##maf version=1 a score=87241 s hg17.chr12_random 7 1126 + 466818 GGGTTtgtaacagattgccccatttttttctaagaaaaagagaatgaattatgattttt-attattatttt-----ctcttctctcccctttccctttgttccctgtatcctgcttagccattcataaatgcaaatagaacctttcacccccactcactagacattccctgcagggcacatttttctaactatgtgctCCGAGACCAATCTCTCCTGAGAACTGACAGTCAATTTGCAGACCAAA-CACACCCACCACAGAATTTTTACCTCCAGGAAGTGGACCAGGAAATTCCAGGCTCTGCTCCACTCTAGGAATTACCTAAGGACTTTCATCCAACAGGAGGGCATATGGAAAGCATACCTACttggccacttttataatgtatttctgcaaaggcaggtgccaattcaactatctggtagtgcaggggttcagtcagaatggtagggaaaattataaaataaaaaaaagaccttcttggaagaccaa-aagtttttgcataacttcagatagtttggctgaaggcagcc--agtctctttgccagagccagagcactttgggcacagacacaaaggaatgtagagtagtttatctaaagagcttgtttactcaggtagtcctaaagctaacctttcatcactcacaggcaggattgctctcctgggggaaggtgacagagttgattaccctctaatggtgttgactcaaagtttttgtcatttaatgtgttctaaataaatgccaag-aaggccagcaagttggggcggcagctgacagcactcttccttagagtctgttaagtggcccggatgctcggctggactgacaagcaaaacatacatgtcggtgtatgttattcctctgtcattgagtcagggtctgctggacaga-cccctgcatggtagaaaaggcaccaagcttgcaggaggaccctctacccttgctcaataaccccccttaccttataaaagtgtctgctttctgctccaaaggtgaagtggtacacttaaaggcaggactctttgtgccccttccccaagctaggtttgaaataaattcattacttttgaaccaggcctcactctttttaactggattctggatgccaccagcaactgaCTCGCATATTG s rheMac1.SCAFFOLD31009 2540 1136 - 42162 GGGTTtgtaacagattgccccatttttttctaagaaaaagagtatgagttactattttttattattattttatcttctcttctttcctccttccctttgttctgtgtgtcctgcttagcccttcataaatgcaaatgtaacctttcacccccactcactggacattccctgcagggcacatttctctaactatgtgctccaagacagatctcccctgagaattgacagtcaatttgcagaccaaagcacacccaccacagaacttttacctccaggaCGTGGACCTGGAAATTCCAGGCTCTGCTCCACTCCAGGAATTGCCTGAGGACTTTCATCCAACAGGAGGGCATATGAAAACCATACCCACttggccacttttgtaatgtatttctgcaaaagaaagcaccaattcaactacctggtagtgtaggggttcagtcagaatggtagggaaaattataaaataaaacaaaaaccttcttggaagaccaagaagttgttgcatagcttcagatagcttggctgaaggcagccagagtctctttgcaggagccagagaacttagggcacagatacaaaggaatgtagagtagtttatctaaagagcttgtttactgagatagtcctaaaactaacctttcatcactcacaggcaatattgctctcctgcgaaaaggtgaccagggtaattaccctctaattgtgttgactcaaagcttttgtcatttaatgtgtgctaaacaaatgccaagaaaggccagcaagtctgggccaagactgacagcactc-tcctgagagtctg-taagtggccaggaggctgggccgggctgacaagccaaatatatgtgtcagtgtatgttattcctctgtcattgagtcagggtctgcaggacagaccccccgcatggtagataaggcaccaagcttgcaggaggaccctctacccttgctcagtatccccccttaccttataaaagtgtctgctttctgctccaaaggtgaagtggtacacttaaaggcaggactcctcgtgccccttccccaagctaggtttggaataaatttattacttttgtaccaggcctcactcttgttaactggactctggatgcagccagcaactgacttgtatattg a score=37813 s hg17.chr12_random 1133 975 + 466818 TTTTcaggttcaagggagtatcctgcctcatccttctgtgtaactgggactacaggtgagcaccaccatgccaaactaatttttgttgttgttttttctttttttagtttttgtagagacaagctctcaccatgtagcccagggtggtctggaactcctggcctcaatagatattcccaactgtgcctaccaaagttccgggattgcaagcaagagccatcataccaagccTGCACTGggagtttttgaaggtcagatgctacctagatttttgactcatgtacatcccaaggtggatctaatcagtttgctgttattacctcttcctgaacatgtaattgaaatggacaaacatggcagctggcaggactctcacctt-cttcctgacctgcagagtaaggg-acactatta-gagcaggaccaaggcgaagcctgcgaaattctcctccactggcaacaag--gattgaaaaataataatcacattctccaaggaatggaattgatcactaccatgacaaaacacttgaaagttacaggggatggtagtct-ttttacatccctctccacttaacctaaatggcctctaccaaaatcagatacattataaaatgagggcagagttccataaatttaaatcactacttacaaatgctctctaggatgtggtatcttccctgagcagagcagagcttctggcactttgcatgtggctctcgattaagtgaatatttcttgtttttcacccacgggtgggtcgggagattaaaacagttggcctttgtttggtaagaacgaaagtgctgcttcactgttttatgtcagggcgatgtcacttctGCTCTCAGTTTAATTTACATTTTGCAAAACATCATGTTAATT-----TATTAATAATGTTACAGTAATTGGTGCAATAACCAGGAAATGGAAAGGTCCCTAAATATAGTAAAATACTTGAACGTTAAATAGAAATAAAATACTA s rheMac1.SCAFFOLD85456 13090 929 - 81052 ttcctgggctaaactgatccccctgccagaacttcctaggtagttggaactacaggcacacagtatcac----aatcagtttat--------------tttcttta--------acaaacagggacttgctaccttgcccaggctgatctggaagtcctggtctcaagtgctcctcccacctcagcctcccagattgtttggattacaggtgtgagccacctcaccagtccTGgagtaggagtttttgaaagtcagacgctgcataaagctttggctcatgttcaacctaaggtggatctaatgggtttatatttattatctcttccagaatgttaaattgaaattaacagtttcaacagctagcagaactctcacattgcttccagacctgtatattaaggggacattattgtaagtagaaccaaaaagagttctctgaaattctcctcttctgtcaagaaaatgagtaaaacataataaccgcatagtctaaggaatagaattggtcactgacatgacaaaaaactctaaa-ttccaggaggtggttgtccattttttatccctattcagttaacctatctggcctctgccaaaaccagatggattataggatgaatgcacatcagcataaacataaATCGC-GCTTGAAGATACTCTCTAGGATGTGGTACCTTCACTGAG-AAAACATGGTTTctggctctttgtatgaggcttttgatttggtgaatgctttttaatctacatccat---tgggagagaaaatcaaaatgatttgctttggtgtggtaagaacgaaagcattgcttcaccattttatgtcagggctatgtcacttctgttttcagtttaattggcattttgcaaaacatcatgctaactcaatatattaataatattgcattaattg------taacccaaaagcaggag-----------atggtgagtttctcaaatat--------agtaaaatacca a score=3451 s hg17.chr12_random 2108 113 + 466818 GCA-GAAAGAGATACACCTGATAATATTTGGAAACCTGCAACATAGATATTGTTTTTAAGGTCTCA-TATTCCTGGTCTACATGTCGAAA----------------AATCCatttatttatttatatattt s rheMac1.SCAFFOLD89827 125 131 + 22897 GAACAAAATaaataaacctgagaagattcagggacctacaacataggtgatgttttaaagcgttcagtggccccagtccacatgtcgaaacaaactttattacagtaaacgatgttttgctctatatattt a score=2382 s hg17.chr12_random 2221 52 + 466818 atttttgagacagagtcttgctctgttgcccaggctagagtgcactggtgcc s rheMac1.SCAFFOLD85456 69141 52 - 81052 tcttctgagtcagaatctccctctgttacccaagctggagtacagtggcagg a score=6361 s hg17.chr12_random 2273 87 + 466818 atctcggctcactgcaaacttcgcctcctgggttcaatcagttcaaatccttcagcctccttactagctgtatttacagccatgtgc s rheMac1.SCAFFOLD31009 4729 87 - 42162 atcttggctcactgcaaccttcgcctcctgggttcaatcagttcaaatccttcaacttcctgagtaactgtgtttacaggcttttgc a score=210 s hg17.chr12_random 2360 45 + 466818 taccatgcctggcaattttttttttttttaaagtagagacctggt s rheMac1.SCAFFOLD85456 14081 30 - 81052 taacatagatgatgatttt---------------aggggtccagt a score=2485 s hg17.chr12_random 2405 35 + 466818 ttcaccatgttagccaggctggtctcaaactcatg s rheMac1.SCAFFOLD31009 4865 35 - 42162 ttcaccatgctgcccagactgatctcaaactcacg a score=-60 s hg17.chr12_random 2440 40 + 466818 gcctcaagtgatctgcccaccttggcctcccaaagtgctg s rheMac1.SCAFFOLD85456 14111 19 - 81052 gctcctagt-------ccac--------------gtgctg a score=2260 s hg17.chr12_random 2480 32 + 466818 ggattacaggggtgagccaccatgcccagcAG s rheMac1.SCAFFOLD31009 4940 32 - 42162 ggattacaggcatgagccaccATAACCAACAG a score=7659 s hg17.chr12_random 2512 147 + 466818 AAACATCCTTTTTAAAGTAAGTGGCCTGTTGCCCTATAAA----tacttcttatcactaaaagagaagcacagtgtttattgactctcttggggttttggagtccacaaataccacaatagaggatattgctctgacTTGTTAATAAAGTC s rheMac1.SCAFFOLD85456 14130 151 - 81052 aaataccctttttaaagtaaacagcatgttgctctgtatgcatctatttcctgtcactaaaaatgagacacaatatttgttgggcctcctgggatttgggagccaacatattccacatttgaggatattgctctgattcactaatgaagtt a score=5109 s hg17.chr12_random 2659 66 + 466818 CTTTTTAAATCCCTGTTCAGTTAACCTACCTAGCCTCTGCCAAAACCAGATGGGttacagaatgaa s rheMac1.SCAFFOLD31009 5118 66 - 42162 CTTTTTATATCCCTATTCACTTAACCTACCTAGCCTCTGACAAAATGAGATGGGttacagaatgaa a score=30654 s hg17.chr12_random 2725 520 + 466818 tgcaaagactagtggtttcaagtggaatccagaacataagatatctctacagcaggtataggctgtggcccaacctgctctgcccattgagtcagatgatccagcagaattcaaagctgctagaggCATGCAT----CGTGGGCATTATAGGACTCTGTGCCTGTCTCCATCAAGCCCGTAGGAGAGGAGAAAGCAAACCCCTAGGGAATTACTGCAGAACTATTCCCTCTTCAGCGGAGGAGTATCTGCTGTCTGAAAAATAAAAATGCAAGTgcagaacattaatccaagcaaaaagcccctc-----------------aagcacaagactgcgtgcaactacacaaggcatctgcttataaaaccagccACAGTTGGAGGGCATGAGCACATCTGAGTGGCACAAGGAGGGGACtatattggacacaaacatgtgcttcctcagattcccttgactctctcctgttcccatggtcagcaccttgcctgatccagATCACCTTTCCATCTGGGACTTGAATGTATC-------TGTgggcatgaa s rheMac1.SCAFFOLD85456 14281 545 - 81052 tccaaaggctactggtcttaagtagaa-ctagaacaaaaaatgactcta--gcaaacgtaggctttagtccaagctgctgtgctcattgtgacagacaatccagcagaattcagacctgctagaggcatgcatgcatagtgggcattataggactttgtgcatgcttctcacaagctcacaggagaggggagagcaaacccctaggaaattagtgcaaaaccattccctcttcaacagaggagtgccctctgtctcaaaaacaAAACAGCAGGTGCAGAAAATTAACCCAAGTATAAAGCGCTTCTAAGCATGCGCATCTCTAAGCACAAGACCCTGTGCAACAGTGGAAATTATATGCTCATAAAGTCAGCCATGATTGGAGGGCATGAGCACATCTGAGTGGCACAAGCAGTGGACTGCATCGGGCACAAACATGTGCTTCCTCAGATTCACTTGACTGTCTCCCATTCCCCTGGTCAGCAGCTTGCCTGACCCACGTCACccttccatttgagacttgaatggatcaccacattgtgggcatgag a score=31353 s hg17.chr12_random 3779 630 + 466818 gtctgactttcccaaacagccaccaaggggttggataatgtaaggaagaaaagcaaagatggtagttctgccacaaaataactttggccaaaggtaaatagaaaacaaaagacagctagg---atacattctcccttttctct--cttccatggactaatatttgctgtggtttccccttgtaacccttctggaaaagtaccgggagccaagtgcatgtatctgatgatcaccatgctgtctgtctcacctcattgtgaagtga-caacggcaaagtcatgtca-acatcatgatacatggttttacatcttcttttgcctcagtttccacatttacccctcattgctaccctggacttgccttcccaaataaatgtcatcactgtaaactcagacactggctctagttctagacacccaaagctaagataTACATTCAGTTGCAT--------------CACTTTTCCATGCATTTATAATATGGCAATTAAAACATTCATTTAGAAAGGATACtaaaatatatatataaata-atGTGTAAGAAAGGTGACTCGTTACTAACTCAATTTTTAAAAGCGAAATGCCATCTTTGTGTATATAGTAACCAGCTAGAAAATATCATAATACAAATATATCATTCACAGTAGAAA s rheMac1.SCAFFOLD85456 14826 641 - 81052 gtctgactttcattacc-tccaccaagggactggatgatggaaagcagaacaacagagatggtaattctgcctcagggaaaccctggccagtgggaaatagaagacagaagacagctgagcagatatgttctccctcctctgttgcttccatggactaatgctggctgtgttttcctcttgcagcccttctgaaaaagtcctgggagccaagtgcacacatctgatgaccgccatgctctct--ctcacctcactgtgaagtggtcgtcagcagagtcatatcacacatcacaacacatagtttcacatcttctcttgcctcaatttccatatgacccggcttttgctgccatggacct--ccttccaaataaatgtcagcactttaatatcagacatttgctctagttctggacccctgagactaagataTTCATTCAGTGTTATAATTATTATTCATTCATTTTTCTATGAGTTTATAATATGGTGATTAAAGTGATCATTTAGAAAGGatattaaaaatactatctaaaaatatattttagtaagata----gttgataattaaattttttaaa-tGAAATGTCATTTTTGTTTATGTAATAACCAGCTAGAAA-TACCACAATACAAATATATAGTTTGCAATAGAAA a score=5470 s hg17.chr12_random 4412 113 + 466818 ATTGGGTACATTTACAAACAGCTTAACCAGTTGCAAAGTTTGCTAGCTTTTTTTTTTTTTCATTTCTTTTGTGTTcacttcttttgtatcagcaaagcattgaaggcagcata s rheMac1.SCAFFOLD45667 43284 108 - 44450 GTTGGGCACATTTCCAACAAACTTACCCAGTTCCAAAATTTGCTGGCTTTTTTTTTC-----TTCttctagaggtcactttctttgtaccaatgaaccactgaaggcagcaaa a score=433 s hg17.chr12_random 4545 6 + 466818 agatgt s rheMac1.SCAFFOLD85456 15467 6 - 81052 AGATAT a score=23372 s hg17.chr12_random 4659 443 + 466818 GTGCAAATATACCAGAATCCTTTATATGCTTTTCAAAAAGTATTACAATAAGTGCCATCTAATTTTGACATTCCACCTTGTCTCTACTTCACACACCTGATATAGCTGCATCAAAGCTATATTACAGTGATACTTCCCCTAGAATTGGGGAATAGCCAAACTTTTGCTCTGAGAAATGCTTCTTCTTTGATAAGCCTATAACCTCAACCTGAAACTAGAAAA------TTCAAGCAACTGCAGATTTTGTCAAGAGTTTCGTTTTCACTGGTTTACCACATCAA-ATTATCCATTTATCCAACCACT---------AATGTGttcattaacgtatcatttttgaccaactattctttgtgctggcttttagatcccgtgagtccagacaaagcaagacagatatgacctctctttttatggtgattacattgtactagggaagatgcatgataaataaa s rheMac1.SCAFFOLD85456 15473 446 - 81052 GTGCACATATGCAAAACTCTTTTATATGCTAAGTAAAAAGTATTGTAATA--TTCCATCTGATTTT-ATTTTCCACTTTGTCTTTGTGTCACACATCCAATATAGCTGCATCAATGCTATATTATAGTGATATTTCCCCTAGAATTGGGGAATAGCCTAACTTTTGCTCTGAGAAATTCTTCTTCTTGGATAATCCTGTAACTTCAATCTGAAACCAGAACAGAAATATTCATGCAACTGTAGATTTTGTGATGTGTTACATTTTCATTGGTTCACCACCCCAATATAGTTCATGTATTCGTTCATTCGCCAATTAAattcgttcatcaaagtatcatttttgaataactattctgtgtgctgtcttt----------atgtctacagtaagcaagatctatacgatctccacttttatggtacttacattgtaccagggaagatatatgataaacaaa a score=1675 s hg17.chr12_random 5102 66 + 466818 atgtgtgtgtatatatatatcagatgtggatCTGatacatatatatgtggatgtaatatatatata s rheMac1.SCAFFOLD31009 5863 51 - 42162 Atgtgtgtgtgtgtgtgtgt--------------gtatatatatatatatatatag-atagatata a score=15269 s hg17.chr12_random 5168 245 + 466818 tatatCAGATGAGGAGTTGACTTATTTTAAGTTTTACATAACAATGTTAAAATCTCATAACACCAAGAATTAACACAGTCATGCAGAATTTAGCTGTTCAGCAAGGCTGTACATTTCCTTCTTATAATAGAACTTGGTATCAATGGATACATCAACACACTTTGTGTCATTTCACCATTTACACCA---TTATAATAAAACATATCATTAATACATTTCCTATCATCAATATATAGATTTCACAGATA s rheMac1.SCAFFOLD85456 15919 246 - 81052 caaatcagatGTGGAGATGATTTATCTTAAGATTTAGATAATTTTGTTAAAATTGCATAACACCAGAAATTAATA--GTCACACAGAATTTAGCTGTTGAACTAGGTTATACATTTTCTTCTTATAATATAACTTGCTATTAGTGAATATGTCAACACACTTTCTCTCATTTCATCATTTACACCAAGATTATAATAAAACGTATCTTTAAGGCATTTCCTATCATCAATATATAGATTTCATAGATG a score=5070 s hg17.chr12_random 5415 61 + 466818 TTTTAACATTTAACGAAAGTTTAACATTTAACATTTGAAGAAAGTTTCATTTGATTATCAT s rheMac1.SCAFFOLD31009 6151 61 - 42162 TTTTAACATTTAGAGAAAGTTTAACATTTAACATTTGAAGAAAGTTTCATTCAATTATCAT a score=19475 s hg17.chr12_random 5476 345 + 466818 CTATAGTTTCTATACTCTCTTTGG-----GACTTTTTTTAAGATAGAGAATATTTGAGTTTTTTTGAGGAATATTAGGAATGGGAGACAAAGGAGAAAATTGGAAATTCAGGAGCTCAGAGGTGGCTAAGAAAATAAATGGAAATACTTGACATCAGATGTCAACTTCACAAAAGGTTTCCTTTAATTCAAAAAGTGGAATAAGTGACTTTTCTAACTACACATAAAAAATTATAACAGCACTGAAAGGA--TCATGATCATGTTTTTTCATTCCTATTATAGAAATGATTTTTATTCTAGGCTATGCACATACTTGTATTAAATTTAGTATTCTTTAGTACTGTTTTTGGT s rheMac1.SCAFFOLD85456 16165 348 - 81052 CCGTCGTTTCTATACCCTCTTTAGATTGAGCTTCGTTTTAAAGTAAGGAAAATTTGAGCTTTTT-GAGGGATTTTAAGGATGGAAGATAAAGGAGAGAATTGGCAATTCAGGAGCTCAGAGGTGGCTTAGACAAAAAACTAAAATATATAACATCAGATCTCAACTTCAAAAAAGCTTTTGTTTAATTCAAAAACTGGAAGAGATGACTTTTCTAATTGCATATGGAAACTTATAACAGCACTGAAAAGAGCTCATGATCATGTTTCTTCATCTTTTTTATAGAAATGATTTTT--TGTAAGCTATTAACATACT-ATATTAAATCTAATATTCCTCAGTATTGCTTTTGAT a score=5092 s hg17.chr12_random 5822 112 + 466818 TATATAAATAAAACTTACTCTACATATCTTTGTCAC--TAAAATTTTATTGTGTGCATCATTAGCTAACAAT---TCTATTTGCTTTCTACCAAACGTAAAATAAGAATTCCTAATG s rheMac1.SCAFFOLD85456 16514 116 - 81052 TACATAAA-AAAATGTACACTAGATATATATTTCACCCTTGAATTTTATTTTGTGCGTCGTTATCTAACAATAATTGTATTTGCTTTATACTATACATAAAATAAGAATTCATCATG a score=122700 s hg17.chr12_random 5934 2256 + 466818 AAATAAAACCTACCCCAAAGATACATTCTCATCATTGATTTAATATTAAACTTCTTTACCATCCA-AACAATTAGGGGTTCAC-CAATGATAGTTAA------------------GTACATATATGTGATACAAATTGCAATGGAAAACAGCAATAATTTCCTGATAAAAGCTGTAAGATCCTAATTTTAAAAAGAGAAAATAAAATCTTCAAATGAAATATTATACAATGAACTATAAG---AAAATATACAT-----------------------------------------------ACATTGTATATGTGAAATATACTCAGCTTCATAGTTTATGGTCAATGTTG-TTATTTATACACATGCACACATATACAACCATATATATATGT-----------------------AAGACTTTTATAGATATCTATTCTGAAATTACTCAAATACATACACTATGGAAAAACTGATAG-AAATATAAAATGTTCAAGACATCATCAGTTTGTTTTCTGCTAGAAGACACACGATGCACCCCTTGTGAATCTATGGAGTTGAGGGTTGCTGTCCTTTCACTAAGCATGTGACCTGACATAAAACTGAAAGAAACGTCTGTTTTAGTTTCCTGCTTCCCATAATCAGGAAGAATGAGTGGAATGAAGGATACATGATTCCAAGAGTTTGGCAAAGCAGGAATACAAGTTTGTTCTGCTGTGTTCAAAGATTCCAGGTTAATGTGATTAGATACAGAAAGTAAATGGCATATAACATGAGGAAGGAGATCACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGAGATCTTGAGATCCTTTGCCATGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTATGCAGAGAACAGATTAACAGCAGAAAACATATTAGGGTCAGAATGAAGGGTATGAGGTTTGCTAGTGTGCTTACAGTCAAGTTTGAAAGGTGTATTGCATTCCTCAATTTGATCTTCCAAGTCACATTTCCTTCATATTCTTTTGTCCACACACTGTCATCCATGGTTATCACAGCAAGATTACAAATCAAAAATACCAAGGGACCCAACAGTATCACCAGAACAACACTCCTAATTCTCTTCTTTAGGTGGAGAAAAATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGGCTAGCAGCAAGCCAGATGCTGAAATGGTTGATTATTGCTGAGATATTAGAAGCAACAGCTCCTACTTCTGAACTATATAAAGCTGAATTAAACACATTTGCATACCAATGTAATAATATGACCCAGAGTAAACCAATTCTGGAGACCACCAGAGCAGTGAGGATTTGGTCAGCTGAGGAGATCTTTCGTGTCTTAACCCAGTCAATGACATTTACTAGAGCTATGAAGCCATTGGAAAAATTTCCAAGAACAAATGCAAACACTACCAGAATTGATAAAATGATGAGCAGAAAATATACCATGTTTGAACAGACAAAAAGAAAAAAATTGCAGTCTTAATAACACTGGTTCTGATACCCTTAATATCCAAACATTAACTTCGATAAACACTTGATTACTAAATGTGCAATAACAT--TTTCTGCCTTTAAATTCTGTGACTAATGTCAACAGGAAAGCACCAGCCTATGCTAATGGATGAGTTCAAAGCTGTCTTCATAGAAATAGAAAATATTGTTATTCTCAAAACAGCTCAGATTCACTCCTCTTCATATACTATCTGTCCCTGCTACATGCTGAATTTTTTTATACTCATGTTGAAGTGAAAAGTGAATTTTCATGTGTTAGTATGCAAATAAAGCCATATTCTTTGTCATTGTTTTGCAATTTTTTTCCTTGTTTAACCTCTCCATAATTTGAATCCAGCATCTTCAGTTGTTTCTTAGGGAAATTTTAAAACCAAATACATATATCATACAGTAAATGTCTAAATTGTTAAAGGAGCTTGGTCATAACTAGGATCAC-ACCAATATGGATTTATTTTT--ATGCCAGATTTAAATAC-CAGATTCTAAACCTTTTATCAGAATCATCCAAGGTTATCTTGGAAAGCCCTGGGAGGCCGATACACCTGAAAATCTGGTTTCTGATAACCAATAAATTGATATGACATCATTGTTAATAAGCTCCTAA------ACACATAGACACACATGCACTCACACCTTTAGGGGATGGAAGGAATTATTTTCTTATAATTCCCCAAATGGAAAATGAGTTTCCAGGAGGTCATCCAGGTGGAATTACTCGTATT----CCACTCAGGGTTGTCAGACAATGAATAATATTTATCAAACATGTTTCTCATGCTTAGGCCATTGATAAATTTAGTCTCAAGTCTGTTTTTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 16978 2337 - 81052 aaaaaaaaCCTACCCCAAAGACACATTCTCATCATTGATTTAGAATTAAATTTCCTTACCATCCAGAAAAATTACAGGCTCAAACAATGATAGTTAAACAGTTACATACACTATGGTACATATACATAATACAAATTACAATCAACAACACCAATAATTTTCTGATATAAGGTGTCAGTTCTCAATTATAAATAGAGATCATAAATTCCTCAAACGAAATATCATACAATAAAATATATGTGTGAAACACACATGGGTTCATAATTCTGACAAATTTCTTATCCTACTTTTGTATAACTGAACAGTTTATATGAAAAATTGATTAAAG---GTATGTTATGGTAAATGTTAAGTTTTcatatacattcagacatacacacacacatatatatacttttatataATAAACTTAAGTAAAAGAATTTTCTAATTCTACTTTTGTAAATTACTCAAATACATAGACTATGCAAAAACTTGTAGGAAATATAAAATGTTCCGGACACCATCAATTTGTTTTCTGCTAGAAAACACACAATGAACCTCTGGTGAATCTATGGAGTTGACAGGTTCTGTCCTTTGGCCCAGCAAGTCACCTGCCACAAAATTGAAAGAAAGTTCTGCTTTAGCTTCTTGTTCCCCCAAATCAGAAGGAATGAGTGGAACGATGGATATATGATTCCAATAGCTTGGCAAAGGATTAAGACAAGTTCTTTCTGTTGCTTCTTATAATTCCAAAATGATACGATTAGACATAGAAAGTAAACGGCAAATAGTATGAGGAAAGAGGTCACAGTTTGCAGAGCTTTTATGTGGATCTTGGTGCTAGGATCTTGCGATCCTTTGCCATAGAGCTTCATCTTCTTCAGATGTTTACACAGAGAGCAGATTAACAGCAGAAAAGATATCAGGGTCAGAGTGAATGGTATCAAGTTTGCTAGCGTGACTACAATCAAGTTAGAAAGGTACGTTGCATTCCTCAATTTGATCTTCCAAGTTATGTTTCTTTCATATTCTTTCGTCCACACATTTATATACACGTTTTCCGCCACAAGATCACAAACCAAAAATAACAAAGCCCCTGACAGTATCCCCAGAACTACACTCTTAACCTTCCTTTTTAAGTGATGAAAAATAAGTCTGGAGAAATTGACGATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGGCTAGTAGCAAGCCAGATGCTGAAATGGTTGGTTACTGCCCAGGCATTAGAAAGAAAAATTCTTACTTTTAAACTAGATGAATTTGGATTCAACACAGTTGCATACCAGTGTAAGACTATTACCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACCGCCAGAGCAGCAATAATTTGATCAGCTGAGGAGATCTTTTGTCTCTTGAACCAGGCAATGAAATTTATCAGTGCTATAAAGCCATTGGCAAAATTTCCAAGAACAAATGCAACCACTACTAGAATGGAAAAAACAATGGGTAGAAAACTCATCATGTCAAAACAAAAAAGCAAGTAAAAAGTTCAGGCCTAATGTCACTGGTTGTGACTCCTCTAATATTCAGACTTTAGATTAAATATGCACTTGATTCCTGAATGTTCAATGACATCCTTTATGCTTTTAAATTCTGTGAACAATGTCAACAGGAAAGCACCAGCTTAAACTAATGAATGAGTTCAATGCTGCCTTT------ATGGAAAATATTGTCAGTCCCAAAACAGCTCAAATTAATTATTATTCATACAGTCTCTGTTCTTGCTATAGGCTGAAATTTTTCTGACTGATGTTGAACGGAAAGCTGGATTCTCATTTGCTAGCATTCAAATAAAGACATATCTTCTTTCACTGCTTTGCAA-TTTTTTCCTTGTTTCACATTTCCATAATTTGTGTTCAGC-CCTTCAGTTG----TTAGGGAAATTTTAATACCCAGTACATAGATGACACAGCAAGTATTTAGATTGTTAAAAGAGCCTGATCACATGTAGGATCATAATCACTATGGATTTATTTTTTAATGCCAGATTTAAATACACAGAATCTAAACTTTTTATCAAAATCACCCAATATTTTATTGGGAACCACAGGAAAGCCAATACTCCTTATACTTTGGTTGCTGTAAACCAATACTTTTGTATGGCATCAGTATTAACAAACTCATAAacacacacacatagacacacacacacTTTCACCCTTCAAGGATGAAAGGAATTTTTTTCTAATAACTTATGAAATGGAAAATGAGTTTCCAGGAGCTCATCCTGGTGGAATTAGTCCTATTTTTCCCATGCCGGATTTTCAGCCAATGAATAATACTCACGAAACATGTCTCTCATCCTTAGGCTTTTGGTAA---------------TGCTACTT a score=2694 s hg17.chr12_random 8190 33 + 466818 GtttaaatattaattatgtaattaaaatattCA s rheMac1.SCAFFOLD31009 8920 33 - 42162 GtttaaatattaattatttaattaaaatGTTCA a score=130271 s hg17.chr12_random 8223 2710 + 466818 GCAATTTTGTAAATATTTCGAAGTGCCCTACACTTTTTCATATAATCCTGCAGCACCCTCCCACCACAGGCAGGGTGACTACCTTGACcattgactctgaattcactcatgtaatttgcttcagtgaacagcaaactagtagactttacgcagagatttaagacggcttccatactggagtttcttgctcttTTCCATTTACCGTGAGGACATCATCTGGCCAATA-ACTGTTCCCATAAGAAGAATGAGAAACTAATGGAGTCAGAATGCCACTGCCTTATCTACAC-TAAATCAGCCA------AACTAGCTTCAAGATGCAGTACATGGCCCGTCTCCAGTCACCAGAGCCATCCACCAAA-TCTAGCTTAGAAAAATGAAATTCAAAGACATATGAGACACAAATATCTAAAGCAGTTTTGGAGGATTTTCTCTTGCAGAAAAACCTAAGTGATAAAGGCACTCTGCTAAACCAAGAGTATGGGAAACATGTCCACCCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGATTCAAGGGAAAAATAGACAGAGAATGTCAAAG-TTTTGTCACATGAAGTGGATAATTAAACCTAAAAGAAAAACCTATT--GAAAAATCTGGGATTGGCAGGTAACATCATGTCAAGTTTCAGAAAGGTGCAACTAAAATCAGAAAGTTTCTACTTAAAATCGCTTAGAGTTATACATAAATGTATAAAAATAGTGAATTTTTCCCTTCGGTATATAATGAGCAGAGTAA-TAATAATTTTCATGGAATCTTTCTCCTGattaataatttttatattataaCTAGACTGCACACTTAGAAATGAGCCAAAACAAAAATGGAAAACATAGCAATGTGTCAtaaacactcatgtaaccttcatgtagggcaagacatggaacattgctaaaagcctaggtttacctcaatgccactttccatttcccctatacctttcttcatatctcctgtgataagcaacatccataatttatgatcatctttttttaaattttctttttactttaccaacaagctatgcaaccctaaactcaatagcttggtttggcccactttgaaatgtttataggtgcaatcctatatg---ttcttattcatggcttcctggaatcaatattatgtatatgaaatttaaccccacagttgcatgtacatgtgatccacttcttttcgcttctgtataacttttcattttatgattttactgtaattatttat---------ccatccttatttgatatata-tttaggcagcttgtttttgagctattatgaataatgctacaatgagcattctttcacatatcatttgctacaattcttatgcatatatatacctgggtgtgaaattacagggtcCTTGA--TAAACGTTCACATTCTCCTCACAGACATAAAAAAGCCAAAAACATAGTTTGACTAAATTTATTTCTGTCACCTTTATCTCCAGTCTCTTTATTGCTATTTGCATATATCTTATCGATTATACATTCAATCCAGGAAGACACtattttatacagtcaacatttatttagaattacacacttatttttcattgtcattaatttttattgctccttgcatgttcaactttgtattttcagta-attttattttatctgaaaaatatcattttcaatttctgtttttgaaggtctACTACTCTTTGGAAACACACTGAAGACATGATTCCCATGATTCCATTGCATTCCTGCTTCCATATTTTCTGTT-AAAATCAGGTTGTATTCAGAATGCAGTTCTTTTCAACATACTCTATCTTCAACCTCTAGCTACTTTTCAGATTTTCTATTGGTCTTTTGTGTCCTGTATTATTTTATGTTAATTTGATTTAAGTCATCATGCCTGAAGTTTGA-GATTACAAAAAATACATGGAGGCATACATtttatcacttttggaaaactccttgcaacatt-ttgttgctctattttctcccctctactgttacagaactccagaagtatgttaggtgttgtgactgtagcctcaatg--tgttaccctc-tagctttgtatatttccatctctt--tctctctgtgcttcattctgtgtagctatcttctaattcacttattctctcttctactgcatctaactg---gttaactc--tgtctattggattctcaatattgataattcatttttttcaGTCTTATTCTTTTAGTGTTCAGAATAATCTTTTATTCTCCTTCCATAAATCATTTTCTAGGGAGAAACTGAACAAACTACTCTTAACACCATGTTCTTTTTAAAA---GCATTTTTGAGTTTTGGGTTTTTGGCTTTTTG-TTTTAGTATGTTAGAAAAGAAAATGGTAGTGGTTTTCTTCATTTCCCAATAGTTTGCTGAGAGAATAGAATAAAAGCTTTGTTCTGGAATTTACCTTCAATTTGAAAGAAACTAGAAATTAAGTTGATGTGAGTAGCTTTTTTTGGATATTAGCTTGTCTGTTGCTGGGTCATCACCACAAACTCTGCTAACAGGCAAACTCAATGACCAGAACTACCTCTCAAAATATCATTGCAATAGATAAAATATATTTCACCAACCACAGCTACGTTGTTGTATTCAAAGAATTAATTTTCA---TTTTGCTTATGTTGTAGAAATGGGGCTCTGTGCCTTTAAATTTCATCATTACCTAAGTGAAATAGAGAAGATATGGGGGAGGGGTTACTTCTCTTTGATTTATTTAGCCCTAACATCC s rheMac1.SCAFFOLD85456 19315 2681 - 81052 GAAAGCTTGTAAATATTCCTGAGTACCAGAT-CTTTGTCACATAATTTTGCAGTATCCTCCCACCACAGGTATAGTGAAAACCTTGCACTAGGGCTCTGAGTTTGATCATGTAATTTGCTTTAATGAACAGAAAATTACTACGCTTTACATCGAAATTTGAAATGG-TTGCATATTAGGCTTTCTTGCTCTTTTCCATTTATCATGAGAACATGTCCACACTAACATACTGTTTCCAGAATGAAAATGAGTAACTCATGGAGTCACATTGCCCCTGCCTGACCCAGTCTTAAATCAGCCAAACTTTAACTAGATCCAAGAGGCAAAGCTTGAAACCTCTCAAATCACCAGCGCCATCCACAAAACCCCAGCTTAAGAAAACAGAATCCAAAAGCATGTGAGATATAAATATCTAATGTGGTTTTGGAGAAGTTTCTTTTGCAGAAAAAGCTAAGTGATATAGACACTCTGATAAAACAAGAGTGTGAGAAATATGTGCACCCTTGTTGTGTCAGAAATTCAGGAGCCGAAGGAAAAATAGGTTGGAAATGTCAAAGTTTTTGTAATATGAGGTAAATATCTAAAACTAGAAGGAAA---TGTTGGGAAAGATCTGGGGGATGTAGGTAATAGCATCTCAAATTTCTCCATTTCGCAACTAAAATAAGAA----TTCACTTTAGCTCTCTT-GATTTGTATAAGAATGTACGTAAATGGTGGATTTTTCCCCTAAGTATAAAATGAGCAGAGCAATTAATAATTTTTATGTGACATTTATCCTAATTTGtaatttttaaaataaaattataataCACACTTTGAAATGGGCCAAAACAAAAATAGGaa--agagcaatgtatcataaacagtcatgtaaccattacacagggtaagacatggaacactgcaaacagactaggtccacttccaggccactttcca-agcgcctaaacctttattcacatctcctgagacaagcaatattcgtaatctatgctgatcatttccttgaatttctttatgctttaccaactaggtttgcaaccctaaactccacagcttggtctgttctgctttgaactgtgtataggtgcagtcctgtgtgttcttcttgttcatggcttcttgcactggacatcatgtttctgaaatttagttacatagttgcatgtacatgtgattcatttcttttcacctctctatattgttccactgtatggatttactgtaatcatttatatcattcaatcatccttagttaatatatattttgggcagtgtatttttgagctattatgagtaactctactatgagtattatttcacatatcatttgaagcaATTCCT-------------------------ATTACAGGGTCATTAAATGTGGTGTTCAAATTCTCCTCATAGACATAGAAAAGTACAAACAATAATTTAACTAAATTTGTTCCTGTCACCTTTACCTCCAGTCTCTTTGTTGCTATTTGCATATATCTTATCAATTACATATTTAACTCAACAAGACGttattttattcagtcaacattcattaagaattatgcacatatttatcatatctgctaatttttattccttcttgcaagtttaaccttgtattttcaatgttttttattttagctgaaaaatatca-tttagatttctgtttatgcaggtcCTCTATTCTTTTGAaacacactgaaga---------catgattccattgaattctaccttccat-ttttctgttgaaaatcagttttcatttagaaagttgttccttttaaaataatctatcttt-ttctctgggcacttttcagattttctattggtctttgatgtcctgTGTCATTTTATGTTAATTTGTTTTTAGTTATCTTGTCTGAACTTTGATGGTTACTAAAAATATATGGATTAATACATTTTATCACTTTTGAGAAAATCTCCACaacattgcttctaccctattttctcccttttaatcttccagaaatccaaaagtatgttagatcctctgattctagcatcaatgcctcttattctcttagttttgcat-tctctgtcttgtggtctctttaggcttcattctttgtagttgtcttccagttcactaattctctcttctcctatgtctaactggttgttaactctttgtttattggattctcaatactgactatttatttttTGC--TCTTATCATTTTAGTAGCAGAAATAATCTTTTGTTCTCCTTCTATAAATCATTATCTATGGAGAAACAGAACAAAGTACTCATA--ACCAAGTTTTTTTTAAAAATGGGGTTCTTTGGTTGGTTGGTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTGTGCTTGATATGAAAATGATAACAATTTTCTTCTTTTCCCAAGACATTGGTCACAAAATAGAATAAAAACTTGGTCTACACATCCTCCCACAAGTTGGAAGAACCTGGAAATTGATGTGATGTGAG-----------------TAGCTTGTCTGTTGATGAGTCTTCACCACAAACTCTCCCCACAGGGAAATTCAATTAGCTGTGCTGGATTTCAAAATGCCATTCCAATAAATAAGTTATAGCACCTCAACCCTAGATACATCATTCTGTTTTACAAATTAAATTTTACTCTTTTTTTTAT-TAGCAGAAGTAGAGCTCTGTGCCTTCAAACTTCTTCATTATC-AGGTGAGATATAGAAGATAT----GAGGGCTTACTTCTATTTGATTTATTTAGTCCTAAAATTC a score=21965 s hg17.chr12_random 10933 410 + 466818 TTACTTTATAAATAAGAGCTTGATCATGAAATGGTTTATTTATTTTTCCTATTAAGCAATTTTATTTATACTAAAATCAAAATCTTTTCATAGTGTTACATGGATTAGTTTAATATAATTTATAATTGTTTCCTTAAGCATTGTATTTTAAACTACACTACACTTAACTTTCTAAATCTAAATGTATTCAGCCTGACTTGAACTTTGCTGTTTACTAATATAACTTTCCTACAATGAT-ATCTCTTAGAAATTATGCAGACATTAACCAAATTATGTATGTAAATATTTCAAAAATAAATCATTTAATAAGACAGATGTAAATGTAGA-TGATGATAATGATGATGTCAGCTAAAAGGTAGAATGTTATTTAATAAATGTGATTTTGGTTTTCTTTTAAAAGCATTAGAGTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 22470 405 - 81052 tCACTTTAGAAATAAGAGCTTGATCATGAAATGGCTTATTTATCTTTCTAATTAAGGAATTTTATTAACACCACAACTAAATCTTTCTTATAGTGTTCCTAAGATTAGTTT------ATCTATAATGATTTGCTTAAGCAATGTATTTTAAACTAAACTATACTTAA-TTTCTAAATCTAAATGTATTTGGCTCAACTTGAAATTTTCTGTTTACTAATGTAACTTTCCCACAATGataatatttttaaaatttattaGACATTATCCAAATTACGTATGGAAACATTTCAAAAATAAATCATTTAATGAGATAGATGTAGATGATGATTGATGATGATGATAATGTCAGCAAAAAGGGGCCATACTCTTCTATAAATATGACTTCAATCATGTTTTCTAACTGCTATATTT a score=21553 s hg17.chr12_random 11343 299 + 466818 AAGGTTGGTGGGAGAACACTATTATTCTTCCTCATAGATACACAAttttttttttcgagatggaaattctctcttgtcacccagtctggagttcaatggcacaatcttggctcacggcaacagctgcctccctggttcaatcgattctcctgcctcagcctcccaagtatctgagattacaggtggctgcaaccacacccagca---------------atttttttttattttttgtagagatggggtttcatcatgttggccaggctggtctggaactcttgacctcaggtgatcggccagccttggcctcc s rheMac1.SCAFFOLD31009 12065 313 - 42162 AATGGTGGTGGGAGAACACTATTATTCTTCCTCATAGATTCACAttttttttttttaagacagaatttctctcttgtcacccaggttggagtgcaatggcacaatctcggcccactgcaacctctgcctccctggttcaaacaattctcctgcctcagcctcct-agtagctgggattacaggtggctgccaccacacccagcagttttttttttttttattttttttttttttttgtagagatggaatttcactatgttggcaaggttggtctggaactcctgacctcaggtgatccaccagccttggcctcc a score=56733 s hg17.chr12_random 11642 1226 + 466818 tagagtgctgggattacagacatgagccactttgcccagcATAATTCCGATATTATTCTCAGAATCAGGCCTTGACAAATACCCTCAACTAGCATTTCATCAAGAATAACATAAAACCAACATATTTCCAGTGATTTACTTGCTATTT-TTTTCTTCTATTGCATTCTAAAAATTATGCCAAAAGTGACCTCCAGCAAAGAATACTCTTGTTCTGGCTGTTTAATT-TTGTTCCACTTCCATATGAACTTACACAAATACTCTGTGCAATTATGAAGTGTATAAGCTTCATTTCATCTTTTAATAGCATCACTAACAAGTTAAATTCTCTCAACTGCTTAATTTCATTCTCAGCTATGGTCACAAAATCTGGGTGATTTTATTATAGCAGTCAAAGTA-----------------------------GTTACACTACATATGTTTTAAGGCTTAACAAAATTATCTTTCTATGAATTTTTCTTGAATAT----TCAAAAAATTTGTAATATCAAAATATTTTTTC--ACACATGTG---TACACATGCATGGTATTAAAATCTTTGAATGGTAAAAA-ATGTGTATAATTATTTTATTTAGGGATAAATTTAG-AAAAATTGTCATGTATATTTAATGTCTGT----------------ATAACTATAATTTATTGGAAATTCACTACTTTCTGCAACTTTGAAATGT-TATCATAAATAATTAAATTGGAAAGAAGAAAAAAGGTGTCTAGCAAAATACAGATGCTCAAAATCTGATGTTTCAAGGTAAGAATAACATTAAGAAAGTGGAGGTAGACTTCCTGCTTACCTCTTCCTTTTTTAAATTAA----AGAAAAGTTTAAAATTTTTCTTGGATTTCTTACTATCATAATGCTGTATTCTTCTTTATTCAGCAAAAATTCTAATTACAATGATGTCTATAAGAATATGTT-TTTTCAGCCT-ATTTTACATTCATTCATTTAGTGTATGTTTCTACTTTTTAAATAtttttattattgtgaaacataacatacatatatatataaagtaataaggtctaaatgtacagtaa---agaaaaaacttatagcattaagagtcatgattccacatcatggtcataaagtagaattcaccagcaatccagacactctccatatacgccttcttgttgataacatttcccttttgtttcctccatccctaccatcccaattgttatgataatcattcatatgtctcactttagaatttcaccaccagtgtaataaatttcaatttattaaaaat s rheMac1.SCAFFOLD85456 22875 1250 - 81052 TAGGGTGATGGACTCATGAACTTG-------------------TTTCTTACATTATTCTCAGCATGAGGCACAGACAAACATCCTCAGACAGTATTTCATTACGAATAAGTTAAAAAAAATGAGTTTCCACTGATATACTGGCTGTTTCTTTTCATTTACCACATACTGAAAATCATGACAAAACTGCCCTACAACAAAGATTCTTCTCCTTTGGGCTGTTTAATTATCACTGCACTTTCACATGAACTTACACAAATCGTCTATACAACTATAGAGCATATAAACTGTATTTTATCTTTTAATAGTATCATTAGTAGGCAAAATTCTCTCAACTGCTTATTTACAATCTCAGCTACTGTCACTAAATCTGGGTTATTTGATTATAGCAGTCGAAGGAACACTACAGATACACAAGCACATTCAAAGATTACACTAGATATGTTTTATAGCTTAAC--AATTATCTTTCTAGGTTTTCTTCTCTAATACAGAGTCAAACAATTTATAGGAACAAAATATTTTCCCCAACACATATGCCATGCACATGCATAGTATTGTGATCTTTGAATGGTAACAATATGAGTATAATTATTTCATTTAGGGATAAATGTAGCAAAAATTGTCCTATATACTTAATATCTATAGTGCTACATACTTTAATATTTGTACTTTATGAAAAATTCCCTAATTGTTGCCAATCTGAAATGTGTATCATGAAAAATTAAATTGGAAACAAGAAAAAA---GTCTATTGCAATACAGTTGTTTAAAATCTGATGTTTCAAATTAAGATTAGCATTAAGAATGTGGATGTACACTTACTGCttatatttttctttttgaaattaatttttaaaaagtataaaattttaGCCATATTTCTTACTACTATAAAGCTGTATTCTTCTTTATTCAGC-AAAATTCTAATTACAATGGTACATGCAGGAATATATTAGTTTTAGCCTAATTTTACATTCATTAATTTATTTAATATTTCTGAGTTTAAAATAttttcattattctggaaccta----acatatgtagggaaagcaataaaatctaaatgtacagtaagaggaaaaaagaatgtaacattaacactcat-attccacaccttcgtcaaaaaatagaatttgtcagcaatct-gacattccccatatatgctttcttgttgatataatttccttgttgtttcctccctcccaagtatccca---gttacgataatcacttatatcttttactttag--ttttgccaccaatgtaataaa--------taataagaat a score=4704 s hg17.chr12_random 12868 108 + 466818 atatttttgtaaactttatataagtggaattatactgAATCATTTTTCAAACCTAATAATTCCTCTCATA----------------TCTATGAAGTTCAAATTTGTTCATTTTCCTTTTTATTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 24578 122 - 81052 ATATTCTTGCAAATTTCATATAAATGTGATTATATTGAAT-GTTTTTCATGT-TAATAATTACTACTATAGCTGTATATATTGCTATCCATGTAAATCAAATTTATTCATTTTCCTTTTTTTTT a score=658 s hg17.chr12_random 12977 29 + 466818 TGTTCT-TTGTAAACATGTTGCTCTAGTTG s rheMac1.SCAFFOLD85601 14626 29 - 44828 tattctgttgtaaac-tgtgagtcttgttt a score=24774 s hg17.chr12_random 13006 383 + 466818 GTTCTGCTGGGACAATTAAGTTCC-CTTCAAAGACTCAACCTTCTGGCCAACAGTTGCAAATGTTGTAAATCAATCCTACCTCACACCcctccttctttttgcaaatcctgcatttaccctatttggaaaagtttaagtcttagccaatcaggatcagtttagatagcacggtccaaccccagccaacaggagaaggacacagaaacaggaactgtgttaggattaaaaactccttccctcctttgttccgtgggctcttgggattgtaacgggcacaagcagcacccttctgcacccttctgccaaagtaaagatgccttgctgagaaattttctgtcgaagtgttggtttcttttgtctactctgagcacttgcttccaaca s rheMac1.SCAFFOLD31009 25686 365 - 42162 GTTCTATTGGGACAACTAAGTTCCTCTTCAAAGACTCAGCTTTCCAGCCATAAGTTATAAATGT---AAATGAATCCTACTTGTCACCCCTCCTTCTTTTTGAAAATCAtgcatttaccctatttggaaaagtttaag------ccattcaggatcagcttagattgtgcagtccaactccaaccaatagacaaaggacacagaaacaggaactgtgttaggattaaaaactccttccctcctttgttaggtgtgctcttgggattgtaacaggtgcaagcagcacccctccgc----------caatgtaaaggtgccttgctgagaaattttctgtccaagtgctgatttcttttggctactccaagcacatgtttccgaca a score=8064 s hg17.chr12_random 13389 131 + 466818 gttcattttgattgctgtatagtatactattgtacaagtatgccataatttacttatccattta-atcactgatggacatttgatagacttctcaactt-agctattaaaactcagtgatatgcatgtgtgtc s rheMac1.SCAFFOLD85601 14655 133 - 44828 gttaattttgatcactgtgtagtattccatgatataagtatgctgcaatttgtttatccatttggagcactgatagacatttgaaggacttctcaacttcagctattaaacctcagtgatatgcacgtgtgtg a score=11111 s hg17.chr12_random 13520 195 + 466818 tatatgtattCTGAtaaggatacaaatactgggtcttcagatgtgatccatcatcttaatcagataatgccatactcagacaaactaactgctctgatttacaattctaggagcagtgtatgaaaattcccattacttcataagctttccaaaataagtaacatcagaataatttttac-cTTTAATATTTATATG s rheMac1.SCAFFOLD85456 26109 186 - 81052 TATATGTATTCTGAtatgagtgcaaatcctgggtctgaggatgtgatccttcatcttattcaagtaatgccacactca----aagcaattgcactgatttataatcctaagagcagtgtatgaaaattcccactgcttcatatgctttctaaAATTAGTCA------AATAATTTTTGCACTTTCatatttatata a score=9613 s hg17.chr12_random 13715 149 + 466818 AAACATTATTAAACCTAACATTTTATAAGCCTTTTTCTATTATGTTTCAGAATGTATTCTTAATTCAAAAAT--TGTTACTCTTTTTAAATTCCATGACCATGACTTCATGCACATTTATTAATAATGAATTACAtatttcatttatttat s rheMac1.SCAFFOLD85456 26608 149 - 81052 AAATATTATTAAACTTAACATTTTATAAACCTTTTTCTATTATAATTCAGAATGTATCTTTAGTTGAAAAATTATATTACTCTTTT--AATTCTATGACTATAATTTCATGCACATTTATTAGGGATTGATTATATATTTCATATATTTAT a score=20481 s hg17.chr12_random 13864 334 + 466818 ttatttatttatt-------catattcttttttcttttcttttcttttttggagacagagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcatgatcttggctcactgcaagctctgcctccc-agaatcacgccattctcctgcatcagcctcctgaatacttgggattacaggggcctgccatcacacccagctaattttttttttcttggtatttttt-gtagagacagggtttcaccgtgttagccaggatggtcttgatgtcctgacctcgtgatccacccaccttggcctcccgaagtgctgggattacagctatcagccacgacacccaaccC s rheMac1.SCAFFOLD85601 15126 336 - 44828 TTTCTTATTAGTTTTTCTAATAttttttcttttttttttttttttttttttgagacggagtcttgctctgtgccccaggctggagtgcagtagcgcgatctcggctcactgcaagctccgcccccctgggttcacgccattctcctgcctcagcctccagagtagctgggactacaggcgcgcgccacctcacccggctaattttctt-------gtattttttagtagagacagggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcatgatccgcccgtctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcttgagccaccgcgcccggccA a score=79720 s hg17.chr12_random 14198 1511 + 466818 TTATTCATATTCT-TTATTACTTTTCCTAATATTTTTCTTCAAGTTTTAAATACTGTTTTGTTATGAACAAGTATAATTATGCTAGACATATTTCCTTTAACCAATCATTATGTCAAATGACTTTGAGAAA-TATGATTTGTTAACAGCATACTGTAAGGCAAATTTCAGCATTGTTTAACAACTCCTTAAAAGGACTCAAAGAAAATAATATGTTGAAATATCAAAATAGTCTTTAAGTACAATGA-AGGTGCCCATGGGAAAATACAAATTCTACCATTACTGTTATGGAAAAAAATGGTTAGTAGTAAACATACCATGTCTGAATT-TTTTTAAGGCAGGCCTAATATCAAGGCCTAATGGACAAGATTCCCTTTAAGGTCCTGACCTTAATTTCTATGTGTACCTGATTTCTGATTGTGCAGTAATGTTCTGGTTCCTTTTAAATTCTCTGACTAATGTCAAAACGGAAAGCACCGGGGCATGCTATTGAATGAGTTCAGGGCTGACTTAACGGAAAATATGATAATTTCCAAAACAGCTGAAACTGACTCATATTCAAATACTATGTCCTTGTTATAA-----AATGTCTCATACTGATGTTGAAGTGAAACCTGAATTCTCAATTCCAGGCATACAAATCAAGTCATATTCTTATTCATCATTTTGAAAT-TTTTTCCTTGTTTAACCTGTCTATAATTTGTGTTCAGCAATGTCGGTTGTTAGGGAAATTTTCCAAACTAATACATAGATCATACATTGGATGCCTGCACTGTTATATGTAGCTTGGTCAAAACTAGAGTCATGACCACTGTTGATTCATTTTTTCAATGCCAGGTTTATGGAAAGTGAATCCTAAATTTTCCTACTAAAAGCATCCAAGGTTTTCTTTGGAAGCCCAGGAAGGCCAATATTCCTTAAAATCTGGTTGCTGTTAACTAATAGTTTTGTATAA-CTTATTGTTAACAAGCTCATTAACATAAACACATTCCCCCCCCCACACACACACCCCTCATGGTTGAG-TAAATTATTGTCCTATAATTTCTAAAATGAAAAATTA----------------------------------ATTTTCTTACTTGGGCTTTTCAGCGCATT--TTCAATGTTTA--------------TCAAGCTTAATGTCTC--ATGCTTAGGCCTTTGACTAAGTTTTTCTCTTGAGTC---TAATACTTAAATCTTAGTTATTTAATGAAAATATTCAGCAATTTTATAACTATTCCTCGGACACTTAAAAAA----------CGTGTTCCATTGAAGAGTCTACACTTCTCTGTGTATGAATATTCAGGTTTATTTTTCCCTATTTAATTTATTTTTGATTATGAAATGGTTTAAAATAGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTC-TTTTCAGTTTTtatagtataatggtttctaagaggggatcttgaagtcagactgccaagacaggaaaccagattccctgcttcatataactatgatg-tgagactccattttacaactactgcctgcctcagtataattacctataaaaaggagacgata s rheMac1.SCAFFOLD85456 26757 1560 - 81052 TTGTTCATATTCCATTATTGGTTTTTATAATTTTTTTCTTGAAGTTTCAAATTCTTTTTTGTTATGAGCAAGTGTAATTACACTGGAGATATTTCCTTTAATCAATCTTTATGTCAAATGACTTTGAGAAAATATGATTAGTTAATGGCATATTGTAGTAGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTCCT-AAAAGGAAACAAAGAAAAAA---TATTAAAATACAAAAACAGTCTGTAAGTTTAATTATAGCAGTCCATGGTAAAACACAAATTC---CATTACCAGTATGGAAAACA-TGATTGGTAGTAAACATACCATGTCTGAATTCTTTTTAAGGTAGGCCTAATTTCAC-------TGGACAAGATTCCCTTTAAGGTTCTTACCTTAAACTCTATGTGCACCTGATTTCTGAATGTGCAGTAACACTCTTGTTCTTTTTAAATTCTCTGACCAATGTCAAACAGAAAAGCACCAGGGCATGCTAATGAATGAATTCAATGCTATCTTTGTGGAAAACTTGATAATTTCTAAAACAGCTCAAATTAACTTCTACTCAAACACTATGTCCAGGCTATAAGATCAAATTTTTCATACTGATGTTGAAGTGAAAAATGAGTCATCACTTACTAGCATGCAAATAAACACATATTCTGTTTCATAGTTTTGCAGTATTTTTCCTTTTTTAACTTCTCCATAATTTGTGTTCGGCAATGTCAGTTGTTAGGGAAATTTTGAAAACCAACACATAGATCCTACATTGGATATCTAAACTGTTAAAAAGAGTTTTGTTGTAACTGGAATCATGACCACTGTGGATTTATTTTTTAAATGTCAGATTTATGTAAACAGAATCCAAAGTTTTCTTGTCAAAAGAATCCAAGGTTTTCTTGGGAAGTGCAAAAAGACCAATACCCTTTAAAATCTGCTTGCTG----CTAATATGTTTGTATAAGTTTATTGTTAACAAGCTCATTAACACAAACACA------CACATGCATACATGCCCCTCATGGATGGGAGGAATTATTGTCCTGTAATTTCCAAAATGGAAAATCAATTTCAGGCAAGTCATCCAGGTTGAAATAGCCCTATTTTCCCATTCACCCTTTTCAGTCAATTGCTTAAACTTTTGAATAAGTTATTCTCTCatgcttaagcttttgaatgcttaagcttttgaatAAGTTATTCTCTCGAGTCTAGtaatatttaaatatgaattgtttaattaaaatattCAGCAATTTTTAAAATACTCCTTGGGCCCTAAAAAAAAAAAAACATGTATTTTCCATTGAAGACTCTAGACTTCCCTCGGTATGAATATTCACTTTTATTTTTCTCTGTTTAATTT-CTTTTGATTACTCTATTAAGAAGAATAGATGTTAGTATTGGTCTCCAATCTTGTATTTTATTTCTTTTTCAGGTTTtatagtataattgtttccaaga---gatctcggagtcagactgccaagagaggaaaccagtttttctgcttcatatagtgatgattctgagattccattttacaactactctctgcatcagtatgatcacc-aaaaaacgcagatgata a score=10131 s hg17.chr12_random 15709 555 + 466818 ggccgggtgcggtggctcaggcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggtgcatcacctgaggtcaggagtttgaaaccagcatggccaacacggtgaaaccctgtctccactaaaaatacaaaaagt-agccaggtgtggtggcacatgcataaaatcccagctactcaggtggctgtggcagaaaaatcattggaacccaggagtgggggggttgtagttagttgagatcatgccactccactccagt-ggggagaccgtgcaa-actccatctcaaa----------------------------------------------------------------------------------------aaCACCACCACCACCAACAAAGGGCGATG----------------------------AAAATACAACTG------------------------TCTTTGGTTA-------------------------ATTTTGTTAGGAGTTAATATACT----------------------ATTTGTATTACTACTTTCA---------AGTTTACCTCTTAT--------------AGGCAGGAACCAAAGA--------TTGTTCATT--------------ATC---GATTCGATACTGT----------TTTACTTGATATTTAAGATACCAGTGAGAAGT---------------TAAACTT--------------------Gttttttttttttctt-ctgagacacagtctccctctgttacccaagctggagtacagtggcacaatcatagcccactgcagcct s rheMac1.SCAFFOLD85456 29119 830 - 81052 ggccgggtg-----gctcacagctgtaatctcggcaccctgggaggccaaggtgggtggatcac--aaggtcaggagatggagaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtctctattaaaaatacaaaaaattagctggatgtggtggcgggcgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatgatgtgaacccgggag-gcagagcttgcagtgagcc-agatcccgccactgcactccagtctgggtgacagagtgagactctgtctcaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaataaaaataaagttgcagaattacaatttctgatttcaaagcttattacaaagctgcaattatcaggatggtgtggtgttggcattacagtagacaaaaagaacataaaacataactgagagtctagaaattaacactgacgttcatggtcattgagttcaaaaagactaccactgcagttgaataggaattaataattttttcaacaattgataatgagaaagttgaataatcacatacataaaaaatgaatttatatcctgtttcatatcataccaaaccaaaaaaaaaaaaactcatatttaatcatagagttacatgtgaaatctGGGATTAGTAACTGAGATACAAACATATATTAAATGTACCAAATGCAAGTAATAAATGTTATGGGTGCACCCTAGATTTTGTAGTGTTtttgtttgtttgtttgtttttgtttttgttgagacacagtctcactctgtggcccaggctggggtggagtagtacacacttggctcactgcagcct a score=212780 s hg17.chr12_random 16264 2906 + 466818 tgaactcctgggctcaagcaatcctcctgcctcagcttcccaagtatttgggactataggcatgcaccaacatgccagctaattttttaaattttttgtagagatggagtttccatatgttgcaaagggaactcctgctctcaaggggtcctcccaccttggcctcccaaagtagtaggactacaggcatgagccatgacatccagccTGCATTGAGAGTTTCTGAAGGTCAGATGCTACCTAGAGCTTTGGCTCATGTCCATCCCAAGGTGGAGCTAATCAGTTtgtagttattacctcttcctgaaagtgtaactgaaatggatatgcatggcagctggcaggacactcacattattcgtgaactgtggagtaagggacattattatagcaggaccaaagggaagcctctgaaattctcctctactggcaacacaatgtacaaaatataataaccgcattccctaaggaatggaactggtcactgccatgacaaaacacttgcaagttacaggggatggtagtcctttctataacctgattcacttaacctatctggcctctaccaaaaccagatggattacagaatcaatgcagactaccatgaacttaaataaacactcacaaatgctttccaggatgtgctgtcttcactaagcagagcagagcttctggtactttttaccgggcttgtgatttggtgaatggttcttaatctacacccattatgaggaaaaatcaaaacaatttgcctcgttttataataataataacactgt--cactgtttta-tatcatggctatgtcacttctgttctcagtttaatttacattttttaaaa--catcgtgattatttaatatattaataatattacagaccaggccctgtggcacatgactgtaatgccatcattttaggaggccgacacgggaagatcatttgagcccaggagtttgagaccagcctgggtaacacggtgaaatcctagccctacagaaaatacaaaaattagccaggcgtgatgttgtgcccctgcagtcccagctgctagcaatgcagaggtgggggaatcacttgagcccagaaggttgaggctgtaatgagctgtgatcctgccactgaactccagcctcagggacagaatgagaccctgtctcaaaataatagcaataataataataatatattacttggtacaataatcaggaagtggcaagtttcttaactatagtaaaatactctaacgatgaatggaagtaaaataccagaagaaaagaaatcaacctgagaagattcagggacctacagcataggtgatgttttaaagcattcagtgtccctagaccacacgttgaaacaatctttttt-acagtatatggcatgttgctctctctataaatttcctatcactacaaaagagacccagtattttgggggcctattgggattttggagacaacatattccacatttgagaatatagctctgactcattaatgaagtttccca-ggctactggtctcaagcagaatccagaacaaaagtgggctctacagaagatatggactctgctccaagctgctctggccactgtgccagatgatccagcaggattcaaagatgctagaaacatacatagtggtcattataggactctgtgcatgtctctgacaagcctgtaggagacaggagagcaaatccctatggaattagtgcaagaacattccctcttcagcagaggagtatcctctgtgtgaaaaacaAAACAGCAAGTGGAGAACATTAATCCAAGCATAGAGTCCCTCTAAACACAAGTCCCTATAAGCACAAAACCCTATGCAACTGTGGACGTCATATGCTCATAAAGCCAGCCATGACTGGAGGGTATGAGCACGCCTCAGTGGCACAAGGAGTGATGGTATTGGACACAAACATGTGCTTTCTTAGATTCCCTTCACTATGTCCTATTCCCCTGGCTAGTACCTTGCCCGATCCAGGTCATCATTCCATTTGGgacttgaatgcatcaccacactgtgggcataaggtatgactttcatgaccaccaccaagggactggatgatggaagacagaacaacagagatgatagttctgcctcaaggaaaccctgaccaataagaaatagaagactaatgacagccgagcagatacattctccctcctctctcacttccacggactaatgccagctgtggtttccccctgtagcccttctggaaaaagtgctggaagccaagtacacgcatctgatgaccgtcatgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcagagccataccagacatcaccacacattgtttcacatttcttcctgtctcaatttccacacgtccttgccattttt-gtcttgaatttgacttctaaataaatgttagcactttaatAACAGGTATTACATTAAAAACATTTTGGTAAAGTAGCTGGTTACTAACTCAATTTTTTGAAATGAAATGCCATTTT-ATTTAAATAG---TCAACTAGAAAATATCATAATACAAATATATAATTCACAATAGAAAAAAA-----ATTCAAATAGACCAAAGTTGTTTATATGATTTTTCAAACTATTGTAATAGGTGCCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCTCCAACTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTATATTATTGTGATATTTCCCCTAAAATTGTGGAATAGCCAAACTTTTCCTTAGAGGAAGGATTCTGCTTGGATAAGCCTGTAATCTTAACCTGAGACCGGAACAGGGGAATTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTCCTTTTCATTGGTTTACCACATCAGCTTACCCATTTTAGCCACCCATTTATTTGTTCATTAAAGTATTA-----------------------------------------------------------ATGAACGTAAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 30090 2929 - 81052 tgaactcctgggctcgagcaatcctcctgcctcagcttcccaagtatttggaactatagacatgcaccaccacgccAgctaaatttt--aattttttgtagagatgaagttt--------tgcgaatggaactctggctctcaagggatcctcccaccttggcctcccaaagtactaggactacaggcaggagccatcacatccagccTGCAGTGGGAATGCTTGAAAGTCAGATGCTACCTAGAGCTTCGGCTCATGTCCATCCTAAGGTAGATGTAATCAGTTtgtagttattacctctccctgaatgtgtaattgaaatggatatctatggcagctggcaggactctcacattcttcctcaactgtagagtaagggacattattatagcaggacccaagggaagcctctgcaattctcctctactggcaacacaatgtataaaatataa---ccgcattccttaaggaatggaattggtcactgccatgacaaaacacttgcaagttgcaagggatggtagtcctttctataatccgattcagttaaccta-----------ccaaaaccagacgggttatagaatgaatgcagattactctaaacttaaatcaacactcacaaatgctttccaggatgtgctatcttcacggagcagagcagagcttctggcactttttacagggctcgtgatttggtgaatggttcttaatctacacccattatgaggaaaaatcaaa-caatttgccttgtattgtaagaataatagcactgtttcactgttttaatatcatggctatgtcacttctgttctctgttta-----cattttgtaaaaaacatcgcgcttatttaatatattaataatattacagcccgggccctgtggcacatgacagtaatcccttcaatttaggaggtcgacacaggaagatcacttcagcccaggagtttgagaccagcctgagtaacatggtgaaatcctaaccctccagaaaatacaaacattaaccaggtgtggtggtgttcccctgcagtcccagctgctagcaatgcagaggtgggagaatcacttgagcccggaaggttgaggccatagtgagctctgatcctgccactgcactccagcctcagggacagaatgagaccctgtctcaaaataatagcaataataataata---tatgagttggtacaatagtcaggaagtggcaagtttcttaaatatagt----------------gaatggaagtaaaacaccaaaagaaaagaaataaacctgaggagattcagggacctacaacataggtgatgttttaaagtgttcattgtccctagaccacatgttgaaacaatctttttttaaagtaattgacatgttgctctacgtatatatttcccattactacaaaagagacacaatgtttcagggggccattaggatgttggagacaacgtattctacatttgagaatattgctctgactcattacagaagtttccaaaggctactggtctcaagtggaacccagagcaaaaaaggactctacagcagatataggctctggtccaagctgctctggccactgtgccagatgatccagcaggattcaaagacactagaaacatacagagcgggtattacaggactctgtccatgtcactaacaagcctgtaggagaggggagagcaaattcctatggaattagtgcaagaccattccctcttcagcagaggagtatcctctgtctgataaGcaaaacagcaagtgcagaacattaatccaagcagagagtccctctaagcacaagcccctatAAGCACAAAACCCTATGCAACTGTGCAAGTCATATGCTCATAAAGTCAGCCATGACTGGAGAGTATGAGGACATCTCAGTGGCACAAGGAGTGGCGGTATTGAACACAGACATGTGCTTTCTTAGATTCCCCTCACTATCTCCTATTCTCCAGGCCAGCACCTTGCCTGAtccagatcatccttccatttgggatttgaatgaatcactgcactgtgggcatgaggtctgactttcataatctctaccaaaggactggatgatgtaagacagagcagcagagatggtagttctgcttcaggtaaaccatggtgaatgggaaatagaagtcaaatgacagctgagcagatagattctccctcctctctctcttccatggtctaatgccggcggtggtttccccttgtaaccttat--ggaaaagtgc-gggagccaagtgcacacatctgatgaccaccgtgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcagagtcacaccagacatcaccacacactgtttcatgtttgttcctgtctcagtttctacatgtccttgccattttttgtcttgaacttgacttctaaataaatgtcatcacttcaatAACAGGTGCTACATTTAAAAAAATTTGGTAAAGTAGCTG-TTACTAACTCAATTTTTTGAAATGAAATGCCATTTTTGTTTAAATAACAATCAACTAGAAAATATCATAATACTAATATATAATTGACAATAGAAAAAAATACATATTCAAATAGACCAAAGTTGTTTATATGCTTTTTAAAAATATTGTAATAGGTGCCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCTCCAAATCAGACACCTGATACAGCTTTATCAAGACTATATTATTGTGATATTGCCCCTAAAATTGTGGAATAACCAAACTTTTCCTTTGGGGAAGGATTCCGCTTGGATAAGACTGTAACCTTAACCTGAGACCGGAACAGGGGAATTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGCATTTCCTTTTCATTGGTTTACCACATCAACTTATCCATTTTATGCACCAatttatttgttcattaaagtatcatttttgaccatctattcttggtgctgggttctagttcctaggagtcaacagaaagcaagacaaacatgat a score=178806 s hg17.chr12_random 19170 2504 + 466818 AGAATTTAGCTGTGAACAGGACTGTACATTTCTTTCTTATAATAGAACTTCCTATTAAAGAATATGTCAACACCCTTTCATTTCATCATTGATGACAAAATTACAAAGTTACGGCTCATCCCATAATTAATACATAGGGTTCACAGATACTATTTTAACATTTACAAAAAGTTTGACTGAAATATTTTCCACAATTTCTATACTATATTTACATTGATTT---TATTTTTCAAAAAGAGAGGATTTGAG-----------------------------------------------TTCTCTTATCTGAAGTTTAGAAGGAATTTTACAAACGGAAGGTAAGGATATAATTAGCAAATCAGGGGCTTAAAAGTGCTTTAGAAAGAATACTAAAATAATTTACATGAGATCTCAACTTCAAAAACAGATTTTCTTTAATTCAAAAGC-GGAAGAAATGACGTTTCTAACTGCATATGCATAACTGATGATACCAATCAAGATCATGATCATGATGTTTCATCCCTTTATTAGAGAAGGAATTTTTTCCTAAGCTATTCACATA------TGAAATCTAATATTCCTCAGTACCGCTTATGGTAGACATACATTAAATTTACTCTGCATATGCTTCTCACTCAAATTCTATTGTGTGCATTGTTTTCTAACAATAATTCTCATTGCTTTTTACTAAACATAAAATAGAAATTCATAATGGAATAAAACACCGAGGATACATCCTCATTATTGATTTAGAATTGAATGACCTTACCATCCAATAAATTTGAGGTTCAAGCAATGAATTCTAAGCACAATGTGGTATATTCCTGTGGTTCAAATAACAATAGAAAAGAGCAATATTTTTCCGGGGATAAGCTCTTACTTCTTAATAATTATAAATAGACATTGCAAATTCTACAAATGAAATAAAAAATACATGAATGAAATAAACATGGCTTCAAAATTCTAAGAAGTTTTTGTCATATTTTGTATAATTTGGCAGTTTGTATGAAAAAACA-GAAAAGAGCATGTTGTTGTCAATGTT--AAGTTTTcatacacaaatacacacacacacacacacatatatatatatatatatat--------------------atatatatTTTCTA-GACTGCCATTGGGTCAAAGACTTTTCTAGGTATACGTTTGGAAATTATTCATACACATACAGTATAGAAAAACCAGTAAGAAATATAAAATGTTTCATACACCACCAGTTTGTTTCCTGCTAGAAGATACACAATGCCCCTCTCGTGAATCTATGGAGATGAAGTCTTCTCTCCTTTCACCCAGTACCTCATTTGCCAAAAAACTGAAAGAAAAGTCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCAAATCAGGATGAATGGGTGGATTGAAGGATAGCTGAATCTAATAGCTTTGCAGAACATGAAGACAGGTTTGTTTTCCAGACTTCCAAAACTCCAAACTGATATCATTATGGACAGAAAGTAAATGGCACATAACAAGAGGAAGGAGATCACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCTTGAGATCCTTTACCATGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTACACAAAGAACAGATTAACAGCATAAAAGATAGTAGGGTCAGAGTGAAGGGTACTAAGTTTGCTACCATGGTTACAGTCATATTTGAAAAGTACATTGCACTCTTCAATTTGATCTTCCAAGTCATGTTTCCTTCAAATTCTTTTGTCCGCACAATCTCATTCATGTTTATCACAAAAAGATGACAAGCCAAAAATAGCAAAGGCCCCAACAACATCACCAGAATGACACTCTTAACTCTCCTCTTTAAGTGAAGAAAAATAAAGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGGGTAGTAGCAAGCCAGTTGCTGAAATGGTTGATCACTGCCCAGATATTATAAGCAGTAGTTCTTACTTCTACACTATTAAAAGCTGGATTCAACACAGTTGAATACCAGTTTAATAATAATACCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACCGCCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAGGAGATCTTTTGTCTCTTGAACCACTCAATGGAATTTACCAGTGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAATGTAACCACTACCAGACTGGAAAAAATGATGGGTAGAAAAGTTATCATGTCTGAACAGACAAAAAAAATTTTTTTAAATGCTGGTGTtgtgtccggaattggttcctgcaggtgggttcgtggtctcgctgacttcaa-aagggagccactgaccttcacggtgagtgttgctgctcttaaagatggtgtggacccaaagagtgagcaacagcaaggtttattgagaagagagaaaggacaaagcttccacagagtgaaaggcaacccaggtaggttgccgcggctggctgaagccatgagcttttattcccttatttgtcccctcccattttccttttttgtcctatcagagtgcccttttatcaatcctccctccgactggctacttttaggatcctgttgattggtgcattt s rheMac1.SCAFFOLD85456 33160 2552 - 81052 AGAATTTAGCTGTGAACAAGACTGTACATTTCTTTCTTATATTAGAGCTTCCTATGAATGAATATGTCAACACACATTCATTTCATTATTGACAACAAAATTACAACGTTAAGGCACATCCCATAATTAATACATAGATTTCATAGATACCATTTTAATATTTACAAAAAGTTTCACTGAATTATTGTCGATAACTTCTATATTAATTTTACATTGATTTGTGTTTTTTTAGAAAAGATCTGATCTAAAAAGATCAGATTTATAATATTCCTTCTAAACTTCAGAAAAGAGATCTTTTCTCTTATCTGAAGTTTAGAAGGAATATTATAA-TGGAAGATAAAGATATAATTAGCAA-TCAGGCGCTTAGAAGTGCTTTAGAAAAAATACTAAAATAGTTTACATCAGATCTCAACTTCAAAAACAGCTTTTCTTGAATTCAAAAGCTGGATGAAATGATGTTTCTAACTGCATATGGA-AACTGATAATAGCAATCAAGATCATGATCATGGTTTTTCATCCCTTTATTGCAGAAGAGATTTTTTTCTAAGCTATTCACATACTTATATGAAATCTAATATTCCTCAGTACTGCTTATGGCAGACATACACGAAATTTACTGTGCATGTGCTTGTCCCACGAATTCTCTTGTGTGCATTGTTTCCTAACAATAATTCTGTTTGCCTTT-ACTAAACATAAAACAGGAATTCATAATGGAATAGAACCCCGAAGATACATCCTCATTACTGATTTAGAATTGAATGACCTTACCGTCCAATAAGTTAGAGGTTCAAACAGTGAATTCTAAGCACAATATGGCATATTTGTGTCGTTCTAATCACATTAGAAAAGAGCAATATTTTTCCTGGGATAAGCTGTTAGTTCTTAATAATGATAAATAGATAATATAAATTTTACAAATGAAATATAAAGTACATAAATGAAATACACATGACTTCATAATTCTGAGGAATTTTTGTCATATTTTGTATAATTTGATTGTCTGTATGAAAAAACACAAAAAGGTCATGTTATTGTGAATATTCTAAGCTTTCATACACACATAAACACACACACatatatatatgtgtgtgtatatatatttatatgtgtgtgtgtatatatatataCTTTTTAAGACTAATTTTAGGTCAATGACTTTTCTAGGTATACATTTGGAAATTATTCATACACGTATATTACAGAAAAGTCAATAAGAAATATAAAATGTTTCACACACCACCAGTTTGTTTTCTGCTAGAAGACACACAATGCCCCTCTTGTCAATCTATGGAGATTGAAGCTTCTGTCCTTTCACGCAGTACCTCACGTTCCACAAAACTGAAAGAAGAGTCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCAAATCAGTATGAATGCGTGGGCTGAAGGATAGCTGAATCTAATAGCTTTGCAGAACATGAAGATAGCTTTGTTTTCCACCCTTCCCAAACTCCAACTTGATATCATTATGGACAGAAAGTAAATGGCACATAACGACA---AGGAGATGACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCTTGAGAGCCTTTGTCACGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTACACAGAGAACAGATTAACAGCAGAAAAGATATTAGGGTCAGAATGAAGGGTACTAAGTTTGCTAGTATGGTTACAGTCGTATTTGAAAGGTACATTGCACTCCTCAATTTGCTCTTCCAAGTCATGTTTCCTTCATATTCTTTTGTCTGTATAATCTCATTCATGTTTACCACAAAAAGATGACAAACCAAAAATAGCAAAGGCCCCCACAGTATCACCAGAACGACACTCTTAACTCTCCTCTTTAAGTGAAGAAATATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGTAAGTAAAATATGCTTAGGCTAGTAGCAAGCCAGTTGCTGAAATGGTTGATTACTGCCCAGAGATTATAAACAATAGTTCTTACTTCTACACTATAAAAAGCTGGATTCAAAACAGTTGAATACCAATTTAATAATAATATCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACTGCCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAGGAGATCTTTTGTCTCTTGACCCACTCAATGGAATTTACCAATGCTATGAAACCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAATGTAAACACTACTAGAATGGAAAAAATGATGGGTAAAAAAGTTATCATGTCTGAACAGAGAAAAAGAAATTTTTAAAATGCTggtggtgtgtccagagttggatcccgcatgtgggttcgtggtctcgctgacttcaatgacggagacacacaccttcacagtgagtgttacagctcttaaagatggcacggacccaaagagtgagcagaagcaaggtttcttgtgaagagtgaaaagacaaagcttccacagagcaggaggtgacccagac---------------------------agctgttattcccttatttgtcccctcccattttccttttttgtcctatcagggtgctctttcttcaatcttccctgcgattggctacttttaggatccttctgatcggtgcattt a score=581 s hg17.chr12_random 21674 37 + 466818 tagag-----cgattggtgcattttaca----------------------------------------------atcctcttgctagc s rheMac1.SCAFFOLD85601 19931 88 - 44828 tacagagcactgattggtgcattttacagagcaatgattggtgcgttttacagagcactgattggtgcattacaatcctctcgccagc a score=52606 s hg17.chr12_random 21711 726 + 466818 tacagagcgctgattgctgtggttttacagtgcgctgattggtgcattttacaatccccttgctagcttcagaaacgttctccaagtccccacaagattcaggaagtatagctggcttcatctctcaATCTAATAAAACTGGGTGTGATTGCTTGAATATCCTGACCTTAAATTCTATATGCACCTGATTTGTGAATGTGCTGTGACATTCTTTTTACTTTTAATTGTTGTGACCAGTGT---------CAAGCCAGAAATAACCATGGCATGTTAACTGATGAGTTCAATGATCTCTTTATGGAAAACATTCCTATTTTCAAACAACTCAAATTAACTCATTCATTCACTGTCTGTTCTTGTTATAGGCTGGAATTATTCACACTGAAATTGACGTGAGACCTGAATCCTCATTTGCTAGTATGCAAATAGGGACATATTCACTTTCAGTGTTTGCAATTTTTCCTTGTGTAAACTCTCCATCATTTATCTTTAGTGACTTCAGTTGTTAGGGAAGTTTTGTAACTTAATATAT-ATATCATCCAGTAAATGTCTAAATTCTCAAAGGGAGCTTGGTCATAACTAAGATCATCACCAATGCGGACTTTTTTAAATCACAGATTTAAATACACAGAATCCTAACTGCTTTTATCAAAGGCATCTCAGATTTTCTTGAGAACCACAGGCAGGCCAATCCTCCATAAGATCTGGTTGCTGCTAATACTTTCGTATAAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 35712 730 - 81052 tacagagcactgattggtgc-attttacagagcactgattggagcattttacaatcctcttgctagctacagaaaaattcttcaagtccccactccatccaggaagtctagctggctttacttctcaATGTAATATAACT--GTGTGATTGCTTGAATATCCTGACCTTAAATACCATATGCACCTGATTTTTTAGTGTGCTGTGACATCCTTTTTACTTTTAATTGTTGTGACAAGTGTCACAATTTCCAAGCCAGAAATCACCATGGCATGTTAATTGATGAGTTCAATGATTTCTTTATGGAAAACATTCTTATTTTCA---AACTCAAATTAATTCATTCATTCACTGTCTGTTCTTGTTTTAGGCTGGAATTATTCATACTGAAGATGACATGAAACCTGAATTCTCATTTGCTAGTATGCAAACAAGGACATATTCTCTTTCAGTGTTTGCAATTTTTCCTTGTGTAACCTCTCCATCATTTGTCATTAGCGACTTCAGTTGTTAGGGAAGTTTTGTAACGCAATACATAACATCATATAGTAAATGTCTAAATTCTTAAAGGGAGCTTGGTCATATCTAAGGTCATCACCTATACGGACATTTTTCAATGACATATTTAAATATACAGAATCCAAACTGCTTTTGTCAAAAGCGTCTAAGATTTTCTTGAGAACCACAGGCAGTCCAATAATCCATAAGATCTACTAGCTGCTAATACTTTTGTATAAC a score=5077 s hg17.chr12_random 22437 72 + 466818 TTCATTATTCACAAACTCATAAATATGCACACAA-ATACACACGTGCACACCACTTATGAATGGAACAAATTA s rheMac1.SCAFFOLD85601 8804 73 - 44828 TTCATTATTCACAAGCTCATAAATGTGCACAAAATACCCACATGTGCACACCACTTATGAATGGAGCAAATAA a score=273 s hg17.chr12_random 22509 3 + 466818 TTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 36442 3 - 81052 TTT a score=23996 s hg17.chr12_random 22512 325 + 466818 TCTTGTAATTTCCAAAATAAAAAATGAGTTTCCAAGAGGCTGTGCAGATGAAATTAGTCCTATTTTCCC------GGGTTTTCAGCCCATGAATAATATTTATTTATCAAACATATCTCTAATTCTTAGGACTTGGTAAAGTTCGTCTCAAGTCTAATGtttaaatatttattattatacaaaatatttaGCAATTTTATAACAATTCCTGAGTACCAGACCCTTTGATATAGAATCCTGCAGTATCCTCCTATCACAGGAAGACTGACTACCTTACCCCTGAACTTGGAATTCAATCATTTCACTTATTTTGATAAACAAAAAATTACTA s rheMac1.SCAFFOLD85456 36582 330 - 81052 TCTTGTAATTTCCAAATTAAAAAATGCATTTCCAAGAGGTT-TCCAGATGAAATTAGTCCTATTTTTCCCACTGAGGGTTTTCAGCTCATTAATAATATTTATTTTTCATACATATCTCCAATTCTTAGGATTTGGTAAAGTTTCTCTCAAGTCTAATGtttaaatatttattattatcttaaatatttagcaattttataaaaattCCTGAGTAccaggccatttgatatataatcttgcagtatcctcccatcataggaagactgactacctttcccctgaacttggagttcaatcatttaacttgctttgatgaacagaaAATTAATA a score=3888 s hg17.chr12_random 22837 46 + 466818 CAGTTTGCATAGAGATTTGAGATGGCTTCCATACTGGGGATTCTTC s rheMac1.SCAFFOLD85601 9211 46 - 44828 CACTTTGCATAGAGATTTGAGATGGCTTCCATGTTGGGGATTCTTC a score=203846 s hg17.chr12_random 22883 2740 + 466818 CTCTTTCCATAGAGATTTGAGATGGCTTCCATACTGGGGATTCTTCCTCTTTCCATTTACCATGAGAATATCGCCTGGCTAGTACACTGTTCCCAGAAGAAGAATGAGAAACTATTGAAGTCAGATTGCCGCCACCTGATCCAGACTAAATTGGCAAAACTCTAACGTCCTCCAAGATGCAGAATTTGGCCCATCTCAAATCACGACAGCCATCCACCAAACCTGGCTTAGAAAAATAAAATCCAGGTCCAGTGCAGGCAaggctgaggaaggcagattatgaggtcaagagatggagaccatcctggccaacatggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaattagcagggcatggtggtgtgggcctgtagccccagctactcaggaggctgaggcaggagaatggcgtgaaccccggaggcggaggttgcagtaaactgagatcacgccactgcaccccagcctgagtgacagaccaagactctgtcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCCCGACGTCAAACGACATGTGAGATATAAATATCTAATGTAGGTTTGGAGGGTTTTCTCCT-GCACAAAAACATAACTGATAAAAGAACTCTGCTAAACCAAGAGTGTGGGAAATATGTACATCCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGAGCCAAAAGAAAAAATAGATGGGGAAT------GGCAAAGGTTTG-TCCTGTGAGATGGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAAAGATCTGGGGGTGGCAGATAACATCATCTCAAATTTTCTTATGTTGCAACTAAATAAGAAAGTTCCTATTTCAACTATCTTAGAATTGTGTAAGAATGTATACAAATATTTGATATTTCCCTTCGGTATATAATGAGATGAGTAATAATAATTTCTAT-----ATTTCTCCTAATTACAAATTTGTATATTAAAGTTATAATGCGCACTTAGAAATGAACCAATACAAAACTGGGAAATTCCACAGTGTATCAtaaacactcaagtaactatgatgaagggcaagacaaggaacacctaaaacaggctagatccacctccattccactttccaagtccctaaacccttcttcgcatctcctgatataagcaatatccataatttataatggttatttcctcaattttcttcatactttaccaactaggtatgcaaccctaaactccatcgcttggtctagcctactttgaacgctgtataggtgcaatcctacatgttcctcttgtttgtggcttcctgaactcaacattatgtttctgaaatttagtcacatagttgcaagcacatgtga--ttttttttcacttctctatattgttccattgcatggaattactgtaatgattcatccaaccttaatatgtatttggccagtttcttttttgaacagttatgaataattctactagaacattctttcatatatcatttgatacaattcctttgcatatatacctatgagtagaattATATTATCATTGTTCAAAATCTCCTCATAGACATAGAAAAGTTCAGAAAATAATTTAACTAAACTTactcctgtcacctttacctccattctattttttgccatttgcatatgtcttatcaattgtataattaccccaacaagacattattattttc-----taaacattcatttagaattatgcacatatttaccactttcattaatttgtattccttcttgcatATTCAACTTAATATTTTCAATAAGACCCTTTATTggccaggcagggtagctcacacccataatcccaacattttgtaaggctggggcaggagcacccaggagttcaagaccagcctgtgcaacacagcaaaactgcctctacaatgaatgaaaaagttagtcaggcatagtgaagctactcacaaggctgaggtgggaggatggtttgagcccaggagttccagactgcagtaagccatgatcctaccactgaactccagcgtggacaacagagtgagaATCCAACTCTACCAACaaaaataataataataataatttttcttttatctgaaaagatatattttaaatttCTGTTTATCAAGATCTATTCTACTTTTGAAATACACtgaagacatgaatccattgaactctagctttatttttgtctgttgaaaatcagcttgtcgtttagacagttattccctttaacataatctatcttttcctctagttacttttcaggttttctattggtctttgatgtcctgtcattttatgttaatttggtttTAGTTATCGTGTCTGAAGTCTGATAGTTTCTAAAAATATATGAACTGATATActttatcacttttggaaaaatctccacattgcttctgccccatttgctctcttctaatcttctggaactgcagaagtatgttagttgttctgattgtagcttcactgtctgtggccctctagccttatattttctacctcttgatctctttatgcttcattctgggtagttatcttccaattcactaattctttcttatgtttaactggttgttaac----gctattggattctcaaaattgatgacCCTTTTTTTTGTCTTATTGTTTTAGAGGTAGAAATGAACTTTTTGTTCTCCTTATATAAATCGTTTTCTAACGGAGAAACTAAACCAA-TATTCCTAAAATCAAGTTATTAAAAAA-AGTTTTTTTAAACTTTTAGTATACCTGACATGAAAATGGTAATGATATTTTTATTTTTGTAATACTTTGGT s rheMac1.SCAFFOLD85456 36912 2734 - 81052 CTCTTTGCATAGAGATTTGAGATGGCTTCCATACTGGGGATTCTTCCTCTTTCCATTTACCATGAGAATATCGCCTGGCTAATACACTGTTTCCAGAAGGAGAATGAGAAATTAATGACGTCAGATTGCTGCCACCTGATCCAGACTAACTAGGCAAAACTCTAACGTCCTCCAAGATGCAGAATTTGGCCCATCTGAAATCACCACAGTCACCAGCCAAACCCAGCTTAGAAAAATGAAATCCAGGCCCAGTGTGGGTgaggccga-gcagacgaattatgaggtcaagagacggagaccatcctggccaacagggtgaaaccccatatctactaagaatacaaaaattagccaggaatggtggcatgtgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatggcatgaacttgggaggcggaagttgcagtgaactgagattgtgccactgcactccagtctgggcgacagagcaagactctgtctcaggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa----aaaTCCAACAACGTGTGAGATATAAATATCTAATGTAGTTTTGGAGGATTTTCTCCTGGCACAAAAATATAATTGATAAAAGAACTCTGCTAAACCA--AGTGTGGGAAATATGTACAAGCTTGTTTTGTCAGGAATTCTAGAGCCAAAAGAAAAAATAGATTATCCACTTCACAGGCAAAGATTTGTTCTTGTGAAGTGGATAATTAAGGCTAGAAGAAAGCCTTTGGAAAGATCTGGGGTTGGAGGATAA---CATCTAAAATTTGCTCCTGTTGCAACCAAATGAGAAAGTTCCCATTTCCACTATCTTAGAGTTGTATAAGAATGTATGCAAATAGTTGATATTTCCCCTCAGTCTGTAATGAGATCAGTAATAATAATTTCTATGAGACATTTCTTCTAATTACAAATTTGTATATTAAAGTTGTAATGCACAATTAGAAATGAACCAATACAAAAATGGGAAATACCACGATGTGTCAtaagcactcaagtaactgtgatgcagggcaagacaaggaacactgaaaacagcgtttgtccacctccatgccagtttccaagtccctaaacatttctttgtatctccggagataagcaatatccataatttataatgagcgtttccttgattttcttcatactttaccacctcggtatgcaaccctaaactgcatagcttggtctggcctgctttgaactgtgtgaaggtgcaatcctacatgt---tcttgtttgtggcttcttgaactcaacattatgtttctgaaatttagtcatatagttgcaagtacatgtgattttttttttcacttctctatgttgttccgttgtatggatttactgtaatgattcatccaaccttaatatatattgggccagcttcttttttgaatagttacaaataattctactagaatattctttcatatatca-ttgatacaattcctttgtatatatacctatgagtagaattATATTGTCATTGTTCAAAATTTCCTCATAGACACAG-AAAGTTCAAAAAATAATTTAACTAATCTTactcctgtcacctttacctccattcta-gttttgccattttcatatgtcttatcaattatataattaccccaacaagacattattattttttacagtaaacattcatttagaattatgcacatatttgtcactttcattaatttgtattccttcttgcatATTCAACTTAATATTTTCAATAAGACCCTTTATTgaccaggcagggtggctcacacccataatcccaacattttgtaaggctggggtaggagaaccccggagtttgagaccagcctgtgcaacacagcaaaacggcctctacaataaatgaaaaagctagccaggcatagcgaagctactcacaaggctgaggtgggaggatggtttgagctcaggagttccagactgcagtaagccatgatcctaccactgaactccagcctggacaacagagtgagactccaactctacaaacaaaaaTAATAACAATAACAATTTTTCTTTTATCTGAAAAGATATATTTTAAGTTTCTGTTTATCAAGATCTATCCCACTTTTGAAATacactgaagacatgattcctttgaactctatctttatttttgtcggttaagaattaggttgtcatttagacagttattctctttaacataacctatcttttcctctagttacttttcagattttctattggtctttgatgtcctgtcattttatgttaatttgattctagTTATCTTGTCTGAAGTTTGATGGTTTCTAAAAATATATGAACTGATACATTTTATCACTTTTGGAAAAATCTCCACattgcttctgcccaactt------------tcttccagaactgcagaagcatgttagctgttctagctgtagcttcaatgtctctgaccctctagccttatattttctatctcttagtatctttatgcttcattctgggtagttatcttccagttcactaatactttcttatgtttaactagttgttaactctgtctattggattctgattattgattactC---TTTTTATCTTACTGTTTTAGGGGTAGAAATGAAC-TTTTATTCTCCTTCTATAAATCATTTTTTAATGGAGAAACTAAACAAAGTATTTATAACACCGAGTTCTTAAAAAATAGTTTTTATAAATTTTTAGTACACCTGACATGAAAATGGTAATGATTTTCTTTTTTTGGCAATACTTAGGT a score=15686 s hg17.chr12_random 25623 243 + 466818 CAAAGAAGAGAGTAAAAGCAGGATCTAGGCAGCCTCATGAAACTCGGAAAAAACTGGAAATTGATTTCATGTCAATAGCTTTTTTTGGATAGTAGCTTATCTGTTGCTGGGTCATCACCACAAACTCTTTTCACAGGGAAATTCAATGAGCAGCACTGGATCTCAAAATGTC------ATTAATTACATATAGAATCTCAACCACAGCTCCATCATTCTATTCCATTATTTAAATTTTATGCGGTTTTT s rheMac1.SCAFFOLD85601 20922 246 - 44828 CAAAGAAGAGAATAAAATAAAGGTCTAGGCATCTTCCTGCAACTTGGAAGAAACTAGAAATTGATTTGATGTGAATAGTTCTTTTTGGATAACAGCTTGTCTCTTTCTGGGTCATCAC---AAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAATGAGCAATACTGGATCTCAAAATGTCATTTCAATTAATAAGATAAAGTATCTCAACCACAGCTCCACCATTCTATCCCATAATTTTAATTTTACGCTGTTTTT a score=553 s hg17.chr12_random 25866 10 + 466818 Gttttttttg s rheMac1.SCAFFOLD85601 12232 10 - 44828 GCTCTTTTTA a score=-2747 s hg17.chr12_random 26056 132 + 466818 ttagtagagacggggtttcaccgtgttccccagtatggtctggatctcctgacctgatgatccgcccacctaggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcgcctgcccTATGCTGTTTTA s rheMac1.SCAFFOLD85601 12242 23 - 44828 TTAGCAGAA----------------------------------------------------------ATCAAGACTTC---------------------------------------------------TTA a score=33137 s hg17.chr12_random 26188 466 + 466818 ATTAGCAAAAATCAAAATTTCTTAGTTTATAACAATCATTAAAATATCAAATAGTAAAACATTACTTACGAGTTTATCAACAAATGAAGGACATCTGATATAAGTAGACTTTAAGTCCCATGGAAACAAAACTGAATCTGGTGCTTCTGTGGAATTCCACCATTTAATCC-TATCCATGAATATAGTTTTGGTTATAGAACTACAACCTTCTAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGGGGTCTTA-CCTCTGTTTGACAGTTTGGTCCTAAAATCCGCTCTTTAGAAATAAAAGCGTGCTCAAAAAATGTGTTATTTGCTGTATCTTTCTTATTAAGGAATTTTATTTACACGAAAAT-TAAATTGTTTCTATCATGAGCATAGTGAAAGGAGGATTCACTGACGGTCATCCATAAATAATTATTTGCTTAAGCAATGTACTGTAAAAT-AAACTA s rheMac1.SCAFFOLD85601 21168 469 - 44828 ATTAGCAGAAATCAAGACTTCTTAGTTTATCACAATCTTTAAAAGATCGAATAGTAAAAGAGTACTTACATGTTTATCAAAAAATGAAGGATATCTGATATAAGTAGACTCGAAGTCCCATGGAAACAAAACCGAATCTGGTGCATCTATGGAATTCCAACATTTATTCCCTATCCGTGAATATAGTTTTGGTTATAGAACTATACCTTTCGAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTAACCTCTGTTTGAAAATTTGGTCCTAAAACCCGCTCTTTAGAAATAAAAGCTTGCTCATAAATTGTGTTATTTGCTTTATCTTTCTTATTAGGGAGTTTTATTTACACTAAAATCTACGTTGTTTCTATACTGATCATAGGGAAAGGAGGATTCCTTTAAGGTCGTCCATAAATAATTATT-GCTTAAGCAATGTATTGTAAAATTAAACTA a score=21124 s hg17.chr12_random 26654 279 + 466818 CACTTAATTTCTAAATCTAAATGTATTGGAGCTTGACTTGAACTTTGCTGTTTACTATTGTAACTTTCCCACAATGATGATCTTTTTAAAATTACTTATTTTCCAAATTATGTATTTAAATATTTCAAAAACAAATCATTTCATGAGATAGATGAAGATATAGATGATGAAGAGAATGATGATGGCAGGTGAAAGGGAGAATGCTATTTGGTAAATGTGATTTCAGGCTTGTTTCTAAGTACTGGAGCTCAGCGTGATGAGAGAACACTATTATTCTTC s rheMac1.SCAFFOLD85601 12705 277 - 44828 CACTTAATTTCTAAATCTAAATGTATT-GAGCTTGACTTGAAATTTGCTGTTTACTATTGTAACTTTCCCGCATTGATGATGTTTTAAAAATTCCTTATTTTGCAAATTACGTATTTGAATATCTCAAAAACAAATCATTTCATGAGATAGCTGAAGATATAGATGATGATGA-AATGAAGATGGCAGATGAAAGGGAGAATGCTATTTGATAAATATGATTTCAGTCTTGTTTCTAAGTACTGAAGTTCAGGTTGATGAGAGAATACTATCATTCTTC a score=18119 s hg17.chr12_random 26933 295 + 466818 CTCATGGCCTCACGATTCTTCTATGATTCTCAGCATTAGGCCTAGACAAGTACCCTCACATGGTATTTCATCAAGAATAATGTAAAACCAACATATTTTCAACGATTTATTTGCTTTTTTTTCTTTTACTACATTTTAAAATTCGATAAGAAACACGACCTCCAACAATTAGGATTCTATTTTGGGATTTTTTTTGGCATTTTTGAACACTAACATGGACAAATAGTCTATGCAATAATACAGTATATCAACTTTAGTTTATCTTTTAATAGCATCAT--TAGCAAGCCAAATTCTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 39646 293 - 81052 CTTATAGCCTCATGATTCTTATATTATTCTCAGCATCAGGCCTAGACCAGTATCCTCATGTGGTATTTCATCAAGAATAATGAAAACCCAACGTATTTTCAATAATTTCTTTCCTTTTCTTTCTTTTATTATGTTTTAAAAATTCATAGCAAA-GTGACCTCCAACAATTAGGATTCATTTTTGGGG--TTTTGGGGCATTTTTCAATATGAATATAGACAAATACTCTATGCAATAATACAGTATATTAACTTTGTTTCAT-TTTTAATAGCATCATTATAGCAAGACAAATTCTT a score=14996 s hg17.chr12_random 27329 195 + 466818 GGAGTGGTGGTATTGGACACAAACATGTGCTTTCTCAGATTCCCTTCACTATCTCCTGTTCCCCTGGTCAGCACCTTGCCTGAtccagatcatccttccatttgggacttgaatgcatcaccacactgtgggcatgaggtctgactttcatgaccaccaccaagggactggatgatgtaagacagaacaacagag s rheMac1.SCAFFOLD85456 43736 194 - 81052 GGAGGGGCGGTATTGGACACAAACATGTGATTTCTCAGATTCCATTCACTGTCTCCTATTCCCCTGGCCAGTACCTGGCCTGATTCAGATCATCCTTCCATTTGGGACTGGAATGTATCACCACACTGTGGGCATGAGGTCTGACTTTCACAACCTCCACGAAGGGACAAG-TGATGTAAGACAGAACAGCAGAG a score=22602 s hg17.chr12_random 27524 340 + 466818 atggtagttctaactcagggaaaccctggccaaggggaaacagaagactaacgacagctgagcagatacattctccctcctctctctctcttccatggactaatgccagctgtggtttccctttgtagcccttctggaaaagttctgggagtcaagtgcatgcatctgatgaccaccatgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcag--tcataccagacatcaccacacattgtttcacatcggttcttgtctcaatttccacatgtccctgccatttttgtcttgaattggccttccatataaatgtcatcactttaatATCAGGTATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 4177 337 - 81052 atggtagttctgcctcagggaaac--tggccaatgggaaatagaagacagaagacagctgagcagatacattttcccttttctttcccttttat---gactaatgccagctgtggtttccccttgaagcccttctggaaaagtactaggagtcaagcacacacatctgatgaccaccatgctgtctctctcacctcattgtgaagtggtcatcagcagagtcatatcatacatcacaacacatggtttcacatctgctcttgcctcagtttccacgtgtcccggccattgctgctctggacttaccttccaaataaatgttatcactttaacatcagacatt a score=379 s hg17.chr12_random 27864 17 + 466818 ACGTTAAAA---------------ACATTTTA s rheMac1.SCAFFOLD85456 4626 32 - 81052 attttaaaatattatataaaaGTTACATTTTA a score=209135 s hg17.chr12_random 27881 2812 + 466818 GTAAAGTAGCTGGTTACTAACTCAATTTTTTGAAATGAAATGCCATTTTT----ATATGATAATCAACTAGAAAATATCATAATACAAATATATAATTCACAATAGAAAAAAATACATACGCAAATAGACCAAAGTCTTTTATATGCTTTTTTAAAATATTGTAATAG-TGGCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCGCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTATATTATTGTGATATTTCCCCTAAAATTGTGGAATAGCCAAACTTTTCCTCTGAGGAAGGATTCTGCTTGGATAAGCCTGTAATCTTAACCTGAGACCAGAACAGGGGAACTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTCCCTTTCATTGGTTTACCACATCAGCTTACCCATTTTATCCACCCatttatttgttcattaaaatatcatttttgaccatctattccttgtgctgggttctaggtcctgggagtcaacagaaagcctgacagacacgatctcttcttttatggttcttacattgtactgaggaagataCATGATTCTAAAAAATACATGAATCAGGTGTGGGGATGATTTATCTTAAGGTCTGAACAACATTGTTAAAATTTCATAACACCAAGAATTAATACAGTCATGTAGAATTTAGCTGTAAACAAGACTGTACATTTCCTTCTTATAATAGAACTTCCCATTAATGAATATGTCAAGACAATTCCATTTAATCATTGACAACAAAATTACA---CTAGGACAAATCCCATAATTAATACATAGATTTCATAGATACTATTTTAACACTTAAAAAAAGTTTCACTGAATTATTTTCCATAATTTTTATACTATTTTCACATTGACAGATTTTTTTTTA----GAAAACGGAAGACTGGAGTTCTCTTATCTGAAGTTTAGAAAGAATTTTAAAAATGGAAGATAAGGATATAATTAGCAATTCAGGGGCTTAGAAGTGCTTTAGAAAAAATACTAAAA-TAATTTACATCTGAGCTCAATTTCAAAAAAAGTTTTTCTTTAATTGAAAAGCTGGAAGAAATGACTGTTCTAACTGCATATGGAAGCTGATAATAGCAATCAAGATCATGATCATGATTTTTCATCCCTCTTATAGCAGAGATTTTTTTCTAAGCTATTCACATACTTGTATTAAATCTAATATTCCTCAGTACTGTTTATGGTACACATACATGAAATTTACTATACGTATACTTCTCACTCAAATTTTATTGTGTTCATTGTTTTGTAACAATAATTCTGATTGCTTTTTACTAAACATAAAATAGGAATTCATAATGGAATAAAACCCTGAAGATACATCCTCATTAGTGATTAAGAATTGAACGACCTTATTATC-AAAAAGTTATAGGTTAAAACAACAGATTGTAAGCACACTGTGGTATATTTGTGTCATTCAAATAACAATAGAAAAGAGCAATATTTTTCCTGAGATAAGCTGTTAGTTCTTAATAATTATAAATAGATATAA---ATTCTACAAATGAAATATAAAATACATGTATGAAATAAACATGGCTTCATAATT--GAGGAATTTTTGTCATATTTTCTATAATTTGGCAGTTTTTGTGAAAAAACAATAAAAAGCATGTTATTGTCAATGTTCTTCAGTTTTTcatac----------------------------acacacacacacacacacacaTCTATATATATGTACTTTTCTAGACTAACTTTAGGTAAAAGACTTTTCTAGGTATACATGTGGAAATTATTCATATACATATATTACAGAAAACCCAGTAAGAAATATAAAATGTTTCATACACCACCAGTTTGTTTTCTGCTAGAAGACACACAATGCCCCTCTTGTGAATCTATGGAGACGAAGGCTTCTGTC-TTTCACCCAGTACCTCACATGCCGCAAAACTGAAAGAAAAATCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCAAAATCAGGATGAATGGGTGGGTTGAAGGATAGCTGAATATAATAGCTTGGCAGAACATGAAGACAGGTTGCTTTTCCAGCCTCCCAAAATTACAAACTGATATGATCATGGACAGAAAGTAAATGGCACATAACAGAAGAAAGGAGGTCACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCTTGAGATCCTTTGCCATGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTACACAGAGAACAGATTAACAGCAGAAAAGATATCAGGGTCAGAGTGAGGGGTACAAAGTTTGCTAGCATGGTTAGAGTCATATTTGAATGGTACATTGCACTCCTCAATTTGATCTTCCAAGTCACGTTTCCTTCATATTCTTTTGTCCATACAGTCTCATCCATGTTTATCACAAAAAGATGACAAACCAAAAATAGCAAAGGCCCCAACAGTATCACCAGAACAACACTCTTAACTCTCCTCTTTATGCGAAGAAAAATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCCTGAGCAAATAAAACATGCTGAGGCTAGTAGCAAGCCAGCTGCTGAAATGGTTGGTTACTGCCCAGACATTATAAGCAGTAATTCTTACTTCTACACTATAAAAAGCTGGATTCAACTGAGTTGCATACCAATGTAGTAATAACACCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACCGCCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAACAAAGGAGATCTTTTGTCTCTTGACCCACTCAATGGAATTTACCAATGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAATATAACCACTATTAGAATGGAAAAAATGATGGGCAGAAAAGTTATCATGTCTGAACAGACAAAAAGAAATTTTTAAAATGCTGG s rheMac1.SCAFFOLD85456 43939 2847 - 81052 GTGAAGTAGCTGGTTACTAACTCAATTTTTTGAAACGAAGTTCCATCTTTGTTTATATAATAATCAACTAGAATATATCATATTACAAATATATAATTCACAATAGAAAAAA-TACATATGCAAATACACCAAAGTCTTCTATATGCTTTTTAAAAGTATTGTAATAGGTGCCACCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCTCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTATATTATTGTGATATTTCCCCTAAAATTGTGGAGTAGCCAAACTTTTCCTCTGAGGAAGGATTCTTCTTAGATAAGCCGGTAAACTTAAACTGAGACCAGAACAGGGGAATTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTCCTATTCATTGGTTTACCACATCATCTTATCCATTTTATCCACTCATTTATTTGTTCATTAAAATATCATTTTTGACCATCTATTCTTGTTGCTGGGTTCTAGTTCATGGGAGTCAACAGAAAGCAAGAGAGATATGATCTCATTTTTTACGGTTCTGACATTGTACTGAGGGAGATACATGATT--AAAAAATACATAAATCAGGTGTGGGGATGATTTATCTTAAGGTTTAAATAAGATCGTTAAACTTTTATAACACCAAGAATTAATACAGTCATATAGAATTTAGCTGTGACCAAGATTGTACATTTCTTTCTTATAATAGAACTTCCTAGTAATGAATATGTCAACACACTTTCAT-----CACTGACAACAAAATTACAATGTTAAGGCACATCCCATAATTAATACATAGATTTTATAGATACTATTTTAACATTTACAAAAACTTTCACTGAATTATTTTCCATAATTTCTATAGTATTTTTACATTGATAGTTTTTTTTTTATTAGAAAAAGAGAAGATTTGAGTTCTCTTCTCTAAAGTTTAGAAGGAATTTTATAAATAGAAGGTAAGGATATAATTAGCAATTCAGGGGCTTAAAAGTGCTTTAGAAAAAATACGAAAAATAATTTACATCAGAGCTCAATTTCAAAACAAGATATTCTTTAATTCAAACCCTGGAAGAAATGACTTTTGTAATAGCACATGTAAGCTGATAATAGCAATCAAGATCATGATCATGAGTTTTCATCCCTCTTATAGAATATATTTTTTTCTAAGCTATTCACATACTTGTATGAAATCTAATATTCTTCAGTACAGTTTATGGTAGATATGGAAGAAATTTACTCTGCATATGCTTGTAACTTAAATTTTATTGTGTGCATTGTTTTCTAACAAT---TCTGTTTGCTTTTTACTAAACATAAAATAGGAATTCATAATGAAATAAAACCCCGCTGATAGATCTTCATTATTGATTTAGAATTGAATGACTTTACCATCCAAAAAGTTAGAGGTTCAAACAATGAATTCTAAGCGCTCTGTGGTGTATTTGTGTGGTTCAAATGACAATAGAAAACAGCAGTATTTTTCCTGAGATAAGCTGTTAGCTCTTAATAATTATAAGCAGCCATCATTAATTCTAAAAGTGAAGCATAAAATACATGTATGAAATAAATCT--CTTCCTAATTCTGAGAAATTTTTGTCATATTTTATATAATTTGGCAGTTTGTGTGAAAAAACAAAAAAGAGTATGTTATTGTCAATGTTCTTAAGGTTTTCATATCcacataaacacacacacacatatatatatacacacacacacacacatatatacatacacacacaTTTTTAGAATAACTTTAGGTAAAACACTTTTCTAGGTATATGTCTGGAAATTACTCATACACATACACTACAGAAAACACAGTAAGAAATAGAAAATGTTTCATACACCACCAGTTTGTTTTCTGCTAGAAGACACACAAGGCCCCTCTTGTGAATCTACGGAGATGAAGGCTTCTGTCCTTTCACCCAGTACCTCACTTGCCGCAAAACTGAAAGAAAAGTCCGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCAAATCAGTATGAATGGGTGGGTTGAAGGATAGCTGAATGTAACAGCTTCACAGATCATGAAGACAGGTTTGTTATCCCGACTCTCAAAACTCAAAGCTGATATGATTAGGAACACAAAGTAAATGGCACATAGCAAGAGGAAAGAGATCACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCCTGAGATCCTTTGCCATGAAGCTGCATCTTCTTCAGATGTTTAAACAGAGAACAGACTAACAGCAGAAAAGATATTAGGGTCAGAGTGAAGGGTACTAAGTTTACTAGCGTGGTTACAGTCGCATCTGAAAGGTACATTGCACTCCTCAATTTGATCTTCCCAGTCATGTTTCCTTCATATTCTTTTGTCTGTACAATCTCATTCATATTTATCACAAAAAGATGACAAACCAAAAATAGCAAAGACCCCAACAGCATCACCAGAATGACACTCTTAACTCTCCTCTTTAAGTGAAGAAACATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGGCAAGTAGCAAACCAGTTGCTGAAATGGCTGGTTACTGCCCAGACATTGTAAGTGGTAGTTCTTACCTCTACACTATAAAAAGCTGGATTCAACACAACTGAATACCAATGTAATAATAACACCCAGAGCAAACCAATTCTGGAGACCACCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAGGAGATCTTTTGTCTCTTGACCCACTCAGTGGAATTTACCAACGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAATGTAACCACTACTAGAATGAAAAAAATGATGGGTAGAAAAGTTATCATGTCTGAACAGACAAAAAGAAATTTTTTAAATGCTgg a score=91446 s hg17.chr12_random 30693 1241 + 466818 TGTAATATCACTGGTTGTGATTGCTTGAATATCCTGACCTTAAATTCTATATGCACCTGATTTGTGTATGTGCTGTGACATTCTTTTTACTTTTAATTGCTGTGACCAGTGTCAAGTCAGAAATCACCATGGCATGCTAATGGATAAGTTCAATGCTCTCTTTATGGAAAACATTCTTATTTTCAAAACAATTCAAATTAACTGACTCATTCACCATCTGTTCTTGTTATAGGCTGGAATTATTCATACTGAAATTGACATGAAACCTGAATTCTCATTTGCTAGTATGCAAACAAGGACATGTTCACTTCCAGTGTTTGCAATTTTTCCTTGTGTAACCTCTCCATCATTTGTCTTTAGCGACTTCAGTTGCTTGGGAAGTTTTATAACCCGATATGTAGATCGTATAGTAAATGTCTAAAATCTTAAAGGGAGCTTGATCATAACTAAGATCATCACCAATACGGACTTTTTTAAATGCCAGATTTAAATACACAGAATCCAAACTGCTTTTATCAAAAGCATCTAAGATTTACTTGAGAACCACAGGCAGGCCAATACTCCATAAGATCTGGTTGCTGCTAATACTTTTGTGTAACTTCATTATTCACAAGCTCATAAATACACACACAAACACACACATGTGCACACCACTTATGAATGGAACGAATTATTTTCTCATAATTTCCAAAATAAAAAATCAGTTTCCAGGAGGTTGTCCAGGTGAAATTAGTCCTATTTTCCCACTCAAGGTTTTCAGCCCACGAATAATGTTTATTTATCAAACATATCTCTAATTCTTAGGCCTTTGGTAAAGTTTCTCTCAAGTCtaatatttaaatatttattatttaattaaaatGTTCAGCAATTTTATAAGTATTCCTGAGTACCAGACCCTTTGATATATAATCTTGCAGTATCCTCCCATCACACGAAGACTGACTACCTTTCCCCTGAACTTGAAGTTCAATCATTTAACTTACTTTGATGAACAAAAAATTAATACACTTTGCATAGAAATTTGAGATAGCTTCCATACTGGGTGTTCTTCCTCTTTCCATTTACTATGAGAATATCACCTGGCTAGTACACTGTTCCCAGAAGGAGAATCAGAAACTAATGAAGGCAGATTGCCCCCCACCTGATCCAGACTAAATTGGCCAAACTCTAACGACCTCCAAGATGCAGAATTTGGCCCATCTCAAGTCACCAGAGCTATCCAACAAACCCA-TTTAGAA s rheMac1.SCAFFOLD85456 47333 1233 - 81052 TGTAATATCACTGGTTGTGATTGCTTGAATGTCCTGACCTTAAATTCTGTGCAAACCTAATTTGTGAATGTGCTGGGTCATTCTTTTTACTTTTAAATGTTGTGACCGGTGTCAAGCCATAAATCACCATGGTATGTTAATTGATGAGTTCAATCATCTCTTTATGGAAAACATTCTTATTTTCAAA-CAACTCAAATTAACTATTTCATTCATGGTCTGTTCTTGTTATAGACTGGAATTATTCATACTGAAATTGACGGGAAACCTGAATCCTCGTTTGCTAGTACACGAATAAGAACAAATTCACTTTCAGTGTTTGCAATTTTTCTTCCTGTAACCTCTCCATCATTTGTTTTTAGCGACTTCAGTTGTTAGGGAAGTTTTATAACCCAATACAGAGATCATATAGTTAATGTTTAAATCTTTAAAGGGAGCTTGGTCATAACTAAGATCATCACCAGTATGGACTTTTTAAAATGCCAGATTTAAATACACAGAATCCAAACTGCTTTTATCAAAAGCATCTAAGGTTTTCTTGAGAACCACAGTCAGGCCAATACTCCATAAGATCTGCTTGCTGCTAATACTTTTGTATAATTTCATTATTCACAAGCTCATAAATATGCACACAAATACACACACGTGCACACCACTTATGAATGGAACAAATTATTTTCTCATAATTTCCAAAATAGAAAATTAGTTTCCAAGAGGTTGTGCAGATGAAATTAGTTCTATTTTCCCACTCAGAATTTTCAGCCCGTGAATAATATTTA-TTATCAAACATATCTCTAATTCTTAGGACTTTGGTAAAGTTTCTCTCAAGTCAAATGTTTAAACATTTATTA-TTAGATAAAATATTTATCAATTTTCTAAGAATTCCTGAGTACCAGACGCTTTGATATATAATCTTGCAGTATCCTCCTATCACAGGAAGACTGACTACCTTGCTCCTGAACTTCGAA-TCGATCATTTACCTTGCTTTGATAAAGAGAAAATTACTACACTTTGCATAGAGCTTTGAGATGGCTTCCATGCTGGGGATTCTTCCTCTTTCCGTTTACCATGAGAATATCGCCTGGTTAGTACACCGTTCCCAGACAGAGAATGAGAAACTAATGAAGTCAGATTG-CCATCACCTGATTCAGACTAATTTGGCAAAACTCT----ATCTCCAAGATGCAGAATTTGGCCCATCTCAAATCTCCAGAGCCATCCACCATACCCAGCTTAGAA a score=39778 s hg17.chr12_random 31934 554 + 466818 AAACAAAATCCAAAGCCATGTGATATATAAATATCTAATGTAGTTTTGAAGGGTTTCTCTTGCAGAAAAACATAACTGATAAAAGAACTCTGCTAAACCAAGAGTGTGGGAAATGTGTACAACCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGAGCCAAAAGAAAAAATAGATGGGGAACGGCAAAGATTTGTTCATGTGAGGTGGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAAAAATCTGGG-GTGGCAAATAAAATCATCTCAAATTTCCTCATGTTGCAACTAAAT---AAAGTTCTTACTTCAACTCTCTTAGAGTTGTATAAGAATGTATACCAATAGTTTATTTTTCCCCTCAGTATATAATGAGACGAGTAATAATAATTTCTATGAGACGTTTCTCCTAATTAAAACTTTTTATGTTAAAATTATAATGCACACTTAGAAATGAACCAAAACAAAAATGGGAAATACCGCAGTGTATCAtaaacattcaagtaaccattatgtggagcaagacaaggaacactgaaaacagcctaggtccacctccatgccacttt s rheMac1.SCAFFOLD85456 48849 553 - 81052 aaaTGAAATCCAAAGACATGCGAGACATATGTGTCTAATGTAATTTTGGAGGGTTTCTTCCGCAGAAAAACATAACTGATAAAAGAACTCTGCTAAACCAAGAGTGTGGGAAATATGTACAACCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGAGCCAAAAGAAAAAATAGATGGGGAATGGCAAAGGTTT-TTCCTGTGAGGTGGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAAAGATCTGGTCTTGGAAGATAACATCATCTCAAATTTCCTCATGTTGCAACTAAATAAGAAAGTTCCTATTTCAACTA----AGAGTTGTATAAGAATGTATACAAATAGTTGATATTTACCCTCAGTATACAATGAGACAAGTAATAGTAATTTCTATGAGACATTTCTCCTAATTATAAATTCGTATATTAAAGTTATAAGTCACACTTAGAAATAAACCAATACAAAAATGGGAAATTCAACAATATATCATAAACACTCAAGTAACCATGATGCAGGGCAAGAGAAGGAACATGGAAAACAGTCTAGGTCCATCTGCATGCTACTTT a score=4416 s hg17.chr12_random 32488 67 + 466818 ccaaccccctaaacccttcttcacatctcctgagataagcaatatccataatttatattgattattt s rheMac1.SCAFFOLD89827 4700 67 + 22897 ccaagcccgtaaccccttgttcacatctctggagataatcaatatccataatttatgatgatcattt a score=27156 s hg17.chr12_random 32555 602 + 466818 ccttaattttcttcacactttaccaactaggtatgcaaccctaaactccatcgcttggtctggcctgctttgaactctgtgtaggtgcattcctacatgttcttgttgtttgtggcttcttggactcaacattatgtttctgaaatttagtcacatagttgcaagtacatgtggttt----tttttcacttctctatattgttccgttgcatggaattaatgtaatgattcacccatcctta----atgtacatttggtctgcttcttttttgaa--gttatgaataattctacta-gagaattctttcatatatcatttgatgcaattcctctgtatatatacctttgggtaaaattacagggtcatTG---------TTCAAAATCTCCTCATAGACATAGAAAAGTTCAAAAACTACTTCAAGTAAATTTACTCCTGT-CACCTTTACCTCCAGTCTATTTTTTGCCATTTGCATATGTCTTATCAATTATATAATCACCCTCAagaca--ttattattttatacagcaaacattcatttacaattatgcacatatttatcactttcattaatttgtattccttcttgcatATTCAACTTAATATTTTCAATAAGTCTCTTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 9686 619 - 81052 ccttgattttctttacacattaacaactaggtaagtaatcctaaactctgtgacagggttttgcctgctttaaaccatatataggtgtagtcctgtatgttcctact---catggcttcttggactcatctttatgtttctgaaatttagtcacatagttgcatctttatgtgattcattcctttacacttctctatattattccattgtacgaatgtgtcgtaatgattcattcatctttagttgatacatatttggg-ggtttcttttttgaacagttatgaataattctagtatgaccattctttaatatatcatttgattcatttcctttggatatacacatagaaagagaattacagg-tcatCAAATATGGCTTTCAGATTCTCTTCACAGACATAGAAAA-TTCCAAATTTAAATTAACTAAATTTTCTTTTTTATACCTTTACTTACAGACTATATATAGCTATTTCTATATATCTTATTAATCTAAAACTGAACCCAAAGAGAAGCCCttattttataaactcaaaatttatttagacttatgcacatatttaccacttgcattatttattattctttcatgcatgttcagctttatatttttaataattttcctt a score=12070 s hg17.chr12_random 33157 151 + 466818 ATTggccaggcagggtggctcacacccataatcccaacattttgtaaggctggggcaggagcacccaggagttcaagaccagcctgtgcaatacaccgaaactccctctacaataaatgaaaatgtgagccaggcatagtgaagcTACTCA s rheMac1.SCAFFOLD31009 36345 151 - 42162 ATTggccaggcagggtggcgcacacccataatcccaacattttctaaggctggagcaggagcacccaggatttcaataccagcctgtgcaacacagcaaaactccctctacaacaaatgaaaatcttagccgggcatcgtgaagctactca a score=646 s hg17.chr12_random 33308 40 + 466818 CAAGTTCTTT---AAAAAGGAGTT-------------------TTTATAAATTTTTAGTATA s rheMac1.SCAFFOLD85456 21549 62 - 81052 CAAGTTTTTTTTAAAAATGGGGTTCTTTGGTTGGTTGGTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTGTG a score=93358 s hg17.chr12_random 33348 1350 + 466818 CCTGACATGAAAATGGTCACAATTTTCTTCTTTTTGTAATACAAAGGTCACAGAAGAGATTAAAATCATGGTCTAGGCATTCTCCTGCAACTTGGAAGAAACCGGAAATTGATTTGATGTGAGTAGCTTTTTTT-GGATAGTAGCTTGTCTGTTGCTGGGTCATCACCACAAACTCACCTTATAGGGAAATTCAGTGAGCAGCACTAGATCTCAAAATGTCATTACAATTAATAAAATATAGTATCTCAACCACAGCTCCACCAATCTATTCCACGATTTAAATTTTACTGTTTTTATAAGCAGAAATCAAGGCTTCTTCATTTATAACAATCTTTAAAAGATCAAAGAGTAAAACAGTACTTACAAGTTTATCAAACATTGAAGAACTTTT-----------------ATTCCCATGGAAACAAAACTGAATCTGGTGCTTCTAAGGAATTCCACCATTTAATCCCTATCCGTGAATATAGTTTTGGTTATAGAACTATAACCTTCAAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTACCTCTGTTTGACAATCTGGTCCTAAAACTCTCTCTTTAGAAATATAAGCTTGCTCATAAAATGTGCTATTTGCTTTGTCTTTCTTACTAGGGAGGTTTAGTTCCATTAAAATCTAAATTGTTTCCATAGTGATCATAGTGAAAAGAGGATTAGTTTAAGCTCATCCATAAATAATTATTTGCTTAAGCAATGTATTGTAAAATAAACTACACTTAATTTCTAAATCTAAGTGTATTGAGCTTGACTTAAACTTTGCTGTTTACTCCTGTAACTTTCCAATAATTATGATCTTTTTAAAATTACTTATTTTCCAAATTATGTGTTTAAATATTTCAAAAATAAATCATTTAATGAGATAGATGTGGATATA---GATAATGATAATGATGATGGCAGGTAAAAGGGAGAATGCTATTTGATAAATGTGATTTCAGTCTTGTTTTTTAAGTACTAGACTTCAAAGTAATGAGAGAACAATATTATTCTTCTTCATGGCCTCATGATTCTTATATTATTC-CAGCATCAGGCCTAGGCAAATACCCTCACGTGGTATTTCATCAAGAATAATGTAAAACCAATGTATTTTCAATGATTTATTTGCtttttttattttattatactttaaaaattCATAGCAAAAGTGATCTCCAACAATTAGGATTCTATTTTGGGTTTTTTTGTGCAGTTTTCAATATGAAAATAGACAAATACTCTATGCAAT-ATACAGCATATCAATTTTATTTCATCTTTTAATAGCATCATTAGCAAGCCAAATTCTTGTAAATGCTTTTTCACATTCTTAGCTATGGTGACTAA s rheMac1.SCAFFOLD85456 49402 1367 - 81052 CCTGACATGAAAATGATAATGATTTTCTTCTTTTTGTAATACTTTTGTCAAAGAAGAGAATAAAAGAAAGGTCTAGGCATCCTCCTGCAACTTGGAAGAAACTGGAAATTGATTTGATGTGAATAGTTTTTTTTTGGATAGTAGCATGTCTGTTTCTGGGTCATCATCACAAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAATTAGCAGTACTGGATCTCAAAATGTCAT-AAAATTATTAAAATACAGTATCTCAACCACAGCTCCACCATTCTATTCCATGATTTAAATTTTACTGTTTTTATTAGAAGAAATCAAGACTTCTTAGTTTATAACAAACTTTAAATGATCAAATAGTAAAACAGTACTTACAAGTTTATCAAAAACTGAAGGACATCTGACATAAGTAGGCTTGAAGTTCCATGGAAACAAAACTGAATCTGGTGCTTCTGTGAAATTCCACCTTTCATTCCCTGTCCTTGAATATAGTTCTGGTTATAGAACTACAATCTTCAAACTCCATCATCATTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTACCTCTGTTAGACAATTTGGTCCTAAAATCCGCTCTTTAGAAATAAAAATTTGTTCTTAAAATGTGTTATTTGCTTTATCTTTCATGTTAGGGGATTTTATTTACACTAAAATCTAAATTGTTTTTATAGTGATCATAGTGAAAGGAGGATTCATTGAAGGTCCTCCATAAATAATTATTTGCTTAAGTAATGTATTCTAAAATAAAATACACTTAATTTCTAAATCTAA-TGTATTAAGCTTGACTTAAACTTGGCTGTTCGCTACTGTACCTGTCCCACAATGGTGATCATTTTTAAATTACTTATTTTCCAATTTATGTATTTAAATATTTCAAAAATGAATCATTTCATGAGCTAgatgaagatatagatgatgatgataatgatgatgGCAGGTGAAAGGGATAATGCTATTTGATAAATGTGATTTCAGCCTTG-TTTCTATGTACTGGAATTCAGGGTAATGAGAGAACACTATTATTCTTCCTCATTGCCTCATAATTCTTCTATGATTCTCAGCATCAGGCCTAGACAAATAACCTCATATGGTATTTCATCAAGAATAATGTAAAAGGAACATATTTC--ATGATTTATTTGCTTTTTTTCTTTCACTACATTTTAAAAATTGATAACAAAAGTGACCTGCAACAATTAGGATTCTATTTTGAA-GATTTGGGGCATTTTTCAATATGAACATGGATACATACTCTATGCAATAATACATTATATCAACTTTATTTCAACTTTTAATAGCATCATTAGTAAGCCAAATTCTTGCAAATGCTTTTTCCTATTCTTAACCATGGTGACTAA a score=42237 s hg17.chr12_random 34698 609 + 466818 ATCTG--TTATCTTACTATAGCAGTCAAAGTAGCATTATATATGCACAAACATACTCAAAGATCATGCTAAATATGTTTTACACCTTAACAAATTTGC----CTATGATTTTTCTTCTCTAATGCAGAACCAAAAAATATATAGTAACAAAATATTTAACCCAAAATGCAGGTGTACACATGAATAGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATATACATATTTCATTTAGAGACACATTTTGG-CATAATAGGTCT-ATATATGTAATATCCATCTTACTATAGTTTATTGGAAATTCATGACTTTCTGACACTG--AAATGTGAATTATGAATAATTAAATTGGAAATAAGAATAAAGGTGTCTAGCAATCATAAATATTCAAATTTTGATGTTTCAAATTCATATTAGCATTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCTTGCTTAT-----CTTCTTTTTTAATTAATTTAAGAAAACTTTTGggccaggtgtggtggctcataactgtaatcccaccattttaggaggctgaggcaggtggattgcctgagcacaggagttcaagaccagcttgggcaacatggcaaaatcccatctctaccaaaaatagaaaaaattag s rheMac1.SCAFFOLD31009 12968 619 - 42162 ATCTGGATTATTTTACTATAGCAGTCAAAGTAGCATTATACATGCACAAACATACTCAAAGATCATGCT-AATATGTTTGATTCCCTAACAAATTTGCCTTTCTATGATTTTT-TTCTC-AACGTAGAGCCAAAAAATTTATAGTAACAAGATATTTTACCCAACACGCAGGTGTACACATGAATAGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATATACATATTTCATTTCGAGACACATTTTGGatatatttaatttaatatatttaatatCCATCTTACGATAATTAATTGGAAATTCATGAATTTCTGACACTTTCAAATGTGTATCATAAGTAATTTAATTGTAAATAAGAA-AAAAGTGTCTATCAATAATAAATATTCAAATTTTGACGTTT-AAATTCATATTAGCATTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCTTGCTTATGTCTCCTTTTTTTTAAATTAACTTAAGAAAAGTTTTGggccaggtgtggtggctcacatctgtaatcccagcagtttgggaggctgaggcaggaggattgcctgagcacaagatttcaagcccagcctgggcaacatggcaaaaccctgtctctgcaaaaaatagaaaaaattag a score=228286 s hg17.chr12_random 35307 3220 + 466818 cagggcgtggtggtgcacgcctgttgtcctagctactctggaggctgaactgagagaatcacttcagcccgggtggcagaggttgcattgagccgcgattgcacttgtgcactccagcctggacaacagagcaagaccctgtctcaaaataaaaaa-----aGTTTTAAATTTTAACTTGTATTTCTTAGTACCATAATGCTCTATTCTCCTTTATTCAGCAAAAACTCTAATTACAATGGTATCTATGAGAATATGCTGTATCACCCTGAATTTATACGTAGAAATGTACTT-ATGTTTTTGCTTTTTTAACATttttttattggggaatataacataca----gagagtaataaaacctaa-aaacagtaaga--aaaaattataacattaacattgatgttaccaaaccttggtcagaaaatagaatttgccagcaatccagatactcccaatatacgtcttcttgttgatatttcccttttatttcctccctcctgattatcccaattgttatgatgatcattcatatatttcactgtagagtttcatcaccaatgtaacaaattacaatgtattaaaaatt-ttttttccaaactttatgtaaa--agatcattccaaatgtatttttccatcttgataattcctttcacatctgtgagtattattatctatgtagctcaaatttgttcatttcctttgttgtattatactgttgtaaacatgtcagtcttctttgttaattttgatcactgtatagtattccattgtataagtatgccataatttgtttatccatttggaggactgacagacattccaagtacttctcaactttagctactgaaactcagtgatacgcatgtgcatgtatatgtattcggataagagtgtaaatactgggt-ttaggatgtgatccttcatcttaatcagataatgccatactcagccaaaatgatggtacagatttatcatcctaggagtagaatatgaaaattcccattgtttcatatcctttccaaAATAAGTAACGTAAGAGTAATATTTACAGTTTTGTATTTATATAACATATTATTAAACAATAGTTTCCAAGTTCTTTCCTATTCTAATTTAGAATGTATTTTTACTTCAATAAATT--------------TCATTCTATGATAGTTATTTCATATACATTTATTAATAATGCCttatatattatacatatttatttatatttcattataaatttGTCTAACCTTTTTTTCTTCAAGTTTCAAATACTCTTTTCTTATAAGCAAGTGTAATTATACTGGAGATATTTCCTTTAATCAATCATTATGCCAAAGGACTTTGAAAAAATATAATT-GTTAACAGCA--CTGTAAGGGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTCCTAAAAGGACTCAAAGACAAAAA-TGTTGAAATATAAAAATAGACAACAAGCTTAATGTAGGTGTCCATGGGAAAA-ATAAATATATCATTGCTGTTATTGAAAAAATGAATGGTAGTAAATTTATCATGTCTGAATGTTTTAAAAAGTAGGCCTAATATCACTGGTCAAGATTCCCTTTAAGGTCCTGACCTTAACTTCTATGTGTAACTGATTCCTGAATGTGCAGTAATGTTCTTGTTCCTTTTAAATTCTGTGACCAACGTCAAAGAGGAAATCATCTCAATATGCTAATGGATGAAATCAATGCTGTCTTTATGGAAAACATGATAATTTCCAAAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAACACAACATCCTTGCTGTAAGGTAAAATTTTCCATATTGATGTTGAAGTGAAAGCTGAATTCTCATATACTAGCATGCCAAGGAAGAGTTTTTTAATTGTTCTGCAATTTTTTCCTTGTTTCACCTCTCCATAATTTGTTTTCAGCAACTTCAGTTGTTAGAGATATTTTACAACCCAATACATATATGACACATTGGTTGTATAGCCTGGTGAATGGAGCTTGAGGATAGCTAGGATCATCACCAAAGTAGATTTATTTTTTTTCAATGCCAGTAATATGTAGAGTGAATCCCAACTTTTCCTACCAAAAGCATTCAAGGTTTTCTTAGGAACCTCAAAAAGGCCAATAGTCCTTAAAACCTGGTTGCTACTAAGTAATACTTGTATAACTTATTGTTAACAAGCTCATTAatacaaacacactcacacacatacacacatactcacCCCTCATGAATAGGAGGAATTATTGTCCTATAATTTCCAAAATGGAAAATTAATTTTAGGGAGATCATCCAGGTGGAAATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTTGACCCATTTTCAATATTTATCAAACTTACCACTCATGCTTAGGCCTTTCACTAAGTTATTCTCTTGAGTCTAGTTAATACTTAAATATTTATTGTTTAATTAAAATGCTCAGCAATTGTGTAACTATTGTGGGTCACTTGAAAA--ACACGTTTTCCATTGAAGAGTCTAGACTTCTTTCTATATGAATATTTGGTTTTGTTTTCCTCTGCTTAATTTATTTTTGATTACTTAATGGTTTAAGATGAGTAGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTATTTTTCATTTTTacagtataattgtttctaagagaggattttggagtcagactgccaagacaggaaaccagattttctgcttcatataggtatgctccagacagacctcattttacaactactctatgccttggtataatcatctgtaaaatacagatgataataatattctctttggatagtctttctgaggagttaatatactatttgtataactgcttTCAATTTTACCT-TCTGGTACAGGCAGGAATCAAGGATTATTAATTTTTCATATGATCATGTGTTACTTGATACATAAAAGATACCAGTGAGAACTTCCTTGTTT-TGGGTGGAGG-GAGGgagacagggtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggcttgattacagctcactgcagtctcaaacttttgggcccaagtggtcctcccacctcaccttctggagtagctgggactacaggcatgcaccaaaacatccagataatttttttttatttttttatagagacaaagagtctccctatgttgcccagtctggtcttcaactcatgtgctcaagtggtcccctcatcttggcctcccaaagtgcttggatacaggcatgaacaaccacacctggctGAGAACCTCCATTTTTGAGCAGA s rheMac1.SCAFFOLD31009 14855 3203 - 42162 cagggtgtggtagtgcacacctgttgtccttgctactctggaggctgaggtgggagaatcacttgagcccaggtggcgaaggttgcattgagccaagattttgcttgtgcactccagcctgggcaacagagtgagaccctgtctcaaaataaaaaacgaaaaGTTTTAAATTTTAACTTGGATTTCTTAGTACCATAATGCTCTATTCTCCTTTATTCAGCAAAA-CTCTAATTACAATGGTATCTATGAGAATATGCTGTATCACCCTAATTTTACACTTAGAAATGTATTTTATGTTTCTGCTTTTTTAACAtttttt-attgtggagcataacatacatatggagagtaatactacccaataaacagaaagagaaaaaattataacgttaacaacgatgttaccacacctttgtcagaaaatagaatttgccagcaatctagataatcctaatatatgtcttcttgctgata----------atttcctccctcctgactattccaattgttatgatgatcactcatatgtttcactgtggagttttatcaccaatgtaataaattacaac-tattaaaattaatgtttttcaaactttatgtaaattagattatactaaatgtatttttccatcttgataattcctctcatatctgt----attattatctatgtagctcaaatttgttcatttcctttgttgtattattctgttgtaaat-tgtgagtcttgtttgtta-ttttgatcactgtatagtattccattgtataagtatgatgcaatttgtttatccatttggaggaatgatagacatgccaaggacttctcaactttagctactgaaactcagtgatatgtatgtgtatggatattaattctgataagagtgtaaatactaggtcttaggatgttatccttaatcttaatcagataatgccatactcggtcgaaatgatggcacagatttataattctaggagtagtgtatgaaaattcccattttttcatatcctttccaaaataagtaatgtcaggctAATATTTACACTTTCATATTTGTATAAAATATTATTAACCAATAGTTTCCAAGTCCTTTTCTATTCTTATTCAGAATGTATTTTTACTTCAAAAAATTACATTAATATTTTTTCATTCTATGACTGTT--TTCATATATACTTATTAATAATGCCttatatattatacatatttatttatatttcattataaatttGTCTAACCTTTTTT-CTTCTAGTTTCAAATACTCTTTTGTTATAAGCAAGTGTAATTATACTGGAGATGCTTCCTTTAATCAATCATTACGTCAAATGACTTTGAAAAAATATAATTAGTTAATAGTATACTGTCAGGGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTCTTAAAAGGACTCAAAGAAAAAAAATGTTGAAATATAAAAATAGTTTACAAGTTTAAAGTAGGCATCTATAGtaaaatataaatatattattattGCTA----AAAACTGATTGGTAGTAAGTTTATTATATCTGAATCTTTTTAAAGGCAGGACAGATATCATTGGTCAAGATTCTCTTTAAGGTCCTGACCTTAACTTCTATGTGTACCTGATTCCTGAATGTGCAGTAACGTTCTTGTTCCTTTTAAATTATGTGACCAATGTCAAACAGGAAAGCAT------ATGTTAATGGATGAAATCAATGCTGCCTTTATGGAAAACACGATAATTTCCATAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAACACAATGTCCTTGCTGTAAGATAAAGTTTTCCATATTGGTGTTAAAGTGAAAGGTGAATTCTCATCTACTAGCATGCCAAGGAAGAGTTTTTTAATTGTTCTGCAATTTTTTCCTTGTTTAACCTCTCCATAATTTGTGTTAAGCAACTTCAGTTGCTAGAGAAATTTTACAACCCAGTACATAGGTGAAACATGGGTTGCGTAACCCGGTAAAGGGAGCTTGGGCATAACTAGGATCATCACCAAAGTAGACTTA--ATTTTTCAACACCAGTAACATGTAGAGTGAATCCCAACTTTTCCTACCAAAAGGATTCAAGGTTTTCTTGGGAACCTCAGAAAGGACAATAATTCTTAAAACTTGGTTGCTACTAAT--ACTTTTGTATAACTTATTGTTAACAAGCTCATTAATGCAAACACACTCACACACATACACATATAC---CCCCTCGTGGATAGAAGGAATTGTTATCTTATAATTTCTAAAATGGAAAATTAATTTCAGAGAGATCATCCAGATAGAAATAGCCCAATTTTCCCATTTGGGCTTTTCAACTCATTTTCAATATCTATCAAACTTATCTCTCATGCTGAGGCCTTTGACTAAGTTTTTCTCTT-----TAGTTAATTTTTAAATGTTAATTTTTTAGTTAAAATTCTCAACAATTGTATAAATATTGTGGGGTACTTTAAAAACACACGTTTTCCATTGAACAGTCTGGATTTCTTTGCACATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTC----TAATTTATTTTTGATTACTTAATGGTTTAAGAGGAATAGATGTTAAACTCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTCTCTTCCATTTTT-tagtgtaattg-ttctaaggaaggattttggagtcagactgccaagacaggaaaccagattttctgcttcatatagttatg-----gtcagacttcatttcacaactactctctgcctcagtataattatctgtaaaactcagatgataataataTTCTCTTTTGGTAGTCTTTATTAGGAGTTAGTATACTATTTGTATAACTGCTTTCAATTTGACCTGTCTAGTACTAGCAGGAACCAAGAATTATTAATTTTTCAGACGATCATGTGTTACTTGATACATAAAAGATACCAGCGAGAACTTCCTCTTTTATGGGTGAGGGCAAGGAagacagggtcttgctgtgtcacccaggctggaattcagtggcttgatcacagctcactgcagcctcaaacttttgggctcaagtggtcctcacaccttagcttctggagtagctgggtctacaggcatgcaccacaacatctagataa-ttttttaaatttttttgtagagac--agagtctccctatgttgcccagtctgaccttcaactcctgttctcatgtggtctcttcatcttgatctcccaatgtgcttggatacaggcatgaacaacagcacctgactGAGAACTTCCGTTTTTGAGTAGA a score=9052 s hg17.chr12_random 38527 164 + 466818 ACACACAAGGTTAAGAAAGGCATGACATCCGTCTCCAACAACTAGGATAAAAGAAACAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTCATCACAGAGTTGTACAAGCAACGATGACCAGCTGAACTGAAATTCAGCACAAGGAGAGTCTTTATAGGTGAAAAGTCAAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 28807 161 - 81052 ATATAGCAAGTTCAAGAAGGGAAGATATCCTTCTGCAATAACTACGATAAGAGAAAGAAAAGGCCAAAAATATTTTTTAAATTCATCAGAGAGTTGTACAAGCAACCAAGACCAGGTGAACTGAAATCCAGCAT---GAGAGCTTTCATAGATGAAGAGtcgat a score=58341 s hg17.chr12_random 38691 851 + 466818 TTAtatatattcagtgcaatccctaccaaatcccagaagacttttt-tcacagaaattggaaaaccactcctaaaatatatctggaaatgccaagtgacaagatcacaaaaagaaattgttaaaaaataagaaatttggaggattatactttctgatttcaaagcttacttcaaagctgccctaatcaggattctatagaactcacattacagtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagagtccagaaactaacaccaacattcatggtcaattgctttcaaaaaaaggtactattgcaattcgaaaggaattaatcgtttttctcaacaaacaatgcCAGGTAAAATTGaagaagactacctcaaggaatttaataatcaatttccct-aaggtcaaggataaagaaaggattct-aaagcagcaaaagaaaagaaacaaataatgtacaatggagctccactacatctggcagcagacttctcagtggaaaaaggccaggagacagtggcatgacatattagaagtgctgaag---gaaaaaacttttagcccagaatagtgttactggagaaaatattcttcaaacatgaaagag----aaagacttttccaaaccaacaaaagctgagggatttcataaacaccagatctgtcctataagaaatgttaaagggattacttcaatcagaaagaaaagggcattaatgagcaatatgtaatcacctaaagctataaaactcactggtaatagtaaggagacagaaaaacacagactagtataacactgtaaatgtggtgtgtaaacctcgctaaagtacaaaaattaaatcatgaactgacaaaaaaaaaatag s rheMac1.SCAFFOLD85456 53380 854 - 81052 TTATATA---tcagtgcaatccctatcaaatcccagcagatgctttatcacaaaaagtaaaaagctactcaaaaaatatatctggaaatgccaaatcaacagatcaacaaaagaaattgataataagtaacaagtttggaggattacactttctgatttcaaagcttacttcaaatctgcactaatcagaattccatggtacttgcattatggtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagattccagaaattaacaccaacattcatggtaaattgatttcaaaaaaggg-actattgcaattcgataggaattaattgtttttctcaa-aaacaatgctgggaaaaATTGaagaagactaccataagcaatttaataatcaatttccctgaaactcacggataaagaaaggattctgaaagcagcaaaagaaaagaaacaaacaatgtacaatggagctccactacatttggtagcagctttttcagtcgaaaaaggccaggagagagtggcat-acatatta-aagtgctgaagcaaaaaaaaagttttagcctagaatagtgtaactggagaatatatcctttaaacaggaaagagaaataaagacttttccacaccaacaaaagctgagggatttcatcagcatcagatccgtcctataaaaaatgttaaagggattgcttcagtcagaaagaaagggacattcaagagcaataagtaatcacttgaagctataaaacttactggtaatagtaaagagacagaaaaacactggctagtataacactgcaaatgtggtgcataaacctcgcttcagtagaaaaactaaatgatgaacgaataaaaaaATAGCAG a score=52886 s hg17.chr12_random 39605 681 + 466818 aaactgagaagatggtgttaaggtgtagagtcttcatttgtttagtgtttgtgcttgtttgtttgcttatgcaaacagtgctaagttgctatcagcttgaaataatgggttacaagatagtatttgcaagcctcatagtaatcgcaaatcaaaaaacataatacaatggatacacacaaaaaaataaaaagcaagaaactatatcatatcaccagagaaaataaccttcactaaagaaagataggaaggaaagaaagaagagcagaccacaacataaccagaaaacagataacaaaatggcagaagtaagtccttactaccaataataacattgaatgtaaatggactaaactctccaatcaaaaggcatagtctag--------------------------ctaatcagttgcctataagaaacacaattcgcctatacagacatgcacagatagaaaataaagggatggaaaaagacactccatggcaatggaagccaaaaaaagaggaatagctatactaatattagacaaaatagatttcaagacaaaaactatgaagcgacaaagaaggtcaacat------ataaaggggtcaactcatcgaaaggatataacaattgtaaatatatatgcactcaacactggagctcccacgtatataagtcaaatatgattagaGCAAATACTGTAATAGATGGAGATGACAAC s rheMac1.SCAFFOLD26339 1155 708 + 9374 aaactgag-agatggtgttaaggtgtagagtcttcatctgtttagtttttgtgctagtttgtttgcttatgcaaacagtgataagttgtaatcagcttgaaataatgggttacaagatagtatttgcaagcctcatggtaatcacaaatcaaaaaacataatacaatggat--acacaaaaaaataaaaagcaagaagctatatcatatcaccagagaaaataaccttcact-aagaaagataggaaggaaagaaagaagagcagaccacaacataaccagaaaacaaataacaaaatatcagaagtaagtccttactaccaataataacattgaatgtaaatggactaaactctccaagcaaaaggtatacgctagctaattgggaaaaaaaaaaaaaatcactaatcagttacctataagaaacacaattcacctatacagacacgcaaagatagaaaataaagggatgg-aaaagatatttcatggcaatggaaaccaaagaaaaaggagtagctatactaatattagacaaaatagatttcaagaaaaaacctatgaagagacaaagaaggtcaacatacaatgataaatgtgtcaattcatcaaaaggatataacaattgtaaagatatattcactcaacactggagctcccaggtatataaatcaaatatgattagagcaaatattataatagatggagacattaac a score=3656 s hg17.chr12_random 47501 126 + 466818 TGAGTGCAGCCTGACTGCATTTCCCCTCAGTCATTAAGCCTGATACTACCCACCTCTCTTTTCCTGTCTTGGGATTTACCTGCAGCAGCTGAAGTGTGAGAACCTGCAAGAGTCTGTCAACATCCA s rheMac1.SCAFFOLD60085 75027 117 + 201758 TGAGTGCAACCCAATGGTGCCTC-------TTGTCATGCTTGA--CCATCCACCTTTCCCTCCTTGTCTTGAACTTTCTCTGCAGCCCTTAAGGAGTGAAACTCTGCAAGACTCGCTCTGCCCCCA a score=8956 s hg17.chr12_random 48357 107 + 466818 TTTTTCATGATGGTAGCCAGATCTAAAATTTTATAATATAGCAATAATACATAGGTATTATTTTTACAGTCGGGTGTTTAGATTTTTAAATAACTTAATGTTTTTCT s rheMac1.SCAFFOLD149119 78 106 + 893 TTTATCATGATGGTAGCCAGATCTAAAATTTTATAATATAGCAATAATACATAGGTATTATTTTTACAAT-GGGTGTTTAGATTTTTAAATAACTTAATAtttttct a score=5179 s hg17.chr12_random 48921 357 + 466818 TTTATTTTTGTTT-TATCACTTATCTGTACTATATTTTAGTTTTAACTATTCTCCACTTTT----------------------ATGTTTATTGACAT----CTATGGTTAAGAAAGTTCAGCTTGGGAGATG------------------ACAGTAGATTGGATTTTTAGCCCCAATTATTTATTCCCTT-TAATAGTATTAC----TCACAGCCTTTG-CATGTAACTTTGCTGTGCTCTCCCACTGTGGGCAAAGTATAATTTCCATGCCCATTAATGTTGTACTTGTCT--GTGAATTGCTTTAG-------AATATTAGCAGAATGTATATGAGCAGAGATCTTAAAAATGCATTATCAGTTTGTCTGGGCCTTCTTGTATTTTGATGA-TCACCATG---AGAATA-GCCACAGCTA s rheMac1.SCAFFOLD85066 104297 416 - 177132 tttattctcatttctaccacatatttg--ctgcattataattttgagtaCCTACCATTATTTTTTTTTAAAAGATGAGTGAGAATATTTAGTAATATATAACTAAAGCATAGAAA---TACTTTGGGATGTCTAAAGAAAAGAAAGATCCATAGGAATATGGATTATTGACTCTAAGTCTTCCCTTCTTCATAATGGGATTATACATTTATGCTGTTTGACATATAACTTTATAGTGTTCTCCCATTGTGGGGGAACAATACTTCCCCCACTCATTTATATTGGGCAATACTAAGCAACTTGTTTTGGTCAATAAAATGTTAGCATATGGGCAATGAGAAAAATCCTTAAATATGCTAGCATAGTTTGACTTGG-CTTCTTGTATTCTTTTCCTTCACCATGACAAGAATATGCCATAGATA a score=6409 s hg17.chr12_random 50330 344 + 466818 ACCCCCAAAAA----------AATGGCAAACAAGAGAGCGAAACAAGTGGTTTGTGTCCAGAGCAAAATAGTGGAATGTTTTTTCTACTTTAATATTGAAATAAAGAAGtaatatttaaaaatagtataaaatatttttGAGTTTTGAAAAATAGTATATAGTATTCAACATACTCAATA----CTGGAGAC----AAATTTGTTAGAATAAAGTCACTCAAATAAATCTTATGATACATCAGCCAACTTTGGCAGTTTACGGATACAATCAAACAATGCCAAAATGTTTTTTATCAATAATTCTTTTAATTCTCCCATCAGTAGCATATACTCCAATTCAACTGAAATACATTAAAAGAGA s rheMac1.SCAFFOLD125516 2630 338 + 48937 ACCTCCAAAAATTATCAGGCAGATAGCAAACCAGAGGGTTGAGTA-TTGATCAGTGTCCAAAAGGAAATTGT---ACTTTTTTTCTAGTTTGGTATTAGCGCAAGTTAATGGTGT--------GGTGTGAA-----CGTAAGTAC--AAAAGCATTAAGCAGTATTAAACATAGCTGATAAATTCTGGAGATGGCTAAACTTATGA----AAAGTCAGTTAAAGGAATCTTACAATGCCTAAGGCAGTCAATGCAGTCAATCTGTACAATCAAGCCATTTCCAAATA-TTCTAATCATGAATTCTCCTAATATCACCCTCAGCAAAATATTCTTCCTTATAACTAGAATACACAGAGAAAAA a score=5446 s hg17.chr12_random 51389 317 + 466818 TTTCATGGTGCCA-----TATTTCTTGCAGTGTGTCACATCTTCTGCTTAATTGTAGAGTTTTAATAGAAAAATCCTTCATACATGT--GGGCACAAATTTTATATTAACATAAAAACATTTTCATTCCTATCAAACAGTTCTGCCAATCCCAGGCAG----------TAACACTCGATCTGTAATTTTGATTGAAGGGCTGGATTCAACTTTGATTACATGCAAATAGGAGAAAAAGTAACTTGCACTGATTTGCAATTTTCATTCTGCCCTAAAGCTTGGGTCACTTGGATCCAAATGCCAACTTTCCTAAATCTCTGCTCAAAAAAGAGAG s rheMac1.SCAFFOLD125516 2976 326 + 48937 TCTCATGTTGTAACTGTTTGTCTGCTTCAGTATAACACATCTGATGCTTGATTGTACAGTCTTGATCCAGAAATTGCCCAGTGTTGCTAGGGAACCTAATCATTGGTATCATTGATACAATTTGTTCTCCTTTCAGC-GTTGTACTGAATCTGTGTAAAAGTTTCCTTTAAATTTCAGTGTGTGATGATGATTGAAAGGT--AACTCA-TTTTGTTAGCATGCAAATGTGGGACAGACT--CTTTCACTGATTTGCAATTTTTCTCTTGCCTTTAGGCTTGGATCCTATGAATCCGA--TCTTGCATTCTGAATGCATTTCTTATATAAGAGAG a score=31071 s hg17.chr12_random 51987 862 + 466818 tttgaactctttataaatacaaccttaatatattttcttcttgtttatgacttctttttttaagcattatgttgataaaatgtatccactttgttgcatgtacatgtggttcattgctttcaatttctctatattgttccattatatgaatttgctataattattaatccttccttaatttataggtatttgagctgtttctttttagaacaattacaaataatactaccatgggcattattttacatgtcattcaatgcacttctcttggatatata--gctagAGTATATGCATTGAATTTGATACTCAGACTCTCTTCACAGACAATGAAAAGGTTAAATAATAATTAAACTAAATTTAATCTTTtcaccttca-ccccagtctatat---gttattggcatacattttattcattacctcttttaac--acaagatattattgttctatacagtcaatagtccttttag--ttacgcac--atttgccattgccttta-ttttcattccttcttgcatcttcaactttgtattttcagtaactttt-ttctatctgaaaatgtatccttttgaatttctgtttatgaaatgtctgCTACTCCTTTGAaacgcactgaaaatat-attacattgaattctagcttccatgctttctgctgaaa----atcagttgtcattcaaacagttgatcctttcaacataatctat-cttttttctcaggctacttttcaaattttctattggtctttggtttcctgtagcatttatatgttaatttgttttcagttatcttgtctgaggtttgttggtttctcgaatgtatggattgatacattttattatttttggaaaggtctcagcaacattacttcttcc s rheMac1.SCAFFOLD85456 62860 865 - 81052 tttgaactgtgtagaggtgagatccta------tatgttcttattcatggcttcctgggctcaacattatgtatctaaaatttcatcacataggtgcatgtacatgtgattcatttcttttcacttctctatatttttccaatttatgattttactgtaattatgtatccatccttatttgatgtacatacgggcagcttattttttgagctagta-gaataatgccacaatgaacattctttcacataccatttgctacaattccttcgcatatatacagctgg-gtataggact---accaggtcCTT-GATTATCT-CACAGTTATAGAAAAGCCCAAAACATGGTTTGACTAAATTTATTCCTGTCACCTTTATCCCCAGTCTGTTTATTGCTATTTGCATATATCTTATCAATTTTACATTtaatccaacaagacactattcttttatacagtca-tgatttatttagaattacacacttatttttcattgtcattaatttttattgctcattgcatgttgaactttgtattttcagtaatttttgttgtatcagaaaa-atagcattttcaatttctgtttatgaag-gtctACTACTCTTTGGAAATGCACAGAAGACATGATTCCTTTGAATTCCTGCTTCCATATTTTCTGTTAAAATCAGGTCAGGTTGTATTTAGAATGCAGTTCTTTTCAACATACTCTATACTTCTACCTCTATCTACTTTTCAGATTTTCTATTGATCTTTGGTACCCTTTATTATTTTT-TGTTAATTTGGTTTTAGTTATCATGCCTGAAGTTGGAGATTACAAAAAATATATGGAGGGATACATtttatcacttttggaaaaatccttgcaacatttctgttgca a score=10875 s hg17.chr12_random 52849 430 + 466818 