20,-5,-13,0,-5,-6,-13,-12,-13,10,32,2,-27,-10,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-11,36,-23,44,12,-32,-6,-1,-32,-3,-30,-26,24,-12,0,-8,12,-1,-25,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='S'; M=5,3,-15,5,15,-23,-5,-7,-23,-5,-27,-20,7,-7,5,-7,30,12,-15,-37,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-29,-1,-14,-30,52,-15,-37,-12,-30,-20,7,-19,-15,-14,0,-17,-29,-23,-27,-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,14,-23,7,5,-25,-10,-3,-25,23,-30,-15,22,-13,5,13,5,-2,-22,-30,-15,5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-5,-35,5,30,-30,-20,-10,-25,0,-25,-20,-10,45,5,-10,-5,-10,-30,-30,-25,15;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,5,23,-30,-20,-7,-30,39,-27,-13,0,-7,13,22,-7,-10,-23,-23,-13,18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-15,-25,-20,-15,31,-25,39,-15,-20,-5,0,-5,-25,-15,-10,-15,-15,-15,-10,25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,0,-21,-7,-11,-7,-21,-12,4,-16,8,0,4,-21,-12,-14,-8,2,-2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-5,3,-17,-1,-7,-15,-18,-14,-8,0,-13,-8,4,-17,-9,-4,4,14,2,-31,-13,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,26,-27,36,24,-33,-12,-4,-32,6,-24,-22,8,-7,4,-5,1,-8,-24,-32,-19,14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00900;
//
ID   RIBOSOMAL_L21E_MP; MATRIX.
AC   MP01171;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L21e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4218040; R2=0.0157898; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=816; N_SCORE=18.296; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=69; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-30,-4,0,-23,-4,18,-31,13,-23,-10,5,-18,5,28,-7,-13,-25,-24,-7,-1;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-27,-10,-15,-28,48,-18,-35,-10,-27,-18,-1,-18,-14,-11,1,-16,-25,-20,-26,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-20,-22,-16,-6,-22,-19,9,-12,5,5,-17,-16,-13,-12,-9,0,11,-23,-6,-16;
MA   /M: SY='S'; M=4,-11,-18,-11,-6,-15,-14,-16,-4,-13,-12,-9,-6,0,-9,-15,10,4,-1,-31,-16,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-10,-31,-8,-3,-23,-14,4,-20,-4,-23,-13,-5,28,-4,-3,-5,-7,-22,-28,-15,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-22,-29,-21,1,-30,-23,22,-25,25,14,-25,-13,-19,-21,-20,-6,15,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-15,-4,-2,-21,-1,-11,-20,-7,-24,-15,5,-11,3,-6,25,17,-12,-33,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-24,-10,-2,-17,-21,-9,-21,17,-14,-8,-2,-14,2,32,-3,8,-12,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-1,-20,-22,-25,-18,12,-23,-8,6,-15,8,6,-18,-23,-14,-15,-13,-7,2,-4,20,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-31,-22,6,-30,-17,25,-24,32,26,-25,-25,-16,-19,-23,-8,15,-18,3,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-27,-2,13,-25,-20,8,-20,9,-17,-6,-2,-12,23,11,-2,-5,-20,-21,-4,17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-21,10,25,-25,-19,-6,-21,5,-18,-14,3,-8,10,-2,3,1,-19,-30,-16,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-10,13,-27,16,20,-29,-15,-5,-29,23,-27,-17,9,-9,9,12,0,-5,-23,-29,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-3,-24,1,6,-18,-23,-13,-4,-4,-9,-7,-7,-9,-4,-7,-6,-7,0,-29,-14,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-30,-9,-19,-30,67,-19,-39,-19,-30,-20,3,-20,-19,-19,0,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,46,28,-38,-14,2,-34,4,-26,-22,12,-8,16,-4,0,-10,-30,-34,-18,22;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-13,-26,-15,-9,-4,-24,-3,-4,7,-2,6,-9,-20,-3,7,-14,-8,-6,-11,12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-7,7,-24,10,-1,-22,-17,31,-18,-10,-15,-8,4,-17,-2,-10,-4,-9,-13,-31,-2,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-24,4,-3,-19,-22,-15,-9,8,-10,-6,-6,-17,-7,-1,-9,-6,0,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-14,-33,-27,-4,-26,-27,27,-27,13,10,-19,-23,-21,-26,-15,-7,20,-24,-7,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-26,36,18,-28,-8,4,-28,2,-26,-20,31,-12,4,-4,3,-6,-28,-37,-19,11;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-34,-9,-4,-28,-2,-19,-23,-12,-29,-20,-13,56,-11,-19,-2,-8,-26,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='S'; M=18,-2,-10,-6,-3,-19,-2,-13,-17,-10,-23,-17,4,-10,-3,-12,31,18,-7,-34,-19,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-19,-33,-28,11,-30,-25,26,-23,10,11,-25,-26,-25,-21,-14,-5,29,-12,2,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-5,-31,-5,5,-27,-21,41,-18,-3,-17,2,0,-5,26,0,-7,-14,-25,-25,1,13;
MA   /M: SY='K'; M=-9,6,-27,5,6,-25,-16,0,-27,28,-27,-12,7,-13,8,18,-4,-7,-21,-23,-7,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-19,0,-19,-19,-19,1,-16,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-21,-26,-15,-5,-19,-1,11,-6,14,44,-17,-19,4,-3,-16,-9,4,-20,-3,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-38,-13,-3,-18,-21,-20,-18,-12,-26,-18,-20,77,-13,-20,-11,-10,-27,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,-28,-3,-4,-6,-20,71,-23,-11,-16,-2,8,-22,2,-3,-10,-16,-25,-21,23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-10,-34,-6,3,-27,-20,-5,-26,17,-27,-14,-8,29,2,16,-10,-11,-25,-25,-16,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-22,-14,-5,-9,-20,-3,-23,18,-16,-9,-5,-21,1,38,-10,-9,-15,-13,1,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-15,3,-29,3,7,-27,-18,61,-27,-3,-21,-3,9,-16,24,2,-4,-14,-29,-28,6,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-28,-8,1,-16,-21,-6,-21,25,-15,-6,-4,-17,6,30,-10,-8,-15,-17,-3,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-10,-14,-14,-8,-22,-22,-2,-12,-6,-6,-6,-14,-14,-12,14,39,11,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-12,-20,-15,-9,-12,-24,-16,-4,3,-7,-3,-8,-18,-7,11,-2,9,4,-25,-9,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-25,-24,-26,-18,4,-29,-18,13,-16,2,2,-24,-25,-17,-17,-16,-8,16,6,9,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,6,-27,1,-13,-27,45,-11,-34,-13,-29,-20,17,-19,-13,-14,3,-14,-29,-26,-27,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-13,-22,-14,-5,-18,-24,-14,-1,6,-9,2,-12,-14,2,1,-7,-4,5,-24,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-25,-7,2,-22,-19,-2,-21,15,-17,-5,2,-15,15,31,-1,4,-17,-23,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-31,-8,-11,-30,42,-16,-35,-7,-29,-17,-2,-8,-9,-9,-2,-17,-28,-21,-26,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,7,-27,9,6,-25,-11,7,-30,15,-25,-15,10,-16,6,28,-2,-8,-23,-28,-12,3;
MA   /M: SY='A'; M=34,-9,4,-16,-10,-20,-3,-19,-15,-12,-16,-14,-6,-13,-10,-19,15,4,-4,-28,-21,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-27,-24,27,-31,-1,10,-17,7,4,-23,-29,-19,-16,-19,-9,6,13,46,-24;
MA   /M: M=-6,-12,-26,-13,-8,-16,-1,-18,-6,-7,-6,-3,-8,-19,-11,-10,-10,-11,-4,-23,-14,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-31,-29,1,-31,-29,32,-22,14,12,-29,-29,-28,-21,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-26,0,19,-23,-16,-8,-15,3,-12,-7,-4,-9,7,-1,-2,-8,-14,-25,-15,12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-16,-31,-28,1,-32,-28,31,-23,17,13,-26,-26,-25,-22,-13,-1,37,-26,-6,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00901;
//
ID   RIBOSOMAL_L44E_MP; MATRIX.
AC   MP01172;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L44e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4463453; R2=0.0111880; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=619; N_SCORE=11.362; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=184; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=15,-4,-15,-6,-1,-22,-5,-12,-20,5,-24,-14,2,-11,0,1,18,6,-10,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-29,-26,-23,32,-31,7,7,-16,4,3,-20,-29,-16,-14,-20,-10,-3,20,61,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-10,-30,-10,-17,-29,58,-17,-39,-13,-29,-19,0,-20,-16,-8,-1,-19,-29,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-29,-6,-17,-29,60,-16,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-15,-2,-28,-2,3,-2,-22,3,-15,-4,-12,-4,-5,-17,18,-3,-7,-10,-20,-9,10,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-23,-14,-9,-4,-21,-20,-12,-13,-15,-12,-10,24,-14,-15,3,19,-11,-24,-12,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-4,5,-25,-17,-6,-29,34,-26,-11,1,-14,9,39,-3,-6,-19,-23,-11,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-38,-8,3,-31,-20,-16,-21,1,-29,-17,-15,65,0,-10,-9,-10,-29,-28,-25,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-20,-28,-22,-2,-31,-25,24,-16,17,12,-24,-25,-20,-16,-17,-6,26,-24,-5,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-25,-30,-24,-14,23,-25,-20,-10,-20,-11,-10,-20,33,-24,-20,-15,-10,-16,-11,-1,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,6,-23,9,10,-21,-13,35,-25,0,-19,-10,7,-12,7,6,0,-8,-22,-27,-1,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-23,-3,-1,-23,10,-10,-26,18,-23,-10,0,-10,-1,9,-5,-10,-18,-15,-13,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-5,-1,-28,5,-10,-33,26,-28,-13,0,-15,2,26,-7,-13,-23,-20,-16,-1;
MA   /M: SY='A'; M=19,9,-17,6,6,-24,-4,-9,-20,-5,-19,-17,7,-10,-2,-12,11,-1,-13,-29,-20,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-26,-11,-6,-20,-21,-21,-13,-11,-19,-14,-12,41,-11,-16,2,15,-13,-30,-20,-11;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-10,-17,-17,-6,-24,-24,5,-14,-3,-3,-11,-17,-17,-14,9,31,19,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-21,-31,-24,1,-33,-26,30,-25,22,14,-21,-23,-20,-23,-15,0,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,12,-20,22,-4,-21,-20,-14,-7,-10,-11,-11,-4,-20,-14,-15,-5,-5,8,-35,-15,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-28,-21,-31,-22,29,-29,-12,12,-25,30,16,-25,-29,-21,-18,-25,-10,5,-5,19,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-29,2,22,-27,-21,-3,-24,22,-20,-10,-2,-10,18,22,-5,-9,-20,-24,-13,19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-18,-12,-10,-17,-8,-17,-10,-4,-13,-7,-6,-16,-6,-7,5,12,1,-27,-14,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-23,4,25,-21,-16,-9,-13,-1,-14,-12,-3,-11,2,-7,1,-5,-8,-31,-18,14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-30,-6,-6,-29,27,-14,-35,12,-29,-15,0,-16,-6,7,-5,-15,-25,-20,-20,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-25,-3,3,-21,-18,2,-24,21,-23,-9,1,-13,7,16,1,1,-17,-22,-3,4;
MA   /M: SY='A'; M=10,-9,-19,-14,-6,-18,-14,-14,-8,6,-12,-1,-6,-13,-3,0,2,0,-2,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-2,-18,-6,-4,-20,-18,46,-22,-4,-18,-4,6,-19,3,2,-5,-12,-20,-29,3,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-11,-22,-16,-5,-15,-24,-8,3,-9,3,11,-10,-16,13,-7,-5,5,-4,-22,-6,3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-26,-11,-3,-14,-22,-4,-14,13,-2,-1,-5,-20,0,22,-15,-10,-12,-22,-6,-3;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-23,-8,0,-23,1,-16,-18,-2,-19,-13,-8,0,-7,-10,1,-7,-11,-25,-21,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-18,-24,-20,-19,-11,11,-20,-4,-23,3,-1,-11,-22,-17,-20,-7,-10,-5,-23,-14,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-16,-14,-20,-11,6,-24,-18,-21,10,-17,-10,-13,-22,-12,3,-17,-13,-15,10,4,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-12,-29,-14,-4,-8,-21,-2,-26,23,-16,-9,-2,-21,4,59,-11,-10,-18,-16,-5,-4;
MA   /M: SY='C'; M=7,-15,70,-25,-22,-19,-21,-26,-22,-22,-16,-16,-15,-28,-22,-25,-1,0,-6,-40,-25,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00902;
//
ID   LIPASE_GDXG_HIS_MP; MATRIX.
AC   MP01173;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipolytic enzymes "G-D-X-G" family, putative histidine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8816929; R2=0.0164186; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=212; N_SCORE=9.352; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=38; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-20,14,-22,-19,-13,-27,-25,0,-3,-8,-2,-20,-27,-19,-9,-10,-5,18,-32,-15,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-20,-5,0,-20,-15,-10,-23,15,-23,-13,3,-13,3,21,10,12,-13,-28,-13,0;
MA   /M: SY='T'; M=11,-5,-15,-12,-13,-17,8,-20,-18,-13,-15,-13,-2,-13,-13,-15,13,21,-8,-25,-17,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-6,-29,-3,20,-21,-24,-5,-13,6,-8,-6,-5,-12,13,14,-8,-10,-15,-24,-12,14;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-15,-23,-20,-12,-1,-24,-16,12,-18,13,5,-11,-20,-12,-16,-15,-6,2,-6,-2,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-7,-22,-6,-6,8,-19,-6,-11,-7,-9,-9,-8,-19,-10,-3,-7,-6,-8,-2,11,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-16,-17,-12,4,-19,-8,10,-11,15,8,-13,-16,-9,-5,-14,-6,4,-7,7,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-26,-5,4,-21,-16,-13,-15,-5,-19,-13,-10,44,-2,-11,-2,1,-19,-23,-19,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-28,8,18,-29,-16,-3,-27,22,-23,-13,4,-10,14,19,-3,-8,-23,-25,-14,15;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-33,-14,-4,-23,-20,-14,-15,2,-20,-12,-12,32,-4,10,-9,-9,-18,-25,-19,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-28,0,5,-27,-21,-8,-16,15,-17,-6,-6,-6,13,7,-8,-9,-13,-24,-12,9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=8,5,-14,5,4,-22,-5,-5,-17,-3,-19,-12,4,-8,8,-7,15,4,-12,-25,-15,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=4,-4,-13,-9,-6,-13,-1,-10,-10,-7,-9,-2,-3,-9,-1,-8,6,11,-6,-18,-10,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=10,1,-12,0,-2,-15,-6,-11,-12,-6,-12,-11,-2,4,-5,-10,7,6,-7,-19,-13,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-26,10,19,-22,-18,-4,-23,6,-12,-13,0,-12,6,13,-3,-7,-19,-28,-14,11;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-24,-16,-10,-19,-8,-17,-7,-9,-14,-8,-8,4,-8,-7,2,-4,-7,-25,-17,-12;
MA   /M: SY='R'; M=1,-15,-19,-18,-12,-7,-19,-14,-9,3,-8,-5,-10,-20,-8,18,-4,0,2,-21,-9,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-16,-3,2,-16,-8,-6,-11,-3,-16,-9,-4,23,3,-6,4,0,-13,-17,-13,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-17,-23,-21,-4,-12,-21,8,-20,12,10,-19,-24,-19,-17,-9,3,13,-25,-9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-19,-36,-28,38,-31,-24,18,-28,18,8,-24,-29,-32,-21,-19,-8,18,-8,12,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-20,-25,-25,-20,43,-28,18,-7,-20,0,0,-13,-28,-20,-13,-18,-12,-10,6,42,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-21,-34,-25,33,-30,-21,19,-27,20,10,-20,-24,-26,-21,-20,-9,11,-6,12,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=9,-6,-20,-7,-12,-25,37,-16,-29,-15,-28,-19,3,-15,-12,-16,16,-3,-19,-27,-25,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-25,-38,-29,65,-29,-18,-3,-27,5,-3,-23,-30,-34,-19,-23,-13,-5,33,35,-28;
MA   /M: SY='C'; M=5,-21,21,-28,-24,-2,-24,-26,2,-22,-3,-4,-19,-26,-24,-23,-6,-1,13,-28,-12,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-18,-22,-21,-14,-5,-23,13,4,-21,17,9,-14,-23,-10,-15,-17,-11,-1,-23,2,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-24,-6,-8,-29,35,-12,-31,-12,-28,-17,3,-16,-1,-12,11,-7,-24,-26,-24,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,9,-13,8,0,-20,-4,-9,-20,-8,-27,-19,14,-11,-2,-9,29,20,-12,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-17,-20,-12,-13,-12,-19,0,-16,0,-3,-13,-6,-11,-19,2,-1,1,-24,-15,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-2,20,-22,17,6,-27,-7,-1,-24,6,-26,-17,22,-14,6,2,6,-3,-22,-32,-17,5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-10,-2,-2,-10,-4,3,-13,-7,-18,-11,5,-9,0,-6,19,9,-8,-21,-3,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-10,-14,-17,-13,-5,-19,-15,11,-13,2,6,-6,-11,-9,-13,2,13,8,-19,-5,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-30,-9,-9,1,-24,66,-17,-10,-11,0,-3,-24,1,-4,-14,-16,-21,-4,46,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-18,26,-30,38,21,-32,-15,11,-35,6,-25,-21,12,-11,6,8,-3,-11,-28,-33,-14,12;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-21,-6,2,-19,-16,-4,-18,-4,-18,-13,-3,6,-2,-3,8,14,-14,-29,-14,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-23,-31,-23,25,-31,-14,16,-27,32,13,-26,-29,-22,-19,-26,-10,7,-6,19,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-17,37,-23,-19,-11,-21,-17,-9,-21,-3,3,-14,-27,-15,-19,-3,-3,-3,-36,-16,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-26,-6,1,-21,-18,6,-27,21,-22,-10,2,-16,7,40,-2,-2,-18,-24,-8,1;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-23,-5,-4,-16,-15,-10,-20,3,-14,-12,-3,-17,-2,16,0,1,-13,-14,-10,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-29,-22,12,-27,-23,8,-24,22,6,-26,-27,-21,-19,-21,-3,5,8,5,-20;
MA   /M: SY='A'; M=25,-17,2,-23,-19,-15,-5,-24,-4,-16,-7,-6,-16,-20,-19,-21,1,-3,10,-26,-19,-19;
MA   /M: SY='H'; M=0,2,-22,2,2,-27,-1,8,-25,-2,-23,-12,4,-13,8,-4,8,-1,-20,-28,-12,4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-11,-26,-11,4,-12,-23,-6,-8,2,0,-1,-11,-17,5,7,-11,-9,-10,-17,-1,3;
MA   /M: SY='C'; M=1,-14,13,-19,-15,-8,-20,-20,-6,-20,3,-4,-13,-22,-15,-18,1,9,-1,-32,-14,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-30,0,-3,-33,29,-10,-34,0,-28,-15,2,-15,4,-5,-2,-15,-28,-22,-22,0;
MA   /M: SY='A'; M=11,-21,3,-28,-21,-9,-16,-21,-6,-16,-6,1,-21,-23,-15,-20,-10,-9,-1,6,-8,-17;
MA   /M: SY='P'; M=13,-9,-22,-12,-2,-25,-13,-15,-15,-6,-18,-11,-9,19,3,-13,4,4,-14,-25,-19,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00903;
//
ID   LIPASE_GDXG_SER_MP; MATRIX.
AC   MP01174;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipolytic enzymes "G-D-X-G" family, putative serine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.2754707; R2=0.0182091; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=212; N_SCORE=10.126; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=13; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-9,-26,-12,-12,-3,-18,-10,-5,-11,3,0,-10,-23,-10,-12,-17,-11,-10,8,6,-11;
MA   /M: SY='S'; M=5,-11,-17,-14,-6,-9,-14,-12,-10,-4,-11,-6,-6,-16,-1,-2,6,1,-4,-23,-10,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-11,-25,-10,-1,-13,-18,-4,-13,1,-16,-9,-8,-3,3,2,-1,-4,-12,-16,2,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-27,7,18,-29,-17,-4,-23,11,-22,-13,0,-3,16,8,1,-6,-20,-28,-16,16;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-21,-26,-24,-19,1,-22,8,-1,-17,-4,5,-17,-24,-13,-14,-16,-13,1,9,9,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-6,-27,-18,1,-24,-19,10,-25,30,13,-23,-27,-17,-19,-18,-7,6,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-25,3,9,-23,-18,-5,-17,3,-7,-6,-4,-14,11,5,-6,-9,-16,-24,-12,9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-4,-20,-2,10,-20,-15,-11,-16,8,-17,-11,-2,-12,2,1,7,1,-9,-30,-14,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-28,-14,-8,-3,-13,2,-10,-3,-4,-1,-12,-22,3,-4,-14,-11,-15,-1,23,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-8,-10,-27,34,-15,-31,-1,-26,-11,-1,-17,-9,-6,0,-13,-23,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-4,-5,-1,-12,-15,-21,-19,-1,-16,-3,-6,-10,-22,-16,-18,-5,-4,8,-33,-14,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-21,16,4,-26,-8,-7,-24,0,-27,-20,14,-2,-2,-6,12,5,-19,-35,-19,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-33,-8,-2,-27,-12,-16,-18,-2,-25,-14,-10,42,-5,-10,-7,-9,-21,-28,-23,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-7,-23,-4,7,-22,2,-14,-19,-1,-18,-12,-6,-14,-4,-4,0,-8,-10,-26,-19,1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-3,-30,-1,2,-20,-20,7,-29,24,-21,-11,1,-19,8,48,-10,-11,-21,-19,-3,1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-19,0,-24,-24,4,1,-21,-11,-23,-9,-8,-13,-26,-25,-21,-8,-6,-5,-17,-5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-34,-25,13,-33,-24,28,-29,34,17,-26,-27,-23,-23,-24,-9,19,-18,2,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-9,-5,-20,0,-15,-15,-10,-21,-15,1,-10,-5,-15,26,11,-5,-31,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=34,-8,3,-16,-9,-20,-3,-18,-15,-12,-16,-14,-6,-13,-9,-18,16,4,-4,-28,-21,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-24,-13,-17,-27,49,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-8,23,-10,8,-6,-19,3,2,-19,-6,-24,-12,38,-21,-4,-6,6,-3,-24,-37,-20,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,1,-21,-13,-18,-5,-21,-10,-12,-10,-10,-11,-14,-13,-20,8,2,2,-24,-20,-13;
MA   /M: SY='H'; M=9,-15,-18,-19,-13,-3,-17,10,-5,-17,3,1,-12,-20,-11,-15,-8,-8,-1,-21,0,-13;
MA   /M: SY='A'; M=25,0,-14,-11,-8,-17,-5,-6,-11,-10,-10,-9,4,-14,-7,-14,7,2,-7,-25,-15,-8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-25,-12,-26,-23,-2,-24,-25,19,-20,13,7,-24,-26,-23,-19,-8,0,30,-28,-10,-23;
MA   /M: SY='A'; M=28,-10,-14,-17,-11,-17,4,-19,-12,-13,-9,-9,-8,-13,-11,-18,9,4,-4,-23,-18,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-16,-23,-16,-4,-15,-25,-8,4,-10,11,9,-16,-21,14,-6,-13,-8,0,-22,-6,5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-30,-10,3,-24,-18,-1,-23,14,-19,-7,-5,-16,23,31,-7,-11,-23,-3,-7,11;
MA   /M: SY='L'; M=10,-23,-16,-28,-19,8,-20,-21,9,-22,19,6,-21,-22,-20,-21,-13,-6,9,-17,-4,-19;
MA   /M: SY='T'; M=1,-13,-21,-17,-11,-13,-15,-17,-6,-2,-4,-3,-9,-17,-8,3,-3,4,-1,-23,-11,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-28,23,17,-30,-14,1,-27,8,-23,-15,8,-11,16,0,-1,-8,-25,-26,-10,16;
MA   /M: SY='D'; M=-4,6,-25,12,11,-24,-15,-5,-21,2,-21,-15,0,-4,5,-5,2,-5,-17,-25,-9,7;
MA   /M: SY='G'; M=1,-13,-30,-13,-11,-25,16,-8,-23,-13,-22,-13,-7,8,-12,-14,-4,-14,-21,-23,-20,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-2,-21,1,-4,-15,-22,-17,3,-13,-7,-6,-5,-16,-10,-16,1,2,7,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-24,-7,-6,-15,-21,-14,-8,1,-2,-4,-12,-10,-8,5,-12,-8,-3,-25,-12,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-20,-5,-21,-16,-9,-26,-20,4,-2,3,8,-20,-24,-14,-6,-14,-7,13,-26,-9,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00903;
//
ID   RIBONUCLEASE_II_MP; MATRIX.
AC   MP01175;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonuclease II family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1323209; R2=0.0145769; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=569; N_SCORE=13.417; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=1,-15,-21,-18,-9,-11,-18,-13,-7,0,2,0,-11,-20,-5,12,-7,-5,-2,-22,-10,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-27,-2,4,-22,-16,2,-26,21,-22,-11,9,-17,10,39,-3,-7,-21,-25,-11,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-15,-19,-18,-15,15,-21,-6,-3,-16,1,-3,-11,-22,-14,-13,-1,7,-4,-8,20,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-20,-22,-23,-13,8,-25,-8,7,-16,20,22,-19,-23,-2,-11,-19,-10,-1,-16,2,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-5,-7,-6,-20,-4,-13,-20,-1,-21,-13,3,-16,-5,-6,6,2,-14,-29,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-12,-22,-16,-9,1,-13,-11,-10,-7,-9,-5,-6,-18,-4,-5,0,0,-9,-16,0,-6;
MA   /M: SY='A'; M=22,-7,-18,-12,-6,-19,12,-8,-20,-12,-18,-13,-3,-13,-8,-16,9,-4,-12,-23,-17,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-23,1,8,-8,-20,-11,-13,1,-11,-9,-5,-13,-4,-3,-4,-4,-8,-23,-8,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-25,-27,-23,27,-30,-1,12,-17,8,7,-21,-27,-17,-15,-19,-9,5,10,45,-23; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-19,-2,-2,-16,-6,-10,-18,-5,-21,-13,2,-7,-4,-9,12,5,-12,-29,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-22,-7,-5,-16,-8,-15,-12,-11,-15,-12,-5,6,-10,-15,2,1,-9,-26,-16,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-26,7,9,-21,-17,3,-19,2,-19,-11,5,-5,5,1,-1,-3,-18,-29,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,3,-30,3,1,-23,-15,-8,-17,-7,-24,-16,6,30,-2,-11,-3,-7,-24,-31,-21,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-1,-16,-21,-20,-14,6,-13,-14,-5,-13,0,-3,-12,-20,-15,-11,-7,-1,-3,-12,4,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-32,-12,-9,-18,6,-9,-24,-8,-22,-12,-8,14,-9,-4,-7,-13,-23,-22,-17,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-2,-30,-3,-2,-18,-22,90,-24,-12,-17,2,8,-20,8,-2,-11,-19,-25,-29,18,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-24,-24,-30,-20,58,-29,-7,-2,-21,5,-2,-18,-28,-27,-16,-18,-10,-5,12,40,-22;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-21,-14,-16,-23,34,-18,-24,-15,-19,-10,-4,-16,-14,-18,5,-6,-15,-22,-23,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,7,-30,-19,24,-27,42,25,-27,-27,-17,-20,-27,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=17,-5,-18,-11,-13,-25,32,-17,-26,-13,-23,-16,1,-16,-13,-17,6,-9,-18,-23,-25,-13;
MA   /M: SY='L'; M=1,-21,-13,-23,-18,4,-21,-18,7,-21,14,4,-18,-24,-17,-18,-7,-1,9,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-26,25,15,-29,-13,-3,-28,3,-25,-20,7,0,2,-6,3,-4,-22,-32,-17,8;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-9,-24,-13,-7,-12,-17,3,-1,-12,-8,-2,-2,-17,-2,-11,-2,-6,-4,-22,-1,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=15,-7,-11,-15,-11,-12,-14,-20,-7,-12,-5,-7,-6,-12,-11,-14,12,27,2,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-24,-3,-2,-18,-20,53,-24,-5,-18,-4,6,-16,4,-1,0,3,-20,-29,8,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-17,-37,-28,43,-25,-24,-5,-25,-1,-6,-25,-29,-31,-21,-21,-13,-4,35,19,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-10,-11,-11,-9,-21,-21,-7,-11,-9,-9,-2,-11,-11,-11,18,47,3,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='S'; M=12,0,-10,-1,0,-20,0,-10,-20,-10,-29,-20,9,-10,0,-10,39,19,-10,-39,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-27,-37,-27,0,-35,-26,40,-28,23,20,-21,-21,-18,-27,-20,-9,24,-20,-1,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,1,-29,29,-20,-9,0,-19,13,66,-9,-10,-21,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='P'; M=6,-13,-22,-12,-8,-24,2,-19,-18,-13,-24,-16,-8,22,-11,-18,6,-3,-16,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-29,-21,5,-28,-12,20,-23,33,26,-26,-27,-16,-17,-24,-9,15,-22,-1,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-21,-32,-25,-1,-33,-26,31,-24,18,14,-22,-23,-19,-23,-14,-2,27,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-6,-17,-14,-18,-6,-20,-15,13,-15,2,2,1,-24,-17,-15,-6,-2,14,-30,-11,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,1,-21,-20,94,-29,-9,-20,0,9,-19,13,1,-9,-19,-30,-29,18,3;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-14,-31,-14,-4,-15,-21,-4,-25,21,-15,-8,-5,-22,5,56,-14,-12,-18,-7,-6,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-22,-21,-8,-7,-24,-11,6,-16,24,13,-20,-23,4,-11,-18,-9,-1,-20,-5,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-28,-8,2,-21,-18,0,-25,23,-23,-8,-4,-14,7,15,-9,-11,-19,-8,-4,4;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-18,-14,-6,-13,-10,-8,-9,-6,-5,-2,-7,-16,-3,-6,0,-3,-6,-20,-7,-5;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-19,-22,-17,-5,-21,-4,8,-17,4,6,-15,-18,-14,-17,-9,-6,10,-21,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-24,-33,-23,4,-31,-24,29,-29,34,18,-25,-23,-20,-24,-25,-10,16,-21,-2,-24;
MA   /M: M=-4,-9,-21,-12,-7,-4,-10,-8,-11,-12,-3,-4,-6,-18,-6,-9,-3,-1,-10,-21,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-27,8,9,-23,-9,0,-24,8,-21,-13,3,-13,4,0,-3,-7,-20,-22,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-28,11,19,-30,-10,-2,-28,10,-24,-15,5,-4,12,2,0,-5,-25,-28,-16,15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-24,2,10,-27,-16,2,-24,2,-23,-14,-2,8,6,-1,0,-3,-22,-29,-15,6;
MA   /M: M=-9,-6,-22,-8,-8,-13,-16,-10,-6,-5,-8,-5,-3,-11,-7,-6,-7,-5,-7,-23,-6,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-12,-10,-5,-9,-19,-3,-13,-5,-10,-7,-5,-19,-5,1,-4,-4,-8,-24,-4,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-21,-8,2,-11,-21,-7,-15,2,-9,-6,-4,-10,1,3,-4,0,-14,-22,-6,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00904;
//
ID   IF2_MP; MATRIX.
AC   MP01176;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Initiation factor 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7363216; R2=0.0063320; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=770; N_SCORE=6.608; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=753; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-57,-72,53,-52,-78,37,12,-53,-38,-61,-71,84,-69,-13,-61,28,-34,-76,-89,-69;
MA   /M: SY='A'; M=59,47,-26,-57,-74,-57,-7,-35,18,-44,-62,13,-69,-5,-1,37,-23,-34,-81,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-59,-78,-61,-39,-73,39,-62,-26,60,-8,-62,6,51,4,-5,-13,-40,-51,-75,-37;
MA   /M: SY='V'; M=23,-5,-82,-76,-11,-78,-81,62,-74,-33,-18,-75,-76,-74,-77,-64,-54,71,-78,-32;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-62,-50,-77,-55,-4,-83,33,-76,-64,-55,-74,-10,108,-61,-65,-77,-76,-63;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-69,-84,-78,-48,-86,-78,29,-77,57,-35,-81,-81,-75,-77,-72,-57,71,-79,-58;
MA   /M: SY='I'; M=-64,-74,-81,-76,-30,-86,-73,70,-16,49,0,-75,-77,-69,-4,-72,-27,18,-72,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-84,-64,-52,-76,-56,-53,-83,-24,-75,-64,-57,-76,-41,116,-61,-66,-77,-76,-63;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-77,93,7,-84,4,-53,-83,-18,-83,-77,61,-68,-4,-40,-52,-56,-80,-94,-71;
MA   /M: SY='N'; M=-56,-74,33,-40,-81,65,-24,-83,10,-84,-73,76,-69,-16,-60,-10,-57,-81,-84,-73;
MA   /M: SY='V'; M=-44,-72,-43,14,-60,-79,-9,48,13,-47,-47,-24,-71,27,-62,-44,-15,68,-81,-61;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-67,-51,-76,-34,-84,-83,28,-74,-14,-42,-76,-78,-76,-76,-66,-14,94,-85,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-73,-82,-77,-51,-86,-81,82,-26,3,-15,-75,-75,-23,-75,-70,-38,60,-78,-58;
MA   /M: SY='W'; M=-24,-29,-72,-70,70,-74,84,-61,-67,-44,-54,-40,-79,-64,-65,-34,-45,-48,92,79;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-77,35,90,-81,-71,-55,-78,20,-75,-71,-8,-59,-9,-50,-19,18,-40,-83,-71;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-76,-40,-73,-82,99,-68,-89,-67,-86,-75,14,-68,-65,-75,-17,-65,-83,-75,-77;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-26,-73,-10,58,-76,-67,-5,-36,50,-71,-65,23,-62,-1,-11,14,32,-20,-81,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-71,-85,-79,-44,-87,-75,60,-78,71,-32,-81,-80,-73,-77,-75,-60,21,-73,-55;
MA   /M: SY='D'; M=15,-73,51,44,-78,-46,-57,-27,33,-74,-68,19,-64,6,-52,30,0,-50,-83,-69;
MA   /M: SY='S'; M=5,-64,-58,-59,-72,-21,-62,-47,-58,-71,-66,-47,-64,-53,-63,92,44,-17,-83,-66;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='K'; M=-64,-79,-58,-45,-78,-72,-56,-81,90,-77,-65,-51,-67,-40,78,-58,-60,-75,-73,-64;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-62,-52,-75,-76,53,-83,-26,-74,-63,-34,-75,-41,111,-43,-65,-77,-78,-59;
MA   /M: SY='F'; M=-71,-72,-75,-2,104,-80,6,-17,-71,-22,7,-5,-81,-74,-71,-70,-64,-9,-47,36;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-80,104,56,-86,-66,-53,-85,-51,-82,-80,-3,-64,-48,-60,-55,-26,-80,-96,-71;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-80,107,35,-85,-65,-54,-56,-53,-81,-79,16,-10,-51,-62,-55,-57,-43,-97,-71;
MA   /M: SY='V'; M=28,-65,-79,-73,-36,-76,-82,1,-72,-43,-45,-74,-76,-73,-75,-60,-23,92,-84,-62;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-72,-4,-34,-77,-63,-57,-74,75,-75,-66,39,-39,-26,30,18,19,-51,-79,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-80,14,106,-81,-75,-54,-55,-43,-58,-71,-56,-57,-20,-53,-41,-60,-30,-81,-72;
MA   /M: SY='V'; M=-53,-67,-83,-77,-54,-84,-85,16,-75,-39,-17,-78,-79,-77,-76,-67,-51,100,-87,-61;
MA   /M: SY='R'; M=20,-75,-59,-25,-77,3,-24,-73,34,-73,-64,0,-2,41,61,14,-16,-29,-77,-66;
MA   /M: SY='N'; M=28,-26,-34,12,-75,-44,-24,-35,30,-70,-63,44,-65,37,-52,33,33,-26,-81,-67;
MA   /M: SY='G'; M=-29,-75,-40,-73,-82,98,-68,-89,-47,-85,-74,14,-68,-65,-74,-25,-65,-82,-75,-77;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-75,-71,-65,62,-76,-22,-18,-31,-1,58,-13,-77,46,-27,-64,-10,-31,-49,80;
MA   /M: SY='E'; M=-60,-81,19,108,-84,-74,-53,-85,-42,-77,-74,-20,-56,-35,-52,-56,-60,-77,-82,-73;
MA   /M: SY='C'; M=-60,150,-80,-80,-72,-9,-80,-79,-75,-70,-69,-66,-90,-83,-53,-63,-62,-67,-99,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-82,103,-71,-61,-70,-85,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-83,-74,-78;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-74,-85,-81,-48,-62,-78,89,-77,22,59,-76,-75,-72,-78,-73,-59,17,-74,-56;
MA   /M: SY='G'; M=19,-68,-64,-67,-68,58,-66,-61,-45,1,41,-9,-68,-35,-45,11,44,-24,-78,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-63,20,-84,-79,39,-84,-75,45,-77,51,0,-78,-80,-75,-77,-37,-59,43,-9,-49;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-48,-80,53,67,-83,-21,-57,-80,51,-79,-72,-7,-64,-1,-20,-29,-60,-32,-83,-71; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-72,15,-18,-77,41,-53,-80,11,-81,-71,85,-70,-52,0,14,-53,-77,-83,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-53,35,-46,-35,74,-76,-20,-57,-68,-52,-53,-14,-82,-38,-66,-24,-64,-61,1,105;
MA   /M: SY='N'; M=-14,-71,20,17,-48,-43,19,-74,7,-78,-68,95,-69,19,-54,-9,-14,-41,-88,-67;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-50,-80,110,9,-52,-47,-22,-84,-53,-82,-80,11,-67,-4,-61,-39,-57,-81,-98,-69;
MA   /M: SY='W'; M=-21,-75,-86,-80,22,-83,-81,76,-76,-1,32,-78,-76,-74,-78,-71,-60,39,84,-49;
MA   /M: SY='K'; M=-37,-7,-56,0,-76,-71,-55,-53,79,-58,-63,-32,-39,51,57,-57,-60,-53,-73,-17;
MA   /M: SY='V'; M=9,-72,-58,60,-41,-75,-69,12,-59,-43,-24,-67,23,-56,-44,-31,-37,63,-81,-66;
MA   /M: SY='G'; M=-40,-29,17,-7,-82,94,-68,-88,-46,-65,-74,-50,-68,-63,-32,-51,-66,-82,-76,-76;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-80,118,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-84,-83,-35,-67,-54,-63,-28,-57,-82,-102,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-72,-28,-19,-59,-78,-28,59,5,-29,19,-62,-70,37,-41,-42,36,43,-78,-32;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-86,-85,-49,-91,-86,108,-79,-32,-35,-76,-74,-76,-83,-74,-58,-19,-73,-56;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00905;
//
ID   ANAPHYLATOXIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01177;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Anaphylatoxin domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0881295; R2=0.0108563; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=339; N_SCORE=8.758; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-19,-29,-24,-14,-11,-30,-16,10,2,-1,5,-11,-20,-6,15,-14,-9,7,-21,-6,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-2,-20,-6,9,-15,-13,-3,-7,-3,-6,11,-2,-12,5,-7,0,-4,-9,-27,-12,7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,23,-27,32,36,-31,-13,0,-31,4,-25,-23,12,-6,10,-4,5,-6,-28,-35,-20,23;
MA   /M: SY='K'; M=-12,1,-28,5,10,-20,-22,-7,-17,15,-11,-7,-4,-14,5,6,-11,-10,-16,-21,-4,7;
MA   /M: SY='A'; M=16,-3,-15,-12,-11,-11,-9,-12,-3,-13,1,-4,3,-19,-11,-15,-1,-3,-3,-26,-14,-11;
MA   /M: SY='G'; M=10,-6,-21,-8,-11,-16,18,-15,-25,-11,-20,-15,-2,-16,-12,-11,5,-7,-15,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-4,-22,-5,5,-25,-16,-7,-17,9,-16,-6,-2,-12,17,5,4,2,-15,-24,-12,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-5,-23,-20,15,-29,0,-1,-16,3,1,-21,-30,-12,-14,-17,-9,-3,1,36,-18;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-24,0,15,-26,-7,-9,-24,7,-22,-15,-1,-3,7,1,5,-2,-19,-26,-18,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,5,-19,4,3,-18,-13,0,-15,-4,-17,-12,4,-12,-2,-8,8,6,-10,-28,-9,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-20,-7,1,-20,-15,-13,-13,1,-18,-10,-3,3,1,-5,8,10,-10,-26,-14,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-7,-25,-6,-5,6,-11,-12,-12,-14,-5,-7,-10,-20,-14,-14,-10,-8,-9,-9,2,-9;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-18,-25,-19,4,-24,-19,10,-20,14,5,-20,-17,-18,-19,-11,0,9,-17,1,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-1,-29,-4,3,-24,-20,-7,-23,34,-23,-9,4,-14,7,33,-9,-9,-17,-22,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-28,-2,11,-27,-18,-4,-28,31,-25,-11,1,-13,14,36,-4,-8,-21,-23,-12,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,96,-30,-28,-15,-30,-28,-21,-30,-8,-13,-22,-38,-28,-28,-13,-10,-7,-45,-25,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,96,-20,-24,-21,-27,-27,-29,-26,-20,-20,-15,-35,-26,-27,-6,-4,-11,-47,-27,-25;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-6,-26,-4,14,-14,-14,-1,-14,-4,-6,-3,-9,-14,8,-7,-7,-10,-16,-15,0,10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,20,-27,32,4,-24,-9,-2,-23,-10,-8,-14,4,-17,-7,-13,-9,-11,-19,-32,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=1,-13,-20,-19,-11,-11,-18,-10,0,3,2,18,-13,-17,-3,0,-9,-2,1,-21,-7,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-19,-11,-4,-17,-18,3,-23,12,-17,-9,-2,-17,2,27,-2,1,-14,-22,-6,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-22,-1,5,-20,-16,1,-17,5,-16,-10,0,-15,1,10,-1,-5,-9,-28,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-11,2,-23,-7,-8,-7,-10,-4,-8,-9,-5,-4,13,-22,-3,-2,-6,-7,-15,-25,-9,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=5,-14,-23,-12,-5,-18,-14,-16,-9,-5,-12,-9,-14,28,-9,-12,-6,-6,-10,-21,-18,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-12,0,-24,-4,4,-13,-17,1,-7,-1,-5,15,0,-15,9,0,-8,-9,-12,-24,-8,6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-26,6,-2,-25,9,-8,-27,-1,-24,-14,2,-12,-2,-2,3,-7,-21,-25,-15,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-3,-28,-5,10,-8,-21,4,-17,3,-14,-6,0,-16,18,8,-6,-9,-22,-13,5,14;
MA   /M: SY='T'; M=3,4,-12,1,-3,-17,-10,-14,-17,-9,-21,-16,6,-10,-5,-10,28,31,-7,-35,-15,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-27,12,41,-30,-17,0,-26,7,-22,-16,2,-4,25,0,7,-5,-27,-30,-18,33;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-5,-26,-2,10,-24,-15,-3,-23,8,-23,-13,-1,1,13,12,5,-2,-21,-25,-11,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-27,-12,-6,-14,-20,-6,-11,9,-10,-5,4,-20,1,32,-8,-7,-10,-24,-10,-6;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-18,-18,-10,-16,-13,-20,-5,-8,-6,-6,-15,1,-12,-15,-2,-1,0,-23,-17,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=10,-7,-14,-10,-3,-14,-8,-8,-11,2,-8,-5,-4,-10,1,5,2,-2,-6,-16,-10,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-15,-11,-6,6,-14,-1,-7,2,-1,-2,-6,-14,-4,16,-9,-6,-6,-3,8,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-18,-22,-14,-3,-25,-19,25,-16,9,9,-15,-15,-13,-17,-11,-5,21,-18,-4,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-21,-6,-3,-21,-5,-2,-17,-2,-19,-4,3,-6,4,-5,7,3,-15,-28,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-14,-25,-16,-1,-13,-28,-13,9,-12,8,6,-13,-16,6,-12,-10,-4,1,-23,-7,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-21,-6,-13,-24,44,-15,-30,-15,-26,-17,2,-15,-13,-15,10,-8,-21,-22,-24,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-5,-29,-3,4,-10,-21,0,-13,-5,-14,-6,-8,9,0,-10,-8,-5,-19,-14,8,-1;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-20,-5,2,-23,-13,-10,-16,-2,-14,-10,-3,-3,6,-5,5,4,-13,-25,-16,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-13,-10,-18,-6,-12,-8,1,-11,-3,-3,-20,-3,7,-8,-10,-6,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-27,-7,6,-21,-22,-1,-15,15,-13,-4,-5,-15,6,14,-9,-9,-11,-23,-8,4;
MA   /M: SY='A'; M=22,-19,-14,-23,-17,-13,-15,-24,5,-14,-4,-3,-19,-6,-18,-20,-1,-1,16,-25,-17,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-20,-34,-23,55,-26,-16,-1,-23,7,4,-17,-26,-26,-17,-16,-9,-2,2,20,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-23,-14,-5,-7,-22,-11,-3,-5,10,3,-10,-21,-5,5,-11,-5,-5,-24,-7,-6;
MA   /M: SY='S'; M=4,9,-21,10,10,-25,-10,-8,-17,-5,-19,-15,6,-10,4,-10,11,0,-14,-31,-17,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-19,-7,-1,-13,-19,-4,-6,-5,-8,-5,-2,-17,-3,-6,0,1,-2,-27,-8,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-16,-26,-19,-14,5,-17,-4,-6,-1,-7,-2,-11,-21,-10,-1,-12,-10,-6,-5,16,-14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,-18,-19,-10,-14,-10,-19,3,-14,-5,-2,-10,-14,-10,-19,3,-2,6,-25,-14,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-22,-3,10,-19,-17,-7,-14,0,-8,-7,0,-13,7,1,1,1,-14,-26,-13,8;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-29,7,22,-28,-14,-5,-24,8,-18,-12,-2,-1,13,1,-3,-9,-24,-27,-16,17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-8,-23,-9,-13,-3,-19,-16,4,-21,16,3,-10,-23,-16,-17,-15,-6,1,-25,-6,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-25,-8,-4,-18,-12,-5,-20,11,-19,-11,5,-18,2,33,1,-1,-15,-25,-13,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-1,5,-24,8,5,-25,-16,-9,-16,4,-16,-11,-1,-13,3,2,-3,-7,-10,-26,-14,3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-2,-4,4,-18,-21,-8,-18,-5,-15,-10,-3,-10,4,-7,-6,-8,-17,-29,-15,4;
MA   /M: SY='H'; M=-9,8,-23,10,9,-24,-15,17,-20,-5,-19,-11,8,-13,8,-5,5,-1,-17,-32,-8,7;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-9,-19,-11,-5,-18,-16,-7,-9,-4,-16,-7,-4,-10,3,2,9,5,-4,-29,-13,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-29,-4,-5,-24,9,10,-33,5,-24,-13,3,-19,0,23,-3,-13,-24,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-24,7,6,-24,-10,-8,-21,8,-21,-14,9,-12,1,5,2,-1,-16,-28,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-27,12,3,-27,-2,2,-25,-3,-24,-15,11,-1,3,-6,2,-7,-25,-31,-17,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00906;
//
ID   RIBOSOMAL_S21_MP; MATRIX.
AC   MP01181;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S21 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1233964; R2=0.0155036; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=234; N_SCORE=6.741; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=218; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-19,-30,-24,-14,-11,-29,-14,6,3,-2,4,-9,-20,-4,25,-15,-10,3,-20,-5,-14;
MA   /M: SY='A'; M=32,-5,-10,-11,-5,-20,0,-15,-15,-10,-19,-15,-1,-10,-5,-15,24,9,-5,-29,-20,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-19,-27,-19,-1,-21,-5,17,-12,16,46,-17,-19,-3,-11,-14,-1,9,-22,-2,-11;
MA   /M: SY='P'; M=5,-6,-21,-10,-8,-18,-12,-14,-6,-11,-16,-7,-1,9,-8,-15,6,2,-7,-30,-18,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-6,-26,-5,7,-24,-10,-3,-18,3,-15,-7,-3,-14,12,7,-2,-6,-16,-24,-13,9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,-19,-30,-27,3,-32,-22,29,-21,10,10,-23,-25,-22,-21,-12,0,31,-18,6,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-22,-12,-7,-14,-22,-13,-10,9,-11,-5,-5,-13,-4,11,-3,7,-3,-23,-7,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,33,-24,18,14,-28,-28,-26,-22,-15,-4,39,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-30,0,1,-27,-1,-5,-32,23,-26,-13,3,-16,3,30,-7,-12,-23,-22,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-27,15,28,-26,-21,-7,-19,8,-17,-14,-2,-9,6,-2,-4,-9,-14,-30,-16,16;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-23,11,0,-25,9,6,-25,-3,-28,-17,35,-18,5,-3,7,-5,-29,-33,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-29,23,39,-29,-16,1,-30,10,-23,-20,10,-7,13,9,0,-9,-29,-31,-19,25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-20,2,6,-22,-1,-8,-20,-5,-24,-17,6,9,-1,-9,11,1,-19,-29,-20,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-35,-27,20,-33,-25,26,-28,26,14,-25,-27,-26,-23,-22,-8,20,-15,5,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-6,-21,-6,0,-17,-18,-11,-9,0,-8,-5,-6,-15,3,-2,0,-2,-5,-26,-11,1;
MA   /M: SY='A'; M=40,-2,-13,-7,-6,-23,-1,-17,-14,-9,-13,-13,-6,-10,-9,-19,9,-1,-4,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-24,-10,4,-30,-16,16,-23,34,13,-24,-25,-14,-18,-24,-10,6,-19,1,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-30,-8,-1,-23,-7,-5,-31,27,-23,-11,0,-18,6,49,-9,-11,-21,-20,-13,-1;
MA   /M: SY='R'; M=2,-10,-24,-13,-3,-20,-14,-6,-24,17,-17,-10,-3,-17,4,42,-4,-7,-14,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,58,-30,-20,6,-30,23,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,1,21,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,36,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-27,-8,2,-24,-17,-6,-27,31,-22,-10,-1,-15,7,43,-7,-9,-17,-20,-11,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-7,-22,-10,0,-20,-17,-9,-13,7,-10,-1,-5,-14,9,5,0,0,-11,-24,-10,4;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-21,2,-26,-21,-1,-28,-22,8,-13,6,7,-19,-25,-19,-14,-13,-4,13,-25,-7,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-26,13,28,-31,-15,-2,-26,11,-23,-15,3,-7,21,3,5,-5,-24,-28,-16,24;
MA   /M: SY='K'; M=-14,5,-30,7,9,-29,-19,-6,-31,38,-28,-13,3,-12,9,34,-9,-10,-21,-23,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-19,-3,11,-21,-11,-10,-19,1,-16,-14,0,-9,2,1,8,4,-13,-26,-17,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-29,-10,-15,-28,50,-19,-35,-10,-25,-16,-2,-19,-15,-13,-3,-18,-26,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-23,-19,-27,-22,-4,-29,-23,20,-15,8,8,-19,-23,-18,-9,-10,1,23,-25,-7,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-33,-24,27,-30,-19,17,-27,29,16,-25,-28,-25,-20,-24,-9,12,-11,10,-24;
MA   /M: SY='R'; M=1,-8,-19,-10,-3,-17,-15,-11,-15,3,-11,-7,-4,-13,1,10,5,6,-9,-26,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-7,17,36,-29,-18,-6,-30,1,-21,-21,0,-8,8,-7,1,-8,-25,-34,-21,22;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-22,-14,-25,-19,-3,-25,-18,8,-10,8,12,-21,-24,-14,-12,-16,-7,11,-12,-2,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-27,-8,2,-24,-17,-6,-27,31,-22,-10,-1,-15,7,43,-7,-9,-17,-20,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=3,-12,-21,-14,-6,-16,-18,-13,-12,13,-10,-5,-9,-17,-3,14,-6,-6,-3,-20,-9,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-6,7,-21,-21,9,-26,21,-18,-9,0,-17,10,46,-9,-11,-20,-22,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,9,-27,9,26,-26,-12,1,-28,12,-23,-16,11,-10,14,16,1,-8,-27,-29,-17,19;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-15,-26,-18,-15,23,-25,37,-13,-15,-5,-1,-8,-25,-11,-8,-15,-14,-15,-2,36,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-29,-24,-22,29,-31,12,6,-15,3,3,-19,-28,-14,-14,-20,-10,-4,18,60,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-9,14,-27,19,48,-28,-16,1,-28,7,-22,-20,9,-3,16,-1,4,-7,-29,-32,-20,32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00909;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F35_MP; MATRIX.
AC   MP01182;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 35 putative active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0767431; R2=0.0145984; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=338; N_SCORE=10.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=98; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-18,-22,-18,-10,-8,-26,-18,2,5,9,6,-18,-22,-10,1,-18,-8,6,-22,-6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-7,-26,-9,-14,-17,-1,-19,1,-19,-9,-5,-3,-17,-13,-21,0,-6,-1,-27,-14,-16;
MA   /M: SY='V'; M=3,-21,-14,-22,-21,-7,-24,-2,12,-17,1,5,-19,-25,-19,-16,-7,-4,26,-29,-5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-2,-19,-1,-10,-8,-20,-13,2,-16,9,0,-5,-23,-14,-15,-9,-4,3,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='M'; M=11,-19,-17,-27,-17,-5,-15,-12,10,-15,17,26,-19,-19,-8,-16,-12,-7,7,-20,-7,-12;
MA   /M: SY='M'; M=2,-15,-24,-19,-9,-16,-16,-10,-3,-1,-5,16,-15,10,-3,-9,-10,-8,-6,-22,-13,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,7,-27,-20,-9,-24,32,-24,-9,0,-10,13,19,-2,2,-17,-22,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=8,-17,-19,-23,-10,-10,-20,-16,13,-13,5,15,-16,-16,-9,-17,-8,-6,12,-23,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-26,4,28,-29,-16,-5,-24,16,-20,-13,-2,-6,17,5,0,-8,-21,-24,-16,23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-31,-4,5,-29,-17,-14,-25,19,-30,-15,-6,29,1,5,-3,-6,-23,-27,-19,1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-28,-20,14,-30,-12,16,-26,40,16,-28,-30,-18,-18,-28,-10,6,-10,16,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-23,-23,-26,-15,23,-28,-9,4,-20,18,8,-20,-26,-8,-13,-20,-10,-3,-5,16,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-5,-26,-10,-4,-7,-21,7,-2,-9,-7,-3,-1,-18,0,-10,-7,-8,-9,-13,12,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-3,-21,-7,-2,-18,-17,5,-17,-6,-17,-8,-1,-13,10,-5,9,15,-15,-14,-4,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,8,-28,-8,10,-20,4,-26,-12,35,-16,25,4,6,-4,-30,-32,-16,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=1,-20,-16,-24,-16,1,-23,-20,8,-22,27,8,-20,-22,-16,-18,-12,6,6,-22,-5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-16,-17,-16,-2,-17,-9,4,-12,-5,1,-9,-22,-12,-14,1,1,9,-18,5,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-24,-30,-24,-6,-32,-28,28,-22,6,8,-24,-1,-22,-24,-14,-6,26,-26,-10,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,17,0,-12,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-26,-10,-18,-26,52,-20,-34,-18,-26,-18,0,-18,-18,-18,4,-6,-24,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-20,0,0,-23,-6,-10,-20,-9,-30,-20,8,16,-3,-11,22,9,-18,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-21,-23,-22,-23,5,-8,-5,3,-15,-1,6,-19,-27,-17,-15,-13,-9,6,-4,22,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-8,-17,-9,5,11,-18,-9,-2,-8,0,-3,-7,-10,-7,-9,-7,-7,-4,-9,2,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=13,-7,21,-13,-10,-11,-8,-14,-10,-10,-8,-8,-7,-12,-10,-13,3,2,-2,-19,-13,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-9,7,-8,-13,-15,-14,-19,-25,-16,-25,-21,-10,-23,-13,-18,0,-5,-18,10,-9,-11;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-16,4,13,-17,9,-5,-19,-3,-16,-12,1,-5,1,-5,5,-4,-16,-18,-14,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-17,-13,-19,-16,5,-20,-11,16,-14,11,8,-15,-17,-13,-13,-11,-4,15,-8,9,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-18,0,4,-18,25,-8,-23,-6,-16,-12,0,-8,-4,-8,0,-10,-18,-14,-16,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,-11,-12,-2,7,-8,-10,-6,-8,-3,-5,-7,-9,-9,-10,-1,-3,-4,-7,-2,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-23,-2,8,-18,-12,-10,-14,-3,-17,-12,-10,43,-2,-10,-5,-6,-18,-18,-17,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-30,37,4,-36,23,-8,-40,-8,-30,-26,12,-14,-8,-14,0,-14,-30,-32,-24,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-10,-30,-10,-2,-6,-22,5,-21,11,-20,-8,-7,4,-4,4,-12,-11,-20,-15,4,-4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-2,-15,-1,-9,-18,-12,-18,-4,-11,-8,-8,-9,-16,-14,-18,1,-2,9,-28,-17,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-13,20,-23,39,35,-26,-26,-13,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='R'; M=6,-10,-23,-14,-4,-20,-13,-7,-23,15,-16,-10,-4,-16,3,36,-3,-6,-13,-20,-14,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-20,0,-24,1,-11,35,-23,-13,-15,-19,-5,-11,-5,-23,-25,-16,-13,-10,-11,-9,11,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-23,-24,-23,-13,-1,-26,-13,1,-8,24,9,-19,-26,-9,14,-23,-10,-1,-20,-4,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00910;
//
ID   UBIE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01183;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ubiE/COQ5 methyltransferase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7258453; R2=0.0160079; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=423; N_SCORE=12.487; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-27,2,6,-26,-15,-4,-26,28,-26,-11,7,-10,8,18,-4,-5,-20,-24,-10,6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-26,-1,12,-27,-11,-8,-22,7,-20,-11,-3,1,10,1,0,-4,-20,-25,-17,10;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-27,3,15,-25,-9,2,-26,3,-23,-14,1,-1,9,-1,1,-6,-24,-25,-14,12;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-25,-1,3,-16,-18,-3,-16,7,-8,-3,0,-16,3,9,-7,-6,-14,-24,-8,2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-32,-29,-1,-32,-30,32,-23,12,11,-27,-27,-27,-23,-12,-3,42,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-1,-25,-4,4,-22,-13,15,-20,5,-17,-6,3,-15,11,10,-3,-9,-19,-22,-4,6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-27,12,14,-27,-7,-2,-25,4,-22,-15,7,-11,6,2,1,-8,-21,-29,-16,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-17,-30,-25,0,-27,-19,27,-18,17,27,-24,-25,-18,-18,-16,-5,30,-25,-5,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-25,26,16,-29,-11,14,-29,0,-25,-18,16,-12,7,-3,5,-5,-25,-34,-13,11;
MA   /M: SY='N'; M=-4,7,-21,5,5,-24,-6,-2,-24,6,-27,-16,14,-13,7,9,14,3,-19,-32,-16,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,38,-25,17,15,-26,-26,-25,-24,-15,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='A'; M=41,-9,-11,-17,-9,-18,0,-17,-11,-10,-13,-11,-8,-11,-9,-18,13,2,-2,-21,-16,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-4,-28,-1,7,-26,-12,-8,-23,5,-25,-16,-4,20,0,-3,0,-5,-22,-27,-18,2;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-25,-2,2,-23,-17,-2,-23,22,-22,-10,6,-15,6,24,-3,-3,-17,-24,-11,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-17,-23,-18,-10,-6,-25,-13,0,-2,8,5,-14,-22,-5,8,-15,-8,1,-21,-5,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-19,-28,-19,2,-23,-10,16,-16,22,36,-19,-21,-8,-14,-16,-1,9,-21,-1,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-24,30,7,-28,-9,2,-29,0,-24,-20,14,-13,0,-1,5,-1,-22,-34,-15,3;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-21,-31,-23,2,-30,-24,24,-24,21,13,-24,-25,-19,-21,-18,-6,21,-15,-2,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-31,-22,4,-28,-15,25,-23,33,32,-23,-25,-13,-18,-24,-10,13,-20,0,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-33,-24,35,-22,-19,7,-28,24,9,-22,-28,-27,-20,-22,-10,3,-8,10,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-26,-9,-14,-28,49,-17,-35,-15,-25,-17,0,-19,-13,-14,-2,-17,-27,-22,-26,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-20,-23,-24,-13,-8,-27,-13,14,-14,14,16,-17,-20,1,-10,-14,-6,7,-21,-5,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,13,-30,18,6,-26,-17,73,-32,-7,-23,-8,12,-17,9,-2,-7,-17,-30,-32,9,3;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-27,-8,-2,-19,-20,4,-23,19,-16,-7,1,-19,5,42,-9,-9,-16,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-21,-22,-16,-1,-20,-13,4,-13,7,3,-16,-22,-14,-10,-11,-4,6,-16,-1,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,0,-29,-2,5,-25,-18,-4,-29,36,-26,-11,6,-15,9,44,-8,-9,-21,-22,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,8,-28,10,6,-25,-16,-1,-27,18,-22,-13,7,-15,5,23,-6,-9,-20,-24,-12,4;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-24,-9,-1,-9,-18,-4,-11,2,-11,-3,-6,-16,-2,2,-5,-6,-9,-18,-2,-2;
MA   /M: SY='T'; M=7,-17,-14,-24,-18,7,-19,-19,3,-17,7,4,-15,-19,-18,-17,-3,8,7,-18,-3,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-12,-30,-24,-2,-27,-22,22,-18,10,16,-22,-24,-19,-17,-12,-5,26,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-25,3,8,-26,-13,-4,-25,17,-23,-11,3,-12,9,14,-1,-5,-19,-22,-11,8;
MA   /M: M=-7,-14,-18,-16,-7,-13,-20,-14,-10,-3,-6,-2,-13,-19,-1,0,-12,-8,-10,-2,-6,-4;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-15,-25,-18,-2,-22,-17,14,-20,18,17,-18,-22,-14,-18,-11,-4,11,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,3,-26,2,-2,-24,8,-3,-25,-3,-20,-12,7,-13,-1,-2,-1,-10,-22,-27,-17,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-19,-14,-9,-13,-20,-19,-1,-10,-7,-5,-13,-1,-13,-13,-4,-2,4,-26,-15,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-1,-20,-13,-7,-19,8,-16,-8,-2,-7,5,11,-2,-3,-16,-24,-12,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-6,-27,-6,1,-19,-13,-9,-19,0,-20,-13,-3,13,-2,-4,-1,-4,-19,-23,-13,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-24,-4,-10,-26,29,-11,-30,-14,-25,-17,1,-8,-12,-14,2,-10,-24,-26,-24,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,5,7,-22,-9,-5,-19,-2,-13,-9,0,-10,5,-5,0,-3,-17,-27,-14,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00911;
//
ID   UBIE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01184;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ubiE/COQ5 methyltransferase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7189832; R2=0.0167909; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=405; N_SCORE=12.509; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-23,32,-29,37,21,-26,-26,-19,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-5,-31,-28,8,-30,-26,22,-23,13,11,-26,-29,-28,-21,-14,-3,33,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=1,-6,-21,-6,-4,-20,-14,-12,-14,-9,-18,-13,-6,13,-7,-13,7,12,-10,-30,-17,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,26,-28,34,12,-27,-13,22,-31,-1,-25,-18,17,-14,5,-3,0,-9,-27,-32,-5,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-29,-19,-11,-7,-27,-12,1,-3,-4,0,-14,-3,-7,-3,-13,-6,-4,-14,4,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-26,14,7,-25,-17,-4,-16,-4,-10,-6,0,-7,8,-6,-4,-7,-17,-29,-14,7;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-4,-24,-5,7,-25,-16,-8,-20,17,-17,-7,-4,-12,11,11,-3,-3,-15,-22,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-13,-20,-15,-15,1,-21,-6,-14,-9,-8,-11,-15,-15,-19,6,0,5,-23,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,9,-30,-21,22,-29,47,20,-29,-29,-20,-20,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-19,-3,4,-24,-12,-5,-26,16,-24,-13,2,-15,8,21,2,-3,-19,-25,-12,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,10,-28,19,53,-29,-19,-1,-29,8,-21,-20,1,-1,18,-1,3,-7,-28,-31,-20,35;
MA   /M: SY='M'; M=6,-20,-18,-29,-20,-1,-19,-14,16,-15,10,26,-18,-18,-10,-17,-10,-5,12,-19,-5,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-18,-18,-22,-18,18,-23,7,-6,-14,-1,-3,-15,-25,-14,-11,-13,-8,-8,6,34,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-14,-27,-19,5,-29,-21,15,-26,36,14,-25,-27,-19,-19,-21,0,11,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,10,-30,-20,-7,-29,43,-28,-9,0,-11,15,33,-9,-10,-21,-20,-10,12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-37,-11,-1,-28,-21,-20,-18,-7,-27,-17,-19,75,-10,-16,-10,-9,-24,-29,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-5,-16,-30,60,-18,-38,-16,-29,-19,1,-19,-17,-18,-1,-19,-29,-21,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-10,-19,-29,66,-20,-39,-19,-30,-20,0,-19,-19,-20,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-24,-12,-3,-19,-22,0,-16,15,-14,0,-4,-18,9,28,-10,-10,-12,-21,-7,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-32,-24,24,-29,-22,16,-27,28,11,-26,-29,-27,-20,-21,-7,15,-15,5,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-18,-26,-22,0,-16,-18,13,-20,13,11,-21,-25,-20,-17,-13,-6,17,-22,-5,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-23,29,-31,-29,-8,-32,-28,13,-26,1,1,-19,-30,-26,-26,-12,-6,19,-35,-15,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-8,-30,-21,5,-29,-21,16,-29,39,16,-28,-29,-20,-21,-26,-10,9,-23,-3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,25,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-18,-33,-25,49,-27,-20,2,-25,11,1,-18,-26,-31,-18,-13,1,3,-3,16,-25;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-12,-3,-3,-19,2,-13,-20,-11,-27,-18,7,-11,-3,-11,33,22,-10,-37,-19,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-26,-3,7,-25,-20,5,-22,17,-20,-6,1,-12,17,17,-2,0,-18,-24,-7,11;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-29,-18,-11,-18,-24,-22,-2,-12,-13,-8,-22,39,-15,-15,-10,-6,-2,-29,-21,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-20,1,3,-14,-17,-11,-16,0,-15,-12,2,-13,-4,-3,4,11,-10,-22,-9,0;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-2,-19,-9,-7,-12,-16,-9,-6,-5,-8,-2,4,-16,-4,-5,-2,-1,-9,-19,-9,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-26,-10,-1,-17,-10,-14,-16,-3,-19,-13,-10,27,-7,-6,-5,-7,-17,-21,-17,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-22,-25,-22,-18,-2,-5,-21,-3,-20,2,-2,-18,-7,-19,-19,-14,-10,-4,-8,-8,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-28,-23,-34,-25,30,-30,-16,15,-26,23,15,-24,-28,-24,-19,-23,-10,8,-2,17,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-25,0,3,-25,-11,-7,-22,15,-22,-12,5,-13,6,14,1,-4,-16,-26,-14,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-10,-28,-11,-2,-16,-18,-12,-13,-2,-16,-8,-8,3,4,-3,-6,-5,-15,-11,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-18,-27,-21,-1,-14,-24,11,-22,12,5,-21,-21,-21,-21,-11,-6,14,-21,-9,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-21,-22,-20,26,-28,14,-5,-13,-2,-2,-18,-29,-13,-12,-18,-11,-10,22,59,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-26,19,8,-21,-16,-3,-23,4,-17,-13,6,-14,3,3,-3,-6,-19,-27,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-17,-22,-19,-9,9,-23,-15,0,-17,11,3,-17,-21,-12,-15,-14,-9,-2,-10,1,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-30,-22,-20,29,-29,19,-4,-13,-2,-1,-19,-29,-12,-11,-21,-12,-12,31,67,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-19,-4,1,-20,-12,-11,-18,11,-19,-10,0,-13,1,4,11,4,-11,-29,-13,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00911;
//
ID   CTCK_1_MP; MATRIX.
AC   MP01185;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   C-terminal cystine knot signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2850080; R2=0.0120904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=398; N_SCORE=10.087; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=101; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-10,-22,-11,-4,-17,-17,-8,-10,0,-11,-5,-6,-9,2,-1,1,1,-8,-24,-8,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-12,4,1,-15,-5,-6,-14,1,-18,-12,6,0,0,-2,11,7,-11,-22,-12,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-12,-18,-18,-16,-8,-14,-18,2,-12,0,-1,-9,-20,-14,-13,-3,5,6,-23,-6,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-5,-28,-1,-1,-4,-21,7,-14,-1,-11,-8,-7,-13,0,-5,-8,-7,-16,-7,23,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-14,-28,-17,-8,-12,-22,-10,-8,9,-10,-2,-9,-18,0,17,-11,-7,-7,-7,0,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-27,-11,-1,-18,-13,-2,-13,-8,-13,-4,-9,9,2,-11,-6,-9,-15,-24,-12,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-20,2,11,-18,-12,-4,-18,17,-17,-10,4,-1,5,14,-4,-6,-15,-18,-11,7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-14,19,-18,-16,16,-18,-7,-7,-15,-3,-5,-12,-20,-16,-13,-10,-6,-4,-5,13,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-10,28,-13,-11,-11,-16,-11,-14,-3,-10,-8,-8,-19,-9,6,-6,-5,-4,-22,-12,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=3,-1,-23,-1,-9,-26,34,-14,-29,-12,-24,-16,2,-14,-9,-14,5,-8,-21,-22,-22,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-19,-20,-19,-9,-6,-14,5,-19,1,4,-13,-22,-16,-18,-3,-4,10,-27,-11,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-9,62,-15,-11,-24,-26,-19,-27,-14,-20,-16,-11,-27,-8,-16,-5,-5,-15,-40,-23,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-1,3,-15,2,-1,-15,-9,2,-12,-7,-16,-9,6,-5,-3,-8,9,5,-9,-27,-11,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-3,10,-23,16,2,-29,9,-7,-26,-6,-23,-17,5,-13,2,-10,6,-6,-20,-28,-19,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-4,22,-10,-14,-23,9,-15,-27,-16,-24,-17,3,-21,-11,-16,3,-7,-19,-33,-24,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-26,-5,6,-24,-12,5,-23,7,-18,-8,0,-15,18,19,1,-4,-20,-25,-11,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-5,-20,-9,-1,-21,-15,-10,-12,-2,-13,-5,-2,-12,12,0,7,12,-11,-25,-11,5;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-15,-33,-10,4,-26,-14,-18,-15,-9,-21,-15,-14,46,-7,-18,-6,-9,-20,-27,-24,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-7,-23,-8,2,-14,-19,8,-13,-3,-8,-4,-4,-16,6,-1,-2,-2,-13,-22,-1,2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,0,-25,-4,0,-21,-17,-4,-18,15,-19,-9,8,-16,8,25,0,-2,-16,-26,-12,2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-11,-14,-14,-13,-3,-19,-14,-1,-14,-2,-4,-8,-18,-12,-13,8,21,4,-24,0,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-27,1,13,-25,-18,-1,-28,27,-25,-12,2,-11,9,25,-2,-4,-20,-25,-11,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-24,-9,-2,-16,-16,-10,-18,5,-14,-9,-5,-5,0,12,-1,7,-14,-22,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-18,-24,-20,-11,-10,-26,-14,5,2,1,8,-14,-21,-6,13,-13,-8,8,-23,-7,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-26,0,12,-28,-16,-6,-25,19,-24,-11,0,-5,15,15,1,-3,-20,-25,-14,12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-16,-30,-27,6,-30,-22,25,-20,14,12,-27,-28,-24,-19,-14,-4,34,-20,2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-28,-2,5,-19,-18,-11,-21,3,-19,-14,-7,-3,-1,10,-4,-5,-15,-12,-12,1;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-25,42,-29,-19,11,-29,29,14,-25,-29,-28,-19,-25,-10,5,-6,14,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,0,-27,1,10,-25,-19,14,-22,9,-19,-7,1,-14,17,16,-2,-6,-19,-26,-7,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-7,-22,-5,1,-20,-16,-16,-14,-9,-18,-14,-7,19,-6,-13,8,10,-11,-32,-19,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,30,-28,35,8,-32,4,-2,-32,-3,-29,-24,23,-7,-1,-9,2,-9,-30,-35,-22,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,59,-15,-37,-17,-30,-20,10,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-22,-3,7,-22,-7,-7,-19,-1,-18,-8,0,-8,8,0,9,4,-16,-28,-16,7;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-19,-16,-12,-10,-13,-16,-5,-5,-9,-4,-7,-18,-9,0,3,4,3,-26,-11,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-26,-23,-31,-25,24,-22,-17,10,-22,12,8,-19,-26,-23,-15,-18,-10,7,-8,11,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-11,-23,-11,-3,-12,-21,-13,-6,-2,-10,-6,-10,-3,-6,-7,-1,3,-4,-22,-5,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-2,-28,0,7,-20,-20,20,-23,12,-15,-6,-1,-15,6,9,-9,-12,-20,-22,1,5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-25,6,21,-24,-16,-4,-23,5,-21,-16,7,1,9,5,5,3,-23,-30,-18,14;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-27,-19,-29,-26,7,-30,-16,24,-19,13,15,-26,-28,-21,-18,-16,-5,28,-14,12,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-9,-22,-11,-1,-4,-21,-8,-4,-6,3,9,-10,-17,-4,-2,-10,-4,-5,-21,-5,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-9,-24,-14,-12,-3,-22,5,-6,-5,-7,1,-4,-20,-7,-2,-9,-2,-7,-10,6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=3,-23,-24,-29,-21,-9,-27,-20,22,-21,4,7,-18,-6,-17,-23,-11,-7,17,-24,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-23,-8,-5,-16,-13,-8,-9,-1,-5,1,-2,-18,0,4,-7,-5,-8,-25,-11,-3;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-19,-3,8,-22,-13,-10,-20,7,-20,-13,0,-9,6,3,11,10,-13,-27,-15,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-25,-9,-7,-19,7,2,-24,-4,-20,-10,-1,-17,0,0,0,-8,-19,-22,-11,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-1,6,-20,3,2,-18,-12,8,-18,-6,-15,-11,8,-14,1,-5,5,3,-15,-29,-9,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-11,1,-14,-7,-11,-19,-9,-13,-3,-8,-3,-10,-20,-6,-5,-8,-6,-9,-22,-3,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-2,43,-11,-15,-21,-14,-15,-24,-13,-23,-17,4,-28,-13,-14,-1,-6,-15,-40,-23,-14;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='C'; M=0,-10,33,-14,-12,-20,-13,-18,-21,-16,-20,-16,-7,-10,-11,-18,4,-2,-12,-35,-23,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-19,-6,-2,-10,-11,-4,-12,1,-13,-8,-6,18,-2,5,-4,-4,-13,-11,-4,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-1,-18,-3,-1,-11,-6,5,-15,2,-13,-5,4,-12,3,1,-1,-6,-14,-17,-5,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,2,-20,1,-3,-22,2,-12,-20,-10,-21,-17,5,1,-7,-14,12,1,-16,-32,-21,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-12,10,-25,1,-4,-17,-11,0,-14,-1,-16,-7,22,-4,-2,5,-3,-5,-21,-31,-16,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-11,10,-23,12,11,-14,-18,-2,-17,-3,-13,-9,3,-12,1,-7,1,6,-16,-23,0,5;
MA   /M: SY='A'; M=20,-12,-19,-19,-12,-17,-7,-20,-2,-8,-9,-5,-8,-13,-10,-15,3,-3,1,-22,-15,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-17,-21,-23,-17,28,-23,-2,-9,-19,-5,-5,-11,-11,-20,-15,-6,2,-8,-9,14,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-17,-21,-16,-5,0,-19,-17,-5,-14,-3,-6,-15,7,-13,-16,-6,-5,-4,-20,-9,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,3,-27,6,8,-29,-14,7,-26,7,-26,-13,4,-2,15,9,4,-4,-23,-29,-12,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-15,-24,-12,-3,-1,-21,-13,-6,-11,5,-2,-15,5,-10,-7,-15,-9,-10,-18,-7,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-14,-24,-14,-7,0,-11,-6,-7,-13,3,-3,-14,-20,-10,-13,-10,-3,-9,-8,14,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-26,3,8,-17,-17,14,-25,7,-20,-12,2,-16,6,18,0,-6,-21,-22,1,4;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-18,-25,-19,-13,-6,-11,-10,-8,-9,4,-1,-15,-14,-10,0,-14,-10,-8,-14,0,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-13,-23,-14,-7,0,-18,-14,-12,2,-15,-4,-9,-3,-9,-3,-2,-3,-8,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-5,-35,-2,0,-27,-15,-12,-20,-7,-30,-20,1,62,-7,-15,-5,-7,-30,-33,-27,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00912;
//
ID   EGF_2_MP; MATRIX.
AC   MP01186;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   EGF-like domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6387091; R2=0.0023904; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=206; N_SCORE=6.131; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-57; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: D=-60; I=-60; B0=-1500; B1=*; E0=-1500; E1=*; MI=-2358; MD=-2462; IM=-89; II=-312; DM=-70; DD=-138;
MA   /I: I=*; I0=*; B1=-846; E0=*; BD=-842;
MA   /M: SY='D'; M=-83,-1504,452,200,-71,-80,50,-78,-73,-70,-97,419,36,-16,-79,14,10,-73,-78,-72;
MA   /M: SY='I'; M=-77,-1560,-47,-78,-70,155,-38,187,-67,147,145,-82,-84,-75,-72,-79,-58,122,-70,-44;
MA   /M: SY='D'; M=-79,-1501,576,101,-72,-74,-34,-70,11,-74,-79,403,56,-13,-5,-40,-70,-74,-70,-75;
MA   /M: SY='E'; M=-74,-1501,76,429,-76,-71,52,-78,-76,-72,-72,-47,173,48,100,0,-71,-75,-70,-74;
MA   /M: SY='C'; M=-560,786,-999,-1030,-990,-749,-398,-974,-972,-1001,-904,-833,-831,-931,-481,-686,-472,-358,-1012,-1008;
MA   /M: SY='S'; M=104,-1543,30,102,-137,-73,-101,-136,-64,-40,-272,4,-92,104,-81,105,23,-71,-273,-653; D=-10;
MA   /I: I=-150,-2050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-539;
MA      MI=-100; MD=-1464; IM=-145; II=-50;
MA   /M: SY='N'; M=-108,-2077,47,-112,-195,34,109,-249,-102,-193,-113,285,-96,63,-53,85,-51,-362,-210,-251;
MA   /M: SY='P'; M=-150,-1593,-100,-75,-124,-257,-106,-116,-193,-68,-105,-158,345,-51,-30,-100,-148,-97,-381,57;
MA   /M: SY='C'; M=-805,588,-1077,-1113,-1071,-870,-1013,-1102,-1094,-572,-1030,-963,-944,-1049,-1047,-442,-852,-981,-1037,-1076;
MA   /M: SY='Q'; M=-20,-1554,-89,-24,-6,-109,188,-136,27,94,27,-122,-189,194,85,-42,-257,-108,-105,-125;
MA   /M: SY='N'; M=-143,-1587,-267,-122,-431,-78,230,-328,-232,-392,-347,381,-73,-183,-145,-120,-280,-259,-705,-91; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-6;
MA      MI=-461; MD=-1448; IM=-206; II=-40; DM=-2; DD=-642;
MA   /M: SY='G'; M=-163,-1582,-3,-180,-174,296,168,-423,-220,-342,-616,150,-156,-32,-38,-153,-287,-472,-725,-155;
MA   /M: SY='G'; M=106,-1568,-352,-398,-703,348,-182,-670,-394,-512,-338,-539,-678,-370,-322,-111,-353,-374,-708,-647;
MA   /M: SY='T'; M=-118,-1505,-281,6,-242,-345,-40,11,9,-99,-138,-61,-250,29,61,18,257,45,-724,-285;
MA   /M: SY='C'; M=-407,586,-860,-481,-933,-761,-873,-977,-899,-468,-905,-806,-453,-416,-892,-701,-724,-856,-966,-467;
MA   /M: SY='I'; M=-203,-1588,-178,-26,-38,-358,120,139,-20,-9,38,-94,-333,75,49,-13,19,130,-81,24;
MA   /M: SY='D'; M=-153,-1560,240,23,-181,-173,18,-213,-287,-207,-57,224,25,51,-212,-53,-123,-36,-316,-33;
MA   /M: SY='T'; M=-106,-1544,-12,-152,-151,83,26,-15,-66,33,-27,4,-233,55,34,7,161,-25,-716,-101;
MA   /M: SY='P'; M=-133,-1507,-25,70,-152,51,-37,81,-53,-42,-103,-56,139,-35,-76,-45,-148,90,81,-104;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-1547,164,48,-143,32,-68,-106,-40,-119,-188,103,-36,83,-23,64,-168,-188,-106,12; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-139;
MA      MI=-158; MD=-183; IM=-191; II=-45; DM=-461; DD=-60;
MA   /M: SY='F'; M=-52,-1509,-89,-6,99,58,-85,31,4,27,-30,-27,-26,-94,-115,49,37,-21,-73,-50;
MA   /M: SY='G'; M=-61,-1541,67,-15,-335,227,9,-153,-152,-239,-278,179,-42,-84,-57,5,-39,-252,-330,-223;
MA   /M: SY='S'; M=-72,-1554,45,-48,-143,161,-13,-283,-100,-299,-11,-1,-178,8,-41,194,45,-220,-184,-272;
MA   /M: SY='Y'; M=-101,-1533,-326,-402,285,-115,19,-167,-232,-278,-313,-171,14,-270,-186,-236,-216,-156,-668,372;
MA   /M: SY='T'; M=-112,-1517,-244,34,2,-324,114,-7,55,-134,-79,-107,-668,99,120,56,139,8,-184,10;
MA   /M: SY='C'; M=-1025,588,-1130,-1168,-1174,-997,-1088,-1251,-1177,-1209,-1179,-1117,-1052,-1156,-1122,-1059,-395,-1171,-1060,-1179;
MA   /M: SY='Q'; M=-63,-1581,60,80,-116,-594,74,43,4,4,-103,-6,-568,106,80,-17,56,28,-232,-182;
MA   /M: SY='C'; M=-994,588,-1126,-1164,-1165,-984,-1081,-1235,-1170,-1200,-1163,-1100,-1041,-1146,-1115,-542,-1035,-1147,-1059,-1170;
MA   /M: SY='P'; M=1,-1044,-30,-90,-216,-273,20,-263,-10,-23,-113,-83,279,69,9,-30,-44,-35,-276,-194; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71;
MA   /M: SY='P'; M=31,-1507,-40,-28,-11,-87,-55,-232,-40,-98,-39,-20,285,-7,-28,-37,-87,-119,-725,-142; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-30; MM=-18;
MA      MI=-313; MD=-1468; IM=-137; II=-71; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='G'; M=-139,-1506,-91,-139,-285,447,-136,-498,-267,-339,-615,-41,-156,-303,-200,-97,-267,-316,-173,-398;
MA   /I: DD=-199;
MA   /M: SY='Y'; M=-247,-1501,-392,-294,316,-713,-31,-300,-284,-253,-237,-327,-322,-284,-49,-248,-156,-308,280,457;
MA   /M: SY='T'; M=-83,-1503,-29,49,-115,-42,21,-150,-84,-242,-25,-105,-173,38,-57,102,233,-92,-132,34;
MA   /M: SY='G'; M=-268,-1538,-140,-323,-200,471,-564,-604,-424,-214,-281,-392,-250,-438,-452,-384,-570,-399,-673,-410; D=-10;
MA   /I: I=-150,-1050,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150,-150; I0=-40; MM=-11;
MA      MI=-382; MD=-800; IM=-227; II=-34; DM=-42; DD=-199;
MA   /M: SY='P'; M=-24,-1542,81,72,-270,-280,-18,-125,102,-81,-219,-101,152,31,116,-7,-18,-58,-163,-306;
MA   /M: SY='H'; M=-260,-1531,-8,-76,24,-241,218,-120,-107,-11,-174,157,-499,51,203,-135,48,-151,-109,67;
MA   /M: SY='C'; M=-463,587,-1006,-1041,-384,-754,-932,-982,-1002,-1008,-910,-839,-439,-944,-960,-469,-713,-848,-1016,-1010;
MA   /M: SY='E'; M=-148,-1507,51,283,-440,-206,4,-207,-187,-132,-210,-47,-339,190,-195,4,-53,-171,-725,-374;
MA   /I: I=*; I0=*; B0=*; E1=-100;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00021;
//
ID   EGF_CA_MP; MATRIX.
AC   MP01187;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Calcium-binding EGF-like domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2449055; R2=0.0077692; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=332; N_SCORE=6.822; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-26,16,3,-18,-1,-4,-23,-8,-14,-15,5,-17,-6,-11,-3,-6,-20,-23,-6,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-10,-21,-14,-10,3,-12,-10,-9,-7,-7,-6,-4,-15,-11,-1,-4,-3,-7,-17,-3,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-9,40,-12,-4,-22,-16,-17,-25,-9,-20,-16,-9,-22,-9,-12,-2,-7,-13,-35,-22,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-21,3,8,-17,-16,-7,-12,1,-12,-8,1,-13,0,-1,0,-1,-9,-26,-11,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,61,-20,-18,-18,-23,-21,-20,-19,-16,-13,-11,-25,-18,-19,-6,-5,-9,-40,-23,-18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-27,-7,0,-12,-15,-10,-15,-4,-13,-9,-7,9,-5,-5,-6,-6,-15,-23,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=0,-6,-25,-5,1,-24,-10,-12,-20,0,-20,-13,-5,11,0,-2,2,1,-17,-27,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-27,-8,-15,-27,49,-18,-35,-15,-27,-19,0,-16,-16,-15,3,-10,-26,-22,-26,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-17,-22,-22,-17,38,-25,-6,-4,-15,2,-1,-13,-24,-19,-11,-14,-5,-6,5,30,-17; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-2,-20,-4,7,-18,-14,-5,-13,0,-12,-7,-1,-11,8,-1,4,0,-12,-24,-11,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-22,-16,-16,-5,19,-16,-17,-16,-7,-8,-9,-18,-17,-14,-7,-12,-13,-14,-10,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-9,-2,-21,-4,-7,-8,-15,-9,-9,-7,-12,-10,0,-13,-7,-7,-7,-5,-11,-2,-2,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-4,-21,-6,-5,-11,-5,0,-14,-4,-11,-6,2,-16,-3,0,-2,-4,-12,-21,-7,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-12,17,-17,-14,-13,-13,-12,-19,-12,-16,-11,-8,-23,-11,-12,-2,-3,-10,-28,-11,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-12,40,-17,-11,-11,-25,-14,-19,-16,-14,-12,-13,-26,-13,-16,-6,-6,-11,-29,-8,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-6,-25,-8,1,-20,-19,-9,-6,0,-11,-3,-4,-11,6,-3,-3,-2,-7,-25,-11,3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,45,-28,56,19,-35,-9,2,-35,1,-29,-27,26,-11,2,-7,2,-8,-30,-39,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-21,-23,-25,-22,-4,-19,-23,18,-18,5,6,-16,-22,-18,-19,-12,-6,17,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,26,48,-33,-18,1,-30,8,-22,-19,3,-3,21,0,0,-10,-30,-30,-19,35;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=3,-3,-21,-5,7,-21,-14,-10,-15,2,-11,-8,-4,-12,4,-1,1,-1,-11,-25,-14,5;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-22,0,1,-18,-9,-8,-15,-7,-13,-10,1,-9,-3,-7,3,0,-12,-29,-15,-1;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-4,-17,-4,-3,-5,-4,-8,-13,-4,-10,-8,-2,1,-7,-3,-3,-4,-11,-13,-8,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-20,4,0,-18,2,7,-20,-5,-18,-11,9,-12,1,-5,4,-5,-18,-24,-10,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-27,-10,-6,-17,-13,-14,-12,-4,-17,-10,-9,15,-7,-8,-5,-5,-11,-23,-13,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-17,100,-25,-25,-17,-25,-25,-25,-25,-17,-17,-17,-33,-25,-25,-8,-8,-8,-42,-25,-25; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-7,-17,-7,-1,-17,-9,-4,-15,2,-13,-6,-3,-8,5,4,-1,-4,-13,-20,-10,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='N'; M=-9,8,2,3,-3,-18,-6,-1,-21,-8,-20,-15,13,-15,-6,-8,0,-6,-19,-31,-16,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-23,6,0,-24,14,-3,-25,-6,-22,-14,9,-14,-3,-7,4,-7,-20,-26,-18,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='G'; M=7,-2,-17,-3,-4,-24,13,-2,-25,-10,-21,-14,1,-13,-3,-12,5,-8,-19,-24,-16,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-13;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-8,-18,-12,-9,-9,-18,-6,-6,-6,-9,-4,-4,-17,-4,-4,5,11,-2,-25,-4,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-14,-22,-17,-10,-6,-25,-10,3,-5,-2,1,-12,-20,-8,-3,-9,-3,6,-18,-2,-10;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,44,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-9,-21,-11,-7,-8,-12,-10,-10,-8,-3,-3,-7,-18,-7,-4,-2,4,-7,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-26,-21,-11,-8,-26,-15,9,-14,3,5,-18,-6,-9,-14,-14,-9,5,-18,-6,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-27,-5,-14,-26,45,-12,-32,-14,-26,-17,9,-20,-14,-14,1,-14,-26,-24,-25,-14;
MA   /M: SY='G'; M=3,1,-20,1,-6,-22,15,-9,-26,-11,-26,-18,5,-14,-7,-11,15,3,-18,-26,-18,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,52,-30,3,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,58,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-23,-4,2,-12,-17,-4,-16,3,-15,-9,-1,-15,0,5,1,2,-11,-23,-5,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: M=-7,-11,-22,-14,-10,-5,-17,-11,-3,-12,-3,-2,-8,-19,-9,-10,-5,-1,-2,-16,-4,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,108,-27,-27,-18,-27,-27,-27,-27,-18,-18,-18,-36,-27,-27,-9,-9,-9,-45,-27,-27; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-26,-4,0,-20,-15,-10,-14,-3,-14,-10,-8,16,-2,-3,-5,-6,-14,-24,-15,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-30,1,8,-26,-14,-11,-20,-2,-21,-15,-6,23,0,-6,-3,-7,-21,-29,-21,2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-29,-2,-9,-29,42,-12,-35,-13,-28,-19,3,-12,-13,-14,1,-14,-28,-24,-25,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-27,-24,-19,34,-26,2,-6,-12,-2,-3,-17,-27,-16,-6,-17,-10,-10,20,48,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-10,-24,-9,5,-13,-19,-12,-6,-6,-9,-5,-9,-6,-1,-8,-2,-1,-5,-24,-11,1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-13,-25,-12,-13,-15,18,-16,-17,-18,-3,-6,-9,-20,-15,-15,-8,-11,-14,-21,-15,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-24,-5,-1,-19,-13,1,-18,6,-15,-5,-1,-13,3,8,-3,-6,-14,-24,-9,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,-23,-1,-2,-11,-12,-3,-14,-5,-13,-9,9,-13,-1,-1,-1,-2,-16,-22,-8,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-2,35,-6,-13,-20,-14,-16,-22,-17,-18,-16,-3,-23,-16,-19,-5,-7,-13,-35,-21,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-25,3,19,-23,-13,-2,-18,5,-16,-8,-1,-9,10,0,-1,-5,-17,-26,-13,14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-19,-8,-5,-12,-10,3,-14,-5,-9,-5,-5,-19,-5,-3,-7,-8,-11,-21,-3,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-16,1,-2,-21,-10,-9,-18,-6,-20,-14,2,-4,-4,-7,7,3,-13,-32,-17,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00913;
//
ID   ELO_MP; MATRIX.
AC   MP01188;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ELO family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4759016; R2=0.0131422; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=749; N_SCORE=14.309; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-30,13,-34,-28,32,-25,14,12,-25,-26,-28,-24,-15,-5,35,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-29,-21,-32,-23,31,-30,-15,12,-28,33,12,-26,-30,-24,-19,-26,-10,5,-6,18,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-26,-28,-23,-5,-6,-21,14,-25,14,15,-17,-23,-17,-22,-17,-13,6,-20,-8,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-17,-32,-26,8,-26,-24,23,-21,10,12,-22,-23,-23,-21,-11,-5,26,-20,-3,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30,69,-31,-21,7,-30,11,3,-20,-29,-37,-21,-20,-10,4,6,26,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-38,-28,33,-34,-24,23,-30,24,12,-22,-26,-28,-24,-22,-10,13,-8,12,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,-1,8,-28,-20,6,-30,40,-28,-9,1,-12,10,30,-10,-11,-21,-21,-6,8;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-34,-4,10,-34,-20,-6,-22,13,-26,-10,-7,27,22,4,-6,-10,-28,-24,-17,14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,36,17,-29,-29,-23,-21,-24,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-18,-22,-17,-5,-26,-22,14,-20,5,3,-9,-16,-14,-18,2,18,11,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,23,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-24,-23,-27,-24,3,-25,-23,4,-17,-4,-4,-24,-25,-20,-17,-12,3,10,24,10,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-10,1,-14,-14,-20,11,-19,-19,-16,-20,-15,-5,-18,-14,-18,12,0,-7,-31,-23,-14;
MA   /M: SY='T'; M=19,-7,-10,-15,-11,-13,-12,-20,-6,-11,-10,-9,-6,-13,-11,-15,15,22,5,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-20,-14,-25,-21,-1,-25,-19,16,-16,13,19,-20,-22,-16,-15,-8,9,22,-26,-6,-19;
MA   /M: SY='F'; M=2,-23,-20,-27,-17,14,-20,-18,2,-20,11,6,-20,-8,-19,-19,-14,-8,0,-14,-1,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-18,-24,-24,-20,1,-25,-20,13,-21,14,5,-14,-24,-17,-18,-16,-3,6,-2,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-23,-23,-25,-20,16,-27,-9,11,-22,18,7,-20,-26,-16,-17,-16,-6,4,-6,22,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-20,7,-27,-23,-5,-22,-26,-19,-19,-16,-16,-20,-25,-19,-19,-11,4,-14,34,0,-19;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-27,-34,-27,-22,9,-20,-14,-10,-16,-14,-12,-26,-27,-15,-16,-19,-14,-14,70,30,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-17,-6,-23,-19,6,-25,0,-9,-20,-8,-5,-12,-23,-16,-16,-9,0,-8,-1,6,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-23,-10,-8,-27,20,-13,-21,-11,-20,-10,-4,-17,2,-12,4,-9,-14,-23,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-25,-24,-27,-23,9,-21,-12,14,-22,20,9,-23,-28,-19,-19,-21,-10,8,-8,17,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-2,-25,-8,-2,-20,-18,-9,-11,20,-16,2,2,-14,2,9,-8,-8,-10,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-4,-33,-6,-9,-15,4,-15,-19,-13,-20,-16,-1,-20,-11,-15,-11,-16,-22,17,-7,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-10,-22,-14,-9,-15,-21,5,-7,1,-10,-2,-6,-17,-4,3,-5,-1,-2,-25,-4,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00914;
//
ID   RIBOSOMAL_S12E_MP; MATRIX.
AC   MP01189;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S12e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5070586; R2=0.0156870; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=534; N_SCORE=13.874; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=64; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-11,-18,-12,-5,-13,-21,-17,4,-10,-6,-3,-10,-11,-10,-13,-4,-3,13,-30,-15,-8;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-19,-4,7,-19,-11,-11,-9,-6,-14,-11,2,-11,-2,-12,8,-1,-7,-29,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=1,-2,-24,2,11,-23,-12,-14,-15,-5,-16,-14,-7,4,-4,-12,0,-3,-10,-29,-20,2;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-18,-7,-1,-20,-8,-17,-10,-9,-12,-10,-10,-7,-9,-15,2,-1,-1,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='A'; M=18,-17,-17,-19,-11,-15,-15,-22,1,-13,-7,-5,-17,0,-14,-19,0,-2,9,-26,-18,-13;
MA   /M: SY='A'; M=12,-12,-17,-14,-2,-15,-18,-19,0,-10,-6,-5,-13,-10,-10,-15,1,3,7,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-26,-7,0,-19,-14,-15,-6,-12,-4,-5,-10,-2,-3,-16,-7,-9,-9,-25,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=0,-2,-26,0,0,-28,-1,-13,-25,2,-26,-16,-2,8,0,-5,3,-2,-20,-27,-20,-1;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-24,-5,5,-24,18,-12,-24,-8,-18,-9,-4,-12,-4,-13,2,-10,-18,-24,-21,1;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-5,-25,0,1,-23,-19,-15,-12,-8,-17,-12,-10,19,-5,-14,-2,-1,-8,-30,-19,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-16,-20,-21,-18,6,-22,-7,12,-14,14,34,-18,-22,-10,-13,-17,-9,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,32,-23,43,11,-31,-9,-5,-31,-4,-27,-25,15,-10,-1,-10,11,5,-21,-39,-19,5;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-18,-23,-21,-2,-27,-21,20,-16,14,9,-15,-26,-19,-15,-14,-5,22,-26,-7,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-22,-1,13,-15,-17,-4,-7,-4,-6,2,1,-14,2,-7,-2,-5,-8,-30,-13,8;
MA   /M: SY='T'; M=-7,17,-19,19,0,-22,-10,-13,-23,-7,-19,-18,7,-11,-7,-11,11,23,-13,-33,-15,-4;
MA   /M: SY='A'; M=48,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-1,-30,1,18,-31,-20,-1,-26,25,-23,-9,-1,-6,27,24,-5,-10,-25,-22,-12,22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-10,-25,-9,9,-15,-18,-14,-5,-4,1,-2,-12,-15,-3,-8,-10,-9,-5,-24,-12,2;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-10,-26,-26,-3,-27,-28,21,-18,6,6,-24,-26,-26,-19,-4,7,39,-29,-11,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-21,25,-28,41,22,-28,-28,-19,-20,-26,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-29,-7,3,-23,-20,-5,-25,36,-21,-3,-2,-15,9,41,-11,-10,-17,-20,-9,4;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-23,-2,2,-23,-16,-9,-23,24,-23,-11,7,-12,3,18,1,5,-15,-25,-12,2;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-16,-24,-17,-9,-6,-23,11,-6,-8,10,8,-11,-23,-4,8,-15,-10,-7,-24,0,-9;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,-17,-22,-13,-9,-22,-13,13,-15,2,6,-17,-19,-14,-17,-7,-5,18,-25,-9,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-6,-24,-9,-7,-10,-19,49,-17,-11,-13,-2,-1,-19,-1,-7,-5,-7,-14,-19,18,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,40,-29,53,12,-36,3,-2,-38,-3,-30,-27,21,-13,-3,-10,1,-10,-30,-37,-21,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=17,-17,-16,-22,-15,-13,-17,-22,5,-4,-4,-1,-15,-17,-14,-12,-3,-3,15,-23,-13,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-14,-13,-5,-19,-24,-1,-20,14,-17,-7,-5,-16,1,31,-11,-11,-14,-24,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-5,-28,-5,0,-20,-18,36,-29,11,-21,-7,5,-19,9,36,-5,-10,-23,-26,0,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,18,57,-31,-20,1,-29,10,-20,-18,0,-1,23,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='A'; M=21,-13,6,-19,-15,-15,-12,-22,-5,-15,-10,-8,-12,-18,-15,-19,9,6,9,-30,-18,-15;
MA   /M: SY='A'; M=17,-10,8,-19,-14,-16,-13,-21,-8,-16,-11,-10,-8,-16,-13,-19,10,10,0,-30,-17,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-11,-18,-10,-16,-4,-18,-8,-13,-5,-8,-9,-13,-10,-18,10,2,0,-24,-17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-28,46,32,-34,-14,-2,-34,3,-25,-25,11,-7,6,-7,2,-5,-28,-36,-19,19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-28,-4,6,-26,-18,-5,-28,33,-26,-11,1,-14,12,38,-3,-6,-19,-22,-11,7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-30,-8,1,-23,-13,7,-30,21,-21,-9,1,-19,14,50,-8,-12,-23,-21,-9,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,4,22,-26,-16,-3,-18,2,-18,-11,3,-9,19,-2,5,0,-18,-28,-16,21;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-5,-28,-5,3,-23,-22,40,-18,1,-13,1,-1,-18,18,3,-9,-13,-19,-25,4,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-31,-22,13,-29,-20,20,-27,40,20,-29,-29,-21,-19,-26,-9,14,-19,1,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00915;
//
ID   RIBOSOMAL_L36E_MP; MATRIX.
AC   MP01190;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L36e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3856087; R2=0.0130539; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1095; N_SCORE=18.670; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-10,-12,-12,-9,-21,-21,-6,-11,-8,-8,-3,-12,-12,-11,17,44,6,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-8,-25,-10,-2,-21,-21,-16,-10,22,-17,-4,-6,-14,-1,9,-6,-6,-3,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-36,-26,59,-30,-20,2,-21,7,1,-18,-27,-32,-16,-19,-10,1,3,22,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-30,-27,32,-20,12,17,-28,-28,-25,-20,-12,-2,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=2,17,-19,19,14,-26,-6,-4,-25,-3,-26,-21,15,-9,3,-8,17,3,-20,-36,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,5,-31,-22,28,-26,34,22,-27,-27,-20,-21,-23,-8,21,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='A'; M=33,-12,3,-21,-14,-17,-9,-22,-8,-13,-9,-9,-12,-15,-14,-20,7,5,4,-25,-19,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-24,-26,-27,-16,21,-26,-4,-1,-21,13,5,-20,-26,-12,-14,-22,-13,-7,7,13,-13;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-16,-28,-23,0,-27,-25,22,-22,18,10,-23,-24,-22,-20,-12,1,26,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-22,-22,-31,-22,0,-28,-16,26,-19,19,32,-18,-20,-11,-18,-16,-2,16,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,0,-17,-10,-17,-9,-18,-13,11,-13,-6,-2,10,-25,-16,-13,-3,-1,13,-33,-13,-17;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-15,-5,-6,-22,17,-14,-24,-12,-28,-19,5,-12,-6,-14,27,8,-14,-33,-22,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,3,-31,5,-11,-32,27,-29,-12,0,-13,6,15,-6,-13,-24,-20,-16,4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-30,56,31,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,14,-7,6,-7,0,-10,-30,-37,-20,18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-20,-24,-20,-10,-4,-26,-13,-1,-2,19,7,-17,-25,-7,14,-21,-10,-3,-20,-4,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-17,-33,-26,29,-29,-21,16,-25,22,15,-26,-29,-27,-19,-20,-7,19,-13,7,-25;
MA   /M: SY='A'; M=24,-18,0,-25,-16,-11,-14,-22,0,-19,5,-1,-17,-19,-15,-22,-4,-4,4,-23,-15,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,49,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,35,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00916;
//
ID   RIBOSOMAL_S3AE_MP; MATRIX.
AC   MP01191;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S3Ae signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2292385; R2=0.0158585; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=330; N_SCORE=10.453; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-4,6,-22,3,-9,-23,19,-15,-27,-12,-22,-18,8,-15,-12,-13,8,9,-19,-28,-20,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,6,-23,-1,-4,-20,9,-6,-23,-2,-22,-12,15,-17,-3,3,5,0,-20,-29,-18,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-21,-7,-4,-16,-21,-13,-10,7,-11,-6,-8,-19,-5,16,-5,-3,3,-26,-12,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-18,-10,2,-8,-23,-17,-2,-10,-7,-6,-8,-14,-8,-12,4,12,4,-28,-10,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-19,-20,-22,-14,-9,-27,-17,14,-15,10,9,-18,-21,-3,-14,-10,-1,13,-23,-7,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-8,-20,-11,0,-9,-23,-12,-6,-7,4,-2,-10,-15,-2,-7,-3,12,-6,-22,-3,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-7,-3,-17,-20,-16,-18,12,-17,-10,0,-10,-2,7,9,27,-8,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-33,-15,-9,-19,-22,-17,-1,-14,-14,-4,-11,40,-10,-19,-9,-8,-12,-28,-19,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,24,-22,26,9,-28,1,-3,-28,-4,-28,-23,21,-12,-1,-9,14,0,-23,-37,-21,4;
MA   /M: SY='D'; M=-18,40,-30,58,30,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,15,-8,5,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='P'; M=1,-15,-32,-11,-7,-28,8,-19,-24,-13,-28,-19,-12,43,-12,-19,-2,-10,-25,-27,-28,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-20,0,6,-13,-17,-11,-9,-12,4,-5,-7,-16,-4,-13,-2,-3,-8,-29,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-28,-1,8,-23,-20,-9,-22,32,-18,-7,1,-13,5,19,-11,-9,-17,-22,-10,7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-8,-19,-17,2,-19,-17,17,-15,15,8,-19,-19,-17,-12,-11,-2,22,-17,-4,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-13,-21,-16,2,-21,-16,21,-17,17,12,-16,-16,-13,-14,-13,-5,17,-14,-2,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-29,-6,-16,-28,53,-4,-37,-17,-29,-18,7,-20,-15,-16,0,-18,-30,-23,-24,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-14,-24,-25,-3,-27,-25,23,-18,5,6,-17,-25,-23,-18,-5,6,34,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-30,-24,18,-26,-20,15,-22,11,9,-21,-25,-24,-19,-11,-4,19,-15,5,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-13,-23,-21,-4,-27,-26,15,-17,3,3,-15,-20,-20,-17,2,21,25,-29,-9,-21;
MA   /M: SY='T'; M=3,-2,2,-8,-8,-15,-12,-17,-16,-12,-19,-15,2,-13,-8,-12,26,32,-5,-36,-16,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,47,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=14,-10,-22,-14,-10,-18,12,-16,-23,0,-18,-12,-5,-15,-9,0,0,-9,-14,-18,-17,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,16,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-6,-1,-19,-19,-9,-12,-4,-10,-5,2,-12,12,-4,10,24,-11,-27,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,18,-25,10,-6,-26,27,-4,-30,-5,-30,-20,30,-19,-8,-7,4,-9,-29,-31,-24,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-27,55,20,-36,-9,-1,-36,-1,-29,-28,17,-9,2,-9,6,-6,-27,-39,-20,11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-8,-27,-7,12,-2,-22,4,-11,-6,-8,-3,-9,-7,-1,-9,-9,-10,-14,-15,5,4;
MA   /M: SY='T'; M=1,7,-15,8,1,-19,-12,-13,-16,-8,-17,-15,3,-11,-5,-11,17,18,-7,-34,-16,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-26,2,8,-20,-17,19,-23,20,-21,-7,5,-12,10,13,-7,-10,-21,-19,1,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=0,5,-20,2,-2,-22,-1,15,-21,-8,-23,-12,12,-16,1,-8,10,-3,-17,-32,-11,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-4,-23,-13,-13,16,-19,24,-9,-13,-6,4,6,-24,-10,-8,-11,-10,-14,-14,16,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-20,-15,-11,-12,-23,-8,-7,2,-9,-4,-6,-19,-6,17,-1,10,2,-26,-7,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-30,-3,6,-24,-21,-6,-28,43,-26,-9,-1,-13,9,33,-11,-10,-19,-16,-4,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-20,-31,-24,10,-30,-21,23,-19,19,18,-23,-25,-20,-17,-19,-7,21,-19,0,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-12,-28,-14,-8,2,-26,-2,-10,12,-11,-4,-10,-20,-4,10,-13,-6,-10,-2,24,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,43,-30,-20,11,-30,31,11,-25,-30,-29,-20,-25,-10,5,-6,14,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-28,-9,3,-24,-20,-5,-20,21,-18,-6,-2,-15,15,32,-6,-5,-16,-21,-10,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00917;
//
ID   HMG_COA_REDUCTASE_3_MP; MATRIX.
AC   MP01192;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductases signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0870457; R2=0.0139297; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=413; N_SCORE=10.830; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=102; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-36,-29,-1,-37,-29,43,-27,16,16,-21,-21,-21,-27,-16,-4,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=9,-25,-15,-30,-25,-5,-26,-28,26,-20,8,8,-23,-23,-23,-23,-8,-3,34,-25,-10,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-14,17,-23,-17,-18,-8,-23,-11,-16,-11,-10,-14,-19,-17,-22,3,-2,2,-28,-21,-17;
MA   /M: SY='G'; M=23,-9,-13,-14,-13,-24,27,-19,-24,-15,-21,-16,-4,-15,-13,-19,9,-6,-14,-24,-24,-13;
MA   /M: SY='T'; M=14,-11,-12,-17,-12,-11,-14,-19,-1,-14,-4,-5,-8,-15,-12,-16,10,15,6,-28,-13,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-25,-15,-25,-28,-7,-7,-28,14,-20,1,3,-23,-28,-28,-20,-8,-5,32,-28,-15,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-30,-21,7,-27,-15,21,-24,40,30,-27,-27,-15,-17,-26,-9,12,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-28,-8,-10,-32,44,-13,-33,-12,-26,-15,-1,-17,-1,-13,1,-16,-28,-20,-25,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-28,18,43,-27,-15,2,-28,9,-22,-19,14,-6,15,4,2,-8,-29,-32,-19,29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-21,17,-28,-20,16,-29,42,16,-28,-29,-22,-20,-27,-9,8,-16,2,-21;
MA   /M: SY='S'; M=12,-4,-13,-5,-4,-19,6,-13,-19,-12,-23,-17,4,-12,-4,-13,28,12,-10,-34,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=4,-24,-17,-27,-17,2,-23,-20,12,-24,33,12,-24,-24,-17,-19,-18,-5,7,-21,-5,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,3,-30,-22,-2,-24,-10,12,-17,18,38,-22,-25,-10,-15,-20,-10,9,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='S'; M=17,-6,-15,-9,-3,-20,-5,-11,-19,-1,-21,-14,1,-12,-1,5,18,6,-9,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=35,-5,-12,-10,-7,-21,-2,-17,-12,-10,-14,-12,-5,-11,-8,-17,14,3,-2,-26,-20,-8;
MA   /M: SY='A'; M=28,-4,-10,-13,-9,-17,-6,-18,-11,-10,-13,-11,-2,-10,-9,-15,16,17,-2,-26,-17,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-29,3,2,-30,40,-13,-37,-11,-28,-21,2,-14,-8,-14,2,-15,-29,-25,-26,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-13,4,-30,6,2,-29,2,42,-32,-7,-24,-8,7,-17,12,-4,-4,-17,-30,-27,-2,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-15,-23,-18,-9,-27,-19,18,-13,4,11,-23,-25,-8,-13,-8,-3,29,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-29,-1,6,-26,-17,-2,-28,33,-26,-11,8,-15,13,38,-6,-9,-22,-23,-11,8;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-15,-6,-7,-22,16,-14,-23,-12,-26,-18,4,-12,-7,-14,25,7,-13,-31,-22,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-1,20,-11,22,57,-21,-21,-1,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-4,-25,-6,8,-24,-18,1,-16,12,-16,-3,-4,-12,14,8,-4,-7,-14,-23,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-9,-29,-9,-9,3,-24,66,-18,-12,-11,0,-2,-24,0,-5,-14,-16,-21,-8,40,-9;
MA   /M: SY='N'; M=4,29,-18,11,-2,-20,0,3,-18,-2,-25,-18,44,-18,-2,-5,10,0,-23,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=11,7,-14,0,-3,-20,1,-8,-19,-6,-25,-17,16,-13,-3,-8,23,11,-13,-34,-20,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=7,-2,-9,-5,-1,-16,-8,-11,-15,5,-18,-11,1,-8,-1,-1,12,10,-7,-23,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-12,-25,-16,-7,-15,-24,-15,2,3,-1,3,-8,-16,0,-1,-10,-5,-1,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='B'; M=10,16,-20,15,3,-27,-5,-8,-23,-1,-23,-18,12,-8,-3,-9,8,-2,-17,-31,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-21,-18,-25,-20,-6,-25,-23,17,-16,5,7,-18,-16,-17,-18,-6,2,20,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-17,-10,-9,-14,-14,-9,-3,-7,-10,1,4,-17,-2,-7,6,7,-1,-29,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=11,2,-19,0,1,-24,-3,-12,-19,1,-22,-15,4,-11,-2,-6,12,1,-12,-29,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=7,-13,-22,-16,-14,-17,12,-10,-14,-18,-8,-7,-8,-14,-13,-18,-2,-6,-11,-23,-15,-15;
MA   /M: SY='A'; M=19,-4,-15,-9,-3,-20,-7,-14,-13,-8,-16,-12,-1,-4,-3,-13,14,10,-8,-28,-18,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-4,-10,-7,-3,-20,-4,-12,-23,-6,-22,-16,1,-6,-4,-2,8,5,-17,-30,-19,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-24,-9,-11,-21,18,-15,-25,-14,-25,-17,-3,3,-12,-16,8,0,-20,-24,-17,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,10,-9,13,-1,-24,-10,0,-23,-11,-17,-15,3,-17,-5,-13,1,-4,-17,-34,-14,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00064;
//
ID   RIBOSOMAL_S8E_MP; MATRIX.
AC   MP01193;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein S8e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1087584; R2=0.0102192; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=718; N_SCORE=11.446; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=234; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=13,-7,-18,-11,-12,-21,29,-17,-23,-13,-19,-14,-2,-13,-12,-16,7,-3,-14,-19,-21,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-25,-29,-32,-23,3,-35,-19,29,-19,10,12,-18,-18,-14,-18,-18,-9,17,-13,10,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-20,-28,-21,-18,15,-19,-10,-10,-15,-12,-11,-17,-24,-15,-14,-9,-6,-12,37,27,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,13,-33,-20,8,-24,19,-21,-4,0,-13,39,30,-4,-10,-26,-20,-9,24;
MA   /M: SY='G'; M=-6,4,-30,10,-9,-30,41,-15,-38,-14,-29,-23,4,-17,-14,-17,0,-16,-29,-17,-24,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-24,-4,-1,-22,-5,-3,-26,11,-25,-14,8,-13,2,24,6,-2,-19,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-22,8,-1,-19,-9,-10,-21,-7,-21,-16,2,-14,-3,-6,9,0,-15,-15,-12,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-26,-9,-3,-15,-16,-10,-17,15,-11,-4,-3,-14,-1,15,-10,-6,-13,-22,-9,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-27,-5,4,-22,-19,-8,-24,33,-21,-8,-2,-14,6,28,-7,-7,-16,-20,-7,4;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-28,-16,-7,-21,-18,-19,-7,-6,-15,-9,-14,26,-8,-12,-5,-6,-10,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,56,-19,-35,-17,-26,-18,-2,-18,-17,-17,1,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-28,-6,3,-21,-20,-8,-22,31,-20,-7,-1,-15,6,29,-9,-7,-16,-21,-9,3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-26,-16,-8,-11,-25,-6,-5,6,-3,1,-10,-20,0,13,-12,-7,-4,-17,1,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-30,-12,-5,-21,-12,-12,-20,16,-20,-9,-7,-8,-1,22,-10,-11,-14,-13,-12,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-28,-12,-3,-19,-21,-11,-11,5,-13,-4,-12,10,2,1,-9,-7,-12,-21,-10,-2;
MA   /M: SY='H'; M=4,-8,-22,-13,-11,-8,-14,8,-9,-10,-11,-6,-2,-17,-8,-10,-4,-7,-7,-11,4,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-8,-1,-18,-19,16,-27,19,-19,-8,0,-19,8,45,-8,-10,-20,-20,-1,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-29,5,8,-30,-11,-10,-31,37,-30,-13,2,-11,6,21,-6,-9,-21,-23,-13,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-28,-1,8,-28,-20,-10,-28,44,-28,-10,0,-10,8,28,-8,-5,-18,-21,-10,8;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-8,-29,-9,0,-20,-19,3,-27,27,-20,-7,0,-18,9,56,-9,-9,-19,-21,-8,1;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-21,-16,27,-25,4,-8,-6,-4,-3,-14,-25,-13,0,-14,-9,-10,8,39,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-27,15,51,-29,-17,-3,-27,7,-19,-19,-1,-1,16,-3,1,-9,-26,-29,-20,33;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-20,-30,-20,6,-27,-17,19,-25,40,25,-27,-25,-16,-19,-26,-9,10,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-28,-7,-1,-21,-10,-2,-30,22,-22,-12,4,-19,6,52,-5,-8,-21,-22,-13,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-5,-34,4,24,-30,-20,-9,-22,-1,-22,-16,-10,38,8,-9,-6,-10,-28,-29,-23,14;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-32,-11,-1,-27,-15,-18,-18,-10,-26,-18,-15,61,-7,-18,-2,-4,-23,-29,-26,-8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-12,-14,-8,-17,-11,-17,-8,-9,-11,-8,-5,-11,-4,-13,14,18,0,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-11,10,-25,4,13,-10,-16,-1,-11,-4,-11,-10,15,-15,0,-6,-3,-6,-18,-26,-8,6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-2,-12,-10,-9,-12,-20,-20,-11,-10,-12,-11,-2,-2,-10,-11,18,45,-2,-30,-12,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-5,4,-24,-21,-4,-24,29,-20,-7,-1,-14,10,30,-7,-3,-17,-21,-9,6;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,30,-27,32,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=7,-7,-23,-8,-13,-26,44,-17,-32,-16,-29,-19,2,-16,-13,-17,13,-7,-22,-26,-26,-13;
MA   /M: SY='E'; M=2,8,-24,14,22,-27,-13,-8,-24,-1,-21,-19,1,4,3,-9,6,0,-20,-31,-20,12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,3,-27,1,9,-25,-15,0,-23,17,-22,-11,7,-10,11,20,-4,-8,-21,-25,-13,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-28,8,10,-24,-19,-6,-24,17,-18,-12,1,-14,5,25,-7,-8,-17,-26,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-16,-22,-19,-8,-4,-28,-19,8,-8,4,3,-14,-18,-11,-8,-10,0,9,-22,-5,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-7,2,-20,-21,10,-22,18,-17,-6,-1,-17,6,30,-8,-10,-15,-24,-6,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00918;
//
ID   RIBOSOMAL_L15E_MP; MATRIX.
AC   MP01194;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L15e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4519243; R2=0.0118944; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1416; N_SCORE=21.284; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=173; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-29,-2,8,-28,-19,11,-27,25,-24,-7,4,-14,22,31,-6,-11,-24,-22,-7,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-25,1,15,-20,-9,-8,-16,-6,-5,-6,-6,-13,6,-8,-5,-9,-17,-26,-15,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-32,-6,-4,-27,-1,-16,-23,-11,-28,-19,-5,45,-10,-17,-1,-4,-26,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='A'; M=19,-9,-15,-12,-7,-19,-6,-16,-12,-5,-18,-12,-5,-6,-7,-10,14,5,-2,-29,-18,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-35,-29,4,-34,-29,37,-26,19,15,-25,-26,-25,-24,-17,-6,36,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-13,-20,-13,-6,-12,-25,9,0,-9,-3,2,-12,-21,-6,-8,-8,-5,8,-28,-3,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-8,4,-21,-20,0,-30,29,-20,-11,0,-19,11,65,-9,-10,-21,-21,-11,3;
MA   /M: SY='I'; M=4,-26,-19,-31,-24,-2,-28,-26,27,-23,16,11,-22,-22,-20,-23,-12,-5,26,-23,-7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-29,16,29,-29,-17,-7,-26,3,-23,-20,-1,15,6,-6,1,-6,-25,-31,-21,16;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,0,-19,-20,8,-29,27,-20,-9,0,-20,9,58,-10,-11,-20,-19,-4,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-10,-10,-7,-18,-19,-11,-11,-11,-11,0,-11,-10,-11,20,43,-1,-29,-9,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-29,-27,-17,-5,-30,-23,17,-24,18,8,-24,8,-17,-23,-21,-10,4,-23,-9,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,59,25,-37,-11,1,-37,2,-28,-28,19,-9,3,-8,1,-9,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,54,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=12,-5,-19,-9,0,-21,-9,-9,-21,8,-19,-13,0,-13,1,16,7,-1,-12,-25,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-18,7,-30,-19,18,-28,45,19,-28,-29,-16,-19,-28,-10,8,-20,-1,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,32,-30,18,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,78,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-7,-29,45,-28,-9,0,-11,13,34,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-13,-18,-8,-21,-2,-19,-12,-10,-13,-12,-9,-1,-9,-19,10,1,-4,-22,-21,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-29,-2,8,-27,-21,-11,-27,45,-25,-8,-2,-11,8,27,-11,-10,-18,-20,-9,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,1,-31,4,17,-38,-19,4,-22,8,-23,-6,-1,5,43,5,-2,-10,-30,-23,-14,29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-23,-33,-27,37,-32,-14,15,-23,9,6,-22,-28,-27,-19,-18,-8,12,2,30,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-18,-30,-26,-2,-32,-28,31,-19,10,11,-24,-25,-23,-20,-12,-3,36,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-33,-29,37,-23,14,15,-26,-26,-26,-23,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-27,-26,9,-27,-16,18,-17,6,5,-25,-28,-23,-17,-11,-3,29,-12,14,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=1,-25,-13,-27,-25,-3,-27,-27,24,-20,5,7,-22,-25,-24,-20,-4,3,37,-29,-10,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-27,-8,0,-20,-17,-1,-28,24,-22,-12,4,-19,8,57,-3,-6,-19,-23,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-29,1,-31,-29,31,-21,13,11,-29,-29,-29,-21,-12,-1,47,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11,-1,-20,-20,-1,-27,27,-19,-7,-2,-15,9,61,-11,-10,-19,-20,-10,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-26,-7,-15,-26,45,-17,-33,-16,-28,-19,3,-12,-15,-17,6,-7,-25,-25,-26,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-13,-24,-14,-4,-12,-19,-6,-17,9,-7,-5,-6,-20,4,31,-7,-7,-12,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-28,0,3,-25,-13,1,-28,29,-27,-12,12,-16,7,33,-6,-9,-23,-24,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-29,-6,3,-24,-19,-1,-29,34,-23,-10,0,-16,9,50,-9,-10,-20,-20,-9,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-32,-6,7,-25,-19,-15,-20,-3,-25,-17,-11,45,-3,-6,-2,-3,-22,-30,-23,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-24,-12,-3,-17,-22,-10,-14,17,-13,-5,-8,-20,0,34,-9,-7,-2,-23,-11,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-22,-31,-20,-11,-12,-25,-13,-7,-17,-16,-9,-19,39,-14,-21,-15,-12,-16,-14,-12,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,7,-27,3,5,-25,-16,-5,-23,32,-24,-4,9,-13,7,18,-7,-8,-19,-24,-11,6;
MA   /M: SY='G'; M=5,-6,-25,-8,-11,-27,34,-13,-31,-6,-27,-16,2,-16,-10,-8,3,-11,-22,-23,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-14,-13,-18,-26,40,-20,-29,-18,-24,-16,-3,-19,-16,-20,2,-14,-20,-24,-26,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-24,-10,-3,-17,-21,-7,-22,19,-17,-9,-2,-18,3,44,-3,5,-12,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-11,-4,-7,-23,4,-21,22,-16,-7,-6,-21,4,40,-13,-10,-17,-5,16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-32,-9,-7,-27,8,-19,-25,-13,-28,-19,-10,41,-12,-18,0,-5,-26,-28,-27,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-27,-3,7,-27,-18,-9,-27,37,-27,-10,0,-11,9,27,-4,-5,-18,-22,-11,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00919;
//
ID   PEPT_TRNA_HYDROL_1_MP; MATRIX.
AC   MP01195;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Peptidyl-tRNA hydrolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3665371; R2=0.0154368; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=551; N_SCORE=13.862; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=74; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-20,-6,-7,-14,-9,-3,-9,-4,-12,4,5,-16,-1,-6,2,1,-10,-24,-9,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: M=-2,-4,-16,-7,-2,-14,-11,-9,-10,-7,-10,-3,-2,-10,-3,-9,0,-1,-10,-18,-10,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-23,-23,-14,-6,-24,-13,12,-10,6,22,-16,-8,-8,-11,-13,-5,7,-23,-6,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-11,-29,-12,-3,-14,-20,-10,-16,17,-11,-3,-10,-18,2,12,-14,-10,-14,-2,2,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-16,-31,-22,8,-30,-20,21,-28,40,21,-28,-29,-20,-20,-26,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-28,7,-35,-27,37,-28,22,16,-23,-24,-23,-26,-20,-8,27,-18,0,-28;
MA   /M: SY='V'; M=6,-26,-12,-28,-26,-3,-26,-28,24,-19,8,7,-24,-25,-25,-20,-7,1,37,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-20,8,-31,-20,22,-29,46,20,-28,-29,-18,-20,-28,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-12,-2,-26,-22,-19,-15,-11,-25,-17,-20,79,-11,-20,-11,-10,-26,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-15,-29,60,-19,-37,-18,-28,-19,0,-19,-17,-19,0,-18,-28,-21,-28,-16;
MA   /M: SY='P'; M=0,-6,-25,-5,0,-22,-13,-12,-18,2,-16,-11,-5,6,-1,0,-1,-4,-16,-26,-17,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-30,6,26,-30,-19,-3,-28,27,-25,-12,1,-8,20,19,-4,-9,-25,-24,-14,22;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-21,-20,32,-30,20,-1,-11,0,0,-19,-30,-11,-10,-20,-10,-10,26,74,-20;
MA   /M: SY='A'; M=7,0,-20,-1,7,-20,-13,-8,-13,-3,-12,-10,-2,-12,1,-8,2,-2,-9,-26,-14,4;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-27,1,1,-22,-4,0,-25,4,-20,-12,2,-16,4,3,-5,-11,-22,-15,-8,2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,8,-12,-4,-8,-12,-16,-14,-12,-8,-14,-12,13,-12,-8,-8,18,40,-6,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,65,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=8,-24,-17,-30,-24,-4,-25,-26,24,-21,9,9,-20,-21,-20,-23,-8,-2,26,-23,-8,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-21,-31,-21,49,-25,-15,-4,-23,4,-3,-17,-25,-27,-17,-14,-8,-3,6,21,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-19,-27,-22,-13,0,-22,-11,3,-12,7,17,-20,-22,-7,-11,-20,-13,-3,11,4,-10;
MA   /M: SY='V'; M=5,-22,-8,-28,-22,6,-22,-20,10,-19,9,7,-21,-24,-21,-19,-10,-2,15,-19,-2,-21;
MA   /M: SY='I'; M=0,-28,-18,-31,-25,1,-29,-25,27,-24,22,14,-25,-25,-22,-22,-16,-6,27,-23,-6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-29,53,29,-36,-12,1,-36,3,-27,-27,18,-8,5,-7,1,-9,-30,-37,-20,17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-23,-6,4,-16,-15,-1,-14,-1,-9,-6,-2,-15,3,4,-2,-5,-12,-25,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-33,-24,13,-32,-21,26,-28,36,18,-26,-27,-21,-22,-26,-10,15,-16,5,-23;
MA   /M: SY='A'; M=22,-17,-14,-22,-15,-9,-13,-17,2,-15,4,0,-15,-18,-14,-17,-2,-2,8,-22,-11,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-26,6,15,-27,-12,-3,-26,12,-22,-14,3,-11,12,15,1,-5,-22,-26,-14,13;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-27,2,9,-25,-15,-3,-23,15,-21,-10,3,-13,12,23,-2,-7,-19,-25,-13,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-23,-13,-9,1,-20,10,-9,-11,-4,-2,-5,-22,-4,-8,-10,-8,-12,-8,12,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-6,8,-24,5,-5,-24,16,-5,-28,-5,-26,-18,16,-15,-5,-2,6,-5,-24,-29,-19,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-22,-16,-26,-20,10,-18,-20,4,-19,5,1,-17,-22,-19,-16,-10,-5,7,-16,-1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-19,-5,-2,-18,-7,-10,-18,-1,-21,-11,3,-9,1,-1,12,7,-12,-29,-15,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-25,-25,-17,14,-23,-13,1,-21,11,4,-19,-8,-18,-16,-19,-10,-5,-10,3,-18;
MA   /M: M=-8,-5,-26,-7,-5,-10,-16,-10,-16,0,-16,-11,-2,-16,-4,0,-5,-4,-14,-2,-4,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-3,4,-19,-19,-4,-17,9,-15,-8,-1,-9,2,10,-3,-2,-13,-25,-11,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-25,11,15,-25,-14,3,-24,7,-21,-14,7,-11,7,2,1,-4,-20,-28,-11,10;
MA   /M: SY='K'; M=-5,1,-23,-1,2,-25,-10,-9,-25,17,-26,-14,5,-6,2,12,3,-2,-19,-27,-16,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00920;
//
ID   PEPT_TRNA_HYDROL_2_MP; MATRIX.
AC   MP01196;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Peptidyl-tRNA hydrolase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3195090; R2=0.0127049; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=9.391; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=172; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,44,39,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-21,-31,-21,4,-29,-20,24,-24,33,21,-25,-26,-17,-19,-23,-9,16,-21,-2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-12,35,-27,48,21,-35,-8,-2,-34,0,-28,-26,16,-9,3,-9,4,-7,-27,-37,-20,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-30,-20,9,-29,-20,19,-25,36,16,-25,-27,-18,-16,-25,-10,10,-19,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-3,-30,3,8,-28,-15,-13,-21,-3,-22,-17,-7,32,-1,-12,-3,-7,-22,-29,-23,1;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-22,-19,-23,-16,9,-25,-18,-2,-20,1,-3,-18,7,-20,-19,-14,-8,-5,-19,-5,-19;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-26,-11,-19,-26,58,-19,-36,-19,-27,-17,-1,-20,-19,-20,0,-17,-26,-20,-27,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-24,-7,-1,-19,-20,-10,-16,18,-17,-7,-3,-16,3,19,-5,-2,-8,-22,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-26,-15,-30,-24,0,-28,-24,24,-24,20,14,-23,-25,-21,-21,-15,-5,23,-25,-6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-29,-6,5,-25,-19,-3,-29,34,-23,-9,0,-16,13,50,-8,-9,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-33,-25,21,-31,-22,22,-29,33,15,-26,-28,-25,-21,-24,-9,16,-15,5,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-28,38,-24,-9,-1,-14,13,41,-10,-10,-19,-20,-10,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-11,-25,-11,0,-12,-20,-9,-10,1,-6,-2,-10,-9,2,0,-9,-5,-11,-18,-5,0;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-27,-1,-4,-28,21,-12,-32,3,-28,-17,3,-8,-5,-1,1,-10,-24,-24,-21,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-23,-11,-19,-27,57,-19,-36,-18,-27,-18,-1,-20,-19,-18,0,-16,-27,-20,-26,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-22,-6,-12,-26,43,-16,-32,-16,-30,-20,4,-16,-12,-16,16,-4,-22,-28,-26,-12;
MA   /M: SY='H'; M=4,0,-21,-2,-3,-19,-11,22,-16,-10,-15,-7,4,-15,-1,-10,4,-5,-13,-29,-5,-3;
MA   /M: SY='G'; M=8,-5,-24,-8,-13,-25,35,-12,-30,-10,-25,-17,4,-17,-12,-9,4,-11,-22,-23,-24,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-27,-10,-19,-28,60,-19,-37,-19,-28,-19,0,-20,-18,-19,1,-16,-28,-20,-27,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-24,5,-32,-23,30,-28,35,21,-26,-26,-20,-22,-24,-9,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='S'; M=2,14,-15,14,3,-23,-2,-6,-23,-7,-30,-22,18,-11,0,-9,29,12,-16,-40,-20,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-15,-33,-26,-1,-34,-27,31,-25,15,14,-20,-22,-20,-24,-14,-1,25,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-6,-23,-9,-10,-13,-23,-14,8,-14,-1,2,-6,-16,-7,-16,-4,1,5,-27,-8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=9,2,-20,-1,7,-24,-6,-5,-20,2,-20,-12,5,-11,8,-4,8,-2,-17,-26,-16,7;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-7,-13,-11,-6,-12,-20,25,-14,-9,-12,-4,-2,-20,-3,-5,-5,-9,-11,-27,1,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-15,-30,-21,9,-29,-20,19,-27,35,18,-26,-28,-20,-20,-23,-7,12,-21,-1,-21;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-28,-7,-14,-29,51,-14,-35,-14,-29,-18,4,-18,-11,-15,2,-15,-28,-22,-26,-12;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,3,-12,-1,-4,-18,-7,-12,-19,-3,-22,-15,8,-10,-4,-4,16,17,-12,-31,-16,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-14,5,8,-14,-7,1,-13,5,-13,-8,9,-7,8,6,2,-3,-14,-16,-9,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,22,-25,26,11,-27,-10,4,-24,-3,-22,-17,15,-13,1,-7,1,-6,-20,-34,-15,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-31,-25,55,-29,-3,1,-21,6,1,-19,-29,-26,-15,-19,-10,-3,17,48,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-16,-28,-18,-13,-4,-19,-10,-11,-8,-12,-9,-14,-6,-10,-8,-13,-9,-14,13,7,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-29,-9,1,-21,-20,-1,-29,29,-20,-10,0,-19,11,63,-9,-8,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-31,-24,10,-30,-23,24,-27,32,16,-27,-28,-23,-21,-23,-7,21,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-8,0,-20,-17,-1,-27,25,-21,-10,2,-18,9,52,-6,-8,-19,-20,-9,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-17,-35,-27,16,-33,-24,27,-27,22,16,-24,-26,-24,-23,-20,-8,21,-17,3,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00920;
//
ID   RIBOSOMAL_L1_MP; MATRIX.
AC   MP01199;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0505900; R2=0.0146015; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=185; N_SCORE=7.742; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-1,2,-24,-2,5,-26,-15,-7,-22,22,-22,-9,5,-12,12,11,0,-2,-18,-24,-12,9;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-28,7,8,-29,-5,-8,-28,21,-27,-14,6,-12,5,9,-3,-9,-22,-25,-16,7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-13,-25,-14,-15,-12,11,-16,-8,-19,3,1,-8,-22,-15,-17,-12,-13,-10,-22,-14,-15;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,-15,-18,-12,-12,-9,-17,-16,-9,-17,-13,-9,-18,-9,-12,-3,-7,-12,10,-7,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-8,-23,-14,-11,-3,-23,-12,2,-4,1,3,-4,-21,-8,-3,-11,-5,0,-21,-3,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,20,-27,25,17,-32,-11,-2,-30,13,-26,-18,12,-10,11,4,0,-8,-25,-30,-17,14;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-21,-19,-28,-23,43,-27,-8,-2,-21,1,-2,-15,-22,-26,-16,-15,-7,-4,3,29,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-29,59,18,-36,-11,7,-37,0,-29,-26,21,-11,2,-8,0,-10,-30,-38,-16,9;
MA   /M: SY='V'; M=4,-20,-18,-25,-18,7,-21,-17,2,-12,2,0,-18,-22,-17,-12,-10,-5,8,-9,1,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-26,-7,-34,-26,32,-27,-23,8,-26,11,3,-21,-27,-30,-22,-15,-7,10,-11,7,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,5,-35,-28,38,-28,23,17,-24,-25,-23,-25,-19,-8,30,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-4,-21,-13,-18,-6,-21,-7,-12,-9,-8,-12,-13,-13,-20,8,2,4,-23,-19,-13;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-15,-2,4,-17,-13,-12,-16,-7,-16,-13,2,-8,-1,-9,18,23,-9,-32,-15,2;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-9,-32,-3,11,-29,-17,-14,-21,-2,-25,-18,-12,47,-1,-12,-4,-7,-25,-28,-24,2;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-26,35,13,-32,-10,-6,-29,0,-26,-22,10,-5,0,-8,5,-3,-21,-35,-19,6;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-22,-18,-27,-17,1,-24,-14,16,-18,19,25,-20,-22,-10,-16,-16,-7,12,-22,-3,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-21,-32,-23,0,-25,-8,27,-15,19,48,-21,-21,-6,-15,-19,-9,17,-21,-1,-15;
MA   /M: SY='P'; M=1,-9,-29,-8,-1,-27,-5,-14,-23,6,-25,-14,-7,20,-2,-2,-3,-8,-21,-24,-21,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-6,-23,-8,-1,-18,-21,-11,-3,-3,-4,-1,-7,-15,5,-6,-3,-1,-4,-25,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-33,-27,2,-33,-27,34,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-10,-28,-10,-10,-28,31,-18,-29,-14,-26,-18,-4,4,-11,-18,3,-10,-24,-24,-27,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-28,-5,5,-25,-17,-4,-28,32,-24,-10,1,-15,12,43,-5,-8,-20,-21,-11,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-23,9,-31,-19,23,-26,36,17,-28,-29,-21,-20,-25,-8,17,-18,4,-22;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-19,-1,-18,-18,-20,3,-16,-25,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-31,-9,1,-25,-20,-10,-21,16,-22,-10,-8,15,5,20,-8,-8,-19,-24,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-22,-27,-23,-6,-20,-18,19,-20,6,9,-18,-23,-18,-20,-12,-7,19,-22,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,10,-29,-19,19,-29,47,21,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-28,-6,-16,-28,55,-11,-37,-17,-30,-19,6,-19,-16,-17,3,-16,-29,-23,-26,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-37,-9,1,-29,-20,-17,-22,2,-29,-17,-15,63,-6,-5,-9,-8,-27,-28,-25,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-26,-10,0,-22,-18,-7,-24,27,-20,-9,-3,-17,5,42,-7,-8,-14,-20,-11,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-24,-17,-8,-8,-26,-15,0,4,14,8,-17,-21,-6,1,-20,-10,-1,-20,-5,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-23,-20,-33,-23,19,-24,-7,16,-17,20,42,-21,-23,-11,-14,-21,-10,8,-13,7,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,13,-17,3,-2,-18,-8,-5,-16,-3,-21,-14,23,-15,-1,-2,14,13,-15,-34,-16,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-22,-33,-14,-6,-22,-22,-21,-10,-13,-18,-12,-22,60,-14,-20,-11,-7,-15,-29,-24,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-12,-18,-13,-6,-17,-25,-17,-8,18,-8,-1,-12,-19,-5,8,-13,-8,0,-23,-9,-6;
MA   /M: SY='T'; M=2,-8,-20,-10,-6,-17,-14,-14,-9,-9,-11,-7,-5,4,-4,-11,6,8,-8,-29,-16,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-9,-28,31,-2,-32,-12,-27,-16,0,-2,-8,-13,-2,-16,-28,-24,-21,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-1,8,-14,-1,-6,-15,-11,-12,-14,-7,-15,-12,11,-12,-5,-8,15,29,-9,-30,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='V'; M=0,-13,-16,-12,-10,-11,-23,-19,10,-11,0,2,-17,-20,-14,-14,-6,-3,22,-28,-12,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-7,-6,-6,-7,-8,-11,-6,-7,-8,-7,0,-7,-6,-7,13,23,0,-19,-8,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-12,-4,-4,-4,-10,-4,-4,-5,-3,1,-3,-1,-4,-6,-2,2,-4,-13,-4,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-14,40,-24,47,12,-31,-7,1,-31,-1,-28,-25,27,-12,0,-7,6,-3,-26,-38,-19,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-29,-23,0,-30,-24,26,-24,21,13,-25,-16,-21,-21,-18,-6,23,-23,-6,-24; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-20,-8,0,-18,-8,-13,-14,-2,-15,-11,-6,-4,-4,-9,4,2,-9,-22,-12,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-26,8,15,-28,-8,-8,-26,8,-25,-17,4,1,5,0,4,-3,-22,-29,-19,10;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-18,-16,-9,-11,-15,-15,-4,-3,-3,-1,-9,-16,-8,-9,-2,1,-1,-20,-8,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,-18,-32,-28,0,-32,-28,34,-24,15,13,-23,-26,-24,-23,-14,-4,36,-26,-6,-28;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-23,8,12,-18,-18,-6,-14,-4,-6,-9,6,-14,2,-6,-2,1,-16,-30,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-27,7,19,-23,-18,-2,-25,13,-16,-13,4,-13,8,22,-4,-8,-22,-27,-14,12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00922;
//
ID   TUB_1_MP; MATRIX.
AC   MP01200;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tub family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9466605; R2=0.0144620; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1036; N_SCORE=19.919; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=108; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=17,-10,-19,-12,-5,-21,-10,-19,-15,-10,-19,-15,-8,21,-9,-17,10,9,-11,-28,-21,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-15,-20,-15,-10,-13,-20,-12,-8,6,-12,-5,-8,-22,-5,25,-1,-1,5,-27,-12,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-17,22,-27,19,4,-24,-12,52,-28,-5,-25,-12,29,-18,5,-2,-2,-12,-30,-35,-1,2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-28,25,35,-31,-16,-3,-31,13,-25,-20,6,-5,12,2,3,-7,-26,-32,-18,23;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,19,-30,27,27,-38,-17,5,-28,7,-23,-14,7,-8,33,2,0,-10,-30,-28,-15,30;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-7,-17,-13,-12,-3,-19,-13,2,-18,13,2,-3,-22,-12,-13,-4,8,-2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-5,-30,-5,5,-34,7,-1,-28,4,-23,-8,0,-15,28,10,-2,-13,-28,-20,-16,16;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-15,53,-20,-20,-16,-20,-23,-16,-22,-18,-15,-12,-28,-20,-22,7,2,1,-43,-23,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-30,-40,-30,-25,20,-25,-4,-10,-15,-10,-10,-30,-30,-15,-15,-30,-20,-20,88,56,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-16,53,-24,-24,-13,-27,-27,-11,-22,-11,-11,-16,-29,-24,-22,-1,10,6,-40,-20,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-3,-30,-3,4,-24,-20,43,-29,13,-21,-4,4,-17,16,27,-9,-14,-26,-24,3,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-16,-20,-16,-8,-17,-25,-11,2,-1,-5,3,-15,-22,7,6,-7,-5,11,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=14,4,-20,3,-1,-24,-8,24,-22,-8,-17,-10,2,-13,-2,-12,2,-8,-15,-27,-7,-3;
MA   /M: SY='A'; M=11,-11,-22,-11,0,-22,-7,-18,-14,-3,-16,-11,-11,5,-8,-11,-1,-6,-7,-25,-20,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-23,11,0,-21,-10,-4,-14,3,-23,-14,25,-15,-1,-2,6,-1,-17,-34,-15,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-18,32,-30,44,16,-36,-14,20,-34,0,-26,-19,14,-12,13,-4,-2,-12,-30,-34,-11,14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-15,-9,-13,-2,-29,-19,-16,-20,-10,-24,-15,-15,38,-1,-16,-5,-9,-23,-30,-25,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-11,20,-27,30,31,-34,-14,0,-30,4,-25,-20,8,-7,18,-3,6,-6,-27,-33,-18,24;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-16,-27,-16,-11,-1,-22,15,-8,-13,-4,-3,-14,-3,-8,-13,-13,-10,-13,-7,22,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-10,-28,-10,-10,-16,-13,-15,5,-17,3,3,-9,-19,-2,-16,-12,-12,-3,-23,-9,-8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-19,-20,-14,-15,-22,-20,7,-12,-5,0,-21,-1,-9,-15,-6,-3,15,-27,-15,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-23,-18,-8,-10,-23,-10,2,-12,10,14,-16,-4,2,-11,-12,-1,-5,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-7,-30,-3,10,-34,-17,-3,-20,0,-25,-10,-5,23,28,-3,3,-5,-27,-26,-18,17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-12,-25,-15,6,25,-25,-8,-13,-11,-5,-6,-10,-17,-3,-8,-10,-10,-15,-8,8,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00923;
//
ID   TUB_2_MP; MATRIX.
