##maf version=1
a score=8841
s hg19.chr9_gl000199_random    26460 162 +    169874 cAAAGACATAGAGGATTGAGTTATTATCATTGATCAATACAAAGTCCCTCTCTC-ATTTATTTTCTTTCATTCCCACCCCCCATTTCTATTCCCCATCTTCCCATGTGCAACCTTCCTAATATGTTTGATATGCTTCTTTTTGtatatatttttagaaaatgt 
s canFam2.chr1              73622316 157 + 125616256 CAGAGACACAGAAGATTAAATTGTTATCAGTGATCCATCTGAGGTCCCTCTCTCAATTTCTTTTCTTTCATTCCCATCCCTCATTTCTCTTCA------TCCCACATGCAGCCTTGCTAATATGTTTTGTATCCTTTTGTTTGTATGTATATTTATGAAATGT 

a score=6798
s hg19.chr9_gl000199_random    28364 77 +   169874 TGTCTGAGTAGTTGTCGACCTTGTTTCCACATTAACTGGCTGTTTTGTTGTGGCTGCACTTCTGTTTCATTACCTTC 
s canFam2.chr17             32418389 77 + 67347617 TGTCTGAGTAGTTGTCGACCCTGTTTCCACATTAACTGGCTATTTTGTTGTGGCTGTACCTCTGTTTCATTACCTTC 

a score=9345
s hg19.chr9_gl000199_random   28441 138 +   169874 ATCTTGCAGGACGGAGTCTTGGCTGCAGACTCAGCCTGTACCTCACCCGTCTCCCACCGACTCTTGGTACTGGCCATGGCCATGCTGGGCAGCTCTATGGAGGCCTGGTGGGCTACCTTGGGGGTTCGGCCAGTGGTC 
s canFam2.chr18             9727464 138 - 58872314 ACCTTGCAGGAGGCAGCCTTGGCAGTGGACTGAGCCTGCACCTCTCCTGTCTCCCATCGGCTCTTGGTGCTTGCCACAGCCATGCTGGGCAGCTCAATGGAGGGCTGGCGGACTAGCTTGGGGGTCCGGCCAGCAGTC