ctacattctctcttctaatcttccagaactccaaaagtatgttaagcctttctgactgtagcctcaatgctcttcccctttagcctgtatttttccatctctttgtctaattatgcttcactctgtgtagttatcttccaattcactaattctttattctaccatttctaactgattgttaaatctaATTGATTGTTAAATATTGAATTCTTAATAT-------TAATTTTTTCAGTC--ATTATTTTGGTGGTAGAAAGAAACTTTCACTCTATTTCTGTAAGTTATTT-CTATGGA-----TAAATAAAATACTCATAATACCAAATTCTTAAAGATTTTTTAAAAACTTTTAGTAAACTTGACAAGAAAATACCAATAATTCTCTTCTTTTACCCACACTTTGGTCAAAGAAAACACCAAttttttttttttttttttttag s rheMac1.SCAFFOLD85601 25496 357 - 44828 CTatgttctctcctctaatcttacagaactccagaagtatgttatatatt-ctgactgtagcatgaatg---ttaccctctagtcttatgttttccatctctttctct--ctattcttcgttctttgtagctatcttccaattcactaattatctcttctactccatctaactgatt---aactctgtcta------------tagattcttaatATGGATAATTCATTATTTTAGTCTTACTCTTTTAGTGTTCAGAATAATCTTTTATTCTCTTTCCATAAATTATTTTCTACAGGGAAACTGAACAAACTAATCTTAACACCGTGTTCTT--------TTTAAATGTGTTT-------TTGAT-----------------------------------TTTTGGG-----------------TTTTTTCTTTTTTGTTTTAG a score=378 s hg17.chr12_random 53425 23 + 466818 tttttttgtatttttagtagaga s rheMac1.SCAFFOLD85601 25853 23 - 44828 TATGTTAGTAATTAAAATAGTAA a score=538 s hg17.chr12_random 53452 50 + 466818 gtttcaccatgttag---ccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatctg s rheMac1.SCAFFOLD85456 64079 43 - 81052 GTTTCAGTATGTTAGAAACGAAAATGGTAACAATTTTAT----------TCTT a score=25905 s hg17.chr12_random 53517 860 + 466818 caaagtgctgggattacCCACACTTTGGTCA-AGAATAGAATAAAAGTGTGAGTCTAATCATTCTTAACCAAGTTGAAAAGAACTAAAAATAAATTTGATGCAAGTAGCAGCTTCT-----------------------------------CTGTTGCTGCATCTTCACCACAGACTCTTATTACATGAAAATTCAAGGAGCAGAACTTGATCTCAAAATGCCATTACCATAAATAAAAGATAATACATCAATCACAGCAACACCATCTTATAACATGGCTTAATATTTAAGTAGTCCTTTTACTCTCCTTACACTGTTAGACATGGGGCTTTGTGCCTTACAAGTCCATCATCAAGAGAGTATGATATTGAAGATGTGAGGGCTTATTTCTGTTTGGTTCATTGACTTTTAAAGCCTCTCTTTTGAAATAAGAGTTTAATTATAAAATGGTTTATTGACTTTATCTCTCTTATTATACAAATGCTATTTACACTAAAAACTAAATATTTCTGGTAGTTAGCCTCTGATGAGTTTAAGATTATTTATAAATCATTTGTTCAAGCAATGCATTTTAAGTAAAAATACACTCAACT-TCTAACTCTAAATGTATTAAGTTTCACATAAGCCTTGCTCTTTAATAATGCAACTTACCCACAATAATAATCTTTAGGAAATTACCTAGACATTCTCCAAATCGTGCATGTAAACATTTAAAAAACAAATAGTTAAATGAAATATAtgatgatgatagtggtggtggtggtgatgatgatATTAATAGCTAAATGAGAGAACCCTACCTGATAAATGTGATAGATGTGACCTCACTCTAATTTCCTGAATGGAAGAGTTCATTTTGTCTGGAGAAAACAACAATTCTTCCCTATGGCCTTAT s rheMac1.SCAFFOLD85601 25876 848 - 44828 CAAATTTCTTCTTTTCCCAACACTTTGTTCAGAGAATAGAATAGAAGCTTCA-TCTTGGAATTTACCTTCAATTTGAAAGAAACTGGAAATTAAGTTGATGTTAGTAGTTTTTTTTGGGATAGTAGTTTGTCTGTTGTTTAATGTAGGTGTCTGTTGCTAGGTCCACACCACAAAATCTCCTCCCAAGGAAACTCAATGAGCAGCACTCCATCTGAAAATATCACTGCAATAGATAAATTATAGTTCATCAACCACAGCTACATCATTGTATTCCAGGAATTAAT-------------TTTCACTTTGCTTATGTTG-TAAAAATGGGACTCTGTGCTTTTGAACTCCAGCATTACCTAGATGCAATAGAGAAGATGT--GGACTTACATCT-TTTATTTATTTAGCCCCAAAATCCTATCTTTAGAAACAAGAGCTTGATCATGAAATTGTTTA-----TTTATTTTTCTTATTAAGC-AATTTTATTTATACTAAAATCAAAATCTTTTT-ATACTGTTCCGGTGATTGGTTTAATATCATCTAT-AATTGTTTTCTTAAGCAATGTGTTTTAAACTACACTACACTTAACTCTCTAAATCTAAATGTATTCAGCTTGACTTGAACCTTGCTGTTTACTAATGTAACTTTCCCACAGTGATGTCCCTTA-GAAATTACATAGACTTTGCCCAAATTATATATGTAAACATTTCCAATATAAATTATTTAATAAGATAGATGTAACTGTAGATGATGATAATAATCATGATGATGT---CAGCTAAAAGGGAGAATGTTGTTTAATAAATGTGTC-------------------TTTTCAAAGTACTAGAGTTAAGGGTGGTGGGAGAATACTATTATTCTTTCTCATGGATTTAT a score=8972 s hg17.chr12_random 54377 255 + 466818 CATTCTTACACCATTCTCTGCATCAGGGCTTAACCTGGAAGAATATTTTCACCTACTACTTCATGAAGACTAATATAAAACCAACATACTTCCCATGATTTACCAGCTAT--TTTTTCCCTTTATTCCATTTTTAAAATTATGGTAAAAGTTACCTCAAAC-AACAGTGCTGGGTTTTT-------------------TTTC--TTTCATATGGACATATCCATTTCCTCTAT----TAAAATAATACATGATCTTCATTTCATATTTTAGTAACATCATTTG s rheMac1.SCAFFOLD85601 27040 277 - 44828 AATTCTTATATTATTCTCAGCATCAGG------CCTAGACAAATATCTTCACATAGTATTTCATCAGAAATAACATAAAACCAACATATTTCCAATGTTGTTCTTGCTATTATTTTTTCTTTTACCACATTCCAAAAATTATAGTAAAAGTGACCTCCAGCAAATAATACTATTTTTTTGGGGGGCTGTTTAACTTTGTTCCAGTTTCATATTAACTTACACAAATACTCTGTGCAATTAGAGAGTGAATAAGCTTCATTTCATCTTTTAATAGCGTCATTAA a score=2684 s hg17.chr12_random 54632 51 + 466818 CAAGCAAAATTCTCTTAACTGCTTCATTACATTCCCAGCTACTGTGATTAC s rheMac1.SCAFFOLD85601 27635 51 - 44828 CAAGTGACATTCTCTCTACTGCTTATTTACATTCTCAGCTACTGTCACAAA a score=3846 s hg17.chr12_random 54683 69 + 466818 ATCTGGGTTATTTTATTACAGTAGTCAAAGTAGCACTACACATCCACAAACATATCCAAGCATTACACT s rheMac1.SCAFFOLD85456 50769 69 - 81052 ATCTGGATTATTTTACTCTAGCAGTCAAAGTAGCATTAAATATGCATGAACATACTCAAAGATCATGCT a score=11299 s hg17.chr12_random 54832 307 + 466818 TGTTCA---AAAAATTACATTACACTTTTT----TCTGTGA---TTTTATATATATTTATTCATATTGCCTTGTATATCATATGTGCATTTATTTATATTCCATTATAAATGTTTAT----CTTTTTCTCCAAGTCTCACATACTCTATTGTTATTAGCAGGCATTATTATAGTAGAGACATTTCCTTGAATCAGACATTATGTCCGGCAACTTTGAGAAAATATGGTTAGT-----GAATATTTTAAGGAAAATTTCAGAATTATTTAACAAC-ACTTAAAAGGACTCCA--AAAAAGAAATTGTTAAATATAAAATTAACTTATGAG s rheMac1.SCAFFOLD85456 66802 316 - 81052 CATTTATTTAAAAATTGTA--ACTCTTTTTAAATTCTATGACTATTTCATGCACATTTATTAATAATGAATTATATAT-----------TTGTTCATATTCCTTTATTAGTTTTTCTAATATTTTTTCTTAAAGTTTTAAATACTCTTTTGTTATGAACAAGTGTAATTATACTAGACATATTTCTTTTAACCAAACATTATGTAAAACTACTTTGAGAAAATATGATTCATTAGCAGCATCTTGAAAGGCAAATTTCAGCATTGTTTAACAACTTCTTAAAAGGACTCAAAGAAAAAGAAATGTTGAAATATAAAAATAGTCTATAAG a score=17973 s hg17.chr12_random 55187 908 + 466818 TCTATGAAGTTAAAGGTTTTGCTTTTTTCAGAGAGAATTTAAGATGCCACAGTAGTCTCAAGGAGCTCTGTCTTAGCTTGTTGTTTCCCAAAATTATAATAAATGAGTGGCCTGAGGGAAAGGCAAGTAAAATCATCATAATAAACGTCATGACCTGATAATTCTCTA---CCTCAAGGAAGATCCAATCTCCTATTAAAGTGGAAATAAAGTTAATAAAAAAAAGGAGGAGGAAGGCTATCACCATTTTCATGGCCCTTTTATGGGCCTCTGTGCTGGAGTCCCTTGAGCCCAGAGAGTTGAGCTGCAAATTCTTGGTGTGTCT-CACTAAGGATATAAATAAAAGGAGCAAAGAGGTCAGAGTCAGAA-GAAAGGGAATAACGTATGT--CAAGCTGAGAAGCCTAAGGCCTTGAAGACAGACTATTTTACT-----TGTATCTGAGTGCAAAGTCATGTTTTTTTCAC-----------------AACTCACTAATGGCATTGGACATAAAAAGGTAAACAAACGATAAGAACAAAGACCGCAGGAAAAGCACAAGAACCACTCTGTTCATTCTCCACTTCAGCCAGGCAAAAAATAAGCGGGAGAAATTGGCTATCTTAAGCAAGTAGAAAATGCTTAGGCAGGTGGCAAACTAGATACTTAACTGATTAATTAATGCCCAAAGAATAGTAAACAGTTTTACTAGTTTACGGATGGTATATAGATGAGGGGACAATACCATTATAAATGAATCAAATAGTATTAAATACAGTCGAATGATTCTGACTATAGCCAAGCTGGTGAGGATGAAATCAGCTGATGAGACCTTCCAACTCTTGGCCCACTCAATGCAGTTTACCAGTCCAATGAGCCCGTTTCCCAGCATTCCTAAGACAAGTCCTCTTGTTGCCACCACCAGAAAGAAAATATTAAT s rheMac1.SCAFFOLD85601 43434 913 - 44828 TTTATGGAGATTGAAACTTCTATCCTTTCACCCAATACCTCACGTTCCACAAAACTGAAAGAAAAGTCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCTAATCATGATGAATGGGTGGGCTGAAGGATAGCTGAATCTAATAGCTTGGCAGAACATCAAGACAGGTTTGTTTCCCAGACTCTCA---AAACTCCAAATTGATATAATTACAGACACAAAGTAAATGACACATAACAAGAGGAAGGAGATCACAATTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCTTGAGATCCTCTGCCATGGAGCTGCATCTTCTTCAGATGTTTACACAGAGAACA-GATTAACAGCAGAAAAGATATCAGGGTCAGAGTGAAAGGTACTAAGTTCTGTAGCGTGGTTACAGTCATA---CCTGGATGGTAAATCGCATTCCTCAATATGTACTT-----CCAAGTCATGTTTTCTTCATATTCTTTTGTCCGTACAATCTCATTCATG---TTTACCATAAAAAGATGACACGCCAAAACGAGCAAAGGCCCCAACAGCATCACCAGAATGACATTCTTAACTTTCCTCTTTAAGTGAAGAAAAATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGACTAGTAGCAAGCCAGTTGCTGAAATGGTTGGTTACTGCCCAGA-CATTGTAAGTGGTAGTTCTTACTTCTACACTATAAAACGCT--GGATTCAACACAGTTGCATACCAATTTAATAATAATACCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACCGCCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAGGAGATCTTTTGTCTCTTGACCAACTCAACGGAGTTTACCAGTGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAA------TGTAACCACTACTAGAGTGGATAAAATGAT a score=-307 s hg17.chr12_random 56095 137 + 466818 TCCAACGAACAT----TTCTATGAAAATATTTCCGATATTCTACTTCACTGACA-------GCTTTATAGTCAAACAGTTGCAGA--------TGGGCATG-CATTTA-----TGATG-------CTTTCTATCTATGTTTTCATCACAATTTCAGAAGGCATAGCCAA s rheMac1.SCAFFOLD110213 13258 165 - 136334 TCTATTGTACTTGGCATACCA-GCAGAGACTTCTGATTTTGAATATCACTGATGATGAATTGACTTTCAGCTGACCAG-TGAAGAACAATGTCTCGGTATACCACTTAGACCGTGATATAATTGTCTTTCTCTTTCCTTTTTGTTGGCGGATGAAGAAG--ATAGCCAG a score=-1166 s hg17.chr12_random 56303 176 + 466818 AACCAAATTGTTAAGAGATACAAA--------------GCTTCATGAAT-------ACCTTTCTTACCACTTTCAGTCAGCTACTATATAATTTCTA-------------------GAACAAACACT---AATGATGTCTATTTATCTTCAGCATCAGCCACAATTT-----------------TCCATTCATGGTAATG-------------------ACTAAAGAAGCGAAGTCGAGTATGTAAACATGCAAA s rheMac1.SCAFFOLD110213 13498 247 - 136334 GACAGAAGGGCTCTAGGATGCAAATGGGAATGGATCTGGTTTCTTAAATTTGCACAATCTTTCTTATT--------TTAACCTCTGTATATTTTGGATTTATCAATCAGAGCTGTTGACCAGGAACTTCAAGAGGTATCAATTGCTTGGAAAATACGGCTAGAATTTAATTTGCTGGCCGACTATCCACCCTTGTTAGTATATTGGCATAGCTATCGCTATTACAGATTCTAGGTTTAATGTGTTAGCTTGTGTA a score=2829 s hg17.chr12_random 56485 255 + 466818 AGATCATTTTTCACTAATTTGCATTTTCAT-CTCCCCTGAG---CCATACCACTTGAATACAAATATCTTAAATTTTGAATAGAAATTGTTAGAAATAACATTTAT------TTCAGTAATTATTTGTCTCTCATTCAGTAACATCCTTCTACATACCAAGCATTTTTGTTGATGCAATATGATTTATAGAAATAAGTCCCTAAAATTATTCATAATTCAAGAATTTCACCCAAGTCCTAAAACTATTAATATAAATAATTTGTA s rheMac1.SCAFFOLD125516 15170 236 + 48937 AGATTTCTTTACACTGATTTGTAATTTCCTCCTCAACTGAAAGTCAATACCATTTGGATTTGaatattttaa--ttttaaaagaattatctaaaaataaCCTCTATAATATGTGTATTATTCATTTGT------TTCATTAAACTCCATC-ATATTTCCGATTCTACTTTAGATGAATTAAGTGTAATAAAAAGAAGCA------------------TCAAAAAGCTCACAGAGTAGTGAAAAAAATCAACATTA--AATGTGCT a score=18435 s hg17.chr12_random 56740 462 + 466818 TGCAATGTTACAGGAGCTAAAAAGAATAAACAAAATATACCAGAATTAAAGACGAGGAAGATACAAATGCTTCAGTGAAGAATTGACTATAGTTCTCTGAGGTTAGGGACATTCAGTTTGAACTGGAATTtttgtttgtttgtt-tgtttgtttgtttttttgagacagagtgagactccatcacacaggctgtactgcagtggcacaatctcagctcactgcaacctccgcctcccaggttcaagcgatccttctgcctcagcctcccgagtagctgggactataggcgagcaccaccacgcccagctgatttttgta---ttttcagtagagacggggtttcaccatattggccaggcaggctggtctcaaactcctgacctcgtgatcctcctgcctcagcctccaaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacgcctggccCTG------GAATTCTTTAGAAT s rheMac1.SCAFFOLD110213 14007 424 - 136334 tgcagtgttgtct--tctcaacagaaggtaca-------------------acgagggaaatAAACATG----------AAATTG--TAGAGTTGTC---AGTAAACGGGACACAG--------AAAATTCTGGTTTAGATGTTAGGGtttcttttttttttgagacggagtcttactctgtcgcccaggctggagtgcagtggccggatctcagctcactgcaagctccgcctcccgggtttacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacagacgcccgccaccttgcccggctagtttttttgtattttttagtagagacggcgtttcaccgtgttagc----caggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccgcccgtctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcttgagccaccgcgcccggccCTGATGTTAGGGTTTCTTAGAGT a score=9838 s hg17.chr12_random 57429 235 + 466818 ATTAGAATGCTAACAATGTGAATATAAATATTTCATTTAGAGACACatttttaatacatttaatttaatatatttaatatCCATCGTACTATAATTTATTGTAAATTCCTGAATTTCTTACACTTTCAAATGTG--TATCAAAAATAATTAAATTGGAAATAAGAAAAAAGGTGTCTA-TCAATCATGGATATTCAAATTTTGATGTTTCAAATTCATATTAGCACTAAGAAAGTGGA s rheMac1.SCAFFOLD85601 27845 234 - 44828 ATTTGAATGGTAAAAATATGTGTATAATTACTTAATTTAGGGATAAATTTAGAAAA----TTGTCCTTTATATTTAATATCTATATTACTAAAATACATTGGAAATTCACTAATTTCTGCCACTTTGAAATGTTGTTATCATAAATATTTAAACTGAAAATAAGAAAAAAGGTATCTAGTAAAATACAGATGTGCAAAATCTAATGTTTCAAAGTAAGAATAACATTAAGAATGTGGA a score=1823 s hg17.chr12_random 57664 53 + 466818 TTAACAATTCTTGCCTATCTCTTCTTTTGTGTGAATTAATTT-AAGTAATGTTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 65924 52 - 81052 CGTAGACTTCCTGCTTATCTCTTTCTT--TTTAAATTAATTTAAAGTAAAGTTT a score=4527 s hg17.chr12_random 57717 55 + 466818 TGggccaggtgtggtggctcacacctgtaatcccatca-tttgggaggctgaggca s rheMac1.SCAFFOLD31009 13447 56 - 42162 TGggccaggtgtggtggctcacatctgtaatcccagcagtttgggaggctgaggca a score=688 s hg17.chr12_random 57772 12 + 466818 ggtggattgcct s rheMac1.SCAFFOLD85601 28079 12 - 44828 GGTAGACTTCCT a score=2820 s hg17.chr12_random 57784 41 + 466818 aagcacaggagttcaagacctgcctgggcaacatggaaaaa s rheMac1.SCAFFOLD31009 13515 41 - 42162 gagcacaagatttcaagcccagcctgggcaacatggcaaaa a score=348 s hg17.chr12_random 57825 10 + 466818 ccatgtctct s rheMac1.SCAFFOLD85601 28091 10 - 44828 TCTTATCTTT a score=1386 s hg17.chr12_random 57835 22 + 466818 acaaaaaaatagaaaaaattag s rheMac1.SCAFFOLD31009 13566 21 - 42162 gc-aaaaaatagaaaaaattag a score=10583 s hg17.chr12_random 57857 136 + 466818 cagggcgtagtggtgcacgcctgttgtcctagctactctggaggctaagatgggagaatcacttgagccaaggtgacagaggctgcattgagccaagattgttcttgtgcactccagcctggacaacagagtcaga s rheMac1.SCAFFOLD31009 14855 136 - 42162 cagggtgtggtagtgcacacctgttgtccttgctactctggaggctgaggtgggagaatcacttgagcccaggtggcgaaggttgcattgagccaagattttgcttgtgcactccagcctgggcaacagagtgaga a score=13630 s hg17.chr12_random 57993 295 + 466818 tcctgtctcaaaataaaa-atagaaaaGTTTTAAATTTTAACTTGGATTTCTTAGTACCATAATCCTCTATTCTT---TATTCAGCAAAAACTCTAATTACAATGATATCTATAAGAATATGCTGCATCACCCTAATTTTACACTTAGAAATGTACTTTAGGTTTCTGCTTTTTTAACATTTT--TTATTGTGGAGCAAAACATACAGATACAGAGTAATAACAACTA-ATAAACAGTAAGATAAAAAATTATAAGGTTAAAATTGATGTTACCATACCTTGGTAAGAAAATAGAATTTGCC s rheMac1.SCAFFOLD85601 28101 299 - 44828 TCCttttttaaattaatttaaagaaaagtttaaaattttatCTTGGATTTATTACTATCATAATGCTCTATTCTTCTTTATTCAGCAAAAATTCTAATTACCATGGTATCTATAAGAATATGTTTCTTCAGCCT-ATTTTATATTCATTCATTTATTATATGTTTCTGCTTtttaagtgttttcattactgtcaaacataacatat--atataaagtaataaaacctagatgtacagcaaagaaaaaaattatagcattaagagtcatgttaccacatcttggtcatgaagtagagttcgcc a score=5187 s hg17.chr12_random 60278 58 + 466818 CATACACAAATTTCTAAGCACACAATAAATGCTCAAGAATGTTAGTGGCATTACTGTT s rheMac1.SCAFFOLD26465 1086 58 - 27862 catatacaaatttctaagcacacaataaatgctcaagaatgttagtggtattactGTT a score=28534 s hg17.chr12_random 60336 386 + 466818 ACTGTGGCTGTTTATTGTATTTTAACACCTAAAGAAATTCCTCAAATAAAATTGGTGTTAAGTCATTGTGAGGTGCTTCAATATGTAATATTTTCTTTCTACAGTTCACTAAATTACTTTTTCTAGTAACCAGTTTCCTGGTTCTAATCAGATAATCACACGTGTTTAGATGGGCTTGTGCAACCTAACTAGGCTACCCTGTTGCTGTACCACCACTACCAC---TCCCCCATCCAACTTCATTGAGTGCTTTTGATGTGGACACTAGGATgttccagattcactttatttagatatttgattcaacggtgaccaacacagtcaaagatacttcgcacagataagatccaaatgaaagaGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGGAAGA s rheMac1.SCAFFOLD89827 17323 368 + 22897 aCTGTGGTTGTTTATTGTATTTTAATTCCTAAAGAAATTCCTCAAACAAAATTGGTGTTAAGCTGTTGTGAGGTGCTTGAATATGTAATATTTTCTCTCTACAGTCCACTAAATTCCTTTTTCTAGTAACCAGTTTCCTGGTTCTAATCATATAATCACACGTGTTTTGATGGGCTTGTGCAACCTAACTAGGCTACCCTATTGCTGTACCACTACCACCACCAGTCCCCATTCCAACTTTATTCAGTGCTTTTGATGTGGGCACTAGGATgttccagattcagtttatttagatatttgattcaatgatgaccaacacagtcaaagatacttcacacagataagatccaaataaaagGGTGAAAAA---------------------A a score=65527 s hg17.chr12_random 60736 1380 + 466818 agcaatccagatactcccgatatatgtcttcttgttgatat-------------tttcctcccttctgactatcccaaattgttatgatgatcactcatatgatgatcactcatatgtttcactgtagggttttatcaccaatgtaatgaatgacaatgtattaaaaataaagtttttcaaactttacgtcaatgagattacagtaaatgtatttttccatcttgataattcctctcacatctgtattattatctatgtagctcaaatttgttcattttctttgttgt-attattctgttgtaaacatgtcagtcttgtttgttaattttgatcactgtatagtattccactgtataagtatgccacaatttctttatccatttggaggactgagacatttggaggacttctcaactttagctattaaaactcagtgatatgcatgtgtatgtatatgtattctgataagagtgtaaatacttgatcttaggatatgatccttcaccttaatgagataatgccatactcagccgaaatgatggcacagatttataattctagga----------------gtagtgtatgaaaattcccattgtgtcatatcctttccaaAATAAATAATGTTGGGCtaatatatacatttttgtatttatataaaatattattaaac--aatattttCCAAGTCCTTTTCTATTCTTATTCAGAATGTATGTTTACTTCAATGAATTACATTAATCTTTTTCATTCTATGACTATTTCATATACACTTATTAATAATGCCttatatattatacatatttatttatatttcattat-aaattGTCTAACCTTTTTCTTCAAATTTCAAATACTCTT--GTTATAAGTAACTGTAATTATACTGGAGATACTTCCTTTAATCAATCATTGTGTCAGATGACTTTGAAAAAATATAATTAGTTAACAGCATACAGTAAGGGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTC-TTAAAAGGACTCAAAGAAAAAAA---GTTGAAAAATAAAAAGAGTCTATAAGTTTAATGTAGGTGTCCATGGGAAAATATAAATATA----TTATTGTTGATGAAAAAA-TGATTGGTAGTAAATTTATCATGTCTGAATTTTTTTAAAGGCAAGCCTGATATCACTGGTCAAGATTTCCTTTAAGGTCTTGACCTTAACATCTATGTGTACCTGATTCCTGAATTTGCAGGAATGTCCTTGTTCCTTTTTAAATTCTGTGACCAATGTCAAACAGGAAAGCATCTCAATATGCCAGTGGATGAAATCAATGCTGTCTTTATGGAAAACATGATGATTTCCAAAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAACACAACGTCCTTGCTGTAAGATAAAATTTTCCATATTGGTGTTGAAGTGAAAAGTGATT s rheMac1.SCAFFOLD85601 28400 1350 - 44828 agcaatccagacactccccatatatg-cttcctgttgacatcatttcccttttgtttcctccatccctattgtcccaa-ttgttatgacaatcactcatatg---------------cctcactttagaacttcgacaacaatgaaataaattgcagttcattaaaaatatatctttgtaaactttatataaatggaattacactgaatct-tttttccatcttaata-----tctca------------tatctatgtagttcaagtttgttcattttcctttttattaatattct-ttgcaaa--tgtctctctagttgattcattttgattgctgtatcgtattctattgtacaagtatgctgtaattcatttatccatttt----------atcaccgatggacttctaaactttagctattggaactcagtgatatgcacatgtgtgtatatatattctgataagagtgcaa-tactggatattcagatgtgattcaccatcttaatcagataatgccaaactca----aagtaattacactgatttacaattctaggattacaatgctagaactgtaatgtatgaaaattcccattactacatatg-tttccaaaataagtaacatcagactGCATTTTACACttttatatttatttaaaatattattaaaCCTAACATTTTATAAGCCTTTTTCTATTATAATTGAGAATGGATCCTTAATTTAA-AAATTG--TTACTCTTTTTATGACCATGA---TTTCATGCACATTTTTTGAG------TTATATATTTTACATATTCATTCATATTCCTTTATTAGGTTTTCTAATTTTTTTCTTAAACTTTTAAATACTCTTTTGTAATGAACGAGTGTAATTATACTGGACGTATTTCCTTTAACTAAACATTATGTTAAATGACTTTGAGAAA---TA--TGGTTAACAGCATACTGTAAGGTAAATTTCAGCATTGCTTAACAACTCCTTAAAAAGATTCAAAGAAAATAATATGTTGAAATATCAAAATAGTCTATAAGCCTAAAGAAGGTATCCAGGGGAAAATATGAATTTAACCATTACTGTTATGGAAAAAAATGAGTAGTAGTAAACATACCATGTCCAAATTTTTT--AAGGCAGGCCTAATATCAATGGACAAGATTCCCTTTAAGGTCTTGACCTCAAACTCTGTGTGCACCTGATTTCTGATTGTGCAGTAATGTTCTTGTTCCTTTT-AAATTCTCTGACTAATGTCAAGCAGGAAAGCACCAGGGCATGCTGTTGAATGAGTTCAAGGCTGTCTTAATGGAAAACATGATAATTTCAAAAGCAGCTCAAATTAACTCCTACTCAAATACTATGTCCTTGTTATATGATAAAATTTTTCATACTGATGTTGATGTGAAAGCTGAAT a score=15313 s hg17.chr12_random 62116 335 + 466818 TCTCATCTACTAGCATGCCAATGAAG-----AGTTTTTTAATTGTTCTGCACTTACTTCTTTGTTTAACCTCTCCACAATTTGTGTTCAGCAACTTCAGTTGTTAGAGAAATTTTACAACCTAATACAGAGATGACACACTGGTTGTATAACCTGGTAAAGGGAGCTTGGACATAACTAGGATCATCACCAAAGTAAATTTAATTTTTCAACGTGAGTAATATGTAGAGTGAATCCAAACTTTTCCTACCAAAAGGATTCAAGTTTTTCTTGGGAATCTCAGAAAGGCCAATAATTCTTAAAACCTGGTTGCTCCTAAT-----ACTTTTGAATAACTTAttctt s rheMac1.SCAFFOLD85601 29855 345 - 44828 TCTCATTTGCCAGCATGCAAATCAAGTCATACACTTATTCATCATTTTGCAATTTTTTCCTTGTTTAATCTTTTCATAACTTGTGTTCAGTAATGTCAATTGTTGGGGAAATTTTCCAAACTAATACATAAATCATGCATTGGATTCCTACACTGTTACATGTACCTTGGTCTAAACTAGAATCATGACCACTGTTGATCCATTTTTTCAATGCCAGATTTATGGAGAGTGAATCCCAACTTTTCCTACAAAAAGCATGCAAGGTGTTCTTGGGAAACCCAAGAAGGCCAATATTCCTTAAAATCTAGTTGCTGCTAACTAATAATAATTGGATAACTTATTGTT a score=3486 s hg17.chr12_random 62865 40 + 466818 aacagatcaataacaaataaggagactgaatcagtaattt s rheMac1.SCAFFOLD53235 1048 40 + 1229 aacagatcaataacaaataaggagattgaatcagcaattt a score=34687 s hg17.chr12_random 62905 414 + 466818 aaaactttcaatcaaagaaaagcccaggGACCAATTGGAAGAAGAAACCACTGAATTGGAGGCAGTGAAAAAAGGCAACTGGAGCGTACTTTCCAAGAAGTTGCACACAGTGAGATAGCTGAGGAAGGGCCAAATTACTTAGGGTggccaggtg----gcctcacacttccaattccagctctttgtgaggccagggtggaaagatagttcaaggccaggagttcaagacaagcctgggcaacatattgagtccctgtctctacaaaaaatttaaaaaatagccaagcatggtggtgcttgcctgtactcccagctactcaggaagctaatgtagaatcactcacttgaccccatgaaatcaagctgcagtgaattgtgatcgcaccattgcattccagcctgggcaacaaagtgaga s rheMac1.SCAFFOLD182867 40 414 - 684 aaaaCCTTCAATCAAAGAAAAGCCCAGGAACCAAATGGAAGAAGAAACCAGTGAAATAGAGGCAGTGAAAAAAGGCAACTGGAGCGTACTTTCCAAGAAGTTGCACACAATGAGATAGCTGAGGAAGGGCCAAATTACTTAGGGTggccgggtgccctggctcacagttccaatcccagctctttgggaggccaaggtggaaagatagttcaaggccagaagtttgagacatgcctgggcaacatattgagtccctgtctctacaaaaaatttaaaaaatagccaggcatggtggtgcttgcctgtactcccagctactcaggaagctaatgtagaa----tcacttgaccccatgagatcaagctgcagtgaactgtgatcacaccattgcattccagcctgggcaacaaagtgaga a score=29791 s hg17.chr12_random 63319 367 + 466818 cAGCCATAGTTGCCCTTTGTGCTTTTTCCTCAAACATAGTCTATCTACAGAGTATAAGCCATCTTTTTATTTATTGATTTTGCAGCCTTTCTTGCTAGCAGACTGCCTAGAAATTTCCCAATCCACCCAGGCAGCATTTCTACAGCAGTCTCAACGGAGAGAGTAAGGTGGAACAGAAAAGACTGCTATTTAAGGCTCATCTGGAATAATTTTTAATGCACGAAACATTCATGCATACACACACTTGCACGCACATGGTCCTAATACATGGCCAAGTTACCTGNTTATGCCTGGATTATTCAGTCTCCCTTGCTAAACAGAAAACTGTACTATAATTCATTATATTACTTAATGACAATTTAAAATA s rheMac1.SCAFFOLD120026 1174 360 - 373026 CAGCCATAGTTGCCCTTTGTGCTTCTTCCTCAAACATAGTCTAACTACAGAGTATAAGCCATCTCTTTATTTATTGATTTTGCAGCCTTTCTTGCTAGCAGACTGCCTAGAAAGTTCCCAACCCACCCAGGCAGCATTTGTACAGCAGTTTCAATGGAGAGAGTAAGGTGGGACAGAAAAGATTGCTATTTAAGGCTCAACT-----AATTTTTAATGCATGAAACATTCATGCATACACACACATGCACATACATGGTCCTAA--CATGGCCAAGTTTCCCTTTTATGCCTGGATTATTCAGTCTCCCTTGCTAAACAGCAAACTGTACTATAATTCATTATATTACTTAATGACAATTTAAAATA a score=102872 s hg17.chr12_random 63969 1297 + 466818 ACTGTTTTCTTAGGAATCTTCCCTGATTAACAATGTAATGGGTCTTACCATCATGCAAGTACAAGTatgtgccccatgacctttcagtcaataatggactacataaatgacagtatgcacataagagaatggagctggagaattcctatcacctagtacttactatacttgttattttagtgcatactcctacttattaaaaaagttaactgtgaaacagcctcaggtaggtccttcagtaggtgttccagaaagaggcattgctacataggagatgacagctccatacatgattcagccccttaagaccttccagggggacaagatgtggaggtggaagacagggatattggtgatcctgactctatgtaggcctatgctaatgtgt----gtcttagtcgctaataaagtttaaaaaagtaaacaaattttaaaa-tagaaaaaagcttatagaataaagatatttaaaaggaaaatgtttttgtacagctgtacaatgtgatttaagctaagtgttattacaaaagagctaaaaagttaaaagttcacaa---gttacagtaagctaagattattgaagaaaattgttttataaatttagtgtagcctaagtatacagttttataaagtctacagtcgtgtgcagctgcagcaatgtcctaaacattcatgttcactcaccactcactcgctcaaagcagctttcagtcctgcaagctccattcatgcatttttaacttttataccacatttctagtgtacctattgggtttagatacataattacttaccattgtgttacaattgcctatagtattcagtatagtacagtaacatgctgtacaggtttgtagtcaaggagcaataggctatcccacgtagcctaggtgcgtagtaagctacaccatctaggtttgtgtaagcaaactctaggatgctcacacaataacaaaatgcccatgaagcatttctaagaacatatccATTA-----------CCGTATTACCAGTCCAGTTTTGGCCAGTAATAATTTGATAGTAGACCCATCAGAAAATTGCACCATTTTAGTGACATCTTCCTTTCCTTCGAGGTCCTGCTGTGGTTGAACCCCCTGAGCATTTCCAGAG--CTCCAACACTCTTCTGTGCGGACCTCCTGGTTCATGAGATGGGCTTTCACTTCCTTCTTCTCCCCATGTATTAGCTGTTCCTGATAAGCCCTGGTCACCCTCCCAGACCTACAGTCCACCTTGCTTCAGGTGACCAGGTGTCAGGAAAGAATACTGATGGGTTATTATCAACTGCTTAAAGCCCC s rheMac1.SCAFFOLD120026 1534 1301 - 373026 ACTGTTTTCTTAGGAATTTTCACTGATTAACAATGTAATGGGTCTTATCATCATGCAAGTACAAGTatgtgctccatgacccttcagtcaataatggactacataaatgacagtggacccataagtgaatggagctggagaattcctatcacctagtacttactatacttgctattttagtgcatactcctacttactaaaaaagttaactgtgaaacagcctcaggcaggtccttcagtaggtgttccagaaggaggcattgctacataggagatgaccactccatacatgttattgcccatgaagtccttccagtgggacaagatgtggaggtagaagacagggatattggtgattctgactctaggtaggcctacactaatgtgtctgtgtcttagtcactaacaaagtttaaaaa-gtaaacacattttaaaaatagacaaaagctcatagaataaggatattaaaaaggaaaatgtttttgtacagctgtacaatgtgatttaagctaagtgttattacaaaagagctaaaaagttaaaagttcacaaaaagttacagtaaactaagattattgaagaaaattgttttataaatttagtgtagcctaagtgtacagttttataaagtctacagtagtgtgcagc------aatgtcctaaacattcatgttcactcaccacgca--------aagcagctctcagtcctgcaaactccattcatacatttttatcttttatatcacatttctagtgtaccttttgtgtttagatacataattacttaccattgtgttacaactgcctatagtattcagtatagtacagtaacatgctgtacaggtttgtagtcaaggagcaataggctatcccatacagcctaggtgtgtagtaagctacaccatctaggtttgtgtaagtagactctaggatgctcacacaataacaaaatgcccatgaagcatttataagaacatatccattattgacacatgaccgTATTACCAGTCCAGTTTTGACCAGTAATAATTTGGTAGTAGACCCATCAGAAAATTGCACCATTTTAGTGATATCTTCCTTTCCTTCCAGGTCCCGCTGTGGTTGAACGCTCTGTCCCTTTCCAGAGAGCTCTGACACCCTT--GTGCAGACCTCCTGGTTCATGAGATGGGCTCTCACTCCCTACTTCTCTCCATGTATTAGCTGTTCCTGATAAGCCCTGGTTACCCTCCCAGACCTACAGTCCACTGTGCTTCAGGTCCCCAGATGTCAGGAAAACATATTGATGGGTTATTATCAACTGCTTAAAGCACC a score=2715 s hg17.chr12_random 65500 130 + 466818 tgaagtggtgtgctgttataataaaaatctaaaatatatggcaatggcttagcatttggTTTTCAGATGGCGAGGAAACAGAGCGGCCAGATCAGATATCCCAGATGCTGAAGATATTTGTTTGC-TGAAA s rheMac1.SCAFFOLD95755 10251 116 - 38873 tgaagtgcaatgctgcagcatcaaaaatttaaagtagatggcatcggcttAGCATTCGGT---------------AATAAGCACAGGATATTCTCACATGCCACATTCGGGAGAGATGCGTCTGGGTGGAA a score=96365 s hg17.chr12_random 65639 1173 + 466818 GCAGCAATTAGAAGGCAGAAGTACCTTTGGAGTCTATTGCTCTGGGCAAAAATTTGGAAGTGCTCGATGTTAGTGTGTGTTGGTTGATTCTGGATATATTACAAGAGCTCCAAGAAAGAGATGCTCCTCAGGCAAGCATTGCAAAGAAAAGAAAGGGAACAGAGACAGTCCAGAAATATGGAGCACATAGGGATGAAGAGTTATTTACTTCTGGATCCCAAAGCGCAGGAAAT-ATCAGTGAGAAGATGTTGAATAACAAAGGCCCCCAGAGATTTTTCAATTAACAAGAATTGTGGTGGAATTCAGATTAAGTTTGCTGTCTTCCTAGACATGCCTACTGCTTGAGATGGCCTCCAGTTAGCCAATACTAAGTTGAGAGGGAAAGAGAGGTACAGAGGGACAAAATAAATAATAAAGCAGAATTTAAGACCATGTTTAGGAAAGAATTTTGATTTTGGTTACTGGCTTGCAGAACTGACCCAAAGCAAGTAGATCCTAGAACATAGATTTAGGGTCAAATCAAGGAGCCTCCTGTACTAGTAGGTCAAGGGTTTCATCATTGCTAAGAACTACAGGCAGTTAGTTTACCATTCTTTTCTGTCTTGAATGGAGGCTTTTTATTGCTAGTAGCCTG-CCTTATTTCACATTATATAGaggttgaatatgccttatttaaaatgcttgggaccagaagtgtttcaggttttgaattcttttggatttggggaaattagcatatacataatgagatatcttgaggaatagaaccaaccctaaatacaaaactaatttattttttatatataccttatatgcatagcctaaagtttattttatacaatattttaaataattttgtgcatgaaacaaagttttgactgcattttgactatgacccatcgcataaaattagatgtggaattgcctacttatggcatcatgtaggtgcacaaaaagttg---attttggagcattttggattttagatttttggattatggatgctcaacctgTACTGAGTGTTTTGTGTGTGTGTTGGTGGGGGGGCTTACATAAGTTCAGATAACTTGCTTTTGCTTTAACTTGTTTACCAGCAGCCACATCTGGTCTTGATGAAGAAGGTTGCACATCTAACCAGAAGACTGGAACTTTGAGCTAGATGGGGTAAATAGATG s rheMac1.SCAFFOLD123517 2 1177 + 1181 GCAGCAATTAGAAGGCAGAAGTACGTTTGGAGTCTATTGCTCTGGGCAAAAATTTGTAAGTGCTCAATGTTAGTGTGTTTTGGTTGATTCTGGGTATATTACAAGAGCTCCAAGAAAGAGATGCTCCTCAGGCAAGCATTGCAAAGAAAAGAAAGGGAAGAGAGACAGTCCAGAAATATGGAGGACATAGGGATGAAGAGTTATTTATTTCTGGATCCTAAAGTGCAGAAAATTATCAATGAGAAGATGTTGAATAACAAAGGCCCCCAGAAATTTCTCAATTAACAAGAATTGTGGTGGAATTCAGATTAAGTTTGCTGTCTTCCTAGACGTATCTACTGCTTGAGATGGCCTCCAGTTAGCCAATACTAAGTTGAGAGGGAAAGAGAAGTACAGAGGGATAAAATAAATAATAAAGCAGAATTTAAGACCATGTCTAGGAAAGAATTTTGATTTTGGTTGCTGGCTTGCAGAACTGGCCAAAAGCAAGTAGATCCTAGAACATATATTTAGGGTCAAATCAAGGAGCCTCCTCTACTACTAGGTCAAGGGTTTCATCATTGCTAAGGACTAGAGGCAGTTAGTTTACCAGTCGTCTCTGTCTTGAATTGAGGCTTTTTATTGCTAGTAGTCTGCCCTTGTTTCACGTTTTATAcaggttgaatatcctttatttaaaatgcttaagatcagaagtgtttcaggttttgaattcttttggatttggggaaattagtatatacataatgaggtatcttggggaatagatccaaccctaaatacaaagctcatttattttttatatataccttatatacatagcctgaaagttattttatacaatatttaaaataattttgtgcatgaaccaaatttttgactgcattttgactatgacccatcgcataaaatcagatgtggaatttcctgcttatggcatcaggtaggtacacaaaaaagttcacattttggagcattttggattttagatttttggattatggatgctcaacctgTACTGAGTGTTTTGTGTGTGTGTTGGT-GGGGAGCTTACATAAGGTCAAATAACTTGCTTTTGGTTTAACTTGTTTACAAGAAGCCACATCTGGACTTGATGAAGAAGGTTGCACATCTACCTAGAAGATTGGAACTTTGAGCTAAATGCGGTAAATAGATG a score=2566 s hg17.chr12_random 66812 55 + 466818 AGGCTTTGGGTTGGCTGCCTTGGGAAGGGGCATGAATGTGCTTTATTTTTGGAAG s rheMac1.SCAFFOLD35035 52169 54 - 204068 AGACTTTGGCTTGCCTTCTTTGGAAAGGGA-ACAAGTATGTTCTATTTGTGGAAG a score=75861 s hg17.chr12_random 67001 952 + 466818 actgctgacccaggctggcccttctaaatatatcatcatcctggacccagtaatgagttcatcgtcaagcacctgtcccaaacagggccaacaacatcctcacttagggatttatatggatgccaagcaagtttatccacatatgtgatttctagtgttaagaaaaatataggagtt-----------ggggggagccatttttactgtcaaataaaatgagtctaccaagaataaagccaagacagtggcagacagggctgatacatgcagggagagaga----gtcctaatgctgtagtttgaatccctggatacagttgtgtttgcaattaaagtcaccatttggggttcctagtttagatggcaaatacttctccctttgccttagctagttctgatagagttttgtgattctcagctgaaaacatcttaaACTGTCAtagtattgaagctgggacaaaaactcaggttttctgatgccaattcagggctcttttcctcaCCTCATGAGAGTTGTGAAATAATTGTCACTTAAAATTAATAAAAGACTAGTGAGGAACTGTGGTAACAAAGACACTAGCCAGGTAGTAAGATCAATATTTGCCAAGAAATGAAAACAATTCTGTTCTGGAGAAGTGTAATTGCAAGGC-CTGGGAAGTTGTGGGAAGTCTAATCACAGGGGAGGCACCCTAGCTTCTTGCTCAGCACCAAGAGAAGTCTGGTCAAAATCTTATGGTGATATTTGGAAACTAGTATCAAATAGCCAAGCAGCAGAAAGCTAATGGACCAGGCAGTGGGAGGACCTTCGCCTGAGATtagtgtagtagcaagagtatagcttttatatctacatagcccaagttcaatgacagttccttcacttaccagctgctgtggtttgaatgtgtcccctccaaaattcagatgttgccaatgtga-agtatgatgaagtagaaccttgaaga s rheMac1.SCAFFOLD133605 2 965 + 969 ACTCCtgacccaggctggcccttctaagtatatcatc---ctggacccagtaacgagttcatggtcaagcacttgtcccaaacagggccaacaacatcctcacttagggatttatatggatgccaagcaagttaatctacttatgtgatttctagtattaagaaaaatgtaggagtttggtgggggtggggggagaacatttttactgtcaaataaaatgagtctaccaagaaaaaagccaagacagcggcagatagggctgatagatgcagtgagagagacagagtcctaatgctgttatttgaatcccttgatacagttgtgtttgcaattagagtcaccatttggggttcctagtttagacaacaaatgcttctctctctgccttagctagttcggatagagttttgtgattctcagctgaaaACATTTTAAACTGTCATAGTGTTGAAGCTTGGACAAAAACTCAGGTTTTCTGATCCCAATTCAGGGCTCTTTTCCTCACCTCATAAGAGTTATGAAATAATTATCACTTAAAATTAATAAAAGACTAGTGAGGAACTGTGGTAACAAAGACACTAGCCAGGCAGTAAGATCAATATTTGCCAAGAAACAGAAACATTTCTGTTCTGGACAAGTGGAATTGCACAGCGCTGGGAAGTTGTGGGAAGTCTGACTACAAGGGAGGCACCCTAGCTTCTTGCTCAGCATCAAGACAAGTTTGGTCAAAATCTTATGGTGGCATTTGGACTCTAGTACCAAATAGCCAATCAGCGGGAAGCCAATGG-CCAGGCAGTGGGAGGACCTTCGCCTGAGATTAATATTGTAGTAAGAGTATAGCCTTTATACCTACATAGCCCAAGTTCAATGACAGTTCCTTCACTTACCAGCtgctgtggtttaaatgtgtcccctccaaaattcagatgttgccaatgtgatagtatgatgaggtagagccttgaaga a score=274429 s hg17.chr12_random 68996 3381 + 466818 ATCacaaagttgccactttaataaagttagggaagaattgtcttttcaatgttcggtaatgtttcaactgattatccatatggaaaaaatattgaccccctatttcaaaccacacacaacaaatcaattccaaatagttcatagatctaagtgtaaaaggtaaaatagtaacgctctggatgatatcacaggaatatatcttcatgagcttggggtacacaaacattttaaataggatataaca-gcactaactacaaaataaaaattatagttaataaaaatgaagaacttct--attcgtcataaagcatcattatgaaagtgaaaaaagtcacacgtaaagaagtttgcaatataaatatttgataaaatgttt-------------------------------------------------atatccagaatatataaataactcctttgaatcagaataaaaaatccagacaattgaataaatcatgaataaatactttcaaaaagctcctaaaaaaaggggatcctaaatgggtaataaaatatacaaagctattaaacatcactagttatcagagaaatgcaaactaaaaccactatacttcctttagaatgtttaaaataaaacattaaaataccaagaattggtgagaatttgagtcacctgtactatcataaactgctgatgacaatatacatttttaaagccacttcaaaaagtcatttggcagcatctataaacctggttatctgtgtatcctgtgacttagtaaattcactcctggatacacagccaacaaaaatgtatacatatatacagaaaaagacacagaaaatgttcaaggcagcattattttt-aataatttacaattggaagcaagtctaccaatagtaaaataaagaaactgttaaatattaatgaacaatattagacagcaaagaaataaacaactattgctacacaaaacaacatgctaaatgtcatgtaccaaatagtgaggacaagaagactgttatggaagaatttatactatctcatttcatttaatgaagtttagaaataggcaaaattaGAACCATGTTTTGTCATAGTGTAATAAGTGGGAGGAAGACAAAGAAACAGGAGAGAAAGAACTGGGTTTGCTCAGGATGAAAGAGACTTGAGTATGTCCCTAGGCTGAGGAGAAGGAGCAAGACAGACTGGCAGAGACTGAGTGGCACAATAGTAGGAAGCAGACTGATGGAGCAAGGTCTCAGAGGGGCAGAAACAAGTGGGTTCAAGGGCTTACACTCCCCAAAACCCTGCTCATGGATTCCTGGATGACCTGGTCTGACACCCATGGTCAGGAAGCTGGCCTATTCACATAAATGCGGATGGCTTTTTATAATTGGTTTTGGCTGCTCTCCTTTGGTGTTTAAACAAAGATATCCCTAAAAGAAGAATATTTACATTTTATGTGACAATAGTTAGGCCCTAGGGAGTTCAGAAAAGTAAAACCAGCAATGTATTTCCAGATTTCTGGGGACAGATTACCATGATGGTTGTCATTACCTCTCCAGAGATAATCTCTCCAGGGCCTCCTCGTGCTCTGGGCTAAACAGCAAAAAAAAGAAATGTTGGTCCTTATCCTCTTAAGGCTTATATACTCTCCTTCTAAGTCCTGAACTCTAATATAACCGAAGAGAGAGGTGCTTGTGCTTCTAAGAAATGCATAATCTAATGACCACTTCCTCAGTTGATGGCTGAAGCATGGTTCAACTAGAACTAGAAGCACAGTTGAGGTCTAACTTATACCTTATTAGTCATTTGATGGTTATCTGGCCTCTTTTAGCATAAATTTGCTGGGATTTTTTAAATTATGATTTTCTTAAGATTTGCTTACCTCATCCCATCACTGATCATTACAGAACACTTTTAGTTTTATCTTCTTTCCAGAAAATTGTTCTTTTCAAATCTCTGAAGGAAACTCATTAAGTGCCCTATAAAAATAGTAAATGGGCCGTTTAGGAATGTACACAGAATTGTTGATTGTC-GTATAGGAAAGAAAGCTGCGTAAGGAGGAAGGTAATTGTAAAACAAACAGAACAATTTTTAAGCCCTTCATATTTGAAAAGTATTTTTGAAAGCTGAAAAAATTCACATAAATTAATTACCTAGAGGTTTGAAGCTGGCTCTTCTAAGCTTCAAAAACTGTTTTTATAAATTTTTAATTGTTTGGTATGTAAAGTTCCCTAAAATATATATCCCTGCCATAATATCTAGTATACCAGGACCTCTAGCCTTTTGTTAATGGCTAAGTTTTGGTTATCTGGGTCTCTGCAATGGTTGCTCTGAGCAGGTGAAGAGTCTAGGGCTGCTTGTCCTGGCACGAAATGACATTAGGTGACTCTGCTGGTTGTACCATATGGCTACTCTGTATAGGATTTATCTCTTATATAAAGCCACGAGAACACAATAAGAACATTTACTCTTGCATTAAACATGATTATAATTACTTGGTCATCTGGATGTCTAGCCTACAACAGATAAGAAGCATCTAGATGCTTCACTGTTAGAGCAAGCTGTGTCTGTCCCAGTGTCTGTTTCCTGCAGCGATCCTATCTAAATCTCTGCTCAAAATTCATATGGGCTAAGTACAAGGCACTATGGTAAATGCAGTAATACAGGTAGTAGTGATTTAAAACTGTGTAGCATTTTATAGCAATATATCGTGCCTTATTCAATATACCATTTGATacacacacacacacacacacacacacacacacCTGTGAGAAAAGAAAAtaacatttattaaacacctgctgtgtgccaggcacagtgctaaacttgtggtagtcattgttttgcttattcactcaacaaagtttcactgatgggctactctgtgccaggcactgttctaagctcaaggaatacctcaggaaacaaaataaccaaagtctctcctctgatgtagttcattgctta-gcggggggcaacagataacaaccaacc--------aaccaagtaaataaatacatggagcatccaatggaaggagtgctttagacacaaataaaacagagaaggaggtagaggatactggggtagagggtgggagctgttttaaccagggtggttggggaaggacttgctgagaaggtgacatctgagcatagaactgaaggacaccaggaaaccatctaagcagattacctaggggaaaggcattctggtcagaggaaacagcacgtgcaaaggcaatgaggtagaagtgagacttgtgtgtcccagggtcagcaaagaggcactgtgactaaaagagagtgaacaagggaaagagtagtaaaaaatgaaaatatagtttatcaaaggccattgagaggattttgacttttattctgaaaaagaagagaaaacgttgggagatttttgagcagaggaatgGTAA s rheMac1.SCAFFOLD80370 65382 3395 + 91160 atcacaaagttgccactttagtaaagttagggaagaattgtcttttcaatgtttggtaatgtttcagttgattatccatatggaaaaaatcttgaccccctatttcaaaccacacacaacaaatcaattccaaatagatcatagatgaaagtgcaaaaggtgaaatagtaatgctctagatgatatcataggaatatatcttcatgagcttggggtacacaaacattctaaataggatataacaagcactaactacaaaataaaaattatagttaataaaaatgaagaacttttttattcatcataaagcaccattttgaaagtgaaagaagtcacatgtaaagaagtttgcaatataaatatttgataaaagatttgtaccctagaacttaaagtataataataaataaataaataaaaagaTttatattcagaatgtataaataactcctttgaatcagaataaaaaattcagactattgaataaatcatgaataactactttgaaaaagcttctcaaaaaaggagattctaaatgggtaataacatatacaaagctattaaacatcactagctatcagagaaatgcaaaataaaaccactatacatccattagagtgtttaaaataaaacattaaaataccaagaattggtgagaatttggatcacctgtactctcataaactgctgatgggaatatacatttttaaagccacttcaaaaagtcatttggcagcatctataaacctgattatctgtgtatcctgtgacatagtaaattcactgctggatacacatccaacaaaaatgtatacatatgtacacaaaaagacccagaaaatgctcaaggcagcattgttttttaataatttacaactagaagcaagtctaccaatagtaaaatagagaaattgttaaatgttaataaacaatattagacagcaaagaaataaac---tattgctacacaaaacaacatgataagtgtcatgtaccaaatagcgagggcaagaagcctgttatggaagaatttatactgtatcatttcatttaatgaagtttggaaataggcaaaattaGAACCATGTTTTGCCATAGTGTAATAAGTGGGAGGAGGACAAATAAACACGAGAGAA----CTGGGTTTGCTCAGGATGGAAGAGACTTGAGTATGTCCCTAGGCTGAGGGGAAGGAGCAAGTCAGACTGGCAGAGACTGAGTGGCACAAGAGTAGGAAGGAGACTGATGGAGCAAGATCTCAGAGGGGCAGAAACAAGTGGGTTCGAGGGCTTACACTCCCCAAAATCCTGCTCATGGATGC-TGGATGACCTGGTCTGATACCCATGGTCAGGAAGCTGGCCTATTCATATACATGCAGATAGCTTTTTATAATTGGTTGTGGCTGCTCTCCTTTGGTGCTTAAAGAAAGCTATACGTAAAAGAATAATATTTACATTTTATGTGACAATAGTTAGGCCCTGGGGAGTTCAGAAAAGTAAAACCAACAATGTATTTGCAGATTTCTGGGGAGAGATTACCATGATGGTTGTCATTACCTCTCCAGAGATAATCTCTCCAGGGCCTCCTCGTGTCCCGGGCTAAACAGAGAAAAAGAGAAATGTTGGTTCTTATCCTCTTAAGGCTTATATACTCCCCTTCTAAGTCCTGAACTCTCATATAACCAAAGGGAGAGGTGCTTGTGCTTCTAAGAAATGCATAATCTAATGACCACTTCCTCAGTTGATGGCTGAAGCATGGTTCAACTAGAACTAGCAGCACAGTTGATGTCTAACTTATACCT---------------------------TCTTTTAGCACAAATTTGCTGGGG-TTTTTAAATTATTATTTTCTTAAGGTTTGCTTACCTCATCCCTTCACTGATCATTACAGAACACTTTTAGATTTATCTTCTTTCCAGAAAATTGTTCTTTTCAAACCTCTGAAGGAAACTCATTAAATGCCCTATAAAAATAGTAAATGGGCCATTTAGAAATGTACAGAGAATTGTTGACTGTCAGTATAGGAAAGAAAGCTGGACAAGGAGGAAGGTAATGGTAAAACGAACAGAACAATTTTTAAGCCCTTCATATTTGAAAAGTATTTTTGAAAGCTGAAAAAATTCACATAAATTAATTACCTAGAGGTTTGAAGCTTCCTCTTCTAAGATTCAAAAACTGTTTTTATAAATTTTTAATTGTTTGGTATGTAAAGCTCCCTAAAATATATATCCCTGCCTTAATATCTAGTATACCAGGACCTCTAGCCTTTTGTTAATGGCTAAGTTTTGGTTATCTGGCTCTCTGCAGTGGTTGCTCTGAGGAGGTGAAGA-------GCTGCTTGTCCTGGCACAAAATGGCATTAGGTGACTCTGCTGGTTGTACCATATGACTACTCTGTATAGGATTTATCTCTTATAGAAAGCCATGAGAACACAATAAGAATATTTATTCTTGCATTAAACATGATTGTAATTACTTGGTCATCTGGATGTCTAGCCTACAACAGATAAGAAGCATCTAGATGGCTCGCTGTTAGAGCAAGCTGCATCTGTCCCAGTGTCTGTTTCCTGCAGCGATCCTATCTAAATCTCTGCTCAAAATTCATATGGGCTAAGTACAAGGCACTGTGGTAAATGCAGTAATACAGGTAGTAGTGACTTAAAACCATATGGCATTTTATAGCAATATATCATGCCTTATTCAATATACCATTTA------acacacacacacacatacacacacacTCCTGTGAGAAAAGAAAAtaacatttattaaacatctgctgtgtgccaggcacagtgctaaacttgtgatagtcattgttttacttattcaatcaacaaagtttcactgatggactactctgtgccaggcactgttctaagcccaaggaatacctcaggaaacaaaataaccaaagtctctcctctgatgtagttcgctgcttaggaggggggcaacagataacaaccaaccaaccaactaaccaagtaaataaatgcatggagcatccaatggaaggagtgctttagacaaaaataaagcggggaaggaggtagaggatgctggggttgagggtgggagctgttttaaccagtgtggttggggaaggacttgctgagaaggtgacatctgagcattgaactgaaggacaccaggaaaccacctaagcagattacctaggggaaaggcattctggtgagagaaaatagcaagtgcaaaggccctgaggtagaagtgagacttgtgtgtcccagtttcagcaaagagccagtgtgactaaaagagagtgaacaagggaaagagtagtaagaaatgaaaatacagattatcaaaggccattgagaggattttgacttttattctgaaaaagaagataaaacattggaagatttttgagcagaggagtggtaa a score=2198 s hg17.chr12_random 72477 33 + 466818 CCAATATAGAGACTTATTGAAGATATTAAGTTG s rheMac1.SCAFFOLD31009 5812 33 + 42162 ccAATAAAGGTACTTATTGAAAATATTCAGTTG a score=42157 s hg17.chr12_random 72510 639 + 466818 AATatgcaagaaggaatacaaattaatgaaagtggtaaatatgtgcataattgtaaatgaatgtttactgtataaaataataatgtctTGAGGGTGATTATATAATTGATAAGACATATGCAAATGGCAAAAAA--TAGACTGGAGGTAAAGGTGACAGGAGTAAATTTACTTGAAGTAGTTTTTGAACTTTTCTATGTCTATGAGGAGATTTTGAACAatgaccctgtaattttacccaaaggtatatatacagaggaattgcatcaaatgatatatgaaagaattctctagtagaattattcataact-tcaaaaaagaagctgaccaaatgtacattaaggatgggtgaatcattacattaattccatgcaacggaacaatatagagaagtgaaaaaaaaccacatgtacttgcaactatgtgactaaatttcagaaacataatgttgagtccaagaagccacaaacaacaagaacatgtaggaatgcacctacacagagttcaaagcaggccagaccaagctatggagtttagggttgcatacctagttggtaaagtatgaagaaaattaaggaaataatcaatataaattatggatattgcttatctcaggagatgtgaagaagggtttagggggtt s rheMac1.SCAFFOLD85601 4813 632 + 44828 AAAATCCAAGATTGGAGACTGATT--------TGGTAAATATGTGCATAATTATAAACGAATGTTTACTGTCAAAAATAATGTCTTATTGCGG-TAATTACATAATTGATAATATATAGGCAAATGGCAAAAAAAATAGACTGGAGGCAGAGGTGACAGGAGTAAATTTACTTAAAGTATTTTTTGAACTGTTCTATATCTATGAGGAGATTTTGAACAatgaccctgtaattctatctaaaggtatgtatacaaaggaattgtatcaaatgatatttgagagaatgctttagtagaattattcataactgttcaaaaaaaagctggccaaatatatattaaggatagatcaatcattacagtaaatccacacaacagaacaacatagagaagtgtaaaaaaac-atatgtacatgcaactctgtgactaaatttcagaaacacaatgttgagaccaagaaaccacaaccaagaagaacatgaaggattgtacctacacacagctgaaagcaggccagaccaagctgtgcagtttagggttgcatacctaattggtaaagtataaggaaaatcaaggaaatgatcatcataaattatgggtattgattatctccagagatgtgaacaaggggttacaggctt a score=22513 s hg17.chr12_random 73149 331 + 466818 ggaaagtggcatggaggtggacctaggctgttttcagtgttccttgtcttgctccacataatggttacttgaatgtttaTGATACACTGCGGTATTTCCCATTTTTGTTTTGGTTCATTTCTAAGTGTGCATTATAATTTTAACA-TAAAAAGTTTTAATTAGGAGAAACGTCTCATAGAAATTATTATTACTCGTCTCATTATATACTGAGGGGAAAAATAAACTATTGGTATACATTCTTATACAACTCTAAGAGAGTTGAAGTAAGAACTTT---ATTTAGTTGCAACATGAGGAAATTTGAGATGATTTTATTTGCCAC-CCCAGATTTTTC s rheMac1.SCAFFOLD85456 3932 336 + 81052 GGAAAGTGACATGGAGATGGACCTAGGCTGTTTTTACTGTTCCTTCTCTTGCTCTGCATCATGGTTGCTTGAGGGTTTATGACACATTGTGGAATTTCCCATTTTTGTATTGGTTCATTTTTAAGTGTGCATTATAACTTTAATAATACAAACTTGTAATTAAAAGAAATGTCTCATAGAAATTATTATTACTCATCTCATTATATACTGAGGGTAAGTATCAACTATTTGTATACATTCTTATACAATAATAAGATAGTTGAAATAGGAACTTTCTTATTTAGTTGCAACATGAGAAAATTTGAGATGATGTTATCTTCTAAGCCCAGATCTTTC a score=14283 s hg17.chr12_random 73481 187 + 466818 AAAGGATTTCTTCTAGCCTTAATTATCCACCTCACATGAACAAATCTTTGCCATTCCCCATCTATTTTTT-CTTTTGGCTCCTGAATTCCTGACACAACAAGGTTGTACACATTTCCCACACTCTTGGTTTAGCAGAGTTCTTTTATCAGTTATGTTTTTCTGCAAGAG-AAACCCTTCAAAACTACAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 4269 188 + 81052 AAAGGATTTCTTCTAGCCTTAATTATCCCCCTCACA-GGACAAACCATTGCCATTCCCCACCCATTTTTTTCTTTTGACTCCTGAATTCCTGACACAACAAGGTTGTACATATTTGCCACACTCTTGGTTTAGCAAAGTTCTTTTATCAGTTCTGTTTTTCTGCAGGAGAAAACCCTCCAAAACTACAT a score=94247 s hg17.chr12_random 73668 1225 + 466818 TGGATAGCTCTGGTGACTTGAGATGGGCCAAATTCTGCATCTTGGAGGTCGTTAGAGTTTGGCCAATTTAGTCTGGATCAGGTGGGGGGCAATCTGCCTTCATTAGTTTCTGATTCTCCTTCTGGGAACAGTGTACTAGCCAGGTGATATTCTCATAGTAAATGGAAAGAGGAAGAACACCCAGTATGGAAGCCATCTCAAATTTCTATGCAAAGTGTATTAATTTTTTGTTCATCAAAGTAAGTTAAATGATTGAACTTCAAGTTCAGGGGAAAGGTAGTCAGTCTTCGTGTGATGGGAGGATACTGCAAGATTATATATCAAAGGGTCTGGTACTGAGGAATACTTATAAAATTGCTGAACattttaattaaataataaatatttaaatattaGACTTGAGAGAAACTTTACCAAAGGCCTAAGAATTAGAGATATGTTTGATAAATAAACATTATTCATGGGCTGAAAACCTTGAGTGGGAAAATAGGACTAATTTCACCTGGACAACCTCCTGGAAACTGATTTTTTATTTTGGAAATTATGAGAAAATAATTCGTTCCATTCATAAGTGGTGTGCACATGTGTGTGTTTGTGTGTGTATTTATGAGCTTGTGAATAATGAAGTTACACAAAAGTATTAGCAGCAACCAGATCTTATGGAGTATTGGCCTGCCTGTGGTTCTCAAGTAAATCTTAGATGCTTTTGATAAAAGCAGTTTGGATTCTGTGTATTTAAATCTGGCATTTAAAAAAGTCCGTATTGGTGATGATCTTAGTTATGATCAAGCTCCCTTTAAGATTTTAGACATTTACTATACGATCTACATATCAGGTTATAAAACTTCCCAAGCAACTGAAGTCGCTAAAGACAAATGATGGAGAGGTTACACAAGGAAAAATTGCAAACACTGGAAGTGAACATGTCCTTGTTTGCATACTAGCAAATGAGAATTCAGGTTTCATGTCAATTTCAGTATGAATAATTCCAGCCTATAACAAGAACAGATGGTGAATGAGTCAGTTAATTTGAATTGTTTTGAAAATAAGAATGTTTTCCATAAAGAGAGCATTGAACTTATCCATTAGCATGCCATGGTGATTTCTGACTTGACACTGGTCACAGCAATTAAAAGTAAAAAGAATGTCACAGCACATACACAAATCAGGTGCATATAGAATTTAAGGTCAGGATATTCAAGCAATCACAACCAGTGATATTACA s rheMac1.SCAFFOLD85456 4800 1217 + 81052 TGGATGGCTCTGGTGATTTGAGATGGGCCAGATTCTGCATCTTGGAGAT----AGAGTTTGGCCAATTTAGTCTGGATCAGGTGGGGG-CAATCTGAGTTCACTAGTTTCTCATTCTCCTTCTGGGAACAGTGTAATAGCCAGGTGATATTCTCATAGTAAATGGAAAGAGGAAGAATCCCCAGTATAGAAGCCATACCAAATCTCTATGCAAAGTGTTGTAATTTTCTCTTTGTCAAAGTAAGTTAAAAGACTGAACTCCAAGTTTAGGGGCAAAGTAGTCAGTCTTCCTTTGATGGGCAGATACTGCAAGATCATATATCAAAGGGTCTGGTACTTAGGAATTCTTATAAAATTGCtaaatattttatataa-taataaatatttaaaCATTAGACTTCAGAGAAACTTTACCAAAGTCCTAAGAATTAGAGATATGTTTGATAA-TAAATATTATTCATGGGCTGAAAATTCTGAGTGGGAAAATAGGACTAATTTCATCTGCACAACCTCTTGGAAACTAATTTTCTATTTTGGAAATTATGAGAAAATAATTTGTTCCATTCATAAGTGGTATGCACGTGTGTCCATTTGTGTGCATATTTATGAGCTTGCGAATAATGAAGTTATACAAAAGTATTAGCAGCAACCAGATCTTATGGGGTATTGGCCTGCCTGTGGTTCTCAAGAAAACCTTAGATGCTTTTGATAAAAGCAGTTTGGATTCTGTGTATTTAAATCTGGCATTTAAAAAAGTCCATATTGGTGATGATCTTAGTTATGACTAAGCTCCCTTTAAGGATTTAGACATTTACTATATGATCTATGTGTTGGGTTATAAAACTTCCCTAGGAACTGAAGTTGCTAAAGACAAATGATGGAGAGGTTTCACAATGAAAAACTGCAAACACTGAAAGTGAATATGTCCTTATTTGTGTACTAGCAAATGAGGATTCAGGTTTCCTGTTAATTTCAGTATGAATAATTCCAGCCCATAACAAGAACAGACAGTGAATGAATGAGTTAATTTGAGTTG-TTTGAAAATAAGAATGTTTTCCATAAGGAGATGATTGAACTCGTCAATTACCATGCCATGGTGATTTCTGGCTTGATGCTGGTCACAACATTTAAAAGTAAAAAGAATGACCCAGAACATTCACAAATTAGGTGTGTATAGAATTTAAGGTCAGGATATTCAAGCAATCACAAGCAGTGACATTACA a score=10508 s hg17.chr12_random 74893 126 + 466818 CCAGCATTTTAAAAATTTCTTTTTGTCTGTTCAGACATGATAACTTTTCTGCCCATCATTTTTTCCATTCTAATAGTGGTTATATTTGTGATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCATTGGTA s rheMac1.SCAFFOLD85601 7238 126 + 44828 CCGGCATTTTAAAAATTTCTTTCTGTCTGTTCAGACATGATAACTGTTCTATCTATCACTTTTTCCATTCTAATAATGGTTATATTTGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCATTGGTA a score=146374 s hg17.chr12_random 75019 2071 + 466818 AATTCCATTGAGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGTTGACCAAATTCTCACTGCTCTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTACTACATTGGTATGCAACTCAGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAAGTAAGAATTACTGCTTATAATGTCTGGGCAGTAACCAACCATTTCAGCAGCTGGCTTGCTACTAGCCTCAGCATGTTTTATTTGCTCAGGATTGCCAATTTCTCCAACCTTATTTTTCTTCGCATAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTTGTTCTGGTGATACTGTTGGGGCCTTTGCTATTTTTGGTTTGTCATCTTTTTGTGATAAACATGGATGAGACTGTATGGACAAAAGAATATGAAGGAAACGTGACTTGGAAGATCAAATTGAGGAGTGCAATGTACCATTCAAATATGACTCTAACCATGCTAGCAAACTTTGTACCCCTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGTTCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCAAGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGACCTCCTTTCTTCTGTTATGTGCCATTTACTTTCTGTCCATGATCATATCAGTTTGTAATTTGGGGAGGCTGGAAAAGCAACCTGTCTTCATGTTCTGCCAAGCTATTATATTCAGCTATCCTTCAACCCACCCATTCATCCTGATTTTGGGAAACAAGAAGCTAAAGCAGATTTTTCTTTCAGTTTTGCGGCATGTGAGGTACTGGGTGAAA-GACAGAAGCCTTCGTCTCCATAGATTCACAAGAGGGGCATTGTGTGTCTTCTAGCAGAAAACAAACTGGTGGTGTATGAAACA-TTTTATATTTCTTACTGGGTTTTCTGTAATATATGTATATGAATAATTTCCAAATGTATACCTAGAAAAGTCTTTTACCTAAAGTTAGTCTAGAAAAGTATATATATATAGAtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtatgAAAAACTGAAGAACATTGACAATAACATGCTTTTTATTGTTTTTTCACAAAAACTGCCAAATTATAGAAAATATGACAAAAATTCCTC--AATTATGAAGCCATGTTTATTTCATACATGTATTTTATATTTCATTTGTAGAATTTATATCTATTTATAATTATTAAGAACTAACAGCTTATCTCAGGAAAAATATTGCTCTTTTCTATTGTTATTTGAATGACACAAATATACCACAGTGTGCTTACAATCTGTTGTTTTAACCTATAACTTTTTG-ATAATAAGGTCGTTCAATTCTTAATCACTAATGAGGATGTATCTTCAGGGTTTTATTCCATTATGAATTCCTATTTTATGTTTAGTAAAAAGCAATCAGAATTATTGTTACAAAACAATGAACACAATAAAATTTGAGTGACAAGTACATGTAGAGTAAATTTCATGTATGTGTACCATAAACAGTACTGAGGAATATTAGATTTAATACAAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAATCTCTGCTATA--AGAGGGATGAAAAATCATGATCATGATCTTGATTGCTATTATCAGCTTCCATATGCAGTTAGAAAAGTCATTTCTTCCAGCTTTTCAATTAAAGAAAAACTTTTTTTGAAATTGAGCTCTGATGTAAATTATTTTAGTATTTTTTCTAAAGCACTTCTAAGCCCCTGAATTGCTAATTATATCCTTATCTTCCATTTTTAAAATTCTTTCTAAACTTCAGATAAGAGAACTCCAGTCTTCCGTTTTCTAAAAAAAAATCTGTCAATGTGAAAATAGTATAAAAATTATGGAAAATAATTCAGTGAAACTTTTTTTAAGTGTTAAAATAGTATCTATGAAATCTATGTATTAATTATGGGATTTGACCT---AGTGTAATTTTGCTGCCAATGATTAAATGGAATTGGCTTGACATATTCATTACTAGGAAGTCCTATTATACGAAGGAAATGTACAGGCTTGTTGACAGCTGGATTCTACATGACTGGGTGAATTGCTGGGCGTAAGAAAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 6588 2064 + 81052 AATTCCACTGAGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTCTCACTGCTCTGGCAGTCTCCAGAATTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTATTACATTGGTATTCAATTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATCGTGTAGAGGTAAGAATTACCACTTAAAATGTCTGGGCAGTAACCAGCCATTTGAGCAACTGGCTTGCTACTAGCCTCGGCATATTTTATTTGCTTAAGATTGCCAATTTCTCCAGCCTTATATTTCTTCACTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGATGCTGTTGGGGCCTTGG-TATTTTTGCCTTGTCATCTTTTTGTGATAAATATGAATGAGATTTTACAGACAAAAGAATATGAAGGAAACATGACTTGGAAGATCCAATTGAGGAGGACAATGTTCCTTTCAGATACGGCTATAACCATGGTAGCAAACTTAGTACCCTTTACTCTGACTCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGTTCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTTCATGGCAGAGGATCTCAAGATCCCAATGCCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATTTCCTTCCTCTTGTTATGTGCCATTTACTTTGTGTTCGTAACCATATCAGTTTGGAGTTTTCAGACTCTGGATAATAACCCTGTCTTCATGTTCTGCCAAGCTATTACATTCAGCTATCCTTCAGCCCACCCATTCATCCTGATTTGGGGAAACAAGAAGCTAAAGCAGACTTTTCTTTCAGTTTTGTGGAATGTGAGGTACTGGGTGAAAGGACAGAAGCCTTCATCTCCATAGATTCAGGAGAGGGGCATTGTGTGTCTTCTAGCAGAAAACAAACTGGTGGTGTATGGAACATTTTTCTATTTCTTACTGTGTTTTCTGTAATGTATGTGTATGAATAATTTCCAAACCTATACCTAGAAAAGTCTTTTACCTAAAGTTAGTCTAAAAAAGTGTATATATA--------TGTGTGACTGTGTTTATGCATGTGTGAAAAACTTAAGAGCATTGACAATAACATACTCTTTTTTGTTTTTTCACACAAACTGCCAAAGTATACAAAATATGATAAAAAATCTTTAGAATTATGAAGTCATGTTTATTTCATGCATGTATTTTATGTTTCATTTGTAGAATTTATGTCTGATTTTAATTGTTAAGAACTAACAGCTTATCTCGGGAAAAATGTTGCTGTTTTCTATTGTTATTTGAGCCACAAAAATATACCACAGTGTGCTTAGAATTCATTTTTTGAACCTCTAACTTATTGAATGGTAATGCCATTCAATTCTAAATCAATAATGAGGATGTCTCCTCGGGGTTTTAGTCCATTATGAATTCCTATTTTATGTTTAGTAAAAAGCAAACAGAATTATTATTAGAAAACAACGCACCCAATAAAATTCGAGT-ACAAGCATATGTAGAGTAAATTTCGTCTATATCTACCATAAGCTGTACTGAGGAATATTAGATGTCATACAAGTATGCGAACAGCTTAGATAAAAATCTCTTTGATAATAAAGGGATTAAAAATCATGATCATTATCTTGATTGCTATTATAGGTTTCCATATGCAGTTAGAAACCTCATTTCGTTCAGCTTTTGAATTGAAGAAAAGATGTTTTTGAAGTCGAGATGTGATGTAAACTATTTTACTATTTTTTCTAAAGCACTTCTAAGCCCCTGAATTGCTAATTATATCCTTATCTTCCATTTATAAAATTCCTTCTAAACTTCACATAAGAGAACTCAAATTTTCTCTTTTCTTAAAAAAAAAAAATCCA--TGAAAAAACTATAGAAATTACGGAAAATAATTCAGTGAAACTTTTTGTAAATGTTAAAATAGTATCTATGAAATCTATGTATTAATTATGGGATGTGCCTTTAAGTTGTACTTTTGTTGTCAATG-----ATGAAAGTGTTTTGACATACTCATTAATAGAAAGTACTATTATAAGAAAGAAATGCAGAGTCTTGTTCACAGCTAACTTCTACCTGACTGTATTAATTCTTGGTATTATGAAAT a score=451358 s hg17.chr12_random 77219 5872 + 466818 TCTAATTTAATTATGCCTA----GTACTCAGTA-TGAG-GATAAGAT-AGCTA-GATCTAGATG--CCTCAAATG--TTTTTCAAAATGTC-TTGACACTTTAAAGCAAAACTTACTCTAAT-GAGTT-GAATGTGCAATAAAATGGAGATATAGAGAAGAAATAAATCTGTAAAATATCAGATTACA-TTTACCTTTGGTTTTCAAGTTTCATATAAACCAAGG---TGAAGAGGTGTTCTAGAGTTTCTCCTCTCCTTTCCAATGAGGGGAGGACCTCCAGGGTCAATAATTTAGAATGGGGTTAAGAAGGAAAAAAATATGGACAGAGAAAGTCAAGAGGCAGTCGGATGTGGACTGGTATAAGTAGCTATATCATTTAAagccaaaactctttcagttgctagtgaaaaaaacctaaatcaaaccaatgtgaacagtaagagagaatttgttgatcatatatgaaaaagtacaagactatacagcctcaggaaccgttgtacctgagtgctcatattacatattattagaattttttttactccctatatctcagcttaacttt-ctttacaatggcttaattctcagggaggttttctctttatgctaacaaggtgggcaccactagctccaggcctacattctatcagcatagcaactccaaagaaaagtttcagcaaaacttctgctgtttccactgtgtttaggggattagacacactgattggctaagcctgagtcatgtgctaactccagaagctacaaattggatgagatccagaagaatcacatgaactgagaggaggggaagagagtttcttcaaaggaaccataggtgaaatgaatgacaggcaagtagaaacaatagatgtttgttacTAGtgcatcaatttgttactagtgccataacagaataccacaaattgagtggcttaaacaacagaaatatattgtcttacagttctagaggctacaagtccaaaatcaaggtgtcagcagcgttggctcctcctgagggctgtgagaggaggattcacagtggcaccccaggcctgtcccctgaaatcattctgtcctcttaagcctctggcctctgatgggagggtggcctgctgaaatgcatttggagctttttttctccttaatcttgacgattagaacctctaatctctctagctagtggttgcaccacagcacccttggatttctctcctgaaaatgctctttccttctctaccacatggccaagctgaagatttttccagatttttaaactctgcttcctttttaatcataaattccactttcagatcatttctttgctgctgtatttgatcataagctgttaaaagtagccacaccgcatcttgaagactttcttgattagaaatttctttcacaagatgccctaggccaccactcttaaattcagccttccgcaaaccctagggcatgaatacaatgtagccaagttctttgctgtggcagtgtaacaagagtgatctttattccagctcccaataacttcctcatttccatctgagacctcatcatctgggcctttactgtccctatttctatcagcattttggttacaaccacttaactagtttctaacaagttcccaaccttcttttatcttt-ttatcttcttctgagctccctaaactcttctaaccactgcctattacccagttccaaagctgcttacacatttttaggtatct--atagcaacaccccacttcttggtaccaattttTtgtctcagtttgtttttgttgctataaaggaatacccatagctgggtaatttataaagaa--atatttatttggcttatggttctgcacactatacaagaaagcatggtgccagcatctgcttctgat-agggcctcaagttttgcccattcatggcaggaagagaatggaagccagtgtgtgcagagatcacatggcaagagagagagcaagagagagaggagggaggtgccaggccctttttaaaaaccaactgtcaagagaactgataaaagtgagaacccattcacccccatctccaggaagggcattaatctatacatgagggatctgcccccatgacctgaatacctcccattaggacctactttcaacattggggatcaaatttcaacattaggtttggagggcataaatatcctaactatagcaGcctatcatcaaataatgtcacattctgaccttgttggaggttaggactccaatatatttcttttgttgaggtacacaatttaacccataataTGCCTCTACACTAGGTGTACTTTATTTT-CTTGGTCAAGATTACCTCTGCCCTTTTAATTTAATCATTTGTTATAGGAAATACTTTTCACCTAGAAAGGCTTCTATTGGTAGGggctgggcacggtggctcacacctgtaatctcagcactttgggaggccgaggcgggcaga--tcatgaggtcaggagttcgagaccatcctgactaacatggtgaaaccccatctctactaaaaaaaatacaaaaaattagccaggtgtggtggcgggcacctgtggtctcagctactggggaggctgaggcaggagaatagtgtgaacccaggaggtggagcttacagtgagc---------agagatcaagctactgcactccagcctgggcgacagagggagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaGGCTTCTATTGGTAGTAGATGGAGATGGAGTAGTTCCCCAGCACTGTACCCTCCAAACCCAAAGAATACAATTAACACACATTTTATGAGAAACGGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTT--------CTCTTAAAATGTAGATATGTGTTTAGGAAAAGGGATATAATATATAAATAAATGTGTATAAGTTGACTTTGTAATAGTTTAGTAATTTCCAAATTGACATTCCTAAAAGATCTCCATTAAAAGGAGTAttccctagttaaaaaatttggaaaatgtttcttatgttattcctctcttgaataactataatggatattagcatattgtggtaaattgattatagtgatgttgtaattattcagctgtccctacacccaggtcctttgcaatgtaatgctgggagttccttctatcaaaaggtggaatatatttcctgccccttgacccattttttgtttggctatgtgtcttgccttggactatagaggttatccagcttgatgctcttttgatgctcttgtgcttttccactcctcttcttgcttctctgctgttctcttccagctagcctgctggaagatgaaacatatgcagcagaatcaagttgccctgtcatcctggccaaggctatgctagagcagtcaactgccagacaaTTCCAAGACATGTAAGCAAGCCAAGATCTGCACACCATAAAGGcaacctgtagacttatgggcaataataaatggttgttgctttaagccatcaagttattgggcttgttatttagcatttttgtggcaatagagaaccTACACCTGtatcaaagcttccaagaagtcctgcataaagaaatactttaacttggtttaaaccagcacattccaaaTGTACCATTATAGCATAACTATTAACTTCCAGAAGAAAAAATATTGTGGAACTCTATATTGGGAAATTCTTCCGTAGTCATATCCAGGAATGACAACACTAAACAGATTTTTAAAAATTCCTAGGTTATTGATTACCATCTATGGTGCAGGCAGTGAATTGGTTTTTAGTATCCATTTAAACTCTATGCTGTATGATTCATGACTCTGTAAAGGGTGCAAATATAACCAATATATTTCTCAGATTCCCTTGAAGCTACTTTTTAAAATGCACA-CAGTTTCCCCCAGTTAGATATGCTCGTATGAGATTTGAAATGTGAAAGAGAGGCAGAGCTATTGTCCTATTTTTAGCGCTTTGTTGTTGACAAGCAAGGTCTTGGGGACTTTCTTTTTCTGAAGCAACACTTCAATGTCTAGTTTTGCTTCTGGATGTTGAGAGGCACTGGGGGTGGCATCAGCAGTGGCATTTTGTTTTGTGCATTATGACCATCATAGGATGTGTCTTGAATCAACAGTTCCAGAGTATATGAAAAGAATAGCCATGATGGTGGCACCAGTTTTCTGAGAATCAATGCTGGATGGCAAGACTAAAGTTCTCTTCTTCAACTCTCCCAATGATGTACTAAGTAACCAGATTCCTATATAAAACCGCTTTCTGCATAAAATAAATTGAGAGGGTTCTGTGTCCTGCCTGAATTGATGACAGATTCTATatttaatgcatttgagtctaagattccttatctgtaaaaattagggtaaataatatctTACTTGAGATAATGGGTAG-CTTGTAACTTGCAAGAGAGCAATTGCTCAATTAAGGGGATTCTCCTAATATGGCATGGCATCTTTTAGAAGTACTAACTTTATTTTTCTCTTTGTTGCATATTTTAGGAGGAGGAGGAGCCGGTAACATACATTTGTTACTTGGAAAATGGGAAGTATTT---TTCTTTTCTCATCTGACAAGAGCAAATGCCATTCATTTTCTGCCATCATGGCAAGGAAAATGCATTTAAAAG-ACACAAAGGTGAGAATAagagtgagagtgagtgaaagaggcagagtgggagagtgagagagagttacagagtgagagaaagaaagtgagagagTAAGATAACTCTTACTCTGTAAGGCTGTTGCTACCTtgatatggtttggctgtgtccccacccaaatttcatcttgaattgtagttcccataatccccacatgtcatgggagggtaactgaatcatggggactgttaccctcatgctgttgctgtgatagtgagttctcatgagatctgatggttttatatggggctttcccatcctccttcactctgcacttcttcctgctgccactatgtaaaaaagaaagcgtttgtttccgcttccatgatgatcataggtttcctgaggcctccccagccctgtgcaactatgagtggattaaacttctttccttcatatattacccagtcttgggtatgttattagcagcttgagaacagactaatacaTACCTTCattcagggtctttataccatctgttatttcctctttttgcaa---------atctctc-----ccccccccaactc----------------tgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtctgtgttggtatctttcccatcaatatttacacatattttagtctttttaattaaaaaaaattaaaatcctccatctattccatttctcagcattttcctgcttttcacagacaaaagtcttgaaagtgttaactacatttgctgctttcatttcttcccttcccatccattcctcaacccccagaaatccagattctgtcttgttacctccatgaaaatgttctctaa---catcaactactcacatcacttagctgcgtatcagccatcaaccatttgtttcctaagcttcagctggcagaatttaccactccttccctttagacacattttttttctttgctctacacaac-gagacaccctGCTCtttactaagaatttgtttccttttcttcctggccttgcagctagactacatttctcactctctcccacactcctagtgactgaattctac----tcgatgggatgactgggagtaatgtatgtcatttctgaactgaagcttttaagaagtgaggaggacctcccatgctctctttttaccatcctattgactgaatgaagacaaaagcac-gagatggtagatccacaagacaaaaggaacctgacgaacttgggttcctgattcaccatgtggagaagtgccacccaagaatgagg-------------------gacatgtaaatgagaaataaacctccacagtgttTGAACATtatatatat s rheMac1.SCAFFOLD80653 65996 5845 - 71846 TCAATTTTAATTATGCATTTAATGTACTCAGTAATGAGTGATAAGATTAGCTAAGATCTAGATTGTCCTCAAGTTGTTTCTTCAAAATATCCTTGACACTTTAAAGCAAAACTTGCTCTAATTGAGTTTGAATGTGCAATAAAATGGAGATATAGAGAAGAAAGAAATCTATAAAAGATCAGATTACAGTTTCCTTTTTTTTTTCAAGTTTCATATAAACCAAGGAGGCGAAGAGGTGTCCTAGAGTTTCTCCTCACCTCTCCAATGAGGGGAGGAACTCCAGGATCAAGAATTTTGAATGAAGTTAAGAAGGAAAAAAATATGGACAGAGACAGTCAAGAGGCAGTTGGATGTGAATTGGTATAAGTAGCTATATCATttaa--ccaaaactc----agttgctagagagaaaaacctaaatcaaaccaatatgaacaataagagagaatttgttgatcgtctatggaaaagtacaagactatacagcttcaggaactgttgtatctgattgctcacattacatattattagaacgttttt-actccctatctctcagcttaacttttctttacaacggcttaattctcagggaggttttctccttctgctaacaaggtgggcaccactagctccaggtccacattctatcagcatagcaactccTAAGAAAAATTTCAGCAAATCTTCTGCTGTTTCcactgtgtttaggggattggacacactgattggctaggcctgagtcatgtgctaactccaaaaactacaaattggatgaaacccagaagaatcacacgaactgagaggaggggaggagagtttcttcaaaggaaccataggtgaaatgaatgacagaaaagtaaaaacaatagatgtTTTTTACTAGtgcatcagtttgtcactagtgccataacagaaaaccacaagctgagtggcttaaacaacagaaatatattgtcttacagttctagatgctaccagtccaaaatcaaggtgtcagcagcgttggctcctcctgagggctgtgacaggagggttcacagtggcaccccagtcctgtcccctgaaatcattctgtcctcttaggcctctggcctctgatgggagggtggctttctgaaatgcattcagggctttttttctctttaatcttgacgattagagcctctaatctctctagcaagcatttgcaccacagcacccttggatttctctcctgaaaatgctctttccttctctaccatatggccaagctgaggatttttccaaatttttacactctgcttcctttttaattataaattccactttcagatcatttatttgctgctgtatttgatcataagctgttaaaagtagccacaccacatcttgaagactttcttgattagaaatttctttcacaagacaccctaggccatcactcttaaattcagccttccacaaaccctacagcatgaaagcaatgtagccaagttctttgctgtggcagtgtaacaagcatgatctttactccagctcccaataacttcctcatttccatctgagacctcatcatctgggcctttactgtccctatctctatcagcatttcaatcacaatcacttaactaatttctaacaagttcccaaccttcttttatctttcttgtcttcttctgagctctccaaactcttctaaccactgcccattaccctgtttcaaagctgcttacacattttcaggtatctttatagcaacaccccacttcttggttccaattttctgtctcagttcgtttttgttgctataaaggaatacccaaaactgagtaatttattaaaaatgatatttatttgacttatggatctgcacactgtacaagaaagcatggtgccagcatccgcttctgatgagggcctcaagttttgtccactcatggcaggggg-gaatggaagccagtatgtgcagagatgacatcacaagagagaaagcaagagagaggggagggaggtgccaggccctttttaacaaccagctgtgaagagaactgataaaagtgagaacccattcacccccatctccaggaatggcattaatctatacatgagggatctgcccccaagacctgaacacctcccattaggacctactttcaacattggggatcaaatttcaacattaggtttggagggcatatatatccaaactatagcaCTGTATCATcaaataatgtcacattctgaccttgttggaggt-----ctccaatatattt--tttgttgaggtacacaatttaacccataataTGCCTCTATACTAGGTGTACTTTTTTTTTCTTGGTCAAGATTACCTCTGCCCTTTTAATTTAATCATTTGTTAGAGGAAATGCTTTTCACCTAGAAAGGTTTCTATTGGTAGGggccaggtgcggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggcagaaatcacgaggtcaggagatcaagaccatcctagctaacacggtaaaaccccatctctactaaaaaat-tacaa----ttagccaggtgtggtgatgggcgcctgtggtctcagctactagggaggctgaggcag---aatagtgtgaacccaggaagtggagcttgcagtgagccgagctcaaggagatcaagctactgcactctagtctgggtgacagagcaagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-------GACTTCTATTGGTAGCAGATGGAG------TAGTTCCCCAGCACTGTACCCTCCAAACCCAAAGAATACAGTTAACACATAGTTTACGGGAAACAGGGTTTtttgtttgtttgtttgtttgtttCTCTTAAAATGTAGATATATGTTTAGGAAAAGGGATATAATATATAAATAAATGTGTATAAGTTAACTTTGTGATAGTTTAATAAATTCCAAATTGACATTCCTAAAAGATCTCCATTAAAAGGAATAttccctagttaaaaaatttggaaaatgtttcttacgttattcccctcttgaataactataatggatattagcatattgtggtaaattgattatagtgatgttccaattattcagctgtccctacacccaggtcctttgcaatgtaacgttgggagttccttttatcgaaaagtggaatatatgtcctgccccttgatccattttttgtttggctatgtgtcttgccttggactgtagaGGTTATCCAGCTTGATGCTCTT-----------GTGCTTTTCCACTCCTCCTCTTGCTTCTCTGCTGTTCTGTTCCAGCTAGCTGGCTGGAAGGTGAAACACATGCAACAGAATCAAGTTGCTCTGTCATCATGGCCAAGGCTACGCTAGAGCAGTCAACTGCCAGACAATTCCAAGACATGTAAGCAAGCCGAGATCTGCACACCATGTAgtcaacctgtagacttatgggcaataataaatggttgttgctttaagccatcaagttattgggggtgttatttagcatttttgtggcaatagataacCTACACCTGtatcaaagcttccaagaagtcctgcataaagaaatactttaacttggtttcaactagcacattccaaaTGTACCATTAAAGCATAACTATTAACTTCCAGAAGAAAAAATATTGTGGAACTCTATATTGGGAAATTCTTCTATTGTCATATCCAGGAATGACAATACTAAACAGATTTTTAAAAATTCCTAGGTTATTGATCACCATCTATGGTGGAGGCAGTGAATTGACTTTTAGTATCCATTTAAACTCTATGCTGTATGATTCATGACTCTGTAAAGGTTGCAAATATAACCAATATATTTCTCAGATTCCCTTAAAGCTACTTTTTTAAATGCACATTAGTTTCCCCCAGTTAGATGCTCTTGTATGAGATTTGAAATGTGAAAGAGAGGCAGAGCTATTGTGCTATGTTTAGC-CTTTGTTGTTGACAAGCAAAGTCTTTGGGACTTTCTTTTTCTGAAGCAACATTCCAATGTCTAGTTTTGCTTCTGGATGTCGAGAGACACTGGGAGTGGCATCAGCAGTGGCATTTTGTTTTCTCCATTACGACCATCATAGTATGT-TCTTGAATCAACAGTTCCAGAGAATATGAAAAGAACAGCCATGATGTTGGCACCAGTTTTCTGAGAATCAATGCTGGAGGTCAAGACTAAAATTTTCTTCTTCAACTCTCCCAATGATGTACTAAGTAACCAGATTCCTATATAAAACCTCTTTCTGCATAAAATAAATTGAGAGTGTTCTTTTTCCTGCCTTAACTGATGACAGAACCTATatttaactcgtttgagtctaagatcccttacctgtaaaaattagggttaataatatctTACTTGAGATAATGGGTAGCCTTGTACCTTGCAAGAGAGCAATTGCTCAAGTAAGGGAATTCTTCTAATATGACATGGCATCTTTTAGAAGTACTAACTTTATTTTTCTGTTTCTTGCATATTTGAGCAGGAGGAGGAGCCAGTAACATACATTTGTTACGTGGAAAACGGCAATTATTTTTATTCTTTTCTCATCTGACAAGAGCAAATGTCATTTATTTTCTGCCATCATGGCAAGGAAAATGTATTTAAAAGAACACAAGGGTAAGAA------------------------------------------------------------------------------TAAGATAACTCTTACTCTGTAAGGCTGTTGCTACCCtgatatggtttgactgtgtccccacccaaatctcatcttgaattgtagttcccataatccccac--gtcatgggagggtaactgaatcatgggaaa-gttaccctcatgctgttgttgtgatagtgagttttcatgagatctgatggttttataggggactttcccatcctccttcactctgcactttttcctgctgccactatgtgaaaaagaaagtgtttctttctacttccatgatgatcgtaggtttcctgaggcctcccaagccctgtgcaactatgagtcaattaagcttccttcctttataaattaccccatcttgggtatgttatcagcagtgtgagaacagactaata-----cCCCATTCAGGGTCTTTATACCATCTGTTATTTACTCTTTTTGCGAtctctctctgtctctctgtctctctctctgtctctctctctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttggtacctttcccatcaatatttacacatatttgagtctttttaattaaaaaaaa-taaaattctccatctattccatttcccagcattttcctgcttttcacagacaaaagtcttgaaagtgttgactacatttgctgccttcatttcttcccttcccattcattcctcaacccccagaaatccagcttctatcttgttacttccataaaaatgttctctaacatcatcagctactcacatcacttggctgcatatcagctctcaactacgtgctccataagcttcaactggcagaattaaccactccctccctttagacacatttttttccttcactCAACACAAcagagacttcctgctgtttactgagaatttgtttccctttcttcctggccttgtagctagacaacatttctcactctctcccgcactcctagagactgaattctacatcatctatgggatgatt-ggagtaatgtatgtcatttctgaactgaagcttttaagaagtgatgaggaccttccgtgctctcttttaaccattctactgactgaatgaagacaaaagcaaggggatggtagctccacaagacaaaaggaacctgacgaacctgggctcctggttcaccatgtggagaagtgccacccaagaacaagggacatgtttacctcagactgacatgtaaatgagaaataaacCACCACAGTGTTTGAACATTGTGTGTGT a score=40048 s hg17.chr12_random 83742 511 + 466818 CTTAGCTGACTGCTGAATGTTACCCACAGTAAGTTGGAATCTCAATGTTGCTAAATATTGAAGGCGAAGATCTTGATTTCCATCCTCAGGAGAATCTGTATTCTTTATCTGACTCCGGCATTTTTCAGTGTAGTAGACATAAAACATGTTGTATTCCTCAGCCTCAGGATTTTCTTACAAACATAATTTCATCCCTTGATGCTACTTGAGGGCAATGAATGTGACAACTCCAAAAATATTACAGGCATGCAATAAAGAAAAGCAAAGAATATTATctacttatttgcatgcacactctgtcttagacactgtgccacgctctccacgtgcatggtttcacttcttcctcttaacaatcccatgaactatgcactcccttttaataggcaagaaactgaggcctaggaagtttaaacaaatggcccaaattcaATCTATGTTTCACCCAACACCAAGGCACTGCACTGGCTCTCAAATACTTTTGCTTTCCTGTTTGAAATGAGGACAA--------------------------------------------------CAT s rheMac1.SCAFFOLD65323 62236 559 - 89934 CTTAGGGGCCTGATGAATATTTCCCATAGTAAGTTGGAAGATCAATGTTGTTAAATATTGAAGGCCAAGGTCTTGATTTCCATCCTCAGGAGAAT--GTATTCTTTATCTGACTCCAGTATTTTTCAATGTAGAAGACATAAAACATGTTGTATTCCTCAGCCTCCGGGTTTTCTTACAAACTTCATTTCATCTCTTGATGCTACTTGAGGGCAATGAATGTGACAGCTCCAAAAATATTACAGGCATGCAATAAAGAAAAGCAAACAATGTTATctacttatttgcatgcacactctgtcttagacactgtgccaggctctccacatgcatggtttcacttcttcctctcaacaatcccatgaactatgcactccctcttaataggcaagaaactgaggcccaggaagtttaaacgaatggcccaaattcaatctatatttcgcccaacaccaagccactgcactggctctcaaatactttttctttccTGTTTGAAATGAGGACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCat a score=209085 s hg17.chr12_random 84365 2703 + 466818 tcatggagtatgtgcaatattttgatacagg-catgcaatgtgtaataatcacatcattgaaaatggggcatccatcccctc--aagcatttatcttttgtgttgcaaacaagccaattatactctttcaggtatttttaaatgtataattaaattattttgactatattcgccctgttgtactatcaaatactaggtcttattcattctttctatatttttttgtacctattaaccatctccacctcccctccaggcccctactacccttccccacctctggtaattagctctctactctctagctccatgaatcagattgttttgatttttagaccccacatatgagtgagaatatgtgatgtttggctttctgtgcctggcttatttcatttgacataatgacctccagttctgtccatgttattgcaaataacaggatctcattcttttttattgctgaatagtactccattgtgtattaaagtaccacatttttttaaaacccatgttgatggagacttgggttgcttccagatcttggctattgtgaacagtgctgcaacaaacataaaagaacagacatctctttgatatactgatttcctttcttataggtatatacccagcagtgggatcactagatcatatagtagctctatttttagtttttt-ggggaactgccaaactgttctccatagtggttgtacAAAAATGGAATTTTTAATCCTATCTCACATAAAAATGCCCTAAATCTAGGTTGAGAGGAAAGCACA-----TCAT-TGCTATCTGAGAGAAGAAAAACTAATCGCTTCTTTAAAAAAAATTATTCTGGCAAAAAGGAAAAATTTATTTATGCACTAAGATAAAAATAAGAGATTGCTTGTGCCATAAACTTGCAGATGATTTTTAAGCCACCTTTTTGTTCAATTTGGTTGGAATGCAATGTGCTGCTATAATGAGAGCAGTGCTGGGTGCTAAGGAAATGGAGGAAAAAAA-GGCACATCTAGAAGAAGCATCCACAGTCAG-TCAGTAGACCACTGAGGTATTTTTT-AACACTGCACAGAGGTGGGGAACATGTCACAAGATGAGAAGTTGTGTACTTGGCAAACTTAGAGCTGACCTTTGCTGATTTGGAAGTTGAAGATTACCCAACCATTGCAGGTTTATCAGTTCTTTCTTGTTTATCTTCATGTGCAGAAGGTTGAGTTAATCATAATCCATGAGTTCATGGCACAGAAACAAAACCTACATGACCCTTCTCTTGTTTTTTTATTCATTCTCTTTTATCATAATTCCTCACTCTCACTGCCTTTCCCCAGAGGCAACTTCTCTAATATGATGTTTAGCCTTGAACTTGTAAAATACATAGAAATGTTTGTGCGTAT-----ATGTATTTTTCATGGATATGTGATGTGGCACTATAGATTTACTACAATCTATGGATGTACTATAGATTTCATAGtttcttttttctttcaactgtgttcttaggatccagccatgctgctgaatatgtatctagttctttgcttttctaaatggttcagaatatcccagtgtgtatttgccacacttgacttctttattttccagttatggacatctaagtcattgctaatttttcaccaccccaaacaatactgtgataaatttccttatctttcttcccttataggcctggggtagaaattttctgggatagaagagtggtgctattatgaatcatagggaacatgcactcttaatttcacaaagtgctgccagattgccctttagagtggcttggaccagtctacacaccaaccagcaggcaaaagagttcctattggtgggtatacctaatatgtggtattctccaaaggtcagaatttttgccaatctgatcagcataagctggtgtcttgttgtttttaatttgaatttctctcataactcatgagtttgagcatctctttatatacttatacctcttagatttcccatgctatgaatagtttatcatcatattttctacccattttctactaggattcctgtcttgtagatttgttGCAATAATTTCTGTTAGCTCTGTGTCCAAATATTAGCTCTGTGCCCTTCTCAGTCACTGAACACATTGCCTCCCAATGTGTCACTGTCAGTTAATTGTCAACTGGTGTCCTTCCTTGATTAAACAATAAAACAAGTAATTTTGAAATAACAAGTCCATCCTTTTAAAAATTTTTGTGGTTTGTACTATAGAGTATTGTTTAAGAAGTCCTTCCCCATCCCAAAGTTCCAAAGAGGTGCTCTTCTCTCTAGCATCTAGATCTATCATAGCTAGATCTTTAATCTACCTGCATTGTAGATATACCTGTACATGCCTTGGGGATTTCTTAGAGGCTTTTCAACATGGTCCCACAGTCCAGGTAATACCACTTAACTTAAAGAGGCCAATCCCACAATCAATTGTCTTTTGGGATTTTCTCACCATAGAGCCTATTTTAACTTTCCGCTAGATATATAGATCAAATTTTCTTTCTCTGATTTGAAAGTTATCCCTTATATTTTAATTTTTTTGCTGTATTTTTATTTTTTTG----------------CTCCAAGTTATATAATTTTTTCCTTTTAGATATAACTTT--tttcatttatttttgaggaggtgagcactcatatggctcaaacatcaaaatataaaacctagtgaaaattatttcacattcccctgttcat s rheMac1.SCAFFOLD65323 62795 2696 - 89934 ttatggggtatgtgtgacattttgatacagggcatgtaatgtgtaataatcacatcattgaaaatggggcatccatccccttcaaagcatttattttttgtgttgcaaacaacccaattatactctttcaggtatttttaaatgtataattcaattattttcactatattcaccctgttgtactaccaaatactaggtcttattcattctttctatatttttttgtacctgttaaccatctccacctcgcctccaggccctcactacccttccccacctctggtaattatccctctactctctagccccattaatcaaattgttttgatttttagaccccatatatgagtgagaacatgcgatgtttggctttctgtgcctggcttatttcatttgacataatgacctccagttctgtgcatgttattacaaatgacaggatctcattcttttttatggctgaatagtactccattgtgtataaaagtacgtcattttttttaaacccatgttgattgatacttgggttgcttccaaatcttggctattgtgaatagtgctgcaacaaacataagagagcagacatctcctcgatatactgatttcccttcttatgggtatatacccaggagtggaatcgctggatcatacagtagctctacttttagtttttttgaggaactgccaaactcttctcta-aatggttgtacAAAAATGGAATTTTTAATCCTATCTCACATAAAAATGCCCCAAATCTAGGTTGAGAGGAAATCACACTTAATCGTCTGCTAACTCAGAGAAGAAAATCTAATCACTTCTTTTAAAAAAATTATTCTGACAAAAAGGAAACATTTACTTATGCACTAAGATAA------GAGATTGCTTGTGCAATAAACTTGCAGATGATTTTTAAGC----TTTTTGTTCAATTTGGATGGAATGCAGTGTGTTGCTATAATGAGGGTAGGGCTGGATACTAAGGAAATTGAGGAAAAAAATGGCACATCTAGAAGAAGCATCCACAGTCAAATCAGTAGACCACTGAGGTATTTTTTTAAGACTGCATAGAGGTGGGCAACATGTCGCAAGATGAGAAGTTGTGTACTTGGCAAACTTAGAGCTGACCTTCACTGATTTGGAAGTTGAAGATTACCCAACCATTGCAGGTTTATCAGTTCTTTCTTGTTTATCTTCATGTGCAGAAGGTTGAGTTAATCATAATCCATGAGTTCATGGCACAGAAACAAAACCTACATGACCTATCTCTTGTTGTTTTATTCGTTCTCTTTTATCATAATTCTTCACTCTCATTGCCTTTCCCCAGAGGCAACTTCTCTAATATGACATTTGGCCTTGAACTTGTAAAATACATAGAAATGTTTGTGCATATCTTTCGTCTATTTTTCATGGATATGTGATGTGGCATTACAGATGTACTATAATCTATGGATGTACTGTAGATTTCATAGtttcttttttctttcaactgtgttcttaggatctagccatgctgctgaatatttatctagttctttgcttttctaattgattcagaatatcccagtgtgtatctgccacatttgacttctttattttccagttatggatacctaagccgtttctaatttttcaccaccccaaacaatactgtgatgcatttccttatatttcttcctttataggcctggggtagaagttttctgggatataagagtggggttattatgaatcacagggaacatacactc----tttcacgaagtgctgccagattgccctttagagtgacttggaccagtctctatgtccacccgaaggcaaaagagttcctattgctggatatatctaatatgtggtgttctccaaaggtcagaatttttgccaacctgatcagctagagctggtgtgtt-ttttttttaattttaatttctctcataactaatgagtctgagcatc-ctttatgtatttatacctcttagatttcccatgctgtgaatagtttatcatcatattctctgcccattttctaCTAGGATTCCTGtcttatagatttgctgcaataatttctat--------ggtccaaatattag------------ctcagtcactgaacacattgcctcccaa----tcactgtcacttaactgtcaactggtgtccttccgtgattaaacaataaaacaagtaattttgaaataataagtccatcctttaaaaaactgttgtggtttgtagtatagagtattgtttaagaagtccttccccatcccaaagttccaaagaggtgctcttctccctatcatctagacctttcatatctagatctttaatctacctgCATTGTAGATCTACCTGTACAAGCCTTGGGGATTTCTTAGAGGCTTTTCAACATGGTCCCACAGTCCAGGTAATACCACCTGACTTAAAGAGGTCCA-CCCTCAGTCAATTGTTTTTTGGGATTATCTCACCATGCAGCCTATTTTAACTTTCTGCTAGATATATAGGTCAAATTTCCTTTCTGTGATTTGAAAGTTATTCCTTGtatttatatttttttgctatatttttatttttttaCTCCAAGGTTTATTATCTCCAAGTTATATAATTTCTTCCTTTTAGATATCATTTTTCTTTCATTTATTTTTGAGAAGGTGAGCACTCATATGGCTCAAACATCAAAATGTAAAACCTAGTG-AAATTATTTTACATTCCCCTGTTCAT a score=239930 s hg17.chr12_random 87119 2982 + 466818 agagatctttaagcaaatatttatgatagtgtatatgcatatattccttccctccttttcttacacaaatagtagcatactatacatgattctaaatcttgcc----tttttttttttttttttgagatgaagtctcgctctgttgccaggctggaatacagtggtacgatctcagctcactgcaacctccacctccccagttcaagtgattcccccacctcagcatccttagtagctgggtctacaggtgcgcaccaccatgcccagctaattttttgtattttagtagagacagtgtttcatcatgttggccaggttagtctcgatctcctgaactcatgatccacccacctcagccttccaaactgctgggattacaggcgtgagtcaccacgcccggccctaaaccttgcctttttaaactttaaacttaatgatatatcttgaggtcacgctgtttactacaggaagaccttatttattcttttgtaatggctccattgtatttttatgtggattatcgtaatttatttcatcagtactctgttggtaagtattaacatttatgttgtttctaatctttcactattacaagtaatgctttaatgaagaactttgtatgtatcattttacacatgtgtaagaagatagctatgtgaaataatacattaagttgaatgtatgagtcaaaggacatgagaatgtatcattttagtacatactgacaaattaccctTTAGaggatgaccatataatttattatccatgttggaatgttttgatagtgaaaggaggtactagttataattacac--agaaaaaaaaccagatataaattggactgtctccgttaaacggttatgtatggtcTATCAATCCATATGAGTTCTACCAACTTACATTTTACCAACAAAATATAAGAATGTCCACTTTCCCTATAGTTTTCAACCCAATGTGACATTGTATACTTTACCACTGGGCAAATGTCAACAAGTAAGTTCAGATTTACAGAAAGACCAGACATCACTTGAGTAAATCAAGAGGTCTGCTGAGTCAAGATTCACAGCA-AAAAGATCATCAGTATCACCTATGAACAAGCAGGA--TATGTTTA--------------CAGCAGGGGGTACACACTTGTGGATGATAATGCCTGCGTGAATGAGAGATATGCTAGACCTTATGGAAGCTCAGCTCCTCCTTCACACACAGCCTGATGAGCATGAGACTAAAGCAGTTCTGGACAGGGACTTGACTGTATACAACAAACTTGGTTTCAGCATAACACGTTAA------TCACACATTGCACAGTTTGGTGAAATGGATATAGCACAGGGTACCCTTATGCCTGAACAAACTTCTCATTAATCATATTCAAGCTCTTCATGCTAATGTAAGTTGCTTGAACCAAGAACATTTATAAATTTATTGCTGTGGGACCAGAACAAATGTTAGGTACCCAGGCATGTGGCCTATAGACCATCCATGAGAACttaccaaaatttttgattctcaccattctagaggggg-aaaaacatattatagtttaaattagaatgtaccttattttgagcaatgtttgtacatatttaaaagtaatttctattgttatttctgtgaactgtctACACCTAAGATGTCTAAATTCTGATTATTTCTCTAATGGGATATTTTGTACCTGTCTTGGGGATTTCCCAGAGGTTTTTCAACATGGTCTCACAGTCCAGATAATACCACCTGACTTAAAGAGGTCCATCCCACAATCAATTGTCTTTTGGGGTTATCTCACCGTGCAGCCTATTTTAAGAAAAACATACCTTTGTCCTGCCAATGGTGGAGTCCAGCTTCTTCTCTGGACTTCTTTTCTGTCTATGCTCAATATTCAAAGAAGTTATCCAGTTTCTTGCCTTTATACACGAGTTAGGCAGTTTCTACACCTGCAAAATCCAGAGGACGTAGGCCAAGCTCTCTGGTAGGTTCTTTTTAACCACCCTAACTTGGTATAAGGTAAAGAGGAGGGAATACTTCTCCCCTTCCAATGGAAGCAAAAGAGAAATGTCACAGCACATTGACACATCTCTAGTGAAATTCTCTTCCCAGCCATTTGTTTTAGTCTTCTGGTTTGTTCTTATAAATCCTTACAGTGAGTATTGAATCTAATGCTGCAAAATGGGATTCTCCATCTCTTAGCATGCATGTCCTGTATAGAAAGTCTCAAACTCCAAAGCAGCAAAAACAAAACAATCACATTCAATGTACTATTAGCAGCAACTAGACTGATGGGGTTTTTTTTTTAAATTAAGCTACTTCCTTAAATATTTAACCAGTTTTATGCATTTGTAAAGAATTTAACAAATGGAGATGTTAGAGACAATTTCTATGGCATTTCTATAtatcttggactaccttttcaaggatatatgcacagcaaagagcattagaggc------tagtctgtccctttgggtcagacagcagaattatttattgtccagtataataattacagagaacatctccatcTCTGAAGACATTCCATAATAATAAAGTCTTCAACCTCTCACCAGAAGAAAACTTGTTTCCATGCCaaggtaaagataatgcctatctttgaagaggaggatgaggaagttgccatcagcttctgtatgaatcagaatgtcctaagctcagtgttccttggctgtgaaactgtatgctcagcatacacctggatctactctgcattacccatggacttgggggacaaggagaatcaatgaaaatatggacctcatgttgcctattgtgccctgaacaataaaCTGTGTAAATTCATTTGGATTCCTGGTTTACTCATTTGCCAATGTTATGAAAGTGTGGAAAGTCTGCCTAGAAGTTACACTGATGTTCAGGAATTGCTTGGCAAGTTGATAGGAAAGAAAGGGACCTGTGGCATATACAGCTAGGTTCTCCATTTTCTTTCCTTCTTTCGCATGGAAATGGAAACTCAATATTAGTTTTC s rheMac1.SCAFFOLD65323 65542 2993 - 89934 AGAGATTTTTAGGCAAATAATTATGATAGTGtatgtgcatatattccttccctccttttcttacagaaatagtagtgtaccatacatgattctaactcctgcctttttttttttttttttttttgagatgaagtctcgctctgtcggcaggctggaatacagtggtgcgatctcggctcactgcaacctctgcctgccaagttcaagtgattcccccatctcagcatccttagtagctgggactacaggtgcacaccaccatgcccagctaattttttgtattttagtagagacagggtttcgccatgttggccaggatggtctcaatctcctgaactcatgatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagtcactgtgcccggctgtaaatcttgccattttaaactttaaacttaatgatatatcttgaggtcaccctgcttactacatgaagaccttctttattcttttgtaatggctccattgtatttttatgtggattatcataatttatttcatcagtactctgttggtaagtattaacatttatgttgtttctaatctttcac-attacaaataatgctctaatgaagaactttgtatgtatcattttacatatatgtcagaagatatctatgtgaaataataccttaagttgaatttatgtgtcaaaggatatgagaatttatcattttagtacatattgacaaattaccctTTAAaggatgaccatataatttattatccatgtgggaatgttttgatagtgaaatgaggtgctagttataattacactgaaaaaaaaaaacagatataaattggactgtctccgttaaacagttatgtatagtcTATCAATCCATATGAGTTTTACCAACTTACACTTTACCAACATAATAAAAGAATGTCCACTTTCCCTATACTTTTCAACCCAATGTGACATTGTATACTTCACCACTGGGC-AATGTCAAGAAGTAAGTTCAGATATACAGAAAGACCAGACATCACTTGATTAAATCAAGAGGTCTGCTGAGTCAAGATTCACAGCACAAAAGGTCATCAATATCACCTACGAACAAGCAGGATGTACGTTTACAGCCTGCAATCTTCAGCAGGGCATACACACTTGTGGATGACAATGCCTGCGTGAATGAGAG--ATGCTAGACCTTATGGAAGCTCAGCTTCCCCTTCACACACAGCCTGATGAGCATGAGACTAAATCAGTTCTGGACAGAGACTTGACTGTATACAACACACTTGGTTTCAGCATAACACATTAATCTTACTCACACATTGCACAGTTTGGTGAAGAGGATATAGCACAGGGTACCCTTATGGCTGAACAAACTTCTCATTAATCATATTCAAGCTCTTCATGCTAATGTAAACTGCTTGAACCAAGAACACTTATGAATTTATTGCTGTGGGACCAGAATAAATGTTAGGTACCCAGACATGTGGCCTATAGACCATCCATGAGAACTTACCAGAATTTTTGATTCTCACCATTCTGGAGGGGGAAAAAACACATTATAGTTTAAATTAGAATGTACCTTATTTTGAGCAATGTTTGTACACATTTAAAAGTAATTTCTATTGTAATTTCTGTGAACTGTCTATACCTAAGATGGCTAAATTCTGATTATTTCTCTAATGGGGTATTTTATACATGTCTTGGGGATTTCCCAGAGGCTTTTCAACATGGTCTCACAGTCCAGGTAATGCTACCTGACTTAAAGAGGTCCATCCCACAATCAATTTTCTTTTGGGGTAATTTCCCTGTGCAGCCTATTTCAAGAAAAACATACCTTTGTCCTGCCAGTGGTGGAGTCCAGCTTCTTC-------------TCTGTCTATGCTCAATATTCAAAGAAGTTATCCAGGTTTTTGCCTTTATACACGAGTTAGGCAGTTTCTACACCCCCAAAGTCCAGAGGACATAGGCCAAACTCTCTGGTAGGTTCTTTTTAACCTCCCTAACTTGGTATAAGGTGAAGAGGAGGGAACCCTTTTCCCCTTCCAGTGGAAGCAAAAGAAAAATGTCACAGCACACTGGTACATCTCTAGTGAAATTCTCTTTCCAGCCATTTGTTTTAGTCTTCTGGTTTGTCCTTATAAATCCTTACAGTGAGTATTGAGTCTAATCCCACAAAATGGGATTCTTCATCTCTTA----GCATGTCCTGTATAGAAAGTTTCCAACTCCAAAGCAGCAAAAACAAAACAATCACATTCAGTGTACTATTAGCAGCAACTAGACTGATGGG----TTTTTAAAGATTAAGCTATTTCCTTAAATATTTAACCAGTTTTATGCATTTGTACAGAATTTAGGAAATGGGGATGTTAGAGACAATTTCCATGGCATTTCCACAtgtcttggactaccttttcaaggatacatgcacagcaaagacctttagaggctagagatagtttgtctctttgggtcagacagcagaattatttCTTGACACGTATAATAATTATAGAGAACATCTGCATCTCTGAAGACGTTCCATAATGATAAAATCTTCAACATCTCATCAGAAGAAAACTTGTTTCCATGCCAAGGTAAAGACAATGCCTGTCTTTGTAGAGGAGGATGAGGAATTTGCCATCAGCTTCTGTATGGATCAGAATGTCccaagctcagtgattctcggctgtgaaactgtacgcttggcatccacctggatccactctgcattacccatggacttgggagacaaggagaatcaatgaaaacatggacctaatgttgcttattgtgccctgaacaataaaCTGTGTGAATTCATTTGGGTCCCTGGTTTACTCATTTGCCAATGTTATGAAAGTGTAGAAAGTCTGCCTAGAAGTTACACTGATGTTTAGGAATTGCTTGGCAACTTGATATGAAAAAAAGGGAGCtgtggcatatacagctaggttctccattttctttccttttttctcatggaaatagaaactcaaggttagttatc a score=62049 s hg17.chr12_random 90235 784 + 466818 TCTAGAGACTTAAGGAGTAGGATTTGGAGCTTTGTGACTGTTCTTTGCCTATTCCCGTCCCATTGGAATAGGCCCTCAATCTGGCCATGTTATCAGTGGGTGGCTGCTATTTTCCCCACGGTCTCAGGGTGGAAGATAAGGTTTTCATGGAGTTACCCAGAAACGGAGCAAGTAGGGCGTAAAGGGTGGCACAAAAGAGGAATAGAAGACAGAATGAGTCCACATAGCTTTACATATTTGGAAATGAAAAATCCAGGAACGTAATGACTCCTGTGACTCTGAATGGCTCTGTGTATTAGTCTTTCAGTTTTCAAAGGGAGTAAATTATATGTGTGAACTGAAACTATATATCTTCTCCCAGTTCTCAGAATTGATCATTTATTTTACATCGCTCTTCAGTCTCTATACCAGTATTTTAGAAGTTGTCATAAGTAATTCCTCTAAGTGCTACCTCGCTGGAGTGGTACTGGAGCAGCAAAGTAGCAAAAG----AATACTAGCTGGGAGCACAAAATTAATTTTTACAAATTTCTCAGTGGCACGTTATTTCTACCAGTCATATAATCAGTAGACTATATAGAAACAGAGGTACTCTAGGGTACCGTACTTGTGCTCTGAATAGCTGCTAGACATGCAGTGCACGGTGCGATGTGTGGTATCTCAACAATGCTTTTCAGAACAAGACTGTAACCTTAAGGTCATGATCAGAAATCACACATTTGAATAATCCATGAATGAAGACGGTGTGTGCGATTAAAAAATACAGTGCTTTCTAGTTAAAATGGGA s rheMac1.SCAFFOLD125516 3689 783 + 48937 TCTAGAGCATTAAGGAGTAGGATTGGGAGCTTTGTGACTGTTCTTTGCCTATTCCCTTCCCACTGGAATAGGACCTCAATCTGGCCATGTTATCAGTGGGTGGCTGCTATTTTCCCCACGGTCTCAGGGTGGAAGACAAAGTTTTCATGGAGTTACCCAGAGCTGGAGCAAGTAGGGCATAAAGGGTGGCACAAAAGAGGAACAGAAGAGAGAGAGAGTCCACATAGCTTTACATATTTGGAAATGAAAAATCCAGGAACGTAATGACTCCTGTGACCCTGAATGGCTCTATGTATTAGTCTTTCAATTTTCAAAGGGAGTAAATTATATTTGTGAACTGAAATTACATAACTTCTCCCAGTTCTTGGAATGGATCATTTATTTTACATTGCTCTTCAGTCTGTATACCAGTATTTTAGAAGTTGTCATAAGTAATTCCTGTAAGTACTATCTCCAGGTAGTGGTATTGGTACAGCAAAGTAGCAAAAGAAGAAATACTGGCTGGGAAAACaaaattaatttttataaatttCTCAATGGCATGTTATTTCTACCAGTCATATCATCAGTAGACTATATAGAAACAGAGGTACTCTAGGGTACTGAACTTGTGCTTTGAATAGCTGCTAGACATGCAGTGCACGGTGCGATGTGTGGTATCTGAACAATGCTTTTCAGAACAAGACTGTAATCTTAATGTCATGATCAGAAATCACACATTTGAATAATCCATGAATGAAGAC-GTGT-TAAGAT--AAACATACA-CGCTGTCTAGTTAAAATGGGA a score=16754 s hg17.chr12_random 91151 283 + 466818 taatcccagcactttgggaggctgacgcgggcagatcac--gaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacggtgaaaccccatctctaccaaaaaatacaaaaaattagccgggcatggtggcgggcgcctgtagtcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcctgggcgaca-gagcgagactcccgtctcaaaaacaacaacaaaaaaaGAGTTT s rheMac1.SCAFFOLD91656 5476 277 - 6797 taatcccagtactttgggaggccgaggcaggcagatgacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccctgtctactaaaaa-tacaaaaa-ttagccaggcgtggtgatgtgcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttaaatccaggaggcagaggttgcagtgagccaagatggcgccactgcactccatcctgggcaataagagcaaaactga-gtcttaaaaaaaa------aaaaaaTGCTC a score=108192 s hg17.chr12_random 91626 1338 + 466818 TTATCATTCCTGTCACTTGCAATTTAAATATTCCTAATAAATAGAAAAATCCAAAGACTAAGATTGTGATCCTTTTTATGTCTATGGTATATTATGAATACAGAGACCTTGTGCTTTTATTGGCGTAGGAATCATCTTGCCCTAATATTAATATTATGAAATCAAAAGGGTAAGATTCCT----AACATCCCACATAACACAGcagacaaactaaagttttaatctagctttggcccttacaaattttgtgccctacggcaagttacatctcgcttagattttttcattttaaagtggAACTATCTGCATGGATGTTCGTACATGCTATATAACACATCCTATTCCAGAGCCACCTACCATCAGTTGAGCTCTAAATGGTAAATGCCACA-GTGAGAAGCAGACAGGAAGGGGCGGAGCGCCAGCGGCGCCCGGGGCTACGCGCCGCACTGCACCGAGCGGCGGCAGCGGCAAGCTTGGGTGTGAGCCCGGGAGCCGCTTTGCTTACCGTCCTGCCGGTCCCAGCCGTCGCTAGGAGGTCCGCGGGCCCTGCGGCAACCCTCGCTACAGACGCTGGGCGGCCGGCGACACCTGGCTCATGGCCCCCGCGGCGGCTCCGTCCTCCTTGGCCGTCAGAGCCTCAAGCCCCGCCGCGACACCCACCTCGTACGGCGTCTTCTGCAAGGGGCTCTCCCGCACCCTGCTCGCCTTCTTCGAGCTGGCCTGGCAGCTGCGCATGAACTTCCCGTACTTCTACGTCGCGGGCTCGGTGATCCTCAACATCCGATTGCAGGTACATATTTAGAGCCATGACTAAGATAACGGCCTCCGGGGCCAGCATGATGGCCGACTCCCAGGGTCCGTTGCGGCGCGGCGGAGCAGCCAATGGCGAGCCCCACAGTCTCGCGAGAGTGCTCAGGCGCTCTTCGTGGCTGCCCTCTTAGCTGCTAGCGGAGCTCCTCAGGGGGCGGCCGGGAGCCTACAATTCCTAGAAAGAAAATACGCCATTCCGGAAACAGAACTGCAGTTAAGACCCTCGAAAAGATCTAAGAAAGTGTGCATCCTAAAACACCTGACGAATTTCAGAATGTGACAAAGCGCAGAGGATGCATTATTTCAAAACAAAACAGAAGGCTAAAATTTGCAGGAAAAAGAAAATCAGTAAACCGGGAATCCTCGGACTGGATTGTAAGCAAGATTTGAATGAATAAGAAGCTGAAGGTATTAAGGCTGTGATATAGAAGGTACATA---TTTCATCCCACAAGAGAAAACAATAATAATCAGAAATTTTCGGTGAAAAAAACGCAAAACTGTACAGGAAAATCATCCTCCAAGTACCAGACA s rheMac1.SCAFFOLD125516 4522 1337 + 48937 TTATCATTTCTGTCACTTGCAATTTAAATATTCCTAATACATAGAAAAATCCAAAGACTAAGATTGTGATCCTTT--ATGCCTATGGTATATTATGAATACAGAGATCTTGTGCCTTTACTGGCTTAGGAATAATCTTGCCCTAATATTAATGTTATGAAATCAAAAGGGTAAGATTCCTGGCTAACATCCcacagaacacagcagacaaactaaagttttaatctagttttggactttacaaattttgtgccctagagcaagttacatctcgcttagcttttttcattttaaagtggaaatatctgcatggttgttCGTACATGCTATATAACACATCCTATTCCAGA----TCAACCACCAGTTGAGCTCTAAACGGTAAATGCCAAAAGTGAGAGGCAGACAGGAAGGGGCGGAGCGCCAGCGGCGCCTGGGGCGACGCGCCGCACCGGACCCAGCAGCGGCAGCGGCAAGCTTGGGTGTGAGCCCGGGGGCCGCTTTGCCCACCGTCCCGCCGGTCCCAGCCGTCGCTAGGGGGTCCGTGGGCCCTGCGGCAACCCTCGGTACAGACGCTGGGCGGGCGGCGACACCTGGCCCATGGCCCCCCCGGCGGCTCAGTCTTCCTTGGCCGTCAGGGCCTCAAGCCCCGCCGCGGCCCCCACCTCGTACGGCGTCTTCTGCAAGGGGCTCTCCCGCACCCTGCTCGCCTTCTTCGAGCTGGCCTGGCAGCTGCGCATGAACTTCCCGTACTTCTACGTCGCGGGCTCGGTGATCCTCAACATCCGATTGCAGGTACACATTTAGAGTCGTGACTAAGCTAACGGCCTCAGGGGCTAGCATAATGGCCTACTCCCAGGGTCCCTTGCGGCGCGGCGGAGCAGCGAATGGCGAGCCCCACAGTCTCGCGTTAGCGCTCAGGCGCTGTTCGCGGCCTCTTTCTTCGCTACAAGCAGAGCTCCTCTGGGGGCCGCCGAGAGCCTACAGTTCCTAGAAAGAAAATACGCGATTCCGGAAACAGAACTGCAGTTAACACCCTCGAAAAGATCTAAGAAAGTGTGCATCCTAAAACACCTGACGAATTTCAGGACGTGACAAAGCGCAGAGGTTGCATTATTTCAAAACAAAACAGAAGGCTAAAATTTTCAGGAAAAAGCAAATCAGTAAACCGTGAGTACT-GGACTGGATTGTAAGCAAGATTTGAATGAGTAAG-AGCTGAAGGTATTAAGATTGTGATATAGAAGGTACATACTTCTTCATTCCACAAGAGAAAATAATAATAATCAGAAACTTTCAGTGAAAAAAA-GCAAAACTGTACAGGAAAAGCATCCTCCAAGTACCAGACA a score=9914 s hg17.chr12_random 92964 158 + 466818 TAAAATGCTGCAAGCTTTTGAACTAATGGCGAGAGTGTAAGAAAATGGGCTC----TACTTCAGTGATCCTGTGGCAGGACGTGGATCAAGA-CTTGGAACCGCAGAAAACGAAATCCCATAGTAGCACAAAGCTTGGCTGTTCAGTGAATAACATTTAAATA s rheMac1.SCAFFOLD48760 267 162 - 1188 TAAAATGCTGCAAGATTTTGAATGAATGGTGAGAGTGTAAGAAAATGGGCTGGCTGTATTTCAATGCTCCTGTGGCAGGATGTCAATCAAGAGCTTGGAACCAAAGAAAAAGAAATTCCTTCCTAGCA-AAAGTTTGGCTATTCAGTGAATAACATTTAAACA a score=285353 s hg17.chr12_random 93122 3995 + 466818 ATCGTAAAATACAAATGTTGTTTATGGTTTTTATTGTTTAAGGGCATACTTAATTATGGTTACAAAGTGGAGTGCAAATGTTATTTACCATGTTTTAAAAATACAGCCGGAAAATACAAGTGGGAATGTTGAAGGAGGGCGGGGGAAGTAAATGGAATGGGGGTTATGTCCTTATAAAGTGGAAACTTGAAAGGTACTGTCTGTTGTTGAGTGGGGAAAGACATTTTTATTACTTACAGGGTAGCCATAAAGTTTCTAAAACGGTAATATATTAAAGAGGGAGAGTGGTAGGGGAGAACAGTATGAAGTCAACAGGAAATGGCTAAAGATGGAGAGCTCAGGTAGAATAGTTTaaaaaatgaaaattgatagagtacctggtgtatttgaatacagcctagagagctttcattttccaaagagtgtggggataaattagtgaatgcatatttttcaaaattaagaaaacagaacatataattttgaacgctgagaaaaataaaaatttaaaaactacactgtatacacggtatacctcaactgtgaataatagtagtcatgtaaagtcagtcataattatgtaaatactgaatactgattttacaacaaatgattctataacgctgggaggatgggagaaaagagatgtgtgtgtgtgtaatggtggtgagCCAATCAAGATCTGATATAGAAAAATGCAGAAAAAGGAGTATACACATGTTTTCTTCGGATT-----AAAAAAACTAATAATAAATCACCAAGAGTGGTAAAGTTTTAAATCAAGATCTGAT--------------------------------------------------------ATAG----------------------------------------------------------------------------------------------AAAAGTGCAGAAAAAGTAGTATACGCATTTTTTTTTTCAGGAAAAAATTAACTAATAAACCACTAAGAGGGGTAAAGTGTTAAAATAGTTGCATTGTTCTATATTCCACTCATTGTGTCCAGCAAACAGT-----GTTCTATGGCTTTAAGTAGTAAACATCTTGCCCCGTCCAACACCATGTCTGGCCTAGGGTAATTGTTCTTTCTAGTCTTTATTCTTTGTCTCCAGCCAAACTCCATTTGGGCACATTCTCCTATA-GCCTTTTCTACCTGAAGAtactctgtgttttaaagctaagcttaggtggcgctttttccattaaatttttcctggattccactgaccatataggagctcacttctTTTAATCCATAAGGCCATTTTCATAGGTTGCCTTATTTTTCCCTAATCGTGCATCAACTATCTGTTTTATATACCCAAGACAGGTTTCCTAGACTGCGATAAGCCAAAACATTTTAGTCTAAAATATCAGAAGTGTAGTTTAATCAATGAAATAGTAATACCAAGGGATTTAGAATCGTGGACATCACTGTTTCCCAGAGCACTGATGTCCCAATTTGTAACACAAAAGACTGTCTAGTCTTAATCCTGAAATGGTGACAGAGTAGGATGCTCCATTTGGGTGACTATGTGAACATATTCCTACAACTTTTTTCCTCACATCAGTCATTTGTTAAATCGAAGATGAAGAAACAGACTTTGTATTTATTACATCCTCCAACATAATTGGCAGCTCTGTGAGGGAAGACACTATATCCTATTCAATTTTACACCCGGTAGTAACAGTATGTGTGTGTACTGtatatatacatatatatatacatacacatatataaatttaagtagtaactatatatgtatatatgtatagttactacttactatatatgtatacagtatataagtatatatgtataGTTACTACTTACAATATATGCATAAAGTTACAGCTTACATTTACCTCGTAatatatgtatatatatatatatat---------TAGGAGTTAAA-------------------------------------------------------------------------------TGTATTAGGAGGTAAATGTAAACTCTGTGGTTTATCATTTATTCACAATTGCTCTTAATTCTTGGGGTATAGTTTGCCTCCTACATGATGCAATTCAGTGAAATTCCCAGGAGACAAAACAAGATTTTGACCTGAATAAACCACTTATTGTTGTAATTCACAAGTGAgtttattcttcctggcacacttccaggtaatatccattaggctaaggattttgtttgttcactgttctatccccaagcctagagcattgcccagtgcggaatagctaataaatattgttgaatggatagatGAATGGCAATTTTGTTGGTATGCTCTACATAGTCAGCAGTCAATAAAGGAAAC--ATATATTCGTTCCTGATAATAAGATGATTCACTTTATTGCCCATAAATTGGGCTTTTTCAGGCCATCATGCACGTTGATTGATCCAGAGATCCCTCAAGCATGAAAAAGCAGAGACATAGGTGGTATAGTTATTATCAATAGAGA-------TAAGAAATGTAGCTGGCAAAAAAAAAAATGGGAAACGATGCGTTACAGCTTATTTTAACTATAAAAGGAAAACAGTGAACATAGCAACATATGTAACCTAAGGGATAGGGGAAAAGTTGT---TTTTTTTTTTAAATTCTGGGTAAAAATATGTGTGATTACTTGACAAATAGCATATCATTACCATCAGCATCATTTTTAAA-atatattgagtttttaataccaggaactatgaaaaactatttatatacatgagctccgtaattctcacatataccctgtgaggaaaacatttttatcatttttcagagaagcaaaccgggatttagagaggttaagtaaattcctaaggtcatgataaccaaccagACCTCAAATGAATCTCCAGTAATTCCTAAAGTTATATTTCATAAGGAGTTCAATTTTCTTAAATGTGTAGATAATTACAAATAATTCTGTTTCTCAAATTTCTGGACAGAAATATTACCTGGGTAATAGTTATTTTTTTTAACATAACTATTGAGGGTCTTTCATACTAAAATATAAATATTTAACATGATTTGATATGTAAGTTCAAGTATTTTATACTCTCTGCAGCCTTAAACCTATTGGCTTATTTTATTAGAGGGTTGGTGGGATTGAGGGATATGGGAGCAAAGGGAGAGAGAGGAAAGAACGTTGTCCTCAGAATGGAAGGGAAACACTTTCCTGTGCTACCCAGAGTAGAGATCAGACAATGTTAAATTTTGAAGCCATGTCTGCTCCTGTCCTGAGGATCCCTAACTAAATTGTGTTAGAAAATCTTGCAGTTTGCTTTTAATGGGAGATGTTTCTGGCAGGACATCAATAGCTTTTGATAGCGTCAAGAAGAAAATAAAGTTACATGCAGAAGCATAAAGGGGTAGGATGAAAGTTGAGGAATATAGGGACAAAAGATGAGGGAAAGGAATATCCTAATACTTGGAAGTTTGAGCATGGAAAGTAGTCTAAAGAC--GACTTGGGAAGTTCCAAGAAAATGAACCAAGAAAAGAACCTCTGCAAGAACTATGAGAATTCCCAACAATTGGGTTGGATTGATTCATATTAGTCTATTACTTGGGTTACCTTGAGTGTGGGGATTCTTCTTGCAGTTTTAACACTTGtactatggtctgaatgtgccccccaaaaattcacatgttggcatt-taacccccaaagtgatgatctcaggagatgggacctttgggaggtgatcaggtcataaagatgaaaccctcgtgaatgggattagtgcctttataaaggagaccccaaaataattcccttaccccttttgccatgtaaggttatagggaaaagtcatctatgaacaaggaaatgaaccctcaccagataccaaatttgtgaatgcctggatcttggacttcccagcttctagaactataagaaataaatttctgttgttcataagcacccattttatggtattttttatagcagcctgaacaaactaGACTTAATAGGATTTGCTCAGCAGGATTACCACCAGGTCAAGTCATGAGATCTTTTCAAAATATAAAGTAAACCCTCCCCTAACCCCTACTCTTCACAAATACCAAATTCAGCAATGCTCTTGGAACACCT----TAAAAGGCCAAGGGACCTTNCCCAAAAGCCTACTACNAAT-----GAAGAAACTATTGGAAGCCTTAGTA s rheMac1.SCAFFOLD125516 6373 4113 + 48937 ATCGTAAA-TACAAATGTG---TATGGTTTTA--TGTTAAG-----TACATAATTATGGT-ACGAAGTGGAATGCAAATGTTATTTACCATATTT-AAAAAGAGAGCCGGAAA-TACAGGTGGGAATGTTGAAGGAGGGCGGCGGGAATAAATGGAATGGTGGTTCTGTC-TTATAAAGTGGGAACTTGAAAGGTACTGTCTGTTGTTGAGTGTGGAATGAC--TTTTATTAC----AGGGTAGCCATAAAGTTTCTAAAACGGTAATATATTAAAGAGGGAGAGTGGTAAGGGAGAACAGTATGAAGTCAACAGGAAATGCCTAaagatggagcgctcaggtagaatatttcaaaaaataaaaattgatagagtacctggcgtatttgaatacagcctagagagctttcatttttcca-tagagtggggataaagtagtgattgcatatttttcaaaattaagaaaatagaacatataattttgaaccctgagaaaaataaaaatttaaaaactacactgtatac---------ctcaactatgaacaatactagtcatgtaaagtctgtcataattatgtgaatactgaatactgattttacaacaaatgattctacaac--ctggaggatggaagagaagagagatgtgtgtgtgTAATGGTGGTGAGCCAATCAAGATCTGATACAGAAAAGTGCAGGAAAAGTAGTATACACATGTTTTTTCCAGATTTAAAAAAAAAAAACTATAATAAACTACTAAGAGTGGTAAAGTTTTAAATCAAGATCTgattgcattgggagttatacctgatgtaaatgatgagttgatgggtgcagcacaccaacatggcacaagtatacatatgtaacaaacctgcacgttatgcacatgtaccctacaacttaaagtataataataaTAATaataaataaataaataaataaaAAGTGCAGTAAAAGTAGTATACACATGTTTTTT--CAGAAAAAAAT-----AATAAACCACTAAGAAGGGTAAAGTTTTAAACTAAATGCAGTGTTCTATATTCCACTCATTGTGCCCAGCGAACAGTTAGTTGTTCTATGTCTTTAAGTAGTAAGGATCTTGCCCCCTCCAACACCAGGTCTGGCCTTGGATAATTGTTCTTTCTAGTCTTTATTCGTTGTCTCCAGCCAAACTCCACTTGGGCATATTCTCCTTTATGCCTTTTCTACTTGAAGAtactctgt--tttaaagctaagcttagatgacactttttccattaaatttttcctggattccactgaccatataggagctcacttctTTTAATCCATAAGGCCATTTTCATAGGTTGCCTTATTTTTCCCTGATTGTGCATCAGCTGTCTGTTTTATATATTCAAGACAGGTTTCCTAGACGGCAATAAGCCAAAACATTTTAATCTAAAATATCAGAAGTGTAGTTTAATAAATGAAATAGTAATACCAAGGGATTTAGAATGGTGAACATCACTGTTTCGCAGAGCACTAATGTCCCAATTTGTAACACAGAAGACTGTCTAGTCTTAATCCTGAAATGGTGACAGAGTAGGATGCTCCATTTGGGTGACTATGTGAACATGTTCCTACAACTTTTTTCCTCACATCAATCATTTGTTAAACC------GAAGAAACAGACTTTGTATTTATTATATCCTCCAACATAATTGACAACTCTTTGAGGGAAGACACTATATCCTATTCAATTTTACACCCTGTAGTAACAGTATGTGTGTGCATTGtatatatac--atatatgtacatacacatatataAATGTAAGTAGTAACTATGTA---------------------------------------------------------CACAGTTACCACTTACTATATATGTATACAGTTGCAGCTTACATTTACCTCCTAatatatatgcatatttacataaatgtaaatatgtaaaaattacatatttacaatgtaaatgtgtaattatgtaatttacataaatgtaaatacgcatacatattatttacataaatatgggtctatatTAGGAGGTAAATGTAAGCTCTGTGGTTTATCATTTATTCACAATTGCTCTTAATTCTTGAGGTATACTTTGCCACCTACATGTTGCAATTCAGTGAAATTCTCAGGAGACAAAACAAGATTTTGACCTGAATAAACCAGTTACTGTTGTAATTCACAAGTGAGTTTATTCTTCCTGGCACGCTT-CAGGT-ATAtccattaggccaaggattttgtttgttcactgttctatccccaatcctagagcattgcccagtgcagaatagctaataaatattgttggatggatagatGAATGGCAATTTGGTTGGTATGCTCTACATAGTCAGCAGTCAATAAAGGAAACAGATATATTTGTCCTTGATGATAAGATGATTCACTTTATTGCCCATAAATTGGGTTTTTTCAGACCATGATGCACGTTGATTGTTCCAGAGATCCCTCAAGCATGAAAAAGCAGAGACATAGGTGGCATAATTATTATCAGTAAATACAAAACTTAAGAAATATAGCTGACAAAAAAAA----GGGAAATGATGTGTTACAGTTTATTTTAGCTATAAAAGGAAAATGGTGAACATAGCAATGTATGTAACCTAAGGGATAGAGGAAAAGTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTCTGGATAAAAATACATGTGG-----TGACAAACAGCATATCATTACCGTCAACATCATTTAAAAATatatattgagtttttaatgccagaaactatgaaaaagtgtttatatacatgagctccataattctcacatatgccctgtgaggaaaacatttttatcatttttcaaagaagcaaac--ggatttagagaggttaagtaacttcctaaggtcaTGGTAACCAACCAGCCCTCAAATGAATCTCCAGTAATTCCTAAAGATATATTTCATAAGGAGTGCAATTTTCTTAAATATGTAGATAATTACAGATAATCCTGTTTCTCAAATTTCTGGACAGAAATATTACCTGGGTAATAGTTACTTTTTTTAATGTAACTATTGAGGGTCTTTCATACTAAAATATAAATATTTAACATGATTTGTTATGTAAGTTCAAGTATTTTATACTCTCTGCAGCCTTAAATCTATTGGCTTATTTTATTAGACAG-TGGTGAGATTGAGGGATATGGAAGCAAAGGGAGAGAGAGG-AAGGGCATTGTCCTCAGAATGGAAGGAAAACACTTTTCTTTGCTACCCAGAGTAGAGATCAGACAATCTTAAA-TTTGAAGCCATGTCTGTTCCTGTCCTGAGAATCCCTAACTCAATTTTGTTAGAAAATATTGCAGTTTGCTTTTAATGGGTGATCTTTCTGGCAGGACATCAATAGCTTTTGATAGAGTCAAGAAGAAAATAAAGTTACATGCAGAAGCATAAAGGGGTAGGATGAAAGTAGAGGAATACAGGGACAAAAGATGAGGGGAAGGAATATCCTAATACTTAGAAGTTTGAGCATGGAAAGTAGTCTAAAGACTAGGTTTGGGAAGTTCCAAGAAAATGGGCCAAGGAAAGAACCTCTGCAAGAACTATGAGAATTCCCAATAATTGGGTTGGATTGATTCATGTTAGTCTATTTCTTGGGCTACCTTGAGTGCAGGGATTCTTCATGCAgttttaacact----------------tgtgccccccaaaaattcacatactggcattctaacccccaaagtgatgatcttaggagatggggcctttggaaggtgatcaggtcataaagatgaaactcccatgaatgggattagtgcccttacaaaggagaccccaaaataattcccttaccccttttgccatgtaaaattatagggaaaagtcatctatgaacaaggaaatgaaccctcaccagatatcaaatttgtgaatgcctggatcttggacttcccagcctctagaactgtaagaagtaaatttctgttgtttataagcacccattttatggtattttttatagcagtatgaacaaacta-----aATAGGATTTGCTCAGCAGGATTACCACCAGGTCAGGTCATGA-ATCTTTTCAAAAT-TTCAGTAAACCTCCCCCTACCC--------TTACAAATACAAATTTCAGCAATGCTCTTGGCATTGCTAAACTAAAAGGCCCAAGGACCTT-CCCAAGAGCCTACTACAAATGAAAAGAAGAAACTA-TGGAAGTCTTAGTA a score=4959 s hg17.chr12_random 97217 76 + 466818 Catgtccatgggtgataaaatggataaataaattattgcatactcatacaatagaatactatacagcaatcaaaat s rheMac1.SCAFFOLD85456 14548 74 + 81052 catttccatcagtgataaaatgtatgaataaatta--gcacacttatacaatagaatactataaaacaatcaaaat a score=157792 s hg17.chr12_random 97293 2253 + 466818 gaaccaactagagagacgt--ttataaagaatgttaataaaaaggaaaatgaacaaatttgcactacatagatacgagagatattaagatggaaacatgattccgtataattacatttatataaagtttacaaaactatatttttaatgaactgcaatttattacattgttgtcgaaattctaaagtgagacccaagagtgattattgtaacaactggcacagtagggacggaggaaacaaaagggaaatgatatcaacaagaaggtgtatatggggagtgtctggattgctggtaaattctacttcatgaccaagatgtggtaacatgacccttaatgctataatttttttctatactgtaccttcaggctttattaatttatatatat--gttatgtttcatagtaatgaaaaTATTTAAAAAGCAGAATCATATAATAAATGAATGAATATAAAATAGGCTGAAAAAACAT--TCTTGTAGACACCATGGTAATTAGAATTTTTGCTGAATAAAGAAGAATAGAGCATTATGATAGTAAGAAATCCAAGataaaattttaaacttt-----aaattaattttaaaaaGGAAGAGATAAACAGGAAGTCTACCTCCACACTCTTAATGTTATTCTTATTTTGAAACATCAGATTTTGCACATCTGTATTTTGCTAGACACCTTTTTTTCTTATTTCCAATTTAGATATTTATGATCACAACATTTCAAAGTGGCAGAAATTAGTGAATTTCCAATATATTATAGTAATATAGATATTAAATATACAGGACAATTTTCTAAA--TTTATCCCTAAATGAAATAATAATACACATATTTTTACCATTCAAAGATTATAATACCATGCATG----------TGTACACATGTGTGAGGAAAAATATTTTGATACTACAAATTTTTTGAATATTACAGGAGAATTAGTAGAAAGATAATTTTGTTAAGGCATAAAACATATGTAGTATAACTACTTGGACTGCTATAATAAAATCACCCAGATTTTGTGACAGTAGCTGAGAATGTAAATAAGCAGTAGAGAGAATTTAACTTGTTAATGATGCTATTAAAAGATGAAATGAAGCTTATTCACTCTATAATTGCAAAGAGTATTTGTGTAAGTTCATAGGAAAGTGGAACAAAATTAAACAGCCAACAAGAGAGTATTCTTTGCTGGAGGTCAATTTTACTGTAATTTTTAGAATGTGGTAAAAGAAAAAAAATAGCAAGTAAATCATTGGAAATGTGTCGGTTTTGTATTATTCTTGACGAAATATTATGTGAGGGTATTTGTCTAGGCCTGATGCTGAGAATAATACAAGAATTGTgccgggcatggtggctcatgcctgtaatcccagcactctgggagaccaaggctggtggatcacctgaggtcaggatttccagactggcctggccaatatagtgaaaacccatctcttctaaaaatacaaaaattagctgggcgtgatggcgggcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggataatcaattgaaccagggaggcagaggctgcagtgagccaatattgcgccattgcactgcagcctgggtgacaagagtgaaactccatgtcaaaaaaaaaaa---------TCGTAAATCCATGAGAAAGAATAATAGTGTTCTCCCACTACCCTTAACTCTAGTACATTGAAAAGAAGACCCAAATCACATTTATCAAATAACATTCTCCCTTTTAGCTGACATTATCATCATTATTATAATCATCTACATTTACATCTATCTTATTATATGATTTATTTTTGAAATATTTACATACATAATTTGGACACCGTTTACATAAGTTCTAAGAGATATCATTGTGGGAAATTTACGTTAGTAAACAGCAAAGTTCAAGTCAAGTTGAATACATTTAGATTTAGAAAGTTAAGTGTAGTGCAGTTTAAAATACATTGCTGAAGAAAACAATTATAGATGATATTAAACTAATCCAAGGAACACTATAAAAAGATTTTGATTTTAGTATAAATAAAATTGCTTAATAAGAAAAATAAATAAACCATTTCATGATCAAGCTCTTATTTCTAAAGAGAGGATTTTAGGGCTAAACAAATCAAA------TAAGCCCTCCCCCACATCTTCTCTATTTCATGTAGGTAATGATGGAGTTCAAAGGCACAGAGCCCCATTTCTACAACATAAGCAAAGTGAAAATTAATTCATGGAATACAATGACATAGCTGTGGTTGATGAACTATATTTTATCTATTGC s rheMac1.SCAFFOLD31009 16472 2273 + 42162 GAACTAACTAGAGTGACATATTTACAAAGAATATAAATAAAAACAAAAATGAATAAATTTGAGCTACATAGGTATGAGAGGAATTAAGTTTGAAAAAGGGTTcagtataattccatttatataaagttcacaaaaatatatttttaataaattgcaatttattacattggtggcaaaattctaaagtgagacatatgagtgattatcataaca-ttgggatagtagggatggaggaaacaaaaaggaaatgatatcaacaagaaggcatgtgtgaggagtgcctggattgctggtgaattctgctgtatgaccaagatgccgtaacatgactcttaatgctatatattttttctttactgtacctttaagccttattactttatatatatatgttatgtttcacaataatgaaaaTGTTTAAAAAGTAGAAACATATACGAAATAAATGAATATAAAATAGACTGAAAAAACATATTCTTATAGACATCATTGCAG---AGTTTTTTTCTGAATAAAGAAGAATAGAGCATTATGATAGTAAGAAATCCAAGATAAAGTTTTTAACTTTTCTTTAAATTAATTTTATAAAG-AAGAGATAGGCAGGAAAATTACCTCCACATTCTCAATGTTATTCTTACTTTGAAACATCAGATTTTGAGC----GTGTTTTACTAGACACCTTTTTTGCTTATTTACAATTTAATTATTTATGATAACAACATTGCAATGTGGCAGAAATTAGTGAATTTCCaataaattatagtagtataaatattaaatatatacaacaatttttaaaaaatttatCCCTAAATGAAATAATTATACACATATTTTTGAAATTCAAAGATTATAATACTGTGCATGCGTGTGCATGTGTACACATGCGTGAGGAAAAATATTTTGATGCTACAAATTTTTTTAATATTAGAGAAAAATTAGTAGAAAGATAATTTTATTAAGGCATATAACAA--GTATTGTAACTACTTTGACTGCTATAATAAAATCACCCAGATTTTGTGACAGAAGCTGAGAATGTAAATAAGCACTCAAGAGAATTTAACTTGTTAATGATGCTATTAAAAGATGAAATGAAGCTTGTACACTGTATAATTGCACAGAGTATTTGTGTAAGTTCATATGAAAATGGAACAAAACTAAGCAGCCAAAAAGAGAGTAATCTTTGCTGGAGGTTATTTTTGCCATAATTTTTAGAATGTGCTTAGAG-AAAAAAATAGCAAGTAAATCAAT-GAAATATGTTGGCTTTATGTTATTCTTGATGAAATACTATGTGAGGGTATTTGTCTAGGCTTGATTCTAAGAATAATATAAGAATGATgccaagcacagtggctcatgcataaaatcacagcaatctaggaggccaaggc-agtggatcacctgaggtcaagagttccagattagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaacacaaaaattaactgggtgaggtggtgggcacctgtaatcccagctacctgggaagttgaggcaggataattgattgaaccagggaggcagaggttgcagtgagccgagactgcacccttgcattacagcctgggtaacaagagagaaattccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCTCATAAATCCAGGAGGAAGACTAAGAGTGTTCTCCCAGCATCCTTAACTCCAGTACTTTGAAAAGACGACCCTAATCACATTTATTAAATAACATTCTCTCTTCTAGCTGAcatcatcatcattattatcatcatcTACATTTACATCTGTCTTATTAAATGATTTATTTCTGAAATGTTTACATACATAATTTGGGTAACGTCTGTGTAATTTCTGAGAGAT---ATTCTGGGAAAGTTATATTAGTAAACAGCAAAGTTCTTGTCAAGCTGAATACATTTAGATTTAGAAAGTTAAGTGTAGTGTAGTTTAAAGTACACAGCCTAA-CAAACAATTATAGATGGTATTAAACTAATCCAAGGAACACTATAAAAAGATTTTGATTTTAGTATAAATAGAATTGCTTAATAACAAAAATAAATAAACCATTTCATGATCAAGCTCTTATTTATAAAGAAAGGATTTTAGGGCTAAATAAATCAAAGAGAAGTAATCCCTCCCCAAAATCTTCTCTATTTCATTTAGGTAATGATGGAGTTCAAAGGCACAAAGCTGCATTTCTACAACACAAGCAAAGTGAAAATTAATTCGTGGAATACAACAATGTAGCTGTGGTTGATGAACTATATTTTATCTATTGC a score=13369 s hg17.chr12_random 99546 202 + 466818 AATGATATTTTGAAATGCAGTGCTACTCATTGAGTTTCCTTGTGAGGAGATTGTGTGGCGAGGACCCAGCAA--GACAAGCTACTATCCCAAAAAAGCTACTTATATGAACTTCATTTCTGGTTTCTTTCAAATTGAAGGTAAATTCCAAGATGAAGCTTTTATTCTATTCTCTGACCAAAGTGTTGGGAAAAGAAGGAATTTG s rheMac1.SCAFFOLD85456 16739 204 + 81052 AATGATATTCTAAGATTCAGTGCCGCTCGTTGAGTTCCCCTGTGAGCACAGTTTATGGTGAGGACCCAGCAAAAGACAAGCTACTGTCTCCAGAAAGCTACTCACATCAACTTCATTTCCAGTTTCTTTCAAATTGAAGGTAATTTCTAACACGAAGCTTTTATTCTAGTCTCTGACCAAAGTGTTGGAAAAAGAATAAAATTG a score=5297 s hg17.chr12_random 99748 78 + 466818 TTACCATTTT-------CATTTCTAACATACTAAAACAGAAAACAAAAAACCCCAAAATCAAAAACACTTTTAAAAAGAACATGC s rheMac1.SCAFFOLD31009 22003 85 - 42162 tttccattttatgaTTACATTTCTAACATACTAAAACAAAAAACAAAAAGTCAAAAAATCAAAAACATTTTTAAAAAGAACATGA a score=21432 s hg17.chr12_random 99826 313 + 466818 CGTTAAGATTAGTTTGTTCAGTTTCCCTGTAGAAAATAATTTATGGAAAGATAATAAAAGATTATTCTGAACACTAAAACAAgaaaact-aaaaaatgaattatcaatattgagaatccaatagacagagttaaccagttagatggagtagaagagataattagtgaattggaagatagctacaaagaatgaagcac--tgagagaaagatggaaa-atataagactaga-gggtaacaaattcatgctacagttggaatatgtaacatacttctggagttctgtaagattagaggagagaaaatagagcaagagaaa s rheMac1.SCAFFOLD31009 22394 317 - 42162 CGTTAAGAGTAGTTTGTTCAGTTTCCCTGTAGAAAATGATTTATGGAAAGAGAATAAAAGATTATTCTGAACACTAAAACGATAAGACtgaaaaaatgaattatcagtattaagaatccaacagacagagttagccagttaggtgcagtagaatagagaattagtgaaatggaatatagct-cacagaatgaagcatagtgtgaaacagatggaaatacacaaagctagaggggtaacacattgatgctacagtaagaacacctaacatacttctggagttctgtaagattagaagagagaaactagagcaagagaaa a score=447 s hg17.chr12_random 100139 12 + 466818 atacaaagTTGT s rheMac1.SCAFFOLD31009 22843 12 - 42162 atgaaaagtagc a score=25518 s hg17.chr12_random 100151 406 + 466818 ACTGAa-----------------------------------aatacaaagttgaacatgcaagaagcaat-aaaattaatgacaatgaaaaataagtgtgtaattctaaataaatgttgcctgtagaaaacaatagtgtcttgttggattaATTGTATAATTGATAAGATATATGCAAATAGCAATAAGGAGACTGGAGACAAA-GTGACAGGAATAAATTTAGTCAAAC--TGTTTTGGGCTTTTCTATGTCTGTGagtagaatttgaatatcataatccaggaccgtataaatctacacccagatatatatacacaaaggaattgtagcaaatgatatgtgaaagaatgttcattgtagcattattaataatagctc-aaaaataagctgcccaaatatatatcaaataaagatggataaataattacagtaaaatcataaaat s rheMac1.SCAFFOLD31009 22995 436 - 42162 actgaaaatgatatttttcagataaaataaaaatgactgaaaatacaaggttgaacatgcaaggagaaataaaaattaatgacaatgaaaaataagtgtgtaattctaaataaatgctgactgtgtaaaacaatattgtcttattGGATTAAATTTATAATTGATAAGATATATGCAAATAGCAATAAAGAGACTGGAGATAAAGGTGACAGGAATAAATTTAGTCAAACTATGTATTGGGCTTTTTTATGTCTGTGAGGAGaatttgaacatcataatcaaggaccctgtaattctacaccgaggtatatgtatgcaaaagtactgtagcaaatg--atgtgaaagaaagctcattgaagcattattcatagtagctcaaaaaataagctgcccatatgtatatcaaATAA----TGATAAATATTTGCAATAG----ATAAAAT a score=81024 s hg17.chr12_random 100557 1088 + 466818 ggaaaaatatacagaagtgaaaataaatgaatcacatgtacatgcaaccatgtgattaaatttcagatacataatgttgagtccaggaagccatgaataaggacatataggattgcacctatacacagttcaaagcagaccaaacgaagctattgagtttagggttgcatgctttgttcgtaaagtacaaagaaaata---aaaaaagatcattataaattatggatgt-acttattataagaggtgtgaagaaaggtgtaggggattggaaagtggcattgaggtaaacctagcctcttagcaatgttccatgtctcgccctacataatggttacatgagtgtttaTGATACATTGCTATGTTTTCCATTTTTGTTTTGGCCCATTTCTAAGTGTGTAGTCTAGTTATAA-----AAATTATTAATTAGGAGAAATTTTCCATGAAAATTATTATTACCCTGCTCATTATATACTGAAGGGAAAAATCCACTATTTGTATACATTCATGTATAACTCTAAGAGATTTTAAGAAGAAACTTTCTGATTTTAGTTGCAACTTTTGGAAATTTGACATGATGTTTCCTGCCAACCCCGGATTTTTCAACAGGTTTTTCTTTTAGGTTTAATTATTGACTTCATATGACAAAACTTTGACATTCTCCAACTATTTTTCCCTTGTATCCTGAATTCCTGACACAACAAGTGTGGACATATTTCCCACACTTTTGGTTTAGCAGAATACCTATGTCACTTATGTTTTTCTGCAAGAGAAAATCCTCCAAAACTACATTAGATATTTGTATCTCATATGTCTTTGGATTTCATTTTTCTAAGCTGGGTTTGATGGATGGCTGTGGTGATTGGAGATGGGCCACGTACTGCATCTTGAAGA----TAGAGTTTGGATGATTTAGGCTAGATCAGGCAGTAGCATTCTGACTCCATTAGTTTCTCATTCTTCTTCTGGGAACAGTGTAATAGCCAGATGATGTCCTCATGGTAAATGGAAAAGAGCAAGAAACTCCAATGTGGAAGCCATCTTAAATCTCTGTGTAAAGTCTACTAATTTCCTGTTCATTGAAGCAAGTTACAGGAGtg s rheMac1.SCAFFOLD85456 18058 1099 + 81052 ggaaaaatatagagaagtgaaaagaaatgaatcacatgtacatgcacctatgtgatgaaattttagatacataatgttgagcccaggaagccatgaataagaacatataggatctcacctctacacagttcaaagcaggccaaaccaagctattgaatttagggttgcatacctagttggtaaagtataaagaaaatttttaaaaatgatcatcataaattatagatgttgcttatcacaggaggtgtgaagaaagttgtagggcattagaaagtggcattgaggtaaacctaggttcttagcaatgt-ccatgtcttgtcctacataatggttacatgaatgtttaTGACACATTGTTATGTTTTCCATTTTTGTTTTGGCCCATTTCTAAGTGCACAGTCTAGttataatataaaaattattaatGAGGAGAAGCGTTC-ATGAAAATTATTATTACTCTGCTCATTATATACTGAAGGGGAAAATCCACTATTTGTATACTTTCATGCATAACTCTAAAAGATTTTAAGTAGAAGTGTTCTGATTTTTGTTGCAACTTTTGGAAATTTGACATGATGGTAACTGCCAATCCCGGATTTTTCAATAAGTTTTTCTTTTAGGTTTAATTATCCACTTCATATAACAAAACTTTGACATTATCCATCTATTTTTCCCTTGGATCCAGAATTTCTGACACAACAAGAGTGGACATATTTCCCACAGTCTTGGTTTAGCAGAATATCTATATTGCTCATGTTTTTCTAAAAGAGAAAATCCTCCCAAATTGCCTTAGATATTTGTGTCTCATATGTCTTTGGATTTCATTTTTCTAAGCTAGGTTTGGTGGATGGCTGTGGCGACTGGAGTTGGACCACATACTGCATTTTGAAGCTAGTTAGTGTTTGGCTGATTTAGGATAGATAAGGCAGTGGCATTCTTATTCCATTAGTTTCTCATTCTTCTTCTGGGAATGGTGTACTAGCCAGATGATGTCTTCATGGAGAATGGAAAAGAGCAAGAAATTCCAATATGGAAGCCATCTTAAATCTCTGTGTAAAGTCTAGTAACTTCTTGTTGACTGAAGCAAATTACATGAGTG a score=144768 s hg17.chr12_random 101650 1975 + 466818 gcatatatatatgtgtgtatatgtgtgcatgtgtatgaataACAACACTGACCATAAATTATGAAGCCGAGTACATTTCACATATATATGTATGTTTATTATATGATAGTTTATTGTATGATATTTCATTTGAAGAATT----ATCTCTATTTATAATTAAGAACATATAGCTTTTATCAGCAAATTATTGCTGTTTTCCATTGTAATTTGTACCACATGTATGAACTTAACTATCATTGTTTGAACATCTAATTTTTTGGATGGTAAAGACATTCAACTCTAAATCAATGAGGAGAATGTATCTTTGGGGTAGGTTTTATTTCATTATGAATTCTTATTTTATGTTG--------------------TTGTTAGATAATGATGCACACAATTAAATTTGAGTGACAAACATATGTAGAGTAAATTTTGTATATATATACCAAAAACAGTACTAAAGAATACTAGATTTATACCAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAAATTCGTTTGTATAATAGGAATGAAGAAACATAATCATGATCATTTCAGTGCTGTTATAATTTTTTATGTGTAGTTAGAAAAGAGATTTCTTCCACTTTTT-AATTAAAGAAAGCCTTTTTTGAAGTTGACATCTGATGTCAAGTATTTCCATTTAATTTGCTTAGCCACCTCTGAGCCCCTGAATTTCCAATTATCTCCTTTGTCTCCCATTCCTAATATTCCTCAAAAAAATTCAAATATTCCTTCTCTTAAAAAAAACTCAATGTAAAGAGGGTATAGAAACTATGGATCATAACTGAATGAAACATTCTGCAAATATTACAAATTATCTGTCTAATCAATATATTGATGATAGGAAACGTATTAATGATATGTTTTATTGGGGGTGGGCAGTGAGCTGAGGATCCTCAGGCATC----TCTATTTTTATTTTGTTTCTCTACGTAGTTTCTCCAGCATTTGGCTCTAGGTGCCAAGGGCACATGTGACAAGAAGGTGCCAGCTTTATAAACCTTGTAACTTCTTCTGTGTCAGTTCTGAGACATACAATTTACTAAAACACATCATGAAGGCCTGTTTTGAAGAGAAGGGGAATAAGACTGCATCTGTTCATATGAGGTATGTCGAAGCACTTGGATATGTTTTCAAACCACCAATCTTGATGATTTAGAAATGTGCTCCCTTTTCCAATTTCATCCTGATAAAAATGTATGATCTCTGGACGTTGCCAATATTCCCCTCCATTCCATCATGAGCCGTTCTCTGTAATTCAGAATCTGTGGACTAAGCTGTAAAACTAATGACTGTCAATCTATTCTACATGAAATAGTGGGCCAAAGAAAAAGGAAAACATGATAAGCAGTAAAAATATATACACAACATTttttgcttacactaatgatcaaataacacccataggaccaaacctcccacagatactttctataaattctggataaaatatttaaaaaaaaaaacagccatctgaaggcaatggagaatgaacaaaataggccgatactgaaaagcagttgacacttggaagaaggaaatagcaaggagtgagtttcctg--attttatagctggccctagtgtgcaccaggcagaggactaaaacgtcagtaaaaaagctgtagagttactgggttgaagtaacagaggactgagtttagggtaacatgagccgcaggaggtcaggagaaaatctgagaaaggagaagtccagaaaaggggagccccagcttctgactataaactatccaaagctttgtctggtccctacaccacacatgtata-ggcagacttcatgaagcccagctaaaataataaaatt--gaTTTCAGTTATCATCAAGCACAGTGAGGACAGAAATAGCAACAAAACACATTACTTTAGGCAAAGATACTCTTTTCTTGAAAACCCAAACTACATTCCATTACCTTTCATAACAGTCATATTCCTTGTCCATTCTTGTTTCTACCGTGGTTCTAACTCCTACTATTATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 