AC   MP01201;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tub family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=32;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=29;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6702366; R2=0.0132618; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1104; N_SCORE=19.301; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-17,-17,-6,-10,-23,-18,8,-12,0,4,-14,-16,-10,-15,-3,5,14,-27,-11,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-7,20,-17,30,47,-23,-23,-7,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-17,5,-27,-1,0,-20,-14,3,-27,21,-23,-13,18,-20,7,49,-4,-7,-23,-26,-13,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-30,-16,-13,18,-28,18,-4,-6,-4,0,-16,-26,2,-6,-16,-10,-14,21,64,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=2,-8,44,-12,-12,-20,-12,-18,-24,-18,-26,-20,-2,-22,-12,-18,19,8,-10,-44,-24,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-17,-34,-27,34,-30,-23,15,-27,21,9,-26,-30,-31,-20,-20,-7,19,-12,8,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-17,-17,-13,-23,23,-20,-20,-13,-17,-13,-7,-13,-13,-20,7,-7,-10,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='C'; M=16,-14,37,-22,-20,-22,3,-24,-24,-20,-18,-16,-12,-24,-20,-24,0,-8,-10,-32,-26,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,7,-29,-17,24,-26,40,28,-27,-27,-16,-19,-27,-10,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-7,-14,-16,-10,-23,-16,6,-10,-4,-10,33,31,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,30,-30,42,9,-34,2,16,-38,-6,-28,-22,14,-14,-2,-10,-2,-14,-30,-34,-14,3;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-16,-7,-10,-19,14,-17,-22,-13,-22,-16,3,-13,-10,-13,20,19,-12,-30,-19,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-28,-18,5,-29,-20,15,-28,40,15,-29,-15,-19,-20,-28,-10,5,-21,-4,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00923;
//
ID   MAP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01202;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Methionine aminopeptidase subfamily 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8788085; R2=0.0139898; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=923; N_SCORE=17.781; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-29,-27,-24,42,-29,5,-2,-16,1,-2,-22,-30,-19,-14,-22,-12,-9,35,62,-23;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,3,-10,-7,-10,26,41,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-32,-13,-6,-24,-20,-21,-10,-12,-22,-14,-20,59,-13,-19,-6,-6,-13,-31,-25,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,9,-23,1,-5,-11,-14,0,-13,1,-15,-10,18,-11,-4,-2,-2,1,-18,-23,-2,-5;
MA   /M: SY='P'; M=1,-12,-27,-12,-3,-22,-18,-17,-12,6,-16,-8,-10,14,-4,-4,-5,-6,-12,-24,-16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,4,-25,-1,-13,-26,45,-11,-33,-14,-30,-20,16,-19,-13,-14,7,-11,-28,-27,-26,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-28,11,23,-30,-14,-3,-27,16,-24,-14,6,-8,17,7,0,-5,-25,-26,-15,20;
MA   /M: SY='T'; M=-8,12,-20,14,2,-21,-16,-11,-21,1,-16,-15,5,-12,-3,0,7,15,-13,-31,-13,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-17,-24,-18,-5,-29,-24,19,-14,5,6,-19,-23,-18,-10,-8,2,28,-27,-9,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,18,-32,-22,23,-30,39,17,-27,-28,-23,-22,-27,-10,12,-16,4,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-29,-3,6,-30,-13,-10,-27,27,-27,-10,-2,0,11,14,-5,-5,-21,-22,-14,8;
MA   /M: SY='E'; M=-14,9,-30,18,36,-17,-21,5,-24,4,-17,-17,-2,-8,10,-4,-5,-10,-25,-17,3,22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,15,-29,20,2,-32,31,-9,-37,-9,-29,-23,12,-15,-8,-13,1,-14,-30,-29,-25,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,44,-28,61,17,-38,-9,-2,-37,-1,-28,-28,17,-10,-1,-11,1,-9,-27,-38,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-29,-27,6,-31,-21,25,-21,17,11,-28,-29,-25,-19,-16,-4,33,-19,5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-8,-30,-25,2,-28,-21,22,-22,23,21,-28,-29,-21,-19,-18,-6,26,-26,-6,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-25,5,-34,-25,33,-28,32,18,-26,-26,-22,-24,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-21,-33,-25,33,-31,-18,15,-27,25,10,-25,-29,-27,-20,-23,-9,11,-6,16,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=16,-13,-10,-20,-17,-10,-17,-23,4,-13,-3,-3,-13,-17,-17,-17,7,17,17,-27,-13,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-19,0,-30,0,2,-22,-20,92,-29,-8,-20,0,9,-19,15,1,-9,-19,-30,-29,17,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-18,-28,-24,-4,-28,-26,29,-22,7,8,-18,-22,-20,-22,-5,0,30,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-16,45,-26,54,14,-34,-7,2,-34,-1,-30,-27,29,-12,0,-8,5,-6,-29,-40,-20,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-13,-26,-18,-15,25,-24,8,-12,-6,-6,-4,-5,-26,-12,8,-14,-10,-13,0,28,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-16,-24,-16,-12,-13,-17,8,-14,0,9,-13,-15,-10,-19,1,-2,9,-23,-12,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,65,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,1,-12,-11,-12,-15,-17,-9,-13,-13,-7,-3,-16,-10,-13,18,24,2,-34,-14,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-27,-21,-34,-27,32,-31,-12,16,-26,9,7,-19,-26,-27,-20,-17,-9,15,-11,13,-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-33,-30,12,-32,-28,29,-23,12,10,-27,-28,-30,-22,-13,-3,38,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=9,-2,-18,-1,-4,-21,-10,-13,-16,-4,-18,-14,-3,-6,-6,-3,9,3,-6,-29,-18,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-19,-35,-27,36,-31,-23,17,-28,21,9,-25,-29,-31,-21,-20,-8,17,-9,11,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-7,11,-27,13,-2,-30,22,-8,-33,-2,-29,-19,13,-15,-3,-6,3,-11,-27,-28,-22,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,2,-26,6,8,-22,-16,-8,-14,-5,-17,-7,-2,11,-2,-11,-1,-5,-14,-32,-18,2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-22,2,10,-22,-13,-3,-16,5,-17,-7,7,-13,8,4,1,-4,-14,-28,-15,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-11,-25,-11,-5,16,-26,0,-7,-11,0,-3,-12,-21,-6,-10,-12,-5,-11,-1,26,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-30,35,23,-36,-6,-1,-34,5,-26,-21,9,-9,13,-3,-1,-11,-29,-31,-19,18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,1,-28,3,6,-23,-18,-10,-20,1,-18,-14,0,15,-2,0,-3,1,-20,-29,-18,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-9,-27,-17,2,-29,-18,13,-25,34,14,-26,-29,-13,-18,-24,-9,7,-23,-4,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00575;
//
ID   BTG_2_MP; MATRIX.
AC   MP01203;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   BTG family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8307104; R2=0.0141395; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=960; N_SCORE=18.395; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-9,-25,-3,22,-11,-25,-9,-7,-9,13,-1,-14,-14,1,-9,-14,-10,-11,-25,-11,12;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-2,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,10,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='C'; M=15,-13,50,-21,-17,-20,-14,-23,-21,-19,-18,-16,-11,-24,-17,-23,6,-1,-6,-37,-25,-17;
MA   /M: SY='K'; M=3,-3,-21,-2,12,-23,-15,-11,-19,14,-21,-12,-3,-10,3,4,4,-2,-10,-27,-15,7;
MA   /M: SY='E'; M=-13,12,-29,17,32,-31,-17,3,-28,11,-22,-16,8,-8,22,13,-1,-9,-28,-28,-16,26;
MA   /M: SY='S'; M=6,-6,-14,-8,-6,-16,-8,-14,-7,-14,-20,-12,4,-12,-4,-14,29,14,-2,-36,-16,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,5,-7,-17,-25,31,-15,-33,-17,-28,-20,10,-24,-17,-17,0,-13,-26,-31,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,29,-28,34,18,-28,-28,-22,-22,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='D'; M=1,11,-19,13,0,-19,-9,-8,-15,-10,-9,-13,7,-16,-6,-13,4,-1,-12,-32,-16,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-24,-26,-18,18,-30,-9,10,-16,4,5,-18,-24,-9,-14,-14,-8,6,-4,21,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-24,9,10,-14,-13,-10,-23,-7,-23,-19,0,8,-4,-11,9,0,-20,-30,-15,3;
MA   /M: SY='D'; M=-18,28,-30,40,15,-35,-14,26,-34,-1,-26,-17,14,-12,14,-4,-2,-12,-30,-34,-8,13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-30,-23,6,-30,-23,23,-27,36,17,-30,-30,-23,-20,-23,-6,24,-23,-4,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-16,-4,0,-11,-11,19,-16,9,-11,-4,2,-11,5,25,-5,-7,-13,-13,0,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=7,-4,-13,-5,-1,-16,8,-5,-13,-3,-11,-5,-2,-7,6,-5,2,-5,-11,-11,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-25,-3,-13,-19,26,-9,-22,-15,-15,-12,15,-22,-13,-13,-2,-11,-22,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,43,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,3,19,-30,-16,-5,-26,25,-27,-12,2,-8,19,14,3,-4,-22,-26,-14,19;
MA   /M: SY='E'; M=-12,17,-30,29,53,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,30,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-17,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-32,-26,4,-32,-26,31,-27,29,17,-28,-28,-23,-22,-21,-6,29,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-23,14,14,-27,-27,-27,-23,-14,-4,43,-27,-6,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,7,-31,-27,42,-30,-9,-6,-24,0,-4,-20,-32,-28,-19,-18,-10,-5,3,33,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=1,-9,50,-14,-14,-20,-14,-19,-25,-19,-25,-20,-4,-24,-14,-19,17,6,-10,-45,-25,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-15,-20,39,-25,-25,7,-30,-3,-14,-19,-9,-9,-20,-35,-19,-19,-15,-10,-10,-7,30,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,7,-27,-20,4,-27,23,-20,-6,0,-17,28,49,-6,-10,-23,-20,-10,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-30,-31,-25,14,-35,-7,27,-21,11,11,-20,-25,-15,-21,-20,-10,12,3,37,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,54,-30,-20,-1,-30,15,-21,-19,0,-1,19,4,-1,-10,-29,-29,-19,36;
MA   /M: SY='K'; M=-12,10,-30,13,12,-32,-18,-8,-32,40,-30,-14,4,-10,8,22,-8,-10,-22,-24,-12,10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-27,1,-10,-27,35,-9,-32,-4,-30,-19,20,-19,-10,-7,2,-12,-29,-27,-24,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-7,0,-22,-3,-5,-18,-14,16,-14,-10,-21,-10,9,-1,-5,-9,4,-3,-12,-34,-10,-7;
MA   /M: SY='V'; M=6,-23,-21,-25,-18,-12,-23,-25,13,-17,-2,0,-21,5,-19,-22,-8,-4,16,-26,-15,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-18,3,-24,-16,22,-27,-18,-16,-2,-10,-7,-13,-25,-21,-4,-15,-10,-9,-12,5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-14,-27,-25,-2,-30,-28,25,-20,7,7,-21,-23,-23,-20,-5,10,34,-28,-8,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-25,5,-31,-25,27,-27,33,17,-29,-29,-23,-21,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=12,-15,-21,-20,-15,7,-16,2,-5,-10,-5,-5,-15,-21,-10,-15,-6,-5,-5,7,34,-15;
MA   /M: SY='S'; M=1,-9,-16,-7,3,-13,-14,-13,-6,-11,-7,-8,-6,-15,-5,-12,11,6,0,-33,-15,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-5,-25,-4,-2,19,-7,-13,-20,-15,-10,-13,-6,-19,-18,-14,-9,-12,-16,-12,1,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-2,18,-26,25,20,-32,-13,-6,-30,12,-24,-19,5,-8,5,0,-1,-8,-22,-29,-18,13;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-23,0,-5,-24,13,-10,-25,-10,-30,-20,13,5,-7,-12,14,0,-23,-33,-24,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,0,18,-20,-18,-7,-17,6,-16,-12,-4,-12,4,11,3,-3,-9,-29,-16,10;
MA   /M: SY='W'; M=7,-1,-28,2,4,-19,-11,-15,-22,-7,-18,-18,-9,-13,-5,-14,-6,-11,-19,15,-8,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00742;
//
ID   REL_1_MP; MATRIX.
AC   MP01204;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NF-kappa-B/Rel/dorsal domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6301594; R2=0.0134879; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=794; N_SCORE=15.330; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=139; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-33,-8,0,-28,-15,-18,-20,-10,-30,-20,-13,65,-8,-18,2,-3,-25,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-13,-30,-12,-4,11,-26,13,-11,1,-7,-5,-13,-23,-1,7,-15,-10,-15,11,47,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-20,-6,1,-15,-18,-12,1,-10,-11,-7,2,-15,-5,-12,6,1,2,-32,-14,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-19,-28,-23,-4,-31,-26,25,-21,8,8,-15,-18,-18,-21,-4,13,23,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,18,-38,-20,6,-22,18,-22,-2,0,-10,50,14,-2,-10,-28,-20,-10,34;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-26,-10,-2,-18,-20,-4,-26,22,-18,-10,0,-18,6,55,-4,2,-16,-22,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-20,-34,-24,35,-24,-9,11,-19,16,34,-20,-24,-17,-14,-20,-10,6,-7,13,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-25,-5,6,-24,-6,-12,-15,5,-17,-7,-7,-15,4,-1,-5,-9,-8,-24,-16,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-34,-10,0,-24,-20,-9,-26,13,-24,-14,-9,28,1,31,-10,-10,-24,-24,-19,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=12,-4,-19,-10,-6,-18,-12,32,-19,-10,-14,-6,0,-14,-1,-10,3,-1,-13,-26,-1,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-30,-10,-15,-28,48,-15,-38,-8,-28,-18,0,-20,-13,2,-2,-18,-28,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-19,-4,-9,-24,31,-14,-29,-14,-30,-20,6,-14,-9,-14,23,3,-19,-31,-24,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-33,-17,-7,-16,-24,-20,-6,-17,-2,-6,-24,48,-14,-20,-17,-10,-16,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=16,1,-21,3,29,-26,-11,-9,-21,1,-16,-16,-4,-4,7,-9,4,-6,-17,-26,-20,18;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-17,-2,2,-22,-7,-8,-24,8,-28,-16,6,-12,4,13,22,9,-14,-33,-16,2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-19,3,21,-19,-20,-11,-19,-1,-14,-14,0,-6,3,-6,11,24,-13,-30,-14,12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-30,22,30,-32,-18,-4,-32,25,-26,-18,4,-6,11,11,-4,-10,-26,-28,-16,21;
MA   /M: SY='G'; M=7,-6,-22,-10,-13,-22,23,-1,-26,-14,-20,-13,0,-16,-11,-15,5,-1,-18,-24,-16,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00924;
//
ID   T4_DEIODINASE_MP; MATRIX.
AC   MP01205;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Iodothyronine deiodinases active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5071921; R2=0.0129967; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1174; N_SCORE=19.755; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=154; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=3,-7,-20,-8,-10,-9,-17,-12,1,-15,13,11,-13,-19,-9,-16,-12,-8,0,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,11,-24,18,23,-29,2,-6,-31,-2,-26,-22,6,-8,4,-8,11,-3,-24,-33,-22,13;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-13,-28,-15,-18,-10,38,-16,-32,-13,-22,-15,-3,-22,-18,-4,-5,-17,-23,-15,-17,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-2,-26,-2,18,-31,-16,0,-22,10,-18,-7,-2,-10,30,13,0,-8,-22,-22,-14,23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-23,-7,0,-20,-17,-7,-24,19,-21,-12,2,-15,4,34,4,7,-14,-25,-12,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=2,-12,51,-20,-15,-22,-22,-20,-22,-17,-17,-13,-12,-25,-8,-18,0,2,-10,-37,-22,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-12,1,-25,-1,2,-22,-14,18,-27,15,-25,-11,11,-16,7,27,1,-6,-21,-28,-7,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-28,-27,-28,-19,5,-22,-21,2,-24,16,2,-26,-26,-16,-18,-21,-10,-5,25,5,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,52,23,-37,-13,-2,-37,10,-29,-25,14,-9,4,-2,-2,-10,-28,-35,-18,14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='A'; M=15,-15,-15,-21,-13,-9,-11,-13,2,-14,6,13,-13,-16,-7,-15,0,-1,3,-24,-11,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-26,0,14,-34,-16,2,-22,13,-24,-6,2,-10,39,10,6,-4,-24,-24,-12,27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-16,-30,52,-20,-36,-18,-30,-20,-4,2,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-22,12,12,-22,-11,0,-22,9,-25,-17,28,-13,4,4,6,4,-23,-33,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,35,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,25,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-6,33,-18,16,0,-20,0,6,-20,-2,-30,-20,51,-18,0,-2,15,4,-26,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=2,-18,94,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28,-6,-8,-8,-44,-28,-26;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-31,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11,62,-7,-17,4,-1,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-18,-18,-26,-18,0,-22,-7,14,-13,19,39,-18,-20,-5,-12,-14,2,8,-22,-2,-12;
MA   /M: SY='F'; M=10,-15,-16,-22,-15,17,-14,-11,-7,-16,-7,-7,-11,-19,-17,-16,2,-1,-4,-7,12,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,9,-29,-20,-3,-28,35,-25,-8,0,-13,20,40,-8,-10,-22,-20,-10,13;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-20,-33,-23,28,-28,-17,14,-27,34,21,-26,-28,-22,-18,-26,-10,7,-11,9,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-29,30,13,-35,-12,-4,-29,-2,-28,-21,7,10,9,-8,5,-5,-27,-34,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-19,-7,11,-27,-9,-8,-16,-1,-15,-9,-5,-8,15,-8,5,-5,-14,-22,-17,13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,-3,-28,36,-25,-8,0,-14,18,42,-8,-10,-22,-20,-10,11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,6,-26,-20,0,-28,30,-22,-8,0,-16,19,51,-8,-10,-22,-20,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=8,-26,-12,-29,-26,-4,-26,-28,25,-19,8,8,-25,-25,-25,-21,-8,-1,39,-27,-11,-26;
MA   /M: SY='E'; M=2,3,-23,5,27,-25,-16,-9,-23,10,-18,-15,-2,-5,8,0,3,2,-18,-26,-17,18;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-30,36,26,-36,-15,0,-33,12,-26,-19,9,-8,16,2,-2,-10,-28,-31,-17,21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-23,-23,-30,-23,54,-28,8,-5,-23,3,0,-15,-28,-26,-15,-18,-12,-7,6,36,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00925;
//
ID   ASC_MP; MATRIX.
AC   MP01206;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Amiloride-sensitive sodium channels signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3392124; R2=0.0128859; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=272; N_SCORE=8.834; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-16,-4,-18,-18,-14,-12,-9,-2,-15,-7,-2,-14,-24,-12,-14,-4,-2,10,-29,-12,-15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-26,7,9,-26,1,-6,-25,4,-22,-14,6,-4,2,-1,-1,-9,-23,-25,-19,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-12,17,-4,19,11,-28,-9,-6,-31,-1,-25,-21,11,-16,-2,-4,1,-6,-24,-36,-21,4;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-11,6,-14,-12,-18,5,-20,-21,-17,-19,-14,-8,-15,-17,-18,-1,-6,-11,-30,-22,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-22,-4,2,-14,-14,-9,-19,3,-21,-14,1,-5,-2,7,7,0,-13,-27,-13,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,12,-16,18,7,-19,-5,-3,-18,-2,-14,-13,5,-8,2,-3,4,-3,-14,-22,-12,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-8,-11,-10,-10,-7,-13,-12,3,-7,-5,-2,-5,-8,-10,-5,0,2,9,-20,-9,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,2,-26,7,11,-25,-16,-11,-20,-5,-18,-16,-4,17,0,-12,2,1,-19,-31,-20,4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-18,-18,-11,-3,-15,-16,4,-13,-2,4,-13,-16,-12,-12,-3,-3,8,-23,-9,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-25,9,10,-26,-12,-5,-23,6,-22,-14,5,-1,9,3,2,-3,-21,-28,-16,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-8,9,-14,3,-4,1,-7,3,-8,-5,-10,-8,15,-14,-5,-4,0,-2,-12,-12,4,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-20,-21,-16,0,-19,-16,13,-19,13,7,-17,-7,-14,-17,-14,-7,6,-14,-1,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-12,-22,-13,-11,13,-22,10,-1,-9,-2,0,-12,-20,-7,-9,-10,-6,-5,7,40,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-15,-10,-5,-11,-11,-10,-4,0,-6,1,-5,-7,-3,-4,1,2,-3,-18,-8,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-11,2,-24,-3,-8,1,-4,-2,-18,-9,-17,-12,10,-18,-5,-8,-1,-6,-20,-17,1,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-6,-4,-22,-3,-2,-6,-17,-6,-17,-2,-18,-12,-3,-6,-4,-5,4,4,-14,-17,3,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-21,-2,1,-22,-15,-9,-15,2,-18,-11,0,-5,-1,-4,4,4,-10,-28,-14,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-12,-4,-3,-16,-10,-10,-14,-10,-20,-14,5,-12,-4,-10,25,24,-4,-36,-15,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-24,-24,-15,0,-29,-17,13,-17,9,6,-19,-11,-12,-15,-14,-4,8,-18,1,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-26,0,19,-23,-18,-4,-17,0,-18,-9,-2,0,19,-3,4,-1,-20,-26,-14,19;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-17,-15,-15,-19,12,-19,-11,-14,-14,-10,-3,-16,-14,-18,5,-3,-4,-24,-20,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-16,-26,-17,-6,-1,-26,2,-6,-4,4,2,-11,-22,-3,11,-16,-11,-7,-17,4,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-15,-9,-9,-24,5,-5,-3,3,3,-5,-22,-1,14,-14,-9,-7,-22,-1,-8;
MA   /M: SY='S'; M=2,7,-17,5,0,-21,-2,-4,-21,-6,-23,-17,12,-13,-1,-4,18,7,-15,-34,-17,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-12,-25,-14,4,19,-25,-9,-13,-3,-6,-7,-10,-17,-9,-1,-11,-10,-12,-8,8,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-23,-4,8,-29,-20,-1,-14,4,-17,-3,-2,-12,33,3,5,4,-16,-24,-11,21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-25,-1,8,-18,-19,-5,-20,10,-13,-10,0,-14,6,20,-3,1,-16,-23,-9,6;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-1,-25,-3,-1,-10,-15,8,-13,-3,-9,-6,2,-19,0,-3,-7,-8,-15,-17,6,-2;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-25,-19,-31,-24,1,-28,-17,27,-19,21,31,-23,-23,-14,-18,-17,-5,23,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-19,-30,-24,-2,-30,-26,29,-23,16,12,-23,-24,-20,-22,-13,-4,29,-25,-6,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-27,5,20,-28,-17,-3,-27,20,-22,-13,0,-9,14,18,-3,-9,-22,-24,-14,16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,4,-24,0,6,-14,-16,-6,-20,11,-19,-12,9,-14,2,13,-1,-1,-17,-24,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-26,-1,-8,-27,30,-4,-31,-7,-29,-17,15,-18,-4,-7,5,-10,-27,-27,-22,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=7,-8,-24,-11,-7,-23,9,-3,-26,2,-20,-12,-2,-16,-4,11,0,-10,-17,-21,-16,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-13,5,-24,5,-4,-12,-17,13,-10,-6,-8,8,1,-17,1,-8,-6,-4,-12,-22,5,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-26,-20,-16,-2,-25,-11,5,-14,-6,-1,-21,7,-15,-17,-11,-6,3,-12,10,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-12,-25,-15,-9,5,-22,18,-15,-5,-5,0,-6,-22,-4,9,-11,-11,-13,-15,10,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-16,-18,-18,-14,26,-20,2,0,-13,6,2,-13,-20,-11,-9,-14,-7,-4,7,29,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-8,-26,-1,1,-22,-12,-12,-15,-6,-20,-14,-10,50,-6,-13,-5,-7,-20,-22,-20,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-21,-24,-14,5,-24,-13,10,-13,18,22,-21,-19,-11,-11,-18,-8,6,-20,-2,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-34,-10,-4,-24,-14,-16,-15,-11,-25,-16,-11,55,-11,-18,-6,-8,-22,-28,-22,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-29,1,2,-26,10,-11,-30,-1,-26,-18,1,-3,-4,1,0,-10,-25,-20,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,8,-23,9,-1,-26,14,-11,-28,-7,-23,-17,7,-13,-7,-11,7,0,-20,-29,-20,-4;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-17,-7,-4,-11,-13,-12,-9,-9,-10,-9,-7,-15,-7,-10,6,2,-2,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-28,10,11,-28,-9,-3,-27,5,-25,-17,7,4,5,1,1,-4,-25,-30,-18,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-14,-24,-18,-15,5,-18,2,-4,-9,-6,-3,-9,-20,-11,-4,-10,-8,-5,-6,20,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,78,-27,-27,-17,-24,-23,-22,-27,-17,-15,-15,-34,-25,-26,-9,-8,-9,-37,-22,-26;
MA   /M: SY='T'; M=6,-4,-14,-9,-6,-16,-13,-18,-14,-10,-17,-14,-2,5,-8,-13,19,29,-7,-31,-16,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-39,-6,9,-30,-20,-17,-21,-7,-29,-20,-17,77,-6,-17,-9,-10,-30,-30,-29,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00926;
//
ID   GLYPICAN_MP; MATRIX.
AC   MP01207;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glypicans signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5330563; R2=0.0116926; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1587; N_SCORE=23.079; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-3,-29,-1,2,-25,-14,9,-23,0,-28,-15,3,23,0,-4,2,-5,-25,-31,-15,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-23,-29,-21,23,-27,-19,7,-22,13,9,-23,-5,-23,-19,-19,-9,3,-13,3,-21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-5,-13,-8,-6,-15,-3,-14,-14,-13,-15,-12,1,-13,-6,-13,23,18,-6,-33,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-30,0,16,-28,-18,1,-26,15,-24,-13,-4,12,6,4,-5,-10,-23,-25,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-30,16,24,-33,10,-5,-34,-1,-25,-19,3,-9,9,-7,0,-13,-30,-27,-22,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-17,-8,-8,-18,1,-14,-16,-8,-20,-13,3,-14,-6,-3,18,14,-9,-31,-16,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,5,-25,-20,14,-28,21,-20,-7,1,-18,22,48,-8,-11,-23,-21,-7,9;
MA   /M: SY='A'; M=41,-12,-12,-22,-12,-17,-3,-17,-5,-10,-5,1,-12,-12,-8,-18,5,-2,2,-20,-17,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,41,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,19,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-20,-18,-27,-18,1,-23,-9,15,-16,24,37,-20,-21,-7,-13,-17,-1,8,-22,-2,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,46,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,41,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-29,-30,-19,-5,-29,-19,18,-18,8,13,-21,-22,-4,-17,-19,-12,9,5,2,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-30,-18,-20,16,-7,11,-9,-12,-7,-5,-15,-28,-12,-12,-15,-12,-15,18,54,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=3,-13,-28,-9,-1,-26,-12,-17,-19,-10,-27,-19,-11,50,-7,-17,6,-1,-21,-31,-26,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-12,-28,-12,-9,-1,-25,53,-11,-15,1,5,-6,-25,-2,-7,-17,-15,-16,-14,29,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-8,-29,-8,5,-25,-21,2,-23,19,-15,-4,-2,-17,25,43,-8,-10,-21,-20,-9,12;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,4,-16,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-16,-30,-24,5,-29,-21,24,-24,32,21,-29,-29,-21,-19,-22,-6,24,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='P'; M=2,-19,-26,-19,-11,-17,-18,-16,-2,-11,-9,6,-19,29,-10,-17,-9,-7,-5,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-16,-13,-11,-11,-4,-14,-7,-15,-4,2,-5,-16,-8,-13,9,11,-4,-29,-13,-10;
MA   /M: SY='V'; M=5,-22,-12,-24,-20,-3,-22,-23,14,-19,11,5,-21,-24,-20,-18,-4,3,24,-28,-10,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-28,-9,1,-21,-20,-6,-18,32,-16,6,-5,-14,8,29,-12,-10,-13,-20,-8,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-8,-27,-10,-7,-16,-4,-2,-15,-4,-15,0,-3,-5,2,0,-3,-8,-17,-19,-5,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,13,-27,9,-9,-28,39,-8,-34,-11,-30,-21,21,-19,-11,-13,3,-13,-30,-29,-26,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-13,-20,-16,-12,-2,-21,-12,3,-15,20,5,-8,-25,-11,-4,-13,-5,-2,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-18,12,-5,-17,-5,4,-12,-3,-24,-15,46,-22,-5,-3,7,0,-18,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='M'; M=0,-23,-18,-30,-22,-1,-23,-15,22,-17,18,31,-22,-22,-12,-17,-15,-7,20,-22,-5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-30,-4,6,-26,-20,11,-28,28,-23,-7,1,-15,18,39,-8,-11,-23,-21,-6,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-17,20,-27,45,26,-28,-28,-17,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-21,7,-3,-22,7,17,-25,-7,-28,-16,30,-18,-1,-5,12,-2,-25,-35,-14,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-11,-25,-12,0,-22,-22,0,-7,6,-8,10,-8,-17,23,16,-8,-8,-8,-22,-8,11;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-17,-17,-17,-19,18,-22,-14,-15,-14,-10,-8,-17,-17,-19,5,-1,-3,-23,-21,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-23,37,29,-27,-11,0,-27,3,-20,-20,9,-4,7,-4,0,-8,-23,-27,-15,18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-15,38,-27,44,24,-32,-9,3,-32,2,-28,-25,27,-11,5,-5,3,-7,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-13,-27,-13,-5,-12,-19,-18,-16,-3,-19,-13,-12,29,-10,-10,-3,3,-16,-23,-15,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-14,8,-30,16,32,-20,-20,21,-26,2,-18,-14,1,-9,11,-3,-5,-12,-27,-22,3,20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-28,-1,-4,-23,5,15,-30,7,-25,-12,14,-19,1,18,-4,-12,-26,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='N'; M=1,8,-22,1,1,-15,0,-2,-17,-6,-15,-13,15,-17,-4,-9,1,-6,-19,-23,-9,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-26,-22,35,-30,3,5,-19,14,5,-22,-30,-18,-14,-22,-10,-3,14,52,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00927;
//
ID   VWFC_1_MP; MATRIX.
AC   MP01208;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   VWFC domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6876009; R2=0.0029668; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2078; N_SCORE=6.852; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1960; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-52,-66,-83,-77,-54,-84,-86,-19,-75,-39,-42,-78,-79,-77,-76,-66,-50,103,-88,-62;
MA   /M: SY='V'; M=-52,-66,-83,-77,-54,-84,-86,-19,-75,-39,-42,-78,-79,-77,-76,-66,-50,103,-88,-62;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-73,18,-62,64,-70,73,-54,-64,10,-53,39,-2,-63,-65,9,-58,5,-67,11;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-74,57,18,-76,34,30,-76,-29,-12,-67,77,-69,-17,-60,-28,-56,-76,-88,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-76,-59,5,-81,94,-67,-44,-65,-81,-72,-2,-67,-21,-72,-12,-64,-45,-75,-76;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,-71,-65,-30,-8,-42,-63,-27,27,6,-52,-59,-70,46,33,-15,41,37,-76,-60;
MA   /M: SY='R'; M=-37,-74,-69,-32,6,-75,-10,31,-28,-6,-8,-63,8,14,53,5,1,26,-72,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-79,-72,-72,46,-79,50,6,-36,-49,-7,-69,-81,-64,-64,-67,-64,-7,-38,113;
MA   /M: SY='R'; M=11,-74,-58,-13,-68,0,-8,-67,8,-3,-11,40,28,25,42,-29,11,-66,-75,1;
MA   /M: SY='N'; M=-59,-75,63,10,-34,-59,-55,-75,-54,-79,-72,65,60,-53,-63,39,-24,-43,-88,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-76,-58,-20,-81,83,-63,-86,16,-83,-72,23,-68,-56,36,-17,-63,-81,-76,-73;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-16,-78,65,80,-84,-69,-56,-82,-5,-79,-75,-49,-61,-16,-55,8,-3,-75,-86,-72; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='T'; M=-55,-71,-58,27,-70,-69,-15,-19,10,-63,6,-25,-29,-53,21,46,47,28,-84,-66; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-92,-100,-82,54,-78,-93,-63,-75,-31,-66,-92,-82,-76,-77,-81,-81,-18,164,-28; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-40,-77,-13,12,-72,-71,66,-22,44,-65,20,-53,-29,58,-48,-8,20,2,-80,-22; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-42,-84,-34,3,-77,-73,-17,0,-37,-48,-63,-69,95,18,-70,-1,-59,23,-83,-74; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-78,62,28,-18,-15,-61,-44,-60,-79,-75,59,-73,-58,-67,19,-58,-8,-92,-72; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-6,97,-64,-7,-75,-66,-68,-68,8,-50,-66,-10,63,-25,-65,36,-29,-6,-85,-74; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-65,140,-78,-42,-76,-79,-77,-82,7,-74,-72,-67,-89,-9,4,-66,-65,-71,-98,-81; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-72,-61,-6,-28,-71,9,-19,-17,-12,-54,-57,-68,58,15,-31,57,4,-68,48;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-73,-32,3,-30,-73,33,49,-8,7,-11,4,-69,45,-32,8,31,-8,-78,-58;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-25,-69,-63,-19,-63,-73,22,-18,-49,-42,-56,-56,-68,-56,56,-30,76,28,5,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-75,53,-29,-64,-72,34,1,16,27,-12,5,-71,27,15,-35,-4,-4,-82,-60;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-59,-75,62,-3,-78,3,9,-69,10,-74,-68,49,-30,34,-30,15,-14,7,-88,-68; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-13,-77,-34,-42,-3,88,-71,-85,-70,-56,-74,-25,-71,-67,-76,9,-65,-80,-75,-73; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=1,-73,-26,47,-76,-14,-13,-66,39,-70,-63,22,-64,41,0,2,14,8,-80,-67;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-69,-74,-69,-11,-76,-76,32,-68,-15,-48,-66,-73,17,-71,-8,46,65,-82,-61; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-40,-73,28,27,-62,22,22,15,-36,25,22,-27,-70,-24,-35,-59,5,16,-80,-62;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='W'; M=-62,-77,50,-4,-65,-71,34,-37,22,-22,-16,-53,-30,10,27,-19,25,8,70,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-81,39,13,-81,-43,-13,-76,50,-53,-67,-24,72,35,9,-56,-16,-75,-80,-70;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='V'; M=-27,-74,-39,-71,-57,-83,-76,45,-1,29,-45,-72,-12,-68,12,-67,5,47,-81,-63; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-72,-62,-18,-65,-43,56,19,-55,5,8,-56,4,34,20,29,35,-34,-80,-59;
MA   /M: SY='C'; M=-62,145,-80,-79,-66,-77,-78,-68,-76,9,-61,-69,1,-81,-81,-65,-33,-62,-95,-77;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-85,17,23,-83,-68,-15,-43,-33,-79,-69,13,108,-23,-35,-36,-31,-47,-82,-77;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-78,29,40,-76,-15,-60,-13,-30,-25,-65,14,64,-51,26,14,-15,-67,-81,-70;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-81,-40,-73,-60,-78,-72,-54,-75,35,32,-78,53,-29,-77,-3,-35,3,32,20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-62,46,66,-4,-78,-42,-64,-75,-35,-78,-73,-7,50,-5,-35,20,20,-29,48,-70; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-43,147,-83,-46,-76,-49,-84,-83,-80,-74,-73,-71,-94,-86,-86,-67,-65,-70,-104,-86; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=15,-82,-65,10,-81,-70,-17,-72,8,-38,-68,-66,88,-60,-5,0,-4,-28,-83,-76; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-18,-77,0,-6,31,-42,10,-69,-55,-23,-16,64,-32,61,-15,-19,-60,-71,-71,30; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=16,-81,-66,-35,-83,38,-70,-75,-65,-81,-70,-64,99,-65,-74,1,-16,-46,-80,-79; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-66,9,-62,39,-14,-79,-63,-12,10,-48,-64,-64,-74,34,40,-10,4,-6,6,20; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='V'; M=-55,-100,-98,-15,-41,-108,-100,-11,-50,-37,3,-19,-104,-93,-25,-93,-85,42,-110,-89; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-27,-75,-63,-5,10,-74,-61,24,48,-12,-13,-9,-70,28,48,-36,-16,10,-73,-58;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-77,7,2,-33,-73,-71,3,-64,-20,-56,-12,76,-65,-19,-37,-31,48,-83,-69; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-45,-85,34,49,23,-74,-64,-79,-19,-79,-74,13,74,-4,-66,-62,-17,-78,-81,-69; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-75,-1,-67,-82,92,-66,-87,7,-84,-74,15,-68,-62,-67,-29,-17,-81,-76,-75;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-79,5,87,-81,-16,-12,-80,32,-76,-69,-52,-60,30,-10,1,-32,-47,-79,-69;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-85,-58,36,-85,-6,-66,-78,30,-82,-71,-64,101,-22,-60,-60,-60,-77,-79,-78; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-62,-77,-15,17,-13,-78,-64,40,10,-39,8,-62,-72,34,47,-10,-32,29,-77,-61; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='C'; M=-46,134,-90,-47,-71,-83,-91,-84,-82,-77,-77,-79,-95,-87,-88,-74,-73,-77,103,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-83,52,-16,-75,-16,-67,-25,-61,-17,-67,-59,78,-6,-19,0,5,-44,60,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-26,-79,30,50,-79,-43,34,-41,-53,-71,-17,-55,67,50,-59,1,-15,-7,-82,-67;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-39,46,46,28,-78,8,-64,-42,1,-74,-19,-53,41,-56,-34,25,14,-16,-86,-72; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=16,-76,38,18,-33,-68,8,-64,9,-15,-62,-56,29,27,-59,1,-4,-6,6,21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=31,53,23,3,-75,19,-65,-67,-19,-34,5,-56,14,-5,-4,9,6,-14,-82,-70; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,-73,29,4,-74,9,23,-70,-18,-50,-17,-23,23,10,-3,40,26,-27,-81,-25; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=6,10,17,32,-36,-41,8,-12,-18,-71,-65,-8,66,-4,-62,9,35,-64,-82,-69;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-17,-78,29,27,-73,-45,-64,18,-57,-14,-16,21,14,27,-5,-9,13,-13,-85,-69; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-48,8,-5,-24,-17,21,-19,-75,-25,-4,-73,-13,12,-76,-22,-25,-21,-9,-91,-29; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-77,-92,-19,-24,9,-32,-79,-42,-42,-3,-19,10,1,6,-7,-14,-75,-18,89,-64; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-46,-91,5,-74,-92,22,-80,-29,-42,-87,-22,-68,-86,16,3,35,-20,-19,-98,-85; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='C'; M=-77,52,-19,-78,-91,17,-80,-94,-78,-95,-87,19,49,-10,-44,-25,2,-91,-97,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-92,21,0,-16,-18,-20,-27,-75,-18,-74,-75,40,-30,-81,-13,-73,-48,89,-68; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=15,-80,14,-21,-78,-7,-74,22,-2,-35,5,-30,-33,-27,-71,24,5,-39,-89,-75; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=8,-75,-65,-12,-28,27,-64,-64,-28,6,14,-60,44,3,34,16,4,-36,-76,-66; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=14,-73,16,-56,-65,2,65,-2,-13,-15,29,-20,-24,27,-27,16,-9,-6,14,-16;
MA   /I: I=-4; E1=0; IE=-105; DE=-19;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00928;
//
ID   LDLRA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01209;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   LDL-receptor class A (LDLRA) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4225149; R2=0.0058774; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=575; N_SCORE=6.798; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=524; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-12,-19,-18,-11,-8,-25,-21,7,-16,2,0,-10,-9,-12,-17,1,18,7,-26,-9,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-14,3,11,-21,-13,2,-23,0,-19,-14,1,-2,3,-2,0,-6,-20,-27,-12,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=1,-8,-23,-7,-1,-17,-6,-8,-16,-4,-16,-10,-7,-1,-6,-7,-2,-7,-11,-19,-13,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: M=-7,-4,-26,-3,-4,-18,-9,-5,-18,-5,-16,-11,-3,-2,-3,-6,-3,-3,-17,-21,-11,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,115,-29,-29,-20,-30,-30,-29,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29,-9,-8,-10,-49,-29,-29;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-23,1,5,-24,-4,-9,-22,-1,-20,-13,2,-6,5,-2,7,0,-18,-28,-17,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-2,-22,-1,-3,-21,4,-8,-20,-6,-19,-13,0,3,-6,-8,2,-4,-17,-24,-17,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-19,15,2,-24,1,-5,-28,0,-25,-18,13,-15,-1,-3,3,-5,-23,-29,-15,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-10,1,-27,3,11,-22,-16,14,-21,4,-18,-8,0,-14,13,2,-3,-7,-20,-21,-1,11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-21,-36,-27,64,-29,-15,2,-28,12,3,-19,-29,-34,-19,-20,-10,0,5,27,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-26,-9,3,-15,-19,0,-19,7,-14,-6,-4,-9,10,13,-4,-5,-17,-21,-7,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-6,2,-26,4,1,-23,4,-1,-29,2,-24,-15,2,-15,-2,2,0,-8,-22,-22,-13,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-2,16,-17,12,3,-22,-1,-4,-22,-6,-26,-19,22,-13,0,-7,20,9,-19,-37,-19,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-25,-9,-14,-23,38,-16,-26,-16,-20,-14,1,-19,-13,-14,3,-11,-20,-23,-23,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-17,-4,7,-22,-20,-6,-16,8,-13,-5,-3,-15,11,9,-4,-3,-13,-26,-12,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-27,2,-35,-27,39,-28,25,19,-24,-24,-21,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-26,0,-1,-21,-9,-11,-19,-3,-21,-15,-1,13,-6,-9,1,-2,-19,-28,-16,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-8,-5,-15,-17,-7,-9,-1,-7,-2,-1,-11,-1,2,-6,-6,-11,-26,-10,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-4,3,-21,3,3,-18,-13,1,-17,-2,-16,-9,5,-9,3,-1,5,1,-15,-28,-11,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-15,-24,-17,-9,-1,-22,-8,-3,-9,8,2,-13,-18,-7,-8,-15,-9,-7,-12,2,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-22,-17,-8,-9,-24,-7,-1,-5,-1,1,-15,-21,-4,-1,-11,-6,4,-17,-5,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,45,-26,49,12,-32,-7,7,-32,0,-30,-25,35,-14,0,-6,3,-7,-30,-40,-19,6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-28,-6,-11,-24,36,-9,-31,-11,-23,-13,1,-19,-9,-11,-1,-15,-25,-22,-20,-11;
MA   /M: M=-10,-7,-24,-6,-1,-7,-22,-6,-8,-5,-9,-5,-8,-18,-3,-5,-7,-7,-4,-16,-3,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,4,-23,3,-1,-23,-12,-8,-15,-2,-19,-12,6,-2,2,-4,2,-3,-13,-30,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-28,49,15,-34,-11,13,-34,-1,-27,-23,22,-12,3,-7,1,-8,-29,-38,-15,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-26,-10,-4,-23,4,-15,-18,-5,-17,-11,-7,-1,-6,-7,-2,-9,-15,-24,-19,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-27,48,13,-30,-8,1,-32,-1,-27,-25,24,-13,-1,-8,2,-5,-27,-35,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-28,-9,-10,-21,29,-12,-29,-12,-24,-16,-1,-13,-11,-13,-2,-14,-25,-13,-18,-11;
MA   /M: SY='S'; M=8,-2,-16,-2,6,-17,-6,-9,-20,-8,-23,-17,2,-10,0,-10,22,9,-13,-25,-15,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-23,14,10,-23,-12,-7,-20,-2,-17,-16,6,-7,-1,-7,2,-3,-17,-30,-16,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,11,-25,8,-2,-18,-5,6,-22,-1,-20,-12,15,-18,-1,4,-1,-7,-20,-28,-10,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,108,-26,-27,-21,-29,-28,-30,-25,-21,-20,-18,-38,-27,-26,-10,-10,-11,-48,-29,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-23,-3,6,-17,-9,-12,-13,-5,-13,-10,-6,-11,-4,-8,0,-5,-7,-26,-14,1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,0,-8,1,0,-22,-16,-12,-17,-4,-14,-12,-2,-13,-5,-3,-5,-6,-12,-31,-17,-4;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: M=-7,-4,-18,-6,-7,-10,-10,-9,-13,-7,-10,-8,-3,-15,-10,-8,-4,-2,-8,-24,-8,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-12,-5,-2,-4,-12,-8,-3,-5,-1,-3,-6,-4,-5,-4,-3,2,-3,-9,-4,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-2,1,-14,-2,0,-10,-2,-4,-12,-1,-10,-7,5,-10,0,0,2,0,-11,-16,-9,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-7,-19,-6,2,-12,-9,-9,-11,-3,-9,-8,-7,0,0,-4,-5,-6,-12,-1,-7,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=0,-3,-15,-3,-2,-15,-7,-10,-12,-5,-13,-10,-1,5,-5,-7,3,1,-10,-22,-14,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-15,-5,-3,-8,-11,-7,-9,-6,-9,-6,-3,-4,-4,-4,3,2,-7,-19,-8,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: M=-8,-9,-2,-11,-6,-9,-16,-4,-8,-7,-5,-3,-7,-14,-4,-2,-7,-6,-6,-19,-5,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-3,0,-21,-3,-4,-12,-1,-11,-14,-9,-12,-10,4,-17,-8,-11,0,-5,-12,-20,-12,-6; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='N'; M=-4,0,-21,-5,-2,-19,-10,-4,-11,-3,-13,-6,4,-11,4,-3,1,0,-11,-24,-12,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-4,-21,-7,-7,-12,1,-8,-11,-9,-8,-6,1,-17,-8,-8,-4,-6,-9,-22,-12,-8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: M=-4,-9,-18,-12,-13,-7,-6,-8,-8,-9,-8,-5,-6,-17,-11,-10,-4,-1,-4,-17,-1,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: M=-4,-9,-10,-10,-5,-11,-13,-8,-10,-10,-11,-8,-6,-11,-8,-9,-1,-3,-6,-23,-11,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-12;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-14,-24,-14,-9,-13,-17,0,-13,-5,-17,-8,-9,-20,0,2,-1,-5,-7,-1,-2,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-25,-6,2,-16,-11,18,-13,-13,-8,-4,-2,-16,-1,-10,-3,-9,-14,-28,-4,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00929;
//
ID   CAVEOLIN_MP; MATRIX.
AC   MP01210;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Caveolins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1322594; R2=0.0127052; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1216; N_SCORE=19.572; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=187; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-10,-27,-8,-1,-25,-13,9,-18,-4,-20,-8,-5,6,8,-1,-2,-7,-17,-27,-11,1;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,47,11,-31,-5,5,-31,0,-30,-25,38,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,2,-27,-1,2,-22,-19,30,-26,17,-22,-7,8,-16,7,16,-7,-8,-22,-26,0,2;
MA   /M: SY='H'; M=-17,9,-29,7,3,-23,-14,28,-28,7,-23,-11,15,-18,11,20,-5,-11,-27,-24,-4,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,29,-30,41,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=3,14,-19,20,16,-27,-6,-7,-26,-4,-26,-22,9,-8,3,-9,19,4,-18,-36,-20,9;
MA   /M: SY='H'; M=-18,25,-29,33,11,-31,-14,38,-33,-2,-25,-15,17,-14,11,-3,-3,-13,-30,-34,-4,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,5,-31,-23,28,-27,34,20,-28,-28,-21,-21,-23,-8,22,-22,-2,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,11,-31,-20,-7,-29,45,-29,-9,0,-10,17,27,-9,-10,-21,-20,-10,14;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,20,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-9,17,-30,26,-2,-35,34,-11,-40,-11,-30,-25,9,-15,-11,-15,0,-15,-30,-29,-25,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,12,11,-30,-30,-29,-20,-11,-1,48,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=4,-8,-20,-6,14,-17,-19,-13,-4,-4,-6,-3,-12,-12,-2,-10,-3,-5,3,-27,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=3,-3,-19,-6,-11,-23,28,-16,-27,-14,-26,-18,6,-15,-11,-14,17,7,-18,-29,-23,-11;
MA   /M: SY='T'; M=5,-2,-10,-12,-10,-11,-18,-19,-9,-10,-9,-7,-2,-10,-10,-11,17,42,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,-5,-7,-23,79,-22,-10,-15,0,2,-23,5,-3,-13,-17,-25,-14,36,-5;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-14,-39,-29,68,-30,-20,1,-30,13,1,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,4,24,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-6,-30,-6,-5,-29,21,-13,-35,16,-29,-15,0,-16,-4,12,-5,-15,-25,-20,-19,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-17,-30,-23,-13,-13,-31,-20,14,5,-2,6,-11,-16,-6,0,-15,-10,7,-20,-5,-13;
MA   /M: SY='C'; M=9,-18,45,-25,-24,-17,-12,-26,-14,-22,-13,-12,-17,-28,-24,-24,-4,-7,2,-35,-24,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-12,-25,-15,-12,18,-22,40,-15,-16,-9,-2,-4,-23,-9,-9,-9,-11,-16,-10,28,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00930;
//
ID   UPF0001_MP; MATRIX.
AC   MP01211;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0001 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9428406; R2=0.0145575; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=460; N_SCORE=11.629; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=7,-3,-24,-3,7,-28,7,-11,-26,5,-23,-14,-1,-11,5,-3,4,-8,-20,-23,-19,6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-15,9,20,-16,-9,-2,-16,5,-11,-10,0,-3,6,3,0,-5,-13,-16,-10,13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-10,-13,-10,-1,0,-14,-7,1,-9,11,4,-10,-11,-1,-7,-9,-5,-3,-10,-2,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-17,-16,-6,-2,-21,-13,7,-10,17,7,-16,-18,-9,-5,-15,-7,5,-17,-4,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=4,2,-24,5,10,-23,-11,-11,-18,-2,-13,-13,-3,-5,-1,-7,-1,-4,-14,-27,-17,4;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-26,-5,3,-25,-11,-11,-26,29,-23,-10,-1,-13,4,20,-4,-7,-17,-22,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=2,-14,-21,-22,-16,-9,-22,-16,15,-15,1,7,-9,-19,-8,-17,-5,-4,12,-23,-6,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-28,8,23,-30,-16,2,-26,7,-22,-14,0,1,16,2,1,-7,-24,-28,-16,19;
MA   /M: SY='K'; M=0,-9,-22,-11,-5,-14,-12,-1,-13,2,-9,-5,-5,-18,-4,1,-5,-7,-8,-20,-4,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-22,-27,-16,13,-21,-18,10,-24,25,12,-22,-25,-19,-19,-21,-10,4,-16,0,-17;
MA   /M: SY='E'; M=4,-4,-25,-3,14,-24,-16,-3,-19,9,-14,-9,-6,-4,6,0,-4,-8,-16,-24,-13,9;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-1,1,-11,1,6,-12,-6,-3,-10,2,-10,-7,3,-6,4,0,6,1,-9,-17,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-1,6,0,-6,-16,-11,-5,-16,-7,-12,-10,-2,-11,-8,-9,-3,-5,-10,-26,-13,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-25,-8,-6,-17,-9,-13,-8,-11,-5,-5,-7,1,-4,-12,-6,-5,-12,-24,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-28,24,8,-30,4,-5,-31,-3,-29,-23,15,0,-3,-7,3,-8,-28,-33,-23,2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-25,-33,-24,0,-32,-24,31,-25,23,19,-23,-17,-18,-24,-20,-9,20,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-13,9,-28,11,23,-25,-18,11,-25,10,-21,-13,7,-10,10,7,-3,-8,-23,-29,-11,15;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30,16,-21,-29,-18,-21,-18,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-28,139,30,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-27,-20,-37,-27,58,-27,-15,5,-25,13,16,-20,-27,-29,-17,-20,-10,3,2,22,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-7,-30,-5,4,-29,-13,3,-25,6,-25,-11,-3,13,14,9,-2,-8,-25,-26,-15,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,31,-29,35,19,-27,-27,-21,-23,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-17,-2,3,-20,-9,-8,-22,5,-25,-16,6,-11,3,10,21,13,-13,-33,-16,2;
MA   /M: SY='N'; M=-11,30,-22,15,3,-23,-4,8,-21,6,-29,-17,47,-18,7,7,6,-2,-29,-36,-18,4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-29,2,9,-29,-18,-8,-29,45,-30,-11,6,-11,9,27,-8,-9,-21,-22,-11,9;
MA   /M: SY='V'; M=11,-16,-7,-23,-18,-10,-20,-24,8,-17,-2,-2,-13,-18,-16,-20,4,10,15,-28,-13,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,5,-28,0,0,-25,-2,-4,-29,23,-27,-14,14,-17,3,27,-4,-9,-24,-25,-15,0;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-7,-22,-7,-4,-13,-17,-10,-11,2,-10,-7,-5,-12,-4,-3,1,-1,-9,-22,-3,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-20,-33,-26,4,-33,-26,31,-27,31,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-1,-23,-15,-12,-10,-18,-1,-13,-1,3,-15,-16,-12,-18,-1,-3,6,-22,-15,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-26,4,19,-26,-11,-1,-26,11,-22,-14,8,-11,14,14,2,-7,-24,-27,-17,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-30,-4,-8,-16,-1,12,-26,-5,-26,-15,11,-21,-4,-5,-7,-13,-28,8,-1,-6;
MA   /M: SY='F'; M=1,-25,-17,-30,-22,24,-23,-22,6,-23,12,3,-22,-19,-26,-20,-14,-6,8,-12,3,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-4,1,-23,2,-5,-9,-15,4,-18,-10,-15,-12,-2,-17,-6,-11,-1,-2,-14,-10,2,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-23,-16,-27,-20,2,-21,-17,-7,-18,-2,-2,-22,-24,-15,-17,-15,-5,-9,30,11,-17;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,3,-30,-25,-4,-27,-25,17,-22,11,10,-24,-26,-22,-22,-12,-5,23,-28,-10,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-16,2,-30,5,17,-26,-20,62,-28,-2,-20,-5,6,-14,21,2,-6,-16,-30,-28,6,16;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-28,2,-33,-28,34,-26,22,16,-27,-27,-24,-23,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-30,63,26,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-1,-19,-3,3,-20,-11,-5,-24,7,-24,-15,7,-14,4,22,15,8,-15,-31,-15,2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-12,-23,-10,5,-11,-21,-14,-6,-7,7,-2,-13,-8,-4,-9,-9,-4,-8,-25,-11,0;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-28,-5,3,-24,-16,-8,-25,25,-25,-11,0,-14,10,22,-5,-8,-20,-9,-9,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00931;
//
ID   P2X_RECEPTOR_MP; MATRIX.
AC   MP01212;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP P2X receptors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7450747; R2=0.0137781; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1406; N_SCORE=24.107; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,37,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-13,-32,-30,14,-31,-28,26,-22,11,9,-28,-29,-31,-21,-12,-2,40,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-3,-25,-4,15,-27,-15,-4,-23,12,-18,-10,-3,-10,16,16,0,-7,-19,-22,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-2,-29,-1,14,-13,-18,-6,-19,7,-16,-6,-5,-12,5,0,-9,-11,-20,-3,-6,11;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-11,-17,-10,-18,-5,-19,-8,-11,-11,-10,-6,-11,-9,-18,14,9,0,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-28,5,15,-30,4,9,-29,-3,-23,-13,3,-11,14,-5,2,-11,-27,-26,-15,13;
MA   /M: SY='B'; M=-10,33,-21,33,7,-27,-6,0,-27,-3,-28,-23,30,-13,-1,-7,12,4,-24,-39,-19,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,1,-21,0,16,-25,-16,-5,-20,3,-18,-11,1,-8,18,2,10,9,-17,-27,-14,17;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-27,41,27,-33,-13,-3,-33,5,-26,-24,11,-7,6,-4,4,-4,-26,-35,-19,16;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-23,6,-31,-22,27,-26,35,22,-27,-27,-20,-21,-24,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-19,-8,-5,-28,-4,8,-16,15,8,-18,-23,-11,-9,-17,-9,8,-25,-3,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-26,-4,13,-21,-22,-7,-15,11,-6,-3,-7,-13,12,8,-9,-6,-15,-23,-10,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-16,-29,-24,-5,-26,-27,26,-21,6,7,-20,-22,-21,-22,-5,-1,31,-27,-9,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-19,-32,-26,1,-29,-20,31,-20,18,29,-24,-24,-18,-19,-17,-6,30,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,1,-25,-3,7,-18,-20,-5,-11,3,-14,-7,4,-13,8,4,0,4,-13,-24,-7,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-15,11,-28,12,6,-17,-11,26,-25,0,-21,-12,12,-17,2,-2,-5,-11,-26,-21,7,2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,37,-27,47,15,-32,-11,7,-31,-1,-26,-23,21,-13,0,-8,0,-8,-24,-38,-16,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,48,11,-31,-6,4,-31,0,-30,-26,38,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-25,-14,-7,-12,-19,-15,-17,5,-12,-9,-8,-17,-4,10,-4,5,-12,0,-4,-6;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-27,-15,-9,-18,-3,-3,-22,-5,-20,-13,-10,-8,-7,-10,-5,-11,-18,6,-6,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,-19,-9,-9,-13,0,-18,-14,-13,-15,-13,-8,-16,-13,-16,4,-4,-5,-14,-14,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-2,2,-18,3,1,-21,-7,11,-25,-4,-27,-16,9,-13,3,3,21,7,-16,-35,-12,1;
MA   /M: SY='H'; M=-15,4,-29,7,9,-21,-11,31,-28,-2,-18,-9,4,-15,7,1,-7,-14,-26,-26,-2,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-6,-18,-11,-8,-13,-18,-2,-14,-2,-11,-7,2,-22,-1,7,-9,-9,-15,-10,-6,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-30,-8,1,-23,-23,16,-17,16,-17,-2,-1,-16,12,20,-10,-12,-16,-22,-2,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-14,0,5,-19,-5,-6,-20,-7,-27,-17,7,-10,5,-8,31,14,-13,-34,-13,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-27,-4,4,-24,-18,15,-25,13,-21,-7,6,-16,19,31,-1,-5,-22,-25,-7,9;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-15,-28,-15,-8,-14,-10,-8,-20,9,-5,-4,-7,-22,-1,36,-13,-11,-14,-20,-11,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-23,-11,-2,-28,-13,11,-21,34,15,-23,-25,-1,-13,-23,-10,1,-20,-2,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-18,30,-30,44,21,-28,-15,3,-31,1,-23,-22,10,-11,6,-7,-3,-10,-27,-27,-5,13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,10,-27,11,5,-27,-3,-8,-28,6,-26,-18,8,0,-2,1,0,-2,-24,-29,-19,1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-22,-5,-1,-21,-4,-10,-22,20,-22,-10,-1,-13,1,17,-2,-6,-13,-20,-12,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,0,-22,1,-6,0,-17,18,-11,-8,-8,-6,0,-19,-4,-7,-5,-4,-13,-7,24,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-15,0,-3,-11,-13,-7,-5,-7,-7,-4,8,-15,-6,-8,3,7,-3,-28,-11,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-23,0,9,0,-16,-8,-17,-3,-14,-12,0,0,-6,-7,-5,-7,-17,-18,-6,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-25,-4,6,-22,-17,12,-23,13,-20,-9,0,-14,6,18,-3,-8,-16,-25,-7,4;
MA   /M: SY='S'; M=2,11,-13,3,-2,-18,-5,-7,-18,-7,-25,-18,22,-13,-2,-7,27,21,-13,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=9,-22,-14,-25,-19,0,-20,-22,11,-20,11,4,-19,-22,-19,-19,-5,-1,16,-23,-8,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,1,-12,-4,-6,-7,-7,-7,-11,-9,-18,-12,9,-14,-6,-9,19,13,-6,-27,-7,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-12,-29,-7,-1,-19,-16,6,-18,-9,-23,-13,-9,40,-4,-12,-3,-7,-22,-23,-9,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-1,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00932;
//
ID   GLOBIN_FAM_2_MP; MATRIX.
AC   MP01213;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protozoan/cyanobacterial globins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7723699; R2=0.0146236; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=638; N_SCORE=14.092; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-29,65,-31,-16,5,-27,10,2,-20,-29,-34,-20,-20,-10,2,9,33,-29;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-19,-8,-5,-11,-10,-13,-16,-3,-20,-14,2,-1,-7,-8,9,4,-12,-26,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-7,7,-29,8,2,-29,22,-9,-32,-5,-29,-20,11,-4,-6,-9,0,-12,-29,-28,-25,-3;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-15,-4,-9,-13,-20,-18,-4,-12,-9,-8,-1,-13,-11,-13,12,28,3,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,29,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-5,20,-15,27,51,-22,-22,-5,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,0,-19,-3,1,-22,-11,-14,-16,0,-19,-14,-1,0,-4,-8,7,4,-10,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-26,-2,2,-22,-8,6,-23,11,-21,-10,4,-17,1,14,-5,-10,-16,-26,-11,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-6,-24,-9,6,-26,-19,-2,-11,-1,-6,1,-6,-13,30,-1,-2,-2,-16,-21,-10,18;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-4,-23,-6,6,-21,-17,-9,-23,17,-18,-11,-2,-12,4,25,0,3,-14,-23,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-23,3,5,-24,4,-5,-26,6,-26,-17,15,-14,1,5,6,-4,-22,-29,-19,2;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-30,-1,8,-28,-20,19,-29,29,-25,-6,2,-14,17,26,-9,-12,-24,-22,-3,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-8,-25,-9,6,-24,-23,-1,-8,-3,-1,4,-8,-15,31,0,-6,-3,-16,-21,-7,19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-19,-17,-9,-3,-22,-17,-4,3,-7,-3,-13,-19,-11,3,-6,-2,7,-21,-7,-10;
MA   /M: SY='A'; M=17,1,-19,-1,8,-24,-9,-8,-15,-3,-12,-4,-5,-10,5,-11,2,-5,-11,-24,-16,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,22,-30,-20,17,-30,43,17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-15,5,-22;
MA   /M: SY='A'; M=15,-5,1,-12,-4,-19,-7,-19,-17,-10,-14,-13,-6,-13,-9,-15,9,13,-7,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-10,-23,-14,-2,-14,-17,2,-8,-3,-8,5,-10,-16,17,-5,-4,-7,-12,-9,8,6;
MA   /M: SY='A'; M=18,-18,-19,-24,-16,-2,-16,-12,4,-15,4,0,-16,-19,-13,-19,-6,-5,3,-8,9,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-31,-24,-34,-24,26,-29,-21,10,-29,32,10,-29,-30,-25,-20,-29,-13,3,8,11,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-9,-30,58,-17,-39,-16,-29,-20,0,-17,-15,-17,0,-19,-30,-21,-29,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-33,-11,-2,-27,-17,-20,-18,-10,-26,-18,-17,68,-10,-19,-5,-3,-23,-29,-27,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-26,10,9,-25,-12,4,-25,9,-26,-16,15,-3,4,8,1,-6,-24,-31,-16,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-6,-26,-6,7,-22,-19,3,-17,-1,-13,-7,-6,5,7,-5,-4,-3,-18,-26,-11,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-35,-25,-22,25,-28,8,-5,-12,-5,-5,-25,-30,-12,-12,-25,-15,-15,59,68,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-20,1,-2,-22,-4,-14,-23,5,-22,-14,3,-11,-4,-1,10,16,-13,-28,-15,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-27,-7,1,-23,-17,17,-27,19,-21,-8,1,-16,7,28,-7,-11,-19,-22,-5,1;
MA   /M: SY='P'; M=-12,4,-33,7,1,-23,-15,-6,-21,-6,-27,-19,5,39,-6,-13,-5,-8,-28,-28,-16,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-7,20,-17,30,46,-23,-23,-7,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-27,3,4,-25,-17,-5,-29,26,-23,-13,2,-15,6,37,-5,-5,-19,-23,-12,3;
MA   /M: SY='E'; M=-2,0,-24,0,20,-24,-18,-4,-17,8,-14,-3,-4,-8,16,1,0,-1,-17,-25,-13,18;
MA   /M: SY='A'; M=13,-14,-15,-19,-13,-13,-16,-18,-3,-3,-7,-4,-12,-18,-11,2,1,4,9,-24,-14,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=12,-7,-21,-11,1,-24,-14,-11,-15,12,-12,-5,-7,-12,8,3,-3,-6,-11,-20,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-31,6,-1,-30,23,-12,-32,-10,-29,-21,5,9,-9,-15,-1,-13,-30,-28,-27,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-24,-22,-29,-19,19,-26,-12,7,-15,22,20,-20,-26,-15,-2,-22,-10,3,-13,5,-17;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-9,4,-28,-1,-7,-25,19,6,-30,-6,-27,-16,15,-8,-6,-1,-1,-12,-29,-28,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-1,4,-16,-2,2,-22,-12,-6,-17,-4,-21,-11,9,-11,13,-4,20,20,-14,-31,-14,7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,12,-24,6,-3,-19,-5,1,-13,-6,-10,0,17,-19,4,-6,-4,-7,-18,-30,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-11,-25,-10,2,-16,-21,2,-5,-11,-7,-4,-10,-1,-4,-13,-5,-7,-5,-28,-10,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,1,10,-24,-20,66,-29,-1,-20,-4,7,-16,17,9,-8,-17,-29,-28,8,10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-20,-34,-24,57,-26,-17,-5,-20,4,-2,-16,-27,-30,-9,-16,-9,-3,3,20,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-11,27,-25,37,11,-33,-6,-4,-31,-2,-26,-21,12,-11,6,-8,7,0,-24,-35,-18,8;
MA   /M: SY='A'; M=33,-12,-12,-21,-12,-13,-8,-20,-4,-14,1,-4,-12,-14,-12,-19,4,4,2,-21,-15,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-33,-29,-36,-30,3,-30,-30,22,-23,4,4,-30,-27,-24,-23,-22,-12,19,27,5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=13,-22,-19,-29,-19,-5,-22,-23,18,-22,17,8,-19,-19,-16,-23,-11,-6,12,-20,-8,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00933;
//
ID   UPF0016_MP; MATRIX.
AC   MP01214;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0016 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7768035; R2=0.0138760; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=814; N_SCORE=16.062; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-21,-23,-28,-21,49,-27,17,-9,-24,1,0,-11,-27,-25,-14,-17,-13,-9,-2,27,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-3,-30,-3,3,-23,-20,32,-30,22,-23,-6,4,-17,10,33,-10,-14,-24,-24,1,3;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,56,-30,-20,7,-30,24,7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,3,0,20,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-33,-27,3,-33,-27,34,-26,26,16,-27,-27,-24,-23,-20,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='F'; M=8,-20,-16,-30,-20,20,-16,-14,3,-17,6,15,-16,-20,-17,-17,-9,-6,3,-10,3,-17;
MA   /M: SY='S'; M=24,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-24,-16,-30,-24,0,-24,-11,24,-14,16,42,-24,-24,-11,-14,-16,-6,24,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-27,-31,-27,18,-3,-24,5,-27,1,1,-14,-23,-27,-24,-14,-13,1,-10,1,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-23,-20,-23,-24,-7,4,-24,3,-23,9,3,-20,-27,-24,-20,-13,-10,11,-24,-14,-24;
MA   /M: SY='C'; M=3,-7,34,-10,-10,-20,-10,-17,-23,-17,-27,-20,0,-20,-10,-17,23,10,-10,-43,-23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,23,-20,0,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,31,-33,-23,23,-30,26,13,-23,-27,-27,-23,-23,-10,13,-9,11,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-7,20,-17,30,46,-23,-23,-7,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-23,-20,-33,-23,27,-23,-7,13,-17,17,40,-20,-23,-14,-13,-20,-10,7,-10,10,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-3,-30,0,20,-23,-20,0,-30,23,-20,-13,0,-13,13,46,-7,-10,-23,-23,-13,14;
MA   /M: SY='H'; M=-17,6,-27,0,-7,-2,-17,41,-16,-7,-16,-7,16,-24,0,-4,-7,-10,-23,-12,28,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-3,14,-20,7,3,-23,-6,-3,-23,12,-30,-17,25,-14,3,6,14,4,-20,-34,-17,3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-13,-16,-13,-4,-23,-20,-1,-16,8,-1,-9,-16,-13,-13,5,32,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,55,-30,-20,7,-30,24,7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00934;
//
ID   MRP_MP; MATRIX.
AC   MP01215;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mrp family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7968774; R2=0.0143461; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=918; N_SCORE=17.957; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-34,-10,-2,-27,-17,-19,-18,-10,-26,-18,-16,68,-9,-19,-5,-7,-25,-30,-27,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-24,-17,-7,-12,-21,-6,-2,15,0,26,-12,-16,3,8,-16,-10,-3,-20,-4,-2;
MA   /M: SY='K'; M=0,-15,-21,-16,-8,-13,-22,-18,-3,9,0,1,-15,-19,-8,1,-12,-7,4,-22,-9,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,-18,0,-5,-17,-4,6,-16,-8,-19,-7,18,-16,-2,-7,11,9,-15,-33,-12,-4;
MA   /M: SY='G'; M=7,-7,-23,-9,-6,-24,11,-14,-26,7,-22,-13,-2,-14,-5,3,2,-8,-16,-22,-18,-6;
MA   /M: SY='M'; M=13,-19,-16,-26,-17,-6,-16,-16,10,-16,14,18,-18,-19,-11,-18,-9,-4,9,-21,-8,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-36,-27,3,-36,-27,40,-29,29,19,-24,-24,-21,-26,-23,-9,25,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-27,-2,6,-21,-18,-2,-22,22,-20,-7,4,-14,10,20,-5,-5,-19,-20,-5,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-29,2,19,-37,-19,7,-22,14,-22,-3,4,-10,48,12,-1,-9,-29,-22,-11,33;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-27,55,-29,-18,7,-28,20,11,-22,-29,-31,-19,-22,-10,3,0,20,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-32,-23,16,-31,-22,21,-29,39,17,-28,-29,-23,-21,-26,-9,14,-17,3,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-22,-5,-1,-18,-7,-2,-23,9,-23,-11,3,-14,2,6,7,1,-16,-25,-9,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-28,48,22,-36,-12,0,-33,1,-26,-24,14,-10,7,-7,2,-8,-26,-36,-19,15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-11,-25,-24,-3,-27,-27,19,-18,4,5,-21,-24,-24,-18,-1,13,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-24,6,3,-15,-17,-6,-15,1,-10,-8,-1,-16,-3,-2,-6,-6,-11,-22,-4,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-30,7,-6,-31,41,-13,-37,-13,-29,-22,6,-10,-12,-16,0,-16,-30,-26,-27,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,21,-26,26,28,-29,-13,0,-28,5,-24,-20,13,-8,11,-2,4,-6,-26,-32,-17,19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,8,-30,-21,21,-28,44,19,-30,-30,-21,-20,-27,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-24,-23,35,-30,9,3,-14,3,1,-21,-30,-17,-13,-19,-9,-3,21,64,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-30,-19,22,-28,46,23,-29,-29,-18,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,2,-33,-27,34,-25,23,17,-26,-26,-24,-23,-18,-6,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-34,-27,38,-26,21,18,-25,-25,-22,-24,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-14,-16,-22,-16,3,-23,-14,5,-15,12,17,-13,-18,-11,-13,-4,17,5,-22,-2,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-21,-6,-11,-26,39,-16,-31,-16,-30,-20,4,-16,-11,-16,18,-2,-21,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-8,-25,-6,17,-16,-26,-14,2,-7,-4,-4,-11,-11,-1,-12,-6,-7,2,-27,-13,7;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-3,-27,-6,2,-24,-19,47,-19,-6,-16,0,2,-16,18,-2,-4,-11,-21,-25,4,7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-33,-22,30,-29,39,22,-26,-26,-19,-23,-26,-10,16,-20,0,-23;
MA   /M: SY='S'; M=6,3,-11,0,-3,-18,-8,-14,-17,-9,-21,-16,6,-10,-4,-11,28,28,-7,-35,-16,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-18,-31,-25,3,-31,-25,29,-25,25,16,-26,-26,-22,-21,-18,-3,29,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=9,-9,-15,-16,-13,-10,-14,-8,2,-13,0,3,-5,-19,-11,-14,-1,0,5,-27,-10,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-27,4,25,-32,-18,2,-22,8,-20,-8,2,-8,35,6,4,-2,-25,-25,-13,30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-2,-19,-9,-6,-3,-15,-3,-8,-8,-7,-4,3,-18,-5,-8,2,4,-9,-20,1,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-25,12,-32,-20,26,-26,29,17,-26,-27,-21,-21,-23,-8,19,-16,6,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-32,-8,4,-25,-20,-2,-20,5,-18,-9,-10,23,4,5,-10,-11,-22,-25,-15,1;
MA   /M: M=-5,-10,-22,-11,-4,-11,-19,-14,-1,-12,0,-1,-9,-11,-7,-12,-6,-4,-2,-24,-11,-6;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-8,0,-3,-17,-11,-12,-18,-6,-18,-14,1,-14,-6,-11,11,8,-10,-29,-12,-5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-26,-5,-3,-25,25,-11,-30,-6,-23,-15,0,-15,-5,-8,1,-10,-23,-22,-21,-4;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-21,-19,-10,-14,-14,-18,2,-16,-4,-3,-14,-3,-12,-19,-2,-3,3,-25,-15,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00935;
//
ID   SUCCINYL_COA_LIG_1_MP; MATRIX.
AC   MP01216;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-citrate lyase / succinyl-CoA ligases family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1681919; R2=0.0151169; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1189; N_SCORE=23.132; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=89; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-21,-19,-27,-19,-1,-25,-12,19,-16,19,31,-20,-22,-7,-14,-16,-3,14,-22,-3,-13;
MA   /M: SY='P'; M=6,-17,-32,-13,-3,-27,-15,-20,-17,-10,-25,-17,-17,63,-10,-20,-5,-7,-22,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-5,-20,-6,-9,-22,16,-15,-21,-13,-22,-13,-1,-8,-10,-15,12,1,-13,-29,-21,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-29,1,6,-20,-18,30,-26,15,-23,-8,9,-16,10,14,-7,-12,-24,-23,3,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-34,-26,2,-34,-26,36,-28,24,17,-22,-23,-20,-25,-18,-7,24,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-25,-21,-18,29,-27,19,-6,-17,1,0,-12,-26,-15,-11,-15,-7,-9,2,39,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-28,-7,1,-24,-12,-8,-25,24,-20,-8,-2,-15,8,29,-7,-6,-18,-21,-11,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-33,-6,7,-28,-18,-12,-22,6,-25,-15,-8,36,2,3,-7,-9,-24,-26,-21,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-4,1,-17,0,2,-24,-11,-5,-24,9,-28,-16,7,-4,1,7,10,3,-18,-32,-16,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,37,-24,16,14,-26,-26,-26,-24,-15,-4,40,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-26,-12,-18,-28,55,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-25,-31,-26,9,-33,-14,28,-22,16,15,-23,-25,-18,-21,-19,-8,19,-8,20,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-15,-10,-13,-15,5,-20,-18,-13,-15,-13,0,-13,-13,-13,15,31,-8,-27,-15,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,31,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-11,-7,-8,-14,-9,-17,-15,-11,-17,-13,3,-11,-8,-11,24,38,-5,-32,-14,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-4,-27,-9,-15,16,-22,17,-5,-7,-8,-5,2,-27,-7,-7,-12,-7,-15,11,53,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,52,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,28,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='A'; M=16,-20,-17,-28,-18,-3,-17,-20,11,-19,15,10,-18,-19,-14,-21,-10,-6,8,-19,-8,-17;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-6,-13,-15,-13,-12,-13,0,-11,-8,-1,2,-21,-13,-14,0,-2,6,-30,-16,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-3,6,-22,-2,-2,-6,-12,14,-16,-5,-16,-10,15,-18,-1,-6,-1,-6,-19,-20,2,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-27,-9,6,-25,-22,-4,-1,-3,-9,1,0,-13,23,-5,-4,-8,-11,-23,-10,13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-21,-28,-21,1,-30,-22,22,-23,22,14,-18,-21,-16,-20,-12,6,14,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-14,-5,-3,-17,-13,-14,-18,1,-20,-13,3,-11,-2,2,20,27,-8,-31,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-26,3,17,-28,-17,6,-23,17,-20,-7,1,-9,24,13,-3,-9,-22,-21,-9,20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=11,-6,-12,-12,-9,-9,-13,-14,-3,-10,-3,-4,-4,-14,-10,-12,4,12,2,-22,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,3,-25,4,-10,-26,31,-16,-32,-14,-25,-19,4,-15,-14,-15,5,1,-22,-26,-23,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-9,-23,-10,-14,7,-25,-15,7,-22,17,4,-10,-24,-18,-18,-18,-9,1,-21,-1,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-15,-22,-17,-6,-12,-25,-10,3,-7,-4,4,-13,-19,13,-6,-6,-4,4,-21,-6,4;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-15,-6,-6,-5,-10,-3,-14,-10,-20,-14,1,-15,-4,-10,22,15,-9,-20,8,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-17,-5,8,-13,-21,-15,-11,-7,-4,-8,-4,-10,-3,-9,7,25,-7,-29,-11,2;
MA   /M: SY='C'; M=6,-16,15,-20,-21,-18,4,-24,-14,-20,-14,-11,-13,-24,-21,-21,0,-5,0,-31,-22,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-39,-28,48,-29,20,23,-20,-20,-19,-29,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-35,-11,-1,-26,-19,-14,-23,3,-26,-16,-13,49,-4,8,-9,-9,-25,-26,-23,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-22,-31,-27,26,-31,-12,19,-21,10,10,-23,-27,-23,-19,-17,-7,16,-2,26,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-30,-10,-8,-19,-19,-13,-4,-12,-17,-10,-2,30,-10,-17,-5,-5,-12,-30,-19,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-12,-11,-9,-10,-17,-17,-7,-13,-4,-7,-3,-14,-7,-11,15,31,-1,-30,-10,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,10,-16,5,-4,-17,-11,-11,-18,-6,-17,-15,11,-13,-6,-5,14,24,-11,-33,-14,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-23,-31,-24,58,-28,4,-5,-24,4,0,-15,-28,-28,-16,-18,-12,-6,7,36,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-23,-29,-22,-4,-32,-24,26,-15,10,13,-17,-20,-16,-15,-13,-1,21,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-19,46,-30,65,24,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='H'; M=0,-15,-2,-18,-16,-12,-22,15,-4,-17,-5,0,-12,-24,-13,-15,-8,-9,5,-30,-4,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,39,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-28,-2,12,-20,-22,-11,-11,7,-8,-6,-6,-8,2,1,-9,-9,-11,-25,-12,5;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-18,-22,-21,-11,-8,-21,-10,-2,-1,9,10,-14,-22,-5,15,-15,-8,-1,-21,-7,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,70,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,40,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00335;
//
ID   SUCCINYL_COA_LIG_3_MP; MATRIX.
AC   MP01217;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP-citrate lyase / succinyl-CoA ligases family signature 3.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1059558; R2=0.0134411; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=327; N_SCORE=7.491; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=253; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-26,8,27,-25,-5,-5,-24,0,-17,-13,-3,-8,6,-8,0,-10,-21,-25,-16,16;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-23,-15,-9,-15,-9,-17,-7,0,-8,-5,-10,-18,-9,-4,-7,-6,-1,-17,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,-2,10,-17,-17,-4,-14,5,-10,-1,-2,-12,5,3,-3,-2,-13,-25,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=28,-11,-16,-19,-12,-17,6,-13,-11,-9,-10,-2,-10,-14,-9,-16,2,-6,-5,-17,-13,-11;
MA   /M: SY='A'; M=9,5,-21,5,9,-26,-8,-7,-23,7,-21,-14,2,-10,2,-2,6,-3,-15,-27,-17,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-25,7,14,-27,-13,-3,-23,12,-24,-13,10,-6,12,6,4,-3,-22,-29,-16,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-26,-21,-13,6,-26,-3,5,-14,7,4,-15,-23,-12,-12,-17,-10,-1,-5,14,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-7,6,-27,8,1,-27,9,-11,-25,0,-24,-16,6,-12,-6,-6,-2,-10,-18,-28,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-19,-31,-21,19,-26,-20,13,-27,34,12,-25,-27,-22,-20,-23,-9,8,-14,3,-21;
MA   /M: SY='N'; M=6,14,-15,4,-2,-19,-4,-4,-18,-5,-23,-16,23,-14,-3,-7,18,12,-15,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,-28,-21,-18,23,-30,6,2,-7,2,2,-18,-27,-11,-8,-19,-10,-6,14,52,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-32,-27,3,-32,-27,32,-25,24,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-3,1,-26,-2,1,-19,-6,-2,-23,13,-22,-12,6,-14,0,6,-3,-7,-19,-18,-4,0;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-24,-24,-14,0,-27,-15,7,-15,28,13,-22,-19,-12,0,-24,-10,1,-21,-4,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,31,-30,44,18,-36,-12,-3,-36,15,-29,-23,13,-10,4,2,-2,-10,-27,-33,-17,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-22,18,9,-24,-7,2,-25,4,-27,-19,27,-14,5,8,10,0,-24,-35,-18,6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-19,-34,-29,0,-34,-30,38,-24,14,14,-24,-25,-25,-24,-14,-3,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='G'; M=6,-15,-30,-16,-20,-22,44,-22,-32,-18,-25,-18,-8,-20,-18,-20,-4,-18,-25,6,-19,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-20,34,-27,-26,-5,-30,-22,0,-23,-4,-4,-19,-29,-23,-23,-8,1,9,-28,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-22,-34,-25,4,-30,-18,31,-22,24,31,-23,-23,-15,-20,-21,-9,22,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-16,-20,-22,-12,5,-24,1,-18,-8,-3,-15,-24,-22,-19,0,-4,16,-28,-18,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-1,27,-20,11,0,-21,-3,3,-20,5,-27,-17,42,-17,0,1,7,-1,-24,-34,-19,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-27,-9,-17,-29,61,-19,-37,-19,-30,-20,1,-19,-17,-19,5,-15,-27,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-16,-17,-13,-23,20,-20,-18,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-25,-19,-29,-19,4,-24,-17,16,-24,36,21,-25,-25,-16,-19,-22,-8,9,-20,-3,-17;
MA   /M: SY='A'; M=25,-9,-10,-14,-10,-16,-7,-19,-7,-11,-13,-10,-6,-13,-10,-16,17,13,4,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-15,-18,-24,-19,-2,-20,-5,16,-12,15,38,-12,-22,-6,-11,-16,-7,11,-24,-4,-13;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-14,-11,-3,-17,-6,-16,-9,-9,-13,-10,-7,-13,-8,-14,11,7,0,-27,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-14,-16,-13,2,-21,-17,-5,-14,-1,-5,-7,-16,-13,-13,8,29,0,-21,0,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-15,-20,-16,-1,-19,-7,8,-14,13,26,-8,-21,-7,-12,-11,-2,2,-25,-5,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-21,-31,-25,0,-33,-26,31,-25,19,14,-20,-22,-19,-23,-13,2,24,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,36,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-1,-4,-3,-21,-14,-10,-23,11,-24,-14,5,-17,-3,2,1,-4,-16,-28,-13,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-5,-24,-3,-5,-8,-20,1,-5,-11,6,1,-7,-20,0,-7,-13,-10,-9,-17,5,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=0,-12,-17,-17,-13,-1,-19,3,-4,-15,4,1,-8,-21,-10,-13,-6,0,-4,-18,6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-27,-8,-17,-27,54,-18,-35,-17,-27,-19,4,-19,-17,-17,3,-10,-26,-23,-27,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=1,1,-24,1,-10,-26,29,-14,-28,-11,-25,-17,4,-18,-11,-12,4,-10,-19,-26,-23,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-28,8,22,-28,-7,-6,-29,15,-24,-15,2,-9,10,9,-1,-8,-24,-26,-17,16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-22,-32,-16,-7,-19,-22,-21,-7,-14,-12,-9,-22,51,-14,-20,-12,-8,-12,-28,-22,-14;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,-13,-20,-11,-14,-4,-15,-9,-10,-9,-9,-11,-13,-10,-19,6,-1,-1,-14,-7,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-9,32,-15,16,6,-21,-5,6,-21,0,-27,-19,46,-18,1,-2,8,1,-28,-39,-20,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-26,-23,-33,-27,58,-17,-14,-5,-26,3,-3,-17,-29,-33,-18,-17,-11,-5,9,30,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-19,-27,-21,2,-15,-21,12,-27,32,12,-25,-29,-21,-20,-23,-10,9,-22,-6,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,36,-27,51,22,-36,-10,-3,-35,0,-26,-26,13,-8,2,-10,1,-9,-26,-36,-20,12;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-21,-33,-28,5,-34,-22,33,-23,14,13,-23,-25,-22,-23,-16,-6,28,-16,9,-28;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,6,-26,9,-8,-30,37,-14,-35,-13,-28,-21,5,-16,-12,-17,4,-12,-25,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-18,-18,-8,-20,-8,-18,-12,-5,-13,-10,-12,4,-8,-7,2,-3,-5,-22,-19,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-17,-1,-3,-13,-11,-6,-17,-2,-21,-14,4,-14,-3,-5,16,15,-11,-24,-1,-4;
MA   /M: SY='P'; M=5,-6,-26,-3,11,-26,-15,-12,-20,3,-20,-14,-8,16,2,-5,-1,-6,-17,-26,-20,5;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-29,19,17,-32,11,-8,-34,-3,-26,-22,4,-5,0,-9,1,-11,-28,-29,-23,8;
MA   /I: MD=0;
MA   /M: D=0;
MA   /I: I=0; E0=0; MI=0; IE=0; DE=0;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00335;
//
ID   TATC_MP; MATRIX.
AC   MP01218;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TatC family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4128613; R2=0.0148413; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=8.994; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=74; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-7,4,-22,-1,-2,-20,-8,-1,-19,6,-20,-10,12,-16,2,5,4,1,-17,-29,-12,-1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-16,-17,-19,-16,18,-20,-6,0,-14,0,-2,-13,-21,-15,-12,-4,2,1,-3,22,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-20,-8,-8,-17,21,-11,-22,-11,-19,-13,-2,-14,-7,-12,5,-2,-16,-17,-11,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-3,2,-21,3,1,-18,-10,-4,-18,0,-21,-13,5,2,2,-2,6,0,-17,-23,-8,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-15,16,-28,27,18,-19,-13,-6,-25,-6,-12,-16,2,-13,-2,-10,-6,-11,-21,-29,-13,9;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-7,-23,-10,-13,-14,-9,0,0,-13,-4,6,-3,-21,-7,-12,-8,-9,0,-27,-9,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-19,-32,-25,11,-30,-24,23,-23,16,10,-23,-26,-22,-21,-15,-6,24,-19,0,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-22,1,16,-16,-17,-6,-15,-1,-14,-11,4,-12,7,-5,2,0,-14,-27,-13,12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-28,-13,-3,-19,-21,-17,-8,-11,-11,-6,-15,30,-5,-15,-5,2,-12,-27,-18,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-19,-21,-23,-14,1,-25,-15,15,-18,12,11,-15,-21,-13,-18,-12,-6,10,-19,0,-15;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=0,-24,-27,-29,-21,4,-21,-22,0,-19,0,-4,-22,-21,-17,-20,-15,-5,-4,31,9,-18;
MA   /M: SY='S'; M=-2,5,-19,6,0,-23,-2,-9,-26,0,-26,-18,7,-12,-1,3,18,9,-16,-33,-18,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-24,-36,-28,16,-27,-26,26,-27,11,9,-19,-22,-25,-25,-15,-9,18,-13,3,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-4,16,-23,19,11,-28,0,2,-29,-1,-27,-20,13,-11,1,-6,9,-4,-23,-33,-18,6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-24,2,20,-26,-16,-2,-21,7,-19,-9,1,-9,20,7,7,0,-20,-28,-14,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-36,-27,41,-31,-23,16,-29,22,9,-24,-29,-31,-21,-22,-9,12,-7,13,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-25,19,11,-27,-9,0,-23,-2,-23,-16,12,-12,6,-3,6,-2,-21,-33,-16,7;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,71,-30,-20,3,-30,15,3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,1,6,26,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-21,-19,-28,-23,7,-28,-22,21,-22,13,11,-16,-24,-21,-20,-12,-1,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-19,-29,-22,14,-29,-21,16,-25,26,14,-22,-25,-21,-19,-17,1,12,-18,2,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-5,-22,-9,-2,-17,-19,-2,-9,3,-5,-1,-2,-18,6,3,-7,-5,-9,-24,-8,1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-29,-21,6,-29,-21,22,-28,38,17,-26,-27,-19,-21,-23,-7,14,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-19,-31,-24,22,-29,-22,16,-25,18,10,-20,-25,-24,-20,-14,-2,14,-15,5,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-26,-19,-31,-24,27,-27,-18,14,-24,15,12,-21,-26,-24,-19,-15,-6,13,-12,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=16,-10,-18,-12,-8,-17,-1,-14,-14,-11,-19,-14,-6,1,-9,-16,12,2,-8,-24,-13,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-17,-31,-24,50,-27,-20,-1,-24,7,-1,-15,-24,-30,-17,-9,7,1,-3,17,-24;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-26,-13,-18,-19,49,-19,-32,-19,-24,-17,-2,-19,-19,-19,2,-14,-23,-19,-23,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-19,-34,-27,7,-33,-27,31,-26,24,15,-26,-27,-25,-23,-19,-6,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,2,-20,-13,-13,-10,-19,-7,-17,0,-6,-12,-18,-13,-19,4,0,0,-27,-16,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-30,9,39,-35,-20,5,-25,10,-20,-9,0,-5,41,5,0,-10,-30,-25,-15,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-9,-33,-25,5,-30,-20,23,-24,23,23,-24,-26,-19,-21,-20,-9,18,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-27,-19,-33,-25,12,-29,-25,23,-25,18,10,-23,-24,-24,-23,-16,-6,22,-18,0,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-16,-22,-21,-10,-14,-25,-15,11,-13,4,6,-13,-17,4,-13,-6,0,6,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-25,-22,-30,-23,12,-30,-6,19,-22,17,18,-21,-26,-17,-18,-19,-9,14,-14,12,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-18,-34,-26,36,-30,-21,15,-27,23,12,-25,-29,-29,-20,-21,-8,15,-10,10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,12,-27,-19,15,-28,41,15,-26,-28,-20,-19,-23,-7,8,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-8,-14,-15,-12,6,-16,-16,-16,-11,-10,-1,-20,-13,-16,-1,-2,-12,-24,-16,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-28,-17,-11,-5,-21,-14,-9,3,-9,-5,-7,-20,-7,6,-13,-10,-9,3,-1,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-24,-18,-28,-19,1,-25,-21,18,-24,27,14,-22,-24,-17,-20,-16,-4,13,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-29,-5,-12,-24,36,-11,-33,-3,-28,-17,6,-19,-11,-5,-2,-15,-27,-19,-17,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-33,-24,0,-34,-26,33,-27,21,15,-22,-15,-19,-25,-19,-6,20,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-19,-29,-23,4,-31,-25,24,-20,16,11,-22,-24,-21,-18,-14,-1,24,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,11,-15,6,-2,-18,-11,-11,-18,-4,-21,-16,12,-11,-4,-6,20,26,-11,-34,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-25,-6,-8,-15,-14,-13,-9,-12,-16,-11,-9,11,-10,-16,1,0,-8,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-22,-1,14,-20,-15,-6,-18,6,-16,-9,-2,-10,8,0,5,-2,-15,-25,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00936;
//
ID   AMMONIUM_TRANSP_MP; MATRIX.
AC   MP01219;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ammonium transporters signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6742592; R2=0.0161579; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=403; N_SCORE=12.176; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-11,-24,-13,-10,-4,-11,25,-16,-14,-10,-5,-5,-14,-7,-11,-5,-9,-15,-17,10,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-24,-30,-26,-19,1,-10,-18,-8,-15,-8,-4,-22,-20,-12,-15,-19,-15,-13,59,10,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-17,-22,-16,-3,-25,-21,15,-15,1,2,-17,-21,-17,-16,-4,0,21,-24,-5,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-28,-39,-27,-19,2,-19,-20,-18,-9,-18,-15,-27,-15,-13,-8,-27,-19,-24,87,18,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,6,-18,5,-5,-19,17,-8,-21,-9,-18,-14,9,-13,-8,-11,5,-4,-17,-23,-17,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=1,-6,-19,-6,-5,-17,-2,-8,-11,-6,-14,-8,-3,2,-4,-10,0,-4,-10,-20,-13,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-27,-1,-3,-27,33,-14,-32,-12,-26,-19,4,-10,-10,-14,4,-7,-26,-26,-25,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-29,-7,-17,-24,49,-16,-35,-17,-28,-19,2,-20,-16,-17,0,-16,-28,-12,-20,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-31,-32,-33,-26,18,-14,-24,-7,-22,-1,-6,-27,-29,-24,-17,-26,-18,-9,52,13,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-20,-29,-20,9,-25,-19,16,-25,28,14,-20,-25,-19,-20,-19,-8,8,-18,-1,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-12,-23,-15,-11,7,-19,-6,-5,-8,-5,-4,-9,-21,-10,-7,-8,-6,-6,-7,15,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-25,-1,0,-26,-4,-6,-18,5,-20,-6,4,-15,9,0,0,-6,-16,-26,-14,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-24,-21,-16,-2,-22,-14,2,-17,9,5,-19,-23,-13,-14,-14,-4,-1,4,1,-14;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-30,-6,-11,-29,48,-12,-37,-12,-29,-19,2,-13,-13,-14,-1,-17,-29,-22,-26,-13;
MA   /M: SY='V'; M=8,-22,-15,-27,-22,11,-19,-21,5,-18,-1,-2,-19,-23,-22,-19,-5,-3,14,-7,2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-17,-25,-19,-16,-4,-28,6,11,-19,13,11,-14,-23,-11,-13,-18,-11,6,-22,5,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-25,-34,-26,57,-27,-12,-3,-24,3,-3,-20,-29,-30,-17,-19,-10,-6,25,38,-25;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-7,-8,-13,-25,32,-17,-31,-17,-29,-20,2,-18,-13,-17,15,-3,-20,-31,-26,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-20,-12,-14,-13,12,-15,-16,-16,-11,-10,-3,-18,-13,-15,5,7,-11,-22,-11,-14;
MA   /M: SY='V'; M=9,-18,-8,-22,-20,-8,-20,-22,10,-17,2,1,-16,-20,-21,-18,-5,-2,21,-28,-14,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-19,1,-30,2,6,-21,-20,90,-30,-8,-20,-2,9,-18,11,0,-9,-19,-30,-30,16,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-23,-29,-21,0,-24,-19,23,-25,23,20,-20,-23,-15,-21,-17,-8,13,-22,-4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-9,-6,-15,-17,-4,-19,-17,4,-17,-1,-2,-4,-25,-18,-15,-1,4,11,-31,-11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=12,-7,-20,-8,-12,-25,35,-17,-28,-15,-27,-18,2,-15,-12,-17,15,-3,-18,-27,-25,-12;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-21,-31,-25,5,-28,-20,21,-22,8,9,-21,-24,-21,-21,-13,-6,22,-11,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-14,-20,-13,-15,-6,-20,0,-15,-5,-5,-10,-14,-12,-20,7,0,4,-24,-16,-13;
MA   /M: SY='G'; M=13,-9,-24,-12,-16,-27,48,-19,-31,-17,-25,-18,-2,-17,-16,-19,5,-12,-21,-21,-27,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,32,-30,-20,14,-30,37,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='V'; M=8,-23,-13,-27,-23,-5,-16,-22,9,-18,3,5,-22,-23,-19,-20,-10,-6,16,-10,-6,-21;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-20,-19,-16,-8,5,-13,-10,-16,-2,-5,-13,-20,-14,-18,-5,-6,-7,-11,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-12,-18,-11,-16,-8,-20,-4,-12,-10,-8,-7,-12,-10,-18,12,8,4,-25,-17,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-28,-26,-30,-24,12,-29,-14,16,-22,17,8,-25,-27,-18,-20,-23,-11,7,11,22,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-20,-33,-27,14,-30,-24,21,-23,12,8,-26,-27,-26,-21,-17,-7,23,-5,6,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-22,-21,-23,-10,1,-28,-17,16,-21,28,16,-23,-23,-13,-17,-20,-7,10,-23,-4,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,61,-19,-39,-13,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-36,-7,3,-29,-20,-15,-24,11,-29,-16,-12,49,-2,5,-10,-10,-26,-26,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-22,-16,-10,-14,-25,-8,0,-1,-8,-1,-6,-13,-4,4,-11,-9,-2,-23,-6,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,13,-28,16,3,-31,25,-9,-35,-5,-29,-22,11,-14,-6,-10,2,-12,-28,-29,-24,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-24,-8,-2,-14,-13,-2,-22,16,-18,-9,0,-11,2,27,-7,-9,-17,-11,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-16,-19,-19,-18,30,-15,-12,-4,-19,4,-2,-14,-18,-23,-15,-14,-9,-4,-2,13,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: M=-3,-2,-20,-2,-1,-15,-15,-11,-8,-4,-7,-7,-4,-2,-6,-4,-4,-1,-6,-23,-12,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-25,5,8,-22,-16,-5,-16,4,-15,-8,2,-12,3,1,-1,0,-14,-27,-12,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-21,3,-3,-17,-2,-8,-21,2,-19,-14,11,-15,-4,2,3,-1,-16,-25,-14,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-15,-18,-18,-17,13,5,-14,-9,-16,-2,-4,-10,-19,-19,-13,-8,-9,-6,-7,1,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-28,-9,0,-20,-14,-6,-19,13,-16,-5,-2,-9,3,26,-6,-8,-16,-24,-13,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-33,-6,-2,-26,-18,-18,-14,-11,-24,-16,-12,55,-10,-18,-4,-5,-20,-31,-25,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-25,-2,-5,-18,-17,34,-15,-6,-14,-3,5,-20,1,-1,-6,-11,-12,-30,0,-4;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-21,4,2,-19,-9,2,-18,1,-20,-13,22,-10,1,-3,4,-1,-20,-29,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-19,-28,-22,0,-25,-22,21,-20,20,16,-23,-25,-19,-18,-15,-5,21,-24,-6,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-18,-7,-3,-11,-6,-8,-7,-7,-9,-6,-9,24,-4,-9,-6,-6,-12,-12,-9,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-7,-22,-5,-3,-17,-2,-12,-16,-6,-10,-9,-5,-18,-6,2,0,-5,-10,-27,-16,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00937;
//
ID   PBP_MP; MATRIX.
AC   MP01220;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphatidylethanolamine-binding protein family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0146279; R2=0.0138996; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=609; N_SCORE=13.469; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='N'; M=3,4,-19,-2,1,-21,-9,-5,-18,8,-23,-9,10,-13,5,2,10,2,-15,-27,-12,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-26,-7,4,-25,-20,-12,-16,9,-19,-9,-8,8,7,1,-2,1,-13,-25,-15,5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-10,-1,-28,-16,-20,-20,-10,-29,-19,-17,76,-10,-19,-6,-5,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-26,-13,-3,-11,-22,-9,-13,9,-13,-5,-4,-16,4,22,-4,-3,-10,-20,-6,-1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-16,-17,-20,-6,-24,-22,17,-17,6,4,-15,-24,-21,-18,-8,-3,25,-29,-11,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-24,9,14,-23,-16,-7,-18,8,-20,-13,8,-10,4,1,3,-1,-15,-30,-15,9;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-26,-30,-30,-22,5,-22,-24,1,-15,-7,-5,-22,-23,-18,-17,-17,-12,-2,37,8,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-13,6,-28,8,3,-14,-7,16,-25,-7,-20,-13,6,-12,1,-7,-3,-11,-25,-22,1,1;
MA   /M: SY='G'; M=12,-12,-20,-15,-16,-19,24,-20,-18,-17,-14,-11,-7,-18,-16,-19,3,-5,-9,-23,-21,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-19,-2,4,-17,0,-5,-15,-7,-11,-9,-4,0,-1,-10,0,-6,-14,-21,-14,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,20,-26,29,18,-31,-14,-3,-25,-1,-19,-16,5,-10,10,-7,0,-7,-20,-32,-17,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-28,2,-1,-17,-17,-12,-12,-10,-10,-7,-11,29,-8,-15,-11,-9,-17,-25,-16,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,7,-30,11,9,-29,5,-6,-32,4,-26,-19,6,-5,0,9,-3,-12,-28,-28,-21,3;
MA   /M: SY='D'; M=3,18,-20,23,9,-28,-6,-7,-27,1,-26,-21,11,-10,0,-7,12,1,-18,-34,-19,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-8,-28,-19,21,-27,-19,-1,-17,14,3,-19,-27,-21,-9,-18,-7,-1,-14,4,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-28,-23,46,-30,3,2,-19,8,2,-21,-30,-21,-14,-21,-10,-5,19,56,-23;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-12,-15,-13,-8,-21,-21,-2,-13,-3,-5,-6,-13,-13,-13,12,35,7,-28,-10,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-20,21,-28,45,20,-30,-30,-20,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-18,-34,-28,9,-33,-27,31,-25,20,14,-26,-27,-26,-23,-17,-5,33,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-29,-19,0,-21,-2,18,-10,21,54,-20,-21,-2,-10,-21,-10,9,-20,0,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-16,-14,-22,-20,-5,-27,-24,14,-17,3,4,-14,-19,-18,-17,2,21,22,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-16,61,15,-38,-12,-3,-39,-3,-29,-29,16,-13,-3,-12,-1,-10,-28,-41,-21,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-17,-13,-24,-17,-4,-11,-19,0,-14,-3,-4,-16,-18,-17,-19,1,-2,10,-15,-5,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,2,-14,0,-3,-22,11,-10,-23,-11,-30,-20,13,-12,-3,-11,31,12,-15,-37,-22,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-31,-10,0,-24,-19,-8,-26,17,-23,-13,-7,14,3,33,-9,-9,-21,-23,-17,-3;
MA   /M: SY='S'; M=6,-3,-16,-5,2,-18,-12,-13,-16,0,-16,-12,-1,-11,-1,-4,14,12,-9,-30,-15,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-27,33,19,-29,-10,3,-30,7,-27,-22,27,-12,5,4,2,-7,-29,-35,-19,12;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-16,-37,-8,-1,-28,-13,2,-23,-11,-28,-16,-13,62,-7,-16,-9,-13,-30,-29,-21,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-4,-25,-5,-4,-10,-21,2,-11,8,-12,0,-4,-19,1,5,-9,-7,-8,-16,6,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-22,-30,-24,-16,6,-16,-7,-4,-15,3,6,-20,-25,-4,-12,-20,-15,-12,23,19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-26,-6,0,-23,-10,-5,-29,23,-24,-13,2,-16,6,42,0,-5,-19,-24,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-28,12,43,-21,-19,0,-25,5,-18,-16,-1,-5,16,-2,2,-7,-26,-25,-11,30;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-35,-27,-21,12,-24,3,-12,-14,-11,-8,-23,-28,-14,-8,-25,-19,-16,59,31,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-21,2,-24,-18,-5,-28,-1,0,-20,14,6,-17,-28,-14,-10,-19,-11,0,-28,-4,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-36,-42,-37,-28,19,-23,-24,-12,-21,-9,-12,-35,-30,-21,-19,-35,-24,-21,109,31,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-32,-25,27,-27,28,16,-28,-27,-21,-23,-24,-10,20,-9,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-14,-26,-21,-3,-30,-27,27,-18,8,8,-26,-26,-24,-19,-10,-2,40,-29,-10,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,0,-19,-18,-9,-23,-23,4,-17,-5,-4,-11,-19,-17,-17,8,20,14,-32,-12,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-14,40,-26,42,8,-31,1,2,-32,-2,-30,-25,35,-15,-2,-7,4,-7,-30,-38,-21,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-37,-28,1,-36,-26,42,-27,22,23,-22,-22,-19,-26,-20,-9,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-34,-6,3,-29,-19,-16,-23,10,-29,-16,-11,47,-3,-2,-7,-6,-24,-27,-22,-3;
MA   /M: SY='G'; M=2,-13,-24,-14,-19,-21,40,-21,-24,-19,-16,-12,-6,-20,-19,-19,-1,-10,-15,-22,-23,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-19,-5,-2,-16,-9,-11,-13,-5,-7,-8,4,-15,-4,-7,2,6,-11,-27,-14,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-11,23,-22,22,7,-19,-13,-2,-22,-3,-21,-18,19,-13,-2,-7,6,10,-20,-30,-8,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-5,-27,-4,-7,-14,-12,-15,3,-16,1,1,-6,-18,-11,-18,-11,-11,-1,-26,-11,-11;
MA   /M: SY='A'; M=10,-10,-13,-15,-9,-18,-13,-16,-7,-6,-14,-4,-7,-1,-7,-12,4,0,-4,-28,-17,-9;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-18,-3,0,-23,3,-13,-24,2,-26,-16,4,-11,-2,-3,17,10,-14,-30,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-14,-28,-16,-20,-1,33,-8,-29,-19,-19,-13,-4,-22,-21,-14,-6,-17,-22,-14,-10,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00938;
//
ID   PMP22_1_MP; MATRIX.
AC   MP01221;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PMP-22 / EMP / MP20 family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=55;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.1983219; R2=0.0082100; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1418; N_SCORE=11.838; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=768; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-39; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-67,-77,-72,-50,-76,-72,-31,-72,60,-39,-72,-78,-68,-73,38,-52,62,-79,-58;
MA   /M: SY='L'; M=-68,25,-85,-78,42,-85,-69,-1,-78,81,-32,-82,-84,-74,-76,-76,-63,-41,-66,-47;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-70,-81,-71,-44,-83,-64,-35,-69,81,64,-78,-81,6,-7,-74,-63,-42,-72,-53;
MA   /M: SY='A'; M=57,-66,-72,-68,-58,23,-68,-51,-69,55,-46,-65,-73,-63,-71,14,-56,-50,-74,-63;
MA   /M: SY='G'; M=-14,-71,-70,-74,39,74,-71,-56,-70,-22,-60,-58,-72,-69,-74,14,-59,33,-70,-59;
MA   /M: SY='I'; M=-16,-74,-80,-79,-54,32,-80,80,-75,4,-42,-70,-74,-73,-79,-65,-59,37,-76,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-71,-79,-76,61,-77,-71,61,-74,41,-41,-70,-77,-70,-74,37,-56,-37,-64,-45;
MA   /M: SY='V'; M=38,-66,-80,-74,60,-73,-75,-33,-73,3,-46,-74,-78,-74,-74,-61,-55,71,-68,-48;
MA   /M: SY='C'; M=-62,69,-83,-78,41,-20,-73,-36,-77,60,-40,-77,-83,-76,-77,-71,-60,43,-71,-51;
MA   /M: SY='H'; M=18,-77,-55,-55,-70,-15,138,-82,-59,-69,-56,-45,-69,-49,-55,-8,-63,-78,-96,-42;
MA   /M: SY='W'; M=-63,-77,-86,-81,-49,-84,-85,90,-76,-11,-41,-77,-75,-73,-79,-14,-59,29,93,-52;
MA   /M: SY='A'; M=66,-64,-73,-67,-59,-64,-72,-42,-68,32,-47,-68,-72,-65,-71,-52,19,43,-78,-64;
MA   /M: SY='T'; M=-13,-68,-68,-70,-63,33,-73,39,-67,-54,-53,-58,-68,-66,-72,29,54,43,-81,-65;
MA   /M: SY='L'; M=30,25,-72,-69,-53,-71,-69,-42,-69,59,-42,1,-74,-67,-71,-56,45,11,-78,-61;
MA   /M: SY='I'; M=19,-70,-82,-77,-54,-79,-81,72,-74,-38,23,-75,-75,-73,-77,-65,-54,68,-79,-60;
MA   /M: SY='M'; M=-66,-69,-84,-76,5,-83,-64,-33,-75,79,84,-80,-81,-68,-72,-76,-63,-41,-70,-50;
MA   /M: SY='L'; M=-66,25,-84,-77,-42,-85,-68,-33,-77,88,26,-82,-84,-70,-75,-76,-63,-40,-72,-54;
MA   /M: SY='F'; M=-70,-70,-87,-82,109,-83,-71,-40,-78,5,-47,-78,-84,-85,-76,-73,-63,35,-48,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-83,-78,-53,-85,-85,35,-75,-11,-41,-78,-78,-77,-77,-68,-52,95,-85,-61;
MA   /M: SY='S'; M=71,-62,-61,-58,-75,-49,-64,-69,-60,-72,-66,-52,-65,-53,-64,80,-43,-58,-79,-69;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-61,-58,-61,-66,-69,-68,-57,-58,-22,-58,-48,-60,-62,-66,-37,113,-50,-87,-65;
MA   /M: SY='I'; M=30,-72,-80,-76,-52,-76,-78,83,-74,27,-39,-73,-74,-70,-77,-11,-56,-1,-74,-59;
MA   /M: SY='D'; M=39,-68,71,-51,-71,-65,-66,-52,-61,-62,-61,-51,-67,-62,-67,-48,54,42,-89,-67;
MA   /M: SY='N'; M=-57,-70,50,-48,-78,-55,-50,-78,40,-81,-71,88,-68,-48,-50,48,-47,-75,-89,-69;
MA   /M: SY='Q'; M=20,-71,-63,-55,-1,-65,65,-53,-57,-59,-55,-56,-70,69,-58,39,-53,42,-75,11;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-78,-88,-77,4,-79,-75,29,-72,26,83,-79,-76,-69,-73,-73,-7,-9,129,-41;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-68,-8,-62,-78,-71,-33,-60,-49,-49,-64,-71,48,-5,-56,45,81,-85,-63;
MA   /M: SY='G'; M=20,-72,-67,-67,-57,61,-61,-63,-66,22,-56,-58,-71,7,-68,28,-58,-62,-64,51;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-76,58,-4,-82,-58,-53,-78,-53,-82,-72,77,65,9,-61,28,-51,-77,-89,-73;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-74,-1,41,-74,74,-63,-80,-59,-78,-71,-50,-64,-56,-67,15,33,-74,-74,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-87,-96,35,-71,37,-88,-79,-93,38,-90,-89,25,-93,-76,-70,-15,-78,-93,-93,-74; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=57,-71,-56,41,39,-14,86,-71,-59,-65,-60,-56,-67,-53,-61,-7,-58,-64,-74,-51;
MA   /M: SY='H'; M=20,-68,-59,-58,23,-58,86,-71,-57,-68,-62,-49,-67,-52,-4,76,-1,-66,-79,-52;
MA   /M: SY='T'; M=20,-67,-67,-61,-61,-68,-67,-5,-61,24,-48,-60,-69,48,-64,14,54,35,-79,-62;
MA   /M: SY='D'; M=-57,-76,77,-51,-83,70,-58,-86,-59,-85,-77,55,-69,-59,-68,-50,-59,-83,-86,-74;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-69,-85,-77,-41,-86,-70,1,-78,88,-29,-83,-83,-71,-75,-77,-62,-5,-72,-54;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-82,-60,-46,-61,-72,-49,-74,50,-70,-60,-55,2,77,63,-57,-62,-73,-61,63;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-72,50,-6,-61,-61,-49,-11,-54,-68,-63,92,-72,-54,-61,-51,-3,7,-76,51;
MA   /M: SY='C'; M=-60,152,-80,-81,-72,-18,-80,-79,-77,-70,-69,-66,-91,-84,-83,-63,-61,-67,-100,-82;
MA   /M: SY='T'; M=-53,-64,-59,-62,-63,-67,21,-54,-60,12,-54,5,-64,-60,-65,30,93,-11,-85,-62;
MA   /M: SY='W'; M=-56,-72,-57,-65,-66,42,21,-74,-60,-75,-68,63,-68,-59,-66,15,54,-72,105,-57;
MA   /M: SY='N'; M=-54,-69,1,-60,-73,34,-56,10,-57,-73,-66,83,-68,-55,-64,48,20,-64,-85,-69;
MA   /M: SY='S'; M=7,-67,-1,-56,-71,-59,-61,11,29,-67,-62,28,-64,-53,-56,62,55,-56,-82,-66;
MA   /M: SY='C'; M=-59,115,21,-65,-68,-16,-66,-13,-66,-3,-62,43,-77,-67,-72,13,19,-61,-91,-72;
MA   /M: SY='C'; M=-14,69,22,-62,23,34,-61,-72,-62,-70,-67,28,-71,-61,-68,48,20,-67,-75,9;
MA   /M: SY='T'; M=6,-70,22,-56,-69,33,-62,-62,29,11,-58,28,-68,8,-57,-7,34,-15,-80,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-53,-70,-59,16,-65,-16,-62,-7,-56,-59,-56,-55,-67,60,-60,39,45,42,-77,9;
MA   /M: SY='W'; M=-65,-77,-73,-65,-52,-77,64,28,-65,39,-46,-66,2,32,-67,-63,33,-51,105,-48;
MA   /M: SY='H'; M=30,52,-51,31,-74,-59,86,-77,-56,-73,-64,43,-67,-50,-59,48,-51,-69,-88,-61;
MA   /M: SY='C'; M=-60,110,21,-9,-52,-71,-58,-65,-64,-23,-60,-60,-78,6,-68,27,-57,-15,-66,72;
MA   /M: SY='S'; M=7,-69,-66,-67,25,23,-63,27,-65,-21,-56,-56,-69,-61,-69,61,20,-52,-66,36;
MA   /M: SY='N'; M=20,-66,-52,-58,-3,-55,22,-66,-55,-70,-64,71,-68,9,-60,62,21,-15,-82,-62;
MA   /M: SY='Y'; M=-54,-72,-1,42,-58,-16,-57,-55,-56,-22,-58,-56,-68,33,-61,47,-3,33,-69,51;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00939;
//
ID   PMP22_2_MP; MATRIX.
AC   MP01222;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PMP-22 / EMP / MP20 family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1749992; R2=0.0128291; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=247; N_SCORE=8.334; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-30,-4,3,-22,-18,-8,-21,5,-23,-13,-7,3,4,-2,-4,-5,-19,-5,-9,3;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-8,9,-12,-15,-18,-5,-4,-19,-18,-13,-10,-6,-22,-14,-18,-2,-2,-11,-31,-14,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-8,18,-13,-14,-7,-13,-11,-19,-16,-20,-16,-2,-17,-14,-16,4,-1,-14,-27,-6,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-8,-23,-6,-1,-6,-21,-7,-4,-13,9,1,-11,-20,1,-11,-9,-6,-8,-21,-1,0;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-19,4,13,-26,-8,-2,-21,-1,-25,-15,11,-10,15,-4,19,5,-19,-33,-18,14;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-13,-14,-18,-17,8,-22,-14,-1,-14,-5,-5,-10,-20,-16,-13,6,19,7,-17,8,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,5,-23,8,17,-30,-4,-3,-25,0,-24,-15,4,-9,18,-4,12,-2,-23,-29,-18,18;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-2,-19,1,3,-20,-8,-8,-13,-8,-18,-13,0,-11,-5,-11,9,0,-5,-33,-17,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-1,-23,-7,-5,-5,-17,-7,-2,-11,-9,-6,4,-17,-8,-14,-2,-4,-6,-19,0,-8;
MA   /M: SY='G'; M=8,4,-22,7,4,-28,16,-12,-28,-8,-24,-19,3,-11,-5,-14,10,-5,-20,-28,-23,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-5,-22,-29,-25,-21,10,-21,-8,-6,-13,-7,-7,-22,-25,-14,-15,-15,-6,-8,44,33,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-31,-28,-34,-25,6,-29,-24,18,-26,24,14,-29,-27,-19,-21,-28,-14,8,16,6,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,9,-28,4,10,-30,-16,19,-24,16,-25,-7,15,-14,25,12,-2,-9,-27,-26,-7,16;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-10,-18,-12,-16,-6,-20,-5,-12,-10,-8,-10,-13,-12,-18,12,6,7,-25,-18,-12;
MA   /M: SY='V'; M=0,-19,-10,-22,-22,-4,-26,-26,15,-16,2,2,-19,-22,-22,-16,1,19,31,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,16,-36,-20,8,-22,14,-20,-2,0,-12,49,23,-2,-10,-28,-20,-10,31;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-10,-18,-10,-19,-2,-19,-9,-11,-12,-10,-8,-11,-10,-18,13,3,2,-24,-19,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-20,-17,-29,-22,41,-27,-20,-1,-23,8,-1,-15,-23,-27,-17,-8,10,1,-7,13,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,2,-30,-22,-3,-22,-5,12,-13,14,47,-20,-23,-5,-13,-18,-10,7,-25,-5,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-3,-2,-20,0,-12,-18,-10,-27,-18,7,-10,-2,-12,35,17,-8,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=5,-19,-16,-25,-20,-5,-24,-24,16,-20,8,5,-16,-20,-18,-20,-3,7,19,-26,-9,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,39,-30,31,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,6,-35,-27,25,-28,-24,-3,-28,11,-1,-26,-32,-28,-22,-24,-13,-4,10,7,-25;
MA   /M: SY='C'; M=11,-10,26,-15,-15,-22,2,-20,-24,-18,-23,-18,-5,-21,-15,-20,12,0,-11,-36,-25,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-23,26,-29,-26,-6,-30,-27,7,-25,6,1,-21,-29,-24,-24,-11,0,14,-33,-13,-26;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-18,-27,-21,3,-27,-21,28,-22,22,14,-20,-20,-17,-19,-17,-6,21,-17,-2,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-8,-4,-2,-16,0,-10,-13,-8,-19,-13,3,-8,-2,-10,25,11,-6,-27,-16,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-23,-16,-28,-20,41,-23,-16,6,-23,20,6,-19,-23,-25,-16,-19,-8,3,-1,14,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-23,-36,-26,19,-34,-24,28,-29,28,16,-24,-26,-24,-24,-23,-9,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,27,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26,51,-28,-16,8,-26,19,16,-22,-28,-28,-18,-22,-10,4,-1,19,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-20,-18,-22,-20,3,-2,-18,0,-20,2,5,-14,-23,-19,-17,-5,-5,5,-21,-7,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-27,21,-34,-28,14,-32,-26,7,-29,10,2,-23,-31,-28,-25,-18,-9,9,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-11,-27,-13,3,-24,-25,-2,1,-3,-3,10,-9,-15,31,-2,-8,-9,-9,-21,-7,16;
MA   /M: SY='L'; M=3,-24,-21,-25,-15,-3,-22,-20,7,-22,24,7,-24,-7,-16,-20,-18,-8,1,-22,-9,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-20,-34,-26,58,-25,-15,-2,-24,6,-2,-18,-27,-31,-19,-15,-8,-1,8,28,-26;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,-15,-15,-10,-11,-17,-16,-9,-6,-2,-5,-7,-15,-8,1,4,18,-2,-24,-11,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-21,-19,-10,-7,-20,1,4,-14,13,21,-13,-20,2,-10,-10,-6,-2,-24,-3,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-1,-24,-3,13,-26,-17,-6,-22,14,-19,-9,-2,-10,16,12,1,0,-18,-23,-13,14;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-21,-3,5,-21,-17,-5,-19,19,-18,-7,0,-10,14,18,0,5,-14,-19,-8,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-13,-23,-15,-19,-1,37,-17,-25,-19,-17,-12,-4,-19,-21,-17,-4,-15,-19,-10,-12,-19; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-19,3,5,-20,13,-7,-23,-6,-21,-15,10,-11,-3,-8,8,1,-19,-25,-18,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-13,-29,-13,-6,-18,-7,-6,-25,14,-13,-8,-4,-21,1,44,-11,-12,-18,-20,-12,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-34,-24,48,-29,-18,2,-20,12,3,-18,-28,-28,-6,-20,-10,1,-1,17,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00939;
//
ID   PROA_MP; MATRIX.
AC   MP01223;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Gamma-glutamyl phosphate reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6295686; R2=0.0159248; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=714; N_SCORE=16.990; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=55; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-27,54,19,-36,-10,-2,-35,-1,-28,-27,16,-9,2,-9,5,-4,-26,-38,-19,10;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-36,-28,38,-26,-17,-6,-23,-1,-6,-29,-30,-25,-18,-29,-18,-13,68,36,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-2,9,-24,12,2,-26,4,-2,-27,-4,-22,-17,7,-13,-1,-4,3,-6,-21,-28,-16,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-17,-2,0,-16,-17,-3,-17,-2,-14,-11,4,-12,-3,-3,10,22,-10,-29,-10,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-31,-29,-25,40,-28,0,-4,-17,-1,-4,-24,-30,-20,-15,-24,-14,-11,45,57,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-18,-24,-18,3,-19,-18,10,-26,33,11,-20,-27,-18,-18,-20,-8,3,-23,-5,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-3,25,-21,34,9,-30,-5,-6,-30,-4,-27,-24,12,-10,-1,-10,14,2,-20,-37,-20,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-24,-23,-16,11,-26,-8,5,-16,17,7,-21,-18,-14,-14,-20,-9,-2,-6,18,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-4,-23,-5,-7,-16,-24,-18,6,-11,-4,-2,-7,-15,-9,-15,-6,-3,5,-27,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-11,-32,-23,4,-31,-22,23,-28,32,19,-26,-27,-19,-22,-24,-9,15,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=22,-1,-9,-8,-7,-20,3,-14,-17,-10,-20,-15,5,-13,-7,-14,18,8,-9,-30,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-14,-31,-27,-2,-29,-28,29,-22,12,11,-25,-26,-25,-23,-12,-3,37,-26,-8,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-4,-27,-3,8,-25,-18,-9,-24,30,-22,-10,-3,-12,6,27,-7,-8,-15,-22,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-15,-29,-26,2,-30,-27,25,-21,12,10,-23,-25,-24,-20,-9,5,33,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='V'; M=1,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,29,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,49,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-5,18,-26,25,13,-31,-9,-6,-29,1,-26,-21,9,1,1,-6,5,-4,-23,-33,-20,7;
MA   /M: SY='D'; M=-5,19,-22,22,2,-28,11,-6,-30,-8,-29,-23,18,-14,-5,-11,14,0,-23,-35,-22,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-16,-31,-24,9,-31,-23,24,-25,22,14,-24,-27,-23,-21,-18,-6,22,-21,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-28,27,22,-29,-12,2,-29,5,-23,-19,8,-10,10,-2,0,-9,-26,-28,-12,15;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-23,7,23,-28,-2,-7,-26,0,-20,-17,1,-8,7,-6,4,-5,-22,-27,-20,15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-34,-26,1,-33,-25,34,-25,22,19,-23,-23,-19,-24,-19,-7,25,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=0,15,-25,21,20,-30,-5,-6,-28,0,-22,-20,6,-9,4,-7,4,-6,-23,-29,-20,12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-4,-31,-5,-3,-13,-21,85,-28,-12,-18,-1,5,-21,6,-2,-12,-20,-28,-17,22,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-39,-28,48,-29,20,23,-20,-20,-19,-29,-20,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,8,-24,2,6,-23,-11,7,-23,8,-21,-12,15,-15,11,16,1,-6,-22,-27,-12,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-2,-24,-2,11,-23,-20,-1,-20,10,-16,-8,-1,-11,12,11,0,2,-16,-25,-10,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-15,-29,-17,-15,18,-25,35,-12,-12,-7,-2,-10,-26,-8,-7,-17,-13,-16,12,45,-14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-1,-22,-4,-12,-25,37,-14,-30,-14,-29,-19,9,-16,-12,-14,14,-2,-22,-28,-25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-10,-5,-4,-17,-4,-14,-17,-10,-23,-16,5,-10,-4,-11,31,26,-7,-35,-17,-4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-2,1,-24,1,1,-24,-3,8,-24,2,-21,-11,5,-14,5,3,3,-6,-20,-26,-10,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,2,-18,-14,-17,-3,-21,-10,-14,-13,-10,-10,-17,-14,-19,9,3,3,-28,-20,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-29,-39,-30,0,-39,-30,49,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,31,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-28,-17,-33,-26,0,-31,-26,31,-24,20,16,-25,-25,-22,-23,-16,-6,29,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=7,-1,-10,-11,-9,-12,-16,-19,-11,-10,-11,-11,-1,-10,-9,-11,20,42,-1,-29,-12,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-24,12,31,-28,-14,-1,-27,7,-22,-16,7,-8,16,5,3,-5,-26,-30,-18,23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,38,-24,41,10,-30,-6,4,-30,-1,-30,-24,33,-14,0,-5,8,-2,-27,-40,-19,5;
MA   /M: M=-5,-12,-27,-12,-3,-11,-22,-5,-3,-9,-2,-1,-12,-4,-2,-10,-10,-9,-8,-18,-1,-5;
MA   /M: SY='E'; M=5,2,-20,1,9,-23,-12,-2,-19,2,-20,-12,3,-9,6,-3,8,1,-14,-28,-14,7;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-17,-8,-8,-15,-13,-9,-8,-5,-11,-8,5,-17,-6,-2,5,7,-3,-28,-13,-8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-12,-20,-11,-18,-4,-20,-6,-11,-9,-8,-10,-12,-11,-18,9,2,3,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,11,24,-28,-16,-1,-26,11,-21,-14,4,-9,15,10,0,-7,-23,-27,-16,19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-11,-26,-12,-2,-12,-23,-5,-14,12,-9,-4,-7,-18,5,25,-10,-5,-11,-17,-1,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-19,-24,-15,-1,-27,-16,14,-18,15,12,-19,-22,-9,-15,-12,-1,12,-22,-4,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-4,10,-23,5,3,-25,-10,-2,-22,7,-22,-13,14,-14,9,12,4,0,-20,-28,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-24,1,16,-22,-14,-1,-18,0,-12,-8,-3,-11,12,0,1,-4,-17,-26,-12,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,14,13,-27,-27,-27,-23,-14,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00940;
//
ID   ARGC_MP; MATRIX.
AC   MP01224;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8401318; R2=0.0141365; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=540; N_SCORE=12.464; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-19,4,22,-19,-20,-11,-19,-1,-15,-15,0,-5,4,-5,11,22,-14,-30,-15,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-28,-7,-10,-29,54,-17,-37,-16,-28,-19,0,-17,-14,-17,1,-17,-28,-22,-28,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-20,-29,-20,6,-28,-18,20,-26,39,21,-25,-27,-17,-19,-25,-9,11,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='P'; M=3,-10,-26,-7,-4,-23,-14,-16,-16,-10,-22,-16,-10,38,-9,-17,1,-1,-17,-28,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-29,17,53,-29,-19,-2,-29,10,-20,-19,0,1,17,1,0,-8,-28,-29,-19,35;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-27,-28,-29,-20,4,-24,-21,8,-22,16,6,-26,-26,-17,-17,-25,-14,1,17,5,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-10,4,-24,-3,-3,-9,-14,20,-17,-4,-16,-6,12,-19,6,-2,-3,-6,-21,-19,6,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-28,-7,0,-20,-13,-4,-26,15,-20,-12,-2,-11,5,35,-5,-8,-19,-19,-11,0;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,16,31,-25,-16,0,-24,5,-19,-16,3,-6,10,-2,-1,-8,-23,-28,-15,20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-22,5,15,-25,-12,-7,-22,10,-19,-13,1,-9,8,4,1,-4,-17,-24,-15,11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-25,-32,-24,2,-34,-24,34,-25,22,16,-20,-22,-18,-23,-19,-7,22,-20,1,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=3,-5,-21,-8,1,-24,-14,-9,-22,21,-21,-10,-2,-11,4,19,-2,-6,-14,-22,-13,1;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-25,2,3,-27,7,-7,-27,5,-25,-14,9,-13,6,2,4,-4,-23,-26,-18,5;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-11,-14,-6,-20,-3,-17,-13,-8,-14,-12,-4,-10,-5,-15,15,7,-4,-24,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-27,5,7,-25,-17,-3,-26,20,-23,-13,6,-12,10,25,-3,-4,-20,-25,-12,7;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-26,-17,12,-27,-12,5,-14,18,8,-19,-26,-15,-2,-21,-10,2,-11,5,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,16,15,-24,-24,-24,-25,-15,-5,38,-24,-5,-30;
MA   /M: SY='A'; M=39,-8,-11,-15,-9,-21,5,-18,-14,-11,-15,-13,-5,-11,-9,-18,15,3,-4,-24,-21,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-8,3,-10,-16,-6,-4,-10,-8,-20,-13,29,-23,-10,-8,5,-1,-10,-37,-19,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,80,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-16,-27,-20,-20,35,-27,11,-2,-13,-1,-2,-11,-29,-15,-11,-17,-9,-10,18,59,-20;
MA   /M: SY='P'; M=11,-15,-27,-13,-4,-25,-13,-20,-15,-10,-22,-16,-15,46,-10,-19,0,-3,-16,-27,-25,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-9,-7,-16,-12,-21,12,-19,-18,-14,-17,-14,-6,-14,-12,-19,11,-1,-7,-25,-22,-12;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-12,-19,-14,-10,-14,-20,1,-14,-6,-4,-9,-15,-13,-17,10,12,10,-27,-13,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-17,-25,-21,-9,-10,-28,-14,14,-16,13,10,-14,-19,3,-14,-13,-5,3,-22,-5,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-19,-28,-20,5,-25,-20,16,-27,39,16,-27,-27,-19,-20,-24,-8,10,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-15,-17,-12,-21,10,-20,-16,-14,-13,-12,-9,-4,-13,-20,4,-4,-10,-23,-22,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-32,-22,7,-30,-22,24,-28,36,17,-26,-26,-20,-22,-24,-9,15,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=4,-14,-21,-18,-11,-3,-18,-8,-5,-4,-2,-1,-11,-19,-7,-4,-6,-4,-3,-14,3,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-29,-20,-20,-19,-11,-28,-19,-20,86,-10,-20,-11,-10,-29,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-30,-20,11,-25,-20,16,-28,38,15,-26,-27,-20,-20,-24,-9,9,-18,0,-20;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-24,-20,-27,-20,0,-25,-21,16,-17,16,10,-20,-24,-18,-13,-15,-4,16,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='K'; M=3,-1,-24,-2,6,-24,-12,-9,-20,12,-19,-11,-2,-9,6,5,0,-5,-15,-23,-13,6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=6,0,-21,-2,7,-20,-9,-1,-17,-4,-13,-10,1,-13,6,-6,3,-4,-16,-24,-11,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-23,-3,-6,-21,14,-8,-22,-3,-17,-10,3,-16,-5,-3,-4,-11,-18,-21,-16,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-20,-21,-17,-3,-13,-18,10,-18,14,8,-16,-20,-15,-16,-14,-8,7,-19,-6,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-24,-23,-30,-24,-2,-22,-25,25,-25,17,11,-19,-23,-20,-23,-16,-8,19,-22,-6,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-25,23,15,-26,-16,-6,-23,0,-13,-14,2,-9,2,-6,-4,-7,-19,-31,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-26,-9,-3,-18,-17,-15,-12,-10,-13,-10,-10,22,-9,-11,-4,-1,-13,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-22,14,8,-26,-11,-5,-24,2,-23,-16,7,-8,4,-3,7,1,-18,-30,-15,6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-5,-17,-6,-8,-15,-10,-11,-9,-9,-13,-7,-3,-16,-5,-7,2,-2,-4,-27,-11,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-26,-31,-23,14,-28,-21,18,-23,9,6,-19,-20,-20,-21,-16,-8,10,-1,9,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-26,-22,-18,-8,-20,-23,14,-20,-1,2,-17,3,-18,-22,-12,-8,9,-23,-11,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-15,-20,-20,-7,-25,-19,17,-18,2,3,-14,-21,-18,-19,-3,2,23,-29,-9,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00941;
//
ID   HMG_COA_SYNTHASE_MP; MATRIX.
AC   MP01226;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9839218; R2=0.0124322; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1481; N_SCORE=22.386; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=203; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,-13,-24,-22,6,-20,-22,11,-17,1,1,-14,-25,-24,-18,-5,-2,22,-23,-7,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,10,-30,14,20,-40,-18,8,-24,8,-22,-6,4,-10,48,6,0,-10,-30,-24,-12,34;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-32,4,23,-30,2,-10,-30,2,-25,-19,-4,13,3,-6,-3,-12,-29,-27,-24,12;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-24,24,30,-26,-14,-2,-26,12,-20,-17,5,-4,10,2,-2,-8,-22,-25,-14,20; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-20,-7,-13,-20,46,-13,-26,-13,-20,-13,0,-13,-13,-13,0,-13,-20,-13,-20,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-13,-7,-7,-13,-16,-1,-15,-10,-16,-11,3,-11,-5,-9,20,34,-6,-32,-8,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,26,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,4,-17,-15,-11,-22,-22,-2,-17,-8,-7,-5,-16,-13,-17,11,25,3,-32,-12,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-14,-17,-18,-14,-9,-26,-21,5,-4,0,1,-12,-18,-13,-7,-3,13,12,-26,-8,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-30,-10,-18,-29,60,-18,-39,-14,-29,-19,0,-20,-17,-10,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=10,-6,-10,-15,-13,-11,-17,-21,-4,-11,-7,-7,-6,-13,-13,-13,14,33,7,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='A'; M=19,5,-17,-4,0,-24,-4,-5,-15,-3,-19,-11,11,-12,8,-8,11,0,-15,-27,-18,4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26,55,-30,-20,7,-30,24,7,-24,-30,-33,-20,-24,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-22,16,0,-20,-4,29,-22,-2,-28,-16,50,-20,2,0,6,-4,-30,-38,-12,0;
MA   /M: SY='A'; M=29,-9,10,-18,-12,-19,-7,-20,-14,-13,-14,-13,-8,-15,-12,-19,12,8,-3,-28,-20,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,31,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-24,29,4,-25,-8,0,-19,-4,-24,-19,33,-16,-2,-8,6,-3,-21,-38,-18,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-26,14,46,-26,-20,-4,-26,6,-18,-18,0,-2,14,-2,4,2,-24,-30,-18,30;
MA   /M: SY='S'; M=8,-6,-10,-6,-6,-16,-6,-14,-10,-12,-22,-14,2,-14,-6,-12,30,16,2,-38,-18,-6;
MA   /M: SY='N'; M=1,19,-15,9,0,-20,0,-1,-20,-5,-30,-20,34,-15,0,-5,26,11,-19,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00942;
//
ID   UPF0012_MP; MATRIX.
AC   MP01227;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0012 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5238338; R2=0.0161858; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=543; N_SCORE=14.303; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=61; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=9,-11,-27,-10,-6,-28,23,-18,-27,-12,-24,-18,-7,10,-12,-18,0,-12,-23,-23,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-28,-5,-8,-22,30,-12,-30,-8,-25,-17,2,-12,-11,-11,-1,-10,-25,-19,-15,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,15,-24,18,14,-26,-13,-4,-22,2,-20,-16,9,-12,6,0,3,-2,-18,-32,-17,10;
MA   /M: SY='A'; M=6,-7,-23,-10,0,-19,-18,-12,-4,-2,-4,1,-9,-13,2,-8,-6,-7,-5,-22,-11,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-26,-13,0,-7,-21,-10,-6,-5,-9,-3,-13,1,-6,-4,-7,-7,-6,-19,-5,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-27,-7,-6,-20,-20,-18,-11,-7,-18,-12,-13,27,-11,-8,-3,1,-7,-30,-20,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-25,-27,-19,0,-28,-23,15,-20,7,7,-22,4,-19,-21,-15,-5,10,-23,-8,-21;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-21,-12,-24,-21,9,-23,-19,20,-17,11,8,-19,-20,-20,-16,-11,-3,25,-15,-1,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-19,26,20,-23,-8,-2,-23,4,-19,-17,7,-5,5,-3,5,-3,-18,-25,-14,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-17,-10,-12,-9,-18,-19,-7,-13,-9,-9,-8,-17,-13,-13,6,18,1,-10,-7,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-31,24,16,-31,-15,-6,-30,4,-27,-22,3,15,2,1,-1,-7,-27,-33,-21,7;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-17,-10,-21,-22,-6,15,-17,-17,-21,-10,-9,-11,-24,-20,-20,-8,-13,-12,-14,-6,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-17,-30,-19,-22,-16,30,-21,-23,-19,-19,-11,-12,-22,-19,-19,-8,-14,-18,11,-13,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-1,-29,-3,4,-21,-19,-3,-27,35,-25,-10,3,-15,8,35,-9,-9,-20,-18,-3,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-27,13,-33,-26,29,-27,25,15,-26,-27,-25,-23,-20,-7,26,-19,1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=4,-12,-25,-13,-18,-22,43,-20,-27,-19,-17,-13,-5,-19,-18,-19,-1,-11,-19,-21,-24,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-23,-25,-15,2,-27,-18,11,-22,20,8,-21,-11,-13,-18,-17,-7,4,-21,-4,-15;
MA   /M: SY='A'; M=6,-13,-18,-16,-10,-13,-5,-14,-6,-15,2,1,-10,-17,-4,-14,0,0,-5,-24,-12,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-35,-29,-1,-36,-29,41,-26,15,15,-21,-22,-22,-26,-15,-3,33,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-23,-34,-26,3,-33,-23,34,-25,27,25,-24,-24,-18,-23,-21,-8,24,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-30,-5,11,-22,-20,0,-30,26,-20,-12,0,-16,12,57,-8,-10,-22,-22,-12,7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-26,10,43,-26,-19,-5,-21,5,-16,-16,-4,-4,11,-4,0,-8,-18,-29,-19,27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-24,-28,-21,14,-27,-19,11,-27,33,11,-24,-29,-20,-19,-28,-12,2,1,5,-19;
MA   /M: SY='A'; M=18,-10,-14,-13,-9,-9,-8,-9,-9,-12,-11,-9,-6,-15,-7,-15,13,5,-5,-19,-1,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-17,-24,-19,-10,-7,-23,-8,-6,2,8,8,-12,-22,-3,24,-15,-5,-5,-21,-6,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-9,-27,-14,-6,-7,-21,-8,-4,-1,-7,-4,-5,-19,-5,-3,-11,-9,-8,-4,7,-7;
MA   /M: SY='L'; M=2,-17,-20,-20,-11,-6,-19,-15,4,-19,18,5,-15,-13,-10,-16,-13,-6,-2,-23,-9,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=30,-8,-12,-14,-6,-18,-3,-14,-13,-3,-12,-10,-6,-10,-5,-4,8,0,-4,-19,-16,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-23,0,2,-18,-16,-3,-19,11,-10,-7,-1,-15,8,25,-5,-6,-15,-21,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=0,3,-22,-4,1,-23,-11,-3,-18,11,-19,-6,9,-14,11,12,2,-4,-17,-25,-14,5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-30,0,-15,-31,60,-18,-40,-18,-30,-21,2,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-16;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-3,-21,-13,-14,-6,-16,-10,-11,-10,-10,-12,-15,-11,-20,5,-2,-2,-16,-9,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-28,18,27,-27,-17,-2,-28,12,-23,-16,4,-8,15,3,0,-8,-25,-27,-14,21;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-22,-34,-25,2,-33,-26,33,-27,27,17,-24,-24,-21,-24,-20,-8,25,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=2,-25,-21,-31,-21,0,-25,-20,22,-23,26,19,-22,-22,-15,-21,-18,-8,13,-20,-4,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-22,-7,-29,-22,18,-26,-22,7,-24,10,2,-18,-24,-24,-20,-10,0,8,-17,1,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-21,-25,-23,24,-29,-5,8,-17,6,3,-21,-28,-20,-15,-14,-1,9,2,35,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-18,-15,-9,-23,-22,-22,-11,-14,-21,-14,-20,49,-15,-20,-7,-6,-11,-32,-25,-15;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-13,-15,-10,-9,0,-17,-14,-13,-15,-13,-4,-13,-11,-16,16,7,-5,-24,-15,-10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-3,1,-13,-8,-22,-5,-14,-15,-9,-16,-12,0,-14,-4,-15,10,0,-8,-27,-20,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-25,-30,-32,-26,38,-23,-21,-10,-22,-6,-10,-19,-27,-27,-17,-21,-10,-13,52,22,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-3,-24,-6,-3,-20,-1,-13,-16,-9,-18,-10,0,6,-8,-12,2,4,-15,-29,-20,-7;
MA   /M: SY='A'; M=5,-8,-19,-10,-9,-13,-15,-14,-1,-12,-1,0,-7,-16,-8,-11,1,1,0,-27,-11,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-10,-26,-10,-9,-17,-4,-12,-14,-4,-20,-11,-4,1,-8,-3,-1,-5,-12,-23,-11,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-7,-22,-10,-4,-16,-21,-10,-16,0,-16,-10,-5,2,2,7,4,18,-13,-23,-7,-3;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00943;
//
ID   COF_1_MP; MATRIX.
AC   MP01228;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hypothetical cof family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=30;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=27;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7875319; R2=0.0152202; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=387; N_SCORE=10.671; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-16,1,7,-14,-10,-5,-11,4,-10,-2,-2,0,2,-2,0,-1,-9,-18,-10,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-23,-25,-28,-22,12,-31,-11,18,-18,9,7,-18,-24,-16,-15,-15,-6,10,-4,23,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-3,-29,-2,5,-20,-21,-4,-26,31,-23,-9,-1,-15,11,32,-9,-10,-20,-17,-4,7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-21,-24,-19,3,-25,-14,16,-20,17,8,-15,-24,-16,-18,-15,-7,10,-16,5,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-20,-33,-26,5,-31,-25,31,-25,20,17,-24,-25,-22,-23,-17,-6,28,-21,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=24,-16,-16,-24,-17,-3,-9,-16,-1,-15,-4,-4,-14,-17,-15,-20,-1,-4,4,-12,0,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-18,-17,-23,-17,6,-20,-20,9,-21,1,0,-11,-20,-17,-19,3,2,9,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-22,12,-29,-18,22,-27,38,26,-26,-27,-18,-19,-26,-10,12,-18,2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,43,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-29,-21,10,-30,-19,20,-27,41,17,-29,-30,-21,-19,-27,-9,14,-18,4,-21;
MA   /M: SY='S'; M=6,-1,-12,-6,-6,-14,-8,-12,-12,-10,-16,-10,6,-12,-4,-10,24,23,-6,-34,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-7,-34,1,-2,-22,-15,-14,-25,-6,-27,-21,-9,21,-6,-7,-6,-9,-26,2,-13,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-25,20,21,-29,-15,-2,-26,15,-23,-15,8,-7,13,6,-1,-6,-23,-26,-14,17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-27,-1,0,-19,-12,40,-25,0,-21,-6,12,-18,9,8,-4,-9,-25,-26,1,2;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-6,-23,-8,1,-15,-17,-4,-12,-3,-7,-4,-5,-15,3,-1,-2,5,-11,-23,-5,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-33,-25,10,-33,-25,26,-26,18,11,-24,-14,-24,-24,-19,-8,19,-19,-1,-26;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-17,-10,-10,-13,-5,-3,-11,-15,-9,-7,0,-18,-9,-12,8,10,-6,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-14,6,-33,16,17,-27,-18,1,-27,1,-25,-19,-3,23,2,-7,-6,-11,-28,-27,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-27,-4,5,-16,-20,0,-15,4,-10,-5,-7,-11,13,4,-7,-8,-17,-15,3,7;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-13,-8,-11,-13,-10,-16,-10,-10,-13,-10,5,-14,-11,-11,15,29,-1,-31,-14,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-12,-25,-13,-2,-11,-25,-15,-5,14,-8,-1,-11,-17,-4,8,-12,-8,0,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,4,-22,5,16,-23,-17,-7,-18,5,-16,-11,1,-11,8,0,4,2,-14,-29,-14,12;
MA   /M: SY='A'; M=13,-16,-18,-23,-17,2,-18,-16,2,-15,-3,-3,-14,-12,-16,-19,-2,2,4,-12,3,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-24,6,-34,-24,32,-29,36,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=4,-4,-25,-7,4,-27,-15,-9,-24,26,-22,-9,-3,-12,11,21,-4,-7,-16,-20,-13,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00944;
//
ID   COF_2_MP; MATRIX.