21018 1997 + 81052 gtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtttgcatgtgtatgAATAACAACATTGACCATAAACTATGAAGCCGAATATATTTCACATATATATGTATGTATATTTTATGATAGTTCGC-ATGTGATATTTCATATGAACAATTTATTATCTCTACTTACAATTAAGAACTTACAACTTTTATCAGGACGTCACTTCTCTTTTCCATTTTAATTTGTACCTCATATATGTACTTAACTATCATTGTTTGAACCTCTAATTTTTTGGATGGTAAAAACATTCAATTCTAAATCAATGATGAGAATGTATCTTTGGGACAGGTTTTATTTTATTATGAATTCTTATTTTATGTTTCATAGAAAGCAAATAGAATTTTTTTAGATAATGATGCACAATATATAATTCGAGTGACAAACATATGTAGAGTAAATTTTGTATATGTATACCAAAAACAGTACTAAAGCATACTAGGTTTATAGCAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAA-CACATTTCTGTAATAGAAATGAAGAAACATGATCATGATAATTTCAGTGCTGTTGTAATTTTTTATGTATAGTTAGAAAAGTCATTTCTTTCACTTTTTGAATTAAAGAAAACTTTTTTTGAAGTTGACACCTGATGTCAAGTATTTCAATTTATTTTGCTTAGACACCTCTGAGCCCCTGAATTTTCAGTGTTCTCTTTTATCTCCCATTCTTAATATTCCTCAAAAAAATTCAAATATTCCCTCTCTTAAAAAAATCTCAATTTAAAGAAGGTATAGAAACTATGGATCATAATTGAATGAAACGTTCTGCAAATGTTAAAAATCATCTGTCAAATCTATATATTGATGACAGGAAATGTATTAATGATATGTTTTATTGGGGGTGGGCTGTGAGCTGAGGCTCCTCAGACATCTCTTTCTATTTTTATTTTGTTTTCCCCCATAGTTTCTCCAGCATTTGGCTCAAGGTGCCAAGGGCACATGTGACAGGAAGGCGCCGGCTTTTTAAACCTTGGAAGTTCTTCTGTGTCGGTTCTGAGACAGATGGTATACTAAa----atcacgaaggcccatttcgaagggtaggggaataagcctccatctattcatgtgaggtgtgtcgaagcacttggacatgttttcaaactaacaACTTTGATAATTCAGAACTGTGCTCCCTTTTCCAACTTCGTCCTGATACAAATGTATGATCTCTGGACGCTGCCAATATTCTCCTCAATTCCATCATGAACCTTTCTCCTTAATTCAGAACCTGTAGCCTAAGCTGTAAAACCAATGACTGTCAATGTATTCTACAAGAAAC-GTTGGCCAAAGAAAGAGAAAAACATAATAAGTAGTAAAAATATATACAAAACa-tttttgcttacactaacgatcaaataacacccataggaccaagcctcccacagatactttctatacattctggataaaatattt----aaaaacacagccatccataggcaatggagaatgaacaaaagaggcagataccggagagtggtcggcacttggaagaagggaatagcaaggagtgagtttcctgaaattttatagctggtcctagtgtgcaccatgcagaggactaaaacatcagtagaaaagctgtagacttactgggttgaagtaacagaagactgagtttgggataacatgagcagcaggaggtcaggagaaaagctgagaaaggagacggacagaaaaggggagctctaactactgaatataaactatccaaagctttggctggtccctacaccatgcatatatagggcagacttcatgtagcccagctaaaataataaaattgaGATTTCAGTTATCATCAAGCACAGTGAAGACAGAGATAGCAACAAAACACCTAACTTTAGGCAAAGATACTCTTTTCTTGAAAACCCACACTACATTCCATTACCTTACATAACAGTCATATTCCTTGTCCATTCTTGTTTCTACCATGGTTTTAACTCCTACTTTTTTT a score=3064 s hg17.chr12_random 103625 45 + 466818 CATTACATTAATCAAAGTAATTCTCTTTCAGTGAGGAAACTGAGA s rheMac1.SCAFFOLD85601 40778 45 + 44828 AATTACATTAATCAAAGTAATTCTCTTTCATAAAGAAAACTGGAA a score=53682 s hg17.chr12_random 110672 695 + 466818 CTGTGTTTGCCAGCATCTCATAGCAAAGAA-GTGTCATGAGATGTCCTTGGGGAGAAACTGAATGCCTATTCAGAAATCTCATACCTCTTCAAATACAGATCTTAATCATAACCAGACTGGCTTCAAACAAAAGGAAGTGATGTGTCATTTTTAGGGTTTGTCTTATAGAAT-TTTTTTTATTGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGCTGGGATTTTTCATTTGTTTTTAAATCAGACAGTAGAGCCTGTGGGATATATAGGGAAATACTAAATTTCAGAAATGCAGATTCCACATCAAGTTTTGCTCGATTCAGCAAGTTCATTAAATCTTGAGAGACTTTT-AAATAATTAGTTTGTATTTCATTGATGATATTCTCCGTAAATAATTGAGG----TATCTTTCTAAAATTTTGGCATATATTTTATTTGTTAAAAATTTTTGCAAAAGTTACTGGAATTTTTATGTTGGTTTTTGAAGTGTCCTGAAATTTTCTTAATACATATCTAAGAGAATGTTGCCATCATGTATGCATTATTCATACTCTCAGACCTAGGCACCACTTTTATTTACCCCAATCTACCATCTTGATTTCTACCCATGTCTCTCCTAAAATCAAACACTATGTCCTATGTCCTTTAGTGTTAATTAAGGAATTGAACATTTCTTTTATTTCCttttttttttttttttttttttttttt s rheMac1.SCAFFOLD90294 77298 695 - 83108 CTATGGCAGCTAGCATCTCATAGCAAAGAAAGTGTCATGAGATGTCCTTGGGGAGAAACTGAATGCCTATTCAGAAATCTCATACCTCTTCAAATACAGATCTTAACCATAACCAGACTGGCTTCAAACACCAGGAAGTGATGTGTCATTTTTAGGGCTTGTTTTATAGCATGTTTTTTTATTGTGGTGGTGGTGGTGG---TGCTGGGATTTTTTATTTGTTTTTAAATCAGACGGTAGAGCCTGGGGGATGTGCAGGGAAATACTAAATCTCAGAAATACAGATTCCAGATCAAGTTTTGCTTGATTCAGCAAGTTCATTAAATCTTGAGAGATTTTTTAAATAATTAGTTTGTATTTCATTGATGATACTGTCCATGAATAATTGAGACAAATATCTTTCTAAAATTTTGGCATATATTTTATTTGTTAAGAATTTTTGCAAAAGTTACTGGAATTTTTATGTTGGTTTTTGAAGTGTCCTGAAATTTTCTTAATACATATCTAAGAGAAAGTCGCCATCATGTATGCATTATTCATACTCTCAGACCTAGGCACCACTTTTATTTCCCCCAACCTACCCTCTTGATTTCTAGCCATGTCTGTCCTAAAATCAAATACTATGTCCTATGTCCTTTAGTGTTAAT----GAATTGAATATTTCTTTTATTTTCCTCTAATTCATCATCTTTACTTCATTT a score=529065 s hg17.chr12_random 111649 6596 + 466818 GTTACTCACtttttaatgattgcctaatcttccattgtgggaattataccacaggccacttcatcattcctttattatgggagtttagttagcttaaaagttttGGGGAAATGCTATGGGAATTTTCCCATAAGTTAAATCTCTAGCACTAGAAAAACTGAGTCATAAAACATAAATTGTTTTATTGTTATCCTCAAAA-----------GCTGTGGAAGTGGATGCTTCCAGGGGTGGGGTATGAGTGATGAGCACTGTATCCTATGGTCTGCTTCCCAGAACTTCTTCTTTGCTCCCCTCCCTTCCAAAACTCTCCCACAAATAAGCGTGCCAGAGGTGTGTCCATTCTCGGTTCTTGGATTTGCTGTGCTCTCAGCTCTACATAAGGCAGGGATTGGTTATGTCTCCTTTTGAAGTTTCATCTTAGGTAAATAGTAGGTGGAACCTACCCATTCTCTTTATTCCTGAGCCAAGAAGGATGACATTGCTCTTTGCTTTGTTTAACAAGTAATCTCTGTTTGCCAGAGAAAGCTTCAGATCTATCTATATCTCTCTGGCATTACCTCCTCACTATTCTCTCTCTCCCTAGTGGGGTCCCCTCTGTGGGTTTCCCTAGCCACAGCCCTCAGGGGTGTGTTGTCTGCAGTTGGAGCCATAAATAATGGCTGCACCGTGAGCCTGTTTGAGGTTACTTATTATATTTACTACACCC--AGAGGTTTTAATTATTTGTGTTTGACATAATGGTAGTAATAATAATCAAAGTTGATATTT--GTGGAGTGCTCACTGTATGTATGCCTGGCAGGAAAGGCAGTGTGGTTAAAAAACTAATGA--CTGAAATTA-GAAAAAAAATGGGCCTCGCTCTCTAGCTACTTGCGGCCAAGCACCTTCATCTCTGATTTTATTTTTTTATGTCTCCCTTAACCTTTTCAAAGGATTGTTGGGATGGTCACAGAAAAGAATTCTATACTATAAAGTGTTACTTAAGTATGAAAAGGCATCACTACAGTTCTTTTGAACCTTATACCGTTAATGATCAAGGCAAAAGATACACCTCTTCAACTACAAGTTCAGTGAATTTTAATTTTTTGAAATTTTAGAGTTATTT-AGTTATATTTTCAGATACTTTCTGTCCATTTAAATATTGGAATAACCCCTATTATGTGTTTGTTTGTTTTAATAAAGTGTATATGATACTCCTTGGTTTTCTCCAAAATAAATAGCATTACTAAGGAAATCACATACTTTCTGACTAAGTAGCAGATGATTTGCTGGGCATTTATGTTAGAGGACCAACTAAAATAAATGACTTTGTTTTTGTAATAACCATAAGAGCTAAAATATC-CCATCTAAAGACACTGAAATTGAGAAGCTGTAGTAAATAATCATTATTTTCACATTTTTATGGCATTTAATGAAAGCAGCTTCCCAGCTCTTTGCACGAATGTGGGAGTGGGATGCTTCCATGCTTAGCAAGTGCTTCCAGCAGGAAAACACTGACTGATGACTGCAGGTTGAAATCTTTGTGTTGGGGGTTCAGTGTATTTTAGTAGACTTTGCCAAGTGTTGCTGCTGACCAACATTCATTTTTTAGTTCATTTCTGCTTCAGAACCAGTGTAAAGAGTCCAGGTTTTACAAGAAAACTGTGGCATAATTACAGATGAGCTCCAGTCCCCCACAGCCCATTCTTGGAAAGGGACAAGAGAGTTGTAAATAAAACTCTTGAGTCATCCAGCCTAATATTTTTTAGAGGATGCATTTGGACAAATTATACAACCCACCTTGTGCTTCTTATTTATGTCTGGTGATTTTGCACCTAGCACTCAGCAGATGCCATAGTAATCCAGAGGAGTCCAAGGAATTTGGTTCTACAATTAGGGA-CATTTGAGACATCAAGCAAACTCTGATACTCAGGCAGTTATTGCCTTTGAGAAAGAAGTTATTGCCTTTTTTCTGATAATGCATCACAGCTACATTCCTTAAAAACTCTAAGACTATTTATACTTGTGATGTTCCAACATTTTTTGAGAGCATTTTAAAAATTGTTTTTTCACTGAGGTGTTTAAGAATAGCCAAGAATAAATGTCAGTTTGAATtatatatatatatatatatatatatatacacacacacacacatatatatGAGAGTTAATATgaaaatataaaaaattattacaaatcagtaaaaaatctctataat-aagaaaatggtataaactgataattcataaaagaaatgcaaatggccactaaacctaggaaaaatgtttagtgtcatcagcagttaaat-aaaaaattgaacaatgagttatttgctgttttcatctgtcaagtcaagaatattgaaaatccttaaaggtggtacaggtgagaaacatggatcctctagtgggaagatagaagagatgagtatagactttctggaaggcaatgggacaatatatagagaatctttaaagggtagtttctgattaaacaatttgacccctaggcatttattctgagaaatcagttagacaagtaggcaaaactttatgtatattgctgaccgttatttctagtggcagaaaaacaagaagcaac----atacccatcactagggtattggttaaagaatttatgaccacatctgtgctgcggatcatcaggcagccactaaaaatGGTCTGATGAGGGTACGAATGGCTAATGTAAAAGCAGGAAATATCTTATTCATCCTTGCATTGTCCAAGTACCTAGCCTGGCCCATGATATTTGATTTAAAGACGATATTCCTCAGGGAGATATGATGTGCTCTTTTTTTCCCGTTGGATTCCTGAAATTCTCTTTATTTAGCCACATAGACAACAGAGTAATAGTCAAATCTGAGGGTGGCATGGAATATGATGGAC--TTTTTCCATTTTCCTACCCACAAACTCTTCTCATATCCTTGGATAATTTTGATCCTTTTGAGGTGATTATagaagacgtcctgaatgtaatatcttcttaccatttccactcccaccaacatagacatagccaccttcacgtcttgtctgcatttcagcaatggcctcttgacaggacttgcttggtctatcttatcccttaaagtttattctcaacatagaaattagactggtccttttaagcctatgagatcatattcttcctctgctcaaaatcttgcaaagatccctatttctttcagaatcaaaaccataattcttaaaatggcctgcaatgaccctgtgattattctgacactgtctcctgttattttccccttgacctcatccactctcatcaacccaccttgtggctgtctcttcaacaggccaggcatgctgccaccttccggccttcacctctctcaactcctttaggactgtacataaatcttgccatcccaatgaggccccatgtgcctgccctatttagtcctgcaatctgccctcaccctgtctcaggaatgcccatttgcttccccctgctctgtgttgcatttttgccttagtctttctcatgataacatgcacaaatgagtttctgtttgttgtttgtatcccctcaacttgaatgtaagctttataaaggaaagcatctttattttgttcactggtggatcccaagccgctagaaggatgattggccactgttgggtgttacaaatgtatatatttattgaatACCTTGAATGGAAAGTAATTTtatatacatatatatatatatatatatattt-tttttttttttttgagacagagtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgcgatcttggctcactgcaacttccacctccgtggttcaagcaattcccctgtctcagcctcccaagtagctgggattgggattacaggcacacaccaccatgcccagctaattcttttgtgttttcagtagagacagggtttcaccatgttggccagacttgtctccaactcctgacctcaggcaatctgcccacctcggcccctcaaagtgctgggattacaggcgtgagccacagcgccaggccTATATAAATATATTAGTGGTAATTatattagataatttttactgagcatttactatgtgccaagtggtgcacatgtatcatatcatccaacactcccaatgaacttatgaagcaggtataattaagaccagcaagttacagatggaaaaactgaggaatggaaacatgaaagtacatcgtctcacaagcaataaatttagatattagatataaatcaaataagtctga-ccccCTATTCAAGCAGAACAATGTTGCTTCTATATTATTTATTTATTGTAATTCCATAGAATTTCGTTTGGAAAGTGGGGGTGTTTCCTATGTAAATATTTTTGGCAGCCACTGTCCTAAATATTTTAACCAAATCAAAATCTTATAGTGGCAATTCTAGGCCTTTAGCAGATTTTCATGTGATTAAATTGTGACATGTGAACTAACTGCCCCACCTCCTGCCACTTAGTACTTGGTTTTAAAGAAGAAAAAGTAAAC----AACTTTTGCAAATTTAAGGACTTTTTTATACTCTTATAAAAATAATTGTATTCTTGAACTCTCCATTTTGTTGCGTTAGGTTTTCCTGTTCTGGTTCTGCATCTTTGGCCTGCGTTAGTTCCAGTGACTGTCTCCTCACCCTCCCCATTCTCTCTTCTAGGAGAATGATGTAAACCTGACCCACATTGAATCTAGACCTTCTCGTTTAAAGAAAGATGAGTATGAATTTTTCACCCATTTGGATAAACGTAGCCTGCCTGCTCTGACAAACATCATCAAGATCTTGAGGCATGACATTGGTGCCACTGTCCATGAGCTTTCACGAGATAAGAAGAAAGACACAGGTAAGAATTAGAGGAATTTTGCAACATAAGTAACTCCACACTGTCTTCATAAAATAACAGCAATATACATATTTAACAGCatatttaaatatatgtatatttaatatatattGCTGTTATTTTGCGGAAGCAAAATTAATATATATGTATTGGAAATAAtgccttggaagactgtttgggggattaaatgagtggacataggttggggacctaggcaagtgcctggtatattttagacatatagtgaattttagttatttttCCCCTTCCTAAAGATAGCTAtttcttttttcttttttttt---------------ttttactttataagcttttaatttttatttatttttatttttctctctcttttttcttttgacttttattttaaattcagggttatatgtacaggtttgttacacgggtaaattgtgtgtcatgggaatttggtatacagataattttgtcacccaggtaatcagcataatacccaataagtagtatctaattttcaacaaaacccatgaaagcaagcaatgaagaaaggaattcctagtcaataaatactgctgggataactcgaaagccatatgcagaaaattgaaactggaccactgccttttaccatatacaaaaatcaactcaagatgattgaaTGGATTTTTGAATCTCTCCACTCCAACCAAAGGGATCTCTTCAAG----TCCTTTTTGTAACATGCCAATTCCAGAGctggagacacctggctccttgttactagggctttcattgtcattttccatcttcttatctgtctcttcttctcatacaatctccttgtgggcaggtagactctcttacctatatttatatcctcagagtttagcacactgcttggtacacaggtgctctgcacatatttctgagtgaatgaCTAATATAGGAGTTGTCAAAACTTGCATTGTCCCATTATTTACGTACTGAAATGCTACTCATCCTCC--------------GGGGAGGAAAAGGGTGgtagagtatagaaattataagtgtgggcttgaagttgaatagactgtggttcaagtcctacttcttccacatattgagtttgata-ccctgacaaattgctttaactgccctgacctcaatttttcatagggcttttgtgaggattaaatgaagtcatacataaacagtgcttagaacagtgcctggtgcactgtagggctggacaaatgatagcatgtggttgttattATGATTATGATTAGCCTGAAAGCAATACAGAGGAAGAAGGTGACTGCTTTTTAGGGCCTCAAGCATATTCAAATGAACCATTTTTTAATAGACtttttattttattttttatttttatttttatttttttagacagaatttcgttcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgatctcagctcactgcaacctctgcctcctgggttcaggcaattctcctgcctcaacctcttgagtagctgggattacaggcatgccccaccacgcctggctaatttttgtattttccatagagacgggatttcaccatgtttgtcaagctggtctcaaactctcgacctcaggtgaaccacccgcctcagcctcccaaagtgttgggattacaggcatgagccactgtgcctggccttaatagactttttaaaagagcagtattaggtttacagaaaaactgcacagaaagtacagagagttcccaggtctttcatccctacctcagtttcttctattaacatcttgcatttgtgtg---------------------gtattttttttt s rheMac1.SCAFFOLD65323 45761 6603 + 89934 GTTACTCACtttttaatgattgcctaatcttccattgtgtga-ttataccatagtccacttcatcattcctctattatgggagtttagTTAGCTTAGAAGTTTTGGTGAAATGCTATGTGAATTTTCTCATAAGTTAAATCTCTAACACTAGAAAAACTGAGTCATGAAACATAAATTGTTTTATTGTTATCCTCAAAGCTAGAAGCTTCTCTGTGGAAGTGGATGCTTCCAGGGGTGGGGTATGAGTGAAGAGCACTATATCCTATGGTCTGCTTCCCAGAACTTCTTCCCTGCTCCCCTTCCTTCCCAAACTCTCCCACAAATAAGCATGCCAGAGGTGTGTCCATTCTTGGTTCTTGAATTTGCTGTGCTCTCAGCTCTGCATAAGGCAGGAATTGGTTATGTGTTCTTTTGAAGTTTCATCTTAGGTAAATAGTAGGTGGAACCTACCCATTCTCTTTCTTCTTGAGCCAAGAAGGATGACATTGCTCTTTGCTTTGTTTAACAAGTAATCTGTGTTTGCCAGAGAAAGCTTCAGACCTGCCGCTGTCTCTCTGGCGTTACCTCCCCACTATTCTCTCTCTCCCTAATGGGGGCCCCTCTGTGGGTTTCCCTAGCCACAGTCCTCAAGGGTGTGTTGCCTGCAGTTGAAGCCATAAATAATGGCTGCACCATGAGCCTGTTTGAGGTTACTTATTGTATTTACTACATCCAGAGAGGTTTTAATTATTTGTGTTTGACATAATGGTAGTAATAATAATAAAAGTTAGTATTTTAGTGGAGTGCTCACTGTATATATGCCTGGCAGGAAAGGCAGTGTGGTTAAAAAACTAATGACTCTGAGATTAGGAAAAAAAATGGGCCTTGTTCTCTAGCTGCTTAAGGCAAAGCACCTTCATCTCTGATTTTATCTTTTTATGTCTCCTTTAACCTTTTCAAAGGATTGTTGGGATGGTCATAGAAAAGAATTCTGTACTATAAAGTGATACTTAAGTGTGAAAAGGCATCACTACCGTTCTTTTGAACTTTATACCATTAACGATTCAGGCAATAGATAAACCTCTTCAACCACAAGTTCAGTGAATTTTAATTTTTTGACATTTTAGAGTTATTTAAGTTATATTTTCAGATACTTTCTGTCCATTTAAATATTGGAGTAACCCCTATTA----TCTGTTTGTTTTAATAAAGTGTATATGATACTCCTTGTTTTTCTCCATAATAAATAGTATTACCAAGGAAATCACACACTTTCTGACTAAGTAGCAGATAATTTGCTAGGCATTTATGTTAGAGGACCAACTAAAATAAATGACTT--TTTTGGTAATAACCATAAGAACTAAAATATCACTATCTAAAGACATTGAAATTGAGAAGCTGTAGTAAATAATCATTATTTTCACGTTTTTATGGCATTTAATGAAAGCAGCTTCCCAGCTCTTCGCACGAATGTGGGAGTGGGGTGTTTCCATACTTAGTAAGTGCTTCCAGTAGGAAAACAC-------TGACTGCAAGTTGACATCTTTGTGTTGGGGGTTCAGTGCATTTTAGTAGACTTTGCCAAGTGTTGCTGCTGACCAACATTCATTTTTTAGTTCATTTCTGCTTCAGAACCAGTGTAAAGAGTGAAGGTTTTGCAAGAAAACTGTGGCATAATTACAAATGAGCTCCAGTCCCCCACAGCCTATGCTCAGAAAGGGACAAGACAGATATAAATAAAACTCTTGAGTCATCCAGCCTAATA-TTTTTAGGGGATGCATTTGGACAAATTATACAACCCACCTTGTGCCTCTTATCTATGTCTGGTGATTTTGCATCTAGCACTCAGCAGATGCCATAGTAATCCAAAAGAGTCCAAGGAATTTGGTTCTACAATTAGGGAGCATTTCAGACATCAAGCGAACTCTGATACGCAGGCAGTTATTACCTTTGAGAAAGAAGTTATCGCC-TTTTTCTGGTAATACATCACAGCTACATGCCTTAAAAACTCTAAGACTATTTATACTTGTGATGTTCCAGCACTTTTTGAGAGCATTTTAAAAATTGTTTTTTCATGGAGGTGTTTAAGAATAGTCAAGAATAAATGTCAGTTTGAATTTtatatatatatatatatatatataCACACACACACACACAC--------GAGTTAATGTGAAAATATAAACAATTATTACAAATCAGTAAAAAATCTCTGTGATAAAAAAAATGGTATAAACTGGTAATTCGTTAaaaaaatgcaaatggctactaaacctaggaaaaatgtttagtgtcatcagcaattaaataaaaaaattgagtaatgagttatttgctgttttcatctgtcaagtcaagaatattgaaaattcttaaagttagtacaggtgggaaacatggatcttctagtggaaagatagaagagatgagtatagtctttctggaaggcaatgggacaatatataaataatctttaaagggtagtttctgattaaacaatttgacccctaggcatttattctgagaaatc----agacaagtaggcaaaaatttatgtataatgttgtccattatttctagtggcagaaaaacaagaagcagcacatatatccatcactatagtattggttaaagaatttatgactgcatctatgcagcagatcatcaggcagccattaaaaatGGTCTGATTAGGGTAGGAATGGCTAATGTAAAAGCGGGAAATATCTTATTCATCCTTGCATTGTTCGAGTACCTAGCTTGGCCCATAATATTTGATATAAAGATGATATTCCTCAGGGAGATATGATGTGCTCTTTTCTTCCCATTGGATTCCTGAAATTCTCTTTATTTAGCCACATAGTGATCAGTGTAATAGTCAAATCTGAGGGTGACATGGAATATGATGAACTTTTTTTCCGTTTTCTTACCCACAAACTTTTCTCATATCCTTGGATAATTTTGATCCTTTTGAGGAGATTATagaagatgtcctgaacataatgtcttcttaccacttccactcccaccaacgtggacatagccacattcacgtcttgtctgcatttcagcaccagcctcttgacaggctttgcttggtctatcttatcccttaaagtttgttctcaacatagaagttagactgatccttttaagcctatgagatcatattattcctctgctcaaaattttgcaaagacccctatttctttcagaatcaaaaccatagtccttaaaatggcctgcaatg-ccctgtgattattctgacactgtctcctgttattttccccttgacctcctccactctcgtcaacccaccttgtggctgtctcttcaacaggccaggcatgctgccaccttccggccttcatctccctcaactcctttaggactgtacataaactgtgccatcccaatgaggccccatgtgcctgccctatttagtcctgcaatctgccctcaccctgcctcaggaatgcccatttgcttcctcctgctctgccttgcatcgttgccttagaccttctcattataacatgcacaaatgagtttctgtgtgttgtttgtgtcccctcaacttcaatgtaagctttataaaggaaagcatctttattttgttcactgatggattccaagctgctagaaggatcattggccactgttgggtgctacaaatgtatatatttattgaatAGCTTGAATGGAAAGTAATTATATATACACATATTATtttatttatttatttatttatttaattttgagacagagtctcgctttgtcgcccaagttggagtgcagtggcacgatcttggctcactgcaacctccacctccctggttcaagtaattccccggtctcagcctcccaagtagctgggattgggattacaggcacacaccaccatgcacggctaattcttttgtgtttttagtagagatggggtttcactatgttggccagattggtctcgaactcctgacctcaggcaatccacctgcctccgccctgcaaagtgctgggattacaggcatgagtcaccgcacctggccTACATAAACATATTAGTGGTAATTATATGAGATAATT-----------TTTACTAtgtgccaagtggtgcgtatgtatcatatcat-caacattcccaatgaacttacgaagcaggtataattaagaccagcaagttacagatggaaaaactgaggattagaaacatgaaagtacattgtctcacaagcaataaatttagatgttagatataaatcaagtaagtctgatcccCCTATTCAAGCAGAACAATGTTGCTTCTATCTTATTTATTTATTGTAATTCCATAGAATTTCACTTGGGAAGTGGGGAGGTTTCCTATGTAAATATTTTTGGCAACCACTGTCTTAAATATTTTAACCAAATCAAAATCTTACAGTGGCAACTCTAGGCCTTTAGCAGATTTTCATGTGATTAAATTGTGACATGTGAACTAACTGCCCCACCTCCTGCCACTTAGTACTTGGTTTTAAAGAAGAAAAAGTAAACAAAAAAAATTTGCAAATTTAAGGACTCTTTTCTACTCTTATAAAAACAATTGTATTCATGAACTCTCCATTTTGTTGCGTTAGGTTTTATTGTACTGGTTCTGCATCTTTGACCTG-GTTAGTTCCAGTGACTGTCTCCTCACCCTCCCCATTCTCTCTTCTAGGAGAATGATATAAACCTGACCCACATTGAATCTAGACCTTCTCGCTTAAAGAAAGATGAGTACGAATTTTTCACCCATTTGGATAAACGTAGCCTGCCTGCTCTGACAAACATCATCAAGATCTTGAGGCACGACATTGGGGCCACTGTCCATGAGCTTTCACGAGATAAGAAGAAAGACACAGGTAAGAATTAGAGGAATTTTGCAACATAAGTAACTCCACACTGTCTTCATAAAATAACAGCAAGATATATATTTAACAGCatatttaaatatatgtatat-----------------------------------ttaatatatatGTATTGGAAATAATGCCTTGGAAGACTGTTTGGGGGAT----TGAGCGGATATAGGTTGGGGACCTAGGCAAGTGCGTGGTATATTTTAGACATATAATGAATTTTAGTTCTTTTCCCCCTTCCTAAAGATAGCTATTTCTTTTCTCTTTTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAACTTTATAAGCTTTTAATTTGTATTTATTTTTATTTTTCTCTCttttttttcttttgacttttattttaaattcagggttataggtacaggttttttacatgggtgaattgtgtgtcatgggaatttggtgtacagataattttgtgacccacgtaatcagcgtaatacccaataagtagtatctagttttcaacaaaacccatgaaaacaagcaatggggaaaggagttcctagtcaatacatgctgctgggataactcgaaagccatatgcagaagattgaaactggaccactgccttttaccatatacaaaaatcaactcaagatggTTGAATGGATTTTTGCATCTCTCCATTCCAACCAGAGGGATCTCCCCATATAGCTCCAGTTCATAACATGCCAATTCCAGAGctggagctacctggcttcttgttactagggctttcattgtcattttccatcttcttatctgtctcttctactcatacaagctccttgtgggcaggt--acactcttacctatatttgtatcctcagagtttagcacactgcttggtacacaggtgctctgcacatatttccaagtgaatgaCTAATAAAGGAGTTGTCAAAACTTGCATTGTCCCATTATTTACATACTGAAATGCTACCCATCCTCTCGGGATTGGGGGTGGGGGCGGGGAAGGGTGATGGAGTGTAGCAATTATAagtgtgggcttgaagttgaatagcctgtggttcaagtcctgcttcttccacctattgagtttgatacccctgacaacttgctttaactgccttgacctcaatttttcatagggcttttgtgaggattaaatgaagtcatacataaacagtgcttagaacagtgcctggtgcactgtagggctggacaaatgATACCATGTGATTGTTATTATGATTATGATTGGCCTGAAAGCAATACAGAGGAGCAAAGTGACTGCTTTTTAGGGCCTCGAGTATATTCAAGTGAACCATTTTTTAATAGACGTTTTAttttattttttatttttattttattctttttagacagagtgttgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggtgcgacctcggctcaccgcaacctctgcctcccaggttcaagccattatcccgcctcaacctctcgagtagctgggattataggcattcgccaccaagcccggctaatttttgtattttctgtacagacggtctgtcaccatgtttgtcaagctggtctcgaactctttacctcaggtgatctacccgcctcagcctcccaaagtgttgggattacaagcgtgaacctctgcgtctgaccttaataggctttttaaaagagcaatattaggcttacagaaaaattgcacagaaagtacagagagttcccaggtctttcatccctacctcagtttcttctattgacatcttgcatttgtgtgttttttgttttttgtttttttgttttttttttt a score=76188 s hg17.chr12_random 118245 916 + 466818 agaactgatgagccgatattgatatattatcactaattgaagtccatagtttatattcgggatcatgctttgtattttacagttttattggttttgacaaatgcgtaatgtcatgtatctaccatttcaatgtcatacagaatagtttcattgccctaaaaaatgccctgtgctccagctattcattccttcttctttacagactccttccagcaaccactgctctttttgctagctccatagttttgctttttcaagaatgtcacatagttgaaatcatacagtatgtagccttttcagactggcttcctccatttagcaatacatatttacaaatcctccatgtctttctgtgacttgatagctcatttctttttgttcctgaataatattccatggtcaagatgtaccacagtttgtttattcattcacctattgaaggacatcttggttgcttccaatttttgatgattatgaataaagctgtgaataaacatttatgtgcagtttttttgtgtgaagataagttttcaactgattcaagtaaatacctaagaatgtgattgctgAGGTTAACTTCTTTAAAAAATTATTTTTTTTCTACTGTAAAATCGAGTTTCTTTCAAAAACACTTGGAAAGACTTTGG-TCAAGAGGAGTTCAGGCACCATAGCTGAAAGAAGCATTTGAATAGGCAGAGATGCTTTAAAATGAGACAAGATCCACCCCGTAAAACAGGCCACTGAAACATTTTTTAAAAGGTAGCTCCATGGCCTTTCTAGGAGACTCATCTCTGCCTTCATTCTCCTGTAGGTATAACCAAGGCAAGGAAAGCCCACTCCAGTGTTCTGGCCTTGTGGAGAGTGGACAGCCATGCAGATGGGCTCAGGTCCCTGGAGGGCAGGCACTTGGAATTCC s rheMac1.SCAFFOLD65323 52539 911 + 89934 aatattgatgagccaatattgatatattatgtctaactgaagtccatagcttacattcgggatcatgctttgtgttttgtagttttattgattttgacaaatgcgtaatgtcatgtatctaccatttcaatgtcatacagaatagtttaattgccct-aaaaatgccccatgctccagctattcattc---cttctttacacactccttgcagcaaccactgatctttttactagctccatagttttgctttttcaagaatgccacatagttgaaatcatacagtatgtagccttttcagactggcttcctccatttagcaatacatatttacaaatcctccatgtctttttgtgacttgatagctcatttctctttgttcctgaataatattccattgtcaggatgtatcacagtttgcttatgcattcacctattgaaggacatcttggttgcttccaatttttgatgcttatgaataaagctgtgaataaacatttatgtgtag-gtttttgtgtgaagataagttttcaactgattcaagtaaatacttaagaatgtgattgcAGAGATGAACTTCTTTAAAAAATTA-TTTTTTTCTACTGTAAAATCAAGTTTCTTTCCAAAACACTTGGAAAGACTTTGGTTCAAGAGGAATTCAGGCACCATAGCTGAAAGAAGCATTTGAATAGGCAGAGATGCTTTAAAATGAGACAAGATCCACCCCGTAAAATAGGCCACTGAAACATTTTTCAAAAGGTAGCTCCGTGGTCTTTCTAGGAGACTCATCTCTGCCTTCATTCTCCTGTAGGTATAACCAAGGTAAGGAAAGCCCACCCCAGTGTTCTGGCTTTGCAGAGAGTGGGCAGCCATGCAGATGGGCTCAGGTCCCTGGAGGGCAGGCACTGGGAATTCC a score=569562 s hg17.chr12_random 119409 6844 + 466818 cctgcctggccccctgagcacatagccacttgctactctgaactggaataattgggtaaataactatcgtactcgttttcattaatctctttaaatgtatatttagctaacatttgtttcaatgcttaatattagaagcgttttggcctttatttagaagtcttataatcagaaatatgccatatgaagttaactcttgtttatagcaattagcttatggtaaaattagttttgctatatgtcattttgcttaaatgtgcagtttcaagaacctattgacgacattaagtg------------TATTTCCTGTATTTGCCA--GGTAGAAGGACCCAGAGAAAGACTCTTCTTATCACTTTGGGGCCACATGGTCCATTTCTGAGGAAACCACTTAGCAAGGAGTTTTCTGTCATTCATCTAGGTGAGGAATGGGATACTCTGAATTGCAGTAATTCCAGAACCACA-CGGAATGGGGGAGCTTAGTTACTCGAAGAAGGAGGAATTGGTACAACCACAGGAAGGAGAGGAAGGGCTCTGGACAGTAACAAAATAGATGTTCATTACAGTAAGAATAGACATCTATCTTTTCTACTAAGGAGATGATGGAACTTCTGTAGCATTTTCAATAATTCTATGCATAGGCAGTTTATATCAGAGAGGCCAAATTATAATTATGCTTTTAATCGTGTGACCTGGAAACAGTAGATTCCATTCCCTAGTACCTGGTATTCATGCACAAATTCTATGAAAAAGACAGATATGgcttctagcacagtgcctggcacataggtgagacccaataaacactttttgaattaatgaGGGCAGGAATGAACATACTGTCTATAGATATGTCAGTCTCTAATCTACTGGTATTTTCAGGAGGTAGGGCTAATTTTTTAAATAAAGACTTTATTTTGTGGACACATACAGCAGTGAAATTTTAAAATTCACACTTCCAAATCAGCATGTTAGAAACCCTGCCTCATCCTCACACACTGGCTTTAGACAGCAAGAACATCTGAAAGCTTTTGTATAATCTGATTAAGAGCTAAGTAAGAAGAGGCAAGGGGTTAGCGATTAGTGGTTTAACACCACATTTACCTAAGCTGAAAGGCTTTTTCTAAAGATCTTAAAAAAACCTTTGTGAAGTATGTAATATGAGGGCTGGGCTTGAAGCCCAAAGTTAACACATCCACTGTCCTTTTTGCCCACTCTTGTCAATTTTTATGGTCAGAGTTCTTCCACACTGAAGCTCTGAGACAAGTCTCCTCCATTTTCATATGGGACAGAATTAATTCCCTGGTATTGTGGCACCATCAGAAATCTGTATGTTTTTCTACAAATGACTATCCTGGTTGTGAcatgcattctcaagggaggtgatatcactcccatggaggcaaaaattggttcttggggtggaggaaaatcttcgatattataatgatttgtagcccttcaaaggacagtataaaaatagatagtatatccctggtaatttcatggaagccgattaggaaaaaaatagctaaaaaggcttcttagaagagcagtaataaTAGTAATACTATATATTTGAAAGGGTTGGGAAATACTGGGTAGTAAGGAAGTGTTTAAAAACACACCAGCGCTGTTTCTTTACACTCCCCAAGAAAAAGACATACTCCCCAAGAAAAAAGATTCATGTGTACACTCCCCAAGAAAAAAACATATATTGGAGGATAGAAGACTTGAGTTATAATTTTCATATTTGCCACCAATGAGCACAGCCATGTatttacttatttatcaaatatttattgaatgtcttgtatgttccaggcactgtattagatagatacactatagcaaagctcctattcttgtagagtttatatttggggatgggacaggcaataaataagcttcgaatgcctaataataatgtaacaatgatgatagcaacaaatataattataactgctgtctagagtaaataatca---attttaataattaataataatacatgatatacagaaatttcaagaggacaacagatacagttgagcttatagagtgataacagagatggtttcctaagacagcggtct------------atgacctgagtctcaaatagtgagaaggatagagtcccaaaaagatctgggggcagggctttccaggcagggaggagagcaaggcagaggtcctgaggctggagtgagtttgttttatctgaggaacaaaaaaaggtagatgtggctggaatgaactgagactgggagagacaggctggagatcagctagggccagattatcctggacctgcaggcactgatggggagcttgattttattttaaatgcagtgtgaCATCCTGCAAGTCATTCTGTTTCTGTCAAATGGCAAGGATGGGGTGATGAGGATGGAGCAGCTGAATGATTCTCACAGTCTGGAATGCTAAGTCTAACCTTATCTAATTCAGGACCTGGGAGAGGTGCTTTGAGTATCTACAGTGAGGAAAGTAAGGTAGCAAAAAGACCTCAGATCCTGCCTCCCAGAATCCTGTCACTAGGGCTGGGGAAAGAAAGGAGTGGAGAGCGTTCAGGGCTGGGATGCTATATTCCTGTAAAACCAGAACCTGTTCTTCTTCCACTTTTAATTTTTGAGGTGCATAGGATTTTTTTTCACTTTGACAATCTGCTTCTCATATTACTTTAGCTTTCTGTAGTGagaaaaagcacaggattaggggtcaggtgcctcaggctccagaaccccatctgttagtaaatagctaacctgatccagaccattcccggatctgggcctccagaccctcatctgGGGACCATCATTAGGATTCCTTCTGTGATTTGATTATTTTCCTCCCTGCCAGAGCCGGGGAGGAGGCTAAACCCTTGCATGCAAGTCCACCAAAGCTGTCCTAAAATAATAAAGCAATTTCCTTTGAAATGGTCA-GAAGAAAAGTCAGGAGGCCCTTGCAAAATGTGATGAAACCCAGCCCCAGCTGAATATTAAGTTAGCGAGGGGTCTGCAATGAGGGTGGGGGGCTGGGGAGAGAAGAGAGATGCAGGGTTGGGGAGAGAGAAATTTTAATTGCAATTGTTTGGCCTGCTGATCCTAGGCAAATGACAAGAAGCCCCCAAGCAGCCTCAAACACAGATATTTGAAAGGCAGAGACGGCTGGGGGATGGTTTGGTTTCTCCCTCCCCTCTGAGGCTGTTTGAGGAACGGTCTACAGTGCTGACAAGCACGGGTTTTGGAGGCCATTGAAAAGTTTTGGGCCTAAATAGGGTAGGCAGCTTGGCTTAAGTGTTGCTAAGGAATACCTGGCAACCAGCAACAATAGGCCTTTTAGAGAATCCAGGGCAAACAGTGACCGTGGTAATGGGGTGGGCTTAAGGGTCTCCTTGCCCGGCTGGGCCCCTCCTCTTCTCACACAGAGGCCTGGGCACTGGGCTATGTTCCGGAAATTCCCTGCACAAAGCCCCATTCAGTGGGAGGAGGGCCAATGCGTGTGCTTTgggggcagtgggggtggagacaggggatagggagagggcgggggagggggtaccggagaaggagCTTTACTGCC-----AAAAAAAAAAAAAAAAACCTCTCAAGTCTCTTTCTTCTCGCAAAGACTAAAAGAGGCACAGAAAGTGCTAAGTTTGTAAAAGAGTCTGAAAAGGTTCAGAAAAGTAGCATAAAAGGAACTGGGGAACGCCCCGTGAATTTTGAACAGAGAGCAGAAAAGGGACCCTAAAAAGCAATTAGTGATGCTGCTTGTAAATGAAGAGGCACCTAGTTTGGGGTGGGGAGCTGA-GTCTGGAGGTAGGTGTGCAGGGGTGCAGCAGGTGGTGGGGGTTGAGGGGCAGGTGAGGAGAATGAAGTGGGGCGGGAAGCGGGTGAGGGGAAGGGGAGGCCAGTGAAGAATGGATGGATGGAAACTGGGGAACTGTGGCCTCAGTCCCCACTCTAACCACATGCCTTCAGGCTGCTCTCTCCTTGGGCTGTGCAGATGCCCCACCCACTCAGTTTCTGTCCCCTGGTAAGGCAGCCCCCCGAAAGTCATGGGTGCCTGGGACAGTGACCAGCACCCAGAGTCTGAGCAGTCTCCCCAGTCCCTTCAGTCTCTGATAACCATGAAAGAAGCCCTGACGTTCTGTGTGAGTGTAGACTGCACACTCCTCACAAGTAGGCAAATGGCAGGATGCTCCAGGGAGCTGGGTGTCTGCCTGCGTTCCTGGGGGAGGCTCACATGACAGTCAGTGAAGGAAGGCCAGGGAGCCAACAAATTAGCGCTCTACAAATTCCACGTGCCTGAGCTGCATAACATTCATGCTGAAATACCCTACTCAAAGGCTCTAAAGATAATAATTTTACATTTCCAGCAGAATGTGCACGGTGACAATTATCTGTATTCCTACTGTGTCGCAGCATCAACCGATAATTCAAGAGAATTATGTTCCAGTTGAAAGCAGATTTAAATAAACGGA-ACTAAATGGAGCCCAATAATAGATGTACCAANAATAGTCCAGGCAAGGAAGCAGCCTTTCAGATAAAGAGCTGTTTAGTCGAGGAGACATGAGGCATCCAGAGCGCAGAGTTTACAGCTCTCTGTCTGTGGCTCAGCCTGTCTGATTCTTTCTAGCTGTCCTCTGCAGACCCGACCAGAGGACTATCCTAAACTGATCCTTTTCccctcctttccttcctccctcccttctccctcttcctccctcTTCTTTGTTTCTTCAACAAAAATTCACTATTTATTATCAACGAGGTACATTTGGGCACCATCATTAAAATTAATAAACCCTACCCTTCTTTGATTTTTGTGTCCTTCTGTTCAAGATTTAAACCGGATCATGTTGGCCCTGCATGGGGCTAGGGAGGAGGGTATTAGTAAGTTCTTTCAAGGAAAAATCTAACTGCTGTTTCTTTAAGAAGGGAGAATGGGATACTAAAGAGACAAACTATTGGAGTTCTACTACATattctttcaatgattgcacatttgttggaggtcactgtgtgttccaggcattgtcctaggtactgtgaattcaaagataaaagcacttgttcctgccctcacaaagcttccaaccttgcagggaaggaataagcaGGCCTGGTGACAGCTGGATGGGCATGGGTACAATGCATGATGGAAGCACCAGAGAAATGCTCTGCCGGGGTAAGGTGAAGGAGACATCAAGAGGAGGCAGCTGTGCCTTGAAGGAAAATAACTTAAATGAATTTACAAATTCATCTGGAAATAATTGTTGAAGCACAGGAACGAGATAAACTGCTGAGAGAACATGTAGAATGAGGCAAAGAGAAGTGTGTACACGCAAACCAACATTAAAGTCAAGTTCAACAAAAATATTGAGTCTCCTCTGAAAACTAGTATTATACTTGCTTTtaatgtcttcaaaacttagcagaatgcctggcatgcaataaagcatttaataTCACTTGAGTATTTAAGTCATCACATAATACCTTCCACAATGCCCAACAAAACACATCTTCTTTTTGTTTGTTAAGAATTTAAGCCATGTGCTAAGTATCCATTATAGCatctatctatctacctatctatctatcaatctatccatctatc-atctatttacctatctgtgtatctacctatctTACACATataaaggctaacatttattgaacatcatcatgaatcagataccttgctaaactctgcacacaatttcatcatatagttaatgttaattccattttataaatgaggacactgaggctcagaacagtttagCCATCCAAGAACTAAAACCTTGCCTGGCCAACTGCAAAGCCTGTACTCTGATCCCAAGGTCACACACTTCTCTCTATCAAAGAAGATGAAACATGAGTTGAGGTCTTTAGGAGCTTATTGCCTGGCTGGGGAGAAAAGAACACCTTCTTGAAATGGTAGAGAATAACCATAAAGTGCAAAGTAAGAAAGAACCTGTTATATTGGTAAGTTACCAAGAAAACTGCTTGAGGAAGGCTAATGCTAGACTTAAAGTTAGACAGTTGTTAGTTTGGATCCCATAACCTACTTATTGTACAATGTTATGTGCAATGAATGCCAATTCTCCTAATCTATTAACTGAGTGGAAAATATTTCTTCACAGGTACATTTTTGACTCTATGGGAAGCTATGTTATAGAAAGCTCAGTGAACAAGATGGACACCCACATTGTAGAAATATTTCCTCCCATCTCACTTTAACAG--AAAAAAAGCC----CAAACAAACAAAAACAAGACAAATTGAAAAAGAGCTTCAAGTAGAGAAAGCATCAAGAATATAGAACTACATTTCTTTGTCAAAATATTTATAATAAAAAGAAATGACATCATTGTGGAAAGGCAAAGGCTCATATTTATAAATATTAGAAAGAAAAATTTAGCAATGAATATTATGTGATGATATTTAAACTTTGAGAAGATAGTTGGATGTTTCTCTTTATAAAACAGCTATAAATTAAGGCCAAAAGAAGATGGGAAATTCTAGTTTCTCTTTAGTGGTTTTCTTTTACTGTCTGTATTTATTATTACTTTGTAGCTACACATGAT-----------------TGCCAGAATAAGGAAAGTAATCTACTCCACTAATTTATCTGCTCAGGAGGAATGAAAGTCAAGGAAGATGAAATTGAATTTCTGTTTTATTCAG-CATTCTTTAAGAATAGTTTTCTTTAGGAAAAATATCTCATTATTACTTACAATAACAATAAGGAAAAATTCTCATTTCCTAAATGTCTCATTTAGGAAAAATGTCTCATTATTACTTACAATAACAGTAAATAATAAAAAGTATCCATGTTTTTTAA s rheMac1.SCAFFOLD80653 58777 6795 - 71846 CCTGCCTGGTCCCGTGAGCACATAgccacttgcta-tctgaactggaataattgggtaaatgattatcttacttgtttgtattaatctctttaaatgtatatttagctaccatttgtttcaatgcttaatattagaagtgttttggcctttatttagaagtcttataatcagaaatatgccgtatgatgttaactcttgtttatagcaattagcctacggtaacattggttttgctatctgtcatttcgcttcaatgtgcagtttcaagaacctattgatgacattaagtgaggatttaAGTGTATTTCCTGTATTTGCAAAAGGTAGAAGGACTCAGAGA----CTCTTCTCATCACTTTGGGGCCACATCGTCCATTTCTGAGGAAACCACTTAGCAAGGAGTTTTCTGTCATTCTTCTAGGTGAGGAATGGGATACTCTGAATTGCAGTAATTCCAGAACCACAATGGAATGGGGGAGCTTAGTTCCTCGAAGAAGGTAGAGTTGGTATAACCACAAGAAGGAAAGGAAGGACACTGGACAGCAACAAAATAGATGTTCACTACA-TAAGAATAGACATCTATCTTTTCTACTAAGGAAATGATGGAACTTCTGTAGCATTTTCAATAATTCTATGCATAGGCAGTTTATATCAGAG--GCCAAATTATAATTATGCTTTTTATCATGTGACCTGAAAACAGTAGATTTCATTCCCTAGTACCTGGTATTCATGTACGAATTCTATGAAAAAGACAG---TGgcttctagcacagtgcctggcacataggtgagactcaataaacacttttttaattaatgaGGGCATGAATGAACATACTGTCTATAGATATGTCAGTCTCTAATCTACCGGTGTGTTCAGGAGGTAGTGCGAATTTTTTAAATAAAGACTTTATTTTGTGGACACATAGAGCAATGAAATTTTAAAATTCACACTTCCAAACCAGCATGTTAGAAACCCTACCTCATCCTCACACACTGGCTTTAGACAGCAAGAACATCTGAAAGCTTTTGTATAATCTGATTAAGAGCTAAGTAAGAAGAGGCAAGGGGTTAGCGATTAGTGGTTTAACACCACATTTACCTAAGCTGAAAGGCTTTTTCTAAAGATCTTTAAAAAACCTTTGTGAAGTATGTAATATGAGGGCTGGGCTTGAAGCCCAAAGTTAACACATCCACTGTCCTTTTTGCCCACTCTTGTCAATTTTTATGGTCAGAGTTCTTCCACACTGAAGCTCTGAAACAAGTCTCCTTCATTTTCATATTTGACAGAATTAATTCCCTGGTATTGTGGCACCTTCAGAAATCCGTATGTTTTTCTACAAATGACTCTACTGGTTGTGAcatgcattctcaagggaggttatatcactcccacggaggcaaaaattggttcttggggtggaggaaaatcttagatattacaatgatctgtagcccttcaaaggacagtataaaaatagatagcatatccctggtaatttcatggaagccaattaggaaaaaaatggctaaaaaggcttcttagaagagcaataataaTAGTAATACTATATATTTGAAAGGGTTGGGAAATACTGGGTAATAAGGAAGTGTTTAAAAACACAGCAGTGTTGTTTCTTTACACTCCCCAAGAAAAA--------------------AGATTTATGTGTACTCTCCCCCC-AAAAAAACATATATTGGAGGATAGAGGATTTGAGTTATAATTTTCATATCTGTCATCAATGAGCACAGCCATTCatttacttacttatccaatatttattga-cgccttgtatgttccaggcactgtattagatacatacattatagcaaagctcctattcttgtagagttcatatttggggatgggacaggcaataaataagctttgaatgcctattaataatataacaatgatgatagcaataaatataat-ataatcgctatctagagtaaataatcatcaattttaataatttataataacaaatgctatacagaaatttcaagaggacaacagatacagttgagcttataggctgataacagagatgatttccgaagagagcagtctctgttcactgttatgacctgagtctcaaacagtgagaaggatacagtccccaaaagatctgggggcagagctttccaggcagggaggagagcaaggcagaggtcctgaggctggagtgagtttgttttatctgaggaaccaaaaaaagtagatgtgggtggaatgaactgagactgggaaagatagcctggtgatcagctagggccagattatcctggacctgcagacactgacggggagcttgattttattttaaatgcaatatgaCATCCTGCAAGTCATTCTGTTTCTGTCAAATGGCAAGGGTGGGGTGGTGAGGATGGAGCAGCTGAATGACTCTCACAGTCTAGAATGCTAAGTCTAGCCTTGTCTAATTCAGGACCTGGGAGAGGTGCCTTGAGTATCTGCAGTGAGGAAAGTAAGGTAGCAAAGAGACCTCAGATCCTGCCTCCCAGAATCCTGTCACTGGGGCTGGAAAAAGAAAGGAGTGGAGAGTGCTCAGGCCTGGGATGCTATATTCCTCTAAAACCAGAACCTGTTCTTCTTCCACTTGTAGTTTTTGAGGTGCACAGGCTGTTTTGTCACTTGGACAATCTGTTTCTCATATTACTTTCACTTTCTGCAGTGAGGAAAAGCACAGGATTCGGGGTCAGGTGCCTCAGGCTCCAGAACCCCATCTGTTAGTAAAAAGCTAACCTGATCCAGACCATTCCCGGATCTGGGCCTCCAGACCCTCATCTGGGGACCATCATTAGGATTCCTTCTGTGATTCGATTATTTTCCTCCCTGCCAGAGCTGGGGAGGAGTCTAAACCCTTGCATGCAAGTCCACCAAAGCTGACCTAAAATAATAAAGCAATTTCCTTTGAAATGGTCAAGAAGAAAAGTCAGGAGGCCCTTGCAAAATGTGATGAAACCCAGCCCCAGCTGAATATTAAATTAGCGAGGGGTCTGCAATGAGGGTGGGGGGCTGGGGAGAGAAGAGAGATGCAGGGTTGGGGAGAGAGAAATTTTAATTGCAATTGTTTGGCCTGGTGATCTTAGGCAAATGACAAGAAGCCCCCAAGCAGCCTCAAACACAGATATTTGAAAGGCAGAGACGGCTGGGGGATGGTTTGGTTTCTCCCTCCCCTCTGAGGCTGTTTGAGGAACAGTCTACAGTGCTGACAAGCACGGGTTTTGGAGGCCATTGAAAAGTTTTGGGCCTAAATAGGGTAGGCAGCTTGGCTTAAGTGTTGCTAAGGAATACCTGGCAACCGGCAACAATAGGCCTTTTAGAGAATCCAGGGCAAACAGTGACCGTGGTAATGGGGTGGGCTTAAGGGTCTCCTTGCCCGGCTGGGCCCCTCCTCTCCTCACACAGAGGCCTGGGCACTGGGCTATGTTCCGGAAATTCCCTGCACAAAGCCCCATTCAGTGGGAGGAGGGCCAATGCGTGTGCTTTGGGGGCAGTGGGGGTGGAGAC--GGGGTAGGGAGAGGGCGGGGGAGGGGGTACCGGAGAAGAAGCTTTACTGCCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCCTCTCAAGTCTCTTTCTTCTCGCAAAGACTAAAAGAGGCACAGAAAGTGCTAAGTTTGTAAAAGAGTCTGAAAAGGTTCAGAAAAGTAGCATAAAAGGAGCTGGGGAACGCCCCGTGAATTTTGAACAGAGAGCAGAAAAGGGACCCTAAAAAGCAATTAGTGATGCTGCTTGTAAATGAAGAGGCACCTAGTTTAGGGTGGGGAGTTGAGGTCTGGAGGTAGGTGTGCAGGGGTGCAGCAGGTGGTGCGGGCTGAGGGGCAGGTGAGGAGAATGAAGTGGGGTGGGGAGCAGGTGAGGGGAAAGGGAGGCCAGTGAAGAATGGAGGGATGGAAACTGGGGAACTGTGGCCTCAGTCCCCACTCTAACCACATGCCTTCAGGCTGCTGTCTCCTTGGGCTGTGCAGATGCCCCACCCACTCAGTTTCTGTGCCCTGGTAGGGCAG-CCCCCGAAAGTCAGGGGCGCCTGAGACAGTGACCAGCATCCACAGTCTGAGCAGTCTCCCCAGTCCCTTCAGTCTCTGATAACCATGTAAGAAACCCGGATGTTCTGTGTTAGTGGAGACTGCACTCTGCTCACGAGTAGGTAAATGGCAGGATGCTCCAGGGAGCTGGGTGTCTGCCTGCGTTCCTGGGGGAGGCTCACATGACAGCCAGTGAAGGAAGGCCAGGGAGCCAACAAATTAGTGCTCTACAAATTCCACGTGCCCGAGCTGCATAACATTCATGCTCAAATACCCTACTCAAAGGCTCTAAAGATAATAATTTTACATTTCCAGCAGAATGTGCACAGTGACAATTATCTGTATTCCTACTGTGTCGCAGCATCAACCGATAA-TCAAGAGAATTATGTTCCAGTTGAAAGCAGATTTAAATAAACAGACACTAAATGGAAGCCAATAATAGATGTACCAA-AATAGTCCAGGCAAGGAAGCAGCCATTCAGATAAAGAGCTGTTTAGTCGAGGAGACATGAGGCATCCAGAGCACAGAGTTTACAGCTCTCTGTCTGTGGCTCAGCCCGTCTGATTCTTTCTAGCTGTCCTCTGCAGACCTGACCAGAGGACTATCCTAAACTGGTCCTTTTCccctcctttccttcctccctcccctctccctcttcctccctcTTCTTTGTTTCTTCAACAAAAATTCACTATTTATTACCTACTAGGTACATTTGGGCCGCATCATTAAAATTAATAAAAGCTGCCCTTCTTTGATTTTTGTGTCTTTCTGCTCAGGATTTAAACTGGATCATGTTGGCCCTGCATGGGGCTAGGGAGGAGGGTATTAGTAAGTTCTTTCAAGG-AAAATCTAACTGCTGTTTCTGTAAGAAGGGAGAATGGGATACTAAAGAGACAAACTATTAGAGTTCTACTATATattcattcaatcattgcacatttgttagaggtcactgtgtgtttcaggcactgtcctaggtactgtggattcaaagataaaagtgcttgttcctgccatcacaaagcttccaaccttgcagggaaggaataggcaggcctggtgacagctagatgggcatgtgtacaatgcataatggaagcaccagagaaatgctctgccagggtaaggtgaaggagacatcaagaggaggcagctgtgccttgaaggaAAATAACTTAAATGAATTTACAAATTCATCTGGAAACAATTGTTGAAGCACAGGAATGAGATAAACTGCTGAGAGAACATGTAGAATGAGGCAAAGAGAAGTGTGTACATGCAAACCAACATTAAAGTCAAGTCCAACAAAAATATTGAGTCTCCTCTGAAAACTAGTATTATACTTGCTTTTATTGTCTTCAAAActtagcagaatgcttggcatgcaataaagcatttaataTTACTTGAGTATTTAAGTCATCGCATAATACCTTCCACAATGCCTGACAAATCACATCTTCTTTTTGTTTGTTAAGAATTTAAGCCATGTGCTAAGTATCCATCATAGCatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatgtgtctacctatctTACACATATAaaagctaacatttattgaacatcatcatgcatcagataccttgctaaactctgcacacaatttcatcatatagttaatgttaattccattttataaatgaggacactgagactcagaacagtttagccatccaagaactaaaacctggcctggtcaactgcaaagcctgtactctgatcccaaggtcACACACTTCTCTCTATCAAAGAAGGTGAAACATGAGTTGAATTCTTTAGGAGCTTATTGCCTGGCTGGGGAGAAAAAAATACCTTCTTGAAATGGTAGAGAATAACCATAAAGTGCAAAGTAAGAAAGAACCTGTTATATTGGTAAGTTACCAAGAAAACTGCTTGAAGAAGACTAATGCTAGACATAAAGTTAGACAGTTCTAAGTTTGGATCCCATAACCTACTTATTGTACAACGTTATGTGCGATGAATGCCAATTCTCCTAATCTATAAAATGGGTGGAAAGCATTTTTCCACAGGTACATTTTCGACTCTGTGGGAAACCATGTTATAGAAAGCTCAATGACCATGATGGACACCCAGATTGTAGAAATATTTCCTCCCCTCTCATTTTAACAGGAAAAAAAAGCCCAAACAAACAAACAAAAACAAAACAAGTTGAAAAAGAGCTTCAAGTAGAGAAAGCATCAAGAATATGGAACTACATTTCTTTGTCAACATATTTATAATAAAAAGAAATGACATCATTGTGG------AAAGGCTCATATTTACGAATATTAGAAATAAAAATTTAGCAAAGAATATTACATGACAATATTTAAGCTTTGATAAGATAGGTGGATGTTTCTCTTTATAAAACAGCTGTGAATTAAGGCCAAAAGAAGATGGGAAATTCTAGTTCCTCTTTAGTGATTTTCTTTTACTGTTTGTATTTATTATTACTTTGTAGCTACACATGATTGTAATATAAAGCTATCTGCCAGAATAAGGAAAGTAATCTACTCCACTAATTTATCTGCTCAGGAGTAATGAAAGTCAAGGAAGATGAAATCAAATTTCTGTTTTATTCAGCCATTCTTTAGGAATGGTTT------------------------------------------------------------------TGTCATTTAGGAAAAATGTCTCATTATTACTTACAATAACAGTAAATAATAAACAGTATCTATGTTTTTNNN a score=809 s hg17.chr12_random 126401 77 + 466818 agacagagttttgttctgccatccaggctggagtacagtggcatgctcacagctcactgcagccttgacctcctagg s rheMac1.SCAFFOLD80653 65771 46 - 71846 agatagagtttcctcatttttcccagactg-------------------------------gtcttgatttcctggg a score=15613 s hg17.chr12_random 126613 190 + 466818 ctcaggcgatccactcacctctgcttcccacactgctgggattataggcatgaaccaccgcacccagctCAATCTTTATTTTCAAATTTATATTTTCAGTCTAAAAAGAAAAAGACGTGTTTGGGAATGCTAAGTCTCTAGTTATTTTTCCTCATTTTCATTCATTGTTGGTATTTCATCTCAAATTTAA s rheMac1.SCAFFOLD80653 65817 189 - 71846 ctcaggcgatccactcacctctgcttcgcacagtgctgggattataggtatgaaccactgcacccagctCAATCTTTATTTTCAAATTTATATTTTTTGTCT-AAAAGAAAAAGATATGTTTGGGAATGTTAAGTCTTTAGTTATTTTTCCTCATTTTCATTCATTGTTGGTATTTCATCTCAATTTTAA a score=27090 s hg17.chr12_random 126904 392 + 466818 GGAATGGCAAAGGTTTGTCCTGTGAGGTGGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAGAGATCTGCGCTTGGCAGATAACATCATCTCAAATTTCCTCATGATGCAACTAAATAAGAAAGTTCCTATTTCAACTATCTTAGAGTTGTATAAGAATGTATATACAACTAATTGATTTTTCCCTTCAGTATATAATCAGATGAGTAATAATAATTTCTATGAGACATTTCTCCTAATCAAAAACTT-TAATATTAAAATTATAATGCACACTTAGAAATGAACCAAAACAAAAATGGGAAATACCGGAATGTATCATAAACAGTCAACTAACCCTTATAAAGGGCAAGAGATGGAACACCGAAAATAGGCTAAGTCCATCTCCATGCCACCCT s rheMac1.SCAFFOLD85456 76727 391 - 81052 GGAATGGCAATGGTTTGTCCTGTGAGGGGGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAAAGATCTGGGCTTAGAAGATAACATCATCTCAAATTTTCTCATGTTGCAACTAAATAAGAAAGTTCCTATTTCAACTATCTTATTATTGTATAAGAATGTATA--CAAATAGTTGATACTTACCCTCAGTATATAATGAGATGAGTAATAATAATTTCTATGAGACATTTCTTTTAATTACAAGTTTGTATTATTAAAGTTATAATGCACACTTAAAAATGAACCAATACAAAAATGGGAAATTCCACAATGTGTCATAAACCCTCAAGCAACCATGATGCAGAGCAAGAGAAGGAACAGTAAAAACAGCCTAGGTCCATCTCCATGTCACTTT a score=26079 s hg17.chr12_random 127296 380 + 466818 CCTGACATGAAAATGGTAATGATTTTCTTCCTTTTGTAATACTTTGGTCAAAGAAGAGAATAAAACCAAGGTCTAGGCATCCTCCTGCAACTTGGAAGAAACTGGAAATTGATTTGATGTGAGGAGTTTTTTTGGATAGTAGCTTGTCTGTTGTGGGGTCATCACCACAAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAGTGAGCAGCACTGGATCTCAAAATGTCATTTCAATTAATAAGACAAAGTATCTCCGCCACAGCTCCACCATTCTATTCCATGATATAAATTTTAAGCTGTTTTTATTAGCAGAAATCAACACTTCTTAGTTTTTAACAATCTTTAAAAGATCAAATAGTAAAACAGTACTTAAAACTTTATCAAAAAA s rheMac1.SCAFFOLD31009 37299 376 - 42162 CCTGAAATGAAAATGGTAGTGATTTTCTTCTTTTTGTAATACTCGGGTCACAGAAGAGATTAAAATCATGGTCTAAGCCTTCTCCTGCAACTTGGAAGAAACTGGAAATTGATTTGCTGTGATAGCTTTTTTTGGATAGTAGCTTGTCTATTGTTGGGTCATCACCACAAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAGTGAGCAGCACTGGATCTC-AAATGTCA-TACAATTAGTAAAATATAGTATCT-AACCTCAGCTCCACCATTCTATTCCATGACTTAAATTTTACTCTGTTTTTATTAGCAGGAATCAAGTCTTCTTCGTTTATAAC-ATCTTTAAAAGATCAAATTGTAAAACAGTACTTACAAGTTTATGAAAGAT a score=2803 s hg17.chr12_random 127676 134 + 466818 TGACGGCATTCTCAGCAAACTA-----TCACAAATGCTTTTTCTCATTCTTAGCTATGGTGACTAAATCTGGATTATTTTACTACAGCAGTCAAAGTAGCATTATATGTGCACAAACATGCTCAAAGATCAGGCTAAAT s rheMac1.SCAFFOLD31009 24614 105 - 42162 TAATAGCATCATTAACAAGTTAAATTCTCTTGAGTGCTTATTTACATTCTCAGCTTCTGTCACAAAATCTGGGTGATTTTATTATAGCAGTCAAAGTAGT----------------------------------TACAA a score=19506 s hg17.chr12_random 127810 260 + 466818 TATTTTTTATACCTTAAAAAATTTGCCTTTCTATGATTTTTTTCTCTAATGGACAGCCAAAAAATTTATAGTAACAAAAAATTTTACCCAACACACTGGTGTACACAGGAATAGTATAGTGAAATTAGAATGCTAACAATGTGAATATAAATATTTCATTTAGAGACACatttttaatacatttaatttaatatatttaatatCCATCGTACTATAATTTATTGTAAATTCCTGAATTTCTTACACTTTCAAATGTGTAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 50841 256 - 81052 TAAGTTTCATACCTTAAAAAATTTGCCTGTTTATGATTTTTTTCTCTAATGCAGAGCCAAAAA----AAGGTAACAAAATACTTTACCCAACACACCAGTGTACACAGGAATAGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATATAAATATTTCATTTAGAGAAACatttttaatatacttaatttaatatatttaaCATCCATCGTACTATAATTTATTGGAAATTCATGAATTTCTGACACTTTCAAatgtgtat a score=5400 s hg17.chr12_random 128070 120 + 466818 CATAAATAATTAAATTGGAAATAAG-AAAAAAGGTGTCTA-TCAATCATGGATATTCAAATTTTGATGTTTCAAATTCATATTAGCACTAAGAAAGTGGATTAACAATTCTTGCCTATCTCT s rheMac1.SCAFFOLD31009 24984 118 - 42162 CATAAATAATTAAATTGTAAATAAGCAAAAAAGGTGTCTAGTAAAACACG----CTCAAAATCTGATGTTTCAAAGTAAGAATAACATTGAGAATGTGGAGGTAATTTTCCTGCCTATCTCT a score=5557 s hg17.chr12_random 128190 86 + 466818 TCTTTTGTGTGAATTAATTTAAGTAATGTTTTGggccaggtgtggtggctcacacctgtaatcccatca-tttgggaggctgaggca s rheMac1.SCAFFOLD89827 14549 87 + 22897 TCTTTTGTTTTAGTTAATTAAAGTAATGTTTTGGTAcaggtgtggtggttcacacctgtaatcccagcattttggttggctgagcca a score=766 s hg17.chr12_random 128334 11 + 466818 tctctacaaaa s rheMac1.SCAFFOLD31009 25102 11 - 42162 TCTTTATAAAA a score=11389 s hg17.chr12_random 128345 152 + 466818 aaa------tagaaaaaattagcagggcgtagtggtgcacgcctgttgtcctagctactctggaggctaagatgggagaatcacttgagccaaggtgacagaggctgcattgagccaagattgttcttgtgcactccagcctggacaacagagtcaga s rheMac1.SCAFFOLD89827 14705 158 + 22897 aaaaaaaactagaaaaaattagcagggcgtggtggtgaacgcctgttgccctagctactctggaggctgagatggcagaatgacttgagccaaggtggcagaggttgcattgagccgagattgtacttctgcactccagcctggacaacacggcgaga a score=11116 s hg17.chr12_random 128504 289 + 466818 tcaaaataaaaatagaaaaGTTTTAAATTTTAACTTGGATTTCTTAGTACCATAATCCTCTA---TTCTTTATTCAG-CAAAAACTCTAATTACAATGATATCTATAAGAATATGCTGCATCACCCTAATTTTACACTTAGAAATGTACTTTAGGTTTCTGCTTTTTTAACATTTT--TTATTGTGGAGCAAAACATACATATACAGAGTAATAACAACTAATAA-AGAGTAAGATAAAAAATTATAAGGTTAAAATTGATGTTACCATACCTTGGTAAGAAAATAGAATTTGCCa s rheMac1.SCAFFOLD31009 25113 287 - 42162 TTAATTTAAA----GAAAAGTTAAAAACTTTATCTTGGATTTCTTACTATCATAATGCTCTATTCTTCTTTATTCAGAAAAAAACTC----TGCAATGATGTCTATAAGAATATGTTTTTTCAGTCT-ATTTTATATTCATTTATTTCGTATATGTTTCTACTTTTTAAACAttttcattattgtgaaacataacatatatatataaagtaataaggcttaaaggtacagtaaagaaaaaatatatagcattaagagtcatgttacggcatcttggtcatacagcagaattcacca a score=5309 s hg17.chr12_random 130788 58 + 466818 CATACACAAATTTCTAAGCACACAATAAATGCTCAAGAATGTTAGTGGTATTACTGTT s rheMac1.SCAFFOLD26465 1086 58 - 27862 catatacaaatttctaagcacacaataaatgctcaagaatgttagtggtattactGTT a score=28662 s hg17.chr12_random 130846 399 + 466818 ACTGTGGCTGTTTACTGTATTTTAAC-ACTAAAGAAATTCCTCAAATAAAATTGGTGTTAAGTCATTGTGAGGTGCTTCAATATGTAATATTTTCTTTCTACAGTTCACTAAATTACTTTTTCTAGTAACCAGTTTCCTGGTTCTAATCAGATAATCACACGTGTTTAGATGGGCTTGTGCAACCTAACTAGGCTACCCTGTTGCTGTACCACCACTACCAC---TCCCCCATCCAACTTTATTGAGTGCTTTTGATGTGGACACTAGGATgttccagattcactttatttagatatttgattcaacggtgaccaacacagtcaaagatacttcgcacagataagatccaaatgaaagaGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGGAAGAaaatagaatttgct s rheMac1.SCAFFOLD89827 17323 381 + 22897 aCTGTGGTTGTTTATTGTATTTTAATTCCTAAAGAAATTCCTCAAACAAAATTGGTGTTAAGCTGTTGTGAGGTGCTTGAATATGTAATATTTTCTCTCTACAGTCCACTAAATTCCTTTTTCTAGTAACCAGTTTCCTGGTTCTAATCATATAATCACACGTGTTTTGATGGGCTTGTGCAACCTAACTAGGCTACCCTATTGCTGTACCACTACCACCACCAGTCCCCATTCCAACTTTATTCAGTGCTTTTGATGTGGGCACTAGGATgttccagattcagtttatttagatatttgattcaatgatgaccaacacagtcaaagatacttcacacagataagatccaaataaaagGGTGAAAAA---------------------AAAATAGAATTT-CC a score=10752 s hg17.chr12_random 131245 311 + 466818 agcaatccagatactcccgatatatgtcttcttgttgatat-------------tttcctcccttctgactatcccaaattgttatgatgatcactcatatgatgatcactcatatgtttcactgtagggttttatcaccaatgtaatgaatgacaatgtattaaaaataaagtttttcaaactttacgtcgatgagattacagtaaatgtatttttccatcttgataattcctctcacatctgtgagtattattatctatgtagctcaaatttgttcattttctttgttgt-attattctgttgtaaacatgtcagtcttgttt s rheMac1.SCAFFOLD85601 28400 283 - 44828 agcaatccagacactccccatatatg-cttcctgttgacatcatttcccttttgtttcctccatccctattgtcccaa-ttgttatgacaatcactcatatg---------------cctcactttagaacttcgacaacaatgaaataaattgcagttcattaaaaatatatctttgtaaactttatataaatggaattacactgaatct-tttttccatcttaata-----tctca----------------tatctatgtagttcaagtttgttcattttcctttttattaatattct-ttgcaaa--tgtctctctagttg a score=10633 s hg17.chr12_random 131556 185 + 466818 gttaattttgatcactgtacagtattccactgtataagtatgccacaatttctttatccatttggaggactga--gacatttggaggacttctcaactttagctattgaaactcagtgatatgcatgtgtatgtatatgtattctgataagagtgtaaatacttgatcttaggatatgatccttcac s rheMac1.SCAFFOLD31009 26051 182 - 42162 Gttcattttgattgttgtatagtattatattgcaaaagtatgccata----ttttattcatttt-atcactgatggacattcaatagacttctcaactttagctattaaaacacagtgatatgcatgtgtatgtatatgtactctgataagagtgcaaatactgggtcttcggatgtgatccatcat a score=15439 s hg17.chr12_random 131741 193 + 466818 cttaatgagataatgccatactcagccgaaatgatggcacagatttataattctaggagtagtgtatgaaaattcccattgtgtcatatcctttccaaAATAAATAATGTTGGGCtaatatatacatttttgtatttatataa-aacattattaaacaatattttCCAAGTCCTTTTCTATTCTTATTCAGAAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 51097 194 - 81052 tttaattagataatgccatagtcagctgaaatgatggcacagatttataattctaggagtagtgtatgaaaattcccattgtgtcatatcctttccaaaataagtaatgtcaggctaacatttacacttttgTATTTATATAAGAATATTATTAAATAACATTTTCCAAGCCCTTTTCTATTTTTATTCAGAAT a score=51534 s hg17.chr12_random 131934 988 + 466818 GTATGTTTACTTCAATGAATTACATTAATCTTTTTCATTCTATGACTAT----TTCATATACACTTATTAATAATGCCttatatattatacatatttatttat----atttcatta-taaattGTCTAACCTTTTTCTTCAAATTTCAAATACTCTT--GTTATAAGTAACTGTAATTATACTGGAGATACTTCCTTTAATCAATCATTGTGTCAGATGACTTTGAAAAAATATAATTAGTTAACAGCATACAGTAAGGGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTC-TTAAAAGGACTCAAAGAAAAAAA---GTTGAAAAATAAAAAGAGTCTATAAGTTTAATGTAGGTGTCCATGGGAAAATATAAAT----ATATTATTGTT----GAAGAAAAAATGATTGGTAGTAAATTTATCATGTCTGAATTTTTTTAAAGGCAAGCCTGATATCACTGGTCAAGATTTCCTTTAAGGTCTTGACCTTAACATCTATGTGTACCTGATTCCTGAATTTGCAGGAATGTTCTTGTTCCTTTTTAAATTCTGTGACCAATGTCAAACAGGAAAGCATCTCAATATGCCAGTGGATGAAATCAATGCTGTCTTTATGGAAAACATGATGATTTCCAAAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAACACAATGTCCTTGCTGTAAGATAAAATTTTCCATATTGGTGTTGAAGTGAAAAGTGATTTCTCATCTACTAGCATGCCAATGAAG----AGTTTT-TTAATTGTTCTGCACT-TATTTCTTTGTTTAACCTCTCCACAATTTGTGTTCAGCAACTTCAGTTGTTAGAGAAATTTTACAACCTAATACAGAGATGACACACTGGTTGTATAACCTGGTAAAGGGAGCTTGGACATAACTAGGATCATCACCAAAGTAAATTTAATTTTTCAACGTGAG-TAATATGTAGAGTGAATCCAAACTTTTCCTAGCAAAAGGATTCAAGTTTTTCTTGGGAATCTCAGAAAGGCCAATAATTCT s rheMac1.SCAFFOLD31009 26428 1013 - 42162 GTATCCTTAATTCAA-AAATTGTTTCTAT-TTTTAAATTCTATGACCATGATTTTCACACACatttattaataatgaattatatatttcatgtatttatttattCATATTCCTTTAATAGTTTTTCTAATATTTTTCTTAAAGTTTTAAATACTCTTTTGTTATAAAAAGGTATAATTATGCTAGACATATTTCGTTTAATCAAACATTATGTCAAATGACTTT-AAGAAATATGGTTAGTTAACAGCATACTGTAAGGCAAATTTCAACATTGTTTAACAACTCCTTAAAAGGATTCAAAGAAAATAATAGGCTAAAATATCAAAATAGTCTATAAATATAATGAAGGTGCCCATGGGAAAATATGAATTCGACTATTACTGTTTTGGAAAAAAAAAATGATTAATGGTAAACATACCATGTCCGAAATTTTTTAA-GGCAGGCCTAATGTCAATGGGTAAGATTCTCTTTAAGGTCCTGTCCTTAATTTCTATGTGCACCTGATTTCTGGTTGTGCAGTAATGTCCTTGTTCCTTTT-AAATTCTCTGACTAATATCAAGCAGGAAAGCACCAGGGCATGCTACTGAATGAGTTCAAGTCTGTCTTAATGGAAAATATGATAATTTCCAAAACAGCTCAAATTAACTTCTATTCAAATACTAGGTCCTTGTTATAAGATAAAATTTTTCATACTGATGTTGAAGTGAAAGCTGAATTCTCATTTGCTAGCATGCAAATCAGGTCATATTCTTATTCATCAATTTGCAATGTATTTCCTTGATTTACCTCTCCATCATTTCTGTTCAGCAATGTCAGTTGTGAGGGAAATTTTCCAACCTAATACATAAATCATACATCGGATGCCTACACTGTTACATGCAGCTTGGTCAAAACTAGAATCATGACCACTGTTGATTCACTTTTTTGATCCCAGATTTTATGGAGAGTGAATCCCAACTTTTCCTACCAAAAGCATCCAAGGTCTTCTTGGGAAGCCCAGAAATGCCAATATTCCT a score=191105 s hg17.chr12_random 132922 2743 + 466818 TAAAACCCGGTTG--CTACTAATACTTTTG-AATAACTTATTCTTAAGAAGCTCATTAATACAAACACACTCAAACCCATACACACATACTCACTCACTCATGGATAGAAGAAATTGTTGTCCTATAATTTCCAAAATGGAAAATTAATTTCAGGGACATCATCC-AGGTAAAAATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTCAACCCATTTTCAATATTTTTCAAACTTATCTCTCATGCTGAGACCTTTGACTAAGTTTTTCTCTTGAGTTTACTTAATTGTTAAATATTAATTTTTTAGTTAAAATACTCAGCAATTGTGTAACTATTGTGGGCTACTTAAAAAAC--ACGTTTTCCATTGAAGAGTCTAGAT--CTTCATATATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTCtatttaatttatttttgattacttaatttatttttGATTACTTAATGGTTTAAGAGGAATCGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTCTTTTCCATTTTTacagtataattgtttctaacagaagattgtggagtcagactgccaagacaggaaagcagattttctgcttcaaata----tggtctgagacttcatttgacaactactctctgccttggtataatcatctgtaaaatgcaaatgataataatattctcttcaggtagtctttatgaggaGTTAGTATACTAGTTGTATAACTGCTTTCAATTTTATCTGTCTAGTACAGGCAGGAACCAAGAATTATTAATTTTTTGTATGATCGTGTGTTACTTGATACATAAAAGATAACCAGTGAGACCTTCTTTTTTGG----------------GGTAGGGGAGCGAGAAagacagggtcttact-cgtcacccaggctggagtgcaatggcttgatcacagctcactccagtctcaaacatttgt---------gtcctcccacctcagcttctggagtagctgtgtctacaggcatgcatcacaacacccagctaatttattaattttt-----ttgttgagacagagtctccctatgttgcccagtctggtcttcaactcctgttctcaagtggtcccctcatcttggcctcccaaagtgcttggatacaggtgtgaacaaccacacgtggctGAGAACTTCCATTTTTGGGCAGAATGCACAAGGTTCAGAAAAGCATGATA-CCTTCTGCTACAATTAAGATAAGAGAAATAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTTGTCACAGAGTTGTACAAGCAAGAATGACCAGCTGAACTGAAATCCAGCACAGGGAGAGTCTTTATAGATTGCAGTtatatattcagtgcaatccctatcaaatcccagcagatgttttatcacagaaagtggaaaactactcctaaaatgtgtctggaaatgccaagtgacaagatcacaaaaagaaattgttaaaaaataacaaatttggaggattacactttctgatttcaaagcttccttcaaagctgcacgaatcaggattctatggtactcgcattagggtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagagtccagaaattaacaccaacattcatggtcaattgatttcaaaaaagggactactgcaatttgataggaattaatggtttttctcaacaaacaatgctggGTAAAATTGaagaagactacctcaaagaatttaataatcaatttccct-aagctcaaggataaagaaaggattctgaaagcagcaaaagaaaaggaacaaataatgtacaatggagctccactacatgtggcagcagacttttcagtggaaaaaggccaggagagagtggtatgacatattaaaagtgcagagagtggtatgacatattaaaagtgctgaag--aaagaaaactttcagcctagaatagtgtaactggagaaaatatccttcaaacgtgaaagagaaataaagacttttccagaccaacaaaagctgagtgatttcatcagcaccagatctctccta-gaaaaatttcaaacggattacttcagtcagaaagaaaaggacattaatgggcaataagtaatcacttgaagctataaaacgtacgggtaatagtaaggagacag-aaaacacagactaatataacactgtaaatgtggtgcataaacatcacttaaatagaaaaactaaatgatgaagtaatAATGAAAAAAAATAGTGGAgtggctggcaaaatgtcctaataggaacagctccagtctgcaaatcccagcaagatcaacacaaaaggtgggtgatttctgcatttccaactgagttacatggctcatctcattgggactggttagacagcgggtgaagcccacggaggacgagccaaaggagggtgtggtgttgcctcacccgggaagtgcaaggggtcagggaactccctctcctagccaagggaagctgtaagggaccatgcagtgagggacgatgtattctggcccagatactacactttccccatggtcttcgtaacccacaaaccaggagatttcctccagtgtttatgccaccagggccatgggtctcaagcataaaactgggcgatcatttgggcagacaccaagctagctgcagaagttttttgtcataccccagtggtgcctggaatgccagcaagacagaaccattcagtcccctggaaagggggctgaagccaggaagccaagttgtctagctcagtggatcccacctccttggagcccagcaagctaagatccactggtttgacattctcactg s rheMac1.SCAFFOLD85456 52075 2725 - 81052 TAAAACCCTGGTGGGCTAGTAATACTTTCGTAAAAACTTATTGTTAACAAACTCATTAatacaaacacactcacacacatacacatatactcacccactcaTGGATAGAAGGAATTGTTGTCCTGTAATTTCTAAAATGGATAATTAATTTTGGGGAGATCCTCCCAGGTAGACATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTCAACCCATTTTCAATATTTATCAAACTTATCTCTCATGCTGAGGCCTTTAAATAAGTTTTTCTATTGAGTCTA----ATTCttaaatattaattttttaattaaaattCTCAGCAATTGTGTCACTATTGTGGGCTACTTGAAAAACTGATGTTTTCCTTTGAAGAGTCTAGATTTCTTTGTATATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTTTATTTAATTTATT----------------------GACTAATTAATGGTTTAAGAGGAATAGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTCTTTTCCATTTTT-tagtataattgtttctaagagaggatttaggagtcagactgccaagataggaaaccagattttctgcttcatatagccatgctctgagacttcattttacaactactctctgcctaagtataatcatctgtaaaactcagatgataataatactctctttgggtagtctttatgaggagttggtatactatttgtataactgctttcaattttagctgtctagtacaggcaggaagAAACAATTATTAATTTTTCATATGATCTTATGTTACTTGATACATAAAAGATA-CCAGTGAGAACtttttttttttttttttttttttttttggtgggggagcaaggaagacagggtcttgctgtgtcacccaggctggaattcagtggcttgatcacagctcactgcagcctcaaacttttggatgcaagtggtcctcgcacttcagcttctggagtagctgtgtctacaggcatgcaccacaacacccagctaatttttttatttttattttttgtagagacagagtctccctatgttgcccagtctggacttcaactcctgttctcaagttgtcctctcatcttggcctcccaaagtgcttggatacaggcatgaacaactgcacctgcccGAGAATTTCCATTTTTGAGCAGAACACACAAGGTTAAGAAAGGCATGGTATCCTTCTGCTACACCTAGGATAAGAGAAATAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTCATCACAGAGCTGTACAAGCAAGGATGACCAGCTGAAATGAAATCCAGTACAAGGAGTGTCTTTGTAGATTGCAGTTATATA-tcagtgcaatccctatcaaatcccagcagatgctttatcacaaaaagtaaaaagctactcaaaaaatatatctggaaatgccaaatcaacagatcaacaaaagaaattgataataagtaacaagtttggaggattacactttctgatttcaaagcttacttcaaatctgcactaatcagaattccatggtacttgcattatggtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagattccagaaattaacaccaacattcatggtaaattgatttcaaaaaagggactattgcaattcgataggaattaattgtttttctcaa-aaacaatgctgggaaaaATTGaagaagactaccataagcaatttaataatcaatttccctgaaactcacggataaagaaaggattctgaaagcagcaaaagaaaagaaacaaacaatgtacaatggagctccactacatttggtagcagctttttcagtcgaaaaaggccaggagagagtggcat-acatatt-----------------------------aaagtgctgaagcaaaaaaaaagttttagcctagaatagtgtaactggagaatatatcctttaaacaggaaagagaaataaagacttttccacaccaacaaaagctgagggatttcatcagcatcagatccgtcctataaaaaatgttaaagggattgcttcagtcagaaagaaagggacattcaagagcaataagtaatcacttgaagctataaaacttactggtaatagtaaagagacagaaaaacactggctagtataacactgcaaatgtggtgcataaacctcgcttcagtagaaaaactaaatgatgaacgaat-----aaaaaaATAGCAGAAtggttggcaagatgatcgaatggaaacagctctggtcggcaattcccagtgagattaatacagaaggtgggtgatttctgcatttccaactgagttacatggctcttctcactgggactggtgagacagtggctgcagcccacggaggacgagctgaaggagggtggggcatcacctcacctgggaagtgcatggggtcagggaacgctctcccctagccaagggaagcagt-agggaccatgcaatgagggacaatgcattccagcccagatactacgtttttcccacagtctttgtaacccacaaaccaggagacttcctccggtgcctatgccaccagggccctgggtttcgagcacaaaaatgggcaatcatttggacagacatcaagctagctgaacaagtttttt-tcacgacccagtggtgcctggaatggcagcgagacagagccattcactcccctggaaaagaggaagaagccagggaaaaaagtggtctttctcagcacatcccatgcccttgaaacccagcaagctaagatccactggcttgaaattatcactg a score=8361 s hg17.chr12_random 137576 797 + 466818 tgtaatgtgagtggaaattatgtgcactacttccaggcccgtcccataaaaatttgccatgcatcctcctccatgcaccttttctgctcctggctgcctggaataaggtgaccccaag-gcaatcttggaagctatgtgttaaaggtcaccaagtgatcagcctattttagtgaataactacatagggaagg------------------------------------------ttactcagacatatcagtaccatta---aaagaacaaaattaaatcatattgtttgaaacgttttacattttggagctatttg-tgatgcagttTGTCTACCCAGTCTAACACAGAAATTGGA-ACTGAAAGTGGGAGAATTTGTTTAGAGGATTTGGATAGTGA----AGGAACAGATCTTGGAGACTGGCAACACGATGGCACATGTGGTGTATAAGCAAACTTTTTAAAAACATTAT--ATGCAATAACTTAGAAGAAGGCCATGTTTAATGAGTCTCTGGC---CCTAGGGGAAGTGGTTGATGAAAGTCAAAACGG---TGTGCCAGGGTTGTTCTCCAAAATATTT-TAGCAAGATATTATGAGAA----GATGAGAAAGGAAAAGAATTGACTGGTTTGCAAATAAGAATTAAGAGCAAGAGAGAGTTCAGAAATCT--AAGGTTTCAGAGGGGTATAAAATCTCACCGGTTTGGGGTATCAAACAGCAATAAGTGAGACTGAAAAAAAAATTAAGAGGCC---CATTAAGACTTTTCAATTAAACATAGA---------------GACCA-TTGTTTCGAATGCCTTCAAGATAACTGCCACCAAAGTGAAAGAAAGAGGCCTGGGATAAGTAAGGGAAAA s rheMac1.SCAFFOLD19367 4725 827 + 7900 tggaatgggaagagaagtgatgtgaaccatttc-atgccttaccaatgaaaa----------------cttcttgctgtttttcttctc-tggatgactggga--gggtcatgctgggagcctccttggaaaccatgtgttgaagat---------ggcagcctgagtctttcagtaaccatgtggagctgagtcccctcttccccaaccctgctcctacagattttgaacattttacttagatgtctctgaactgttaggtaaattgcaaaaaaaatttctattgtgtgtaaactattacattttggatctgtttaataaactagctta---acttaccctaattTAGAAATCCAACACCTAAAACATAGGGATTGGCttagtagatgcaaagcaggaggttaggaactgatatcattgactga-aagacggagcctcttcctatgccatggcaaaatatttggtaaaactgttgctgtggtaacttgacaagcagacacaattcttatggtactggtacttctagggaaggtagatggaatgagccagaatgtaactgtgagttggctg--ctgctggctgtttgtggctaggtatgttcaaaaaagagatgagctcacaccagaatctactggtttgcaagcaa-----aggaagggaatagagtccaggggacttaaagatttc---------taaaagccaactgcttcAGT-------ACTGTAATAGCCGAGACAAGACTTGTAGCTCAGAGGACTGTCACTGAGACATTTCAGTCAGGCAAAGATCTTCTTTCAATCATGCCCAATTGTTTCAGATAGTTTCAAGACAACTGACACTAAATTGAGAAAAGAGGGTTTGGGGCAGGAAAGAAAAGA a score=170486 s hg17.chr12_random 142580 2151 + 466818 ACAACAA-GAAAAACTGCCTAAAATCAGTGAAGGATCCTGGCTGAAAGCCGGTTTT-CTCCCCCTCCTCCAGTAGCAACAGATGGCTTTCACCCAGTGTCAGCATGGGAGTCCAAGTCAGGCAATCTTCCTGCCCCTCCTTGAGTGTCAGTCAATCAATGTCTTGTATCAGTGGAGGGTCTTGATATCATCAGGTTAACTGCCCCCTTCCTGCAGCAAATGGGTTTTTCCTGGTGTTCATGCAGAGTCCAGGATTGGTGGGTTTTCTGCCTTCCTTCACTGGCAGATCCTTTCTGTTTAGCCAGCATGCAGCCCAGAGCAAGTGAGTTTCCTGGACTTCCCCTGTGACAACAGACTTCTAATATGTATTAATACAGACCTAGGAGTGCAGGCAGGTTTCTTACCCCACTCCTTGTGCCAATCAGCTATTGCCCAATATCAGAGTAGGGTCCAGGTTACAGTGTATTCCCTGCCCCTCACTCAGCAGCAGGCAGATTTTGCATAATAAAGATCCAGAACATGTGTAGTTTTCTTGCCTGTCCCCTAGCACTGGCCAACAACCACCTTTTACTCATGCAGGGTCCAGTGTAAATGGGCTTCTCCAGTTTCTATTACTCCACTTTAAAACTTAAGAAGATTTTGTTCCCATTtgttttagatttgcactgctgctaaaacaaattatcataaatttagtggcttaaatactacaaaattatcttaacagttctacagatcagaagtctggtatttgtcttactaagctaaaatcaaggtgtcagcaaggctgcattgctttctggaggctctaggaaggaatccatttccttgccattcccagcttctagaaactacctgcagaccttggtttggggcctccttcatcttcaaagtcagaagtgttgcatctctctaaccctagttaagaaataatctgtttttaagggctcatatgattagactgaacccacctaaataatatgggataatctcccatctcaaggtgcataccaataatcacatttgcaaaatctccatgccatataatgtaacatattaactagttccaaagattaagtcatagacatctttgggaaagccattattctgcctcctataCCGtgtaccataaaggaactttcctaggtttcctg-tctgtcctcaacctttccagtaagcattcggtagaagcccaaggggaaaagctggcaattacagaccactcctgtgtctggggctcccaggtattctaaactgtcacattaaactacactcaacctttgtaagaatttgttaaaatttcagccattttcttgttacctactgaaatgccagagaactcttctggagttctgccacagatgaaacaattcatgtctcctatttggaaaggcttgtaattt-----------ttttttttttttttgatatggagtctcgctctgtcacccaggctggagtgcagtggccccatctcggctcactgcaagctccacctcctgggttcacaccattctcctgcctcagcctcccgagtaggtgggactacaggcgcctgccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagagacggggtttcaccatgttagccaggatggcccagatctcctgacctcgggatccacccacctcagcctcccaaagtgctaaaattcagtttacctgctcaccttgtaacttcagttctaacaagctcaaaataaattatgactttgtagcctacctagtttactctctttgttagagcagaagcaacattctcttttggtctactgctaactaaaaggaagtaaaattCTCAAGCTGGTTTTCAAAATGCATGCATAAATGCATGCTATATCATATTCTTCCACATGCATGGTTTAAAAAATGTCTCAATT-AAAAAATAGATTCATGTATAGGTGATTTTTTATGCACCTATGAAATCTGGCCTTGTAATGAAGAATACAATAGATCTTAATAATCTGACAATTATTAAATGTGTTTCATTGTCTAAAAGAGAGGTTTGAGGGGAGAAAAAGAAAAGTCTTTCTTGAAATATGGAAATAAGAGTATATATTTAGCTCTGAGTATGTTCTGGTAAGAATTACAATGATGTCAAACTATATGTACATATTAAAGCCATGGCaaaaaa s rheMac1.SCAFFOLD125516 2 2154 + 48937 ACAACAAAGAAAAACTGCCTAAAACTAGTGCAGGATCCTG--TTCAAGCTGTTTTTTCTTCCCTTCCTCCAGTGGCAATAGATGGCTTTCCCCCGGGGTCAGCATGGGAGTCCAAGGCAGGCAACCTTCCTGCCCCTCCCTGAGTGTCAGTTAATCAATGCCTTGTATCACTGGAGGGTCTTGATATCATCAGATTAACTGCCCCCTTCCTGCAGCAAATGGCTTTTTCCTGGTGTTCATGCAGAGTTCAGGGTTGGTGGGTTTTCTGCCCTCCCTCAGTGGCAGATCCTTTCCATTTAGCCAGCATGCAGTCCAGAGCAAGTGAGTTTCCCGGACTTCCCCTGTGGCAACAGATCTCTAACAAGTATCAATGCAGACCCAGGAGTGCAGGGAGGTTTCCTACCCCACCCCCGGTGCCAATCAGCTATTGCCCAATACCAGAGTAGGGTCTAAGCTACagtggatgccctgcccctcactcagcagcaggcagattttgcttaataaagatccagaacatgtgtagttttcttgcctgtcccctagcactggccaacaaccaccttttactcaggcaagttccagtgtaaatgggcttctccagtttcTATTACTCCTCCTTAAAACTTAAGAAGACTTTGTTCCCATTtgttttagatttgcactgctgctgaaacaaagtatcataaatttagtggcttaaatgctacaaaattatcttaacagttctgtagatca-aagtctgatatatgtcttactaagctaaaatccaggtatcagcaagcctgcattgctttctggaggctctagggaggaatccatttccttgccattcccagcttctagaaactacctgcagaccttagtttggggcctccttcatcttcaaagtcagaagtgttgcatctctctaaccctaattaagaaataatctgtttttaaggactgatataattagactgaacccacctaaataatacaggataatctcccatctcagggtgcataccaaaaatcacatttgcaaagtccccatgccgtgtaatgtaacatattaactagttccaaagattaagtcatagacatctttggaaaagccattattctatctcctataCCAtgtaccataaaggagctttcccaggtttcctgctctgtcctcaacctttccagtaagcattcggtagaagcccaagggaaaaagctggcaattactgatcactcctgtgtctggggctcccaggtactctaaactgttacattaaactacactcaacctttgtaagaactggttaaaatttcagccattttcttgttacctatcgacatgtcagagaactcttgtggagttctgtcacagatgaaacaatttgtgtctcctatttgcaaaggcttttttttttgtttgttttgttttttttttttttgagatagagtcttgctctgtctaccagactggaatgcagtggtgcgatctcagctcactgcaagctccacctcctgggttcatgccattctcctgcctcagcctcctgagtggctgggactacaggcgcccaccaccatgcccagctaatttttcatacttttaat--agagacagggtttcaccatgttagctaggatggtctagatctcctgacctcatgatcttcccgcctcggcctcccaaaatgctaaaattcagtttacctgctcaccttgtaacttcagttctaacaagctcaaaataaattacgactttgtagcctacctagtttactccccttgttagagcagaagcaacattttcttttggttttctaccttctaaaaggaagcagaattCTCGAGATGCTTTTCAAAATGCATGCATAAATGCATGCTGTATCATATTCTTCCACATGCATGGTTT-ATAAATGTCTCAATTAAAAAAATAGATTCACATATAGGTGATTTTTCATGCAACCTC----TCTGGCCTTGTAATGAAGAATACAATAGATCTTAATAATCTGACAATTATTAAGTGTGTTTCATTGTTTAAAAGAGAGG--TGGGGGAGGAAAAAGAAAAGTCTTGCTTGAAATATGGAAATAAGAGTATATGTTTAGCTCTGAGTATGTTCTGGTGAGAATTACAATGATGCCAAACTCTATGCATATATTAAAGCCATAGCaaaaaa a score=58339 s hg17.chr12_random 144899 890 + 466818 aaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaagaaaggaaaagaaaagaaaagaaaaaagaaagaaagaaagagaaaagaaaAATTAAAGAGTTTTTATGTGGGCTTCTACTTGATTTTATTTTTTCCTAATACAAAAA--AGTTTTCGTCAAGGCTTTCAAGGAGCCAAGGTTTCCCATCATATCAAGAATCTAATCTTCCACAGCATTATCAGTGAGGTCTGACTCAGCTTGCTCTTCCCAAGAATCAGAATCAGAGTGATCAGAAAGGCAGAAGGCTCCTACTATCTGGAAAAGCATCATGCCCAGCAGGCTGTTTACCATAAAGTGAATCAAATCTGCTATAAAAGCTGAAAAACAGTACATGATAAAAAGAAAATAAGAAAGATTAC-GACTCCAAAATCATTTATTTCCCAATGGAATGTTAATAAACCAAGGACTCCATCAGAATCATAATATTCACATAATTAATTCTACACTTTATCCAAAGGAAAAATGGCTGAG-AAAAATTAGCTATTGTGAACCACCCCCACCTCCAAAAATTATCAGGCAGATAGCAAACCAAAGGGTTGAGTACTGATCAGTGTCCAAAAGGAAA-CGTACTTTTTTTCTAGTTTGGCATTAGCACAAGTTAATGGTGTGGTGTGAACATAAGTATAAAAATATTAAGCAGTATTAAACACAGCTGTTAAATTCTGGAGCTGGCTAACCTGATGAAAAGTCAGTTAAAGGAAGCTTCCAATGCCCAAGCCAGTCAATGCAGTTAATCTGTACAATCAAGCCATTTCCAATCATGAATTTTCTAATTTGTACAATCAAGCCATTTCCAATCATGAATACTCTAATCATGAATTCTCCTAATATCACCCTCAGCAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 2156 775 + 48937 aaaagaaagaaagaa-------------------------------------------------------------------------agaaaagaaaaatgaaagaGTTTTTATGTGGGCTTCTACTTGATTTTATTTTTTCCTAATACAAAAAACAGTTTTCGTTAAGACTTTCAAGGAACCAAGGTTTCCCATCACATCAAGAATATAATCTTTCACAGCATTATAA--GAGGTCTGACTCAGCTTGTTCTTCCCAAGAATCAGAATCAGAGTGATCAGAAAGGCAGAAAGTTGCTACTATGTACAAAAGCATCATGCCCAGCAGGCTGTTTACCATAAAGTGAATCGAATCTGATATAAAAGTTGAAAAACAGTACACGATAAAAAGAAAGTAAGAAAGATTACAGACTCCAAAATCATTTATATCCCAATGGAATGTTAATAAACCAAGGACTCCATCAGAATCATAATATTCACATAATTAATTCTACATTTTGTCCAGAGGAAAAATGGCTGAGAAAAAATTAGCTATCTTGAATTGCCCCCACCTCCAAAAATTATCAGGCAGATAGCAAACCAGAGGGTTGAGTATTGATCAGTGTCCAAAAGGAAATTGTACTTTTTTTCTAGTTTGGTATTAGCGCAAGTTAATGGTGTGGTGTGAACGTAAGTACAAAAGCATTAAGCAGTATTAAACATAGCTGATAAATTCTGGAGATGGCTAAACTTATGAAAAGTCAGTTAAAGGAATCTTACAATGCCTAAGGCAGTCAATGCAGTCAATCTGTACAATCAAGCCATTTCCA---------------------------------------------AATATTCTAATCATGAATTCTCCTAATATCACCCTCAGCAA a score=71122 s hg17.chr12_random 145789 900 + 466818 AAGAAGTGTGGATTAGGCATTCAAATCTAAA-CATCAAGGGGCAGATAAAAACTACAACCACCTAAATTATTGCTCCTATCCCACTCTCAGGTGGAAAGAAGGAAATCTTTCTTCAGCTCTAGAGCATTAAGGAGTAGGATTTGGAGCTTTGTGACTGTTCTTTGCCTATTCCCGTCCCATTGGAATAGGCCCTCAATCTGGCCATGTTATCAGTGGGTGGCTGCTATTTTCCCCACGGTCTCAGGGTGGAAGATAAGGTTTTCATGGAGTTACCCAGAAACGGAGCAAGTAGGGCGTAAAGGGTGGCACAAAAGAGGAATAGAAGACAGAATGAGTCCACATAGCTTTACATATTTGGAAATGAAAAATCCAGG-ACGTAATGACTCCTGTGACTCTGAATGGCTCTGTGTATTAGTCTTTCAGTTTTCAAAGGGAGTAAATTATATGTGTGAACTGAAACTATATATCTTCTCCCAGTTCTCAGAATTGATCATTTATTTTACATCGCTCTTCAGTCTCTATACCAGTATTTTAGAAGTTGTCATAAGTAATTCCTCTAAGTGCTACCTCGCTGGAGTGGTACTGGAGCAGCAAAGTAGCAAAAG----AATACTAGCTGGGAACACAAAATTAATTTTTACAAATTTATCAGTGGCACGTTATTTCTACCAGTCATATAATCAGTAGACTATATAGAAACAGAGGTACTCTAGGGTACCGTACTTGTGCTCTGAATAGCTGCTAGACATGCAGTGCACGGTGCGATGTGTGGTATCTCAACAATGCTTTTCAGAACAAGACTGTAACCTTAAGGTCATGATCAGAAATCACACATTTGAATAATCCATGAATGAAGACGGTGTGTGCGATTAAAAAATACAGTGCTTTCTAGTTAAAATGGGA s rheMac1.SCAFFOLD125516 3571 901 + 48937 AAGAAATGTGGATTAGGCATTCAAATCTAAAACATCAAGGGGCAGATAAAAACTATGACCATCTACATTATTGGTCCTATCCCACTCTCAGGAGGAAAGAAGGAAATCTTTCTTCCGCTCTAGAGCATTAAGGAGTAGGATTGGGAGCTTTGTGACTGTTCTTTGCCTATTCCCTTCCCACTGGAATAGGACCTCAATCTGGCCATGTTATCAGTGGGTGGCTGCTATTTTCCCCACGGTCTCAGGGTGGAAGACAAAGTTTTCATGGAGTTACCCAGAGCTGGAGCAAGTAGGGCATAAAGGGTGGCACAAAAGAGGAACAGAAGAGAGAGAGAGTCCACATAGCTTTACATATTTGGAAATGAAAAATCCAGGAACGTAATGACTCCTGTGACCCTGAATGGCTCTATGTATTAGTCTTTCAATTTTCAAAGGGAGTAAATTATATTTGTGAACTGAAATTACATAACTTCTCCCAGTTCTTGGAATGGATCATTTATTTTACATTGCTCTTCAGTCTGTATACCAGTATTTTAGAAGTTGTCATAAGTAATTCCTGTAAGTACTATCTCCAGGTAGTGGTATTGGTACAGCAAAGTAGCAAAAGAAGAAATACTGGCTGGGAAAACaaaattaatttttataaatttCTCAATGGCATGTTATTTCTACCAGTCATATCATCAGTAGACTATATAGAAACAGAGGTACTCTAGGGTACTGAACTTGTGCTTTGAATAGCTGCTAGACATGCAGTGCACGGTGCGATGTGTGGTATCTGAACAATGCTTTTCAGAACAAGACTGTAATCTTAATGTCATGATCAGAAATCACACATTTGAATAATCCATGAATGAAGAC-GTGT-TAAGAT--AAACATACA-CGCTGTCTAGTTAAAATGGGA a score=16848 s hg17.chr12_random 146821 283 + 466818 taatcccagcactttgggaggctgaggcgggcagatcac--gaggtcaggagatcgagaccatcctggctaacacggtgaaaccccatctctaccaaaaaatacaaaaaattagccgggcatggtggcgggcgcctgtagtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcctgggcgaca-gagcgagactcccgtctcaaaaacaacaacaaaaaaaGAGTTT s rheMac1.SCAFFOLD91656 5476 277 - 6797 taatcccagtactttgggaggccgaggcaggcagatgacctgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccctgtctactaaaaa-tacaaaaa-ttagccaggcgtggtgatgtgcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttaaatccaggaggcagaggttgcagtgagccaagatggcgccactgcactccatcctgggcaataagagcaaaactga-gtcttaaaaaaaa------aaaaaaTGCTC a score=107957 s hg17.chr12_random 147296 1338 + 466818 TTATCATTCCTGTCACTTGCAATTTAAATATTCCTAATAAATAGAAAAATCCAAAGACTAAGATTGTGATCCTTTTTATGTCTATGGTATATTATGAATACAGAGACCTTGTGCTTTTATTGGCGTAGGAATCATCTTGCCCTAATATTAATATTATGAAATCAAAAGGGTAAGATTCCT----AACATCCCACATAACACAGcagacaaactaaagttttaatctagctttggcccttacaaattttgtgccctacggcaagttacatctcgcttagattttttcattttaaagtggAACTATCTGCATGGATGTTCGTACATGCTATATAACACATCCTATTCCAGAGCCACCTACCATCAGTTGAGCTCTAAATGGTAAATGCCACA-GTGAGAAGCAGACAGGAAGGGGCGGAGCGCCAGCGGCGCCCGGGGCTACGCGCCGCACTGCACCGAGCGGCGGCAGCGGCAAGCTTGGGTGTGAGCCCGGGAGCCGCTTTGCTTACCGTCCTGCCGGTCCCAGCCGTCGCTAGGAGGTCCGCGGGCCCTGCGGCAACCCTCGCTACAGACGCTGGGCGGGCGGCGACACCTGGCTCATGGCCCCCGCGGCGGCTCCGTCCTCCTTGGCCGTCAGGGCCTCAAGCCCCGCCGCGACACCCACCTCGTACGGCGTCTTCTGCAAGGGGCTCTCCCGCACCCTGCTCGCCTTCTTCGAGCTGGCCTGGCAGCTGCGCATGAACTTCCCGTACTTCTACGTCGCGGGCTCGGTGATCCTCAACATCCGATTGCAGGTACATATTTAGAGCCATGACTAAGCTAACGGCCTCCGGGGCCAGCATGATGGCCGACTCCCAGGGTCCGTTGCGGCGCGGCGGAGCAGCCAATGGCGAGCCCCACAGTCTCGCGAGAGTGCTCAGGCGCTCTTCGTGGCTGCCCTCTTAGCTGCTAGCGGAGCTCCTCAGGGGGCGGCCGGGAGCCTACAATCCCTAGAAAGAGAATACGCTGTTCCGGAAACAGAACTGCAGTTAAGACCCTCGAAAACATCTAAGAAAGTGTGCATCCTAAAACACCTGACGAATTTCAGAATGTGACAAAGCGCAGAGGATGCATTATTTCAAAACAAAACAGAAGGCTAAAATTTGCAGGAAAAAGAAAATCAGTAAACCGGGAATCCTCGGACTGGATTGTAAGCAAGATTTCAATGAATAAGAAGCTGAAGGTATTAAGGCTGTGATATAGAAGGTACATA---TTTCATCCCACAAGAGAAAACAATAATAATCAGAAATTTTCGGTGAAAAAAACGCAAAACTGTACAGGAAAATCATCCTCCAAGTACCAGACA s rheMac1.SCAFFOLD125516 4522 1337 + 48937 TTATCATTTCTGTCACTTGCAATTTAAATATTCCTAATACATAGAAAAATCCAAAGACTAAGATTGTGATCCTTT--ATGCCTATGGTATATTATGAATACAGAGATCTTGTGCCTTTACTGGCTTAGGAATAATCTTGCCCTAATATTAATGTTATGAAATCAAAAGGGTAAGATTCCTGGCTAACATCCcacagaacacagcagacaaactaaagttttaatctagttttggactttacaaattttgtgccctagagcaagttacatctcgcttagcttttttcattttaaagtggaaatatctgcatggttgttCGTACATGCTATATAACACATCCTATTCCAGA----TCAACCACCAGTTGAGCTCTAAACGGTAAATGCCAAAAGTGAGAGGCAGACAGGAAGGGGCGGAGCGCCAGCGGCGCCTGGGGCGACGCGCCGCACCGGACCCAGCAGCGGCAGCGGCAAGCTTGGGTGTGAGCCCGGGGGCCGCTTTGCCCACCGTCCCGCCGGTCCCAGCCGTCGCTAGGGGGTCCGTGGGCCCTGCGGCAACCCTCGGTACAGACGCTGGGCGGGCGGCGACACCTGGCCCATGGCCCCCCCGGCGGCTCAGTCTTCCTTGGCCGTCAGGGCCTCAAGCCCCGCCGCGGCCCCCACCTCGTACGGCGTCTTCTGCAAGGGGCTCTCCCGCACCCTGCTCGCCTTCTTCGAGCTGGCCTGGCAGCTGCGCATGAACTTCCCGTACTTCTACGTCGCGGGCTCGGTGATCCTCAACATCCGATTGCAGGTACACATTTAGAGTCGTGACTAAGCTAACGGCCTCAGGGGCTAGCATAATGGCCTACTCCCAGGGTCCCTTGCGGCGCGGCGGAGCAGCGAATGGCGAGCCCCACAGTCTCGCGTTAGCGCTCAGGCGCTGTTCGCGGCCTCTTTCTTCGCTACAAGCAGAGCTCCTCTGGGGGCCGCCGAGAGCCTACAGTTCCTAGAAAGAAAATACGCGATTCCGGAAACAGAACTGCAGTTAACACCCTCGAAAAGATCTAAGAAAGTGTGCATCCTAAAACACCTGACGAATTTCAGGACGTGACAAAGCGCAGAGGTTGCATTATTTCAAAACAAAACAGAAGGCTAAAATTTTCAGGAAAAAGCAAATCAGTAAACCGTGAGTACT-GGACTGGATTGTAAGCAAGATTTGAATGAGTAAG-AGCTGAAGGTATTAAGATTGTGATATAGAAGGTACATACTTCTTCATTCCACAAGAGAAAATAATAATAATCAGAAACTTTCAGTGAAAAAAA-GCAAAACTGTACAGGAAAAGCATCCTCCAAGTACCAGACA a score=9914 s hg17.chr12_random 148634 158 + 466818 TAAAATGCTGCAAGCTTTTGAACTAATGGCGAGAGTGTAAGAAAATGGGCTC----TACTTCAGTGATCCTGTGGCAGGACGTGGATCAAGA-CTTGGAACCGCAGAAAACGAAATCCCATAGTAGCACAAAGCTTGGCTGTTCAGTGAATAACATTTAAATA s rheMac1.SCAFFOLD48760 267 162 - 1188 TAAAATGCTGCAAGATTTTGAATGAATGGTGAGAGTGTAAGAAAATGGGCTGGCTGTATTTCAATGCTCCTGTGGCAGGATGTCAATCAAGAGCTTGGAACCAAAGAAAAAGAAATTCCTTCCTAGCA-AAAGTTTGGCTATTCAGTGAATAACATTTAAACA a score=452250 s hg17.chr12_random 148792 5994 + 466818 ATCGTAAAATACAAATGTTGTTTATGGTTTTTATTGTTTAAGGGCATACTTAATTATGGTTACAAAGTGGAGTGCAAATGTTATTTACCATGTTTTAAAAATACAGCCGGAAAATACAAGTGGGAATGTTGAAGGAGGGCGGGGGAAGTAAATGGAATGGGGGTTATGTCCTTATAAAGTGGAAACTTGAAAGGTACTGTCTGTTGTTGAGTGGGGAAAGACATTTTTATTACTTACAGGGTAGCCATAAAGTTTCTAAAACGGTAATATATTAAAGAGGGAGAGTGGTAGGGGAGAACAGTATGAAGTCAACAGGAAATGGCTAAAGATGGAGAGCTCAGGTAGAATAGTTTaaaaaatgaaaattgatagagtacctggtgtatttgaatacagcctagagagctttcattttccaaagagtgtggggataaattagtgaatgcatatttttcaaaattaagaaaacagaacatataattttgaacgctgagaaaaataaaaatttaaaaactacactgtatacacggtatacctcaactgtgaataatagtagtcatgtaaagtcagtcataattatgtaaatactgaatactgattttacaacaaatgattctataacgctgggaggatgggagaaaagagatgtgtgtgtgtgTAATGGTGGTGAGCCAATCAAGATCTGATATAGAAAAATGCAGAAAAAGGAGTATACACATGTTTTCTTCGGATT-----AAAAAAACTAATAATAAATCACCAAGAGTGGTAAAGTTTTAAATCAAGATCTGAT--------------------------------------------------------ATAG----------------------------------------------------------------------------------------------AAAAGTGCAGAAAAAGTAGTATACGCATTTTTTTTTTCAGGAAAAAATTAACTAATAAACCACTAAGAGGGGTAAAGTGTTAAAATAGTTGCATTGTTCTATATTCCACTCATTGTGTCCAGCAAACAGT-----GTTCTATGGCTTTAAGTAGTAAGCATCTTGCCCCGTCCAACACCATGTCTGGCCTAGGGTAATTGTTCTTTCTAGTCTTTATTCTTTGTCTCCAGCCAAACTCCATTTGGGCACATTCTCCTATA-GCCTTTTCTACCTGAAGAtactctgtgttttaaagctaagcttaggtggcgctttttccattaaatttttcctggattccactgaccatataggagctcacttctTTTAATCCATAAGGCCATTTTCATAGGTTGCCTTATTTTTCCCTAATCGTGCATCAACTGTCTGTTTTATATACCCAAGACAGGTTTCCTAGACTGCGATAAGCCAAAACATTTTAGTCTAAAATATCAGAAGTGTAGTTTAATCAATGAAATAGTAATACCAAGGGATTTAGAATCGTGGACATCACTGTTTCCCAGAGCACTGATGTCCCAATTTGTAACACAAAAGACTGTCTAGTCTTAATCCTGAAATGGTGACAGAGTAGGATGCTCCATTTGGGTGACTATGTGAACATATTCCTATAACTTTTTTCCTCACATCAGTCATTTGTTAAACCGAAGATGAAGAAACAGACTTTGTATTTATTACATCCTCCAACATAATTGGCAGCTCTGTGAGGGAAGACACTATATCCTATTCAATTTTACACCCGGTAGTAACAGTATGTGTGTGTACTGtatatatacatatatatatacatacacatatataaatttaagtagtaactatatatgtatatatgtatagttactacttactatatatgtatacagtatataagtatatatgtataGTTACTACTTACAATATATGCATAAAGTTACAGCTTACATTTACCTCGTAATATATGTATATATATATAT-------------TAGGAGTTAAATGT-------------------------------------------------------------------------------ATTAGGAGGTAAATGTAAACTCTGTGGTTTATCATTTATTCACAATTGCTCTTAATTCTTGGGGTATAGTTTGCCTCCTACATGATGCAATTCAGTGAAATTCCCAGGAGACAAAACAAGATTTTGACCTGAATAAACCACTTATTGTTGTAATTCACAAGTGAgtttattcttcctggcacacttccaggtaatatccattaggctaaggattttgtttgttcactgttctatccccaagcctagagcactgcccagtgcggaatagctaataaatattgttgaatggatagatGAATGGCAATTTTGTTGGTATGCTCTACATAGTCAGCAGTCAATAAAGGAAACA--TATATTCGTTCCTGATAATAAGATGATTCACTTTATTGCCCATAAATTGGGCTTTTTCAGGCCATCATGCACGTTGATTGATCCAGAGATCCCTCAAGCATGAAAAAGCAGAGACATAGGTGGTATAGTTATTATCAATAGAGA-------TAAGAAATGTAGCTGGCAAAAAAAAAAATGGGAAACGATGCGTTACAGCTTATTTTAACTATAAAAGGAAAACAGTGAACATAGCAACATATGTAACCTAAGGGATAGGGGAAAAGTTGTTTTTTTTT--TTTTAATTCTGGGTAAAAATACATGTGATTACTTGACAAATAGCATATCATTACCATCAGCATCATTTTTAAA-atatattgagtttttaataccaggaactatgaaaaactatttatatacatgagctccgtaattctcacatataccctgtgaggaaaacatttttatcatttttcagagaagcaaaccgggatttagagaggttaagtaaattcctaaggtcatgataaccaaccagACCTCAAATGAATCTCCAGTAATTCCTAAAGTTATATTTCATAAGGAGTTCAATTTTCTTAAATGTGTAGATAATTACAAATAATTCTGTTTCTCAAATTTCTGGACAGAAATATTACCTGGGTAATAGTTATTTTTTTTAACATAACTATTGAGGGTCTTTCATACTAAAATATAAATATTTAACATGATTTGATATGTAAGTTCAAGTATTTTATACTCTCTGCAGCCTTAAACCTATTGGCTTATTTTATTAGAGGGTTGGTGGGATTGAGGGATATGGGAGCAAAGGGAGAGAGAGGAAAGAACGTTGTCCTCAGAATGGAAGGGAAACACTTTCCTGTGCTACCCAGAGTAGAGATCAGACAATGTTAAATTTTGAAGCCATGTCTGTTCCTGTCCTGAGGATCCCTAACTAAATTTTGTTAGAAAATCTTGCAGTTTGCTTTTAATGGGAGATCTTTCTGGCAGGACATCAATAGCTTTTGATAGCGTCAAGAAGAAAATAAAGTTACATGCAGAAGCATAAAGGGGTAGGATGAAAGTTGAGGAATATAGGGACAAAAGATGAGGGAAAGGAATATCCTAATACTTGGAAGTTTGAGCATGGAAAGTAGTCTAAAGAC--GACTTGGGAAGTTCCAAGAAAATGAACCAAGAAAAGAACCTCTGCAAGAACTATGAGAATTCCCAACAATTGGGTTGGATTGATTCATATTAGTCTATTACTTGGGTTACCTTGAGTGTGGGGATTCTTCTTGCAGTTTTAACACTTGtactatggtctgaatgtgccccccaaaaattcacatgttggcatt-taacccccaaagtgatgatctcaggagatgggacctttgggaggtgatcaggtcataaagatgaaaccctcgtgaatgggattagtgcctttataaaggagaccccaaaataattcccttaccccttttgccatgtaaggttatagggaaaagtcatctatgaacaaggaaatgaaccctcaccagataccaaatttgtgaatgcctggatcttggacttcccagcttctagaactataagaaataaatttctgttgttcataagcacccattttatggtattttttatagcagcctgaacaaactaGACTTAATAGGATTTGCTCAGCAGGATTACCACCAGGTCAAGTCATGAGATCTTTTCAAAATATAAGTAAACCTCCCCTTACCCCTACTCTCCACAAATACAAATTTCAGCAGTGCTCTTGGGAC-----AACTAAAAGGCCCAAGGACCTTCCCAAAAGCCTACTACAAATGAA-----GAAACTATGGAAGTCTTAGTAGCTTAATTGCAGGACATCCCTGCCAGTTTCTATCCTGATTAGGGATCTGCAATGAACATTACAAAATCTTCACCATCTCCATGGCTTTCAACACCAAGCATATGGACTTAGCCACTGTAAAATAGTGGCATGCATCAATGAACAATAAAGAGAAATGGAGATCATTCATATTATTAGTGAGGGAAGTTGGGTACAACTTTTCATCAGCCAAAAAGAGGGAGAAAAA-AATCACACCACCAAATAATGAAATACTGTAACTA----------------AGATCATTGGCAGAGAATTAGAGATTATGTTCAGCAGATTAAAAAAAAAAAGAAAACag----ctgtgatcatgccactgcactccagccagggctgcagagcaagaccctgtctcaaaaaaacaaaaaGCCAAAAATACGAGATGCTTAAA-----AAAAGAACTGTTGTTCAAGAGATCATTTTCACTTTTTAATTGGTTTTTGAAAACTGTGAAAGTATCTCAAACTGAAGTCTAAAAGGAAAATAAT----AGAAGCTTCAAAGTTCAGGGGCCAGGTTATATCTATATAAAAGGGAAGCTAACTTATTTCCAGAACTGATTCATTTATTAAACATGGGGCTAAGGAATAGAGGTGGCAATATACAAGTCAGGATAATGCCTTTGTCTTCTGAAGCTGCATCTACATTGGTGCCCCTCAAAATAGCTAAAATTGAAAATAGTTTATCTGTCACCTGGGATTTCTTCTACAAATAACCTTCCCAAAAAAATATTGCCTAACATTTTTCTGAATTTATCAAGCCAACCATCTGATCAGTTTTCTAAATGAAGATTTATTCTTGGCAATAATCTAGCTCAGGGCCTAGGTC-TTGTACACAGCATTAAGCAATGTAACAGATGAGTGCACTGGAAGTATGGATTT-GCAGATGGCCTCCTTGTTTCTGTATTTTAATTAAGGAAGTCTCTAGCTCAAAGGACATGAGATTAAGGGCAGCAGCAAACCATGTGAACTATCAGAGATTCAACAGAGACAATCACGCCCTCTGAAATATGTATTGATCCATGCATATTTTCACTAGGATGTTTTCTTTGAGTAAAGCTAAGGACAACATGGCTTGCGCACCCAAAATATCTTCTCATCTTAAGTTCTAGGCCTAAGGCAGGGCTCAGGCATCAGCCGTTTTTGGCATTAGAAACAGGTTATTCAGGTTATTGGCAACTCTTCTATAAATCAACTGTGTGACCAAACTGGGTTGGGGGGAGGGCAGGGGCGGGAAACTCAAAAACTCTCATGACATCAAGACTATAAACTTACTTTAGGGGAAAGCAATTGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTCGATCATTTTCTTTTCCCAATTATTTGTTCCCAGGATAGGATACAGTTCTCTCCAGATTGCCTGAAACTAGGTTTGGATGTAAGAGTCGTGGTTTTCTTGGATCGTGGCTTGCATCTCCAACCCAAGCTTTCATTATGGAAAATGATGGTGCAGAGCTTAATCTCAAAATGCCATTGTAATAGGGAGACTGCAATACAGTGGTAGCAACAGTCCCACACTTTCTCCCAGCCTTCATCATTTAATAGTCATTTTCTGTGCTTTTATTATCTGGAATAGGTCTCTGCTCCATATGGCTTCATCTCTGCAAGGATAGTACGTGAGATGTGAAGACTTAATCCTAATGAGACATTTACTTCTAAGTCCCACTCACTAGAAGCAAGGGTTGTGTATGGTTGTTTAAATCTTTTGAATCTTGATCATTAAAGAAAAGTTTAGTctggacgcagtggctcacccctataatctcagcactttgggaggccaaggcgggcaggtcacctgaggtcgggagttcaagaccagcctgaccaaaatggagaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaaattagccaggcatgctggcgcatgcctataatcccagctacttgggaggctaaggcaggagaattgcttgaacccaggaagcagaggttgcagtgagccaagattgcgcca s rheMac1.SCAFFOLD125516 6373 6103 + 48937 ATCGTAAA-TACAAATGTG---TATGGTTTTA--TGTTAAG-----TACATAATTATGGT-ACGAAGTGGAATGCAAATGTTATTTACCATATTT-AAAAAGAGAGCCGGAAA-TACAGGTGGGAATGTTGAAGGAGGGCGGCGGGAATAAATGGAATGGTGGTTCTGTC-TTATAAAGTGGGAACTTGAAAGGTACTGTCTGTTGTTGAGTGTGGAATGAC--TTTTATTAC----AGGGTAGCCATAAAGTTTCTAAAACGGTAATATATTAAAGAGGGAGAGTGGTAAGGGAGAACAGTATGAAGTCAACAGGAAATGCCTAaagatggagcgctcaggtagaatatttcaaaaaataaaaattgatagagtacctggcgtatttgaatacagcctagagagctttcatttttcca-tagagtggggataaagtagtgattgcatatttttcaaaattaagaaaatagaacatataattttgaaccctgagaaaaataaaaatttaaaaactacactgtatac---------ctcaactatgaacaatactagtcatgtaaagtctgtcataattatgtgaatactgaatactgattttacaacaaatgattctacaac--ctggaggatggaagagaagagagatgtgtgtgtgTAATGGTGGTGAGCCAATCAAGATCTGATACAGAAAAGTGCAGGAAAAGTAGTATACACATGTTTTTTCCAGATTTAAAAAAAAAAAACTATAATAAACTACTAAGAGTGGTAAAGTTTTAAATCAAGATCTgattgcattgggagttatacctgatgtaaatgatgagttgatgggtgcagcacaccaacatggcacaagtatacatatgtaacaaacctgcacgttatgcacatgtaccctacaacttaaagtataataataaTAATaataaataaataaataaataaaAAGTGCAGTAAAAGTAGTATACACATGTTTTTT--CAGAAAAAAAT-----AATAAACCACTAAGAAGGGTAAAGTTTTAAACTAAATGCAGTGTTCTATATTCCACTCATTGTGCCCAGCGAACAGTTAGTTGTTCTATGTCTTTAAGTAGTAAGGATCTTGCCCCCTCCAACACCAGGTCTGGCCTTGGATAATTGTTCTTTCTAGTCTTTATTCGTTGTCTCCAGCCAAACTCCACTTGGGCATATTCTCCTTTATGCCTTTTCTACTTGAAGAtactctgt--tttaaagctaagcttagatgacactttttccattaaatttttcctggattccactgaccatataggagctcacttctTTTAATCCATAAGGCCATTTTCATAGGTTGCCTTATTTTTCCCTGATTGTGCATCAGCTGTCTGTTTTATATATTCAAGACAGGTTTCCTAGACGGCAATAAGCCAAAACATTTTAATCTAAAATATCAGAAGTGTAGTTTAATAAATGAAATAGTAATACCAAGGGATTTAGAATGGTGAACATCACTGTTTCGCAGAGCACTAATGTCCCAATTTGTAACACAGAAGACTGTCTAGTCTTAATCCTGAAATGGTGACAGAGTAGGATGCTCCATTTGGGTGACTATGTGAACATGTTCCTACAACTTTTTTCCTCACATCAATCATTTGTTAAACCGAAGA------AACAGACTTTGTATTTATTATATCCTCCAACATAATTGACAACTCTTTGAGGGAAGACACTATATCCTATTCAATTTTACACCCTGTAGTAACAGTATGTGTGTGCATTGtatatatacatatatgta--catacacatatataAATGTAAGTAGTAACTATGTA---------------------------------------------------------CACAGTTACCACTTACTATATATGTATACAGTTGCAGCTTACATTTACCTCCTAatatatatgcatatttacataaatgtaaatatgtaaaaattacatatttacaatgtaaatgtgtaattatgtaatttacataaatgtaaatacgcatacatattatttacataaatatgggtctatatTAGGAGGTAAATGTAAGCTCTGTGGTTTATCATTTATTCACAATTGCTCTTAATTCTTGAGGTATACTTTGCCACCTACATGTTGCAATTCAGTGAAATTCTCAGGAGACAAAACAAGATTTTGACCTGAATAAACCAGTTACTGTTGTAATTCACAAGTGAGTTTATTCTTCCTGGCACGCTTC-AGGTA-TAtccattaggccaaggattttgtttgttcactgttctatccccaatcctagagcattgcccagtgcagaatagctaataaatattgttggatggatagatGAATGGCAATTTGGTTGGTATGCTCTACATAGTCAGCAGTCAATAAAGGAAACAGATATATTTGTCCTTGATGATAAGATGATTCACTTTATTGCCCATAAATTGGGTTTTTTCAGACCATGATGCACGTTGATTGTTCCAGAGATCCCTCAAGCATGAAAAAGCAGAGACATAGGTGGCATAATTATTATCAGTAAATACAAAACTTAAGAAATATAGCTGACAAAAAAAA----GGGAAATGATGTGTTACAGTTTATTTTAGCTATAAAAGGAAAATGGTGAACATAGCAATGTATGTAACCTAAGGGATAGAGGAAAAGTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTCTGGATAAAAATACATGTGGT-----GACAAACAGCATATCATTACCGTCAACATCATTTAAAAATatatattgagtttttaatgccagaaactatgaaaaagtgtttatatacatgagctccataattctcacatatgccctgtgaggaaaacatttttatcatttttcaaagaagcaaac--ggatttagagaggttaagtaacttcctaaggtcaTGGTAACCAACCAGCCCTCAAATGAATCTCCAGTAATTCCTAAAGATATATTTCATAAGGAGTGCAATTTTCTTAAATATGTAGATAATTACAGATAATCCTGTTTCTCAAATTTCTGGACAGAAATATTACCTGGGTAATAGTTACTTTTTTTAATGTAACTATTGAGGGTCTTTCATACTAAAATATAAATATTTAACATGATTTGTTATGTAAGTTCAAGTATTTTATACTCTCTGCAGCCTTAAATCTATTGGCTTATTTTATTAGACAGT-GGTGAGATTGAGGGATATGGAAGCAAAGGGAGAGAGAGGAAGGG-CATTGTCCTCAGAATGGAAGGAAAACACTTTTCTTTGCTACCCAGAGTAGAGATCAGACAATCTTAAATTT-GAAGCCATGTCTGTTCCTGTCCTGAGAATCCCTAACTCAATTTTGTTAGAAAATATTGCAGTTTGCTTTTAATGGGTGATCTTTCTGGCAGGACATCAATAGCTTTTGATAGAGTCAAGAAGAAAATAAAGTTACATGCAGAAGCATAAAGGGGTAGGATGAAAGTAGAGGAATACAGGGACAAAAGATGAGGGGAAGGAATATCCTAATACTTAGAAGTTTGAGCATGGAAAGTAGTCTAAAGACTAGGTTTGGGAAGTTCCAAGAAAATGGGCCAAGGAAAGAACCTCTGCAAGAACTATGAGAATTCCCAATAATTGGGTTGGATTGATTCATGTTAGTCTATTTCTTGGGCTACCTTGAGTGCAGGGATTCTTCATGCAgttttaacacttgt----------------gccccccaaaaattcacatactggcattctaacccccaaagtgatgatcttaggagatggggcctttggaaggtgatcaggtcataaagatgaaactcccatgaatgggattagtgcccttacaaaggagaccccaaaataattcccttaccccttttgccatgtaaaattatagggaaaagtcatctatgaacaaggaaatgaaccctcaccagatatcaaatttgtgaatgcctggatcttggacttcccagcctctagaactgtaagaagtaaatttctgttgtttataagcacccattttatggtattttttatagcagtatgaacaaacta-----aATAGGATTTGCTCAGCAGGATTACCACCAGGTCAGGTCATGA-ATCTTTTCAAAATTTCAGTAAACCTCCCCCTACCCTTAC-------AAATACAAATTTCAGCAATGCTCTTGGCATTGCTAAACTAAAAGGCCCAAGGACCTTCCCAAGAGCCTACTACAAATGAAAAGAAGAAACTATGGAAGTCTTAGTAGTTTAATTGCAGGACATCCCTGCCAGTTTCTGTCCTGATTAGGAATCTGCAATGAACATTACAAAGTCATCACCATCTTCATGACTTTCAACACCAAGAATATGGACTTAGCCACTGTAAAATAGTGGAATGCATCAATGAACAATAAAGAGATACGGAGATCATTCATGTTATTAGTGAGG-AAGTTGGGTACAACTTTTCATCAACCAAAAAAAAGGAGAAAAACAATCACACAGCCAAATAATGAAATATTGTAACTAGAGTGTCTTGGCTCTAAGATCATTGGCAGAGAATTAGAGATTATGTTCAGCAGATTAAAACAAAACAAAAAAcagtgagctgtgatcatgccactgcactctagccagggctgcagagcaagaccctgtctcaaaaaa-caaaaaGCCAAAGATACAAGATGTTTAAAGTTAAAAAAGAACTGTTGTCCAAGAGATCATTTTCACTTTTTAATTGTTTTTCGAAAACTGCAAAAGTATCTCAAACTGAAGTCTAAAAGGAAAATAATTAATAGAAGCTTCAAAGTTCAGAGGCCAGGTTATATCTATATAAAAGGGAACGTAAATTATTTCCAGAACTGATTCATTTATTAAACATGGGGCTGAGGAATAGAGGTGGCAATGTACAAGTCAGGATAATGCCTTTGTCTTCTGAAGCTGCATCTACATTGGTGCCCCTCAAAATAGCTAAAATTGAAAATAGTTTATCAGTCACCTGGGATTTCTTCTACAAATAACCTTCCCAAAAAAATATTGCCTAACATTTTTCTGAATTTATCAAACCAACCATCTGATCAGTTTTCTAAATGAAGATTTATTCTTGGCAATTATCTAGCTCAGGGCCTAGGTCATTGTACACAGCATTAAGCAATGTAGCAGATGAGTGGACTGGAAGTATGGATTTTGCAGATGGCCTCCTTGTTTCTGTATTTTAATTAAGGAAGTTTCTAGCTCAAAGGACATGAAATTAAGGGCAGCAGCAAACCATGTGAACTATCAGAGATTCACCAGAGACTATCACGCCCTCTGAAATATTTATTGATCCATGCATATTTTCACTAGGATGTTTTCTTTGAGTAAAGCTAAGGACAACATGGCTTGCACACCCAAAATATCTTCTCATCTTAAGTTCTGGGCCTAAGGTAGGGCTCAGGCATCAGCCGTTTTTGGCATTAGAAACAGGTTATTCAGGTTATTGGCAGCTCCTCTATAAATCAACTGTGTGACCAAACTGAGACGGGGG----------------AACTCGAAAACTCTCATGACATCAAGACTATAAACTTACTTTAGGAGAAAGCAATTGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GTCAATCATTTTCTTTTCCCAATTATTTGTTCCCAGGATAGGATTCAGTTCTCTCCAGATTGCCTGCAACTAGCTTTGGATGTAAGAGTCGTGGTTGTCTTGGATCGTGGCTTGCATCTCCAACCCAGGCTTTTATTATGGAAAATGATGGTGCAGAGCTTAATCTCAAAATGTCATTGTAATAGGGAGAATGCAATACAGTGGTAGCCACAGTCCCAGACTGTCTCCCAGCCTTCATCGTTTAATAGTCATTTTCTGTGCTTTTATTATCTGGAATAGGTTTCTGCTCCATATAGCTTCGTCTCTCCAAGGATAGTACCTGAGATGTGAGGACTTAATCCTAGTAAGACATTTACTTCTAAGTCCCACTCACTAGAAGCAAGGATTGTGCATGGTTGTTTAAATCTTTTGAATCTGGATCATTAAAGAAAAGTTTAggccaggcgcagtggctcatccctgtaatcc-----------------------------tcacctgaggtcgggagtttgagaccaacctgaccaaaatggagaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaaattagccaggcgtggtggcgcatgcctataatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaagcagaggttgcggtgagccaagattgcacca a score=3533 s hg17.chr12_random 154786 77 + 466818 ttgcactccagcctgggcaacaagagcaaaactccatcccaaaaagtaaagaagggaagggaaggggagggaaggga s rheMac1.SCAFFOLD125516 19490 76 + 48937 ctgcactccagcctgggcgaca-gagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa a score=423936 s hg17.chr12_random 154934 5300 + 466818 gggaagggAATTTAACTTATTTACTGAAAGGAGTAATTCCAAACCATATTATCCTCACTATCTGAACCTAAATATAGCCAGTGTGATTTTAATGTTGCCCTTTCTAAAGCAAGATAATGCCCATGATAATCATTAGGAAATTTATTATACAGTATCTAACAATGAATGGAGTTTTAAAAATCTAAATGTCTGTATAGGCCTGGACTGGCCTTAAGATTATATATTATATACATTTTCAGTTACTTTA-----TTTTTTTGTAAAAGTCAACCTAGAACTATACACAAATACAAACATGCCTAAAATTTATGCAAATATGTGACATTCTCTTATAAATTTTCCTTTATGTTCTTATTCTTAGTGAGTTAGTTGGTTGTGTTAGTTTTCTCTGGTGTGACACACTAGTATTCATGGTATGACAAAAATATGTCATTACACATGTGCACACACACAGAGATCCTGTGTCAAAGTGTGGTTTTGATTCAAAAAAGTAAAAATATAAGCATCATTATGGACATAGGGATAAGTATTCAACTTCTTTTTAGAAATTCAATTGATTTTGCACTTATCCTACAAAGGTAGGATAGCTTGAATTCCTAGCTGGAGTCCTAATGAGAGAATGCTATTTTGTTTTAAAAGTTACCTCTATTGCTATGAGATTATATGCTTTCAATATTTTTAGTTCTTAATGTATTTGACTTAGTGTTATAAAAATATGCCACCTACTCCGGATTGGAGTAGGTATTAGGTTCTAATGGCATTTAGAACCATTTCCAAATATTACTGTTTTTTTCCTCACATGTGAATGTAATCACACATTTGCCAGCACATATAAAATAAATACATGTTGCATTATATATTTTACATTTATATTAAGTCTCAAATATTTCCTAGTTACTAGCAAATATTAAAATGACAATGATACTTACTTTTTTAAAAAAATCCGGTATTACATTGGCTGACTTTATGAGTAAATCGTTCATTTATAGGCCATTCTAGGGAAATTTTGTGATGCTTAATTACACCTTAAAATAATCTGGGTGAAAAACACATGCTAAAATACATCTTCAATGTGTTCTCATTAATTCCCCTGGAATACAGAAAAATCCAGAAAAGTCTACAAAACTAAAG-TTTCACTCTTTTTAGGTGGCACTTAAGATGCCACAGTGGTCCCACAGCAGTCTGTCTCAGCATGCAGTTTTCCAAAATTAGGACAAATGAGTGGCTTGAAGGAAAAATAATTGACGTTAACAAGACAAAAAAATTGGCCTGCTATTTCTGCTGTATAAGGAAAATCCAACCTGTTGGTaggagagaagaaaagtgaaccaaaaagaagaggagaaaagaCACCATCATTTT---------------------CATTTTCATTTTCATGGCCCTCTTATGGGCCTTCATTCTGAGGTCCCTCGGGCCCATGGTGTTGAGCTGCAAATTCCTGATATGTCTCATCAAGGACAGAATTAAAAGGAGCAGTGAGATCAGGGACAGAAGAAAGGAAATTAAGTAGATCAAACTGACAAGAATCCAGAGGCTACAATATAGAATTTTACTTACATCTAAAGACCAAGTTGAGTTTCTTTCATACATTGTGTAGATGTTAATCCACAAGTCACTAAGTCCACCTGTTAATGCAAGGTTGAAAAACAGTAAGAGCAAGGACCCCAGTGGGAGTTCAAGTAGCGTTCTGCTAATTCTCCATCTCAGCCAGATGAAGCATGGGTGGGAAAAATAGGCTATTTTAAAGAAGTAGAAAACACTAAG----GCAGCAAGCCAGGTAACTAAGTGATTGGTCAGTGCCCAAAAAATATGAATAAATTTTATTAGTTTATTGAAGGCATATAGATGTGGCCATAATGCTGTTACAAATGAATCAAGTAGTATTATCCAAAGTTGACTGATTGTGGAGATAGCCAGGCTGGTGAGGATGCAGTTGTCTAATAAGATCATTTGACTCCTCACCAGTCAATGCAGTTAACTAGTACAATGAACCCATTCCCTAACATTCAGATTATGAATTCTCCCATCATTACTATCAGAAAGGTATTTCCAATTCCAGGTGGCATTTCTGGAGAAACAAATCCAGAAAGCTAATACTATGTTTCACTGATACTTTTGCTGTCAAAACGTTGCAGAATAATATCCAACTTGATGATTTTCAGATTTATATTTAAAATGTTCAGAGTAACTCAGAATGATCTTCTGTTTGATGCCACCTCACTTATCTTCACAAAAGATCTTTCTGTTTTTTTT-ATATTCATCTCACTAGTAGGCCTGAAATATGTGCAAGAAGATCCAGTCTCACATATCTTAATT---TAAAAAAAACTTTAACATTATTTTTAATCAGCTACTGACTTACAAATTAAATAGTAAATGTAGTAAATGTGCCCACTCATCATTGGCACTGAGAGCAATTTCCCACTTGTGAGGACATCTAGAAGGGCGAAGTCAGGTATGCAAATATCAAACAGATTTCTTTACACTGATTTGTAATTTTCTCCTCAACTGAAAGTCAATACCATTTGGATTTGAATATCTTAATTTTACAAGAATTATCTAAAAATAACCTCTACAATATATGTATTACTCATTAGTTTCATTAAATAAACTCCATAATATTTCCAATTCTACTTTAGATGAATTAAGTGTAATAAAAAGAAGCATCAAAAAGCTCACAGAGTAGTGAAAAGAAGCAACATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAACCACAGTTTGATCAAAATGCAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCTTTTAGGATTTCTTAAAGAAATAGACAAAAAGGGAGATGATTTTACATAATTATGTAAAAGCATATGTAAAGAAACAAAAAGTATTCCTTTATCTGAGCTATTTTACTGAACTTTTGAGCTTGGTTTCCAATGCCTTCCTGGCTATTTGATTTTGAATAAGCTCTTATCAACTGAAATGAAAAAAAAATAGTAAAAAAGGATGGAAAAATAGCAAAAAAACATAAGAGGGAGAATAGGAGGGAGATTCTCCTTTTCATTAATTCTTCCTTTGGTAAAATTCTTTGTCTCATAAAAATGTATCCACAGTAAAATACATTTTATAATTTATTTGTATTATTTTGTAACTCTAATAcaatgtttttcaaacttgactgcacattggagttaacttgggagatttaaaaaaacatattgatgcctgtgggcca-ctcccagggattttttttacctaattggtctggagtACATTGCTGGCACTCACTGAGAGGCTCTTGATGTATGTCTTACAGTGACTCCCAAACCCAGGCAAAAATCTTTCTACCCAAAAGCTGCAAATCTATGATTCTGCAAGGACAGGACAGGATTTTGCCTGCCTTGTTCTCTAACAATGTGTTTCTCATTCAGCCAATTTTGACGCTGACTGGCAAACTGGCCACCAACTCTCTTAACAACCACATAagcgacttttttgttgttgttcattagtctgtttccaattcacagaacataaagggcatggataatagcaggtcttccataactatttgttaaatgaatTAGTGCTAACTTAGTTGGCAGTCCCACTAGCAGCACACAAAAGGAGAAAATGAATTAGGCTTGACTGTGAAACAAGTATCAGAGCAAGAAAAGAAAGTACCTCCTTAC------AGAAAATGTTACATTCATGTATGAGCTTATGAAAGATTTCTGTTCTAATCCTGAAAAACCCAACACTGCTCTGTAATCTTTCTAGTTCAATCAAGAAATCATACAGAATCAAAAGGAACA---TGGTCTGCCACCTAAGATGGGGGAGGCTTGGTACTTTTCTTCATGAAAAGGAACTACTTCT----------GTTGAAGATGGCTAGAAAACTAGATTTCATGACCCAAGAAGCAAGATAGCCCT------AGAGATCACTAATGTTTTCAGAAATGCTCTGCAAGTCATGTAAAGGCTAATTGAGAAGAAGATTCCATTGATAGGCATGGTTTAGCTGTGAAAAACACCGAAAACAAGTCAGTCAGGAGATAGTGATTAAAGAACATCTAAGTTTGTAGTTACGCTGAAGAAACTAAAAATAAAAGATGCAATAACAAGTATAAAAACCACAAGTCCCATATACTATGAGTTGTATTCAAAGTCCAAGTTAATAATCACAATTTTTTAAATCTACATAAT-----TAATCTATGTCCTACTCTAGACAAAATATCATCCAGTGTCTAGAATGAAAGCAAAATGACTGTGCAAATATACAAACACCCCCTaaaataactattgggtaataggcttaatacctgggtgatgaaataatctgtacaacaaactcccatgacatgagtttacttgtgtaacaaacctgcacatttacccctgaaacta-----aaagtttttttgtaaaaaaaaaaaAAAAACACCCCTTAAAGCATGA-TCTGGCTCAGAGAAGATGCTGTCTAATGAAGATTTTGCTAGAAAAAGCCACCTACTAAGACATAGCAGATAAACCACCCAAGACAGTGAGGAAATTGGTGCTCCTTTTTCTTGGAAATCAGTATTGGTATGGGTTTCTACCTGATGT-TACATTCAGTACAGTTTAAGAAAACATGCCTTGATATACTTGATTTGTGTCTTATTTGCCTTCAGAACTAGAGCTATGGGTTGGAGATAAGCCAATTTCAGCAGTAGAAACAGGTTATTTGTTCCTGTCCTATAAATTACCTGACTGTATGCATTGAAATAACCACAATGATTACACCCAGTATCTTGAAATGAGCATTTATTTGACAAGTGAGATGAGTGGGAGTCTATAAAAATGAGTGATAATTTCCCTCTTTCCCCAACAGCTGGGTCCCAGGGTAGGTCATAATCCCATCAGTCTTGTTGATGGGATGTTGCATGTTGCATGTGTCAGTGCATGTGTTGGGCATGGCTCTTGGATTGTGGCTTGGTGGCTGCTAAATTCCCACAAAGGCCTTGTTTGGGAGAAAGTGGAGGTGCAGAGCTTGCTCTCATTTGCCATTCAAATATGCAGATTACTggccaggcacggtggctcatgcctgtaatcccaatactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggctaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcatacaccacctgtaatcccagctactcaggaagctgaagcaggagaatcacttgaacccgggaggtggaggttgc s rheMac1.SCAFFOLD125516 12711 5297 + 48937 GGGAAGGGAATTTAACTTGTTTACTGAAAGGAATAATTCCAAACCAAATTATCCTCACGATCTGAACCTAAATATAGTCAATGTGATTTTAATGTTGCCCTTTCTAAAGCAAGATAATGTCCATGATAATCATTAGGAAATTTATTACACAGTATCTAAGAATGAATGAAGTTTTAAAAATCTAAATGTCTTAA--------GACTGGCCTTAAGATTATATATTGTATACATTTTCAGTTACTTTAAATTATTTTATTGTAAAAGTCAACCTAGAACTATACACAAATGCAAACATGCCTAAAATATATGCAAATATGTGACATTCTCTTATAAATTTTCCTTTATGTTCTTATTCTTAGTGAGTT----GGTTGTGTTAGTTTTCTCTGATGTGACACACTAGTATTCATGGTATGACAAAAATATATCATTACACATGTGCACACACACAGAGATCTTGTGTCAAAGTGTGGTTTTGATCCTA-----TAAAAATAGAAGCATCATTATGGACATAGGGATAAGTATTCAACTTCTTTTTAGAAGTTCAGTTGATTTTGCACTTATCCTACAAAAGTATGATAGCTTGAATTCCTAGCTAGGGTCCTAATGAGAGAATTATCTTTTGTTTTAAAAGTTACATCTATTGTTATGAGATTATATGCTTTCAACATTTTTAGTTCTTAATGTCTTTTACTTAGTGTTATAAAAAT------------------TGGAGTAGATATTAGGCTCTAATGGTATTTAGAACCATTTCCAAATACTACT-TTTTTTTCCTCACATATGAATGTCATCACACATTTGCCAGCACATATAAAATAAA-ACATGTTGCATTGtatattttatatttatattaaGTCTCAAATATTTCCTTGTTACTAGCAAATATTAAAATGACAATGAGAATTACTTTTTTAAAAA--TCTAGTATTACATTGGCTGACTTTATGAGTAAATTGTTCATTTATAGGCCATTCTAGGGAAATTTTGTGATGCTCACTTATACCTTAAAATAATCCGGGTGAAAAACACATGCTAAAATACATCTTCAATGTGTTCTCATTAATTCCCCTGGAATATAGAAAAATCTGGAAAAGTCTACGAAACTAAAGCTTTCACTCGTTTTAGGTAGCACTTAAGATGCCACAGTAGTTCCACAGCAGTCTGTCTCAGCTTGTGGTTTTCCAAAATTAGGACAAATGAGTGATTTGAAGGAAAAATAATTGATGTCAACAAGACAAAGAAATTGACCTGCTATTTCTGCTGTACAAGGAAAATCCAACCTGTTAGTAGGAGAGAAGCAAAGTGAACCAAAAAGAAGAGGAGGAAAGACACCATCAtttttttcattttcattttcattttcattttcattttcaCGGCCCTCTTATGGGCCTTCATTCTGAGATTCCTTGGGCCCATGGTGTTGAGCTGCAAACTCCTGATACGTTTCATCAAGGACAGAATTAAAAGGAGCGGTGAGATCAGGGACAGAAGAAAGGAAATTAAGTAGATCAAACTGGCAAGAATCCAGACATTACAATATAGAATTTTCCTTACATCTAAAGACCAACTTGAGTTTCTTTCATAAGTTGTGTAGCTGTTAATCCACAAGTCACTAAGTCCACCTGTTAATGCAAGGTTGAAAACCAGTAGGAACAAAGACCCCAGTGGGAGTACAAGTAGCACTCTGCTAATTCTCCATCTCAGCCAGATGAAGCAGGGGTGGCAAAAATTGACTATTTTAAAGAAGTAGAAAACACTAAGACAGGCAGCAAGCCAGGTAACTAAGTGATTGGTCAGTGCCCCCAAAATACCAATAAATTTTACTAGTTTGTTGAAGGCATATAGATGTGGCCATAATGCTATTAAAAATGAATCAAGTAGTATTATCCAAAGTTGACTGATTCTGGAGATAGCAAGGCTGGTGAGGATGCAGTCGGCTGATAAGATCATTTGACTCCTCACCAGTTAATGCAGTTAACTAGTACAATGAACCCATTCCCTAACATTCAGATTATGAATTCTCCCATCATTACTATCAGAAAGGTATTTCCAATTCCAGGTGGCATTTCTGTAGAAGCAAATCCAGAAAGCTAATACTATGTTTCACTGATACTTTTGCTGTCAAAATGTTGCAGAGTAATATCCAACTTGATGATTTTCAGATTTATATTTAAAATGTTTACAGTAACTCAGAATGATCTTCTGTTTGATGCCATCTCACTTATCTTTACAAAATATCTTTCTGGTTTTTTTAATATTCATCTCACTAGTAGGCCTGAAATATGTGCAAGAAGATCCAGTCTCACATATCttaattaaaaaaaaaaaactttaacattatttttaatCAGCTACTGACTTACAAGTTAAACAGTAAATATAGTAAATGGGCCAACTTATCATTGGTACTGTCAGCAGTTTCCAATTTGTGAGGACATCTAGAAGGGCGAAGTCAGGTATGCAAATACCCAACAGATTTCTTTACACTGATTTGTAATTTCCTCCTCAACTGAAAGTCAATACCATTTGGATTTGaatattttaattttaaaagaattatctaaaaataaCCTCTATAATATGTGTATTATTCATTTGTTTCAT----TAAACTCCATCATATTTCCGATTCTACTTTAGATGAATTAAGTGTAATAAAAAGAAGCATCAAAAAGCTCACAGAGTAGTGAAAAAAATCAACATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAATCAAAGTTTGATCAAAATGTAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCTTTTAGGATTTCTTAAAGAAATAGACAAAAAGGGAGATGATTTTACACAATTATGTAAAAGCGTATGCAAACAAACCAAAATTATTCCTCTATCTGAGCTGTTTTACTGAACTTTTGAGCTTGGTTTCCAATGCCTTCCTGGCTATTTGATTCCGAATAAGCTCTTATCAACTGAATTG--AAAAACATAGTAAAAAA-GATGG-AAAATAGCAAAAAAA-ATAAGACGGAGAGTAGGAGGGAAATT---CTTTTCATTAATTCTTCCTTTGGTAAAATCCTTTGTCTCATAAAAATATATCCACAGTAAAATATATTACATAATTTATTTGTATTATTTTG-AACTCTAATAcaatggttttcaacctttactgcacattgcagttaatgtgggagctgtaaaaaaac--attgatgcctgtgggccaccccccagggatttttattacttaattggtctggAATACATTGCTGGCACTCACTGAGAGGCTCTTGATGTATGTCTTACAGTGACTCCCAAACCCAGGCAAAAATCTTTCTACGCAAAAGCTGCAAATCTATGATTCTCTGAGGACAGGACAGGATTTTGCCTGCCTTGTTCTCTGACAATGTGTTTCT-ATTCAGCCAGTATTGATGCTGACTGGCAAATTGGCCAGCAACTCTCTTAACAACCACATAagtgacttttttgttgttgttgattggtatatttccaattcacagaacataaagggcctggataatagtaggtcttccataactatttgttaaatgaatTAGTGCTAACTTAGTTGGCAGTCCCACTAGCAGCACACAAAAGGAGAAAATGAGTAAGGCTTGACTGTGAAACAAGTATCAGAGCAAGAAAAGAAAGTACCTCCTTAAAATTAGAGAAAATGTTACATTCATATATGAACTTATGAATCATTTCTATTCTAATCCTGAAAAACCCAGCACTGTTCTGTAATCTTTCTAGTTCAATCAAGAAATCATACAGAATCAAAAGGAACATGCTGGTCTGCCACCCAAGATGGGGGAGGCTTGGTACTTTTCTTCATGAAAAGGAACTACTTCTAGCCCAGGGAGTTGAAGATGGCTAGAGAACTAGATTTTGTGACACAAGAAGCAAGATAGCCCTATCTGAAAACGTCACTGATGTTTTCAGAAATGCTTTGTAAGTCATATAAAGGCTAATTGAGAAGAAGACTCCATTGACAGGCATGGCTTAACTGTGACAAACACAGAAAACAAGTCAGTCAGGAGATAGCAATTAAAGAACATTTGAGTTTGTAGTTACACTGAAGAAACTAAAAATAAAAGATGCAATAACAAGTATAAAAACCACAAGTCCCATATACTGTGAGTTGTATTCAAAGTCCAAGTTAATAATCACAATTTTTTCAATCTACATAATTAGAGTAATCTATGTCCTACTCTAGACAAAATACCATCTGGTGTCTAGAATGAAAGAAAAACAACTGTGCGAATATACAAACACCCCCTaaaataactattgggtaataggcttagtacctgggtgatgaaataatctgtacaacaaaccctcatgacatgggtttacctgtataacaaacctgcacatgcgcccctgaaactaaaatgaaagtttttttt------aaaaaagaaaaCACCCCTTAAAGCATGACCCTGGCTCAAAGAAGATGCTGTCTAATCAAGATTTTGCTAGAAAAAGCCACCTACTAAGACATAGCAGATAAACCACCTGAGAGAGTGAGGAAACTGGTGCTCCTCTTTCTTGGAAATCAGTATAGGTGTGGGTTTCTACCTGATGTATACATACAGTACGATTTAAGAAAACATGCCTTGTTATACTTGATTTGTCTCTTATTTGCCTTCAGAACTAGAGCTATGGGTTGGAGATAAGCCAATTTCAGCAGTTGAAACAGGTTATTTGTTCCTCTCCTATAAATTACCCGACTGTGTGCATTGAAATAACCACAATGATTACACCCAGAATGTTGAAATGAGCATTTATTTGACAAGTGAGGTTAGTGGGAGTCTATAAAAATGAGTGATAATCTCCCTCTTTCCCCAACAGCTGCGTCCCAGGGTAGGTCATAATCACATCAGTCTTTC--------TTCTCCATGGTGCATGTGGCAGTGCATGTGTTGGGCATGGCTCTTGGATTGTGGCTTGGTGACTGCTAAATTCCCACAAAGGCCTTTTTTGGGAGAAAGTGGAGGTGCAGAGCTTGCTCTCATTTGCCATTCAAATTTGCAGATTACTggccaggcatgatggctca----tgtaatcccaacactttggggggccgaggcaggtggatcacctgaggtcaggagctcgagaccagcctggctaacatggtaaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggtgtacaccg---gtaatcccagctattcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaaccagggaagcagaggttgc a score=81811 s hg17.chr12_random 160234 1112 + 466818 catgagccgagatcgccccactgtactccagcctggacgacagagcaagactctgtgtcaaaaaaaaaaca-----------------aaaaaacaaaaaCGGATTACAATACATCAATTGCAATAACCAGAATATGTCCCGGGCTGCTCTTACTACTT----TTTTGTTTTGCTTCTATTGTGAAGAATGGGGTCCTGTTCCTTGTAGTCCCATCTCCCTGGGGTTGCTGCCTACTAAGTGTTAGACATGTATTACTCTTAATTAGACATGTATTAATTTACCACTAAGGTTGCTTATGAGTTGGATCAACTGCTTATCAAAGAAAAGTTTACTGACACAAAAATATAAATAGTATT--------TTGTGTTTTAAAGAATACAAGGTTAAGTCATTTATATAAAAGACTATCTTTAAAATAAACTCAGTATCTAAGTCTAAAATATATTCAGCTTGATTTGCACATTACCTTTTATCAAGGCAAGAAAATTATAATTATAATCTTTGACAAAATACTAAATTAGTGATCAAAATAATATATGTACATTTTATTTTGTAAAATGCAAATTACTAAAAAA--AGATGTTGTATTATCATTAAAACAATCATCAACATCATTGTTATTGATACATGATACCATATAGCCCAGATGTACTTACAATTTCATTTTATGCATATGGGGAGGGGGAAGTACTAATAATTCTAACATCATTTCCGGCTCCAGGGCACAGCTGTGGAGTCATGCCCTCAACTATAGCTTCATCAAGATTAATTTACAAGCATGTATTTATCAGTATTTAATAGCACATTTTTGTTTCTGTAATCTAGCACAATATAAAGAACATATCAAAAGTAAATTCTAAAAGGAATTCTTTGTTATTAAAAAG--TTTCACTATACAGCTTCTGTACAGTGTTTTAATCTATGCCATCATATTC-AAAATTTTTAGTAAATTTTCCCACCCTTAGCCTTATTTACAATCTGTAGTTTGTTACCTTATCTAATCTTAGATTATCACAGTCAAAGCAGCACTATGTATACATATGCTTGTCTAAAATTTACAATAAGCCTGCAACATTCTATAAACAACATCACTTTGCTTTCTGTGCCTTGCTGGTTAACATTGTTTCTATTTTTTCCTCT s rheMac1.SCAFFOLD125516 18110 1132 + 48937 CAtgagccaagatcaccccactgtactgcagcctggatgacagagcaagactccatctcaaaacacacacacacacacacacacacacacacaACAAATACAGATTACAATATATCAATTGCAATAACCAGAATATGTCCTGGGCTGCTTTTACTAGTTTTACTTTCATTTTGCTTCTATTGTGAAGAATAGGTCCCTGTTCCTTGTAGTCCCATCTCCCTGGGGTTGCTGCCTACTAAGTGTTAAACATGTGTTACTCTTAGTTAGACATGTATTAATTTACCAATAAGGTTGCCCATGAATTGGATCAATTGCTTACCAAAGAAAAGTTTACTGACACAAAAATATAAAAAATACTGTTTTGGGTTATCTTGTAAATAGTACAAAGTTAAGTCatttatattaaaaa--atatttaaaataaattCAATATCTAAGTCTAAAATATATGCAACTTGATTTGCACATTACCTTTTATCAAGGCAAGAAAATTATGATTATAATCTTTGATAAAATACTAAATTAGTGATTAAAATAATATATGTACATTTTATTTTGTAAAAGGTAAATTACTAAGAAAATAGATTCTGTATTATTATTAAAACTATCAT---CATCACTGTTATTTATACATGATACCACATAGCTCAGATGTACTTACAATTTCAGTTGATGCATATGGGGAGGGGGAAGTATTAATAATTTTAACATCATTTCTGGCTCCAGGGCACAGCTGTGCAGTGGTGCCCTCACCTATAGCTTCATCAAGATTAATTTACAAGCATCCATTTATCAGTATTTAATAGCATATTTTTGTTTCTGTACTCTAGCACAATATAAAGAATATATCGAAAGTAAATTCTAAAAGGTATCCTTCGTTGGTAAAAAAATTTTCATTATACAGCTTCTGTACAATGTTTTAATCTATGCCATCATATTCAAAAATTTTTAGTAAAATTTCCCACCCCTAACCTTATATACAACCTATAG---------TTACCTTATCTTAGATTATCATAGTCAAGGCAGGACTATGTATACATATGCTTGTCTAAAATTTACAATAAACCTGCAACATTCTGTAAACAACGTCACTTTGCTTTCTGTGCCTTCCTGGCTAACATTGTTACTATTTTTTCCTCT a score=221459 s hg17.chr12_random 161346 2765 + 466818 AAGAAATACAGTGATCAGATTGCAACAAAGTGCATGTCACATAAACAAACACAA-----ACACAAACATCCTCAGAATGTAATTATGATCTTTTTGTAGTAGCAATATGAGTATAATTGTGAATTAAGACATAAACTTCTATAATTTTAGTTCTATTACATAACATGGTAGAAACATTGGTTTCTGCCTCTCTGAAAATGCATATTGCATGTCCTAGAATTTAGCAAAATTAGCATGTGCCTAGAAACATCAAAATGTTTATTATTTGGGGTTTTAAATTGACATCAGCATTAAATCATGTGTTTCCAGTTTCCATTTAAAGATAATTTATTTTATTTCACACTACAAATCTTCTCCTTTTCTCACATAATCGTCGTATTTCCTTGTTATCAACAAGACTTCTAATAACAAAAAAAAACCACTTTTTTTCATTTAAAAAAAATGCTTGGggctgggcacagtgtctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaacagcctgaccaatatggtgaaaccccatctctattaaaaatacaaaaattagccatgtgtggtggtgtgtgcctgtagtcccagctactcgggagactgagataggagagttgtttgaacccaggaggtggaggtggcagtgagccaagatcacaccactgcactccagcctgggcgacagagtgagatgccatt-----------------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTTTAGCTTTGAAGCTATGAGGCTATATTTTTCCTGCTGTGACTTTAGTTTTTAATTAGATTTTCTATCCACATTGTATATATCTTTTACCCATTCAAGTTTGTAATCTATCTTGCTTT-TAAAGA--CACACACCTTTTTCTCCACAAGTTGCAATTACCTATCGTTTGCatataaaattaaataatttagattttttgaaataatatGTGAGGTTAAAATATTGCTTGCCAATGCTCCAAACAAAAATGATTACTTTTAAAATGGTATCGACCGGCAATGTGTGAATTACCATCAAAAGCAACCTGGTAGGATTTCATTTATGTTCCAAAATACTTAGAGAAACCCAGTAGAAAAAAAAAAAAAAAA-------------------ACAGTGGACGTGATCCCCAAATGCACCTCGTTGAGTTATTCTCTTAGAAAAGCTTCTGGAAAGTCTGTCTACAAAGGTAAAGCATTTGGTGTTTTTGTATAGTTCCTAAGATGCCACAGTAGCCTCACAGCTGTCTGTCGCAGCTTGCTGTTTCCCAGAATGAGAATAAATGAGTGGCACGAGGGAAAGGCATTTAAGGCTAACATGACAAACTTTATGTACTTGTTGTTCCACAACATAAAAAATATCCCATTGGCCACTTGTAAGGAAAAAAAATGAACTATGAAGAGGAAAAGGAAAGACATCACCATTTTCATGGCCCTCCTATGGGCCTCTGTGCTGGAGTCTCTAGAGCCCAAGGAACTGAGCTTCAAATTTCTAGTATGTCTCACCAAGGACAGAAATAAAAAAAGCAAGGAGGTCAGGAACAGAGAAAAGGGGATAAAACTGGTTAAGCTGAGAAGAGTTTTTAAAATAGAGAGTTTATCATAGAGAGTTTTACTTTCATCTAAATATAAAGTCAGATTACTTTTATCTATTATATTGAGTGAGATATCAATAAATATTTCTAGCACTAAACTGTCAAAAATCAGTAAGAACAAAGACAATATAAGAAGCATAACAATCATTCCGTTCATCCTCCACCTCAGCCAGAGGAAAAGGGAGTGGGGGAAGTGGGCTATCTTAAAGAAATAGAAAATGCTTAGGCAGGTGGCAAGCCAGGTTGTCAAGTGATTAGTCATGTGCCAAAGCATAATAACAGTTTTTCCTAGTCTATATGTGGTATATAAATGTGAAGCAAGTCCCACTAGAAATGAATCAAACAGTATCACCAACAGTTGTCCAATTGTGGAGATAGCCAAGCAGGTGAGGATGAAGTCAGCTGAGAAGACCTTTTGGTTCTTGATCCCTTCAGAGCAGTTTACCAGTCCAATGAACACATTCCCCAGCATGCTGATGATGAATTCTGCTATTGCCAGAATCAGAAAGATTTTGTCCAATTCGGTGGCCATCTCCAGAGAC--AAAAAATCCAAGTTTTTAATACTTTGTATCATTAATAAATTTACAATCAAACCATTGCAGAAGAGCATTCATATCTGATACTTATCTTCATTGCTTTTATTGCACTTCCAGTCTTGATCAGAACCTTCTGCTGTTGGATAGAGTCTCATATACTTAAGGAAGTCTTTGCCTATTTTTACTATAATTCTGATCTTAATCCCAAAAGATCTACTAAGGGATGCAGTCTCACATACCTTCACGGGAGTGTTTTCATTTCTTTGAAAGAGCTGCTGAATTCTAAACCAAACAGTTTCTGTGTCCATTTATCATTGTCATGGGCTGAAACTTTCCACTTGTGGTAATGATTAAAAGGATAAAGTCAAGTATATTAATATGCAAATATAGACTGGATTCC-CCCCCTTTCTCTGATTTGTACATTTCTGCTCACCTGAAAAACTACACCACTTGGATCCAAATATCTTTATTGTTTTTCAGAGGAAGCTGCAGATATAATCTAATAATTTTGTTATTATTCAACGAATATATTTTATAAGTGCCTGCTGTGTTTCTGATCTTATGCAAATGCAATATATTTACCACAAAAAAAAGCATTAAGAAGTCTATAAAATAGTGAAAACAGGAAAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 19564 2795 + 48937 aaGAAATCCAGTGATCAGATTGCAACAAAATGCATGTCACATAAACGAACACAACACAAACACAATCATCCTCTAAATGTATTTATGATCTTTTTATAGTAGCAATGTGAGTATAATTGTGAATTAAGAGATAAAACTCTATAATTTTAGTTCTGTTACATAACATGGTAGAAAC--TGATTTCTGCCTCTCTGAAAATGCTTATTGCATGTCTTAGAATTTAGCAACATTAGCAAGTGCCTAGGAACATCAAAATGTTTATTATTTGGGGCTTTAAATGGACGTCAGCATTAAATCATGTGTTTCCAGTTTCCATTTAAAGATAATTTATTTT----CATACTACAAATC--ATCCTTTTCTCATATAATCATCGTATTTCCTTGTCATCAATAAGACTTCTAATAACAAAAATATACCACTTTTTT-CATTTTAAAAAAATGCTTGGggccaggcacagtggcttatgtctgtaatcccagcacttagggaggctgagagaggtggatcacctgaggtcaggagttcgagacgagcctgaccaatatggtgaaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagctgtgtgtggtgatgtgtgcctgtagtcccag--actcgggaggctgagacagaa---ttgcttgaacccgggaggtggaggtggcagtgagacaagatcgcaccactgcactccagcctgggcgacagagcaagattccgtctcaaaacaaacaaaaaaacaaaaaaacaaaaaACAAAAAAAAAAAGCTTGGCTTTGAAGCTATGAGTCTGTATTTTTCCTACTGTGACTTTAGTTTTTAAATAGATTTTCTACCCACATTGTATAT--CTTTTACCCATTCAAGTTTATAATCTATCTTGCTTTCTAAAGAATCACACACTTTTTTCTCCACAAGTTGCAATTACCTCTCATTTGCatataaaattaaataatttagattttttgaaataatatGTGAGGCTAAAATATTGCTTGCCAATGCTCCAAACAAAAATGATTACTTTTAAAATGGTATGGACTAGCAATGTGTGAATTACCATCAAAAGCAGCCTGGTGGGATTTCATTTATGTTCCAAAATTCTTAGAGAAACCCAGTAGGAaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaAACAAAAACACAGTGGAAGTCATCCCCAAATGCTCCTCATTGAGTTATTCTCTTAGAAAAGCTTCTGGAAAGTCTGTCTACAAAGGTAAAGGGTTTGGTCTTTTTGTATAGTTCCTAAGATGCCACAGTAGCCTCACAGCTGTCTGTCGCAGCTTGCTGTTTCCCAGAATGAGAATAAATGAGTGGCACGAGGGAAAGGCATGTAAGGCTAACGTGACAAACTGTGTGTACTTGTTGTTCCCCAATATGCAAAATGTCCAATTTGCCACTTGTAAGGAAAAAAAGTGAACTATGAAGAGGAAAAGTAAAGACATCACCATTTTCATGGCCCTCCTGTGGGCCTCTGTGCTGGAGTCTCTAGAGCCCAAGGAACTAAGCTTCAAATTTCTAGTATGTCTCACCAAGGAGAGAAATAAAAAAAGCAATGAGGTCAGGCACAGAGAAAAGGGGATAAAACTGTTCAAGCTAAGAAGAATTTTTAACAGAGAGAGTTTATCATAGGGAGTTTTACTTTCATCTAAGTATAAAGTCAGATTACTTTTATCTATTATATTCAGTGAGATATCAATAAACATTTCTAGCACTAAACAGTCAAAAATCAGTAAGAACAAAGACAATGTAAGGAGTATAGCAATCACTCTGTTCATCCTCCACCTCAGCCAGAGGAAAAGGGAGTGGGGGAAGTGGGCTATCTTAAAGAAATAGAAAATGCTCAGGCAGGTGGCAAGCCAGGTGGTCAAGTGATTAGTCATGTGCCAAAGCATAGTAACAGGTCTTCGTACTCTATCTGTGGCATATAAATGTGGAGCAAGTCCCACTACACATGAATCAAACAGTATCACCAACAGGTGACCAATTGTGGAGATAGCCAAGCAGGTGAGGATGAAGTCAACTGAGAAGACCTTTTGGTTCTTGATCCCTTCAGAGCAGTTTACCAGTCCAATGAACACATTCCCCAGCATGCCGATGATGAATTCCACTGTTGCCAGAGTCAGAAAGATTTTGTCCATTTCGGTGGCCATTTCCAGAGACCAAAAAAATCCAAGTTTTTAATACTTTGCGTCATTAATAAATTTACAATCAAACTATTGCAGAAGAGCATTCATTTCTGATACTTATCTTCATTGCTTTTATTGCACTTCCAGTCTTGATCAGAACCTTCTGCTGTTGGATACAGTCTCATATACTTAAGGAAGTCTTTGCCTGTTTTTACTATAATTCTGATCTTAATCCCAAAAGATCTACCAAGGAATGCAGTCTCACATACCTTCACGAAAGTGTTTTCATTTCTTTGAAAGAGTTACTGAATTCTAAACCCAACAGTTTCTGTGTCCATTTATCACTGGCATGGGCTGAAACATTCCACTTGTGGTAATGACTGAAAGGATAAAGTCAAGTATATTAACATGCAAATATAGGCTAGATCCCGCCCACCTTCTCTGATTTGTACATTTCTGCTCACCTGAAATACTACACCACTTGGATCCAAATATCTTTATTGTTTTTCAGAGGAAGCTGTAGATATAATCTAATAATGTTGTTATTATGCAAGGAATATATTTTATAAGTGACTGCTTTGCTTCTGACCTTATGCAAATGCAACATATTTACCAC-AAAAAAAGCATTAAGAAGTCTATAAAATAGTGAAAACAGAAAAA a score=1416 s hg17.chr12_random 164111 133 + 466818 AAACAATGAG-------------ACAGAATCAA-----GAATAAAATGTGCTATTAAAGCAGAAAAGGGAACTACAAACACTACTGTTGGGGAGAAA-------------AGGGGGGTGACATTTGCTTTGGATCTGGAAAATACTTAGAATTTCATGAGGAAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 15394 163 + 48937 ATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAATCAAAGTTTGATCAAAATGTAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCT-TTTAGGATTTCTTAAAGAAA a score=78288 s hg17.chr12_random 164282 949 + 466818 AGATACCGAAACCCAAACTACTTTTTTGAAATTAAAGTCCTACTGATATTTCAGTCTAAATGTTCCTCAGGTATCTTATAGTAACTTGTTCAAAATTAAACATGGTTTTGCTCTTTACCTTGGTTTTATATATGTTCTATTTTTTTTTT--------GGCAAGAGATATATTGCTACCAATTTAGCCTTAATAGACAGGTAGAAAATTGTTTTAGATGAAATAAGGAAAGAGGAAACAAAAGTATTTGTTCTACATTCTAGGAACAATTATTTTGACAAAAACCCCCAATGCACCATAATTGAACTCAGAGTTACAGATTATGTGTCTTGGTTTATGGTCAGCAAACAGATATTCTATTACTAGAAATTAGTGTTCAAGTGTTGCCAGACAAAAATTAACCCAAAAAATGAATGAAATCATTTTTAAAACTTGGACCTTTTTAATGTTGCTGTCATACTCCTCAATTAAATTCTATTAATTAACATTTAAAAGTGTATATTTTAAGAATGATGTTGTATAAAGAACTACTGGTAAGTTATTTCCTATGAACAAAAATATTTTCATTTAGGACAGATATTTAAAATTATAGTAAGACAGGAGGagaaaaagagtaagcaagaaaggaaggaaagaaagaaaagagggagggaaggaagagaatgagaaagaggaaaggaagagagagacaaagaaagaaaAAGGAGGGAGCTTCTGAGAC----AAAGGCTGAATGAAAATGAAGAAAtgtagcaatatcataggaaggagaatgatggcttcggccaaattagtgtctagagatggaaagaaatatatggctatgagaaacatttaagggaaagaatcaatagtctgtgtgatggatttggaggctagaaaaaggaggaggagtctgcaatgacatttaggctctcctttcactgctggatgcatgtggtactgtgatctgagggaatcac s rheMac1.SCAFFOLD135526 2 954 + 958 AGACCCTAAAACCTAAACTACTTTTTTGAAATTAAAGTCCTACTGATATTTCAGTCTAAATGTTCCTCAGGTATCTTAGAGTAACTTGTTCAAAATTATACATAGTTTTGCTTTTTACCTTGGTCTTATATATGTTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCAGAGATATATTGCTACCAATTTAGCCTTAATAGACAGGTAGAAAATTGTTGTAGATGAAATAAGGAAAGAGTAAACAAAAGTATTTGTTCTACATTCTAGGAACAATTATTTTGACAAAA-CCACCAATGCATCATAATTGAACTCACAGTTACAGATTATGTGTCTTGGTTTATGATCAGCAAACAGATATTCTATTACTAGAAATTAGTAATAGAAT-TTGCCAGACAAA--TTAACCCAAAAAATGAATGAAATCATTTTTAAAACTTAGACCTTTTTAATGTTGCTGTCATACTCTTCAATTAAATTCTATTAATTAACATTTAAAAGTGTATATTTTAAGAATGATGTTGTATAAAGAACTACTGGTAAGTTATTTCCTATGAACGAAAATATTTTCATTTAGGGCAGATATTTAAAATTATAGTaagaaaggaggagaaaaagagtaaacaagaaaggaaggaaagaaagaagagagagagggaagaaagagaatgagaaagaggaaaggaagagagggacaaagaaagaGAAAGGAGGGAGTTTATGAGACAGAGAAAGGCTGAATGAAAATGAAGAAATGTAGCAATATCAT---AAGAAGAatgatggctttggccaaattagtgtctagagatggaaagaaatgtatgactatgagaaatatttaggagaaagaatcaatagtctgtgtgatggatttggaggctagaaaaaggaggaggagtctgtgatgacATTTAGGCTCTCCTTTCACTCCTGAATGCATGTAGTACTGTGACCTGAGGGAATCAC a score=275657 s hg17.chr12_random 165781 3479 + 466818 ttcagaaaaaaatttgatacaattctgcatttattcacaaatattcttagcaaactgggaatcaaatgaaatactctattttctgatgaaaagtatt----aaaaaaaaaacctagagcaaatattatagctatcgatgatgtactgaaatccttctccctgagtttaggaccaagtcagtgataaccatcttactaggtctattTTTTTTAAGTTGTCTATTGATCAAAGTAAGGCAAGAAAAATATATTTTAAGAAATTATAggctggacatgatggctcacccgtgtaatcccagcacactgggaggccaaggcaggaggatcacttgagcccagaagttcaagactagcctgggcaacatagttaaaAATTAGCTGAGCTAATTTTTAATCTGCAAAAATCTGCAAACATCTTTTGCATTTCTTCATACCATCAACAGTTTAAGTCTGAAAATACCTTAGCTTTTATGCCCATATAATTAGCTTATAATTAATACATATTGAATATAATCAAACATTCCAGAGTTTTAAAAAATTTAAACCATTATCACACTCCTTTTCTCATTTTAGGTATTATTCAAGAACATTAAGTTCTCTGACTGTGTCATTGGATATATTCAGTTTTCCTGCTTGGTATCTTAATTATAGACTGTCTTCCAGTCTAAAGCAACTACCTCTAGTATCATATCAGCCATCCCCTCTCTCCACAAAGACCAGCCCTGCTCCTTTTACCTAGTCCAGTCACTCAGTA-TTTTTTCTTTTTCAAAACCTATGGGCTGTACTTTTCCATGTGGGGTGATGGGTAACAAGAGAGTTTCTCCTTCACTATTATGCAAACACAGACCGATATTGTTACTCTTTTTGCATTTTCTTTGCCTAATGAATTTCCATTTGTATCTTTAGCTGTGGAAGATCTAGAGGAAGAATTTACAGATCGTAAATATTAAAATTCAATCTAAAAGTCTCTTCATCCAAGCATGTGAGAAAAATCTTGGTCAGAATCTTGTTCAGAATAGGAGGAAGAGGATGTGTGGCATGCCTTATAGTCTTTCAAtgggcagagtagtggtttgaccacttacaaatttacaaatgtggattgtaccatactgtagcccttattctctgttttgtccacaggtaccaggggaatctatacctgaagcattactggagtcaaggtataaaacatttatgttctcttatctaataagtctaagaactgaactgcaaaggattttagtttgccagaacttgcccttcgtATGTTAATGTAAAGGATGTTGGTACTAATTAGAATGGTTCTTGCCAATGTGAGGGTACTAACCGATATGCTATTTATGTCCACTTGTTCAACTATATCTCTTTTGAAATACCTGAATAATTTTAGAAATGAACCAAGAAATTAGTTGAGAAGAAACCAAATAATATCTAAGGGAGAAATCATATACAACTTCAGGGATtatcttagtttgtttgtgctgctgtaacagactatcacaaactgggtaatttat-aagaaaagaaactgatttctcacagtttgagaggatgggaagttcaatatcaatgtgttggcctctggcagaggccttcttgctgcatcatcccatggcagaacgtcaaagagagggagacagagac--agagtaaactcacacttttaaaagaaaccaactcatgtgat---aaacccactcctgtgataacagcatggatccatccatgagggtaatgccctcacgacctaacaccttttaaaggtcccacctcccaatacctccaggtctccaac-aagtgaactttgtgggacacattcaaatcatagcatttcacccctgggcccccaaaggtatgtccttcacacatgcaaaattcatttcctcccttccagtagcccccacattgtaactcattctagcaccaacttaaaaatccaaactccagagtctcatccaagtcagatatggataagactcaaggcacaattcatcctgaggcaaattctccagccatgagcctgtggaatcaaaacaagttacccacttccgaaattcagtggtgggacagacatatgaaagacatttccattcctgggaaaaataggcaagaaaagaggggcaattggccttaagtaagtccaaaacccagcagggcaaaccatattaaatcctaagggttgagaataatctttgactccatgtcccaccttctagacccactgggtcagggattgggcccccaatttcccaggcagcctcacctccacagctttgcttgtctcagttcactcctgagcagctctcacaggttggagttttgtgcctatagatctcccagactggTTTTGTGAGGCAGCACAGGGCAGTGAATGCTGAGGTCTTTCAGGCACCTCTCTGGAAGCTTTGACCTTAAGGTCCTAACTTGCGTAACTTCTGGTCCTAACTCCatgatctcggaaatatcttccaggtcattctccctttgtcttatgaatagaacttggcttccttctagccagattaatattttcagcaaatgaccacttggccaaacccttcttattctctctcgaacatgcttttttattctttatatggccaggctgagagttctccaaatttttctattagtcttcacttttcattataaattccatctttaaatcatttctctctcctcaacattttactatatgtgcttgaaagaagccatggagcccactgaatgttttgctgctgagatgtctcttccatcagatatcgtagttcacctctcttaaattctgccttccataaagccaaagggcatgaacagaattctgccaagtttttttgccacttcataacaaggatgatccttactccagtttccaataagacatttctcttttccacctgagacctcatcagaatggcgtttactctctatatgtctaccaacattctcatcaggaccataaaagtaatctctaagaagttgcagactttccctacagttatcctcgc---ctgagacctcagtggaatcactcttaatacaaaatttgtggcaatctaggctttttctagcctgctcctcCCATACCAATTTCCtgtcttagcctgctttgtgctgctctaacaaaataccacaaactgggaaaattataaagaaagaaatttattcctcaattctggagtctgggaagtccaatataaaggtgccagcatgtggtaagggatttcttactgtgtcatcttatgggagaagggcaaaaagagagagagagaacgagaatggggcttaacttgtccttgtataaggaatcagctcctgtaataacaaacccactactcaataattgtgttaagccatttatgagggttgtgccttcatgacctaaacacttcttaaagtttccacctccaaaaacctccacactggggatcaagcttctaacacatgaactttgggggacatattcaaaccatagcaGCCATGTATTTT s rheMac1.SCAFFOLD125516 23779 3420 + 48937 TTcagaaaaatatttgatacagttctgcatctgttcacaattattcttagcaaactgggaatcaaatgaaatactctatttcctgatagatagtgttttaaaaaaaaaaaacctagagcaaatattatagctatcaatgatacattgaaacccttctccctgattttaggacccagtcagtgataaccatcttaccaggtct---tattttaaggcttctactgatcaaagtaaggcaagaaaTATACATTTTAAGAAATTATAggctggacatggtggctcacccctgtaatcccagcacactggaaggcaaaggcaggaagatcacttgagcccaggcgtttaagactagcctgggcaacattgttaaaAATTAGCTAAGCTAATTT--------------------AACATCTTTTGCATTTCTTTATACCATCAACAGTTTAAGTCTGAAAATACCTTAACTTTTTTGCCCATATAACTAGCTTATAATTAATACATATTGAACATAATCAAACATTCCAGAGTTTTAACAAAATTAAACCATTATCACACTCTTGTTCTCACTTTGGATGTTACTCAAGAACATTAAGCTCTCTGACTGTGTCATTGGATATATTCAGTTTTCCTGCTTGGTATCTTAATTATAGACTGTCTTCCAGTCTAAAG-AAGTACCTCTAATATTGTATCAGCTGT-CCCTCTCTCCATGAAGACCAGCCCTGCTCCTTTCACCTAGTCCAGTCACTCAATATTTTTTTCTTTTTCAAAAGCTATGGACTCTACTTTTCCATGTAGGGTGATGGGTAACAAGAGAGTTTCTCCTTCGCTATTATGCAAACACAGACCGATATTGTTACTCCTTTTGCATTTTCTTTGCCTAACAAATTTCCATCTGTATCTTTAGCTGTGGAAGATCTAGAGGAAGAATTTACAGATTGTGAATATTAAAATCCAAACTAAAAGTCtcttcatccaagtatgtgagaaaaatattggtcagaatcttgttcagaataggaggaaaagtatctgtggcatgcgttatagtctttcaatgggcagagtagtggtttcaccacttacaaatatacaaatatggattgta------------tcttattctctgttttgtccacaggtaccaggggaatctatacctgaagcactactggagtcaaggtataaaacacctgtgttctcttatctaataagtctaagaattgaactgcaaaggattttagtttgccagaacttgcccttCATATGTTAACGTAAAGGATGTTGGTACTAGTTAGACTGGTTCTTGCCAGTGTGAGGGTAGTAACTGATATGCTATTTATGCCCACTTGTTCAACTGTATCTCTTTTGAAATACCTGAGTGATTTTAGAAATGAACCAAGAAATTAGTT-----GAAACTAAATAATATCTGAGGGAGAAATTATATACAACTTCAGCGATtatcttagtctatttgtgctgctataacagactgtcacaaactgggtactttataaagaagagaaattgatttctcacagtttgggaggatggaaagttcaatatcaaggtgctagcctctggcagaggccttcttgctgcatcatcccatggcagaagggcaaagagagggagacagagacagagagtaaactcacacttttaaaagaaaccaactcacgtgatgacaaacccactcctgtgataacagcatggatccatccatgggggtgatgccttcatgacctaacaccttttaaaggttccacctcccaatacctccaggcctccaacgaggtgaactttgtgggacacattcaaatcatagcatttcacccctgggcccccaaatttatgtccttcacacatgcaaaatacatttcctccattccagtagccccaacactgtaacgcattccagctccaacttaaaagtccaaagtccagagtttcactcaagtcagatatggatgagactcaaggcacaattcatcctgaggcaaattctccagccatgagcctgtggaatcaaaacaagttacctacttctaaaattcaatggtgggacaggcatatgatagacatttccattcctgggaaaaataggcaagaaaagaggggcaattggccttaagtaagtccaaaacccagcagggcaaaccgtattaaatcctaagggttgagaatagtctttgactccatgtcccaccttctagacccactgggtcagggattgggcccccaattccccaggcagcctcacctccacagctttgcttatctcagttcactcctgagcagctctcacaggttggagttttgtgcccgtagctctcccagacAAGTGTTAtgaggcagcacagggcagtgaatgctgaggtctgtcaggcacctctccagaagccttgcccttaaggtcctaacttgc-----------------ctccatgatctgggaaatgtcttccaggtcattctcccattgtcttatgaatagaactcggctttcttctagccagaaaaatcttttcagcaaatgaccacttggccaaatccttcttattctctcccaaacatgcttttaaattctttatatggccaggctgagaattttccaaatttttctattagtcttcactgtatattataaattccatctttaaatcatttctctctcctc-acattttactatatgtgcttgaaagaagccatgcagcccactgaatgctttgctgctgagatgtttcttccatcagatatcctggttcacctctcttaaat--taccttccataaagccatagggcatgaacagaattctgccaagtatttttgccacttcataataaggatggtctttactccagtttccagtaagacatttttcttttccatctaagacctcgtcagaatggtgtttac----------tctacgaacattctcctcagaaccacaaaagtaatctctaagaagtttcagactttccctacagttatcctctccttctgagccctcactgaaatcgctctcaatgcaaaatttatggcaatctaggc-ttttctagcctgctcctcCCTTACTAATTTCTtgtcttagcctgctttgtgctgctgtaacaaaataccacaaaccaggcaaattataaagaaagaaatttatttctcaattctggaggctgggaagtccaatataaaggtgccagcatctggtaagggacttcttactgtgtcatcttatgggagaagggcaaaaagagagagaaagaacgagaatgaggcttaacttgtccttttataaggaatctgctcctgtaataacaaacccactactcaataattgtattaagccatttataaggtttgtgccttcatgacctaaacaattcttaaagtttcgacctccaaaaacctccacactggggatcaagcttctaacacatgaactttgagggacatattc-aaccatagcaGCCATGTATTTT a score=268758 s hg17.chr12_random 169379 3288 + 466818 aagaaaatgcatgacaaccaatgagcatatgaaaagaagctcaatatccctgatcattcaagaaaaattaatcaaaaccacaatgagatatcattgcacaccagtcagaatgactattattaaaaagtcgaaaaataacaaatgccagtgaggttgtggagaaaaagaagtgcttataccctattggtgggaatgtaaagtagttcagccattgtggaagaaaatgtggcagttcctcaaagatctaaagccagaactaccattcgacccagcaatcccattactgggtatatacccagaggaatataaatcattctgttataaagacacatacatgcaaatgttcattgcagtactgttcataatagcaaagacatggaatcaacccaaatgcccatcaatgatagactggtaaggaaaatgtggtacatatacaccatgaaatactatgcagccataaaaaagaataagatcatgtccttttcagggatacggatggagctggaggccattatctttagcaaactaatacagaaactgaaaaccaaatactgcctgttctcacttataagtgggagctaaattatgagaacacgtggactcatagaggggaacaccacacactgaagcctcttggagggtggagggtgggaggatgaagaggatcagaaaaataactattaggtactaggcttaattcctgggtgataaaataatctgtacaacaaacccccacaacacaagcttacttatgaaacaaatctgtgtttgtacccctgaacttaaaacgtgatttctgggtgtgtctgtgatgctgtctgaaagagattagcatttaaattggttgactgagaaaagaagatcatcctcaacaatgtaggtgggTTTCCATTCATCTCTGGCCCTACTGCTGGGTCTGAGGACCATTCTTGGGACAGATGTAATTTAAAGCTGACACAGTGTTAAATGGTTGCATGAGAACCAGGTCTTGGGTGCTTTGGACTCAGATCTTCATCATCTCTTGGGGGAGCATAGTAGAGCTAGATATCAGAGTTCCATTCTACTGATTTTTTTTTTAACATCAATCATGTTATATCTAGTGAACATGGCTCCTTCCACCTCCATCTGCTTCTGTTCATGAGAACCAAACTAACTTTTCTCTGGTCTCTCTCT--AAGGGTATGTGTTAGGGTGTGAGGGCAAGTGATTGTCTCCATTGATTTATTTCTTGTTATTTCATAGGCATAAGGAAGGGGGATCTAATTACTATTGGCTCAAGGAGCCATATTTAAGAAAGCAAACATTGGTTTTCTAAGTGAGTCATACAACTTGCATATAGTTAATTTTAGTTAATTTTTAAAAATTGAGGCAACTCATACCTGTTATTGAAATCCAACTATTTTCAATGAATACCAAGGTACTGTAGAAGAAAATTCCAGTTATATAGGATAATATCTGCTTTACTTTTTCTCATCCTAACAAGTTTTGATAATTATAAATGAAATTT---AAATTCTGTTTTACTGTGAATCAAGAGTATAAAATTCTACTCTGGGCCTAGGTGATAAACAAAAGCTTTATTAGCACTTATTTGGAAAATTCAGATAGGGCAAGGTCTCTTTAAAATAATATTGGCGTCTGttattgagcactcagcatgtgcaaagcacagtgccaggcatttttatacattgtgccatttaactagcacaacaaaacttcaaagtggtggcattacagccatttagaagattaaaaaGTTTTCAGTCCTTTAATTAAACGTAACAGTTTTGTAATGGCTACAATGTGAAAGAATGAAGCTAATAATTGTGTGCTGTTGTCATCTGAAATGCAACTGGACACTGTCACTAATTTTCT--TATATATATCCACTCTTCCGTGATTTATTTGCTGTGTGTATGAATGTAATATGGCCCAGAAAAGAACCATGGCTCTCTGTTTTTATCTAAATTTCCTTTTCTTTTCtttatatattttgagaaatatatttttatttaactatttaaaaatGAATCATCATTTTTCAGAAGCTAAAATACACAGATGGGTACAAACATCTGTGAGATGttttgagatagggtcttgccctgtcaccaaggctggagtgcagtggcacaaccatggctcagtccagcctcagctgcctgggctcaaacaatcctcct-------cctcctgagtacctaggattttaggtacgcaccaccatgcccagctattttcttctatgttttgtagaaacagagtcttgctatgttgcctagactggtctgaaagtcctgatctcaaacaatcctcccgcctcagcctcctaaagtgctgggattacaggcataagccacTATGTGCAGCTAACTAGATGGATTTTTATATCAAATTTGGAGAGTATATTTGGTATGGTTTGCCTTAATATATAGACACATATTTTGCAAATATCCATATAACTGTTCATGGCAGTTGTTCATTTACTTATTAGTTTGTCTGATATTAAAACTTTCAGTCTTCTGTTATT--TTTGTGTGCTTGTATGTGATACTTATATCCCTATCTCTTTTTTTTGTTGTTATAAATAGTTTATCGTTGGATTTGACTTCTTCATACAAATCCAGCTACAGACCACTTATGGGAGAGATGTAATGGAATTAAACCATTTGTAGTACTGATTAGTACATTTGATCTTATGATTGATATTTTATTTTTGTCTTTTCTTGTTTATTTTGCTTTCGATTTATTTTCTTTCCTGAC-TTTGCTGAGCTGACCAAGACTTTATACTGCCTTTTCTTGTCACTCCAGTGGTT--AAAAAAAAAAAAGTTCTTACCCGTATTTCTAATCTACTAGTAGTTATCATTGAAGTGTTTATAAAGTGAATTAAATTCATAATTTTCAGTAAACATAGCAAATTTAACAAGATTGATTATAATACTCCTGCTCCAAGAGGACCTCATTTATTATAAAATTATTTTCTCCCAGAGCTCTTCCTAGCTCTTAGATTTTGTTGAAAACATCTAGAATTTACTTCCAAACTACTGCTGATGGTTCTTTACATTATTAGTCatataattcatttacttatatttttaaataaaattCAAAACCACATAAACAAAAATTGTTTAAACAAGTAAAAGTTTTGCTGGTTTGAGTGCTCACTCACCACTGCTGCTTATTTGCCATGCTGTGCCTTTTATTGGTTGTTTTATCTTGACTTGGCTCAATTtttttcaggaaagatgcaagtgtcgcagtatttctgagccatggccattgtccataaaatgacct s rheMac1.SCAFFOLD125516 27531 3289 + 48937 aagaaaatgcatgacaaccaacaaacatatgaaaagaagctcaacatcactgatcattcaagaaaaagtaatcaaaaccacaatgagatatcatcgcataccagtcagaatgactattattaaaaagtaaaaaaataa---atgccagtgaagttgtgtagaaaaagaagtgcttatacactcttggtgggtgtgtaaagtagttcagccattgtggaagacagtgtggcagttcctcaaaaacctaaagacagagctaccactcgacccagcaatcccattactgggtatatacccagaggaatataaatcattctattataaagacgcatacatgcaagtgttcattgcagtactgttcataatagcaaagacatggaatcaacccaaatgcccatcaatgatagactagtaaggaaaatgtggtacatatacaccaaggaatactatgcagccataaaaaagaataagatcatgtccttttcagggatatggatggagctggaggccattatctttagcaaactgacacaaaaactgaaaaccaaatacttcatgttctcacttataagtggaagctaaattatgagaacacattgactcatagaggggaacaccacatactggggcctcttggagggtggagggtggaaggataaagaggatcagaaaaataactattaggtagtaggcttaattcctgggagataaaataatctgtacaacaaccccctgcagcacaagcttacctatgaaacaaacctgcgtctgtacccctgaacttaaaacatgatttgtgggtgtgtctgtgatgctgtctgaaagagattagcatttaaattgttagactgagaaaagaagatcatcctcaacaatgcaggtgggcttccattcatctctggccccaCTGCTGGCTCTGAGGACCATTCTTGGGATAGATGTAATTTAAAGCTGACATAGTGTTAAATGGTTGCATGAGAACCATGTCTTGGGTGCTTTGGATTCAGATCTTTGTCATCTCTCGGGGGAGCATAGTAGAGCTAGATATCAGAGTTCCCTTCTACTGATTTTTTTTTTAACATCAATCATGTTATACCTAGTGAACATGGCTCCTTCCACCTCCACCTGCTTCTGTTCATGGGAACCAAACT--------TGTGGTCTCTCTCTCTAAGGGTATGTGTTAGGGTGTGGGGGCAAGTGATTGCTTTCATTGATTTATTTCTTCTTATTTCATAGGCATAAGGAAGGGGGATCGAATAACTATTGGCTCAAGGAGCCATATTTAAGAAAGCAAACATTTGTTTTCTAAGTGAATCATACCACTTGCATATAGTTAATTTTAGTTAATTTTTAAAAATTGAGGCAACTCATACGTATTATTGAAATCCAACTATTTTCAATGAATACCAAGGCACTGCAGAAGAAAATTCCAGTTATATAGGATAATATCTGCTTTACTTTTTCTCATCCTAACAAGTGTTGATAATTGTAAATGAGATTTTGAAAATTCTGTTTTACTGTGAATCAAGAGTAT-AAATTCTATTCTGGG-CTAGGTGATAAACAAAAGCTTTATTAGCACTTATTTGGAAAATTCAGATAGGACAAGGTCTCTTTAAaataagattgtcatctgttactgagcactcagcatgtgcaaagcacagtgccaggcatttttatacattatgctatttaactagcataacaaaacttcaaagtggtggcattatagtcatttagaagactaagaaGTTTTCAGTCCTTTAATTAAATGTAAGAGTTTTGTAATGGCTACAATGTGAAAGAATGAAGCTAAAAATTGTGTGCTGTTGTCATCTGAAATACAACTGGACACTGTCACTAATTTTCTTATATATATATCCGCTCTTCCGTGATTTATTTTCTGTGTATATGAATGTAATATGGCCCAGAAAAGAACCATGGCTCTCTGTTTTTATCTAAATTTGCTTTCCTTTTCTTTATATATGTTAATAAATACATTTTTATTTAACTGTTTAAAAATGAATCATCATTTTTCAGAAGCTAAAGTACCCAGATGGGTACAAACATCTGTGAGATGttttgagatagggccttgccctgtcaccaaggatggagtgcagtggcacaatcatggctcactccagcctcgacctcttgggttcaaacaatcctcttacctcagcctcctgagtagctaggattttaggtatacaccaccatgcccagctattttcttctattttttgtagagacggggtctcgctatgttgcccaggctggtctcaaagtcctaatctcaaac-atattcctgcctcaacctcctaaagtgctgggattacaggcataagccactatgcacagctTACTAGATGGATTTTTATATCAAATTTGGAGAGTATATTTCGTATGGtttgccttaatatatagacacatattttgcaactatccatataactgttcattgcagttgtttatttacttattagtttgtctgatattaaaactttcagccttctgttatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgatacttatatccctatctc-tttttttgttgttataaatagtttatcattggatttggctttttcatacaaatccagctacaaatcacttatgggagagatttaatggaattaaaccatttgtagtactgattagtacatttgttcttatgattggtatcttatttttgtctttgcttgtttgttttgcttttgatttattttgtttcctgacttttgctgagttgaccaagactttatactgccttttcttttcactccagtggtttaaaaaaaaaaaaagttctgacccatatttctaatctactagtagttaccattaaagtgtttataaagctaattaaattcacaaTTTTCAGTAAACATAGCAAATTTAACAAGCTCAATTATAATACTCCTGTTCCAAGAAGACCCCATTTATTATAAAATTATTTTCTCCCAGAGCTCTTCCTAGCTCTCGGATTTTGTTGAAAACATCCAGAATTTACTTCCAAAGTATTGCTAATGGTTCTTTACATTATTAGTCatataattcatttacttatatttttaaataaaattCAAAACCACGGAAATAAAACTTGTTTAAACAAGTAAAAGTTTT-CTGGTTTGAGTGCTCACTCACCAATGCTGCTTATTAGCCATGCTGTGCCTTTTATTGATTGTTTTATCTTGACTTGGCTCTATTTTTTTCAGGAAAGATGCAAGTGTAGCGGTATTCCTGAGCCATGG-CATTGTTCAT-AAATGACTT a score=11372 s hg17.chr12_random 172899 901 + 466818 TTTTTAAGTCTGTATATGGAGTTAAGGATTTCCTCTTTTTGCTACTTTGAAGCATTTTTAAATTGACACG---GCAATCTTTAAAGGGCTTTTCTAACCTTGTTGTTTTCCATAATCAGGATAAATGAGTGACTTAATGGATAGGTAGGCAC-----------CTAGTGCCACTATTTTCCTCTTGCAT---AGAAAGTAGCTGATG---GATGAAAGGGAAGTTCCCAAACTGTAGAGAAGGTGGAAGAAGAAAGCAA------TCATAATGTTCATGGCTCTCACATAGGCCTCTGT-CCTGGGTCTCTGGAGCCAGTCGCCTATCACTACAGCTGTACAGTGTTTCCCCTTAGGGAGATAACAAACAAGGAACATTAGATAGGAGAAATGGTAAAGTGAATAG-ACAACTCCAGG----TTAATGAGCATCTGGTCAACAGGAAGGTGGGCTTCATTCACACCGACC-TTCCAATAGGAGTTTCTGTTATATTTTATATCAACATTGATCCAGAAATAAT------------TTGATCTTAATCATTGAAATGATGGATATGTAGAAAAACAAGAAGATCATTAAGAATGTAAAAACAGCCCTGCTAATCCTCCACTTCAGCCAGAGGAAAATTGCATGGTGGAAAAGTGCTACTTTAAGCAAATAAAAAATACTGAGATATGAGGCTAACCAGATACCTAACTGCTTTGAAACTAATCTGAGAATGTCAAATATTGTTATAATTTTAATTAGGTTATGATTAACGGCATCTATATTTGGATA----GTCATTATAAGTACATCTAATAGCAACAC-CCGAGCAAAAGTGTTCTGCATATGGCCAAGCTTGAGAGGATGAAATCCATCAAACAAATCTGG---TTCTCAGCCCAGTCAATTAAGTTTGCCAATTAAATCCATCCAGTCCATGAATAttttttttctttatt s rheMac1.SCAFFOLD110213 9226 913 - 136334 TTTTAAATTCTATTTATACGACTAAG-ATTTCCTAT--------CACGCAGGCAATTTT---TCTACACATCAGCATTCTGACAGATGCCTGCCTCAGTTTGttatttaaaataattaaaataaGTGAGTGACCCGAGGGATAGAGAATTGCTACAATCTCTGCAAACGCCATAGCTAACTTGTAGTTTGTAATAAGATAGCTAAAGTTCACCAAAAGAGAAGT------AATATAGTATAGGAAAAAAAAGAAGATAAGGAAAGTCATAGTTTTAATGGCTCTCACATGAGCTTCTGTGCTTGGGTCTCTACCGCCAGTAGCATGGAGTTTTATTTGCTTGGTATGTCTCCATAAAGATCTTACTAAAAGGAAAAATGACATC-----AATGACACAATAAATGGGACAATTGCAAGCAAGTTAAAGAGAGTCAAGGGTTCAAAATATGGCATTTTACTCACATGGAACATTTCAGTAA-CGTTTCTTTTATGTTTGGCAATTGCATGAAACCTATAATCATGACTCAGTACTGTTGCT----ATTATAAGACTGACCAACAAGGAAATGGCAAAACATCCCAGCAGGATCCAACGAACCACCGTATCAATTTTCCGCTTCAGCCAGAGAAAAAGTGGGTGAGAGGAATTGGCTACCTTGAGAGAATAGAAGACATTAAGGCAGGCAGTAAACCACATATTTAAGTAGTTGGCAAATGTCCAGAAGGTACAAATGACTATCTGTAGTTTACTTTTTGTATAA------------ATGTCCGGGTAAAGTACTATTACAATGCCATTTACAACCATTACACTGATCAAACAAATTCTGGAGATAACTAAATTGGTGAGGATGCAGTCAATTGTGGAGATCTTTTTCTTCTTAATCCAGTCAATCCAGTTGACTAGTCCAATGTATCCATTCCCC-AATATTCCTATTATGAATT a score=73067 s hg17.chr12_random 177281 905 + 466818 ccttcacttcaaggtagtggggtctcttctgtcccaggatgtgtctagaaatgttgtctggaagctagagcctggaatagggacctcaggactctgcccagcaccctattctactgtagctgagctgatattcaagttgcaagacaaagccctctttattcctccctctcctttcctcaaacagagggaaggagtctctcctggagctgtgagctgtgctgccagaggttggaagaggggtgagacaagcactcccttggcaacccttgctggggattcactaggtcatgtgccccgcaagtccactggctctgagcccagcatagcgtcaggacttgcctgggaattgcagtctttgtggcctagactgccttttgagtttctttagtacccaagagctgtttagcccatgttggtgagacttgcaagaactaaacttttgaacactaggatgggcagttctcctctggctaggcctggtctaaatgctccctctgtgggtgctgactgagttctgcctggtgttgctttccactatggcagggcaggac--------aatgccaagtcccacaatccctttgctgtcccttaccgaagcacacagattctctgtccatgccatgcgtccactgctgctggagtgttggggtgatgggggaggagttgcatcagcaattcaagactgtcttttctaccttcttaggtgtccctttcagtgatataaaactaaaatagcgtactgtgatggcttacctgatttttggttcttatgaagatgctttttt-gtgtggatagtcacacaatttggtgttcctgtggggagaatgataggtgaaggcttctattcagccatcctgttccCCTGTTCTGAAAGGTTTTGTAGAGGAGCAATAGGGTATGTGATACTTTG s rheMac1.SCAFFOLD146749 2 900 - 904 ctttcacttcaaggcagtggggtctctt-tgtcccagggtgtgtctagaaatgttgtctgggagctagagcctggaatagaggcctcaggactctgcccagtactctattctactgtggctgagctaatattcaagttgcaagacaaagccctctttattcctccctctcct-----caaacagagtgaaggggtctctcctggagctgtgagctgtgctgccaagggttgcaggatgggtgagacaagcactcgcttgaccactctggctggggattcactaggtcatgtgtcctgcaagtccactggctctgagcccagcatagcatcaggacttgcctgggaattgcagtctttgtggcctagactgcctttcaagtttatttagtatccaagagctgtttagcccatgttactgagacttataggaactaaacttttgaacactaggatggacagttctcctctggctaggcccggtctaaatactccctctgtaggtgctgactgagttctgcctgatgttgctttccactgtggcagggcagaactgagttccaatgccaagtcccacaatccctttgctgtcccttaccaaagcacagagattctctctccaagccatgcggccactgctgctggagtgttggggtgatgggggaggagttgcatccgcaattcaagactgtcttttctacccactttggtgtccctttcagtgatataaaacaaaaatcatgtaatgtgatcgctcacctgatttttggttcttatgaagatgctttttttgtgtggatagtcacacaatctggtgttcctgtggggagaatgataggtgaaggcttctattcagccatccttttc--------tgAAAGGTTTTGTAGAGGAGCAATAGGGTATGTGATACTTTG a score=222275 s hg17.chr12_random 178819 2688 + 466818 aaggaacttgacactggggatgagaaactaaaaaaa-ctaagtactgagAAACAAAGGATCAGAAGGATAAGAACCAtggtagtcaaaggaggagagaatctcaagaagagatgagtgatcagcagggccagatgcattgagatgatcaaataaagtaggacctgatttatcttttatgtgtagcaaaatagagtc-ggggtgactgtattagtctgggttctccagaaaaa-agaaccagtaagaaattagatgtagatggacatgtatttcaagaaattagctcgtgtggttatggaggctgag---tcccaagatctgcagttgacaaactgtggacccagactacagttccagtatgagtctgagtccaaagttaggagaagactagtgccccagctccaagacaggtagagagagtaagttctccctcactcatcctcagtccctcaacagattggatgagccctacccacaatctttactcagcccccctcatccagaaagattcccacagacacactcTGGGTACTCCAGAGGGAAGAGCAAGAAATAAATGAAACTGTGGGTGTTGACTAATGTTCAAAAAATTTGTCAGAGGGCTGAAGGTGGTCACAAGGTCAGAGAGTGTATCAGCCTTTTTTTTAGGATGGGAAGGTACGCATTTTATAAGTTACAGGTTTATGAGTTAATCAATCAAACTTTCCTGAGTTGGGGGGAGACCAGATTGG-AAGAAATAGAGCTCAGGAAAGgaggttggagagaggtagggcagaagtgaggatgaggaagaatcagaggatgaggctacata-tgggaatggaaagttaagatttccaaagtggggctcttttgggtaaagacaaagcccaagatgcagacttgcaaggggtggctgaagaggaatggaggttaaggctactggagtggagaaagtcaaggaagcgaaaggctccggggctgggtaggttgttcctgtggatcttTTCTTCCCGCTGCAAGTTTCTGACCATTCTTCAGGGCCAGTATCAAAGGCCATCTTTGTAATAACTTACTGAGCCTCTCCTCCCCCTCAAGTCACTAGGGCATCCTCTTACCCAAATAAAGTATTAACATATTTACATGGCTAGTTTAACTTCTTTATCAGAATATATTAGTTCTTCATGAGTCTGAGTAATGGAGACTGTCTTATCACCCAGAATACCTCTAGAGAAATAGTTCTTTATCTTTAGTATACAAAAGGACTTCCAGGTAGCTTGCTAAAAGAGCCAATTTGCcagattctgatttggtgggtctgggataaagcttcagaatctgaatattaacaaacatctcagTTATCTCTAATGGGAGTATCAGGGGAGAACGTCATTAAGTCCTCACGATGCTCTATGGTTGAACCAAATTGTATGGAGAAGAATTAATGGAATAGAATCAAGTAGTCCTGAATGAATCAAGTTGCAAATGTTCGCAGTCCCAGCTGCAGTTTGCGAAATAACCGGCAGGTGGCGAACGACCCACACAACTCGCAGAAATTACAGCTTCTCGGGGTCCCAATTCCTAGACCCAAAACTGCCCAGGAGTAGAGGAGAATCCTATTTCCCAAGCAATGCTGTCGGCGACAATGGTGAGTTTCATCCGTTTGCATGTGCATCCTGAGGTGCCAATGGCCGATCTCTTGCCCTAGTCCCCAGGGCTAAAGTCATGCTGACCCAATGACATTGCCTTCTGGCTACCAAGAGCCATAATCCTGGCACCAGCAAGGACTGGTCTCACTGATGACATCATTTGCCTAATGAAGGTTCTTATGGCAGGAGGGCAGTGGGAGAAGAACAGCAAACCAAGTTCGTCTATTCAAAGAGAGGAATGGTTGCCACTAGAGGATCATGTGGTCCACGCCTGTATTCTCTATTTAgtcagaatcagaggggaggcatcttactcaaccctctcattttatagagcctgagagacgatgagcaacttgccagaggtcacagaggtagaaagtttcaggattttctgggatctgtctctttaagtgacttgccttttcattgcaccTAACAGTAACGTGT--CAAAGGGTGTGTGTATGTTGAAATCATTAGTGTCTGCTCATGAATTGTTATATAGGAGAAGCTTAGGGGTGACCATCTGGTTGGGGAAGAGGGGCTGGATGACATTAGGATGTGTTTGCATAACAAGTCCACCACTTTTACCTAGATTGTGTATTTATTTGGGG------TGGGAGATGCAGGAAGGTGGGAGTCCAAAGAGAAGGGACCATGGGGAAGAAGATTCTCCATGGTTGCCCCCACCGCATGTTTTAATGGACTTTCTTATACATCTGCTTTAATGTCTACTAAGTCACAAATGTATTGAAGGCACTCATTGTGTCTTATTCCCCTCTGATTAGGTTTCATAGTTATTTGATGAATCAATGAGCATGTCAGCCTTGATCATTTTTAGATCTGAACAGTATTTTCTAACATCTTAGATGATTAGCATATACCTCCTGTTATCTATTTCTGTCTGTTTGTACTTATTTaacacatatccagtgtttactatgtgcactgttgtcagcattttaaaaatatcaacttacttaatcttGTCTTTGTTGCTGTTTCCTAAAGAGTCCATGAGAGTGAATATCTACTATTAGAAATCCTTCTCTTCCTCTCTCTTCCT s rheMac1.SCAFFOLD80653 2 2687 - 71846 AAGAAACTTGACACTGGGGATGAgaaactaaaaaaaactaagtactgagaaacaaaggatcagaaggatgagaaccatggtagtcaaaggaggagagaatctcaagaagagatgagtgatcaacagggccagatgcattgagatgatcaagtaaagtaggacctgatgtatccattatatgtagcagaatagagtcaggggtgaGtgtattagtctgggttctccagagaaacagaaccagtaagagattagatgtagatggacatatatttcaagaaattagctcaggtggttatggaggctgaggagtcccaagatctgcagttgacaaactgtggacccagactacagttccagtatgagtctgagtccaaagttaggagaagactgctgccccacctctaagacagtcagagagagtaagttctccttcactcatcctcagtccctcaacagattggatcaggcctacccacaatctttactcagcccacctcatccagaaagactcccacagacacactcTGGGCACTCCAGAGGGAAGAGCGGGAGATAAATGAAACTGTGGGTGTCGACTAATGTTCAAAAAATTTGGCAGAGAGCTAAAGGTGGTCACAAGGTCAAAGAGTGTATCAGC-TTTCTTTTAGGATGGGAAGGTAAGCATTTTATAAGTTATAGGTTTATGAGTTAATCAATCAAGCTTGCCTGAGTTGGGGGT-GACCAGATTGGGAAGAAATAGAGCTCAGGAAAGGAGGTTGGAGAGAGGCAGGGCAGAAGTGAGGATAAGGAAGAATCAGAGGATGAAGCTACACAGTCGGAATGGAAAGTTAAGATTTCCAAAGTGGGGCTCTTCTGAATAAAGGCAAAGCCCAAGATGCAGCCTTGAAAGGGGTGACTGAAGAGGAATGGAGGTTAAGGCTACTGGAGTGGAGAAAGCCAAGGAAGCGAAAGGCTCCGGGGCTGGGTACGTTGTTCCTGTGGCTCTTTTCTTCCCCCTGCAAGTTTCTGACCATTCTTCAGGGCCTGTATCAGAGGCCATCTTTGTAATAACTTACTGAGCCTCTCCTCCCATTCAAGTCACTAGGGCATCCTCTTACCCAAATAAAGTATTAATATATTTACATGACTAGTTTAACTTCTTTATCAGAAGATATTAGTTCTTCATGAGTCTGAGTAATGGAGACTGTCTTATCACCCCGAATACCTCTAGAGAaatagttctttatctttagtatacaaaaggactaccaagtagcttgttaaaagagccgatttgccagattctgatttggtggatctgggataaagcttcagaatctgaatattaacaaacatctcagatatctctaatgGGAGTATCAGGGGAGAACGTCATTTAGTCCGCACAATGCTCTATGGTTGCACCAAATTGTATGGAGAAGAATTAACAGAATAGAATCCAGTAGTCCTGAATGAATCAAGTTGCAAATGTTCACAGTCCCAGCTGCAGTTTGAGAAATAACCGGCAGGTGGCGAACGACCCACACAACTGGCAGAAATTACAGCTTCTCGGGATCCCAATTTCCAGACCCAAAACTGCCCAGGAGTAGAGGAGAAACCTATTTTCCAAGCAATGCTGTCGGCGACAATGGTGAGTTTCATCTGTTTGCATGTGCATCCTGATGTGTCGATGGCCGATCTCTTGCCCTGGTCCCTAGGGCTAAAGTCATGCTGACCCCATGACATTGCCTTCTGGCTACAAAAAGCCATAATCCTGGCACCAGCAAGGACTGGTCTCACTGATGACATCATTTGCCCCCTGAAGGTTCTTGTGGTGGAAGGGCAGTGGGAGAAGAACAGCAAAACAAGTTTGTCTGTTCAAAGA-----ATGGTTGCCACTAGAGGATTATGTGGTCCACACCTGTATTCTCTATTTAGTCAGAA------GGGAGGcatcttactcaaccccctcattttatagagcctgagagaggatgagcaactttccagaggtcacagcgctagaaagttccaggatcttctgggatttgtctc---aagtgacttgccttttcactgcaccTAACAGTAACGTGTGGCAAAGGGTGTGTGTATGTTGAAATCATTAGTGTCTGCTCATGAATTGTTACATAGGAGAAGCTT-GGGGTGACCATCTGGTTGGGCAAGAGGGGCTGGATGACATTAGGATGTGTTTGCATAACAAGTCCGGCACTTTTTCCTAGATTGTGTGTTTATTTGGGGGTAGTCTGGCAGATGCAGGAGGGTGGGAGTTCAAAAAGAAGGGAGCACGGGGAAGAAGATTCTCCATGGCTGCCCCCACTGCATGTTTTAATGGACTTTCTTATACATCTCCTTTAATGTCTACTAAGTCACAAATTTATTGAAGGCACTCATTGAGTCTTATTCCCCTCTGATTATGTTTCATAGTTATTTGATGAATCAATGACCATGTCAACCTTGATCATTTTCAGATCTAAACAGTATTTTCTAACATCTTAGATGATTAGCATATACCTCATGTTATCTATTCCTGTCTGTTTGTACTTGTTcaacacatatccagtgtttactatgtgcaccattgtcagcattttacaaacatcaacttatttaatcttGTCTTTGTTGCTGTTTCCTAAACAGTCCATGACGGTGACTAGCTACTATTAGAAATCCTTTTCTTCCTCTCTCTTCCT a score=625139 s hg17.chr12_random 181507 7310 + 466818 CTTCCTCTCAAAAGGCCTGAAAATCAGTTACTGGTCCCTGCCCGTGCTGCAAATACTTGGCCTAGGGAAGAGTGGTGGGGAGGGATGAAATAGTTAACTAGCTGACCTGGGGCGCACAGTTTCCCTGGCAGATGCCGCGCTCAGGCTGCGGCTGCTTCCTCCTGAATCTGTTAGGAGTACACTTTCCCTTTGCCCTCGGGGCCAGCGTCCAGGTTTGCCACGGTGGTGGAGACAGCTCCAGCCACGAAGCTGATTTATAGGCCAGAGCATTCCCAGGCCGCACCGCAAGGAGTCGGGCTGAGCTTGGACTTTGGGAAGGTGGTGATGGACACAGGACACGTGGCCACACAATGGGGACACACGACTGACCTCAGTCACTTCGGTAAACTGCCCTTGCTTTCCGGAGGCGGCAGGAACGTTTCAGGAGCTCCAAGGCTCTAGGCGCCTGCATTCCTCGCCCCAGCCGGTAGTCTCCTAGCCCTGTTGAACGCAAGAGCATCCAAGGGCGCGCAAGTCCCCAAGAGCTCTCAGAGGTTCCTGACCCTGAGCGTTAAAGCCCTTCCTCGCGGATGAGACCCTTGGTGCGTTCCACCCGCTTGGGGGCTGAGACTCGCCAGGACGCACTCAGAATGAACTTTCCGCGCAGGTCAGATATAGGCACCCCAGGGGTTTTGTGACGTCACAATGCCGTCTGACCCGGTGAAAGGCAAAGGAAGGGTCAAAAACGGATAGTGTGTGTGTTGTG--GCTGAAGTGGGGGCATGTGAGAAGAGGGAAGTCCGAGGAATGGGGGAAGGGATTTGGGGACATGAATTTGAGAAGGAGCAATCAAGTTTGTGCGTGGGGGG-----GGAAGCAGGATTTTTTCTTCTTCCCTCCTATATGCAAACTGTCACTTCGGGTTAGCGTGAGCCCTTATCTGGCTCATTAGCATGAGCTGTGGCTAACACGCTTAAACCCTCTAATTATTTATTATGCCGTCACGGGGCGGATTGCAACCCCACCCCGGGGCGCACTTTCGGGAACCTGCAGAGCTGGGCACCGCACGGGGGCCGGAGCACAGAGCCTGGCCCCGCTGCGCGCTACCAGGGAGACTCCTTACGGCTCAGGAGTCCCACAGGGTACTGTTCTGAGGGTCAACGAAGCAGAGTTGTTGGGGGTCTATCTGGAATGGCTTCTCACCAACATTCATCCCCAGGGTAGTAGTACTGAACTCGCCTGGTGAATCTACATAGCACCCTAACTTCTCCATTAACAACTCCAAAGACGGAAGTTGGAGCCAAGAGGAACAGACTTT--GCAAAAATAAAAACAGAAGCCAAACCTGGTGCAAAGGGT-TGGGAATTGGGCTGAGTAGCATGTTGGGTACACCTTCCAGAAGAACCCTGGGGAGAACCTAAAGTTTGCTGGAGCCCTCTTCCCC-ACCCCCGAGTTCCAAGAGGATCCACAAAGTGGGGGTGGGAGATTTGATGGGCTGAAATCCGGTCACTCACGTCCACGGTTCTATTCAGAAAACAGTTTCAAAATAAGTTAACCTCTGTAGGGCATTTTTCCCCCTCCCCTTTAAATTGTCCCCCCTTCCCCCTCCTTCTTCTCATTTGAGTCTGTTTTATGTTCCCCTGCGTTGTGCCAACTATTTTATCTTTATTCCTTCTCTTTCTCTCTTGCCATTCATTGCTTTTTTTGTGTGTGTGGCTTCTCCGGCTGATGTGCGGCTCGTTACCACCCACTGCACACTTGCTCCTGTAGCTGAGGTGTTTCTATACAAACTCCAGCGTCCAGTTGTCATATTAATTATTACACTGAGTAATGACTGAAATGGTCAAAATAAGGGGAGACTCAAGAGCGCTTTTTCTTGCGGCTCAAAGATTCAGCAAAGAAGCCGTACAACAAAGCACTAATTGGTCCCCAGAAACACTCTGACAAGGCATGGAAGATAGGTTTCATAGAGCCCTTCGATTGTGAAGGGGGGAGAGCTCTGAATGGACTCCACGCTTCTTTTCTAAACTCTCTTGCTGAGCAAAAAATGGACCTCTGTTTGAATACTGCCCTGATCCTTGAATACTACACCCAGCAGAGAAAAAAATGCACCATTTATTGTAAGTTTTTTTTTTCTTCTCCAGCTATTCAGGGGTTCTCTGTGAAGAATCAGCTGGTTTTGTTTACCATGAAAGACCTTTACTTTATTTTCATTCTTGGAGGAGGTGGGGAGGAGGAGGGAAGGAAAGCCATGTGCCTAGACAGAGAGGAGCTGGCCTACTGTAACAAAATAGAGTGTAACAAATCCTACAAAAGTTTAGAATGTATTGATTCTTTGGAGAGCTATATAGATTAACGACTTTCTTTATGCTCATCCAAGGAAGGTATTTAATCATAATGTAAATGGGGCTTTAGAAAAAAATAAAGACTTAGCGTTACTTCTCCTTATTTGGAGAACTTCAAAAGGACTTGTGAGGGTGGCTGCAAATTACCTCCTCACCCCACCCCACATTCCCTCCTTATCCCAAAAGCCACAATAAAATATAGTTTGTGCTTTTTTTGTTTTGTTTTTTCAAAC---TTTTTTCTTTTTAAAGCATATTGAAAAAGTGAATAGATTTGTTAGAAGGCTGAATTCCTTAATGCAGGTGCAAGCCTGGCTGCTGTGACCAGGAAGCTGAGCCAAGCCAAATACATGGTTTGTGCTATTCTGCCCCCTGAGCAGGCCCTCCAAGGCTGGTGCAGAGTCAATGCAGGCTGGGCAGCAATCCTTTCTGAAATTACCTTGGGTAGGGTATTCTTAGAGGCAGTAGATTGTGCAGTAAAGTCCTTTTCATTTTCCCTGGGTAGGACAGTGTCTAGCACAGCCTTAGAACAGCAGACACCCCAGCAGGACAGAGGCCCTGTATTAATTATAGCTCCTGGAAGATGAATATTGGCTATGAATGCCAAGCACACTCACTTTTCTCGGAGCATCCATTGCTTCTGGAACTCAAGTCACCCCCAAATT-GAGGATTACACTTAAAATCCTGTAACAAAATCCAGAATCCAAGACTTGTGTTCATCTTTGTATTCCCTTTGCCCCTGATTCAGAATCTAACTAAAGttaaaaatataactttattaaattatttGTCCAATGAAAATCCTAGTTTCACTTTTAATATCAATCCCTCTCCCCAAAGAGAAAGCATAAATTGGTTTTCAAAGAGATGAGTCATATCTTCTTTTTACAGANGAGACATACATCACAATCAAGAAGAACATACATAGGTCTTGAGCTTCAGCAAAGGTGGTACTGGCCTGGCCTTCAGCTGTGAATGGAAATTAAGGTGGCAGGAGACTCAGGGCACAGGGTCTCTGATCTCAGGGCAGCAGACCCCTTTGGCCACTAGGAAAGCCATCTCCCCCTACAGATCCTGATGCTGAATGAAGATAAAGTCTAATCTGAAGTATGGTTCAGCTCCAGAGTGTTCTGATATAGGAAAGGGGTCTGAAGGTGCAGAAATTAAGTCCCTTATTGTATTGGAGGAGAAAGAGAAGCCTTCTTATCTTTCTGCAATGTCTGTACTCTGGGTGATACTCACCAAAGGGGATCAGTGCTTTGTCCTTCCCACTCCCCCACCCTCATGACAAGACAGAACAC----TGAATGCTGCTATTCGGAAAAAGTGAAAAGGCAATCTCTGATATGTGGAGAGACTTGCAAAGCAAATTACCCAACAACATCTGATTTAATTCTCATAACACCCTTGACATACAGGCAAAGGGAGTACTACCACCTCATTTATGAATGAAGGTATCAAACCTTCCTTTTGTGAGTTGTTTACTTCTCCCTTCATGTGAAGATAAATGGGACATTGTTCAAGTGTCTTAGCCAACTAAAGCCCTAAGGACTTGCTCAGAATCAGGCCCACTGTGTGGCAAGGGAGCCA-AGAAAGCAGGGCCCAGTGGCTCTGCTGAAGCCCCTTGCATGTGGAGGCCACAGAACATCTCTATAGTCTATCTTACTTGCTACTTTTCATGTCTAAAAATCGGGTTACTATCTCCATCATCTTAATATGCCAGTATCACCACCATTTCTCAAAAATGACAGGAATGACTCACCCCTAGGTGCTGGGACAGTGAGACAGAGTGGCACTGGATCTCCATTGGCTGGAGTGATGATCACAGAGTGGTTCCAGGAAGCCAAGTGCTGAGGCTCCTCCTGCCACACACCCTTTCCTGGGTGGGTTGTGTGAGCATGACTTTCttattaatccctttctctttagacctgggctagagtgctctacatacatatcattgaagtctcacaactcttggaggtagatactataattactggcataggtgaaatagagacccctagagtgtctcagggtcacacagctctcaggtaaaggggcctagataccaagtcaaatcagcctgCTTTATCTGGAATTCCATGGGCCTAGGAGAGCAGAACATGTGGCCAGTTCTCTCAGGTCGGGAGGAGGGATTATAATCTAGGTCACACAGTCAGAGGCAGGATTCTAATTTTGGCTCCTGAGCCTCCCATCTTTTGCTTCACACTGGTGAAAACAACCAGAAAGCCAATATCAATGGAAAACTCT-CTTGGTAGAATCCCCAAGGATAGAAATGCAAACCTCTAAAGAAAAATTATAGACTGTTCTACCCTAGGGTTGGAGGAGAAAGTGGAGATGACAGTGTTGAGGTGCAAACTCCAGGTTTACTTGAGTGGGGGGAGGAGAACGCCTCGGTTCTTGGAAGGCTTTGCAAAGCATGTAAGGAAG-AAAACTTAGCATACTAGGGTGAGAAGAGTGAGGTCAGGCTCAGGGCTGGCATAGGGAGAATAGAGACAAATGTTCTGGCGGTTTTGGCCAGAAGGATCCCAGCAACGACTGTCCTTCCTCCTGGCCTGAGGCCAATGAGTAAGGCCACTACAAGACAAGGCTTCTTCACTACAATGCACTTCCACTCCATTTGGGCACCCATTTCATGGTGTGTGTAGGGGGGAGGAGGAGAGGAGGTTCTGTCCTCTACTTCCCTGGTATTGAGATCTCTGTGTATGCATCCTGGAAAAGGA-------AACACGTGCTGGCTACCAGCAAATTTtctaagctgttagatacaagtttcaaaattagctactgtacatcccttgtgtgtagatcagaaaactgaggccagtagaggcagagggacttgttcaaggttataaggcaccattgtggtagagctcagactCGGGACCTTTGTGAAGTGAGTCCAAGTTAGTAGGGAGTTTGGGGCTCATGTTTCAGCTTAATGTAAAAGAAAACACATCTAGATGCTTCCACATTTGCGACACTCCCTCCCACCCCCA------ACACTCAACTATTTGGCTGAAATAGAGTGAATGGGGCATTAGGACACAGCTGGGTCATGTGGGAGGTGGGTAAGGAGTGCCTGAATAATTCCTATTTCTGCAAGTGGTCTGAGGCTTACTCTGGCTGGGAGGTGCAGGGTGCCCAGGCTGTGTTGTGACTCTGCTTTTGGGTGCTCACCTCCTATACTTCCAGAGACCTCTTAGGCCCTTTCCT-TGGTCAGGGATGTGGAGAAAGGCCTGAGGTGTGAATCCCACGGGGTTCAGCCAGTCCTGTGAGGCCATCAAGCCACAGGTTACCATGGGGAGAAGGGGCTGTGTGGCTGGGAAAGGTTACAGAATTGACCTCTGTTGGCACGATTTGGTCCTATACCTCTGAAGCCTACCTATTCTGCAAAGATGAAACTGAGGTAGAGAAGAGAGGTGATTCACTTCGGGAGCCGCCCGTCATTACTGCCCACCATCATCACTATTGTTCCAGAAACACTCAGCCAGCCCACATACCAAGAGCAGCTCCCTGGGTCATCCCC-TTGGCCCTTTAGAAAGATCCACCTCCACAAAGGGGAGTTCAATTAGAACCAATTATCCGGATAATTCACCACAATCATTCCTGCACCCAGATCTCGGATTATTTCTACTGGAAAATCAAATGGATGATTGCCCTCCACTTCGTTCTGCCTATGTAGACAAGACCTGAGACATGCCCCAGCCTCTCTCCGGACCAGATCCTTAAAGAGATGGGGCCTATTGCTTGGTCTGCTTTCTCCGCAGCGCCGCGTCCCCAGACGTCCTGAAGCTGGACGGGGTTCTGGCCAGAGAGCGCCAGGGCCGAAGGCCCAGGAAGGACGCCTGGGCAGGCGCTGTCCAAGCGGTCGAGCGACGGCTGCAAGCGCCTCCCCCTCCCTCTCGGCGCCAGCACGCGGCCCCGCCGGGCTCCGCTCCCAGTCGCCTGCCACCGGGCCGCCGGGCACACGCCTGGGGCGGGATGGTGGCTGCGCCAAGGCCGCCGAGGTGCCCGCGGCGGCGCCGAAGAACCAGGAATCCCCACCAGTGCCCTAAGCGCCATCACTCAACCCCCGCCCCGCATCTTTCTTCTCCGAGGGTCTGGGAGTATCCCAGAGCACTCCCTTCTTTATGATATCCGCTAAGCTGGTCCGGAAATAATCTTTATGGGGAGGGGGTGGCGGTAGGGGGCGATGGTACA------------GGGGGCCAGAGGTCATCCTAGGGGGACGTCCCTGCCATATACACCCACCTACAGGACGGCTCACAACCACTCCTCGGTGTCGCTTCCCCGCGGCCCCCCACACACTTGCTCAGTTATGGGGAGCACATCCTAGTTTttagagctgaatgggacattagagaccatattctgtggctgcagacgaggaagcgaaggctcagagaggatgccactt-cgaggagccacagagcattgagaggacgccttgggactagaacccacgttttcacatagtccagcactttttttcactgttctggacggagtccctcCCCCAACCATGTTTCTAAACTTCAATCGTAATTTGCTCCAATTTCTAGGGTCACCGAGGAACCCGAAGAGAATAACAGTGAGGAGAGAGAGAAAACAGGAAAAGTCGAGCCCCACTCCCTCCTCACCTCCACACCGTTCCTGTGCCATTTTTTCTGCCCAAACCCTTCCCTGCGCTTTGCTTCAAGTTCTTAGTAGAATCCAAGAGAGCTTCACCCCAAGTCTTTCCACCTATACACCTCAATTCCTAGAGCCATTTGTCCCTCCTGTGACGCCCCCCACCCCCTTCCTAAAGCCACCCCCGGCAGCAGCCCGCCCCGAGCGCGCCGCCTGTTTATTCAGCCGGGAGTCCGGCACGCGCCAGGCGCACGCACTGCAACAACAAACCCAGCTGAATGGAGAGTTTGCAAGGAGCGGGAGAAAGGAACGGGAGGGGGGGAGAGGAGtagacgaaagtcaactcaag s rheMac1.SCAFFOLD80653 2819 7332 - 71846 CTTCCTCTCCAAAGGAATGAAAATCAATTATTGGTCCCAGCCCGTTTTGCAAATACTTGGCATGGGGAAGAGTGGTGGGGAGGGATGAAATAGTTAACTAGCTGACCTGGGGCGCACAGTTTCCCTGGCAGATGCTGCGCTCAGGCTGCGGCTGCTTCCTCCTGAATCTGTTAGGAGTACACTTTCCCTTTGCCCTCGGGGCCAGCGTCCAGGTTTGCCCCGGTGGTGGAGACAGCTCCAGCCACGAAGCTGATTTATAGGCCAGAGCATTCCCAGGCCGCACCGCAAGGAGTCGGGCTGAGCTTGGACTTTGGGGAGGTGGTGATGGACACAGGACACGTGGCCACACAATGGGGACACACGACTGACCTCAGTCACTTCGGTAAACTGCCCTTGCTTTCCGGAGGCGGCAGGAACGTTTCAGGAGCTCCAAGGCTCTAGGCGCCTGCCTTCCTCGCCCAAGCAGGTAGTCCCCTCGCCCTGTTGAACGCAAGAGCATCCAAGGGCGCGCAAGCCCCCAAGAGCTCTCAGAGGTCCCTGACCCTGAGCGTTAAAGCCCTTCCTTGTGGATGAGACCCTTGGTGTGTTCCACCCGCTTGGGGGCTGAGACTGGCCAGGACGCGCTGAGAACGAACTTTCCGCGCAGGTCAGATATAGGCACTC-AGGGGTTTTGTGACGTCACAGTGCCGTCGGGCCCGTTGAAAGGCAAAGGAAGGGTCAAAAACGGATAGTGTGTGTGTTGTGTGGCTGAAGTGGGGGCATGTGAGAAAAGGGAAGTCAGAGGAATGGGGGAAGGGATTTGGGGACATGAATTTGAGAAGGAGTAATCAAGTTTGTGCGTGGAGGGTAGGGGGAAGCAGGATTTTTTCTTTTTCCCTCCTATATGCAAACTGTCACTTCGGGTTAGCGTGAACCCTTATCTGGCTCATTAGCATGAGCTGTGGCTAACACGCTTAAACCCTCTAATTATTTATTATGCCGTCACGGAGCGGGTTGCAACTCCACCCCGGGGCTCACTTTCGGGAACCTGCAGAGCTGGGCACCGCACGGGGGCCGGGGCACAGCTCCTGGTCCGGCTGCGCGCTACCAGGGAGACCCCTCACGACTCAGGAGCCCCACGGGGCACTGTTCTGAGGGTCAACGAAGCAGAGTTGTTGGGGGTCTGTCTGGAATGGCTTCTCACCAACATTCATCCCC----TAGTAGTACTGCACTCGCCTGGCGAATCTACATAGCACCCTAATTTCTCCATTGACAACTCCAAAGACCGAAGTTGGAGCCAAAAGGAACAGACTTTTTGCAAAAATAAAAACAGAGGCCAGACCCGGTGCAAAGGGCCTGGGAATTGGGTTGAGTAGCATGTTGAGTACACTTTCCAGAAGAACCCTGGGGAGAACCTAAAGTTTGCTGGAGCCTTCTTCCCCCACCCCCACGTTCCAAGAGGATCCACAAAGTGGGGGTAGGAGATTTGATGGGCTGAAATCCGGTCACTCACTACCACGGTTCTATTCAGAAAACAGTTTCAAAATAAGTTAACCTCTGTAGGGCGTTTTTTCCCCTCCCCTTCTAATTGTCCCCGCTTCCCCCTCCCCCTCCTCATTTGAGTCTGTTTTATGTTCCCCTGCGTTGTGCCAACTATTTTATCTTTATTCCTTCTCTTTCTCTCTTGCCATTCATTCCTTTTTTTGTGTGTGTGGCTTCTCTGGCTGATGTGCGGCTCGTTACCACCCACTGCACACTTGCTCCTGTAGCTGAGGTGTTTCTATACAAACTCCAGCGTCCAGTTGTCATATTAATTATTACACTGAGTAATGACTGAAATGGTCAAAATAAGGGGAGACTCAAGAGCGCTTTTTCTTGCAGCTCAAAGATTCAGCAAAGAAGCCGTGCAACAAAGCACTAATTGGTCCCCAGAAACACTCTGACAAGGCATGGAAGATAGGTTTCATAGAGCCCTTCGATTGTGAAGGGGGGAGAGCTCTGAATGGACTCCACGCTTCTTTTCTAAACTCTCTTGCTGAGCAAAAAATGGACCTCTGTTTGAATACTGCCCTGATCCTTGAATACTATACCCAGCAGAGAAAAAAATGCACCATTTATTGTAAG-TTTTTTTTTCTTCTCCAGCTATTCAGAGGTTCTCTGTGAAGAATCAGCTGGTTTTGTTTACCGTGAAAGACCTTTACTTTATTTTCATTCTTGGAGGAGGTGGGGAGGAGGAGGGAAGGAAAGCCATGTGCCTAGACAGAGAGGAGCTGGCCTACTGTAACAAAATAGAGTGTAACAAATCCTACAAAAGTTTAGAATGTATTGATTCTTTGGAGAGCTATATAGATTAACGACTTTCTTTATGCTCATCCAAGGAAGGTATTTAATCATAATGTAAATGGGGCTTTAGAAAAAAATAAAGACTTAGCGTTACTTCTCCTTATTTGGAGAACTTCAAAAGGACTTGTGAGGGTGGCTGCAAATTACCTCCTCACCCATCCCCACATTCCCTCCTTATCCCAAAAGCCACAATAAAATATAGTTTGTGCTTTTTTTGTTTTGTTTTTTCAAACTTTTTTTTTCTTTTTAAAGCATATTGAAGAAGTGAATAGATTTGTTAGAAGGCTGAATTCCTCAATGCAGGTGCAAGCTTGGCTGCTGTGACCAGGAAGCTGAGCCAAGCCAAATATATGGTTTGTGCTATTCTGCCCCCTGAGCAGGCCCTCCAAAGCTGGTGCAGAGTCAATGCAGGCTAGGCAGCAATCCTTTCTGAAATTACCTTGGGTAGGGTATTCTTAGAGGCAGTAGATTGTGCAGTAACGTTCTTTTC-TTTTCCCTGGATAGGGCAGTGTCTAGCACAGGCTTACAGCAGCACACAGCTCAGCAGGACAGAGGCCCTGTATTAATTATAGCTCCTGGAAGATGAATATTGGCTATGAATGCCAAGCACACTCACTTTTCTCAAAGCATCCATTGCTTCTGGAACTCAAGTCACCCCCAAATTCAAAGATTACACTTAAAATCCTGTAACAAAATCCAGAATCCAAGATTTGTGTTCATCCTTGTACCCCCTTTGCCCCTGATTCGGAATCTAACTAAAGTTAAAAATACAACTTTATTAAATTATTTGTCCAGTGGAAATCCTAGTTTCACTTGTAATATCAATCCCTCTCCCAAAAGAGAAAGCATAAATTGGTTTTCAAAGAGATGAGTCATATCTTCTTTTTACAGA-GAGACA-ACA-CACAGTCAAG-AGCACATACATAGTTCTTGAGCTTGAGTGAAGTTGGTATTGGCCTGGCCTTCAGCTGTGAATGGAAATTAAGGTGGCAGGAGACTCAAGGCACAGGGTCTCTGATCTCAGGGCAGCAGACCCCTGTGGCCACTAGGAAAGCCATCTCACCCTACAGATCCTGATGCTGAATGAAGATAAGGTCTAATCTGAAGTATGGTTCAGCTCCAGAGTGTTCTGATATAGGAAAGGGGCCTGAAGGTGCAGAAATTAAGTCCCCTATTGTATTGGAGGAGAAAAAGAAGCCTTCTCATCTTTCTGCAATGTCTGTACTCTGGTTGACACTCACCAAAGGGGATCAGTGCTTTGCTCTTCCCACTCCCCCACCCCCATGACAAGACAGAACACTGTTTGAATACTGCTATTT-GAAAAAGCAAAAAGGCAATCTCTGATATATGGAGAAACTTGCAAAGCAAATCACCCAACAACATCTGATTTAATTCTCATAACACCCTTGACATACAGGCAAAGGGAGTACCACCACCTCATTTACAAATGAAGGTATCAAACCCTCCTTTTGTGAGTTGTTTACTTCTCCCTTCATGTGAAGATAAATGCGACATTGTTCAAGTGTCTTAGCCAAGTAAAGTCCTAAGGACTTGCTCAGAATCAGGCCCACTGTGTGGCAAGGGAGCCACAGAAAGCAGAGCCCAGGGGCTCGGCTGAAGCCCCTTGCATGTGGAGGCCACAGAACATCTCTATAGTTTATCTCACTTGCTACTGTTCATGTCTAAAAATTGGGTTACTATCTCCATCACTTTAATATGCCAGCATCACCACCATTTCTCAAAAATGACAGGAATTACTCACCCCTAGGTGCTGGGGCAGTGAGACAGAGTGGCACTGGATCTCCATCGGCTGGAGTGACGATCACAAAGTGGTTCCAGGAAGCCAAGTGCTGAGGCTGCTCCTGCCATACACCCTTTCCTGGGTGTGTTGTGTGAGCGTGACTTCCttattaatccttttctctctagacctggcctagagtgctctacatacatatcattgaaatcgcacaactcttcgaggtaggtactataattattggcataggtgaaatagagacacccagagtgtctcaggatcacacagctctcaggtaatgaggcctggataccaagtcaaatcagcctgCTTTATCTGGAATTCCATGGGCCTAGGGGAGCAGAACATGTGGCCAGTTCTCTCAGGTTGGGAGGAGGGATTCTAATCTAGGCCACAGTGTCAGAGGCAGGATTCTAATTTTGGTTCCTGAGCCTCCCATCTTTTGCTTCGCACTGGTGAAAACAACCAGGAAGCCAATATCAATGGAAAACTCTCCTTGATAGAATCCCCAAGGATAGAAATGCAAACCTCTAAAGAAAAATTATAGACTGTTCTACCCTAGGGTTGGAGGAGAAAGTGGACAGGACAGTGTTGAGGTGCAAATTCCAGGTTTACTTGAGTGGAGAAAGGAGAATGCCTGGGTTCTTGGAAGGCTTTGCAAAGCATGTAAGGAAGAAAAACTTAGCATACCAGGGTGAGAAGAGTGAGGACAGGCTCAGGGCTGGCATAGGGAGAATAATGACAAATGTTCTGGTGGTTTTGGCCAGAAGGATCCTAGCATCAACTGTCTTTTCTCCTGGCCTGAGGCCAATGAGTAAGGCCTCTACAAGACAAGTCTTCTTCACTACAATGCACT-----TCCATTTGGGCACCCATTTCATGGTGTGT-------GGGAGGGGAGAGGAGGTTCCATCCTCTACATCCCTGGTATTGAGATCCTTGTGTATGCATCCTGGAAAAGGAAACTGGGAACACGTGCTGGCTACCAGCAAATTTTCTAAGCTGTTAGATACAAGTttcaaaattagctggtgtacatcccttctgtgcagatcagaaaactgaggcccgtagaggcagagggacttgttcaaggttataaggcaccattgtggtagagctcagactccggacctttgtgaAGTGAGTCCAAGTTGGTAGGGAGCTTGGGGTTCATGTTTCAGCTTAATGTAAAAGAAAACACATCTAGATGATTCCACGTTTGCAAGACTCCCTCTCACTCCCACCCCGGACACTCAACTATTTTGCTGAAATAGAGTGAATGGGGCATTCGGACACAGCTGGGTCATGTGGGAGGTGAGTAAGGAGTGCCTGAATAATTCCTATTTCTGCAAGTGATCTGAGGCTTACTGTGGCTGGGAGGAACAGGGTGCCCAGGCTGTGTTGTGACTCTGCTTTTGGGTGCTCACCTCCTATACTTCCAGAGATCTCTTAG--CCTTTCCTGTGGTCAGGGATGTGGAGAAAGGCCCGAGGTGTGAATCCCACGGGGTTCAGCCAGTCCTGTGAGGCCAGCAAGTTACAGGTTACTATGGGGAGAAGAGGCTGTGTGGCTAGGAAAGGTTACAGAATTGACCTCTGTTGGCACGATTTGGTCCTATACCTCTCAAGCCTACCTATTCTGCAAAGAGGAAACTGAGGCAGAGAAGAGAGTTGATTCACTCCGGCAGCCGCCCGTCCTTACCGCCCACCATCATCAATATTGTTCCAGAAACACTCAGCCAGCCCACATACCAAGGGCAGCTCCCTGGGTCATCCCCGTTGGCCCTTTAGAAAGATCCATCTCCACAAAGGGGAGTTCAATTAGAACCAATTATCCGGATAATTCACCACAATCATTCTTGCATCCAGATCTCGGATTATTTCTACTGGAAAATCAAACGGATGATTGCCCTCCACTTCGTTCTGCCTATGTAGACGCGACCTGATACGCGCCCCAGCCTCTCTCCGGACCAGAGCCTTAAAGAGATGGGGCCTGTTGCTCGGTCTGCTTTCTCTGCAGCGCCGCGTCCCCAGACGTCCTGAAGCTGGACAGGGTTCTGGCCAGAGAGCGCCAGGGCCGAGGGCCCAGGAAGGGCGCCTGGGCAGGCGCTGTCCAAGCGGTCGAACGACGGCTGCAAGCGCCTCCCCCTCCCTCGCGGCGCCAGCACGCGGCCCCGCCGGGCTCTGCTCCCAGTCGCCTGCCACCGGCCCGCCGGGCACACGCCTGGGGCGGGATGGGGGCTGCGCCAAGGCCGCCGAGGTGCCCGCGGCGGCGCCGAACAACCAGGAAGCTCCACCAGTGCCCTAAGCGCCATCACCCAACCCCCGCCCGGCGTCTTTCTTCTCCGAGGGTCTGGGAATATCCCAGAGCACTCCTTTCTTTATGATATCCCCCAAGCTGGTCCGGAAATAATCCTTATGGGGAGGGGGTGGCGGTAGAGGGCGGCGGTAGGGGGTGATCCTACGGGGGCCAGAGGTCATCCTAGGGGGATGTCCCTGCCATATACACCCACCTATAGGACGGTTCACAACCACTCCTCAGTGGCGCTTCTCCTTGCCCCCCCATACACTTGCTCAGTTGTGGGGAACACATCCTAGGTTttagagctgaatgggactttagagaccatattctgtggctgcagacgaggaagcgaaggcttagagaggatgccacttacgaggagccacagagcattgagaggacgccttgggactagaacccacgttttcACATAGTCCAGCACCCTTTTTCACTGTCCTGGACGGAGTTAC-CCCCTACCCATGTTTCTAAACCTCAATCATAATTTGCTCCAATTTCTAGGGTTACCGAAAAACCCGAAGAGAATAATAGTGAGGAGGGGGAGAAAACAGGAAAAGTCGAGCCCCACTCCATCCTCACCGCGACACCGCTCCTGTGCCAGTTTTTCTGCCCAAACCCTTCCCTGCGCTTTGCTTCAAGTTCTTAGCAGAATCCAAGGGAACTTCACCCCCAATCTTTCCACCTATACACCTCAATTCCTAGAGCCATTTGTCCGTCCTGTGACGCCCCCCACCCCCTTCCTAAAACCACCCCCGGCTGCAGCCCGCCCCGAGCGCGCCGCCTGTTTATTCAGCCGGGAGTCCGGCACGCGCCAGGCGCACGCACTGCAACAACAAACCCAGCTGAATGGAGAGTTTGCaaggagcgggagaaaggaacggga-ggggggagaggagaggaggagggggagtttagg a score=9961 s hg17.chr12_random 194451 520 + 466818 ATATTATGAGTTAATCTTAGTTGGTCTAAATTGGCCCCTGTACTTGTCTTCAGGGTTGTTGACTCTTGGTCAAT------------------------CATATTCTGTAACCTTGG---------GTAAGTTGTTTCATAATAGAATGTATGAGACTTTCAACATTTTTAGTAATAATAATTTGACTTATGATTTGAATGTGGTTTCAGTGGA--TTCTGGGAAT---------TTCAATGGTAAAGTCTGGTCAGTTACATAGCTCGAATGTGTTTATGTGACCAGCTCACTATAAGAAAACCCCCACCATATACAAAATTTTGGCTTTGGCTTTCTTCTACTGAGGGTCTTTGCACACATGCTGGTGGTAATTTAAGACCTAGAGACTATGCATATTCTATGTGAACTGATCCAGTGTGAAAGGAAAAAAAAGCCTACTCTTGAGACTTCTAGTGCCCTTTCTATGCACatatttctccatcatagttaccgtttttgatgctcttaattcctttgatagattcaggttttcatctgatacaattttctttttacttgtagc s rheMac1.SCAFFOLD5494 153420 510 - 160645 ATAGCACGGGTTAATCTC-TCTGCTCTGGACGGACCAC-ATACTTGTCTCCAGTGCTGCTGACCCTCGGCCAACACTACGGGACACGTTAACCAAGGATACATTTTGTTGTCTCAGCTTGGGCCCGTGAGTTGTGGTGCAGCAGGACGTAGCAGACTGTTGGCATTGTT--TAGTAATCATCGAATTTATGATTTGCAGTTGGCTTCAGTGGAGGTGAGGGGAGTAGGAGTGGATTCACTGGTTAAGGCTGATCC----TGGAGCTGGAATGTGCCCATGTGGCCAGCTCACTACAAGAGAA-CCCCACCATGAGCAGA---TAGG---GGGATTCCAGGCACCAAGATGCTTTGTGCATACGCTGGTGGTGGTTC---ACATGGGGATACTGCATGTTCTGTGT------ATC-------------------AGCCTGTACCCGAGATCTCCAGACCCCTTTCAATGCATATCCTTCTCGATTC---TTGCTGTGCT--GTGCCTTTA--TCCTTTAATA----CAGCTGTTCTCTGTATATAAACTCTTTGGGTCTTGTTGC a score=586108 s hg17.chr12_random 196175 7364 + 466818 gtttatgtggatcctgggagttttaatgattaacagttaaaaatcccttttaaaactctaactggtgccctgtaaattataagattttcaaatctgatatttggaaacagacactattattgaccctatgatttgacattattttctctaatcctttcaggtggttctttcttcagccttgggtacctttctcacatggatgcattattgagtagtctactgaatacttgaaggggaccctctacagatctataaagttctttctgtgtgtagctctctcttccctagtactctgtcctgtgatcttcagttgccttggtttccccagattcccggattcttgtcctagactcagagatactaccaagctcttcctgtgtctctctaatcctgcacaatgcaggccagaaattttcttctggagctaagttggaacaattataaggttcacctattttgtttttcatcttggctagattatggccttccttgtctgatgtccaatgttccaatgtattcagagccatttttttttttcatttttttggtagttttttgagtgaggagtgtaaatctagtctatgtcaattcattttaatcaagatcagaagtcAAACCTCTTGTGTTTCATTCAGATACCTTTCTTCCTGCCACTGGAGCCCATATCTTTCAGGGAAAGCTCATCTCACTTCCCTGGGATGAATCTGGAGGGTCTAAGTGTAATCTCATTGAGTTCAGCAATTCagctaatcatcacatggtattcccctggccacagagattatttcaagaatggacatacaaatcagttttgacttagtcacaaaggaaaagttttctgggggattccatgaaaagttatctcctTCTTAAGAGAGGATAAATGAAAGTAATGGTCCCGTTTCTTCTGGTTATAGTTGTTAGCATAAGTAAGACCTGAAACTGCAGCAATGATATTGCTACCAGCAAGAATGTGAGGCTAAGGAAAGACAGAGCGAATAGAATCACCAAGAAACAATGATAGAGAAATTGTATTAAGCTTTAACTAATCAAACCTTTACCTCTGGTCTTTTCCAGTTACATGAGCCAATATATTTTCTTATT-----AACCATTCTGAAATTAGCATTCTTTTACTAGGAGATTAAGCTTTTTCCAGCTCTGCACTTTGACTCACACTTAACATTTAAATTCCTATAGATCAAAGACTAGATATCATTTCTTTGTGGCTCTCTTTGCAACTAAAAGCAATAGctgactgagtgacttgggaatgttttaaaaatttctttgagtctcagtttgcttgtccataaaagtggagataatattatcaggttattataaagttttaaaa-tgctatagtttttcttttcttttaattaatttgaatttttattttaagttttagggtacatgtgaaggatgtgcaagtttgttacataggtaaatgtgtgccgtggtggtttgctgcacctatcaagccatcacctaggtattaagcccagcatgcattgactatttttcctaatgctctccctcccccaacc--ataccctgacaggccccagtgtgtattgttcctctccctgtgttcatgtgttctcattatccagctcccacttataagtgagaacatgtagcgtttggttttctgttcctgcattaatttgctgaagacaatgtcttccggctccatccatgtccctgcaaaggacatgatctttttcctttttatggctgcatagtgtttcatggagtatatgtaccacattttctttatccagtgtatcattgatgggcatttgggttgattccatgtctttgctattgtgaagagt---acagtgaacataagtgtgcatgtatctttgtaaaagaatgatttatat-----------------------------------------------------tcctttgggtgtatacccagtaatggtattgctgggtcaaatggtatttctggttctaaatctttgaagaatcaccacaccatctttcacaatggttgaacgaatttacattcccaccaacagtgtaaaagcattcctatttatctgcaacctcaccagcatctgttgtttcttgactttttaataatcattgtcccagtgcttgttaagcctgtcacacattatcagcttaataaatatGAGTCCCCCTTTGCCTCATCACAGTAAGTGTTCTAGTGACTAtttctttttctttttcttttttcttctctttctttcttctttttctttctttctttctctttctttctttctctctctctctctttcttctttctttctttctttctctctCACTCTCTGTCTGGCtttctttcttctttttcttttttcagagtctcactctgttgcccaggctggagtccattcattgcaacctccacctccaggttcaagtgattcctgtgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgcatgccaccatttacctggctaatttttgtgtttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggctggtgttaaactcccaacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaaatgctggaattacaggcTCCAGTGACTATTTCTATAGCTCTGGAGTCAGGATTCACcagaggtgtgctagaaaatatttaaaaatgggtctgtcaaaaaaaaggcatcctgctttgtggtatttgccattatccatgg-tgaaaatccttccaccatagccgacttcaagcaatcaacatgacatcactaaacatagaattgtgaagagatgaatagtaacacaccattatataatatttccatgatacagatacacatataatagaga--aataacctcaaaagcataaataataataaaacacagtaaaatagttaagaagttaaacttaagagtttaagatctttattacctttgtttttaatctaattaattttgttgtcagctaattta----aattttTTTTCTAATTAAGATTTTTTATTTTTTTCacaagcacaaagaatga----tttattattagatttacagatataaaattatgttttaataaatgttatcacaacaaacagcataggaaaacaaca-------------gaacatgtttattacaggcatacatctaggagattaatataaataattgatattacattagtaaatttttatcattctacaacttaacatttaatgatgacaatatttaaacaataggaaaatctagcaactggctcttgcaagctggtaccagccaactccaacaGCCTGCTGTGTTTCATCTCCCACCTCCCCAACTCACCTTTCTAGGGCTAGCTCCCTTGAGCAAATAGTTGAAAAAATGGGAGTTTTCCTCTTACATTTCTCTGGAACTGAGTTTTGGACTCTGCTTCTCAGTGGCTTGTATGTTTTACCTGCAGGTCACTGGTTGATTTGTGGCAGGACACCATGGAAACATGGATGTAGGGCAGGCTACTCTCCCTCTGACTGTCCTGCTCCTTTGATCTCCCAGCATCACTCCAAACAAAGCTGCAGGAGTGATCTTGGCACCCTTTAATCAATAGTTGAGGAGTAATTAGACAAAATTATAATGTCAGAAGGGAAAATCCAAAAGCTGTGTGGCAATTTGTGCAGTCCAAGGAAAAGCATATAAAACACTAAATCATATAAAAGCATATAAAACACTAAATCCTTCACATTttaattcaagagcaacttattggacatttactatgtgccaggcatagggttagATCCATTTAAACAGTTGACATATCCCAAGATTTTAATTTGGCTATCTTGTCCTCAGTTTTTATTCTCTCCCACAGTGTCTATTTTTTCTCGCCTTCCTAATGTGAACTCTTACTCCCTGCTCTCCACGAGGAATCCTGTCCCCTGACATCTCCACCTGCAATAGTTCTTTCCCCTAGTTTGGTATCATTTCATCTCAGTCAACTATAAATGAGATATGGGGG-AGATGGGGGCTTTTTAGAACATATATGGATGACCTTTGACACCTTAGATTCTACAAAAGAGGCTGAGTTAAGGTAGGGTTGGGGCTCCAACTCACACAGAAAATTGCAGAGCAGCATAAACCTTCTAGATATCTCCTTTAAGATCACCCTAGCAGTGAAAATTAAAGTCATACTTACTGATTTTCTTGAATATTTTTCAGGTAAACATTAACTTATTTCATTAAGCATGTATACATAATCTCTGAAGGAAGAAGTATTAATTCTGTGTCAGTAAACCTTAAACCCATAATGAGGAATAAAATGTTTACCCAGTGGTCTGGTAATTTCTAAGGCACCTCTTGCCATAGCAGCAATAAGTAACATTGTTATGCAGAGAAGTTGAGTTCCTTTGTTTTACCCCATCATTCCTAAATTATATCCCTTCTTGCTCTTCAACAATAAGACTCAAACCCATTGGTGATCCATTTTCCTTCTTGTGGCCTGTCATAGGAGCAGGTCTAAGTAATGCAGCAAATTGGGATTCAGGTGTTAAAAGAAGAAAGATGaaataggacacagtccctattaccacagagctcacccttcagtggagaatacacagatgtacaaatgaaagattatgatacaatgtgataaataccatagcagagcatcaacaagtaaatgatgtggaatcatagaatagaccttcattttgggtgggaaggtggaaggcttGGAGAAAACTTCATATTAACATTGGGCAGTCAAGGCTTAGAAGGtgtattagtcagggttctctagagggacagaactaataggatagatgcatatatgaaggggagtttattaagataattgactcacacgatcacaaggtgaagtcccacaataggccatctgcaagctgaggagccaagaagccagtctgagtcccaaaacttcaaaagtagggaagccaatggtgcagatttcagtctgtggccaaaggcccgagagcctctgtcaggtggctggtgtaagtccaagagtccaaaagctaaagaacttggagactgacgttcagggacaagaagcatccagcacaggagaaagatggaggccagaagactcagcaagtctactcttaccttgcctccttttatgctggcagctgactagatggtgcccacccagattgagggtgggtctgcctctcccagttcactgactccaatgctaatctactttggcaacacctgcaaagacacacccaagaacaatactttgcatccttcaatacaatcaagttgacactcaatattaaccatcacaGAAGGGATTTGCCTGGCAAAGAAGACCAGATTATGTGAGGTACAGAAAACTGCATGTATCAAGATATAAAGGCCTTTGGATGGGGAATTGTGTGTAGTCTACTATGATTATTGCGTGTGCATGTGTGTGTGCATGCATGTGTGCATTTAATGTGAAAGGAGTGATAAGGGCTGAGCAAAATCATCAAAAAGTGAGCAAAATGAGC---AAAAAATGTGTAAAATGAGCAAAAATAAGATTG---AGCAAGATGCCAAAGATATTTGAATGTACtaaagattttggactttattttgtaggtgtattggcctgaatagagccaattaatattctcaagtaggagagtgatatgctcagttatgagaaataaccttgttcacattgttgagtatgacttgttgtgcagagactgaaggcaggaggatagttaagaggctgttaggataatcaacttttcagagatgaagacctgaacta---------ctgtggtaggtaagcatacagaacattatagatcaacagttcatagaagataattaataaaaagaagaacgaaagaatgctttaagtctcctaaatgaacatcttccaggtaggtggggatgctgttaacataatgtaggcagcaagcatggggaagacactgacggaatgaatttaaagtatctggaaaacaccaaggcagatatgtccaagtctcagttacaaatgagatttggcattcaagaaagaggtcagaatggaagctctataaatttgggaattattaggaaataATAAtgaattattttcccactgccgctttaagaaattaagtagttccccttatctgcagttttgatttccatggtttcaggtacctacagtcaaccacaatctgaaaatagctgaacatagtgcaataaggtattttgagagagagagagaaaaaaaaagaga-agagcatccacatttacataactttaattacagtatattattataattgttctattttattatt-gtgatggttgttaatctctcactctgcctgattta----------tttatcatagttatatccgtatagggaaaacatattatatattggatttggtattatctgtgatttcaggcatccatggggtgtcttggaatatattctctgcagataaggggagatgactgaactatacacttaggaatttaaaacaacacaaaactgttatttttcagaagcctgaaatgagtcttttgagactaaaataaaggtttcagcagggttgcgttccttctgtaggctccagg-ggcaattttcctttcttacgttttccaactcctagaagctgccttctttctttggcttgcggcccctacttccaccttcgaagtatcttagtcaacctcacttttattgtcatatctgcttcttccatacagacccgcctgctcgtctagataatccaagataatctcatctcaagatt-----cttaatcacatctgcaaaatcccttttgacatgtatgctaacacaccaaacaggttctgggagttagagtgtgtacatctttgggatagggggcatggttcaactgaccacaGGGGTAGATGAGAAAAGTGTGGAAGAATGAGGAAAGAGAAGGGCTGAATGCAATAATCTGGAAACATCAATATGAGAAGGAGGAAGGAAGATACGTGTACAATCAATGTTTCTTGGAAGTCAATGGATCAAGATATTTATAAAAGGAGAAATTAAAACTCTCCAAGACTCTTCTCTGCCAGTGGCTCTGTTAGCCTGCCAGCCACTAGGTTTACCTTCCTGCT-GTCTATGAAGTGAACAAAAACACCAAATGGTATATGAAACAATGATGCAGACCATATTTGCCAGTTCCTGATTTATTTGCTCTCCAGGGTGGCACTAATTAACTCTGAACTCCTGGTTTGACTCCCAGGTCTAAATCCAAGATTTGATGTAACC-TTGAGCTCCCTTTTCAGAATTTGTGTTGACTTTTCCTCTGGCTCTCTTCTTCTTTCACTGTGGTAGCAGTGAGCAACAGCAGACTTCAAGATCCTTAGGGACCTTTACCCTCTAAAACTGGTCTCTTCCTTCCCTCTCAAGCCCCTTGAGCAGAAAGAGTGGAATC----Agtacagcaggtccctgaacaacattgtttcattca s rheMac1.SCAFFOLD80653 50403 7331 - 71846 GTTTATGTGGATCCTTGGAGTTTTAATAATTAAgagacaaaaatcccttttaaaactctaactgatgccctgtgaattgtaagattttcaaatctgatatttggaaacagacactattattgaccatatgatttgacattatttcctctaatcctttcaggt---tatttcctcagccgtgggtacttttctcacatggatgcattattgagtactctactgaatacttgaaggggaccctctccagatctataaagttgtctctgtgtgtagctctctcttctctagtactctgtcctgtgagcttcagttgccttggtttccccagattcccggattcttgtcctagactcagagatactaccaagctcttcctgtgtctctctcatcctgcacaatgcagcccagaaattttcttctggacctaagttggaacaactataaagttcacctattttgcttttcatcttggctggattatggccttccttgtctgatgtccaatgttccaatgtattcagagcc-tttttttttttcattttttcggtagttgtttgagtcaaaagtgtaaatctagtct-tgtcaattcattttaattgagatcagaagtcACACCCATTGTGTTTCATTCAGATACCTTTCTTCCTGCCATGGGAGCCCATATCTTTCAGGGAAAGCTCATCTCACTTCCCTGGGATGAGTCTGGAGGGTCTAAGTGTAATCTCACTGAGTTCAGCAATTCagctaatcatcgcatggtattcccctggtcacagagattatttcaagaatggacatacaaataagttttgacttagtcacagaagaaaagttttctgggagattccatgaagagttatctccttcttaagag--gataaatgaaagtaatggtcccctttcctccggatatagttgttagcgtaagtaagacctgaaactgcagcaatgatattactaccaCCATGAATGTGATGCTAAGGAAGGACAGAGCTAAT-----CACCAAGAAACAGTGATAGAGAAATTGTACTAAGCTTTAACTAATCAAACCTTTACCTCTGGTCTTTTCTAGTTACATGAGCCAATATATTTTCCTATTGATTTAACTATTCTGAAATTAGCATTCTTTTACCAGGAGATTAAGCTTTTTTCAGCTATGTGCTTTGACTCACACTTAAAATTTAAATTCCTATAGATCAAAGACTAGATATCATTTCTCTGTAGCTCTCTTTGCAACTAAAAGCAGCAGGTGActgagtgacttgggaatgttttaaaaatttctttgagtctcagtttgcttgtctataaaagtggagataatattatcaggttattataaagatttaaaaatgctatagtttttcttttcttttaattaatttgaatttttattttaagttctagggtacatgtgaaggatgtgcaagtttgttacataggtaaacgtgtgctgtggtggtttgctgcacctatcaacccatcgcctaggtattaagcccagggtgcactgactatttttcctaatgctctccctcccccaaccccataccctgacaggccccagtgtgtattgtccctctccctgtgttcatgtgttctcattgttcagcttccacttataagtgagagcatgtagtgtttggttttctcttcctgcattagtttgctgaagacaatgtcttccagctccatccatgtccctgcaaatgacatgatcttgtccctttttatggctgcatagtatttcgtgcagtgtatgtaccatattttcttcatccggtgtatcctcgatggacatttgggttgatttcatgtctttgctattgtgaagagtgccacagtgaacataagtgtgcatgtatatttgtaatagaatgatttatatagaatttatataaattctcctccattatattctttataatagaatgatttgtatcctttgggtatatacccagtaatggtattgctgggtcaaatggtatttctggttctagatctttgaggaaccaccacaccatctttcaccatggttgaactaatttacattcccaccaacagtggacaagcattcctctttatccacaacctcaccagcatctgttgtttctttactttttaataatcattgtcccagtgcctgttaaacctgtcacacattatcagtttaataaat--GAGTCCCCCTTTGCCTCATCACAGTAAATGTTCTAGTGACTAtttctttttctttttcttctctctttc---------------------------ttccctttctttctttctctctctctctctt---------------------------------------------------ctttttcttttttcagagtctcactctgttgcccaggctggaatccattcatcgcaacctccacctcaaggttcaagtgattcttgtgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggtgcatgccaccat--gcctggctaatttttgtgtttttagtagagatgggatttcactatgttggccaggctggttttaaact----------ggtgatc----------agcctcccaaaatgctggaattacaggcTCCAGTGACTATTTCTATAGCTCTAGAGTCAGAATTCACcagtggcgtgctagaaaatgtttaaaaatgagtctgtcaaaaaaa-ggcatcctgctttgcagtatttgccattatccatgggtgaaaatccttccactatagccaatttcaagcaatcaacatgacatcactaaacaaagaattgtgaagagatgaatagtaccacaccattatataatatttccatgatacaggtacagat-taatagagacaaataacctcaaaagcatgaataataatgaaacacagtaaaacagttaagaagtgat------gagtttaagatctttattacctttgtttttaatctaattaattttgttgtcagctaatttagcttaaattttTTTCTAATTAAGATTT---ATTTTTTTCATAAGCACAAAGAATaaattttttattattagagttacagatataaaattatgttttaataaatgttatcacagcaaacagcataggaagaaaacaaattacaaaaactgaacatgtttattacaggcatacatctaggagattaatgtaaagaattgctattacattagtaaatttttatcgttctacaacttaacatttaatcatgacaatatttaa-caataggaaaatttagcaattgactcttgtaagctggtaccagccaactccaacaGCCTGCTGTGTTTCATCTCCCACCTCCCCAACTTACCTTTCTAGGGCTAGCTCCCTTGAGCAAATAGTTGAAAAAATGGGAATTTTCCTCTTATGTTTCTCTGGAACCGAGTTTTGGA-TCTGCTTCTCAGTGGCTTGTATGTTGTACCTGCGGGTCACTGGTTGATTTGTGGCAGGACACCATGGAGACATGGATGTGGAGCAGGCTACTCTCCCTCTGACTGTCCTGCTCCTTCGACCTCCCAGCATCACTCCAAACAAAGCTGCAGGAGTGAACTTGGTGCCCATTAATGAATAGTTGAGGAGTAATTAGACAAAATTATAATGTCAGAAGGGAAAATCCAAAAGCTGTGTGGTAATTCATGCAGTCCCAGGGT-------------------CCAAGGAAAAGCATATAAAACACTAAATCTTTCACATTttaattcaagagcaacttattggacatttactatgtgccaggcatagtgttagATCCATTTAAACAGTTGACATATCCTAAGATTTTAATGTGGCTATCTTGTCCTCAGTTTTTGTTCTCTCCCAAAATGTCTACTTTTTCTTACTTTCCTAATGTGAACTCTTACTCCCTGCTCTTCAGGAAGAATCCTGTTCCCTGACATCTCCACCTGCAATAGTTCTTTCCCCCAGTTTGGTATCATTTCATCTCAGTCAACCATAAATGAGATATGGGGGGAGATGGGGGCTTTTTAGAACGTATGTGGATGACCTTTGACACCTTCGATTCTACAAAAGAGGCTGAGTTAAGGTAGGGTTGGGGTTTCAGCTCATACAGAAAATTGAAAAGCAGCATAAACCTTTCAGATATCTCCTTTAAGATCACCCTAGCAGTGAAAATTGAAGTCATACTTATTGATTTTCTTTAATATTTTTTAGGTAAACATTCACTTATTTCATTAAGCATGTACACATAATCTCTGAAGGAAGATGTATTAATTCTGTGTCGGTAAACCCTAAACCCATAAAGAGGAATAAAATGTTTACCCAGTGGCCTGGTAATTTCTAAGGCACCTCTTGCCATGGCAGCAATAAGTAACATTGTTATGCAAAGAAGTTGAGTTCCTTTGTTTTACCCCATTATTCCTAAATTATATCCC-TCTTGCCCTTCTACAATAAGACTCAGACCCATTGGTGATCCATTTTCCTTCTTGTGGCCTCTCCTAGGAGTAGGTCTAGGTAATACAGCAAATTGGGATTCaggtgttaagagaagaaagatgaaataggacacagtccttattattgcagagctcacccgtcagtggggaatacacagatgtacaaataaaagactatgatacaatgtgataAATACCATAGCAGAACGTCAACAAGTAAATGGTATGGAATCATAGAATA-ATCTTCATTTTGAGTGGGAAGGTGGAAGACTTGGAGAAAACTTTATATTAGCATTGGGCAGTCCAGGCTCAGAAGGtgtattagtcagggttctctagagggacagaacaaataggatagatgcatgcatgaaggggagtttattaagataattgactcacacaatcacaaggtgtagtcccacaataggccatctgcaagctgaggagccaagaagcccatctgagtcccagaacctcaaaagtagggaagccaatagtgcagacttcactctgtggccaaaggcctgagagtctctgttatatcactggtgtaagtccaagagtccaaaagctaaagaacttggagactgat-ttcaggcacaagaagaaaccagcacaggagaaagaaggaggccagaagactcagcaagtctgctct----ttgcctccttttatgctggcagctgactagatggtgcctgcccagactgagggtgggtctgcctctcccagtccactgactccaatgttaatctcctttggcaacaccttcacagacacacctaggaacaatactttgcatccttcaatatgatcaagctgacactcaatattagccatcacaGAAGGGATTTGCCTGGCAAAGAAGACTGGATTATGTGAGGTACAGAAAACTGCAAGCGTCAAGATATAGAGGCCTTTGGATGGGGAATTGTATGTAGTCTACTATGATTATTGCGTGTGCATGTGTGTGTGCATGCATGTGTGCATTTAATGTGAAAGGAGTGATAAGGGCtgagcaaaataatcaaaaagtgagcaaaatgagcaaaaaAAAATGTGTAAAATGAGCAAAAATAAGATTAAGCAGCAAGATGCCAAAGATATTTGAATGTACtaaagattttggactttattttgtaagtgtgttggcctgaatagagccaattaatattctcaagtagaagagtgatatgctcagttacaagaaaaaacattgttctcattgttaagtatgacttgttgtgcagagactgaaggcaggcggatagctaagaagctgttaggataatcaacttttcggagatgaagacctgaactagagtagttggtgtggtaggtaagcaaacagaacattatagatcaacagttcatagaagataattaataaaaagaagaactaaagaatgctttaagtctcctaaatgaacctctttcaggtaggtggggaggctgttaacataacataggtagcaagtatagggaagacactgacggattgaatgtaaagtacctggaaaacaccaaagcagagatgtccaagtttcagttacaaatgggattttgcattcaagaaaggggtcagaatggaaggtctataaatttgggaattattagaaaataATAAtgaactagtttcccactgctgctttaagaaattaagtagttccccttatctgcagttttgatttccatggtttcagttacctacagtcaaccacaatctgaaaatagctgaacatagtgcactaacgtattttgagagagagag-----aaaaaagagacagagtatccacatttacataactttaattacagtgtgttgttataattgttctattttattattagttatggttgttaatctctcactctgcctaattcataaattagactttatcataggtatgtctgtatagaaaaaacatattatatattgggtttggtactatctgtgatttcaggtatccacgggggaccttggaatatatcctctgcagataaggggagatgactgtactataaacttaggaatttaaaacaacacaaatc--ttatttttcagaagcctggaatgagtcttttgagacaaaaataaaggtttcagtcggattgcattccttctgtaggctctaggaggcagttttccttccttaccttttccaactcctagaagctgccttctttttttggcttgtggcccctacctccaccttcgaagtatcttagtcaacctcactttaattgtcacatctgcttcttccatacagacctgcctgctcatctagataagtcaagataacctcatctcaagattcttaacttaatcatatcagcaaaatcccttttgacatgtatgctaacacattaaacaggttctgggagttcgagtgtggacatctttgggataggagtcatggttcaaccgaccacaGGGGTAGATGAGAAAAGTGTGGAAGAATGAGAAAAGAGAAGGGCTGAATGCAATAATCTGGGAACATCAATATGAGAAAGAGGAAGGAAGATACGTGTACAATAAATGTTTCTTGGAAGTCAATGGATCAAGACATTTATAAAAGGAGAAATTAAAACTCTCCAAGACTCTTCTCTGCCAGTGGCTCTGTTAGCCTCCCAGCCACTAGGTTTACCTTCCTGCTAGTCTATGAAATGAACAAAAACACCAAATGGTATATGAAACAATGATGCAGTCCATATCTGCCAGTTCCTGATTTATTTGCTCTCCAGGGTGGCACTAATTAACTCTGAACTCCTGGTTTGACTCCCAGGTCTAAATCCAAGACTTGATGTAACCTTTAAGCTCCCTTTTCAGAATTCGGGTTGACTTGTCCTCTGGTTCTCTTCTCTTTTCACTGTGGTAGCAGTGAGCAACAGCAGGCTTCCAGATCCTTAAGGATCTTTACCTTCTAAAACTGGTCTCTTCCTTCCCTCTCAAGCCCCTTGAGCAG-AAGAGTGGAATCACTTAgtacagcagatccctgaacaacattgtttcattca a score=183257 s hg17.chr12_random 203640 2461 + 466818 TGTCTTTGGCTAGTTTTCTTATGAGTTAACATACTATTTGTATAACTGCTTTCCATTTTACCTTTTTGCTATAGGCAGGAACCAAAGATTGTTAATTATTGATTTGAACCTGTTTTACTTGATATTTAAGACACCAGTAAGAACTTTCACtttttttttt-----ttcttcttagacagagtctccctctgttacccaagctggagtacagtggcaggatcatagcccactacagccttgaaaccctgggctcaagcaatcctcctgcctcagtttcccaagtatttggaactataggcatgcagcaccacgccagctaatttttcaattttttgtagacatggagtttccatatgttgcaaagggaactcctgctctcaagggattctcccaccttggcctcccaaactactaagactacaggcatgagccatcacatccagccTGCAGGGGGAGGTTTTGAAGGTCAGATGCTACCTAGAGCTTCGTCTCATGTCCATCCCAAGGTGGATCTAATCAGTTtgtagttactacctcttcctgaacgtgtaattgaactggatacgtatggcagctggcaggactttcacattcttcgtgaactgtagagtaagggacattattatagcaggaccaagttgaagcctctgaaattctccactgctggcaacccaatgtataaaatataataaccgcattccctaaggaatggaactggtcactgccgtgacaaaacacttgcaagttacaggggatggtagacctttctataactggattcacttaacctatctggcctctaccaaaaccagatggattatagaatgagtgcagattaccataaacttcaatcaacactcacaaatgctttctaggatgtactgtcttcacagagcagagcatagcttctggcactttttacggggctcgtcatttggtgaatatttgttaatctacaccctttatgagggaaaatcaagacaatttgccttgtattgtaagaataatagcactgcttcactgttttatgtcaggactatgtcacttctgttctctgtttaatttacatttttttaaaaacatcatgctaatttaatatattaataatattacagcccgggccctgtggcacatgattgtaattccagcactttaggaggctg-------------acttgggcccaggagtttgaaaccagcctgggtaacatggtgaaatcccagccctacaaaaaataccaaaattagccaggcaaggtggtgtgtccctgcagtcccagctgctagcaatgctgaggagggagaatcaactgagcccagaaggttgaggctgcaatgagctatgatcctgccactgcactccagcctcatggacagaatgagaccctgtctcaaataataattatatattatttggtaaaataaacaggaagaggcaagattcttaatattgtaaaatactataacattgaatggaagtaaaataccagaagaaaagagatatgtgaagattcagggactgacaacataggtgatgttttcaggttttcagtgtccctagtccacatgtcaaaacaatcttttttaaagtaaacggcatgttgctctctctctatatttcctatcactacaaaagagacacagtgttttgggggcctactgggattttggagccaacatattccacatttgagaatattgctctgactcattaatgaagtttctataggctactggtctcaaatggagcccagaacaaaagagggctctacagcagatataggttctgatccaaactgctatggccactgagccaaatgatccagcagaattcaaagctgttagaggcatacatagtgggcattataggactctgtgcacgtctctgacaagcctgtgggagaggggagagcaaatccctatggaattagtgcaagaccattccctcttcagcagaggagtatcct-------------------------------------------------------------------------------------------------cTGTGCAACTGTGCAAGTCATATGCTCATAAAGCCAGCCATGACTGGAGGGCATGAGTACATCTGAGCGGCACAAAGAGTGG-TGGTATTGGACACAGACATGTGCTTTCTTAGATTCCCTTCACTATCTCCTATTCCCCTGGCCAGCACCTTGCCTGAtccagatcatccttccatttgggacttgaatggaacaccacactgtgggcatgaggtctgactttcacaacctccacctagggactggatgatggaaggcagaacagcagagatggtagttctgcctcagggaaacaatggccaatgggaaatcaaatacagaagacaactgagcagatacattctccattctccctcctctctctcatccctggactaatgccggctgtggtttccccttgtagcccttctggaaaagtgctgggagccaagtgtacgcatctgatgaccgtcatgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcagagtcataccagacatc s rheMac1.SCAFFOLD85456 55496 2541 - 81052 TGTCTTTGGCTTGTTTTCTTAGGAGTTAATATACTATTTGTACAACTACTTTCAATTTTACCTGTTTGCTATAGGCAGGAACCAAATATTGTTAAATATTGGTTTGAACCTGTTTTACTTGATATTTAAGACACAAGTAAGAACTTTTAAttcttttttttcttcttcttcttagacagagtct--ctctgttacccaagctggagtacagtggcaggatcatagcccactacagccttgaatgcctgggctcaagcaatcctcctacctcagcttcccaagtatttggaactgtaagcatgcaccaccacaccaactaattttccaattttttgtggagatggagtttccacatgttgcgaagagaactcctgctgtcaagggatcctctca-cttgttctcccaaagtagtagggctacagacatgagccatcacctccagccTGAAGTGTGAATTTTTGAAGGTCAGATGCTACCTAGAGCTTCGGCTCATGTCCATTCCAAGGTGGATCTAATcagtttgtagttacttcttcttcctgaatgtgtaattgaaatggatatgcatggcagctggcagaactctcacattcttcatgaactgtagagtaaggaacattattatggaaggaccaaggggaagcctctgaaattctcctctgctggcaacacaatatctaaaatgtaataaccacattccttaaggaatggaactggtcactgccatgataaaacacttgcaagttacaagggatggtagtcctttctataaccggattcacttaacctatctggcctctaccaaaaccagatgggttatagaatgaatgcagattaccataaacttaaatcagcacttacaactgctttccgggaggtgctattttcatggagcagagcatagcttctggcacgttttacggggttcgtgatttggtgaatgtttattaatctacacccattaggagagaaaatcaaaa-aatttgacttgtattgtaagaataatagcactgcttcactgttttatgtcagggctatgtcaattctgttctctgtttaatttacattttttt-taaacatcatgctaatttaatatattaataatattacagaccggaccctatggcacatgattgtaattccatcactttaggaggctgatatgggcaaatcacttgagcccaggagttttaggccagcctgggtaacatggtgaaatcccagccctacaaaaaatacgaaaatcagccaggcgtggtggtgcgcccctgcagtcccagctgctagcaatgctgaggcgggagaatcacttgagcgcagaaggttgaggctgtaatgagctgtgatcttgccactacactccagcctcagggacagaatgagaccctgtcccaaataata---atatattagttggtacagtaaacaggaagaggcaagtttcttaatattgtaaaatactataacattgagcggaagtaaaataccagaagaaaagggatatgagaatattcagggaccaacaacataggagatgttttaaggttttcagcatccctagaccacatgttgaaacaatctttttaaaagtaattggcatgttg--ctctctctatatttcctatcgctacaaaagagacacaatgttttgggggcctattgggattttggagacaacatattccacatttgagaatattgctctgactcattaacgaagcttccaaaggctactggtttcaagcggaagccagaacaaaagagggctctacagcagatatagtctctggtccaagctgctctggccactgtgccagatgatccagc-------------------ggCATGCATCGTGGGCATTATAGGACTCTGTGCACGTCTCTGACAAGCCTGTAGGAGAGGGGAGAGCAAATTCCTATGGAATTAGTGCAAGACCATTCCCTCTTCAGAGGAGGAGTATCCTCTGCCTGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCAAGTGCAGAACATTAATCCAAGCACAGAGTTCATCTAAGCACAAGCCCCTCTGGGCACAAAACCCTGTGCAGCTCTGCAAGTCATATGCTCCTAAAGCCAGCCATGACTGGAGAGCATGAGCACATCTGAGTGGCAAAAGGATTGGACTGCACTGGACACAGACATGTGCTTTCTTAGATTCCCTTCACTATCTCCCATTCCCCTCGTCAGCACCTTGCCTGAACTAGATCAACCTTCCGTTTGGAacttgaatgcatcaccacactgtgggcatgaggtctgactttcaaaacctccaccaagggactagatgatgtaagacagaacaacagagatggtagttccgcctcaggtaaactctggccaataggatatagaagtccaatgatagctgagcagaaa-------cattctccctcctctctctcttccatggactaatgttggctgtggtttccacttgtagccctcctggaaaaatgctgggagccaagtgcacgtatctaatgaccaccattctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcagagtcacacCAGACAAC a score=185645 s hg17.chr12_random 206101 2704 + 466818 accacacattgtttcacatttgttcctgtctcaatttccacatatccttgccatttttgtcttgaacttgatttctaaataaatgtcatcaccttaatAACAGGTAATACATAAAAAACATTTTAGTAAAGTAGCTGGTTACTAACTCAATTTTT-AAAATGAAATGCCATTTTTGTTTAAATAATAATCAACTAGAAAATATCATAATACAAATATATAATTCACAATAGAAAAAAATACATATTCAAATAGACCAAGGTTGTTTATACGCTTTCTAAAAATATTGTAATAGGCGCCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCTCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTATATTATTGTCATATTTCCCCTAAAATTGTGGAATAGCCAAACTTTTCCTCTGCGGAAGGATTCTGCTTGGATAAGCCTGTAACCTTAACCTGAGAACAGAACAGGGGAATTCACGCAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTCCCTTTCATTGGTTTACCACATCAGCTTACCCATTTTATCCACCCatttatttgttcattaaaatatcatttttgaccatctattcttgttgctgggttctaggtcctgggagtcaacagaaagcaagaaagagatgagatcatcttgctctctgatcttacattcaacagaaagcaagacaGAGATGAGATCATCTCTGATCTGATTTTACAGTTCTTACATTGTACTGAGGAAGATACATGATTTTAAAAAAACACATAAATCACATGTGGGGATGATTTATCTTAAGGTTTAAATCACATTTTTAAAATTTCATAACACCAA-AATTAATACAGTCATGTAGAATTTAGCTGTGAACAAGACTGTACATTTCCATCTCATAATAGAACTTCCTATTAATGAATATGTCAAC-CACTTTCATTTCATCATTGACAACAAAATTATAACTGTAAAGCACATTCTATAATTAAAACATAGATTTCATAGATGCCATTTTAACATTTACAAAAA-TTTCATTGATTTATTTTCCATAATTTCTATACTATTTTTACATTGATAGTTTTTTTTTAGAATAAGGAAGATTTGGGTTCTGTTACCTGAAGTTTAGAAGGAATTTTATAAATGGAAGGTAAGGGTATAATTAACAATTCAGGGGCTTAAAAGTGCTTTAGAAAAAAATACTAAAATAGTTTACATCACCTCTCAACTTCAAAAAAAAAGCTTTTCTTTAATCCAAAAGCTGGAAGAAATGACTTTTCTAACTACATATGGAAACTGATAATAGCAATCAAGATCACAATCATGATTTTTC-ATCCCTATTATAGAAGAGATTGTTTTCTAAGCTATTCACATGCTTGTATTAAATCTAATATTCCTCAGAACTGTTTATGGTAGACATAGTTGAAACTTACTCTACATATGCTTGTCACTCAAATTTTATTGTGTGCATTGTTTTCTATCAATAATTCTGATTGCTTTTTACTAAACATAAAATAGGAATTCATAATGGAATAAAACCTCAAAGACACATCCTTATTATTGATTTAGAATTGAATGACCTTACCATCCAAAAAGTTACAGGTTCAAACAATGAATTCGAAGCACACTGTGGTATATTTGTGTGGTTCAAATAACAATAGAAAACAGCAATGTCTTTCCTGAGATAAGCTGATAGTTCttaataattataaatatagatcataaattattcaaatgaaatataaaataCATAAATGAAATAGGTATGGATTCATAATTCTTAAGAATTTTTGTCATATTTTGTATAATTTGGCAGTTTGTGTGAAAAAACAAAAAAGAGTATGTCACTGTCAATGTTCTTTTGTTTTTcatacaaacatacacacaaaaatacatatatatacatacgcacTTTTTTAGACTAACGTTAGGTAAAAGACTTTTCTAGGTACATGCTTGAAAGTTATTCATATACA--TACATTACAGAAAACACAGTAAGAAATATAAAATGCTTCATATAACAC--GTTTGTTTTCTGCTAGAAGATACACAATGCTGCTCTTGTGAATCTATGAAGATGAAGGCTTCTCTCCTTTCACCCAGTACCTCACATGCCACAAAACTGAAAGAAAAGTCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCAAATCAGGATGAATGGGTGGGTTGAAGGATAGCTGAATGCAATAGCTTCGCAGAACATGAAGACAGGTTTGTTTTCCAGACTCTCAAAACTCTAAACTGACATGATTATGGACAGAAAGTAAATGGCACATAACAAGAGGAAGGAGGTCACAGTTTGCATAGCTTTTATGTGGACCTTCATGCTGGGATCTTGAGATCCTTTGCCATGGAGCTGCATCTTTTTGAGATGTTTACACAGAGAACAGATTAACAGCAGAAAAGATATCAGGGTCAGAGTGAAGGGAACTAAGTTTGCTAGGATGGTTACCGTTGTATTTGAAAGGTACATTGCACTCCTCAGTTTGATCTTCCAAGTCATGTTTCCTTCATATTCTTTTGTCCATATAATCTGATTCATGTTTATCACAAAAAGATGACAAACCAAAAATAGCAAAGG-CCCCAATAGTATCACCAGAACAACACTCTTAACTCTCCTCTTTAAGTGAAGAAAAATAAGGTTGGAGAAATTGGCAATCTTGAGCAAATAAAATATGCTGAGGCTAGTAGCAAGCCAGTTGCTGAAATGGTTG s rheMac1.SCAFFOLD31009 30935 2611 - 42162 accacacattgtttcacatttgttcttgtgtcaatttccatatttccctgccatttttgtcttgaacttgccttccaaataaatgtcatcgctttaatATAAGGTATTACATTAAAAATATTTTAGTAAAGTAGCTGATTACTAACTCAATTTTTTGAAAGGAAATGAA----TTATTTATATGATAACCAACAAGAAAATATCGTAATACAAATATATAATTCACAGTA---AAAAATACATATGCAAATAGATCAAAGTATTTTATATGCTTCTTAAAAATATTGTCATAGGTGCCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTATCTCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTCTATTAGTATGATATTTCCCCTAAAATTGTGGAATAGCCAAATTTTTCCTCTGAGGAATGATTCTTCTTGGATAAGCCGGTAACCTCAACCTGAGACCAGAACAGAGGAATTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGGGTTTCCTTTTCATTGGTTTACCACATCAACTTATGTGTTTTATCCACCCatttatttgtttattaaaatatcatttttgaccatctattcttggtgctgggttctaggtcctggga---------------------------------------------------ttcaacagagagccaggcagacacgatttcttcc----------tttagcgtacttacattgtacagaggaTGATACATGATTTTAAAAAG-TACATAAATCAGGTGTGGGGATGATCTATCTTAAGGTTAAAACAACATTGTTAAAATTTCATAACACCAAGAATTAATACAGTCAAATAGAATTTAGCTGTGAACAAAACTGTACATTTCCTTCTTATAATGGAACTTCCTATTAATGAATATGTCAACACACTTCCATTTCACCACTGACAACAAAATTACAACACTAGGGCACATCCTATAATTAATACATAGATTTCATAGATACTATTTTAACATTTACAGAAAGTTTAACTGAATTATTTTCCATAATTTCTGTAGTAGTTTCACATTGATAGTTTTTTTT-AGAAAAGGGAAGATTGCAGTTCTCTTATCTGAAGTTTAGAAGGAATTTGATAAATGGAAGATAAGGATATAATTAGCAATTCAGGAGCTTAGAAGTGCTTTAGAAAAAA-TACTATAATAATTTACATCAGAGCTCAATTTCAAAACAA--GCATTTCTTTAATTCAAAC-CTGGAAGAAATGACTTTTCTAACTGCATATGGAAGCTGATAACAGCAATCAAGATCATGATAATGATTTTTCGATCCCTCCTATAGAAGAGATTTTTCTCTAAGCTATTCACATACTTATATTAAATCTAACATTCATCAGTA--GTTTATGGTAGACATAGACAAAATTTACTCAACGTATGCTTGTCACTCGAATTGTTTTGTGTACATTGTTTTCTAACAATAATTCTGATTGCTTTTTACTAAGCATAAAATAGAAATTCGTCATGGAATAAAACCCTGAAGATATATCCTCATTATTGATTTAGAATTGAATGACCTTATTATCCAGAAAGTTGTAGGTTAAAACAATGAATTCTAAGCACACTGTGGTATATTTGTGTGGTTCA--TAACAAAAGAAAAAAGCAATAT-TTTCCTGAGCTAAGCTGTTAGTTCTTAATAATTATAAATAGA---CATAAATTCTTCAAATGAAATATAAAATACATATATAAAATAAACATGGCTTCATAATTCTAAGGAATT--------ATTTTCTATAGTTTGGCAGTTTTTGTGGAAAAATAATAAAAAGCATGTTATTGTCAATGTTCTTCAGTTTTTCATACACACATAAATGCACACACACACATATA----------CTTTTCTAGACTAACTTTAGGTAAAAGACTTTTCTAGGTATACATTTTGAAATTATTCATATACACATACATTACAGAAAACACAGTAAGAAATAGAAAATGTTTCATACACTACCAGTTTGTTTTCTGCTAGAAGACACACAATGCCCCTCTCGTGAATCTATGGAGATGAAGGCTTCTGTCCTTTCACCCAGTATCTCACGTTCCACAAAACTGAAAGAAAAATCTGCTTTAGCTTCTTGTTTCCCCAAATCAGGATGAGTGGGTGGGTTGAAGGATAGCTGAATATGACAGCTTGGCAGAACATGAAGACAGGTTTCTTTTCCAG---CTCAAAATTCCAAACTGATAGGATCATGGACAGAAAGTAAATGGCACATAACAGGAGAAAGGAGGTCACAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGGGATCTTGAGATCCTTTGCCGTGGACCTGCATCTTCTTGAGATGTTTACACAGAGAACAGATTAACAGCAGAAAAGACATCAGGGTCAGAGTGAGGGGTATAAGGTTTGCTAGCATGGTTACAGTCACATTTGAAAGGTACATTGCACTCCTCAATTTGATCCTCCAAGTAATGTTTCCTTCATATTCTTTTCTCCACACAATATGATTCATGTTCATCACAAAAAGATGACAAACCAAAAATAGCAAAGGGCCCCAACAGTGTCACCAGAATGACACTCTTAACTTTCCTCTTTAAGTGAAGAAAAATCAGGTTGGAGAAAGTGGCAATCTTGAGCAAATAAAACATGCTGAGGCTAGTAGAAAGCCAGTTGCTGAAATGGTTG a score=294406 s hg17.chr12_random 208826 3909 + 466818 GCAGTAATTCTTACTTCTATACTGTTAAAAGCTGGATTCAACTCAGTTGCATACCAATTTAATACTAATACCCAGAGTAAACCAACTCTGGAGACTGCCAGAGCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAAGAGATCTTTTGTCTCTTGACCCACTCAATGGAATTTACCAATGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATCACAAATGTAACCACTATTAGAATGGAAAAAATGATGGGCAGAAAAGTTATCATGTCTGAACAGACAAAAAGAAATTTTTAAAATGCTGGTGTAATATCACTGGTTGTGATTGCTTGAATATCCTGACCTTAAATTCTATATGCACCTGATTTGTGTATGTGCTGTGACATTCTTTTTACTTTTAATTGTTGGTACCAATGTCAAGCCAGAAATCACCATGGCATGCTAATGGGTAAGTTCAACGCTCTCTTTATGGAAAATATTCTTATTTTCAAAACAACTCAAATTAACCCATTCATTCACTGTCTGTCCTTGTTATAGGCTGGAATTATTCATACTGAAGTTGACATGAAACCTGAATTCTCATTTGCTAGTATGCAAACAAGGACATATTCACTTTCAGTGTTTGCAATTTTTCCTTGTGTAACCTCTCCATCATTTGTCTTTAGTGACTTCAGTTGTTAGGGAAGTTTTATAACCCAATACAGAGATCATATAGTAAATGTCTAAATTCTTAAAAGGAGCTTGGTCATAATTAAGTTCATCACCTATATGGACTTTTTTAAATGACAGATTTAAATACACAGAATCCAAACTGCTTTTATCAAAAATATCTAAGATTTTCTGGAGAACCTCAG-------------------AATCTGGTTGCTGCTAATACGTTTGTATAACTTCATTATTCACAAGCTCATAAATACACACACAAACACACACATGTGCACACCACTCACGAATGGAACAAATTATTTTCTCATCAGTTCCAAAATAAAAAAAGGAGTTTCCAGGAGGTTGTCTAGGTGAAGTTAGTCCTATTTTCCCACTCAGGGCTTTCAGCTCATGAATAATATTTATTTATCAAACATATCTCTAATTCTTAGGCCTTTGGTAAAGTTTCTCTCAAGACTAATGTTTAAATATTTATTA-CTATACAAAACATTTAGCAATTGTATAAGAATTCCTGAGTACCCAACCCTTTGATATATAGTCTTGCAGTATCCTGCCATCACTGAGAAGACTGACTACCTTGCCCCTGAACTTGGAGTACAACCATTTAACTTGCTTTGATAAACAGAAAATTACTACACTTTGCATAGAGATTTCAGATGGCTTCCATAATGGGGATTCTTCCTCTTTCCATTTACCATGAGAATATCACCTGGCTAGTACACTGTTCCCAGAAGGAGAGTGAGAAACTAATGAAGTCAGATTGCCCCCACCTGATCCAGACCAAATTGGCCAAACTCTAACTACTACCAAGATTCAGAATTTGGTCCATTTCAAATAAACAGAGCCATCCACCAAACCCAGCTTAAAAAAAATGAAATCCAACAACATGTGAGATATAAACATCTAATGTAG-TTTGGAGGGTTTTTCTCTTGCAGAAAAACATAACTGATAAATCAACTCTGCTAAACCAAGAGTGTGGGAAATATGTACAACCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGAGCCAAAAGCAAAAATAGATGGGAAATTGCAAAGGTTTGTTCTTGTGAGGTCGATAATTAAGGCTAGAAGAAATCCATTGGAAAGTTCTGGGGTTGGAGGATAACATCATCTCAAATTTCCTCACGTTGCAACTAAATAAGAAAGTGCTCACTTCAACTCCCTTAGAGTTGTATAACAATGTATACAAATAGTTTATTATTGCCATCAGTATATAATGAGATGAATAATAATAATTTCTATGAGACATATCTCCTAATTAAACA-TTTTACATTAAAATTATAATGCACACTTAGAAATGAACCAAAACAAAAATGGGAAATACCGCAGTGTATCAtaaacattcaagtaaccatgatgcag-gcaagacaaggaacaccaaacacaacctaggtccacctccatgccactttccaagtccctaaacatttcttcatacctcctgagataagcaatatccaaaatttatggtgattatttccttaattttctttacactttaccaactaggtatgcaaccctaaactccatcgcttggtctggcctgctttgcactgtgtgtaggtgcaatcctacatgttcttcttgtttgtggcttcttggactcaacattgtgtttctgaaatttagtcacatagttgcaagtacatgtgattttttttcacttctctatattgttccattgtgtggatttactgtaatgattgatctatccttaatatatatttggccagcttcttttttgaacagttacgaataattctactagagcattctttcatatatcatttgatgcaattcctctgtatatatacctttgagtagaattacagggtcatTGTGCAAAATATCCTCATAGACATAGAAAAGTTTAAAAGATAATTTAACTAAATGTACTCCTGTCAGCTTTACCTCCATTCTATTTTTTGCCATTTGCATATATCTTATCAATTATATAATTACCCCAACAagacattattattttatgcagtaaacattcatttagaattatgcacatatttaccac-ttcattaatttgtattcctttttgcatATTCAATTTAATAGTTTCAAAAAGTCCTTTTATTggcaaggcagggtggctcacacccataatctcaacattttgtaaggctgagtcaggaacacccaggagttcaagaccagcctgtgcaacacagcgaaactgtgtctacaataaatgaaaa----agccaggcataaggaagctactcacaaggctgaggtgggaggatggtttgatcccgggagttccagactgcagtaagccatgatcctaccactgaactccagcctggacaccagattgagactcCAACTCCACATAGAATAATACTGATAATAATAATAATTTTTCTATTATCTGAAAAAAATATCATTTTAAGTTTCTGTTTATCAAGGTCTATTCTACTTTTGAAATGCACtgaaggcatgattccattgaattctagcttcatttttgtctgttgaaaatcaggttgtcatttagacagttattccctttaacataatctgtcttttcctttagttacctttcaggttttttattggtctttgatgtcctgtcattttatattaatttggtttTAGTTATCTTGTCTGAAGTTTGATGGTTTCTAAAAATATATGAACTGATACACTTTACCACTTTTGGAAAAATCTCCACAATGCTTCTGGCCcattttctctcttctaatcttctggaactgcagaagtatgttagttgttctgattgtagcttcaatgtctctgaccctctagccttatattttctacctcttggtctctttatgcttcattctgggcagttatcttccaattcactaattctt---tcttatgtttaactggttctcaactctgtctattggattctcaatattcattactCTTTTTTATCTTATTGTTTTAGGGGTAGAAATGAACTTTTATTCTCTTGCTATAAATCA--TTTTTAATGGAGAAACTAAACAAAGTATTTATAACACCAAGTTCTTAAAAAA-TAGTTTTTATAAATTTTTAGTACACCTGACATGAAAATTTTAGTGATTTTCTTCTTTTTGTAATACTTAGGTCACAGAAGAGATCAAAATTATGGTCTAGGCATTCTCCTGCCACTGGGAAGAAACTGGAAATTGATTTGATGTGAGTAGCTTCTTTTGAATAGTAACTTGTCTGTTGCTGGGTCATCACCACAAACTCTCCTCAAAGGGAAATTCAGTGAACAGCACTGGATCTCAAA s rheMac1.SCAFFOLD31009 33597 3916 - 42162 GCAGTGATTCTTACTTCTACACTATAAAAAGCTAGATTAAACTCAGTTGCATACAAATGTAGTAATAATACCCAGAGCAAACCAACTCTGGAGACAGCCAGACCAGTGAGAATTTGGTCAGCAAAGGAGATTTTTTGTCTTTTCACCCACTCAATGGAATTTACCAATGCTATGAAGCCATTAGCAAAATTTCCAATAACAAATATAACCCCTACTAGAATGGAAAAAGTGATGGACAGAAAAGTTATCATATCTGAACAGACTAAGAGAAATTTTTTAAATGCTAGTGTAATATCACTGGTTGTGATTGCTTGAATATCCTGACCTTAAATTCTATATGCACCTGATTTGTGTATCTGCTGTGACATTCTTTTTACTTTTGATTGTTGTGACCAGTGTCAAGCCAGAAATCACCATAGCATGCTAATGGATGAGTTCAATGCTGTCTTTATGGAAAACATTCTTGTTTTCAAAACAACTCAAATTAACTCATTCATTCGCTGTCTGTTCTTGTTATACACTGGAATTATTCATACTGAAGTTGACATGAAACCTGAATTCTCAGGTGCTAGTATGCAAACAAGGACATATTCACTTTCAGTGTTTGCAAGTTTTCCTTGTGTAACCTCTCCATCATTTGTCTTTAATGACTTTAGTTGTTAGGGAAGTTTTATAACCCAATACAGAGATCATATAGTAAATGTCTAAATTCTTAAAGGGAGCTTGGTCATAACTAAGATCATCACCTATACAGTCTTTTTTAAACGCCAGATTTAAATACACAGAATCCAAACTTATTTTATCAAAAGCATCTAAGATTTACTTGAGAACCACAGGCAGGCCAGTACTCCATAAGATCTGGTTGCTGCTAATACTTTTGTGTGACTTCATTATTCTCAAGCTCATAAATACACACACAAACAAACACATGTGCCCTCCACCTATGAATGGAATGAATTATTTTCTCATAATTTCCAAAATAAAAAAATGAGTTTCCAAGAGGTTGTCCAGCTGAAATTAGTCCTGTTTTCCCACTCAGGGTTTTCAGCCCATGAATAATATTTATTTATCAAACATATCTCTAATTCTTAGGTCTTTGGTAAAGTTTCTCCGAAGCCTAATGtttaaatatttattatttaattaaaatattCAGCAATTTTATAAGTATTCCTGACTACCAAACCCTTTCATATATAATCTTGCAGCATCCTCCCATCACAGGAA-----GATTGCCTTTCCCCTGAACTTGGAGTTCAATCATTT-ACTTACTTTCATGAACAGAAAATTACTACACTTTGCATAGAGATTTGAGATGGCTTCCATACTGGGGATTCTTCCTCTTTCCATTTACAATGAGAATATCGCCTGGCTAGCACACTGTTCCCAG-AGGAGAATCAGAAACTAATGAAGGCAGATTGTCCCCACCTGATCCAGACTAAATTGGTCAAACTCTAAGGACCTCCAAGATGCAGAATCTGGCCCATCTCAAATCACCACAGTCATCCACCAAACTCA--TTTAGAAAAATGAAATACAA-AACATGTGATATATAAATGTCTAATGTAGTTTTGGAGGG--TTTCTCTTGCAGAGAAACATAACTGATAAACGAACTCTGCTAAA-CAAGAGTGTGGGAAATACATACAACCTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGAGCCAAAAGAAAAAATGGATGGGGAATGGCAAATATTTGTTCCTGTGAGGTAGAAAACTATGGCTAGAAGAAATCCTTTGGAAAAATCTGGGGGTGGCAGATAACACGGTCTCAAATTTCCTCACGTTGCAACTAAACAAGAAAGTTCTCACTTCAGCTCTCTTAGAGTTGTATAAGAATGTATACAAGTAGTTTATT-TTCCCCTCAGTATATAATGAGGTGAGTAATGATAATTTCTATGAGACATTTCTCttaattaaaaatttttatattaaaattataatGCACACTTGGAAATGAACCAAAAC-AAAATGGGAAATACCGCAGTGTATCAtaaacactcaagtaatcatgatgcagagcaagacaaggaacactgaaaacagcccaggtccacctccatgccactttccaagcaactaaacccttcttcacacctcctgagataagcaatatccataatttataatgattatttccttaattttcttcatactttaccacctgggtatgcaaccctaaactgcatagcttggtctggcctgctttgcactgtgtgtagatgaaatcctacatgtttttcttgtttgtggcttcttggactcaacattatgtttctgaaatttagtcacatagttgaaagtacatgtgattttttttcacttctctatattgttccattgtatggatttactgtaatgattcatccacccttaatatatatttggccagcttcttttttgaacagttattaataattctactatagtattctttcatatatca-ttgattcaatttctttgtatatatgcttttggatagaaatacagggtcatTGTTCAAAGTCTCCTCATAGACATAGAAAAGTTCAAAAACTACTTTAACTAAATTTACTCCTGTCACCTTTACCTCCAGTCTATTTTTTGCCATTTGCATATgtcttatcaattatataattacccaaacaagacattattattttatacagtaaacattcatttacaattatacacatatttaccactttcattaatttgttttccttctcgaatATTCAACTGAATATTTTCAATAAGTACCTTTATTggccaggcagggtggcgcacacccataatcccaacattttctaaggctggagcaggagcacccaggatttcaataccagcctgtgcaacacagcaaaactccctctacaacaaatgaaaatcttagccgggcatcgtgaagctactcataaggctgaggtgggaggatggtttgagtccaggagttccagacggcagtaagccatgatcctaccactgaactccagcctggacaacagagtgagactcCAACTCTACATACA---------AAAATAATAATAATTTTTCTTTTATCTG-AAAAAATACCATTTTAAGTTTCTGTTTATCAAGGTGTATACTACTTTTGAAATacactgaagacatgattccactgaactctagcttcatttttgtctgttgaaaatcaggctgtcatttagactgctattccctttaatgtaatctgtcttttcctcttattacttttcaggttttctattggtctttgatgtcctatcattttatGTTAATTTAATTCTAGTTATCTTGTCTGAAGTTTGATGGTTTCTAAAAATATATGAACTGATACATTTTATCACTTTTGGAAAAACATCCacatttcttctgccccattttctctcttctaatcttccagaactccagaagtatgttagttgttctgattgtagcttaaatatctctgaccctctagccttatattttgtatcccttggtctctttatgcttcattctgggtagttatcttccaattcactaattctttcctcttatgtttaactggttgttacctctgtctattggattctcaatgttgattacCCGTTTTTATCTTATTGTTTTAGGGGTAGAAATGAACTTTAGTTTTCCTTCTATAAATCATTTTTTTAATGGAGAAACTAAACAACGTATTCCTAACGCGAAGTTCTTAAAAAAGGAGTTGTTATAAATTTTTAGTATACCTGAAATGAAAATGGTAGTGATTTTCTTCTTTTTGTAATACTCGGGTCACAGAAGAGATTAAAATCATGGTCTAAGCCTTCTCCTGCAACTTGGAAGAAACTGGAAATTGATTTGCTGTGA-TAGCTTTTTTTGGATAGTAGCTTGTCTATTGTTGGGTCATCACCACAAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAGTGAGCAGCACTGGATCTCAAA a score=34733 s hg17.chr12_random 212735 552 + 466818 CTGTCATTACAATTAATAAAATAGAGTATCTCAACTACAGCTCCACCTTTCTATTCCATGATTTAAATTTTACTCTGTTTTCATTAGCAGAAATCAAGACTTCTTCATTTATAACAATCTTCAAAAGATCAAAGAGTAAAACAGTACATACAAGTTTATGAAAGATTGAAGAACTTTT----------------AAGTCTCATGGAAACAAAACTGAATCTGGTGTTTCTAAAGAATTCCACCATTTAATCCCTATCCAT-AGTATAGTTTTGTTTATAGAACTATAACTTTCAAACTCCACCATCACTCACACAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTAA-CTCTGTTTGACTATTTGGTCCTAAAATCCTCTC-TTAGAAATAAAAGCTAGCTCATAAAATGTATTATTTGCTTTATCCTTCTTATTGGGTAGTTTTAGTTACACTAAAATCTAAATTGTTTCTATAGTGATCATAATGAAACAAGGATTAGTTTAAGCTCATCCATAAATAATTATTTGCTTAAGCAATATATTGTAAAATAAGCTATACCTAATTTCTAAATCTAC s rheMac1.SCAFFOLD85601 21086 552 - 44828 ATGTCATTTCAATTAATAAGATAAAGTATCTCAACCACAGCTCCACCATTCTATCCCATAATTTTAATTTTACGCTGTTTTTATTAGCAGAAATCAAGACTTCTTAGTTTATCACAATCTTTAAAAGATCGAATAGTAAAAGAGTACTTACATGTTTATCAAAAAATGAAGGATATCTGATATAAGTAGACTCGAAGTCCCATGGAAACAAAACCGAATCTGGTGCATCTATGGAATTCCAACATTTATTCCCTATCCGTGAATATAGTTTTGGTTATAGAACTATACCTTTCGAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTAACCTCTGTTTGAAAATTTGGTCCTAAAACCCGCTCTTTAGAAATAAAAGCTTGCTCATAAATTGTGTTATTTGCTTTATCTTTCTTATTAGGGAGTTTTATTTACACTAAAATCTACGTTGTTTCTATACTGATCATAGGGAAAGGAGGATTCCTTTAAGGTCGTCCATAAATAATTA-TTGCTTAAGCAATGTATTGTAAAAT-----------------TAAA-CTAC a score=6155 s hg17.chr12_random 213287 86 + 466818 ATGTATTGAGCATGACT-AAGCTTTGCTGTTTACTCCTGTAATTTTCCCACAATGACGGTCTTTTTAAAATTACTTATTTTCCAAAT s rheMac1.SCAFFOLD85601 21791 87 - 44828 ATGTATTGAGCTTGACTTGAACTTTGCTGTTGACTACTGTAACTTTCCCACAATGATGATCTTTTTAAAATTACTTATTTTCCAATT a score=124214 s hg17.chr12_random 213571 1945 + 466818 tatGTATTTAAATATTTCAAAAATAAATCATTTAATGAGATGTATATATAGAT-GATGATGATAATAATTATGGCAGGTAAAAGGGAGAATGCTATTTGATAAATGTGATTTCCATCTTGTTTTTTAAGTACTGGAGTTCAGGGTAGTGAGAGAACCCTACTATTCTTCCTCATGGCCTCATGTTTCTTCTATGATTCTCAGCATCAGGCCTAGAGAAGTATCCTCATGTGGTAGTTCATCAAGAATAATGTAAAACCAACATATTTTCAAGAATTTCTTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTACATTTTAAAAATTCATAGCAAAAGTGACATCCGACAATTAGGATTCTATTTTGGGGCTTTTTGGGCATTTTTCAATATGAATATAGAAAAATACTCTCTGCAATAATACAGTATATCAACTTTATTTCATCTTTTAATAGCATCATTAGCAAGCCAAATTCTTGCAAG-GCTTTTTCACATTCTTAGCTATGGTGACTAAATCTGG---ATTTTACTATAGCAGTCAAAGTAGTATTTAATATGCACAA--ACATGCTCAAAGATCATGCTAAATATGTTTTATATCTT---AAATTTGCCTTTCTATGA---TTTTTTTCTCTAATGCAGAACCaaaaaatttatattaacaaaatattttaCCCAACACACAGGTGTACACATGATTAGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATACAAATATTTCATTTAGAGACACATTTTGGGATAATAGGTCT------ATGTATTTAACCTCCATCGTAGTATAATTTATTGGAAATTCATGACTTTGTGACACTTTGAAATCTGTATTAAAAATAATTAAATTGGAAA-GAGAAAAAAGGTGTCTAGCCGTCATAAATATTCAAGTTTTGATGTTTCAAATTCATATTAGCATTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCTTGCTTATGTCTTCTTTTTCAAAAAATAATAATTTAAGAAAATTTTCAGGACAGGTCTAgtggctcacatctgtaatcccagcattttggaaggctgaggcagttggattgcctgagcacaggagttcaagtccagcctgggaaacatgccaaaaccctgtctctaccagaaatagaaaaaattagcagggcgtggtggtgcactcctgttgtcctagctactctggaagctgagatgggagaattacttgagcctggatagcagaggttgcactgagccaagattcgaatta-gcactccagtctgggcaacagagagagaccctgtctcaaaac--aataagaaaaaTTTTAAATTTTAACTTGGATTTCTTAGTACCATAATGCTCTATTCTCCTTTATTCAGCAAATACTCTAATAACAATGGTATCTATAAGAATATGCTGTATCACCCTAATTTTATATGTAGGAATGTATTTTATGTTTCTGCTTTTTTAACTTTTTTttttttattggggagcataacttacatatggagcataataaaacctaataaacagtaagagaaaaaattataacattaacatcgatgttaccacaccttggtcagaaaatagaatttgccagtaatccagacactcccaatatatgtcttcttgctgacatttcccgtttatctcctccctcctgattatcccaattgttatgatgatcactcatatgtttcactgtagagttttatcaccaatgtaacaaattacaatatattaaaaat-atttttcttgaactttatgtaaatgagattatactgaatgtatttttccatcttgataattcctctcacatttgtgagtattattatctatgtagctcaaatttgttcattttctttgttgtattattctgttgtaaacatgtctgtctagttcattaattttgatcactgtatagtattccattgtataag-tatgccacaatttgtttatccatttggaggtctgaaagacatttggAGGAC s rheMac1.SCAFFOLD85601 21878 1929 - 44828 TATGTCATTAAATATTTCAAAAACAAATAATTTCATGAGATAGATGAAGACATAGATGATGATGATAATGACGGCAGGTGAAAGGGAGAATGCTATTTGATAAATGTGATTTCACTCTTG-TTTCTACGTACTGGAGTTCAGGGTGATGAGAGAACACTATTATTCCTCCTCATGGCCTCATGATTTTTCTATTACTCTCAGCATCAGGCCTAAACAAATACCCTCACATGGCATTTCATCAAGAATAATGTAAACCCAACATATTTTGATG-ATTTATTTGC-TTTTATTCCTTTTACTACATTTTAAAAATTAATAAGAAAAGTGACCTTTAACAATTAGGATTCTATTTTGGAGA-TTTTGTACATTTTTTAATACGAACATGGACACATACTCTATGTAATAATACAGTGTATCAACTTTATTTCATCTTTTAATAGCATCATTAGCAAGTCAAATTCTTGCAAATGCTTTTTCCCATTCTTAGTTTTGGTGACTAAATCTGGATTATTTTACTACAGCAGCCAAAGTAGCATTATATAAGCAAAGATATATACTCAAAGATCATGCTAA--ATGTTTCATACCCTTACAAATTTGCCTTTCTATGATTTTTTTTTTTTCTAATGCAGAGCCAAAAAATTTATAGTAACAAAATACTTTACCCAACACACCAGTGTACACAGGAATGGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATATAAACATTTCATTTAGAGACACatttt----taatatatttaatttaatatatttaataaCCATCATACAATAATTTATTAGAAATTCATGAATTTCTGACACTTTCAAATGTGGATCATAAGTTATTTAATTGTAAATAAGGAAAAAGCTGTCTATCAATCATAAATATTCAAATTTCGATGTTTCAAATTCAAATTAGCCTTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCTTGCTTATCTCTTTTGTTTTA------ACTAATGTAATAAAAGTTTTGggccaggtgtggtggcttgcacctgtaatcccagcattttgggaggctgaggcaggaggattccctgagcacaggagttcaagaccagcctgggtaacatggcaaaacactgtctctaaaaataataggaaaaaatagcaaggtgtggtggttcacgcctgttgtcctagctactcaggagtctgagatgggagaatcacttgagccaaggtggcagaggttgcattgagctgagagtgtgcttgtgcactccagcctgggcaacacagtgagaccccatctcaaaataaaaaaagaaaaGTTTTAAATTTTAACTTGCATTTCTTAGTACCATAATGCTCTATTCTCCTTTATTCAGCATAAACTCTAATTACAATGGTATCTATGAGAAGATGTTATATCACCCTAACTTTATACTTAGAAATGTACTTTATATTTCTGCTTTTTTAAC------Atttttattgtggagcataacatacatacagagagtaataacacctaataaacagaaaaagaaaaaattacaacattaacattgatgttaccatacctttgtcagaaaattgaatttgccagccatccagataatcccaatatatgtcttcttgttggtattttctg----------ccctcctgactatcccaattgttatgatgatcactcata--tttcgctgtagagttttatgaacagtgtaataaattacaatgtattaaaaataatgttttccaaactttatgtaaatgagattatactaaatgcatttttccatcttggtaattcctctcacatct----gtattattttctatgtagctcaaatgtgttcattttcc---ttgtattcttctgttgtgaacatgccagtcttgtttgttaattttgttcactgtatagtattcaattgtgtaagatatgccactactactttatccatttgtaggactgatagacatttggaggac a score=12041 s hg17.chr12_random 215522 309 + 466818 aaagataaatttatattcttatttcataccatacacaagaaataactcatattt----gattatagagctatatgtaaaaggtgagattaGTAACTAAGATACTAAAACATACTACCTGGAC-AACTGCAAGTAATATAAGTGGGTTAATCAACCATAATTCCATCTGT-ATATTTGCCTACTTAGATCATTATTTCTATGATGATAATAATGCCCTGCATAGGAACCTATCGGTATCTATAGTGCTATTTTACATAGAACTAACTTAGATGGTGGGTCACCGTGACTCTGATTTAGTGGAAATGCGAGGGAAAG s rheMac1.SCAFFOLD85456 11744 301 - 81052 AAACATGAGTGTAGACCATTATTTCAAACCATACACAAAAATTAACTCATAATTAATTGATCATAGAGAAAAATATAAAAACAGAAT------ACTGAGATACTGAGACAT--TAACTGTACCAAGTGCAAGAAGTCAAAATGGGTTAATCAATCATCAT---ATTTCTCATATTTCTTTACTTAGATCATTTTTTCTATAATGATAATC---CCCTACTTATCAATCTATCAATATCTACATTGCTATTTTAAATAAAACTCAATTAGCTATCTGCTCACTATCACTCTGATTTAGTAGAAATTCAAGTAAAAG a score=51045 s hg17.chr12_random 215934 854 + 466818 CCACTTTCCTTAGGTTTTAACACCCTATTCCATCTAGTCGAAAATGG-GCACAACCACATCCACATTCCAGCCAGGAGAAAGAGGATTACACACTCAGAAGCCACATCAAATCTGCCCATATGcagaatttagatacaaggaaatatctatctgcaaaggggtcttggaaatgtaatatatatattatatatgttttatatatattatatatgtcatatatattatatatgttatatatatatatacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaagacggagtcttgctctgtctccaggctgaagtacagtggcgtgatctcagctcactgcagcctctgcctcc--------------------------------caagtagctgggactacaggtgcacgccaccaccgccggctaatttttttaattttttttttattttagtagagacagggtttcaccacattggccagggtggtcttaatctcctgatctcgtgatccacccgcctcggcctcccgaagtgctgggatcacaggtgtgagccaccgcacccagcctatttactcatattttttacagccatgaactcagccaacaatcaggagttctattaccatgaaaaggaaggtaagagcagatattggcaaacattagcaatcttgctacaAATGTCAAAAGGACCATTATGTGGTATCTCAACAGGAAGAAGAATAACAGCAAGTTATTTGTCTAGAGTTTACATTTTACAAAGCATTTTGATATATATTATCTCATTTTGCACTCACATAATCCTGTAAATTAGAGAAGTGGAGTGGGGAAGGATGGACTCAAGAAACAGGCAGAA--------TT s rheMac1.SCAFFOLD80653 34872 787 - 71846 ccaatttccttagggtc-aacacc-tatttcatctagtcaaagatggtgtacaaccacatccacattccagccaggagaaagaggaTTACACACTCAGAAGCCACATCCAATCTGcccatatgcagaatttagacacaaggcaatatctatctgcaaaggggtcttggaaatgtactctctCTCTC----------------------------------------------TATATATATATATagatagatagata----------gatagagagagagagagagagcgagagagagagagtgagagagac--agtcttgcttagtctctaggctgaagtacagtggcacaatctcaggtcattgcagcctctgcctcctggcttctagagattcccctgcctcagcctcccaagtagctgggactacaggtgcatgccaccacc-ccagctaaatttttttatttttttc--attttagtagtgacagggtttcaccatgttgaccacaatggtctcaatctcctgaccttgtgatccacc--------------------------------------------acctccagcctATTTACTtatattttttattgccatgaacttagccaacaatcaggagttctattaccatgaaaaggaaggtaaaagcagatattg-taagcattagcaatcttgctacaAATGTCCAAAGGACCATTATGTGGTATCTCAACAGGAAGAAGAATAACAGCAAGTTATTTGTCTAGAGTTTACATTTTACAAAACATTTTGATATATATTATCTCATTTTGCACTCACATAATCCTGTAAATTAGAGAAGTGAAGTGGGGAAGGATGAACTCAAGCAACAGGCAGAATTGACAGTTT a score=376270 s hg17.chr12_random 216788 4736 + 466818 AGAAAAGTGCACTCCGAACAACCATTGTCAGCTGCTTAATTTAATAGCCTTATTTGGTCATTA------------ATG-AACATACTTCAATTGTTTCAGTTATGTGATTCTGCAGAAGATATTATTTCTGAAAGAAGTGGAGGTCTTTCTTTTTCAGATGAAGAAGTGAAATCCGGTTGGGATAAATATGTAAAGAGGAAAGGCGGAGAATGCAGGGAGACAGGCTCTGAGGAGCCAAGCAGACAGGACCACAGGCATAAATGGCATTTGAAGGGGACACACTCGATTATATGAAATGATTTCTAAGATGCTTATGACCTTTTGTTGGGGATCTCCTCATCACTGATGGAGGACAAGTTTGGCACACATGGTTGCCGTTAAGTGTACGTCAAAGGATAGGATTTCAGCGTTTGTGTCATTTCTCAATTCAGCCTTCTTGTTAAGCTTGAGGCATCAAAGTAAGAAGAGATAAGCTCTTCCAGTTCCCGTGGACCACATACAGAAGGaatgcagctcaaatttattgaccacatactatgtgcttgacactgctaacagcagttggattatttcattttgatcctctaaacaaccctaggaggtggaaataattc---cagttttgcaaatgaggaaataggcttgaaggaattgtagccatgtggcacaaagcaaagtggcttataactgtgtaagccttcagacattgagtccaatcagtacttgctGACTACCTATGTTCCAAGTTCTATTATCAAAGGCAAGGATGATTGTCACTAGGTGTATGTCCCTTCCTCTGGCCAGAGCAGCCTATACCTATGCTATATCACCATGTGGGTGAAGAAATTTGCAGACTCATTCATTAGTTTTGCTTTCCCATTTTCCATTTCTGAATGAAAAATCAATTTCTGAAACTCTCTCCAAGTCTTCTGAATATTTCTCTTTCTTTCTTGGATGTCCAGTATTCATTCAAGGTGAAGACCAGGTAATGAA-GATTCCTGTGACTGTGAGGACATATAGCTGATATATCAGTTCAAAGAGGAAGATGAGCATGAAATCTAGACTTGCTTAGATTGATATTAAAGGCTTGTCATGGTCTGGCCTTAATCTGCCTCTCCAGACTTGTTTCCTGTGACTTCTCACAAGGAATCACATTTCAGAACTGCCTGATTCattcattttattccatgactatttaattatttataggatgttccatgcatggttttaggcatagggaatttaagcagtgaacaagacagaagtctctgctatccatggggcttacattctattaatcaaatatataataacataatttcaggccatggtaagtgcaatgaagaaaattaggatggagtcatatgataaagaggttggagcataggcggattgctttagcaaggttatctgggaggtgtctctgaggagctggcatgttgctgagacctgaatgatgaggaagtgtcagccaggtgaagatgggaagaagcatgacactggtagtgggaacaaaaacgcaaaggctctgagacaggaatgagctccaggagcaggagaaatggtctggagcataggaatgaggaggagagtagtgggaaatgtggctggagaggaagtcagagctagtgcatggagttgtgaaggtcattgtaggtggttaggattttaagttcaatgggaagctagtagatgattataagcagggaaatgatctggttcatgttttaagagaatagatctggcttctctttgggagaaaagactgcagggagcaaaagtggaagtaggaaaggcagctaggagatcacagttgtcttcaggggaaacatgatggtttacactggggtggtggggcatgaagaattggaatagtcaggatttatactgaaagtggaattaacagcagagctaatggattgcctgggcagggttgggtcggggagcaaagtaaaagagaccctgaagATACCATGTTGGGTTTTATTGTTGTTATTGTTGtttgcttttgttcactctggaatgcactcagagtgcccttcttcctatctcctcaattcaacccattatttgagtctcagcataaaggtcacctcttgctggaagcctccaacctgTGACTGGAATGAATCTCTCCCTGCCTCTCTATTCCTTATTCAAGACTTCTCATACTTGATACTTTATTGAAGAAATTTGTAATGCATTAGTGCCTCCATCTTATGGCAGGAACCATATTACAGTGCCTCCTGAGTAAACACAGTGCCTAAATTATAGCTGATGCTCACCCCTTGCTGGACTGAGACCGCCCAATGCTGCATTTTGCTAAGACTTAGGAAAAGGAAGAAAAAA------GTAAGATgtggaaagtgctcaagactagctgcagaggtctgggttccagttctagccctgtttctagggagctgggaaatttgggacaagtcgcttcagcttttatgatctaaataaccttgctgcttaatgagatatgagatacaaagtttcttaaatctcaaatagtttatggttaatgattcATTTTATGCGCAACCAGAATGTTTAGAAAACCTAATAATTACATGAAAAGTCTGTAAGCTTGCAACCTCCAGAAGTTAAAGGTTTCTAGAAAGTTATAATAATTAAAACAGCATGATAACCATCCACAAATCAGCAGATCAACTGATAAAAGAAAATACAACATCTTGAAACAGTATTTACCAAAAAAGGAAGAATAAGATAGTGGAAACACTATAAATCACTTAGGAATGAACAATTTATTTAACAAGGACATTGAGAAAATTGGCAATTTGAGGAGACAACAGTTTCTGACTTTGCTCTATAATGTAAAATAAAATCCAGCTTAAGTAAAGGGCTAAATATATTTTAAAAAATACAAGCAATCAGAAGATAAGATAGGTCTTTATTTAACTGATTTGTGACACGTGATCTTCTTAAGCATAAATA--ATGGGAGAAACTATGTAAGAGAAGTGACCAGTAGATTTGACTACAAAAATATTTTAACATTTAGTATTTTAAATTATCTTAATCATATTGAAAAATGAAAAGCAAACTGGGGAAATATTTGTAACATGTATTATCAATATCTAGTACTTGTATGTCAATACAATATCAATAAACACAAATATCAATAATAAAA-AATTTTTCCAGATTAATAAAAAATACTTAAGAATTATGatagaaaaacagaaaagatacaaatagataatttataaaatatgacaatagtaaataaagattagaaaactatttaatgttaccaa----taaagaaatgaaaatttaaatgagatatttctttacctatttaaaatataaagattaaaataattgatagtactcaattcaggccatggaaataaatatttcacaatgactggtgggaatccaaattggcatagccttttgggaaagcaattttacagcgcatatcaagaatattgacaatctcatattatttaaaaaccagaaattcctttcattgagattaacatcctgaaaacctctcatgaagaaacagtcagatacgtaaccaaagattcatctaagacctcaattgaagtactacttttaata-gaaaaaacttgagaataatgttaatgatcaaaaccagaggaataataatgtgaactattaggatctccattaaagaggttttttttttttttctcaaagtctatttattgacatggaaatgatcacaataaaattttaagtaaaatgtaaaaatcaggatacaaagctgcatacacaatatgaaactg-aacctcattgtgtaaatatctataatatatataaccacttagaaaaCCGCATGAAGGAAAGGATAGCCATGCTAATGTCCCTGGGTACAGCGATTCCAAACGGTTATTAATTATACTTTTATAATAATTGTTCCTAGCCATATGTATAAATTTAGTACCAAGGCAGAAGAATGCAAATGCTATAAAATCTAGCAACAAATAGTCAAACTAGCAACCTCCCTTTTCTTTCTTCCCTCCTCCCTCCCCTATGTGTAATAGATATTTCTAGGGACGAAAGCACAGAAAATCTGGATTTTTTTACTTAGAAAGTTCAGAATAAGGCTGAATTTCACTGACTCATTGAGAGAAAGCTTCTAAGAGAGGAAATATGATAAATTAATGGTGAGACATAAAATAAGCCATTTATGTATTTtatatatatatatgtatatacatatatataATTTCTAAC-----TTGTGttttttgagacagggtcttgctctagtgttcagggtgcagtgcagtggcacaatcatag-----------------ctcctgggctcaagagatcttcccacttcagcctcccgggtagctgggactacaggtgtgtgccaacatgcccgggtaattttattatcattattattattatcgagacagggttttgccaagctgcccaggctgatcttgaacacctgggctgaagtgatttgtctgcctcagcctctcaaagtgctgggattacaggtgtgagccactacattcagccAATACAtgccatttattgagcacacattgcgttccaggaaggatggtaggaacttggcaagttatttcactttcctGGCTGCAGTTTTATCTCTGTCTTACTCAAGGAGCCCCTTCTGATAGGTCCTTTCTGATGGGACCTGTGGCTGCTACAAGGAGAGTGGGAAGGAAAAAGATATGTCCCAGTGTTCTCAACCAGAATTCAGAAAACACTTCTTCACAGAAATAGTGGTGATGGGGGA s rheMac1.SCAFFOLD80653 36000 4687 - 71846 AGAAAAGTGCACTCTGAACAACCATTGTCAGCAGCTTAATTTAAAAGCCTTGTTTGGTCATTATATATGTCATTGATGGAACATACTTCAATTGTTCTAGATATCTAATTCTGCAGGAGGAGATATTTCTGAAAGAAGTGGAGGTCTTTCCTTTACAGATGAAGAAGTGAAATCTAGTTGGGATAAATATGTAAAGAGGAAAGGCGGAGAATGCAGGGAGACAGGCTCTGAGGAGCCAAGCAGACAGGACCACAGGCATGAATGGCATTTGAAGGGGACACACTCGATTATATGAGACGATTTCTACAATGCTCATGGCGTTTTGTTGGGGATCTCCTCATCACTGATGGAGGTCAAGTTTGGCACAGATGGTGGCCGTTAAGTGTACATCAAAGGATAAGATTTCAGTGTTTGTGTCATTTCTCACTTCAGCCTTCTTGTTAAGCTTGAGGCATCAAAGTAAGAAGAGATAAGCTCTTCCAGTTCCCATGGACCACATACAGAAGGaatgcagctcaaatttattgagcacatactatgtgcttggcactgctaacagcacttggattatttcattttcattccctaaacaacgctatgaggtggaaatgatacttgcagttttgcaaatgaggaaataggcttgaaggagttgtagccatgtgacacaaagcaaaatggcttataactgtgtgagctttcagacattgagtccaATCAGTACTTGCTGACTACCTATGTTCCAAGTTCTATTATCAAAGGCAAGAATGACTGTCACGAGGTGCATGTCCCTTTCTCTGGCCAGAGCAGCCTATGCCTATGCTATATCACTATGTGGGTGAAGAAATTTGCAGACTCATTCATTGGTTTTGCTTTCCCATTTTCCATTTCTGAATGAAAAATCAATTTCTGAAACTCTCTCCAAGTCTTCTGAATGTTTCTATTTCTTTCTTGAATGTTCAGTATTCATTCAAGGTGAAGACCAGGTAATGAAAGATTCCTATAACTGTGAGGACATATAGCTGATATATCAGTTCAAAGAGGAAGATGAGCATGAAATCTAGACTTGCTTAGATTGATATTAAAGGCTTTTCATGGTCTGGCCTTAATCTGCCTCTCCAGACTTGTTTCCTGCGACATCCCACAAGGA------------------------------Ttttattccatgactatttaattatttatagaatgttccatgcatggttttagggataggggatttaagcagtgaacaagacagaagtct--gctatccacggggcttacattctattaatcaaatgtataataacataatttcaggtcatggtaagtgcaatgaagacaattaagatggaatcatatgataaaga---tggagcatatgcgggttgctttagcaagggtatctgggaggtgtctctgaggagctggcatggtgctgagacctgaatgatgaggaagtgtcagccaggtggagatgggaagaagcatgacactggtagtgggaacaaagatgcaaaggctctgagacaggaatgagctccaggagcagcagaaaggcgctggagcacaggaaagaggaggagagtagtgggagatgtggctggagag-aagtcagaggtactgcatggaggtgtgaaggttattgtaggtggttaggattttaagttcaatgggaagctagtggatgattataagcagggaaatgatctggttcatggtt-aagagaatggatttggcttctctttgggagaaaagactgcagggagcaaaagtggaagtaggaaaggcagctaggagatcacagttgtcttcaggggagatatgatggtttacgctggggtggtggggcatgaagaattggaatggtcagaatttatattgaaagtggaatcaacagcagagctaatggattggctgGGCAGGATTGGGTCGGGGATCAAAGTAAAAGAGACCCTGAAGATACCATGTTGGGTTTTATTGTTGTT---GTTGtttgcttttgttcactctgtaatgcactcagagtgcccttcttcctgtctcctcaattcaacccattctttgagtctcagcataaaggtcacctcttgctggaagcctccaacctgTGACCGGAATGATTCTCTCCCTGTCTCTCTATTCCTTATTTATGACTTCTCATACTTGATATTTTATTGAAGAAATTTGTAATGCATTAGTGCCTCCACCATATGCCAGGAACCATATTACAGTGCCTCATGAGTAAACACAGTGCCTGAATCATAGCTGATGCTCACCCCTTGCTGGACTGAGACAGCCCAATGCTGCATTTTGCTAAGACCTAGGAAAAGGAAGAAAAAAAAAAAAGTAAGATTTGCAAAGTGCTCAAGACTAGCTGCAgaggcctgggttgaaattctagcactgtttctagggagcagggaaatttgggacaagtcgcttcagctttTATGATCTGAATAATCTTGCTGCTTAATGAGATATGAGAGACAAAGTTTCTTATATCTCAAATAGT----GATTAATGATTCATTTTATGTGTAACCAGAATATTTAGAAAACCTAATAATTACATGAAAAGTCTGTATGCTTGCAACCTCCAGAAGTTAAAGGTTTCTAGAAAGTTATAACAATTAAAACAGCATGATAATCATCCACAAATCAGCAGATCAATCGATAAAAGAAAATACAACATCTTGAAACAATATTTACCAAAAAAGGAAGCATAAGATAGTGGAAACACTATAAATCACTTAGGAATGAACGATTTATTTAGGAAGGACATTGACAAAATTGGCTAGTTGAGGAGATAACAGTTTCTGACTTTGCTCTATAACGTAAAATAAAATCCAGCAAAAGTAAAGAGCTAAATATATTTTTAAAAATACAAGCAATCATAAGATAAGACAGATCTTTATTTAACTGATTTGTGACACGTGATCTTCTTAAGCATAAATATGATGGGAGAAACTATATAAGAGAAGTGACCAATAGATTTGACTACAAAAATATTTTAACATTTAGTATTTTAAATTATCTTAATCAATTTGAAAAATGAAAAACAAACTGGGAAAATATTTGTAACATGTATGATCAATATCTAGTACTTGTATGTCAATACAATATCAATAAACACAaatatcgataataaaagaatttttccagattaataaaaaatacttgagaattatgacagaaaaacataaaagatacaaatagataatttataaaatatgacaatagtaaataaagattagaaaatgatttaacctcaccaatagttaaagaaatgaaaatttaaatgagatacttctttacctatttaaaatataaagattaaaataattgatagtactcaattcaggccatggaaataaatatttcacaatgactggtgggaatccaaattgacatagtcttttgggaaagcaattttacggtgcatattaagaatattgacaaactcatattattt--aaaccagaaattcctttcattgagattaacatcctgaaaacctctcataaagaaacagtcagatatgtaaccaaagattcatctaag-----------------acttttaataggaaaaaacttgagaataattttaatgatcaacaccaggggaataataatgtgaactattaggatctccattaaggaggtttttttttt-----tcaaagtctatttattgacatggaaatgatcacaataaaattttaagtaaaatgtaaaaatcaggatacaaaactgcatacacaatgtgaaactgaaacctcattgtgtaaat-tctataatatatataaccacttagaaaaatgcatgaaggaaaagaacagcatgctaatgttcccgggtagagcgatttcaaatggtt-ttaattatctttt-----ttatatttcc--------tgcatattttATTTATACAAGCAGAAAAATGCAAATGCTATAAAATCTAGCAACAAATAGACAAACAAGCAACCTCCCTTTTCTTTCTTCCCGTCTCCTTTCCCTATGTGTAATAGACATTTCTAGGGAAG-AAGCACAGAGAATCTGGATTTTTTTACTTAGAAAGTTCAGAATAAGGCTGGATTTGACTGACTCATCGAGAGAACGCTTCTAAGAGAAGAAATATGATAAATTAATGGTGAGACATAAAATAAGCCATTTATGTATTTTATATACAAATATGTAT----ACATATAATATTTCTAACttttttttttttttttgagacagggtcttgctctagtgttcagggtgcagtgcaatggcacaatcatagctcactgcaggcttgatctcctgggctcaagagatcttcccacttcagcctcccaagtagctgggactacaggtgtatgccagcatgcctgggtaattttattattattattat--------agata------cgccaagctgcccaggctgatcttgaacacctgggctgaagtgatttgtctgcctcag-ttctcgaagtgctgggattacaggtataagccactacattcagccAATATGTGTcatttattgagcacacattgtgtgccaggaaggacggcaggaacttggcatgttatttcacttTACTGGCTGCAGTTTTATCTCTGTCTTACTCAAGGAGCCCTCTCTGATAGGTCCTTTCTGATGGAACTTGTGGCTGCTACAAGGAGAGTGGGAAGGAGACAGATGTGTCCCAGTGTTCTCAACCAGAATTCAGAAAACACTTCTTCACAGAAATAGTGATGATGGGGGA