AC   MP01229;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hypothetical cof family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1482531; R2=0.0096193; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2376; N_SCORE=22.707; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=692; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-34; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=22,-73,-66,-56,28,-69,52,-55,-5,3,-52,-60,-73,64,0,-6,-59,11,-65,40;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-72,-78,-74,-48,-16,-68,20,-69,64,52,2,-79,-67,-4,-70,-61,15,51,-54;
MA   /M: SY='A'; M=55,-69,0,19,-62,-65,-62,-52,-59,16,24,-62,-69,36,-63,-52,-1,13,-73,12;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-79,42,36,26,-14,-56,-77,66,-72,-66,-50,-65,53,4,-56,-60,-74,-72,-59;
MA   /M: SY='K'; M=8,-74,-60,-3,-59,-69,26,-60,53,15,-54,6,-70,13,25,-6,-57,-12,-68,39;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-76,-73,-7,7,-79,-61,-3,-62,49,-44,-72,-77,36,-2,-66,-3,-8,81,56;
MA   /M: SY='G'; M=-54,-76,3,18,-82,78,-60,-85,-58,-84,-73,58,6,11,-66,-50,-61,-81,-79,-75;
MA   /M: SY='I'; M=-66,-74,-84,-79,8,-85,-69,60,-76,55,27,-79,-80,-71,-75,-74,-62,-2,52,40;
MA   /M: SY='D'; M=-54,-72,62,22,-79,-60,-56,-77,33,-77,-71,9,-63,13,-52,59,24,-71,-85,-68;
MA   /M: SY='P'; M=-63,-76,-1,-60,-61,-74,-64,-4,-7,36,66,-66,77,10,-65,-62,22,-53,-77,-63;
MA   /M: SY='E'; M=8,-75,28,62,-81,-64,-54,-79,34,-76,-69,32,-63,38,2,17,-54,-73,-81,-69;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-77,54,55,-79,-65,-50,-78,-1,-75,21,67,-66,14,39,-54,-56,-76,-86,-68;
MA   /M: SY='C'; M=-12,73,-73,-72,-60,-76,-76,33,-68,-48,24,-63,-72,-71,-73,-54,65,54,-86,-64;
MA   /M: SY='M'; M=8,-70,-82,-75,-52,-78,-70,60,-71,-7,102,-73,-73,-67,-72,-67,-57,41,-76,-56;
MA   /M: SY='A'; M=74,29,-74,-67,2,-61,-75,-43,-68,-54,-53,-68,-72,-67,-71,-51,-53,60,-78,-64;
MA   /M: SY='F'; M=-70,28,-87,-83,97,-84,-71,59,-77,-37,51,-75,-81,-81,-77,-73,-63,-40,-53,-32;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='G'; M=24,-69,-56,-61,-78,60,-60,-78,-59,-79,-70,47,-67,11,-65,59,-50,-71,-79,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-77,52,34,28,36,-60,-61,-62,2,66,-57,-70,-58,-66,-61,-63,-64,52,14;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='I'; M=8,-73,-78,-72,-51,-80,-70,60,-62,29,-41,-73,-77,-65,37,-66,-58,40,-72,13;
MA   /M: SY='E'; M=34,-73,6,83,-79,-64,-58,-77,-47,-74,-69,-54,-60,-42,0,32,0,-68,-81,-71;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-69,-83,-73,-51,-75,-57,21,-67,-30,139,-70,-71,-59,-66,-69,-59,-40,-74,-51;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-72,-85,-79,56,-85,-67,44,-76,60,52,-79,-81,-73,-75,-75,-63,-38,-60,17;
MA   /M: SY='Q'; M=-58,-77,-45,62,-80,-67,-53,-73,45,-73,-65,31,-63,65,4,17,-55,-15,-78,-67;
MA   /M: SY='W'; M=8,-75,-68,-5,4,-68,24,-57,17,-58,49,-63,-70,11,-58,16,-2,11,110,16;
MA   /M: SY='A'; M=81,-63,-73,-65,-67,-58,-74,-43,-66,-55,-53,-67,-70,-65,-70,-48,-51,60,-80,-68;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-76,1,-58,-82,78,-63,-84,43,-82,-71,8,-67,11,0,-51,-63,-79,-75,-72;
MA   /M: SY='Y'; M=-62,28,-64,-64,6,-71,52,-55,17,2,-53,30,-74,-59,-59,-7,22,11,52,67;
MA   /M: SY='G'; M=-48,28,-62,-66,-79,74,-67,-82,-64,-82,-73,-50,32,-60,-71,65,-53,-76,-78,-74;
MA   /M: SY='V'; M=-59,56,-83,-79,65,-83,-76,-30,-75,-42,-47,-76,-82,-80,-76,-68,-56,82,-67,16;
MA   /M: SY='A'; M=78,-64,-69,-64,-67,-56,-70,31,-65,-18,-54,-62,-68,-61,-69,33,-50,-6,-77,-66;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-70,-83,-73,-50,-77,-57,-36,-68,31,134,-72,5,-60,-66,-72,-60,-43,-74,-52;
MA   /M: SY='G'; M=24,-72,1,19,-76,53,-65,-10,32,-71,-65,-52,-65,-54,-58,18,-1,-12,-78,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-60,-69,7,-55,-78,13,-47,-78,19,-83,-71,110,-71,-50,-54,-3,-49,-78,-90,-71;
MA   /M: SY='A'; M=78,-64,-64,-61,-76,28,-67,-70,-62,-72,-65,-55,-66,-57,-67,52,-49,-59,-77,-71;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-75,41,-3,-72,-13,25,15,-6,-64,23,7,48,11,-61,-5,22,-11,-83,-65;
MA   /M: SY='P'; M=-62,-81,61,-1,-79,-66,-60,-10,-56,-24,-66,7,83,36,-64,16,-55,-69,-84,-71;
MA   /M: SY='E'; M=8,-75,-49,68,-70,-70,-57,-9,-2,15,-57,6,-65,38,24,-6,-58,-61,-77,-65;
MA   /M: SY='C'; M=23,56,-81,-75,-52,-78,-77,45,-75,44,-40,-75,-78,-72,-76,-65,-57,48,-78,-61;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-76,-59,-47,2,-72,-58,-67,98,-22,-60,-53,-67,-44,8,-59,-58,-13,-67,13;
MA   /M: SY='Q'; M=33,-73,2,35,-73,-65,-57,-66,53,1,23,7,-66,53,-46,-53,-57,-64,-76,-65;
MA   /M: SY='A'; M=42,-68,-66,-7,-58,-68,-65,32,-62,36,25,30,-72,-60,-3,-57,-1,-5,-77,-62;
MA   /M: SY='A'; M=87,29,-67,-61,-72,-53,52,-65,-63,-21,-59,-60,-68,-59,-66,-2,-53,-55,-79,-66;
MA   /M: SY='N'; M=-61,-73,27,-49,-77,-63,-56,-73,53,-77,-68,67,48,-51,2,-49,49,-71,-84,-70;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-76,0,33,56,-77,26,-5,-63,-16,-52,4,-75,-60,-65,-64,-61,12,-51,84;
MA   /M: SY='I'; M=-14,-73,-75,-69,-54,-80,51,65,-66,19,-41,-67,-74,9,-3,-64,-2,40,-79,-56;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-66,-57,19,-69,-13,-65,-8,-57,-62,23,-51,7,-57,-65,19,90,-53,-83,-66;
MA   /M: SY='D'; M=-13,-74,61,21,-76,11,-60,-63,33,-70,-66,8,-67,-52,0,-5,-1,25,-85,-68;
MA   /M: SY='S'; M=-54,-71,27,-55,4,-63,-60,32,19,-62,-59,-50,-67,13,-58,67,26,-54,-73,15;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00944;
//
ID   TRMA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01230;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA methyltransferase trmA family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9905519; R2=0.0142243; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=510; N_SCORE=12.235; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=107; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-23,-6,3,-17,-18,-9,-18,5,-17,-10,-5,-4,2,3,-4,-5,-15,-19,-10,2;
MA   /M: M=-6,-7,-20,-8,-3,-11,-14,-8,-11,-3,-9,-5,-5,-18,-5,-4,-6,-7,-9,-20,-6,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-16,-20,-19,-11,-8,-20,-17,3,-15,6,2,-15,-19,-9,-14,-10,-5,1,-12,-7,-10;
MA   /M: M=-6,-2,-24,0,-1,-18,-18,-8,-13,-3,-11,-8,-4,-2,-3,-6,-3,-1,-11,-27,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-27,-6,5,-16,-16,-11,-17,2,-13,-10,-6,-13,3,-2,-7,-8,-17,-3,-7,5;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-24,4,11,-24,-13,-3,-18,3,-17,-9,5,-9,10,-1,2,-3,-18,-27,-14,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-1,-10,-18,-11,-8,-13,-6,-14,-10,-9,-5,-5,-8,-14,-7,-9,-3,-4,-7,-24,-12,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-26,-5,4,-15,-17,-4,-13,-2,-12,-7,-4,-7,7,-4,-4,-6,-16,-19,-3,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,1,-23,-1,0,-22,-7,-8,-20,8,-20,-12,2,-11,0,4,-1,-5,-16,-23,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-17,-20,-13,8,-22,-15,-10,-16,-11,-9,-15,12,-18,-18,-9,-6,-11,-16,-2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-12,30,-26,38,14,-29,-9,0,-31,-1,-26,-23,17,-11,1,-7,4,-3,-25,-35,-17,8;
MA   /M: SY='V'; M=2,-16,-15,-21,-16,-4,-20,-21,3,-11,4,1,-15,-20,-16,-11,-5,5,10,-23,-8,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-28,2,-31,-27,30,-23,18,14,-28,-27,-25,-22,-16,-5,34,-21,-5,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-27,13,-33,-25,29,-27,25,16,-26,-27,-25,-23,-20,-7,25,-19,1,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-25,8,-29,-25,24,-24,23,14,-27,-28,-25,-20,-17,-4,28,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,78,-10,-20,-7,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='K'; M=7,-6,-17,-9,-2,-21,-13,-12,-17,8,-18,-10,-3,-11,0,8,6,3,-9,-25,-15,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=8,-22,-7,-28,-20,-4,-22,-21,12,-22,18,11,-21,-23,-16,-21,-14,-7,10,-23,-9,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-25,11,4,-26,6,-5,-27,-5,-21,-15,4,-14,-1,-8,2,-6,-21,-28,-17,1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-25,4,13,-25,-7,-9,-23,5,-21,-15,0,-3,3,-1,2,-5,-19,-27,-18,8;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-21,4,8,-17,-9,-7,-17,4,-15,-10,-1,-7,3,-2,0,-5,-14,-21,-11,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-11,-26,-21,6,-25,-23,12,-20,10,4,-20,-23,-22,-17,-8,3,18,-22,-5,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-2,-27,-20,-4,-24,-20,11,-21,15,9,-20,-25,-16,-19,-14,-6,11,-26,-8,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-26,12,17,-25,-13,-2,-25,13,-21,-13,5,-10,12,9,-1,-7,-22,-24,-12,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-10,-20,-13,-5,-5,-18,-2,-10,-7,-7,-1,-8,-17,1,-7,-3,-1,-10,-12,3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-30,-23,3,-30,-24,27,-26,27,15,-24,-25,-20,-22,-19,-6,21,-22,-3,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-10,-13,-7,-9,-9,-12,0,-8,0,-1,-8,-7,-7,-10,-1,-1,1,-16,-9,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-24,-2,6,-24,-9,-4,-22,9,-19,-10,2,-13,9,8,0,-6,-18,-24,-13,7;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-15,-17,-18,-12,3,-20,-11,-1,-14,4,3,-12,-20,-10,-13,-5,-1,-2,-15,4,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=0,-2,-20,-4,-2,-21,0,-9,-20,4,-19,-10,1,-9,1,1,1,-4,-15,-21,-14,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-26,-14,-7,-17,-17,-19,-7,-12,-14,-10,-17,41,-12,-17,-6,-5,-10,-24,-19,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-29,11,20,-29,-14,-1,-26,9,-23,-15,2,1,13,4,-1,-9,-25,-27,-16,15;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-26,-9,-3,-7,-18,-4,-18,11,-13,-7,-3,-19,2,18,-8,-6,-15,-14,3,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-36,-28,6,-35,-27,37,-27,21,18,-23,-24,-22,-25,-19,-8,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-16,-32,-26,3,-30,-26,28,-24,19,13,-24,-25,-23,-23,-16,-5,27,-23,-4,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-18,-29,-19,-18,24,-26,21,-3,-10,-2,-1,-18,-28,-9,-10,-18,-10,-11,24,70,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-25,-18,-29,-25,-3,-29,-26,29,-22,9,10,-20,-23,-20,-22,-7,-1,30,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-11,-1,-1,-20,3,-11,-21,-10,-30,-20,9,-10,-1,-11,38,18,-11,-39,-20,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-22,23,2,-22,-2,11,-23,-1,-28,-19,45,-18,0,-2,7,-3,-28,-37,-16,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-32,-14,-5,-24,-18,-17,-13,-11,-22,-13,-18,53,-10,-19,-7,-7,-16,-25,-23,-11;
MA   /M: SY='A'; M=7,-3,-20,-4,4,-22,-9,-9,-15,-3,-15,-10,-4,-10,0,-8,5,0,-8,-27,-15,1;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-11,-8,-8,-12,-16,-17,-12,-9,-14,-12,2,-10,-7,-8,22,41,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-25,-21,-29,-17,17,-27,-13,11,-22,28,21,-23,-26,-11,-15,-23,-10,3,-14,5,-13;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-13,-19,-11,-17,-5,-19,-8,-6,-9,-6,-11,-14,-9,-13,3,-2,2,-21,-16,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-28,-6,6,-21,-19,-1,-26,25,-19,-9,1,-16,10,45,-6,-8,-19,-22,-11,4;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,63,18,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-23,-16,-27,-20,4,-24,-20,13,-22,20,10,-21,-24,-18,-19,-14,-4,11,-21,-3,-19;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-21,-5,3,-22,-8,-11,-20,5,-18,-12,-3,-14,1,2,0,-6,-14,-19,-15,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-12,-23,-14,-7,-7,-24,-9,3,-11,1,1,-10,-17,-7,-10,-8,-4,1,-20,-2,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-31,-22,20,-30,-18,15,-28,37,15,-28,-30,-22,-20,-28,-11,6,-5,10,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-12,-18,-10,-11,-20,-16,0,-12,-1,-1,-12,-16,-8,-11,-4,0,2,-27,-11,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-22,10,11,-26,-8,2,-25,3,-22,-14,7,-12,6,-1,4,-4,-20,-30,-15,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-22,-7,-2,-12,-11,-3,-16,-3,-13,-8,-2,-14,1,-3,-2,-2,-15,-17,0,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-28,-6,-10,-21,27,2,-31,-12,-22,-13,0,-19,-7,-9,-3,-14,-25,-20,-12,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-28,-15,-11,13,-24,4,-5,-9,-3,-2,-14,-23,-7,-9,-14,-9,-10,10,37,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-9,-26,-10,2,-17,-22,-5,-7,5,-10,-3,-6,-13,2,5,-8,-8,-6,-23,-7,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00945;
//
ID   TRMA_2_MP; MATRIX.
AC   MP01231;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA methyltransferase trmA family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7289662; R2=0.0164767; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=244; N_SCORE=9.739; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=47; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-5,-10,-21,-10,-7,-14,-15,-14,-7,-5,-2,-3,-10,-19,-7,-3,-9,-8,-4,-20,-10,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-14,-22,-16,-11,-7,-24,-14,10,-16,7,5,-13,-18,-8,-15,-10,-5,7,-23,-4,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-20,-20,-21,-11,5,-26,-12,7,-18,15,7,-19,-23,-11,-15,-15,-7,6,-18,1,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-17,-15,-5,-10,-23,-1,-3,-12,6,2,-11,-17,-4,-8,-12,-7,-5,-25,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-22,6,12,-23,-11,-6,-20,1,-14,-10,0,-12,4,-3,0,-4,-17,-28,-15,8;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-2,-22,-4,-1,-21,0,-4,-22,0,-17,-10,1,-16,1,1,-2,-8,-18,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-23,-7,-11,-25,31,-15,-29,-12,-25,-17,2,-14,-12,-12,5,-5,-21,-25,-23,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-18,-30,-18,-17,23,-28,30,-6,-11,-3,-1,-16,-28,-8,-9,-19,-12,-13,23,66,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-27,-1,9,-26,-17,-1,-23,18,-20,-9,0,-13,14,23,-4,-8,-18,-24,-11,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-18,-32,-24,4,-31,-24,26,-25,22,14,-23,-24,-21,-22,-18,-5,21,-21,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-9,1,-24,3,9,-22,-20,-4,-17,8,-15,-9,-1,-13,4,6,-2,-1,-11,-27,-11,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-27,2,12,-23,-14,-5,-26,17,-22,-13,0,-11,7,17,-1,-6,-19,-22,-10,8;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-15,-29,-22,0,-24,-23,19,-21,12,10,-20,-22,-20,-21,-10,-3,21,-23,-7,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-6,-25,-9,1,-27,-5,-4,-18,2,-17,-6,-4,-14,19,4,0,-6,-17,-20,-12,9;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-22,-25,-21,-14,-12,-16,-20,2,-18,2,1,-21,13,-15,-20,-12,-7,0,-25,-15,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-19,-35,-29,27,-32,-25,23,-26,17,10,-25,-28,-30,-22,-18,-7,25,-14,6,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-16,-22,-23,-11,-2,-22,-2,8,-10,14,33,-15,-20,8,-7,-16,-10,-1,-18,-1,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-6,-30,-6,1,-16,-22,49,-19,-4,-14,3,-1,-19,21,0,-10,-15,-24,-12,20,8;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11,1,-10,-9,-10,22,47,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-2,-24,-2,-3,-19,-9,10,-20,-9,-19,-11,0,2,-4,-10,2,0,-18,-26,-7,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,97,-30,-9,-20,0,10,-20,10,2,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-19,-31,-26,6,-31,-22,28,-23,21,16,-25,-27,-22,-21,-18,-5,27,-20,2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=5,-4,4,-11,-11,-14,-12,-16,-10,-14,-13,-11,2,-18,-11,-15,14,12,-2,-35,-17,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-29,-26,-4,-17,-25,20,-23,12,11,-22,-25,-22,-21,-13,-6,23,-25,-9,-25;
MA   /M: SY='A'; M=19,-17,-9,-23,-18,-11,-11,-23,3,-16,-2,-2,-15,-19,-17,-20,1,3,13,-25,-15,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-19,-26,-18,4,-28,-19,12,-17,24,11,-23,-25,-17,-14,-20,-5,10,-16,1,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,28,-30,-20,16,-29,37,16,-27,-29,-25,-20,-27,-10,9,-12,8,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-23,-1,16,-20,-22,-5,-13,4,-13,-8,-3,-11,6,1,0,1,-9,-28,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,-28,-9,0,-20,-20,-7,-22,25,-16,-7,-4,-15,6,39,-10,-8,-15,-21,-10,1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-5,-23,-6,2,-20,-16,-10,-14,10,-13,-7,-3,-13,1,10,-3,-5,-10,-24,-12,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-5,0,-23,1,1,-19,-14,-7,-14,-1,-16,-10,-1,-15,-2,-2,1,-2,-8,-21,-11,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-20,0,0,-20,-4,-11,-19,0,-20,-14,1,-12,-4,0,7,0,-11,-27,-16,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-1,2,-23,1,-3,-20,-1,-5,-16,-9,-11,-10,3,-11,-5,-9,-3,-8,-15,-26,-15,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-20,-6,-2,-14,-19,-13,-11,1,-3,-5,-4,-16,-4,1,-2,7,-8,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='K'; M=3,-2,-19,-2,-1,-21,-13,-8,-17,9,-21,-11,0,-13,-2,1,8,4,-6,-29,-13,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-9,-32,-6,-1,-22,-23,-15,-11,7,-13,-7,-10,13,-4,1,-13,-10,-13,-25,-14,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00945;
//
ID   PNP_UDP_1_MP; MATRIX.
AC   MP01232;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Purine and other phosphorylases family 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8325729; R2=0.0170805; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=371; N_SCORE=12.159; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=40; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-17,-23,-18,8,-27,-18,8,-21,22,7,-18,-23,-18,-16,-10,11,7,-19,2,-18;
MA   /M: SY='G'; M=5,0,-21,2,-9,-25,24,-16,-26,-13,-24,-18,2,-16,-12,-16,9,-3,-15,-28,-23,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-31,-29,-22,35,-27,-6,-9,-12,-4,-5,-21,-28,-19,-3,-22,-14,-12,39,40,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-16,-12,-10,-5,-21,-11,-10,-5,-8,-7,-4,-16,-7,1,8,28,-4,-19,4,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-11,-14,-14,-19,-27,47,-21,-33,-19,-25,-18,-4,-19,-19,-21,1,-15,-22,-22,-28,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-5,-21,-8,3,-9,-21,-7,-11,2,-9,1,-6,-13,1,0,0,11,-9,-20,-1,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-28,-24,-21,26,-31,8,7,-16,11,5,-22,-29,-14,-13,-22,-10,-4,17,58,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-11,11,-21,11,8,-30,-17,-7,-30,32,-29,-15,9,-13,5,17,-6,-9,-22,-27,-14,7;
MA   /M: SY='G'; M=2,-4,-26,-7,-13,-27,48,-17,-33,-15,-26,-18,4,-17,-15,-17,3,-11,-25,-23,-26,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-28,-3,7,-26,-7,-1,-28,19,-23,-11,0,-14,7,20,-5,-9,-21,-23,-12,5;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-9,-28,-8,-1,-24,-13,-13,-23,9,-25,-14,-6,18,-2,10,0,0,-19,-26,-18,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,18,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-10,-14,-12,-9,-11,-13,-16,-1,-16,-8,-6,-3,-16,-8,-15,17,11,2,-33,-13,-9;
MA   /M: SY='V'; M=2,-26,-14,-29,-26,-3,-27,-27,27,-21,9,9,-23,-25,-24,-21,-8,-1,36,-28,-9,-26;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-19,7,-27,-19,-9,-23,-11,7,-14,5,26,-18,-23,-5,-15,-13,-9,6,-27,-9,-12;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-18,-5,-9,-23,27,-15,-28,-14,-29,-19,5,-14,-9,-14,22,6,-18,-31,-23,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-21,-4,-4,-16,-18,47,-22,-10,-17,-5,6,-16,2,-4,5,9,-17,-31,6,-4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-24,-34,-24,0,-28,-12,32,-18,20,44,-20,-20,-8,-18,-20,-10,18,-20,0,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-28,-29,-26,-10,-2,-26,16,-25,3,5,-14,-21,-20,-25,-12,-12,10,-21,-11,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,85,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-16,2,-26,-20,-9,-26,-20,9,-20,0,3,-12,-19,-15,-21,-3,7,9,-28,-9,-20;
MA   /M: SY='S'; M=13,-4,-13,-5,-5,-20,6,-13,-19,-12,-24,-17,4,-12,-5,-13,28,13,-10,-34,-20,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,47,-30,23,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-18,-21,-19,10,-21,5,-2,-9,-1,6,-17,-27,-10,-5,-15,-9,-4,4,36,-17;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-13,-27,-23,1,-24,-24,17,-20,14,8,-23,-25,-22,-19,-9,1,26,-25,-8,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-26,4,17,-20,-19,17,-24,6,-18,-11,4,-11,8,8,0,0,-21,-26,-4,11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=6,-23,-23,-33,-23,-2,-26,-23,28,-22,11,14,-18,-18,-16,-24,-12,-7,19,-18,-3,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-5,-24,-7,3,-22,-19,-2,-14,12,-15,-1,-3,-13,12,6,0,-1,-11,-24,-9,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-6,3,-15,4,5,-10,-14,-7,-10,-6,-6,-5,-1,-9,-2,-7,3,8,-8,-22,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-24,-27,-21,27,-30,-4,10,-22,25,10,-25,-30,-19,-16,-25,-10,1,4,35,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-29,-1,-8,-24,32,0,-32,-10,-26,-16,8,-19,-7,-11,-1,-15,-28,-21,-14,-8;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-14,-25,-23,-6,-25,-9,17,-18,3,6,-21,-25,-21,-17,-8,-4,30,-28,-6,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-3,7,-26,5,7,-27,-14,0,-26,22,-25,-12,8,-12,8,16,-3,-8,-20,-25,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-7,2,-21,-2,1,-19,-16,-9,-19,14,-21,-11,7,-14,1,15,5,8,-11,-28,-13,0;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-1,-33,-25,17,-31,-22,9,-24,12,5,-20,-27,-24,-16,-18,-10,7,-17,2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-13,-32,-24,-3,-33,-26,28,-27,15,11,-17,-21,-18,-25,-12,-2,18,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-3,-28,-3,0,-19,-19,-1,-25,20,-15,-9,3,-20,6,50,-10,-9,-19,-23,-11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-32,-27,1,-34,-25,33,-23,12,12,-22,-24,-22,-23,-12,-1,32,-21,1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-28,-10,-17,-27,48,-20,-34,-18,-27,-18,-2,-8,-18,-18,2,-8,-25,-22,-27,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-10,-7,-6,-11,-13,-13,-12,-5,-13,-10,2,-9,-5,-1,18,31,-4,-26,-10,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-18,-21,-17,-7,-25,-23,13,-18,-1,1,-7,-14,-13,-18,7,22,11,-27,-7,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00946;
//
ID   UROCANASE_MP; MATRIX.
AC   MP01233;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Urocanase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5910935; R2=0.0137002; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1110; N_SCORE=19.788; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=140; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-13,12,-30,20,36,-34,-18,3,-29,10,-22,-15,3,-7,27,8,-1,-10,-29,-28,-16,31;
MA   /M: SY='M'; M=7,-19,-17,-27,-17,-3,-17,-10,12,-14,18,31,-19,-19,-7,-15,-14,-7,7,-20,-6,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=9,-2,-22,-4,-1,-23,-11,-9,-23,12,-18,-12,-2,-14,1,21,-1,-6,-13,-22,-15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-2,18,-18,13,3,-23,-3,-2,-23,1,-30,-20,27,-13,1,-2,20,7,-20,-38,-19,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-30,12,40,-29,-20,-3,-30,23,-23,-16,0,-5,16,15,-4,-10,-26,-26,-16,28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-34,-26,4,-34,-26,34,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-22,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-24,1,12,-27,-14,-10,-26,28,-27,-13,1,-9,7,14,3,-3,-17,-25,-14,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='V'; M=6,-28,-10,-29,-28,-2,-26,-29,25,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,44,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-27,3,-36,-27,39,-29,27,19,-24,-24,-21,-26,-22,-9,27,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-22,-7,-13,-25,40,-17,-31,-16,-28,-19,3,-16,-13,-16,14,-1,-21,-27,-25,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-18,-24,-18,-12,-2,-26,29,0,-22,22,12,-14,-26,-8,-12,-22,-14,-6,-24,8,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=10,-14,13,-20,-18,-12,-18,-23,-4,-16,-9,-7,-13,-21,-18,-18,7,11,11,-33,-17,-18;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,50,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,11,-9,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,20,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,29,9,-16,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-10,-24,-24,-3,-27,-27,19,-17,4,4,-22,-24,-24,-17,-2,14,36,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,8,-16,7,-1,-26,-3,-13,-19,-7,-17,-17,0,-10,-6,-16,10,-1,-9,-27,-20,-3;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,3,-23,-9,-14,23,-17,4,-8,-11,-10,-8,14,-26,-14,-9,-7,-6,-16,-5,24,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-24,14,43,-27,-14,-3,-27,4,-23,-20,3,-3,14,-3,11,-2,-24,-33,-20,29;
MA   /M: SY='A'; M=26,5,-15,-6,-5,-21,-2,-10,-15,0,-18,-13,11,-13,-5,-8,8,-1,-11,-26,-19,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-23,-33,-23,0,-26,-8,28,-16,20,49,-20,-20,-6,-16,-20,-10,16,-20,0,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-29,-11,-4,-7,-24,1,-18,20,-12,-5,-8,-20,2,28,-14,-10,-15,-6,16,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,26,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,33,-24,45,12,-34,-7,-6,-32,-3,-24,-24,12,-10,-3,-13,3,-7,-22,-34,-20,4;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-13,-26,-16,8,-8,-20,-7,-16,-4,-7,-13,-16,-18,-20,2,-3,0,-12,-6,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-27,23,-32,-30,-6,-32,-30,17,-25,4,4,-25,-31,-28,-25,-12,-5,29,-34,-14,-30;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-12,-13,-8,-21,7,-17,-16,-11,-18,-14,-3,-11,-8,-17,18,4,-6,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-34,-42,-37,-27,7,-20,-22,-9,-17,-9,3,-34,-27,-14,-17,-34,-24,-19,102,22,-17;
MA   /M: SY='P'; M=13,-16,-28,-14,-4,-26,-12,-20,-16,-10,-22,-16,-16,52,-10,-20,-2,-6,-18,-26,-26,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00947;
//
ID   GATB_MP; MATRIX.
AC   MP01234;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2898283; R2=0.0158605; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=355; N_SCORE=10.910; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=6,13,-20,17,4,-24,-9,-1,-22,-6,-19,-16,4,-12,-4,-12,6,-1,-14,-29,-12,-1;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,-9,-14,-7,-17,-9,-11,-11,-9,-11,-9,-7,-8,-8,-15,7,7,-3,-23,-14,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=1,-8,-25,-9,-9,-23,21,-12,-27,-2,-21,-13,-2,-17,-6,4,-2,-11,-19,-18,-17,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-3,-28,-3,4,-26,-12,-10,-25,32,-25,-10,-1,-9,5,22,-7,-8,-17,-20,-11,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=1,-8,-19,-11,-6,-15,-10,-12,-2,-12,-8,-3,-2,-15,0,-12,7,1,-3,-27,-13,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-12,-21,-14,-5,-10,-18,-11,1,-11,3,3,-11,-17,-7,-10,-6,-1,1,-23,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-9,2,-18,1,-1,-12,-10,42,-17,-7,-13,-4,7,-12,2,-3,-2,-8,-16,-20,6,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-18,11,5,-18,0,-7,-16,-2,-13,-11,2,-7,-3,-5,-1,-5,-12,-20,-13,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,4,-15,5,3,-13,-5,-2,-13,3,-11,-7,3,-8,3,5,-1,-4,-11,-15,-7,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-14,7,8,-11,-7,4,-13,-1,-9,-7,2,-6,2,-2,0,-2,-11,-14,-3,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-16,-3,-2,-13,4,-5,-14,1,-12,-7,-1,-7,-2,1,-1,-3,-11,-12,-7,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=2,3,-16,6,3,-19,6,-7,-18,-5,-16,-13,2,-2,-3,-9,4,-3,-14,-20,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-6,10,-23,11,2,-25,-1,-7,-24,0,-23,-17,9,-6,-2,-4,5,-1,-19,-30,-18,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-10,-26,-11,-3,-5,-15,7,-10,-6,-6,-1,-9,-19,1,-7,-9,-8,-13,-9,15,-3;
MA   /M: SY='T'; M=3,-9,-13,-13,-11,-12,-14,-18,-1,-13,-11,-6,-4,-15,-9,-14,17,18,6,-32,-13,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-25,-20,8,-24,-14,11,-22,21,9,-23,-27,-18,-17,-20,-8,7,-10,11,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-21,-31,-26,10,-32,-18,26,-23,19,12,-25,-28,-22,-20,-19,-7,23,-12,14,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-17,39,-25,53,15,-35,-10,-1,-36,2,-29,-27,19,-12,0,-2,2,-7,-27,-38,-19,7;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-27,-19,-30,-23,28,-30,-10,10,-24,25,10,-25,-30,-21,-18,-24,-10,3,-1,27,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,30,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,52,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-3,-18,-11,-14,-11,-18,-6,-15,-2,-5,-11,-17,-9,-17,5,3,-1,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-25,-9,-19,-29,62,-19,-38,-19,-30,-20,2,-20,-19,-19,2,-17,-28,-22,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-19,-28,-23,-3,-28,-23,23,-20,6,8,-17,-21,-19,-21,-6,5,24,-22,-5,-23;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-3,-28,-10,-20,-20,-11,-27,-18,-17,66,-11,-20,-6,-9,-25,-28,-28,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-34,-26,1,-33,-24,34,-25,23,22,-24,-24,-19,-23,-19,-8,26,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-26,-38,-29,0,-38,-29,45,-28,19,19,-21,-22,-21,-28,-18,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-11,-26,-25,-4,-22,-27,20,-19,4,5,-23,-26,-25,-19,-3,2,37,-30,-12,-25;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-10,-7,-6,-13,-12,-16,-13,-11,-16,-13,3,-11,-6,-10,27,36,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,7,24,-26,-15,-4,-26,14,-19,-13,-1,-8,9,8,-2,-7,-21,-25,-14,16;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-24,46,11,-32,-14,-6,-26,-4,-22,-21,10,-13,-4,-12,-1,-7,-17,-37,-18,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-24,-33,-22,9,-30,-18,27,-23,21,26,-21,-22,-15,-21,-20,-10,15,-17,2,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-23,-3,1,-20,-14,2,-26,16,-22,-12,3,-17,5,32,-1,-4,-18,-24,-9,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=5,4,-10,2,-2,-20,-6,-9,-20,-10,-23,-17,7,-12,-4,-11,24,19,-11,-35,-17,-3;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-29,-10,-5,-26,-3,-19,-19,-11,-24,-17,-12,39,-10,-19,0,-6,-20,-28,-26,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-28,13,30,-30,-16,-2,-28,14,-22,-15,1,-7,16,8,-1,-9,-24,-27,-16,22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-27,11,41,-29,-20,3,-26,8,-19,-12,-1,-5,25,3,-1,-9,-27,-26,-15,33;
MA   /M: SY='A'; M=42,-12,-10,-21,-12,-17,-4,-21,-5,-11,-7,-7,-12,-12,-12,-20,8,1,5,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='R'; M=0,-12,-19,-13,-5,-16,-16,-10,-15,7,-15,-8,-9,-11,-3,13,-5,-6,-7,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='E'; M=10,-4,-19,-5,15,-20,-14,-11,-15,-1,-9,-10,-7,-10,4,-6,1,-3,-11,-25,-16,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-24,-22,-28,-24,32,-28,-5,6,-18,4,2,-21,-28,-22,-16,-16,-7,6,8,40,-24;
MA   /M: SY='L'; M=12,-22,-15,-27,-19,-3,-20,-21,12,-21,20,10,-22,-22,-17,-20,-12,-5,13,-22,-9,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-27,1,13,-23,-17,-5,-23,16,-19,-10,-1,-12,10,15,-4,-5,-19,-19,-10,11;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-3,-24,-4,8,-21,-18,-9,-21,20,-20,-10,-2,-11,6,13,-2,-3,-14,-22,-10,6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00948;
//
ID   PDXS_SNZ_1_MP; MATRIX.
AC   MP01235;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PdxS/SNZ family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2929049; R2=0.0121907; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1360; N_SCORE=20.862; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-5,-27,-5,2,-32,12,-4,-27,0,-24,-10,1,-14,20,5,3,-10,-26,-22,-18,10;
MA   /M: SY='A'; M=32,-13,-12,-19,-9,-16,-10,-21,-2,-11,-6,-6,-14,-14,-12,-18,4,-1,10,-23,-17,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13,-3,-27,-22,-21,-14,-12,-25,-16,-20,80,-11,-21,-11,-10,-24,-29,-27,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-27,-25,-22,32,-31,5,6,-17,11,4,-22,-29,-16,-14,-22,-10,-3,16,55,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,22,-27,32,27,-33,-13,4,-30,2,-23,-20,7,-7,10,-6,1,-9,-26,-32,-17,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,19,12,-30,-30,-28,-20,-15,-2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='R'; M=2,-7,-24,-8,6,-22,-16,-7,-17,12,-13,-5,-6,-13,10,16,-4,-7,-12,-22,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-5,-29,-3,17,-19,-22,6,-15,3,-8,-1,-7,-13,20,1,-9,-11,-20,-14,0,18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-15,-26,-24,-3,-29,-27,22,-19,6,6,-19,-22,-22,-19,-3,13,30,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='A'; M=18,-8,-18,-13,-5,-21,-10,-2,-16,5,-15,-8,-6,-14,-3,1,1,-5,-6,-23,-12,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,2,-28,4,13,-28,-17,-4,-28,25,-24,-12,2,-12,15,27,-3,-7,-22,-24,-13,13;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-10,-19,-15,-9,-5,-20,-2,1,-15,11,12,-7,-20,-7,-11,-8,2,-2,-26,-5,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-30,59,-18,-38,-13,-30,-18,0,-19,-14,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-28,-7,3,-22,-21,-5,-26,31,-21,-9,-2,-17,7,48,-9,-8,-16,-21,-10,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,46,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,14,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-16,-26,-23,-6,-28,-28,20,-18,2,4,-26,-8,-25,-20,-8,1,32,-30,-13,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-9,11,-20,1,-4,-13,-13,1,-8,-9,-4,-5,22,-21,0,-6,-2,0,-16,-31,-11,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,76,-30,-20,1,-30,12,1,-21,-30,-39,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='A'; M=32,-10,-10,-18,-12,-16,-7,-20,-6,-11,-9,-8,-9,-12,-12,-17,12,11,5,-25,-17,-12;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-29,1,-35,-29,38,-25,18,15,-25,-25,-25,-25,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,5,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-11,-18,-8,-21,-1,-18,-11,-9,-11,-10,-9,-10,-6,-18,11,0,-2,-21,-19,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-12,-19,-12,-19,4,-20,-10,-12,-11,-10,-10,-13,-12,-19,9,-1,1,-22,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-18,-30,-22,1,-22,-7,22,-13,21,48,-22,-22,-7,-12,-19,-8,17,-22,-2,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-29,-19,-1,-21,-2,17,-8,17,52,-19,-21,-1,-5,-19,-9,10,-21,-1,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-32,-1,20,-30,-20,11,-23,5,-20,-6,-4,-11,38,3,-6,-13,-30,-2,-5,29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,6,-20,-13,-18,-7,-20,-10,-13,-11,-9,-11,-16,-13,-20,9,1,2,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-30,56,26,-38,-12,1,-37,2,-28,-26,15,-8,9,-7,0,-10,-30,-37,-19,17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,0,-31,-30,31,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,49,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-7,-13,-30,62,-18,-39,-17,-29,-20,0,-18,-16,-18,0,-19,-30,-21,-29,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00949;
//
ID   PDXT_SNO_1_MP; MATRIX.
AC   MP01236;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   PdxT/SNO family family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8610148; R2=0.0139913; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=449; N_SCORE=11.133; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=118; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-29,21,37,-28,-17,-3,-28,7,-22,-19,4,-6,12,-1,-1,-7,-26,-24,-17,25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=9,-18,-16,-21,-17,-10,-17,-17,7,-16,-2,0,-16,-9,-16,-18,-2,1,14,-25,-12,-18; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-22,-22,-25,-19,-6,-29,-19,16,-5,3,8,-18,-23,-14,-2,-13,-5,20,-22,-3,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-8,-26,-9,6,-17,-19,-8,-13,1,-10,-6,-8,-10,3,1,-7,-6,-13,-13,-9,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-16,-32,-28,0,-32,-29,32,-23,15,12,-26,-26,-25,-22,-13,-2,38,-26,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-24,-9,-1,-16,-19,-1,-19,14,-17,-8,-2,-16,4,22,-2,0,-12,-22,-6,0;
MA   /M: SY='P'; M=1,-13,-26,-11,-4,-22,-16,-16,-14,-1,-19,-12,-10,22,-7,-4,-2,-4,-11,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-28,12,23,-29,4,-7,-30,3,-23,-19,5,-9,4,-4,0,-10,-26,-28,-21,14;
MA   /M: SY='D'; M=-14,18,-28,28,19,-30,-18,-1,-21,-1,-17,-14,4,-11,10,-7,-3,-9,-18,-32,-15,14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-31,-23,12,-30,-22,22,-28,38,17,-29,-30,-23,-20,-25,-8,18,-20,0,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-27,16,15,-29,-13,-3,-26,4,-24,-18,5,4,6,-2,1,-7,-24,-31,-18,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-26,6,14,-24,-2,-5,-27,1,-20,-15,1,-11,5,0,2,-6,-22,-26,-16,9;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-26,9,-31,-26,-3,-30,-26,17,-25,12,9,-23,-28,-23,-23,-13,-5,21,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-13,37,-27,51,19,-35,-11,-3,-35,2,-28,-26,15,-9,1,-7,4,-5,-26,-37,-19,10;
MA   /M: SY='G'; M=13,-11,-22,-14,-15,-23,28,-18,-24,-10,-20,-13,-5,-18,-13,-8,2,-10,-13,-21,-23,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,27,-28,38,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-29,-21,-35,-29,0,-34,-29,38,-26,18,15,-24,-24,-24,-25,-16,-6,35,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-37,-27,5,-37,-27,40,-30,28,19,-23,-23,-21,-27,-23,-10,24,-19,1,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-10,-11,-11,1,-10,-9,-10,21,48,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='T'; M=10,-6,-10,-15,-13,-11,-17,-21,-5,-11,-8,-7,-6,-13,-13,-13,14,32,7,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-26,-35,-24,3,-33,-20,34,-24,23,28,-21,-22,-13,-22,-21,-10,19,-19,1,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-18,-3,-9,-17,7,-12,-21,-11,-16,-12,-1,-18,-9,-8,5,-1,-15,-23,-13,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-29,-7,2,-22,-20,-3,-24,30,-20,-8,0,-16,7,38,-10,-10,-17,-21,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-20,13,-30,-20,19,-29,42,18,-28,-29,-19,-20,-27,-10,10,-18,2,-20;
MA   /M: SY='L'; M=5,-22,-19,-28,-19,-1,-22,-18,16,-21,23,18,-20,-21,-14,-19,-15,-4,10,-21,-5,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-26,3,9,-20,-14,2,-22,6,-16,-10,1,-14,9,9,-3,-8,-19,-24,-9,8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-24,0,6,-22,-17,-7,-23,14,-18,-11,0,-13,5,21,1,1,-15,-26,-13,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-7,-21,-9,-3,6,-21,-1,-9,-11,-5,-6,-5,-19,-9,-11,-3,3,-9,-14,11,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-28,5,-9,-31,43,-12,-36,-12,-29,-20,9,-18,-10,-13,2,-15,-29,-25,-26,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-34,-25,10,-33,-23,29,-29,34,19,-26,-27,-22,-23,-24,-9,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-14,-21,-16,-11,10,-21,-13,-1,-14,6,0,-15,-21,-15,-14,-12,-7,0,-12,6,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,19,-28,27,30,-32,-11,-3,-31,6,-24,-21,7,-4,9,-3,1,-8,-27,-31,-20,19;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-9,-28,-3,17,-25,-20,-13,-20,-1,-17,-14,-12,30,0,-8,-8,-10,-23,-28,-21,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-33,-24,4,-33,-24,30,-26,30,17,-25,-26,-20,-20,-23,-9,22,-21,-2,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00950;
//
ID   UPF0028_MP; MATRIX.
AC   MP01237;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0028 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6624489; R2=0.0129900; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1380; N_SCORE=22.579; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-23,-11,-6,-14,-15,-6,-15,6,-6,-6,2,-20,-1,24,-7,-6,-12,-23,-12,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-26,-22,-26,-16,4,-28,-16,10,-18,36,14,-24,-28,-14,-2,-26,-10,4,-20,-2,-16;
MA   /M: SY='A'; M=40,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-2,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,10,-22,-18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-22,-5,-3,-32,22,-22,-12,0,-20,5,55,-8,-12,-22,-20,-13,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-24,-33,-29,-22,-8,-12,-22,7,-15,-3,1,-15,-21,-14,-8,-17,-15,0,5,-3,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-22,-20,-27,-18,1,-24,-14,18,-21,23,25,-19,-22,-11,-17,-14,-5,10,-23,-3,-15;
MA   /M: SY='S'; M=15,-4,-13,-10,-6,-17,-9,-14,-16,-4,-17,-13,0,-11,-4,-1,18,18,-6,-28,-16,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-27,-5,-8,-28,33,-15,-34,2,-30,-17,2,-15,-8,-4,4,-10,-24,-23,-23,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-12,0,-30,-5,-2,-22,-17,-7,-11,-2,-20,-11,8,15,2,2,-5,-7,-20,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='K'; M=10,-4,-19,-7,0,-23,-9,-11,-22,14,-23,-13,0,-12,2,12,9,1,-12,-26,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-28,2,-37,-28,42,-28,23,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,23,-30,47,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='V'; M=23,-21,-10,-25,-21,-9,-16,-25,12,-15,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,27,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,15,-28,-17,18,-27,41,24,-27,-28,-19,-18,-27,-10,9,-17,3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,38,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,18,-2,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=4,-24,-24,-28,-20,4,-21,-16,5,-19,11,2,-23,-23,-15,-19,-17,-10,0,13,12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-23,-35,-26,13,-31,-25,28,-27,22,13,-22,-24,-23,-24,-19,-8,19,-16,2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-11,-29,-27,-2,-26,-25,25,-18,9,14,-27,-27,-24,-19,-9,-1,40,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-26,-33,-24,9,-34,-18,29,-27,30,17,-24,-26,-18,-23,-24,-10,15,-12,13,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,4,-26,1,10,-30,-14,3,-23,14,-24,-9,10,-13,28,18,4,-4,-24,-26,-13,18;
MA   /M: SY='A'; M=35,-5,-13,-11,3,-22,-3,-15,-15,-7,-14,-13,-6,-8,-4,-15,13,1,-6,-24,-20,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-27,-6,5,-21,-22,8,-18,11,-16,-5,-1,-14,11,18,-4,-2,-16,-24,-6,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,46,-30,-20,-3,-30,21,-23,-17,0,-3,17,9,-3,-10,-27,-27,-17,31;
MA   /M: SY='R'; M=5,-8,-21,-10,0,-21,-16,4,-15,4,-14,-5,-6,-15,4,7,-3,-7,-7,-24,-9,0;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-11,-31,49,-15,-36,-9,-29,-16,0,-18,-6,-11,-1,-18,-29,-20,-25,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-34,-28,5,-36,-22,36,-24,14,14,-23,-24,-21,-24,-17,-7,28,-14,11,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,1,-30,10,18,-28,-20,-10,-18,-2,-20,-15,-7,19,4,-10,-5,-8,-17,-31,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-27,53,12,-33,-13,-5,-28,-3,-23,-23,12,-13,-5,-12,-2,-8,-17,-38,-18,3;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-24,-26,-20,-8,-10,-13,9,-11,4,22,-14,-21,-9,-4,-14,-11,7,-21,-8,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-20,-36,-30,13,-34,-28,33,-26,14,12,-24,-26,-28,-24,-16,-6,34,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=23,-10,-21,-15,-15,-25,38,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,9,-12,-12,-13,-17,-20,-11,-14,-15,-12,-4,-17,-12,-14,18,26,2,-36,-16,-12;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-24,-31,-22,-3,-27,-18,30,-21,12,26,-15,-18,-11,-21,-10,-5,17,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-33,-24,14,-32,-23,24,-28,35,16,-27,-28,-24,-22,-24,-8,19,-19,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-14,-30,-26,5,-25,-24,21,-19,9,13,-24,-25,-23,-19,-10,-3,31,-23,-6,-24;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=24,-8,-17,-12,-11,-23,23,-18,-22,-13,-21,-16,-2,-13,-11,-18,14,-2,-12,-25,-23,-11;
MA   /M: SY='L'; M=9,-24,-15,-28,-20,9,-21,-22,10,-22,19,6,-23,-24,-21,-20,-13,-5,12,-17,-4,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-31,-22,-19,27,-27,21,-8,-14,-4,-2,-17,-28,-13,-11,-21,-14,-14,32,56,-18;
MA   /M: SY='A'; M=43,-11,6,-21,-12,-20,-4,-21,-12,-12,-11,-11,-11,-14,-12,-21,8,-1,-1,-24,-21,-12;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,4,-15,-7,-16,-14,-18,-13,-9,-7,-9,-10,-17,-9,-13,3,3,-5,-28,-16,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,9,-27,13,1,-29,24,-13,-34,-10,-25,-21,5,-13,-9,-13,3,-5,-25,-28,-23,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-30,-13,-5,-14,-21,13,-17,7,-13,2,-7,-3,3,25,-13,-11,-17,-18,1,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-16,24,-26,33,5,-22,-15,-5,-19,-9,-5,-13,9,-17,-6,-12,-8,-9,-18,-34,-14,-1;
MA   /M: SY='V'; M=1,-4,-20,-3,-10,-15,-18,-17,3,-15,-2,-4,-7,-17,-12,-18,-1,-3,6,-29,-12,-12;
MA   /M: SY='A'; M=11,-9,-18,-11,-2,-19,-2,-16,-13,-6,-13,-10,-8,-14,-8,-7,3,0,-3,-25,-18,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00951;
//
ID   GDA1_CD39_NTPASE_MP; MATRIX.
AC   MP01238;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   GDA1/CD39 family of nucleoside phosphatases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2901297; R2=0.0152938; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=308; N_SCORE=9.991; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-25,-11,0,-10,-16,-11,-19,2,-19,-12,-8,9,-4,-3,-1,-5,-16,-21,-11,-3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=2,0,-18,-5,-4,-16,-12,2,-15,3,-18,-9,5,-15,-2,1,5,3,-9,-25,-6,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-15,-23,-17,-9,-8,-14,-6,0,-11,1,4,-11,-18,-6,-8,-11,-10,-2,-20,-5,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-13,-4,-2,-7,-10,-7,-13,4,-14,-8,3,-10,-1,4,7,9,-8,-18,-6,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-2,13,-14,16,9,-19,-7,-4,-18,-2,-16,-14,7,-6,3,-5,9,4,-13,-24,-12,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-23,-24,-19,33,-25,0,-1,-16,2,2,-16,-26,-15,-13,-12,-6,-5,7,39,-17;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-11,-25,-5,1,-19,-13,-12,-14,-1,-19,-12,-11,49,-5,-8,-6,-6,-18,-18,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-12,-25,-19,47,-19,-13,2,-19,6,1,-13,-19,-25,-13,-12,-6,3,4,17,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-19,-14,-7,0,-17,-4,-3,-11,5,1,-10,-2,-6,-6,-12,-7,-8,-15,-3,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-18,-9,-20,-19,4,-21,-20,15,-15,4,4,-17,-19,-20,-14,-3,5,26,-20,-5,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-24,20,11,-27,-5,-5,-25,-1,-23,-18,10,-4,2,-6,6,-3,-22,-32,-18,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,3,-21,7,-1,2,-14,-9,-16,-4,-12,-11,-3,2,-10,-7,-7,-7,-14,-14,-3,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,9,-25,14,6,-20,-5,-5,-27,-1,-22,-17,5,-14,3,2,3,-6,-21,-26,-14,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-9,-21,-12,-14,-21,20,-2,-30,-15,-25,-16,-2,-21,-8,-14,-4,-15,-26,-1,-12,-11;
MA   /M: SY='V'; M=13,-21,-14,-27,-22,-7,-22,-26,18,-18,4,4,-19,-20,-20,-21,-3,3,25,-25,-11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-22,-2,9,-24,-14,-3,-24,10,-23,-13,3,-12,15,21,11,3,-18,-28,-14,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-28,-36,-27,-3,-37,-29,41,-27,14,15,-21,-11,-20,-28,-18,-9,27,-22,-4,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-35,-25,2,-32,-20,35,-25,27,31,-22,-22,-15,-22,-22,-10,20,-20,0,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-7,23,-21,29,11,-27,-7,-6,-28,-4,-25,-22,14,-10,-1,-9,13,8,-20,-36,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-20,2,10,-25,-12,-7,-20,6,-21,-13,4,-9,10,0,10,7,-16,-28,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-13,7,-31,13,24,-24,-18,-2,-24,2,-19,-13,-2,-10,15,-4,-5,-8,-26,-7,-7,20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-24,-16,-27,-22,-3,-26,-25,22,-22,11,8,-20,-23,-20,-21,-6,-1,26,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-25,-25,-21,39,-28,4,0,-17,4,0,-19,-29,-18,-13,-17,-8,-6,17,55,-21;
MA   /M: SY='A'; M=24,-10,-17,-16,-13,-21,19,-18,-17,-14,-14,-9,-6,-15,-12,-18,7,-5,-9,-22,-21,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-39,-47,-40,-30,17,-21,-29,-18,-21,-17,-18,-38,-30,-22,-20,-38,-28,-27,137,30,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-24,-36,-28,0,-35,-29,40,-27,18,16,-22,-22,-22,-27,-17,-7,32,-22,-3,-28;
MA   /M: SY='T'; M=9,-3,-13,-12,-11,-14,-4,-20,-14,-11,-13,-11,-2,-11,-11,-13,16,32,-4,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='V'; M=5,-24,-16,-29,-23,-3,-26,-26,23,-21,14,9,-22,-23,-21,-22,-10,0,26,-24,-8,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20,36,-29,19,-3,-14,0,0,-17,-29,-14,-11,-19,-11,-10,20,64,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-28,-19,-30,-20,6,-27,-21,19,-27,39,16,-27,-27,-20,-21,-24,-8,13,-21,-3,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-18,-24,-17,5,-25,-16,11,-23,30,13,-21,-25,-15,-17,-16,1,5,-20,2,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-6,-7,-29,49,-15,-38,-11,-28,-19,0,-17,-12,-9,-1,-18,-29,-21,-27,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,11,-23,3,2,-22,-12,6,-23,13,-24,-12,21,-16,8,19,3,1,-22,-29,-12,3;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-36,-26,39,-31,-21,15,-30,29,11,-24,-29,-29,-21,-24,-10,8,-7,13,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-1,-27,-3,-7,-22,14,-6,-19,-10,-18,-11,6,-17,-9,-12,-2,-11,-18,-26,-16,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-27,4,9,-29,-2,-2,-29,14,-25,-13,1,-11,6,5,-2,-8,-23,-24,-14,7;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-29,3,1,-13,-18,0,-18,5,-18,-11,-1,-5,-3,0,-8,-7,-17,-19,0,-2;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-2,2,-21,0,1,-15,-3,-4,-17,-5,-17,-13,5,-4,-3,-6,2,-3,-17,-20,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-15,3,-1,-16,-2,-9,-15,-3,-13,-11,0,-2,-4,-5,4,2,-11,-20,-13,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-7,-26,-5,1,-10,-13,-12,-18,-3,-16,-12,-8,-11,-1,-6,-5,-6,-18,8,-3,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-7,-12,-8,-1,-3,-12,-3,-6,-2,-2,-3,-5,-11,-4,1,-2,-1,-3,-13,-3,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-2,-8,-1,-7,-20,-5,-11,-20,-9,-18,-14,-3,-7,-10,-12,3,3,-12,-30,-17,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-10,-18,-14,-6,-7,-20,-13,-2,-5,-6,4,-9,-13,-8,-6,0,7,4,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='W'; M=4,-16,-28,-18,-17,-14,4,-22,-11,-17,-13,-11,-14,-13,-16,-20,-9,-11,-10,8,-10,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00952;
//
ID   DYNEIN_LIGHT_1_MP; MATRIX.
AC   MP01239;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dynein light chain type 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4811020; R2=0.0138569; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1058; N_SCORE=19.132; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=31,-6,-13,-14,-5,-21,-5,-15,-12,-7,-14,-10,-5,-10,0,-14,14,7,-5,-24,-18,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-17,-24,-22,-21,34,-27,6,0,-16,0,-1,-12,-28,-19,-13,-15,-9,-3,6,41,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-30,2,18,-28,-20,-6,-30,37,-26,-12,0,-10,12,33,-8,-10,-22,-22,-12,14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,25,56,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,18,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-25,42,-29,-18,10,-28,27,15,-24,-29,-27,-19,-24,-10,5,-6,14,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-25,-1,7,-27,-15,-7,-26,27,-28,-12,3,-11,12,23,4,-2,-18,-25,-13,9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-5,-29,-5,5,-24,-21,-9,-25,38,-20,-7,-3,-14,7,33,-12,-10,-17,-20,-9,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-27,-22,-18,33,-28,12,-5,-9,-2,-1,-16,-27,-14,-8,-18,-11,-10,16,54,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-29,-5,-11,-27,32,-6,-31,-14,-29,-19,6,1,-12,-15,2,-12,-28,-27,-24,-12;
MA   /M: SY='P'; M=13,-11,-25,-12,-6,-26,4,-6,-21,-11,-21,-13,-8,16,-6,-16,0,-9,-19,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='T'; M=1,3,-11,-6,-7,-13,-15,-16,-13,-9,-15,-13,6,-11,-7,-9,23,41,-4,-33,-13,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-46,-36,-28,14,-22,-21,-16,-18,-16,-16,-36,-30,-18,-18,-36,-26,-26,128,39,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-24,65,-30,-30,-12,-30,-30,-5,-26,-7,-7,-24,-36,-30,-26,-10,-6,15,-42,-22,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,12,-30,-30,-3,-30,-30,20,-22,5,5,-28,-32,-30,-22,-10,-2,40,-33,-13,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='N'; M=-4,9,6,1,-5,-20,-8,9,-23,-10,-27,-17,20,-20,-4,-9,15,3,-19,-40,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-18,-24,-22,-17,22,-23,2,-7,-7,-3,-4,-15,-25,-12,0,-13,-8,-8,9,37,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,4,-10,-6,-10,27,39,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-30,-3,-3,-12,-22,87,-25,-10,-17,0,5,-22,7,-2,-12,-18,-27,-20,30,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-3,-17,-10,-5,-15,-18,-11,-10,1,-11,2,-2,-12,3,-2,8,22,-5,-27,-9,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-7,-30,-7,-5,-27,18,-2,-34,8,-26,-13,1,-18,1,16,-5,-15,-26,-21,-16,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-28,-2,2,-15,-19,54,-24,-2,-19,-2,8,-18,14,3,-8,-15,-26,-24,10,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-36,-28,-1,-37,-29,42,-27,16,16,-19,-20,-20,-27,-15,-3,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-18,-16,17,-28,28,-2,-13,5,3,-16,-28,-8,-10,-20,-12,-10,11,56,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26,54,-28,-16,7,-26,19,14,-22,-28,-29,-18,-22,-10,4,-1,19,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-13,-30,-13,-9,9,-26,9,-11,11,-11,-4,-13,-23,-3,4,-16,-10,-14,12,48,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,5,-32,-26,1,-32,-26,19,-27,22,11,-27,-30,-24,-23,-19,-7,21,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-8,15,-28,17,-3,-32,31,-8,-35,-9,-29,-21,15,-17,-6,-12,2,-13,-30,-29,-24,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-26,2,8,-26,-19,2,-22,5,-21,-11,-1,6,9,0,1,5,-20,-28,-12,7;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-24,-6,-25,-21,3,-29,-14,7,-14,11,5,-23,-30,-18,-6,-17,-7,12,-17,7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=27,0,-15,-10,-6,-20,-4,7,-15,-8,-15,-10,5,-14,-5,-13,6,-4,-11,-25,-13,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-18,-36,-29,32,-32,-25,20,-26,15,9,-24,-28,-31,-22,-17,-6,23,-12,8,-29;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00953;
//
ID   PNP_MTAP_2_MP; MATRIX.
AC   MP01240;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Purine and other phosphorylases family 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5621853; R2=0.0161983; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=548; N_SCORE=14.429; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=58; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-9,7,-28,11,-1,-25,-3,29,-28,-7,-21,-11,6,-16,-1,-3,-5,-14,-23,-29,-5,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-28,1,14,-27,-16,-7,-24,9,-22,-14,-3,8,10,8,0,-4,-22,-26,-18,10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-27,-21,-30,-21,2,-30,-22,25,-25,29,16,-25,-25,-17,-21,-21,-8,19,-22,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-17,-22,-18,-5,-6,-26,-14,5,-7,4,5,-15,-20,-4,-3,-11,-6,7,-23,-7,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-22,-22,-13,5,-27,-16,7,-12,6,3,-15,-22,-13,-3,-11,-6,7,-18,0,-14;
MA   /M: SY='G'; M=5,-13,-26,-14,-20,-25,48,-21,-26,-19,-22,-14,-5,-20,-20,-20,-1,-15,-17,-21,-26,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-25,1,3,-18,-20,-4,-16,3,-14,-7,-1,-9,2,4,-1,2,-13,-27,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-25,-21,-19,1,-21,-13,14,-21,15,10,-14,-24,-15,-19,-17,-8,5,-15,7,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-1,9,-22,5,7,-21,-3,-5,-24,4,-24,-16,13,-13,3,-1,7,-3,-21,-28,-16,5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-26,-9,-14,-25,42,-11,-29,-16,-24,-16,1,-19,-15,-17,0,-15,-21,-23,-24,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-14,-21,-16,-11,-6,-21,-3,-6,-1,-7,-2,-8,-22,-6,10,-7,-6,3,-23,-5,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-24,3,16,-23,-19,8,-23,0,-15,-12,-3,-1,6,3,-4,-8,-21,-28,-12,9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,17,-30,-28,-6,-28,-28,15,-22,3,5,-25,-29,-26,-23,-10,-4,29,-32,-14,-27;
MA   /M: SY='V'; M=11,-24,-14,-28,-22,-3,-22,-24,18,-20,14,10,-23,-23,-20,-20,-10,-3,24,-24,-9,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,-10,-33,-26,31,-28,-21,11,-26,18,10,-24,-29,-28,-20,-19,-8,13,-12,7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-32,-22,10,-28,-16,22,-25,37,29,-26,-26,-16,-18,-26,-10,12,-19,1,-19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=17,-8,-10,-11,-5,-8,-4,-11,-7,-7,-8,-7,-8,7,-7,-11,1,-2,-4,-11,-10,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-17,-6,0,-11,-11,0,-17,17,-11,-6,0,-11,6,40,-6,-6,-11,-11,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-28,-2,1,-24,-10,55,-27,-4,-21,-4,8,-17,13,0,-5,-15,-27,-27,4,4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,64,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-2,-17,-23,3,-17,16,-14,-5,-4,-19,4,40,-11,-10,-10,-22,-7,-3;
MA   /M: M=-10,-11,-27,-14,-8,-4,-7,-13,-12,-8,-11,-7,-6,-9,-8,-7,-7,-6,-13,-17,-5,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: M=-6,-7,-23,-9,-5,-1,-15,-11,-9,-9,-4,-3,-7,-14,-10,-6,-7,-5,-7,-19,-4,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-28,-23,25,-32,-1,14,-20,14,8,-22,-28,-17,-17,-22,-10,3,9,44,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-29,0,22,-24,-18,-8,-18,-1,-17,-7,-9,22,5,-9,-3,-6,-21,-29,-20,12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-10,-9,-30,18,-20,-29,-14,-30,-20,-11,43,-14,-20,-6,-14,-30,-26,-30,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-25,-4,-4,-14,-13,30,-22,-3,-20,-8,4,-13,1,1,0,-4,-20,-21,9,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-27,10,10,-30,-3,-6,-28,8,-27,-16,8,-6,8,1,3,-4,-24,-28,-18,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-15,-32,-27,7,-30,-25,27,-23,19,17,-27,-28,-25,-20,-16,-4,34,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-12,9,-27,3,-1,-16,-12,-4,-21,0,-24,-17,17,1,-3,5,-1,-3,-25,-21,-14,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-20,-23,-22,18,-26,-5,8,-15,2,4,-17,-27,-18,-14,-11,-2,11,-3,28,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-21,-12,-6,-15,-22,-5,-14,8,-12,-5,-5,-19,1,27,-2,7,-4,-25,-8,-5;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,-17,-16,-11,-1,-10,2,-13,-13,-9,-7,-7,-16,-12,-16,0,-6,-7,-17,-3,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-26,7,-2,-24,0,-3,-21,-5,-29,-19,28,12,-5,-9,3,-5,-28,-34,-24,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,1,-35,-27,39,-26,20,19,-24,-24,-22,-25,-18,-7,33,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-17,-26,-18,-12,-10,-18,-12,-23,4,-18,-14,-14,-23,-5,19,-16,-14,-20,30,3,-9;
MA   /M: SY='A'; M=31,-12,-10,-20,-14,-14,-10,-22,-2,-12,-6,-6,-12,-14,-14,-18,8,9,10,-24,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-18,-30,-20,13,-24,-19,12,-25,32,15,-25,-26,-19,-19,-21,-8,7,-16,0,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-21,-4,3,-23,-18,2,-25,26,-23,-9,1,-15,7,20,-7,-9,-19,-20,-4,4;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-2,-22,-4,7,-22,-13,-1,-16,-1,-11,-7,-1,-13,10,-2,1,-5,-15,-25,-12,8;
MA   /M: SY='L'; M=4,-19,-18,-22,-11,-3,-21,-17,5,-17,20,8,-19,-21,-12,-13,-13,-2,4,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-29,-8,-19,-29,66,-18,-39,-19,-30,-20,3,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=11,-23,17,-27,-25,-9,-22,-27,7,-19,-2,-2,-23,-27,-25,-22,-5,-2,24,-31,-17,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-26,12,31,-26,-19,-4,-25,8,-18,-16,1,-7,12,6,2,0,-22,-29,-16,21;
MA   /M: SY='A'; M=3,-6,-20,-11,-3,-16,-17,-2,-9,-4,-8,-5,-3,-15,-2,0,0,2,-6,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-26,4,-33,-25,33,-27,29,19,-26,-26,-22,-23,-21,-8,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-28,7,-35,-27,35,-28,24,16,-25,-25,-24,-25,-20,-8,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='A'; M=16,-19,-5,-23,-17,-9,-16,-22,5,-18,3,-1,-17,-21,-17,-19,0,0,15,-27,-14,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-14,-20,-17,5,-24,-22,3,-17,0,-2,-10,-18,-18,-15,6,23,9,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,27,-17,12,-1,-19,-3,2,-19,-3,-27,-19,42,-17,-1,-3,17,11,-22,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='A'; M=39,-9,-12,-17,-10,-20,5,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,13,3,-4,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=15,-21,20,-27,-23,-12,-20,-27,2,-19,-4,-4,-21,-25,-23,-22,-3,-2,19,-31,-18,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,36,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,19,-1,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,27,-29,41,19,-28,-28,-21,-22,-27,-9,17,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,10,-26,3,3,-23,-12,12,-25,14,-24,-11,21,-18,11,26,-1,-7,-24,-28,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=2,-2,-28,3,27,-28,-16,-8,-22,1,-20,-16,-6,18,10,-8,0,-6,-23,-27,-21,17;
MA   /M: SY='E'; M=-3,17,-25,21,26,-29,-12,2,-28,5,-23,-19,10,-8,7,-3,3,-7,-24,-31,-17,16;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-25,-34,-26,21,-30,-17,19,-23,16,15,-24,-26,-21,-20,-22,-11,12,4,16,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-30,-2,9,-31,6,-9,-30,9,-26,-14,-2,-4,9,3,-3,-12,-26,-22,-19,8;
MA   /M: SY='P'; M=6,-17,-25,-16,-8,-21,-17,-22,-9,-12,-17,-12,-17,38,-13,-19,-3,0,-7,-28,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-21,-11,-16,-26,47,-18,-35,-15,-24,-17,-3,-21,-16,-10,-3,-18,-26,-22,-26,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-25,29,8,-28,-14,12,-27,-3,-22,-14,12,-12,5,-6,4,1,-22,-34,-11,6;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-28,-24,-32,-22,22,-30,-21,14,-27,23,10,-24,-13,-24,-21,-23,-10,5,-13,4,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-1,-30,-27,3,-28,-23,20,-20,11,17,-27,-29,-24,-19,-14,-4,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-5,-32,-25,5,-31,-25,21,-27,23,11,-25,-28,-23,-23,-19,-8,19,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-25,-32,-25,-15,-12,-29,-24,14,-21,2,2,-21,25,-15,-24,-16,-10,1,-24,-13,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-23,16,5,-23,-12,10,-26,0,-24,-16,11,-14,5,1,9,1,-20,-31,-7,3;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-29,39,19,-39,-13,3,-31,3,-26,-18,12,-10,24,-2,2,-8,-29,-32,-16,21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00954;
//
ID   LINK_1_MP; MATRIX.
AC   MP01241;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Link domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1982431; R2=0.0144310; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1114; N_SCORE=21.264; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=91; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-25,-15,-8,-14,-14,-15,-11,5,-9,-5,-10,-9,-7,8,-9,-6,-7,-21,-11,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-2,3,-20,-4,-5,-14,-4,-11,-14,-8,-14,-11,9,-12,-7,-10,6,5,-13,-29,-15,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-9,-26,-10,-11,-24,21,-9,-25,-9,-23,-13,-2,-9,-10,-9,-1,-9,-18,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-10,-32,-8,1,-25,-18,-7,-20,7,-20,-10,-6,21,7,14,-8,-9,-23,-25,-17,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-29,-7,-1,2,-20,5,-13,-4,-12,-9,-10,-8,-3,-5,-8,-5,-17,-1,29,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-25,-3,6,-27,-11,-7,-25,23,-24,-10,1,-12,12,16,1,-5,-19,-24,-13,9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-33,-23,18,-31,-20,22,-28,36,21,-26,-27,-21,-21,-26,-10,12,-15,5,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,6,-11,-4,-7,-13,-14,-14,-13,-9,-16,-13,10,-11,-7,-9,22,38,-6,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-31,-22,46,-28,-13,-2,-17,9,1,-19,-28,-25,-5,-20,-10,-3,6,25,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,5,-19,5,9,-21,-15,-11,-17,-5,-15,-13,0,-10,2,-9,9,12,-11,-27,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,17,52,-30,-17,-2,-30,13,-21,-19,0,-2,18,2,-1,-10,-29,-29,-19,35;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-3,-25,-6,5,-25,-14,-2,-20,13,-18,-7,0,-14,14,15,-3,-8,-16,-23,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=3,9,-24,13,23,-28,-13,-5,-25,4,-18,-16,0,-8,10,-1,1,-7,-20,-27,-18,16;
MA   /M: SY='A'; M=18,-16,-16,-21,-10,-4,-15,-16,-1,-14,5,-1,-16,-18,-11,-17,-5,-4,3,-16,-4,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=1,-4,-25,-3,15,-25,-17,-6,-20,11,-15,-9,-5,-6,13,9,-3,-7,-18,-23,-14,13;
MA   /M: SY='A'; M=5,-3,-21,-7,3,-14,-7,-9,-17,0,-13,-8,0,-13,-2,-2,1,-4,-13,-23,-13,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-26,-2,9,-10,-22,-2,-17,0,-10,-6,-4,-15,12,5,-6,-7,-16,-20,-5,11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,14,-26,12,-6,-28,31,-9,-32,-10,-28,-21,18,-17,-10,-13,3,-11,-27,-29,-25,-8;
MA   /M: SY='A'; M=28,-11,-14,-16,-11,-18,8,-19,-13,-14,-10,-10,-8,-14,-11,-18,8,0,-5,-23,-19,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-17,-14,-9,-13,-21,-14,-4,-5,-8,-4,-6,-15,-3,-2,6,19,3,-27,-10,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-23,7,-32,-22,27,-29,40,22,-27,-27,-19,-22,-27,-10,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='A'; M=39,-11,-15,-18,-8,-22,-3,-20,-12,-10,-14,-12,-11,6,-10,-20,8,-1,-5,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-12,-5,-4,-16,-11,-15,-16,-4,-21,-14,4,-10,-4,-6,26,31,-6,-33,-14,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-19,-22,-17,0,-23,-10,6,-10,2,10,-17,-18,-10,-9,-8,1,10,-15,5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,7,-28,9,2,-30,22,-11,-32,-5,-27,-20,7,-8,-7,-11,1,-12,-26,-27,-24,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,2,21,-38,-19,12,-21,9,-20,-2,2,-10,54,9,0,-10,-30,-22,-10,38;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-22,6,-29,-18,23,-25,38,27,-28,-28,-17,-19,-25,-9,15,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-25,-3,11,-6,-20,13,-17,-3,-14,-8,-4,-15,8,-4,-1,-6,-18,-15,10,8;
MA   /M: SY='A'; M=26,-12,-15,-18,-8,-12,-9,-14,-7,-8,-4,-5,-12,-14,-8,-15,2,-2,-1,-17,-8,-9;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-25,-38,-25,-13,-4,-22,-14,-15,-8,-10,-8,-24,-24,2,-1,-25,-19,-22,62,14,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-27,2,8,-26,-16,0,-28,27,-26,-12,7,-13,11,27,-1,-6,-21,-25,-12,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: M=-2,-3,-23,-6,-4,-14,-13,-9,-8,-5,-8,-5,0,-16,-3,-6,-3,-6,-9,-24,-10,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,62,-19,-39,-14,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-33,-25,48,-30,-13,7,-26,21,7,-23,-30,-28,-18,-23,-10,1,4,29,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-17,27,-30,39,28,-33,-15,22,-35,1,-25,-20,12,-9,8,-5,-2,-12,-30,-35,-11,17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-23,-14,-6,-13,-22,-11,-11,1,-7,-4,-9,-18,2,10,-5,6,-7,-12,-5,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-7,12,-22,16,2,-18,-11,-3,-23,-1,-21,-17,9,-15,-2,3,6,-1,-18,-27,-8,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=13,-16,-21,-20,-14,-2,-12,-6,-5,-11,-7,-4,-15,-9,-11,-16,-4,-5,-5,-4,14,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-38,-45,-40,-30,21,-22,-28,-17,-22,-15,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-25,127,30,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-32,-23,7,-31,-21,26,-28,39,21,-28,-28,-20,-21,-26,-9,18,-21,-1,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=18,-6,-15,-9,0,-18,-1,-11,-15,0,-13,-10,-4,-10,-3,-2,5,-2,-8,-19,-15,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-27,42,24,-33,-12,-1,-33,5,-27,-24,17,-9,5,-4,3,-5,-27,-36,-19,14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-29,-9,-13,-31,52,-16,-35,-15,-27,-16,-1,-18,-8,-16,1,-17,-28,-20,-26,-10;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-17,-6,-4,-8,-10,5,-20,-6,-21,-13,6,-15,-2,3,17,8,-13,-29,-7,-4;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-11,-27,-26,-2,-26,-27,23,-19,9,7,-25,-27,-26,-19,-7,2,38,-29,-10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-15,-22,-16,-10,-17,-14,-12,-11,6,-11,-4,-10,-20,-2,22,-6,-6,1,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-30,-24,-21,17,-31,15,10,-16,3,5,-16,-26,-11,-14,-19,-11,-1,8,49,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-23,-26,-19,-7,-29,-21,17,-10,3,6,-15,-18,-13,-1,-11,-2,17,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-18,-25,-21,-6,-26,-23,22,-19,3,6,-14,-20,-16,-20,-3,3,23,-27,-8,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-10,-21,-14,-10,0,-22,11,-10,-7,-10,-3,-4,-19,-6,-1,-3,3,-6,-20,6,-9;
MA   /M: SY='P'; M=6,-16,-30,-11,-2,-27,-13,-19,-18,-10,-25,-18,-14,56,-9,-19,0,-4,-21,-29,-27,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-9,5,-23,-1,-3,-20,-6,1,-24,9,-24,-14,17,-19,2,27,4,-3,-19,-29,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=5,-9,-26,-8,4,-25,-14,-13,-18,-1,-20,-13,-8,22,2,-5,1,-3,-18,-26,-20,1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-28,-4,-2,-22,-18,-7,-12,6,-17,-8,5,-4,4,11,-5,-7,-15,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-24,-12,-17,-26,48,-20,-30,-17,-24,-17,-3,-18,-17,-20,4,-13,-20,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-5,-25,-9,-11,-20,23,-15,-26,-8,-24,-16,2,-7,-12,-12,1,-10,-21,-22,-21,-12;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-16,3,-6,-14,14,-5,-16,-8,-15,-11,15,-13,-6,-7,3,-3,-16,-21,-14,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: M=-5,-4,-25,-5,-2,-18,-2,-5,-16,-3,-11,-8,0,-17,-5,-3,-5,-9,-13,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-16,-22,-15,-11,-15,-18,-21,-5,-11,-9,-7,-15,13,-14,-14,-2,7,-1,-28,-16,-14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-28,-10,-19,-28,60,-20,-36,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-14,-26,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-15,-30,-29,-2,-25,-29,29,-22,9,10,-26,-27,-27,-22,-11,-3,40,-27,-10,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-17,-24,-18,-12,-5,-24,-7,-4,4,-4,-1,-12,-23,-6,19,-11,-7,2,-14,5,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-20,-6,-11,-10,-18,-18,0,-15,-7,-6,-2,-14,-12,-17,5,14,1,-27,-9,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-28,-25,-29,-24,15,-22,-15,8,-23,17,6,-26,-29,-21,-18,-23,-11,5,9,18,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-22,-12,-15,-2,10,-6,-15,-11,-11,-8,-4,-20,-13,-9,-4,-5,-13,-7,6,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=2,-12,-21,-14,-11,-16,-2,-16,-11,-10,-9,-7,-7,-12,-8,-5,3,2,-7,-25,-15,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-9,-24,-14,-12,13,-16,-3,-15,-6,-13,-9,1,-16,-12,6,-5,-6,-15,-12,7,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-26,-4,2,-21,-14,-11,-17,-6,-16,-13,-5,18,-5,-11,-1,2,-18,-29,-18,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,54,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00955;
//
ID   ZF_FPG_1_MP; MATRIX.
AC   MP01242;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger FPG-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0657563; R2=0.0092073; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=631; N_SCORE=9.875; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=265; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=4,-9,-13,-9,-6,-11,-9,-13,-8,-16,-7,-8,-2,-16,-6,-13,20,11,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-25,-14,-14,5,-9,5,-11,-9,-9,-6,-9,-21,-8,-9,-10,-9,-14,4,33,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-21,-31,-24,52,-26,-11,-1,-23,6,0,-17,-27,-28,-16,-17,-9,-2,6,29,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-2,-24,-2,6,-28,-5,-5,-19,-1,-17,-8,-1,-12,19,-3,4,-4,-19,-24,-15,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-26,-6,2,-17,-15,6,-17,1,-13,-5,3,-14,13,6,-5,-7,-19,-23,-7,7;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-3,-24,-2,11,-16,-17,2,-19,2,-16,-8,0,-13,11,6,3,-4,-17,-25,-8,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-16,-29,-21,20,-27,-15,9,-26,29,10,-23,-28,-22,-19,-21,-6,4,-13,8,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-27,-6,-2,-10,-17,-1,-19,6,-17,-7,-1,-17,4,4,-8,-8,-19,-4,1,1;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-11,-29,-28,-2,-27,-29,27,-20,9,9,-27,-27,-27,-21,-9,-1,43,-28,-10,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-20,-20,31,-29,22,-2,-12,0,0,-18,-29,-11,-10,-19,-11,-10,24,72,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-29,-2,-11,-28,39,-8,-36,-9,-27,-17,3,-18,-11,-7,-1,-14,-27,-23,-22,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-7,3,-23,-20,1,-29,32,-22,-9,1,-17,13,55,-9,-10,-21,-21,-9,4;
MA   /M: SY='E'; M=3,2,-24,3,13,-26,-6,-9,-23,3,-20,-15,-1,-4,3,-5,2,-4,-17,-27,-18,7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-29,-1,-11,-30,47,-14,-36,-12,-29,-19,6,-16,-12,-14,0,-16,-29,-23,-27,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-27,6,29,-28,-18,3,-23,13,-18,-9,-1,-7,23,7,-3,-9,-24,-24,-12,26; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-29,-7,2,-23,-13,-13,-18,-6,-21,-14,-10,39,-4,-13,-4,-7,-22,-26,-21,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-28,-6,1,-20,-16,-10,-17,7,-14,-8,-7,1,0,12,-9,-9,-15,-24,-13,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-19,-8,-1,-15,-17,-2,-9,6,-10,-3,-2,-14,6,15,-4,-2,-6,-19,-7,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-24,-6,-14,-27,44,-11,-34,-13,-28,-18,6,-19,-13,-14,4,-13,-26,-25,-25,-14;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-14,-4,-5,-20,1,-9,-20,-9,-20,-14,6,-14,-5,-8,12,12,-14,-30,-17,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-23,-17,-9,-13,-22,-18,1,-7,-2,0,-13,-1,-10,-9,-7,1,1,-25,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-36,-28,3,-36,-27,40,-28,24,20,-23,-23,-21,-26,-21,-9,28,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-23,-7,9,-20,-21,-8,-12,5,-11,-7,-5,-13,6,10,-3,-3,-9,-25,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-25,-5,7,-21,-20,-4,-21,20,-18,-8,-3,-15,7,25,-5,-6,-14,-23,-9,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-11,-23,-14,-2,-8,-24,-16,2,-8,0,0,-11,-15,-6,-9,-6,0,1,-22,-7,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-8,-22,-10,-6,-18,-17,-15,-12,11,-14,-5,-6,-14,-4,10,-3,2,-3,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-20,-24,-23,-13,1,-29,-12,13,-18,12,9,-17,-22,-6,-15,-16,-8,7,-16,0,-11;
MA   /M: SY='G'; M=7,0,-17,-5,-8,-22,17,-11,-22,-10,-21,-11,7,-16,-8,-12,8,-5,-17,-28,-21,-8;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,0,0,-31,23,-5,-29,-6,-27,-14,10,-15,10,-6,5,-10,-28,-25,-21,5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,-2,-19,-5,-8,-21,12,-12,-20,-11,-24,-14,7,-6,-7,-13,15,3,-15,-31,-21,-8;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-11,-10,-9,-7,-15,-17,-12,-11,-14,-12,1,-12,-9,-9,22,35,-2,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-19,-24,-23,-20,29,-28,17,-3,-17,0,1,-14,-27,-17,-12,-15,-9,-3,2,38,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-30,-32,-34,-27,41,-28,-13,-3,-22,1,-4,-26,-30,-25,-18,-26,-16,-9,52,41,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-31,-8,-1,-25,-13,-16,-19,-6,-25,-17,-9,46,-7,-11,-2,-3,-23,-29,-24,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-1,-24,-4,-1,-21,-13,13,-19,5,-19,-7,5,-16,6,7,0,-4,-16,-26,-6,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-25,-7,0,-22,-18,-1,-21,18,-21,-8,-2,-8,3,17,-6,-6,-15,-23,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-27,-7,5,-19,-17,-8,-14,7,-12,-4,-5,-12,6,11,-6,-8,-12,-23,-11,4;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-6,1,-15,-2,-3,-8,-7,-2,-10,3,-11,-7,6,-5,-2,4,-2,-1,-11,-12,-2,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-2,-15,0,1,-14,-8,-8,-11,1,-13,-9,-4,18,-3,-4,-1,0,-11,-14,-11,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-27,-5,4,-19,-11,-7,-17,0,-19,-10,-5,22,7,-4,-5,-8,-22,-19,-14,4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-7,-7,-3,-10,-14,10,-18,8,-13,-6,-1,-14,1,21,-7,-8,-13,-16,-2,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-9,-14,-12,-3,-15,-14,12,-10,2,3,-13,-4,-13,-11,-6,-2,17,-14,-6,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-20,-14,-10,-12,-23,-5,-9,4,-8,-3,-7,-20,-6,17,-3,6,2,-26,-7,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-25,-24,-20,-16,-14,-25,-25,6,-15,-9,-4,-25,28,-20,-20,-10,-5,11,-30,-20,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00956;
//
ID   BI1_MP; MATRIX.
AC   MP01243;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bax inhibitor-1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4429340; R2=0.0120569; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1031; N_SCORE=16.864; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-14,1,-30,7,31,-14,-22,22,-23,2,-15,-12,-3,-10,11,-2,-6,-12,-25,-16,10,19;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-7,-30,-7,5,-18,-22,7,-19,15,-17,-3,-5,-17,27,20,-8,-10,-22,-8,11,14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-25,-3,5,-25,-18,-10,-26,32,-26,-11,1,-11,6,24,0,3,-16,-24,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-12,-30,-11,-1,-22,-18,-7,-25,16,-21,-12,-6,6,3,40,-8,-9,-20,-22,-16,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-21,-29,-20,13,-24,-21,6,-24,24,6,-24,-26,-20,-19,-20,-4,2,2,4,-19;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-26,-10,-17,-28,55,-19,-35,-18,-28,-19,0,-18,-17,-19,5,-14,-25,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-34,-24,4,-33,-21,33,-27,32,26,-24,-24,-17,-23,-24,-10,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-15,-19,-13,3,-12,-11,-6,-15,-3,-6,-11,-18,-12,-16,4,1,-3,-13,4,-13;
MA   /M: SY='A'; M=25,-11,-15,-17,-15,-19,13,-21,-14,-14,-13,-10,-8,-15,-15,-19,6,0,-2,-22,-20,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-18,-33,-24,56,-23,-19,-4,-25,3,-4,-15,-25,-32,-19,-9,-5,-1,1,18,-24;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-12,-22,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,8,-3,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-19,-36,-28,54,-30,-21,8,-29,20,6,-24,-30,-34,-20,-21,-9,8,-2,18,-28;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-25,-17,-29,-20,32,-25,-17,10,-25,29,10,-22,-25,-24,-17,-22,-8,5,-7,10,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-6,-17,-8,5,-9,-18,-8,-3,-6,3,8,-8,-11,0,-7,-3,8,-4,-22,-7,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-17,-20,-20,-14,-1,-21,-4,3,-10,-3,0,-17,-22,-4,-12,-7,-5,5,-6,18,-11;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-18,-11,-13,-17,7,-19,-13,-15,-17,-12,0,-14,-11,-15,15,17,-7,-29,-17,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,26,-28,37,18,-29,-29,-22,-21,-24,-8,22,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-15,-12,-21,-29,60,-21,-39,-21,-29,-20,-2,-22,-21,-21,-1,-19,-28,-23,-30,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=1,-24,-21,-30,-21,0,-27,-23,22,-25,24,12,-20,-21,-17,-22,-15,-2,14,-21,-4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-27,17,10,-28,2,-2,-30,10,-29,-19,23,-14,2,3,1,-8,-28,-31,-19,6;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-23,-19,-28,-22,19,-27,-10,11,-19,18,18,-21,-25,-17,-15,-16,-2,9,-10,15,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-20,2,-26,-22,2,-24,-11,3,-17,-2,-2,-19,-25,-17,-20,-10,-7,5,-9,16,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,0,-34,-28,-1,-34,-28,26,-28,18,11,-25,-28,-24,-25,-18,-8,24,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=15,7,-17,8,-1,-26,5,-13,-23,-9,-22,-19,4,-11,-6,-15,15,3,-13,-31,-21,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-21,-31,-23,7,-29,-23,20,-19,12,9,-20,-23,-20,-14,-14,-7,19,-18,-2,-23;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-9,25,-22,22,0,-24,13,-1,-26,-4,-25,-19,28,-15,-4,-7,4,-7,-25,-29,-19,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-12,-33,-6,2,-29,3,-17,-26,-10,-29,-20,-9,42,-8,-17,0,-9,-27,-29,-28,-6;
MA   /M: SY='S'; M=9,10,-14,13,3,-24,-2,-9,-23,-8,-27,-21,9,-10,-2,-12,26,10,-13,-37,-20,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='I'; M=0,-21,-20,-24,-18,-7,-24,-21,12,-18,7,8,-20,-3,-16,-19,-10,0,12,-25,-11,-18;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-12,-12,-10,-9,-16,-15,-6,-12,-5,-1,-3,-13,-7,-11,15,28,0,-30,-10,-8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,61,-30,-20,5,-30,21,5,-23,-30,-35,-20,-23,-10,3,2,22,-27;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-15,-22,-19,-9,-8,-19,4,-16,3,8,-16,-20,-15,-17,-3,3,11,-24,-12,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-29,-12,-20,-27,60,-18,-33,-19,-24,-11,-2,-20,-18,-19,-2,-19,-25,-20,-27,-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-12,-21,-12,-4,-5,-19,-9,-13,-9,-9,-10,-13,-14,-19,8,0,-1,-17,-12,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-33,-26,2,-32,-23,33,-24,24,24,-25,-25,-19,-22,-20,-7,27,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='V'; M=9,-21,-15,-27,-22,-6,-24,-26,20,-19,5,5,-18,-19,-19,-21,-3,5,25,-25,-10,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-22,-19,-29,-25,22,-17,-24,7,-23,3,1,-16,-24,-27,-20,-9,1,11,-14,3,-25;
MA   /M: SY='C'; M=1,-15,69,-22,-22,-21,-11,-25,-27,-24,-22,-19,-12,-30,-22,-25,1,-5,-11,-42,-27,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-28,11,-35,-27,39,-30,-22,-1,-30,14,1,-23,-32,-32,-22,-20,-10,0,-12,8,-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=17,-20,2,-25,-17,-7,-16,-21,0,-21,14,1,-20,-22,-17,-21,-9,-5,3,-24,-13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=9,-9,-17,-12,-9,-3,-10,-2,-11,-10,-15,-11,-5,-17,-6,-12,13,5,-8,-12,14,-9;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,4,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-30,-19,24,-28,43,25,-28,-28,-18,-20,-28,-10,13,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-17,-18,-21,-18,7,-27,-11,6,-17,11,3,-17,-23,-15,-14,-8,12,6,-11,17,-18;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-10,-17,-10,-17,-7,-20,-10,-10,-10,-10,-7,-10,-10,-17,13,17,0,-23,-17,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-4,-30,-2,13,-25,-20,-3,-30,34,-23,-12,0,-14,12,46,-8,-10,-22,-22,-12,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-2,-28,34,-23,-8,0,-15,18,47,-8,-10,-22,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,10,-30,17,4,-28,-3,-3,-35,12,-25,-18,7,-17,2,29,-5,-12,-25,-27,-16,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-21,-5,9,-17,-15,-4,-10,4,-11,9,-4,-11,6,-1,2,-2,-10,-28,-12,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00957;
//
ID   ACONITASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01244;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Aconitase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8675776; R2=0.0162707; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=140; N_SCORE=8.135; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=2,-7,-24,-9,3,-19,-15,-6,-16,9,-10,-3,-7,-14,5,7,-7,-8,-13,-20,-9,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,1,10,-18,-20,2,-19,8,-16,-8,-3,-13,16,6,-4,-4,-19,-14,5,12;
MA   /M: SY='A'; M=23,-18,-12,-25,-16,-8,-14,-18,4,-17,9,4,-17,-18,-13,-20,-6,-4,5,-19,-9,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-24,-4,14,-17,-21,-7,-9,-3,-3,-3,-8,-13,4,-2,-5,-5,-10,-26,-12,8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-26,5,18,-27,-14,-4,-26,18,-23,-14,3,-10,11,15,0,-7,-21,-25,-15,14;
MA   /M: SY='E'; M=-2,7,-23,11,23,-24,-14,-6,-21,2,-17,-15,2,-8,7,-4,5,-3,-18,-30,-17,14;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-8,-19,-30,68,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-25,-20,7,-29,-16,18,-24,28,12,-23,-26,-18,-19,-21,-7,10,-15,9,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-9,-28,-8,-11,-10,-21,-12,-1,-14,-2,-2,-12,-20,-7,-14,-14,-10,-5,0,1,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-28,9,19,-29,-16,-5,-25,13,-21,-13,0,-1,13,6,-2,-8,-23,-26,-16,15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-16,-24,-21,-17,-3,-30,-16,16,-13,2,5,-13,-19,-13,-15,-10,0,12,-17,6,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,46,-30,-20,10,-30,29,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-10,-23,-13,-5,-13,-19,-15,2,-8,0,0,-8,-17,-5,-9,-6,-2,1,-25,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,15,-27,20,22,-30,-14,-4,-29,14,-24,-18,7,-8,9,5,-1,-8,-23,-29,-17,15;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-14,-20,-11,-12,-8,-17,-4,-13,-1,-3,-11,-15,-9,-18,2,-2,0,-20,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=9,-20,-3,-29,-22,21,-11,-21,-9,-21,-4,-7,-15,-23,-26,-21,-6,-7,-1,-11,-1,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-24,-3,7,-16,-20,-6,-8,-1,-8,-3,-3,-14,1,-2,-4,-3,-7,-25,-8,3;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-30,-28,-32,-26,1,-29,-28,16,-22,5,3,-28,-19,-21,-22,-20,-9,13,19,2,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-15,-17,-15,-7,-11,-18,-14,-6,-5,0,-2,-11,-20,-7,7,-6,-2,0,-26,-11,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-5,-26,-6,-3,-19,0,-10,-18,-8,-17,-11,-2,2,-5,-12,-1,-4,-17,-22,-13,-5;
MA   /M: SY='P'; M=0,-12,-28,-11,-7,-13,-12,-11,-15,-10,-20,-14,-9,29,-10,-16,-3,-6,-19,-19,-7,-11;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-20,-11,-18,-26,49,-20,-33,-18,-26,-18,-1,-19,-18,-19,4,-9,-23,-23,-27,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=3,-5,-20,-7,-11,-23,29,-16,-27,-15,-26,-16,3,-15,-11,-15,17,4,-17,-29,-23,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-26,-17,-9,-16,-19,-15,-5,-11,-8,4,-16,30,-8,-16,-6,2,-10,-26,-17,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-23,-33,-24,5,-32,-21,31,-27,34,24,-25,-25,-18,-22,-24,-9,19,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-1,-23,-9,-9,-15,-2,-3,-7,-7,-5,10,6,-19,0,-4,-6,-8,-12,-26,-12,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-8,6,-24,0,-4,-18,-3,21,-23,-8,-24,-13,16,-18,2,-6,4,-5,-24,-17,-4,-2;
MA   /M: M=-2,-5,-25,-5,-7,-15,-2,-11,-15,-11,-13,-4,-5,0,-7,-14,-3,-6,-14,-23,-14,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-9,10,-31,17,1,-32,20,-10,-35,-6,-29,-22,5,-2,-7,-9,-1,-13,-29,-29,-24,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-17,-21,-17,-14,-7,-27,-18,11,-12,12,7,-18,-23,-10,-9,-15,-6,13,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-21,-20,-15,-3,-25,-18,10,-21,21,7,-20,-16,-16,-17,-17,-7,8,-24,-7,-16;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-27,6,13,-28,2,-11,-26,-1,-23,-18,-1,2,0,-9,1,-9,-22,-27,-22,6;
MA   /M: SY='P'; M=-3,2,-29,7,12,-29,-7,-11,-26,1,-26,-19,-1,18,-1,-7,1,-7,-24,-29,-22,4;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-25,-8,-16,-21,28,-18,-20,-15,-19,-12,-1,-20,-17,-16,-2,-11,-12,-23,-20,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-24,9,31,-25,-16,-6,-21,2,-17,-14,-1,-7,11,-4,4,-2,-18,-30,-17,21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-14,-21,-15,-9,-13,-23,-11,-2,3,-8,-2,-10,-18,-8,8,-7,-4,7,-25,-8,-10;
MA   /M: SY='C'; M=7,-12,26,-19,-17,-15,-7,-21,-16,-19,-16,-13,-7,-23,-18,-21,2,-4,-5,-33,-21,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=9,-21,-16,-27,-20,-5,-22,-23,20,-19,9,7,-17,-18,-17,-21,-7,-3,20,-22,-8,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=8,2,-12,-2,0,-19,-5,-11,-18,-7,-24,-17,9,-11,-1,-8,29,20,-9,-36,-18,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00423;
//
ID   RIO1_MP; MATRIX.
AC   MP01245;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RIO1/ZK632.3/MJ0444 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9018712; R2=0.0143463; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=762; N_SCORE=15.824; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=112; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-26,-22,38,-30,5,3,-17,10,3,-22,-30,-18,-14,-22,-10,-5,18,57,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-17,17,-30,26,5,-20,-14,8,-28,1,-22,-18,4,-15,-1,-5,-9,-13,-24,-3,3,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-28,-1,20,-29,-22,-3,-15,8,-16,-5,-2,-9,28,4,-1,-3,-19,-23,-11,23;
MA   /M: SY='V'; M=8,-21,-16,-28,-22,-6,-23,-23,20,-18,7,11,-19,-20,-18,-20,-6,1,24,-24,-9,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-21,-24,-27,-17,-7,-29,-16,22,-11,12,23,-18,-20,-5,-12,-17,-9,14,-21,-3,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-26,16,32,-29,-14,7,-27,3,-21,-17,4,-6,15,-4,4,-7,-25,-30,-15,23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-17,-25,-17,-9,-1,-13,-10,1,-18,9,1,-15,-22,-11,-15,-12,-8,-4,-14,7,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-21,-32,-24,0,-26,-11,28,-16,19,44,-21,-21,-9,-16,-19,-9,20,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-9,-14,-6,-19,-23,-12,-15,15,-15,-5,-9,-21,1,23,-9,-8,-3,-26,-12,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-29,-7,4,-23,-21,-6,-24,31,-17,-6,-3,-15,11,36,-11,-10,-18,-20,-9,6;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-24,-19,-29,-19,3,-23,-13,16,-21,33,29,-24,-24,-12,-17,-22,-9,9,-20,-2,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-18,-28,-19,-19,17,-14,10,-6,-11,-5,-4,-16,-26,-11,-12,-14,-10,-11,18,55,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-3,15,-25,13,20,-29,-12,1,-24,8,-23,-15,15,-10,16,2,3,-6,-25,-29,-17,18;
MA   /M: SY='H'; M=-12,6,-26,7,13,-20,-20,18,-13,-5,-14,-8,6,-14,3,-7,-5,-10,-14,-31,-7,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-12,22,-16,-20,-22,24,-20,-29,-20,-21,-16,-7,-23,-20,-20,-2,-13,-17,-27,-25,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-16,-5,3,-10,-14,-4,-12,7,-4,-4,-3,-11,2,20,-5,-1,-9,-15,-6,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-30,-21,11,-31,-16,21,-28,40,18,-27,-29,-19,-20,-27,-10,10,-14,10,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=26,-10,-19,-15,-15,-25,33,-20,-24,-15,-19,-15,-5,-15,-15,-20,5,-9,-14,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,10,-12,5,0,-20,0,-5,-20,-8,-30,-20,22,-12,0,-8,33,15,-15,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26,58,-30,-2,0,-21,6,0,-20,-30,-27,-16,-20,-10,-4,19,52,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-21,-30,-21,2,-28,-16,24,-22,27,29,-21,-22,-13,-18,-19,-3,14,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-31,-20,27,-28,40,25,-27,-27,-18,-21,-27,-10,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-31,-24,19,-29,-20,14,-25,25,10,-29,-30,-24,-19,-24,-10,12,2,12,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-17,18,-28,24,7,-27,-16,39,-32,0,-24,-13,11,-14,4,-1,-3,-8,-26,-33,-1,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-29,15,17,-30,-8,-7,-30,9,-24,-19,1,1,4,5,-3,-10,-25,-28,-19,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,24,-25,31,3,-30,17,-5,-33,-6,-26,-22,15,-13,-6,-11,1,-11,-26,-29,-20,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-13,6,-30,10,12,-29,-11,18,-32,19,-27,-12,5,-12,7,10,-7,-13,-26,-26,-7,8;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-29,-20,-31,-26,8,-31,-27,24,-24,12,9,-25,-15,-26,-22,-16,-6,26,-22,-4,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-22,-20,-19,6,-26,3,0,-13,-4,-2,-16,-24,-13,-12,-9,4,2,6,27,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-27,-21,-35,-26,20,-29,-16,23,-22,19,28,-22,-24,-19,-19,-20,-9,16,-14,6,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-31,-20,-35,-29,30,-29,-25,12,-25,12,4,-28,-30,-31,-20,-20,-9,17,8,10,-27;
MA   /M: SY='P'; M=8,-9,-21,-6,-1,-24,-7,-15,-19,-10,-27,-19,-4,26,-5,-15,18,6,-16,-34,-24,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00958;
//
ID   UPF0003_MP; MATRIX.
AC   MP01246;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0003 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6513410; R2=0.0160217; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=433; N_SCORE=12.579; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=53; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-13,7,-27,2,4,-24,-15,-1,-27,30,-27,-13,16,-16,7,35,-5,-7,-23,-25,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-36,-10,-4,-25,-9,-16,-21,-11,-28,-18,-16,61,-10,-19,-6,-9,-27,-25,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-37,-28,43,-31,-21,17,-27,15,13,-22,-27,-29,-21,-20,-9,13,-5,15,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-24,-2,2,-22,-14,-5,-26,22,-25,-13,9,-15,6,32,3,1,-18,-27,-13,2;
MA   /M: SY='I'; M=0,-20,-19,-27,-20,-6,-28,-24,22,-19,8,7,-16,-19,-14,-20,-6,6,20,-24,-7,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-8,-15,-30,65,-19,-39,-18,-29,-20,0,-19,-18,-19,0,-19,-30,-21,-29,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-29,47,31,-34,-13,5,-35,3,-26,-25,16,-8,7,-6,0,-10,-30,-36,-18,19;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-23,-30,-25,-18,2,-24,-15,-6,-12,-4,-5,-22,-24,-10,-8,-18,-6,-8,38,17,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-8,11,-21,10,7,-21,-17,-9,-20,4,-19,-14,9,-12,-1,2,6,12,-13,-31,-14,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-11,-31,-25,4,-31,-25,23,-25,15,10,-20,-24,-22,-23,-13,-2,20,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,1,-26,1,-3,-28,20,-12,-30,-3,-28,-18,5,-7,-6,-5,4,-8,-24,-27,-23,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,4,-27,7,3,-28,17,-11,-31,-6,-27,-20,5,-2,-6,-11,5,-6,-26,-29,-24,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-18,-31,-27,7,-24,-26,22,-24,15,10,-24,-27,-26,-22,-15,-6,27,-21,-4,-27;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-16,-2,10,-18,-12,-11,-16,-5,-16,-11,0,-8,1,-9,17,17,-10,-31,-16,6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-14,-16,-13,-3,-21,-20,0,-15,-7,-6,-3,-13,-12,-14,13,29,4,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-23,0,23,-19,-18,-9,-15,-1,-7,-10,-7,-10,4,-4,-1,-3,-12,-27,-15,13;
MA   /M: SY='D'; M=-12,19,-27,25,21,-29,-13,-2,-31,13,-26,-20,13,-10,8,9,3,-6,-25,-32,-17,14;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-36,-28,0,-35,-25,41,-25,18,25,-22,-22,-18,-25,-18,-8,30,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-6,2,-25,-1,-1,-25,13,4,-28,-4,-25,-14,10,-16,2,1,5,-5,-25,-27,-16,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-28,7,-35,-28,34,-28,18,14,-22,-23,-21,-26,-20,-8,21,-7,3,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-17,-27,-19,-9,4,-23,-7,-17,9,-4,-3,-8,-23,-4,39,-15,-10,-12,-14,-1,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,-6,-15,-9,-6,-13,-7,-9,-12,-9,-19,-13,1,-13,-3,-8,21,10,-6,-27,-8,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-11,-14,-14,-8,-22,-22,-2,-12,-6,-6,-5,-13,-13,-12,14,41,8,-29,-9,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-20,-10,-8,-16,-12,-17,-15,4,-15,-9,-2,-13,-6,4,5,19,-7,-25,-11,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-37,-28,11,-35,-26,36,-28,23,18,-23,-24,-23,-25,-21,-9,25,-18,2,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-15,-13,-6,-18,-20,-8,-21,13,-16,-9,-3,-19,1,38,-3,-1,-12,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='T'; M=2,7,-16,3,-2,-20,-16,-13,-16,-6,-14,-12,2,-10,-1,-9,13,27,-8,-29,-13,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-15,-22,-19,-17,26,-22,-12,-6,-19,2,-5,-15,-23,-21,-17,-12,-6,-5,5,18,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-28,56,17,-37,-12,-2,-35,0,-27,-26,16,-10,3,-9,2,-3,-27,-38,-18,10;
MA   /M: SY='G'; M=-8,6,-27,0,-8,-22,22,-4,-29,-1,-27,-17,19,-20,-6,5,0,-11,-27,-24,-17,-8;
MA   /M: SY='K'; M=6,-6,-21,-9,-1,-21,-13,-12,-19,16,-16,-9,-4,-13,1,13,1,-1,-11,-23,-13,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-21,-27,-20,-8,2,-30,-12,12,-18,15,6,-20,-14,-11,-17,-19,-9,3,-13,9,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,-19,-29,-25,-1,-32,-14,27,-23,15,13,-23,-26,-22,-20,-15,-6,30,-26,-3,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-19,-24,-20,-3,-28,-20,16,-15,2,4,-14,-20,-16,-12,-3,9,18,-23,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,31,-23,13,-3,-17,-2,6,-20,-2,-29,-20,49,-21,-2,-2,4,-3,-30,-19,-14,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-21,1,4,-25,2,-9,-27,7,-29,-17,8,-12,2,4,15,2,-19,-30,-18,3;
MA   /M: SY='K'; M=0,1,-22,2,10,-24,-15,-9,-21,13,-19,-11,0,-10,7,5,4,0,-15,-27,-14,8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-24,-37,-28,21,-34,-25,29,-29,24,14,-23,-26,-26,-24,-22,-9,20,-14,6,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-21,-19,-28,-22,2,-27,-24,21,-22,7,6,-15,-20,-19,-21,-4,3,19,-23,-4,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,6,-16,2,-1,-19,-6,-11,-17,-8,-17,-11,5,-11,-4,-10,14,18,-10,-31,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-25,-3,4,-13,6,-10,-21,-6,-20,-14,5,-15,-6,-9,2,-7,-19,-24,-15,-1;
MA   /M: SY='N'; M=4,8,-21,-1,-2,-22,-8,2,-14,-4,-20,-11,17,-9,4,-4,6,-3,-17,-30,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-22,-24,-31,-26,3,-33,-25,34,-25,13,12,-14,-23,-21,-24,-15,-7,25,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-13,-25,-18,-4,-2,-28,-17,8,-12,0,1,-10,-15,-6,-10,-6,3,2,-21,-4,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-9,32,-19,14,-3,-18,-3,6,-14,-2,-26,-17,50,-21,-3,-2,8,0,-21,-39,-19,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-33,-27,-20,16,-25,-6,-10,-13,-7,-7,-23,-20,-16,-7,-23,-16,-13,42,26,-18;
MA   /M: SY='S'; M=6,-8,-16,-10,-11,-18,3,-18,-14,-13,-19,-13,-3,-8,-11,-15,17,12,-3,-31,-19,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-16,-24,-18,-10,-13,-15,-12,-8,2,-3,-2,-9,-21,-5,21,-9,-7,-5,-22,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-4,-25,-3,8,-21,-8,2,-22,8,-18,-4,-1,-13,5,11,-1,-6,-18,-26,-12,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,8,-25,8,1,-23,-13,-9,-16,-1,-23,-15,9,10,-3,-7,3,0,-18,-30,-17,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=4,-7,-20,-11,-4,-18,-11,-14,-10,6,-13,-3,-5,-16,-5,1,-3,-3,-1,-25,-14,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-26,-13,-5,-16,-18,-7,-24,16,-17,-11,-4,-18,3,41,-5,0,-15,-11,-9,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-3,-29,-5,2,-22,-18,1,-28,27,-22,-10,7,-19,12,56,-7,-9,-22,-22,-11,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-19,-22,-26,-23,8,-29,-17,22,-21,11,8,-12,-25,-20,-19,-15,-6,17,-17,6,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-9,7,-22,13,12,-21,-18,-10,-17,1,-14,-13,-1,-13,-2,-3,1,2,-8,-31,-15,5;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-20,-31,-24,24,-29,-17,15,-22,14,12,-20,-25,-22,-18,-15,-1,12,-10,12,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-20,-7,-8,-11,-22,-15,2,-11,-6,-5,-6,-16,-10,-11,3,10,5,-26,-6,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-26,-34,-26,-2,-35,-26,36,-21,15,15,-20,-22,-19,-16,-17,-8,28,-22,-3,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-28,-8,-16,-28,55,-7,-37,-18,-29,-18,2,-19,-15,-17,2,-17,-28,-23,-24,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00959;
//
ID   IUNH_MP; MATRIX.
AC   MP01247;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=32;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=29;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7143645; R2=0.0140378; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=827; N_SCORE=16.314; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-14,-17,-21,-14,-6,-14,-3,9,-10,6,37,-11,-17,0,-10,-3,-1,4,-26,-6,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=1,2,-25,-4,-2,-23,-10,-7,-20,2,-23,-15,10,10,-2,7,0,-5,-21,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-21,-25,-21,-14,7,-27,-5,2,-7,17,7,-20,-26,-10,0,-22,-10,-3,-6,20,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,2,-32,1,3,-27,-14,-9,-23,8,-30,-17,8,33,-2,-2,-4,-7,-27,-30,-22,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-33,-33,-40,-30,22,-32,-28,18,-27,6,4,-26,-25,-25,-25,-26,-16,6,36,16,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,90,-25,-25,-18,-28,-28,-25,-25,-18,-18,-15,-33,-25,-25,-3,4,-8,-45,-25,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-15,-29,-18,-13,-9,-28,38,5,-20,3,10,-6,-21,-5,-13,-16,-15,-3,-25,10,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-16,-10,-23,-16,-14,-9,-23,1,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,14,-23,-17,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-13,-23,-18,4,-20,-22,4,-17,5,0,-15,-20,-20,-17,-1,12,13,-21,-6,-18;
MA   /M: SY='L'; M=4,-25,-18,-28,-18,3,-23,-20,13,-25,36,13,-25,-25,-18,-20,-21,-8,8,-20,-5,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=5,-17,-22,-22,-14,-9,-21,8,6,-19,8,6,-12,-19,-10,-17,-11,-10,2,-23,-1,-14;
MA   /M: SY='C'; M=4,-18,20,-25,-23,1,2,-23,-21,-23,-13,-13,-13,-26,-25,-23,-5,-10,-10,-22,-14,-23;
MA   /M: SY='A'; M=26,5,-13,-5,-5,-20,0,-10,-15,-7,-20,-15,12,-13,-5,-13,17,5,-10,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-6,-30,6,-20,-26,-13,-30,-20,-14,58,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-13,7,-30,14,43,-27,-20,29,-30,4,-20,-14,3,-6,17,0,-3,-13,-30,-30,-9,29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,18,-33,-25,-1,-33,-25,13,-30,22,9,-25,-30,-23,-25,-22,-10,9,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,26,36,-32,-18,-3,-32,19,-25,-19,5,-5,12,6,-3,-10,-27,-29,-17,24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,32,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-25,-16,-4,-11,-25,-11,-1,-3,16,9,-16,-21,5,-2,-18,-10,-6,-20,-5,1;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,-18,-19,-15,-16,13,-20,-12,-18,-2,-6,-12,-18,-15,-20,-2,-8,-6,-20,-18,-15;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00960;
//
ID   EGF_LAM_1_MP; MATRIX.
AC   MP01248;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Laminin-type EGF-like (LE) domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1475167; R2=0.0064676; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=708; N_SCORE=8.723; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=364; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-11,24,-23,21,4,-24,-7,29,-27,-5,-27,-17,29,-16,3,-4,8,-4,-26,-37,-9,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-30,-5,0,-22,-13,-9,-14,-10,-13,-9,-12,18,0,-13,-8,-9,-17,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-27,-10,-8,-15,-11,-10,-9,-13,-12,-8,-10,5,-12,-14,-6,-6,-8,-25,-12,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-21,-15,-17,-18,26,-19,-26,-18,-23,-16,-9,-7,-18,-19,-3,-12,-20,-11,-17,-18;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-14,-5,-5,-17,-7,-10,-11,-6,-18,-10,8,-15,-4,-7,17,7,-5,-33,-17,-5;
MA   /M: M=0,-9,-21,-12,-7,-5,-9,-8,-12,-9,-10,-8,-5,-14,-10,-9,-1,-3,-8,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-2,2,-13,3,-2,-23,5,-2,-26,-9,-26,-18,6,-15,-4,-7,15,1,-17,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-19,-10,-9,-11,1,-13,-21,-6,-16,-10,-4,-11,-9,-2,-3,-7,-16,-22,-13,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-8,-24,-10,-3,-15,-16,-9,-12,-3,-14,-6,-5,1,2,-3,0,3,-12,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-18,95,-25,-23,-19,-28,-27,-27,-26,-18,-18,-18,-32,-25,-27,-8,-9,-11,-47,-28,-24;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-22,24,8,-22,-11,3,-19,-2,-17,-13,13,-12,0,-6,-1,-6,-17,-28,-11,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,0,-26,3,6,-22,-15,-4,-17,0,-17,-10,-2,11,4,-3,-3,-5,-18,-25,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='N'; M=-1,1,-15,-1,1,-13,-4,-1,-10,-6,-9,-7,5,-9,-1,-7,2,-2,-11,-21,-10,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-3,8,-17,5,3,-20,-11,-11,-18,-6,-19,-15,8,-11,-1,-9,16,21,-12,-33,-15,1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-11,-27,-11,-17,-21,49,-17,-32,-18,-24,-17,-3,-20,-18,-18,0,-16,-23,-17,-19,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-4,-28,-4,9,-24,-21,-1,-16,10,-16,-4,-2,-14,25,17,-5,-8,-18,-21,-9,16;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-14,73,-20,-20,-12,-20,-20,-17,-19,-12,-12,-14,-26,-20,-19,-7,-6,-4,-32,-19,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-8,-17,-6,2,-13,-13,-7,-6,-5,-6,-4,-9,9,-1,-8,-4,-4,-7,-18,-10,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-28,-9,3,-18,-22,-4,-14,10,-8,-3,-5,-10,5,15,-12,-10,-14,-23,-9,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,0,-30,4,10,-24,-17,2,-21,-5,-21,-15,-1,22,-1,-9,-4,-7,-24,-30,-16,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-27,-3,-14,-25,43,-5,-32,-15,-26,-17,14,-20,-13,-14,1,-15,-28,-26,-23,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-15,-23,-20,8,-24,-19,7,-16,2,1,-17,-23,-20,-14,-3,9,16,-18,3,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-20,-11,-2,-14,-15,-13,-5,-8,-7,-4,-6,-14,-3,-10,1,6,-3,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-27,-8,-2,-13,-21,-8,-13,2,-11,-7,-7,-2,1,8,-8,-5,-13,-21,-7,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-28,-10,-2,-15,-20,13,-21,10,-15,-5,-5,-18,8,19,-10,-9,-18,-8,7,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-28,37,31,-31,-13,5,-32,4,-26,-23,19,-8,8,-2,1,-9,-30,-35,-19,19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-25,-1,9,-24,-17,-2,-21,11,-16,-7,1,-14,17,20,-1,-4,-19,-25,-12,12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=7,-7,-22,-8,-2,-18,-12,-11,-11,-5,-6,-5,-8,-11,-4,-8,-3,-5,-9,-20,-12,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-29,-3,6,-24,-16,-8,-19,-2,-22,-15,-3,27,-1,-6,-1,-5,-21,-29,-19,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-5,-28,-6,-13,-27,41,-12,-33,-14,-29,-19,5,-9,-14,-13,2,-12,-27,-25,-25,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-23,-19,31,-27,11,-6,-10,-2,-2,-16,-27,-14,-4,-18,-11,-11,19,50,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-22,-24,-27,-21,23,-24,-10,-1,-17,-2,-3,-19,-25,-18,-15,-13,-6,-1,17,25,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-6,-29,-6,-5,-21,17,-8,-26,-7,-18,-13,0,-19,-5,-4,-5,-14,-23,-15,-14,-5;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='B'; M=-8,4,-18,3,-5,-9,-15,-9,-7,-8,-8,-8,4,-17,-7,-6,1,0,-4,-26,-9,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-6,-18,-8,-3,-12,-12,-7,-13,-2,-14,-9,-3,11,-3,0,0,3,-12,-18,-11,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-12,-1,1,-12,-5,-5,-12,0,-11,-7,0,-3,1,2,6,2,-9,-17,-9,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=2,-2,-17,-1,-2,-16,10,-7,-18,-6,-14,-10,-2,-6,-4,-9,0,-6,-14,-11,-12,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-3,-22,-2,-3,-19,8,-9,-20,-8,-17,-12,-1,1,-4,-9,1,-4,-18,-21,-15,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-27,-2,-7,-27,22,-4,-29,-5,-26,-15,3,-14,-7,-8,0,-12,-22,-25,-19,-8;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-20,107,-29,-29,-18,-29,-29,-25,-28,-17,-17,-19,-37,-28,-28,-10,-9,-7,-46,-27,-29; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-8,-23,-10,3,-17,-21,-5,-8,-1,-6,-2,-6,-14,13,4,-3,-1,-10,-20,-6,7; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-29,-6,5,-25,-18,-15,-16,1,-21,-13,-12,32,-3,-7,-5,-7,-16,-26,-21,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-14,83,-23,-22,-17,-25,-23,-21,-24,-15,-15,-13,-32,-23,-24,-8,-8,-8,-42,-24,-22; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='B'; M=-7,5,-17,5,0,-11,-8,0,-12,-1,-11,-8,4,-12,1,-2,-2,-3,-11,-14,0,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; MD=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-8,63,-15,-16,-12,-16,-16,-18,-16,-13,-12,-6,-23,-16,-16,-5,-5,-8,-30,-18,-16; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='B'; M=-7,15,-10,15,3,-17,-6,6,-17,-2,-17,-12,15,-7,1,-4,3,-2,-16,-23,-10,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-4,-19,-1,-2,-18,3,-3,-17,-7,-16,-11,-3,12,-5,-8,-1,-6,-15,-19,-13,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-17,-4,-2,-11,-13,18,-9,-3,-5,1,-3,-8,4,0,-7,-8,-10,-15,2,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-15,-6,-5,-16,17,-10,-16,-8,-12,-9,-1,-10,-5,-10,1,-6,-12,-14,-14,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-13,-2,-4,-13,-5,-9,-9,-6,-9,-7,-2,-12,-3,-4,6,2,-4,-21,-11,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-10,-11,-11,-7,-2,-15,-11,8,-9,8,5,-10,-12,-8,-7,-7,-1,9,-14,-4,-8; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-9,16,-10,-10,-12,-4,-5,-14,-11,-11,-8,-7,-8,-10,-9,-4,-6,-9,-20,-12,-11; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-24,7,-2,-20,-7,-8,-12,-10,-14,-11,4,-1,-7,-13,-3,-7,-12,-28,-15,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-21,4,5,-22,-8,-10,-20,-2,-18,-14,-1,3,0,-6,4,4,-16,-26,-16,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-14,47,-20,-19,-18,-15,-18,-17,-20,-16,-12,-11,-22,-17,-20,-6,-8,-8,-35,-21,-19; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,2,-21,4,4,-11,-13,-4,-16,-3,-15,-12,2,3,-2,-4,1,0,-16,-19,-4,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-23,-8,-7,-21,17,-12,-23,-3,-18,-11,0,-16,-6,1,0,-8,-16,-21,-18,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='S'; M=1,-4,-16,-7,-4,-12,-13,-9,-8,-5,-7,-5,-2,-14,1,-5,4,3,-5,-24,-10,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-16,7,-20,-18,-6,-17,-13,-6,-18,-8,-6,-13,-20,-18,-17,-4,0,2,-19,-8,-18; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,6,-10,6,7,-17,-9,-2,-16,6,-15,-10,6,-3,5,3,-1,-5,-15,-19,-11,5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-13,3,5,-13,-5,-6,-10,-4,-8,-6,-2,-5,-2,-7,2,-1,-7,-18,-10,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-16,-2,-3,-13,3,-9,-9,-4,-9,-6,-1,-9,-5,-5,-2,-4,-7,-14,-10,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='I'; M=3,-13,-11,-17,-12,-4,-15,-14,13,-12,5,5,-11,-12,-9,-12,-5,-1,13,-14,-5,-12; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='W'; M=6,-2,-16,-4,-6,-9,-6,-11,-12,-7,-12,-11,-5,-10,-7,-10,-1,-1,-10,12,-4,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,7,-17,-9,-4,-19,-17,-17,-10,-12,-12,-15,-22,-12,-9,-11,-10,-12,4,-5,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-4,-22,-2,-1,-12,-16,1,-9,-10,-7,-4,-4,2,-5,-11,-5,-6,-10,-26,-9,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-8;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-25,-5,9,-25,-17,-4,-23,12,-20,-10,-2,-6,15,21,1,-1,-19,-24,-14,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-16,-3,-8,-11,-18,-13,-5,-10,-8,-8,-5,-17,-12,-13,3,10,4,-25,-5,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-26,-7,2,-24,-19,-10,-20,23,-20,-8,-5,-7,7,20,-5,-3,-12,-22,-12,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00961;
//
ID   HYPA_MP; MATRIX.
AC   MP01249;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Hydrogenases expression/synthesis hypA family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=73;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=68;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8196931; R2=0.0157644; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=505; N_SCORE=13.771; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=44; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-27,-2,16,-25,-16,-5,-22,15,-17,-9,-3,-12,14,19,-4,-9,-18,-23,-14,14;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-26,-1,10,-25,-14,-2,-22,16,-19,-9,0,-13,13,14,-3,-8,-19,-22,-10,11;
MA   /M: SY='H'; M=-7,8,-25,3,8,-22,-14,31,-23,2,-20,-9,14,-15,8,3,-2,-10,-23,-28,-4,6;
MA   /M: SY='G'; M=-6,7,-28,7,4,-30,19,-7,-32,0,-27,-17,10,-14,2,-2,0,-12,-28,-26,-22,3;
MA   /M: SY='A'; M=26,-15,-15,-23,-16,-5,-3,-21,-5,-14,-6,-6,-13,-16,-17,-19,1,-4,3,-17,-12,-16;
MA   /M: SY='A'; M=6,-5,-20,-7,2,-20,-12,-6,-17,3,-17,-10,-3,-9,2,-2,5,3,-11,-24,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-1,-28,-1,10,-26,-19,-4,-27,30,-24,-11,3,-13,14,35,-5,-6,-21,-23,-12,10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-16,-32,-29,0,-32,-29,33,-23,13,12,-27,-27,-26,-23,-13,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-5,-19,-9,-3,-14,-20,-10,-10,0,-5,-4,-4,-15,-2,0,1,12,-6,-26,-9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=6,-6,-21,-7,0,-20,-5,-6,-19,0,-15,-11,-3,-14,-2,3,3,-4,-11,-25,-15,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-15,-32,-28,2,-32,-28,32,-24,19,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,39,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-13,-24,-16,-11,-9,-21,-11,-15,2,-13,-9,-11,-21,-7,10,-11,-3,-11,11,2,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-17,-30,-24,6,-30,-22,24,-26,35,19,-29,-29,-22,-20,-23,-7,24,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-27,3,22,-23,-16,-6,-22,11,-16,-12,-4,-12,8,15,-4,-9,-16,-26,-15,14;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-23,-35,-27,2,-34,-25,36,-25,20,18,-23,-24,-21,-24,-18,-7,29,-21,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,68,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,1,-19,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=4,-4,-24,-4,14,-24,-16,-8,-19,8,-15,-10,-5,-7,10,8,-1,-5,-14,-24,-15,11;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-31,-20,18,-29,-19,11,-25,33,12,-27,-29,-19,-15,-27,-11,4,-4,6,-19;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,-8,-7,-3,-19,-7,-13,-16,-9,-20,-14,2,-11,0,-11,24,16,-8,-33,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,1,-6,-13,-19,9,-6,-25,-17,-16,-14,-3,-22,-14,-18,-3,-11,-17,-29,-17,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-15,-31,-27,0,-31,-27,30,-22,15,14,-26,-27,-25,-21,-12,0,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-24,14,21,-23,-14,-3,-17,0,-17,-13,10,-11,3,-6,0,-6,-16,-32,-18,12;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-15,-27,-11,-1,-22,-20,-19,-11,-5,-18,-12,-15,31,-9,-11,-5,-3,-9,-28,-21,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,11,-25,18,28,-27,-14,-2,-27,5,-22,-19,4,-7,8,1,7,-4,-21,-32,-18,18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-16,-16,-6,-18,-11,-14,-5,-10,-5,-4,-9,-13,1,-14,6,1,-2,-23,-14,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-31,-23,14,-31,-22,22,-28,38,16,-29,-29,-24,-21,-25,-8,17,-19,1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-25,1,13,-25,-15,-3,-22,12,-20,-11,0,-12,11,15,0,-5,-17,-26,-13,10;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-19,-35,-26,63,-26,-18,-2,-25,6,0,-17,-27,-33,-16,-15,-8,-1,4,22,-26;
MA   /M: SY='C'; M=18,-15,51,-24,-19,-19,-15,-24,-19,-19,-15,-13,-14,-25,-19,-24,1,-4,-5,-35,-24,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-38,-28,65,-29,-17,4,-28,14,7,-21,-29,-34,-19,-21,-10,2,5,26,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-29,27,34,-31,-11,-3,-31,7,-25,-22,8,-3,9,-2,2,-8,-28,-32,-20,21;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-16,-22,-14,-8,-22,-22,11,-16,5,4,-17,-18,-14,-18,-4,3,16,-25,-10,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-3,-30,-24,7,-28,-23,14,-23,13,6,-24,-28,-23,-21,-14,-6,19,-22,-3,-23;
MA   /M: SY='A'; M=7,-11,6,-17,-11,-12,-16,-17,-15,-7,-11,-9,-8,-18,-9,-6,3,5,-6,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-27,2,21,-26,-16,1,-27,16,-21,-12,0,-10,15,21,-2,-7,-23,-25,-13,17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-29,1,-9,-30,47,-13,-37,-12,-29,-20,6,-18,-11,-12,0,-17,-30,-24,-26,-10;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-18,-28,-23,-1,-31,-25,24,-24,14,11,-22,-17,-21,-23,-16,-7,21,-24,-6,-24;
MA   /M: SY='A'; M=27,-16,3,-24,-16,-11,-9,-22,-6,-17,0,-5,-15,-19,-16,-21,-1,-4,1,-23,-16,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-28,13,41,-30,-17,-1,-27,11,-20,-16,1,-4,20,2,0,-9,-26,-28,-18,31;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-1,-11,-29,49,-14,-36,-13,-30,-20,7,-18,-12,-15,3,-15,-29,-24,-27,-12;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,11,-22,-13,-20,-5,-22,-13,-13,-12,-12,-12,-15,-13,-22,7,-2,-2,-25,-22,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-23,1,14,-25,-20,-6,-22,15,-19,-11,-1,-12,11,17,-3,-5,-17,-25,-13,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,14,-32,-22,24,-30,40,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,14,-18,2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-26,2,12,-16,-22,8,-9,-7,-11,-7,0,-13,2,-9,-4,-9,-10,-28,-7,6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-37,-28,9,-36,-27,38,-29,23,18,-22,-23,-22,-26,-21,-9,25,-18,2,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-25,8,28,-22,-21,-5,-15,2,-12,-11,-4,-10,5,-4,-3,-7,-11,-30,-15,16;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-25,3,15,-16,-22,-7,-12,-2,-9,-7,-5,-13,3,-2,-3,-3,-9,-25,-9,8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-14,-24,-14,0,-13,-26,-16,7,-10,0,1,-13,-11,-5,-12,-9,-6,6,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-36,-3,13,-29,-20,-14,-24,3,-27,-18,-12,52,0,-5,-7,-10,-28,-28,-24,3;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-20,-19,-17,-18,13,-22,-11,-17,-9,-8,-13,-10,-17,-20,-2,-8,-3,-22,-20,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-24,-4,9,-19,-22,-7,-12,5,-10,-6,-7,-15,8,7,-4,-2,-8,-24,-9,8;
MA   /M: SY='A'; M=7,-20,1,-27,-21,0,-7,-23,-4,-23,0,-4,-15,-23,-22,-23,-8,-9,-1,-20,-10,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-14,-33,-13,2,-11,-20,-12,-21,7,-16,-12,-14,-17,-1,8,-16,-13,-21,27,4,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-15,-26,-15,-5,-7,-15,-3,-11,-4,-3,-1,-12,-15,-2,2,-14,-12,-13,-1,1,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,18,-25,21,13,-29,-8,1,-27,0,-22,-16,11,-12,8,-5,2,-4,-24,-31,-16,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,115,-29,-29,-20,-30,-25,-30,-29,-20,-19,-19,-39,-29,-29,-10,-10,-11,-49,-28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-26,0,-8,-29,34,-5,-32,-12,-28,-17,8,-17,-4,-12,6,-11,-27,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-27,-7,2,-18,-17,12,-19,5,-16,-6,-4,-12,13,6,-4,-7,-19,-14,5,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-21,-1,14,-17,-20,-10,-12,-2,-13,-10,-5,-9,1,-5,4,5,-6,-28,-12,7;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-23,-22,-26,-22,12,-14,-22,1,-20,-2,-3,-19,-24,-23,-18,-10,-7,6,4,3,-21;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-22,-4,8,-20,-18,-12,-15,2,-14,-11,-5,-3,1,-2,2,4,-11,-25,-13,3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-26,-23,-14,-7,-28,-22,12,-18,11,5,-23,5,-16,-18,-18,-8,6,-24,-11,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-26,8,19,-23,-18,-1,-20,4,-15,-11,0,-6,6,1,-2,-6,-19,-29,-14,12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-25,6,15,-24,-11,-4,-23,3,-19,-13,0,-10,9,0,1,-3,-20,-20,-13,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13,-6,-6,-23,-1,-8,-4,-1,0,-9,-17,-5,8,-13,-8,-7,-17,-2,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: M=-10,-5,-20,-5,-6,-3,-16,-9,-11,-7,-7,-7,-5,-20,-8,-6,-8,-8,-8,-19,-1,-7;
MA   /M: M=-4,-5,-20,-4,-6,-6,-11,-9,-11,-11,-4,-6,-8,-19,-10,-10,-9,-9,-10,-17,0,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-9,-24,-9,-2,-20,-10,-13,-18,5,-15,-9,-6,-6,-2,5,-6,-9,-14,-23,-14,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-17,74,-23,-20,-13,-28,-21,-22,-23,-13,-14,-17,-34,-24,-23,-11,-10,-8,-41,-21,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-7,-22,-2,-3,-23,-11,-16,-21,-11,-27,-19,-6,36,-10,-17,0,-5,-22,-32,-24,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00962;
//
ID   CHH_MIH_GIH_MP; MATRIX.
AC   MP01250;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Arthropod CHH/MIH/GIH neurohormones family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4976664; R2=0.0111698; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=834; N_SCORE=13.803; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=180; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-5,18,-24,24,16,-28,-4,-6,-26,-3,-23,-20,9,-10,0,-9,6,-3,-20,-34,-20,8;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-15,-34,-15,-6,-14,-20,2,-27,15,-20,-11,-8,-22,6,42,-16,-15,-23,17,1,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-29,1,-34,-29,37,-25,18,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,38,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-28,44,29,-34,-13,-1,-34,6,-27,-25,14,-8,7,-4,2,-8,-28,-36,-19,18;
MA   /M: SY='D'; M=-19,44,-29,61,17,-37,-11,0,-35,-1,-26,-22,17,-11,0,-10,-2,-10,-27,-38,-18,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-15,-24,-18,-14,14,-22,13,-7,-11,-5,-3,-12,-23,-7,-11,-8,-4,-10,6,40,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,37,-21,20,5,-21,-2,9,-21,1,-29,-20,55,-18,2,0,9,-1,-30,-39,-20,3;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,30,-27,31,17,-27,-27,-23,-23,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-24,-30,-24,56,-29,3,-3,-22,4,0,-17,-29,-26,-15,-19,-11,-6,13,45,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-28,-9,0,-20,-18,-1,-29,27,-21,-11,1,-19,9,63,-6,-7,-19,-22,-11,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-27,12,22,-26,-17,-3,-24,13,-19,-14,8,-10,10,9,-2,-6,-22,-28,-15,15;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-32,-2,3,-27,-18,-14,-21,-5,-27,-18,-8,52,-6,-13,-2,-1,-25,-31,-24,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,7,-27,5,-2,-17,2,3,-24,2,-23,-13,12,-18,2,-2,-3,-10,-25,-18,-2,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-15,-31,-26,2,-29,-22,27,-21,21,22,-27,-27,-22,-19,-17,-5,33,-25,-5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-18,-11,-6,-17,-6,-7,-13,-7,-8,-8,-7,-14,-7,-9,1,-4,-7,-21,-11,-7;
MA   /M: SY='T'; M=5,-7,-13,-12,-12,-12,-10,-18,-4,-13,-11,-6,-3,-16,-12,-14,14,18,6,-31,-14,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-23,-3,7,-16,-9,-9,-11,-6,-4,-2,-3,-14,-2,-9,-5,-5,-12,-26,-14,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-20,0,6,-24,-8,-9,-22,9,-24,-15,4,-11,4,6,12,2,-14,-29,-17,5;
MA   /M: SY='B'; M=-13,35,-25,32,7,-28,0,5,-29,0,-29,-22,35,-16,0,-1,4,-6,-29,-37,-19,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-6,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-19,-10,-9,1,-15,1,-12,-10,-11,-8,2,-18,-7,-9,6,8,-10,-19,6,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,25,-16,10,-3,-17,-5,0,-17,-4,-25,-17,39,-16,-3,-4,16,15,-20,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-26,3,12,-19,-18,-10,-15,-5,-9,-9,-7,3,-1,-7,-3,-4,-15,-27,-15,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-22,-11,-13,-5,-21,-14,2,-13,-4,-2,-17,-22,-15,-16,-10,-7,7,-3,5,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-25,-14,-3,-12,-24,-11,-9,8,1,0,-11,-20,-2,21,-14,-7,-5,-22,-8,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-31,-9,1,-20,-12,-10,-16,-6,-15,-8,-11,-17,13,-7,-8,-10,-19,11,-5,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-32,-23,5,-30,-20,27,-25,34,25,-27,-27,-18,-20,-24,-8,20,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-12,7,-29,13,20,-24,-19,2,-23,11,-17,-9,0,-11,12,5,-6,-10,-22,-23,-6,15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-1,-19,-1,-4,-12,-12,-8,-11,-9,-7,-10,-7,-16,-8,-15,-1,-4,-7,-17,0,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-21,-17,-26,-18,9,-26,-20,10,-23,26,11,-20,-23,-18,-17,-14,5,8,-20,-1,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-7,-24,-8,4,-8,-24,-9,1,-11,7,4,-9,-17,-3,-11,-10,-4,-4,-23,-5,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-18,-28,-16,-8,-12,-22,-12,-7,-4,3,1,-14,6,-6,8,-16,-10,-11,-24,-12,-10;
MA   /M: SY='S'; M=1,-7,-20,-9,-2,-15,-14,-1,-10,-5,-11,-1,-5,-13,-1,-4,2,1,-6,-25,-8,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-15,19,-29,29,20,-30,-11,12,-33,3,-24,-19,10,-11,6,4,-2,-11,-27,-32,-13,12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-26,7,18,-17,-19,2,-16,-3,-6,-8,-3,-14,2,-6,-8,-10,-15,-28,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-16,-23,-22,-13,3,-27,-2,6,-13,6,9,-12,-20,-9,-11,-12,-3,2,-19,3,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-28,26,22,-30,-13,-2,-29,4,-24,-20,9,-1,6,2,2,-7,-26,-33,-19,13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,9,-30,15,30,-32,-19,9,-29,15,-23,-13,3,-8,24,9,-3,-11,-28,-27,-12,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-25,-27,-21,30,-30,5,6,-21,14,6,-20,-28,-18,-15,-22,-11,-2,5,39,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-26,-2,6,-23,-18,-5,-19,16,-17,-6,-1,-14,10,19,-6,-8,-14,-22,-10,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00963;
//
ID   PCNA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01251;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Proliferating cell nuclear antigen signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2666044; R2=0.0153932; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=450; N_SCORE=12.184; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-20,-32,-24,10,-30,-24,23,-27,28,14,-25,-26,-22,-22,-20,-6,18,-19,0,-24;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-20,-4,2,-23,-2,-12,-22,7,-23,-14,2,-12,0,2,11,2,-13,-28,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-24,16,10,-26,-13,-8,-23,9,-21,-15,4,-12,2,3,0,-2,-14,-30,-15,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-18,-34,-25,15,-33,-22,23,-29,31,15,-25,-28,-23,-23,-24,-10,14,-16,5,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-16,-29,-26,3,-30,-25,27,-23,18,12,-24,-28,-25,-20,-15,-4,33,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-10,26,-24,33,13,-30,-10,1,-29,-3,-26,-22,16,-8,3,-8,9,2,-23,-37,-17,7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,11,-30,21,46,-28,-20,5,-27,5,-17,-17,1,-4,15,-3,-2,-11,-27,-30,-16,30;
MA   /M: SY='A'; M=29,-15,-7,-22,-17,-17,-1,-23,-4,-15,-8,-7,-13,-16,-16,-21,3,-4,5,-23,-19,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-1,-8,-8,-8,-15,-17,-11,-10,-2,-11,-6,4,-16,-6,-2,-1,4,-6,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-31,-23,-38,-28,52,-31,-22,9,-29,17,5,-23,-29,-32,-21,-23,-11,5,8,20,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-13,10,-28,16,12,-26,-19,2,-19,3,-15,-10,3,-12,7,-1,-4,-9,-17,-29,-10,8;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-28,9,-34,-28,19,-31,-26,11,-27,10,4,-23,-30,-30,-24,-16,-8,15,-20,0,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-21,12,3,-24,-4,-10,-25,0,-22,-17,8,-12,-3,-3,10,9,-17,-32,-17,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-25,8,16,-25,-9,-5,-22,0,-20,-14,5,0,6,-6,3,-5,-22,-30,-19,11;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-25,29,21,-29,-10,2,-29,3,-26,-21,17,-10,6,-2,6,-2,-26,-35,-18,13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-10,-19,-29,65,-20,-38,-19,-29,-20,0,-19,-19,-19,2,-17,-28,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-26,10,-34,-23,32,-28,28,21,-24,-25,-21,-24,-22,-9,21,-18,2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-23,-4,4,-21,-14,-2,-20,10,-22,-11,2,-14,8,17,8,0,-14,-26,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-17,-28,-21,0,-24,-21,19,-22,23,15,-23,-24,-18,-20,-14,-5,18,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-6,-26,-6,2,-23,-18,-1,-20,10,-19,-8,-3,-16,16,20,-1,-3,-16,-15,-8,8;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-14,-18,-12,-20,7,-20,-11,-13,-13,-10,-7,-13,-11,-19,10,-1,-3,-23,-20,-12;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-19,-31,-24,2,-27,-14,26,-18,23,36,-24,-24,-13,-17,-19,-8,22,-22,-2,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-18,47,-29,66,19,-39,-9,-1,-39,-1,-30,-29,19,-10,0,-10,2,-8,-29,-40,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-29,-6,-3,-25,-12,-16,-18,-5,-25,-16,-8,36,-8,-9,0,-2,-18,-30,-23,-8;
MA   /M: SY='S'; M=21,1,-12,-2,0,-21,-1,-12,-18,-9,-23,-17,5,-10,-3,-13,26,10,-9,-33,-20,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-29,-1,1,-21,-18,49,-29,9,-22,-6,10,-18,9,23,-7,-13,-25,-27,4,1;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-12,-29,-28,-1,-30,-29,29,-20,9,9,-26,-27,-27,-20,-9,3,43,-29,-9,-28;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-11,-14,-11,-16,-3,-18,-8,-13,-12,-10,-6,-14,-11,-16,15,8,2,-28,-18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-30,-21,14,-28,-12,17,-24,36,27,-26,-28,-16,-17,-26,-10,8,-15,7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-16,-30,-27,-3,-25,-28,27,-22,10,9,-24,-25,-24,-23,-10,-4,34,-25,-9,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-23,18,3,-25,-12,-1,-18,-4,-21,-14,9,-13,1,-6,7,-2,-14,-34,-14,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,9,-32,-22,26,-28,39,20,-27,-28,-20,-22,-26,-9,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-25,7,19,-15,-18,-3,-20,2,-12,-12,3,-12,4,0,-3,-3,-19,-26,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-33,-23,5,-31,-21,29,-27,35,24,-26,-26,-19,-21,-25,-9,19,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-34,-6,-1,-26,-11,-11,-24,-1,-25,-16,-11,39,-6,-1,-9,-11,-26,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='K'; M=7,-4,-20,-5,2,-22,-10,-11,-21,10,-23,-13,-1,-12,1,5,9,1,-12,-21,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-23,16,23,-25,-10,-6,-23,-2,-17,-16,4,-8,5,-8,7,-2,-20,-32,-18,14;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-20,-17,-15,-10,6,-12,-9,-15,-8,-2,-9,-19,-12,-16,1,-5,-5,-17,-4,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-26,17,29,-25,-16,-5,-27,8,-22,-18,3,-7,9,0,3,-6,-22,-29,-16,19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-28,13,31,-27,-14,2,-28,9,-22,-17,3,-5,10,3,1,-7,-24,-30,-16,20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,4,-26,5,13,-21,-16,1,-22,8,-19,-11,5,-10,6,15,-1,-6,-19,-26,-11,7;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-21,29,-25,-22,-11,-24,-25,-1,-21,-3,-3,-20,-24,-22,-22,-8,-3,10,-34,-18,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,27,-25,39,23,-31,-7,-2,-31,0,-24,-23,11,-7,4,-7,3,-7,-24,-32,-18,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-28,9,13,-27,-6,3,-29,7,-22,-15,5,-13,9,13,-2,-10,-24,-27,-15,9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,8,-27,9,25,-25,-11,-2,-23,3,-22,-16,8,2,8,-3,1,-5,-24,-30,-19,16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-13,-19,-14,-1,-1,-24,-12,0,-9,8,5,-15,-18,-8,-9,-14,-8,-1,-19,-3,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-21,-1,9,-21,-14,-8,-20,9,-18,-11,-1,-7,3,9,4,3,-13,-26,-14,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-35,-27,14,-32,-21,30,-25,20,20,-23,-25,-21,-22,-20,-8,22,-15,6,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-26,-9,-14,-26,48,-18,-31,-16,-25,-17,1,-18,-16,-18,2,-14,-22,-23,-27,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-29,-17,-33,-26,14,-30,-23,25,-24,22,18,-26,-28,-24,-20,-19,-6,26,-19,1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-12,32,-24,29,7,-27,-6,2,-27,4,-29,-22,33,-11,1,2,6,-3,-27,-37,-19,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00265;
//
ID   OPIOIDS_PRECURSOR_MP; MATRIX.