a score=616543 s hg17.chr12_random 221833 7494 + 466818 AAGTTAGCTTCTCAAACATGATTCGTTTTATAGCTGGATTCTCCCTTATATTATTTGTATAGTTTGCACAGTTCTTTTTATGTAGACCTAGAAATCAAAGCCTGGTTTATTTAAGATGattaggggcttggtgtgtgctgggcattgtgttaagtgctttacacccattatcttatttaacctttatataccctataacgctactactattTAAGTGTATATTTTATTTTATGTTGTGTTCATATGTGTTCTTTGTGTTCATAGCATCAGCTATGATTCAGGCAcatatgtactcaatatttagctcccacttataagtaataataaatggtatttggttttctgttc-tgcattagtttgcttaggataatggcctccagcctcatccatgttgctgcaaaggatgtgatctcattttttatggttgcatagtattccaaggttaaactttaccacttggtgggaagatctacaaggtaatgttaaaaaagggcttgggcacaggaggggaatgtggtgcccatggtgactatttttaccaacaattcacATattttattcacaaggaacctgagacctagataagttatttcagtacttctcaaacttcagtgtgcataagagtcatttgaaaattttgttaaactgggacttgtgattcagtaggcctagcctggagttgaagactctgtttcttgtgaatctgcttgagaatctgtttttgagattcttgtttctaatacactcccagatggtgctggttctctaagtccctggacaacaatttgattagcatggggtcaacccacttgccagatcccagggttagagtatggctgggccatgatgtgaacccCAGCAAGCTGGTGTCACACTTGGCTGGACAACTTACAAGAGCATGTGCTTTTGTTCTCCTGATCTGCAGTTTTTCAACATCCTCTCCATCCTCTGTGCCCTACACTAGGTCCTATGTCAAGAAGATAAGTCAGTTCTGCACTCATTGCTTCAGGGGAGGGATCAAGAGCACTGGAAGCAGAAATAAAGAAATATTTCTTCCTCTCCAAAATTtcacagtctgatgccccttaggccaaatctagcctgaagatgtgttctgatgaacacaccttaaaattctagattcacacatgcttagaattttaattgcccattaaaaacccttaaatt-ctcataacaatcaagattgttagctttttttgaaagcttagatagtctgggaacaagggccaactctcccacatggcagcagttagttggagcttatagtgcctgttgctttcctaagggacaaggacccc-agtgagccatgacccccaccttgtccaatggactcatttctcattatctgcATTCCTCAGTAATGAAGGGAATCTGGGTAAAATGAAACATTTAGTAGAAAGATTGAAGAGGTCCACGGGGCCAACGGCAGAGGACCAGACCTAAACACCATACAATCAGGAATTAAAGATGCAGGGAATTTTTGGAGAGCCCAGAAACGGAATCACCTTTGGGCTGCCAAGCCCTCACTTGAGTGAGCATGATCTACCATCCTTGGTGTTTCAAGGCCGTGACAGATGATTGCATGACCAACATCTAAAGGAGGCTTTCTTTCTACAGCTCCAGCATGTCATCTTGTGCAGGAGTAAGAAAATAGAGAGGGAGGCATGTGCTCCAAGACTTTGCTTCATCCCCATCTGACACACTCATGAGGACAACTCTCTCCCTAGAAAACCCAGTACACTTATAAGCTCAAGAGAAGATGTGTAGAGCCCTAGATGCCCAGAAGAACTATAATGGGAGCAAAAGAAAAGCCCTTTCCCTGTAATTTGTGAAGGGGTAGAGGGACTGAACAGGACTCACTAGGAATCCCTTTTGAGCAGACAGTGGCTTTCTATATCCTTCAGGTg-gttgttggtaaaaatagtcaccatgggcactatattccccttctgggcccaagcctttttttaacatgaccttgcagatcttcccaccaagaggtaaagtttaaccgtggaatactatgcagccataaaaaataagatcacatactttgcagcaacatggatggggctgggggccattatcctaagtgaactaatgtaagaatggaaaaccaaataccacatgttattacttataagtgggagctaaacattgagtgcgtatgaacacaaagaagggaacaacagacatcaagacctacttgagggtggaggatgggagggggttgaggactgaaaaactatctatcaggttctatgcttattacctgagtgacaaaataatctgtacaccaaacccctgtgacatgtactttccctatataacaaacctgtacatgtacccctgaacctaaaataaaagttaagaagtaaaaaTTTAAAAAAGCATAAGGAAGAAATAGGATTTTAATTTTGTAACTGTTATGTATCAAAGATTCATTATAGAAATCAAATGAATTTCTAAAGCATAACAAAaagaggtgcattttatttccccatcactggactctggactggccttgtgacttgtttggccagtagaatgtggcaaaagtgacaggccaattccaaatctaggcctcaaaatgttttgtgtgtttctgctctgtgtgcctctggaacactgcctgatgccatcagcatgaggccaggcaagtctgctggaggataagagacacagtttacagagaccggccatcccagctatggccaccagagatcagctattccctagctgacctagcccctaactgaagatgtgtgagtgagcccagccaagataagaagaactgctcagctgggcccagcccaaattgctgacccacgcaatcatgaaacatataaatggctttattttaagccactgagctttctggctggttttattttttaggcagcaaaagctgacACCCCACTTAACACAC--TGttagtttcctagaatgtctgtaacaaagtaccacagacagggtggcttaaaataacagaaatgtattatctgacagttctggagtctagaagaccaaaatcagtatcagcagggttggcttattctagaggctctgagggagaacctgttccctgcctgtctcctagcttctagcagctgctgatagtccttgacatcttgtgacctgtagaagaattactccaatgcctgactctgtcatcacgtaatattctcttctctgtgtgtgtccaaatttccctcatcttataagggcaccagtcattgggttagaatctaccctattcccctatgacttcaacttgattgagtcttcaaagactctatttccaaataagcc-ccatccaggggtaccaggggttggaacttcagacataattttctgcgggacaaattatcaatccCCCAAAACCACTATGCGAACTTGCCTGTATATTGGACAAATTCATATAGATTTCCAAATATACCTGCTAAAGGAATCTTTGAAACACCATCCATTGGTAAGTTGAGTTTTCTTTCTCCATGTAGCTATTTGTGGATTCGAGCTAGGATTCTGCCATTTAATCTAGTTTGGTAGAAAGATCGGAGACTTTGGAGATGAAGAAGGAAGTTAACATTCATGGTATGTAAATTGTCTTATTGAATCCTTAC---------TTAGAGTATGTATTTAAAAAAAAACTATTTCACaggtcagagatgttgagaaatttgcctaagtcacacagtaaataccctcagcaatcagcctttgaatgcaagtctgtatgatttcaaagatatgatctttctactgtaccCTagagcatctccttggtgtcagaagatctggattcttgtcctggtccattttctacttagtggcatgacctggag--tcttaattttaatgaaatccctcctctttaaaatggagtcaataaatgtcatccttgttgatttttatgagtattgagaaagatgaggcagaacgtggtggcaagggttgggttttggagttagacaaccttgaactggggtcttggctctaactctgtgatcctgggcatatcgtgtaagctttcaaagctttaatttctttatctgtaaaaaagaacatagtaatatccccaatcttaaaggtttattgcaaagattcaataagaagattatatatataacatatttagctcagtatcttgccatagaaagtgctcaaagatgatctataattAGATATTTAAAAGCATTTTCTAAAGTGCAAAGTTCTAATTAATGCTAATTATTAAAATTGCATTTTATTTTCAGTTTGATGAAATCATGTGCTCTCTGAAGCCAAAGTGATTTCTCTGGGCTTTTTCTAACTCAGCATCACCCAGGTTTGCTTACTGACTGTAACTCATACCTCTGCACAATCTGAAAAGCAGACCTAGTCCTGTGGCTAGAGATTTTCCAGGTAGAAGGAC-AAAGCTCCCACCACAGAGCTCCCCAGTGCTTCCCTCTTACGGTGGAGGGAGGTCTGTCAGGATGATTTAGGCTGTGCGAGGTCTCAGAGTCTCTGACAAGTCCCTCATTAGCTCATCCTTGTTTGCATGCTCTGTGACCTGTACAGTTTGTATAGGTTGTTCCAAGTTCTCACGTGGGGCTGGCTTCCCTAGACCTGTTTCAGCTTGAGTGACTCAGGGCAAGATAAAATGTCTGTCAAAGTATTCACCACGGTATTCTAATAAGTGTTGGAAACATTTGCCTGGCTGCTCCCCCAC--------CCACCCCGCCCACTGACCACCACTAATATCCCTGGGGTTTCCCTCATTTGTAAACTTAGGCTCTGAGAAATAGAAATAGAAATAGAAATTCCCATCCCTGCTCCCATAACCTATGCTCACCTTTTTCTCACTCAGACAAAGGCGGGATATGCGCAGGGTCCTGGGTGCTTGCCTTATCCACAGCCCCTTCTGAGGGAAGTAACTTTAAGTATAAATCTTGATACTTTCTACGCACTTGAAGACCACAGCTGTTTAGACTAAGGAGCAGTGTCAGCCCCCAATGGAGGCTATTTGCAGTGCAAGAGGTAGTGGCTTAAGACTTCTGACTGGCAAGG-----CTATGCCTTGCACTGACCACAGTGCCCACAGACAGCTTTTCTCCCTTGAGGAGGTTGGCCTGAAGACACCCATAAAGGAATATGAAGACAGTGAAGTCTCACCGAGTGAAGTCAGTGAGAGGCCACTAAGAAGCAGAAGCTAGGAGGCAGAGGCAAAGCCTGTGGAGACAGAAGTGCCTGAAAGGAGACAGAAAGGGAATGAGTTCCACATGTGGGGAAATTGTGAGTGGGGACTGTCTAAGGAGATTGTTACTAATATGGTCATGAAGTCACCAGAGACTTAAGTTGCTGAGGCATCCCAAAAAGTAATGTAGACTGTGCTATTTCATTCTTAGACAGCTAGCAACAAAAACTAACTCTTGTCAACTTGAGGAAATGGGAAATGTATTGGAAAGACATGGGAAGGCTCTTGGAATAAAAAAGTAGCTGAAGAAAGATGTCTCTGGGAATCCAGGAAGCAAGGTCCTTCTGAGTTTTGCCTCTGCAATGAGTCAAGTTTAACTGTAACCTCACTCCACTCCAGAGTCAGAGTCATTGAGAGTGTCTTAATGCTTCAGCTAGACCTACCCTGTGGTTAGAAAATTGTAGGAAATCTTGGTTGACAGAAATTACGCTTTTTTTTTTTCTATAAAAGGGGACATGAATATTGATGGGGCCAGAGAAATAATAGTCATCTTATTCTATGAGTTTTGGCTGTGTGGCTGCTGACACCATTTCCTGTGCCCTTATCTTTACATCTAAAACCTCTTGTCACCTCAGATCCCCTGAGCTTGTCTCACAGATGTGATCCTCCTTTATCTTCTCCAATTTTGCACATCTTACCATCCTAAAGTGTTACTCACATTCTCTTCCTTTTACTGGTCAATTGTTGGTAGCTGCATTATTGCTCCCATTTCTTCActccttgtatctactgctttcaccatgtgacttactagttcctcccaccaggggttaggtatacttccctatctcttgagtttaggatcagccatgtaacttgcttcagtcaatgagatatttgcagacataatgcaagcagaggcttaaattgtgcttgagcagttgaactttcctcATTTGCACTTCAAAATCATCAAGAGACTAGTGTGCTCTAGGTAGCCTACTGGTCCCAGGATATTGA-AGTTCTACAGAGCATACCTGAAAACAACCTCCACCTAGAAACCAAACTCAGCTGAACCCAGCCTAGATCAGTAGACCTCCAGCTGATTTGTGGATGAGCTAGCAAGAATAAATGTTTAATTTGGGGACAGTTTTCTACACAGCATTATTATGGCAATAGCTAACATATAAATCTTgcaaggtgtaatggaaataacatgattttgaaataagatagacttggtttgcaattctgaatctaaaaaggg------aggagaaacttaatctctttgatcctcaggtatcacactaatagaaagaataatTACTTTTCCTTTCCATTTTTCTGAAACCAttctttttaacagctttattgagtaataacagactacttcatgttacatatggttaaaatatagtttgataagtttgacatatatgtgtagttgtgaacccctatcacagtcaagataataaatatgttcatcaccccccaaaacttcctggtgatcttttgtaattcctctcttctttcccttaacttttcttccatccttaggcaacaactatctgctctctgtcaatagagcttgcattttctagaattttactgatatggaaacaaatggcatgtactcattttgtttggttgcttggcttctttcactgagcgaaattattttgagattcatccatgttgttgtgtgtattca---ttaattccttttacattttgagtagcattccattgtatgaatataacacaatttgtttatccattcacctgttgacggacatttcacttaacagattttgactattacaaataaaactgatatgaatatttatatgcaagtctttgtatgacaaacattcatttttcttgggtaaatgtctaagagtacaatggccggattttatgggaagtataAAATTTCCTTTCATTTTTTTATTGAAATTTTACAgagatagtgataaattcacgtgcagtttt-aaatatacagatagattccacaaacattttactcagtttctccaaaatgtaacattttgcaaaactataatatcacaaccaagatattgatattgatacaatccaacaatcttattcagaatactaatttgtaggtacacttattcttataagcaatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgtgtgtagttctttacagtcttatcacatgtgtaggtttttgcatttaccatcacagtggagatactgactagttacatcacagtaagaaactctattgctacc-ttttctntattgttacttttccccactgccctncc s rheMac1.SCAFFOLD80653 40687 7485 - 71846 AAGTTAGCTTCTCAAACATGATTCATTTTATAGTTAGATTCTCCCTTATATTATTTGTATAGTTTGCACAATTCTTTTTATGTAGGCCTAGAAATCAAAGTCTGGTTTATTTAACATGattagggtcttggtgtgtgctggacattgtgttaagtgctttacacccattatcttatttaacctttatataccctataatgctactactattTAAGTGTATATTTCATTTTATATTCTTTTCATATGTGTTCTTTGTGTTCATAGCATGAACTATGATTCAGGCAcatatgcactcaatgtttagctcccacttgtaagtaataatacatggtatttggttttctgctcctgcattagttcactgaggataatggccttcagcctcacccatgttgctgcaaaggatgtgatctcattttttatggctgtatagtttcccatggttaaacttcactgcttggtgggaagatatacaagttcatgttaaaaaagggcttgggcacaggaggggaatgtggtgcccatggtgactatttttaccaacaattcacATATTTTATTCACAAGGAACCTGAGACCTAGATAAATTAATTCAAtacttctcaaacttcagtgtgcataagagtcatttgaagattttgttaaactgggacttgtgattcagtaggcctaggctggagttgaagactctgtttcttgtgaatctgcttgataat--gtttttgagattcttgtttcgaacacactcccagatggggctggttctctaagtccctagacaacaatttgaTTATCATGAGGCCAACCAACTTGCCAGATCCCAGGGCTAGAGTGTGGCTGGGACATGATGTGAGCCCCAGCAGGCTGGTGTCACACTTGGCTGGACAACTTACGAGAGCATGTGCCTTTGTTCTCCTGATCTGCAGTTTTTCCACATCCTCTCCATCCTCTACGCCCTATACTAGGCCCTATGTCAAGAAGATAAGTCAGTTCTGTACTCATTGCTTCAGGGGAGGGATCAAGAGCACTGAAAGCAGAAATAAA---ATATTTCTTCCTCTCCAAAATTtcacagtctgatgccccttaggccaaatctagcctgaagatgtgttctgatgaacacaccttaaaattctagattcacacatgcttagaattttaactgtctgttaaaaacccttaaatttcacataacaatcaagattgttggctttttttgaaagcttagatagtctgggaatgagggccaactctcccacatggcagcagttagttggagcttatagtgcctgttcctttccgaagggacaaggacccccagtgagccatgatccccaccttgtccaatgcactcatttctcattatctgcATTCCTCAGTAATGAAGGGAATCTGGGTAAAATGAAACATTTAGTAGAAAGATTGAAGAGGTCCACAGGGTCAACAGGAGAGGACCAGACCTAAACACCATACAGTCAGGAATTAAAGATGCAGGGAATTTTTGGAGAGCCCAGAAGCGGAATCACCTCTGGGCTGCCAAGACCTCACTTGAGTGAGCATGATCTACCATCCTTGGTGTTTCAAGGCCATGACAGATGATTGCATGGCCAACACCTGAAGGAGGCTTTCTTTCTACAGCTCCAGGATGTCGTCTTGTACAGGAGTAAGAAAATAGAGTGGGAGGCATGTGCTCCAAGACTTTGCTTCATCTCCATCTGACATACTCATGAGGACAACTCTTTCCCTAAAAAACCCAGGACAATTATAAGCTCAAGAGAAGATGTGTAGAGCCCTAGATGCCCAGAAGAACTGTGATGGGAGCAAAAGAAAAGCCCTTTCCCTGTAATTTGTGAAGGAGTAGAGGGACTGGACGGAACTCACTAGGAATCCCTTTTGAACAGACAGTGGCTTTCTATATCCTTCAGGTGAATTGTTGGTAAAAATAGTCACCACGGGTACCCCATTcccctcctggacccaagcctttttttaacatgaccttgcagatcttcccaccaaaaggtaaagtttaaccacggaatactatgtaaccataaaaaatgagatcacatcctttgtagcagcacggatggggctggaggtcattatcctaagtgaactaatgtaggaatggaaaaccaaataccatgtattattacttataagtgggagctaaacattgagtgcatatgaacacaaagaaggaaacaacagacatcaagacctacttgaggatggaggaggggagggagttgaggactgaaaaactacctatcagatactatgcttattacctgagtgacaaaataatctgtacaccaaatccctgtgacatgtactttccctatataacaaacctgtacatgta-ccctgaacctaaaataaaagttaagaaataaaaaTTTTAAAAAGTATAAGGAAGAAATAGGATTTTAATTTTATAACTGTTATGTATCAAAGATTCATTTTAGAAATCAAATAAATTTCTAAAGAATAACAAAaagaggtggatttcatttccccaatgctggactctggactggccttgtgacttgtttggccagta-aatgtggcaaaagtgacaggccaattccaaatctaggtctcaaaatgttttgtgtgtttctgctctgtgtgcctctgaaacgccacctgatgccatcagcatgaggctaggcaagcctgctggaggataggagacccagtttatagagaccggccatcccacctatggccaccagagatcagctattccctgactgacctagcaactgactaaagatgtgggagtgagcccagccaagataagaagaactgctcagctgagcccagcccaaattgctgacccatgcaatcatgaaacatataaatggttttattttaagccactgagctttctggctggttttattttttaggcagcaaaagctgacACTCCACTTAACACACtgtgttagtttcctagaatgtctgtaaccaagtaccacagacagggtggcttaaaacaacagaaatgtattctctgacagctctggagactagaaaaccaaaatcagtgtcagcagggttggcttcttctggaggctctgagggagaatctgttccctgcctgtctcctagcttctagcagctgctgatagtccttgacattccttggcttgtagaagaattactccaatgtctgactctgacatcaggtaatattctcttctctgtgtgtgttcaaatttccctcatcttatatgggcaccagtcattgggttagaatctactctactcccc--tgacttcaacttgattgaatcttcaaagactctatttccaaataagccatcatccaggggtaccaggggttggaacttca-acatcattttctgcaggacaaatt-tcaacccccaacaCACACTAT--GGAATTGCT--TATATTGGA-AAACTCATTTAGATTTCCAAATATACCTGCTAAAGGAATCTTTGAAACACCCTCCTTTGGTACGTTGAGTTTTCTTTCTCCATGTAGTTATTTGTGGATTTGAGCTAGGATTGTGTCATTTAATCTAGTTTCGTAGAAAGATCAGAGACTGTGGAGAAGAAGAAGAAAGTTAACATTCATGGtatgtaaattgtcttattgaatccttacaattcccctttagagtatgtattt-aataaaaactatttcaaaggtcagagatgttgagaaatttgcctaagtcacacagtaaataccctcagcaatcagcatttgaatgcaagtctatctgatttcaaatatatgatctttttactgtaccCTagagcatctccttggtgtcagaagatctggattcttgtcttggtccattttctacttagtggcatgacctgaagtctcttaattttgccgaaatccctcctctttaaaatggagtcaataaatgtcatccttgtggatttttatgagtattgagaaagatgaggcagaatgtggtggcaagggttgagttttggagttagacaacctcgaattggggtcttggctctaactctgtgatcctgggcatatcatgtaagctttcaaagctttaatttctttacctgtaaaaaagaacataataatatcaccaattttaaaggtttattgcaaagattaaataagaagattatgtatgtaacatatttaactcagtatctgcccatagaaaatgctcaaagatgatctataattAGGTATTTAAAAGCATTTTCTAAAGTGCAAAGTTCTAATTAATGCTAATTATTAAAATTGCATTTTATTTTCAGTTTGATGAAATCATGTGCTCTCTGAAGCCAGAATGATTTCTCTGGGCTTTTTCTAACTCAGCATCACCCAGGTTTGTTTACTGATTGTAACTCATACCTCTGCACAATCTGAAAAGCAGACCTGCTCCTGTGGCTAGAGATTTTTCAGGTAGAAGGACAAAAGCTCCCACCACAGAGCTCCCCAGTGCTT-CCTCTTACGGTGGAGGGAGGTCTGTCAGGCTGATTTAGGCTGTGCAAGGCCTCAGAGTCTCTGACAAGTCCCTCATTAGCTCATCCTTGTTTGCATGCTCTGTGACCTGTACAGTTTGTATAGGTTGTTTCAAGTTCTCACGT--GACTGGCTTCCCTAGACCTGTTTTGGCTGGAGTGACTCAGCGCAAGACAAAATGTCTGTCAAAGTATTCACCGTGGTATTCTAATAAGTGTTGGAAACATTTGCCTGGCTCCCCCCCCCCACCCCCCGCCACCCCGCCCACTG---ACCACTAATATCCCTGGGGCTTCCCTCATTTGTAAACTCAGGTTCTGAGAAATAGAAATAGAAACAGAAATTCCCATCCCTGCTCCCATAACCTACTGTCACCTTTTTCTC-CTCA---AAGGCTGGGATATGTGCAGGGTCCTGGGTGCTTGCCTTATCTACAACCCCTTCTGAGGGAAGTCACGTTAAGTATAAATCTTGATACTTTCTACCCACATGACGACCACAGCTGTTCAGACCAAGGAGCAGTGTCAGCCCCGGAAGGAGGCTATTTGCAGT-------GTAGTGGCTTAAGACTTCTGACTGGCAAGGGAGTTCTGTGCCTTGCACTGACCACAGTGCCCACAGACAGCTCTTCTCCCTTGAAGAGGCTGGGCTGAAGGCACACATAAAGGAATATGAGGACGGTGAAGTCTTACCGAGTGAAGTCAGTGAGAGGTCACCAAGAAGCAGAAGCTAGGAGGCAGAGGGAAAGCCTGTGGAGACAGAAGTGCCTGAAAGCAGACAGAAAGGGAATGAGTTCCACGCGTGGGGGAATTGTGAGTGGGGACTGTCTAAGGAGACTGTTATTAATGCGGTCATGAAGTCACCAGAGACTTGAGTTTCTGAGGCATCCCAAAAAGTAATGTAGACTGTGCTTTTTTGTTCTTTGACAGCAAGTCACAAAAACTAACTCTTGTCAACTTGAGGAAAAGGGAAATGTATTGGAAAGACATGGGAAGGCTCTCAGAATCAAAGAGTAGCTGAAGAAAGATATCTCTGGGAATCCAGTAAGCAAGGTCCTTCT--GTTTTGTCTCTGCAATGAATCAAGTTTAACTCCAACCTCACTCCACTCCAAAGTCAAAGTCATTGAGAGTGTCTGAATGCTTCAGCTAGACCTACCCTGTGGTTAGAAAATTGTAGGAAGTCTTGGTTGATAGCAATTAGGCTTTTTGTTATTCTAAAAAAGGGGGCCTGGATATTGGTGGGGCCAAGGAAATAATAGTCATCTTGTTCTATGAGTTTTGGCTGTGTGGCTGCTGATACCATTTCCTGTGCCCTTATCTTTATATCTAAAACCTTTTGTCACCTCAGATCCCCTGAGCTTGTCTCACAGATGTGATCCTCCTTTATCTTCTCCAATTTTGCACATGTTACCATCCTAAAGTGTTATTCATGTTCTCTTCCTTTTATTGGTCAATTGTTGGTAGCTGCACTATTGCTCTCATTTCCTCActccttgtgtatgctgctattgctatgtgacttcctagttcctcccacttggggttaggtatacttccctatctcttgagtttgggatcagtcatgtaacttgcttcagtcaatgagatatttgcagatataatgcaagcag-ggcttaaattgtgcttgggcagttggactttcctcACTTGCACTTCAAAATCATCAAGAGACTAGTGTGCTCTAGGTAGCCTACTGGTCCCAGGATATTGACAGTTCTACAGAGCATACCTGAACACAACCTCCACCTAGAAACCAAACCCAACTGAACCCAGCCTAGATCAGTAGACCTCCAGCTGATTTGTGGATGAACTAGCAAGAATAAATGTTTAGTTTGGGGACAGTTTTCTACACAGCATTATTATGGCAATAGCTAACATATAAATCTTgcaaggtgtaatggaaataacatggttttggaataagatagacttagtttgcaattctgaatctaaaaagggattctaaggagaagcttaatttctttgatcctcaggtattacactaatggaaagaataatTACTTTTCTTTTTCATTTTTCTGAAACCAttctttttaacagctttattgagtaataatggactacttcatgttacatatggttaaaatatagtttg-taagtttgacatatatgtgtagttgtgaacccttgtcacagtcaagataataaacatattcatcaccccccaaaacttcctggtgatcttttgtagttcctctcttctttcccttaacctttcttccatccctagacaacaactatctgctctctgtcaatagggcttgcattttctagaattttactgaaatggaaacaaatggcatgtactcattttgtgtggttgcttggcttctttcacttggcgtaattgttttgagattcatccctgttgttgtgtgtattcattgttaattccttttacattctgagtagcattccattgtgtgaatataacacaatttgtttatacattcacctgttgacagacatttcacttaacagattttgactattaccaatacaactgatagaaatatttatatgcaagtctttgtatgacaaacattcatttttcttgggtacatgtctaagagtatgatggccggat---------GGCATAAAATTTCCTTTCA-TTTTTTATTGAAATTTTACAgagatagtgataaattcacatgcagttttaaaatatacagatagattccacaaacagtttactcagtttctccaaaaggtaacattttgcaaaactataatatcacaaccaggatattgatatcgatacaatccagccatcttattcagaatactaatatgtaggtacacttattcttgcaagcaatt--tgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgcatgtgtgtagttccatacagtcttatcacgtgtgtaggtttttgcatttaccatcacagtggagatactgactagttacatcacaataagaaa--ctattgctacctttttctctattgttac-tctctccactgcccctcc a score=17601 s hg17.chr12_random 229455 216 + 466818 CTACTACAAATGTAGA------ACTATGGAAGTCTTAGTAGCTTAATTGCAGGACATCCCTGCCAGTTTCTATCCTGATTAGGGATCTGCAATGAACATTACAAAATCTTCACCATCTCCATGGCTTTCAACACCAAGCATATGGACTTAGCCACTGTAAAATAGTGGCATGCATCAATGAACAATAAAGAGAAATGGAGATCATTCATATTATTAGTGAGG s rheMac1.SCAFFOLD125516 10446 222 + 48937 CTACTACAAATGAAAAGAAGAAACTATGGAAGTCTTAGTAGTTTAATTGCAGGACATCCCTGCCAGTTTCTGTCCTGATTAGGAATCTGCAATGAACATTACAAAGTCATCACCATCTTCATGACTTTCAACACCAAGAATATGGACTTAGCCACTGTAAAATAGTGGAATGCATCAATGAACAATAAAGAGATACGGAGATCATTCATGTTATTAGTGAGG a score=135219 s hg17.chr12_random 229672 1629 + 466818 AAGTTGGGTACAACTTTTCATCAACCAAAAAGAGGGAGAAAAA-AATCACACCACCAAATAATGAAATACTGTAACTAGAATGTCTTGGCTCTAAGATCATTGGCATAGAATTAGAGATTATGTTCAGCAGATTAAAAAAAAAAAGAAAACag----ctgtgatcatgccactgcactccagccagggctgcagagcaagaccctgtctcaaaaaaacaaaaaGCCAAAAATACGAGATGTTTAAA-----AAAAGAACTGTTGTTCAAGAGATCATTTTCACTTTTTAATTGGTTTTTGAAAACTGTGAAAGTATCTCAAACTGAAGTCTAAAAGGAAAATAAT----AGAAGCTTCAAAGTTCAGGGGCCAGGTTATATCTATATAAAAGGGAAGCTAACTTATTTCCAGAACTGATTCATTTATTAAACATGGGGCTAAGGAATAGAGGTGGCAATATACAAGTCAGGATAATGCCTTTGTCTTCTGAAGCTGCATCTACATTGGTGCCCCTCAAAATAGCTAAAATTGAAAATAGTTTATCTGTCACCTGGGATTTCTTCTACAAATAACCTTCCCAAAAAAATATTGCCTAACATTTTTCTGAATTTATCAAGCCAACCATCTGATCAATTTTCTAAATGAAGATTTATTCTTGGCAATAATCTAGCTCAGGGCCTAGGTC-TTGTACACAGCATTAAGCAATGTAACAGATGAGTGCACTGGAAGTATGGATTT-GCAGATGGCCTCCTTGTTTCTGTATTTTAATTAAGGAAGTCTCTAGCTCAAAGGACATGAGATTAAGGGCAGCAGCAAACCATGTGAACTATCAGAGATTCAACAGAGACAATCACGCCCTCTGAAATATGTATTGATCCATGCATATTTTCACTAGGATGTTTTCTTTGAGTAAAGCTAAGGACAACATGGCTTGCGCACCCAAAATATCTTCTCATCTTAAGTTCTAGGCCTAAGGCAGGGCTCAGGCATCAGCCGTTTTTGGCATTAGAAACAGGTTATTCAGGTTATTGGCAACTCTTCTATAAATCAACTGTGTGACCAAACTGGGTTGGGGGGGGGGGGGCAGGGGCGGGAAACTCAAAAACTCTCATGACATCAAGACTATAAACTTACTTTAGGGGAAAGCAATTGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTCGATCATTTTCTTTTCCCAATTATTTGTTCCCAGGATAGGATACAGTTCTCTCCAGATTGCCTGAAACTAGCTTTGGATGTAAGAGTCGTGGTTTTCTTGGATCGTGGCTTGCATCTCCAACCCAAGCTTTCATTATGGAAAATGATGGTGCAGAGCTTAATCTCAAAATGCCATTGTAATAGGGAGACTGCAATACAGTGGTAGCAACAGTCCCACACTTTCTCCCAGCCTTCATCATTTAATAGTCATTTTCTGTGCTTTTATTATCTGGAATAGGTCTCTGCTCCATATGGCTTCATCTCTGCAAGGATAGTACATGAGATGTGAAGACTTAATCCTAATGAGACATTTACTTCTAAGTCCCACTCACTAGAAGCAAGGGTTGTGTATGGTTGTTTAAATCTTTTGAATCTTGATCATTAAAGAAAAGTTTAGTctggacgcagtggctcacccctataatct s rheMac1.SCAFFOLD125516 10668 1623 + 48937 AAGTTGGGTACAACTTTTCATCAACCAAAAAAAAGGAGAAAAACAATCACACAGCCAAATAATGAAATATTGTAACTAGAGTGTCTTGGCTCTAAGATCATTGGCAGAGAATTAGAGATTATGTTCAGCAGATTAAAACAAAACAAAAAAcagtgagctgtgatcatgccactgcactctagccagggctgcagagcaagaccctgtctcaaaaaa-caaaaaGCCAAAGATACAAGATGTTTAAAGTTAAAAAAGAACTGTTGTCCAAGAGATCATTTTCACTTTTTAATTGTTTTTCGAAAACTGCAAAAGTATCTCAAACTGAAGTCTAAAAGGAAAATAATTAATAGAAGCTTCAAAGTTCAGAGGCCAGGTTATATCTATATAAAAGGGAACGTAAATTATTTCCAGAACTGATTCATTTATTAAACATGGGGCTGAGGAATAGAGGTGGCAATGTACAAGTCAGGATAATGCCTTTGTCTTCTGAAGCTGCATCTACATTGGTGCCCCTCAAAATAGCTAAAATTGAAAATAGTTTATCAGTCACCTGGGATTTCTTCTACAAATAACCTTCCCAAAAAAATATTGCCTAACATTTTTCTGAATTTATCAAACCAACCATCTGATCAGTTTTCTAAATGAAGATTTATTCTTGGCAATTATCTAGCTCAGGGCCTAGGTCATTGTACACAGCATTAAGCAATGTAGCAGATGAGTGGACTGGAAGTATGGATTTTGCAGATGGCCTCCTTGTTTCTGTATTTTAATTAAGGAAGTTTCTAGCTCAAAGGACATGAAATTAAGGGCAGCAGCAAACCATGTGAACTATCAGAGATTCACCAGAGACTATCACGCCCTCTGAAATATTTATTGATCCATGCATATTTTCACTAGGATGTTTTCTTTGAGTAAAGCTAAGGACAACATGGCTTGCACACCCAAAATATCTTCTCATCTTAAGTTCTGGGCCTAAGGTAGGGCTCAGGCATCAGCCGTTTTTGGCATTAGAAACAGGTTATTCAGGTTATTGGCAGCTCCTCTATAAATCAACTGTGTGACCAAACTGAGACGGGGG-------------------AACTCGAAAACTCTCATGACATCAAGACTATAAACTTACTTTAGGAGAAAGCAATTGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GTCAATCATTTTCTTTTCCCAATTATTTGTTCCCAGGATAGGATTCAGTTCTCTCCAGATTGCCTGCAACTAGCTTTGGATGTAAGAGTCGTGGTTGTCTTGGATCGTGGCTTGCATCTCCAACCCAGGCTTTTATTATGGAAAATGATGGTGCAGAGCTTAATCTCAAAATGTCATTGTAATAGGGAGAATGCAATACAGTGGTAGCCACAGTCCCAGACTGTCTCCCAGCCTTCATCGTTTAATAGTCATTTTCTGTGCTTTTATTATCTGGAATAGGTTTCTGCTCCATATAGCTTCGTCTCTCCAAGGATAGTACCTGAGATGTGAGGACTTAATCCTAGTAAGACATTTACTTCTAAGTCCCACTCACTAGAAGCAAGGATTGTGCATGGTTGTTTAAATCTTTTGAATCTGGATCATTAAAGAAAAGTTTAggccaggcgcagtggctcatccctgtaatcc a score=2444 s hg17.chr12_random 231301 29 + 466818 cagcactttgggaggccaaggcgggcagg s rheMac1.SCAFFOLD125516 19291 29 + 48937 cagcactttgggaggccgaggcgggcgga a score=16557 s hg17.chr12_random 231330 185 + 466818 tcacctgaggtcgggagttcaagaccagcctgaccaaaatggagaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaaattagccaggcatgctggcgcatgcctataatcccagctacttgggaggctaaggcaggagaattgcttgaacccaggaagcagaggttgcagtgagccaagattgcgcca s rheMac1.SCAFFOLD125516 12291 185 + 48937 tcacctgaggtcgggagtttgagaccaacctgaccaaaatggagaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaaaattagccaggcgtggtggcgcatgcctataatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggaagcagaggttgcggtgagccaagattgcacca a score=3390 s hg17.chr12_random 231515 75 + 466818 ttgcactccagcctgggcaacaagagcaaaactccatcccaaaaagtaaagaagggaagggaagggcagggaagg s rheMac1.SCAFFOLD125516 19490 74 + 48937 ctgcactccagcctgggcgaca-gagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa a score=423383 s hg17.chr12_random 231663 5297 + 466818 gggaagggAATTTAACTTATTTACTGAAAGGAGTAATTCCAAACCATATTATCCTCACTATCTGAACCTAAATATAGCCAGTGTGATTTTAATGTTGCCCTTTCTAAAGCAAGATAATGCCCATGATAATCATTAGGAAATTTATTATACAGTATCTAACAATGAATGGAGTTTTAAAAATCTAAATGTCTGTATAGGCCTGGACTGGCCTTAAGATTATATATTATATACATTTTCAGTTACTTTA-----TTTTTTTGTAAAAGTCAACTTAGAACTATACACAAATACAAACATGCCTAAAATTTATGCAAATATGTGACATTCTCTTATAAATTTTCCTTTATGTTCTTATTCTTAGTGAGTTAGTTGGTTGTGTTAGTTTTCTCTGGTGTGACACACTAGTATTCATGGTATGACAAAAATATGTCATTACACATGTGCACACACACAGAGATCCTGTGTCAAAGTGTGGTTTTGATCCAAAAAAGTAAAAATATAAGCATCATTATGGACATAGGGATAAGTATTCAACTTCTTTTTAGAAATTCAATTGATTTTGCACTTATCCTACAAAGGTAGGATAGCTTGAATTCCTAGCTGGAGTCCTAATGAGAGAATGCTATTTTGTTTTAAAAGTTACCTCTATTGCTATGAGATTATATGCTTTCAATATTTTTAGTTCTTAATGTATTTGACTTAGTGTTATAAAAATATGCCACCTACTCCAGATTGGAGTAGGTATTAGGTTCTAATGGCATTTAGAACCATTTCCAAATATTACTGTTTTTTTTCCTCACATGTGAATGTAATCACACATTTGCCAGCACATATAAAATAAATACATGTTGCATTATATATTTTACATTTATATTAAGTCTCAAATATTTCCTAGTTACTAGCAAATATTAAAATGACAATGATACTTACTTTTTAAAAAAAATCCGGTATTACATTGGCTGACTTTATGAGTAAATCGTTCATTTATAGGCCATTCTAGGGAAATTTTGTGATGCTTAATTACACCTTAAAATAATCTGGGTGAAAAACACATGCTAAAATACATCTTCAATGTGTTCTCATTAATTCCCCTGGAATACAGAAAAATCCAGAAAAGTCTACAAAACTAAAG-TTTCACTCTTTTTAGGTGGCACTTAAGATGCCACAGTGGTCCCACAGCAGTCTGTCTCAGCTTGCAGTTTTCCAAAATTAGGACAAATGAGTGGCTTGAAGGAAAAATAATTGACGTTAACAAGACAAAAAAATTGGCCTGCTATTTCTGCTGTATAAGGAAAATCCAACCTGTTGGTaggagagaagaaaagtgaaccaaaaagaagaggagaaaagaCACCATCATTTT---------------------CATTTTCATTTTCATGGCCCTCTTATGGGCCTTCATTCTGAGGTCCCTCGGGCCCATGGTGTTGAGCTGCAAATTCCTGATATGTCTCATCAAGGACAGAATTAAAAGGAGCAGTGAGATCAGGGACAGAAGAAAGGAAATTAAGTAGATCAAACTGACAAGAATCCAGAGGCTACAATATAGAATTTTACTTACATCTAAAGACCAAGTTGAGTTTCTTTCATAAATTGTGTAGATGTTAATCCACAAGTCACTAAGTCCACCTGTTAATGCAAGGTTGAAAAACAGTAAGAGCAAGGACCCCAGTGGGAGTTCAAGTAGCGTTCTGCTAATTCTCCATCTCAGCCAGATGAAGCATGGGTGGGAAAAATAGG-TATTTTAAAGAAGTAGAAAACACTAAG----GCAGCAAGCCAGGTAACTAAGTGATTGGTCAGTGCCCAAAAAATATGAATAAATTTTATTAGTTTATTGAAGGCATATAGATGTGGCCATAATGCTGTTACAAATGAATCAAGTAGTATTATCCAAAGTTGACTGATTGTGGAGATAGCCAGGCTGGTGAGGATGCAGTTGTCTAATAAGATCATTTGACTCCTCACCAGTCAATGCAGTTAACTAGTACAATGAACCCATTCCCTAACATTCAGATTATGAATTCTCCCATCATTACTATCAGAAAGGTATTTCCAATTCCAGGTGGCATTTCTGGAGAAACAAATCCAGAAAGCTAATACTATGTTTCACTGATACTTTTGCTGTCAAAACGTTGCAGAATAATATCCAACTTGATGATTTTCAGATTTATATTTAAAATGTTCAGAGTAACTCAGAATGATCTTCTGTTTGATGCCACCTCACTTATCTTCACAAAAGATCTTTCTGTTTTTTTT-ATATTCATCTCACTAGTAGGCCTGAAATATGTGCAAGAAGATCCAGTCTCACATATCTTAATT---TAAAAAAAACTTTAACATTATTTTTAATCAGCTACTGACTTACAAATTAAATAGTAAATGTAGTAAATGTGCCCACTCATCATTGGCACTGAGAGCAATTTCCCACTTGTGAGGACATCTAGAAGGGCGAAGTCAGGTATGCAAATATCAAACAGATTTCTTTACACTGATTTGTAATTTTCTCCTCAACTGAAAGTCAATACCATTTGGATTTGAATATCTTAATTTTAAAAGAATTATCTAAAAATAACCTCTACAATATATGTATTACTCATTAGTTTCATTAAATAAACTCCATAATATTTCCAATTCTACTTTAGAGGAATTAAGTGTAATAAAAAGAAGCATCAAAAAGCTCACAGAGTAGTGAAAAGAAGCAACATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAACCACAGTTTGATCAAAATGCAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCTTTTAGGATTTCTTAAAGAAATAGACAAAAAGGGAGATGATTTTACATAATTATGTAAAAGCATATGTAAAGAAACAAAAAGTATTCCTTTATCTGAGCTATTTTACTGAACTTTTGAGCTTGGTTTCCAATGCCTTCCTGGCTATTTGATTTTGAATAAGCTCTTATCAACTGAAATGAAAAAAAAATAGTAAAAAAGGATGGAAAAATAGCAAAAAAACATAAGAGGGAGAATAGGAGGGAGATTCTCCTTTTCATTAATTCTTCCTTTGGTAAAATTCTTTGTCTCATAAAAATGTATCCACAGTAAAATACATTTTATAATTTATTTGTATTATTTTGTAACTCTAATAcaatgtttttcaaacttgactgcacattggagttaacttgggagatttaaaaaaacatattgatgcctgtgggcca-ctcccagggattttttttacctaattggtctggagtACATTGCTGGCACTCACTGAGAGGCTCTTGATGTATGTCTTACAGTGACTCCCAAACCCAGGCAAAAATATTTCTACCCAAAAGCTGCAAATCTATGATTCTGCAAGGACAGGACAGGATTTTGCCTGCCTTGTTCTCTAACAATGTGTTTCTCATTCAGCCAATTTTGACGCTGACTGGCAAACTGGCCACCAACTCTCTTAACAACCACATAagcgacttttttgttgttgttcattagtctgtttccaattcacagaacataaagggcatggataatagcaggtcttccataactatttgttaaatgaatTAGTGCTAACTTAGTTGGCAGTCCCACTAGCAGCACACAAAAGGAGAAAATGAATTAGGCTTGACTGTGAAACAAGTATCAGAGCAAGAAAAGAAAGTACCTCCTTAC------AGAAAATGTTACATTCATGTATGAGCTTATGAAAGATTTCTGTTCTAATCCTGAAAAACCCAACACTGCTCTGTAATCTTTCTAGTTCAATCAAGAAATCATACAGAATCAAAAGGAACA---TGGTCTGCCACCCAAGATGGGGGAGGCTTGGTACTTTTCTTCATGAAAAGGAACTACTTCT----------GTTGAAGATGGCTAGAAAACTAGATTTCATGACCCAAGAAGCAAGATAGCCCT------AGAGATCACTAATGTTTTCAGAAATGCTCTGCAAGTCATGTAAAGGCTAATTGAGAAGAAGATTCCATTGATAGGCATGGTTTAGCTGTGAAAAACACCGAAAACAAGTCAGTCAGGAGATAGTGATTAAAGAACATCTAAGTTTGTAGTTACGCTGAAGAAACTAAAAATAAAAGATGCAATAACAAGTATAAAAACCACAAGTCCCATATACTATGAGTTGTATTCAAAGTCCAAGTTAATAATCACAATTTTTTAAATCTACATAAT-----TAATCTATGTCCTACTCTAGACAAAATATCATCCAGTGTCTAGAATGAAAGCAAAATGACTGTGCAAATATACAAACACCCCCTaaaataactattgggtaataggcttaatacctgggtgatgaaataatctgtacaacaaactcccatgacatgagtttacttgtgtaacaaacctgcacatttacccctgaaacta-----aaagtttttttgtaaaaaaaaaaaAACACCCCTTAAAGCATGA-TCTGGCTCAGAGAAGATGCTGTCTAATGAAGATTTTGCTAGAAAAAGCCACCTACTAAGACATAGCAGATAAACCACCCAAGACAGTGAGGAAATTGGTGCTCCTTTTTCTTGGAAATCAGTATTGGTATGGGTTTCTACCTGATGT-TACATTCAGTACAGTTTAAGAAAACATGCCTTGATATACTTGATTTGTGTCTTATTTGCCTTCAGAACTAGAGCTATGGGTTGGAGATAAGCCAATTTCAGCAGTAGAAACAGGTTATTTGTTCCTGTCCTATAAATTACCTGACTGTATGCATTGAAATAACCACAATGATTACACCCAGTATCTTGAAATGAGCATTTATTTGACAAGTGAGATGAGTGGGAGTCTATAAAAATGAGTGATAATTTCCCTCTTTCCCCAACAGCTGGGTCCCAGGGTAGGTCATAATCCCATCAGTCTTGTTGATGGGATGTTGCATGTTGCATGTGTCAGTGCATGTGTTGGGCATGGCTCTTGGATTGTGGCTTGGTGGCTGCTAAATTCCCACAAAGGCCTTGTTTGGGAGAAAGTGGAGGTGCAGAGCTTGCTCTCATTTGCCATTCAAATATGCAGATTACTggccaggcacggtggctcatgcctgtaatcccaatactttgggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggctaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggcatacaccacctgtaatcccagctactcaggaagctgaagcaggagaagcacttgaacccgggaggtggaggttgc s rheMac1.SCAFFOLD125516 12711 5297 + 48937 GGGAAGGGAATTTAACTTGTTTACTGAAAGGAATAATTCCAAACCAAATTATCCTCACGATCTGAACCTAAATATAGTCAATGTGATTTTAATGTTGCCCTTTCTAAAGCAAGATAATGTCCATGATAATCATTAGGAAATTTATTACACAGTATCTAAGAATGAATGAAGTTTTAAAAATCTAAATGTCTTAA--------GACTGGCCTTAAGATTATATATTGTATACATTTTCAGTTACTTTAAATTATTTTATTGTAAAAGTCAACCTAGAACTATACACAAATGCAAACATGCCTAAAATATATGCAAATATGTGACATTCTCTTATAAATTTTCCTTTATGTTCTTATTCTTAGTGAGTT----GGTTGTGTTAGTTTTCTCTGATGTGACACACTAGTATTCATGGTATGACAAAAATATATCATTACACATGTGCACACACACAGAGATCTTGTGTCAAAGTGTGGTTTTGATCCTA-----TAAAAATAGAAGCATCATTATGGACATAGGGATAAGTATTCAACTTCTTTTTAGAAGTTCAGTTGATTTTGCACTTATCCTACAAAAGTATGATAGCTTGAATTCCTAGCTAGGGTCCTAATGAGAGAATTATCTTTTGTTTTAAAAGTTACATCTATTGTTATGAGATTATATGCTTTCAACATTTTTAGTTCTTAATGTCTTTTACTTAGTGTTATAAAAAT------------------TGGAGTAGATATTAGGCTCTAATGGTATTTAGAACCATTTCCAAATACTACT--TTTTTTTCCTCACATATGAATGTCATCACACATTTGCCAGCACATATAAAATAAA-ACATGTTGCATTGtatattttatatttatattaaGTCTCAAATATTTCCTTGTTACTAGCAAATATTAAAATGACAATGAGAATTACTTTTTTAAAAA--TCTAGTATTACATTGGCTGACTTTATGAGTAAATTGTTCATTTATAGGCCATTCTAGGGAAATTTTGTGATGCTCACTTATACCTTAAAATAATCCGGGTGAAAAACACATGCTAAAATACATCTTCAATGTGTTCTCATTAATTCCCCTGGAATATAGAAAAATCTGGAAAAGTCTACGAAACTAAAGCTTTCACTCGTTTTAGGTAGCACTTAAGATGCCACAGTAGTTCCACAGCAGTCTGTCTCAGCTTGTGGTTTTCCAAAATTAGGACAAATGAGTGATTTGAAGGAAAAATAATTGATGTCAACAAGACAAAGAAATTGACCTGCTATTTCTGCTGTACAAGGAAAATCCAACCTGTTAGTAGGAGAGAAGCAAAGTGAACCAAAAAGAAGAGGAGGAAAGACACCATCAtttttttcattttcattttcattttcattttcattttcaCGGCCCTCTTATGGGCCTTCATTCTGAGATTCCTTGGGCCCATGGTGTTGAGCTGCAAACTCCTGATACGTTTCATCAAGGACAGAATTAAAAGGAGCGGTGAGATCAGGGACAGAAGAAAGGAAATTAAGTAGATCAAACTGGCAAGAATCCAGACATTACAATATAGAATTTTCCTTACATCTAAAGACCAACTTGAGTTTCTTTCATAAGTTGTGTAGCTGTTAATCCACAAGTCACTAAGTCCACCTGTTAATGCAAGGTTGAAAACCAGTAGGAACAAAGACCCCAGTGGGAGTACAAGTAGCACTCTGCTAATTCTCCATCTCAGCCAGATGAAGCAGGGGTGGCAAAAATTGACTATTTTAAAGAAGTAGAAAACACTAAGACAGGCAGCAAGCCAGGTAACTAAGTGATTGGTCAGTGCCCCCAAAATACCAATAAATTTTACTAGTTTGTTGAAGGCATATAGATGTGGCCATAATGCTATTAAAAATGAATCAAGTAGTATTATCCAAAGTTGACTGATTCTGGAGATAGCAAGGCTGGTGAGGATGCAGTCGGCTGATAAGATCATTTGACTCCTCACCAGTTAATGCAGTTAACTAGTACAATGAACCCATTCCCTAACATTCAGATTATGAATTCTCCCATCATTACTATCAGAAAGGTATTTCCAATTCCAGGTGGCATTTCTGTAGAAGCAAATCCAGAAAGCTAATACTATGTTTCACTGATACTTTTGCTGTCAAAATGTTGCAGAGTAATATCCAACTTGATGATTTTCAGATTTATATTTAAAATGTTTACAGTAACTCAGAATGATCTTCTGTTTGATGCCATCTCACTTATCTTTACAAAATATCTTTCTGGTTTTTTTAATATTCATCTCACTAGTAGGCCTGAAATATGTGCAAGAAGATCCAGTCTCACATATCttaattaaaaaaaaaaaactttaacattatttttaatCAGCTACTGACTTACAAGTTAAACAGTAAATATAGTAAATGGGCCAACTTATCATTGGTACTGTCAGCAGTTTCCAATTTGTGAGGACATCTAGAAGGGCGAAGTCAGGTATGCAAATACCCAACAGATTTCTTTACACTGATTTGTAATTTCCTCCTCAACTGAAAGTCAATACCATTTGGATTTGaatattttaattttaaaagaattatctaaaaataaCCTCTATAATATGTGTATTATTCATTTGTTTCAT----TAAACTCCATCATATTTCCGATTCTACTTTAGATGAATTAAGTGTAATAAAAAGAAGCATCAAAAAGCTCACAGAGTAGTGAAAAAAATCAACATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAATCAAAGTTTGATCAAAATGTAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCTTTTAGGATTTCTTAAAGAAATAGACAAAAAGGGAGATGATTTTACACAATTATGTAAAAGCGTATGCAAACAAACCAAAATTATTCCTCTATCTGAGCTGTTTTACTGAACTTTTGAGCTTGGTTTCCAATGCCTTCCTGGCTATTTGATTCCGAATAAGCTCTTATCAACTGAATTG--AAAAACATAGTAAAAAA-GATGG-AAAATAGCAAAAAAA-ATAAGACGGAGAGTAGGAGGGAAATT---CTTTTCATTAATTCTTCCTTTGGTAAAATCCTTTGTCTCATAAAAATATATCCACAGTAAAATATATTACATAATTTATTTGTATTATTTTG-AACTCTAATAcaatggttttcaacctttactgcacattgcagttaatgtgggagctgtaaaaaaac--attgatgcctgtgggccaccccccagggatttttattacttaattggtctggAATACATTGCTGGCACTCACTGAGAGGCTCTTGATGTATGTCTTACAGTGACTCCCAAACCCAGGCAAAAATCTTTCTACGCAAAAGCTGCAAATCTATGATTCTCTGAGGACAGGACAGGATTTTGCCTGCCTTGTTCTCTGACAATGTGTTTCT-ATTCAGCCAGTATTGATGCTGACTGGCAAATTGGCCAGCAACTCTCTTAACAACCACATAagtgacttttttgttgttgttgattggtatatttccaattcacagaacataaagggcctggataatagtaggtcttccataactatttgttaaatgaatTAGTGCTAACTTAGTTGGCAGTCCCACTAGCAGCACACAAAAGGAGAAAATGAGTAAGGCTTGACTGTGAAACAAGTATCAGAGCAAGAAAAGAAAGTACCTCCTTAAAATTAGAGAAAATGTTACATTCATATATGAACTTATGAATCATTTCTATTCTAATCCTGAAAAACCCAGCACTGTTCTGTAATCTTTCTAGTTCAATCAAGAAATCATACAGAATCAAAAGGAACATGCTGGTCTGCCACCCAAGATGGGGGAGGCTTGGTACTTTTCTTCATGAAAAGGAACTACTTCTAGCCCAGGGAGTTGAAGATGGCTAGAGAACTAGATTTTGTGACACAAGAAGCAAGATAGCCCTATCTGAAAACGTCACTGATGTTTTCAGAAATGCTTTGTAAGTCATATAAAGGCTAATTGAGAAGAAGACTCCATTGACAGGCATGGCTTAACTGTGACAAACACAGAAAACAAGTCAGTCAGGAGATAGCAATTAAAGAACATTTGAGTTTGTAGTTACACTGAAGAAACTAAAAATAAAAGATGCAATAACAAGTATAAAAACCACAAGTCCCATATACTGTGAGTTGTATTCAAAGTCCAAGTTAATAATCACAATTTTTTCAATCTACATAATTAGAGTAATCTATGTCCTACTCTAGACAAAATACCATCTGGTGTCTAGAATGAAAGAAAAACAACTGTGCGAATATACAAACACCCCCTaaaataactattgggtaataggcttagtacctgggtgatgaaataatctgtacaacaaaccctcatgacatgggtttacctgtataacaaacctgcacatgcgcccctgaaactaaaatgaaagtttttttt---aaaaaagaaaaCACCCCTTAAAGCATGACCCTGGCTCAAAGAAGATGCTGTCTAATCAAGATTTTGCTAGAAAAAGCCACCTACTAAGACATAGCAGATAAACCACCTGAGAGAGTGAGGAAACTGGTGCTCCTCTTTCTTGGAAATCAGTATAGGTGTGGGTTTCTACCTGATGTATACATACAGTACGATTTAAGAAAACATGCCTTGTTATACTTGATTTGTCTCTTATTTGCCTTCAGAACTAGAGCTATGGGTTGGAGATAAGCCAATTTCAGCAGTTGAAACAGGTTATTTGTTCCTCTCCTATAAATTACCCGACTGTGTGCATTGAAATAACCACAATGATTACACCCAGAATGTTGAAATGAGCATTTATTTGACAAGTGAGGTTAGTGGGAGTCTATAAAAATGAGTGATAATCTCCCTCTTTCCCCAACAGCTGCGTCCCAGGGTAGGTCATAATCACATCAGTCTTTC--------TTCTCCATGGTGCATGTGGCAGTGCATGTGTTGGGCATGGCTCTTGGATTGTGGCTTGGTGACTGCTAAATTCCCACAAAGGCCTTTTTTGGGAGAAAGTGGAGGTGCAGAGCTTGCTCTCATTTGCCATTCAAATTTGCAGATTACTggccaggcatgatggctca----tgtaatcccaacactttggggggccgaggcaggtggatcacctgaggtcaggagctcgagaccagcctggctaacatggtaaaaccccatctctactaaaaatacaaaaattagccaggcgtggtggtgtacaccg---gtaatcccagctattcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaaccagggaagcagaggttgc a score=83190 s hg17.chr12_random 236960 1128 + 466818 catgagccgagatcgccccactgtactccagcctggacgacagagcaagactctgtgtcaaaa-----------------aaaaaaacaaaaaacaaaaaCGGATTACAATACATCAATTGCAATAACCAGAATATGTCCCGGGCTGCTCTTACTACTT----TTTTGTTTTGCTTCTATTGTGAAGAATGGGGTCCTGTTCCTTGTAGTCCCATCTCCCTGGGGTTGCTGCCTACTAAGTGTTAGACATGTATTACTCTTAATTAGACATGTGTTAATTTACCACTAAGGTTGCTTATGAGTTGGATCAACTGCTTATCAAAGAAAAGTTTACTGACACAAAAATATAAATAGTATT--------TTGTGTTTTAAAGAATACAAGGTTAAGTCATTTATATAAAAGAATATCTTTAAAATAAACTCAGTATCTAAGTCTAAAATATATTCAGCTTGATTTGCACATTACCTTTTATCAAGGCAAGAAAATTATAATTATAATCTTTGACAAAATACTAAATTAGTGATCAAAATAATATATGTACATTTTATTTTGTAAAATGCAAATTACTAAAAAA--AGATGTTGTATTATCATTAAAACAATCATCAACATCATTGTTATTGATACATGATACCATATAGCCCAGATGTACTTACAATTTCATTTTATGCATATGGGGAGGGGGAAGTACTAATAATTCTAACATCATTTCCGGCTCCAGGGCACAGCTGTGGAGTCATGCCCTCAACTATAGCTTCATCAAGATTAATTTACAAGCATGTATTTATCAGTATTTAATAGCACATTTTTGTTTCTGTAATCTAGCACAATATAAAGAACATATCAAAAGTAAATTCTAAAAGGAATTCTTTGTTATTAAAAAG--TTTCACTATACAGCTTCTGTACAGTGTTTTAATCTATGCCATCATATTC-AAAATTTTTAGTAAATTTTCCCACCCTTAGCCTTATTTACAATCTGTAGTTTGTTACCTTATCTAATCTTAGATTATCACAGTCAAAGCAGCACTATGTATACATATGCTTGTCTAAAATTTACAATAAGCCTGCAACATTCTATAAACAACATCACTTTGCTTTCTGTGCCTTGCTGGTTAACATTGTTTCTATTTTTTCCTCTAAGAAATACAGTGATC s rheMac1.SCAFFOLD125516 18110 1148 + 48937 CAtgagccaagatcaccccactgtactgcagcctggatgacagagcaagactccatctcaaaacacacacacacacacacacacacacacacaACAAATACAGATTACAATATATCAATTGCAATAACCAGAATATGTCCTGGGCTGCTTTTACTAGTTTTACTTTCATTTTGCTTCTATTGTGAAGAATAGGTCCCTGTTCCTTGTAGTCCCATCTCCCTGGGGTTGCTGCCTACTAAGTGTTAAACATGTGTTACTCTTAGTTAGACATGTATTAATTTACCAATAAGGTTGCCCATGAATTGGATCAATTGCTTACCAAAGAAAAGTTTACTGACACAAAAATATAAAAAATACTGTTTTGGGTTATCTTGTAAATAGTACAAAGTTAAGTCatttatattaaaaaata--tttaaaataaattCAATATCTAAGTCTAAAATATATGCAACTTGATTTGCACATTACCTTTTATCAAGGCAAGAAAATTATGATTATAATCTTTGATAAAATACTAAATTAGTGATTAAAATAATATATGTACATTTTATTTTGTAAAAGGTAAATTACTAAGAAAATAGATTCTGTATTATTATTAAAACTATCAT---CATCACTGTTATTTATACATGATACCACATAGCTCAGATGTACTTACAATTTCAGTTGATGCATATGGGGAGGGGGAAGTATTAATAATTTTAACATCATTTCTGGCTCCAGGGCACAGCTGTGCAGTGGTGCCCTCACCTATAGCTTCATCAAGATTAATTTACAAGCATCCATTTATCAGTATTTAATAGCATATTTTTGTTTCTGTACTCTAGCACAATATAAAGAATATATCGAAAGTAAATTCTAAAAGGTATCCTTCGTTGGTAAAAAAATTTTCATTATACAGCTTCTGTACAATGTTTTAATCTATGCCATCATATTCAAAAATTTTTAGTAAAATTTCCCACCCCTAACCTTATATACAACCTATAG---------TTACCTTATCTTAGATTATCATAGTCAAGGCAGGACTATGTATACATATGCTTGTCTAAAATTTACAATAAACCTGCAACATTCTGTAAACAACGTCACTTTGCTTTCTGTGCCTTCCTGGCTAACATTGTTACTATTTTTTCCTCTAAGAAATCCAGTGATC a score=220612 s hg17.chr12_random 238088 2744 + 466818 AGATTGCAACAAAATGCATGTCACATAAACAAACACAA-----ACACAAACATCCTCAGAATGTAATTATGATCTTTTTGTAGTAGCAATATGAGTATAATTGTGAATTAAGACATAAACTTCTATAATTTTAGTTCTATTACATAACATGGTAGAAACATTGGTTTCTGCCTCTCTGAAAATGCATATTGCATGTCCTAGAATTTAGCAAAATTAGCATGTGCCTAGAAACATCAAAATGTTTATTATTTGGGGTTTTAAATTGACATCAGCATTAAATCATGTGTTTCCAGTTTCCATTTAAAGATAATTTATTTTATTTCACACTACAAATCTTCTCCTTTTCTCACATAATCGTCGTATTTCCTTGTTATCAACAAGACTTCTAATAACAAAAAAAAACCACTTTTTTTCATTTAAAAAAAATGCTTGGggctgggcacagtgtctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtggatcacctgaggtcaggagttcgagaacagcctgaccaatatggtgaaaccccatctctattaaaaatacaaaaattagccatgtgtggtggtgtgtgcctgtagtcccagctactcgggagactgagataggagagttgtttgaacccaggaggtggaggtggcagtgagccaagatcacaccactgcactccagcctgggcgacagagtgagatgccatt----------------------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTTTAGCTTTGAAGCTATGAGGCTATATTTTTCCTGCTGTGACTTTAGTTTTTAATTAGATTTTCTATCCACATTGTATATATCTTTTACCCATTCAAGTTTGTAATCTATCTTGCTTT-TAAAGA--CACACACCTTTTTCTCCACAAGTTGCAATTACCTATCGTTTGCatataaaattaaataatttagattttttgaaataatatGTGAGGTTAAAATATTGCTTGCCAATGCTCCAAACAAAAATGATTACTTTTAAAATGGTATCGACCGGCAATGTGTGAATTACCATCAAAAGCAACCTGGTAGGATTTCATTTATGTTCCAAAATACTTAGAGAAACCCAGTAGAAAAAAAAAAAAAAAACA--------------------GTGGAAGTGATCCCCAAATGCTCCTTGTTGAGTTATTCTCTTAGAAAAGCTTCTGGAAAGTCTGTCTACAAAGGTAAAGGGTTTGGTGTTTTTGTATAGTTCCTAAGATGCCACAGTAGCCTCACAGCTGTCTGTTGCAGCTTGCTGTTTCCCAGAATGAGAATAAATGAGTGGCACGAGGGAAAGGCATTTAAGGCTAACATGACAAACTTTATGCACTTGTTGTTCCACAACATAAAAAATATCCAATTGGCCACTTGTAAGGAAAAAAAATGAACTATGAAGAGGAAAAGGAAAGACATCACCATTTTCATGGCCCTCCTATGGGCCTCTGTGCTGGAGTCTCTAGAGCCCAAGGAACTGAGCTTCAAATTTCTAGTATGTCTCACCAAGGACAGAAATAAAAAAAGCAAGGAGGTCAGGAACAGAGAAAAGGGGATAAAACTGGTCAAGCTGAGAAGAGTTTTTAAAATAGAGAGTTTATCATAGAGAGTTTTACTTTCATCTAAATATAAAGTCAGATTACTTTTATCTATTATATTGAGTGAGATATCAATAAATATTTCTAGCACTAAACTGTCAAAAATCAGTAAGAACAAAGACAATATAAGAAGCATAACAATCATTCCGTTCATCCTCCACCTCAGCCAGAGGAAAAGGGAGTGGGGGAAGTGGGCTATCTTAAAGAAATAGAAAATGCTTAGGCAGGTGGCAAGCCAGGTTGTCAAGTGATTAGTCATGTGCCAAAGCATAATAACAGTTTTTCCTAGTCTATATGTGGTATATAAATGTGAAGCAAGTCCCACTAGAAATGAATCAAACAGTATCACCAACAGTTGTCCAATTGTGGAGATAGCCAAGCAGGTGAGGATGAAGTCAGCTGAGAAGACCTTTTGGTTCTTGATCCCTTCAGAGCAGTTTACCAGTCCAATGAACACATTCCCCAGCATGCTGATGATGAATTCTGCTATTGCCAGAATCAGAAAGATTTTGTCCAATTCGGTGGCCATCTCCAGAGA-CAAAAAAATCCAAGTTTTTAATACTTTGTATCATTAATAAATTTACAATCAAACCATTGCAGAAGAGCATTCATATCTGATACTTATCTTCATTGCTTTTATTGCACTTCCAGTCTTGATCAGAACCTTCTGCTGTTGGATAGAGTCTCATATACTTAAGGAAGTCTTTGCCTATTTTTACTATAATTCTGATCTTAATCCCAAAAGATCTACTAAGGGATGCAGTCTCACATACCTTCACGGGAGTGTTTTCATTTCTTTGAAAGAGCTGCTGAATTCTAAACCAAACAGTTTCTGTGTCCATTTATCATTGTCATGGGCTGAAACTTTCCACTTGTGGTAATGATTAAAAGGATAAAGTCAAGTATATTAATATGCAAATATAGACTGGATTCC-CCCCCTTTCTCTGATTTGTACATTTCTGCTCACCTGAAAAACTACACCACTTGGATCCAAATATCTTTATTGTTTTTCAGAGGAAGCTGCAGATATAATCTAATAATTTTGTTATTATTCAACGAATATATTTTATAAGTGCCTGCTGTGTTTCTGATCTTATGCAAATGCAATATATTTACCACAAAAAAAAGCATTAAGAAGTCTATAAAATAGTGAAAACAGGAAAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 19580 2779 + 48937 AGATTGCAACAAAATGCATGTCACATAAACGAACACAACACAAACACAATCATCCTCTAAATGTATTTATGATCTTTTTATAGTAGCAATGTGAGTATAATTGTGAATTAAGAGATAAAACTCTATAATTTTAGTTCTGTTACATAACATGGTAGAAAC--TGATTTCTGCCTCTCTGAAAATGCTTATTGCATGTCTTAGAATTTAGCAACATTAGCAAGTGCCTAGGAACATCAAAATGTTTATTATTTGGGGCTTTAAATGGACGTCAGCATTAAATCATGTGTTTCCAGTTTCCATTTAAAGATAATTTATTTT----CATACTACAAATC--ATCCTTTTCTCATATAATCATCGTATTTCCTTGTCATCAATAAGACTTCTAATAACAAAAATATACCACTTTTTT-CATTTTAAAAAAATGCTTGGggccaggcacagtggcttatgtctgtaatcccagcacttagggaggctgagagaggtggatcacctgaggtcaggagttcgagacgagcctgaccaatatggtgaaaacccatctctactaaaaatacaaaaattagctgtgtgtggtgatgtgtgcctgtagtcccag--actcgggaggctgagacagaa---ttgcttgaacccgggaggtggaggtggcagtgagacaagatcgcaccactgcactccagcctgggcgacagagcaagattccgtctcaaaacaaacaaaaaaacaaaaaaacaaaaaACAAAAAAAAAAAGCTTGGCTTTGAAGCTATGAGTCTGTATTTTTCCTACTGTGACTTTAGTTTTTAAATAGATTTTCTACCCACATTGTATAT--CTTTTACCCATTCAAGTTTATAATCTATCTTGCTTTCTAAAGAATCACACACTTTTTTCTCCACAAGTTGCAATTACCTCTCATTTGCatataaaattaaataatttagattttttgaaataatatGTGAGGCTAAAATATTGCTTGCCAATGCTCCAAACAAAAATGATTACTTTTAAAATGGTATGGACTAGCAATGTGTGAATTACCATCAAAAGCAGCCTGGTGGGATTTCATTTATGTTCCAAAATTCTTAGAGAAACCCAGTAGGAaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaAACAAAAACACAGTGGAAGTCATCCCCAAATGCTCCTCATTGAGTTATTCTCTTAGAAAAGCTTCTGGAAAGTCTGTCTACAAAGGTAAAGGGTTTGGTCTTTTTGTATAGTTCCTAAGATGCCACAGTAGCCTCACAGCTGTCTGTCGCAGCTTGCTGTTTCCCAGAATGAGAATAAATGAGTGGCACGAGGGAAAGGCATGTAAGGCTAACGTGACAAACTGTGTGTACTTGTTGTTCCCCAATATGCAAAATGTCCAATTTGCCACTTGTAAGGAAAAAAAGTGAACTATGAAGAGGAAAAGTAAAGACATCACCATTTTCATGGCCCTCCTGTGGGCCTCTGTGCTGGAGTCTCTAGAGCCCAAGGAACTAAGCTTCAAATTTCTAGTATGTCTCACCAAGGAGAGAAATAAAAAAAGCAATGAGGTCAGGCACAGAGAAAAGGGGATAAAACTGTTCAAGCTAAGAAGAATTTTTAACAGAGAGAGTTTATCATAGGGAGTTTTACTTTCATCTAAGTATAAAGTCAGATTACTTTTATCTATTATATTCAGTGAGATATCAATAAACATTTCTAGCACTAAACAGTCAAAAATCAGTAAGAACAAAGACAATGTAAGGAGTATAGCAATCACTCTGTTCATCCTCCACCTCAGCCAGAGGAAAAGGGAGTGGGGGAAGTGGGCTATCTTAAAGAAATAGAAAATGCTCAGGCAGGTGGCAAGCCAGGTGGTCAAGTGATTAGTCATGTGCCAAAGCATAGTAACAGGTCTTCGTACTCTATCTGTGGCATATAAATGTGGAGCAAGTCCCACTACACATGAATCAAACAGTATCACCAACAGGTGACCAATTGTGGAGATAGCCAAGCAGGTGAGGATGAAGTCAACTGAGAAGACCTTTTGGTTCTTGATCCCTTCAGAGCAGTTTACCAGTCCAATGAACACATTCCCCAGCATGCCGATGATGAATTCCACTGTTGCCAGAGTCAGAAAGATTTTGTCCATTTCGGTGGCCATTTCCAGAGACCAAAAAAATCCAAGTTTTTAATACTTTGCGTCATTAATAAATTTACAATCAAACTATTGCAGAAGAGCATTCATTTCTGATACTTATCTTCATTGCTTTTATTGCACTTCCAGTCTTGATCAGAACCTTCTGCTGTTGGATACAGTCTCATATACTTAAGGAAGTCTTTGCCTGTTTTTACTATAATTCTGATCTTAATCCCAAAAGATCTACCAAGGAATGCAGTCTCACATACCTTCACGAAAGTGTTTTCATTTCTTTGAAAGAGTTACTGAATTCTAAACCCAACAGTTTCTGTGTCCATTTATCACTGGCATGGGCTGAAACATTCCACTTGTGGTAATGACTGAAAGGATAAAGTCAAGTATATTAACATGCAAATATAGGCTAGATCCCGCCCACCTTCTCTGATTTGTACATTTCTGCTCACCTGAAATACTACACCACTTGGATCCAAATATCTTTATTGTTTTTCAGAGGAAGCTGTAGATATAATCTAATAATGTTGTTATTATGCAAGGAATATATTTTATAAGTGACTGCTTTGCTTCTGACCTTATGCAAATGCAACATATTTACCAC-AAAAAAAGCATTAAGAAGTCTATAAAATAGTGAAAACAGAAAAA a score=1416 s hg17.chr12_random 240832 133 + 466818 AAACAATGAG-------------ACAGAATCAA-----GAATAAAATGTGCTATTAAAGCAGAAAAGGGAACTACAAACACTACTGTTGGGGAGAAA-------------AGGGGGGTGACATTTGCTTTGGATCTGGAAAATACTTAGAATTTCATGAGGAAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 15394 163 + 48937 ATTAAATGTGCTTTTACTACTGAATGTAATCAAAGTTTGATCAAAATGTAATTACAACACAGAGGAGGGTGTTATAAAATCTATGGCCAATAACTAATTCTAGTTTCATGAAGATAATGACAGTTGGCTTGGGTCTTGAAGCT-TTTAGGATTTCTTAAAGAAA a score=77554 s hg17.chr12_random 241003 953 + 466818 AGATACCGAAACCCAAACTACTTTTTTGAAATTAAAGTCCTACTGATATTTCAGTCTAAATGTTCCTCAGGTATCTTATAGTAACTTGTTCAAAATTAAACATGGTTTTGCTCTTTACCTTGGTTTTATATATGTTCTATTTTTTTTTT--------GGCAAGAGATATATTGCTACCAATTTAGCCTTAATAGACAGGTAGAAAATTGTTTTAGATGAAATAAGGAAAGAGGAAACAAAAGTATTTGTTCTACATTCTAGGAACAATTATTTTGACAAAAACCCCCAATGCACCATAATTGAACTCAGAGTTACAGATTATGTGTCTTGGTTTATGGTCAGCAAACAGATATTCTATTACTAGAAATTAGTGTTCAAGTGTTGCCAGACAAAAATTAACCCAAAAAATGAATGAAATCATTTTTAAAACTTGGACCTTTTTAATGTTGCTGTCATACTCCTCAATTAAATTCTATTAATTAACATTTAAAAGTGTATATTTTAAGAATGATGTTGTATAAAGAACTACTGGTAAGTTATTTCCTATGAACAAAAATATTTTCATTTAGGACAGATATTTAAAATTATAGTAAGACAGGAGGagaaaaagagtaagcaagaaaggaaggaaagaaagaaaagagggagggaaggaagagaatgagaaagaggaaaggaagagagagacaaagaaagaaaAAGGAGGGAGCTTCTGAGAC----AAAGGCTGAATGAAAATGAAGAAAtgtagcaatatcataggaaggagaatgatggcttcggccaaattagtgtctagagatggaaagaaatatatggctatgagaaacaattaagggaaagaatcaatagtctgtgtgatggatttggaggctagaaaaaggaggaggagtctgcaatgaaatgcatttaggctctcctttcactgctggatgcatgtggtactgtgatctgagggaatcac s rheMac1.SCAFFOLD135526 2 954 + 958 AGACCCTAAAACCTAAACTACTTTTTTGAAATTAAAGTCCTACTGATATTTCAGTCTAAATGTTCCTCAGGTATCTTAGAGTAACTTGTTCAAAATTATACATAGTTTTGCTTTTTACCTTGGTCTTATATATGTTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCAGAGATATATTGCTACCAATTTAGCCTTAATAGACAGGTAGAAAATTGTTGTAGATGAAATAAGGAAAGAGTAAACAAAAGTATTTGTTCTACATTCTAGGAACAATTATTTTGACAAAA-CCACCAATGCATCATAATTGAACTCACAGTTACAGATTATGTGTCTTGGTTTATGATCAGCAAACAGATATTCTATTACTAGAAATTAGTAATAGAAT-TTGCCAGACAAA--TTAACCCAAAAAATGAATGAAATCATTTTTAAAACTTAGACCTTTTTAATGTTGCTGTCATACTCTTCAATTAAATTCTATTAATTAACATTTAAAAGTGTATATTTTAAGAATGATGTTGTATAAAGAACTACTGGTAAGTTATTTCCTATGAACGAAAATATTTTCATTTAGGGCAGATATTTAAAATTATAGTaagaaaggaggagaaaaagagtaaacaagaaaggaaggaaagaaagaagagagagagggaagaaagagaatgagaaagaggaaaggaagagagggacaaagaaagaGAAAGGAGGGAGTTTATGAGACAGAGAAAGGCTGAATGAAAATGAAGAAATGTAGCAATATCAT---AAGAAGAatgatggctttggccaaattagtgtctagagatggaaagaaatgtatgactatgagaaatatttaggagaaagaatcaatagtctgtgtgatggatttggaggctagaaaaaggaggaggagtctgtgatga----cATTTAGGCTCTCCTTTCACTCCTGAATGCATGTAGTACTGTGACCTGAGGGAATCAC a score=1846 s hg17.chr12_random 242545 32 + 466818 aatattcttagcaaaATTAGCTGAGCTAATTT s rheMac1.SCAFFOLD125516 24135 30 + 48937 aacattgtta--aaAATTAGCTAAGCTAATTT a score=45155 s hg17.chr12_random 242597 556 + 466818 AACATCTTTTGCATTTCTTCATACCATCAACAGTTTAAGTCTGAAAATACCTTAGCTTTTATGCCCATATAATTAGCTTATAATTAATACATATTGAATATAATCAAACATTCCAGAGTTTTAAAAAATTTAAACCATTATCACACTCTTTTTCTCATTTTACGTATTATTCAAGAACATTAAGTTCTCTGACTGTGTCATTGGATATATTCAGTTTTCCTGCTTGGTATCTTAATTATAGACTGTCTTCCAGTCTAAAGCAACTACCTCTAATATCATATCAGCCATCCCCTCTCTCCACAAAGACCAGCCCTGCTCCTTTTACCTAGTCCAGTCACTCAGTA-TTTTTTCTTTTTCAAAACCTATGGGCTGTACTTTTCCATGTGGGGTGATGGGTAACAAGAGAGTTTCTCCTTCACTATTATGCAAACACAGACCGATATTGTTACTCTTTTTGCATTTTCTTTGCCTAATGAATTTCCATTTGTATCTTTAGCTATGGAAGATCTAGAGGAAGAATTTACAGATCGTAAATATTAAAATTCAATCTAAAAGT s rheMac1.SCAFFOLD125516 24165 555 + 48937 AACATCTTTTGCATTTCTTTATACCATCAACAGTTTAAGTCTGAAAATACCTTAACTTTTTTGCCCATATAACTAGCTTATAATTAATACATATTGAACATAATCAAACATTCCAGAGTTTTAACAAAATTAAACCATTATCACACTCTTGTTCTCACTTTGGATGTTACTCAAGAACATTAAGCTCTCTGACTGTGTCATTGGATATATTCAGTTTTCCTGCTTGGTATCTTAATTATAGACTGTCTTCCAGTCTAAAG-AAGTACCTCTAATATTGTATCAGCTGT-CCCTCTCTCCATGAAGACCAGCCCTGCTCCTTTCACCTAGTCCAGTCACTCAATATTTTTTTCTTTTTCAAAAGCTATGGACTCTACTTTTCCATGTAGGGTGATGGGTAACAAGAGAGTTTCTCCTTCGCTATTATGCAAACACAGACCGATATTGTTACTCCTTTTGCATTTTCTTTGCCTAACAAATTTCCATCTGTATCTTTAGCTGTGGAAGATCTAGAGGAAGAATTTACAGATTGTGAATATTAAAATCCAAACTAAAAGT a score=23713 s hg17.chr12_random 243253 319 + 466818 ATAACTTATTCTTAAGAAGCTCATTAATACAAACACACTCAAACCCATACACACATACTCACTCACTCATGGATAGAAGAAATTGTTGTCCTATAATTTCCAAAATGGAAAATTAATTTCAGGGACATCATCCAGGTAAAAATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTCAACCCATTTTCAATATTTTTCAAACTTATCTCTCATGCTGAGACCTTTGACTAAGTTTTTCTCTTGAGTTTACTTAATTGTTAAATATTAATTTTTTAGTTAAAATACTCAGCAATTGTGTAACTATTGTGGGCTACTTAAAAAACACG s rheMac1.SCAFFOLD85601 25128 311 - 44828 ATAATTTATTGTTAACAAGCTCGTTAACACAAACACACTCA--------CACACATATACACCCCCTCATGGATAGAAGGAATTGTTGTCCTATAATTTCTAAAATGGAAAATTAATTTCAGGGAGATCAACCAGGTAGACATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTCAACCCATTTTCAATATTTATCAAACTTCTCTCTCATGTTGAAGCCTTTGAATAAGATTTTCTCTTGAGTCTACttaatttttaaatactaattttttatttaaaataCTCAGTAATTGTGTAACTATTGTGGGCTACTTGAAAAACACA a score=167230 s hg17.chr12_random 243572 2376 + 466818 TTTTCCATTGAAGAGTCTAGAT--CTTCATATATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTCTATTTAATTTATTTTTGATTACTTAATGGTTTAAGAGGAATCGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTCTTTTCCATTTTTacagtataattgtttctaacagaagattgtggagtcagactgccaagacaggaaagcagattttctgcttcaaata----tggtctgagacttcatttgacaactactctctgccttggtataatcatctgtaaaatgcaaatgataataatattctcttcaggtagtctttatgaggaGTTAGTATACTAGTTGTATAACTGCTTTCAATTTTATCTGTCTAGTACAGGCAGGAACCAAGAATTATTAATTTTTTGTATGATCGTGTGTTACTTGATACATAAAAGATAACCAGTGAGACCTTCTTTTTTGG----------------GGTAGGGGAGCGAGAAagacagggtcttact-cgtcacccaggctggagtgcaatggcttgatcacagctcactccagtctcaaacatttgt---------gtcctcccacctcagcttctggagtagctgtgtctacaggcatgcatcacaacacccagctaatttattaattttt-----ttgttgagacagagtctccctatgttgcccagtctggtcttcaactcctgttctcaagtggtcccctcatcttggcctcccaaagtgcttgcatacaggtgtgaacaaccacacatggctGAGAACTTCCATTTTTGGGCAGAATGCACAAGGTTCAGAAAAGCATGATA-CCTTCTGCTACAATTAAGATAAGAGAAATAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTTGTCACAGAGTTGTACAAGCAAGAATGACCAGCTGAACTGAAATCCAGCACAGGGAGAGTCTTTATAGATTGCAGTtatatattcagtgcaatccctatcaaatcccagcagatgttttatcacagaaagtggaaaactactcctaaaatgtgtctggaaatgccaagtgacaagatcacaaaaagaaattgttaaaaaataacaaatttggaggattacactttctgatttcaaagcttccttcaaagctgcacgaatcaggattctatggtactcgcattagggtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagagtccagaaattaacaccaacattcatggtcaattgatttcaaaaaagggactactgcaatttgataggaattaatggtttttctcaaaaaacaatgctggGTAAAATTGaagaagactacctcaaagaatttaataatcaatttccct-aagctcaaggataaagaaaggattctgaaagcagcaaaagaaaaggaacaaataatgtacaatggagctccactacatgtggcagcagacttttcagtggaaaaaggccaggagagagtggtatgacatattaaaagtgcagagagtggtatgacatattaaaagtgctgaag--gaagaaaactttcagcctagaatagtgtaactggagaaaatatccttcaaacgtgaaagagaaataaagacttttccagaccaacaaaagctgagtgatttcatcagcaccagatctgtccta-gaaaaatttcaaacggattacttcagtcagaaagaaaaggacattaatgggcaataagtaatcacttgaagctataaaacgtacgggtaatagtaaggagacag-aaaacacagactaatataacactgtaaatgtggtgcataaacatcacttaaatagaaaaactaaatgatgaagtaatAATGAAAAAAAATAGTGGAGTGGCTGGcaaaatgtcctaataggaacagctccagtctgcaaatcccagcaagatcaacacaaaaggtgggtgatttctgcatttccaactgagttacatggctcatctcactgggactggttagacagcgggtgaagcccacggaggatgagccgaaggagggtgtggtgttgcctcacccgggaagtgcaaggggtcggggaactccctctcctagccaagggaagctgtaagggaccatgcagtgagggacgacgtattctggcccagatactacactttccccatggtcttcgtaacccacaaaccaggagatttcctccagtgtttatgccaccagggccatgggtctcaagcataaaactgagcgatcatttgggcagacaccaagctagctgcagaagttttttgtcataccccagtggtgcctggaatgccagcaagacagaaccattcagtcccctggaaagggggctgaagccaggaagccaagttgtctagctcagtggatcccacctccttggagcccagcaagctaagatccactggtttgacattctcactg s rheMac1.SCAFFOLD85456 52425 2375 - 81052 TTTTCCTTTGAAGAGTCTAGATTTCTTTGTATATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTTTATTTAATTTATT---GACTAATTAATGGTTTAAGAGGAATAGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTCTTTTCCATTTTT-tagtataattgtttctaagagaggatttaggagtcagactgccaagataggaaaccagattttctgcttcatatagccatgctctgagacttcattttacaactactctctgcctaagtataatcatctgtaaaactcagatgataataatactctctttgggtagtctttatgaggagttggtatactatttgtataactgctttcaattttagctgtctagtacaggcaggaagAAACAATTATTAATTTTTCATATGATCTTATGTTACTTGATACATAAAAGATA-CCAGTGAGAACtttttttttttttttttttttttttttggtgggggagcaaggaagacagggtcttgctgtgtcacccaggctggaattcagtggcttgatcacagctcactgcagcctcaaacttttggatgcaagtggtcctcgcacttcagcttctggagtagctgtgtctacaggcatgcaccacaacacccagctaatttttttatttttattttttgtagagacagagtctccctatgttgcccagtctggacttcaactcctgttctcaagttgtcctctcatcttggcctcccaaagtgcttggatacaggcatgaacaactgcacctgcccGAGAATTTCCATTTTTGAGCAGAACACACAAGGTTAAGAAAGGCATGGTATCCTTCTGCTACACCTAGGATAAGAGAAATAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTCATCACAGAGCTGTACAAGCAAGGATGACCAGCTGAAATGAAATCCAGTACAAGGAGTGTCTTTGTAGATTGCAGTTATATA-tcagtgcaatccctatcaaatcccagcagatgctttatcacaaaaagtaaaaagctactcaaaaaatatatctggaaatgccaaatcaacagatcaacaaaagaaattgataataagtaacaagtttggaggattacactttctgatttcaaagcttacttcaaatctgcactaatcagaattccatggtacttgcattatggtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagattccagaaattaacaccaacattcatggtaaattgatttcaaaaaagggactattgcaattcgataggaattaattgtttttctc-aaaaacaatgctgggaaaaATTGaagaagactaccataagcaatttaataatcaatttccctgaaactcacggataaagaaaggattctgaaagcagcaaaagaaaagaaacaaacaatgtacaatggagctccactacatttggtagcagctttttcagtcgaaaaaggccaggagagagtggcat-acatatt-----------------------------aaagtgctgaagcaaaaaaaaagttttagcctagaatagtgtaactggagaatatatcctttaaacaggaaagagaaataaagacttttccacaccaacaaaagctgagggatttcatcagcatcagatccgtcctataaaaaatgttaaagggattgcttcagtcagaaagaaagggacattcaagagcaataagtaatcacttgaagctataaaacttactggtaatagtaaagagacagaaaaacactggctagtataacactgcaaatgtggtgcataaacctcgcttcagtagaaaaactaaatgatgaacgaat-----aaaaaaATAGCAGAAtggttggcaagatgatcgaatggaaacagctctggtcggcaattcccagtgagattaatacagaaggtgggtgatttctgcatttccaactgagttacatggctcttctcactgggactggtgagacagtggctgcagcccacggaggacgagctgaaggagggtggggcatcacctcacctgggaagtgcatggggtcagggaacgctctcccctagccaagggaagcagt-agggaccatgcaatgagggacaatgcattccagcccagatactacgtttttcccacagtctttgtaacccacaaaccaggagacttcctccggtgcctatgccaccagggccctgggtttcgagcacaaaaatgggcaatcatttggacagacatcaagctagctgaacaagtttttt-tcacgacccagtggtgcctggaatggcagcgagacagagccattcactcccctggaaaagaggaagaagccagggaaaaaagtggtctttctcagcacatcccatgcccttgaaacccagcaagctaagatccactggcttgaaattatcactg a score=21397 s hg17.chr12_random 255129 658 + 466818 aaagtgaagagacaatccacagaataggagaaaatatttgcaaactactcatctggcaagggattaataaccagaatataaaaggagcttaaacaactgtataggaaaaaaaatctaacaatctgatcaaaaaaatgggtgaaatatttggatagtcatttctcaaaacaagatatacgaatgtcaaacagacatgtgaaaaggtgctcaacatcattgatcatcagagaaatgcaaatcaaaactaaaataagatatcatctcatcccagttaaaacagcttatatacaaaagacaggtagtaacaaatgctggtgaggatgtggagaaacgggaaccactgtacaccgcaggtgggaatataaattagtaaaaccactatggaaaacagtttaaaggtttctcaaaagactaaaattagagttaccatatgatccagcaatctcgctggtgggtatatacccaaaagaaaggaagtaagtgtatcaaacaggtatccacactcccatgtttgttgtagcactgttcacaatagccaagatttggaagcaatcaaagtgtccagcaacagatgaatagataaagagaaggtggtatggccgggggcggtggctgacaccggtaatcccagcactttgggaggccgaggtgggtggat s rheMac1.SCAFFOLD85601 2435 452 - 44828 AGagtgaagagacaa------gaatgggggaaaatatttgcaaactactcatctgacaagagattaataatcagaatacaaaaggagctttaacaactccacaggaaaaaaaatctaacaatctgatcaaaaaa-tgggtgaaagatttgaatgggcatttctcaaaagaagatatacaaatgccaaacagacatatgaaaaggtgctcaacatcactgatcatcggagaaatgcaaatcaaaactaaaatgagatatcatctcatcccagtgaaaacagcttatatccaaa-gacaggcagtaacaaacgctggtgaggatgtggagaaatgggaaccattgtaca-------------------------------------------------------------------------------------------------ttgcaggtgggaataca--------------aatgagtaca----------------accactatg----------------------------------gaaaacagttgaaaggtttctcaaaagactaacat-tagagctaccgtatgat---------------------ccaacaatctcact---------------ggtgggtatat a score=71748 s hg17.chr12_random 255953 1186 + 466818 agccgagattgcgccactgcactccagcctggagacagagcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagagggagagagaatgtggtacatatacacagtggagtactattcagccatttaaaaaatgagatcctgtcatttgcagcaatacggatggaattggagattattatgttaagttgaataagtaaaaaataactgcaatgtttgtgcagaaaggcaagcattgcactttctcactcatctgtggtatctaaaaatcaaaacaattgaactcgtggacatagagagtacatagatggttaacaaaggctaggaaaggtagtgggggctaaagggaaggtgtggctggttaatggctaccaa--------aaaaaaaaaatagaaagagtgaatgagacctactatttgataccacagcagagtgactatagtcaatgataatttagctgtacattttaacgtaactaaaagagtataactggattgtttgtaacaaaaaagagtaaatgtttgaggggatggctaccccattctt----atgtgattattactctttgcatgcctgtatcaacacatcccgtgtactcaata------cagacctactatatatccacaaaacttaaaaATACATTAAAAAAAAAGAAATTCCTAAACTTCCCATACCTGTTTACTGATAAGGTAAACTAATATGCCCACATAATGTTAAAATACCAAAAAATGTAAAATTATGTTTTCAAACAAACTGAATACAAATTATGAAAAATTCCACATATTGACAGTAATTATTTTCTGTAGCCTATTGTCTTAAATTTAATTTCCAAGATTCCTAGTTCAA-----GACCTTAGACTAATATTAGATTCAGTGACTTCATGAAAATCTTTGGATAATTACTAGTTAAGATGGAATACTGAAATGTGGTCACCAATCACGGGTTATATAAATAAATAACTAAAT----GTAACTTTTATATTT----------TATGGACTGGCTATTTGTTTGGATTACATTAACAAACATGGGAGTTTTGTATGCCAATTCAAGCAAGTGTAAAAAGGATGTATATGACTATAGAAAGTTGTAATATATGTGCTTGAGAATTTTGCACATCTGCCAAAATACTTATTTTTAATAGTCCTCAATTACATAACTTCCAGTTTCCTCTTTGAAAGAGAATTACTTTGATTAATGTAATG s rheMac1.SCAFFOLD85601 2960 1090 - 44828 agccaagatt-------------------tggaagcaacctcagtgtccagc------------------aacagatgaatagataaagagaatgtggtacatatacacaataaagcactattcagccatttaagaaatgagatcccgtcatttgcaacaatatggatggaattggagattattacgttaagttgaataagtgagaaataactgaaaggtttgcacagaaaggcaa------------------------------------------------------------------------------------------------aggtagtgggggctaaagggaaggtgtggcgggttaatggttatcaaccaaaaaaaaaaaaaaaatagaaagattgaataagacctactatttgatagcacagcagggtaactatagtgaatgataatttagttgcacattttaaagtaactaaaggagtataactaggttgtttgtaacaaaagagggtaaatgtttgagaggatggctaccccattcttcattatgtgattattacacttcgcatgcctgtatcaaaacatcccatgtacccaataaatatacacacctactatgtatcCACAAAACCTAAAAATACATTTTAATAAAAGAAATACCTAAATTTCCTATATCTGTTTACTGATAAGGTAAACTAATATGCCCACATAATGTGAAAATACCAAAAAATACAAAATAATGTTTTCAAATAAACTGAATAAAAATTATGAAAAATTCCACATATTAACAGTAATTATTTTCTGTAGTCTATCAGTTTAAATTTAATTTCCAAGATTCCTAGTTCAATTTAAGACCTTAGACTAATACTAAATTCAGTGGTTTCATGAACACCTTTCAATAATTTCTCGGTAGGATGGAATACTGAAATGTGGTCAACAATCACAGGttatataaataaataaataaatatatgtaacttttattcttattttatGTTTATGGAGTGGCTATTTGTTTGGATTATGTTAACAAACGTGGGAGTTTTGTAGGCTAATTCAAGCAAGTGTAAAAAAGATGTATATGACCTTAGAAATTTGTAATATATGTGCTTGAGAATTTTGCACATCTGCCAAAATAGTTATTTTTAAGAGTCCTCAATCACATCACTTCCAGTTTTCTTTATGAAAGAGAATTACTTTGATTAATGTAATT a score=146045 s hg17.chr12_random 257139 1978 + 466818 AATAAAAGTAGGAGTTAGAACCATGGTAGAAACAAGAATGGACAAGGAATATGACTGTTATGAAAGGTAATGGAATGTAGTTTGGGTTTTCAAGAAAAGAGTATCTTTGCCTAAAGTAATGTGTTTTGTTGCTATTTCTGTCCTCACTGTGCTTGATGATAACTGAAAtc--aattttattattttagctgggcttcatgaagtctgcc-tatacatgtgtggtgtagggaccagacaaagctttggatagtttatagtcagaagctggggctccccttttctggacttctcctttctcagattttctcctgatctcctgcggctcatgttaccctaaactcagtcctctgttacttcaacccagtaactctacagcttttttactgacgttttagtcctctgcctggtgcacactagggccagctataaaat--caggaaactcactccttgctatttccttcttccaagtgtcaactgcttttcagtatcggcctattttgttcattctccattgccttcagatggctgttttttttttaaatattttatccagaatttatagaaagtatctgtgggaggtttggtcctatgggtgttatttgatcattagtgtaagcaaaaAATGTTGTGTATATATTTTTACTGCTTATCATGTTTTCCTTTTTCTTTGGCCCACTATTTCACGTAGAATAGATTGACAGTCATTAGTTTTACAGCTTAGTCCACAGATTCTGAATTACAGAGAACGGCTCATGATGGAATGGAGGGGAATATTGGCAACGTCCAGAGATCATACATTTTTATCAGGATGAAATTGGAAAAGGGAGCACATTTCTAAATGATCAAGATTGGTGGTTTGAAAACATATCCAAGTGCTTCGACATACCTCATATGAACAGATGCAGTCTTATTCCCCTTCTCTTCAAAACAGGCCTTCATGATGTGTTTTAGTAAACTGTATGTCTCAGAACTGACACAGAAGAAGTTCCAAGGTTTATAAAGCTGGCACCTTCTTGTCACATGTGCCCTTGGCACCTAGAGCCAAATGCTGGAGAAACTACGTAGAGAAACAAAATAAAAATAGAAAGAGATGCCTGAGGATCCTCAGCTCACTGCCCACCCCCAATAAAACATATCATTAATACGTTTCCTATCATCAATATATTGATTAGACAGATAATTTGTAATATTTGCAGAATGTTTCATTCAGTTATGATCCATAGTTTCTATACCCTCTTTACATTGAGTTTTTTTTAAGAGAAGGAATATTTGAATTTTTTTGAGGAATATTAGGAATGGGAGACAAAGGAGATAATTGGAAATTCAGGGGCTCAGAGGTGGCTAAGCAAATTAAATGGAAATACTTGACATCAGATGTCAACTTCAAAAAAGGCTTTCTTTAATT-AAAAAGTGGAAGAAATCTCTTTTCTAACTACACATAAAAAATTATAACAGCACTGAAATGATCATGATTATGTTTCTTCATTCCTATTATACAAACGAATTTTTTTTCTAAGCTATTCACATACTGGTATAAATCTAGTATTCTTTAGTACTGTTTTTGGTATACATATACAAAATTTACTCTACGTATGTTTGTCACTCAAATTTAATTGTGTGCATCATTATCTAACAA--------------------CAACATAAAATAAGAATTCATAATGAAATAAAACCTACCCCAAAGATACATTCTCCTCATTGATTTAGAGTTGAATGTCTTTACCATCCAAAAAATTAGATGTTCAAACAATGATAGTTAAGTTCATACATGTGGTACAAATTACAATGGAAAACAGCAATAATTTGCTGATAAAAGCTATATGTTCTTAATTATAAATAGAGAT----AATTCTTCAAATGAAATATCATACAATAAACTATCATATAATAAACATACATATATATGTGAAATGTACTCGGCTTCATAATTTATGGTCAGTGTTGTtattcatacacatgcacacatatacacacatatatatatgc s rheMac1.SCAFFOLD85456 58037 1997 - 81052 AAAAAAAGTAGGAGTTAAAACCATGGTAGAAACAAGAATGGACAAGGAATATGACTGTTATGTAAGGTAATGGAATGTAGTGTGGGTTTTCAAGAAAAGAGTATCTTTGCCTAAAGTTAGGTGTTTTGTTGCTATCTCTGTCTTCACTGTGCTTGATGATAACTGAAATCtcaattttattattttagctgggctacatgaagtctgccctatatatgcatggtgtagggaccagccaaagctttggatagtttatattcagtagttagagctccccttttctgtccgtctcctttctcagcttttctcctgacctcctgctgctcatgttatcccaaactcagtcttctgttacttcaacccagtaagtctacagcttttctactgatgttttagtcctctgcatggtgcacactaggaccagctataaaatttcaggaaactcactccttgctattcccttcttccaagtgccgaccactctccggtatctgcctcttttgttcattctccattgcctatggatggctgtgttttt---aaatattttatccagaatgtatagaaagtatctgtgggaggcttggtcctatgggtgttatttgatcgttagtgtaagcaaaaa-tGTTTTGTATATATTTTTACTACTTATTATGTTTTTCTCTTTCTTTGGCCAAC-GTTTCTTGTAGAATACATTGACAGTCATTGGTTTTACAGCTTAGGCTACAGGTTCTGAATTAAGGAGAAAGGTTCATGATGGAATTGAGGAGAATATTGGCAGCGTCCAGAGATCATACATTTGTATCAGGACGAAGTTGGAAAAGGGAGCACAGTTCTGAATTATCAAAGTtgttagtttgaaaacatgtccaagtgcttcgacacacctcacatgaatagatggaggcttattcccctacccttcgaaatgggccttcgtgat----tTTAGTATACCATCTGTCTCAGAACCGACACAGAAGAACTTCCAAGGTTTAAAAAGCCGGCGCCTTCCTGTCACATGTGCCCTTGGCACCTTGAGCCAAATGCTGGAGAAACTATGGGGGAAAACAAAATAAAAATAGAAAGAGATGTCTGAGGAGCCTCAGCTCACAGCCCACCCCCAATAAAACATATCATTAATACATTTCCTGTCATCAATATATAGATTTGACAGATGATTTTTAACATTTGCAGAACGTTTCATTCAATTATGATCCATAGTTTCTATACCTTCTTTAAATTGAGATTTTTTTAAGAGAGGGAATATTTGAATTTTTTTGAGGAATATTAAGAATGGGAGATAAAAGAGAACACTGAAAATTCAGGGGCTCAGAGGTGTCTAAGCAAAATAAATTGAAATACTTGACATCAGGTGTCAACTTCAAAAAAAGTTTTCTTTAATTCAAAAAGTGAAAGAAATGACTTTTCTAACTATACATAAAAAATTACAACAGCACTGAAATTATCATGATCATGTTTCTTCATTTCTATTACAGAAATGTG-TTTTTTTCTAAGCTATTCACATACTGCTATAAACCTAGTATGCTTTAGTACTGTTTTTGGTATACATATACAAAATTTACTCTACATATGTTTGTCACTCGAATTATATATTGTGCATCATTATCTAAAAAAATTCTATTTGCTTTCTATGAAACATAAAATAAGAATTCATAATAAAATAAAACCTGTCCCAAAGATACATTCTCATCATTGATTTAGAATTGAATGTTTTTACCATCCAAAAAATTAGAGGTTCAAACAATGATAGTTAAGTACATATATGAGGTACAAATTAAAATGGAAAAGAGAAGTGACGTCCTGATAAAAGTTGTAAGTTCTTAATTGTAAGTAGAGATAATAAATTGTTCATATGAAATATCACAT-GCGAACTATCATAAAATATACATACATATATATGTGAAATATATTCGGCTTCATAGTTTATGGTCAATGTTGTTATTcatacacatgcaaacacatacacacacacacacacac a score=108158 s hg17.chr12_random 259122 1495 + 466818 caCTCCTGTAACTTGCTTCAATGAACAGGAAATTAGTAGACTTTACACAGAGATTTAAGATGGCTTCCACATTGGAGTTTCTTGCTCTTTTCCATTTACCATAAGGACATCATCTGGCTATTACACTGTTCCCAGAAGAAGAATGAGAAACTAATGGAGTCAGAATGCCACTGCCTGATCTAGCCTAAATCATCCAAACTCTA----TCTTCAAGATGCAGTACGTGGCCCATCTCCAATCACCACAGCCATCCATCAAACCCAGCTTAGAAAAATGAAATCCAAAGACATATGAGATACAAATATCTAATGTAGTTTTGGAGGATTTTCTCTTGCAGAAAAACATAAGTGACATAGGTATTCTGCTAAACCAAAAGTGTGGGAAATATGTCCACACTTGTTGTGTCAGGAATTCAGGATACAAGGGAAAAATAGTTGGAGAATGTCAAAGTTTTGTCATATGAAGTCAATAATTAAACCTAAAAGAAAAACCTGTTGAAAAATCTGGGGTTGGCAGGAAACATCATGTCAAATTTCCAAAAGTTGCAACTAAAATCAGAAAGTTTCTTCTTAAAATCTCTTAGAGTTATACATGAATGTATACAAATAGTGGATTTTTCCCTTCAGTATATAATGAGCAGGGTAATAATAATTTTCATGGAAAATTTCTCCTAATTAATAATTT-----TTATAACTAGACTACACACTTAGAAATGGGCCAAAACAAAAATGGAAAACATAGCAATGTATCAtaaacactcatgtaaccattatgtagggcgagacatggaacattgctaagaggctaggtttacctcaatgccactttccaatcccctacacctttcttcacacctcttatgataagt-acatccataatttataatgatctttttt---tattttctttgtactttacgaacaaagcatgcaaccctaaactcaatagcttcgtttggtctgctttgaactgtgtataggtgcaatcctatatgtccttattcatggcttcctggactcaacattatgtatctgaaatttaatcacatggttgcatgtacatgtgattcatttattttcacttctgtatatttttccattttatgattttactgtaattatttatccatctttatttgatatatatttgggcagctta-tttttgagctattattaataatgctacaatgaacattctttcacatatcatttgctacaattcctttgtgtatatatatctgggtgtagatttatacggtccttgattatgatattcaaattctactCACAGACATAGAAAAGCCCAAAACA--GTTTGACTAAATTTATTCCTGTCA-CTTTATCTCCAGTCTCTTTATTGCTATTTGCATATATCTTATCAATTATACAATtaatccaacaagacactattgttttctacaggcaacatttatttagaattacacacttatttttcattgtcattaa-ttttattgcttcttgcatgttcaactttgtatttTCAGTA s rheMac1.SCAFFOLD85456 61895 1495 - 81052 CACTCATGTAATTTGCTTCAGTCAACAAGAAGTTACTAGACTTTACACAGAGATTTAAGATGGCTTCCATATTGGAATTTCTTGCTCTTTTCCATTCTCCATGAAGACATCATCTGGCTAGTACACCATTCCCAGAAGAAGAATGAGAAACTAATGGAATAAGAATGCCACTGCCTTATCTATCCTAAATCAGCCAAACACTAACTAGCTTCAAAATGCAGTATGTGGTCCAACTCCAGTCGCCACAGCCATCCACCAAACCTAGCTTAGAAAAATGAAATCCAAAGACATATGAGACACAAATATCTAAGGCAATTTGGGAGGATTTTCTCTTTTAGAAAAACATGAGCAATATAGATATTCTGCTAAACCAAGACTGTGGGAAATATGTCCACTCTTGTTGTGTCAGAAATTCTGGATCCAAGGGAAAAATAGATGGATAATGTCAAAGTTTTGTTATATGAAGTGGATAATTAAACCTAAAAGAAAAACTTATTGAAAAATCCGGGATTGGCAGTTACCATCATGTCAAATTTCCAAAAGTTGCAACAAAAATCAGAACACTTCTACTTAAAATCTTTTAGAGTTATGCATGAAAGTATACAAATAGTGGATTTTCCCCTTCAGTATATAATGAGCAGAGTAATAATAATTTTCAT-GAACGCTTCTCCTCattaataatttttatattataaCTAGACTGTGCACTTAGAAATGGGCCAAAACAAAAATGGAAAACATAACAATGTGTCAtaaacattcatgtaaccattatgtaggacaagacatgg-acattgctaagaacctaggtttacctcaatgccactttctaatgccctacaactttcttcacacctcctgtgataagcaacatctataatttatgatgatcatttttaaaaattttctttatactttaccaactaggtatgcaaccctaaattcaatagcttggtttggcctgctttgaactgtgtagaggtgagatcctatatgttcttattcatggcttcctgggctcaacattatgtatctaaaatttcatcacataggtgcatgtacatgtgattcatttcttttcacttctctatatttttccaatttatgattttactgtaattatgtatccatccttatttgatgtacatacgggcagcttattttttgagctagta-gaataatgccacaatgaacattctttcacataccatttgctacaattccttcgcatatatacagctgggtataggactaccaggtcCTTGATTAT---------------CTCACAGTTATAGAAAAGCCCAAAACATGGTTTGACTAAATTTATTCCTGTCACCTTTATCCCCAGTCTGTTTATTGCTATTTGCATATATCTTATCAATTTTACATTtaatccaacaagacactattcttttatacagtcatgatttatttagaattacacacttatttttcattgtcattaatttttattgctcattgcatgttgaactttgtattttcagta a score=100 s hg17.chr12_random 260617 24 + 466818 CAAc-----------------------------tttgtattttctcttgctct s rheMac1.SCAFFOLD85456 63544 53 - 81052 CAACATACTCTATACTTCTACCTCTATCTACTTTTCAGATTTTCTATTGATCT a score=171793 s hg17.chr12_random 260641 2491 + 466818 attttctctcctctaatcttacagaactccagaagtatgttacatattccaactgtagcatgaatttgttaccctctagtcttatattttcca--tctttctctcagtgcttcattctttgtagctatcttccaattcactaattatctcttctactccatctaactggttaactctgtctattggattctcaatattgataattcat-tttttagttttcTTGTTTTAGTGTTCAGAATAATCTTTTATTATCTTTCCATAAATTATTTTCTACAGGGAAACTG-AACAAACTAATCTTAACGCCATGTTCTTTTTAAAAGTGTTTTTGATTTTGGGGTTTTTTGTTTTCTGTTTTAGTATGTTAGAAATGAAAATGGTAACAAATTCCTTCTTTTTCCAACACTTTGGTCAGAGAATAGAATAAAAGCTTCATCTTGGAATTTACCTTCAATTTGAAAGAAACCGGAAATGAAGTTCATATAAGTAGCTTTTTTGGGATAGTAGCTTGTC--TTGCTGGGTCCTCGCCACACAATCTCCTCACAAGGAAACTCAATGAGTAGCACTGCATTTCAAAATATCATTGCAATAGATAAAATATAGTTCATCAACCACAGCTATGTCATTGTATTCCATGAATTAATTTTCACTTTGCTTATGTTGTAGAAATGGGGCTCTGTGCCTTTGAACTCCATCATTACCTACATGAAATAGAGAAGATGTGGGGGAGGGCTTACT--TATTTGATTTGTTTAGCCCTAAAATCCTCTCTTTAGAAATAAGAGCTTGATCATGAAATGGTTTATTTATTTTTCTTATTAAGCAATTTTATTTATACTAAAATCAAAAT-CTTTTTATAGTGTTCCTTGGATTAGTTTAATATCATCTATAATTGTTTTCTTCAGCAATGTATTTTAAACTGCACTACACTTAACTTTCTAAATCTAAATGTATTCAACTTGACTTGAACTTTGCTGTTTACTAACGTAAATTTCCCACAATGATATCTCTTAGAACTTATGTAAACGTTGTCCAAATTATGTATGTAAATATTTCAAAAATAAATCATTTAATAAGATAGATGTAAATGTAGATGATTATAATAATGATGATAATGTCAGCTAAAAGGGAGAATGTTATTTGATAAATGTGATTTGGGTCTTCTTTTCAATGTACTAGAGTTAAGGGTAGTGGGAGAACACTATTATTCTTTCTCATGGATTTACGAtttttttttttg----acatggagcttcactcttgtcacccaggctgcagtgcaatggcgcaatattggctcactgcagcctctgcctccctggttcaattgattatcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaggtgcccgccatcacgcccagctaatttttgtatttttagaagagatgggttttcactatattggccaggccagtctggaaatcctgacctcaggtgatccaccagcctcggtctcccagagtgctgggattacaggcatgagccaccatgcccggcACAATTCTTGTATTATTCTCAGCATCAGGCCTAGACAAATACCCTCACATAATATTTCGTCAAGAATAATACAAAACCGACACATTTCCAATGATTTACTTGCTATTTTTTTTCTTTTACCACATTCTAAAAATTACAGTAAAATTGACCTCCAGCAAAGAATACTCTCTTGTTGGCTGTTTAATTTTGTTCCACTTTCCTATGAACTTACACAAATACTCTTTGCAATTATAGAGTGAATAAGCTTCATTTCATCTTTTAATAGCATCATTAACAAGTTAAATTCTCTCTACTGCTTATTTACATTCTCAGCTACTGTCACAAAATCTGGGTGATTTTATTATAGCAGTCCAAGTAGTTATACTACATATGTTTTATGCCTTAACAAAATTATCTTTCTACTAATTCTCCTGTAATATTCAAAAAATTTGTAGTATCAAAATATTTTTCCTCACACATGTGTACACATGCATGGTATTATAATCTTTGAATGGTAAAAATATGTGTATTATTATTTCATTTAGGGATAAATTTAG-AAAATTGTCCTGTATATTTAATATCGATATTACTA-----TATTGGAAATTCACTAATTTCTGCCACTTTGAAATGTTGTGATCATAAATATCTAAATTGGAAATAAGAAAAAAAGGTGTCTAGCAAAATACAGATGTGCAAAATCTGATGTTTCAAAATAAGAATAACATTAAGAGTGTGGAGGTAGACTTCCTGTTTATCTCTTCCtttttaaaattaatt-----taaagtttaaaattttatCTTGGATTTCTTACTATCATAATGCTCTATTCTTCTTTATTCAGCAAAAATTCTAATTACCATGGTGTCTACAAGA--ATGTTTTTTCAGCCTATTTTATATTCATTCATTTATTATATGATTCTGCTTTTAAAATAttttcattactatgaaacataacatatatataaattaataaag-cctgaaggtacagtatagaaaaaaatt s rheMac1.SCAFFOLD85456 63727 2459 - 81052 attttctctcctctaatctgacagaactccagcagtacgttaggtgttctgatggtagcatcaatgtgttaccctctgtccttgtattttccatctcttcctctctatgtttcattctgtgtagctatcttccaattcactaattctcttttctactgcatctaactggttaactctgtctattggattctcaatatttataattcatgttttCAGTCTTATTGCTTTTGTGTTCAGAATAATCTTTTATTCTCCTTCCACACATCATTTTCCATGCGGAAACTGAAAAAAACTACTCTTACCACCATGTTCTTTTTAAAGTGCTTTTGGTTTTTTGGATTTTTTGTTTTCTGTTTCAGTATGTTAGAAACGAAAATGGTAACAATTTTATTCTTTTTCCAACACTTTGGTCAGAGACTAGAATAAAAGCTTCGTGTTAGAAATTACCTTCAATTTGAAAGAAACTGGAAATGAAGTTGATGTGAGTAGCTTTCTGGAGACAGTAGCTTGTCTTTTGCTGGGTCCTCACCATAAACTGTGCTCACAGGGGAACTCAACGAGCGGCACTGAATCTTAGAATATCATTGCAATAGATAAAATACAGTTCATCAACAACAGCTACATCATTGTATTCCATGAATTAATTTTCACTTTGCTTATGTTGTAGAAACAGTTGCCTGTGCCTTTGAATTCCATCATTATCCAAATGACACAGAGAAGATATGAGGGAGGGCTTACTTCTGTTTGATTTATTTAGGCCTAAAATCCTCTCTTTAGAAATAAGAGCTTGATCATGAAATGGTTTATTTATTTTTCTTATTAAGTGATTTTATTTATACTAAAATCAAAATCCTTTTTATAGTGTTCCTTGGATTAGTTTAATATCATCTATAATTGTTTTCTTAAGCAAAGTATTTTAAACTGCACTATACCTAACTTTCTAAATCTAAA-GTATTCAGCTTGACTTGAACTTTGCTGTTTACTAATATAACTTTCCCATAATGACATCTCTTAGAAATTATGTAGACGTTATCCAAATTATGTATGTAAATATTTCAGAAATAAATCATTTACTAAGATACATGTCAATGTAgatgatgataataatgatgatgatgTCAGCTAAAAGGGAGAATG-----------------------------TTTCAAAGTACTAGAGATAAGGGTCGTCAGGGAACACTATTATTCTTACTCATGGCTTTACtttttttttttttttttcagacagagtttcactcttgtcacccaggctgcagtgaaatggtgtaatctcggctaactgcaacc-ccacctcccaggttcaattgattctcctgcctcagcctcccaagtagctaggattacaggtgcccaccactacgctcagctaatttttatatttttagtagacagtgggtttcactatgttggccaggctggtctagaactcttgacttcaggtgatccactagcctcga-cttccaaagcgcttggattacaggcatgagccacagtgtttggTATGATTCTTATATTATTCTCAGAATCAGGGCTAGAAAAATACCCTCACATAGTATTTCATCAAGAAAAACATAAAACCAACATATATCTAATGATTTACTTGAGACT-------------CACATTCTAAAAATTATGGCAAAAGTGACCTCTAACGAAGAATACTATCTTTTTGGCTGTTTAATTTTTTTCCACTTTCATATGAACTTAAACAAATACTCTGTGCACTTATAGAGTGTATAAGCTGCATTTCATCTTTTAATAGCATCGTTACCAAGTTAAATTCTCTTGACTGCTTATTTACCTTCTCAGCTACAGTCACAAAATCTGGGTGATTTTATTATAGCAGTCAAAGTAGTTACACTAAATATGTTTTATGCCTTAACAAAATTATCTTTCTGCTTTTTCTC---TAATATTCAAAAAATTTGTAGTATCAAAATATTTTTCCTCACAC--GTGTACATATGCATGGTGTTATAATCTTTGAATGGTAAAAATATGTGTAGAATTATTTCATTTAGGGATAAATTTAGAAAAATTGTCCTGTATATCTAATGTCTGTATTGCTATAATTTATTGGAAATTCACTAATTTCTGCCATATTGAAATGTTGTTATCATAAATAATTAAATAGGAAATAAGAAAAAAAGGTGTCTGGTAAAATACAGATGCTCAAAATCTGATGTTTCCAAGTAAAAGTAACATTAAGAGTGTGGACGTAGACTTCCTGCTTATCTCTTTCTTTTT-AAATTAATTTAAAGTAAAGTTTAAAATTCTATCTTGGATTTCTTACTATCATAATGCTCTATTCTTCTTTATTCAGCAAAAACTCTAATTGCAA---TGTCTATAAGAATATGTTTTTTCAGCCTATTTTGTATGCATTCACTTATTATATGTTTCTACTTTTTAAGTATTTTCATTAATGTG-----TAACATATGTATAAAGTAATAAAACCCTAAATGTACAGTAAAGAAAAAAANN a score=11223 s hg17.chr12_random 263132 151 + 466818 atagcattaagggtcatgttaccacatcttggtcatgaagtagaatttaccagcaatccagacactccccatatacaccttcttgttgatatcatttcccttttgtttcctccgtccctactgtgccagttgttacaataatcactcttgg s rheMac1.SCAFFOLD85601 28349 150 - 44828 atagcattaagagtcatgttaccacatcttggtcatgaagtagagttcgccagcaatccagacactccccatatatgc-ttcctgttgacatcatttcccttttgtttcctccatccctattgtcccaattgttatgacaatcactcatat a score=28096 s hg17.chr12_random 263283 429 + 466818 gtctcac-tttagaatttcgacaacaatgtaataaattgcaattcattaaaaatatagttttgtaaactttatataaatgtaattatacggaatcatgtttccatcttaatatctctcgtatctatgtagtgcaaatttgttcattttcctttttattaacattctttataaac--gtctctctagttggttcattttgattgctgtatagtattctattgtatgactatgcaataatttatttatccattttatcacccatggacatttgacagacttgtcaactttagcaattaaaactcagtgatatgcatgtgtgtgtatatgtattCTGATAAGAGTGC-AATAGTGGGTCTTCAGATGTGATCCATCATCTTAATCAGATAATGCCATACTCAAAGTAATTGCACTGATTTACAATTCTAGG--------------------ATTAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 66237 451 - 81052 GTCTCACTTTTAGAATTTTGACAACAAGGTAATAAAATGCAATTCATTAAAAATAtatttttgtacactttatatcaatggaattatactgaatcttttttccatcttagtatctctcatgtctatgtagttcaactttgttcaatttccttgttatttatcttctttgtaaacatgtctctctaattggttcattttgattgttttatagtattctattgtataagtgtgc--taatttattcatacattttatcactgatggaaatgtaagagacttctcaactttagctactaaaactcagtgatatgcatgcgtgttcgtgtgtattctggtaagagcgcaaatactgggtcttcgaatgtgttccatcatcttaatcagatattgccatactcaaagtaattgcactgacttacaatcctgggagcagtgtatgaaaattcccattac a score=524 s hg17.chr12_random 263712 7 + 466818 AATCCTA s rheMac1.SCAFFOLD85456 66831 7 - 81052 AATTCTA a score=25539 s hg17.chr12_random 263719 366 + 466818 GAGTGTAACTGTACTAGACATATTTCCTTTAACCAAACATTATGTCAAATGACTTTGGGAAAATATGATTAGTTAACAGTATACTGTAAGGCAAATTTTAGCATTGTTTAACAACTCATTAAAAGGACTCAAAGAAAATAATATGTTGAAATATCAAAATAGTCTATAAGCCTAATGAAGGTGCCCATGGGAAAATACAAATTCTACCATTACTGTTATGG-----------AAAATAATGATGAGTAGTAAACATACCATGTCCGCA-TTTTTTAAGGCAGGCCTAATACCAATGGACAAGTTTCCCTTTAAGGTCCTGACCTTAATTTCTATGTGCTCCTGATTTCTGACTGTGCAATAACGTTCTTGTTCCTTTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 66948 378 - 81052 AAGTGTAATTATACTAGACATATTTCTTTTAACCAAACATTATGTAAAACTACTTTGAGAAAATATGATTCATTAGCAGCATCTTGAAAGGCAAATTTCAGCATTGTTTAACAACTTCTTAAAAGGACTCAAAGAAAAAGAAATGTTGAAATATAAAAATAGTCTATAAGTGTAATGAAGTTGCCCACGGGAAAATACAAATTCTACCATTGCTGCTATAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTACTAATAAAGATACCATGTCCGAATTTTTTTAAGGCAGGCCTAATATCAATGGACAAGATTCCGTTTAAGGTCCTGACCTTAATTTTTATGTGCACCTGATTTCTGGTTGTGCAGTAATGTTCTTGTTCCTTTT a score=54186 s hg17.chr12_random 264085 741 + 466818 AAATTCTCTGGCTAATGTCAAACAGGAAAGCACCGGGGAATGCTATTGAATGAGTTCAAGGCTGTCTTAATGGAAAACAGGATAATTTCCAAAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAATACTATATGCTTGTTATAAGATAAAATTTTTCATACTGATGTTGATGTGAAAGCTGAATTCTCATTTGCTAGCATGCAAATCAAGTCATACACTTAATCATCATTTTGCAATTTTTTCCTTGTTTAATGTCTCCATAATTTGCGTTCAGCAATGTGAGTTGTTAGGGAAATTTTCCAACCTAATACATAAATCATACATTGGATGCCTACACTGTTATATGTAGCTTGGTCAAAACTAGAATCATGACCACTGTTGAATCATTTTTTCAATGCCAGATTTATGGAGAGTGAATCCCAACTTTT-CTACCAAAAGTGTCCAAGGTTTTCTTGGGAAGCCCAGGAAGGCCAATATTCCTTGAAAACTGGTTACTGCTAACTAATAATTTTGTACAACTTATTGTTAACAAGCTCATTAacacaaacacattcacacacacacaca----tacacacCCCTCATGGTTTGGAAAAATTACTGTCCTATAACTTCTAAAATG-AAAATTAATTTTCTTACTCGGGCTTTTCAGCCCATTTTCAATGTTTATCAAACTTAATCTCTAAGGCTTAGGCCTTTAACTAAGTTATTCTCTTGAG---AATACTTAAATATTAGTTATTTAATTAAAATA s rheMac1.SCAFFOLD85456 67581 743 - 81052 AAATTTTCTGACTAATGTCAAAATGGAAAGCACTGGGGCATGCTATTGAATGAGTTCCAGGCTGTCTTAATGGAAAACATGATAATTTCCAACACAGTTCAAATTAACTCCTATTCAAATAATATGCCCTTGTTATAAGATAAAATGTTTCATACTGATGCTGAAATGAAAGCTGAATTCTCATTTGCTAGCATGTAAATCAGATCGTATTCTTACTCATCATTTTGTAATTTTTTCCTTGTTTAAACTCTCCACAATTTGTATTCA-CAACAGCAGTTGTTAAGGAAATTTTCTATTCTAATACATAAATCGTACATCAGATGCCTACACTGTTATATGTAGCTTGGTCAAAACTAGAATCATGACCACTGTTGATTCATTTTTTCAATGCCAGATTT------AGTGAATCCCAACTTTTCCTACCAAAAGCATACAAAGTTTTCTTGGGAAGCCCAGAAAGGCCAATATTCCTTAAAATCTGGTTGTTGCTAACTAATAATGTTGTATAACTTATTGTTAACATGCTCATTAacacaaacacatacacacacacacacacacgtacatacCACTCATGGTTGGGAAAAATTACTGTCCTATAATTACTAAAATGAAAAAATAATTTTCTTACTCGGGCTTTTCAGTGCATTTTCAATGTTTATCAAACTTAATCTCTCATACTTACGCCTTTGACTAAGTTATTCTCTTGAGCCTAATACTTCAATATTAGTTATTTAATTACAATA a score=652 s hg17.chr12_random 264826 12 + 466818 CTCAACTATTTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 27978 12 - 81052 ttCAGCAATTTT a score=-3325 s hg17.chr12_random 264955 178 + 466818 taaaaatacaaaaccaaagttagccgggcatggtggcaggcgcctgtagtcccagctactcggggaggctgaggccagagaatggtgtgaacccaggaggcggagcttgcagtgagccgagatggcgccactgcactctagcctgggcgacagagcgagactcagtctcaaaaaaaaa s rheMac1.SCAFFOLD85456 27990 29 - 81052 TAAAA---------------------------------------------------TACTC--------------------------------------------------------------------------------CTTGGGC------------------CCTAAAAAAAAA a score=119623 s hg17.chr12_random 265157 1723 + 466818 CTCAACAATTGTATAACTATTCCTTGGGCACTAAAAAAACATGTTTTCCATAGAAGAATTTACACTTCTCTGTGTATGAATATTCACTTTTACTTTTCTCTAT-----TTATTTTTGATTACTTATTGATTTATGATGAATAGATGTTAAAATCAGTCTCCAATCCTGGATTTTGTTTCTTTTCAGTTTTtatagcataactgtttctaagaggggatcttggagtcagac-gccaggtcaggaaatcatattccctgcttggtatagctatgctctgagactccattttccaactactcc-tgcctcagtataatcacctataaaaagc-----------gggcgcagtggctcatggctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggtggatcacctgaagtcaggagtgcaaatccagcatggccaacatggtgaaaccctgtctccactaaaaatataaaaattagccaggtggtggtggcacgcacctataatccgagccactc-ggtgactgcagcaggagaatcatttgaacccagaaggcagaggttatagttagtcgagatcacgccactgcactctagcctgagagacagagcgagactccgtatcaaaa------taacaacaaaaaggagatgataataaaactttcattggttagttttgttaggagttaatataCTATTTCTGTAACTACTTTCAATTTTACCTGTTTGCTATAAGCAGGAACCAAAGATTGTTAATTATTGATTTGATCCTGTTTCTCTTGATATTT--GACACCAGTGAGAACTTCCACCttttttt-----ttgttctgagacagcatctccctctgttacccaagctggagtacagtggcacaatcatagcccactgcagcctggaactcctgggctcaagcaatcctcctgcctcagcttctcaactatttggaactataggcatgtaccaccatgccaggtaattttt----aaaattttttgtagagacggagtttccatatgatgcacagggaactcctgctctcaagggatcttcacaccttggcctcccaaagtactaggactacaggcatgagccatcacatccagccCGCAGTGGGAGT-TTTGAAGGTCAGATGCTACCTAGAGCTTCGGCTCATGTCCATCCCAAGGTGGATCTAATcagtttgtagttattacctcttcctg-------aattgaaatggatacgtatggcagctggcaggactctcacattcttcgtgaactgtagagtaaggaacattattatagcaggaccaagggaaagcctctgaaattctcctctactggcaacaaaatatataaaatataataaccgcattccctaaggaatggaactggtcactgtcatgacaaaacacctgaaagttacaggggatggtagtcttttctataacccgattcacttaacctatctggcctctaccaaaaccagatgggttatcgaatgaatgcagactaccataaacttaaatcaacactcacaaatgctttccaggatgtgctatcttcactgagcagagcagagcttctggtactttttgtggggctagtgatttggtgaatggttcttaatctacacccattatgagggaaaatcaaaacaatttgccttg---taagaataatagcactgcttcactgttgtatgtcagggctatgtcacttctgttctcagtttaatttacattttttaaaacatcctgccagtttaatgtattgataatatta s rheMac1.SCAFFOLD85456 68324 1760 - 81052 CTCAGCAATTTTATAACTATTCCTTGGGCACTTAAAAA---TGTTTTCCACTGAAGAGTCCACACTTCTCTGTGTATAAATATTCAGTTTTATTTTCCTCCATATAATTTATTTTTGATTACTTAATGGTTTAAGATGAATAAATGTTAAAATCAGTCTCCCATCTTGGATTTTCTTTCTTTTCAGTTTTtatagtataatggtttctaagaggggatcttggagtcacactgccaggacaggaaaccagattcctggct-ggcaaacctatgatctgagactccattttacaactactccctgcctcagtacactcacctatgaaaagcagatgataGGcgggtggagtggctcaggcctgtgaccccagcactttggaaggtcgaggcaggtggatcacatgaggtcaggagttcgaaaccagcatggccaaaacaatgaaaccctgtatgcactagaaatgcaaaaattagccaggtg-tggtggtgcacacctataatcccagctactcaggtggctgtaccaggagaatcactggaacccaggaggtgaaggttgtaggtagtcgaaatcacatcactgctctccagcctgggagacagagcaagactccatctcaaaaaacaaacaacaacaaaaaa-aGATGATAATAAAACCGTCTTTGGTTAGTTTTCTTAGGAGTTAATATACTATTCGTATAACTACTTTCCATTTTACCTGTTTGCTCTAGGCAGGAACCAAAGATTGTTAATTATTGATTTCATCCTGTTTTACTTGATATTTAAGACACCAGTGAGAACTTACACttcttttttcttcttcttctgagtcagaatctccctctgttacccaagctggagtacagtggcaggatcatagtccactgcagccttgagtgcctgggcggaagcaatcctcctgcctcagcttcccaagtatttggaactgtaggcatgcaccaccatgccagctaatttttttaaaaaattttttgtggagatgtagtttccatatgcagcacagggaactcctgctctcaaatgatcctcccacctcggcctcccaaagaactagtactacaggcaggagccatcacatccagctTGCAGTGGGAGTGCTTGAAGGTCAGATGCTACCTAGAGCTTCGGCTCATGTCCATCCCAAGGTGGATGTAATCAGTTTGTAGTTATTACCTCTTCCTGAATGTGTAATTGAAGTGGATATCTAAGGCAGCTAGCAGAGCTGTCACATTCTTCCTGAACTATAGAGTAAGGGACATTATTATAGCGGGACCAACAGGAAGCCTCTGAAATTCTCCACTACTGGCAACACAATATATAGAATATAATAACTACATTCCCTAAGGAATGGAATTGGTCACTGCCATGACAAAACACTTGCAAGTTACAGGGGA--GTAGTCTCTT-TATATCACTATTCACTTAACCTATCTGGCCTCTACCAAAACTAGATGGATTATAAAATACATGCAGATTACCATAAACTTAAAACAACACTCACAAATGCTTTCCAGGATATGCTATCTTCACTGAGCAGAGCTTAGCTTTTGGTACTTTTTACGGGGCTCGTGATGTGGTGAAAGTTTCTTAATCTATACCTAGTAAGATGGAAAATCAAAACAATTTGCCTTGTATTAAGAATAATAGCACTGCTTCACTGTTTTATGTCAGAGTTCTGTC-CTTCTGTTCTCAGTTTAATTTACAATTTTTAAAACATCGACCtaatttaatatattaataatatta a score=85724 s hg17.chr12_random 266881 1244 + 466818 agaccgggccctgtggcatatgactgtaatcccaacactttaggaggccgacacaggcagatcacttgagcccaggagtttgagaccagcctgggtaacacggtgacatcccagccctacaaaaaataccaaaattagccaggcatggtgttgtgcccctgcagtcccagctgccagcaatgccgaagtgggagaatcacttgtgcccagaaggttgaggctgcaatgagctgtgatcctgccactgcattccagcctcagggacagaaagagaccgtgtctcaaaataataccaataataata---tattagttggtacaataatcaggaaatggcaagtttcttcagtatagtaaaatattataacattgagcagaagtaaaataccagaagaaaatagataaatcagagaagattcagggaccgacaacataggtgatgttttaaggtttttagtgtccctagtccacatgctgagacaatctttttt--acagtaaacggcattttgctctctctatatatttcctatcactacaaaagagacactatgttttgggggcctactgggattttggagacaacatattccacatttgagaatattgctctgactcacgaacgatgtttctaaaggctactggtctcaaatggagcccagaactaaagagggctctacagaagata-taggctctggtccaggctgctctggccactgtgccagatgatccagcggaattcaaagctgctagaggCATGCATAGTGGGCATTATAGGACTCTGTGCATGTCTCTGACAAGCCTGTAGGAGAGGGGAGAGCAAATCCCTATGGAATCAGTGTAAGACCAGTGTAAGACCATTCCCTCTTCAGCAGAGGGAATGCTGAAGTATACTCTGTCTGAAAAGCCAAACAGCAAGTGCAGAACATTAATCCAAGCATAGAGTCACTCTAAGCACAAGCCCCTATAAGCACAAAACCCTGTACAACT--GTGCAAGTCATATGCTCATAAAGCCAGCCATGACTGGAGGGTATGAGCACGTCTCAGTGGCACAAGGAGTGGTGGTATTGGACACAAACATGTGCTTTCTCAGATTCCCTTCACTATCTCCTGTTCCCCTGGTCAGCACCTTGCCTGAtccagatcatccttccatttgggacttgaatgcatcaccacactgtgggcatgaggtctgactttcatgaccaccaccaagggactggatgatgtaagacagaacaacagag s rheMac1.SCAFFOLD85456 70547 1227 - 81052 agactgggccctgcggcacatgattgtaatccaagcacttctggaggccgacatgggcagatcacttgaggccaggagtttgagaccagcatgggaaacatggtgaaatcctaaccctccagaaaatacaaaaattagccaggtgtggtggtattcccctgcagtcccagctgctagcaatgtggaggtgggagaatcaccagagcc-agaaggttgaagctgtaatgagctttgatctttccactgcactccagcctcaaggacagaatgataccctgt-tcaaaTTAATGACAATAATAATAGTATATTAGTTGGTACAATAATGAGGAAATGACAAGTTTCTTAAATACAATAAAGTACCCTAATGTTGAATGGAAGGAAAataccaaaagaaaataaataaacctgagaagattcagggacctacaacataggtgatgttttaaagcagtcagtgtccctagaccacatgtcaaagcaatcttttttttaaagtaaatggcatgttgccgtcttcatatatttcctatcactacaaaagagacacaatgttttgggggtctactgggattttggagccaacatattccacatttgaaaatattgctctgactcattaatgaagtttccaaaggctactggtctcaagtggaacgcagaacaaaaaagggctctacagaagttaataggctctggtccaagctgctctggccactgtgctagatgatgcagcagaattcaaagctgctagaggcatacacagttggcattataggactctatgcatgtcactgagaagcctgtaggataggggagagcaaatccctatggaattagtgcaagacca-----------ttccatcttcagcagagg---------agtatcctctgtttgaaaaacaAAACAGCAAGTGCAGAACATTAATTAAAGCATAGAGTCCCTGTAAGCACAAGCCCCTATAAGCACAAAACCC-GTACAACTCTGTACAAGTAATATGCTCATAAAGC-AGCCATGATTGGAGAGCATGAGCACGTCTGAGTGGCACAAGGAGGGGCGGTATTGCGTACAAACATGTGATGTCTCAGATTTCCTTCAGTATGTCCTACTCCCCTGGCCAGCACCTTGCCTGATCCAGATCATCTTTCCATTTGGGACTTGAATGTATCACCACACTGTGGGCATGAGGTGTGATTTTCATAACCTCCACCAAGAAAC-AATTGATGTAAGGCAGAACAGCAGAG a score=26227 s hg17.chr12_random 268125 351 + 466818 atggtagttctaactcagggaaaccctggccaaggggaaacagaagactaacaacagctgagcagatacattctccctcctctctctctcttccatggactaatgccagctgtcgtttccctttgtagcccttctggaaaagttctgggagtcaagtgcatgcatctgatgaccaccatgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcagagtcataccagacatcaccacacattgtttcacatccgttcttgtctcaatttccacatgtccctgccatttttgtcttgaattggccttccatataaatgtcatcactttaatATCAGGTATTACGTTAAAA s rheMac1.SCAFFOLD85601 33398 348 - 44828 aaggtagttcggcctcaggggtaccatggccaatgggaaatacaagactaatgacagctgaacagatacattctcccac--ctctttctcttccatggactaatgctggctgtggtttccccttgta-cccttctggaaaagtgctgggagccaagtgcatgcatctaatgaccaccgtgctgtctctctcacctcactgtgaagtggctgccagcaaagtcacaccagacatcacgacacattgtttcacgtttgttcctgtctcaatttccacatgttcttgctatttttgtcttgaacttgccttccaaataaatatcatcactttaatATCAGGTATTACATTAAAA a score=41490 s hg17.chr12_random 268476 557 + 466818 ACATTTTAGTAAAGTAGCTGGTTACTAACTCAATTTTTTGAAATGAAATGCCATTTTT----ATATGATAATCAACTAGAAAATATCATAATACAAATATATAATTCACAATAGAAAAAAATACATACGCAAATAGACCAAAGTCTTTTATATGCTTTTTTAA-AATATTGTAATAG-TGGCATCTAATTTTGATGTTCTACCTTGTCTCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGACTATATTATTGTGATATTTCCCCTAAAATTGTGGAATAGCCAAACTTTTCCTCTGAGGAAGGATTCTGCTTGGATAAGCCTGTAATCTTAACCTGAGACCAGAACAGGGGAACTCATGCAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTCCTTTTCATTGGTTTACCACATCAGCTTACCCATTTTATCCACCCatttatttgttcattaaaatatcatttttgaccatctattccttgtgctgggttctaggtcctgggagtcaacagaaagcctgacagacacgatctcttcttttatggttcttacattgtactgaggaagata s rheMac1.SCAFFOLD85456 71775 559 - 81052 ACCTCCCTGTGAAGTAGCTGGTTACTAACCCAATTTTTTGAAATGAAATGCCATTTTTGTTTATATAATAATCAACTAGAAAATATCATAATACAAATATATAATTGGCAATA---AAAAATACATATGTGAATAGACCAAAGCCTTGTATATGCTTTTTTAATAATATTGTAATAGGTGCCATCTAATTTTCATGTTCTACCTTGCCTCCAATTCAGACACCTGATACAGCTGCATCAAGATTATATTATTGTGATATTTCCCCTAAAATTCTGGAATAGCCAAACTTT-ACTTTGAGGAAAGATTCTAATTGGATAAGCCTGTAACCTCAACCTAAGACCAGAACAGCGGAATTCACACAACTGCAGATTTTGTGATGAGTTTTCTTTTCATTGGTTTACCACATTAACTTATCCACTTTATCCTCCCatttatttgttcatgaaaatatcatttttgaccatctattcttggtgctgggttctagttcctgggagtcaacagaaagcaagacagacatgatctctcattttacggttcttacagggaactgaggaagata a score=241642 s hg17.chr12_random 269151 3013 + 466818 TTTTTTTTCCTTCTTTCTCTTTTTTTATTTTCATAGTTCAAGTTTCCTAGAAACATTTATTGCtttttttttttttttttt------gagatggagtcttgctctgtcgcccaggctggagtgcagtggcgtgatctcggctcactgcaagctccgcctcccaggttcatgccattctcctgcctcagcctcatgagtagctgggactactggcacctgtcaccacgcctggctaattttctgtatttttagtagagatgaggtttcaccgtgttaaccaggatggtcttgatctcctgacttcgtgatccgcctgcctcagcctcccaaagtgccgggattacaggcgtgagccactgtgcccagACACATTTATTACTTTTATAATAAAAACTTAACTTTATCTGTTAAATGGTTATAATGATAACCATTGGGGTAAATACTTATAATAGATATAGGTATGGGATTATTAAAAAATGTTTAAAAAATTATGCCCGGGCTGACAAATGGGGGGTGGGGTGTGGGAGTTATG-------------TAACTGCTACTTACTTGGCAAAAGTCTTATATGAGTGAAGTTTCTGGTTAATTACACACTGAACATAGAGCTGAATTGTTTAAATCATTTCTTTCCC-TTTGAGTCAATTTGTTAAAAAATAACCCTCCAGTTTGGCATGTAATTTCCTTATTGGCGTCTTTCTAATTTACTAGTATGGATCCTTAGAAACCAATAATTTTGATTGCTAAGAGAGCCTCAAAAGTTAATTTACAAGCCTGATTAGGATCATACTTTTAACAAATGAATTTTTACTTTTCAACAAGAGGTTTGTGTAGGTTTACAAATTGACCCATATACGCTCACCACATCTTTGCTGAGGGATAAAGAAAGCACTCTTGATATTACTCCAAGTGGGCATCTCGGGGAAGGCAATAAAGGCTTGAACTTTTCAAAAACAATTTCACGATTTGTCTAATATTTAATTTATGCATAAAAGATGGCAGCATAAAACCTTGCT-AATCAGGATTCAAACAGAAGATATAGGCAAGGTGAAATGAATCACCAATTTTTCTAAGGATTCACCAGAAACCACTTTCTTCTCCTATCCTTTAAGAAAGCCTTTCTAAAGGGGGATTGGTCACAAGTAAATAAAACTATAGAAACAGAGTTCATAATGGTGAAAAGTTGGCTTGTCTTTCTGGATCTTCTTTTGACTGCATACTGGGCGCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCTATCTTATTCACTGACAAGAGATAATGGTATCTTGCAAGTATGTGGGCTatctgggttcaaattctggttctgctactcactacctttggatatattaattggccattctgaagttggtattctgtgtttaaaataaagat---aattttacctggcagCTTAATGAGAGTTTAAAAAAGCAAAAGCACCCAACAATTTTTGTCTGCACCTAATAATTTTTGTCTTCATTAATATATATTCAGTAGGTACTCCTTATACTCTGCCTCCTCAACTTGGTATAGATACCCATTTCTCTGAAAGATGGAGCACATCACATTTTATGTGTCATTTTATCCTTCAATATTTGTTTTACCCTAAATTTTTCTCAGCTCTTTTTTTTAATTTTT----TTTTTGAGAGCACACTTCAAAAAGAAGGAAAGCCTAGGCATCTTTTGAGATGAGAATAGACTGGCAAGGGAGAACTTCTTGGACCACTATGTGCT-------GTTATCTTGGAGTAAACTTAAGTGAAGTTATGTCCTGGCCTATTTCAGAGGTTGCTGGGGACAACATCAAAGACATTTACAAAAAA-TGCCCTAAATCACTGGTCTTAGGTAAATAGACAGGACcattcaataattcactcagttaagcaccatttttgtgttaaccactgttctaggtgctggagtgtaacagtgggaaaagcagaaaaaaaaa-tctctgcccttgtggagctttatgttctcaaaggaggagacaaccagtagttatggtaaataagtaaa-tatacagtcttcagatggtggtcagcaccatggagaaagatgaagcaggaaagagggactggctacaccattgtgcatgggggtgctattttttaaacaatgcagccacgaagtcataaaaaa-taaacaggtaacctttaagcatgaacctgaaatcagtgagggagaaaaacgtgagggaacagccagtgcaagggtcctggagtaagagaatgcacaatgtgagggcagaccaacaaggagaccggtgtgactggggcagagtgagcaggaagcgggggtgtgaagacaccaggcagagaagttaccaggaatagatcatggaaggccattttggccattacctgaactttgtttggttttcactctgagtgatataagaagctatgagaggtaattaggcagaagagaggtatcatttgattcatgttttaaaagacacattctggcagctgttttaagactagactgtagtgggacaagacaggaactgtctggggcaacaacagtatttggggtgagatacggtagttgcaaaggttggagaagtcgcaaggagatactgaTGGAACTTCTTACATGTTTCACTGATTTCCTCTTCTGGGAGGGCCAGCAATGCCCCAGTTGACCAACAATATGGAAATTAAACCCACTGGCATTTACAGGAAACCAGAAATATTCAAGAAAGTATGAGCAGCACAATTAAATTCTACAGGGAGCTCAAGATTATCCCCCACTCTAGTCTGGAGGAGGAGATCTTGGAGAGGTTCAAGCTGGACCTTCCATGGGATTCTCACCCCAAAGACCATCTTTTGGGATCTCACTCTTGCTTCCTCTTGGCATGTCTCCTGTGTGATTCTTTGGACA-TTTTTTCTTTCAGTCACCTCCCACTTCATGAGATTATTTCTTCCCCCACCCTCCCTTCCAGGTGGCTGGGGCTGCCTAACTCAGGGGAGACTCCTTGCAGGAGAAAGCCAGGGTTGCAGCTTAATCTGGCTCAGCTCACGCCTTTAG--AGA s rheMac1.SCAFFOLD65323 44307 3012 - 89934 ttttgtttccttctttctctttttttaaaatcatagttcaactttCCTAGAAACATTTATTGCttttttttttttttttttttttttgagacagagtctcgctctgttgcccaggctggaatgcagtggcacgatctcggcccactgcaaactccgcctcccgggttcatgtcattctcctgcctcaggctcccgaataagtgagactacaggtgcttgccaccacgcctggctaattttttgtatttttagtaggaaagaggtttcaccactttaaccaggatgatctcgatctcctgacctcgtgatccacctgccttgacctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccactgtgcccagccACATTTATTACTTTTATAATGAAACCTTAACTTTATTTGTTAAGTGGTTATAATGATAACCATTGGGGTAAATATTTATGATAGGTATAGGCATGTGATTATTAAAAAATGTTTAAAATATGATGCCCAGGCTAACAAATGGGGGGTGGGGCGTGGAAGTTATGATGAGATTATATGTAACTGCTACTTACTTGGCAGAAGTCTTACATGAGTGAAGTTTCTGGTTAATTACATACTGAACATAGAGCTGAATTGTTTAAATCATTTCTTTCCCATTGGAATCAATTTGTTAATAAACAACCCTCCAGTTTGGCATGTAATTTCCTTATTGGCGTCTTTCTAATTTACTAGTATGGATCCTTAGAAACCAATAATTTTGATTGCTAAGAGAGCCTCGAAAGTTAATTTACAAGCCTGATTAGGATCATACTTTTAACAAATGAATTTTTACTTTTCAACAAG-TGTCTGTGTAGGTTTACAAATTGACCCATATACACTCACCACATCTTTGCTGAGGGATAAAGAAAGCACTCTTGATACTACTCCAAGTGGACATCTAGGGGAAGGCAATAAAGGCTTGAACTTTTCAAAAACAATTTCATGATTTGTCTAATATTTAATTTATGCATAAAAGATGGCAGCATAAAACCTTGCTTAATCAGGATTCAAACAGAAGATACAGGCAAGGTGAAATGAATCACCAATTTTTCTAAGTATTCACCAGAAACCCCTTTCTTCTCCTATCCTTTAACAAAGTCTTTCTAAAGGGGGATTGGTCACAAGTAAATAAAACTATAGAAACAGACTTCATAATGGTGAAAAGTTGGCTTGTCTTTCTGGATCTTCTCTTGACCAGAAACTGGGCACCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCTATTTTATTCATTGAAAAGAGAGAACAGTATCTTGCAAGTATGTGggctatctgagttcaaattttggttctgctactcactacctttgGCTATATTAATTGGCCATTCTGAAGTTGGTATTCTGTGTTTAAAATTAAGATGATAATATTACCTGGCAGCTTAATGACAGTTTAAAAAAGCAAAAgcacttaacaatttttgtctgcacctaacaatttttgtctTCATTAATAGATATTCAGTAGGTATTCCTTACACTCTGCCTCCTCAACTTGGTATAGATGCTCATTTCTCTGAAAGATGGAGCACATTACATTTTATGTGTCATTTTATTCTTCAATATTTGTTTCACCCTAAATTTTTCTCAGCTCtttttttttatttttattttttttGAGAGCACACTTCAAAAAGAAGGAAGGCCTAGGCATCTTTTGAGATGAGAATAGACTGGCAAGGGAGAGCTTCTTGGACCACTATGTGCTACGTGCTGTTGTCTTAGAGTAAACCTAAGTGAAGTTATGTCCTGGCCTGTTTCAGAGGTTGCTGGGGACAATATCAAAGAAATTTACAAAAAAATGTCCTAAATCACCGGTCTTAGGTAAATAGACAGGAAcgttcaataattcattcagttaagcaccttttttgtgttaaccactgttctaggtgctggggtgtaacagtgggaaaagcagaaaaaaaaaatctcagccctcgtgaagctttatgttctcgaaggaggagataaatggtaggtatggtaaagaagtaaaatatatagtcttcagatggtggtcagcatcacggagaaagatgaagctggaaag--ggactggctacaccattgttcatggaggtgctattttt-aaacaatgtagcgacgaagtcataaaaaaataaacaggtaatgtttaagcatgaacctgaaatcagtgagggagaaaaacgtgagggaacagccagtgcaagggtcctggagtaagagaatgcacaacgtgagggcagaccaacaaggaggccggtgtgactggggcagagtgagcaggaagtgggggtgtgaaaacaccaggcagagaagttaccaggaatagattatggagggccattttggccatta----------------------------------taagaagctatgcaaggtaattaggcagaagagagatatcatttaattcatgttttaaaagacgcattctggcagctgttttaagactagactgtagtgggacgagacaggaactgtctggggcaacaacaacatttggagtgagatatggtagttgcaaaagttggagaagtcgcaaggagatactgatggaagtTCTTACATGTTTCACTGATTTCCTCTTCCGGGAGGGCCAACAATGCCCCAGTTGACCAACAATATGGAAATTAAACCCACTGGCATTTATAGGAAACTAAAAATATTCAAGAAAGTATGAGCAGCACAATTAAATTCTATAGGGAGCTCAAGATTATCCCCCACTCTAGTCTGGAGGAGGAGATCTTGGAGAGATTCAAGCTGGACCTTCCATGGGATTCTCACCCCAAAGACCATCTTTTGGGATCTCATTCCTGCTTCCTCTTGGCATGTCTCTGGTGTGATTCTTTGGACATTTTTTTCTTTCAGCCACCTCCCTCTTTATGAGATTATTTCTTCCTCCACTCTCCCTTCCAGGTAGTTTGGGCTGCCTAACTCAGAGGAGACTCCTTGCAGGAGAGAGCCAGGGCTGCAGC-----CAGTCTGAGGACAGACCTTTTGGAAGC a score=939849 s hg17.chr12_random 272810 11923 + 466818 AAAGGTCTGTCTACTGTAAAAATGGAAGGTAAATTCTGAAGCAGTTTTTGTCTCTAAGTGTCTAGCTCCTGGAAGCTTGTTTAGTCTGAGCCTCTGTGTCTTCATCAATTGAATGATGCTGTCTTTGAACCTACCCACATACGTCAGAGATGACCTTGGAGCTCAGAGCTCTGTACATCTGCTTGTTTGCTTGTTCCCTTCCCTAGAGAATATGTGGTAAGGTGAACAGTGTACTTCCCCCAGGAGCCTGCTTCTCATTTTGTAGCCCATTACTAAGCCACTTACAGTAAAGACTCTCAGGAGAGTATTTTCCTAAAAGGCATGGACATGAGCTAGTAGAGGCTAAAAATATAGAGCACTACAGAAAATGTTTAAACCAATGCATAAATAATTGAAAGTTGGAACAATCTACTGAGGTCAGTGGGATGTT-GTAGGTTAGCAGGTAAGGGTTTTGGTATACTCCTAATCATTTGgccccaattcactagaacttctacttcttatcttaatttttagaatgaggaaacctagccactaagaagttaaatacttttcttgaggtcttcaagctcacaggttgtgcaactgggttctgaatcttttacgtngttacnctagatggtatatccttaaccccaatgccatTCCATCCCTCAGGACCCCAAACCTAGGTTATCACTGATAGTTTGGAGTTCATAACTCTAAAACAGCATGAGTTTAGTGGAACACTAGTGCCTGGAAGATATTAAGAGATCTTCCCTAAACAGGgtcccatggtaaatacatataggaaatgctgagtgagattacattgaacaggtttcctccctacagaacttctcagagtctttaataagttcatgtgcactatggctctctaaaaCCTAGATGTGGAATTTTTCAGATATAATGACCCTTGGAATTCTTTTCTGATAAAATACCTACTATCATACAGATTTTGACAGAATAT-TATTTGGGAAACACTGCTCTAAAGTATAGTCTAGATTATTTCATTTGTTTTGCCACTTATTTCCTTTAATTTCATTTTATAGGGTCCAGAAATGTGTTGTAAACTGCACAGCTTAAAGGTCTCATccgtattttcatctatggcttgcttctccatttcattcacaaagatgttgggagagatgtaaacacccgagtagactatgcacaccacagtccccctgctctaccaagctacttttcttctggcgaatggctcaaccccagctcttattgctcattgccatttttctgtaagtattcacaaacaatacaagtcattcattctagattttCATTAAAACAAAAAACAACACTTTAAAATAAAAGCTTTCTACTCtccctagtcttccaacatctttctcatcttcacgctttctcaaagatTCCTGATGGGGTAAA-ATAAAACACGTGAAAGGGGTAAAGGAATAAAAATTGTGTGAGCATCTTCTGTGGCCTCAGAGTCACACCAGGCATAGCAAGACCAGTAAGTCAATCACTGGTAGATCTGGGATTTAGATGCCCAATATCAAGCCTATATTCCTCCTACTCTTTATGTCATAACATGGGGCTACTATAATGTTTGGAACCAAAGATATGAATTCTTCTACGGGCAAATAGTGATCTCTTGATTTCTCATAAAACCTTGGCCCCAAATAGCTCCCTGATTCACCCCCTTGTAAGTAACAGATAGGTGATGGGGTGAAGTCACTAGTCCAAGGACAGGGTACCAAGATCTACCAGCCAAGCttctcttggctctcaatattttgtttcaacattcccagtttaaagatcgttctctttacaacaaaaagagatgcaaaataactgctgtgtcattctgctttctcATAACAATTGGTTTTTCTCTGATTAAAAAAA-ATATAAGGCCGGAggttttagcataatagacctaggtcaatttctgaagtcctaccaccttgtctaccttagacaagctactgagtctctgaggtttagtttcctcctctctaagatcagtatggcatcgctgactccccacagcactgtgatgagtattaaatatgacttaattcatgtgaagtgataacacagtctctcatgcacagcaagAACCCCTTCCCGGGCAATAGCTTAGAAcaatggttctcattcccgacttggcatcagagtcaccagtggaatttaaaaaaaAAAAAAAAAATTCAAGAATAAACAAAAATCCAAAACACATGAAAAAATGACTGAAAGTATTGATTATATCAGAATTTTAAATTTCAGTATGACAAATTATACCATAAACCCAAGTAAAATGAGAAAGACTGGGAGAAAATCTTTGTAACACACATAACAgtattcagagtatataaaatgtcaaaaaatcggtaagaaaaaggcacatttgccacaaaaaatacaatgtgtagacaaatcacaatttacaaaaagacaaattataaatgttatgaaatatgacctacatctcactaatagtcagaaaaatgaacattaaatcaacaaattaccatatttcactcattatattgttcaagattaaaggcaataataagcatatattcttaaatgtatagagaaatgagtattctcatgttgaaccagtgggagtataaattcttacaggacatttggagaaaaactttgtagttctgattaaaactaaaaatgtccatatcctacgaccagattccacttctaggtatctaccctaaagaaatttttgcatattacttaccaaaaaaattgaacaaaatactgcagaattgtctgtgactatagaaactagaaaacaccatggatgccaaaaatagagggatgataaataaaatatgatacacagatattaagaactatacttcagaggttaaaagttatgAACCTGATCTATATGTATCAGCATGTATACATTTTTTAAATGTTGCATTCACAAAATATATATATAGTAATTCTTACTTAACAGTTAATAAATATTCTGAGGGCACATTAAGTGATTTAATCTTTAGATCACATGCATTAAGTGATTTAATCTTTAGAtcacatgcattaagtgatttaatctttagaactaccctatgaagcagatacgattactatttccattttacagatgaggaactgaggcacagagaagtcaagtcaccctctctaagccacaGCCCTGCATCCATGGAGTCCATCCTCTTGGCCACTCCATTGTGCTTACTGAAAGAGGCTGCAGACCAATGTGCATAGCATGACACTTGTCAATATCAACATACTTTTCCAAAGGACTGGAAGGAAATATGCTAAACTCATAATGATGCTGTCTTGGCTAGAAAGTTTGTAGAATTAGAATGATCAGGATAGAGGAGAGATGAGAAAAGACTGTAGCTTTATCTTCTAATTTTTTT-CTTAAGAAATGATATGTTAATTTGTAATATTTGAAACTGCAATGACACAGGAAAAAATGAAAGTGATATGTCCAAATGTTAACAGCGGTTGATAATAGATGGAAGGAATATTAGTAGTTAATTGTCTTGCATTTAAATGCATTTTTCAATATGAAAGAAAAAATACCCAGAGACAGGTACTTTTGCCCCCTCACCCCAAGAATGAgagactgggaccaggatatttgcattttttaaaaaactccagagtgattcagatgttcagGGATAGCTGTATTTGGcagaggtgtggggtgtaatagaaagatcatgggcttcggaatctgagattcagagttcaatgccatttccactgcacattagctgtgtgatcttgagcaaattactcaaccgctctgaacctcagttccctcatccataaagtgagagtaccaccttcacttagtttaatgcggattaaatgaagagtcatatgtgcccagctcattgcataatgcGGTTCCACAAATACTAGAATTTGATTCTCTCTCTTAACGTAGCATCTttttccttcttttcttttctttttttttttgtggggagggagggggcggacagagtctcactctgttgcccaggctggagtgcagtggggtgatcttagctaacttcaaactctgcctcctgggttcaagcaattctcatgcctcagccaccttagtagctgggattacaagtatgcgccatcacgcccagataatttttgtatttttagtagtgatggggattcgccattttggccaggctggtttgaactcctggcctcaagtgatctgcccgccttggccttccaaagtgctgggactacaggtgtgagccaccatgcccagccTTAACTCAGCACTTTGAGTGATTTTAACATTTTGCCAGGCTGTTACTAAGGCGAGAAGTATACTGGCCTATACAATTTATACAGCAACTTCTGAAGTATGTTTGGAAAAAAAAAAATCAATACTCACTAACAACCCTTCTTCAATCACCCAATACAgtgacctctgtttcctcttctgtaaaatgggtgtaataacatcacttacTGACCTGTGCAGTTGAGATTCTGGATAATGCTTCAGAGAGTTCACCCAGAGTTCACATACATGCATGCGCCCCCCTCCCTACCACCCCCTGCAGCCCCGacacacacacacacacacacacacacaaacacacaTGTCTTGAGTGCATTCCATCCAATTCTGGTAATTTAGTTACTTGTCGTTTATTTATTAGGTTGAAAACATTCTGTTCATTTACTATTATTTAATCTATTAACTCTGACTTAGGCCTAAGGGGCAACCTCTCAAGGAGAAAATGCTGATTATCTAATATAAAAGCTAAAAAGTTACATAGGTGCATTTTACAGATATATTCTTTCTCATGGACAGTTTGTTGCTCAGAAAATGCTGTCTCTCTTCTCTACACCCATTGCTCGCTTGCTCTCACTCAGACATACATTCTCCTCCCCCAGGTTTAATTTTTTAAGGCAGTTTTTAAagaataattttgatttatgaaaaaatagaaatgatagcacagag--tttccacataacctggactcagtgtcccccattatgaacatatgaacatcttacattaatgtggaacataggttacaattaatgaaccaatattgatgcacgttataaacgaaagaccatactttattcaaatttctttagtttatatctaaagtcctttgtctgttctaggatcccattcaaaataccacgttacatttagtcctcatgtctcttttttttttttttttttttt-gagacagagtttcactctcgctgctcaggctggagtgcaatggcgtgatctcagctttctgcaacctctgtctccctggttcaagcaattctcctgcctcagcctcccaagtagctg----------------ccaccatgcccagctaatttttttgtgtttttagtaaagaccgggtttcaccatgttggccaggctggtcttaaactcctgacctcaggtgatactcccgcctcagcctctcaaagtgctgggattacagacgtgagccaccgtgcctggccctagtcttcatgcctctttaagctcctctcggctgtgacagtcgctcagacagtacttgtttttgatgaccctgagagttttcaggagtaatggtcatgtattttggataatgttcctcaattaggattcatttgattttttctctcatggttagatggaggttatggattgtgtggagga--agaccacaggggtaatgtgccattttcatcctaccaagaatgcataccatcaacatgacatcactgatgatgttaat------------------------------------------------tttaatTTTAATTTTTTTTTACTATTAAGGAAAGGTTTGTTTTAATATTCAGTTTCTTTTTGAAtaatgttgattttggtcacatggctgaggtgtctttgtcatatttctccactgtaaagaaactcttctcccccttccatgtggtactttttgg-aaaaaaagtcactataaaaacccactacttaaattatttggaactctaaataggagatctatcttttctctacttattcatatatttgatcacaagatttaattatatttaaaaactcagggTAAAAATTAATTGGCcctggc------tggtagctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcaggcagatgacttgagtccaggagttccagatcagcttgggcaacatggtgaaaccctgtctctactaaaattataaaaattagctgggcatggtggtgcgtgcctgtaatcccagactactcgggaggctgaggcaggagaattgcttaaatccaggaggcggaggttgcagtgagccgagatggcgccattacactccagcctgg-cgacagacagagagtccgtctcaaaaa--------------------------acaaaaTTAATTGGCTCAAAAAGTGAAAAGATACttttaaaatatttttttaacttaaaaatatttattaaGGTAAAAAA-TTTTCTTTAGATTGAATTTCATTCTTAATTGAACACAACATATATAAAACTCAGGTTCTGTTGAGGATATAAACATGACTGAGACAAGGTTCTCTTCTTGAAGAAACCATCCTCAGGGCTAGACATAA-TGTATATGCTGAGCACGCAAGGAAGTGCTGCAGTTAAAAGTAAGAAGTGCTTTGGGAACACTGAGAAGATTGTAATTAATTCAGGGAAAGCTTGATAAAAGAGGTCTGAGGTcagggccagcttctgggatatgcaaccactgtc-------ataccacaggaatcacacttggggtttcat---------gttctttgcaacctccttgaaattccttt-------------ttttttttttttggggagggagtcttgctctgtcacccaggctagagtgcagtggcacgatccgggctcactgcaagctccgcctccagggttcacgccattctcctgccttggcctcccaaataggtgggactacaggcacccaccaccacgccgggctaatttttttgtatttttg-tacagacggggtttcaccatactgcccaggctggtcttgaactcgtgggctcaagtgatccacccacctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagttgaaattcttaataacgacttttgaatttgtgtttcataagcaaagtccagtgggacaatgaagcacatgctgggtatttggagactcagctcatgtgtaatcacaccatttgccctctccttaccttctcagccatggttctaaggggttgctttcaagcacgttggccctctggacccacgcagccttcccctccctggtcttacctcaccaccactactgccctttgcccagagtcatgaccaggaggcatgggctttggggggaagTTTATATTCTGCTGCCACTCTCCGCCAACCCTGGGAGATCTGGCAGGGGATTTGGTGGGTGATTTGGCTTCAGGCAAGCTTCCTTTCCATTCTCATTCCAGAGGTTACAATCTCTTGGGGGATAGCTCATCACTGTGGGTTGGTGCAGCAGGTCCACGGAAATGGAAGATGGATTTCCCCATCCTTGGTAGGGGCTTGGCTGTCAGCCCAGCCCTGGCTGGACAGGGAACCCAGCAGTTAGAGGGCCAAGgtgcccaggggaggagagcacaactaaatggcaaatcaaaaacaccataacaggacatgagagagaccacagaagaaaggataaagttatatattttagtacttttaacagcattatttcctgttattgaggaagagaccccacgttttcattttgcactgcgccctgcaaactatgaagcccgttctgTCTGGGGcagtactgaatagcagttaagagtgtatgtaggttctagactcagaatgcctgggtttaaatgatttcttccgtatttactagctgtttgaccttgggcacatttacctaacccctctaagcatcagtttctatctctgaaaaatgggggcagaaatagctcctacctcatgttattttcattagactgaataagatcatgtctataaagcTACCTTTTACTGAGATAACTTCTCATGCTCTGCCTTCCCTCCCCAGCTGCTCAGAATATTTGCTTCCCCTGTTAGATCCTAAAGGAGGCAGTTTCTCTTCCTTACAATTTCTATGTGTCCCCCATCTTCCTCCCCACCCACAGTGCTGAGAACATCATAGGTTTTCACAAGATATCTAATCGTATCCAGTCATGCCCCAAAAGGATTTGTTGATTGCATGCCCAAACACACTGAGCACTAAGTATGTGCACAGCCCTGACCAATGTGCTACCCCTGCCTCCCAATCAGCTAGAGAGGTCACAGGAATCTTAGCATAAAGCAATGTATTTTCAGGTGGGACAAAATCCCACCAAAAATATTAGCATAGTACTCGGAAGGAATCTGGCTGAGGAAACCTATTTGGAGTTCTGTGAAGTTTGGCTGCCCAGCAAACACCCAAATCAACGTTTCCTAAACTCTGTTCCCAGATGTGAATACATGTTCTTAAAAT-AAAAAGGAtccacagtcaagtaagtttggaaaataatacatacattcctctctgtaaacaacttagtataattagttttatagactctaaaagtcctataataaagaaatcaggtaaaataatatgcccgaatttcccaagtttattaattatggaacCACTTTAATCATAAGACATTTACCAATGTCTTGAAGAACATTAGCTATTTTCTAAAGCATAGTTTTGGGTTAAGCTACTTGAAGAAAGGGACGGTGTCTTGCATATTATTTTACACTTATACATAGAAGACAATCAATATTAATTTAGTGAATAAAAGAATTAATATTTATTTC------TTGTTTACTCTTTAACTGTAATCACATGTGACACATGTGATTACATGTTATGTGAAATGTAATCAC--GTGTCACATATGACTTATAGTTAATCATGCCTAATCACACATATGATtaggcattttacaaaacacattatttcatcacaaagttcctgttgaaactgacaaggcacatattatcagcactatattatgaatggaaaaactgaagctcagagagattgaatgacttaactaaggtcacacagttggttaatgtaaaaacttgagctcaaattcaaatctgcctgttccagatcctgtgttcttttcattgcatcTAACTAGAAAAGAACATGGAAGTTTGCTACGACATTATCCAAGACAAACATGATTGTAGCACTGACCTCAAATAAGCGCAATACTTTGGCCAATGCACCAACTTCTTCTTTGAGTGAGAAGATCAGTGATATGGCACCATTTTGATTGCAGTTGTCTTCAATATAGCTTGTTTCCTACAGGATAAGATGCATTTGTTTAAAACATTTTCCACAGTTTAGCAATTCATTCCTGTTAAACCTCCATGGACAAAGCAAGCATGAACTC-TTTCTTCTAGTTAAATCTTGCAATACAATGAGCTATATATATTCTATACAGAAATATGTAGTGTGGTGGAAAATAAGTAAGTCCAGGGCAATTAAATGATCAATGATGCTACTGGGTCAGTTATCAGCTTAAGGAATCGGCAATTATTCAAAAATGTCGCCCTTCNAAACTAGGAAtcaaaaccttttattgagcaactactaggttccaggcactatttgggctctgagaaatttaaagatgaataagacaatgctttatcttttaggagctcacaatctaacttaatagacacatatataacaaacTGAAAGATCCTTAGAGGTGATATAATATGATTTATAAAATGTCCCAGAAAGACATTGAGAAATACAGTGTGGAAAGTACTAAAaatggaacatgcacaggcttttgaatcgtaagacctggattggaatcctctctctttcattttccaggtggactactttgggcaaatcattcagctttcttagttttctcatccgtgaaagcatgctaataacaagatctgtcaaaacagtattcagaggatgaaaaaagGAAAAGAATAGTTTAAAAAGAATATTGAGAAGTATATAAAAATGATGGAAA-ATTATAAATACACAAAAATGACCTCTTGACCTTTGGCAAAGATCTCAGGAAGCATTAACTTGCTCCCATATGCTGAGATCTGAGACATCCAATTGTTGAAAAAGAGTTACAAAATCCATGAAAGTACACAAATAACCTATCAGAAAATAAACTTAGTCTTAAACTAAATCTCAAAGAATGTCCAGGATCTAGCACTTACTACATGCATGTGACAGAAAACCAAGGTTGGGGTTAGGGCTGACATTCCAGAGTTTGCTAAATCATTAGCCTAAGTCGAAAAATAATACATAAAATTCTATGTGTGTCCACAATAAGCAGCAGGTACCTAAAACTGGGAAGAAAAAAATTTGCAGAACAATTACTCTCTTGTAAGCAAGTTAATGAAATTAATGGAATAGATGTTACATCATCTCAATGAGAGAAGGCTGTGTTAGGAAACTCTTAGTGACTCAGAATAACAAGCCC----TGCATGAATACTGATGACCCTTAGCAAAAAATTCTTTCAATTCAGAAAATTCAGATTTTTGCCAAAACAT-CCCATGAAACTGAGGTGTGAAGGAAAAAACAAATTTATCAGCAAGAGTGATTTTAGGGAGCTTCAAATGAAATGGAAGACTAAACTGTTAAATATCCC-ATTTTGATCATGATGTTATCTTTCTAAAAAACTTCATTTATTTAGAGCCTATATAaacatttatttagagcctataatttctgggtattataataagcacttgatttggattatctcatgtaatt-tggcaacaacctaagaggtaggttttattaggcaccaagtgcccccttttattgatgacaagattaaggcttagagaggttaaggaacttgcctatagttacacagttagcagtggagccaggatctgaacccaggtcatttgatctctgcatactgtccatgAATCACAATCTCTTGCAGCCTCTATTCCTCTTCCCCCTTTTAAACCCTGCCAGAGAGGTACAGATGAGTCTCTGACTTAAGTCTTCTTCCTACTAAAGAATACTGAGCCTTCTTCTTTCCAGTTTCCTTGAAATGACAAAAGATATTCCTGTCTCTAGTTCACTTGGTAGCACTCTTTTCTCCTGTTGGCTTCCAAGAAAAGTAAGATATTTCTGATACACATCCACAGATGCCACTTTTGACTAGGGCAATTCAGACTTGAATGTACCTGGGCTTGAAGTTGAGTCACCCCCTAAACCCCACCCCACTACAGTGTGTGTTCAGCCAATCACAAGTCTGATCTCATCTTCTCCAGAAATGCCTCTGGGCATCAGGTCCTTTC----TTCCCACTGCCATCACCTGAATCCATTTCTTAGTGGCCTGCATCGATCCAGCCTGACATTTTTACTCTTGTC---CTTCTATTTAGAATCCCTCAAACGCTCCATCCCCATGGCTTCTTGCTGATGTTTGGCAGTTTCTGTGGTACCGAATCTCTGGAGGCCCACCTACAGGAACCTCCTTTCCAGCCAAGCTGCTTTCTTTCTTGCCTTTTTAGCTCCTCATTAGAGTATTCACCAAATTTCCCTTTCCAAGATCTCACCTTCCTTAAAGGCTCTTTTGGGTCTCAATTCTCTTAGGAAATGTTTGTTCCCCTCAGCCCAGGTGCACAATCACTTCTTTATCTATGCTTTCCACTTGGCATTTGATGCCCACATGGTATTTCATAATAATTGACTCACAGAAATTGATTTGTccttagtgctcatctagttaaactcccttacattacagatggggaaaacttagagccaaagggagaaaataactcacctgaggccacataggtagtggaggctggtcaagaactcaggctcctaattatcaatTTTTCTACATAATTCCCTTTGCTATGGACATAATATGGGAATTTAGTC--CTGTTTCTTGCAAAGTAAAAGATTTACTCTGGTCCAGTCACCAGACAGTTAGTCAATAGCACTCCTAACAG