AC   MP01252;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Endogenous opioids neuropeptides precursors signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7659068; R2=0.0122258; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1337; N_SCORE=21.102; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=142; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-27,30,-31,-27,6,-30,-25,3,-28,13,2,-25,-33,-28,-23,-18,-8,10,-29,-9,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-5,-23,1,-8,-6,-24,-14,2,-20,23,4,-14,-24,-14,-17,-20,-10,-1,-27,-7,-11;
MA   /M: SY='A'; M=21,-20,-13,-25,-17,-6,-16,-22,8,-18,13,4,-20,-20,-17,-20,-7,-3,13,-22,-12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=11,-23,-16,-27,-18,-1,-20,-21,11,-22,26,9,-23,-23,-18,-20,-15,-6,11,-21,-8,-18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-23,-26,-21,7,-4,-20,2,-27,25,8,-21,-27,-22,-20,-21,-13,-1,-17,-5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-23,-21,-23,-14,-2,-22,-19,7,-23,23,7,-22,-8,-15,-19,-15,-6,1,-24,-9,-15;
MA   /M: SY='S'; M=8,-10,1,-13,-13,-17,1,-17,-13,-15,-18,-9,-5,-18,-12,-16,14,4,-2,-33,-20,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,13,-29,-18,20,-28,42,23,-28,-28,-19,-19,-28,-10,10,-18,2,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-24,-25,-22,-13,5,-24,-19,0,-21,9,0,-21,11,-18,-19,-14,-7,-7,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='S'; M=18,-7,-12,-9,-6,-19,-5,-15,-12,-11,-21,-14,-2,-5,-7,-14,23,10,-3,-33,-20,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=1,3,-11,1,6,-14,-8,-8,-14,-4,-16,-13,6,-7,0,-6,18,18,-9,-26,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=3,-25,-12,-28,-26,-3,-28,-28,24,-19,7,7,-24,-25,-25,-20,-6,5,38,-28,-10,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-20,-17,-8,2,-18,-8,-12,-3,-8,-1,-7,-17,0,6,-1,1,-9,-16,-2,-4;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-8,22,-24,33,26,-31,-10,-3,-31,0,-27,-24,11,-7,6,-7,12,-1,-24,-37,-20,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-13,-21,-11,-3,-15,-16,-12,-7,-13,-2,-4,-9,-1,2,-12,3,1,-10,-29,-13,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-1,-23,-1,11,-28,-13,-3,-24,14,-24,-11,2,-11,20,15,8,-1,-20,-26,-14,15;
MA   /M: SY='D'; M=-17,30,-29,43,13,-34,-10,-2,-32,0,-21,-20,11,-13,5,-3,-3,-10,-26,-33,-17,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-13,-17,-10,-11,-9,-17,-4,-16,2,-4,-10,-16,-10,-17,7,3,0,-27,-14,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-13,-15,-17,-12,-6,-21,-19,0,-11,7,1,-12,-18,-12,-10,-1,14,4,-26,-8,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=20,-5,-16,-10,0,-24,-7,-9,-16,-2,-18,-10,-2,-11,9,-3,13,3,-11,-25,-17,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-22,-12,2,-1,-27,-7,3,-9,2,-1,-18,-21,-8,-11,-12,-7,5,-14,11,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-4,-30,-4,4,-24,-20,12,-30,32,-24,-8,2,-16,10,43,-10,-12,-22,-22,-5,4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-18,-25,-18,4,-28,-20,13,-24,32,12,-21,-24,-17,-18,-16,7,8,-23,-3,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-9,-25,-9,-2,-23,-12,16,-14,-3,-14,-1,-5,-18,14,2,-5,-11,-11,-24,-6,4;
MA   /M: SY='P'; M=-14,8,-32,18,9,-32,-16,-6,-29,4,-27,-19,1,19,5,5,-3,-8,-27,-31,-20,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=11,-5,-13,-9,-10,-15,21,-13,-16,-10,-13,-10,-2,-10,-10,-12,4,-2,-10,-14,-15,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-36,-12,-1,-25,-22,-17,-14,-11,-16,-11,-19,60,-4,-17,-12,-10,-24,-27,-23,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,7,-28,11,2,-29,5,-4,-32,8,-26,-16,5,-14,1,8,-2,-9,-24,-26,-16,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,7,-27,17,12,-29,-11,-10,-26,-5,-29,-23,2,24,-1,-12,9,-1,-24,-36,-23,4;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-30,-26,-39,-29,26,-36,-26,32,-30,20,14,-21,-24,-26,-26,-21,-10,19,-11,9,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-20,22,1,-21,-1,7,-21,-1,-30,-21,53,-18,0,-2,12,1,-28,-40,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-26,-21,-12,6,-23,-19,-3,-20,3,-3,-20,17,-18,-19,-13,-7,-9,-20,-7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-23,-17,-3,-2,-27,-15,4,-12,27,9,-21,-22,-9,-9,-22,-10,-1,-22,-5,-6;
MA   /M: SY='I'; M=14,-20,-17,-28,-20,-7,-20,-22,17,-18,8,9,-17,-18,-15,-21,-6,-1,16,-22,-9,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-16,-17,-14,-10,-20,-20,7,-17,-6,-3,-5,-14,-11,-17,13,19,9,-30,-10,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,22,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,16,51,-32,-20,2,-28,10,-20,-16,0,-2,29,2,0,-10,-30,-28,-18,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,47,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,33,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='G'; M=2,3,-27,7,16,-29,17,-11,-31,-5,-23,-19,0,-10,-1,-11,2,-12,-25,-26,-24,7;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-24,-7,4,-25,-18,-10,-19,22,-17,-6,-4,-12,10,11,-5,-4,-14,-21,-11,7;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-28,-16,-29,-22,4,-27,-22,20,-24,31,16,-28,-28,-21,-19,-20,-6,21,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-23,-30,-21,-10,9,-25,-17,-8,-17,-5,-6,-20,26,-14,-17,-15,-10,-15,-15,-5,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-26,-6,-1,-25,-13,-16,-19,-10,-28,-19,-7,45,-6,-15,11,6,-20,-34,-25,-6;
MA   /M: SY='S'; M=7,-10,-16,-12,-7,-10,-10,-7,-13,-8,-10,-8,-3,-16,-5,-2,10,3,-7,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-33,3,21,-30,-20,-9,-26,18,-27,-15,-6,24,9,5,-7,-10,-26,-26,-19,14;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-13,-24,-14,6,-9,-25,-16,5,-14,12,2,-15,-15,-5,-15,-11,-6,0,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-24,7,30,-24,-10,-8,-25,1,-18,-17,0,-5,6,-5,6,8,-21,-29,-18,18;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-10,-20,-13,-8,-13,-22,-16,-11,-3,-9,-8,-8,1,-7,6,2,18,-5,-27,-12,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-24,-4,5,-25,-20,-7,-21,20,-21,-8,0,-11,16,16,2,9,-16,-23,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,7,-29,13,13,-31,6,-9,-33,12,-28,-18,4,-11,2,2,0,-10,-26,-27,-19,8;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-18,-32,-24,16,-28,-23,19,-26,27,12,-26,-28,-25,-21,-20,-7,18,-18,1,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-29,-20,6,-25,-14,16,-22,34,29,-25,-26,-13,-16,-24,-9,7,-14,0,-16;
MA   /M: SY='A'; M=15,-6,-16,-9,0,-22,-8,-9,-13,-7,-13,-7,-3,-12,10,-9,13,3,-10,-27,-15,5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-19,-26,-19,22,-24,-17,1,-16,7,1,-16,-25,-20,-4,-10,-4,5,-15,4,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-7,-18,-9,-11,-2,-2,-16,-13,-17,-7,-9,-4,-18,-14,-15,6,6,-8,-24,-9,-12;
MA   /M: SY='S'; M=1,-2,-20,-4,1,-22,-13,-13,-21,11,-25,-14,1,-3,0,5,13,12,-13,-29,-15,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-31,-16,-6,-15,-15,-19,-11,-14,-12,-10,-19,15,-9,-16,-12,-11,-15,1,-12,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-24,7,20,-24,-17,-3,-20,1,-15,-10,0,-9,19,-3,3,-2,-20,-26,-13,20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-17,-22,-17,9,-23,-17,7,-22,22,6,-13,-25,-18,-16,-13,0,4,-21,-2,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-20,-11,-7,-16,-15,-16,-8,-11,-14,-10,-9,10,-9,-9,8,4,-4,-32,-18,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-26,-12,-6,-26,1,-15,-23,-12,-21,-13,-13,19,-1,-14,-9,-14,-26,-15,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=5,5,-21,9,1,-19,-13,-11,-14,-8,-2,-9,-4,-15,-6,-9,-5,-7,-10,-27,-14,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00964;
//
ID   FN1_1_MP; MATRIX.
AC   MP01253;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fibronectin type-I domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2202511; R2=0.0087985; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1084; N_SCORE=13.757; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=260; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-18,-20,-16,-6,-24,-21,11,-19,4,2,-9,-16,-13,-18,4,17,9,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-15,-16,49,-21,-21,-6,-28,9,-22,-21,-15,-11,-14,-33,-17,-19,-13,-12,-14,-24,10,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-34,-11,-2,-26,-12,-13,-24,2,-25,-16,-11,39,-4,10,-8,-10,-25,-25,-23,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-28,-1,5,-24,-20,1,-19,11,-11,-1,-2,-17,20,27,-8,-10,-19,-22,-9,11;
MA   /M: SY='H'; M=2,-17,-20,-21,-14,8,-19,11,-5,-19,8,3,-12,-22,-13,-15,-12,-10,-5,-17,6,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-21,-26,-16,23,-22,-14,-8,-8,3,-2,-14,-24,-17,7,-13,-8,-5,-8,5,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-19,-10,-5,-15,-20,-11,-19,9,-15,-10,0,-15,-1,28,6,22,-9,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=5,11,-19,2,0,-22,-6,-4,-21,10,-25,-15,20,-14,1,6,8,0,-18,-30,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,3,-29,5,-2,-25,6,15,-33,3,-25,-14,8,-19,0,18,-5,-14,-27,-26,-11,-4;
MA   /M: SY='C'; M=2,-9,36,-14,-10,-23,-17,-19,-25,-2,-24,-16,-7,-22,-10,-9,4,-2,-11,-36,-21,-10;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-20,1,-3,-22,23,-6,-22,-6,-18,-10,1,-10,4,-7,0,-10,-20,-14,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-16,3,15,-16,-13,-6,-16,10,-13,-9,0,-4,5,4,2,6,-12,-18,-9,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-4,-17,-2,16,9,-16,-5,-12,-4,-5,-8,-5,-8,-2,-5,-5,-7,-12,-9,0,8; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-20,0,7,-20,-13,-7,-20,33,-20,-7,0,-7,7,20,-7,-7,-13,-13,-7,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-19,-8,-7,5,-16,23,-7,-6,-6,-2,-7,-6,-3,-5,-10,-8,-11,3,29,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-18,3,15,-18,-1,-3,-19,7,-14,-9,0,-6,7,7,-2,-7,-16,-15,-11,11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='A'; M=18,-11,-6,-15,-11,-7,-8,-15,4,-9,-1,-1,-11,-11,-11,-12,1,0,13,-15,-10,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=6,-3,-7,-9,-7,-7,-11,-13,-3,-7,-5,-5,-2,-7,-7,-8,9,21,2,-16,-7,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-20,-26,-24,-16,31,-27,-3,-10,-2,-4,-3,-13,-26,-15,11,-17,-10,-10,5,29,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,10,-32,21,35,-32,-11,-5,-31,2,-24,-22,0,14,8,-7,-2,-11,-30,-31,-23,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-27,-8,-3,-26,2,-12,-20,2,-20,-9,-2,-8,7,-2,0,-1,-18,-23,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-8,-21,-12,-6,-7,-22,-13,-15,10,-9,-6,-5,-16,-5,14,-2,11,-8,-21,-5,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-11,-24,-14,-4,-8,-24,0,-3,-7,3,7,-11,-19,13,-5,-8,0,-10,-12,11,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-4,-18,-6,8,-13,-15,-1,-7,2,-4,9,-5,-9,10,4,-4,-2,-8,-18,-7,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-12,-15,-17,-14,16,-20,-3,1,-13,0,0,-8,-16,-13,-11,-4,7,0,-5,16,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-27,-23,40,-30,4,3,-18,9,3,-21,-30,-19,-14,-21,-10,-5,18,56,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-14,4,-29,4,18,-28,-18,31,-26,7,-21,-7,8,-13,26,13,-3,-12,-29,-26,-5,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-11,-22,-11,0,-22,-16,-11,-7,2,-11,-2,-10,-17,9,2,-4,-7,0,-24,-13,4;
MA   /M: SY='G'; M=-8,3,-28,-1,-7,-27,25,17,-31,-10,-27,-13,14,-19,1,-8,0,-15,-30,-26,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-13,20,-30,31,43,-34,-17,1,-31,7,-23,-20,6,-4,20,-1,0,-10,-30,-31,-19,32;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-23,-9,-1,-21,-17,0,-9,-3,-16,-4,0,-14,14,3,8,0,-10,-28,-10,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=0,-15,-23,-17,-6,-10,-20,3,-3,-12,8,5,-14,-20,6,-9,-11,-9,-8,-16,3,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-27,-9,6,-12,-23,-17,-10,-9,-14,-11,-15,22,-9,-14,-5,-2,-8,-26,-16,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-27,-5,6,-9,-20,4,-21,11,-16,-11,-4,-17,5,25,-4,-6,-18,-12,10,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-10,-24,-8,1,-20,-7,-9,-13,-10,-6,-5,-7,-6,7,-9,1,-4,-15,-26,-15,4;
MA   /M: SY='G'; M=7,0,-23,-5,-10,-26,30,-13,-28,-5,-26,-17,9,-16,-10,-10,5,-9,-22,-25,-23,-10;
MA   /M: SY='R'; M=8,-7,-23,-11,-3,-24,-5,6,-22,3,-17,-8,-2,-15,7,11,0,-9,-17,-21,-11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,12,1,24,-25,-19,-11,-27,-4,-20,-19,-5,-12,2,-11,2,-6,-20,-35,-23,13;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-25,-4,2,-18,-16,22,-21,4,-21,-7,2,-16,15,8,3,-4,-20,-20,7,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-27,-7,5,-21,-14,-8,-22,2,-18,-11,-5,-13,13,7,-2,2,-21,-2,-7,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-11,5,-24,3,-5,4,-17,-5,-16,0,-13,-7,4,-19,-9,-4,-8,-8,-14,-16,4,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-6,-9,-27,42,-15,-35,-10,-28,-19,1,-17,-11,-6,5,-12,-26,-24,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-16,-30,53,-20,-36,-18,-30,-20,-4,1,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-1,-29,1,9,-28,-20,1,-19,11,-11,-3,-2,-15,27,17,-7,-10,-21,-22,-10,17;
MA   /M: SY='A'; M=23,-11,-16,-18,-8,-19,-11,-15,-8,-3,-10,-6,-8,-13,-2,-2,3,0,-1,-21,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-31,-7,5,-25,-20,12,-26,15,-20,-6,-2,-17,27,35,-8,-12,-25,-10,-4,14;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,15,-30,22,20,-30,-17,35,-32,4,-23,-13,9,-11,14,1,-4,-13,-29,-31,-4,16;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-21,5,-3,-22,2,-7,-24,-4,-27,-18,17,-6,-4,-2,12,5,-21,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-21,22,-26,-25,-6,-28,-27,6,-22,2,-1,-21,-29,-25,-21,-6,6,21,-34,-14,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-11,-2,-23,-16,-4,-23,6,-22,-13,-8,20,-1,16,-6,-9,-20,-24,-17,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-13,-19,-13,-10,-13,-20,8,-7,-3,-11,-3,-7,-22,-6,9,0,-3,4,-29,-6,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-28,-5,3,-25,-19,-8,-21,8,-22,-11,-1,13,10,10,-1,3,-21,-26,-16,4;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-15,-11,-11,-21,15,-17,-18,-13,-20,-14,-2,-14,-11,-17,16,2,-7,-28,-22,-11;
MA   /M: SY='C'; M=3,-17,86,-27,-25,-21,-19,-27,-26,-25,-18,-18,-17,-33,-25,-27,-5,-8,-9,-42,-28,-25;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-5,-17,-4,6,-14,-11,-8,-13,-6,-9,-9,-2,-12,0,-1,11,4,-10,-29,-13,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-21,3,19,-22,-14,-9,-20,-2,-20,-16,-1,12,3,-7,10,8,-18,-29,-18,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-2,0,-23,-1,-2,-22,-3,-10,-19,-10,-26,-18,8,16,-5,-12,13,3,-20,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-15,-37,-10,-2,-23,-19,-13,-23,1,-27,-17,-11,44,-5,6,-11,-11,-27,-14,-19,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-7,81,-10,-12,-24,-26,-22,-31,-21,-21,-21,-12,-31,-20,-24,-7,-10,-15,-46,-27,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-26,-22,-29,-24,27,-9,-20,0,-28,18,4,-20,-28,-27,-20,-20,-12,-2,-9,5,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00965;
//
ID   FETUIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01254;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fetuin family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=148;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=143;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4221416; R2=0.0122135; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3414; N_SCORE=46.109; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=171; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-12,-34,-10,0,-25,-23,14,-14,-7,-19,-6,-8,26,8,-6,-9,-12,-22,-26,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=0,-12,-24,-9,-4,-21,-13,-16,-11,-13,-24,-15,-6,28,-6,-16,13,4,-13,-34,-21,-8;
MA   /M: SY='A'; M=10,-14,-20,-19,-11,-15,-7,-16,-2,-15,3,0,-12,-17,-3,-15,-4,-3,-3,-21,-12,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-19,-33,-12,-3,-22,-19,-19,-13,-13,-17,-13,-18,58,-10,-19,-7,-6,-21,-30,-24,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-3,-20,-8,-1,-20,-16,-1,-10,-3,-9,-3,1,-16,12,-1,1,1,-10,-25,-10,5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-23,-11,-13,-15,7,-17,-12,-14,0,-5,-10,-21,-14,-9,-9,-11,-7,-23,-15,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-6,-25,-7,-5,-18,-14,-14,-13,-11,-15,-13,-1,24,-8,-14,2,4,-16,-31,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-11,-26,-9,-13,-11,10,-18,-17,-18,-14,-12,-7,-4,-17,-18,-4,-10,-14,-23,-16,-15;
MA   /M: SY='A'; M=7,-12,-18,-14,-5,-14,-14,-11,-4,-13,3,0,-10,-17,4,-11,2,-1,-5,-25,-11,0;
MA   /M: SY='A'; M=4,-17,-25,-16,-12,-19,3,-22,-7,-15,-13,-8,-14,4,-16,-19,-5,-9,-3,-25,-21,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-21,-25,-22,-12,17,-27,-7,-1,-11,14,4,-18,-26,-12,2,-20,-10,-5,-6,16,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-29,-11,-6,-19,-3,2,-25,9,-13,-7,-3,-21,-1,27,-11,-13,-19,-21,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-28,19,22,-31,-14,-4,-27,0,-26,-20,6,13,9,-7,5,-5,-27,-33,-21,14;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-26,-22,-13,-5,-26,-18,3,-15,17,5,-23,2,-14,-7,-21,-9,-2,-23,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=14,-1,-22,-4,2,-26,21,-13,-26,-8,-21,-17,2,-12,-6,-14,4,-9,-20,-24,-24,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,52,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,34,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,64,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,0,-10,-30,-39,-20,13;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-27,-4,2,-26,-13,-14,-22,3,-30,-18,-5,33,-2,-6,8,1,-21,-31,-22,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-14,24,-30,38,46,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,7,-4,13,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='V'; M=13,-15,-10,-21,-18,-8,-19,-24,7,-14,-2,-2,-15,-18,-18,-17,5,15,21,-27,-13,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-6,-26,-2,21,-16,-24,-9,-12,4,3,-4,-11,-13,4,-1,-13,-10,-14,-24,-11,12;
MA   /M: SY='A'; M=15,2,-20,-3,12,-26,-9,0,-18,-1,-17,-10,2,-9,13,-6,5,-5,-17,-25,-16,13;
MA   /M: SY='V'; M=9,-27,-18,-30,-25,-3,-20,-27,9,-17,-1,-1,-27,-25,-23,-20,-11,-6,20,10,-4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,6,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-6,-26,-2,-12,-15,10,-16,-14,-20,5,-5,-9,-22,-16,-18,-13,-14,-13,-24,-15,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-14,-17,-19,-18,20,-22,-20,-1,-19,2,-3,-13,-21,-23,-18,-6,3,4,-14,3,-19;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-31,-26,4,-31,-26,28,-25,25,15,-29,-29,-25,-21,-18,-5,34,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-18,18,-30,27,13,-33,-16,2,-32,13,-24,-17,9,-14,16,23,-4,-10,-26,-29,-14,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,3,-28,2,-10,9,-21,15,-10,-6,-11,-9,3,-25,-6,-8,-11,-8,-17,5,44,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,2,-29,3,20,-30,-19,0,-27,25,-23,-10,4,-11,23,26,-4,-9,-25,-23,-13,21;
MA   /M: SY='H'; M=-17,13,-27,16,1,-23,-17,52,-25,-8,-20,-8,13,-19,2,-5,-6,-13,-21,-33,3,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-13,-2,-16,-24,-3,-8,6,2,3,-11,-20,8,11,-14,-10,-8,-21,-5,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-16,-28,-14,-4,-14,-24,-15,-9,7,1,0,-15,0,-5,4,-18,-10,-10,-22,-10,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-18,10,-33,17,6,-26,-16,18,-30,-1,-24,-15,3,-16,10,1,-10,-15,-29,-1,-1,7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20,34,-29,21,-3,-13,0,0,-17,-29,-13,-11,-19,-11,-10,21,66,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-9,-25,-11,-3,-19,-21,-10,-11,26,-13,8,-9,-16,2,16,-12,-9,-3,-21,-8,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-13,-26,-13,-5,-8,-25,29,-7,-13,7,7,-10,-23,7,-6,-16,-13,-13,-18,13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=7,-11,-15,-17,-12,-12,-17,-19,-2,-8,-7,-5,-7,-15,-10,-4,7,14,6,-26,-12,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-10,2,-24,-22,-2,-13,11,-14,-1,-6,-18,23,25,-6,-8,-10,-22,-10,11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,27,-29,33,11,-31,-13,20,-33,8,-28,-18,20,-14,4,2,-3,-11,-28,-34,-9,6;
MA   /M: SY='D'; M=-12,27,-26,31,15,-31,-10,-1,-31,12,-29,-21,21,-11,4,3,3,-5,-26,-34,-18,10;
MA   /M: SY='V'; M=11,-25,-14,-29,-25,-5,-24,-27,24,-19,7,7,-23,-23,-23,-22,-7,-2,33,-25,-11,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-13,-9,0,-24,-22,-8,-22,23,-20,-7,-5,-18,9,27,-9,-9,-13,-24,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-15,-18,-8,-7,-28,-23,15,-13,3,3,-23,-23,-18,-15,-8,-2,30,-30,-12,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-27,-34,-27,-22,5,-24,5,-9,-16,-11,-7,-24,-28,-14,-14,-24,-19,-10,56,27,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-31,-9,-2,-20,-18,-9,-21,0,-24,-15,-10,32,-3,6,-2,-5,-22,-23,-12,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-14,-34,-14,-1,-19,-20,-4,-25,14,-20,-10,-8,-20,16,36,-14,-14,-25,16,-2,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,7,-29,9,14,-28,-4,-1,-31,10,-24,-16,8,-14,10,20,-2,-11,-27,-26,-17,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-2,-34,7,-3,-32,14,-16,-31,-11,-30,-22,-4,30,-11,-18,-4,-14,-30,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-3,-20,-4,-9,3,-18,-10,-6,-14,1,5,-6,-19,-11,-13,-4,0,-4,-23,-3,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-15,-31,-15,-21,-22,50,-21,-32,-21,-21,-16,-7,-22,-20,-20,-7,-20,-26,-1,-20,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-17,-1,14,-18,-16,-12,-10,-5,-15,-12,-5,-12,-1,-9,12,3,-1,-34,-17,7;
MA   /M: SY='L'; M=6,-26,-15,-28,-21,0,-24,-23,17,-22,24,10,-26,-26,-21,-20,-15,-5,21,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-31,-27,46,-30,-9,6,-21,7,2,-22,-30,-28,-17,-18,-8,7,8,38,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-6,-28,-2,9,14,-25,3,-14,-6,-7,-10,-10,-18,-5,-9,-11,-10,-17,-1,26,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,8,-31,-21,26,-29,43,22,-28,-28,-19,-21,-28,-10,14,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-23,7,29,-23,-20,-8,-23,7,-18,-15,0,-5,8,0,6,11,-18,-29,-15,19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24,12,-32,-23,26,-29,38,18,-27,-28,-22,-22,-26,-9,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,59,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-17,-12,-21,-19,-2,-26,-24,11,-18,10,3,-17,-21,-19,-16,-1,19,20,-28,-8,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-21,16,11,-24,-7,-11,-25,-4,-19,-18,5,-9,-2,-9,9,15,-17,-31,-17,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=12,-25,-10,-28,-25,-5,-23,-28,20,-18,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,38,-28,-12,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-14,31,-26,43,13,-33,-9,-2,-34,2,-29,-25,15,-11,1,2,7,-4,-24,-37,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-16,-36,-11,-1,-26,-21,-15,-19,6,-24,-14,-13,44,-4,6,-11,-10,-22,-26,-21,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-17,-6,-3,-17,-20,-16,-17,11,-17,-10,0,-10,-3,4,9,29,-7,-26,-10,-3;
MA   /M: SY='P'; M=11,-16,-29,-14,-4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16,54,-10,-20,-3,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-22,-29,-21,2,-28,-22,13,-22,21,9,-29,-28,-15,-17,-22,-10,12,2,0,-17;
MA   /M: SY='A'; M=14,-4,-21,-7,7,-26,-13,-11,-18,14,-18,-9,-5,-10,9,3,0,-6,-11,-21,-15,8;
MA   /M: SY='B'; M=-15,35,-26,33,8,-28,-7,4,-29,8,-29,-22,34,-15,2,6,3,-6,-28,-36,-18,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,-3,-17,-5,-6,-21,12,-15,-24,-7,-26,-17,4,-13,-6,-9,20,13,-14,-31,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-18,-26,-22,-6,-26,-23,18,-16,3,11,-26,-3,-21,-19,-11,-4,27,-29,-13,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-12,-29,-15,-1,-22,-25,-7,3,-6,-6,8,-9,-2,20,-7,-7,-6,-8,-22,-9,8;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-23,-23,-10,17,-26,-10,-1,-15,8,5,-16,-23,0,-9,-14,-9,-5,-10,6,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-10,-22,-15,-11,7,-21,15,-13,-7,-9,-4,-6,-19,-8,-7,-5,2,-10,-9,20,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,15,-28,16,40,-30,-16,4,-26,8,-22,-16,13,-6,23,2,2,-8,-30,-30,-18,32;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-19,0,0,-13,-13,64,-19,-6,-13,0,6,-13,6,0,-6,-13,-19,-19,13,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-14,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-16,18,11,-2,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,2,-30,8,34,-14,-22,16,-23,3,-15,-13,-4,-10,12,-2,-6,-11,-25,-15,9,21;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-28,-14,-20,-24,51,-16,-27,-18,-19,-3,-4,-20,-16,-18,-4,-18,-22,-20,-24,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,20,-40,-14,4,-33,4,-26,-19,13,-10,21,-3,0,-10,-30,-33,-16,21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,16,-36,-14,-4,-36,18,-30,-23,13,-10,4,4,-4,-10,-26,-33,-16,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-17,-12,-22,-17,19,-17,-13,8,-15,6,6,-13,-16,-17,-13,-9,-4,9,-6,5,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-19,0,4,-17,-13,33,-18,8,-15,-2,3,-10,11,7,-5,-10,-17,-16,4,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=13,-23,-19,-30,-22,-6,-23,-25,22,-21,10,8,-19,-19,-18,-24,-9,-5,21,-22,-9,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-21,-31,-21,4,-27,-13,24,-22,33,37,-24,-24,-12,-17,-24,-10,13,-20,0,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-17,-24,-23,-13,33,-26,-16,-13,5,-7,-4,-11,-21,-18,2,-16,-10,-9,-3,13,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-14,3,-27,-2,2,-17,-18,28,-15,-3,-13,-2,9,-19,19,0,-6,-10,-23,-19,8,9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,6,-22,12,-7,-17,-21,-13,0,-11,-5,1,-6,-19,-12,-15,-8,-7,8,-32,-12,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,17,-26,13,-1,-28,27,-5,-32,-8,-29,-21,24,-17,-7,-10,4,-11,-30,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,6,-24,1,8,-28,-17,-2,-21,17,-22,-8,9,-11,21,10,3,4,-21,-25,-11,14;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-27,-29,-19,41,-26,-20,-7,-23,-4,-7,-20,13,-29,-20,-16,-10,-11,-4,9,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-3,-21,-3,2,-22,-11,-7,-25,15,-27,-15,5,-13,5,24,13,4,-15,-29,-15,2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-21,-15,-6,-13,-24,-13,-4,6,-7,-3,-13,-22,-6,23,-9,-6,9,-25,-11,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,0,-10,4,-7,-8,-13,-11,2,-7,-3,-3,-7,-13,-11,-9,-4,-2,12,-19,-8,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-16,-30,-24,5,-29,-21,24,-24,31,21,-29,-29,-21,-19,-21,-6,25,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-26,-24,-20,40,-28,19,-5,-17,0,0,-15,-28,-18,-12,-18,-12,-10,12,51,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-14,-22,-16,-5,-18,-21,5,-18,13,3,-17,-19,-16,-18,-4,7,8,-23,-10,-16;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-26,7,8,-28,-13,-1,-25,28,-29,-12,21,-14,12,17,-2,-6,-25,-27,-14,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-12,10,-23,11,4,-21,-18,31,-25,-7,-18,-11,8,-13,2,-5,3,8,-19,-32,-1,1;
MA   /M: SY='S'; M=3,-11,-14,-11,-7,-9,-11,-14,-6,-17,-1,-6,-4,-17,-7,-14,15,9,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-1,-18,-6,-4,-16,-15,-9,-20,5,-19,-12,6,-14,0,19,12,20,-11,-29,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,21,-23,34,2,-26,-17,-11,-15,-7,-16,-16,2,-17,-11,-14,-4,-6,-1,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=13,-11,-19,-14,-6,-19,-15,-17,-10,12,-14,-6,-10,-15,-6,4,-3,-4,2,-22,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-12,4,-30,11,40,-28,-20,-1,-30,20,-21,-16,0,-6,16,19,-4,-10,-26,-26,-16,27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,30,-28,34,12,-32,-11,-1,-32,18,-30,-21,21,-12,4,6,-1,-8,-26,-33,-16,8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-31,-28,-1,-32,-29,31,-22,11,11,-24,-25,-25,-22,-10,2,40,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,-3,-13,-21,24,-26,16,-17,-6,-1,-21,7,43,-11,-12,-21,-15,10,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-5,-24,-7,0,-20,-18,-7,-20,24,-19,-1,-2,-14,5,24,-3,-1,-13,-23,-10,2;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-15,-15,-16,-1,-20,-14,6,-14,4,5,-2,-22,-14,-12,-3,9,8,-27,-7,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-36,-8,2,-30,-18,-16,-20,-8,-29,-18,-15,71,-2,-16,-4,-7,-28,-30,-27,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,26,-30,37,14,-34,-15,5,-35,14,-28,-20,12,-12,8,9,-4,-11,-27,-32,-14,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-21,-22,-15,-3,-24,-7,12,-23,15,8,-13,-21,-12,-18,-8,-4,6,-26,-3,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-23,-21,-13,-3,-23,-19,6,-23,21,6,-22,-2,-15,-19,-15,-6,-1,-25,-9,-15;
MA   /M: SY='I'; M=4,-20,-18,-27,-20,-4,-25,-24,19,-21,14,7,-17,-19,-17,-21,-8,5,17,-23,-7,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-31,-8,0,-23,-16,-15,-16,-6,-23,-15,-15,65,-7,-11,-8,-8,-23,-23,-23,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-21,-19,-22,-15,10,-21,-18,3,-22,12,2,-17,-13,-18,-17,-7,-1,2,-22,-4,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-3,26,-16,13,0,-20,0,3,-20,-4,-30,-20,42,-16,0,-4,21,7,-23,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-4,34,-21,27,4,-25,-2,3,-24,-2,-28,-21,39,-16,-1,-5,9,-1,-25,-38,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-26,-7,-3,-21,-17,-1,-19,-10,-23,-14,-5,31,-6,-13,6,10,-19,-32,-16,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,6,-24,2,7,-27,-12,12,-23,8,-25,-10,13,-14,22,13,7,-3,-24,-29,-11,13;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,26,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,45,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,24,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,36,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-18,13,-30,21,18,-24,-18,45,-30,-3,-21,-12,8,-13,9,-3,-6,-14,-29,-28,5,11;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-14,-8,-19,-3,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-16,19,11,-2,-26,-19,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00966;
//
ID   FETUIN_2_MP; MATRIX.
AC   MP01255;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Fetuin family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2177625; R2=0.0145850; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=685; N_SCORE=15.198; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-14,-19,-11,-6,-28,-24,17,-14,4,4,-24,-24,-19,-16,-8,-2,33,-30,-12,-15;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-23,-34,-23,-19,-4,-22,20,-13,-16,-14,-6,-19,-26,-11,-12,-22,-20,-13,44,18,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-14,-29,-10,-4,-13,-17,-6,-17,-3,-22,-14,-10,22,-4,-1,0,-3,-19,-18,-1,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-11,-34,-11,5,-25,-20,-1,-22,8,-20,-7,-8,-17,31,18,-11,-14,-28,16,-2,18;
MA   /M: SY='E'; M=-12,10,-28,9,26,-27,-16,4,-26,13,-22,-14,13,-11,20,18,0,-8,-28,-28,-16,22;
MA   /M: SY='P'; M=-12,9,-34,20,3,-34,3,-12,-32,-8,-30,-24,-1,29,-8,-16,-4,-12,-30,-32,-26,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-4,-20,-6,-10,7,-17,-6,-4,-13,-2,13,-6,-19,-9,-12,-5,-5,-4,-21,-1,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-14,-28,-14,-20,-22,49,-20,-27,-22,-13,-12,-6,-22,-20,-20,-6,-18,-22,-20,-24,-20;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-18,2,18,-20,-14,-10,-14,-4,-18,-14,-2,-10,2,-8,13,4,-6,-34,-18,10;
MA   /M: SY='L'; M=5,-26,-16,-28,-20,1,-24,-22,16,-23,28,11,-26,-26,-20,-20,-17,-6,17,-22,-7,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-33,-28,51,-30,-13,6,-23,8,2,-22,-30,-31,-18,-18,-8,8,6,33,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-10,-28,-8,11,16,-26,3,-12,-6,-6,-8,-12,-18,-4,-8,-12,-10,-16,1,29,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,9,33,-22,-20,-8,-22,2,-16,-16,0,-4,9,-4,8,13,-19,-30,-16,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,60,16,-36,-8,2,-36,0,-30,-28,28,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-12,-22,-20,-2,-26,-24,12,-18,10,4,-18,-22,-20,-16,-2,18,21,-28,-8,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,11,-22,13,9,-24,-3,-12,-26,-5,-20,-18,4,-10,-3,-10,8,13,-18,-30,-18,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=12,-25,-10,-28,-25,-5,-23,-28,21,-18,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,38,-28,-12,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,31,-22,43,12,-32,-6,-4,-32,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,15,1,-22,-40,-20,6;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-12,-24,5,-26,-16,-12,48,-2,14,-10,-10,-26,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-18,-6,-2,-18,-20,-16,-18,13,-18,-10,0,-10,-2,5,9,27,-8,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='P'; M=13,-16,-29,-14,-4,-26,-12,-20,-16,-10,-22,-16,-16,52,-10,-20,-2,-6,-19,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-18,-24,-15,-5,-28,-17,15,-18,20,12,-24,-26,-7,-14,-16,-6,17,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='K'; M=15,-2,-22,-4,12,-26,-12,-12,-22,17,-20,-12,-4,-8,4,3,0,-6,-14,-22,-16,8;
MA   /M: SY='D'; M=-16,27,-28,30,10,-30,-11,0,-31,16,-28,-20,22,-14,4,15,-1,-8,-26,-32,-16,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-18,-4,-3,-22,3,-14,-23,1,-26,-16,4,-12,-3,-3,18,13,-13,-30,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-21,-22,-19,-11,-26,-26,11,-16,-5,-1,-26,16,-22,-20,-10,-4,20,-30,-18,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-28,-13,3,-25,-23,1,0,-1,-5,16,-8,-14,34,-1,-8,-10,-11,-20,-6,18;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-17,-24,-20,-6,14,-26,-7,-5,-12,4,3,-13,-21,8,-7,-13,-10,-12,-9,7,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-10,-25,-12,-8,-3,-19,22,-14,0,-12,-4,-8,-20,-2,-3,-9,-10,-14,-3,28,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00966;
//
ID   CULLIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01256;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cullin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8143702; R2=0.0137614; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=388; N_SCORE=10.144; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-26,-3,-29,-24,1,-30,-25,18,-25,23,10,-25,-28,-23,-21,-17,-1,21,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-20,-26,-24,-2,-18,-22,16,-21,8,8,-18,-23,-20,-20,-10,1,18,-21,-3,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-23,12,15,-26,-11,5,-24,4,-24,-15,16,-11,11,2,8,0,-23,-32,-15,12;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-25,-7,5,-27,-19,-2,-10,1,-15,-2,1,-13,28,2,2,-3,-16,-23,-11,16;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-17,-25,-18,2,-25,-21,14,-24,28,11,-22,-25,-18,-19,-14,0,12,-24,-5,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=1,-1,-23,-3,2,-25,-6,-4,-24,18,-24,-11,3,-12,6,12,2,-5,-17,-23,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-22,-4,-5,-15,-2,-7,-19,-5,-19,-13,2,-6,-5,-1,3,-3,-14,-25,-14,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-29,-14,-8,-18,-2,-7,-22,8,-13,-2,-6,-13,-1,29,-10,-12,-17,-21,-14,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-27,-18,-34,-27,45,-21,-22,4,-26,8,1,-20,-28,-33,-20,-15,-8,8,-4,13,-27;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-21,-12,-7,-15,-17,-11,-5,-2,-8,-3,-2,-10,-5,-6,0,4,-5,-26,-10,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-2,-17,-9,-24,-22,-23,-17,-16,-20,-16,-21,45,-16,-22,-10,-9,-18,-33,-27,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-5,6,-19,4,2,-20,-12,-6,-19,5,-19,-12,8,-13,5,6,9,6,-15,-29,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-18,-15,-11,-13,-19,-19,2,-7,-10,-4,-12,-2,-11,-8,2,3,8,-28,-14,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-20,-7,-1,-21,-10,-13,-16,2,-21,-10,-2,-2,0,-4,12,8,-10,-29,-16,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-11,7,-24,11,-5,-15,-19,-9,-2,-10,-4,6,-3,-16,-7,-15,-9,-9,-2,-28,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-36,-29,1,-36,-29,40,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-28,-6,4,-22,-22,-12,-20,33,-13,-4,-6,-14,4,20,-14,-10,-14,-20,-8,4;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-25,-1,11,-24,-17,-7,-23,19,-23,-12,1,-11,10,18,4,0,-17,-26,-13,10;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-12,33,-17,-10,-23,-20,-14,-25,-5,-20,-14,-8,-24,-2,5,-2,-6,-14,-34,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-38,-27,46,-28,21,24,-20,-20,-18,-28,-20,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-28,17,31,-24,-18,-4,-21,-1,-8,-12,-2,-9,9,-6,-6,-10,-22,-29,-16,20;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-7,-26,-7,-8,-13,-15,8,-13,-10,-13,-6,-5,-18,-5,-10,-4,-7,-12,-5,0,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,14,33,-28,-8,-6,-26,2,-19,-17,0,-7,9,-5,0,-7,-22,-29,-19,21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-29,-1,8,-28,-19,6,-28,30,-25,-8,4,-14,18,33,-7,-10,-23,-22,-8,11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-29,11,20,-28,4,-6,-30,3,-20,-14,0,-10,5,-1,-3,-13,-26,-26,-19,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-28,-19,-19,27,-29,17,-1,-10,-1,-1,-18,-28,-10,-10,-17,-5,-9,25,73,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-33,-24,4,-31,-21,30,-26,31,25,-26,-26,-18,-21,-23,-9,21,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-28,5,29,-28,-18,-1,-25,13,-19,-12,-1,-8,21,15,-1,-8,-24,-25,-15,24;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-12,13,-25,17,8,-26,-11,5,-27,3,-22,-14,9,-14,5,8,2,-3,-21,-31,-13,5;
MA   /M: SY='D'; M=-4,18,-28,27,19,-33,-10,-6,-30,5,-25,-20,5,-1,4,-5,0,-9,-24,-30,-20,11;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,24,-25,30,16,-30,-4,1,-30,0,-24,-20,14,-10,4,-5,2,-8,-25,-32,-18,10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-24,25,13,-26,-10,4,-28,7,-23,-18,18,-12,6,12,1,-6,-24,-30,-15,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-28,-12,-6,-20,-11,-9,-10,-6,-16,-8,-11,27,-7,-11,-8,-9,-14,-22,-15,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='B'; M=-11,24,-25,24,12,-30,-10,4,-26,5,-27,-17,24,-13,14,4,6,-4,-27,-33,-17,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-14,-19,-17,-8,-8,-24,-15,7,-12,-1,3,-12,-17,-7,-14,-1,7,10,-24,-5,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-26,-22,35,-30,4,4,-18,12,4,-22,-30,-18,-14,-22,-10,-4,16,54,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-6,-22,-10,-3,-12,-19,3,-4,-6,-7,3,-2,-16,2,-5,-2,-1,-5,-23,-1,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='L'; M=5,-25,-17,-29,-21,0,-24,-22,20,-22,23,15,-24,-24,-18,-21,-16,-6,19,-22,-6,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-10,-17,-10,-17,-5,-20,-8,-11,-11,-10,-8,-12,-10,-18,13,9,3,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,9,33,-22,-20,-8,-22,2,-16,-16,0,-4,9,-4,8,13,-19,-30,-16,21;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-29,-18,-11,-19,-24,-24,-1,-14,-15,-9,-24,44,-18,-20,-10,-6,0,-30,-22,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-30,1,10,-30,36,-12,-36,-9,-26,-20,0,-12,-5,-12,0,-16,-30,-24,-26,3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-14,-12,63,-19,-19,-20,-26,19,-30,-22,-20,-12,-9,-32,-15,-19,-10,-14,-18,-42,-11,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-26,-18,-8,-12,-20,0,-11,15,-5,17,-8,-20,6,40,-14,-10,-9,-20,-6,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-30,1,10,-30,36,-12,-36,-9,-26,-20,0,-12,-5,-12,0,-16,-30,-24,-26,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-22,0,12,-32,-12,2,-20,2,-24,-8,4,-10,37,2,15,1,-22,-28,-14,25;
MA   /M: SY='A'; M=27,-18,-14,-24,-14,-9,-11,-20,1,-18,13,1,-18,-18,-14,-20,-5,-4,4,-20,-12,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00967;
//
ID   RIBOSOMAL_L10E_MP; MATRIX.
AC   MP01257;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosomal protein L10e signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4302912; R2=0.0128991; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1221; N_SCORE=20.170; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-11,-26,-15,-11,17,-24,56,-19,-17,-9,0,-1,-24,-9,-7,-14,-16,-19,-15,24,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-17,1,-30,2,10,-26,-20,69,-28,-3,-20,-2,7,-16,23,2,-7,-17,-30,-28,9,13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-18,-30,-23,7,-32,-19,22,-26,30,15,-25,-27,-20,-21,-22,-6,15,-17,6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-30,4,37,-22,-25,-8,-9,0,-10,-10,-5,-5,10,-8,-5,-10,-14,-27,-15,22;
MA   /M: SY='N'; M=-11,32,-22,16,1,-21,-4,16,-22,4,-29,-17,50,-19,2,3,6,-3,-29,-37,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-33,-4,6,-30,-20,-13,-27,31,-30,-13,-6,20,4,17,-10,-10,-23,-23,-16,3;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-19,-20,-26,-16,-4,-21,-2,16,-9,15,46,-19,-20,4,-9,-17,-9,9,-21,-2,-6;
MA   /M: SY='A'; M=19,-19,-14,-25,-16,-6,-15,-18,7,-17,14,11,-19,-19,-14,-19,-8,-4,9,-21,-10,-15;
MA   /M: SY='T'; M=14,-4,-12,-10,-9,-17,-2,-18,-14,-11,-17,-13,-1,-12,-9,-14,20,22,-4,-29,-17,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-16,11,-20,-24,-11,26,-22,-29,-23,-20,-14,-9,-27,-24,-22,-6,-16,-19,-24,-21,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-12,-19,-9,-20,-2,-18,-12,-6,-11,-10,-9,-11,-8,-10,8,-1,-2,-20,-19,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,60,-19,-39,-12,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-25,8,-32,-20,27,-26,29,16,-27,-28,-21,-21,-22,-8,21,-17,7,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-1,-23,-1,9,-32,-3,0,-22,0,-25,-9,4,-11,30,0,14,0,-23,-27,-16,19;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-23,26,14,-30,-13,-2,-26,0,-23,-18,14,-10,11,-4,8,5,-23,-33,-16,12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-15,-25,-16,-11,-14,0,-11,-12,-8,3,-1,-11,-21,-6,0,-12,-12,-11,-20,-11,-9;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-13,-13,-6,-21,-2,-17,-14,-10,-18,-14,-5,1,-7,-17,16,5,-6,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-21,-39,-30,75,-30,-18,-1,-29,9,-1,-21,-30,-38,-20,-21,-11,-1,15,32,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-28,-3,6,-26,-20,-10,-26,40,-26,-10,-1,-12,7,30,-7,-6,-16,-22,-10,6;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-17,-37,-10,-2,-28,-18,-19,-17,-10,-27,-18,-16,75,-10,-19,-8,-9,-26,-29,-28,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-22,-22,-16,-9,-27,-15,16,-10,2,7,-14,-21,-8,-12,-10,-6,16,-23,-4,-14;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-10,-17,-15,-11,-7,-23,-16,-6,-6,3,-2,-8,-17,-8,5,1,22,-1,-25,-8,-11;
MA   /M: SY='A'; M=38,-14,-2,-22,-14,-17,-7,-22,-5,-13,-7,-7,-14,-15,-14,-21,6,-1,7,-23,-19,-14;
MA   /M: SY='A'; M=45,-12,-10,-21,-12,-18,-3,-21,-6,-11,-8,-8,-12,-12,-12,-20,8,0,5,-21,-19,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-10,1,-21,-21,-1,-26,25,-16,-7,-2,-19,13,57,-10,-10,-19,-20,-9,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,16,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-28,4,10,-18,-19,0,-21,15,-19,-11,1,-15,8,13,-6,-9,-19,-17,1,7;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-11,-30,-11,4,-17,-23,-14,-8,5,-14,-7,-9,6,-2,1,-8,-8,-11,-23,-12,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-29,1,-14,-29,50,-14,-35,-15,-28,-18,7,-19,-15,-16,0,-16,-28,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,8,-29,12,26,-36,-19,5,-24,7,-21,-8,3,-8,40,4,1,-6,-28,-25,-13,33;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-12,-26,-13,-3,-19,-24,-16,-4,9,-11,-2,-11,-6,-1,2,-10,-6,-1,-23,-11,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,34,-29,33,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-34,-24,23,-29,-17,19,-25,28,23,-24,-26,-21,-19,-23,-10,12,-13,7,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-13,-8,-6,-11,-13,-12,-10,-11,-16,-12,0,-13,-6,-11,22,24,-2,-29,-7,-7;
MA   /M: SY='V'; M=4,-26,-18,-31,-26,-4,-25,-27,28,-22,10,12,-22,-22,-21,-23,-11,-5,30,-24,-8,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-31,-15,-3,-4,-17,-7,-23,9,-16,-11,-10,-20,-2,24,-14,-13,-19,10,4,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,5,-28,-25,6,-27,-26,10,-21,2,1,-20,-26,-26,-20,-6,5,22,-26,-7,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,20,-27,19,13,-28,-12,-2,-29,22,-29,-17,20,-12,6,13,-1,-6,-25,-30,-16,9;
MA   /M: SY='D'; M=-12,4,-31,12,10,-29,-14,-10,-26,11,-25,-17,-2,9,0,4,-6,-10,-21,-29,-19,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-26,9,22,-30,-6,-1,-27,7,-24,-15,8,-9,19,3,5,-6,-26,-28,-18,20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00968;
//
ID   BH2_MP; MATRIX.
AC   MP01258;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Apoptosis regulator, Bcl-2 family BH2 motif signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1903348; R2=0.0141620; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=164; N_SCORE=7.503; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=93; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-25,3,-33,-26,31,-27,26,16,-24,-24,-21,-23,-18,-3,24,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-15,-4,-20,-14,-13,-15,-17,2,-14,-6,2,-12,-18,-9,-17,4,1,8,-28,-14,-12;
MA   /M: SY='A'; M=5,-8,-19,-10,-6,-6,-6,-14,-11,-12,-9,-8,-8,-16,-9,-14,1,0,-6,-20,-8,-7;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-25,-30,-28,-20,8,-19,-21,-11,-15,-5,-9,-22,-24,-16,-10,-17,-9,-12,45,9,-16;
MA   /M: SY='M'; M=3,-19,-18,-25,-19,-6,-13,-17,10,-17,11,17,-17,-20,-13,-17,-9,-1,10,-22,-8,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,-15,-12,-12,-7,-17,-14,-1,-13,0,1,-10,-17,-11,-14,2,10,4,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='B'; M=-1,11,-22,11,8,-21,-13,-8,-14,-6,-12,-13,7,-12,-2,-11,3,0,-13,-31,-16,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-25,-24,-16,32,-29,-4,1,-14,2,0,-17,-26,-18,-9,-17,-9,-1,5,34,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-27,-20,-30,-20,5,-28,-19,21,-26,38,21,-26,-26,-17,-20,-24,-9,11,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-20,-7,0,-16,-15,1,-12,2,-12,0,1,-15,1,4,1,0,-8,-27,-10,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,8,-28,11,20,-25,-11,20,-30,4,-22,-14,8,-12,8,7,-2,-9,-27,-29,-10,12;
MA   /M: SY='H'; M=-12,5,-25,0,2,-18,-8,14,-23,2,-20,-11,12,-17,5,9,0,-2,-22,-24,-3,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-21,-12,-3,-27,-8,7,-16,22,11,-17,-23,-7,-11,-17,-4,1,-22,-1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-2,-4,-20,1,-4,-20,-6,-8,-8,-4,-18,-3,0,-7,-11,-16,-24,-13,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,0,-28,6,9,-27,-4,-12,-24,-3,-22,-17,-4,11,-4,-7,-2,-7,-20,-28,-22,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-36,-26,2,-34,-22,38,-26,26,28,-22,-22,-16,-24,-22,-10,22,-20,0,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-27,-7,8,-26,-21,12,-13,3,-14,-1,-4,-14,23,5,-4,-10,-14,-23,-6,14;
MA   /M: SY='E'; M=-4,10,-26,16,23,-32,-14,-1,-26,7,-23,-14,4,-8,22,1,6,-5,-24,-29,-16,23;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,12,-26,6,7,-27,-13,24,-23,4,-24,-8,21,-16,25,9,3,-7,-28,-29,-9,15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-30,-10,-18,-29,62,-18,-39,-16,-29,-19,0,-20,-17,-12,-1,-19,-29,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-37,-48,-37,-26,6,-20,-27,-20,-17,-20,-18,-37,-28,-13,-17,-37,-28,-30,136,27,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-24,28,23,-28,-15,-6,-24,-1,-20,-19,4,-9,2,-9,3,-5,-16,-34,-19,13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-6,-24,-8,-3,-25,23,-15,-28,-7,-21,-16,-2,-14,-8,-6,3,-5,-19,-23,-22,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-28,-19,-36,-26,57,-28,-20,3,-28,17,3,-21,-28,-33,-20,-20,-9,2,1,20,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-27,6,-30,-26,-1,-31,-27,18,-25,16,8,-25,-29,-25,-22,-15,-3,23,-29,-9,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-25,6,16,-26,-9,2,-27,10,-23,-15,6,-10,6,6,1,-7,-22,-27,-15,11;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-18,-24,-19,-15,23,-26,-14,-2,-15,12,2,-17,-19,-20,-13,-20,-10,-4,-9,11,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-16,-24,-22,-18,35,-23,-5,-7,-15,-4,-5,-8,-20,-20,-8,-11,-7,-9,2,28,-19;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-3,-30,-1,-2,-25,16,12,-27,-10,-21,-12,2,-17,-5,-6,-5,-16,-24,-25,-12,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-4,-26,-3,-3,-22,-17,-14,-16,-3,-22,-15,-3,23,-7,-4,2,5,-15,-31,-20,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,-29,4,3,-25,-3,6,-23,-2,-24,-14,8,0,-2,-6,-2,-10,-23,-29,-14,-1;
MA   /M: SY='A'; M=5,-7,-18,-10,-10,-9,-6,-9,-8,-15,-8,-4,-4,-16,-10,-16,4,1,-5,-25,-10,-11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-18,-26,-19,-14,-8,-7,-15,-14,-11,-9,-9,-14,-13,-11,-7,-8,-6,-13,8,-1,-13;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=4,-11,-22,-11,3,-16,-14,-12,-11,-7,-10,-8,-12,-7,3,-10,-3,-6,-10,-3,-9,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-10,-20,-10,0,-12,-9,-10,-6,-9,1,3,-11,-4,-2,-10,-7,-5,-8,-19,-11,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=5,-15,-13,-19,-17,2,-10,-20,-1,-16,-2,-3,-12,-18,-18,-16,2,7,8,-20,-7,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: M=-13,-9,-25,-10,-11,-1,-23,-14,-2,-8,-5,-4,-7,-17,-10,0,-10,-3,-3,-6,0,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-14,-24,-18,-6,5,-24,-12,-9,-1,-2,-2,-10,-19,-4,8,-10,-4,-7,-15,0,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,3,-22,-4,-7,-9,-4,-8,-14,-8,-12,-10,12,-13,-9,-7,0,-4,-16,-28,-13,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00829;
//
ID   BH3_MP; MATRIX.
AC   MP01259;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Apoptosis regulator, Bcl-2 family BH3 motif signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.0104718; R2=0.0165604; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=35; N_SCORE=6.580; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=30; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-6,-5,-5,9,-21,-21,4,-23,4,-16,-8,-5,-12,3,7,-6,-9,-19,-30,-12,5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-9,-18,-10,-3,-11,-6,-10,-2,-7,-5,3,-6,-12,-3,-6,-2,-5,-2,-20,-10,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=0,8,-21,14,8,-21,-14,-11,-15,-8,-10,-13,-2,-14,-5,-13,1,-4,-8,-31,-16,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='A'; M=14,-7,-16,-13,-9,-11,-4,-16,-12,-10,-13,-11,-5,4,-11,-15,4,4,-9,-20,-15,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-4,-24,0,-5,-13,-21,-12,-8,-4,7,-1,-10,-21,-8,1,-15,-9,-5,-25,-9,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-19,3,5,-17,-10,1,-16,0,-16,-11,-2,15,1,2,-1,-4,-16,-19,-11,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-25,-10,2,-16,-18,-14,-9,-13,-4,-7,-13,14,-3,-14,-3,-3,-13,-29,-16,-2;
MA   /M: M=-2,-12,-24,-11,-1,-19,0,-16,-9,-12,-9,-6,-11,-11,-7,-14,-6,-10,-5,-25,-18,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-16,-28,-12,-4,-19,-11,-18,-10,-14,-12,-10,-14,24,-11,-17,-4,-6,-12,-28,-20,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-8,-15,-6,4,-25,-16,-4,-20,4,-20,-10,-4,6,15,11,-1,-6,-21,-24,-15,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,5,-21,7,4,-17,-6,-5,-18,-3,-16,-8,2,-12,0,-4,1,-5,-15,-13,-11,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=18,1,-13,0,8,-20,-4,-10,-16,-5,-17,-14,0,-7,0,-11,14,3,-10,-25,-17,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='A'; M=12,-10,-12,-15,-11,-11,-4,-16,1,-12,-6,-3,-6,-11,-10,-15,5,3,4,-19,-11,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=7,-9,-12,-14,-10,-7,-12,-13,4,-12,-1,2,-6,-11,-7,-13,5,7,4,-20,-8,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-22,2,3,-22,-3,8,-23,9,-18,-8,2,-11,11,14,-4,-10,-19,-17,-8,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-1,1,-17,-2,-3,-22,-10,-9,-15,5,-15,-8,3,-17,1,-1,-3,-7,-11,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,-15,-28,-23,-2,-27,-25,21,-21,15,9,-22,-23,-21,-20,-9,4,26,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-19,-13,-8,-19,0,0,-17,-8,-12,-8,-4,-15,-6,-7,3,-5,-11,-24,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-26,-8,10,-16,-21,-6,-13,2,1,-2,-10,-16,8,14,-11,-9,-13,-22,-10,7;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-7,-3,-12,-5,-21,-18,6,-22,-1,-16,-8,-3,-18,4,8,0,1,-14,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=8,-7,-23,-11,1,-24,-13,-7,-22,16,-18,-9,-4,-14,10,24,-2,-6,-14,-20,-14,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-6,-15,-7,3,-24,-19,-6,-17,4,-12,-6,-5,-16,13,13,-5,-8,-15,-24,-13,6;
MA   /M: SY='I'; M=10,-24,-19,-31,-22,-5,-25,-25,24,-22,14,9,-20,-20,-19,-24,-11,-5,21,-22,-8,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,16,-29,26,40,-31,-7,-3,-32,4,-24,-22,5,-5,11,-5,2,-9,-29,-32,-21,25;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-34,-25,24,-29,-19,20,-25,26,21,-24,-27,-23,-19,-22,-9,14,-13,7,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-26,30,16,-30,-11,16,-30,-1,-26,-19,18,-12,10,-4,5,-6,-27,-35,-13,12;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-25,-11,-3,-16,-19,5,-18,9,-11,-5,-3,-20,6,31,-5,-6,-12,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,6,-24,0,0,-20,-11,1,-25,14,-25,-15,19,-18,5,36,5,-2,-21,-29,-15,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-18,-25,-22,-18,8,-26,9,7,-15,6,11,-15,-23,-9,-14,-14,-6,0,-3,30,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-14,2,-29,6,17,-26,-19,0,-21,10,-16,-3,-2,-6,16,17,-6,-10,-21,-25,-13,15;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-21,-10,-5,-14,-13,-11,-16,2,-16,-11,-6,4,-3,10,0,3,-13,-8,-10,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=3,3,-20,4,6,-22,-6,-9,-21,1,-17,-14,-1,-2,-1,1,2,-1,-15,-23,-16,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-22,-30,-20,37,-28,-15,-1,-16,15,3,-18,-28,-23,0,-21,-10,-2,-5,12,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=11,-10,-18,-13,-2,-22,-14,-10,-6,-6,-8,-2,-9,-15,12,-8,4,-2,-3,-24,-13,5;
MA   /M: SY='R'; M=-9,6,-26,5,5,-25,-6,-3,-28,9,-22,-15,9,-15,6,22,-1,-5,-22,-26,-16,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-16,-22,-20,-10,-9,-15,-5,5,-10,10,27,-16,-10,5,-9,-15,-10,-3,-19,-6,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-19,-21,-14,-2,-23,-18,8,-19,16,6,-14,-21,-12,-11,-6,3,5,-25,-6,-14;
MA   /M: SY='S'; M=11,-1,-19,-2,2,-24,-3,-9,-22,0,-21,-15,1,-12,3,3,12,0,-14,-28,-18,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-2,-27,-1,10,-28,-17,3,-20,6,-17,-7,-3,-4,19,5,-3,-9,-21,-23,-12,14;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-24,-19,-25,-15,-2,-26,-17,14,-20,26,13,-24,-25,-9,-15,-18,-7,11,-22,-5,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-11,3,-28,8,2,-17,-18,19,-22,-8,-16,-10,0,-1,3,-9,-7,-12,-22,-26,-4,1;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-22,-24,-16,-8,-23,-18,10,-15,7,12,-16,-5,-11,-14,-10,-1,5,-23,-9,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00829;
//
ID   BH4_1_MP; MATRIX.
AC   MP01260;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Apoptosis regulator, Bcl-2 family BH4 motif signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1753011; R2=0.0148012; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=699; N_SCORE=15.511; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-12,0,-22,-4,-4,-16,-20,51,-22,-10,-16,-4,6,-16,2,-4,2,9,-18,-30,8,-4;
MA   /M: SY='P'; M=5,-17,-32,-13,-3,-27,-15,-20,-17,-10,-25,-17,-17,65,-10,-20,-5,-7,-22,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-22,-14,-16,-26,41,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-22,-6,-5,-23,11,-9,-28,1,-27,-17,4,-16,-2,15,13,0,-18,-28,-19,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-10,-18,-18,-12,-8,-20,-8,-2,-2,0,17,-8,-16,-2,7,-2,14,0,-24,-6,-8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-25,-6,-7,-26,20,-16,-27,-14,-30,-20,-1,11,-10,-16,13,-2,-22,-30,-26,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-7,-18,-7,-3,-1,-15,7,-8,-4,-10,-4,-5,-15,8,-4,1,-1,-11,-1,23,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,31,-22,43,12,-32,-6,-4,-32,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,16,2,-22,-40,-20,6;
MA   /M: SY='N'; M=-7,30,-17,12,-3,-17,-5,2,-17,-3,-25,-17,45,-17,-3,-3,13,13,-22,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=5,5,-25,10,42,-27,-15,-5,-25,5,-17,-17,-3,-3,12,-5,3,-7,-22,-27,-20,27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,31,-30,39,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,17,-20,0,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=7,-23,-18,-29,-21,-3,-23,-21,20,-20,17,17,-21,-21,-16,-20,-13,-6,19,-22,-7,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,16,-36,-14,-4,-36,18,-30,-23,13,-10,4,4,-4,-10,-26,-33,-16,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26,62,-30,-6,0,-23,6,0,-20,-30,-29,-16,-20,-10,-4,17,48,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,35,-25,21,15,-26,-26,-25,-24,-17,-5,35,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-3,-22,-3,-5,-23,10,27,-29,-13,-26,-13,7,-16,-1,-9,12,-4,-22,-31,-8,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-15,-3,0,-20,-5,-7,-23,0,-27,-17,7,-13,3,10,27,12,-13,-35,-17,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-16,-30,-16,-16,20,-28,36,-6,-10,-4,0,-14,-28,-6,-8,-18,-12,-14,18,68,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-6,0,9,4,0,-21,-19,-15,-15,-11,-16,-15,-6,-19,-10,-15,3,-2,-2,-38,-19,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-35,-7,-37,-30,2,-23,-30,-23,-23,-20,-20,-35,-33,-23,-23,-32,-25,-25,100,15,-23;
MA   /M: SY='S'; M=11,3,-18,4,-4,-26,16,-13,-26,-11,-26,-19,5,-13,-7,-15,18,1,-16,-31,-23,-6;
MA   /M: SY='A'; M=27,-4,-18,-8,10,-26,-8,-10,-16,-2,-14,-10,-6,-8,9,-10,6,-4,-12,-22,-18,9;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-18,-26,-20,-22,-1,31,-20,-20,-24,-6,-8,-10,-24,-24,-20,-10,-16,-16,-14,-13,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-24,6,24,-24,-13,-7,-21,0,-21,-17,-3,21,6,-7,5,-3,-22,-27,-19,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-30,40,18,-35,8,-5,-38,-3,-28,-25,11,-11,-1,-11,0,-13,-30,-33,-23,8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-15,0,14,-15,-9,-3,-15,7,-11,-9,-2,-6,6,11,-1,-5,-12,-15,-10,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-21,-5,3,-17,-3,-13,-11,-7,-13,-9,-10,10,-7,-11,-4,-7,-7,-21,-17,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=0,6,-21,13,14,-23,-10,-7,-19,-2,-18,-15,-2,15,0,-9,-1,-6,-18,-23,-17,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,-6,-23,-4,11,-22,4,-14,-17,-7,-15,-12,-8,-13,-5,-12,-1,-9,-9,-26,-20,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,8,-22,4,0,-19,-7,-3,-15,-4,-22,-15,16,25,-4,-7,0,-4,-22,-26,-19,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-12,-24,6,-26,-16,-12,47,-2,15,-10,-10,-26,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='A'; M=23,-6,-13,-15,-12,-18,3,-20,-15,-12,-13,-12,-5,-12,-12,-16,12,16,-5,-24,-18,-12;
MA   /M: SY='P'; M=12,4,-24,8,11,-28,-10,-12,-22,-4,-20,-18,-4,13,-2,-14,2,-6,-18,-28,-22,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=22,7,-13,7,0,-21,-3,-11,-16,-5,-13,-13,0,-8,-5,-13,5,-3,-8,-21,-16,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-30,-7,0,-22,-15,-15,-15,-7,-22,-15,-15,67,-7,-15,-7,-7,-22,-22,-22,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-16,-21,-16,1,-26,-20,7,-21,23,7,-17,-21,-16,-16,-8,17,6,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='H'; M=11,-4,-21,-9,-4,-20,-11,47,-21,-10,-16,-4,1,-16,1,-9,-1,-11,-17,-26,2,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00829;
//
ID   UPF0020_MP; MATRIX.
AC   MP01261;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0020 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3987823; R2=0.0155097; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=487; N_SCORE=12.942; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=72; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=31,-10,1,-17,-13,-22,8,-20,-18,-14,-16,-14,-7,-15,-13,-20,9,-2,-7,-25,-23,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22,4,-28,-15,26,-23,33,35,-24,-24,-13,-18,-24,-10,14,-20,0,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,21,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,39,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-11,4,-22,-5,-5,-11,-16,2,-10,0,-9,-1,12,-20,4,7,-3,0,-15,-22,-2,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-20,-25,-16,3,-25,-14,11,-19,31,18,-22,-26,-12,-8,-20,-7,5,-22,-3,-15;
MA   /M: SY='S'; M=13,-5,11,-11,-9,-18,-9,-17,-17,-13,-20,-16,-1,-15,-9,-15,21,17,-6,-35,-20,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,4,-29,6,1,-29,32,-10,-35,-6,-27,-20,8,-16,-7,-5,0,-14,-29,-26,-24,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-34,-36,-32,-25,0,-23,-28,-4,-18,-12,-11,-34,-11,-22,-20,-26,-17,-5,65,8,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,1,-24,-4,2,-21,-19,-9,-18,19,-16,-7,3,-13,7,11,-3,4,-14,-24,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-3,-33,6,19,-30,-17,-12,-24,-3,-25,-20,-9,42,0,-13,-4,-9,-27,-30,-25,7;
MA   /M: SY='G'; M=-6,11,-26,13,1,-28,22,-11,-32,-9,-26,-20,10,-14,-8,-12,4,-4,-25,-29,-23,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-25,23,15,-24,-18,-6,-24,0,-13,-16,4,-11,1,-1,0,2,-18,-31,-15,8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-19,-28,-18,-11,-16,-24,-18,-1,-9,-11,-1,-17,26,-11,-9,-9,-2,-3,-27,-17,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-34,-25,13,-32,-22,27,-27,31,21,-25,-26,-21,-22,-23,-9,18,-18,2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-30,-24,9,-31,-19,23,-25,31,15,-28,-29,-21,-20,-23,-7,20,-17,7,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-24,-20,-33,-23,26,-24,-8,14,-18,20,37,-21,-24,-15,-14,-21,-10,7,-11,9,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-9,-15,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-10,31,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=9,-4,-14,-11,-11,-17,4,-19,-17,-12,-16,-13,-1,-12,-11,-14,16,24,-7,-27,-17,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-39,-29,35,-35,-25,26,-30,19,12,-21,-25,-28,-25,-21,-10,15,-7,13,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-25,-24,-24,-14,-3,-24,-20,7,-23,23,7,-25,3,-16,-20,-21,-9,-1,-23,-10,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,28,-20,0,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-15,-17,-13,-23,18,-20,-18,-13,-15,-13,-7,-13,-13,-20,7,-5,-8,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='G'; M=28,-10,-19,-16,-14,-24,30,-20,-23,-14,-19,-14,-6,-14,-14,-20,6,-9,-13,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-18,-27,-18,5,-26,-16,15,-23,34,23,-23,-25,-14,-16,-20,0,8,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-26,-21,-5,-8,-27,-10,16,-13,12,24,-16,-17,2,-13,-16,-10,5,-22,-4,-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-12,-27,-13,-13,-20,24,-18,-28,-10,-26,-18,-5,-17,-12,-13,2,-10,-21,3,-15,-12;
MA   /M: SY='S'; M=2,-12,-17,-15,-9,-13,-17,-15,-1,-10,-5,-3,-7,-17,-3,-5,6,6,2,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-15,26,-26,22,5,-25,-9,19,-28,6,-27,-17,31,-17,4,8,1,-7,-28,-34,-12,3;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-23,-4,-27,-20,-10,-30,-22,8,-14,2,2,-18,-13,-15,-6,-15,-9,7,-27,-11,-21;
MA   /M: SY='A'; M=15,-19,-20,-24,-17,-7,-18,-17,7,-15,-2,-1,-17,-8,-14,-20,-5,-5,7,-14,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-35,-8,-6,-28,8,-1,-28,-13,-28,-17,-9,38,-10,-17,-7,-15,-30,-27,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-16,-13,-21,-23,-20,23,-24,-12,-23,-13,-8,-8,-21,-20,-24,-5,-14,-9,-23,-21,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-4,5,-24,8,0,-12,-17,-12,-17,0,-6,-9,-4,-16,-8,-6,-9,-8,-12,-23,-9,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-13,-26,-21,-18,14,-11,-5,-4,-15,-6,-2,-3,-22,-18,-13,-12,-12,-7,-13,4,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-18,11,-30,17,6,-28,-19,-2,-24,10,-19,-13,5,-15,9,23,-6,-10,-19,-27,-13,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00969;
//
ID   IF1A_MP; MATRIX.
AC   MP01262;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Eukaryotic initiation factor 1A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9609447; R2=0.0140195; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1088; N_SCORE=20.204; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=110; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-24,-17,-27,-21,8,-29,-22,17,-24,27,11,-23,-26,-21,-19,-16,3,16,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-30,-16,-8,-19,-23,-17,-8,-3,-16,-9,-16,30,-9,2,-10,-6,-8,-27,-19,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-23,-16,-12,7,-21,-6,-7,-3,0,5,-7,-22,-8,8,-11,-6,-7,-14,6,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-33,-3,10,-29,-19,-13,-25,19,-28,-15,-8,30,2,9,-8,-10,-24,-25,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-28,17,33,-29,-12,-3,-28,9,-22,-18,6,-7,10,2,0,-8,-25,-30,-19,21;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-29,28,29,-31,-8,-1,-32,7,-25,-21,11,-8,8,2,1,-9,-28,-32,-19,18;
MA   /M: SY='G'; M=-6,10,-28,9,-9,-29,40,-7,-35,-12,-30,-21,17,-19,-12,-13,2,-14,-30,-28,-25,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-29,11,42,-32,-20,2,-25,9,-19,-13,0,-4,32,3,1,-6,-28,-27,-16,37;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-22,-21,-7,-6,-28,-17,18,-15,10,14,-18,-19,-10,-16,-12,-5,16,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-30,-23,34,-31,-10,10,-24,19,7,-23,-25,-23,-18,-23,-10,2,2,30,-23;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,3,-18,-16,-23,19,-21,-23,-16,-18,-15,-8,-18,-16,-21,4,-8,-12,-24,-25,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-20,-19,-11,-14,-27,-17,11,-8,-1,5,-15,-19,0,-10,-5,1,15,-25,-9,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-23,-6,10,-19,-20,-12,-8,0,-9,-5,-5,-11,3,-5,0,3,-7,-26,-12,6;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-27,3,13,-29,-16,-3,-27,24,-25,-11,3,-11,17,22,0,-6,-22,-25,-13,14;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-20,-20,-28,-19,-1,-22,0,16,-14,19,41,-19,-21,-5,-13,-18,-9,10,-21,0,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-20,-22,-15,6,-27,-17,14,-25,35,14,-22,-27,-17,-18,-23,-8,7,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=17,8,-18,-1,-6,-23,10,-6,-21,-8,-21,-16,14,-15,-7,-13,9,-3,-16,-28,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-26,4,-4,-27,30,-10,-32,-6,-29,-20,13,-16,-8,-9,6,-9,-26,-28,-24,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-31,-11,-3,-12,-21,15,-28,17,-19,-8,-2,-21,5,45,-12,-13,-21,-10,0,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-6,-31,-26,6,-30,-25,22,-24,21,14,-28,-30,-25,-21,-18,-5,27,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-27,6,20,-25,-19,-5,-22,12,-19,-12,2,-9,13,11,0,-1,-19,-27,-14,16;
MA   /M: SY='V'; M=11,-25,-12,-27,-23,-3,-22,-26,18,-19,11,7,-25,-25,-23,-20,-8,-2,31,-26,-11,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-15,-25,-18,-8,-13,-22,-6,-2,2,0,10,-9,-19,6,16,-11,-8,-4,-21,-7,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,113,-30,-30,-19,-30,-30,-28,-30,-17,-18,-20,-40,-30,-30,-11,-10,-9,-49,-29,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-14,-20,-19,-4,5,-21,-12,1,-12,4,10,-14,-17,-7,-12,-8,-3,0,-18,-3,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-22,-7,0,-16,-22,-9,-7,8,-12,-4,-5,-17,-1,1,-5,-2,1,-25,-8,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-22,-8,4,-16,-24,-15,-3,4,-8,-4,-8,-15,-4,-2,-5,0,2,-26,-11,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-30,-11,-1,-17,-21,1,-28,28,-19,-9,-1,-21,9,65,-11,-10,-19,-17,-5,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-19,-19,-24,-18,1,-23,-11,13,-15,23,27,-17,-24,-10,-9,-18,-4,8,-23,-3,-14;
MA   /M: SY='G'; M=15,-13,8,-19,-19,-19,20,-22,-25,-19,-19,-15,-9,-21,-19,-22,1,-10,-14,-25,-24,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-7,-30,-7,0,-20,-20,25,-30,20,-20,-7,3,-20,10,52,-10,-13,-23,-23,-2,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,48,-30,22,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-15,-23,0,-27,-17,-15,62,-5,3,-10,-10,-27,-27,-25,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-28,-3,6,-26,-18,-7,-29,37,-27,-11,1,-13,9,37,-4,-6,-19,-22,-11,6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-27,-17,1,-25,-10,16,-13,27,36,-22,-23,-8,-11,-23,-10,8,-20,-1,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-29,-3,5,-25,-19,5,-29,30,-24,-9,5,-16,13,43,-8,-10,-22,-22,-9,6;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-3,5,-23,-20,-5,-27,39,-26,-10,1,-14,8,35,-10,-10,-20,-17,-4,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-30,-25,-1,-28,-22,28,-19,14,22,-23,-24,-19,-19,-13,-1,30,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-36,-28,1,-35,-25,40,-25,20,24,-22,-22,-19,-25,-19,-8,29,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,1,-27,-4,-1,-22,-9,-2,-27,21,-23,-13,11,-18,5,40,-4,-8,-21,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,3,-24,7,36,-26,-18,-5,-21,4,-16,-14,-3,-5,14,-4,2,-3,-19,-28,-18,25;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,0,-13,-30,52,-17,-38,-15,-30,-21,3,-18,-15,-16,3,-15,-28,-24,-27,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-19,-33,-28,3,-33,-26,34,-24,18,14,-26,-27,-24,-23,-16,-5,35,-22,-1,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00970;
//
ID   UPF0021_MP; MATRIX.
AC   MP01263;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0021 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2529831; R2=0.0154724; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=954; N_SCORE=20.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=81; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-3,13,-23,19,0,-30,19,-10,-33,-10,-30,-23,10,-13,-6,-13,14,-2,-23,-34,-23,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,3,3,-23,-14,0,-27,27,-26,-13,19,-17,7,35,-4,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,26,-30,-20,-7,-30,37,-27,-13,0,-7,13,20,-7,-10,-23,-23,-13,20;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,20,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-30,-23,39,-30,-7,7,-24,21,7,-24,-30,-23,-17,-24,-10,0,6,35,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-27,-30,-34,-27,10,-37,-14,34,-24,14,14,-20,-23,-17,-24,-20,-10,17,-4,26,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,-3,-7,-23,3,-20,24,-17,-7,-6,-20,4,32,-13,-10,-17,-4,19,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-13,-27,-13,0,-17,-23,-3,-11,4,2,3,-10,-20,16,22,-13,-10,-14,-20,-7,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-7,-34,-4,6,-30,-20,-14,-26,28,-30,-14,-7,26,3,12,-10,-10,-24,-24,-17,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-6,-24,-6,-3,-8,-17,0,-17,12,-20,-10,-3,-16,0,4,3,0,-14,-10,16,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-23,4,0,-23,-6,-6,-20,-6,-30,-20,18,18,-3,-10,13,3,-24,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,2,-23,-4,-4,-12,-17,-7,-9,5,-1,-2,8,-20,-4,2,-11,-7,-12,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-10,-20,-13,-6,-14,-13,-4,-10,3,-11,9,-3,-16,3,16,5,1,-7,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-6,-30,-6,-3,-8,-23,35,-20,12,-17,-4,-3,-20,4,8,-13,-13,-20,-7,28,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,46,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,34,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-14,72,-20,-20,-20,-27,12,-30,-24,-20,-14,-10,-34,-17,-20,-10,-13,-16,-44,-14,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,30,-20,-17,-17,-27,-24,-11,-1,-14,-7,-17,-27,-17,-8,-10,-7,6,-34,-17,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-8,-26,-4,15,-16,-24,-10,-12,8,2,-2,-11,-14,2,2,-14,-10,-12,-23,-10,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-1,-23,5,-11,-3,-24,-4,-2,-10,-6,-6,-11,-24,-14,-14,-10,-6,5,-14,16,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30,54,-33,-23,16,-30,13,6,-20,-27,-34,-23,-20,-10,10,0,20,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,10,-20,0,-4,-16,-14,-4,-20,6,-20,-13,19,-16,0,19,7,15,-16,-30,-13,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,0,-30,4,25,-27,-20,-3,-30,29,-23,-14,0,-10,14,32,-6,-10,-24,-24,-14,18;
MA   /M: SY='V'; M=12,-24,-17,-30,-24,-6,-24,-27,24,-20,7,7,-20,-20,-20,-24,-7,-4,27,-23,-10,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-14,0,-30,0,6,-26,-20,30,-30,28,-26,-6,4,-14,10,19,-10,-14,-24,-24,1,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-26,7,6,-26,-13,-3,-26,32,-30,-14,22,-14,6,19,-3,-6,-24,-27,-14,6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-10,-10,-13,-13,-10,-17,-20,0,-13,-10,-7,-6,-16,-13,-13,17,24,13,-33,-13,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,40,-30,30,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-6,2,-23,8,-11,-22,8,-17,-15,-14,-16,-12,-4,-20,-17,-17,-4,-10,-1,-30,-20,-14;
MA   /M: SY='K'; M=12,-4,-23,-7,3,-26,-13,-14,-23,28,-23,-10,-4,-10,3,12,-3,-6,-13,-20,-14,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,8,-17,1,-6,2,-10,10,-7,-3,-11,-7,15,-17,-3,-3,-3,-3,-14,-5,18,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-13,30,-26,30,10,-30,-10,0,-30,16,-30,-20,28,-14,3,6,0,-6,-27,-34,-17,6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-30,-17,30,-24,31,33,-24,-24,-14,-20,-24,-10,16,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,32,-33,-23,22,-30,26,13,-23,-27,-27,-23,-23,-10,13,-9,11,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-24,-3,7,-27,-14,0,-23,10,-23,-10,3,-13,25,23,10,0,-20,-26,-13,14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,3,3,-23,-14,0,-27,27,-26,-13,19,-17,7,35,-4,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-10,25,-27,25,-1,-30,22,-4,-34,-7,-30,-23,26,-17,-7,-10,3,-10,-30,-33,-24,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-24,4,31,-20,-23,-10,-11,0,-10,-10,-10,-10,4,-6,-3,-7,-4,-30,-17,18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-20,-20,-16,-14,13,-20,-10,-20,3,-4,-13,-20,-16,-20,-6,-10,-6,-20,-17,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='G'; M=16,-10,-24,-13,-17,-27,48,-20,-30,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-16,-30,-23,-7,-22,-26,22,-20,6,6,-20,-20,-20,-23,-6,-3,26,-23,-10,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,22,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,27,7,-16,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-10,-20,-13,-10,-7,-23,18,-7,-16,6,3,-6,-20,-7,-10,-6,8,-6,-27,3,-10;
MA   /M: SY='V'; M=16,-24,-10,-27,-24,-6,-20,-27,17,-17,4,4,-24,-24,-24,-20,-4,0,34,-27,-13,-24;
MA   /M: SY='M'; M=9,-20,-17,-27,-17,-3,-17,-14,10,-17,21,23,-20,-20,-10,-17,-14,-7,7,-20,-6,-14;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-19,-36,-19,-16,6,-23,33,-17,-13,-14,-6,-16,-26,-6,-10,-23,-20,-24,47,42,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-20,-33,-26,0,-30,-19,33,-20,17,31,-23,-23,-16,-20,-17,-7,29,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-8,-26,-4,15,-16,-24,-10,-12,8,2,-2,-11,-14,2,2,-14,-10,-12,-23,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,2,-23,-9,-16,9,13,-9,-20,-16,-17,-14,15,-23,-19,-13,-3,-10,-20,-18,-7,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-17,12,-30,19,4,-14,-20,3,-24,13,-20,-14,1,-16,0,3,-10,-10,-20,-11,15,0;
MA   /M: SY='H'; M=-17,9,-27,3,0,-20,-14,35,-27,8,-23,-10,22,-20,7,25,-4,-10,-26,-30,-4,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00971;
//
ID   TBOX_2_MP; MATRIX.
AC   MP01264;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   T-box domain signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4118404; R2=0.0161517; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; N_SCORE=10.845; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=68; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-13,-22,-15,-6,-13,-22,-15,1,-4,-2,4,-12,-8,-4,-8,-5,0,2,-25,-11,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-12,-21,-9,2,-16,-22,-9,-3,-7,-10,-6,-13,-1,-7,-11,-2,-1,3,-30,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=19,-8,-8,-15,-10,-15,-2,-14,-17,-6,-16,-12,-5,-15,-9,-8,6,0,-8,-21,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-28,-4,-14,-27,42,-8,-33,-13,-26,-17,4,-20,-14,-11,-1,-16,-24,-24,-23,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-24,-2,4,-25,-15,-10,-24,29,-26,-11,3,-12,4,17,0,-4,-14,-25,-13,4;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-19,-13,-6,-21,0,-19,-15,-11,-16,-13,-8,4,-10,-17,6,4,-8,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-12,19,-29,29,30,-31,-17,-4,-27,8,-23,-19,6,-7,8,-2,-1,-8,-23,-32,-17,18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-33,-5,0,-27,-14,-4,-22,2,-27,-15,-5,36,-4,-6,-6,-8,-24,-29,-19,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-4,-26,-5,4,-20,-18,23,-15,-4,-15,-2,0,-5,6,-4,-4,-9,-16,-28,-5,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-12,-25,-11,-3,-15,-22,-5,-3,-7,-1,4,-12,-2,-2,-7,-11,-8,-5,-26,-10,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,0,-32,6,11,-27,-18,-7,-21,-3,-22,-16,-4,31,1,-10,-5,-8,-25,-30,-21,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-4,-22,-8,-7,-19,-12,-13,-8,-8,-16,-7,2,6,-5,-12,2,1,-11,-29,-17,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-19,-4,8,-24,-21,-6,-27,23,-22,-11,-2,-12,9,32,-5,-4,-19,-24,-13,7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-15,-22,-14,11,-27,-12,2,-9,3,3,-18,-24,-16,-10,-14,-7,5,-11,11,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-23,-25,-27,-22,34,-29,0,4,-15,5,5,-19,-27,-19,-13,-19,-10,0,9,42,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-29,-23,-31,-23,7,-30,-25,19,-22,12,8,-27,-26,-22,-21,-19,-9,20,2,2,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-36,-12,-2,-26,-19,-14,-17,-11,-22,-15,-18,67,-10,-19,-10,-10,-25,-28,-24,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-28,48,21,-35,-11,1,-35,3,-28,-25,18,-10,6,-2,2,-8,-28,-37,-19,13;
MA   /M: SY='G'; M=5,-3,-19,-3,-5,-25,27,-13,-29,-13,-29,-20,5,-13,-7,-13,22,2,-19,-31,-24,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-17,-30,-13,-7,-18,-22,-17,-9,-9,-18,-11,-16,39,-11,-15,-5,0,-12,-25,-14,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-17,-7,-2,-16,-14,-5,-21,10,-19,-10,7,-17,5,16,-1,-5,-17,-23,-11,1;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-15,-13,-10,-2,-19,-17,-9,-10,-6,-7,-4,-11,-11,-10,8,22,-4,-25,-7,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=10,5,-21,6,15,-27,-11,-9,-23,7,-21,-15,0,-8,5,-3,6,-2,-16,-27,-18,10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,8,-30,13,18,-27,-18,23,-29,5,-22,-12,5,-12,15,5,-4,-10,-27,-20,-5,15;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-44,-38,-28,10,-22,-28,-12,-22,-5,-12,-38,-30,-20,-20,-38,-26,-22,114,24,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-1,20,-11,22,57,-21,-21,-1,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-25,-8,1,-21,-17,-11,-22,21,-20,-10,-3,-14,5,19,-2,-2,-15,-15,-9,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,6,-25,8,20,-27,-16,4,-24,6,-21,-12,4,-9,21,4,5,-2,-23,-26,-11,20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-26,-12,-7,-19,-7,-18,-9,-13,-15,-8,-8,14,-11,-16,-1,0,-9,-28,-19,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-18,-34,-30,0,-33,-30,37,-24,13,13,-26,-26,-26,-24,-13,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-4,2,4,-19,-10,-7,-22,-5,-25,-18,6,-14,-1,-8,19,7,-15,-33,-13,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-26,17,7,-23,-8,5,-27,-4,-23,-17,5,-5,-1,-8,2,-5,-22,-29,-12,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-25,-4,4,-23,-18,-1,-23,28,-22,-6,0,-12,10,24,-4,-4,-17,-21,-8,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-17,-31,-26,1,-30,-26,28,-23,20,14,-26,-26,-23,-21,-15,-3,31,-25,-6,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-30,-3,6,-28,-14,-9,-31,41,-28,-11,0,-13,8,34,-9,-11,-21,-20,-11,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,36,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,20,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-9,35,-20,17,0,-20,-3,7,-20,3,-29,-19,52,-19,0,1,9,3,-27,-38,-19,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,15,-18,8,3,-18,-10,8,-21,3,-22,-14,24,-18,1,3,3,-3,-22,-31,-10,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-27,-5,10,-21,-20,-9,-14,5,-13,-7,-6,-1,5,1,-4,-3,-14,-25,-13,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-25,20,13,-24,-12,-5,-27,5,-25,-19,12,-4,1,-1,3,-5,-23,-31,-17,7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,7,-24,8,0,-18,-4,-8,-21,-2,-20,-14,8,-12,-2,-5,4,-4,-18,-28,-14,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,7,-23,2,5,-20,-9,7,-20,5,-21,-8,14,-14,4,1,3,-1,-18,-30,-11,4;
MA   /M: SY='G'; M=-7,16,-27,20,5,-31,23,-7,-35,-7,-29,-23,15,-14,-5,-11,4,-11,-29,-31,-24,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-27,1,5,-31,-2,-5,-27,12,-23,-11,0,-13,15,10,-2,-10,-22,-22,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00972;
//
ID   TPX_MP; MATRIX.
AC   MP01265;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Tpx family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9080753; R2=0.0139813; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=630; N_SCORE=13.706; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,33,-21,15,0,-16,-3,8,-19,-1,-27,-17,50,-20,3,0,7,-1,-28,-35,-16,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-27,13,33,-30,-16,-1,-25,10,-22,-15,6,-7,19,2,2,-7,-25,-29,-17,26;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-26,2,21,-26,-18,-6,-17,7,-14,-9,-4,-9,14,2,-3,-8,-17,-24,-14,17;
MA   /M: SY='A'; M=20,-16,-14,-22,-14,-10,-13,-19,1,-13,6,3,-15,-17,-12,-13,-2,1,7,-22,-12,-14;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-14,-13,-10,-20,10,-15,-16,-12,-17,-8,-3,-13,-8,-16,14,3,-7,-26,-20,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-3,5,-25,6,9,-28,-2,-9,-28,12,-25,-16,4,-10,4,3,3,-2,-21,-27,-17,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-21,-25,-16,2,-24,-13,12,-15,22,13,-19,-22,-12,-7,-19,-8,6,-15,2,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-5,16,-25,20,17,-29,-3,-5,-28,-2,-26,-22,13,-1,2,-8,7,-4,-25,-34,-22,9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,23,-25,20,1,-28,18,-3,-31,-6,-30,-22,27,-16,-5,-9,7,-7,-28,-34,-23,-2;
MA   /M: SY='T'; M=8,-12,-12,-18,-17,-10,-13,-23,0,-14,-5,-4,-11,-17,-17,-16,7,21,14,-28,-13,-17;
MA   /M: SY='V'; M=0,-9,-14,-11,-12,-10,-21,-20,6,-13,-5,-3,-9,-19,-15,-15,4,8,17,-32,-13,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-13,-30,-28,8,-30,-28,25,-22,13,9,-27,-28,-28,-20,-11,1,38,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-21,-27,-19,9,-28,-17,16,-25,28,12,-21,-25,-17,-19,-17,-3,8,-16,6,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-16,37,-22,-22,-11,-26,-26,-6,-20,-9,-8,-15,-26,-22,-20,2,13,10,-38,-18,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-30,0,-35,-30,41,-26,17,16,-25,-25,-24,-25,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=14,-15,-16,-21,-15,-12,-9,-15,1,-7,-2,13,-14,-17,-9,-12,-3,-3,7,-22,-12,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=46,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,2,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-27,-8,9,-29,-19,6,-10,4,-9,13,-6,-13,42,3,-5,-10,-19,-20,-8,25;
MA   /M: SY='G'; M=7,-5,-23,-7,-6,-27,21,-15,-29,3,-27,-16,0,-14,-6,-4,6,-7,-19,-24,-21,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,3,-23,-20,0,-29,30,-21,-9,0,-18,15,61,-9,-10,-21,-20,-10,4;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-33,-30,-40,-30,51,-28,-24,-2,-27,1,-4,-26,-29,-32,-21,-26,-16,-7,51,27,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=9,-5,-20,-8,-8,-23,26,-17,-26,-13,-23,-17,0,-14,-11,-15,11,2,-17,-26,-23,-9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-12,-11,-2,-19,-6,-17,-13,-8,-14,-12,-4,-9,-6,-15,16,12,-4,-26,-18,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-27,11,38,-20,-17,7,-25,3,-18,-16,4,-6,11,-3,-1,-9,-26,-27,-13,24;
MA   /M: SY='G'; M=4,-7,-28,-9,-18,-28,59,-18,-36,-18,-28,-19,3,-19,-18,-19,2,-17,-27,-21,-28,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-34,-25,3,-34,-26,34,-28,28,17,-23,-24,-20,-24,-21,-6,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,18,-27,22,23,-31,-13,-2,-28,9,-25,-19,11,-5,10,0,1,-7,-25,-31,-18,17;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,39,-22,26,3,-23,-2,8,-23,2,-30,-21,52,-18,0,0,8,-2,-30,-39,-20,2;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-12,-28,-24,-1,-25,-26,21,-20,15,9,-27,-27,-24,-20,-11,-2,33,-26,-10,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-19,-21,-14,-5,-26,-20,10,-11,0,4,-12,-18,-12,-8,-2,8,14,-25,-7,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-19,-13,-12,-12,-21,-17,0,-12,-8,-3,-4,2,-12,-14,3,18,1,-30,-13,-13;
MA   /M: SY='L'; M=8,-23,-17,-26,-18,-2,-16,-21,9,-23,25,8,-23,-24,-18,-20,-15,-7,9,-21,-8,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,24,-22,31,4,-19,-14,-9,-24,-7,-19,-20,7,-13,-8,-12,2,3,-15,-31,-13,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-23,-24,-28,-22,49,-28,9,-4,-22,5,1,-15,-28,-24,-15,-19,-12,-7,6,37,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00973;
//
ID   ADENYLOSUCCIN_SYN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01266;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Adenylosuccinate synthetase GTP-binding site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=31;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=28;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8483071; R2=0.0145099; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=496; N_SCORE=12.035; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-20,-24,-18,-2,-18,1,15,-9,14,51,-11,-20,0,-9,-17,-9,5,-22,-2,-9;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-5,-22,-7,-4,-23,-1,-12,-22,-5,-22,-14,0,0,1,-2,11,11,-17,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,4,-17,-17,-15,-5,-20,-8,-15,-12,-9,-5,-21,-17,-18,3,2,3,-30,-19,-17;
MA   /M: SY='T'; M=7,-5,-10,-12,-11,-11,-16,-20,-7,-11,-10,-9,-3,-12,-11,-12,18,35,5,-30,-12,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,2,-28,-25,-1,-28,-25,21,-21,12,8,-23,-26,-23,-20,-13,-4,28,-26,-8,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,39,-26,21,16,-25,-25,-24,-25,-18,-6,34,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=4,-11,-18,-14,-14,-14,9,-19,-13,-18,-5,-7,-7,-18,-14,-16,4,7,-8,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-6,-28,-8,6,-19,-9,1,-20,-1,-17,-3,-3,-15,33,1,-3,-11,-25,-15,-6,20;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-36,-26,-38,-29,15,-23,-28,-14,-23,-8,-13,-35,-31,-23,-21,-34,-23,-19,93,20,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-1,-30,-1,6,-30,-8,-11,-31,41,-30,-11,0,-11,6,24,-9,-11,-21,-20,-13,6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-5,-35,-28,-2,-34,-26,30,-27,17,17,-22,-25,-21,-26,-19,-9,23,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-15,-30,-28,-1,-32,-29,31,-22,10,10,-24,-25,-25,-22,-9,3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-6,33,-24,45,11,-33,-10,-6,-31,-3,-24,-24,12,-10,-3,-12,4,0,-21,-35,-19,4;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-27,-27,-20,25,-27,4,0,-23,14,4,-21,-28,-19,-15,-24,-14,-6,12,25,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-30,-23,10,-31,-17,22,-26,34,16,-28,-29,-20,-20,-25,-8,16,-15,9,-23;
MA   /M: SY='A'; M=20,-8,5,-14,-12,-20,3,-19,-19,-14,-19,-15,-4,-15,-12,-18,14,7,-8,-30,-21,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-14,4,-31,10,17,-22,-20,16,-25,6,-21,-12,-1,0,11,0,-7,-12,-26,-21,1,12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-23,25,7,-27,-8,-1,-29,4,-28,-21,18,-14,2,10,10,0,-22,-35,-18,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,1,-6,3,-10,0,-23,-8,-13,-13,-10,-11,-7,-23,-15,-15,-6,-1,-6,-18,8,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-16,29,-30,41,17,-37,-14,-2,-35,16,-29,-21,12,-10,10,4,-3,-10,-27,-32,-16,14;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-26,-27,-25,-18,-9,-24,-25,6,-18,-3,-3,-25,9,-18,-21,-14,-9,5,-6,-10,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-13,-27,-26,-3,-27,-27,26,-20,6,7,-23,-26,-25,-20,-4,1,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-18,-33,-27,-3,-30,-29,33,-23,11,11,-23,-23,-23,-24,-11,-4,36,-25,-7,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00444;
//
ID   UPF0023_MP; MATRIX.
AC   MP01267;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0023 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3154225; R2=0.0154136; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=953; N_SCORE=19.995; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=77; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='L'; M=15,-22,-16,-26,-16,-3,-17,-20,7,-22,25,7,-22,-22,-16,-20,-13,-6,6,-20,-8,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-26,45,-30,-30,-8,-30,-30,5,-24,-3,-3,-26,-34,-30,-24,-10,-4,25,-38,-18,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,13,-30,22,1,-8,-20,8,-22,0,-16,-15,1,-20,-3,0,-10,-10,-20,-8,24,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-12,-36,-6,5,-31,-20,-14,-23,12,-29,-15,-12,48,3,-1,-9,-10,-27,-26,-22,1;
MA   /M: SY='N'; M=-15,17,-26,13,3,-7,-14,11,-17,-2,-19,-15,21,-20,-1,-5,-2,-6,-23,-15,13,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-17,-24,-17,-7,-7,-26,-16,-1,4,16,7,-17,-22,-7,1,-22,-10,-3,-20,-4,-7;
MA   /M: SY='A'; M=29,-18,-10,-24,-18,-12,-13,-24,7,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,21,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='R'; M=3,-15,-18,-20,-12,-4,-19,-15,-5,-4,-6,-3,-12,-19,-7,4,-3,1,4,-20,-7,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-29,28,19,-31,-6,-1,-33,10,-27,-21,15,-11,5,7,-1,-9,-28,-31,-19,11;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-31,-32,-34,-26,31,-27,-15,-2,-22,6,-2,-29,-30,-23,-18,-29,-17,-10,54,35,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,39,-25,-10,0,-15,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-26,16,36,-27,-13,1,-27,10,-24,-19,15,-7,12,2,5,-5,-27,-32,-19,24;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-30,3,-4,-31,27,-14,-36,8,-30,-18,2,-15,-7,0,-4,-15,-26,-22,-21,-5;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-10,-23,-12,-7,-20,-8,-15,-7,0,-16,-5,-4,-15,0,-5,3,-3,-4,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,25,-28,32,40,-31,-14,2,-31,6,-24,-22,15,-6,12,-2,2,-8,-30,-34,-20,26;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-16,-18,-15,-11,-26,-23,7,3,-5,2,-17,-22,-15,-3,-7,2,22,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,34,-28,47,13,-34,-9,-3,-33,-2,-30,-27,18,1,-1,-10,5,-5,-28,-39,-21,5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-35,-26,21,-33,-24,25,-29,29,15,-25,-27,-25,-23,-23,-9,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-15,31,-30,47,39,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,30,-23,20,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,39,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-10,-23,-14,0,-25,-11,-9,-15,-3,-15,-7,-10,-12,18,-7,0,-8,-16,1,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=2,-14,-16,-23,-18,-7,-25,-24,13,-17,2,2,-11,-15,-15,-18,3,21,15,-26,-8,-18;
MA   /M: SY='H'; M=-15,6,-31,12,18,-28,-19,41,-29,-2,-22,-10,4,0,14,-3,-5,-14,-30,-30,-3,13;
MA   /M: SY='T'; M=-6,1,-20,-2,7,-13,-19,-5,-12,-4,-14,-10,1,-13,3,-6,6,11,-9,-24,-3,4;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-15,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,12,36,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-24,-7,-2,-19,-16,-5,-18,18,-18,-4,3,-17,3,27,-2,-4,-11,-26,-11,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,49,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,37,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=23,-21,-10,-25,-21,-9,-16,-25,12,-15,1,1,-21,-21,-21,-20,-1,0,27,-25,-15,-21;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-19,-2,1,-21,-9,6,-25,6,-26,-14,7,-14,5,15,17,5,-16,-32,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,8,-28,15,18,-25,-20,8,-19,-3,-7,-7,-1,-13,14,-5,-8,-11,-21,-28,-9,16;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-14,-23,-14,-7,-15,-24,-16,-6,17,-6,0,-13,-19,-6,13,-13,-7,4,-23,-9,-7;
MA   /M: SY='A'; M=44,-9,-10,-17,-9,-20,0,-19,-11,-10,-13,-11,-7,-10,-9,-19,14,3,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='S'; M=1,2,-19,1,2,-23,-7,-9,-22,4,-30,-18,9,0,1,-1,21,8,-16,-34,-19,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-29,2,21,-26,-21,-9,-23,19,-21,-13,-6,3,7,12,-7,-9,-17,-26,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,21,46,-32,-19,0,-30,14,-22,-18,2,-3,21,4,-1,-10,-29,-29,-18,33;
MA   /M: SY='E'; M=-6,15,-27,24,32,-27,-16,-5,-25,0,-14,-17,1,-7,6,-7,-2,-9,-22,-31,-18,19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-30,-21,6,-28,-16,21,-24,38,28,-28,-28,-16,-18,-25,-9,15,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-28,-9,5,-21,-22,-9,-10,12,-14,-5,-3,-13,8,16,-5,-7,-10,-23,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-25,-3,6,-28,-15,-11,-26,36,-27,-11,-1,-10,6,20,-3,-6,-16,-22,-12,6;
MA   /M: SY='A'; M=18,-20,-4,-29,-21,-11,-20,-25,13,-20,1,1,-17,-19,-18,-24,-4,-4,15,-24,-13,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-30,-6,-10,-30,59,-18,-39,-16,-29,-20,0,-18,-15,-18,0,-19,-30,-21,-29,-13;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-13,-14,-13,-9,-23,-21,-2,-13,-6,-6,-3,-11,-11,-13,14,42,4,-29,-9,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00974;
//
ID   UPF0024_MP; MATRIX.
AC   MP01268;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0024 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5864091; R2=0.0200211; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=119; N_SCORE=8.959; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-4; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-35,-25,7,-34,-25,33,-30,35,19,-25,-26,-21,-24,-25,-10,19,-20,0,-25;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-3,-14,-8,-19,-3,-17,-13,-11,-17,-13,-4,-12,-8,-17,19,7,-3,-29,-20,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-27,2,12,-26,-16,-1,-28,26,-25,-12,6,-13,12,30,-3,-7,-22,-25,-13,10;
MA   /M: SY='A'; M=2,-15,-22,-20,-11,1,-19,-10,-4,-10,-2,-3,-11,-19,-9,-6,-7,-5,-3,-10,1,-10;
MA   /M: SY='L'; M=0,-21,-13,-25,-17,5,-23,-19,8,-22,19,7,-19,-23,-16,-18,-11,-2,7,-21,-4,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-2,-29,-3,-2,-28,20,-5,-33,7,-27,-15,5,-16,-1,8,-3,-14,-26,-22,-18,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-15,-29,-24,-2,-30,-25,25,-18,13,13,-23,-25,-21,-18,-14,-4,29,-25,-7,-24;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-5,-24,-3,1,-23,-11,-1,-22,3,-22,-12,0,4,1,2,5,-2,-18,-30,-14,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-7,3,-17,-21,2,-13,-1,-11,-6,-6,-4,2,6,-6,-6,-13,-25,-8,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-26,-5,4,-19,-17,-4,-24,24,-21,-9,2,-16,7,34,-4,-6,-17,-22,-9,3;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-27,15,9,-24,-15,2,-24,7,-18,-14,10,-15,3,11,-3,-6,-20,-30,-13,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-20,-34,-28,11,-32,-26,30,-24,16,16,-23,-25,-25,-22,-16,-5,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-4,-22,-5,-10,-24,30,-10,-30,-12,-28,-18,6,-16,-9,-9,14,-1,-21,-28,-22,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-25,-28,-28,-24,35,-29,0,2,-17,2,0,-22,-29,-19,-15,-20,-10,-4,29,53,-23;
MA   /M: SY='A'; M=37,-11,-8,-20,-12,-18,-4,-17,-7,-12,-9,-7,-9,-12,-10,-20,8,-1,0,-23,-18,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-19,-21,-14,-1,-25,-16,9,-17,18,12,-15,-20,-11,-14,-10,7,5,-23,-4,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-27,-6,3,-24,-18,-8,-27,33,-23,-10,-1,-13,7,36,-6,-6,-17,-21,-11,3;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-1,-28,-4,1,-17,-18,26,-25,11,-20,-7,7,-18,11,25,-6,-11,-23,-22,1,3;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-13,-19,-11,-21,9,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-3,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-16,-29,-25,-1,-30,-26,26,-21,14,10,-24,-26,-23,-18,-11,0,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-11,-9,-9,-11,-19,-19,-11,-7,-12,-10,0,-10,-9,-8,19,46,-1,-30,-10,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-13,-9,0,-9,-21,-11,-12,-6,-10,-10,-6,-15,-5,-2,4,12,-7,-22,-5,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-23,-33,-25,-17,9,-25,-8,-8,-9,-3,-5,-21,-25,-11,-1,-22,-13,-13,39,26,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-20,-36,-28,29,-32,-25,23,-27,19,11,-24,-28,-29,-22,-19,-7,22,-12,8,-28;
MA   /M: SY='S'; M=7,-6,8,-9,-9,-17,-1,-13,-21,-14,-24,-18,0,-17,-8,-15,22,9,-11,-33,-15,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-10,-33,-27,-1,-32,-27,29,-25,17,14,-24,-26,-23,-24,-16,-4,28,-26,-6,-27;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-18,-5,-2,-7,-12,8,-13,1,-11,-5,4,-8,3,8,-2,-3,-14,-16,-2,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: M=-3,-3,-16,-4,-6,-11,-4,-4,-8,-4,-5,-2,-1,-13,-5,-3,-4,-5,-5,-18,-8,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-21,-14,-10,-17,-22,-16,-4,-13,-11,-6,-17,22,-12,-17,-7,-4,-4,-28,-15,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-3,0,-24,-1,-3,-23,2,-9,-23,7,-20,-12,2,-12,-4,4,-2,-6,-16,-24,-15,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=1,-3,-25,-2,4,-24,-13,-12,-20,11,-19,-11,-4,0,-1,2,-3,-6,-15,-25,-16,1;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-5,-23,-5,6,-13,-14,-8,-11,-3,-10,-7,-6,-11,0,-6,-3,-6,-9,-21,-8,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-15,5,8,-13,-8,-3,-14,4,-10,-7,0,-7,5,4,-1,-3,-11,-15,-8,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-15,-20,-15,-6,-9,-22,-17,6,-15,8,4,-15,-17,-9,-15,-8,-3,6,-26,-10,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-27,-12,-5,-15,-17,-14,-5,-11,-5,-2,-11,12,-8,-15,-9,-7,-10,-25,-14,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-24,10,8,-20,-9,-3,-24,2,-19,-15,6,-13,1,1,0,-7,-19,-27,-14,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-24,-28,-17,8,-28,-20,13,-20,24,11,-23,-25,-17,-16,-22,-10,7,-8,2,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-21,5,7,-18,-8,-2,-17,0,-18,-12,6,-7,2,-3,3,-2,-16,-23,-8,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-1,6,-14,3,-1,-13,4,-4,-16,-1,-15,-10,9,-10,-2,-1,3,-1,-13,-17,-11,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-16,-19,-20,-11,7,-21,-15,6,-15,8,3,-12,-18,-12,-13,-9,-6,3,-15,-1,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-6,17,-20,12,1,-20,-9,-3,-19,2,-21,-15,23,-16,-1,-1,9,4,-18,-34,-16,0;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-26,6,-3,-19,-13,9,-16,-13,-8,-8,-3,-7,-7,-13,-7,-9,-13,-31,-9,-7;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00975;
//
ID   UPF0025_MP; MATRIX.
AC   MP01269;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0025 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7999825; R2=0.0171957; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=683; N_SCORE=17.535; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=41; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-4,-30,-4,-2,-31,18,10,-31,-1,-26,-10,2,-16,11,-2,-3,-16,-29,-22,-13,4;
MA   /M: SY='H'; M=-17,3,-32,6,-4,-16,-17,22,-27,-10,-21,-15,-2,-19,-3,-9,-11,-10,-26,15,8,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-16,-24,-17,-10,1,-26,-2,-2,-8,8,4,-15,-23,1,-1,-13,-1,-7,-8,17,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-13,-22,-14,-3,-3,-21,-9,-8,-5,0,1,-9,-18,7,-3,-6,-5,-10,-18,-3,3;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-7,-23,-11,-9,-16,-6,-9,-6,-5,-5,5,-3,-20,-1,-6,-8,-8,-5,-25,-12,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-27,-18,2,-28,-21,15,-25,31,12,-28,-11,-20,-20,-24,-9,10,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-25,-7,9,-11,-24,-5,-10,4,-9,-7,-11,-18,0,12,-8,-7,-3,-18,0,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-4,-24,-6,-12,3,-21,3,0,-12,7,8,-4,-24,-8,-11,-15,-8,-8,-11,18,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-16,-22,-17,-6,-11,-21,-12,-4,-2,10,4,-14,-20,0,4,-14,-8,-5,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-15,-23,-19,-14,-21,8,-22,-10,-16,-13,-9,-11,2,-14,-22,-1,-8,-8,-22,-21,-16;
MA   /M: SY='K'; M=0,-5,-25,-5,11,-24,-18,-9,-18,17,-12,-6,-6,-12,11,7,-7,-8,-15,-21,-12,11;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-23,3,24,-22,-16,-5,-18,-2,-12,-11,-2,-9,13,-5,7,-1,-18,-30,-15,19;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-12,-24,-16,-17,3,-8,-2,-2,-16,7,6,-7,-26,-12,-13,-15,-10,-8,-10,13,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-16,-28,-14,-11,-20,14,-15,-17,-17,-5,-5,-11,-6,-6,-15,-10,-14,-18,-21,-18,-9;
MA   /M: SY='C'; M=7,-8,19,-17,-18,-10,-16,-12,-11,-15,-12,-10,-5,-25,-16,-18,-2,-4,-4,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-31,-23,7,-31,-23,26,-28,39,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-4,-37,-30,-3,-37,-30,35,-28,12,12,-22,-25,-23,-28,-17,-8,27,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-19,-22,-19,27,-22,-6,-1,-17,-4,-4,-13,-25,-18,-14,-3,-1,0,-2,28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-16,-26,-19,-4,-10,-30,-16,15,-15,9,7,-13,-16,0,-15,-11,-3,4,-23,-6,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-31,-4,14,-27,-17,-11,-23,2,-23,-17,-10,33,1,0,-4,-9,-24,-27,-23,5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-21,-24,-23,18,-14,-3,0,-20,-1,0,-16,-27,-23,-16,-12,-10,7,-10,13,-23;
MA   /M: SY='F'; M=1,-17,-19,-24,-18,10,-22,-16,7,-19,-1,-1,-11,-18,-16,-18,-1,4,5,-13,8,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,15,-29,21,38,-28,-16,1,-30,11,-22,-20,10,-7,14,9,0,-9,-28,-31,-18,25;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-24,8,20,-26,-20,-7,-18,7,-17,-11,-2,-10,12,0,0,-1,-13,-28,-14,16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-7,-29,-22,-2,-31,-22,16,-19,16,9,-21,-27,-18,-9,-19,-8,15,-25,-7,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-14,17,-29,22,12,-29,0,-2,-33,6,-26,-20,14,-14,2,12,-1,-10,-27,-30,-19,6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-29,26,10,-30,9,-6,-30,-5,-22,-13,6,-13,-2,-11,-3,-13,-25,-30,-20,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-25,-31,-23,-4,-32,-22,30,-13,11,20,-19,-20,-14,-16,-17,-8,23,-22,-3,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-21,-24,-13,7,-27,-14,8,-18,19,10,-21,-25,-4,-12,-18,-8,4,-17,1,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-19,-25,-20,1,-27,-1,15,-21,23,20,-22,-27,-15,-15,-19,-9,15,-25,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-30,-26,-37,-27,15,-36,-26,34,-30,26,17,-23,-24,-23,-26,-23,-10,20,-15,5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=7,2,-13,3,10,-22,-3,-8,-22,-7,-28,-20,8,-8,3,-8,33,15,-13,-38,-20,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-2,-26,-20,-9,-29,-25,7,-23,7,1,-24,1,-21,-23,-17,-8,6,-29,-14,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,3,-7,3,-21,-18,-10,-22,-2,-19,-13,-2,-15,5,3,9,11,-14,-32,-16,3;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-22,-30,-25,-2,-16,-25,21,-26,18,11,-22,-25,-23,-23,-17,-9,20,-23,-8,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-38,-12,-3,-20,-22,-13,-17,-10,-25,-17,-20,70,-10,-18,-12,-10,-27,-20,-12,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-12,-28,-12,-2,-17,-22,-5,-22,23,-10,-5,-5,-20,5,49,-13,-10,-15,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,-2,-3,-10,-16,-12,-4,-15,-9,-16,-8,-8,5,-24,-16,-14,-1,2,-5,-32,-17,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-29,-9,-5,-27,9,-13,-27,-5,-24,-14,-5,9,-1,-1,-1,-4,-24,-24,-21,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-25,0,-6,-15,-20,-8,-8,-1,-7,-6,6,-18,-4,9,-5,0,-9,-28,-10,-7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-13,-28,-11,-4,-19,-21,-19,-13,-6,-14,-11,-13,35,-9,-12,-4,7,-15,-28,-18,-9;
MA   /M: SY='P'; M=7,-5,-21,-4,6,-22,-12,-14,-18,-7,-22,-17,-4,18,-3,-13,13,9,-15,-31,-21,0;
MA   /M: SY='S'; M=2,-13,-16,-17,-14,-10,-18,-20,8,-17,-8,-3,-6,-16,-11,-17,13,13,11,-32,-12,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-27,-21,-20,12,-11,8,-1,-12,0,12,-17,-26,-9,-12,-17,-12,-8,9,41,-17;
MA   /M: SY='V'; M=6,-17,-22,-21,-18,-15,-3,-23,2,-10,-7,-1,-13,-19,-15,-15,-6,-8,7,-22,-14,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00976;
//
ID   BAND_7_MP; MATRIX.
AC   MP01270;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Band 7 protein family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9312873; R2=0.0145038; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1061; N_SCORE=20.310; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='N'; M=-1,17,-17,6,-2,-19,-4,-1,-19,-1,-25,-17,30,-16,-1,3,15,9,-19,-35,-18,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-24,-20,-27,-18,-1,-29,-24,24,-20,13,11,-22,-22,-19,-21,-13,-6,24,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-25,-9,21,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='G'; M=6,-10,-28,-11,-19,-29,62,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-5,2,-20,-1,-1,-21,-9,2,-20,-2,-19,-8,3,-13,4,-3,9,11,-15,-29,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-13,-24,-17,-7,-13,-19,-2,-7,6,1,12,-10,-19,3,13,-13,-9,-7,-20,-6,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,6,-19,6,20,-21,-15,-3,-21,-2,-20,-16,6,-7,5,-5,14,14,-17,-33,-15,12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-2,21,-20,28,11,-28,-9,-8,-27,-4,-23,-21,9,-9,-1,-10,12,7,-18,-35,-18,5;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,13,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-13,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-19,-28,-22,-2,-29,-21,23,-20,14,18,-17,-20,-15,-19,-9,7,20,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-31,-21,16,-29,-19,18,-29,44,20,-28,-29,-21,-19,-28,-10,9,-17,3,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,-1,-12,-6,-6,-13,-11,-14,-11,-11,-13,-11,5,-13,-6,-11,21,25,-5,-33,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-2,13,-24,19,21,-30,-7,-5,-28,4,-25,-19,5,-8,8,-4,8,-4,-22,-31,-19,15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-13,19,-28,28,32,-30,-17,3,-31,8,-23,-20,6,-6,9,-1,0,-5,-26,-32,-16,20;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-23,-3,10,-20,-10,-5,-19,5,-18,-8,-3,-11,8,-1,4,-2,-16,-22,-8,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='N'; M=14,17,-15,3,-4,-20,0,-3,-16,-5,-23,-16,29,-15,-4,-9,13,2,-17,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-6,-19,-8,1,-19,-15,6,-11,-6,-12,-1,-4,-14,7,-7,5,0,-7,-27,-9,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,4,-26,6,8,-27,-18,1,-20,7,-14,-6,1,-14,19,7,-3,-7,-20,-26,-10,13;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-11,-29,-21,2,-25,-18,16,-23,30,22,-25,-26,-16,-19,-21,-8,11,-22,-4,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-8,-28,-8,7,-22,-22,-4,-14,12,-5,0,-7,-16,20,16,-11,-10,-16,-21,-8,12;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-8,-23,-9,1,-16,-13,-9,-13,0,-13,-8,-5,-15,1,6,1,3,-8,-23,-8,-1;
MA   /M: SY='I'; M=2,-19,-21,-24,-14,-7,-26,-23,20,-19,7,6,-16,-17,-14,-21,-6,0,17,-24,-8,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,44,19,-29,-29,-21,-21,-28,-9,15,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-27,14,31,-26,-17,-5,-21,3,-19,-16,2,-7,9,0,4,-5,-20,-31,-17,19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-14,-13,-1,-20,-3,-17,-11,-9,-12,-11,-8,-11,-7,-16,9,-1,-2,-25,-19,-4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-11,29,15,-29,-7,-5,-31,-5,-22,-22,12,-14,-2,-10,-2,-10,-25,-36,-21,6;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-15,-30,-13,-6,-15,-20,-11,-10,-6,-14,-9,-12,24,-9,-8,-9,-8,-14,-24,-14,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-34,-28,0,-35,-28,37,-26,17,15,-22,-23,-22,-25,-15,-3,32,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-14,-3,-30,-3,6,-26,-20,-1,-30,40,-26,-9,1,-14,10,40,-10,-11,-21,-21,-8,6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='E'; M=2,2,-20,2,24,-21,-18,-11,-17,-1,-14,-14,-4,-6,4,-7,6,9,-12,-29,-17,14;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-28,-10,0,-21,-18,-3,-28,27,-20,-10,-1,-18,8,56,-8,-9,-18,-20,-11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-36,-28,2,-36,-28,40,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-21,-8,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,8,-28,-20,-6,-29,41,-26,-9,0,-13,14,40,-9,-10,-21,-20,-10,9;
MA   /M: SY='D'; M=-17,38,-28,54,20,-36,-11,-1,-37,2,-28,-27,16,-10,2,-3,3,-7,-28,-38,-19,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,4,-29,8,13,-24,-18,-1,-27,18,-18,-8,1,-14,9,33,-7,-10,-21,-25,-13,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-26,-29,-22,-12,-7,-27,-21,6,-22,16,4,-25,19,-16,-21,-21,-10,-5,-24,-12,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,80,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='A'; M=6,-10,-23,-11,1,-21,-11,-15,-11,-1,-14,-8,-9,-5,-2,-5,-1,-6,-5,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,7,-26,11,16,-33,0,-3,-27,0,-23,-14,3,-10,18,-5,4,-8,-25,-27,-19,17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-32,-23,4,-30,-19,28,-25,32,28,-25,-25,-17,-20,-23,-9,19,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-9,-18,-11,3,-25,-24,-5,-10,3,-9,1,-8,-16,24,5,-6,-6,-12,-23,-10,13;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-26,4,5,-23,-14,10,-28,13,-22,-13,8,-16,7,31,-2,-8,-21,-27,-11,3;
MA   /M: SY='A'; M=29,-7,-11,-13,-7,-19,-3,-17,-10,-11,-16,-12,-2,-11,-7,-17,20,8,-2,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-20,-30,-20,1,-21,-2,20,-12,23,56,-21,-21,-2,-11,-21,-10,10,-20,0,-11;
MA   /M: SY='A'; M=32,-3,-14,-9,4,-22,-4,-14,-15,-6,-15,-13,-2,-9,-3,-14,10,0,-8,-25,-20,1;
MA   /M: SY='A'; M=17,-12,-18,-17,-7,-17,-14,-15,-6,1,-5,1,-12,-15,-2,-6,-3,-5,1,-21,-13,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00977;
//
ID   NA_SULFATE_MP; MATRIX.
AC   MP01271;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Sodium:sulfate symporter family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7062497; R2=0.0164281; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; N_SCORE=12.859; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=1,-25,-20,-31,-21,0,-26,-20,23,-23,25,21,-23,-23,-16,-21,-18,-8,16,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-18,-5,-3,-29,38,-10,-37,-14,-27,-19,-1,-18,-11,-16,-1,-17,-28,-25,-25,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-18,-29,-23,0,-28,-18,24,-23,21,16,-24,-26,-20,-20,-17,-6,24,-24,-4,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-11,7,-25,5,1,-22,-12,41,-25,-8,-26,-12,16,-3,3,-5,4,-6,-26,-34,-4,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-38,-11,1,-27,-22,-19,-13,-7,-24,-15,-17,65,-8,-16,-11,-10,-23,-28,-25,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-23,-23,-23,-12,8,-29,-14,10,-16,27,11,-22,-25,-14,-13,-24,-10,2,-15,6,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-15,-28,-19,-18,0,-9,-5,-2,-15,-7,-4,-11,-12,-13,-16,-10,-7,-8,-3,20,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-29,-22,-32,-22,25,-30,-22,13,-27,23,9,-25,-16,-26,-21,-22,-9,8,-13,5,-24;
MA   /M: SY='M'; M=5,-17,-17,-25,-17,-5,-19,-15,12,-16,12,20,-15,-18,-9,-17,-7,0,8,-22,-7,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-31,-22,16,-30,-15,20,-26,34,20,-26,-28,-19,-19,-26,-10,10,-12,12,-21;
MA   /M: SY='P'; M=3,-21,-28,-17,-9,-21,-19,-22,-5,-13,-16,-10,-20,43,-14,-21,-7,-6,-6,-28,-23,-15;
MA   /M: SY='V'; M=6,-18,3,-23,-20,-8,-22,-24,6,-19,2,-1,-17,-22,-19,-19,-1,8,16,-30,-13,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-8,-3,-16,-15,-15,0,-19,-14,-14,-11,-5,-6,-16,-13,-16,7,16,-6,-27,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-34,-24,11,-31,-20,27,-26,30,24,-25,-25,-19,-21,-23,-9,18,-18,2,-23;
MA   /M: SY='A'; M=23,-9,-9,-14,-13,-23,22,-19,-23,-15,-20,-15,-4,-15,-13,-19,10,-4,-12,-25,-24,-13;
MA   /M: SY='A'; M=24,-12,3,-20,-13,-18,-11,-21,-9,-15,-12,-10,-10,-7,-13,-21,6,3,-2,-27,-19,-14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-15,0,-24,-20,19,-20,-14,-4,-20,1,4,-9,-25,-20,-17,-7,-5,-3,-18,0,-18;
MA   /M: SY='A'; M=28,-3,-12,-6,-6,-20,-4,-16,-12,-10,-15,-13,-4,-12,-8,-16,14,4,-1,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,75,-30,-16,0,-28,9,0,-20,-30,-37,-19,-20,-10,-1,12,35,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-21,-27,-19,5,-22,-3,14,-17,14,32,-16,-21,-8,-14,-14,-7,7,-20,2,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-17,-24,-17,7,-25,-19,9,-24,28,9,-20,-24,-17,-17,-13,5,6,-22,-2,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-16,-33,-29,0,-32,-28,35,-22,13,17,-27,-27,-25,-22,-13,-3,42,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='G'; M=21,-7,-17,-10,-10,-23,23,-17,-23,-13,-23,-17,0,-13,-10,-17,16,0,-13,-26,-23,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-2,-15,-9,-11,-3,-19,-9,-9,-9,-11,-9,0,-15,-9,-9,13,32,-5,-19,7,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-38,-8,4,-32,-20,-14,-20,-6,-28,-16,-16,70,4,-14,-8,-10,-30,-28,-26,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-16,-29,-13,-5,-22,-19,-21,-13,-11,-21,-15,-16,51,-12,-18,-2,4,-14,-29,-23,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-11,-19,-11,-15,-7,-20,-7,-12,-3,-7,-10,-12,-11,-18,7,8,1,-22,-16,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-36,-26,2,-34,-22,38,-25,24,27,-22,-22,-17,-24,-21,-9,24,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-19,-20,-24,-19,32,-24,-6,-2,-18,3,-2,-15,-25,-20,-15,-8,0,-3,2,30,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-24,1,-2,-28,28,-12,-31,-11,-28,-18,4,-14,-2,-12,11,-5,-24,-28,-23,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-26,-11,-5,-1,-20,-7,-13,-10,-16,-12,-11,13,-9,-13,-1,3,-15,-13,8,-9;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-27,-10,-14,-28,46,-19,-34,-8,-27,-17,-2,-17,-14,-13,0,-15,-24,-20,-26,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-8,1,-23,-3,-8,-17,7,13,-19,-10,-17,-6,8,-18,-3,-8,-1,-7,-17,-23,-6,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-30,-25,11,-33,-13,25,-22,19,12,-24,-27,-19,-20,-20,-8,18,-7,22,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-4,5,-25,-17,-6,-28,33,-26,-12,2,-14,8,39,-2,-5,-18,-23,-12,5;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-20,-17,-26,-20,17,-26,-17,6,-13,4,9,-17,-23,-17,-12,-9,2,12,-15,3,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-11,-19,-13,-5,-9,-19,-16,-2,-6,-5,-3,-8,-16,-7,-8,2,4,1,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-18,35,-30,51,24,-31,-14,2,-34,1,-25,-25,12,-10,3,-8,-2,-10,-28,-31,-10,13;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-24,-20,-34,-24,31,-24,-8,12,-18,16,37,-20,-24,-16,-14,-20,-10,6,-8,12,-18;
MA   /M: SY='V'; M=17,-18,-13,-25,-19,-6,-17,-22,9,-15,1,4,-17,-19,-18,-19,-1,4,19,-23,-11,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-11,-14,-7,-14,-22,-13,-16,15,-16,-7,-7,-20,-4,21,-7,-7,-6,-24,-10,-7;
MA   /M: SY='C'; M=3,-21,16,-29,-23,0,-24,-25,3,-23,2,-2,-18,-25,-23,-23,-7,-4,9,-26,-10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00978;
//
ID   GCKR_MP; MATRIX.
AC   MP01272;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucokinase regulatory protein family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2329545; R2=0.0155379; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=589; N_SCORE=14.375; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-12,-1,3,-22,-7,-11,-20,-1,-23,-16,4,-11,0,-5,20,10,-12,-32,-18,1;
MA   /M: SY='E'; M=1,-8,-25,-6,8,-22,-17,-9,-12,-3,-10,-3,-10,7,6,-9,-4,-7,-13,-25,-16,6;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-21,-23,-26,-17,-5,-26,-6,18,-17,14,22,-17,-21,-5,-15,-15,-9,10,-21,0,-12;
MA   /M: SY='S'; M=11,1,-18,0,3,-22,-6,-12,-18,-7,-17,-15,0,-6,-2,-10,12,5,-12,-30,-18,0;
MA   /M: SY='K'; M=2,-5,-22,-6,5,-21,-16,-10,-16,8,-16,-8,-4,-9,7,2,2,-1,-12,-24,-12,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-5,-25,-5,1,-17,-17,-3,-8,-8,-7,-4,-6,-11,5,-9,-5,-7,-10,-21,-4,1;
MA   /M: SY='A'; M=25,-9,-8,-14,-4,-19,-9,-18,-11,-6,-13,-11,-9,-11,-8,-14,5,-2,-2,-23,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,26,-26,33,15,-33,-4,-2,-31,1,-26,-21,15,-11,5,-5,3,-8,-26,-33,-19,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-25,-16,-32,-25,13,-32,-14,19,-24,10,10,-19,-25,-20,-21,-16,-9,16,-16,6,-24;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-21,-7,-8,-19,-11,-13,-7,-11,-13,-8,-6,2,-10,-16,1,-2,-3,-28,-17,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,20,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-17,5,16,-22,-12,-5,-23,2,-18,-15,8,-13,4,4,3,-2,-20,-31,-18,9;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-23,-24,-22,-15,-11,-24,-23,6,-17,0,0,-22,17,-17,-20,-11,-4,6,-27,-16,-18;
MA   /M: SY='V'; M=4,-12,-21,-14,-11,-12,-22,-20,8,-12,1,0,-13,-14,-13,-17,-7,-5,11,-25,-12,-13;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-13,-24,-23,-5,-27,-27,18,-18,3,4,-20,-18,-22,-18,-2,12,29,-29,-10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=0,-18,-35,-12,-2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18,73,-10,-20,-7,-8,-25,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-25,-20,-28,-26,-2,-14,-24,19,-22,7,7,-21,-25,-23,-22,-12,-7,22,-21,-5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,32,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='T'; M=12,-3,-10,-10,-8,-14,-11,-17,-11,-10,-14,-10,0,-10,-7,-12,22,31,-2,-30,-14,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,4,-24,-8,20,-18,32,43,-24,-24,-8,-14,-24,-10,10,-20,0,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=31,-8,-13,-13,-9,-22,12,-18,-18,-12,-18,-14,-3,-12,-9,-18,16,2,-8,-25,-22,-9;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=1,-1,-11,-9,-9,-12,-12,-19,-13,-11,-14,-12,1,-11,-9,-11,22,42,-3,-31,-12,-9;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-11,-20,-11,-19,0,-20,-9,-11,-10,-9,-10,-11,-11,-20,9,1,1,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-22,-3,8,-28,-20,2,-17,2,-16,-4,0,-10,30,2,7,12,-19,-24,-9,19;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-32,-22,4,-29,-16,27,-23,33,33,-24,-24,-13,-19,-24,-10,15,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-17,-31,-25,-1,-28,-27,28,-23,17,11,-24,-24,-22,-23,-13,-5,30,-24,-7,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-14,-30,-20,9,-30,-20,18,-30,47,18,-30,-30,-20,-20,-29,-10,9,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-22,20,10,-22,-3,8,-22,2,-28,-20,50,-17,3,0,8,-2,-30,-38,-20,7;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-18,-25,-17,-4,-21,-8,14,-11,11,35,-14,-17,-3,-12,-9,5,8,-22,-3,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-35,-25,9,-34,-24,32,-30,35,19,-25,-26,-21,-24,-25,-10,18,-19,1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,-12,-7,-6,-13,-9,-14,-11,-13,-12,-11,1,-13,-6,-12,24,21,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-12,-13,-11,-7,-20,-19,-6,-13,-1,-6,-4,-13,-11,-12,13,37,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='A'; M=21,-12,-17,-18,-15,-18,11,-21,-10,-15,-11,-8,-8,-15,-14,-19,5,-1,-2,-22,-19,-15;
MA   /M: SY='A'; M=19,-15,-12,-20,-14,-11,-13,-21,3,-15,-1,-3,-13,-17,-14,-18,6,6,11,-27,-14,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-17,-22,-25,-17,-3,-20,17,11,-10,13,50,-15,-20,2,-8,-18,-12,3,-22,3,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-25,-22,-29,-23,-5,-33,-27,28,-12,7,11,-20,-22,-19,-16,-14,-6,29,-24,-6,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-26,-8,0,-22,-7,-9,-25,17,-19,-10,-2,-15,3,23,-4,-4,-17,-22,-13,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-19,-25,-16,0,-28,-20,19,-21,23,13,-22,-24,-15,-18,-16,-4,16,-24,-5,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00979;
//
ID   COA_TRANSF_1_MP; MATRIX.
AC   MP01273;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Coenzyme A transferases signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2339272; R2=0.0151130; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=15.531; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=84; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=0,17,-20,11,-1,-23,-4,-7,-22,0,-22,-17,18,-13,-4,-5,8,7,-17,-31,-17,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-26,-1,8,-28,-18,-9,-26,33,-27,-10,1,-10,13,20,-1,-1,-18,-23,-11,10;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-19,-17,-11,-1,-23,-18,-5,6,-9,-3,-11,-20,-12,4,-5,0,7,-21,-4,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-22,-24,-25,-20,14,-28,4,10,-19,11,7,-18,-26,-15,-16,-18,-10,4,-4,27,-20;
MA   /M: SY='A'; M=10,-7,-17,-15,-7,-12,-15,-14,-1,-12,-1,1,-5,-14,-7,-14,2,6,0,-26,-12,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-20,18,5,-25,-12,-9,-26,4,-24,-18,8,-11,0,2,12,12,-16,-33,-15,2;
MA   /M: SY='L'; M=7,-21,-20,-25,-15,1,-20,-20,5,-21,13,3,-19,-9,-17,-20,-10,-5,2,-20,-7,-17;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-21,3,9,-23,-15,-9,-15,4,-16,-10,2,-13,4,-3,1,-1,-9,-28,-15,6;
MA   /M: SY='E'; M=-5,18,-25,19,30,-27,-12,-1,-27,7,-24,-20,15,-8,9,-1,5,-5,-26,-33,-19,19;
MA   /M: SY='A'; M=34,-15,-13,-23,-13,-13,-7,-19,-2,-14,4,0,-15,-15,-12,-19,0,-3,3,-20,-15,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-15,-20,-18,-4,-23,-19,9,-13,8,3,-12,-24,-17,-8,-8,2,17,-27,-10,-18;
MA   /M: SY='K'; M=5,-2,-22,-2,7,-27,-3,-9,-24,11,-25,-13,1,-10,8,3,8,-2,-18,-26,-17,7;
MA   /M: SY='D'; M=-10,5,-26,9,-3,-7,-4,2,-23,-12,-13,-12,1,-18,-8,-12,-6,-12,-19,-21,-5,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-25,-37,-28,18,-35,-26,33,-29,23,15,-23,-25,-25,-25,-21,-9,22,-15,5,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-6,-26,-7,-1,-23,-16,15,-23,5,-22,-10,-2,4,1,5,-2,-5,-19,-26,-8,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-8,-18,-29,64,-18,-38,-18,-30,-20,5,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='A'; M=10,-2,-17,-6,-5,-18,-9,-7,-7,-7,-7,8,-5,-13,1,-12,3,-2,-5,-26,-13,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-12,-7,-6,-14,-16,-17,-14,-5,-15,-12,2,-10,-6,-7,21,39,-4,-31,-12,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,38,-29,29,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-22,-19,-29,-19,0,-22,-12,18,-18,25,34,-22,-22,-9,-16,-19,-9,10,-20,-3,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-16,-33,-29,8,-30,-28,28,-23,11,10,-25,-26,-28,-22,-12,-3,36,-22,-4,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-27,-16,-20,-20,41,-16,-21,-19,-11,2,-7,-21,-16,-18,-7,-17,-17,-20,-20,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-14,-21,-18,-17,-5,-3,-17,-2,-22,15,3,-10,-24,-17,-17,-12,-2,-4,-23,-10,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-21,67,-31,-27,-16,-28,-28,-9,-27,-10,-10,-18,-31,-25,-28,-9,-8,0,-39,-22,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-23,-27,-19,-6,-31,-21,23,-19,8,12,-12,-16,-9,-19,-6,9,14,-23,-4,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=6,3,-21,6,29,-24,-12,-8,-22,1,-19,-17,0,-5,8,-7,11,3,-18,-30,-19,18;
MA   /M: SY='K'; M=-3,7,-25,2,10,-21,-13,-1,-22,14,-21,-12,11,-13,8,11,-1,-6,-21,-22,-9,8;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-28,-19,-29,-19,8,-28,-20,18,-28,45,18,-28,-28,-19,-20,-27,-9,9,-20,-2,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=0,14,-25,20,12,-31,-6,-5,-25,-3,-18,-15,3,-11,9,-8,0,-9,-21,-28,-17,11;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-18,-17,-10,-10,3,-13,-15,-11,-13,-9,-8,-15,-6,-15,4,-5,-10,-15,-8,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-26,-20,3,-29,-17,16,-17,20,10,-21,-25,-16,-8,-17,-3,14,-19,2,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-27,26,19,-31,-13,-3,-31,16,-26,-19,12,-10,6,7,-1,-8,-24,-30,-17,12;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-15,-8,-4,-14,-14,-14,-11,-7,-9,-8,-1,-13,-2,-7,15,20,-6,-31,-12,-3;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-28,-8,-16,-28,53,-16,-35,-15,-28,-19,5,-19,-16,-13,1,-16,-27,-22,-27,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-17,-27,-22,-6,-28,-24,22,-15,5,8,-22,-24,-16,-13,-9,-3,31,-26,-9,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-27,-3,6,-26,-19,-9,-28,37,-27,-11,1,-12,8,32,-4,-3,-18,-22,-11,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-28,45,11,-34,5,-2,-36,-3,-30,-26,22,-13,-3,-10,2,-10,-30,-36,-22,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00980;
//
ID   COA_TRANSF_2_MP; MATRIX.
AC   MP01274;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Coenzyme A transferases signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2996254; R2=0.0154990; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=654; N_SCORE=15.426; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=78; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=16,-21,-16,-26,-16,-3,-17,-20,7,-21,24,7,-21,-21,-16,-20,-13,-6,6,-20,-9,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-12,-14,-12,-6,-22,-20,-4,-14,2,-4,-6,-14,-12,-12,10,38,2,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-23,-20,-8,-6,-25,-10,6,-8,22,18,-19,-22,2,-6,-20,-10,-2,-20,-3,-3;
MA   /M: SY='V'; M=13,-24,-13,-29,-24,-6,-23,-27,22,-19,6,6,-23,-23,-23,-21,-6,-1,33,-26,-11,-24;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-12,-17,-11,-17,-7,-20,-5,-12,-12,-9,-10,-6,-12,-18,11,3,5,-27,-19,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-20,24,3,-23,-1,6,-23,-1,-30,-21,47,-17,0,-3,13,1,-27,-40,-20,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-19,-12,31,-28,15,-5,-12,-1,-2,-16,-26,-12,-10,-17,-11,-11,16,55,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,4,-35,-26,36,-29,31,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,24,-21,-1,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-13,-29,-7,-2,-25,-7,-16,-19,-10,-27,-18,-10,52,-8,-16,2,-4,-23,-28,-25,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-26,20,7,-30,-10,-9,-27,3,-27,-20,7,10,-2,-7,3,-5,-22,-32,-21,1;
MA   /M: SY='N'; M=-7,22,-24,16,-1,-26,15,-2,-29,-2,-30,-21,30,-17,-4,-5,7,-5,-27,-33,-22,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-20,-17,-26,-19,13,-23,-13,10,-8,7,20,-18,-22,-15,-8,-14,-7,13,-14,3,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-9,23,-21,19,8,-24,-12,-4,-24,5,-24,-18,22,-12,0,-1,7,10,-20,-34,-16,4;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-12,-21,-18,-15,9,-23,12,-10,-16,-7,-4,-7,-21,-14,-11,-4,6,-5,-9,10,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-34,-20,38,-23,4,-20,0,3,-13,45,7,-3,-13,-30,-23,-1,28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-36,-26,19,-34,-24,28,-29,29,16,-24,-26,-24,-24,-23,-9,18,-15,5,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-31,-22,8,-31,-22,24,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-26,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-33,-24,15,-30,-18,23,-25,29,25,-25,-26,-19,-20,-23,-9,15,-17,3,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-26,-10,-18,-26,53,-20,-34,-18,-26,-18,0,-18,-18,-18,4,-7,-24,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='P'; M=16,-16,-27,-14,-4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16,47,-10,-20,-1,-6,-17,-26,-26,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-19,-24,-21,-16,28,-22,-6,-7,-17,-7,-7,-13,-9,-18,-15,-5,-3,-9,-1,25,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-7,-38,5,4,-32,-18,-16,-24,-8,-30,-22,-13,71,-8,-18,-8,-10,-30,-32,-28,-6;
MA   /M: SY='A'; M=4,-14,-23,-15,-7,-17,-12,-17,-12,-3,-6,-6,-12,3,-8,-5,-7,-3,-10,-23,-15,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-28,0,24,-25,-20,-9,-14,5,-15,-10,-6,1,9,-4,-4,-9,-16,-25,-16,15;
MA   /M: SY='N'; M=-8,22,-26,19,-4,-28,26,-4,-32,-8,-30,-22,27,-18,-8,-10,4,-10,-30,-32,-24,-6;
MA   /M: SY='E'; M=4,4,-23,8,35,-26,-14,-6,-24,3,-18,-17,-1,-4,10,-6,8,0,-20,-29,-19,23;
MA   /M: SY='E'; M=5,-1,-18,-4,6,-17,-16,-12,-5,-5,-10,-8,0,-15,-6,-10,1,-3,1,-30,-17,0;
MA   /M: SY='D'; M=-14,41,-26,57,16,-36,-8,-2,-36,-2,-30,-28,18,-10,0,-10,7,-4,-26,-40,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=16,4,-20,-1,-2,-24,-6,-11,-18,1,-21,-15,5,2,-5,-8,4,-4,-15,-27,-20,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-17,30,-28,44,18,-29,-15,-4,-27,-4,-14,-19,8,-12,-1,-10,-6,-10,-23,-35,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,37,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,23,-23,-3,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00980;
//
ID   EFP_MP; MATRIX.
AC   MP01275;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Elongation factor P signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0658236; R2=0.0140824; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=564; N_SCORE=12.998; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=102; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-28,14,33,-20,-19,4,-26,6,-19,-16,2,-8,11,-1,-2,-9,-25,-23,-7,22;
MA   /M: SY='T'; M=8,-2,-9,-12,-10,-12,-17,-20,-10,-9,-11,-10,-2,-11,-10,-11,18,39,0,-29,-12,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-28,24,28,-29,-16,-4,-27,1,-22,-19,4,2,8,-7,1,-6,-25,-31,-19,18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-36,-7,0,-24,-19,-16,-19,-10,-25,-18,-16,65,-10,-18,-8,-9,-26,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-10,-19,-12,-10,-19,9,-17,-14,-13,-17,-12,-5,-12,-12,-16,6,-3,-6,-24,-19,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-19,-29,-25,0,-26,-25,25,-23,15,12,-22,-24,-22,-22,-13,-4,26,-24,-6,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-12,2,-30,4,10,-30,-19,-7,-30,41,-28,-10,1,-11,14,30,-8,-10,-22,-21,-11,12;
MA   /M: SY='G'; M=2,-6,-28,-7,-15,-29,57,-18,-37,-17,-29,-20,3,-18,-16,-18,4,-15,-28,-23,-28,-16;
MA   /M: SY='D'; M=1,19,-24,22,6,-29,-5,-5,-24,-4,-19,-16,11,-13,4,-10,2,-7,-20,-30,-18,5;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-12,-7,-7,-13,-16,-16,-13,-7,-14,-12,2,-11,-7,-5,20,37,-4,-31,-12,-7;
MA   /M: SY='A'; M=27,-12,-12,-19,-12,-15,-9,-20,-3,-13,-6,-6,-10,-14,-11,-18,9,6,6,-25,-16,-12;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-11,-4,-5,-16,-1,-12,-16,-9,-19,-14,5,-10,-4,-10,23,21,-8,-29,-15,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-2,-18,-7,-9,-21,20,-13,-22,-9,-22,-14,6,-14,-9,-12,11,0,-15,-26,-21,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-23,-7,-6,-23,11,-12,-26,0,-24,-15,0,-11,-4,5,7,-3,-18,-25,-18,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-19,-13,-12,-6,-12,-10,-8,-10,-9,-5,-6,-14,-9,-9,3,11,-4,-19,1,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-16,-35,-9,0,-26,-20,-17,-18,-2,-23,-14,-15,56,-6,-9,-9,-8,-23,-28,-23,-7;
MA   /M: SY='A'; M=48,-11,-10,-20,-11,-19,-1,-20,-8,-10,-9,-9,-11,-11,-11,-20,9,0,2,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-14,-20,-19,-13,-9,-26,-20,4,-3,-1,1,-11,-18,-10,-1,-4,10,9,-25,-7,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-30,-22,8,-29,-19,21,-25,34,22,-26,-27,-19,-19,-23,-6,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-3,8,-23,11,28,-25,-14,-4,-22,2,-21,-17,6,-5,9,-4,8,-2,-19,-32,-19,18;
MA   /M: SY='T'; M=-1,7,-12,-4,-8,-13,-14,-14,-13,-8,-15,-12,11,-12,-8,-8,19,39,-6,-32,-13,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-19,-28,-20,7,-24,-17,14,-21,18,8,-22,-24,-18,-19,-15,-7,12,-14,6,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-22,-4,9,-19,-22,-11,-10,5,-12,-7,-6,-13,2,4,-1,1,-3,-27,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-19,-32,-27,1,-33,-28,33,-24,18,14,-24,-25,-24,-23,-15,-2,34,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-25,-3,5,-22,-16,-1,-13,5,-11,4,0,-11,15,5,-4,-5,-16,-25,-11,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-28,-11,2,-9,-24,-13,-4,-13,3,0,-16,8,-4,-14,-14,-10,-11,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-24,-23,-31,-24,58,-29,2,-3,-24,4,0,-17,-29,-28,-16,-19,-11,-6,9,39,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-18,-36,-29,0,-36,-29,38,-28,20,16,-24,-24,-23,-26,-18,-8,31,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,8,-22,6,16,-25,-10,-4,-23,6,-22,-15,10,-10,9,1,7,1,-21,-29,-17,13;
MA   /M: SY='T'; M=2,-7,-20,-10,2,-17,-20,-14,-3,-8,-8,-5,-6,-9,1,-11,4,7,-2,-27,-13,1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-7,-18,-30,67,-19,-40,-19,-30,-20,1,-20,-19,-20,0,-20,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-11,20,-27,30,35,-30,-16,-3,-29,3,-22,-21,7,-5,10,-5,3,-2,-25,-33,-18,22;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-11,-26,-13,-4,-16,-23,-11,-11,17,-11,-2,-7,-17,0,21,-10,-5,-5,-20,-8,-4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,42,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,32,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-14,-25,-15,-4,-15,-26,-16,0,10,-6,0,-12,-17,-5,8,-12,-7,5,-23,-9,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-25,35,8,-28,-7,7,-28,-2,-26,-20,25,-14,0,-6,4,-5,-25,-36,-15,3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-11,-11,-11,-10,-20,-20,-7,-11,-9,-9,-1,-11,-10,-11,19,45,2,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-2,-24,-3,9,-21,-15,-5,-21,10,-17,-12,0,-12,4,21,-1,-4,-15,-25,-14,4;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-20,20,13,-24,-15,-8,-24,-3,-20,-19,8,-8,0,-7,12,17,-16,-34,-16,7;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-3,-18,-4,-11,-25,26,-10,-30,-9,-23,-14,3,-20,-9,-6,-2,-13,-23,-26,-21,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-23,7,22,-24,-15,-7,-24,10,-22,-16,3,-8,7,6,8,3,-18,-30,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21,37,-30,15,0,-13,1,0,-20,-30,-14,-11,-20,-10,-9,27,73,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-20,-25,-19,-5,-22,-18,15,-13,9,15,-19,-23,-13,-10,-12,-6,17,-24,-6,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-1,0,-24,2,9,-27,14,-9,-29,-4,-27,-18,4,-11,3,-6,12,-3,-23,-29,-22,6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00981;
//
ID   PEPTIDASE_U32_MP; MATRIX.