s rheMac1.SCAFFOLD65323 47319 11868 - 89934 AAAGGTCTGTCTACTGTAAAAATGGAGGGTAAATTCTGAAGCAGTTTTTGGCTCTAAGTGTCTAGTTCTTGGAAGCTTGTCTAGTCTGAGCGTAGGTGTCTTCATCAATTGAATGATGCTGTCTTTGAACCTACCCATATATGCCAGAGACGGCCTTGGAGCTCAGAGCTCTGTATATCTGCTTGTTTGCTTGTTCCCTTCCCCAGAGAATACATGGTAAGGTGAACAGTGTACTTCCCCCAGAAGCCTGCTTCTCATTTTTTATCCCATTACTAAGCCACTTAGAGTAAAGATTCTCAGGAGACTATTTTCCTAAAAGGCATGGACATGAGCTAGCAGAGGCTAAAAATATAGAGCGCTACAGAAAATGTTTAAACCAATGCATAAATAATTGAAAGTTAGAACAATCTACGGAGGTCAGTGGGATGTTTGTAGGTTAGCAGGTAAGGGTTTTGGTATACTCCTAATCATTTGGCCCCAATTCACTTGAACTTCTACttcttatcttaatttttagaatgaggaaacctagccactaaaaagttaaataattttcctaaggtcatcaagcttacaggttatgcaactgggttctgaatctaa-acagtctgattctagatgatatattcttactcccaatgccaGGTTA---------ACCCCAAACCTAGGTTATCGCTGATAGTTTGGAGTTCATAACTGTAAAACAGCATAAGTTTAGTGGAACACTGGTGCCTGGAAGATATTAACAGATCTTCCCTAAACAAGgtcccatggtaaatacatataggaaatgctgagtgagattacactgaacaggtttcctctctgcagaacttctcagaatctttaataagttcatgtgtactatggctctctaaaaCCTAGATGTGGAATTTTTCAGATATAATGACCCTTGGAATTCTTTTCTGATAAAACATCTACTATCATACCAATTTTGCCAAAAAAAATGTTTAGGAAACACTGCTCTAAAGTATAGTCTAGATTATTTCATTTGTTTTGCCACTTATTTCCTTTAATTTCATTTTATAGGGTCCAGAAATGTGTTGTAAACTCCACAGCTTAAAGGTCTTGTCCGTATTTTCATATATGACTCACTTCTCCACCTCATTCACAAAGATGTTGGGAGAGGTGTAAATACACAAGCACACTATGTGCACCACAATCCCCC-ACTCTGCCAAGTTATTTTTCTTCTGGCAAATGGCTCCACACCAGCTATTATTGGCCATTGCCACTTTTCTATAAGTGTTCATGAACAATGCAAGTCATTCATTCTAGATTTTCATTAAAA---AAAATAAAACTTTAAAATCAAGGTTTTCTACTCtccctagtcttccaacatctttctcatcttcacgctttcttgaagattcctaatggggttcatagatcacacatggaagGGGTAAAGGAATAAAAATTGTGTGAGCATCTTCTGTGGCCTCAGAGTCACACCAGGCATAGCAAGATCAATAAGTTAATCACTGGCAGATCTGGGATTTAGATGCCCAATATCAAGCCTATATTCCTCCTACTCTTTATATCATAACATGGGGCTACTATAATGTTTGGTACCAAAGATATGAATTCATCTATGGGCAAACAGTGATCTCTTGATTCCTCATAAAACCTTGGCCCCAGATAGTTCCCTGATTCAACCCTTTGTAAGTAACAGATAGGTGATGGGGTGAAGTCACTAGTCCAAGGACAGAGTCCCAAGATCTACCAGCCATGCttctcttggctctcaatattttgtttcaacattcgcagtttaaagataattctctttacaacgaaaagagatgcaaaataactgctgtgtccttctgctttctcATAGCAATTGGTTTATCTCTGATTAAAAAAATATATAAGCCCGGAGGTTTTAGCACAATagacctaggtcaatttctgaagtcctaccaccttctctaccttagacaagctactgagtctctgaggtttagtttcctcctctctaaaatgggtatggcatctctgactccccatagcactgtgatgagtattaaatatgacttaattcctgtgaagtgataacacagtctctcatacacagcaagAACCCCTTCCCGGGCAACAGCTTAGAAcaatggttctcattcccggctgggcatcagagtcaccagtggagtttaaaaaaaAA--------TTCACAAACAAACAAAAATCTAAAAC-CATGAAAAAATGACTGAAAATGTTGATTATATCAGAATTTTAAATTTCAACATGACAAATTATACCATAAACCCAAGTAAAATGAGAAAGACTGGGAGAAAATCTTTGTAACACACATAACAgtattcagagcatataaaatgtcaaaaaatcagtaagaaaaaggcacatttgccaaaaaaaa--ccatgtgtagacaaatcacaatttacaaaaagacaaatcattaatgttatgaaacatgacctacatctcactgataatcagaaaaatgaaaattaaataaataaattactgcatttcactcattatattgtccaagattaaaggcaataataagcatatattcttaaatctatagggaaatcagtattctcatgtcaaaccagtgggagtataaattcttataggacatttggagaaaaactttgtagttctgattaaaactaaagatgtccatatcctaggaccagattccacttataggtatctactcaaaataaatgtttgcatattacttaccaaaaaaattgaacaaaatactgcagaattgtctgtgactacagaaaacagaaaacaccatggatgccaaaaatagagggatgataaataaaatatgatacacatatattaagaactatacttcagaagttaaaagttatgAACCTGCTCTGTATGTGTCAACATGTATACATTTTT-AAATGTTGCATTCAAGAAATATATATATAGTAATTCTTACTTAACAGTTAATAAACAttctgagggtt-----------------------------------------------------tcacatgcattgagtgatttaatctttagaactaccctatgaagcagacacgattactgtttccattttacagatgaggaactgaagcacagagaagacaagtgaccctttctaagccacaGCCCTACATACATGGAGTCCATCCTCTTGGCCACTCCATTGTGCTCACTGAAAGAGGTTGCAGACCAATGTGCACAGTATGACATTTGTTAATATCAACATACTTTTCCAAAGGCCTGGAAGGAAATATGCTAAACTCATAATGATGCTGTCTTGGCTAGAAAGTTTGTAGAAT------GATCAGGATAGAGGAGAGATCAGAGAAGACTGTAGCTTTATCTTCTATTTTTTTTTCTTAAGAAACAATATGTTAATTTGTAATTTTTGAAACTGCAATTATACAGGAAAAATTGAAAGTGATATGTCAAAATGTTAACAGCGGTTGATAATAGATGGAAGGAATATTAGTAGTTAATTTTCTTGCATTTAAATGCATTTTTCAATATGAAAGAAAAAATACCCAGAGACAGACACTCTTGCCCCCTTCCCCCAAGAAtgggagactggggccaggatatttgcattttttaaaaaactccagagtgattcagatgttcagGGATATCTGTATTTGGcagaggtgtggggtgtaatagaaagatcatgggttttggaatctgagattcatagttcaatgccatttccactgcacattagctgtgtgatcttgagcaaattactcagccactctgaacctcag--ccctcatccataaagtgagagcactaccttcacttagtttaatgcggattaaatcaacagtcatatgtgcccagctcattgcataacaTGGTTCCACAAATACTAGAATTTGATTCTTT----TAACGCAGCATCTTTTT-----------------------TTTG-GGGGGGGGTGCAGGgggacagagtttcactctgttgcccaggctggagtgcagtggggtggtctcagctaactgcaacctctgtctcccgggttcaagcaattttcatgtctcagccacctgagtagctgggattacaggaatgcgccatcatgcccagataatttttgtacttttagtagtgacagcgattcgccattttggccaggctggtttgaattcctggcctcaagtgatctgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtttgagccaccatgcccagccTTAACTCAGCACTTTGAGTGACTGTAACATTTTGCCAGGCTGTTACTAAGGTGAGAAGCATACTGGCCTATACAATGTCTACAGCAACTTCTGAAGTATGCTTGGAAAAAAAA---TCAATACTCACTAACAACCCTTCTTCAGTCACCCACTATAgtgacctctgtttcctcttctgtaaaatgggtgtaataacatcacttacTGACCTGTGTAGTTGAGATTCTGGATAACGCTTCAGAGAGTTCAACCAAAGTTCACACACATTCATGTGCCCCCCTTCCTGGC-CCCCCCGCACCACCACCAC-cacatacacacacacacacacacaaacacacGTCTTGAGTGCATTCCATCCAGTTCTGATAATTTAGTTACTTGTTGTTTATTTACTAGGTTGAAAACATTCTGTTCATTTACTATTATTTAATCTATTAACTCTGACTTAGGCCTAAGGGGCAACCTCTCAAGGAGAAAATGCTGATTATCTAATATAAAAGCTAAAAAGTTA----GGTGCATTTTACAGATATATTCTTTCTCATGGACAGTTTGTTGCTCAGAAAACGCTGTCCCTCTTCTCTACACTCATTGCT----TGCTCTCACTCAGACATAAATTCTCCTCCCCCAGGTTTAATTTTTTAAGGCCATTTTTAAagaataattttgatttatgaaaaaatagaaacgatagcacagagagtttccacataacctggactcagtctccctcattatgaacatgt--------tacattaatgtggaacacaggttacaattaatgaaccaatattgatgcacgttgtaaactaaagaccatactttattcaaatttctttagtttatatctaaagtcctttgtctgttctaggatctcattcaagataccacattacatttagtcctcatgtctcttttttttttttttttttttttgagatgttgtttcactcttgttgcccaggctggagggcaatggtgcgatctcggctttctgcaacctctgcccccctggttcaagcaatactcttgcctcagcctcccaagtagctgggattacaggtgcccaccaccacccccagctaatttttt-gtgtttttagtagagacggggtttcaccatgttggccaggctggtcttaaactcctgacctcaggtgatctgcccgcctcagcctctcaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccatgcctggcctgaatcttcatgcctctttaggctcctctcggctgtgaaaatcgcccagacagtacttgtttttgatgaccctgagagttttcaggagtaatggtcatgtattttggataatgttcctca-ttaggattcatttgatcttt-ctctcatggttagatggaggttatggaatgtgtgggggagaaaaccacaggggtaatgaaccattttcatcctaccaagaat-catac--------------------------taNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAATTTTA---TTTTTTTACTATTAAGGAAAGGTT-ATTTTAATACTCAGTTTCTTTTTGAAtaatgttgattttggtcacatggctgaggtgtctttgtcacatgtcaccactgtaaagagacttttctcccccttccatgtggtactttttgggaaaaaaagtcactataaaaacccactacttaaATTGTTTGGAATTCTAAATAGGAGATCT--CTTTTCTCTACTTATTCATATATTCAATCACAAGATTTAATTATATTTAAAAACTCAGGGTAAAAATTAACCAGCTCTggccaggcctggtagctcatgcctgtaatcccagcactttcggaggccaaggcaggcagatgactcgagtccaggagtgccagatcaggttgggcaacatggtgaaatcctgtctctactaaaattataaaaattagctgggcatgatg-----tgcctgtagtccca-actactcgggaggctggggcattagaatcgcttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcgcgccactgcactccagcctgggtgacagagtaagaccctgtctcaaaaataataataataataataataataataataataataatTGGTTCAAAAAGTGAAAAGATACttttaaaacatttttt-aacttaaaaa-atgtattaagttaaaaaaattttCTTTAGATTGAATTTCATTCTTAACTGAACACAACATATATAAAACTCAGATTCTGTTGAGGATATAAACATGACT----CAAGGTTCCCTTCTTGAAGAAACCATCCTCAGGGCTAGACATAAATGTACACACTGAGCAAACAAGGAAGTGCTGCAGTTAAACATAAGAAGTGCTTTGGGAACACTGAGAAGATCGTAATTAATTCAAGGAAAGCTTCATAAAAGAGGTGTGAGGTcagggccagcttctgggatgtgcaaccagtgtccagtgtcggcccacaggaatcacacttggggtttcatattcttcatgttctttgcaaccttcttgaaatttgtttgtgtttttttgtttttttgtttttttgagacagagtctcactctgtagtccagggtggagtgcagtggtgcgatctgggctcactgcaagctccacctcccgggttcacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggtgcccaccatcatgcccggctaatttttt-gtatttttggtagagacggggtttcaccgtgttagccagcatggtctccatctcctgacctc--gtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagttgaaattcttaataacgacttttgaatttgtgtttgataagcaaagtccaatgggacaatgaagcacatgctgggtatttggagactcagctcatgtgtaatcacaccatttgccctctccttaccttctcagccatggttctaagagcttgctttcaagcttgttggacctctgggcccacacagccttcccctccctggtcttccctcaccaccactactgccgtttgcccagcgtcatgaccaggaggcatggcctttgcggggaagctcatattcagctgccactctcccccaaccctgggagatctggcaggggatttggcgggtggtttggctttaggcaagctttgtttccattctccatccagaggttacaatctcttgggggatagcttgtcactgtgggttggtgcagcaggcccacggaaatgaaacatggatttccccatccttggtagaggcttaactgtcagcccagcactggctggagagggaacccagcagttagagggccactgtgcccagggaaggagagcacaactaaatggcaaatcaaaaacaccataacaggacatgagagagaccacagaagacaggacaaagttatatattctagtacttttaacagcgttgtttcctgtttttgaggaagagaccccacgttttcattttgcactgggccctgcaaactatgaagcccattctgTCTGGGGcagtactgaatagcagttaagagtgtctgtaggttctggagtcagaatgcctgggtttaaatgatgtcttcagtatttactagctgtttgaccttgggtacatttacctaatccctctaagcctcggtttctacctctgaaaaatgggagcagaaatagctcctacctcatgttattttcataagactgaataagatcatgtctataaagTTACCTTTTACTGAGATAACTTCTCATGCTCTGCCTTCCCTCCCCAGCTACTCAGAATATTTGCTTCCCCTGATAGATCCTAAAGGAGGCAGTTTCTCTTCCTTACAATTTCTGTGTATCCCCCATCTTCCTCCCCACCCATAGTGCTGAGAACATCATAGGTTTTCACAAGATATCTAATCATATCCAGTCATGCCACAAAACGATTTGTTGATTGCATGCCCAAACACACTGAGCACTAACTATGTGCACAACCCTGACCAATGTGCTACCCCTGCCTCCCAATCAGCTAGAGAGGTCACAGGAATCTCAGTATAAAGCAATGCATTTTCAGGTGGGACAAAATCCCAGCAAAAATATTAGCATAGTACTTGGGAGGAATCTGGATGAGGAAACCTATTTGGAATTCTGTGAAGTTTGGCTGCCCAGCAAACACCCAAATCAATATTTCCTAAACTCTGTTCCAAGATGTTAATAAATGTTCTTAAAATAAAAAAGGAtccacagtcaaataagtttggaaaataatatatacatttctctctttaaacgacttagtataattagttttagagactctaaaagttctataataaagaaatcaggtaaaataatatgcccaagtttcccaagtttattaattatggaacCACTTTAATCATAAAACATTTACCAATGTCTTGAAGAACATTAGCTATTTTCTAAAACATAGTTTTGCGTTAAGCTGCTTGAAGCAAGGAACAGTGTCTTGCATATTATTTTATACCTACACATAGAAGACAATCAATATTAATTTAGCGAATAAAAGAATTAATATGTATTTCTCGTTTTTGTCTAGTCTTTAACTGTAATCGTATGTGACACATGTGATTACATGGTATGTGAAATGTAATCACATGTGTCACATATGA-TTATAGT----------TAATCAcacatgtgattaggcattttacaaaacacattatttcatcacaaagttcctgttgaagctgacaaggcacatattatcagcactatattatgaatgg-aaaactgaagctcagacagattgaatgacttagctaaggtcacacagttggttaatgtaagaacctgagctgaaattcaaatctgcctgttccagatcctgtgttcttttcattgcatcTAACTAGAAAATAACATGGAAGTTTGCTACGACATTATCCAAGACAAACATGAATGTAGCACTGACCTCAAATAAGCGCAATACTTTGGCCAATGCACCAACTTCTTCTTTGAGTGAGAAGATCAGTGATATGGCACCATTTTGATTGGCGTTGTCTTCAATATAGCTTGTTTCCTACAGGATAAGATGCATTTGGTTAAAACATTTTCCACAGTTTAGCAATTCATTCCTATTAAACCTCCATGGACAAAGCAAACATGAACTCTTTTCTTCTAGTTAAATCTTGCAATACAACGAGCTATATATATTTCATACAGAAATATGTAGTGTGGTGGAAAATAAGTAAGTCCAAGGCAATTAAATGATCAATGATGCCACTGAGTCAGTTATCAACTTAAGGAAGCTTCAATTATTCATTGATGTAACCATTCAATCCTGTAAattcgatacttttaatgagcacctactaggttccagacactatttgggctctgagaaatttaaagatgagtaagacaatgctctatcttttaggagctcacaatctaatttaatagacacatatataacaaacTGAAAGATCCTTAGAGGTGATATAATATGGTTTATAAAATGTCCCAGAAAGATATTGAGAAATACAGTGTGAAAAGTACTAAAaatggaacatacacaggcttttgagtcctaagacctagattggaatcctctctctttcattttccaggtggactactttgggcaaatcactcagctttcttcgttttct-atctgtaaaagcatgctaataacaAGCTCTGTCAAAACAGTATTCAGATGATGAAAAAAGGAAAAGAACAGTTTAAAAAGAATTTTGAGAAATATATAAAAATGATGAAAATATTATAAACACACAAAAATGACCTCTTGACCTTTGGCAAAGATCTCGGGATGCATTAACTTGCTCCCATATCCTGAGATCTGAGATATCCAATTGTTGAAAAAGAGCCACAAAATCCATGAAAGTATACAAATAATCCATTAGAAAATAAACTTAGTCTTAAACTAAATCTAAAAGAATGTCCAGGATCTAGCACCTACTATGTGCACGTGACAGAAAACCAAGGTTGGGGTTAGGACTGACATTCCAGAGTTTGCTAAAACATTAGCCTAAGTTTAAAAATAATACATAAAATTCTATGTGTGCCCACAATAAACAGCAGGTATCTAAAACTGAGAAGAAACAAATTTGCAGAACAATTACTCTCTTGTAAGCAAGTTAATGAAATTAATGGAATGGATGTTACATCATCTCAATGAGAGAAGGCTGTGTTAGGAAACTCTTAGTGACTCAGAATAACAAGCTCAGAATTCATGAATACTGATGACCCTTAGCAAAAAATTCTTTCAACTCAGAAAATGCAGAGTTTTGCCAAAACATCCCCATGAAACTGAGGTATGAGGGAAAAAACAAATTTATCAGCAAGAGTGATTATAGGGAGCTTCAAATGAAATGGAAGACTAAACCGTTAAATATCCCTATTTTGATCGTGATGTTATCTTTCTAAAAAACTGC------TTAATACCc-------catttatttagagcctataatttccgggtattataataatcacttgatttggattatctcatgtaattctggcaacaacctaagaggtaggttttattaggcaccaagtgcctccttttattgatgacaaaattaaggcttagagaggttaagtaacttgcctata-ttacacagttagcagtggagccaggatctgaaaccaggtcATGTGATCTCTGCATACTGTCCATGAATCACAATCTCTTGCAGCCTCCATTCCCCTTCCCCCTTTTAAACCCTGCCAGAAAGGTACAGATGACTCTCTGACTTCAGTCTTCTTCCTACCAAAGAACACTGAG---TCTTCTTTCCAGTGTCTGTGAAATGACAAAAGATATTCCTGTTTCTAGTTCACTTGGCAACA--CTTTTCTCCTGTTGGCTTCCAAGAAAAGTAAGATATTTCTGATACACGTCAACAGGTGCTACCTTTGTCTAGGGCAATTCAGACTTGAATGTACCTGGGC-TAAAGCTGAGTCACCTCCCAATCCCCACCCCACTCCAGTGTGTGTTCAGCCAATCACAAGTCTGATCTCGTCTTCTCCAGAAATGCCTCTGGGCATCAGGTCCTTTCTTCGTTCCCACTGCCATCACCTGAATCCATTTCTTAGTGGCCTGCATGGATCCAGCCTGACATTTTTCCTCGTGTCCTTCTTCTACTTAGAATCCATCAAACGCTCCCTCCCCATGGCTTCTTGCTGATGTTTGGCAGTTTCTGGGGTACCTTATATCTGGAGGCCTA-CTACA-GAACCTCCTTTCCAGCCAAGCTGCTTTCTTTCTTGCCTTTTTAGCTCCTCATTAGAGTAATCACCAAATTTCCCTTTCCAAGATCTCACCTTCCTTAAAGGCTCTTTTGGATCTCACTTCTCTTGGGAAATGTTTGTGCCCCTCAGCCCAGGTGCACAATCACTTCTTTATCTATGCTTTCCACTTGACATTTGATGCCCGCATGGTACTTTATAATAATTAACCAACAGAAATTGATTTGTccttagtgctcatctagttaaactccctcacattacaggtggggaaaacttagagccaaagggagaaagtaactcacctgaagccacataggtagtggaggctggtcaagaactccagctccaaattatcaattgttctATATAGTTCCCTTTGCTATGGACATAATATGGGAATTTAGTCCTCTGTTTCTTGCGAAGTAAAAGATTTACTCTGGTCCAGTCACCATAGAGTTAGtcaataccactgctaacag a score=242772 s hg17.chr12_random 284854 2952 + 466818 cttataatgcagttccctgggctttacctaaacctgttgaatcaagttgtcttagaatctgccatttcaaaaccatcccaggtgattcttaaccatagaaaattttggaaccattgATATATATACAGCCTATTTTTTT-AATTATAACTTTTCCCTAAATGTGTCTGCAAATTCACATTTACTATATAACACGACACTACTTTGTTTGTTATTAATATAATTTGTGGATTCTCAATCTTCTAAGTGCTCTATAAAGAACTTTAAACCCCTATGCTTTCCTGATGAGATCCCTGCCCCTAACCCCTTCCCACAGTTGTGGGGACCGTATTGCCAGCAGCACCAAAACTATGTGCAGGATGGAGCCAGGACCTGTTCTGGGATCACTCTGACTCTCACGCTGTTCCTCTGTACAATAAGTTCTGTCTCCTAAGAGCCATGTACTATTTTCATAAGAAA--TTTTTTTTTTTAAGGATTC----AAATAAAAATCAGTCCTAAGTTCTGCAGTCTTTCTAGTTATATTAACGTTAACATTAACCATTCTTTTCTCTCCAGCCTCCCTGTTTTCTACTGAGAACTCTTCTCCCTAATCCTACTGATGACAGGGGCCTGCAGACTTACATTATTTCCCTGGCCTGGGCTTTATGACTGAATCTCAAGAGTCCAGGAGCAGACTTCCTCCCATGGGTAAATATGTAGGTCACATTAAAGAATGTATTCTGCAATTCTTCACCTCAAGAAAATGCCAACAAATCCCGGAGAATGGAATATACCTTGGGCATTATTTCCAAGTCACGTTTAGGGTTCTTTCACATTCCATGCCCAGGGCTAACTCTTGGTCATTTTCCTCTCTGCTTAGTTTCTGCCTCCCCTGGTCTGAGTAAGTTTCTGTCTGAATTCTCTTCATGCCTCATCTTCTTCCCAAAATGAAAGGAGGATAGTTACTCACAATTTTGCCATTTTGATACCTTGCTGAGAGCACTTTATAAATATTACAAAAGAAATCTAGAAGGATTCCACATCCCATCCCagatcattagggaccagccccttcagtgtacagaagagtaaacagacaacagagagggacagtaacttgtccaaagacacacagctaattggtggcagttctggaggccagatccccaaccccctaaAGCAATGGTCATTCATTCCTGTGAAAGCCACCGAGGACAGATGTTCTCCTACTTAGAAACAATTG-TGAGGACATTGGCCTGTTGACTTCCTGGAAATT-CCATCAGCTCCCACGGAATTCAGACTTCTTACTGAGCTTATGAAACCAGNAAGCACCAGCAGTC-TCGGATCTCTTTCTCTGGAGGCCCAAATTCCCCTAACTGAGCAGCTCAGGCTGCCGTGGCTCACCTGTCCAAAGTCAGAGAGTTTCCTGCCCAAGCCTGGGCTCTCCAGGAACCGCAGTGGACATGCTGGCTCCCCGGGAGTGAGGTCTCTGGCTTTTTAGGGCCTCAGGTACAGGCAGGTTTGCAAACAGCACGTGGGGCTGAAGGTTTTAACCTCGCACTAGGGAGGAGAAGAGAGTTACAAAGGGTGTCTCTTGCGTGGTGCATCTCCGCACAGTAACGCCCCTCGTGGGCGTTGTCCTGACGCAGGAGGCCAGGGCAGCCTGCCGGATGCTCCAGGTCACCTGCCCAGGACGGGCCGGAGGGGAGGGGCTGAGGGAGGGTGTGGGGGACGCAGGAGGCACCACTTCGCTGCCCGCCCTGGGTAAAGGGAAGAAGCCAGGGAGCGACGGGCCACCCAAGCCCCGTCGATTAGACAGGTTTAGGCACTTCCGGGACTCTCAGAAGCCTGGGAAGCGAGTTCTCTGCAATTGGACTAAGCCTGCGACCGTCTGGTATAACAATTATATGAATAATCCGCCCCCCTTACCCCCAGCTGAAACAGTCAGGATTCTCATTTAGATTTTTGTTGTTGTTGTTTTCCCTTCTGTTAACCTCTAAGCACACTGCCTTGCTGTGCGCTGACTTCAGAAAACTACAGCTAGAGGGCACGTGAACGCTGAGCACAGCAGGTAAAGAGCAAATGTAAGAGCGATCTGGGTTTAAATCCAGCCTGGTGTTCTCCAGCTATTCGCACAACTGCTCCTGAAGCTCGGaaaagagggtggtagagccaccttgctggaaggttttaagaataggaataaagaaatgcattaaaatttagtacagttcttccacataaacactcagtaaatggaagATATTGTTTAAAAGCAAATCCACATAAatttgac----aataattactgagacctgtaccgtgtgcttggtggtgttctagtctttgggaatacagcaatgaacaaaacagactctgcctccccagctatgctgccattctggtgggcagaaaataaacatataaataagtttaggtagggctaagtcttttgaagaaagtaaagtagggggatggtctatgagtgagctggtgGGATTTGGCCAGTGGTCTTCAAATAGTCAGGAAGATGCCATTAACCACACTTTTA---GAGAAGACTGAGGGTGAGGCATTACTGACCAGGAGGTAAAACAAAGTATAAAAGAATGCTGGAAAGCAGGTTCAGAGGTTCAGAAAGGATGTGAAAACTCAGGGGCCTCAAGCCTTGAGTGCCTGCTTAATATTTTCCCAAGAGAAAGTAATGGGCTGTAAGAAAATAAGCCAATAATAAAGGTTGCTGGAAGCCCATCCCTCTCCTCCCACTGTTCTTTGACCAAGCATCTGA--------------aaataaataaacaaataaataaataaataagtaaaa-----taaaACTCAGGTTTAGGATTCAAAACAAGTGGTTTAACTCTTGGTTCTACCACTGATTTGGTCAAGCCCATGCCTCAGtttt-----tttttgttttttttttttgttttgtttttGTCTTTAAAATGAGAATTTTAAGGGATATTTAGGATTCCTTAAGCCTTT s rheMac1.SCAFFOLD65323 59187 2976 - 89934 cttataatgcagttccctgggctttacctcaacctattaaatcaggttgtcttagaaactgccatttcaaaaccatcccgggtgatccttaaccatagaaaattttagaaccattgATAAATATGCAGCCTATTTTTTTGAATCATAACTTTTCCCTAAATGTGTCTGCAAATTCACATTTACTATATAACAAGACACTA-TTTGTTTGTTATGAATACAATTTGTGGATTCTCAATCTTCTAAGTGCTCTATAAAGAACTTTAAAGCCCCATCCTTTCCTGATGAGATGGCTGCCCCTAACCGCTTCCTACAGTTGTGGGGACCCTATTGCCAGCAGCAACAAAACTACGTGGAGGATGGAGCCAGGACCTGTTCTGGGATCACTCTGACTCTCACACTGTTCCTCTGTACAATAAGTTCTATCTCCTAAGAGCCATGCACCATTTTCATAAGAAGtttttttttttttaaagattcaaaaaaaaaaaaatCAGTCCAAAGTTGGGCAGTCTTTCTAGTTATATTAACGTTAACATCAACCATTCTTTTCTCTTCAGCCTCCCTGTTCTCTACTGACAACTCTTCTCCCTAATCCTACAGATGACAGAGCGCTACAGACTCACATTGCTTCCCGGGTCT-AGCTTTATGACTGAATCTC-AGAGTCCAGGAGTAGACTTCTTGCCATGGGTAGATATATAGGTCACATTAGAGAATGTATTCTGCAATTCTTCACCTCAAGAAAATGCCAACAAATCCTGGAGAATGGAATATACCTTGGGCATTATTTCCAAGTCACATTTAGGGTTCTTTCACATTCCATGCCCAGGGCTAACTCTTGGTCATTTTCCTCTCTGCTTAGTTTCTGCCT-CCCTGGTCTGAGTAAGTTTCTGTCTGAATTCTCTTCATGCCTCATCTTCTTCCCATAATGAAAGGAGGATACTTACTCACAATTTTGCCATTTTGACACCTGGCTGAGAGCACTTTATAAATATTACAAAAGAAATCTAGAAGGACTCCACATCCCACCTCagatcattagggaccagccccttcagtgtacagaaaagtaaacagacaacagagagggacagtaacttgtccaaagacacacaactaattggtggcagttctggaggccagatccccaaccccctaaAGCAATGGTCACTCATCCCTGTGAAAGTCACCCAGGACAGATGTTCTCCCACTTAGAAACAATTGTTGAGGACATTTGTCTGTTGACTTCCTGGACATTCCCATCTGCTTCCAAAGAATTCAGACTTCTTACTGAGCTTAGGAAACCAGGAAGCACCAGCAGTCTTCAGACCTCTTTCTCTGGAGGCCCAAATTCCCCTCCCTGAGCAGCTCAGGCTGCCGTGGCTCACCTGTCCAAAGTCAGAGAGTTTCCTGACCAAGCCTGGGTTTTCCAGG-ACCGCAGTGGACATGCTGGCTCCCCGGGAGTGAGGTCTCTGGCTCTTTAGGGCCTCAGGTACAGACAGGTTTGCAAACAGCACGTGGGGTTGAAGGTTTTAACCTCGCATTAGGGAGGAGACGAGAGTTACAAAGGGTGTCTCTTGCGCAGTGCATCTCCGCACAGTAACGCCCCTCGTGGGCGTTGTCCTGACGCAGGAGGCCAGGGCAGCCTGCCCGATGCTCCAGGTCACCTGCCCAGGACAGGCCGGAGGGGAAGGGCTAAGGGAAAGTGTGGGGGATGCGGGAGGCACCACTTGGCTGCCCGCCCTGGGTAATGGGAAGACACCAGGCAGCGACCGGCCACCCAAGCCCC-------AGA-AGGTTTAGGCACTTCCGGGACTCTCGGAAGCCTGGGAAGCGGGTTCTCTGCAATTGGAATAAGCTTGCGACCGTCTGGTATAACAATTATATGAATAATCCGCCCCCCTTACCCCCAGCTGAAACAGTCAGGATTCTCATTTAGATTT---TTGTGGTTGTTTTCCCTTCTGTTAACCTCTAAGCACAGTGCCTTGCTGTGCGCTGACTTCAGAAAACTACAGCTAGAGGTCACGTGAACGCTGAGAACAgcaggtaaagagcaaatgtaagagccatctgggtttaaatccagcctggtattctccagctgttcgcataactgctcctgaagctcagaaaagagggtggtagagccaccttgctggaaagttttaagaataggaataaagaaatgcattaaaatttagtgcagttcttccacataaacactcagtaaatggaagATATTGTTTAAAAGCATGTCCACATAAATTTGAcaacaaataactactgagacctatactgtgtgcttggtggtgttctagtctttgggaatacagcaatgaacaaaacagactctgcctccccagccatgctgccattctggtgggcagaaaataaacatataaataagtttaggcagggctaagtcttttgaagaaagtaaagtaggggaatagtatatgagtgagctggtgggttttggccagtggtcTTCAGATAGTCAGAAAGATGTCATTAACCACACTTTTAGAGGAGAAGACTGA-GGTGAGGCATTAGTGACCAGCAGGTAAAACAAAGTATAAAAGAATACTGGAAAGCAGGTTCAGAGGTTCAGAAAGGATGTAAAAACTCAGTGGCCTCAAGCCTTGAGTGCCTGCTTAATATTTTCCCAAGAGAAATTAATGGGCTGTAAGAAAGTAAGCCAATAATAAAGGTTGCTGGAAACCCGTCCCTCTCCTCCCACTGTTCTTTGACCAAGCATCTGACAaaaaaaataaataaataaataaataaataaataaataaataaacaaaAATAATAAAAATTCAGGTTTAGGATTCAAAACAAGTGGTTTAACTCTTGGTTCTACCACTGATTTGGTCAAGCCCATGCTTGttttttctttctttctttttcttttttttttttttttttGGTCTTTAAAATGAGAATTTTAAGGGATATTTAGGATTCCTTAAGCCTCT a score=194997 s hg17.chr12_random 287923 2365 + 466818 aattcatttatgagatctaggagcttcttggaggagtctttagggttttctaggtatacaatcatatcatcagcaaacagtgacagtttgtgttgttctttaccaatctggatgccctttatttctttctcttgtctaattgctctggctaaaacttccagtactatattgaataaaagtggtgaaagtgggtatccttgtcttgttccagttctcagagagaatgctttcaatttttcctcattcagtattaacttggttgtgggtttgtcatagatggcttttactacattgaggtacgatccttgtatgctgattt-ttctgagttttattcataaaatgattttgtcaaatgccttttctgtatctatcaagatgatctttcgattttgtttttaattctgtttgtgtggtgtattacatattgacttgtgtaagttaaaccatccctgcatccctggtatgaaaccacttgatcatggtgggttatctttttgatatgttgttggatttagttagctagtattttgttaaggattttagcacctatgttttcatttttggttatgtcctttcctagtattaggatgatactggcttcagagaataatttagggaaaattacctctttctttatcttgtagaataatatcaatagaattggtaccaattcttctttgaatgtctggtagaattctgctgtgaatctgtctggtcctggactttttttgttgttggtaattttgaaactaccatttcaatcttgcttcttgttattggtctgttcagggtatctaattcttcctgatttaagctaggagggttgtatgtttccaggaatttattcatctcctctaagtttcctagtttatgtgcataaagatgttatagtagccctaaatgatcttttgtatttctgtggtgtcagttgtaatatctcttgttttgtttcttagtgaggttatttggattttctctcttcttgtcttggttaatcttgtgaatggtctatcaattttatttatcttttcaaagaaccagctttttgtttcttttatctttttttttttggtttcaatttgatatagttctgctctgatcttggttatttcctttcttctgctgggtttggatttggtttgttcttgtttctctagttccttgtggtgtgaccttagattgtttagaaagacttagaaagttttccagactttttgatgtaggcattcagggctatgaactttcctcttagcaacacctttgctgtatcccagaggtttcgataggttgtgtcactactgtcattcattttgaagaattttt-aacttacatcttgatttcattgttgacccaatgatcattctggagcaggttatttaatttccacataattgcgtggttttgaaggttccctttggagttgatttccagttttattccactctggtctgacagagtatttgatataatttcaattttcttaaatttattgagacttgttttgtggcctatcatatggtttatcttggagaaagttccatgcactgttgaatagaacgtatactctgaggttgttgggtagaatgttctgtaaatatctgttaagtctatttattccagggtatagtttaaatccattgtttctttctgtgactttcttttaaatccattgagactttctgttttgatgacttgtctagtgccctcagggcagtattgaagtcccccactattattgtgttgctgtctatcccatttcttaggtctaatagtacttgttttataaatttgggagctccagagttag----gtgcatacatattcaggattgccatattttcctgttgggcaaggccttttatc------------cctctttgtctttttaaactgctgttgctttaaagtttgttttgtctgataaaagaatagctactactgcttgcttttggcatccatttgcatggaatgtcttcttccacctctttaccttaagtttatgtgagtccttatgtgttagatgtgtctcttgaaggcagcagataattgattggtgaattcctatccattctgc--------atcttttaagtggaacatttagaccatttacattcaatattagttttgagatgtgaggaactgtttaatttatcatgctaatt--ttttttagttgtatttttgttttataggtcctgtgaaatttatgctttaaagaggttctgttttgatgtgttcaggattcatttcaagatttagagcttcttttatcagttcttgtagtgctggctttgtagtggtgactcactcggcatttgtttgtctgaaaaagactgtatctttccttcatttatgaaggttagtttggctgggtacaaaattctt s rheMac1.SCAFFOLD125516 13018 2377 - 48937 aattcatttatgagatctaggagctttttggaggagtctttagggttttctaggtatacaatcatatcatcagcaaacagcaacaatttgtgctattctttaccaatttggatgcctgttatttctttctcttgtctgattgctctggctaaaatttccagtactacactgaacagaagtggtgaaagtgggcatccttgtcttgttccagttctcagagggaatgttttcaacttttccccactcagtattaacttggttgtgggtttgtcatagatggcttttatcacactgaggtgtgatccttgtatgctgatttcttctgcgttataatcataaagtgattttgtcaaatgccttttctgtatctatcaagatgatcttttgattttgtttttaattctgtttgtgtggtgtattacatattgacttgtgtacgttaaatcatccctgcatccctggtatgaaatcacttgatcatggtggattat--gtttgacatgttgttggatttagttagctagtattttgttaaggattttagcatctatgttttcatttgtggttatatcctttcctggtattaggatgatactggcttcagagaatgatttagggagaattccctctttctctatattgtagattaatatcaatagaattggtaccaattcttctttgaatgtctgatagaattctgctgtgaatctgtctggtcctgcactttttttgttgttggtaatttttaaattaccatttcaatcttgcttcttgttattgatctgttcagggtatctaattcttcctgatgtaagctagaagggttgtatgtttccaggaatttattcatctcctctaagtttcctagtttacgtgcataaaggtgttatagtagccctaaatgatcttttgtatttctgcg-tgtcagttgtaatatttcttgttttgtttcttactgaggttatttggattttctctc-----atcttggttaatcttgtgaatggtctatcaattttatttatcttttcaaagaaccagctttttgtttctttt----tttgtttgtttgtttcaatttgatttagatctgctctgatcttggttatttcctttcttctgttgggtttggatttggtttgttcttgtttctctagttccttgtggtgtgaccttggattgtttagaaagacttaggaagtttcccagtcttttcgatgtaggcattcagggctatgaactttcctcttagtaccacctttgctgtatctcagaggttttgataggttgcatcattattgtcattcattttgaagaattttttaatttacatcttgatttcgttgttgacccaatgatcattctggagcaagttatttaatttccacatatttgcatggttttgaagtttccctttggagttgatttccagttttattctactctagtctcagaccgtatttgatataatttcaattttcttaagtttattgagacttgttttgtggactatcatatggtctattttggagaaagttccatgcactgttgaatagaacgtatactctgcggttgttgggtagaatgttctgtaaatatctgttaagtctctttgttccagggtatagtttaaatccattgtttctttctgtgactttcttttaaatacattgagactttctgttttgatgacttgtctagtgccctcagtacagtattgaagttccccactattattgtgttcctgtctatcccatttcttaggccaactagtacttgttttataaatttaggagctccagagttagttaggtgcatacatatttaggattgtgatattttcctgttgggcaaggccttttatcatatataatgtccctctttgtctttttaaactgctgttgctttaaagtttgttttgtctgatataagaatagctactcctgcttgcttttggcatccatttgcatggaatgtcttcttccacctctttaccttaagtttatgtgagtccttatgtgttagatgtatctcttgaaggtagcagataattggttggtgaattcctatccattctgccattctgcatcttttaagtggaacatttagaccatttacattcaatattacttttgagatgtgaggaactatttcatttatcatgctaattgtttttttaattgtatttttgttttatatgtcctgtaaaatttatgctttaaagaggttctgttttgatgtgtccaggatttgtttcaagatttagagctccttttatcagttcttgtagtgctggcttagtagtggtgactcactcagcatttgt----ctgaaaaagactgtatctttccttcatttatgaaggttagttttgccgagtacaaagttctt a score=104818 s hg17.chr12_random 290444 1364 + 466818 tgctgataattgttttgtttaaggaggttgaagatagggcccta---------------agcccttctagtatgtagggtttctgctgagaaacctgctgttaatctgataggttttcctttacaggttacctgatgcttttcccttgaggttttcctttataggttacctgatgcttttcccttgtggctcttaagattctttcctttgtgttaactttagataacctgatgacaatgtgcctaggcaatgatctttttatgatgaatttcccaagtattctttgagcttcttgtatttggatatctaggtctctagcaaggccagtggagttttcctcatttattcccccaaatacgttttccaaacttttagatttctcttcctcctcaggaacaccagttactcttaggtttggtcatttaatgtaa---------------------------------------------------------------tccaaatctttttggagtctttgttcattttttctttgtctttgttggattgggttaatttaaaaactttatctttgaggttgaggttttttcttctgcctgttcaattctattgctgagactttccagagtattttgcatttctcaaagtgcatccactatttcttgaagttttgattgtttttttatttatgctatatatttcactgaagatgtctcttctcatttcttgtatcattttttgatttccttaaattgaacttcacctttctatgatgccttcttgattaggttaatagctgaccttttgaattctttttcaggtaaatcacggatttcttttttgtttggatccattgctggtgaactagtgtgattatttgggggtgttaaagaactttgttttgtcatattaccagaattgtttttctagttccttctcatttgggtagactatgtcaaagggaaagtctagggctcaaggctgttgttcagattcttttgcccatggggtgttcccttgacatagcactttccccttttcctagggatgtggcttcctgagaactgagctgtagtgattgttattgttcttctggatctaaccacccagcaggtctaccaggctccgggctggtacctggggttgtttgcacagagtcatgtaatgtgaatcatAGACCATGTGCTTTAAAACAATGTTCTCAATTTATTAAAATTATTTTCCTTCTACAGTGATAGCTTGTTTTTCTAAATTTAGTATCCCTGAGAATATAATTTTAATAAGAAAAAAATTGTGTCTC--TTTTTATGTCTGCTTTCTGGGGC-----------TGGAGGTGGATTTGTTTTTGAGTAAGTCCTGTAAGTGATGCATGTTTCCTCATGTGCTTGGTAAAACT---------TAGTGTTGATGAGGGGTGTCCACACTAAATGGTATTGATAGCTGGAGCATGTAT s rheMac1.SCAFFOLD125516 15395 1416 - 48937 tgctgacaattgttttgtttaaggagactgaagctagggccctatcttcagggcttacaagcccttctagcttgtaaggtttctgctgagaaatctgttgttaatctgacaggtttcccttta--------------------------------------taggttacctggtgcttttccctcgtggctcttaagattcttttctttgtgttaactttagataac--------aatgtgc-taggcaatcatctttttatgatgaatttcccaggtattctttgagcttcttgtatttggatgtctaggtctctaggaaggccagtggagttttcttcatttattcccccaaatatgttttccaaacttttagatttatcttcctcctcaggaacaccaattattcttaggtttggtcatttaatgaaacttttagatttatcttcctcctcaggaacaccaattattcttaggtttggtcatttaatgaaatcccaaactttttggagtctttgttcattttttctttgtctttgttggactgggctaatttacaaactttatctttgaggttgaggttttttcttctgcctgtttgattctattgctgagacttcccacagtattttgcatttcttaaagtgcatccattatttctcgaagttttgattgtttttt-atttatgctatctatttcactgaagatgtctcttctcatttcttgtattattttttgatttccttaaattgaacttcacctttctctgatggcttcttgattaggttaataactgaccttttgaattcttttgcaggtaaatcatggatttcttttttgtttggatccattgctggtgaactagtgtgattatttgggggtgttaaagaaccttgttttgtcatattactagaattgtttttctagttctttctcatttgggtagactatgtcaaaaggaaagtctaggactcaaggctgctgttcagattcttttgcccatggggtgttcccttgacatagtactttccccttttcctagggatgtggcttcctgagagctgagctgtagtgattgttatcactcttctggatctaaccacccagcgggtctaccaggctctgggctggtacctggggttgtttgcacagagtcatataatgtgaatcatAGACCATGTGCTTTAAAACAATGTTCTTAATTTATTGAAATTATTTTCCTTCTATAGTGATAGCTTATTTTTCTAAATTTAGTATTCCTGAGAATATAATTTTAATAAGAAAAAAATTGTGCCTCTTTTTTTATGTCTGCTTTCTGGGGCTGAAGGTGATATGGAGGTGGATTTGTTTTTGAGTAAGTCCTGTAAATGACATATGTTTCCTCATGTGCTTGGTAAACTTAGAGAAATATTGTGCTGATGAGGAGTGTCCACAATGAACGGTATTGATAGCTGGAGCACATAT a score=15308 s hg17.chr12_random 292023 198 + 466818 ggtcagcatgaccataaaccacaaataatatctctgaccaaaaaaattccaaacctctcccctaccagaggcatgccagacccgagataatctcccctccacccagagacagtctgaccccaacataaacttctcccccacacagaaacatttcaagcttgtgataaaccccctcactctaaaacCAATGTATACTCT s rheMac1.SCAFFOLD125516 16861 197 - 48937 Ggtgaacatttccataaaccacaaataatatatctgaccaaaaaaattccaaacccctcccctaccagaggcatgccagacctgagataatctcaccaccacccagaaacaatccgactccaccataaacttctcccctacacagaaacatttcaagc-tgtgataagccccctcactgcaaaaccaatgtatactct a score=9894 s hg17.chr12_random 292763 848 + 466818 TATAAACTCAAACTATTTCTAAATGTGATCTATTTCCTTTTCTACCATCTTATGGGTAACTATTTGTTGGAATATAATGCCTTCAAATTCCTTTA-----ATATTCCATTTGCTTTCACGTTC-TCAGGTGGTTTTTTTTAAATACTTTCTTTAAAT---ATGTTTATGGAGTTCTCCACAGTGAGAGATAGGAAGTTGATAAATTCTAGTTCTAATAAAAGAGGCTTTATTCAAACATATTTTGTCCAACTTTTCCCCAC---TGTGGGTAATGC-CACTTAGGA---ATTATTCTATCAGAACAGCATCTGACCTAAACCTTGACCTCATATATTACTCCTGCCCCTTGCTAGCC-TTAGTAGATCTCATTTTCATTGTTTCTTTTCTATGAGAGCTGACTCTTCAAATATCTTGATTATGTTTCTCTCTCACACTGGAAATACCTGCATCTTTACCTACAACATATATGTGAATCTGAAAATCACGTAAT------ACTATTTCG-GCTAATTTTCCTGGTTTTCTCTTCTCAAATA-------------TGTGCCCACTTTATATAACTA------------------------------------------------------GTTCCTGGGGAGGGGTCTCTTCTGTTAGTTT-----TCTG----------------------------------TTATTTGTTTAC---TTTTTTGGATGTTAGTAGTCACCCTTTCCAATCTAGAAACA---AAAACCTCT----CTTTTTCAGTTTCTTCTTTCTGAGTAATTAGATG---------CAGATTCCTTTGATGTG---TGCCTAGCCCGGCCTCCAGATTCTCATTT-----TTCCTGAC--ATTGCTCTCTAGTAAATTCCTCAACCTTTCTCCTAAGAAA-----GTCTTTCTTCCACAACAGTAACCAGGCCTTC--TTGTTTTCCCTTTATTCTCCCATGACTTCCATTCTTATAGTTACATTGAAGAGTA s rheMac1.SCAFFOLD15099 27241 989 - 182290 TAAAAATTTAAACTACTTCTTAAT-TGGGTTGATTCCTTTTCTAACA-CATGTAGG---------GCTGGGATTAAGGCCCTTCC--TTCCTTCCTGTCTATTTTCTCTTTGCCTTCTGGCTCAGAAAATGGTTTTCCTAACATA-TTCCTCTAAGTTTAATGTGTA-GGGCTCCACCTTAGTGGGAGATATGAAATCAATAAAGTCTAGGGCTACCAAAAGCTACACTGTTCAAACAAATCTTAG-CAACTTTCTCCCACCTTTGTTAGAAAGACTCACCTGGGAGATATGATCCCATCAAACCACCACCCAATCTAGGCCTAGACTTGGCTGATTATTGTTCTGTCTCGCTCTCCATTTATATTTTTCATATCTACTGCGCCTTCCCTTAAAATGCCAACTTCATAAATTTCTCTGACAGGTGCCCTCATAGAACAGGCACCATCTGCAT------TGACTGTCTGTCTCTGAATCTAACCATTTGGCAACTATTTGAATATTTTATGCTTATCTACCTGGTCTTCCCCACTCAAATCCCCCTAAATTATTTGTTACCACTTGGTACAACCACACCAGTAGTCAAAAAGTTGTTCCAATTGCTCTTATTTTGGATTCTTCATCTGCGCTTTTCAGGAGAG--CCTCTCAGTTTGTTTCTGGATCTGGCTTCTTGCAAGCAAAGGGATTCACCCAAAGATCTTATCTCTTTCCATTTGTTTTCACTGGGCACAGTCACTACTCCTGTGCTAATAATGCTTAACACATCTTCACCTTTTCTAAATTCCTTTTTAAGAACAATTAGATGTTTACACTTCCTACTGCTTTTGGGTGGGATATCCATTCTGACCTCCAAGAGCTCATATTGACCTTCCTAGATGATTCATCTCCAACTAAGCACTCACTCTGTTTCCTAAGAAAAGTATATTCTCCCTCCA-GTTAATCATCTTGTCTTCTTTTATTTTGTTTTTATTTTCCCATTTCCTCTGCTCTTATAGTCAGACTGAAGTATA a score=4508 s hg17.chr12_random 308587 57 + 466818 AAGTGTAAATTATTCACCATTAATGTCTGTGACTTCCCACTCATCTCCCCTTACCAT s rheMac1.SCAFFOLD125516 18055 57 - 48937 aagggtcatTTATTCACCACTAATGTCTGTGACTTCCCACTCATCTCCCCTTATCAT a score=6142 s hg17.chr12_random 312841 767 + 466818 TTGGCAAACTTAATTGACTGGGCTGAGAACCA---GATTTGTTTGATGGATTTCATCCTCTCAAGCTTGGCCATATGCAGAACACTTTTGCT-TGGGTGTTGCTATTAGATGTACTTATAATGACTATCCAAATATA---GATGCCGTTAATCATAATCTAATTAAAATTATAACAATATTTGACATTCTCAGATTAGTTTCAAAGTAGTTAGGTATCTGGTTCGCCTCATATCTCAGTATTTTTTATTTGCTTAAAGTAGCACTTTTCCACCATGCAATTTTCCTCTGGCTGAAGTGGAGGATTAGCAGGGCTGTTTTTACATTCTTAATGATCTTCTTGTT-TTTCTACATATCCATCATTTCAATGATTAAGATCAAATTATTTCTGGATCAATGTTGATATAA-AATATAAGAGAAACTCCTATTGGAAGGTCGGTGT---GAATGAAGCCCACCTTCCTGTTG--------ACCAGATGCTCATTAACCTGGAGTTGTCTATTC--ACTTTACCATTTCTCCTATCTAATGTTCCTTGTTTGTTATCTCCCTAA------GGGGAAACACTGTACAGCTGTAGTGATAGGCGACTGGCTCCAGAGACCCAGGACAGAGGCCTATGTGAGAGCCATGAACATTATGATTGCTTTCTTCTT-CCACCTTCTCTACAGTTTGGGAACTTCCCTTTCATCCGTCAGCTACTTTCTATGCAAG--AGGAAAATA------------------GTGGCACTAGGTGCCTAC--CTATCCATTAAGTCACTCATTTATCCTGATTATGGAAAACAACAAG s rheMac1.SCAFFOLD85456 34386 771 + 81052 TTGGTAAATTCCACTGAGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTCTCACTGCTCTGGTGGTCTCCAGAATTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTATTACAT----------TGG-TATTCAGTTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAG---AGGTAAGAACTACCACTTACAATGTCTGGGCAGTAACCAGCCATTTCAGCAACTGGTTTGCTACTTGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTATGTTTCTTCACTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGATGCTGTTGGGGTCTTTGCTATTTTTGGTTTGTCATC-TTTTTGTGATAAATATGAA--------TGAGATTGTACAGACAAAAGAATATGAAGGAAACATGACTGGGAAGATCAAATTGAGGAGTGCAATGTACCTTTCAGATGCGACTGTAACC--ACGCTAGTAAACTTAGTACCCTTCACTCTGACCCTAATATCTTTTC-------TGCTGTTAGTCTGTTCTCTGTTTAAACATCTGAAGAAG----ATGCAGCTTCAT-----GGCAAAGGATCTCAGGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATCTCTTTCCTCTTGCTATGTGCCATTTACTTTGTG---TTCCTAATCAT--ATCAGCTTTGAGTTTTGAGAGTCGGGATAACAAACCTGTCTTCATGATCTGTGAAGCT-GTTACATTCAGCTATCCTTCAACCCACCCATTCATACTGATTTGGGGAAACAAGAAG a score=269087 s hg17.chr12_random 313933 3287 + 466818 caagtcatttatggacaatgccatggctcagaaaTACTGCGACACTTGCATCTTTCCTGAAAAAAATTGAGCCAAGTCAAGATAAAACAACCAATAAAAGGCACAGCATGGCAAATAAGCAGCAGTGGTGAGTGAGCACTCAAACCAGCAAAACTTTTACTTGTTTAAACAATTTTTGTTTATGTGGTTTTGaattttatttaaaaatataagtaaatgaattatatGACTAATAATGTAAAGAACCATCAGCAGTAGTTTGGAAGTAAATTCTAGATGTTTTCAACAAAATCTAAGAGCTAGGAAGAGCTCTGGGAGAAAATAATTTTATAATAAATGAGGTCCTCTTGGAGCAGGAGTATTATAATCAATCTTGTTAAATTTGCTATGTTTACTGAAAATTATGAATTTAATTCGCTTTATAAACACTTCAGTGATAACTACTAGTAGATTAGAAATACGGGTAAGAACTTTTTTTTTTTT--AACCACTGGAGTGACAAGAAAAGGCAGTATAAAGTCTTGGTCAGCTCAGCAAA-GTCAGGAAAGAAAATAAATCGAAAGCAAAATAAACAAGAAAAGACAAAAATAAAATATCAATCATAAGATCAAATGTACTAATCAGTACTACAAATGGTTTAATTCCATTACATCTCTCCCATAAGTGGTCTGTAGCTGGATTTGTATGAAGAAGTCAAATCCAACGATAAACTATTTATAACAACAAAAAAAAGAGATAGGGATATAAGTATCACATACAAGCACACAAA--AATAACAGAAGACTGAAAGTTTTAATATCAGACAAACTAATAAGTAAATGAACAACTGCCATGAACAGTTATATGGATATTTGCAAAATATGTGTCTATATATTAAGGCAAACCATACCAAATATACTCTCCAAATTTGATATAAAAATCCATCTAGTTAGCTGTACATAgtggcttatgcctgtaatcccagcactttaggaggctgaggtgggaggattgtttgagatcaggactttcagaccaatctaggcaacatagcaagactctgtttctacaaaacatagaagaaaatagctgggcatggtggtgcatacctaaaatcctaggtactcaggagg-------aggaggattgtttgagcccaggcagctgaggctggactgagccatggttgtgccactgcactccagccttggtgacagggcaagaccctatctcaaaaCATCTCACAGATGTTTGTACCCATCTGTGTATTTTAGCTTCTGAAAAATGATGATTCATTTTTAAATAGTTAAATAAAAATGTATTTCTCAAAATATATAAAGAAAAGAAAAGGAAATTTAGATAAAAACAGAGAGCCATGGTTCTTTTCTGGGCCATATTACATTCATACACACAGCAAATAAATCACGGAAGAGTGGATATATATA--AGAAAATTAGTGACAGTGTCCAGTTGCATTTCAGATGACAACAGCACACAATTATTAGCTTCATTCTTTCACATTGTAGCCATTACAAAACTCTTATGTTTAATTAAAGGACTGAAAACtttttaatcttctaaatggctgtaatgccaccactttgaagttttgttgtgctagttaaatggcacaatgtataaaaatgcctggcactgtgctttgcacatgctgagtgctcaataaCAGACGCCAATATTATTTTAAAGAGACCTTGCCCTATCTGAATTTTCCAAATAAGTGCTAATAAAGCTTTTGTTTATCACCTAGGCCCAGAGTAGAATTTTATACTCTTGATTCACAGTAAAACAGAATTT---AAATTTCATTTATAATTATCAAAACTTGTTAGGATGAGAAAAAGTAAAGCAGATATTATCCTATATAACTGGAATTTTCTTCTACAGTACCTTGGTATTCATTGAAAATAGTTGGATTTCAATAACAGGTATGAGTTGCCTCAATTTTTAAAAATTAACTAAAATTAACTATATGCAAGTTGTATGACTCACTTAGAAAACCAATGTTTGCTTTCTTAAATATGGCTCCTTGAGCCAATAGTAATTAGATCCCCCTTCCTTATGCCTATGAAATAACAAGAAATAAATCAATGGAGACAATCACTTGCCCTCACACCCTAACACATACCCTT--AGAGAGAGACCAGAGAAAAGTTAGTTTGGTTCTCATGAACAGAAGCAGATGGAAGTGGAAGGAGCCATGTTCACTAGATATAACATGATTGATGTTAAAAAAAAAAATCAGTAGAATGGAACTCTGATATCTAGCTCTACTATGCTCCCCCAAGAGATGATGAAGATCTGAGTCCAAAGCACCCAAGACCTGGTTCTCATGCAACCATTTAACACTGTGTCAGCTTTAAATTACATCTGTCCCAAGAATGGTCCTCAGACCCAGCAGTAGGGCCAGAGATGAATGGAAAcccacctacattgttgaggatgatcttcttttctcagtcaaccaatttaaatgctaatctctttcagacagcatcacagacacacccagaaatcacgttttaagttcaggggtacaaaca-agatttgtttcataagtaagcttgtgttgtgggggtttgttgtacagattattttatcacccaggaattaagcctagtacctaatagttatttttctgatcctcttcatcctcccaccctccaccctccaagaggcttcagtgtgtggtgttcccctctatgagtccacgtgttctcataatttagctcccacttataagtgagaacaggcagtatttggttttcagtttctgtattagtttgctaaagataatggcctccagctccatctgtatccctgaaaaggacatgatcttattcttttttatggctgcatagtatttcatggtgtatatgtaccacattttccttaccagtctatcattgatgggcatttgggttgattccatgtctttgctattatgaacagtactgcaatgaacatttgcatgtatgtgtctttataacagaatgatttatattcctctgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcgaatggtagttctggctttagatctttgaggaactgccacattttcttccacaatggctgaactactttacattcccaccaatagggtataagcacttctttttctccacaacctcactggcatttgttattttttgactttttaataatagtcattctgactggtgtgcaatgatatctcattgtggttttgattaatttttcttgaatgatcagggatattgagcttcttttcatatgctcgttggttgtcatgcattttctt s rheMac1.SCAFFOLD125516 18116 3290 - 48937 CAAGTCATTTATGAACAATGCCATGGCTCAGGAATACCGCTACACTTGCATCTTTCCTGAAAAAAATAGAGCCAAGTCAAGATAAAACAATCAATAAAAGGCACAGCATGGCTAATAAGCAGCATTGGTGAGTGAGCACTCAAACCAG-AAAACTTTTACTTGTTTAAACAAGTTTTATTTCCGTGGTTTTGaattttatttaaaaatataagtaaatgaattatatGACTAATAATGTAAAGAACCATTAGCAATACTTTGGAAGTAAATTCTGGATGTTTTCAACAAAATCCGAGAGCTAGGAAGAGCTCTGGGAGAAAATAATTTTATAATAAATGGGGTCTTCTTGGAACAGGAGTATTATAATTGAGCTTGTTAAATTTGCTATGTTTACTGAAAAttgtgaatttaattagctttataaacactttaatggtaactactagtagattagaaatatgggtcagaactttttttttttttaaaccactggagtgaaaagaaaaggcagtataaagtcttggtcaactcagcaaaagtcaggaaacaaaataaatcaaaagcaaaacaaacaagcaaagacaaaaataagataccaatcataagaacaaatgtactaatcagtactacaaatggtttaattccattaaatctctcccataagtgatttgtagctggatttgtatgaaaaagccaaatccaatgataaactatttataacaacaaaaaaa-gagatagggatataagtatcacacacacacacacacacaaataacagaaggctgaaagttttaatatcagacaaactaataagtaaataaacaactgcaatgaacagttatatggatagttgcaaaatatgtgtctatatattaaggcaaaCCATACGAAATATACTCTCCAAATTTGATATAAAAATCCATCTAGTAagctgtgcatagtggcttatgcctgtaatcccagcactttaggaggttgaggcaggaatat-gtttgagattaggactttgagaccagcctgggcaacatagcgagaccccgtctctacaaaaaatagaagaaaatagctgggcatggtggtgtatacctaaaatcctagctactcaggaggctgaggtaagaggattgtttgaacccaagaggtcgaggctggagtgagccatgattgtgccactgcactccatccttggtgacagggcaaggccctatctcaaaaCATCTCACAGATGTTTGTACCCATCTGGGTACTTTAGCTTCTGAAAAATGATGATTCATTTTTAAACAGTTAAATAAAAATGTATTTATTAACATATATAAAGAAAAGGAAAGCAAATTTAGATAAAAACAGAGAGCCATGGTTCTTTTCTGGGCCATATTACATTCATATACACAGAAAATAAATCACGGAAGAGCGGATATATATATAAGAAAATTAGTGACAGTGTCCAGTTGTATTTCAGATGACAACAGCACACAATTTTTAGCTTCATTCTTTCACATTGTAGCCATTACAAAACTCTTACATTTAATTAAAGGACTGAAAACttcttagtcttctaaatgactataatgccaccactttgaagttttgttatgctagttaaatagcataatgtataaaaatgcctggcactgtgctttgcacatgctgagtgctcagtaacagatgacaatcttattTTAAAGAGACCTTGTCCTATCTGAATTTTCCAAATAAGTGCTAATAAAGCTTTTGTTTATCACCTAG-CCCAGAATAGAATTT-ATACTCTTGATTCACAGTAAAACAGAATTTTCAAAATCTCATTTACAATTATCAACACTTGTTAGGATGAGAAAAAGTAAAGCAGATATTATCCTATATAACTGGAATTTTCTTCTGCAGTGCCTTGGTATTCATTGAAAATAGTTGGATTTCAATAATACGTATGAGTTGCCTCAATTTTTAAAAATTAACTAAAATTAACTATATGCAAGTGGTATGATTCACTTAGAAAACAAATGTTTGCTTTCTTAAATATGGCTCCTTGAGCCAATAGTTATTCGATCCCCCTTCCTTATGCCTATGAAATAAGAAGAAATAAATCAATGAAAGCAATCACTTGCCCCCACACCCTAACACATACCCTTAGAGAGAGAGACCACA--------AGTTTGGTTCCCATGAACAGAAGCAGGTGGAGGTGGAAGGAGCCATGTTCACTAGGTATAACATGATTGATGTT-AAAAAAAAAATCAGTAGAAGGGAACTCTGATATCTAGCTCTACTATGCTCCCCCGAGAGATGACAAAGATCTGAATCCAAAGCACCCAAGACATGGTTCTCATGCAACCATTTAACACTATGTCAGCTTTAAATTACATCTATCCCAAGAATGGTCCTCAGAGCCAGCAGtggggccagagatgaatggaagcccacctgcattgttgaggatgatcttcttttctcagtctaacaatttaaatgctaatctctttcagacagcatcacagacacacccacaaatcatgttttaagttcaggggtacagacgcaggtttgtttcataggtaagcttgtgctgcagggggttgttgtacagattattttatctcccaggaattaagcctactacctaatagttatttttctgatcctctttatccttccaccctccaccctccaagaggccccagtatgtggtgttcccctctatgagtcaatgtgttctcataatttagcttccacttataagtgagaacatgaagtatttggttttcagtttttgtgtcagtttgctaaagataatggcctccagctccatccatatccctgaaaaggacatgatcttattcttttttatggctgcatagtattccttggtgtatatgtaccacattttccttactagtctatcattgatgggcatttgggttgattccatgtctttgctattatgaacagtactgcaatgaacacttgcatgtatgcgtctttataatagaatgatttatattcctctgggtatatacccagtaatgggattgctgggtcgagtggtagctctgtctttaggtttttgaggaactgccacactgtcttccacaatggctgaactactttacacacccaccaagagtgtataagcacttctttttctacacaacttcactggcat---ttatttttttactttttaataatagtcattctgactggtatgcgatgatatctcattgtggttttgattactttttcttgaatgatcagtgatgttgagcttcttttcatatgtttgttggttgtcatgcattttctt a score=9237 s hg17.chr12_random 318147 254 + 466818 gagaaatgatttaaagatggaatttataatgaaaagtgaagactaatagaaaaatttggagaactctcagcctggccatataaagaataaaaaagcatgttcgagagagaataagaagggtttggccaagtggtcatttgctgaaaatattaatctggctagaaggaagccaagttctattcat-aagacaaagggagaatgacctggaagatatttccgagatcatGGAGTTAGGACCAGAAGTTACGCAAGTT s rheMac1.SCAFFOLD110386 28765 238 + 45362 gagaaataatttaaagattgaatgtatcactaaaagggaagcagagcagaaagatttagaaaattcacggcctgtcctggtaaagagtgaaaaggcgtcttcaggagagcaaaccaaggccatggccaagcaacaatttgctaaagagattagtaggactagaggaaaaccaggttccgtttattaaggcaaaggaaggatgatcgcagaggcatttcagagctctttaag-----------------ACAAGCA a score=4185 s hg17.chr12_random 318401 71 + 466818 AGGACCTTAAGGTCAAAGCTTCCAGAGAGGTGCCTGAAAGACCTCAGCATTCACTGCCCTGTGCTGCCTCA s rheMac1.SCAFFOLD125494 17203 71 - 118120 AGGGCCTTGAGGGCAAAATTTCCAGAGAGATGCTCTGGAGACTTCAGCATTTGCTGCCCAAGGCTGCTTCA a score=28214 s hg17.chr12_random 318472 664 + 466818 CAAAA--------------------------------------------------------------------ccagtctgggagatctataggcacaaaactccaacctgtgagagctgctcaggagtgaactgagacaagcaaagctgtggaggtgaggctgcctgggaaattgggggcccaatccctgacccagtgggtctagaaggtgggacatggagtca---aagattattctcaacccttaggatttaatatggtttgccctgctgggttttggacttacttaaggccaaatgcccctcttttcttgcctatttttccc---aggaatggaaatgtctttcatatgtctgtcccaccactgaatttcggaagtgggtaacttgttttgattccacaggctcatggctggag--aatttgcctcaggatgaattgtgccttgagtcttatccatatctgacttggatgagactctggagtttggatttttaagttggtgctagaatgagttacaatgtgggggctactggaagggaggaaatgaattttgcatgtgtgaaggacatacctttgggggcccaggggtgaaatgctatgatttgaatgtgtcccacaaagttcacttgttggagacctgga-------------ggtattgggaggtgggacctttaaaaggtg-ttaggtcgtgagggcattaccctcatggatggatccatgctgttatcacaggagtgggtttatca s rheMac1.SCAFFOLD125494 17475 742 - 118120 caaaacctagtggagctgcgggatcaggactgcctccaagaccctagaggtgtagagcaaccagcatgtaactccagcctgggagagcttcaagcatgagactccaacatgtgagagctgt---gacacggcctgcacccagcaaaaccataggggtggggcagcccaaggcctt-gggacccaaccaccaccccattgtgcccagatggagggacatggagtcaaggaagataattctggagctttaatacttaatgt-gttcttcctgttgagttttagacttatttggcattagttattcctttatttttgcctatttctcccttttggaatgggaacatctatcttacacctgggacaccattgtattttggaagcagattacttgttttgatttcgtaggcccatagctgtaggaaatctgcctcaagatgaatcatgccttgagtctcacccatatcttatttggatgagactttggag-------ttttgtgttggtgttggaaggagttaagatcttagagctattgggatggagtgaatgtgttttgcatgtgagaaggacataaattttgaaattcaggggtggaatgctatggtttgaatgtgtcccctaaagttcaagtgttgggaacttaagttcctagtgcactactgttgagagatgtaacctttaaaaggcgtttaggtcttgagggctctgccctcatgaatgaatgagtgtcattatcacaggagtaggctcatta a score=481431 s hg17.chr12_random 330810 5890 + 466818 gagaacagtttggaggttcctcaaaaattgaaaatagagctacaatatgatctagtaatcccactgctgggtatataccccaaataaaggaaattagaatgttgaagagaaatctgcatgccc-atgtttattgcagcactattcacaataggcaaaatttgcaagcaacctatgcctattaacaaatgaatagatatgcaaaatgtggtacttatacacaatggagtactattcagccataaaaagaataagatcctgttgtttgaaaaaacatggatggaactggaggtcattatgttaaacgaaataagccaggaacagaaagacaaactttccatgttctcacttatttatggaggctaaaaattaaaaagattgaatttttggagacagagagaagaacaatgggtaccagaggctgagaaggatagtgtggtggtgaaagcgtggatggttaatggtacaaaaatatagtgatatagaatgaaaaacgtctagtatttgacagcacaacagagtgactatagtcaatgataatttcttgtacattttaaaatgaaagagcataattggattgtttgtaacacaaagaaagaataaatgcttgaggtacaggataccctattttccatgagtataagcgtgcaatgtgtaatgtgaccattaagcattgcatgcttgtatcaaaatatcttatgtactccataaatatacacctactacatactcacaacaactaaaaaTTAAAAATTAAAATAATGAAAAACCTTTCAGTAGCCTCCCATTATTCTTATAAGAACCCACTGCCTTTGAAGTTCCCGTAAGAGTGAAAAACCTGCTTTGCCTCCTTTCATGAACTCAGCACTCACTGTGGTGTCTCAAAAAAGGCAGATGTTCTATATACACCTGTTGAAGAAGTGAATTGAGTTGGTGGTACCAAAGCTGCTTACAAAATGTAAGATATATGTATATGTAATACAGGAAGTGGCATGCAAAACACTTAATTTAATAGTCTCAGAAAAACTGTCCTTCTCCTCTTGTCATCTCTGTAGCCTCATTTATTCCTTGGCATGGGCTCTCTAGGATCACCAGCGATCTTTTTATGTGAATATCTTCCTAGCCTCAAGCAACTGGGTCTTCTCTCCAAGGAGCCCACAGAGTTTGGTGCTTATTTATTGAATAGCAGGCATTTAATAAATGTTCATTGTAGTTGATATTGATGGTTTCACATAATCATGGTTGTTAACTTGTCAAAGTCTTGTGCCATTTCCTTCTCATAAGCTGTAAGTATAAGAAGGGCACAGTGGGAAGAGCAGAGGCCCTGTAATGGTGGGTCCTA-GGGTTTGGGATGGTTGGGCAGGGTAGGCTTGGCTTTGGGAAGCCTTGAATGACAGACAAATGGTTTGGTTGGGATGGCCTGGGAGATTTGTAAGCAGAGAGGTAACACAGATGATAAGTCTGAAGGAATGGAAGGGGGATTGGAGGAGACAGACTCTGACGACCTCAAACCCCTTTCCTAACATCACTTTTTCTGAGCTTGTTCAGCACACACACCGCCAttcatttattc--------tttcaacagacactagaatgtaagccccaggatggcaggggctgtgtctgcttcatttaccagtggttttttggtgtctagtacaggggctgccacatgataggagctcaataaatattACTGCATCaacgtttattggatacctactatgtaccaacaaagtggtgggttctaggatgcaaaaattgaaaaaagactcagtctctgtattgagggagttaacataatattccttttcgcaagagggcaaggaaaaaggctgaatgcaaaaccagaatgtcaacagggtgctaacggagaccaatggaaggggcaactgactctccccagggaaggtaggcaaggAGATTGAGGGAAGTAGCAATGAAAGGAGAGCTTGCAAAATGAAGTCATCAGAGCTTTGCATAAGAAACAATTCATGGACCTTAGATCAAGTAGTGAGGATTAAAACTATGTCTATGTGAGGCTTTGGCTAGTTTTTCTACCTAAGACATCCTTACCTCTCCTTTCCACTTGGGAATCATCTTCCTTTCCTAACCATCATCATCAACCCTCAAGGCAGTCAGGGGCATCTGTGGCGCATTCCCCCAGCACTTGGCCCCACACAGCCAAGCTCTAACACCTACCCACCCCACTGCTATTTCCCTCTCATAAGCTTTAAGTTGT-GGGGGAGCAGGTTATTTTGTCTGACTCACATAGTTCCTGTGTGggggtacctacaaattttggaagcctgtggcttataaaactttggggctctatttaaggaaaggaatacaaaattttaaatataaaatttgatagaaaaatgaatatgtctttagaacaaaaacccaagtaaatgccaccttattgaaggctggcaaaatgccacaaattccaggtaaattatataatatttttattaataaattatctaatcaaccgctatagtaactgtttctgtatttttggtgtacact--gattatctcataatttttactttcattatcttcagagagaataaacagataatttattttttctataacatgattgaaatttgtttttttattattgataccatagatacgtaagacatattgcttcacacacaaatatactgaaatgtgtagttgtagaaccactaaagatttgtgccttacaaaca--ggaattctcatacattgatttcacacaattctccacagaaatggggaagaaaggatgtgtgtttttgctttattatcaagtatattcctgacaaggagagaaattctgttttgatcagggattagagagaactagacccCATATAACATGCTCTCCAAACTTCTTCTCAAGACCTTAAGAcctagtaactcaggagagtggacagcaggggtgttc-tggaatctcttcttacacctagacagccagcaaaacaactcttataaaagtcagtgcaaaagatgtcaatataaccactaactatacac-aaatgaattttcatcctatcttgttcttatctggatctcaaaggtgtctgtggccactggccatgaggagaagcatgatggagaggatgttaatgtgggaagagatggcagtcatacctaactgtggattaactatcttactttggcaaattaaaaaaaaaaa---gatgaaaatatgtaaccagacaaactcatttctagagttcctctaagagcctcagagcttatgtagatgtgaggctctaaagctttagttcattagctacatgatgaatctgcctctgCTGTCTCTGAGTAGGTGGTAAACACATACTGAATGAATGAATGGCAGAAATAAAATAAAAAGAGCATTGAACTTGGACTCAGATAGCctgtgtgactttgagcaagttacttaactactcagtttattttctcatttttaaaatggggttagcaatctataccttacagATAATGTATTTGAAAATACTCTGTAAATCAAAATGTAAAATACAAATAGAAAAATAGTTTTTAGAAAGATAACACATAATAGAAGTTCCCTAACTTAATATCTCAATGAGTCCCAGTTCCAGAGATATCTTCTCAATGATTAGACTGAAGAGCACAACTCAATAGATCTCTTTGTTCCTTCAAAAGCAGAGATGGAGctatctctgagaatggcattctctccatctacttagcagcctaagagtcatctttgacctgtttctcatgctggctcatatctaaactgactcctctttttaaaatttctaaatttttctcaaattcatcctattttcttcatctccaccctcagtaccactttagtccaaggcatcatggccatttctcacctggacaagtgcaatcacctattagctgctttcgataccctccattccactctccaccttgcagccagagtggtcttgtcaaaacgcacatctaatggagccacctctgattacacacttcaagggcactccacctctcaggataaagataaaagttccttgccatggttgacatggtctaccccaaggagctttccactcgcatcttcaaccaagttccccattgtttctgcaatatgacctttgctcatgctattccttctgcctggaaggttctGGAAGGTTCCAGGTTCTTCCCTTCCCTTTTCATCTAGATATTTCTACTTTGCTCTCTGAGATTGCAAAAACTTCCTAGGGAAAAGTTCTCACAGCATTATGTACATCTCCTTCATGACACTTGTTAAGATTACAAATTTGAATTTATTCCTGTGATTTGACTAATGTCtgtattagtctattctcatgctgctaataaagacatacccaagaccgggtaattaataaaggaaagaggtttaattgacccaccattctgcagggctgaggaggcctcaggaaactgacaatcatggtggaaggggaagcaaacacatcctttttcacatggtggcaggaaggaaaagtgccgagcaaaagagaaaaaagccttttataaaaccatcagatatcctgaaaactcatttattaccatgagaacagcagcatgggggcatgagaacgccccaatttgggtggtggcacagccaaaccatatAAATCTCCATTTGCTAAAAGAAACATAAACTCAGGAAGGCAGTTATAATCATAGAACCTAGAAAAGTGGCTCTCTTGCAGCAAAAGCTGAACAAATATTTTTAGATTGGGTGGGTGGATCTCATGTCTAGTCCCCCAAGTGTCTCCTTAGCCCTAGACCTCAGCCACCTTTTTCCC-TGGTGAGACAGACACAGAGGAATTAGCAAAAGAATTTATATCCACAATCAGGTCTGTGTCTTATCAGGAAACTGAGCACCCCATGGCCTGATGGACTGTGTACCTCAGAATATGTGCCTCCAAAATTTTTTATTAGATGAGTAGTGACTGCAGTCTCCAAAACTCATGCTTTCAAATGGTCAAACCTACCAAGTCCCTGCAAGGGTCAGGGGTCTCTAAGTGGATAGGGGTGTTTAGACCACGCCCCTTCCACTAAACATTTTGCTTCCCTTGAGAACCAGAGGGAAAAGATAATGGGGACTTTCTCCAGCCCTGACATCACCATACCTGATATTTTGCTTTCTATCCCAGAAGACTACAATATCTCAGACTTCTCATCCACACAATGAGAATACTAAAAACCTATcagtcaacagtaatttattgtacatttaaaaataactaaaagtataattggattgtttgtaacacaaagaaaggataaatgcttgaggtgacagataccccatttaccctgatgtgattatgactcattgtatgattgtatcaaaatatctcatgtaccccacaaatatatacaactactatgtacccacatatattaaaCattaaaaaattttaaaataaaaGCGTATCTCATTGGACTGTAGAAAGTATCAAGTGAGATAACCT--TTCCGATGTGCCTGGTACTGAATAACTAAGTGCTGAATTAATTTTTGTTTCTCTCTCTTTCCAGAAGGAATGAAATAGAAAGAATAAAGCTGAAGGACATTTCATTTATGTTCAACTAGAAATCCAATATAGTTTTAGGCAAACTATATTTTCCCTTGCAACTGTACTCCCTTACATACATGTAAGTGGGAAAGAATAAATGTGACAAACAAAATATCACTCCTGATTCCACAATCTAAACAAAACACTGCCTCTTTCTAGGttt-tgttttttggtttttgtttgtttgttttttgGCATAGGGTTGGGGTGTATGCTTCTTGACGTACCTACATAATGAGGAATACAAGGCTTTGTATCTTTTATCAGTAATTATTCATAGCTTAATTGTGTAAATTGTAAAATATCACACTTTTATAATCTT s rheMac1.SCAFFOLD65323 13089 5868 + 89934 gagaacagtttggaggttcctcaaaaattgaaaatagagcaacaatatgatctagcaatcccactgctgggtatataccccaaataaacgaagttactatattgaagagaaatattcatgccccatgtttattgcagcattattcataataggcaaattttgcaagaaacctgtgcctattaacaaacgaatagatatgcaaaatgtggtacgtatacaca-tggagtactattcagccataacaagaatgagatcctgttgtttgaaataacatggatggaactggaggtcattatgttaagtgaaataagccaggcacagaaagacaaactttgcatgttctcacttatttatggaggctgaaaatttaaacaattgaatatttggagacagagaattgaacaatgagtaccagaggctgggaaggatagtgttgtggtgaaagggtagatggttaatggtacaaaaatataatgatatagaatgaaaaacttctagtatttgacagcacatcagggtgactacagtcaatgataatttcttgtacattttaaaataaaaaagcataattggattgtttgtaacacaaagaaagaataaacggttgagggacaggataccctattttccatgagtataagcatgcaatgtgtaatgtgactattaagcactgcatgcttgtatgaaaatatctcatgtactccataaatacacacctactacatactcacaa-------aaattaaaaaTTAAAATAATGAAAAA----------GCCTCCCATTGTTCTTATAAGAAcccactgtctttgaagttcc-ataagagtgaaaaacctgctttgccgcctttcatgaactcagcactcatcatggtgtctcgaacaaggcagatgttccatatatacttgttgaagaagtgaatTGAGTTGGTGGAACTAAAGCTGCTTACATAATGTAAGATATATGTATATGTAATACAGGAAGTGGCATGCAAAACACTTAATGTAATGGTCTCAGAAAAACTGTCCTTCTCCTGTTGTCATCTCTGTAGCCTCATTTGTCCCTTGGCATGGGCTCTCTAGGATCACCAGCGATCTTGTCATGTGAATATCTTCCTAGCCTCGAGCAATTGGGTCTTCTCTCCAAGGAGCCCACAGAGTCTGGTGCTTATTTACTGAAGAGCAGGCATTTAATAAATGTTCATTGTAGTTGATATTGATGGTATCATATAATCATGGTTGTTAACTTGCCAAAGTCTAGTGCCATTTCCTTCTCATAAGTTGTAAGTATAAGAACTGCACAGTGGGAAGAGCAGAGGCTCTGTACTGTTGGGTCCTAAGGGTTTGGGATAGTTGAGCAGGGTGGGCTTGACTTTGGGAAGCCTTGAATGACAGACAAATGGTTTGGTTGGGATGGCCTGGGAGGTTTTTAAGCAGAGAGGTAACACGGATGATAAGTCTGAAACAATGGAAGAGGGATTGGAGGAGACAGACTCTGACTGCCTCACACCTCTTTCCTGACATCACTTTTTCTGAGCTTGTTCAGCACACACACCACCattcatttattcatttattctttcaacacagactagaatgtaagccccaggatggcaggggctgtgtctgcttcatttaccagtggttttttggtgtctagtacaggggctgccacatgataggagctcaataaatattACTGCATCaacatttattggatacctactatgtaccaacaaagtggtgggttctaggatgcaaaaattgaaaaaagacttagtttctgtattgagggagttaacataatattcctttttgcaagagggcaaggaacaaggctgaatgcaaaaccagaatatcaacagggtgctgacccagaacaatgcaaggggcaactgactctccccagggaaggtaggcaaggAGATTGAGAGAAGTAGCAATGAAAGGAGAGCTCCCAAAATGAAGTCATCAGAGCTTTGCGTAAGAAACAATTCATGGACCTTAGATCAAGTAGTGAGGATTAAAGCTCTGTCTATGTGAGGTTTTGGCTAGTCTTTCTACCTAAGACATCCTTACCTCTCCTTTCTGCTTGGGAATCATCTTCCTTTCCTAATCATCACCATCAACCCTCGAGGCAGTCAGGGGCATCTGTGGTGCTTTCCCATGGTACTTGGCCCCACACAGCCAAGCTCTAACACCTACCCACCCCACTGCCATTTCCCTCTCATAAGCTTTAAGTTGTTGGGGGAGAAGGATATTTTGTTTGATTCACATAGTTCCTGTGTGggagtacatccaaattttggaagcctgtggctaataaaactttggggctctatttaaggaaaggaatacaaaattttaaatataaaatttgatagaaaaataaatatgtctttagaacaaaaacccaaggaaattccacattactgaaggctggcaaaatgccacaaattccaggtaaattatataatatttttatttaaaaattattgaatcaacctctgtagtaattgtttctatatttttggtgtacactctgattatctcgtaatttttactctcattatcttcagagagaataaaaa----atttattttttctataacatgattgaactttgtttttttattattgatactatagatacctaagacatatcacttcacaca--aatatactgaaatgtgtagttgtagaactactatagatttgtgccttacaaacacaggaattattgtaaattgatttcacacaattctcaacagaaatggggaagaaaaggtgtgtgtttttgctttactatcaagtatattcctgacaaggagagaaattctgttttgatcagggattagagagaactagacccCATATTACATGCTCTCCAAACTTCTTCTCAAGACCTTAAGAcccagtaactcagcatagtggacagcaggggcattcctggaatttcttcttacacttag----ccaggaaaacaactcttataaaagtaggtgtaaaagatgtcaatataaccacta----tacactacattaattttcatcctaccctgttcttatctggatctcaaagatgtctgtggccactggccatgaggagaagcatgatggagaggatgttaatgtgggaagagatggcagtcatacctgactgtggtttaactatcctactttggcaaatcaaaaaaaaaaaaaagatgaaaatatgtaaccagacgaactcatttctaggattcctctaagagcctcagagcttatgtagatgtgaggctctaaagctttagttcattagctccatgatgaatctgcctctgCTGCCTGTGAGTAGGTGGTAAACACGTACTGAATGAATGAATGGCAGAAATAAAATAAA--GAGCATTGAATATGGATTCAGAtagccagtgtgactttgaacaagttacttaactactcactttatttcctcattttcaaaatggggatagcaatctataacttacagATAATGTATTTGAAAATACTCTGTAAATCAAAATGTAAAATACAAATAGAAAAATAGTTTGTAGAAA--CAACACATAATAGAAGGTCTCCTACTTAATATCTCAATGAGTCCCAGGTCCACAGGGATCTTCTCAATGGTTAGATTGAAGATCACAACTCAATGGATCTCTTTGTTCCTTCAAAATTAGAAATGGAGctatctctgagaatggcattccctccatccacttagcagactaggagtcatctttgacctgtttctcatgctggctcatatctaaactgactcctcttt--aaaatttctaaatttttctcaaatccatcctattttcttcatcttcaccctcagtatcactttattccaaggcatcatggccatttctcacctggacaagtgcaatcacctattaacagcctttgatcccctccattccactctccgccttgcaaccagagtggtcttgtaaaaatgcacagatcatggagccacctctgattacacacttcaagggcactccaactctcaggataaagatagaagttccttgccatggttgacatggtctaccccaaggagctttccactcacatcttcaaccaagttccccattgtttctacaccatgacctttgctcatgctattccctctgcctggaaggttctGGAAGGTTCCAGGTTCTTCCCTTCCCTGTTCATCTAGATATTTCAACTTTGCTCTCTGAGATTGTGAAAACTTCCTAGGGAAAAGTTCTCAGAGTATTATGTACATCTCCTTCGTGGTTCTTGTTAAGATTACAAATTTGAATTTATTCCTGTGATTTGACTAATGTCtgtattagtctgttctcatgctgctaataaagacatacccaagaccgggtaatttatataggaaagaggtttaattgacccatagttcttcagggctgaggaggcctcaggaaactgacaatcatggtggaaggggaggcaaacacatccttcttcacatggtggcaggaaggaaaaatgcctagcaaaagagaaaaaatccctt-ataaaaccatcagatatcctgaaaactcatttattaccatgagaacagaagcatgggggcatgagaacgccccaatTTGGGTGGTGGCACAGCCAAACCGTATCAATCTCCATTTCCTACAAGAAGCACAAACTTAGGAAGGCAgttgtaaccatgaaacctagaacagtggctctcttgcagcaaaagctgaataaatacttttagattggatggatgaatCTCATATCTAGTCCTCCAAGTGTCTCCTTAGCCTTAGAGCTCAGCCAGCTTTTTCCCCTGGTGAGACAGACACAGAGGAATTAGAGAAAGAATTCATATCCATGATCAGGTCTGTGTGTTATCAGGAAACTGAGCACCATATGGCCTGATGGACTGTGTACCTCAGAATATGTGCCTCCAAATTTTTTTATTAGATGAGTAATGACTGCAGTCACCAAAACTTAAGCTTTCAAATGGTCGAACCTACCAAGTCCCTGCAAGGGTCAGGGGTCTCTAAGTGGACAGGGGTGTTTAGACCACACCCCTTCCACTAAACATTTTGCTTCCCTTGAGAACCAGAGGGAAAAGATAATGGGGACTTTCTTCAGCCGTGACATCACCATACCTGATATTTTCCTTTCTATCCCAGAAGAGTACAATATCTCAGATTCCTCATCCACATAATGAGAATACTAAAAACCTATcagtcaacagtaatttattgtacatttaaaaataactaaaagtataattggattgtt-gtaacacaaagaaaggataaatgcttgaggtgacagataccccatctatcctgatgtgattatgacacattgtatgattgtatcaaaatatctcatgtaccccacaaacatataaaactactatgtacccgcaaatattaaaCattaaaaaaatttaaaataaaaGCCTATCTCATTGGACTGTAGAAAGTATCAAGTGAGATAACCTGGTTCCAATGTACCTGGTACTGAGTAACTAAGTGCTGAATTAATTTTT-TTTCTCTCTCTTCCCAGGAGGAATGAAATAGAAAAAATAAAGCTGAAGGATATTTCATTCATGTTCAACTAGAAATCCAATATAGTTTTAGGCAAACTATACTTTCCCTTGCAACTGTACTTCCTTACGTACATGTAAGTGGGAAAGAATAAATGTGACAAACAAAATATCACTCCTGATTTCACAATCTAAACAAAACACTGCCTCTTTCTAGGTTTATGTTTTTTGTTTTTTGTTTGTTT----TTTGGCATAAGGTTGGGGTGTATGCTTCTTGACGTATCTACATAATGAGGAATACAAATCTTTATATCTTTTATCAGTAACTATTCATAGTTTAATTGTGTAAATTTTAAAATATCACACTTTTATAATCTT a score=78535 s hg17.chr12_random 336807 952 + 466818 GAACATACTTGTGCATATTTTT-CTACATTTCTGATTATACTAGTAAGCattgaacacataatgtgcatcaggcaccatgcttagtcctgaggatttagaaatactgatatttgatctctgtcctgagagttcttagtccaggagaggagacagaagagtggaaacaaaatcacaaga-gagtgtgtgagtttgcagagaaaactgccaggcagtatctgggccaaggaaggatgcccacctctgactaggagcaatgagtcagaaaaAAAAAAAAAAAAAAACTTTTTTGAAGATGTAGTGTATGAATTGACCTGGTGAGTGTTGATCCTTACTCCTAAGCCTTCCATTTTGGCAGCCTCCCCTAGCTTTCACCTTGAATTTTTCTTCAGACCAAGCATACCCTGATAACTTTGGATTTGATGTCCCTTTCTCTGTTATCAATGGCTGAGCCTTCTCTGCCCCTAAGTGTCTTCTATTCCTAATGACATTGTTGCTCTGTCCTCTGAGCCATCAGACTTCAATCCAGTCCTATTTGTGACTTTGCTACCATAGTAATAGTcagtggggttgcggtaaatgtttagcaacccacccacccaaacaaacagtgcttgctaattatcatggtgtaaagactcactctatgactgacttcaagctaccaacatcatgtcactgaacacagaattgggaagagaggtacagtagcatattatgtcatatttctaccacatagatacaatggacataaaataacattaaaagcataggtagtaataaaatgcagtaaagtaattagaagtaatcttcttggagtatttattacctttgtttttaatataattgattcaatcacaaatttacataattttgtttttaattgtggttctgtttagaaatatgctcacaaaattattgaTAAGTTCTTGAAAAATAGTCTCTGGAATGTCTA s rheMac1.SCAFFOLD65323 18957 945 + 89934 GAACATACTTGTGCATATTTTTTCTACATTTCTGATTATACTAGTaagcatttaacacataatgtgaaccagtcaccatgcttagtcctgagaatttagaaatacaaatatttgatctctgtcctgagagttcttagtccaggagaggagacagaagagtggaaacaaaatcacaagaagaatgtgtgagtttacagagaaaactgccaggcactgtctgagtcaaggaagggtgccCACCTCTGACTAGGAGTAATGAGTCAGAAAAAAAAAAA--------TGTTTTTGAAGATGTACTGTACGAATTGACCAGGTGAGTATTGATCCTTACTCCTAAGCCTTCCATTTTGGCAGCTTCCCCTAGCTTTCACCTTGAATTTTTCTTCAGACCAAGTACACCCTGATAACCTTGGATTTGATGTCCCTTTCTCTGTTATCAATGGCTGAGCCTGCTCTGCCCCTAAGTGTCTTCTATTCCTAATCATATTGTTGCTCTGTCCTCTGAGCCATCAGACTTCAATCCAGTCCTATTTGTGACTTTGCTACCATAGTAATAGTCAGTGGGGTTTCGGTAAAGGTTTAGCAACCC-CCCACCCGAACAAACAGTCtttgctaattttcatgatgtaaagactaactctatgactgacttcaagttaccaacatcatgtcactgaacacagaattgggaagagacgtgcagtagcgtattatgtcatatttctaccacatagatacaatggacataaaataatgttaaaagcatagatactaataaaatgcagtaaaataattagaagtaatcttcttggagtatttattacctttgtttttaatataactgatttaatcacaaatttacataatttagttttaaattgtggttctgtttagaaatatgctcacaaaattattgaTTAGTTCTTGAAAAATAGTCTCTGGAGCATCTA a score=109378 s hg17.chr12_random 337847 1418 + 466818 ACTTTTAGCTCACAACTGGCTATGAACCAGTtacatgaatttgtcgtgcctacttctccagactcagcttacacctctctccttttcactctctttacccgcccccccaacaactggcttatgtatgctcctcagaaaa-gtcccatttactcatatattagagattttgtatagatgtttcctctaccagaaatcccttcccctagctctttgcatttggagcctttccataattcagttctcagctcaaacattaccttgttgaatagatcttccctcagcacccgacttaaaccagtatcccccatatagtctcttacctctttttaaaactcagtgtcttcttggtcactgtaagtactgagtttatcttgccttttttgtctatttatttaatgttcctgtttcctaataggatgtgaaattactttgagtag--------actctcctgtttatcataaacagtgcctggcacttagtacatcttcaacaaacgtttgttgaataaatgTGTGCATGAATGACAGCACCTCAGTGATCTCACTCTGATGTTGCCGAGAAGGGATGCTCATGCAATGACTTCAGAGTCTTGAGATCATACATATAATGTATATTATATATATATTGGTTTGTACTTAAACTTGGATCAAATGCACTTGATTTACTAACTGACTTTATTATGACTCAATGTAAAGTCTAAATTCTGCTAAGAATTCCTGGAATAGCCTGCCTGAAATCTTATTTTAATGAAAACCATGACTTCATACCTTAATTGCATTGGGTTTATGTGGGCTTTGGCTGATCTTTAGATTTCTGGGTTGTCTGTGAGGGAAAAGTTAGACTAAAACGAAGGATGCCATTGAAACAAGGTTCTGAAGAAGTTCGTGAGTCATGCTGACTTATTAGGAAGTCTCCTTTGTGTCTGCAATGAGACGTTGCATTTTTCTCTGAAGTCTGATGAAGAAAGAACAGTTTTAGGACAAGTAAATCCATCTTAAATATCAATCCGTGTCTCTTAGATTgttgtgattagatttgattgtgagtgacagaaacg-tcaaaaaaatgagtttaaagaaagtagaagttaatttttctcatcaaattctaagtcagcagtctaaggctgctgaagtgatgctttatgatatcaataaccacaaatgcttcttctgtcttgaacctttcctcctttgctctgaaaaacatgtctccattcctaaatttaccttataatgtttttatggctgctcctgctccagtcagcatatctgcattccatcctgcaagaaggagaaaataaaaggagaagggtgtgcctgctctatggacactacttagggattgcgcagactacttctgcttgcgtTGGTTTGGGGCCGGCGTTAGACctggcggggcggtcgggcggtggggagggcgg s rheMac1.SCAFFOLD65323 19952 1415 + 89934 ACTTTTAGCTCACAACTGGCTATGAACCAGTGacatgaatttgtcctgcctacttctccagaatcagtttatatctctctccttttcactctctttaccc----ccaccacaactggcttatgtatgctactcaaaaaaagtcccatttactcatacattagagattttgtataggtgtttcctctaccagaaatcccttcccccagctctttgcatttggagcctttctatcactcagttctcagctcaaatatcatcttgttgaatagattttccctcagcacccaacttaaaccagtatcccc-atatagtctcttacctctttttaaaactcaatgtcttcttggtcactgtaagtattgagtttatcttgtcttttgtgactatttgtttaatgttcatgtttcctaataggatgtgaaatcactttgagtagtaaccttgactgtcctgttcatcacaaacagggtctggcacttagtacatcttcaacaaacatttgttgaataaatgTGTGCATGAATGACAGCAC-TCAGTGATCTCACTCTGATGTTGCCGAGAAGGGATGATAATGCAATGGCTTCAGAGTCTTGAGATCATACATATAATGTATATTATATATATATTGATTTGTACTTAAACTTTGATCAAATGCACTTGATTTACTAATTGACTTTATTATGACTCAACGTAAAGGCTAAATTCTGCTAAGAATTCCTGGAATAGCCTGCCTGAAATCTTATTTTAATGAAAACCCTGACTTCATACCTTGATTGCATTGGATTTATGTGGGCTTTGGCTGCTCTTTAGATTTCTGGGTTGTCTGTGAGGGAAAAGTTAGACTAAAAAGAAGGATGCCATGGAAACAAGGTTCTGAAGAAGTTCGTGAGCCATGCTGACTTTTTAGGAAGTTCCCTTAGTGTTTGCAATGAGACATTGCATTTTTCTCTGAAGTCTGATGAAGAAAGAATAGTTTTAGGACAAGTAAATCCATCTTAAATATCATTCCATGTCTCTTAGATTgttgggattatatttggttgtgagtgacagaaactctaaaaaaaaagagtttaaacaaagtagaagttaatttttctcataaaattctaagtcagcagtctaaggctgctgaagtgatgctttatggtatcaataaccactaatgcatcttctatcttgaacctttcctcctttgccctgaaaaacatggctccattcctaaatttaccttataat-tcagtatggctgctcctgctccagtcagcattt-----ttccagcctgcaagaaggagaaaatggaaagagaagggtatgcctcctctatgggcaatacttaggcattgcacagactacttctccttgcatttcttt-tgtcaaatattagacctggagttacactcagctgaaagaaaggctgg a score=20509 s hg17.chr12_random 339896 252 + 466818 GGGGATAAAACAAAACAAGGTTTTAACAGCCTCAGTCTGCAGTGCAGCTCTGAGTAAGGCTCAGTCCAGAGCAAAGATTGCCTGTTTGAGGAGCCACACATTAGGTAGAGAGGCCCAGCTCCAGAGCCTTCATTGGCCACAGCCTCAGTGAGAACACTACTGCAGTGGATCTCTTTTTTGTAGCAGCTGGAGGCTGTCAGCTAACTACACTCCTCACAGCAGGTTCTGTTTTGCAGGGAGATCAAACCATCA s rheMac1.SCAFFOLD80370 400 252 - 91160 ggggataaaacaaaacaaggttgaaacagcttcagtctgcagtgcagctctgagtaaggctcagtccagAGCAAAGATTGCCTGTTTGAGGAGCCCCACATTAGGTAGAGAGGCCCAGCTTCAGAGCCTTCGTTGGCCGCAGTCTCAGTGAGAATACTACTACAGTGGATCTCGGAGGTGTAGCAGCTGGAGGCTGTCAGCTAACTACACTCCTCACAGCAGGTTCTCTTTTGCAGGGAGATCTCAGCACCA a score=151993 s hg17.chr12_random 340155 1864 + 466818 tctgatggctttataaggggaaatcccttttgcttgactctcattttctctcttgtctgctaccatgtaagatgcgtctttgccttctgccagtagtgtgaggcctcccgagccactggaactgtaagtccattaaacctctttttctttataaattacccagtcttgggtatgactttatcagctgtgtgagaacggactaatacagcaaggtatttattgtcatctctattttacagatatggaaaacagggcttacaaatgataaatgacttttccaaagtcatacaactagtaagtgctggagttagaccccaaacccagactcactgactccaaatgctgcgctttttTTCTCTTCCTTCACCAGGGGATGCCCTGGGTTTTACCTCCATGCTTCCTGCTGCTATTTACAGAATGTATTCATTCACCCAACAAAATTCacagctgtggacaaaa---acccaaatccctacccctatggagcctacattctagcaggagacacagatgatacacaaaattaagtaaaaagatactgtatgtttgatggtggtaagtgctctagagaaaaataaagctaaaaagaatttgataggaccagggaagttgcaactttaaatcaggtggattgttgaggcttcactgaaggtggcatttgagcaaagacctgaaggagatgagggaataaattctgctatcatccgcatatcaggcagagggagtggtaagtaaccctgagccggaagcttttcttgcttgttcaaggaataacacagcagctaatgggtctggggctgggtaggcaaagagtgaggtaataagagaagagggccatgggcaatgggaggtcacacaaaaccaggctattacaaggatttttctgagtgaaatggaagtttgtgaagggttttgagtaaagtatattatcatctgacatatcaaaacgacagctctggatgtcatgctgaaaatagactgaacaatgggtccagcacagaagcagagacaatcatttaggaggcagataataaaaataactaataaaataaaaataggccaaagattatattggcttaggctagggaggtagtgagaaatggtcagaAGGAGGAGAAATCAGGCTGGCTCTGCTCCTGTTTCAGCCTGTTTGCCTTGCAGGTTGCCAAGTACCTTGGAGATGTCAAGTAGGAAAAAGCCCTCCAAGGAAAATGATCCTAGGATTGGCATGCAgccatgggagcgtggtgctcagatctccctgcaaaacagaacctgcagcgaggagtgtagttagctgacagcctccagctgctgcacctccgagatccactgcagtagtgttctcactgaggctgtggccaatgaaggctctggagctgggcctctctacctaatgtgtggctcctcaaacaggcaatctttgctctgggctgagccttactcagagctgcactgcagactgaggctgtttcaaccttgttttgttttatcccctctctccctcccttcacagacatcacacttgcattgtgatcagaaggtcttccaacccatttagctttatccttcataggtgcttccccccagtaaatctcttgcactttgaattccattttggtatctgcttctcaaaggacaaaacctgacacaCTTGGCCTCTCTCATCAGCCTTAAGCTTAGTAGTTCTGTTTTTCTCTCTGCTGAGGTTCTTGGGACCTCGACTAGCATGCCCAATTGTTCTCTCTAGTCAACAGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-----------------------aTTA-----AGTAGTAACaataataataaatacagctatacaggggctcttactatgtgacaaaaattattctaaatatatctctttaatcttt s rheMac1.SCAFFOLD80370 89274 1884 + 91160 tctgatggttttataaggggaaatcccttttgcttgactctcattttctcccttgtctgccactatgtaagatgtgtctttgccttctgctagtagtgtgaggcttccccagccactggaactgtgagtctattaaacct--ttttctttataaattacccagtcctaggtatgactttatcagcagtgtgagaacggactaatacaACATggtatttattattatctctgttttacagatatggaaaacagggcttacaaatgataaatgacttttccaaagtcatacaactagtaagtgctggagttacacctcaaacctgggctcactgactccaaatgctgtgctttttcTCTCTTCTTTCACCAGGGGAAGTCCTGAGTTTTACCTACATGCTTCCTGCTGCTATTTACAGAATGTATTCATTCATCCAACAAAATTCacagctatggacaaaacaagcccaaatccctacccct---gagggtacattc-agcaggagacacagaaaatacacaaaat-aagtaaaaagatactgtatatttcatggtggtaagtgctctagacagaaataaacctagaaaagatttgataggaacagggaagttgcaactttaaatcaggtagattgtggaggcttcactgaagttggcatttgagcaaagacatgaaggaggtaagggaataaat-ctgctattatctgcatatcaggcagagggagtggtaagtaaccctgagctgggagcttttcttgcttgtttaaggaataacacagctgctaatggggctggggctgggtgggcaaggaatgaggtaataagaacctc---ccatgggtaatgggaggtcacacagaaccaggacattacaagaatttttctgagtgaaatggaagtttgtgaagggttttgagtaaaggatattatcatctgacatatcaaaatgatagctctggaggtcatgctgaaaatagactgaacaatgggtccagcacacaagcagagacaatcatttaggagccaaataataaaaataactaataaaataaatataggccaaagattatattggcttaggctagggaggtagtgagaaatggtcagaAAGAGGAGAAATCAGGCTGGCTCTGCTCCTGTTTCTGCCTGTTTGCCTTGCAGGTTGCCAAGTACCTTGGAGATGTTGAGTGAGAAAAAGCCCTCCCACGAAAATGATCCTAGGAGTGGCATGCAGCCATGGGAGCGTGGTGCTGAGATCTCCCTGCAAAAGAGAACCTGCTGTGAGGAGTGTAGTTAGCTGACAGCCTCCAGCTGCTACACCTCCGAGATCCACTGTAGTAGTATTCTCACTGAGACTGCGGCCAACGAAGGCTCTGAAGCTGGGCCTCTCTACCTAATGTGGGGCTCCTCAAACAGGCAATCTTTGCTctggactgagccttactcagagctgcactgcagactgaagctgtttcaaccttgttttgttttatcccctctctccctcacttcacaaacatcacacttgcattgtggtcagaaggtcttcccacccatttagctttattcttcatatgtgcttccccctagtaaatctcttgcactttgaattccattttggtatctgcttctcaaagggcaaaaactgacacaCTTGGCCTCTCTCATCAGCCTTAAACTTAGTAGTTCTGTTTTTCTCTCTGCTGAGGCTCTTGGGACCTCAACTGGCACACCCAATTGTTCCCTCTAGTCAACAGCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaagaaaagaaaagaaaaaGATTATAATTAATAGTAACAATAATAATAAATGCAGCTATACAGGGGCTCTTACTATGTGACAAAAATTATTCTAAATATATCTCTTTAATCTTT a score=992828 s hg17.chr12_random 342173 12246 + 466818 atctcttgagacttattcactaccaggagaacagtatgggggaaaattcccccatgattcgattatctcccattgggtccttcccacaacatgtggaaattatgggagctacaatttaagatgagatttgggtggggacacagccaaac-atgtcaCTTGCTAATTGTGAAAACTAATGAATATAAGAAGACAGACAGCACAGATGTTTTTGTTGTGGTTTCCATGGCTTGACAAGCAGTGACATGTTGAATTCCCCACACTAAGATATTGAAGTCATTGACAATTCCTCCGGTGACATTTTATAGCTTTGGGTTTGTTATTATTAACCAAAGGCTTTGCCTaatcctagctgctctgcactcattcactctgtaacctgaagcaagtatctggacctcagtctctccatttgtaaaaaagagatgattgtatcctctatgcctaacttgcagggatgaggattaaatgaaaCTCAGTGGGTGAGATCCACTAGAAACTACTACACAAATGCAAATGATTCCTGGGTTGGTGACATGGCTTCACGTGTCTGAGTCTGATGTCCCCAGCTGGAGTAAAAGAACCTCAGGACGAGTCATGACTAATACTGTTTCTACGCCCTCATCCCTCACAAGCCAGTTTCTTCAACTCAACCCTACTGCAGGCTCTCTTTT-ATTGCCAGTT---TGTTTGCGAAGAACAGATTTTCTGTATACTTTGAATTCCTTAAGCATTTCTTTTAATCATTTTTTCTTAATCTGTTAACTCTGCCCTGATCTTTTAGGCTAATATATTCATGTTTGAGCTACCTCCTGAAATAGCTTTTAAGTGGATGTATTATGAAAGACTGACTAGTCAAAATGAAGGAAAATATTTCCTGAACTGACATTATCTCAACTTAGGATTTCATGTTAGGCTCTGATTTAACACACATAGCTATCGTAAGTAATGTGCTTTTCAGTTCCTTTATTTAAAAGCTCTACAGTTTTATGGCTCTGTTTAACTCTTGAGTGCTTTTACCTCTTTTGAGAAAGGCTATTCCTCCTGCCATTTCAGCTTGCTGTCCCAAATGGACGTGTAAACAGGGCACCATCATGTATATGTGAAAAAAGATGACCTACATATATGATGGTACAGTACAGTATTAAAAGTACAATTTCAGCCATTTCTTCCAATTAAGGCTAACACGTCTGTGATTTCAGCCTTCTATTTGAAATAAAAGTCTAACGATAATTGGAGCACAGAGCTATTCACCAGTGTACTTCAATCTGGAAATAATTGTCTTTGTTCAATTAGGAATCTGCATTTTCATGCCAATCTTCACAGATTATTTTGAATGGAGAATGCACTCTGATTAAGAGCTATACTTCTTAGGAAAAAAAAA------GTAGCAGCCTGGAGTCCTCATCCCCTTGTTAGATTTAACATTTTGTTTTTCCCTAACAGACTGAGAAGGATGTCATATAGACAACTTTTTAAACTTATTTATTCAATGTGGCAAAATTCTCCTGGGGCATTCATATGTGGCTTTATTTTTTTTTAATTCCATAAAGGTGATTCTTTAAATTTAGTCTTGGAAAAGTGTCAATTGGTCTGAGGTCTTCGATTAATTTGTCATGTGAAATTGACCAGGTTTTATATGGAGCAAATATGACCACTATATTTTTGAAATCAGTAGAACCACTTATCTCCCTCAGTGATctttaaacaagttatcttatgtaagtcttatgaaaaaccttcagaattagagattgttatccctattcaacagacaaggacaataaaggtcaaagagtttatgtgattttcccaaagccacccaacgattcatgggtgaaactagagtcaactgcaagtctcactggcttgaaagcccaggttctctcATGCTTCTAGTACCTTTTTCTTATTAATTTAATATAGCCAAAGTAAAATGATGAAGGGCATTCTTGTTAAAAATGACAAAATGCTATAGCTAGAGCTATGAAAAATGCCAGCTCAACATACATCTTTGCTACAAACCACCTCCTC-AATAATTCTGAAAAAAAAAAATGCCTGTGTTTAGCATTTCTTGTTGAAAAATGGCCTACAAATTATGGAAACATATTAACACAATGTCAACTTCCTTAAATAATATAAGGTACTATCCACATCAATATATGACTTAATCATTTTTTCAAAATAAATTCCTTTAGAAACAAGGCCATATCTTCTCCATTTTTGTATGCCTTCAATCAAATGCTGTTATTAGTTGAGAAAATGAAGGACTCATTCTCTTAATATCCCCAAGAGGCAGTTAGAATATACAGAATCTATGTATTACTTACATATCATCTGTGTGTGTATACATTAACATATACACACAAGTAAAAAATCCCATCAGTGCAATAAATAAAACTCTGGTCACACCTTTCATTATTCCTTTCAGAAACATTATACAGCATTGTTAATCTCAACCTTTGATGAAACGCAATTCCTTCTTTTTAATAATACTCTGGTAAACCTACACATGAGAGTTTTCCTATTCTTCTCTGTCTTTGAATGTACCATTTCATAATGCCAACAAGAAGAAAAGACTTATTTAAGAACCTGGATGGAAAGTGATAGCTAACCCAACTTTTCTTATTTAAAATATAGAG--AGTATTTGAGAGATTTGGGGTCAAATGGGACTTGTAAGCAAAGGTGGCAATAACTTCTACATCTCGTGCTGGATTTTATTCCGGT-ATAGAGTGTTTGTCTGGGGCTGTGGGTTGGTGAGAGGAACGTGGCATGT------------TCTCGCTCTCTCTCTTTTTTTAAA-TTTATCTACCTGCTACATAGGCTGTGGCAGGTGTGGAGATAACTTTCCAATAATGACTGGAAGCAATTTTCTCCAACTTCACAGGAACTTACCATCTGGTTCTGAGGGCCAGAGATAACTCAGTCTCTAAGTTAGCTCAGGGCCCAAGAAAAGATTGATAAAGAAGTCTGATTATGCTGCCGCATAGCAGTGTCAATAACACATCACTGTTTGGTCACTCCGAGTGAGCTCTTCAGATGTCTTCAGAAAAAAAAGTGGAGCTCTAATTGAATTAACCTATCTCAAACCCAAGCACATTACTTAACGCAGAGGAGGTCAAGTTTTATGAAGGTAATATAAAAACACTAAAAATGTATTTGCATAGTGTGTGGATCTTTTTCATCTAACCTTTGGTCTCATACGGTAAACTGTCAGATTCAATTTTGGCCTTGAGTACTCTAGAATAAATAATTTTGCCCATGAAATTTTTCTTACCAGTAAAAATGTTTGGCCAAAGTTGAAAAATCACTAAGCTGCCAAGCCAATATGCTCTGTGGCTTAAGAGAAAATAGGTGTGTTCATCAAGCAAAGGAAAGATACAAAACTACAACATGAACAATTTAGCCCAAAAGACAAACGTTTGCAGAAAAATGAATATTGTTCTTGTTCTAAATACCTGGGATGGCTACTAAAATTGCTAAAATGTACTAGCTAGTTTCTCTAATCTCCATTTGATTTTGTCACTGTGGCCATAAACATCTTGGAGTGGTTATTTTGTATAGCCAGCATTGGAGTGGATGCTTAGCATGCAAAACATTCACCACAGGCTGATTTCTCAGGCCCCCTGAGATTACGTGTAGCAACGAGAACATGACATAATTAAATTATATGGCAAAGCATTAAGTAAGAAAGTAAACATACAGGCTCTGTCTCTTGGGAGAATGTCAGCTTACATATTTTTAAAGATGTCTTATT-AAAAAAAGATCAATAAACTGAAGTTATCTCAGCTTGAGGAAATAAAACAGTTCTCTGGAGAAAATAGTTTCTTCTCTAGAAGGTGTATAAGGAGAAGAAAACGTCTTCAGGGGAGTAAAGACTACTTATCCCTTTTCAATGTAAAGAAAATTACCAGTATTTGTAGGGTGGAAAGTGAGGGAGATGAAAtattaaa-gactgaatgttcatttccctccaaaattcatacaaagaagctttaaccccc--aagtgatggtatttggagatgggaccttaaggaactatctaggattggattaggtcatgaggatggggcatttatgatggaattaatgctcttataaaaagaaggagagacaggagatctctctctctgtctccttcttctcccagccacctcaccaccttgtgcagataccaagaaaaggcctagtgaaaacataagaagaagatggctctatgcaaaccaggaagaggactctcacccaaaactgaatctgccagcacttggaactttgacttctcagcctccagaactgtgagaaataaatgtttgttaagtcactctgtctatggtatttcattatggcagcccaaactaagacaTGGGGCAATGGTCAACATCGCTTTAAGGTGTGTCCTACTATAGAAGTCTCTTTTCTCTTCACAGGCAGGTAAAACTAAGCAACCATGTTTGTACTATGTCATGTCCCTGCTTGGACCAGGACAGATTCTTGAATCAATGTTAGAAAATCTATTGGCTGGCCCACAGCCAACTAAATTTTCACTCTTGAAAGTGCTAAGATCATGGCATCTAGCATAGGGCCAATCCTATTGAGAGGCAAAACTAAAAGCAAACCGAATTGAGGAAGGGGCAGAAGTGATGAGTGAAGAAGAAGCAAAAGGCAGTTACTCCACAGAGAAATTAATGGTGGGCAGACATCCACAAATGCTGAGTCCAGTTCCCAGTTTTTTCCTGATGAGTCTCAGTTGAACCTAAtttcctttttttttt--------------ttttttttctgagacagagtttcactcatgttgcctaggctagagtgcaatggcgtgatcttggctcactgcaacctccacctcctgggttcaagtgattctcctgcctcaggctcccgagtagctaggattataggcatgcgacgccacgcccagctaattttgtatttttagtagagacggggtttctccacattgatcaggctggtctcgacctcctgacctcaggtgatccaaccgtctcagcctcccaaagtgctgggattataggcgtgagcctctgtgcctagccCTAATTTTCTTGCTAAAGAAATGTATGAGAGTGCCTCATATAACACTATAATGCTCCTCACTTCTCACACTTTTTTTTTCAGTTGAGCTAATTTCAACAAGTTTTTATTAGCTTACAACTAAATAAACCTTGAATAAGATAAAGGACAAGCATTTAAAGATAATATTCTTGGCATTTTAAAATTATAGAAAATGGGAAATAAGGAGGGAAAAGACGTaacacttgtttagggtctttcatgtgacacacattgtggtggtaggggtattagatattttaatctttttagcagctgcatatctcaacaacattttgattggaattatactgatgaagcaaatgtgtctcaaagagcttaataaacttgctcaaactcctgaggtatcagaatttaaactcaggagtgactggctccagaattcttttccttaacACCAACATCAAACTTAGGAGCAAGGCAAATATTGTGGCCAGGTAACAACCAGACTCTTGAACAAAACAGTGAAGATGTAGGTTACTAGATTTGAAGGTTGATCTCATGTGTCAACTCAgagggtgtttttgggtgagattaccatttaaatcagtgaactttgaggaagctgattgtcctccataatatgggtgggtctcatccagttagctgaaaccctgaatagaacaataagactagcctccaagattaagagataattctgcagtagactgccttcagacttctcttatgccattggctctcctgggtctctgcctgccagcctttggactggaactgcaccatcggctctcctgggtttctagcttgctggttcacactgcagatttggacttgccagcccccgtaattatgtgagtcagttcctggcaatgaattgctttctttctacataaaaccatcctattaattctttctctggagaagctcaagtaatacaCCAAAGAAATGTTTGTTCAGAAAACCAAGATTGCTATTCCAAGCCAGTTCTGGAGTGTGTAAAAGGATTCTAGTTGGGGTGTTTGATatagccctttctgtcttctgatgcttattgttagcatagtgtacttatttccatctttttattttaaacatatttacatttttatatctaaaattcagtagttgagtctt----ttaaaatttatttttactgtttttgccttttaattgaagtgtttagctgattaatatttaaattattattgatatagttagatttagtt-tgccatcttactggttttttttt---ctgttttgttcctctgtttttcatatctgttccttctatcctgacttctttgaattaattgtagtttttggaatcccattttaattcattcattggctttaaacttatatctctttgcattattttttattgttca-----------------------------------------ctgtgaattacaatatatatccttaactttttacagtctactatgagttaatgttgtgcctttttgtggaatgtgtacaaccataaagagacatttatttttcctgtcatgctttatggtagttatggtactataatacagtacatatgctaccaactctaatgacaatgttataattttgggattagtcgtatgttatttttaaataatttaaaagtaaaaacaagtgttttatatttacccccaaatttactgttttcagtcttcttaattatttcctaaac----------------cctgaagaattttctttagcatttatgtagtacaggtgtgcctcctgtatattctcttagttttcttttgtctgaaaatgcctttattttgccctaactcttgaagaatatttttggtagatatgaaatttttgtttgatttctttgctagtactttaaaggtgttctgctgtctcctggtcttcattatttctggtgagaagtcaatggccatttgaattcaaattacacaatgttctt-tgtttgaaatgtgtcattgtcatctggcttccttcaagatattctccttagttttggttttcatcagtatgacaataatgactttagatataattttcctttcatttattctgcttagtgtttgctgagtttcgtgactctgtaaatttgtgcctttccccaaagttggaaaaacttcaaccactatatatgtaaaatatgttatgtcctgttccatccttcttttcctctgggacttcaattacatgtatgttaaaccttttgatattgccttacagttctctgagattttgttcattttcaaaaccttttaatctcagttcttcattttggaa-atttccactgatttatctttaagttaattgatt------tttttttcatctttaatctgagtcaaacccatgcagtggctttttattgcatacattatatttttaggttataaaatttccatttgaatttgagagttttgatttctttgctgagattttgacttttagttgattgtgagtataatagctgttttaaaattgttgtgtaataattacaaaatctgagtaatctcagagtcaatatccactggttttctcttcactaagggtcaaaattttcctatattttaaatgccaaataatttttaactagattctgga----aattgttaatgatacattgtctaggctctggatggtgttatatttctctgaagaatattgatttctgtttggtttgttaagcagttaactgaactgagctcaaattgcaaacttttgttgccctgcagtgagcagcagctgaaattttagccttggatgtgctctttagagtttgcctgccacatgcatattttagaagtagactagagatttcttcagagtttatatgcagaattcagggctccattctctgctctcctcatacatggaatcccccttcaccttccagttgcagtaattgctcagaaatctgtttcctagttcttcaagccagtaacactatgacttgccttcaaagcaagcactcaccaaatgccatttccttttttcaactgtcaatcccccaccaaaatttgcctgatttgcgtggtttttcagtgccttcaggtattgttttttatattttttcccagagtttatggttattattttcagataatataggagctagtcaaccatgacacaaggtggcaggctAGCTGGAATTTTGGGGACTAATGTTTCCAAATAAACCTGCACACAAACCTCTTGGGAAATAGTCTTTTTGATTTACAGGAACAAATATTTAGAAGGTTTAGTGTTGAAGAACTTATTTCAGATGAAGCCAGCCTCAGTCTTTGCATGCTAATGTCACACTTTAGTAAGTCCTTAAACAGGTAATCAGACATAAACTGTTTTAAACTGAAATTTCTGTAAGTCTCAAATATCAAATTTATATCTCAGTATCACAGaatgaataaatggattaggtagtgtgttagaagatgataagtgctgtaaaaaaa-gtaaatcagaatagggtaatgagaattgggagggcaagtaggggtggagggcattgcaattttaggtagggtgattggggtatggctcattgaaaagatcacatccaagcagattgttgaaggagataagggaatttgtttgcagctatctgggggaacagtgtttcagaaagagagaacagcaTCATTTACTACACATATCAAGGGCTACATGtttaatcctctcaaaa------------------------------------aaatatcgagaaagaggctctattatctctcttttacagatgtgtaaactgaggggcagggaagttaaatactttgtctatggtcgtaaagctgataagccacagaaccgagtttgaatgcttggcatcctgtcatcttcagaccccattctcttaacttgtattatctgtTTACTGGATTCATCACCTTTTTTTTTTTT---CAAAAATAAACATTTTGTATGATTTCAATTGTTGAAGATCTAGTCCCAACCCTTAAGTCCCTACCCTTAAGACCAGTGTAGTACAGATGGTCATATGAATAGATAAGTTGCAATACAATGCAGTGGAGGTTATAACAGGGGTCTGTAGGGACAAAGGCAAATTGCACAATTTTACACAGAAAGTTGACTAAACAAAGGAACACTTGAAACTCCACTGCTACTTCTGGTGGAGTCATTTGTGTTTGTCTTATATAAACCCTGAGGTGAGTCACCTTGTAGCTTTCTCTAACCCTGCACAAAGCTGCCTTGAATCTGAATTTAGGACATCTCTCTggaagagaagaaagaaaaaaggaagaaagggaggacaggaggaaagaaggaGGAGAAAAATGCCAGGGAGAATTCTTGATAACATGTAAGCTCTCTCTCTGCCGGCGTGCCTTTCTTAAGAAGTTTTGGCCAACAGCTCTTATCTCCAGGTGAATTGGTAAATGCTAAATACCAAAATTGAGGATCACCAAGATCCAAACTTGAAACCACACACCTGCAAAGGGCCACACATGTCACCCTAATGATCatcctcttttgcactctaagcacatgtctctagatacacttatttaattacttcaaaactcttgttcttcatttgtaaaaagggg-ttataata--ctctattatatttcacagggctattgtgaatattaaataatacaaggcttgccacgtattaagtgctcagtaaatgatagcactaACTATTTCCATTCCAATCTGTTTCTTGGATATTAAAGTGCTCAATAAGTGCTTGGAGATTATGAATTCTAAATTTTATTATGTAGTTGGTTTAGGTAAAAATATTTGAAAGCAAAAGTCATATAGGATAAgtagtggagaaaagcacagatttttggagacagaaggacttgcgtgcgactctggttctgtcagttattagctaagggaacttctattactaaac-tgttttctcattggtgaaatgaaggcagtaatccttaAGTATTAATAATAAATATCTATACTGTATTGAATACTTGCTGTGAGCCAAGATT-TTCTAAATATCTGTATTATGCTATGAAAGCTTTATAAATCCTACAATATGAAAACAGTATAATGGATATCGAGCGAGGGTGATAATT-GTTGAAAAGATGCAAATCCTTGGTAT-CCTGCATAttcttagcttcttttgcaagtattttctcatctgcctggttaccttgcttcggaatatcccaaggctcagatttgtgtcatgccttttctctaccaattttcc-tcccttgggaatctcacccaatccatgatttaaataccgtct-attaaatggactgctttcaaaatcatgt--ttcagccacgacatctcctctgagctttggatgcctctttccttgtgtttattctgtattttcaaacttaatgtgtccaaaatgaaaccctaatcatttctctaaactcactcctcctacatgtttccctaccacacttaatggcaattccattcctcccactgtagcaagacaaaaattctgcagtcatcttcaccttctctcacaccccccccagccaatctttcagcatagattgtgctcctttcagaatcaattcagaattagacagtatctcaccaattccactgctacatccctggttcaagcctccatcctctcttgcttggattattgcagtgatctcctaagtggtctctcctggctttggctttaatgtccctgcctatcccccaccctcatacccctgctgaaatatgttctcaagcatatagtaaaggtgagcctgttaaaaggtaagtcagatcatgtctcttctcttcaaaacttcctcttacaagtttgcatcttagagaaaagctaaaagtctttacaatagcctccagggccctgcgctattcccagtctcctcttccccaacttcatactactgtgaccttagctgctattttcctccttgctcatttttctttagtcctcttagctgttcctagaagacattggacatgcttccacttcagggactttgcacttgctttttcttctacctaaaatattctttgcccagacacagtctccctgctatgttctttaggtttttgtgcaaaagttactttcacagttaaatcttccTAGcaggtctggctatatatattatgaggctcagtgaaaatgaaaatgcagggacctcttgtttatgaaatattaacaaAGACTCTGAAAAATCCAGCAGTAGTAACTTAATTTAACTCAAAGCTATCCAAATTTATTTGAGCACATAAATCTTTTTTCTTCTATAGTACCATTCACAATATTTCTATGTAATGCATTCTGTAAAATGCCTGGCAAAACCTTAAATACATCTTTCAACTATTTCAAAAATTTTATAAGTCTATGCTCAAATCACTATTAATAGTCtataaaattatataattgt----atcttaatattaaaatttacattatacatttagataatatatgtaatttaataaaatacatttataatatataGCTTTTATATCCCATAAGGATTCAGTCCTTTAG---------TCATTTTTTTTTGCTTTATAGGAAGTTTGCCATGCAAATATGAAAACAGGAATTAGCCCTTTGAGTAATTTCTCTATCCAAGTAAGTCTGAAAATTATATAATATACTTTGACAGTATATCTTTCAAATTTTTTGCATTTTTTTCTGCTTTATTTTTCTTAAGGTTTTTGCAAGACATTTGTATTTTAGCAGGAAATGTGATTTTCATTCTTTGGTACTAAACCCTGAAGATTGAATAACTTCAAGATTCAATGACACTAGAGATAACCATTTCTAAAGGTATAAAGACAGAAGAAACTTTCCTCTGAGACAGGCAGAAGAGGTAAGGGCTTTTCCAAGGAAGAGCTCTTCCTTTTCTGACAATAACTGAAGACAAGGGGAATCCATATGAATGGTCTTCCATAAGGTATTTCTCTATTCTTCTGTTGAGAGGatacttagccatatctgtgtgcatgtacacacacatatatgcacacatatacatattatataTTCTTCATATCCCTGTCTCAGTATTGCTCAGCGTGAAGGGCCACACTTATTTTCTTTAAATAACCACTCACAAAGTTACATTTTTGCAAGTTATAATAAAAATAAAATCAAGAAATACTACTAAATAAAAGAAATGTTAtactaaaataaagaaattttaaaaaacaaagccatacaaaatacaaggtcacatgtttaattattgcactcaacaagcataaaatcactctgtcacatttctttaaaaatttctaaatgcctattcttttttttttttaagaaggagtctcgctccgtcgc s rheMac1.SCAFFOLD80370 1885 12289 - 91160 acctcatgagacttattcactaccatgagaacagtatgggggaaaccgcccccatgattcaattttctcccattgggtctctcccacaacacgtggaaattatgggagctacaatttaagatgagatttgggtggggacacagccaaaccatatcaCTTCCTAATTGTGAAAACTAATCAATATAAGACGACAGACAGCACAGACGTTTTTGTTATGGTTTCCATGGCCCGACAAGCAGTGGCATGTTGAGTTCCTCACACTAAGGTGTTGAAGTCATTGACAATTTCTCCAGTGACATTTTATAGCTTTGGGTTTGTTATTATTAACCAAAGGCTTTGCCCaatcctagctgctctg-actcattcactctgtaacctgaagcaagtatctggacctcaatttctccatgtgtaaaaaagagatgattgtatcctctattcctaacttgcagagatgaggatcaaatgaaaCTCAGTGTGTGAGATCCATTAGAAACTACTACACAAATGCAAATGATTCCTGGGTTGGTGACATGGCTTCACGTGTTTGAGTCTGATGTCCTCAGCTGGAGTAAAAGAACCTGAGGATGAGTCATGACTAACAGTGTTTCTACGCCCTCATCCCTCACAAGCCAATTTATCCAACTCAACCCTACTGCAGGCTCTTTTTTTAGTGCCAGTTGTTTGCTTGCGAAGAACAGACTTTGTGTACACTTGGAATTCCTTATGCATTTCTTTTAATCATCTTTTCTTAATCTGTTAACTCTGCCCCGATCTTTTAGGATAATATATTTGTGTTTGAGCTACCTTCTGAAACAGTTTTTAAGTGGATGTATTATGAAAGACTGACTAGTCAAAATGAAGGAAAATATTTCCTGAGCTGACATTATCTCGACTTAGGATTTCATGTTAGGCTATGATTTAACACACATAGCTATCTTAAGTAATGTGCTTTTCAGTTCCTTTATTTAAAAGCTCCACAGTGTTATGGCTCTGATTAACTCTTGCGTGCTTTTACCTTTTTTGAGAAAGGCTGTTCCTCCTGCCGTTTCAGCTTGCTGTCCCAAATGGACGTG-AAACAGGGCACCATCATGTATACATGAAAAAAGATGACCTACATATATGATGGTACAGTACAGTATTAAAAGTACAATTTCAGCCATTTCTTCCAATTAAGGCTAATACGTCTGTGATTTCAGCCTCCTATTTGAAATAAAAGTATAACGATAATTGGAGCACAGAGCTATTCACCACTGTACTTCAATCTGGAAATAATTGTCTTTGTTCAATTAGGAATCTGCATTTTCATGCCAATCTTTACAGATTATTTTGAATGGAGAATGCACTCTGATTAAGAGCTATCCTTCTTAGGAAAAAAAAAAAAAAAGTAGCAGCCTGGAGTCCTCATCCCCTTGTTAGATTTAACATTTTGTTTTTCCCTAATAGACTGAGAAGGATGTTATATAGACAACTTTTTAAACTTATTTATTCAATGTGGCAAAAATCTCCTGGGGCTTTATT-----------TTTTTTTTTAATTCCATAAAGGTGATTCTTTAAAGTTAGTCTTGGAAAAGTGTCAAT-GGTCTGAGGTCTTCAATTAATTTGTCGTGTGAAATTGATCAGGTTTT-TACGGAGCAAATGTGACCACTATATTTTTGAAATCAGTAGAACCACTTATCCCCCTCAGTGATCTTTAAACAAGGtatcatatataagtcttatgaaaaaccttcagaattagagatagttatccctattcaacagacaaggacaataaaggtcaaagagtttatgtgattttcccaaagccactcaatgattcatgggtgaaactagaatcaactgcaagtctcactgaattgaaagccagtgttctctcATGCTTCTAGTACCTTTTTCTTATTAATTTAATATAGTCAAAGTAAAATGATGAGGGGCATTCTTGTTAAAAATGACAAGATGCTATAGCCAGAGCTATGAAAAATGCCAACTCAATATACGTCTTTTCTACAAACCACCTCCTCCAACAATTCTGAAAAAAA-----GCCTGTGTTTAGCATTTCTTGTTGAAAAATGGTGTACAAACTATGGAAACATATTAACACAATGTCAACTTCCTTAAATAATATAAGGTACTATCCACATCAATATATGACTTAATCATTTTTTCAAAATAAATTCTTTTAGAAACAAGGCCGTATCTTCTCCATTTTTGTATACCTTCAATCAAATGCTGTTATTAGTTGAGAAAATGAAGGACTCAGTCTCCTAATATCCCCAAGAGGCAGTTAGAATATACAGAATCTATATATTACTTACATATCATCTATGTGTATATACATTAACATATACACACAAGTAAAAAATCCCATCAGTGCAAGAAGTAAAACTCTGGTCAGACCTTTCATTATTTCTTTTAGAAACATTATACAGCATTGTTAATCTCAACCTTTGATGCAAGGCAATTCCTCCTCTTTAATAATACTCTGGTAAACTTACACATGAGTGTTTTTCTATTCTTCTCTGTCTTTGAACGTACCATTTCGTAATG---ACAAGAAGAAAAGACTTACTTAAGCACCTGGATGGAAAGCGATAGGTAACCCAACTTTTCTTATTTAAAATATAGAGTTAGTATTTGAGAGATTTGGGGTCAAATAGGACTTGTAAGCAAAGGTGGCAATAACTTCAACATCTCACGCTGAATTTTATTCCAGTTATGGAGTGTTTTTCTGGGACTGTGGGTTGGTGAGAG-AATGTGGCACATGctctctctttctttctctctctctctctctTTAAAATTTATCTACCTGCTACATAGGCTGTGGCAGGTGTGGAGATAACTTTCCAGTAATGACTGGAAGCAATTTTCCCCAACTTCACAGGAACTTACCATCTGGTTCTGAGGGCCAGAGATAACTCAGTCTCTACGTTAGCTCAGTGCCCAAGAAAAGATTGATGAATGAATCTGATTATGCTGCCACATAGCAGTGTCAATAACACATCACTGTTTGGTCACTCTGAGTGAGCTCTTCAGATGTCTTCAGAAAAGAAAGTGGAGCTCTAATTGAATTAACCTATCTCAAACCCAAGCCCATTACTTAAAGCAGAGGAGGTCAAGCTTTGTGAAGGTAATACAGAAACAGTAAAAATGTATTTGCATAGTGTGTGGGTCTTTTTCACCTAACCTTTGGTCTCATAC-------TGTCAGATTCAATTTTGGCCTTGAGTACTCTAGAATAAATAATTTTGCCCATGAAATTTTTCTTCCCAGTAAAAATGTTTGGCCAAAGTTGAAAAATCGCTAAGCTGCCAAGCTAATGTGCTCTGTGGCTTAAGAGAAAATAAGTGTGTTCATCAAGCAAAGGGAAGATATAAAACTATGACATGAACAATTTAGCCCAAA-GACAAACCTTTGCAGAGAAATGAATATTGTTCTTGCTCTAAATATCTGGAATGGCTACTGAAATTGCTAAAATATACTAGCTAGTTTCCCTAATCTCCATGTGGTTTTGTCACTGTGGCCATAAACATCTTGGAGTGGTTATTTGGTATAGCCAGCATTGGAGTGGATGCTTAGCATGCAAAACATTTACCACAGGCTAATTTCTCAGGCCCCCTGAGATTACATGTAGCAATGACAAGATGACATAATTAAATTATATGGTACAGCATTAAGTAAGAAAGTAAACATACAGGCTCTGTCTCTTGGGAGAACATCAGCTTACACATTTTTAAAGATGTCTTATTTAAAAAAAGGTCAATAAACTGAAGTTATCGCAGCTTGAGGAAATAAAACAGTTCTCTGAAGAAAATAATTTCTTCTCTAGAAGGTGTATAAGGAGAAGAAAACCTCTTAAGGGGAGTAAAGACTACTTATCCCTTTTCAATGTAAAGAAAATTACCAGTATTTGTAGGGTGGAAAGTGAGGGAGATGAAATCTTAAAAgactgaacgttcatttccctccaaaattcatacaatgaaactttaacccccgaaagcgatggcatttggagatggggccttaaggaactacctaggattggattaggtcatgaggatggggcatgtatgatggaattaatgtccttataaaaagaggaagagacaggagatctctctctctgtctccttcttctcccagccacctcaccaccttgtgcagataccaagaaaaggcctagtgaaaacataagaagaagatggctctgtgcaaaccaggaagaggactctg--ctggcagtgcatctgccggcacttggacctttgacttctcagcctgcagaactgtgagaaataaatgtttgttaagtcactgtgtctatggtatttggttatggcagcccaaactaagacaTGGGGCAATGGTCAACATCGTTTTAAGGTGTGTCCTACTACAGAAGTCTCTTTT-TCTTCACTGGCAGATAAAACTAAGCAACCATGTTTGTACTATGTCATGTCCCTGCTTGGACCAGGACAGATTCTTGAATCAATGTTAGAAAATCTATTGGCTGGCCCACAACCAACCAAATTTTCACCCTTGAAAGTGCTAAGATCATGGCCTCTAGCGTAGGGCCAATCCTGTGGAGAGGCAAAACTAAAAGCAAACCAAATTGAGGAAGGGGCAGAAGTGATGAGTGAAGAAGAAACAAAAGGCAGGTACTCCATAGA-AAATTAATGGTCGGCAGACATCCACAAATGCTGAGTCCAGTTCCCAGATTTTTCCTGATAAGTCTCAGTTGAACCTAATTTCGTTTTTCttttcttttctttcttttttttttttttgagacagagttttgctcatgtttcccaggctagagtgcaatggcacgatcttggctcactgcaacctccacctcccaggttcaagcaattctcctgcctcagccttccaaataattaggattataggcatgcgacaccacgcccggctaattttgtatttttagtagagacagggtttctccacattggtcaggctggtctcgaactcctgaccttggatgatctgcctgtcttggcctcccaaagtgctaggattataggcgtgagccactgtgcctggccCTAATTTCCTTTCTAAAGGAATGTGTGAGGGTGCCTCGTATAACACTATAATACTCCTCACTTCCCATACTTTTTTTT-CAGTTGAGCTAATTTCAACAAGTTTTTATTAGCTTACAACTAAATAATCCTTGAATAAGATAAAGGACAAGCATTTAAAGATAATATTCTTGGCATATTAAAATTATAGAAAATGGGAAATAAGGAGGGAAAAGACGTaacacttgttcagtgtctttcatgtgacacacattgtggtggtaggtgtattagatattttaatctttttagcagct-catatctcaagaacatttcaattggaattatacagatgaagcaaatgtgtctcaaagaacttaataaacttgctcaaactcctgaagtatcagaatttaaacttaggagtgcctggctccagaattcctttccttaacactaACATCAAACTTTGGAGCAAGGCAAATATTGTGACCTGGTAACAAC-AGACTCTTCAACAAAACAGTGAAGATATAGGTTACTAGATTTGAAGGTTGATCTCATGTGTCAACTTGgagggtgtttttgggtgagattaccactgaaatcagtgaactttgaggaagttgattgtcctccataatatgggtgggtctcttccagttagttgaagccttgactagaacaataagactagcctccaagagtaagagataattttgcagtagactgccttcagacttctcttatgccattggctctcctgggtctctacctgccagcctttggactggaactgcaccatcggctctcccgggtttctagcctgctggttcacactgcagatttggacttgccagcctccataattatgtgagtcagttcctggcaatgaactgctttctttctacataaaatcatcttattaaatctttctctggagaagctcgactaatacaCCAAAGACATGTTTGTTCGGAAA-CCAAGATTGCTATTCCAAGACAGTTCTTAAGTGTGTAAA-GGATTCTAGTTGGGGTGTTTGATACAGccctttctgtcttctgatgcttattgttggcatagtgtacttatttccatctttttattttaaacatatttacatttttatatctaaaattcagtagttgagtcttacttttaaaatttatttttactgtttttgccttttaattgaagtgtttagttcattaatatttaaattattattgatatagttagatttagttctaccctcttactgtttttttttttttctcttttgtccctctgtttttcatatctgttccttctatcctgacttcattgaattaattgtagtttttggaatcccattttaattcattcattggctttaaact-------ctttgcattattttttgttgttcaaaaaatatatattgaacaacaaaaaaatattgtatattatattgtgaattacaatatacatccttaactttttacagtctactatgagttaatgttgtgcctttatgcaaaatgtatgcaaccataaagacacatttattcttcctgtcacgttttatggtagttgtggtactataatacagtacatatgctaccaactctaatgacaatgttacagtttggggattagtcctatgttatttttaaataatttaaaagtaaaaacaagttttttatatttacccctaaatttactgttttcagtctccttaattatttctcaaaggtacatttccctttagcctgaagaattttccttagcatttctgttgtacaggtgtgcctcttgtaaactctcttagttttcttttgtctgaaaatgcctgtattttgccctaactcttgaagaatatttttggtagatatgaaattttggattgatttcttcgctagtgctttaaaggtgttctgctatctcccggtcttcgttatttctggtgagaagtcaatg-ccgtttgaattcaaattacacaatgttcttctgtttgaaatgtgtcattatcatctggtttccttcaagatattcttttaagttttggttttcatcagtatgacaataatgactttaggtataattttcttttcatttatcctgcttagtgtttgctgagtttcatgact--gtaaacttgtgcctttccccaaagttggaaaaatttcaaccactatatatctaaaatattttatgtcctgttccatccttcttttcctctgggacttcaattacatgtatgttaaaccttttgaaattgcctcacagttctctgaggttttgtacattttcaaaacctttttatctcagttcttcattttggaacatttccagtgatttatctgtaagttaattgattcttttttttttttcatctttaatctgagttaaacccatgcagtgactttttactgcatatattatatttttaggttataaaatttccatttgaatttgagagttttggtttctttgctgagattttgacttttagttgtttgtgagtataatagctgttttaaaatttttgtataataattacaaaatctgagtaatctcagagtcaatatccactggttttctcttcactacgggtcaaaatttccctatattctaaatgccaaataatttttaactagattctggagggaaattgttaatgatacattgtctaggctctggatggtgttatatttctctgaagaatattgatttctgtttggtttattaagcagttaactgaactgagctcaaattgcgaacttttgttgccctgcagtgagcagcagctgaaattttagccttggatgtgctttttagagtttgcctcccacatgcatattttagaggtaagctaggaattttatcagagtttatatgcagaattcagggctccattctctgctctcctcatacttggaatcccctttcaccttccagttgctgtaattgctcagaaatctgtttcctagttcttcaagccagtaacacTAGGACTTGCCTTCAAAGCAAGCactcaccaaatgccattttcttttttcaactgtcaatcccccaccaaaatttgcctgatttgggtggcttttcagtgccttcaggtattgttttttatattttttcccagagtttatggttattattttcagATATCATAGGAGCTAGGCAACCATGACACAAGGTGGCAGGCTAGCTGGAATTTTTGTGACTAACGTTTGCAAATAAACCTGAACACAAAGCTCTTGGGAAATAGTCTTTTTGCTTTATAGGAACAAATATTTAGAAGGTTTAGTGTTGAAGAACTTATTTCAGATGAAATCAGCCTCAGTCATTGCATGCTAATGTCACGCTTTAGTAAGTCCTTAAACAGGTAATCAGACATAAACTGTTTTAAACTGAAATTTCTGTAAGTCTCAAATATCAAATTTATATCTCAGTATCACAGaatgaataaatggattatgtagtgtgttagatgatgataagtgctgtaaaaaaaagtaaatcagaatagggtaatgagaattgggagggcaagttggggtggagggcattgcaattttaaatagggtggttggggtatggctcattgaaaagatcacatccaggcagattgttgaaggacataagggaattttcttgcagctctctgggggaacagtgtttcagaaagagagaacatcaTCATTTACTACATATACCAAGTGCTACATGTTTAATCCTCTcaaaacaaaaacaaaaacaaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaacgccaagaaagaggctctattatctctcttttacagatgtgtaaactgaggggcagggaggttaaatactttgtctgtggtcataaagctgataagccacagaaccaagtttgaatgcttggcatcctgtcatcttcaaaccccattctcttaacctgtattatctgtTTACTGGATTCATCACCCTTTTTTTTTTTTTCCAAAAATAAACATTCTGTATGATTTCAATTGTTGAAGATCTAGTCCTAACCCTTAAG-----ATGCATA----CAGTGTAGTACAGATGTTCATATGAATAGATAAGTTGCAATATAATGCAGTGGAGGTTATAACAGGGGTCTGTAGGGACAAAGGCAAATCGCACAATTTTACATCCGAAGTTGACTAAACAAAGGAACACCTGAAACTCCACTGCTACTTCTGGTGGAGTCATTTGTGTTTGTATTATACAAACCCTGAGGTGAGTCACCTTGTAGTTCTCTCTAAGCCTGCACAAA-CTGCCTTGAATCTGAATTCAGGACATCTCTCTGCAAGAGAAgaaagaa----ggaagaaagggaggacaggaggaaagaaggaGGAGAAAAATGCCAGGGAGAATTCTCGATGAGATGTAAGCTCCCTCTCTGCAGGTGTGCCTTTCTTAACAAGTTTTGGCCAACAGCTCTTATCTCCAGGTGAATTGGTAAATGCTAAATACCAAAACTGAGGAGCACCAAGATCCAAACTTGAAACCATATACCTGGAAAGGGCCACACATGTCACTCTAATGATCatcctcttttgcactc-aagcacatgtctctagatacacttatttaattactccaaaactcttgttcttgatttgtaaaaagggggttataatatactctattatatttcacagggctattgtgaatattaaataatacaaggcttgccgtgcattaagtactcagtaaatgatagcAGTAACTCTTTCCATTTCAATCTGTTTCTTGGATATTAAAGTGCTCAATAAGTGCTTGGAGATTATGAATTTTAAATTTTATTATGTAATTGGTTTAGGTAAAAATATTTGAAAGCAAAAGTCAtataggataagtactggggaaaagcacggattgttggagacaaaaggacttgggtgtgactctggttctgtcagttattagctaagggaacttctgttactaaacctgttttctcattggtgaaatgaaggcagtaatccttaAGTATTaataataaatatctatactgtattgaatacttgctgcgagccaagattgttctaaatacctgtattatgctatgaaagctttacaaatcttacaatatgaaaacagtattatGGGTATCAAGCGAGGGTGATAATTTGTTGAAAAGATGCAAATCCTTGGTATTCCTGCATAttcttggcttcttttgcaagaaatttctcatctgcctggttaccttgcttcagaatatcccaaggctcagacttgtgtcatgcctcttctctaccaattttccctcctttgggaatctcacccaatccatgatttaaataccatcttattaaatggactactttcaaaatcatgtgtttcagccacaacatctcctctgggctttggatgcctctttccttgtgtttgttctgtattttcacacttaatgtgtccaaaattaaaccatgatcatttctctaaactcactcctcctacacgtttccctaccacacttaatggcaagtccattcttcccactgtagcaagacaaaaattctgcagtcatcttcaccctctctcacaccccgc--agccaaactttcagcacaggttgtgctcctttcagaatcaattcagaagtagacagtatctcaccaattccactgctatatccctggttcaagcctccatcctctcttgcttggattattacagtgatctcctaagtggtctctcctggctttggctttaatgtccctgcccatctcccaccctcatatccctgctgaaatatgttctcaaacatacagtaaaagggggcctgttcaaaggtaagtcagatcatgtctcttctcttgaaactttgctcttacaagtttgcatcttagagaaaagctaaaagtctttacaatagcctccagggccctgcactatacccaatctcctcttccccaacctcatacggctgtgaccttagctgtcatcttcctccttgctcatttttctttagtccactttgctgttcctagaagacattgggc-tgcttccactttaaggactttgcacttgttttttcttctacctaaaatattctttgcccatacacagtttccccgttatgttctttaggtttttgtgcaaatgttactttcacagttaaatcttccTAGcaggtctggctatatatattatgaggctcagtgaaaatgaaaattcgggaacttcttgtttgtgaaatattaacaaAGTCTCTGAAAAATCCAGCAGTAGTAACTATATTTAACTCAAAGCTATCCAAATTTATTTGAGCACATAAATCTTTTTTCTTCTATATTATCATTTACAATATATCTATGTAATGTATTCTTTAAAATGCCTGGCAAAACCTTAAATACGTCTTTCAACACT----GAAATTTTATAAATCTATGCTCAAATCACTATTAACAGTCtataaaattatataattgtttatattttgataataacatttacattatacatttagacagtatatgtaatataataaaatacatttaaaatacatagtttttttattCCATAAGGGTTCAGTCCTTTAGCGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTATAGGAAGTTTGCCATGCAAATATGAAAACAGAAATTAGCCTTTTGAGTAATTTCTCTATCCAAGTAAGTCTGAAAATAATATCATAGACTTTGACAGTGTATCTTTTAAATTTTGTGCATTTTT--CAGCTTTATTTTTCTTAAGGTTTTTGTAAGATATTTGTATTTTAGCAGGAATTGTGAGTTTCATTCTTTGGTACTAAACCCTCAAGATTGAATGGT---GATTCTCAAAAACACTGGAGATAACAGTGTCTAAAGACGTAAAGACAGAAGAAACTTTCCTCTGAGACAGGCAGAAGAGGTAAGGGCTTTTCCAAGGAAGAGCTCTTCCTTTTCTGACAATAACTGAAGACAAGGGGAATCCATATGTGTGCTCTTCCATGGGATATTTCTCTATTCTTCTATTGAGAGGATGCTTAGCcgtatatgtgtataagtacacacacatatatacacacatatacatactatatatTCTCCATATCCCTGTCTcagtgctactcagagtgaagggccagacttattttctttaaataaccactcacaaagttacatttttgcaagttataataaaaataaaataaagaactactactaaataaaagaaattttatactaaaataaagaaattttaaaaaataaagccatgcaaaatacaaggttgcatgtttaattatt-cgctcaacaagcataaaa-----------------------------------------------------------------tcactctgtcac a score=659167 s hg17.chr12_random 354589 8171 + 466818 gatggtctcgatattctgacctcgtgatctgcccgcctcggcatcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgcgcctggcctaaatgcctattcttaatgccgtatttatgccatctcagattggaacagtttggagactggctccaacttgtgggctacctattgaccagtactgCTCTTGCCTTCACCATTAATTTAGTATGTAGTGTATACTACCATTTAT----------------TGTGATTTATCTTTTTATTTCCTTGAGAGCAAGAGATATCTATTTGTGTCCTTGAAGTTCCTAGGATAAAACACTACACATATTACTAGATATGTATCATATACACTAGGTAGGTAGATAGATACATATCTAGCTTTATGATATAGATATTATATTATCTGTATAATAGATATCTCTAGATAGATATCTGGATAGGGTTTTATAAAACCTTAACTTTTTTTTTCCTATTTATACTACTCCATGGATCAAAATTTGAGAGTTTTAACAAGGGAACAAAAGAACGAATGCTCTTTAGAAAATTTCCAAAATCAAGAAAAAATGAATACAGGGTCATAATGTTTATATGCACACCAAGTCACCAAATAATAGTTTTAGAAAGCTTTTACATAAGTTCTATGTTTTAAAAGAAAAGTTGCATCTACACATTGACAGACTTGTGTGTAGCTGTCTTGTTTTTAAAGATCTCCTGGGATCGAAATTTTAAAATTCCCTTTACTGTCTTAATCATGCATAACATTACTTAAAAAAAACAAACCCATATATGCCATTTTCAAAAGGGGTAAATTTATTTCTTATATTTCCTGATGAAAACTTCAACACTAAAACAACTCAGAGCAAAAGACAAAGGTGAGATGTCTAATCTCACCTTTTTAGATTTGGGTGTTTTCTCAAGTCACCTTTGAAGCTCTAATGGTGACAGAATGTTGTAAATCTAATGCATTTTTCATGCAAGCTGATAACAG-CCTTATTTAAGGCAATAAAGAGCAAACGGATCTTTGATTAGTTCATCTGAGGTTTGCTACACACAAAAAAATAAATTTTTAGTGCAGTATGGTTGATTTATTTTGTCCAAACTATGTTAGTGAAATGATGGCTGGAGAAAGGAGTCCTTGCCATTCTGGTCTAGAACCCTGAAAGCTGTAAATGAGATCCTCCTGCAATTATTCAATGGGCTGGTGAGTGTTGAGTTCTATAGCAAAACAGAGAGATACAGGTATGTCAGGGAATCAAGGATGTCAAGCATGGGGATGT---CCATCTAATTCTTTCCTCATTGCTGTCTGATGCCTTTTATTAATTCCTCCACCTTCAGCTTCAGGATAAGTTGATCTACTGTTTTGTGTTTGAGCTGCAGCTCAATACAAAATTTTGTTCCATACAAAATATTTGTGGGGATCACAAACAACAAAACAAAACAGATTGTTTGGAAAATATAAAGATTCACATGAACATATACAATGATAAAGAACAAAAGTACAATAAAACAGCCATGTACCGGGACAATATATTTGCATGTAAAGTGTTCATATTATAATTTGCAAAGGCTCATTAAAGTTTATAGAAGTCCACGCCTCCATAAATAAATTGGCaaagaataggaatgaacaggaatgaacaagcagttcatccaagagaaa-tacaaataggaaacaagcaaatgaaaatattttaattctcaatactgatcaaagaaatggaaattaaaGAAATTGATAGTAA-AAATATCAACTTAGAAATGCTAAATTGTACTAAAAAACTAAGATCTTAGAAACTTAAACATTCATGAAAAATTAACATTCAAACAAATGGCATGTTCGAAGGGAAACAAAAATTCACATAATGATCAAACAGATAAAACTATAAAGCTATCCATACTATTTGGGACTGAAAAACCATGGAGGGACGTATCCTAAGGAAATAATAGAGTCAAAAAGCTGTATGTATGATGATATTTATTGTAACTAAAGGAGAAAAACTTATTAAACAGTAAAAGAAGATTAAGTAGCCAATAAAAATAATACGTTACAAAACTACATAGAAATCTAAAAGAATAGTAATTATATAATATTAAATGAACATCGAAAATGCAAAACAATTCCAGCTATTTAAAAACTGTATGTATGTGGTGATTTACAAAGTTAAAAACATGCAAATTGCTTTAGAGTAATAGGTTAAGATTCCCTCCCTCtttttttttttttttttttttGCCAATCCCCGTATTTGGATTATTTCACCTATCCTATGTATTTTTTTCCCTAAATAATAGCAAAAACTCAAAAACTTTTTCAAGGGACAAAGAAGAAAAAGATGAGTATCTGGAGGAGATACTTCTCCCCCTTCACCTTACAGTCAGGCTTTTGCTGATACTCAGTTTTTTTCAGCCCTGTCAGCCCCTTTTCGGAGGAGTTGATGTGTAGCCCTAATCCTCTCTGCTGGCTGCCTCCCTATTCAGGAGGGTATGCAAATACTTCCAAACCAGAGCATTTTAGACCTATTCAAGGCCCAAGACAACACACTTTTCATTAGCATTTGAAGTGTGAGGGCTGAAAAAGGGGAATGGACAACTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCCCTTTTGGCTCGAAGCTTTGGGGAGACTTGAAAATGTACGTTTTTCATCCCTTTGCACACATCAGCATTGGCGCTAAACTTCAGAGGGACGCATTGACTGCCCTCAGGGGAAAGCATTCAGGGGGATTTTTACACATACACGGAGGGCCATCGCCTGAAATAAATCACAGAAAGGAGGTGGCAGAGATGAAGCGAGAGGGGTTCAACGCGGGGCTAAGCTATGCGTCCAGAGGCATGAATTTAAATCGCGATTTATTTTCCTCTCGCTCTGCACTTGCATGAACCTCAGTTTCTTAATCTTCAGCAATGGGGAGGGGGGCTTTGGGGAGAAGCGGCACAAGATTTAAAATGCAAGGCAAGTCTCCCATCAGACAACCCTCTGGAGGTGCTCTGTCTGTAGCCGTGATGTTAGAGCCTGGCGCTCTGAAGCCTAGGTCACAAGTTCAATCCCCTTCTGGGTCAGTTAGCTTTTCTCTGTTCCACAGCCACAGAATAAAGGCCTGAGCCCCTTATTCAGGCCAAATGTCTAACAAAATGTGTGTCCTTAGTCACTGCACAAAACAGCCCAGCCAGAGCCTAGCAAATCCATCCTTTACTGTTGGGGAGCCGTCAGGAAGCTAGCTGTCCTTGGAGGCCTACA------------ATCTCTGCACGGACAAGGTGAGAAGGTGAGAAGGTCAGAGGGAGGTAG-GTG-gggtgctgaagatggccagaacttggaggagatcgagcccaacaacttactctgtgactctgagtaacttattcaacctctctgggccccagctgtggacaagctgttgtgatgactgagtgtgttaatgcacatcaagagattaacactgtgcctgggacacactaaacagtcaGATTTTGCTAGGATTGTCATCCCTAACCATGATGATAAAACGGTGCTTTATGGCTATTTCAGGAAATTTGAGAAAAGGATTTAACATGTGAAGGTAAGACAGAGAGCTTTTTGACTGATATCAGTAAAAATGATTACGTGCCTAATGTATATCAGGTACCTTGATAGATTCCTTTTGGGGGGAGATAGGTTATTATAAAATAATAAATGCCACATGGATACATGGATCTTGTCCCCAAGGAATTTAtagagccagatgaccctgctataaaccctgattcaatcagttaggaatgacattggatcagttaatctgtcagtgcctttgtttccttatctgtaaaatggggattataactacctacctcataggggtgttactggattaaatgagtgtatgtgaagtgcttagTATTTATAGGAAGCCATTAAATGGGTGGATATTTTTATTATATGAAAATAAAGCGTGCTTTTGCCGTTCTTCAGCTGTAtttattttttgagatggcgtctctctctgttgccgaggttggagttcagtgatgaaatctcagctcactgcaacttctgcctcctgggttccagcgattcttctgcctcagcctcccgagttgctacgattacaggtgcccaccaccatgtccagctaatttttgtatttttagtagagacagggttttaccatgttgcccaggctggtcttgaatgcatgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaattgctggaattacaggcatgagccaccgtgcccggccCATTCTTCAGCTTTAAAAAGGTGACAGCATCCTACTACAAGCCAGATCAGAGCCTTGGTATTTTTTTTAATAATCTGACTCCAACCTACCTTTCTGGTTTTGCTTTCATTTCTCCACTCCCTTCCTCCACATCATACTTTGTGATCCACTAACAGTGATGGGCTCCTTGACGCTTCCTGGCCTCCATGCATGCATTGTCTCCCTGTAGCCTTTTCCTCCCTCATTTGTCCATCTGGTGAATAAATCCTCAACATACCTTTCCTCCAGAAAGCCCTCCTTGACCTGCCCAGAAGAATCCCCTGCCTCCTCTAACTATTGGTTTTTATATGTACAAGTTTTTACAAGCCCAATCATAGACCACAGACCAAAAGCATCTTAAAGTGGAGCTACTTAAAATAGGGACAAAAGTAATGTTAAGAAAATAATGAAAAAGAGATTTCCAACGGAGTTTCCAAGGGGAGGCCATCCCTCTGCCTCACTTCCATAAGAGAGAACAGAGCATGACTATATAATGCAAAGGAAAAGAGCTGTCATTAGTTCTGTTTGTCAGGTTTTCCACCCTCCCACTGTAAATGCCACTCCTTATTAAGGAAGCCTAGCTTTGTGTCCATGATGACTCCATTCTCTACTTGATTCT-----TAGCCACTGCTTTTTATCAGGATGGAGCGAGCAGCAGGAGAAGCTCCGAGCCCACCCTTGAGCAGATTTGATaatgggtttcatttcaagatctaactgattggactgagaaggatggatctgagagggactgctggattgggactgcatctaggcacagcagaagagagtgctgtggttgatgagtgatgcctgtagtgcctactagaaagaagagtggttgcagttttgtaacatagttgcaaaccctgTCTGGGAGGTTGTAGTGTATTCCTAACACTTGCTTAGTATTTCATCTAGAAGTTGGAGCCAACTAATACGAGCTCCCCCAAGTTGTCTCTTCTCTATTTTagggacccccaaaccctgggccccagactggtactagtccatgacctgttaggaatcaggctgcacagcaggaggtgagtggcagcgagcaagcattaccacctgaggtccaccgcctggcagatcagcagcagccacagattctcacaggagtgtgaacgctattgggaactgcgcatccgagggatctaggctgagcgctccttatgagaatctaatgcctgatctgaggtggaacagtttcatctagaaaccatccccttccccagtccgtggaaaaactgtcttccatgaaactggtctctggtgccaaaaaagttgggcaccAGTGCTCTACTTCATTATTTCCTGGTATCTTGCCTTGCCTTTCCTACTGAGCAACCATCTTAAGAGAAAAAGATTTTTTTTTCTAGAAATAACATGTTATACAATATAAATagtcatccctttgtatccacagaagactggttccaggacccccagtggataccaaaattggcagatggtcaagtccctaatataaaatagtgtcatatttgcatataacctatgtacatcctcctgtatactttaagtcatctctggattatttataacacctaatacaatgcaaatttcatgtaaatatttgttatgctatgttgtttatttgtattgtctttattgttgaattgctatcttttcttatttttgaacatttttgatccacagtgggttgaatctgtagatgtgcaacatgcagatatagaggttgactgTATACattttttatttttcaattaa----ataattaa-ttaaaaaaGAGAAATTGTCCTTGCTCCAATCACCTCCCATCTGCCCAGATCTAAAAAAGAAAAACTTCCTCCATTTCCTTACAGCATGTTTAGAAAATTTATAATAGGTTCTCCGAGAAATATTTTAAGCAGATGAAATGCTGAGCAGCTGCAGGGACCTAAAGGAAGTATAAACCCATTTGCTGATTTTTTACAAAATTTAGATTTAGCAATGTTCAGGCTTTGGGAAAATGGAGTGGAAAGACCATTGACGGTGGCAATAAAAGAATAAAATGAGGGAAC----TTCAttagctgttgttactagcaaaccacctcaatacttagaggcttaaaacaaccatttatttggtttctgggcctcgggtttgatggggcagttctcctgacctaggccaggcctggctgatcttggttgggcttatttatggctgacatcagctt-tgggccagctgtgggctggctcatctagaatggtttcagctggggtggctcatcttcattcccatggtctgtaatccagaagaccagcccagtttgttcacatggcagcagggcaggattcctagaaagagtagacac-ggtaaggtttctttgaggctcaggcttagaaatggcgtaatgtcacttttgccatattgtcatggccagagtaaatcacgaggccagcccagattcaaaggctccatcttaccaggaggagctataaagtcacattacaaaggagccttttaccaggagggaaataactagggcaatttttacaaacaatctaccaGTCATTTACTGAAGTGACTGACTAGGATGTGCAGGAAGGCAAAGGAGGGGAAATGAGGCCTTGTAAACGGAGATGAGGCCGTGAGAATGGAAAGGGGGCCAACAGCAAGATAGGGAAAGGAATGGGGGAAGGAGGGGAATAGTTCATTAGAATAATAAAGTAGGGGGCAGAGAATAAAACTACTCACCTCTAACGGCAATCATGATGTAGTTGAAGGAAttaacccctctagaatttaatttcttcacctataaaataggaataataacatctggattacaaggtggttgtgagattgtaaatacaatgcataaaagatttagcCTACATGGGGGGATTCAACACCCTCCCCCATATATGCAACCCCATCCACGCATGCACATATTATAATTACACGTGTGGAACGTCTGACCAAgagtcaaa-acctggggcatgatctcagatctgatttttataatctagtaagtctgagcaaatcacttaaatctctgaacttcagtcttatcatctgttgaatggggataataataacaacctcAAAATAAGTCTCCTGAGGAGTTCAAGAAAGGAACCAAAGAGCTCTCTGTGTGCTCCGGAGAAGAGCTTAGCCTTGACCTTTAACCCAGTATGAgcagaaataaaataaaggtcccaggattccacatgcttctggattcgccttgtagcctccccacttctttt-------agtcttaagaaaatcaggattaattatattgcgcccttatccctcattctcagttctcacaagaagcccagaaatctcaggatatgcctcttccctcagcctcccatttcatatggctctgcacatattcttctcactaaccTTCTTTATCcctcaagtcacaatggccacctatccagtgctcagtcacccatgtgactagtggctaccatactgcacagGATAggtttcgtccttgcacctctaactcattctcctgatgatttcatccattcccatggctttaaatgcaatttctgtgttaataaatccaaaacatatatctatggctcagacctcttagctacactccagtagccattacctccttaacatatccatttgaatgtgtgaaagccatctcaaagtcaacatgtccacaacaaaaatcgtgtgccttccttccaaatccgctcctctcatgatctttgccatttcagtgaacaacaagctcattattttaattgatcaggtcacaaatcttggagtgatgtttgaatcttcttttcctcttaaacgccactgctgatccatcagcaagtcctcttgat--tctgtcttcaaaacgcatctgaatttgtacattcacatctccaacacagccctcctagtccaagctagcgtc-tctttcA