AC   MP01276;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Peptidase family U32 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6422696; R2=0.0120295; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1094; N_SCORE=17.793; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,37,-30,33,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-17,32,-27,35,8,-28,-10,33,-31,-3,-27,-18,28,-16,3,-4,0,-10,-30,-37,-8,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,10,-30,17,28,-34,-18,4,-28,12,-22,-13,4,-9,29,14,-2,-10,-28,-27,-15,27;
MA   /M: SY='I'; M=3,-21,-22,-27,-17,-11,-27,-21,22,-17,5,9,-17,-18,-6,-19,-9,-6,18,-22,-7,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-12,-24,-13,-8,-20,-3,-14,-18,11,-17,-8,-7,-19,-5,18,-6,-9,-6,-22,-15,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-27,6,31,-29,-17,17,-25,3,-18,-11,0,-7,22,-1,0,-10,-25,-26,-11,25;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-10,-17,-16,-14,-1,-19,-12,17,-16,12,7,-3,-16,-11,-14,-11,-5,7,-17,-3,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=0,-20,2,-27,-20,-9,-26,-7,7,-23,5,4,-15,-23,-15,-22,-12,-10,5,-27,-6,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-3,-19,-3,0,-18,3,-7,-21,17,-18,-8,0,-10,1,16,-5,-8,-15,-13,-10,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-21,-2,6,-21,-13,-6,-16,17,-18,-7,-4,11,9,8,-5,-6,-16,-15,-10,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,4,-26,5,9,-31,-15,-3,-25,16,-22,-10,1,-12,19,17,-2,-8,-21,-23,-13,13;
MA   /M: SY='V'; M=4,-19,-19,-20,-17,-11,-6,-22,0,-9,1,0,-17,-22,-17,-12,-9,-7,10,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-23,-11,-8,-16,-22,0,-10,-12,-15,-8,-9,16,-10,-13,1,11,-7,-30,-11,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,24,-34,40,12,-36,-14,-8,-32,-4,-30,-26,5,28,-4,-14,-4,-10,-30,-36,-24,2;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-16,-30,-24,0,-27,-25,23,-23,22,12,-26,-26,-22,-21,-15,-5,26,-24,-7,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-29,4,27,-25,-20,-7,-25,7,-20,-17,-4,13,8,7,-1,-1,-24,-28,-19,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-23,-32,-27,7,-16,-22,19,-23,9,16,-19,-24,-21,-21,-15,-10,16,-17,-2,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=17,-22,-13,-28,-22,-8,-20,-26,18,-18,4,4,-21,-21,-21,-22,-4,-2,28,-25,-12,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-28,-8,-6,0,-22,76,-24,-14,-14,0,4,-22,0,-4,-12,-18,-24,-22,22,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,21,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,27,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-27,-19,-34,-27,15,-29,-19,25,-21,15,26,-23,-25,-21,-19,-17,-7,24,-18,2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-12,-22,-12,-16,-4,-16,-4,-10,-4,4,-12,-12,-8,-18,4,-2,2,-20,-16,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-21,-21,-25,-21,19,-26,-10,9,-19,1,1,-16,-24,-19,-17,-6,-2,9,-6,22,-21;
MA   /M: SY='S'; M=6,2,-14,4,12,-22,-4,-8,-22,-6,-28,-20,8,-8,4,-8,32,14,-14,-38,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,5,-25,-20,0,-28,31,-22,-8,0,-17,18,54,-8,-10,-22,-20,-10,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-25,-26,-22,32,-30,1,6,-19,17,6,-23,-30,-18,-15,-23,-10,-2,11,47,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,30,-30,40,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,-9,-17,-10,-8,-16,1,2,-15,-15,-10,-8,-2,-16,-6,-13,9,0,-10,-29,-12,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-17,-25,-18,-15,10,-24,21,-3,-14,4,2,-15,-25,-8,-12,-15,-10,-8,2,39,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-13,-26,-12,7,-15,-26,-8,1,-9,10,6,-13,-17,14,-8,-13,-10,-8,-22,-7,10;
MA   /M: SY='T'; M=-10,0,-20,-7,-6,-3,-19,7,-17,-1,-15,-8,6,-16,-6,-1,2,11,-13,-23,0,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,0,-28,-3,-13,-28,46,-13,-35,-7,-30,-19,11,-19,-13,-10,1,-15,-29,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-26,-4,10,-20,-20,-4,-26,19,-18,-12,0,-14,8,42,-3,1,-18,-24,-12,6;
MA   /M: SY='S'; M=0,1,-16,3,-3,-19,-10,5,-15,-11,-21,-13,4,-15,-4,-10,18,6,-5,-37,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=19,-15,-25,-15,-5,-25,-10,-20,-15,-10,-20,-15,-15,41,-10,-20,0,-5,-15,-25,-25,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-3,-12,-4,-21,-22,-7,-25,10,-18,-10,-3,-20,6,31,-3,2,-16,-27,-13,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=15,12,-16,13,1,-25,-6,-12,-21,-7,-20,-18,4,-10,-5,-14,14,7,-11,-31,-19,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-12,-17,-10,-13,-9,-18,-6,-14,-2,-6,-8,-14,-10,-16,9,10,0,-25,-14,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00982;
//
ID   RIBONUCLEASE_PH_MP; MATRIX.
AC   MP01277;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribonuclease PH signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2941194; R2=0.0153672; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=511; N_SCORE=13.137; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=13,-21,-10,-25,-21,-8,-18,-24,13,-17,1,4,-19,-21,-19,-20,-1,0,24,-27,-13,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-33,-28,5,-32,-26,33,-24,18,18,-25,-25,-23,-22,-16,-5,32,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-18,37,-28,52,13,-31,-13,-3,-30,-5,-17,-22,14,-14,-3,-11,-4,-10,-24,-37,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-19,-26,-18,8,-27,-17,14,-24,34,19,-23,-25,-16,-16,-20,-1,7,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-26,10,25,-28,-16,-3,-27,15,-23,-16,3,-7,12,10,2,-4,-22,-28,-16,18;
MA   /M: SY='A'; M=23,-10,-18,-15,-4,-21,-10,-16,-13,1,-11,-8,-10,-4,-3,-8,1,-3,-7,-21,-16,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23,25,-30,-20,18,-29,37,17,-27,-29,-24,-20,-27,-10,9,-13,7,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-32,-9,-14,-30,49,-19,-36,-13,-30,-19,-3,-2,-16,-16,-2,-18,-29,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-12,10,-29,16,44,-28,-18,0,-29,12,-21,-19,5,-3,16,10,-1,-9,-28,-29,-19,29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-18,-8,-2,-17,-17,-2,-23,11,-20,-10,3,-18,7,29,0,-3,-17,-25,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-1,-17,-7,-1,-20,-19,-9,-12,-4,-13,-5,0,-10,13,-4,13,27,-9,-27,-10,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,35,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-11,-4,-25,-5,-9,-8,-22,-6,-9,-9,-7,-7,-7,-18,-7,-8,-6,5,-9,-4,5,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,22,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,37,-28,53,12,-21,-13,-3,-34,-5,-24,-25,14,-13,-6,-12,-3,-10,-25,-32,-12,4;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-19,103,-29,-27,-20,-26,-29,-27,-27,-19,-19,-19,-36,-27,-29,-7,-9,-9,-46,-29,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,62,26,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,17,-8,3,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26,4,-35,-26,37,-30,33,20,-25,-25,-20,-25,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-28,-1,14,-35,-19,7,-16,7,-18,-1,2,-12,48,7,0,-8,-24,-22,-11,31;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-13,-18,-12,-22,11,-20,-15,-12,-13,-12,-8,-12,-12,-20,8,-3,-5,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-12,-5,-8,-12,-17,-15,-12,-8,-13,-12,9,-12,-8,-8,18,42,-5,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13,-3,-15,-22,-3,-22,21,-9,-5,-5,-22,5,56,-13,-10,-15,-20,-8,-3;
MA   /M: SY='T'; M=8,-4,-7,-13,-12,-11,-17,-21,-8,-11,-10,-9,-4,-12,-12,-13,16,35,3,-29,-12,-12;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-10,-20,-10,-18,-3,-20,-9,-11,-7,-9,-10,-11,-10,-19,9,3,0,-21,-18,-10;
MA   /M: SY='S'; M=15,-5,10,-9,-7,-20,-5,-15,-20,-13,-25,-18,1,-15,-7,-15,26,11,-8,-38,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,6,-13,-5,-8,-11,-16,-13,-10,-10,-10,-10,10,-14,-8,-9,15,34,-6,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-16,-14,-12,-21,16,-19,-19,-13,-17,-14,-4,-13,-12,-18,11,4,-9,-23,-21,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-19,-18,-23,-18,15,-20,-2,-12,-17,-11,-8,-15,-24,-15,-15,-9,-8,-12,21,22,-16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-15,-31,-26,0,-29,-27,28,-23,18,12,-27,-27,-25,-21,-14,-4,35,-26,-7,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-30,-20,8,-28,-18,19,-27,44,22,-28,-28,-18,-19,-27,-10,10,-20,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-14,-16,-10,-16,-14,0,-7,-7,-10,-4,-9,-18,-5,-7,0,-4,1,-24,-8,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-18,29,-28,43,12,-28,-15,-4,-26,-4,-13,-17,8,-14,-3,-8,-7,-10,-21,-34,-15,4;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,-6,-22,-13,-12,-2,-20,-11,-13,-9,-10,-11,-13,-14,-20,6,-2,-1,-19,-17,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-25,-4,-30,-26,2,-16,-24,10,-26,10,6,-20,-27,-24,-23,-15,-9,11,-23,-7,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-1,6,-23,3,1,-22,-12,-8,-12,-1,-17,-10,8,-13,1,-4,4,-2,-12,-29,-14,0;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-7,-12,-10,1,-23,-15,-4,-14,-3,-15,-6,-6,-15,19,-6,4,-3,-13,-20,-7,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00983;
//
ID   UPF0004_MP; MATRIX.
AC   MP01278;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0004 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9941974; R2=0.0129827; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=558; N_SCORE=12.229; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-13,-26,-13,-7,8,-25,-11,-5,-10,-4,-4,-13,-9,-11,-10,-12,-9,-6,-12,7,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-23,9,11,-21,-16,-7,-24,7,-22,-17,3,-4,0,-1,-3,-5,-21,-22,-11,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-10,-22,-11,-7,0,-23,-11,-3,-7,1,-2,-9,-20,-10,-5,-9,-4,-2,-21,-1,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-8,-1,-18,2,0,-13,-14,-1,-7,2,-8,-2,-3,-4,2,-2,-6,-6,-7,-15,-3,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-12,-11,-13,-8,9,-14,-8,5,-11,8,5,-10,-13,-9,-9,-7,-2,3,-8,3,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-22,-8,-1,-14,-13,-14,-11,-2,-11,-8,-10,7,-6,-5,-5,-4,-9,-21,-13,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-20,-11,-5,-14,-16,-12,-9,-9,-14,-8,-12,4,-7,-12,-4,-6,-6,-24,-11,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-26,-8,3,-18,-18,-7,-16,5,-14,-9,-6,-2,4,13,-2,-4,-14,-24,-10,1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-21,-23,-16,16,-24,-13,-2,-11,5,1,-14,-24,-15,-1,-10,-3,0,-12,8,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-2,-21,-3,0,-15,-17,-12,-13,1,-13,-9,-1,-12,-3,3,2,4,-8,-27,-12,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-29,8,14,-25,-6,-8,-27,-1,-24,-19,1,12,1,-5,0,-8,-26,-28,-20,6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-25,-2,0,-24,6,-2,-27,10,-24,-13,7,-15,2,14,0,-8,-22,-23,-15,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=3,-15,-18,-18,-14,-5,-20,-11,1,-14,-3,-3,-12,-11,-13,-15,0,6,4,-22,-2,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-20,-14,-9,-9,-21,-7,-8,1,-11,-6,-3,-19,-2,12,-2,4,-7,-18,2,-9;
MA   /M: SY='A'; M=29,-10,-13,-17,-10,-13,-4,-15,-10,-12,-12,-10,-8,-10,-11,-17,10,3,-2,-23,-15,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-24,-27,-28,-23,34,-27,-11,2,-21,2,-1,-19,-22,-22,-18,-17,-10,-3,15,30,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,25,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-25,0,7,-26,-13,-9,-24,13,-28,-16,4,7,4,5,8,1,-20,-30,-18,4;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-36,-29,-1,-36,-29,41,-26,16,16,-22,-22,-22,-26,-15,-4,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-9,-10,-13,-2,-19,-16,0,-7,-7,-9,9,-7,-15,11,-8,0,-5,-9,-27,-10,4;
MA   /M: SY='E'; M=-13,10,-29,17,31,-24,-19,-1,-25,9,-19,-16,4,-9,10,7,-3,-9,-23,-27,-12,19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-13,29,-24,26,2,-21,-10,0,-18,-6,-16,-16,28,-18,-4,-8,0,-5,-21,-36,-16,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-9,8,-25,2,-2,-17,1,4,-25,7,-25,-14,18,-17,-2,4,0,-8,-24,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-5,-21,-11,-11,4,-13,-5,-11,-4,-9,-2,1,-20,-9,0,-4,-3,-10,-16,2,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=9,0,-10,-7,-6,-15,-10,-15,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-11,26,32,-5,-33,-15,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-31,-25,57,-30,-2,0,-21,5,0,-20,-30,-26,-15,-20,-10,-5,19,53,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=3,-24,-16,-30,-22,-7,-28,-25,24,-19,7,8,-18,-21,-15,-20,-10,-6,22,-23,-8,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-18,-31,-27,-1,-32,-29,32,-22,11,11,-22,-23,-23,-22,-10,3,36,-26,-6,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-16,-37,-9,1,-28,-20,-15,-23,3,-28,-17,-14,60,-4,2,-10,-10,-27,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-17,-24,-21,-16,22,-24,-2,-4,-11,-1,-2,-12,-24,-13,-8,-11,-7,-7,2,26,-15;
MA   /M: SY='A'; M=14,-13,-12,-21,-15,-5,-16,-20,1,-14,0,0,-12,-16,-14,-16,4,14,8,-23,-10,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-11,-29,-12,-2,-15,-21,-1,-28,27,-18,-9,-1,-21,7,65,-11,-10,-19,-18,-8,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-26,-3,2,-21,-16,-6,-22,18,-18,-10,-1,-16,2,28,-6,-6,-13,-24,-12,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-24,-4,17,-17,-21,-6,-10,-4,-1,-5,-8,-12,5,-4,-5,-5,-11,-26,-12,10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-16,-25,-17,-11,-13,-26,-13,2,4,-5,2,-10,-20,-2,18,-11,-8,5,-22,-7,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=9,2,-11,3,1,-21,0,-10,-21,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,39,19,-11,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-15,-28,-16,-7,-4,-24,-2,-15,13,-9,-4,-8,-22,1,36,-13,-10,-11,-11,7,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-2,-30,5,7,-28,-14,-13,-24,-3,-28,-20,-5,37,-3,-10,3,-2,-24,-32,-24,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-19,-23,-15,-6,-25,-20,10,-17,5,7,-19,-3,-15,-16,-11,-4,8,-25,-10,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-8,15,-28,24,32,-30,-11,4,-31,3,-22,-20,5,-7,9,-3,1,-8,-26,-31,-17,20;
MA   /M: SY='D'; M=-3,7,-24,11,11,-25,-14,-8,-20,5,-18,-13,2,-11,4,-3,3,-2,-15,-29,-15,7;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-30,4,-37,-29,42,-27,17,16,-23,-23,-24,-27,-17,-7,34,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-20,-30,-24,4,-32,-23,26,-21,23,14,-26,-27,-21,-19,-20,-7,25,-20,1,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-24,3,8,-20,-3,-5,-25,1,-19,-14,2,-13,2,0,1,-8,-20,-24,-15,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-31,11,43,-28,-20,-1,-28,12,-21,-16,-3,-5,21,5,-4,-11,-29,-16,-14,32;
MA   /M: SY='V'; M=14,-22,-13,-27,-22,-7,-21,-25,18,-18,4,6,-21,-21,-20,-21,-4,-1,28,-25,-12,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00984;
//
ID   PCMT_MP; MATRIX.
AC   MP01279;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3456249; R2=0.0154279; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=543; N_SCORE=13.713; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=75; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-27,6,8,-25,-16,-2,-26,18,-19,-12,1,-14,5,22,-6,-9,-19,-24,-12,5;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-24,7,0,-21,-12,2,-22,8,-20,-13,19,-17,1,17,0,-3,-20,-29,-13,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-20,-26,-17,5,-26,-19,12,-24,31,11,-25,-19,-18,-16,-21,-7,6,-22,-4,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-25,4,18,-25,-16,-6,-23,15,-21,-12,0,-7,8,9,1,-5,-18,-27,-16,13;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-4,-24,-5,10,-20,-18,-5,-17,8,-11,-5,-4,-13,13,8,-2,-3,-16,-23,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-25,-18,-28,-19,5,-25,-19,15,-25,35,17,-24,-25,-17,-19,-21,-6,9,-20,-3,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-28,6,-6,-29,35,-12,-35,-7,-28,-20,8,-16,-10,-9,2,-12,-27,-26,-24,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-24,-19,-15,9,-26,-4,6,-16,12,4,-18,-25,-12,-12,-15,-6,1,-6,24,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-12,3,-28,6,1,-22,1,3,-29,2,-21,-14,4,-17,-2,7,-4,-9,-23,-20,-9,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,27,-22,14,0,-22,0,5,-23,3,-28,-18,42,-19,2,8,8,-1,-27,-36,-19,1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-31,-29,1,-31,-29,32,-22,15,12,-29,-29,-28,-21,-13,-2,44,-28,-8,-29;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-6,-20,-8,-3,-15,-20,-5,-5,-6,-10,-5,-3,-16,-4,-4,3,4,-1,-29,-9,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-9,-29,-26,9,-29,-26,18,-22,9,6,-22,-26,-26,-20,-9,5,28,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-16,-25,-18,-11,-11,-26,-5,1,3,-2,3,-11,-21,-6,11,-13,-9,3,-22,-2,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-18,-16,-19,-11,-2,-25,4,-1,-15,3,4,-16,-24,-9,-10,-14,-10,2,-16,1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=5,-4,-26,-4,-10,-29,46,-17,-34,-15,-27,-20,1,-16,-13,-17,5,-13,-25,-24,-27,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,22,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-21,-12,-9,-11,-12,-11,-20,-2,-21,-15,-3,-18,-4,6,4,5,-16,3,-2,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-10,-25,-12,2,-16,-21,-6,-8,8,-2,8,-11,-16,9,4,-12,-9,-9,-19,-4,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-32,-35,-34,-27,24,-25,-17,-5,-20,-4,-7,-31,-30,-22,-18,-29,-18,-10,74,35,-23;
MA   /M: SY='P'; M=1,-10,-30,-5,10,-26,-16,-11,-19,-6,-22,-16,-11,40,-1,-14,-2,-5,-22,-28,-23,2;
MA   /M: SY='E'; M=-2,4,-27,8,18,-29,-7,-7,-26,3,-23,-17,1,4,6,-2,1,-7,-24,-28,-20,11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-23,-5,8,-7,-20,3,-17,3,-11,-7,-3,-16,2,3,-6,-8,-16,-18,1,4;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-14,-17,-11,-22,13,-19,-16,-12,-15,-12,-7,-12,-11,-19,10,-2,-6,-21,-22,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-10,-1,-28,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-19,81,-10,-19,-9,-6,-27,-30,-28,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,6,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-28,59,17,-36,-9,4,-36,0,-29,-27,24,-11,1,-8,2,-8,-29,-39,-19,9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-11,-19,-16,-8,-19,-7,-13,-16,5,-13,-9,-7,-16,-4,14,0,-5,-5,-21,-16,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-25,-25,-19,2,-29,5,14,-19,10,11,-15,-23,-13,-17,-17,-11,7,-17,11,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-12,-31,-30,3,-30,-29,29,-21,10,10,-28,-29,-29,-20,-10,0,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-14,-10,-12,-15,1,-20,-17,-12,-15,-13,0,-12,-12,-13,16,31,-7,-28,-15,-12;
MA   /M: SY='A'; M=43,-12,0,-21,-12,-19,-4,-21,-10,-12,-10,-10,-12,-13,-12,-21,8,-1,2,-23,-20,-12;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-9,-18,-14,-22,14,-20,-17,-14,-15,-12,-8,-14,-14,-20,7,-4,-6,-22,-22,-14;
MA   /M: SY='A'; M=30,-13,-16,-19,-12,-15,5,-20,-13,-13,-13,-11,-10,-6,-14,-20,5,-3,-5,-20,-19,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-6,-35,1,8,-29,-18,-14,-23,-2,-28,-19,-7,53,-4,-11,-6,-7,-28,-30,-25,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-25,16,17,-24,-13,-4,-23,4,-21,-16,6,-11,6,-2,3,-2,-19,-28,-12,11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-22,-31,-26,-2,-33,-27,34,-24,15,14,-22,-20,-21,-24,-15,-5,30,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-29,3,18,-29,-20,-3,-22,15,-20,-8,-2,-4,21,12,-4,-7,-21,-24,-13,19;
MA   /M: SY='P'; M=14,-8,-21,-10,1,-22,-11,-16,-16,-7,-18,-14,-8,15,-4,-12,7,5,-12,-27,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-31,-21,15,-30,-19,16,-29,43,16,-30,-30,-21,-20,-30,-11,7,-9,6,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-21,-30,-22,6,-29,-21,22,-23,24,16,-21,-24,-18,-19,-17,-5,16,-21,-1,-21;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00985;
//
ID   GIDA_1_MP; MATRIX.
AC   MP01280;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucose inhibited division protein A family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5837860; R2=0.0130206; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=931; N_SCORE=16.696; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-23,14,3,-23,-6,4,-23,16,-30,-17,41,-17,3,9,4,-3,-27,-34,-17,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-18,6,23,-19,-11,-4,-18,13,-14,-10,-1,-3,8,5,-1,-6,-15,-16,-11,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,29,-20,12,-4,-19,5,5,-18,-3,-25,-14,46,-20,-2,-3,7,-3,-26,-36,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-31,-21,14,-30,-18,19,-24,34,21,-25,-26,-18,-18,-25,-10,10,-16,3,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-13,9,-28,11,8,-24,-16,50,-29,1,-23,-9,11,-15,7,2,-5,-13,-27,-30,3,5;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-10,4,-9,-22,-5,-20,15,-10,-5,-6,-18,7,30,-11,-10,-16,-17,-5,4;
MA   /M: SY='S'; M=18,2,-11,-3,-3,-20,0,-11,-17,-9,-25,-17,10,-11,-3,-12,29,13,-9,-35,-20,-3;
MA   /M: SY='P'; M=9,-16,-28,-14,-5,-22,-14,-17,-13,-11,-20,-14,-15,41,-10,-19,-1,-5,-16,-24,-19,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-19,-21,-23,-15,-1,-23,3,10,-17,16,24,-16,-22,-5,-13,-15,-8,4,-22,1,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-15,-30,-25,36,-29,-8,7,-20,6,4,-21,-28,-24,-16,-17,-8,7,4,33,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=9,3,-14,-3,-3,-18,-6,-10,-15,-6,-20,-14,10,-12,-1,-8,21,14,-10,-33,-17,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-26,-5,-11,-26,46,-15,-33,-15,-25,-17,0,-17,-13,-16,1,-15,-25,-19,-22,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-7,-17,-9,-4,-11,-16,-9,-2,-4,0,4,-6,-14,0,-3,-3,1,-2,-21,-7,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-22,-22,-27,-24,-4,-26,-25,29,-22,8,10,-15,-20,-19,-22,-10,-4,24,-24,-6,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-9,13,-25,15,22,-28,-16,-3,-26,12,-23,-15,9,-8,13,4,3,1,-23,-29,-15,17;
MA   /M: SY='G'; M=5,-11,-22,-15,-17,-20,24,-21,-16,-18,-17,-11,-4,-17,-16,-19,5,0,-9,-24,-20,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-16,-20,-21,-16,-7,-26,-12,11,-13,5,5,-12,-21,-11,-10,-8,2,12,-25,-5,-16;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-26,-10,-17,-28,55,-19,-35,-18,-28,-19,0,-18,-17,-19,6,-13,-25,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-19,-34,-12,-3,-27,-18,-21,-16,-11,-25,-17,-19,69,-11,-20,-7,-6,-22,-29,-27,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11,-1,-18,-21,-1,-27,26,-16,-8,-2,-21,8,64,-11,-10,-18,-20,-9,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-19,26,-29,26,-2,-10,-1,0,-18,-29,-9,-9,-19,-11,-11,26,76,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-29,5,-38,-28,43,-29,22,18,-22,-22,-22,-28,-20,-9,28,-19,1,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,24,57,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38;
MA   /M: SY='D'; M=-9,30,-25,42,13,-33,-10,-4,-32,0,-26,-24,12,-11,0,-5,5,-4,-22,-36,-19,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-18,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,15,13,-26,-26,-25,-24,-14,-4,39,-25,-6,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-18,-22,-18,4,-24,-15,7,-12,9,8,-14,-24,-16,-7,-12,-2,11,-22,-4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-29,-5,3,-23,-19,-3,-29,33,-23,-11,4,-17,9,52,-8,-8,-20,-22,-11,3;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30,78,-30,-18,0,-29,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,11,32,-30;
MA   /M: SY='P'; M=4,-13,-29,-10,-1,-27,-12,-16,-19,-7,-26,-17,-11,45,-6,-14,1,-4,-21,-29,-25,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-27,38,22,-31,-13,14,-31,1,-24,-20,14,-9,7,-5,1,-8,-27,-33,-13,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-2,-30,-2,7,-27,-20,1,-30,40,-27,-9,1,-13,10,37,-10,-11,-21,-21,-8,7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,10,-25,15,19,-24,-14,-6,-20,-1,-17,-15,4,-1,3,-7,1,-5,-20,-30,-17,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-25,-7,1,-20,-15,1,-23,14,-18,-8,0,-16,8,31,0,-3,-16,-25,-10,2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-3,-29,-3,13,-32,-21,15,-19,8,-14,1,-2,-13,43,12,-5,-11,-26,-21,-6,27;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-31,-25,-39,-29,67,-29,-18,-3,-27,5,-3,-23,-30,-35,-19,-23,-13,-5,29,34,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-24,10,-32,-23,26,-29,37,18,-28,-28,-22,-22,-25,-9,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-18,-38,-11,-1,-27,-20,-11,-18,-8,-25,-13,-17,71,-7,-14,-11,-11,-27,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,57,-31,-20,0,-30,10,-20,-19,1,-1,21,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-24,-8,-15,-26,46,-18,-33,-17,-28,-19,2,-17,-15,-17,10,-4,-23,-25,-26,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,37,37,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00986;
//
ID   GIDA_2_MP; MATRIX.
AC   MP01281;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glucose inhibited division protein A family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0765762; R2=0.0139187; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=722; N_SCORE=15.116; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=103; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-16,-31,-21,8,-31,-21,21,-29,45,20,-29,-29,-20,-21,-28,-10,11,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,6,-26,9,3,-16,-17,-4,-23,9,-18,-13,1,-15,-1,4,-5,-3,-18,-16,-1,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-8,-30,-5,3,-23,-15,3,-19,-5,-20,-12,-6,22,0,-8,-4,-8,-22,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-14,-5,-5,-13,-14,-11,-14,-7,-17,-12,3,-12,-3,-7,20,29,-6,-29,-8,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-29,-20,14,-29,-15,16,-27,41,18,-28,-30,-19,-19,-28,-10,7,-13,10,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-29,8,34,-28,-19,2,-26,12,-19,-11,1,-7,24,14,-1,-8,-26,-26,-15,28;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-13,-17,-13,2,-20,-17,-1,-18,7,0,-9,-19,-13,-14,3,17,1,-25,-4,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-28,-3,7,-28,-20,-7,-30,43,-28,-10,0,-11,10,36,-10,-10,-20,-21,-10,7;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-23,-6,-1,-19,-11,-11,-17,8,-14,-8,-2,-13,1,5,-2,-4,-12,-23,-11,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-15,-24,-18,-14,-11,-27,-14,9,-6,0,4,-11,-21,-6,3,-11,-7,9,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-2,-30,2,11,-29,-15,-8,-24,5,-26,-16,-3,24,5,-2,-1,-5,-24,-29,-20,6;
MA   /M: SY='G'; M=-7,8,-26,4,-6,-26,25,-7,-31,-6,-27,-18,17,-18,-5,-3,3,-7,-27,-27,-22,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-19,8,-30,-20,19,-26,43,18,-28,-28,-19,-18,-27,-9,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-25,-23,-31,-22,49,-28,-11,-4,-16,7,0,-17,-28,-25,-2,-19,-10,-4,5,27,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-25,-14,-32,-24,44,-25,-19,1,-26,10,1,-18,-26,-30,-19,-13,-4,2,-6,13,-24;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-6,-20,-11,-20,-1,-20,-11,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,0,0,-21,-20,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-29,-1,18,-38,-20,9,-18,9,-19,0,-1,-11,56,9,0,-10,-27,-21,-10,37;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-35,-27,2,-34,-23,37,-25,21,24,-22,-22,-18,-24,-19,-7,25,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-4,21,-16,6,-5,-16,-9,-4,-14,-5,-20,-15,33,-16,-5,-5,13,19,-16,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,7,-17,-17,-9,-23,-23,-4,-15,-8,-7,-9,-18,-17,-15,10,30,9,-33,-13,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-2,4,-19,5,23,-21,-16,-9,-21,-1,-19,-17,2,-6,5,-6,16,17,-15,-32,-17,14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-22,-1,22,-17,-24,-12,-5,-4,-6,-7,-11,-12,0,-9,-4,-4,1,-29,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-28,17,54,-29,-18,-2,-28,8,-19,-19,-1,-1,18,-2,1,-9,-28,-29,-20,36;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='A'; M=40,-9,-12,-17,-10,-21,8,-19,-15,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,12,0,-5,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='A'; M=35,-9,-12,-16,-11,-22,13,-19,-17,-12,-16,-13,-6,-12,-11,-19,11,-2,-7,-23,-22,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-6,-25,-8,4,-28,-14,-3,-10,-2,-14,1,-3,-13,28,-2,3,-3,-15,-23,-11,16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-31,-25,-33,-24,10,-31,-23,22,-29,35,16,-28,-28,-21,-22,-28,-12,11,-4,4,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-19,-32,-25,5,-30,-22,28,-25,28,21,-26,-26,-20,-21,-21,-7,24,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=49,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,1,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-25,-30,-22,-2,-32,-23,26,-19,15,13,-17,-20,-15,-14,-15,-2,17,-21,-3,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,28,-20,10,-5,-7,-5,5,-16,-4,-23,-15,45,-21,-5,-3,5,-2,-24,-32,-12,-4;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-10,-20,-11,-18,-3,-20,-8,-11,-9,-9,-10,-11,-11,-19,10,3,2,-21,-19,-11;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-12,-18,-11,-17,2,-16,-10,-12,-11,-9,-8,-13,-11,-18,9,0,-1,-22,-18,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-13,-20,-16,-8,-12,-19,-6,-9,-1,2,-1,-8,-21,-3,13,-10,-7,-7,-22,-8,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-4,1,-10,-18,-6,-15,3,-7,-5,-5,-17,-1,5,-8,-7,-13,-18,-4,-1;
MA   /M: SY='V'; M=10,-19,-12,-24,-17,-7,-19,-20,6,-13,2,1,-16,-20,-15,-13,-5,-2,12,-22,-8,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-11,-1,-13,-20,-4,-10,2,1,1,-9,-19,6,8,-12,-9,-11,-20,-6,2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-27,5,-6,-27,34,-9,-33,-10,-28,-19,12,-17,-8,-10,4,-11,-27,-26,-23,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-27,-2,12,-24,-16,-4,-21,17,-15,-7,-2,-13,11,13,-7,-8,-18,-23,-11,11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-25,11,24,-29,-12,-8,-27,5,-24,-19,-1,7,5,-4,2,-6,-24,-30,-21,14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-16,-30,-12,0,-20,-16,-17,-12,-12,-13,-10,-16,35,-8,-17,-8,-7,-17,-26,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-19,-27,-21,8,-25,-22,9,-20,9,4,-22,-23,-20,-18,-14,-6,10,-5,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-19,-17,-22,-16,-6,-25,-20,12,-17,2,2,-16,-12,-16,-18,-6,1,13,-26,-8,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-25,-27,-24,-14,7,-25,-20,1,-21,8,0,-23,14,-20,-20,-18,-9,-5,-18,-6,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-10,-31,-5,-1,-26,-8,-14,-23,-2,-26,-17,-8,35,-6,-5,-3,-6,-23,-27,-21,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-28,-10,-1,-21,-19,-5,-22,14,-18,-10,-5,0,3,33,-7,-6,-17,-23,-14,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00986;
//
ID   BIR_REPEAT_1_MP; MATRIX.
AC   MP01282;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   BIR repeat.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=97;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=92;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0091524; R2=0.0147511; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1314; N_SCORE=24.382; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=102; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-19,-18,-22,-16,0,-13,-18,2,-19,11,3,-16,-23,-13,-14,-8,-3,4,-21,-7,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-30,-3,3,-25,-17,-7,-20,2,-23,-14,-6,22,-1,2,-3,-7,-20,-28,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,-5,3,-16,-18,-7,-8,-8,-4,2,-4,-3,2,-9,-3,0,-11,-28,-13,2;
MA   /M: M=0,-15,-20,-17,-14,-2,-1,-18,-11,-14,-10,-8,-10,-11,-15,-14,0,-2,-5,-21,-11,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-22,-3,7,-20,-15,-8,-17,8,-18,-9,3,-12,4,10,7,6,-13,-29,-13,5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-15,-21,-18,-15,-1,-20,-13,0,-13,-5,-4,-11,-6,-15,-13,-5,-1,1,-18,-1,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-24,-11,-7,-7,-11,-7,-17,6,-13,-8,-4,-18,-5,7,-4,-3,-13,-14,3,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-20,14,-20,-15,-22,-19,-25,-15,-19,-20,-15,-19,23,-19,-24,-9,-9,-12,-35,-26,-20;
MA   /M: SY='N'; M=2,-2,-19,-7,-5,-19,-8,-10,-13,3,-16,-9,4,-17,-3,2,3,-2,-7,-28,-15,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,8,-27,6,-5,-1,-18,17,-17,-1,-16,-11,10,-22,-3,0,-8,-9,-20,-9,23,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-15,-23,-13,-9,-16,-17,-17,-6,-11,-10,-8,-11,15,-11,-10,-2,-2,-4,-30,-18,-12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-10,-11,-11,-7,-21,0,-15,-18,-3,-19,-11,-5,-18,-6,-1,2,-4,-9,-27,-18,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-24,-28,-21,24,-26,4,9,-14,12,25,-21,-26,-11,-12,-21,-10,1,4,36,-18;
MA   /M: SY='A'; M=22,-5,-15,-10,-3,-22,-3,-7,-16,-8,-17,-11,-2,-11,3,-11,15,5,-10,-26,-16,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,6,-13,1,0,-17,-9,4,-18,-8,-20,-14,12,-15,-2,-8,10,7,-16,-32,-10,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-9,-27,-5,12,-10,-25,6,-7,-7,-5,-5,-11,-9,0,-9,-10,-10,-9,-19,4,4;
MA   /M: SY='E'; M=1,14,-24,20,26,-30,-12,-5,-26,1,-21,-19,4,-6,10,-7,6,-3,-21,-31,-19,18;
MA   /M: SY='A'; M=36,-13,-12,-20,-11,-14,-6,-19,-5,-14,0,-5,-12,-14,-11,-19,5,0,1,-21,-16,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-21,-22,-18,3,-24,-12,13,-17,19,18,-10,-25,-13,-10,-17,-8,6,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,5,-27,8,7,-24,-18,-6,-21,11,-18,-11,0,-14,8,13,-5,-8,-15,-25,-12,6;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-11,-8,-7,-13,-13,-15,-12,-10,-15,-10,2,-11,-6,-10,25,36,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=3,-5,-19,-6,-2,-17,-5,-8,-16,-2,-14,-8,-6,-15,-6,-8,-2,-5,-9,-22,-10,-5;
MA   /M: SY='B'; M=-10,18,-24,17,1,-20,-15,1,-13,-7,-16,-13,15,-15,-4,-10,1,0,-14,-30,-8,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-47,-34,-25,5,-20,-10,-22,-18,-20,-17,-32,-28,-15,-17,-35,-28,-30,122,28,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-5,-2,-27,-14,-17,-18,-11,-23,-14,-15,59,-10,-19,-9,-9,-24,-29,-25,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-15,-24,-19,-12,-4,-21,-5,-1,-8,-5,-1,-9,-16,-5,-1,-5,-4,-3,-16,3,-11;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-13,-4,5,-17,-9,-9,-21,2,-21,-15,1,-13,-1,-3,10,2,-14,-26,-12,2;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=4,-10,-11,-14,-10,-4,-12,-11,5,-13,7,4,-7,-14,-9,-12,-2,0,5,-19,-7,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-6,-21,-5,0,-16,-8,-9,-12,3,-13,-8,-3,10,-3,1,-5,-7,-13,-18,-13,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=0,-10,-15,-10,-9,-14,-14,-14,2,-9,-5,0,-12,-17,-4,-10,-2,-1,11,-23,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-24,-1,-3,-21,-4,1,-18,-1,-18,-8,13,-8,1,1,0,-6,-20,-29,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-28,-16,-10,-9,-23,-14,-5,-5,-13,-7,-16,18,-11,-12,-9,-4,-7,-17,-2,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-27,11,38,-26,-18,8,-27,6,-19,-16,1,-5,15,2,2,-5,-25,-29,-14,26;
MA   /M: SY='Q'; M=2,2,-24,0,9,-28,-15,-4,-17,8,-16,-7,1,-12,19,2,-1,-7,-16,-24,-14,14;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23,19,-31,-20,21,-29,38,19,-27,-28,-22,-21,-27,-10,11,-15,5,-22;
MA   /M: SY='A'; M=36,-10,-10,-17,-10,-18,-3,-19,-8,-11,-12,-10,-8,-12,-10,-18,14,4,3,-25,-19,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-4,9,-24,9,16,-26,-12,-2,-25,11,-23,-16,11,-11,9,12,4,-4,-22,-29,-17,12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-26,53,-29,-19,7,-29,23,10,-23,-29,-31,-19,-23,-10,4,-1,19,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-33,-27,59,-30,-8,2,-23,7,1,-21,-30,-30,-17,-19,-9,0,14,44,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-27,-19,-17,21,-25,21,-4,-11,-3,-1,-16,-26,-10,-11,-15,-10,-10,16,58,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-13,-15,-12,-8,-23,-19,0,-13,-2,-2,-7,-14,-9,-12,9,33,6,-28,-8,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-26,-7,-14,-27,47,-16,-33,-14,-27,-15,1,-18,-14,-15,5,-12,-24,-24,-25,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-30,-9,2,-19,-23,1,-13,6,-13,-5,-7,0,5,7,-11,-10,-14,-22,-6,1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-25,-4,-5,-25,19,-12,-29,-1,-25,-16,5,-15,-4,1,5,-2,-22,-25,-20,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,62,26,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,17,-8,3,-8,0,-10,-30,-38,-20,15;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-24,7,9,-21,-17,-7,-13,9,-14,-8,3,-9,5,4,-4,-5,-12,-23,-10,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-13,-27,-26,-2,-29,-28,24,-19,7,7,-22,-24,-24,-19,-5,10,36,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-5,-24,-7,2,-24,-19,-7,-19,19,-18,-6,-3,-14,13,22,-2,1,-12,-22,-11,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28,72,-30,-14,0,-27,8,0,-20,-30,-35,-18,-20,-10,-2,13,38,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-13,28,-18,-17,0,-21,3,-21,-20,-16,-12,-7,-27,-16,-17,0,-4,-12,-29,-2,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-9,14,-29,20,-4,-31,33,-9,-37,-11,-29,-23,10,-17,-11,-15,0,-15,-29,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-8,-17,-22,-22,37,-19,-25,-20,-18,-5,-7,-23,-18,-20,-6,-17,-18,-24,-24,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-10,4,-12,-15,-27,24,-19,-34,-7,-27,-18,-4,-22,-14,-8,-2,-13,-22,-28,-25,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-32,-23,19,-29,-20,18,-28,37,18,-28,-29,-23,-19,-25,-9,14,-17,3,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-3,-9,3,-22,-15,-9,-25,9,-18,-10,-5,-18,3,18,-5,-5,-17,-27,-16,1;
MA   /M: SY='B'; M=-12,25,-4,25,4,-28,-11,-4,-30,2,-29,-22,21,-17,-3,-4,4,-5,-24,-38,-20,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-25,-2,15,-20,-19,0,-15,4,-6,-5,-4,-13,8,-1,-7,-9,-16,-25,-10,11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-29,0,10,-18,-19,-6,-20,-1,-21,-16,-7,19,0,-6,-1,-2,-21,-21,-6,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,5,-27,6,8,-28,25,-9,-33,-5,-27,-20,9,-13,-3,-9,4,-11,-28,-27,-24,2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,49,27,-36,-14,-2,-36,10,-28,-25,13,-8,6,-2,-2,-10,-28,-35,-18,16;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-28,43,16,-32,-13,14,-32,-2,-25,-21,15,-12,2,-8,-1,-10,-25,-36,-13,8;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-10,-1,-29,-20,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-19,-8,-6,-28,-30,-29,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-36,-41,-37,-27,9,-23,-26,-6,-22,-2,-6,-36,-29,-19,-20,-36,-24,-17,98,21,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-27,2,22,-23,-22,-3,-15,4,-14,-7,-4,-10,21,0,-3,-7,-16,-24,-11,21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-27,10,20,-28,-20,-2,-19,7,-17,-10,-2,-12,19,8,-3,-8,-16,-27,-14,19;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=33,-11,-14,-19,-13,-18,4,-21,-9,-13,-10,-9,-9,-13,-13,-20,7,1,0,-21,-19,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-26,-12,-2,-6,-21,-12,-18,22,-12,-5,-7,-17,-3,18,-12,-9,-12,-15,-3,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-33,-36,-34,-22,11,-20,-26,-18,-19,-16,-17,-32,-27,-19,-19,-31,-24,-24,103,21,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-12,-20,-20,-17,34,-20,-7,-6,-18,-4,-6,-3,-24,-20,-13,-4,-2,-7,-5,20,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-11,-36,-3,2,-29,-18,-15,-23,-3,-28,-19,-12,59,-6,-4,-7,-9,-28,-30,-26,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,7,-27,3,5,-27,-2,0,-27,12,-25,-13,16,-16,13,18,1,-8,-26,-26,-16,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-27,-5,8,-19,-7,-6,-19,4,-17,-10,-7,-10,4,0,-6,-10,-15,-17,-5,5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-28,-17,-30,-23,5,-28,-20,23,-24,32,23,-28,-28,-20,-18,-22,-7,23,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-25,-19,-7,-11,-26,-10,3,-6,12,8,-15,-22,6,3,-16,-9,-2,-21,-5,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,-5,-10,-7,-2,-15,-15,-12,-14,-5,-7,-9,-4,-17,-5,1,1,2,-9,-28,-14,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-15,-18,-18,-9,-8,-23,-17,7,-10,4,9,-15,-18,-9,-12,-5,4,11,-26,-9,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-28,-5,5,-24,-22,-12,-22,37,-17,-5,-5,-13,5,22,-13,-10,-15,-20,-8,5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,56,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-4,-26,-4,2,-24,-16,-1,-13,2,-18,-6,0,-9,13,5,2,-5,-14,-26,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=1,2,-26,5,18,-23,-13,-11,-13,-5,-10,-11,-4,-9,1,-12,-3,-9,-13,-27,-17,9;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-16,-26,-17,-7,26,-12,-5,-12,-15,-5,-7,-13,-22,-16,-13,-13,-12,-14,3,24,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,1,-33,-28,-1,-33,-28,26,-26,15,10,-26,-29,-26,-24,-16,-6,30,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-5,8,-24,4,2,-24,-14,0,-16,4,-20,-10,13,-14,9,1,4,-2,-16,-29,-12,5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-26,3,10,-27,-14,-4,-23,11,-26,-14,10,3,10,7,3,-2,-24,-29,-17,9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-18,-20,-16,-5,-24,-17,16,-15,4,11,-16,-20,-14,-17,-7,-1,19,-24,-4,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-18,-27,-22,-12,-10,-28,0,12,-14,9,12,-13,-20,2,-9,-15,-11,2,-21,-1,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=3,1,-21,1,3,-22,-13,-9,-16,-4,-9,-8,-3,-13,7,-4,1,2,-13,-25,-13,5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00987;
//
ID   TBOX_1_MP; MATRIX.
AC   MP01283;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   T-box domain signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1345296; R2=0.0122868; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=796; N_SCORE=13.905; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=193; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,8,-11,11,4,-22,-17,-9,-18,-5,-12,-12,2,-13,-3,-9,-4,-6,-14,-33,-16,0;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-29,-2,8,-24,-12,4,-22,-3,-19,-11,-5,10,5,-7,-3,-6,-23,-25,-11,5;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-18,-11,-4,-16,-10,-12,-8,-5,-9,-1,-7,-13,-1,-5,3,4,-2,-26,-13,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,1,-25,3,6,-19,-17,-9,-10,-6,-12,-5,-2,8,-3,-11,-4,-4,-11,-29,-16,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-6,7,-23,10,8,-21,-13,-6,-21,5,-18,-13,3,-6,4,3,1,-4,-17,-25,-13,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-5,3,-25,4,3,-24,-8,-8,-17,1,-19,-12,3,-1,2,-3,-1,-6,-16,-26,-16,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-22,-30,-24,-3,-31,-26,27,-23,13,11,-25,-10,-21,-23,-16,-6,25,-25,-8,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,-2,7,-23,-15,0,-24,19,-22,-9,3,-13,10,16,-1,-3,-19,-23,-8,7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-4,-31,-29,-1,-30,-29,26,-22,11,9,-28,-29,-28,-22,-12,-2,39,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-17,-3,1,-16,-10,-8,-17,-5,-19,-13,2,-12,1,-6,16,15,-11,-28,-10,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,11,-20,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-18,10,24,-28,-15,4,-25,2,-21,-15,6,-10,14,-1,3,-6,-23,-31,-16,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-7,13,-26,14,9,-27,-4,-5,-24,-1,-22,-14,11,-4,4,-6,2,-2,-23,-30,-18,6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-28,2,9,-28,-16,-2,-25,16,-23,-11,0,-5,14,18,-2,-7,-21,-25,-13,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-29,18,30,-29,-17,-6,-26,3,-21,-19,1,10,7,-6,-1,-6,-25,-31,-20,18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-19,7,-30,-19,20,-28,44,19,-28,-28,-16,-19,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-24,8,11,-24,-15,-7,-22,10,-17,-12,3,-11,5,5,0,-2,-17,-28,-14,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-1,15,-26,-20,-6,-22,23,-19,-9,-2,-11,14,19,-5,-7,-18,-23,-11,14;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-13,-39,-29,69,-30,-20,0,-30,12,1,-21,-30,-38,-20,-20,-10,0,5,25,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-1,-23,-3,-3,-13,-18,53,-23,-6,-18,-5,8,-20,4,-1,-5,-12,-23,-25,12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-27,7,19,-23,-17,-1,-23,6,-20,-14,-1,-3,12,2,-1,-7,-22,-21,-6,14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-19,-14,-21,-12,-2,-26,-5,9,-19,17,8,-18,-23,-12,-15,-17,-9,5,-20,1,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-24,-5,-10,-25,25,-16,-27,-7,-24,-15,0,-16,-8,-10,5,-2,-18,-25,-21,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-4,15,-14,2,-6,-14,-12,-8,-14,-6,-18,-14,23,-14,-6,-6,16,31,-12,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-18,-21,-28,-17,-3,-20,1,17,-8,17,55,-18,-19,5,-8,-18,-10,7,-20,-1,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-26,-33,-27,-1,-34,-25,40,-25,15,17,-15,-22,-19,-25,-16,-8,26,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,-11,-13,-12,-4,-21,-20,-7,-13,-4,-7,-3,-13,-12,-11,14,42,1,-27,-7,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-28,0,6,-27,-18,-8,-26,39,-27,-10,6,-13,7,27,-7,-8,-18,-23,-11,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=7,8,-16,1,-1,-21,-4,-5,-19,-2,-24,-16,18,-13,2,-1,18,7,-15,-33,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-9,-29,-9,0,-21,-21,-4,-25,29,-20,-8,-2,-19,9,54,-10,-9,-15,-21,-10,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-22,-32,-22,1,-25,-9,27,-17,23,47,-21,-21,-7,-15,-21,-10,14,-20,0,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-11,-17,-15,-10,-9,-16,-9,-7,-8,-8,-4,-9,-13,-8,-10,2,5,0,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-9,-30,-23,15,-30,-18,14,-26,29,14,-27,-30,-22,-20,-24,-9,11,-16,7,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,6,-27,7,14,-27,-15,-4,-28,24,-25,-14,7,-11,11,21,-1,-6,-22,-26,-14,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-26,-21,-28,-25,17,-30,-11,18,-19,9,7,-24,-28,-21,-18,-16,-6,19,-4,26,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-22,-5,-2,-20,-16,-11,-15,14,-21,-10,5,-14,0,10,5,5,-9,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-13,-32,-28,5,-30,-28,28,-23,13,11,-26,-27,-27,-22,-13,-4,36,-24,-5,-28;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-17,-3,4,-14,-12,-11,-18,-1,-19,-14,3,-11,-1,-2,16,14,-11,-30,-13,2;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-30,-8,-18,-29,60,-9,-38,-18,-29,-18,3,-20,-17,-18,0,-19,-30,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-30,-21,8,-29,-19,21,-27,44,23,-29,-29,-19,-19,-28,-9,13,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-27,48,15,-32,-10,3,-31,-1,-26,-24,24,-12,0,-8,2,-6,-26,-38,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-34,-9,2,-26,-20,-18,-19,-4,-24,-16,-15,58,-7,-13,-7,-5,-24,-28,-24,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00972;
//
ID   TNASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01284;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thermonuclease family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3402510; R2=0.0147453; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=268; N_SCORE=9.282; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-8,13,-27,19,6,-31,1,-9,-33,15,-30,-19,7,-12,1,4,2,-7,-23,-29,-18,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-23,-22,-12,-2,-26,-14,7,-6,24,19,-21,-23,-9,-5,-23,-10,2,-20,-3,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-13,-28,-25,2,-29,-26,22,-22,19,11,-26,-28,-25,-19,-12,3,32,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-5,-20,-13,-16,8,-21,-12,2,-15,-4,-4,-1,-21,-17,-15,-4,1,1,-17,4,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-24,-5,-7,-24,23,-8,-28,-3,-23,-14,7,-17,-2,4,0,-11,-23,-21,-20,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-29,1,10,-30,-18,-3,-27,35,-27,-9,5,-12,20,27,-6,-9,-23,-22,-11,15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-11,2,12,-22,-17,3,-25,6,-22,-14,6,-13,4,4,3,2,-19,-31,-13,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-29,1,-31,-29,31,-22,14,12,-29,-29,-28,-21,-13,-2,45,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,0,-14,-5,-15,-24,-14,-12,-4,-7,-6,-8,-19,-2,5,-3,5,-8,-28,-12,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-16,-32,-27,16,-31,-25,24,-25,23,12,-28,-29,-28,-21,-18,-5,28,-20,0,-27;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-14,3,8,-14,-14,-10,-9,-4,-9,-9,-4,-9,-3,-8,3,6,-2,-23,-12,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-16,25,6,-19,-9,5,-19,-2,-15,-13,9,-7,-1,-5,2,2,-14,-23,-8,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-25,-7,4,-13,-22,-6,-6,7,-10,-4,-3,-15,0,8,-8,-8,-6,-18,-2,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-1,-26,1,20,-14,-20,-1,-21,15,-17,-9,-4,-10,14,7,-6,-9,-20,-14,-1,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-11,11,-29,13,18,-29,-8,-2,-29,12,-26,-17,10,-5,10,8,-2,-9,-28,-28,-18,14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-24,-2,10,-23,-21,-11,-21,24,-20,-10,-3,-11,4,17,-3,2,-12,-24,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-27,57,15,-35,-12,-3,-35,-2,-27,-27,17,-10,-2,-10,3,0,-25,-38,-18,7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-32,-7,3,-25,-20,-6,-28,30,-25,-12,-3,1,7,43,-10,-10,-22,-22,-13,2;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-17,-30,-17,-14,19,-28,18,-3,-7,-3,0,-17,-27,1,-7,-17,-10,-13,22,66,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-16,-31,62,-17,-38,-17,-29,-18,0,-19,-13,-17,0,-19,-30,-20,-28,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-3,-20,-7,1,-13,-12,-12,-13,-4,-13,-8,-3,-12,-4,-7,8,17,-9,-23,-6,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-28,-21,12,-30,-14,18,-26,39,16,-28,-30,-19,-18,-27,-9,10,-13,12,-21;
MA   /M: SY='G'; M=24,-10,-21,-15,-15,-25,37,-20,-26,-15,-21,-15,-5,-15,-15,-20,5,-11,-16,-20,-25,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-12,-23,-13,-14,3,-25,1,2,-9,0,8,-15,-23,-5,-10,-11,-2,1,-5,25,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-26,-33,-28,-24,33,-28,2,-5,-16,-3,-5,-25,-30,-17,-14,-25,-15,-13,55,60,-22;
MA   /M: SY='L'; M=6,-22,5,-27,-21,-3,-23,-20,5,-22,11,3,-21,-26,-19,-22,-12,-6,8,-21,-4,-21;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-7,8,-27,7,-2,-27,14,-6,-26,-7,-27,-17,14,3,-2,-9,1,-9,-27,-27,-22,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-9,4,-25,5,-1,-22,-1,-8,-20,9,-15,-5,3,-14,-2,2,-7,-10,-17,-23,-13,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-15,11,10,-15,-9,-4,-11,3,-11,-8,2,-5,2,-2,1,-3,-9,-17,-8,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-20,-1,17,-18,-16,0,-7,2,-7,2,-3,-6,19,-1,-3,-7,-13,-17,-8,18; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=-10,9,-17,0,-6,0,-10,10,-9,-7,-8,-6,20,-18,-6,-5,-3,-4,-15,-18,3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-23,-34,-25,12,-30,-26,23,-24,9,7,-21,-13,-24,-24,-14,-7,19,-16,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=3,20,-19,7,-2,-23,4,0,-20,-4,-26,-17,33,-17,2,-5,11,-1,-23,-33,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-28,5,30,-24,-14,-5,-22,4,-13,-12,-5,-9,12,3,-4,-10,-20,-26,-17,21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-6,-24,-5,9,-15,-17,-10,-18,5,-16,-10,-6,-1,4,-1,0,-4,-16,-23,-12,6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-23,-21,-26,-17,1,-25,-13,13,-19,26,27,-23,-12,-11,-16,-20,-5,5,-22,-4,-15;
MA   /M: SY='V'; M=10,-17,-16,-20,-11,-15,-19,-16,5,-11,1,3,-17,-19,-1,-12,-4,-4,11,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-9,-30,-7,3,-23,-21,-10,-23,28,-18,-8,-6,-1,4,27,-12,-10,-18,-21,-12,1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-22,1,15,-24,-16,-2,-21,12,-19,-9,1,-8,19,13,4,1,-18,-23,-12,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=3,3,-25,-4,-14,-26,44,-12,-31,-14,-28,-19,14,-19,-14,-15,4,-13,-26,-25,-26,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00865;
//
ID   FA58C_1_MP; MATRIX.
AC   MP01285;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5176125; R2=0.0138212; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=252; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=144; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-13,-27,-13,-9,-7,-15,16,-16,-2,-5,-3,-6,-23,-2,15,-11,-11,-15,-14,10,-9;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='N'; M=-7,8,-15,-2,-8,-8,-12,-5,-3,-10,-3,-5,17,-19,-8,-7,-1,4,-6,-29,-11,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-2,-11,-1,5,-5,-7,6,-10,-5,-9,-6,1,-7,0,-4,6,0,-8,-16,-3,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-27,-38,-29,-22,4,-19,-16,-18,-14,-17,-15,-26,-24,-14,-11,-25,-14,-22,91,22,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='S'; M=6,-5,-16,-8,-4,-14,-2,-11,-13,-8,-14,-8,-1,-13,-5,-10,11,5,-8,-25,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=4,-15,-33,-9,-2,-28,-15,-19,-18,-10,-25,-18,-16,63,-10,-20,-5,-8,-23,-28,-27,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-24,1,7,-18,-2,-5,-26,3,-23,-16,4,-13,0,6,5,-4,-20,-26,-14,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-8,-26,-12,-6,-4,-19,-1,-15,6,-12,-6,-5,-19,0,5,-10,-8,-15,-3,9,-3;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-13,-18,-11,-20,3,-19,-10,-12,-12,-10,-8,-11,-10,-19,11,0,-2,-22,-20,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-28,-10,0,-20,-18,-2,-28,27,-20,-10,-1,-19,8,60,-8,-9,-18,-20,-11,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-26,-18,5,-28,-18,17,-26,38,15,-22,-28,-17,-17,-23,-8,8,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-13,16,-23,10,0,-15,-13,15,-16,-4,-17,-11,22,-19,-1,-2,-2,-7,-18,-32,-8,-2;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-13,-1,-2,-13,-4,-3,-13,-1,-12,-8,5,-10,-2,0,7,4,-9,-20,-9,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,0,-22,0,12,-25,-12,0,-18,7,-19,-8,2,-1,21,6,3,-4,-20,-21,-12,16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-22,6,2,-24,19,-9,-26,-8,-22,-17,4,-3,-6,-11,3,-8,-22,-23,-20,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-24,-6,-7,-17,16,-11,-25,2,-21,-12,0,-6,-7,2,-4,-11,-20,-17,-15,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: M=-4,-1,-12,-1,-6,-5,-1,-8,-4,-9,-3,-4,-1,-10,-8,-9,-2,-2,-2,-13,-6,-7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=0,6,-13,7,1,-14,-6,-5,-12,-1,-11,-9,4,-9,-1,1,3,-1,-8,-19,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-15,0,0,-23,10,-7,-25,-6,-24,-16,11,-10,-3,-6,7,-4,-22,-28,-21,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-19,-14,-12,-24,25,-19,-23,-14,-20,-15,-5,-9,-13,-19,8,-6,-14,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=6,-10,16,-16,-12,-14,-16,-18,-16,-11,-14,-11,-8,-20,-10,-10,6,6,-6,-31,-16,-11;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=7,-14,-27,-10,-2,-26,-12,-18,-18,-10,-26,-18,-12,48,-8,-18,5,-2,-20,-30,-26,-8;
MA   /M: M=-3,-12,-24,-11,-3,-15,-9,-13,-14,-3,-12,-8,-8,-5,-3,-2,-2,-5,-11,-24,-14,-3;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-6,-15,-8,-6,-8,-9,-9,0,-6,-5,-2,-4,-12,-5,-6,-3,-3,1,-14,-4,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=2,-6,-15,-5,-3,-9,-6,0,-10,-8,-8,-6,-5,0,-5,-9,-1,-4,-7,-16,-6,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-20,4,-1,-19,-8,0,-15,-6,-17,-11,11,-5,2,-6,5,0,-16,-28,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-24,29,6,-25,-9,-2,-27,-1,-25,-21,16,-9,-2,-6,6,2,-22,-32,-11,1;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-24,-5,2,-18,-14,-3,-15,-4,-14,-10,0,2,-2,-7,-1,2,-16,-26,-10,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-26,5,8,-19,-14,4,-21,7,-21,-13,13,-6,4,3,0,-5,-23,-26,-7,5;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-31,6,29,-34,-16,5,-25,5,-22,-11,-2,7,30,0,-2,-11,-30,-25,-16,29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-42,-37,-28,25,-23,-20,-13,-20,-12,-13,-33,-30,-22,-18,-33,-23,-22,106,38,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-27,-3,15,-32,-21,3,-13,5,-14,2,-4,-12,41,4,-1,-6,-18,-22,-10,28;
MA   /M: SY='I'; M=0,-28,-19,-33,-27,3,-30,-27,30,-24,16,12,-24,-24,-24,-24,-14,-5,30,-22,-4,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-18,44,-30,61,16,-39,-1,-2,-40,-2,-30,-29,18,-11,-2,-11,0,-11,-30,-38,-21,7;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-11,-29,-20,13,-27,-20,11,-28,34,12,-25,-28,-21,-20,-22,-8,6,-19,-1,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-5,-27,-5,-4,-22,10,-8,-21,-5,-13,-7,-1,-18,-2,-2,-5,-10,-19,-23,-16,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-24,4,9,-22,-13,-7,-22,9,-20,-13,3,-13,5,8,2,0,-15,-27,-14,7;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-27,-12,1,-17,-23,-15,-7,-5,-6,-5,-14,13,-4,-6,-8,-3,-10,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-7,0,-21,-21,6,-21,23,-19,-3,-1,-15,5,26,-8,-5,-14,-23,-5,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-4,-24,-9,-3,-10,-21,-4,-10,6,-10,-2,1,-17,-1,7,-7,-3,-9,-23,-6,-2;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-19,-35,-29,15,-33,-27,30,-26,16,12,-25,-27,-28,-23,-16,-6,32,-19,1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-14,-12,-8,-13,-16,-15,-11,-2,-12,-6,-2,-13,-5,2,12,25,-2,-28,-11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=8,-12,-16,-15,-17,-23,34,-20,-26,-17,-17,-13,-6,-20,-17,-18,-2,-13,-18,-22,-24,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='I'; M=6,-19,-21,-25,-20,-9,-11,-23,11,-19,3,3,-14,-19,-16,-19,-5,-3,10,-23,-11,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-8,-13,-16,-14,-7,-23,-22,1,-14,-2,-3,-7,-14,-14,-13,10,36,8,-28,-8,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-1,-28,-2,15,-35,-20,6,-18,9,-18,1,-1,-10,49,8,0,-5,-25,-21,-10,32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=5,-11,-16,-13,-9,-20,0,-12,-22,3,-18,-12,-4,-18,-5,17,1,-6,-11,-24,-17,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-19,-8,-8,-15,-3,3,-22,2,-19,-8,3,-19,-5,4,-5,-7,-18,-21,-4,-8;
MA   /M: SY='D'; M=1,12,-21,14,2,-26,-1,5,-25,-7,-23,-15,10,-13,0,-10,10,-2,-18,-33,-15,0;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: M=-2,-12,-20,-15,-12,-7,-2,-7,-10,-13,-6,-5,-6,-18,-10,-9,0,-3,-7,-22,-8,-11; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-18,4,4,-13,6,-7,-17,-6,-12,-11,0,-9,-3,-7,-2,-8,-16,-6,-9,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-2,-11,-4,-4,-3,-9,11,-6,-7,-3,-1,3,-11,-3,-3,-1,0,-6,-15,0,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-7,11,-19,16,10,-18,-10,-4,-17,-2,-18,-15,7,-9,0,-6,5,-2,-14,-20,-10,5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-22,1,3,-6,-12,-1,-14,-5,-10,-3,-2,-14,5,-6,-4,-7,-15,-15,0,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-26,-31,-27,-21,19,-19,-12,-10,-16,-9,-10,-24,-24,-16,-15,-21,-15,-15,67,33,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-26,-17,-27,-23,-4,-29,-25,21,-12,6,8,-24,-22,-22,-11,-12,-3,33,-27,-9,-23;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-15,-10,-7,-15,-16,-16,-11,-1,-14,-7,-3,-12,-4,-4,12,24,-2,-28,-12,-5;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-18,-7,2,-9,-12,-7,-15,-4,-17,-12,-3,-14,-1,-5,11,3,-9,-22,-4,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-24,-21,33,-27,8,2,-14,3,6,-19,-28,-14,-12,-17,-8,-4,16,55,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-18,-5,3,-15,-13,-6,-12,13,-11,-3,-2,-9,5,12,-3,-4,-9,-17,-7,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-14,-13,-10,-4,-17,-13,8,-8,10,7,-13,-15,-10,-9,-11,-5,9,-16,-4,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-14,-12,-7,2,-9,-5,-5,-3,3,3,-7,-13,-3,7,-9,-6,-5,-9,-1,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-22,-11,-2,-18,-21,-11,-11,9,-6,-2,-8,-16,6,9,-6,1,-7,-22,-9,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00988;
//
ID   FA58C_2_MP; MATRIX.
AC   MP01286;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5797057; R2=0.0144321; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; N_SCORE=10.083; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-12,7,-24,-2,-5,-11,-16,12,-9,-3,-8,-4,17,-21,-1,-3,-7,-7,-16,-25,0,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,2,-27,6,6,-17,-19,-7,-20,6,-16,-11,-1,-12,0,17,-5,-8,-13,-26,-12,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-19,-28,-19,19,-28,-19,8,-22,25,8,-20,-25,-21,-13,-18,-1,5,-15,4,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-14,3,-27,5,10,-7,-15,8,-22,-6,-15,-9,2,-10,4,-6,-6,-11,-22,-21,-3,7;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-30,-6,1,-19,-20,-5,-16,-8,-20,-13,-12,33,-7,-13,-6,-5,-17,-26,-14,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-16,-35,-10,-1,-27,-18,-5,-19,-10,-26,-14,-15,63,-7,-17,-7,-9,-26,-30,-22,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-36,-28,15,-33,-24,31,-26,21,19,-23,-25,-23,-23,-20,-8,24,-17,3,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-21,-18,-11,-7,-24,-16,5,-10,0,2,-14,-12,-9,-9,-5,2,7,-24,-6,-11;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-16,-9,-17,-5,-19,-11,-10,-11,-11,-6,-10,-9,-17,14,14,-1,-24,-17,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-9,-30,-9,1,-23,-16,0,-29,26,-20,-9,0,-19,14,60,-9,-10,-21,-20,-11,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-28,-23,42,-29,5,0,-20,5,1,-19,-29,-21,-15,-21,-12,-6,19,48,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-34,-28,2,-34,-28,35,-26,22,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-29,13,-35,-28,35,-28,18,14,-23,-25,-26,-25,-18,-8,29,-18,2,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-19,-26,-23,-20,6,-28,-1,12,-19,10,7,-15,-26,-13,-16,-18,-10,5,-3,19,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-8,-24,-6,7,-17,-22,-9,-9,-3,-2,-3,-10,-16,8,-2,-7,-4,-8,-19,-9,7;
MA   /M: SY='R'; M=3,-1,-21,-1,1,-22,-9,-9,-21,5,-19,-13,1,-13,0,11,6,2,-13,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-23,-40,-23,-21,0,-9,-24,-22,-17,-20,-19,-25,-24,-17,-19,-25,-22,-25,88,13,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-8,9,-21,1,-3,-13,-12,23,-19,-5,-20,-11,19,-18,-1,-1,5,2,-19,-29,-2,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-22,-3,-7,-19,12,7,-19,-10,-17,-5,4,-5,-6,-10,-3,-11,-19,-22,-12,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=1,0,-21,-4,0,-23,-8,2,-23,7,-23,-12,8,-15,7,15,8,-2,-17,-27,-13,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-25,-36,-27,0,-35,-27,40,-27,21,19,-22,-22,-20,-26,-19,-8,27,-21,-2,-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-10,0,-15,-14,-20,19,-20,-26,-17,-20,-16,-6,-19,-16,-19,4,-5,-15,-26,-23,-15;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-26,-18,-30,-23,2,-27,-21,24,-23,25,20,-24,-25,-18,-20,-17,-6,21,-23,-4,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,9,-30,18,55,-30,-14,-1,-31,8,-21,-20,0,-1,17,-1,0,-11,-30,-29,-21,36;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-20,-30,-23,4,-31,-24,24,-26,32,15,-28,-23,-22,-21,-23,-7,21,-23,-4,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-27,-24,-28,-21,22,-31,-8,13,-24,29,12,-25,-29,-19,-17,-25,-10,4,-2,27,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-3,3,-26,9,16,-20,-17,-11,-19,-5,-15,-15,-5,5,-2,-12,-2,-6,-16,-28,-17,6;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-21,-28,-22,-14,4,-24,-10,-1,-13,-2,-1,-22,-17,-12,-15,-17,-8,-5,22,20,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-27,-8,7,-17,-21,-9,-14,1,-12,-8,-10,-4,4,1,-6,-3,-14,-13,-6,4;
MA   /M: SY='D'; M=1,8,-22,13,4,-24,-11,-8,-20,-6,-21,-17,1,-2,-1,-12,7,1,-14,-29,-14,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-3,-21,1,1,-17,-3,-10,-13,-9,-9,-9,-3,1,-5,-11,-3,-6,-13,-23,-15,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-8,-15,-11,-7,-3,-17,-9,5,-6,3,2,-6,-15,-8,-7,-8,-4,5,-15,0,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-24,-20,-14,-8,-24,-19,11,-18,5,2,-17,12,-15,-19,-14,-7,4,-23,-11,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-6,-24,-6,-6,-8,-6,-5,-11,-11,-11,-9,-4,-15,-8,-13,-2,-6,-11,-15,6,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-22,-25,-23,-17,19,-26,-12,-3,-15,-2,-4,-19,-2,-19,-11,-13,-4,-4,-6,15,-19;
MA   /M: SY='B'; M=-8,15,-20,15,-1,-20,-8,-3,-20,-8,-16,-15,12,-14,-6,-10,7,12,-15,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='G'; M=4,-9,-21,-13,-14,-19,18,-11,-21,-14,-14,-11,-4,-17,-13,-11,2,0,-12,-23,-17,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-7,-32,-1,2,-28,-17,-5,-23,0,-26,-16,-7,35,0,-1,-4,-6,-24,-29,-19,-2;
MA   /M: SY='S'; M=2,4,-9,3,3,-22,-4,-11,-17,-8,-19,-15,4,-16,-7,-12,5,-3,-10,-33,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-19,-13,-8,-18,8,-19,-12,-13,-11,-9,-9,-17,-13,-16,2,-4,-2,-25,-19,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00988;
//
ID   RTC_MP; MATRIX.
AC   MP01287;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RNA 3'-terminal phosphate cyclase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1169548; R2=0.0147200; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=233; N_SCORE=8.537; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=94; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-22,-23,-14,-6,-23,-15,6,-8,8,4,-16,-20,-8,-6,-12,-7,4,-16,-1,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-20,-31,-21,18,-27,-19,14,-25,30,14,-24,-27,-21,-17,-22,-9,8,-15,3,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-4,-25,-3,13,-15,-12,-6,-18,-1,-11,-10,-6,-13,2,0,-3,-6,-15,-20,-7,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-6,-26,-8,2,-20,-21,-8,-13,16,-11,0,-4,-15,9,15,-8,-5,-11,-22,-9,5;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-21,-21,-26,-21,11,-26,-15,17,-20,15,20,-18,-19,-17,-18,-18,-8,12,-19,0,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-30,-2,-14,-31,54,-18,-38,-17,-29,-21,1,-13,-17,-19,0,-18,-29,-23,-29,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-14,-25,-15,-3,2,-26,-10,5,-12,0,-1,-14,-18,-10,-15,-10,-8,2,-12,10,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-24,1,12,-18,-12,-3,-22,5,-17,-11,-1,-11,3,4,1,-2,-17,-25,-12,7;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-2,-23,-18,-4,-13,-19,-2,-20,2,-1,-16,-24,-14,-18,-9,-6,2,-22,-9,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-6,10,-26,13,25,-27,-12,-3,-25,7,-21,-16,6,-8,10,3,3,-4,-23,-29,-17,17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-15,-31,-23,4,-31,-23,25,-27,31,18,-25,-26,-20,-22,-22,-6,18,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-25,4,15,-24,-18,-3,-22,14,-20,-12,3,-9,6,9,1,1,-17,-27,-12,10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-33,-26,3,-33,-26,32,-26,26,16,-25,-25,-22,-23,-19,-4,27,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-16,-24,-16,-8,-7,-27,-16,6,-7,15,7,-17,-21,-8,-7,-19,-9,3,-22,-5,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-27,-6,6,-22,-18,-6,-26,27,-19,-10,-2,-14,7,38,-7,-7,-17,-21,-11,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,18,-30,23,-20,-8,2,-20,10,57,-10,-12,-22,-22,-5,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-23,-21,-17,23,-25,17,-4,-17,0,2,-12,-26,-15,-12,-12,-9,-4,-5,29,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-18,-27,-19,-16,14,-25,7,-3,-7,-5,-3,-18,-16,-10,-11,-14,-8,-8,13,48,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-5,-25,-5,7,-21,-11,-9,-20,12,-14,-9,-3,-14,2,12,-5,-8,-15,-23,-14,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-26,-2,21,-19,-22,-10,-9,2,-9,-6,-7,-10,4,-2,-5,-7,-8,-27,-14,11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,32,-22,13,12,-29,-29,-28,-21,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-14,-20,-17,-10,-10,-22,-7,4,-11,2,2,-9,-19,-7,-9,-5,-2,5,-26,-7,-10;
MA   /M: SY='F'; M=5,-22,-18,-27,-21,10,-14,-22,5,-22,10,2,-18,-22,-22,-20,-10,-4,7,-15,-3,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-7,-21,-8,-2,-10,-21,-9,-10,-1,-9,-7,-6,-17,-4,7,1,9,-4,-22,-3,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-22,3,-27,-23,3,-27,-25,12,-20,3,3,-20,-27,-25,-20,-8,-1,24,-27,-9,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-28,4,14,-26,-18,-9,-22,6,-22,-15,-4,12,5,4,-1,-4,-19,-29,-18,8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-12,-31,-9,-5,-23,-19,-17,-11,-9,-22,-14,-9,46,-10,-16,-5,-6,-15,-31,-23,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-21,1,-23,-19,-12,-17,-22,-7,-14,-7,-6,-17,-19,-17,-12,-10,-8,-1,-13,-12,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-1,-24,-4,5,-21,-14,-9,-19,19,-16,-8,1,-12,3,13,-5,-5,-14,-22,-12,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=0,-11,-17,-12,-8,-10,-9,-14,-6,-8,-6,-4,-9,0,-8,-10,0,2,-5,-12,-9,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-17,-24,-18,-8,-2,-23,-7,-6,-4,9,4,-13,-22,-2,8,-14,-8,-7,-19,-2,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,1,3,-25,-9,-8,-25,9,-24,-15,1,5,1,13,0,-5,-21,-28,-18,0;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-25,-18,-9,1,-17,-19,-8,-15,-8,-8,-15,18,-16,-18,-8,-5,-10,-18,-10,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-16,-20,-18,-12,-8,-25,-7,11,-17,7,5,-13,-20,-9,-15,-8,-3,10,-25,-5,-12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-12,-24,-15,-7,0,-23,-3,-2,-7,6,6,-8,-22,-1,-4,-14,-9,-7,-18,1,-4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00989;
//
ID   UPF0027_MP; MATRIX.
AC   MP01288;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0027 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3601794; R2=0.0124558; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1168; N_SCORE=18.899; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=172; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=31,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,24,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-17,18,-21,-14,-12,-24,-20,-10,-8,3,-2,-17,-26,-14,-10,-15,-9,-4,-28,-13,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-24,8,-1,-19,-15,-1,-17,5,-12,2,7,-16,2,14,-4,-2,-14,-28,-11,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-8,-35,-4,15,-20,5,-13,-30,-6,-23,-20,-10,-13,-1,-11,-10,-18,-30,18,-10,8;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-7,-24,-9,1,-19,-10,-13,-11,-4,-8,-5,-6,-13,2,-6,-2,4,-10,-24,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-14,-24,-15,-11,-15,5,-17,-14,-4,-1,-3,-11,-19,-11,-7,-11,-12,-10,-20,-14,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-24,-29,-25,4,-7,-24,12,-26,12,6,-19,-25,-24,-22,-16,-11,10,-18,-6,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-8,1,-25,6,-2,-23,5,-13,-20,-6,-18,-13,-3,-18,-10,-4,-4,-10,-9,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-31,7,2,-30,19,-12,-32,-9,-29,-21,4,11,-8,-14,-1,-13,-30,-28,-26,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-17,-33,-25,26,-29,-20,17,-25,25,16,-26,-29,-26,-19,-21,-7,17,-14,6,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-22,12,39,-23,-14,1,-20,7,-14,-12,0,-1,19,1,0,-7,-22,-20,-13,29; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=5,-12,-23,-12,1,-16,-18,-15,-10,1,-1,-4,-13,-3,-5,-6,-10,-7,-9,-22,-13,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-33,22,9,-34,5,-11,-33,-7,-29,-24,2,17,-5,-14,-3,-12,-30,-31,-25,0;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-22,-29,-20,14,-27,-15,8,-11,10,13,-17,-25,-15,3,-17,-9,8,-15,3,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,8,-29,13,18,-29,-18,1,-23,12,-18,-4,1,-11,19,11,-5,-10,-22,-26,-13,18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,23,16,-26,-26,-24,-24,-19,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=24,-17,-17,-24,-18,-14,-4,-24,5,-17,-3,-2,-14,-16,-16,-22,-1,-5,10,-21,-16,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-10,-26,-26,-2,-28,-28,21,-18,6,6,-24,-26,-26,-18,-4,11,39,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=1,-9,37,-16,-12,-21,-19,-21,-23,-5,-21,-15,-8,-22,-12,-11,3,3,-9,-36,-20,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,29,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-28,-16,-22,-6,49,-20,-31,-22,-21,-16,-4,-22,-24,-20,-4,-18,-24,-14,-17,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-22,-20,-24,-18,15,-28,-10,7,-14,2,4,-20,-26,-10,-12,-12,-6,11,-8,16,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-30,-4,1,-27,-1,3,-32,25,-27,-11,1,-15,4,21,-8,-13,-23,-21,-10,1;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-12,-26,-14,-11,6,-21,34,-15,-7,-9,-3,-6,-23,-4,1,-11,-12,-15,-6,29,-11;
MA   /M: SY='S'; M=6,-6,-14,-9,-6,-16,-9,-14,-5,-14,-19,-11,4,-12,-4,-14,27,14,-1,-36,-16,-6;
MA   /M: SY='I'; M=1,-24,-25,-32,-23,1,-29,-20,27,-23,13,11,-19,-20,-16,-24,-14,-8,16,-13,7,-23;
MA   /M: SY='A'; M=21,-14,-17,-19,-18,-19,18,-22,-12,-16,-13,-9,-11,-18,-18,-20,2,-7,0,-22,-21,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,42,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-2,-31,-28,-4,-29,-29,25,-22,8,8,-25,-27,-26,-23,-10,-3,35,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-21,-25,-22,-18,16,-21,-8,-3,-18,2,-3,-18,-25,-15,-15,-11,-6,-7,17,26,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-16,-30,-16,-14,17,-28,14,-6,3,-6,-2,-16,-26,-6,-1,-18,-10,-12,19,61,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-18,-31,-24,59,-24,-18,-4,-26,1,-4,-14,-26,-31,-18,-7,-4,-2,-1,19,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,-9,-5,-12,-7,-20,-12,-19,-17,-12,-20,-16,-7,11,-10,-16,12,12,-10,-32,-21,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,4,-23,-1,-11,-25,38,-11,-31,-13,-30,-20,17,-18,-11,-13,11,-7,-26,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-30,-26,31,-20,12,17,-28,-28,-25,-20,-12,-2,43,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='A'; M=31,-14,-17,-23,-15,-17,-1,-22,-1,-15,-6,-5,-11,-13,-13,-22,2,-4,3,-20,-17,-15;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,-16,-18,-8,-22,-4,-20,-12,-10,-14,-12,-12,11,-10,-20,6,-2,-6,-22,-22,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-19,-14,-27,-21,50,-22,-16,-1,-21,5,-1,-13,-21,-27,-14,-10,1,0,2,18,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-12,34,-21,47,13,-29,-7,-1,-29,-1,-24,-22,15,-8,0,-8,5,-4,-21,-31,-16,7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='V'; M=3,-13,-13,-15,-7,-9,-17,-12,7,-8,1,8,-14,-15,-4,-10,-5,-3,13,-20,-9,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-3,-25,-5,1,-19,-18,-11,-16,1,-19,-13,1,10,-3,6,0,5,-14,-29,-17,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-26,17,29,-27,-19,-6,-27,13,-22,-17,3,-6,9,3,2,2,-22,-29,-16,19;
MA   /M: SY='G'; M=7,-9,-25,-10,-16,-28,53,-19,-34,-18,-27,-19,0,-18,-16,-19,6,-13,-24,-22,-28,-16;
MA   /M: SY='V'; M=11,-26,-10,-28,-26,-4,-24,-28,21,-18,6,6,-26,-26,-26,-20,-6,0,39,-28,-12,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='S'; M=4,-9,-16,-11,-9,-14,-11,-16,0,-16,-16,-9,1,-13,-6,-16,23,11,1,-34,-14,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00990;
//
ID   TSC22_MP; MATRIX.
AC   MP01289;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   TSC-22 / dip / bun family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2140455; R2=0.0123977; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=970; N_SCORE=16.230; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=185; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-14,-5,-7,-19,7,-15,-21,-12,-24,-17,5,-12,-7,-12,26,21,-11,-33,-19,-7;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-20,-5,-10,-25,36,-15,-30,-15,-30,-20,5,-15,-10,-15,20,0,-20,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='N'; M=12,7,-17,-4,-9,-20,9,-11,-19,-9,-20,-15,15,-15,-9,-12,10,7,-15,-28,-20,-9;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='V'; M=9,-26,-12,-28,-24,-2,-24,-26,20,-20,13,8,-26,-26,-24,-20,-10,-2,32,-26,-10,-24;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,13,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,45,-30,25,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,5,33,-21,-23,-9,-12,1,-11,-11,-9,-9,5,-6,-3,-7,-6,-30,-17,19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=3,7,-12,1,-3,-17,-6,-9,-17,-8,-24,-17,16,-12,-3,-8,29,25,-11,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-14,-17,-24,-17,-3,-20,-6,11,-10,11,39,-14,-17,-3,-10,-8,8,7,-23,-3,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-27,-25,-34,-27,48,-32,-10,11,-24,9,4,-20,-28,-27,-19,-20,-10,3,10,39,-27;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-10,-24,-24,-3,-27,-27,18,-17,4,4,-21,-24,-24,-17,-1,15,35,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,42,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-24,11,39,-24,-20,-6,-24,4,-17,-17,0,-3,11,-3,6,8,-21,-30,-17,25;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-2,-24,-5,3,-23,-20,16,-21,4,-17,-5,2,-14,19,15,2,6,-19,-25,-4,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-4,-20,-7,-2,-18,-16,-9,-22,12,-20,-12,2,-14,2,24,10,14,-12,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,44,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=3,-12,-21,-14,3,-13,-20,-13,5,-8,1,9,-14,-14,-4,-13,-7,-6,6,-25,-12,-1;
MA   /M: SY='E'; M=6,12,-24,19,31,-29,-12,-6,-26,2,-19,-19,1,-5,7,-8,3,-7,-21,-29,-20,19;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,-22,-8,-12,-7,-17,-7,7,-15,4,0,16,-23,-10,-12,-8,-5,-5,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='N'; M=7,19,-15,6,-2,-20,0,-2,-18,-5,-26,-18,32,-15,-2,-7,19,6,-18,-36,-20,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00991;
//
ID   ER_MP; MATRIX.
AC   MP01290;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Enhancer of rudimentary signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6615057; R2=0.0137464; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1273; N_SCORE=22.151; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-12,5,-30,13,45,-28,-20,0,-30,15,-20,-18,0,-5,18,17,-2,-10,-28,-28,-18,30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-3,-30,-3,2,-17,-22,48,-24,8,-19,-2,1,-18,14,7,-10,-15,-24,-17,18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-30,0,19,-27,-20,0,-29,25,-22,-11,0,-12,19,38,-6,-10,-24,-22,-12,17;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-28,-18,-6,-16,-25,-8,0,9,-5,11,-8,-17,8,17,-13,-10,-4,-20,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,29,-18,12,-5,-17,-5,4,-12,-3,-24,-15,46,-22,-5,-3,7,0,-17,-38,-18,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=6,17,-15,4,-3,-19,-3,-4,-17,-5,-24,-17,28,-15,-3,-7,19,12,-16,-35,-19,-3;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,-16,-13,-6,-13,-16,-14,-6,-12,0,-3,-7,-15,0,-11,7,14,-4,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-8,-34,-5,0,-26,-17,-10,-22,1,-28,-18,-2,45,-3,5,-7,-8,-28,-29,-23,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-2,11,-16,4,5,-17,-12,-8,-17,-4,-20,-16,16,-11,-1,-6,18,23,-14,-34,-16,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,2,-10,-8,-10,25,43,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,12,-30,17,17,-37,-18,22,-27,4,-22,-7,7,-12,37,3,-2,-12,-30,-27,-8,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-10,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-28,40,20,-32,-11,1,-32,9,-28,-23,24,-11,5,0,1,-8,-29,-36,-19,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,14,-26,19,4,-31,5,-7,-29,-5,-24,-17,7,-12,6,-8,4,0,-24,-29,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-13,-15,-20,-11,-17,-10,-20,-3,-3,-8,-5,-12,-13,-10,-13,2,-2,6,-21,-16,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=5,-18,66,-28,-23,-17,-21,-23,-17,-22,-11,-5,-18,-29,-20,-24,-7,-8,-4,-38,-23,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,25,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-24,-13,-23,-17,-4,-29,-26,22,-16,6,6,-26,-26,-23,-17,-9,-1,39,-30,-11,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-24,-21,34,-30,8,3,-16,9,3,-22,-30,-16,-13,-22,-10,-5,19,60,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-17,19,-30,27,14,-34,-16,17,-31,7,-24,-14,10,-13,20,11,-3,-11,-28,-30,-10,15;
MA   /M: SY='H'; M=-2,2,-26,-2,1,-24,-13,17,-24,9,-24,-11,8,0,2,2,-3,-9,-22,-27,-9,0;
MA   /M: SY='S'; M=9,7,-13,8,0,-22,-5,-11,-20,-8,-24,-19,7,-10,-3,-11,26,17,-10,-36,-18,-1;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-15,-17,-15,-8,-25,-22,5,-15,-3,-3,-5,-12,-12,-15,10,35,7,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-5,7,-22,1,-3,-17,2,2,-20,-5,-24,-13,16,-17,6,-5,9,-1,-22,-23,-4,1;
MA   /M: SY='T'; M=12,-2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,38,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='V'; M=10,-19,-16,-22,-13,-10,-20,-18,8,-15,9,5,-19,-21,-7,-15,-8,-4,12,-23,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14,15,-27,44,-9,-10,-6,0,-11,-27,-4,-7,-17,-13,-16,12,62,-14;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00992;
//
ID   ART_MP; MATRIX.
AC   MP01291;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   NAD:arginine ADP-ribosyltransferases signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5462441; R2=0.0164113; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=448; N_SCORE=12.889; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=59; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=37,1,-14,-3,-4,-24,-2,-16,-16,-8,-14,-14,-4,-10,-8,-18,8,-2,-6,-24,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-13,-25,-22,12,-25,-20,10,-17,5,9,-17,-22,-21,-15,-4,13,19,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-24,-8,-3,-17,-15,-5,-18,12,-12,-8,6,-19,1,28,-6,-7,-15,-24,-12,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-20,-5,5,-20,-17,-5,-16,3,-15,-4,0,-12,12,10,8,11,-13,-27,-12,8;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-17,-18,-16,-20,19,-22,-14,-15,-14,-10,-10,-16,-16,-20,4,-7,-2,-22,-22,-16;
MA   /M: SY='G'; M=8,-14,-23,-15,-20,-23,41,-22,-23,-18,-20,-13,-7,-20,-20,-20,0,-13,-11,-22,-25,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-15,-11,-4,-23,-8,-5,-30,15,-21,-11,-2,-21,6,41,-8,-11,-21,-23,-15,-2;
MA   /M: SY='S'; M=3,9,-14,11,2,-22,-5,-10,-22,-8,-27,-20,10,-10,-2,-10,30,19,-12,-38,-18,0;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-13,-30,-14,-6,-3,-22,12,-23,5,-16,-8,-5,-5,-2,27,-12,-12,-20,-18,0,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,1,-28,3,25,-34,-18,1,-23,15,-21,-8,-1,-8,34,8,-1,-9,-25,-22,-13,29;
MA   /M: SY='H'; M=-15,3,-29,6,4,-19,-21,23,-20,3,-12,-4,0,-17,9,1,-11,-12,-20,-21,6,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-16,-26,-16,-16,21,-24,14,-4,-10,-6,-4,-14,-26,-8,-10,-9,-4,-10,17,62,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-21,-26,-21,-7,-8,-27,-17,12,-16,11,11,-20,0,-10,-17,-17,-9,4,-24,-10,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-16,4,-27,8,2,-19,-16,30,-28,4,-21,-11,6,-18,5,16,-2,-9,-22,-25,4,0;
MA   /M: SY='H'; M=-5,3,-20,-1,-5,-11,-1,19,-22,-11,-24,-13,15,-17,-3,-8,12,0,-20,-31,-6,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,64,-30,-7,0,-24,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,16,46,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-31,-3,2,-25,-18,47,-25,-8,-24,-8,1,13,8,-6,-4,-12,-28,-30,-1,1;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-13,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=18,-7,-13,-16,-12,-8,-13,-14,-8,-10,-8,-8,-7,-13,-10,-14,10,20,-2,-17,-1,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27,63,-30,-7,0,-23,7,0,-20,-30,-30,-17,-20,-10,-3,17,47,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-24,-26,-25,-21,28,-30,3,7,-19,18,7,-23,-30,-16,-14,-23,-10,-2,11,49,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-12,-11,-10,-10,-19,-20,-6,-12,-10,-9,0,-11,-10,-12,19,41,1,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-27,-4,10,-25,-17,0,-27,18,-22,-11,2,-15,19,40,0,-5,-21,-24,-13,12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,26,-28,38,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-6,-28,-7,8,-15,-22,17,-18,0,-14,0,-2,-15,35,3,-5,-11,-24,-16,2,22;
MA   /M: SY='L'; M=3,-22,-17,-25,-17,2,-23,-20,10,-24,31,10,-22,-24,-17,-19,-16,0,7,-21,-5,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,1,-28,-3,3,-23,-16,3,-27,22,-22,-10,11,-19,15,49,-5,-8,-23,-24,-12,5;
MA   /M: SY='D'; M=3,7,-24,10,9,-29,1,-10,-29,8,-25,-18,3,-10,0,-2,4,-6,-20,-27,-19,5;
MA   /M: SY='S'; M=-3,6,-22,10,7,-28,-9,6,-24,-5,-27,-16,7,-1,11,-6,17,3,-21,-34,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-13,-7,-3,-30,12,-8,-29,-5,-25,-13,0,-17,11,0,4,-9,-24,-26,-20,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-9,-22,-9,-3,-16,-4,-15,-8,-11,-13,-9,-6,9,-7,-14,2,2,-9,-23,-15,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,23,-19,-11,-20,-21,-10,-19,-2,-13,-1,-11,-24,0,8,-8,-9,-12,-30,-16,-7;
MA   /M: SY='S'; M=0,-6,5,-5,1,-24,-4,-15,-25,-12,-27,-20,-2,-2,-6,-15,14,2,-18,-37,-24,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-9,11,-15,-15,-5,-21,-7,-13,-11,-6,-7,-4,-28,-11,-4,-8,-6,-11,-23,1,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-12,-26,-12,-12,-13,3,6,-15,-7,-15,-5,-8,-22,-5,-8,-8,-12,-11,-14,5,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-18,-8,-7,-15,-19,-10,-8,0,-12,-6,3,-18,0,9,3,11,-2,-28,-12,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00993;
//
ID   UPF0036_MP; MATRIX.
AC   MP01292;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0036 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6090784; R2=0.0141714; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1108; N_SCORE=20.301; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=3,-12,-23,-15,1,-8,-20,-7,2,-8,0,7,-13,-14,-2,-13,-8,-8,-2,-15,3,-2;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-10,-27,-11,1,-19,-22,-6,-12,17,-5,7,-9,-16,12,16,-13,-10,-12,-20,-7,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-18,-25,-22,-12,3,-26,-11,5,-9,6,5,-15,-21,-5,-10,-14,-9,-1,-10,9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-6,-10,-30,58,-17,-39,-16,-29,-20,0,-17,-15,-17,0,-19,-30,-21,-29,-12;
MA   /M: SY='A'; M=28,-19,-10,-24,-19,-11,-13,-24,7,-14,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,22,-24,-16,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-2,4,-20,-2,4,-19,-15,-8,-20,9,-18,-13,7,-12,1,12,6,11,-14,-27,-14,2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-26,-21,-33,-26,27,-29,-20,17,-23,9,6,-20,-25,-26,-21,-14,-7,15,-6,14,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-3,-26,-2,9,-9,-23,12,-18,6,-15,-9,-4,-14,4,1,-5,-1,-17,-12,15,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,4,-28,-1,-10,-29,41,-9,-33,-11,-29,-17,15,-19,-5,-11,2,-14,-30,-25,-25,-7;
MA   /M: SY='K'; M=5,-5,-22,-4,7,-24,-11,-10,-23,8,-23,-15,-2,1,3,8,7,-1,-16,-27,-18,3;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-13,7,-20,6,0,-5,-14,11,-14,-8,-7,-6,7,-16,0,-6,-6,-8,-16,-20,-1,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-17,1,-1,-16,-10,-3,-7,-5,-4,2,2,-13,4,-7,-3,-5,-9,-21,-10,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-8,10,-23,9,4,-24,0,-6,-25,18,-24,-13,10,-11,1,9,-3,-8,-20,-21,-13,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-18,-28,-22,2,-28,-22,29,-22,22,14,-20,-20,-18,-20,-17,-6,23,-18,-2,-22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=12,-16,-10,-22,-19,-8,-20,-25,8,-15,-1,-1,-16,-19,-19,-17,4,15,23,-28,-12,-19;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=35,-10,-16,-17,-13,-23,21,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=14,-8,-16,-14,-12,-10,-2,-12,-13,-11,-13,-11,-5,-15,-10,-14,10,11,-7,-16,-1,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-26,0,15,-35,-16,3,-22,14,-24,-5,2,-10,40,10,5,-5,-25,-24,-12,27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-30,10,36,-32,-4,-1,-29,5,-22,-15,0,-6,23,-1,0,-12,-30,-26,-19,29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-13,-26,-13,-4,-12,-24,27,-6,-14,10,8,-9,-22,10,-6,-16,-13,-13,-23,4,1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-7,5,-23,-22,-5,-19,22,-11,-2,-5,-15,17,24,-11,-10,-17,-20,-8,10;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-13,-22,-13,-14,11,-25,-13,5,-21,23,12,-17,-25,-17,-17,-21,-10,1,-19,1,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20,3,-23,-6,20,-16,29,47,-23,-23,-6,-13,-23,-10,10,-20,0,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-28,-20,14,-30,-13,16,-26,41,16,-28,-30,-18,-18,-28,-10,6,-11,14,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,11,-23,1,-1,-20,-9,1,-23,12,-23,-14,24,-19,3,28,1,-4,-21,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-28,-24,-30,-20,5,-23,-22,7,-25,26,7,-28,-26,-18,-20,-25,-12,1,13,2,-18;
MA   /M: SY='I'; M=3,-21,-18,-28,-21,-3,-25,-22,19,-20,15,14,-19,-20,-16,-20,-10,1,17,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-26,-9,-5,2,-19,-5,-21,14,-17,-9,7,-20,-4,25,-9,-8,-17,-17,-2,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,1,-30,3,18,-29,-20,-7,-30,40,-27,-12,0,-9,12,30,-8,-10,-22,-22,-12,14;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-9,-24,-17,-16,31,-23,18,-9,-16,-5,-4,0,-26,-16,-10,-13,-10,-14,-2,31,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-26,-20,-34,-24,30,-27,-22,13,-26,18,7,-21,-25,-26,-22,-17,-8,8,-8,8,-24;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-23,-34,-26,1,-31,-20,34,-23,23,30,-23,-23,-15,-21,-20,-9,24,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-24,-17,-28,-24,-4,-28,-26,28,-22,6,8,-19,-23,-21,-22,-4,0,31,-28,-8,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-31,-27,-22,35,-27,10,-8,-18,-3,-4,-19,-29,-18,-13,-22,-15,-13,37,48,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,2,2,-22,-14,1,-27,25,-26,-13,19,-18,7,38,-4,-7,-23,-26,-13,2;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-16,-23,-21,-14,-4,-22,27,5,-14,13,34,-13,-22,-1,-9,-19,-13,-2,-23,6,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-18,-18,-23,-15,-3,-24,-13,11,-15,18,20,-18,-21,-5,-12,-12,3,9,-23,-4,-10;
MA   /M: SY='R'; M=6,-12,-21,-15,-6,-18,-15,-12,-15,13,-14,-7,-7,-17,-2,24,-4,-5,-4,-21,-13,-6;
MA   /M: SY='K'; M=2,-3,-20,-7,6,-19,-16,-10,-16,7,-12,-4,-4,-11,2,6,2,6,-10,-24,-13,4;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-4,-28,-10,-11,-5,-23,37,-3,-13,-8,1,6,-22,-3,-9,-11,-12,-11,-18,20,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-21,-5,0,-21,-18,-14,-18,22,-21,-9,-2,-12,0,11,3,7,-7,-26,-11,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,12,-28,8,19,-30,-15,2,-25,20,-26,-12,15,-11,23,12,-1,-8,-27,-27,-14,21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-30,-21,4,-30,-20,23,-25,31,22,-22,-24,-16,-20,-20,-2,14,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-27,-7,7,-20,-24,-8,1,-6,-8,-1,0,-12,13,-8,-3,-2,-8,-25,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=3,9,-21,14,27,-27,-10,-6,-25,0,-23,-20,4,-6,7,-7,14,1,-20,-33,-20,17;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-8,47,-13,-2,-23,-25,-17,-25,-13,-18,-15,-10,-23,-4,-15,-1,1,-15,-38,-22,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00994;
//
ID   UPF0035_MP; MATRIX.
AC   MP01293;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0035 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.7470021; R2=0.0143599; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=928; N_SCORE=18.063; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=123; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=17,-9,-10,-11,-9,-16,-6,-17,-7,-12,-17,-11,-3,-14,-9,-14,23,11,5,-33,-18,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-22,-34,-25,3,-32,-22,33,-26,29,24,-25,-25,-19,-22,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-36,-14,-4,-22,-22,-20,-12,-14,-13,-12,-22,65,-12,-20,-14,-10,-22,-28,-24,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-33,-24,22,-31,-22,20,-29,33,14,-27,-29,-26,-21,-24,-9,15,-15,5,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,18,13,-28,-28,-27,-22,-15,-3,40,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='A'; M=8,-2,-20,-9,-8,-21,7,-11,-22,-1,-19,-13,5,-16,-6,5,5,1,-15,-24,-18,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-22,-16,-8,-13,-21,-8,-8,12,-7,7,-8,-19,-1,24,-8,0,-1,-23,-8,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,2,-30,9,10,-30,-3,-11,-29,5,-29,-19,0,13,0,-4,1,-7,-25,-29,-22,4;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-6,-23,-6,-10,-24,41,-11,-28,-11,-22,-13,0,-14,-4,-11,0,-14,-23,-15,-20,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,1,17,-31,-8,-3,-29,20,-24,-11,0,-11,20,18,-4,-11,-26,-22,-15,18;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-13,-25,-10,-8,-11,-21,-17,-2,-18,12,-1,-18,4,-13,-19,-16,-9,-6,-25,-13,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-7,-24,-7,-8,-15,5,9,-25,-4,-22,-12,1,-19,-3,6,5,-5,-20,-20,-1,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,36,16,-30,-30,-24,-20,-23,-6,24,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,26,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-8,-24,-8,3,-25,-23,-8,-10,16,-15,-1,-8,-16,17,9,-6,-7,-4,-23,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-3,-1,-20,0,-11,-19,-10,-27,-19,7,-10,-1,-11,36,17,-9,-37,-20,-1;
MA   /M: M=-13,-8,-31,-6,0,-18,-26,-14,0,-5,-8,-4,-7,-1,-4,-1,-11,-10,-5,-26,-12,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-12,5,-24,1,1,-21,-17,32,-24,8,-22,-8,12,-15,4,6,-1,0,-21,-29,0,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,33,-21,-10,0,-19,10,64,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-20,-3,2,-22,-10,-7,-25,15,-27,-15,5,-13,5,22,14,5,-15,-30,-15,2;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-6,-25,-8,1,-1,-19,45,-21,-11,-12,-4,0,-18,-2,-7,-8,-14,-20,-20,11,-2;
MA   /M: SY='P'; M=15,-11,-21,-12,-4,-23,-8,-15,-18,-4,-21,-15,-7,16,-5,-5,8,0,-13,-27,-21,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-30,23,37,-36,-18,4,-28,8,-22,-15,4,-6,31,2,0,-10,-30,-28,-16,34;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-30,-29,0,-29,-26,29,-19,11,17,-29,-29,-26,-19,-11,-1,45,-29,-9,-27;
MA   /M: SY='C'; M=8,-13,62,-21,-19,-20,-17,-23,-23,-21,-20,-18,-11,-27,-19,-23,5,-1,-8,-41,-26,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=1,-5,-25,-7,3,-25,-15,-10,-25,30,-23,-10,-2,-13,5,29,-5,-8,-15,-20,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=3,-19,-17,-22,-16,-10,-20,-15,4,-3,-1,7,-16,-22,-10,6,-7,-4,14,-24,-11,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-19,45,-30,63,25,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-33,-3,-2,-17,-18,-8,-18,-9,-24,-17,-12,41,-8,-16,-4,-6,-23,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-12,-15,-18,-17,6,-8,-20,-8,-17,-9,-8,-7,-18,-19,-15,7,16,1,-22,-6,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-30,48,26,-39,-14,2,-34,4,-26,-22,13,-9,15,-4,0,-10,-30,-34,-18,21;
MA   /M: SY='A'; M=8,-4,-18,-9,2,-18,-3,-13,-14,-7,-11,-4,-5,-11,-4,-12,5,8,-9,-25,-16,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-2,14,-16,16,2,-22,-10,-11,-22,-7,-23,-19,9,-10,-4,-10,22,22,-12,-36,-16,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-9,2,-22,4,-6,1,-19,2,-15,-14,-5,-8,-2,-18,-12,-13,-6,-2,-11,-22,0,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-8,-24,-9,9,-11,-23,-10,-2,-8,-5,-5,-9,-12,-2,-13,-3,0,-5,-18,0,2;
MA   /M: SY='A'; M=25,-8,-13,-14,-9,-12,-7,-12,-11,-10,-13,-11,-6,-13,-8,-15,14,10,-3,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=26,-11,-10,-19,-14,-13,-12,-22,-2,-12,-6,-6,-11,-14,-14,-17,9,14,10,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='A'; M=41,-13,-11,-21,-11,-16,-4,-20,-6,-13,-1,-6,-13,-13,-11,-20,4,-1,1,-20,-17,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-23,-24,-23,-13,-1,-26,-13,2,-9,25,9,-19,-26,-9,12,-23,-10,-1,-20,-4,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00995;
//
ID   ISPD_MP; MATRIX.
AC   MP01295;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0650579; R2=0.0087527; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1132; N_SCORE=9.972; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=736; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-36; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-80,-58,-40,-72,-67,-48,-68,-44,-63,43,-54,-68,119,-45,-50,-61,-69,-66,32;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-11,-82,88,69,-87,-70,32,-87,-52,-82,-78,-47,-65,-48,-61,-58,-61,-81,-94,-71; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-75,-10,-59,-74,-57,-78,-71,-44,-64,-49,-62,107,-36,-67,-82,-67;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=-22,-67,-84,-77,-54,-84,-84,-22,-76,7,-43,-80,-80,-77,-77,-67,-53,96,-87,-62; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=16,-75,-71,-61,54,-73,9,-19,4,2,9,-64,-75,20,55,-62,-63,-22,35,25;
MA   /M: SY='N'; M=25,37,-51,-58,-16,-53,-55,-73,2,-75,-67,80,-69,-52,-14,61,-46,-68,-83,-67;
MA   /M: SY='G'; M=53,-71,-67,-70,-75,81,-71,-27,-68,-18,-64,-56,-68,-65,-74,-48,-62,-65,-74,-73;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-69,-84,-76,-43,-84,-71,22,-77,82,-31,-81,-82,-71,-75,-74,-61,-2,-72,-55;
MA   /M: SY='Q'; M=9,-76,-14,56,-79,-31,-55,-32,41,-40,-63,-13,-64,66,4,8,-57,-69,-77,-67;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='A'; M=53,3,-67,-4,2,-67,53,-8,-61,-63,0,-63,-73,37,-22,-23,-22,-10,-75,14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='I'; M=-14,3,-84,-80,-54,-38,-2,57,-78,34,27,-77,-80,-74,-79,-70,-22,41,-81,-61; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,14,34,-92,-37,-76,-36,6,-47,-81,-69,5,-13,-25,-9,-4,-81,-96,-85; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-16;
MA   /M: SY='D'; M=16,-82,41,-4,-85,0,-70,-79,33,-25,-74,-15,-76,-11,-21,-7,-24,-36,-90,-78; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-69,-87,58,10,-93,-14,0,-93,-7,-92,-85,7,-19,-12,-69,37,-23,-88,-100,-81; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=7,28,47,-5,-22,-74,-69,-30,-68,-23,-70,6,5,-67,-75,-7,22,-32,-86,12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='D'; M=-2,-81,70,36,-85,-32,-63,-78,-5,-80,-75,-53,49,-55,-22,-24,12,-35,-90,-75; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-16;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-77,-77,-71,-12,-75,-71,19,-7,-4,-52,4,-18,-66,-23,-66,-22,39,120,41;
MA   /M: SY='V'; M=-54,-68,-82,-77,-53,-84,-85,48,-74,-39,-41,-76,-77,-76,-77,-65,1,91,-85,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-63,45,-84,-78,-47,-85,-73,41,-76,61,53,-78,-80,-72,-76,-73,-59,36,-76,-57;
MA   /M: SY='I'; M=-58,-71,-78,-77,-53,-84,-82,81,-73,-38,-41,-70,-72,-73,-77,-62,45,57,-80,-60;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-79,-53,-54,-68,-68,144,-85,-58,-69,-55,-43,-69,-47,-53,17,-63,-83,-101,-39;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='A'; M=62,-66,-67,-66,-73,51,-70,-59,-65,-67,-62,-57,-68,-62,-70,34,-52,27,-78,-71;
MA   /M: SY='A'; M=77,-63,-73,-66,-65,-60,-75,-40,-67,-54,-52,-68,-71,-66,-71,-50,-51,66,-80,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-83,-63,-51,-76,-77,-52,-83,-24,-75,-64,-56,-75,-40,117,-61,-66,-76,-76,-62;
MA   /M: SY='P'; M=-33,1,-68,-58,-24,-12,-70,-71,-64,-80,-69,-71,120,-67,-76,-62,-59,-35,-78,-78;
MA   /M: SY='F'; M=-35,74,-26,-77,96,-80,-68,-49,-76,34,-47,-20,-85,-80,-75,-70,-64,-53,-55,-34;
MA   /M: SY='V'; M=9,-68,-81,-76,6,-80,-77,42,-74,38,-39,-76,-77,-73,-76,-66,-20,65,-76,-56;
MA   /M: SY='T'; M=-55,-71,-17,-3,-64,-63,27,-69,-54,-71,-64,22,49,-54,-1,49,59,-65,-74,39;
MA   /M: SY='H'; M=17,-76,-19,-2,-68,-67,70,-29,19,-8,0,-56,49,13,14,-5,-1,-64,-78,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,-76,49,47,-77,2,3,-80,20,-77,-69,33,-65,-6,33,-4,-20,-75,-80,-11;
MA   /M: SY='D'; M=9,-72,41,28,-60,-73,0,39,-63,19,40,-61,-70,-59,-68,-26,-20,23,-81,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-72,-84,-80,7,-87,-79,75,-77,43,-36,-78,-78,-75,-78,-72,-21,42,-73,-54;
MA   /M: SY='D'; M=9,-72,54,12,-74,-10,2,-30,19,-9,-64,22,-15,-8,-57,33,1,-65,-83,-67;
MA   /M: SY='R'; M=9,-77,28,52,-79,-31,-54,-80,30,-77,-68,22,-66,-43,68,-23,-58,-74,-80,-68;
MA   /M: SY='V'; M=-12,4,-71,-72,-54,-14,-69,-12,-70,47,-42,39,-78,-68,-72,-27,-55,61,-81,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-14,29,-83,-79,20,-37,-75,72,-76,45,6,-75,-77,-73,-77,-69,-21,-13,-71,-53;
MA   /M: SY='Q'; M=24,-74,36,42,-76,-11,-58,-30,10,-22,-63,-12,-66,47,15,8,-56,-31,-79,-67;
MA   /M: SY='A'; M=67,-66,-21,-24,-65,-28,-66,7,-59,-6,-55,-15,-68,-11,-2,-20,24,-7,-76,-11;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00997;
//
ID   UPF0011_MP; MATRIX.
AC   MP01296;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0011 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4507661; R2=0.0158226; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=11.786; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=67; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-5,5,-21,2,5,-15,-16,-5,-18,5,-18,-13,6,-13,0,1,4,7,-14,-23,-4,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-24,-26,-15,2,-30,-18,16,-17,21,12,-20,-23,-8,-14,-20,-10,7,-18,0,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-22,-31,-20,4,-31,-25,27,-24,17,11,-21,-22,-20,-23,-16,-7,22,-20,-3,-22;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-25,6,10,-25,-10,-10,-16,-1,-17,-12,-1,-7,1,-9,-1,-8,-13,-27,-17,5;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-17,-6,4,-16,-19,-9,-15,-3,-9,-9,-7,-9,0,-7,-9,-9,-17,-14,-7,2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-20,-28,-21,9,-21,-20,13,-27,30,12,-23,-27,-21,-20,-19,-8,9,-20,-2,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-26,-11,-1,-12,-22,-12,-4,4,-10,-3,-3,-14,2,-1,-4,-5,-7,-22,-7,0;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-22,4,4,-16,-9,0,-22,-2,-23,-15,9,-6,-2,-5,8,2,-19,-29,-12,1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-29,1,-8,-30,37,-4,-35,-8,-28,-17,7,-18,-6,-10,-1,-16,-29,-24,-22,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-9,-24,-11,-2,-11,-18,-6,-16,14,-14,-2,-6,-15,4,9,-6,-6,-12,-15,0,1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-23,8,7,-24,-13,4,-21,8,-23,-13,13,-13,6,3,5,0,-18,-31,-12,6;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,2,-34,-30,-3,-34,-30,28,-26,11,10,-24,-27,-25,-26,-15,-6,30,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-1,-20,-13,-19,2,-21,-13,-13,-9,-10,-11,-14,-13,-21,6,-3,-3,-22,-21,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-21,-26,-17,4,-29,-15,17,-23,32,15,-25,-27,-12,-16,-23,-9,10,-18,3,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-15,-32,-29,0,-31,-28,33,-21,13,16,-27,-27,-26,-21,-13,-3,43,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-10,-17,-18,-15,0,-22,-8,1,-11,3,12,-10,-17,-8,-11,0,21,2,-17,8,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=5,-16,-15,-18,-15,-9,-9,-20,2,-18,0,-2,-11,-20,-15,-17,4,4,8,-28,-13,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,40,-27,22,17,-24,-24,-23,-26,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='S'; M=4,7,-3,2,-2,-20,-2,-7,-21,-9,-29,-20,18,-14,-2,-9,30,14,-14,-41,-21,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-12,-15,-18,-15,11,-19,11,-8,-13,-5,0,-7,-23,-10,-12,-9,-8,-10,-6,22,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-7,-25,-6,2,-9,-23,-1,-6,-3,-6,-4,-5,-17,-3,-1,-7,-7,-7,-21,0,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,9,-30,-19,22,-28,46,23,-29,-29,-18,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-16,-31,-27,-3,-29,-29,30,-21,10,10,-24,-24,-24,-23,-10,-3,37,-26,-9,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-2,3,-24,-1,6,-23,-10,-6,-23,15,-21,-13,8,-14,3,19,-1,-5,-18,-25,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-27,-3,10,-15,-17,-4,-19,2,-16,-12,-7,-13,6,-1,-4,-7,-18,-2,3,7;
MA   /M: SY='C'; M=8,-21,36,-29,-25,-8,-23,-27,-3,-22,-6,-6,-20,-27,-24,-24,-6,-5,10,-32,-17,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-17,-23,-21,-13,-8,-25,-7,-3,-2,-3,0,-11,-22,-6,10,-14,-8,-4,-11,3,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-11,15,-25,18,12,-23,-16,-6,-23,8,-22,-16,9,-11,3,2,2,-2,-19,-29,-13,7;
MA   /M: SY='H'; M=6,-7,-22,-10,0,-16,-15,10,-15,0,-12,-5,-4,-14,3,-4,-2,-8,-12,-22,-5,1;
MA   /M: SY='G'; M=-7,8,-26,3,-11,-22,23,-10,-21,-14,-19,-14,16,-20,-12,-14,-1,-11,-22,-28,-21,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-28,-29,-22,-3,-28,-17,22,-19,5,8,-16,-12,-17,-20,-16,-10,13,-20,-2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-26,4,14,-26,-17,-3,-24,17,-22,-11,0,-10,14,12,-1,-4,-20,-22,-8,14;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-18,-32,-28,3,-33,-25,33,-23,15,13,-26,-27,-25,-22,-15,-4,36,-22,1,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00998;
//
ID   FLAP_GST2_LTC4S_MP; MATRIX.
AC   MP01297;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FLAP/GST2/LTC4S family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6863379; R2=0.0128679; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1124; N_SCORE=19.140; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=141; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-11,-30,-11,4,-18,-4,-17,-1,-13,-7,-4,-8,-13,-6,-17,-8,-13,-6,-23,-15,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-6,0,-22,0,3,-23,-12,28,-26,6,-27,-10,7,-13,6,4,10,-2,-20,-31,-3,3;
MA   /M: SY='A'; M=29,-3,-17,-6,14,-23,-7,-13,-17,-3,-13,-13,-7,-7,0,-13,7,-3,-10,-23,-20,7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-23,-7,0,-20,-13,-3,-27,16,-23,-13,3,-17,7,42,7,0,-17,-27,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-12,-27,-12,-2,-16,-23,-9,-17,21,-5,-2,-8,-19,2,33,-15,-10,-12,-20,-7,-2;
MA   /M: SY='A'; M=34,-7,-15,-15,-5,-23,-5,-17,-15,6,-15,-10,-7,-10,-5,-7,5,-3,-5,-20,-17,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-17,-26,-21,-17,32,-27,32,-10,-18,-3,0,-10,-27,-15,-10,-17,-13,-13,1,40,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-14,12,-27,5,3,-23,-13,22,-27,17,-26,-11,23,-17,7,21,-3,-9,-26,-29,-7,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-17,-23,-27,-10,5,-27,6,-20,-4,0,-20,-27,-27,-20,-7,-7,22,-27,-17,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-17,-6,-3,-17,-12,-9,-21,4,-21,-14,4,-13,1,18,17,17,-11,-30,-14,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,55,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-23,-33,-20,-10,8,-23,-20,-13,-17,-16,-13,-20,48,-20,-20,-13,-10,-20,-16,-9,-17;
MA   /M: SY='L'; M=6,-14,-21,-17,-3,-15,-19,-10,-2,-11,10,5,-14,-18,10,-10,-9,-7,-7,-20,-9,3;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-11,-17,-15,-12,-11,-23,-16,-7,1,-8,-5,-8,-19,-8,15,2,16,6,-27,-10,-12;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-8,-22,-7,-3,-20,-15,-17,-17,-10,-23,-17,-5,29,-7,-14,13,19,-14,-33,-20,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-33,-17,-7,-16,-23,-20,-6,-17,-2,-6,-23,48,-13,-20,-17,-10,-16,-27,-20,-13;
MA   /M: SY='E'; M=11,3,-23,6,36,-27,-13,-7,-23,3,-17,-17,-3,-3,10,-7,3,-7,-20,-27,-20,23;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,1,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-23,-10,-3,-17,-20,-7,-23,16,-17,-10,0,-17,3,42,0,11,-13,-23,-10,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,14,-27,7,13,-33,-13,10,-20,7,-23,-7,21,-13,39,7,3,-7,-30,-27,-13,26;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-12,-22,-12,0,-24,-24,-6,0,-2,-8,4,-12,-18,25,-2,-4,-6,1,-24,-10,13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-10,-18,-18,-8,-18,-22,10,-16,-6,-2,-14,-22,-18,-16,10,8,26,-34,-14,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='Y'; M=4,-19,-20,-25,-19,26,-20,-4,-3,-15,-1,-3,-17,-23,-18,-16,-10,-7,-4,7,32,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-20,-19,-26,-19,0,-29,-23,17,-23,21,10,-17,-20,-17,-19,-10,11,12,-23,-3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,7,-33,-23,28,-30,42,20,-27,-27,-20,-23,-27,-10,15,-20,0,-23;
MA   /M: SY='V'; M=17,-22,-15,-29,-22,-8,-21,-26,20,-19,5,5,-20,-20,-20,-23,-5,-3,25,-23,-11,-22;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-10,-17,-17,-7,-23,-23,4,-13,-3,-3,-10,-17,-17,-13,10,33,17,-30,-10,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-13,-23,-20,-3,-24,-19,13,-14,6,16,-17,-20,-15,-14,-2,15,22,-27,-7,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC00999;
//
ID   DAPB_MP; MATRIX.
AC   MP01298;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Dihydrodipicolinate reductase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2588768; R2=0.0146829; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; N_SCORE=10.608; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=85; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-13,1,-29,1,13,-21,-19,1,-24,22,-22,-11,4,-14,14,22,-5,-8,-22,-18,-3,12;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-19,-28,-19,5,-27,-18,18,-25,34,20,-24,-26,-16,-18,-21,-6,11,-21,-2,-18;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=0,-19,-18,-23,-16,-6,-22,-16,12,-14,12,16,-18,-21,-9,-14,-11,-2,13,-23,-7,-13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-26,1,14,-24,-15,2,-22,12,-20,-9,2,-11,13,8,-2,-7,-20,-24,-10,13;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-15,-7,-1,-9,-15,-8,-4,1,-3,-1,-6,-11,-1,1,-5,-3,-3,-16,-6,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=16,-18,-14,-24,-17,5,-14,-20,0,-18,4,-1,-15,-19,-18,-19,-2,1,6,-17,-6,-17;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-10,-16,-10,-18,-2,-19,-10,-11,-12,-11,-7,-12,-10,-17,14,7,1,-26,-19,-10;
MA   /M: SY='K'; M=0,-4,-26,-5,6,-26,-14,-9,-19,14,-18,-8,-3,-9,10,8,-2,-6,-16,-22,-13,7;
MA   /M: SY='A'; M=5,-14,-20,-18,-10,-13,-16,-17,3,-9,-1,3,-12,-17,-6,-12,-5,-3,5,-23,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=9,-20,-13,-25,-17,2,-19,-19,7,-21,19,7,-18,-22,-17,-19,-12,-6,5,-20,-7,-17;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=11,-3,-15,-5,-6,-14,5,-9,-12,-7,-12,-9,-1,-11,-7,-9,3,-4,-8,-16,-10,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-24,14,12,-23,-13,-2,-24,12,-20,-14,4,-3,6,10,-3,-7,-20,-22,-11,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-2,-15,-4,-7,11,-11,-2,-7,-8,-5,-5,-1,-11,-9,-7,-6,-4,-8,-4,11,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-8,-23,-9,-12,12,-9,-8,-10,-15,-7,-7,-6,-21,-15,-14,-7,-7,-9,-9,10,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-8,-21,-6,-5,3,-16,-6,-11,-9,-10,-9,-10,-7,-8,-11,-8,-7,-13,6,10,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-15,39,-27,52,15,-33,-9,4,-35,-2,-29,-26,20,-12,0,-9,5,-6,-27,-38,-17,7;
MA   /M: SY='I'; M=3,-26,-14,-33,-27,-3,-30,-28,30,-24,11,10,-22,-23,-22,-25,-12,-5,29,-24,-7,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-30,24,50,-30,-19,0,-31,10,-21,-20,3,-3,17,4,-1,-10,-29,-31,-19,33;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,43,-29,23,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,30,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-21,-31,-24,3,-32,-24,25,-22,15,12,-21,-23,-19,-19,-15,-2,21,-17,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,21,59,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,39;
MA   /M: SY='M'; M=3,-16,-11,-21,-15,-7,-18,-15,2,-13,6,7,-14,-19,-10,-13,-5,3,3,-23,-6,-13;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,98,-30,-9,-20,0,10,-20,10,2,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='R'; M=-13,9,-27,6,3,-23,-14,-1,-24,13,-24,-15,15,-9,3,24,-3,-6,-21,-29,-16,1;
MA   /M: SY='H'; M=-10,0,-24,-4,0,-13,-14,15,-19,1,-15,-6,5,-18,6,3,-5,-7,-20,-21,0,2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-15,-21,-18,-10,-13,-22,-18,2,2,-2,1,-14,-18,-7,-2,-8,-5,8,-23,-10,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,69,21,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=37,-10,-12,-18,-10,-18,-3,-19,-7,-12,-12,-10,-7,-11,-9,-19,13,3,0,-24,-18,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-12,-2,-28,-21,-20,-16,-11,-26,-17,-20,82,-11,-20,-11,-10,-26,-29,-28,-11;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-10,-3,-19,-11,-20,-2,-20,-12,-12,-11,-11,-9,-12,-11,-20,10,1,-1,-23,-20,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-23,-22,-26,-17,1,-29,-19,20,-23,27,14,-20,-25,-15,-18,-20,-8,12,-21,-2,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-23,-7,1,-17,-18,-6,-14,9,-9,0,-5,-15,2,9,-4,-2,-10,-24,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-18,-25,-19,3,-27,-20,15,-22,22,13,-18,-21,-15,-18,-11,9,10,-22,-3,-18;
MA   /M: SY='A'; M=21,-11,-20,-16,-12,-20,16,-17,-18,-10,-13,-10,-8,-16,-12,-14,1,-8,-10,-19,-17,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,11,-28,17,34,-31,-15,1,-28,11,-23,-17,4,-6,17,3,2,-7,-26,-29,-17,25;
MA   /M: SY='V'; M=8,-15,-17,-21,-16,-8,-16,-17,7,-14,6,7,-12,-19,-13,-15,-5,1,9,-24,-10,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-27,-18,-34,-26,-2,-31,-26,33,-25,17,16,-22,-22,-20,-25,-16,-7,25,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,-11,-11,-1,-20,-8,-14,-14,-6,-11,-10,-7,-13,-2,-10,5,-1,-7,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-22,11,22,-28,-12,-4,-27,10,-23,-16,4,-9,10,4,1,-7,-23,-27,-15,15;
MA   /M: SY='A'; M=12,-6,-17,-12,-8,-16,-2,-15,-9,-9,-10,-7,-2,-16,-9,-13,4,3,-3,-25,-15,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-14,-27,-15,-7,-15,-13,-9,-15,9,-5,1,-9,-19,0,25,-14,-11,-11,-19,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-27,0,2,-25,7,-10,-25,5,-24,-14,4,-11,0,-1,-1,-10,-21,-24,-18,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-7,-24,-8,2,-15,-16,-11,-11,-1,-12,-8,-5,-14,-1,0,-3,-5,-8,-17,-9,0;
MA   /M: SY='D'; M=-5,5,-24,7,4,-17,-14,-4,-19,0,-17,-12,2,-9,-1,-5,-1,-5,-15,-26,-11,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01000;
//
ID   EPHRIN_MP; MATRIX.
AC   MP01299;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ephrins signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8906283; R2=0.0139398; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1178; N_SCORE=21.302; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=116; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=1,4,-23,7,4,-24,-15,-11,-18,11,-18,-12,-2,-13,-2,4,-3,-6,-8,-27,-15,1;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-1,-19,2,1,-17,-8,-8,-13,-4,-16,-12,-2,28,-4,-10,-2,-4,-15,-18,-15,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-5,12,-11,4,-3,-6,-6,2,-8,-2,-12,-8,19,-11,-2,-2,5,7,-11,-16,-1,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-15,-11,-6,-9,-16,-11,1,-4,0,1,-13,2,-5,-6,-8,-4,3,-16,-8,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-19,-25,-19,-9,-6,-25,-9,-7,2,13,4,-14,-25,-4,28,-19,-10,-6,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-35,-34,-35,-27,8,-25,-27,1,-23,5,-3,-35,-30,-22,-20,-31,-19,-3,69,14,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-20,5,14,-20,-16,-6,-16,-1,-16,-13,11,-11,5,-4,8,12,-14,-31,-15,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-3,26,-18,16,-1,-21,-4,0,-18,-4,-26,-18,36,-17,-3,-6,12,2,-19,-38,-19,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-28,-11,0,-19,-21,-2,-21,23,-13,-2,-4,-19,10,46,-12,-10,-16,-20,-8,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,2,-31,-20,-17,-20,-8,-29,-18,-18,81,-4,-17,-9,-10,-30,-29,-28,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-10,9,-23,14,7,-11,-8,12,-25,-8,-18,-14,4,-13,-3,-9,-1,-9,-20,-24,-5,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-2,-14,-5,-6,5,-6,20,-11,-8,-7,-3,4,-12,-5,-4,-5,-7,-11,-10,6,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-25,-7,-4,-26,15,-9,-23,-6,-18,-9,-2,-16,7,-7,2,-9,-21,-23,-18,2;
MA   /M: SY='P'; M=-13,6,-34,18,17,-32,-17,0,-28,-3,-27,-21,-3,36,0,-12,-5,-11,-30,-33,-21,6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-21,-24,-14,0,-31,-19,21,-20,17,10,-23,-23,-17,-19,-17,-7,19,-21,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,7,-27,-20,-4,-29,39,-25,-9,0,-14,14,44,-9,-10,-21,-20,-10,9;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,75,-30,-20,2,-30,13,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='T'; M=4,-1,-1,-7,-7,-15,-11,-16,-16,-11,-20,-15,3,-12,-7,-11,27,32,-5,-36,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-9,-29,-7,19,-15,-29,-13,5,-9,1,-1,-10,-10,1,-13,-10,-10,-4,-25,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,67,-32,-22,8,-30,12,3,-20,-28,-37,-22,-20,-10,5,5,25,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-3,-29,2,26,-21,-21,-3,-23,14,-11,-11,-4,-11,11,22,-8,-10,-21,-25,-13,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-9,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-19,-37,-11,-1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19,81,-10,-20,-8,-9,-27,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-15,3,-20,-12,-16,33,-16,-6,-9,-16,-9,-9,17,-25,-21,-11,-6,-5,-14,-13,7,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-13,-19,-14,-11,-1,-18,-9,-4,-15,0,-4,-10,-12,-9,-13,3,8,-5,-18,6,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-31,-28,-33,-23,8,-25,-19,9,-23,25,18,-31,-28,-16,-18,-31,-15,-1,25,8,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-21,-22,-25,-18,25,-27,-1,0,-18,15,5,-17,-26,-19,-12,-19,-7,-3,-8,17,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-28,-12,-2,-11,-22,3,-19,15,-9,-3,-5,-20,5,30,-13,-11,-15,-19,-3,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-8,-29,-4,9,-26,-16,-10,-24,9,-24,-16,-6,19,2,10,-1,-6,-21,-27,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-1,-29,-3,-11,-28,38,8,-34,-13,-28,-15,10,-19,-6,-12,0,-17,-30,-25,-18,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,2,16,-28,-20,31,-28,13,-21,-6,3,-13,23,18,-6,-13,-27,-25,-3,17;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-24,35,21,-29,-14,-5,-29,-1,-23,-22,10,-8,2,-8,8,6,-22,-35,-18,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22,38,-30,14,0,-13,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,27,72,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-30,-29,-25,16,-35,-3,23,-19,9,9,-20,-25,-15,-19,-20,-10,9,7,43,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-24,-26,-34,-26,-2,-36,-28,38,-26,14,14,-16,-18,-18,-26,-12,2,24,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,36,18,-9,-38,-20,-1;
MA   /M: SY='T'; M=2,-5,-13,-11,-9,-13,-19,-19,-7,-3,-11,-8,-4,-13,-9,-6,12,28,4,-29,-11,-9;
MA   /M: SY='P'; M=5,-9,-22,-6,-1,-23,-9,-15,-19,-10,-27,-19,-4,30,-5,-15,17,8,-17,-34,-23,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-22,3,-7,-16,-17,-10,-4,-10,-13,-9,17,-11,-8,-12,3,9,-9,-32,-13,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-10,-32,-7,-8,-27,17,9,-30,-14,-28,-15,-3,13,-8,-15,-2,-14,-29,-27,-17,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-6,10,-19,7,8,-18,-14,-4,-19,-3,-19,-15,10,-11,4,-5,12,16,-16,-29,-9,5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-11,-21,-14,-9,-8,-18,6,-5,-12,6,5,-5,-21,-5,-2,-7,-5,-7,-26,-4,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-28,9,22,-28,-4,3,-27,-2,-22,-16,0,-2,8,-6,1,-9,-24,-29,-17,14;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-4,-32,-1,-9,-27,38,-15,-37,-11,-28,-20,-1,-18,-12,-10,-5,-18,-29,-8,-21,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-17,-24,-18,-7,-8,-25,-11,-4,-1,12,5,-14,-22,-1,14,-16,-6,-5,-21,-5,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-11,0,50,1,6,-26,-24,-16,-31,-13,-21,-21,-8,-23,-10,-17,-5,-10,-19,-42,-25,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-1,-19,-9,-11,-5,-15,-7,1,-16,11,4,7,-23,-9,-11,-7,-3,-6,-29,-9,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-10,1,-20,-21,-2,-23,22,-13,-5,-4,-19,14,47,-11,-10,-18,-20,-9,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-12,-25,-9,12,-11,-24,-8,-2,-10,15,7,-15,-16,5,-9,-15,-10,-9,-23,-8,9;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-6,-30,-6,-5,-31,29,-11,-34,3,-27,-14,0,-16,3,3,-3,-15,-27,-20,-21,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01003;
//
ID   RECR_MP; MATRIX.
AC   MP01300;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   RecR protein signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3356586; R2=0.0094381; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=608; N_SCORE=10.073; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=230; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-1,-26,0,6,-25,-12,-5,-22,5,-21,-13,1,0,5,7,0,-6,-19,-26,-17,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-32,-22,21,-30,-20,19,-29,40,18,-27,-29,-23,-20,-27,-10,10,-15,5,-22;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-16,-19,-13,-18,1,-20,-6,-14,-10,-7,-8,-13,-11,-19,7,0,0,-22,-18,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-25,10,12,-26,-11,7,-25,6,-21,-13,10,-13,11,5,2,-5,-23,-29,-12,10;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-10,-14,-9,-19,-3,-13,-12,-8,-13,-10,-3,-14,-7,-13,9,2,-4,-25,-18,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22,9,-31,-20,24,-28,39,22,-27,-28,-19,-21,-26,-9,15,-20,0,-21;
MA   /M: M=-3,-10,-21,-11,-3,-15,-16,-10,-5,-7,-3,-1,-8,-17,-1,-7,-4,-2,-3,-25,-10,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-7,11,-22,13,23,-24,-15,-1,-24,4,-20,-16,8,-9,9,1,2,-4,-22,-29,-16,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=25,-17,-13,-24,-16,-8,-11,-22,3,-16,3,-1,-16,-17,-16,-20,0,0,10,-21,-13,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-6,-24,-8,-4,-16,-19,-3,-9,7,-8,4,-6,-16,1,5,-7,-5,-6,-24,-6,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-24,10,15,-26,-14,-4,-25,9,-22,-15,5,-10,7,8,5,0,-19,-29,-15,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-27,5,10,-24,-11,5,-26,15,-23,-12,7,-13,8,11,-3,-9,-22,-26,-11,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-21,-32,-26,0,-33,-22,32,-24,18,14,-23,-25,-22,-21,-17,-6,30,-24,-3,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-24,-9,-6,-21,0,-8,-21,6,-19,-9,-4,-17,-3,9,-3,-7,-13,-22,-12,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-26,-11,-5,-2,-24,19,-13,-4,-11,-3,-6,-13,-3,-3,-9,-6,-13,-16,12,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-4,-22,-3,5,-22,-13,-9,-19,6,-20,-12,-1,-5,3,5,6,2,-13,-28,-16,4;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-10,-15,-12,-6,-12,-25,-10,1,-8,-4,-1,-9,-20,-4,-7,-7,-4,2,-25,-6,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-9,-22,-13,-14,-7,18,-5,-27,-11,-19,-12,1,-22,-13,-3,-5,-14,-22,-18,-11,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-9,5,-5,-18,-8,2,-18,-7,-21,-15,25,-18,-5,-6,9,7,-18,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-33,-25,23,-31,-19,21,-26,27,15,-25,-27,-23,-21,-23,-9,14,-11,12,-24;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,8,-6,7,-3,-20,-12,-14,-20,-9,-20,-17,5,-12,-7,-12,19,24,-9,-35,-16,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,14,-25,20,28,-27,-16,-5,-26,5,-21,-18,5,-7,8,-2,5,2,-21,-31,-17,18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-22,7,15,-25,-11,-6,-22,3,-20,-14,5,-10,9,-1,5,2,-19,-29,-16,12;
MA   /M: SY='D'; M=-7,20,-26,27,25,-30,-10,-3,-29,2,-25,-21,11,-5,7,-4,5,-5,-25,-33,-20,16;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-18,-25,-17,-10,-12,-25,-19,5,-14,-1,-1,-17,8,-13,-16,-9,-2,3,-27,-13,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-5,6,-22,6,6,-21,-13,3,-21,-2,-20,-14,6,-6,3,-2,3,1,-19,-27,-9,3;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-37,-28,8,-37,-28,40,-28,18,16,-21,-22,-21,-26,-19,-9,27,-18,2,-28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=9,-1,-15,-5,-2,-18,-9,-11,-15,-4,-16,-12,3,-13,-2,-3,15,10,-8,-30,-16,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,36,-25,41,14,-31,-8,2,-29,-1,-28,-24,26,-12,2,-7,7,-4,-26,-38,-19,8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-27,2,15,-24,-14,-10,-20,-1,-21,-16,-4,24,1,-9,0,-3,-21,-28,-20,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-25,0,5,-21,-10,1,-24,10,-22,-12,4,-14,8,14,2,-2,-20,-22,-6,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-29,58,18,-38,-10,1,-36,1,-29,-26,20,-11,7,-7,1,-9,-30,-38,-19,13;
MA   /M: SY='R'; M=-5,1,-25,0,3,-23,-8,-2,-23,6,-23,-13,6,-8,6,9,3,-4,-20,-26,-14,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-17,-2,0,-21,-4,-2,-21,-2,-23,-14,8,-12,4,-1,17,10,-14,-30,-14,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-16,-20,-20,-13,-4,-26,-18,8,-12,7,5,-14,-19,-7,-10,-7,5,7,-23,-5,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-26,6,-34,-25,34,-29,32,20,-25,-25,-21,-24,-23,-9,22,-20,0,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-20,93,-30,-28,-17,-27,-28,-21,-27,-14,-13,-20,-36,-26,-28,-10,-9,-5,-44,-26,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-30,0,-32,-29,34,-22,13,13,-27,-27,-27,-22,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-10,-30,-29,0,-30,-30,29,-20,10,10,-29,-29,-29,-20,-9,1,48,-30,-10,-29;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-26,9,39,-27,-15,-2,-25,4,-17,-16,-2,-4,14,-4,2,-7,-23,-28,-18,26;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-21,10,15,-19,-12,-3,-22,-3,-19,-14,5,-10,4,-5,10,6,-18,-31,-14,9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-29,-14,-8,-20,-20,-20,-6,-13,-16,-9,-17,42,-13,-19,-6,-4,-8,-30,-22,-14;
MA   /M: SY='K'; M=8,-6,-23,-9,2,-24,-7,-11,-21,12,-18,-9,-4,-11,4,10,-1,-6,-14,-22,-15,2;
MA   /M: SY='D'; M=-19,47,-30,65,22,-39,-10,0,-39,0,-29,-29,19,-9,1,-9,1,-9,-30,-39,-20,12;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-28,-18,-30,-25,1,-30,-25,27,-22,21,14,-26,-27,-21,-18,-17,-5,29,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-24,-24,-28,-18,11,-25,-17,4,-19,3,3,-20,-24,-14,-17,-17,-11,-1,16,11,-16;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-13,-20,-13,11,-9,-17,-10,-16,-10,-10,-7,-16,-16,-17,10,3,-3,-17,-4,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01004;
//
ID   RADC_MP; MATRIX.
AC   MP01302;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DNA repair protein radC family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1587090; R2=0.0149144; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=579; N_SCORE=13.784; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=90; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-18,-34,-27,32,-31,-23,18,-27,19,9,-25,-29,-30,-21,-19,-7,19,-11,10,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-8,-1,-13,-21,3,-22,22,-18,-7,-2,-18,3,29,-9,-9,-16,-16,2,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-6,-27,-4,13,-14,-21,1,-16,5,-10,-8,-5,-14,5,12,-6,-7,-16,-19,0,7;
MA   /M: SY='A'; M=42,-12,-11,-20,-11,-18,-4,-21,-6,-11,-9,-8,-11,-10,-11,-20,8,1,3,-22,-19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-9,-33,-26,4,-33,-25,26,-28,28,15,-26,-28,-22,-24,-22,-9,19,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-28,-4,8,-19,-21,0,-22,22,-17,-7,-3,-14,8,22,-9,-9,-17,-19,-4,6;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-17,-6,-1,-11,-20,9,-13,-4,-7,-4,1,-20,-1,-1,-9,-9,-13,-24,-1,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-3,14,-18,4,-4,-17,-1,1,-15,-6,-20,-8,26,-17,-1,-6,12,2,-17,-35,-16,-3;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,17,4,-2,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='A'; M=23,-3,-12,-12,-9,-15,-7,-13,-10,-10,-13,-10,0,-13,-9,-14,13,12,-2,-25,-13,-9;
MA   /M: SY='A'; M=23,-6,-14,-10,-6,-21,5,-14,-19,-7,-21,-15,0,-12,-5,-7,19,5,-9,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-33,-25,4,-33,-25,31,-27,29,18,-26,-26,-22,-23,-21,-6,25,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-38,-29,1,-38,-28,46,-29,22,21,-21,-21,-20,-28,-20,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-5,-31,-25,5,-30,-24,20,-26,24,13,-26,-29,-24,-22,-19,-7,21,-24,-5,-25;
MA   /M: SY='A'; M=18,-19,2,-26,-21,-8,-14,-24,3,-19,-1,-3,-18,-21,-20,-22,-3,-3,13,-25,-14,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=9,0,-11,0,1,-21,-1,-9,-20,-9,-30,-19,10,-10,2,-9,38,19,-11,-39,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-21,27,8,-26,-11,-3,-21,-4,-22,-18,18,-15,-3,-10,1,-6,-18,-36,-17,2;
MA   /M: SY='P'; M=4,-18,-20,-18,-11,-17,-19,-21,-5,-14,-10,-8,-18,23,-14,-18,-4,-1,-3,-28,-19,-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-19,1,16,-20,-16,-9,-20,2,-17,-14,1,-8,4,-3,10,14,-14,-28,-13,10;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-20,-39,-10,0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20,87,-10,-20,-9,-10,-29,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-28,-2,9,-27,-17,-1,-21,11,-21,-9,2,-2,21,14,-1,-6,-23,-24,-13,14;
MA   /M: SY='E'; M=16,5,-19,3,18,-25,-8,-8,-20,-1,-18,-16,3,-8,5,-9,9,-2,-16,-28,-20,11;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-17,-28,-20,-12,-9,-29,-15,10,-4,6,6,-13,-20,-6,1,-16,-10,4,-19,-2,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,0,-20,-2,0,-17,-19,-1,-9,-5,-7,-2,1,-17,3,-1,-5,-5,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-19,-33,-27,17,-31,-24,24,-25,18,14,-24,-26,-25,-21,-17,-4,24,-17,3,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-19,-20,-10,-10,-11,-10,0,-10,-10,-10,21,49,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-27,4,18,-25,-18,-3,-23,19,-20,-9,1,-10,14,12,-3,-4,-20,-24,-11,16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-28,-9,2,-20,-20,-4,-24,25,-18,-8,-2,-17,10,42,-7,-7,-17,-21,-9,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01006;
//
ID   BCCT_MP; MATRIX.
AC   MP01303;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   BCCT family of transporters signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2507253; R2=0.0101043; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1140; N_SCORE=15.760; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-19,-24,-16,14,-19,-7,0,-9,2,19,-11,-21,-9,-1,-7,-4,-1,-16,2,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-15,-18,-19,-12,8,-21,-15,-3,-9,4,5,-11,-19,-12,-8,-4,4,-1,-19,-1,-11;
MA   /M: SY='F'; M=10,-19,-15,-26,-17,12,-18,-20,1,-20,11,1,-16,-20,-20,-18,-7,2,3,-15,-2,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-23,-25,-28,-22,39,-27,0,0,-13,4,8,-18,-27,-18,-5,-19,-10,-4,10,40,-20;
MA   /M: SY='T'; M=5,8,-14,6,-3,-19,-12,-15,-17,-8,-17,-15,4,-10,-7,-12,17,26,-7,-32,-15,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-2,12,-25,18,2,-20,-12,-2,-24,2,-18,-16,2,-15,-2,3,-2,-7,-17,-20,-3,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-5,-37,6,12,-31,-19,-14,-24,-6,-28,-21,-11,62,-4,-16,-7,-10,-30,-31,-27,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-23,-26,-19,0,-16,-20,12,-21,9,7,-18,-23,-12,-18,-14,-9,9,-19,-5,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='G'; M=6,-2,-17,-4,1,-19,14,-12,-21,-8,-17,-13,0,-9,-5,-11,8,2,-14,-21,-17,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-4,7,-21,9,4,-22,-11,21,-23,7,-19,-9,5,-11,3,2,-3,-9,-18,-22,-3,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-21,1,-10,-22,34,-14,-28,-12,-21,-16,2,-13,-12,-13,3,-4,-20,-20,-20,-11; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,0,-23,4,14,-27,16,-10,-30,-6,-27,-20,3,-10,0,-10,13,-4,-23,-30,-23,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-36,-38,-40,-30,38,-24,-26,-12,-24,-8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18,94,30,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-21,-23,-24,-15,6,-24,-16,3,-18,10,11,-19,2,-15,-16,-13,1,-2,-19,-4,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-6,4,-25,0,-1,-27,10,-2,-27,1,-26,-14,13,-16,10,8,6,-6,-25,-27,-19,4;
MA   /M: SY='N'; M=1,17,-21,10,-4,-25,18,-5,-27,-8,-28,-20,25,-16,-6,-10,11,-4,-24,-33,-23,-5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,33,-25,20,15,-27,-27,-25,-23,-16,-5,37,-25,-5,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,69,-30,-20,3,-30,16,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,40,-30,12,0,-14,2,0,-20,-30,-16,-12,-20,-10,-8,26,70,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=34,-14,-14,-21,-13,-16,2,-20,-8,-15,-2,-6,-12,-15,-13,-20,2,-4,-2,-20,-18,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,1,-34,-30,-3,-34,-30,30,-26,10,10,-24,-27,-26,-26,-14,-6,32,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='S'; M=13,-9,-14,-13,-9,-16,-9,-16,-2,-14,-15,-9,-1,-12,-6,-16,21,9,1,-32,-16,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-32,-42,-32,-26,18,-24,-10,-12,-16,-12,-12,-32,-30,-16,-16,-32,-22,-22,102,50,-20;
MA   /M: SY='A'; M=28,-5,-10,-11,-7,-18,-4,-17,-13,-10,-17,-13,-1,-10,-7,-15,22,16,-3,-29,-18,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-38,-17,-7,-23,-24,-22,-4,-14,-19,-11,-20,65,-12,-22,-12,-10,-17,-28,-23,-14;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-20,-24,-26,-17,34,-10,-13,-11,-19,-4,-4,-12,-24,-14,-13,-12,-12,-12,-2,11,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-12,-30,-28,0,-28,-23,28,-18,12,21,-28,-28,-23,-18,-12,-2,41,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='G'; M=11,-8,-22,-10,-14,-26,42,-18,-30,-16,-26,-18,0,-16,-14,-18,11,-8,-20,-24,-26,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22,3,-28,-14,27,-21,30,37,-23,-23,-11,-18,-23,-10,14,-20,0,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-24,6,-33,-24,30,-28,35,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,9,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01007;
//
ID   UBIH_MP; MATRIX.