s rheMac1.SCAFFOLD80370 14174 8099 - 91160 aattatgtaaacattt----------------------------------------------------------------------ctaaatgcctattcttaatggtgtatttatgccatctcagactacagcagtttggagactggctccaacttgtgggctacctactgaccagtactgCTCTTGCCTTCACCATTAATTTAGTATGAAGTGTGTA-TACCATTTATATATAAAAGATATAATTGTCATTTATCTTTTTCTTTCCTTGCGAGCAGGAGATATCTATCTGTGTCCTTGAAGTTCCTAGGATAAAACACtatacatattactagatatgtatcatatatactaggtagatagatagatacatatctagctttatgatgtagttattatattatctgtataatagatatctatagatagatatCTGAATAGGGTTTTATAAAACCTTAACTTTCTTTTTCCCATTTATACTACTCCATGGATCAAAATTTAAGCATTTTAACAAGGGAACAAAAGAATGAATGCTCTTTAGAAAATTTCCAAAATCAGGAAAAAATGAATACAGGGCCATAATGTTTATATGGACACTAAGTCACCAAATAATAGTTTTAGAAAACTTTTAAATAAGTTCTATGTTTTAAAAGAAAAGTTGCATCTACACATTGACAGACTTGTGTGTAGCTGTCTTGCTTTTAAAGATCTCCTGGTACCGAAATTTTAAAATTCCTTTTGCTGTCTTAATCATGCATAACATTACTTCAAAAAAA--AACCTATATATGCCATTTTCAAAAGGGGGAAATTTATTTCTTGTATTTCCTGGTGGAAAATTCAACACTAAAACAACTCAGAGCAAAAGACAAAGGTAAGATGCCTAATCTCACCTTTTTAGACGTGGGTGTTTTCTCAAGTCACCTTTAAAGCTCTAATGGTGAGAGAATGTGGTAAATTTAATGCACTTTTCACACAAGTTGATAACAGACTTTATTTAAGGCAATAAAGAGCATACAGATCTTTGATTAGTTCATCTGAGGTTTGCTACAAACAAAAAAATAAATTTTTAGTGCAATATGGTTGATTTATTTTGTACAAACTATGTTAGTGAAATGATGGCTGGAGAAAGGAGTCCTTCCCGTTCTGGTCTAGAACCCTGAAAGCTATAAATGAGATCCTCCTGCATTTATTCAATGGACTAGTGAGTGCTGAGTTCTACAGTGAGACAGAGAGGGACAGGTATGTCAGGGAATCAAAGATGTCAAGCATGGGG-TGTACTCCATCTAATTCTTTCCTCATTGCTGTCCATTGCCTTTTATTAATTCCTCCATCTTCAGCTTCAGGATAAGTCGATCTACTGTTTTGCGTTTGAACTGCAGCTCAGTACAAAATTTTGTTCCATACAAAATATTTGTTGGGATCACAAACAACAAAACA-----GATTGTTTGGAAAATATAAAGATTCACATGAGCATATACAATGATAAAGAACAAAAGTACAATAAAACAGCAATGTACAGGGACAATATATTTGCATGTAAAGTGTTCATATTATAATTTGCAAAGGCTCATTAAAGTTTATAGAAGTCCACATCTCCATAAATAAGTTGGCAAAGAATAGGAATGaacaggcatgaacaggcagttcatccaagagaaaatacaaataggaaacaagcaaacgaaaatattttagttctcaatacttatcaaagaaatggaaattaaaGAAATTGATAGTAAGAAATATCAACTTATAAATGCTAAATTGTACTAAAAAACTAAGATCTTAGAAACTTAAACATTCATTAAAA-TTAACATTCAAACAAATTGCATATTTGAAGGGAAACAAAAATTCACATAATGATCAAACAGGTAAAACTATAAAGCTATCCATACTATTTGGGACTGAAAAACCATGGCGGGACATATCCTAAGGAAATAAAAGAATCAAAAAGCTGTATGTATGATGATATTTATTGTAACTAAAGGAGAAAAACTTATTAAACAGTAAAAGAATATTAAGTAGCCAATAAAAATAATACTTTGCAAA-CTATGTAGAAATCTAAAAGAACAGTAATTATATAATACTAAATGAACGTCACAAATGCAAAACGATTCCAGCTATTTAAAAACTGTATGTATGTGGTGATTCACAAAGTTAAAAATATGCAAGTTGTTTTAGAGTAATAGGTTAAGATTCTCTCCCTCTTTCTTTTTCTTTTT------GCAAATTCCTGTATTTGGATTATTTCACCTATCCTATGTATTTCCCCCCCTAAATAATAGCAAAAACTCAAAAACATTTTCAAGGGAAAAAGAAGAAAAAGATGAGTATCTGGAGGAGATACTTCTCCCCCCTCACCTTACAGTCAGGCTTTTGCTGACACTCAATTTTTTTCAGCCCTGTCAGCCCCTTTTGGGAGGAGTTGATGTGTAGCCCTAATCCTCTCTGCTGGCTGCCTCCCTATTCAGGAGGGTATGCAAATACTTCCAAACCAGAGCATTTTAGACCTATTCAAGGCCCAAGACAACACACTTTTCATTAGCATTTGAAGTGTGAGGGCTGAAAAAGGGGAATGGACAACTTTTTTTCTTTATTCTTTTTTTCCCTTTTGGCTCGAAGCTTTGGGGAGACTTGAAAATGTACGTTTTTCATCCCTTTGCACACATCAGCATTGGCGCTAAACTTCAGAGGGATGCATTGACTGCCCTCAGGGGAAAGCATTCAGGGGGATTTTTACACATACACAGAGGGCCATCGCCTGAAATAAATCACAGAAAGAAGGTGGCAGAGATGAAGCGAGAGGGGTTCAACGC-GGGCTAAGCTATGCGTCCAGAGGCATGAATTTAAATCGCGATTTATTTTCTTCTCGCTCTGCTCTTGCATGAACCT--GTTTCTTAATCTTCAGCAATGGGGA-GGGGGCTTTGGGGAGAAGCAGCACAAGATTTAAAATGCAAGGCAAGTCTCCCATCAAACAACCCTCTGGAGGTGCTCTGTCTGTAGCCGTGATGTTAGAGCCTGGCGCTCTGAAGCCTAGGTCACAAGTTCAATCCCCTTCTGGGTCAGTTAGCTTTTCTCTGTTCCACAGCCACAGACTAAAGGCCTGAGCCCCTTATTCAGGCCAAATGTCTAACAAAATGTGTGCCCTTGGTCACTGCACAAAACAGCCCAGCCAGAGCCTAGCAAATCCATCCTTTTCTGTTGGGGAGCCGTCAGGAAGCAAGCTGTCCTTGGGGGCCTATAAAGACAGGGCACATCTCTGCACGGACAAGGTGAGAAGGTGAGAAGGTCAGAGGGAGGTAGTGTGTGGGTGCTGAAGATGGCCAGAAGTTGGAGGAGATGGAGCCCAACAacttactgtgtgactctgagtaacttattcaacctctctgggcctcagctgtagacaagctgttgtgaaaactgagtgtgttaatgcacatcaagagattaacactgtgcctggtacacattaaacagtcaGATTTTGCTAGGATTGTCATCCCTAACCATCATGATAAAATGCTGTTCTATGGCTATTTCAGGAAATTTGAGAAAAGGGTTTAACATGTGAAGGTAAGACAGAGAGCTTTTTGACTGATATCAGTAAAAATGATGATATGCCTAATATGTATCAGGTACCGTGATAGA-TCCTTTTGCGGGAAGATAGGATATTATAAAGTAATACATCCCACATGGATACATGGATCTTGACCCCAAGGAATTTAtagagccagataaccctgctataaaccctgattcactcaattaggaatgacattggatcagttaatctgtcggtgcatttgtttcctcatctgtaaaatggggattataactgcctacctcataggggtgttactgaattaaatgagtgtatgtgaagtgcttagtatttacagtaagctgttaaatgagtggAT-TTTTAATTATGTGAAAATAAAGCATGCTTTTGCCATTCTTCAGCtttatttattctttgatacggtgtctctctttgtcgcccaggctggagtgcaatggtgcaatctcggctcactgtaacctctgcctcctgggttccaacaattttcctgcctcagcttcccgagttgctacgattacaggcg-ccaccaccgtgcccggctaa-ttttgtatttttagtacagacagggttttactatgttgctcaggctggtcttgaacgcgtgacctcaggtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctggaattacaggcatgagccactgcgcccggccCACTCTTCAGCTTTAAAAAGGTGACAACATCCTATTACAAGCCAGATCACAGCCTTGGTA---TTTTTAATAATCTGACTCCAAACTACCTTTCTGGTTTTGCTTTCGAATCTCCACTCCCTTCCTTCACATCATACTTCGTGATCCACTAATAGTGATGGGCTCCCTGATGCTTCCTGGCCTCCATGCATGCATTATCTCCC--------TTTCCTCCCTCATTTGTCCATCTGGTAAATAAATCCTCAACATACCTTTCCTTTGGAAAGCCCTCTTTGACCTGTCCAGAAGAATCCCCTGCCTCCTGTAACTATTGGTTTTTATATGTACAAGTTTTTACATACCCAATCATAGACCACAGACCAAAAGCATCTTAAAGTGGAGCTACTTAAAATAGAGACAAAAATAATATTAAGAAAATAATGAAAAAGAGATTTCCAATGGAGTTTCCAAGGGGAGGCCATCCCTCTGTCTCACTTTCATAAAAGAGAACAGAGCATGACTATATAATGCAAAGGAAAAGAGCTGACATTAGTTCTGTTTGTAAGGTTTTCCACCCTCCCACTGTAAGTACCACTCCTTATTAAGGAAGCCTAGCTTTGTGTCCATGATGACTCCATTCTGTACTTGATTCTTATCATAGCCTTTGCTTTTAATCAGGAGGGAGCAAGCTGCAGGAGAAGCCCTGAGCCCACCCTTGAGCAGATTTGAGaatggatttcatttcaagatctaactgattggactgagaaggatggatctgagagggactgctggattgggactgcatctaggcacagcagaagagagtgctgtggttgatgagtgatgcctgtagtgggttctagaaagaagagtggttgcagttttgtaacatagttgcaaaccctgTCTGAGAGGGTGTAGTATATTCCTAACACTTGCTTAATATTTCATCTAGAAGTTGGAGCCAGCTAATACAAGCTCCCCCAAGTTGTCTCTTCTCTATTTTagggatccccaacccctgggccccagactggtactggtccatgacctgttaagaagcaggctgcacagcaggaggtgagtggcggtgagcaagcattacctcctgagctccaccgcctgtcagatcgtcagcagccatagattctcataggagtgtgaactctactgggaactgtgcatgcgagggatttaggctgagcg-ttcttatgagaatctaatgcctgatctgaggtggaacagtttcaactagaaaccatccccttccccagtccgtgaaaaaactgtcttccacgaaactggtctctggtgccaaaggagttgggcaccTCCGCTCTACTTCATTATTTCCTGGTATCTTACCTTGCCTTTCCTACTGAGCAACAATCTTAAGAGAAAAAGAATTTTTTTTCTAGAAATAACATATTATACCATATAAATagtcatccctttgtatccacagaagactggtttcaggaccccgagtggataccaaaattgacagatggtcaagtccctaatataaaatagtgtcatatttgcatataacctatgtacattctcctatatactttaagtcatctctagattacttataatacctaatacaatacaagttccatgtaaatagttgttatactgtattgtttatttgtattgtttttattgttgaattgctattttttatta-ttttgaatatttttgatccacagtgggttgaaactgtagatatgcaacatgcagatacagaggtcgactgTATACATTTTATATTTGTCaattaaatatataattaatttaaaaaaGAGAAATTGTCCTTACTCCAATCACCTCCCATCTGCCCGGATCTGAAAAATAAAAAATTGCTCCATTTCCTTACAGCATGTTTAGAAAATGTATAATAGGTTCTCTGAGAAATATTTTAAGAGGATGAAATGCTGAGCAACTGCAGGGACCTAAAGGAAGTATAAATCCATTTGCTGATTTAAAAAAAAAATTAGTTTCAGCAATGTTCAGGCTTTGGGAAAATGGATTGGGAAGACCATTGATGGTGGCAAGAAAAGAATAAAATG-GGGAACTCtattcgttagctgttattgctagcaaaccacctc---------------aaaacaaccatgtatttggcttctgggcctggggtttgatggggcagttctcctgacctaggccagtcctggctgatcttggctgggcttatttatgcctgacatcagcttctggaccagctgtgagctggctcgtctagaatggtttcagctgggatagctcatcttcattcccatggtctgtaactcagaagaccagtccagttttttcacatggcagcagggcaggattactagagagagtagacactggtaaggtttctttgaggctcaggcttagaaatggcataatgtcacttttgccatattgtcttggccagagtaaatcacaaggccagcccagattcaagggctccatcttactaggaggagctataaagtcacattacaaatgcgccttttaccaggaaggaaataactagggccgtttttacaaacagtctaccaGTCATTTCCTGAAGTGACTGACTAGGA--TGCAGGAAGGCAAATGAGGGCAAATGAGGCCTCATAAATGGAGATGAGGCCGTGAGAATGGAAAGGGGGCCAACAGCAAAATAGGGAAACGAATGGGGGAAGGAGGGGAATGGTTCATTAGAATAATAAAGTAGGGGGCAGAGAATAAAACCACTCACCTCTAATGGCAACCATGATATAGTTGAAGGAAttaaaccctctagaatttaatttcttcatatataaaatgggaataataacatctggattacaaggtggttgtgagattataaataaaatgcataaaagatttagcCTACAT-GTGGGATATAACACACACCCCCATATACACAACCCCATCCACGCATGCACATTTTATAATTACACATGTGgaacacctggccaagagtcaaagacctggggcgtgttctcagatctgatttttataatgtagtaagtcagagcaaatcacttaaatctctgaacttcagtctt---atctgttgaatggggataataataacaacctcAAAATAACCCTCTTGAAGAGTTCAAGAGAGGAACCAAAGAG--CTCTGTGTGCTTCGGAGAAGAGCTTAGCCTTGACCTTTAACCCAGCATGAgcagaaataaagtaaaggtcccaggattccacatgcttctggattcctcttgtagccttcccacttcttttgacttaagactttaagaaaatcaggattaattatattgtgcccttatccctcattctcagttctcacaagaagcccagaaatctgtggatatgcctcttccctcagcctcccatttcatatggcactgtacctattcttctcACTAACATTCTTTATCcctcaagtcacaatggccacctatccagtgct--gtcacctatgtgactagtggctaccatactgcacaggacagCCTTCATCCTTGCACCtctaactcattctcctgatgatttcttccattcccatggctttaaaggcaatccctgtgttaataaatccaaaacatatatctatggctcagacctcttagctacactccagtagccactgcctccttaacatatccatttgaatgtgtgaaagacatctcaaagtcaacatgactacaacaaaaattgtgtgctttccttccaaatctgctcctcccatgatctttgccatttcagtgaacaacaagctcattcttttaattgaccaggccacaaatcttggagtgatacttgactcttcttttcctcttaaaccccacttctgatccatcagcaaatcctcttgattctctatcttcaaaacgcatctgaatttgtacattcacatgtccaacacagccctcctagtccaag-tagcgtcatctctca a score=85752 s hg17.chr12_random 362890 1158 + 466818 ttggcca-gctggtcttgacgtcctaacctcaggtgatccacctgcctcagcctgccaaattgctgggagccacgggcctg-------------gccaatcatctgctttttataggtgataatactgaggcagggagtagttgtaaaatggagtctcagatcatagctataccaagcagggaatctggtttcctgtcctggcagtctgactccaagatcctctcttagaaaccatcatactgtaAAAACTGAAAAGAAATAAAAATCCAAGATTGGAGACTGATTTTAACATCTATTCATCT-AAACCATTAAGTAATCAAAAATGAATTAAATAGAGGAAAATACAACTGACTATTCATACACAGAGAAGTGTAGACTCTTCAATGGAAAACATGTTTTTTAAGTGCCCAAGGAATAGTTATAAAATTGCTGAGTATTNTAATTAAACAACTAATATTTAAGTATTAGGCTCAAGAGAATAATTTAGTCAAAGTCCTAAATATGAGAGGCTAAGTTTGATAAAGATTGAAAATGCACTGAAAAGCCCAAGTAAGAAAATTATTTTTTCATTTTAGAAATTATAGGACAATAATATTTCCCAGCTATGAG------gtgtgtgtatgtgtgtgtgtgaacgtgtttgtgtTAATGAGCTTGTTAACAATAAGTTATACAAAATTATTAGTTGGCAGCAACCAGATTTTTAGGAATATTGGCCTTCCTGGGCTTCCCAAGAAAACGTTGGATGCTTTTGGTAGGAAAAGTTAGGACTCACTAAATCTGGCACAGAAAAGGTGAATCAACAGTGGTCGTGATTCTAGTTTTGACCGAGCTGCATATAACAGTGTAGGCATCTGATGTACGATCTATGTATTAGGTTAGAAAATTTCCCTTACAACTGCCATTGCTCAGCACAAATTATAGAGAGGTTAAACAAGGAATAAATGGCAAAATGATGAATAAGAATATGACCTGATTTGCATGCTGGCAAATGAGAATTCAGCTTTTACTTCAACATCAGCATGAAACATTTTATCTTATAACAAGGTCACAGCATTTGAATAGGAGTTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCATGTTTTCCATTAAGACAGCCTTGAACTCATTCAGTAGCATGGCCCGGTGCGTTCCTGCTTGACATTAGTCAGAGAATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 12298 1172 + 81052 ttggccatgctggtttcgaactcctgacctcatgtgatccacctgcctcgaccttccaaagtgctggg-gtcacaggcctgagccactccacccgCCtatcatctgcttttcataggtgagtgtactgaggcagggagtagttgtaaaatggagtctcagatcataggtttgcca-gccaggaatctggtttcctgtcctggcagtgtgactccaagatcccctcttagaaaccattatactataAAAACTGAAAAGAAA-GAAAATCCAAGATGGGAGACTGATTTTAACATTTATTCATCTTAAACCATTAAGTAATCAAAAATAAATTATATGGAGGAAAATAAAACTGAATATTTATACACAGAGAAGTGTGGACTCTTCAGTGGAAAACAT---TTTTAAGTGCCCAAGGAATAGTTATAAAATTGCTGAGTATTGTAATTAAATAACTAATATTGAAGTATTAGGCTCAAGAGAATAACTTAGTCAAAGGCGTAAGTATGAGAGATTAAGTTTGATAAACATTGAAAATGCACTGAAAAGCCCGAGTAAGAAAATTATTTTTTCATTTTAGTAATTATAGGACAGTAATTTTTCCCAACCATGAGTGgtatgtacgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtttgtgtTAATGAGCATGTTAACAATAAGTTATACAACATTATTAGTTAGCAACAACCAGATTTTAAGGAATATTGGCCTTTCTGGGCTTCCCAAGAAAACTTTGTATGCTTTTGGTAGGAAAAGTTGGGATTCACTAAATCTGGCATTGAAAAAATGAATCAACAGTGGTCATGATTCTAGTTTTGACCAAGCTACATATAACAGTGTAGGCATCTGATGTACGATTTATGTATTAGAATAGAAAATTTCCTTAACAACTGCTGTTG-TGAATACAAATTGTGGAGAGTTTAAACAAGGAAAAAATTACAAAATGATGAGTAAGAATACGATCTGATTTACATGCTAGCAAATGAGAATTCAGCTTTCATTTCAGCATCAGTATGAAACATTTTATCTTATAACAAGGGCATATTATTTGAATAGGAGTTAATTTGAACTGTGTTGGAAATTATCATGTTTTCCATTAAGACAGCCTGGAACTCATTCAATAGCATGCCCCAGTGCTTTCCATTTTGACATTAGTCAGAAAATT a score=40150 s hg17.chr12_random 364048 591 + 466818 TAAAAGGAACAAGAACATTACTGCACAATCAGAAATCAGGTGCACATAGAAATTAAGGTCAGGACCTTAAAGGGAATATTGCCCATTGATATTAGGCCTGCCTTAAAAAAATTCAGACATGGTATGTTTACTACTCATCATTATTAT-----------CCATAACAGTAATGGTAGAATTTGTATTTTCCCATAGGCACCTTCATTACACTTATATACTGATTTGATATTTCAACATATTATTTTCTTTGGGTCCTTTTAAGTAGTTGTTAAACAATGCTGAAAGTTGCCTTACAGTATGCTGTTAACTAATCATATTTTCTCAAAGTCATTTGGCATAATATTTGGTTAAAAGAAGTATGTCTAGTATAATTACATGTGTTCATAATAAAAGAGCACTTAAAACTTT---AAAAAATATTAGAAAAACGAATAAAGGAAAATGAATACatatataaaatatataattcattattaataaatGTGCATAAAATCACACTCATAGAATTTAAAAAGAGTAACAATTTTTGAATTAAGGATACATTCTAAATTATAATAGAAAAAGGCTTATAAAATGTTAGTTTTAATAATACTTTATGTAAATAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 13725 590 + 81052 TAAAAGGAACAAGAACATTACTGCACAACCAGAAATCAGGTGCACATAAAAATTAAGGTCAGGACCTTAAACGGAATCTTGTCCATTGATATTAGGCCTGCCTTAAAAAAATTCGGACATGGTATCTTTATTAGTACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTATAGCAGCAATGGTAGAATTTGTATTTTCCCGTGGGCAACTTCATTACACTTATAGACTATTTTTATATTTCAACATTTCTTTTTCTTTGAGTCCTTTTAAGAAGTTGTTAAACAATGCTGAAATTTGCCTTTCAAGATGCTGCTAATGAATCATATTTTCTCAAAGTAGTTTTACATAATGTTTGGTTAAAAGAAATATGTCTAGTATAATTACACTTGTTCATAACAAAAGAGTATTTAAAACTTTAAGAAAAAATATTAGAAAAACTAATAAAGGAATATGAAC---------AAATATATAATTCATTATTAATAAATGTGCATGAAAT---AGTCATAGAATTTAAAAAGAGTTACAATTTTTAAATAAATGATACGTTTTAAATTATAATAGAAAAAGGCTGATAAAATGTTAGGTT---TAATATTTTCTATAAATAT a score=21308 s hg17.chr12_random 365442 314 + 466818 CATATCACTGAGTTTtaatagctaaagttgagaagtctctcaaatttccgtcagtgataaaatgtataaataaattatggcacacttgtacaatagaacactatacagcaatcaaaatgaaccaactagagagacaagtttacaaagaatataaataaaaaggaaaatgaacgtatttggacaacatcgatatgagaggaattattaaaattgaaaaaagattcagtataattccatttatataaagtttacaaaaa-atatttttaataaattacaatttattacattggtggcgaaattctaaa-gtgagacat s rheMac1.SCAFFOLD85456 14506 311 + 81052 catatcactgagttttagtagctaaagttgagaagtctcttacatttccatcagtgataaaatgtatgaataaatta--gcacacttatacaatagaatactataaaacaatcaaaatgaaccaattagagagacatgtttacaaagaagataaataacaaggaaattgaacaaagttgaactacatagacatgagaga---tactaagatggaaaaaagattcagtataattccattgatataaagtgtacaaaaataTATTTTTAATGAATTGCATTTTATTACCTTGTTGTCAAAATTCTAAAAGTGAGACAT a score=12486 s hg17.chr12_random 365756 151 + 466818 gtgagtgattatcataacaattgggatagtagggatggaggaaacaaaagggaaatgatatcaacaggaaggcatatatggggagtgtctggattgctggcaaattctactttatgaccaagatgtgataacatgactcttaatgccataa s rheMac1.SCAFFOLD85601 16331 150 + 44828 atgagtgattgtcataacaattgggacaatagggatggaggaaacaaaagggaaatgatgtcaacaggaag-catatatggggagtgtctggattgctggcgaactctacttcatgaccaagatgtggtaacatgactcttaatgctataa a score=19144 s hg17.chr12_random 365907 283 + 466818 ttttttaatttactgtacatttagg-ctttattactttataaatatgcttcacaataatgaaaaTACTTAAAAAGCA-AATCatataataaataaat----ataaaataGGCTGAAAAAACATATTCTTATAGACATCATGATAATTAGAGTTTT-GCTGAATAAAGAAGAATAGAGCATTATGATAGTAAGAAATCCAAGataaaattttaaacttttctttaaat-attttaaaaaGTAAGAGATAAGCAGGAAGTCTACCTCCACATTCTTAATGTTAGTTTTACTAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 14868 288 + 81052 TTTTTTTCTTTACTGTACATTTAGGGTTTTATTACTTTATACATATGTTACACATTAATGAAAATACTTAAAAAGTAGAAACATATAATAAGTGAATGCATACAAAATAGGCTGAAAAAACATATTCTTATAGACATTGC---AATTAGAGTTTTTGCTGAATAAAGAAGAATAGAGCATTATGATAGTAAGAAATCCAAGATAGAATTTTAAACTTTACTTTAAATTAATTTAAAAAGAAAGAGATAAGCAGGAAGTCTACGTCCACACTCTTAATGTTACTTTTACTTG a score=436 s hg17.chr12_random 366209 31 + 466818 gggtgcggtggctcatgcctgcaatcccagc s rheMac1.SCAFFOLD31009 2772 29 + 42162 aggctggagtgcacaagc--gcaatctcggc a score=195 s hg17.chr12_random 366287 106 + 466818 ccatcctggctaacacggtgaaaccccctctctactaaaaatacaaaaaataagccaggcctgatggcaggcgcctgtagtcccagcta--ctccggaggttgaggca s rheMac1.SCAFFOLD31009 2816 98 + 42162 ccacctgggctgaagtgat-------tctctcaactcagcctccagagta---gctaggacaacaggtgtgcacaaccactccctgctaaatttttctggttttggta a score=193 s hg17.chr12_random 366413 84 + 466818 gagatggagctt-gcagtg------aggcagagcttgcagtgaggcggagcttgcagtgaggcgg------------agcttgcagtgaggcagagcttgcag s rheMac1.SCAFFOLD85456 40476 94 + 81052 gagatggggttttgccatgtttcccaggctggtcttgaact---------cctgtgctcaggcaatccacctgcttcagcctcccaaaatgctgggattacag a score=902 s hg17.chr12_random 366546 32 + 466818 tccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa s rheMac1.SCAFFOLD85456 40611 32 + 81052 ttttttttaaaaaaGAAGACATAAGCAAGAAC a score=301814 s hg17.chr12_random 366578 4208 + 466818 gaaaCATCAGATTCTGAGCATCTGTATTACACTAGACACCTTTTTTTCTTATTTCCAATTTCATTATTTATGATAACA---TTTCAAAGAGGCAGAAATTAGTGAATTTCCAATAAATTATAGTAATATAGATATTAAATACACAGGACAATTTCTATAAATTTATCTCTAAATGAAATAATTATGCCCAT--TTTTACCATTCAAAGATTATA---CCATGCATGTGTACACATATGTGAGGAAAAATATTTTGATAGTACAAAGTTTTTGAATATTAGAGAAGAATTAGTAGAAAGATAATTTTGTTGAGGCATAAAGCATATTTAGTGTAACTACTTTGACTGCTGTAATAAAATCACCCAGATTTTGTGACAGTAGCTGAGATTAAAAATAAACAGTAGAGAGAATTTCACTTGTTAATAATGCTATTAAAAGATGAA-----GCTTATACACTTTATAATTGCACAGAGTATTTGTGTAAGTTCATATAAAAGTGGAATAAAATTAAACAGCCAAAAAGAGAGTATTCTTTGCTAGAGGTCACTTTTGGGGTAATTTTTAGAATGTGGTAAAAGAAAAAATATCTTGCAAATCATTAGAAATATGTTGATTTTGTGTTACTCTTGATGAAATACTATGTGAGGGTATTTGTCTAGGCCTGATTCTGAGAATAATATAAGAATCGagccaggcaccatggctcatggttgtaatcccagcactttggaagttgagactggtggatcacctgaggtcaggagttccagaccagcctggccaatatagtgaaacccactgtctactaaaaatataaaaattagctggatgtgatggacagcacctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcaattgaaccttggaggcggaggttgcagttagctgagattgtgccattgcactgcagcctgggtgacaagagcgaaactccatctcaCACACACACACACACAAAATGTAAAGCCATGAGGATGAATAATAGTGTTCTCCCACCACCCTTAACTCTAGTGCTTTGAAAAGAAGACTCGAATCACAATTATTTAGTAACATTCTCCCTTTCAGGTGAcatcatcatcattattatcatcatcTACATTTACATCTGTCTTATTAAATGATTTATTTCTGAAATATTTACATACATAATTTGGGTAACGTCTATGTAATTTCCAAGAGATATCATTGTGGGAAAGTTACATTAGTAAACAGCAAAGTTCATGTCAGGCTGAATACATTGAGATTTAGAAAGTTAAGTGTAGTGTAGTGTAGTTTAAAATACATTGCTTAAGAAAACAATTATAGATGATATTAAACTAATCCAAGGAACACTATAAAAAG-ATTTTGATTTTAGTATAAATAAAATTGCTTAGTAAGAAAAATAAATAAACCATTTCATGATCAAGCTCTTATTTCTAAAGAGAGGATTTTAGGGCTAAATAAATCAAACAGAAGTAAGCTCTCCCCCACAACTTGTCTATATCATTTGGATAATGATGTAATTCAAAGGCACAGAGCACCTTTTCAACAACATAAGCAAAGTGAAAATTATGTCATGGAATACAATGATGTATCTGCGGTTAATGAACTATATTTTATCTATTGCAATGATATTTTGAAATCCAGTGCTGCTCTTTGAGTTCCCTT-TGAGCAGAGTTTGTGGTGGGGACCCAGCAACAGACAAGCTAATATCCAAAAAAAGCTACTCACATCAACTTAATTTCCAGTTTCTTTCAAATTGAAGGTAAATTCTAACACAAAGCTTTTATTCTATTCTCTGACTAAAGTGTTGGGAAAAGAAGAAAATTGTTACCGTTTTCATTTCTAACATACTAAAACAAAAAACAAAAAATCAAAAAAATCAGAAACATTTTTAAAAAGAACAGAGTGTTAAGAGTAGTTTGTT-CAGTTTTCCTATAGAAAATAATGTTCAGAAAGAGAATAAAAGATTATTCTGAACACTAAAACAATAAGACTAAAAAAATGAAATATCAGTactgagaatccaatagaaagagtcaaccagttaga-gcactagaagagataattagtgaattagaagatagctacacagaatgaagcatagagagaaagaaatggaaaatgcaaggctagagggtaacacactgatgctatcatcaaaacacctaacatacttgtagagttctgtaagattagaggagagaaAACAGAGCGAGAGAAATGTTGCAGGGATTTTTCCAAAAGTGA--AAATGTATCCCAGCATATATCTTTAGTAATCACAAACTTCAGGCATGATAACTAAAATCAAGTTAACAAAAAATAAtacaggacaccaaagaccagtagaaaatctgaaaagtagctagaggtagaag-atagagtatgttgataagaactgcattctaaatacaacctga-----ttttaacagaaaatatggaaggaggaattcaatggaatcatgtcttcagtgtgttTCCAAAGAGTAGTagaccttcataaacagaaattgaaaatgatatttttcagatataataaaaattactgaaaatacaaagttgaacatgcaaggagcaataaaaattaatgac---gaaaaataagtgtgtaattctaaataaatgttgactgtataaaacaatattgtcttgttggattaAATGTATAATTGATAAGATATATGCAAATAGCAATAAAGAGACTGGAGATAAAGGTGACAGGAATAAATTTAGTCAAACTGTGTTTTGGGCTTTTCTATGTCTGTGAGGAGAATTTGAATGTcataatcaaggacgctgtaattctacacccagctatatatatgcaaaggaattgtagcaaatgatatgtgaaagaatgctcattgtagaattattctaacagctcagaaaagaagctgcccatatgtacatcaaataaggatgaataaataattacaataaaatcataaaatggaaaaacatagagaagtgaaaagaaatgaatcacatgtacatgcagttatgtgattacatttcagatccataatgttgagcacaggaagccatgaatacgaacatataggattgtatctatacagagttccaagcagaccaaaccaagctattgagtttagggttgcatacctagttggtaaagtataaagaaaaattttaaaaaatgatcatcataaattatggacgttgcgtattacaggaggtgtgaagaaaggtgtagagggatggaaac--acattgaggtaaacctaggctgttagcaacattccatgtcttgccctacctgatggttacatgagtgtttaTGACATATTGCTATGTTTTCCATTTTTGTTTTGGCTCATTTCTAAGTGTGCAGTCTAGttataatataaaaattattaatCAGAAGAAATGTTCCATGAAAATTATTATTACTCTGCTCATTATATACCAAAGGGAAAAATACACT----GTATACATTCATGTACAGCTCTAAAAGATTTTAATTAGAAAATTTTTGATTTTAGTTGTGACTACTGAAAATTTGACAAGATGTTTCCTGCCAACCCCAGATTTTTCAGTAGATATTTCTTCTAGTTTTAATTATCTACTTCATGTGACAAAACATTGACATTTTCCATCTATTTTTCCCTTGGATCCTGAATTCCTGACACAACAGGGGTGGACATGTTTCCCACACGCTTGGCTTAGCAGAATACCTATATCACTTAAGTTTTTCTGCAAGAGAAAATCCTCCAAAACTGCATTAGATATTTGTGTCTCATGTGTCTTTGGATTTCATTTTTGTCAGCTAGGTTTGGTGGATGGCTGTGGTGATTGGAGATGGGCCACATTCTGCATCTTGAAGCTA------CTTTGGCTGATTTAGGCTGGATAAAGCAGTGGCATTCTGACTCCATTAGTTTCTCATTCTTCTTCTGGGAACAGTGTACTCACCAGATGATGTTCTCATGGTGAATGGAAAAGAGCAAGAAACTCCAATATGGAAACCGTCTTAAATCTCTGTGTAAAGTCTACTAATTTGCTGTTCACTGAAGCAAATTACATGAGTGAATTCAGAGTCCAAGTTCCAGGTAGTCACCCTGCCTGTGGTGGGAGGATACTGCAGGATTATATGACAAAGTGTAGCGTACTTAGAAATATTTGCAAAATTGCTGACTGttttaattaaataattaatatttaaaCAAAAAACAGACTTGAGAATAAATTTACCAAAGGCCT s rheMac1.SCAFFOLD85456 15156 4173 + 81052 GAAACATCAGATTTTGAGCATCTGTATTTTACCAGACACCTTTTTTTCTTATTTCCTATTTAATTATTTATGATAACAACATTTCAATATGGCAGAAATTAGTGAATTTCCAATAAATTATAGCAATACAGACATTAGATATACAGGACAATTTTTCTAAATTTATCCCTAAATGAAATAATTCTACACATATTTTTACCATTCAAAGATTATAACACCATGCATATGTACACGT--GTGAGGAAAAATATTTTGATACTACAAATTTTTTGAATATTAGAGAAAAA---GCAGAAAGATAATTTTGTTAAGGCATAAAACATATTTAGTGTAACTACTTTGACTGCTATAATAAAATCACCCAGATTTTGTGACTGTAGCTGAGAAGGTAAATAAGCAGTCAAGAGAATTTAACTTGGTAACGATGCTATTAAAAGATGAAATGCAGCTTATACACTCTATAAGTGCACAGAGTATTTGTTTAAGTTCATATGAAAGTGGAAAAAAATTAAACAGCCAAAAAGATAGTATTCTTCGTTAGAGGTCACTTTTGCCATAATTTTTAGAATGTG-----------AGTCTCAAGTAAATCATTAGATATATGTTGGTTTTATGTTTTTCTTGATGAAATACTATGTGAGGGTATTTTTCTAGCCCTGATTCTGAGAATAATATAAGAATCATAccaaacactgtggctcatgcctgtaatccaagcgctttggaagtcgaggctagtggatcacctgaagtcaagagttctagaccagcctggccaacatagtgaaacccactgtctactaaaaatataaaaattagctgagcgtagtggtgggcacctgtaatcctagctacttgggaggctgaggcaggagaatcaattgaacctgggaggtgg-ggttgcagttagccgagattacaccatttcactgcagcctgggtgacaagagtgaaactctgtctgaaaaaaaaaaaaa----aaaaGTAAAGCCATGAGTAAGAATAATAGTGTTCCCTGACGACCCTTATCTCTAGTACTTTGAAA-----------------------------CATTCTCCCTTTTAGCTGAcatcatcatcattattatcatcatcTACATTGACATGTATCTTAGTAAATGATTTATTTCTGAAATATTTACATACATAATTTGGATAACGTCTACATAATTTCTAAGAGATGTCATTATGGGAAAGTTATATTAGTAAACAGCAAAGTTCAAGTCAAGCTGAATAC-TTTAGATTTAGAAAGTTAGGTATAGTGCAGT-----TTAAAATACTTTGCTTAAGAAAACAATTATAGATGATATTAAACTAATCCAAGGAACACTATAAAAAGGATTTTGATTTTAGTATAAATAAAATCACTTAATAAGAAAAATAAATAAACCATTTCATGATCAAGCTCTTATTTCTAAAGAGAGGATTTTAGGCCTAAATAAATCAAACAGAAGTAAGCCCTCCCTCATATCTTCTCTGTGTCATTTGGATAATGATGGAATTCAAAGGCACAGGCAACTGTTTCTACAACATAAGCAAAGTGAAAATTAATTCATGGAATACAATGATGTAGCTGTTGTTGATGAACTGTATTTTATCTATTGCAATGATATTCTAAGATTCAGTGCCGCTCGTTGAGTTCCCCTGTGAGCACAGTTTATGGTGAGGACCCAGCAAAAGACAAGCTACTGTCTCCAGAAAGCTACTCACATCAACTTCATTTCCAGTTTCTTTCAAATTGAAGGTAATTTCTAACACGAAGCTTTTATTCTAGTCTCTGACCAAAGTGTTGGAAAAAGAATAAAATTGTTACCATTTTCGTTTCTAACATACTGAAACAGAAAACAAAAAATCCAAAAAACCAAAAGCACTTT-AAAAAGAACATGGTGGTAAGAGTAGTTTTTTTCAGTTTCCGCATGGAAAATGATGTGTGGAAGGAGAATAAAAGATTATTCTGAACACAAAAGCAATAAGACTGaaaacatgaattataaatattgagaatccaatagacagagttaaccagttagatgcagtagaaaagagaattagtgaattggaagatagctacacagaatgaaacatagagaggaagagatggaaaatacaaggacagagggtaacacattgatgctaccatcagaacacctaacgtactgctggagttctgtcagattagaggagagaaaattgtgcaacagaaatgttgcaaggatttttccaaaagtgataaaATGTATCCCTCCATATATTTTTTGTAATCTCCAACTTCAGGCATGATAACTAAAACCAAATTAACAAAAAATAATAAAGGGTACCAAAGATCAATAGAAAATCTGAAAAGTAGATAGAGGTAGAAGTATAGAGTATGTTGAAAAGAACTGCATTCTAAATACAACCTGACCTGATTTTAACAGAAAATATGGAAGCAGGAATTCAAAGGAATCATGTCTTCTGTGCATTTCCAAAGAGTAGTagaccttcataaacagaaattgaaaatgctatttttctgatacaacaaaaattactgaaaatacaaagttcaacatgcaatgagcaataaaaattaatgacaatgaaaaataagtgtgtaattctaaataaatcatgactgtataaaagaatagtgtcttgttggattaAATGTAAAATTGATAAGATATATGCAAATAGCAATAAACAGACTGGGGATAAAGGTGACAGGAATAAATTTAGTCAAACCATGTTTTGGGCTTTTCTATAACTGTGAG---------------ATAATCAAGgacctggtagtcctatacccagctgtatatatgcgaaggaattgtagcaaatggtatgtgaaagaatgttcattgtggcattattctactagctcaaaaaataagctgcccgtatgtacatcaaataaggatggatacataattacagtaaaatcataaattggaaaaatatagagaagtgaaaagaaatgaatcacatgtacatgcacctatgtgatgaaattttagatacataatgttgagcccaggaagccatgaataagaacatataggatctcacctctacacagttcaaagcaggccaaaccaagctattgaatttagggttgcatacctagttggtaaagtataaagaaaatttttaaaaa-tgatcatcataaattatagatgttgcttatcacaggaggtgtgaagaaagttgtagggcattagaaagtggcattgaggtaaacctaggttcttagcaatgt-ccatgtcttgtcctacataatggttacatgaatgtttaTGACACATTGTTATGTTTTCCATTTTTGTTTTGGCCCATTTCTAAGTGCACAGTCTAGttataatataaaaattattaatGAGGAGAAGCGTTC-ATGAAAATTATTATTACTCTGCTCATTATATACTGAAGGGGAAAATCCACTATTTGTATACTTTCATGCATAACTCTAAAAGATTTTAAGTAGAAGTGTTCTGATTTTTGTTGCAACTTTTGGAAATTTGACATGATGGTAACTGCCAATCCCGGATTTTTCAATAAGTTTTTCTTTTAGGTTTAATTATCCACTTCATATAACAAAACTTTGACATTATCCATCTATTTTTCCCTTGGATCCAGAATTTCTGACACAACAAGAGTGGACATATTTCCCACAGTCTTGGTTTAGCAGAATATCTATATTGCTCATGTTTTTCTAAAAGAGAAAATCCTCCCAAATTGCCTTAGATATTTGTGTCTCATATGTCTTTGGATTTCATTTTTCTAAGCTAGGTTTGGTGGATGGCTGTGGCGACTGGAGTTGGACCACATACTGCATTTTGAAGCTAGTTAGTGTTTGGCTGATTTAGGATAGATAAGGCAGTGGCATTCTTATTCCATTAGTTTCTCATTCTTCTTCTGGGAATGGTGTACTAGCCAGATGATGTCTTCATGGAGAATGGAAAAGAGCAAGAAATTCCAATATGGAAGCCATCTTAAATCTCTGTGTAAAGTCTAGTAACTTCTTGTTGACTGAAGCAAATTACATGAGTGAATTCAGAGTCCAAGTTCCAGGTAGTCACCCTGCTTGTGATGGGAGGATACTGCAGGATTCTATGACAAAGTGTAGGGTACTTAGAAATATTTACAAAATTACTGattattttaattaaataattaatatttaaaCAAAAAACAGACTTGAGACTAAATTTACCAAAGGCCT a score=10177 s hg17.chr12_random 371300 164 + 466818 AAGCATGAGAAACATGTTTGATAAATATTATTCATTGTCTGACAACCCTGAGTGGAATATGACTAATTCCACCTAGATGACCTCCTGGGGAAACTCGTTTTCCAATTGGGGATTTATAAGAAAATAATTCATTGCATCTGCTAAGTGTGTGAGTGCATGTGTGT s rheMac1.SCAFFOLD85456 19329 150 + 81052 AAGCATGAGAAACATGTTTGATAAATATTACTCATTGTCCAACAACCCTGAGTGGAATATGAGTAA-TCTACCTGGAGG-------------ACTTGTTTTCCATTTGGGGATTTATAAGAAAATAATTCCTTCCATCCCCTAAGGTTGTGAGTGTATGTGTGT a score=45898 s hg17.chr12_random 371464 699 + 466818 CTATGTATTGAGGAGCTTATTAACAATGATGTCATATAAATGTATTGGTTATCAGAAACCAGATTTTAAGGTGTATTGGCCTCCCAGGACTTTCCAAAATAATCTTGGATGATATTGATAAAAGGTTTAGATTCTGGTATT--------------AAACAAA-CCATATTGGTATTATCCTAGTTATGACCAAGCTCCTTAAACAATTTAAACCTGTACTGTATGATATGTGTATTGGGTTTTAAAATTTCCCTATGTAACAACTGACGATGCTGGACACAAATTATGGAGAGGTTAG-CAAGGACAACAATTGCAAAACAATTAAAAAAA---TGCCTTTATTTGCATACTAACACATGAGAATTTACTTTTCACTTCATCCTCAATATAAAATATTTCAGCATATAGTAAG-ACAGACAGTGTATGAAGAGGAGTGAATTTGAGCTGTTTTGAGAATAAGAATATTTTCTATTTCTATAAAGACAGCTTTGAATTCATCCATTAGCATATGATGGTGCTTTCCTGTTGAAATTAGTCAT-GAATTTAAAGGCAGAAAATGTTACTGCACATTTAAAAGTCAAGTGTTTATCGACATTAAGGTCTGGATATTAAGGGAATCACAACCAGTGTTATTAAGGCTGCATTTTTTCTTTCTTTTCATTTGTTCAAACATGATATGTTTTCTGCTCATCATTTTATCAATTCTGGTAGTGTTTG s rheMac1.SCAFFOLD31009 33441 712 + 42162 CTATATGTTTATGAGTTTATTAATAATGGTGTCATATAAATTTATTGGTTATCAGAAACCAGATTTTAAGTTGTATTGGCCTCCCAGGGCTTTCCAAGATAACCTTAGATGATTTTGATAAAAGGTTTAGAATCTGGTATTTAAGTCTGGCATAAAAATAAATCCATATTGGTATGATCCTAGTTATGACCAAGCTCCTTTAATGATTTAGACATTTACTGTATGATATATGTATGTGGTTTTAAAATTTCCCTATGAAACAACTGAAGATGCTGCATACAAATTATGGAGAGGTTAAACAAGGCAAAAAATTGCAAAACAATGAAAAAGAATATGCCTTTATTTGCATACTGACACATGAAAATTCACTTTCCACTTCAACATCAGTATAAAAAATT-CAGCATGTAGCAGGGACACATAGTATATTAAGAGGAGTGAATTTGAGCTGTTTTGAGAATAACAATATTTTCTATTTCTATAAAGACAGCTTTGAACTTATCCATTAGTATATGCTGGTGCTTTCCTGTTGACATTAGTCACAGAATTTAAAGGCC--CAATGTTATTGCACAGTTAGTAATCAAGTATTTATTGAAGTTAAAGTCTGGATATTAAAGGAATCAGAACCAGTGTTATTAAGCCTGCAATTTTTTTGGTCTAACATCT-----AACATGATGTATTTTCTGTTCATCATTTTGTCAATTCTGTTAGTGTTTG a score=20390 s hg17.chr12_random 372163 332 + 466818 CATTTGTTCTTGGAAATGTTGCCAATGGCTTCATAGCTCTAGTAGGTGTCCTTGAGTGGGTTAAGACACAAAA-GATCTCATCAGCTGACCAAATTTCTCACTGCTCTGGTGGTGTCCAGAATTGGTTTACTCTGGGTCATATTATTACATTGGTATGCAACTGTGTTTAATTTGGCTTCATATAGATTAGAAGTAAGAATTTTTGGTTCTAATGTCTCAGCAATAACCAAGCATTTCAGCATGTGGGTGTTACTAGCCTCAGCATATTTCATTTGCTCAAGACTGCCAATTTCTCCAACCTTATTTT-------------TCTCCA----CCTAAAGAAGAGGATTAAG s rheMac1.SCAFFOLD85456 19479 348 + 81052 CATTTGTCCTTGGGAATGTAGCCAACAGCATCACAGTTCTAGTAAATGTCACTGAGTGGGTTAAGACAAAAAAAGATCTCCTTAGCTGACCAAATT-CTCACTGCTCTGGAGGTCTCCAGAATTAGTTTATTCTGGGACATATTAGTATATCAGTATGCAACTGTGTTTAATTTGGCATTATTTAGTTTAGAAGTAGGAATTGTTGCTTCTAATGTCTGGACAATAAGCAATCATTTCAGCCTCTGGTTGCTACTAGCCTCAGCATATTTTATTT-TTCAAGATTGACAATTTCTCTaaacttatttttagaagaaacttatttttagaaTCCTAAAGAAGAGGATTAAG a score=51290 s hg17.chr12_random 372495 697 + 466818 AATGTTGGTTTGGTGATGCTGTTGGGGCCCTTGGTATTTTTCATTTGTAATCTTGCTCTGATAACCACGGGTGAGAGTGTGTGGACAAAAGAATATGAAGGAAATTTGTCTTGGATGATCAAATTGAGGAATGCAATACAGCTTTCAAACTTGACTGTAACCATGCCAGCAAACGTCACACCCTGCACTCTGACACTAATATCTTTTCTGCTGTTAATCTATTCTCCATGTAAACATGTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCAACATCTCAGCACCAAGGTGCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATCTCCTTCCTTATGTTATTTGCCATTTACTTTCTGTGTCTAATCACATCAACTTGGAATCCTAGGACTCAGCAGAGCAAACTTGTATTCCTGCTTTACCAAACTCTTGGATTCATGTATCCTTTGTTCCACTCATTCATCCTGACTATGGGAAGTAGGAAGCCAAAACAGACCTTTCTTTCAGCTTTGTGACAGGTGAAATGCTGAGTGAAAGGACAGAAACCCTCAACTCCATAGATTCACAAAGGGAGCATTGTGTATCTTTTAGCTGAAAACAAACTGACGGTATCTGGAACATTTTATATTTCCATTCGTTTTTCCTTAGTGTATATATTTGAATAATTTCAAAACAGATACCTAGAAAAGTCatctatctatctat s rheMac1.SCAFFOLD85456 20332 688 + 81052 AATGTTGGTTTGGTGATACTTTTGTGGCCCTTGGTATTTTTGATTTGTAATCTTGCTCTGGTTACCATGGATGAGAGTGTGTGGACAAAAGAATAAGAAGGGTATTTGTCTTGGATGATCGAATTGAGGAATGCAATACACCTTTCAATCATGGCTGTACCCACGCTAGCCAACTTCACACTCTTCATTCTGACGCTAATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGTTCTCTGTGTAAACATCTCAAAAAGATGTAGCTCCATGACAAAGGATCTCAAGATCTCAGCACCAGGGTCCACATAAAAGCTTTGTAAACTGTGATCTCCTTCCTCATGTTATTCGACATTTAATTTCTGTATCTAATCACATCAACTTGGAATCCTAGGACACAGCAGAGCAAACTTGTATTACTGCTTTGCCAAACTCTTGCAATCATGTATCCT---------TCATTAGTCCTGATTCTGGGTAGTAGGAATCCAAAACAGACCTTTCTTTTCATTTTGTGGCAGGTGACATGCTGAGTGAAATAACAGAAACCCTCAACTCCATAGATTCACAGGGGGAGCATCGTGTGTCTTCTAGCAGAAAACAAACTGATGGTATCTGGAATATTTTATATTTCCATTGGTTTTTCCATAGTTTATGTATTTGAGTAATTTCAAAACAGATACCTAGAAAAGTCATATATAtgtgtgt a score=1173 s hg17.chr12_random 373192 40 + 466818 ctatctatctatctatctatctatctatACACACACACAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 46770 40 + 81052 atatatacacacacacatataaatatatatacacacacat a score=146810 s hg17.chr12_random 373234 2009 + 466818 ATATATGTGTGTGGGTATATGTGTGCATGTGTGTGAATAACAACATTGACCACAAATTATGAAGCCGAGTATATTTCACATATATATGTAGGTATATTTTATGATAGTTCATCCTATGGTATTTCATGTGAAGAATTTATTACCTCTATTTATAATTAGGAACTTACAGCTTTTATCAGGAAATCATTGTTGTTTTCCATTGTAATTTGTACCACATATATGTACTTAACTATCATTGTTTGAACCTCTAATTTTTTGGATGGTAAAAACATTCAATTCTAAATTAATGATGAGAATGGATCTTTGGGGTAGGTTTTATTTCATTATGAATTCttattttatatttattataaaGCAAATAGAATGGTTGTTAGCTAATGATGCACACAATAAAATTTGAGTGACAAACATACATACATAAGTAGAGTAAATTTTGTATGTGTATACCAAAAACTGTTCTAAAGGATACTGGATTTAATAGTAGTATGTGAATAGATTAGAAAAAAAT-CATTTCTATAATAGGAATGAAGATACATGATCATGATACTTTCAGTGCTGTTATAATTTTTTAATGTGTAGTTAGAAAAGTTGTTTCTTCCACTTTTTGAATTAAAGAAAACCTTTTTTTTTTGAAATTGACATCTGATGTCAAGTATTTCCATTTATTTTGCTTAGCCACCTCCGAGCCCTTGAATTTCCAATTTTC-CCTTTGTCTCCCATTCTTAATATTTCTCAAAAAAATTCAATTATTCCCTCTCTTAAAATAAACTCAATGTAAACAGGGTATATAAACTATGGATCACAATTGAATGAAACATTCTGCAAATATTGAAAATTATCTGTCTAATCTATATATTGATGATAGGAAATGTATTAATCATATGTTTCATTGTGGGTGGGCAGTGAGCTGAGGCTCCTCAAGCATCTCTTTCTATTTTTATTTTGTTTCTTGACATAGGTTCTCCAGCATTTggctcaaggctccaagggcacatgtgacaagaaggcgccggctttttaaacattggaagttcttctgtgtcagttctgtgacagaacatttacttaacacatcatgaaggctagtttggatgtggaggggaat-agactccatctatccatatgaggtgagtcaaagcacttagacgtgttttcaaaCCACTAATCTTGATGATTCAGAAATGTGCTCCCTTTTCCAATTTCATCCTGATACAAATGTATCATCTCCGGATGATGCCAATATTCTCCCCAATTCCATCATGAGCTGTTCTCTATAATTCAGAATCTGTAGACTAAGTTGTAAAACTAATGACTGTCAATGTATTCTACATGAAATAGTGGGCCAAAGAAAGAGGGAAACATGATAAGTAG-AAAAATATACATACAACATTTTTTTCTTACACTAAAGATCAAATAAAAcccataggaccaagcctcccacagatactttttataaattctggataaaatatttaaaaaaacagccattcattggcaatggagaatgaacaaaataggcagatactagagagaggtcagcacttggaagaagggaatagcaaggagtgagtttcctg--attttatagctggccctagtgtgcaccaggcagaggactaaaacgtcagaagaaaa-ctgtagacttactgggttgaagtaacagaggactgagtttggcataacacgagcagcaggaggtcaggagaaaatctgagaaaggagaaggccagaaaaggggagccccaacttctgaatataaactatccaaagctttgtctggtccctataccatgcatgtatagggcagacttcatgtagcccagctaaaataattaaattgagatttcagttatcatcAAGCACAGTGAAGACAGAGATAGCAACAAAACATATTACTTTAGGCAAAGATACTCTATTCTTGAAAACCTAAACTACATTCCATTACCTTTCATAACAGTCATATTCCTTGTCCATTCTGGTTTCTACCTTGGTTCTAACTCCTACTTTTATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 21020 1995 + 81052 gtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtttgcatgtgtatgAATAACAACATTGACCATAAACTATGAAGCCGAATATATTTCACATATATATGTATGTATATTTTATGATAGTTCG-CATGTGATATTTCATATGAACAATTTATTATCTCTACTTACAATTAAGAACTTACAACTTTTATCAGGACGTCACTTCTCTTTTCCATTTTAATTTGTACCTCATATATGTACTTAACTATCATTGTTTGAACCTCTAATTTTTTGGATGGTAAAAACATTCAATTCTAAATCAATGATGAGAATGTATCTTTGGGACAGGTTTTATTTTATTATGAATTCTTATTTTATGTTTCATAGAAAGCAAATAGAAT-TTTTTTAGATAATGATGCACAATATATAATTCGAGTGACAAACATAT--------GTAGAGTAAATTTTGTATATGTATACCAAAAACAGTACTAAAGCATACTAGGTTT-ATAGCAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAACACATTTCTGTAATAGAAATGAAGAAACATGATCATGATAATTTCAGTGCTGTTGTAATTTTTT-ATGTATAGTTAGAAAAGTCATTTCTTTCACTTTTTGAATTAAAGAAAAC----TTTTTTTGAAGTTGACACCTGATGTCAAGTATTTCAATTTATTTTGCTTAGACACCTCTGAGCCCCTGAATTTTCAGTGTTCTCTTTTATCTCCCATTCTTAATATTCCTCAAAAAAATTCAAATATTCCCTCTCTTAAAAAAATCTCAATTTAAAGAAGGTATAGAAACTATGGATCATAATTGAATGAAACGTTCTGCAAATGTTAAAAATCATCTGTCAAATCTATATATTGATGACAGGAAATGTATTAATGATATGTTTTATTGGGGGTGGGCTGTGAGCTGAGGCTCCTCAGACATCTCTTTCTATTTTTATTTTGTTTTCCCCCATAGTTTCTCCAGCATTTGGCTCAAGGTGCCAAGGGCACATGTGACAGGAAGGCGCCGGCTTTTTAAACCTTGGAAGTTCTTCTGTGTCGGTTCTGAGACAGATGGTATACTAAa---atcacgaaggcccatttcgaagggtaggggaataagcctccatctattcatgtgaggtgtgtcgaagcacttggacatgttttcaaactaacaACTTTGATAATTCAGAACTGTGCTCCCTTTTCCAACTTCGTCCTGATACAAATGTATGATCTCTGGACGCTGCCAATATTCTCCTCAATTCCATCATGAACCTTTCTCCTTAATTCAGAACCTGTAGCCTAAGCTGTAAAACCAATGACTGTCAATGTATTCTACAAGAAAC-GTTGGCCAAAGAAAGAGAAAAACATAATAAGTAGTAAAAATATATACAAAACa-tttttgcttacactaacgatcaaataacacccataggaccaagcctcccacagatactttctatacattctggataaaatatttaaaaacacagccatccataggcaatggagaatgaacaaaagaggcagataccggagagtggtcggcacttggaagaagggaatagcaaggagtgagtttcctgaaattttatagctggtcctagtgtgcaccatgcagaggactaaaacatcagtagaaaagctgtagacttactgggttgaagtaacagaagactgagtttgggataacatgagcagcaggaggtcaggagaaaagctgagaaaggagacggacagaaaaggggagctctaactactgaatataaactatccaaagctttggctggtccctacaccatgcatatatagggcagacttcatgtagcccagctaaaataataaaattgaGATTTCAGTTATCATCAAGCACAGTGAAGACAGAGATAGCAACAAAACACCTAACTTTAGGCAAAGATACTCTTTTCTTGAAAACCCACACTACATTCCATTACCTTACATAACAGTCATATTCCTTGTCCATTCTTGTTTCTACCATGGTTTTAACTCCTACTTTTTTT a score=114591 s hg17.chr12_random 375243 1646 + 466818 AATTACACTAATCAAAGTAATTCTCTTTCAAGGAGAAAACTGGAAGTTATGTAATTGAGGACTATTAAAAATAACTATTTTGGCAGATGTGCAAAATTCTCAAGCACATATATTACAACTTTCTATAGTCATATACATCCTTTTTACACTTGCTTGAATTGGTCTACAAAACCCCCATGTTTCATAGTGTAATCCAAACAAATAGCCACTCCataa----aatataagaataaaagttatatttattta---------ttatataaCTT-TGATTGGTGACCACATTTCAGTATTCCAACTTAACTAGAAATTATCCGAAGATTTTCATCAACTCACTGAATTTAATATTAGTCTAAGGTCTTAAATTGCACCAGGAATCTTGGAAATTAAATTTAAGCTGATAGGCTAGAGAAAATAATTACTGTCAATATGTGGAGTTTTTCATAATTTGTATTCAGTTTATTTGAAAGCATAATTTTACA-TTTTTGGTATTTTAACATTATGTGGACATATTAATTTACCTTATCAGTAAACAGATATAGGAAGTTTAGGAATTTCTTTTTTTAAAATGTATttttaagtttcatggatacatactaggtgcatacatttattgggtacatgagatgtgttgatacaggcatgcaatg--------tcacataatgaagaatggggtagccatcccctcaaacatttactcttttttgttacaaacaattcagttatactctttcagtcattttaaaatgtacaactgaattatcattgattatagtcaccctgctgtgctatcaaatagtaggtcttattaattctttctattttttttttttttttgg----taaccattaacaagccactccttccctttagcctccactacctttcccagcctttgtttagcatccatgtactctctatgtccatgccttctgtgcaaacattgcagttgtttctgatgtattcaacttaacataataatctccaattctatccatatattgctgcaaatgacaggatctcatttttt-aatggctcaattgtactccattgtgtatatgtaccatattatctttatctattaatctgttgctggacactcaggttgcttccaaatcatggctattgtgaacagtgctacaacaaacatgggagtgtagatacctgtttgatacacttatttcctttcttttgggtatatacacaccagtgagattggtggaacatatggtagctctaatttttgtcttttaagaaaactttcaatggttttccatagtggttttactaatttatattcccacctgaggtgtagaatggttcccgtttctccacatcttcaccagcacttgttacatgcct---tttggatataagctgttttaacggggttgagatgatatctatctcattttagttttggtttgcatttctctgatggtcaatgatgttgagcaccttttcaccttttcatatgtgtgtttgacatttgtatatcttcttttgagaaatgcatattcaaatctttcacccattgtttgatcagattgttagattttttttttcctatacagttgttaaagctccttttatattctggttattaatcccttgtgagatgagtagtttgcaaatattttctcccattctgtgggttgtctctttacttt s rheMac1.SCAFFOLD85601 40778 1615 + 44828 AATTACATTAATCAAAGTAATTCTCTTTCATAAAGAAAACTGGAAGTGATGTGATTGAGGACTCTTAAAAATAACTATTTTGGCAGATGTGCAAAATTCTCAAGCACATATATTACAAATTTCTAAGGTCATATACATCTTTTTTACACTTGCTTGAATTAGCCTACAAAACTCCCACGTTTGTTAACATAATCCAAACAAATAGCCACTCCATAAACataaaataagaataaaagttacatatatttatttatttatttatataaCCTGTGATTGTTGACCACATTTCAGTATTCCATCCTACCGAGAAATTATTGAAAGGTGTTCATGAAACCACTGAATTTAGTATTAGTCTAAGGTCTTAAATTGAACTAGGAATCTTGGAAATTAAATTTAAACTGATAGACTACAGAAAATAATTACTGTTAATATGTGGAATTTTTCATAATTTTTATTCAGTTTATTTGAAAACATTATTTTGTATTTTTTGGTATTTTCACATTATGTGGGCATATTAGTTTACCTTATCAGTAAACAGATATAGGAAATTTAGGTATTTCTTTTATTAAAATGTATTTTTAGGTTTTGTGgatacatagtaggtgtgtatatttattgggtacatgggatgttttgatacaggcatgcgaagtgtaataatcacataatgaagaatggggtagccatcctctcaaacatttaccctcttttgttacaaacaacctagttatactcctttagttactttaaaatgtgcaactaaattatcattcactatagttaccctgctgtgctatcaaatagtaggtcttattcaatctttctattttttttttttttttggttgataaccattaacccgccacaccttccctttagcccccactacctttgc---------------------------------------ctttctgtgcaaacctttcagttatttctcacttattcaacttaacgtaataatctccaattccatcc--atattgttgcaaatgacgggatctcatttcttaaatggctgaatagtgctttattgtgtatatgtaccacattctctttatctattcatctgttgctggacactgaggttgcttccaaatcttggctattgtgaacagtgctacaacaaacatgggagtgtagatacttgtttgatacactaatttcctttcttttgggtatatacccaccagtgagattgttggatcatacggtagctctaatgttagtcttttgagaaacctttcaactgttttccatagtggttgtactcatttgtattcccacctgcaatgtacaatggttcccatttctccacatcctcaccagcgtttgttac-tgcctgtctttggatataagctgttttcactgggatgagatga----tatctcattttagttttgatttgcatttctccgatgatcagtgatgttgag--------caccttttcatatgtctgtttggcatttgtatatcttcttttgagaaatgcccattcaaatctttcacccattttttgatcagattgttaga--ttttttttcctgtggagttgttaaagctccttttgtattctgattattaatctcttgtcagatgagtagtttgcaaatattttcccccattc------ttgtctcttcactCT a score=61159 s hg17.chr12_random 376889 1558 + 466818 gttgattgtaccctttgctgtgcagaagtattttttaacttgatgtcatcccaattgtgcatttttgacttggttccctgtgcttgtggggtattactactcaagaaatttttgctcaaaccaatgtcc------tggggagtttctctgaagttttcttatgggagcttcatggtttgaggtcttaaagatacatctttaatccattttgatttgatatttgtat------agatatatgggactagtttcattcttctgcatagggatattcagttgtcccagcaccatttattgaagagactgt-ctttttccagtgtacgttcttggcatctttttcaaaaatgagttcactgtaggtgtgtggatttgtttccaagttgtctattctattccgttggtctatgtgtctgtcttaatgccagtaacatgctgttttggttactacagcctctgtagtataatatgaagtcaggtaacatgattcctccacttttgttcttttttcttaggatacttttggctattctgggtcagttgtggctccatataaattttaggattgttttctc---tatgtctgtgaagaatg--------tttttagtattttgataggaattacattgaatctgtagatt-ctttgggtagtatggccattttaacaatgttgatacttctaatccatggacatggaccatcttttcttttgttgggtgtccttttcaatttcttgcattagtgttttatagttttcattatagagatctttcatctctttggttgagttaatcttcagctatttaattttatgtgtggcttttgtgagtgggattaattttttgattttgttttcagattgttcactattgacatatagaaatactactaattttttatgttaattgtgtatactgcaaatttattgagtttgtttatcaattctaatagttttttggtacagtcttcagg-ttttataaatataagatcatattgtttgaaaacagggataatttggcttattcttttcctatgtggatgctctttatttatttttcttgcatgattgctctagctagagcttctactattatgttgaatagcagcagtgattgtgagcatttttggcatgttccagatcttagaggaaagtcttttagtttttcccaattcagtatgatactagttgtgggtct-ttctatatgatttttattatgtttagattttccttctatattcagatttctgagggtttttatcatgaaggaatat--tgaattttatcaaatgctttttcagcattaatttaaatgatcatatggttcttgtcctacattctgttgatatgatgtattacattgattgattttgatttgtgtatgttgaaccacccttgcatctcagggataaatcccacttggccatgaggaattatctttttaatgtattatttaatttgattcgctagtatattgttgag-actttagcatcaatgttcatcagggatatttatttgtagttttcctttttcaatgtgtctttgtctggttttggtatcagggtaataa-gattttcaagaataa s rheMac1.SCAFFOLD65924 3245 1538 + 39746 gctgattatttcttttgctgtccagaag--ctttttagtttaattaagtcccatctatttttctttgtttttgttgcatttgattttggg---ttcttggacatgaattctttgcctaaaccaatgtctataatataaggggtttc-ccaatgttgtcttttagaatttttacagtgtcaggtcttagatttaagtctttgatccatgttgagttgatttttgtataaggtgagagatgaggacccagtttcattcttctacatgtggcttgtcaattatcccagcaccatttgttgaatagggtgtcctttccccactttatatttttgtttgctttgttgaagatcggttgac--taagtatttggctttatttctgggttctctattctgtttcattggtctatatgcctattttcatactagtaccatgctgttttggtgactatggcct-tacagtatagtttgaaatcgggtaatgtgatgcctccagatttgttctttttacttagtctttctttggctatg-tgggctctttttggttccatatgaatttcaggattttttttttttgtagttctgtgaagaatgatgatggtatggtggtatttttatgggaactgtgttgaatttgtagattgcttttggcattatggtcgttttcacaatattgattttacccatccatgagcatgggatgggtttccatttgtt-tgtgccgtctatgatttctttcagcaatgttttgtagttttccttgtagaggtttttcacctcctta-------tattctgttgttttttttttttttttgcaactattgtgaaagaggttgagttcttgatttgattcttggcttgattgctgttggtgtatagcagggccactg-----tgacattaattttgcatcctgaaactttgctgaattcatttaccagttataggagctttttgaatgagtctttaggattttctatgtatgcaatcatgttatcagcaaacagcaacactttgacttcctctttaccaatttggatgccctttatttctttctcttttctgatggctctgactagggcttccagtactatgttgaatagaagtggtga----aagcatccttgtcttgttccagttctcaggggaaatgctttcaactttcccc-attcagtataatgtgggctgtgggtttgttgtagatggcttttattaccttaaaatatgtcccttctatgccgatttt-----------------actgaatatgctggattttgtcaaatgctttttctgcatctattgaaatgatcatgtaatttttatttttaattctgtttatatggcatatcacattta------ttgacttgcagatgttaaaccatccctgcatccctggcatgaaacccacttggtcacggtggattatctttttggtatgctgttggatttggttagctagtattttgttaagaatttttgcatctgtgttcatcagggatattggtctgtagttttctttttttgttatgtcttttcctggtcttggtattaggatgatactggctttatagaatga a score=42983 s hg17.chr12_random 381014 637 + 466818 acagatgattatactgaggcacagagtagttataagatgaagtctcagagcatagctatgtgaagcagaaaatctggtttcctgtcttggcagtttgactccaaaatcctctcttagaaacaattatactTTTTAAATGGAAAAGAAATAAAATCCAAGATTGGAGACTGATTTTAACATCTATTCCTCTTAATCCTTTAAGTAATCAAAAATAAATTAAACGGAGAAAAATGAAACCAAATATTCATATACAAAGAACTCTAGACTCTTCAGTGAGAAACATGTGTTTTTCAAGTCACCCAAAATAGTTACACAATTGCTGAGTATTTTAATTAAACAATAAATATTTAAGTATTAACTGGGCTCTAGAGAAAAACTTAGTCAAAGGCCTCAGCATGAGCGATAAGTTTGATAAATATTGAAAATGGTCTGAAAAGCCCAAGTGGAAAAGCAGGGCTATTTCTACCT-GGATGATGTCCCTGTAATTAATTTTCCATTTTGGAAATTAGAGGACAGAAATTCCTTCTATCCATGAGGGGGTGAgtatgtatgtatgtgtgtatgtttgtgaatgtgtttgtatgaatgAGCTTGTAAACAATAAG-TTATACAAAAGTATTAGTAG-CCACCAGGATTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 28351 624 + 81052 acagatgattatacttaggcagagagtagttgtaaaatgaagtctcagagcatggctatatgaagcagaaaatctggtttcctatcttggcagtctgactcctaaatcctctcttagaaacaattatactaAA-AAATGGAAAAGAAATAAAATCCAAGATTGGAGACTGATTTTAACATCTATTCCTCTTAAACCATTAATTAGTCAA---TAAATTAAATAAAGAAAAATAAAACCAAATATTCATATACAAAGAAATCTAGACTCTTCAAAGGAAAACATCAGTTTTTCAAGTAGCCCACAATAGTGACACAATTGCTGAGaattttaattaaaaaattaatatttaaGAATTA----GACTCAATAGAAAAACTTATTTAAAGGCCTCAGCATGAGAGATAAGTTTGATAAATATTGAAAATGGGTTGAAAAGCCCAAATGGGAAAATAGGGCTATGTCTACCTGGGAGGATCTCCCCAAAATTAATTATCCATTTTAGAAATTACAGGACAACAATTCCTTCTATCCAtgagtgggtgagtatatgtgtatgtg--------tgtgagtgtgtttgtatTAATGAGTTTGTTAACAATAAGTTTTTACGAAAGTATTACTAGCCCACCAGGGTTT a score=60033 s hg17.chr12_random 381651 834 + 466818 AAGGATTATTGGCCTTTCTGAGGTTCCCAAGAAAACCTTAAATGCTTTTGGTAGGAAAAGATGGGATTCATTCTACATATTACTGGCGTTGAAAATA--TAAATCTACTTTGTTGATGATCCTAGTTATGCCCAAGCTCCCTTTACCAGGTAATAAAACCAATGTGTCATCTGTGTATTGGGTTGTTAAAT------------------TGCTGAACACAAATTATGGAGAGTTTAAACAAGGAAAAAATTGCAGAACATTTAAAAAA-CTCTTCATTGGCATGCTAGTAGATGAGAATTCAGGTTTTACTTCAACAACGATGTGGAAAATTTTATCTTACAGCAAGGACATTGTGTTTGAACAAGAGTTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCATATTTTCCATAAAGAGAGCATTGATTACATCCGTTGGCCTATTGAGATGCTTTCCTGTTTGACATTGGTCACAGAATTTAAAAGGAAAAACAACATTACTGCACACTTAGGAATCAGG----AATAGAAGTAAAAGTCAGG----TAAAGGGAATCTCGTCAGG--ATATCAGGCCTGCCTTTAAAAAAATTCAGACATGATAAGTTTACTACCAATCATTTTTTCAATAACAACAATAATATATTTATATTTTCCCATGGACACCTACATTAAGCTTGTAGACTATTTTTATATTTCAATATTTTTTTCTTTGAGTCCTTTTAAGAGTTGTTCAACAATCCTGAAATATCCCTTACAGTATGCTGTTAACTAATTATATTTTTTCAAAGTCATTTGACATAATGATTGATTAAAGGAAGTATCTCCAGTATAAGTACACTTGCTTATAACAAAAGAGTATTTGAAATt s rheMac1.SCAFFOLD31009 793 861 + 42162 AAGGACTATTGGCCTTTTTGAGGTTCCTAAGAAAACCTTGAATGCTTTCGGTAGGAAAAGTTGGGCTTCACTCTATGTATTACTGGCGTTGAAAAAAAATAAATCTACTTTGGTGATGATCCTAGGTGTCCTCAAGCTCCGTTCACCAGGCTATACAACCAATGTGTCATATATGTATTGAGTTGTAAAATACCTCTAACAACTGAAGTTGCTGAGCACAAATTATGGAGACATTAAACAAGGAAAAA-TTGCAGAACAATTAAAAAAATTCTTCCTTGGCATGCTAGTAGATGGGAATTCAGCTTTCACTTCAACATCAAAATGGAAAATTTT--CTTACAGAAAGGACATTGTGTTTGAATAGGAATTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCATGTTTTCCATAAAGACAGCATTGATTTCATCCATTAGCATATTGAGATGCTTTCCCGTTTGACATTGGTCACAGAATTTAAAAGGAACAAGAACATTACTGCACATTCAGGAATCAGGTACACATAGAAGTTAAGGTCAGGACCTTGAAGGGAATCTTGTCCAGTGATATTAGGCCTACTTTTTAAAACATTCAGACATAATAAATTTACTACCAATCATTTTTTCAATAACAGCAATGATATATTTAT-TTTTCCCATGGACGCCTGCATTAAGCTTGTAGACTATTTTTATATTTCAGCATTTTTTTCTTTGAGTCCTTTTAAAAGTTGTTAAACAATCCTGAAATTTCCTTTACAGTATGCTGTTAACTAATTACATTTTTTCAAAGTCTTTTGGCATAATGATTGATTAAAGGAAGTATCTCCAGTATAATTACACTTGCTTATAACAAAAGAGTATTTGAAACT a score=92264 s hg17.chr12_random 382485 1300 + 466818 gacattacttattttggaaaggatatgacacaatgggaattttcatacaccactcctagaattataaatctgtgacatcatttcggccgagtatggcattatctgattaagatgaaggatcacatcctaagacccagcatttatactcttatcagaatacatatacattcacatgcatatcactgagtttcaatagctaaagttgagaagtcctccaaatgtctatcagtcctccaaatgaataaacaaattgtggcatacttatacaatggaatactatacagtgatcaaaattaacaaacaagactgacatgtttacaacagaataatacaacagagaaaatgaacaaatttgagctacataaataataatacagatatgagaagaattatcaagatggaaaaatacatttagtataatctcatttacataaagtttgaaaaacattctttttaata-attgtaatttattacattggtgataaaactctgtagtgaaacatatgagtgatcatcataacaactgggatagtcaagaaggagga----------aaatgtcagcaagaagacatatattgggattatctggatggctggcaaattcttttttcttgccaatgtgtggtaacatccatgttaacgttacaattttttctctttctgtttctgttgtgttattactctctatgtgtatgttatgctccacaataaaaaa--TGTTAAAAAAGCAGAAACATAAAGTATATTTCTAAGTATAAAATTAGGGTGATACAGCATATTCTCATAGATACCATTGTAATTAGAGTTTTT-GCTGAATAAAGGAGAATAGAGCATTATGGTACTAAGAAATCCAAATTAAAATTTAAAACttttctttttttattttgagacagcgtctcactctgttgcccaggctggagtgcacaagcgcaatcttggctcaatgcaacctccgccacctgggctcaagtgattctcccatctcagcctcctgaatatctaggacaacaggtgtgcaccaccacaccctgctgattttttctatttttttttagaggcaaggttttgccatgttgcccaggctgggcttgaactcttgtgctcaggcaatccacctccctcagcctttcaaaatgctgggattataggtgtgagccaccacacctgaccTAAAACTTTTCTTAAATTAATTTTAAAAAAGGAGAGATAAGCAAGAACTGTAAATCCACCTTCTTAATGCTAATATGAATTTGAAACATCAAAATTTGAATATTTATTATTGATAGACACTTTTT------ATTTCCAATTTGAT s rheMac1.SCAFFOLD31009 1873 1300 + 42162 GATGTTACTTATTttggaaaggatatgacacaatgggaattttcatattctactcctaggatcataaatctgtacagtctttttggctgagtatagcattatctgattaagatgaaggatcacatcctaagacccagtatttacactcttatgcgaatacatatacatacacatgcatatcagtgagtttcagtagctaagtt--------ccttggaatgtctatcagttctccaaatggataaacaaatt-tggcgtacttatacaacggaatactatatagtgatcaaaattaacaa----gactggcatgtttacaacaggataatacaacaaagaaaatgaacaaattggagctacatagataataatacagatgtgaaaggaattattaagatggaaaaatacatttagaataatctcatttacataaagtttgaaaaaacatggttttaatacaatgtaacttgttatattggtgataaaactctacagtgaaatatatgagtgatcatcataacaattgggatagtcaggagggaggagataaaagggaaatatcaacaagaagacatatactgggagtatctggattgctggcaaattctattttctgaccaaggtgtggtaacatcaatgttaatgttataattttttctcttactgtttattaggttttattactatct----gtatattatgctccccaataaaaaaaacattaaaAAAGCAGAAACATAAAGTACATTTCTATGTATAAAATTAGGGTGATACAGCATATTCTCATAGATACCATTGTAATTAGATTTTTTTGCTGAATAAAGGAGAATAGAGCATTATGGTACTAAGAAATCCAATTTAAAATTTAAAACGtttctttttttattttgagacaaggtctcactctgttgtccaggctggagtgcacaagcgcaatctcggcttagtgcaacctctgccacctgggctgaagtgattctctcaactcagcctccagagtagctaggacaacaggtgtgcacaaccactccctgctaaatttttctggttttggt-agagatggtgtttttccatgttgtccaggctggtcttgaactcccgtgctcaggcaatccacctgcctcagcctcccaaaatgctgggactacagttatgagccactacacctagccCAAATCTTTTCttaaattaatt--aaaaaaaaaaaGATAAACAAGAACTGTAAATCCACCTACTTAATGCTAATATGAATTTGAAACATCAAAATTCGAATATTTATGATTGCTATACACCTTTTTTTCTTATTTCCAATTTAAT a score=89815 s hg17.chr12_random 383785 1266 + 466818 TATTTATGATACACATTTGAAAGTGTTAGAAATTCATGAATTTCCAATAAATTATACTACGATGGatattaaat----taaat-aaatatatCCAACAATGTGTCTCTAAATGAAATATTTATACTCATATTTTTAGCATTTTAATTTCACAATACTATTCACATGTACACCTGTAAGTTGGGTTAAATATTTTGTTACTATAAATTTTTTGGCTCTACATTAGAGAAAAATACCATAGAAAGGCAAATTTTTTAAGGTATAAAACATATTTAGCATGATCTTTGAGTATGTTTGTGCATATATAATTCTACTTTGACTGCTATAGTAAAATGATCCAGATTTAGTCACCATAGCTAAGAAGGGGAAAAAGCATTTGCAAGAATTTGGCTTGCTAATGATGCTATTAAAAGATAAACTAAAGTTGATATACTGTATTATTGCATAGACTATTTGTCCATGTTTGTATTCAAAAATGCCAAAAAAAATCCCAAAATAGAATCCTAATTGTTGGAGGTCGTGTTTCTTATCGAATTTTAAAATGTAGTAAAAGAAAAAAAAGCAAATAAATCGTTGAAAATATGTTGGTTTTACATTATTCTTGATGAAATACCATGTGAGGGTACTTGTCTAGGCCTAATGCTGAGAATCATAGAAGAATCATGAGGCCATGAGGAAGAATAGTAGTGTTCTCTCATCACGCTGAGCTCCAGTACTTAGAAACAAGCCTGAAATCACACTGATCAAATAGCATTCTCCCTTTCACCTGCCATCATCATTATCATCATCGTCTATATCTTCATCTATATCATGAAGTGGTTTGTTTTTGAAATATTTAAATACATAATTTGGAAAATAAGTAATTTTAAAAAGATCATCATTGTGGGAAAGTTACAATAGTAAACAGCAAAGTTCAAGTCAAGCTCCAATACATTTAGATTTAGAAATTAAGTGTAGTTTATTTTACAATACATTGCTTATGCAAATAATTATTTATGGATGACCTTCAATGAATCCTCCTTTCACTATGATCATGATAGAAACAATTTAGATTTTCGTGTAAATAAAATTCCTTAATAAGAAAGATAAAGCGAATAACACATTTTTTGAGCACGCTTTTATTTCTAAAGAGCGGATTTTAGGACCAAACTGTCAAACAGAGGTAAGACCCCAGATCTTCTGTCACACTTGAGTGAGTGATGATGGAGTTAGAAGGTTGTAGTTCTATAACCAAAACTATATTCATGGATA-GGATTAAATGGTGGAATTCCGC s rheMac1.SCAFFOLD85456 29947 1260 + 81052 taattaaaatacacatTTGAAAGTGTCAGAAATTCATGAATTTCCAATAAATTATAGTACGATGGATGttaaatatattaaattaagtatattaaa-aatGTTTCTCTAAATGAAATATTTATATTCATATTGTTAGCATTCTAATTTCACAATACTATTCCTGTGTACACTGGTGTGTTGGGTAAAGTATTTTGTTACCTT----TTTTTGGCTCTGCATTAGAGAAAAAAATCATAAACAGGCAAATTTTTTAAGGTATGAAACTTATTTAGCATGATCTTTGAGTATGTTCATGCATATTTAATGCTACTTTGACTGCTAGAGTAAAATAATCCAGATTTAGTCACCATGGTTAAGAATAGGAAAAAGCATTTGCAAGAATTTGGCTTACTAATGATGCTATTAAAAGTTGAAATAAAGTTGATATAATGTATTATTGCATAGAGTATGTATCCATGTTCATATTGAAAAATGCCCCAAAT--CTTCAAAATAGAATCCTAATTGTTGCAGGTCACTTTTGTTATCAATTTTTAAAATGTAGTGAAAGAAAAAAA-GCAAATAAATCAT--GAAATATGTTCCTTTTACATTATTCTTGATGAAATACCATATGAGGTTATTTGTCTAGGCCTGATGCTGAGAATCATAGAAGAATTATGAGGCAATGAGGAAGAATAATAGTGTTCTCTCATTACCCTGAATTCCAGTACATAGAAACAAGGCTGAAATCACATTTATCAAATAGCATTATCCCTTTCACCTGCcatcatcattatcatcatcatctatatcttcatcTAGCTCATGAAATGATTCATTTTTGAAATATTTAAATACATAAATTGGAAAATAAGTAATTTAAAAATGATCACCATTGTGGGACAGGTACAGTAGCGAACAGCCAAGTTTAAGTCAAGCTT-AATACATT-AGATTTAGAAATTAAGTGTATTTTATTTTAGAATACATTACTTAAGCAAATAATTATTTATGGAGGACCTTCAATGAATCCTCCTTTCACTATGATCACTATAAAAACAATTTAGATTTTAGTGTAAATAAAATCCCCTAACATGAAAGATAAAGCAAATAACACATTTTAAGAACAAATTTTTATTTCTAAAGAGCGGATTTTAGGACCAAATTGTCTAACAGAGGTAAGACCTCAGATCTTCTGTCACACTTGAGTGAATGATGATGGAGTTTGAAGATTGTAGTTCTATAACCAGAACTATATTCAAGGACAGGGAATGAAAGGTGGAATTTCAC a score=268421 s hg17.chr12_random 385152 3138 + 466818 AACCTGCTGTTTTTTGT----TCTTGTCAGTGGCGTTGGGAGGGGGAGAAaaggaaaagaaaaaaaaaagaagaagaagaagaaaagagaagaagaaaaaAACGAAAACAGTCAACCAACCCCATCGCCAACTAAGCGAGGCATGCCTGAGAGACATGGCTTTCAGAAAA-CGGGAAGCGCTCAGAACAGTATCTTTGCACTCCAATCATTCACGGAGATATGAAGAGCAACTGGGACCTGAGTCAATGCGCAAAATGCAGCTTGTGTGCAAAAGCAGTGGGCTCCTGGCAGAAGGGAGCAGCACACGCGTTATAGTAACTCCCATCACCTCTAACACGCACAGCTGAAAGTTCTTGCTCGGGTCCCTTCACCTCCTCGCCCTTTCTTAAAGTGCAGTTCTTAGCCCTCTAGAAACGAGTTGGTGTCTTTCGTCTCAGTAGCCCCCACCCC-AATAAGCTGTAGACATTGGTTTACAGTGAAACTATGCTATTCTCAGCCCTTTGAAACTCTGCTTCTCCTCCAGGGCCCGATTCCCAAACCCCATGGCTTCCCTCACACTGTCTTTTCTACCATTTTCATTATAGAATGCTTCCAATCTTTTGTGAATTTTTT-ATTATAAAAAA-TCTATTTGTATCTATCCTAACCAGTTCGGGGATATATTAAGATATTTTTGTACATAAGAGAGAAAGAGAGAGAAAAATTTATAGAAGTTTTGTACAAATGGTTTAAAATGTGTATATCTTGATACTTTAACATGTAATGCTATTACCTCTGCATATTTTAGATGTGTAGTTCACCTTACAACTGCAATTTTCCCTATGTGGTTTTGTAAAGAACTCTCCTCATAGGTGAGATCAAGAGGCCACCAGTTGTACTTCAGCACCAATGTGTCTTACTTTATAGAAATGTTGTTAATGTATTAATGATGTTATTAAATACTGTTCAAGAAGAACAAAGTTTATGCAGCTACTGTCCAAACTCAAAGTGGCAGCCAGTTGGTTTTGATAGGTTGCCTTTTGGAGATTTCTATTACTGCCTTTTTTTTTC-TTACTGTTTTATTACAAACTTACAAAAATATGTATAACCCTGTTTTATACAAACTAGTTTCGTAATAAAAC-TTTTTCCTTTTTTTAAAATGAAAATAATCAGCTGACTCTAAGCTTTCTTTGACTCTGATGCCCCTGGTCCAGTTTTATGAAAATGTCAAAGGGAAGAGGTGGATGGAGAAGAAAATGTTGCAAAACATGCTAAGTGGCAGAAATGACAATGATAAGTGCTATGGCCAGTCCCATCCAAATGGTTTCTTTATGATGAATGAgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtACATGTATATATGTTTTCTTTCTATCCTATGCTGCAAATGTACATGCCCACCAAAAAGA---------ATAGATGGCTGCATTATCCTTTGATCAAAATTTAAAATCCCCCAAAAAAGTGAACCAGAAAGAGAGGGTCCTCCACCATTTTCCAATTCTCAACTCCATTCTGAGTTTCTCCCTGTGAAACTATGGTGGGGCTGGATGAAATAATGGAGACTAGGTCTGGGTGGGGAGGATGGTGGTTCTGGGATGGGGGTTGGAGAGGCATCCCTCTCCACATACAAGCTCCTAGTGGTGAGTATGTTTCTCTTCCCTCACTTCCAGGCATACATTTTCTACTCATTTTCTCCAATACACCTACTTGCTATATTGATTTTAAGTAAGAGGCATATATGATATGAATTCATTCCAAACGGATTGAGATTTTAATTAAAAAAACGCATTAGAAATGTGTGGTCGCTTTGAGACACTGGTCTATCTAAGCTTGTGACTCTATCCGAATAGCGTGAGCTGCGTGTAAAAGTACCCAATTACCAAGATTCAAAAAGAAATTGGTGGGTTTTTGGCTGGCTTGCTTCTTGTCAGTTAGCAAGGACGTGATTAGAATCCTACTCGGCCTCTCGCCGGCTCCTCGCTCGCCGCCTGCATTACTTGCAGATTCAGTTTGCGTGTCTCCAGCCAAGCGGAAAGCCGAGCGCAAAATGCATCTTACAAAACCCAACAAAGAACGGGTAGCCAGCACGTCTTCCAGAGTTAAAAATCTAGTCTGTGTTGGTACATCTATACCATTTAGTGGCACAGAATAATCATTTTTTAAAGCCACGATGCGCGGAGCACGCCACAGCGTCTGATGTCATTTTGCTAAATGACCCTCTATAGAATGCACATTGAGGCTTCAGTCCCTTTCAAAGAGATGAGCGTAATTAAGGAAAAAAAATCAGTAAATTCCTCATCGCCATAAATAATCGGACTTTCTGCCAGCAGTGGGCCAATTTAGAGCTTACTTGAGAGAAGTAATGCTTTTGTGATGCCTGCTTTTATTTTTATCTTCTCATTTGGAGGACCAGAGATGGGCTCCACCCCCACTCTCCATTTCTCTTTCCTTTAATTTAGCTCCTTTGCAAGATTCCAGATAAGGTATGCAAAGAAAGTGTAGCAAGTCATTTATGGCTATGAATATAACATTAGGATAATGTTTCAGCCCCCACAAAGGGGGATTTTTTTTTCCTTCTCCTGTGAGGACAGGTGTTC-TTTACTCACTTCTGAATGGGAAATATCCAGTCTCGTTAAACTCGAGGCAAAGTTAGTCGTTGTTTGCCACAATGCGAAGGCAAACTCGAAAAATTCACAAAA----ACACACACAATTTTGCCTAAGCTAGGAAAGGGCAAAGCGAGGATTGGGCAAAATCTCATTACATCTGCTCTAATCGCTTAGCAACACAAAGCCGGGGCTTGTGCGGCGAAGGGAAGCCATTCACAGAGCTCTGACAGGCCGCATTCAGCGCGCGTTAGTCAGCTCCATAAATCACCGCTGCCCATTGGCTGCGCGGCGGGCTTTGGAGCGGCCCTGGGCTGTCAGCGAAATACAAAATGTAGACCCCAGAGGCTAGCAATAGTAGCCTCTCCCCCGTCTTAGCCCCCACCCATTtttcttttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttcttccttcctttctttctctttctttctttctttctttctttctttcttctttctctttctttctttctttttctttctttcttttcttt s rheMac1.SCAFFOLD80653 11796 3109 - 71846 AACCTGC-ATCTTTAGTGCTTTCTCGTCAGTGGCGTTGggagggggagaaaagaaaaagaa-----------------gaagaaaagggaagaagaaaaaaacgaaaaCAGTCAACCAACCCCAACGCCAACCAAGCGAGGCATGCCTGAGAAACATGGCTTTCAGAAAAACGGGAAGCGCTCACAACAGTATCTTTGCACTCCAATCATTCACGGAGATATGAAGAGCAACTGGGACCTGAGTCAACGCGCAAAATGCAGCTTGTGTGCAAAAGCAGTGGGCTCCTGGCAGAAGGGAGCAGCACACGCATTATAGTAACTCCCACCACCTCTAACACGCACAGCTGAAAGCTCTTGCTCGGGTCCCTTCACCTCCCTGCCCTCTCTCAAAGTGCAGTTCTTAGCCCTCTAGAAACGAGTTGGTGTCTTTCGTCTCAGTAGCCCCCACCCCCAATAAGCTGTAGACGTTGGTTTACAGTGAAACTATGCTATTCTCAGCCCTTTGAAACCCTGCTTCTCCTCCAGGGCCGGATTCCCAAACCCCATGGCTTCCCTCACACTGTCTTTTCTATCATTTTCATCATAGAATGCTTCCAATCTTTTGTGaatttttttattataaaaaaatCTATTTGTATCTATCCTAACCAGTTTGGGGATATATTAAGATATTTTTGTACATAAGAGAGAAAGAGAGAGAAAAATTTATAGAAGTTTTGTACAAATGGTTTAAAATGTGTATATCTTGATACTTTAACATGTAATGCTATTACCTCTGCATATTTTAGATGTGTAGTTCACCTTACAACTGCCATTTTCCCTATGTGGTTTTGTAAAGAACTCTCCTCATAGGTGAGATCAAGAGGCCACCAGTTGTACTTCAGCACCAATGTGTCTTACTTTATAGAAATGTTGTTAATGTATTAATGATGTTATTAAATACTGTTCAAGAAGAACAAAGTTTATGCAGCTACTGTCCAAACTCAAAGTGGCAGCCAGTTGGTTTTGATAGGTTGCCTTTTGGAGATTCCTCTTACTGCCTTTTTTTTTCCTTACTGTTTTATTACAAACTTACAAAAATATGTATAACCCTGTTTTATACAAACTAGTTTCATAATAAAACCTTTTTCCTTTTTTAAAAATGAAAATAATCAGCTGCCTCTAATCTTTCTTTGACTCTGGTGCCCCTAGTTCAGTTTTATGAAAGTGTCAAAGGGAAGAG-TGGGTGGAGAAGAAAATGTTGCAAAACATGCTAAGTGGCAGAAATGACAATGATAAGTGCCATGGCCAGTCCCATCCAAATGGTGACTTTATGATGAATG------------------------TGTGTGTGTGTGTGTACATGTATATACGTTTTCTTTCTATCCTGTGC-GCAAATGTACATGCCCACCAAAAGAATAGATGATGATTGATGGCTGCATTATCCTTTGATCAAAATTTAAAATCCCC-AAAAAAGTGAACCAGAAAGAGAGGGTCCTCCACCGTTTTCCAATTCTCAACTCCATTCTGAGTTTCTCCATGTGAAACTATGGTAGGACTGGATGAAATAATGGAGACTAGGTCTGGGTGGGGAGAATGGTGGTTCTGGGATGGGGGTTGGAGAGGTATCCCTCTCCACATTCAAGCTCCTAGTGGTGAGTATGTTTCTCTTCCCTCACTTCCAGGCACACATTTTCTACTCATTTTCTCCAGTACACATACTTGCCACATTGATTTTAAGTAAAAGGCACATATGATATGAATTCATTCCAAACGGATTGAGATTTTAAT-AAAAAAACGCATTAGAAATGTGTGGTCGCTTTGAGACACTGGTCTATCTAAGCTTGTGACTCTATCCGAATAGCGTGAGCTGCGTATAAAAGTACCCAATTACCAAGATTCAAAAAGAAATTGGTGGGTTTTTGGCTGGCTTGCTTCTTGTCAGTTAGCAAGGACGTGATTAGAATCCTACTCGGCCTCTCGCCGGCTCCTCGCTCGCCGCCTGCATTACTTGCAGATTCAGTTTGCGTGTCTCCAGCCAAGCGGAAAGCCGAGCGCAAAATGCATCTTACAAAACCCAACAAAGAACGGGTAGCCAGCACGTCTTCCAGAGTTAAAAATCTAGTCTGTGTTGGTACATCTATACCATTTAGTGGCACAGAATAATCATTTTTTAAAGCCACGATGCGCGGAGCACGCCACAGCGTCTGATGTCATTTTGCTAAATGACCCTCTATAGAATGCACATTGAGGCTTCAGTCCCTTTCAAAGAGATGAGCGTAATTAAGGAAAAAAAATCAGTAAATTCCTCATCGCCATAAATAATCGGACTTTCTGCCAGCAGTGGGCCAATTTAGAGCTTACTTGAGAGAAGTAATGCTTTTGTGATGCCTGCTTTTATTTTTATCTTCTCATTTGGAGGACCAGAGATGGGCTCCACCCCCACTCTCCATTTCTCTTTCCTTTAATTTATCTCCTTTGCAAGTTTCCAGATAAGGTATGCAAAGAAAGTGTAGCAAGTCACTTATGGCTATGCATATAACATTAGGATAATGTTTCAGCCCGCACAAAAGGGGA-TTTTTTTTCCTTCTCCTGTGGAGACAGGTGTTCTTTTACTCACTTCTGAATGGGAAATATCCAGTCTCGTTAAACTCGAGGCAAAGTTAGTCGTTGTTTGCCACGGTGTGAAGGCAAACTCGAAAAATTCACAAAAACACACACACACAATTTTGCCGAAGCTAGGAAAGGGCAAAGCGAGGATTGGGCAAAATCTCATTACATCTGCTCTAATCGCTTAGCAACACAAAGCCGGGGCTTGTGCGGCGAAGGGAAGCCATTCACAGCGCTCTGACAGGCCGCATTCAGCGCGCGTTAGTCAGCTCCATAAATCACCGCTGCCCATTGGCTGCGCGGCGGGCTTTGGAGCGGCCCTGGGCTGTCAGCGAAATACAAAATGTAGACCCCAGAGGCTAGCAATAGCAGCCTCTTCCCGGTCTTAGCCCCCACCTATTtttc-tttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttttctttctttctttccttccttccttctt-----tctttctttctttctctcttttcgtttcgtttcgtt a score=1795 s hg17.chr12_random 388290 54 + 466818 ctttcttcttttttcctttttttc--ttctgtcttctttcttttttccttttttt------------------c s rheMac1.SCAFFOLD17328 2999 74 + 4950 tttctttctttctttctttctttccttccttccttctttctttctttctctcttttcgtttcgtttcttttagt a score=790178 s hg17.chr12_random 388344 9574 + 466818 ttctttctttcttttttGAGAGAAAGAGGAGGGGAAGAATGCTGAGGTAGAAAACTGCGTTGACTTTATTGACTGAGAAATCTTACCTATTCAACAAAGGCTTGGAGACCACCGAGTTAAGACTGAAGACACGCCCGAAATCGACGAGGAGGAGCGGGGAGTGCGGGAGAGAAAGAAAAAACAGACCTGCCGCGAGCTGCAGAGCTGTTGAATGGCACACATCATCAGAGGCTGGGAGAAAGCTATTGGTGCACAGGTTTCACCTCTCTGACACAGTTATTTTAACATTTTAAATTGAGAGTAGGAGGAGATGCATCAAGAAGAATCTATCTCGAGTTCACATCAGGCAGGACCCACCAAGGAAGAGAGAAGAAACTATTCTGTGGTTTGCAAAGAACTTCAAAGGAGTAAGACTGAGATGTCTTAAGAAAGAGCAATAGAACGTGCCTTTCCACTTCACCGTTCTTGCAGTGCTGGGGATGTTTAAACACAGAAGTAACAGCCCAGTTCCTTGATATACACAGGAGCTAGGTGAAGCCATGCAAAGGAGTTAAGAAAAGGCTTGATGGCAGAGATTACAAGCTATATGTAAATGTTATCCCCTGCTGTTGTTGCTATTCTTATCTTCCAGTCCTTTATCTCATTTTCCTGGGGACTGGTCAGATGCATCTAGATCACAGCCCAAATTGGATTCTTACCCACAAACCACGTAGAAAAACCCTGATAGTAGATGTGGAATCAAGGGAGATTTTTCTAAGAAGCCCAGATTgccttaactcaagtgccacctcctccaagaagcttttcctgaccaccctctttaaagcagctctccatctgctacaatca--gtccattaatcctgttgttccttcctggcatttaccactatctgaaaatgctgtatctttgtttggttatatgattattgtcaattatcccctactacatggtaacctccctgaagctagggaccttacttgtcttgtc-----ttgtcttccctgcccctggTAAG-ATAGGTATTTGTTGACTAAATGGACAAATGGGGATGGTTTTCTCTGCTTCACTGAAAGT--TGTTTCTTATtcttcctttcccctccacttgcactctccacccttctctgctcttctctctgtctcaggaggcaggcttatctttatggatttcatcacaagagttgtgtgtccttctggcttcttcttgggtttggccagtgggagacaccagcaggagttggcaaagtaggaggggatataggttgggatatttttatccctgctccatccctgcctaggccctattgctttgcctgtagctctactccttgtcctaaggctagggctgttgtcaggaggcttctctcccgcagatacacctcttgctgaagtccagtaacaactcccttctcttgccctttaa-taaggcccagaggtggtaacagctctcccttgttcctagtctccgggtgcagcatcatttttgttaacctcaccaacatctctgtctttctgttaaactttttcatttacccttgtgccatcatctctctttccgac----tctgCTACACAGGCCGTTTCCCCATAGGATCTCATGGATATACTAGTTTTGTTTAAGATTTTTCAGGGACTCTTGGGGTTATGAGTAAGAAAAATCCTAGAGTATGGGTGAACCCAACTCCATATAACATGTAACTCTAGAAACATTACTTCATCTTTTTGAGACAGGAGTGAAGTCAATTACAGTTTTCTCTTCTGGAAAAACGAGAAAAATGATACCTTCCTTTGCATAGATCACCAGATGAACAGAAAATGAAAGGGCTTTAGAGCAACTAATGACTATATCAATGCAAGAGATACGTGCTTCTTAAGATCTTTCTGAACCAGGTAGTGGGGTGGTACTGGGT-CTTGCCGTTAAGATCAGCAAAGCTGCTGCTGCTGTTGGAAGCCACCCCTACTTTCTTTCGCCCATTCATTCGCTCTGCAATTTATGCACTCACTTCAAAGGGGAGGGACAAATTATTAAATCTGGTCAACATTTCTAGAACTTAGTTGTGTTAATTTGTATTTTCTAGAGAGTGCTCTCCAAGAAGCATCAGTTATTGCAACTTCTTAAAAAAAAAAAA--------------------AGCAACACTGTGGATGCTTTTGTGGTGTAATAATCGTCCGCAACCTCAGGTCCTTTTACTTATTGCTGAAAAGCCTCTGAACTCCTTTCTCCCTCTCTCCACTCCTGAGCCAAGAAATAATTCTTTCCGGACTTCCCGAGAAGCTCCAGGTTATCCGGAGTCAACGGTAAGGAGGGAAGTGGATTCGGTGACACTAAGGTTCTTTACCCACTGCGAAAGCGAATGGCTTGGATCTAGCGCAGGTCGAAGTTATATTCCTTCTTCCTTTGTATGCAAGATTAGGTTGTTACAAAAGAGGGTGTGTAGGTTAATGGCAGGAAGCAAGTTGCAGCGCGGAGCGCGGGCCCTGAGCGCGTGTCAGGCTTAATGATTTATTCAAGCTGCAGCGCATCCGGGCGTTGATTGGCTGCAGGCATGCGTCCGCTGTCAGCTGCGCGCGCCGGGAACTCTCCAGGCTACCTGAAGCTGGGGGGAGGAAGAGGAGGCGTGGGGACCCGAGGGGAGAGGTGTGAAAAGGAGGAACAGGTAGGAGTAGGGGGTgagagagagaaacagggatagagc----------aagagagacatagag-------------------------------------agagaggagagaaggcaaggaaggaaggagaagagagaagggaagagaaactcaagcgtaggttgcgggggtgggagagaggagagaggaaaagatggagaaagcagacgagaaaaacaagagggagaaagagagaataaaggagaggcgaggataggagaataaatgagagagagcatagagagaggCTGGAGACAGGAGTGGGACGCGCTCCCAGAACGTCCCGCGTGCGCCCCCCTCTAGGCAGCCAGCGGGCGGCCGCTTAC----------------------------------------------------------------------------------------AAAGCCGCCTTTGATGCTCTGGCTACCAGGGCTATTTTGGGGACGAGATGGGGGAAAGCCGCCAACCCACACTCCTTGGAGGGAGTCACTTTCTGCAAAGTGCGTTGGAGAGGACTGGGCCCTGGGTCCGGGCTGTCGAAGCAGGAAGTGGATGTAGGGGACAAAAGCTCCGCACCTGCCAAATGCGAGACCTTAGAGAGAGCCTCCCCCTCGCCGCTCCCTGCTCCCCCGCGGGCCCGGGAAGCTTGCACTACCGGGCTCAGCGCAGCCAGCCCCACCGCCTCCGGACTCGACCCCACCATAGCCCCGCCGTCCGAATCGTCTCTGAACCAAACTACttctgcctgcctttctttggatctgtctttctctgtcatctgagtcactttctctctcgcctctcttttctttcttctttttcttcttccttcccctcttctttctcactcatttgttcttt-ctttTCTGTCATCATTATTTACAATTAACAAAACCCCGGACACTTCTAGATTGGAGCTCTGCTCAGCCGGTGGACTCTTTGGAAAGAGGGAGGATAGTGGGGAGAAAGAGCAGAAGAAAGATATTGCTGGGGGAAGAGAGTGACATTTGAAAATTGAATGAAAAAACCAGCCTACTGTGTGCATTTTCCTGGATGAAGTTCTTGAGCCTGCAGGGTCAGCAGTCAGAGGGCGGCTGCTTCTGTTGGGGGAATTGGAAATTCTATCAATAACCACCCCACTCCTGAAGACCAGACAGAAGTAAAGCTGGCGTGTCCTTTCCCCAGCCACCCCCCTCCAGTACACAGAGCTTTTAGGTTCCTCCAGCTATCTCTCTTTACTAGGAAAAACAGTCTGTCTCCATTGTCCAGGTGCCAGCAGGGCCTTTGGCAAAAGGGAGGCCGGCCAGCCTTCTGATCAAACTCAAAGGTTAGTTAAAAGACAAAAACAGCTGAAAGTCTTCATGAATAATGTTGGGCCAGCACCCCCCTCCTCCACTCCACCACCCCAAACCCCCCCACTCCCAACTCAGTGTAGTGCAAGCCATGCTGAATGCCCTACCACTTGGTTATGCTGCTCGCCTAAGTCAGAATTTCACAGAAAGGCCGAAAAGAAAAGCTCCCACAATTAGGGGTCGCCTGTCAGAAAACATTAACGCCTTCCTCTCCCAGCCTGTCAGGCCTGCTGCAGATACAAACTGCCATGGCGAATTGGCCCTCCACCCCATGAAGTGCCTGCCAGCCAAAGGAGCGGGGATTTGCAAGCCAAAGGAGATGGAGCCTGTCCTAGTGCAGTTTCCGCAGTGTCCTGACGCACCGAGATGCCCCCAGCTTCTGCTTTCTGAGGCTTGGCTGTGTTGGATGCCTGGGAGAGGTCATACAAGATAGTACTGCAGGTGGGCAGATGAATGACCACCCAGACCAGGGCAGTATAGCAGGACCTTTTCCTACAATGGGAATGGGTAAAATATATACACATGGCTACATCCTTATttcctgtttgctgagcatttttcaagtgccagggatcttacattgttcatgatcagagcaatccttcaaggtggtgtattattatatttatcttataggtgaataaaactgagagtctgtaacagctaagtagtggcagacaggattggacgtcagatttgcctgactccaaatttcattccccttccaccataatccagcccttAGTTTCTCCAATAAGATCCAGACACCAACTCTATGCTTGCTTGCTTCTGAAAGCACTGCCAATACTTGAGCATGTTCTTTGCCATCTTCTTTGTATTACCAAGAAtattctccacttttagaacagtatctggcatgtccttgacactcataaacttgtggaaggaaGGGAAGaggaagatacaaagaaaggaaaaaaaggaggaagggaggaaTTCCTTAGAAAGGTCCTTTTGGTTTTCTTTGAACATTATTTTGTTCTGGAAGATATTTAACTTTGCGTGAAGAGATCTGGTTGGGATTCTTATGTACCATCAGTTAGTTCGGGAGTGgaacctttgttttctcatctgcataagtggagataataataactaccttctatggtaatgataaagatagaataagattaactttgcaaaagttgctagcatgatatccaacacaggctcaagaaaATCCAGTTGAAAATGAAATAGGTATTAGTCTTTTATTTTTGTGTATCAAGAAAATATATATCACACATGCCTTACATCTGTGAAACAAAAATGCTATGCCATAGCTAAGTCGTCAGGGAATTTTTAATACTGTTGTCCCGTGGTGTTCGTGCCACCAAGATAGAATGAGGTAAAGCAGAGATCATGTTCACAGGTCTAAACTTATGGAAAGAAGGAAAGAGGAAAGAGTGTCTAGTGTTGTGGAAGAGTTTCAGGGCTTCCAAGAAGTGAGCCATCATCTTCCAGCAAGAGCAAAATGATGTGGGTGTTACTTCTCCCTGATGAAGCAGGTAGGAAATTATCACCCCATTTTGTGGAACAGAAAAATGAAGCCCCAAGATGTGACTACTTTGCTAGGAGAAAATAAACACTGGAAGTTAAAATTGGCCACTGTGATTCCTTCCAGGAGACATATCTTCTGAGCTTTCTGGAGTGATTCAGAACTTTGGTCTCCTCAGGACTTAGAAGGAACATTTTCACAAAACCATTCAT----ATTCATGGGATAGTCATTATTTCCACTGCATGGGACACTAGTGAAATTATTAAAATTTGCTTCAGTTTTCAAACTTCCAAGATTGCTGTCACTGTCTCCCTCTGCTTCTACCCACCAATCAGCTCTTTCAGTTCCAAAACACCAATTTTTTAAAAATGGAGAAAAAAAACCCAAGAAAAACTGCTGTTGATAATCCCAGAAATGTTTGATAATCCTGCAAAAGTTGGTCAGCTTCCTGGTCATTAGCTTTTCACTGAGTCCTTGTATGATGTTTTCGTTTCTGGAGAGCGGGGATGATCTTCCACATGTCCCTCTTTGTCTTTCCCACATTTCT-GGTTTTTTTTCCTTCTCTGGGCAAACTTC---ATTTTCCAGAAGACAGACTATGTTTTTGAGATATAATAATTACCTCATGGACTGTTGGCCAAAAATAATGGAGGCCAAAAATGTAAACACAAGGTCTACTTTTCAGATATTTTATGAAAATATTACATTGTCTAAATATGTTCAGAATGCAGTAGTATTTGATACATAGGACAGATTTAGAAACAACCATAAGCCTGCCCCACATAAGCACATAATATAGGACTGCTGAAATAAAAACTCTAGAGTTGGTATAACCACAGAGATGTAGCCAATGGTGCTTCATGTAAACTAATGATGATATTTTTCCCCTTGAAAATCCATGAAAATATAAT-ACCAAATATCTCAGGCTTGGGAGGATGATCTGGCTAGACTAGTCCAGGTTCAGCATTCAGACCACTCATGTCTCCACTTCCTGAGGACATGGAAGCTGTGTTTGGAAGACAGAGCAACACGTGTAGGGCATG-TTCTTTCTCCTGTTGGGGTGGCTAAGAAGAGGCCTGCTTTACATCCATCTCCTCTTTCTCAGGAATGTCCCTGTGTCACTGGGACACAGAAATGAGGGGGATTTATTTTGTGCTGTTTAAACAGGGTATACATTTCAACAAACAGCTAATTTGTTGCTGGAGATCCTCTATAGATGAAAACAGACATGCTATTCTAATTCTAGGGACTTTTTTGTAAGGCAAAAAA-------------------------AAAAAAA---TCAGACAAGTTGAAAAGATACATAGCCAGAGGTGTTTGTTGTCGTA-------TTTTTTTTTAAAAGATAATGGTGAAAAACCCAAAACAACCCAAAACTTTAATCTTGAGTATTGGTTCAAATAAATACTATATTTGCAggcaggtcacagcagctcatgcttgagatctcagcactttaggaggctgaggcaggagggttgc--ttgagtgcgggagtttgagactagcctgggaaagatggcgagaccctgtctctacaaaaattagctgaaggtgctggtgcatacctgtggtcccagctactcaggaagctgaggtgggaggatcacttaagcctaggatgttgaggctacagcaagccactatggtgctactgaattccaggctgggtggcagagctagagaccttgtctcaataaaTATATAAATAGATAAATAGATTAATATTTGCAAGCTCATATAATAGTATATTGTGCAGAATTTTAAATGGTGATGCAGATTTACGTTTATTACCATAGAAATATATCTGTGATATACATAAATGAAAAGAAGAAAATAGCCATCACATATAATTCTATTAACCAGAGAGTATTAGTCAACatttagttatct----atctatcatctatctttcatctatttatttTTATAAAATAGCATCAGATCTTTCACTTTTCTACTTAAAATATGAATATTAATTAGTTTAGttatttattcaacaaatgttttcccaggtcctgttgtaagccctcaaggtacagtagtgaaaaagaccaa-attggtcccagaccttacagTTTATGTCATCCCATTAAGACAGAAACTCAAACATCTAGTAGTTACATGTTTCTGTATCATTAGTCTTCTACAACATGATTTAAAATGTTAAAATGTTGATTGAAGGTACAATAACATCTTAACAAATCTGTGTGTTTTTAAACAAGGGAATTTCTTTTTTAAAATATGTTGCCCTTAGTGAATAAATTCTATGATGAAAAACATTATAACCAAGCAATtacacacttccatgattatatcctcaggacagatctacagaaggagacttgctttgcccaaggaaatgtgtcttttggaggctttttgcttaatatttcttaattgccttcagaaagattcaatcagttatgattccatggtcagtgatatgagtataaatttcctcacagtctcactaaGTTTTATTATAGTTTAAACCAACAAATTTACCAATTGGTAAGTTTTCTTAAAAGTGATTTCTCATTTTTAAAATTATGC-----TTACATCACTAGTGACACTCAATTTTTCTTTTCTTATGTATTTGTAGCAGTGATTATCATATGCTGGACTAAGACTGGTAGCATTATAATAAATGGAGAGAGGTTTGCTTAAAATACATATTTCTGGAGATTCT-AATTAACTGAGGTTTCTCTGATATAAGGCTAGTTTGTAGACAATCGTTTTTAATTTTAGCCTTTCTGGGGAGATAAATCAGATAGAAAATTTTAGAAATAACAATTGTGGATAAGATAAAGCCTCTAATTCCATAAAGAGGGCTTATTCTAAATTTACTTCTCCCAAGTTACATGGATTGAATGTCCCCAGTGGTAATCTATTGGAGGTGAATGCAAAGGATTACTTTGGACTCTGATTCCCCCAGTGGTCCTGCTTCTCCTTTCCAGTCTCTTTCCGTTTGTGCTGACCTCTCAGCCCTGCCCCCCACCTGCTGCTAGCCCGGAGAAGAAAGCCATTTCCATTGGCCTTGGCTGCCTGGGGAGATCTATATTACTCTGGGGAAGACAAGAGCTGCCCCCATCTTGGTAAAGTGTGAAATTCGGTTTTGATTGCAAAGGGAAGCCATTTCAATGGGATTACACCGTGACCATGTAGATTAAACTCAGCCATATGGCCTAGGGACACTTCTTCCTACTGTCAGGTAACAGTGCATTGCTAATGATGTGGCAATGACATTTTCAAATGAAAAATAAAGCCACCTGGATGGGAATAAAGGAGGCAAATAAATGACAAGATGCTGGTAAGCATTAACAGAGCTCTGGACTCTGCTGGTTTTGAAGAGGGGATGT-ATTTGCTTAATTTATAAGTAAAAGCAGTAAGCGTGATGCTATAAAAGGACTTTTGCCTGCTTGGCATAGTGCAAAGAGATTCCTTGTTTTTATCAAAAGAGATCCCAGTGTTGACATAATGAGATTGctcaacctcacttaacctcagtttcgtcacctgtttagtgggcgtaaacacattttgcagggttgtcacaagACAAAAACAGTTATATGAAGGTGATTTGTAAACTGCTAACTGATGTACAAGTGG--AAAAAAATAGGTGGTTTtatcagtcagagctctcagttacaagcaacagaaatagactttggtcaatttaaacaagaaagaaagtcacagaaggagctttgggtagttcataaaattactaaaaaggctaattccagaatcagaacatggactagaaaatgtacggctgagaagcagccaaaaccatcattaaaaccatttcccagaatagttggataaggctgcaaccaccactgcttctgatctctggttcccactgtttgtactgacgccatccccaggtctagacattggatgtactgctggtgcagatggtgccacagcctggaaattggtttgctgtagccccaggtactacagggaccaaaacagattatcttctgtccctgcttctttgtgtcactagtcgtcaggtccacaactatggtgagagcttcagaatggttgagccgtagatgcaaggaaggccaggaaagtgagtggccttgtctgcttttaaacttttctcaaaatgcttaagaatacccaagggaag---------------------tgtactc-------------------agaca s rheMac1.SCAFFOLD80653 14905 9803 - 71846 tcgtttctttttttttttTAAGAGAGAGGAGGG---GAATGCTGGGGTAGAAAACTGCATTGACTTTATTGACTGACAAATCTTACCTATTCAACAATGGCCTGGAGACCACCGAGTTAAGACTGAAGACACG-CTGAAATCGATGAGGAGGAGTGGGGAGTGCGGGAGAGAAAGAAAATACAGACCTGCCGCGGGCTGCAGAGCTGTTGAATGGCACACATCATCAGAGGATGGGAGAGAGCTATTGGTGCACAGGTTTCACCTCCCTGACACAGTTCTTTTAACATTTTAAATTGAGAGTAGAAGGGGATGCATCAAGAAGAATCTATCTCAAGTTCACATCAGGCAGGACCCACTAAGGAAGAGAGAAGAAACCATTCTGTGGTTTGCAGAGAACTTCAAAGGAGTAGGACTGAGATGTCTTAAGAAAGAGGGATAGAACGTGCCTTTCCACTTCGCTGTTCTTGCAGTGCTGGCGATGTTTAAACACAGAAGTAGCAGCCCAATTCGTTGATATACACAGCAGCTGGGTGAAGCCACGTAAAGGAGTTAAGAAATGGCTTGGTGGCAGAGATTACAAGCTATATGTAAATGTTAACCCCTGTTGCTGTTGCTATTCTTATCTTCCGGTCTTGTATCTCATTTTCCTGGGGACTGGTCAGGTGCATCTAGATCACAACCCAAATTGGATTCTTACCCACAAACCACGTAGAAAAAGTCTGATAATAGATGTGGTATCAAGGGAGATTTTTCTAAGATGCCCAAGTTGCTTTACctcaaatgccacctcctccaagaagctttccctgactaccctctttaaagcagctctccat-tgctataatcgctgtccattaatcctatttttccttcctggcatttaccgctatctgaaaatgctgtatctttgtttggttatatgattattgtcaattatcccccactacacggtaacctccctgaagctagggaccttacttgtcgtgttcaccattatctctcccgcccctggGAAGAAAAGGTATTTATTGACTACATGGACACATGGGGATGGTCTTCTCTGCTCCACGGAAAGTTGTGTTTCTCATtcttcctttcccctccacttgcactctccacccttctctgctcttctctctgtctcaggaggcaggcttatctttatggaattcatcacaagagttgtgtgtccttctggcttcctcttgggtttggccagtgggagacaccagcaggaggtggcaaagtagaaggggagatagggtgggatatttttatccctgctccatccctgcctaggccctattgctttgacagtgtctctactccttgtcctaagtccagggctcttgtcaggaggcttctctcccaccaatacagctcttactgaagtctagtaacaactccctcctcttgccccttaattaaggcccagagctggtaacagctctcccttgttcctagtctctgggtgcagcatcattttagttaacctcaccaacatctctgtctttctgttaaactttttcatttacccttgtgccatcatctctcttgccaactctgtctgctacaCAGGCCATTTCCCCACAGGATCTCATGGATATATTAGTGTTGTGTAAGATTTTTCAGGGACTCTTGGGGTTATGAGTAAGAAAAATCCTAGAGTATGGATGAACCCAACTCCATACAACATGTAACTCTAGAAACATCAGTTCATCTTCTTCAACCAGGAGTGAAGTCAATTAcagttttctcttctgg-aaaatgaggaaaataataccttcctttgcatagATCACCAGGTGAACAGAAAATGGAAGGGCTTTAGAGCATCCAATGACTATATCAATGCAAGAGATATGTGCTTCTTACGATCTTTCTGAACCAGGTAGTGGAGTGGTACTGGGGACTTGCCATTAGGATCAGCAAAGCTGTTGCTGCTGTTGGAAGCCACCCCCACTTTCTTTCGCCCATTCATTCGCCCTGCAATTTATGCACTCACTTCAAAGGGGAGGGACAAATTATTAAATCTGGTCAACATTTCTAGAACTTAATTGTGTTAATTTGTGTTTT----------CTCTCCAAGAAGCATCTGTTATTGCAACTTCTTAAaacaacaacaacaacaacaacaacaCCACCACCACCACTGTGGATGCTTCTGTGGTGTAATAATTGTCCGCAACCTCAGGTCCTTTTATTTATTGCTGAAACGCCTCTGAACTTCTTTCTCCCTCTCTCCACTCCTGAGCCAAGACATAGTTCTTTTCGGACTTCCAGAGAAACTCCTGGTTATCCGGAGACAACGGTAAGGAGGGAAGCGGATTCGCTGACACTAAGGTTCTTTATCTACTGCGAAAGCGAATGACTTGGATCTAGCGCAGGTCGAAGTTATATTCCTTCTTCCTTTGTATGCAAGATTAGGTTGTTACAAAAGAGGGTGTGTAGGTTAATGGCAGGAGGCAAGTTGCAGCGCGGAGCGCGGGCCCTGAGCGCGTGTCAGGCTTAATGATTTATTCAAGCTGCAGCGCATCCGGGCGTTGATTGGCTGCAGGCATGCGTCCGCTGTCAGCTGCGCGCGCCGGGAACTCTCCAGGCTACCTGAAGCTGGGGGGAGGAAGAGGAGGCGTGGGGACCCGAGGGGAGAGGTGTGAAAAGGAGGAACAGGTAGGAGTAGGGGGTgagggagaggaacagagagagagaaacagagaggaagagagacatagaggagatgggaaaagaaaaagtagagagaaactgagtgagaggaggagagaagggaaggaaggagggagaACAGAGAAGGGAAGAGAAACTCAAGCCTAGGTTGCTGGGGTaggagagaggggagaggaaaagatggagaaagcagacgagaaaaacaagagggagaaagagaaaatgaaggagaggcgaggataggagaataaatgagagagagCATAGACAGAGATTGGAGACAGGAGTGGGACGCGCTCCCAGAACGTCCCGCGTGCGCCCCCCTCCAGGCAGCCAGCGGGCGGCCGCTTACAAAGCCGCCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGGCAGCCAGCGGGCGGCCGCTTACAAAAGCCGCCTTTGATGCGCTGGCTACCAGGGCTATTTTGGGGACGAGATGGGGGAAAGCCGCCAACCCACACTCCTTGGAGGGAGTCACTTTCTGTAAAGTGCATTGGAGAGGACTGGGCCCTGGATCCGTGCTATCGAAGCAGGAAGTGGATGTAGGGGACAAAAGCTCCGCACCTGCCAAATGGGAGACCTTAGAGAGAGCCTCCCACTCGCCGCTCCCTGCTCCCCCGCCGGCCCGGGAAGCCTGCACTACCAGGCTCAGCGCAGCCAGCCCCACCGCCTCCGGACTCGA-CCCAGCACAGCCCCGCCCTGCACATCCTCTCTGAACCAAACTGCTTCTGCCTGCCTTTCTTTGGATCTGTCTTTCTCGGTCATCTGAGTCActttctctctcgcctctcttttctttcttccttttcttcttccttcccctcttctttcgcactcatttgttctttgtttttttgttATCATTATTTACAATTAACAAAACCCCAGACACTTCTAGATTGGAGCTCTGCTCAGCCGGTGGACTCTTTGGAAAGAGGGAAGACAGAGGGGAGAAAAAGCAGAAGAAAGGTATTGCTGGGGGAAGAGAGTGACATTTGAAAATCGAATGAGAAAATCAGCCCACTGTGTGCATTTGCCCGGATGAAGTTGTTGAGCCTGCAGGGTCAGCAGTCAGAGAGCGGCTGCTTGTGTTGGGGGAGTTGGAAATTCTATCAATAACCACCCCTCTCCTGAAGACCAGACAGAAGTAAAGCTGGCGTGTCCTTCCCCCAGCCACCCCCCTCCAGTACACACAGCTTTTGGGTTCCTCCAGCTATCTCTCTTTACTAGGAAAAACAGTCTGTCTCCATTGTCCAGGTGCCAGCAGGGCCTTTGGCGAAAGGGAGGCCGGCCAGCCTTCTGATCAAACTCAAAGGTTAGTTAAAAGACAAAAACAGCTGAAAGTCTTCATGAATAATGTTGGGCCAGTGCCCCCCTCCTCCACTCCACCATCCCAA---CCCCCCCTCCCAACTCAGTGTAGTGCAAGCCATGCTGAATGCCCTACCACTTGGTTATGCTGCTCGCCTAAGTCAGAATTTCACAGAAAGCCCGAGAAGAAAAGCTCCCACAATTAGGGGTCGCCTGTCAGAAAACATTAACGCCTTCCTCTCCCAGCCTGTCAGGCTTGCTGCAGATACAAACCGCCATGGCGAATTGGCCCTCCACCCCATGAAGTGCCTGCCAGCCAAAGGAGCAGGGATTTGCAAGCCACAGGAGATGGAGCCTGCCCTAGTGCAGTTTCTGCAGTGTCCTGATGCACCGAGATGCCCCCAGTTTCTGCTTTCTAAGGCTTGGCTGTGTTGGATGCCTGGAAGAGGTCATACAAGATAGTACTGCAGATGGGCAGATGAATGACCTCCCAGACCAGGGCAGTATAGCAAGACCTTTTCCTACAATGGAAATGGGTAAAATATATACACATGACTACATCCTTATCTCCTGTTtgctgagcatttttcaagtgccggggatcttatattgtcaatgatcagagcaatccttcaaggtggtgtattattatatttatcttataggtgaataaagctgacagtctgtaacagctaagtagtggcagataggattggacctcagatttgcctgactccaaatttcattccccttccacCATAATCCATCCCTTAGTTTCTCCAATAAGATCCAGACACCAACTCTATGCTTGCTTGCTTCTGAAAGCATTGCCAATACTTGAGTGTGTTCTTTGCCATCTTCCTTGTATTATCGAGAATATTCTCCACTTTTAGAACAGTATCTGGCATGTCCTTGACACTCATAAACTTGTggatggaagggaagaggaagatacaaagaaaagaaaaaagggaggaagggaggaaTTCCTTAGAAAAGTCCTTTTGGTTTTCTTTGAACATTATTTTGTTCTGGAAGATATTTGACTTTGCATGAAGAGATCTGGTTGGGATTCTTATGTACCATCAGTTAGTTCGGGAGTGgaacctttgttttctcatctgcataagtggagataataataactaccttctacggtaatgataaagatagaataagattaactttgtgaaagttcctagcatgatatccaacacatgctcaagaaaATCCAGTTGAAAATGAAATAGGTCTTAGTTTTTTATTTTTGTGTATCAAGAGAATATATATCACACATGCATTATATCTGTGAAACAAAAATGCTGTGTTATAGCTAAGTCCTCAGAAAATTTTTAATACTGTTGTTCTGTGGTGTTCATGCCACCAAGATGGAATGAGGTAAAGTAGAAATGATGTTCACAGGTCTAAACCTGCGGAAGGAAGGAAAGAGGAAAGACCGTCTAGTGTTGTGGAAGAGTTTCAGGGCTTCAAAGAAGTGAGCCGTCATCTTCCAGCAAGAGCAGAATGATGCGGGTGTTACTTCTCCATGATGAAGCAGGTAGGAAATTATCAGCCCATTTTGTGGAACAGAGAAATGAAGCCCCAAGATGTGATTACTTTCCTAGGAGAAATTAAACACTGGAAGTTAAAATTGGCCACTGTGGTTCCTTTCAGGAGACATATCTTCTGAGCTTTCTGGAGTGATTCAGAACTTTGGTCTTCTCAGGCCTTAGAAGGAACATTTTCACAAAACCATTCATAGCGATTCAAGGGATAGCCATTATTTCCATTGCATGGGACACTAGTGAAATTATTAAAATTTGCTTCAGTTTTCAAACTTCCAAGATTGCTGTCACTGTCTGTCTTTGATTCTACCCACCAATCAGCTCTTTCAGTTCCAAAACACCAATTTTTTAAAAATGGAGAACAAAG---CAAGAAAAACTACTGTTGATAATCCCGGAAATGTTTGATAATCCTGCAAAAGTTGGTCAGCTTCTTGGTCATTAGTTTTTCACTGAGTCCTTGTATGATGTTTTCATTTCTGGAGAGCAGGAATGATCTTCAACATGTCCCTCTTTGTCTTTCCCACATTTCTGGGTTTTTTTTCCTTCTCTGGTTAACCTTCTTTATCTTCCAGAAGACAGATTATGTTTTTGAGATATAATAATTACCTCATGCACTGTTGGCCAAAAATAA--GAGGCCAAAAAAGTAAACACAAGGTCTACTTTTCAGATATTTTATGGAAATATTACATTGTCTAAATATGTTCAGAATGCAGTAGTGTTTGATACATAGGGCAGATTTAGAAACAACCATAAGCCTGCCCCACATAAGCACATAATATAGGACTGCTGAAATAAAAATGGTAGAGTTGGTATAACCATAGCGATGTAG-CAATAGTGGTTCATGTAAACTAATGATGATATTTTTTCCCTTGAAAATCCATGAAAATATAATAACCAAATATCTCAGCCTTGGGAGGATGATCTGGCTAGACTAGTCCAGGTTCAGCATTCAGACCACTCATGTGTCCACTTCCTGAGGACAGGGAAGCTGTGTTTGGAAGAGAAAGCAACACGTGTAGGGCATGTTTTTTTCTCCTGTTGGGGTGGCCAAGAAGAGGCCTGCTTTATATCCATCTACTCCTTCTCAGGAATGTCCCTGCTTCACCAGGACACAGAAATGAGGGGGATTTATTTTGTGGCATCTAAATAGGGTATACATTTCAATGAACAGCTAATTTGTTGCTGGAGATCCTCTATAGATGAAAGTAGACACGATATTCTAATTCTAGGGAC-TTTTTGTAAGGCAAaaaacaaaacaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaaaacCCCAGACAAGTTGAAAAGATACATAGCCAGGGGTGTTTGTTGTAGtatttatttttttttttttaaaGATAATGGTGAAAAACCCAAAACAACCTGAAACTTTAATCTTGAGTATTCATTCAAATAAATATTTTATTTGCAggcaggtcacagcagctcatatctgagatctcagcgcttcaggaggctgaggcaggagggttgcttttgagtgtgggagtttgagactagcctgggcaagatggagagaccctgtctctacaaaaattagctgagtgtgctggcgcacaccggtggtctcagctactcaggaagctgaggtgggaggatcatttaagcctgggaggctgaggctacagtgaaccactgtagtgctactgaactccaggttgggtggcagagctagagaccctgtctcaataaaTGTATAAAGAGATAAATCGATTAATATTTACAAGCTCATATAATAGTATATTGTGCAGAATTTTAAATGGTCATGCAGATTTATGTTTATTACCATAGAAATATATCTGTGTTATACAT---TGAAAAGAAGAAAATAGCCATCACCTATAATTCTATCAACCAGAGAATATTAGACAAtatttaattatctatcaatctattatctatctttcatctatttatttTTATAAAATAGCATCAGATCTTTCACTTGTCTACTTAAAATATAAACATCAATTAGTTTAGttatttattcaacaaatgttttcccaggtcctgttgtaagccctcaagatacagtagtgaaaaagaccaatagtggt-ccagaccttacagtttacgtaacccca-taagacagaaactcaaacatataatAGTTACATGTTTCTGTATCACTAGTCTTCTACAACATGGTTT-AAATGTTAAAATGTTGATTGAAGGTATAATAACATCTT---AAATCTGTGTATTTTTAAACAAGGAATTTCTtttttttaaatatgttgctcttagtgaataaattctatgatgaaaaacattataaccaaacaattacacacttccatgattatatcctcaggacagatctacagaaggagactttctttgcccaaggaaatgtgtcttttggaggctttttgattcatatttcttaattatcttcagaaagattcaatcagttatgattccattgtcagtgatatgagtatgaatttcctcatggtctcactaagttttattatattttAAACCAACAAATTTACCAATTAGTAAGTTTTCTTAAAAGTGATTTCTCATTTTAAAAATTCTGCTTATTTTATATCACTAGTGACACTCAATTTTTCTTTTCTTA-GTATTTGTAGCAGTGATTATCATACGCTGGACTAAAATTGGCAGCATTATAATAAATGGGGAGAGGTTTGCTTAAAATACCTATTTCTGGAGATTCTAAATTAACTGAGGTTGCTCTGATATAAGGCTAGTTTGTAGACAATTGTTTTTAATTTTAGCCTTTCTGGGGAGATAAATCAGATAGAAAACTTTAGAAATAACAATTGTGGATAAGATAAAGCCTCTAATTCCATAAAGAGGGCTTATTCTAAATTTACTTCTCCCAAGTTACATGGGTTGAATGTCCCCAGTGGTAATCTACTGGAGGCGAATGCAGAGGATTACTTTGGACTCTGATTCCCCCAGTGGTCCTG-TTCTCCTTTCCAATCTCTTCCCGTTTGTGCTGACCTCTCAGCCCTGCCCCCCACCTGCTGCTAGCCTGGAGAAGAAAGCCATTTCCATTGGCCTTGGCTGCCTGGGGAGATCTATATTACTCTGGGGAAGACAAGAGCTGCCCCCATCTTGGTAAAGTGTGAAATTCGGTTTTGATTGCAAAGGGAAGCCATTTCAACGGGATTACACCGTGACCATGTAGATTAAACTCAGCCATATGGCCTAGGGACACTTCTTCCTACAGTCAGGTAACAGTGCGTTGCTAATGACATGACAATGACATTTTCAAATGAAAAATAAAGCCACCTGGACGGGAATAAAGGAGGCAAATAAATGACAAGATGTTGGTAAGCATTAACAGAACTCTGGACTCTGCTGGTTTTGAAGAGGGGATGTAATGTGCTTAATTTATAAGTAAAACTTGTAAGCGTGATGTTATAAAAGGACTTTCGCCTGCTTGGCATAGTGGAAAGAGATTCCCTGTTTTTATCAAAAGAGATTCCAGTGTTGACCCAACGAGATTGcttaacctcacttaacctcagtttcttcacctgttaagtgggcgtaaacacacttcacagagttgtcacaagACAAAAACAGTTATATGAAGGTGATTTGTAAACTGCTAACTGATGTACAAATGGGAAAAAAAATAGGTGGTTTtatcagtcagagctctcagttacaagcaacagaaatagactttggtcaatttaaactaaaaagaaagttacagaaggagctttgggtagttcataaaattactaaaaaggctaattccagaatcagaacagggactagaaaatgtgcagctgaaaagcagccaaaaccatcattaaaaccacttcccagaatagttagataaggctgcaaccaccactgcttctgatctctgtttcccactgtttgtactgatgccatccccaggtctagacacttaatgtcctgctggtgcagatggtgccacagcctggaaatttgt------tagccccaggtactgctgggacacaaacagactctcctctgtccctgcttctctgtgctagtaatcattaggtccacatctgtggtgagagcttcagaatggttgagccatagatgcaagggaggccaggaaagtgagtGGCCTTGTCCGCTTTTATACTTTTCTCAAAATGCTTAAGAATACCCAAGGGAggccgggcgcggtggctcaagcctgtaatcccagcactttgggaggccgagacg a score=802265 s hg17.chr12_random 397918 9920 + 466818 ctgggcagc-----------------caaaaataaaa------------------------------------------------------caaaACAACAAACAAGAAAATACAACTATCTTTTAGATcaggaatctgcaaactgttttgtaaagggtgacatagtaaatattttcagcttcatgagcaactactcaatttcgcaactgtagtgcaacagcagcgaggaacaatatgtaaatgaatgagtgtggctgtcctccaataaaattttacctacaacaacaggatttgattc-cagattgtactttgctgatccttgCTCTAGAGTGATGATGATGGTGATAACTAGGTGAAACTTTAAAACTGTCCTTCAAGGAGTGGCTGGAAATGGATGCTGGCAGAGAGAGTAGCAATTCACTCAACTGTGCACTAGCAAGATGTTTTCTCTCATTCGGTTATGTTGCCCGTGGTAACTGTTGGTTTTGTTGTGAAAACTGTTTCCCAGTTAGGGGGTTAACAATATGTAAACTATCTGCATTTAAACATAATTTCAGTTCAGATCTGGGCATTAGTTGAGACCTCCTCTAGGTAGGGAGTGTAGCAGAACAAAGGAGGGAGAAGAAGTGCCTTCTCCTACCTTATGCCTTCCTGCA--------------------------------------------------------------------TGACCACCCAGGCTCTGCTCTGAGGCTCCCAAGTGCTCCTCTTCTCAGCCCTGATGCATTATTACACCTTTTGGGGCAAGTTTCATATTTCCTTGCCATGGATGGTATCACAAGGGCACTTCATCTACCCCAGGAATCTGGGTATTACCTTCTTCCTAAGGGCATGTCATGCCACACTGGTGAAATTCAGCAGATACTTCTTGTGGTTTCCATGTGATGTTCCCATAGACTGATTTAGTTGACCTGGGAAGGAGAAAGAATCAATCTAATGATGAATCATCACGTGTAAATGTTTGCTGTCAAAATGATAGAATAACTCTTTGATGGAAAAA-GACACTTTCCTTCTCTCCATCATTTATTTAACCCATAGGAATTGTGGTCCTAAAGTTTGTCATGTCTACACT-GGGCAATAGGGCTAGAGGTGTATAAAATGTGGCCTCTGTCCTGGAAGACATACAATTAGTTTTGTTCCTCTTTGTAGTCAAGATTTTTTACTGGAAGCAGTCATTTATTATATCTGTAGCTCCCAAGCATACTAAGTGTTGCAGGAAAATGAGCTTATTCATCACTAAATGAAAGAGGTCAGTCATCATATTTATCAGAAATAGGTTGATGGTGCAGAAAACCCAACCTATGATAGTAAAACCAAATTACGGATGCACccttccttctttccttccttccttctttccttccttccttcctccctcccttccttcctccctccccctctctgcctcccttctttccttccttccttcctttctccctccctccccccttccttccttccttcccttcctttcttcatgcctttcttttcttcttttttctcttcctttgttccttccttccttcctcaccttccttcctcccactgcctccctcttttcctcccttctttcttctttcattcctttcctccctccttcctctctcttccttcctcaatctctccctcctctcccttccttcctttctttcttccttccatccttccccctccctctttcccttccttccttcattccttTCTCAGTCCCTCCTCTATCTACTTTCTGCCTCCCCTTCTCTGTTCTCTTCCTCTCTCCAGCttccttccttccctctctctttccctccctttttccttccttccttccttccctccttccttcctgcctttgttcctttcctgcctgtcttctttctctccttctttctctcttctcctccctctgtctgtctctcttattcttttcctctctccttcacttccttccactcttcctccctcccCTCTTTCCTTTCTTCCtttttctctgagcaagaagtctggatgtgggaatgcactggggttactatgatggctctcagtgctttcagggtcacaggtgctgactagctttccacccagccatccttagtgtttaacctgttgccttatggtcccaggatgactgccccatctccagataatgtctgctttctaggcaagaaggggaaggataaagagaaaaagagcaggccAGCTGAAAGCTGCTGTCTTCTAAAATGTGGCTAGAGTTTTACTTTTTAAGCCAGGAATGTCACTGCTTAAAATGCAAGGGGGATTCTGTGAGTAAGGAAGAGGGGCACAGTGGGTATGGGGTTTCGGAGAGACTTGGGCTCTGTCTACTGTAGATTTTACTCCAAGTGCCATTTTTAATGAATTTGTGGGTCCCACCCATGAGCTGGGCATTTGCTTCCAATACTTTTCATCCTCCTTAATTGTCTGAACTTTTAAGTTTTCTGAACAGTAGGGTCAGATTTCCCAACATGGTGTCATCAATTTCATttatggaatccctgaatgtttaaaggtagaagtaccttagaggtctccttcttcaaccccctgagctatagatggtggaaacagaggctcagaaatattaaatgacttaggctgggcgcgatggctcaagcctgtaatcccaacactttgggaggccaaggcgggcaaatgacgagttcaggagttcaagaccagcctggccaaaatggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaatgagctggtcgaggtggtgagcgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccgggaggcggaggttgcagtgagtccagatcgtgccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactctgt------------------------ctcaa---------------aaacaaaca---aaaaaattaaatgacttgcccaagatgataccactcataactgggagattcaagattaaaaAACATGGAGAGAATGGCAAGTATGTTCCCTCAAAAGACCATTTTCTCAATTAGATTTGAAGATTGCAAAAATTTCAAACCATCAAGGCCAGGCAGAATCTTCTCTATCTAGTTCCTTTCATTACTAGGATCTACATTTTAGCTGACAGCACTGGCATTGGTGTTTGAACTACATTTCCAGCCTTCCTTATTTTTTTCCATTCCTAGAACCTCTAAGGGCCTAAATCTAGCTCTCATTAAGTGCTTCTTAGGCTCTGAAAAAAATGTTGGTTGAAAGAGCATGCCCAACTTGTTTTCCAAATCTTCATTTGTGATATTGCCACCCCCATCCCCACAATATTTTCAACCAGAAACCCAAGAGTAGTTTGTATCCTTTCTCATCTTCTTCTACCAGATCCCAGTGAGCATCAATAAATCTAAAAGATTCTATATGATGTCTTAAAAGTCTAGAAAATGGGGAAATATTAGAATGATTTGTTGAACTATTTCCCCCAGTTAATGATTAGACCCATAAAGCTTTACATTTAGAGATATTTTGCCTGTAAAGATGTCCTGAGGTTGGAGGAAACTTCTGAGAATGTTATTTGAAAATGTAACTGATGCACGATTTAGACATAATTTTTTCTGTTTCCAAACCTTTTATATGCCCTTTTCATTTCAGCTCCTGCcttctcaaccccatggcttttgcctttgttcaggacctgatcatttctccctggaccttcgcctcttaaatactgttcttattcttgtcactccaatccatcttccaccctgtggccactagagtacttttaaaataatacacagaccacaccactgccaccaaagtgatct---------------------------tttaaaacacttctatggtttcccCCATTGCCCATGATTGCAGTTACTTTTttcaccccacaaatgttcatggagctcttacaatgtgccagtactatggtaggcaaagttgatgtgatgccgagtatggcagacgtgctggctactcacctggaacttctgttctaatggaTGCTTGATAAGAGATTTGATGACCTAGCCTCTGTCTTCAGTCCCACCCAGATCTCCAGCCACCCTGTTGACCTTTATCCCCCAGCAATGCCAAATTGTTTGTCCTCTCTGCACACATTCTGCTTTGTCTCATCTTGGTGTCTTTGCATATGTCCTCTTTGTTTCTCTGGTGTCTCAGTCATCACTTCCTCCAGGAGGCCTTCTTTGATCCCACTTTACACAGATTAATCACTTTTCTCTGGAACTTTTGCACAGagttggccctccatagccatgggttccacatccatggattcaaccaatttcagattgaacatatccgaaaaaaaattacatctgtactgaacatggacagatttttttcttgtcattattccctgaatgatataacagctatttatatatcatttaccttgtattaagtattataagtaatctagagatgatttaaagtagaaggggggatgtatataggttatatgcaaatactatgccattttatatcagggattgtagtatatcagcacctgtggactttggtattccaggggttcctggaaccaatccaccacagacaccaagggatgaccgTATTCTGTTGTTACGTAGTTGCCCTCATCACAATATTCTATTTATTTGTGCATAGTCCTTCCTTTTTTAT--TTCCTAAAGTGAAAAAGCTTATTAAAACGAAAGAAATTTGAATTGTGTTTAGAATTCAGAAGAACTCCTGGAATCACTTTTATTAAGTAGACTCTGCTGTATCAAAAAGAGAAAGGATGAAAATTTTCATATTGACCACCAGGAGTTACAATGAGCATTCTGTAGCTCTGAGAACAATAGCTCTAAAGAAAAGTAGCCAGGAAACTCCATGATGCTTTATCTCACTCAGCTATAACAATTTGTGAATCCTCATTAATTGTCTAACAATGTTTCACGAATCTTGAAAGTAACTGAAATAAAAGGGTTCATTAGTGTGTGCTTCATAATGAGAGAAACTCAATTTTCAGAACACAAGAAGGGAACTATTCTTTTTGTTCTCTTTAGGTGTCAGGAGGTCTAGGGAACAGAAAGAACTGTCTATAGCAAAATGCAAACGGATTTGGGAC--TTTTTTCTCAGTCTAAAAAATCTTGGTAGCAATAAAATGGGGGTGGAGAGAGAAAAATCTAAGCAAAACCGATTCATGTGGGAAAGCAGAAACTTGTATGTCTATTCT---GTTTTTTTCTCCATATGAGGGAACTTTTATGTTTTATTTTCACACTAGATTATTGGGGTTTGGGGAAAAGTACTGTGTTTAAtattcccaatgcctagggcagaaacacagtaggtgctcaataaatgtagatttCAATTAAATAATTGTATAGTTAATGACTGTTTTTTGGGAAAAATTGTGTAGTATAATTGTATAGTTGATGACTGGTTTTGATGGGAAAAAAATCTAAAATCTAAGAGAGGTGACAGATATGGTAGGAAAAAA-ACATTGGCTATGTAAAACGACAGGTCTTAGGGTGTTGTTGAGTTTTACATTTTTGGGCATGCAGGACATAGGCCCAGCAATGGGGAATATGAGTATATGTGCACATGTACAGCCCCATGCAGATGGGTCATATATATCCCAAGCTTTGGCCTAGCAACTCCTAGACTCTATAGCTTAAGTCCTGTTTTTTTTCTGGTAGTCTCAGCACCCCC-TTCTC-TTTGTTGCCTTTGCCAGTGACATGGAACTTTATTCCTGCATTTTGTTTTCAACTTTTCTTTTCAAACAACCTCAGGGAGTCCAGGTAT-AAAAAAAGAGGAGGACCCTAAGAGCTGTTCTGGCCCACTGGGAGCAGGATTTTAACTTCCCTTCTTTCTGGCCCCAATTCATAACTTTTTATTTTTGTTCTTGGTGCCCCCTTCTTTATAAACCCATTCAGCaatttttttaaaaaaaattataCAAATTCAATGTGTGTGTGGATTTTGGGTGGGCTGTGGAAATTGATTTACGAGTCAACCACTTTTCTCTTTTCTTGCCATCTCCCGCTTGAGTGGTTTGTCGGCCCTGGGGCCTTTCTTTCACTCGAGGAGAATAAGGTTGTCTATGGAAGAGGTCAGCATTTCAAATTGGTGGAGTTCAACTGCACAAATGACATAGAACTGACAAGAAAAGACAGGGGGTTTGGAGGTCACAGACTGCATAGGTCTCGCTTAGGGTTTTTGCTTTGTGATGAACCCTGTCACCAAAATGAATTAAATAACAGGCTTAAGGACTATTGAGGGAGGACTGAATGCAAATCAAAGATAAGTAGAAGTTTTCTTTCCTAAAAGGGGAATGATTTTTTTCCTTCCCTCTCCCCTTCCATATCTGTGCCGGCAAGAGCTGCATGTTAAACATGATTTCGCTGGCATTATGCTGGGCGCTTTCACTCCAGGCTGCTGCGATGGCCTATCTTGGCCTATGATTAATGACCTGCTAGGCAATTTGGAAACCATAATAACTCCACGGTTCACACACAAACTATATAGTCGCATTCCTTTTGCAGATTTGCCAAGCTGTTACCAAGGGGCCCGCAGAGGAGCCGGATTGTTGGAGAGATAGGGAGGCATTTCTGCAAATGCCATTCGGGCCTTATCTTGCTGAAAAGTGCAATGAGCGGCAGGCTCATTTAGAAAATTCAAAGCGTAGATCTTGCAGCTTCTTTATTTAAGCCCAGATTAGGGAAAACAAAACAAAACAAACAAAAATGGCTCCAAAAAAAAATGGGCTGGTAAAAATCAATCTCTCTGTATGGTCTCCAGGCTCTGAGTGATTCCAGAGACAGCACAGTGGTATTCCCAAATTTTGAATTGGATTCATCAAGGTCTAATGATAGTAATGCCTCTCAAAACAAAGAGTAGATTTTTGAAAAACCTAGGCAGAGACAAAGGCTCCGCTTAAAGTTTTGCTCTTTGGAACTATTTGTGCACACACTTCTAAACAGTAAAATTGTTTATTAgagtggaagggcattgcactgggagtcacagagtctgggtctagtgctgggtcagtcgctgcactgctctgcgaccccggatgcatttcttctcctctctgggctgcagttttcacatcagttcaatgagaatgttggatttagaaacaatctagcaggctttttctggcttgaattttcatttatgttgcggatatttattgagcactcaccatgtagttagcactcttctaggctcttgagatatttagagaagaaagcagacaaagttc--cctgtgcccaaggagctcacactctagaggggtgagacaatcattgacaataacaataatttaataaggaaattatatatgttagaggataataagcactatggaaaagaaaatacttggacagaataaggggaaataggaatggtattaggtggaggttggggacagaacaaagtcagaaatatggtggtcagtgagatttgacagtgacctgaaggagatgagggagtcagccaagcatatatctgacagagaagcattcaggcaaggagaacatttctagagcaaaggccctaaTGGTCTATAAGACCACTGATGCTGTCGTTTTCTGTGACTAACTGGCTCTCAGTCACTTAGCTAGCTGATGGTGACTTTATCACCCAGCCTTgtggttttcaaccttggctgcatgttgaaagcacacagataattagaaaaataaaactcctgggtcctacttccagagattctgatttaattggtgtggggcgtagcctgggcatggagggctttcaaagctcccaggtgtttcttctatgcagtcaaggatgagaaacactCAACCTTGGGAGCAGTGGGTCAGCTCCACCATAACATTTCTGGGAGCTGTTTGTCACTAAGAAAGCTGACCTTACAATGCACACAGTCAAGCCAAGTAACTGTCATCAAGTTCCCAGGCATTATCTCATGAAGAACCTTCTATGCACTAGGTTCTATGCACAGTACTCATCATGCAAGATAATCCATGCCAAAATATGGAGGAGATGGACATGTGAAAAACATTTTTCACAAAGAAAAATGTTTGGTACGGAGCACCAAAACTTGTAAGATGCTAACGGCCAGTTTCTCTCACACATAACTCATTCAAATGACACTTCCTTATGTTTGTCATATTCATGTAATATTGAATCATGCTTTTCACTTAATTTCTTACTTTACTCTTGTCCTAGTCAATAGTACCTGTAAAATTACTTGTTTG-TATGTTATATGTCACAAATTTGATATGTACTTTATATAATATATGTAATTACATATATATGTGTGTAATTGAAAAAATGACAAATGTTTATCCGTGCACTATCTAAAATCATCTCCAGGATGACTACCAGAAGAAAGTGAGCTACATTTTTGGAAATAGAACTGAATGACATGAGGTGGTGACAACAAAGGGAGGAAGAGAACATTTGAGGCTGAGGGACCCATGGCTTCCATCTTTATTTACATACAAAAACAGTCAATGCCAGACTAAGAGAGTCAAAGTTAGGTAGTTGAGGTAGGCTTTGTGGTTACGCAACCCATTGATCAAGTTTGTGCCATTTGGATGATTAGTGGATGGATTTTTCTTTGAAATTTCTAAACATCAAAAATCACTTGCTTTTCACTGTATGGCCAGACTTCACTTTTCTCTCTTTGTGTCAAAGCATTGTGACTGGAAGTCAAGGTCATGCCATGTGAACTCAGGGGAATCTAAGGCATAAAGTATGCCCTAGTATGTTTAGAAAAAGCATTAAAATGATAATTTTTGGTCTGATAATTGTATCTTTCTGGAGAGCTTACCTTTGAGAGAAAAACATGTAAAAACTTTTTTTAAAAAATTAGGC-TTGGCTACTGGGTGAGGCAAATTTCCAAATTTCTATGTTTTTCAGGTATATATTTGCTTTGAAAATTATTTTTTCTTTCCCTACTTATTCTAATTAGAAGGCAGCAACATATTTTTGGAATCTGTACAATACTCAATAGACACATGGTACGGGTGTCCTCTTTTCtaaaaatattttta-tttttaaCTTCCAAGTAATAAATAAATTAATTCCCACTGCAAACAATTTAGGCATTGTAGAGAATAGTTATAGCTTCCTATCTTTATTCCAAAGGGAGTCATTTTCACCAGCTAGGACTGAACCTGGCTGGCC---------TTTTTTTTCTTTTTAAGGTATTTATGTATATGAAGCTTTGAAACTAATTTCTGTCTGTATGTGTTTCATAGAAGTATGCATGATGTTATACTTTACATGTCATTCTGCAAAATTTTTTTCACCGAACAATATGTCTCATGTATGTATGTCTTGTACTAGGTCAGTACAAATGAATCCACCTCATTAAAAAAATAGGTGCACAAAGTTTCAAAGTATGCATTTACATCCTAGAGATAGTCATTGTGCTACAAAACCAATGTTGCCTGATGACTGTCCATGCAAATGCCTTCCTCTTTTATAACACCTCATCATacacctatgagtctgtctctagggtagacactgaaaattgaaatcgatggattatagggcaagagcattattaactttaatatattccaccaaaatatcctccaaaatagcctaaccaactttcactATGTTGTAGGACCACGTGCCATTTCTTAGGTGTGTCTTTTATGTAATTCCACTGTTTGTAGGTGGTATATTCACTAAAATCTTCTCACCTATGGTAGTGGGAATGTATTTACCCAGATCTATCCATATTCTCATTTGCAGCCCAGAGTAGTAAGAGGTGGTTGAAGACAGTATGGAATTATCTGTCCCAGGCAGGGGTGATAATCCTCATCTTAAACTGGGCATTGACCAACTGAGCTAAACAGTGGCCCAGAGTCTTCACAACACCTTGGCACATCTATATTGCATTAATTACATGCAGGATATTAGGCTTTGGAACACACACACAAAATAATAGTGGTTAAAATAAGTTTAGAAAATTAATTGTCTCACAAAACTGTTCAAGTGTGATAAGCTCAAGGCTGCTACTGAAGATCCACAGTGGTAGGAATCCAGGACCCTTT s rheMac1.SCAFFOLD80653 24913 9952 - 71846 ctgggcgacagagcgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaagaaTACCCAAGGGAAGGGTACTCAGACACCGGGCAGCCAAAAATAAAGCAAAACAACAAACAAGAAAATACAACTATCTTTTAGATcaggagtctgcaaattattttgtaaagggtgacatagtaaatattttcagcttcatgagcaactactcagttctgcaattgtagtgcaagagcagcaaggagcaatatataaatgaatgagtgtgactatgctccaataaaattttacttacaacaacaggatttgattctcagattgtactttgctggtccttgCTCTAGAGTGATGATGATGGTGACAACTAGGTG-AACTTTAAAACTGTCCTTCAAGGACTGGCTGGAAACGGATGCTGGCAGAGATAGTAGCAATTCACTCAACTGTGCACTAGAAAGATGTTTTCTCTCATTTGGTTGTGTTGCCCCCAGTAACTGTTGGTTTCATTGTGAAAACTGTTTCCCAGTTAGAAGGTTAACAATATGTAAACTATTTGCATTTAAACATAATTTCAGTTCAGATCTGGGCATTAGTCGA----------------GGACTGTAGCAGAACGAAGGAGGCAGAAGAAGTGCCTTCTCCTACCTTATGCCTTCCTGCATGATTACCCAGGCTCTGCTCACAAAAGAGGCAGAAGAAGTGCCTTCTCCTACCTTATACCTTCCTGTGTGACCACCCAGGCTTTGTTCTGAGGCTCCCAAGTGCTCCTCTTCTCAGCCCGGATGCATTATTACACCTTTTGGAGCATGTTTCATAATTCCTTGCCATGGATGGTATCGCAAGGGCACTTCACCTACCCCAGGAACCTGGGTATTACGTTCTTCCTAAGGACATGTCA-GCCACGTTGGTGAAATTCAGCAGAAACTTCTTATGGTTTCCATGTGATGTTCCCATAGACTGGTTTAGTTGACCTGGGAAGGAGGAAGAATCAATCTAATGATGAATCATCACATGTAAATGTTTGCTGTCAAAATGATGGAATAACTCTTTGATGGAAAAAGGACTCTTTCCTTCTCTCCATCATTTATTTAACGCATAGGAATTGTGGTCCTAAAGTATGTCATGTCTACATTGGGGCAATAGGGCTAGAGATGAATAAAATGTGGCCTCTGTCCTGGAAGACATACAATTAGTTTTGTTCTTCTTTGTAGTCAAGATTTCTTACCGGAAGCAGTCATTTATTATATCTGTAACTCCCAAGCATACTAAGTGTTGCAGAGAAACGACCTTATTCATCACTATACGAAAGAGGCCAGTCATCATATTTATCAGAAATAGGTTGATGGTGCAGAAAACCCAACCTATGATAGCAAAACCAAATGACGGATGCACC-------ccttccttccttccttctttccttccttcctt----------------------------------------------------------------------------------------------ccttcctttcctcatgcctttcttttcttcttttctctcttcctttgttccttccttccttcctcccctctcttcctccccctgcctccctcttttccttccttctttcttctttcattcctttcctccctccttcctctctcttccttcctcaatctctccctcctctccctt-----ctttctttcttccttccatccttccctctccctctttc----cctgccttcattccttTTTCAGTGCCTCCTCTCTCTACTTTCTGCCCCCCTTTCTCTGTTCTCTCCCTCTCTCCAGcttccttccttccctctctctttccctccctttttccttccttcttt--------------------cctttgttcctttcctccctctcttctttctctccttctctctctcttctcctccctttgtctgtctctcttattcttttcctctctccttcacttccttccactcttcctccctcctgcctttcctttcttcctttttctctgagcaagaagtctgggtgtaggaatgcactggggttactatcatggctctcagtgctttcagggtcacaggtgctgactagctttccactcagccatccttagtgtttaacctgttgccttgtggtcccaggatgactgccccatctccagataatgtctgctttcaaggcaagaaggggaaggatacaggggaaaagaGTGTGCCAGTTGAAAGCTGCTCTCTTCTAAAATGTGGCTAGAGTTTTACTTTTTAAGTCAGGAGTGTCACTGCTTAAAATGCAAGGGGGATTCTGTGAGTAAGGAAGAGGGGGACAGCAGGTATGGGGTTTCAGAGAGACTCAGGCTCTGTCTACTATAGATTTTACTCCGAGGGCCACTTTGAACAAATTTGTGGGTCCCACCCACGAGCT-GGCATTTGCTCCCCATCCTTTTCATCCTCCTTAATTGTCTGAAC-TTAAAGTTTTCTGAACAGTAGGGTCAGATTTCCCTAc---------------------atagaatccctgaatgttt-aaggtagaagtaccttagaggtctccttcttcaaccctctgagctacagatggtggaaacagaggcccagaaatattaaatgacttAggccgggcgcgatggctcacgcctgtaatcccggcactttgggaggccaaggtgggcgaatgatgaggtaaggagttcgagactagtctggccaaaatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaaacaattatctgggcgtggtggtggatgcct-taatccaagccactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtaagcccagatcttgccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactatctgaaaaaacaaaaaataaataaaaactaaaaaTAAATAAATAAATAAACAAACAAACAaaaaattaaatgacttgcccaagatgataccactcgtaactgggagattcaagattaaaaGACATGGAGAGAATAGCAAGTATGTTCCCTCAAAAGGCCATTTTCTCAATTAGATTTCAAGATTGCAAAAATTTCAAACCATCAAGGCCAGGAAGAATCTTCTCTGTCTAGTTCCTTTCATTACTGGGATCTACGTTTTAGCTGATAGCACTGGCATTGGTGTTTGAACTGCATTTCCAGCCTTTCCTATGTTTTTCCATTCCTAGAACCTCTAAGGTCCTTAGTCTAGCTCTCATGAAGTGCTTCTCAGGCTCTGAAAAAAACGTTGGTTGAAAGAACATGCCGAACTTGTTTTCCAAATCTTGGTTTGTGATATTGCCACCCCCCT------AATATTTTCAACCAGAAACCCATGAGTAGTTTGTATCCTTTCTCATCCTCTTCTACCAGACCCCAGTGAGCATCAATAAATCTAGAAGATTCTGTATGAGGTCTTAAAAGTCTAGAAAATGGGGATATATTAAAATTATTTGTTGAACTATTTCCCCCAATTAATGATTAGACCCATAAAGCTTTAAATTTAGAGATATTTTGCCTGTAAATATGTCCTGAGGTTGGAGGAAACTTCTGAGCATGTTATTTGAAAATGTAACTGATGCACAATTTAGACATATTTTTTTCTGTTTCCAAACCTTTTATATGACCTTTTCAATTCAGCTGCTGCCTTCTCAACTCCATGGTTTTTGCCTTTGTTCAGGACCTGATCATTTCTCCCTGGACCTTCGCCTCTTAAACACTTTTCTTATTCTTGTCGCTCCAATCCATCCTCCACCCTATGGCCACTAGAGTACTTTTAAAATAGTACACAGACCACACCACTGCCACCAAAGTGATCTTTTAAAAGTATGATTGTATATCTCTTATTTAAAACACTTTCACGGTTTCCCCCATTGTCCGTGACAGTAGTTACTTTTttcactccacaaatattcatggagctcttacaatgtgccagagctatgctaggtaaagttgatgtgatgctgaataaggcagatgtgctggctactcacctggaacttctgttctaatggaTGCTTGATAAGAGATTTGATGACCTCGCCTCTGTCTTCAGCCCCACCCAGATCTCCAGTCACCCTATTGACCTTTATCCCCCAGCAATGCCAAACTGCTTGTCCTCTCTGCACACATTTTGCTTTGTCTCATCTTGGTATCTTCGTGTATGACCTCTTTGTTTCTCTGGTGTTtcaatcatcacttcctccaggaggccttccttgatcccaCTTTACACAGATTAATCACTTTTCTCTGGAACTTTTGCACAcaattggccctccatatccatgagttctacatctgtgaattcaaccaatttcagattgaacatatcccccaaaaaattatatctgtactgaacatggacagatttttctcttgtcattattccctgaatgatataacaactatttttatatcatttaccttgtattaagtattataagtaatctacagatgatttaaagtagaaggggggatgtatataggttatacgcaaatactatgccattttatatcagggattgtagtatatcagcactcgtggactttggtgtcccaggggttcctggaaccaatccaccacagacaccaagggatgaACGTATTCTGTTGTTATGTAGTTGCCCTCATCACAATATTCT-CTTATTTGTGTATAGTCCTAACTTTTTTTTCCCCCCCAGAGTGAAAAAGCTTATCAAAATAAAAGAACTTTGAATTGTGTTTAGAATTCAGAAAAACTCCTGGAATCACTTTTATTAAGTAGACTCTGCTGTATCAAAAAGAGAAAGGATGAAAATTTTCATATTGACCACCAGGAGTTACAATGAGCATTCTGTAGCTCTGAGAACAATAGCTCTAAAGAAAAGGAGCCAGGAAACTCCATGATGCTTTATCTCACTCAGCTATAACAATTTGTGAATCCTCATTAATTGTCTAACAATGTTTCGAGAATCTTGAAAGTAACCGAAATAAAAGAGTTCATTAGTGTGTGCTTCATAATGGGAGAAACTCAATTTTCAGAACACCAGAA-GGAACTATTCTTTTT-TTCTCTTTAGGTGTCAGGAGGTCTAGGGAACAGAAAGAACAGTCTGTAGCAAAATGCAGACGGATTTGGTACTTTTTTTTCTCAGTCTAAAAAATCTTGGTGGCAAGAAAATGGGGGTGGAGAGAGAACAATCTAAGCAAAACTGATTCATGTGGGAAAGCAGAAACTTGTGTGTCTACTCTCACGTTTTGTTCTCCATATGAGGGAACTTTCATGTTTTATTTTCACACAAGATTGTTGGGGTTTTGGGAACAGTACTGTGTTTAAtattcccaatgcctaaggcagaaacatagtaggtgctcaataaatgtAGATTTCAATTAAATCATTGTATGGTTGATGAAGGTTTTTGGGGAAAAATTGTGTAGCGTAATTGTATAGTTGATGACTGGTTTTGATGGG-AAGCAATCTAAAATCTAAGAGAGGTGACAGACATAATAGGAAAAAATACTTTGGTTATGTAAAACAACAGGTCTTAGGGTGTTGCTGAGTTTTACATTTTTGGGCATGCAGGACAAAGGCCCAGCAATGGGGAATATGAGTATATGTGCACATGTACAGCACCACGCAGATAAGTCATATATATCCCAAGCTTTGGCCTGGCAACTCCTAGACTCTATAGCTTAAGTGCTG-TTTTTCTCTGGTAGTCTCAGCACCCCCATTCTCTTTTGTTGCCTTTGCCAGCGACATGGAACTTTATTCCTGCATTTTATTTTCAACTTTTCTTTTCAAACAACCTCAGGGAGTCCAGGTATAAAAAAAAGAGGAGGGCCCTAAGAGCTGTTCTGGCCCACTGGGAGCAGGATTTTAACTGCCCTTCTTTCTGGCCCCAATTCATAACTTTTTATTTTTGTTCTTGGCGCCCCCTTCTTTATAAACCCATTCAGCaatttttttaaaaaaaattataCAAATTCAATGTGTGTGTGGATTTTGGGTGGGCTGTGGAAATTGATTTACGAGTCAACCACTTTTCTCTTTTCTTGCCATCTCCCGCTTGAGTGGTTTGTCGGCCCTGGGGCCTTTCTTTCACTCGAGGAGAATAAGGTTGTCTATGGAAGAGGTCAGCATTTCAAATTGGTGGAGTTCAACTGCACAAATGACATAGAACTGACAAGAAAAGACAGGGGGTTTGGAGGTCACAGACTGCATAGGTCTCGCTTAGGGTTTTTGCTTTGTGATGAACCCTGGCACCAAAATGAATTAAATAACAGGCTTAAGGACTATTGAGGGAGGACTGAATGCAAATCAAAGATAAGTAGAAGTTTTCTTTCCTAAAAGGGGAATGATTTTTTTCCTTCCCTCTCCCCTTCCATATCTGTGCCGGCAAGAGCTGCATGTTAAACATGATTTCGCTGGCATTATGCTGGGCGCTTTCACTCCAGGCCGCTGCAATGGCCTATCTTGGCCTATGATTAATGACCTGCTAGGCAATTTGGAAACCATAATAACTCCACGGTTCACACACAAACTATATAGTCGCATTCCTTTTGCAAATTTGCCAAGCTGTTACCAAGGGGCCCACAGAGGAGCCGGATTGCTGGAGAGATAGGGAGGCATTTCTGCAAATGCCATTCGGGCCTTATCTTGCTGAAAAGTGCAATGAGCGGCAGGCTCATTTACAAAATTCAAAGCCTAGATCTTGCGGCTTCTTTATTTAAGCCCAGATTAGGGAAAACAAAACAAAACAAACAAAAATGGCTCC-AAAAAAAATGGGCTGGTAAAAATCAATCTTTCGATATGGTCTCCAGACTCTGAGTGATTCCAGAGACAGCACAGTGATATTCCCAAATTTTGAATTGGATTCATCAAGGTCTAATGATAGTAACGCCTCTCAAAACAAAGAGTGGAGTTTTGAAAATCCTAGGCAGAGACAAAGGCTCCTCTTCAAGTTTTGCTC-TTGGAACTATTTGCGCACACGCTTCTAAACAGTAAACTTGTTTATTAgagtggaagggcattgcactgggagtcatagagtcggggtctagtgctgggtcagtcgctgctctgctctgtgaccccggatgcatttcttctcctctctgggctgcagttttcacaccagttcaatgagaatgttggatttagaaacaacctggcaagctttttctggctcagatttttatttatgttgcggatatttattgagcactcaccatatagttagcactcttctaggctcttgagatatttagagaagaaagcagacaaagatcgtcctgtgcccaaggagctcacattctagaggggtgagacaatcattgacaataacaataatttaataaggaaattatatatgttagaggataataagcactatggaaaagaaaatagtaggacagaataaggggaaataggaattgtattgggtagaggttggggacagagcacagtcagaaatatggtggtcagtgagatttggcagtgacctgaaggagatgagggagtcagccaagcatatatctgaaggcgaagcattcaggcaaggagaacatgtctagagccacggccctaaTGGTCTGTAAGACCACTGATGCTGTCGTTTTCTGTGACTAACTGTCTCTCAGTCACTTAGCTAGCTGATGGTGACTTTATCACCCAGCTCTgtggttttcaatcttggctgcatgttgaaagcacccagataattagaaaaataaaactcctgggttccacttccagagattctgattcaattggtgtgagatgtagtctgggcgtggagggctttcaaagctcccaggtgtttcttctatgcaatcaaggatgagaaacactCAACCTTGAGAGCAGTGGGTGAGCTTCACCATAACCTTTCCGGGAGCTGTTTGTCACTAAGAAGGCTGGCCTTACAATGCACACAGTCAAGCCAAGTAACTGTCATCAAGTTTCCAGGCGTCATCTCATGAAGAACCTTCTATGCACTAGGTTCTATGCACAGTACTCATCATGCAAGATAATCCATGCCAAAATATGGAGAAGATGGACATGGGAAAAACATTTTTCACAAAGAAAAATGTTTGGTACGGAGCACCAAAACTTGTAAGATACTAACAGCCAGTTTCTGTCACGCATAACTCATTGAAATGACACTTCCTTATGTTTGTCATATTCATGTAATA----------CTTTTTGTTTGGTTGCTTACTTTACTCTTGTCCTAGTCAATAGTACCTGTAAAATTACTTGTTTGATATGCTATATGTCACAAATTTGATATATACTTTATATAATATATGTCGTTGCATGTATATGTATATAATTGAAAAAATAACAATTGTTCATCCAAACACTATCTAAAATCATCTCCAGGATAACTACCAGAAGAAAGTGAGCTACATTTTTGGAAATAGAACTGAATGACATGAGGTGGTGACAACAAAGAGAGAAAGAGAACATTTGAGGCTGACGGACCCATGGCTTCCAT-TTTATTTACATACATAAACAGTCAATGCTGGACAAAGAGAGTCAAAGTCAGATAGTTGAAGTAGGCTTTGTGGTTA--TAACCCTTTGATCAGGTTTTTGCCATTTGGATGATTAGTGGATGAATTTTTCTTTGAAATTCCTAAACATCAAAAATCACTTGTTTTTCACCGTGTGGCCAGACTTCACTTTTCTCTCTTTGTGTCAAAGCATTGTGACTGGGAGTCAAGGTCATGCCACATGAACTCAGGGGAGTCCAAGGCATAA-----GCACTAGTATGTTTAGAAAAAACATTAAAATGGTAATTTTTGGTCTGATGATTGTATCATTCTGGAGAGCTTACCTTTGAGAGAAAAACATGTAAAAACATTTTTTAAAAAATTAGGCTTTGGCTACTGGATGAGGCAAATTTCCAAATTTCTATGTTTTTCAGGTTTATATTTGCTTTGAAAATTCTTTTTTCTTTCCCTACTTATTCTAATTAGAAGGCAGCAACATACTTTTGGAATCTGTACAATACTCAATAGACACATGGTACTAGTGTCCTCTTTTCtaaaaatatttttattttttaaCTTCCAAGTAATAAATAAATTAATTCCCACTGCAAAATATTTAGGCATTGTAGAGAATAGTTATAACTTCCTATCTTTATTCCAGAGGGAGTCATTGTCACCAGCTAGGATTGAACCTTGCTGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTAAGGTATTTACACACATGAAGCTTTGAAACTAATTTCTGTGTGTATCTGTTTCATAGAAGTATGTATGATGTTATACTTTACATGTCATTCTGCAACATTTTTTTCACTGAACAATATGTCTCATGCATGTATGTCTTGTACTAGGTCAGTACAAATGAGTCCACCTCATTAAAAAAATAGGTGCACGAAGTTTCAAAGTATGCATTTACATACTAGAGATAGTCACTGTGCTACAAAACCAATGTTGCCTGATGACTATCCATACAAATGCCTTCCTCTTTTATAAAACCTCGTCTTACACCTATGAGTCTGtctgtagggtaggtactgaaaattgaaattgatggattatagggcataagggttattaactttaatatattccaccaaaatgtcctccaaaatagcttaaccaactttcactATGTTGTAGGACCACGTGCCATTTCTTAGGTGTGTCTTTTATGTAATTCCACTGTTTGTAGGTGGTATGTTCACTAAAATCTTCTCATGTATGATGGTGGGAATATATATACCCAGATCTATCCATATTCTCATTTGCAGCCCAGAGTAGTAAGAGTTGGTTGAAAACAGTATGGAATTATCTGTCCCAGGCAGGGGTGATGGTCCTCATCTTAAACTGTGTTTTGATCAACTGAACTAAACAGTGGCCCAGAGTCTTCACAACACCTTGGCATATCTATGTTGCATTAATTACATGCAGGATATTAGGCTTTGGAacagacacacaaaataatagtggttaaaataagtttagaaaattaattgtctcacaaaactgttcaagtgtgataagctcaaggctggtactgaagatccacagtggtaggaatctaggtcccttt a score=16880 s hg17.chr12_random 407938 245 + 466818 TTCACTATACTATTCCTGT-GTACACCAGTGTGTTGGGTAAAATTTTTTGTTACTATAAATTTTTTGGCTGTCCATTAGAGAAAAAAATCATAGAAAGGCAAATTTTTTAAGGTATAAAAAATAATTTAGCCTGATCTTTGAGTATGTTTGTGCACATATAATGCTACTTTGACTGCTGTAGTAAAATAATCCAGATTTAGTCACCATAGCTAAGAATGAGAAAAAGCATTTGTGATAGTTTG--CTG s rheMac1.SCAFFOLD85601 31314 246 + 44828 TTCACAATACTACTCCTGTTGTACATGGGTGTGTTGGGTAAAATATTTTGTTACTATAAATTTTTTGGCTCTACATTAGAGAAAAAAA-CATAGAAAGGCAAATTTGTTAAGGTATAAAACGTA-TTTAGTGTGATCTTTGAGTATGTGTGTGCATATATAATGTTACTTTGACTGTTATAGTAAAATAATCCAGATTTAGTCACCATAGCTAAGAATGTGAAAAAGCATTTACAAGAATTTGGCTTG a score=208094 s hg17.chr12_random 408189 3006 + 466818 CCGTCATTTTTTGATAAAGTTTTAAGTACTGTTTTACTATTTGATGTTTTAAAGATTGTTAAAAACTAAGAAGTGTTGATTTCTGCTAATAAAAACAGCTTAAAATTTAAATCATGGAATAGAATGGTGGAGCTGTGGTGGAGATACTTTGTCTTATTAATTGAAATGACATTTTGAGATCCAGTGCTGCTCACTGAATTTCCCTGTGAGGAGAGTTTGTGGTGATGACCCCACAACAGACAAGCTACTATCCAAAAAAA--CTCCTCACATCAAATCAATTTCCAGTTTCTTCCAAGTTGCAGGAGGATGCCTAGACCTTGGTTTTATTCTCTTCTTTGACCAAAGTATTACAAAAGGAAGAAAATCATTACCATTTTCATGTCAGGAGGGTGGCATGGAGATGGACTTAGCCTATTTTCAGTGTTCCATCTCTTGCCCTTTATAAGGGTTAGTTGACTGTTTATGATGCATTCCGGTATTTCCCATTTTTGTTTTGGTTCATTTCTAAGTGTGCATTATAATTTTAATATTAAAGTTTTTGATTAGGAGAAATGTCTCATAGAAATTATTATTACTCATCTGATTATATACTGAAGGGAAAAATCAATTAGTTGTATATACATTCTTATACAACTCTAAGATAGTTGAAATAGGAACTTTCTTATTTAGTTGCATCATGAGGAAATTTGAGATGATGTTATCTGCCAAGCGCAGATCTCTCCAAAGGATTTCTTCTAGCCTTAATTATCCACCTCACAGGACAAACCTTTGCCATTCCCCATCTACTTTTTCTTTCGGCTCCTCAATTCCTGACACAACAAAGTTGTACATATTTCCCACACTCTTGGTTTAGCAGAGTTCTTTTATCAGTTATGTTTTTCTGCAAGAGAAGACCCTCTAAAA---CATTAGACATATATATCTCACATGTCTTTGGATTTCATTTGTGTGTGTGTGTGttttctgttttttgagatggagtctcactctgttgcccaggctggagtgcagtggcactatcttggctcactgcaacctccacctccagggttcaagcgattctcctgcctcacccttctgagtagatgggactacaggcacactccactgagcccacctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggatggtctcaatctcttgacctcgtgatctgccctcctcagcctccTCCACACCTGGCCTGGATTTCATTTTTCTAAGCTGGGTTTGATGGATGGCTCTGGTGATTTGAGATGGGCCAAATTCGGCATCTTGGAGATAGAGTTTGGCCAATTTAGTCTGGATCAGGTGGGGGCAATCTGACTTCATTACTTTCTCATTCTCCTTCTGGGAACAGTGTACTTGCGAGGCGATATTCTCATGGTAAATGGAAAGAGGAAGAATCCCCAGTATGGAAGCCATCTCAAATCTCTATGCAAAGTGTAGTAATTTTCTGTTTATCAAAGTAAGTTAAATGATTGAACTCCAAGTTCAGGGGAAAGGTAGTCAGTCTTCCTGTGATAGGAGGATACTGCAAGATGATATACCAAAGGGTCGGGTACTCAGGAATTCTTATAAAATGGCtaaatattttatataataataaatatttaaaCATTAGACTTGAGAGAAACTTTACCAAAGGCCTAAGAATTAGAGATATGTTTGATAAATAAATATTATTCTTGGGCTGAAAACTCTTGAGTGGGAAAATAGGGCTAATTTCATCTGGACAACTTCTTGGAAACTCATTTTTTATTTTGGAAATTTTGAGAAAATAATTTGTTCCATTCATAAGTGGTGTGCACATGCGTGTATTTGTGTTCATATTTATGAGCTTGTGAATAATGAAGTTATACAAAAGTATTAGCAGCAACCAAATCTTATGGAGTATTGGCCTGCCTGTGGTTCTCAAGAAAATCTTAGATGCTTTTGATAAAAGCAGTTTGGATTCTGTGTATACAAATCTGGCATTTTAAAAAGTCCATATTGGTAATGATCTTAGTTGTGACCAAGCTCCCTTTAAGACTTTAGACATTTGCTATATGATCTATGTATTGGGTTATAAAACTTCCCAAACAACTGAAGTTGCTAAACACAAATGATGGAGAGGTTACACAAAGAAAAATTGCAAACTCTGAAAGAGAGTACATTCTTATTTGTGTACTAGCAAATGAGGATTCAGGTTTCCAGTCAATTTCAGTATGAATAATTCCAGCCTGTAACAAGAACAAACAGTGAATGAATGAGTTAATTTGAGTTGTTTGAAAATAAGAATGTTTTCCATAAAGAGATCATTGAACTCATTAGTTAACACGCCATGGTGATTTCTGGCTTGACACTGGTCACAACATTTAAAAGTAAAAAGAATGACCCAGCAGATTTACAAATTAGGTGCATATAGAATTTAAGGTCAGGATATTCAAGCAATCACAACCAGTGATATTACATtgagaggtgaagccagctggacttcctgggtggagtggag-atttggagaactatTCTGAAGctagcaaggggattgtaaaatgcaccaatcagtgctctgtaaaaggcaccaatcagcactctttaggtagcatggggattataaaatgcaccaatcagcactctttaggtagcgtgggaattataaaatgcaccagtcaacactctgtaaaaatgcaccaatcagcactctagctagccagaggattgtaaaatgcaccaatcagctctctgtaaaaggcaccaatcagcgctccataaaacgcaccaatcatcaggatcctaaaagtagccaatcacagggaggattgaaaaaagggcactctgataggacaaaaatggaacatgggaggggacaaataagggaataaaagctggccattccagcccacggggcagcccacggggcaacccactcaggcccccttccaccctgtggaacctttgtccttttgctcttaacaataaaccttgctaccactcagtctttgggtcca s rheMac1.SCAFFOLD85456 31265 2896 + 81052 CCTTCAGTTTTTGATAAACTTGTAAGTACTGTTTTACTATTTGATCATTTAAAGTTTGTTATAAACTAAGAAGTCTTGATTTCTTCTAATAAAAACAG--TAAAATTTAAATCATGGAATAGAATGGTGGAGCTGTGGTTGAGATACTGTATTTTAATAATTTTA-TGACATTTTGAGATCCAGTACTGCTAATTGAATTTCCCTGTGAGGAGAGTTTGTGATGATGACCCAGAAACAGACATGCTACTATCCAAAAAAAAACTATTCACATCAAATCAATTTCCAGTTTCTTCCAAGTTGCAGGAGGATGCCTAGACCTTTCTTTTATTCTCTTCTTTGACAAAAGTATTACAAAAAGAAGAAAATCATTATCATTTTCATGTCAGGAAAGTAGCATGCAGATGGACCTAGACTGTTTTCCATGTTCCTTCTCTTGCCCTGCATCATGGTTACTTGAGTGTTTATGATATATTGTTGAATTTCCCATTTTTGTATTGGTTTATTTCTAAGTGTGACTTATAACTTTAATATACGAATTTATAATTAGGAGAAATGTCTCATAGAAATTACTATTACTTGTCTCATTGTATACTGAGGGTAAATATCAACTATTTGTATA--CATTCTTATACAACTCT----TAGTTGAAATAGGAACTTTCTTATTTAGTTGCAACATGAGGAAATTTGAGATGATGTTATCTTCCAAGACCAGATCTTTCCAAAGGATTTCTTCTAGCCTTAATTATCCACCTCACAGGAAAAACCTTTGCCATTCCCCATCTATTTTTTCTTTTGGCTCCTGAATTCCTGACACAACAAGGTTGTACATATTTCCCACACTCTTGGTTTAGCAGAGTTCTTTTATCAGTTATGTTTTTCTGCGGAAGAA-ACCCTCCAAAATTACATTAGACACATATGTCTCGCATGTCTTTGGATTTCAtttgtttgtttgt-------ttgttttttgagatggcgtctcattctgttatccaggctggagtgcagtggggtgatctcggctcactgcaacctctgccttccgggttcaagcgattctcctgcctcagcctccctagtagctggaactacaggtgcacagcaccacgctcggctaatttttgtatttttagtagagacagggcttcaccatgttggccaggttggtctcgatctcttgacttagtgatctaccctctttggccttccCTGCTGTCAGCACGGATTTCATTTTTCTAAGCTGGGTATGGTGGATGGCTCTGGAGATTTGAGATGGGCCAAATTCTGCATCTTGGAGATAGAGTTTTGCCAAATTAGTCTGAATCAGGTGATGGCAATCTGACTTCATTAGTTTCTCATTCTCTGTCTGGGAACGGTGTACTAACCAGGCGATATTCTCATGGTAAACGGAAAGAGGAAGAATCCCCAGCATGGAAGCCATCTCAAAGCTCTATGCAAAGTGTAGTAATTTTCTCTTTATCAAAGCAAGGTAAATGATCGA-TTCGAAGTTCAGGAGCAAGGTAGTCAGTCTTCCTGTGATAGGAGGATACTGCAAGATTATATATCAAAGCGTCTGGTACTCAGGAATTCTTAGAAAATTGATAAATATTTTATCTAATAATAAATGTTTAAACATTTGACTTGAGAGAAACTTTACCAAAGTCCTAAGAATTAGAGATATGTTTGATAA-TAAATATTATTCACGGGCTGAAAATTCT-GAGTGGGAAAATAGAACTAATTTCATCTGCACAACCTCTTGGAAACTAATTTTCTATTTTGGAAATTATGAGAAAATAATTTGTTCCATTCATAAGTGGTGTGCACGTGTGTGTATTTGTGTGCATATTTATGAGCTTGTGAATAATGAAATTATACAAAAGTATTAGCAGCAAGCAGATCTTATGGAGTATTGGCCTGACTGTGGTTCTCAAGAAAACCTTAGATGCTTTTGATAAAAGCAGTTTGGATTCTGTGTATTTAAATCTGGCATTTTAAAAAGTCCATACTGGTGATGATCTTAGTTATGACCAAGCTCCCTTTAAAGATTTAAACATTAACTATATGATCTCTGTATTGGGTTATAAAACTTCCCTAACAACTGAAGTCGCTAAAAACAAATGATGGAGAGGTTACAGGAAGAAAAATTGCAAACACTGAAAGTGAATTTGTTCTTATTCGTGTACTAGCAAACGAGGATTCAGGTTTCCCGTCAATTTCAGTATGAATAATTCCAGTCTATAACAAGAACAGACCATGAATGAAATAGTTAATTTGAGTTGTTTGAAAATAAGAATGTTTTCCATAAAGAGATGATTGAACTCATCAATTAACATACCATGGTGATTTATGGCTTGACACCGGTCACAACATTTAAAAGTAAAAAGAATGACCCAGCACATTCACAAATTAGGTTTGCACAGAATTTAAGGTCAGGACATTCAAGCAATCACAACCAGTGATATTACATtgagaggtgaagccagctggacttcttgggttgagtgggggaattggacaacttttctctagcttgcaagaggattgtgaaatgcaccaatcag------------------------cactattta-----------------aaaacccaccaatcagcactctgcagctagccagaggcttgtaa---------------------------tgcaacaatcagtgctct----------------gtaaaaagcactaaacattgctctgtaaaatgcaccaatcagtgctctgtaaaacacaccaatcagcaggatcctaaaagtagccaatcgcaggaaggattgtaaaaaggacactctgataggacaacaatggaacctgggaggggacaaataagggaataaac-ctagtcaccccagcccacagca-----------acaacctcctcaggtcccctcccatgttgtggaagctttgttctttggctcctcacgataaaccttcctactgctcgctctttgggtcca a score=3002 s hg17.chr12_random 411195 45 + 466818 caccgtctttaagagctgaaaccttgctactgctcagccctgggg s rheMac1.SCAFFOLD89827 12676 45 - 22897 tgctatctttaagagctgaaacctggctaccgctcagtctttggg a score=205433 s hg17.chr12_random 411243 2787 + 466818 tgccatctttaagagctgtaaca-tcactgcaaaggtccgtgcctccattcttgaagtcagcgagaccacgaacccacctgcaggaaccaactccggatacaacaccAGCATTTTAAAAATTTCTTTTTGTCTGTTCAGACATGATAACTTTTCTGCCCATCATATTTTCCATTCTAGTAGTGGTTACATTTGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCGTTGGTAAATTCCACCGAGTGGGTGAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTGTCACTGCTCTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTATTAAATTGGTATTCAACTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAATTAAGAACTACTGCTTATAATATCTGGGCAGTAACCGGCCATTTCAGCAACTGGCCTGCTACTAGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTATTTTTCTTCGCTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGGTGCTGTTGGGGCCTTTGCTATTTTTGGCTTGTCATCTTTTTGTGGTAAACATGAATCAGATTGTATGGACAAAAGAATATGAAGGAAACATGACTTGGAAGATCAAATTGAGGCGTGCAATGTACCTTTCAGATACGACTGTAACCATGCTAGCAAACTTAGTACCCTTTACTGTAACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAGTCTGTTCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCAAGATCCCAGTACCAAGGTCCACATAAAAGTTTTGCAAACTGTGATCTCCTTCTTCTTGTTATGTGCCATTTACTTTGTGTCTGTAATAATATCAGTTTGGAGTTTTAAGAATCTGGAAAACAAACCTGTCTTCATGTTCTGCCAAGCTATTGGATTCAGCTGTTCTTCAGCCCACCCGTTCATCCTGATTTGGGGAAACAAGAAGCTAAAGCAGACTTATCTTTCAGTTTTGTGGCAAATGAGGTACTGAGTGAAAGGAGAGAAGCCTTCATCTCCATAGATTCAGAAGAGGGGCATTGTGTGTCTTCTAGCAGAAAACAAACTGGTGGTGTATGAAACATTTTATATTTCTTACAGTGTTTTCTGTAATGTATGTGTATGAATAATTTCCAAACATATACCTAGATAAATCTTTAACCTAG------TCTAAAAA-----Atgtatgtatgtgtgtgtgtatgtgtgtg----------------------------------tgAAAAACTTAAGAACATTGACAATAACATACTCTTTTTTGTTTTTTTCATATGAACTGCCAGATTATACAAAATATGACAAAAATTCCTCAGAATTATGAAGCCATGTGTATTTCATTCATGTATTTTATCTTTCATTTGTAGAATTTACAATGTCTATTTATAATTATTAAGAACTAACAGCTTATCTCAGGAAAGATATTGCTGTTTTCTATTGTTATTTGAACCACACAAATATACCACAGTGTGCTTAGAAATCATTGTTTGAACCTCTATCTTATTGGATGGTAAGGTCATTCAATTCTAAACCAATAATGTGGATGTATCTTTGGGGTTTTATTCCATTATGAATTCCTATTTTATGGTTAGTAAAAAGCAAACAGAATTATT-GTAAACAATGCACACTATAGAATTCGAGTGACAAGTATAGGTAGAATAAATTTCATATATGTCTACCATAAACAGTACTGAAGAATACTAGATTTAAAGCAAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAATCTCTTTGATAATAAAGGGAGGAAA---TATGATCATGGTCTTGATTGCTATTATCGGTTTCCATACGCAGTTAGAAACGTCATTTCTTCCAGCTTTTGAATTAAAGAAAAGCTGTTTTTGAAGTTGAGATCTGATGTAAATTATTTTAGTATTTTTTTCTAAGACACTTCTAAGCCCCTGAATTGCTAATTATATCCTCATCTTCCATTTACAAAATTCCTTCTAAACTTCAGATAAGAGAACTCAAATCTTCTC-TTTTCTA--AAAAAAAAAACTATCAATGTAAAAATAGTATAGAAATTATGGAAAATAATTCAGTGAAACTTTTTGTAAATGTTAAAATAGTATCTATGAAATCTATGTATTAATTATGGGATGTGCCTTACCATTGTAATTTTGTTGTCAGTGATGAAAGTGTTTTGACATATTCATTAACAGGAAGTTCTATTATAAGAAAGAAATGTACAGTCTTGTTCACAGCTAAATTCTATATGACTACATTAATTCTTGGTGTTATGAAGTTTTAACAATGTTATTTAATGTTATTTAAACCTTAAGATAAATCATCCCCACACCTGatttatgtaattttttaatcatatatcttcctcagtacaatgtaagaactgtaaagaaagagatcatgtctgtcttgctttctgttgattcccaggacctagaacccagcaccaagaatagatggccaaaaatgatactttaatgaacaaataaatGGGTGGCTAAAATGGATAAGTTGATGTGGTAAATCAATGAAAAGGAAACTCATCACAAAATCTGCAGTTGCATGAATTCCCCTGTTCTGGTCTCAGGTTGAGGTTTCAGGCTTATCCAAGCAGAATCCTTCCTCAGAGGAAAAGTTTGGCTATTCCACAATTTTAGGGGAAATATCACACTAGTGATatatatagtgatatatagtcacactatatatatatatagtgatatatagtCTTGATGCAGCTGTGTCAGGTGTCTGAATTGGAGACAAGGTAAAACATCAAAATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 34161 2776 + 81052 tgccatcttgaagggctgtaacactcactgcgaagctccgaggctccattcttgaagtcagccggaccatgaacccacatacaggaaccaactccggacacaataccAGCATTTAAAAAATTTCTTTTTGTCTGTTCAGACATGATAACTTTTCTACCCATCATTTTTTTCATTCTAGTAGTGGTTACATTTGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCGTTGGTAAATTCCACTGAGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTCTCACTGCTCTGGTGGTCTCCAGAATTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTATTACATTGGTATTCAGTTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAGGTAAGAACTACCACTTACAATGTCTGGGCAGTAACCAGCCATTTCAGCAACTGGTTTGCTACTTGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTATGTTTCTTCACTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGATGCTGTTGGGGTCTTTGCTATTTTTGGTTTGTCATCTTTTTGTGATAAATATGAATGAGATTGTACAGACAAAAGAATATGAAGGAAACATGACTGGGAAGATCAAATTGAGGAGTGCAATGTACCTTTCAGATGCGACTGTAACCACGCTAGTAAACTTAGTACCCTTCACTCTGACCCTAATATCTTTTCTGCTGTTAGTCTGTTCTCTGTTTAAACATCTGAAGAAGATGCAGCTTCATGGCAAAGGATCTCAGGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATCTCTTTCCTCTTGCTATGTGCCATTTACTTTGTGTTCCTAATCATATCAGCTTTGAGTTTTGAGAGTCGGGATAACAAACCTGTCTTCATGATCTGTGAAGCTGTTACATTCAGCTATCCTTCAACCCACCCATTCATACTGATTTGGGGAAACAAGAAGCTAAAGCGGACTTTTCTTTCAGTTTTGCGGCAAGTGAGGTACTGGGTGAAAGGACAGAAGCCTTCATCTCCGTAGATTCACAAGAGGGGCCTTGTGTGTCTTCTAGCAGAAAACAAACTGGTGGTGTATGAAACATTTTCTATTTCTTACTGTGTTTTCTGTAGTGTATGTGTATGAGTAATTTCCAGACATATACCTAGAAAAGTGTTTTACCTAAAGTTATTCTAAAAAtgtgtgtgtatgtatatatgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatatgtgtgtgtgtgtttatgtgGATATGAAAACCTTAAGAACATTGACAATAACATACTCTTTTTTG-TTTTTTCACACAAACTGCCAAATTATATAAAATATGACAAAAATTTCTCAGAATTAGGAAG--AGATTTATTTCATACATGTATTTTATGCTTCACTTTTAGAATTAATGATGGCTGCTTATAATTATTAAGAGCTAACAGCTTATCTCAGGAAAAATACTGCTGTTTTCTATTGTCATTTGAACCACACAAATACACCACAGAGCGCTTAGAATTCATTGTTTGAACCTCTAACTTTTTGGATGGTAAAGTCATTCAATTCTAAATCAATAATGAAGATCTATCAGCGGGGTTTTATTTCATTATGAATTCCTATTTTATGTTTAGTAAAAAGCAAACAGAATTGTTAGAAAACAATGCACACAATAAAATTTAAGTTACAAGCATATGCAGAGTAAATTTCTTCCATATCTACCATAAACTGTACTGAAGAATATTAGATTTCATACAAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAATATATTCTATA--AGAGGGATGAAAACTCATGATCATGATCTTGATTGCTATTATCAGCTTACATGTGCTATTACAAAAGTCATTTCTTCCAGGGTTTGAATTAAAGAATATCTTGTTTTGAAATTGAGCTCTGATGTAAATTATTTTTCGTATTTTTTCTAAAGCACTTTTAAGCCCCTGAATTGCTAATTATATCCTTACCTTCTATTTATAAAATTCCTTCTAAACTTTAGAGAAGAGAACTCAAATCTTCTCTTTTTCTAATAAAAAAAAAACTATCAATGTAAAAATACTATAGAAATTATGGAAAATAATTCAGTGAAAGTTTTTGTAAATGTTAAAATAGTATCTATAAAATCTATGTATTAATTATGGGATGTGCCTTAACATTGTAATTTTGTTGTCAGTGATGAAAGTGTGTTGACATATTCATTACTAGGAAGTTCTATTATAAGAAAGAAATGTACAATCTTGGTCACAGCTAAATTCTATATGACTGTATTAATTCTTGGTGTTATAAAAGTTTAAC----------GATCTTATTTAAACCTTAAGATAAATCATCCCCACACCTGATTTATGT-ATTTTTTAATCATGTATCTCCCTCAGTACAATGTCAGAACCGTAAAAAATGAGATCATATCTCTCTTGCTTTCTGTTGACTCCCATGAACTAGAACCCAGCAACAAGAATAGATGGTCAAAAATGATATTTTAATGAACAAATAAATGAGTGGATAAAATGGATAAGATGATGTGGTAAACCAATGAATAGGAAACTCATCACAAAATCTGCAGTTGCATGAATTCCCCTGTTCTGGTCTCAGTTTAAGTTTACCGGCTTATCTAAGAAGAATCCTTCCTCAGAGGAAAAGTTTGGCTACTCCACAATTTTAGGGGAAATATCACAATA------------------------------------------------ATATAGTCTTGATGCAGCTGTATCAGGTGTCTGAATTGGAGACAAGGTAGAACATCAAAATT a score=9310 s hg17.chr12_random 414039 258 + 466818 cttggaaggctgaggcgggcggat--cacgaggtcaggatatcgagaccatcccggctactatggtgaaaccccgtctccactaaaaatacaaaaaaattagctgggagtggtggtgggcac-------ctgtattcccagctactcggaaggctgtggccggagaatggcgtgaacgtgggtggcagagcttgcagtgagccgagaccgcgccactgcattccagcctgggcgacaga-----------------------caaaaaaaaaaaaagaaaagaaaaaaTT s rheMac1.SCAFFOLD85456 50918 287 + 81052 cttgggaagctgaggcaggaggattgctcgagcccaggagttcaagaccagcctgggagacatggccaaactctgtttctaccaaaaatacaagaa--ttagtcaggtgtggtggtgtgtgcttgtagcctgtagtcccagttactcaggaggctaaaggcaagagattccttgagcttgga-gttggaggctgcagtgagccaagtgtgtactactccaccccagcctgggccacagagtgagactgtgtctcaacaaaaacaaaaacaaacaaacaaacaaaAACACT a score=9024 s hg17.chr12_random 414297 124 + 466818 AGGTGGCACCTATGACAATAC-TTTAAAAAGCATATAAAAGACTTTGGTCTATTTGCATAAGTATTTTTT-TATTGTGAATTATATATTTGTGTTATGATATTTTCTAGTTGATTATTAGGTAAAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 36937 126 + 81052 AGGTGGCACCTATTACAATACTTTTAAAAAGCATATAGAAGACTTTGGTGTATTTGCATATGTATTTTTTCTATTGTGAATTATATATTTGTAATATGATATATTCTAGTTGATTATTATATAAAC a score=11333 s hg17.chr12_random 414421 168 + 466818 AAAATGGCATTTCATTTCAAAAAATTGAGTTAGTAACCAGCTACTTGACCAAAATGTTTTTAAT-TAATACCTGTTAATGAAAGTGATGACATTTATTTAGAAGTAAAGTTCAAGAC-AAAAATGGCAGGGACATGTGGAAATTGAGACAGGAAGAAATGTGAAACAATG s rheMac1.SCAFFOLD85456 48499 168 + 81052 AAAATGGCATTTCATTTCAAAAAATTGAGTTAGTAA-CAGCTACTTTACCAAATTTTTTTAAATGTAGCACCTGTTattg-aagtgatgacatttatttagaagtcaagttcaagacaaaaaatggcaaggacatgtagaaactgagacaggaacaaacatgaaacagtg a score=117365 s hg17.chr12_random 414590 1622 + 466818 TCTAGTCGCTTTGAATtctgctggatcatctggcacagtggccatagcagcttggaccagagcctgtatctgctgtagagccctcttttgttctgggttccacttgagaccagtagcctttggaaactttattaatgagtcagagcaatattttcaaacgtggaatatgttggctccaaaatctcaataggtccccaaaacattgtatctcttttgtagtgataggaagtacatagagagagcaacatgccatttactttaaaaaa-gattgttttgacatgtgccctagggacactgcacaccttaaaacatcacctatgctgtaggtccctgaatcttctcaggtttatttcttttcttctggtattttacttccatccaacattagggtattttactatatttaataaacttgcaacttcctgattattgtaccaactaatactttattattattgttattattttga-acagggtctcattctatccctgaggctggagttcagtggcaggatcacacctcattacagcctcaaccttctgggctcaagtgattctcccacttccgcatttctagcagctgggactgcaggggtacaacaccttgcctggctaattttggtatttcctgtagggctaggatttcaccatgttacccaggctggtctcaaactcctgggctgaagtgatctgtctgtgtcggcctccaaaagtgctgggattacagtcatgtgccacagggcccggtttgtaatattactaatatattaaattagcacgatgtttt--aaaaaatgtaaattaaactgagaacagaagtgacatagccctgacat-aaaacagtgaagcagtgctattattcttacaatacaagccaaattgttttgattttcctgcataatgggtgtagattaacaaacattcaccaaatcatgagccccgtaaaaagtatcaaaagctctgctctgctcagtgaagatagcacatcctggaaagcatttgtgagtgttgattgaagtttatggtagtctgcattca--ctataacctgtctgtctttggtagaggccagataggttaagtgaatcgggttatagaaaggactaccatcccctgtaactttcaagtgttttgtcatgacagtgaccagttccattccttggggaatgcagttattatattttatacattgtgttgccaatggaggagaatttcagaggcttccccttggtcctgctataataatgttccttactctacagttcaggaagaatgtgatagttctgccagctgccatacgtatccatttcaattacacattcaggaagaggtaataactacaaactggttagatccaccttgggATAGACATGAGCCGAAGCTCTGGGCAGCATCTGACCTTCAAGAACTCCCACTGCAggctggatgtgatggcgcatgcctgtagtcctagtactttgggaggccaaggtgggaggatcttttgagagcaggagttcccttcgcaacatatggaaactctgtctctacaaaaaatttaaaaaattagctggcggggtggtgcatgcctatagttccaaatacttgggaagctgaggcaggaggattgcttgagcccaggagttcc s rheMac1.SCAFFOLD85456 49379 1583 + 81052 tctagtgtctttgaatcctgctggatcatctggcacagtggccagagcagcttggaccagagcctatatctgctgtagagtccttttttgctctgggttccacttgagaccagtagcctttggaaacttctgtaatgagtcagagcaatattctcaaatgtagaatacgttgtctccaacatcctaatggccccctgaaacattgtgtctcttttgtagtaatgggaaatatatacgtagagcaacatgtcaattactttaaaaaaagattgtttcaacatgtggtctagggacaatgaacactttaaaacatcacctatgttgtaggtccctgaatctcctcaggtttatttcttttcttttggtgttttacttccattca----------------ctatatttaagaaacttgccacttcctgactattgtaccaactcatatattattattattgctattattttgagacagggtctcattctgtccctgaggctggagtgcagtggcaggatcagagctcactatggcctcaaccttccgggctcaagtgattctcccacctctgcattgctagcagctgggactgcaggggaacaccaccacacctggttaatgtttgtattttctggagggttaggatttcaccatgttactcaggctggtctcaaactcctgggctgaagtgatcttcctgtgtcgacctcctaaattgaagggattactgtcatgtgccacagggcccgggctgtaatattattaatatattaaataagcgcgatgttttttacaaaatgtaaa-----cagagaacagaagtgacatagccatgatattaaaacagtgaaacagtgctattattcttacaatacaaggcaaattgttt-gatttttcctcataatgggtgtagattaagaaccattcaccaaatcacgagccctgtaaaaagtgccagaagctctgctctgctccgtgaagatagcacatcctggaaagcatttgtgagtgttgatttaagtttagagtaatctgcattcattctataacccgtctggttttggtag-----------gttaactgaatcggattatagaaaggactaccatcccttgcaacttgcaagtgttttgtcatggcagtgaccaattccattccttaaggaatgcggttat---attttatacattgtgttgccagtagaggagaattgcagaggcttcccttgggtcctgctataataatgtcccttactctacagttgaggaagaatgtgagagtcctgccagctgccatagatatccatttcaattacacattcagggagaggtaataactacaAACTGATTACATCTACCTTAGGATGGACATGAGCCGAAGCTCTAGGTAGCATCTGACTTTCAAGCATTCCCACTGCAggctggatgtgatggctcctgcctgtagtcctagtactttgggaggccaaggtgggaggatcccttgagagccagagttccattcgca--------aaacttcatctctacaaaaaatt--aaaatttagcTggcgtggtggtgcatgtctatagttccaaatacttgggaagctgaggcaggaggattgctcgagcccaggagttca a score=2316 s hg17.chr12_random 416212 113 + 466818 aggctgcagtgggctatgatcctgccactgtactccagcttgggtaacaaacggagactgtctcggaggaagaaaaaaaaaaga-----------------------------aGTGCA--------AGTTCTCAC-------TGGTATCTTAAATA s rheMac1.SCAFFOLD85456 51103 157 + 81052 aggctgcagtgagccaagtgtgtactactccaccccagcctgggccacagagtgagactgtgtctcaacaaaaacaaaaacaaacaaacaaacaaaAACACTACAAAATCTAGGGTGCACCCATAACATTTATTACTTGCATTTGGTACATTTAATA a score=-182 s hg17.chr12_random 416341 91 + 466818 CAAATCAATAATTAACAA------------TCTTTGGTTCCTGCCTATAGCAAACAGG---TAAAAT---------GGAAAGTAGTTATACAAAGGGTATATTA-----------------TATTAACCCCT s rheMac1.SCAFFOLD85456 51299 132 + 81052 taactctatgattaaatatgagtttttttttttttggtttggtatgatatgaaacaggatataaattcattttttatgtatgtgattattcaactttctcattatcaattgttgaaaaaattattaattcct a score=13044 s hg17.chr12_random 416432 335 + 466818 AACA----------------------------------------AAATTAAA-------------CAAAGCCAGTTTTTTTTCATCTCCTTTCAt--------------tttttttttttttgaaacagggtgttgctctgtctccccg-ttggagtgcagtggtgtgatctcgaccaattacaacctccgtctcctgggttcaaatgattctcctgccgcaggcaaccaagtacctaggatcataggcatgcacaaccacaactggc-aaatttttgtatttttagtggagacagggtttcaccatgttggccatgctgttttctaactcctgacctcaggtgatccacctgcctcggcctcccaaagtgctggaattacaggcctgagccaccgtgcccagc s rheMac1.SCAFFOLD85456 51536 401 + 81052 aacaccacaccatcctgataattgcagctttgtaataagctttgaaatcagaaattgtaattctgcaactttatttttattttattttattttattttattttattttattttattttatttgagacagagtctcactctgtcacccagactggagtgcagtggcgggatct-ggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacatcattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcgcccgccaccacatccagctaattttttgtatttttaatagagacggggtttcaccgtgttagccaggatggtctccatctcctgacctt--gtgatccacccaccttggcctcccagggtgccgagattacagctgtgagccacccggccaact a score=90327 s hg17.chr12_random 416767 1658 + 466818 ctattatctgctttttataggtaattatactgaggcaggcagtagttgtaaaatggagtctca----catatctgtatgaaacagggaatctggtttcctgtctttgtagtctgactcgaagatcccctcttagaaaccattatagtgtaAAAACTGAAAA-GATATAAAATCCAAGATTGGAGACTGATTTTAATATCTATTCATCTTAAACCATTTAGTAATCAAAAA----TAAATAGGGAAAAATAAAGCTGGATATTCATACATAGAGAAGTGTAGATTCTTCAATGGAAAACA--------TGTTTTTTAAGTGTCCAAGGAATAGTTATAAAATTTCTGAGTATTTTAATTAAATAACTAAGATTTAAGTGTTA---GACTCATGAGAATAACTTAGTCAAAGGCCTAAGCAT----------------GAGAGATTAAGTTTGATAAACATTGAA--AATGGGCTGAAAAGCCTGAGTAAGAAAATT------------------------------AATTACTTTTTCATTTTAGAAATTATAGGACAACAATTTTTCCCAACCGTCAGGGGTGTATATATGTGCATGTGAAAGTGCTTATGTTAATGAGCTTGTTAATAATAAG-TTATACAAAATTATTAGTTGGCAGCAACCAGATTTTAAGGAATATTGGCCTTCTTGGGCTTCCGAAGAAAACCTTGGACGCTTTTGGTAGGAAAAGTTGGGATTCACTCTCCATAAATCCGGCGTTGAAAAAATGAATCAACAGTGGTCATGATTCTAGTTTTGACCAAGCTACATATAACAGTGTAGGCATCTGATGTATGATCTATGTATTAGGTTGGAAAATTTCCCTTACAACTGACATTGCTGAATACAAATTATATAGAGGTTAAACAAGGAAAAAAATTACAAAATGATGAATAAGAATATGACTTGATTTGCATGCTAGCAAATGAGAATTCAGCTTTCACATCAACATCAGTATGAAAATTTTTATCTTATAACAAGGACATAGTATTTGAATAGGAGTTAATTTGAGCTGTTTTGGAAATTATCATGTTTTCCATTAAGATAGCCTTGAACTCATTCAATAGCATGCTCCGGTGGTTTCCTGCTTGGCATTAGTCAGAGAACTTAAAAGGAACAGGAACATTACTGCACAACCAGAAATCAGGTGCACATAGAAATTAAGGTCAGGACCTTAAAGGGAATCTTGCCCATTGATATTAGTCCTGCCCTAAAAA-AAGTCGGACATGGTATGTTTACTACTAATCATTTTTTTTCCATAACGTTAATGGTATTTTGTATTTTCCCATGGGCACCTAC-ATTACACTTATAGACTATTTTGATATTTCAACCTATTATTTTCTTTGAATCCTTTTAAGGAGTTGTTAAACAATGCTGAAATTTGCCTTACAGTATGCTGTTAACTAATCATA-TTTCTCAAAGTCATTTGACATAATGTTTGGTTAAAGGAAATATGTCTAGCATAGTTATACCCGTTCATAACAAAAGAGTATTTAAATCTTTAAGAAAAAATATTAGAAAAGCtaat-----aatatgaataaataaatatatgaagtatataattcattattaatatatGTGCATGAAATCATGGTCATAGAATTTAAA-AGTA--ATAATTTTTGAATTAAGGATACATTCTGAACTATAATAGAAAAAGGCTTCAAAAATGTTAGGTTT-ATAATGTTTCAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 52734 1713 + 81052 ttatcatctgcgtttttt-ggtgatcatactgatgcagagagtagttgtaaaatggaatctcagaatcatcactatatgaagcagaaaaactggtttcctctcttggcagtctgactccgagatc---tcttggaaacaattatactataAAACCTGAAAAAGAAATAAAATACAAGATTGGAGACCAATACTAACATCTATTCTTCTTAA----TAGAGTAATCAAAAGAAATTAAACAGAGAAAAATAAAAGTGAATATTCATACCGAGGGAAGTCTAGAGTCTTCAATGGAAAATACATGTTTTTTTTTTTTTAGGGCCCAAGGAGTATTTTAAAAATTGCTGaatattttaattaaacaattcatatttaaatattaCTAGACTCGAGAGAATAACTTattcaaaagcttaagcattcaaaagcttaagcatGAGAGAATAACTTATTCAAAAGTTTAAGCAATTGACTGAAAAGGGTGAATGGGAAAATAGGGCTATTTCAACCTGGATGACTTGCCTGAAATTGATTTTCCATTTTGGAAATTACAGGACAATAATTCCTCCCATCCATGAGGGGCATGTAT----GCATGTGT--GTGTTTGTGTTAATGAGCTTGTTAACAATAAACTTATACAAACATATTAG----CAGCAAGCAGATTTTAAAGGGTATTGGTCTTTTTGCACTTCCCAAGAAAACCTTGGATTCTTTTGACAAGAAAACTTTGGATTCTGTTTACATAAATCTGACATTTAAAAAATAAATCCACAGTGGTCATGATTCCAGTTACAACAAAACTCTTTTTAACAGTTTAGATATCCAATGTAGGATCTATGTGTTGGTTTTCAAAATTTCCCTAACAACTGACATTGCCGAACACAAATTATGGAGAAGTTAAAAAAGGAAAAATACTGCAAAACTATGAAACAGAATATGTGTTTATTTGCATGCTAGTAAGTGATGACTCATTTTTCACTTCAACATCAGTATGAAAAATTTGATCTTATAGCCTGGACATAGTGTTTGAGTAGAAGTTAATTTGAGCTGTTTTAGAAATTATCAAGTTTTCCACAAAGATAGCATTGAATTCATTCATTAGCATGCCCTGGTGCTTTTCTGTTTGACATTGGTCAGAGAATTTAAAAAGAACAAGAGTGTTACTGCACATTCAGAAATCAGGTGCACATAGAGTTTAAGGTAAGAACCTTAAAGGGAATCTTGTCCAGTGAAATTAGGCCTACCTTAAAAAGAATTCAGACATGGTATGTTTACTACCAATCA--TGTTTTCCATACTGGTAATGG-AATTTGTGTTTTACCATGGACTGCTATAATTAAACTTACAGACTGTTTTTGTATTTTAA--TATT-TTTTCTTTGTTTCCTTTT-AGGAGTTGTTAAACAATCCTGAAATTTCTACTACAATATGCCATTAACTAATCATATTTTCTCAAAGTCATTTGACATAAAGATTGATTAAAGGAAATATCTCCAGTGTAATTACACTTGCTCATAACAAAAAAGAATTTGAAACTTCAAGAAAAAA-ATTATAAAAACCAATAATGGAATATGAACAAATAAATATATGAAATATATAATCAATCCCTAATAAATGTGCATGAAATTATAGTCATAGAATTAAAAGAGTAATATAATTTTTCAACTAAAGATACATTCTGAATTATAATAGAAAAAGGTTTATAAAATGTTAAGTTTAATAATATTTGAt a score=54368 s hg17.chr12_random 418425 747 + 466818 ATAGATACGAAAGTgtaaaaattagtctgatgttacttattttggaaagcatatgaagcaatgggaattttcatacattgctcctagaattgtaaatcagagcaattactttgtctgactatggcattatctgattaagttgatggatcacatttgaacacccagtatttgcactgttatcagaatatatgtgcacacacatgcatatcactgagttttaatagctaaagttgagaagtctctcaaatatccatcagtgataaaatggataagtaaattatggcatacttgtacaatagaatactatacagcaatcaaaatgaaCtgttggagacatgtgctcggagtagccaaaagaaatccccacttggac----aatttctcagcaaggcacctttacgtcagcagaagggtgctgcttgcacctgttacaatcccaagagaagagcatacctaacaaaggagggaaggagtttttaatcctaacacagttcctgtttctgtgtccttcccttattggctggggttggattgcacaatctaagctgatcctgaatggcttagacttaaacttttccaaatagggtaaacgcacattttgcaaaaagaaagaggggtgggaggTAGGATTCATTTACAACATTTACAACTTATGGCTGGGAAGTTGAGTCTTTAAAGAGGAATTTAGTTGTCCTAACGGAACCAGCTAGAGTGACATGTTTACAAAGAATATAAATAAAAAGAAAAATG s rheMac1.SCAFFOLD31009 15790 733 + 42162 ATAAATATAAAACTGTAAAAATTAGCCTGTTGTTACTTATTttggaaagcgtatgaactaatgggaattttcatacactgctcctagaatggtaaatcacagcaattactttgtatgagtatggctttatctggttaagatgatggatcacatccgaagacccagtatttgcactcttatcagagtacatatacatacacatgcatatcactgtgttttaatagctaaagttgagaagtctattgaatgtccatcagtgataaaatg----aataaaatatggcatacttttgcaatataatactatacaacaatcaaaatgaaCtgtcggaaacatgtgcttggagtagccaaaagaaatcagcacttggacagaaaatttctcagcaaggcacctttacattggcggaggggtgctgcttgcacctgttacaatccc-----aagagcacacctaacaaaggagggaaggagtttttaatcctaacacagttcctgtttctgtgtcctttgtctattggttggagttggactgcacaatctaagctgatcctgaatgg------cttaaacttttccaaatagggtaaatgcaTGATTTTCAAAAAGAAGGAGGGGTGACAAGTAGGATTCATTT---ACATTTATAACTTATGGCTGGAAAGCTGAGTCTTTGAAGAGGAACTTAGTTGTCCCAATAGAACTAACTAGAGTGACATATTTACAAAGAATATAAATAAAAACAAAAATG a score=57767 s hg17.chr12_random 419172 1300 + 466818 AAGAAATTTGAACTACATAGA------TATGAGAGGAATTAAGTTTGaaaaaatgattcagtataattccattta------tataaagtttacaa----aaatgtatttttaataaattgaaatttattacactggtggtgaaattctaaggtgagacatatgagtgattatcctaacaattgggatggtagggatggaggaaacaaaagggaaatgttatcagtaagatggcatatatggagagtgtctggattgctggtgaaatctactttatgaccatgatgtggaatcatgactcttaatgctataatttttttct---ttactgtacatt-agacctcattactttatatactttatatatatatgttatgtttcacaatattaaaTATTTCACAATAATGAAAATATTTAAAAAGTAGAAACATACACTAAATGAATGAATATAAAAT-AGGCTGAA-CAAACATATTCTTATAGACATCATTGTAATTAGAGTTTTTGCTGAATAAAGAA---TAGAGCATTATGATAGTAATAAATCCAAGataaaattttaaacttttttttaaattaattaGAAAAAGGAAGAGATAAGCAGGAAGACTACCTCCACATTCCTAATGTTATTCTTACTTTGAAACATCAGATTTTGAGCACTTATATTTTACTGGACACATTTTTTTCTTATTTCCAATTTAATTATTTATGATA-ACATTTCAAAGTGGCAGAAATTAGTGAATTTCCAATAAATTA----------------TAGTAGTATAGATATTAAATGTATAGGACAATTTTT-CTAAATTTATCTTTAAATGAAATAATTATACACATATTTTTACCATTCAAAGATTATAATACCATGCATGTGTA---CACATGTGTAAGGAAAAATATTTTGATACTGCAAATTTTTTTA----ATATTAGAGAAAAATTAGTAGAAAGATAATTTTATTAAGGCATAAAACATATTTAGTGTA-----------------------------GTTACTTTGACTGCTATAATAAAAACACCCAGATTTTGTGACAGTAGCTGAGAATGTAAATAAGCAGTCAAGAGAATTTAACTTGGTAATGATGCTATTAAAAGATGAAATGAAGCTTATTCAGTCTATAATTGCACAGAGTATTTGTGTAAGTTCATATGAAACTGGACCAA-AACTAAACAGCCAAAAAAAGAGTATTATTTGCTTTAGGTCACTTTTGCCATAATTTTTAGAATGTGGTGAAAGAAAAAAAATAGCAAGTAAATCATTGGAAATGTGTTGGCTTTGCGTTATTCCTGATGAAATACTATATGAGGGTATTTGTCTAGGCCTGATTCTGAGAATAATATAAGAA s rheMac1.SCAFFOLD85456 56825 1327 + 81052 AAGAAATTTTAGATTCTTataactctttataaaagaaataactttttataaaacaa---attataaattattttaagttcttataattcttataatttgaaataaattcttatta--------tttattacattggtggcaaaa--ctaaagtaaaagatataagtgattatcgtaac---tgggatacttgggagggaggaaacaacaaggaaattatatcaacaagaaagcatatatggggaatgtc-agattgctgacaaattctattttttgacgaaggtgtggaat-atgagtgttaatgttacattcttttttcctcttactgtacatttagattttattgctttccctac---------atatgttaggttccagaata-----------------atgaaaaTATTTTAAACTCAGAAATATTAAATAAATTAATGAATGTAAAATTAGGCTAAAACTAATATATTCCTGCATGTACCATTGTAATTAGAATTTT-GCTGAATAAAGAAGAATACAGCTTTATAGTAGTAAGAAATATG-GCtaaaattttatactttttaa-aaattaatttcaaaaagaaaaatataaGCAGTAAGTGTACATCCACATTCTTAATGCTAATCTTAATTTGAAACATCAGATTTTAAACAACTGTATTGCAATAGAC----TTTTTTCTTGTTTCCAATTTAATTTTTCATGATACACATTTCAGATTGGCAACAATTAGGGAATTTTTCATAAAGTACAAATATTAAAGTATGTAGCACTATAGATATTAAGTATATAGGACAATTTTTGCTACATTTATCCCTAAATGAAATAATTATACTCATATTGTTACCATTCAAAGATCACAATACTATGCATGTGCATGGCATATGTGTTGGGGAAAATATTTTGTTCCTATAAATTGTTTGACTCTGTATTAGAGAAGAAAACCTAGAAAGATAATT--GTTAAGCTATAAAACATATCTAGTGTAATCTTTGAATGTGCTTGTGTATCTGTAGTGTTCCTTCGACTGCTATAATCAAATAACCCAGATTTAGTGACAGTAGCTGAGATTGTAAATAAGCAGTTGAGAGAATTTTGCCTACTAATGATACTATTAAAAGATAAAATACAGTTTATATGCTCTATAGTTGTATAGACGATTTGTGTAAGTTCATGTGAAAGTGCAGTGATAATTAAACAGCCCAAAGGAGAAGAATCTTTGTTGTAGGGCAGTTTTGTCATGATTTTCAGTATGTGGTAAATGAAAAGAAACAGCCAGTATATCAGTGGAAACTCATTTTTTTTAACTTATTCGTAATGAAATACTGTCTGAGGATGTTTGTCTGTGCCTCATGCTGAGAATAATGTAAGAA a score=21546 s hg17.chr12_random 420472 301 + 466818 TGGTgccaagcacagtggctcatgcctgtaatcccagcactctaggaggccaaggcagtggattccctgaggtcaggagttccagaccagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattgac-gggtggggtggtgggcacctgtaatcataggtacttgggaggctgaggcaggagaattgattgaatcagggaggcagaggtttctgcaagccgagattgtgccattgcactccagcctgggtgacaagggagaaacttcatctgagaaaaaaaaaaaaa-----TT s rheMac1.SCAFFOLD31009 17801 307 + 42162 TGATgccaagcacagtggctcatgcataaaatcacagcaatctaggaggccaaggcagtggatcacctgaggtcaagagttccagattagcctggccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaacacaaaaattaactgggtgaggtggtgggcacctgtaatcccagctacctgggaagttgaggcaggataattgattgaaccagggaggcagaggttgcagtgagccgagactgcacccttgcattacagcctgggtaacaagagagaaattccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCTC a score=20267 s hg17.chr12_random 420773 448 + 466818 GTAAATCCATGAGGAAGAATAAGAGTGTTCTCCCATCACCCTTAACTCCAGTACTTTGAAAAGAAGACCCAAATCACAGTTATTTGGTAACATTCTCCCTTTTAGTTGAcatcatcatcattattatcatcatcTCTATTTACATCTGTTTTATGAAATGATTTATTTTTGAAATATTTACATACATAATTTCG-TAACATCTATGTAATTTCTAAGAGAT-ATCATTGTGGGAAAGTTACATTAGTAAACAGCAAAGTTCAAGTAACAATAAATACATTTAGATTTAGAAAGTTAAGTGTAGTGTAGTTTAACATACATTGCTTAAGAAAACAATTGTAGATGACATTAAACTAAACCAAGAAACACTATAAAAAAGATTTTGATTTTAGTATAAATAAAATTCCTTAAT----AAGAAAAATAAACCATTTCATGATCAAGCTCTGATTTAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 58152 423 + 81052 ACAAGTTCATGAG------------------TCCATCACCCTAAAATATAGCAGTTAGAAAACATGATTGAAGTCATATTTATAGAAGAGTATGGCCCCTTTTTGCTGACATTATCATCATCATCA--ATCATC---ATCTACATCTATCTCATTAAATGATTTATTTTTGAAATGTTTCCATACGTAATTTGGATAATGTCtaataaattttaaaaatattatCATTGTGGGAAAGTTACATTAGTAAACAGAAAATTTCAAGTTGAGCCAAATACATTTAGATTTAGAAA-TTAAGTATAGTTTAGTTTAAAATACATTGCTTAAGCAAATCATTATAGA------TAAACTAATCTTAGGAACACTATAAGAAAGATTTAG-TTGTGGTGTTAATAAAATTCCTTAATTAGAAAGATAAATAAGCCATTTCATGATCAAGCTCTTATTTCT a score=133021 s hg17.chr12_random 421221 2701 + 466818 AAAGAGAGGATTTTAGGGCTAAATAAATCAAAGAGAAGTAAGCCTTCCCCCACATCTTCTCTATTTCATTTAGGTAATGATGGGGTTCAGAGGCACAGAGCCCCATTTCTAC-AACATAAGCAA-AGTGAAAATTAATTCATTGAATACAGCAATGTAGCTGTGGTAGATGAACTATATTTTATCTATTGCCATGATATTTTGAGATCCAGTGCTGCTCATTGAGTTCCCCTGTGGGCAGAGTTTGTGGTGAGGAGCCAGCAACAGACAAGCTAATATCCAAAAACATCTACTCACATCAACTTAATTTCCAGTTTCTTTCAAATTGAAGGTAAGTTCCAAGACAAACTTTTTATTCTATTCTCTGACCAA-GTGTTGGGAAAAGAA---AACTGTTACCATTTTCATTTCTAGCATACTAAAACAAAAAACATAAAAACCCCAAAATCTAAAA-----CACTTTTAAAAATAACATGGTGTTAAGAGTAGTTTGTTCAGTTTCCCTATAGAAAATGATTTATGGAAGGAGAATAAAAGATTATTCTGAACACTAAAACAATAAGACCaaaaaaatgaattatcaatattgagaatccaatagacaga-----attagcctgttagatgcagtagaagagagaattagtgaattggaagatagctaaacagaatgaagcatagagaga--aacagatggaaatataccaagcta-gagggtatca--cattgatgctacagtcagaacacctaacatacttctggagttctgtaagattagaggagagaaaatcaagcaagagaaatgttgcaaggatttttccaaaagtgataaaATGTATTCCTCCATATATTTTTAGTAATC-TCAAACTTCAAGCATGATAAATTAAACCAAATTAGCATAAAATAATACAGGACACCAAAGACCAATAGAAAATCTGAAAAGTAGCGAGAGGTGGAAGATAGAGTATGTCGTGTGTTGAAAAGAACTGCATTCTAAATACAACCTGATTTT-AACAGAAAACATGGAAGAAGGAACTCAATGGAAACATGTCTTCAGTGCATTTCCAAAGAGTAGTagaacttcataaacagaaattgaaa--atatttttcagagaaaataaaaatgactgaaaatgcaaagttgaacatgcaaggagcaataaaaattattgacaatgaaaaataagtg--taattctaaataaatgttgactgtataaaaATTATTGTCTTGTTAGATTAAATTTATAATTGATAAGATATATGCAAATGGCAATAAAGAGACTGGAGATAAAGGTGACAGGAATAAATTTAGTTAGACTATGTTTTGGGCTTTTCTATGTCTGTGCAGATaatttgaacatcataatcaaggaccctgtaattctacacccaggtatatatatgcaaaagaattgtagtaaatgatgtagg---------tcattgaagcattattcataatagctaaaaaataagctgcccaaa-tatatatcaaataaagatgg---------ataaataattacagtaaaatcataaaatggaaaaatatggagaaatgaaatgaaataaatcacatgtacatgcaactatgggattaaatttctgatacagaatgttgatttcaggaagccatgaataagaa---catatagaattgcacctatacacagttcaaagaaggccaaaccaagctattgagtttagggtcgcatacctagttggtaaagtataaagaaaattttaaaaa-gatcaacataaattatggatgttgcttatcacaggagatgtgaagaaacgtgtagcagattggaaagtggcattgaggtaaacctaggctcttagcaattttccatgtcttgccctacatgatgattacatgagtatttaTGACACATTGCTATGCTTCCCAGTTTTGTTTTGGCTCATTTCTAAGTGTGCACTCTAGTTACAATACAAAAATTGTTAATGAGGAGAAATGTTCCATGAAA-TTATTA-TTACTCTGCTCATTATATACTGAAGGGAAAAATCCACTATTTGTATACATTCATGTATAACTCTAAGAGGTTTTAAGTAGAAATGTTCTGATTTTAGTTGTAACTTTTGGAAATTTGACATGATGTTACCTGCCAACCCCACGTTTTTC--AATAGGTTTTTCTTCTAGGTTTAATTATCTACTTCATATGACAAAA-CTTTGACATTCTCCATCTATTTTTCCCTTGGATCCAGAATTCCTAACACAACAAGGGTGGTCATGTTACCCACACTCTTAGTTTAGCAGAATACCTATATCAGTTATGTTTTTCTGCAAGAGAAAATCCTCCAAAACTGCTTTAGATATTTGTGTCTCATAAGTCTTTGGATTTCATTTTTCTAAGCTTGG-TTTGGCAGATGGCTCTGGTGATTGGAGATGGGCCACATACTGCATCTTGCAGCTAGTT------TGGCTGATTTAGG-CTGGATCAGGTAGTGGCATTCTGACTCCATTAGTTTCTCATTCTTCTTCTGGGAACAGTGTACTAGCCAGATGATGTCCTCATGGTAAAAGGAAAAGAGCAGGAAACTCCAACATGGAAGCTGTCTTAAATATCTGTGTAAAGTCTACTAACTTCCTGTTGACTGAAGCAAATTAGAGGAGTGAATTTAGAGTCCAAGTTCAAGGTAGTCACCCTGCCTGTGGTGGGAGGATACTGCAGGATTATATGACAAAATGTAGGGTACTTAGAAACATTTACAAAATTGC s rheMac1.SCAFFOLD85456 59049 2688 + 81052 AAAGTGAGAATTTTAGGACTAAATAAATCAAATAGAAGTAAGCC----CTCATATCTTCTATATCTCACCT-GATAATGAAGAAGTTTGAAGGCACAGAGCTCTACTTCTGCTAATAAAAAAAAGAGTAAAATTTAATTTGTAAAACAGAATGATGTATCTAGGGTTGAGGTGCTATAACTTATTTATTGGAATGGCATTTTGAAATCCAGCACAGCTAATTGAATTTCCCTGTGGGGAGAGTTTGTGGTGAAGACTCATCAACAGACAAGCTA-----------------CTCACATCACATCAATTTCCAGGTTCTTCCAACTTGTGGGAGGATGTGTAGACCAAGTTTTTATTCTATTTTGTGACCAATGTCTTGGGAAAAGAAGAAAATTGTTATCATTTTCATATCAAGCACAC--AAAAAACAAACAAACAAAACCAACCAACCAAAGAACCCCATTTTTAAAAAAAACTTGGT--TATGAGTACTTTGTTCTGTTTCTCCATAGATAATGATTTATAGAAGGAGAACAAAAGATTATTTCTGCTACTAAAATGATAAGAGCAaaaaa-taaatagtcagtattgagaatccaataaacaaagagttaacaaccagttagacataggagaagagagaattagtgaactggaagacaactacaaagaatgaagcctaaagagaccacaagacagaga-atgcaaaactaagagaataagaggcattgatgctagaatcagaggatctaacatacttttggatttctggaagattaaaagggagaaaatagggtagaagcaatgttGTGGAGATTTTCTCAAAAGTGATAAAATGTATTAATCCATATATTTTTAGTAACCATCAAAGTTCAGACAAGATAACTAAAAACAAATTAACATAAAATGACAcaggacatcaaagaccaatagaaaatctgaaaagtgcccagaga-aaaagatagattattt-------taaaaggaacaactttctaaatgaaaactgattttcaacagaaaa-atggaaggtagaattcaatggaatcatgtcttcagtgtgttTCAAAAGAATAGAGgacctgcataaacagaaatctaaatgatatttttcagctaaaataaaaaacattgaaaatacaaggttaaacttgcaagaaggaataaaaattagcagatatgataaatatgtgcataattcttaatgaatgttgactgaataaaa--taaCGTCTTGTTGAGTTAAATATGTAATTGATAAGATATATGCAAATAGCAACAAAGAGACTGGAGGTAAAGGTGACAGGAACAAATTTAGTTAAATTATTGTTTGTACTTTTCTATGTCTATGAGGAGAATTTGAACACCACATTTAATGACCCTGTAAT-------------------------AGGAATtgcttcaaatgatatgtgaaataatactcatagtagagttactcataatagctcaaaaatacactgcccaaaatatatattaactaaggatgattgaatgatataaatgattacagtaaatccatacagtggaacaatatagagaggtgaaaagaaatgaatcacatgtacatgcaactatgtaactaaatttcagaaacatgatgtccagtgcaagaagccatgaacaagaagaacacacaggactgcacctatacacagttcaaagcagaacagaccaagctgtggagtttagggttgcaaacctagttggtaaagcataaagaaattcaaggaaatgatcagcatagattacgaatattgcttgtctcaggagatgtgaataaaggtttaggcgcttggaaagtggcctggaagtggacctagtctgtttgcagtgttccatgtcttaccctgtgtaatggttacatgactgtttatgatacattgctct--ttCCTATTTTTGTTTTGGCCCATTTCAAAGTGTGtattataattttattttaaaaattaCAAATTAGGATAAATGTCACATAAAAATTATTAATTGCTCTGCTCATTTTATACTTAGGGGAAAAATCCACCATTTACGTACATTCTTATACAAATC-AAGAGAGCTAAAGTGAA----TTCTTATTTTAGTTGCGAAATGGAGAAATTTGAGATGCTATTACCTACATCCCCCAGATCTTTCCCAACA---TTTCCTTCTAGTTTTAGATATTTACCTCATATTACAAAAACTTTGACATTTCCAACCTATTTTTCCTTCGGCTCCTGAATTTCTGACACAACAAGGGTGCACATATTTCTCACACTCTTGTTTTATCAGAGTGTCTATATCACTTAGCTTTTTCTGCAAAAGAAACTTCTCCAAAACCACATTAGATATTTATATCTCACATGCTTTTGGATTCTGTTTTCTTAAGCTGGGGTTTTGTGGATGGCGCTGGTGATTTGAGAGGTTTCAAGCTTTGCCTCTTGGATCTAGTTAAAGTTTGGCTGATTTAAGACTGGGTCAGGCAGGGGCAATGTGACTCCATGAGTTACTCATTTTCATTCTGGAAACAGTATGTTAGTGTGGACATGTTCTCATGATAAATGGAAAAGAGCAAGAAAGCCTAATATGCAA-CCATTTCAAATTTCGATGTAAAGCGTAGTAATTTTCTGTTCATTAAAGCAAATTACATGATCAAACTCAGAGCCCTAGTGCAAGGTTTTCACTATACCTGTGGTGGGAGGATACTGCAAAATTATGTGACAAAG-ATCTGGTACTCAGGAATATTTACAAGCTTTC a score=2065 s hg17.chr12_random 423922 40 + 466818 TGaatattttaattaaa--------atttaaaCAAAAAACAGACTTGA s rheMac1.SCAFFOLD31009 33209 46 + 42162 TGAACattttaattaaataattaatatttaaaC--AAAACAGAGTTGA a score=121003 s hg17.chr12_random 423962 2263 + 466818 ATGTAAATTTACCAAAGACCTAAGCATAAGAAACATGTTTGATAAACATTATTCATTGTCTGACAACGCTGAATAGGAAAA-TAGTACTAATTCTACCTGGATGACCTCCTGGAAACTCGTTTTCCATTTGGTGAGTAATAAGAAAATAATTCCTTCCATCCCCTAATGGTGTGAGTGCATGTGTGTCTATGTGT------TTAGGAGCTTATTAACAATAATGTCATATAAATGTATTGGTTATCAGAAACCAGATTTTCAGGTGTATTGGCCTCACAGGACTTTCCAAGATAACCTTGGATGATTTTGACAAAAGGTTTAGAATCTG-GTATTTAAATCTGGCAT--AAAAATAAATCCATATTGAT-ATGATCCTATTTATGACCAAGCTCCTTTAACAATTTAGACATTTACTGTATGATATATGTATTGGGTTTTAAAATTTCCCTATGTAACAACTGAAGATGCTGGATACAAATTATGGAGAGGTTAAACAAGAAAAAAATTGCAAAACAATGAAAAAGAATATGGCTTTATTTGCATACTAACACACGAGAATTCACTTTTGACTTCAACATCAGTATAAAACATTTCAGCATATAGCAAGGACAGATAGTCTATAAAGAGGAATGAGTTTCAGCTGTTTTGAGATTAATAATATTTTCCCTAAAGACAGCTTTGAATTCATCCATTGGCATATGCTGGTGCTTTCCTGTTGACATT----AGAGAACTTAAAGGCAGAAA--ATGTTACTGCACATTTAGAAATCAAGTGTTTATCGAAGTTAATGTCTGGATATTAAGGGAATCACAACCAGTGTTATTAAGCCTGCATTTTTT-TTTTTGTTGTTGTTCAAACATAT---GTGTTCTGCTCATCATTTTATCAATTCTGGTAGTGTTTGCATTTGTTCTTGGAAATGTTGCCAATGGCTTCATAGCTCTAATTAATGTCAATGACTGGGTTAAGACACAAAAGATCTCCTCAACTGACCAAATTGTCACTGCTCTGGCATTCTCCAGAATTGGTTTACTTTGA-TCATATTATTACATTGGTATGCAACTGTGTTTAATTCAGCTTTATATAGTTTAGAAGTAAGAATTGTTCCTTCTAATGTCTCGGCAATAATCAATCATTTCAGCATTTGGCTTGCTACGAGCCTCAGCATATTTTATTTGTTCAAGATTGCCAATTTCTCCAATTTTATTTTTCTCCACCTAAAGAAGAGAATTAAGAGTGTTCTTCTTGTGATACTGTTGGGGTCCTTGGTATTTTTGATTTGTAATCTTGCTGTGGTAACCATGGATGACAGTGTGTGGACAAAAGAATTTGAAGGAAATGTGACTTGGAAGATCGAATTGAGGAATGCAATACACCTTTCAAACATGACTATAACCAACCATGCTAGCAAACTTCACACTGTTCATTCTGACTCTAATATCTTTTCTGCTGTTAGTCTGTTCTCCGTGTAAACATCTCAAGATGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCAAGATCTCAGCACCAAGGTCCATATAAAACCTTTGCAAACTGTTATCTCCTTCCGTATGTTATTTGCCATTTACTTTCTGTGTATAATCACATCAACTTGGAATCCTAGGACACAGCAGAGCAATCTTGTATTCCTGCTTTACCAAACTCTTGCAATCATGTATCCTTCATTCCACTCATTCATCCTGATTATGAGAAGTAGGAAGCTAAAACAGACCTCTCTTTCAGTTTTGTGTCAGGTGACGTGCTGGGTGAAATAACAGAAACCCTCAACTCCATAGATTCACAAGGGGAGCATGGTGTGTCTTTTAGCAGAAAAGAAACTGATGGTGTCTAGAACGTTTTATATTTCTGTCAGTTTGTTG--TAGTGTATGTATGTGAGTAATTTCAAAACAGATTCCTAGGATAGTCTTTtatatatatataatatatataaaactcatatatatataaaatacgtatgggtgtatatgtgtgcatgtgtgtgaataA-TAACATTGACCATAAATTATGAAGCCTAGTATATTTCACATAT--------------------------ATAAG----------------------TATGTGTATTTTATG---ATAGCTAATTGTATGATATTTCATTTGAAGAATTT---ATCTCTCTTTGTAATTAAGAAATTACAGCATTTATCAGAAAATCATTGCTGTTTTCCATTGTAATTTGTACCACATACATGTAC------------------TTAACTATCATTGTTTGAACCTCTCA-TTTTCTGGATGGTAAAGACATTCAATTCTAAATCAATGATGAGACTGTATCTTTGTAGTAGGTTTTAT s rheMac1.SCAFFOLD85456 61737 2335 + 81052 AAGTAGCATTACCAAAAGCCTAAGGATGAGAGACATGTTTCGTGAGTATTATTCATTGGCTGAAAATCCGGCATGGGAAAAATAGGACTAATTCCACCAGGATGAGCTCCTGGAAACTCATTTTCCATTTCATAAGTTATTAGAAAAAAATTCCTTTCATCCTTGAAGGGTGAAAgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtTTATGAGTTTGTTAATACTGATGCCATACAAAAGTATTGGTTTACAGCAACCAAAGTATAAGGAGTATTGGCTTTCCTGTGGTTCCCAATAAAATATTGGGTGATTTTGATAAAAAGTTTAGATTCTGTGTATTTAAATCTGGCATTAAAAAATAAATCCATAGTGATTATGATCCTACATGTGATCAGGCTCTTTTAACAATCTAAATACTTGCTGTGTCATCTATGTACTGGGTATTAAAATTTCCCTA----ACAACTGAAGG-GCTGAACACAAATTATGGAAATGTGAAACAAGGAAAAAATTGCAAAGCAGTGAAAGAAGATATGTCTTTATTTGAATGCTAGCAAATGAGAATCCAGCTTTCCGTTCAACATCAGTCAGAAAAATTTCAGCCTATAGCAAGAACAGAGACTGTATGAATAATAATTAATTTGAGCTGTTTTGGGACTGACAATATTTTCCATAAAGGCAGCATTGAACTCATTCATTAGTTTAAGCTGGTGCTTTCCTGTTGACATTGTTCACAGAATTTAAAAGCATAAAGGATGTCATTGAACATTCAGGAATCAAGTGCATATTTAATCTAAAGTCTGAATATTAGAGGAGTCACAACCAGTGACATTAGGCCTGAACTTTTTACTTGCTTTTTTGTTTTGACATGATGAGTTTTCTACCCATTGTTTTTTCCATTCTAGTAGTGGTTGCATTTGTTCTTGGAAATTTTGCCAATGGCTTTATAGCACTGATAAATTTCATTGCCTGGTTCAAGAGACAAAAGATCTCCTCAGCTGATCAAATTATTGCTGCTCTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTAATAGTCTTACACTGGTATGCAACTGTGTTGAATCCAAATTCATCTAGTTTAAAAGTAAGAATTTTTCTTTCTAATGCCTGGGCAGTAACCAACCATTTCAGCATCTGGCTTGCTACTAGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATCGTCAATTTCTCCAGACTTATTTTTCATCACTTAAAAAGGAAGGTTAAGAGTGTAGTTCTGGGGATACTGTCAGGGGCTTTGTTATTTTTGGTTTGTGATCTTGTGGCGGAAAACGTGTATATAAATGTGTGGACGAAAGAATATGAAAGAAACATAACTTGGAAGATCAAATTGAGGAATGCAACGTACCTTTCTAACTTGATTGTAGTCA----CGCTAGCAAACTTGATACCATTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGCTCTCTGTGTAAACATCTGAAGAAGATGAAGCTCTATGGCAAAGGATCGCAAGATCCTAGCACCAAGATCCACATAAAAGCTCTGCAAACTGTGACCTCTTTCCTCATACTATTTGCCGTTTACTTTCTATGTCTAATCGTATCATTTTGGAATTATAAGAAGCAACAGAAAGAACTTGTCTTAATCCTTTGCCAAGCTATTGGAATCATATATCCATCGTTCCACTCATTCCTTCTGATTTGGGGGAACAAGAAGCTAAAGCAGAACTTTCTTTCAATTTTGTGGCAGGTGACTTGCTGGGCCAAAGGACAGAACCTGTCAACTCCATAGATTCACCAGAGGTTCATTGTGTGTTTTCTAGCAGAAAACAAATTGATGGTGTCCGGAACATTTTATATTTCCTACAAGTTTTTGCATAGTCTATGTATTTGAGTAATTTACAAAAGTAGAATTAGAAAATTCTTTTACTTAAGTTTATtatataaaa-----gtatatata---------tgtgtgtgtgtatgtctgaatgtatatgAAAACTTAACATTTACCATAACATAC---CTTTAATCAATTTTTCATATAAACTGTTCAGTTATACAAAAGTAGGATAAGAAATTTGTCAGAATTATGAACCCATGTGTGTTTCACACATATATTTTATTGTATGATATTTCGTTTGAGGAATTTATGATCTCTATTTATAATTGAGAACTGACACCTTATATCAGAAAATTATTGGTGTTGTTGATTGTAATTTGTATTATGTATATGTACCATAGTGTATGTAACTGTTTAACTATCATTGTTTGAGCCTGTAATTTTTCTGGATGGTAAGGAAATTTAATTCTAAATCAATGATGAGAATGTGTCTTTGGGGTAGGtttttt a score=21889 s hg17.chr12_random 426225 512 + 466818 TTCATTATGAATTCTTACTTTACTTTTAGTATAAAGCAAATAGAATTTTTGTTAGATAATGATGTACACAATAAAATTAGTGTACATATTAAATAAAATCAGTGACAAACATGTAGAGT---ATATGTATTTGCCTTTGGGAAGGCAAATTTTGTATATGTATAACAAAA-CTGTACTAAAGAATACTAGATTTAATACCAGTATGTGAATAGCTTAGAAAAAAATCATTTCTATAATAGGAATGAAGAAACAAAACCATGA--TCATTTCAGTGCTATTATAATTTTTTAAGTGTAGTTAGAAAAATCATTTCTTCCACCTTTTGAGTTAAAGAAAATCTTTTTTGAAGTTGACATCTGATGTCAAGTATTTCCATTTATTTTGCTTAGCAACCTCTGAGCCTCTGAATTTCCAATATTCTTCTTTGTCTCCCATTCCTGATATTCCTCAAAAAAACTCAAATATTCCCTTTCTTTAAAAAAAAAAGCCCAACATAAACAGGGTGTAGAAACTATAG s rheMac1.SCAFFOLD85456 64420 467 + 81052 tTCATGATGAATTCTTATTTTATGTATAGTATAAAGCAAATACAATTATTGTTAGATAACGACGCACAAAATAAAAT----------------------------------TCAAGGGTGAAATATATATCT---------AGTGTACATTTTTT-TATGTATATCAAAAGCAATACTGAGGAATATTAGATTTAATA-TAGTATGTTAATAGCTTA-CAAAAAATCATTTCTATAAAAAAGATGAAGAAACATGATCATGAGCTCTTTTCAGTGCTGTTATAAGTTTCCATATGCAATTAGAAAAGTCATCTCTTCCAGTTTTTGAATTAAACAAAAGCTTTTTTGAAGTTGAGATCTGATGTTATATATTTTAGTTT-TTTGTCTAAGCCACCTCTGAGCTCCTGAATTGCCAATTCTCTCCTTTATCTTCCATCCTTAAAATCCCTC-AAAAAGCTCAAAT-TTTCCTTACTTT--AAAACGAAGCTCAATCTAAAGAGGGTATAGAAACGACGG a score=3063 s hg17.chr12_random 426737 38 + 466818 ATGATAATCGAATGAAACTTTCTTCAAATGTTAAAAAT s rheMac1.SCAFFOLD31009 35950 38 + 42162 ATGATAATTGAATGAAACTTTCTTCAAATGTTAAATGT a score=13093 s hg17.chr12_random 426775 239 + 466818 TGCCTGTGAAATCTATATATTGATGATAGGAAATATATTAATGA------CTATTATAA---TGATGTAAATGGTGAAATGATACAAAGTGTGCTGATGTATCCATTGATACCAAGTTCTATTATAAGAAGGTAATCTACAGCCTTGTGGAACAGCTAAATTCTGTGTGACTATATTCATTCTTGGTGTTATGAAATTTTAACATTGTTATCTCAACCTTAAAATAAATCAACTCCTCATATtatata s rheMac1.SCAFFOLD85456 64887 246 + 81052 CATCTATGAAATCTATATATTGATGATAGGAAATGCCTTAAAGATACGTTTTATTATAATCTTGGTGTAAATGATGAAATGAGAGAAAGTGTGTTGACATATTCACTAATAGCAAGTTATATTATAAGAAGAAAATGTATAACCTAGTTCAACAGCTAAATTCTGTGTGAC--TATTAATTTCTGGTGTTATGCAATTTTAACAAAATTATCTAAATCTTAAGATAAATCATCTCCACatctgatttg a score=1332 s hg17.chr12_random 427014 28 + 466818 tatata-atatatatat----------acacacatacat s rheMac1.SCAFFOLD31009 36260 39 + 42162 tatatatatatatatatacacacacacacacacacacaT a score=21442 s hg17.chr12_random 427042 442 + 466818 TTTGTTTATCATACATCTTCCCTAGTACTATGTAATCAGCATAAAAAGAGAGGTAATAGCTGTCTTGCTTTCTCTTGACTCACAGGATCTAAAAGCCAGCACAAAGAATAGTTGGTCAAAAG-AATATATTAATGAACACAT---------AAGTGATTGGATAAATGGATAAT-TTGTTGTGGTAAACCAATGACAATGAAACTCATCACAAAATCTGCAGTTGCTTGAA------TTTTCTAGTTTCAGGTTGAGGTTATAGGCTTATCAAAGAAGAAGCATTTCTCAGAGCAAAAGTTTGACTATTCCAAAATTCTAGGGGAAATATCACTGTAATATAGCTTTGCTGTAGCTATATCAGGTGTGTGAAGTAGAGACAAGGTGGAACGTCAAAATTAGATGGCACTTATTCTAATGCTTTTTGAAAAGCATATTAAAGATTTTGGTATATTTGCAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 65133 446 + 81052 tttgtttatcatatatcttccctggtacaatgtaagtaccataaaagtggagatcgtatagatcttgcttactgtagacat----------aaagacagcacacagaatagttattcaaaaatgatactttgatgaacgaatTTAATTGGCGAATGAACGAATACATGAACTATATTGGGGTGGTGAACCAATGAAAATGTAACACATCACAAAATCTACAGTTGCATGAATATTTCTGTTCTGGTTTCAGATTGAAGTTACAGGATTATCCAAGAAGAAGAATTTCTCAGAGCAAAAGTTAGGCTATTCCCCAATTCTAGGGGAAATATCACTATAATATAGCATTGATGCAGCTATATTGGATGTGTGACACAAAGACAAAGTGGAAAAT-AAAATCAGATGGAA--TATTACAATACTTTTTACTTAGCATATAAAAGAGTTTTGCATATGTGCAC a score=433 s hg17.chr12_random 427592 6 + 466818 atgtct s rheMac1.SCAFFOLD85456 65579 6 + 81052 ATATCT a score=6221 s hg17.chr12_random 427598 132 + 466818 ctttctccttcat-tatgacttatgctgccttcaatgctttgctgatacaaaagaagtgAACTC-AAAAGAAGTAAAAATAAAAGCTAGCAAACTTTGCAACTGGTTAAGCTGGTTGTAAACGTACCTAATCAC s rheMac1.SCAFFOLD45667 1037 132 + 44450 cttttgcctccaggcacgacatttgctgccttcagtggttcattggtacaaagaaagtgacctctagaaGAAGAAAAAA--AAAGCCAGCAAATTTTGGAACTGGGTAAGTTTGTTGGAAATGTGCCCAACCAC a score=31275 s hg17.chr12_random 427730 630 + 466818 TTTCTACTGTGAATGATATATTTGTATTGTGATATTTTTTAGCTGGTTATTAGATACACAAAAAAGGTATTTCATTTTTAAAAATTGAGTTAGTAACCACTCACCTTACTTACAAAT-TATTTGTATATTATTTTGTTTAGTATCCTTTCTAAATGAATGTTTTAATTGCCACGTTATAAACACATGGAAAAGTGATTCA--------------GATGAATGTAtatcttagctttgggtgtctagaactagagccaatgtctgattttacagtgatgacatttatttgggaaggcaagtccagggcagcaatgagggatacatgtggaaactgaggcaaaggaagatgtaaaatcatgtgtcatgatgt-tgatatgactttgccagttgtcgcttcacaatgaggtgagacagacagcatggtggtcatcagatacatgcacttggctccccgtacttttccagaagggttacaaggggaagccacaacaaatattagtccatggagg--agagaaaagggagaatgtat---cctagctgtcttctgtcttctatcttcctttggccaaagattgtttgaggcagaactaccatctttgcttttcttccttacattatccaaccccttggtggctgtttgggaaAGTC s rheMac1.SCAFFOLD85456 65585 637 + 81052 TTTCTATTGCAAACTATATATTTGTATTGTGGTA-TTTCTAGCTGGTTATTACATAAACAAAAATGACATTTCa-tttaaaaaatttaattatcaac----tatcttactaaaatatatttttagatagtatt---tttaatatCCTTTCTAAATGATCACTTTAATCACCATATTATAAACTCATAGAAAAATGAATGAATAATAATTATAACACTGAATGAAtatcttagtctcaggggtccagaactagagcaaatgtctgatattaaagtgctgacatttatttggaagg--aggtccatggcagcaaaagccgggtcatatggaaattgaggcaagagaagatgtgaaactatgtgttgtgatgtgtgatatgactctgctgacgaccacttcacagtgaggtgag--agagagcatggcggtcatcagatgtgtgcacttggctcccaggactttttcagaagggctgcaagaggaaaacacagccagcattagtccatggaagcaacagaggagggagaacatatctgctcagctgtcttctgtcttctatttcccactggccagggtttccctgaggcagaattaccatctctgttgttctgctttccatcatccagtcccttggtgga-ggtaatgaaagtc a score=29788 s hg17.chr12_random 428903 525 + 466818 AGACTTCATGCCCACA-------GGTATATTCAAGTCCCAGATGGAAAGATGATCTGGATCAGGCAAGATGCTGACCAGGGGAACAGGAGACACAGTCAAGGGAATCTGAGGAAGTGCATGTTTTTGCCCAGTACAGTCCCCACCTTGTGCCACTCAGATGTCCTCATGCCCTCCAATTGTGGCTGGTTTTATAAGCACATGACTAGTGTAGTTGCACGCGGTCTTGTGCTT--------------TTGGGA----TTTTTGCTTGGATTAATGTTCTGCACTTGCATTTTtatttttcagacagcggatactcctccgctgaagagggaatagttctgcagtaattccctaggggtttgctttctcctctcctaagggcttgatggagacaggcacagagtcctataatgcccacg----atgcatgcctctagcagctttgaattctgctggatcatctgacgcaatgggcagagcaggtttggccacagcctatatctgctgtagagatatcttatgttctggattccacttgaaaccactagtctttgca s rheMac1.SCAFFOLD85456 66222 549 + 81052 agacctcatgcccacaatgtggtgatccattcaagtctcaaatggaaggGTGACGTGGGTCAGGCAAGCTGCTGACCAGGGGAATGGGAGACA--GTCAAGTGAATCTGAGGAAGCACATGTTTGTGCCCGATGCAGTCCACTGCTTGTGCCACTCAGATGTGCTCATGCCCTCCAATCATGGCTGACTTTATGAGCATATAATTTCCACTGTTGCACAGGGTCTTGTGCTTAGAGATGCGCATGCTTAGAAGCGCTTTATACTTGGGTTAATTTTCTGCACCTGCTGTTTtgtttttgagacagagggcactcctctgttgaagagggaatggttttgcactaatttcctaggggtttgctctcccctctcctgtgagcttgtgagaagcatgcacaaagtcctataatgcccactatgcatgcatgcctctagcaggtctgaattctgctggattgtctgtcacaatgagcacagcagcttggactaaagcctacgtttgc--tagagtcattttttgttctag-ttctacttaagaccagtagcctttgga a score=4898 s hg17.chr12_random 429428 65 + 466818 ttcattctgcaaCCCATCTAGTTTTGGCAGAGGCTAGGTAGGTTAACTGAACAGGGATTTAAAAA s rheMac1.SCAFFOLD31009 36978 65 + 42162 ttcattctgtaaCCCATCTCATTTTGTCAGAGGCTAGGTAGGTTAAGTGAATAGGGATATAAAAA a score=7965 s hg17.chr12_random 429494 147 + 466818 GACTTTATTAACACgttggagcaatatcctctattgtggtatttgtggactctgaaaccccaagaggctcaataaacactgtgcttcctttttagtgataagaagta----tatatagggcaacatgccatttaccttaaaaaggatgttt s rheMac1.SCAFFOLD85456 66771 151 + 81052 aacttcattagtgaatcagagcaatatcctcaaatgtggaatatgttggctcccaaatcccaggaggcccaacaaatattgtgtctcatttttagtgacaggaaatagatgcatacagagcaacatgctgtttactttaaaaagggtattt a score=2140 s hg17.chr12_random 429641 32 + 466818 ctgctgggcgtggtggttcaagcctgtaatcc s rheMac1.SCAFFOLD31009 37190 32 + 42162 CTGTTGGTTATggtggctcatgcctgtaatcc a score=590 s hg17.chr12_random 429673 45 + 466818 cagcactttgggaggccaaggtgggcagatcacttgagaccatga s rheMac1.SCAFFOLD85456 66922 40 + 81052 cagcac-----gtggactaggagcactggacccctaaaatcatca a score=2748 s hg17.chr12_random 429718 38 + 466818 gtttgagaccagcctggataacatggtgaaaccctgtc s rheMac1.SCAFFOLD31009 37267 38 + 42162 gtttgagatcagtctgggcagcatggtgaaaccccatc a score=373 s hg17.chr12_random 429756 4 + 466818 tcta s rheMac1.SCAFFOLD85456 66962 4 + 81052 tcta a score=1506 s hg17.chr12_random 429760 30 + 466818 c-----ttaaaaaaaaaaaaaaatgccagtcctgg s rheMac1.SCAFFOLD31009 37309 35 + 42162 cttaaattaaaaaaaaagaaaattgccaggcatgg a score=316 s hg17.chr12_random 429790 29 + 466818 tggcacatgcctgtaaacactgctactca s rheMac1.SCAFFOLD85456 66966 29 + 81052 tgttataggtcactgaatcttcttgttca a score=4797 s hg17.chr12_random 429819 62 + 466818 ggaggctgaaagatttgaactgattgaacccaggagacaaagcttgcagtaagccgagattg s rheMac1.SCAFFOLD31009 37373 62 + 42162 ggaagttgaaggatttgaactgattgaacccaggaggcgaaggttgcagtgagccaagattg a score=35949 s hg17.chr12_random 429917 1128 + 466818 tctgtctcaaaaataaataaataaataaataaatgaataaataaacagattttttgacatgtggactaggagtatgggacccctaaaaacaatatctgtgttgcaggtctctaaatattatcaggtgtatctctttctgctggtattttatttctatttaatgttcaagtattttactatatttaggaaactttccatttcctggttattgcaccaattactgtaacattattaata-----aattaacatgatgttttgcaaaatgtaaattaaactgagagcagaagtgacatcg-cctgacataaaacactgaagcagcgtttttgttcttaccacacaaaggtcaattgttttaatctcctgacccacccatgggtgtaaaataagaaacattcactaaatcaagagccacatgcaaagtgccagaagctctgctctgctcagggaagataccttatcctagagagcatttgtaagtagtgatttaaatttatggaactctgccctcattttataatgcatctgattttggtagagaccagttaggttaagtggagagggatgtaaaa-agactaccatcccctgtaactttcaagtgttttgtcatggtagtgatcaattccattccttggagaatgtgattattatttttcaatc--cttgttgccagtggaggagaatttcgcaggcttcgccttggtcctgctc-taatagtgt-cccttactctacaggtcaggaagaaa-gtgagagtcctgccagctgccatgtgtgtccatttcaattacacattcaggaagaggtaataacagcaaactgatcagattcactttgggatggacatgagtcaaaactctaggtagcatctaaccttcaaaaactccCAGTGCAggctgggtatgacggctcatgcttgcagtctccacactttggtaggcacagttgggaatatctattgaggccaggagttccagaccaccctgggcttcatggtgagagcctgtctgtacaaaaactaaaaaaagaaaaaacaacaacaaaaaattagtttggcatggtggtgctcacctgtagtcccagttatccaggaggctgaggcaggatactcccttgaacctaaaagCAATATGTGAGtc s rheMac1.SCAFFOLD85456 66995 975 + 81052 tctttct------------------------------------------tcttctggtattt------------------------------tacttctgt----------tcaatgtta--------------------tggtattttact--------atatttgagaaactcaccat-----------ctcctgcttttgggtta------caattaatgcaatattattaatatattgagttagcatgatgttttgcaaaatgccaattaaactgaaaacagaagtgacatagccctgacataaaatggtgaagcaatgctttcgttcttaccacaccaaagcaaatcattttgattttctctccca---atggatgtagattaaaaagcattcaccaaatcaaaagcctcatacaaagagccagAAACCATGTTTT-CTCAGTGAAGGTACCACATCCTAGAGAGTATCTTCAAGC-GCGATttatgtttatgctgatgtgcattcatcctataatccatctggttttggcagaggccagataggttaactgaatagggataaaaaatggacaaccacctcctggaa-tttagagttttttgtcatgtcagtgaccaattctattccttagactatgcggttattatgttttactcattttcttgacagaagaggagaatttcagagaactctttttggttctacttacaataatgtccccttaatatacaggtctggaagcaatgtgagagttctgctagctgttgaaactgttaatttcaatttaacattctggaagagataataaatataaacccattagatccaccttaggttgaacatgagccaaagctttatgcagcgtctgactttcaaaaactcctactcCAggactggtgaggtggctcacacctgtaatccaaacaatctgggaggctgaggtgggaggagcacttgagaccaggacttccagatcagcctgggcaaggtagcaagtccctgtttgt--------taaagaa---------------aataaactgatt----gtgatactgtgtgcctgtagttccaactacctaggaagttctggcagggggatcagtttagcccagga-----atttgagtc a score=158377 s hg17.chr12_random 431045 2070 + 466818 agttgctggccacatccagagtactgttaacaagagtgatgcctggtagaaaagtaatgaatttattccaaacctagcttggggaaggggcacaaagagtcctgcctttaagtgtaccacttcacctttggagcagaaagcagacacttttataagataaggggggttattgagcaagggtagagggtcctcctgcaagcttggtgccttttctaccatgcggggg-tctgtcctgcagaccctgactcaatgacagaggagtaatatacaccgacacatatattttgcttgtcagtccagctgagcatcctggccacttacagactctaaggaagagtgctgtcagctgccgccccaaattgctggcctt-cttggcatttatttagaacacattaaatgacaaacgctttgagtcaacaccattagagggtaatcaacctggtcaccttcccccaggagagcaatcctgcctgtgagtgatgaaaggttagctttaggactacctgagtaaacaagctctttagataaactactatacattcctttgtatctgtgccccaagtgcccaggctccggcaaagagact--ggctgccttcagccaaactatctgaagctatgcaaaaactt-ttggtcttccaagaaggtttttgttttgttttatacttttccctaccattctgactgaacccctacactaccagatagttgaattggtgccttcctttgcagaaatacgttataaaagtggccaagtgggtatgttttccatatgccctcctgttggatgaaagcccttgggtaattcctagagtggagaagagcctggaatttccaggtccactttctggaggtaaaaattctgtggcgggtgtgctttggtctgcaaattgactgtcagttctcaggaga-atctgtcttggagcactaagtttga-aaatgtgccctgtagggaatgtctagtgagtgggagtgaaaggttatatttgcatttatgaagggctaagcaggatacagggaacaaagagaaaggggagagaagagaagagaaaataataattaaaaaaacagtaaatcattctctttttcttagaaaaaaatggggcaatctgttacaaacccag--------gagt-----------tcaaggctgtagtgagtaatgatcatgccactgtactagatacagcctgggtgacagattgaggctgtgtctctaaaaaaaaTCTAAGGCAAATAACACAAAAAACAAAAGAACATTAAAAAGAAAATCTCCCATTCCATCTCATGGAACACGTTGTCTTTGGGGTACCTAGATATTAGTGTTAGTTCAGGCTCTGCTGGggtggccaatatctggtttactggtggcaatttcatacgagtctgcagcaacgtcaagtcttgcctccccagaggaaggaattcaactgaggggcatacgtaagaagagactgaaggaagtttctgagcaggaatggaagtttattaaaaagagagcaggaaagaaaggaagagactttattggaagtctcttggaagacacttggaagagaccacagtgggcactttggagatcaagtgcagtgtcacaccttt-gacttgtggttttatatgttggtatacttctggggtcttgtgttccttttcccacgattcttctcttagggtcttgtgttcctttttccatgattcagccccttagggtgggctgctcacatgcatggtagcttgctaacactttagaggtgagtatgcgcagtgtgtttactggaattgtacacatgcttgcctgaggcattcttcccttttttggtggaatgcccacagaaggtcatattccaccattttctctcttaacacgcatgcctcagcctactcaccctattcctgagctgctgactaccaattttaagcgtttttatttattgtgaaat-gcctctccctggcacctatgatcaattattatttttagagaggcagggtgtcaactgccaggccatcagctgatggccacttgacattccttgtgggtggtgggagccttcttctgccctactcatgcctgactaactacgtactgtaaGAG s rheMac1.SCAFFOLD31009 38499 2070 + 42162 agttgctggctgcatccagagtccagttaacaagagtgaggcctggtacaaaagtaataaatttattccaaacctagcttggggaaggggcacgaggagtcctgcctttaagtgtaccacttcacctttggagcagaaagcagacacttttataaggtaaggggggatactgagcaagggtagagggtcctcctgcaagcttggtgccttatctaccatgcggggggtctgtcctgcagaccctgactcaatgacagaggaataacatacactgacacatatatttggcttgtcagcccggcccagcctcctggccacttacagactctcagga-gagtgctgtcagtcttggcccagacttgctggcctttcttggcatttgtttagcacacattaaatgacaaaagctttgagtcaacacaattagagggtaattaccctggtcaccttttcgcaggagagcaatattgcctgtgagtgatgaaaggttagttttaggactatctcagtaaacaagctctttagataaactactctacattcctttgtatctgtgccctaagttctctggctcctgcaaagagactctggctgccttcagccaagctatctgaagctatgcaacaacttcttggtcttccaagaaggtttttgttttattttataattttccctaccattctgactgaacccctacactaccaggtagttgaattggtgctttcttttgcagaaatacattacaaaagtggccaaGTGGGTATGGTTTTCATATGCCCTCCTGTTGGATGAAAGTCCTCAGGCAATTCCTGGAGTGGAGCAGAGCCTGGAATTTCCAGGTCCACGtcctggaggtaaaagttctgtggtgggtgtgctttggtctgcaaattgactgtcaattctcaggggagatctgtcttggagcacatagttagagaaatgtgccctgcagggaatgtccagtgagtgggggtgaaaggttacatttgcatttatgaagggctaagcaggacacacagaacaaagggaaggaggaaagaagagaagataaaataataat--aaaaaatagtaactcatactctttttcttagaaaaaaatggggcaatctgttacaAACCCAGTCTTTACTGAGTAAAATCATTACtcaaggctgtattgagtaatgatcatgccactgtactacatacagcctgggtgacggattgagactgagtctctgaaaaaaCCCAGATGCAAATAACACAAAAAACAAAAGAAAATTAAAAAGAAaatctcccactctatttcatggaccacagtgtcttttgggtacccagacattagtgttagttcagGCTCTGCTGGGGGGGCCAAtatctggtttactggtggcaatttcatatgagtctgcagcaacctcaagtcttgcctcctcagaagaaggaattcaactgaggggcgtaagtcagaagagactgaaggaagtttctgaggaggaatggaagtttattaaaaagagagcaggaaagaaaggaa------------------------atcacacttggaggataccacagcgggcactttcgaggtcaagtgcagtgttaggcctttcgacttggggttttatatgttggtatacctctggggtcttgtgttccttttcccacgattcttcccttagggtcttttgttcctttttccatgagtcaacctcttagggtgggctgctcacatgcgtggtggcctgctaacactggagaggtgagcatgcacagtgtgtttaccggagttgtacacatggttgcctgaggcattcttcctgtttttggtggaatgcccacagaaggtcatattccaccattt-ctctctcaacacgcatgcctcagcctactcgccctgttcctgagctgctgactaccaattttaagcatttttatttattgtgaaattgtctctccctggtgcctgtgaccaattattatttttagagaggcagtgtgacaacagccaggccatcacctgatggtcgcctgacattcctggtgggtggtgagaaccgtcttctgccccgctcatgcctgactatctacctactgtaaGAG a score=46434 s hg17.chr12_random 433115 791 + 466818 CCCTATACCTAAAAGTCTCAGATGGTATGGATGTGTGTccttccctctgagtactattatctgggaaatggctacaggtctttgagaaagcatcatatgaatacattctgaatattct-gtggtgaattttctgcatcttttatcaaggggacttaagcttcccttcagttattgaattcttgttctctgaattggctcagtcctgacaactggttgaggttcttggattttccacttctaAGGCTGACCTCAGGAATCAGCTTTTCAGCTCCATTTTGCTCTTGGTTTATAAGTATTTATCAAAGTATGAAGcctcttcaactattggcttatgaactcattccaatgaagctgctactgtcatcgtttcattgattctgacatttgcaagatcacca--gagtctgtgttgct-gaggttagtcttcatgttgcatgctctattagccacattgaacatagtttatttgcatttcaggatgctgtcctctcctgattttatctttgttcactgggcagcacttctcagtctcctttgctagttctt--ttttgtctctaaactgaaaataccaattttcaacagggtctcaattcttcaatctcta--caatgatgcctgttgtgttggtgatctcatgtattctcCTTACTGACAATGTAGTCAAATCAGTCAACAGACAGGCATAAGGGTGAT----------TATCCATTTATATTGTTTATTTATTCACATATCTTGGTATATAGCACATTATGTAAATATTTTTCCTTCAAATGTCAAATTTACATTTAGAAGTAATAGTAC s rheMac1.SCAFFOLD85456 79166 802 + 81052 ctccaaacttaaaagtctcagataatatggacgtgtgttcttttctctgaggactgttatctggggaatagctacaggtccttgagaaagcaacataaga-cacaccctgagtattctcgcagtgaattttcaatgtccttcatcaagaggacttaagattccctttaatcattgaactgtgcttctctgaattggctcagtcctgagaactggctgagggtttttgattttcagtGTCAAAGACTGACCTCAGGAATCATCTTTTTCAACTCTTTACCCCCTTGGTTTATAGTTATTTAGCAAAATATGAAGcttcttcaactattggcctatcaacccatttcaataaggctg---ttgtcaccacttcattgaatctgacatttggaagatcactggtgagtctgtgttgccagtggttagtcttcgtgttgcatgctctatgagcagtactgaacatagtttatttgcatttcaggatgctgccctctcctgattttatccttgttcactgggcgccacttctcagtctcccttgctagttctttctcttgtctctgaattgaaaatatcacactgc-gcaaggtctcaattcttcagtctttaatcaatcaggcttgttttgttggtgatctcatgcagtctcCTTACTGATAATGGAGCCAAATTGTTCAATAGAGAGGAATAAGGCTGGTTATTCATAAGTATTCATATATATTATTTATTTATGTTCATCTATTTACATATATCTAATTATGTAAACCTTTTTTCTTCAAATGTCAG--TTGCATTTAAAAGTAACAGGAC a score=1051 s hg17.chr12_random 434498 47 + 466818 TATAAGTGTATAGAAGCGCGG-CATGAAGATGGCCACAATATGGTAAG s rheMac1.SCAFFOLD31009 547 48 - 42162 TATAAATTTTTAGTACACCGGACATGAAAATGGCAACGATTTTCTACT a score=231495 s hg17.chr12_random 434545 3629 + 466818 TCTGTAATACAAAGGTCAGAGGAGCGATTGCAATCACGGTGTGGGGATTATCCTGCAGGGTGGAAGGAGCCAGGAATTGATTTGATGTGAGTAGCTTTTTTT-GGATAATAGCGTGTCTGTTGCTGGGTCATCACCACAAACTCACCTTATAGGGAAATTCAGTGAGCAGCACTAGATCTCAAAATGTCATTACAATTAATAAAATATAGTATCTCAACCACAGCTCCACCAATCTATTCCACGATTTAAATTTTACTCTGTTTTTATAAGCAGAAATCAAGGCTTCTTCATTTATAACAATCTTTAAAAGATCAAAGAGTAAAACAGTACTTACAAGTTTATCAAACATTGAAGAACTT---------------------TTATTCCCATGGAAACAAAACTGAATCTGGTGCTTC----------------TAAGGAATTCCACCATTTAATCC------------CTATCCGTGAATATAGTTTTGGTTACAGAACTATAACCTTCAAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGACAGAAGATCTGAGGTCTTACCTCTGTTTGACAATCTGGTCCTAAAACTCTCTCTTT---------------------------------------------------------------------------------------AGAAATATAAGCTTGCTCATAAAATGTGCTATTTGCTTTGTCTTTCTTACTAGGGAGGTTTAGTTCCATTAAAATCTAAATTGTTTCCATAGTGATCATAGTGAAAAGAGGATTAGTTTAAGCTCATCCATAAATAATTATTTGCTTAAGCAATGTATTGTAAAATAAACTACACTTAATTTCTAAATCTAAGTGTATTGAGCTTGACTTAAACTTTGCTGTTTACTCCTGTAACTTTCCAATAATTATGATCTTTTTAAAATTACTTATTTTCCAAATTATGTGTTTAAATATTTCAAAAATAAATCATTTAATGAGATAGATGTGGATATAG---ATAATGATAATGATGATGGCAGGTAAAAGGGAGAATGCTATTTGATAAATGTGATTTCAGTCTTGTTTTTTAAGTACTAGACTTCAAGGTAATGAGAGAACAATATTATTCTTCTTCATGGCCTCATGATTCTTATATTATTCTCAGCATCAGGCCTAGGCAAATACCCTCACGTGGTATTTCATCAAGAATAATGTAAAACCAATGTATTTTCAATGATTTATTTGCTTTTTT--TATTTTATTACACTTTAAAAATTCATAGCAAAAGTGATCTCCAACAATTAGGATTCTATTTTGGGTTTTTTTGTGCAGTTTTCAATATGAAAATAGACAAATACT-CTATGCAAT-ATACAGCATATCAATTTTATTTCATCTTTTAATAGCATCATTAGCAAGCCAAATTCTTGTAAATGCTTTTTCACATTCTTAGCTATGGTGACTAAATCTG--TTATCTTACTATAGCAGTCAAAGTAGCATTATATATGCACAAACATACTCAAAGATCATACTAAATATGTTTTACACCTTAACAAATTTGC----CTATGATTTTTCTTCTCTAATGCAGAACCAAAAAATATATAGTAACAAAATATTTAACCCAAAATGCAGGTGTACACATGAATAGTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATATGAATATACATATTTCATTTAGAGACACATTTTGGCATA-ATAGGTCTATATATGTAATACCCATCTTACTATAGTTTATTGGAAATTCATGAC------------TTTCTGACACTG-------------------------------AAATGTGAATTATGAATAATTAAATTGGAAATAAGAATAAAGGTGTCTAGCAATCATAAATATTCAAATTTTGATGTTTCAAATTCATATTAGCATTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCTTGCTTA-----TCTTCTTTTTTAATTAATTTAAGAAAACTTTTGggccaggtgtggtggctcataactgtaatcccaccattttaggaggctgaggc-ggtggattgcctgagcacaggagttcaagaccagcttgggcaacatggcaaaatcccatctctaccaaaaatagaaaaaa--ttagcagggcgtggtggtgcacgcctgttgtcctagctactctggaggctgaactgagagaatcacttcagcccgggtggcagaggttgcattgagccgcgattgcacttgtgcactccagcctggacaacagagcaagaccctgtctcaaaataaa-----aaaaGTTTTAAATTTTAACTTGTATTTCTTAGTACCATAATGCTCTATTCTCCTTTATTCAGCAAAAACTCTAATTACAATGGTATCTATGAGAATATGCTGTATCACCCTGAATTTATACGTAGAAATGTAC-TTATGTTTTTGCTTTTTTAACATttttttattggggaatataacatac----agagagtaataaaacc---taaaaacagtaagaaaaaattataacattaacattgatgttaccaaaccttggtcagaaaatagaatttgccagcaatccagatactcccaatatacgtcttcttgttggtatttcccttttatttcctccctcctgattatcccaattgttatgatgatcattcatatatttcactgtagagtttcatcaccaatgtaacaaattacaatgtattaaaaat-tttttttccaaactttatgtaaa--agatcattctaaatgtatttttccatcttgataattcctttcacatctgtgagtattattatctatgtagctcaaatttgttcatttcctttgttgtattatcctgttgtaaacatgtcagtcttctttgttaattttgatcactgtatagtattccattgtataag-tatgccataatttgtttatccatttggaggactgacagacattccaagtacttctcaactttagctactgaaactcagtgatacgcatgtgcatgtatatgtattcggataagagtgtaaatactgggt-ttaggatgtgatccttcatcttaatcagataatgccatactcagccaaaatgatggtacagatttatcatcctaggagtagaatatgaaaattcccattgtttcatatcctttcc-aaATATGTTATGTAAGAGTAATATTTACAGTTTTGTATTTATAAAACATATTATTAAACAATAGTTTCCAAGTTCTTTCCTATTCTAATTTAGAATGTATTTTTACTTCAATAAA------TTTCATTCTATGATAGTTATTTCATATACATTTATTAATAATGCCttatatatt-----------------------------------------------------------------------------------------atacatatttatttatatttcattataaatttGTCTAACCTTTTTTTCTTCAAGTTTCAAATACTCTTTTCTTATAAGCAAGTGTAATTATACTGGAGATATTTCCTTTAATCAATCATTATGCCAAAGGACTTTGAAAAAATATAATT-GTTAACAGC--ACTGTAAGGGAAATTTCAGGATTGTTTAACAACTCCTAAAAGGACTCAAAGACAAAAATGTTGAAATATAAAAATAGACAACAAGCTTAATGTAGGTGTCCATGGGAAAA-ATAAATATATCATTGCTGTTATTGAAAAAATGAATGGTAGTAAATTTATCATGTCTGAATGTTTTAAAAAGTAGGCCTAATATCACTGGTCAAGATTCCCTTTAAGGTCCTGACCTTAACTTCTATGTGTAACTGATTCCTGAATGTGCAGTAATGTTCTTGTTCCTTTTAAATTCTGTGACCAACGTCAAACAGGAAATCATCTCAATATGCTAATGGATGAAATCAATGCTGTCTTTATGGAAAACATGATAATT s rheMac1.SCAFFOLD85456 77150 3900 - 81052 TTTGTAATACTTTTGTCAAAGAAGAGAATAAAAGCAAGGTCTAGGCATCCTCCTGCAACTTGGAAGAAGCTGGAAATTCATTTGATGTGAATAGTTTTTTTTTGGATAGTAACTTGTCTGTTTCTGGGTCATCATCACAAACTCTCCTCACAGGGAAATTCAGTGAGCAGTACTGGATCTCAAAATGTCATTAAAATTAATAAGATAAAGTATCTCAACCACAGCTCCACCATTCTATTCCATGATTGTAATTTTAACACTGTTTTATTAGCAGAAATCAAGGCTTCTTAGTTTATAACAGTCTTTCAAATATCAGATAGTAAAACAATACTTACAAGTTTATCAAAAAATGAAGGACATCTGATATAAGTAGACTTTAAGTCAGTCTCATGGAAACAAAACTGAATGAGGTGCATCCACCATTTATTCGCTATAAATAattccaccatttattccaccatttattcGCTATCCATGAATATAGTTTTTGTTACAGAACTATAACCTTCAAACTCCATCATCACTCACTCAAGTGTGAC--AAGATCTGAGGTCTTACCTCTGTTTGACAATTTTGTCCTAAAAC-CCCTCTTTAgtatacctatgtaacaaacctgcacgttatgcacatgtaccctagaacttaaagtataataataataaaaaaTAATAAATAAAAAAAGAAATAAAAGCTTGCTCATAAAATGTGTTATTTGCTTTATCTTTCTTATTAGGGAGTTCTATTTATACTAAAATCTAAATTGTTTATATCGTGATCATAGAGAACGGCAGATTCATTTAAAGTCATCCATAAATAATTCTTTGCTTAAGCAATGTATTGTAAAATAAACTACGC--AATTTCTAAATCTAA-TGTATTGAGCTTGACTTCAACTTTGCTGTTTGCTACTGTAACTTTCCCACATTTATGATATTTTTAAAATTACTTATTTTCCAATTTATGTATTTAAATATTTCAAAAACAAATCATTTAATGAGATAGATGAAGACATAGATCATGATGATAATGATGACGGCAGGTGAAAGGGAGAATGCTATTTGATGAATGTGATTCCAGTCTTG-ATTCTATGTACTGGAGTTCAGGGTAAT----GAACACTATTATTCTTCCTCATGGGCTTGTGATTCTTCTCTTATTCTCAGCATCAGGCCTAGACAAAT---TTCACATGGTACTTCATCAAGAATAATGTAAAACCAACATATTTTC-ATGATTTATTTGCTTTTTTTCTCTTTCACTACATTTTAAAAGTTGATAAGAAAAGTGACCTCCAACAATTAGGATTCTATTTTGGG-GATTTGGGGCATTTTTCAATACGAACATGGACACATACTGGTATGTAATAATACAGTGTATCAACTTTATTTCTCCTTTTAATAGCATCATTACCAAGCCAAATTCTTGCAAATGCTTTTTCCCA-TCTTAATTATGGTGACTAAATCTGGATTATTTTACTATATCAATCAAAGTAGCATTATATATGCACAAACATACTAAAAAATCATGCTACATATGTTTT-TACCTTAACAAATTTGCCTTTCTATGATTT---TTTTCTAATGCAGAGCCAAAAAACTTATAGTAACAAAATACTTTACCCAACACACCAGTGTACACAGGAATACTATTGTGAAATTAGAATGCTAACAATACAAACATAAATATTTCTTTTACAGACACattttaatatatttaatttcatatatttaatattCATCATACTGTACTTTATTGGAAATTC-TGACACACTTTCAGAAtttctgacactttcaaatgtgtgtcaaagtttctgacactttcaaatgtgtgtcataagtAATTAAATTGTAAATTACAA-AAAGGTGTCTATCAATCATAAATATTCAAATTTTGATGTTTCAAATTCATATTATCATTAAGAAGGTGGATTTACAGTTCCTGCCTATCTCTTCTTTTGTTTTAATTAATGTAATAAAAGTTTTGgaccaggtgtggtggctcacacctgtaatcctagcattttgggaggctgaggcaggtggattgcctgagcacaggagttcaagcccagcctgggcaacatggcaaaaccctgtctctacaaaaagtagaagaaaacatatcagggtgtggtggtgcacacctgttgtcctagttactcaggaggctaagatgggagaatcacttaagccaaggtggcggaggttgtattgagccaaaattgtgcttgtgcactccagcctgggcaacagaatgagaccctgt-tcaaaataaaaaaagaaaaGTTTTAAATTTTAACTTGGATTTCTCAGTACCATAATGCTGTATTCTCCTTGATTCAGCAAAAACTCTAATTACAATGGTATCTATGAGAATATGCTGTGTCATCCTTATTGTATACTTAGAAATGTACTTTATGTTTCTGCTTTTTTAACA-ttttttattgtggagcataacatacatatagagagtaataacacctcataaacagaaaaagaaaaaattataacgttaacatcggtgttaccacaacttcgtcag-aaatagaatttgccagcaatgcagataatcccaatatatgttttcttgatgatat----------tttcttccatcctgactatcccaattgttatgatgatcactc--atgtttcactgtcaagtttgatcaccaacgtaataaattgcaatgtattaaaaataagattttccaaactttatgtaaatgagattatagtaaatgtatttttccatcttgataattcctctcacatct----gtattaatatctatatagctccaatttgttcattttctttattgtattgttctgttgtaaacatgtcagtcttatttgttaattttgctcactgtatagtattccattgtataagatatgccacaatttgtttatccatttgtaggattgatagacatttggaggacttctcaactttagctattaaaactcagtgacatgcatgtgtatgtatatgtattctgataagagtgaaaatacttggtcttaggatgttatccttcttcttaatcagataacaccaggctcagccaaaatgatggcacagatttataattctaggagtaatgtatgaaaattcccattatgttaaatcctttccaaaataagtaatgtcagactAATATTTACAGTTTTGTATTTATATAAAATACTATTAAACAATATTTTCCAAGCCCTTTGCTATTCTCAATCAGGATGTATTTTTACTTCAAAAAATTAATTTTTTATTCTATGACTGTTATTTCATATACACTTATTAATAATACCTTATGTATTATTAGtacatatttattatacatacatataatatgtatacatacatataatatgtattattaatacatattattaatacatatatattaatacatatttatttatatTTCATTATAAATTTGTCTAAC--TTTTTTCCTCAA-TTTCAAATAATCTTTTGTTATAAGCAAGCGTAATTGCACTGGCGATACTTCCTTTAATCAATCATTACATCAAATGACTTTGAAAAAATATAATCAATTAACAGCATACTGTAAGGGAAATTTCAGGATTTTTTAACAACTCTTAAAAGGACTCAAAGAAAAAAATCTTGAAATACAAAAATAGTCTAAAAGTTTAATGTAGGCATCCATGGGAAAACACAAATATATTATTGTTGTTAGTGAAAAAATGATTGGTAGTAAATTTATCATATCTTAATTTTTTAAAAGGCAGGCCTGATATCACTGGTCAAGATTCCCTTTAAAGTCCAGATCTTAACTTCTATGTGTACCTGATTCCTGAATGTGCAGTAATGTTCTTGTT-CTTTTAAATTCTGTGACCAATGTCAAACAGGAAG-CATCTC-ATATGCTAATGGATGAAATTAATGCTGACTTTATGG-AAACATGATATTT a score=68900 s hg17.chr12_random 438174 902 + 466818 TCCAAAACAGCTCAAATTAACTCCTATTCAAACACAACATCCTTGCTGTAAGGTAAAATTTTCCATATTGATGTTGAAGTGAAAGCTGAATTCTCATATACTAGCATGCCAAGGAAGAG-TTTTTTAATTGTTCTGCAATTTTTTCCTTGTTTCACCTCTCCATAATTTGTTTTCAGCAACTTCAGTTGTTAGAGATATTTTACAACCCAATACATATATGACACATTGGTTGTATAGCCTGGTGAATGGAGCTTGAGGATAGCTAGGATCATCACCAAAGTAGATTTATTTTTTTTCAATGCCAGTAATATGTAGAGTGAATCCCAACTTTTCCTACCAAAAGCATTCAAGGTTTTCTTAGGAACCTCAAAAAGGCCAATAGTCCTTAAAACCTGGTTGCTACTAAGTAATACTTTTGTATAACTTATTGTTAACAAGCTCATTAatacaaacacactcacacacatacacacatactcacCCCTCATGAATAGGAGGAATTATTGTCCTATAATTTCCAAAATGGAAAATTAATTTTAGGGAGATCATCCAGGTGGAAATAGCCCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTTGACCCATTTTCAATATTTATCAAACTTACCACTCATGCTTGGGCCTTTCACTAAGTTATTCTCTTGAGTCTAGTTAATACTTAAATATTTATTGTTTAATTAAAATGCTCAGCAATTGTGTAACTATTGTGGGTCACTTGAAAAACACGTTTTCCATTGAAGAGTCTAGACTTCTTTCTATATGAATATTTGGTTTTGTTTTCCTCTGCTTAATTT--ATTTTT-----GATTACTTAATGGTTTAAGATGAATAGATGTT-AAAATCAGTCTCCAATCTTGGATTTTATTTATTTTTCATTTTTacagtataattgtttct s rheMac1.SCAFFOLD31009 40984 885 - 42162 TCCAAAACAGCTCAAATTAATTCCTATTCAAACACAATGTCCTTTCTGTAAG--AAAATTTTCCATTTTGATGTTGAAGTGAAAGCTGAATTCCCATCTACTAGCATGCCAAGGAAGAATTTTTTTAATTGTTCTGCAA-TTTTTCCTTGTTTAATGTCTCCATAATTTGTGCTCAGCAACTTCAGTTGTTAGAGGTATTTTACAACTCAATACATATATGACACATTGGTTGTATAGCCTGGTGAACGGAGCTTGAGGACACCTAGGATCATCACCAAAGTAGATTTATTTTTTTTCAACGCCAGTAATACATAGAGTGAAGCCCAACTTTTCCTACCGAAAGCATTCAAGGTTTTCTTAGGAACCTCAAAAAGGCCAATAGTCCTTAAAACCTGGTTGCTACTAAGTAATATTTTTGTATAACCTATT----------------------ATACATACACACACATACACACATACTCACCCCTCATGAATAGGAGGAATTATTGTCCTATAATTTCCAAAATGGAAAATTAACTTCAGGGAGATCATCCAGGTGGAAATAGACCTATTTTCCCATTTGGGCTTTTTGGTCCATTTTCAATATTTATAAAACTTACCGCTCATGCTTAGTCCTTTCACTAAGTTATTCTCTTGAGTCTAGTTAATACTTACATATTTATTGTTTAATTAAAATATGCAGTAATTATGTAACTATTGTGGGTCACTTGAAAAACACGTTTT-CATTGTAGAGTCTAGACTCCTTTGTATATGAATATTTGGTTTTATTTTTCTCTGTTTATTTTTGATTGTTTAATAGTTTACTCAATGGTTTAAGATGAATAGATGTTAAAAATCAGTCTCCAATCTTGGattttatttattttccatttttataatataattcttttt a score=17454 s hg17.chr12_random 439076 287 + 466818 aagagaggattttggagtcagactgccaagacaggaaaccagattttctgcttcatataggtatgctccagacagacctcattttacaactactctctgccttggtataatcatctgtaaaatacagatgataataatattctctttggatagtctttctgaggagttaatatactatttgtataactgcttTCAATTTTACCT-TCTGGTACAGGCAGGAATCAAGGATTATTAATTTTTCATATGATCATGTGTTACTTGATACATAAAAGATACCAGTGAGAACT s rheMac1.SCAFFOLD50632 30990 284 + 35419 aagaaaggatcttggagtcagactgccaggacaggaaatcaggttctctgcttcatataggtatgatctg---agaatctattttacaacaactatcagccttaggatagccatctgttaaatgcagatgataataataccctctttggatagtctttatgaagaGTTAGTACAC-ACTTGTATAACTAATTTCAATTTCACCTGTCTGGTTCAGACAGGAAACAAGGACTGCTAGTTTTTTATTTGATTCTATGTTACTTGATATGTAGAAGTTACGTGTGAAAACT a score=4616 s hg17.chr12_random 439363 140 + 466818 TCC-----------------------------------TTGTTTTGGGTGGAGGGAGGgagacagggtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggcttgattacagctcactgcagtctcaaacttttgggcccaagtg--------gtcctcccacctcaccttctggagtagctgg s rheMac1.SCAFFOLD85456 28460 174 - 81052 TCCATTTATTTTTTTCTTCttttcttttcttttcttttttttttttcct---------gagacaagctcttgatctctcacccaagctggagtgcagtggcacaatcatacctcactgtagtcttgaactcctggacacaagtgatactcttgctctcctgcctcagctttccaagtaactgg a score=13481 s hg17.chr12_random 439503 176 + 466818 gactacaggcatgcaccaaaacatccagataattttttttt-atttttttatagagacaaagagtctccctatgttgcccagtctggtcttcaactcatgtgctcaagtggtcccctcatcttggcctcccaaagtgcttggatacaggcatgaacaaccacacctggctGAGAACC s rheMac1.SCAFFOLD26339 2 173 + 9374 gactacaggcatgcacgaaaacacccatatatttttttttttatttttttgtaga----cagagtctccctatgttgcccagtcaggtcttcaactcctgtgctcaagtggtcccctcatcttggtctcccaaagtgcttggatacaggtatgaacaaccacacctggctGAGAACT a score=2698 s hg17.chr12_random 439679 67 + 466818 TCCATTTTTGAGCAGAACACACAAGGTTAAGAAAGGCATGACATCCGTCTCCAACAACTAGGATAAA s rheMac1.SCAFFOLD50632 31274 66 + 35419 TCCACTTTTGAATAGA-TATAGTAGGTTCCAGAAAGCAAGATGTCCTTCTGCAACAACAAGGATAAG a score=20947 s hg17.chr12_random 439749 446 + 466818 AACAAAAGGCCAAAATTATATTTTCAATTCATCACAGAGTTGTACAAGCAACGATGACCAGCTGAACTGAAATTCAGCACAAGGAGAGTCTTTATAGGTGAAAAGTCAACTTAtatatattcagtgcaatccctaccaaatcccagaagacttttttcacagaaattggaaaaccactcctaaaatatatctggaaatgccaagtgacaagatcacaaaaagaaattgttaaaaaataagaaatttggaggattatactttctgatttcaaagcttacttcaaagctgc----cctaatcaggattctatagaactcacattacagtagacaaaaagaacaatgaaacacaactgagagtccagaaactaacaccaacattcatggtcaattgctttcaaaaaaaggtactattgcaattcgaaaggaattaatcgtttttctcaacaaa s rheMac1.SCAFFOLD50632 31343 432 + 35419 AATAAAAGGCCAAAATTGTGTGTGT-ATTCATCAAAGAGCT-TGCAAGCAATAAGGACCATCTGAACTGAAATCCAGTACAAGAAGAGTCTTTATGTGTGAAGAG-CAATTTATaaa--------gcaatccttatcacatcacagaaagttttttctgcagaaaatgtaaaactactccaaaaatacacctggaaatgccaagtgattaggccaataaaataattttttaaaatac---aaatttggaggattag--tttctaatttcaaagtttactacaagtttgctggactaaatcaagacagtgtggtaactgcatcatgagagac-aaaagaacaatgaaacacaattgagagtccggaaattagtaatgacattcatggtcagctgatttttaaaatc-acaccattgcaattcaacaggaattaatcatttttctcaactaa a score=34496 s hg17.chr12_random 440195 405 + 466818 caatgcCAGGTAAAATTGaagaagactacctcaaggaatttaataatcaatttccctaaggtcaaggataaagaaaggattctaaagcagcaaaagaaaagaaacaaataatgtacaatggagctccactacatctggcagca---gacttctcagtggaaaaaggccaggagacagtggcatgacatattagaagtgctgaaggaaaaaacttttagcccagaatagtgttactggagaaaatattcttcaaacatgaaagag----aaagacttttccaaaccaacaaaagctgagggatttcataaacaccagatctgtcctataagaaatgttaaagggattacttcaatcagaaagaaaagggcattaatgagcaatatgtaatcacctaaagctataaaactcact s rheMac1.SCAFFOLD26339 694 411 + 9374 caatgctggg-aaaactgaagaagactacctcaaggaatttaataatcaatttccctaaggtcaaggataaagaaaggattctaaagcagcaaaagaaaagaaacaaataatgtacaatggagctccactacatctagcagcagtcgacttttcagtggaaaaaggccaggagacagtggtatgacatattagaagtgctgaaggaaaaaacttttagcccagaatagtgttactggagaaaatattcttcaaacatgaaagagaaataaagacttttccaaaccaacaaaagctaagggatttcatcaacaccagatctgtcctataagaaacgttaaaaggattacttcaatccgaaagaaaagggcattaacgagcaatatggaatcacctgaagctatgaaactcact a score=51437 s hg17.chr12_random 440772 665 + 466818 aaactgagaagatggtgttaaggtgtagagtcttcatttgtttagtgtttgtgcttgtttgtttgcttatgcaaacagtgctaagttgctatcagcttgaaataatgggttacaagatagtatttgcaagcctcatagtaatcgcaaatcaaaaaacataatacaatggatacacacaaaaaaataaaaagcaagaaactatatcatatcaccagagaaaataaccttcactaaagaaagataggaaggaaagaaagaagagcagaccacaacataaccagaaaacagataacaaaatggcagaagtaagtccttactaccaataataacattgaatgtaaatggactaaactctccaatcaaaaggcatagtctag--------------------------ctaatcagttgcctataagaaacacaattcgcctatacagacatgcacagatagaaaataaagggatggaaaaagacactccatggcaatggaagccaaaaaaagaggaatagctatactaatattagacaaaatagatttcaagacaaaaactatgaagtgacaaagaaggtcaacat----------------------atggaaaggatataacaattgtaaatatatatgcactcaacactggagctcccaggtatataagtcaaatatgattagaGCAAATACTGTAATAGATGGAGATGACAAC s rheMac1.SCAFFOLD26339 1155 708 + 9374 aaactgag-agatggtgttaaggtgtagagtcttcatctgtttagtttttgtgctagtttgtttgcttatgcaaacagtgataagttgtaatcagcttgaaataatgggttacaagatagtatttgcaagcctcatggtaatcacaaatcaaaaaacataatacaatggat--acacaaaaaaataaaaagcaagaagctatatcatatcaccagagaaaataaccttcact-aagaaagataggaaggaaagaaagaagagcagaccacaacataaccagaaaacaaataacaaaatatcagaagtaagtccttactaccaataataacattgaatgtaaatggactaaactctccaagcaaaaggtatacgctagctaattgggaaaaaaaaaaaaaatcactaatcagttacctataagaaacacaattcacctatacagacacgcaaagatagaaaataaagggatgg-aaaagatatttcatggcaatggaaaccaaagaaaaaggagtagctatactaatattagacaaaatagatttcaagaaaaaacctatgaagagacaaagaaggtcaacatacaatgataaatgtgtcaattcatcaaaaggatataacaattgtaaagatatattcactcaacactggagctcccaggtatataaatcaaatatgattagagcaaatattataatagatggagacattaac a score=3656 s hg17.chr12_random 448650 126 + 466818 TGAGTGCAGCCTGACTGCATTTCCCCTCAGTCATTAAGCCTGATACTACCCACCTCTCTTTTCCTGTCTTGGGATTTACCTGCAGCAGCTGAAGTGTGAGAACCTGCAAGAGTCTGTCAACATCCA s rheMac1.SCAFFOLD60085 75027 117 + 201758 TGAGTGCAACCCAATGGTGCCTC-------TTGTCATGCTTGA--CCATCCACCTTTCCCTCCTTGTCTTGAACTTTCTCTGCAGCCCTTAAGGAGTGAAACTCTGCAAGACTCGCTCTGCCCCCA a score=8956 s hg17.chr12_random 449504 107 + 466818 tTTTTCATGATGGTAGCCAGATCTAAAATTTTATAATATAGCAATAATACATAGGTATTATTTTTACAGTCGGGTGTTTAGATTTTTAAATAACTTAATGTTTTTCT s rheMac1.SCAFFOLD149119 78 106 + 893 TTTATCATGATGGTAGCCAGATCTAAAATTTTATAATATAGCAATAATACATAGGTATTATTTTTACAAT-GGGTGTTTAGATTTTTAAATAACTTAATAtttttct a score=5262 s hg17.chr12_random 450073 357 + 466818 TTTATTTTTGTTT-TATCACTTATCTGTACTATATTTTAGTTTTAACTATTCTCCACTTTT----------------------ATGTTTATTGACAT----CTATGGTTAAGAAAGTTCAGCTTGGGAGATG------------------ACAGTAGATTGGATTTTTAGCCCCAATTATTTATTCCCTT-TAATAGTATTAC----TCACAGCCTTTG-CATGTAACTTTGCTGTGCTCTCCCACTGTGGGCAAAGTATAATTTCCATGCCCATTAATGTTGTACTTGTCT--GTGAATTGCTTTAG-------AATATTAGCACAATGTATATGAGCAGAGATCTTAAAAATGCATTATCAGTTTGTCTGGGCCTTCTTGTATTTTGATGA-TCACCATG---AGAATA-GCCACAGCTA s rheMac1.SCAFFOLD85066 104297 416 - 177132 tttattctcatttctaccacatatttg--ctgcattataattttgagtaCCTACCATTATTTTTTTTTAAAAGATGAGTGAGAATATTTAGTAATATATAACTAAAGCATAGAAA---TACTTTGGGATGTCTAAAGAAAAGAAAGATCCATAGGAATATGGATTATTGACTCTAAGTCTTCCCTTCTTCATAATGGGATTATACATTTATGCTGTTTGACATATAACTTTATAGTGTTCTCCCATTGTGGGGGAACAATACTTCCCCCACTCATTTATATTGGGCAATACTAAGCAACTTGTTTTGGTCAATAAAATGTTAGCATATGGGCAATGAGAAAAATCCTTAAATATGCTAGCATAGTTTGACTTGG-CTTCTTGTATTCTTTTCCTTCACCATGACAAGAATATGCCATAGATA a score=6259 s hg17.chr12_random 453437 130 + 466818 CATTGAATTTGATACTCAGACTCTCTTCACAGACAATGAAAAGGTTAAATAATAATTAAACTAAATTTAATCTTTtcaccttcacc-ccagtctatatgtt---attggcatacattttattcattacctcttt s rheMac1.SCAFFOLD85456 20661 134 - 81052 CATTAAATGTGGTGTTCAAATTCTCCTCATAGACATAGAAAAGTACAAACAATAATTTAACTAAATTTGTTCCTGTCACCTTTACCTCCAGTCTCTTTGTTGCTATTTGCATATATCTTATCAATTACATATTT a score=7607 s hg17.chr12_random 453636 167 + 466818 ttttcattccttcttgcatcttcaactttgtattttcagtaactttt-ttctatctgaaaatgtatccttttgaatttctgtttatgaaatgtctgCTACTCCTTTGAaacacactgaaaatat-attacattgaattctagcttccatgctttctgctgaaa----atcact s rheMac1.SCAFFOLD85456 63349 171 - 81052 tttttattgctcattgcatgttgaactttgtattttcagtaatttttgttgtatcagaaaa-atagcattttcaatttctgtttatgaag-gtctACTACTCTTTGGAAATGCACAGAAGACATGATTCCTTTGAATTCCTGCTTCCATATTTTCTGTTAAAATCAGGTCAGG a score=9526 s hg17.chr12_random 453803 205 + 466818 tgtcattcaaacagttgatcctttcaacataatctatcttttttctcaggctacttttcaaattttctattggtctttggtttcctgtagcatttatatgttaatttgttttcagttatcttgtctgaggtttgttggtttctcgaatgtatggattgatacattttattatttttggaaaggtctcagcaacattacttcttcc s rheMac1.SCAFFOLD31009 8 194 - 42162 TGTCATTTAGACAGT--ATTCCTTTAATGTAATCTATCTCTCCTCT--AGTTACTTTTCAGATTT-CTATTGGTATTTGATGTCCCGT--CATTT-TATGTCAATTTGGTTTTAGTTACCTTGTCTGAAGCTTGATGGTTCCTAAAATATATGAACTGATACTTTTTGTCACTTTTTAAAAAATCTCC---ACattgcttctgcc a score=10736 s hg17.chr12_random 454008 425 + 466818 ctacattctctcttctaatcttccagaactccaaaagtatgttaagcctttctgactgtagcctcaatgctcttcccctttagcctgtatttttccatctctttgtctaattatgcttcactctgtgtagttatcttccaattcactaattctttattctaccatttctaactgattgttaaatctaATTGATTGTTAAATATTGAATTCTTAATAT-------TAATTTTTTCAGTC--ATTATTTTGGTGGTAGAAAGAAACTTTCACTCTATTTCTGTAAGTTATTT-CTATGGA-----TAAATAAAATACTCATAATACCAAATTCTTAAAGATTTTTTAAAAACTTTTAGTAAACTTGACAAGAAAATACCAATAATTCTCTTCTTTTACCCACACTTTGGTCAAAGAAAACACCAAttttttttttttttttt s rheMac1.SCAFFOLD85601 25496 354 - 44828 CTatgttctctcctctaatcttacagaactccagaagtatgttatatatt-ctgactgtagcatgaatg---ttaccctctagtcttatgttttccatctctttctct--ctattcttcgttctttgtagctatcttccaattcactaattatctcttctactccatctaactgatt---aactctgtcta------------tagattcttaatATGGATAATTCATTATTTTAGTCTTACTCTTTTAGTGTTCAGAATAATCTTTTATTCTCTTTCCATAAATTATTTTCTACAGGGAAACTGAACAAACTAATCTTAACACCGTGTTCTT--------TTTAAATGTGTTT-------TTGAT-----------------------------------TTTTGG---------------GTTTTTTCTTTTTTGTTT a score=-499 s hg17.chr12_random 454439 88 + 466818 aggcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggcgcgatcttggctcactgcaagctctgcctcccgggttcacaccagtctcctg s rheMac1.SCAFFOLD31009 638 59 - 42162 AGGCATTCTCCTGCAACT----TGGA----AGAAACTCGAAATTGATTTCATGTTAGT---------------------AGttttttg a score=23833 s hg17.chr12_random 454578 955 + 466818 taatttttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatctgcctgccgcagcctcccaaagtgctgggattacCCACACTTTGGTCA-AGAATAGAATAAAAGCGTGAGTCTAATCATTCTTAACCAAGTTGAAAAGAACTAAAAATAAATTTGATGCAAGTAGCAGCTTCT-----------------------------------CTGTTGCTGCATCTTCACCACAGACTCTTATTACATGAAAATTCAAGGAGCAGAACTTGATCTCAAAATGCCATTACCATAAATAAAAGATAATACATCAATCACAGCAACACCATCTTATAACATGGCTTAATATTTAAGTAGTCCTTTTACTCTCCTTACACTGTTAGACATGGGGCTTTGTGTCTTACAAGTCCATCATCAAGAGAGTATGATATTGAAGATGTGAGGGCTTATTTCTGTTTGGTTCATTGACTTTTAAAGCCTCTCTTTTGAAATAAGAGTTTAATTATAAAATGGTTTATTGACTTTATCTCTCTTATTATACAAATGCTATTTACACTAAAAACTAAATATTTCTGGTAGTTAGCCTCTGATGAGTTTAAGATTATTTATAAATCATTTGTTCAAGCAATGCATTTTAAGTAAAAATACACTCAACT-TCTAACTCTAAATGTATTAAGTTTCACATAAGCTTTGCTCTTTAATAATGCAACTTACCCACAATAATAATCTTTAGGAAATTACCTAGACATTCTCCAAATCGTGCATGTAAACATTTAAAAAACAAATAGTTAAATGAAATATAtgatgatgatagtggtggtggtggtgatgatgatATTAATAGCTAAATGAGAGAACCCTACCTGATAAATGTGATAGATGTGACCTCACTCTAATTTCCTGAATGGAAGAGTTCATTTTGTCTGGAGAAAACAACAATTCTTCCCTATGGCCTTAT s rheMac1.SCAFFOLD85601 25850 874 - 44828 TAGTATGTTAGTAATTAAAATAGTAA---------------------------------------------------------------------CAAATTTCTTCTTTTCCCAACACTTTGTTCAGAGAATAGAATAGAAGCTTCA-TCTTGGAATTTACCTTCAATTTGAAAGAAACTGGAAATTAAGTTGATGTTAGTAGTTTTTTTTGGGATAGTAGTTTGTCTGTTGTTTAATGTAGGTGTCTGTTGCTAGGTCCACACCACAAAATCTCCTCCCAAGGAAACTCAATGAGCAGCACTCCATCTGAAAATATCACTGCAATAGATAAATTATAGTTCATCAACCACAGCTACATCATTGTATTCCAGGAATTAAT-------------TTTCACTTTGCTTATGTTG-TAAAAATGGGACTCTGTGCTTTTGAACTCCAGCATTACCTAGATGCAATAGAGAAGATGT--GGACTTACATCT-TTTATTTATTTAGCCCCAAAATCCTATCTTTAGAAACAAGAGCTTGATCATGAAATTGTTTA-----TTTATTTTTCTTATTAAGC-AATTTTATTTATACTAAAATCAAAATCTTTTT-ATACTGTTCCGGTGATTGGTTTAATATCATCTAT-AATTGTTTTCTTAAGCAATGTGTTTTAAACTACACTACACTTAACTCTCTAAATCTAAATGTATTCAGCTTGACTTGAACCTTGCTGTTTACTAATGTAACTTTCCCACAGTGATGTCCCTTA-GAAATTACATAGACTTTGCCCAAATTATATATGTAAACATTTCCAATATAAATTATTTAATAAGATAGATGTAACTGTAGATGATGATAATAATCATGATGATGT---CAGCTAAAAGGGAGAATGTTGTTTAATAAATGTGTC-------------------TTTTCAAAGTACTAGAGTTAAGGGTGGTGGGAGAATACTATTATTCTTTCTCATGGATTTAT a score=8542 s hg17.chr12_random 455533 256 + 466818 CATTCTTACACCATTCTCTGCATCAGGGCTTAACCTGGAAGAATATTTTCACCTACTACTTCATGAAGACTAATATAAAACCAACATACTTCCCATGATTTACCAGCTAT--TTTTTCCCTTTATTCCATTTTTAAATATTATGGTAAAAGTTACCTCAAAC-AACAGTGCTGGGTTTTT-------------------TTTC--TTTCATATGGACATATCCATTTCCTCTAT----TAAAATAATACATGATCTTCATTTCATATTTTAGTAACATCATTTG s rheMac1.SCAFFOLD85601 27040 277 - 44828 AATTCTTATATTATTCTCAGCATCAGG------CCTAGACAAATATCTTCACATAGTATTTCATCAGAAATAACATAAAACCAACATATTTCCAATGTTGTTCTTGCTATTATTTTTTCTTTTACCACA-TTCCAAAAATTATAGTAAAAGTGACCTCCAGCAAATAATACTATTTTTTTGGGGGGCTGTTTAACTTTGTTCCAGTTTCATATTAACTTACACAAATACTCTGTGCAATTAGAGAGTGAATAAGCTTCATTTCATCTTTTAATAGCGTCATTAA a score=5845 s hg17.chr12_random 455789 176 + 466818 CAAGCAAAATTCTCTTAACTGCTTCATTACATTCCCAGCTACTGTGATTACATCTGGGTTATTTTATTACAGTAGTCAAAGTAGCACTACACATCCACAAACATATCCAAGCATTACACTG-ATATATATTATGCTTTATCAAACTTACTTAATTATACTTAACATTTTATAATTTT s rheMac1.SCAFFOLD85601 27635 146 - 44828 CAAGTGACATTCTCTCTACTGCTTATTTACATTCTCAGCTACTGTCACAAAATCTGGGTGATTTTATTATAGCAGTCAAAGTGG-----------------------------TTACACTACATACATTTTATGCCTTAACAAAATT--TTCTTTCTACTAATTCTTTTCTAATATT a score=-332 s hg17.chr12_random 455965 314 + 466818 TTCCCTACTGTATTTATAATTTTTTGTTCAAAAAATTACATTACACTTTTTTCTGTGATT---TTATATATATTTATTCATAT-TGCCTTGTATATCATATGTGCATTTATTTATATTCCATTATAAATGTTTATCTTTTTCTCCAAGTCTCACATACTCTATTGTTACTAGCAGGCATTATTATAGTAGAGACATT--TCCTTGAAT-----CAGACAT-------TATGTCCGGCAACTTTGAGAAAATATGGTTAGTGAATATTTTAA----------GGAAAATTT-CAGAATTATTTAACAACACTTAAAAGGACTCCAAAAAAG---AAATT---GTTAAATA s rheMac1.SCAFFOLD50632 10068 335 + 35419 TTATGTACTTTATCTACCAGATTGAGAT-GTAAGGTTA-AGCAGTCTATTTTTAGTAACTGTGTCACATACATACATACACATGTATCTTATACCTTATAGGTTT-TTCATTTAAAAATCTCAAAAAACATTAAT-GATTGATACAAAACCTATATTATCTGTTTGTATAAGAA---CTCTTTATAGTATTCACATTCTTCTCTGTATGGTAATATACATACTTTCATATATCC--TAATTTGTGATATGTTTGGATGGTGTTGATTCCAAACATACCTTTGTAAAATTCACAAAGTTATACA-CAA----TGAAAGAATCTTGAGGAAGTATAAATTTACATAATATA a score=23655 s hg17.chr12_random 456279 944 + 466818 TAAAATTAACTTATGAGGTCTTCTATTATTTCTTTCATAGATGCAGAAAGTTAAATTTT-----------GTCTATGAAGTTAAAGGTTTTGCTTTTTTCAGAGAGAATTTAAGATGCCACAGTAGTCTCAAGGAGCTCTGTCTTAGCTTGTTGTTTCCCAAAATTATAATAAATGAGTGGCCTGAGGGAAAGGCAAGTAAAATCATCATAATAAACATCATGACCTGATAATTCTCTACCTCAAGGAAGATCCAATCTCCTATTAAAGTGGAAATAAAGTTAATAATAAAAAGGAGGAGGAAGGCTATCACCATTTTCATGGCCCTTTTATGGGCCTCTGTGCTGGAGTCCCTTGAGCCCAGAGAGTTGAGCTGCAAATTCTTGGTGTGTCTCACTAAGGATATAAATAAAAGGAGCAAAGAGGTCAGAGTCAGA-AGAAAGGGAATAACGTATGTCAAGCTGAGAAGCCTAAGGCCTTGAAGATAGACTATT-----TTACTTGTATCTGAGTGCAAAGTCATGTTTTTTT---------------CACAACTCACTAA--TGGCATTGGACATA---------AAAAGGTAAACAAAC---GATAAGAACAAAGACCGCAGGAAAAGCACAAGAACCACTCTGTTCATTCTCCACTTCAGCCAGGCAAAAAAATAAGTGGGAGAAATTGGCTATCTTAAGCAAGTAGAAAATGCTTAGGCAGGTGGCAAACTAGATACTTAACTGATTAATTAATGCCCAAAGAATAGTAAACAGTTTTACTAGTTTACGGATGGTATATAGATGAGGGGACAATACCATTATAAATGAATCAAATAGTATTAAATACAGTCGAATGATTCTGACTATAGCCAAGCTGGTGAGGATGAAATCAGCTGATGAGACCTTCCAACTCTTGGCCCACTCAATGCAGTTTACCAGTCCAATGAGCCCGTTTCCCAGCATTCCTAAGACAAGTCCTCTTGTTG s rheMac1.SCAFFOLD110213 4752 973 - 136334 TGAAGTTAATTTAGAAA----CATCTTATCTTTGTCCTAGA-----AAAGCTTAGTTTTTTTTCAGATTTGTTTATGTTGTTGGAATTTTCTTCCTTTTAGAATAGACATTACTGT-CCAAAGCACCTTTAGAGATGCACGTCTTAATTTACTGTTCCCCAGTATTAGGATAAATGAATGGCTTGAGGGGTAGATTAGAGCTATGAACTCACCAAAAATCACAGCTAATTCCGTCTCTGGAATAAAGTAGCTGGAGGTGGCGATGAGAAAGGACAAATAGTAGGCAATAAAGAGGAGAAGGAAGGAAATGACAGCTTTCAGGGCTCTCACGTGGGCTTCTGTGCTGGGGTCTCTGCACCCTGTGGCACTGAGCTGCATTCGCCTGATATGTCTCCACAGGGAGAGGATCAAGAGGAAAAATGACATCAGGCACACAGAAAAAGGGAGCAGCGT-TACCAGGTTGAGAAA--TAA---CTTGGTAGAAGCATGTTGAGCTTTAGTTACTCTGCAACTCCAAGTTAAGTTTGTTTTCCTCTTTGCCTTCACACAACGCCTGAAATCAGCATTCAAATTCTCAGTGGCTGGAAGGTTAATAAACACAGAGAGAACCATGCATCCCAGTAGAATCCAGGAAATCACCCTGTCAATTCTCCACTTCATCCAGA-GGAAAAGTGGGTGAAAGAAATTAGCTATCTTGAAGAAATAGTAAATGCTGAGGCAGGTTGCAAACCAGATACTTAAATGGTTGGTTAGTGTCCAGAAGAAGTCAATGATTCTCATTTGTTTACCAGTGGCATAGACATCTGGATACAGCACCAACATAAAACAATCTAATAATATTACACATAATAGACAAATTCTGGAAATGGCCAGACTTGTGAGGATTAAATCAATGGAGGCAATTTTCCTCTTCTTGACCCAGTCCATGCAGTTTACCAATCCAATGAACGCATTCCCTAAGATCCCCACTGAAAACTCTCCAATTG a score=-212 s hg17.chr12_random 457223 162 + 466818 CCACCACCAGAAAGA--AAATATTAATTCCAACGAACAT----TTCTATGAAAATATTTCCGATATTCTACTTCACTGACA-------GCTTTATAGTCAAACAGTTGCAGA--------TGGGCATG-CATTTA-----TGATG-------CTTTCTATCTATGTTTTCATCACAATTTCAGAAGGCATAGCCAA s rheMac1.SCAFFOLD110213 13231 192 - 136334 CCAGCAATTAAAATAATATATATTGCCTCTATTGTACTTGGCATACCA-GCAGAGACTTCTGATTTTGAATATCACTGATGATGAATTGACTTTCAGCTGACCAG-TGAAGAACAATGTCTCGGTATACCACTTAGACCGTGATATAATTGTCTTTCTCTTTCCTTTTTGTTGGCGGATGAAGAAG--ATAGCCAG a score=-1166 s hg17.chr12_random 457456 176 + 466818 AACCAAATTGTTAAGAGATACAAA--------------GCTTCATGAAT-------ACCTTTCTTACCACTTTCAGTCAGCTACTATATAATTTCTA-------------------GAACAAACACT---AATGATGTCTATTTATCTTCAGCATCAGCCACAATTT-----------------TCCATTCATGGTAATG-------------------ACTAAAGAAGCGAAGTCGAGTATGTAAACATGCAAA s rheMac1.SCAFFOLD110213 13498 247 - 136334 GACAGAAGGGCTCTAGGATGCAAATGGGAATGGATCTGGTTTCTTAAATTTGCACAATCTTTCTTATT--------TTAACCTCTGTATATTTTGGATTTATCAATCAGAGCTGTTGACCAGGAACTTCAAGAGGTATCAATTGCTTGGAAAATACGGCTAGAATTTAATTTGCTGGCCGACTATCCACCCTTGTTAGTATATTGGCATAGCTATCGCTATTACAGATTCTAGGTTTAATGTGTTAGCTTGTGTA a score=17931 s hg17.chr12_random 457797 554 + 466818 TTGATGCAATATGATTTATAGAAATAAGTTCCTAAAATTATTCATAGTTCAAGAATTTCACCCAAGTCCTAAAACTATTAATATAAATAATTTGTATGCAATGTTACAGGAGCTAAACAGAATAAACAAAATATACCAGAATTAAAGACGAGGAAGATACAAATGCTTCAGTGAAGAATTGACTATAGTTCTCTGAGGTTAGGGACATTCAGTTTGAACTGGAATTtttgtttgtttgt-----ttgtttgtttgtttgagacagagtgagactccatcacacaggctgtactgcagtggcacaatctcagctcactgcaacctccgcctcccaggttcaagcgatccttctgcctcagcctcccgagtagctgggactataggcgagcaccaccacgcccagctgatttttgta---ttttcagtagagacggggtttcaccatattggccaggcaggctggtctcaaactcctgacctcgtgatcctcctgcctcagcctccaaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccacgcctggccCTG------GAATTCTTTAGAAT s rheMac1.SCAFFOLD110213 13944 487 - 136334 tccattcactagggcattgagaaatacattattgaggtaattcccagt-----------------atcctcaaa--------------aagctg--tgcagtgttgtct--tctcaacagaaggtaca-------------------acgagggaaatAAACATG----------AAATTG--TAGAGTTGTC---AGTAAACGGGACACAG--------AAAATTCTGGTTTAGATGTTAGGGtttcttttttttttgagacggagtcttactctgtcgcccaggctggagtgcagtggccggatctcagctcactgcaagctccgcctcccgggtttacgccattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacagacgcccgccaccttgcccggctagtttttttgtattttttagtagagacggcgtttcaccgtgttagc----caggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccgcccgtctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcttgagccaccgcgcccggccCTGATGTTAGGGTTTCTTAGAGT a score=7738 s hg17.chr12_random 458606 795 + 466818 tgtaatgtgagtggaaattatgtgcactatttccaggcccgtcccataaaaatttgccatgcatcctcctccatgcaccttttctgctcctggctgcctggaataaggtgaccccaag-gcaatcttggaagc--tgtgttaaaggtcaccaagtgatcagcctattttagtgaataactacatagggaagg------------------------------------------ttactcagacatatcagtaccatta---aaagaacaaaattaaatcatattgttcgaaacgttttacattttggagctatttg-tgatgcagttTGTCTACCCAGTCTAACACAGAAATTGGA-ACTGAAAGTGGGAGAATTTGTTTAGAGGATTTGGACAGTGA----AGGAACAGATCTTGGAGACTGGCAACACGATGGCACATGTGGTGTATAAGCAAACTTTTTAAAAACATTAT--ATGCAATAACTTAGAAGAAGGCCATGTTTAATGAGTCTCTGGC---CCTAGGGGAAGTGGTTGATGAAAGTCAAAACGG---TGTGCCAGGGTTGTTCTCCAAAATATTT-TAGCAAGATATTATGAGAA----GATGAGAAAGGAAAAGAATTGACTGGTTTGCAAATAAGAATTAAGAGCAAGAGAGAGTTCAGAAATCT--AAGGTTTCAGAGGGGTATAAAATCTCACAGGTTTGGGGTATCAAACAGCAATAAGTGAGACTGAAAAAAAAATTAAGAGGCC---CATTAAGACTTTTCAATTAAACATAGA---------------GACCA-TTGTTTCGAATGCCTTCAAGATAACTGCCACCAAAGTGAAAGAAAGAGGCCTGGGATAAGTAAGGGAAAA s rheMac1.SCAFFOLD19367 4725 827 + 7900 tggaatgggaagagaagtgatgtgaaccatttc-atgccttaccaatgaaaa----------------cttcttgctgtttttcttctc-tggatgactggga--gggtcatgctgggagcctccttggaaaccatgtgttgaagat---------ggcagcctgagtctttcagtaaccatgtggagctgagtcccctcttccccaaccctgctcctacagattttgaacattttacttagatgtctctgaactgttaggtaaattgcaaaaaaaatttctattgtgtgtaaactattacattttggatctgtttaataaactagctta---acttaccctaattTAGAAATCCAACACCTAAAACATAGGGATTGGCttagtagatgcaaagcaggaggttaggaactgatatcattgactga-aagacggagcctcttcctatgccatggcaaaatatttggtaaaactgttgctgtggtaacttgacaagcagacacaattcttatggtactggtacttctagggaaggtagatggaatgagccagaatgtaactgtgagttggctg--ctgctggctgtttgtggctaggtatgttcaaaaaagagatgagctcacaccagaatctactggtttgcaagcaa-----aggaagggaatagagtccaggggacttaaagatttc---------taaaagccaactgcttcAGT-------ACTGTAATAGCCGAGACAAGACTTGTAGCTCAGAGGACTGTCACTGAGACATTTCAGTCAGGCAAAGATCTTCTTTCAATCATGCCCAATTGTTTCAGATAGTTTCAAGACAACTGACACTAAATTGAGAAAAGAGGGTTTGGGGCAGGAAAGAAAAGA a score=169683 s hg17.chr12_random 463617 2149 + 466818 ACAACAA-GAAAAACTGCCTAAAATCAGTGAAGGATCCTGGCTGAAAGCCGGTTTT-CTCCCCCTCCTCCAGTAGCAACAGATGGCTTTCACCCAGTGTCAGCATGGGAGTCCAAGTCAGGCAATCTTCCTGCCCCTCCTTGAGTGTCAGTCAATCAATGTCTTGTATCAGTGGAGGGTCTTGATATCATCAGGTTAACTGCCCCCTTCCTGCAGCAAATGGGTTTTTCCTGGTGTTCATGCAGAGTCCAGGATTGGTGGGTTTTCTGCCTTCCTTCACTGGCAGATCCTTTCTGTTTAGCCAGCATGCAGCCCAGAGCAAGTGAGTTTCCTGGACTTCCCCTGTGACAACAGACTTCTAATATGTATTAATACAGACCTAGGAGTGCAGGCAGGTTTCTTACCCCACTCCTTGTGCCAATCAGCTATTGCCCAATATCAGAGTAGGGTCCAGGTTACAGTGTATTCCCTGCCCCTCACTCAGCAGCAGGCAGATTTTGCATAATAAAGATCCAGAACATGTGTAGTTTTCTTGCCTGTCCCCTAGCACTGGCCAACAACCACCTTTTACTCATGCAGGGTCCAGTGTAAATGGGCTTCTCCAGTTTCTATTACTCCACTTTAAAACTTAAGAAGATTTTGTTCCCATTtgttttagatttgcactgctgctaaaacaaattatcataaatttagtggcttaaatactacaaaattatcttaacagttctacagatcagaagtctggtatttgtcttactaagctaaaatcaaggtgtcagcaaggctgcattgctttctggaggctctaggaaggaatccatttccttgccattcccagcttctagaaactacctgcagaccttggtttggggactccttcatcttcaaagtcagaagtgttgcatctctctaaccctagttaagaaataatctgtttttaagggctcatatgattagactgaacccacctaaataatatgggataatctcccatctcaaggtgcataccaataatcacatttgcaaaatctccatgccatataatgtaacatattaactagttccaaagattaagtcatagacatctttgggaaagccattattctgcctcctataCCGtgtaccataaaggaactttcctaggtttcctg-tctgtcctcaacctttccagtaagcattcggtagaagcccaaggggaaaagctggcaattacagaccactcctgtgtctggggctcccaggtattctaaactgtcacattaaactacactcaacctttgtaagaatttgttaaaatttcagccattttcttgttacctactgaaatgccagagaactcttctggagttctgccacagatgaaataaattcatgtctcctatttggaaaggcttgtaattt-----------ttttttttttttttgatatggagtctcgctctgtcacccaggctggagtgcagtggccccatctcggctcactgcaagctccgcctcctgggttcacaccattctcctgcctcagcctcccgagtaggtgggactacaggcgcctgccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagagacggggtttcaccatgttagccaggatggcccagatctcctgacctcgggatccacccacctcggcctcccaaagtgctaaaattcagtttacctgctcaccttgtaacttcagttctaacaagctcaaaataaattatgactttgtagcctacctagtttactctctttgttagagcagaagcaacattctcttttggtctactgctaactaaaaggaagtaaaattCTCAAGCTGGTTTTCAAAATGCATGCATAAATGCATGCTATATCATATTCTTCCACATGCATGGTTTACAAATGTCTCAATT-AAAAAATAGATTCATGTATAGGTGATTTTTTATGCACCTATGAAATCTGGCCTTGTAATGAAGAATACAATAGATCTTAATAATCTGACAATTATTAAGTGTGTTTCATTGTCTAAAAGAGAGGTTTGAGGGGAGAAAAAGAAAAGTTT--CTTGAAATATGGAAATAAGAGTATATATTTAGCTCTGAGTATGTTCTGGTAAGAATTACAATGACGTCAAACTATATGTACATATTAAAGCCATGGCaaaaaa s rheMac1.SCAFFOLD125516 2 2154 + 48937 ACAACAAAGAAAAACTGCCTAAAACTAGTGCAGGATCCTG--TTCAAGCTGTTTTTTCTTCCCTTCCTCCAGTGGCAATAGATGGCTTTCCCCCGGGGTCAGCATGGGAGTCCAAGGCAGGCAACCTTCCTGCCCCTCCCTGAGTGTCAGTTAATCAATGCCTTGTATCACTGGAGGGTCTTGATATCATCAGATTAACTGCCCCCTTCCTGCAGCAAATGGCTTTTTCCTGGTGTTCATGCAGAGTTCAGGGTTGGTGGGTTTTCTGCCCTCCCTCAGTGGCAGATCCTTTCCATTTAGCCAGCATGCAGTCCAGAGCAAGTGAGTTTCCCGGACTTCCCCTGTGGCAACAGATCTCTAACAAGTATCAATGCAGACCCAGGAGTGCAGGGAGGTTTCCTACCCCACCCCCGGTGCCAATCAGCTATTGCCCAATACCAGAGTAGGGTCTAAGCTACagtggatgccctgcccctcactcagcagcaggcagattttgcttaataaagatccagaacatgtgtagttttcttgcctgtcccctagcactggccaacaaccaccttttactcaggcaagttccagtgtaaatgggcttctccagtttcTATTACTCCTCCTTAAAACTTAAGAAGACTTTGTTCCCATTtgttttagatttgcactgctgctgaaacaaagtatcataaatttagtggcttaaatgctacaaaattatcttaacagttctgtagatca-aagtctgatatatgtcttactaagctaaaatccaggtatcagcaagcctgcattgctttctggaggctctagggaggaatccatttccttgccattcccagcttctagaaactacctgcagaccttagtttggggcctccttcatcttcaaagtcagaagtgttgcatctctctaaccctaattaagaaataatctgtttttaaggactgatataattagactgaacccacctaaataatacaggataatctcccatctcagggtgcataccaaaaatcacatttgcaaagtccccatgccgtgtaatgtaacatattaactagttccaaagattaagtcatagacatctttggaaaagccattattctatctcctataCCAtgtaccataaaggagctttcccaggtttcctgctctgtcctcaacctttccagtaagcattcggtagaagcccaagggaaaaagctggcaattactgatcactcctgtgtctggggctcccaggtactctaaactgttacattaaactacactcaacctttgtaagaactggttaaaatttcagccattttcttgttacctatcgacatgtcagagaactcttgtggagttctgtcacagatgaaac-aatttgtgtctcctatttgcaaaggcttttttttttgtttgttttgttttttttttttttgagatagagtcttgctctgtctaccagactggaatgcagtggtgcgatctcagctcactgcaagctccacctcctgggttcatgccattctcctgcctcagcctcctgagtggctgggactacaggcgcccaccaccatgcccagctaatttttcatacttttaat--agagacagggtttcaccatgttagctaggatggtctagatctcctgacctcatgatcttcccgcctcggcctcccaaaatgctaaaattcagtttacctgctcaccttgtaacttcagttctaacaagctcaaaataaattacgactttgtagcctacctagtttactccccttgttagagcagaagcaacattttcttttggttttctaccttctaaaaggaagcagaattCTCGAGATGCTTTTCAAAATGCATGCATAAATGCATGCTGTATCATATTCTTCCACATGCATGGTTTATAAATGTCTCAATTAAAAAAATAGATTCACATATAGGTGATTTTTCATGCAACCTC----TCTGGCCTTGTAATGAAGAATACAATAGATCTTAATAATCTGACAATTATTAAGTGTGTTTCATTGTTTAAAAGAGAGG--TGGGGGAGGAAAAAGAAAAGTCTTGCTTGAAATATGGAAATAAGAGTATATGTTTAGCTCTGAGTATGTTCTGGTGAGAATTACAATGATGCCAAACTCTATGCATATATTAAAGCCATAGCaaaaaa a score=58889 s hg17.chr12_random 465870 854 + 466818 aaaagaaagaaagaaaggaaaagaaaagaaaagaaaaaagaaagaaagaaagagaaaagaaaAATTAAAGAGTTTTTATGTGGGCTTCTACTTGATTTTATTTTTTCCTAATACAAAAA--AGTTTTCGTCAAGGCTTTCAAGGAGCCAAGGTTTCCCATCATATCAAGAATCTAATCTTCCACAGCATTATCAGTGAGGTCTGACTCAGCTTGCTCTTCCCAAGAATCAGAATCAGAGTGATCAGAAAGGCAGAAGGCTCCTACTATCTGCAAAAGCACCATGCCCAGCAGGCTGTTTACCATAAAGTGAATCAAATCTGCTATAAAAGCTGAAAAACAGTACATGATAAAAAGAAAATAAGAAAGATTAC-GACTCCAAAATCATTTATTTCCCAATTGAATGTTAATAAACCAAGGACTCCATCAGAATCATAATATTCACATAATTAATTCTACACTTTATCCAAAGGAAAAATGGCTGAG-AAAAATTAGCTATTGTGAACCACCCCCACCTCCAAAAATTATCAGGCAGATAGCAAACCAAAGGGTTGAGTACTGATCAGTGTCCAAAAGGAAA-CGTACTTTTTTTCTAGTTTGGCATTAGCACAAGTTAATGGTGTGGTGTGAACATAAGTATAAAAATATTAAGCAGTATTAAACACAGCTGTTAAATTCTGGAGCTGGCTAACCTGATGAAAAGTCAGTTAAAGGAAGCTTCCAATGCCCAAGCCAGTCAATGCAGTTAATCTGTAAAATCAAGCCATTTCCAATCATGAATTTTCTAATTTGTACAATCAAGCCATTTCCAATCATGAATACTCTAATCATGAATTCTCCTAATATCACCCGCAGCAA s rheMac1.SCAFFOLD125516 2156 775 + 48937 aaaagaaagaaagaa-------------------------------------agaaaagaaaaatgaaagaGTTTTTATGTGGGCTTCTACTTGATTTTATTTTTTCCTAATACAAAAAACAGTTTTCGTTAAGACTTTCAAGGAACCAAGGTTTCCCATCACATCAAGAATATAATCTTTCACAGCATTATAA--GAGGTCTGACTCAGCTTGTTCTTCCCAAGAATCAGAATCAGAGTGATCAGAAAGGCAGAAAGTTGCTACTATGTACAAAAGCATCATGCCCAGCAGGCTGTTTACCATAAAGTGAATCGAATCTGATATAAAAGTTGAAAAACAGTACACGATAAAAAGAAAGTAAGAAAGATTACAGACTCCAAAATCATTTATATCCCAATGGAATGTTAATAAACCAAGGACTCCATCAGAATCATAATATTCACATAATTAATTCTACATTTTGTCCAGAGGAAAAATGGCTGAGAAAAAATTAGCTATCTTGAATTGCCCCCACCTCCAAAAATTATCAGGCAGATAGCAAACCAGAGGGTTGAGTATTGATCAGTGTCCAAAAGGAAATTGTACTTTTTTTCTAGTTTGGTATTAGCGCAAGTTAATGGTGTGGTGTGAACGTAAGTACAAAAGCATTAAGCAGTATTAAACATAGCTGATAAATTCTGGAGATGGCTAAACTTATGAAAAGTCAGTTAAAGGAATCTTACAATGCCTAAGGCAGTCAATGCAGTCAATCTGTACAATCAAGCCATTTCCA---------------------------------------------AATATTCTAATCATGAATTCTCCTAATATCACCCTCAGCAA a score=6888 s hg17.chr12_random 466724 94 + 466818 AAGCAGTGTGGATTAGGCATTCAAATCTAAA-CATCAAGGGGCAGATAAAATCTACAACCACCTAAATTATTGCTCCTATCCCACTCTCAGGTGG s rheMac1.SCAFFOLD125516 3571 95 + 48937 AAGAAATGTGGATTAGGCATTCAAATCTAAAACATCAAGGGGCAGATAAAAACTATGACCATCTACATTATTGGTCCTATCCCACTCTCAGGAGG