AC   MP01304;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ubiH/COQ6 monooxygenase family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8492379; R2=0.0144461; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1031; N_SCORE=19.733; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=115; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-3,-32,-28,-4,-30,-29,26,-23,8,8,-25,-27,-26,-24,-11,-4,35,-28,-10,-28;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-4,-2,-8,-2,-22,-19,-11,-20,3,-19,-10,-2,-15,7,5,7,14,-13,-29,-13,2;
MA   /M: SY='P'; M=-12,5,-30,8,8,-25,-16,18,-25,-5,-24,-15,6,19,1,-8,-2,-5,-27,-32,-12,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-30,-10,-7,-23,9,-7,-33,14,-23,-13,0,-20,0,41,-7,-13,-23,-20,-17,-7;
MA   /M: SY='V'; M=1,-22,-3,-27,-21,-3,-26,-24,12,-22,14,5,-21,-24,-20,-21,-10,3,16,-27,-9,-21;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-10,-22,-13,-17,-5,-22,-4,-12,-7,-7,-13,-13,-13,-20,7,0,8,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,1,-32,-30,-2,-32,-30,27,-23,9,9,-27,-29,-28,-23,-12,-3,39,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,48,-28,62,17,-37,-8,2,-37,0,-30,-28,26,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,3,-23,-20,86,-28,-7,-20,0,8,-18,18,2,-8,-18,-30,-28,15,6;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-1,-2,-9,-8,-16,-19,-11,-20,2,-17,-12,5,-18,-5,15,5,17,-11,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-2,-29,-23,-3,-30,-23,17,-23,12,11,-19,-23,-18,-21,-11,4,16,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,26,-29,40,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-12,-19,-11,-21,9,-20,-14,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-15,-32,-27,16,-30,-25,22,-25,23,12,-28,-30,-28,-20,-18,-5,29,-20,0,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-19,-28,-19,6,-27,-16,17,-24,37,25,-24,-26,-15,-17,-22,-3,9,-21,-1,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-27,-33,-23,26,-29,-14,11,-20,7,12,-20,-24,-15,-17,-20,-12,2,10,18,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-7,-23,-8,-3,-21,-6,-5,-21,6,-19,-6,0,-16,7,20,5,1,-15,-25,-14,1;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-15,-28,-27,-5,-16,-28,20,-20,4,6,-23,-26,-26,-21,-8,-4,33,-27,-12,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-1,-22,-2,5,-22,-13,5,-17,0,-13,-1,-2,-13,8,2,1,-6,-14,-26,-11,6;
MA   /M: SY='S'; M=10,-8,-18,-10,-4,-14,-3,-10,-11,-11,-16,-12,-3,-14,-5,-14,13,3,-8,-22,-6,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=9,-17,-18,-20,-20,-10,-22,-24,18,-18,3,3,-17,-20,-19,-22,-6,-4,22,-25,-11,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-26,8,19,-23,-16,10,-24,5,-20,-12,1,-10,13,-1,2,-7,-22,-23,-4,15;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-14,-13,-7,-13,-16,-7,-3,-11,-8,-5,-9,-16,-10,-13,6,7,8,-29,-11,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,-16,-8,-2,-20,-3,-16,-16,-5,-18,-13,-3,-12,-6,-10,13,9,-6,-28,-18,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,2,-21,-2,-1,-12,-16,-8,-18,2,-16,-10,3,-14,3,3,3,6,-14,-22,-8,1;
MA   /M: SY='A'; M=38,-12,-13,-20,-12,-19,6,-20,-11,-13,-7,-9,-11,-13,-12,-20,5,-3,-3,-20,-19,-12;
MA   /M: SY='H'; M=2,-12,-22,-16,-8,-17,-19,12,-4,-7,-6,6,-7,-17,5,-4,-6,-9,-3,-23,-4,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-25,-4,11,-6,-18,-3,-21,7,-17,-12,-3,-14,2,11,0,-4,-17,-17,1,6;
MA   /M: SY='R'; M=-7,0,-26,-3,7,-21,-16,14,-22,7,-18,-8,5,-15,16,17,-3,-9,-22,-20,-2,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01008;
//
ID   MOAA_NIFB_PQQE_MP; MATRIX.
AC   MP01305;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   moaA / nifB / pqqE family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1819679; R2=0.0094725; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1063; N_SCORE=9.887; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=706; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-63,-70,-79,-73,-4,-78,-63,-8,-72,64,76,-74,-9,-66,-71,8,-59,-5,-67,25;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=9,-11,-69,-6,-28,-75,-70,33,23,-16,-10,-65,-72,-3,-13,-18,23,36,-77,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-82,107,23,-85,-68,-10,-83,-56,-38,-19,-41,-28,-54,-64,-34,-60,-81,-99,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=13,-75,-12,-15,-77,-4,-12,-73,29,-50,-16,-55,6,-1,53,17,22,-42,-80,-68; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-72,-13,-77,-75,86,-81,64,-32,-72,-1,-51,-70,-83,-71,-35,-23,-67,-37,-49,72; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-23,-78,-13,-66,-79,79,24,-83,-36,-54,-17,7,-8,20,-35,-30,-34,-80,-78,-25; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-47,-89,-70,-61,-82,-82,-61,-28,-34,-80,-70,-9,-83,-50,103,-39,-71,-79,-84,-71; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-81,-13,-4,-70,-74,-12,-64,12,-13,-14,-28,63,29,34,-35,-15,3,-77,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-75,-76,-72,29,-79,51,40,-71,0,-8,-72,43,-70,-73,-67,-59,44,-68,33; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='T'; M=2,-71,41,-30,-64,-41,-11,-36,-4,1,9,25,-69,-54,38,-15,45,-37,-78,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-26,-78,49,-57,-43,-13,-48,-67,-32,-66,-62,6,-74,-56,16,22,-58,-42,53,96;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-11,-84,-76,-43,-85,-68,-6,-76,81,53,-81,-82,-70,-74,-75,-61,11,-73,-54;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-81,-64,-54,-67,-77,45,-72,-30,6,-57,-57,-76,-44,105,-62,-34,-70,-76,-20;
MA   /M: SY='I'; M=2,-71,-83,-78,-49,-83,-78,71,-76,45,-4,-77,-77,-72,-77,-69,-57,41,-75,-57;
MA   /M: SY='S'; M=16,-67,-53,30,-76,-53,-59,-74,-54,-75,-69,-48,-26,13,-59,92,-21,-66,-81,-68;
MA   /M: SY='V'; M=-60,-69,-84,-78,-47,-86,-78,43,-77,57,-35,-80,-80,-74,-77,-72,-57,66,-78,-57;
MA   /M: SY='T'; M=4,-62,-58,-61,-67,-67,-68,-7,-58,-61,-58,-4,-61,-62,-66,-38,107,-30,-86,-66;
MA   /M: SY='D'; M=-64,-79,89,16,-76,-40,45,-80,4,-78,-72,-2,25,-19,-57,-6,-13,-78,-85,12;
MA   /M: SY='R'; M=18,-76,-61,-2,-75,-43,-57,-68,22,-69,-61,-57,-70,23,89,-55,-14,4,-77,-64;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-70,16,-54,-78,-53,-46,-76,-50,-84,-71,116,38,-52,-59,-47,-48,-79,-94,-73;
MA   /M: SY='F'; M=-69,-70,-86,-80,79,-85,-70,15,-78,68,-36,-80,-84,-77,-76,-76,-64,-25,-58,-38;
MA   /M: SY='R'; M=-62,-80,-11,-47,-78,-69,-51,-80,-30,-75,-64,7,-72,61,97,17,-60,-76,-77,-63;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-72,-30,-34,43,-25,25,-6,-60,-28,9,36,32,21,-33,11,28,6,-73,-53;
MA   /M: SY='Y'; M=-72,-80,-72,-75,40,-78,-40,-55,-67,-51,-10,-73,-83,-63,-64,-67,-66,-60,-29,129;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='M'; M=-60,-70,-67,-66,-26,-69,77,-48,-63,7,115,24,-71,-55,-62,21,-57,-53,-78,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-81,-59,-30,-78,-65,-59,-71,5,-74,33,46,97,-55,38,-33,-57,-73,-80,-73;
MA   /M: SY='E'; M=13,-77,14,70,-81,-67,-58,-76,44,-76,-69,-24,44,2,-49,-16,-30,-43,-79,-71;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-59,-78,32,48,-12,53,36,-40,-59,0,-14,-54,-68,-55,-33,-33,-33,-42,-74,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-80,41,25,-71,33,25,-42,-35,-34,-16,-57,-8,11,-34,-34,-16,-27,8,22; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=17,-75,24,3,21,-27,-69,-5,-69,16,23,-29,-10,-67,-73,-20,-15,12,-77,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-25,-12,26,13,-33,-40,-57,-39,-29,-49,-65,51,52,-20,29,-16,28,-25,-80,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-64,-13,-31,29,64,-5,-63,-35,-7,-4,-58,-9,-9,-3,-32,9,-32,-39,64,16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-23,-72,-31,4,-10,25,-63,-18,-18,40,-51,-26,-8,11,-2,31,-1,-57,-74,-61;
MA   /M: SY='P'; M=8,-13,2,14,-79,-12,25,-74,-3,-51,-65,-7,72,37,29,-6,-58,-44,-80,-69;
MA   /M: SY='K'; M=-38,-78,-23,46,-32,-23,29,-75,51,-48,-13,10,36,-14,34,-30,1,-72,-78,-65;
MA   /M: SY='L'; M=-22,-75,4,8,-63,13,-9,-16,-31,33,27,8,28,33,-12,5,-58,-59,-76,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-21,-73,49,-10,-73,-37,-57,-64,21,-46,-12,11,-25,46,-9,39,3,7,-81,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-72,-77,-72,18,-1,-71,20,-72,40,3,-72,48,-70,-74,-28,-21,34,-71,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01009;
//
ID   UPF0054_MP; MATRIX.
AC   MP01306;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0054 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3427591; R2=0.0146533; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=227; N_SCORE=8.659; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-26,9,34,-27,-17,-4,-25,10,-20,-15,0,-6,14,4,3,-5,-22,-28,-17,24;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-25,-13,-4,8,-22,6,-10,-7,-5,-2,-5,-21,1,-1,-10,-8,-13,-9,14,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-7,9,-28,5,-4,-27,25,-4,-31,-5,-28,-19,18,-14,-5,-4,1,-12,-29,-28,-23,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-6,-26,-6,-1,-17,-22,32,-16,4,-12,-1,-2,-19,2,5,-10,-11,-12,-26,3,-2;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-16,5,2,-20,-6,-11,-21,-8,-24,-19,6,-4,-3,-11,23,15,-13,-35,-18,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-24,-23,-27,-18,20,-28,-18,7,-22,14,4,-21,-13,-21,-18,-17,-6,2,-11,8,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,5,-26,7,18,-20,-18,3,-20,5,-15,-8,3,-12,9,4,-3,-5,-19,-25,-7,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-26,11,15,-26,-13,2,-27,8,-21,-15,4,-12,6,13,-1,-8,-20,-28,-14,9;
MA   /M: SY='E'; M=-13,5,-29,12,38,-26,-20,29,-27,3,-19,-13,2,-7,15,-1,-4,-13,-26,-30,-7,25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-22,-31,-23,18,-26,-18,11,-23,20,11,-24,-26,-21,-19,-21,-8,6,2,10,-21;
MA   /M: SY='A'; M=9,-11,-13,-15,-9,-13,-7,-15,-11,-9,-7,-7,-8,-16,-7,-10,3,2,-7,-22,-11,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-17,-27,-18,-12,5,-25,23,-8,-12,3,2,-12,-25,-7,-1,-18,-14,-10,-5,19,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-21,8,-29,-17,19,-24,34,19,-26,-27,-18,-18,-22,-5,14,-18,4,-20;
MA   /M: SY='V'; M=2,-21,-15,-27,-21,8,-24,-22,11,-21,13,5,-19,-22,-21,-19,-8,6,14,-20,-3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-17,-28,-24,-4,-29,-27,26,-21,7,8,-18,-22,-21,-21,-4,5,30,-27,-8,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-27,-9,-17,-28,59,-19,-37,-18,-30,-20,1,-18,-17,-19,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-19,-30,-22,12,-28,-20,18,-23,17,14,-19,-23,-19,-20,-14,-2,13,-17,2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-14,-29,-20,8,-30,-19,16,-28,42,16,-28,-30,-20,-20,-27,-8,9,-20,1,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-21,-31,-21,8,-30,-21,22,-29,44,19,-28,-28,-20,-21,-27,-10,12,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-19,-24,-17,1,-24,-14,15,-20,27,20,-18,-25,-11,-15,-19,-7,8,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-30,-23,-20,29,-27,17,-4,-14,-2,1,-18,-28,-13,-11,-21,-13,-12,29,56,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-18,46,-29,62,18,-37,-10,-1,-37,1,-29,-28,20,-10,0,-9,1,-7,-28,-39,-19,9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,5,-30,7,2,-22,-19,90,-31,-9,-21,-3,11,-19,9,-1,-9,-19,-30,-31,16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-28,-4,15,-22,-17,-5,-9,-3,-10,-3,-6,-4,10,-7,-4,-9,-14,-25,-12,11;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-19,14,13,-21,-16,-1,-23,1,-20,-16,7,-12,1,-3,5,5,-17,-31,-12,7;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-28,22,19,-29,-9,-4,-27,-2,-25,-21,9,6,2,-9,2,-7,-26,-33,-21,9;
MA   /M: SY='E'; M=-3,12,-26,15,23,-28,-7,-4,-27,3,-22,-18,6,-6,7,-5,3,-6,-24,-29,-18,15;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-29,23,34,-31,-13,-3,-30,4,-24,-21,4,3,11,-3,2,-7,-28,-32,-20,22;
MA   /M: SY='A'; M=11,-8,-22,-11,3,-16,-11,-12,-15,0,-10,-8,-8,-13,-1,-4,-3,-7,-11,-14,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,11,-25,-14,-7,-21,12,-17,-10,0,-13,8,11,-3,-8,-16,-25,-14,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-8,-22,-9,6,-13,-17,-11,-4,-4,-4,-3,-7,-13,1,-5,-6,-6,-5,-21,-10,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-18,-20,-27,-15,1,-20,-1,16,-10,17,51,-19,-19,-1,-10,-18,-10,7,-19,-1,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-7,-25,-7,9,2,-22,-8,-14,-2,-3,-6,-6,-16,-2,2,-10,-9,-14,-18,-3,4;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-24,-3,8,-22,-4,-8,-19,0,-17,-10,0,-13,5,0,2,-5,-16,-25,-16,6;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-19,-23,-21,-10,-1,-24,-15,2,-6,14,6,-17,-21,-9,-3,-17,-9,-1,-17,-2,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-28,10,39,-30,-20,1,-24,9,-19,-13,0,-5,27,2,1,-5,-25,-27,-16,33;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-26,-5,6,-17,-18,-12,-8,-1,-7,-6,-5,-13,-2,-2,-6,-4,-8,-25,-11,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01010;
//
ID   MOTA_MP; MATRIX.
AC   MP01307;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Flagellar motor protein motA family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.1570020; R2=0.0177483; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=332; N_SCORE=12.039; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=20; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=10,-5,-20,-8,-2,-24,1,-11,-20,5,-21,-9,-1,-12,4,0,8,-2,-13,-25,-17,1;
MA   /M: SY='N'; M=-1,1,-22,-9,-9,-15,-16,-3,0,-6,-11,-4,11,-16,-6,-9,0,-1,-5,-28,-9,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-3,-21,-3,-9,-7,-19,-8,1,-16,14,11,-6,-22,-9,-13,-13,-7,-3,-27,-7,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,20,-27,25,24,-29,-4,-1,-31,3,-26,-22,14,-10,6,1,3,-8,-28,-33,-20,14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,25,-23,29,7,-28,-7,-4,-27,-4,-28,-23,19,-3,-2,-10,11,1,-22,-37,-20,2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-32,-12,-3,-24,-20,-19,-13,-1,-21,-12,-14,43,-7,-11,-7,-4,-17,-26,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=12,3,-19,3,10,-25,-8,-4,-22,2,-22,-15,2,-9,2,-6,12,1,-14,-29,-17,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,-8,-17,-8,6,-15,-15,-13,-6,-8,-6,-5,-9,-13,-3,-12,5,0,0,-29,-15,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-31,-20,27,-28,40,24,-27,-27,-18,-21,-27,-10,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='G'; M=5,-10,-28,-11,-19,-29,63,-20,-37,-19,-28,-19,-1,-19,-19,-20,1,-18,-27,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='P'; M=8,-11,-25,-11,-6,-19,-4,-3,-18,-10,-20,-12,-8,13,-4,-14,2,-5,-17,-21,-9,-7;
MA   /M: SY='N'; M=3,0,-21,-4,-7,-18,1,0,-16,-9,-10,-8,5,-18,-7,-10,-1,-7,-15,-27,-13,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-26,-23,-34,-26,0,-30,-17,34,-20,19,37,-21,-21,-12,-20,-19,-9,23,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-12,-17,-10,-21,7,-19,-14,-11,-14,-12,-7,-11,-10,-19,11,0,-4,-22,-21,-10;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-16,-21,-18,-13,-8,-13,2,-16,-4,-2,-13,-19,-16,-19,-1,-2,11,-24,-12,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22,22,-29,-18,16,-28,40,20,-27,-29,-22,-19,-27,-10,8,-14,6,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-16,-30,-26,1,-31,-27,27,-23,18,12,-25,-26,-24,-21,-13,1,32,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='G'; M=9,-6,-17,-12,-14,-19,17,-20,-21,-14,-17,-14,-2,-14,-14,-16,11,15,-11,-24,-19,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-19,-33,-24,29,-29,-19,15,-27,31,17,-26,-29,-25,-19,-24,-9,11,-12,8,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-22,-24,-25,-20,16,-30,-3,11,-19,18,8,-21,-27,-14,-16,-19,-4,2,1,35,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=8,-19,-20,-26,-19,-8,-23,-24,20,-20,2,4,-12,-16,-15,-22,0,2,16,-25,-9,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-23,-35,-25,25,-32,-20,23,-28,29,19,-24,-26,-23,-22,-24,-10,13,-12,8,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-5,-26,-21,-2,-17,-18,6,-23,21,16,-21,-27,-17,-18,-18,-6,5,-25,-8,-19;
MA   /M: SY='A'; M=20,-7,1,-11,-7,-22,1,-15,-19,-12,-21,-15,-2,-14,-5,-15,18,4,-9,-31,-21,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,7,-26,-2,-11,8,-17,16,-9,-6,-13,-9,16,-26,-6,-6,-7,-6,-19,-1,35,-11;
MA   /M: SY='A'; M=4,-19,-5,-23,-19,-9,-9,-20,-5,-18,-5,-1,-16,-23,-15,-18,-4,-5,0,-8,-10,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-23,-34,-27,18,-22,-23,20,-27,15,12,-20,-25,-25,-23,-18,-10,15,-14,3,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-29,-9,-36,-27,31,-29,-24,8,-28,12,3,-24,-29,-29,-22,-20,-10,7,2,9,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-22,0,-7,-16,1,-2,-17,-11,-18,-12,9,-16,-6,-12,4,0,-15,-27,-12,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-34,-26,19,-32,-23,25,-27,27,17,-25,-27,-24,-22,-22,-8,19,-16,4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=29,-11,-14,-17,-10,-19,2,-18,-10,-12,-10,-8,-9,-14,-8,-17,8,-1,-2,-23,-18,-9;
MA   /M: SY='N'; M=3,11,-17,3,-4,-17,-9,4,-16,-8,-17,-12,18,-15,-4,-8,10,9,-14,-32,-13,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-1,-25,-3,5,-27,-17,-9,-21,30,-23,-8,1,-13,8,16,-5,-7,-13,-22,-12,6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-20,23,-27,41,23,-28,-28,-19,-20,-26,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='K'; M=0,-1,-26,-1,13,-28,-11,-8,-26,22,-24,-12,-1,-10,10,14,-1,-7,-19,-23,-15,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-10,-25,-11,-1,-18,-10,-8,-11,-1,-9,-3,-7,-16,7,0,-4,-8,-12,-19,-7,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-10,-26,-11,-3,-18,-23,-9,-11,19,-14,-3,-8,-17,5,17,-9,-8,-5,-19,-4,0;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-3,-19,-2,-3,-18,-14,3,-19,1,-20,-11,3,-16,0,10,10,6,-9,-31,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,9,-24,12,17,-27,-15,-9,-26,14,-22,-16,2,-8,4,3,2,1,-18,-27,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-27,9,14,-27,-17,1,-23,11,-17,-8,1,-12,13,9,-3,-8,-20,-26,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-27,8,31,-26,-20,-2,-17,3,-16,-11,4,-7,18,-2,1,-4,-21,-28,-15,24;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-17,-21,-19,-6,-24,-9,14,-16,4,10,-11,-21,-14,-16,-7,2,17,-27,-5,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-23,-12,-3,-9,-21,-13,-17,16,-11,-6,-6,-16,-3,17,-7,1,-10,-19,-6,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01011;
//
ID   UPF0057_MP; MATRIX.
AC   MP01309;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0057 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9039822; R2=0.0134566; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=417; N_SCORE=10.505; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,22,-30,-23,-6,-23,-9,5,-16,8,36,-20,-26,-9,-16,-17,-10,4,-29,-9,-16;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='C'; M=0,-6,33,-9,-9,-12,-9,-12,-15,-12,-15,-12,-3,-15,-9,-12,9,3,-6,-27,-15,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-19,-27,-19,0,-20,-2,16,-11,13,45,-18,-20,-3,-11,-14,-7,10,-19,3,-11;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='A'; M=20,-3,-4,-10,-6,-18,-4,-13,-13,-8,-15,-12,0,0,-7,-14,7,0,-8,-24,-18,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-8,-20,-17,1,-19,-17,10,-17,4,7,-12,-18,-14,-16,-6,0,9,-20,-4,-16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-5,14,-19,10,2,-19,-8,-3,-21,-5,-21,-16,15,-13,-3,-6,12,15,-16,-33,-14,-1;
MA   /M: SY='C'; M=5,-14,16,-20,-16,-11,-17,-18,-8,-14,-6,1,-12,-21,-13,-16,0,2,0,-31,-15,-14;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-13,1,3,-22,-6,-9,-19,-5,-17,-8,0,-13,1,-8,8,2,-13,-30,-17,2;
MA   /M: SY='D'; M=-11,19,-25,26,6,-28,-13,-8,-22,0,-19,-15,6,-13,0,-6,0,-1,-14,-32,-15,3;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-16,-38,-29,23,-34,-25,23,-29,15,11,-22,-26,-26,-25,-21,-10,15,-7,7,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-27,-7,-32,-24,2,-32,-26,17,-26,13,6,-23,-15,-22,-24,-19,-8,11,-19,-5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-27,4,19,-20,-20,-5,-18,8,-7,-8,-2,-13,6,7,-9,-9,-18,-26,-12,12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-28,-22,-34,-28,8,-33,-24,33,-25,18,16,-23,-24,-22,-24,-17,-7,27,-18,3,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-37,-28,7,-36,-27,38,-28,23,17,-23,-24,-23,-26,-20,-8,27,-19,1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-4,-34,-26,8,-33,-25,21,-29,26,13,-25,-28,-23,-24,-22,-9,15,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='A'; M=38,-9,-1,-18,-10,-20,-3,-19,-13,-11,-14,-12,-8,-12,-10,-19,13,4,-2,-25,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-38,-29,11,-37,-28,39,-29,20,16,-22,-23,-24,-27,-20,-9,27,-18,2,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-23,-38,-28,42,-33,-23,18,-30,22,10,-22,-27,-30,-23,-22,-10,11,-5,15,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,11,-32,-22,24,-29,41,18,-28,-28,-22,-22,-27,-9,15,-19,1,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-39,-12,-2,-22,-21,-20,-19,-11,-27,-19,-20,82,-12,-20,-11,-10,-28,-27,-26,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-29,-18,-31,-24,4,-30,-25,26,-26,30,15,-28,-28,-23,-21,-20,-6,25,-23,-4,-24;
MA   /M: SY='G'; M=20,-11,-21,-15,-17,-24,35,-21,-23,-16,-19,-14,-6,-17,-17,-20,3,-11,-12,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-16,-36,-28,44,-21,-23,-7,-27,4,-4,-23,-30,-32,-21,-23,-14,-7,26,18,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-24,-31,-21,13,-30,-21,17,-25,33,15,-27,-27,-20,-18,-27,-11,7,-5,4,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-29,0,13,-26,-15,10,-28,17,-21,-11,1,-13,13,26,-5,-11,-23,-24,-9,11;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-20,-14,-9,-6,-17,-7,-17,9,-15,-7,-6,-20,-6,19,-6,-4,-8,-18,-2,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-29,-7,-16,-29,58,-17,-38,-12,-30,-19,4,-19,-16,-14,0,-18,-29,-21,-28,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-14,37,-18,-15,0,-24,-19,-14,-20,-7,-8,-15,-21,-20,-20,-11,-9,-8,-28,-11,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-13,36,-17,-16,0,-15,-15,-12,-15,-8,-9,-12,-19,-16,-14,-8,-7,-6,-6,-6,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,7,-21,3,-8,-23,17,-13,-26,-10,-23,-17,11,-15,-10,-11,10,8,-19,-29,-20,-9;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-16,-20,-15,-9,-18,-12,0,-8,-5,2,-13,-20,-11,-8,-4,-1,5,-17,-5,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-11,25,-28,35,24,-31,-13,12,-32,0,-25,-21,13,-6,6,-6,0,-9,-28,-35,-15,14;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-8,-34,-27,39,-30,-22,7,-27,17,5,-23,-30,-31,-20,-18,-5,10,-10,10,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-3,-29,-24,-33,-23,7,-24,-24,7,-24,16,4,-27,-26,-20,-22,-24,-13,0,22,5,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-29,43,-28,22,18,-23,-23,-22,-27,-20,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,24,19,13,-6,-23,-10,-3,-26,-9,-27,-21,31,-24,-9,-10,3,-4,-24,-43,-23,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-35,-26,6,-35,-26,33,-29,29,17,-24,-25,-22,-25,-23,-9,21,-20,0,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-9,-32,-24,4,-32,-24,24,-29,33,16,-27,-29,-22,-23,-24,-9,17,-24,-4,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,19,-30,47,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,22,-18,-17,-5,-23,-23,-14,-17,-11,-12,-7,-19,-18,-16,9,29,-3,-32,-12,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-11,-34,-25,8,-32,-25,23,-28,24,12,-23,-26,-22,-24,-20,-9,15,-20,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,15,-30,39,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01013;
//
ID   FXYD_MP; MATRIX.
AC   MP01310;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   FXYD family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3781562; R2=0.0152733; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=608; N_SCORE=14.654; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=74; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=14,-16,-13,-22,-15,-8,-14,-16,5,-14,5,11,-15,-18,-11,-16,-1,2,10,-24,-11,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-13,-10,-14,-10,4,-14,-8,8,-11,14,11,-13,-14,-7,-8,-11,-4,7,-10,0,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-8,-22,-5,-5,-25,-4,-18,-21,-11,-23,-17,-9,32,-11,-17,-1,-1,-20,-27,-24,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-16,-15,-17,-15,-4,-21,-20,5,-17,7,1,-17,-11,-17,-17,-6,5,10,-24,-9,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-19,-20,-14,-6,-20,-18,6,-19,11,6,-18,-7,-14,-17,-7,-2,5,-27,-11,-15;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-20,-2,3,-13,-17,-9,-10,-8,-4,-5,-6,-13,-2,-11,0,6,-8,-23,-6,0;
MA   /M: SY='A'; M=14,2,-19,-3,-3,-22,-11,-10,-10,-6,-11,-5,0,-12,3,-12,3,0,-8,-25,-15,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,6,-16,-1,-1,-19,-2,-8,-15,-8,-19,-14,14,-14,-4,-10,15,5,-12,-33,-19,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-1,5,-27,7,1,-29,4,-7,-27,-3,-25,-17,2,3,-1,-9,1,-7,-23,-28,-20,-1;
MA   /M: SY='P'; M=5,-7,-25,-6,-6,-23,-4,-18,-19,-11,-19,-15,-9,22,-11,-17,1,2,-16,-27,-22,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-16,5,8,-8,-11,-5,-14,0,-11,-10,3,-10,-1,-3,2,-2,-12,-20,-8,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=5,-5,-15,-5,-4,-15,-7,-10,-7,-1,-9,-2,-6,-6,-4,-6,-1,-4,-2,-19,-11,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-27,-4,12,-21,-17,-13,-18,1,-21,-15,-9,20,-2,-7,0,-5,-17,-27,-19,4;
MA   /M: SY='B'; M=-11,15,-28,15,12,-31,-3,4,-29,9,-27,-15,15,-13,14,3,0,-10,-28,-28,-16,13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-28,14,31,-27,-19,-4,-25,16,-20,-11,0,-6,11,5,-3,-6,-22,-28,-15,21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,7,-27,8,4,-25,-11,0,-17,-3,-20,-12,7,-2,1,-7,-2,-6,-18,-30,-15,1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,39,-25,51,14,-34,-7,-1,-34,-2,-30,-27,23,-11,0,-9,9,-3,-26,-40,-20,7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-5,-30,-19,-18,82,-8,-16,-10,-10,-29,-29,-28,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-13,-25,-15,-11,17,-26,16,-8,-11,-5,-3,-11,-23,-9,-9,-10,0,-11,5,43,-12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-35,-19,-17,17,-25,5,-9,-11,-8,-8,-20,-28,-11,-12,-22,-15,-18,53,55,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-27,8,21,-27,-18,15,-24,6,-20,-10,4,-10,19,2,0,-6,-24,-26,-7,20;
MA   /M: SY='T'; M=2,3,-11,-5,-7,-13,-13,-15,-13,-9,-17,-13,8,-11,-7,-9,24,38,-5,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,25,-27,36,17,-29,-29,-23,-21,-24,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,8,-28,-20,4,-26,22,-20,-6,0,-16,30,47,-6,-10,-24,-20,-10,16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-13,-23,-18,-13,-9,-27,-19,8,-2,2,4,-10,-18,-10,-6,-10,1,7,-24,-6,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-25,-12,-17,-23,38,-18,-26,-13,-23,-14,-4,-21,-16,-8,1,-12,-15,-23,-24,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-15,20,-25,43,29,-28,-28,-15,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-21,-31,-25,-1,-33,-27,32,-24,16,13,-19,-21,-20,-23,-12,3,26,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,7,-35,-28,32,-31,-24,6,-29,12,3,-23,-31,-32,-23,-18,-9,9,-14,6,-28;
MA   /M: SY='A'; M=36,-5,-15,-11,-9,-23,10,-18,-17,-11,-15,-13,-6,-12,-11,-19,8,-4,-7,-22,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=10,-11,-20,-15,-18,-21,27,-21,-19,-16,-17,-12,-6,-18,-18,-18,4,-2,-8,-23,-22,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,26,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,30,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=3,-25,-18,-28,-18,3,-23,-19,14,-25,35,16,-25,-25,-17,-19,-21,-8,8,-20,-4,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,6,-37,-28,54,-27,-22,-6,-28,3,-4,-19,-30,-36,-22,-16,-9,-2,-3,15,-28;
MA   /M: SY='I'; M=0,-26,-21,-32,-24,-1,-30,-26,30,-25,17,12,-21,-22,-20,-24,-13,-5,25,-23,-5,-24;
MA   /M: SY='V'; M=4,-23,-14,-26,-21,-1,-24,-23,15,-20,18,10,-23,-24,-20,-18,-10,2,21,-25,-8,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-31,-10,-18,-30,62,-20,-38,-19,-30,-20,-2,-10,-19,-20,-1,-19,-30,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-26,-34,-25,0,-34,-24,38,-27,19,20,-19,-20,-17,-25,-16,-7,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-26,-9,-31,-22,0,-28,-24,20,-27,26,12,-23,-25,-19,-24,-19,-8,12,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-25,-26,-33,-24,-3,-32,-15,33,-24,15,18,-18,-20,-16,-24,-16,-9,21,-22,-1,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01014;
//
ID   LGT_MP; MATRIX.
AC   MP01311;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Prolipoprotein diacylglyceryl transferase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.9609938; R2=0.0135580; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=10.754; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-21,-31,-24,15,-27,-19,15,-23,18,11,-24,-26,-21,-19,-18,-6,13,-5,9,-22;
MA   /M: SY='A'; M=13,-17,-6,-23,-16,-7,-14,-19,0,-18,9,4,-16,-20,-14,-19,-5,0,3,-23,-11,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,68,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,20,-10,0,-10,1,-9,-29,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-26,-20,-31,-23,19,-27,-19,15,-24,19,10,-21,-25,-22,-19,-17,-7,11,-12,7,-22;
MA   /M: SY='V'; M=3,-24,-10,-30,-25,-3,-22,-26,19,-23,7,6,-20,-23,-22,-24,-10,-6,21,-24,-9,-25;
MA   /M: SY='A'; M=33,-12,-13,-19,-13,-17,0,-21,-7,-13,-8,-8,-10,-13,-12,-19,7,2,1,-22,-18,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-27,-16,-8,-22,-19,-19,-8,-14,-17,-11,-17,46,-12,-20,-7,-7,-14,-29,-22,-14;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-9,-16,-14,-13,-7,-20,-6,-17,-6,-7,-11,-13,-15,-17,5,6,3,-29,-16,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-18,-31,-26,10,-27,-25,22,-24,15,9,-23,-25,-25,-22,-13,-4,24,-20,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-21,-30,-19,-11,-16,-16,-21,-2,-17,-5,-4,-19,28,-14,-21,-11,-9,-9,-25,-18,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-12,-32,-23,9,-30,-23,19,-27,24,12,-23,-24,-21,-23,-19,-7,12,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=15,-10,-23,-13,-17,-26,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,4,-12,-20,-20,-26,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-13,-25,-14,-1,-13,-22,-1,-4,-7,4,5,-13,-19,18,-5,-10,-9,-11,-13,5,8;
MA   /M: SY='A'; M=17,-16,-17,-22,-18,-5,2,-21,-6,-17,-4,-4,-13,-18,-18,-20,-1,-4,1,-18,-12,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-36,-26,23,-31,-22,24,-27,22,16,-22,-24,-23,-23,-20,-9,14,-12,7,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-12,-30,-13,-21,-27,58,-21,-31,-21,-25,-16,-2,-20,-20,-21,-2,-19,-24,-20,-27,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-33,-31,-37,-27,6,-29,-27,15,-26,12,5,-30,-27,-20,-23,-29,-17,4,40,10,-24;
MA   /M: SY='G'; M=8,-10,-27,-12,-18,-28,59,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-23,-39,-30,73,-29,-19,-1,-29,7,-1,-21,-30,-37,-20,-21,-11,-3,21,32,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-27,-21,-35,-26,24,-29,-20,21,-24,15,17,-21,-24,-23,-21,-17,-8,16,-12,6,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-9,37,-21,18,-1,-21,4,8,-21,-1,-30,-20,56,-20,-1,-1,9,-1,-30,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-3,-23,-5,0,-29,7,5,-25,-5,-21,-9,2,-15,16,-5,2,-10,-24,-23,-13,8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=3,-26,-18,-29,-21,2,-25,-22,19,-25,30,13,-25,-25,-19,-21,-18,-7,15,-21,-5,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-26,-30,-28,-23,26,-28,2,-1,-18,0,-2,-22,-29,-18,-15,-23,-14,-7,37,42,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-26,-9,-3,-19,-12,-8,-23,16,-18,-10,-4,-16,2,32,-6,-5,-14,-19,-11,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-29,-17,-6,-17,-22,-21,0,-13,-10,-6,-19,27,-12,-19,-9,-8,-3,-26,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-8,-10,-14,-13,-10,-19,-20,-1,-14,-5,-4,-7,-15,-13,-14,10,25,7,-30,-11,-13;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='S'; M=-1,6,-16,3,1,-17,-10,-4,-16,-5,-19,-13,8,-4,-1,-7,12,11,-13,-28,-13,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-18,-19,-14,-1,-18,-11,3,-12,7,7,-13,-21,-9,-8,-7,-1,4,-18,1,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-9,-31,-4,2,-27,-10,-15,-21,-6,-25,-17,-9,43,-6,-14,-2,-6,-24,-29,-24,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-27,-37,-30,-23,14,-19,-21,-12,-18,-12,-11,-24,-26,-16,-17,-25,-18,-19,73,19,-16;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=11,-9,-21,-13,-12,-19,17,-15,-18,-11,-13,-10,-4,-17,-12,-14,1,-8,-12,-21,-17,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-17,-29,-21,17,-25,-16,17,-20,21,19,-21,-23,-18,-15,-18,-7,13,-13,4,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-15,-24,-18,-10,-2,-22,-5,5,-12,0,2,-11,-11,-9,-11,-10,-8,1,-16,2,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-18,-20,-24,-17,25,-25,-15,7,-19,8,4,-13,-22,-17,-15,-13,-7,4,-9,8,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-31,-9,-4,-18,-15,-14,-15,-9,-21,-14,-13,49,-10,-16,-8,-8,-21,-23,-18,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-4,4,-24,0,-3,-21,6,-4,-20,-6,-19,-12,10,-15,-2,-7,3,-4,-19,-27,-15,-3;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-20,-14,-7,-15,-2,-16,-13,-10,-14,-9,-8,-9,-8,-12,4,-3,-7,-18,-15,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01015;
//
ID   SECA_MP; MATRIX.
AC   MP01312;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SecA family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8138118; R2=0.0142856; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=856; N_SCORE=17.032; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=119; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=8,3,-20,3,18,-23,-13,-10,-21,1,-17,-15,-1,-7,3,-4,8,6,-14,-28,-17,11;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-1,-29,-1,12,-26,-19,1,-27,25,-22,-10,4,-14,20,41,-6,-9,-24,-22,-12,14;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-25,8,26,-20,-19,-5,-21,4,-14,-13,-1,-10,8,3,-2,-5,-18,-27,-14,17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-36,-30,0,-36,-30,41,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,39,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-13,-16,-7,-21,-5,-18,-13,0,-13,-10,-7,-10,-7,-11,8,3,-3,-21,-17,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,12,-30,18,25,-36,-18,12,-27,9,-23,-11,5,-9,33,5,-1,-11,-29,-27,-12,29;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-10,-19,-10,-20,0,-20,-10,-10,-11,-10,-9,-10,-10,-20,11,1,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-9,3,-17,-21,-5,-18,19,-12,-5,-6,-17,7,29,-10,-9,-13,-18,-5,3;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-12,-30,-11,-2,-12,-23,-9,-18,17,-15,-7,-10,1,-2,15,-13,-10,-15,-15,-1,-4;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-29,-11,-18,-24,52,-16,-34,-15,-26,-17,-2,-20,-17,-17,-2,-17,-26,-15,-18,-18;
MA   /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-15,-8,-19,-2,-18,-12,-10,-14,-12,-5,-10,-8,-17,17,9,-2,-25,-19,-8;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-33,-30,0,-33,-30,35,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,45,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-10,-11,-11,-9,-21,-21,-7,-11,-9,-9,-2,-11,-11,-11,18,46,4,-30,-10,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,36,-21,18,2,-22,-2,10,-20,1,-29,-18,53,-19,7,1,9,-1,-30,-38,-19,4;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-10,-12,-12,-9,-21,-21,-6,-11,-8,-8,-3,-12,-12,-11,17,45,5,-30,-10,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-15,-26,-18,-8,-16,-26,-14,2,8,-5,5,-11,-18,1,10,-12,-9,3,-21,-7,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-28,-10,-19,-28,61,-20,-37,-19,-28,-19,0,-19,-19,-19,2,-13,-27,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,2,-5,-31,50,-15,-39,-14,-29,-21,2,-16,-13,-16,0,-18,-30,-23,-28,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-4,21,-20,11,3,-22,8,0,-24,-4,-29,-20,34,-16,-1,-5,15,1,-25,-36,-21,1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-15,-25,-14,-13,-13,-23,-22,3,-16,-6,-5,-17,6,-16,-19,-9,-3,4,-18,-13,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-29,13,30,-31,-19,-2,-22,8,-19,-12,0,-7,20,0,-2,-9,-23,-27,-15,25;
MA   /M: SY='F'; M=-2,-11,-22,-14,-1,4,-21,-10,-1,-11,-1,4,-12,-16,-8,-14,-9,-8,-2,-15,0,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-8,-24,-7,0,-12,-21,-9,-6,-2,8,7,-12,-18,-3,0,-14,-9,-6,-23,-8,-2;
MA   /M: SY='A'; M=12,-16,-19,-19,-17,-14,4,-9,-6,-17,-4,-3,-12,-20,-15,-18,-4,-8,1,-23,-13,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-28,5,4,-22,4,-7,-30,6,-23,-16,4,-15,0,8,-3,-11,-23,-23,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-22,-11,-2,-14,-20,-10,-9,1,2,-1,-7,-17,2,4,-9,-3,-9,-23,-9,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-11,-24,-11,-6,-2,-19,-8,-8,-5,-6,-5,-13,-19,-8,-8,-9,-7,-5,-2,10,-8;
MA   /M: SY='L'; M=0,-18,-20,-22,-13,-5,-24,-19,11,-14,15,6,-16,-22,-13,-11,-14,-7,9,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-25,-10,-1,-13,-21,-8,-6,0,-7,-4,0,-16,1,5,-5,0,-8,-21,-4,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-27,-7,-1,-21,1,-13,-11,-11,-10,-7,-3,-9,-2,-14,-5,-11,-14,-24,-17,-3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01016;
//
ID   LIPB_MP; MATRIX.
AC   MP01313;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lipoate-protein ligase B signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1236997; R2=0.0144644; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; N_SCORE=11.883; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-25,4,18,-22,-15,1,-22,2,-16,-13,-1,-3,6,-1,-2,-8,-21,-27,-13,11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-13,0,3,-2,-3,-6,-11,-4,-8,-7,-1,-8,-4,-4,0,-3,-9,-12,-5,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-8,-20,-6,-5,-7,-23,-13,-3,-14,6,-1,-11,-15,-9,-13,-12,-7,-4,-22,-7,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-22,-23,-15,2,-27,-15,9,-17,21,9,-22,-19,-15,-12,-19,-7,6,-19,1,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-3,1,-22,-3,-4,-13,-14,-8,-10,-6,-12,-7,4,-11,-4,-7,-1,-2,-10,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-6,0,-25,1,4,-19,-13,-7,-19,-1,-21,-14,2,7,-1,-4,2,-2,-18,-27,-14,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-7,1,-25,1,-2,-20,-6,-6,-19,-5,-19,-12,2,-3,-4,-7,0,-3,-17,-22,-13,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-8,5,-27,6,-2,-25,11,-8,-27,-4,-20,-16,7,-10,-6,-3,-2,-10,-23,-28,-20,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-23,-23,-30,-22,7,-27,-23,20,-23,9,7,-18,-16,-20,-23,-13,-6,14,-17,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-34,2,11,-29,-18,-13,-23,-1,-27,-19,-8,49,-1,-10,-5,-8,-28,-30,-25,2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-31,-27,6,-31,-27,27,-24,20,12,-27,-27,-26,-21,-16,-3,33,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-23,-21,-26,-23,11,-30,0,15,-19,6,7,-19,-26,-19,-17,-15,-8,16,-12,18,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-3,-28,-2,9,-22,-17,0,-23,13,-20,-10,-1,-10,14,16,-3,-7,-21,-15,-6,10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-15,-12,-21,-18,-8,-22,-23,10,-17,-2,0,-11,-17,-16,-18,5,15,17,-28,-11,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-28,32,18,-32,0,-4,-32,-1,-25,-22,12,-11,3,-8,1,-9,-27,-33,-20,11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,11,-30,16,22,-33,-18,5,-27,13,-22,-11,4,-10,27,10,-3,-10,-27,-25,-12,24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-21,-31,-26,6,-31,-22,27,-22,11,11,-23,-25,-22,-21,-15,-5,27,-14,5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-24,-24,-21,29,-28,11,-5,-15,-3,-3,-20,-29,-15,-13,-20,-12,-12,31,57,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-25,-10,-17,-24,51,-19,-33,-19,-23,-15,-3,-20,-18,-19,-2,-17,-24,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-10,0,-27,-20,-17,-19,-10,-27,-18,-19,81,-10,-19,-10,-10,-28,-28,-25,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-19,-30,66,-16,-39,-20,-30,-19,0,-20,-19,-19,0,-19,-30,-21,-28,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-23,-24,-14,-4,-26,-16,9,-13,19,10,-19,-24,-8,-2,-19,-9,5,-18,-4,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-15,-32,-29,0,-32,-29,33,-22,14,13,-27,-27,-26,-22,-13,-1,41,-27,-7,-28;
MA   /M: SY='A'; M=8,-19,-17,-24,-20,-11,-1,-21,4,-19,1,4,-15,-20,-17,-21,-6,-7,7,-23,-14,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-23,-24,-22,-15,-3,-24,-22,2,-18,-3,-3,-20,17,-19,-20,-12,-6,1,-22,-12,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-23,-33,-25,3,-32,-19,32,-25,27,25,-24,-24,-17,-22,-22,-9,21,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-18,-33,-25,17,-31,-22,22,-27,29,16,-25,-27,-23,-21,-22,-7,16,-17,3,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-27,42,11,-30,-9,6,-32,1,-28,-23,25,-10,0,-3,2,-7,-28,-37,-17,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-31,-22,9,-31,-22,25,-29,43,19,-28,-29,-21,-21,-27,-9,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-3,-27,-3,4,-24,-10,-6,-27,20,-23,-12,1,-12,7,23,-3,-7,-20,-22,-13,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-6,2,-21,-17,-3,-24,18,-19,-10,1,-16,6,32,-4,-6,-17,-21,-10,1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-15,-28,-16,-9,-5,-21,0,-11,-1,-6,-3,-9,-10,-5,13,-13,-10,-11,-14,0,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-26,-7,-5,-22,1,-10,-21,8,-20,-10,3,-15,-1,9,-5,-10,-17,-23,-15,-4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: M=-8,-9,-18,-12,-8,-12,-16,-11,-10,-3,-5,-2,-7,-16,-6,-1,-9,-5,-9,-19,-7,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-9,13,-24,17,-1,-23,2,-8,-24,-5,-21,-16,8,-16,-7,-7,1,-5,-16,-30,-16,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,-19,-28,-22,1,-25,-23,19,-21,14,8,-24,-20,-22,-19,-14,-5,23,-22,-5,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-27,-3,-1,-20,-15,4,-24,13,-18,-10,2,-14,3,29,-6,-8,-18,-24,-10,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-1,-27,1,2,-13,-16,-5,-21,1,-18,-14,-2,-16,-1,2,-5,-7,-19,-3,-1,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01017;
//
ID   UPF0047_MP; MATRIX.
AC   MP01314;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0047 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0611715; R2=0.0144011; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=839; N_SCORE=17.134; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-2,-23,2,6,-10,-18,-6,-11,-9,1,-7,-9,-16,-4,-12,-9,-8,-11,-18,1,0;
MA   /M: SY='D'; M=-9,22,-27,29,2,-33,22,-8,-36,-8,-30,-24,15,-15,-7,-13,5,-10,-28,-33,-24,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-16,38,-26,39,9,-29,-8,20,-31,-2,-28,-21,34,-16,2,-4,2,-8,-30,-38,-14,4;
MA   /M: SY='M'; M=5,-12,-18,-20,-15,-11,0,-10,-2,-12,-2,19,-10,-16,-6,-13,-1,0,-1,-23,-11,-11;
MA   /M: SY='P'; M=4,2,-29,9,3,-30,-12,-14,-23,-7,-25,-20,-6,35,-7,-17,-2,-7,-22,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='A'; M=28,2,-13,0,-2,-23,-2,-14,-18,-8,-19,-16,0,-10,-6,-16,17,4,-8,-29,-20,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-34,-25,3,-33,-23,34,-27,29,24,-24,-24,-19,-23,-22,-9,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-7,-28,-7,3,-21,-22,-9,-22,33,-15,-5,-5,-15,5,31,-13,-10,-15,-20,-8,3;
MA   /M: SY='S'; M=14,-5,-15,-5,-2,-22,-3,-13,-18,-10,-26,-18,2,6,-3,-13,27,12,-11,-35,-22,-3;
MA   /M: SY='S'; M=20,-6,-10,-9,-6,-17,-4,-16,-12,-11,-19,-14,0,-12,-6,-14,25,15,-1,-32,-18,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-18,-29,-21,17,-28,-19,14,-25,30,17,-24,-27,-21,-18,-20,-2,11,-17,3,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-16,-28,-23,2,-30,-25,23,-23,23,12,-25,-26,-22,-20,-14,2,26,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-9,-27,-10,-14,-28,46,-19,-34,-8,-27,-17,-2,-17,-14,-13,0,-15,-24,-20,-26,-14;
MA   /M: SY='P'; M=1,-8,-7,-12,-11,-19,-10,-19,-14,-13,-18,-13,-6,9,-14,-17,2,7,-9,-31,-21,-14;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-22,-14,1,-13,-26,-11,3,-10,9,6,-17,-20,7,-8,-12,-7,2,-24,-8,4;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-9,-16,-13,-12,-9,-23,9,-4,-14,-3,0,-6,-19,-10,-10,1,16,3,-29,-1,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-32,-28,2,-32,-28,33,-24,21,14,-28,-28,-26,-22,-16,-4,37,-26,-6,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-22,-38,-16,-6,-24,-24,-22,-5,-14,-19,-11,-20,66,-12,-22,-12,-10,-17,-28,-24,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-6,-22,-5,6,-18,-20,-1,-11,1,-14,-7,-3,-14,0,2,2,1,-5,-29,-10,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,21,-24,14,2,-27,6,0,-26,2,-29,-18,30,-16,4,-1,7,-4,-27,-33,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-28,-5,6,-26,-18,-2,-28,29,-24,-9,1,-15,17,42,-4,-7,-21,-22,-11,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-26,-26,-16,-2,-28,-19,13,-23,24,13,-26,3,-16,-20,-23,-10,2,-23,-8,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-9,-23,-10,-7,-17,-7,-12,-5,-14,0,-1,-8,-18,1,-13,-5,-7,-8,-24,-12,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,8,-29,-20,17,-28,44,17,-27,-28,-19,-19,-25,-4,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-25,1,-9,-28,36,-14,-34,-11,-29,-20,4,-17,-10,-8,9,-8,-24,-27,-25,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-28,-27,-31,-23,28,-27,-16,0,-20,3,-1,-24,-28,-19,-16,-21,-12,-2,29,23,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,38,-30,-20,12,-30,34,12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,6,-8,12,-24;
MA   /M: SY='A'; M=9,-20,-6,-25,-21,-12,0,-24,-11,-19,-8,-9,-18,-23,-20,-21,-8,-10,-3,-1,-13,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-20,-23,-24,-17,29,-27,22,-6,-23,9,5,-12,-27,-18,-13,-19,-13,-8,-11,19,-17;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,2,-17,-1,0,-12,-9,2,-17,13,-14,-8,9,-12,4,31,-3,-4,-14,-15,-8,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-7,-18,-9,0,-14,-16,-3,1,0,-4,3,-4,-9,15,4,-5,-6,-5,-12,-4,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-19,26,-30,37,13,-33,-14,21,-34,3,-26,-18,13,-13,10,6,-3,-12,-29,-33,-9,10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-21,-3,-12,-21,42,-10,-27,-12,-23,-15,9,-15,-12,-12,2,-12,-23,-18,-21,-12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,-2,-20,-24,-12,-30,-20,-16,68,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-19,-4,0,-13,-13,25,-19,9,-13,-4,2,-13,6,28,-6,-9,-15,-15,1,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-17,-2,1,-19,-11,-6,-16,-1,-19,-11,5,0,7,2,11,11,-14,-26,-13,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-26,-2,13,-21,-20,-5,-26,18,-19,-12,0,-12,8,31,-1,3,-18,-25,-12,9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-4,-30,-25,3,-29,-26,20,-24,4,5,-18,-24,-22,-23,-7,-3,21,-26,-6,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-23,-24,-25,-22,9,-30,-6,12,-10,3,5,-20,-27,-14,-4,-16,-7,12,-3,27,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01018;
//
ID   CDS_MP; MATRIX.
AC   MP01315;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphatidate cytidylyltransferase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2908592; R2=0.0154437; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=895; N_SCORE=19.103; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=79; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,-9,-19,-14,-13,-19,11,-19,-11,-16,-17,-11,-2,-14,-11,-18,12,3,-6,-27,-19,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-23,-5,-28,-22,15,-26,-22,6,-24,15,4,-20,-25,-24,-20,-12,1,9,-19,-1,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-23,-17,-29,-22,23,-27,-22,10,-24,18,6,-20,-24,-24,-19,-13,3,10,-14,5,-22;
MA   /M: SY='V'; M=11,-21,-16,-26,-20,-2,-16,-23,10,-20,9,3,-18,-21,-19,-21,-7,-2,13,-21,-8,-20;
MA   /M: SY='S'; M=14,-10,-13,-12,-10,-15,-1,-17,-9,-14,-13,-10,-5,-16,-10,-15,17,7,1,-31,-18,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-21,-32,-24,11,-31,-24,25,-27,24,13,-22,-24,-22,-23,-18,-4,18,-18,1,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-17,-30,-24,14,-27,-23,18,-21,9,11,-19,-23,-23,-19,-9,1,21,-19,0,-24;
MA   /M: SY='A'; M=20,-4,-17,-8,-9,-23,19,-17,-23,-12,-21,-16,0,-13,-10,-17,14,1,-13,-26,-22,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-19,-25,-19,-10,-13,-25,-17,4,-13,-5,0,-17,7,-3,-15,-8,-4,2,-24,-12,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-25,-13,-30,-23,24,-17,-21,3,-26,15,3,-20,-27,-26,-21,-16,-9,3,-12,3,-23;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,35,-30,50,10,-38,10,-5,-40,-5,-30,-28,15,-12,-5,-12,0,-12,-30,-35,-22,3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-32,-23,28,-30,-18,15,-28,33,13,-26,-30,-25,-20,-25,-10,9,-9,13,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-23,-16,-30,-24,38,-27,-20,4,-23,8,1,-18,-25,-29,-18,-10,3,9,-7,13,-24;
MA   /M: SY='E'; M=4,-4,-24,-5,19,-13,-18,-10,-13,0,-10,-8,-7,-9,2,-7,-3,-8,-12,-22,-12,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=1,-16,-24,-21,-17,1,0,-6,-9,-13,-6,3,-14,-21,-9,-14,-10,-11,-10,2,11,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-30,-21,-36,-27,31,-32,-22,21,-28,23,14,-24,-27,-27,-22,-22,-9,15,-10,10,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=0,4,-24,5,9,-25,-15,5,-20,2,-14,-8,-1,-12,10,-3,-2,-7,-17,-25,-10,9;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-23,-19,-28,-22,29,-25,-15,7,-21,6,1,-17,-25,-23,-18,-9,-2,7,-6,17,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-4,0,-28,-1,-7,-29,31,-13,-34,3,-30,-17,6,-16,-8,-3,0,-13,-26,-23,-22,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-22,-33,-26,-3,-33,-28,35,-20,12,13,-22,-22,-21,-22,-14,-6,32,-23,-5,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-14,-15,-19,-14,23,-14,-14,-9,-18,-10,-7,-5,-19,-17,-14,11,5,-5,-18,2,-13;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-24,-8,-14,-27,48,-17,-33,-17,-29,-20,2,-17,-14,-17,11,-8,-23,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-14,14,-28,12,10,-27,-14,12,-28,17,-26,-13,18,-14,12,17,-2,-9,-26,-29,-11,10;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-23,-18,-27,-20,0,-26,-22,20,-23,21,12,-21,-23,-18,-20,-12,0,17,-24,-5,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-25,-35,-25,11,-35,-25,32,-30,33,18,-25,-25,-22,-25,-25,-10,18,-18,2,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,-3,-29,-3,-19,-23,-12,-30,-20,-14,64,-11,-19,-5,-10,-29,-29,-29,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-30,-7,-11,-30,54,-17,-38,-11,-29,-19,0,-17,-14,-14,-1,-18,-29,-21,-27,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-21,-35,-28,8,-33,-25,33,-25,20,19,-25,-25,-23,-23,-18,-7,29,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-18,-26,-18,3,-25,-17,13,-22,32,20,-22,-24,-14,-17,-18,0,8,-22,-3,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-28,-21,-36,-27,35,-31,-21,18,-26,17,13,-21,-26,-27,-21,-18,-6,13,-8,12,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=7,-7,19,-11,-11,-22,4,-17,-25,-17,-26,-19,-1,-19,-11,-17,19,5,-12,-38,-24,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-19,-23,-21,-10,-1,-26,-10,8,-16,14,11,-16,-21,2,-12,-13,-7,-1,-18,1,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-17,-26,-21,5,-26,-20,16,-21,14,11,-19,-23,-19,-18,-9,3,18,-22,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-26,-19,-32,-22,31,-24,-21,5,-25,15,3,-21,-19,-27,-20,-16,-8,4,-8,7,-23;
MA   /M: SY='M'; M=7,-14,-15,-20,-16,-8,-13,-17,4,-15,2,8,-12,-17,-11,-16,2,7,8,-26,-11,-14;
MA   /M: SY='A'; M=30,-16,-15,-24,-16,-14,-5,-22,2,-15,-2,-1,-13,-15,-14,-21,1,-4,7,-21,-16,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-27,-14,-7,-19,-19,-20,-7,-13,-16,-11,-15,37,-12,-18,-1,2,-9,-30,-21,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-27,-17,-33,-26,33,-27,-23,12,-25,13,5,-22,-27,-30,-20,-14,-5,17,-11,8,-26;
MA   /M: SY='F'; M=1,-24,-16,-30,-22,25,-22,-21,6,-23,14,3,-20,-25,-25,-20,-12,-5,9,-12,4,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-13,-24,-18,-16,20,-19,6,-8,-14,-7,-4,-6,-24,-13,-12,-8,-7,-11,7,28,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-16,-30,-25,13,-30,-19,18,-23,14,8,-22,-26,-22,-21,-15,-3,17,-13,10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-27,-24,-30,-25,28,-32,-9,15,-22,16,8,-23,-28,-22,-18,-21,-9,9,2,32,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-19,-24,-23,-19,3,-23,0,11,-21,13,12,-13,-24,-13,-17,-16,-10,4,-18,7,-18;
MA   /M: M=-3,-15,-10,-18,-12,-7,-17,-13,-7,-11,-6,-5,-11,-20,-10,-10,-4,-1,-3,-16,-4,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01019;
//
ID   ATP_P_PHORIBOSYLTR_MP; MATRIX.
AC   MP01316;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   ATP phosphoribosyltransferase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.2929974; R2=0.0151584; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=527; N_SCORE=13.271; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=80; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-24,6,13,-24,-12,2,-22,5,-19,-13,5,-12,6,3,2,-4,-18,-29,-14,9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-23,-6,1,-17,-17,-3,-14,12,-9,-4,-2,-15,5,14,-7,-7,-11,-21,-8,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,1,-28,1,-10,-29,44,-13,-35,-12,-28,-20,6,-17,-12,-15,2,-15,-27,-24,-26,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-24,-27,-17,-4,-31,-22,23,-17,13,12,-21,-22,-13,-16,-16,-8,18,-18,-4,-17;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,7,-25,7,8,-27,-13,0,-22,2,-23,-14,6,1,9,-2,4,-1,-21,-30,-15,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-11,-25,-21,0,-21,-20,10,-16,2,1,-19,-23,-20,-18,-4,3,20,-18,0,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-13,13,-28,19,29,-29,-17,0,-29,13,-23,-17,7,-8,13,12,-1,-6,-26,-29,-16,20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-20,-32,-26,-1,-33,-27,33,-25,17,13,-21,-24,-22,-24,-14,-4,29,-24,-5,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-24,-14,-29,-23,-5,-32,-23,25,-18,8,10,-19,-23,-17,-18,-13,-5,24,-25,-5,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-4,-28,-2,9,-14,-21,1,-21,16,-18,-8,-4,-9,4,11,-8,-8,-18,-18,0,5;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-26,-18,-27,-20,3,-27,-21,20,-25,28,13,-23,-26,-19,-20,-16,-4,16,-25,-5,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-5,2,-22,0,-2,-12,-8,1,-18,-7,-18,-13,5,-17,-2,-8,7,2,-17,-16,3,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=23,-1,-11,-6,-4,-20,0,-13,-16,-9,-23,-16,5,-11,-4,-13,27,12,-7,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-21,-11,-27,-24,-3,-27,-24,20,-18,7,12,-20,-23,-20,-18,-5,7,29,-27,-8,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=2,-24,-19,-28,-21,-3,-16,-23,15,-24,20,10,-21,-24,-19,-21,-15,-7,13,-22,-8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=29,-8,-13,-15,-9,-18,1,-17,-12,-9,-12,-7,-6,-12,-8,-15,11,4,-3,-24,-18,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-21,-19,-16,-8,-24,-22,-23,-12,-14,-22,-14,-21,55,-15,-21,-10,-8,-15,-31,-26,-15;
MA   /M: SY='L'; M=2,-16,-20,-20,-11,-8,-19,-12,0,-9,4,2,-13,-20,-7,-4,-8,-5,2,-21,-7,-10;
MA   /M: SY='L'; M=2,-20,-17,-24,-17,-2,-24,-22,15,-20,17,8,-18,-22,-17,-19,-10,1,16,-24,-7,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-30,-4,-17,-30,63,-18,-39,-18,-30,-21,3,-19,-18,-19,0,-19,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-18,-29,-21,2,-27,-22,21,-24,27,16,-24,-25,-18,-20,-17,-3,18,-23,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=42,-9,-11,-17,-9,-21,4,-19,-13,-11,-14,-12,-7,-11,-9,-19,13,2,-3,-23,-21,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-30,57,25,-37,-10,0,-38,1,-28,-28,16,-9,3,-8,0,-10,-29,-37,-19,14;
MA   /M: SY='A'; M=27,-15,-13,-21,-13,-13,-7,-19,-4,-11,-1,-2,-14,-16,-12,-14,-1,-4,3,-20,-14,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-28,-39,-30,0,-39,-30,48,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,32,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='V'; M=3,-26,-2,-30,-27,-3,-27,-28,21,-21,7,6,-25,-27,-26,-22,-9,-2,35,-29,-11,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,49,-30,68,21,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,19,-10,1,-10,0,-10,-30,-40,-20,11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-33,-26,4,-33,-26,32,-28,31,18,-27,-27,-22,-23,-22,-8,26,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='V'; M=0,-22,-9,-25,-24,-3,-26,-25,19,-17,5,8,-22,-25,-23,-17,-3,10,34,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-19,9,18,-25,-6,-7,-24,-3,-24,-19,5,-7,7,-7,20,7,-18,-34,-19,12;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=2,1,-19,-3,4,-20,-10,-9,-20,2,-19,-13,5,-12,2,6,10,10,-13,-28,-16,2;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,8,-29,-18,22,-27,44,26,-28,-28,-17,-19,-28,-10,11,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-6,7,-23,-18,-5,-25,27,-20,-10,-2,-14,10,37,-6,-8,-17,-22,-12,6;
MA   /M: SY='A'; M=20,-6,-18,-9,4,-20,-11,-13,-10,-6,-7,-6,-8,-11,0,-13,2,-4,-6,-24,-16,2;
MA   /M: SY='N'; M=-4,27,-20,12,-1,-21,-3,19,-20,-3,-26,-15,42,-18,2,-2,7,-3,-26,-36,-14,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-2,-29,-3,-12,-28,40,1,-36,-11,-28,-16,7,-19,-10,-6,-2,-17,-29,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-11,-23,-11,-1,-18,-22,-14,-7,14,-12,-2,-10,-16,-2,9,-8,-6,2,-23,-10,-2;
MA   /M: SY='E'; M=0,-11,-25,-9,5,-18,-22,-17,-1,-9,-8,-6,-13,4,-6,-15,-5,-6,-1,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-26,-21,-30,-24,8,-32,-23,25,-24,18,12,-22,-25,-21,-21,-17,-6,22,-19,1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-2,13,-25,20,27,-29,-6,-6,-28,0,-22,-20,4,-7,6,-7,5,-5,-23,-31,-20,16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-22,8,12,-20,-20,-6,-15,-1,-13,-11,-2,-11,0,-5,1,5,-8,-29,-12,6;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-23,-32,-26,-3,-25,-26,28,-25,14,12,-22,-18,-21,-24,-16,-8,24,-23,-7,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-15,-28,-21,12,-23,-14,10,-21,18,16,-22,-26,-17,-17,-18,-8,7,-13,5,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-9,0,-17,4,9,-21,-19,-2,-17,-3,-15,-11,-3,-7,0,-5,-1,-4,-14,-30,-13,4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-17,-12,-11,-11,-18,-12,1,-15,-7,-4,-4,-16,-8,-15,11,13,4,-30,-9,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01020;
//
ID   SSRP_MP; MATRIX.
AC   MP01317;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SsrA-binding protein.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6974902; R2=0.0134831; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=646; N_SCORE=13.398; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=134; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-5,-30,-4,6,-26,-20,-7,-30,40,-26,-10,-1,-10,9,44,-10,-10,-20,-20,-11,5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-29,-1,8,-27,-20,-5,-29,39,-27,-10,0,-12,11,34,-8,-8,-20,-21,-9,8;
MA   /M: SY='A'; M=47,-10,-11,-20,-11,-20,2,-20,-11,-11,-10,-10,-10,-11,-11,-20,9,-1,-1,-20,-20,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-26,-14,-6,-1,-22,-2,-17,10,-10,-5,-5,-20,-1,26,-11,-6,-14,-12,4,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-15,-26,-19,-15,26,-25,36,-13,-17,-5,0,-7,-25,-13,-7,-15,-14,-14,-6,30,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-14,35,-27,40,19,-31,-10,2,-30,2,-27,-23,26,-12,5,-3,3,-7,-28,-37,-19,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,34,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,76,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-24,-5,12,5,-20,3,-18,-6,-11,-10,-4,-14,-3,-6,-3,-5,-16,-17,1,5;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-25,-37,-28,3,-36,-28,41,-29,25,18,-23,-24,-22,-26,-21,-9,29,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-11,-25,-8,11,-11,-25,-12,0,-10,11,2,-14,-16,-2,-11,-14,-9,-5,-25,-9,4;
MA   /M: SY='E'; M=-13,22,-29,34,38,-33,-16,0,-32,8,-24,-22,7,-5,14,-2,1,-8,-28,-33,-19,26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-2,-20,-5,-1,-15,-18,-13,-16,6,-15,-10,0,-13,-3,8,5,15,-8,-26,-11,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-25,-29,-23,32,-30,-4,8,-21,13,6,-22,-28,-20,-16,-22,-10,1,11,38,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-23,17,48,-30,-20,-2,-29,8,-20,-18,0,-3,18,-1,1,-7,-28,-30,-19,33;
MA   /M: SY='A'; M=41,-11,5,-20,-12,-20,-4,-21,-13,-12,-12,-11,-10,-13,-12,-21,9,1,-1,-24,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-35,-26,3,-34,-24,37,-27,28,23,-24,-24,-19,-24,-22,-9,23,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=7,-16,-14,-17,-9,-11,-20,-19,8,-11,-2,2,-17,-19,-12,-14,-1,-1,19,-28,-13,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-7,-22,-8,4,-17,-21,-7,-9,2,-5,1,-7,-15,8,0,-3,1,-8,-24,-8,5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-13,-24,-16,-13,-8,-15,-20,-15,-13,-19,-16,-10,-11,-11,-14,5,13,-13,21,-2,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,11,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-4,-2,-20,0,-12,-18,-10,-26,-18,6,-10,-2,-12,34,16,-8,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-29,-23,-34,-25,4,-33,-25,33,-28,30,20,-25,-25,-20,-24,-22,-9,23,-21,-2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,0,-20,-19,1,-29,27,-20,-10,0,-19,10,61,-7,-9,-19,-21,-10,1;
MA   /M: SY='A'; M=11,0,-17,-4,1,-20,-9,-10,-13,-7,-9,-8,1,-14,0,-10,1,-4,-11,-26,-16,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-28,-7,-14,-28,46,-8,-35,-12,-28,-17,5,-19,-12,-12,0,-16,-27,-22,-23,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-28,0,5,-26,-13,1,-29,27,-25,-11,4,-14,10,29,-5,-8,-22,-23,-11,6;
MA   /M: SY='V'; M=14,-20,-13,-25,-21,-11,-8,-24,8,-18,0,1,-17,-21,-20,-21,-3,-4,17,-24,-15,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,22,-18,12,2,-23,-2,2,-21,-2,-28,-18,35,-15,6,-2,17,5,-23,-37,-19,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24,12,-33,-23,28,-30,37,19,-26,-27,-21,-23,-26,-10,16,-18,2,-24;
MA   /M: SY='K'; M=1,-4,-21,-6,-3,-20,-10,-13,-16,7,-17,-10,-1,-12,-4,3,2,0,-8,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-15,34,-29,47,30,-35,-9,0,-35,3,-27,-26,15,-8,6,-6,1,-10,-30,-36,-20,18;
MA   /M: SY='S'; M=21,-5,-11,-9,-7,-21,9,-15,-19,-12,-22,-16,2,-12,-7,-15,22,8,-9,-30,-21,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-26,-26,-22,45,-29,10,-2,-17,2,0,-18,-29,-19,-13,-19,-11,-8,19,59,-22;
MA   /M: SY='V'; M=15,-22,-2,-28,-23,-9,-21,-26,14,-19,2,2,-20,-22,-21,-23,-5,-3,23,-26,-14,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-23,-14,-7,-1,-22,-6,-5,-6,-3,-1,-9,-19,-4,-1,-7,-3,-5,-16,4,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-23,-30,-23,14,-32,-23,25,-24,14,11,-19,-24,-22,-22,-17,-8,19,-16,2,-23;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01021;
//
ID   UPF0066_MP; MATRIX.
AC   MP01318;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0066 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6651530; R2=0.0136123; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=319; N_SCORE=9.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=135; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-13,-28,-15,-5,-4,-22,-3,-25,20,-15,-8,-3,-22,2,56,-12,-10,-17,-15,-4,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,40,-28,51,15,-35,-10,0,-35,8,-30,-25,23,-12,2,-2,0,-8,-28,-37,-18,8;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-19,-25,-23,-16,-13,-19,-18,10,-7,-2,4,-13,-20,-7,-3,-10,-8,10,-22,-9,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-22,-26,-18,1,-28,-22,14,-25,30,11,-28,-9,-20,-20,-23,-8,9,-23,-7,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-12,-21,-15,-6,-12,-21,-14,-9,6,2,-1,-10,-18,-5,8,-9,2,-5,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,16,12,-30,-30,-28,-20,-13,-2,44,-28,-8,-28;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-8,-20,-7,-1,-15,-17,10,-13,1,-13,-5,-3,-17,0,13,0,-4,-5,-26,-6,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-36,-9,0,-27,-18,-18,-18,-9,-27,-18,-18,80,-9,-18,-9,-9,-27,-27,-27,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-28,-10,-3,-17,-16,1,-17,-2,-18,-11,-10,25,-4,0,-7,-8,-19,-18,-7,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='G'; M=-10,0,-26,2,-5,-22,13,0,-27,0,-19,-8,2,-16,-3,9,-5,-13,-21,-22,-14,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-12,12,-29,16,9,-29,7,4,-34,3,-26,-18,10,-14,1,3,-2,-13,-28,-28,-17,4;
MA   /M: SY='N'; M=-9,22,-23,15,4,-24,5,0,-26,-1,-27,-20,29,-16,-1,1,7,-2,-26,-34,-20,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-3,-30,1,19,-30,-9,-7,-26,6,-23,-14,-4,9,13,1,-2,-10,-26,-25,-20,15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-3,3,-17,-22,-11,-9,4,-5,-4,-6,-16,-1,8,-9,-7,-8,-25,-10,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-9,-24,-11,-6,-15,-21,25,-14,4,-10,7,-3,-19,3,16,-9,-6,-9,-25,1,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=8,-27,-10,-28,-27,-3,-25,-28,24,-18,7,7,-27,-27,-27,-20,-7,0,42,-28,-12,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=32,-6,-10,-14,-8,-18,-3,-18,-12,-10,-15,-12,-4,-10,-8,-16,19,13,-2,-26,-18,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-5,-12,-12,-11,-8,-20,-19,-6,-13,-3,-6,-4,-13,-11,-12,14,38,1,-29,-9,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-32,-10,-3,-25,-20,-20,-17,-10,-25,-17,-15,64,-10,-17,-2,6,-22,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='H'; M=5,-14,-18,-19,-14,5,-17,11,-7,-15,-6,-2,-10,-21,-13,-14,-4,-6,-1,-16,9,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-39,-10,-2,-30,-12,-20,-22,-11,-30,-20,-18,81,-11,-20,-9,-11,-30,-29,-30,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-24,-34,-27,5,-35,-23,36,-26,21,16,-24,-25,-21,-24,-20,-8,26,-17,6,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-12,-12,-20,-27,50,-21,-36,-20,-27,-19,-2,-21,-20,-20,1,-12,-25,-24,-28,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-21,-25,-16,0,-28,-18,14,-14,13,12,-17,-21,-10,-13,-13,0,10,-21,-2,-14;
MA   /M: SY='S'; M=4,-5,5,-8,-7,-16,-11,-12,-19,-7,-23,-16,0,-16,-6,-10,19,12,-9,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-24,-20,-25,-20,-5,-29,-25,17,-15,8,6,-22,-12,-19,-16,-12,-1,21,-26,-9,-21;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-26,2,-27,-27,-4,-29,-17,18,-20,4,6,-25,-30,-26,-19,-10,-3,36,-32,-9,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-11,4,-30,9,34,-29,-20,-4,-30,29,-24,-15,0,-6,15,19,-5,-10,-25,-25,-15,24;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,37,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-10,-25,-6,12,-13,-24,-1,-9,-2,4,-1,-11,-17,0,1,-13,-10,-9,-25,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-28,3,23,-28,-9,-5,-28,15,-22,-14,-1,-9,13,13,-2,-10,-24,-24,-17,18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-19,-5,-23,-23,-7,-26,-22,13,-12,0,2,-15,-28,-20,-6,-9,-3,25,-30,-12,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-25,11,13,-22,-9,-5,-24,4,-21,-16,1,-13,2,2,2,-5,-17,-26,-10,6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-13,-2,-15,-10,-23,6,-18,-22,-11,-19,-14,-8,-12,-12,-8,-5,-12,-16,-27,-22,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01022;
//
ID   RBFA_MP; MATRIX.
AC   MP01319;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ribosome-binding factor A signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6990800; R2=0.0158785; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=144; N_SCORE=7.976; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=51; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-6,14,-24,18,14,-28,-12,-3,-24,3,-22,-16,8,-10,9,-3,5,-1,-19,-31,-16,11;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-23,-9,-5,-13,-21,-10,-6,2,-10,-4,-3,-14,-3,2,-6,-4,-5,-24,-7,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-26,10,15,-28,-16,-4,-23,12,-20,-13,2,-10,10,5,-1,-6,-19,-27,-14,12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-24,4,17,-23,-15,-3,-21,7,-17,-12,0,-10,6,1,-1,-5,-17,-26,-13,11;
MA   /M: SY='V'; M=8,-17,-15,-23,-19,-8,-20,-24,12,-16,1,2,-14,-19,-17,-18,0,7,19,-26,-11,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-19,-20,-22,-14,-2,-25,-17,13,-17,14,12,-19,-21,-10,-16,-13,-5,12,-22,-5,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-24,5,13,-24,-11,-8,-22,8,-20,-13,4,-9,5,1,3,-2,-18,-27,-16,8;
MA   /M: SY='A'; M=20,-13,-19,-18,-13,-19,8,-20,-10,-12,-10,-7,-9,-15,-11,-16,1,-7,-4,-21,-18,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,16,-30,-20,19,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-8,17,-25,13,13,-26,-10,3,-24,10,-24,-15,21,-13,10,5,2,-6,-25,-31,-15,11;
MA   /M: SY='R'; M=-3,1,-24,-1,4,-24,-11,-4,-23,15,-22,-12,5,-14,6,16,2,-4,-17,-26,-14,4;
MA   /M: SY='A'; M=31,-7,-12,-14,-8,-18,-4,-9,-12,-10,-14,-10,-3,-12,-7,-15,12,2,-3,-25,-16,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-2,-19,-5,4,-23,-11,-12,-20,11,-21,-12,-1,-10,3,3,10,5,-12,-26,-15,3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-27,-8,-13,-25,39,-15,-33,-10,-28,-18,2,-13,-13,-11,2,-13,-25,-22,-24,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-21,-20,-26,-18,33,-26,-8,0,-19,5,1,-17,-25,-20,-15,-13,-5,0,-3,21,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-24,-36,-26,15,-34,-24,30,-28,27,19,-24,-25,-22,-24,-22,-9,20,-16,4,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-8,-28,-8,2,-23,-18,-1,-28,28,-21,-10,0,-17,13,55,-6,-8,-20,-21,-11,4;
MA   /M: SY='N'; M=-5,0,-22,-3,-2,-21,-3,4,-23,2,-21,-11,6,-16,3,6,6,0,-18,-27,-11,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-9,-24,-9,7,-8,-21,-4,-8,-5,-3,-1,-8,-15,1,-3,-7,-6,-9,-22,-5,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-16,-31,-24,5,-31,-24,26,-27,33,16,-27,-28,-22,-22,-22,-8,22,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-17,-14,-15,-20,23,-19,-19,-16,-16,-12,-4,-16,-14,-18,6,-4,-12,-23,-21,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-26,-3,3,-25,-9,3,-26,15,-24,-11,3,-11,10,16,-1,-7,-21,-23,-10,5;
MA   /M: SY='R'; M=-1,0,-23,-4,1,-23,-9,-4,-22,12,-21,-11,6,-14,7,17,3,-2,-17,-24,-13,3;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-24,-20,-29,-20,1,-28,-19,22,-22,26,20,-22,-24,-14,-19,-18,-4,15,-22,-3,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,1,-24,-3,-4,-19,-2,-5,-23,7,-21,-12,7,-17,0,10,0,-1,-18,-23,-10,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-21,-31,-22,6,-27,-17,20,-22,31,28,-27,-27,-16,-18,-25,-10,14,-11,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-28,-11,-2,-11,-20,-3,-25,25,-18,-9,-3,-19,4,45,-10,-10,-17,-14,-2,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-25,-19,-13,10,-25,-7,-4,-1,-6,-2,-9,-21,-10,1,-10,-5,-4,-8,15,-13;
MA   /M: SY='V'; M=3,-15,-4,-22,-19,-6,-22,-21,7,-17,-1,4,-13,-19,-16,-17,2,12,13,-28,-10,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-11,-1,-29,-20,-20,-18,-10,-28,-19,-20,84,-11,-20,-10,-10,-26,-30,-29,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-27,16,26,-29,-17,-3,-26,10,-22,-16,4,-4,13,4,1,-4,-23,-29,-16,19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-33,-24,9,-32,-23,27,-28,35,19,-27,-27,-21,-22,-25,-9,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-9,-23,-12,-7,-13,-22,13,-9,-3,-9,0,-4,-19,0,7,-4,-1,-5,-26,-2,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-21,-39,-30,76,-30,-19,1,-29,10,0,-20,-30,-38,-20,-20,-10,0,10,31,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-14,-18,-16,-8,-9,-25,-5,0,-4,-3,0,-11,-21,-6,-2,-10,-6,4,-22,-2,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-14,-27,-14,-8,3,-24,0,-5,-5,1,0,-12,-19,-6,-5,-15,-10,-9,-5,16,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-25,15,16,-24,-17,1,-25,7,-21,-16,6,-10,6,4,2,1,-20,-28,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=8,-5,-15,-6,-4,-19,2,-14,-16,-10,-21,-15,2,-13,-5,-10,23,11,-7,-33,-19,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-23,-29,-23,17,-29,-21,16,-24,13,7,-19,-17,-23,-21,-16,-5,11,-14,5,-23;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-26,25,25,-27,-12,-6,-25,1,-19,-18,4,-8,4,-7,0,-8,-20,-31,-18,14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-8,4,-24,0,4,-16,-15,2,-19,10,-19,-11,9,-14,5,11,-2,-4,-18,-19,-2,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=8,-12,-22,-14,-14,-16,23,-16,-21,-13,-17,-12,-6,-18,-14,-15,2,-9,-13,-20,-17,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='M'; M=0,-2,-20,-6,-6,-12,-15,-6,-5,-9,-3,2,-1,-17,-4,-10,-2,-2,-5,-26,-10,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-29,0,10,-22,-19,7,-27,24,-23,-10,1,-14,10,26,-6,-9,-21,-21,-4,8;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-34,-26,1,-33,-24,35,-25,20,21,-22,-22,-18,-23,-17,-6,26,-22,-2,-25; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-23,27,22,-26,-14,-2,-26,-1,-18,-19,8,-10,3,-6,3,-4,-21,-33,-17,12; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-22,4,12,-25,-12,-3,-23,8,-20,-13,6,-12,10,7,3,-4,-20,-27,-16,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-31,-21,5,-31,-21,25,-25,36,21,-25,-26,-17,-18,-25,-10,14,-20,-1,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,15,-32,-22,25,-29,37,19,-26,-27,-22,-22,-26,-10,14,-17,3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-24,7,11,-24,-12,-2,-23,7,-20,-14,10,-13,6,9,1,-4,-20,-26,-15,8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01023;
//
ID   UPF0067_MP; MATRIX.
AC   MP01320;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Uncharacterized protein family UPF0067 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8148670; R2=0.0139300; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1270; N_SCORE=22.496; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=121; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,79,-30,-27,-14,-27,-21,-15,-24,-8,3,-20,-34,-21,-24,-13,-10,-4,-41,-21,-24;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-10,-30,-10,-14,-27,44,-14,-37,-5,-27,-17,0,-20,-11,6,-3,-17,-27,-20,-24,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-16,-7,-7,-13,-20,15,-16,-10,-13,-7,3,-13,-4,-7,11,30,-9,-30,-1,-7;
MA   /M: SY='A'; M=38,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='V'; M=24,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25,10,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,26,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-7,-16,-12,-4,-20,-6,-12,-18,2,-18,-13,-2,-13,-2,9,12,2,-8,-25,-17,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-2,-20,-7,-2,-18,-20,-13,-20,16,-18,-10,0,-12,0,19,5,19,-10,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-11,4,-28,-1,-2,-25,5,-5,-30,17,-27,-14,13,-17,1,24,-3,-10,-24,-24,-17,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,0,-30,3,23,-30,-20,-1,-28,26,-23,-10,0,-10,24,27,-5,-10,-25,-23,-13,22;
MA   /M: SY='T'; M=1,-13,-15,-18,-16,-8,-21,-22,10,-17,-5,-2,-8,-17,-14,-17,10,17,15,-31,-11,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-30,-3,8,-37,6,1,-26,1,-23,-6,0,-13,37,1,0,-13,-30,-20,-16,22;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-17,4,-22,-15,-15,-27,-15,-9,1,-10,-5,-10,-25,-7,21,-13,-10,-5,-27,-12,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-2,-33,5,31,-28,-20,-5,-27,9,-23,-18,-5,19,10,11,-5,-10,-28,-28,-20,18;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-14,22,-24,11,0,-20,-9,50,-24,-4,-26,-11,38,-20,4,0,1,-9,-30,-36,-2,0;
MA   /M: SY='A'; M=12,-9,-15,-15,-9,-16,-16,-20,-6,3,-11,-6,-9,-14,-9,-5,3,9,6,-24,-13,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-5,-38,7,4,-32,-18,-16,-24,-8,-30,-22,-11,68,-8,-18,-8,-10,-30,-32,-28,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-2,1,-28,-3,-15,-28,54,-13,-35,-15,-30,-20,14,-20,-15,-15,2,-15,-30,-25,-28,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-22,-15,-10,-25,14,-20,-20,-13,-20,-15,-10,10,-13,-20,3,-7,-15,-22,-25,-13;
MA   /M: SY='A'; M=25,-3,-15,-5,10,-23,-5,-13,-17,-5,-17,-15,-3,-7,0,-13,14,2,-10,-27,-20,5;
MA   /M: SY='S'; M=17,-2,-10,-7,-5,-17,-5,-15,-15,-10,-20,-15,3,-10,-5,-12,28,23,-5,-33,-17,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=4,6,-23,0,6,-28,-11,-2,-20,14,-22,-9,11,-12,18,6,2,-6,-21,-24,-14,12;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,25,-20,0,-28;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,33,17,-28,-28,-23,-22,-23,-7,25,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,27,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-20,-26,-22,-14,-10,-27,-14,4,3,-3,2,-12,-22,-7,24,-13,-8,8,-22,-7,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=3,-9,-12,-9,-11,-12,9,-14,-8,-12,-12,-8,-4,-14,-11,-12,8,1,1,-22,-14,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-15,-6,-9,-10,-13,-6,-3,1,-9,-5,7,-19,-6,10,-3,-2,2,-24,-10,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,28,-30,39,18,-38,-14,0,-33,13,-28,-19,11,-10,16,3,-2,-10,-28,-31,-16,17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,12,-26,3,-11,-26,39,-7,-31,-11,-30,-20,27,-20,-11,-11,4,-11,-30,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-1,-26,32,-26,-6,0,-10,32,21,-6,-10,-24,-20,-10,23;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-25,-32,-25,-3,-35,-27,34,-25,12,12,-15,-17,-17,-25,-10,6,22,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,32,17,-28,-28,-23,-22,-22,-7,26,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='G'; M=11,-10,-25,-12,-18,-28,54,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01024;
//
ID   RUVC_MP; MATRIX.
AC   MP01321;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Crossover junction endodeoxyribonuclease ruvC signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5852056; R2=0.0155845; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=587; N_SCORE=14.723; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=59; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-7,-33,1,3,-27,-17,-14,-20,-6,-24,-18,-9,49,-6,-13,-6,-8,-25,-30,-24,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-16,-32,-28,6,-31,-24,29,-21,14,16,-26,-27,-25,-20,-14,-4,36,-22,-1,-27;
MA   /M: SY='F'; M=0,-14,-15,-19,-12,8,-16,-3,-10,-13,-6,-5,-9,-20,-12,-9,-3,-2,-5,-16,3,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-27,14,47,-24,-19,2,-24,6,-15,-14,-2,-3,15,-1,-1,-9,-25,-27,-16,31; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-27,-21,-20,33,-28,15,-1,-13,2,1,-18,-28,-13,-11,-19,-10,-8,21,63,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=16,-5,-14,-11,-5,-17,-11,-17,-13,-5,-12,-10,-4,-8,-7,-10,12,16,-5,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='P'; M=5,-15,-30,-12,-3,-26,-14,-14,-18,-10,-24,-16,-14,54,-9,-18,-3,-6,-21,-28,-24,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-21,-5,-5,-14,-14,-5,-10,-2,-9,-3,10,-15,0,4,0,1,-12,-29,-12,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-2,-25,-2,16,-26,-19,-2,-18,7,-15,-6,-3,-11,24,7,1,-2,-18,-23,-11,20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-28,-15,-31,-27,-2,-30,-28,30,-22,11,10,-24,-25,-25,-22,-10,-2,38,-27,-8,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-31,-2,8,-28,-20,-11,-29,46,-29,-11,-2,-11,8,27,-12,-11,-21,-11,-8,8;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-26,-8,4,-23,-21,-8,-15,20,-12,-1,-6,-14,13,12,-8,-7,-13,-21,-9,8;
MA   /M: SY='A'; M=30,-9,-5,-17,-11,-17,-5,-20,-9,-12,-12,-10,-7,-13,-11,-18,12,8,0,-26,-18,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-30,-26,0,-31,-21,29,-23,17,14,-25,-27,-23,-21,-15,-5,33,-26,-5,-26;
MA   /M: SY='T'; M=2,-14,-10,-20,-18,-6,-23,-23,8,-16,0,0,-13,-19,-17,-16,5,21,18,-29,-10,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,4,-21,-2,-7,-5,-16,1,-12,0,-15,-10,9,-20,-5,-2,0,3,-11,-16,10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=1,-10,-30,-10,-20,-30,69,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-29,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-7,1,-26,-2,1,-23,-9,24,-27,9,-23,-9,8,-16,6,14,-2,-10,-22,-26,-5,1;
MA   /M: SY='A'; M=47,-10,-11,-19,-11,-21,4,-20,-12,-11,-11,-11,-9,-11,-11,-20,9,-1,-2,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-4,14,-21,17,13,-27,-10,-7,-26,2,-25,-19,9,-4,2,-5,7,0,-21,-33,-19,7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=0,4,-24,7,21,-26,-15,-7,-20,4,-17,-13,-1,-8,9,-2,3,-4,-17,-28,-16,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-29,2,24,-38,-19,8,-21,9,-20,-3,0,-9,53,8,0,-10,-29,-21,-12,38;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-16,-33,-29,0,-32,-28,34,-22,13,16,-27,-27,-25,-22,-13,-3,42,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-7,-20,-10,3,-24,-14,2,-13,-4,-9,-2,-5,-14,18,-5,-1,-5,-15,-23,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-7,-24,-9,-3,-2,-17,12,-11,-9,-5,3,-6,-18,-2,-6,-9,-10,-11,-18,5,-3;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-17,-19,-27,-18,-4,-17,-3,14,-8,14,48,-17,-18,-1,-10,-15,-8,7,-20,-3,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-32,-29,1,-32,-29,33,-23,17,13,-28,-28,-27,-22,-14,-3,41,-27,-7,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-5,-16,-7,3,-24,-15,-7,-18,11,-18,-3,-4,-13,11,6,0,-2,-13,-25,-12,7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-10,-4,-14,-20,1,-14,11,-11,-3,-1,-20,3,27,-8,-8,-11,-23,-6,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-22,-23,-26,-13,7,-29,-14,16,-21,25,18,-20,-23,-12,-17,-21,-10,7,-18,2,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,13,-30,-19,20,-29,46,21,-29,-29,-20,-20,-29,-10,10,-18,2,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-6,4,-27,2,-1,-26,6,-3,-26,-1,-28,-17,12,3,-2,-2,2,-7,-26,-29,-20,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-22,-26,-18,2,-19,-20,10,-21,28,12,-22,-26,-17,-14,-22,-10,5,-20,-4,-18;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-18,-2,2,-23,-10,-11,-18,-3,-20,-14,-1,1,0,-9,8,5,-13,-29,-18,0;
MA   /M: SY='E'; M=-1,4,-21,7,9,-24,-1,-9,-26,0,-21,-16,1,-12,0,-5,3,-4,-19,-27,-18,4;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-2,-10,-21,-10,-1,-12,-18,-11,-3,-4,-2,-2,-10,-4,-5,-6,-7,-5,-3,-21,-10,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-14,-24,-12,-6,-8,-18,-14,-1,-11,-6,-4,-13,26,-9,-14,-10,-7,-8,-17,-10,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-28,-8,-1,-21,-17,-12,-15,8,-16,-6,-6,5,-1,4,-6,-3,-14,-24,-14,-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-26,-5,0,-24,-6,-11,-20,-6,-23,-14,-2,25,1,-10,0,-3,-23,-26,-20,-1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=3,3,-21,4,0,-19,-12,-8,-13,-8,-11,-9,-1,-8,-4,-13,2,-1,-10,-27,-12,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=28,-12,-12,-19,-9,-16,-10,-20,-2,-12,-7,-6,-11,-13,-10,-19,6,1,5,-24,-17,-10;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-10,-17,-10,-18,-4,-19,-9,-11,-12,-10,-7,-11,-10,-17,14,9,1,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=46,-10,-12,-19,-11,-21,5,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-2,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,10,-31,-22,25,-28,39,19,-28,-28,-21,-21,-26,-9,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='A'; M=44,-10,-12,-19,-11,-21,8,-20,-14,-11,-13,-11,-9,-11,-11,-20,9,-2,-4,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-16,-34,-27,0,-32,-27,32,-26,20,15,-24,-25,-22,-24,-17,-7,28,-24,-5,-27;
MA   /M: SY='A'; M=48,-10,-8,-20,-10,-20,-1,-20,-11,-10,-11,-10,-10,-11,-10,-20,10,0,0,-21,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-29,-25,-33,-25,8,-34,-19,30,-26,25,16,-24,-26,-19,-23,-23,-9,18,-11,11,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-12,62,-22,-21,-16,-24,-26,-21,-21,-16,-16,-12,-27,-21,-22,3,13,-6,-40,-22,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-1,-20,-2,-4,-22,-6,62,-30,-11,-21,-6,6,-20,2,-6,-7,-17,-27,-29,6,-5;
MA   /M: SY='A'; M=12,-17,-10,-23,-15,-4,-16,-13,-4,-18,1,-3,-15,-20,-14,-19,-6,-5,-2,-10,-5,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-8,-25,-12,-11,1,-20,25,-11,-13,-7,-2,-1,-23,-6,-7,-11,-10,-13,-6,14,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-6,-22,-9,-4,-17,-11,6,-16,-2,-12,-4,0,-18,4,6,-1,-2,-13,-25,-8,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-9,-21,-13,-8,-17,-7,-9,-12,0,-11,-3,-3,-17,-3,6,-4,-6,-8,-24,-13,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-3,-2,-25,-4,-1,-23,-4,-5,-20,3,-20,-11,4,-7,2,3,-1,-7,-18,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-18,-9,-10,-10,-3,-7,-12,-11,-12,-8,2,-15,-8,-10,7,4,-10,-23,-7,-10;
MA   /M: M=-4,-8,-24,-10,-7,-11,-18,-11,-6,-8,-2,-3,-7,-7,-7,-7,-8,-6,-8,-24,-10,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: M=-1,-7,-19,-9,-8,-14,-15,-11,-2,-10,-3,0,-5,-17,-5,-8,-3,-4,-1,-26,-11,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-9,-20,-11,-8,-17,-5,-9,-15,-1,-11,-5,-6,-14,-5,4,-3,-5,-10,-23,-12,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-23,-18,-10,-7,-15,-5,-3,-9,5,5,-13,-19,-7,-3,-12,-8,-3,-20,-4,-10; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=5,-9,-21,-12,-6,-16,-3,-13,-12,-5,-12,-7,-6,-16,-5,-6,0,-4,-6,-23,-14,-6;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01025;
//
ID   PHOSPHOTRIESTERASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01322;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphotriesterase family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6517243; R2=0.0165738; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=379; N_SCORE=11.923; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,4,-28,11,0,-30,10,-13,-30,-10,-30,-22,2,14,-8,-15,7,-5,-25,-32,-25,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-25,1,16,-23,-20,-7,-25,20,-20,-13,0,-10,8,22,0,5,-18,-25,-13,11;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-32,-27,3,-32,-27,32,-25,23,15,-28,-28,-25,-22,-18,-5,35,-25,-5,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-10,20,-25,10,10,-30,-10,10,-20,5,-25,-10,30,-15,30,5,5,-5,-30,-30,-15,20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=13,-25,-10,-27,-25,-5,-22,-27,19,-17,5,5,-25,-25,-25,-20,-5,0,37,-27,-13,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-20,-25,-20,-10,-5,-25,-10,-5,0,15,5,-15,-25,-5,25,-20,-10,-5,-20,-5,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-33,-10,-2,-25,-20,-20,-18,-10,-25,-18,-15,66,-10,-18,-3,5,-23,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-36,-28,0,-33,-23,39,-23,18,28,-22,-22,-17,-23,-18,-8,29,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,12,-18,14,12,-22,-13,-10,-22,-4,-21,-18,7,-8,0,-8,17,19,-14,-35,-16,6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-27,-23,-15,7,-26,-22,-1,-18,-7,-6,-16,21,-19,-20,-8,2,-6,-18,-6,-18;
MA   /M: SY='B'; M=7,18,-17,17,3,-25,-2,-6,-23,-6,-26,-20,18,-12,-2,-10,18,5,-17,-36,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-12,1,-31,10,15,-27,-20,-7,-18,-4,-12,-11,-6,13,9,-9,-8,-10,-23,-28,-17,10;
MA   /M: SY='L'; M=3,-19,-16,-23,-16,0,-22,-20,7,-22,25,7,-19,-22,-16,-18,-11,7,6,-22,-6,-16;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-24,-22,-16,14,-26,-5,-5,-1,-4,-2,-15,-26,-12,16,-14,-8,0,-4,19,-16;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=10,-7,-12,-17,-12,-10,-15,-16,-4,-10,-4,4,-7,-12,-8,-12,9,25,2,-25,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-26,4,-32,-26,29,-26,29,16,-28,-28,-24,-22,-21,-6,29,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-11,6,-19,-15,2,-20,8,-16,-18,-10,-7,-7,-22,-15,-15,-3,1,-9,-24,0,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-25,-26,-31,-25,-3,-15,-21,23,-24,17,21,-18,-22,-16,-23,-18,-12,12,-20,-5,-23;
MA   /M: SY='D'; M=1,16,-21,20,3,-25,-8,-6,-19,-6,-16,-6,4,-12,-2,-12,5,-3,-13,-32,-16,0;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-19,-16,-24,-18,27,-23,-18,-1,-22,9,-1,-13,-22,-22,-16,-4,7,1,-14,6,-18;
MA   /M: SY='S'; M=6,10,-17,11,11,-24,-10,-10,-22,-4,-21,-18,5,-8,0,-10,16,11,-14,-33,-18,5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-2,-26,0,4,-26,22,8,-32,-10,-26,-16,4,-14,-3,-10,6,-10,-26,-28,-17,0;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,64,-32,-22,10,-30,12,4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,6,4,24,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-15,-24,-17,-10,1,-21,-3,-6,1,-1,-1,-15,-21,-7,-4,-13,-8,-7,-1,23,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,3,1,-4,-2,-24,-17,-1,-25,7,-22,-12,11,-22,10,21,-3,-8,-23,-31,-16,2;
MA   /M: SY='P'; M=1,9,-26,2,-2,-24,-7,-6,-18,-5,-26,-18,18,23,-5,-11,3,-4,-25,-33,-24,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-26,-32,-22,-17,-3,-25,-16,-3,-14,-12,-8,-26,15,-17,-18,-17,-11,-6,14,8,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-3,-38,10,5,-32,-18,-15,-25,-8,-30,-22,-10,65,-8,-18,-8,-10,-30,-32,-28,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-9,4,-4,15,-28,-22,-15,-26,-7,-24,-20,-12,24,-4,-15,-6,-10,-25,-35,-26,4;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-4,4,-6,-9,-6,-18,-13,-23,-6,-15,-14,-6,-22,-12,2,-6,-8,-12,-24,-11,-11;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01026;
//
ID   PHOSPHOTRIESTERASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP01323;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphotriesterase family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.4316750; R2=0.0154735; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=764; N_SCORE=17.243; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=70; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=11,-5,-16,-12,-13,-18,10,-20,-19,-13,-16,-13,-2,-13,-13,-15,12,19,-9,-25,-18,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-5,5,23,5,-6,-22,-15,-16,-25,-14,-23,-20,1,-19,-11,-16,12,11,-12,-41,-21,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-2,5,-20,8,27,-23,-14,-7,-23,0,-21,-18,3,-5,8,-5,16,12,-18,-33,-18,17;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-21,-38,-19,-18,-18,24,-23,-30,-18,-27,-20,-16,1,-18,-20,-14,-21,-30,27,-13,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-8,-33,-5,1,-30,0,-15,-29,17,-30,-15,-6,17,-2,5,-8,-12,-25,-23,-20,-2;
MA   /M: SY='L'; M=3,-26,-21,-31,-21,1,-26,-23,22,-26,29,13,-23,-23,-18,-23,-18,-8,13,-20,-4,-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-13,0,-37,13,6,-33,-17,-14,-26,-7,-30,-23,-8,61,-7,-17,-7,-10,-30,-33,-27,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-17,-19,-19,-16,8,1,-17,-9,-22,1,-5,-10,-22,-19,-17,-1,-4,-7,-19,-6,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-26,5,31,-26,-22,-4,-15,3,-13,-9,-7,-9,18,-2,-2,-8,-12,-28,-16,25;
MA   /M: SY='E'; M=-13,4,-30,11,43,-27,-20,0,-30,16,-20,-17,0,-6,17,20,-3,-10,-27,-27,-17,28;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-9,-28,-9,1,-19,-22,-10,-19,28,-10,-3,-7,-17,3,28,-14,-10,-13,-20,-8,1;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,29,-30,-20,15,-30,39,15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,7,-12,8,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-30,-7,11,-20,-25,-10,-8,12,-11,-5,-5,-12,5,14,-10,-10,-9,-23,-10,6;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,-10,-19,-14,-13,-12,-22,-1,-12,-6,-6,-12,-14,-14,-17,8,14,11,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-10,-27,-10,-1,-16,-23,26,-14,-2,-1,3,-5,-21,13,12,-13,-13,-17,-23,1,3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,0,-26,0,6,-26,-16,50,-25,-4,-22,-4,7,-15,22,1,4,-8,-26,-29,3,12;
MA   /M: SY='A'; M=7,1,-19,-7,-5,-16,-11,-10,-10,1,-7,-6,7,-17,-5,-4,-3,-4,-10,-25,-13,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-4,-26,-7,9,-31,-16,1,-20,10,-18,-4,-2,-12,34,17,0,-8,-21,-20,-12,20;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-13,-16,-13,-4,-23,-20,-1,-16,7,-1,-9,-16,-13,-13,6,33,3,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=3,-17,22,-22,-17,-16,-21,-20,-12,-7,-11,-8,-15,-26,-15,2,-6,-6,3,-31,-18,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,-9,-16,-14,-11,-12,-16,-18,2,-16,-11,-6,-1,-13,-8,-16,18,18,4,-32,-12,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-19,-16,-7,-26,-23,7,-16,-1,-1,-6,-13,-13,-16,8,33,9,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-19,-10,-7,-16,-20,-20,-13,-10,-16,-13,-6,19,-10,-13,11,33,-9,-30,-16,-10;
MA   /M: SY='G'; M=9,-5,-20,-7,-8,-23,16,9,-26,-13,-23,-13,3,-15,-6,-13,11,-5,-18,-28,-14,-8;
MA   /M: SY='A'; M=11,-15,-18,-23,-13,7,-14,-14,-13,-4,-7,-7,-10,-18,-12,6,-4,-6,-6,-12,-4,-13;
MA   /M: SY='S'; M=2,9,-17,4,-4,-22,15,-6,-24,-9,-30,-20,22,-15,-4,-9,23,5,-20,-36,-22,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-12,-25,-12,-3,-18,-22,-13,-9,-10,-5,-4,-12,14,3,-11,-4,6,-13,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-27,-15,-11,-17,6,-6,-19,5,-12,6,-5,-20,-1,22,-10,-13,-15,-20,-13,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=6,6,-16,7,2,-19,-7,-6,-18,4,-14,-12,2,-9,-1,7,1,-4,-11,-19,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-14,-30,44,-20,-34,-17,-30,-20,-6,12,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-21,-22,-22,-5,21,-28,-16,3,-21,23,5,-21,-23,-17,-16,-21,-10,-2,-14,4,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,14,-30,21,31,-37,-18,5,-27,8,-22,-12,4,-7,36,3,0,-10,-30,-27,-15,33;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-30,-12,6,-28,-26,-2,0,-2,-8,6,-6,-13,37,-2,-6,-10,-13,-20,-7,20;
MA   /M: SY='I'; M=3,-19,-23,-24,-12,-10,-24,-16,13,-17,13,9,-16,-18,0,-16,-12,-8,5,-20,-7,-8;
MA   /M: SY='R'; M=14,-10,-20,-15,-5,-20,-10,-10,-20,10,-15,-10,-5,-15,0,26,0,-5,-10,-20,-15,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01026;
//
ID   GLYCOSYL_HYDROL_F4_MP; MATRIX.
AC   MP01324;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Glycosyl hydrolases family 4 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0415235; R2=0.0138856; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=788; N_SCORE=15.973; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=106; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-37,-29,11,-36,-28,36,-28,21,16,-23,-24,-24,-26,-19,-8,28,-18,2,-29;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-37,-9,-2,-30,-4,-19,-25,-5,-30,-19,-14,59,-9,-14,-8,-12,-29,-27,-28,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-21,-22,-24,-23,-5,-11,-9,10,-19,0,3,-16,-24,-19,-19,-10,-9,14,-19,1,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-30,-19,-35,-28,19,-33,-26,27,-26,19,12,-25,-27,-28,-23,-18,-6,28,-17,3,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-25,-24,-28,-16,11,-27,-22,11,-22,14,5,-22,-23,-19,-20,-18,-10,7,-1,2,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-14,25,-30,39,34,-34,-11,0,-34,5,-25,-23,9,-7,11,-2,0,-10,-30,-33,-20,22;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-29,-27,-36,-27,13,-36,-22,35,-28,22,16,-22,-24,-21,-25,-22,-10,20,-12,11,-27;
MA   /M: SY='V'; M=14,-21,11,-28,-22,-10,-20,-26,6,-20,2,-1,-20,-23,-21,-23,-6,-4,15,-28,-15,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-15,13,-30,20,15,-31,-17,-4,-33,28,-27,-17,6,-11,8,24,-6,-10,-24,-27,-14,11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,17,-24,23,4,-20,-14,-3,-24,1,-21,-18,5,-14,-3,-6,2,0,-18,-22,0,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-35,-27,0,-31,-20,36,-21,18,32,-22,-22,-15,-21,-18,-8,27,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,1,-28,6,31,-24,-20,-2,-28,16,-19,-15,0,-9,13,26,-2,-4,-23,-26,-15,20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-28,15,31,-29,-19,-6,-29,23,-24,-16,2,-6,12,10,-2,-5,-24,-27,-15,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-23,-21,-24,-21,12,-28,-6,12,-18,16,11,-23,-27,-16,-15,-17,-2,9,-5,25,-20;
MA   /M: SY='C'; M=11,-9,33,-14,-12,-20,-10,-19,-21,-17,-23,-18,-4,-20,-12,-19,18,6,-8,-39,-23,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-18,-36,-9,0,-27,-18,-18,-18,-9,-27,-18,-18,80,-9,-18,-9,-9,-27,-27,-27,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-11,24,-26,20,10,-27,-2,0,-28,11,-29,-19,28,-14,2,4,2,-7,-28,-32,-19,6;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,0,-19,-11,-20,-2,-20,-13,-12,-13,-12,-9,-12,-11,-20,11,1,-2,-24,-21,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-28,-40,-30,-22,2,-20,-26,-19,-11,-19,-17,-28,-24,-15,-13,-25,-12,-23,97,18,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-26,-21,-32,-25,17,-29,-14,22,-20,17,23,-23,-25,-19,-18,-19,-8,17,-11,12,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,37,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,21,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,18,2,-22,-2,10,-20,1,-29,-18,53,-19,7,1,9,-1,-30,-38,-19,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-25,-26,-22,38,-27,4,-1,-16,2,-1,-19,-28,-18,-14,-17,-9,-6,19,55,-22;
MA   /M: SY='T'; M=13,-5,-10,-11,-9,-14,-12,-18,-9,-11,-13,-11,-2,-12,-9,-13,20,27,2,-30,-15,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=18,-15,-16,-24,-15,-11,-12,-13,6,-12,2,17,-13,-15,-6,-16,-1,-3,6,-22,-11,-11;
MA   /M: SY='A'; M=24,-11,-17,-18,-14,-11,16,-19,-18,-15,-15,-13,-6,-15,-15,-19,7,-5,-9,-19,-17,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-17,-23,-22,-12,-6,-26,-1,16,-14,8,25,-14,-18,-5,-14,-13,-6,10,-24,-2,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-13,-4,-19,-22,-9,-14,-21,8,-19,-1,0,-7,-27,-21,-18,-7,-5,15,-31,-14,-22;
MA   /M: SY='T'; M=13,-3,-10,-13,-10,-13,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-3,-10,-10,-13,17,37,0,-27,-13,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-4,-32,0,24,-19,-14,-9,-27,2,-20,-18,-8,-10,5,1,-6,-8,-26,6,-9,15;
MA   /M: SY='A'; M=31,-16,-12,-24,-15,-4,-10,-21,-2,-15,1,-4,-15,-16,-16,-20,0,-2,6,-18,-11,-15;
MA   /M: SY='V'; M=1,-19,-13,-24,-20,-3,-23,-20,13,-17,12,13,-19,-21,-16,-16,-6,9,19,-26,-8,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-16,-26,-18,-12,1,-26,-3,-4,1,0,0,-12,-22,-5,12,-13,-3,-6,-7,18,-12;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-1,-29,-2,7,-22,-18,0,-29,28,-23,-12,6,-17,10,50,-7,-9,-22,-23,-12,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-22,-21,-19,12,-28,7,5,-15,8,4,-19,-27,-13,-13,-15,-2,3,-2,34,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-17,-21,-19,-14,3,-14,-17,-9,-11,-5,-5,-11,-11,-15,-2,-4,2,-3,-20,-6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-33,-1,6,-28,-9,-1,-25,-2,-28,-17,0,34,-2,-8,-5,-10,-29,-30,-21,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-9,-24,-18,-20,3,-15,-12,9,-18,1,1,1,-24,-17,-17,-10,-8,2,-18,2,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-15,3,6,-15,-10,-7,-10,5,-12,-7,1,-6,1,-1,2,-2,-7,-18,-9,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-13,3,-30,5,9,-29,-19,-7,-31,42,-28,-12,2,-12,9,33,-9,-10,-21,-22,-11,8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-18,-18,-26,-18,6,-23,-20,8,-17,2,2,-14,-19,-14,-18,-4,3,10,-17,-2,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,37,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='G'; M=-3,3,-27,-2,-15,-27,52,-12,-35,-15,-30,-20,15,-20,-15,-15,3,-15,-30,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-8,-34,-26,12,-33,-24,21,-29,27,13,-25,-28,-24,-24,-23,-9,16,-20,0,-26;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-17,24,-27,23,5,-25,-12,50,-30,-5,-25,-13,26,-17,5,-3,-2,-12,-30,-35,-1,3;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-14,-21,-17,-12,-12,-2,-14,1,-14,-4,9,-11,-18,-10,-15,-2,-5,4,-26,-13,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-28,-16,-11,-18,-24,-10,-3,-14,-15,-7,-20,35,-15,-18,-10,-8,-1,-30,-17,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-21,-28,-27,-16,1,-32,-13,21,-17,6,10,-15,-20,-1,-16,-14,-10,8,-12,9,-11;
MA   /M: SY='G'; M=1,-5,-26,-8,-16,-25,42,-6,-30,-16,-25,-15,5,-20,-15,-16,0,-15,-22,-24,-22,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-12,-29,-24,2,-21,-23,14,-22,5,8,-15,-22,-20,-21,-9,2,13,-22,-5,-23;
MA   /M: SY='M'; M=2,-7,-23,-11,5,-19,-18,-9,-6,4,-7,6,-8,-11,6,-4,-4,-4,-7,-22,-11,5;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-26,6,16,-23,-16,-5,-19,11,-15,-3,-2,-11,6,7,-6,-7,-15,-26,-13,11;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-9,-28,-8,3,-10,-18,-10,-7,-5,-4,-4,-7,-16,1,1,-10,-11,-10,-21,-8,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-22,-32,-25,5,-31,-18,29,-23,24,24,-25,-25,-18,-20,-21,-8,22,-18,4,-23;
MA   /M: SY='A'; M=32,-9,-15,-16,-3,-14,-6,-16,-13,-5,-11,-10,-9,-11,-7,-10,5,-3,-5,-19,-16,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-28,12,29,-30,-18,-3,-29,20,-23,-15,1,-7,16,13,-3,-9,-24,-26,-16,22;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,-21,-22,-19,-6,-24,-18,20,-18,13,17,-18,-20,-14,-20,-13,-7,17,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-29,-22,12,-19,-21,12,-27,31,12,-26,-29,-24,-20,-23,-10,10,-18,-2,-22;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01027;
//
ID   LYS_HYDROXYLASE_MP; MATRIX.
AC   MP01325;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Lysyl hydroxylase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2638054; R2=0.0126940; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1449; N_SCORE=22.647; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=177; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=7,15,-17,-1,-7,-16,-4,0,-10,-5,-15,-2,25,-17,-3,-7,4,-2,-14,-31,-16,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-25,-3,5,-25,-15,-7,-27,28,-27,-13,3,-13,7,29,4,-2,-17,-25,-13,5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-30,47,38,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='E'; M=-13,5,-30,12,44,-27,-20,0,-30,15,-20,-17,0,-5,17,19,-3,-10,-27,-27,-17,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-17,-37,-10,0,-27,-20,-15,-23,1,-27,-17,-15,60,-5,5,-10,-10,-27,-27,-25,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-26,-16,-6,-14,-21,-2,-15,18,-10,6,-6,-21,5,47,-12,-9,-9,-21,-8,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-7,-10,-15,-7,-20,0,-17,-13,-10,-15,-13,-5,-10,-7,-17,18,5,-3,-25,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-27,3,-37,-27,41,-29,27,19,-23,-23,-21,-27,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,29,4,-24,-2,8,-24,0,-30,-22,52,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-25,-37,-30,0,-37,-30,45,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,35,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-15,8,-27,3,2,-22,-15,27,-27,15,-25,-10,19,-18,7,25,-5,-10,-25,-28,-5,2;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-17,-19,-17,-12,-13,-26,-21,3,11,-8,1,-17,-21,-12,2,-10,-4,19,-26,-10,-12;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-11,-24,-8,11,-14,-25,-12,-4,-1,-1,-3,-12,-16,-2,4,-9,-8,0,-26,-12,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23,44,-30,9,0,-15,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,25,66,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,15,49,-33,-20,3,-27,10,-20,-15,0,-3,31,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01028;
//
ID   DAP_EPIMERASE_MP; MATRIX.
AC   MP01326;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Diaminopimelate epimerase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7094164; R2=0.0153338; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=394; N_SCORE=11.741; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=52; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-9,-21,-9,3,-9,-23,-5,-4,-10,0,-2,-11,-17,-4,-11,-9,-8,-4,-23,-5,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-13,-24,-15,-12,-6,-25,-18,3,-8,0,0,-11,-9,-12,-8,-11,-5,2,-22,-7,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-24,-9,-1,-14,-16,-10,-16,-7,-16,-11,-10,13,-5,-8,-3,-6,-17,-23,-10,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-2,-21,-2,3,-23,-9,-9,-25,3,-23,-14,0,5,-2,5,-3,-5,-22,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='S'; M=1,3,-17,2,3,-20,-9,-3,-18,-4,-20,-14,6,-13,0,-5,15,8,-11,-33,-14,1;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-27,8,11,-26,-10,-8,-23,2,-21,-16,-1,5,1,-5,-1,-7,-20,-28,-17,5;
MA   /M: SY='B'; M=-8,3,-21,3,3,-23,-1,-8,-22,-4,-20,-14,3,-11,-2,-7,-3,-8,-20,-26,-14,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-9,-13,-14,-13,-8,-10,-16,-7,-14,-8,-8,-8,-12,-14,-16,2,4,-2,-21,-7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-13,22,-27,34,10,-23,-14,-5,-25,-5,-20,-20,6,-10,-4,-12,-2,-7,-19,-27,-10,3;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-24,-23,-30,-24,26,-18,-15,-1,-20,-1,-3,-20,-25,-24,-19,-14,-10,0,16,21,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-8,-26,-9,3,-6,-19,4,-20,7,-14,-7,-5,-16,3,12,-7,-7,-17,-13,4,2;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-24,-25,-31,-23,11,-26,-6,16,-16,13,29,-23,-24,-10,-15,-22,-11,6,6,19,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-15,4,-28,7,4,-23,-17,-5,-22,12,-19,-12,4,-16,3,26,-5,-7,-16,-26,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-27,-36,-28,14,-36,-20,34,-25,15,16,-21,-23,-20,-24,-19,-9,21,-9,15,-28;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-26,-31,-24,41,-29,-7,0,-19,4,0,-20,-28,-23,-10,-20,-11,-3,17,34,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=18,-3,-9,-9,-7,-19,-4,-11,-13,-9,-19,-13,4,-13,-6,-12,17,5,-7,-30,-18,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,22,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,66,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,2,-18,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-12,-2,-1,-16,-1,-11,-19,-10,-26,-18,9,-11,-3,-10,33,20,-10,-36,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-24,1,22,-21,-18,-5,-17,3,-15,-11,-4,-7,6,0,0,-5,-13,-28,-15,13;
MA   /M: SY='A'; M=33,-12,-13,-18,-12,-18,0,-20,-8,-12,-11,-9,-11,-9,-12,-19,9,0,3,-24,-20,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-1,-24,0,17,-22,-8,-6,-23,5,-20,-12,-1,-9,12,0,4,-3,-20,-24,-15,14;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-12,-21,-20,-9,-10,-17,-2,4,-7,6,29,-11,-17,10,-7,-10,-8,-3,-20,-5,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-30,-12,-21,-28,64,-21,-35,-21,-27,-18,-1,-20,-20,-21,-1,-19,-27,-20,-28,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,61,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=8,-18,-17,-24,-18,-7,-17,-21,11,-19,7,5,-14,-18,-14,-20,-2,3,11,-24,-10,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-20,95,-29,-28,-17,-28,-29,-22,-27,-16,-16,-20,-36,-28,-28,-8,-5,-3,-46,-26,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-27,-14,-31,-26,22,-26,-23,14,-22,11,5,-24,-27,-29,-20,-12,-3,23,-15,4,-26;
MA   /M: SY='A'; M=26,-16,-13,-22,-17,-10,-4,-22,-1,-15,-6,-4,-14,-17,-16,-20,3,-2,9,-22,-15,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-9,-28,-11,-1,-19,-19,2,-20,16,-14,-3,-6,-17,7,21,-11,-11,-16,-11,-4,1;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-24,-25,-29,-22,38,-26,-2,-3,-19,5,-1,-20,-28,-22,-14,-20,-11,-6,19,37,-22;
MA   /M: SY='L'; M=3,-27,-17,-30,-22,1,-26,-24,22,-24,25,12,-25,-25,-21,-21,-16,-6,22,-23,-6,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-16,-22,-19,-14,3,-19,0,-3,-9,-1,1,-13,-21,-9,-7,-9,-5,-3,-8,16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-24,2,12,-20,-18,-2,-14,-5,-6,-7,-4,-13,5,-5,-3,-6,-14,-27,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,2,-26,3,8,-23,-18,5,-18,9,-17,-8,2,-13,6,5,-3,-7,-15,-27,-8,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-24,-7,-7,-23,15,-11,-25,-3,-20,-13,2,-16,-6,-3,1,-3,-19,-24,-18,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-18,-24,-20,-18,-9,3,-16,-2,-20,6,2,-12,-22,-16,-18,-11,-9,-4,-20,-8,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-11,-20,-14,-5,-15,-23,-16,-2,2,-6,-2,-10,-16,-3,1,-3,3,4,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,7,-24,6,8,-26,-10,-5,-23,8,-24,-14,7,-5,6,1,4,0,-19,-29,-16,6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,7,-21,7,7,-25,-12,-10,-23,10,-22,-15,4,-8,0,2,2,0,-16,-29,-16,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01029;
//
ID   MSCL_MP; MATRIX.
AC   MP01327;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Large-conductance mechanosensitive channels mscL family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2406454; R2=0.0128091; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1016; N_SCORE=17.245; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=177; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-19,-21,-27,-17,-4,-16,-2,14,-10,16,48,-18,-20,2,-10,-18,-11,5,-20,-2,-7;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='S'; M=3,-1,-14,-2,-5,-18,15,-10,-20,-8,-22,-14,6,-11,-5,-8,17,6,-13,-25,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-22,-19,-29,-21,15,-21,-9,15,-16,15,32,-19,-20,-11,-13,-18,-9,8,-6,6,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-31,-25,-35,-26,18,-30,-23,17,-27,23,11,-28,-28,-23,-21,-26,-12,10,9,8,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-28,-1,7,-28,-15,-5,-26,31,-26,-10,4,-13,14,26,-4,-8,-20,-23,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,13,-30,23,47,-31,-11,-2,-32,7,-22,-21,3,-3,14,-2,0,-11,-30,-30,-21,30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-7,-29,44,-28,-9,0,-11,14,34,-9,-10,-21,-20,-10,11;
MA   /M: SY='E'; M=-4,8,-26,13,36,-28,-18,-5,-25,10,-20,-16,0,-4,12,0,1,-4,-22,-28,-17,24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-18,-17,-27,-17,-11,-15,-23,12,-18,5,2,-15,-15,-14,-23,-3,-4,11,-20,-12,-17;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-20,-17,-26,-18,2,-20,-12,13,-17,16,25,-18,-22,-11,-15,-10,-4,11,-22,-4,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-14,-31,-29,0,-30,-27,32,-20,12,16,-28,-28,-26,-20,-12,-2,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-18,-32,-26,2,-31,-23,31,-23,22,22,-26,-26,-21,-21,-18,-6,31,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,40,33,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-28,-38,-28,1,-37,-27,45,-28,22,23,-21,-21,-19,-27,-21,-10,27,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=21,-10,-18,-15,-15,-22,26,-20,-20,-15,-18,-13,-6,-15,-15,-19,6,-4,-10,-22,-23,-15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,76,-30,-20,1,-30,12,1,-21,-30,-39,-20,-21,-10,1,8,28,-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-24,-6,-13,-25,37,-16,-31,-12,-26,-18,6,-17,-13,-13,7,-2,-22,-25,-24,-13;
MA   /M: SY='K'; M=10,-3,-22,-6,1,-26,-7,-13,-24,21,-24,-12,-1,-11,1,8,3,-4,-14,-23,-15,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,1,-39,-29,46,-30,24,20,-21,-21,-20,-29,-21,-10,27,-20,0,-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-31,-30,32,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,48,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,14,-17,9,-1,-20,-7,-9,-20,-3,-23,-17,17,-12,-4,-6,17,20,-14,-34,-16,-3;
MA   /M: SY='S'; M=13,0,-12,-3,-1,-21,-2,-11,-19,-5,-27,-18,7,-10,-1,-8,30,15,-10,-35,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-32,-23,22,-29,-21,17,-28,35,14,-27,-29,-24,-21,-24,-9,12,-15,5,-23;
MA   /M: SY='V'; M=0,-25,-10,-27,-27,-2,-28,-28,23,-18,7,7,-25,-27,-27,-18,-5,9,41,-30,-10,-27;
MA   /M: SY='B'; M=-1,17,-22,17,9,-27,-8,-6,-26,8,-25,-18,13,-11,1,-1,7,-1,-20,-31,-18,5;
MA   /M: SY='D'; M=-13,29,-27,37,10,-28,-7,-1,-31,-1,-28,-23,18,-13,1,-7,3,-6,-26,-26,-13,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-28,25,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01030;
//
ID   4HBCOA_THIOESTERASE_MP; MATRIX.
AC   MP01328;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.6361871; R2=0.0179305; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=750; N_SCORE=19.074; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=49; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-22,-25,-14,-6,-20,2,14,-7,14,50,-17,-18,10,-7,-17,-10,4,-20,-2,-2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=9,5,-12,5,8,-15,-7,-7,-13,-2,-10,-10,0,-5,0,-7,5,3,-8,-18,-12,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-22,-4,-4,-20,4,-7,-24,10,-21,-12,7,-14,-1,17,-1,-2,-18,-20,-14,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-14,-24,-15,-12,-12,-6,-19,-15,-15,-15,-13,-10,-2,-11,-15,3,6,-14,-1,-10,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,60,-32,-22,12,-30,12,5,-20,-28,-35,-22,-20,-10,7,3,23,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-19,-9,1,-14,-21,-15,-8,-5,-11,-8,-2,-11,-3,-2,10,21,-4,-28,-11,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-24,-28,-30,-23,18,-27,-3,12,-16,9,22,-22,-25,-12,-15,-22,-12,2,16,31,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-8,-31,-5,12,-25,-20,-2,-19,9,-16,-2,-7,8,17,16,-7,-10,-22,-24,-14,12;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-2,-17,-10,-18,-25,-12,-8,0,-10,-3,-13,-24,2,13,-8,-7,3,-28,-13,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,4,-24,-20,2,-28,26,-20,-8,0,-18,19,59,-8,-10,-22,-20,-10,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-30,-6,8,-1,-25,13,-12,0,-10,-4,-10,-18,15,-3,-10,-10,-20,4,35,9;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-25,-26,-27,-21,35,-29,-6,1,-20,8,1,-22,-13,-22,-17,-20,-10,-6,6,33,-22;
MA   /M: SY='E'; M=0,-3,-26,-2,12,-19,2,8,-25,-5,-18,-13,-3,-13,1,-9,-2,-12,-22,-18,-4,5;
MA   /M: SY='D'; M=-19,38,-30,54,22,-36,-13,14,-37,0,-27,-25,16,-10,4,-7,-1,-11,-30,-37,-14,12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-4,18,-14,-14,-12,-22,-22,-14,-14,-12,-12,-4,-16,-14,-14,14,37,-2,-34,-14,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=13,-12,-23,-13,-10,-17,4,-13,-18,-12,-19,-14,-9,7,-10,-17,4,-4,-15,-18,-10,-12;
MA   /M: SY='G'; M=17,-6,-22,-8,0,-27,18,-13,-24,-8,-19,-13,-4,-12,0,-13,4,-9,-18,-21,-22,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-24,-37,-24,-21,17,-25,13,-11,-14,-10,-7,-23,-29,-11,-12,-26,-18,-20,64,55,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-12,-26,-16,-12,20,-24,52,-18,-18,-8,0,-2,-24,-10,-8,-14,-16,-18,-14,24,-12;
MA   /M: SY='A'; M=14,-2,-21,-7,-6,-24,5,-13,-19,-10,-23,-17,5,8,-8,-15,8,-2,-17,-28,-24,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-8,18,-20,7,2,-22,-8,3,-20,2,-24,-14,30,-16,11,6,11,6,-23,-33,-16,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22,39,-30,13,0,-14,2,0,-20,-30,-15,-12,-20,-10,-8,26,71,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-24,-21,-25,-18,12,-28,5,8,-25,26,12,-20,-28,-17,-16,-22,-11,4,-19,7,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-25,-7,3,-24,-18,5,-23,16,-19,-7,0,-14,14,26,-2,-2,-18,-22,-8,6;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-29,-33,-33,-25,27,-25,-9,-3,-17,-1,4,-27,-28,-18,-15,-27,-17,-11,59,38,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-13,-26,24,-31,-25,18,-30,-19,-3,-28,13,1,-24,-33,-27,-22,-20,-10,-1,-18,5,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-14,17,-30,27,41,-30,-18,18,-32,4,-22,-18,6,-6,14,-2,-2,-12,-30,-32,-13,26;
MA   /M: SY='R'; M=1,-2,-23,-3,15,-22,-16,-7,-23,10,-16,-13,-2,-10,6,18,1,0,-16,-24,-15,9;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-26,-10,-4,-11,-18,2,-22,14,-18,-10,-2,-20,4,38,-1,-4,-16,-15,4,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-6,-20,-6,2,-18,-7,-12,-18,0,-17,-12,-3,-14,-3,6,6,6,-8,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-6,15,-24,16,36,-26,-12,0,-26,4,-24,-20,15,-6,12,-2,9,-2,-26,-34,-20,24;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-26,-9,-31,-26,30,-27,-9,-6,-20,-2,0,-24,-30,-22,-17,-22,-14,-9,31,34,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-30,-20,-34,-24,35,-30,-20,13,-30,36,13,-26,-30,-27,-20,-26,-10,6,-9,11,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-15,-25,-19,-11,-2,-22,-11,-7,1,-9,-4,-5,-20,-5,21,-4,-5,-5,-19,-4,-11;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-19,-1,3,-23,-11,0,-24,11,-27,-13,5,-11,4,5,15,8,-15,-31,-11,3;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01031;
//
ID   COX6A_MP; MATRIX.
AC   MP01329;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cytochrome c oxidase subunit VIa signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5271974; R2=0.0129435; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=869; N_SCORE=15.765; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=5,-9,-23,-13,-9,-20,13,8,-18,-12,-13,3,-5,-17,-6,-13,-4,-13,-15,-22,-11,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-5,1,-22,2,10,-24,-12,18,-26,6,-26,-13,6,-11,7,3,11,-1,-20,-32,-8,7;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-1,-30,-1,3,-21,-20,79,-30,-3,-20,-3,8,-19,11,11,-9,-18,-28,-28,13,2;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-18,0,9,-15,-20,-12,-3,-5,-7,-6,-11,-6,-6,-10,-4,-5,5,-26,-14,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-5,-19,0,11,-16,-11,-7,-12,-1,-14,-11,-7,30,0,-7,-3,-5,-16,-16,-14,4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-7,13,-16,20,25,-18,-9,0,-18,3,-13,-13,4,-2,7,-2,0,-5,-16,-18,-11,16; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-23,-12,-5,-8,-13,-5,-18,11,-13,-8,-7,-15,1,30,-12,-10,-15,17,1,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-32,-8,0,-24,-16,-16,-16,-8,-24,-16,-16,73,-8,-16,-8,-8,-24,-24,-24,-8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-30,5,32,-27,-18,-6,-26,8,-21,-17,-5,13,10,7,-3,-9,-26,-27,-20,19;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-14,-14,-18,-14,34,-17,8,-5,-16,1,0,-8,-17,-17,-9,-11,-8,-5,0,17,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-10,-19,-17,-1,-20,-17,17,-10,6,6,-15,-17,-15,-8,-8,-2,24,-17,-5,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=1,1,-29,7,8,-30,3,-13,-27,-7,-25,-20,-4,18,-5,-15,-1,-10,-25,-28,-25,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=4,-4,-23,-2,10,-25,-11,4,-21,-5,-23,-14,-1,9,6,-9,9,-2,-20,-30,-16,6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-16,-25,-22,-16,34,-25,35,-14,-21,-4,0,-6,-25,-17,-11,-15,-15,-14,-8,25,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-20,-5,1,-26,-13,10,-19,31,19,-22,-22,-9,-14,-22,-10,2,-22,-4,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-15,17,-25,6,0,-20,-9,5,-25,14,-25,-15,32,-20,5,32,1,-5,-25,-31,-15,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-36,-28,2,-36,-28,41,-28,24,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,1,-14,-8,-10,3,-14,-13,-12,-12,-14,-12,9,-16,-12,-10,15,23,-7,-26,-6,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-15,-37,-7,3,-30,-20,-17,-23,6,-30,-17,-15,63,-5,-7,-10,-10,-27,-27,-25,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-27,-35,-27,56,-28,-11,-3,-23,3,-3,-23,-30,-29,-17,-23,-13,-7,37,43,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-32,-15,-6,-9,-19,-19,-16,-14,-22,-16,-17,55,-14,-19,-6,-7,-22,-23,-18,-13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,58,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-8,34,-20,25,4,-24,-2,4,-24,-2,-30,-22,43,-16,0,-4,14,2,-26,-40,-20,2;
MA   /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,4,-24,-20,59,-30,12,-24,-4,6,-16,10,11,-10,-16,-26,-26,9,4;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,16,-30,-20,18,-30,46,18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,9,-17,3,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-15,-37,-15,-11,-9,-20,52,-26,-14,-20,-7,-8,-24,-1,-7,-21,-24,-30,37,24,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-1,-32,6,4,-30,-16,-14,-24,2,-27,-19,-7,39,-5,-9,-4,-5,-24,-29,-23,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-8,-23,-10,-5,-18,-18,27,-16,3,-15,-3,-3,-18,0,5,-7,-10,-8,-26,-1,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-17,-15,-16,-6,-8,-26,-20,12,-11,2,3,-20,-21,-15,-14,-6,1,24,-30,-12,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,33,-22,17,3,-23,-3,10,-20,2,-28,-17,50,-18,10,2,8,-2,-30,-37,-18,7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-28,-15,-7,-6,-19,7,-19,-6,-16,-9,-9,13,-8,0,-9,-10,-18,-20,-5,-10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-23,7,-32,-23,27,-28,38,18,-28,-28,-22,-22,-25,-8,20,-22,-2,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-11,-36,-3,13,-30,-20,-15,-24,5,-28,-18,-13,55,-1,-7,-8,-10,-28,-28,-24,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-2,-16,-2,-1,-14,4,13,-18,4,-14,-5,2,-9,0,2,-4,-9,-14,-13,-3,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-8,-7,-4,-6,-14,-13,-1,-6,-4,-4,-5,-9,-7,-7,6,18,6,-19,-7,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-7,12,-30,20,-5,-34,40,-13,-40,-13,-30,-24,7,-16,-13,-16,0,-16,-30,-27,-26,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,4,-28,10,-7,13,-23,6,-15,-10,-9,-11,-5,-23,-11,-12,-13,-10,-16,1,35,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=5,3,-25,4,-3,-27,9,6,-29,-2,-23,-14,2,-14,-4,-8,-1,-12,-21,-25,-14,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-13,4,-36,16,15,-33,-17,-11,-27,-4,-28,-23,-6,49,-2,-14,-6,-10,-30,-33,-26,3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,0,-20,-20,50,-30,10,-20,-5,5,-20,10,35,-10,-15,-25,-25,5,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01032;
//
ID   SPERMIDINE_SYNTHASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP01330;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Spermidine/spermine synthases family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0780663; R2=0.0149487; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=459; N_SCORE=11.930; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-6,0,-16,-7,-7,-13,-20,14,-16,-10,-13,-7,3,-13,-4,-7,11,30,-9,-30,-1,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-14,-8,-21,-14,-9,-16,-10,1,-10,1,19,-12,-17,-5,-8,-2,1,3,-27,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-21,-32,-23,5,-30,-23,27,-28,35,18,-26,-26,-19,-22,-23,-9,17,-21,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=3,-21,-11,-25,-23,-4,-25,-26,18,-18,3,4,-20,-23,-23,-18,-1,10,33,-29,-11,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-3,-29,-4,-2,-15,-21,83,-24,-9,-16,4,5,-21,10,-1,-11,-18,-26,-24,23,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-24,-29,-19,-13,-17,-19,-24,1,-16,-10,-6,-22,33,-18,-21,-11,-8,0,-28,-20,-18;
MA   /M: SY='P'; M=15,-15,-24,-16,-7,-22,-9,-20,-12,-12,-17,-12,-14,28,-11,-20,0,-4,-11,-26,-23,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-20,-29,-21,2,-20,-15,17,-22,29,27,-23,-25,-14,-18,-21,-10,10,-20,-3,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-19,-7,-24,-18,9,-16,-18,-3,-19,2,-1,-14,-23,-19,-16,-7,-5,-2,-19,-2,-18;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=10,-4,-14,-8,-4,-11,-3,-12,-14,-8,-14,-11,0,-12,-6,-11,12,9,-8,-23,-12,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-23,-4,-5,-13,-19,43,-10,-12,-7,1,0,-18,-1,-7,-8,-12,-11,-25,7,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-1,-30,5,5,-24,-8,-11,-23,-1,-23,-17,-5,19,-4,-9,-4,-7,-22,-24,-15,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-2,13,-21,7,3,-22,-5,-2,-21,-1,-22,-16,19,-10,1,-2,9,3,-20,-32,-17,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-18,-33,-14,-6,-22,-14,-14,-12,-11,-19,-12,-16,44,-11,-18,-9,-10,-18,-24,-17,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-10,1,-28,2,18,-27,-18,-5,-29,31,-25,-13,2,-10,11,29,-5,-8,-22,-24,-13,13;
MA   /M: SY='R'; M=-12,8,-19,7,4,-25,-15,3,-29,18,-26,-14,10,-15,4,19,-2,-5,-21,-29,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=4,-28,-11,-30,-28,-2,-28,-29,28,-20,9,9,-28,-28,-28,-21,-9,-1,44,-28,-10,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-19,-30,-20,9,-29,-20,20,-29,46,19,-29,-29,-20,-20,-28,-9,12,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-35,-27,3,-35,-27,37,-29,29,19,-25,-25,-21,-25,-22,-9,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-19,43,-30,61,22,-37,-12,-1,-35,0,-27,-27,16,-9,1,-10,-1,-10,-28,-38,-19,11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-23,-11,-20,-30,65,-20,-40,-20,-30,-20,-1,-21,-20,-20,0,-20,-29,-21,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-16,-25,-18,-20,-14,31,-20,-18,-22,-6,-7,-10,-21,-20,-20,-7,-15,-14,-19,-18,-20;
MA   /M: SY='T'; M=14,-11,-13,-19,-15,-11,-16,-21,3,-14,-4,-2,-10,-14,-13,-17,8,17,10,-26,-12,-14;
MA   /M: SY='L'; M=6,-25,-18,-29,-19,0,-24,-22,17,-24,28,12,-24,-24,-18,-21,-17,-7,13,-21,-6,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-11,-20,-12,-3,-16,-21,-3,-29,24,-19,-10,-2,-21,5,58,-10,-10,-19,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-3,-31,-28,-1,-30,-27,25,-23,14,12,-26,-28,-25,-22,-14,-4,32,-28,-9,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-12,-27,-19,4,-27,-20,13,-24,33,13,-25,-28,-19,-15,-21,-6,10,-23,-4,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-4,-29,-4,6,-26,-19,-6,-30,40,-26,-10,0,-14,10,43,-8,-9,-20,-21,-10,6;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-9,-29,-10,-8,1,-24,58,-16,-11,-8,1,-4,-24,2,-5,-14,-15,-20,-9,36,-7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-7,-30,-2,8,-28,-17,-11,-22,7,-25,-14,-7,30,5,-2,-2,-6,-23,-27,-20,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,8,-17,9,4,-23,-3,-8,-22,-7,-22,-16,8,-5,-1,-9,12,5,-17,-33,-18,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-14,-30,-27,4,-29,-26,29,-21,13,13,-25,-26,-25,-20,-13,-3,37,-23,-5,-27; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-29,7,31,-27,-15,-4,-29,20,-21,-15,-1,-8,12,16,-4,-10,-24,-26,-16,21;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-26,2,11,-25,-16,7,-22,16,-21,-6,6,-12,16,16,-2,-7,-21,-25,-10,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-18,-31,-25,-4,-27,-27,27,-22,12,10,-22,-22,-21,-23,-10,-4,29,-24,-8,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-7,4,-17,3,-8,-15,-21,-9,-7,-11,-9,-8,-2,-15,-11,-13,5,18,2,-32,-9,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-27,-16,-2,-26,-10,17,-17,26,31,-22,-23,-2,-13,-21,-10,7,-20,-2,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,11,-30,-29,-3,-30,-29,19,-22,6,5,-28,-31,-29,-22,-11,-2,37,-32,-13,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-13,24,-30,37,46,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,7,-3,13,-3,0,-10,-30,-33,-20,30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01033;
//
ID   THYMIDYLATE_KINASE_MP; MATRIX.
AC   MP01331;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-MAR-2007 DATA UPDATE; 01-MAR-2007 INFO UPDATE.
DE   Thymidylate kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.6917048; R2=0.0199260; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=-5; N_SCORE=7.808; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-9; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-20,-23,-15,-3,-25,-16,12,-15,6,6,-18,-18,-11,-14,-10,-4,13,-21,-3,-14;
MA   /M: M=-1,-6,-22,-6,0,-16,-15,0,-11,-5,-10,-5,-5,-16,-1,-6,-2,-6,-7,-22,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-26,3,12,-22,-14,4,-23,6,-20,-11,4,-9,10,7,-1,-6,-21,-25,-10,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-13,-20,-14,-7,-9,-19,-16,1,-6,-1,0,-12,-20,-11,-8,-7,-2,7,-25,-8,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-28,-32,-23,-4,-35,-26,35,-21,13,14,-18,-20,-15,-22,-17,-9,23,-19,-2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-27,-13,-2,-14,-24,-11,-4,4,-3,0,-10,-17,1,5,-12,-9,-6,-16,-5,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-33,-6,5,-26,-17,-15,-18,-4,-21,-15,-13,44,-5,-11,-7,-9,-23,-28,-23,-3;
MA   /M: SY='A'; M=18,-7,-14,-12,-4,-18,-7,-11,-15,-3,-11,-7,-7,-14,-3,-9,0,-5,-9,-22,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-19,-22,-15,0,-27,-19,12,-23,30,11,-22,-23,-16,-18,-23,-9,6,-23,-4,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='E'; M=3,0,-23,-2,9,-22,-11,-4,-19,5,-16,-11,2,-12,8,2,0,-6,-17,-20,-13,8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,4,-24,3,13,-27,-12,-4,-23,13,-20,-11,5,-11,14,8,1,-6,-20,-25,-15,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-1,-29,-1,-8,-28,35,-12,-33,-9,-28,-18,5,-11,-9,-12,-1,-15,-28,-23,-23,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-21,-1,4,-17,-20,-5,-17,10,-17,-8,-2,-15,1,5,-6,-7,-12,-22,-5,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-25,-24,-21,-2,-25,-17,13,-20,6,4,-17,-23,-17,-19,-15,-5,10,-1,1,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-11,-31,-29,0,-31,-29,31,-23,14,12,-28,-29,-28,-22,-13,-3,42,-28,-8,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-16,28,-20,-19,-13,-14,-20,-10,-21,-8,-5,-12,-26,-17,-19,2,1,0,-36,-18,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,66,20,-39,-11,-1,-39,0,-29,-29,19,-10,0,-10,1,-8,-29,-39,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,3,-30,29,-20,-10,0,-20,10,68,-10,-10,-20,-20,-9,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-21,-20,-24,-21,38,-27,9,-4,-17,-1,-2,-16,-28,-18,-13,-15,-9,-8,12,50,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-17,-17,-20,-19,1,-25,-13,11,-17,4,4,-15,-22,-17,-18,-10,-4,11,-18,3,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,1,-27,5,-6,3,-20,-3,-12,-12,-6,-8,-6,-20,-12,-13,-12,-11,-12,-7,11,-9;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=4,-1,-15,-4,-7,-19,9,-14,-21,-12,-24,-17,7,-12,-7,-12,25,19,-12,-33,-19,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-22,-29,-21,2,-29,-18,22,-20,18,16,-21,-24,-15,-15,-17,-7,17,-19,1,-20;
MA   /M: SY='A'; M=39,-14,-7,-22,-14,-16,-6,-22,-3,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,9,-23,-18,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21,35,-30,16,0,-12,1,0,-20,-30,-13,-11,-20,-10,-9,28,75,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,0,-25,-2,14,-34,-16,4,-19,5,-20,-4,2,-10,43,4,6,-4,-24,-23,-12,28;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-21,-11,-15,-24,38,-17,-30,-14,-24,-15,-3,-18,-12,-15,2,-12,-22,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-20,-17,-14,-6,-5,-10,-6,-15,-6,-5,-11,-16,-13,-17,-2,-4,-3,-16,-1,-15;
MA   /M: SY='G'; M=2,-7,-24,-8,-7,-20,13,-15,-21,-5,-16,-11,-3,-16,-9,-7,-1,-8,-15,-22,-18,-8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-4,-23,-2,4,-18,-3,-5,-21,8,-14,-9,-1,-13,2,19,-5,-9,-16,-19,-12,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-26,-4,-8,-23,20,-11,-23,-9,-21,-14,6,-17,-8,-11,0,-11,-20,-20,-19,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-15,-22,-15,-13,-1,-24,-18,11,-20,17,6,-16,-21,-16,-18,-17,-8,7,-23,-6,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-7,8,-22,12,5,-25,4,-9,-28,-6,-24,-19,5,-9,-3,-9,3,-6,-23,-26,-19,1;
MA   /M: M=-5,-13,-24,-14,-4,-6,-21,-14,-2,-10,0,0,-12,-11,-7,-10,-10,-7,-5,-15,-6,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-26,6,10,-15,-15,-8,-19,-2,-16,-13,0,-12,0,-6,-2,-6,-16,-19,-10,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-14,-20,-18,-14,-2,-22,-15,5,-15,4,2,-11,-22,-14,-14,-12,-6,3,-15,-2,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-17,-17,-19,-13,-8,-26,-17,8,-8,5,6,-15,-22,-10,-6,-13,-7,10,-24,-7,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-24,-5,1,-14,-16,-5,-15,5,-14,-8,1,-16,1,4,-2,-3,-13,-18,-5,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-4,-20,-7,-1,-16,-17,-8,-9,-4,-10,-4,-2,-14,2,-6,-2,-4,-9,-21,-9,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-9,-22,-13,-12,-2,-21,-14,4,-15,8,1,-4,-15,-13,-12,-12,-6,-2,-24,-7,-13;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01034;
//
ID   HTH_RRF2_1_MP; MATRIX.
AC   MP01332;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Rrf2-type HTH domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8478265; R2=0.0171216; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=553; N_SCORE=15.306; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=39; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-13,-21,-16,-9,-14,-20,-13,-9,8,-9,-4,-8,-18,-4,22,-4,0,-1,-23,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-11,-26,-13,-6,3,-23,11,-8,-8,-4,0,-7,-22,9,-5,-9,-8,-15,-4,24,1;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-27,5,-6,-28,26,-7,-33,-2,-29,-18,11,-17,-7,-1,2,-11,-26,-27,-21,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-22,-34,-28,0,-35,-29,38,-25,16,15,-23,-23,-23,-25,-15,-3,34,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-17,-2,0,-22,-5,-12,-20,-10,-30,-20,3,13,-2,-12,28,13,-15,-38,-22,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-14,-29,-11,1,-15,-18,-10,-14,4,-5,-5,-12,-2,-3,10,-13,-10,-14,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-22,4,1,-21,-8,6,-20,-2,-24,-14,20,-5,3,1,10,1,-22,-34,-15,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-15,-28,-17,-15,23,-26,41,-11,-15,-5,0,-9,-26,-9,-9,-16,-14,-15,3,46,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,27,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=1,-7,-20,-6,11,-14,-20,-13,-8,0,-9,-5,-10,-13,-3,-6,-2,-3,-1,-26,-13,5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,3,-30,4,12,-32,-19,2,-29,35,-27,-8,2,-11,20,22,-7,-11,-23,-22,-9,16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,34,-27,28,17,-26,-26,-23,-24,-21,-7,28,-23,-3,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-22,-34,-25,15,-32,-22,26,-26,25,19,-23,-25,-21,-22,-21,-7,18,-16,4,-24;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-23,-6,-5,-14,-13,6,-15,0,-14,-7,8,-18,1,6,0,-2,-15,-23,-3,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-25,3,11,-25,-16,-8,-22,11,-22,-13,1,-1,7,7,1,0,-18,-27,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-12,-23,-12,-10,-18,1,-12,-19,3,-18,-10,-4,-20,-6,19,0,-4,-7,-25,-16,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-13,1,-28,1,7,-27,-19,0,-27,27,-24,-9,4,-14,17,32,-5,-6,-22,-23,-10,11;
MA   /M: SY='A'; M=17,-4,-17,-8,-3,-16,-11,-13,-9,-9,-2,-7,-5,-15,-7,-11,-2,-4,-5,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-10,-29,-10,-17,-28,55,-17,-38,-13,-29,-19,0,-20,-15,-8,0,-17,-28,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-28,-22,13,-31,-12,18,-24,32,14,-27,-29,-19,-18,-25,-9,11,-9,18,-22;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-14,-31,-28,-1,-30,-29,31,-22,13,11,-27,-27,-27,-22,-12,-2,42,-27,-8,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-25,5,18,-21,-17,0,-23,8,-18,-13,2,-10,6,6,0,-1,-19,-24,-9,11;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-10,-5,-4,-17,-5,-14,-16,-10,-22,-16,5,-10,-4,-11,31,25,-6,-35,-17,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-25,-18,-29,-25,0,-31,-18,26,-22,12,11,-22,-25,-21,-20,-12,-1,29,-23,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-11,-31,-10,0,-21,-20,-4,-27,26,-19,-10,-3,-8,7,53,-11,-10,-20,-21,-12,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-11,-29,-10,-1,-24,-19,-12,-21,15,-22,-12,-8,15,-1,18,-7,-5,-16,-24,-17,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-8,11,-25,4,-2,-21,11,2,-27,0,-27,-17,22,-18,-2,3,3,-7,-26,-27,-15,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-30,-25,28,-33,-4,16,-20,8,6,-20,-27,-19,-18,-20,-10,6,9,44,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-19,-8,2,-21,-18,-5,-18,8,-16,-8,-2,-17,10,24,1,-1,-13,-26,-12,4;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,19,-30,47,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=17,-9,-19,-14,-13,-20,18,-17,-18,-14,-14,-10,-4,-11,-13,-18,4,-4,-12,-23,-21,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-27,-6,2,-25,-12,-4,-25,26,-22,-6,-2,-14,7,22,-6,-9,-18,-21,-11,4;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-1,-30,4,12,-28,-14,-11,-23,-1,-25,-19,-3,31,-1,-9,-1,-7,-24,-30,-23,3;
MA   /M: SY='P'; M=12,-16,-25,-16,-8,-21,-8,-19,-12,-13,-13,-9,-16,28,-11,-19,-3,-6,-13,-25,-22,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-1,11,-23,14,13,-26,-11,1,-26,4,-23,-17,7,-10,4,0,6,-1,-19,-31,-15,8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,12,-26,17,19,-30,-14,-3,-27,8,-20,-16,3,-10,12,6,1,-6,-22,-28,-16,15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-39,-30,0,-39,-30,47,-29,19,19,-21,-21,-21,-29,-19,-9,33,-21,-1,-30;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-16,-7,-6,-16,-13,-12,-10,-7,-16,-11,6,-10,-4,-6,15,19,-6,-31,-14,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-22,-35,-26,6,-33,-26,33,-27,24,16,-24,-24,-22,-25,-19,-8,26,-20,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-15,-26,-16,-18,-11,29,-16,-23,-18,-16,-13,-8,-21,-17,-18,-4,-13,-18,-5,-8,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-12,29,-28,41,24,-35,-10,-1,-32,1,-24,-21,10,-9,8,-7,0,-9,-27,-34,-19,16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-33,-29,1,-33,-29,35,-24,16,14,-27,-27,-26,-23,-14,-4,42,-26,-6,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-21,-34,-28,7,-34,-26,34,-25,18,14,-25,-26,-24,-23,-17,-6,32,-20,2,-28;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-6,-25,-7,2,-20,-16,-5,-22,14,-15,-9,-3,-15,6,27,-4,-6,-15,-20,-9,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01035;
//
ID   PYRASE_GLU_MP; MATRIX.
AC   MP01333;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyrrolidone-carboxylate peptidase glutamic acid active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3866682; R2=0.0152620; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=270; N_SCORE=9.497; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=73; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-8,-1,-16,-21,-11,-9,1,-9,-6,-7,-5,-1,0,-6,-2,-7,-24,-9,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-2,3,-24,4,11,-25,-16,-2,-24,12,-20,-12,1,-11,8,12,0,-1,-18,-25,-13,9;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-19,-17,-7,-9,-18,-9,-4,-7,4,1,-13,-17,-8,-10,-7,-2,-1,-20,-4,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-31,-29,-37,-27,8,-35,-27,31,-29,23,15,-25,-24,-21,-26,-25,-12,16,0,5,-26;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-25,11,26,-27,-15,0,-26,6,-19,-15,1,-8,11,4,2,-7,-22,-28,-16,18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,6,-26,11,28,-27,-17,-6,-27,16,-23,-16,2,-6,10,9,2,-2,-22,-28,-16,19;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-12,-25,-14,-9,-8,-26,10,4,-13,-1,5,-9,-20,-4,-11,-11,-8,1,-19,5,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,9,-26,10,13,-30,-14,7,-26,14,-25,-12,10,-12,19,11,2,-6,-24,-28,-12,15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,-1,-27,-20,-18,-19,-10,-29,-19,-20,85,-10,-20,-10,-10,-29,-27,-25,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-6,16,-26,23,11,-30,-8,-6,-23,-4,-20,-16,5,-11,6,-10,2,-5,-19,-30,-17,8;
MA   /M: SY='L'; M=5,-23,-16,-28,-20,2,-23,-19,15,-21,19,11,-22,-23,-17,-20,-14,-6,13,-18,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=1,-26,-12,-28,-27,-2,-29,-28,26,-20,8,8,-24,-26,-26,-20,-7,5,39,-28,-9,-27;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,8,-34,-26,33,-28,29,17,-25,-26,-23,-24,-22,-8,24,-20,0,-26;
MA   /M: SY='H'; M=1,-6,3,-12,-12,-16,-7,4,-16,-15,-12,-3,0,-21,-8,-14,2,-4,-11,-32,-12,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-19,-31,-25,2,-32,-25,28,-25,23,15,-24,-25,-21,-22,-16,-1,26,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-14,-23,-13,2,-15,-25,-8,1,-9,10,6,-15,-19,13,-6,-12,-8,-3,-23,-8,8;
MA   /M: SY='A'; M=39,-10,-12,-17,-10,-17,0,-16,-11,-10,-12,-11,-8,-12,-9,-18,11,1,-3,-19,-13,-10;
MA   /M: SY='G'; M=6,-13,-29,-12,-12,-28,30,-20,-28,-15,-26,-18,-8,15,-15,-20,-1,-13,-24,-23,-28,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-9,-28,-11,-19,-26,54,-17,-32,-18,-24,-11,0,-20,-17,-18,-1,-16,-25,-21,-26,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-28,-11,-2,-18,-18,-1,-27,24,-18,-10,-2,-19,7,57,-8,-9,-17,-18,-8,-2;
MA   /M: SY='S'; M=8,-4,-18,-9,-6,-13,-7,-14,-15,-10,-18,-13,0,2,-8,-13,11,10,-11,-26,-15,-8;
MA   /M: SY='B'; M=-2,7,-23,7,2,-25,-7,-3,-22,4,-19,-9,4,-13,4,-1,1,-1,-17,-27,-14,3;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-29,1,-37,-29,43,-27,19,17,-23,-23,-23,-27,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-25,-25,-18,-8,-28,-25,14,-20,5,3,-25,12,-20,-21,-15,-7,13,-27,-13,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,61,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-29,-2,-33,-29,-2,-33,-29,28,-25,12,10,-26,-28,-26,-24,-14,-5,35,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='A'; M=38,-10,-15,-18,-12,-22,17,-20,-17,-12,-15,-12,-8,-12,-12,-20,8,-5,-7,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-25,-26,-30,-23,-5,-34,-12,31,-23,12,14,-18,-22,-13,-22,-16,-9,22,-23,0,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-9,36,-21,18,-1,-21,5,8,-21,-1,-30,-20,56,-20,-1,-1,9,-1,-30,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-17,-28,-21,-2,-30,-20,20,-15,10,12,-20,-23,-15,-16,-16,-8,17,-19,1,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-10,20,-26,18,-1,-24,-3,-4,-18,-4,-19,-11,19,-16,-4,-6,-2,-8,-18,-32,-16,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-18,30,-29,44,15,-25,-14,3,-30,-2,-23,-23,10,-13,0,-9,-2,-8,-25,-26,-1,6;
MA   /M: SY='A'; M=18,-12,-3,-18,-13,-10,0,-19,-18,-9,-15,-12,-8,-17,-14,-15,3,-4,-8,-21,-15,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-31,-9,-2,-24,-4,-5,-30,15,-23,-12,-2,-9,6,40,-7,-11,-23,-21,-16,-2;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-25,-30,-18,-1,-33,-23,33,-24,20,15,-18,-18,-15,-23,-18,-9,19,-19,-2,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-13,-29,-8,1,-25,-9,-16,-17,-6,-22,-15,-13,44,-6,-14,-5,-8,-20,-24,-23,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-11,33,-11,15,-2,-20,-3,7,-21,-1,-29,-19,51,-21,-2,2,8,-1,-28,-40,-20,-2;
MA   /M: SY='E'; M=6,3,-7,4,10,-26,-12,-10,-22,-3,-15,-13,-4,-13,1,-9,0,-7,-16,-29,-19,5;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-16,-29,57,-17,-39,-14,-29,-19,1,-20,-16,-10,-1,-18,-29,-21,-27,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-13,1,-26,-5,0,-2,-17,0,-13,1,-14,-7,7,-18,4,-1,-6,-8,-18,-14,5,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-3,-10,-5,8,-32,-20,-2,-22,10,-20,-6,-3,-14,31,6,-1,-5,-22,-24,-13,20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-20,-38,-13,-5,-19,-23,-14,-13,-11,-23,-15,-20,65,-10,-19,-12,-10,-24,-20,-10,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-25,2,-14,-25,28,-18,-22,-16,-20,-15,-3,-20,-18,-18,-3,-13,-10,-27,-23,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01036;
//
ID   PYRASE_CYS_MP; MATRIX.
AC   MP01334;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Pyrrolidone-carboxylate peptidase cysteine active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8797112; R2=0.0142759; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=387; N_SCORE=10.394; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=114; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-1,7,-14,-3,-5,-15,-12,-11,-15,-7,-17,-13,12,-12,-3,-6,19,31,-9,-32,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-39,-2,2,-31,-19,-18,-22,-9,-30,-21,-16,81,-9,-19,-9,-10,-30,-31,-29,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-34,-28,0,-33,-26,36,-23,17,20,-23,-23,-21,-23,-15,-4,32,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-13,4,-30,6,11,-29,-19,-6,-31,38,-27,-13,3,-12,9,33,-8,-10,-22,-23,-12,9;
MA   /M: SY='A'; M=32,-4,-16,-10,0,-22,-5,-15,-16,-1,-14,-12,-6,-10,-4,-7,6,-3,-7,-22,-19,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-22,-34,-24,0,-32,-20,34,-23,20,29,-21,-22,-15,-22,-19,-9,22,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,1,-26,-24,-5,-26,-26,15,-19,5,5,-22,-26,-23,-19,-6,5,29,-30,-12,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-4,2,-27,3,15,-29,-17,2,-24,18,-21,-9,0,-10,16,9,-3,-8,-21,-24,-11,15;
MA   /M: SY='A'; M=11,-4,-20,-7,4,-21,-6,-12,-19,3,-15,-11,-2,-12,-1,2,3,-1,-12,-24,-16,1;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-18,-33,-25,4,-31,-23,26,-26,28,20,-26,-27,-20,-22,-23,-9,19,-16,-1,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-26,-6,1,-20,-20,5,-19,15,-17,-7,4,-16,7,25,-5,-3,-16,-24,-7,2;
MA   /M: SY='E'; M=-4,12,-25,14,23,-28,-15,-5,-26,12,-22,-16,7,-8,10,2,2,-1,-22,-29,-16,17;
MA   /M: SY='A'; M=11,2,-20,-4,5,-20,-6,-4,-16,-4,-12,-10,6,-13,2,-6,3,-4,-15,-26,-16,3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-6,-30,-6,-13,-30,55,-16,-37,-12,-29,-19,3,-18,-13,-14,0,-18,-29,-21,-27,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-24,-36,-27,6,-35,-27,36,-29,27,18,-24,-25,-22,-25,-22,-9,26,-20,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-38,-3,2,-31,-19,-18,-22,-9,-30,-21,-16,79,-9,-19,-9,-10,-29,-31,-29,-8;
MA   /M: SY='A'; M=35,-12,-4,-20,-14,-19,2,-21,-11,-13,-12,-10,-11,-15,-14,-20,7,-2,1,-24,-21,-14;
MA   /M: SY='S'; M=10,1,-16,1,5,-21,-8,-10,-17,-5,-20,-14,1,-10,2,-9,17,7,-9,-30,-16,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-27,36,-25,21,18,-26,-26,-23,-24,-18,-6,33,-24,-4,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-12,16,-25,7,2,-17,-12,12,-16,0,-18,-10,25,-19,12,1,0,-6,-25,-24,-1,6;
MA   /M: SY='T'; M=4,4,-12,1,-3,-17,-10,-14,-17,-9,-20,-16,6,-10,-5,-10,26,30,-7,-35,-15,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-13,-11,-9,-11,-17,-18,-11,-8,-9,-9,-2,-12,-8,-4,14,36,-3,-28,-11,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,51,-30,3,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,59,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-14,-29,-27,2,-30,-26,27,-23,21,13,-27,-29,-26,-20,-16,-3,36,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-21,24,2,-22,-1,9,-22,0,-30,-21,55,-19,0,-1,10,0,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-3,-27,-6,-6,0,-20,60,-22,-12,-14,-2,5,-22,-1,-5,-10,-15,-23,-19,20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=3,-23,-14,-26,-22,-1,-25,-25,18,-21,16,8,-22,-24,-21,-19,-9,4,24,-25,-8,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-23,-16,-31,-22,21,-24,-6,11,-17,17,32,-21,-25,-13,-14,-20,-10,5,-9,13,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21,34,-30,17,0,-11,1,0,-20,-30,-12,-11,-20,-10,-9,29,76,-21;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-9,-27,-11,-10,-22,14,0,-22,-10,-15,-8,-2,-18,-4,-6,-3,-8,-19,-23,-13,-8;
MA   /M: SY='V'; M=4,-21,-15,-24,-18,-3,-22,-21,14,-20,14,8,-18,-22,-17,-19,-6,2,16,-25,-8,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-22,-24,-15,-3,-19,-14,10,-20,27,17,-21,-24,-7,-14,-20,-10,2,-20,-4,-11;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-1,-30,-1,-5,-7,-21,61,-22,-7,-15,-3,4,-22,3,0,-11,-15,-24,-13,31,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-12,-26,-13,-2,-4,-24,12,-7,-10,1,3,-11,-19,1,-6,-12,-8,-11,-10,10,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-20,-22,-23,-17,-8,-14,-19,9,-19,10,5,-15,-21,-12,-15,-9,-6,6,-23,-9,-15;
MA   /M: SY='R'; M=0,6,-24,6,7,-25,-8,6,-26,5,-21,-14,6,-13,3,9,0,-8,-20,-27,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-23,-4,3,-24,-10,-11,-20,11,-19,-9,-3,-11,4,4,-2,0,-14,-24,-13,3;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-2,-27,-4,5,-18,-19,13,-23,16,-20,-7,2,-15,7,19,-6,-8,-19,-20,0,4;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-21,-9,-12,-7,9,-6,-21,-9,-19,-13,1,-19,-11,-11,3,-4,-17,-16,-1,-12;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01036;
//
ID   METHYLGLYOXAL_SYNTH_MP; MATRIX.
AC   MP01335;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Methylglyoxal synthase active site.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.1651592; R2=0.0152303; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=586; N_SCORE=14.080; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=88; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-26,-6,5,-18,-12,6,-11,-7,-1,3,-3,-17,11,-5,-9,-11,-17,-24,-8,8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-18,-23,-19,-9,-7,-23,-12,-5,0,13,4,-15,-23,-6,15,-17,-9,-4,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-22,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,23,17,-25,-25,-23,-25,-19,-7,32,-23,-3,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-5,-25,-6,11,-22,-18,1,-13,8,-11,9,-4,-12,20,11,-4,-7,-15,-24,-10,15;
MA   /M: SY='E'; M=-11,15,-29,17,29,-30,-16,0,-29,19,-25,-16,11,-8,16,9,-1,-9,-27,-29,-16,22;
MA   /M: SY='A'; M=18,1,-18,-4,8,-22,-9,-12,-18,4,-17,-13,1,-9,0,-6,6,2,-12,-25,-17,4;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-11,-15,-13,-8,-21,-21,-3,-13,-2,-5,-7,-14,-13,-13,11,35,6,-28,-10,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-27,-5,-13,-29,49,-14,-35,-15,-29,-18,7,-18,-10,-15,5,-13,-28,-24,-26,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-23,7,-32,-23,26,-29,41,19,-28,-28,-21,-22,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='E'; M=2,1,-22,3,4,-24,-15,-14,-18,3,-20,-14,-3,2,-3,-6,4,2,-10,-29,-17,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-11,14,-24,12,5,-25,-15,16,-25,5,-23,-12,15,-14,8,2,2,3,-22,-31,-7,5;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-9,9,-13,-7,-20,-22,-12,-27,13,-20,-12,-5,-21,-2,27,-6,-1,-15,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='M'; M=-12,-25,-7,-31,-25,19,-27,-12,11,-20,15,21,-23,-28,-19,-17,-19,-9,10,-13,10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-16,-25,-17,-2,1,-27,-12,0,-6,9,4,-14,-19,-1,-6,-16,-10,-5,-17,-1,-1;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,-14,-1,0,-21,-3,-11,-20,-10,-30,-20,6,3,-1,-11,33,16,-13,-39,-21,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-24,-30,-21,9,-26,-14,15,-23,32,25,-28,-27,-14,-17,-28,-12,5,0,7,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-6,-25,-8,7,-25,-22,-1,-10,-1,-4,3,-6,-14,33,1,-3,-1,-17,-21,-8,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,7,33,-37,-20,7,-23,10,-20,-7,0,-7,47,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-28,2,-37,-28,42,-29,25,19,-23,-23,-21,-27,-21,-9,28,-21,-1,-28;
MA   /M: SY='G'; M=7,-10,-27,-11,-19,-29,60,-20,-36,-19,-27,-19,-1,-19,-19,-20,1,-17,-26,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-10,-19,-10,-19,-3,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,7,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-16,-24,-19,-7,-10,-23,-5,5,-5,14,25,-16,-20,10,-4,-17,-10,-3,-20,-4,2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,44,-28,21,18,-23,-23,-22,-27,-19,-8,31,-22,-2,-29;
MA   /M: SY='A'; M=28,-13,-13,-20,-13,-15,-9,-21,1,-14,-7,-5,-10,-14,-12,-20,9,2,8,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-12,20,-28,24,34,-29,-15,1,-30,12,-25,-20,15,-8,11,6,0,-8,-28,-32,-18,22;
MA   /M: SY='N'; M=-7,13,-25,9,-2,-26,11,4,-29,3,-29,-17,21,-16,-2,-1,4,-8,-26,-30,-17,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,10,-27,14,16,-28,-18,-7,-29,23,-24,-16,4,-9,7,15,-2,-1,-21,-27,-14,11;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-23,-36,-28,7,-34,-24,35,-25,20,22,-23,-24,-21,-24,-19,-8,27,-20,0,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-10,41,-27,57,16,-37,-9,-3,-36,-1,-27,-27,16,-10,-1,-11,1,-9,-26,-37,-20,7;
MA   /M: SY='M'; M=5,-22,-19,-29,-19,-2,-21,-16,18,-19,20,24,-20,-20,-12,-19,-15,-7,11,-20,-5,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-14,-31,-27,2,-30,-25,29,-22,19,18,-28,-28,-24,-20,-16,-4,37,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01037;
//
ID   ADOMETDC_MP; MATRIX.
AC   MP01336;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   S-adenosylmethionine decarboxylase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0663490; R2=0.0144050; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=759; N_SCORE=15.990; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=21,-21,-12,-25,-19,-7,-16,-24,10,-17,7,3,-21,-21,-19,-20,-4,-2,21,-24,-13,-19;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,11,-26,7,18,-30,-14,3,-22,12,-23,-11,14,-11,26,6,2,-7,-26,-27,-15,22;
MA   /M: SY='C'; M=0,-18,99,-28,-27,-20,-25,-28,-27,-27,-18,-18,-18,-35,-27,-28,-7,-8,-8,-45,-28,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-23,2,17,-26,-17,-4,-23,9,-21,-11,2,-9,19,10,8,5,-20,-27,-14,18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-32,-27,3,-32,-27,31,-26,26,16,-28,-28,-24,-22,-19,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='S'; M=4,5,-14,7,2,-22,-3,3,-23,-9,-29,-19,11,-11,1,-9,31,13,-14,-39,-16,1;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-16,-11,-10,-13,-15,-13,-2,-2,-11,1,-2,-17,-7,-5,6,7,5,-31,-12,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-9,-21,-9,3,-13,-22,-14,-8,2,-2,-3,-9,-15,-4,-2,-4,3,-4,-26,-10,0;
MA   /M: SY='S'; M=0,4,-19,2,4,-24,-8,-8,-24,14,-30,-16,11,-11,4,6,18,6,-16,-32,-16,4;
MA   /M: SY='N'; M=-5,24,-16,9,-3,-17,-6,-1,-17,-4,-24,-17,37,-16,-3,-4,16,17,-19,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-15,28,-30,42,33,-35,-15,-1,-35,11,-26,-24,10,-6,9,-1,-1,-10,-29,-34,-19,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-7,-13,-6,9,-10,-25,5,-16,2,-13,-8,-8,-17,1,-4,-10,-11,-16,-15,11,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-24,-29,-18,-3,-31,-17,25,-20,22,20,-21,-22,-6,-17,-19,-9,14,-21,-3,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-18,34,-30,49,23,-35,-13,0,-37,6,-27,-25,14,-10,5,4,-2,-10,-28,-35,-18,13;
MA   /M: SY='A'; M=29,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,26,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,41,-30,11,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,69,-22;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,19,12,-30,-30,-28,-20,-15,-2,41,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-3,-12,-18,-10,-27,-18,8,-10,-2,-10,37,25,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-32,-22,11,-27,-14,21,-23,33,33,-25,-26,-14,-17,-25,-10,11,-18,2,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-16,-18,-21,-16,23,-18,-6,-4,-16,-4,2,-9,-21,-14,-13,1,1,-4,-9,16,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,7,-28,13,7,-29,-14,-8,-28,14,-27,-18,2,4,2,10,-1,-6,-21,-29,-18,3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-3,-29,-1,-5,0,-22,26,-21,-1,-13,-7,-2,-22,-2,11,-12,-12,-19,-10,22,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-31,-27,-38,-29,15,-34,-27,30,-28,18,13,-24,-25,-24,-25,-22,-11,19,-1,7,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-27,-36,-27,-1,-37,-29,41,-27,16,16,-17,-19,-19,-27,-14,-1,26,-21,-1,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,6,-31,-20,27,-27,38,26,-26,-26,-17,-21,-26,-10,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-6,4,-25,-23,-13,-17,37,-22,-5,-3,-12,5,20,-12,-10,-12,-20,-8,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-19,-11,-5,-13,-22,-15,-12,6,-6,-5,-5,-14,-4,7,1,19,-6,-25,-8,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01038;
//
ID   ODC_AZ_MP; MATRIX.
AC   MP01337;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ornithine decarboxylase antizyme signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.9655986; R2=0.0173249; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; N_SCORE=11.933; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=31; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-31,-15,-7,-9,-19,-6,-16,-13,-19,-13,-15,42,-13,-18,-9,-10,-21,-22,-13,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-15,29,4,-21,-14,-2,-26,-6,-21,-20,6,-16,-5,-12,1,-3,-19,-26,-2,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-2,-30,-2,10,-36,8,0,-27,1,-23,-8,0,-12,32,0,0,-13,-30,-21,-17,21;
MA   /M: SY='P'; M=4,-4,-22,-1,-3,-21,-13,-16,-13,-11,-15,-13,-7,13,-9,-16,4,3,-10,-30,-19,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-19,-23,-17,6,-27,-3,7,-22,22,9,-18,-25,-16,-15,-16,0,6,-22,2,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-9,-33,-4,-5,-18,-17,-15,-19,-6,-15,-15,-13,12,-8,-5,-14,-12,-21,2,-11,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-11,20,-28,23,17,-34,-3,3,-29,2,-25,-16,15,-12,20,-2,2,-10,-30,-30,-18,19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-19,-25,-20,-23,-15,25,-23,-9,-23,-5,-4,-12,-23,-21,-21,-9,-14,-4,-21,-18,-23;
MA   /M: SY='S'; M=2,7,-15,4,0,-20,-3,10,-21,-8,-29,-17,19,-13,1,-7,27,10,-17,-39,-14,0;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,37,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,13,-27,21,23,-31,0,-6,-32,5,-27,-21,6,-8,5,-3,5,-7,-26,-31,-20,14;
MA   /M: SY='S'; M=9,1,-16,-3,-4,-21,4,-9,-22,-4,-25,-17,10,-14,-2,0,20,6,-14,-32,-19,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27,61,-30,-20,6,-30,21,6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,3,2,22,-27;
MA   /M: SY='V'; M=7,-20,-12,-24,-20,-5,-22,-24,14,-18,5,3,-18,-21,-20,-18,-1,9,24,-27,-11,-20;
MA   /M: SY='A'; M=13,5,-18,6,-2,-22,-8,-13,-13,-10,-14,-13,1,-12,-6,-16,10,1,-7,-30,-17,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-18,-26,-18,6,-28,-20,15,-26,39,15,-25,-26,-18,-18,-21,1,8,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-9,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,43,-27;
MA   /M: SY='C'; M=22,-17,31,-25,-20,-16,-15,-25,-9,-18,-10,-10,-17,-23,-20,-23,0,-3,6,-31,-21,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,16,-30,27,54,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,6,-3,14,-3,0,-10,-30,-33,-20,31;
MA   /M: SY='K'; M=-9,7,-25,2,6,-26,-17,3,-24,22,-25,-9,11,-12,13,14,-1,0,-21,-26,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-22,-18,-26,-18,4,-26,-15,15,-21,32,24,-22,-24,-13,-16,-19,1,8,-22,-2,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-11,4,-30,4,13,-29,-16,-3,-25,19,-27,-13,7,5,13,13,-4,-8,-26,-26,-16,12;
MA   /M: SY='V'; M=1,-27,-15,-31,-27,-1,-28,-26,29,-20,11,16,-26,-26,-23,-20,-11,-3,38,-26,-8,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-13,23,-28,30,16,-31,-15,-4,-29,16,-26,-19,12,-11,3,4,-3,-8,-21,-32,-16,10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-3,-25,-2,7,-17,-16,21,-25,4,-21,-11,3,-16,7,17,3,-5,-20,-24,1,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-27,48,-31,-21,13,-30,23,9,-23,-29,-31,-21,-23,-10,7,-3,17,-27;
MA   /M: SY='I'; M=8,-25,-18,-30,-23,-4,-25,-26,24,-22,15,10,-22,-22,-20,-23,-11,-5,24,-23,-8,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-12,60,-21,-25,-15,-25,-23,-12,-22,-14,-12,-8,-34,-25,-22,-6,-6,2,-43,-23,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,68,-30,-20,3,-30,17,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='H'; M=-12,3,-29,1,6,-24,-4,15,-25,0,-22,-11,9,-9,11,4,-3,-11,-28,-23,-7,7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-7,-30,-9,1,-23,-24,-12,-16,33,-19,-5,-4,-13,5,25,-12,-10,-11,-20,-8,1;
MA   /M: SY='N'; M=6,10,-21,4,-6,-21,-2,-11,-11,-10,-16,-12,12,-15,-8,-15,4,-4,-11,-29,-18,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-18,7,-28,7,3,-23,-15,2,-30,21,-23,-15,13,-19,7,46,-5,-8,-23,-26,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-3,-25,1,8,-17,-24,-13,-5,0,-3,-4,-9,-15,-4,-6,-10,-8,-2,-27,-11,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01039;
//
ID   SURF4_MP; MATRIX.
AC   MP01339;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   SURF4 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1649036; R2=0.0119460; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1226; N_SCORE=18.801; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=196; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-10,-18,-13,-14,-9,-20,-1,-13,-9,-7,-11,-16,-13,-18,12,5,12,-28,-17,-13;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-26,-36,-28,59,-29,-12,-3,-24,4,-3,-23,-30,-30,-18,-23,-13,-6,34,41,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,2,-15,-8,-10,6,-14,-11,-12,-12,-14,-12,11,-17,-13,-10,13,19,-9,-25,-5,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-26,-25,-19,0,-31,-14,17,-5,2,7,-17,-22,-13,-10,-16,-8,14,-11,14,-19;
MA   /M: SY='P'; M=-12,9,-33,15,5,-30,-13,-9,-25,-5,-30,-22,7,43,-5,-13,-3,-8,-30,-35,-25,-3;
MA   /M: SY='A'; M=12,0,-16,-7,-7,-18,-7,-9,-13,-1,-17,-11,8,-16,-5,3,8,1,-6,-28,-17,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-3,-26,-1,16,-4,-24,3,-15,-2,-11,-11,-7,-13,3,-6,-3,3,-16,-9,18,7;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-19,0,6,-21,-12,-8,-21,27,-23,-10,2,-8,6,15,2,-2,-14,-19,-10,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-22,-5,0,-16,-11,-11,-11,-5,-16,-11,-11,49,-5,-11,-5,-5,-16,-16,-16,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-12,-13,-15,-11,7,-14,1,7,-8,11,16,-12,-14,-5,-7,-12,-5,2,-1,16,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-12,-5,-13,-22,17,-19,8,-4,-1,-5,-22,3,35,-15,-12,-15,-22,-1,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,39,-30,54,15,-35,-12,23,-38,-2,-28,-23,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-11,8;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,62,-32,-22,11,-30,12,5,-20,-28,-35,-22,-20,-10,7,3,23,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-28,-24,-30,-22,12,-32,-15,23,-26,34,16,-26,-28,-18,-20,-26,-10,11,-10,16,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-18,41,-30,59,29,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,17;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,69,-30,-11,0,-26,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,14,41,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='T'; M=-2,9,-12,-3,-8,-12,-16,-13,-12,-8,-14,-12,13,-12,-8,-8,18,39,-7,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-28,-19,7,-28,-18,17,-26,40,21,-26,-27,-17,-18,-24,-4,9,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='V'; M=7,-25,-18,-32,-25,-5,-27,-28,29,-22,10,10,-21,-21,-21,-24,-10,-4,30,-24,-8,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-28,-20,12,-29,-9,16,-23,36,22,-27,-29,-15,-17,-27,-10,6,-10,16,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-17,-31,-26,4,-31,-26,29,-26,28,16,-29,-29,-24,-21,-20,-6,30,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-15,-28,-26,-2,-30,-28,26,-20,8,8,-21,-23,-23,-20,-6,9,34,-28,-8,-26;
MA   /M: SY='N'; M=3,15,-19,4,-2,-20,-5,21,-20,-6,-23,-13,27,-16,0,-6,10,-2,-21,-33,-11,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-14,-17,-14,-3,-24,-20,1,-17,11,1,-11,-17,-14,-14,2,29,4,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=3,-18,-33,-12,-2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18,68,-10,-20,-6,-8,-23,-28,-28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-30,5,22,-30,12,-9,-34,7,-25,-18,0,-9,4,-1,-2,-14,-28,-25,-22,13;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-30,-16,-34,-28,36,-30,-24,15,-26,19,8,-26,-30,-32,-20,-19,-6,20,-11,9,-28;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-26,-16,-32,-26,18,-26,-17,20,-19,14,26,-24,-26,-22,-16,-16,-6,24,-17,3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01041;
//
ID   CORNICHON_MP; MATRIX.
AC   MP01340;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cornichon family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=44;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=40;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.7228918; R2=0.0169705; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=785; N_SCORE=19.035; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=46; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,44,18,-30,-30,-22,-20,-27,-8,16,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-19,-33,-27,1,-31,-24,33,-23,19,22,-25,-25,-21,-21,-17,-6,33,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='L'; M=1,-27,-17,-28,-20,4,-25,-22,17,-25,34,14,-27,-27,-20,-20,-21,-7,15,-22,-5,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-6,2,22,-9,-15,-14,-18,-15,-12,-14,-16,-13,8,-24,-15,-14,4,11,-4,-38,-18,-15;
MA   /M: SY='C'; M=14,-15,48,-23,-21,-22,-3,-25,-24,-21,-18,-16,-13,-26,-21,-25,-1,-8,-9,-34,-26,-21;
MA   /M: SY='A'; M=10,-17,-16,-24,-16,4,-18,-20,4,-19,4,-1,-12,-18,-16,-19,0,4,5,-19,-5,-16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,4,1,-7,-12,-9,-16,-8,-6,-16,2,-5,14,-27,-12,-12,-8,-5,-12,-34,-14,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-25,-33,-24,-1,-33,-25,35,-27,18,14,-17,-20,-17,-25,-13,-6,21,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-21,-38,-28,56,-30,-18,10,-27,13,12,-20,-27,-31,-20,-20,-10,6,1,21,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-25,-1,-32,-27,36,-14,-21,-8,-28,6,-3,-18,-30,-32,-21,-17,-12,-5,-8,7,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=15,-8,-19,-12,1,-27,-13,-7,-9,-2,-12,-3,-8,-13,20,-6,3,-5,-7,-21,-14,11;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-37,-28,0,-35,-25,42,-25,18,25,-22,-22,-18,-25,-18,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-24,-38,-24,-21,14,-25,14,-12,-14,-11,-8,-23,-28,-11,-12,-26,-19,-21,66,51,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-14,-22,-20,-16,28,-25,26,-13,-19,-4,-2,-6,-23,-16,-11,-10,-5,-11,-11,20,-16;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-16,-18,-24,-21,-5,-29,-25,19,-19,4,4,-12,-17,-17,-19,0,20,19,-26,-6,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='A'; M=13,-19,5,-26,-18,-8,-17,-18,1,-19,12,9,-19,-22,-15,-20,-10,-6,3,-25,-12,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-23,-29,-25,44,-30,-3,5,-19,5,2,-22,-30,-24,-15,-18,-8,3,13,47,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-1,24,-24,33,6,-32,5,-8,-32,-6,-27,-24,11,-11,-5,-13,8,-5,-22,-34,-21,1;
MA   /M: SY='D'; M=-15,29,-30,43,41,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-1,-30,2,21,-26,-20,-3,-30,29,-23,-13,0,-11,13,38,-7,-10,-23,-23,-13,15;
MA   /M: SY='T'; M=12,5,-13,0,-5,-18,-12,-17,-15,-8,-13,-13,0,-10,-8,-13,14,25,-5,-29,-15,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,51,-30,3,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,59,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-14,-30,-19,-9,-16,-29,-19,7,13,-7,4,-9,-15,-4,2,-15,-10,3,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-7,35,-19,17,0,-20,0,7,-20,-1,-30,-20,54,-19,0,-1,14,3,-27,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,75,-9,-19,-3,-6,-27,-31,-29,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-15,32,-30,47,38,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-14,-25,-14,1,-17,-25,-4,-1,-9,13,9,-14,-19,23,-4,-14,-10,-11,-20,-5,12;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-15,79,-22,-24,-21,-11,-25,-30,-25,-23,-20,-12,-32,-24,-25,-1,-7,-13,-44,-28,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-10,12,-23,4,1,-21,-9,1,-25,15,-27,-15,24,-17,5,25,6,-1,-22,-31,-15,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,-2,2,-25,-17,-9,-24,17,-26,-14,4,14,1,13,-4,-2,-22,-27,-17,-1;
MA   /M: SY='V'; M=3,-27,-14,-29,-23,2,-26,-24,20,-23,24,12,-27,-27,-23,-20,-16,-4,26,-24,-7,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-13,28,-23,13,0,-20,-5,20,-23,3,-27,-16,45,-20,3,10,5,-4,-29,-36,-13,0;
MA   /M: SY='K'; M=3,-13,-29,-14,-3,-21,-15,-12,-20,7,-20,-11,-11,-3,5,6,-8,-11,-19,6,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-14,-23,-24,-23,-15,5,-27,-8,3,-11,23,9,-20,-27,-10,6,-23,-10,-1,-12,10,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-22,-15,-2,-11,-26,-19,13,-14,-1,1,-13,-16,-9,-16,-3,-3,14,-28,-11,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-20,-20,-21,-15,-3,-26,-16,3,-9,16,6,-17,-24,-12,6,-14,1,6,-23,-6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-35,-15,-5,-19,-23,-20,-9,-15,-9,-9,-23,58,-13,-20,-15,-10,-19,-27,-22,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-30,13,45,-29,-20,-1,-30,18,-21,-17,0,-4,17,13,-3,-10,-27,-27,-17,31;
MA   /M: SY='Y'; M=6,-1,-20,-11,-12,-3,-11,2,-5,-7,-8,1,4,-20,-6,-10,-3,-4,-9,-12,10,-10;
MA   /M: SY='I'; M=1,-24,-26,-31,-24,-7,-15,-26,23,-25,11,9,-16,-20,-18,-26,-13,-10,13,-20,-8,-24;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01042;
//
ID   FRATAXIN_1_MP; MATRIX.
AC   MP01344;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Frataxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.6624608; R2=0.0133989; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=624; N_SCORE=13.013; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=3,3,-20,-2,2,-26,-5,2,-18,-3,-22,-10,9,-13,15,-4,12,2,-18,-29,-15,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,4,-27,4,-10,-28,36,-3,-33,-13,-26,-16,8,-18,-11,-15,0,-15,-26,-26,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-6,12,-25,8,-5,-22,22,-4,-28,-9,-27,-19,20,-18,-7,-10,6,-8,-26,-26,-16,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-30,0,-30,-29,31,-20,11,13,-29,-29,-28,-20,-11,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21,11,-28,-16,20,-25,39,28,-27,-27,-16,-18,-27,-10,10,-18,2,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-2,2,-13,-7,-6,-12,-19,-16,-9,-9,-12,-10,4,-11,-6,-9,16,37,-4,-30,-11,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,31,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-22,8,14,-22,-16,-7,-20,7,-19,-12,7,-11,3,2,5,6,-15,-30,-15,8;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-34,-26,48,-28,-21,6,-27,16,4,-20,-27,-31,-20,-17,-4,5,-3,16,-26;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,8,-25,13,17,-25,2,-6,-25,-4,-19,-17,4,-6,2,-8,1,-8,-22,-28,-19,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-6,24,-21,21,4,-25,5,-1,-26,-1,-26,-20,26,-14,-2,-5,7,-4,-24,-32,-19,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-8,-26,-9,-11,-18,18,-11,-25,-3,-18,-11,-1,-19,-11,0,-5,-11,-18,-21,-16,-11;
MA   /M: SY='G'; M=6,1,-18,-1,-7,-23,19,-14,-25,-12,-26,-19,7,-14,-8,-13,19,7,-16,-31,-22,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-24,-8,3,-24,-23,-8,-10,8,-13,-2,-4,-12,19,4,-1,5,-11,-23,-9,10;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-27,-25,-31,-26,11,-34,-13,27,-22,15,12,-23,-26,-19,-21,-19,-8,19,-6,24,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-24,-37,-29,6,-36,-29,40,-28,20,16,-23,-24,-24,-26,-19,-8,31,-20,0,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,36,-19,18,0,-20,0,8,-20,-1,-30,-20,55,-19,0,-1,13,2,-28,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-27,-7,2,-22,-20,-8,-25,32,-20,-8,-2,-15,6,37,-8,-6,-15,-21,-10,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,0,-30,0,18,-38,-20,18,-21,8,-20,0,1,-11,56,9,-1,-11,-30,-21,-7,36;
MA   /M: SY='E'; M=3,0,-22,3,23,-24,-15,-10,-21,-1,-19,-17,-3,7,4,-8,9,6,-18,-30,-19,13;
MA   /M: SY='P'; M=1,-17,-32,-11,-3,-26,-16,-20,-16,-11,-25,-17,-16,61,-10,-19,-2,-5,-20,-30,-27,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-5,-19,-14,-13,-3,-16,-7,4,-15,12,12,1,-23,-9,-12,-10,-5,-3,-26,-8,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-29,-4,6,-26,-21,17,-25,21,-19,-4,0,-15,19,25,-9,-12,-22,-22,-4,11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,4,-30,9,38,-36,-20,6,-24,10,-20,-9,0,-6,42,6,0,-10,-30,-24,-14,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-36,-27,3,-35,-26,38,-28,28,21,-24,-24,-20,-25,-22,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,6,-31,-22,26,-27,37,20,-28,-26,-20,-21,-25,-9,18,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='A'; M=39,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,18,6,-3,-26,-20,-7;
MA   /M: SY='S'; M=18,-1,-11,-5,-4,-18,-5,-15,-16,-10,-20,-15,2,-10,-5,-13,25,21,-6,-32,-18,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-9,-33,-6,4,-27,-20,-11,-25,25,-27,-11,-7,20,3,20,-10,-10,-22,-23,-16,1;
MA   /M: SY='S'; M=5,-12,-14,-15,-11,-7,-12,-16,-4,-11,-8,-3,-8,-18,-9,-12,9,6,4,-27,-11,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,0,-22,-3,-11,-26,39,-13,-31,-14,-30,-20,11,-17,-11,-14,14,-5,-24,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='G'; M=2,-10,-29,-10,-20,-30,67,-20,-39,-20,-29,-20,0,-20,-20,-20,0,-19,-29,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-16,-25,-20,-16,31,-25,4,-8,-7,-5,-3,-11,-25,-15,-7,-14,-9,-10,7,39,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-30,-2,0,-20,-20,80,-30,-2,-20,-2,8,-20,10,14,-10,-18,-28,-28,14,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28,68,-30,-10,0,-25,8,0,-20,-30,-33,-18,-20,-10,-2,15,42,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-10,18,-26,23,10,-21,-11,-4,-28,3,-23,-19,10,-13,0,4,1,-6,-22,-29,-14,4;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-29,-22,-17,24,-28,4,-3,-11,3,-1,-20,-28,-12,-6,-20,-11,-10,23,48,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-11,5,-25,8,8,-23,-19,-8,-15,6,-15,-9,0,-14,4,4,-4,-5,-10,-28,-13,5;
MA   /M: SY='N'; M=-9,12,-27,11,12,-26,1,-1,-24,-2,-20,-15,14,-14,5,-3,0,-9,-25,-29,-18,8;
MA   /M: SY='G'; M=-5,8,-28,11,6,-30,18,-9,-33,0,-27,-19,7,-13,-1,-6,0,-11,-27,-26,-22,3;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-24,1,10,-26,-10,0,-23,10,-22,-12,4,-11,10,6,3,-5,-18,-26,-14,9;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-35,-46,-35,-28,5,-10,-28,-22,-20,-21,-20,-34,-28,-19,-20,-33,-27,-29,124,22,-19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01043;
//
ID   COE_MP; MATRIX.
AC   MP01345;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   COE family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8380120; R2=0.0097936; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2202; N_SCORE=25.403; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=272; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-37,-30,0,-37,-30,43,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,37,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-30,53,34,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,47,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01044;
//
ID   CLAUDIN_MP; MATRIX.
AC   MP01346;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Claudin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.3679972; R2=0.0138752; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=182; N_SCORE=7.883; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=82; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=8,-9,-17,-12,-6,-13,-13,-10,-9,-2,-10,-4,-6,-15,-2,-6,6,4,-5,-21,-5,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-8,-22,-13,-16,12,-16,-9,-5,-16,-5,-5,-5,-21,-18,-15,-5,3,-4,-12,10,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-21,-20,-27,-22,3,-27,-23,19,-22,10,6,-17,-16,-21,-21,-11,-1,17,-22,-5,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-8,1,-27,3,-6,-13,6,-4,-23,-13,-16,-14,0,-9,-12,-14,-6,-12,-21,-22,-10,-9;
MA   /M: SY='B'; M=-6,19,-22,19,0,-24,1,-4,-25,-8,-21,-18,16,-15,-5,-10,8,3,-20,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,18,-9,11,5,-24,-10,0,-24,0,-25,-17,24,-17,4,2,6,0,-23,-35,-18,4;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-17,-25,-22,-17,-9,-27,-20,15,-15,1,3,-10,-6,-14,-12,-9,-3,9,-26,-10,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-14,-22,-16,-12,-9,-28,-20,17,-12,5,5,-13,-20,-14,-15,-12,-6,17,-26,-8,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-17,-9,-2,-12,-20,-15,-7,-3,-6,-5,-6,-6,-6,-6,4,19,-2,-25,-10,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='A'; M=8,8,-17,5,-5,-13,-10,-11,-14,-9,-13,-10,4,-14,-9,-13,4,3,-7,-27,-13,-7;
MA   /M: SY='E'; M=1,-8,-20,-8,6,-17,-20,-11,-2,-7,-4,-3,-8,-15,2,-10,-3,-4,0,-27,-13,4;
MA   /M: SY='T'; M=0,-5,-16,-12,-10,-8,-13,-16,-7,-11,-6,-6,-1,-17,-11,-9,5,16,-1,-26,-11,-11;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-26,-25,-19,2,-19,-15,8,-15,6,7,-18,-23,-11,-14,-16,-9,3,-4,6,-16;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-23,-23,-25,-21,16,-23,-8,-9,-17,-7,-8,-21,-26,-16,-15,-15,-7,-12,40,32,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-26,2,23,-26,-19,-1,-22,15,-18,-8,-2,-8,15,8,-2,-4,-20,-25,-12,19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-6,-17,-29,61,-16,-37,-17,-30,-20,8,-20,-17,-17,1,-17,-30,-23,-29,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-11,-23,-14,-11,-8,-19,-1,-2,-3,-1,18,-12,-19,-2,-4,-13,-10,-1,-12,0,-7;
MA   /M: SY='B'; M=-4,9,-22,8,7,-21,-13,-8,-14,-1,-19,-11,9,-12,0,-6,8,2,-12,-32,-15,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-14,-24,-19,-9,-21,-22,11,-11,1,3,-19,-22,-15,-10,-4,0,23,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-12,-22,-15,-6,-11,-22,-13,-5,-3,-7,0,-10,-17,-2,3,-2,7,-1,-14,-6,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,5,-27,7,9,-23,-17,17,-19,4,-17,-5,4,-14,27,6,-4,-9,-24,-16,4,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=14,4,-14,5,7,-23,-3,-10,-21,-7,-24,-19,5,-9,0,-11,24,9,-12,-34,-20,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-3,4,-14,-1,-1,-13,-13,-10,-12,-6,-11,-8,6,-11,-4,-6,13,23,-7,-29,-12,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-28,-13,-19,-24,42,-19,-27,-13,-22,-14,-4,-21,-17,-7,-3,-16,-17,-21,-24,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-25,-18,-8,-9,-15,-11,-1,-11,-2,3,-13,-19,-3,-8,-9,-8,-2,-13,-6,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-13,-22,-17,-12,-2,-20,-1,-1,-6,-2,8,-7,-20,-4,1,-5,-1,-3,-17,5,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,11,-26,12,18,-31,-15,13,-24,4,-22,-10,11,-11,29,2,4,-5,-27,-29,-12,23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-28,-2,1,-23,-11,-12,-24,19,-19,-10,-4,-15,1,11,-9,-8,-18,-12,-10,1;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-10,-26,-7,-2,-11,-23,-12,1,-11,0,5,-13,-3,-4,-13,-12,-9,-2,-25,-10,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-22,-26,-24,-20,33,-29,3,-1,-14,4,0,-19,-23,-17,-12,-18,-7,-7,14,49,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-27,34,8,-27,-14,-3,-26,-5,-23,-21,7,-1,-5,-10,-1,-7,-19,-35,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=4,4,-14,5,3,-21,-7,-10,-20,-6,-25,-18,7,-10,2,-7,27,18,-12,-36,-17,2;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-31,-23,6,-28,-20,18,-20,16,16,-22,-23,-16,-15,-19,-7,11,-4,2,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-26,-24,-28,-21,7,-24,-18,12,-26,32,12,-25,-29,-19,-19,-27,-12,3,-2,5,-20;
MA   /M: SY='A'; M=19,-12,-19,-18,-13,-9,-5,-11,-7,-13,-7,-7,-10,-13,-10,-17,0,-4,-5,-12,0,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-14,-26,-17,10,-27,-19,12,-26,32,11,-24,-28,-19,-19,-21,-7,7,-21,-1,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-3,-28,3,5,-27,-13,-6,-23,-5,-27,-18,-2,29,0,-10,6,-2,-23,-32,-21,0;
MA   /M: SY='A'; M=11,-12,-22,-14,-9,-23,4,-17,-14,-11,-16,-10,-9,-1,-5,-14,2,-4,-9,-24,-20,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-11,8,-26,14,6,-16,-18,6,-17,-5,-10,-8,-2,-16,2,-9,-7,-8,-16,-19,5,3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-24,-26,-16,-5,-29,-19,17,-18,18,12,-21,-13,-10,-16,-18,-8,10,-22,-6,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-8,-27,-8,9,-26,-23,-1,-8,3,-6,3,-8,-15,31,4,-7,-9,-14,-21,-9,19;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01045;
//
ID   MRAY_1_MP; MATRIX.
AC   MP01347;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MraY family signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.8331385; R2=0.0169448; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=128; N_SCORE=8.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=40; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-20,-24,-16,5,-23,-19,7,-15,4,4,-15,-21,-14,-15,-11,-5,5,-14,0,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-27,-8,-8,-23,19,-2,-27,-10,-20,-12,-3,-12,-7,-8,-2,-13,-21,-23,-17,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-28,4,17,-34,-17,4,-22,12,-22,-6,5,-10,39,10,1,-6,-27,-23,-12,28;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-3,-27,-1,4,-19,-20,-10,-9,-7,-15,-10,-5,8,-1,-12,-3,-4,-11,-27,-13,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-27,-28,-22,-4,-29,-17,23,-18,7,9,-17,-17,-16,-14,-15,-9,17,-20,0,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-7,-12,-7,-4,-21,-16,-6,-27,14,-20,-12,-1,-21,1,38,-8,-10,-18,-25,-13,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,7,-22,11,23,-25,-15,-6,-24,4,-19,-16,2,-7,8,0,4,-1,-20,-30,-17,15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-21,19,15,-23,-17,-7,-25,3,-18,-17,1,-9,0,-5,-4,-8,-20,-26,-12,8;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-25,-18,-20,-9,29,-20,-19,-21,-10,-9,-8,-21,-21,-20,-5,-13,-14,-16,-14,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-14,-34,-6,3,-27,-17,-18,-17,-9,-24,-17,-16,58,-8,-18,-7,-9,-22,-29,-26,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-27,-2,10,-26,-18,-9,-18,9,-19,-9,-6,6,10,1,-2,-4,-16,-25,-16,9;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-9,-11,-12,-7,-10,-9,-15,-14,-13,-11,-10,-4,-14,-9,-11,5,4,-10,-20,-12,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-1,-29,-2,-1,-21,-15,87,-29,-10,-20,-1,8,-19,8,-2,-8,-19,-28,-29,15,-1;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-10,-24,-12,-1,-6,-21,-5,-9,-2,-2,0,-7,-18,4,-1,-9,-7,-10,-19,-4,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-6,6,-24,4,5,-23,-11,-2,-21,9,-21,-12,7,-14,3,5,1,-2,-17,-27,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-29,-2,8,-29,-19,-10,-29,46,-28,-10,-1,-10,9,28,-9,-9,-19,-20,-11,8;
MA   /M: SY='A'; M=12,-6,-14,-10,-2,-22,-11,-13,-16,4,-18,-11,-4,-10,0,0,7,2,-8,-26,-16,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-5,0,-28,-1,-11,-25,40,-8,-33,-13,-27,-18,7,-19,-13,-14,1,-13,-27,-21,-18,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-14,-15,-13,-9,-23,-22,0,-10,-6,-4,-5,-13,-12,-11,10,34,7,-28,-9,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=1,0,-10,-9,-9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,1,-10,-9,-10,23,46,-1,-31,-11,-9;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-18,-20,-27,-19,-4,-10,-4,12,-11,13,47,-17,-19,-3,-12,-16,-10,6,-20,-4,-11;
MA   /M: SY='G'; M=3,-10,-29,-11,-19,-29,66,-20,-38,-19,-29,-19,-1,-19,-19,-20,1,-19,-28,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-29,-20,-33,-26,1,-32,-27,33,-26,22,15,-25,-25,-23,-24,-17,-6,30,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-26,-19,-31,-24,8,-26,-22,22,-24,20,16,-23,-25,-21,-21,-16,-6,19,-19,-1,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-39,-29,34,-34,-24,25,-29,17,13,-21,-25,-28,-24,-20,-10,16,-8,12,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-34,-27,9,-33,-25,30,-27,26,16,-26,-27,-24,-23,-20,-7,27,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-23,-21,-26,-19,6,-23,-21,11,-22,11,4,-19,-12,-20,-20,-10,-3,8,-20,-4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=16,-11,-13,-15,-11,-17,-1,-19,-8,-14,-15,-10,-6,-9,-11,-17,13,5,0,-29,-19,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-22,-16,-27,-22,2,-17,-22,12,-23,8,7,-17,-22,-20,-21,-9,-2,12,-22,-6,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-26,-19,-30,-23,5,-28,-24,20,-24,19,10,-23,-25,-22,-21,-16,-4,19,-17,-3,-23;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-27,-18,-31,-24,2,-27,-25,24,-26,22,12,-23,-25,-21,-23,-17,-7,20,-22,-4,-24;
MA   /M: SY='S'; M=10,-11,-15,-14,-11,-12,-6,-18,-8,-15,-10,-9,-7,-9,-12,-16,11,8,-1,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='T'; M=1,-14,-9,-19,-17,-4,-17,-18,1,-17,-1,-2,-12,-20,-15,-17,3,11,7,-24,-4,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-20,-28,-22,12,-27,-18,17,-25,29,14,-23,-28,-21,-19,-21,-8,12,-17,4,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-22,-31,-23,9,-23,-23,17,-27,26,12,-25,-26,-22,-21,-21,-10,11,-12,0,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-29,-15,-31,-24,9,-24,-23,-1,-23,6,-1,-27,-28,-21,-20,-22,-12,-4,30,8,-21;
MA   /M: SY='A'; M=5,-11,-19,-16,-14,-12,1,-8,-9,-13,-6,0,-5,-19,-10,-13,-3,-6,-6,-22,-11,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-8,2,-26,2,-2,-20,-14,-8,-16,3,-15,-10,2,-5,-3,3,-6,-7,-15,-27,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-22,-24,-19,5,-24,-19,5,-21,10,2,-17,-15,-18,-17,-17,-9,0,-4,-1,-19;
MA   /M: SY='S'; M=-2,0,-21,-1,-5,-17,-1,-4,-19,-10,-18,-12,3,-12,-5,-10,7,2,-15,-26,-13,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01046;
//
ID   MRAY_2_MP; MATRIX.
AC   MP01348;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MraY family signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2235348; R2=0.0094542; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2046; N_SCORE=19.563; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=664; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-38; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-77,-81,-75,39,-30,-76,53,-1,21,11,-13,-11,-70,-70,-71,-63,14,101,-45;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-72,-85,-77,66,-30,-71,-12,-76,62,12,-79,-81,-73,-75,-72,-65,-47,79,-40;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-74,7,-72,86,-76,-54,2,-70,-47,9,-68,-80,-70,-69,-22,-63,-54,-42,88;
MA   /M: SY='W'; M=-7,-75,-82,-76,29,-77,-72,42,-72,5,34,-76,-11,-70,-73,-23,-61,31,101,39;
MA   /M: SY='P'; M=6,11,-75,-67,12,-73,-71,16,-70,41,-48,-74,83,-69,-75,-22,-59,-19,-73,-61;
MA   /M: SY='F'; M=-28,-72,-85,-79,75,-30,-72,19,-77,54,-40,-79,-82,-76,-76,-73,-64,1,63,-38;
MA   /M: SY='A'; M=66,13,-68,-66,-68,11,-72,26,-65,-59,-57,-60,-68,-63,-70,17,22,13,-79,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-26,-71,-74,-74,-6,-29,-64,49,-70,28,35,13,-76,-67,-72,-21,-14,32,-65,49;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-70,-85,-80,102,-81,-71,6,-77,15,-45,-77,-82,-82,-76,-70,-63,23,-51,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-70,-82,-77,-52,-30,-81,45,-74,-42,11,-76,-77,-74,-76,-66,-55,81,62,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-26,-71,-83,-77,-7,-83,-73,55,-75,43,61,-77,-11,-71,-75,-71,-58,45,-74,-55;
MA   /M: SY='V'; M=-23,-68,-77,-73,-54,-77,-78,10,-70,-6,11,-12,-75,-71,-73,-20,22,81,62,-58;
MA   /M: SY='G'; M=44,-70,-65,-69,-15,81,-68,-76,-66,-74,5,-53,-68,-63,-72,17,-59,-69,-73,-70;
MA   /M: SY='S'; M=9,-67,-57,37,26,-63,-64,-20,-58,-62,7,-54,-64,-54,-64,58,54,-22,34,-57;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-66,-58,-60,-71,-1,-61,-1,-59,-69,-65,16,-66,-53,-64,92,-41,-3,-82,-66;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-68,-36,-56,-76,-51,37,-77,-49,-82,-69,121,-73,-49,-56,-13,-47,-78,-96,-68;
MA   /M: SY='A'; M=81,13,-66,-62,-74,22,-68,-68,-63,-34,-63,-58,-67,-59,-68,36,-51,-57,-77,-71;
MA   /M: SY='V'; M=8,-65,-76,-72,13,-76,-77,-29,-70,-21,10,-70,-74,-72,-73,-57,41,83,-81,-58;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-56,-77,-51,-43,-76,-14,-84,-70,124,-73,-49,-55,-44,-47,-78,-95,-72;
MA   /M: SY='L'; M=-28,12,-84,-77,29,-84,-70,-8,-77,81,-32,-81,-83,-72,-75,-74,-62,-14,-68,-50;
MA   /M: SY='T'; M=9,-62,-58,-61,-68,-64,-67,-20,-58,-63,-60,-5,-61,-61,-66,7,104,-51,-86,-66;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-69,-84,-77,-44,-84,-68,21,-76,74,71,-80,-80,-69,-74,-75,-61,16,-73,-54;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-81,119,-31,-88,-64,-53,-86,-55,-85,-84,-35,-67,-54,-63,-56,-57,-83,-103,-70;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-84,-76,-41,-85,-67,-32,-77,89,37,-83,-83,-70,-74,-77,-63,-40,-71,-53;
MA   /M: SY='A'; M=86,13,-70,-63,-67,-55,-70,-55,-65,10,-54,-65,-70,-62,-69,-14,-53,0,-77,-68;
MA   /M: SY='A'; M=56,-68,-67,-67,-68,36,-71,46,-66,-60,-57,-58,-67,-62,-71,35,8,-47,-76,-67;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-75,-68,-75,-74,91,-70,-71,-69,-70,47,-54,-69,-66,-75,-16,-64,-6,34,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-6,55,-69,-66,-63,-69,-70,16,-66,11,9,-10,58,-66,-72,15,41,12,-82,-66;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-67,-69,-68,-60,20,-67,5,-66,-25,60,-59,-69,-63,-69,41,32,43,-77,-2;
MA   /M: SY='V'; M=52,-67,-78,-72,-56,-70,-75,43,-71,14,35,-72,-74,-68,-73,-59,-55,54,-78,-61;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-72,-83,-78,14,-83,-74,73,-75,29,61,-74,-76,-71,-76,-23,-14,26,-72,-52;
MA   /M: SY='V'; M=53,12,-72,-68,-62,-25,-74,28,-68,-25,-51,-65,-71,-66,-72,16,8,53,-80,-65;
MA   /M: SY='F'; M=17,12,-75,-73,54,19,-69,-15,-71,32,34,-66,-75,-69,-72,1,7,0,-67,-50;
MA   /M: SY='I'; M=26,-69,-73,-71,-58,28,-71,35,-69,32,10,-64,-72,-66,-73,15,7,14,-76,-62;
MA   /M: SY='A'; M=49,-68,-66,-66,10,47,-70,-61,-65,-66,-62,-57,15,-64,-71,17,32,10,-75,-65;
MA   /M: SY='Y'; M=-68,12,-81,-76,31,-82,-58,-39,-74,67,51,-78,-83,-69,-71,-73,-64,-46,-54,72;
MA   /M: SY='G'; M=49,12,-69,-70,-69,60,-72,0,-68,-32,-60,-59,-70,-65,-73,3,-14,11,34,-68;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-72,-83,-78,-7,-83,-78,79,-76,35,13,-75,-76,-73,-77,-69,-15,27,-73,-55;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01046;
//
ID   NODA_MP; MATRIX.
AC   MP01349;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nodulation protein nodA signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1712713; R2=0.0121687; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1441; N_SCORE=21.696; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=192; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-18,-38,-10,0,-28,-20,-16,-22,-1,-28,-18,-16,66,-6,0,-10,-10,-28,-28,-26,-8;
MA   /M: SY='T'; M=-4,0,-14,-8,-8,-12,-20,6,-14,-10,-12,-8,2,-12,-6,-8,13,35,-7,-30,-3,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-18,-10,-18,-4,-20,-10,-10,-10,-10,-8,-10,-10,-18,12,9,0,-22,-18,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28,71,-30,-12,0,-26,8,0,-20,-30,-34,-18,-20,-10,-2,14,39,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-12,17,-22,5,-4,-13,-11,22,-13,-9,-11,-7,30,-22,-2,-4,-3,-6,-21,-34,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-8,-28,-8,2,-21,-22,-10,-21,31,-13,-4,-6,-16,4,28,-14,-10,-14,-20,-8,2;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-26,-10,-18,-26,52,-20,-34,-18,-26,-18,0,-18,-18,-18,4,-6,-24,-22,-26,-18;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-26,-12,-18,-28,57,-20,-34,-18,-26,-18,-2,-18,-18,-20,2,-16,-24,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-8,-30,-8,0,-20,-20,19,-30,22,-20,-8,2,-20,10,57,-10,-12,-22,-22,-4,0;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-10,-2,-2,-18,-4,-12,-18,-10,-26,-18,8,-10,-2,-10,36,27,-8,-38,-18,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=32,-8,-14,-14,-10,-22,14,-18,-18,-12,-18,-14,-4,-12,-10,-18,14,0,-8,-24,-22,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-22,-24,-24,-14,13,-26,-12,-5,-6,13,4,-16,-26,-12,16,-20,-10,-4,-13,2,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=31,-18,-10,-24,-18,-12,-11,-24,5,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,19,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,42,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-6,-26,-6,-6,-16,-22,74,-18,-12,-14,2,2,-22,2,-4,-10,-16,-14,-30,14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01047;
//
ID   ISPF_MP; MATRIX.
AC   MP01350;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8782811; R2=0.0139203; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=493; N_SCORE=11.731; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=117; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-17,-32,-23,6,-32,-22,26,-29,39,20,-27,-28,-20,-22,-26,-10,14,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=10,-12,2,-16,-19,-25,31,-22,-29,-19,-22,-17,-6,-21,-19,-21,1,-12,-17,-26,-27,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-18,-11,-18,-29,59,-20,-39,-20,-29,-20,-2,-21,-19,-20,-1,-19,-28,-23,-30,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-29,-17,-32,-26,1,-31,-27,31,-24,20,14,-27,-27,-24,-22,-16,-5,34,-25,-6,-27;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-26,-1,10,-19,-21,-5,-12,4,-9,-6,-3,-10,3,0,-7,-7,-12,-26,-11,5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-37,-29,16,-33,-27,26,-27,13,10,-23,-25,-25,-25,-20,-10,18,0,6,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-2,-32,5,15,-29,-16,-10,-24,0,-26,-19,-5,36,0,-8,-3,-8,-26,-30,-23,5;
MA   /M: SY='H'; M=-12,1,-19,-2,-7,-8,-9,27,-22,-9,-19,-10,7,-20,-5,-7,-3,-9,-21,-21,8,-8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-16,7,14,-21,-18,1,-22,-3,-19,-15,0,-6,2,-7,2,-2,-18,-29,-10,7;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-6,-25,-4,0,-15,-22,-7,-15,7,-11,-5,-7,-6,-1,5,-10,-7,-13,-22,-8,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-28,-9,-14,-28,49,-15,-35,-10,-27,-17,0,-18,-13,-11,-1,-16,-26,-20,-25,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-5,-31,-23,13,-29,-23,13,-28,26,10,-25,-29,-24,-22,-20,-8,11,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-11,-23,-11,2,-14,-23,-13,1,-7,4,1,-12,-16,1,-9,-9,-7,-1,-24,-10,1;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-21,-13,-15,-26,40,-20,-28,-16,-22,-16,-3,-16,-15,-20,6,-10,-18,-21,-26,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-19,6,-29,4,0,-20,-17,84,-29,-8,-22,-4,16,-20,8,-1,-7,-17,-30,-30,14,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,69,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,21,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-23,-13,-17,-27,46,-20,-30,-17,-23,-17,-3,-17,-17,-20,3,-13,-20,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-13,-30,-28,-2,-29,-29,29,-21,10,10,-27,-26,-27,-21,-10,-2,42,-28,-10,-28;
MA   /M: SY='V'; M=6,-24,-18,-27,-22,-4,-14,-24,13,-22,15,7,-21,-24,-21,-21,-12,-6,16,-23,-10,-22;
MA   /M: SY='L'; M=2,-23,-15,-28,-20,9,-24,-20,10,-23,19,8,-20,-23,-19,-20,-13,-3,8,-16,1,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='A'; M=43,-9,-8,-18,-9,-19,-2,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,13,5,-1,-23,-20,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-17,-33,-25,2,-32,-25,29,-27,26,15,-24,-25,-21,-24,-20,-8,22,-23,-4,-25;
MA   /M: SY='C'; M=0,-16,25,-24,-21,-11,-23,-24,-2,-20,-6,-4,-14,-24,-19,-21,0,8,8,-34,-16,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-18,47,-28,61,16,-36,-9,1,-36,0,-29,-28,25,-11,0,-9,2,-7,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-18,-9,-20,0,-19,-11,-10,-12,-11,-8,-10,-9,-19,12,1,-1,-22,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-34,-24,8,-33,-24,28,-29,34,18,-26,-26,-21,-23,-24,-9,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-19,-27,-18,11,-27,-17,14,-27,37,15,-25,-28,-18,-19,-21,-7,7,-19,2,-18;
MA   /M: SY='G'; M=6,-7,-22,-8,-13,-26,44,-17,-32,-16,-29,-19,2,-16,-13,-17,13,-6,-22,-26,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=39,-12,-6,-21,-13,-18,-3,-21,-7,-12,-9,-9,-12,-14,-13,-20,7,1,4,-23,-19,-13;
MA   /M: SY='A'; M=13,-16,-10,-22,-16,-9,-15,-20,2,-17,6,0,-14,-18,-14,-18,-2,3,5,-23,-11,-15;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=10,-3,-19,-8,-12,-24,26,-8,-26,-12,-23,-15,5,-17,-11,-12,6,-8,-19,-25,-21,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-17,-15,-19,-8,-4,-19,-15,0,-13,16,8,-17,-22,-10,-11,-15,-8,-2,-22,-8,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-30,-13,-19,-26,51,-20,-29,-19,-23,-15,-2,-17,-18,-17,-3,-18,-23,-21,-26,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-18,39,-29,55,14,-35,-13,-4,-30,-4,-25,-24,15,-11,-2,-12,-1,-9,-23,-38,-18,5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-28,2,-38,-28,43,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-3,-23,-4,7,-20,-14,-4,-18,5,-16,-7,-1,-12,9,6,4,1,-15,-25,-10,7;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-17,-25,-19,-14,4,-26,26,-3,-17,4,5,-12,-25,-9,-11,-17,-13,-4,-12,16,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-28,-19,-37,-28,65,-27,-20,0,-27,8,-1,-19,-28,-36,-20,-16,-8,2,5,23,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-8,-35,0,-2,-30,1,-17,-26,-11,-28,-20,-10,48,-11,-18,-6,-11,-29,-29,-28,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-11,14,-26,23,11,-27,-16,-9,-21,-4,-21,-19,4,6,-4,-11,0,-3,-16,-35,-20,3;
MA   /M: SY='T'; M=-2,3,-16,-1,-7,-17,-2,-14,-17,-10,-14,-12,5,-15,-8,-10,11,15,-11,-31,-16,-8;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01048;
//
ID   MAPK_MP; MATRIX.
AC   MP01351;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   MAP kinase signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=133;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=128;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4266698; R2=0.0099339; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3180; N_SCORE=35.016; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=310; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,17,-30,24,7,-27,-17,65,-33,-7,-23,-10,13,-17,7,-3,-7,-17,-30,-33,6,3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-2,-22,-4,0,-20,-14,-7,-20,6,-18,-11,0,-9,1,11,4,6,-13,-27,-13,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-27,-10,-1,-18,-12,-2,-15,-1,-11,-7,-8,-4,-3,6,-9,-10,-12,-24,-12,-5;
MA   /M: SY='T'; M=-2,1,-14,-4,-6,-12,-17,-15,-11,-10,-8,-10,1,-13,-8,-8,14,30,-4,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,-28,0,-5,-28,32,-10,-33,-6,-27,-18,8,-17,-5,-4,1,-13,-28,-24,-24,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-26,7,22,-25,-15,-3,-21,5,-17,-11,3,-10,14,4,0,-4,-21,-28,-15,17;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-27,-7,0,-16,-20,-2,-18,18,-18,-7,0,-14,4,21,-8,-7,-14,-18,-2,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-31,-30,4,-30,-30,29,-21,10,10,-29,-30,-30,-20,-11,-1,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-27,-38,-29,0,-38,-28,46,-28,20,21,-21,-21,-20,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,49,-29,-10,0,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-36,-26,7,-34,-24,35,-28,28,22,-23,-24,-20,-24,-22,-10,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-5,-19,-10,-7,-5,-12,0,-13,-9,-14,-4,2,-12,-5,-7,7,5,-10,-25,-5,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-13,15,-23,13,7,-22,-11,2,-25,14,-22,-14,18,-14,6,23,-2,-6,-22,-25,-13,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=1,-21,-29,-18,-10,-20,-20,-23,-4,-13,-16,-10,-20,43,-15,-21,-8,-7,-6,-28,-22,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,8,-26,13,22,-27,-15,1,-25,5,-21,-13,4,-10,22,4,4,-6,-25,-27,-14,22;
MA   /M: SY='H'; M=-10,14,-23,11,2,-23,-11,20,-25,2,-25,-14,20,-15,3,3,7,-1,-21,-34,-9,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-8,-23,-8,3,-19,-21,-12,-7,-2,-10,-5,-7,-6,4,-4,-2,-1,-6,-26,-13,2;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-15,-19,-20,-14,-6,-25,-15,12,-17,5,7,-11,-18,-12,-16,-2,8,11,-27,-6,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-17,7,-26,12,-2,-2,-19,19,-19,-13,-8,-8,2,-20,-8,-10,-10,-11,-18,-22,7,-5;
MA   /M: SY='A'; M=37,-12,13,-22,-14,-19,-6,-22,-13,-14,-11,-11,-12,-16,-14,-21,6,0,-1,-26,-21,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-27,-7,4,-24,-21,-9,-19,26,-16,-4,-4,-13,11,19,-9,-6,-15,-21,-9,7;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10,-1,-20,-16,-1,-30,28,-20,-10,0,-20,9,66,-10,-10,-20,-20,-11,-1;
MA   /M: SY='T'; M=11,-8,-13,-18,-14,-11,-18,-22,1,-14,-5,-5,-6,-12,-12,-16,11,26,6,-26,-11,-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-24,-28,-22,29,-30,-5,10,-23,24,9,-24,-30,-20,-16,-24,-10,1,4,35,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-28,32,19,-24,-24,-20,-24,-23,-7,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-27,-7,2,-22,-21,-8,-20,31,-18,-3,-4,-14,6,27,-10,-7,-12,-21,-9,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-20,23,-29,46,21,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,24,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-5,-25,-6,4,-25,-20,-5,-26,29,-22,-8,0,-15,13,36,-8,-9,-19,-22,-11,7;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-10,-18,-11,-4,-7,-24,39,-15,-13,-2,2,-5,-22,-2,-4,-13,-12,-16,-24,10,-6;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-34,-25,32,-27,-16,14,-24,23,22,-24,-27,-23,-17,-21,-9,11,-10,10,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,6,-26,5,3,-25,-9,3,-29,18,-25,-13,12,-17,7,29,-4,-9,-24,-26,-13,3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-12,8,-32,17,29,-31,-18,-6,-30,12,-25,-19,-1,13,8,4,-4,-10,-28,-29,-20,18;
MA   /M: SY='N'; M=-11,41,-21,26,2,-22,-1,9,-22,0,-30,-21,55,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,18,17,-24,-24,-23,-26,-17,-7,36,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-25,-35,-28,0,-36,-28,40,-27,18,16,-21,-21,-21,-26,-16,-4,29,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-2,-4,-1,-24,7,-14,-27,-10,-24,-18,0,-16,-7,-11,10,0,-17,-32,-22,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-28,-23,-33,-23,4,-31,-23,29,-28,33,20,-24,-24,-18,-23,-23,-9,17,-20,-1,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-24,-18,-10,-1,-26,-12,3,-5,16,7,-17,-23,-8,-2,-20,-9,-1,-17,3,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-28,51,14,-34,-9,12,-35,-1,-29,-25,25,-13,1,-7,1,-9,-29,-39,-16,7;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-18,-34,-28,-1,-33,-27,35,-23,16,16,-24,-24,-22,-23,-16,-6,33,-24,-5,-27;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-25,-22,-32,-23,31,-29,-15,14,-22,15,15,-20,-25,-20,-17,-19,-9,8,-6,15,-21; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-11,-22,-14,-7,-11,-22,-7,-8,-5,-3,-2,-8,-8,-4,2,-3,8,-6,-25,-7,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-32,-8,-2,-26,-15,-17,-18,-10,-26,-18,-13,59,-9,-18,-3,-6,-23,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-1,-31,5,6,-29,-16,-10,-21,-2,-24,-16,-5,31,1,-10,-3,-7,-23,-29,-22,2;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-14,-1,4,-17,-12,-1,-14,1,-15,-8,1,-5,3,-1,6,4,-11,-24,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-1,-17,-2,0,-10,-13,-5,-13,3,-13,-9,2,-8,-1,6,2,1,-10,-19,-6,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-24,14,16,-22,-8,-1,-24,5,-18,-12,6,-10,6,7,0,-7,-20,-24,-13,10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,15,-23,17,20,-24,-10,-1,-24,3,-23,-17,13,-10,8,-1,7,-3,-22,-30,-15,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-24,-21,-30,-25,56,-28,-18,2,-27,13,3,-18,-28,-32,-19,-20,-10,0,0,20,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,10,-26,6,12,-25,-14,6,-25,14,-24,-12,17,-14,16,20,1,-5,-25,-28,-13,12;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-29,50,24,-36,-10,1,-35,1,-27,-25,16,-9,6,-7,1,-9,-29,-36,-19,15;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,7,-33,-29,33,-25,16,13,-26,-27,-27,-23,-15,-5,37,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,29,-30,21,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-33,-25,13,-32,-24,27,-28,30,16,-27,-28,-24,-22,-22,-8,22,-19,1,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-13,-30,-29,2,-30,-26,28,-20,10,10,-28,-29,-27,-20,-11,-2,43,-24,-2,-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-9,-20,-15,-5,6,-21,-7,-6,-10,-3,5,-7,-17,-2,-8,-2,6,-7,-16,3,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-11,6,-26,14,41,-27,-20,5,-26,4,-19,-16,-1,1,12,-4,-2,-9,-25,-31,-17,26;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-30,-21,19,-29,-20,15,-29,41,15,-27,-29,-22,-20,-26,-9,8,-16,4,-21;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-19,-20,-28,-18,-2,-19,-1,17,-9,17,54,-19,-19,2,-10,-18,-10,8,-20,-1,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-11,18,-30,28,24,-34,4,-4,-35,0,-26,-21,7,-9,8,-7,0,-12,-30,-30,-21,16;
MA   /M: SY='T'; M=14,-4,-6,-12,-8,-15,-11,-17,-14,-9,-15,-12,-2,-12,-8,-10,19,25,-3,-30,-15,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-28,61,17,-37,-8,1,-37,0,-30,-28,25,-11,0,-9,3,-7,-29,-40,-20,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-19,20,-29,48,23,-29,-29,-19,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-15,2,-12,-2,-4,-17,-15,46,-24,-9,-20,-7,11,-22,5,-4,-6,-13,-25,-26,9,-3;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-27,-2,8,-29,-16,5,-23,17,-22,-7,6,-14,25,21,-1,-8,-23,-23,-11,15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-33,-28,3,-34,-26,34,-25,19,15,-25,-26,-23,-23,-17,-5,32,-22,-1,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-25,-35,-26,1,-34,-24,37,-26,23,22,-21,-22,-17,-24,-19,-8,23,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-2,-28,-3,6,-27,-15,-2,-26,27,-24,-9,2,-14,14,29,-5,-8,-20,-22,-11,8;
MA   /M: SY='S'; M=4,-7,-11,-12,-8,-16,-13,-10,-7,-7,-13,0,-2,-14,-2,-9,11,8,-3,-30,-12,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,7,-30,11,21,-35,-16,5,-27,12,-22,-10,3,-10,33,14,-2,-10,-28,-25,-13,26;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-9,4,-24,9,5,-22,-12,-4,-20,3,-19,-13,0,13,0,3,-3,-6,-18,-23,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,12,-29,-19,19,-29,47,22,-29,-29,-20,-19,-29,-10,10,-19,1,-20;
MA   /M: SY='S'; M=0,7,-15,6,4,-21,-9,-11,-20,-5,-22,-17,7,-10,0,-8,23,22,-12,-35,-16,2;
MA   /M: SY='D'; M=-16,26,-29,36,16,-32,-13,8,-32,3,-26,-21,13,-4,3,-3,-1,-9,-27,-35,-15,8;
MA   /M: SY='D'; M=-10,19,-28,29,29,-32,-16,-2,-26,3,-20,-18,5,-7,13,-5,-1,-9,-23,-31,-17,21;
MA   /M: SY='H'; M=-19,-3,-29,-3,2,-16,-21,66,-28,-1,-19,-3,6,-19,10,11,-10,-17,-27,-26,12,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-23,-6,-28,-23,0,-30,-11,15,-20,6,9,-19,-26,-18,-19,-15,-8,14,-22,2,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-3,-20,-4,11,-32,-18,2,-23,12,-21,-5,0,-13,36,18,1,-7,-24,-24,-12,22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-22,-18,-25,-22,33,-27,-2,0,-18,2,-1,-17,-28,-19,-15,-13,-6,-3,7,41,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-22,-37,-27,46,-32,-22,14,-30,23,9,-23,-28,-31,-22,-23,-10,8,-4,16,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-24,10,-31,-23,24,-27,29,15,-25,-26,-22,-21,-20,-4,19,-20,0,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,31,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,79,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-23,-33,-24,2,-31,-21,31,-24,26,26,-22,-23,-16,-21,-20,-6,20,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,9,-30,-20,21,-30,48,21,-29,-29,-20,-20,-29,-10,11,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-2,-13,-5,-21,-22,-6,-30,20,-21,-12,-4,-23,2,47,-9,-10,-18,-26,-14,-5;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-24,-13,-17,-27,50,-20,-31,-17,-24,-17,-3,-17,-17,-20,3,-14,-21,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-20,-29,-20,7,-30,-21,21,-28,41,18,-26,-27,-19,-20,-24,-5,12,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,1,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-27,-20,-18,27,-27,20,-4,-13,-2,-1,-16,-27,-12,-11,-16,-10,-9,15,56,-18;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-25,-36,-27,2,-35,-25,39,-27,26,23,-23,-23,-19,-25,-21,-9,25,-21,-1,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='S'; M=13,-1,-10,-2,-2,-20,0,-12,-19,-10,-27,-19,8,-10,-2,-11,36,19,-9,-37,-20,-2;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-12,-19,-11,-21,5,-20,-12,-11,-12,-11,-9,-11,-11,-20,10,-1,-2,-20,-21,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-7,14,-26,9,-5,-27,25,1,-31,-7,-29,-19,23,-18,-5,-6,3,-10,-29,-30,-21,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-34,-30,0,-34,-30,37,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,43,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-35,-27,10,-35,-24,33,-28,25,16,-24,-25,-22,-24,-21,-9,23,-17,5,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-28,-17,6,-30,-18,18,-27,43,18,-27,-28,-14,-18,-27,-10,8,-20,-1,-16;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,-4,-11,-5,-5,-24,12,-14,-26,-6,-29,-18,4,-14,-5,-9,21,5,-15,-33,-22,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,33,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='L'; M=8,-25,-16,-27,-18,1,-22,-21,13,-23,29,11,-25,-25,-18,-20,-17,-6,12,-21,-7,-18;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-16,-30,-25,0,-28,-26,25,-23,20,12,-26,-26,-23,-21,-15,-4,30,-25,-7,-25;
MA   /M: SY='N'; M=-10,34,-21,20,2,-22,-4,6,-22,5,-29,-19,47,-18,1,3,8,1,-27,-37,-18,1;
MA   /M: SY='A'; M=15,1,-18,1,13,-24,-4,-11,-21,-4,-19,-16,0,-8,1,-11,13,3,-14,-29,-20,7;
MA   /M: SY='B'; M=-12,37,-24,37,9,-29,-7,2,-28,1,-27,-23,32,-14,0,-3,5,-3,-27,-37,-19,5;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,108,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28,-6,-7,-10,-49,-29,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,18,-27,26,23,-29,-17,-5,-28,9,-22,-18,6,-8,7,2,1,-2,-21,-31,-16,15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,42,18,-30,-30,-22,-20,-26,-8,17,-22,-2,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-2,-30,-2,8,-28,-20,-9,-28,46,-27,-7,-1,-11,10,31,-10,-10,-19,-20,-10,8;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,45,-29,21,19,-22,-22,-21,-28,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-23,59,-29,-26,-6,-25,-26,-12,-29,5,-5,-22,-35,-26,-26,-17,-10,-4,-36,-17,-26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-19,48,-29,67,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,20,-10,0,-10,2,-9,-29,-40,-20,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,78,-30,-20,1,-30,11,1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,9,29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-29,-10,-19,-30,67,-20,-39,-20,-30,-20,0,-20,-19,-20,2,-18,-29,-21,-30,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-18,8,-29,-18,18,-28,47,20,-29,-29,-16,-19,-29,-10,8,-20,0,-17;
MA   /M: SY='A'; M=45,-10,-10,-19,-10,-19,-1,-19,-9,-11,-9,-9,-9,-11,-10,-19,10,1,0,-21,-19,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10,0,-20,-19,-1,-29,28,-21,-11,0,-18,9,66,-8,-9,-20,-21,-11,0;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-13,-15,-17,-14,-9,-12,-13,-1,-15,-7,-1,-9,-16,-9,-14,3,6,4,-27,-10,-12;
MA   /M: SY='A'; M=10,-12,-8,-17,-9,-10,-16,-16,-4,-14,0,-4,-11,-17,-8,-15,1,4,-2,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,9,-17,12,3,-14,-5,-11,-23,-10,-19,-18,3,-13,-8,-14,4,-4,-16,-28,-14,-2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01049;
//
ID   HEMATOPO_REC_L_F1_MP; MATRIX.
AC   MP01352;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Long hematopoietin receptor, single chain family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=112;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.0516582; R2=0.0140010; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=119; N_SCORE=6.708; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-4,18,-21,7,2,-18,-7,0,-15,-5,-16,-14,29,-11,-2,-6,2,-3,-22,-34,-18,0;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-28,-34,-25,-17,-4,-22,-23,-6,-18,-5,-8,-28,9,-17,-19,-24,-15,-13,35,0,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=7,-3,-11,-12,-10,-12,-17,-20,-9,-7,-10,-9,-3,-11,-10,-10,15,36,1,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-24,-24,-18,-3,-11,-20,5,-25,24,7,-23,-12,-19,-20,-21,-11,-1,-22,-10,-19;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-9,-23,-7,11,-9,-22,-9,-3,-12,13,2,-10,-17,-2,-11,-12,-7,-8,-26,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-6,-18,-13,-16,-3,-20,-12,9,-17,14,4,1,-27,-16,-13,-12,-4,6,-29,-9,-16;
MA   /M: SY='K'; M=1,-9,-22,-14,-8,-17,-21,-3,-6,3,-11,-2,-6,-14,-5,-3,-3,1,-1,-24,-6,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-25,-9,-3,-18,-14,-1,-21,3,-23,-12,-3,-17,5,9,4,-3,-16,-5,-5,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-27,-18,-8,-11,-23,-12,-5,-6,6,3,-16,0,-4,6,-15,-8,-9,-22,-10,-8;
MA   /M: SY='E'; M=4,-2,-20,-4,11,-20,-18,-14,-14,2,-14,-11,-4,-5,0,-6,5,10,-9,-27,-15,5;
MA   /M: SY='D'; M=-8,16,-27,21,5,-28,7,-9,-25,-8,-22,-19,8,-14,-6,-13,-1,-11,-19,-31,-21,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-11,-27,-12,2,-17,-24,-11,-1,1,-9,-2,-6,-14,4,6,-4,-6,-4,-25,-10,1;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-3,-26,-3,-1,-22,-3,15,-28,9,-26,-11,4,-15,3,9,2,-7,-21,-25,-5,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=6,-12,-27,-11,-11,-27,23,-20,-26,-14,-26,-18,-7,15,-14,-19,2,-8,-22,-25,-27,-14;
MA   /M: SY='H'; M=-20,9,-29,15,-1,-6,-20,28,-23,-5,-16,-11,2,-20,-2,-3,-10,-12,-22,-13,23,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-22,-33,-25,5,-33,-25,32,-28,33,18,-27,-27,-22,-23,-23,-8,24,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-17,-29,-16,-1,-13,-23,-12,-7,-5,-8,-2,-18,-20,7,-3,-14,-12,-8,13,-2,4;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-17,-31,-26,4,-31,-26,29,-25,27,15,-29,-29,-25,-21,-19,-5,32,-25,-5,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-26,-2,10,-23,-17,-6,-27,24,-23,-13,1,-13,8,33,1,-1,-18,-25,-13,7;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-23,0,14,-18,-18,-6,-13,-4,-4,-5,-5,-13,12,-5,-1,-4,-15,-27,-11,13;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-36,-9,-1,-28,-18,-4,-21,-10,-27,-16,-15,67,-7,-17,-8,-11,-28,-29,-22,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-39,-9,1,-31,-20,-18,-20,-9,-29,-19,-19,83,-5,-18,-9,-10,-30,-29,-29,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-28,-9,-2,-23,-17,-16,-19,-5,-25,-17,-9,42,-6,-5,3,7,-20,-30,-22,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-20,-6,-6,-14,-4,-10,-9,-10,-7,-6,6,-18,-7,-10,3,1,-10,-29,-14,-7;
MA   /M: SY='A'; M=25,-13,-16,-22,-14,-12,-10,-22,-7,-13,-9,-9,-13,-14,-13,-18,3,7,-1,0,-10,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-9,30,-29,44,13,-36,-10,-6,-33,-3,-27,-26,9,7,-3,-13,0,-9,-26,-36,-22,4;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-13,-28,-24,-3,-25,-24,22,-18,10,14,-23,-24,-21,-19,-8,1,32,-26,-9,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-5,-26,-7,6,-26,-19,-4,-20,17,-15,-5,-3,-13,20,20,-4,-3,-17,-21,-10,12;
MA   /M: SY='S'; M=-1,1,-19,0,9,-22,-12,-10,-21,11,-24,-12,3,-9,4,3,14,10,-13,-30,-15,6;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-21,-7,-14,-21,49,-14,-28,-14,-21,-14,0,-14,-14,-14,0,-14,-21,-14,-21,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-28,-35,-28,-21,7,-14,-21,-14,-14,-14,-14,-28,-21,-14,-14,-28,-21,-21,104,21,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-17,-26,-19,15,-23,-15,20,-19,16,14,-15,-17,-16,-16,-15,-7,12,-9,5,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-15,-17,-14,-5,-21,-6,6,-14,2,5,-8,-15,-10,-12,0,13,8,-23,-3,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-30,-21,4,-30,-21,23,-26,33,18,-23,-24,-17,-20,-20,-2,13,-21,-1,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,1,-9,4,20,-26,-22,-6,-23,4,-16,-13,-3,-13,10,6,-6,-10,-20,-30,-16,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,17,55,-31,-20,1,-29,10,-20,-17,0,-1,25,1,0,-10,-30,-29,-19,40;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-33,-25,5,-33,-25,30,-28,34,18,-27,-27,-22,-23,-24,-8,23,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-16,3,-29,4,8,-28,-18,8,-27,17,-22,-9,7,-16,23,36,-5,-10,-25,-24,-10,13;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-26,-24,-27,-23,16,-31,-5,16,-20,18,10,-25,-29,-17,-17,-21,-8,10,0,33,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-24,-1,6,-26,-17,-11,-25,31,-27,-11,2,-10,7,17,3,3,-16,-25,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-7,-29,-2,13,-26,-2,-12,-23,-6,-19,-15,-8,16,0,-12,-1,-8,-23,-27,-22,5;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-23,0,20,-19,-13,-12,-12,-4,-10,-10,-9,-12,-1,-9,-2,-5,-6,-29,-17,10;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,20,-24,12,10,-24,2,0,-25,5,-26,-18,29,-14,2,1,4,-5,-27,-31,-19,6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=5,-2,-24,-1,18,-24,-6,-2,-23,1,-17,-14,-3,-10,4,0,1,-7,-18,-25,-17,10;
MA   /M: SY='T'; M=12,1,-16,-3,7,-21,-11,-13,-17,-5,-16,-13,-1,-8,2,-10,14,16,-10,-28,-16,4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-30,18,23,-33,-2,-4,-32,11,-26,-17,4,-9,13,2,-2,-12,-28,-27,-18,18;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-33,-47,-33,-21,1,-20,-23,-20,-15,-20,-17,-33,-27,-6,-15,-33,-27,-30,121,23,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,2,-30,6,26,-29,-20,-5,-30,33,-25,-14,0,-8,14,25,-6,-10,-24,-24,-14,19;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-16,-21,-17,-5,-25,-18,16,-14,5,14,-13,-20,-14,-15,-5,6,19,-27,-8,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-12,-25,-14,-2,-9,-23,21,0,-12,8,18,-11,-19,0,-9,-16,-12,-6,-25,2,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-3,-24,-2,0,6,-18,-13,-9,-13,-7,-9,-6,-17,-13,-15,-7,-8,-7,-18,-3,-5;
MA   /M: SY='P'; M=3,-19,-26,-17,-9,-17,-19,-21,-6,-14,-8,-8,-19,32,-13,-19,-7,-2,-9,-26,-20,-13;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-27,-8,-7,-20,4,-17,-11,-13,-12,-9,-7,-8,-11,-13,-4,-10,-9,-25,-18,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-15,-27,-15,-8,-14,-7,-5,-11,-10,1,1,-12,-20,3,-8,-13,-11,-14,-9,-5,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-6,-23,-7,1,-25,-4,-5,-19,0,-17,-7,-1,-15,16,8,5,-3,-17,-25,-14,7;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-11,-11,-9,-13,-17,-19,-11,-6,-11,-10,-1,-10,-9,-9,17,40,-1,-28,-11,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-24,-2,14,-22,-16,2,-18,4,-17,-4,-1,-12,18,7,5,-3,-17,-25,-9,15;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-24,11,-29,-27,11,-17,-22,-1,-24,0,-3,-21,-31,-28,-21,-13,-8,9,-19,-1,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-29,-9,-5,-24,-8,-17,-17,5,-23,-12,-8,19,-8,-4,-7,-9,-13,-26,-20,-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-19,-29,-23,2,-30,-22,24,-23,24,19,-23,-24,-18,-20,-16,0,21,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-22,-24,-19,31,-25,-5,1,-20,8,1,-17,-27,-19,-15,-12,-5,-3,2,32,-19;
MA   /M: SY='S'; M=1,13,-16,11,9,-23,-3,-4,-23,-5,-29,-21,20,-11,3,-6,26,10,-18,-39,-20,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-6,-29,-8,-2,-13,-20,7,-24,22,-19,-9,2,-21,6,43,-10,-10,-19,-13,6,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-20,-29,-16,-11,-18,-6,-19,-8,-16,-9,-4,-17,25,-14,-19,-9,-9,-11,-26,-20,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-9,7,-30,12,-5,-31,31,-11,-38,-5,-28,-21,6,-17,-9,0,-2,-15,-28,-26,-23,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-24,-4,4,-27,-12,-8,-23,18,-22,-9,0,-11,13,12,3,2,-17,-23,-13,8;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-29,6,20,-26,-19,-4,-29,26,-23,-14,1,-10,11,29,-5,-6,-22,-25,-13,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-18,-30,-18,-18,26,-29,26,-2,-10,-2,0,-18,-29,-8,-9,-19,-11,-12,25,75,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-22,-7,11,-12,-23,-12,-6,-8,3,-3,-9,-14,-1,-6,-4,2,-7,-26,-11,4;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-16,-33,-29,15,-31,-27,26,-25,17,11,-27,-29,-29,-21,-16,-5,33,-20,0,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-6,-27,-8,7,-28,-18,2,-18,12,-15,1,-3,-14,31,24,-4,-9,-20,-20,-10,17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-28,-15,-30,-27,1,-31,-28,29,-22,16,12,-27,-27,-26,-21,-12,0,38,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-9,-30,-9,0,-20,-20,8,-30,27,-20,-9,1,-20,10,64,-10,-11,-21,-21,-8,0;
MA   /M: SY='C'; M=15,-10,36,-17,-14,-20,-11,-21,-20,-17,-19,-17,-7,-21,-14,-20,12,5,-7,-37,-23,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,53,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-9,-16,-11,-2,-10,-15,-1,1,-3,6,13,-9,-12,13,0,-9,-6,-5,-13,-3,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=1,1,-15,-4,-1,-14,-7,-2,-14,8,-13,-7,6,-11,4,18,0,-3,-11,-16,-10,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-15,5,7,-16,4,-3,-17,-1,-16,-12,11,-8,0,-4,6,0,-16,-20,-13,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-31,-10,-3,-19,-16,-18,-18,-12,-26,-18,-13,55,-10,-17,2,-1,-22,-29,-22,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-24,30,20,-29,-9,-5,-30,-1,-25,-22,10,-8,3,-6,9,3,-22,-35,-19,11;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-5,-27,-8,-5,1,-21,33,-20,3,-16,-4,2,-20,-2,3,-11,-13,-20,-13,19,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-9,-20,-9,-7,2,-6,11,-11,-7,-9,-3,-5,-16,1,-6,-6,-8,-13,-1,20,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-11,-27,-10,7,11,-23,-6,-14,-7,-11,-11,-11,-2,-8,-9,-8,-8,-16,-9,10,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-37,-40,-40,-30,34,-23,-27,-13,-23,-10,-13,-33,-30,-27,-20,-33,-23,-20,103,30,-23;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=8,2,-23,5,31,-25,-13,-7,-23,4,-17,-16,-3,-5,9,-2,5,-5,-18,-27,-19,20;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-36,-38,-37,-30,6,-24,-30,-2,-21,-9,-9,-35,-29,-22,-21,-30,-21,-6,90,17,-23;
MA   /M: SY='S'; M=3,-11,-14,-11,-7,-10,-8,-14,-7,-17,-3,-6,-4,-17,-7,-14,15,8,-4,-33,-14,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-7,-29,-1,7,-13,-20,-2,-17,-3,-15,-12,-8,7,2,-4,-5,-7,-20,-16,3,2;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-26,-10,4,-18,-23,-18,-3,-9,-11,-8,-16,17,-8,-15,-6,-3,-1,-29,-18,-4;
MA   /M: SY='T'; M=11,-3,-13,-9,-7,-16,-11,-16,-10,-6,-16,-11,1,-12,-7,-10,17,20,-2,-30,-15,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-20,-19,-13,16,-19,-8,-7,-13,-2,-5,-9,-22,-13,-3,-1,0,-6,-12,11,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-25,-25,-25,-18,-7,-28,-24,16,-21,7,5,-23,7,-19,-22,-14,-5,12,-26,-11,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-4,-27,-2,17,-28,-20,1,-15,4,-9,-2,-4,-12,33,3,-3,-8,-21,-23,-11,25;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-15,-18,-24,-18,-5,-24,-18,15,-16,5,15,-12,-16,-11,-17,-1,13,13,-25,-6,-16;
MA   /M: SY='P'; M=5,-5,-27,-4,-4,-26,1,-14,-21,-10,-26,-18,-1,28,-9,-16,4,-5,-22,-30,-25,-8;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,4,-19,-2,-3,-18,-11,-8,-10,-8,-20,-12,12,-1,0,-9,13,9,-13,-31,-16,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-12,26,-22,38,25,-26,-10,0,-26,3,-19,-19,9,-5,5,-5,0,-7,-22,-26,-14,15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-19,-15,-24,-18,31,-23,-14,4,-20,15,4,-16,-21,-21,-14,-13,0,2,-4,14,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-20,-3,-5,-4,-16,-14,-13,-9,-9,-11,-6,-9,-11,-8,0,2,-7,-23,-9,-8;
MA   /M: M=-1,-18,-25,-20,-14,-10,-19,-6,-5,-14,-7,-1,-17,-1,-11,-16,-10,-4,-5,-2,-4,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-14,23,-20,-15,-14,-27,-19,-10,-6,-5,-5,-11,-26,-13,-6,-14,-9,-5,-31,-14,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,12,-26,18,20,-25,-18,-8,-16,-4,-15,-15,2,-8,2,-11,1,-3,-14,-31,-16,10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-8,-22,-8,11,-11,-23,-11,-5,-6,7,2,-11,-14,-1,-8,-8,2,-7,-25,-9,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-8,-11,-10,-6,-15,-15,2,-10,-4,-3,-5,-11,-10,-10,9,20,9,-22,-8,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-10,-18,-16,0,-19,-16,13,-14,12,10,-16,-18,-14,-12,-7,5,18,-19,-4,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-3,-31,1,-5,-14,-11,-16,-24,-10,-23,-21,-10,-17,-8,-15,-6,-11,-22,35,-1,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-22,-40,-30,61,-32,-22,12,-30,12,5,-20,-28,-35,-22,-20,-10,7,3,23,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01050;
//
ID   HEMATOPO_REC_L_F2_MP; MATRIX.
AC   MP01353;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Long hematopoietin receptor, gp130 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=91;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=86;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1130556; R2=0.0068933; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=3044; N_SCORE=20.867; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=960; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-38; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=-52,-61,-57,-61,-67,-68,-68,-58,-57,-63,-60,-47,-59,-62,-66,-35,115,-50,-88,-65;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-81,-53,-53,-68,-71,149,-86,-58,-68,-54,-43,-70,-47,-52,-59,-68,-86,-103,-37;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-69,-85,-77,-40,-86,-68,-32,-78,92,-28,-84,-84,-71,-75,-77,-63,-39,-71,-53;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-77,-55,-41,-79,-70,-58,-79,110,-78,-66,-48,-63,-39,-24,-57,-57,-75,-72,-65;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-69,-84,-73,-51,-75,-54,-35,-66,-28,146,-70,-70,-57,-64,-71,-60,-42,-74,-50;
MA   /M: SY='F'; M=-64,-70,-83,-78,74,-83,-74,31,-76,26,-42,-76,1,-78,-76,-69,-5,51,-63,-42;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-73,-64,-63,-54,-72,22,48,-9,39,-44,42,-74,32,-5,12,-56,-46,-73,10;
MA   /M: SY='W'; M=-68,-78,-84,-73,-46,-79,-75,-44,-73,66,-42,-84,55,-70,-75,-75,-66,-11,115,-49;
MA   /M: SY='T'; M=-16,-72,58,-49,-76,-65,-59,-72,-48,-74,-67,6,29,-54,46,15,67,-66,-87,-68;
MA   /M: SY='E'; M=-57,-71,-48,51,-72,-15,-57,-69,41,-4,-62,43,-64,-47,-1,14,45,-65,-80,-67;
MA   /M: SY='N'; M=-16,24,24,17,-81,34,23,-80,-52,-78,-68,63,3,60,-58,-7,-56,-77,-83,-69;
MA   /M: SY='A'; M=62,-71,48,-52,-77,-58,-61,-13,-52,-71,-65,28,28,-55,34,-6,-54,-61,-82,-70;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-85,-68,-64,-34,-74,86,-66,-62,-61,-55,-64,-78,33,-59,-65,-69,-72,106,105;
MA   /M: SY='T'; M=20,-68,-60,-8,-65,-67,-66,39,14,-19,-53,27,-67,8,-60,-7,54,11,-80,-64;
MA   /M: SY='V'; M=46,-68,-79,-74,-57,-73,-81,62,-72,-42,-44,-73,-74,-71,-75,-60,-53,67,-80,-62;
MA   /M: SY='T'; M=39,25,-60,-59,-72,-57,21,-67,-57,-69,-63,-50,-64,-55,-5,62,68,-58,-84,-66;
MA   /M: SY='V'; M=-56,-68,-84,-77,-50,-85,-81,22,-76,34,-38,-79,-80,-76,-76,-69,-54,88,-82,-59;
MA   /M: SY='V'; M=6,-66,-72,-69,-56,-69,-71,17,-68,33,-45,-64,-72,-65,-71,47,20,51,-80,-61;
MA   /M: SY='A'; M=93,-61,-67,-60,-74,-51,-69,-61,-62,-66,-60,-61,-66,-59,-67,-3,-2,-11,-77,-70;
MA   /M: SY='R'; M=30,-72,-62,-60,-61,-66,-58,27,16,-60,-56,42,-72,-53,55,-8,-55,9,-71,35;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /M: SY='S'; M=-45,-66,-57,-55,-72,-54,-59,-67,14,-26,-65,-47,-65,10,-56,98,-40,-15,-81,-65;
MA   /M: SY='V'; M=38,-69,-74,-65,0,-71,-72,40,39,-16,21,-67,-72,-63,-59,-59,-55,51,-75,-59;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78;
MA   /M: SY='A'; M=62,-65,-61,-56,-75,-54,-64,-69,29,-72,-65,-53,4,-53,-56,62,21,-60,-78,-69;
MA   /M: SY='S'; M=-41,-64,-56,-57,-75,-10,-59,-74,-57,-78,-71,-44,-64,-49,-62,107,-36,-67,-82,-67;
MA   /M: SY='P'; M=5,-75,-5,-61,-64,-69,-68,-51,-63,38,-51,-68,85,-63,-7,12,-56,9,-78,-67;
MA   /M: SY='P'; M=52,-75,-61,16,-78,-62,-67,-63,-60,-72,-64,1,94,-60,-69,-54,-55,7,-80,-76;
MA   /M: SY='T'; M=7,-64,-51,-57,-73,-55,-57,-68,-54,-72,-65,64,-64,9,-61,62,68,-62,-86,-67;
MA   /M: SY='F'; M=-63,-73,-70,-62,60,-77,21,-49,40,1,-52,-63,2,-60,35,-62,18,34,-67,-47;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-73,-68,-74,-53,-75,-69,72,-68,16,23,62,-76,-67,-72,-65,-56,27,47,-57;
MA   /M: SY='N'; M=30,-66,-63,-66,-59,-66,21,-43,-64,32,-48,54,-73,-63,-67,-53,34,43,-83,-62;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='I'; M=-59,-71,-73,-73,25,-75,-74,66,-70,2,-48,-63,-72,-68,-74,38,54,-39,-75,-56; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=-17,-72,-75,-70,60,-70,-65,-51,-68,-17,83,-67,44,-66,-71,38,-4,-12,-68,-49; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=6,-73,39,58,-81,-13,-58,-80,-54,-80,-74,28,-65,-48,-61,61,-50,-73,-86,-72; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-65,24,20,-67,-53,-73,20,47,-69,24,-51,1,1,-66,-72,11,-61,-50,115,-50;
MA   /M: SY='P'; M=-62,81,-3,-7,-79,-68,48,-77,-60,-78,-69,-61,98,-61,-7,12,-58,-75,-85,-73;
MA   /M: SY='M'; M=-15,-72,-59,14,23,56,-59,-59,-61,-57,83,54,-70,-59,-66,-55,-59,-15,-74,-59;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=20,-72,58,18,-79,-60,-59,-75,15,-76,-70,-48,29,9,-56,48,20,-68,-84,-69;
MA   /M: SY='D'; M=38,-73,49,43,-80,23,-60,-78,49,-76,-70,-50,-63,-49,-51,-50,-4,-70,-80,-71;
MA   /M: SY='V'; M=-16,-68,-78,-73,-51,-79,20,19,-73,46,-39,-72,-77,-70,-73,-12,-4,67,-80,-58;
MA   /M: SY='H'; M=-60,-70,-54,-7,-61,-67,65,-61,29,22,-54,54,-68,-53,-54,-7,54,-61,-79,10;
MA   /M: SY='A'; M=46,-72,-61,41,-68,-16,-69,39,-59,-57,-55,-64,28,-57,-6,-8,-55,24,-78,-68;
MA   /M: SY='P'; M=-59,-75,-60,50,-66,-77,-69,-43,14,0,-53,-68,65,-57,-62,-63,-56,61,-81,-68;
MA   /M: SY='Q'; M=-59,-78,-58,-3,-74,-71,65,-60,-46,-62,20,-53,-68,98,21,-53,18,22,-79,-57;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-78,-99,19,-69,-107,-83,-78,-103,-75,-103,-94,0,-92,59,-79,46,-73,-99,-108,-92; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-88,-94,-110,-103,-71,-112,-100,-53,-103,49,-59,-108,-109,-99,-102,-100,-85,33,-102,-82; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='S'; M=-73,-93,-83,-80,-97,-82,-86,-96,26,-33,-90,-73,-91,-74,-75,65,-68,-91,-105,-91; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='A'; M=90,-63,-70,-63,-70,-54,-72,27,-65,-59,-55,-65,-68,-62,-69,-45,-53,-8,-76,-69;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-72,-68,-65,41,-73,-55,-47,39,-17,46,26,-76,-60,-55,-62,-58,34,-56,72;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=6,-78,-64,-62,-82,56,-68,-78,-64,-82,-71,-58,90,-62,-72,39,-55,-75,-78,-77;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-79,-92,-72,40,-78,-94,-76,-70,27,30,-65,-79,-85,6,-6,-79,-77,-18,-92,-79; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-58,-73,57,-56,-69,33,-59,27,-61,-22,46,55,-69,-59,-67,14,-4,-58,-84,-66;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-77,-67,-10,-76,33,-68,-71,13,-25,61,-59,2,-60,-65,54,-4,-70,-84,-72; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-57,-71,58,-49,-78,-12,23,-79,-7,-81,-72,88,-69,-50,-57,48,-48,-77,-92,-68;
MA   /M: SY='C'; M=-15,90,-63,-66,-70,42,-63,-69,-9,-3,19,43,-74,-61,19,-8,-5,-66,-82,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-71,-83,-79,41,-86,-77,62,-77,41,-37,-77,-78,-75,-77,-70,-5,45,-70,-49;
MA   /M: SY='W'; M=-65,-76,-76,-75,26,-18,-72,39,-70,33,21,25,-76,-68,-73,-12,-6,-48,115,-45;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-68,-84,-77,-47,-85,-76,21,-76,56,24,-80,-80,-73,-76,-71,-56,71,-78,-57;
MA   /M: SY='S'; M=-49,-68,0,31,-70,-13,-59,-71,-7,-72,-67,-47,-62,-50,-59,72,62,-64,-78,9;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='T'; M=-59,-73,-52,42,-70,-71,22,11,-6,-23,-57,4,4,49,-3,-49,67,-57,-81,-64;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-81,-70,-63,-60,-73,48,-60,-67,31,-54,-69,89,-65,-72,-11,-5,-64,-72,35; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-77,37,-52,-79,-62,-63,-66,-59,-75,-67,3,90,7,-67,47,-51,6,-84,-73;
MA   /M: SY='P'; M=-59,-81,-59,-6,-81,-15,-62,-76,-6,-81,-70,2,98,-54,34,39,-54,-76,-79,-74;
MA   /M: SY='N'; M=-15,-72,1,17,-76,23,-56,-75,49,-28,-67,63,3,-49,-50,29,-53,-72,-81,-70;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='M'; M=30,-72,37,-53,-68,-62,-60,-62,14,-22,74,3,28,8,-58,28,-54,-61,47,-62;
MA   /M: SY='V'; M=-15,-67,-72,-68,-57,-75,-73,-36,-68,33,-45,-67,28,-68,-72,-9,54,62,-82,-63;
MA   /M: SY='M'; M=-61,81,-68,-58,-64,-72,-59,13,-8,1,83,2,-74,69,-4,-10,-59,-53,-78,-61;
MA   /M: SY='Y'; M=-61,-79,49,42,-58,42,-53,-76,29,-72,-67,-51,-67,-51,-55,-55,-6,-73,-62,72;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-79,-74,-75,45,-79,-42,-53,-68,2,-47,-74,-84,-65,-65,-68,-66,-58,-31,124;
MA   /M: SY='V'; M=-57,25,-84,-79,-52,-86,-85,63,-76,-11,-40,-77,-78,-77,-78,-69,-54,82,-83,-60;
MA   /M: SY='I'; M=-61,-72,-85,-80,-49,-88,-82,80,-77,27,-36,-78,-77,-75,-79,-72,-57,58,-77,-57;
MA   /M: SY='E'; M=-61,-80,40,96,-83,-73,-54,-84,41,-78,-73,-51,-58,-37,-46,-57,-59,-77,-81,-71;
MA   /M: SY='W'; M=-76,-101,-103,-80,-40,-74,-103,-73,-72,-71,-74,-96,-79,-72,-76,-82,-88,-88,179,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-62,120,-65,-7,-76,-18,-65,-80,49,-73,-67,-58,-76,8,46,-60,-61,-71,-84,-72;
MA   /M: SY='N'; M=19,-70,0,30,-67,-63,-58,13,-57,-21,20,77,2,-55,-63,-53,-53,23,-84,-67;
MA   /M: SY='L'; M=-58,-69,-70,-68,-52,-17,64,-45,-69,66,-40,-63,-76,-61,-68,47,-55,-10,-78,-54;
MA   /M: SY='S'; M=-51,-69,-50,-56,-75,-11,65,-76,-55,-77,-67,64,3,9,-59,76,0,-72,-87,-63;
MA   /M: SY='P'; M=-64,-84,23,58,-78,-72,-57,-76,-45,-27,-66,-58,65,61,35,-59,-62,-76,47,-66;
MA   /M: SY='D'; M=-55,-73,77,-46,-80,23,-56,-80,-7,-81,-74,30,-66,-52,-4,55,-2,-75,-88,-69;
MA   /M: SY='G'; M=30,-74,23,42,-73,42,22,-73,-56,-72,-66,-52,-66,33,-61,14,-57,-17,-75,8;
MA   /M: SY='P'; M=-59,-81,-1,30,-77,42,-63,-14,-55,-27,-66,3,79,-56,18,-9,-60,-71,-79,-73;
MA   /M: SY='C'; M=-60,115,-72,-75,-62,-18,-69,27,-69,-18,74,26,-78,-70,-74,-60,19,-50,-86,-67;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-74,37,-49,-66,-70,-61,13,56,23,-53,-54,-69,49,-48,13,-56,-12,-77,-62;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-78,-73,-10,26,-74,-68,-52,-67,24,46,-1,44,-66,-70,-66,18,-13,115,13;
MA   /M: SY='D'; M=-65,24,71,-45,-70,-71,-59,-63,14,30,-57,-53,56,48,-58,-60,-60,-66,-82,-66;
MA   /M: SY='W'; M=-66,-84,-79,-67,-52,-72,-74,-66,-54,11,-61,-72,1,-59,54,11,-7,-71,145,-43;
MA   /M: SY='W'; M=-63,-79,-66,-57,-62,-17,21,54,40,-20,-53,2,-71,49,21,-10,-60,-51,76,-56;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01051;
//
ID   HEMATOPO_REC_L_F3_MP; MATRIX.
AC   MP01354;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Long hematopoietin receptor, soluble alpha chains family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3851933; R2=0.0119562; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1277; N_SCORE=19.643; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=177; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-20,-26,-21,-20,0,5,-16,-6,-23,10,0,-16,-26,-19,-18,-18,-14,-9,-5,-2,-19;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-25,-4,-4,-27,19,-14,-31,8,-30,-16,3,-14,-4,1,6,-6,-21,-25,-20,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-2,-10,-25,-12,-6,-5,-19,8,-14,5,-13,-6,-8,-19,2,2,-6,-7,-13,-4,22,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-19,7,20,-17,-9,-5,-22,-3,-24,-19,10,-9,5,-6,17,4,-19,-33,-17,13;
MA   /M: SY='N'; M=4,14,-14,5,-2,-19,-2,-4,-18,-6,-26,-18,26,-14,-2,-7,25,15,-16,-38,-19,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-16,-11,-10,0,-21,11,-14,-4,-13,-7,-6,-21,-5,-2,-1,4,-12,-9,24,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-6,-17,-13,-11,-4,-17,-16,-4,-15,-2,-6,-2,-10,-12,-14,5,15,-4,-27,-10,-11;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-13,-18,-14,-6,-11,-20,-14,1,-14,2,0,-10,-18,-2,-12,2,6,2,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-16,0,-5,-20,-3,-15,-18,-10,-20,-16,1,-5,-8,-14,16,15,-8,-32,-18,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30,71,-30,-21,4,-29,10,1,-21,-30,-39,-20,-19,-9,6,5,25,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-9,-24,-9,-6,12,-23,-4,-8,-12,-6,-5,-7,-20,-7,-8,-8,-8,-8,-14,7,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-15,-24,-19,-10,-11,-12,-20,8,-19,2,1,-10,-16,-11,-19,-4,-3,3,-24,-11,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-12,-17,-13,1,-5,-24,-4,-17,4,-7,-6,-9,-20,4,19,-12,-10,-15,-16,-1,1;
MA   /M: SY='D'; M=-7,16,-25,22,5,-29,0,-1,-31,2,-26,-19,9,-13,-1,-1,4,-4,-22,-31,-16,1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,0,-38,-27,47,-28,20,25,-20,-20,-18,-28,-20,-10,28,-20,0,-28;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,38,-28,25,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,30,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,11,-31,-20,-4,-27,37,-26,-7,0,-11,23,31,-7,-10,-23,-20,-10,16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=2,-1,-25,-1,17,-27,-17,-8,-21,18,-19,-10,-4,-9,12,6,-2,-6,-15,-24,-14,15;
MA   /M: SY='N'; M=-6,25,-22,11,-5,-23,18,1,-25,-6,-30,-20,42,-19,-5,-6,9,-4,-29,-35,-23,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-19,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,35,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,23,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-23,-11,-1,-21,-22,-7,-10,7,-12,-2,-7,-17,14,17,-3,1,-4,-24,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=1,-27,-15,-29,-22,2,-26,-22,20,-22,25,16,-27,-27,-21,-19,-17,-5,24,-24,-6,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-23,1,10,-24,-15,-7,-26,22,-26,-14,4,-11,7,19,6,2,-18,-27,-14,8;
MA   /M: SY='P'; M=8,-14,-27,-11,-3,-25,-13,-19,-17,-10,-23,-17,-12,46,-9,-18,3,1,-18,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-26,-16,-28,-23,0,-26,-24,22,-23,21,11,-24,-26,-21,-20,-13,-3,25,-25,-7,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-7,-30,-4,0,-28,-10,-15,-23,8,-25,-15,-8,23,-4,-1,-6,-9,-19,-25,-21,-4;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-5,9,-20,2,-5,-19,16,-3,-23,-2,-23,-15,20,-15,-4,3,5,-5,-21,-25,-18,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-6,8,-11,2,-3,-3,-6,4,-8,0,-10,-7,14,-11,-1,3,0,0,-11,-10,3,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-10,-25,-4,4,-22,-12,-13,-17,-7,-24,-16,-8,46,-4,-13,3,-2,-20,-26,-21,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-28,-7,3,-23,-18,0,-27,22,-21,-10,1,-17,17,51,-3,-6,-20,-22,-11,6;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-13,-35,-13,-1,-19,-20,4,-24,7,-20,-8,-9,-19,20,20,-14,-16,-27,22,3,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-29,-17,-30,-23,6,-29,-22,22,-26,35,18,-29,-29,-22,-20,-23,-7,22,-23,-3,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-8,4,-27,9,33,-29,-17,4,-27,12,-23,-14,2,-6,21,8,3,-6,-25,-28,-15,26;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-11,-29,-27,-2,-27,-28,25,-20,10,8,-27,-27,-27,-20,-9,-1,42,-28,-10,-27;
MA   /M: SY='S'; M=5,-2,-12,-5,-3,-17,-8,-12,-15,-10,-19,-13,4,-12,0,-9,27,23,-7,-35,-15,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,4,-28,8,32,-31,-20,9,-24,6,-19,-10,1,-6,31,3,2,-4,-26,-26,-12,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,0,-30,3,-6,0,-22,12,-14,-7,-14,-10,-5,-7,-6,-10,-10,-6,-18,-3,30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=0,15,-24,22,12,-30,-4,-1,-28,-4,-24,-20,6,-3,-1,-11,5,-6,-22,-32,-19,5;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-4,4,-25,7,2,-26,-9,-9,-23,-6,-30,-21,8,21,-3,-8,12,2,-22,-36,-23,-2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-7,0,-7,-3,-7,0,-16,-11,-12,-7,-8,-9,-1,-12,-10,-4,3,15,-6,-18,-4,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-35,-7,2,-30,-17,-15,-20,-8,-29,-18,-14,64,0,-15,-2,-6,-27,-30,-26,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-11,2,-28,6,11,-21,-16,34,-26,-5,-22,-12,3,-1,6,-6,1,-8,-25,-28,0,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-21,-18,21,-27,13,1,-16,-2,0,-13,-25,-12,-13,-12,-8,-5,5,43,-18;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-10,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,43,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-11,-19,-10,-5,-14,-12,-12,-12,-9,-10,-9,-4,-4,-4,-2,11,5,-9,-31,-15,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-1,-25,-4,6,-26,-20,-8,-22,26,-22,-6,-1,-11,14,19,-2,3,-17,-22,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29,73,-30,-14,0,-27,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,13,37,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-11,-13,0,-1,-19,-6,-21,-5,-12,-10,-9,-20,-4,3,-9,-10,-17,-10,-3,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-18,-31,-24,6,-31,-24,27,-27,34,17,-29,-29,-23,-21,-23,-7,25,-23,-3,-24;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,9,-29,-20,4,-26,21,-20,-6,0,-16,32,44,-6,-10,-24,-20,-10,18;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-24,-23,-22,18,-29,2,9,-14,3,3,-22,-28,-16,-14,-15,-5,8,9,47,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-30,-6,5,-24,-20,11,-27,22,-20,-6,0,-17,22,44,-8,-11,-23,-19,-5,10;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-14,-31,-11,-6,-26,5,-15,-26,-2,-25,-16,-8,20,-7,3,-5,-11,-23,-24,-23,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-8,-24,-7,6,-20,-20,-11,-14,16,-11,-5,-8,-14,4,10,-8,-8,-8,-23,-11,5;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-30,-10,-6,-19,-6,-6,-18,3,-20,-9,2,-18,3,8,-7,-11,-19,-5,-8,-3;
MA   /M: SY='E'; M=2,-3,-21,-3,5,-20,-13,2,-18,3,-15,-9,1,-13,2,-1,5,-2,-14,-28,-11,3;
MA   /M: SY='K'; M=-8,3,-28,5,6,-27,-15,-8,-28,23,-27,-15,3,-1,4,19,-3,-7,-21,-26,-15,3;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-24,-2,14,-23,-18,3,-21,8,-16,-7,-1,-10,13,10,0,-1,-18,-25,-11,12;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-20,-30,-23,-17,23,-20,-18,-16,-6,-11,-10,-16,-24,-19,-4,-18,-14,-15,31,14,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,2,-22,1,11,-23,-17,0,-22,9,-21,-11,4,-10,11,8,7,8,-18,-28,-11,10;
MA   /M: SY='T'; M=-7,2,-19,2,-3,-18,-19,1,-15,-4,-14,-9,1,-15,-1,-2,6,13,-7,-30,-8,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-24,-25,-24,-16,-3,-25,-21,2,-8,0,0,-23,-25,-13,-5,-18,-10,8,10,0,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-27,-11,4,-9,-11,-5,-8,-11,2,5,-12,-11,-4,-12,-12,-12,-11,-20,-6,-1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01052;
//
ID   HEMATOPO_REC_S_F1_MP; MATRIX.
AC   MP01355;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Short hematopoietin receptor family 1 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4549742; R2=0.0122222; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=629; N_SCORE=12.133; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=168; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-21,4,-4,-16,-17,4,-13,-3,-9,-7,10,-18,-5,-4,-2,2,-11,-31,-8,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-15,-16,-16,-7,-3,-24,-18,11,-13,6,4,-16,-17,-13,-14,-7,2,16,-23,-7,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='T'; M=-1,2,-15,-1,6,-16,-12,-7,-14,-5,-14,-10,4,-9,5,-5,14,16,-11,-27,-12,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-15,-21,-17,-15,2,-23,0,3,-14,6,2,-10,-24,-11,-8,-9,-2,1,-15,13,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-13,-21,-14,-13,-4,-25,-18,6,-8,6,5,-14,-21,-13,-10,-11,-4,8,-24,-5,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-7,9,-24,13,10,-27,-7,1,-21,-3,-21,-13,6,-13,9,-6,5,-5,-17,-31,-15,9;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-29,-7,-4,-21,-8,5,-25,3,-23,-12,-1,6,-2,11,-5,-5,-23,-24,-10,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-5,-21,-7,1,-20,-17,-9,-14,7,-16,-7,-2,-15,6,12,2,2,-7,-26,-13,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-23,-14,-7,-8,-24,5,0,-16,11,5,-11,-16,-5,-11,-14,-7,-4,-26,-3,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-11,-23,-14,-9,-12,-15,-15,-12,-4,-18,-11,-4,-16,-4,3,7,6,-9,-5,-7,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-29,-21,-35,-25,28,-31,-20,20,-27,27,18,-24,-27,-24,-21,-23,-10,13,-11,9,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-8,-14,-7,0,-11,-17,-15,-14,-13,-9,-11,-9,3,-9,-15,0,-1,-12,-28,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=7,-20,-20,-22,-11,-9,-20,-17,5,-17,15,5,-20,-10,-7,-17,-12,-7,1,-21,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-5,-26,-3,7,-15,-17,-9,-17,-3,-18,-14,-1,12,-3,-2,-1,-4,-17,-28,-17,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,0,-20,-2,11,-20,-16,-10,-16,2,-16,-9,0,-9,6,-3,10,12,-11,-29,-14,8;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-31,-23,15,-30,-22,20,-28,39,16,-29,-30,-24,-20,-26,-8,16,-19,1,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-13,12,-26,15,11,-26,-17,1,-23,8,-20,-11,7,-12,7,7,-1,-2,-19,-29,-12,8;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-11,-30,-5,3,-27,-8,-16,-23,-3,-29,-19,-8,40,-5,-12,3,-4,-23,-30,-25,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-26,12,0,-29,12,-9,-29,-4,-23,-16,4,-15,0,-6,2,-9,-23,-27,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=9,-8,-15,-14,-9,-10,-15,-18,-9,-3,-13,-8,-5,-13,-9,-8,9,13,0,-25,-11,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-12,-20,-15,-9,-9,-17,-9,-4,-6,-7,2,-5,-17,-1,2,4,2,-3,-23,-6,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-19,27,-29,25,-2,-10,-1,0,-18,-29,-9,-9,-19,-11,-11,26,76,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-14,2,21,-22,-19,-8,-24,1,-19,-16,-2,-10,7,0,5,5,-19,-22,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=16,-21,-16,-29,-19,11,-17,-22,5,-20,7,1,-17,-19,-20,-21,-7,-5,7,-14,-3,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,6,-26,-20,1,-28,28,-21,-8,0,-16,22,51,-8,-10,-22,-20,-10,11;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,15,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,45,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,32,-21,-10,0,-19,10,66,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=15,-16,-10,-19,-16,-11,-14,-22,6,-15,-6,-4,-14,-19,-16,-17,9,6,20,-30,-15,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-14,-30,-16,-5,-18,-18,-11,-13,10,-13,-4,-8,-18,5,19,-12,-12,-13,-4,-6,-2;
MA   /M: SY='P'; M=4,-16,-25,-16,-9,-10,-16,-11,-9,-11,-13,-4,-14,20,-9,-16,-3,-2,-11,-18,-5,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,4,-23,0,3,-23,-14,6,-11,-2,-12,-1,8,-14,19,-3,0,-6,-17,-25,-9,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-6,-17,-6,-6,-10,-11,-4,-14,-5,-17,-11,-2,1,-5,-2,-1,-4,-15,-16,0,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-22,-24,-20,32,-26,0,6,-17,11,4,-19,-25,-17,-13,-19,-9,-1,11,42,-20; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-11,6,0,1,-1,-25,-17,-7,-25,7,-24,-14,9,-14,3,8,-1,-2,-20,-32,-17,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-25,-7,-15,-27,51,-17,-34,-17,-29,-20,5,-18,-15,-17,8,-9,-25,-25,-27,-15;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-19,-12,-6,-4,-20,-7,-5,-11,-10,-6,0,-14,-5,-10,7,12,-5,-25,-5,-6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-31,16,45,-30,-20,-4,-29,10,-23,-20,-2,11,14,0,-2,-10,-29,-30,-20,29;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-12,0,-33,5,13,-30,-19,5,-23,0,-24,-12,-3,23,18,-5,-5,-10,-29,-25,-13,13;
MA   /M: SY='P'; M=0,-11,-28,-5,4,-26,-12,-15,-20,-9,-28,-20,-8,45,-5,-15,9,1,-22,-33,-25,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-23,-19,-26,-22,2,-29,-18,19,-17,10,9,-20,-24,-18,-14,-10,1,21,-19,4,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-10,-12,-9,-13,-19,4,-11,-8,-13,-6,-3,-16,-6,-9,5,11,-6,-26,-2,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-35,-35,-40,-30,44,-25,-25,-10,-25,-5,-10,-30,-30,-30,-20,-30,-20,-15,82,30,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-5,-29,-3,2,-22,-5,6,-24,2,-18,-9,-2,-10,8,9,-6,-11,-23,-19,-5,3;
MA   /M: SY='T'; M=3,8,-12,-2,-5,-15,-10,-11,-15,-8,-19,-15,15,-12,-5,-8,22,29,-9,-34,-15,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-13,1,-30,3,5,-22,-17,12,-23,2,-23,-13,3,10,6,1,-4,-9,-26,-24,-5,3;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-25,-11,0,-6,-19,-8,-14,-7,-15,-11,-9,-1,0,-10,-1,3,-16,-5,3,0;
MA   /M: SY='A'; M=1,-10,-22,-10,1,-19,-13,-12,-10,-2,-13,-8,-8,-9,0,1,1,-4,-4,-26,-16,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,3,-24,5,15,-20,-17,-4,-17,8,-10,-5,0,-11,7,5,-6,-8,-16,-24,-12,11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-6,-32,-2,11,-26,-19,-9,-17,-5,-18,-13,-6,36,4,-10,-7,-9,-26,-29,-21,5;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-3,-22,-8,-6,-12,-1,-9,-12,-7,-7,-2,3,-19,-4,-7,-3,-4,-14,-25,-12,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-28,-10,4,-16,-15,-15,-10,-6,-7,-7,-13,6,-5,-10,-9,-9,-13,-16,-13,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-8,-27,-6,1,-18,-1,-10,-17,-10,-9,-7,-8,-17,4,-10,-7,-11,-17,-11,-11,3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-13,-21,-16,-9,-3,-23,-8,6,-8,5,3,-8,-17,-8,1,-10,-4,3,-19,-3,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-10,-24,-8,-10,-2,-21,-16,-2,-18,4,-3,-12,-3,-16,-18,-13,-8,-4,-23,-8,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-18,-32,-12,-1,-22,-19,-17,-14,-10,-14,-12,-17,47,-9,-13,-9,-8,-19,-27,-22,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-28,-26,-18,1,-26,-8,7,-21,14,8,-20,-26,-14,-17,-24,-14,-1,11,6,-16;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-13,-30,40,-20,-33,-17,-30,-20,-7,17,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01053;
//
ID   HEMATOPO_REC_S_F2_MP; MATRIX.
AC   MP01356;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Short hematopoietin receptor family 2 signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=5.5505471; R2=0.0159856; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=831; N_SCORE=18.825; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=60; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=14,-2,-10,-9,-7,-15,-10,-17,-13,-10,-16,-13,1,-10,-7,-12,24,30,-3,-31,-15,-7;
MA   /M: SY='A'; M=18,-9,-18,-14,-11,-21,8,-19,-17,-3,-16,-10,-7,-14,-11,-10,3,-1,-6,-22,-19,-11;
MA   /M: SY='A'; M=21,-17,-14,-21,-12,-12,-16,-22,8,-13,-1,-1,-17,-17,-15,-19,-1,-2,18,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,7,-25,10,22,-31,-17,0,-23,4,-20,-11,3,-8,27,0,7,3,-23,-28,-14,25;
MA   /M: SY='B'; M=-11,34,-24,33,16,-28,-6,3,-28,1,-28,-23,33,-13,3,-4,8,-3,-28,-38,-20,10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-22,-27,-19,14,-27,-1,11,-23,29,21,-22,-27,-15,-15,-24,-11,3,-13,13,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-6,8,-19,8,3,-23,-14,-8,-22,3,-21,-15,6,-11,4,5,13,16,-14,-31,-14,3;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-17,91,-25,-24,-20,-28,-14,-30,-22,-20,-17,-15,-36,-22,-17,-10,-11,-13,-45,-23,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-27,-28,-28,-16,8,-28,-23,9,-21,9,2,-26,-24,-19,-19,-22,-13,5,18,5,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-26,-31,-29,-22,3,-30,-15,11,-12,1,2,-21,-25,-14,-4,-20,-12,5,17,16,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-9,-29,-8,-6,-7,-21,42,-20,-5,-16,-5,-3,-11,1,3,-8,-11,-21,-13,24,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-5,19,-23,12,4,-13,-9,6,-18,-2,-20,-16,24,-17,-1,-6,2,-4,-22,-22,0,1;
MA   /M: SY='W'; M=4,-19,-25,-21,-13,-13,-7,-17,-8,-13,-4,-4,-18,-20,-3,-14,-11,-11,-8,9,-6,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-23,7,4,-26,-17,-5,-16,1,-18,-9,0,-15,13,5,4,-3,-10,-29,-14,8;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-19,-19,-16,26,-20,-2,-2,-15,2,-2,-13,-22,-15,-12,-7,-3,-4,3,31,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-15,20,-25,42,31,-27,-27,-15,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-2,-19,-4,-3,-17,-13,1,-16,3,-17,-9,5,-17,-1,5,8,1,-10,-31,-11,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,-1,-12,-6,-2,-19,-8,-12,-16,-8,-20,-13,3,-10,3,-9,25,23,-8,-32,-16,1;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=1,-13,-22,-14,0,-12,-20,-13,-8,1,6,0,-13,-17,-4,3,-12,-8,-6,-21,-10,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-17,-28,-12,-1,-19,-23,-16,-9,-1,-15,-9,-16,18,-8,3,-9,-7,-4,-28,-18,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-15,-32,-13,-4,-21,-22,-15,-12,1,-17,-6,-13,32,-5,1,-9,-4,-15,-26,-17,-8;
MA   /M: SY='B'; M=0,13,-24,11,-3,-27,13,-10,-28,-2,-25,-18,13,-14,-7,-8,4,-4,-22,-28,-21,-5;
MA   /M: SY='A'; M=33,-12,-10,-20,-14,-15,-9,-22,-3,-12,-6,-6,-12,-14,-14,-18,8,9,9,-23,-17,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-29,-9,-3,-21,-17,-8,-16,-12,-20,-13,-11,40,-7,-15,0,2,-19,-31,-19,-8;
MA   /M: SY='A'; M=3,-11,-25,-11,3,-13,-6,-14,-18,-7,-12,-11,-10,3,-7,-7,-5,-9,-16,-21,-16,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-14,-10,-19,-19,-5,-25,-25,8,-15,-1,-1,-14,-19,-19,-15,6,27,23,-30,-10,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-13,9,-27,4,8,-28,-15,27,-23,6,-23,-7,18,-16,27,13,-1,-9,-29,-27,-7,16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-2,-20,-6,-7,8,-18,-9,-16,-7,-13,-10,3,-18,-7,-1,2,5,-12,-19,-1,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,46,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-20,38,-29,5,-4,-11,0,-1,-17,-29,-16,-3,-19,-10,-8,17,53,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-26,-29,-27,-24,19,-30,-2,9,-17,6,3,-25,-29,-16,-16,-22,-11,2,27,46,-22;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-18,-35,-20,-13,-6,-19,-12,-19,2,-12,-11,-12,-25,-5,20,-21,-16,-21,37,4,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,2,-25,-1,-11,7,-20,14,-9,-9,-10,-7,5,-24,-10,-9,-9,-8,-12,-8,25,-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,-19,-5,2,-21,5,-13,-20,-6,-20,-14,-1,-14,-4,-5,11,0,-10,-29,-20,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=1,-2,-19,-5,-9,-21,13,-14,-21,-7,-23,-15,6,-16,-9,-9,12,5,-12,-30,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-23,-29,-22,-15,-6,-13,-17,-7,-13,9,0,-20,-12,-13,-2,-21,-13,-10,-4,-7,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-6,7,-24,9,11,-23,-16,7,-25,3,-19,-14,4,-12,4,8,2,2,-18,-29,-11,5;
MA   /M: SY='H'; M=-15,7,-30,12,18,-28,-19,29,-30,12,-23,-11,6,-12,16,12,-6,-13,-27,-28,-4,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=2,-2,-15,-5,1,-15,-12,-8,-3,-6,-11,-6,2,-12,1,-8,6,0,-2,-24,-12,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=1,-12,-19,-15,-9,-6,-16,2,-4,-4,-2,0,-8,-16,-4,4,-7,-7,-4,-12,3,-9; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-12,2,-30,6,31,-30,-20,2,-27,19,-21,-11,0,-8,27,22,-3,-10,-27,-24,-14,28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-26,-9,6,-20,-22,-9,-7,-6,-6,2,-13,9,7,-8,-7,-4,-11,-26,-14,6;
MA   /M: SY='H'; M=-7,14,-26,15,12,-20,-13,23,-24,-3,-20,-14,13,-14,4,-5,-1,-9,-24,-26,-1,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-13,-30,-12,-16,16,-29,9,3,-12,0,0,-15,-26,-10,-13,-17,-10,-6,12,53,-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-26,-18,-12,-4,-23,-2,1,-11,-9,-2,-8,-4,-9,-13,-5,-5,-4,-20,3,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-4,-26,-5,1,-25,-6,-8,-27,18,-24,-12,1,-14,8,23,1,-2,-19,-23,-14,3;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-12,23,-18,33,8,-20,-9,-2,-19,-4,-10,-13,7,-9,-2,-8,-4,-7,-15,-24,-11,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='A'; M=10,7,-13,8,-1,-19,-7,-11,-13,-7,-14,-13,1,-10,-6,-12,8,4,-4,-26,-15,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-17,6,10,-12,-12,-2,-9,-3,-1,-4,1,-10,5,-4,-5,-6,-11,-18,-8,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-3,-21,-5,-13,-21,45,-12,-28,-13,-22,-15,6,-15,-13,-13,1,-13,-22,-17,-21,-13; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-21,-12,-3,-19,-23,-10,-8,6,-11,-2,-8,-17,9,12,-1,5,-1,-25,-10,2;
MA   /M: SY='N'; M=-14,13,-25,2,-6,-13,-14,21,-12,-4,-18,-8,27,-21,-1,2,-2,-7,-19,-27,0,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-19,-28,-22,4,-29,-23,20,-20,8,10,-14,-18,-18,-19,-5,12,17,-22,-2,-21;
MA   /M: SY='G'; M=19,-9,-22,-13,-11,-27,30,-16,-25,-12,-21,-13,-4,-15,-6,-16,4,-11,-18,-20,-23,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,102,-28,-29,-21,-18,-29,-31,-29,-21,-20,-18,-38,-29,-29,-9,-11,-12,-46,-30,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-27,-12,-6,-18,-19,3,-11,-4,-17,-7,-3,1,-1,6,0,-4,-11,-28,-10,-7;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,-14,-28,-18,20,-12,-20,-6,-18,-2,-6,-14,-18,-22,-20,-2,-4,0,-8,0,-18;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC01054;
//
ID   ZF_ZZ_1_MP; MATRIX.
AC   MP01357;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger ZZ-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.3728347; R2=0.0076336; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=453; N_SCORE=7.828; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=279; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-23,-12,-25,-17,-2,-25,-19,10,-23,21,10,-21,-14,-16,-20,-15,-4,4,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-14,-11,-17,-10,-6,-21,9,-8,-14,-1,1,-11,-22,-8,-10,-9,-7,-7,-17,4,-10;
MA   /I: I=-4; MD=-18;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-1,-25,1,-2,-15,-13,-5,-18,0,-14,-10,-4,-7,-2,4,-3,-1,-14,-20,-4,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-6,-21,-7,-1,-12,-16,0,-2,-10,-2,4,-5,-17,-3,-10,-4,-5,-2,-27,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=9,-10,-19,-14,-3,-10,-15,-15,-8,-3,-1,-4,-10,-11,-7,-8,-5,-2,-6,-20,-10,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-6,-24,-5,3,-19,-15,9,-14,-8,-10,-6,-5,-2,0,-9,-4,-8,-14,-26,-9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='B'; M=-2,2,-22,1,-2,-19,-10,-11,-13,-3,-14,-11,2,-7,-6,-3,-1,-1,-9,-28,-16,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-6,-25,-5,6,-11,-6,-10,-17,-9,-12,-11,-4,-1,-2,-10,-2,-5,-18,-23,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='N'; M=-3,3,-20,-2,-5,-16,-9,-10,-7,-9,-10,-4,5,-15,-5,-11,3,5,-7,-28,-13,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-19,-17,-10,-15,-14,-14,0,-3,-6,4,-12,-17,-4,-4,-4,-4,6,-23,-11,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-8,-27,-7,-5,-9,-19,22,-18,-1,-15,-5,-5,-6,-4,-2,-11,-12,-15,-21,3,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-18;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-4,-21,-3,0,-20,-11,15,-23,-8,-18,-11,-2,0,-3,-7,-3,-9,-20,-28,-9,-3;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-3,-26,-4,1,-25,-1,-2,-19,-3,-18,-9,2,-8,7,-5,-2,-9,-18,-26,-16,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-19,-20,-24,-20,6,-26,-11,11,-15,3,4,-17,-22,-14,-16,-8,2,12,-9,17,-19;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-8,-18,-12,-5,-10,-17,-5,-10,-6,-12,-5,-4,-10,-6,-8,1,2,-7,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-9,30,-22,29,6,-25,-6,1,-26,-1,-27,-21,28,-14,-1,-5,10,2,-23,-35,-15,2;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-9,-18,-13,-12,-11,-9,1,-8,-12,-11,-5,-3,-20,-9,-11,-4,-6,-7,-20,1,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,3,-17,1,5,-27,-10,8,-26,9,-25,-11,7,-15,12,9,2,-7,-23,-28,-12,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-6,-19,-8,2,-19,-15,-2,-16,3,-13,-5,-4,-15,7,1,-2,-2,-13,-24,-9,4;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-11,0,-12,3,2,-12,-19,1,-21,-5,-13,-12,-4,-10,-3,-3,-7,-8,-17,-23,-5,-2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-18,-15,-18,-12,-15,-16,-19,-2,-15,-9,-3,-16,18,-13,-19,-7,-6,-4,-26,-17,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-20,-20,-24,-15,0,-27,-20,20,-19,11,9,-16,-19,-14,-18,-9,-2,15,-22,-4,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-17,-11,-9,-11,-9,-13,-2,-8,-9,-3,-1,-15,-8,-8,3,2,1,-25,-12,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-28,-9,-13,-27,46,-17,-33,-11,-25,-17,-2,-19,-14,-10,-1,-16,-24,-21,-25,-14;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-13,-20,-17,-10,7,-23,-14,-1,-8,-2,1,-9,-19,-10,-6,-6,-1,1,-17,-1,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-21,-10,-4,-21,-8,-4,-30,18,-21,-12,-1,-20,4,49,-7,-10,-20,-22,-14,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-29,-36,-31,-25,25,-27,-6,-4,-17,-5,-6,-28,-29,-18,-16,-27,-17,-12,66,50,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-27,-7,1,-21,-20,6,-23,24,-21,-6,-2,-17,7,30,-8,-9,-14,-22,-5,2;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-18,108,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28,-5,-7,-10,-49,-29,-27;
MA   /M: SY='S'; M=1,-6,-20,-8,2,-18,-13,-8,-13,-4,-9,-7,-4,-11,2,-3,3,2,-10,-26,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-22,-7,2,-18,-21,-11,-6,5,-11,-3,-7,-16,2,2,-3,-4,0,-27,-12,2;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-17,101,-26,-25,-21,-29,-20,-29,-26,-20,-17,-17,-37,-22,-26,-9,-11,-13,-47,-26,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-27,-8,-2,-9,-20,-8,-14,-4,-16,-9,-9,12,-6,-7,-6,-6,-15,-22,-9,-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-11,33,-23,36,14,-28,-4,2,-29,0,-28,-23,28,-12,2,-6,7,-3,-27,-37,-19,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-27,-23,43,-30,3,2,-18,7,2,-21,-30,-21,-14,-20,-10,-3,18,56,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-18,32,-28,44,11,-28,-14,8,-30,-2,-24,-21,14,-14,2,-8,-3,-10,-24,-32,-8,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24,12,-32,-22,25,-29,37,18,-27,-28,-22,-22,-25,-9,17,-19,1,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,2,-23,2,9,-21,-19,-6,-11,-2,-13,-7,0,-13,13,-4,2,0,-11,-27,-12,10;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-22,8,9,-24,-11,-8,-21,3,-20,-15,4,-8,2,-1,6,1,-15,-30,-17,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-17,-25,-19,-11,38,-27,-2,-6,-14,0,-2,-15,-24,-18,-12,-16,-10,-9,8,36,-14;
MA   /M: SY='S'; M=-3,0,-22,-2,-5,-10,-8,-7,-17,-8,-16,-11,2,-13,-7,-10,3,0,-15,-15,-8,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=2,-5,-18,-8,-4,-17,-7,-10,-16,0,-17,-10,-1,-14,-3,1,7,7,-8,-25,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-6,0,-25,3,-1,-26,20,-8,-31,-5,-26,-18,2,-7,-7,-9,-2,-12,-26,-24,-19,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-5,-10,-7,-3,-14,-10,-3,-14,7,-12,-6,-1,-13,-1,9,-2,-4,-9,-19,-8,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-3,-14,-4,0,-7,-11,21,-12,-5,-9,-4,0,-12,-1,-4,-3,-6,-10,-15,5,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-14,-6,-6,-11,-5,-6,-5,-7,-8,-5,-2,-7,-6,-6,2,-1,-3,-18,-9,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-1,-24,-3,1,-17,-9,-6,-15,-2,-10,-7,2,-14,3,-4,-2,-2,-16,-24,-9,1;
MA   /M: SY='H'; M=-9,-1,-26,-1,-1,-23,-3,18,-26,-2,-21,-11,6,-9,3,3,0,-8,-23,-28,-9,-1;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-4,-26,-5,-3,-17,-19,47,-19,-10,-12,-1,2,-10,3,-4,-7,-9,-20,-29,4,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-1,-25,-1,6,-21,-16,8,-23,9,-21,-9,0,-7,4,8,0,-3,-18,-26,-8,3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-7,-17,-11,-7,2,-17,-12,-8,-10,-3,-3,-2,-16,-11,-9,-5,-2,-9,-23,-6,-9;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-2,-17,-4,-1,-10,-13,6,-8,-2,-5,1,1,-13,2,-1,-3,-3,-9,-18,-2,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-12,0,-24,2,4,-13,-16,31,-19,-4,-14,-7,1,-15,2,-2,-6,-8,-18,-18,10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-20,-7,-4,-14,-17,-7,-10,12,-11,-4,-4,-15,0,24,-6,-5,-3,-18,-8,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-12,-5,-14,-11,-3,-17,13,-4,-13,1,1,-9,-17,-7,-10,-12,-10,-6,-5,8,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-16,-29,-15,-6,-11,-12,-14,-14,-5,-12,-4,-13,14,-6,-6,-10,-9,-16,-21,-13,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50135;
//
ID   ZF_RANBP2_1_MP; MATRIX.
AC   MP01358;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger RanBP2-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.8420935; R2=0.0108431; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=246; N_SCORE=7.499; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-24,-2,5,-19,-2,-7,-21,-5,-16,-12,-3,-7,-2,-7,1,-2,-17,-25,-14,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-4,-4,-15,-3,-4,-22,-8,-12,-17,-5,-16,-10,-4,-6,-4,-4,-2,-5,-12,-28,-17,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-19,-3,-3,-23,-2,-2,-22,-5,-21,-13,-1,-1,-2,-9,3,-6,-18,-27,-14,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: M=-3,-10,-23,-12,-7,-7,-8,-13,-13,-4,-11,-4,-7,-16,-6,-4,-5,-7,-9,-15,-8,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-4,2,-23,5,3,-26,1,-2,-26,-5,-21,-13,0,-7,1,-5,1,-6,-20,-28,-17,1;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: M=-5,-6,-25,-5,-3,-15,-3,-9,-18,-6,-12,-10,-6,-9,-4,-5,-4,-7,-15,-20,-8,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-20,7,1,-24,-7,-9,-22,1,-21,-14,5,-10,-1,-1,3,-3,-16,-30,-17,-1;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-9,-14,-10,-8,-8,-13,-12,-1,-8,2,0,-10,-7,-7,-7,-4,3,2,-18,-8,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-13,-26,-12,1,-13,-11,-14,-13,-9,-11,-9,-12,9,-8,-11,-6,-8,-12,-23,-15,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-5,-24,-5,0,-19,-17,-10,-9,-2,-13,-7,-5,-2,2,-4,-1,-3,-9,-25,-12,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-8,-23,-9,-3,-11,-17,-12,-13,-4,-13,-8,-7,2,-6,-7,0,2,-11,-23,-9,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-2,-26,1,9,-24,-14,-8,-23,7,-20,-14,-1,0,5,10,2,-1,-19,-28,-16,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=4,-4,-23,-3,7,-21,-4,-12,-20,-5,-20,-15,-3,8,-2,-11,3,-3,-17,-25,-19,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,2,-26,4,3,-28,12,-11,-25,-5,-23,-16,2,-10,-2,-10,1,-10,-19,-27,-22,0;
MA   /M: SY='D'; M=-11,5,-28,9,6,-20,-10,1,-20,-2,-18,-10,-1,-11,5,-6,-4,-9,-18,-22,-4,5;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,4,-18,4,5,-23,-16,-5,-19,4,-17,-10,2,-14,9,0,1,-2,-16,-26,-10,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-25,-2,1,-23,-13,-12,-15,-6,-22,-14,0,17,-2,-11,6,4,-15,-31,-20,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=1,-9,-18,-11,-7,-12,-12,-6,-10,-7,-12,-7,-5,-17,-7,-9,3,1,-2,-22,-9,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-7,-4,-7,-16,-10,-16,-17,-9,-15,-13,5,-14,-9,-10,13,26,-9,-32,-15,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-16,-21,-22,-16,27,-24,-10,1,-16,6,2,-11,-25,-19,-13,-14,-8,-1,-7,15,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-16,-17,-12,-5,-25,-10,6,-14,5,9,-11,-21,-4,-10,-12,-7,2,-22,-3,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: M=-7,-10,-22,-12,-5,-1,-17,-4,-17,-6,-17,-11,-6,-3,-7,-7,-2,-5,-16,-11,-2,-6;
MA   /M: SY='P'; M=8,-11,-25,-9,-5,-24,-2,-17,-19,-8,-22,-16,-9,23,-8,-13,3,-4,-17,-27,-23,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-25,-4,0,-19,-10,-11,-21,1,-17,-13,-3,-10,-3,4,-1,-4,-17,-12,-12,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-10,-22,-12,-6,-16,-13,-11,-14,2,-9,-6,-4,-9,-3,11,-2,-2,-10,-25,-14,-6;
MA   /M: M=-8,-7,-25,-9,-6,-12,-15,-13,-12,-2,-14,-10,-3,-4,-8,-2,-4,-3,-10,-18,-11,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-7,-25,-8,-1,-16,-13,9,-17,5,-16,-7,-4,-17,-1,5,-5,-7,-12,-20,1,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-18,0,8,-8,-18,-9,-13,-6,-10,-9,0,-14,-5,-9,-4,-6,-11,-26,-11,2;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-11,-22,-16,-7,-15,-18,-6,-2,1,-3,15,-9,-16,6,6,-8,-7,-3,-21,-9,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-9,2,-20,4,4,-21,0,-6,-27,-6,-22,-18,2,-17,-4,-9,-3,-11,-24,-11,-13,0;
MA   /M: SY='T'; M=4,-7,-12,-13,-7,-13,-14,-12,-10,-5,-9,-5,-5,-15,-7,-3,5,11,-3,-27,-12,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-28,-8,-3,-23,-12,-12,-17,-8,-18,-13,-10,26,-6,-10,-1,-2,-17,-28,-19,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-29,-6,4,-24,-20,-4,-27,33,-23,-9,0,-16,12,47,-8,-9,-19,-21,-10,5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-9,-29,-6,-1,-16,-8,-11,-20,-8,-20,-15,-8,17,-8,-13,-3,-6,-21,-19,-13,-6;
MA   /M: SY='B'; M=-7,1,-17,1,0,-13,-15,-11,-16,-8,-10,-12,0,-11,-7,-7,-1,0,-13,-28,-13,-4;
MA   /M: SY='A'; M=1,-2,-24,-3,-8,-18,-3,-10,-17,-9,-19,-14,-2,-16,-7,-13,1,-4,-13,-6,-10,-7;
MA   /M: M=-5,-11,-24,-12,-4,-9,-18,-13,-7,-6,-6,-6,-9,-9,-7,-9,-4,-1,-8,-14,-4,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-6,-26,-3,4,-24,-8,-10,-18,-4,-17,-10,-6,4,5,-5,0,-5,-16,-27,-18,3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-7,-24,-5,6,-21,-16,-5,-16,0,-12,-8,-7,-6,3,-1,-7,-10,-15,-20,-12,3;
MA   /M: M=-6,-8,-19,-9,-5,-14,-17,-5,-12,-7,-11,-8,-4,-4,-6,-4,-4,-5,-11,-27,-11,-7;
MA   /M: SY='S'; M=2,-3,-24,-4,0,-23,1,-7,-23,-2,-21,-14,0,-1,-3,-3,4,-3,-19,-27,-18,-3;
MA   /M: SY='A'; M=4,-10,-24,-12,-6,-16,1,-14,-16,-9,-12,-10,-7,-3,-9,-11,-1,-5,-13,-22,-14,-8;
MA   /M: M=-1,-5,-23,-8,-5,-13,-3,-9,-15,-5,-12,-9,-1,-13,-4,-6,-3,-6,-14,-20,-8,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50199;
//
ID   ZF_PHD_1_MP; MATRIX.
AC   MP01359;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger PHD-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9832842; R2=0.0074227; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=556; N_SCORE=7.106; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=474; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-3,-10,-18,-10,-4,-13,-15,-11,-9,-6,-7,-3,-9,-12,-5,-4,-3,-3,-5,-25,-11,-6;
MA   /I: I=-1; MD=-6;
MA   /M: M=-6,-7,-22,-6,-2,-18,-7,-8,-17,-6,-14,-9,-5,-6,-4,-6,-4,-6,-15,-20,-12,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
MA   /M: M=-8,-5,-22,-6,-6,-12,-11,-9,-15,-3,-15,-10,-4,-9,-7,-4,-3,-2,-12,-14,-6,-7; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-25,0,1,-18,-7,-7,-16,-4,-15,-11,0,-4,-1,-3,-1,-6,-16,-24,-12,-1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-4,-16,-5,5,-16,-12,-8,-18,-1,-15,-10,-4,-8,-1,-3,-3,-6,-16,-19,-10,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-2,-23,0,1,-20,-6,-10,-17,-3,-16,-11,-2,-6,-3,-4,0,-4,-12,-25,-15,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-3,-3,-22,-3,0,-17,-13,-1,-15,-2,-13,-9,-4,-16,-2,0,-2,-4,-9,-18,-7,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-21,-3,2,-17,-9,-9,-16,-4,-14,-11,-1,-3,-3,-5,0,-3,-13,-26,-14,-2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: M=-2,-6,-19,-8,-9,-13,-9,-12,-9,-8,-9,-6,-6,-12,-9,-9,-2,-1,-4,-20,-9,-10; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='B'; M=-7,5,-23,5,5,-19,-14,-4,-16,1,-15,-9,4,-9,0,0,-1,-4,-14,-26,-12,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-24,1,6,-17,-11,-8,-19,-1,-17,-13,-1,-6,-2,-4,-1,-4,-15,-20,-12,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-25,4,6,-23,-11,1,-22,2,-21,-12,6,-4,4,0,-1,-6,-21,-25,-13,4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-6;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-2,-22,-2,-3,-17,-11,-7,-12,-6,-13,-8,-2,-12,-4,-7,1,-1,-8,-27,-11,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-19,-9,-8,-9,-19,-13,-3,-10,-4,-3,-7,-18,-9,-10,-3,1,0,-20,-6,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-25,-13,-10,-2,-19,-6,-8,-4,-9,-5,-10,-15,-7,0,-8,-5,-6,-9,8,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-5,-10,-6,-4,-11,-4,-9,-11,-8,-10,-8,-3,-6,-4,-8,1,-3,-9,-18,-9,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-28,-21,2,-29,-22,18,-18,10,8,-22,-20,-20,-18,-14,-6,19,-20,-1,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-18,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-4,-25,-3,-2,-22,6,0,-26,0,-20,-11,1,-15,-2,2,-3,-10,-21,-23,-12,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-25,2,7,-22,-13,-7,-20,8,-17,-10,0,-12,5,4,-2,-5,-16,-23,-13,6;
MA   /I: I=-1; MD=-4;
MA   /M: M=-3,-6,-16,-6,-2,-14,-12,-9,-10,-6,-11,-7,-5,-5,-4,-9,-1,-3,-7,-19,-11,-4; D=-1;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,1,-18,4,4,-14,-6,-3,-14,-3,-12,-9,-1,-10,-1,-5,-3,-6,-12,-14,-6,1; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='D'; M=-6,8,-20,11,7,-13,-9,-4,-17,-4,-15,-14,4,-7,-2,-7,0,-4,-16,-17,-8,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-24,6,7,-21,-1,-4,-25,-2,-22,-15,4,-5,-1,-4,0,-6,-22,-24,-13,2; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='G'; M=-5,5,-25,5,2,-22,8,-7,-24,-6,-19,-15,7,-15,-5,-8,1,-6,-19,-27,-18,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-22,-4,3,-11,-17,-10,-16,0,-13,-10,-4,-11,-1,-2,-2,-2,-13,-19,-8,1;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-24,-25,-27,-20,8,-23,-16,8,-19,14,16,-23,-24,-15,-17,-20,-10,2,8,5,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-29,-19,-32,-25,6,-32,-24,29,-25,25,18,-26,-26,-22,-21,-19,-7,27,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-10,-13,-11,0,-16,-15,-6,-14,-6,-12,-5,-8,-15,11,-5,-5,-9,-16,-20,-7,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,21,-21,27,13,-30,-6,-5,-30,-1,-25,-21,11,-9,1,-6,3,-5,-24,-34,-20,6;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: M=-5,-4,-24,-5,-2,-19,-7,-7,-14,0,-13,-6,-2,-15,-1,-1,-2,-3,-11,-24,-11,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-29,-29,-20,-30,-27,-30,-30,-20,-20,-19,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-50,-29,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-10,11,-24,13,10,-26,-13,-1,-24,5,-21,-13,8,-6,6,0,-1,-6,-23,-29,-15,8;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-5,-14,-7,-1,-15,-18,-9,-14,1,-11,-7,-4,-18,-2,6,-5,-4,-9,-25,-11,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-26,-32,-28,-21,-1,-14,-20,-12,-16,-14,-11,-24,-22,-15,-17,-18,-15,-14,59,9,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-23,-22,-27,-20,34,-28,-8,2,-18,3,2,-19,-27,-16,-13,-15,-9,2,3,26,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: M=-4,-12,-21,-14,-5,-12,-15,-12,-8,-8,-7,-4,-11,-11,-2,-7,-5,-4,-8,-17,-8,-4;
MA   /M: M=-6,-1,-25,0,0,-15,-13,-8,-13,-3,-13,-9,-3,-12,-5,-5,-4,-5,-10,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-20,-19,-23,-17,0,-22,-6,8,-18,13,9,-19,-24,-14,-15,-14,-6,8,-18,5,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-25,-6,-6,-19,11,-11,-20,-7,-15,-9,-1,-17,-4,-7,-1,-9,-17,-23,-16,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-19,-21,-20,-14,-4,-25,-16,4,-17,4,3,-17,-2,-13,-16,-15,-8,-1,-19,-6,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-24,-2,0,-20,-10,-11,-17,-4,-18,-12,0,7,-4,-7,2,1,-16,-28,-17,-4;
MA   /I: I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
MA   /M: M=-5,-5,-21,-7,-4,-13,-11,-11,-10,-5,-8,-5,-3,-13,-6,-7,-5,-4,-9,-23,-10,-5; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-3,-20,-2,7,-18,-15,-10,-12,2,-11,-8,-4,-6,1,-1,-1,0,-9,-24,-13,3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-14,1,2,-14,-7,-8,-13,-1,-11,-8,-2,-7,-2,-3,-1,-4,-9,-19,-11,0; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: M=0,-2,-12,-4,-5,-10,-3,-8,-7,-5,-8,-5,-1,-8,-6,-6,-2,-5,-5,-12,-9,-6; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='D'; M=-4,5,-21,8,8,-20,-12,-3,-14,-1,-14,-10,2,-4,0,-4,-1,-5,-12,-25,-12,3; D=-1;
MA   /I: I=-1; DM=-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-8,-29,-5,0,-20,-17,-10,-14,-5,-16,-11,-8,15,-4,-8,-5,-4,-15,-22,-12,-4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-25,1,2,-15,-11,-11,-18,-3,-18,-13,0,-3,-5,-4,-1,-5,-15,-26,-14,-2;
MA   /M: SY='S'; M=0,-2,-21,-3,0,-16,1,-10,-19,-7,-16,-12,0,-14,-6,-8,4,0,-13,-24,-13,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-19,-1,5,-21,-11,-6,-19,1,-17,-10,-2,-11,2,-3,0,-4,-15,-25,-12,3;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-32,-36,-34,-26,28,-26,-13,-6,-20,-3,-7,-30,-30,-21,-17,-30,-19,-15,75,41,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-20,-16,-9,-2,-23,-7,-2,-9,-4,-2,-10,-17,-7,-7,-6,-1,-3,-16,4,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-3,-24,-1,4,-21,-16,-8,-18,-1,-20,-13,-3,9,-2,-3,0,-2,-16,-28,-15,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-19,-8,-2,-13,-18,-9,-11,-1,-11,-6,-5,-14,-4,1,-5,-4,-8,-23,-8,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-19,-6,-3,-14,-16,-7,-12,-3,-10,-6,-5,-14,-2,1,-2,-1,-9,-25,-8,-4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-4,-23,-6,1,-19,-12,-9,-15,-2,-16,-9,-1,-2,1,-3,3,0,-13,-27,-15,0;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-23,-3,2,-22,-7,-7,-21,3,-19,-11,-3,-8,1,3,-2,-8,-17,-25,-14,0;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-5,-23,-4,3,-18,-13,-4,-15,-1,-14,-6,-4,-3,2,-3,-3,-6,-15,-24,-10,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-22,-4,1,-17,-11,-2,-16,0,-14,-7,-2,-13,-1,0,-3,-5,-12,-24,-9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-22,0,3,-21,-11,-7,-20,0,-18,-12,-5,1,0,-3,-3,-5,-17,-24,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-20,-11,-6,-16,-16,-6,-9,-1,-10,-4,-5,-11,-2,1,-5,-4,-7,-23,-8,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=-5,-7,-24,-7,-3,-11,-14,-11,-14,-5,-13,-9,-7,-2,-7,-5,-3,-3,-11,-18,-9,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-18,-2,4,-17,-14,-8,-17,0,-15,-9,0,-7,1,-1,-2,-4,-15,-26,-13,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=-6,-5,-13,-6,-2,-16,-18,-9,-14,-2,-13,-8,-5,-9,-2,-2,-4,-4,-10,-22,-10,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=-6,-8,-18,-9,-4,-17,-13,-10,-13,-3,-12,-6,-5,-8,-2,-2,-5,-5,-11,-22,-12,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: M=-6,-10,-18,-11,-4,-14,-18,-11,-7,-3,-6,-2,-8,-13,-4,-4,-6,-5,-6,-24,-9,-5;
MA   /M: M=-7,-11,-19,-10,-2,-15,-17,-9,-13,-4,-11,-7,-9,-9,-2,-4,-5,-6,-12,-17,-7,-3;
MA   /M: M=-3,-10,-16,-10,-3,-17,-12,-13,-15,-6,-14,-9,-8,-5,-5,-8,-2,-4,-12,-21,-13,-5;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50016;
//
ID   ZF_MYND_1_MP; MATRIX.
AC   MP01360;
DT   01-JUL-2007 CREATED; 01-JUL-2007 DATA UPDATE; 01-JUL-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger MYND-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2840; R2=0.00864205; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1121; N_SCORE=10.967; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=603; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-11,99,-22,-25,-20,-25,-24,-28,-25,-22,-20,-8,-37,-25,-25,-7,-8,-13,-48,-28,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,-24,-12,-11,-4,-17,0,-13,-8,-10,-8,-7,-20,-9,-4,-7,-3,-11,4,7,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-8,0,-23,-6,-7,-10,-11,-5,-9,-7,-13,-9,7,-20,-5,-8,-1,-2,-10,-15,-2,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-26,-7,-12,-12,30,-15,-26,-17,-17,-14,2,-20,-16,-16,-2,-13,-22,-21,-18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-8,-4,1,-22,-16,-8,-25,15,-23,-14,6,-16,1,18,0,0,-17,-29,-15,0;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-10,-28,-8,5,-11,-12,-13,-21,-2,-18,-15,-9,-15,-2,-3,-2,-5,-19,9,-5,2;
MA   /M: SY='A'; M=17,-4,-11,-8,4,-23,-10,-12,-17,-1,-16,-10,-3,-7,1,-9,4,-4,-12,-26,-19,2;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-18,-5,-2,-14,-9,-11,-8,-9,-7,-3,-2,-7,-5,-11,2,4,-7,-25,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-3,-18,-2,2,-4,-13,1,-14,2,-13,-8,-3,-6,-2,-2,-2,-4,-12,-12,3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-14,-6,0,-13,-9,0,-9,7,-7,1,-4,-8,4,2,-4,-5,-7,-12,-5,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-24,-4,5,-21,-20,0,-22,18,-17,-8,-1,-13,4,18,-3,2,-15,-24,-8,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-16,-5,-1,-17,1,-10,-19,-4,-18,-13,2,-12,-2,1,16,6,-11,-28,-16,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-24,-10,-4,-15,4,-9,-23,4,-15,-9,-4,-16,-1,14,-5,-10,-17,-17,-12,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-31,-5,1,-21,-12,1,-25,16,-24,-10,4,-17,11,19,-8,-12,-25,-4,-3,5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-21,-4,-6,-8,-17,-6,-13,3,-15,-7,7,-19,-3,10,-1,1,-9,-25,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-11,-12,-16,-10,-12,-15,-21,-2,-12,-5,-5,-11,-15,-13,-16,8,15,9,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-27,-13,-5,-17,-16,0,-19,9,-18,-7,-8,-13,0,14,-8,-10,-14,-4,-5,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-6,1,-3,-22,5,-12,-24,-12,-29,-21,8,-13,-4,-12,31,12,-13,-38,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-25,-7,3,-24,-18,-10,-18,17,-20,-9,-3,-7,7,15,-1,-3,-12,-24,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,6,25,-13,-18,-7,-23,6,-18,-15,-1,-8,4,-1,1,-3,-19,-24,-11,15;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-16,86,-23,-23,-20,-28,-1,-30,-26,-20,-16,-13,-36,-21,-23,-10,-12,-14,-46,-19,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-23,-11,-3,-18,-20,2,-12,7,-11,-2,-7,-18,6,11,-6,-5,-7,-21,-4,0;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-22,-7,0,-19,-13,-13,-13,3,-8,-6,-5,-14,0,0,-2,-3,-9,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-1,22,-24,27,10,-29,-10,16,-29,-4,-22,-18,11,-12,1,-9,1,-9,-22,-32,-12,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-27,-3,4,-19,-15,-4,-17,2,-10,-7,-4,-5,2,4,-7,-8,-17,-26,-12,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-22,-7,-8,-15,4,-12,-17,-7,-12,-10,-3,-18,-10,-10,-1,-3,-12,-20,-8,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-29,-3,6,-27,-14,4,-29,28,-25,-9,1,-14,14,30,-5,-10,-22,-22,-9,8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-26,-3,1,-17,-20,9,-15,4,-12,-2,-2,-12,5,8,-7,-7,-13,-24,-3,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-28,-9,11,-10,-22,-14,-9,-7,-10,-10,-9,-13,-3,-12,-7,-5,-11,1,-5,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo, B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50865;
//
ID   ZF_DOF_1_MP; MATRIX.
AC   MP01361;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger Dof-type signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1667809; R2=0.0115612; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2121; N_SCORE=28.678; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=-1,2,-18,-1,-1,-20,-8,-10,-18,0,-20,-13,5,-12,-2,-1,7,5,-14,-28,-14,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-1,3,-23,-1,3,-21,-3,-8,-20,-3,-20,-14,8,-9,1,-5,3,-2,-19,-20,-16,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-25,0,9,-24,-15,-5,-18,9,-17,-7,-2,-10,7,7,-3,-7,-14,-26,-14,8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-22,5,1,-21,-14,-10,-15,-3,-13,-11,2,-10,-1,-4,1,0,-10,-30,-15,-1;
MA   /M: SY='N'; M=0,8,-20,3,0,-20,-10,-7,-18,2,-20,-14,12,-12,0,-2,8,8,-15,-28,-12,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-24,-6,5,-19,-14,-10,-13,-2,-14,-9,-2,1,-1,-4,-1,-3,-12,-26,-15,0;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-15,-24,-16,-6,-12,-20,-13,0,-8,2,6,-13,-4,-6,-8,-10,-7,-3,-25,-11,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-2,-27,-3,4,-26,-15,-9,-20,9,-23,-12,1,14,5,0,-2,-3,-21,-27,-17,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-5,-26,-4,0,-21,-19,-11,-14,6,-14,-8,-5,1,-1,5,-7,-7,-11,-26,-15,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-31,-11,-3,-22,-18,-9,-12,-9,-15,-3,-15,37,-4,-14,-9,-8,-17,-27,-18,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,5,-29,11,12,-31,-12,-5,-23,-2,-22,-15,-1,14,10,-8,-1,-6,-24,-28,-18,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-31,-1,15,-28,-17,-8,-23,8,-23,-14,-7,21,6,-1,-5,-8,-24,-26,-18,9;
MA   /M: SY='P'; M=2,-15,-27,-16,-8,-20,-17,-18,-3,-12,-11,-6,-12,17,-5,-16,-4,-5,-7,-25,-17,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-20,-25,-20,-12,-5,-27,-14,4,-10,19,8,-18,-19,-7,5,-20,-10,0,-21,-5,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-25,-10,-5,-21,-18,-16,-10,4,-19,-10,-7,12,-8,-3,-4,-4,-5,-28,-18,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-11,24,-26,26,12,-22,-10,3,-25,3,-23,-19,19,-14,1,-4,0,-7,-25,-26,-6,6;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-1,5,-19,6,-3,-19,-13,-10,-13,-7,-12,-6,0,-7,-5,-10,5,7,-8,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-11,29,-23,19,12,-25,-8,9,-23,2,-26,-17,37,-15,11,0,6,-2,-29,-35,-17,11;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,47,-29,-10,0,-11,10,35,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-17,102,-26,-26,-20,-26,-27,-29,-27,-21,-20,-16,-36,-26,-27,-3,-6,-10,-49,-29,-26;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20,32,-30,19,0,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10,29,78,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22,42,-30,10,0,-15,2,0,-20,-30,-17,-12,-20,-10,-8,25,68,-22;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-12,-29,-15,-17,23,-26,19,-3,-9,-4,-3,-9,-29,-9,-9,-16,-9,-13,21,66,-17;
MA   /M: SY='N'; M=-3,16,-8,7,-1,-21,-5,-3,-22,1,-29,-19,28,-16,-1,-2,17,5,-20,-38,-19,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-21,-20,-21,-10,2,-27,-18,9,-12,19,9,-21,-23,-14,-11,-18,-6,10,-22,-4,-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,6,-13,-1,-4,-12,-5,-8,-16,-9,-23,-16,16,-14,-5,-9,24,17,-12,-34,-15,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-11,-30,-11,-11,6,-25,58,-14,-10,-9,0,-6,-25,-1,-5,-15,-15,-19,2,52,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-22,-33,-24,59,-29,-16,-4,-18,5,-1,-18,-27,-30,-12,-19,-10,-3,7,28,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='N'; M=6,12,-19,3,-4,-22,8,-7,-22,-3,-25,-17,21,-15,-5,-7,12,2,-19,-31,-20,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-10,-10,0,-24,-21,2,-28,17,-20,-9,-2,-21,14,42,-8,-10,-21,-24,-11,4;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-10,-21,-21,23,-30,13,-4,-13,-3,-3,-20,-31,-13,-13,-19,-10,-10,19,65,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-1,-3,-25,-5,4,-23,-15,26,-25,9,-20,-7,1,-14,9,12,-3,-10,-20,-24,-4,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=17,-8,-10,-14,-11,-14,-11,-19,-6,-12,-11,-9,-6,-13,-11,-15,17,21,6,-29,-15,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20,8,-28,-16,20,-26,44,27,-28,-28,-16,-18,-28,-10,10,-20,0,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,35,-21,21,0,-21,-3,6,-18,-2,-27,-19,49,-18,-1,-3,9,0,-26,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-27,-10,-19,-27,58,-20,-36,-19,-27,-19,0,-19,-19,-19,3,-11,-26,-21,-27,-19;
MA   /M: SY='G'; M=8,-9,-25,-10,-17,-28,54,-19,-34,-18,-27,-19,0,-18,-17,-19,5,-14,-24,-22,-28,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-12,-26,-13,-18,-23,39,-20,-22,-20,-22,-13,-2,-19,-17,-20,4,-11,-15,-24,-23,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-12,41,-18,-16,-17,-22,-18,-24,-10,-19,-15,-8,-26,-13,-1,2,4,-9,-36,-18,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-2,-30,1,3,-23,-19,0,-31,26,-21,-13,3,-19,9,59,-9,-10,-21,-23,-11,1;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-1,-28,-2,7,-28,-18,-9,-28,41,-27,-10,1,-12,8,32,-8,-9,-19,-21,-11,7;
MA   /M: SY='N'; M=-3,17,-19,8,1,-21,-4,-2,-21,3,-29,-18,29,-11,1,1,16,6,-21,-36,-19,1;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50884;
//
ID   DM_1_MP; MATRIX.
AC   MP40000;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   DM DNA-binding domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8414934; R2=0.0090122; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1878; N_SCORE=20.765; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=295; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=8,-8,-21,-7,-5,-24,7,-15,-23,-10,-27,-18,-2,10,-7,-11,15,2,-17,-31,-23,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=9,-7,-19,-10,-9,-18,5,-14,-13,-10,-12,-4,-7,2,-9,-14,1,-1,-10,-21,-17,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-9,-17,-9,-1,-13,-11,-16,-7,-12,-6,-7,-8,-15,-8,-12,6,9,0,-30,-14,-5;
MA   /M: SY='G'; M=2,-9,-22,-10,-6,-21,10,-11,-18,-12,-12,-8,-4,-17,2,-11,6,-4,-15,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='A'; M=13,-9,-16,-15,-8,-17,-14,-16,-2,-11,-9,-5,-5,-12,-1,-14,11,11,0,-26,-13,-5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-13,-30,-8,-2,-25,1,-14,-23,-3,-23,-15,-9,17,-7,1,-4,-10,-19,-26,-23,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,7,-26,10,2,-26,-4,-5,-29,5,-27,-19,8,-5,0,14,6,-3,-22,-31,-19,-1;
MA   /M: SY='R'; M=0,-8,-11,-10,-7,-24,3,-12,-28,7,-24,-14,-2,-18,-4,13,1,-7,-17,-25,-19,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-10,-29,-11,-3,-25,-12,-17,-16,14,-21,-9,-8,6,-3,1,-8,-10,-13,-22,-16,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-16,-20,-17,-12,-5,-20,-11,0,-9,1,-1,-11,-21,-8,2,-2,0,2,-22,-2,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-25,-11,-3,-22,-18,-15,-10,-7,-20,-11,-12,23,-1,-8,2,-2,-9,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=-4,6,-16,5,-4,-15,-16,-14,-13,-11,-9,-11,1,-13,-8,-12,12,23,-6,-32,-12,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-25,1,3,-23,-17,13,-25,20,-24,-9,10,-13,5,12,-2,1,-20,-27,-5,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-26,-8,0,-20,-16,-2,-28,22,-22,-12,2,-18,8,54,0,-4,-18,-24,-12,0;
MA   /M: SY='N'; M=2,30,-18,12,-2,-20,0,4,-18,-2,-26,-18,46,-18,-2,-4,10,0,-24,-36,-20,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-14,-28,-27,6,-30,-21,24,-20,14,10,-28,-30,-26,-18,-14,-3,35,-19,5,-27;
MA   /M: SY='L'; M=3,-17,-16,-21,-14,-6,-22,-21,5,-10,11,4,-17,-20,-14,-11,-8,5,10,-24,-8,-14;
MA   /M: SY='S'; M=13,-12,-13,-15,-12,-13,-12,-19,2,-15,-11,-7,-6,-15,-11,-17,16,8,10,-32,-15,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-18,-15,-9,-18,-19,0,-21,-13,-21,-14,-13,19,-9,-16,-8,-5,-21,-7,-9,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-25,-23,-31,-23,37,-28,-5,8,-21,17,16,-22,-28,-20,-15,-22,-10,1,4,32,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-12,-27,-13,-1,-17,-22,-3,-11,11,-2,8,-9,-18,13,23,-13,-10,-12,-20,-7,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-33,-30,-40,-30,56,-27,-23,-7,-27,0,-7,-27,-30,-33,-20,-27,-17,-10,58,30,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-11,-26,-11,-1,-21,-22,-6,-16,19,-15,-4,-6,-19,11,35,-8,-8,-8,-22,-10,3;
MA   /M: SY='D'; M=-3,19,-22,25,3,-21,-13,-5,-23,-5,-18,-18,5,-13,-5,-12,3,4,-16,-25,-4,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-23,3,25,-26,-18,-5,-20,3,-16,-11,-1,-6,19,-2,6,7,-19,-27,-15,22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-22,0,14,-22,-16,9,-22,5,-18,-11,0,-9,5,-1,3,2,-17,-27,-9,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-27,-4,3,-21,-20,-10,-19,29,-14,-5,0,-15,3,17,-12,-9,-15,-22,-9,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-10,-17,-16,-14,-8,-22,-17,4,-10,-1,-1,-4,-19,-12,-4,0,12,8,-28,-9,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-21,-33,-27,-1,-34,-29,36,-24,13,13,-20,-22,-22,-24,-12,1,32,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='A'; M=14,-14,-19,-17,-2,-12,-18,-18,3,-13,5,-1,-15,-15,-9,-17,-5,-5,4,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-13,13,-30,23,42,-29,-19,20,-31,5,-21,-17,5,-5,15,-1,-2,-12,-30,-31,-12,28;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-4,-30,-4,12,-32,-20,6,-24,18,-20,-4,0,-14,40,33,-4,-10,-26,-20,-10,24;
MA   /M: SY='R'; M=-18,0,-28,-4,0,-20,-16,2,-28,24,-22,-12,12,-20,8,56,-6,-8,-22,-24,-12,0;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,18,12,-30,-30,-28,-20,-14,-2,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=42,-13,-11,-21,-11,-16,-4,-20,-6,-13,-2,-6,-13,-13,-11,-20,5,-1,1,-20,-17,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-26,-14,-29,-27,-1,-31,-29,29,-21,9,9,-24,-25,-25,-21,-8,5,39,-28,-8,-27;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC50809;
//
ID   CHITOSANASE_46_80_MP; MATRIX.
AC   MP60000;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Chitosanases families 46 and 80 active sites signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4793644; R2=0.0130107; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1843; N_SCORE=28.448; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,56,15,-35,-7,3,-35,0,-30,-27,31,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-34,-7,-4,-30,8,-17,-29,3,-30,-17,-8,28,-8,-6,-7,-13,-27,-24,-25,-8;
MA   /M: SY='H'; M=-17,17,-30,25,24,-29,-17,41,-33,-1,-23,-14,10,-11,10,-3,-4,-14,-30,-33,-3,15;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,2,-24,27,-24,-4,0,-10,39,18,-4,-10,-26,-20,-10,28;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-13,-36,-13,-3,-17,-20,-16,-27,28,-27,-13,-13,-16,1,14,-19,-16,-23,33,3,1;
MA   /M: SY='N'; M=-15,21,-27,21,18,-26,-12,3,-29,11,-25,-19,22,-14,7,17,0,-7,-27,-32,-17,11;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-3,-27,-13,-12,-12,-22,-9,6,-4,-7,-1,11,-20,-6,7,-8,-7,-2,-26,-9,-12;
MA   /M: SY='A'; M=31,-16,-16,-26,-16,-14,-13,-23,9,-16,-1,-1,-13,-13,-13,-23,1,-3,9,-20,-14,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-12,-23,-16,2,-8,-20,0,6,-5,9,38,-15,-15,5,-7,-15,-10,-1,-23,-5,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,5,26,-35,-20,1,-25,23,-23,-8,0,-8,35,14,-3,-10,-27,-22,-12,31;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-16,-28,-25,-3,-30,-27,25,-20,8,8,-19,-21,-21,-20,-5,10,30,-27,-7,-25;
MA   /M: SY='S'; M=4,13,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,26,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-8,-22,-11,-5,-18,-17,-15,-4,3,-16,-6,-1,-13,-2,-3,8,2,-2,-28,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=12,-19,-22,-22,-12,4,-14,-20,-10,-15,-11,-10,-16,16,-18,-20,-4,-6,-9,-15,-10,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,27,-23,14,6,-26,-6,10,-20,3,-27,-14,41,-17,19,3,7,-3,-30,-34,-17,13;
MA   /M: SY='D'; M=-2,13,-22,19,1,-29,16,-10,-32,-10,-30,-23,10,-13,-5,-13,17,0,-22,-35,-23,-2;
MA   /M: SY='S'; M=-2,16,-16,19,4,-24,-9,-10,-24,-7,-25,-20,10,-10,-3,-10,22,19,-14,-37,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-17,-25,-17,5,-27,-20,12,-25,34,12,-22,-25,-17,-17,-16,6,7,-23,-3,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-14,36,-27,41,25,-31,-10,3,-31,3,-27,-24,27,-10,5,-4,3,-7,-30,-37,-20,15;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-29,-36,-29,-22,7,-15,-22,-15,-15,-15,-15,-29,-22,-15,-15,-29,-22,-22,109,22,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-9,-22,-13,-5,-12,-21,-14,3,11,-6,2,-6,-10,-2,3,-10,-7,1,-15,-4,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=8,-11,-22,-16,-7,-18,-17,-18,-2,3,-12,-4,-6,-13,-5,-5,1,-2,0,-24,-11,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-6,-30,-6,7,-18,-23,13,-14,4,-14,0,-6,-16,38,4,-6,-10,-24,-4,18,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-8,-30,33,-16,-36,9,-30,-16,0,-16,-8,1,-4,-16,-26,-20,-22,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-27,23,-34,-30,-6,-34,-30,19,-27,5,5,-23,-29,-26,-27,-14,-7,23,-32,-12,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=-20,34,-30,48,15,-35,-13,0,-37,8,-27,-25,15,-13,3,12,-3,-10,-27,-35,-17,7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,42,-30,28,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,25,-20,0,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-10,14,-30,23,21,-33,4,-6,-35,7,-27,-21,5,-9,3,-2,-2,-12,-28,-29,-21,12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-1,5,-30,42,-14,-37,-11,-27,-20,0,-14,-7,-14,0,-17,-30,-23,-27,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='C'; M=3,-19,14,-27,-24,-16,-4,-26,-4,-24,-8,-6,-14,-24,-21,-26,-7,-11,0,-28,-19,-24;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-25,-27,-29,-19,-2,-31,-19,19,-14,19,12,-18,-23,-12,0,-20,-10,10,-20,-3,-19;
MA   /M: SY='F'; M=3,-25,-21,-35,-25,20,-26,-24,18,-25,9,6,-17,-20,-24,-24,-12,-7,12,-11,4,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=2,-24,-17,-34,-24,49,-21,-20,-3,-24,4,-3,-17,-24,-31,-20,-11,-7,0,1,14,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-4,-8,44,-18,-18,-14,-24,-24,-18,-18,-14,-14,-8,-22,-18,-18,8,25,-4,-38,-18,-18;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-25,-13,-17,-27,51,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,-3,-16,-10,-13,-16,8,-20,-19,-13,-16,-13,0,-13,-13,-13,14,28,-9,-27,-16,-13;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,48,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,13,-7,-24,-26,-27,-14;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=9,-14,-20,-21,-17,-15,14,-12,-7,-13,-4,16,-11,-17,-9,-16,-6,-10,-5,-20,-15,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-26,-24,-14,-3,-27,-20,7,-24,25,7,-27,8,-17,-20,-24,-10,-3,-23,-9,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-25,-7,21,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-30,-13,-33,-30,25,-30,-27,21,-23,10,7,-27,-30,-33,-20,-13,-3,34,-17,3,-30;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-26,2,22,-31,-16,-4,-24,19,-21,-10,-2,-7,21,8,-1,-8,-22,-23,-15,22;
MA   /M: SY='H'; M=7,-2,-18,-2,-8,-18,-15,9,-9,-11,-10,-6,-5,-18,-9,-14,-2,-6,1,-29,-8,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,16,-16,15,-1,-19,-17,-14,-19,-7,-16,-16,6,-10,-7,-10,14,31,-9,-33,-13,-4;
MA   /M: SY='D'; M=5,18,-24,23,8,-31,-10,-9,-28,10,-24,-18,5,-10,0,-2,0,-7,-18,-28,-17,4;
MA   /M: SY='A'; M=25,-18,-14,-24,-14,-8,-12,-20,2,-18,15,2,-18,-18,-14,-20,-7,-4,4,-20,-12,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-6,-25,-3,11,-22,-23,-13,-14,22,-17,-7,-8,-13,1,9,-8,-7,-3,-25,-12,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-6,-30,8,-20,-26,-13,-30,-20,-14,55,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='G'; M=13,4,-21,-5,-11,-24,29,-12,-25,-11,-24,-17,13,-17,-11,-15,6,-8,-21,-25,-24,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60000;
//
ID   NOS_MP; MATRIX.
AC   MP60001;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Nitric oxide synthase (NOS) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5257740; R2=0.0123576; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; N_SCORE=18.517; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=16,7,-18,7,12,-24,-10,-12,-20,-3,-16,-16,-1,-8,-1,-12,7,4,-12,-27,-18,6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-17,-21,-27,-21,-4,-31,-26,24,-21,7,7,-11,-16,-16,-21,-3,16,17,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-29,-31,-32,-26,43,-28,-7,-5,-20,-1,-5,-25,-30,-23,-16,-25,-15,-11,53,50,-24;
MA   /M: SY='G'; M=9,-10,-27,-12,-18,-28,58,-20,-35,-18,-27,-18,-2,-18,-18,-20,2,-17,-25,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-12,-23,-15,-9,-14,-22,28,-1,-9,-3,17,-9,-21,6,-6,-11,-11,0,-26,2,-3;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-4,3,-23,-1,-2,-21,-12,-11,-18,-8,-25,-18,9,23,-6,-11,10,12,-19,-34,-21,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-30,-10,-4,-22,-4,-4,-32,21,-22,-12,0,-20,5,54,-8,-12,-22,-20,-14,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-25,-21,-28,-20,1,-28,-21,23,-26,26,13,-20,-23,-16,-21,-14,-5,13,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-12,-28,-15,-2,6,-25,5,-10,-5,-8,0,-10,-20,18,-2,-10,-10,-18,0,22,8;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-20,22,20,-27,-7,-5,-27,-3,-28,-22,10,-8,5,-8,20,5,-20,-38,-20,12;
MA   /M: SY='K'; M=10,4,-18,-1,1,-23,-7,-9,-21,12,-25,-14,10,-12,1,3,11,1,-14,-28,-17,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,10,-23,5,10,-30,-10,5,-20,3,-25,-10,17,-12,31,3,12,0,-25,-30,-15,20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-25,-25,-33,-23,36,-30,-17,5,-15,5,2,-15,-25,-23,0,-18,-10,2,-5,13,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-12,-22,-12,-13,-7,-20,-3,-15,5,-3,-15,-15,-12,-20,0,-2,2,-20,-15,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,11,-6,9,-6,0,-10,-30,-36,-20,23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-27,27,-32,-28,-4,-32,-28,11,-28,12,4,-25,-31,-26,-25,-17,-8,17,-32,-12,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-4,8,-20,-1,-6,-20,1,-11,-21,1,-22,-14,15,-14,-6,-2,9,14,-16,-29,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-5,12,-15,9,-3,-17,-18,-15,-17,-8,-15,-15,5,-10,-8,-10,15,35,-7,-32,-12,-5;
MA   /M: SY='A'; M=25,-7,-20,-9,9,-24,-8,-15,-17,-5,-16,-14,-9,10,-3,-15,4,-4,-13,-24,-22,2;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60001;
//
ID   PHOSPHOKETOLASE_1_MP; MATRIX.
AC   MP60002;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoketolase signature 1.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4037819; R2=0.0130735; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1238; N_SCORE=20.579; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=161; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-37,-30,11,-36,-29,38,-27,16,15,-23,-24,-25,-26,-17,-7,31,-19,1,-30;
MA   /M: SY='P'; M=3,-15,-31,-11,-6,-28,5,-19,-23,-12,-27,-18,-12,44,-12,-19,-2,-9,-24,-27,-28,-12;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='V'; M=10,-22,7,-28,-23,-5,-20,-22,8,-18,2,8,-21,-24,-20,-20,-6,-3,20,-27,-13,-21;
MA   /M: SY='A'; M=22,5,-13,-3,-5,-19,-5,-14,-15,-8,-16,-14,6,-11,-7,-14,13,12,-7,-28,-18,-6;
MA   /M: SY='P'; M=10,-17,-30,-13,-3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17,57,-10,-20,-3,-7,-20,-27,-27,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-30,16,49,-31,-20,0,-29,13,-21,-17,0,-3,24,3,-1,-10,-29,-28,-18,36;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-8,-6,-16,-16,-8,-23,-23,0,-13,-5,-5,-8,-16,-15,-13,11,35,11,-30,-10,-16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-3,-1,-20,0,-11,-19,-10,-27,-19,7,-10,-1,-11,36,17,-9,-37,-20,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-39,-29,5,-39,-29,45,-30,23,19,-21,-21,-21,-29,-21,-10,27,-19,1,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-18,7,-28,3,0,-20,-17,85,-28,-8,-22,-3,18,-20,8,0,-7,-17,-30,-32,13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=20,-9,2,-13,-10,-17,-7,-18,-11,-13,-17,-13,-5,-15,-10,-16,19,8,1,-33,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=10,-8,-12,-10,-7,-13,-7,-13,-8,-13,-12,-7,-2,-15,-6,-13,21,11,-1,-33,-16,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-4,-27,-4,-4,-17,-21,83,-22,-11,-16,1,5,-21,5,-3,-10,-17,-19,-30,16,-4;
MA   /M: SY='A'; M=33,-8,-13,-14,-9,-22,11,-18,-17,-12,-18,-14,-4,-12,-9,-18,15,1,-7,-25,-22,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-17,-24,-21,28,-26,-1,-1,-15,0,-2,-18,-27,-18,-14,-12,-2,-2,9,42,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=16,-23,-14,-28,-23,-7,-21,-26,20,-18,5,5,-21,-21,-21,-22,-5,-2,28,-24,-12,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,44,-30,-19,10,-29,29,12,-25,-30,-29,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,68,19,-39,-10,0,-39,0,-30,-30,22,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,28,-23,14,2,-22,-5,10,-22,5,-27,-16,45,-19,8,10,6,-3,-29,-35,-17,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,36,-29,49,18,-34,-4,-1,-35,-1,-28,-26,17,-11,0,-9,1,-9,-29,-35,-17,9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60002;
//
ID   PHOSPHOKETOLASE_2_MP; MATRIX.
AC   MP60003;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Phosphoketolase signature 2.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2455263; R2=0.0129525; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1809; N_SCORE=27.667; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-11,-30,-28,-39,-29,5,-38,-28,44,-30,23,19,-21,-22,-21,-28,-21,-10,26,-18,2,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-19,5,-29,3,0,-20,-17,88,-29,-9,-21,-3,17,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=23,-8,-1,-13,-9,-18,-5,-17,-12,-12,-18,-13,-4,-14,-9,-16,20,8,0,-32,-20,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=11,-9,-11,-10,-7,-14,-7,-15,-8,-14,-12,-10,-2,-15,-7,-14,21,11,0,-34,-16,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-3,-28,-3,-3,-18,-21,87,-24,-11,-17,1,6,-21,6,-2,-10,-18,-22,-30,17,-3;
MA   /M: SY='A'; M=35,-8,-13,-15,-10,-22,12,-18,-17,-12,-17,-13,-5,-12,-10,-18,13,0,-7,-23,-22,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-20,-23,-24,-21,29,-26,0,1,-15,1,-1,-18,-26,-18,-14,-12,-2,-1,11,45,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=19,-22,-15,-28,-22,-8,-20,-26,18,-18,4,4,-19,-19,-19,-22,-4,-2,24,-23,-12,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-20,-35,-25,43,-29,-19,10,-29,29,13,-25,-29,-28,-19,-25,-10,5,-6,14,-24;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,67,19,-39,-9,1,-39,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='N'; M=-11,30,-22,15,2,-22,-4,10,-21,4,-28,-17,47,-19,7,8,7,-2,-29,-36,-17,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,32,-28,43,16,-31,-3,-1,-34,-2,-27,-25,17,-12,0,-9,3,-8,-28,-34,-16,8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-23,-10,2,-28,-15,12,-23,37,15,-25,-26,-9,-15,-25,-10,3,-21,-3,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-28,-25,-37,-29,5,-37,-29,40,-28,17,16,-21,-22,-22,-27,-17,-6,29,-20,0,-29;
MA   /M: SY='V'; M=16,-21,-10,-25,-22,-7,-20,-26,14,-16,2,2,-21,-22,-22,-19,-1,4,30,-27,-13,-22;
MA   /M: SY='A'; M=23,-14,-15,-21,-14,-4,-6,-21,-8,-14,-8,-8,-12,-8,-17,-19,3,2,0,-18,-12,-15;
MA   /M: SY='C'; M=1,-17,68,-25,-24,-18,-18,-27,-21,-24,-16,-15,-16,-31,-24,-25,-4,-3,-4,-40,-25,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-12,-31,-29,1,-31,-29,31,-21,13,11,-29,-29,-29,-21,-12,-1,46,-29,-9,-29;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-16,-32,-29,-1,-31,-29,34,-22,12,12,-25,-25,-25,-23,-12,-3,40,-26,-8,-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=40,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,84,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-19,-28,-19,8,-29,-20,17,-28,44,17,-27,-28,-19,-19,-25,-4,9,-21,-1,-19;
MA   /M: SY='A'; M=44,-11,-11,-21,-11,-18,-2,-18,-7,-10,-7,-3,-11,-11,-9,-19,7,-1,1,-20,-18,-10;
MA   /M: SY='T'; M=6,-1,-10,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-10,-10,-10,-1,-10,-10,-11,19,44,0,-29,-11,-10;
MA   /M: SY='S'; M=15,-3,-13,-4,-4,-21,9,-13,-21,-11,-27,-18,6,-11,-4,-13,30,12,-11,-34,-21,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,6,-26,-20,72,-27,-4,-20,0,7,-17,25,3,-7,-17,-30,-27,11,12;
MA   /M: SY='S'; M=15,-5,-11,-7,-6,-19,2,-14,-15,-12,-23,-16,2,-12,-6,-13,28,12,-4,-34,-20,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-21,10,-4,-17,-8,12,-13,-5,-22,-13,42,-19,-2,-4,6,1,-22,-36,-13,-4;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60002;
//
ID   OMEGA_CONOTOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60004;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Omega-conotoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2210938; R2=0.0047470; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2141; N_SCORE=11.380; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1113; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-40; D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-69,-78,1,-55,-61,-73,136,-69,-61,26,-48,-48,-72,-51,-56,-62,-66,-72,-95,-41;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-70,-84,-5,-53,-76,-77,90,-86,-33,-75,-63,-53,-75,-44,99,-62,-68,-81,-84,-56; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=38,-69,-46,74,-78,-59,-59,-75,-51,-74,-69,-53,-60,-44,-58,63,-7,-65,-80,-70;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-68,-79,-72,-48,-79,-62,-36,-69,60,108,-71,-74,-63,-69,-66,37,-42,-74,-53;
MA   /M: SY='R'; M=22,-76,-53,34,-78,-21,-56,-79,43,-75,-66,20,-67,-43,75,-14,-58,-71,-77,-67;
MA   /M: SY='S'; M=-52,-69,-5,-53,-76,-54,-52,-77,10,-79,-69,74,-68,-47,38,75,-44,-72,-85,-67;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-77,29,-52,-78,-68,-63,-71,-12,-75,-67,-54,86,-57,37,-13,64,-68,-83,-71;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-72,-85,-13,-80,-93,-85,-87,-86,-80,-90,-86,-68,-83,-80,-87,30,77,-78,-110,-89; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-78,-46,67,-81,-23,-57,-81,90,-78,-68,-51,-60,-38,-32,-56,-59,-76,-75,-68;
MA   /M: SY='A'; M=58,-65,-11,-64,-61,-61,-68,-46,-66,31,-50,-5,-72,-62,-69,31,-51,35,-79,-64;
MA   /M: SY='S'; M=-15,-67,-52,34,-76,-53,-59,-75,-54,-77,-71,-47,-3,-47,-60,98,-40,-67,-82,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-74,-60,10,-66,-72,-59,-59,82,16,66,-56,-4,-47,-39,-16,-10,-61,-74,-62;
MA   /M: SY='S'; M=13,-65,-68,-65,-55,-65,-65,-48,-66,58,-45,-60,-71,-60,-68,58,38,-49,-77,-60;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='T'; M=-27,-80,-13,-19,-76,-83,-76,-76,-69,-79,-75,-64,-77,-73,-17,-55,86,-69,-90,24; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-85,59,-55,-80,11,-62,-82,-48,-81,-75,-55,-77,-56,71,3,-15,-28,-86,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-76,-60,12,-61,-74,-58,19,66,5,27,-13,-69,-5,36,-25,-59,-25,-70,16;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-77,19,43,-80,22,-62,-76,-56,-42,-69,-55,72,-7,-64,40,-18,-72,-80,-73;
MA   /M: SY='P'; M=37,-73,3,-53,-74,-9,-64,-68,46,-73,-65,-56,63,-55,-54,28,-17,-10,-76,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-51,-77,17,-4,-81,94,-69,-88,-66,-84,-75,-50,-67,-63,-74,-50,-23,-82,27,-74;
MA   /M: SY='S'; M=26,-68,-15,-1,-70,-25,-55,-70,-20,-71,0,50,-66,40,-57,51,26,-65,-76,15;
MA   /M: SY='P'; M=-60,-77,-67,-62,47,-67,-57,-63,-5,-64,-61,-63,76,-61,-64,50,-54,-30,-55,70;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-74,18,-61,-79,71,3,-82,-56,-81,-72,11,-14,-57,25,41,1,-76,-80,-70;
MA   /M: SY='P'; M=-60,-75,-71,-62,5,-74,-67,20,21,-29,42,-65,44,-58,41,8,-19,36,27,-58;
MA   /M: SY='T'; M=-57,-69,-65,-66,5,13,27,19,-64,13,-52,-56,24,-64,-70,-2,77,-50,-78,-59;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='M'; M=-29,-75,-74,-70,4,-71,-68,-58,8,-33,75,-64,-76,-63,-67,58,1,4,-80,-8; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-66,-81,-68,-63,-44,-12,-54,27,10,-16,-53,-16,43,-9,34,-64,-63,-57,29,87;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-70,-82,64,-55,-70,-73,3,17,-62,11,-61,42,23,13,-22,-63,-21,-63,-87,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='S'; M=-68,-86,0,-75,-94,-77,-1,-91,-75,-94,-88,-65,-84,-72,-27,64,40,-84,-106,-85; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=-24,-76,-63,-26,-80,93,-68,-84,-63,-43,-71,-51,-68,-10,-1,-19,-22,-78,-74,-74;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-58,-75,-69,-66,40,-65,-62,-26,-58,-35,-61,-14,-73,-58,25,65,-18,-64,107,44;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='S'; M=2,-70,-64,-64,31,-29,3,9,-22,5,-53,23,-73,-58,25,45,-17,-7,-69,17;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-82,-99,-87,-79,-82,-39,-79,-83,-27,-11,-78,-82,42,-74,46,5,-78,-38,-90,12; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-60,-75,-67,-67,62,65,2,-28,41,-18,-60,-13,-72,-62,-19,-58,-64,-67,-63,-50;
MA   /M: SY='K'; M=10,-75,-67,-56,5,-73,-67,27,69,-58,-56,-60,-70,-53,36,-60,-59,23,55,-57;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='M'; M=31,-69,-71,-69,-11,34,-66,15,-65,2,68,-61,-70,-64,-19,-53,39,-19,-72,-3;
MA   /M: SY='W'; M=-59,-74,46,-54,-73,5,-58,-75,-53,-78,-70,67,25,-55,16,12,42,-73,72,-64;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-78,-86,-78,-81,41,-84,-46,-61,-73,-57,-56,-78,-90,-70,-70,-73,-72,-66,-34,122; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-73,-96,-76,-66,-84,-78,-79,27,-72,-77,-69,-80,113,-74,-83,-72,-66,-68,-85,-84; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-55,-74,39,-42,-80,-62,-56,-78,74,-78,-68,-45,-64,51,-39,57,-50,-73,-78,-66;
MA   /M: SY='N'; M=-62,-67,-35,-57,-77,-50,-43,-76,-48,-84,-70,125,-73,-50,-56,-44,-47,-78,-96,-72;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60004;
//
ID   DELTA_CONOTOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60005;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Delta-conotoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9700186; R2=0.0070367; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=6.979; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=360; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,18,-30,26,12,-32,-16,18,-34,19,-28,-15,10,-12,6,9,-6,-12,-26,-30,-7,8;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-9,12,-18,19,15,-14,-11,2,-18,0,-14,-13,3,-7,3,-4,0,-5,-16,-15,-1,9; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='E'; M=0,-4,-31,-1,4,-24,2,-15,-27,-5,-23,-19,-8,0,-6,-12,-6,-13,-24,-1,-15,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-12,-25,-13,-8,0,-21,-3,-9,5,-13,-6,-7,-19,-4,6,-4,-4,-9,-8,17,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=0,5,-23,1,6,-28,-11,-4,-21,10,-26,-12,10,-4,14,3,7,-2,-21,-28,-16,9;
MA   /M: SY='P'; M=10,-9,-24,-8,3,-25,-6,-16,-19,-8,-22,-17,-8,25,-6,-16,6,0,-17,-28,-24,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-11,-30,-11,-20,-24,59,-16,-36,-19,-27,-18,-2,-21,-19,-19,-2,-19,-28,-15,-18,-20;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-19,-3,9,-22,-7,-12,-19,-4,-16,-12,-1,-9,4,-8,10,14,-14,-27,-16,6;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-26,-19,-34,-25,52,-26,-16,3,-26,12,8,-18,-27,-29,-18,-16,-7,2,-2,18,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,9,-26,11,-7,-27,30,-11,-32,-13,-25,-20,11,-17,-11,-14,4,-10,-25,-29,-24,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-28,-34,-25,-2,-35,-27,35,-27,18,15,-22,-9,-19,-26,-20,-9,21,-22,-4,-26;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-9,-27,-12,-6,-8,-23,6,-11,7,-7,-1,-3,-19,-3,9,-13,-11,-11,-20,1,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-31,1,-2,-16,-10,-13,-21,-11,-25,-19,-2,35,-11,-16,-3,-7,-25,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-6,-33,39,-10,-33,-10,-27,-13,0,-17,7,-10,0,-17,-30,-20,-23,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-6,-20,-13,-13,0,-20,-10,6,-20,23,6,1,-27,-13,-13,-16,-7,-4,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,3,-15,5,0,-21,-6,-9,-19,-5,-25,-17,6,-13,-2,-1,24,11,-8,-37,-18,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-1,-27,1,10,-27,23,-11,-29,-7,-23,-18,1,-13,-4,-12,1,-13,-23,-25,-24,3;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-25,-29,-22,22,-25,-16,3,-19,6,0,-20,-24,-20,-14,-16,-6,-1,13,18,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-13,103,-24,-26,-20,-26,-25,-29,-26,-21,-20,-10,-38,-26,-26,-8,-9,-12,-49,-29,-26;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-23,-1,-28,-21,17,-26,-19,12,-24,17,7,-19,-23,-21,-19,-17,-8,8,-13,3,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=4,-15,-10,-16,-14,-2,-14,-17,6,-12,-3,-2,-13,-7,-15,-13,0,1,14,-20,-9,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-20,-30,-24,27,-13,-21,3,-27,18,5,-21,-28,-28,-20,-19,-10,3,-10,4,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-31,-22,-34,-29,15,-27,-28,13,-22,3,1,-28,-28,-27,-21,-18,-9,19,17,6,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-21,-19,-29,-23,5,-28,-25,20,-22,10,7,-17,-20,-21,-21,-7,6,19,-20,-3,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-3,9,-19,11,7,-23,-1,-11,-25,-7,-22,-19,6,-10,-3,-10,15,14,-16,-32,-18,2;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-21,-35,-27,53,-20,-20,0,-29,15,2,-20,-29,-34,-20,-20,-11,-1,0,17,-27;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,33,-26,48,23,-34,-10,-2,-34,0,-28,-26,15,-8,3,-8,8,-4,-26,-38,-20,13;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-16,-15,-21,-16,32,-16,-15,-10,-20,-9,-10,-6,-20,-21,-15,9,4,-5,-14,6,-16;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60004;
//
ID   CYCLOTIDE_BRACELET_MP; MATRIX.
AC   MP60008;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclotides bracelet subfamily signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5431783; R2=0.0074812; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=926; N_SCORE=10.468; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=396; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=3,-6,-20,-7,-9,-23,21,-16,-25,-7,-26,-16,1,-15,-9,-10,13,2,-15,-28,-21,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-26,-36,-27,2,-36,-28,39,-28,19,16,-19,-20,-19,-26,-16,-3,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-16,-35,-8,0,-28,-16,-18,-20,-10,-30,-20,-15,72,-8,-18,-1,-5,-26,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=11,-9,-24,-12,-17,-26,52,-19,-32,-17,-24,-17,-2,-17,-17,-19,2,-15,-22,-19,-26,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-8,9,-28,18,55,-29,-18,-1,-29,8,-21,-20,1,-1,18,-1,4,-7,-28,-31,-20,36;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=5,-28,-10,-29,-28,-2,-27,-29,26,-19,8,8,-28,-28,-28,-20,-8,0,45,-29,-11,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-30,-36,-32,-26,26,-25,-9,-6,-17,-5,-2,-28,-29,-18,-16,-28,-18,-15,72,44,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,80,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-22,-36,-29,12,-35,-27,34,-27,20,14,-24,-25,-26,-25,-18,-7,29,-19,1,-29;
MA   /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,3,-10,-7,-10,27,40,-3,-33,-13,-7;
MA   /M: SY='A'; M=22,-4,-15,-8,-1,-22,7,-15,-19,-9,-20,-15,-1,-10,-6,-14,17,5,-10,-27,-21,-4;
MA   /M: SY='V'; M=6,-26,-16,-29,-23,-1,-25,-25,21,-22,20,10,-25,-25,-22,-21,-14,-4,25,-24,-8,-23;
MA   /M: SY='I'; M=0,-27,-20,-33,-25,8,-29,-25,25,-25,19,11,-23,-24,-23,-23,-16,-6,22,-19,-2,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-4,-29,-7,-18,-29,62,-17,-38,-18,-30,-20,7,-20,-18,-18,1,-18,-30,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,0,-13,-1,1,-21,-4,-11,-21,-1,-29,-18,8,-10,1,-4,31,17,-11,-36,-18,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-26,1,13,-27,-17,-10,-27,33,-27,-12,1,-9,8,18,0,-1,-18,-25,-12,10;
MA   /M: SY='N'; M=-6,31,-19,22,3,-23,-2,3,-23,-3,-30,-22,41,-16,0,-4,16,4,-25,-40,-20,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,49,-29,-10,0,-11,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,9;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC51052;
//
ID   CYCLOTIDE_MOEBIUS_MP; MATRIX.
AC   MP60009;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Cyclotides Moebius subfamily signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5209019; R2=0.0064881; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1065; N_SCORE=10.427; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=460; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=7,-19,-15,-21,-14,-4,-17,-18,5,-20,14,3,-16,-21,-14,-17,-3,0,7,-26,-10,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-25,-24,-30,-22,-5,-32,-22,24,-12,7,10,-18,-23,-15,-2,-15,-7,23,-23,-5,-22;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=13,-10,-25,-13,-17,-27,52,-20,-32,-17,-25,-17,-3,-17,-17,-20,3,-15,-22,-20,-27,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,2,-10,-8,-10,24,44,-2,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-24,-16,-32,-26,46,-28,-22,3,-24,6,0,-18,-26,-32,-18,-10,5,9,-6,14,-26;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-17,-24,-22,-21,-10,4,-23,1,-23,3,1,-11,-20,-18,-21,-8,-2,-1,-22,-12,-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-21,-3,2,-22,-18,-13,-22,23,-23,-11,1,-10,2,12,6,13,-12,-26,-11,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,1,-27,-6,-13,13,-20,17,-7,-7,-10,-7,8,-27,-7,-7,-10,-7,-17,6,45,-13;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=5,-12,-25,-8,7,-22,-18,-17,-11,-7,-16,-12,-15,23,-6,-15,-3,-6,-9,-28,-22,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-30,-8,-13,-32,53,-14,-36,-14,-28,-16,0,-18,-5,-14,0,-18,-30,-20,-26,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,8,-13,9,1,-21,-7,-11,-21,-8,-25,-19,9,-10,-3,-10,28,23,-11,-37,-17,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-2,-32,-40,-35,-25,2,-15,-27,-17,-17,-17,-17,-32,-25,-17,-20,-27,-22,-22,107,17,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-23,-35,-18,-8,-2,-23,-20,-15,-15,-20,-15,-20,60,-18,-20,-13,-10,-22,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-28,-14,-30,-26,3,-28,-22,26,-21,22,21,-28,-28,-22,-18,-17,-4,33,-26,-6,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-3,-13,-9,-9,-6,-17,-12,-11,-10,-13,-11,-1,-13,-8,-10,18,34,-4,-23,1,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC51052;
//
ID   ASSASSIN_BUG_TOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60010;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Assassin bug toxin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2088728; R2=0.0087642; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1485; N_SCORE=17.222; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=262; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-30,45,40,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,10,-5,10,-5,0,-10,-30,-35,-20,25;
MA   /M: SY='K'; M=-13,15,-30,23,24,-33,-17,-5,-33,28,-28,-18,5,-8,10,13,-5,-10,-25,-28,-15,17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,35,-30,35,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,20,-20,0,-25;
MA   /M: SY='P'; M=20,-15,-25,-15,-5,-25,-10,-20,-15,-10,-20,-15,-15,40,-10,-20,0,-5,-15,-25,-25,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-15,-35,-10,0,-25,-20,-10,-25,10,-25,-15,-10,35,0,25,-10,-10,-25,-25,-20,-5;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=30,-5,-10,-10,-5,-20,0,-15,-15,-10,-20,-15,0,-10,-5,-15,25,10,-5,-30,-20,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-35,-5,5,-30,-20,-15,-25,20,-30,-15,-10,40,0,5,-10,-10,-25,-25,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,45,-30,-20,10,-30,30,10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,5,-5,15,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-20,5,25,-20,-20,-10,-20,0,-15,-15,0,-5,5,-5,10,20,-15,-30,-15,15;
MA   /M: SY='B'; M=-15,45,-25,45,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,40,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-35,-5,10,-35,-20,-5,-20,0,-25,-10,-10,40,25,-5,-5,-10,-30,-25,-20,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,23,-25,15,17,-25,-10,2,-25,15,-28,-17,30,-13,7,8,2,-5,-27,-32,-17,12;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-10,-20,-5,0,-15,-10,-10,-10,-5,-15,-10,-10,45,-5,-10,-5,-5,-15,-15,-15,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-8,-30,-8,-3,-25,3,-8,-33,22,-25,-13,0,-18,2,37,-7,-13,-23,-20,-15,-3;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-5,-10,-10,-15,15,25,0,-25,-15,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-20,-30,-25,-20,0,-20,-25,-15,-15,-15,-15,-20,-20,-15,-15,-10,10,-15,61,10,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=0,-10,-15,-15,-10,-10,-10,-5,0,-10,-5,20,-5,-15,0,-10,10,5,0,-30,-10,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-5,-15,-15,-20,-15,30,-15,-15,-10,-20,-10,-10,-5,-20,-20,-15,10,5,-5,-15,5,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,50,-10,-10,-20,-20,-10,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,30,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60010;
//
ID   PLANT_C6_AMP_MP; MATRIX.
AC   MP60011;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Plant C6 type antimicrobial peptide (AMP) signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7168336; R2=0.0079110; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=959; N_SCORE=11.301; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=352; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-22,29,-32,-25,-7,-27,-16,7,-21,6,24,-20,-27,-14,-21,-16,-10,6,-31,-11,-21;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-18,-12,-22,-18,0,-20,-13,21,-13,11,21,-17,-17,-12,-13,-11,-4,21,-17,-3,-16; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='L'; M=8,-16,-11,-18,-11,-1,-13,-14,6,-16,20,6,-16,-16,-11,-14,-11,-4,4,-14,-5,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-17,-26,-19,21,-23,-17,17,-21,16,9,-15,-18,-19,-17,-15,-7,10,-6,7,-19; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-14,-21,-14,4,-18,-9,14,-16,27,24,-18,-18,-9,-11,-18,-7,7,-14,0,-11; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28,0,-35,-23,43,-25,20,30,-20,-20,-15,-25,-20,-10,25,-20,0,-25;
MA   /M: SY='K'; M=1,-10,-23,-11,-7,-22,-6,-18,-15,15,-18,-7,-8,-16,-7,4,-6,-8,-2,-22,-14,-7;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-8,30,-15,15,0,-15,0,8,-15,0,-23,-15,45,-15,0,0,8,0,-23,-30,-15,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-8,-23,-8,-13,-22,43,-13,-29,-10,-22,-14,0,-15,-12,-5,-1,-14,-22,-15,-20,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,9,-19,3,-5,-19,19,-4,-23,0,-23,-14,19,-14,-5,-2,2,-8,-21,-21,-17,-5; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-8,-23,-8,-9,-20,25,-9,-27,0,-20,-12,0,-15,-6,13,-3,-12,-20,-15,-16,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,91,-23,-23,-15,-23,-23,-23,-23,-15,-15,-15,-30,-23,-23,-8,-8,-8,-38,-23,-23; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-23;
MA   /M: SY='N'; M=-14,23,-27,22,11,-31,-11,6,-26,7,-26,-15,24,-14,20,10,2,-7,-29,-31,-16,15;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-33,-3,16,-28,-17,-14,-21,-4,-24,-18,-13,49,-1,-14,-4,-8,-25,-28,-26,4;
MA   /M: SY='D'; M=-5,27,-19,29,7,-27,-3,-1,-27,-4,-30,-23,26,-13,0,-7,19,5,-22,-40,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=4,-14,-21,-18,-15,-18,10,-13,-7,-12,-7,9,-11,-19,-5,-14,-5,-10,-3,-22,-15,-10;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-24,-7,-14,-27,48,-17,-34,-17,-30,-20,3,-17,-14,-17,13,-7,-24,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-14,-29,-10,2,-28,-19,-12,-13,-5,-20,-9,-14,32,10,-11,-4,-8,-17,-26,-20,3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-14,-34,-10,-11,-30,30,-20,-31,-16,-30,-20,-9,28,-16,-20,-4,-16,-30,-24,-30,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,5,-26,0,5,6,-18,7,-14,-5,-13,-11,10,-19,-3,-6,-6,-7,-20,-9,18,0;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,81,-25,-23,-22,-28,-28,-28,-25,-22,-20,-20,-8,-25,-28,-10,-10,-15,-45,-30,-25;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-27,-8,-15,-27,50,-16,-36,-13,-29,-19,2,-18,-14,-9,5,-13,-26,-23,-26,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-25,-28,-23,37,-28,4,5,-16,8,15,-20,-28,-16,-13,-20,-10,-2,12,46,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-17,10,-21,-18,6,-27,20,-14,-21,-2,-2,-12,-29,-15,-15,-16,-13,-12,-19,14,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-3,6,-26,-15,-4,-26,23,-26,-11,2,-13,15,29,4,-3,-19,-25,-12,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-30,-2,21,-32,-23,2,-11,4,-14,-1,-3,-9,39,2,-3,-10,-21,-22,-11,29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-22,-27,-21,-13,2,-21,-21,-7,-16,-12,-10,-20,30,-20,-20,-9,-7,-8,-19,-11,-18;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-2,-28,-5,-17,-28,59,-15,-37,-17,-30,-20,9,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='W'; M=-17,-23,-39,-23,-12,-1,-22,-5,-15,-8,-15,-9,-23,-24,7,-8,-23,-19,-25,68,30,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=8,-15,-18,-16,-19,-18,19,-22,-11,-17,-15,-9,-9,-20,-19,-18,4,-5,2,-26,-21,-19;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-12,-24,-15,-8,-6,-17,-1,-14,7,-12,-7,-9,-19,-2,12,-7,-7,-11,-4,15,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-23,-24,-23,-23,21,-30,4,9,-13,3,3,-23,-30,-16,-13,-17,-7,9,11,52,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-7,-30,-7,-2,-25,2,-8,-32,23,-25,-12,0,-17,3,37,-8,-12,-22,-20,-15,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-14,18,-24,7,0,-20,-9,6,-24,13,-26,-16,34,-20,4,31,1,-4,-26,-31,-16,0;
MA   /M: SY='R'; M=3,-9,-24,-12,-2,-21,-14,-8,-24,20,-18,-10,-3,-16,4,37,-4,-7,-14,-20,-13,-2;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='A'; M=27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,9,-15,-1,-1,-19,-19,-19,-20,1,0,23,-25,-15,-19;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60011;
//
ID   MU_CONOTOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60013;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mu-conotoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6221254; R2=0.0060924; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=915; N_SCORE=9.193; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=473; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,41,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,43,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,48,-33,-20,3,-27,10,-20,-14,0,-3,32,3,0,-10,-30,-27,-17,40;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-6,-30,-6,-6,-5,-23,76,-21,-10,-14,0,1,-23,4,-3,-13,-17,-24,-12,38,-6;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-14,-21,-14,7,-21,-14,14,-21,36,14,-21,-21,-14,-14,-21,-7,7,-14,0,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,-3,-30,-3,14,-34,-20,7,-23,16,-20,-3,0,-13,45,28,-3,-10,-27,-20,-10,28;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-17,-6,0,-11,-11,0,-17,17,-11,-6,0,-11,6,39,-6,-6,-11,-11,-6,0; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-16,33,-26,39,8,-26,-11,-1,-24,-5,-16,-19,21,-16,-4,-9,-3,-7,-23,-36,-16,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,9,-16,-2,-9,-16,1,-12,-18,-9,-19,-14,15,-14,-9,-9,14,25,-13,-31,-16,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-34,-15,-10,-11,1,-20,-22,-16,-23,-16,-15,40,-18,-20,-9,-13,-25,-20,-19,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-15,-30,-7,0,-22,-15,-15,-15,-7,-22,-15,-15,67,-7,-15,-7,-7,-22,-22,-22,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-22,-2,5,-20,-15,-5,-22,33,-20,-7,0,-10,7,31,-7,-7,-15,-15,-7,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-26,-3,1,-28,7,-13,-31,21,-30,-14,2,-13,1,10,1,-7,-21,-24,-17,1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-25,-2,6,-26,-15,-8,-27,31,-28,-13,3,-12,7,27,3,-2,-17,-25,-13,6;
MA   /M: SY='D'; M=-7,28,-21,40,11,-31,-6,-4,-31,-4,-30,-26,16,-10,0,-10,17,3,-21,-40,-20,6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,35,-23,-10,0,-17,10,60,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-14,-35,-14,-1,-19,-20,-4,-24,10,-20,-9,-10,-19,20,25,-14,-15,-26,24,0,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,45,-27,-10,0,-13,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-2,-37,11,5,-33,-17,-15,-25,-7,-30,-23,-10,64,-7,-17,-7,-10,-30,-33,-27,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-14,-9,-26,-12,-4,-14,-22,42,-9,-10,1,16,-5,-20,12,-4,-14,-14,-15,-24,7,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-6,-11,-6,-11,0,-11,-6,-6,-6,-6,-6,-6,-6,-11,6,0,0,-11,-11,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60004;
//
ID   ALPHA_CONOTOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60014;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Alpha-conotoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8347995; R2=0.0060057; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=944; N_SCORE=6.500; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=777; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-45; D=-20; I=-4; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: I=-20; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=82,-66,-67,-65,-78,58,-70,-72,-65,-73,-65,-58,-67,-62,-70,-43,-57,-60,-75,-73;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-71,36,-48,-79,-56,-47,-78,53,-82,-70,105,-70,-47,-46,-48,-50,-78,-90,-70;
MA   /I: MD=-19;
MA   /M: SY='A'; M=73,-72,64,-52,-83,-59,-66,-76,-59,-77,-71,-56,-71,-59,18,-51,-59,-66,-86,-74; D=-4;
MA   /I: MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=1,-80,-56,39,-79,-74,-64,6,87,-74,-66,-56,-66,-46,-38,-60,-61,-67,-78,-70; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='A'; M=70,-68,-67,-62,-78,-60,-68,-71,-55,-72,-66,-60,-70,-58,42,12,42,-60,-82,-72; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=-48,-72,-61,-60,-80,-56,-64,-78,-62,-82,-74,-52,52,-55,-67,96,-43,-72,-86,-73; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-84,90,15,-88,29,-59,-90,-52,-86,-81,-46,-71,-55,42,-59,-65,-85,-92,-74; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='M'; M=-67,-73,-85,-77,-51,-87,-70,-36,-70,64,71,-81,-83,-69,14,-76,-64,32,-78,-58; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-65,-78,-77,-75,-59,-86,89,63,-75,-46,-46,-69,-78,-70,-74,-70,-61,59,-89,-55; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='S'; M=42,-71,-57,38,-80,-62,-67,-74,-59,-76,-70,-57,25,-55,-66,52,42,-65,-84,-74; D=-4;
MA   /I: DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-61,49,-75,-69,22,-74,-68,-47,-71,63,-43,-71,52,-67,-73,34,-57,-51,-72,-56;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='T'; M=2,-67,45,-59,64,-68,-64,-56,-62,-58,-59,25,-69,-65,-68,-49,69,6,-72,-49;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='D'; M=-66,-77,73,-52,-63,-73,-60,51,-54,20,-52,24,-73,-58,42,-62,-59,-49,-83,-62;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-92,-106,-86,-81,-98,-99,-82,1,7,-94,-86,18,-100,-72,66,-86,-87,-89,-104,-90; D=-4;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-82,-102,-86,-80,-102,21,-82,-107,5,-102,-92,-76,-94,-71,63,1,-84,-101,-100,-91; D=-4;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='K'; M=-68,-85,39,-47,-83,-74,-60,-84,67,-82,-71,-54,46,-48,65,-62,-63,-80,-81,-71; D=-4;
MA   /I: MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-54,-80,18,36,-85,87,-68,-90,-64,-86,-77,-52,-1,-60,-72,-53,-67,-84,-79,-78; D=-4;
MA   /I: MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='C'; M=-60,152,-80,-80,-71,-75,-80,-78,-76,-69,-69,-66,-91,-83,-82,-18,-60,-66,-100,-81;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='H'; M=-50,-69,-53,-55,-69,-55,90,-76,-56,-74,-64,35,-67,2,-57,85,-45,-72,-83,3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-80,-89,38,-65,-68,-83,83,-79,-67,1,-67,17,-85,-66,9,-71,-16,-81,-86,41; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-65,-91,-67,-56,-86,-1,-70,-75,-63,-84,-71,-71,124,-66,-76,-62,-60,-79,-79,-83;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='P'; M=67,-72,-66,-57,-77,-60,12,-67,-54,-71,-63,-63,75,-58,36,-50,-11,-21,-78,-70;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=20,-74,-62,-69,41,46,13,-71,-61,-68,36,60,-75,-63,9,-55,-62,-70,-75,-59; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='V'; M=36,-73,-73,-65,-62,-71,-67,-49,30,-8,37,-68,18,-62,-12,-17,-58,40,-74,25; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-75,14,-14,-74,-65,39,-77,-14,-35,-69,72,-73,-55,11,30,25,-74,-88,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-75,-81,-57,-71,30,-70,67,-77,-65,-74,-68,85,-85,-64,-67,-62,-64,-80,-71,62; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-60,-85,-12,-61,-81,-1,-71,-80,-65,-85,-76,-63,88,-2,-73,56,-57,-80,66,-73; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-71,-88,71,31,-91,6,48,-91,-62,-88,-81,4,2,7,-68,-62,-7,-88,-99,-75; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-73,23,-83,-83,-43,-87,-63,38,-78,0,-54,-79,-87,-75,-78,-14,-7,-11,-57,91; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-65,149,-85,-85,-75,-81,-85,-82,-81,-73,-73,-71,-96,-89,-87,-68,-65,-70,-105,-86; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='W'; M=-62,-85,-70,-77,-82,70,-74,-92,-66,-90,-81,26,-79,-68,17,12,-70,-89,76,-74; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-63,-80,-61,-51,-78,23,-56,-83,60,-77,-66,-53,-70,-43,93,-58,-63,-77,-74,-65;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='R'; M=-60,-73,-61,-55,-72,-73,-58,-71,-34,-70,-62,-52,-68,-47,95,-49,77,-64,-80,-64;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='R'; M=-67,-77,-71,-60,-58,-80,-58,-55,-38,54,-46,-65,-79,-50,95,-67,-65,-58,-74,-58;
MA   /I: I=-5; E1=0; MI=0; IE=0; DE=-25;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60004;
//
ID   MU_AGATOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60015;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Mu-agatoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2906728; R2=0.0086286; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1072; N_SCORE=13.539; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=0,15,-24,21,15,-30,-6,-7,-29,6,-25,-20,6,-9,2,-4,5,-5,-21,-31,-19,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=4,-27,-13,-28,-23,0,-25,-25,20,-22,21,10,-27,-27,-23,-20,-14,-3,28,-25,-8,-23;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-23,-8,-12,-24,27,-16,-26,-13,-24,-17,4,-6,-13,-16,5,-2,-21,-25,-24,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-30,24,47,-31,-19,-2,-31,15,-23,-20,3,-3,16,3,-2,-10,-28,-30,-18,31;
MA   /M: SY='G'; M=3,5,-22,-3,-11,-17,19,-5,-22,-10,-23,-16,15,-19,-9,-12,5,-6,-21,-21,-10,-11;
MA   /M: SY='Q'; M=1,3,-27,5,7,-33,6,-6,-27,3,-23,-13,1,-12,14,-2,0,-11,-24,-23,-18,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-1,-33,2,3,-23,-18,6,-29,14,-23,-12,-1,-17,11,27,-11,-14,-25,-2,-3,5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=27,-8,-15,-14,-6,-20,-5,-14,-16,-1,-16,-12,-4,-12,-4,3,10,1,-6,-23,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-11,26,-27,40,12,-33,-9,-6,-32,-4,-30,-26,11,6,-2,-12,8,-2,-25,-38,-22,4;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-36,-45,-37,-27,6,-17,-29,-19,-19,-19,-19,-36,-27,-19,-20,-33,-26,-26,127,23,-19;
MA   /M: SY='A'; M=15,-9,-15,-13,-9,-3,-8,-7,-11,-11,-14,-11,-5,-16,-8,-14,13,5,-6,-15,6,-9;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-23,-8,-15,-23,54,-15,-31,-15,-23,-15,0,-15,-15,-15,0,-15,-23,-15,-23,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-13,2,-36,15,13,-33,-17,-12,-27,-5,-29,-23,-7,52,-3,-15,-6,-10,-30,-33,-26,2;
MA   /M: SY='H'; M=-9,0,-25,4,2,-11,-14,11,-21,-7,-21,-14,0,-16,0,-8,5,-2,-19,-8,10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,25,-28,37,15,-34,-1,-5,-35,5,-29,-24,11,-10,1,-4,2,-8,-26,-33,-20,8;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-32,-6,-7,-30,44,-17,-36,-15,-29,-20,-3,0,-13,-17,-2,-17,-30,-23,-29,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-23,-26,-27,-22,37,-29,5,4,-16,9,9,-21,-29,-17,-13,-21,-10,-4,15,52,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-24,-31,-24,-21,24,-29,7,1,-14,5,1,-24,-30,-13,-13,-24,-13,-9,37,61,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,5,-11,1,-1,-19,-3,-9,-19,-9,-27,-19,15,-11,-1,-9,33,21,-11,-39,-19,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-13,-29,-13,-5,-18,-21,-9,-15,10,-16,-8,-4,-5,1,32,-5,-6,-12,-24,-12,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-5,-9,-21,-10,-5,-4,-4,-4,-17,-10,-17,-10,-2,-17,4,-8,8,-1,-16,-16,2,-1;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-24,-26,-28,-19,31,-26,-10,-1,-18,1,7,-20,0,-21,-17,-18,-10,-7,-2,18,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-19,-37,-12,-6,-20,-10,-14,-19,-11,-25,-17,-17,57,-11,-18,-10,-11,-27,-19,-12,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-11,-32,-10,-6,-10,-9,-3,-20,10,-20,-10,-10,-2,-4,1,-12,-12,-20,-5,13,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-17,-24,-21,-13,-8,-23,-11,4,-4,3,10,-10,-20,-4,10,-8,-5,2,-23,-6,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-10,-28,-10,-1,-20,-21,-4,-25,29,-19,-8,-2,-20,7,58,-10,-9,-14,-21,-10,-1;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-27,6,1,-24,-9,-4,-21,2,-30,-19,22,17,-2,-3,4,-2,-27,-34,-22,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,30,-22,20,4,-24,-5,3,-24,8,-30,-19,40,-16,2,4,8,-1,-26,-36,-18,3;
MA   /M: SY='N'; M=0,15,-18,6,-4,-22,13,-4,-24,-8,-30,-20,29,-16,-4,-8,20,4,-22,-36,-22,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60015;
//
ID   OMEGA_ACTX_1_MP; MATRIX.
AC   MP60016;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Omega-atracotoxin (ACTX) type 1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=25;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=23;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8749931; R2=0.0083825; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=993; N_SCORE=12.197; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=314; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=6,-13,-27,-9,-2,-26,-11,-17,-18,-10,-27,-18,-10,45,-7,-17,7,0,-19,-31,-26,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,15,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,19,31,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-20,-23,-30,-23,-3,-33,-27,30,-23,10,10,-13,-17,-17,-23,-7,10,20,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,0,-27,-7,-13,13,-20,17,-7,-7,-10,-7,6,-27,-7,-7,-10,-7,-17,7,47,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-3,20,-15,7,-3,-17,-7,-3,-17,-5,-23,-17,32,-15,-3,-5,18,20,-17,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,5,-30,10,38,-33,-20,2,-27,17,-22,-12,0,-5,32,8,-2,-10,-28,-25,-15,35;
MA   /M: SY='P'; M=-13,5,-29,1,-3,-15,-14,12,-18,-6,-24,-14,14,15,-4,-8,-4,-7,-27,-24,-2,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,13,-13,7,0,-20,0,-3,-20,-7,-30,-20,27,-13,0,-7,30,13,-17,-40,-20,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,10,-27,4,1,-30,12,0,-27,2,-27,-13,20,-16,13,0,2,-10,-29,-27,-19,7;
MA   /M: SY='S'; M=23,-3,-10,-7,-3,-20,0,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,13,-7,-33,-20,-3;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-13,80,-20,-20,-13,-20,-20,-20,-20,-13,-13,-13,-27,-20,-20,-7,-7,-7,-33,-20,-20; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-17,0,13,-17,-20,-13,-17,-3,-13,-13,0,-7,0,-7,13,30,-10,-30,-13,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-12,-28,-10,5,19,-27,6,-10,-7,-5,-7,-13,-20,-6,-9,-13,-10,-15,6,38,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,7,27,-30,-20,-7,-30,37,-27,-13,0,-7,13,20,-7,-10,-23,-23,-13,20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60016;
//
ID   OMEGA_ACTX_2_MP; MATRIX.
AC   MP60017;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Omega-atracotoxin (ACTX) type 2 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.2635999; R2=0.0093267; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1399; N_SCORE=17.311; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-11; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,38,17,-30,-30,-23,-20,-24,-7,22,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='D'; M=2,31,-24,41,10,-34,-7,-6,-30,-3,-24,-24,10,-10,-3,-13,3,-7,-20,-34,-20,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-13,-30,-27,3,-30,-27,27,-23,23,13,-30,-30,-27,-20,-16,-3,37,-27,-7,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,32,-30,-20,14,-30,37,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-10,10,-23;
MA   /M: SY='G'; M=1,9,-20,3,-6,-23,22,-7,-26,-10,-30,-20,22,-16,-6,-10,18,1,-23,-34,-23,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-11,9,-21,0,-3,-17,-14,-3,-21,8,-20,-13,19,-17,1,23,6,12,-17,-30,-13,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-24,-20,-24,-24,-6,2,-24,4,-23,10,4,-20,-27,-24,-20,-13,-10,12,-24,-13,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-19,-6,-6,-16,15,-6,-22,3,-16,-9,0,-13,-3,16,-3,-9,-16,-13,-13,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=6,-4,-16,-2,0,-22,-4,-12,-20,-10,-30,-20,4,11,-2,-12,30,14,-14,-38,-22,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-17,47,-27,54,14,-34,-7,3,-34,0,-30,-27,33,-13,0,-7,3,-7,-30,-40,-20,7;
MA   /M: SY='R'; M=9,-7,-23,-11,-1,-23,-13,-10,-23,22,-19,-10,-4,-13,3,24,-3,-6,-13,-20,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,52,13,-33,-6,4,-33,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,0,6,-30,41,-14,-37,-10,-27,-20,0,-14,-7,-14,0,-17,-30,-23,-27,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,7,-27,-14,20,-24,41,32,-27,-27,-14,-17,-27,-10,10,-20,0,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=1,-16,-14,-20,-17,-8,-21,-22,12,-17,-4,0,-11,-18,-15,-17,8,12,19,-31,-11,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-3,4,-24,-20,-13,-24,31,-24,-10,0,-10,4,18,-1,9,-14,-23,-10,4;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-20,-23,-24,-14,-3,-23,-6,4,-3,17,25,-17,-23,-3,13,-20,-10,0,-20,-3,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-20,-20,-24,-17,-3,-24,-20,17,-24,15,7,-14,-20,-14,-20,-4,0,10,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=16,-24,-10,-27,-24,-6,-21,-27,18,-17,4,4,-24,-24,-24,-20,-4,0,34,-27,-13,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-30,-7,0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-10,58,-7,-17,6,0,-24,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='S'; M=3,0,-17,0,4,-24,-7,-10,-24,12,-30,-16,6,-10,4,5,22,9,-14,-33,-16,4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-24,-16,-24,-27,-10,2,-27,8,-20,-3,0,-20,-27,-27,-20,-7,-6,24,-27,-16,-27;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-33,-10,-14,-30,41,-20,-34,-17,-30,-20,-6,15,-17,-20,-3,-17,-30,-23,-30,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-14,-30,-26,4,-30,-26,26,-24,25,14,-30,-30,-26,-20,-17,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60016;
//
ID   DELTA_ACTX_MP; MATRIX.
AC   MP60018;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Delta-atracotoxin (ACTX) family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8298841; R2=0.0090048; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2087; N_SCORE=22.622; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=297; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=24,-7,-16,-12,-10,-23,21,-17,-22,-13,-21,-16,-2,-13,-10,-17,15,-1,-12,-25,-23,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-24,-3,4,-24,-14,-7,-27,27,-27,-13,3,-13,7,29,5,-1,-17,-26,-13,4;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-25,0,7,-27,-15,-10,-27,34,-30,-13,3,-10,7,19,3,-2,-17,-25,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-20,6,-30,11,5,-25,-17,0,-33,22,-23,-15,5,-17,7,49,-7,-10,-23,-25,-13,3;
MA   /M: SY='G'; M=11,7,-21,0,1,-24,16,-9,-24,-7,-22,-17,13,-14,-5,-11,6,-7,-21,-27,-23,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=5,-7,-27,-9,-9,-28,32,-17,-32,3,-27,-15,-2,-15,-9,-5,-1,-14,-22,-20,-22,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,25,-30,-20,-7,-30,38,-27,-13,0,-7,13,21,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='T'; M=-5,6,-18,-2,-2,-18,-17,-12,-18,10,-19,-12,9,-12,-2,4,9,24,-11,-29,-12,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-10,7,-30,14,45,-30,-20,-3,-30,22,-23,-17,0,-3,17,9,-3,-10,-27,-27,-17,31;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-37,-10,-6,-30,7,-20,-26,-13,-30,-20,-14,57,-13,-20,-7,-13,-30,-27,-30,-13;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-20,-23,-27,-20,9,-23,6,14,-10,14,42,-20,-23,-3,-10,-20,-10,4,-5,24,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,7,-27,-14,-4,-27,35,-30,-13,18,-13,7,21,-4,-7,-23,-26,-13,7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-15,-30,-15,-12,14,-27,12,-8,6,-8,-3,-15,-25,-5,1,-17,-10,-13,17,56,-12;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,29,-23,15,3,-23,-5,5,-23,13,-30,-17,44,-17,3,8,5,-3,-27,-35,-17,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,31,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,49,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,11,-27,5,15,-35,-15,10,-20,7,-23,-5,16,-13,44,7,3,-7,-30,-25,-13,29;
MA   /M: SY='G'; M=5,-5,-21,-5,-11,-25,38,-15,-31,-15,-30,-20,5,-15,-11,-15,18,-2,-21,-29,-25,-11;
MA   /M: SY='S'; M=5,11,-13,5,0,-20,0,-5,-20,-7,-30,-20,23,-13,0,-7,32,15,-15,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,6,32,-37,-20,7,-23,10,-20,-6,0,-7,48,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='N'; M=-7,8,-19,0,-2,-18,-11,-4,-21,5,-22,-15,18,-16,1,17,12,13,-16,-32,-15,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-4,-16,-20,-17,-16,8,-16,-10,0,-10,-4,2,11,32,-6,-27,-10,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-33,-34,-40,-30,16,-32,-28,21,-27,6,5,-26,-25,-23,-25,-26,-16,7,36,14,-27;
MA   /M: SY='S'; M=2,0,-16,-2,1,-21,-9,-12,-21,8,-27,-15,5,-10,1,2,22,16,-11,-32,-15,1;
MA   /M: SY='A'; M=13,-13,-22,-17,-16,-8,13,-8,-16,-13,-13,-10,-10,-19,-13,-17,-2,-9,-12,-5,7,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,6,-31,-19,28,-27,37,26,-26,-26,-17,-21,-26,-10,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-32,-40,-30,53,-26,-24,-8,-26,-2,-8,-28,-30,-32,-20,-28,-18,-12,64,30,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-3,4,-24,-20,-13,-24,32,-24,-10,0,-10,4,18,-1,8,-14,-23,-10,4;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,14,-27,11,22,-27,-15,-2,-27,25,-27,-16,16,-10,10,13,-2,-7,-26,-28,-16,16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60018;
//
ID   I_CONOTOXIN_MP; MATRIX.
AC   MP60019;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   I-superfamily conotoxin signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.1237626; R2=0.0065264; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; N_SCORE=8.552; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=365; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-13,-25,-10,10,-9,-25,-12,-4,-4,15,3,-16,-17,-3,-5,-17,-10,-7,-23,-8,3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-19,-25,-19,-7,-7,-25,-9,-2,-5,17,7,-16,-24,2,13,-19,-10,-6,-20,-5,-4;
MA   /M: SY='V'; M=0,-18,-10,-22,-22,-4,-26,-26,14,-16,2,2,-18,-22,-22,-16,2,20,30,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26,4,-36,-26,38,-30,32,20,-24,-24,-20,-26,-24,-10,22,-20,0,-26;
MA   /M: SY='A'; M=15,-13,-13,-16,-11,-13,-11,-17,-4,-9,-9,-6,-9,-17,-10,-7,10,4,7,-28,-15,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-15,25,-20,-19,-8,-4,-18,-27,-14,-19,-15,-8,-27,-18,-4,-4,-9,-15,-28,-17,-19;
MA   /M: SY='L'; M=14,-22,-16,-26,-16,-2,-18,-20,8,-22,26,8,-22,-22,-16,-20,-14,-6,6,-20,-8,-16;
MA   /M: SY='N'; M=10,21,-16,5,-4,-19,-2,-2,-16,-4,-22,-16,33,-16,-4,-7,11,5,-18,-33,-19,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-24,-14,1,-27,-14,5,-12,29,11,-21,-27,-11,7,-24,-10,1,-20,-3,-14;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-16,-17,-18,-17,-9,-24,-18,7,0,-4,1,-12,-25,-15,6,-8,-3,21,-28,-11,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-15,-18,-17,-21,-12,2,-20,0,-13,-8,-3,-9,-25,-20,-10,-5,-6,13,-27,-17,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-8,-26,-4,-9,-15,1,-16,-12,-14,4,-4,-11,-15,-13,-14,-14,-13,-12,-24,-14,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-9,-24,-12,-9,-15,-12,-8,-19,-9,-18,-12,-6,2,-8,-6,3,15,-15,-12,-9,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,1,-21,-2,-5,-20,-2,-7,-19,-1,-24,-15,12,-9,-3,6,10,1,-14,-32,-19,-6;
MA   /M: SY='R'; M=1,-14,-23,-18,-6,-4,-13,-10,-13,-2,-8,0,-10,-8,-6,6,-7,-8,-9,-17,-8,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-16,-25,-18,-11,-1,-15,-17,-11,0,-6,-5,-12,-20,-11,2,-11,-7,-8,-6,-2,-11;
MA   /M: SY='P'; M=7,-11,-22,-11,-6,-21,-7,-17,-15,-4,-18,-12,-8,8,-8,-8,4,1,-10,-27,-19,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,11,-30,17,13,-26,-11,-8,-21,-6,-18,-17,5,6,-2,-12,-4,-10,-22,-31,-20,4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-7,-29,-6,-6,-28,40,-14,-36,-5,-28,-18,0,-17,-9,-3,0,-15,-27,-22,-25,-8;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-23,-11,-3,-17,-20,-7,-9,8,-13,0,-6,-16,8,9,-1,0,-6,-22,-5,2;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-27,-9,-6,-10,-10,1,-19,-4,-21,-12,-6,6,-5,-4,0,-5,-19,-17,2,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-19,-1,4,-22,4,-12,-25,-3,-24,-17,3,-11,-2,-5,16,10,-16,-30,-19,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-12,-27,-13,-8,0,-22,5,-10,0,-7,-2,-8,-16,1,8,-10,-7,-14,-4,23,-7;
MA   /M: SY='H'; M=-16,9,-28,13,2,-19,-17,57,-28,-8,-21,-9,9,-18,5,-4,-3,-12,-26,-27,13,0;
MA   /M: SY='A'; M=9,-7,-18,-9,-2,-16,-4,-12,-15,-6,-12,-10,-4,-14,-4,-7,9,3,-9,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-12,22,-28,27,13,-31,-11,2,-28,-1,-28,-21,16,6,5,-7,3,-6,-28,-35,-19,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-11,2,-28,-3,-5,-19,-1,6,-24,0,-22,-13,12,-12,-3,7,-4,-10,-25,-17,-11,-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,2,-19,1,-5,-7,4,-4,-17,-2,-16,-11,5,-14,-6,-4,-1,-6,-15,-12,-1,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-10,-14,-12,-6,-7,-15,-9,1,-4,-1,3,-7,-14,-4,1,-1,1,4,-20,-7,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-12,-23,-24,-26,-19,20,-23,-14,0,-18,9,0,-19,-25,-18,-10,-16,-9,-4,12,14,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-13,-3,-4,-10,5,3,-14,-3,-14,-8,1,-9,-2,-3,5,-2,-11,-13,-2,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-1,-29,1,-10,-29,41,-13,-35,-12,-28,-19,4,-18,-8,-12,0,-15,-29,-18,-23,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-18,-27,-22,-15,-8,-24,-20,7,-7,-1,2,-13,-18,-11,-7,-12,-3,4,-9,-2,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=1,-2,-23,-4,2,-24,-12,-10,-20,15,-19,-10,-1,-13,4,12,-1,-2,-12,-23,-14,2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-13,-28,-13,-7,-12,-20,-9,-11,-10,-14,-6,-10,26,-8,-11,-6,-3,-14,-26,-14,-9;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-7,-19,-7,-3,-19,-14,-7,-14,-6,-20,-9,-2,4,0,-5,13,12,-10,-32,-15,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-14,45,-22,-21,-8,-23,-24,-16,-21,-13,-13,-12,-26,-22,-21,3,10,-1,-35,-17,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-7,-22,-13,-12,-3,-10,-5,-10,-12,-9,-8,2,-20,-10,-7,-1,-4,-11,-12,-4,-11;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-14,-30,-16,-17,-20,23,-7,-23,-13,-19,-11,-5,-20,-12,-7,-7,-17,-19,-7,-13,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-15,55,-20,-21,-13,-27,-14,-21,-22,-17,-15,-14,-18,-21,-23,-11,-10,-13,-34,-12,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-12,-25,-12,-16,-16,38,-16,-26,-15,-20,-15,-6,-16,-15,-15,-6,-16,-22,11,-13,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-2,-22,-1,4,-24,-12,-2,-24,17,-27,-13,3,-2,4,8,8,0,-17,-27,-12,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-9,-23,-12,-9,-12,-14,-8,-18,7,-14,-8,-4,-19,-3,26,-1,8,-9,-20,-5,-9;
MA   /M: SY='A'; M=22,1,-15,-2,-3,-23,-3,-13,-17,-8,-21,-16,3,-2,-5,-15,16,4,-11,-30,-21,-4;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-4,-16,-9,-6,-15,-18,-18,-12,-1,-16,-11,-3,-3,-7,-5,13,27,-3,-30,-13,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,67,-30,-20,4,-30,18,4,-22,-30,-36,-20,-22,-10,2,4,24,-28;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-6,-25,-8,3,-14,-22,-2,-12,-2,-6,0,-4,-16,22,3,-5,-3,-17,-19,-5,13;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-7,7,-20,13,40,-20,-13,0,-20,7,-13,-13,0,0,13,0,0,-7,-20,-20,-13,26; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-14,-12,-21,-17,36,-19,-14,-2,-17,2,-2,-10,-17,-21,-12,-5,7,0,-2,12,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,-2,-30,34,-22,-10,0,-18,10,62,-10,-10,-20,-20,-10,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60004;
//
ID   J_ACTX_MP; MATRIX.
AC   MP60020;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Janus-faced atracotoxin (J-ACTX) family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7742014; R2=0.0068300; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2013; N_SCORE=17.520; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=400; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=20,-4,-10,-14,-10,-14,-12,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,30,0,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,16,-36,-20,2,-24,26,-24,-4,0,-10,40,18,-4,-10,-26,-20,-10,28;
MA   /M: SY='G'; M=20,-10,-22,-14,-16,-26,42,-20,-28,-16,-22,-16,-4,-16,-16,-20,4,-12,-18,-20,-26,-16;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-24,-6,0,-18,-12,-12,-12,-6,-18,-12,-12,54,-6,-12,-6,-6,-18,-18,-18,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-17,-2,0,-22,-5,-12,-20,-10,-30,-20,3,14,-2,-12,28,13,-15,-38,-22,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,-11,-10,-11,-11,-13,-11,-17,-2,-14,-16,-9,-4,-17,-11,-14,22,13,12,-36,-16,-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,24,-24,12,4,-24,-8,2,-24,20,-30,-16,36,-16,4,12,2,-4,-26,-32,-16,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,21,-26,30,2,3,-17,-7,-26,-11,-16,-19,6,-17,-14,-14,-7,-10,-19,-22,-2,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60020;
//
ID   HWTX_1_MP; MATRIX.
AC   MP60021;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Huwentoxin-1 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0382857; R2=0.0078545; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=799; N_SCORE=10.312; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=314; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-16,-6,-2,-18,-8,-8,-13,2,-19,-1,2,-12,2,-2,17,8,-8,-32,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-20,-36,-30,16,-34,-28,32,-26,14,12,-24,-26,-28,-24,-16,-6,32,-18,2,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-18,-36,-28,49,-30,-22,10,-28,18,6,-24,-30,-34,-20,-20,-8,13,-4,16,-28;
MA   /M: SY='A'; M=35,3,-14,-1,-4,-24,-2,-16,-16,-8,-14,-14,-4,-10,-8,-18,8,-2,-6,-24,-20,-6;
MA   /M: SY='V'; M=8,-20,-14,-22,-17,-10,-22,-24,9,-3,-3,2,-20,-22,-17,-9,-6,-2,25,-26,-12,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-26,53,14,-34,-12,-4,-34,-2,-26,-26,16,-10,-2,-10,4,3,-24,-38,-18,6;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,28,-18,32,8,-24,-4,0,-24,-2,-24,-20,22,-10,0,-6,10,0,-20,-32,-16,4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-3,35,-24,41,10,-32,-6,-2,-30,-2,-26,-24,21,-12,-2,-10,4,-6,-24,-36,-20,4;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-16,-30,-24,44,-24,-20,3,-24,2,-2,-16,-26,-30,-18,-6,-2,9,-8,12,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,41,-28,-8,0,-10,21,26,-8,-10,-22,-20,-10,16;
MA   /M: SY='G'; M=9,-12,-22,-14,-12,-24,17,-16,-16,-12,-16,-8,-8,-18,-4,-14,0,-10,-8,-22,-20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-4,14,-27,23,29,-31,-2,-5,-31,0,-24,-22,5,-7,5,-8,4,-8,-26,-31,-21,17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-17,-23,-18,-10,-10,-16,-15,-6,1,6,2,-14,-22,-8,7,-15,-9,-2,-21,-9,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-8,-34,-6,-10,-23,33,-18,-35,-11,-27,-20,-6,-19,-13,-14,-8,-19,-29,9,-16,-11;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-24,-31,-25,41,-27,-10,4,-21,5,0,-21,-27,-25,-17,-19,-10,1,22,35,-24; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-21,-24,-18,14,-7,-13,-1,-19,11,11,-16,-23,-14,-14,-16,-11,-4,-11,1,-14; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-12,3,-31,7,-1,-24,-1,-12,-31,10,-26,-18,-1,-15,-4,5,-8,-10,-24,-2,-10,-2;
MA   /M: SY='G'; M=6,-3,-22,-4,2,-26,9,-13,-27,7,-26,-15,1,-12,-2,-1,7,-4,-18,-25,-19,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-8,14,-22,13,3,-24,-13,-7,-22,13,-24,-15,14,-13,0,5,4,4,-15,-31,-15,2;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-7,-34,-1,12,-25,-19,-8,-21,1,-25,-16,-7,39,4,-7,-7,-9,-28,-24,-15,5;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-20,17,2,-25,10,-8,-27,-2,-25,-19,8,-10,-3,-7,10,-2,-19,-28,-18,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,15,-14,7,2,-14,-4,2,-14,10,-17,-9,22,-9,2,6,2,-2,-15,-19,-9,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-8,28,-23,26,5,-27,2,-1,-28,1,-30,-22,29,-15,-1,-4,10,-2,-26,-37,-20,2;
MA   /M: SY='E'; M=-12,12,-29,20,24,-31,-11,-3,-28,8,-19,-15,2,-9,12,0,-4,-11,-25,-28,-16,18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-27,-1,8,-27,-8,-11,-27,17,-28,-15,-1,4,3,9,3,-4,-21,-27,-18,5;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-10,16,-26,10,-1,-25,8,16,-29,2,-28,-15,25,-18,-1,-1,0,-11,-28,-30,-13,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-25,-18,15,-29,-3,8,-17,25,10,-24,-29,-14,-9,-25,-10,0,-1,30,-18;
MA   /M: SY='V'; M=4,-16,-15,-17,-9,-13,-23,-18,7,-10,-2,1,-17,-19,-5,-12,-2,2,18,-27,-12,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-14,1,0,-20,-4,12,-22,-9,-28,-16,13,-13,2,-7,29,11,-15,-38,-13,0;
MA   /M: SY='R'; M=-3,0,-19,2,2,-22,-8,-6,-25,5,-26,-17,7,-14,4,19,18,7,-15,-33,-16,1;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-28,-5,1,-18,-19,-2,-25,27,-22,-10,3,-17,6,36,-7,-4,-18,-18,-2,1;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-7,-37,-4,-11,-7,-19,7,-24,-12,-20,-16,-12,-22,-8,-12,-19,-16,-26,48,18,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-12,0,-30,1,17,-28,-20,-6,-30,38,-26,-12,0,-10,12,33,-8,-10,-22,-22,-12,13;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-15,-21,-15,-9,-14,-25,-19,-1,14,-6,1,-15,-20,-9,5,-12,-6,11,-24,-9,-9;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-29,-30,-29,-24,16,-27,-9,3,-19,8,1,-29,-30,-18,-16,-26,-14,-3,42,36,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-4,3,-28,8,6,-23,-16,-5,-20,0,-16,-12,-4,3,5,-7,-5,-8,-20,-21,-7,4;
MA   /M: SY='L'; M=1,-18,-22,-21,-18,-10,2,-20,1,-23,6,1,-12,-21,-16,-20,-6,-7,-1,-23,-13,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-12,-29,-8,-4,-25,-5,-18,-21,-11,-27,-18,-9,44,-10,-17,4,3,-22,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-30,-35,-25,46,-26,-21,-10,-17,-4,-7,-23,-27,-28,-13,-24,-16,-11,45,25,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-23,-6,0,-20,-13,-4,-26,16,-24,-14,4,-16,6,42,8,1,-16,-27,-14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,37,-24,-10,0,-16,10,56,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60021;
//
ID   HWTX_2_MP; MATRIX.
AC   MP60022;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Huwentoxin-2 family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4074478; R2=0.0088840; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=738; N_SCORE=9.963; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=349; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-36,-26,29,-33,-23,22,-30,29,14,-24,-27,-26,-23,-24,-10,13,-10,10,-26;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,19,-27,20,42,-27,-14,3,-27,7,-23,-20,18,-6,14,0,3,-7,-30,-33,-20,28;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-14,-16,-19,-16,-9,-21,-21,12,-18,-4,-1,-8,-16,-13,-18,9,13,14,-30,-10,-16;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-21,-16,-27,-20,35,-23,-16,11,-21,13,5,-15,-19,-23,-16,-15,-7,6,-1,13,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=3,2,-11,4,12,-16,-4,-5,-16,-3,-19,-14,5,-5,4,-5,20,8,-11,-26,-14,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-14,84,-21,-21,-14,-21,-21,-21,-21,-14,-14,-14,-28,-21,-21,-7,-7,-7,-35,-21,-21; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-11,22,-21,32,27,-25,-10,0,-25,3,-18,-18,7,-4,7,-4,0,-7,-21,-25,-14,17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-21,-24,-17,-4,-26,-17,29,-17,10,12,-12,-13,-7,-17,-12,-7,16,-14,-1,-15; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-7,5,-21,10,32,-21,-14,-2,-21,15,-16,-12,0,-2,12,6,-2,-7,-19,-19,-12,22; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,1,-30,7,-13,-33,29,-30,-13,0,-13,1,15,-7,-13,-23,-20,-16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-30,17,51,-30,-20,-2,-30,17,-22,-18,0,-2,18,5,-2,-10,-28,-28,-18,35;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-30,-7,-8,-33,43,-11,-34,-11,-27,-14,0,-17,4,-11,0,-17,-30,-20,-24,-2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-7,-24,-6,7,-21,-23,-14,-12,22,-16,-6,-9,-14,0,10,-8,-7,-1,-25,-12,3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-35,-8,0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15,73,-8,-18,-1,-5,-27,-32,-28,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,15,-30,21,13,-33,-17,-7,-33,35,-30,-16,6,-10,7,18,-7,-10,-23,-26,-13,10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-35,1,20,-30,-20,-12,-25,6,-27,-18,-11,47,2,-6,-7,-10,-28,-28,-24,8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,7,-27,-14,-4,-27,35,-30,-13,18,-13,7,21,-4,-7,-23,-26,-13,7;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-6,11,-20,17,-1,-23,23,-7,-27,-7,-20,-16,6,-10,-7,-10,0,-10,-20,-19,-17,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='H'; M=-9,2,-20,3,13,-18,-13,16,-20,15,-16,-6,2,-7,8,9,-5,-9,-17,-17,-3,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-20,0,7,-20,-13,-7,-20,33,-20,-7,0,-7,7,20,-7,-7,-13,-13,-7,7; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-3,4,-24,-20,-13,-24,32,-24,-10,0,-10,4,18,-1,8,-14,-23,-10,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-23,78,-30,-27,-11,-30,-27,-15,-30,1,-8,-23,-37,-27,-27,-16,-10,-4,-41,-21,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-6,0,-23,-1,3,-23,-14,22,-26,10,-25,-10,6,-13,6,6,7,0,-19,-30,-4,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-30,-19,-23,-21,37,-23,-13,-23,-15,-8,-6,-20,-20,-23,-6,-17,-12,-20,-21,-23;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-2,-21,-2,5,-19,-14,-5,-21,31,-19,-7,0,-9,7,29,-7,-7,-14,-14,-7,5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-23,75,-33,-30,-14,-33,-30,-6,-30,-8,-8,-20,-34,-27,-30,-13,-10,2,-41,-21,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-21,-19,-26,-19,23,-23,-19,6,-24,7,1,-13,-22,-21,-19,-4,-1,4,-16,4,-19;
MA   /M: SY='N'; M=-4,13,-21,7,4,-24,-7,-3,-24,15,-30,-16,23,-13,4,8,12,2,-20,-33,-16,4;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-24,-23,-27,-20,13,-27,-1,14,-17,25,27,-24,-27,-10,-14,-24,-10,4,-5,24,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-27,-23,13,-30,-11,17,-21,22,11,-27,-30,-20,-17,-20,-7,17,-8,21,-23;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-27,24,-34,-30,9,-32,-28,10,-27,3,1,-23,-31,-30,-25,-14,-7,19,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60022;
//
ID   OMEGA_AGA_II_III_MP; MATRIX.
AC   MP60023;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Omega-agatoxin type II and III signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.8978465; R2=0.0074353; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1494; N_SCORE=15.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=350; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,48,11,-31,-6,4,-31,0,-30,-26,38,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-30,-19,-36,-30,19,-33,-28,29,-26,13,11,-24,-27,-29,-23,-16,-6,32,-17,3,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-9,17,-30,26,-2,-34,34,-11,-40,-11,-30,-24,9,-16,-11,-16,0,-16,-30,-29,-26,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-20,14,-26,21,-2,13,-19,-9,-22,-13,-12,-17,2,-19,-18,-14,-9,-10,-17,-18,2,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,11,38,-30,-20,-4,-30,28,-24,-16,0,-4,16,13,-4,-10,-26,-26,-16,27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-25,28,9,-29,-11,-2,-32,7,-27,-21,11,-13,3,15,7,-3,-22,-34,-17,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=22,-10,-21,-14,-16,-26,39,-20,-27,-16,-21,-16,-4,-16,-16,-20,4,-11,-17,-20,-26,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24,52,-30,2,0,-19,4,0,-20,-30,-23,-14,-20,-10,-6,21,58,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-11,-21,-11,-11,8,-17,7,-9,-10,-13,-9,-7,-21,-6,-10,7,3,-10,-1,36,-11;
MA   /M: SY='V'; M=1,-4,-12,-8,-13,-11,-13,-14,2,-12,-12,-7,4,-21,-13,-12,11,6,12,-36,-16,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,33,-30,37,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,19,-20,0,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-17,-11,-17,-11,6,-17,-11,11,-17,28,11,-17,-17,-11,-11,-17,-6,6,-11,0,-11; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=6,0,-10,-4,-4,-16,-9,-14,-16,-10,-21,-16,6,-10,-4,-10,31,33,-6,-36,-16,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-4,12,-26,3,-11,-26,39,-7,-31,-11,-30,-20,27,-20,-11,-11,4,-11,-30,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,41,-26,-10,0,-14,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60023;
//
ID   AGOUTI_1_MP; MATRIX.
AC   MP60024;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Agouti domain signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0006332; R2=0.0074291; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1481; N_SCORE=15.000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=0,6,-20,8,22,-24,-8,-5,-24,-2,-26,-20,9,-2,7,-6,20,6,-20,-36,-21,14;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-25,-16,-31,-25,0,-26,-16,27,-16,16,35,-24,-24,-15,-16,-16,-6,29,-24,-4,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-12,-24,-13,-4,-13,-22,-15,-9,13,2,1,-12,-17,-4,5,-14,-6,-6,-21,-7,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-13,24,-28,28,12,-32,-13,-2,-31,19,-29,-18,17,-12,8,8,-2,-7,-25,-31,-15,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-21,-24,-19,-8,-27,-26,13,-18,2,2,-27,8,-22,-20,-13,-4,20,-29,-15,-22;
MA   /M: SY='A'; M=21,-6,-19,-10,6,-26,-10,-9,-16,0,-14,-8,-6,-10,12,-3,4,-4,-11,-22,-17,8;
MA   /M: SY='R'; M=-15,4,-29,5,3,-26,-5,0,-30,14,-24,-14,9,-17,10,33,-4,-10,-25,-25,-15,4;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-15,-35,-10,-1,-25,-20,-13,-23,5,-25,-16,-12,45,-3,13,-8,-7,-25,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-31,-2,16,-25,-20,-4,-29,23,-22,-14,-2,-1,10,37,-8,-10,-24,-24,-15,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-15,-31,-10,-3,-23,-18,-19,-16,-11,-22,-16,-14,55,-9,-17,-1,3,-20,-31,-24,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-17,-35,-11,-1,-24,-21,-13,-21,3,-22,-14,-13,43,-3,13,-11,-10,-24,-26,-21,-7;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-10,-20,-8,-2,-16,-12,-11,-12,-8,-12,-9,-6,11,-1,-7,7,2,-12,-27,-15,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-27,-6,0,-23,-12,-15,-18,-9,-26,-18,-9,50,-6,-15,6,0,-21,-29,-23,-6; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=11,-5,-18,-11,-5,-19,-9,-10,-19,5,-17,-12,1,-14,-1,16,7,4,-10,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10,0,-26,-20,-13,-24,5,-26,-16,-13,50,-3,13,-10,-10,-26,-26,-23,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='A'; M=25,-10,-17,-16,-6,-20,-7,-13,-17,5,-14,-10,-6,-14,-3,13,3,-4,-7,-20,-16,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-14,-15,-13,-3,-22,-18,0,-17,11,0,-7,-18,-13,-13,1,25,2,-27,-7,-13;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-6,-30,-6,0,-20,-20,36,-30,15,-20,-6,4,-20,10,45,-10,-14,-24,-24,1,0;
MA   /M: SY='D'; M=-15,30,-28,39,29,-30,-13,3,-31,3,-25,-23,18,-9,7,-5,1,-8,-29,-33,-15,18;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-11,-26,-11,-1,-15,-24,-14,-12,21,-1,1,-11,-17,-1,12,-17,-10,-9,-20,-6,-1;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-14,-33,-9,-7,-29,15,-19,-27,-14,-30,-20,-10,40,-13,-19,-1,-11,-28,-27,-29,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-13,-36,-6,5,-31,-20,2,-21,-5,-26,-13,-11,52,9,-10,-8,-11,-30,-28,-19,3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-6,-17,-13,1,-27,-7,-9,-14,-3,-14,-6,-6,-10,15,-9,6,-4,-11,-20,-16,8;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-24,-28,-18,-12,-17,-24,-24,1,-15,-11,-7,-24,39,-18,-20,-11,-6,2,-29,-21,-18;
MA   /M: SY='A'; M=28,-14,-21,-16,-6,-24,-7,-20,-14,-10,-17,-14,-14,26,-10,-20,3,-4,-11,-24,-24,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,66,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,23,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-11,-8,-7,-5,-11,-15,-14,-12,-18,-14,3,-12,-8,-11,26,27,-5,-31,-11,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-14,-7,-30,-7,5,-15,-24,14,-13,3,-13,0,-7,-17,35,3,-7,-10,-23,-2,23,18;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-14,8,-26,1,-2,-21,-2,1,-28,13,-25,-15,22,-20,3,34,-2,-8,-25,-27,-16,-2;
MA   /M: SY='S'; M=25,-4,-10,-7,-4,-20,0,-14,-16,-10,-23,-16,3,-10,-4,-14,29,13,-6,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-14,-26,-16,16,-11,-19,-7,-17,-4,-7,-12,-17,-20,-19,1,-2,-1,-11,-2,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-3,-7,-17,-9,-9,0,-15,-1,-11,-10,-15,-11,-3,-17,-6,-10,14,16,-8,-12,19,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-19,-17,-19,-15,-11,-26,-23,8,5,-5,3,-19,-23,-15,-2,-10,-4,25,-26,-10,-15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-2,8,-21,2,-8,-23,23,-7,-27,-9,-28,-19,21,-17,-7,-7,12,0,-23,-31,-23,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-25,-13,-7,-16,-22,-19,-10,-11,-9,-9,-13,27,-10,-11,-2,12,-12,-28,-17,-11;
MA   /M: SY='T'; M=9,8,-14,-3,-6,-16,-9,-10,-14,-5,-17,-13,15,-13,-6,-6,14,20,-10,-31,-16,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-15,71,-25,-24,-15,-26,-24,-19,-23,-13,-8,-15,-30,-21,-23,-4,4,-5,-41,-21,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-23,-34,-16,-6,-18,-23,-20,-8,-16,-6,-8,-23,53,-13,-20,-16,-10,-18,-27,-21,-13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60024;
//
ID   CONANTOKIN_MP; MATRIX.
AC   MP60025;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Conantokin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6362395; R2=0.0104758; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=578; N_SCORE=9.681; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=274; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,15,-35,-20,1,-25,29,-25,-5,0,-10,36,19,-5,-10,-25,-20,-10,26;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-26,-21,-26,-23,15,-30,-7,15,-19,19,9,-26,-30,-19,-16,-20,-7,13,-3,29,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-3,-24,-6,12,-34,-14,2,-17,4,-17,-3,-3,-10,40,2,3,-7,-22,-20,-13,26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,3,-30,6,26,-30,-20,-7,-30,37,-27,-13,0,-7,13,21,-7,-10,-23,-23,-13,19;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-1,-20,-14,-14,-6,-14,3,7,-7,4,35,5,-20,0,-7,-11,-7,-3,-26,-6,-7;
MA   /M: SY='L'; M=7,-15,-20,-18,-5,-14,-18,-11,-1,-12,11,5,-15,-18,8,-11,-9,-7,-5,-20,-9,2;
MA   /M: SY='E'; M=7,4,-24,9,40,-27,-14,-6,-24,4,-17,-17,-3,-3,12,-6,3,-7,-22,-27,-20,26;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-2,-20,-10,-12,-2,-18,-8,4,-18,18,4,6,-26,-12,-12,-14,-6,-6,-28,-8,-12;
MA   /M: SY='L'; M=7,-24,-20,-30,-20,-2,-25,-23,21,-24,24,12,-21,-21,-17,-23,-16,-7,13,-20,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='D'; M=11,10,-22,12,5,-29,-9,-11,-25,12,-22,-16,2,-10,-1,-1,1,-6,-15,-26,-17,2;
MA   /M: SY='E'; M=13,1,-18,2,21,-24,-8,-9,-21,-2,-20,-17,0,-6,5,-9,15,2,-15,-30,-20,13;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,12,-16,0,-12,-12,-12,-6,0,-8,-14,-8,24,-24,-12,-8,2,0,2,-36,-16,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-8,-30,34,-16,-36,8,-30,-16,0,-16,-8,0,-4,-16,-26,-20,-22,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='N'; M=-14,18,-24,7,0,-20,-9,6,-24,13,-26,-16,34,-20,4,31,1,-4,-26,-31,-16,0;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60025;
//
ID   ERGTX_MP; MATRIX.
AC   MP60026;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Ergtoxin family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9325607; R2=0.0090096; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1965; N_SCORE=21.635; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=285; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,19,-38,-4,-2,-39,-1,-29,-28,17,-10,0,-10,0,-11,-30,-38,-21,9;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-18,47,-29,62,21,-38,-10,1,-38,1,-29,-28,22,-10,1,-8,1,-9,-30,-39,-20,11;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,5,-25,-20,-3,-29,36,-24,-9,0,-16,13,52,-9,-10,-21,-20,-10,6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=22,-8,-19,-12,-8,-26,20,-15,-22,-10,-19,-12,-4,-13,-2,-15,7,-7,-15,-21,-22,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-14,-30,-15,-15,18,-26,23,-5,-9,-6,-3,-11,-20,-8,-9,-16,-10,-15,16,60,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-27,-7,-4,-29,23,-4,-28,-8,-24,-11,0,-16,9,-9,3,-11,-25,-20,-16,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,3,-30,5,31,-37,-20,7,-23,10,-20,-5,0,-7,49,7,0,-10,-30,-23,-13,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-11,20,-25,28,21,-31,-16,-3,-27,2,-21,-17,7,-8,14,-4,5,4,-23,-32,-16,18;
MA   /M: SY='D'; M=-7,14,-25,23,22,-26,-17,-8,-19,-2,-16,-16,0,-10,1,-10,-2,-7,-12,-32,-18,11;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-29,3,9,-29,-17,-7,-29,43,-30,-11,8,-11,9,26,-7,-9,-21,-23,-11,9;
MA   /M: SY='A'; M=45,-11,-12,-20,-11,-16,-2,-17,-9,-10,-9,-9,-11,-12,-10,-19,8,-1,-1,-16,-12,-11;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='H'; M=-19,16,-30,23,10,-27,-17,63,-33,-6,-23,-10,12,-16,8,-3,-6,-16,-30,-33,5,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,11,-24,3,0,-20,-12,1,-24,16,-24,-14,23,-18,4,32,1,-1,-22,-29,-14,0;
MA   /M: SY='G'; M=14,-10,-23,-14,-15,-25,35,-20,-26,-11,-21,-14,-5,-17,-15,-16,2,-12,-15,-21,-24,-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,4,-12,-7,-10,-11,-18,-17,-9,-10,-11,-10,7,-12,-9,-10,17,41,-3,-31,-11,-10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-7,-20,-6,-7,-11,-23,-13,8,-11,2,12,-14,-19,-10,-14,-10,-6,14,-29,-10,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25,54,-30,1,0,-20,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,20,56,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-27,-23,-33,-26,60,-30,-7,1,-24,9,1,-21,-30,-29,-17,-21,-10,-3,15,45,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-1,-29,-2,8,-28,-20,-9,-27,46,-27,-6,-1,-11,9,28,-11,-10,-18,-20,-9,9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-17,6,-3,-16,-2,-2,-15,4,-20,-12,25,-15,-3,1,4,1,-16,-27,-14,-3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='P'; M=9,-14,-25,-13,-6,-22,-15,-18,-9,-10,-17,-11,-12,29,-8,-17,-2,-5,-9,-27,-22,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-1,5,-21,11,32,-25,-11,-5,-25,1,-25,-20,5,-5,11,-5,19,4,-21,-35,-20,21;
MA   /M: SY='K'; M=1,0,-19,0,5,-25,-9,-10,-25,18,-30,-15,5,-10,5,9,17,6,-15,-31,-15,5;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-15,-25,-19,-20,-16,28,-11,-12,-15,-7,17,-9,-20,-11,-15,-9,-15,-11,-20,-16,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-15,13,-25,4,0,-20,-11,5,-25,16,-25,-15,28,-20,5,37,-1,-5,-25,-29,-15,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60026;
//
ID   CONTRYPHAN_MP; MATRIX.
AC   MP60027;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Contryphan family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=24;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=22;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0761310; R2=0.0100592; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=772; N_SCORE=7.832; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=639; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-56; D=-3; I=-3; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: I=-20; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-75,39,-63,-82,89,-66,-87,-65,-85,-76,-47,-67,-62,-72,30,-60,-81,-78,-75; D=-20;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-58,-84,-71,-77,-88,89,-74,-96,-64,-91,-80,-58,-76,-68,35,-58,-74,-89,-81,-82;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=63,-70,-77,-71,-71,-66,-70,-58,-69,-56,92,-68,-73,-66,-72,-54,35,-55,-84,-69;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-59,-78,38,-60,-77,-67,-67,27,-58,-73,-70,-55,-74,-58,36,73,-53,-63,-89,-71;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-57,-83,-63,21,-87,86,-71,-94,-62,-88,-78,-57,-72,-62,25,-56,-72,-87,-80,-80;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-79,-96,-72,-57,-98,-87,-74,-96,85,-94,-82,-66,-81,40,-43,-73,-75,-93,-90,-82;
MA   /I: MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='F'; M=-90,-90,-100,-93,88,-100,-82,-67,-81,5,-65,-91,-101,-91,24,-90,-84,-72,-66,-46;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-79,-87,-101,-91,-66,-94,-73,-52,-85,9,121,-89,-90,-77,-83,-89,-78,-59,-91,-68;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-81,-88,30,-66,-96,-73,-64,-96,20,-100,-89,90,-88,-66,-67,-65,-67,-96,-110,-88;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='V'; M=10,-83,-98,-91,-74,-93,-100,-41,-90,-61,-62,-93,-94,-91,-92,-78,-68,78,-103,-81;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-85,-86,-102,-94,-58,-104,-86,-49,-96,74,-46,-101,-102,-88,-92,-95,-81,-57,-89,-71;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-82,-98,-73,-66,-96,-87,-67,-98,-47,-93,-81,33,-91,40,82,-73,-79,-94,-95,-81;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-83,-102,-74,21,-96,-93,-72,-99,-48,-94,-84,-76,35,-60,82,-78,-81,-94,-95,-85;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='S'; M=-70,-87,-78,-73,29,-78,-76,-88,20,-86,-82,-68,-86,-67,26,62,-65,-84,-87,-71;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='G'; M=-62,-86,21,14,-92,77,-74,-97,12,-93,-83,-57,-74,-66,-71,-60,-73,-91,-85,-84;
MA   /I: DM=-15;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='P'; M=-62,-83,-71,-60,-75,-72,-74,-51,-66,-67,-61,-75,114,-69,-76,-64,-56,49,-82,-76; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='W'; M=-73,-90,-97,-79,-40,-77,-91,-58,-74,38,-56,-92,-81,-72,-76,-81,-80,-69,165,-33; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='D'; M=-65,-80,65,18,-58,-71,49,-69,15,-3,-59,-50,-69,60,-52,-58,-61,-71,-67,63; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-92,-67,-55,-86,-68,-70,-74,-63,-84,-70,-73,128,-66,-75,-64,-59,-79,-79,-83; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='W'; M=-75,-99,-99,-80,-38,-74,-91,-72,-71,-69,-71,-93,-80,-71,-74,-81,-86,-85,175,40; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; D=-20;
MA   /I: I=-20;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-77,-64,-76,-83,103,-71,-91,-70,-86,-75,-50,-68,-67,-77,-49,-68,-84,-74,-78; D=-20;
MA   /I: I=-20; E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60027;
//
ID   SCORPION_CALCINE_MP; MATRIX.
AC   MP60028;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Scorpion calcine family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=46;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=42;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7795546; R2=0.0094993; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1971; N_SCORE=22.502; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=287; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-17,-26,-17,-7,-9,-24,-7,-12,9,5,1,-11,-24,-1,38,-17,-10,-9,-20,-6,-7;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='E'; M=14,2,-22,4,32,-26,-12,-8,-22,2,-16,-16,-4,-4,8,-8,4,-6,-18,-26,-20,20;
MA   /M: SY='B'; M=-14,44,-24,40,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,44,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,26,-24,13,4,-24,-7,3,-24,18,-30,-16,39,-16,4,11,3,-4,-26,-33,-16,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=6,-4,-18,-4,-8,-24,28,-14,-28,-14,-30,-20,6,-14,-8,-14,24,4,-18,-32,-24,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='A'; M=14,-20,-24,-25,-15,-15,-19,-24,9,-17,-4,-2,-16,11,-14,-24,-6,-6,3,-22,-15,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60028;
//
ID   SPIDER_CSTX_MP; MATRIX.
AC   MP60029;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Spider toxin CSTX family signature.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=39;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.0105829; R2=0.0081004; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1426; N_SCORE=15.560; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=308; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-19,0,4,-24,-9,-10,-24,16,-30,-16,6,-10,4,7,19,7,-14,-31,-16,4;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-7,30,-20,32,8,-28,-4,-1,-28,-3,-30,-24,28,-13,0,-7,16,3,-23,-40,-20,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-19,-22,-29,-22,-4,-32,-26,27,-22,9,9,-12,-16,-16,-22,-5,13,19,-24,-4,-22;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-24,-32,-18,-8,-15,-24,-20,-5,-18,0,-5,-24,44,-14,-20,-18,-10,-15,-26,-19,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='H'; M=-16,15,-26,8,0,-20,-12,66,-26,-6,-24,-8,29,-20,6,0,-2,-12,-30,-34,5,0;
MA   /M: SY='H'; M=-17,3,-30,7,20,-23,-20,66,-30,-3,-20,-7,7,-13,13,0,-7,-17,-30,-30,6,14;
MA   /M: SY='E'; M=-14,25,-30,39,45,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,8,-4,12,-4,0,-10,-30,-34,-20,29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-14,44,-24,39,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,45,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,42,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-30,0,3,-23,-20,69,-30,7,-23,-3,7,-17,10,8,-10,-17,-27,-27,12,3;
MA   /M: SY='N'; M=-2,25,-16,12,0,-20,0,2,-20,-4,-30,-20,41,-16,0,-4,21,8,-22,-40,-20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='K'; M=-2,0,-22,0,6,-26,-12,-10,-26,27,-30,-14,4,-10,6,15,9,1,-16,-28,-14,6;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-30,-6,-9,-30,36,-16,-36,7,-30,-16,0,-16,-9,-1,-4,-16,-26,-20,-22,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-12,20,-22,39,35,-26,-26,-12,-16,-26,-10,10,-20,0,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-22,-17,-32,-24,55,-27,-20,-3,-24,4,-3,-14,-24,-32,-17,-9,7,0,-1,19,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='M'; M=-14,3,-24,8,-5,-12,-20,-7,-3,-13,11,12,-8,-20,-7,-13,-16,-10,-5,-28,-8,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-11,-22,-11,-5,-19,-24,-18,-7,23,-15,-2,-11,-18,-5,11,-10,-6,7,-24,-10,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,0,-22,-4,6,-26,-20,-7,-19,14,-19,-7,0,-10,19,8,5,13,-16,-24,-10,13;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-20,-17,-26,-20,46,-20,-17,-7,-23,-4,-7,-10,-23,-26,-17,0,0,-3,-7,13,-20;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-6,-6,-6,-6,-12,-12,-6,-6,-6,-6,0,-6,-6,-6,12,31,0,-19,-6,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-19,-10,-22,-19,27,-19,-15,8,-16,6,3,-15,-19,-22,-12,-10,-3,14,-5,7,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=7,14,-13,18,4,-19,-3,-6,-16,-3,-13,-13,4,-6,-3,-9,3,-3,-10,-19,-12,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-12,31,-19,43,12,-25,-6,0,-25,0,-19,-19,12,-6,0,-6,0,-6,-19,-25,-12,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='E'; M=11,1,-13,1,17,-16,-7,-6,-13,1,-10,-10,-3,-3,4,-6,3,-3,-10,-16,-12,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=1,0,-12,0,3,-15,-6,-6,-15,11,-19,-10,3,-6,3,5,11,4,-9,-19,-10,3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-19,-6,-12,-19,43,-12,-25,-12,-19,-12,0,-12,-12,-12,0,-12,-19,-12,-19,-12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-10,-24,-13,-4,-8,-18,5,-10,-3,-10,-3,-10,-18,14,-6,-5,-7,-14,-1,21,3;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-32,-10,-3,-24,-20,-20,-17,-10,-24,-17,-14,62,-10,-17,-2,7,-22,-30,-24,-10;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-7,-13,-17,-10,-23,-17,7,-10,-3,-10,33,30,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,6,-30,12,45,-34,-20,4,-26,10,-20,-12,0,-4,35,4,0,-10,-30,-26,-16,40;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60029;
//
ID   BACTERIOCIN_IIA_MP; MATRIX.
AC   MP60030;
DT   01-APR-2007 CREATED; 01-APR-2007 DATA UPDATE; 01-APR-2007 INFO UPDATE.
DE   Bacteriocin class IIa family signature
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.4112086; R2=0.0125314; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=552; N_SCORE=11.319; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=167; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-200; B1=-200; E0=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-27,8,33,-29,-20,-2,-25,13,-20,-12,0,-5,23,5,1,-1,-24,-26,-15,28;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-18,-27,-18,9,-27,-18,18,-27,44,18,-27,-27,-18,-18,-27,-9,9,-18,0,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-3,19,-15,16,2,-20,-4,-3,-20,-5,-24,-18,23,-12,-1,-6,19,11,-17,-34,-17,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-5,-18,-9,-4,-10,-18,-9,1,-2,-1,5,-3,-18,-6,-4,-8,-5,4,-25,-9,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,7,-22,2,5,-22,-14,-7,-22,28,-24,-11,10,-11,5,16,-2,1,-17,-22,-11,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-23,11,42,-25,-14,-3,-23,6,-16,-16,-2,-2,13,-3,2,-7,-22,-25,-18,27; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-22,-17,-27,-19,3,-22,-9,19,-16,26,36,-22,-22,-9,-13,-20,-8,13,-19,-1,-14; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,1,-22,0,17,-27,-16,-2,-19,10,-17,-7,-1,-7,25,5,2,-2,-19,-20,-12,21; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,0,-20,-4,4,-22,-15,-1,-11,-1,-9,-2,3,-12,22,-1,2,1,-15,-21,-10,13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-24,-20,-29,-23,0,-30,-24,31,-23,17,13,-19,-20,-18,-21,-13,-1,24,-21,-3,-23; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-3,-15,-10,-12,-9,-19,0,1,-12,-6,-2,2,-16,-9,-10,3,13,4,-27,-5,-12; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-27,-9,-18,-27,62,-18,-36,-18,-27,-18,0,-18,-18,-18,0,-18,-27,-18,-27,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-9,-27,-9,-18,-27,62,-18,-36,-18,-27,-18,0,-18,-18,-18,0,-18,-27,-18,-27,-18; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-7,-25,-9,-2,-20,-23,-14,-14,25,-18,-5,-5,-14,0,17,-7,0,-6,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-3,-22,-6,-10,5,-15,8,-10,-8,-15,-10,4,-22,-5,-8,5,2,-14,-6,29,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-24,-6,-6,-6,-18,43,-18,-10,-16,-6,1,-19,1,-6,2,-2,-18,-17,24,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,20,-19,7,-5,-20,7,-3,-21,-6,-26,-18,34,-17,-5,-6,13,9,-22,-35,-20,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-8,4,-27,2,8,-28,-17,-8,-28,41,-30,-12,6,-11,8,24,-4,-7,-20,-23,-12,8;
MA   /M: SY='K'; M=-5,4,-22,2,8,-23,-13,8,-25,11,-26,-13,9,-11,6,6,9,3,-19,-30,-10,6;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-3,-27,-3,-2,-28,13,-13,-32,17,-30,-15,2,-13,-2,7,1,-9,-22,-23,-18,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-4,-16,-26,-18,-14,-6,-11,-20,-19,-14,-23,-19,-12,-18,-10,-14,4,4,-17,39,2,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,50,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='W'; M=-16,-32,-41,-32,-24,2,-21,-25,-15,-9,-17,-14,-31,-27,-16,-7,-30,-22,-17,92,17,-17;
MA   /M: SY='G'; M=7,-8,-24,-9,-15,-27,48,-18,-33,-17,-28,-19,1,-17,-15,-18,10,-9,-23,-24,-27,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-9,3,-27,6,28,-23,-21,-3,-24,14,-19,-13,-2,-7,15,5,-1,-1,-22,-22,-7,21;
MA   /M: SY='A'; M=36,-8,-12,-18,-11,-16,-4,-17,-7,-12,-3,-7,-6,-14,-11,-18,4,-1,-1,-22,-17,-11;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: M=-9,-11,-24,-14,-2,-3,-23,-14,-1,-6,-5,-3,-9,-13,-3,-8,-7,0,-5,-4,-1,-3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-20,-6,-3,-23,9,-9,-20,-6,-17,-9,0,-12,8,-6,6,7,-17,-21,-15,3; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='A'; M=13,-4,4,-12,-7,-18,-12,-15,-9,-12,-13,-11,1,-17,-9,-17,4,-2,-6,-31,-19,-9;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-30,-29,-24,-10,-9,-24,18,-21,3,6,-13,-20,-17,-17,-14,-13,9,-20,-9,-24;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-10,-20,-12,-15,-9,-1,-14,-1,-15,-6,-4,-8,-17,-14,-16,-4,-3,1,-16,-4,-16; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-6,11,-18,2,-7,-16,6,8,-17,-7,-19,-11,21,-17,-6,-6,4,-1,-16,-28,-12,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-2,7,-20,-4,-9,-16,-5,-8,-10,-5,-16,-10,17,-18,-7,-1,4,3,-10,-30,-16,-9;
MA   /I: E0=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /VERSION=1;
DO   PDOC60030;
//
